JP5689074B2 - 分析対象ペプチドの保護方法および回収方法 - Google Patents
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Description
がんや他の疾病の早期発見や確定診断のためのバイオマーカーとして血清や血漿中の特定のペプチドを分析する場合、アルブミンがペプチド分析の妨げとなるので、アルブミンを除去した後に分析が行われる。ところが、血清からアルブミンを除去すると、血清に含まれているプロテアーゼなどのペプチドを分解する酵素によって、分析対象のペプチドが分解されてしまうという問題が生じる。
非特許文献1には、pH2.5に調製されたメソポーラスシリカMCM−41の懸濁液と血清とを混合することにより、血清中のペプチドをメソポーラスシリカMCM−41に選択的に担持させ、この担持されたペプチドをメソポーラスシリカMCM−41から溶出し、2−D LC−MS/MS分析を行ったことが記載されている。
また、本発明によれば、上記のようにメソ多孔体により保護されたペプチドを効率的に回収することができる。
なお、血清または血漿からアルブミンを除去する方法は、当該技術において公知である。そのような方法としては、例えば、Cibacron-blueをリガンドとするクロマトグラフィー法、抗アルブミン抗体を用いるイムノアフィニティー法、抗アルブミン抗体を担持させた磁性粒子を用いる磁気分離法などが挙げられる。また、市販のアルブミン除去キットを使用することができる。
液体試料中のペプチドを有効に保護するためには、メソ多孔体のメソポアにペプチドを包接させる必要がある。このため分析対象ペプチドを含む液体試料と、メソ多孔体の乾式粉体を混合する。
なお、包接されるペプチドの大きさには、メソポアのサイズ(細孔径)によって選択性がある。したがって、本発明の実施形態において、メソ多孔体を用いて包接し、回収する対象のペプチドとしては、アミノ酸残基長(以下「aa長」という)が10〜100aa長、好ましくは10〜50aa長の短鎖ペプチドが好適である。
ここで用いるプロテアーゼは特に限定されないが、トリプシン、V8プロテアーゼ、LEP(リシルエンドペプチダーゼ)などが好ましい。
本発明の一実施形態において、メソ多孔体に包接されたペプチドを回収する工程は、洗浄されたメソ多孔体を遠心分離によって取得し、得られたメソ多孔体にペプチド回収用溶媒を添加して、包接されたペプチドを該溶媒中に溶出させることにより行われる。ペプチド回収用溶媒は、アセトニトリルを含む水溶液が好ましい。
また、本発明の実施形態においては、溶出液における短鎖ペプチドの割合を増加させることができるので、分析対象ペプチドを含む液体試料をクエン酸バッファーの存在下で処理することがより好ましい。
得られた電気泳動用サンプルを、泳動・染色して、ペプチドを可視化した結果を図3に示す。
また、24aa長のACTHペプチドにおいても同様の結果が得られた(図3参照)。また、多孔体に吸着されたペプチドを剥離するためには、酸性緩衝液が有効であり、中性緩衝液では剥離効果が弱いことが確認された。
ACTH 0.5 mgを超純水25 μLあるいは10 μLに溶解してACTH溶液1及び2を調製した。このACTH溶液1をメソ多孔体粉体(TMPS-4)25 mgを収容したチューブに添加し、ACTH溶液2をマイクロ多孔体粉体(TMPS-1.5)25 mgを収容したチューブに添加し、それぞれボルテックスにて攪拌して各溶液を各粉体に吸収させ、ペプチドを包接させた。これらに超純水1 mLを添加してボルテックスを用いて約30秒間攪拌した後に15,000 rpmで10分間遠心処理を行った。この洗浄操作を3回行い、沈殿物(ペプチド包接多孔体粉体)を回収した。回収したペプチド包接多孔体粉体を遠心濃縮機にて乾固した後に超純水500 μLを添加して50 mg/mLの懸濁液とした。ペプチド包接多孔体粉体が2.8 mgとなるように0.5 mLチューブに懸濁液を分注した後に、遠心濃縮機にて乾固して、ACTHキャッピング処理を施したメソ多孔体粉体1(TMPS-4)およびマイクロ多孔体粉体2(TMPS-1.5)を得た。
一方、メソ多孔体によりACTHが包接されているとき、ACTHは恒温静置時間が経過してもあまり減少しないことが確認された(レーン4〜6の比較)。各レーンのバンドの濃淡を定量化してプロットした結果を図8に示す。この結果から、ACTHの半減期を計算すると、メソ多孔体によるペプチドの保護効果は、半減期を3.5時間から11時間に延長させる程優れていることが判明した。
回収した沈殿物を50 mMグリシン−塩酸緩衝液(pH 2.5)1 mLで3回洗浄した後、50 %アセトニトリル,0.1 % TFA溶液1 mLを添加し、ローテーターを用いて室温で1時間攪拌してマイクロ多孔体に吸着されたペプチドを溶出した。15,000 rpmで10分間遠心処理を行って溶出液を回収した。回収した溶出液(約900 μL)の1/10量を遠心濃縮機にて乾固して得た固形物をSDSサンプルバッファーに溶解して45℃で1時間加熱処理し、電気泳動用サンプルとした(多孔質体の孔外に非特異的吸着した廃棄物)。
回収した沈殿物を50 mMグリシン溶液(pH 2.5)1mLで3回洗浄した後、50 %アセトニトリル,0.1 % TFA溶液1 mLを添加し、ローテーターを用いて室温で1時間攪拌してメソ多孔体に包接されたペプチドを溶出した。15,000 rpmで10分間遠心処理を行って溶出液を回収した。回収した溶出液(約900 μL)の1/10量を遠心濃縮機にて乾固して得た固形物をSDSサンプルバッファーに溶解して45℃で1時間加熱処理し、電気泳動用サンプルとした(沈殿回収物)。
包接効果がない無孔質シリカで夾雑タンパク質(長鎖ペプチド)を取り除いた後、包接効果のあるメソ多孔体を用いて、目的とするペプチド(短鎖ペプチド)を単離する確認実験を電気泳動により行った。
電気泳動用サンプルは、下記のようにして合計6サンプルを調製した。
上清に再度、無孔質シリカ10 mg を添加して、ローテーターを用いて室温で1時間撹拌し、上清と沈殿物を回収した。
回収した上清を、さらに上記と同様の操作を3回繰り返すことにより、沈殿物を合計6回回収した。
無孔質シリカはペプチド包接効果がなく、該シリカの外表面へのアーティファクトの非特異吸着が支配的である。しかし、この性質を利用することにより、ヒト血清中でメソ多孔体の孔をふさぐ夾雑物(長鎖ペプチド、とりわけアルブミン)を除去することができた。さらに、夾雑物除去処理を施した血清にペプチド包接効果を有するメソ多孔体を添加することにより、メソ多孔体のメソポア中にペプチドがより濃縮され、未処理のヒト血清の電気泳動上ではみられなかった短鎖ペプチドが確認することが出来た。
これにより、無孔質シリカによる夾雑物の除去処理を行うことで血清中の短鎖ペプチドをより多く回収できることが判明した。
血清0.5 μLをSDSサンプルバッファーに溶解して45℃で1時間加熱処理し、電気泳動用サンプルとした(図12のレーン1)
血清100 μLを50 mMグリシン−塩酸緩衝液(pH 2.5)200 μLと混合した。この血清溶液300 μLに マイクロ多孔体粉体(TMPS-1.5)10 mgを添加して、ローテーターを用いて室温で1時間攪拌した。15,000 rpmで10分間遠心処理を行い、上清を回収した。
このようにプロテアーゼとメソ多孔体とを併用した結果、未処理のヒト血清の電気泳動上では認められなかった短鎖ペプチドが回収された(図12のレーン3)。したがって、本発明において、プロテアーゼとメソ多孔体の併用は、実験例7で示した方法と同様に、血清中の短鎖ペプチドの単離・探索に有効である可能性があることが判明した。
得られた電気泳動用サンプルを電気泳動した後に染色を行い、電気泳動像を得た。結果を図13(b)に示す。
ヒト血清(健常者ドナー血清; Sunfco社)を50 mMグリシン緩衝液(pH2.5, A液)で5倍希釈したものと、89 mMクエン酸- 21mMリン酸緩衝液(pH2.6, B液)で5倍希釈したものを準備した。各希釈物をローテーターにて室温で一晩撹拌した。A液処理血清サンプルをA液処理血清、B液処理血清サンプルをB液処理血清とする。
ローテーターを用いて、室温で一時間撹拌し、多孔体にペプチドを包接させた。 15,000 rpmで5分間遠心処理を行い、沈殿物を回収した。
このため、血清ペプチドを遊離する効果は、グリシン緩衝液よりもクエン酸-リン酸緩衝液の方が、優れていることがわかった。
乾燥状態のメソ多孔体粉体(乾式メソ多孔体試薬)をそのまま用いた場合と、メソ多孔体粉体を緩衝液に懸濁した懸濁液(湿式メソ多孔体試薬)を用いた場合とにおける、メソ多孔体に取り込まれるペプチドの量を比較した。
図15の可視化したゲル電気泳動写真から、54 アミノ酸残基から75 アミノ酸残基のいずれのペプチドにおいても、乾式沈殿回収物の方が湿式沈殿回収物よりも優位に回収することができた。
図16の結果からも、短鎖ペプチドを湿式に比べ乾式の方が回収していることが明らかになった。湿式と比べ乾式の方が、メソ多孔体のメソポアに液体と共にペプチドを吸引する表面張力(メニスカス力、毛細管力)が働くことに起因し、短鎖ペプチドを包接出来たのではないかと考えられる。
乾燥粉体状態のメソ多孔体粉体をそのまま用いた場合(乾式)と、メソ多孔体粉体を緩衝液に懸濁した懸濁液を用いた場合(湿式)とにおけるペプチド回収効率の差を調べるために、以下のように、微量のペプチドを定量可能な蛍光分光測定を実施した。
・25 mgのTMPS-7の粉体へ200 μLの水を添加して懸濁して得た試薬(以下、「TMPS-7湿式メソ多孔体試薬」という)、
・25 mgのTMPS-7の粉体へ200 μLの上記の蛍光修飾ACTH水溶液を添加して、この溶液の全量を吸収させて得た試薬(以下、「TMPS-7乾式メソ多孔体試薬」という)、
・25 mgのTMPS-1.5の粉体へ100 μLの水を添加して懸濁して得た試薬(以下、「TMPS-1.5湿式メソ多孔体試薬」という)および
・25 mgのTMPS-1.5の粉体へ100 μLの上記の蛍光修飾ACTH水溶液を添加してこの溶液を吸収させて得た試薬(「TMPS-1.5乾式メソ多孔体試薬」という)。
なお、このときペプチドの総添加量は、5μMと400μLとの積の値である。
なお、このときのペプチドの総添加量は、湿式メソ多孔体試薬の場合と同一の、5μMと400μL (200μLと200μLの和)との積の値である。
攪拌後、これら4つの試料を、15,000rpm、5分間の遠心分離に供し、上清と沈降した多孔質体とに分けた。多孔質体は、最初に50 mMグリシン緩衝液(900 μL)で3回洗浄され、TBST緩衝液(50 mMトリス-塩酸、500 mM NaCl、0.2% Tween 20含有、900 μL)で3回洗浄され、20% エタノール溶液(900 μL)で1回洗浄され、最後に30 %アセトニトリル溶液(0.1 % TFA含有、900 μL)で洗浄された。
洗浄された各多孔質体にそれぞれ100 %アセトニトリル(900 μL)を添加し、多孔質体に包接された蛍光修飾ACTHを溶出した。
得られた550 nmから600 nmまでスペクトルの蛍光波長のうち、アーティファクト由来の散乱などの測定に無関係な2次光を回避するため592 nmの蛍光波長を採用し、このときの光強度を測定することでペプチドの回収量とした。
図17より、口径の小さい多孔質体であるTMPS-1.5を用いた場合は、乾式試薬であっても湿式試薬であっても、両者の間にペプチド回収量に差は認められない。
対照的に、口径の大きな多孔質体であるTMPS-7を用いた場合では、多孔に起因したメニスカスフォースがもっとも発生される乾式試薬において、湿式試薬に対して200%のペプチド回収量を認めた。
したがって、本発明において、メソ多孔体を乾燥状態で用いることは、ペプチドの回収に優れていることがわかる。
2 メソポア
3 側壁面
Claims (11)
- 生物学的試料に含まれる分析対象ペプチドを含む液体試料と、メソポアを有するメソ多孔体の乾式粉体とを混合することにより、前記分析対象ペプチドを前記メソ多孔体のメソポアに包接させることを含み、前記分析対象ペプチドが前記生物学的試料中でアルブミンと会合しており、前記液体試料がアルブミンを実質的に含有しないことを特徴とする、分析対象ペプチドの保護方法。
- 前記液体試料が、アルブミンを除去された前記生物学的試料を含有する、請求項1に記載の分析対象ペプチドの保護方法。
- 前記生物学的試料が血清または血漿であり、前記分析対象ペプチドをメソポアに包接させることにより、血清または血漿に含まれるプロテアーゼから前記分析対象ペプチドを保護する、請求項1または2に記載の分析対象ペプチドの保護方法。
- 前記メソ多孔体がメソポーラスシリカである、請求項1〜3のいずれか1項に記載の分析対象ペプチドの保護方法。
- 前記メソポーラスシリカがハニカム構造を有する、請求項4に記載の分析対象ペプチドの保護方法。
- 生物学的試料に含まれる分析対象ペプチドを含む液体試料と、メソポアを有するメソ多孔体の乾式粉体とを混合することにより、前記分析対象ペプチドを前記メソ多孔体のメソポアに包接させる工程と、
前記メソ多孔体のメソポアに包接された分析対象ペプチドをペプチド回収用溶媒中に溶出させる工程と
を含み、前記分析対象ペプチドが前記生物学的試料中でアルブミンと会合しており、前記液体試料がアルブミンを実質的に含有しないことを特徴とする、分析対象ペプチドの回収方法。 - 前記生物学的試料に含まれる分析対象ペプチドを含む液体試料に、マイクロ多孔体又は無孔質体を添加して液体試料の前処理をする工程をさらに含み、
前記前処理を施した分析対象ペプチドを含む液体試料に、前記分析対象ペプチドを包接させる工程を行う、請求項6に記載の分析ペプチドの回収方法。 - 前記分析対象ペプチドを包接させる工程において、分析対象ペプチドを含む液体試料とメソポアを有するメソ多孔体の乾式粉体とを混合して得られた混合物にプロテアーゼをさらに添加する、請求項6または7に記載の分析ペプチドの回収方法。
- 前記メソポアに分析対象ペプチドを包接したメソ多孔体を酸性緩衝液で洗浄する工程をさらに含む、請求項6〜8のいずれかに記載の分析対象ペプチドの回収方法。
- 前記分析対象ペプチドを含む液体試料が緩衝液を含む、請求項6〜9のいずれかに記載の分析ペプチドの回収方法。
- 前記緩衝液がクエン酸緩衝液である、請求項10に記載の分析ペプチドの回収方法。
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