JP5684476B2 - 両親媒性物質による担体上への膜タンパク質の固定 - Google Patents
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Description
−膜タンパク質が病原体の膜に由来する場合においては、そのような方法は、対象から入手した生体サンプルにおいて、この膜タンパク質に対して産生された抗体の存否を検出することにより、対象の病原体への暴露の存否を検出するのに、有用であり得る;
−ヒト若しくは動物の膜受容体で、疾患の原因に関わっていることが示されており、従って、該疾患の処置において治療の標的となる場合は、そのような方法は、この膜受容体のアゴニスト化合物又はアンタゴニスト化合物を同定するための化合物ライブラリーのスクリーニングに、有用であり得る。
−完全に界面活性剤フリーで水溶性且つ生化学的に安定した形に膜タンパク質を維持し、これにより当該方法をより簡易化し、膜タンパク質の不安定化を防ぐ方法、
−タンパク質毎に実験的方法を特に調整することなく且つタンパク質のいかなる改変の必要もなく、任意の膜タンパク質に適用可能で、従って完全に公知ではないタンパク質、又はタンパク質の生化学及び遺伝的な特徴が制御されていない場合などにも使用可能な、普遍的方法、並びに
−膜タンパク質を担体表面に高密度で付着させることにより、実験結果の収率及び感度を向上させ、もってデータ解釈を向上させる方法。
発明者らは、膜タンパク質と複合体化したアンフィポルを、この膜タンパク質を担体上へと付着させる中間介在物として更に使用できることを見出した。ここで担体への結合は、アンフィポルを通して行われる。
Rb1からRbnは異なり、以下から選択され:
−以下から選択される親水性基
・M+が陽イオン性の対イオンである、カルボン酸基−COO−M+、スルホン酸基−SO3 −M+、又はホスホン酸基−PO3 −M+、
・(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基
・フェニルスルホン酸基
・CONRc1Rc2であって、式中、Rc1及びRc2は同一であっても異なっていてもよく、(−C(CH2ORd1)(CH2ORd2)(CH2ORd3))基を表し、式中、Rd1、Rd2及びRd3は、独立に、水素原子、糖部分、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基、糖部分を表すもの
・COOReであって、式中、Reが、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一であっても異なっていてもよく水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基、を表すもの、
・ヒドロキシル基
・mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、
・1級、2級、3級アミン
・4級アンモニウム
・N−ホルムアミド、N−アルキルホルムアミド、
・N−アセトアミド、N−アルキルアセトアミド、
・N−ピロリドニル、
・CONRg1Rg2であって、式中、Rg1及びRg2は、同一であっても異なっていてもよく水素原子、糖部分、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOHであるもの、
・COORh又はCONRkRlであって、式中、Rhが(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸を表すか、又は水素原子でないという条件でRe若しくはRg1に与えた意味の1つを有し、Rk及びRlは独立に、Rhに与えた意味の1つを有し且つ更にそのうちの1つが水素原子を表し得るもの;
−以下から選択される疎水性基:
・水素原子、
・ハロゲン原子、
・−CONH(−C(CH2ORm1)(CH2ORm2)(CH2ORm3))基であって、式中、Rm1、Rm2、Rm3が独立に、3から50の炭素原子を有する直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル、Rn及びRoが3から50の炭素原子を有する直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であるアルキルカルバモイル(O=C−NH−Rn)若しくはアシル(O=C−Ro)であるもの、
・COORp、CORp、COSRp、C−NH−Rp又はCONRq1Rq2であって、式中、Rpは3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルキニル若しくはアルケニル基であり、且つRq1及びRq2は同一であっても異なっていてもよくRpに与えた意味の1つを有し、更にそのいずれか1つが水素原子を表し得るもの、
・−Rr、−ORr、又は−SRr基であって、式中、Rrが3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルケニル又はアルキニル基を表すもの;或いは
−以下から選択される両親媒性基:
・アルキル基−(CH2)m−Rsであって、式中、mが6から20の間であり、且つRsがカルボン酸基、スルホン酸基、ホスホン酸基、硫酸基、リン酸基、双生イオン基、アンモニウム基、ポリ(オキシエチレン) 基又は糖鎖などの親水性基であるもの、
・ポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であって、式中、Rtが6から20の炭素原子をもつ直鎖、分岐若しくは環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、
・COORu、CoRu、COSRu、CONRvRw基で、式中、Ruがポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であって、Rtが6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐又は環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、グリコシルアルキル基であって、式中、Rvが水素原子若しくはRuに与えた意味の1つを有し、式中、RwがRuに与えた意味の1つを有するもの、
・−CONH(−C(CH2ORx1)(CH2ORx2)(CH2ORx3))基であって、式中、Rx1、Rx2、Rx3の基のうち1つ若しくは2つが、Rm1、Rm2、Rm3に与えた意味の1つを有し、且つこれらの基のうち1つ若しくは2つが、水素原子でなく且つRd1、Rd2、Rd3、Ruに与えた意味の1つを有するもの、
・或いは、Rx1、Rx2、Rx3が同一又は異なり、且つそれらの基のうち少なくとも1つが水素原子でなく且つRuに与えた意味の1つを有するもの、
nは2以上の整数であり、好ましくは2から10の間、2から8の間、2から6の間、2から4の間であり、nが3であることが有利である;
X1からXnは、それぞれ該ユニットの割合
Rb1は以下から選択される親水性基であり:
・M+が陽イオン性の対イオンである、カルボン酸基−COO−M+、スルホン酸基−SO3 −M+、又はホスホン酸基−PO3 −M+、
・(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基
・フェニルスルホン酸基
・CONRc1Rc2であって、式中、Rc1及びRc2は同一であっても異なっていてもよく、(−C(CH2ORd1)(CH2ORd2)(CH2ORd3))基を表し、Rd1、Rd2及びRd3は、独立に、水素原子、糖部分、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基、糖部分であるもの、
Rb2は:
−以下から選択される疎水性基:
・水素原子、
・ハロゲン原子、
・−CONH(−C(CH2ORm1)(CH2ORm2)(CH2ORm3))基であって、式中、Rm1、Rm2、Rm3が独立に、3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル、Rn及びRoが3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であるアルキルカルバモイル(O=C−NH−Rn)若しくはアシル(O=C−Ro)であるもの、
・COORp、CORp、CSRp、C−NH−Rp又はCONRq1Rq2であって、式中、Rpは3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルキニル若しくはアルケニル基であり、且つRq1及びRq2は同一であっても異なっていてもよくRpに与えた意味の1つを有し、更にそのいずれか1つが水素原子を表し得るもの、
・−Rr、−ORr、又は−SRr基であって、式中、Rrが3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルケニル又はアルキニル基を表すもの;或いは
−以下から選択される両親媒性基:
・アルキル基−(CH2)m−Rsであって、式中、mが6から20の間であり、Rsがカルボン酸基、スルホン酸基、ホスホン酸基、硫酸基、リン酸基、双生イオン基、アンモニウム基、ポリ(オキシエチレン) 基、糖鎖などの親水性基であるもの、
・ポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であって、式中、Rtが6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐若しくは環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、
・COORu、CORu、COSRu、CONRvRw基であって、式中、Ruがポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であって、Rtが6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐若しくは環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、グリコシルアルキル基であって、式中、Rvが水素原子を表すか若しくはRuに与えた意味の1つを有するものであって、式中、RwがRuに与えた意味の1つを有するもの、
・−CONH(−C(CH2ORx1)(CH2ORx2)(CH2ORx3))基であって、式中、Rx1、Rx2、Rx3の基のうち1つ若しくは2つが、Rm1、Rm2、Rm3に与えた意味の1つを有し、且つこれらの基のうち1つ若しくは2つが、水素原子でなく且つRd1、Rd2、Rd3、Ruに与えた意味の1つを有するもの、
或いは、Rx1、Rx2、Rx3が同一又は異なり、且つそれらの基のうち少なくとも1つが水素原子でなく且つRuに与えた意味の1つを有するものであり、
−Rb3は以下から選択される親水性基であり:
・COOReであって、式中、Reが、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一であっても異なっていてもよく水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基、
・ヒドロキシル基
・mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、
・1級、2級、3級アミン
・4級アンモニウム
・N−ホルムアミド、N−アルキルホルムアミド、
・N−アセトアミド、N−アルキルアセトアミド、
・N−ピロリドニル、
・CONRg1Rg2であって、式中、Rg1及びRg2が、同一であっても異なっていてもよく水素原子、糖部分、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4(R3)の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOHであるもの、
・COORh又はCONRkRlであって、式中、Rhが(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸を表すか、又は水素原子でないという条件でRe若しくはRg1に与えた意味の1つを有し、Rk及びRlは独立に、Rhに与えた意味の1つを有し且つ更にそのうちの1つが水素原子を表し得るもの;
−x1が20から90%の間
−x2が10から80%の間
−x3が 0から60%の間であり、且つ
−x2/x1+x3が、0.25から2.5の間;好ましくは0.25から2の間;0.25から1.5の間;0.25から1の間;或いはより好ましくは0.25から0.5の間であり;且つ
平均分子量が500から100,000の間、有利には1,000から50,000の間、2,000から25,000の間、より有利には4,000から15,000の間、6,000から12,000の間、そして好ましくは8,000から10,000の間であり、更に好ましくは9,000から10,000g.mol−1の間である。
Ra1、Ra2及びRa3は同一又は異なり、水素原子、又はメチル基を表し;
Rb1は、M+ が陽イオン性の対イオンであるカルボン酸基COO−M+ を表し;
Rb2はCONRq1Rq2であって、式中、Rq1及びRq2は独立に、3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルキニル又はアルケニル基を表し、更にそのいずれか1つが水素原子を表し得;
Rb3は、CONRkRlであって、式中、Rk及びRlは独立に、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一又は異なり水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表し、更にRk及びRlのいずれか1つが水素原子を表し得るものである (CH2)t−NRf1Rf2基であるもの、を表す。
Ra1、Ra2及びRa3は同一又は異なり、水素原子、又はメチル基を表し;
Rb1は、M+ がNa+ 又はK+ であるCOO−M+ を表し;
Rb2はCONRq1Rq2を表し、Rq1はn−オクチル、Rq2はHであり;
x1が70から80%の間、x2が20から30%の間、且つx3が0%であり;且つ
平均分子量が2,000から50,000g.mol−1の間である。
Ra1、Ra2及びRa3は同一又は異なり、水素原子、又はメチル基を表し;
Rb1は、M+ が陽イオン性の対イオンであるCOO−M+ を表し;
Rb2はCONRq1Rq2を表し、Rq1はn−オクチル、Rq2はHであり;
Rb3は、上記式(II)にて定義のとおり、即ち、CONRkRlであって、式中、Rk及びRlは独立に、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一又は異なり水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表し、更にRk及びRlのいずれか1つが水素原子を表し得るものである (CH2)t−NRf1Rf2基であるもの、を表し;
x1が30から40%の間、x2が20から30%の間、且つx3が30から50%の間であり;且つ
平均分子量が2,000から50,000g.mol−1の間である。
a)該両親媒性分子が、受容体−リガンド分子ペアの第1の半分を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b)該担体が、該受容体−リガンド分子ペアの第2の半分を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c)該担体上への該両親媒性分子の付着が、該両親媒性分子の該官能基(単数又は複数)と該担体に付着した該官能基(単数又は複数)との間の、特異的な受容体−リガンド結合を通して媒介される。
−酵素−基質型の相互作用を伴うペアは、当該基質に高い親和性を有するタンパク質により認識される小分子から成り、以下のペアなどである:
(ビオチン/アビジン)、(グルタチオン/グルタチオンS−転移酵素、グルタチオン−結合タンパク質若しくはグルタチオンS−転移酵素を含む融合タンパク質)、(カルモジュリン/ATPアーゼ、プロテインキナーゼ、ホスホジエステラーゼ若しくは神経伝達物質)、(L−アルギニン若しくはp−アミノベンズアミジン/セリンプロテアーゼ)、(L−リジン/プラスミノーゲン(及びアクチベーター)若しくはrRNA)、(AMP、ADP若しくはATP/酵素補因子)、(レクチン/グルカンタンパク質、糖脂質(glucolipid)若しくは多糖類)、(へパリン/成長因子及び凝固因子、ステロイド受容体、エンドヌクレアーゼ、リポタンパク質若しくはリパーゼ)、又は (シバクロンブルー(登録商標)/NAD若しくはNADP酵素補因子、アルブミン、凝固因子若しくはインターフェロン)、並びにそれらに対応する逆のペア。
−(抗原/抗体)若しくは(ハプテン/抗体)型、又はその逆の(抗体/抗原)若しくは(抗体/ハプテン)型、
−(ニトリロ三酢酸(NTA)/遷移金属)、(EDTA/遷移金属)などのように、遷移金属のキレート化を伴う基から成る、キレート化型の相互作用を伴うペア、
−(核酸/相補的核酸)型のペア、特に(オリゴヌクレオチド/相補的なオリゴヌクレオチド)型のペア、並びに
−(フェニルボロン酸(APB)/サリチルヒドロキサム酸 (ASH))型のアフィニティーペア。
Raaは、水素原子又はメチル基であり;
Rbbは、COORcc、又は−COSRcc若しくは−CORcc若しくはCONRccRdd基を表し、
式中、
Rccは、該受容体−リガンドペアの第1の半分を与える両親媒性分子中の官能基を表し、且つ、
Rddは、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、水素原子、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一又は異なり、水素原子又は(C1−C4)アルキル基である (CH2)t−NRf1Rf2基を表す。
a)該両親媒性分子が、化学反応性ペアの第1の半分を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b)該担体が、該化学反応性ペアの第2の半分を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c)該担体上への該両親媒性分子の付着が、該両親媒性分子の官能基(単数又は複数)と該担体に付着した官能基(単数又は複数)を化学反応させることにより行われる。
Raaaは、水素原子又はメチル基であり;
Rbbbは、COORccc、又は−COSRccc若しくは−CORccc若しくはCONRcccRddd基を表し、
式中、
Rcccは、化学反応性ペアの第1の半分を与える両親媒性分子中の反応性官能基を表し、且つ、
Rddは、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、水素原子、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一又は異なり、水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基を表す。
a)上記の任意の実施態様における、少なくとも1つの膜タンパク質、担体、及び両親媒性分子を提供し、
b)該両親媒性分子と該膜タンパク質との間で複合体を形成させ、且つ
c)該複合体の該両親媒性分子を、疎水結合、イオン結合、該両親媒性分子中の少なくとも1つの官能基と該担体表面の少なくとも1つの官能基の間での特異的な受容体−リガンド結合、又は該両親媒性分子中の少なくとも1つの反応性官能基と該担体表面の少なくとも1つの反応性官能基との間での共有結合により、該担体へ付着させる。
−界面活性剤により臨界ミセル濃度よりも高濃度において可溶化した膜タンパク質(単数又は複数)の溶液に、タンパク質の重量の0.5から10倍の重量の両親媒性分子を加える。
−4℃で15分インキュベート後、バイオビーズ(Bio-beads)(登録商標)上での吸着、若しくは透析、又は界面活性剤の臨界ミセル濃度より低濃度に希釈後に界面活性剤は通すがタンパク質は通さない濾過システム(例えばセントリコン(登録商標)方式又はアミコン(登録商標)方式)での調製物の濃縮、或いは、界面活性剤を沈殿させる、などにより、界面活性剤を除去する。界面活性剤を完全に取り除くため、これらの工程のいくつかを連続して行っても良い。
−次いでこの段階で、使用するタンパク質の性質及びサイズに応じて、ショ糖勾配によって調製物を遠心分離することにより、又は分子ふるい若しくはアフィニティー・カラムで両親媒性分子と複合体を分離することにより、複合体を洗浄し、過量の両親媒性分子を取り除くことができる。
−或いは、膜タンパク質(単数又は複数)/両親媒性分子の複合体の形成は、開始調製物(生体膜、封入体など)から、任意で界面活性剤の存在を助けとしてタンパク質の直接抽出、再変性の過程での捕獲、無細胞合成などの、他の種々の経路によっても行える。
a)該両親媒性分子が受容体−リガンド分子ペアの第1の半分を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b)該担体が、該受容体−リガンド分子ペアの第2の半分を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c)該担体上への該両親媒性分子の結合が、該両親媒性分子の該官能基(単数又は複数)と該担体に付着した該官能基(単数又は複数)との間の、特異的な受容体−リガンド結合を通して媒介される。
(ビオチン/アビジン)、(グルタチオン/グルタチオンS−転移酵素、グルタチオン−結合タンパク質若しくはグルタチオンS−転移酵素を含む融合タンパク質)、(カルモジュリン/ATPアーゼ、プロテインキナーゼ、ホスホジエステラーゼ若しくは神経伝達物質)、(L−アルギニン若しくはp−アミノベンズアミジン/セリンプロテアーゼ)、(L−リジン/プラスミノーゲン(及びアクチベーター)若しくはrRNA)、(AMP、ADP若しくはATP/酵素補因子)、(レクチン/グルカンタンパク質、糖脂質(glucolipid)若しくは多糖類)、(へパリン/成長因子及び凝固因子、ステロイド受容体、エンドヌクレアーゼ、リポタンパク質若しくはリパーゼ)、又は (シバクロンブルー(登録商標)/NAD若しくはNADP酵素補因子、アルブミン、凝固因子若しくはインターフェロン)、又は対応する逆のペア、(抗原/抗体)、(ハプテン/抗体)、(抗体/抗原)、(抗体/ハプテン)、(ニトリロ三酢酸(NTA)/遷移金属)、(EDTA/遷移金属)、(フェニルボロン酸(APB)/サリチルヒドロキサム酸(ASH))又は(オリゴヌクレオチド/相補的なオリゴヌクレオチド)。
Raaは、水素原子又はメチル基であり;
Rbbは、COORcc、又は−COSRcc若しくは−CORcc若しくはCONRccRdd基を表し、
式中、
Rccは、該受容体−リガンドペアの第1の半分を与える両親媒性分子中の官能基を表し、且つ、
Rddは、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、水素原子、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一又は異なり水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基を表す。
a)該両親媒性分子が、化学反応性ペアの第1の半分を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b)該担体が、該化学反応性ペアの第2の半分を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c)該担体上への該両親媒性分子の結合が、該両親媒性分子の官能基(単数又は複数)と該担体に付着した官能基(単数又は複数)と化学反応させることにより行われる。
Raaaは、水素原子又はメチル基であり;
Rbbbは、COORccc、又は−COSRccc若しくは−CORccc若しくはCONRcccRddd基を表し、
式中、
Rcccは、該化学反応性ペアの第1の半分を与える両親媒性分子中の反応性官能基を表し、且つ、
Rddは、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、水素原子、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、特に4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシエチレンなどのポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一又は異なり、水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基を表す。
a)膜タンパク質を界面活性剤中に溶解し、
b)該膜タンパク質を、上記の両親媒性分子と複合体化させ、界面活性剤を除去し、
c)該膜タンパク質を、上記の担体上へ、該両親媒性分子を通して固定し、
d)膜タンパク質のタンパク質断片を生成しつつ、膜貫通ドメインが該両親媒性分子と複合体形成して該担体へ付着したままとなるよう、徹底的に洗浄し、プロテアーゼを加え、
e)膜貫通ドメインが該両親媒性分子と複合体化して結合したままである該担体を取り除き、当該タンパク質断片を、質量分析により分析する。
1.1 原理
膜タンパク質の固体担体表面への固定のために開発された実験原理は以下のとおりである(図2):膜タンパク質は、界面活性剤にて可溶化し(工程a)次いで、ビオチン化アンフィポルで捕獲し、界面活性剤を除去する(固定b);得られた複合体を、ストレプトアビジン基をグラフトした担体と接触させ、特異的なビオチン/アビジン相互作用により複合体を担体と結合させる(工程c)。タンパク質リガンドを担体上にて循環させることで、リガンド/タンパク質相互作用を研究することができる(工程d)。
1.2.1 ビオチン化アンフィポル(BApol)の合成
BApolの構造を図3に示す。
BApolの合成方法は、非官能性アンフィポルの合成方法(7、16−17)から派生したものであり、低分子量のポリアクリル酸のカルボン酸官能性と、イソプロピルアミン及びオクチルアミンなどの適切に選択されたアルキルアミン、並びにこの特定な場合においては、低い比率で、選択的に単保護されたエチレンジアミンとで、アミド結合を形成する工程を含む。ポリマーに結合していないアミン官能基の脱保護に際しては、官能性アンフィポル(「普遍的(universal)」アンフィポル、又は「UAPol」;図2)が得られ、それを任意の十分に活性な基質上にて反応し得る。従ってBApolは、UAPolのアミン官能基が、D−ビオチンサクシニミジルエステルと反応することで得られる(図3)。
BAPolの溶液中特性は、非ビオチン化APolsのものと同一であり、特に、同サイズ、同分子量分布の粒子を形成する。
更にBAPolで捕獲された膜タンパク質は、(界面活性剤なしでも凝集せず)溶液中で適切に維持され、非ビオチン化アンフィポルと同様である。
要約するとBAPolは、ビオチン分子がグラフトされているが、アビジン又はストレプトアビジンに特異的に結合するという能力以外は、ビオチン−フリーのAPolと同じ物理化学的及び生化学特性を有しているため、膜タンパク質の複合体化させ、界面活性剤なしで水溶性として担体と結合させるために、使用することが可能である。
非ビオチン化アンフィポル(HAPol)及びビオチン化アンフィポル(BApol)の溶液を、ストレプトアビジン基がグラフトされた担体(SA担体)の2つの別々のチャネルに、別々に注入した。
得られた結果によれば、注入後、両ポリマーとも、SA担体へ付着することが示されたが(図4)、結合したBApolの重量は、HAPolの重量の約3倍であった。
両者を区別しているのはビオチングラフトの有無だけであることから、この実験により、アンフィポルのチップへの高い吸着率は、ビオチンの存在に起因することが確認できた。
生化学が周知であり、そのAPolの挙動も事前に検査されている以下の4つのモデル膜タンパク質を用いて、本発明の膜タンパク質の固定の方法を検査した:OmpAタンパク質の膜貫通ドメイン(tOmpA)、バクテリオロドプシン(BP)、b6fシトクロム(b6f)及びbc1シトクロム(bc1)である。
更にSPRによって膜タンパク質/リガンド相互作用をモニターするためのリガンドとして、これら4つの各タンパク質に対して産生された抗体を含有するウサギ血清を調製した。
これらの4つのタンパク質をBAPolにて捕獲した:
−tOmpAは、6g/lのオクチルテトラオキシエチレン界面活性剤(C8E4)存在下では、濃度1.2g/lで溶解して利用できる。100g/lのBAPol水溶液18μlを500μlのタンパク質溶液に加えることにより(即ち1gのtOmpAにつき4gのBAPol)、捕獲を行った。15分間インキュベーション後、30mgのバイオ−ビーズを加え、攪拌下で3時間、4℃にてインキュベーションを行い、その後に溶液を回収し、バイオ−ビーズを除去した。
−BR溶液は、界面活性剤オクチルチオグルコシド(OTG)中にて1g/lのタンパク質を含有し、OTGは20mMである。100g/lのBAPol水溶液23μlを450μlのタンパク質溶液に加えた(即ち1gのBRにつき5gのBAPol)。15分間インキュベーション後、30mgのバイオ−ビーズを加え、攪拌下で3時間、4℃にてインキュベーションを行い、その後に溶液を回収し、バイオ−ビーズを除去した。
−b6f溶液は、界面活性剤ラウリルマルトシド(LM)中にて0.27g/lのタンパク質及び0,1g/lのLMを含有する。100g/lのBAPol水溶液1.2μlを150μlのタンパク質溶液に加えた(即ち1gのb6fにつき3gのBAPol)。15分間インキュベーション後、140mgのバイオ−ビーズを加え、攪拌下で3時間、4℃にてインキュベーションを行い、その後に溶液を回収し、バイオ−ビーズを除去した。
−bc1溶液は、LM溶液中35g/lのタンパク質及び0.1g/lのLMを含有する。100g/lのBAPol水溶液119μlを225μlのタンパク質溶液に加えた(即ち1gのbc1につき1.5gのBAPol)。15分間インキュベーション後、90mgのバイオ−ビーズを加え、攪拌下で3時間、4℃にてインキュベーションを行い、その後に溶液を回収し、バイオ−ビーズを除去した。
実験により、該物質が、該担体に、効果的且つ非可逆的に結合することが示された(図5)。
続いて、任意の抗体のみを保持し、NaCl−HEPES緩衝液で100倍に希釈した精製血清を用いて、抗体/固定物質の認識実験を行った。
要約すると、あらかじめBAPol又はBAPolに捕獲されたタンパク質でコーティングしたチャネルに、10μlの免疫前精製血清(pre−i.)を注入し、続いてtOmpA(Post−i.−OA)、BR(Post−i.−BR)、b6f(Post−i.−b6f)そして続いてbc1(Post−i.−bc1)に対して産生された免疫後の血清を注入した。注入期間は60秒で、時刻ゼロを矢印で示した。注入間期には、NaCl−HEPES緩衝液(150mM NaCl、HEPES 10mM pH=7.4)を担体上に流した。各々の記録は異なるサンプルでコーティングされたチャネルより得た。
タンパク質のSA担体への結合が、特異的なビオチン/ストレプトアビジン結合によりポリマーに共有結合したビオチンにより媒介されているかについて調べるため、対照実験において、検査するタンパク質を(ビオチン化されていない)HAPol又は(ビオチン化された)BAPolのどちらかにて捕獲後にチップ上に置き、得られた応答を比較した。
結果から、タンパク質がBAPolに捕獲されていた場合にのみ、抗体はSA担体に有意に結合し、従って、SA担体に置かれたタンパク質を認識することが示された(図7参照)。
これらの結果から、担体上の膜タンパク質の固定のための本発明の方法の信頼性及び効力が実証された。事実、実験結果によって、アンフィポルが、化学的に適切に生成されたものであれば(この場合においてはビオチンのグラフトによるが、他の多くの取得方法が用いられてもよい)、過度の開発をせずとも、固体担体の表面における任意のタンパク質の固定に容易に用いることができることが示された。
・本明細書中にて示されたように、膜抗原に対して産生された循環抗体を検出する、又は
・薬理学的に価値のある膜受容体リガンドについて、化合物バンクをスクリーニングし、該受容体のアゴニスト若しくはアンタゴニストを同定する。
本発明者らは、ストレプトアビジンに結合させて官能基化した磁気ビーズ(SAビーズ)上におけるバクテリオロドプシン(BR)の固定を試験した。
これらの結果より、ビーズに膜タンパク質を固定することも可能であることが実証された。
ビオチン化アンフィポル(BAPol)の構造を図3に示す。
ポリヒスチジン標識アンフィポル(HISTAPol)の合成方法は、非官能性アンフィポルの合成方法(7、16−17)に由来し、3つの工程を含む。
二番目の工程は、ヒスチジンへキサマーの作成に関与する。この合成は、選択的に保護されたモノマーのダブルカップリングに関する自動化技術を用いて、固体担体上にて行われる。
最後の工程は、ペプチドのN末端と、合成の最初の工程の結果物であるアンフィポルの酸性官能基の縮合を含む。該ペプチドは、側鎖が保護され固体担体上に結合されたままの状態で用いる。使用したアンフィポル及びペプチドの量は、グラフトされたポリ(ヒスチジン)標識の量の2%を超えないように計算する。ペプチドを脱保護し、固体担体から切断後、HISTAPolを従来法により精製する。該合成を図10に図示した。
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Claims (29)
- 担体及びその表面に付着した少なくとも1つの膜タンパク質を含み、該膜タンパク質が、該膜タンパク質と複合体化された両親媒性分子を用いて該担体に付着され、前記両親媒性分子が、両親媒性ビニルポリマー、両親媒性ポリペプチド、両親媒性多糖類、又は両親媒性デンドリマーから選択されることを特徴とする、チップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。
- 前記両親媒性分子が、以下の式(I):
式中、
Ra1からRanは、同一又は異なり、水素原子又はメチル基を表し:
Rb1からRbnは異なり、以下から選択され:
−以下から選択される親水性基
・M+が陽イオン性の対イオンである、カルボン酸基−COO−M+、スルホン酸基−SO3 −M+、又はホスホン酸基−PO3 −M+、
・(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基
・フェニルスルホン酸基
・CONRc1Rc2であって、式中、Rc1及びRc2は、同一であっても異なっていてもよく、(−C(CH2ORd1)(CH2ORd2)(CH2ORd3))基を表し、式中、Rd1、Rd2及びRd3は、独立に、水素原子、糖部分、4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基、糖部分を表すもの
・COOReであって、式中、Reが、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシアルキレン、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一であっても異なっていてもよく水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基を表すもの、
・ヒドロキシル基
・mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、
・1級、2級、3級アミン
・4級アンモニウム
・N−ホルムアミド、N−アルキルホルムアミド、
・N−アセトアミド、N−アルキルアセトアミド、
・N−ピロリドニル、
・CONRg1Rg2であって、式中、Rg1及びRg2は、同一であっても異なっていてもよく、水素原子、糖部分、4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOHであるもの、
・COORh又はCONRkRlであって、式中、Rhが(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸を表すか、又は水素原子でないという条件でRe若しくはRg1に与えた意味の1つを有し、Rk及びRlは独立に、Rhに与えた意味の1つを有し且つ更にそのうちの1つが水素原子を表し得るもの;
−以下から選択される疎水性基:
・水素原子、
・ハロゲン原子、
・−CONH(−C(CH2ORm1)(CH2ORm2)(CH2ORm3))基であって、式中、Rm1、Rm2、Rm3が独立に、3から50の炭素原子を有する直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル、Rn及びRoが3から50の炭素原子を有する直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であるアルキルカルバモイル(O=C−NH−Rn)若しくはアシル(O=C−Ro)であるもの、
・COORp、CORp、COSRp、C−NH−Rp又はCONRq1Rq2であって、式中、Rpは3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルキニル若しくはアルケニル基であり、且つRq1及びRq2は、同一であっても異なっていてもよくRpに与えた意味の1つを有し、更にそのいずれか1つが水素原子を表し得るもの、
・−Rr、−ORr、又は−SRr基であって、式中、Rrが3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルケニル又はアルキニル基を表すもの;或いは
−以下から選択される両親媒性基:
・アルキル基−(CH2)m−Rsであって、式中、mが6から20の間であり、且つRsがカルボン酸基、スルホン酸基、ホスホン酸基、硫酸基、リン酸基、双生イオン基、アンモニウム基、ポリ(オキシエチレン) 基、糖鎖などの親水性基であるもの、
・ポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であって、式中、Rtは6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐若しくは環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、
・COORu、CORu、COSRu、CONRvRw基であって、式中、Ruがポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であり、且つRtが6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐又は環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、グリコシルアルキル基であって、式中、Rvが水素原子若しくはRuに与えた意味の1つを有するものであり、式中、RwがRuに与えた意味の1つを有するもの、
・−CONH(−C(CH2ORx1)(CH2ORx2)(CH2ORx3))基であって、式中、Rx1、Rx2、Rx3の基のうち1つ若しくは2つが、Rm1、Rm2、Rm3に与えた意味の1つを有し、且つこれらの基のうち1つ若しくは2つが、水素原子でなく且つRd1、Rd2、Rd3、Ruに与えた意味の1つを有するもの、
或いは、Rx1、Rx2、Rx3が同一又は異なり、且つそれらの基のうち少なくとも1つが水素原子でなく且つRuに与えた意味の1つを有するもの;
nは2以上の整数であり;
X1からXnは、それぞれ該ユニットの割合;
平均分子量が500から100,000の間である、
ことを特徴とする、請求項1に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。 - nが2から10の間であることを特徴とする、請求項2に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。
- nが3であり、該ビニルポリマーが、以下の式(II):
式中、Ra1、Ra2及びRa3は、同一又は異なり、水素原子又はメチル基を表し;
Rb1は以下から選択される親水性基であり:
・M+が陽イオン性の対イオンである、カルボン酸基−COO−M+、スルホン酸基−SO3 −M+、又はホスホン酸基−PO3 −M+、
・(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基
・フェニルスルホン酸基
・CONRc1Rc2であって、式中、Rc1及びRc2は、同一であっても異なっていてもよく、(−C(CH2ORd1)(CH2ORd2)(CH2ORd3))基を表し、式中、Rd1、Rd2及びRd3は、独立に、水素原子、糖部分、4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、(C1−C5)アルキルカルボン酸基、(C1−C5)アルキルスルホン酸基、又は(C1−C5)アルキルホスホン酸基、糖部分を表すもの
Rb2は:
−以下から選択される疎水性基:
・水素原子、
・ハロゲン原子、
・−CONH(−C(CH2ORm1)(CH2ORm2)(CH2ORm3))基であって、式中、Rm1、Rm2、Rm3は、独立に、3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル、Rn及びRoが3から50の炭素原子を有する直鎖若しくは分岐のアルキル、アルケニル若しくはアルキニル基であるアルキルカルバモイル(O=C−NH−Rn)若しくはアシル(O=C−Ro)であるもの、
・COORp、CORp、CSRp、C−NH−Rp又はCONRq1Rq2であって、式中、Rpは3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルキニル若しくはアルケニル基であり、且つRq1及びRq2は、同一であっても異なっていてもよく、Rpに与えた意味の1つを有し、更にそのいずれか1つが水素原子を表し得るもの、
・−Rr、−ORr、又は−SRr基であって、式中、Rrが3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルケニル又はアルキニル基を表すもの;或いは
−以下から選択される両親媒性基:
・アルキル基−(CH2)m−Rsであって、式中、mが6から20の間であり、Rsがカルボン酸基、スルホン酸基、ホスホン酸基、硫酸基、リン酸基、双生イオン基、アンモニウム基、ポリ(オキシエチレン) 基、糖鎖などの親水性基であるもの、
・ポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であって、式中、Rtが6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐若しくは環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、
・COORu、CORu、COSRu、CONRvRw基であって、式中、Ruがポリ(オキシエチレン)−O−アルキル基(−(CH2CH2O)m−Rt)であり、且つRtが6から20の炭素原子を持つ直鎖、分岐若しくは環状のアルキル、アルケニル、アルキニル基であるもの、グリコシルアルキル基であって、式中、Rvが水素原子若しくはRuに与えた意味の1つを有するものであって、式中、RwがRuに与えた意味の1つを有するもの、
・−CONH(−C(CH2ORx1)(CH2ORx2)(CH2ORx3))基であって、式中、Rx1、Rx2、Rx3の基のうち1つ若しくは2つが、Rm1、Rm2、Rm3に与えた意味の1つを有し、且つこれらの基のうち1つ若しくは2つが、水素原子でなく且つRd1、Rd2、Rd3、Ruに与えた意味の1つを有するもの、
又は、Rx1、Rx2、Rx3が同一又は異なり、且つそれらの基のうち少なくとも1つが水素原子でなく且つRuに与えた意味の1つを有するものであり、
Rb3は以下から選択される親水性基であり:
・COOReであって、式中、Reが、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシアルキレン、tが1から5までの整数であり且つRf1、Rf2が同一であっても異なっていてもよく水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基、を表すもの
・ヒドロキシル基
・mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、
・1級、2級、3級アミン
・4級アンモニウム
・N−ホルムアミド、N−アルキルホルムアミド、
・N−アセトアミド、N−アルキルアセトアミド、
・N−ピロリドニル、
・CONRg1Rg2であって、式中、Rg1及びRg2が、同一であっても異なっていてもよく、水素原子、糖部分、4から10のアルキレンオキサイドユニットを含むポリオキシアルキレン、双性イオン基、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOHであるもの(R3)、
・COORh又はCONRkRlであって、式中、Rhが(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸を表すか、又は水素原子でないという条件でRe若しくはRg1に与えた意味の1つを有し、且つRk及びRlは独立に、Rhに与えた意味の1つを有し且つ更にそのうちの1つが水素原子を表し得るもの;
x1、x2、x3は、それぞれ該ユニットの割合を表し、ここで、
−x1が20から90%の間
−x2が10から80%の間
−x3が 0から60%の間であり、且つ
x2/x1+x3が、0.25から2.5の間であり;且つ
平均分子量が500から100,000の間であること;
を特徴とする、請求項2または3に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。 - Ra1、Ra2及びRa3は同一又は異なり、水素原子、又はメチル基を表し;
Rb1は、M+ が陽イオン性の対イオンであるCOO−M+ を表し;
Rb2は、CONRq1Rq2を表し、式中、Rq1及びRq2が、独立に、3から50の炭素原子を含む直鎖若しくは分岐及び/又は環状のアルキル、アルキニル若しくはアルケニル基を表し、且つ更にそのいずれか1つが水素原子を表し得;
Rb3は、CONRkRlを表し、式中、Rk及びRlが、独立に、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり、Rf1、Rf2が同一又は異なり且つ水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表し、且つ更にRk及びRlのいずれか1つが水素原子を表し得るものである (CH2)t−NRf1Rf2基、を表すもの、
であることを特徴とする、請求項4に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。 - 平均分子量が500から50,000の間であることを特徴とする、請求項2〜5のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。
- 前記両親媒性分子の前記担体への結合が、疎水結合、イオン結合、両親媒性分子中の少なくとも1つの官能基と担体表面の少なくとも1つの官能基との間の特異的な受容体−リガンド結合、又は両親媒性分子中の少なくとも1つの反応性官能基と担体表面の少なくとも1つの反応性官能基との間の共有結合により、媒介されることを特徴とする、請求項1〜6のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。
- a.前記両親媒性分子が、受容体−リガンド分子ペアの一方を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b.前記担体が、該受容体−リガンド分子ペアの他方を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c.該担体上への該両親媒性分子の結合が、該両親媒性分子中の官能基(単数又は複数)と該担体に付着した官能基(単数又は複数)との間の、特異的な受容体−リガンド結合を通して媒介される:
ことを特徴とする、請求項7に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。 - 前記受容体−リガンドペア(両親媒性分子中の官能基/担体に付着した官能基)が以下のペア:(ビオチン/アビジン)、(グルタチオン/グルタチオンS−転移酵素)、(グルタチオン/グルタチオン−結合タンパク質)、(グルタチオン/グルタチオンS−転移酵素を含む融合タンパク質)、(カルモジュリン/ATPアーゼ)、(カルモジュリン/プロテインキナーゼ)、(カルモジュリン/ホスホジエステラーゼ)、(カルモジュリン/神経伝達物質)、(L−アルギニン/セリンプロテアーゼ)、(p−アミノベンズアミジン/セリンプロテアーゼ)、(L−リジン/プラスミノーゲン)、(L−リジン/プラスミノーゲンアクチベーター)、(L−リジン/rRNA)、(AMP/酵素補因子)、(ADP/酵素補因子)、(ATP/酵素補因子)、(レクチン/グルカンタンパク質)、(レクチン/糖脂質(glucolipid))、(レクチン/多糖類)、(へパリン/成長因子及び凝固因子)、(へパリン/ステロイド受容体)、(へパリン/エンドヌクレアーゼ)、(へパリン/リポタンパク質)、(へパリン/リパーゼ)、(シバクロンブルー(登録商標)/NAD若しくはNADP酵素補因子)、(シバクロンブルー(登録商標)/アルブミン)、(シバクロンブルー(登録商標)/凝固因子)、(シバクロンブルー(登録商標)/インターフェロン)、(抗原/抗体)、(ハプテン/抗体)、(ニトリロ三酢酸(NTA)/遷移金属)、(EDTA/遷移金属)、(フェニルボロン酸(APB)/サリチルヒドロキサム酸(ASH))又は(オリゴヌクレオチド/相補的なオリゴヌクレオチド)、又はそれらに対応する逆のペア、から選択されることを特徴とする、請求項8に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。
- 前記両親媒性分子が、請求項2に定義される式(I)又は請求項4に定義される式(II)で表されるポリマーであり、以下の式
式中:
Raaは、水素原子又はメチル基であり;
Rbbは、COORcc、又は−COSRcc若しくは−CORcc若しくはCONRccRdd基を表し、
式中、
Rccは、前記受容体−リガンドペアの一方を与える該両親媒性分子中の官能基を表し、且つ、
Rddは、(C1−C5)アルキル基、アルキルスルホン酸、水素原子、糖部分、mが1から4の範囲内である1級、2級、又は3級ヒドロキシアルキル−(CH2)mOH、
4から10のアルキレンオキサイドユニットを有するポリオキシアルキレン、双性イオン基、tが1から5までの整数であり、Rf1、Rf2が同一又は異なり且つ水素原子又は(C1−C4)アルキル基を表す (CH2)t−NRf1Rf2基を表す、
ことを特徴とする、請求項9に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。 - a.前記両親媒性分子が、化学反応性ペアの一方を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b.前記担体が、該化学反応性ペアの他方を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c.該担体上への該両親媒性分子の結合が、該両親媒性分子中の官能基(単数又は複数)と該担体に付着した官能基(単数又は複数)を化学反応させることにより行われる:
ことを特徴とする、請求項7に記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。 - 前記少なくとも1つの膜タンパク質が、抗原、抗体、酵素、細胞受容体、イオンチャネル、又は、ウイルス、細菌若しくは真核生物由来の膜タンパク質から選択されることを特徴とする、請求項1〜11のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブ。
- a)請求項1〜6及び8〜11のいずれかにて定義された、少なくとも1つの膜タンパク質、1つの担体及び1つの両親媒性分子を提供し、
b)該両親媒性分子と該膜タンパク質との間で複合体を形成させ、且つ
c)該複合体の両親媒性分子を、疎水結合、イオン結合、両親媒性分子中の少なくとも1つの官能基と担体表面の少なくとも1つの官能基との間での特異的な受容体−リガンド結合、又は両親媒性分子中の少なくとも1つの反応性官能基と担体表面の少なくとも1つの反応性官能基との間の共有結合により該担体へ付着させる:
ことを含む、チップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブの製造方法。 - 生物試料中における、前記少なくとも1つの膜タンパク質のリガンドの存否を検出するための、請求項1〜12のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブの使用。
- 前記少なくとも1つの膜タンパク質が、病原体の膜抗原であり、前記生物試料が血清サンプルであり、且つ前記検出されるリガンドが該抗原に対して産生された抗体であることを特徴とする、請求項14に記載の使用。
- 前記少なくとも1つの膜タンパク質のリガンドのための化合物バンクのスクリーニングのための、請求項1〜12のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブの使用。
- 前記少なくとも1つのタンパク質が酵素であり、該酵素の基質を制御条件下で変換させるものである、請求項1〜12のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブの使用。
- 担体及び両親媒性分子を含み、該両親媒性分子と該担体が、疎水結合、イオン結合、両親媒性分子中の少なくとも1つの官能基と担体表面の少なくとも1つの官能基との間の特異的な受容体−リガンド結合、又は、両親媒性分子中の少なくとも1つの反応性官能基と担体表面の少なくとも1つの反応性官能基との間の共有結合を通して相互作用することを特徴とする、請求項13に記載の方法を実行するためのキット。
- a)前記両親媒性分子が、受容体−リガンド分子ペアの一方を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b)前記担体が、該受容体−リガンド分子ペアの他方を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c)該担体への該両親媒性分子の結合が、該両親媒性分子中の官能基(単数又は複数)と該担体に付着した官能基(単数又は複数)との間での特異的な受容体−リガンド結合を通して媒介される:
ことを特徴とする、請求項18に記載のキット。 - 前記受容体−リガンドペア(両親媒性ビニルポリマーの官能基/担体に付着した官能基)が以下のペア:(ビオチン/アビジン)、(グルタチオン/グルタチオンS−転移酵素)、(グルタチオン/グルタチオン−結合タンパク質)、(グルタチオン/グルタチオンS−転移酵素を含む融合タンパク質)、(カルモジュリン/ATPアーゼ)、(カルモジュリン/プロテインキナーゼ)、(カルモジュリン/ホスホジエステラーゼ)、(カルモジュリン/神経伝達物質)、(L−アルギニン/セリンプロテアーゼ)、(p−アミノベンズアミジン/セリンプロテアーゼ)、(L−リジン/プラスミノーゲン)、(L−リジン/プラスミノーゲンアクチベーター)、(L−リジン/rRNA)、(AMP/酵素補因子)、(ADP/酵素補因子)、(ATP/酵素補因子)、(レクチン/グルカンタンパク質)、(レクチン/糖脂質(glucolipid))、(レクチン/多糖類)、(へパリン/成長因子及び凝固因子)、(へパリン/ステロイド受容体)、(へパリン/エンドヌクレアーゼ)、(へパリン/リポタンパク質)、(へパリン/リパーゼ)、(シバクロンブルー(登録商標)/NAD若しくはNADP酵素補因子)、(シバクロンブルー(登録商標)/アルブミン)、(シバクロンブルー(登録商標)/凝固因子)、(シバクロンブルー(登録商標)/インターフェロン)、(抗原/抗体)、(ハプテン/抗体)、(ニトリロ三酢酸(NTA)/遷移金属)、(EDTA/遷移金属)、(フェニルボロン酸(APB)/サリチルヒドロキサム酸(ASH))又は(オリゴヌクレオチド/相補的なオリゴヌクレオチド)、又はそれらに対応する逆のペア、から選択されることを特徴とする、請求項19に記載のキット。
- 前記両親媒性分子が請求項2に定義される式(I)又は請求項4に定義される式(II)で表されるポリマーであり、以下の式
式中、Raa及びRbbが、請求項10にて定義されたものであることを特徴とする、請求項20に記載のキット。 - a)前記両親媒性分子が、化学反応性ペアの一方を与える少なくとも1つの官能基を更に含み、
b)前記担体が、該化学反応性ペアの他方を与える、担体表面に付着した少なくとも1つの官能基を更に含み、且つ
c)該担体への該両親媒性分子の結合が、該両親媒性分子の官能基(単数又は複数)と該担体に付着した官能基(単数又は複数)を化学反応させることにより行われる、
ことを特徴とする、請求項18に記載のキット。 - 膜タンパク質を複合体化させ、担体に付着させるための、請求項1〜6及び8〜11のいずれかにて定義された両親媒性分子の使用。
- 受容体−リガンド分子ペアの一方を与える官能基を更に含む、請求項1〜6のいずれかにて定義された両親媒性分子。
- 前記官能基が、ビオチン、アビジン、グルタチオン、グルタチオンS−転移酵素、カルモジュリン、ATPアーゼ、プロテインキナーゼ、ホスホジエステラーゼ、神経伝達物質、L-アルギニン、p−アミノベンズアミジン、セリンプロテアーゼ、L-リジン、プラスミノーゲン、プラスミノーゲンアクチベーター)、rRNA、AMP、ADP、ATP、酵素補因子、レクチン、グルカンタンパク質、糖脂質(glucolipid)、多糖類、へパリン、成長因子及び凝固因子、ステロイド受容体、エンドヌクレアーゼ、リポタンパク質、リパーゼ、シバクロンブルー(登録商標)、NAD若しくはNADP酵素補因子、アルブミン、凝固因子、インターフェロン、抗原、ハプテン、抗体、ニトリロ三酢酸(NTA)、EDTA又はオリゴヌクレオチドから選択されることを特徴とする、請求項24に記載の両親媒性分子。
- 前記両親媒性分子が請求項2に定義される式(I)又は請求項4に定義される式(II)で表されるポリマーであり、以下の式
式中、Raa及びRbbが、請求項10にて定義されたものであることを特徴とする、請求項24に記載の両親媒性分子。 - 化学反応性ペアの一方を与える官能基を更に含む、請求項1〜6のいずれかにて定義された両親媒性分子。
- 請求項1〜12のいずれかに記載のチップ、ビーズ、膜、繊維又はナノチューブを製造することを含む、サンプル中の膜タンパク質の分析方法。
- 以下の工程:
a)膜タンパク質を界面活性剤中に溶解し、
b)該膜タンパク質を、請求項1〜6にて定義された両親媒性分子と複合体化させ、界面活性剤を除去し、
c)該膜タンパク質を、請求項1にて定義された担体上へ、該両親媒性分子を通して固定し、
d)膜タンパク質のタンパク質断片を生成しつつ、膜貫通ドメインが該両親媒性分子と複合体形成して該担体へ付着したままとなるよう、徹底的に洗浄し、プロテアーゼを加え、
e)該膜貫通ドメインが該両親媒性分子と依然として複合体化して結合したままである該担体を取り除き、該タンパク質断片を、質量分析により分析する:
を含むことを特徴とする、サンプル中の膜タンパク質の分析方法。
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