JP5525445B2 - 活性酸素耐性菌及びその利用方法 - Google Patents
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Description
単離菌を上述する液体培地で培養後、遠心回収(3000rpmで5分から15分)した。DNA抽出キットを用いてDNA試料とし、細菌の遺伝学的分類に用いられる16S領域(16S rRNA遺伝子)を標的として遺伝子を部分増幅し、電気泳動により増幅バンドを確認した。電気泳動ゲルからDNAを切り出して精製し、再度部分的に増幅し、精製後シーケンス反応を行いシーケンサーで塩基配列を確定した。そして、塩基配列をデータベース(NCINB;blast)と照合し、相同性から同定した。このときの培養条件として、ニュートリエントブロス液体培地(Oxioid社製 粉末型)を用い、37℃で、12時間培養を行った。DNAの抽出は、QIAamp DNA mini kit(QIAGEN社製)を用いて行った。このとき、サーマルサイクラーとしては、GeneAmp PCR System 9600 (ABI社製)を用いた。また、Primerとして、16S rRNA検出用プライマー(島津評論 vol.57 p121−131 2000年)を用いた。遺伝子増幅酵素としては、AmpliTaq Gold(ABI社製)を用いた。また、シーケンサーは、ABI Prism 3100−Avant Genetic Analyzer(ABI社製)を用い、シーケンス試薬としては、BigDye(登録商標) Terminato 3.1を用いた。これにより、配列表1のような塩基配列の結果を得た。類似した塩基配列とアラインメントを取り近隣結合法により系統樹を作成したところ、イグジオバクテリウム(Exiguobacterium)属に属することが分かった。具体的には、16S rRNA遺伝子を調べ、1523 bp の塩基配列により、イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌とした。
・形態学的特性
グラム染色:陽性
芽胞:無し
菌形:球桿菌
・培地における生育特性
(1)肉汁寒天平板培養
(2)肉汁液体培養
色調:黄色〜黄褐色
形:円形
表面:平滑
・生理・生化学的特性
グラム染色性:有
カタラーゼ試験:陽性
・各温度における生育
−1℃:−
4℃:+
30℃:+
45℃:+
・近縁菌種とのDNA−DNA 相同性
(ア)イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌、並びに、(イ)大腸菌(E.Coli)及び黄色ブドウ球菌(S.Aureus)の混合、について、それぞれ次亜塩素酸耐性を調べた。具体的には、ニュートリエントブロス液体培地を準備し、温度37℃で、6時間培養を行った。(ア)のSW1菌については、次亜塩素酸ナトリウム20ppm、200ppm、500ppmをそれぞれ添加した3種類を、(イ)の大腸菌及び黄色ブドウ球菌については、次亜塩素酸ナトリウム20ppm、200ppmをそれぞれ添加した2種類を準備した。その結果、SW1菌については、500ppm添加であっても生育するが、大腸菌及び黄色ブドウ球菌については、20ppm、200ppmのいずれにおいても生育が見られなかった。
これらの菌は、単離方法として、釣菌単離方法による。これらの菌は、R2A寒天培地に生育したコロニーを、個々に釣菌してリン酸緩衝液100μL(マイクロリットル)に懸濁し、コンラージ棒を用いて新たなR2A寒天培地に塗布し、37℃で、24時間培養することにより、単離した。このときの培地は、R2A寒天培地であり、培養温度を37℃として、24時間培養を行った。
単離したプレート上の菌を回収し、DNA抽出キットを用いてDNA試料とした。細菌の遺伝学的分類に用いられる16S領域(16S rRNA遺伝子)を標的として遺伝子を部分増幅し、電気泳動により増幅バンドを確認した。電気泳動ゲルからDNAを切り出して精製し、再度部分的に増幅し、精製後シーケンス反応を行いシーケンサーで塩基配列を確定した。塩基配列をデータベース(NCINB;blast)と照合し、相同性から同定した。このときの培養条件として、ニュートリエントブロス液体培地を用い、温度37℃で、12時間培養を行った。このとき、DNA抽出には、QIAamp DNA mini kit(QIAGEN社)を用いた。また、サーマルサイクラーとしては、GeneAmp PCR System 9600 (ABI社製)を用いた。また、プライマーとしては、16S rRNA検出用プライマー(島津評論 vol.57 p121−131 2000年)を用いた。更に、遺伝子増幅酵素としては、AmpliTaq Gold(ABI社製)を用いた。そして、シーケンサーとしては、ABI Prism 3100−Avant Genetic Analyzer(ABI社製)を用いた。このときのシーケンス試薬としては、BigDye(登録商標) Terminato 3.1を用いた。
(A〜E)においては、液体窒素中保存菌株(1〜2×108〜109)を20μL(マイクロリットル)ずつ接種した。
(F〜H)においては、R2A寒天培地上に生育したコロニーを釣菌してリン酸緩衝液100μL(マイクロリットル)に懸濁した。ここで、(F)及び(G)は、20μL(マイクロリットル)ずつ接種した。そして、(H)においては、各20μL(マイクロリットル)ずつ接種した。以下に各々の条件を並べる。
(A)培地:ニュートリエントブロス液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(B)培地:LB液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(C)培地:標準液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(D)培地:GAM液体培地
温度:37℃
時間:24時間 嫌気培養
(E)培地:標準液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(F)培地:R2A液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(G)培地:R2A液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(H)培地:R2A液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(I)10倍濃度で標準液体培地を調整し、採水した安倍川の水で10倍に希釈した。
培地:標準液体培地
温度:37℃
時間:12時間 振盪培養
(A)〜(I)各々の培養菌液は、100μL(マイクロリットル)をL字管に調整したニュートリエントブロス液体培地の、10mL(ミリリットル)中に添加し、37℃で振盪培養した。
カタラーゼ活性試験は、10mL(ミリリットル)の発酵管(旭硝子社製のアインホルン型)中に3%過酸化水素水を充填し、マイクロピペットを用いて上述の培養後菌液を1mL(ミリリットル)だけ、挿入添加し、カタラーゼにより分解発生する酸素ガス量を測定した。
上述(A)培養液100μL(マイクロリットル)と、(B)〜(I)の各々の培養菌液の100μL(マイクロリットル)をL字管に調整したニュートリエントブロス液体培地10mL(ミリリットル)中に添加し((AB)、(AC)、(AD)、(AE)、(AF)、(AG)、(AH)、(AI))、37℃で振盪培養した。カタラーゼ活性試験は、10mL(ミリリットル)発酵管(アインホルン型)中に3%過酸化水素水を充填し、マイクロピペットを用いて上述の培養後菌液を1mL(ミリリットル)だけ、挿入添加し、カタラーゼにより分解発生する酸素ガス量を測定した。
Ex菌の培養時に培地に耐性限界の次亜塩素酸ナトリウムを入れた場合及び入れない場合において、上述するような条件で16時間培養した結果、細胞溶解法で取り出したカタラーゼの量及び性質について検討した。元菌(原液)、溶解(細胞溶解液(自家製:50mM Tris−HCl緩衝液 pH7.5, 0.15M NaCl, 0.1% SDS,1% Triton X−100)で溶解した溶液)、精製(ゲルクロマト(GE社製 Sephacryl S−1000))についてそれぞれ調べた。次亜塩素酸ナトリウムを添加した場合、活性のある60kD(キロダルトン)カタラーゼの量が、元菌、溶解、精製の何れの場合でも次亜塩素酸ナトリウムを添加しなかった場合の量に比べ少なかった。また、次亜塩素酸ナトリウムを添加した場合、120kD(キロダルトン)カタラーゼの量が、次亜塩素酸ナトリウムを添加しなかった場合の量に比べ多かった。このことから、次亜塩素酸ナトリウムを添加した場合、活性のある60kD(キロダルトン)カタラーゼが減量し、120kD(キロダルトン)に変化したことが認める。因みに、カタラーゼ単体の分子量は約24kD(キロダルトン)である。このように培地に次亜塩素酸ナトリウムを添加することは、培地や培養タンクの滅菌のために有効である。例えば、大量培養時には、培地や培養タンクの滅菌は通常の実験室レベルの方法では困難である。しかし、次亜塩素酸ナトリウムを培地に添加するという方法であれば、大量培養にも比較的容易に行うことができる。但し、例えば、耐性限界まで添加してしまうとカタラーゼ産生には悪影響が上述するようにあると考えられる。そのため、添加濃度を検討したところ、次亜塩素酸ナトリウムの添加量は培地に対して0.04%以下となるように添加することが好ましい。より好ましくは、0.01%以下であり、更に好ましくは、0.005%以下である。例えば、約0.002%とすることもできる。一方、一般に濃度が低いと滅菌効果が低下するので、滅菌効果の観点からは、好ましくは、0.0001%以上、より好ましくは、0.0005%以上、更に好ましくは、0.01%以上である。例えば、本実施例の場合は、0.002%から0.005%の範囲が特に好ましい。尚、この濃度は、次亜塩素酸ナトリウムの理論値に対するもので、例えば、35%の次亜塩素酸ナトリウム溶液の場合、実際の添加量に35%を乗じたものが次亜塩素酸ナトリウムの量となる。
(1)普通ブイヨン液体培地(0.1%肉エキス,0.2%酵母エキス,0.5%ペプトン,0.5%塩化ナトリウム,pH7.0±.)
(2)普通ブイヨン液体培地 + 次亜塩素酸ナトリウム 1μL(マイクロリットル)/25mL(ミリリットル)
(3)ノーマルLB(1.0%,0.5%酵母エキス,1.0%塩化ナトリウム)
(4)普通ブイヨン液体培地 + 次亜塩素酸ナトリウム 1μL(マイクロリットル)/25mL(ミリリットル)
(5)普通ブイヨン液体培地 + トリプトン(BD社製 Bacto Tryptone) 100mg(ミリグラム)/10mL(ミリリットル)
(6)普通ブイヨン液体培地 + トリプトン(BD社製 Bacto Tryptone) 100mg(ミリグラム)/10mL(ミリリットル) + 次亜塩素酸ナトリウム 1μL(マイクロリットル)/25mL(ミリリットル)
大量に培養した場合、菌をどのように回収し、カタラーゼをどのように精製するかが重要である。そこで、例えば、タンク内で菌を沈殿させるために、ミョウバンを所定量(例えば、1kg(キログラム)/1t(トン))を加えることができる。菌回収後、物理的に破壊して(フレンチプレス)、カタラーゼ溶液とすることができる。更に、10〜30kD(キロダルトン)と100〜300kD(キロダルトン)の透析膜を使って簡易精製することができる。
I.Ex菌の培養・増殖
Ex菌の増殖に最も好ましい条件(例えば、培地に約0.001%の次亜塩素酸ナトリウムを添加したもの)で、Ex菌を増殖する。例えば、2L(リットル)(2×1012個)のEx菌の種菌を[500L(リットル)培地+次亜塩素酸ナトリウム20mL(ミリリットル)(35%濃度原液)]の条件で、16時間培養する。ここでは、主菌となる菌の増殖のための最適な条件を提供することが好ましい。例えば、主菌が活性酸素に対する耐性が高い場合、従菌を加えないので従菌の活性酸素対する耐性を考慮する必要がない。また、主菌の増殖を妨げる他の菌の増殖や生存を制限可能な条件(例えば、より高い濃度の活性酸素)を選択することもできる。特に高い活性酸素濃度での増殖は、増殖容器内の滅菌効果も期待できる。
II.ミクロバクテリウム(Microbacterium)種菌の準備
Ex菌の増殖中にミクロバクテリウム(Microbacterium)種菌を別途所定量(例えば、2L(リットル))準備する。ここでは、主菌とは異なる条件で従菌を繁殖させてもよい。また、必ずしも大量である必要がないならば、その他の菌の滅菌を事前に行ってから従菌を繁殖させることもできる。
III.Ex菌及びミクロバクテリウム(Microbacterium)種菌による混合培養
増殖したEx菌(例えば、16時間で200L(リットル)(2×1014個))に、培地を所定量(例えば、4500L(リットル))加え、更に、準備した所定量(例えば、2L(リットル))のミクロバクテリウム(Microbacterium)種菌を添加して、所定時間(例えば、24時間)培養し、所定量(例えば、2〜5000L(リットル)(2〜5×1014個))まで増やす。ここで、所定量とは、主菌の活性を図るのに充分な量であればよい。例えば、主菌に対して、従菌の量が、0.001%以上であることが好ましい。また、0.01%以上であることがより好ましい。更に、0.1%以上であることが好ましい。また、従菌の量は主菌よりも多くてもよいが、カタラーゼの産生効率を考慮すれば、主菌と同量又はそれ以下が好ましい。好ましくは、25%以下であり、条件によっては10%以下である。
IV.培養タンクへミョウバンを所定量添加・分離精製
混合培養を行った培養タンクにミョウバンを所定量(例えば、1kg(キログラム)/1t(トン))を加える。これにより、Ex菌等を沈殿させ、菌を回収する。そして、残りの溶液から、カタラーゼを透析膜又は限界ろ過により簡易精製することができる。
尚、上述するIからIVの工程では、Ex菌について述べてきたが、このような大量なカタラーゼの産生の方法は、他の菌種についても適用することが可能と考えられる。
G ミクロバクテリウム(Microbacterium)属菌
10 給湯システム
12 浴槽
20、36 配管
22 ポンプ
24 薬剤槽
26、34 バルブ
28 ろ過装置
30 無害化槽
42 撹拌槽
44 生物処理槽
46 粗い膜
48 ローラ
60、62、64 V字型槽
68 バイオペレット
80 光触媒評価装置
82 ランプ
86 シャーレ
Claims (10)
- 主菌及び従菌を含む活性酸素を分解する混合物であって、
前記主菌は、受託番号NITE P−439として寄託された新規微生物イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌株を含み、かつ、カタラーゼ活性を示し、
前記従菌は、ミクロバクテリウム(Microbacterium)属(EUS)菌及び/又はラネラ(Rahnella)属(Cit)菌を含み、
前記(EUS)菌は、受託番号NITE P−450として寄託された新規微生物(EUS)菌株であり、
前記(Cit)菌は、受託番号NITE P−440として寄託された新規微生物(Cit)菌株であることを特徴とする混合物。 - 主菌及び従菌を用いてカタラーゼを産生する方法において、
前記主菌は、受託番号NITE P−439として寄託された新規微生物イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌株を含み、かつ、カタラーゼ活性を示し、
前記従菌は従属栄養細菌であり、
前記従菌は、ミクロバクテリウム(Microbacterium)属(EUS)菌及び/又はラネラ(Rahnella)属(Cit)菌を含み、
前記(EUS)菌は、受託番号NITE P−450として寄託された新規微生物(EUS)菌株であり、
前記(Cit)菌は、受託番号NITE P−440として寄託された新規微生物(Cit)菌株であり、
前記主菌を培養して増殖して増殖主菌溶液を生成する工程と、
前記増殖主菌溶液に前記従菌を所定の割合で添加して混合培養溶液とする工程と、
前記混合培養溶液を用いて培養し、カタラーゼを産生させる工程と、を含むカタラーゼの産生方法。 - 主菌及び従菌を含む活性酸素を分解する混合物であって、
前記主菌は、受託番号NITE P−439として寄託された新規微生物イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌株を含み、かつ、カタラーゼ活性を示し、
前記従菌は、ミクロバクテリウム(Microbacterium)属(EUS)菌及び/又はラネラ(Rahnella)属(Cit)菌を含み、
前記(EUS)菌は、受託番号NITE P−450として寄託された新規微生物(EUS)菌株であり、
前記(Cit)菌は、受託番号NITE P−440として寄託された新規微生物(Cit)菌株である、混合物を用いて、活性酸素を分解する方法。 - 主菌及び従菌を含む活性酸素を分解する混合物であって、
前記主菌は、受託番号NITE P−439として寄託された新規微生物イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌株を含み、かつ、カタラーゼ活性を示し、
前記従菌は、ミクロバクテリウム(Microbacterium)属(EUS)菌及び/又はラネラ(Rahnella)属(Cit)菌を含み、
前記(EUS)菌は、受託番号NITE P−450として寄託された新規微生物(EUS)菌株であり、
前記(Cit)菌は、受託番号NITE P−440として寄託された新規微生物(Cit)菌株である、混合物を用いて、過剰な活性酸素により殺菌した後に、残存活性酸素を無毒化することを特徴とする方法。 - 光触媒を施した第1の試料に、受託番号NITE P−439として寄託された新規微生物イグジオバクテリウム(Exiguobacteriu)属(SW1)菌株と、受託番号NITE P−450として寄託されたミクロバクテリウム(Microbacterium)属(EUS)菌株及び/又は受託番号NITE P−440として寄託されたラネラ(Rahnella)属(Cit)菌株と、を含む培養液を滴下する工程と、
同じ光触媒を施した第2の試料に、紫外線耐性のある微生物を含む培養液を滴下する工程と、
前記第1及び第2の試料に紫外線を所定の強さで、所定時間、均等に照射する工程と、
前記第1及び第2の試料のそれぞれの微生物が紫外線照射後に生存しているかを調べる工程と、を含む光触媒の評価方法。 - 前記新規微生物(SW1)菌株は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号1に記載の塩基配列であり、
前記(EUS)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号2に記載の塩基配列であり、
前記(Cit)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号3に記載の塩基配列である、ことを特徴とする請求項1に記載の混合物。 - 前記新規微生物(SW1)菌株は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号1に記載の塩基配列であり、
前記(EUS)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号2に記載の塩基配列であり、
前記(Cit)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号3に記載の塩基配列である、ことを特徴とする請求項2に記載の産生方法。 - 前記新規微生物(SW1)菌株は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号1に記載の塩基配列であり、
前記(EUS)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号2に記載の塩基配列であり、
前記(Cit)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号3に記載の塩基配列である、ことを特徴とする請求項3に記載の方法。 - 前記新規微生物(SW1)菌株は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号1に記載の塩基配列であり、
前記(EUS)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号2に記載の塩基配列であり、
前記(Cit)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号3に記載の塩基配列である、ことを特徴とする請求項4に記載の方法。 - 前記新規微生物(SW1)菌株は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号1に記載の塩基配列であり、前記ミクロバクテリウム(Microbacterium)属(EUS)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号2に記載の塩基配列であり、
前記ラネラ(Rahnella)属(Cit)菌は、16S rRNAに対応するDNAの塩基配列が、配列番号3に記載の塩基配列である、ことを特徴とする、請求項5に記載の評価方法。
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