JP4515524B2 - 正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子及びその利用 - Google Patents

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Description

本発明は、正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子及びその利用に関する。
緑内障は正常視機能を維持できる健常眼圧以上の眼圧上昇のために、視神経に傷害を来す進行性の難治性疾患である。放置すると視野狭窄が進行し、失明することのある疾患で、現在本邦の失明原因の第一位を占めているのにも関わらず、その原因は不明であり正確は診断法、有効は治療法および予防法は存在しない。日本人ではそのなかでも眼圧が正常範囲にあるにも関わらず緑内障を発症する正常眼圧緑内障（NTG）が最も多く、その頻度は40歳以上の約4％である。NTGは眼圧が正常範囲にあるため、眼圧検査では発見することが困難であり、健康診断や通常の眼科検査では見落とされがちである。視神経の障害は回復しないため、NTGにおいては早期発見・早期治療が最も重要である大切である。しかしながら、その進行は遅く、かつ中心視野は後期に障害を受けるため自覚症状に乏しく、本人も気づかないうちに視神経傷害が進行する。
正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子の探索はおこなわれているが、未だに疾患と連鎖する遺伝子は発見されていない。いくつかの候補遺伝子解析が進められてきた。緑内障との関連が強く疑われているmyocilin（非特許文献1-15）そしてoptineurin（非特許文献16-30）、optic atrophy 1（非特許文献31-41） 遺伝子の解析がそれぞれ精力的におこなわれてきたがNTGとの関連は明らかではない。また、候補と考えられる遺伝子の解析も進められているが、関連の示唆までにしかいたっていない。
本発明は、正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子を見出し、その利用方法を提供することを目的とする。
本発明者は、正常眼圧緑内障患者と正常人を対象に全ゲノム上のSNPを網羅的に解析・比較した結果、複数の遺伝子に相違があることを見出した。本発明はその知見に基づいて完成された。
本発明の要旨は以下の通りである。
（１）ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位の塩基を同定することを含む、正常眼圧緑内障の検査方法。
（２）ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs222450、rs9474394、rs2816344、rs2816341、rs2518579、rs2518578、rs9367511、rs6915699、rs6930045、rs9370188、rs9382180、rs9382181、rs4486010、rs2816379、rs6939730、rs2817088、rs2817090、rs2816372、rs2562895、rs2816364、rs2562893、rs2817101、rs2816362、rs2816356、rs10948744、rs12183976、rs2562898、rs735860、rs715441、rs2057024、rs1429146、rs9463895、rs2235723、rs1346603、rs9474476、rs2294867、rs9349660、rs974323、rs6909592、rs9367520、rs9395854、rs209485、rs9395856、rs7747926、rs7738788、rs209500、rs9357760、rs9370196、rs209512、rs209517、rs9370201、rs9367529、rs12209741、rs7744451、rs6904083、rs6904376、rs9367532、rs2067833、rs9382212、rs2139077、rs2397146、rs7742367、rs9474576、rs622447、rs3736729、rs13212365及びrs761141からなる群より選択され、
ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs11686431、rs7580559、rs3908093、rs2343412、rs12623996、rs7573149、rs918810、rs6721199、rs7579209、rs10194925、rs17033378、rs2343466、rs17033398、rs6737172、rs4953226、rs3851333、rs12473388、rs11681887、rs35608719、rs11888802、rs11678872、rs2343468、rs13003019、rs6760244、rs12471726、rs2081297、rs10460504、rs7562458、rs4953230、rs4952763、rs6719211、rs1014454、rs3755070、rs3213787、rs10210691、rs3770251、rs4455206、rs3755076、rs3770254、rs11125017、rs3770264、rs10205197、rs10427308、rs17033745、rs3770278、rs17322370、rs6736954、rs10427402、rs4476395、rs13023749、rs17033801、rs755652、rs748573、rs6708810、rs6710581、rs12712945、rs17033871、rs3755082、rs6544840、rs7599740、rs11884064、rs7596942、rs7565326、rs17323037、rs1916231、rs1517001、rs1522988、rs614281、rs582213、rs650508、rs666334、rs17033965、rs556650、rs2204204、rs3795863、rs2285024、rs505310、rs10490342、rs612717、rs10490341、rs656823、rs563601、rs609573、rs6746467、rs637889、rs10495926、rs1522986、rs1522987、rs6544843及びrs6724488からなる群より選択され、
ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1523048、rs1523029、rs12487524、rs1403468、rs872133、rs1523040、rs1523041、rs13069451、rs12629480、rs1357449、rs6801949、rs17033355、rs9873254、rs9839823、rs6794354、rs6794373、rs12637211、rs9855328、rs2037538、rs2037539、rs1523038、rs11718271、rs1608314、rs2197728、rs9311101、rs10490870、rs17033506、rs12634096、rs2359774、rs9860326、rs4678788、rs3213953、rs6799641、rs17201627、rs4678789、rs12632607、rs11129660、rs11129662、rs17033672、rs17280201、rs6779091、rs3772395、rs9872664、rs1963934、rs35102908、rs4678802、rs4678803、rs6550367、rs17033738、rs6801590、rs17033748、rs9865772、rs17033755、rs17228111、rs2016955、rs2016975、rs735353、rs11920715、rs1378481、rs17814981、rs1455489、rs4678509、rs10510667、rs6799649、rs6799609、rs17033836、rs4234248、rs6770245、rs10865865、rs7615307、rs9845811、rs17033961、rs1488092、rs10461001及びrs17033999からなる群より選択され、
ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs371925、rs4241661、rs170654、rs1514271、rs2063419、rs13102419、rs11131589、rs2167320、rs1159057、rs12501311、rs17086016、rs961489、rs7684130、rs3749526、rs4860651、rs11938753、rs1376417、rs10025570、rs1376416、rs2084682、rs7658065、rs9312144、rs1376412、rs17086181、rs17086185、rs6847413、rs2198103、rs12509018、rs17082122、rs6823779、rs17086224、rs1451170、rs4289492、rs4371663、rs9986026、rs9991256、rs4267782、rs7660334、rs6815080、rs11737314、rs4365778、rs7673091、rs4320185、rs4604104、rs7684022、rs4860679、rs6844942、rs12644315、rs4599467、rs6834811、rs4320186、rs4487412、rs7667410、rs4611975、rs4370201、rs4438803及びrs4608860からなる群より選択され、
ヒト第６染色体のGMDSを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs11966212、rs2143396、rs6911992、rs9378593、rs9392253、rs9378594、rs2050158、rs9391900、rs6596786、rs2235706、rs9378596、rs1997773、rs6926322、rs7754106、rs7750178、rs742520、rs2210370、rs6940618、rs349100、rs9405444、rs6932005、rs4959523、rs10484953、rs464778、rs115705、rs1013185、rs11242672、rs463641、rs4959525、rs369656、rs459162、rs127091、rs4959530、rs463264、rs7757477、rs448915、rs444018、rs443971、rs9391913、rs238048、rs238050、rs9378605、rs2459602、rs2438074、rs12191625、rs2438077、rs2496292、rs2496301、rs2438083、rs977674、rs977673、rs17259747、rs1437288、rs7772349、rs6596805、rs1347656、rs6925983、rs1550199、rs11242676、rs7744559、rs11966550、rs9378290、rs9405136、rs9405470、rs9392285、rs9405137、rs9405471、rs746095、rs9378623、rs9378292、rs1711957、rs7742720、rs9378629、rs7741690、rs9328052、rs9328053、rs1922938、rs2745636、rs2816242、rs932410、rs1474721、rs9392296、rs9502950、rs6907725、rs9405484、rs4443540、rs4355648、rs9328058、rs9328059、rs2569866、rs6935712、rs6935896、rs6937266、rs6925228、rs11242704、rs2816286、rs2816287、rs6596833、rs2317965、rs2873591、rs2569835、rs2745567、rs2493160、rs2317966、rs9392305、rs9501738、rs2569839、rs9328061、rs9378300、rs2816221、rs6916316、rs2281272、rs2569824、rs9405496、rs1810496、rs2814827、rs7759035、rs9502997、rs2814811、rs2317964、rs9378304、rs2569854、rs12206340、rs4538755、rs9378305、rs9503011、rs9405505、rs9503015、rs9501762、rs9405506、rs12197419、rs7765344、rs7765461、rs1013303、rs3800046、rs689035、rs2318108、rs6919059、rs6928276、rs226456、rs9378314、rs1157673、rs1157675、rs9391933、rs9328071、rs3778533、rs1028714、rs3800094、rs3778539、rs6596857、rs7776397、rs6596858、rs9378661、rs3823279、rs3800122、rs10484693、rs17772389、rs4959160、rs3778555、rs4463305、rs3800140、rs17134506、rs3800142、rs3800143、rs3800144、rs3800146、rs2761234、rs9405156、rs17134549、rs1408002、rs1830733、rs1830734、rs10223785、rs9405157、rs7772545、rs6596866、rs4959621、rs4412249、rs4367413、rs11242729、rs6925298、rs12212324、rs9392353、rs11242730、rs4580917、rs6910252、rs11242733、rs9503080、rs11242735、rs476594、rs9378676、rs676015、rs2026446、rs4959631、rs17134693、rs3800156、rs11242740、rs4959635、rs3800159、rs3778557、rs3800168、rs4959642、rs234930、rs9392372、rs234915、rs234914、rs3800184、rs234932、rs6903476、rs3778568、rs9405550、rs17134819、rs3823287、rs1196396、rs1684153、rs9328087、rs2479003、rs2479004、rs2505678、rs2479008、rs2505674、rs7766115、rs4959648、rs4413658、rs7449538、rs9503158、rs6902556、rs6925653、rs4281006、rs12210286、rs12213061、rs4959663、rs9501836、rs6911665、rs13200914、rs17135028、rs4959184、rs11242770、rs9328099、rs12206851、rs6904395、rs17609498、rs742487、rs4959185、rs9391949、rs9391950、rs6899721、rs1610416、rs3924452、rs10458144、rs9501850、rs9503199、rs4959677、rs35374935、rs2449448、rs1772982、rs1680885、rs2794569、rs2624936、rs12196957、rs2624933、rs1773000、rs1773001、rs1614248、rs1616044、rs2624917、rs2624916及びrs6899711からなる群より選択され、
ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2248373、rs2248459、rs2248462、rs2248617、rs3749946、rs2523650、rs2904776、rs2516422、rs2905747、rs9267247、rs2395034、rs3095229、rs3131631、rs2516486、rs2734573、rs3115537、rs2516478、rs2071593、rs3219183、rs13215091、rs1799964、rs1052248、rs9348876、rs2857697、rs2736172、rs1046089、rs2255741、rs760293、rs2077102、rs3130048、rs2844463、rs805301、rs805300、rs805297、rs707921、rs2242655、rs707974、rs805268、rs805267、rs9378164、rs707918、rs805292、rs2299851、rs707939、rs707937、rs480092、rs2075800、rs2763979、rs11965547、rs486416、rs644045、rs537160、rs2072633、rs522162、rs550513、rs9296003、rs406936及びrs492899からなる群より選択され、
ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs602698、rs678116、rs649930、rs643677、rs592698、rs675053、rs612557、rs629364、rs627967、rs628203、rs2771425、rs9355655、rs10499309、rs1041566、rs12530454、rs7753885、rs9347236、rs6455585、rs6931414、rs10447366、rs9457403、rs9355246、rs4709219、rs4708797、rs4709226、rs4709235、rs6925091、rs3799195、rs6913912、rs894124、rs6903405、rs6901469、rs9364496、rs7759006、rs6455600、rs2129209、rs6455601、rs9456350、rs3123094、rs9456352、rs3102970、rs6455604、rs3127188、rs3127194、rs3127196、rs3102966、rs3127168、rs923198、rs6924755、rs2361472、rs4569991、rs9457516、rs9456363、rs9365009、rs3923902及びrs12207795からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs3807826、rs7802863、rs3757521、rs3757520、rs3807823、rs1861032、rs17145870、rs7805508、rs6977682、rs3807815、rs1008038、rs3807811、rs11769978、rs3779356、rs3807807、rs3807806、rs7455929、rs6463790、rs4620183、rs12668479、rs17147407、rs11762595、rs12702719、rs17147608、rs12154895、rs17403198、rs16873367、rs42949、rs2349188、rs6463805、rs7811039、rs10247446、rs10270530、rs7795595、rs6945018、rs17148966、rs1476623、rs10246412、rs17404198、rs6463813、rs17149337、rs17404218、rs11976158、rs10244689、rs6978212、rs757704、rs2214694、rs2189904、rs765855、rs17150199、rs10261060、rs4401754、rs10266489、rs5018942、rs4556000、rs10278603、rs7787432、rs6959052、rs17150410、rs17150472、rs17150479、rs17150761、rs10237485、rs4720785、rs972247、rs1859274、rs10238726、rs6970999、rs17151821、rs7456267、rs6963180、rs10257265、rs970526、rs977458、rs13240427及びrs17154007、並びにNCBI(v36.1)8484291からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs41521、rs2188486、rs977641、rs17389507、rs10274138、rs17136882、rs13234807、rs7794181、rs7787988、rs7787976、rs17331134、rs1557689、rs6465984、rs7798273、rs2188494、rs1468143、rs10953427、rs2214087、rs4730006、rs6952170、rs17137313、rs4727599、rs17137382、rs10228106、rs42181、rs4730010、rs11763758、rs17137711、rs11763095、rs6977743、rs4520098、rs10216261、rs11972050、rs12539136、rs756669、rs41037、rs41038、rs28253、rs41058、rs9649272、rs6949801、rs9987005、rs6465994、rs6465995、rs1477110、rs12216618、rs10254402、rs6969323、rs9641335、rs10272959、rs3919550、rs4730030、rs10246540、rs4730031、rs2891730、rs995661、rs10487221、rs10487222、rs11773248、rs11983223、rs6943307、rs7782065、rs7801387、rs12705261、rs12531723、rs17269890、rs4730038、rs4584085、rs10216010、rs17141284、rs17141299、rs10953450、rs6466018、rs4530975、rs12705276、rs4283980及びrs2470965、並びにNCBI(v36.1) 103849313、104068646及び104196627からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs11223704、rs470713、rs470935、rs641024、rs11606866、rs7131644、rs10894784、rs1031381、rs522134、rs4362160、rs473041、rs498602、rs554874、rs1144225、rs1595895、rs1146192、rs4936229、rs1144219、rs2510356、rs553231、rs512359、rs568044、rs10894798、rs10894799、rs11223765、rs10894800、rs7940114、rs10894801、rs10791357、rs3741100、rs3741098、rs7113199、rs1866769、rs1866768及びrs1561613からなる群より選択され、
ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs3794941、rs17055278、rs514931、rs494721、rs17055426、rs2896769、rs12717033、rs7227977、rs10871527、rs10514139、rs17832851、rs17055756、rs1473224、rs2628125、rs8085262、rs8089151、rs2628123、rs4891199、rs17055919、rs10514148、rs17055185、rs2404482、rs10514149、rs4337381、rs2959165、rs12456768、rs4891217、rs9945585、rs9961644、rs9961742、rs9952375、rs13381156、rs9319675、rs2120144、rs8096648、rs17056218、rs2289609、rs4891228、rs1396098、rs894575、rs10871567、rs7242893及びrs7239800からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のPAX7を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs3000058、rs2816030、rs16862061、rs2816040、rs2816046、rs4920334、rs4920516、rs4920335、rs2816064、rs6704504、rs1934057、rs2298893、rs2743208、rs2076021、rs2076020、rs2236826、rs2282704、rs2282699、rs624761、rs851123、rs2236817、rs685300、rs2056446、rs2841078、rs4920344、rs6669544、rs4076925、rs6603910、rs11261070、rs7539659、rs11261074、rs7411058、rs4920545、rs6684577及びrs12565195からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2494997、rs1999674、rs2842180、rs2255632、rs2251804、rs1334973、rs6687571、rs2039528、rs2819341、rs10890251、rs2367617、rs11210864、rs2782641、rs11210871、rs10890257、rs12058744、rs11210879、rs11210886、rs516790、rs641365、rs673485、rs643445、rs10789438、rs11210892、rs617521、rs660899、rs2274465、rs10789439、rs489319、rs607062、rs10789442及びrs3791035、並びにNCBI(v36.1)43760103からなる群より選択され、
ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2355388、rs6686200rs12122453、rs12122534、rs4950474、rs4950475、rs6593810、rs6657631、rs21327、rs517201、rs575115、rs2031481、rs2477568、rs2477569、rs692963、rs535827、rs4950361、rs6593732、rs17359526、rs6693631、rs11811023、rs4950371、rs2304893、rs6593739、rs7525703、rs2883434、rs2077749、rs17159914、rs6593745、rs2120003、rs10900325、rs2354432、rs6670503、rs1470261、rs6703187、rs10793652、rs7537483、rs7537703、rs1890038、rs3820130、rs3737845、rs17160062、rs3766525、rs4950315、rs17356240、rs10494244、rs6683839、rs10793656、rs17360443、rs3753433、rs12033407、rs7554833、rs10793661、rs10736837、rs10900336、rs7520661、rs4950409、rs2353983、rs6658836、rs17360812、rs6656156、rs12759145、rs12049491、rs10793682、rs4950431、rs7539416、rs2353969、rs4504949、rs17160205、rs2353967、rs12728058、rs6688308、rs11589438、rs6688154、rs6678706、rs4950436、rs7519891、rs11240053、rs11240054、rs11240055、rs7556087、rs7518276、rs2644579、rs2353951、rs2644577、rs6674761、rs2644566、rs2803535、rs17160256、rs12406844、rs17160264、rs612963、rs586000、rs17160295、rs644550及びrs17160305からなる群より選択され、
ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10752613、rs11583896、rs16835600、rs4434872、rs4567311、rs4363451、rs9427232、rs4845576、rs4520447、rs4845578、rs11585416、rs4845584、rs12033835、rs11581644、rs10908557、rs6701341、rs2297898、rs12048137、rs11264875、rs2066134、rs2494663、rs6671166、rs4845600、rs16835819、rs4521985、rs4620534、rs9803857、rs11265310、rs2340473、rs1194596、rs1212352、rs6672010、rs6702754、rs2274988、rs2297607、rs4414034、rs6696089、rs11265607、rs6427631、rs6427658、rs6694817、rs4537545、rs4845626、rs11265618、rs10752641、rs4240872、rs4474240、rs6700296、rs11265627、rs6691727、rs6687112、rs6427716、rs12136771、rs7553602、rs6660775、rs1127314、rs1127313、rs2131902、rs2229857、rs3766923、rs3766922、rs12125166、rs2335230、rs7531982、rs7533471、rs11264233、rs10796927、rs2335252、rs2036627、rs6699979、rs1995662、rs6664817、rs11264249、rs6426905、rs960182、rs16836320、rs868108、rs4845390、rs10494300、rs1051614、rs6666341、rs11808053、rs883319、rs1777910、rs951240ｖ、rs951241、rs9970364、rs1984285、rs6681725、rs16836414、rs10796934、rs10908445、rs4845678、rs4845679、rs4845681、rs12130132、rs10908448、rs4845690、rs4845406、rs10908455、rs7368345、rs10908456、rs4971079、rs4276913、rs11264339、rs3768566、rs11264345、rs7520184、rs12032720、rs11264359、rs11264363、rs5005770、rs1325908、rs11264375、rs475550、rs821551、rs822490、rs822519、rs822508、rs1749405、rs1749409、rs572609、rs3768280、rs2275078、rs2016251、rs1475766、rs12035615、rs4661146、rs6700693、rs10908489、rs11264449、rs2253677、rs2241110、rs2853641、rs2075163、rs2241107、rs1052053、rs1052067、rs759330、rs7542798、rs2253358、rs2842880、rs16837272、rs2287023、rs2246476、rs2248273、rs11264467、rs7522860、rs10908500、rs10494304、rs3795730、rs3762281、rs35478936、rs2274226、rs2985714、rs2842854、rs954916、rs6686886、rs11590409、rs4661040、rs7551781、rs16837376、rs11806983、rs1109751、rs11264486、rs3790458、rs1342442、rs12136856、rs10159180、rs1171564、rs1609666、rs728918、rs11264495、rs744224、rs4661184、rs879461、rs12742817、rs3795736、rs2236601、rs1046650及びrs3795737からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7521610、rs16850728、rs227521、rs227519、rs10047146、rs10489307、rs972484、rs1402640、rs10913291、rs12094495、rs10798503、rs6425414、rs7515582、rs10913294、rs7534953、rs10913295、rs725416、rs12090000、rs12564343、rs12031932、rs12079554、rs554454、rs6660903、rs10913300、rs760689、rs6683060、rs926319、rs6699955、rs10798508、rs2139876、rs16851037、rs17315298、rs2861972、rs1883243、rs6660559、rs4652245、rs4140633、rs7528533、rs3946142、rs6658794、rs9425456、rs6672376、及びrs12025407からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のPKP1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1122396、rs1722755、rs6413916、rs831771、rs1404401、rs831767、rs16847944、rs831765、rs16847947、rs831764、rs16847951、rs831762、rs831753、rs16847994、rs831751、rs4915220、rs10157719、rs947379、rs12466、rs1592085、rs4915499、rs12134467、rs10158798、rs1954214、rs12046907、rs10920161、rs12117501、rs1997018、rs1880450、rs1857489、rs16848184、rs868381、rs854488、rs832169、rs832174、rs700469、rs860554rs1779301、rs2300293、rs2268156、rs832147、rs854502、rs1722780、rs1779293、rs854505、rs1572968、rs17425876、rs12143423、rs947377、rs10753899、rs17459837、rs6427900、rs1122481、rs2275862、rs11806184、rs2365652、rs2275860、rs947485、rs6671391、rs1256941、rs10800779、rs7553988、rs10920205、rs3887566、rs3888929、rs6427908及びrs12090950からなる群より選択され、
ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2577720、rs2723120、rs10495742、rs2577717、rs6720565、rs12053097、rs12613333、rs7566157、rs17045229、rs875077、rs17045238、rs2723129、rs2577698、rs2954818、rs12989910、rs11125011、rs6742888、rs7564616、rs2723111、rs6544822、rs893430、rs737564、rs737565、rs747344、rs6727901、rs7570872、rs17045350、rs6544861、rs6756357、rs4665214、rs10172684、rs1653748、rs1465677、rs1864807、rs1864808、rs4665218、rs10169643、rs1368080、rs10490750、rs11677730、rs7601971、rs1653751、rs1653753、rs1368081、rs11678782、rs11678785、rs4497835、rs1653780、rs17445645、rs4665223、rs4284788、rs4665612、rs1709339、rs6544949rs17045574、rs6544966、rs4665230、rs583168、rs17045705、rs2280122、rs1548020、rs518113、rs497973、rs3806510、rs13386930、rs6721623、rs3795933、rs7560892、rs4233701、rs9261、rs7579413、rs12470949、rs12478701、rs2081302、rs12478744、rs2339853及びrs35379186からなる群より選択され、
ヒト第３染色体のTHRBを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1397878、rs6765461、rs6801153、rs1464010、rs7630879、rs6550848、rs826375、rs1667765、rs826378、rs6808673、rs2596623、rs17194828、rs1562736、rs9310730、rs2683535、rs7652337、rs7652444、rs2683542、rs1667739、rs1505302、rs6799431、rs17014338、rs826249、rs10510540、rs6772213、rs851719、rs6792783、rs1354605、rs866651、rs958892、rs826225、rs6550853、rs826223、rs826218、rs1466122、rs1449874、rs11719336、rs7625917、rs17787283、rs4858594、rs1449872、rs9849581、rs9863517、rs9843698、rs9867989、rs1667746、rs17787319、rs1505307、rs7640580、rs12639035、rs9810037、rs9833191、rs12630454、rs3951794、rs6781111、rs1505287、rs12495379、rs4858608、rs7624363、rs4640503、rs6550865、rs9839986、rs5014281、rs9831450、rs4241527、rs4858617、rs4858618、rs2196427、rs10490840、rs6788339、rs6765048及びrs892941からなる群より選択され、
ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs13088412、rs9837084、rs744876、rs571170、rs358954、rs9833515、rs6440716、rs358967、rs1993404、rs9883677、rs2048229、rs16863149、rs891666、rs1835668、rs6787683、rs16863204、rs16863208、rs16863229、rs3732755、rs3773614、rs1231521、rs3108727、rs3773619、rs7649855、rs16863264、rs2870518、rs3846072、rs6782715、rs1882014、rs16863287、rs10513391、rs3773621、rs10935835、rs9863821、rs9864095、rs1873619、rs7623356、rs1491981、rs6440735、rs3971192、rs7644001、rs16863323、rs6801273、rs9820422、rs16863336、rs1388622、rs3975404、rs10513394、rs6787801、rs9289836、rs3821663、rs7429509、rs3821664、rs1491974、rs9653953、rs17204501、rs17204508、rs4680406、rs12490051、rs16863364、rs11708767、rs11709550、rs3732769、rs10935844、rs2276765、rs2276766、rs16863376、rs6440741、rs6771904、rs6772196、rs3732771、rs9864533、rs4435614、rs17204557、rs6798252、rs4680440、rs4680443、rs13088575、rs6790903、rs9289840、rs4680474、rs4541381、rs4596123及びrs7612205、並びにNCBI(v36.1)152200518、152229595、152456055及び152609183からなる群より選択され、
ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10866277、rs12645545、rs12649063、rs7437897、rs11132327、rs10866278、rs6823490、rs6843640、rs6818789、rs2101307、rs6552895、rs6552896、rs6552897、rs12498673、rs10025265、rs2306707、rs3749579、rs6848934、rs2306703、rs11934819、rs4862558、rs4599460、rs4862559、rs6823546、rs11132334、rs5018568、rs904451、rs7677363、rs2030144、rs11132338、rs11132340、rs7669883、rs6858544、rs1027521、rs2173480、rs2173479、rs11132344、rs10084919、rs7677532、rs6835720、rs10024805、rs6834923、rs6812818、rs10015164、rs11132345、rs10024359、rs10000785、rs1039235、rs2310357、rs10028428、rs4862571、rs7684943、rs10021308、rs1566347、rs12504307、rs11132355、rs10028944、rs1499010、rs11724690、rs11940307、rs1566354、rs2648126、rs2648120、rs2648117、rs2648112、rs4861686、rs1026362、rs12643549、rs2310372、rs4862588、rs10031442、rs4637445、rs1947455、rs2278938、rs12641600、rs4862600、rs10002339、rs7694098、rs830829、rs830838、rs830841、rs2603731rs7697039、rs7697051、rs1356672、rs7679967、rs4861696、rs1519320及びrs12643213からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のMAST4を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7733618、rs12514219、rs4532318、rs6861487、rs7700850、rs4587034、rs7705086、rs16895307、rs16895308、rs6890124、rs4339298、rs4613646、rs6862416、rs4532319、rs10515011、rs16895357、rs7732647、rs4355471、rs4554157、rs12055346、rs16895417、rs17210621、rs7706654、rs6864239、rs6896102、rs4374700、rs16895456、rs6880657、rs6863239、rs16895458、rs11953193、rs10940078、rs4446417、rs9791090、rs33721、rs33728、rs2548712、rs33696、rs257711、rs33724、rs26384、rs7704890、rs7725568、rs30729、rs26383、rs27637、rs26382、rs9918275、rs258082、rs257699、rs257700、rs16895719、rs30731、rs16895744、rs1835136、rs36157、rs36155、rs544158、rs36144、rs36143、rs26923、rs16895768、rs463219、rs16895790、rs26921、rs192295、rs26929、rs26928、rs461702、rs460844、rs455938、rs464881、rs456775、rs154620、rs17217092、rs154618、rs10056426、rs152407、rs37568、rs734828、rs2280174、rs16896071、rs40206、rs706701、rs17218390、rs6863305、rs39664、rs34691、rs34693、rs10044452、rs34698、rs34699、rs4016246、rs1159201、rs2662227、rs27206、rs469300、rs467845、rs2545396、rs16896246、rs16896295、rs17221226、rs2287929及びrs16896325、並びにNCBI(v36.1)65944399からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs34896、rs34897、rs3777220、rs3777217、rs11738579、rs3777213、rs7736948、rs6556883、rs9314160、rs6876015、rs11135436、rs17085165、rs17085170、rs10040697、rs6884979、rs7702848、rs2080947、rs10476660、rs154454、rs147295、rs17085249、rs11741590、rs3777194、rs2270554、rs3777190、rs3777188及びrs4642392、並びにNCBI(v36.1)95206085からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のEBF1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2913384、rs173423、rs244654、rs824854、rs824848、rs1095103、rs403334、rs10515769、rs2112262、rs33196、rs17056089、rs2042875、rs3843489、rs1541649、rs17056186、rs2116727、rs10067813、rs7709065、rs17056205、rs1368298、rs4704963、rs10070743、rs4704967、rs10056564、rs6875710、rs17643057、rs6883655、rs891903、rs10054046、rs6556373、rs4921537、rs6556377、rs13180086、rs6556379、rs6556381、rs1544754、rs883540、rs17056426、rs17056435、rs1363561、rs9313797、rs1422672、rs17056474、rs17717829、rs10515787、rs10515786、rs10515789、rs9637861、rs7442845、rs12659540、rs3862065及びrs270661からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4493692、rs3797712、rs3797713、rs264881、rs36101422、rs264834、rs6879467、rs6883997、rs7721990、rs7713640、rs900464、rs264846、rs2161404、rs2306560、rs3816764、rs11134586、rs12515906、rs264844、rs2279318、rs264843、rs10063658、rs4867879、rs17736846、rs264838、rs12658902、rs2306558、rs262865、rs262840、rs262841、rs262842、rs155239、rs262848、rs262851、rs4867572、rs262852、rs746468、rs90213、rs17051884、rs262860、rs262859、rs10076580、rs6875474、rs185532、rs17669613、rs1013193、rs17669636、rs966595、rs17669654、rs13171272、rs261612、rs13163565、rs17737323、rs155074、rs261016、rs261597、rs166368、rs261633、rs10054135、rs261624、rs261625、rs17560224、rs4867895、rs168678、rs30080、rs30083、rs17670092、rs7717087、rs17737597、rs7729471、rs261039、rs261038、rs1482333、rs2291229、rs261021、rs261076、rs12515095、rs17646198、rs17560405、rs261067、rs261060、rs261006、rs261008、rs11740615、rs11741667、rs155023、rs11742527、rs978914、rs12522080、rs2624252、rs6896240、rs6862278、rs3860755、rs259897、rs259899、rs259900、rs259902、rs259903、rs6895199、rs259916、rs12659898、rs1422695、rs17738158、rs17561105、rs11134600、rs6893165、rs2161366、rs9313476、rs17738326、rs2287727、rs17738444、rs6884677、rs13152920、rs9790867、rs11134603、rs17738530、rs2134151、rs12055169、rs17738584、rs1316638、rs17072023、rs13361200、rs17738710、rs10462994、rs10462995、rs6890267、rs6871764、rs17671355、rs6555884、rs17562083、rs10516070及びrs955078からなる群より選択され、
ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1044043、rs10484565、rs241438、rs1800454、rs241429、rs241427、rs4711312、rs2071482、rs4148882、rs12529313、rs9276815、rs20547、rs9276825、rs9276832、rs241404、rs241403、rs3101942、rs241400、rs3132132、rs151719、rs1050391、rs9378127、rs188245、rs3129305、rs176248、rs12216336、rs2894311、rs12191230、rs2395301、rs12192713、rs12199692、rs1044429、rs592625、rs399604、rs365066、rs3763341、rs4713603、rs4713604、rs6936620、rs2116264、rs1367731、rs439852、rs446853、rs9296069、rs440841、rs3128952、rs3130180、rs3097662、rs3128955、rs3130588、rs9277183、rs3097669、rs9277194、rs376877、rs6457710、rs3077、rs9348904、rs9296073、rs2856816、rs3135021、rs1431403、rs9277542、rs3128963、rs3128965、rs3128966、rs3117229、rs2068204、rs2179920、rs2295120、rs3117242、rs3128921、rs3128923、rs9296079、rs3117230、rs3128930、rs872956、rs9380343、rs6937034、rs6937061、rs9277637、rs3117039、rs3130233、rs3117016、rs2395351、rs3116985、rs3129249、rs3129248、rs1003979、rs2071025、rs2855459、rs439205、rs213208、rs461338、rs458679、rs455567、rs14398、rs3130267、rs3130014、rs211455、rs211453、rs10807124、rs411136、rs2772376、rs7747216、rs9469491、rs17627049、rs210137、rs9296095、rs210138、rs444697、rs1794681、rs9469529、rs4711332、rs12205634、rs1408711、rs1536041、rs2229637、rs10947427、rs3818527、rs3818528、rs3818530、rs4713659、rs594223、rs7759668、rs626156、rs498114、rs654682、rs16869412、rs10947432、rs3818532、rs9394163、rs12203688、rs4713670、rs4713671、rs622917、rs12189725、rs877187、rs4713674、rs4713677、rs943466、rs943467、rs755495、rs747692、rs943475、rs6929696、rs3806108、rs3828783、rs3763253、rs9366829、rs9394169、rs4713686及びrs10947441からなる群より選択され、
ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1338657、rs9485685、rs9377361、rs9377365、rs9377366、rs9322660、rs9322661、rs2399802、rs17063309、rs680011、rs9499111、rs9404214、rs1569366、rs1569367、rs17443301、rs17063399、rs6906578及びrs7740643、並びにNCBI(v36.1)102984444からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1156490、rs6462540、rs1419842、rs2392267、rs1419803、rs1419805、rs1419809、rs6977125、rs17169769、rs17169771、rs7778512、rs1419840、rs35114106、rs1019089、rs16878925、rs1362172、rs2392270、rs17831435、rs10951417、rs1468559、rs10486643、rs6951496、rs7458608、rs2893480、rs4723375、rs1419863、rs1419864、rs9639694、rs9639695、rs10951418、rs10215667、rs6971556、rs12673387、rs4723377、rs6950303、rs1034876、rs17169864、rs17169865、rs16878959、rs12672624、rs10486649、rs2893482、rs12672538、rs10486650、rs2392274、rs2079509、rs10243426、rs2097960、rs1362173、rs1458549、rs450463、rs1023555、rs1023556、rs2530548、rs2530549、rs2530550、rs1419794、rs2530565、rs1458544、rs2609226、rs9792042、rs2530567、rs2609218、rs323925、rs323912、rs10239860、rs1419791、rs17777040、rs17198254、rs17777663、rs17777675、rs17198982、rs17788843、rs324978、rs324981、rs324983、rs1419780、rs325464、rs17199659、rs17789420、rs17789642、rs17170015、rs17200455、rs10263313、rs17790181及びrs11768189からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のELMO1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10277512、rs4720221、rs7787226、rs10951500、rs10274668、rs10255208、rs2006882、rs2392472、rs756507、rs2241152、rs7785934、rs7782979、rs17170754、rs3807162、rs3734948、rs741302、rs2041801、rs6966276、rs4723592、rs11769038、rs4723598、rs1882080、rs4723601、rs11982286、rs1986619、rs1882082、rs10268319、rs17170799、rs6957979、rs10225164、rs2293628、rs999744、rs17170820、rs17170826、rs17170830、rs1364373、rs13233995、rs6971267、rs7809487、rs1035582、rs2541103、rs2541074、rs2541075、rs2551069、rs1420421、rs6958656、rs10257460、rs12666532、rs1420422、rs17170915、rs10224438、rs7809365、rs6963276、rs6967358、rs6967403、rs10279544、rs4723619、rs17170955、rs2723969、rs6944921、rs6462746、rs1016321、rs2541082、rs4723631、rs2541089、rs2717975、rs10238916、rs2723952、rs12534004、rs2893540、rs2724006、rs2717983、rs2717990、rs2701004、rs2724007、rs2717992、rs2723996、rs9655380、rs2701003、rs2717993、rs2724003、rs2723980、rs2723990、rs2717948、rs2700992、rs6462758、rs2724014、rs2724016、rs1882079、rs2717954、rs13247953、rs2392495、rs10233634、rs12532031、rs4720246、rs7782999、rs1425124、rs1647801、rs2052688、rs2052687、rs10282309、rs10239693、rs17261508、rs10267165、rs918979、rs7777258、rs11767227、rs1647791、rs1732001、rs17171045、rs9655382及びrs6952260、並びにNCBI(v36.1)37495022からなる群より選択され、
ヒト第８染色体のTNKSを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12680471、rs2085640、rs17149989、rs17730481、rs17663071、rs17663167、rs4841147、rs1458938、rs1458939、rs11786942、rs17674819、rs1466338、rs13253327、rs17150066、rs11777274、rs11249921、rs17150087、rs1380104、rs11997346、rs4841156、rs6991328、rs17150131、rs7817148、rs10100760、rs17150181、rs17150185、rs17733293、rs7835349、rs7013746、rs7016636、rs3989158、rs17150211、rs4841169、rs4841171、rs6985564、rs11991621、rs4840426、rs6992432、rs10503380、rs7013834、rs6980831、rs12681719、rs4840427、rs4841179、rs7832096、rs4474027、rs4457339、rs12674762、rs4535743、rs1393、rs4342598、rs11780274、rs13273033、rs4841197、rs7010270、rs4841200、rs7459728、rs7461939、rs9644708、rs12545912、rs4840437、rs7004915、rs11785739、rs17150478、rs11787443、rs2898223、rs7820917、rs7829463、rs7000483、rs1567837、rs17734290、rs12540961、rs7829733、rs2137790、rs13249584、rs7013686、rs7015101、rs13270146、rs6601389、rs6601390、rs10098618、rs12056944、rs12543996、rs7828229、rs17150703、及びrs531564からなる群より選択され、
ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12549261、rs10955436、rs6981257、rs11774921、rs11781710、rs1954724、rs6997025、rs1892764、rs16875775、rs11778352、rs2584372、rs2246255、rs2022958、rs2022949、rs16875901、rs1010824、rs2507799、rs10505100、rs11777978、rs16875983、rs9297393、rs7009229、rs13257393、rs4077322、rs11997995、rs10505105、rs4133396、rs4133395、rs4341141、rs10505107、rs11780324、rs35143736、rs17368715、rs17296616、rs17368821、rs10955450、rs1433178、rs2514850、rs1283653、rs2445351、rs1283659、rs16876122、rs1632130、rs1672143、rs16876200、rs2514867、rs1283706、rs1283703、rs11785702、rs1283663、rs1283694、rs1433192、rs1433191、rs1298936、rs1368497、rs1529747、rs2916085、rs1368494、rs3847160、rs1654680、rs17301273、rs10086467、rs16876325、rs1283720、rs1433171、rs1433172、rs10216767、rs1583300、rs281708、rs10955457、rs10103715、rs281673、rs439896、rs281685、rs281696、rs2014769、rs281740及びrs190735、並びにNCBI(v36.1)108394240からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のPGM5を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs3869296、rs7020465、rs11142449、rs11142461、rs10868851、rs13439981、rs7039076、rs265083、rs2131355、rs265087、rs265073、rs7861495、rs10869020、rs17085775、rs11795256、rs10869034、rs1411992、rs10869043、rs12343877、rs11142941、rs869950、rs7046236及びrs9644996からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のTMC1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs3012514、rs7846808、rs7027640、rs10781101、rs4526421、rs7853275、rs10869178、rs7864535、rs12004208、rs6560277、rs4573342、rs4132905、rs4073227、rs10121866、rs7044241、rs7855743、rs4373587、rs11143314、rs7047875、rs6560284、rs6560285、rs7857300、rs6560287、rs7866185、rs6560293、rs7026124、rs12346185、rs7041300、rs4307407、rs17095、rs10113863、rs7029452、rs6560297、rs7045535、rs13285932、rs10521449、rs13285999、rs10869190、rs9314799、rs1037031、rs2487471、rs2589623、rs2793153、rs2589615、rs969205、rs1796991、rs1838487、rs2589609、rs1663756、rs12351661、rs1663763、rs13298704及びrs2501914からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のROR2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs6479357、rs9409602、rs10991978、rs10991988、rs7867934、rs1388966、rs902923、rs902922、rs10512215、rs1532230、rs12337820、rs7029450、rs2131304、rs10992027、rs9299395、rs1388967、rs4073736、rs4073735、rs9409652、rs10992075、rs7031729、rs17585790、rs16907725、rs16907728、rs4372069、rs16907761、rs16907764、rs17586213、rs7039620、rs16907768、rs10992090、rs3802379、rs3935382、rs4601388、rs4744101、rs4743852、rs10119449、rs7858240、rs7022147、rs1569141、rs10992124、rs7856144、rs7855417、rs6479374、rs1881385、rs16907863、rs12002851、rs1881392、rs10992137、rs7045226、rs11789730、rs16907923、rs12684524、rs7858435、rs10116326、rs16907979、rs10992161、rs6479386、rs3858082、rs7038823、rs7871522、rs10125466、rs10992178、rs10820926、rs6479389、rs10820927、rs7867072、rs1954599及びrs10992207からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7022663、rs7024526、rs2289631、rs10986505、rs16927802、rs12001999、rs10819019、rs6478690、rs1017530、rs3824507、rs12352758、rs4838242、rs650599、rs7860360、rs2113352、rs7019234、rs7867749、rs2271746、rs16927930、rs10986618、rs10986626、rs12237026、rs463774、rs420423、rs10986641、rs10513445、rs393721、rs10819043、rs10986689、rs10986698、rs10986703、rs10986714、rs10986715、rs10986721、rs10986722、rs1463837、rs4837016、rs10126025、rs10986738、rs2819624及びrs3122938からなる群より選択され、
ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2202925、rs17306253、rs10887498、rs12243608、rs1876887、rs2457451、rs2664403、rs2664394、rs1912274、rs1912322、rs744413、rs2664406、rs2664405、rs2616673、rs2175200、rs2175201、rs17105725、rs1912277、rs2457450、rs17105747、rs746992、rs7076174、rs4027581、rs11201743、rs4418740、rs17105793、rs12221324、rs17105805、rs7924009、rs11201759、rs11201775、rs3011700、rs2949380、rs17105842、rs3011704、rs2140661、rs1917136、rs17105866、rs1880389、rs884316、rs2949384、rs2949385、rs2140666、rs2949386、rs1106789、rs11201804、rs17105912、rs17105916、rs2352181、rs947596、rs2352099、rs7924131、rs7923188、rs7923344、rs1418396、rs7899222、rs10788472、rs10887538、rs2153828、rs7910835、rs7914815、rs7918491、rs2001417、rs2001416、rs10887540、rs7095652、rs12773130、rs12779841、rs10887544、rs11201871、rs10887549、rs10788476、rs2003111、rs7912451、rs11201882、rs2352178、rs7923926、rs7082134、rs4284352、rs6585995、rs6585996、rs5003944、rs7923310、rs884700、rs4934156、rs11201909、rs868042、rs12257526、rs12262754、rs11817682、rs12243396、rs1870156、rs2607830、rs17320915、rs2814322、rs2607840、rs11201944、rs17106434、rs2607822、rs10887563、rs10887564、rs2492738、rs1870161、rs2607839、rs1870165、rs2814340、rs1902678、rs2814349、rs1947567、rs2168725、rs1902680、rs2607833、rs1902676、rs1896527、rs6586003、rs12262612、rs6586004、rs17106584、rs7905184、rs10887578、rs10509530、rs1078789、rs10749537、rs12355013、rs7904985、rs10788500、rs10788501、rs10458771、rs2018507、rs10887608、rs4934207、rs4934208及びrs7083506からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7124648、rs7128650、rs4587689、rs11039097、rs12796744、rs17197619、rs17790390、rs11039105、rs10501319、rs11039112、rs747650、rs7937410、rs17197710、rs1685404、rs2013867、rs901746、rs7118396、rs10838681、rs10501321、rs1051006、rs3816724、rs7124955、rs4752824、rs1052373、rs11570094、rs10769255、rs11039212、rs4992357、rs11605672、rs1534576、rs10742805、rs12419692、rs4752856、rs3817334、rs7120548、rs10838739、rs11039329、rs10742817、rs4752791、rs17788930、rs7114011、rs10838774、rs2305982、rs6485788、rs10838782、rs7924699、rs1872167、rs747782及びrs1681630からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1586004、rs7940239、rs10896302、rs17615246、rs10750820、rs1945245、rs3938998、rs10791979、rs1573511、rs12277883、rs7116573、rs10896333、rs4420287、rs1894026、rs1945213、rs1945211、rs7113069、rs11228306、rs12785840、rs10501353、rs1945203、rs585475、rs615231、rs617315、rs675991、rs7939886、rs4939052、rs621957、rs611534、rs594854、rs618594、rs634955及びrs613050からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1026250、rs10750931、rs7126121、rs11230241、rs10897026、rs12225299、rs10792264、rs7125753、rs11605188、rs1899571、rs11230258、rs11230261、rs7943967、rs4442568、rs10897047、rs2868121、rs7945665、rs10897049、rs4506675、rs10792267、rs2304935、rs2165832、rs10736703、rs4939347、rs2233244、rs950803、rs950802、rs3816270、rs2241920、rs10501383、s10897056、rs4939352、rs955019、rs4938943、rs11230304、rs3763850、rs2282524、rs10897061、rs2120182、rs12787520、rs4146870、rs4939364、rs1051756、rs1941032、rs17615252、rs17543397、rs8181503、rs7946021、rs4939391、rs2186919、rs2847222、rs2633277及びrs2847212、並びにNCBI(v36.1)59954904からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs565976、rs534179、rs2276443、rs532454、rs511190、rs566818、rs482458、rs1793412、rs1790149、rs1790155、rs1790154、rs668727、rs11600640、rs611449、rs11236449、rs661928、rs621305、rs11236452、rs7128888、rs7129014、rs688727、rs674503、rs606452、rs11236458、rs599816、rs660343、rs541993、rs601142、rs648930、rs611221、rs12574551、rs584046、rs640927、rs11236476、rs17134231、rs12282340、rs10160335、rs12281880、rs656007、rs479592、rs589443、rs4944086、rs10751245、rs7110142、rs7947980及びrs509530、並びにNCBI(v36.1)75005360からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む)を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs17120344、rs6589597、rs10790175、rs12420127、rs10892082、rs7107152、rs1242229、rs1784042、rs2269399、rs526602、rs664971、rs11216315、rs1263499、rs17120523、rs236919、rs528508、rs593245及びrs477036、並びにNCBI(v36.1)116617736からなる群より選択され、
ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7297299、rs5745807、rs5745811、rs9739560、rs4767654、rs10638、rs9788041、rs11068799、rs11068803、rs10850953、rs7135008、rs11613924、rs7307331、rs9669474、rs7957463、rs10850956、rs2936840、rs904661、rs1726407、rs1726392、rs17440336、rs1277442、rs11068860、rs11068865、rs17512142、rs17440364、rs364823、rs418941、rs7974718、rs11068891、rs16948230、rs404566、rs16948234、rs17512483、rs17512574、rs2271007、rs11068937、rs7966814、rs6490178、rs905579、rs983421、rs1503767、rs7132650及びrs7316050からなる群より選択され、
ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7964173、rs11061064、rs10848174、rs7965385、rs7979388、rs7953972、rs4759749、rs4759751、rs7308461、rs1881062、rs10083153、rs729463、rs1881067、rs2695872、rs10848193、rs10848194、rs7305915、rs2398529、rs3864899、rs4412792、rs2632601、rs1554807、rs10848205、rs2037789、rs4619189、rs2001483、rs1609985、rs10848218、rs11061198、rs7307055、rs11061209、rs10773833、rs11061222、rs7299940、rs2141182、rs1405904、rs1316893、rs4074922及びrs4388928からなる群より選択され、
ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs9521809、rs4773201、rs1106649、rs9521814、rs385037、rs7997619、rs912941、s1886871、rs2182271、rs912942、rs331596、rs9559844、rs331602、rs1536621、rs9521853、rs9559849、rs7999854、rs3858821、rs4771696、rs4773228、rs4773229、rs2765341、rs3742193、rs3742194、rs7323602、rs3759463、rs179356、rs330565、rs7394、rs389656、rs450514、rs445490、rs418321、rs2251314、rs2165418、rs7999702、rs9521926、rs3098728、rs9515279及びrs2582886、並びにNCBI(v36.1)110097814からなる群より選択され、
ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs6493469、rs12595526、rs8031702、rs17599974、rs16953045、rs10744956、rs2306335、rs6493470、rs7181201、rs11856609、rs1124769、rs17647040、rs12899586、rs12904155、rs7170455、rs7177664、rs8040954、rs17647084、rs4775916、rs1111266、rs16964077、rs1025738、rs7179084、rs7176579、rs16964113、rs10519293、rs17522553、rs12324478、rs1075681、rs2899469、rs8031580、rs8029120、rs4774583、rs2289105、rs8034835、rs6493489、rs16964201、rs12595627、rs8023263、rs2899473、rs700518、rs3759811、rs17703883、rs1865803、rs4775936、rs10459592、rs17523270、rs10519297、rs11636686、rs11636667、rs1062033、rs2008691、rs11636403、rs10519299、rs17647707、rs17647719、rs7167343、rs936308、rs12594203、rs999480、rs2290622、rs8031463、rs6493495、rs2445765、rs2445766、rs2445768、rs1551656、rs12441382、rs2446420、rs2124873、rs2470184、rs2470187、rs2445781、rs12595284、rs17647970、rs7174434、rs764530、rs12438104、rs16964308、rs4775942、rs16964316、rs2470172、rs2470173、rs16964319、rs10163098、rs12443092、rs2168623、rs3751586、rs2445741、rs8036694、rs2459396及びrs16964348、並びにNCBI(v36.1)49383121からなる群より選択され、
ヒト第１７染色体のCA10を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4794268、rs4794274、rs4399573、rs12051837、rs6504736、rs7208167、rs9303589、rs1468118、rs10491154、rs17695254、rs2073864、rs9912472、rs3764798、rs17695921、rs11867674、rs886078、rs8076197、rs8076496、rs2073866、rs9901183、rs4794293、rs8064617、rs4794294、rs985758、rs4794295、rs16950363、rs2873938、rs1263962、rs1263965、rs1263988、rs1263989、rs4794298、rs4794300、rs8080331、rs11869209、rs1269480、rs1263978、rs1003290、rs1263981、rs1405191、rs1263984、rs9904076、rs4794304、rs8074185、rs6504747、rs16950512、rs7223782、rs4794305、rs16950534、rs1526182、rs1501255、rs4496207、rs1125750、rs1405187、rs767326、rs981577、rs4794307、rs202133、rs16950626、rs9896969、rs202136、rs202121、rs202120、rs203076、rs203090、rs203092、rs203093、rs203097、rs203098、rs10514990、rs203010、rs10514991、rs203022、rs6504754、rs12603762、rs169386、rs203042、rs7215008、rs996379、rs4794315、rs1501253、rs203050、rs203002、rs1005092、rs9896168、rs8065627、rs16950939、rs2907784、rs11079991、rs1393735、rs2970016、rs1875675、rs2938139、rs1354275、rs7224915、rs9893317、rs1503059、rs2970052、rs11655715、rs1155218、rs2931368、rs2931365、rs2931364、rs9908649、rs1486745、rs4605214、rs1503041、rs10514997、rs10514998、rs11079993、rs1503050、rs1503051、rs10515000、rs12949235、rs1393734、rs17678475、rs16951169、rs12150128、rs16951176、rs16951177、rs9903651、rs10515001、rs1847245、rs12150499及びrs6504764からなる群より選択され、
ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs8086948、rs12457951、rs11151371、rs17077389、rs1480679、rs5000099、rs1480682、rs433411、rs370944、rs395074、rs379982、rs281571、rs1444106、rs2448716、rs1562072、rs1867412、rs17077583、rs764133、rs17828615、rs2440515、rs10503119、rs2318439、rs12607172、rs9319737、rs1444112、rs2448755、rs2448745、rs2440527、rs28379561、rs10503118、rs1562070、rs2448727、rs17077858、rs12605273、rs2440540、rs4127445、rs7231324、rs12964913、rs9319739、rs17077963、rs12954315、rs4127447、rs7243836、rs8085641、rs2054299、rs515540、rs519360、rs17078114、rs2613163、rs652082、rs638006、rs3911662、rs12966846、rs3845265、rs11661918、rs11151403及びrs9953435からなる群より選択され、
ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1884029、rs6072606、rs2207220、rs4812571、rs4572656、rs2013923、rs4812574、rs6513762、rs6513763、rs6029950、rs2144009、rs2866941、rs6102658、rs2144011、rs3787282、rs746413、rs4812578、rs6102671、rs1126101、rs6065434、rs4810352、rs1076666、rs6029980、rs6016688、rs2076249、rs17221018、rs17221067、rs17312515、rs17221137、rs6130047、rs16986551、rs17221326、rs16986558、rs12625871、rs6016698、rs6030014、rs17221823、rs1883377、rs6016705、rs2179336、rs2143008、rs6030030、rs2206169、rs6102713、rs6093598、rs6030070、rs6030071、rs1014757、rs2143632、rs6030076、rs16986712、rs727337、rs727336、rs6030096、rs11906485、rs2867026、rs16986733、rs11698118、rs6124439、rs11696306、rs1016071、rs6030124、rs1573707、rs6016745、rs12481463、rs4812588、rs6102795、rs11697499、rs4812591、rs916327、rs1883269、rs16986850、rs1033414、rs11700137、rs6072747、rs999114、rs999113、rs6016798、rs2076082、rs6065482、rs6065484、rs6065487、rs6130145、rs230153、rs230154、rs172981、rs230155、rs6072758、rs230157、rs6124468、rs6102880、rs6130153、rs6065504、rs6065509、rs6072789、rs1033643、rs13040647、rs16987042、rs6030322、rs6072792、rs4482557、rs6130168、rs6030341、rs17747544、rs6065515、rs1883843、rs8119203、rs10854226、rs6102929、rs8121443、rs6030363、rs6102950、rs2867488、rs7360934、rs909863、rs6030370、rs6030380、rs6030381、rs9974028、rs6093705、rs6030385、rs6102967、rs2223542、rs6030395、rs6065520、rs6072814、rs2206426、rs6016864、rs6072819、rs6030407、rs6065525、rs2425520、rs2425530、rs4812631、rs4810366、rs2017914、rs3092557、rs17749109、rs4812637、rs6030442、rs6030443、rs1018407、rs6016884、rs1022819、rs733976、rs6030456、rs6093729、rs6030462、rs17749217、rs2146615、rs8119733、rs13042473、rs6103041、rs1973949、rs208256、rs208254、rs3092043、rs2077768、rs208250、rs4812645、rs6130222、rs4812655、rs6130232、rs208230、rs208229、rs6065544、rs6065545、rs6065546、rs7262282、rs7262355、rs11699742、rs8125304、rs6065547、rs4812659、rs16987493、rs208272、rs208273、rs4315585、rs208186、rs208197、rs206636、rs6030572、rs4812664、rs4812665、rs16987668、rs206148、rs206154、rs206159、rs206163、rs2208048、rs2425546、rs2425553、rs2425554、rs2425560、rs2425562、rs1106978、rs6030634、rs6016951、rs1006746、rs2425587、rs927058、rs2425593、rs2425599、rs2425610、rs16987770、rs6016963、rs6065579、rs1572929、rs6072998、rs6030670、rs947202、rs947203、rs4812681、rs6093784、rs4812683、rs10485698、rs926288、rs1569445、rs6030689、rs2867656、rs11699547、rs6030709及びrs7267873、並びにNCBI(v36.1)40130174からなる群より選択され、
ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12626309、rs2834231、rs4817579、rs2834238、rs2211689、rs2834246、rs2834251、rs2834252、rs1537097、rs1892589、rs2073368、rs2409499、rs9978415、rs2268247、rs9979937、rs2834264、rs2834268、rs879261、rs2245099、rs1108000、rs9979150、rs743316、rs2300384、rs3746861、rs2834292、rs2834295、rs2040113、rs2834296、rs2834297、rs2239565、rs17655810、rs12626410、rs2834303、rs2236645、rs2834310、rs16991110、rs2070513、rs2032312、rs2032313、rs2834315、rs11088265、rs17730050及びrs2834332からなる群より選択され、
ヒト第２染色体のLRP2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs13416802、rs2287616、rs2287613、rs3770597、rs10200158、rs6761690、rs13430236、rs3814381、rs4148765、rs10490134、rs11902639、rs10183805、rs13403114、rs3815574、rs2302698、rs6750251、rs4667590、rs4668121、rs1990702、rs6746604、rs990627、rs990626、rs2268380、rs6733122、rs2284681、rs11679947、rs10490132、rs2239602、rs2024481、rs741378、rs2284679、rs4287730、rs10210408、rs1548936、rs3770604、rs2075248、rs10490131、rs10169232、rs2239600、rs2284675、rs2268373、rs2268372、rs2193193、rs2268370、rs6747692、rs2300445、rs2239598、rs2239597、rs2239596、rs2239594、rs830957、rs830959、rs12988804、rs831002、rs16856748、rs11887007、rs16856759、rs830964、rs830971、rs830972、rs2247506、rs3845731、rs3770636、rs2673172、rs6713072、rs1990842、rs10199676、rs830955、rs12616998、rs12613663、rs10930354、rs4281872及びrs12052892からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs523246、rs10501136、rs836950、rs12808574、rs10836315、rs502857、rs731726、rs731727、rs967751、rs1553760、rs1396880、rs2941043、rs2941042、rs2941061、rs2956079、rs2941054、rs1509662、rs2941052、rs2915234、rs891550、rs919554、rs2915232、rs2956086、rs1998603、rs2985390、rs1571134、rs1571135、rs2915224、rs1430855、rs2985389、rs3751078、rs2915223、rs2915220、rs2986425、rs2986427、rs1326940、rs1326941、rs1326942、rs2986429、rs2915217、rs7111607、rs2915214、rs984690、rs3763934、rs10488801、rs2956106、rs11032927、rs2915202、rs2915201、rs2915199、rs1998912、rs2915193、rs11032937、rs2915227、rs2732557、rs10836326、rs2767038、rs10488806、rs2732564、rs2732565、rs2767033、rs1409716、rs2762955、rs952489、rs514182、rs1425806、rs2732528、rs2553794、rs2553793、rs678137、rs2785156、rs2553787、rs737503、rs737502、rs2162159、rs2732552、rs387619、rs10836332、rs353610、rs353605、rs2785189、rs2553822、rs11032995、rs12291631、rs353590、rs353589、rs353587、rs1559759、rs4756190、rs353581、rs7106681、rs507230、rs634096、rs2732578、rs404977、rs4756191及びrs2785180からなる群より選択され、
ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7979656、rs10849918、rs2106407、rs2106406、rs12425190、rs11065783、rs2339706、rs4509829、rs7961663、rs4766526、rs4766442、rs4766443、rs12815195、rs12229654、rs756825、rs16941284、rs6489979、rs4766553、rs9783423、rs7952972、rs16941319、rs3809290、rs7962233、rs4766451、rs886126、rs2078851、rs1265566、rs2301658、rs7300082、rs7300860、rs16941414、rs7398833、rs16941437、rs10849946、rs2078863及びrs11065898からなる群より選択され、
ヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2332297、rs2934884、rs16955216、rs2934890、rs7225247、rs16955225、rs9303359、rs7207731、rs17683089、rs11658131、rs2958944、rs2934909、rs2934914、rs2934921、rs2958933、rs7221313、rs7210248、rs2958921、rs8079105、rs16955327、rs12949718、rs9899602、rs17745123、rs8070668、rs9910653、rs17817829、rs12936860、rs12951898、rs17817950及びrs2787501、並びにNCBI(v36.1)50344775からなる群より選択される（１）の検査方法。
（３）正常眼圧緑内障患者と健常者間での有意差をｐ値で表したとき、多型部位のｐ値が0.05未満を示す（１）又は（２）記載の検査方法。
（４）ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2817088、rs2817090、rs2816372、rs2562895、rs2816364、rs2562893、rs2817101、rs2816362、rs2816356、rs2562898、rs735860、rs2057024、rs1429146、rs9463895、rs2235723、rs1346603、rs9474476、rs2294867、rs9349660、rs974323、rs6909592、rs9367520、rs9395854、rs209485、rs9395856、rs7747926、rs7738788、rs209500、rs9357760、rs9370196、rs209512、rs209517、rs9370201l及びrs9367529からなる群より選択され、
ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2343466、rs11888802、rs2343468、rs12471726、rs2081297、rs10460504、rs6719211、rs3213787、rs4455206、rs3755076、rs3770264、rs10205197、rs17033745、rs17322370、rs17033801、rs748573、rs6708810、rs6710581、rs17033871、rs3755082、rs11884064及びrs556650からなる群より選択され、
ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12487524、rs872133、rs2197728、rs2359774、rs6799641、rs4678789、rs11129660、rs11129662、rs6779091、rs3772395、rs17228111、rs735353、rs11920715、rs1455489、rs4678509、rs10510667、rs6799649及びrs4234248からなる群より選択され、
ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs371925、rs4241661、rs2167320、rs1159057、rs12501311、rs17086016、rs961489、rs7684130、rs3749526、rs11938753、rs7658065、rs17082122、rs4289492、rs9991256、rs7660334及びrs4604104からなる群より選択され、
ヒト第６染色体のGMDSを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2438083、rs7744559、rs9378292、rs2569866、rs11242704、rs2816286、rs2816287、rs2317965、rs2873591、rs2569835、rs2745567、rs2493160、rs1810496、rs12197419、rs2318108、rs6919059、rs17134506、rs3800142、rs3800146、rs10223785、rs6596866、rs4959621、rs4412249、rs4367413、rs11242729、rs6925298、rs9392353、rs11242730、rs4580917、rs11242733、rs11242735、rs476594、rs9378676、rs676015、rs2026446、rs4959631、rs11242740、rs3778557、rs234930、rs234915、rs234914、rs3800184、rs234932、rs3778568、rs9405550、rs3823287、rs1196396、rs1684153、rs9328087、rs2479003、rs2479004、rs2505678、rs2479008、rs2505674、rs7766115、rs4959648、rs7449538、rs6902556、rs6925653及びrs6904395からなる群より選択され、
ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2077102、rs805301、rs2242655、rs707918、rs805292、rs2299851、rs707939、rs480092、rs2075800、rs2763979及びrs11965547からなる群より選択され、
ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs6455585、rs6931414、rs6925091、rs6913912、rs894124、rs6455601及びrs3123094からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10246412、rs17404198、rs17149337、rs17404218、rs11976158、rs6978212、rs10261060、rs4401754、rs10278603、rs7787432、rs10237485及びNCBI(v36.1)8484291からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7794181、rs11763758、rs756669、rs4730038、rs4584085、rs17141284、rs17141299及びNCBI(v36.1)104196627からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs11223704、rs1146192、rs1144219、rs2510356及びrs1866768からなる群より選択され、
ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs514931、rs10871527及びrs17832851からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のPAX7を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2298893、rs685300及びrs2056446からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs6687571、rs2039528、rs10890251、rs10890257、rs12058744、rs11210879、rs10789438、rs11210892、rs617521及びrs10789439からなる群より選択され、
ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2355388、rs6686200、rs12122453、rs12122534、rs517201、rs2031481、rs2477568、rs2477569、rs535827、rs6593732、rs17359526、rs6693631、rs11811023、rs4950371、rs2304893、rs6593739、rs7525703、rs2883434、rs17159914、rs6593745、rs6670503、rs6703187、rs10793652、rs7537483、rs7537703、rs3820130、rs3737845、rs4950315、rs10494244、rs6683839、rs10793656、rs17360443、rs12033407、rs10793661、rs10736837、rs10900336、rs4950409、rs10793682、rs11240055、rs17160256、rs17160264及びrs17160305からなる群より選択され、
ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs11265310、rs16836320、rs868108、rs4845390、rs1984285、rs11264339、rs3768566、rs11264345、rs7520184、rs12032720、rs11264359、rs11264363、rs5005770、rs1325908、rs11264375、rs475550、rs821551、rs822490、rs822508、rs1749405、rs954916及びrs11590409からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs227521、rs227519、rs10047146、rs10489307、rs1402640、rs10913291、rs10798503、rs725416、rs554454、rs10913300、rs760689、rs6683060、rs926319、rs6699955、rs10798508、rs2139876、rs17315298、rs2861972及びrs6672376からなる群より選択され、
ヒト第１染色体のPKP1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1404401、rs16847944、rs1572968、rs12143423、rs6427900及びrs2275860からなる群より選択され、
ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12613333、rs2723129、rs1465677、rs1864807、rs1864808、rs497973及びrs3806510からなる群より選択され、
ヒト第３染色体のTHRBを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1397878、rs6808673、rs17194828、rs9310730、rs7652444、rs4858594、rs17787319、rs1505307、rs7640580、rs9833191、rs3951794及びrs5014281からなる群より選択され、
ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1993404、rs16863149、rs16863204、rs16863208、rs3732755、rs3773614、rs9820422、rs1388622及びrs4680474からなる群より選択され、
ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10015164、rs10024359、rs11940307、rs2648120、rs2648117、rs4861686、rs4637445、rs2278938、rs12641600、rs4862600及びrs10002339からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のMAST4を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs16895719、rs16895744、rs37568、rs16896071、rs39664、rs469300、rs467845及びNCBI(v36.1)65944399からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs6876015、rs11135436、rs6884979、rs7702848、rs2080947及びNCBI(v36.1)95206085からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のEBF1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1541649、rs2116727、rs10067813、rs7709065、rs10070743、rs10056564、rs6556373、rs4921537、rs1544754、rs17056426、rs1363561、rs1422672、rs10515787及びrs10515786からなる群より選択され、
ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7729471、rs261039、rs2291229、rs17646198、rs17560405、rs261006、rs155023、rs259900、rs13152920、rs11134603及びrs10462995からなる群より選択され、
ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10484565、rs9276825、rs188245、rs6457710、rs455567、rs211453、rs2772376、rs9469491、rs9296095、rs498114、rs654682、rs10947432、rs943466、rs755495、rs747692、rs943475、rs6929696、rs3828783及びrs9366829からなる群より選択され、
ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs9377361、rs9322660、rs9322661、rs2399802、rs680011、rs9499111、rs1569366、rs1569367及びrs6906578からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12673387、rs6950303、rs1034876、rs17169864、rs17169865、rs16878959、rs10486649、rs12672538、rs450463、rs2530548、rs2530549、rs2530550、rs1458544、rs323925及びrs323912からなる群より選択され、
ヒト第７染色体のELMO1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4720221、rs2392472、rs17170754、rs3807162及びrs11982286からなる群より選択され、
ヒト第８染色体のTNKSを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1466338、rs6991328、rs17150131、rs7817148、rs7016636、rs6985564、rs4840426、rs7832096、rs13273033、rs4841200、rs7459728、rs7461939、rs9644708、rs12545912、rs4840437、rs7004915、rs7820917、rs7829463、rs17734290、rs13270146、rs6601389、rs6601390、rs10098618、rs12056944、rs12543996及びrs7828229からなる群より選択され、
ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs16876200、rs2514867、rs11785702、rs1283663、rs1283694、rs1433192、rs1433191及びrs10216767からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のPGM5を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7020465、rs10868851、rs7039076、rs2131355、rs265073、rs7861495、rs10869020、rs11795256、rs10869034、rs1411992、rs10869043及びrs12343877からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のTMC1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7027640、rs12004208、rs6560277、rs7044241、rs4373587、rs11143314、rs7047875、rs7866185、rs7026124、rs12346185、rs7041300、rs4307407、rs10113863、rs7029452、rs7045535、rs13285932、rs10521449、rs1037031及びrs2487471からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のROR2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10119449、rs7022147、rs7856144、rs6479374、rs1881385及びrs7045226からなる群より選択され、
ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1017530、rs7860360、rs2113352、rs7019234、rs2271746、rs10986618、rs10986626、rs10513445、rs10986703及びrs10986738からなる群より選択され、
ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2202925、rs11201743、rs17105793、rs17105805、rs11201775、rs10887549、rs10788476及びrs4284352からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs11039112、rs747650、rs1685404、rs11570094、rs11039212、rs4992357、rs11605672、rs10742805、rs12419692、rs4752856、rs3817334、rs4752791、rs17788930、rs2305982、rs6485788、rs7924699及びrs1872167からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs1586004、rs7940239、rs10791979、rs1573511、rs12277883、rs7116573、rs10896333、rs4420287、rs1894026、rs7113069、rs11228306、rs10501353、rs1945203、rs615231、rs7939886、rs4939052、rs621957、rs611534、rs594854、rs618594及びrs634955からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4939347、rs2233244、rs3816270、rs2241920、rs10501383、s10897056及びrs4939352からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs482458、rs661928、rs7128888、rs7129014、rs688727、rs12574551、rs17134231、rs12282340、rs10160335及びrs12281880からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む)を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs664971、rs17120523及びrs528508からなる群より選択され、
ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs10850953、rs1726392、rs17440336、rs17512142、rs17440364、rs16948230、rs16948234、rs17512483及びrs17512574からなる群より選択され、
ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs7305915、rs3864899、rs1554807、rs10848205、rs2037789、rs4619189、rs2001483及びrs1405904からなる群より選択され、
ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4773201、rs450514、rs445490、rs418321及びrs2251314からなる群より選択され、
ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs12595526、rs1124769、rs17647040、rs7170455、rs7177664、rs8040954、rs8029120、rs4774583、rs2289105、rs8034835、rs6493489、rs8023263、rs700518、rs3759811、rs4775936、rs10459592、rs17523270、rs10519297、rs11636686、rs11636667、rs11636403、rs10519299、rs2445765、rs12441382、rs2446420、rs2445781、rs7174434、rs12438104、rs4775942及びrs16964316からなる群より選択され、
ヒト第１７染色体のCA10を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4794268、rs4794274、rs12051837、rs6504736、rs4496207、rs9896969、rs203076、rs203090、rs203092、rs12603762、rs169386、rs7215008、rs996379、rs4794315、rs1501253、rs203050、rs1005092及びrs9896168からなる群より選択され、
ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs433411、rs370944、rs395074、rs281571、rs2448716、rs2440515、rs10503119、rs2318439、rs12607172、rs9319737、rs1444112及びrs17077963からなる群より選択され、
ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4572656、rs16986733、rs6016745、rs6016798、rs6065487、rs6130145、rs230153、rs230155、rs6072758、rs8119203、rs6030395、rs2425530、rs4812637、rs6030456、rs927058、rs2425593、rs16987770、rs6065579、rs6072998、rs6030670、rs947202、rs947203及びrs6093784からなる群より選択され、
ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs2834268、rs9979150、rs2300384、rs3746861、rs2834292、rs2834303及びrs2236645からなる群より選択され、
ヒト第２染色体のLRP2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs4668121、rs6746604、rs990627、rs990626、rs2268380、rs6733122、rs2284681、rs2239602、rs741378、rs10210408、rs1548936、rs3770604、rs2075248、rs10169232、rs2239600、rs2284675、rs2268370、rs6747692、rs2239596、rs830957、rs830959、rs12988804、rs831002、rs1990842及びrs10199676からなる群より選択され、
ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs836950、rs12808574、rs10836315、rs1998603、rs2985390、rs1571134、rs1571135、rs2915224、rs1430855、rs2985389、rs3751078、rs2915223、rs2915220、rs2986427、rs1326940、rs1326941、rs1326942、rs2986429、rs2915217、rs7111607、rs2915214、rs3763934、rs10488801、rs2956106、rs11032927、rs1998912、rs2915193、rs11032937、rs2915227、rs2767038、rs10488806、rs2732564、rs2732565、rs2767033、rs952489及びrs353589からなる群より選択され、
ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs756825、rs4766553、rs3809290、rs4766451、rs886126、rs1265566、rs2301658及びrs7300082からなる群より選択され、
ヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域における多型部位が、一塩基多型国際番号rs17817829、rs12951898、rs17817950及びNCBI(v36.1)50344775からなる群より選択される（３）記載の検査方法。
（５）正常眼圧緑内障の検査をするための試薬であって、下記の(a)及び(b)の成分からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含む前記試薬。
(a) ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位を含む領域を増幅することができるプライマー
(b) ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位を含む領域にハイブリダイズすることができるプローブ
（６）（５）記載の試薬を含む、正常眼圧緑内障の検査キット。
（７）ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位を含む最長１０００塩基長の連続したＤＮＡ部分配列又はその相補鎖からなるポリヌクレオチドを含む正常眼圧緑内障診断用マーカー遺伝子。
（８）（７）記載のマーカー遺伝子のＤＮＡ配列を含有するベクター。
（９）（８）記載のベクターで形質転換した宿主細胞。
（１０）（７）記載のマーカー遺伝子のＤＮＡ配列を含有するベクターで形質転換した宿主細胞を培養し、培養物から（７）記載のマーカー遺伝子のＤＮＡ配列がコードするポリペプチドを採取することを含む、ポリペプチドの製造方法。
本発明により、正常眼圧緑内障をより正確に診断することが可能となった。既に発症した患者では確定診断が可能となり、積極的な治療をおこなうことが可能となった。また、未発症者では発症の危険率が算出されるので、発症の危険率が高い未発症患者に対しては検査を頻回に行うことを勧め、早期発見につなげることができる。
第６染色体、ELOVL5を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸には0.5Mbにわたる当該領域内遺伝子の位置を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外にELOVL5遺伝子の位置を示す。当該領域でp=0.000023を最大とするSNPがELOVL5遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。 候補遺伝子を含む領域内における各SNPの患者と健常者間の有意差を示す。横軸にはMbで当該領域内遺伝子との位置関係を示し、縦軸に有意差の指標であるp値を示す。下枠外に遺伝子の位置と名前を示す。当該領域において患者と健常者間で有意な差を示すSNPが候補遺伝子を中心に存在し、この領域に正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子が存在することを示している。
以下、本発明の実施の形態についてより詳細に説明する。
本発明者によって、正常眼圧緑内障に関連する遺伝子（正常眼圧緑内障疾患感受性遺伝子）が、ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む)を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域に存在することが解明された。正常眼圧緑内障の患者においては、有意に該遺伝子上に変異が見出されることから、該遺伝子上の変異の有無を調べることにより、被検者について正常眼圧緑内障であるか否かの検査、また、発症危険率の予測を行うことが可能である。
本発明は、ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位の塩基を同定することを含む、正常眼圧緑内障の検査方法を提供する。
本発明において、多型部位は、正常眼圧緑内障患者と健常者間で有意差を示すものであればよく、正常眼圧緑内障患者と健常者間の有意差の指標であるｐ値がより小さいものが望ましい。例えば、ｐ値が0.05未満なら、生物学的には明らかに有用であると通念上は判断される。ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域における多型部位とｐ値を後述の表１〜５３に示す。上記の領域における多型部位で、正常眼圧緑内障患者と健常者間の有意差の指標であるｐ値が0.05未満のものは、これらの表から探すことができる。
ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs222450、rs9474394、rs2816344、rs2816341、rs2518579、rs2518578、rs9367511、rs6915699、rs6930045、rs9370188、rs9382180、rs9382181、rs4486010、rs2816379、rs6939730、rs2817088、rs2817090、rs2816372、rs2562895、rs2816364、rs2562893、rs2817101、rs2816362、rs2816356、rs10948744、rs12183976、rs2562898、rs735860、rs715441、rs2057024、rs1429146、rs9463895、rs2235723、rs1346603、rs9474476、rs2294867、rs9349660、rs974323、rs6909592、rs9367520、rs9395854、rs209485、rs9395856、rs7747926、rs7738788、rs209500、rs9357760、rs9370196、rs209512、rs209517、rs9370201、rs9367529、rs12209741、rs7744451、rs6904083、rs6904376、rs9367532、rs2067833、rs9382212、rs2139077、rs2397146、rs7742367、rs9474576、rs622447、rs3736729、rs13212365、rs761141などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs11686431、rs7580559、rs3908093、rs2343412、rs12623996、rs7573149、rs918810、rs6721199、rs7579209、rs10194925、rs17033378、rs2343466、rs17033398、rs6737172、rs4953226、rs3851333、rs12473388、rs11681887、rs35608719、rs11888802、rs11678872、rs2343468、rs13003019、rs6760244、rs12471726、rs2081297、rs10460504、rs7562458、rs4953230、rs4952763、rs6719211、rs1014454、rs3755070、rs3213787、rs10210691、rs3770251、rs4455206、rs3755076、rs3770254、rs11125017、rs3770264、rs10205197、rs10427308、rs17033745、rs3770278、rs17322370、rs6736954、rs10427402、rs4476395、rs13023749、rs17033801、rs755652、rs748573、rs6708810、rs6710581、rs12712945、rs17033871、rs3755082、rs6544840、rs7599740、rs11884064、rs7596942、rs7565326、rs17323037、rs1916231、rs1517001、rs1522988、rs614281、rs582213、rs650508、rs666334、rs17033965、rs556650、rs2204204、rs3795863、rs2285024、rs505310、rs10490342、rs612717、rs10490341、rs656823、rs563601、rs609573、rs6746467、rs637889、rs10495926、rs1522986、rs1522987、rs6544843、rs6724488などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1523048、rs1523029、rs12487524、rs1403468、rs872133、rs1523040、rs1523041、rs13069451、rs12629480、rs1357449、rs6801949、rs17033355、rs9873254、rs9839823、rs6794354、rs6794373、rs12637211、rs9855328、rs2037538、rs2037539、rs1523038、rs11718271、rs1608314、rs2197728、rs9311101、rs10490870、rs17033506、rs12634096、rs2359774、rs9860326、rs4678788、rs3213953、rs6799641、rs17201627、rs4678789、rs12632607、rs11129660、rs11129662、rs17033672、rs17280201、rs6779091、rs3772395、rs9872664、rs1963934、rs35102908、rs4678802、rs4678803、rs6550367、rs17033738、rs6801590、rs17033748、rs9865772、rs17033755、rs17228111、rs2016955、rs2016975、rs735353、rs11920715、rs1378481、rs17814981、rs1455489、rs4678509、rs10510667、rs6799649、rs6799609、rs17033836、rs4234248、rs6770245、rs10865865、rs7615307、rs9845811、rs17033961、rs1488092、rs10461001、rs17033999などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs371925、rs4241661、rs170654、rs1514271、rs2063419、rs13102419、rs11131589、rs2167320、rs1159057、rs12501311、rs17086016、rs961489、rs7684130、rs3749526、rs4860651、rs11938753、rs1376417、rs10025570、rs1376416、rs2084682、rs7658065、rs9312144、rs1376412、rs17086181、rs17086185、rs6847413、rs2198103、rs12509018、rs17082122、rs6823779、rs17086224、rs1451170、rs4289492、rs4371663、rs9986026、rs9991256、rs4267782、rs7660334、rs6815080、rs11737314、rs4365778、rs7673091、rs4320185、rs4604104、rs7684022、rs4860679、rs6844942、rs12644315、rs4599467、rs6834811、rs4320186、rs4487412、rs7667410、rs4611975、rs4370201、rs4438803、rs4608860などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第６染色体のGMDSを含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs11966212、rs2143396、rs6911992、rs9378593、rs9392253、rs9378594、rs2050158、rs9391900、rs6596786、rs2235706、rs9378596、rs1997773、rs6926322、rs7754106、rs7750178、rs742520、rs2210370、rs6940618、rs349100、rs9405444、rs6932005、rs4959523、rs10484953、rs464778、rs115705、rs1013185、rs11242672、rs463641、rs4959525、rs369656、rs459162、rs127091、rs4959530、rs463264、rs7757477、rs448915、rs444018、rs443971、rs9391913、rs238048、rs238050、rs9378605、rs2459602、rs2438074、rs12191625、rs2438077、rs2496292、rs2496301、rs2438083、rs977674、rs977673、rs17259747、rs1437288、rs7772349、rs6596805、rs1347656、rs6925983、rs1550199、rs11242676、rs7744559、rs11966550、rs9378290、rs9405136、rs9405470、rs9392285、rs9405137、rs9405471、rs746095、rs9378623、rs9378292、rs1711957、rs7742720、rs9378629、rs7741690、rs9328052、rs9328053、rs1922938、rs2745636、rs2816242、rs932410、rs1474721、rs9392296、rs9502950、rs6907725、rs9405484、rs4443540、rs4355648、rs9328058、rs9328059、rs2569866、rs6935712、rs6935896、rs6937266、rs6925228、rs11242704、rs2816286、rs2816287、rs6596833、rs2317965、rs2873591、rs2569835、rs2745567、rs2493160、rs2317966、rs9392305、rs9501738、rs2569839、rs9328061、rs9378300、rs2816221、rs6916316、rs2281272、rs2569824、rs9405496、rs1810496、rs2814827、rs7759035、rs9502997、rs2814811、rs2317964、rs9378304、rs2569854、rs12206340、rs4538755、rs9378305、rs9503011、rs9405505、rs9503015、rs9501762、rs9405506、rs12197419、rs7765344、rs7765461、rs1013303、rs3800046、rs689035、rs2318108、rs6919059、rs6928276、rs226456、rs9378314、rs1157673、rs1157675、rs9391933、rs9328071、rs3778533、rs1028714、rs3800094、rs3778539、rs6596857、rs7776397、rs6596858、rs9378661、rs3823279、rs3800122、rs10484693、rs17772389、rs4959160、rs3778555、rs4463305、rs3800140、rs17134506、rs3800142、rs3800143、rs3800144、rs3800146、rs2761234、rs9405156、rs17134549、rs1408002、rs1830733、rs1830734、rs10223785、rs9405157、rs7772545、rs6596866、rs4959621、rs4412249、rs4367413、rs11242729、rs6925298、rs12212324、rs9392353、rs11242730、rs4580917、rs6910252、rs11242733、rs9503080、rs11242735、rs476594、rs9378676、rs676015、rs2026446、rs4959631、rs17134693、rs3800156、rs11242740、rs4959635、rs3800159、rs3778557、rs3800168、rs4959642、rs234930、rs9392372、rs234915、rs234914、rs3800184、rs234932、rs6903476、rs3778568、rs9405550、rs17134819、rs3823287、rs1196396、rs1684153、rs9328087、rs2479003、rs2479004、rs2505678、rs2479008、rs2505674、rs7766115、rs4959648、rs4413658、rs7449538、rs9503158、rs6902556、rs6925653、rs4281006、rs12210286、rs12213061、rs4959663、rs9501836、rs6911665、rs13200914、rs17135028、rs4959184、rs11242770、rs9328099、rs12206851、rs6904395、rs17609498、rs742487、rs4959185、rs9391949、rs9391950、rs6899721、rs1610416、rs3924452、rs10458144、rs9501850、rs9503199、rs4959677、rs35374935、rs2449448、rs1772982、rs1680885、rs2794569、rs2624936、rs12196957、rs2624933、rs1773000、rs1773001、rs1614248、rs1616044、rs2624917、rs2624916、rs6899711などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2248373、rs2248459、rs2248462、rs2248617、rs3749946、rs2523650、rs2904776、rs2516422、rs2905747、rs9267247、rs2395034、rs3095229、rs3131631、rs2516486、rs2734573、rs3115537、rs2516478、rs2071593、rs3219183、rs13215091、rs1799964、rs1052248、rs9348876、rs2857697、rs2736172、rs1046089、rs2255741、rs760293、rs2077102、rs3130048、rs2844463、rs805301、rs805300、rs805297、rs707921、rs2242655、rs707974、rs805268、rs805267、rs9378164、rs707918、rs805292、rs2299851、rs707939、rs707937、rs480092、rs2075800、rs2763979、rs11965547、rs486416、rs644045、rs537160、rs2072633、rs522162、rs550513、rs9296003、rs406936、rs492899などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs602698、rs678116、rs649930、rs643677、rs592698、rs675053、rs612557、rs629364、rs627967、rs628203、rs2771425、rs9355655、rs10499309、rs1041566、rs12530454、rs7753885、rs9347236、rs6455585、rs6931414、rs10447366、rs9457403、rs9355246、rs4709219、rs4708797、rs4709226、rs4709235、rs6925091、rs3799195、rs6913912、rs894124、rs6903405、rs6901469、rs9364496、rs7759006、rs6455600、rs2129209、rs6455601、rs9456350、rs3123094、rs9456352、rs3102970、rs6455604、rs3127188、rs3127194、rs3127196、rs3102966、rs3127168、rs923198、rs6924755、rs2361472、rs4569991、rs9457516、rs9456363、rs9365009、rs3923902、rs12207795などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs3807826、rs7802863、rs3757521、rs3757520、rs3807823、rs1861032、rs17145870、rs7805508、rs6977682、rs3807815、rs1008038、rs3807811、rs11769978、rs3779356、rs3807807、rs3807806、rs7455929、rs6463790、rs4620183、rs12668479、rs17147407、rs11762595、rs12702719、rs17147608、rs12154895、rs17403198、rs16873367、rs42949、rs2349188、rs6463805、rs7811039、rs10247446、rs10270530、rs7795595、rs6945018、rs17148966、rs1476623、rs10246412、rs17404198、rs6463813、rs17149337、rs17404218、rs11976158、rs10244689、rs6978212、rs757704、rs2214694、rs2189904、rs765855、rs17150199、rs10261060、rs4401754、rs10266489、rs5018942、rs4556000、rs10278603、rs7787432、rs6959052、rs17150410、rs17150472、rs17150479、rs17150761、rs10237485、rs4720785、rs972247、rs1859274、rs10238726、rs6970999、rs17151821、rs7456267、rs6963180、rs10257265、rs970526、rs977458、rs13240427、rs17154007、並びにNCBI(v36.1)8484291などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs41521、rs2188486、rs977641、rs17389507、rs10274138、rs17136882、rs13234807、rs7794181、rs7787988、rs7787976、rs17331134、rs1557689、rs6465984、rs7798273、rs2188494、rs1468143、rs10953427、rs2214087、rs4730006、rs6952170、rs17137313、rs4727599、rs17137382、rs10228106、rs42181、rs4730010、rs11763758、rs17137711、rs11763095、rs6977743、rs4520098、rs10216261、rs11972050、rs12539136、rs756669、rs41037、rs41038、rs28253、rs41058、rs9649272、rs6949801、rs9987005、rs6465994、rs6465995、rs1477110、rs12216618、rs10254402、rs6969323、rs9641335、rs10272959、rs3919550、rs4730030、rs10246540、rs4730031、rs2891730、rs995661、rs10487221、rs10487222、rs11773248、rs11983223、rs6943307、rs7782065、rs7801387、rs12705261、rs12531723、rs17269890、rs4730038、rs4584085、rs10216010、rs17141284、rs17141299、rs10953450、rs6466018、rs4530975、rs12705276、rs4283980及びrs2470965、NCBI(v36.1) 103849313、104068646及び104196627などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs11223704、rs470713、rs470935、rs641024、rs11606866、rs7131644、rs10894784、rs1031381、rs522134、rs4362160、rs473041、rs498602、rs554874、rs1144225、rs1595895、rs1146192、rs4936229、rs1144219、rs2510356、rs553231、rs512359、rs568044、rs10894798、rs10894799、rs11223765、rs10894800、rs7940114、rs10894801、rs10791357、rs3741100、rs3741098、rs7113199、rs1866769、rs1866768、rs1561613などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs3794941、rs17055278、rs514931、rs494721、rs17055426、rs2896769、rs12717033、rs7227977、rs10871527、rs10514139、rs17832851、rs17055756、rs1473224、rs2628125、rs8085262、rs8089151、rs2628123、rs4891199、rs17055919、rs10514148、rs17055185、rs2404482、rs10514149、rs4337381、rs2959165、rs12456768、rs4891217、rs9945585、rs9961644、rs9961742、rs9952375、rs13381156、rs9319675、rs2120144、rs8096648、rs17056218、rs2289609、rs4891228、rs1396098、rs894575、rs10871567、rs7242893、rs7239800などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１染色体のPAX7を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs3000058、rs2816030、rs16862061、rs2816040、rs2816046、rs4920334、rs4920516、rs4920335、rs2816064、rs6704504、rs1934057、rs2298893、rs2743208、rs2076021、rs2076020、rs2236826、rs2282704、rs2282699、rs624761、rs851123、rs2236817、rs685300、rs2056446、rs2841078、rs4920344、rs6669544、rs4076925、rs6603910、rs11261070、rs7539659、rs11261074、rs7411058、rs4920545、rs6684577、rs12565195などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2494997、rs1999674、rs2842180、rs2255632、rs2251804、rs1334973、rs6687571、rs2039528、rs2819341、rs10890251、rs2367617、rs11210864、rs2782641、rs11210871、rs10890257、rs12058744、rs11210879、rs11210886、rs516790、rs641365、rs673485、rs643445、rs10789438、rs11210892、rs617521、rs660899、rs2274465、rs10789439、rs489319、rs607062、rs10789442及びrs3791035、NCBI(v36.1)43760103などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2355388、rs6686200rs12122453、rs12122534、rs4950474、rs4950475、rs6593810、rs6657631、rs21327、rs517201、rs575115、rs2031481、rs2477568、rs2477569、rs692963、rs535827、rs4950361、rs6593732、rs17359526、rs6693631、rs11811023、rs4950371、rs2304893、rs6593739、rs7525703、rs2883434、rs2077749、rs17159914、rs6593745、rs2120003、rs10900325、rs2354432、rs6670503、rs1470261、rs6703187、rs10793652、rs7537483、rs7537703、rs1890038、rs3820130、rs3737845、rs17160062、rs3766525、rs4950315、rs17356240、rs10494244、rs6683839、rs10793656、rs17360443、rs3753433、rs12033407、rs7554833、rs10793661、rs10736837、rs10900336、rs7520661、rs4950409、rs2353983、rs6658836、rs17360812、rs6656156、rs12759145、rs12049491、rs10793682、rs4950431、rs7539416、rs2353969、rs4504949、rs17160205、rs2353967、rs12728058、rs6688308、rs11589438、rs6688154、rs6678706、rs4950436、rs7519891、rs11240053、rs11240054、rs11240055、rs7556087、rs7518276、rs2644579、rs2353951、rs2644577、rs6674761、rs2644566、rs2803535、rs17160256、rs12406844、rs17160264、rs612963、rs586000、rs17160295、rs644550、rs17160305などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs10752613、rs11583896、rs16835600、rs4434872、rs4567311、rs4363451、rs9427232、rs4845576、rs4520447、rs4845578、rs11585416、rs4845584、rs12033835、rs11581644、rs10908557、rs6701341、rs2297898、rs12048137、rs11264875、rs2066134、rs2494663、rs6671166、rs4845600、rs16835819、rs4521985、rs4620534、rs9803857、rs11265310、rs2340473、rs1194596、rs1212352、rs6672010、rs6702754、rs2274988、rs2297607、rs4414034、rs6696089、rs11265607、rs6427631、rs6427658、rs6694817、rs4537545、rs4845626、rs11265618、rs10752641、rs4240872、rs4474240、rs6700296、rs11265627、rs6691727、rs6687112、rs6427716、rs12136771、rs7553602、rs6660775、rs1127314、rs1127313、rs2131902、rs2229857、rs3766923、rs3766922、rs12125166、rs2335230、rs7531982、rs7533471、rs11264233、rs10796927、rs2335252、rs2036627、rs6699979、rs1995662、rs6664817、rs11264249、rs6426905、rs960182、rs16836320、rs868108、rs4845390、rs10494300、rs1051614、rs6666341、rs11808053、rs883319、rs1777910、rs951240ｖ、rs951241、rs9970364、rs1984285、rs6681725、rs16836414、rs10796934、rs10908445、rs4845678、rs4845679、rs4845681、rs12130132、rs10908448、rs4845690、rs4845406、rs10908455、rs7368345、rs10908456、rs4971079、rs4276913、rs11264339、rs3768566、rs11264345、rs7520184、rs12032720、rs11264359、rs11264363、rs5005770、rs1325908、rs11264375、rs475550、rs821551、rs822490、rs822519、rs822508、rs1749405、rs1749409、rs572609、rs3768280、rs2275078、rs2016251、rs1475766、rs12035615、rs4661146、rs6700693、rs10908489、rs11264449、rs2253677、rs2241110、rs2853641、rs2075163、rs2241107、rs1052053、rs1052067、rs759330、rs7542798、rs2253358、rs2842880、rs16837272、rs2287023、rs2246476、rs2248273、rs11264467、rs7522860、rs10908500、rs10494304、rs3795730、rs3762281、rs35478936、rs2274226、rs2985714、rs2842854、rs954916、rs6686886、rs11590409、rs4661040、rs7551781、rs16837376、rs11806983、rs1109751、rs11264486、rs3790458、rs1342442、rs12136856、rs10159180、rs1171564、rs1609666、rs728918、rs11264495、rs744224、rs4661184、rs879461、rs12742817、rs3795736、rs2236601、rs1046650、rs3795737などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7521610、rs16850728、rs227521、rs227519、rs10047146、rs10489307、rs972484、rs1402640、rs10913291、rs12094495、rs10798503、rs6425414、rs7515582、rs10913294、rs7534953、rs10913295、rs725416、rs12090000、rs12564343、rs12031932、rs12079554、rs554454、rs6660903、rs10913300、rs760689、rs6683060、rs926319、rs6699955、rs10798508、rs2139876、rs16851037、rs17315298、rs2861972、rs1883243、rs6660559、rs4652245、rs4140633、rs7528533、rs3946142、rs6658794、rs9425456、rs6672376、rs12025407などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１染色体のPKP1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1122396、rs1722755、rs6413916、rs831771、rs1404401、rs831767、rs16847944、rs831765、rs16847947、rs831764、rs16847951、rs831762、rs831753、rs16847994、rs831751、rs4915220、rs10157719、rs947379、rs12466、rs1592085、rs4915499、rs12134467、rs10158798、rs1954214、rs12046907、rs10920161、rs12117501、rs1997018、rs1880450、rs1857489、rs16848184、rs868381、rs854488、rs832169、rs832174、rs700469、rs860554rs1779301、rs2300293、rs2268156、rs832147、rs854502、rs1722780、rs1779293、rs854505、rs1572968、rs17425876、rs12143423、rs947377、rs10753899、rs17459837、rs6427900、rs1122481、rs2275862、rs11806184、rs2365652、rs2275860、rs947485、rs6671391、rs1256941、rs10800779、rs7553988、rs10920205、rs3887566、rs3888929、rs6427908、rs12090950などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2577720、rs2723120、rs10495742、rs2577717、rs6720565、rs12053097、rs12613333、rs7566157、rs17045229、rs875077、rs17045238、rs2723129、rs2577698、rs2954818、rs12989910、rs11125011、rs6742888、rs7564616、rs2723111、rs6544822、rs893430、rs737564、rs737565、rs747344、rs6727901、rs7570872、rs17045350、rs6544861、rs6756357、rs4665214、rs10172684、rs1653748、rs1465677、rs1864807、rs1864808、rs4665218、rs10169643、rs1368080、rs10490750、rs11677730、rs7601971、rs1653751、rs1653753、rs1368081、rs11678782、rs11678785、rs4497835、rs1653780、rs17445645、rs4665223、rs4284788、rs4665612、rs1709339、rs6544949rs17045574、rs6544966、rs4665230、rs583168、rs17045705、rs2280122、rs1548020、rs518113、rs497973、rs3806510、rs13386930、rs6721623、rs3795933、rs7560892、rs4233701、rs9261、rs7579413、rs12470949、rs12478701、rs2081302、rs12478744、rs2339853、rs35379186などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第３染色体のTHRBを含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1397878、rs6765461、rs6801153、rs1464010、rs7630879、rs6550848、rs826375、rs1667765、rs826378、rs6808673、rs2596623、rs17194828、rs1562736、rs9310730、rs2683535、rs7652337、rs7652444、rs2683542、rs1667739、rs1505302、rs6799431、rs17014338、rs826249、rs10510540、rs6772213、rs851719、rs6792783、rs1354605、rs866651、rs958892、rs826225、rs6550853、rs826223、rs826218、rs1466122、rs1449874、rs11719336、rs7625917、rs17787283、rs4858594、rs1449872、rs9849581、rs9863517、rs9843698、rs9867989、rs1667746、rs17787319、rs1505307、rs7640580、rs12639035、rs9810037、rs9833191、rs12630454、rs3951794、rs6781111、rs1505287、rs12495379、rs4858608、rs7624363、rs4640503、rs6550865、rs9839986、rs5014281、rs9831450、rs4241527、rs4858617、rs4858618、rs2196427、rs10490840、rs6788339、rs6765048、rs892941などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs13088412、rs9837084、rs744876、rs571170、rs358954、rs9833515、rs6440716、rs358967、rs1993404、rs9883677、rs2048229、rs16863149、rs891666、rs1835668、rs6787683、rs16863204、rs16863208、rs16863229、rs3732755、rs3773614、rs1231521、rs3108727、rs3773619、rs7649855、rs16863264、rs2870518、rs3846072、rs6782715、rs1882014、rs16863287、rs10513391、rs3773621、rs10935835、rs9863821、rs9864095、rs1873619、rs7623356、rs1491981、rs6440735、rs3971192、rs7644001、rs16863323、rs6801273、rs9820422、rs16863336、rs1388622、rs3975404、rs10513394、rs6787801、rs9289836、rs3821663、rs7429509、rs3821664、rs1491974、rs9653953、rs17204501、rs17204508、rs4680406、rs12490051、rs16863364、rs11708767、rs11709550、rs3732769、rs10935844、rs2276765、rs2276766、rs16863376、rs6440741、rs6771904、rs6772196、rs3732771、rs9864533、rs4435614、rs17204557、rs6798252、rs4680440、rs4680443、rs13088575、rs6790903、rs9289840、rs4680474、rs4541381、rs4596123及びrs7612205、NCBI(v36.1)152200518、152229595、152456055及び152609183などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs10866277、rs12645545、rs12649063、rs7437897、rs11132327、rs10866278、rs6823490、rs6843640、rs6818789、rs2101307、rs6552895、rs6552896、rs6552897、rs12498673、rs10025265、rs2306707、rs3749579、rs6848934、rs2306703、rs11934819、rs4862558、rs4599460、rs4862559、rs6823546、rs11132334、rs5018568、rs904451、rs7677363、rs2030144、rs11132338、rs11132340、rs7669883、rs6858544、rs1027521、rs2173480、rs2173479、rs11132344、rs10084919、rs7677532、rs6835720、rs10024805、rs6834923、rs6812818、rs10015164、rs11132345、rs10024359、rs10000785、rs1039235、rs2310357、rs10028428、rs4862571、rs7684943、rs10021308、rs1566347、rs12504307、rs11132355、rs10028944、rs1499010、rs11724690、rs11940307、rs1566354、rs2648126、rs2648120、rs2648117、rs2648112、rs4861686、rs1026362、rs12643549、rs2310372、rs4862588、rs10031442、rs4637445、rs1947455、rs2278938、rs12641600、rs4862600、rs10002339、rs7694098、rs830829、rs830838、rs830841、rs2603731rs7697039、rs7697051、rs1356672、rs7679967、rs4861696、rs1519320、rs12643213などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第５染色体のMAST4を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7733618、rs12514219、rs4532318、rs6861487、rs7700850、rs4587034、rs7705086、rs16895307、rs16895308、rs6890124、rs4339298、rs4613646、rs6862416、rs4532319、rs10515011、rs16895357、rs7732647、rs4355471、rs4554157、rs12055346、rs16895417、rs17210621、rs7706654、rs6864239、rs6896102、rs4374700、rs16895456、rs6880657、rs6863239、rs16895458、rs11953193、rs10940078、rs4446417、rs9791090、rs33721、rs33728、rs2548712、rs33696、rs257711、rs33724、rs26384、rs7704890、rs7725568、rs30729、rs26383、rs27637、rs26382、rs9918275、rs258082、rs257699、rs257700、rs16895719、rs30731、rs16895744、rs1835136、rs36157、rs36155、rs544158、rs36144、rs36143、rs26923、rs16895768、rs463219、rs16895790、rs26921、rs192295、rs26929、rs26928、rs461702、rs460844、rs455938、rs464881、rs456775、rs154620、rs17217092、rs154618、rs10056426、rs152407、rs37568、rs734828、rs2280174、rs16896071、rs40206、rs706701、rs17218390、rs6863305、rs39664、rs34691、rs34693、rs10044452、rs34698、rs34699、rs4016246、rs1159201、rs2662227、rs27206、rs469300、rs467845、rs2545396、rs16896246、rs16896295、rs17221226、rs2287929及びrs16896325、NCBI(v36.1)65944399などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs34896、rs34897、rs3777220、rs3777217、rs11738579、rs3777213、rs7736948、rs6556883、rs9314160、rs6876015、rs11135436、rs17085165、rs17085170、rs10040697、rs6884979、rs7702848、rs2080947、rs10476660、rs154454、rs147295、rs17085249、rs11741590、rs3777194、rs2270554、rs3777190、rs3777188及びrs4642392、NCBI(v36.1)95206085などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第５染色体のEBF1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2913384、rs173423、rs244654、rs824854、rs824848、rs1095103、rs403334、rs10515769、rs2112262、rs33196、rs17056089、rs2042875、rs3843489、rs1541649、rs17056186、rs2116727、rs10067813、rs7709065、rs17056205、rs1368298、rs4704963、rs10070743、rs4704967、rs10056564、rs6875710、rs17643057、rs6883655、rs891903、rs10054046、rs6556373、rs4921537、rs6556377、rs13180086、rs6556379、rs6556381、rs1544754、rs883540、rs17056426、rs17056435、rs1363561、rs9313797、rs1422672、rs17056474、rs17717829、rs10515787、rs10515786、rs10515789、rs9637861、rs7442845、rs12659540、rs3862065、rs270661などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs4493692、rs3797712、rs3797713、rs264881、rs36101422、rs264834、rs6879467、rs6883997、rs7721990、rs7713640、rs900464、rs264846、rs2161404、rs2306560、rs3816764、rs11134586、rs12515906、rs264844、rs2279318、rs264843、rs10063658、rs4867879、rs17736846、rs264838、rs12658902、rs2306558、rs262865、rs262840、rs262841、rs262842、rs155239、rs262848、rs262851、rs4867572、rs262852、rs746468、rs90213、rs17051884、rs262860、rs262859、rs10076580、rs6875474、rs185532、rs17669613、rs1013193、rs17669636、rs966595、rs17669654、rs13171272、rs261612、rs13163565、rs17737323、rs155074、rs261016、rs261597、rs166368、rs261633、rs10054135、rs261624、rs261625、rs17560224、rs4867895、rs168678、rs30080、rs30083、rs17670092、rs7717087、rs17737597、rs7729471、rs261039、rs261038、rs1482333、rs2291229、rs261021、rs261076、rs12515095、rs17646198、rs17560405、rs261067、rs261060、rs261006、rs261008、rs11740615、rs11741667、rs155023、rs11742527、rs978914、rs12522080、rs2624252、rs6896240、rs6862278、rs3860755、rs259897、rs259899、rs259900、rs259902、rs259903、rs6895199、rs259916、rs12659898、rs1422695、rs17738158、rs17561105、rs11134600、rs6893165、rs2161366、rs9313476、rs17738326、rs2287727、rs17738444、rs6884677、rs13152920、rs9790867、rs11134603、rs17738530、rs2134151、rs12055169、rs17738584、rs1316638、rs17072023、rs13361200、rs17738710、rs10462994、rs10462995、rs6890267、rs6871764、rs17671355、rs6555884、rs17562083、rs10516070、rs955078などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1044043、rs10484565、rs241438、rs1800454、rs241429、rs241427、rs4711312、rs2071482、rs4148882、rs12529313、rs9276815、rs20547、rs9276825、rs9276832、rs241404、rs241403、rs3101942、rs241400、rs3132132、rs151719、rs1050391、rs9378127、rs188245、rs3129305、rs176248、rs12216336、rs2894311、rs12191230、rs2395301、rs12192713、rs12199692、rs1044429、rs592625、rs399604、rs365066、rs3763341、rs4713603、rs4713604、rs6936620、rs2116264、rs1367731、rs439852、rs446853、rs9296069、rs440841、rs3128952、rs3130180、rs3097662、rs3128955、rs3130588、rs9277183、rs3097669、rs9277194、rs376877、rs6457710、rs3077、rs9348904、rs9296073、rs2856816、rs3135021、rs1431403、rs9277542、rs3128963、rs3128965、rs3128966、rs3117229、rs2068204、rs2179920、rs2295120、rs3117242、rs3128921、rs3128923、rs9296079、rs3117230、rs3128930、rs872956、rs9380343、rs6937034、rs6937061、rs9277637、rs3117039、rs3130233、rs3117016、rs2395351、rs3116985、rs3129249、rs3129248、rs1003979、rs2071025、rs2855459、rs439205、rs213208、rs461338、rs458679、rs455567、rs14398、rs3130267、rs3130014、rs211455、rs211453、rs10807124、rs411136、rs2772376、rs7747216、rs9469491、rs17627049、rs210137、rs9296095、rs210138、rs444697、rs1794681、rs9469529、rs4711332、rs12205634、rs1408711、rs1536041、rs2229637、rs10947427、rs3818527、rs3818528、rs3818530、rs4713659、rs594223、rs7759668、rs626156、rs498114、rs654682、rs16869412、rs10947432、rs3818532、rs9394163、rs12203688、rs4713670、rs4713671、rs622917、rs12189725、rs877187、rs4713674、rs4713677、rs943466、rs943467、rs755495、rs747692、rs943475、rs6929696、rs3806108、rs3828783、rs3763253、rs9366829、rs9394169、rs4713686、rs10947441などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1338657、rs9485685、rs9377361、rs9377365、rs9377366、rs9322660、rs9322661、rs2399802、rs17063309、rs680011、rs9499111、rs9404214、rs1569366、rs1569367、rs17443301、rs17063399、rs6906578及びrs7740643、NCBI(v36.1)102984444などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1156490、rs6462540、rs1419842、rs2392267、rs1419803、rs1419805、rs1419809、rs6977125、rs17169769、rs17169771、rs7778512、rs1419840、rs35114106、rs1019089、rs16878925、rs1362172、rs2392270、rs17831435、rs10951417、rs1468559、rs10486643、rs6951496、rs7458608、rs2893480、rs4723375、rs1419863、rs1419864、rs9639694、rs9639695、rs10951418、rs10215667、rs6971556、rs12673387、rs4723377、rs6950303、rs1034876、rs17169864、rs17169865、rs16878959、rs12672624、rs10486649、rs2893482、rs12672538、rs10486650、rs2392274、rs2079509、rs10243426、rs2097960、rs1362173、rs1458549、rs450463、rs1023555、rs1023556、rs2530548、rs2530549、rs2530550、rs1419794、rs2530565、rs1458544、rs2609226、rs9792042、rs2530567、rs2609218、rs323925、rs323912、rs10239860、rs1419791、rs17777040、rs17198254、rs17777663、rs17777675、rs17198982、rs17788843、rs324978、rs324981、rs324983、rs1419780、rs325464、rs17199659、rs17789420、rs17789642、rs17170015、rs17200455、rs10263313、rs17790181、rs11768189などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第７染色体のELMO1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs10277512、rs4720221、rs7787226、rs10951500、rs10274668、rs10255208、rs2006882、rs2392472、rs756507、rs2241152、rs7785934、rs7782979、rs17170754、rs3807162、rs3734948、rs741302、rs2041801、rs6966276、rs4723592、rs11769038、rs4723598、rs1882080、rs4723601、rs11982286、rs1986619、rs1882082、rs10268319、rs17170799、rs6957979、rs10225164、rs2293628、rs999744、rs17170820、rs17170826、rs17170830、rs1364373、rs13233995、rs6971267、rs7809487、rs1035582、rs2541103、rs2541074、rs2541075、rs2551069、rs1420421、rs6958656、rs10257460、rs12666532、rs1420422、rs17170915、rs10224438、rs7809365、rs6963276、rs6967358、rs6967403、rs10279544、rs4723619、rs17170955、rs2723969、rs6944921、rs6462746、rs1016321、rs2541082、rs4723631、rs2541089、rs2717975、rs10238916、rs2723952、rs12534004、rs2893540、rs2724006、rs2717983、rs2717990、rs2701004、rs2724007、rs2717992、rs2723996、rs9655380、rs2701003、rs2717993、rs2724003、rs2723980、rs2723990、rs2717948、rs2700992、rs6462758、rs2724014、rs2724016、rs1882079、rs2717954、rs13247953、rs2392495、rs10233634、rs12532031、rs4720246、rs7782999、rs1425124、rs1647801、rs2052688、rs2052687、rs10282309、rs10239693、rs17261508、rs10267165、rs918979、rs7777258、rs11767227、rs1647791、rs1732001、rs17171045、rs9655382及びrs6952260、NCBI(v36.1)37495022などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第８染色体のTNKSを含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs12680471、rs2085640、rs17149989、rs17730481、rs17663071、rs17663167、rs4841147、rs1458938、rs1458939、rs11786942、rs17674819、rs1466338、rs13253327、rs17150066、rs11777274、rs11249921、rs17150087、rs1380104、rs11997346、rs4841156、rs6991328、rs17150131、rs7817148、rs10100760、rs17150181、rs17150185、rs17733293、rs7835349、rs7013746、rs7016636、rs3989158、rs17150211、rs4841169、rs4841171、rs6985564、rs11991621、rs4840426、rs6992432、rs10503380、rs7013834、rs6980831、rs12681719、rs4840427、rs4841179、rs7832096、rs4474027、rs4457339、rs12674762、rs4535743、rs1393、rs4342598、rs11780274、rs13273033、rs4841197、rs7010270、rs4841200、rs7459728、rs7461939、rs9644708、rs12545912、rs4840437、rs7004915、rs11785739、rs17150478、rs11787443、rs2898223、rs7820917、rs7829463、rs7000483、rs1567837、rs17734290、rs12540961、rs7829733、rs2137790、rs13249584、rs7013686、rs7015101、rs13270146、rs6601389、rs6601390、rs10098618、rs12056944、rs12543996、rs7828229、rs17150703、rs531564などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs12549261、rs10955436、rs6981257、rs11774921、rs11781710、rs1954724、rs6997025、rs1892764、rs16875775、rs11778352、rs2584372、rs2246255、rs2022958、rs2022949、rs16875901、rs1010824、rs2507799、rs10505100、rs11777978、rs16875983、rs9297393、rs7009229、rs13257393、rs4077322、rs11997995、rs10505105、rs4133396、rs4133395、rs4341141、rs10505107、rs11780324、rs35143736、rs17368715、rs17296616、rs17368821、rs10955450、rs1433178、rs2514850、rs1283653、rs2445351、rs1283659、rs16876122、rs1632130、rs1672143、rs16876200、rs2514867、rs1283706、rs1283703、rs11785702、rs1283663、rs1283694、rs1433192、rs1433191、rs1298936、rs1368497、rs1529747、rs2916085、rs1368494、rs3847160、rs1654680、rs17301273、rs10086467、rs16876325、rs1283720、rs1433171、rs1433172、rs10216767、rs1583300、rs281708、rs10955457、rs10103715、rs281673、rs439896、rs281685、rs281696、rs2014769、rs281740及びrs190735、NCBI(v36.1)108394240などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第９染色体のPGM5を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs3869296、rs7020465、rs11142449、rs11142461、rs10868851、rs13439981、rs7039076、rs265083、rs2131355、rs265087、rs265073、rs7861495、rs10869020、rs17085775、rs11795256、rs10869034、rs1411992、rs10869043、rs12343877、rs11142941、rs869950、rs7046236、rs9644996などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第９染色体のTMC1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs3012514、rs7846808、rs7027640、rs10781101、rs4526421、rs7853275、rs10869178、rs7864535、rs12004208、rs6560277、rs4573342、rs4132905、rs4073227、rs10121866、rs7044241、rs7855743、rs4373587、rs11143314、rs7047875、rs6560284、rs6560285、rs7857300、rs6560287、rs7866185、rs6560293、rs7026124、rs12346185、rs7041300、rs4307407、rs17095、rs10113863、rs7029452、rs6560297、rs7045535、rs13285932、rs10521449、rs13285999、rs10869190、rs9314799、rs1037031、rs2487471、rs2589623、rs2793153、rs2589615、rs969205、rs1796991、rs1838487、rs2589609、rs1663756、rs12351661、rs1663763、rs13298704、rs2501914などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第９染色体のROR2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs6479357、rs9409602、rs10991978、rs10991988、rs7867934、rs1388966、rs902923、rs902922、rs10512215、rs1532230、rs12337820、rs7029450、rs2131304、rs10992027、rs9299395、rs1388967、rs4073736、rs4073735、rs9409652、rs10992075、rs7031729、rs17585790、rs16907725、rs16907728、rs4372069、rs16907761、rs16907764、rs17586213、rs7039620、rs16907768、rs10992090、rs3802379、rs3935382、rs4601388、rs4744101、rs4743852、rs10119449、rs7858240、rs7022147、rs1569141、rs10992124、rs7856144、rs7855417、rs6479374、rs1881385、rs16907863、rs12002851、rs1881392、rs10992137、rs7045226、rs11789730、rs16907923、rs12684524、rs7858435、rs10116326、rs16907979、rs10992161、rs6479386、rs3858082、rs7038823、rs7871522、rs10125466、rs10992178、rs10820926、rs6479389、rs10820927、rs7867072、rs1954599、rs10992207などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7022663、rs7024526、rs2289631、rs10986505、rs16927802、rs12001999、rs10819019、rs6478690、rs1017530、rs3824507、rs12352758、rs4838242、rs650599、rs7860360、rs2113352、rs7019234、rs7867749、rs2271746、rs16927930、rs10986618、rs10986626、rs12237026、rs463774、rs420423、rs10986641、rs10513445、rs393721、rs10819043、rs10986689、rs10986698、rs10986703、rs10986714、rs10986715、rs10986721、rs10986722、rs1463837、rs4837016、rs10126025、rs10986738、rs2819624、rs3122938などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2202925、rs17306253、rs10887498、rs12243608、rs1876887、rs2457451、rs2664403、rs2664394、rs1912274、rs1912322、rs744413、rs2664406、rs2664405、rs2616673、rs2175200、rs2175201、rs17105725、rs1912277、rs2457450、rs17105747、rs746992、rs7076174、rs4027581、rs11201743、rs4418740、rs17105793、rs12221324、rs17105805、rs7924009、rs11201759、rs11201775、rs3011700、rs2949380、rs17105842、rs3011704、rs2140661、rs1917136、rs17105866、rs1880389、rs884316、rs2949384、rs2949385、rs2140666、rs2949386、rs1106789、rs11201804、rs17105912、rs17105916、rs2352181、rs947596、rs2352099、rs7924131、rs7923188、rs7923344、rs1418396、rs7899222、rs10788472、rs10887538、rs2153828、rs7910835、rs7914815、rs7918491、rs2001417、rs2001416、rs10887540、rs7095652、rs12773130、rs12779841、rs10887544、rs11201871、rs10887549、rs10788476、rs2003111、rs7912451、rs11201882、rs2352178、rs7923926、rs7082134、rs4284352、rs6585995、rs6585996、rs5003944、rs7923310、rs884700、rs4934156、rs11201909、rs868042、rs12257526、rs12262754、rs11817682、rs12243396、rs1870156、rs2607830、rs17320915、rs2814322、rs2607840、rs11201944、rs17106434、rs2607822、rs10887563、rs10887564、rs2492738、rs1870161、rs2607839、rs1870165、rs2814340、rs1902678、rs2814349、rs1947567、rs2168725、rs1902680、rs2607833、rs1902676、rs1896527、rs6586003、rs12262612、rs6586004、rs17106584、rs7905184、rs10887578、rs10509530、rs1078789、rs10749537、rs12355013、rs7904985、rs10788500、rs10788501、rs10458771、rs2018507、rs10887608、rs4934207、rs4934208、rs7083506などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7124648、rs7128650、rs4587689、rs11039097、rs12796744、rs17197619、rs17790390、rs11039105、rs10501319、rs11039112、rs747650、rs7937410、rs17197710、rs1685404、rs2013867、rs901746、rs7118396、rs10838681、rs10501321、rs1051006、rs3816724、rs7124955、rs4752824、rs1052373、rs11570094、rs10769255、rs11039212、rs4992357、rs11605672、rs1534576、rs10742805、rs12419692、rs4752856、rs3817334、rs7120548、rs10838739、rs11039329、rs10742817、rs4752791、rs17788930、rs7114011、rs10838774、rs2305982、rs6485788、rs10838782、rs7924699、rs1872167、rs747782、rs1681630などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1586004、rs7940239、rs10896302、rs17615246、rs10750820、rs1945245、rs3938998、rs10791979、rs1573511、rs12277883、rs7116573、rs10896333、rs4420287、rs1894026、rs1945213、rs1945211、rs7113069、rs11228306、rs12785840、rs10501353、rs1945203、rs585475、rs615231、rs617315、rs675991、rs7939886、rs4939052、rs621957、rs611534、rs594854、rs618594、rs634955、rs613050などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1026250、rs10750931、rs7126121、rs11230241、rs10897026、rs12225299、rs10792264、rs7125753、rs11605188、rs1899571、rs11230258、rs11230261、rs7943967、rs4442568、rs10897047、rs2868121、rs7945665、rs10897049、rs4506675、rs10792267、rs2304935、rs2165832、rs10736703、rs4939347、rs2233244、rs950803、rs950802、rs3816270、rs2241920、rs10501383、s10897056、rs4939352、rs955019、rs4938943、rs11230304、rs3763850、rs2282524、rs10897061、rs2120182、rs12787520、rs4146870、rs4939364、rs1051756、rs1941032、rs17615252、rs17543397、rs8181503、rs7946021、rs4939391、rs2186919、rs2847222、rs2633277及びrs2847212、NCBI(v36.1)59954904などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs565976、rs534179、rs2276443、rs532454、rs511190、rs566818、rs482458、rs1793412、rs1790149、rs1790155、rs1790154、rs668727、rs11600640、rs611449、rs11236449、rs661928、rs621305、rs11236452、rs7128888、rs7129014、rs688727、rs674503、rs606452、rs11236458、rs599816、rs660343、rs541993、rs601142、rs648930、rs611221、rs12574551、rs584046、rs640927、rs11236476、rs17134231、rs12282340、rs10160335、rs12281880、rs656007、rs479592、rs589443、rs4944086、rs10751245、rs7110142、rs7947980及びrs509530、NCBI(v36.1)75005360などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む)を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs17120344、rs6589597、rs10790175、rs12420127、rs10892082、rs7107152、rs1242229、rs1784042、rs2269399、rs526602、rs664971、rs11216315、rs1263499、rs17120523、rs236919、rs528508、rs593245及びrs477036、NCBI(v36.1)116617736などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7297299、rs5745807、rs5745811、rs9739560、rs4767654、rs10638、rs9788041、rs11068799、rs11068803、rs10850953、rs7135008、rs11613924、rs7307331、rs9669474、rs7957463、rs10850956、rs2936840、rs904661、rs1726407、rs1726392、rs17440336、rs1277442、rs11068860、rs11068865、rs17512142、rs17440364、rs364823、rs418941、rs7974718、rs11068891、rs16948230、rs404566、rs16948234、rs17512483、rs17512574、rs2271007、rs11068937、rs7966814、rs6490178、rs905579、rs983421、rs1503767、rs7132650、rs7316050などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7964173、rs11061064、rs10848174、rs7965385、rs7979388、rs7953972、rs4759749、rs4759751、rs7308461、rs1881062、rs10083153、rs729463、rs1881067、rs2695872、rs10848193、rs10848194、rs7305915、rs2398529、rs3864899、rs4412792、rs2632601、rs1554807、rs10848205、rs2037789、rs4619189、rs2001483、rs1609985、rs10848218、rs11061198、rs7307055、rs11061209、rs10773833、rs11061222、rs7299940、rs2141182、rs1405904、rs1316893、rs4074922、rs4388928などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs9521809、rs4773201、rs1106649、rs9521814、rs385037、rs7997619、rs912941、s1886871、rs2182271、rs912942、rs331596、rs9559844、rs331602、rs1536621、rs9521853、rs9559849、rs7999854、rs3858821、rs4771696、rs4773228、rs4773229、rs2765341、rs3742193、rs3742194、rs7323602、rs3759463、rs179356、rs330565、rs7394、rs389656、rs450514、rs445490、rs418321、rs2251314、rs2165418、rs7999702、rs9521926、rs3098728、rs9515279及びrs2582886、NCBI(v36.1)110097814などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs6493469、rs12595526、rs8031702、rs17599974、rs16953045、rs10744956、rs2306335、rs6493470、rs7181201、rs11856609、rs1124769、rs17647040、rs12899586、rs12904155、rs7170455、rs7177664、rs8040954、rs17647084、rs4775916、rs1111266、rs16964077、rs1025738、rs7179084、rs7176579、rs16964113、rs10519293、rs17522553、rs12324478、rs1075681、rs2899469、rs8031580、rs8029120、rs4774583、rs2289105、rs8034835、rs6493489、rs16964201、rs12595627、rs8023263、rs2899473、rs700518、rs3759811、rs17703883、rs1865803、rs4775936、rs10459592、rs17523270、rs10519297、rs11636686、rs11636667、rs1062033、rs2008691、rs11636403、rs10519299、rs17647707、rs17647719、rs7167343、rs936308、rs12594203、rs999480、rs2290622、rs8031463、rs6493495、rs2445765、rs2445766、rs2445768、rs1551656、rs12441382、rs2446420、rs2124873、rs2470184、rs2470187、rs2445781、rs12595284、rs17647970、rs7174434、rs764530、rs12438104、rs16964308、rs4775942、rs16964316、rs2470172、rs2470173、rs16964319、rs10163098、rs12443092、rs2168623、rs3751586、rs2445741、rs8036694、rs2459396及びrs16964348、NCBI(v36.1)49383121などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１７染色体のCA10を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs4794268、rs4794274、rs4399573、rs12051837、rs6504736、rs7208167、rs9303589、rs1468118、rs10491154、rs17695254、rs2073864、rs9912472、rs3764798、rs17695921、rs11867674、rs886078、rs8076197、rs8076496、rs2073866、rs9901183、rs4794293、rs8064617、rs4794294、rs985758、rs4794295、rs16950363、rs2873938、rs1263962、rs1263965、rs1263988、rs1263989、rs4794298、rs4794300、rs8080331、rs11869209、rs1269480、rs1263978、rs1003290、rs1263981、rs1405191、rs1263984、rs9904076、rs4794304、rs8074185、rs6504747、rs16950512、rs7223782、rs4794305、rs16950534、rs1526182、rs1501255、rs4496207、rs1125750、rs1405187、rs767326、rs981577、rs4794307、rs202133、rs16950626、rs9896969、rs202136、rs202121、rs202120、rs203076、rs203090、rs203092、rs203093、rs203097、rs203098、rs10514990、rs203010、rs10514991、rs203022、rs6504754、rs12603762、rs169386、rs203042、rs7215008、rs996379、rs4794315、rs1501253、rs203050、rs203002、rs1005092、rs9896168、rs8065627、rs16950939、rs2907784、rs11079991、rs1393735、rs2970016、rs1875675、rs2938139、rs1354275、rs7224915、rs9893317、rs1503059、rs2970052、rs11655715、rs1155218、rs2931368、rs2931365、rs2931364、rs9908649、rs1486745、rs4605214、rs1503041、rs10514997、rs10514998、rs11079993、rs1503050、rs1503051、rs10515000、rs12949235、rs1393734、rs17678475、rs16951169、rs12150128、rs16951176、rs16951177、rs9903651、rs10515001、rs1847245、rs12150499、rs6504764などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs8086948、rs12457951、rs11151371、rs17077389、rs1480679、rs5000099、rs1480682、rs433411、rs370944、rs395074、rs379982、rs281571、rs1444106、rs2448716、rs1562072、rs1867412、rs17077583、rs764133、rs17828615、rs2440515、rs10503119、rs2318439、rs12607172、rs9319737、rs1444112、rs2448755、rs2448745、rs2440527、rs28379561、rs10503118、rs1562070、rs2448727、rs17077858、rs12605273、rs2440540、rs4127445、rs7231324、rs12964913、rs9319739、rs17077963、rs12954315、rs4127447、rs7243836、rs8085641、rs2054299、rs515540、rs519360、rs17078114、rs2613163、rs652082、rs638006、rs3911662、rs12966846、rs3845265、rs11661918、rs11151403、rs9953435などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs1884029、rs6072606、rs2207220、rs4812571、rs4572656、rs2013923、rs4812574、rs6513762、rs6513763、rs6029950、rs2144009、rs2866941、rs6102658、rs2144011、rs3787282、rs746413、rs4812578、rs6102671、rs1126101、rs6065434、rs4810352、rs1076666、rs6029980、rs6016688、rs2076249、rs17221018、rs17221067、rs17312515、rs17221137、rs6130047、rs16986551、rs17221326、rs16986558、rs12625871、rs6016698、rs6030014、rs17221823、rs1883377、rs6016705、rs2179336、rs2143008、rs6030030、rs2206169、rs6102713、rs6093598、rs6030070、rs6030071、rs1014757、rs2143632、rs6030076、rs16986712、rs727337、rs727336、rs6030096、rs11906485、rs2867026、rs16986733、rs11698118、rs6124439、rs11696306、rs1016071、rs6030124、rs1573707、rs6016745、rs12481463、rs4812588、rs6102795、rs11697499、rs4812591、rs916327、rs1883269、rs16986850、rs1033414、rs11700137、rs6072747、rs999114、rs999113、rs6016798、rs2076082、rs6065482、rs6065484、rs6065487、rs6130145、rs230153、rs230154、rs172981、rs230155、rs6072758、rs230157、rs6124468、rs6102880、rs6130153、rs6065504、rs6065509、rs6072789、rs1033643、rs13040647、rs16987042、rs6030322、rs6072792、rs4482557、rs6130168、rs6030341、rs17747544、rs6065515、rs1883843、rs8119203、rs10854226、rs6102929、rs8121443、rs6030363、rs6102950、rs2867488、rs7360934、rs909863、rs6030370、rs6030380、rs6030381、rs9974028、rs6093705、rs6030385、rs6102967、rs2223542、rs6030395、rs6065520、rs6072814、rs2206426、rs6016864、rs6072819、rs6030407、rs6065525、rs2425520、rs2425530、rs4812631、rs4810366、rs2017914、rs3092557、rs17749109、rs4812637、rs6030442、rs6030443、rs1018407、rs6016884、rs1022819、rs733976、rs6030456、rs6093729、rs6030462、rs17749217、rs2146615、rs8119733、rs13042473、rs6103041、rs1973949、rs208256、rs208254、rs3092043、rs2077768、rs208250、rs4812645、rs6130222、rs4812655、rs6130232、rs208230、rs208229、rs6065544、rs6065545、rs6065546、rs7262282、rs7262355、rs11699742、rs8125304、rs6065547、rs4812659、rs16987493、rs208272、rs208273、rs4315585、rs208186、rs208197、rs206636、rs6030572、rs4812664、rs4812665、rs16987668、rs206148、rs206154、rs206159、rs206163、rs2208048、rs2425546、rs2425553、rs2425554、rs2425560、rs2425562、rs1106978、rs6030634、rs6016951、rs1006746、rs2425587、rs927058、rs2425593、rs2425599、rs2425610、rs16987770、rs6016963、rs6065579、rs1572929、rs6072998、rs6030670、rs947202、rs947203、rs4812681、rs6093784、rs4812683、rs10485698、rs926288、rs1569445、rs6030689、rs2867656、rs11699547、rs6030709及びrs7267873、NCBI(v36.1)40130174などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs12626309、rs2834231、rs4817579、rs2834238、rs2211689、rs2834246、rs2834251、rs2834252、rs1537097、rs1892589、rs2073368、rs2409499、rs9978415、rs2268247、rs9979937、rs2834264、rs2834268、rs879261、rs2245099、rs1108000、rs9979150、rs743316、rs2300384、rs3746861、rs2834292、rs2834295、rs2040113、rs2834296、rs2834297、rs2239565、rs17655810、rs12626410、rs2834303、rs2236645、rs2834310、rs16991110、rs2070513、rs2032312、rs2032313、rs2834315、rs11088265、rs17730050、rs2834332などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第２染色体のLRP2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs13416802、rs2287616、rs2287613、rs3770597、rs10200158、rs6761690、rs13430236、rs3814381、rs4148765、rs10490134、rs11902639、rs10183805、rs13403114、rs3815574、rs2302698、rs6750251、rs4667590、rs4668121、rs1990702、rs6746604、rs990627、rs990626、rs2268380、rs6733122、rs2284681、rs11679947、rs10490132、rs2239602、rs2024481、rs741378、rs2284679、rs4287730、rs10210408、rs1548936、rs3770604、rs2075248、rs10490131、rs10169232、rs2239600、rs2284675、rs2268373、rs2268372、rs2193193、rs2268370、rs6747692、rs2300445、rs2239598、rs2239597、rs2239596、rs2239594、rs830957、rs830959、rs12988804、rs831002、rs16856748、rs11887007、rs16856759、rs830964、rs830971、rs830972、rs2247506、rs3845731、rs3770636、rs2673172、rs6713072、rs1990842、rs10199676、rs830955、rs12616998、rs12613663、rs10930354、rs4281872、rs12052892などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs523246、rs10501136、rs836950、rs12808574、rs10836315、rs502857、rs731726、rs731727、rs967751、rs1553760、rs1396880、rs2941043、rs2941042、rs2941061、rs2956079、rs2941054、rs1509662、rs2941052、rs2915234、rs891550、rs919554、rs2915232、rs2956086、rs1998603、rs2985390、rs1571134、rs1571135、rs2915224、rs1430855、rs2985389、rs3751078、rs2915223、rs2915220、rs2986425、rs2986427、rs1326940、rs1326941、rs1326942、rs2986429、rs2915217、rs7111607、rs2915214、rs984690、rs3763934、rs10488801、rs2956106、rs11032927、rs2915202、rs2915201、rs2915199、rs1998912、rs2915193、rs11032937、rs2915227、rs2732557、rs10836326、rs2767038、rs10488806、rs2732564、rs2732565、rs2767033、rs1409716、rs2762955、rs952489、rs514182、rs1425806、rs2732528、rs2553794、rs2553793、rs678137、rs2785156、rs2553787、rs737503、rs737502、rs2162159、rs2732552、rs387619、rs10836332、rs353610、rs353605、rs2785189、rs2553822、rs11032995、rs12291631、rs353590、rs353589、rs353587、rs1559759、rs4756190、rs353581、rs7106681、rs507230、rs634096、rs2732578、rs404977、rs4756191、rs2785180などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs7979656、rs10849918、rs2106407、rs2106406、rs12425190、rs11065783、rs2339706、rs4509829、rs7961663、rs4766526、rs4766442、rs4766443、rs12815195、rs12229654、rs756825、rs16941284、rs6489979、rs4766553、rs9783423、rs7952972、rs16941319、rs3809290、rs7962233、rs4766451、rs886126、rs2078851、rs1265566、rs2301658、rs7300082、rs7300860、rs16941414、rs7398833、rs16941437、rs10849946、rs2078863、rs11065898などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
ヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域における多型部位としては、一塩基多型国際番号rs2332297、rs2934884、rs16955216、rs2934890、rs7225247、rs16955225、rs9303359、rs7207731、rs17683089、rs11658131、rs2958944、rs2934909、rs2934914、rs2934921、rs2958933、rs7221313、rs7210248、rs2958921、rs8079105、rs16955327、rs12949718、rs9899602、rs17745123、rs8070668、rs9910653、rs17817829、rs12936860、rs12951898、rs17817950及びrs2787501、NCBI(v36.1)50344775などを例示することができるが、これらに限定されることはない。
本明細書において、一塩基多型(SNP)は、dbSNPデータベースにおけるrs番号又はNCBI(v36.1)番号で示す。
本明細書において、「正常眼圧緑内障の検査」とは、被検者が正常眼圧緑内障に罹患する可能性が高いか低いかを判定するための検査、すでに被検者が正常眼圧緑内障に罹患している場合にはその確定診断を行うための検査が含まれる。
本発明の検査方法における「多型部位」は、遺伝子のＯＲＦ中、遺伝子の発現を制御する領域（例えば、プロモーター領域、エンハンサー領域等）中、遺伝子のイントロン中、あるいはこれら遺伝子と連鎖不平衡にあるその前後の領域に存在しうる。多型の種類としては、例えば、一塩基多型、一から数十塩基（時には数千塩基）が置換、欠失、挿入、転移あるいは逆位している多型などが挙げられるが、これらに特に限定されない。さらに、多型部位の数も、1個に限定されず、複数個であってもよい。
本発明の検査方法において、多型部位の塩基の同定（すなわち、塩基種の決定）は、下記の方法によって行うことができる。
・抽出したゲノムDNA、転写産物、または多型領域を含むPCR で増幅したDNAを鋳型にして遺伝子配列を直接決定する方法。
・多型配列が制限酵素認識部位である場合、制限酵素切断パターンの相違を利用して、遺伝子型を決定する方法。
・多型領域に相補するプライマーの親和性が異なる結果、ポリメラーゼ塩基伸展反応の有無、あるいは程度を検出する方法。
・多型領域におけるポリメラーゼ塩基伸展反応の結果得られたDNAの分子量あるいは質量を測定する方法。
・多型部分に特異的なプローブを用いたハイブリダイゼーションの強度を比較する方法。
・多型領域における鋳型特異的なプライマーから開始されるポリメラーゼ塩基伸長反応の際、多型部位に取り込まれる塩基を特定する方法。
・鋳型特異的なプライマーに続いて多型領域に相補的な塩基対または非相補
的な塩基対の有無を酵素によって認識させる方法。
以上は代表的なＳＮＰ検出方法であるが、本発明の正常眼圧緑内障の検査においては、これらの方法に限定されるわけではない。
多型部位の塩基を同定するために、被検者の生体試料からゲノムＤＮＡを抽出するとよい。生体試料は、例えば、被検者の血液、皮膚、口腔粘膜、手術により採取あるいは切除した組織または細胞、検査等の目的で採取された体液（唾液、リンパ液、気道粘膜、精液、汗、尿など）等である。生体試料としては、末梢血から分離した白血球又は単核球が好ましい。市販のDNA抽出キットを用いて、生体試料からゲノムＤＮＡを抽出することができる。次いで、必要に応じて、多型部位を含むDNAを単離する。該DNAの単離は、多型部位を含むDNAにハイブリダイズすることができるプライマーを用いて、ゲノムDNA、あるいはRNAを鋳型としたPCR等によって行うことができる。
また、本発明は、正常眼圧緑内障の検査をするための試薬であって、下記の(a)及び(b)の成分からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含む前記試薬を提供する。
(a) ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位を含む領域を増幅することができるプライマー
(b) ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位を含む領域にハイブリダイズすることができるプローブ
ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域における多型部位、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域における多型部位、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域における多型部位、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域における多型部位、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域における多型部位、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域における多型部位、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域における多型部位、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域における多型部位、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域における多型部位、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域における多型部位、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域における多型部位、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域における多型部位、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のROR2を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域における多型部位、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域における多型部位、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域における多型部位、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域における多型部位、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域における多型部位、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域における多型部位、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域における多型部位、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域における多型部位、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域における多型部位、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域における多型部位、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域における多型部位、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域における多型部位、ヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域における多型部位としては、上記のものを例示することができる。
さらにまた、本発明は、上記の試薬を含む、正常眼圧緑内障の検査キットを提供する。
上記のプライマー及びプローブは、少なくとも15ヌクレオチドの鎖長を有するオリゴヌクレオチドであるとよい。該オリゴヌクレオチドをプライマーとして用いる場合、その長さは、通常15bp〜100bpであり、好ましくは17bp〜30bpである。プライマーは、上記多型部位を含むDNAの少なくとも一部を増幅しうるものであれば、特に制限されない。プライマーが増幅することができるDNAの長さは、通常、１５〜１０００ｂｐ、好ましくは、２０〜５００ｂｐ、より好ましくは２０〜２００ｂｐである。また、該オリゴヌクレオチドをプローブとして用いる場合、その長さは、通常15bp〜500bpであり、好ましくは30bp〜500bpである。プローブは、上記多型部位を含むDNAとハイブリダイズしうるものであれば、特に制限されない。プローブがハイブリダイズできるＤＮＡの長さは、通常、１６〜５００ｂｐ、好ましくは、２０〜２００ｂｐ、より好ましくは２０〜５０ｂｐである。
本発明において、多型部位を含む領域を増幅することができるプライマーは、多型部位を含むDNAを鋳型として、多型部位に向かって相補鎖合成を開始することができるものであるとよい。
プライマーには、多型部位を含む領域の塩基配列に相補的な塩基配列に加え、任意の塩基配列を付加することができる。例えば、IIs型の制限酵素を利用した多型の解析方法のためのプライマーにおいては、IIs型制限酵素の認識配列を付加したプライマーが利用される。更に、プライマーは修飾してもよい。例えば、蛍光物質や、ビオチンまたはジゴキシンのような結合親和性物質で標識したプライマーを利用してもよい。
本発明において、多型部位を含む領域にハイブリダイズすることができるプローブは、多型部位を含む領域の塩基配列を有するポリヌクレオチドとハイブリダイズすることができるものであればよく、多型部位を含む領域の塩基配列を有するDNAに特異的にハイブリダイズするものが好ましい。ここで「特異的にハイブリダイズする」とは、通常のハイブリダイゼーション条件下、好ましくはストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下（例えば、サムブルックら,Molecular Cloning,Cold Spring Harbour Laboratory Press,New York,USA,第２版1989に記載の条件）において、多型部位を含む領域の塩基配列を有するDNA以外のDNAとクロスハイブリダイゼーションを有意に生じないことを意味する。より具体的には、プローブの塩基配列中に多型部位を含むプローブが好ましい。あるいは、多型部位における塩基の解析方法によっては、プローブの末端が多型部位に隣接する塩基に対応するように、デザインされる場合もある。従って、プローブ自身の塩基配列には多型部位が含まれないが、多型部位に隣接する領域に相補的な塩基配列を含むプローブも、本発明における望ましいプローブとして示すことができる。
プローブには、プライマーと同様に、塩基配列の改変、塩基配列の付加、あるいは修飾が許される。例えば、Invader法に用いるプローブは、フラップを構成するゲノムとは無関係な塩基配列が付加される。このようなプローブも、多型部位を含む領域にハイブリダイズする限り、本発明のプローブに含まれる。本発明のプローブを構成する塩基配列は、ゲノムにおける本発明の多型部位の周辺DNA領域の塩基配列をもとに、解析方法に応じてデザインすることができる。
当業者であれば、多型部位を含む周辺DNA領域についての塩基配列情報を基に、解析手法に応じたプライマー及びプローブをデザインすることができる。プライマー及びプローブを構成する塩基配列は、ゲノムの塩基配列に対して完全に相補的な塩基配列のみならず、適宜改変することができる。
プライマー及びプローブは、それを構成する塩基配列をもとに、任意の方法によって合成することができる。与えられた塩基配列に基づいて、当該塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを合成する手法は公知である。更に、オリゴヌクレオチドの合成において、蛍光色素やビオチンなどで修飾されたヌクレオチド誘導体を利用して、オリゴヌクレオチドに任意の修飾を導入することもできる。あるいは、合成されたオリゴヌクレオチドに、蛍光色素などを結合する方法も公知である。
プローブは、固相に固定されていてもよい（ＤＮＡアレイ）。DNAアレイは、同一平面上に配置した多数のプローブに対してサンプルDNA（あるいはRNA）をハイブリダイズさせ、当該平面をスキャンすることによって、各プローブに対するハイブリダイズが検出される。多くのプローブに対する反応を同時に観察することができることから、例えば、多数の多型部位について同時に解析するには、DNAアレイは有用である。ヌクレオチドの固定（アレイ）方法として、Affymetrix社開発によるオリゴヌクレオチドを基本としたアレイが例示できる。オリゴヌクレオチドのアレイにおいて、オリゴヌクレオチドは通常in situで合成される。例えば、リソグラフィー方式（Affymetrix社）、インクジェット方式(Agilent社)、ビーズアレイ方式(Illumina社)等によるオリゴヌクレオチドのin situ合成法が知られている。
オリゴヌクレオチドは、検出すべき多型部位を含む領域に相補的な塩基配列で構成される。基板に結合させるヌクレオチドプローブの長さは、オリゴヌクレオチドを固定する場合は、通常10〜100ｂｐであり、好ましくは10〜50ｂｐであり、さらに好ましくは15〜25ｂｐである。
DNAアレイ法によるSNP検出のための試料は、被検者から採取された生体試料をもとに当業者に周知の方法で調製することができる。生体試料は特に限定されない。例えば被検者の末梢血白血球、皮膚、口腔粘膜等の組織または細胞、涙、唾液、尿、糞便または毛髪から抽出したゲノムDNAから、DNA試料を調製することができる。判定すべき多型部位を含む領域を増幅するためのプライマーを用いて、ゲノムDNAの特定の領域が増幅される。このとき、マルチプレックスPCR法によって複数の領域を同時に増幅することができる。マルチプレックスPCR法とは、複数組のプライマーセットを、同じ反応液中で用いるPCR法である。複数の多型部位を解析するときには、マルチプレックスPCR法が有用である。
一般にDNAアレイ法においては、PCR法によってDNA試料を増幅するとともに、増幅産物が標識される。増幅産物の標識には、標識を付したプライマーが利用される。例えば、まず多型部位を含む領域に特異的なプライマーセットによるPCR法でゲノムDNAを増幅する。次に、ビオチンラベルしたプライマーを使ったラベリングPCR法によって、ビオチンラベルされたDNAを合成する。こうして合成されたビオチンラベルDNAを、チップ上のオリゴヌクレオチドプローブにハイブリダイズさせる。ハイブリダイゼーションの反応液および反応条件は、固相に固定するヌクレオチドプローブの長さや反応温度等の条件に応じて、適宜調整することができる。当業者は、適切なハイブリダイゼーションの条件をデザインすることができる。ハイブリダイズしたDNAを検出するために、蛍光色素で標識したアビジンが添加される。アレイをスキャナで解析し、蛍光を指標としてハイブリダイズの有無を確認する。
ＤＮＡアレイ法を用いて本発明の検査方法を実施する手順の一例を示せば、被検者から調製した多型部位を含むDNA及びヌクレオチドプローブが固定された固相を用意した後、該DNAと該固相を接触させる。次いで、固相に固定されたヌクレオチドプローブにハイブリダイズしたDNAを検出することにより、多型部位の塩基種を決定する。
本明細書において「固相」とは、ヌクレオチドを固定することが可能な材料を意味する。固相は、ヌクレオチドを固定することが可能であれば特に制限はないが、具体的には、マイクロプレートウェル、プラスチックビーズ、磁性粒子、基板などを含む固相等を例示することができる。固相としては、一般にDNAアレイ技術で使用される基板を好適に用いることができる。本明細書において「基板」とは、ヌクレオチドを固定することが可能な板状の材料を意味する。また、本発明においてヌクレオチドには、オリゴヌクレオチドおよびポリヌクレオチドが含まれる。
上記の方法以外にも、特定部位の塩基を検出するために、アレル特異的オリゴヌクレオチド（Allele Specific Oligonucleotide／ASO）ハイブリダイゼーション法が利用できる。アレル特異的オリゴヌクレオチド(ASO)は、検出すべき多型部位が存在する領域にハイブリダイズする塩基配列で構成される。ASOを試料DNAにハイブリダイズさせるとき、多型によって多型部位にミスマッチが生じるとハイブリッド形成の効率が低下する。ミスマッチは、サザンブロット法や、特殊な蛍光試薬がハイブリッドのギャップにインターカレーションすることにより消光する性質を利用した方法等によって検出することができる。また、リボヌクレアーゼAミスマッチ切断法によって、ミスマッチを検出することもできる。
本発明の試薬およびキットには、塩基の同定方法に応じて、各種の酵素、酵素基質、および緩衝液などを含めることができる。酵素としては、DNAポリメラーゼ、DNAリガーゼ、あるいはIIs制限酵素などの、上記の塩基同定方法として例示した各種の解析方法に必要な酵素を示すことができる。緩衝液は、これらの解析に用いる酵素の活性の維持に好適な緩衝液が、適宜選択される。更に、酵素基質としては、例えば、相補鎖合成用の基質等が用いられる。
さらに、本発明の試薬およびキットには、多型部位における塩基が明らかな対照を添付することができる。対照としては、予め多型部位の塩基種が明らかなゲノムDNA、あるいはゲノムDNAの断片を用いることができる。ゲノムDNAは、細胞から抽出されたものを対照として添付してもよいし、あるいは、細胞又は細胞の分画を対照として添付しておき、そこから使用者がゲノムDNAを抽出してもよい。細胞を対照として用いれば、対照の結果によってゲノムDNAの抽出操作が正しく行われたことを証明することができる。あるいは、多型部位を含む塩基配列からなるDNAを対照として用いることもできる。具体的には、多型部位における塩基種が明らかにされたゲノム由来のDNAを含むYACベクターやBACベクターを対照として用いてもよい。あるいは多型部位に相当する数十から数百ｂｐのみを切り出して挿入したベクターを対照として用いることもできる。
また、本発明は、ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域、ヒト第９染色体のROR2を含む領域、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域、並びにヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域からなる群より選択される少なくとも１個の領域における少なくとも１個の多型部位を含む最長１０００塩基長の連続したＤＮＡ部分配列又はその相補鎖からなるポリヌクレオチドを含む正常眼圧緑内障診断用マーカー遺伝子を提供する。
ヒト第６染色体のELOVL5を含む領域における多型部位、ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域における多型部位、ヒト第３染色体のARPP-21を含む領域における多型部位、ヒト第４染色体のEPHA5を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体のGMDSを含む領域における多型部位、ヒト第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体のSYTL3を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のNXPH1を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のLHFPL3を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のGLB1L3を含む領域における多型部位、ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のPAX7を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のPTPRFを含む領域における多型部位、ヒト第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1を含む領域における多型部位、ヒト第１染色体のPKP1を含む領域における多型部位、ヒト第２染色体のKLHL29及び/又はFLJ14126を含む領域における多型部位、ヒト第３染色体のTHRBを含む領域における多型部位、ヒト第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171を含む領域における多型部位、ヒト第４染色体のSORBS2を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のMAST4を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のGLRX及び/又はC5orf27を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のEBF1を含む領域における多型部位、ヒト第５染色体のDOCK2を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第６染色体のLOC100132919を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のAAA1及び/又はNPSR1を含む領域における多型部位、ヒト第７染色体のELMO1を含む領域における多型部位、ヒト第８染色体のTNKSを含む領域における多型部位、ヒト第８染色体のANGPT1を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のPGM5を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のTMC1を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のROR2を含む領域における多型部位、ヒト第９染色体のPPP6C及び/又はC9orf126を含む領域における多型部位、ヒト第１０染色体のGRID1を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のOR5R1を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のMS4A7及び/又はMS4A14を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体の11q23-24(PCSK7及び／又はRNF214を含む) を含む領域における多型部位、ヒト第１２染色体のTAOK3を含む領域における多型部位、ヒト第１２染色体のSTX2を含む領域における多型部位、ヒト第１３染色体のCARS2を含む領域における多型部位、ヒト第１５染色体のCYP19A1を含む領域における多型部位、ヒト第１７染色体のCA10を含む領域における多型部位、ヒト第１８染色体のLOC643542を含む領域における多型部位、ヒト第２０染色体のPTPRTを含む領域における多型部位、ヒト第２１染色体のITSN1を含む領域における多型部位、ヒト第２染色体のLRP2を含む領域における多型部位、ヒト第１１染色体のAPIP及び/又はPDHXを含む領域における多型部位、ヒト第１２染色体のCUX2を含む領域における多型部位、ヒト第１７染色体のTOM1L1を含む領域における多型部位としては、上記のものを例示することができる。
本発明のマーカー遺伝子は、通常、１０塩基長以上、好ましくは２０塩基長以上の長さである。例えば、上記多型部位を含む５０塩基長、１００塩基長、２００塩基長、３００塩基長、６００塩基長、１０００塩基長などの長さでありうる。本発明のマーカー遺伝子の全長塩基配列を決定することにより、その遺伝子のORF、その遺伝子の発現を制御する領域（例えば、プロモーター領域、エンハンサー領域等）などを決定することができる。さらには、ORFがコードするポリペプチドのアミノ酸配列を決定することができる。上記遺伝子領域やポリペプチドは、正常眼圧緑内障の病因又は発症機序に関与している可能性が高いため、それらの機能を促進又は阻害することにより、正常眼圧緑内障を予防及び/又は治療できる可能性がある。
本発明のマーカー遺伝子のDNA配列がコードするポリペプチドは、該DNA配列（少なくとも翻訳領域を含有するその断片でもよい）を含有するベクターで形質転換した宿主細胞を培養し、培養物から該ポリペプチドを採取することにより製造することができる。本発明は、本発明のマーカー遺伝子のＤＮＡ配列を含有するベクター、該ベクターで形質転換した宿主細胞も提供するものである。
本発明のマーカー遺伝子のDNA配列は、例えば、以下のようにして製造することができる。ヒト生体試料（例えば、健常者や患者の血液）からmRNAを抽出し、逆転写酵素およびオリゴdTプライマーを用いてcDNAを合成する。これを鋳型として、本発明のマーカー遺伝子をPCRによって増幅する。
本発明のマーカー遺伝子のDNA配列を含有するベクター（組換えベクター）は、公知の方法（例えば、Molecular Cloning２nd Edition, J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989に記載の方法）により、本発明のマーカー遺伝子のDNA配列を適当な発現ベクターに挿入することにより得られる。
発現ベクターとしては、大腸菌由来のプラスミド（例、ｐＢＲ３２２，ｐＢＲ３２５，ｐＵＣ１２，ｐＵＣ１３）、枯草菌由来のプラスミド（例、ｐＵＢ１１０，ｐＴＰ５，ｐＣ１９４）、酵母由来プラスミド（例、ｐＳＨ１９，ｐＳＨ１５）、λファージなどのバクテリオファージ、レトロウイルス，ワクシニアウイルスなどの動物ウイルス、バキュロウイルスなどの昆虫病原ウイルスなどを用いることができる。
発現ベクターには、プロモーター、エンハンサー、スプライシングシグナル、ポリＡ付加シグナル、選択マーカー、SV40複製オリジンなどを付加してもよい。
また、発現ベクターは、融合タンパク質発現ベクターであってもよい。種々の融合タンパク質発現ベクターが市販されており、pGEXシリーズ（アマシャムファルマシアバイオテク社）、pET CBD Fusion System 34b-38b（Novagen社）、pET Dsb Fusion Systems 39b and 40b（Novagen社）、pET GST Fusion System 41 and 42（Novagen社）などを例示することができる。
本発明のマーカー遺伝子のDNA配列を含有するベクター（組換えベクター）を宿主細胞に導入することにより、形質転換体を得ることができる。
宿主細胞としては、細菌細胞（例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、枯草菌など）、真菌細胞（例えば、酵母、アスペルギルスなど）、昆虫細胞（例えば、S2細胞、Sf細胞など）、動物細胞（例えば、CHO細胞、COS細胞、HeLa細胞、C127細胞、3T3細胞、BHK細胞、HEK293細胞など）、植物細胞などを例示することができる。
組換えベクターを宿主に導入するには、Molecular Cloning２nd Edition, J. Sambrook et al., Cold Spring Harbor Lab. Press, 1989に記載の方法（例えば、リン酸カルシウム法、DEAE-デキストラン法、トランスフェクション法、マイクロインジェクション法、リポフェクション法、エレクロトポレーション法、形質導入法、スクレープローディング法、ショットガン法など）または感染により行うことができる。
形質転換体を培地で培養し、培養物からマーカー遺伝子のDNA配列がコードするポリペプチドを採取することができる。ポリペプチドが培地に分泌される場合には、培地を回収し、その培地からポリペプチドを分離し、精製すればよい。ポリペプチドが形質転換された宿主細胞内に産生される場合には、その細胞を溶解し、その溶解物からポリペプチドを分離し、精製すればよい。
ポリペプチドが別のタンパク質（タグとして機能する）との融合タンパク質の形態で発現される場合には、融合タンパク質を分離及び精製した後に、FactorXaや酵素（エンテロキナーゼ）処理をすることにより、別のタンパク質を切断し、目的とするポリペプチドを得ることができる。
ポリペプチドの分離及び精製は、公知の方法により行うことができる。公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法などの溶解度の差を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ過法、およびＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動法などの分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィーなどの荷電の差を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーなどの疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動法などの等電点の差を利用する方法などが用いられる。
以下、実施例に基づいて本発明を詳細に説明するが、本発明はこれらの実施例に限定されるものではない。
〔実施例１〕
NTGは多くの遺伝要因が多数重なることにより発症の危険度が増大する多因子疾患であると考えられている。NTGの疾患感受性遺伝子を同定し、それをもとに迅速遺伝子診断キットを開発することで、NTGの早期発見しいては早期診断に繋がることが期待される。現在までにNTGを含む緑内障の疾患感受性遺伝子としてMYOC遺伝子、OPA1遺伝子やOPTN遺伝子などが報告されているが、いずれも緑内障患者の数％にしか見られず、日本人においてはほとんど相関を示さない。したがって、本発明者は、NTGの疾患感受性遺伝子を網羅的に同定するため、Affymetrix社のGeneChip Mapping 500k Array setを用いて、50万以上のSNPをハイスループットに一度に解析を行うことで、全ゲノム領域を対象とした網羅的な遺伝子スクリーニングを行った。また、本研究の解析データは膨大な量になり、従来のデータベースでは扱えない容量であるため、大規模な量のSNPを用いた相関解析に対応するSNP解析用データベースの開発を行った。
(1)50万SNP解析用データベースの構築
統計学的解析に用いるデータベースは従来のデータベースを大規模SNPタイピングに使用できるように改変・作成した。本発明者の研究室で現在SNP解析に使用しているデータベースはTaqman(登録商標)SNP Genotyping Assay用であり、統計計算とHardy-Weinberg検定が可能なものである。現在稼動中のデータベース管理システムに準じ、(i)Gene Chip 250kおよび500ｋのSNPタイピング出力ファイル（Textファイル）をデータベース入力用ファイルとしてデータ入力できること、(ii)GTYPEで使用されているSNP IDとrs番号・位置情報・近傍の遺伝子情報・人種別既知アリル情報（Hapmap）との対応が管理できること、(iii)Haploview他、各種解析ソフトの入力用テキストフォーマットを任意に指定して出力ファイルとして得られることなど、新しい機能を付加し、登録データや解析結果の検索・ソート・抽出表示が可能なデータベースの構築を行った。
(2)500k GeneChipを用いた全ゲノム網羅的SNP解析
横浜市立大学ほか共同研究医療機関において年齢、眼圧、屈折異常など厳密なクライテリアを満たしたNTG患者血液白血球を収集した。QIAamp DNA Blood Maxi Kitを用いてDNAを抽出した。DNAチップの解析方法はAffymetrix社のプロトコールに準拠して行った。疾患感受性遺伝子のスクリーニング法としてAffymetrix社GeneChipのHuman Mapping 500k Array setを用いたSNP解析を行った。Gene ChipのMapping 500k Array setは2枚の高密度オリゴヌクレオチドアレイ(250k Array)、NspIとStyIからなり、各アレイは平均25万SNPをジェノタイピングすることが可能である。Mapping 500k setの全てのSNPは厳密なスクリーニングと評価実験を受けている。1度の実験で50万以上のSNPのジェノタイピングを行えることから、全ゲノムの網羅的な解析ツールとして有用である。まず、PicoGreen定量キット(PicoGreen ds DNA Quantification Reagent and Kit 200-2000 assay)を用いてDNA濃度を定量し、各サンプルのDNA濃度が均一になるように調製した。その後、全ゲノムを制限酵素で切断し、4塩基の特異的突出端末を認識するアダプターをライゲーションした。アダプターを付加したDNA断片をPCRで増幅し、フラグメント化して標識した後、Mapping 250k Arrayにハイブリダイゼーションさせた。蛍光で染色し、レーザースキャナーで各プローブの蛍光強度から各SNPの対立遺伝子をDirect Model (DM) Algorithm（DMアルゴリズム）を用いて解析を行った。得られた結果からSNPごとに患者群と健常群の対立遺伝子分布を統計学的に解析し、疾患と相関する遺伝子の決定を行う。実験精度とコンタミネーションの評価はmodified partitioning aroundmethods (MPAM) algorithm（MPAMアルゴリズム）にて行った。
NTG患者266検体についてAffymetrix社GeneChip(登録商標)mapping 500kアレイを用いたSNPタイピングを終了した。SNPのcall rate（解析が適切に行われたSNPの割合）はNspIとStyIの両アレイともに平均95％以上と良好なタイピング精度を示した。患者255検体、健常者187検体ずつを対象に統計解析を行った結果、16,562個のSNPがP値0.05未満の陽性を示した。これらのSNPについてジェノタイピングの精度の評価を行うとともに、遺伝子型のタイピングエラーおよび妥当性を評価するため、ハーディーワインバーグ検定を行い、統計解析不向きなSNPを除外したところ、最終的に15,729個のSNPがP値0.05未満を示した。疾患とより顕著な相関を示すP値0.00001未満では24個のSNPが陽性を示した。
これらの遺伝子の中で次の３つの条件を満たすものをさらに重要な正常眼圧緑内障の疾患感受性遺伝子とした。
１．HapMapデータベースと比較し、健常者のアリル頻度が妥当である。
２．近接するSNPも同様に疾患と相関している。
３．SNPは遺伝子上または遺伝子近傍に位置する。
第６染色体のELOVL5領域を含む0.5Mbについて、この結果を表１及び図１に示す。
第２染色体のSRBD1領域を含む0.5Mbについて、この結果を表２及び図２に示す。
第３染色体のARPP-21領域を含む500Kbについて、この結果を表３及び図３に示す。
第４染色体のEPHA5領域を含む500Kbについて、この結果を表４及び図４に示す。
第６染色体のGMDS領域を含む1500Kbについて、この結果を表５及び図５に示す。
第６染色体の6p21.3（HSPA1Bを含む）領域を含む500Kbについて、この結果を表６及び図６に示す。
第６染色体のSYTL3領域を含む500Kbについて、この結果を表７及び図７に示す。
第７染色体のNXPH1領域を含む500Kbについて、この結果を表８及び図８に示す。
第７染色体のLHFPL3領域を含む500Kbについて、この結果を表９及び図９に示す。
第１１染色体のGLB1L3領域を含む300Kbについて、この結果を表１０及び図１０に示す。
第１８染色体のZNF407領域を含む500Kbについて、この結果を表１１及び図１１に示す。
第１染色体のPAX7領域を含む300Kbについて、この結果を表１２及び図１２に示す。
第１染色体のPTPRF領域を含む300Kbについて、この結果を表１３及び図１３に示す。
第１染色体の1q12-q21.1（CHD1L及び／又はFMO5を含む）領域を含む500Kbについて、この結果を表１４及び図１４に示す。
第１染色体の1q21.2-q21.3（FDPS及び／又はASH1L及び／又はKCNN3を含む）領域を含む3000Kbについて、この結果を表１５及び図１５に示す。
第１染色体のFAM5B及び／又はASTN1領域を含む300Kbについて、この結果を表１６及び図１６に示す。
第１染色体のPKP1領域を含む300Kbについて、この結果を表１７及び図１７に示す。
第２染色体のKLHL29, FLJ14126領域を含む500Kbについて、この結果を表１８及び図１８に示す。
第３染色体のTHRB領域を含む500Kbについて、この結果を表１９及び図１９に示す。
第３染色体のMED12L及び／又はCLRN10S及び／又はGPR171領域を含む500Kbについて、この結果を表２０及び図２０に示す。
第４染色体のSORBS2領域を含む500Kbについて、この結果を表２１及び図２１に示す。
第５染色体のMAST4領域を含む600Kbについて、この結果を表２２及び図２２に示す。
第５染色体のGLRX, C5orf27領域を含む200Kbについて、この結果を表２３及び図２３に示す。
第５染色体のEBF1領域を含む500Kbについて、この結果を表２４及び図２４に示す。
第５染色体のDOCK2領域を含む500Kbについて、この結果を表２５及び図２５に示す。
第６染色体の6p21.31-p21.3（HLA-DPA1を含む）領域を含む1000Kbについて、この結果を表２６及び図２６に示す。
第６染色体のLOC100132919領域を含む200Kbについて、この結果を表２７及び図２７に示す。
第７染色体のAAA1, NPSR1領域を含む600Kbについて、この結果を表２８及び図２８に示す。
第７染色体のELMO1領域を含む700Kbについて、この結果を表２９及び図２９に示す。
第８染色体のTNKS領域を含む500Kbについて、この結果を表３０及び図３０に示す。
第８染色体のANGPT1領域を含む500Kbについて、この結果を表３１及び図３１に示す。
第９染色体のPGM5領域を含む200Kbについて、この結果を表３２及び図３２に示す。
第９染色体のTMC1領域を含む500Kbについて、この結果を表３３及び図３３に示す。
第９染色体のROR2領域を含む500Kbについて、この結果を表３４及び図３４に示す。
第９染色体のPPP6C, C9orf126領域を含む500Kbについて、この結果を表３５及び図３５に示す。
第１０染色体のGRID1領域を含む1000Kbについて、この結果を表３６及び図３６に示す。
第１１染色体の11p11.2（SPI1及び／又はSLC39A13及び／又はPSMC3及び／又はRAPSN及び／又はNUP160を含む）領域を含む1000Kbについて、この結果を表３７及び図３７に示す。
第１１染色体のOR5R1領域を含む200Kbについて、この結果を表３８及び図３８に示す。
第１１染色体のMS4A7, MS4A14領域を含む300Kbについて、この結果を表３９及び図３９に示す。
第１１染色体のMAP6及び／又はGDPD5及び／又はSERPINH1領域を含む300Kbについて、この結果を表４０及び図４０に示す。
第１１染色体の11q23-24(PCSK7, RNF214)領域を含む200Kbについて、この結果を表４１及び図４１に示す。
第１２染色体のTAOK3領域を含む500Kbについて、この結果を表４２及び図４２に示す。
第１２染色体のSTX2領域を含む300Kbについて、この結果を表４３及び図４３に示す。
第１３染色体のCARS2領域を含む300Kbについて、この結果を表４４及び図４４に示す。
第１５染色体のCYP19A1領域を含む500Kbについて、この結果を表４５及び図４５に示す。
第１７染色体のCA10領域を含む700Kbについて、この結果を表４６及び図４６に示す。
第１８染色体のLOC643542領域を含む500Kbについて、この結果を表４７及び図４７に示す。
第２０染色体のPTPRT領域を含む1200Kbについて、この結果を表４８及び図４８に示す。
第２１染色体のITSN1領域を含む500Kbについて、この結果を表４９及び図４９に示す。
第２染色体のLRP2領域を含む500Kbについて、この結果を表５０及び図５０に示す。
第１１染色体のAPIP, PDHX領域を含む300Kbについて、この結果を表５１及び図５１に示す。
第１２染色体のCUX2領域を含む500Kbについて、この結果を表５２及び図５２に示す。
第１７染色体のTOM1L1領域を含む200Kbについて、この結果を表５３及び図５３に示す。
表２〜５３におけるRs Idはrs番号を、Chromosomeは染色体を、PositionはNCBI(v36.1)番号を、Astat2 P Value(2x2)はｐ値を表す。
本発明は、生命科学、医学、眼科学及び診断に利用可能である。
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Claims (4)

  1. ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域中に存在する配列番号１のヌクレオチド配列における27番目の塩基（一塩基多型国際番号rs3213787の多型部位の塩基）及び／又はヒト第１８染色体のZNF407を含む領域中に存在する配列番号２のヌクレオチド配列における27番目の塩基（一塩基多型国際番号rs17832851の多型部位の塩基）を同定することを含む、正常眼圧緑内障の検査方法。
  2. 下記の(a1)、(a2)、(b1)及び(b2)の成分からなる群より選択される少なくとも１つの成分を含む、正常眼圧緑内障の検査をするための試薬。
    (a1) ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域中に存在する配列番号１のヌクレオチド配列における27番目の塩基（一塩基多型国際番号rs3213787の多型部位の塩基）を含む領域を増幅することができるプライマー
    (a2) ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域中に存在する配列番号２のヌクレオチド配列における27番目の塩基（一塩基多型国際番号rs17832851の多型部位の塩基）を含む領域を増幅することができるプライマー
    (b1) ヒト第２染色体のSRBD1を含む領域中に存在する配列番号１のヌクレオチド配列における27番目の塩基（一塩基多型国際番号rs3213787の多型部位の塩基）を含む領域にハイブリダイズすることができるプローブ
    (b2) ヒト第１８染色体のZNF407を含む領域中に存在する配列番号２のヌクレオチド配列における27番目の塩基（一塩基多型国際番号rs17832851の多型部位の塩基）を含む領域にハイブリダイズすることができるプローブ
  3. プローブが固相に固定されている請求項２記載の試薬。
  4. 請求項２又は３記載の試薬を含む、正常眼圧緑内障の検査キット。
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