JP3366933B2 - キシラナーゼ遺伝子、該遺伝子を含むベクター及び形質転換体 - Google Patents
キシラナーゼ遺伝子、該遺伝子を含むベクター及び形質転換体Info
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Description
子、該遺伝子を含むプラスミドベクター及び形質転換体
に関する。キシラナーゼは、植物ヘミセルロースの主要
成分であるβ−1,4−D−キシランをランダムに分解
する酵素であり、正式な名称はエンド−1,4−β−キ
シラナーゼ(EC 3.2.1.8) である。
れるキシランを分解する作用を有することから、広葉樹
キシランからキシロオリゴ糖を生産する技術で活用され
ている他、パルプの漂白に用いる塩素の消費量を減らす
ためのパルプ漂白用酵素としての利用が期待されてい
る。
ーゼ生産能を有する微生物が用いられている。キシラナ
ーゼ生産能を有する微生物としては、主にストレプトマ
イセス属に属する微生物が知られている。しかしなが
ら、これら微生物が有するキシラナーゼ遺伝子の塩基配
列については、未解明であった。
ラナーゼ生産能を有する微生物からキシラナーゼ遺伝子
をクローニングし、該酵素に関する遺伝子の構造を解明
し、該酵素の工業的生産に寄与することである。
を解決するために、まず、ストレプトマイセス オリバ
セオビリディスから抽出したキシラナーゼのN末端塩基
配列を決定した。このN末端塩基配列をもとにして作製
したプライマーを用い、該微生物から抽出したゲノムD
NAを鋳型としてPCR反応を行った。得られたPCR
産物(配列表の配列番号6参照)をプローブとして、イ
ンバースPCR(Nucleic Acid Research 16号,81
86頁,1988年)を実施してキシラナーゼ前駆体の
遺伝子のDNA配列を決定した(配列表の配列番号1参
照)。
のDNA配列とキシラナーゼのN末端アミノ酸配列をも
とに、キシラナーゼ遺伝子を構成し、そのDNA配列を
決定した(配列表の配列番号2参照)。また、このキシ
ラナーゼ遺伝子をプラスミドへのクローニングを実施
し、該プラスミドを大腸菌に形質転換した。このように
して、本発明を完成したのである。
号1記載の塩基配列を有するストレプトマイセス オリ
バセオビリディス由来のキシラナーゼ前駆体の遺伝子で
ある。請求項2記載の本発明は、請求項1記載のキシラ
ナーゼ前駆体の遺伝子を含むプラスミドである。請求項
3記載の本発明は、請求項2記載のプラスミドで形質転
換された大腸菌(FERM P−16713)である。
請求項4記載の本発明は、配列表の配列番号2記載の塩
基配列を有するストレプトマイセス オリバセオビリデ
ィス由来のキシラナーゼの遺伝子である。請求項5記載
の本発明は、請求項4記載のキシラナーゼの遺伝子を含
むプラスミドである。請求項6記載の本発明は、請求項
5記載のプラスミドで形質転換された大腸菌である。
る。前記したように、本発明のキシラナーゼ遺伝子は、
ストレプトマイセス属微生物に属し、キシラナーゼ生産
能を有する微生物に由来するものである。この微生物と
しては各種のものがあるが、特にストレプトマイセス
オリバセオビリディス(Streptomyces olivaceoviridi
s)が好適であり、中でも、得られるキシラナーゼの酵素
活性を考慮すると、ストレプトマイセス オリバセオビ
リデスE−86株を用いることが好ましい。
レプトマイセス属微生物から、以下のようにして入手す
ることができる。まず、上記ストレプトマイセス属微生
物菌株を該微生物が十分に生育し、目的とする酵素を生
成するような条件にて培養し、得られる培養物から菌体
を除去してキシラナーゼを抽出する。キシラナーゼは、
さらに遠心分離、クロマトグラフィー等の手段により精
製しておくのが、以下の処理をスムーズに行う点から望
ましい。この精製キシラナーゼについて、N末端のアミ
ノ酸配列を解読した結果、配列表の配列番号3に示す通
りのものであった。
(配列表の配列番号3参照)から塩基配列を解読し、該
配列を基にしてプライマー(配列表の配列番号4)を作
成する。また、この配列のホモロジー検索の結果から、
データベースを活用してアミノ酸配列のアラインメント
を作成し、保存されているアミノ酸配列領域の情報を参
考にしてプライマー(配列表の配列番号5)を作製す
る。これら1組のプライマーを用い、キシラナーゼ生産
菌株から抽出したゲノムDNAを鋳型として、常法に従
いポリメラーゼ連鎖反応法(PCR法)を行う。その結
果、500bpの明瞭なバンドを得ることができる。
(PCR産物)をクローニングし、そのDNA塩基配列
を解読した結果、配列表の配列番号6に示す配列を有す
ることを見出した。さらに、該DNA塩基配列(配列表
の配列番号6)をアミノ酸に翻訳したところ、先に得ら
れたペプチドフラグメントのアミノ酸配列(配列表の配
列番号3参照)に相当する配列の存在が認められた。こ
のことから、この500bpのDNA配列(配列表の配
列番号6)は、キシラナーゼ遺伝子の一部であることが
確認された。
列番号6)をプローブとして、インバースPCR(Nucl
eic Acid Research 16号,8186頁,1988年)
を行う。まず、DNA塩基配列(配列表の配列番号6)
のN末端側の情報を基にして、1組のプライマー(配列
表の配列番号7及び8)を化学合成する。同様にC末端
側の情報を基にして、もう一組のプライマー(配列表の
配列番号9及び10)を化学合成する。
出したゲノムDNAに制限酵素を作用させ、得られる分
解物をセルフライゲーションし、環状構造とする。この
環状DNAを鋳型とし、まず、先に化学合成したN末端
由来のプライマー(配列表の配列番号7及び8)を用い
てPCR法によりDNA断片を増幅する。同様に、環状
構造のDNAを鋳型とし、プライマーとしてC末端由来
のプライマー(配列表の配列番号9及び10)を用い、
PCR法によりDNA断片を増幅する。上記2回のPC
R反応から得られる2つのDNA断片をつなぎ合わせる
ことにより、請求項1記載の本発明のキシラナーゼ前駆
体の遺伝子を得ることができる(配列表の配列番号1参
照)。
遺伝子のDNA配列から翻訳したアミノ酸配列(配列表
の配列番号1)を、最初に判明したキシラナーゼのN末
端のアミノ酸配列(配列表の配列番号3参照)と比較し
たところ、前駆体遺伝子のアミノ酸配列(配列表の配列
番号1)の31〜70番目が、キシラナーゼのN末端の
アミノ酸配列(配列表の配列番号3参照)と一致するこ
とを見出した。このことから、キシラナーゼ前駆体遺伝
子の塩基配列中の91番目以降がキシラナーゼ遺伝子で
あることを確認した。
ーゼのN末端アミノ酸配列(配列表の配列番号3参照)
を基にして、キシラナーゼ前駆体遺伝子(配列表の配列
番号1参照)から構築した。その結果、請求項4記載の
本発明のキシラナーゼ遺伝子を得ることができる(配列
表の配列番号2参照)。本発明のキシラナーゼ遺伝子の
アミノ酸配列のホモロジー検索の結果、ストレプトマイ
セス リビダンス由来のものにホモロジーの高いものが
存在するが、これを本発明に係る酵素と酵素活性を比較
すると、後述するように、著しく劣っており、産業上の
利用性が低いものである。その他には、60%以上のア
ミノ酸配列のホモロジーを有する放線菌由来の酵素の特
性は明らかでない。
ミドは、上記のキシラナーゼ遺伝子を常法によりプラス
ミドに導入することによって得ることができるが、その
1例を以下に示す。
する。この制限酵素切断プラスミドとDNAの塩基配列
が合致するよう、本発明のキシラナーゼ遺伝子の塩基配
列を基に、1組のプライマーP(配列表の配列番号11
及び12)を化学合成する。ストレプトマイセス属微生
物のゲノムDNAを鋳型とし、上記両プライマーを用い
て、PCR法によりキシラナーゼ遺伝子の全長をコード
するDNAを増幅する。得られた増幅産物に制限酵素を
作用させて制限酵素切断DNA断片とし、これに、先の
制限酵素切断プラスミドpQE60を接合することによ
り、プラスミドpQE60/XynGを調製する。
菌に形質転換することにより形質転換体を得ることがで
きる。このようにして形質転換された大腸菌(請求項3
記載のもの)は、工業技術院生命工学工業技術研究所に
寄託されている。その受託番号は、FERM P−16
713である。
転換体である大腸菌を培養し、該大腸菌及び培養上清中
の酵素を測定して確認することができる。また、この形
質転換体を栄養培地で培養し、得られた菌体を破砕した
のち、固液分離して得られる上清を常法によって精製す
ることにより、キシラナーゼを得ることができる。
はキシラナーゼ生産菌であるストレプトマイセス オリ
バセオビリデス E−86株由来のキシラナーゼを用い
ることが望ましい。その理由は、該微生物由来のキシラ
ナーゼは高い酵素活性を有しているからである。すなわ
ち、この酵素はオートスペルト麦由来のキシラン(不溶
性)あるいは樺由来のキシラン(可溶性)に対し、それ
ぞれ149単位/mg酵素、104単位/mg酵素と高
い活性を示す。
であるストレプトマイセス リビダンス由来のキシラナ
ーゼC(本発明酵素とアミノ酸配列のホモロジーが82
%)の活性は、上記の不溶性あるいは可溶性キシランに
対し、それぞれ45単位/mg酵素、32単位/mg酵
素である。また、ストレプトマイセス リビダンス由来
のキシラナーゼB(本発明酵素とアミノ酸配列のホモロ
ジーが79%)の活性は、上記いずれのキシランに対し
ても5単位/mg酵素にすぎない。これらの数値を比較
すれば、ストレプトマイセス オリバセオビリデス E
−86株の生産するキシラナーゼが、いかに高い活性を
示し、産業上利用する上で優れた特性を有しているかが
明らかである。
る。 実施例1 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
を、キシラン2%、ペプトン1.4%、酵母エキス0.
1%、コーンスティープリカー0.5%、KH2 PO4
1%、MgSO4 ・7H2 O 0.05%を含む培地
で培養したのち、菌体を除去し得られた培養上清から、
イオン交換クロマトグラフィーを活用して高度に精製し
たキシラナーゼを得た。この精製酵素を用いて、プロテ
インシーケンサーG1005A型(ヒューレットパッカ
ード社製)により、そのN末端のアミノ酸配列(配列表
の配列番号3参照)を決定した。
3参照)の中から、コドンの縮重の少ない領域を1箇所
選びだし、フォーワードプライマー(配列表の配列番号
4)を化学合成した。一方、N末端のアミノ酸配列(配
列表の配列番号3参照)のホモロジー検索を行い、その
結果に基づいてデータベースを活用して作成したアミノ
酸配列のアラインメントの中から、保存されているアミ
ノ酸配列領域を見出し、該領域の情報を基に、リバース
プライマー(配列表の配列番号5)を作成した。
E−86株から、斉藤の方法(蛋白質核酸酵素,11
巻,446頁)によりゲノムDNAを抽出した。このゲ
ノムDNAを鋳型とし、上記二つのプライマー(配列表
の配列番号4及び5)を用いてPCR反応により増幅さ
せた。その結果、500bpの明瞭なバンドが得られ
た。
ダミン・ターミネーター・サイクルシークエンシング・
キット(パーキンエルマー社製)を用いてDNA塩基配
列を解読した。解読した塩基配列の情報をつなぎ合わせ
ると、DNA塩基配列(配列表の配列番号6)が得られ
た。このDNA塩基配列をアミノ酸に翻訳したところ、
先に得られたN末端アミノ酸配列(配列表の配列番号
3)に相当する配列が認められることから、該配列はキ
シラナーゼ遺伝子の一部であることが判明した。
bpのDNA塩基配列(配列表の配列番号6)を、ディ
ゴキシゲニン化学発光核酸検出システム(ベーリンガー
・マンハイム社製)で標識し、全長のキシラナーゼ遺伝
子クローニングのためのプローブとして用いることとし
た。この500bpのDNA塩基配列(配列表の配列番
号6)のN末端側の情報をもとに、フォーワードプライ
マーN(配列表の配列番号7)とリバースプライマーN
(配列表の配列番号8)を作製した。同様に、C末端側
の情報をもとに、フォーワードプライマーC(配列表の
配列番号9)とリバースプライマーC(配列表の配列番
号10)を化学合成した。
レプトマイセス オリバセオビリデス E−86株のゲ
ノムDNAを、制限酵素ApaIで完全分解した。得ら
れた制限酵素分解物をアガロース電気泳動で分離後、先
に標識したプローブを用いてサザンハイブリダイゼーシ
ョン(「クローニングとシーケンス」渡辺監修,農村文
化社,1989年,157頁)を実施した。その結果、
1.5kbpと3.0kbpの2つのDNA断片に強く
ハイブリダイズした。このことは、目的とするキシラナ
ーゼ遺伝子が、1.5kbpと3.0kbpの2つのD
NA断片に分断されていることを示唆するものである。
esearch,16号,8186頁,1988年)を実施する
ために、上述のストレプトマイセス オリバセオビリデ
スE−86株のゲノムDNAの制限酵素ApaI分解物
を、DNAライゲーションキット(宝酒造株式会社製)
を用いて、セルフライゲーションし、環状構造とした。
次に、この環状DNAを鋳型とし、先述のフォーワード
プライマーN(配列表の配列番号7)及びリバースプラ
イマーN(配列表の配列番号8)を用いて、PCRによ
りDNA断片を増幅し、得られたDNA塩基配列を解読
した。
型とし、先に化学合成したフォーワードプライマーC
(配列表の配列番号9)及びリバースプライマーC(配
列表の配列番号10)を用い、PCRによりDNA断片
を増幅し、得られたDNA塩基配列を解読した。
列をつなぎ合わせることにより、最終的にキシラナーゼ
前駆体の遺伝子のDNA配列を決定した(配列表の配列
番号1参照)。
配列(配列表の配列番号1)から翻訳したアミノ酸配列
(配列表の配列番号1)を、既に判明しているキシラナ
ーゼのN末端のアミノ酸配列(配列表の配列番号3)と
比較した。その結果、キシラナーゼのN末端のアミノ酸
配列は、前駆体遺伝子のアミノ酸配列中の31〜70番
目の配列と一致したことから、前駆体遺伝子の塩基配列
中の91番目以降にキシラナーゼ遺伝子の存在を見出し
た。
キシラナーゼのN末端アミノ酸配列を基に、キシラナー
ゼ前駆体遺伝子から構成した(配列表の配列番号2参
照)。また、活性型キシラナーゼの分子量を、島津製作
所製、レーザーイオン化TOF−MS KOMPACT
MALDI III型で測定したところ、21,000ダル
トンであり、本遺伝子でコードされる蛋白の分子量2
0,851と良く一致していた。
のクローニングを実施した。まず、プラスミドpQE6
0を制限酵素NcoIとBamHIで分解した。その
後、この制限酵素切断プラスミドとDNAの塩基配列が
合致するように、キシラナーゼをコードする全長のDN
A配列を基にして、フォーワードプライマーP(配列表
の配列番号11)とリバースプライマーP(配列表の配
列番号12)を化学合成した。次いで、ストレプトマイ
セス オリバセオビリデス E−86株のゲノムDNA
を鋳型とし、両プライマーを用いて、PCR法により、
キシラナーゼ遺伝子の全長をコードするDNAを増幅し
た。増幅されたDNA断片を、さらに制限酵素NcoI
とBamHIで分解した。この制限酵素切断DNA断片
を、DNAライゲーションキット(宝酒造株式会社製)
を用いて、先の制限酵素切断プラスミドと接合し、プラ
スミドpQE60/XynGを調製した。
nGを用いてSambrook, J., Fritsch, E. F. and Mania
tis, T. "Molecular Cloning, A Laboratory Manual",
第2版1.74章,Vol. 1(1989)に記載された方
法に従い、大腸菌に形質転換した。形質転換された大腸
菌は、工業技術院生命工学工業技術研究所に寄託されて
おり、その受託番号は、FERM P−16713であ
る。なお、プラスミドpQE60/XynGにはキシラ
ナーゼ遺伝子が含まれている。請求項6記載の形質転換
体も同様の方法で得ることができる。
解する酵素であるキシラナーゼの遺伝子が提供される。
この遺伝子を発現させて得られるキシラナーゼは、キシ
ランからのキシロオリゴ糖の生産、パルプの漂白用酵素
等として、食品産業をはじめとして様々な分野において
有用である。
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 プラスミド名:pQE60/XynG 配列の特徴 特徴を示す記号:CDS 存在位置:298..993 特徴を決定した方法:P 配列 GGAATCGAAA GTTTCGTATT GCCTGACGAG CGTTGCGTCA CGCTAAGCAG GCGCCAATTC 60 CGCGTCAACC ATCGTGTCGA CAGTCTTTTC GGCCACCCCT TCCAGCAGCT TCGAAAGTYG 120 CGGCTCTACA CGCCGGAGTT CACCGTCAAG TTTCGATGAA GTTTCGGAAA CAGACGCATT 180 GACCGCCCTT TCGAACCCGC CCCATACTCT CCAGCAATCG AGCCCTCCCT CCCACGGGAA 240 CGGCCCGGCC ATGGCGTATG GCGCGAACAT GACAACCCAC CTCATCCAGG AGGCACG 297 ATG GAC ATG GAG CAC GCC CTC ACC CGC CCG ATG AGC CGC AGG GGC TTC 345 Met Asp Met Glu His Ala Leu Thr Arg Pro Met Ser Arg Arg Gly Phe 1 5 10 15 ATC AAC CGT GCC GGC GCG CTC GCG CTG GCC ACC ACC GCG TCC GGG CTG 393 Ile Asn Arg Ala Gly Ala Leu Ala Leu Ala Thr Thr Ala Ser Gly Leu 20 25 30 CTG CTG CCC GAC ACC GCT CAG GCC GCC ACG GTC ATC ACC ACC AAC CAG 441 Leu Leu Pro Asp Thr Ala Gln Ala Ala Thr Val Ile Thr Thr Asn Gln 35 40 45 ACC GGC ACC AAC AAC GGG TTC TAC TAC TCC TTC TGG ACC GAC GGC GGC 489 Thr Gly Thr Asn Asn Gly Phe Tyr Tyr Ser Phe Trp Thr Asp Gly Gly 50 55 60 GGT TCG GTC TCG ATG ACC CTG AAC TCC GGC GGC AAC TAC AGC ACC TCG 537 Gly Ser Val Ser Met Thr Leu Asn Ser Gly Gly Asn Tyr Ser Thr Ser 65 70 75 80 TGG ACG AAC TGC GGG AAC TTC GTC GCC GGC AAG GGC TGG AGC AAC GGC 585 Trp Thr Asn Cys Gly Asn Phe Val Ala Gly Lys Gly Trp Ser Asn Gly 85 90 95 GGA CGC AGG AAC GTG CAG TAC TCG GGC AGC TTC TAC CCG TCC GGC AAC 633 Gly Arg Arg Asn Val Gln Tyr Ser Gly Ser Phe Tyr Pro Ser Gly Asn 100 105 110 GGC TAC CTG GCG CTG TAC GGG TGG ACC TCG AAC CCG CTC GTC GAG TAC 681 Gly Tyr Leu Ala Leu Tyr Gly Trp Thr Ser Asn Pro Leu Val Glu Tyr 115 120 125 TAC ATC GTC GAC AAC TGG GGC AAC TAC CGG CCC ACC GGA ACG TAC AAG 729 Tyr Ile Val Asp Asn Trp Gly Asn Tyr Arg Pro Thr Gly Thr Tyr Lys 130 135 140 GGC ACG GTC ACC AGC GAC GGC GGC ACG TAC GAC GTC TAC CAG ACG ACG 777 Gly Thr Val Thr Ser Asp Gly Gly Thr Tyr Asp Val Tyr Gln Thr Thr 145 150 155 160 CGG TAC AAC GCC CCC TCC GTG GAA GGC ACC AAG ACC TTC AAC CAG TAC 825 Arg Tyr Asn Ala Pro Ser Val Glu Gly Thr Lys Thr Phe Asn Gln Tyr 165 170 175 TGG AGC GTC CGG CAG TCC AAG CGG ACC GGC GGC ACC ATC ACC ACC GGC 873 Trp Ser Val Arg Gln Ser Lys Arg Thr Gly Gly Thr Ile Thr Thr Gly 180 185 190 AAC CAC TTC GAC GCC TGG GCC CGC TAC GGC ATG CAA CTG GGC AGC TTC 921 Asn His Phe Asp Ala Trp Ala Arg Tyr Gly Met Gln Leu Gly Ser Phe 195 200 205 AGC TAC TAC ATG ATC ATG GCC ACC GAG GGC TAC CAG AGC AGC GGC TCC 969 Ser Tyr Tyr Met Ile Met Ala Thr Glu Gly Tyr Gln Ser Ser Gly Ser 210 215 220 TCC AAC CTC ACG GTG AGC GGC TGACCCTCCC CGTCCCGTCC CATCCCCCAC 1020 Ser Asn Leu Thr Val Ser Gly 225 230 GGAGGTCACG CCGCCCACCC GAGGAGGACG CACCCGCATG CGTGCCGCAC CCCGCTCCCT 1080 GCTGACCGGA CTGGCCCTCG CGGCGACCGC CGTGGCCGGC ACGGTCACCG CCGTCACCGA 1140 CGCCGCCCCG GCGCACGCCG CCGCCTGCTC CGGGTACGTC GGGCTCACCT TCGAC 1195
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 プラスミド名:pQE60/XynG 配列の特徴 特徴を示す記号: mat peptide 存在位置:418..993 特徴を決定した方法:P 配列 GGAATCGAAA GTTTCGTATT GCCTGACGAG CGTTGCGTCA CGCTAAGCAG GCGCCAATTC 60 CGCGTCAACC ATCGTGTCGA CAGTCTTTTC GGCCACCCCT TCCAGCAGCT TCGAAAGTTG 120 CGGCTCTACA CGCCGGAGTT CACCGTCAAG TTTCGATGAA GTTTCGGAAA CAGACGCATT 180 GACCGCCCTT TCGAACCCGC CCCATACTCT CCAGCAATCG AGCCCTCCCT CCCACGGGAA 240 CGGCCCGGCC ATGGCGTATG GCGCGAACAT GACAACCCAC CTCATCCAGG AGGCACGATG 300 GACATGGAGC ACGCCCTCAC CCGCCCGATG AGCCGCAGGG GCTTCATCAA CCGTGCCGGC 360 GCGCTCGCGC TGGCCACCAC CGCGTCCGGG CTGCTGCTGC CCGACACCGC TCAGGCC 417 GCC ACG GTC ATC ACC ACC AAC CAG ACC GGC ACC AAC AAC GGG TTC TAC 465 Ala Thr Val Ile Thr Thr Asn Gln Thr Gly Thr Asn Asn Gly Phe Tyr 1 5 10 15 TAC TCC TTC TGG ACC GAC GGC GGC GGT TCG GTC TCG ATG ACC CTG AAC 513 Tyr Ser Phe Trp Thr Asp Gly Gly Gly Ser Val Ser Met Thr Leu Asn 20 25 30 TCC GGC GGC AAC TAC AGC ACC TCG TGG ACG AAC TGC GGG AAC TTC GTC 561 Ser Gly Gly Asn Tyr Ser Thr Ser Trp Thr Asn Cys Gly Asn Phe Val 35 40 45 GCC GGC AAG GGC TGG AGC AAC GGC GGA CGC AGG AAC GTG CAG TAC TCG 609 Ala Gly Lys Gly Trp Ser Asn Gly Gly Arg Arg Asn Val Gln Tyr Ser 50 55 60 GGC AGC TTC TAC CCG TCC GGC AAC GGC TAC CTG GCG CTG TAC GGG TGG 657 Gly Ser Phe Tyr Pro Ser Gly Asn Gly Tyr Leu Ala Leu Tyr Gly Trp 65 70 75 80 ACC TCG AAC CCG CTC GTC GAG TAC TAC ATC GTC GAC AAC TGG GGC AAC 705 Thr Ser Asn Pro Leu Val Glu Tyr Tyr Ile Val Asp Asn Trp Gly Asn 85 90 95 TAC CGG CCC ACC GGA ACG TAC AAG GGC ACG GTC ACC AGC GAC GGC GGC 753 Tyr Arg Pro Thr Gly Thr Tyr Lys Gly Thr Val Thr Ser Asp Gly Gly 100 105 110 ACG TAC GAC GTC TAC CAG ACG ACG CGG TAC AAC GCC CCC TCC GTG GAA 801 Thr Tyr Asp Val Tyr Gln Thr Thr Arg Tyr Asn Ala Pro Ser Val Glu 115 120 125 GGC ACC AAG ACC TTC AAC CAG TAC TGG AGC GTC CGG CAG TCC AAG CGG 849 Gly Thr Lys Thr Phe Asn Gln Tyr Trp Ser Val Arg Gln Ser Lys Arg 130 135 140 ACC GGC GGC ACC ATC ACC ACC GGC AAC CAC TTC GAC GCC TGG GCC CGC 897 Thr Gly Gly Thr Ile Thr Thr Gly Asn His Phe Asp Ala Trp Ala Arg 145 150 155 160 TAC GGC ATG CAA CTG GGC AGC TTC AGC TAC TAC ATG ATC ATG GCC ACC 945 Tyr Gly Met Gln Leu Gly Ser Phe Ser Tyr Tyr Met Ile Met Ala Thr 165 170 175 GAG GGC TAC CAG AGC AGC GGC TCC TCC AAC CTC ACG GTG AGC GGC TGAC 994 Glu Gly Tyr Gln Ser Ser Gly Ser Ser Asn Leu Thr Val Ser Gly 180 185 190 CCTCCCCGTC CCGTCCCATC CCCCACGGAG GTCACGCCGC CCACCCGAGG AGGACGCACC 1054 CGCATGCGTG CCGCACCCCG CTCCCTGCTG ACCGGACTGG CCCTCGCGGC GACCGCCGTG 1114 GCCGGCACGG TCACCGCCGT CACCGACGCC GCCCCGGCGC ACGCCGCCGC CTGCTCCGGG 1174 TACGTCGGGC TCACCTTCGA C 1195
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 Ala Thr Val Ile Thr Thr Asn Gln Thr Gly Thr Asn Asn Gly Phe Tyr 1 5 10 15 Tyr Ser Phe Trp Thr Asp Gly Gly Gly Ser Val Ser Met Thr Leu Asn 20 25 30 Ser Gly Gly Asn Tyr Ser Thr Ser 35 40
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 GGSACSAACA ACGGSTTCTA CTAC 24
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 WCTGGTASCC CTCSGTSGCC AT 22
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 PCR反応物 配列 GGC ACC AAC AAC GGG TTC TAC TAC TCC TTC TGG ACC GAC GGC GGC GGT 48 Gly Thr Asn Asn Gly Phe Tyr Tyr Ser Phe Trp Thr Asp Gly Gly Gly 1 5 10 15 TCG GTC TCG ATG ACC CTG AAC TCC GGC GGC AAC TAC AGC ACC TCG TGG 96 Ser Val Ser Met Thr Leu Asn Ser Gly Gly Asn Tyr Ser Thr Ser Trp 20 25 30 ACG AAC TGC GGG AAC TTC GTC GCC GGC AAG GGC TGG AGC AAC GGC GGA 144 Thr Asn Cys Gly Asn Phe Val Ala Gly Lys Gly Trp Ser Asn Gly Gly 35 40 45 CGC AGG AAC GTG CAG TAC TCG GGC AGC TTC TAC CCG TCC GGC AAC GGC 192 Arg Arg Asn Val Gln Tyr Ser Gly Ser Phe Tyr Pro Ser Gly Asn Gly 50 55 60 TAC CTG GCG CTG TAC GGG TGG ACC TCG AAC CCG CTC GTC GAG TAC TAC 240 Tyr Leu Ala Leu Tyr Gly Trp Thr Ser Asn Pro Leu Val Glu Tyr Tyr 65 70 75 80 ATC GTC GAC AAC TGG GGC AAC TAC CGG CCC ACC GGA ACG TAC AAG GGC 288 Ile Val Asp Asn Trp Gly Asn Tyr Arg Pro Thr Gly Thr Tyr Lys Gly 85 90 95 ACG GTC ACC AGC GAC GGC GGC ACG TAC GAC GTC TAC CAG ACG ACG CGG 336 Thr Val Thr Ser Asp Gly Gly Thr Tyr Asp Val Tyr Gln Thr Thr Arg 100 105 110 TAC AAC GCC CCC TCC GTG GAA GGC ACC AAG ACC TTC AAC CAG TAC TGG 384 Tyr Asn Ala Pro Ser Val Glu Gly Thr Lys Thr Phe Asn Gln Tyr Trp 115 120 125 AGC GTC CGG CAG TCC AAG CGG ACC GGC GGC ACC ATC ACC ACC GGC AAC 432 Ser Val Arg Gln Ser Lys Arg Thr Gly Gly Thr Ile Thr Thr Gly Asn 130 135 140 CAC TTC GAC GCC TGG GCC CGC TAC GGC ATG CAA CTG GGC AGC TTC AGC 480 His Phe Asp Ala Trp Ala Arg Tyr Gly Met Gln Leu Gly Ser Phe Ser 145 150 155 160 TAC TAC ATG ATC ATG GCC ACC GAG GGC TAC CAG T 514 Tyr Tyr Met Ile Met Ala Thr Glu Gly Tyr Gln 165 170
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 TAGTTGCCGC CGGAGTTCAG GGTCATC 27
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 CATCGTCGAC AACTGGGGCA ACTACCG 27
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 TGAAGCTGCC CAGTTGCATG CCGTAGC 27
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 TGATCATGGC CACCGAGGGC TACCAGA 27
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 CCATGGACAT GGAGCACGCC CTCACCCGCC CG 32
reptomyces olivaceoviridis ) 株名:E−86株 直接の起源 ストレプトマイセス オリバセオビリデス E−86株
が生産した酵素 配列 GGATCCGCCG CTCACCGTGA GGTTGGAGGA GC 32
Claims (6)
- 【請求項1】 配列表の配列番号1記載の塩基配列を有
するストレプトマイセス オリバセオビリディス由来の
キシラナーゼ前駆体の遺伝子。 - 【請求項2】 請求項1記載のキシラナーゼ前駆体の遺
伝子を含むプラスミド。 - 【請求項3】 請求項2記載のプラスミドで形質転換さ
れた大腸菌(FERMP−16713)。 - 【請求項4】 配列表の配列番号2記載の塩基配列を有
するストレプトマイセス オリバセオビリディス由来の
キシラナーゼの遺伝子。 - 【請求項5】 請求項4記載のキシラナーゼの遺伝子を
含むプラスミド。 - 【請求項6】 請求項5記載のプラスミドで形質転換さ
れた大腸菌。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP09070298A JP3366933B2 (ja) | 1998-03-20 | 1998-03-20 | キシラナーゼ遺伝子、該遺伝子を含むベクター及び形質転換体 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP09070298A JP3366933B2 (ja) | 1998-03-20 | 1998-03-20 | キシラナーゼ遺伝子、該遺伝子を含むベクター及び形質転換体 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JPH11266873A JPH11266873A (ja) | 1999-10-05 |
JP3366933B2 true JP3366933B2 (ja) | 2003-01-14 |
Family
ID=14005870
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP09070298A Expired - Lifetime JP3366933B2 (ja) | 1998-03-20 | 1998-03-20 | キシラナーゼ遺伝子、該遺伝子を含むベクター及び形質転換体 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP3366933B2 (ja) |
-
1998
- 1998-03-20 JP JP09070298A patent/JP3366933B2/ja not_active Expired - Lifetime
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Biosic.Biotech.Biochem.,Vol.58,No.6,p.1041−1044(1994) |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JPH11266873A (ja) | 1999-10-05 |
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