JP2024079823A - ErbB-2およびErbB-3に結合する抗体 - Google Patents
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Abstract
【課題】本発明は、抗体の分野に関する。詳細には、本発明は、異常な細胞を伴う疾患の処置のための治療的(ヒト)抗体の分野に関する。より詳細には、本発明は、ErbB-2およびErbB-3に結合する抗体、ならびにErbB-2およびErbB-3陽性細胞、特 に腫瘍細胞との結合におけるそれらの使用に関する。【解決手段】本発明は、とりわけ、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3 に結合する第2の抗原結合部位を含む抗体に関する。これらの抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を、典型的には 低減できる。治療のための方法、ならびに画像化における、およびErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/3陽性腫瘍を有する対象の処置におけるこれらの抗体の使用 もまた記載される。【選択図】なし
Description
本発明は、抗体の分野に関する。詳細には、本発明は、異常な細胞を伴う疾患の処置のための治療的(ヒト)抗体の分野に関する。より詳細には、本発明は、ErbB-2およびErbB-3に結合する抗体、ならびにErbB-2およびErbB-3陽性細胞、特 に腫瘍細胞との結合におけるそれらの使用に関する。
ヒト上皮増殖因子受容体ファミリー(HER、集合的に、ErbBシグナル伝達ネットワークとも呼ばれる)は、膜貫通受容体チロシン・キナーゼ(RTK)のファミリーである。このファミリーは、ErbB-1(またはHERl)としても公知の上皮増殖因子受容体(EGFR)、ならびに相同受容体ErbB-2(HER2)、ErbB-3(HE R3)およびErbB-4(HER4)を含む。これらの受容体(YardenおよびP ines、2012において概説される)は、上皮細胞上で広く発現される。HER受容体またはそれらのリガンド、例えばヘレグリン(HRG)もしくは上皮増殖因子(EGF)の上方調節は、ヒト癌において頻繁な事象である(Wilson、Fridlyand ら、2012)。特に、ErbB-1およびErbB-2の過剰発現は、上皮腫瘍にお いて生じ、腫瘍浸潤、転移、化学療法に対する耐性、および予後不良と関連する(Zhan g、Berezovら、2007)。正常乳房では、ErbB-3は、管腔上皮の成長および分化において重要であることが示されている。例えば、ErbB-3の欠失/阻害は、管腔上皮よりも基底側の選択的増大を生じる(Balko、Millerら、2012)。RTKの細胞外ドメインへのリガンドの結合は、同じ(ホモ二量体化)受容体サブタイプ間および異なる(ヘテロ二量体化)受容体サブタイプ間の両方で、受容体二量体化を誘導する。二量体化は、自己リン酸化を受ける細胞内チロシン・キナーゼ・ドメインを活性化でき、次に、マイトジェン活性化タンパク質キナーゼ(MAPK)および生存促進性経路Aktによって媒介されるものを含むいくつもの下流の増殖促進性シグナル伝達経路を活性化できる(YardenおよびPines、2012に概説される)。特異的内因性リガンドは、ErbB-2については同定されておらず、従って、これは通常、ヘテロ二量体化を介してシグナル伝達すると仮定される(Sergina、Rauschら、2 007)。ErbB-3は、そのリガンドの会合によって活性化され得る。これらのリガンドには、ニューレグリン(NRG)およびヘレグリン(HRG)が含まれるがこれらに限定されない。
ErbB受容体ファミリーのシグナル伝達の活性化の種々の様式が同定されている。これらには、シグナル伝達のリガンド依存的およびリガンド非依存的な活性化がある。過剰発現されたErbB-2は、ErbB-3リガンドの非存在下であっても、ErbB-2:ErbB-3ヘテロ二量体を介した発癌性シグナル伝達を生成することができる(Ju nttila、Akitaら、2009)。ErbB-2活性は、ErbB-2特異的 抗体によって阻害され得る。かかるErbB-2特異的抗体は、例えば、ErbB-2陽性(HER2+)腫瘍の処置において使用される。かかる処置に伴う問題は、腫瘍がしばしばErbB-2特異的処置を逃避し、阻害抗体の存在下であっても成長し続けることである。ErbB-2陽性腫瘍、例えば、乳房、卵巣、子宮頸部および胃の腫瘍は、上方調節されたErbB-3発現(Ocana、Vera-Badilloら、2013)および/またはErbB-3リガンド発現(Wilson、Fridlyandら、2012) を示す腫瘍細胞の部位集団が選択的により早く成長することによって、処置を逃避し得ることが観察されている。また、ErbB-3受容体における活性化変異が同定されている。
臨床適用のために承認されたいくつかのモノクローナル抗体の中に、抗ErbB-2モノクローナル抗体トラスツズマブ(ハーセプチン)およびErbB-1特異的セツキシマブ(アービタックス)がある。トラスツズマブは、転移性乳癌において証明された延命効果を有する(Arteaga、Sliwkowskiら、2011)。トラスツズマブの正確な作用機構は、はっきりとは確立されていない。作用の示唆された様式は、RTKシグナル伝達の阻害および抗体依存性細胞傷害(ADCC)の動員である。記載されてきた他の作用機構には、ErbB-2細胞外ドメインのタンパク質分解性切断を遮断すること、血管新生因子の阻害、および受容体エンドサイトーシスの増強が含まれる。ErbB- 2シグナル伝達を妨害する他の薬剤は、乳房および他のErbB-2過剰発現癌の処置のために承認されているか、または開発中である。例えば、化学化合物ラパチニブは、Er bB-1およびErbB-2の両方のチロシン・キナーゼ活性を阻害し、ErbB-2増幅された乳癌の第1選択の処置において使用される。
HER2+転移性乳癌を有する患者では、単剤としてのまたは化学療法と組み合わせたトラスツズマブに対する耐性が、通常治療を開始して数カ月以内に生じる。HER2+転移性乳癌を有する患者のごく一部だけが、単剤トラスツズマブに応答し、進行癌における耐性のde novo機構を示唆している。これらの機構には、とりわけ、他のHERファミリーの受容体からのシグナル伝達、およびHERファミリーではないRTKからの代償的シグナル伝達が含まれる(Theryら、Resistance to human epidermal growth factor receptor type 2-targeted therapies、Eur J Cancer(2014)、第50巻、第5号、892~901頁(ttp://dx.doi.org/10.101 6/j.ejca.2014.01.003))。例えば、HER2と併せたHER3またはそのリガンドの過剰発現は、HER-2/HER-3ヘテロ二量体の形成、および トラスツズマブに対する耐性の獲得をもたらす。従って、抗体トラスツズマブは、ErbB-3リガンドによって駆動されるシグナル伝達を遮断することにおいては無効であると考えられる(Wehrman、Raabら、2006、Junttila、Akitaら、2009、Theryら、2014)。
最近、モノクローナル抗体ペルツズマブが、無増悪生存期間がさらに5カ月延長されることに基づいて、トラスツズマブと組み合わせた使用について承認された(Baselg a、Cortesら、2012)。ペルツズマブもまた、トラスツズマブとは異なる位置においてであるが、ErbB-2に結合する。
ErbB-2陽性腫瘍を処置するための他の戦略は、ErbB-3を対象とする。ErbB-3結合モノクローナル抗体は、前臨床研究においてその活性が実証されている(S choeberl、Faberら、2010)。一部のErbB-3結合モノクローナル抗体は、種々の癌の増殖および成長を阻害できる。
ErbB-2陽性腫瘍を処置するための他の戦略は、ErbB-3を対象とする。ErbB-3結合モノクローナル抗体は、前臨床研究においてその活性が実証されている(S choeberl、Faberら、2010)。一部のErbB-3結合モノクローナル抗体は、種々の癌の増殖および成長を阻害できる。
別の戦略は、ErbB-2受容体およびErbB-3受容体の両方の結合を伴う。分子MM-111は、ErbB-2およびErbB-3に結合する2つの単鎖Fv(scFv)断片を含む人工の生物学的分子である。2つのscFvは、分子の半減期を増加させるために、変異したヒト血清アルブミン(HSA)タンパク質と会合される。予備試験において、この分子は、ErbB-3シグナル伝達および増殖を阻害することが示された。この効果は、比較的高い量のErbB-2を発現したErbB-3陽性細胞株において主に測定された。
Theryら、Resistance to human epidermal growth factor receptor type 2-targeted therapies、Eur J Cancer(2014)、第50巻、第5号、892~901頁(ttp://dx.doi.org/10.101 6/j.ejca.2014.01.003)
本発明は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減できる。上記第1の抗原結合部位は、好ましくは、図16Aまたは図16Eに示されるVH鎖MF292 6;MF2930;MF1849;MF2973;MF3004;MF3958(ヒト化MF2971である);MF2971;MF3025;MF2916;MF3991(ヒト化MF3004である);MF3031;MF2889;MF2913;MF1847;MF3001;MF3003またはMF1898のアミノ酸配列を有するVH鎖を含む可変ドメイン中に存在する。上記第2の抗原結合部位は、好ましくは、図16Bまたは図16Eまたは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF3163;MF 3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058; MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF606 4;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6 070;MF6071;MF6072;MF6073またはMF6074のアミノ酸配列を有するVH鎖を含む可変ドメイン中に存在する。可変ドメイン中の免疫グロブリン軽鎖は、好ましくは、図16Cのアミノ酸配列を含む。
本発明の抗体は、特記しない限り、好ましくは、二重特異性抗体である。
本発明はさらに、本発明に従う抗体を含む医薬組成物を提供する。
標識、好ましくは、in vivo画像化のための標識をさらに含む、本発明に従う抗体がさらに提供される。
本発明は、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫 瘍を有する、またはこの腫瘍を有するリスクがある対象の処置のための方法もまた提供 し、この方法は、本発明に従う二重特異性抗体を対象に投与することを含む。ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、または有するリスクがある対象の処置における使用のための、本発明に従う二重特異 性抗体もまた提供される。
本発明は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この二重特異性抗体は、 ErbB- 2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減する、または低減できる。
本明細書で使用する場合、用語「抗原結合部位」とは、抗原に結合することが可能な、二重特異性抗体に由来する部位、好ましくはかかる二重特異性抗体上に存在する部位を指す。未改変の抗原結合部位は、典型的には、抗体の可変ドメインによって形成され、かかる抗体の可変ドメイン中に存在する。可変ドメインは、上記抗原結合部位を含む。抗原に結合する可変ドメインは、抗原に結合する抗原結合部位を含む可変ドメインである。
一実施形態では、本発明の抗体可変ドメインは、重鎖可変領域(VH)および軽鎖可変領域(VL)を含む。抗原結合部位は、組み合わされたVH/VL可変ドメイン中に、またはVH領域中にだけ、もしくはVL領域中にだけ、存在し得る。抗原結合部位が、可変ドメインの2つの領域のうち一方中にだけ存在する場合、対応物の可変領域は、結合性可変領域のフォールディングおよび/または安定性に寄与し得るが、抗原の結合自体には顕著には寄与しない。
本明細書で使用する場合、抗原結合とは、その抗原への抗体の典型的結合能力を指す。ErbB-2に結合する抗原結合部位を含む抗体は、ErbB-2に結合し、他の点は 同一の条件下で、同じ種の相同受容体ErbB-1およびErbB-4に、少なくとも 10 0分の1低く結合する。ErbB-3に結合する抗原結合部位を含む抗体は、ErbB- 3に結合し、他の点は同一の条件下で、同じ種の相同受容体ErbB-1およびErbB-4には結合しない。ErbBファミリーが細胞表面受容体のファミリーであることを考慮すると、結合は、典型的には、受容体(複数可)を発現する細胞に関して評価される。抗原への抗体の結合は、種々の方法で評価され得る。1つの方法は、抗体を抗原(好ましくは、抗原を発現する細胞)と共にインキュベートし、未結合の抗体を除去し(好ましくは、洗浄工程によって)、結合した抗体に結合する標識された抗体によって、結合した抗体を検出することである。
抗体による抗原結合は、典型的には、抗体のランダムな非特異的付着とは対照的に、これら2つの構造を正確に一緒に結合させる、抗体の相補性領域ならびに抗原および可変ドメインの両方の特異的三次元構造を介して媒介される(錠および鍵と類似の相互作用)。抗体は、典型的には、抗原のエピトープを認識し、かかるエピトープは、他の化合物中にも同様に存在し得るので、ErbB-2および/またはErbB-3に結合する本発明 に従う抗体は、かかる他の化合物が同じエピトープを含む場合、他のタンパク質も同様に認識し得る。従って、用語「結合」は、別のタンパク質または同じエピトープを含むタンパク質(複数可)への抗体の結合を排除しない。かかる他のタンパク質(複数可)は、好ましくは、ヒト・タンパク質ではない。本発明において定義されるErbB-2抗原結 合部位およびErbB-3抗原結合部位は、典型的には、出生後の、好ましくは成人のヒトでは、細胞の膜上の他のタンパク質に結合しない。本発明に従う二重特異性抗体は、典型的には、以下により詳細に概説されるように、少なくとも1×10e-6Mの結合親和性で、ErbB-2およびErbB-3に結合することが可能である。
用語「結合を妨害する」とは、本明細書で使用する場合、抗体が、ErbB-3上のエピトープに対するものであり、抗体が、ErbB-3への結合についてリガンドと競合することを意味する。抗体は、リガンド結合を減退させ得、リガンドがErbB-3に既に結合している場合にはこれを置き換え得、または、例えば立体障害を介して、リガンドがErbB-3に結合する可能性を少なくとも部分的に防止し得る。
用語「抗体」とは、本明細書で使用する場合、タンパク質性分子、好ましくは、抗原上のエピトープに結合する1または複数の可変ドメインを含む免疫グロブリン・クラスのタンパク質に属するものを意味し、ここで、かかるドメインは、抗体の可変ドメイン由来であるか、またはかかる可変ドメインと配列相同性を共有する。治療的使用のための抗体は、好ましくは、処置される対象の天然抗体に可能な限り近い(例えば、ヒト対象に対してヒト抗体)。抗体結合は、特異性および親和性に関して表現され得る。特異性は、どの抗原またはそのエピトープが結合ドメインによって特異的に結合されるかを決定する。親和性は、特定の抗原またはエピトープへの結合の強さについての尺度である。特異的結合は、少なくとも1×10e-6Mの、より好ましくは1×10e-7Mの、より好ましく は 1×10e-9Mよりも高い親和性(KD)での結合として定義される。典型的には、治療的適用のための抗体は、最大で1×10e-10Mまたはそれより高い親和性を有する。本発明の二重特異性抗体などの抗体は、天然抗体の定常ドメイン(Fc部分)を含む。本発明の抗体は、典型的には、好ましくはヒトIgGサブクラスの、二重特異性全長抗体である。好ましくは、本発明の抗体は、ヒトIgG1サブクラスの抗体である。本発明のかかる抗体は、良好なADCC特性を有し、ヒトへのin vivo投与の際に好ましい半減期を有し、クローナル細胞における共発現の際にホモ二量体よりもヘテロ二量体を優先的に形成する改変された重鎖を提供できるCH3操作テクノロジーが存在する。
本発明の抗体は、好ましくは、「全長」抗体である。本発明に従う用語「全長」は、本質的に完全な抗体を含むと定義されるが、かかる抗体は、インタクトな抗体の全ての機能を有する必要はない。誤解を避けるために、全長抗体は、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む。各鎖は、定常(C)領域および可変(V)領域を含み、これらは、CH1、CH2、CH3、VH、およびCL、VLと称されるドメインへと解体され得る。抗体は、Fa b部分中に含まれる可変ドメインを介して抗原に結合し、結合後、定常ドメインを介して、主にFc部分を介して、免疫系の分子および細胞と相互作用できる。用語「可変ドメイン」、「VH/VL対」、「VH/VL」は、本明細書で相互交換可能に使用される。本発明に従う全長抗体は、所望の特徴を提供する変異が存在し得る抗体を包含する。かかる変異は、これらの領域のいずれかの多くの部分の欠失であるべきではない。しかし、得られた抗体の結合特徴を本質的に変更することなしに1またはいくつかのアミノ酸残基が欠失されている抗体は、用語「全長抗体」内に包含される。例えば、IgG抗体は、定常領域中に、1~20アミノ酸残基の挿入、欠失またはそれらの組み合わせを有し得る。例えば、抗体自体が低いADCC活性を有する場合、抗体の定常領域を僅かに改変することによって、抗体のADCC活性は改善され得る(Junttila,T.T.、K.Parsonsら(2010)、「Superior In vivo Efficacy o f Afucosylated Trastuzumab in the Treatm ent of HER2-Amplified Breast Cancer」、Can cer Research 70(11):4481~4489)。
全長IgG抗体は、それらの好ましい半減期、および免疫原性を理由として完全な自己の(ヒト)分子に近いものである必要性に起因して、好ましい。本発明の抗体は、好ましくは、二重特異性IgG抗体、好ましくは、二重特異性全長IgG1抗体である。IgG 1は、ヒトにおけるその長い循環半減期に基づいて好ましい。ヒトにおけるいずれの免疫原性をも防止するために、本発明に従う二重特異性IgG抗体は、ヒトIgG1であることが好ましい。
用語「二重特異性」(bs)とは、抗体の1つの部分(上に定義される)が抗原上の1 つのエピトープに結合する一方で、第2の部分が異なるエピトープに結合することを意味する。この異なるエピトープは、典型的には、異なる抗原上に存在する。本発明によれば、この第1および第2の抗原は、事実上、2つの異なるタンパク質である。好ましい二重特異性抗体は、2つの異なるモノクローナル抗体の部分を含む抗体であり、結果として、2つの異なる型の抗原に結合する。二重特異性抗体の一方のアームは、典型的には、1つの抗体の可変ドメインを含み、他方のアームは、別の抗体の可変ドメインを含む。本発明の二重特異性抗体の重鎖可変領域は、典型的には互いに異なるが、軽鎖可変領域は、好ましくは、本発明の二重特異性抗体において同じである。異なる重鎖可変領域が同じまたは共通の軽鎖と結び付けられている二重特異性抗体は、共通の軽鎖を有する二重特異性抗体とも呼ばれる。従って、両方のアームが共通の軽鎖を含む、本発明に従う二重特異性抗体が、さらに提供される。
好ましい二重特異性抗体は、単一細胞における2つの異なる重鎖および1つの共通の軽鎖の共発現によって得ることができる。野生型CH3ドメインが使用される場合、2つの異なる重鎖および1つの共通の軽鎖の共発現は、3つの異なる種、AA、ABおよびBB を生じる。所望の二重特異性産物(AB)の百分率を増加させるために、CH3操作が使用でき、または言い換えれば、本明細書の以下に定義されるような、適合的な(comp atible)ヘテロ二量体化ドメインを有する重鎖を使用できる。
用語「適合的なヘテロ二量体化ドメイン」とは、本明細書で使用する場合、操作されたドメインA’が、操作されたドメインB’とのヘテロ二量体を優先的に形成し、逆もまた然りであるが、A’-A’間およびB’-B’間のホモ二量体化は減退されるように操 作されている、タンパク質ドメインを指す。
本発明に従う用語「共通の軽鎖」とは、同一であり得るか、またはいくらかのアミノ酸配列差異を有し得る軽鎖を指すが、全長抗体の結合特異性は影響されないものを指す。例えば、本明細書で使用する場合、共通の軽鎖の定義の範囲内で、例えば、保存的アミノ酸変化、重鎖とペアリングした場合に結合特異性に寄与しないまたは部分的にのみ寄与する領域中のアミノ酸の変化を導入および試験することなどによって、同一ではないがなおも機能的に等価物である軽鎖を調製および見出すことが可能である。用語「共通の軽鎖」、「共通のVL」、「単一軽鎖」、「単一VL」は、全て、用語「再編成された」の付加ありまたはなしで、本明細書で相互交換可能に使用される。機能的抗原結合ドメインを有する抗体を形成するために異なる重鎖と結びつき得るヒト軽鎖を共通の軽鎖として使用することは、本発明の一態様である(WO2004/009618、WO2009/1577 71、Merchantら、1998およびNissimら、1994)。好ましくは、共通の軽鎖は、生殖系列配列を有する。好ましい生殖系列配列は、ヒト・レパートリーにおいて頻繁に使用され、良好な熱力学的安定性、収量および溶解度を有する軽鎖可変領域である。好ましい生殖系列軽鎖は、O12、好ましくは、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVκ1-39*01/IGJκ1*01またはその断片もしくは機能的等価 物(即ち、同じIgVκ1-39遺伝子セグメントであるが、異なるIGJκ遺伝子セグメント)である(imgt.orgにおけるIMGTデータベース・ワールドワイド・ウェブに従う命名法)。従って、共通の軽鎖が、生殖系列軽鎖、好ましくは、IgVKl- 39遺伝子セグメントを含む再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖、最も好ましくは、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVKl-39*01/IGJKl*01であ る、本発明に従う二重特異性抗体が、さらに提供される。用語、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVκ1-39*01/IGJκ1*01、IGKV1-39/IGK J1、huVκ1-39軽鎖、または短くhuVκ1-39は、本出願を通じて相互交換可能に使用される。明らかに、当業者は、「共通の」が、そのアミノ酸配列が同一でない軽鎖の機能的等価物もまた指すことを認識する。機能的結合領域の形成に実質的に影響しない変異(欠失、置換、付加)が存在する、上記軽鎖の多くのバリアントが存在する。本発明の軽鎖はまた、1~5アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせを有する、本明細書の上で特定した軽鎖であり得る。
VHが、第1の抗原を特異的に認識することが可能であり、免疫グロブリン可変ドメイン中のVHとペアリングしたVLが、第2の抗原を特異的に認識することが可能である抗体もまた、企図される。得られたVH/VL対は、抗原1または抗原2のいずれかに結合する。例えばWO2008/027236、WO2010/108127およびScha eferら(Cancer Cell 20、472~486、2011年10月)に記載される、かかるいわゆる「ツー・イン・ワン抗体」は、本発明の二重特異性抗体とは異なるが、さらに「ツー・イン・ワン」抗体と呼ぶ。かかる「ツー・イン・ワン」抗体は、同一のアームを有し、本発明の抗体ではない。
用語「ErbB-2」とは、本明細書で使用する場合、ヒトにおける、ERBB-2遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。この遺伝子またはタンパク質の代替名には、CD340;HER-2;HER-2/neu;MLN 19;NEU;NGL;TK R1が含まれる。このERBB-2遺伝子は、しばしばHER2と呼ばれる(ヒト上皮増殖因子受容体2から)。本明細書でErbB-2に対する言及がなされる場合、この言及は、ヒトErbB-2を指す。ErbB-2に結合する抗原結合部位を含む抗体は、ヒ ト ErbB-2に結合する。ErbB-2抗原結合部位は、ヒト・オルソログと他の哺乳動物オルソログとの間の配列および三次構造の類似性に起因して、かかるオルソログに も結合し得るが、必ずしも結合しなくともよい。ヒトErbB-2タンパク質およびそれをコードする遺伝子についてのデータベース登録番号は、(NP_001005862.1、 NP_004439.2 NC_000017.10 NT_010783.15 NC_018928.2)である。これらの登録番号は、標的としてのErbB-2の同定のさらなる方法を提供するために主に与えられ、抗体によって結合されるErbB-2タンパク質の実際の配列は、例えば、一部の癌において生じるものなどの、コード遺伝子中の変異などに起因して、変動し得る。ErbB-2抗原結合部位は、ErbB-2および それらの種々のバリアント、例えば、一部のErbB-2陽性腫瘍細胞によって発現され るものに結合する。
用語「ErbB-3」とは、本明細書で使用する場合、ヒトにおける、ERBB-3遺伝子によってコードされるタンパク質を指す。この遺伝子またはタンパク質の代替名は、 HER3;LCCS2;MDA-BF-1;c-ErbB-3;c-erbb-3;er bb-3-S;p180-Erbb-3;p45-sErbb-3;およびp85-sE rbb-3である。本明細書でErbB-3に対する言及がなされる場合、この言及は、ヒトErbB-3を指す。ErbB-3に結合する抗原結合部位を含む抗体は、ヒトEr bB-3に結合する。ErbB-3抗原結合部位は、ヒト・オルソログと他の哺乳動物オルソログとの間の配列および三次構造の類似性に起因して、かかるオルソログにも結合し得るが、必ず結合するわけではない。ヒトErbB-3タンパク質およびそれをコードする遺伝子についてのデータベース登録番号は、(NP_001005915.1 NP_ 001973.2、NC_000012.11 NC_018923.2 NT_029 419.12)である。これらの登録番号は、標的としてのErbB-3の同定のさらなる方法を提供するために主に与えられ、抗体によって結合されるErbB-3タンパク質の実際の配列は、例えば、一部の癌において生じるものなどの、コード遺伝子中の変異などに起因して、変動し得る。ErbB-3抗原結合部位は、ErbB-3およびそれら の種々のバリアント、例えば、一部のErbB-2陽性腫瘍細胞によって発現されるもの に結合する。
ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む本発明の二重特異性抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減できるまたは低減する。過剰なErb B-2の存在下では、ErbB-2/ErbB-3ヘテロ二量体は、ヘテロ二量体中のE rbB-3鎖に対する検出可能なリガンドの非存在下で、発現細胞に成長シグナルを提供し得る。このErbB-3受容体機能は、本明細書で、ErbB-3のリ ガンド非依存的受容体機能と呼ばれる。このErbB-2/ErbB-3ヘテロ二量 体は、ErbB-3リガンドの存在下でも、発現細胞に成長シグナルを提供する。このErbB-3受容体機能は、本明細書で、ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能と 呼ばれる。
用語「ErbB-3リガンド」とは、本明細書で使用する場合、ErbB-3に結合および活性化するポリペプチドを指す。ErbB-3リガンドの例には、ニューレグリン1(NRG)およびニューレグリン2、ベータセルリン、ヘパリン結合性上皮増殖因子ならびにエピレグリンが含まれるがこれらに限定されない。この用語は、天然に存在するポリペプチドの生物学的に活性のある断片および/またはバリアントを含む。
本発明の好ましい一実施形態では、ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能は、Er bB-2およびErbB-3陽性細胞のErbB-3リガンド誘導性成長である。好ましい一実施形態では、この細胞は、MCF-7細胞(ATCC(登録商標)HTB-22( 商標));SKBR3(ATCC(登録商標)HTB-30(商標))細胞;NCI-8 7(ATCC(登録商標)CRL-5822(商標))細胞;BxPC-3-luc2細胞(Perkin Elmer 125058)、BT-474細胞(ATCC(登録商標)HTB-20(商標))またはJIMT-1 細胞(DSMZ番号:ACC 589)である。
好ましい一実施形態では、このErbB-2およびErbB-3陽性細胞は、細胞表面上に、少なくとも50.000のErbB-2受容体を含む。好ましい一実施形態では、少なくとも100.000のErbB-2受容体。好ましい一実施形態では、このErb B-2およびErbB-3陽性細胞は、細胞表面上に、少なくとも1.000.000 の ErbB-2受容体を含む。別の好ましい一実施形態では、このErbB-2およびEr bB-3陽性細胞は、細胞表面上に、1.000.000以下のErbB-2受容体を含む。現在使用されている治療、例えば、トラスツズマブ(ハーセプチン)およびペ ルツズマブは、臨床応答を得るために、その細胞表面上に1.000.000超のErbB-2受容体を有する悪性ErbB-2陽性細胞を有する患者のみに処方される。その細胞表面上に1.000.000超のErbB-2受容体を有するErbB-2陽 性腫瘍細胞を有する患者は、典型的には、ErbB-2[+++]と分類される。患者は 、例えば、共に Dako Denmark A/Sによって市販されるHercepTest(商標)および/もしくはHER2 FISH(pharm Dx(商標))を使用して、ならびに/またはMonogram Biosciencesによって市販されるHERmark(登録商標)アッセイを使用して、分類される。トラスツズマブおよびペルツズマブは、ErbB-2[+++]患者のみに処方されるが、それは、より低いErbB-2濃度 を有する患者は、典型的には、トラスツズマブおよびペルツズマブで処置した場合に十分な臨床応答を示さないからである。しかし、本発明は、トラスツズマブと比較して、より低いErbB-2受容体濃度を有する細胞に対する改善された結合親和性もまた有する 二重特異性抗体を提供する。実施例に示されるように、より低いErbB2発現を有するかかる細胞の増殖は、本発明に従う抗体により効率的に対抗される。かかるより低いErbB-2受容体濃度は、ErbB-2[++]またはErbB-2[+]と分類された患者の 悪性細胞上に存在する。また、再発したErbB-2陽性腫瘍は、細胞1つ当たり1.0 00.000未満の受容体のErbB-2受容体濃度を有する場合が多い。従って、かかるErbB-2[++]またはErbB-2[+]患者、ならびに再発したErbB-2 陽性腫瘍を有する患者は、好ましくは、本発明に従う二重特異性抗体で処置される。従って、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体がさらに提供され、この抗体は、1.000.000 未満のErbB-2細胞表面受容体を有するErbB-2およびErbB-3陽性細 胞のリガンド誘導性成長を低減できる。ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/E rbB-3陽性腫瘍を有する、またはこの腫瘍を有するリスクがある対象の処置のための方法もまた提供され、この腫瘍は、細胞1つ当たり1.000.000未満のErbB- 2細胞表面受容体を有し、この方法は、本発明に従う二重特異性抗体または医薬組成物を対象に投与することを含む。ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/Erb B-3陽性腫瘍を有する、またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、本発明に従う二重特異性抗体も また、本明細書で提供され、この腫瘍は、細胞1つ当たり1.000.000未満のErbB-2細胞表面受容体を有する。本発明に従う抗体は、典型的には、 ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体 機能、好ましくはリガンド誘導性成長を低減することが可能である。本発明に従う抗体 は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む。好ましい一実施 形態では、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、本明細書で 以下により詳細に説明するように、ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位 の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗 原結合部位の親和性は、好ましくは2.0nM以下、より好ましくは1.39nM以下 、より好ましくは0.99nM以下である。ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原 結合部位の親和性は、好ましくは5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、好まし くは4. 0nM以下である。
好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、T144、T164、R166、P1 72、G179、S180およびR181、ならびにT144、T164、R166、P 172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、好ましくは、R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-3のドメインIII の少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
腫瘍がErbB-3について陽性かどうかを確立するために、当業者は、例えば、Er bB-3増幅および/または免疫組織化学における染色を行うことできる。生検中に少なくとも10%の腫瘍細胞がある場合、陽性とすべきである。生検はまた、20%、30%、40%、50%、60%、70%またはそれ超の陽性細胞を含み得る。
本明細書で使用する場合、リガンド誘導性受容体機能は、少なくとも20%、好ましくは少なくとも30、40、50 60または少なくとも70%低減され、特に好ましい一実施形態では、このリガンド誘導性受容体機能は、80%、より好ましくは90%低減される。この低減は、好ましくは、本発明の二重特異性抗体の存在下でリガンド誘導性受容体機能を決定し、それを、他の点では同一の条件下で当該抗体の非存在下での同じ機能と比較することによって、決定される。これらの条件は、ErbB-3リガンドの存在を少なくとも含む。存在するリガンドの量は、好ましくは、ErbB-2およびErbB-3 陽性細胞株の最大成長の半分を誘導する量である。この試験のためのErbB-2およびErbB-3陽性細胞株は、好ましくは、MCF-7細胞株(ATCC(登録商標)HT B-22(商標))、SKBR3細胞株(ATCC(登録商標)HTB-30(商標)) 細胞、JIMT-1細胞株(DSMZ ACC 589)またはNCI-87細胞株(A TCC(登録商標)CRL-5822(商標))である。ErbB-3リガンド誘導性 受容体機能を決定するための試験および/またはリガンドは、好ましくは、実施例に特定されるような、ErbB-3リガンド誘導性成長低減についての試験である。
ErbB-2タンパク質は、いくつかのドメインを含む(Landgraf,R Breast Cancer Res.2007;9(1):202~の図1を、参考のために参照のこと)。これらの細胞外ドメインは、ドメインI~IVと呼ばれる。本明細書に記載される抗体の抗原結合部位のそれぞれのドメインへの結合の場所は、マッピングされている(実施例を参照のこと)。ErbB-2のドメインIまたはドメインIVに結合する抗原結合部位(第1の抗原結合部位)(第1の抗原結合部位)を有する本発明の二重特異性抗体は、種々の軽鎖と組み合わせた場合に、ErbB-2に対する顕著な結合特異性および親和性を維持する重鎖可変領域を含む。ErbB-2のドメインIまたはドメインIVに結合する抗原結合部位(第1の抗原結合部位)(第1の抗原結合部位)およびEr bB-3に対する抗原結合部位(第2の抗原結合部位)を有する二重特異性抗体は、Er bB-2の別の細胞外ドメインに結合する抗原結合部位(第1の抗原結合部位)を含む二重特異性抗体と比較した場合、ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減させるのにより有効であることが見出された。ErbB-2に結合する抗原結合部位(第1の抗原結合部位)を含む二重特異性抗体であって、この抗原結合部位が、ErbB-2のドメインIまたはドメインIVに結合する抗体が、好ましい。好ましくは、この抗原結合部位は
、ErbB-2のドメインIVに結合する。ErbB-2に結合し、ADCCをさらに 含む抗原結合部位(第1の抗原結合部位)を有する二重特異性抗体は、特にin vivoで顕著なADCC活性を有さなかった他のErbB-2結合抗体よりも、有効 であることが見出された。従って、ADCCを示す本発明に従う二重特異性抗体が好ましい。第1の抗原結合部位がErbB-2のドメインIVに結合する抗体は、固有のADCC活性を有することが見出された。低い固有のADCC活性を有する、ドメインI 結合性のErbB-2結合抗体は、ADCC活性を増強するために操作され得る。Fc領域は、免疫エフェクター細胞、例えば、マクロファージ、ナチュラル・キラー細胞、B細胞および好中球上の異なる受容体に結合することによって、抗体機能を媒介する。これらの受容体の一部、例えば、CD16A(FcγRIIIA)およびCD32A(FcγRIIA)は、細胞を活性化して、抗原に対する応答を構築させる。他の受容体、例えばCD32Bは、免疫細胞の活性化を阻害する。(アミノ酸置換を導入することによって)より高い選択性で活性化受容体に結合するFc領域を操作することによって、抗癌Mabによる所望の細胞傷害活性を媒介するより高い能力を有する抗体が創出され得る。
、ErbB-2のドメインIVに結合する。ErbB-2に結合し、ADCCをさらに 含む抗原結合部位(第1の抗原結合部位)を有する二重特異性抗体は、特にin vivoで顕著なADCC活性を有さなかった他のErbB-2結合抗体よりも、有効 であることが見出された。従って、ADCCを示す本発明に従う二重特異性抗体が好ましい。第1の抗原結合部位がErbB-2のドメインIVに結合する抗体は、固有のADCC活性を有することが見出された。低い固有のADCC活性を有する、ドメインI 結合性のErbB-2結合抗体は、ADCC活性を増強するために操作され得る。Fc領域は、免疫エフェクター細胞、例えば、マクロファージ、ナチュラル・キラー細胞、B細胞および好中球上の異なる受容体に結合することによって、抗体機能を媒介する。これらの受容体の一部、例えば、CD16A(FcγRIIIA)およびCD32A(FcγRIIA)は、細胞を活性化して、抗原に対する応答を構築させる。他の受容体、例えばCD32Bは、免疫細胞の活性化を阻害する。(アミノ酸置換を導入することによって)より高い選択性で活性化受容体に結合するFc領域を操作することによって、抗癌Mabによる所望の細胞傷害活性を媒介するより高い能力を有する抗体が創出され得る。
抗体のADCCを増強するための1つの技術は、非フコシル化である(例えば、Jun ttila,T.T.、K.Parsonsら(2010)、「Superior In vivo Efficacy of Afucosylated Trastuzumab in the Treatment of HER2-Amplified Breast Cancer」、Cancer Research 70(11):4481~4489を参照のこと)。従って、非フコシル化されている、本発明に従う二重特異性抗体が、さらに提供される。あるいは、またはさらに、例えば糖鎖工学(Kyowa H akko/Biowa、GlycArt(Roche)およびEureka Thera peutics)および変異誘発(XencorおよびMacrogenics)を含む複数の他の戦略が、ADCC増強を達成するために使用され得、これらの戦略は全て、低親和性活性化FcγRIIIaへのFc結合を改善し、および/または低親和性阻害性F cγRIIbへの結合を低減させようとするものである。
ADCCを惹起することにおける抗体またはエフェクター細胞の効力を決定するための、いくつかのin vitro方法が存在する。これらには、クロム-51[Cr51] 放出アッセイ、ユーロピウム[Eu]放出アッセイおよび硫黄-35[S35]放出アッセイがある。通常、表面に露出した特定の抗原を発現する標識された標的細胞株は、その抗原に特異的な抗体と共にインキュベートされる。洗浄後、Fc受容体CD16を発現するエフェクター細胞は、典型的には、抗体標識された標的細胞と共に共インキュベートされる。標的細胞溶解は、引き続いて、典型的には、例えば、シンチレーション・カウンターまたは分光光度法によって、細胞内標識の放出によって測定される。好ましい試験は、実施例中に詳述される。
本発明の1つの利点は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞への、例えばPB4 188などの本発明に従う抗体の結合が、トラスツズマブと比較して同じ程度までの内部移行を生じるという事実である。トラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせが使用される場合、これらの抗体の内部移行が増強される。しかし、この増強された内部移行は、低減されたADCCを生じる。従って、トラスツズマブと比較して本質的に同じ程度までの内部移行を生じる本発明に従う抗体は、トラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせよりも好ましいが、それは、かかる抗体を用いると、ADCC活性がより良く維持されるからである。
ErbB-3に結合する抗原結合部位を含む本発明の抗体は、ErbB-3へのErbB-3リガンドの結合を妨害する。かかる抗体は、特に、ErbB-2に結合する抗原 結合部位も含む二重特異性抗体において、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞株 上の ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減させるのに、より有効である。
本発明の好ましい実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびEr bB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、ErbB-2のドメインIに結合する。実施例に示されるように、これらの特徴を有する二重特異性抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞に結合し、 それらの活性(例えば、ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能ならびに ErbB-2およびErbB3陽性細胞のリガンド誘導性成長)に対抗することが十分に 可能である。さらに、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位を含む 本発明に従う二重特異性抗体は、トラスツズマブおよびペルツズマブなどの既存の抗ErbB-2治療と組み合わせた使用のために特に適切であるが、それは、トラスツズマブおよびペルツズマブが、ErbB-2の異なるドメインに結合するからである。トラ スツズマブは、ErbB-2のドメインIVに結合し、ペルツズマブは、ErbB-2のドメインIIに結合する。従って、ErbB-2のドメインIに結合する本発明に従う二重特異性抗体が好ましいが、それは、これらが、同じエピトープについてトラスツズマブおよびペルツズマブと競合しないからである。
別の好ましい一実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第2の抗原結合部位は、ErbB-3のドメインIIIに結合する。本発明に従うかかる抗体は、Er bB-3のドメインIIIに結合しない現在使用されている抗ErbB-3結合分子、 例えば、ErbB-3のドメインIに結合するMM-121(Merrimack Pha rmaceuticals;#Ab6とも呼ばれる)およびRG7116(Roche)との組み合わせ治療に特に適切であるが、それは、これらの異なる結合分子が、同じエピトープについて互いと競合しないからである。
好ましくは、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体が提供され、この第1の抗原結合部位は、E rbB-2のドメインIに結合し、第2の抗原結合部位は、ErbB-3のドメインII Iに結合する。かかる抗体は、ErbB-2のドメインIに結合しない抗ErbB-2結合分枝、例えば、トラスツズマブおよびペルツズマブとの、ならびにErbB-3のド メインIIIに結合しない抗ErbB-3結合分子、例えば、 MM-121(#Ab6)およびRG7116との組み合わせ治療に特に適切である。
好ましい一実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB- 3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、ErbB-2のドメインIに結合し、第2の抗原結合部位は、ErbB-3のド メインIIIに結合し、この抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上の Erb B-3のリガンド誘導性受容体機能を低減できる。この抗体は、好ましくは、ErbB- 2およびErbB-3陽性細胞のリガンド誘導性成長を低減できる。
本発明のさらなる実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびEr bB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、ErbB-3 陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、ErbB-2陽性細胞に対す る第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。例えば、ErbB-3に対してよりもErbB-2に対してより高い親和性を有する、Merrimack P harmaceuticalsのMM-111などの先行技術の二重特異性化合物とは対照的に、本発明は、細胞上のErbB-2に対するErbB-2特異的アームの親和性よりも高い、細胞上のErbB-3に対する親和性 を有するErbB-3特異的アームを有する二重特異性抗体を提供する。かかる二重特異 性抗体は、ErbB-3の低い細胞表面濃度にもかかわらず、ErbB-3をより良く結合することが可能である。これは、Er bB-3に対する機能的活性が、先行技術の化合物と比較して増強されるという利点を提供し、これは、本発明に従うこれらの二重特異性抗体が、ErbB-3活性(例えば、リガンド誘導性成長)により良く対抗することが可能であることを意味する。
本明細書で使用する場合、用語「親和性」とは、KD値を指す。
ErbB-3陽性細胞に対する上記第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、好ましくは2.0nM以下、より好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である。好ましい一実施形態では、SK-BR-3細 胞上のErbB-3に対するこの第2の抗原結合部位の親和性は、2.0nM以下、より 好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1.39nM以下、好ましくは0.99nM 以下である。一実施形態では、この親和性は、1.39~0.59nMの範囲内である。好ましい一実施形態では、BT-474細胞上のErbB-3に対するこの第2の抗原 結合部位の親和性は、2.0nM以下、より好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1. 0nM以下、より好ましくは0.5nM未満、より好ましくは0.31nM以下、より好ましくは0.23nM以下である。一実施形態では、この親和性は、0.31~0.15 nMの範囲内である。上述の親和性は、好ましくは、定常状態細胞親和性測定を使用して測定され、ここで、実施例に記載されるように、細胞は、放射活性標識された抗体を使用して4℃でインキュベートされ、その後、細胞に結合した放射活性が測定される。
ErbB-2陽性細胞に対する上記第1の抗原結合部位の親和性(KD)は、好ましくは5.0nM以下、より好ましくは4.5nM以下、より好ましくは3.9nM以下である。好ましい一実施形態では、SK-BR-3細胞上のErbB-2に対するこの第1の 抗原結合部位の親和性は、5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.5nM以下、より好ましくは3.0nM以下、より好ましくは2.3nM以下である。一実施形態では、この親和性は、3.0~1.6nM の範囲内である。好ましい一実施形態では、BT-474細胞上のErbB-2に対す るこの第1の抗原結合部位の親和性は、5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、よ り好ましくは3.9nM以下である。一実施形態では、この親和性は、4.5~3.3nMの範囲内である。上述の親和性は、好ましくは、定常状態細胞親和性測定を使用して測定され、ここで、実施例に記載されるように、細胞は、放射活性標識された抗体を使用して 4℃でインキュベートされ、その後、細胞に結合した放射活性が測定される。
好ましい一実施形態では、本発明に従う二重特異性抗体が提供され、BT-474細胞に対するこの二重特異性抗体の親和性(KD)は、5.0nM以下、好ましくは4.5n M以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.5nM以下、より好ましくは3.7nM以下、好ましくは3.2nM以下である。一実施形態では、この親和性は、3.7~2.7nMの範囲内である。好ましい一実施形態では、本発明に従う二重特異性抗体が提供され、SK-BR-3細胞に対するこの二重特異性抗体の親和性は、5.0n M以下、好ましくは4.5nM以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.5nM以下、より好ましくは3.0nM以下、好ましくは2.5nM以下、より好ましくは2.0nM以下である。一実施形態では、この親和性は、2.4~1.6nMの範囲内である。重ねて、上述の親和性は、好ましくは、定常状態細胞親和性測定を使用して測定され、ここで、実施例に記載されるように、細胞は、放射活性標識された抗体を使用して4℃でインキュベートされ、その後、細胞に結合した放射活性が測定される。
本発明のさらに好ましい実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、ErbB-2陽性細胞 に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高く、この抗体は、E rbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減できる。この抗体は、好ましくは、ErbB-2およびErbB-3陽性細 胞のリガンド誘導性成長を低減できる。
上述の、ErbB-3に対する高い親和性を有する本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB2のドメインIおよび/またはErbB-3のドメインIIIに結合する。従って、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結 合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う二重特異性抗体がさらに提供され、Erb B-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれより も高い。ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う二重特異性抗体もまた提供され、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。特に好ましい一実施形態では、Erb B-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う二重 特異性抗体が提供され、Erb B-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれ よりも高い。
この第2の抗原結合部位は、好ましくは、ErbB-3のドメインIIIに結合し、2.0nM以下、より好ましくは1.5nM以下、好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である、ErbB-3陽性細胞に対する親和性(KD)を有する。好ましい一実施形態では、この第2の抗原結合部位は、ErbB-3のドメインIII に結合し、2.0nM以下、より好ましくは1.5nM以下、好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である、SK-BR-3細胞上のErbB-3に対 する親和性を有する。一実施形態では、この親和性は、1.39~0.59nMの範囲内である。好ましい一実施形態では、この第2の抗原結合部位は、ErbB-3のドメインIIIに結合し、2.0nM以下、より好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1. 0nM以下、より好ましくは0.5nM以下、より好ましくは0.31nM以下、より好ましくは0.23nM以下である、BT-474細胞上のErbB-3に対する親和性を有する。一実施形態では、この親和性は、0.31~0.15nMの範囲内である。
この第1の抗原結合部位は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合し、5.0 nM以下、より好ましくは4.5nM以下、より好ましくは3.9nM以下である、Er bB-2陽性細胞に対する親和性(KD)を有する。好ましい一実施形態では、この第1 の抗原結合部位は、ErbB-2のドメインIに結合し、5.0nM以下、より好ましくは4.5nM以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.5nM以下、より好ましくは3.0nM以下、より好ましくは2.5nM以下、より好ましくは2.3n M以下である、SK-BR-3細胞上のErbB-2に対する親和性を有する。一実施形 態では、この親和性は、3.0~1.6nMの範囲内である。SK-BR-3細胞に対 するこの二重特異性抗体の親和性は、好ましくは5.0nM以下、より好ましくは 4.5n M以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.5nM以下、より好ましくは3.0nM以下、より好ましくは2.5nM以下、より好ましくは2.4nM以下、より好ましくは2.0nM以下である。一実施形態では、この親和性は、2.4~1.6n Mの範囲内である。
好ましい一実施形態では、この第1の抗原結合部位は、ErbB-2のドメインIに結合し、5.0nM以下、より好ましくは4.5nM以下、好ましくは3.9nM以下である、BT-474細胞上のErbB-2に対する親和性(KD)を有する。一実施形態では、この親和性は、4.5~3.3nMの範囲内である。BT-474細胞に対するこ の二重特異性抗体の親和性は、好ましくは5.0nM以下、より好ましくは4.5nM以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.7nM以下、より好ましくは3. 2nM以下である。一実施形態では、この親和性は、3.7~2.7nMの範囲内である。
重ねて、上述の親和性は、好ましくは、定常状態細胞親和性測定を使用して測定され、ここで、実施例に記載されるように、細胞は、放射活性標識された抗体を使用して4℃でインキュベートされ、その後、細胞に結合した放射活性が測定される。
別の好ましい一実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う二重特異性抗体を提供し、この抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減でき、この二重特異性抗体は、心筋細胞の生存に顕著には影響を与えない。心臓毒性は、ErbB-2標的化治療における公知の危険因子であり、合併症の頻度は、トラスツズマブがアントラサイクリンと併せて使用され、それによって、心臓負荷を誘導する場合に、増加する。例えば、ドキシサイクリン(DOX)とトラスツズマブとの組み合わせは、重症の心臓副作用を誘導する。臨床研究により、乳癌のアジュバント設定においてトラスツズマブを投与される患者の5%~10%が、心機能不全を発症すると推定されている(Guarneriら、J Clin Oncol.、1985、3:81 8~26;Ewer MSら、Nat Rev Cardiol 2010;7:564~75)。しかし、レトロスペクティブ研究において、無症候性心機能不全を発症するリスクが、実際には、トラスツズマブがDOXと共にアジュバント設定において使用される場合、約25%もの高さであることが実証された(Wadhwaら、Breast Ca ncer Res Treat 2009;117:357~64)。実施例に示されるように、本発明は、ErbB-2を標的化し、心筋細胞の生存に影響を与えない、またはトラスツズマブおよびペルツズマブと比較して、顕著に低い程度までしか影響を与えない、抗体を提供する。心臓毒性が低減されるので、これは、重要な利点を提供する。これは、障害された心機能に罹患していない人々にとって既に有利であり、障害された心機能に罹患している人々またはそのリスクがある人々、例えば、うっ血性心不全(CHF)、左室機能不全(LVD)および/もしくは10%以上減少した左室駆出分画(LVEF)に罹患している対象、ならびに/または心筋梗塞を有している対象などにとっては、さらにいっそう有利である。従って、心筋細胞の生存に顕著には影響を与えない本発明に従う抗体が、好ましい。in vitroでは、心筋細胞の機能は、例えば、心筋細胞の生存度を決定することによって、BNP(B型ナトリウム利尿ペプチド、心バイオマーカーである)を決定することによって、QT延長を決定することによって、および/またはミトコンドリア膜電位を決定することによって、測定される。
本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む。一実施形態は、心筋細胞の生存に顕著には影響を与えない、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う抗体を提供し、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、ErbB-2 陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。Er bB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、好ましくは2.0nM以下、より好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である。ErbB- 2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性は、好ましくは5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、好ましくは4.0nM以下である。
好ましい一実施形態では、心筋細胞の生存に顕著には影響を与えない抗体は、以下を含む:
・図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF184 9;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2 916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、M F3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の、少なくともCDR3配列、好ましくは、少なくともCDR1、CD R2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列;ならびに/あるいは
・図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF317 6;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6 057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;M F6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF 6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域の、少なくともCD R3配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列。好ましい一実施形態では、この抗体は、PB4188である。
・図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF184 9;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2 916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、M F3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の、少なくともCDR3配列、好ましくは、少なくともCDR1、CD R2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列;ならびに/あるいは
・図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF317 6;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6 057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;M F6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF 6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域の、少なくともCD R3配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列。好ましい一実施形態では、この抗体は、PB4188である。
本発明の別の一態様は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB- 3に結合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う抗体を提供し、この抗体は、T1 44、T164、R166、P172、G179、S180およびR181、ならびにT 144、T164、R166、P172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、E rbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸残基に結合する抗原結合部位を含む。アミノ酸残基番号付けは、Protein Data Bank(PDB)ID #1 S78のものである。実施例に示されるように、ErbB-2のドメインIのこの領域に結合する抗体は、特に良好な結合特徴を示し、これらは、ErbB-2陽性細胞の活性( 例えば、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受 容体機能ならびに/またはかかる細胞のリガンド誘導性成長)に対抗することが可能である。さらに、かかる抗体は、トラスツズマブ(ErbB-2のドメインIVに結合する) およびペルツズマブ(ErbB-2のドメインIIに結合する)などの現在公知の抗 Er bB-2モノクローナル抗体との組み合わせ治療に特に適切であるが、それは、これらが、ErbB-2の異なるドメインに結合するからである。従って、これらの抗体は、同じエピトープについての競合なしに、同時に使用できる。用語「T144、T164、R1 66、P172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基」とは、列挙された残基に隣接する最初の約5つのアミノ酸残基以内に位置する一次アミノ酸配列中にあり、タンパク質の外側に少なくとも一部露出しており、その結果、抗体によって結合され得る、アミノ酸残基を指す(例えば図2 1Bを参照のこと)。好ましくは、T144、T164、R166、P172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置するアミノ酸残基は、L13 9、C140、Y141、Q142、D143、I145、L146、W147、K14 8、D149、L159、T160、L161、I162、D163、N165、S16 7、R168、A169、C170、H171、C173、S174、P175、M17 6、C177、K178、C182、W183、G184、E185およびS186からなる群から選択される。好ましくは、この抗体は、T144、T164、R166、P1 72、G179、S180およびR181、ならびにT144、T164、R166、P 172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも2つまたは少なくとも3つのアミノ酸残基に結合する抗原結合部位を含む。
好ましい一実施形態では、本発明に従う二重特異性抗体が提供され、この抗体は、Er bB-2のドメインIのT144、R166およびR181を少なくとも結合する抗原結合部位を含む。別の一実施形態は、本発明に従う二重特異性抗体を提供し、この抗体は、ErbB-2のドメインIのT144、R166、P172、G179およびR181を少なくとも結合する抗原結合部位を含む。別の一実施形態は、本発明に従う二重特異性抗体を提供し、この抗体は、ErbB-2のドメインIのT144、T164、R166、P172、G179、S180およびR181を少なくとも結合する抗原結合部位を含む。
本発明の別の一態様は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB- 3に結合する第2の抗原結合部位を含む抗体を提供し、この抗体は、R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-3のドメインI IIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。アミノ酸残基番号付けは、Protein Data Bank(PDB)ID #4P59のものである。実施例に示されるように、ErbB-3のドメインIIIのこの領域に結合する抗体は、特に良好な結合特徴を示し、これらは、ErbB-3陽性細胞の活性(例えば、ErbB- 2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能ならびに /またはかかる細胞のリガンド誘導性成長)に対抗することが可能である。用語「ネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置す る、表面に露出したアミノ酸残基」とは、R426から11.2Å以内に空間的に位置するE rbB-3タンパク質の三次構造中にあり、タンパク質の外側に少なくとも一部露出しており、その結果、抗体によって結合され得る、アミノ酸残基を指す。好ましくは、ネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に 位置するアミノ酸残基は、L423、Y424、N425、G427、G452、R453、Y4 55、E480、R481、L482、D483およびK485からなる群から選択される(例えば、図21Cおよび表15を参照のこと)。好ましい一実施形態では、本発明に従う二重特異性抗体が提供され、この抗体は、ErbB-3のドメインIIIのR426と少なくとも結合する抗原結合部位を含む。好ましくは、この抗体は、ErbB-3のドメインIIIのR426と少なくとも結合する抗原結合部位を含む。
本発明の二重特異性抗体は、好ましくは、ADCC活性を増強するために非フコシル化されている。本発明の二重特異性抗体は、好ましくは、正常CHO細胞中で産生される同じ抗体と比較した場合、Fc領域中に、N結合型炭水化物構造の、低減された量のフコシル化を含む。
本発明の二重特異性抗体は、好ましくは、ヒトにおいて使用される。この目的のために、本発明の二重特異性抗体は、好ましくは、ヒトまたはヒト化抗体である。
ポリペプチドに対するヒトの寛容は、多くの異なる局面によって支配される。T細胞媒介性、B細胞媒介性などである免疫は、ポリペプチドに対するヒトの寛容に包含される変数の1つである。本発明の二重特異性抗体の定常領域は、好ましくは、ヒト定常領域である。この定常領域は、天然に存在するヒト抗体の定常領域と、1または複数の、好ましくは10以下の、好ましくは5アミノ酸以下の差異を含み得る。定常部分が、天然に存在するヒト抗体に完全に由来することが好ましい。本明細書で産生される種々の抗体は、ヒト抗体可変ドメイン・ライブラリーに由来する。かかるこれらの可変ドメインは、ヒトのものである。ユニークなCDR領域は、ヒト由来、合成、または別の生物由来であり得る。可変領域は、CDR領域を別にして、天然に存在するヒト抗体の可変領域のアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を有する場合、ヒト可変領域とみなされる。本発明の抗体中のErbB-2に結合するVH、ErbB-3に結合するVHまたは軽鎖の可変領域は、 C DR領域のアミノ酸配列中の潜在的差異を数に入れずに、天然に存在するヒト抗体の可変領域と、1または複数の、好ましくは10以下の、好ましくは5アミノ酸以下の差異を含み得る。かかる変異は、体細胞超変異に関しても天然に存在する。
抗体は、重鎖可変領域に関しては少なくとも、種々の動物種由来であり得る。例えば、マウス重鎖可変領域などをヒト化することは、一般的実務である。マウス重鎖可変領域の3D構造とマッチする3D構造を有するヒト重鎖可変領域中へのCDR移植;マウス重鎖可変領域から既知のまたは疑わしいT細胞エピトープまたはB細胞エピトープを除去することによって好ましくは実施される、マウス重鎖可変領域の脱免疫化がその中にある、これが達成され得る種々の方法が存在する。この除去は、典型的には、エピトープ中のアミノ酸のうちの1または複数を、別の(典型的には保存的)アミノ酸に置換することによるものであり、その結果、エピトープの配列は、もはやT細胞エピトープでもB細胞エピトープでもないように、改変される。
かかる脱免疫化されたマウス重鎖可変領域は、元のマウス重鎖可変領域よりも、ヒトにおいて免疫原性が低い。好ましくは、本発明の可変領域またはドメインは、さらにヒト化、例えば、ベニヤ化(veneered)などされる。ベニヤ化技術を使用することによって、免疫系が容易に遭遇する外面残基は、弱い免疫原性のベニヤ化表面または実質的に非免疫原性のベニヤ化表面のいずれかを含むハイブリッド分子を提供するために、ヒト残基で選択的に置き換えられる。本発明において使用される動物は、好ましくは哺乳動物、より好ましくは霊長類、最も好ましくはヒトである。
本発明に従う二重特異性抗体は、好ましくは、ヒト抗体の定常領域を含む。重鎖定常ドメインにおける差異に従って、抗体は、5つのクラスまたはアイソタイプにグループ分けされる:IgG、IgA、IgM、IgDおよびIgE。これらのクラスまたはアイソタイプは、対応するギリシャ文字を用いて名付けられた、上記重鎖のうち少なくとも1つを含む。好ましい一実施形態では、本発明は、本発明に従う抗体を提供し、その定常領域は、IgG、IgA、IgM、IgDおよびIgEの定常領域の群から選択され、より好ましくは、この定常領域は、IgG定常領域、より好ましくはIgG1定常領域、好ましくは変異したIgG1定常領域を含む。例えば、アロタイプG1m1、17およびG1m3 などの、IgG1の定常領域におけるいくつかのバリエーションが、天然に存在し、ならびに/または得られた抗体の免疫学的特性を変化させることなしに許容される。典型的には、約1~10のアミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせが、定常領域において許容される。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する可変ドメインを含む抗体を提供し、この抗体は、図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF 1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF184 7、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域のCDR3配列を少なくとも含み、またはこの抗体は、図16A もしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF39 91、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF 3003およびMF1898からなる群から選択されるVHのCDR3配列と、多くて3 つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは1つ以下のアミノ酸が異なる重鎖CDR3配列を含む。この抗体は、好ましくは、MF1849、MF2971、MF3958、MF30 04またはMF3991の少なくともCDR3配列を含み、最も好ましくはMF3958 の少なくともCDR3配列を含む。
この抗体は、好ましくは、図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2 930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、M F3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、またはMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF303 1、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003もしくはMF1898のCDR1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは多くて1つのアミノ酸が異なる、重鎖CDR1、CDR2およびCD R3配列を含む。この抗体は、好ましくは、MF1849、MF2971、MF3958、MF3004またはMF3991の少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列を含み、最も好ましくはMF3958の少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む。
本発明は、ErbB-3に結合する可変ドメインを含む抗体もまた提供し、この抗体は、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;M F3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF60 63;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF 6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF607 4からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域のCDR3配列を少なくとも含み、またはこの抗体は、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3 178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;M F6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF60 67;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF 6073およびMF6074からなる群から選択されるVHのCDR3配列と、多くて3 つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは1つ以下のアミノ酸が異なる重鎖CDR3配列を含む。この抗体は、好ましくは、MF3178、MF3176、MF3163、MF60 58、MF6061またはMF6065の少なくともCDR3配列を含み、最も好ましくはMF3178の少なくともCDR3配列を含む。
この抗体は、好ましくは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3 178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;M F6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF60 67;MF068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF 6073およびMF6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域のCDR1、CDR2およびCDR3配列、またはMF3178;MF3176;MF3 163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;M F6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF60 69;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF6074 のCDR1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは多くて1つのアミノ酸が異なる、重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列を、少なくとも含む。この抗体は、好ましくは、MF3178、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061またはMF6065の少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列を含み、最も好ましくは、MF3178の少なくともCDR1、CDR2 およびCDR3配列を含む。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF18 49;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF 2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2 特異的重鎖可変領域のCDR3配列、または図16Aもしくは図16Eに示されるMF2 926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、M F2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるVHのCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは1つ以下のアミノ酸が異なる、重鎖CDR3配列を少なくとも含み、第2の抗原結合部位は、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF317 6;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;M F6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF 6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域のCDR3配列、または図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176; MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF605 7;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6 063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;M F6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF60 74からなる群から選択されるVHのCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2 つ、好ましくは1つ以下のアミノ酸が異なる重鎖CDR3配列を少なくとも含む。この第1の抗原結合部位は、好ましくは、MF1849、MF2971、MF3958、MF3 004またはMF3991の少なくともCDR3配列、最も好ましくは、MF3958の少なくともCDR3配列を含み、第2の抗原結合部位は、好ましくは、MF3178、M F3176、MF3163、MF6058、MF6061またはMF6065の少なくともCDR3配列、最も好ましくは、MF3178の少なくともCDR3配列を含む。
この第1の抗原結合部位は、好ましくは、図16Aもしくは図16Eに示されるMF2 926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、M F2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域のCDR1、CDR2およびCDR 3配列、またはMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF300 4、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3 031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003もしくはMF1898のCDR1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは多くて1つのアミノ酸が異なる、重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含み、第2の抗原結合部位は、好ましくは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3 099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;M F6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF60 70;MF6071;MF6072;MF6073およびMF6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域のCDR1、CDR2およびCDR3配列、または図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176; MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF605 7;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6 063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;M F6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF6 074のCDR1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは多くて1つのアミノ酸が異なる、重鎖CDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含む。この第1の抗原結合部位は、好ましくは、MF1849、MF29 71、MF3958、MF3004またはMF3991の少なくともCDR1、CDR2 およびCDR3配列、最も好ましくは、MF3958の少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列を含み、第2の抗原結合部位は、好ましくは、MF3178、MF31 76、MF3163、MF6058、MF6061またはMF6065の少なくともCD R1、CDR2およびCDR3配列、最も好ましくは、MF3178の少なくともCDR 1、CDR2およびCDR3配列を含む。
好ましい一実施形態は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、MF3958のCDR3配列、またはMF3958のCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは1つ以下のアミノ酸が異なるCDR3配列を少なくとも含み、第2の抗原結合部位は、MF3178のCDR3配列、またはMF3178のCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは1つ以下のアミノ酸が異なるCDR3配列を少なくとも含む。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、MF3958のCDR1、CDR2およびCDR3配列、またはMF3958 のCDR1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは多くて1つのアミノ酸が異なるCDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含み、第2の抗原結合部位は、MF3178のCDR1、CDR2およびCDR3配列、またはMF3178のCDR1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3つ、好ましくは多くて2つ、好ましくは多くて1つのアミノ酸が異なるCDR1、CDR2およびC DR3配列を少なくとも含む。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、MF3958のCDR3配列を少なくとも含み、第2の抗原結合部位は、MF 3178のCDR3配列を少なくとも含む。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を提供し、この第1の抗原結合部位は、MF3958のCDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含み、第2の抗原結合部位は、MF3178のCDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含む。
CDR配列は、好ましくは、抗体の結合効力または安定性を改善するために、例えば、最適化目的のために変化させられる。最適化は、例えば変異誘発手順によって実施され、その後、得られた抗体の安定性および/または結合親和性が好ましくは試験され、改善されたErbB-2またはErbB-3特異的CDR配列が好ましくは選択される。当業 者は、本発明に従う少なくとも1つの変更されたCDR配列を含む抗体バリアントを作製することが十分に可能である。例えば、保存的アミノ酸置換が適用される。保存的アミノ酸置換の例には、イソロイシン、バリン、ロイシンまたはメチオニンなどの1つの疎水性残基の、別の疎水性残基への置換、および1つの極性残基の別の極性残基への置換、例えば、アルギニンのリジンへの置換、グルタミン酸のアスパラギン酸への置換、またはグルタミンのアスパラギンへの置換が含まれる。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する可変ドメインを含む抗体を提供し、この可変ドメインのVH鎖は、図16Aもしくは図16Eに示されるVH鎖MF292 6;MF2930;MF1849;MF2973;MF3004;MF3958(ヒト化MF2971である);MF2971;MF3025;MF2916;MF3991(ヒト化MF3004である);MF3031;MF2889;MF2913;MF1847;MF3001、MF3003もしくはMF1898のアミノ酸配列を含み、または図1 6Aもしくは図16Eの上述のVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aもしくは図16Eに示されるVH鎖MF2926;MF2930;MF1849;MF2973; MF3004;MF3958(ヒト化MF2971である);MF2971;MF3025;MF2916;MF3991(ヒト化MF3004である);MF3031;MF2 889;MF2913;MF1847;MF3001、MF3003もしくはMF189 8のアミノ酸配列を含む。ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Aに示されるように、以下のアミノ酸配列を含む:
・MF1849;または
・MF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;または
・MF3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3991のアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、以下のアミノ酸配列を含む:VH鎖MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはMF3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3991のアミノ酸配列を含み、ここで、列挙されたVH配列は、図16A に示されるそれぞれの配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは多くて1、2、3、4または5アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせを有する。好ましい一実施形態では、ErbB-2 に結合する可変ドメインのVH鎖は、MF3958のアミノ酸配列を含み、またはこのV H鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるMF3958のアミノ酸配列を含む。ErbB-2に結合する可変ドメインを含む抗体は、好ましくは、ErbB-3 に結合する可変ドメインを好ましくはさらに含む二重特異性抗体である。Erb-B3に 結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF33 07;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF 6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065; MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF607 1;MF6072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含み、または図16Bもしくは図16Eもしくは図37のVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16 Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF 3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057; MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF606 3;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6 069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF607 4のアミノ酸配列を含む。Erb-B3に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、MF3178、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061もしくはM F6065のアミノ酸配列を含み、または図16Bもしくは図37のそれぞれのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、MF3178、MF3176、MF3163、MF605 8、MF6061もしくはMF6065のアミノ酸配列を含む。好ましい一実施形態では、ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、MF3178のアミノ酸配列を含み、またはこのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるMF3178のアミノ酸配列を含む。好ましくは、上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、CDR3 領域中には存在しない。上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、好ましくは、CDR1およびCDR2領域中にも存在しない。上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、好ましくは、FR4領域中にも存在しない。
・MF1849;または
・MF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;または
・MF3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3991のアミノ酸配列を含む。
一実施形態では、ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、以下のアミノ酸配列を含む:VH鎖MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはMF3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3991のアミノ酸配列を含み、ここで、列挙されたVH配列は、図16A に示されるそれぞれの配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは多くて1、2、3、4または5アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせを有する。好ましい一実施形態では、ErbB-2 に結合する可変ドメインのVH鎖は、MF3958のアミノ酸配列を含み、またはこのV H鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるMF3958のアミノ酸配列を含む。ErbB-2に結合する可変ドメインを含む抗体は、好ましくは、ErbB-3 に結合する可変ドメインを好ましくはさらに含む二重特異性抗体である。Erb-B3に 結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF33 07;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF 6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065; MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF607 1;MF6072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含み、または図16Bもしくは図16Eもしくは図37のVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16 Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF 3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057; MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF606 3;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6 069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF607 4のアミノ酸配列を含む。Erb-B3に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、MF3178、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061もしくはM F6065のアミノ酸配列を含み、または図16Bもしくは図37のそれぞれのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、MF3178、MF3176、MF3163、MF605 8、MF6061もしくはMF6065のアミノ酸配列を含む。好ましい一実施形態では、ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、MF3178のアミノ酸配列を含み、またはこのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるMF3178のアミノ酸配列を含む。好ましくは、上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、CDR3 領域中には存在しない。上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、好ましくは、CDR1およびCDR2領域中にも存在しない。上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、好ましくは、FR4領域中にも存在しない。
本発明は、ErbB-3に結合する可変ドメインを含む抗体をさらに提供し、この可変領域のVH鎖は、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF317 8;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6 056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;M F6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF60 73もしくはMF6074のアミノ酸配列を含み、またはこのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178; MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF605 6;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6 062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;M F6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073 もしくはMF6074のアミノ酸配列を含む。ErbB3に結合する可変ドメインのVH 鎖は、好ましくは、VH鎖MF3178、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061もしくはMF6065のアミノ酸配列を含み、またはこのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、VH鎖MF3178、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061もしくはMF6065のアミノ酸配列を含む。好ましい一実施形態では、ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、図16Bに示されるVH鎖MF317 8のアミノ酸配列を含み、またはこのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列を含む。ErbB-3に結合する可変ドメインを含む抗体は、好ましくは、ErbB-2に結合する可変ドメインを好ましくはさらに含む二重特異性抗体である。ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Aもしくは図16EのVH鎖のアミノ酸配列を含む。ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Aに示されるように、以下のアミノ酸配列を含む:MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはMF3 004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3991のアミノ酸配列を含む。一実施形態では、列挙されたErb-B2結合VH 配列は、図16Aに示されるそれぞれの配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10、より好ましくは多くて1、2、3、4または5 アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせを有する。好ましい一実施形態では、図16AのErbB-2結合VH鎖は、MF3958のアミノ酸配列を含み、またはこのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9 もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、MF3958のアミノ酸配列を含む。好ましくは、上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、CDR3領域中には存在しない。上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、好ましくは、CDR1およびCDR2領域中にも存在しない。上述のアミノ酸の挿入、欠失および置換は、好ましくは、FR4領域中にも存在しない。
本発明に従う抗体がさらに提供され、この抗体は、図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF39 58、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF 2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003およびMF189 8の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域配列を含み、またはこの抗体は、MF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF399 1、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3 003もしくはMF1898の重鎖可変領域配列と、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる、重鎖可変領域配列を含む。
本発明に従う抗体がさらに提供され、この抗体は、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF33 07;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF 6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065; MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF607 1;MF6072;MF6073およびMF6074の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域配列を含み、またはこの抗体は、MF317 8;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6 056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;M F6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF60 73もしくはMF6074の重鎖可変領域配列と、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5 アミノ酸が異なる、重鎖可変領域配列を含む。
本発明は、一実施形態では、ErbB-2に結合する2つの抗原結合部位を含む抗体を提供し、これらの抗原結合部位のうち少なくとも一方は、ErbB-2のドメインIに結合する。好ましくは、両方の抗原結合部位が、ErbB-2のドメインIに結合する。本発明に従うかかる抗体は、ErbB-2のドメインIに結合しない現在使用されている抗ErbB-2結合分子、例えば、ErbB-2のドメインIVに結合するトラスツズマ ブおよびErbB-2のドメインIIに結合するペルツズマブとの組み合わせ治療に特に 適切であるが、それは、これらの異なる結合分子が、同じエピトープについて互いと競合しないからである。
ErbB-2に結合する2つの抗原結合部位を含む抗体がさらに提供され、これらの抗原結合部位のうち少なくとも一方は、ErbB-2のドメインIに結合し、ErbB-2 陽性細胞に対するこの少なくとも一方の抗原結合部位の親和性(KD)は、5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、より好ましくは3.9nM以下である。好ましくは、両方の抗原結合部位が、ErbB-2のドメインIに結合する。好ましい一実施形態では、SK-BR-3細胞上のErbB-2に対するこの少なくとも一方の抗原結合部位の親和 性は、5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、より好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.5nM以下、より好ましくは3.0nM以下、より好ましくは2.3n M以下である。一実施形態では、この親和性は、3.0~1.6nMの範囲内である。好ましい一実施形態では、BT-474細胞上のErbB-2に対するこの少なくとも一 方の抗原結合部位の親和性は、5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、より好まし くは3.9nM以下である。一実施形態では、この親和性は、4.5~3.3nMの範囲内である。
上述の親和性は、好ましくは、定常状態細胞親和性測定を使用して測定され、ここで、実施例に記載されるように、細胞は、放射活性標識された抗体を使用して4℃でインキュベートされ、その後、細胞に結合した放射活性が測定される。
本発明は、ErbB-2に結合する2つの可変ドメインを含む抗体をさらに提供し、これらの可変ドメインのVH鎖は、図16Aもしくは図16Eに示されるVH鎖MF292 6;MF2930;MF1849;MF2973;MF3004;MF3958(ヒト化MF2971である);MF2971;MF3025;MF2916;MF3991(ヒト化MF3004である);MF3031;MF2889;MF2913;MF1847;MF3001、MF3003もしくはMF1898のアミノ酸配列、または図16Aもしくは図16Eに示されるそれぞれの配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aもしくは図16Eに示されるVH鎖MF2926;MF2930;MF1849;MF2973; MF3004;MF3958(ヒト化MF2971である);MF2971;MF302 5;MF2916;MF3991(ヒト化MF3004である);MF3031;MF2 889;MF2913;MF1847;MF3001、MF3003もしくはMF189 8のアミノ酸配列を含む。このVHは、好ましくは、以下のアミノ酸配列を含む:VH鎖MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはMF3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、図16A に示されるMF3991のアミノ酸配列を含む、;あるいは、このVHは、以下のアミノ酸配列を含む:VH鎖MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む; またはMF3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、図16Aに示されるそれぞれの配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるMF3991のアミノ酸配列を含む。抗体のこれらの可変ドメインは、好ましくは、図16Aまたは図16Eに示される配列を好ましくは有する、同一のVH鎖を含む。同一のVH鎖を有する可変ドメインを有する抗体は、二重特異性抗体ではない。VH鎖は、図16Aもしくは図16Eもしくは図37に示されるのと同じVH鎖配列、または図1 6Aもしくは図16Eもしくは図37に示されるそれぞれの配列に関して、1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを別にして同じV H鎖配列を含む場合、本発明にとって同一である。
本発明は、一実施形態では、ErbB-3に結合する2つの抗原結合部位を含む抗体を提供し、これらの抗原結合部位のうち少なくとも一方は、ErbB-3のドメインIII に結合する。好ましくは、両方の抗原結合部位が、ErbB-3のドメインIIIに結合する。本発明に従うかかる抗体は、ErbB-3のドメインIIIに結合しない現在使用されている抗ErbB-3結合分子、例えば、ErbB-3のドメインIに結合するMM-121(#Ab6)およびRG7116との組み合わせ治療に特に適切であるが、それは、これらの異なる結合分子が、同じエピトープについて互いと競合しないからである。
ErbB-3に結合する2つの抗原結合部位を含む抗体がさらに提供され、これらの抗原結合部位のうち少なくとも一方は、ErbB-3のドメインIIIに結合し、ErbB-3陽性細胞に対するこの少なくとも一方の抗原結合部位の親和性(KD)は、2.0n M以下、好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である。好ましくは、両方の抗原結合部位が、ErbB-3のドメインIIIに結合する。好ましい一実施形態では、SK-BR-3細胞上のErbB-3に対 するこの少なくとも一方の抗原結合部位の親和性は、2.0nM以下、好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である。一実施形態では、この親和性は、1.39~0.59nMの範囲内である。好ましい一実施形態では、BT-474細胞上のErbB-3に対するこの少なくとも一方の抗原結 合部位の親和性は、2.0nM以下、より好ましくは1.5nM以下、より好ましくは1. 0nM以下、より好ましくは0.5nM以下、より好ましくは0.31nM以下、より好ましくは0.23nM以下である。一実施形態では、この親和性は、0.31~0.15 nMの範囲内である。
重ねて、上述の親和性は、好ましくは、定常状態細胞親和性測定を使用して測定され、ここで、実施例に記載されるように、細胞は、放射活性標識された抗体を使用して4℃でインキュベートされ、その後、細胞に結合した放射活性が測定される。
本発明は、各々がErbB3に結合する2つの可変ドメインを含む抗体をさらに提供し、これらの可変ドメインのVHは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF 6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060; MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF606 6;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6 072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含み、またはこれらのVH 鎖配列のいずれかに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、VH鎖MF3178;MF3176;MF 3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057; MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF606 3;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6 069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF607 4のアミノ酸配列を含む。このVHは、好ましくは、VH鎖MF3178、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061もしくはMF6065のアミノ酸配列を含み、またはこれらのVH鎖配列のいずれかに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、VH鎖MF317 8、MF3176、MF3163、MF6058、MF6061もしくはMF6065のアミノ酸配列を含む。このVHは、好ましくは、VH鎖MF3178のアミノ酸配列を含み、またはMF3178のVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるV H鎖MF3178のアミノ酸配列を含む。抗体のこれらの可変ドメインは、好ましくは、図16Bまたは図16Eまたは図37に示される配列を好ましくは有する、同一のVH鎖を含む。同一のVH鎖を有する可変ドメインを有する抗体は、二重特異性抗体ではない。VH鎖は、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるのと同じVH鎖配列、または図16Bもしくは図16Eもしくは図37のVH鎖配列に関して、1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを別にして同じVH鎖配列を含む場合、同一とする。
ErbB-3に特異的な、本発明に従う単一特異性抗体は、例えばMM-121(#Ab6)などの先行技術の化合物と比較して、ErbB-3に対してより優れた機能的活性を有するという利点を有し、これは、本発明に従うこれらの抗体が、ErbB-3活性( 例えば、ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能ならびに/またはErbB-2およ び ErbB-3陽性細胞のリガンド誘導性成長)により良く対抗することが可能であることを意味する。これは、例えば、表7および図38に示される
好ましい一実施形態では、本発明は、ErbB-2に結合する可変ドメインを含む二重特異性抗体を提供し、この可変ドメインのVH鎖は、以下のアミノ酸配列を含む:
・VH鎖MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはM F3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、図16Aに示されるMF3991のアミノ酸配列を含む;あるいは
・VH鎖MF1849またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはMF 3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、このVHに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるMF3991のアミノ酸配列を含む。この実施形態に従うかかる二重特異性抗体は、さらに好ましくは、ErbB-3 に結合する可変ドメインを含む。ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF 3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056; MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF606 2;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6 068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含み、または最も好ましくは、図16Bもしくは図1 6Eもしくは図37のVH鎖配列のいずれかに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF60 58;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF 6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069; MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含む。ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16 Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列を含み、または図16BのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列を含む。
・VH鎖MF1849;またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはM F3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、図16Aに示されるMF3991のアミノ酸配列を含む;あるいは
・VH鎖MF1849またはMF2971もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、MF3958のアミノ酸配列を含む;またはMF 3004もしくはそのヒト化バージョン、ここで、このヒト化バージョンは、好ましくは、このVHに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるMF3991のアミノ酸配列を含む。この実施形態に従うかかる二重特異性抗体は、さらに好ましくは、ErbB-3 に結合する可変ドメインを含む。ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF 3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056; MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF606 2;MF6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6 068;MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含み、または最も好ましくは、図16Bもしくは図1 6Eもしくは図37のVH鎖配列のいずれかに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるVH鎖MF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF60 58;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF 6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF6069; MF6070;MF6071;MF6072;MF6073もしくはMF6074のアミノ酸配列を含む。ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、好ましくは、図16 Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列を含み、または図16BのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列を含む。
本発明は、好ましくは、ErbB-2に結合する可変ドメインおよびErbB-3に結合する可変ドメインを含む二重特異性抗体を提供し、
ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Aに示されるVH鎖MF3958のアミノ酸配列、または
・このVHに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9 もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるVH鎖MF3958のアミノ酸配列を含み、ならびに
ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列;または
・図16BのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF 3178のアミノ酸配列を含む。
ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Aに示されるVH鎖MF3958のアミノ酸配列、または
・このVHに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9 もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるVH鎖MF3958のアミノ酸配列を含み、ならびに
ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列;または
・図16BのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF 3178のアミノ酸配列を含む。
本発明は、好ましくは、ErbB-2に結合する可変ドメインおよびErbB-3に結合する可変ドメインを含む二重特異性抗体を提供し、ErbB-2に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Aに示されるVH鎖MF3991のアミノ酸配列、または
・このVHに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9 もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるVH鎖MF3991のアミノ酸配列を含み;ならびに
ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列、または
・図16BのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF 3178のアミノ酸配列を含む。
・図16Aに示されるVH鎖MF3991のアミノ酸配列、または
・このVHに関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9 もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aに示されるVH鎖MF3991のアミノ酸配列を含み;ならびに
ErbB-3に結合する可変ドメインのVH鎖は、
・図16Bに示されるVH鎖MF3178のアミノ酸配列、または
・図16BのVH鎖配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Bに示されるVH鎖MF 3178のアミノ酸配列を含む。
図16中の配列と比較した場合、VH鎖の挙動は、典型的には、このVH鎖が、図16 に示されるVH鎖のアミノ酸配列に関して、15アミノ酸超の変化を有する場合、著しく異なり始める。図16に示されるVH鎖に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせを有するVH鎖は、図16に示されるVH鎖に関して、1、2、3、4または5アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせ、図16に示されるVH鎖に関して、好ましくは1、2、3または4の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせ、好ましくは1、2または3の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせ、より好ましくは1または2の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせ、好ましくは1の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせを、好ましくは有する。この1または複数のアミノ酸の挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせは、好ましくは、VH鎖のCDR1、CDR2およびC DR3領域中には存在しない。これらは、好ましくは、FR4領域中にも存在しない。アミノ酸置換は、好ましくは、保存的アミノ酸置換である。
好ましい一実施形態では、本発明は、図16Dに示されるアミノ酸配列を含む二重特異性抗体、または図16Dの配列に関して、多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Dの二重特異性抗体を提供し、この多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10 アミノ酸の置換は、好ましくは、保存的アミノ酸置換である。この挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせは、好ましくは、VH鎖のCDR3領域中には存在せず、好ましくは、VH鎖のCDR1、CDR2およびCDR3領域中には存在せず、好ましくは、FR 4領域中には存在しない。
ヒト背景において非ヒト残基の含量を最小化することに向け、合理的方法が進化している。種々の方法が、二重特異性抗体の抗原結合特性を別の抗体に首尾よく移植するために利用可能である。抗体の結合特性は、圧倒的に、まさにCDR3領域の配列にあり、これは、全体としての可変ドメインの適切な構造と組み合わせた、可変ドメイン中のCDR1 およびCDR2領域の配列によってしばしば支持される。種々の方法が、CDR領域を別の抗体の適切な可変ドメインに移植するために、現在利用可能である。これらの方法の一部は、本明細書に参照により含まれる、J.C.Almagro1およびJ.Frans son(2008)Frontiers in Bioscience 13、1619~1633において概説されている。従って、本発明は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含むヒトまたはヒト化二重特異性抗体をさらに提供し、ErbB-2結合部位を含む可変ドメインは、図16A または図16Eに示されるVH CDR3配列を含み、ErbB-3結合部位を含む可変ドメインは、図16Bまたは図16Eまたは図37に示されるVH CDR3領域を含む。ErbB-2結合部位を含むVH可変領域は、好ましくは、図16Aまたは図16E中のVH鎖のCDR1領域、CDR2領域およびCDR3領域の配列を含む。ErbB-3 結合部位を含むVH可変領域は、好ましくは、図16Bまたは図16Eまたは図37中のVH鎖のCDR1領域、CDR2領域およびCDR3領域の配列を含む。CDR移植は、図16または図37のVHのCDR領域を有するが、異なるフレームワークを有する、V H鎖を産生するためにも使用され得る。異なるフレームワークは、別のヒトVHまたは異なる哺乳動物のものであり得る。
上述の多くて15、好ましくは1、2、3、4、5、6、7、8、9または10アミノ酸の置換は、好ましくは、保存的アミノ酸置換である。挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせは、好ましくは、VH鎖のCDR3領域中には存在せず、好ましくは、VH鎖のCDR1、CDR2またはCDR3領域中には存在せず、好ましくは、FR4領域中には存在しない。
図16または図37に示される可変重鎖配列を含む可変ドメインの軽鎖は、好ましくは、生殖系列軽鎖O12、好ましくは、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVκ1-39*01/IGJκ1*01またはその断片もしくは機能的誘導体である(imgt.orgにおけるIMGTデータベース・ワールドワイド・ウェブに従う命名法)。用語、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVκ1-39*01/IGJκ1*01、IGKV1-39/IGKJ1、huVκ1-39軽鎖または短くhuVκ1-39が 使用される。この軽鎖は、1、2、3、4または5アミノ酸の挿入、欠失、置換またはそ れらの組み合わせを有し得る。上述の1、2、3、4または5アミノ酸の置換は、好ましくは、保存的アミノ酸置換であり、挿入、欠失、置換またはそれらの組み合わせは、好ましくは、VL鎖のCDR3領域中には存在せず、好ましくは、VL鎖のCDR1、CDR2もしくはCDR3領域またはFR4領域中には存在しない。
種々の方法が、二重特異性抗体を産生するために利用可能である。1つの方法には、1 つの細胞における2つの異なる重鎖および2つの異なる軽鎖の発現、ならびに細胞によって産生される抗体を収集することを伴う。この方法で産生された抗体は、典型的には、重鎖および軽鎖の異なる組み合わせを有する一群の抗体を含み、その一部は、所望の二重特異性抗体である。この二重特異性抗体は、引き続いて、この一群の抗体から精製され得る。細胞によって産生される他の抗体に対する二重特異性抗体の比率は、種々の方法で増加され得る。本発明の好ましい一実施形態では、この比率は、細胞において、2つの異なる軽鎖を発現させず、2つの本質的に同一の軽鎖を発現させることによって、増加される。この概念は、当技術分野で、「共通の軽鎖」方法とも呼ばれる。本質的に同一な軽鎖が、2つの異なる重鎖と一緒に機能して、異なる抗原結合部位および付随する異なる結合特性を有する可変ドメインの形成を可能にする場合、その細胞によって産生される他の抗体に対する二重特異性抗体の比率は、2つの異なる軽鎖の発現よりも顕著に改善される。細胞によって産生される二重特異性抗体の比率は、2つの同一の重鎖のペアリングよりも、2 つの異なる重鎖の互いとのペアリングを刺激することによって、さらに改善され得る。当技術分野は、重鎖のかかるヘテロ二量体化が達成され得る種々の方法を記載している。1 つの方法は、「ノブ・イントゥー・ホール(knob into hole)」二重特異性抗体を作製することである。米国特許出願公開第20030078385号(Arat hoonら、-Genentech)を参照のこと。別の好ましい方法は、参照によって本明細書に組み込まれる、米国仮特許出願第61/635,935号とそれに続く米国特許出願第13/866,747およびPCT出願PCT/NL2013/050294( WO2013/157954A1)に記載されている。単一細胞から二重特異性抗体を産生するための方法および手段は、開示されており、それによって、単一特異性抗体の形成よりも、二重特異性抗体の形成が優先される手段が提供される。これらの方法は、本発明においても好ましく使用され得る。従って、本発明は、(単一細胞から)本発明に従う二重特異性抗体を産生するための方法を提供し、この二重特異性抗体は、接触面を形成することが可能な2つのCH3ドメインを含み、この方法は、この細胞に、a)第1のCH3 ドメイン含有重鎖をコードする第1の核酸分子、b)第2のCH3ドメイン含有重鎖をコードする第2の核酸分子を用意することを含み、これらの核酸分子には、第1および第2 のCH3ドメイン含有重鎖の優先的ペアリングのための手段が提供され、この方法は、宿主細胞を培養するステップ、およびこれら2つの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性抗体を回収するステップをさらに含む。この第1および第2 の核酸分子は、同じ核酸分子、ベクターまたは遺伝子導入ビヒクルの一部であり得、宿主細胞のゲノムの同じ部位において組み込まれ得る。あるいは、この第1および第2の核酸分子は、上記細胞に別々に提供される。
好ましい一実施形態は、(単一細胞から)本発明に従う二重特異性抗体を産生するための方法を提供し、この二重特異性抗体は、接触面を形成することが可能な2つのCH3ドメインを含み、この方法は、
・a)ErbB-2に結合し、第1のCH3ドメインを含む抗原結合部位を含む重鎖をコードする第1の核酸分子、およびb)ErbB-3に結合し、第2のCH3ドメインを含む抗原結合部位を含む重鎖をコードする第2の核酸分子を有する細胞を用意するステップを含み、これらの核酸分子には、これら第1および第2のCH3ドメインの優先的ペアリングのための手段が提供され、この方法は、上記細胞を培養するステップ、およびこれら2つの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性IgG抗体を回収するステップをさらに含む。特に好ましい一実施形態では、この細胞は、共通の軽鎖をコードする第3の核酸分子もまた有する。この第1、第2および第3の核酸分子は、同じ核酸分子、ベクターまたは遺伝子導入ビヒクルの一部であり得、宿主細胞のゲノムの同じ部位において組み込まれ得る。あるいは、この第1、第2および第3の核酸分子は、上記細胞に別々に提供される。好ましい共通の軽鎖は、上記のように、O12、好ましくは、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVκ1 39*01/IGJκ1*01である。この第1および第2のCH3ドメインの優先的ペアリングのための手段は、好ましくは、重鎖コード領域のCH 3ドメイン中の、対応する変異である。本質的に二重特異性抗体のみを産生するための好ましい変異は、第1のCH3ドメイン中のアミノ酸置換L351KおよびT366K(K abatに従う番号付け)、ならびに第2のCH3ドメイン中のアミノ酸置換L351D およびL368Eであり、または逆もまた然りである。従って、二重特異性抗体を産生するための本発明に従う方法がさらに提供され、上記第1のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351KおよびT366K(Kabatに従う番号付け)を含み、第2のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351DおよびL368Eを含み、この方法は、上記細胞を培養するステップ、およびこれらの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性抗体を回収するステップをさらに含む。二重特異性抗体を産生するための本発明に従う方法もまた提供され、上記第1のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351DおよびL368E(Kabatに従う番号付け)を含み、第2のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351KおよびT366Kを含み、この方法は、上記細胞を培養するステップ、およびこれらの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性抗体を回収するステップをさらに含む。これらの方法によって産生され得る抗体もまた、本発明の一部である。これらのCH3ヘテロ二量体化ドメインは、好ましくは、IgG1ヘテロ二量体化ドメインである。これらのCH3ヘテロ二量体化ドメインを含む重鎖定常領域は、好ましくは、IgG1定常領域である。
・a)ErbB-2に結合し、第1のCH3ドメインを含む抗原結合部位を含む重鎖をコードする第1の核酸分子、およびb)ErbB-3に結合し、第2のCH3ドメインを含む抗原結合部位を含む重鎖をコードする第2の核酸分子を有する細胞を用意するステップを含み、これらの核酸分子には、これら第1および第2のCH3ドメインの優先的ペアリングのための手段が提供され、この方法は、上記細胞を培養するステップ、およびこれら2つの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性IgG抗体を回収するステップをさらに含む。特に好ましい一実施形態では、この細胞は、共通の軽鎖をコードする第3の核酸分子もまた有する。この第1、第2および第3の核酸分子は、同じ核酸分子、ベクターまたは遺伝子導入ビヒクルの一部であり得、宿主細胞のゲノムの同じ部位において組み込まれ得る。あるいは、この第1、第2および第3の核酸分子は、上記細胞に別々に提供される。好ましい共通の軽鎖は、上記のように、O12、好ましくは、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVκ1 39*01/IGJκ1*01である。この第1および第2のCH3ドメインの優先的ペアリングのための手段は、好ましくは、重鎖コード領域のCH 3ドメイン中の、対応する変異である。本質的に二重特異性抗体のみを産生するための好ましい変異は、第1のCH3ドメイン中のアミノ酸置換L351KおよびT366K(K abatに従う番号付け)、ならびに第2のCH3ドメイン中のアミノ酸置換L351D およびL368Eであり、または逆もまた然りである。従って、二重特異性抗体を産生するための本発明に従う方法がさらに提供され、上記第1のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351KおよびT366K(Kabatに従う番号付け)を含み、第2のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351DおよびL368Eを含み、この方法は、上記細胞を培養するステップ、およびこれらの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性抗体を回収するステップをさらに含む。二重特異性抗体を産生するための本発明に従う方法もまた提供され、上記第1のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351DおよびL368E(Kabatに従う番号付け)を含み、第2のCH3ドメインは、アミノ酸置換L351KおよびT366Kを含み、この方法は、上記細胞を培養するステップ、およびこれらの核酸分子の発現を可能にするステップ、および培養物から二重特異性抗体を回収するステップをさらに含む。これらの方法によって産生され得る抗体もまた、本発明の一部である。これらのCH3ヘテロ二量体化ドメインは、好ましくは、IgG1ヘテロ二量体化ドメインである。これらのCH3ヘテロ二量体化ドメインを含む重鎖定常領域は、好ましくは、IgG1定常領域である。
一実施形態では、本発明は、本発明に従う抗体重鎖可変領域をコードする核酸分子を提供する。核酸分子(典型的には、in vitroの、単離されたまたは組換え核酸)は、好ましくは、図16Aもしくは図16Bもしくは図37に示される重鎖可変領域、または1、2、3、4もしくは5アミノ酸の挿入、欠失、置換もしくはそれらの組み合わせを有する、図16Aもしくは図16Bもしくは図37に示される重鎖可変領域をコードする。好ましい一実施形態では、この核酸分子は、図16または図37に示される配列を含む。別の好ましい一実施形態では、この核酸分子は、図16または図37に示される核酸と同じアミノ酸配列をコードするが、1または複数の異なるコドンをコードするので、異なる配列を有する。例えば、かかる核酸分子は、例えばチャイニーズ・ハムスター卵巣(C HO)細胞、NS0細胞またはPER-C6(商標)細胞などの抗体産生細胞のためにコドン最適化される。本発明は、図16Dまたは図37の重鎖をコードする核酸配列をさらに提供する。
本発明で使用される核酸分子は、排他的ではないが典型的には、リボ核酸(RNA)またはデオキシリボ核酸(DNA)である。代替的な核酸は、当業者に入手可能である。本発明に従う核酸は、例えば、細胞中に含まれる。この核酸が細胞において発現される場合、この細胞は、本発明に従う抗体を産生する。従って、本発明は、一実施形態では、本発明に従う抗体および/または本発明に従う核酸を含む細胞を提供する。この細胞は、好ましくは動物細胞、より好ましくは哺乳動物細胞、より好ましくは霊長類細胞、最も好ましくはヒト細胞である。本発明の目的のために、適切な細胞は、本発明に従う抗体および/ または本発明に従う核酸を含むことが可能な、好ましくはそれを産生することが可能な、任意の細胞である。
本発明は、本発明に従う抗体を含む細胞をさらに提供する。好ましくは、この細胞(典型的には、in vitroの、単離されたまたは組換え細胞)は、この抗体を産生する。好ましい一実施形態では、この細胞は、ハイブリドーマ細胞、CHO細胞、NS0細胞またはPER-C6(商標)細胞である。特に好ましい一実施形態では、この細胞は、C HO細胞である。本発明に従う細胞を含む細胞培養物がさらに提供される。種々の機関および会社が、例えば臨床使用のために、抗体の大規模産生のための細胞株を開発している。かかる細胞株の非限定的な例は、CHO細胞、NS0細胞またはPER.C6(商標) 細胞である。これらの細胞は、タンパク質の産生などの他の目的のためにも使用される。タンパク質および抗体の産業規模産生のために開発された細胞株は、本明細書で、産業的細胞株とさらに呼ばれる。従って、好ましい一実施形態では、本発明は、本発明の抗体の産生のための、抗体の大規模産生のために開発された細胞株の使用を提供する。
本発明は、本発明の細胞を培養すること、およびこの培養物から抗体を回収することを含む、抗体の生産方法をさらに提供する。好ましくは、この細胞は、無血清培地中で培養される。好ましくは、この細胞は、浮遊成長(suspension growth)に適応される。本発明に従う抗体の生産方法によって得ることができる抗体が、さらに提供される。この抗体は、好ましくは、培養の培地から精製される。好ましくは、この抗体は、アフィニティ精製される。
本発明の細胞は、例えば、ハイブリドーマ細胞株、CHO細胞、NS0細胞、または臨床目的のための抗体産生についてのその適切性が既知の別の細胞型である。特に好ましい一実施形態では、この細胞は、ヒト細胞である。好ましくは、アデノウイルスE1領域またはその機能的等価物によって形質転換された細胞。かかる細胞株の好ましい例は、PE R.C6(商標)細胞株またはその等価物である。特に好ましい一実施形態では、この細胞は、CHO細胞またはそのバリアントである。好ましくは、抗体の発現のためにグルタミン・シンテターゼ(GS)ベクター系を使用するバリアント。
本発明は、本発明に従う抗体を含む、組成物、好ましくは医薬組成物をさらに提供する。この医薬組成物は、好ましくは、(医薬的に許容される)賦形剤または担体を含む。好ましい一実施形態では、この医薬組成物は、5~50mMのヒスチジン、100~300 mMのトレハロース、0.1~03g/Lのポリソルベート20またはそれらの組み合わせを含む。pHは、好ましくは、pH=5.5~6.5に設定される。好ましい一実施形態では、この医薬組成物は、25mMのヒスチジン、220mMのトレハロース、0.2 g/Lのポリソルベート20またはそれらの組み合わせを含む。pHは、好ましくはpH=5.5~6.5、最も好ましくはpH=6に設定される。
本発明の抗体は、好ましくは、標識、好ましくは、in vivo画像化のための標識をさらに含む。かかる標識は、典型的には、治療的適用には必要でない。例えば診断設定では、例えば、身体中の標的細胞を可視化する際に、標識は有用であり得る。種々の標識が適しており、多くが当技術分野で周知である。好ましい一実施形態では、この標識は、検出のための放射活性標識である。別の好ましい一実施形態では、この標識は、赤外標識である。好ましくは、この赤外標識は、in vivo画像化に適している。種々の赤外標識が、当業者に入手可能である。好ましい赤外標識は、例えば、IRDye 800; IRDye 680RD;IRDye 680LT;IRDye 750;IRDye 700DX;IRDye 800RS IRDye 650;IRDye 700ホスホロアミダイト(phosphoramidite);IRDye 800ホスホロアミダイト(LI-COR USA;4647 Superior Street;Linco ln、Nebraska)である。
本発明は、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫 瘍を有する、またはこの腫瘍を有するリスクがある対象の処置のための方法であって、 本発明に従う抗体または医薬組成物を対象に投与することを含む方法をさらに提供する。この処置の開始前に、この方法は、好ましくは、対象が、かかるErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有するかどうか、または そのリスクがあるかどうかを決定することを含む。一部の実施形態では、この対象は、ErbB-2について[+]または[++]と分類される。別の一実施形態では、この 対象は、ErbB- 2について[+++]と分類される。本発明は、ErbB-2、ErbB-3もしくはE rbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、本発明の抗体をさらに提供する 。代替的に考案すると、本発明は、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍の処置のための医薬または予防剤の製造のため の、本発明に従う抗体の使用を提供する。本明細書で使用する場合、用語、処置は、予防を包含する。
この腫瘍は、好ましくは、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性癌である。好ましくは、この陽性癌は、乳癌、例えば、早期乳癌である。しかし、本発明は、広範なErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽 性癌、例えば、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓 癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌、黒色腫などに適用され得る。本発明に従う抗体は、典型的には、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導 性受容体機能、好ましくはリガンド誘導性成長を低減することが可能である。本発明に 従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む。好ましい一実施形態では、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、ErbB-2 陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。従って、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍、好まし くは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌 、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌もしくは黒色腫を有する、またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErb B-3に結合する第2の抗原結合部位を含む抗体がさらに提供され、ErbB-3陽性 細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原 結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。このErbB-3陽性細胞に対す る第2の抗原結合部位の親和性は、好ましくは2.0nM以下、より好ましくは1.39n M以下、より好ましくは0.99nM以下である。ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性は、好ましくは5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、好ましくは4.0nM以下である。好ましい一実施形態では、この抗体は、抗体PB4188である。
好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、T144、T164、R166、P1 72、G179、S180およびR181、ならびにT144、T164、R166、P 172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、好ましくは、R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-3のドメインIII の少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
従って、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍 、好ましくは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌 、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌もしくは黒色腫を有する、またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部 位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む抗体がさらに提供され、本 発明に従うこの抗体は、T144、T164、R166、P172、G179、 S180およびR 181、ならびにT144、T164、R166、P172、G179、S180もしくはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも 1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含み、ならびに/または本発明に従うこの抗 体は、好ましくは、R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR426か ら11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群 から選択される、ErbB-3のドメインIIIの少なくとも1つのアミノ酸に結合す る抗原結合部位を含む。
この対象は、好ましくはヒト対象である。この対象は、好ましくは、トラスツズマブなどのErbB-2特異的抗体を使用したモノクローナル抗体治療に適格な対象である。好ましい一実施形態では、この対象は、腫瘍、好ましくはErbB-2/ErbB-3陽 性癌、好ましくはErbB-2治療耐性表現型および/またはヘレグリン耐性表現型、好ましくはモノクローナル抗体耐性表現型を有する腫瘍/癌を含む。かかる表現型を伴う腫瘍は、現在の抗HER2レジメン、例えば(それらに限定されないが)ErbB-2に 対するモノクローナル抗体治療を用いた処置を逃避し得る。
患者に投与される本発明に従う抗体の量は、典型的には、治療濃度域中にあり、これは、治療効果を得るために十分な量が使用されるが、その量は、許容できない程度の副作用をもたらす閾値を超えないことを意味する。所望の治療効果を得るために必要とされる抗体の量が低くなるほど、治療濃度域は典型的には大きくなる。従って、低い投薬量で十分な治療効果を発揮する本発明に従う抗体が好ましい。投薬量は、トラスツズマブについての投薬レジームの範囲中にあり得るか、またはより低くてよい。
本発明は、とりわけ、例えばNRG1-β1の上方調節などの逃避機構の存在下であっても、ErbB-2受容体およびErbB-3受容体を標的化し、癌細胞株のin vi troでの強力な増殖阻害およびin vivoでの腫瘍成長阻害を生じる抗体を記載する。ErbB-2またはErbB-3のいずれかに特異的なヒトおよびマウスFab結 合アームの多様なパネルが同定された。これらは、重鎖のヘテロ二量体化を駆動するCH3領域中の変異を含む相補的発現ベクター中にそれらをクローニングすることによって、二重特異性抗体として産生された。500超の二重特異性抗体を、小規模で産生し、3つの異なる癌細胞株に対する結合アッセイおよび機能的アッセイにおいて試験した。種々の二重特異性抗体を選択し、BxPC3細胞株を使用する同所性異種移植モデルにおいて試験した。この細胞株は、ErbB-2受容体およびErbB-3受容体の両方を発現し、成長についてErbB-3リガンドに部分的に依存する。BxPC3モデルは、堅 固でストリンジェントなスクリーニング・モデルである。さらに、in vivoでの強い抗腫瘍活性は、JIMT-1細胞株を使用する異種移植モデルを使用して確認されて いる。JI MT-1細胞は、トラスツズマブに対して臨床的に耐性であった、乳癌を有する62歳の患者の胸膜転移に由来する。JIMT-1細胞は、接着性単層として成長し、ヌード・マウスにおいて異種移植腫瘍を形成する。JIMT-1細胞は、そのコード配列中に同定可能な変異を示さなかった、増幅されたHER-2癌遺伝子を有する。JIMT-1細胞は、HER-2のmRNAおよびタンパク質を過剰発現し、HER-1、HER-3およびHER-4のmRNAおよびタンパク質のレベルは、トラスツズマブ感受性細胞株SKB R-3と類似である(Tannerら、Mol Cancer Ther 2004) 。
重要なことに、現在使用されているモノクローナル抗体トラスツズマブおよびペルツズマブ、ならびに化学化合物ラパチニブと比較して、より良い抗腫瘍効果が、本発明に従う抗体を使用して得られた。
本発明の抗体は、懸濁(suspension)293F細胞における一過的トランスフェクション後に、>50mg/Lの水準で産生され得る。これらの二重特異性抗体は、70%超の収率で、98%よりも高い純度に精製され得る。分析的特徴付け研究は、二価単一特異性lgG1と匹敵する、二重特異性lgGl抗体プロファイルを示している。機能的活性に関して、本発明の二重特異性抗体は、トラスツズマブ+ペルツズマブと比較して、in vitroおよびin vivoで優れた強度(potency)を実証できる。
本発明の好ましい実施形態は、組み合わせ治療を提供する。一実施形態では、本発明に従う抗体は、トラスツズマブまたはペルツズマブと組み合わされるが、それは、これらの抗体が、異なるErbB-2エピトープに結合し、その結果、実施例に示されるように、同じエピトープについて本発明に従う抗体と競合しないからである。別の一実施形態では、本発明に従う抗体は、MM-121(#Ab6)またはRG7116(Roche)と組み合わされるが、それは、これらの抗体が、異なるErbB-3エピトープに結合し、その結果、実施例に示されるように、同じエピトープについて本発明に従う抗体と競合しないからである。
別の好ましい一実施形態では、ErbB-2およびErbB-3に特異的な結合化合物は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤および/またはMAPK経路の成分の阻害剤、例えば、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤またはSrc阻害剤などと組み合わされる。一実施形態では、ErbB-2およびErbB-3に特異的な結合化合物は、微小管破壊薬物、またはヒストン・デアセチラーゼ(HD AC)の阻害剤と組み合わされる。驚くべきことに、本発明者らは、これらの組み合わせが使用される場合に、相乗効果を見出した。従って、ErbB-2、ErbB-3もし くはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、またはこの腫瘍を有するリスクが ある対象の処置のための方法がさらに提供され、この方法は、ErbB-2およびErbB-3に特異的な結合化合物、ならびにPI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物、およびヒストン・デアセチラーゼ(HDAC)の阻害剤からなる群から選択される1 または複数の化合物を対象に投与することを含む。この阻害剤は、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤またはSrc阻害剤を含む。このチロシン・キナーゼ阻害剤は、好ましくは、アファチニブ、ラパチニブおよび/またはネラチニブである。このPI3Ka阻害剤は、好ましくはBYL719である。一実施形態では、このAkt阻害剤は、MK-2206である。好ましい一実施形態では、このmTOR阻害剤は、エベロリムスである。好ましい一実施形態では、このSr c阻害剤は、サラカチニブである。好ましい一実施形態では、この微小管破壊薬物は、パクリタキセルである。好ましい一実施形態では、このHDAC阻害剤は、ボリノスタットである。好ましい一実施形態では、ErbB-2およびErbB-3に特異的な結合化 合物は、MM-111(Merrimack Pharmaceuticals)である。好ましい一実施形態では、ErbB-2およびErbB-3に特異的な結合化合物は、二重特異性抗体である。好ましい一実施形態では、ErbB-2およびErbB-3に特異的な結合化合物は、本発明に従う二重特異性抗体である。
従って、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍 を有する、またはこの腫瘍を有するリスクがある対象の処置のための方法がさらに提供 され、この方法は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2 の抗原結合部位を含む二重特異性抗体、ならびにPI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物を対象に投与することを含む。
ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍の処置における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結 合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体もまた提供され、この処置は、この二重特異性抗体、ならびにPI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される少なくとも1つの化合物を、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有 する対象に投与することを含む。好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1 の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を 有する本発明に従う二重特異性抗体は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK 経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1 または複数の化合物と組み合わされる。この阻害剤は、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、P I3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤またはSrc阻害剤を含む。このチロシン・キナーゼ阻害剤は、好ましくは、アファチニブ、ラパチニブおよび/またはネラチニブである。このPI3Ka阻害剤は、好ましくはBYL719である。一実施形態では、このAkt阻害剤は、MK-2206である。好ましい一実施形態では、このmTOR阻害剤は、エベロリムスである。好ましい一実施形態では、このSrc阻 害剤は、サラカチニブである。好ましい一実施形態では、この微小管破壊薬物は、パクリタキセルである。好ましい一実施形態では、このHDAC阻害剤は、ボリノスタットである。
このErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍は、好 ましくは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝 臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫である。最も好ましくは、この腫瘍は、乳癌である。一実施形態では、このErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍は、腫瘍細胞1つ当たり1.000.000未満のErbB-2細胞表面 受容体を有する。
一実施形態では、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR 阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる、本発明に従う抗体は、典型的には、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB- 3のリガンド誘導性受容体機能、好ましくはリガンド誘導性成長を低減することが可能である。この本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1 の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む。好ましい一実施形態では、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、好ましくは2.0nM以下、より好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99 nM以下である。ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性は、好ましくは5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、好ましくは4.0nM以下である。
好ましい一実施形態では、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる、本発明に従う抗体は、T144、T164、R166、P172、G179、S18 0およびR181、ならびにT144、T164、R166、P172、G179、S1 80またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
好ましい一実施形態では、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる、本発明に従う抗体は、R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR42 6から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-3のドメインIIIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
好ましくは、図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF184 7、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3配列、好ましくは少なくともCDR1、C DR2およびCDR3配列を含む、ならびに/または図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF33 07;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF 6060;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065; MF6066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF607 1;MF6072;MF6073およびMF6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3配列、好ましくは少なくともCDR1、C DR2およびCDR3配列を含む、本発明に従う二重特異性抗体は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる。
好ましい一実施形態では、
・図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF29 16、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF 3001、MF3003およびMF1898の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域配列、またはMF2926、MF2930、MF18 49;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF 2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003もしくはMF1898の重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なるErbB-2特異的重鎖可変領域配列を含み、ならびに
・図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF60 57;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF 6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068; MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF6 074の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域配列、またはMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307; MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF606 0;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6 066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;M F6072;MF6073もしくはMF6074の重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なるErbB-3特異的重鎖可変領域配列を含む、本発明に従う二重特異性抗体は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka 阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる。好ましい一実施形態では、抗体PB4188は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC 阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる。
・図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF29 16、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF 3001、MF3003およびMF1898の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域配列、またはMF2926、MF2930、MF18 49;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF 2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003もしくはMF1898の重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なるErbB-2特異的重鎖可変領域配列を含み、ならびに
・図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF60 57;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF 6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068; MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF6 074の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域配列、またはMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307; MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF606 0;MF6061;MF6062;MF6063;MF6064;MF6065;MF6 066;MF6067;MF6068;MF6069;MF6070;MF6071;M F6072;MF6073もしくはMF6074の重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なるErbB-3特異的重鎖可変領域配列を含む、本発明に従う二重特異性抗体は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka 阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる。好ましい一実施形態では、抗体PB4188は、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC 阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物と、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と、より好ましくは、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL719、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物と組み合わされる。
本発明の好ましい実施形態は、ヘレグリン・ストレス条件下での、本発明に従う抗体の使用を提供する。ヘレグリンは、ErbB-3陽性腫瘍細胞の成長に関与する増殖因子である。典型的には、腫瘍細胞が高レベルのヘレグリン(ヘレグリン・ストレスと呼ばれる)を発現する場合、トラスツズマブ、ペルツズマブおよびラパチニブなどの現在公知の治療は、腫瘍成長を阻害することがもはや可能ではない。この現象は、ヘレグリン耐性と呼ばれる。しかし、驚くべきことに、本発明に従う抗体は、高レベルのヘレグリンを発現する腫瘍細胞の成長に対抗することも可能である。本明細書で使用する場合、ヘレグリンの発現レベルは、細胞が、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの、少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する場合、高いとみなされる。ヘレグリン発現レベルは、例えば、腫瘍RNAを用いたqPCRを使用して(例えば、Shamesら、PLOS ONE、2 013年2月、第8巻、第2号、1~10頁およびYonesakaら、Sci.tra nsl.Med.、第3巻、第99号(2011);1~11頁などに記載されている)、または血液、血漿もしくは血清サンプルを好ましくは使用する、例えばELISAなどのタンパク質検出方法を使用して(例えば、Yonesakaら、Sci.transl.Med.、第3巻、第99号(2011);1~11頁などに記載されている)、測定される。従って、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽 性腫瘍を有する、またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、 本発明に従う抗体がさらに提供され、この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。この本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位を含む。ErbB-2、E rbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する対象の処置のための方法もまた提供され、この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7 細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有し、この方法は、本発明に従う抗体または医薬組成物を対象に投与することを含む。好ましい一実施形態は、ErbB-2、ErbB-3または E rbB-2/ErbB-3陽性腫瘍の処置のための医薬の調製のための本発明に従う抗体の使用を提供し、この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発 現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。このErbB-2、ErbB-3またはErbB- 2/ErbB-3陽性腫瘍は、好ましくは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫である。最も好ましくは、この腫瘍は、乳癌である。従って、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌もしくは黒色腫、好ましくは乳癌、を有するまたは有するリスクがある対象の処置における使用のための、本発明に従う抗体がさらに提供され、この癌の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位を含む。
高いヘレグリン・レベルは、典型的には、転移の形成(即ち、腫瘍細胞または腫瘍開始細胞の遊走、浸潤、成長および/または分化)の間に存在する。典型的には、腫瘍開始細胞は、例えばCD44、CD24、CD133および/またはALDH1などの幹細胞マーカーに基づいて同定される。従って、これらのプロセスは、トラスツズマブおよびペルツズマブなどの現在公知の治療によって、ほとんど対抗されない。本発明に従う抗体は、高レベルのヘレグリンを発現する腫瘍細胞または腫瘍開始細胞の成長および/または分化に対抗することが可能であるので、本発明に従うかかる抗体は、転移の形成に対抗するのにも特に適切である。従って、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/Erb B-3陽性腫瘍を有する対象における転移の形成に対抗するための方法が、さらに提供され、このErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞 は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有し、この方法は、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合す る第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を対象に投与することを含む。転移の形成の処置または予防における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位お よび ErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体もまた提供され、この ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞は、BXP C3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。転移の形成の処置または予防のための医薬の調製のための、本発明に従う二重特異性抗体の使用がさらに提供され、このErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン 発現レベルの少なくとも6 0%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。このErbB-2、ErbB-3また はErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍は、好ましくは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫である。最も好ましくは、この腫瘍は、乳癌である。従って、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫の細胞、好ましくは乳癌細胞の転移の形成の処置または予防における使用のた めの、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2 の抗原結合部位を含む、本発明に従う二重特異性抗体がさらに提供され、これらの細胞 は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。この本発明に従う抗体は、典型的には、ErbB-2およびErbB-3陽性細 胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能、好ましくはリガンド誘導性成長を低 減することが可能である。この本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびEr bB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む。好ましい一実施形態では、ErbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性(KD)は、ErbB- 2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い。E rbB-3陽性細胞に対する第2の抗原結合部位の親和性は、好ましくは2.0nM以下、より好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である。ErbB-2陽性細胞に対する第1の抗原結合部位の親和性は、好ましくは5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、好ましくは4.0nM以下である。
好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、T144、T164、R166、P1 72、G179、S180およびR181、ならびにT144、T164、R166、P 172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸残基に結合する抗原結合部位を含む。
好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、好ましくは、R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-3のドメインIII の少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。
好ましい一実施形態は、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB- 3陽性腫瘍を有する対象の処置のための、本発明に従う方法であって、この腫瘍の細胞は、BXPC3もしくはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも8 5%、より好ましくは少なくとも90%もしくは95%であるヘレグリン発現レベルを有する、方法、またはかかる処置における使用のための本発明に従う抗体を提供し、この抗体は、図16Aまたは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849; MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF291 6、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3 001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、または少なくとも重鎖可変領域配列を含む。
好ましい一実施形態は、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB- 3陽性腫瘍を有する対象の処置のための、本発明に従う方法であって、この腫瘍の細胞は、BXPC3もしくはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも8 5%、より好ましくは少なくとも90%もしくは95%であるヘレグリン発現レベルを有する、方法、またはかかる処置における使用のための本発明に従う抗体を提供し、この抗体は、図16Bまたは図16Eまたは図37に示されるMF3178;MF3176;M F3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF6057;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF60 63;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068;MF 6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF607 4からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、または少なくとも重鎖可変領域配列を含む。一実施形態は、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ ErbB-3陽性腫瘍を有する対象の処置における使用のための、抗体PB4188を提供し、この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。
既に記載したように、本発明に従う抗体は、その細胞表面上に1.000.000未満のErbB-2受容体を有するErbB-2陽性腫瘍細胞を処置するために、特に適切 である。典型的にはErbB-2[++]またはErbB-2[+]と分類される、か かる腫瘍を有する患者には、原発性腫瘍を有する患者ならびに再発したErbB-2陽性 腫瘍を有する患者が含まれる。トラスツズマブ(ハーセプチン)およびペルツズマブなどの現在使用されている治療は、ErbB-2[+++]と分類される、その細胞表面上 に1. 000.000超のErbB-2受容体を有する悪性ErbB-2陽性細胞を有する患者のみに処方される。従って、ErbB-2[++]またはErbB-2[+]と分類される患者は、好ましくは、本発明に従う抗体で処置される。従って、本発明に従 う使用のための方法または抗体がさらに提供され、その対象は、腫瘍細胞1つ当たり1.000.0 00未満のErbB-2細胞表面受容体を有するErbB-2またはErbB-2/Er bB-3陽性腫瘍を有する。好ましい一実施形態は、転移の形成の処置または予防における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およ びErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む、本発明に従う二重特異性抗体を提 供し、このErbB- 2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞は、BXPC3または MCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有し、この腫瘍細胞は、1.000.000未満のErbB-2細胞表面受容体を有する。
別の好ましい一実施形態では、本発明に従う抗体は、障害された心機能を有する、またはそのリスクがある対象において、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/E rbB-3陽性腫瘍に対抗するために使用される。障害された心機能とは、その対象が、健康な心機能と比較して、90%未満、好ましくは85%未満または80%未満、好ましくは75%未満または70%未満である、例えば左室駆出分画(LVEF)などの心機能を有することを意味する。この健康な心機能は、例えば、健康な集団の平均心機能(例えば、平均LVEFなど)である。あるいは、この健康な心機能は、本発明に従う抗体を用いた抗腫瘍治療の開始前に患者において測定される機能(例えば、LVEF)である。
心機能は、例えば、対象の身体診察、および心エコー図またはMUGAスキャンなどを使用したLVEFの試験によってモニタリングされる。
ErbB-2は、ヘレグリン受容体複合体HER2:HER4が関与するシグナル伝達ネットワークの一部として、成体の心筋細胞の成長、修復および生存に関与する。本明細書で上に記載したように、心臓毒性は、ErbB-2標的化治療における公知の危険因子であり、合併症の頻度は、トラスツズマブがアントラサイクリンと併せて使用される場合に増加し、それによって、心臓負荷を誘導する。例えば、ドキシサイクリンとトラスツズマブとの組み合わせは、重症の心臓副作用を誘導する。トラスツズマブ誘導性心機能不全の臨床症例の漸増する数にもかかわらず、その作用機構は未知である。ErbB-2、E rbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍に対する現在公知の治療の心臓毒性の観点から、本発明に従う抗体を使用することが特に有利である。実施例に示されるように、心筋細胞の生存に影響を与えないか、またはトラスツズマブおよびペルツズマブと比較して、顕著に低い程度までしか影響を与えない抗体が、ここで提供されている。心臓毒性が低減されるので、これは、重要な利点を提供する。これは、障害された心機能に罹患していない人々にとって既に有利であり、障害された心機能に罹患している人々、例えば、うっ血性心不全(CHF)、左室機能不全(LVD)および/もしくは減少した左室駆出分画(LVEF)に罹患している対象、ならびに/または心筋梗塞を有している対象などにとっては、さらにいっそう有利である。従って、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、本発明に従う二重特異性抗体がさらに提供され、こ の対象は、健康な心機能と比較して、90%未満、好ましくは85%未満または80%未満または75%未満または70%未満である心機能を有する。この心機能は、好ましくは、L VEFを含む。このErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍は、好ましくは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃 食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫である。最も好ましくは、この腫瘍は、乳癌である。本発明に従う抗体は、好ましくは 、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む。好ましい一実施形態は、 ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ ErbB-3陽性腫瘍を有する対象の処置のための、本発明に従う方法であって、この対象は、健康な心機能と比較して 、90%未満、好ましくは85%未満、好ましくは80%未満、好ましくは75%未満もしくは70%未満である心機能を有する、方法、またはかかる処置における使用のための本発明に従う抗体を提供し、この抗体は、
・図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF29 16、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF 3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列を含み、ならびに/あるいは
・図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF60 57;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF 6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068; MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF6 074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3 配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列を含む。好ましい一実施形態では、この抗体は、PB4188である。
・図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849;MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF29 16、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF 3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列を含み、ならびに/あるいは
・図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178;MF3176;MF3163;MF3099;MF3307;MF6055;MF6056;MF60 57;MF6058;MF6059;MF6060;MF6061;MF6062;MF 6063;MF6064;MF6065;MF6066;MF6067;MF6068; MF6069;MF6070;MF6071;MF6072;MF6073およびMF6 074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域の少なくともCDR3 配列、好ましくは少なくともCDR1、CDR2およびCDR3配列、もしくは少なくとも重鎖可変領域配列、または列挙された重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸、好ましくは多くて1、2、3、4、5、6、7、8、9もしくは10アミノ酸、より好ましくは多くて1、2、3、4もしくは5アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列を含む。好ましい一実施形態では、この抗体は、PB4188である。
一実施形態では、この二重特異性抗体は、別の場所において詳細に説明されるように、ヘレグリン・ストレス条件下での対象の処置における使用のためのものである。従って、ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、 またはそれを有するリスクがある対象の処置における使用のための、本発明に従う二重 特異性抗体がさらに提供され、この対象は、健康な心機能と比較して、90%未満、好ましくは85%未満、好ましくは80%未満、好ましくは75%未満または70%未満である心機能を有し、この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。この心機能は、好ましくは、LVEFを含む。ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する対象の処置の ための方法もまた提供され、この対象は、健康な心機能と比較して、90%未満、好ま しくは85%未満、好ましくは80%未満、好ましくは75%未満、好ましくは70%未満である心機能を有し、この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも8 0%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95% であるヘレグリン発現レベルを有し、この方法は、本発明に従う二重特異性抗体または医薬組成物を対象に投与することを含む。好ましい一実施形態は、健康な心機能、好ましくは健康なLVEFと比較して、90%未満、好ましくは85%未満、好ましくは80%未満、好ましくは75%未満または70%未満である心機能、好ましくはLVEFを有する対象における、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫 瘍の処置のための医薬の調製のための、本発明に従う二重特異性抗体の使用を提供し、 この腫瘍の細胞は、BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する。
転移の形成の処置または予防における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体もまた提供され、その対象は、健康な心機能と比較して、90%未満、好ましくは85%未満、好ましくは80%未満、好ましくは75%未満、好ましくは70%未満である心機能を有する。転移の形成の処置または予防のための医薬の調製のための、本発明に従う二重特異性抗体の使用がさらに提供され、その対象は、健康な心機能と比較して、90%未満、好ましくは85%未満、好ましくは80%未満、好ましくは75%未満、好ましくは70%未満である心機能を有する。このErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/E rbB-3陽性腫瘍は、好ましくは、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫である。最も好ましくは、この腫瘍は、乳癌である。この心機能は、好ましくは、LVEFを含む。好ましい一実施形態では、この抗体は、抗体PB4188である。
別の実施形態では、生存促進性経路Akt(PI3キナーゼ経路とも呼ばれる)およびMAPキナーゼ経路の種々の因子のリン酸化に対抗するための本発明に従う抗体の使用が行われる。これらは、HER3の下流の増殖促進性シグナル伝達経路である。驚くべきことに、本発明者らは、本発明に従う抗体を用いて、Akt、ERK1/2およびS6リボソーム・タンパク質(S6-RP)のリン酸化を顕著に阻害することに成功したが、トラスツズマブおよびペルツズマブは、これらの強い抗リン酸化効果を有さない。増殖促進P I3キナーゼおよびMAPキナーゼ経路の因子のリン酸化に対抗することは有利であるが、それは、これが、ErbB-3陽性腫瘍細胞の成長に対抗するからである。従って、A kt、ERK1/2および/またはS6-RPのリン酸化に対抗する、好ましくはそれを阻害するための、本発明に従う抗体の使用がさらに提供される。重要なことに、Aktのリン酸化は、実施例に示されるように、in vitroおよびin vivoの両方で、本発明の抗体によって顕著に低減され得、またはさらには完全に遮断され得る。従って、好ましい一実施形態は、Aktのリン酸化に対抗する、好ましくはそれを阻害するための、本発明に従う抗体の使用を提供する。HER3-p85複合体の形成に対抗するための、本発明に従う抗体の使用もまた提供される。HER3-p85複合体の形成は、Ak t活性化における第1段階であるので、このHER3-p85複合体の形成に対抗することが有利である。この本発明に従う抗体は、好ましくは、ErbB-2のドメインIに結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3のドメインIIIに結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体である。この抗体は、好ましくは、T144、T164、R 166、P172、G179、S180およびR181、ならびにT144、T164、R166、P172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。さらに、または代替的に、この抗体は、好ましくは、F409およびR426、ならびにネイティブErbB- 3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-3のドメインIIIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む。一実施形態では、この抗体は、図16または図37に示される、少なくとも1つのCDR1、CDR2およびCDR3配列、または少なくとも1つのVH配列を含む。一実施形態では、この抗体は、PB4188である。
明確さおよび簡潔な記述を目的として、特徴は、同じまたは別々の実施形態の一部として本明細書に記載されるが、本発明の範囲は、記載された特徴の全てまたは一部の組み合わせを有する実施形態を含み得ることが理解される。
(実施例)
方法、材料および抗体についてのスクリーニング細胞株:
BxPC-3-luc2(Perkin Elmer 125058)、N87(AT CC(登録商標)CRL-5822(商標))、SK-BR-3(ATCC(登録商標) HTB-30(商標))、BT-474(ATCC(登録商標)HTB-20(商標))、JIMT-1(DSMZ ACC 589)、L929(Sigma Aldrich 85011425)、K562(DSMZ ACC10)、HEK293T(ATCC(登録商標)-CRL-11268(商標))、CHO-K1(DSMZ ACC110)、MCF-7(DSMZ ACC 115)、MDA-MB-468(#300279-513、Cell line services)SK-OV-3(ATCC(登録商標)HTB-77(商標))、MDA-MB-175(ATCC-HTB-25)、MD A-MB-453(ATCC-HTB-131)、MDA-MB-361(ATCC-HTB-27)、ZR-75-1(ATCC-CRL-1500)およびMKN-45(D SMZ ACC409)細胞株を、ATCC、DSMZまたはSigma Aldric hから購入し、10%熱不活化胎仔ウシ血清(FBS)を補充した成長培地中で慣用的に維持した。HEK293F Freestyle細胞を、Invitrogenから取得し、293 FreeStyle培地中で慣用的に維持した。
方法、材料および抗体についてのスクリーニング細胞株:
BxPC-3-luc2(Perkin Elmer 125058)、N87(AT CC(登録商標)CRL-5822(商標))、SK-BR-3(ATCC(登録商標) HTB-30(商標))、BT-474(ATCC(登録商標)HTB-20(商標))、JIMT-1(DSMZ ACC 589)、L929(Sigma Aldrich 85011425)、K562(DSMZ ACC10)、HEK293T(ATCC(登録商標)-CRL-11268(商標))、CHO-K1(DSMZ ACC110)、MCF-7(DSMZ ACC 115)、MDA-MB-468(#300279-513、Cell line services)SK-OV-3(ATCC(登録商標)HTB-77(商標))、MDA-MB-175(ATCC-HTB-25)、MD A-MB-453(ATCC-HTB-131)、MDA-MB-361(ATCC-HTB-27)、ZR-75-1(ATCC-CRL-1500)およびMKN-45(D SMZ ACC409)細胞株を、ATCC、DSMZまたはSigma Aldric hから購入し、10%熱不活化胎仔ウシ血清(FBS)を補充した成長培地中で慣用的に維持した。HEK293F Freestyle細胞を、Invitrogenから取得し、293 FreeStyle培地中で慣用的に維持した。
組換えヒト、ニワトリ、ラットおよび交換(swapped)ドメイン・ベクターの作製(HERのクローニング)(ヒトHER2。)全長ヒトHER2を、乳癌細胞株JIMT-1から単離したRNA由来のcDNAからPCRによって増幅した。ヒトHER2の増幅に使用したプライマーは、以下の通りであった。フォワード・プライマー:AAGCTGGCTAGCACCAT GGAGCTGGCGGCCTTGTGC、リバースド・プライマー:AATAATTC TAGACTGGCACGTCCAGACCCAGG。全長増幅産物を、NheIおよびXbaIで消化し、引き続いて、pcDNA3.1(Invitrogen)の対応する部位中にクローニングした。
配列を、NCBI参照配列NM_004448.2との比較によって検証した。トランスフェクションおよび免疫化の目的のためにヒトHER2細胞外ドメイン(ECD)をもっぱら発現する構築物を作製するために、HER2の膜貫通ドメインおよびECDを、P CR増幅し、pVax1中に再クローニングした。トランスフェクション目的のために、別の構築物を、HER2 ECDドメインを増幅することによってpDisplayにおいて作製し、この構築物中では、HER2 ECDドメインは、PDGFR膜貫通ドメインと融合される。
(ヒトHER3。)HER3の全長ヒトcDNAクローンを、Origeneから取得した。トランスフェクションおよび免疫化の目的のためにヒトHER3 ECDをもっぱら発現する構築物を作製するために、HER3の膜貫通ドメインおよびECDを、PCR増幅し、pVax1中に再クローニングした。さらに、別の構築物を、pVax1において作製し、ここで、HER3 ECDドメインを、PDGFR膜貫通ドメインに融合させた。全ての配列を、NCBI参照NM_001982.3との比較によって検証した。
カニクイザルHER2細胞外ドメインを、カニクイザルcDNA-Monkey)No rmal Colon Tissue(Biochain)からPCR増幅した。カニクイザルHER2の増幅に使用したプライマーは、以下の通りであった:
フォワード・プライマー:AAGCTGGCTAGCACCATGGAGCTGGCGG CCTGGTAC、リバースド・プライマー:AATAATTCTAGACTGGCAC GTCCAGACCCAGG。全長増幅産物を、NheI-XbaIで消化し、引き続いて、pcDNA3.1の対応する部位中にクローニングした。このクローンを配列決定し、アカゲザルの利用可能な配列(XM_002800451)とアラインして、ErbB-2クローンの正確さをチェックした。
フォワード・プライマー:AAGCTGGCTAGCACCATGGAGCTGGCGG CCTGGTAC、リバースド・プライマー:AATAATTCTAGACTGGCAC GTCCAGACCCAGG。全長増幅産物を、NheI-XbaIで消化し、引き続いて、pcDNA3.1の対応する部位中にクローニングした。このクローンを配列決定し、アカゲザルの利用可能な配列(XM_002800451)とアラインして、ErbB-2クローンの正確さをチェックした。
カニクイザルHER3細胞外ドメインを、カニクイザルcDNA-Monkey)No rmal Colon Tissue(Biochain)からPCR増幅した。カニクイザルHER3の増幅に使用したプライマーは、以下の通りであった:
フォワード・プライマー:AAGCTGGCTAGCACCATGAGGGCGAACG GCGCTCTG、リバースド・プライマー:AATAATTCTAGATTACGTT CTCTGGGCATTAGC。全長増幅産物を、NheI-XbaIで消化し、引き続いて、pcDNA3.1の対応する部位中にクローニングした。このクローンを配列決定し、アカゲザルの利用可能な配列(ENSMMUP00000027321)とアラインして、HER3クローンの正確さをチェックした。
フォワード・プライマー:AAGCTGGCTAGCACCATGAGGGCGAACG GCGCTCTG、リバースド・プライマー:AATAATTCTAGATTACGTT CTCTGGGCATTAGC。全長増幅産物を、NheI-XbaIで消化し、引き続いて、pcDNA3.1の対応する部位中にクローニングした。このクローンを配列決定し、アカゲザルの利用可能な配列(ENSMMUP00000027321)とアラインして、HER3クローンの正確さをチェックした。
ニワトリHER2配列は、参照配列NM_001044661.1に基づいた。キメラ交換ドメイン構築物を、ニワトリHER2配列のドメインIからIVを、ヒトIのドメインIからIVに交換することによって作製した。mycタグを含む配列を、哺乳動物細胞における発現のために最適化し、Geneartにおいて合成した。
ラットHER3配列は、参照配列NM_001044661.1に基づいた。キメラ交換ドメイン構築物を、ラットHER3配列のドメインIからIVを、ヒトIのドメインI からIVに交換することによって作製した。mycタグを含む配列を、哺乳動物細胞における発現のために最適化し、Geneartにおいて合成した。
HER2およびHER3過剰発現性細胞の作製
細胞表面上に高レベルのHER3を発現する細胞株を作製するために、哺乳動物発現ベクターを、NotIおよびKpnI消化によって全長HER3を切り出すことによって作製した。引き続いて、この断片を、pcDNA3.1(-)/hygroベクターの対応する部位中にクローニングした。ネオマイシン耐性遺伝子をコードする全長HER2およびHER3発現ベクターを使用して、細胞表面上に高レベルのHER2を発現する細胞株を作製した。トランスフェクション前に、プラスミドを、SSpIおよびFspI消化によって線状化した。両方のベクターを、K562細胞中に別々にトランスフェクトし、安定なプールを、抗生物質選択後に作製した。得られた細胞株(K562-HER2およびK562-HER3)は、それらの細胞表面上に高レベルのHER2およびHER3を発現した。
細胞表面上に高レベルのHER3を発現する細胞株を作製するために、哺乳動物発現ベクターを、NotIおよびKpnI消化によって全長HER3を切り出すことによって作製した。引き続いて、この断片を、pcDNA3.1(-)/hygroベクターの対応する部位中にクローニングした。ネオマイシン耐性遺伝子をコードする全長HER2およびHER3発現ベクターを使用して、細胞表面上に高レベルのHER2を発現する細胞株を作製した。トランスフェクション前に、プラスミドを、SSpIおよびFspI消化によって線状化した。両方のベクターを、K562細胞中に別々にトランスフェクトし、安定なプールを、抗生物質選択後に作製した。得られた細胞株(K562-HER2およびK562-HER3)は、それらの細胞表面上に高レベルのHER2およびHER3を発現した。
免疫化
(HER2免疫化。)4つの異なる免疫化戦略を適用した。コホート#Aについて、6匹のC57Bl/6マウスを、腹腔内注射によって、200μl中2×106の、HER2 を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で免疫化した。引き続いて、マウスを、1 4日目に腹腔内注射によって、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのErbb-2-Fc(RND systems)タンパク質で追加免疫し、その後、28日目および42日目に、200μl中2×106の、HER2を一過的にト ランスフェクトしたL929細胞で追加免疫した。コホート#Cについて、6匹のC57B l/6マウスを、腹腔内注射によって、2×106の、HER2を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で免疫化した。引き続いて、マウスを、14日目に腹腔内注射によって、200μl中2×106の、HER2を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で追加免疫し、その後、35日目に腹腔内注射によって、125μlのTiterma x Gold中に溶解させた20μgのErbb-2-Fcタンパク質でタンパク質追加免疫し、49日目に腹腔内注射によって、200μlのPBS中に溶 解させた20μgの Erbb-2-Fcタンパク質で最終追加免疫した。コホート#Eについて、6匹のC5 7Bl/6マウスを、腹腔内注射によって、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのErbb-2-Fcタンパク質で免疫化した。引き続いて、腹腔内注射を介した、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのE rbb-2-Fcタンパク質によるタンパク質追加免疫を、14日目および28日目に実施し、42日目に腹腔内注射によって、200μlのPBS中に溶解させた20μgのE rbb-2-Fcタンパク質で最終追加免疫した。コホート#Gについて、6匹のC57 Bl/6マウスを、そのプロトコールに従って、Genovac(Freiburg、G ermany)においてDNAワクチン接種によって免疫化した。DNAワクチン接種に使用した、エンドトキシン・フリーの提供されたベクターは、pVax1中にクローニングされたHER2の膜貫通部分および細胞外部分をコードしていた。引き続いて、DNA追加免疫を、14日目、28日目および66日目に与えた。
(HER2免疫化。)4つの異なる免疫化戦略を適用した。コホート#Aについて、6匹のC57Bl/6マウスを、腹腔内注射によって、200μl中2×106の、HER2 を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で免疫化した。引き続いて、マウスを、1 4日目に腹腔内注射によって、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのErbb-2-Fc(RND systems)タンパク質で追加免疫し、その後、28日目および42日目に、200μl中2×106の、HER2を一過的にト ランスフェクトしたL929細胞で追加免疫した。コホート#Cについて、6匹のC57B l/6マウスを、腹腔内注射によって、2×106の、HER2を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で免疫化した。引き続いて、マウスを、14日目に腹腔内注射によって、200μl中2×106の、HER2を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で追加免疫し、その後、35日目に腹腔内注射によって、125μlのTiterma x Gold中に溶解させた20μgのErbb-2-Fcタンパク質でタンパク質追加免疫し、49日目に腹腔内注射によって、200μlのPBS中に溶 解させた20μgの Erbb-2-Fcタンパク質で最終追加免疫した。コホート#Eについて、6匹のC5 7Bl/6マウスを、腹腔内注射によって、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのErbb-2-Fcタンパク質で免疫化した。引き続いて、腹腔内注射を介した、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのE rbb-2-Fcタンパク質によるタンパク質追加免疫を、14日目および28日目に実施し、42日目に腹腔内注射によって、200μlのPBS中に溶解させた20μgのE rbb-2-Fcタンパク質で最終追加免疫した。コホート#Gについて、6匹のC57 Bl/6マウスを、そのプロトコールに従って、Genovac(Freiburg、G ermany)においてDNAワクチン接種によって免疫化した。DNAワクチン接種に使用した、エンドトキシン・フリーの提供されたベクターは、pVax1中にクローニングされたHER2の膜貫通部分および細胞外部分をコードしていた。引き続いて、DNA追加免疫を、14日目、28日目および66日目に与えた。
(HER3免疫化。)4つの異なる免疫化戦略を適用した。コホート#Bについて、6匹の(C57Bl/6)マウスを、腹腔内注射によって、200μl中2×106の、HE R3を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で免疫化した。引き続いて、マウスを、14日目、28日目、49日目および63日目に、200μl中2×106の、HER 3で一過的にトランスフェクトされたL929細胞で追加免疫した。コホート#Dについて、6匹のC57Bl/6マウスを、0日目、14日目および28日目に腹腔内注射によって、2×106の、HER3を一過的にトランスフェクトしたL929細胞で免疫化した。引き続いて、マウスを、49日目に腹腔内注射によって、125μlのTiterm ax Gold中に溶解させた20μgのErbb-3-Fcタンパク質で追加免疫し、 66日目に腹腔内注射によって、200μlのPBS中に溶解させた20μgのErbb-3-Fcタンパク質で最終追加免疫した。コホート#Fについて、6匹のC57Bl/ 6マウスを、腹腔内注射によって、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのErbb-3-Fcタンパク質で免疫化した。引き続いて、マウスを、 1 4日目および28日目に腹腔内注射によって、125μlのTitermax Gold中に溶解させた20μgのErbb-3-Fcタンパク質で追加免疫し、42 日目に腹腔内注射によって、200μlのPBS中に溶解させた20μgのErbb-3-Fcタンパク質による最終追加免疫を与えた。コホート#Hについて、6 匹のC57Bl/6マウスを、そのプロトコールに従って、Genovac(Freiburg、Germany)においてDNAワクチン接種によって免疫化した。DNAワクチン接種に使用した、エンドトキシン・フリーの提供されたベクターは、pVax1中にクローニングされたPD GFRの膜貫通部分およびHER3の細胞外部分をコードしていた。引き続いて、DNA 追加免疫を、14日目、28日目および66日目に与えた。
抗体力価の決定。
免疫化されたC57Bl/6マウス由来の血清中の抗HER2力価を、ECD-Erb b-2タンパク質(Bendermedsystems)に対するELISA、ならびにHER2陰性K562、HER2低発現性細胞株MCF-7ならびにHER2増幅されたSKBR-3およびBT-474細胞に対するFACS分析によって、決定した。免疫 化されたC57Bl/6マウス由来の血清中の抗HER3力価を、Erbb-3-Fc タンパク質に対するELISA、ならびにHER3陰性K562、HER2低発現性細胞 株M CF-7ならびにHER2増幅されたSKBR-3およびBT-474細胞に対するFA CS分析によって、決定した。
免疫化されたC57Bl/6マウス由来の血清中の抗HER2力価を、ECD-Erb b-2タンパク質(Bendermedsystems)に対するELISA、ならびにHER2陰性K562、HER2低発現性細胞株MCF-7ならびにHER2増幅されたSKBR-3およびBT-474細胞に対するFACS分析によって、決定した。免疫 化されたC57Bl/6マウス由来の血清中の抗HER3力価を、Erbb-3-Fc タンパク質に対するELISA、ならびにHER3陰性K562、HER2低発現性細胞 株M CF-7ならびにHER2増幅されたSKBR-3およびBT-474細胞に対するFA CS分析によって、決定した。
動物を屠殺する前のHER2およびHER3に対する血清力価は、それぞれ、表1および表2に記載されている。全てのコホート中の動物は、HER2またはHER3に対する抗体応答を発達させた。
リンパ組織の回収。
脾臓および流入領域リンパ節を、DNAでワクチン接種した全てのマウス(コホート# Gおよび#H)から取り出した。単一細胞浮遊液を、全ての組織から作製し、引き続いて、組織を、Trizol試薬中で溶解した。コホート#Aから#Fまで、脾臓を、最初の追加免疫後に死亡したコホート#Cの1匹のマウスを除く全てのマウスから取り出した。単一細胞浮遊液を、全ての脾臓から作製し、総B細胞画分を、CD19富化(コホート# A、E、F)または非B細胞の枯渇(コホート#B、C、D)のいずれかによって、MA CS分離手順を使用して単離した。
脾臓および流入領域リンパ節を、DNAでワクチン接種した全てのマウス(コホート# Gおよび#H)から取り出した。単一細胞浮遊液を、全ての組織から作製し、引き続いて、組織を、Trizol試薬中で溶解した。コホート#Aから#Fまで、脾臓を、最初の追加免疫後に死亡したコホート#Cの1匹のマウスを除く全てのマウスから取り出した。単一細胞浮遊液を、全ての脾臓から作製し、総B細胞画分を、CD19富化(コホート# A、E、F)または非B細胞の枯渇(コホート#B、C、D)のいずれかによって、MA CS分離手順を使用して単離した。
免疫化したマウスからのファージ・ディスプレイ・ライブラリーの作製
1つのファージ・ライブラリーを、各マウスについて構築した。この目的のために、1群ごとの全てのマウス(1群につき5または6匹のマウス)からの材料を使用して、以下のアプローチを使用してファージ・ライブラリーを調製した。各個々のマウスから、RN Aを単離し、cDNAを合成し、VHファミリー特異的PCRを実施した。引き続いて、マウス1匹当たりの全てのVHファミリーPCR産物を精製し、DNA濃度を決定し、消化し、共通の軽鎖を含むファージ・ディスプレイ・ベクター中にライゲーションして、マウス-ヒト・キメラ・ファージ・ライブラリーを作製した。全てのファージ・ライブラリーは、85%超の挿入頻度で、106超のクローンを含んだ。
1つのファージ・ライブラリーを、各マウスについて構築した。この目的のために、1群ごとの全てのマウス(1群につき5または6匹のマウス)からの材料を使用して、以下のアプローチを使用してファージ・ライブラリーを調製した。各個々のマウスから、RN Aを単離し、cDNAを合成し、VHファミリー特異的PCRを実施した。引き続いて、マウス1匹当たりの全てのVHファミリーPCR産物を精製し、DNA濃度を決定し、消化し、共通の軽鎖を含むファージ・ディスプレイ・ベクター中にライゲーションして、マウス-ヒト・キメラ・ファージ・ライブラリーを作製した。全てのファージ・ライブラリーは、85%超の挿入頻度で、106超のクローンを含んだ。
HER2およびHER3に特異的に結合するFab断片を保有するファージの選択
抗体断片を、抗体ファージ・ディスプレイ・ライブラリーを使用して選択した。免疫化ライブラリーおよび合成ライブラリー(de Kruifら、Mol.Biol.(19 95)、248、97~105に記載される通り)を、選択に使用した。
抗体断片を、抗体ファージ・ディスプレイ・ライブラリーを使用して選択した。免疫化ライブラリーおよび合成ライブラリー(de Kruifら、Mol.Biol.(19 95)、248、97~105に記載される通り)を、選択に使用した。
HER2ファージの選択およびスクリーニング
ファージ・ライブラリーを、VCS-M13ヘルパー・ファージ(Stratagen e)を用いてレスキューし、組換えタンパク質でコートされたイムノチューブ(Nunc)中で、2ラウンドにわたって選択した。第1ラウンドでは、ECD-Erbb-2タ ンパク質(Bendermedsystems)を、イムノチューブ上にコートし、第2 ラウンドでは、Erbb-2-Fc(RND systems)を、イムノチューブ上にコートした。これらのイムノチューブを、4%脱脂粉乳(ELK)中でブロッキングした。ファージ抗体ライブラリーもまた、4%ELKでブロッキングし、その後、イムノチューブにファージ・ライブラリーを添加した。免疫チューブ中での、ファージ・ライブラリーとコートされたタンパク質とのインキュベーションを、回転条件下、室温で2時間実施した。次いで、イムノチューブを、PBS中0.05%のTween-20で5~10回洗浄し、その後、PBS中で5~10回洗浄した。結合したファージを、50mMのグリシン(pH2.2)を使用して溶出し、E.coli XL-1 Blueに添加し、ファージ感染のために37℃でインキュベートした。引き続いて、感染した細菌を、アンピシリン、テトラサイクリンおよびグルコースを含む寒天プレート上にプレートし、37℃で終夜インキュベートした。第1ラウンドの後、コロニーをプレートから掻き取り、合わせ、その後、レスキューし、増幅して、富化された第1ラウンド・ライブラリーを調製した。次いで、富化されたライブラリーを、上記プロトコールを使用して、Erbb-2-F c(RND systems)に対して選択した。第2ラウンドの選択後、個々のクローンを取り、レスキューして、ファージ・モノクローナル・ミニプレップを調製した。次いで、Erbb2と結合している陽性ファージ・クローンを、乳癌細胞株BT-474への結合についてFACSにおいて同定した。全てのErbb2特異的クローンのVH遺伝子を配列決定した。VH遺伝子再編成を、VBASE2ソフトウェアを用いて確立して、ユニーククローンを同定した。次いで、全てのユニーククローンを、HEK293T細胞( 陰性コントロール)、ErbB-2で一過的にトランスフェクトされたHEK293T細胞、およびBT-474細胞への結合について、FACSにおいてファージ形式で試験した。
ファージ・ライブラリーを、VCS-M13ヘルパー・ファージ(Stratagen e)を用いてレスキューし、組換えタンパク質でコートされたイムノチューブ(Nunc)中で、2ラウンドにわたって選択した。第1ラウンドでは、ECD-Erbb-2タ ンパク質(Bendermedsystems)を、イムノチューブ上にコートし、第2 ラウンドでは、Erbb-2-Fc(RND systems)を、イムノチューブ上にコートした。これらのイムノチューブを、4%脱脂粉乳(ELK)中でブロッキングした。ファージ抗体ライブラリーもまた、4%ELKでブロッキングし、その後、イムノチューブにファージ・ライブラリーを添加した。免疫チューブ中での、ファージ・ライブラリーとコートされたタンパク質とのインキュベーションを、回転条件下、室温で2時間実施した。次いで、イムノチューブを、PBS中0.05%のTween-20で5~10回洗浄し、その後、PBS中で5~10回洗浄した。結合したファージを、50mMのグリシン(pH2.2)を使用して溶出し、E.coli XL-1 Blueに添加し、ファージ感染のために37℃でインキュベートした。引き続いて、感染した細菌を、アンピシリン、テトラサイクリンおよびグルコースを含む寒天プレート上にプレートし、37℃で終夜インキュベートした。第1ラウンドの後、コロニーをプレートから掻き取り、合わせ、その後、レスキューし、増幅して、富化された第1ラウンド・ライブラリーを調製した。次いで、富化されたライブラリーを、上記プロトコールを使用して、Erbb-2-F c(RND systems)に対して選択した。第2ラウンドの選択後、個々のクローンを取り、レスキューして、ファージ・モノクローナル・ミニプレップを調製した。次いで、Erbb2と結合している陽性ファージ・クローンを、乳癌細胞株BT-474への結合についてFACSにおいて同定した。全てのErbb2特異的クローンのVH遺伝子を配列決定した。VH遺伝子再編成を、VBASE2ソフトウェアを用いて確立して、ユニーククローンを同定した。次いで、全てのユニーククローンを、HEK293T細胞( 陰性コントロール)、ErbB-2で一過的にトランスフェクトされたHEK293T細胞、およびBT-474細胞への結合について、FACSにおいてファージ形式で試験した。
HER3ファージの選択およびスクリーニング
ファージ・ライブラリーを、VCS-M13ヘルパー・ファージ(Stratagen e)でレスキューし、組換えタンパク質でコートされたイムノチューブ(Nunc)中で、2ラウンドにわたって選択した。両方の選択ラウンドで、Erbb-3-Fc(RND systems)を、イムノチューブ上にコートした。融合タンパク質のFc部分に向 かう選択バイアスを克服するために、Erbb-3-Fcに対する両方の選択ラウンドを、150μg/mlのヒトIgGの存在下で実施した。これらのイムノチューブを、4% ELKでブロッキングした。ファージ抗体ライブラリーを、4%ELKでブロッキングし、その後、イムノチューブにファージ・ライブラリーを添加した。ファージ・ライブラリーとのインキュベーションを、回転条件下、2時間実施した。次いで、イムノチューブを、PBS中0.05%のTween-20で5~10回洗浄し、その後、PBS中で5~ 10回洗浄した。結合したファージを、50mMのグリシン(pH2.2)を使用して溶出し、E.coli XL-1 Blueに添加し、ファージ感染のためにインキュベートした。引き続いて、感染した細菌を、アンピシリン、テトラサイクリンおよびグルコースを含む寒天プレート上にプレートし、37℃で終夜インキュベートした。第1ラウンドの後、コロニーをプレートから掻き取り、合わせ、ファージをレスキューし、増幅して、富化された第1ラウンド・ライブラリーを調製した。次いで、富化されたライブラリーを、上記プロトコールを使用して、Erbb-3-Fc(RND systems)に対して選択した。第2ラウンドの選択後、個々のクローンを取り、レスキューして、ファージ・モノクローナル・ミニプレップを調製した。陽性ファージ・クローンを、乳癌細胞株B T-474への結合についてFACSにおいて同定した。全ての陽性クローンのVH遺伝子を配列決定した。VH遺伝子再編成を、VBASE2ソフトウェアを用いて確立して、ユニーククローンを同定した。全てのユニーククローンを、K562細胞(陰性コントロール)、安定なK562-HER3細胞およびBT-474細胞への結合について、FA CSにおいてファージ形式で試験した。
ファージ・ライブラリーを、VCS-M13ヘルパー・ファージ(Stratagen e)でレスキューし、組換えタンパク質でコートされたイムノチューブ(Nunc)中で、2ラウンドにわたって選択した。両方の選択ラウンドで、Erbb-3-Fc(RND systems)を、イムノチューブ上にコートした。融合タンパク質のFc部分に向 かう選択バイアスを克服するために、Erbb-3-Fcに対する両方の選択ラウンドを、150μg/mlのヒトIgGの存在下で実施した。これらのイムノチューブを、4% ELKでブロッキングした。ファージ抗体ライブラリーを、4%ELKでブロッキングし、その後、イムノチューブにファージ・ライブラリーを添加した。ファージ・ライブラリーとのインキュベーションを、回転条件下、2時間実施した。次いで、イムノチューブを、PBS中0.05%のTween-20で5~10回洗浄し、その後、PBS中で5~ 10回洗浄した。結合したファージを、50mMのグリシン(pH2.2)を使用して溶出し、E.coli XL-1 Blueに添加し、ファージ感染のためにインキュベートした。引き続いて、感染した細菌を、アンピシリン、テトラサイクリンおよびグルコースを含む寒天プレート上にプレートし、37℃で終夜インキュベートした。第1ラウンドの後、コロニーをプレートから掻き取り、合わせ、ファージをレスキューし、増幅して、富化された第1ラウンド・ライブラリーを調製した。次いで、富化されたライブラリーを、上記プロトコールを使用して、Erbb-3-Fc(RND systems)に対して選択した。第2ラウンドの選択後、個々のクローンを取り、レスキューして、ファージ・モノクローナル・ミニプレップを調製した。陽性ファージ・クローンを、乳癌細胞株B T-474への結合についてFACSにおいて同定した。全ての陽性クローンのVH遺伝子を配列決定した。VH遺伝子再編成を、VBASE2ソフトウェアを用いて確立して、ユニーククローンを同定した。全てのユニーククローンを、K562細胞(陰性コントロール)、安定なK562-HER3細胞およびBT-474細胞への結合について、FA CSにおいてファージ形式で試験した。
合計36回の選択を、Erbb2およびErbb3抗原形式で実施した。全ての選択スクリーニング手順は、HER2に対する89のユニークFabクローンおよびHER3に対する137のユニークFabクローンを生じた。Fabを、ユニークVDJ組換え事象を示すそのユニークHCDR3配列に基づいて、ユニークであるとみなした。一部の場合には、同一のHCDR3を有するが、CDR1および/またはCDR2中に差異を有する、クローナル・バリアントが得られた。免疫化マウス・ライブラリーから、親和性バリアントを反映するVH遺伝子中の置換を含むクローナル・バリアントのクラスターを選択した。
抗体の選択/特徴付け
モノクローナル抗体の作製
免疫化マウス・ファージ・ライブラリー由来の、VH遺伝子配列およびそのいくつかの配列バリアントによって判断される、ユニーク抗体のVH遺伝子を、骨格IgG1ベクター中にクローニングした。2つの異なる産生細胞株を、プロセスの間に使用した;HEK 293Tおよび293F Freestyle細胞。接着性HEK293T細胞を、6ウェル・プレート中で、80%のコンフルエンシーまで培養した。これらの細胞を、個々のDNA-FUGENE混合物で一過的にトランスフェクトし、さらに培養した。トランスフェクションの7日後、上清を回収し、培地をリフレッシュした。トランスフェクションの14日後、上清を合わせ、0.22μM(Sartorius)を通じて濾過した。無菌上清を4℃で貯蔵した。
モノクローナル抗体の作製
免疫化マウス・ファージ・ライブラリー由来の、VH遺伝子配列およびそのいくつかの配列バリアントによって判断される、ユニーク抗体のVH遺伝子を、骨格IgG1ベクター中にクローニングした。2つの異なる産生細胞株を、プロセスの間に使用した;HEK 293Tおよび293F Freestyle細胞。接着性HEK293T細胞を、6ウェル・プレート中で、80%のコンフルエンシーまで培養した。これらの細胞を、個々のDNA-FUGENE混合物で一過的にトランスフェクトし、さらに培養した。トランスフェクションの7日後、上清を回収し、培地をリフレッシュした。トランスフェクションの14日後、上清を合わせ、0.22μM(Sartorius)を通じて濾過した。無菌上清を4℃で貯蔵した。
懸濁適応させた293F Freestyle細胞を、T125フラスコ中で、3.0×106細胞/mlの密度まで、シェーカー・プラトーで培養した。細胞を、24深ウェル・プレートの各ウェル中に、0.3~0.5×106の生存細胞/mlの密度で播種した。これらの細胞を、個々の無菌DNA:PEl混合物で一過的にトランスフェクトし、さらに培養した。トランスフェクションの7日後、上清を回収し、0.22μM(Sar torius)を通じて濾過した。無菌上清を4℃で貯蔵した。
二重特異性抗体の作製
二重特異性抗体を、二重特異性抗体の効率的なヘテロ二量体化および形成を確実にするために、所有のCH3テクノロジーを使用して作製した。このCH3テクノロジーは、2 つの異なる重鎖分子の効率的ペアリングを可能にするために、上に記載されたように(P CT/NL2013/050294;WO2013/157954A1として公開)、C H3領域中の荷電ベースの点変異を使用する。
二重特異性抗体を、二重特異性抗体の効率的なヘテロ二量体化および形成を確実にするために、所有のCH3テクノロジーを使用して作製した。このCH3テクノロジーは、2 つの異なる重鎖分子の効率的ペアリングを可能にするために、上に記載されたように(P CT/NL2013/050294;WO2013/157954A1として公開)、C H3領域中の荷電ベースの点変異を使用する。
機能的スクリーニングのためのIgG精製
IgGの精製を、アフィニティ・クロマトグラフィーを使用して、小規模(<500μg)、中規模(<10mg)および大規模(>10mg)で実施した。小規模精製を、減圧濾過を使用して、24ウェル・フィルター・プレートにおいて無菌条件下で実施した。最初に、培地のpHを、pH8.0に調整し、引き続いて、小規模産生物を、600rp mの振盪プラットフォーム(Heidolphプレート・シェーカー)上で25℃で2時間、プロテインA Sepharose CL-4Bビーズ(50% v/v)(Pie rce)と共にインキュベートした。次に、ビーズを、減圧濾過によって回収した。ビーズを、PBS pH7.4で2回洗浄した。IgGを、0.1Mクエン酸塩緩衝液を用いてpH3.0において溶出し、IgG画分を、Tris pH8.0で即座に中和した。緩衝液交換を、マルチスクリーンUltracel 10マルチプレート(Millip ore)を使用する遠心分離によって実施した。これらのサンプルは、PBS pH7. 4の最終緩衝液中で終わった。
IgGの精製を、アフィニティ・クロマトグラフィーを使用して、小規模(<500μg)、中規模(<10mg)および大規模(>10mg)で実施した。小規模精製を、減圧濾過を使用して、24ウェル・フィルター・プレートにおいて無菌条件下で実施した。最初に、培地のpHを、pH8.0に調整し、引き続いて、小規模産生物を、600rp mの振盪プラットフォーム(Heidolphプレート・シェーカー)上で25℃で2時間、プロテインA Sepharose CL-4Bビーズ(50% v/v)(Pie rce)と共にインキュベートした。次に、ビーズを、減圧濾過によって回収した。ビーズを、PBS pH7.4で2回洗浄した。IgGを、0.1Mクエン酸塩緩衝液を用いてpH3.0において溶出し、IgG画分を、Tris pH8.0で即座に中和した。緩衝液交換を、マルチスクリーンUltracel 10マルチプレート(Millip ore)を使用する遠心分離によって実施した。これらのサンプルは、PBS pH7. 4の最終緩衝液中で終わった。
HER2/HER3特異的IgGの検証
抗体を、BT-474、HEK293T、およびHER2またはHER3を過剰発現するHEK293Tへの結合について、FACSにおいて試験した。従って、細胞を、トリプシンを使用して回収し、FACS緩衝液(PBS/0.5%BSA/0.5mM ED TA)中106細胞/mlに希釈した。1~2×105細胞を、U底96ウェル・プレート中の各ウェルに添加した。細胞を、4℃で300gで2分間遠心分離した。上清を、プレート(複数可)を反転させることによって廃棄した。50μlの各IgGサンプルを、10μg/mlの濃度で添加し、氷上で1時間インキュベートした。細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。50μlの1:100希釈したマウス抗ヒトIgG PE(Invitrogen)を添加し、暗中で氷上で30~60分間インキュベートした。FACS緩衝液を添加した後、細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。細胞を、HTS設定のFAC SCantoフロー・サイトメーターで分析した。細胞への抗体の結合を、平均蛍光強度(MFI)によって評価した。
抗体を、BT-474、HEK293T、およびHER2またはHER3を過剰発現するHEK293Tへの結合について、FACSにおいて試験した。従って、細胞を、トリプシンを使用して回収し、FACS緩衝液(PBS/0.5%BSA/0.5mM ED TA)中106細胞/mlに希釈した。1~2×105細胞を、U底96ウェル・プレート中の各ウェルに添加した。細胞を、4℃で300gで2分間遠心分離した。上清を、プレート(複数可)を反転させることによって廃棄した。50μlの各IgGサンプルを、10μg/mlの濃度で添加し、氷上で1時間インキュベートした。細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。50μlの1:100希釈したマウス抗ヒトIgG PE(Invitrogen)を添加し、暗中で氷上で30~60分間インキュベートした。FACS緩衝液を添加した後、細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。細胞を、HTS設定のFAC SCantoフロー・サイトメーターで分析した。細胞への抗体の結合を、平均蛍光強度(MFI)によって評価した。
非特異的結合について試験するために、反応性ELISAアッセイを使用した。HER 2抗体およびHER3抗体を、抗原フィブリノーゲン、ヘモグロビンおよび破傷風毒素に対する反応性について試験した。HER2およびHER3への特異的結合を試験するために、これらの抗体を、EGFR、HER2、HER3およびHER4の精製された組換え細胞外ドメインへの結合について試験した。抗原を、MAXISORP(商標)ELIS Aプレートに終夜コートした。ELISAプレートのウェルを、5%BSAを含むPBS(pH7.2)で37℃で1時間ブロッキングした。選択された抗体を、PBS-2%B SA中に希釈した10μg/mlの濃度で2連で試験し、25℃で2時間結合させた。コントロールとして、この手順を、コートされた抗原に特異的な抗体および陰性コントロール抗体を用いて、同時に実施した。ELISAプレートを、PBS-T(PBS-0.0 5% v/v Tween 20)で5回洗浄した。結合したIgGを、1:2000希釈したHRPコンジュゲート(ヤギ抗マウスBD)を用いて検出し、25℃で2時間結合させた。ELISAプレートを、PBS-T(PBS-0.05% Tween 20) で5回洗浄し、結合したIgGを、OD492nm測定によって検出した。
HER2/HER3特異的IgGのエピトープ・グループ分け
抗HER2抗体のパネルを、キメラ構築物を使用して、他の種(マウス、ニワトリ)由来のHER2 ECDに対するそれらの反応性、ならびにHER2分子中の特定のドメイン、即ち、ドメインI、II、IIIおよびIVへのそれらの結合に基づいて、ビニングした。
抗HER2抗体のパネルを、キメラ構築物を使用して、他の種(マウス、ニワトリ)由来のHER2 ECDに対するそれらの反応性、ならびにHER2分子中の特定のドメイン、即ち、ドメインI、II、IIIおよびIVへのそれらの結合に基づいて、ビニングした。
抗HER3抗体のパネルを、キメラ構築物を使用して、他の種(カニクイザル、ラット)由来のHER3 ECDに対するそれらの反応性、ならびにHER3分子中の特定のドメイン、即ち、ドメインI、II、IIIおよびIVへのそれらの結合に基づいて、ビニングした。
この目的のために、CHO-K1細胞を、リポフェクタミン/DNAミックスを使用して、適切な構築物で一過的にトランスフェクトした。キメラ交換ドメイン構築物において、ニワトリHER2またはラットHER3のドメインを、ヒト対応物によって置き換える。特異的抗体の結合を、FACSによって測定した。構築物の発現を、抗myc抗体を使用して確認した。トラスツズマブによるFACS染色を、ドメインIVへの特異的結合についてのコントロールとして含めた。各群中の抗体を、染色の強度(MFI)に基づいてランク付けできた。
65の抗体のHER2パネルが、7つのビンにマッピングできた(表3)。
1.ドメインI特異的(25)
2.ドメインII特異的(2)
3.ドメインIII特異的(23)
4.ドメインIV特異的(7)
5.ドメインIV特異的およびマウスと交差反応性(2)
6.全ての構築物と反応性(2)
7.ヒトHER2とだけ反応性(4)
1.ドメインI特異的(25)
2.ドメインII特異的(2)
3.ドメインIII特異的(23)
4.ドメインIV特異的(7)
5.ドメインIV特異的およびマウスと交差反応性(2)
6.全ての構築物と反応性(2)
7.ヒトHER2とだけ反応性(4)
トラスツズマブとの競合
HER2ドメインIVにマッピングされた2つの抗体は、SKBR-3細胞の増殖を阻害した。両方の抗体が、1アミノ酸の差異を除き、類似のCDR3を共有していた。1つの抗体PG1849を、競合ELISAにおいてトラスツズマブと競合するその能力について調査した。このELISAでは、Fc-HER2をコートし、15μg/mlの濃度のIgG抗体と共にインキュベートした。15分間のインキュベーション後、ファージを、もう1時間インキュベートした。その後、ファージを検出した。表4は、PG1849 およびトラスツズマブが、HER2に同時に結合できたことを実証しているが、それは、ELISAの間にシグナルの喪失が現れなかったからである。真の競合は、同じファージおよび抗体をこのアッセイにおいて組み合わせた時にだけ観察された。
HER2ドメインIVにマッピングされた2つの抗体は、SKBR-3細胞の増殖を阻害した。両方の抗体が、1アミノ酸の差異を除き、類似のCDR3を共有していた。1つの抗体PG1849を、競合ELISAにおいてトラスツズマブと競合するその能力について調査した。このELISAでは、Fc-HER2をコートし、15μg/mlの濃度のIgG抗体と共にインキュベートした。15分間のインキュベーション後、ファージを、もう1時間インキュベートした。その後、ファージを検出した。表4は、PG1849 およびトラスツズマブが、HER2に同時に結合できたことを実証しているが、それは、ELISAの間にシグナルの喪失が現れなかったからである。真の競合は、同じファージおよび抗体をこのアッセイにおいて組み合わせた時にだけ観察された。
124の抗体のHER3パネルが、5つのビンにマッピングできた(表5):
1.高いドメインIII反応性、ラットおよびマウス反応性、ならびにドメインIVへの軽微な反応性(8)
2.高いドメインIII反応性、ラット、ヒトおよびカニクイザル反応性、ドメインIVへの軽微な反応性(8)
3.ラット、カニクイザルおよびヒトHER3とだけ反応性(43)
4.ヒトHER3とだけ反応性(32)
5.全ての構築物と反応性(33)
1.高いドメインIII反応性、ラットおよびマウス反応性、ならびにドメインIVへの軽微な反応性(8)
2.高いドメインIII反応性、ラット、ヒトおよびカニクイザル反応性、ドメインIVへの軽微な反応性(8)
3.ラット、カニクイザルおよびヒトHER3とだけ反応性(43)
4.ヒトHER3とだけ反応性(32)
5.全ての構築物と反応性(33)
細胞株増殖アッセイ
SK-BR-3細胞を、L-グルタミンおよび10%熱不活化FBSを補充したDMEM-F/12中で培養した。BxPC-3-luc2細胞を、10%熱不活化FBSを補 充したRPMI1640中で培養した。MCF-7細胞を、100μM、NEAA 1m Mのピルビン酸ナトリウム、4μg/mlのインスリンおよび10%の熱不活化FBSを補充したRPMI1640中で培養した。
SK-BR-3細胞を、L-グルタミンおよび10%熱不活化FBSを補充したDMEM-F/12中で培養した。BxPC-3-luc2細胞を、10%熱不活化FBSを補 充したRPMI1640中で培養した。MCF-7細胞を、100μM、NEAA 1m Mのピルビン酸ナトリウム、4μg/mlのインスリンおよび10%の熱不活化FBSを補充したRPMI1640中で培養した。
SK-BR-3細胞の増殖アッセイのために、コンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを、培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、培養培地中6×104細胞/mlに希釈した。抗体を、10μg/ml および1μg/mlの濃度に希釈し、96ウェル黒底プレート(ABgene AB-0 932)中に100μlの体積で添加した。細胞を、6000細胞/ウェルの密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%COで3日間培養した。A lamar Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%COで6時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。成長阻害の程度を、同じ濃度のトラスツズマブのものと比較した(表6)。
MCF-7およびBxPC-3-luc2細胞の増殖アッセイのために、コンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを、培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% B SAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1640培地)で2 回洗浄した。
MCF-7細胞を、培養培地中5×104細胞/mlに希釈した。抗体を、10μg/ mlおよび1μg/mlの濃度に希釈し、96ウェル黒底プレート(ABgene AB-0932)中に100μlの体積で添加した。細胞を、1ng/mlの最終濃度のヒト組換えヒトNRG1-ベータ1/HRG1-ベータ1 EGFドメイン(396-HB- 050 RND)の存在下で、5000細胞/ウェルの密度で添加した。ヒトNRG1- ベータ1/HRG1-ベータ1 EGFドメインを、本明細書で以下、HRGと呼ぶ。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%COで5日間培養した。Alama r Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。成長阻害の程度を、同じ濃度の#Ab6のものと比較した(表7)。
BxPC-3-luc-2増殖アッセイを使用して、二重特異性抗体をスクリーニングした。BxPC-3-luc-2細胞を、培養培地中8×104細胞/mlに希釈した。 抗体を、10μg/mlおよび1μg/mlの濃度に希釈し、96ウェル黒底プレート( ABgene AB-0932)中に100μlの体積で添加した。細胞を、10ng/ mlの最終濃度のヒトHRGの非存在下または存在下で、8000細胞/ウェルの密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%COで4日間培養した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%COで4時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。
エッジ効果を最小化するために、96ウェル・プレートの外側ウェルを、PBSで完全に満たした。
HER2特異的IgGの親和性ランキング
本発明者らは、Devash(PNAS、1990)によって記載される方法を使用して、限定抗原-ELISAにおいて抗体をランク付けした。減少した抗原コーティング濃度の使用は、観察された交差反応性反応を排除し、高親和性/結合力の抗体を検出するために使用され得る。従って、固体支持体上の抗原濃度を徐々に減少させて、弱い免疫反応性を調査した。2.5μg/mlから開始して0.019μg/mlまでのECD-Er bb-2タンパク質の連続滴定を、MAXISORP(商標)ELISAプレートに終夜コートした。ELISAプレートのウェルを、5%BSAを含むPBS(pH7.2)中で37℃で1時間ブロッキングした。選択された抗体を、PBS-2%BSA中に希釈した10μg/mlの濃度で2連で試験し、25℃で2時間結合させた。コントロールとして、この手順を、コートされた抗原に特異的な抗体および陰性コントロール抗体を用いて、同時に実施した。ELISAプレートを、PBS-T(PBS-0.05% v/v Tween 20)で5回洗浄した。結合したIgGを、1:2000希釈したHRPコンジュゲート(ヤギ抗マウスIgG、BD Biosciences)を用いて検出し、25℃で2時間結合させた。ELISAプレートを、PBS-T(PBS-0.05% Tween 20)で5回洗浄し、結合したIgGを、OD492nm測定によって検出した。PG1849、PG2916、PG2926、PG2930、PG2971、PG 2973、PG3004およびPG3031を、HER2抗原滴定ELISAにおいて試験した(図1)。
本発明者らは、Devash(PNAS、1990)によって記載される方法を使用して、限定抗原-ELISAにおいて抗体をランク付けした。減少した抗原コーティング濃度の使用は、観察された交差反応性反応を排除し、高親和性/結合力の抗体を検出するために使用され得る。従って、固体支持体上の抗原濃度を徐々に減少させて、弱い免疫反応性を調査した。2.5μg/mlから開始して0.019μg/mlまでのECD-Er bb-2タンパク質の連続滴定を、MAXISORP(商標)ELISAプレートに終夜コートした。ELISAプレートのウェルを、5%BSAを含むPBS(pH7.2)中で37℃で1時間ブロッキングした。選択された抗体を、PBS-2%BSA中に希釈した10μg/mlの濃度で2連で試験し、25℃で2時間結合させた。コントロールとして、この手順を、コートされた抗原に特異的な抗体および陰性コントロール抗体を用いて、同時に実施した。ELISAプレートを、PBS-T(PBS-0.05% v/v Tween 20)で5回洗浄した。結合したIgGを、1:2000希釈したHRPコンジュゲート(ヤギ抗マウスIgG、BD Biosciences)を用いて検出し、25℃で2時間結合させた。ELISAプレートを、PBS-T(PBS-0.05% Tween 20)で5回洗浄し、結合したIgGを、OD492nm測定によって検出した。PG1849、PG2916、PG2926、PG2930、PG2971、PG 2973、PG3004およびPG3031を、HER2抗原滴定ELISAにおいて試験した(図1)。
種々のカッパ軽鎖とのHER2 VH遺伝子の結合
異なるファージ・ディスプレイ・ライブラリー由来のHER2 VHの結合を調査するために、HER2抗体のパネルを、クローニングし、別のVKカッパ鎖、即ち、MEHD 7945AのVLの背景で発現させた。産生されたIgGを、K562細胞および安定なK562-HER2細胞に対するFACS分析に供した。コンビナトリアル・ライブラリーおよび非コンビナトリアル・ライブラリー由来のVH遺伝子を、表8に列挙する。VH 鎖MF2971、MF3958、MF2916、MF2973、MF3004、MF30 25、MF3031は全て、共通の軽鎖IGKV1-39と組み合わせた場合に観察されたように顕著な抗原特異性および結合を喪失することなくMEHD7945A軽鎖と組み合わせることができた。VH鎖MF1849は、バリアント・カッパ軽鎖と組み合わせることはできず、抗原特異性および結合を保持できなかった。
異なるファージ・ディスプレイ・ライブラリー由来のHER2 VHの結合を調査するために、HER2抗体のパネルを、クローニングし、別のVKカッパ鎖、即ち、MEHD 7945AのVLの背景で発現させた。産生されたIgGを、K562細胞および安定なK562-HER2細胞に対するFACS分析に供した。コンビナトリアル・ライブラリーおよび非コンビナトリアル・ライブラリー由来のVH遺伝子を、表8に列挙する。VH 鎖MF2971、MF3958、MF2916、MF2973、MF3004、MF30 25、MF3031は全て、共通の軽鎖IGKV1-39と組み合わせた場合に観察されたように顕著な抗原特異性および結合を喪失することなくMEHD7945A軽鎖と組み合わせることができた。VH鎖MF1849は、バリアント・カッパ軽鎖と組み合わせることはできず、抗原特異性および結合を保持できなかった。
他のHER2およびHER3抗体
HER2またはHER3の機能を阻害する抗体は、当技術分野で公知である。さらなる抗体を、公開された情報に従って構築し、293F Freestyle細胞において発現させた。抗HER2抗体ペルツズマブおよびトラスツズマブを、米国特許出願公開第2 006/0212956号A1(Genentech)に開示された情報に基づいて作製した。抗HER3抗体#Ab6は、WO2008/100624(Merrimack Pharmaceuticals,Inc.)に開示された情報に基づき、IgG1骨格ベクター中に再クローニングした。1-53およびU1-59抗HER3抗体の情報は 、米国特許第7,705,103号B2(U3 Pharma AG)から得た。抗HER3 LJM716抗体の情報は、米国特許出願公開第2012/0107306号から得た。ツー・イン・ワン抗EGFR抗HER3抗体MEHD7945Aの構築のための情報は、WO2010/108127から得た。
HER2またはHER3の機能を阻害する抗体は、当技術分野で公知である。さらなる抗体を、公開された情報に従って構築し、293F Freestyle細胞において発現させた。抗HER2抗体ペルツズマブおよびトラスツズマブを、米国特許出願公開第2 006/0212956号A1(Genentech)に開示された情報に基づいて作製した。抗HER3抗体#Ab6は、WO2008/100624(Merrimack Pharmaceuticals,Inc.)に開示された情報に基づき、IgG1骨格ベクター中に再クローニングした。1-53およびU1-59抗HER3抗体の情報は 、米国特許第7,705,103号B2(U3 Pharma AG)から得た。抗HER3 LJM716抗体の情報は、米国特許出願公開第2012/0107306号から得た。ツー・イン・ワン抗EGFR抗HER3抗体MEHD7945Aの構築のための情報は、WO2010/108127から得た。
HER2×HER3二重特異性抗体のスクリーニング
HER2およびHER3抗体パネル由来のVHを、荷電した操作されたベクター中に再クローニングし、その結果、抗体重鎖の発現の際に、重鎖のヘテロ二量体化が強制され、トランスフェクション後に二重特異性抗体を生じる。3つの異なる戦略を、二重特異性I gG形式でHER2およびHER3アームを組み合わせる際に使用した:
1.HER2(リガンド非依存的成長を遮断する)×HER3(リガンド非依存的成長を遮断する)
2.HER2(リガンド非依存的成長を遮断する)×HER3(リガンド依存的成長を遮断する)
3.異なるエピトープ・ビン由来のHER2×HER3(リガンド依存的成長を遮断する)
HER2およびHER3抗体パネル由来のVHを、荷電した操作されたベクター中に再クローニングし、その結果、抗体重鎖の発現の際に、重鎖のヘテロ二量体化が強制され、トランスフェクション後に二重特異性抗体を生じる。3つの異なる戦略を、二重特異性I gG形式でHER2およびHER3アームを組み合わせる際に使用した:
1.HER2(リガンド非依存的成長を遮断する)×HER3(リガンド非依存的成長を遮断する)
2.HER2(リガンド非依存的成長を遮断する)×HER3(リガンド依存的成長を遮断する)
3.異なるエピトープ・ビン由来のHER2×HER3(リガンド依存的成長を遮断する)
一部の二重特異性組み合わせでは、群2および3において作製した抗体は、群1と重複した。
合計495の二重特異性抗体を、24ウェル形式で産生し、精製した。全ての抗体を、HER2発現性およびHER3発現性膵臓BxPC-3-luc-2細胞株(Calip er)の増殖を阻害する能力について試験した。抗体の強度を、10μg/mlおよび1 μg/mlの濃度で存在する抗体を用いた黒色および白色スクリーニングにおいて、HR G依存的およびHRG非依存的設定で決定した。トラスツズマブを、同じ濃度で参照抗体および陰性コントロール抗体として含めた。1μg/mlにおける上位80のHER2× HER3二重特異性(組み合わされた阻害に基づく)の機能的活性を、図2に示す。
陽性コントロール抗体と比較して高い阻害活性を示した抗体(合計で40)を、24ウェル形式で選択、再産生および精製し、10μg/mlおよび1μg/mlの濃度で黒色および白色BxPC-3-luc-2スクリーニングにおいて再度試験した。これらの抗 体を、HRG依存的MCF-7アッセイにおいてさらに滴定し、トラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせ(1:1)ならびに陰性コントロール抗体に対して比較した。図3は、親HER3抗体およびトラスツズマブ+ペルツズマブの組み合わせと比較した、3 つの二重特異性抗体の滴定曲線の一例を示す。親モノクローナル抗体は、上のパネルに示され、二重特異性抗体は、下のパネルに示される(図3)。
二重特異性抗体、モノクローナルおよびコンパレーター抗体についてのIC50を、P rismソフトウェアを用いた非線形回帰分析を使用して計算した。Graph pad ソフトウェアは、MCF-7アッセイにおける二重特異性抗体のIC50値、およびBx PC3アッセイにおけるそれらの阻害活性を、比較のために列挙する。12のHER2× HER3二重特異性抗体のパネルは、トラスツズマブ+ペルツズマブと比較して、より強力な阻害活性を有していた。さらに、これらの二重特異性抗体は、親モノクローナルPG3178と等しく強力またはより強力であった(表9)。
リガンド依存的細胞成長を阻害した二重特異性抗体は、HER3アーム3178、31 63、3099および3176と組み合わせたHER2アームから構成された。最も強力な二重特異性のHER2アームおよびHER3アームの両方は、二価モノクローナルとして、リガンド非依存的SKBR-3増殖(HER2アームおよびHER3アームの両方)(表6)またはリガンド依存的MCF-7増殖(HER3アーム)(表7)を阻害することも可能であった。強力な抗体の大部分は、抗HER3抗体3178と組み合わせた、ドメインIを認識するHER2アームから構成された。
BxPC-3-luc2腫瘍成長の阻 害
表9に記載される抗体を、BxPC-3-luc2膵臓異種移植モデルにおいて試験した。BxPC-3-luc2細胞株は、HER2およびHER3の両方を発現し、 HER 2低発現性細胞株とみなされる。研究の開始時に8~10週齢のCB17 SCID雌性マウスに、20μl中1×106の腫瘍細胞を、膵臓中に同所性に移植した。この目的のために、マウスを麻酔し、右側を下にして寝かせて左側を露出させ、0.5cmの切開を左側腹領域に作製した。膵臓および脾臓を剥き出しにし、20μl中1×106の腫瘍細胞を、膵尾部の嚢下(sub-capsulary)空間中に注射 した。移植の1週間後、バイオルミネセンス(BLI)データを生成した。画像化の15分前に、全てのマウスが、150mg/kgのルシフェリン(D-ルシフェリン-EFカリウム塩、カタログ 番号E6552、Promega)の腹腔内注射を受けた。BLI画像化を、左側面からの表示を使用して、1週間に1回または2回実施した。異常値動物-BLI/腫瘍体積 に基づく-を除去し、マウスを、各々7匹のマウスの群中にランダムに分配した。実験8 日目に、処置を開始した。抗体処置群中の動物に、3連続週にわたって毎週(0日目、7日目、14日目および21日目)、30mg/kgの抗体を投薬した。処置の0日目に、これらの動物は、2回分の負荷量、即ち、60mg/kgの抗体を投与された。最終画像化を、31日目に実施した。
表9に記載される抗体を、BxPC-3-luc2膵臓異種移植モデルにおいて試験した。BxPC-3-luc2細胞株は、HER2およびHER3の両方を発現し、 HER 2低発現性細胞株とみなされる。研究の開始時に8~10週齢のCB17 SCID雌性マウスに、20μl中1×106の腫瘍細胞を、膵臓中に同所性に移植した。この目的のために、マウスを麻酔し、右側を下にして寝かせて左側を露出させ、0.5cmの切開を左側腹領域に作製した。膵臓および脾臓を剥き出しにし、20μl中1×106の腫瘍細胞を、膵尾部の嚢下(sub-capsulary)空間中に注射 した。移植の1週間後、バイオルミネセンス(BLI)データを生成した。画像化の15分前に、全てのマウスが、150mg/kgのルシフェリン(D-ルシフェリン-EFカリウム塩、カタログ 番号E6552、Promega)の腹腔内注射を受けた。BLI画像化を、左側面からの表示を使用して、1週間に1回または2回実施した。異常値動物-BLI/腫瘍体積 に基づく-を除去し、マウスを、各々7匹のマウスの群中にランダムに分配した。実験8 日目に、処置を開始した。抗体処置群中の動物に、3連続週にわたって毎週(0日目、7日目、14日目および21日目)、30mg/kgの抗体を投薬した。処置の0日目に、これらの動物は、2回分の負荷量、即ち、60mg/kgの抗体を投与された。最終画像化を、31日目に実施した。
2つのBxPC-3-luc2異種移植モデルを、二重特異性抗体および親抗体の異なるパネルを用いて実行した。第1のBxPC-3-luc2異種移植モデル(図4)では、1つの群が陰性コントロール抗RSV抗体(コントロールIgG)を投与され、1つの群がコントロール抗体トラスツズマブを投与され、1つの群が陽性コントロール抗体トラスツズマブ+ペルツズマブ(1:1 v/v)を投与された。残り7つの群は、モノクローナル(PG)または二重特異性(PB)抗体PG3004、PG3178、PB356 6、PB3710、PB3443、PB3448およびPB3441のうちの1つを投与された。二重特異性抗体の組成の詳細は、表9に示される。
試験した5つ全ての二重特異性抗体は、腫瘍成長を阻害することができた。二重特異性HER2×HER3抗体処置した動物の平均腫瘍量(BLI)は、トラスツズマブ+ペルツズマブの組み合わせで処置した動物のものと類似であった(図4)。
第2のBxPC-3-luc2異種移植モデル(図5)では、1つの群が陰性コントロール抗RSV抗体(コントロールIgG)を投与され、1つの群が陽性コントロール抗体の組み合わせトラスツズマブ+ペルツズマブ(1:1 v/v)を投与された。残り5つの群は、抗体PG3163、PB3986、PB3990、PB4011およびPB38 83のうちの1つを投与された。二重特異性PB抗体の詳細について:表9。これらの二重特異性抗体は、同じHER2アームMF2971と組み合わされた3つの異なるHER 3結合アーム、およびHER3結合アームMF3163と組み合わされたさらなるHER 2アームを含んだ。この実験では、コントロール群中の腫瘍は、第1の実験と同じレベルの加速された成長を示さず、結果の解釈を複雑化した。それにもかかわらず、トラスツズマブ+ペルツズマブと比較して、PB3883およびPB3990 HER2×HER3 二重特異性は、類似の阻害活性を有していた(図5)。
in vivoおよびin vitroのデータに基づいて、そのHER2アームがM F2971、MF3004、MF1849から構成され、HER3アームがMF3178 から構成される、二重特異性パネルの抗体を選択した。MF2971およびMF3004 アームは、マウス起源のものであり、それらをヒト化した。
親モノクローナル抗体と比較した二重特異性HER2×HER3抗体の結合
それらの親対応物と比較した、HER2×HER3二重特異性抗体の結合を、FACS 分析によって決定した。FACSを、BxPC-3-luc2細胞およびMCF-7細胞 に対して実施し、抗体の連続滴定は、2,5μg g/ml~0,01μg g/mlの範囲であった。試験した抗体パネルは、二重特異性抗体PB3566ならびにその親抗体、抗HER3抗体PG3178および抗HER2抗体PG3004から構成された。MF Iデータをプロットしたところ、両方の細胞株についてのグラフは、二重特異性PB35 66が、抗HER3抗体PG3178および抗HER2抗体PG3004と比較して、両方の腫瘍細胞株により効率的に結合することを示す(図6)。
それらの親対応物と比較した、HER2×HER3二重特異性抗体の結合を、FACS 分析によって決定した。FACSを、BxPC-3-luc2細胞およびMCF-7細胞 に対して実施し、抗体の連続滴定は、2,5μg g/ml~0,01μg g/mlの範囲であった。試験した抗体パネルは、二重特異性抗体PB3566ならびにその親抗体、抗HER3抗体PG3178および抗HER2抗体PG3004から構成された。MF Iデータをプロットしたところ、両方の細胞株についてのグラフは、二重特異性PB35 66が、抗HER3抗体PG3178および抗HER2抗体PG3004と比較して、両方の腫瘍細胞株により効率的に結合することを示す(図6)。
MF2971およびMF3004のヒト化
MF2971およびMF3004を、当技術分野で公知のテクノロジーに従ってヒト化した。MF2971の合計7つのヒト化/脱免疫化バリアント配列を発現させ、検証し、in vitroでモノクローナルとして、HER3特異的抗体MF3178と二重特異性形式で組み合わせて特徴付けた。7つのMF2971バリアント中のMF2971のH CDR3をMF3004のHCDR3で置き換えることによって創出したMF3004の7つのバリアント配列について、同じことを行った。全てのヒト化バリアントの発現、完全性、熱安定性および機能的活性を分析した。産生、完全性、安定性および機能性完全性に基づいて、MF2971のバリアント(2971-var2)を、MF3178と二重特異性形式で使用されるVHの最適なヒト化バリアントとして選択した。この2971- var2を、MF3958と改名した。二重特異性HER2×HER3組み合わせMF3 958×MF3178は、PB4188を生じた。
MF2971およびMF3004を、当技術分野で公知のテクノロジーに従ってヒト化した。MF2971の合計7つのヒト化/脱免疫化バリアント配列を発現させ、検証し、in vitroでモノクローナルとして、HER3特異的抗体MF3178と二重特異性形式で組み合わせて特徴付けた。7つのMF2971バリアント中のMF2971のH CDR3をMF3004のHCDR3で置き換えることによって創出したMF3004の7つのバリアント配列について、同じことを行った。全てのヒト化バリアントの発現、完全性、熱安定性および機能的活性を分析した。産生、完全性、安定性および機能性完全性に基づいて、MF2971のバリアント(2971-var2)を、MF3178と二重特異性形式で使用されるVHの最適なヒト化バリアントとして選択した。この2971- var2を、MF3958と改名した。二重特異性HER2×HER3組み合わせMF3 958×MF3178は、PB4188を生じた。
PB4188の大規模産生、精製および分析的研究
懸濁適応させた293F Freestyle細胞を、エルレンマイヤー・フラスコ中で、3.0×106細胞/mlの密度まで、シェーカー・プラトーで培養した。細胞を、4Lエルレン・フラスコ中に、0.3~0.5×106生存細胞/mlの密度で播種した。これらの細胞を、個々の無菌DNA:PEl混合物で一過的にトランスフェクトし、さらに培養した。トランスフェクションの7日後、二重特異性抗体を含む馴化培地を、低速遠心分離、5分間1000gによって、その後、高速遠心分離、4000gで5分間によって回収した。収集された馴化培地を、5kDa Satorius hydrosar tカセットで約600mlに濃縮し、引き続いて、4LのPBSに対して透析濾過した。抗体を、約35mlのMabSelectSure XL(11℃)に対して、カラム上に結合させた。非特異的(A-specifically)に結合したタンパク質を、1 50ml PBS、1M NaCl含有150ml PBS、100ml PBSを用いて逆流様式でカラムを洗浄することによって除去した。結合した抗体を、100mMクエン酸塩pH3.0を使用して逆流様式で溶出させ、5mlの画分を、中和のために、4m lの1Tris pH8.0を含む10mlチューブ中に収集した。溶出した抗体を、s uperdex 200 50/1000を使用するゲル濾過によって、さらに精製した。この精製された抗体を、0.22μmシリンジ・フィルターを使用してフィルター滅菌した。IgG濃度を、OD280測定によって決定し、タンパク質濃度を、アミノ酸配列に基づいて計算した。タンパク質を、凝集(HPSEC)、純度(SDS-PAGE、rtMS、IEXおよびIEF)について試験した。タンパク質サンプルを-80℃で貯蔵した。
懸濁適応させた293F Freestyle細胞を、エルレンマイヤー・フラスコ中で、3.0×106細胞/mlの密度まで、シェーカー・プラトーで培養した。細胞を、4Lエルレン・フラスコ中に、0.3~0.5×106生存細胞/mlの密度で播種した。これらの細胞を、個々の無菌DNA:PEl混合物で一過的にトランスフェクトし、さらに培養した。トランスフェクションの7日後、二重特異性抗体を含む馴化培地を、低速遠心分離、5分間1000gによって、その後、高速遠心分離、4000gで5分間によって回収した。収集された馴化培地を、5kDa Satorius hydrosar tカセットで約600mlに濃縮し、引き続いて、4LのPBSに対して透析濾過した。抗体を、約35mlのMabSelectSure XL(11℃)に対して、カラム上に結合させた。非特異的(A-specifically)に結合したタンパク質を、1 50ml PBS、1M NaCl含有150ml PBS、100ml PBSを用いて逆流様式でカラムを洗浄することによって除去した。結合した抗体を、100mMクエン酸塩pH3.0を使用して逆流様式で溶出させ、5mlの画分を、中和のために、4m lの1Tris pH8.0を含む10mlチューブ中に収集した。溶出した抗体を、s uperdex 200 50/1000を使用するゲル濾過によって、さらに精製した。この精製された抗体を、0.22μmシリンジ・フィルターを使用してフィルター滅菌した。IgG濃度を、OD280測定によって決定し、タンパク質濃度を、アミノ酸配列に基づいて計算した。タンパク質を、凝集(HPSEC)、純度(SDS-PAGE、rtMS、IEXおよびIEF)について試験した。タンパク質サンプルを-80℃で貯蔵した。
分析研究および異種移植研究のためのIgG精製
中規模精製を、HiTrap MabSelect SureカラムおよびHiTra p脱塩カラムを使用して、AKTA 100 Explorerで実施した。サンプルを、5ml/分でロードした。カラムを、2カラム体積のPBSで洗浄した。IgGを、0.1Mクエン酸塩緩衝液を用いてpH3.0で溶出した。次に、サンプルを脱塩し、PB S pH7.4の最終緩衝液中で終えた。IgGを、0.45μMフィルター(Sart orius)を通して濾過した。IgG濃度を、プロテインAセンサーを用いてOcte tを使用して測定した。タンパク質を、凝集(HPSEC)、純度(SDS-PAGE、nMS、IEXおよびIEF)について試験した。タンパク質サンプルを-80℃で貯蔵した。
中規模精製を、HiTrap MabSelect SureカラムおよびHiTra p脱塩カラムを使用して、AKTA 100 Explorerで実施した。サンプルを、5ml/分でロードした。カラムを、2カラム体積のPBSで洗浄した。IgGを、0.1Mクエン酸塩緩衝液を用いてpH3.0で溶出した。次に、サンプルを脱塩し、PB S pH7.4の最終緩衝液中で終えた。IgGを、0.45μMフィルター(Sart orius)を通して濾過した。IgG濃度を、プロテインAセンサーを用いてOcte tを使用して測定した。タンパク質を、凝集(HPSEC)、純度(SDS-PAGE、nMS、IEXおよびIEF)について試験した。タンパク質サンプルを-80℃で貯蔵した。
PB4188の分析的特徴付け
PB4188(MF3958×MF3178)を、HP-SECおよびCIEX-HP LC(TSKゲル-STAT 7μmカラム、4.6mm ID×10cm L)による分析に供した。PB4188の分析プロファイルは、通常の単一特異性IgG1、例えば、親HER2アームPG3958および抗RSVモノクローナル・コントロール抗体の挙動と、概して一致していた(図7)。
PB4188(MF3958×MF3178)を、HP-SECおよびCIEX-HP LC(TSKゲル-STAT 7μmカラム、4.6mm ID×10cm L)による分析に供した。PB4188の分析プロファイルは、通常の単一特異性IgG1、例えば、親HER2アームPG3958および抗RSVモノクローナル・コントロール抗体の挙動と、概して一致していた(図7)。
親和性決定
組換えHER2およびHER3に対するPB4188およびPB3448の一価結合親和性を、SPR(Biacore T100)によって決定した。Biacore(商標)T100(GE Healthcare、Uppsala、Sweden)を使用して、記載された全ての実験を実施した。センサー表面準備および相互作用分析を、25℃で実施した。緩衝液およびBiacore試薬は、GE Healthcareから購入した。ErbB2-FcおよびERbB3-Fc(RND)を、500RUの標的固定化 レベルで、酢酸カリウム緩衝液(pH5.5)中でCM5センサー・チップの表面にコートした。ランニング緩衝液は、フィルター滅菌したHBS(hepes緩衝食塩水):10 mM HEPES pH7.4、150mM NaCl、0.005% Tween-2 0;0.2μm)であった。これらの二重特異性抗体を、HBS中100、50、20、 10、1および0.1nMに希釈し、CM5センサー・チップの抗原カップリングした表面上に高い(30μl/分)流速で実行した。BIA評価ソフトウェアを用いて、1:1の一価相互作用についての曲線適合モデルは、HER2アームの親和性(一価相互作用)の決定を可能にし、HER2アームの親和性が決定できた。HER3アームの低オフ・レートに起因して、その親和性は決定できなかった。HER3 アームの親和性を決定するために、PB4188を、500RUの標的固定化レベルでCM5センサー・チップにコートした。Her2-FcおよびHer3-Fc抗原を、HBS中100、50、20、1 0、1および0.1nMに希釈し、PB4188表面上に高い流速(40μl/分)で実行した。kオンおよびkオフ値を決定するために、BIA評価ソフトウェアを、一価分子をセンサー・チップ表面にコートしたことおよびErbB3-Fc抗原が二価分子であることを考慮に入れるモデルと併せて使用した。PB4188およびPB3448の親和性を、表10に示す。
組換えHER2およびHER3に対するPB4188およびPB3448の一価結合親和性を、SPR(Biacore T100)によって決定した。Biacore(商標)T100(GE Healthcare、Uppsala、Sweden)を使用して、記載された全ての実験を実施した。センサー表面準備および相互作用分析を、25℃で実施した。緩衝液およびBiacore試薬は、GE Healthcareから購入した。ErbB2-FcおよびERbB3-Fc(RND)を、500RUの標的固定化 レベルで、酢酸カリウム緩衝液(pH5.5)中でCM5センサー・チップの表面にコートした。ランニング緩衝液は、フィルター滅菌したHBS(hepes緩衝食塩水):10 mM HEPES pH7.4、150mM NaCl、0.005% Tween-2 0;0.2μm)であった。これらの二重特異性抗体を、HBS中100、50、20、 10、1および0.1nMに希釈し、CM5センサー・チップの抗原カップリングした表面上に高い(30μl/分)流速で実行した。BIA評価ソフトウェアを用いて、1:1の一価相互作用についての曲線適合モデルは、HER2アームの親和性(一価相互作用)の決定を可能にし、HER2アームの親和性が決定できた。HER3アームの低オフ・レートに起因して、その親和性は決定できなかった。HER3 アームの親和性を決定するために、PB4188を、500RUの標的固定化レベルでCM5センサー・チップにコートした。Her2-FcおよびHer3-Fc抗原を、HBS中100、50、20、1 0、1および0.1nMに希釈し、PB4188表面上に高い流速(40μl/分)で実行した。kオンおよびkオフ値を決定するために、BIA評価ソフトウェアを、一価分子をセンサー・チップ表面にコートしたことおよびErbB3-Fc抗原が二価分子であることを考慮に入れるモデルと併せて使用した。PB4188およびPB3448の親和性を、表10に示す。
細胞上でのPB4188親和性決定
結合親和性もまた、BT-474およびSK-BR-3細胞を使用し、定常状態細胞 親和性測定によって決定した。4つのIgGを分析した:1)抗HER2抗体3958および抗HER3抗体3178を含む、PB4188(二重特異性HER2×HER3);2)抗HER3抗体3178および抗TT(破傷風トキソイド)抗体1337を含む、PB9215(二重特異性HER3×TT);3)抗HER2抗体3958および抗TT抗体1337を含む、PB9216(二重特異性HER2×TT);4)ハーセプチン(単一特異性HER2)。IgGを、IODO-GEN(登録商標)Precoated Io donation Tubes(Pierce)および付随の指示書を使用して、125 Iで放射活性標識した。標識されたIgGを、25mM Tris-HCl、0.4M NaCl、0.25% BSA、5mM EDTA、0.05% NaN3中で、約1~ 2×108cpm/mlの活性に希釈した。タンパク質濃度を、BCA Protein Assay Kit(Pierce)を用いて決定した。BT-474およびSK-B R-3細胞を使用した、標識されたIgGおよび非標識IgGのフロー・サイトメトリー分析は、標識化後に、結合における低減の徴候を示さなかったか、または軽微な徴候のみを示した。定常状態細胞親和性測定を、以下のように実施した。細胞を、96ウェル・プレート中に播種し、種々の濃度の標識されたIgGと共に4℃でインキュベートした。未結合の放射活性を、4時間後に除去し、細胞結合した放射活性を、ガンマ・ウェル・カウンターを使用して測定した。非特異的結合を、受容体遮断濃度(100倍過剰)の未標識の抗体を添加することによって測定した。各条件を、3連で試験し、抗体1つにつき3つの独立した実験を実施した。KD値を、Prism6.0d(GraphPad Sof tware)を使用して、非特異的結合について補償する非線形回帰モデルに基づいて計算した。適合された曲線を含むグラフを、両方の細胞株へのHER2×HER3 IgG(PB4188)の結合について、図20に示す。平均値を含む24全てのアッセイについてのKDデータを、表12に示す。まとめると、BT-474およびSK-BR-3細 胞を使用して決定した平均KD値は、それぞれ、HER2×HER3について3.2および2.0nM、ハーセプチンについて3.7および1.3nM、HER2×TTについて3.9および2.3nM、ならびにHER3×TTについて0.23および0.99nM であった。従って、PB4188は、HER3と比較してより高い親和性でHER2を標的化するHER2×HER3二重特異性分子MM-111とは対照的に、HER2と比較してHER3に対してより高い親和性を示す。
結合親和性もまた、BT-474およびSK-BR-3細胞を使用し、定常状態細胞 親和性測定によって決定した。4つのIgGを分析した:1)抗HER2抗体3958および抗HER3抗体3178を含む、PB4188(二重特異性HER2×HER3);2)抗HER3抗体3178および抗TT(破傷風トキソイド)抗体1337を含む、PB9215(二重特異性HER3×TT);3)抗HER2抗体3958および抗TT抗体1337を含む、PB9216(二重特異性HER2×TT);4)ハーセプチン(単一特異性HER2)。IgGを、IODO-GEN(登録商標)Precoated Io donation Tubes(Pierce)および付随の指示書を使用して、125 Iで放射活性標識した。標識されたIgGを、25mM Tris-HCl、0.4M NaCl、0.25% BSA、5mM EDTA、0.05% NaN3中で、約1~ 2×108cpm/mlの活性に希釈した。タンパク質濃度を、BCA Protein Assay Kit(Pierce)を用いて決定した。BT-474およびSK-B R-3細胞を使用した、標識されたIgGおよび非標識IgGのフロー・サイトメトリー分析は、標識化後に、結合における低減の徴候を示さなかったか、または軽微な徴候のみを示した。定常状態細胞親和性測定を、以下のように実施した。細胞を、96ウェル・プレート中に播種し、種々の濃度の標識されたIgGと共に4℃でインキュベートした。未結合の放射活性を、4時間後に除去し、細胞結合した放射活性を、ガンマ・ウェル・カウンターを使用して測定した。非特異的結合を、受容体遮断濃度(100倍過剰)の未標識の抗体を添加することによって測定した。各条件を、3連で試験し、抗体1つにつき3つの独立した実験を実施した。KD値を、Prism6.0d(GraphPad Sof tware)を使用して、非特異的結合について補償する非線形回帰モデルに基づいて計算した。適合された曲線を含むグラフを、両方の細胞株へのHER2×HER3 IgG(PB4188)の結合について、図20に示す。平均値を含む24全てのアッセイについてのKDデータを、表12に示す。まとめると、BT-474およびSK-BR-3細 胞を使用して決定した平均KD値は、それぞれ、HER2×HER3について3.2および2.0nM、ハーセプチンについて3.7および1.3nM、HER2×TTについて3.9および2.3nM、ならびにHER3×TTについて0.23および0.99nM であった。従って、PB4188は、HER3と比較してより高い親和性でHER2を標的化するHER2×HER3二重特異性分子MM-111とは対照的に、HER2と比較してHER3に対してより高い親和性を示す。
HER2増幅された乳癌細胞に対する抗増殖活性軟寒天におけるJIMT-1
PB3448およびPB4188を、軟寒天におけるトラスツズマブ耐性JIMT-1 細胞の成長を阻害する強度について試験した。この目的のために、96ウェル懸濁細胞培養物プレートを準備した。100μLの軟寒天下層(完全培地中0,6%の最終濃度)を注ぎ、凝固させた。次いで、10.000のJIMT-1細胞/ウェルを含む50μLの軟寒天上層(0,4%の最終濃度)を、上に添加し、凝固させ、かかる96ウェル・プレートを、37℃、10%CO2で終夜インキュベートした。次の日、陰性コントロール抗体、ペルツズマブ+トラスツズマブ(1:1 v/v)、PB3448およびPB418 8を、10~0,003μg/mlの範囲の片対数滴定で、DMEM培地中に添加した。引き続いて、アッセイを、細胞培養インキュベーター中で8日間インキュベートした。最後に、細胞を、37℃でAlamar Blueと共に3~5時間インキュベートし、蛍光強度を決定した(励起:560nm;発光:590nm)。PB3448およびPB4 188によるJIMT-1増殖の用量依存的阻害の一例が示される(図8)。
PB3448およびPB4188を、軟寒天におけるトラスツズマブ耐性JIMT-1 細胞の成長を阻害する強度について試験した。この目的のために、96ウェル懸濁細胞培養物プレートを準備した。100μLの軟寒天下層(完全培地中0,6%の最終濃度)を注ぎ、凝固させた。次いで、10.000のJIMT-1細胞/ウェルを含む50μLの軟寒天上層(0,4%の最終濃度)を、上に添加し、凝固させ、かかる96ウェル・プレートを、37℃、10%CO2で終夜インキュベートした。次の日、陰性コントロール抗体、ペルツズマブ+トラスツズマブ(1:1 v/v)、PB3448およびPB418 8を、10~0,003μg/mlの範囲の片対数滴定で、DMEM培地中に添加した。引き続いて、アッセイを、細胞培養インキュベーター中で8日間インキュベートした。最後に、細胞を、37℃でAlamar Blueと共に3~5時間インキュベートし、蛍光強度を決定した(励起:560nm;発光:590nm)。PB3448およびPB4 188によるJIMT-1増殖の用量依存的阻害の一例が示される(図8)。
マトリゲルにおけるBT-474およびSKBR-3
PB3448およびPB4188を、BT-474およびSKBR-3細胞の成長を阻害する強度について試験した。3次元マトリゲルにおいて細胞を増殖させ、処置された細胞と非処置の細胞を識別するために主成分分析を使用する、Leiden、Nether landsを本拠とするOcello社で、細胞を試験した。2000のSK-BR-3 細胞または2250のBT474細胞を、384ウェル・プレート(Greiner 7 81091)のウェル1つ当たり15μlのマトリゲル中に播種した。次の日、10~0.003μg/mlの範囲の抗体の片対数滴定を、5ng/mlのHRGの非存在下または存在下で培養培地中に添加した。試験抗体は、陰性コントロール抗体、ペルツズマブ+ トラスツズマブ(1:1 v/v)、PB3448、PB4188および二重特異性抗E GFR×HER3ツー・イン・ワン抗体MEHD7945Aを含んだ。さらに、HRGの用量依存的滴定を、陽性コントロールとして含めた。各用量を、4連で試験した。細胞を、37℃、5%CO2で細胞培養インキュベーター中において7日間インキュベートした。次に、細胞を固定し、細胞のアクチン細胞骨格をファロイジンで染色し、核をヘキストで染色した。次に、蛍光画像を、ゲル(Z-スタック)を通じて異なるレベルで撮影し、画像を重ねた。広い範囲の形態学的特徴を測定した(合計で800)。培地処置とHRG 処置との間で異なった特徴だけを、分析のために選択した。成長と関連した特徴、平均球状体面積および球状体当たりの核は、培地処置とHRG処置との間で、最も顕著に異なっていた。マルチパラメーター分析および単一パラメーター分析の両方を行った。単一パラメーター測定のために、t検定を実施して、培地に対して処置(HRGまたは抗体)を比較した。各点についてのP値を決定した。変動性のほとんどを捕捉する、高次元データの低次元組み合わせを見出すための方法である主成分分析(PCA)を、抗体濃度との関連で使用して、データをプロットした。図9は、HRGの存在下での、ペルツズマブ+トラスツズマブ(1:1 v/v)、PB3448およびPB4188の効果を実証している。両方のHER2増幅された乳癌細胞株において、PB4188は、HRGの存在下で、ペルツズマブ+トラスツズマブ、PB3448およびツー・イン・ワン抗体MEHD79 45Aと比較して、優れた活性を示した。
PB3448およびPB4188を、BT-474およびSKBR-3細胞の成長を阻害する強度について試験した。3次元マトリゲルにおいて細胞を増殖させ、処置された細胞と非処置の細胞を識別するために主成分分析を使用する、Leiden、Nether landsを本拠とするOcello社で、細胞を試験した。2000のSK-BR-3 細胞または2250のBT474細胞を、384ウェル・プレート(Greiner 7 81091)のウェル1つ当たり15μlのマトリゲル中に播種した。次の日、10~0.003μg/mlの範囲の抗体の片対数滴定を、5ng/mlのHRGの非存在下または存在下で培養培地中に添加した。試験抗体は、陰性コントロール抗体、ペルツズマブ+ トラスツズマブ(1:1 v/v)、PB3448、PB4188および二重特異性抗E GFR×HER3ツー・イン・ワン抗体MEHD7945Aを含んだ。さらに、HRGの用量依存的滴定を、陽性コントロールとして含めた。各用量を、4連で試験した。細胞を、37℃、5%CO2で細胞培養インキュベーター中において7日間インキュベートした。次に、細胞を固定し、細胞のアクチン細胞骨格をファロイジンで染色し、核をヘキストで染色した。次に、蛍光画像を、ゲル(Z-スタック)を通じて異なるレベルで撮影し、画像を重ねた。広い範囲の形態学的特徴を測定した(合計で800)。培地処置とHRG 処置との間で異なった特徴だけを、分析のために選択した。成長と関連した特徴、平均球状体面積および球状体当たりの核は、培地処置とHRG処置との間で、最も顕著に異なっていた。マルチパラメーター分析および単一パラメーター分析の両方を行った。単一パラメーター測定のために、t検定を実施して、培地に対して処置(HRGまたは抗体)を比較した。各点についてのP値を決定した。変動性のほとんどを捕捉する、高次元データの低次元組み合わせを見出すための方法である主成分分析(PCA)を、抗体濃度との関連で使用して、データをプロットした。図9は、HRGの存在下での、ペルツズマブ+トラスツズマブ(1:1 v/v)、PB3448およびPB4188の効果を実証している。両方のHER2増幅された乳癌細胞株において、PB4188は、HRGの存在下で、ペルツズマブ+トラスツズマブ、PB3448およびツー・イン・ワン抗体MEHD79 45Aと比較して、優れた活性を示した。
HER2増幅された乳癌細胞に対する、HRGの存在下でのPB4188の優れた抗増殖活性
SKBR-3およびBT-474に対する、10ng/mlのHRGの存在下でのPB 4188の活性を、HER2、HER3抗体およびそれらの組み合わせのパネルと比較した。アッセイを、上記のようにマトリゲルにおいて実施し、形態学的特徴を分析した。図10a中にプロットしたPCAデータは、マトリゲルにおけるSKBR-3細胞のHRG 誘導性の増殖および分岐/浸潤を示している。図10bは、抗体PB4188が、HRG 誘導性表現型を完全に復帰させることができるが、親モノクローナル抗体の組み合わせ( PG3958+PG3178)は効果を有さないことを示している。さらに、PB418 8は、試験した全ての抗HER3抗体と比較して、はるかに効果的であった(図10c)。さらに、個々の抗HER3抗体とトラスツズマブとの組み合わせ(転移性乳癌(mBC
)の治療における現在の標準)は、HRG誘導性表現型を復帰させることができなかった(図10d)。HRGの存在下でPB4188にトラスツズマブを追加することで、PB 4188単独と比較して、SK-BR-3細胞の増殖および分岐/浸潤は低減された(図 10e)。
SKBR-3およびBT-474に対する、10ng/mlのHRGの存在下でのPB 4188の活性を、HER2、HER3抗体およびそれらの組み合わせのパネルと比較した。アッセイを、上記のようにマトリゲルにおいて実施し、形態学的特徴を分析した。図10a中にプロットしたPCAデータは、マトリゲルにおけるSKBR-3細胞のHRG 誘導性の増殖および分岐/浸潤を示している。図10bは、抗体PB4188が、HRG 誘導性表現型を完全に復帰させることができるが、親モノクローナル抗体の組み合わせ( PG3958+PG3178)は効果を有さないことを示している。さらに、PB418 8は、試験した全ての抗HER3抗体と比較して、はるかに効果的であった(図10c)。さらに、個々の抗HER3抗体とトラスツズマブとの組み合わせ(転移性乳癌(mBC
)の治療における現在の標準)は、HRG誘導性表現型を復帰させることができなかった(図10d)。HRGの存在下でPB4188にトラスツズマブを追加することで、PB 4188単独と比較して、SK-BR-3細胞の増殖および分岐/浸潤は低減された(図 10e)。
HER2およびHER3モノクローナル抗体と比較した、HER2増幅された胃癌細胞に対するPB4188の優れた抗増殖活性。
NRG1-β1の上方調節は、HER2標的化治療に対する重要な耐性機構である(Wilson、2012)。NRG1-β1の上方調節がPB4188による抗増殖の強度を妨害するかどうかを評価するために、抗体のパネルを、N87(HER2増幅された) 胃癌細胞株に対して、100ng/mlのHRGで試験した。N87細胞を、10%熱不活化FBSを補充したRPMI1640中で培養した。増殖アッセイのために、N87細胞のコンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを、培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% BSAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1 640培地)中で2回洗浄した。抗体を、1~0,0001μg/mlで変動する片対数滴定で希釈した。細胞を、100ng/mlの最終濃度のHRGの存在下で10000細胞/ウェルの密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%C O2で3日間培養した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で6時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。PB4188は、抗HER2または抗HER3モノクローナル抗体よりも優れた活性を示した(図11)。
NRG1-β1の上方調節は、HER2標的化治療に対する重要な耐性機構である(Wilson、2012)。NRG1-β1の上方調節がPB4188による抗増殖の強度を妨害するかどうかを評価するために、抗体のパネルを、N87(HER2増幅された) 胃癌細胞株に対して、100ng/mlのHRGで試験した。N87細胞を、10%熱不活化FBSを補充したRPMI1640中で培養した。増殖アッセイのために、N87細胞のコンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを、培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% BSAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1 640培地)中で2回洗浄した。抗体を、1~0,0001μg/mlで変動する片対数滴定で希釈した。細胞を、100ng/mlの最終濃度のHRGの存在下で10000細胞/ウェルの密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%C O2で3日間培養した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で6時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。PB4188は、抗HER2または抗HER3モノクローナル抗体よりも優れた活性を示した(図11)。
HER2×HER3二重特異性抗体は、ADCCを誘導するADCC活性は、癌における、治療的抗体にとって重要な抗腫瘍作用機構である。セツキシマブおよびトラスツズマブなどの、HERファミリーの受容体に対するヒト・モノクローナル抗体は、ADCCを誘導する。PB4188およびPB3448のベースラインおよび増強されたADCC活性を、検証されたin vitro ADCCアッセイにおいて決定した。トラスツズマブおよび陰性コントロール抗体を、実験中にコントロール抗体として含めた。全血およびPBMC画分を、健康なドナーから取得した。各抗体を、H ER2高(SK-BR-3)およびHER2低(MCF-7)発現性の標的細胞に対して 試験した。標的細胞に、51Cr(Amersham)をロードし、示された濃度の抗体でオプソニン化した。全血またはPBMC画分を、RPMI1640+10%熱不活化F CS中200μLの反応において、エフェクター細胞として使用した。細胞を、4時間一緒にインキュベートし、溶解を、γ-シンチレーターを使用して上清中の放射活性を測定することによって推定した。特異的溶解の百分率を、以下のように計算し:(実験的cp m-基底cpm)/(最大cpm-基底cpm)×100、ここで、最大溶解を、抗体 およびエフェクターの非存在下で5% Triton X-100および基底溶解の存在下で決定した。図12に示されるように、二重特異性抗体PB3448は、組み合わせペルツズマブ+トラスツズマブと比較して、類似のADCC活性を示した。二重特異性抗体P B4188は、高い抗体濃度(10μg/ml)で有効であった。
HER2×HER3二重特異性抗体は、親抗体の組み合わせと比較して、より高いADCCを示す異なるADCC設定では、ADCC Reporter Bioassay(Prom ega)を使用した。このバイオアッセイは、FcγRIIIa受容体、V158(高親和性)またはF158(低親和性)バリアント、およびホタル・ルシフェラーゼの発現を駆動するNFAT応答エレメントを安定に発現する操作されたJurkat細胞を使用する。このアッセイは、古典的51Cr放出アッセイに対して、ADCC Reporte r Bioassayを用いて得られたデータを比較することによって検証された。これらのADCCアッセイを、384白色ウェル・プレートを使用した、Promega A DCC Bioassayキットを使用して実施した。この実験設定では、SKBR-3 細胞を、バイオアッセイの20~24時間前に、30μlのアッセイ培地(4%の低Ig G血清を含むRPMI)中、1000細胞/ウェルの密度でプレートした。次の日、培養培地を除去した。次に、抗体PB4188、ならびにその親抗HER2 PG3958および抗HER3 PG3178ならびにそれらの組み合わせの連続希釈を、2連で作製した。10μl抗体希釈を、ウェルに添加した。抗体の出発濃度は10μg/mlであり、10点の片対数倍連続希釈を作製して、完全な用量応答曲線を提供した。最後に、5μl のADCC Bioassayエフェクター細胞(15000細胞/ウェル、V158) を添加した。これらの細胞を、37℃で6時間インキュベートした。次に、15μlのB IO-Gloルシフェラーゼ基質を添加し、5分後、ルミネセンスを、プレート・リーダーで検出した。得られたデータを図13に示す。PB4188二重特異性抗HER2×H ER3抗体は、親HER2およびHER3モノクローナルまたはそれらの組み合わせと比較して、より高いADCC強度を示した。
PB4188のADCC増強
ADCC活性は、異なる技術によって増強され得、そのうちの1つは、フコースの除去である。フコースの除去は、いくつかのin vivoモデルにおいて、増加した抗腫瘍活性を生じている[Junttila、2010]。PB4188の活性を最大化するために、非フコシル化テクノロジーを適用し(Cheng LiuおよびAndreia Lee.ADCC Enhancement Technologies for Ne xt Generation Therapeutic Antibody.Antib ody therapeutics-Trends in Bio/Pharmaceu tical Industry 2009[13~17])、それによって、Fc領域中のN結合型炭水化物構造のフコシル化を防止する。野生型PB4188と比較した、非フコシル化されたPB4188のADCC強度を、HER2低発現性細胞(MCF-7)およびHER2増幅された細胞(SK-BR-3)を使用して、ADCC51Cr放出アッ セイにおいて決定した。両方の抗体を、連続希釈で適用し、陰性コントロール抗体およびトラスツズマブを、このアッセイ中に含めた。図14は、高HER2発現性細胞および低HER2発現性細胞の両方における、野生型バージョンおよび/またはトラスツズマブと比較した、非フコシル化されたPB4188のADCC強度における増加を示している。
ADCC活性は、異なる技術によって増強され得、そのうちの1つは、フコースの除去である。フコースの除去は、いくつかのin vivoモデルにおいて、増加した抗腫瘍活性を生じている[Junttila、2010]。PB4188の活性を最大化するために、非フコシル化テクノロジーを適用し(Cheng LiuおよびAndreia Lee.ADCC Enhancement Technologies for Ne xt Generation Therapeutic Antibody.Antib ody therapeutics-Trends in Bio/Pharmaceu tical Industry 2009[13~17])、それによって、Fc領域中のN結合型炭水化物構造のフコシル化を防止する。野生型PB4188と比較した、非フコシル化されたPB4188のADCC強度を、HER2低発現性細胞(MCF-7)およびHER2増幅された細胞(SK-BR-3)を使用して、ADCC51Cr放出アッ セイにおいて決定した。両方の抗体を、連続希釈で適用し、陰性コントロール抗体およびトラスツズマブを、このアッセイ中に含めた。図14は、高HER2発現性細胞および低HER2発現性細胞の両方における、野生型バージョンおよび/またはトラスツズマブと比較した、非フコシル化されたPB4188のADCC強度における増加を示している。
非フコシル化されたPB4188は、低親和性FcγRIII受容体と共に優れたAD CC活性を示す
非フコシル化されたPB4188の活性を、V158(高親和性)FcγRIIIa受容体バリアントまたはF158(低親和性)FcγRIIIa受容体バリアントのいずれかを含むADCCレポーター細胞に対して試験した。抗体、即ち、コントロール抗体、トラスツズマブおよび非フコシル化されたPB4188の連続滴定を、接着性SK-BR- 3細胞に、異なるFcγRIIIaバリアントを保有するADCCレポーター細胞と組み合わせて添加した。ADCC活性を、ルシフェラーゼ活性を測定することによって測定した。非フコシル化されたPB4188は、高親和性V158 FcγRIIIa受容体バリアントと組み合わせると、トラスツズマブと比較して、等しい活性を示した。対照的に、非フコシル化されたPB4188は、低親和性F158 FcγRIIIa受容体バリアントと組み合わせると、トラスツズマブと比較して、優れたADCC活性を示した(図15)。
非フコシル化されたPB4188の活性を、V158(高親和性)FcγRIIIa受容体バリアントまたはF158(低親和性)FcγRIIIa受容体バリアントのいずれかを含むADCCレポーター細胞に対して試験した。抗体、即ち、コントロール抗体、トラスツズマブおよび非フコシル化されたPB4188の連続滴定を、接着性SK-BR- 3細胞に、異なるFcγRIIIaバリアントを保有するADCCレポーター細胞と組み合わせて添加した。ADCC活性を、ルシフェラーゼ活性を測定することによって測定した。非フコシル化されたPB4188は、高親和性V158 FcγRIIIa受容体バリアントと組み合わせると、トラスツズマブと比較して、等しい活性を示した。対照的に、非フコシル化されたPB4188は、低親和性F158 FcγRIIIa受容体バリアントと組み合わせると、トラスツズマブと比較して、優れたADCC活性を示した(図15)。
JIMT-1異種移植研究
JIMT-1ヒト乳癌腫細胞を、移植の時まで、10%胎仔ウシ血清、100単位/m LペニシリンGナトリウム、100μg/mL硫酸ストレプトマイシン、25μg/mL ゲンタマイシンおよび2mMグルタミンを含むDMEM中で成長させた。移植当日、JI MT-1乳房細胞を、対数期成長の間に回収し、冷PBS中に再懸濁した。雌性CB.17 SCIDマウス(Charles River)は、研究1日目に8週齢であり、1 6.5~20.7gの体重範囲を有していた。各マウスに、5×106の腫瘍細胞(0. 2mL細胞懸濁物)を右側腹に皮下注射した。これらの腫瘍を、2次元でノギスによって測定して、サイズをその平均体積として1週間に2回モニタリングした。腫瘍がおよそ1 00~150mm3のサイズに達したところで、動物を、効力研究へと進めたた。異常値動物-腫瘍体積-を除去し、マウスを、各々10匹のマウスの群中にランダムに分配した。マウスに、4週間の期間にわたって、1週間に1回(抗体)または1日1回(ラパチニブ)注射した。処置群の詳細を表11に示す。
JIMT-1ヒト乳癌腫細胞を、移植の時まで、10%胎仔ウシ血清、100単位/m LペニシリンGナトリウム、100μg/mL硫酸ストレプトマイシン、25μg/mL ゲンタマイシンおよび2mMグルタミンを含むDMEM中で成長させた。移植当日、JI MT-1乳房細胞を、対数期成長の間に回収し、冷PBS中に再懸濁した。雌性CB.17 SCIDマウス(Charles River)は、研究1日目に8週齢であり、1 6.5~20.7gの体重範囲を有していた。各マウスに、5×106の腫瘍細胞(0. 2mL細胞懸濁物)を右側腹に皮下注射した。これらの腫瘍を、2次元でノギスによって測定して、サイズをその平均体積として1週間に2回モニタリングした。腫瘍がおよそ1 00~150mm3のサイズに達したところで、動物を、効力研究へと進めたた。異常値動物-腫瘍体積-を除去し、マウスを、各々10匹のマウスの群中にランダムに分配した。マウスに、4週間の期間にわたって、1週間に1回(抗体)または1日1回(ラパチニブ)注射した。処置群の詳細を表11に示す。
腫瘍サイズを、ノギス測定によって毎週測定した。この効力研究により、両方の投薬スケジュールにおけるPB4188が等しく有効であり、ラパチニブまたはペルツズマブおよびトラスツズマブの組合せよりも強力であったことが明らかになった。データを図17 および18に示す。
PB4188は、HRG媒介性の耐性を克服できる
NRG1-β1の上方調節は、HER2標的化治療に対する重要な耐性機構である(W ilson、2012)。PB4188を、漸増する濃度のHRG(NRG1-β1 EGF)の存在下で、連続滴定でその親抗HER3モノクローナル抗体PG3178と比較して試験した。この目的のために、N87細胞を、10%熱不活化FBSを補充したRP MI1640中で培養した。増殖アッセイのために、N87細胞のコンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを、培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% BSAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1640培地)中で2回洗浄した。抗体を、1から0.0001μg/mlまでの範囲の片対数滴定で希釈した。細胞を、漸増する濃度のHRG(0.04~39,5nM)の存在下で10000細胞/ウェルの密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で3 日間培養した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で6時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。PB4188は、親抗HER3モノクローナル抗体と比較して優れた活性を示した(図1 9)。
NRG1-β1の上方調節は、HER2標的化治療に対する重要な耐性機構である(W ilson、2012)。PB4188を、漸増する濃度のHRG(NRG1-β1 EGF)の存在下で、連続滴定でその親抗HER3モノクローナル抗体PG3178と比較して試験した。この目的のために、N87細胞を、10%熱不活化FBSを補充したRP MI1640中で培養した。増殖アッセイのために、N87細胞のコンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを、培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% BSAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1640培地)中で2回洗浄した。抗体を、1から0.0001μg/mlまでの範囲の片対数滴定で希釈した。細胞を、漸増する濃度のHRG(0.04~39,5nM)の存在下で10000細胞/ウェルの密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で3 日間培養した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を、製造者の指示に従って添加し、暗中で95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で6時間インキュベートした。蛍光を、550nmの励起波長および590nmの発光波長で測定した。PB4188は、親抗HER3モノクローナル抗体と比較して優れた活性を示した(図1 9)。
従って、例えばNRG1-β1の上方調節などの逃避機構の場合、本発明に従う二重特異性抗体が好ましい。
HER2/HER3特異的IgGのエピトープ・マッピングショットガン変異誘発実験
アラニン・スキャニング変異誘発を使用して、それぞれHER2およびHER3について、PG3958およびPG3178のエピトープをマッピングした。ショットガン変異誘発アッセイでは、クローンを作製するが、ここでHER2/HER3細胞外ドメイン( ECD)の各アミノ酸残基を、アラニンに置換する。次に、細胞アレイを、リバーストランスフェクションによって調製した(米国特許出願公開第2011/0077163号A 1)。従って、各クローンのDNAを、リポフェクタミンと混合し、この混合物を、38 4ウェル・プレートの特化したウェル中に配置した。HEK293T細胞を、各ウェルに添加し、タンパク質の発現を、24時間後に測定した。引き続いて、抗体の反応性を、免疫蛍光染色によって測定し、結合マップおよび抗体結合のための重要残基の同定をもたらした。HER2およびHER3 ECD構築物の発現レベルを、市販のモノクローナル抗体(R&D mAb 1129(HER2)およびR&D mAb 66223(HER 3))を使用してFACS分析によって検証した。
アラニン・スキャニング変異誘発を使用して、それぞれHER2およびHER3について、PG3958およびPG3178のエピトープをマッピングした。ショットガン変異誘発アッセイでは、クローンを作製するが、ここでHER2/HER3細胞外ドメイン( ECD)の各アミノ酸残基を、アラニンに置換する。次に、細胞アレイを、リバーストランスフェクションによって調製した(米国特許出願公開第2011/0077163号A 1)。従って、各クローンのDNAを、リポフェクタミンと混合し、この混合物を、38 4ウェル・プレートの特化したウェル中に配置した。HEK293T細胞を、各ウェルに添加し、タンパク質の発現を、24時間後に測定した。引き続いて、抗体の反応性を、免疫蛍光染色によって測定し、結合マップおよび抗体結合のための重要残基の同定をもたらした。HER2およびHER3 ECD構築物の発現レベルを、市販のモノクローナル抗体(R&D mAb 1129(HER2)およびR&D mAb 66223(HER 3))を使用してFACS分析によって検証した。
HER2
HER2 ECD変異体への一価PG3958 Fabの結合を、このアッセイにおいて0.25μg/mlの濃度で試験し、ストリンジェントな洗浄条件を使用した(pH9.0、350mM NaCl)。これにより、コントロールmAbの結合を保持しつつ、WT HER2と比較して、PG3958 Fabの35%未満の残留結合を示した、H ER2における3つの「重要」残基(T144、R166、R181)が同定された。H ER2構造中の重要残基近傍に位置する2つの残基(P172、G179)は、顕著ではあるが、より重度ではない結合の喪失を示し、これらを「二次重要」残基と称した(表1 3および図21A)。これら全ての、表面に露出した残基は、HER2のドメインI中に位置し、これらは、一緒になって、HER2分子の表面上に非連続的パッチを形成する。
HER2 ECD変異体への一価PG3958 Fabの結合を、このアッセイにおいて0.25μg/mlの濃度で試験し、ストリンジェントな洗浄条件を使用した(pH9.0、350mM NaCl)。これにより、コントロールmAbの結合を保持しつつ、WT HER2と比較して、PG3958 Fabの35%未満の残留結合を示した、H ER2における3つの「重要」残基(T144、R166、R181)が同定された。H ER2構造中の重要残基近傍に位置する2つの残基(P172、G179)は、顕著ではあるが、より重度ではない結合の喪失を示し、これらを「二次重要」残基と称した(表1 3および図21A)。これら全ての、表面に露出した残基は、HER2のドメインI中に位置し、これらは、一緒になって、HER2分子の表面上に非連続的パッチを形成する。
確認実験HER2エピトープ
野生型(WT)HER2 ECDおよび表13に列挙されるHER2 ECDバリアントをコードする構築物を、CHO-K1細胞において発現させた。表面に露出しており、決定された重要残基に対し構造的に近傍にある3つのドメインI残基を、さらなる分析に選択した。チロシンへのT164、S180およびD143の点変異を、HER2 EC D構築物において作製し、得られた構築物もまた、CHO-K1において発現させた。L159A HER2 ECDバリアントを、コントロール・サンプルとして、CHO-K 1細胞において発現させた。
野生型(WT)HER2 ECDおよび表13に列挙されるHER2 ECDバリアントをコードする構築物を、CHO-K1細胞において発現させた。表面に露出しており、決定された重要残基に対し構造的に近傍にある3つのドメインI残基を、さらなる分析に選択した。チロシンへのT164、S180およびD143の点変異を、HER2 EC D構築物において作製し、得られた構築物もまた、CHO-K1において発現させた。L159A HER2 ECDバリアントを、コントロール・サンプルとして、CHO-K 1細胞において発現させた。
FACS滴定実験においてECDバリアントへの結合について試験した二重特異性PG3958×TT抗体。HER2のドメインIVに結合する抗HER2抗体トラスツズマブを使用して、細胞表面におけるHER2 ECD発現を検証した。平均MFI値をプロットし、各曲線について、AUCを、GraphPad Prism 5ソフトウェアを使用して計算した。WT HER2結合を使用して、データを標準化した。このFACSデータは、T144A、R166A、R181A、P172A、G179Aに加えて、変異T164YおよびS180Yが、PG3958×TT抗体の結合において顕著な低減を生じたことを示した(図22)。D143Y変異は、コントロールmAbの減少した結合によって実証されるように発現の重度の喪失を生じ、従って、PG3958エピトープにおけるその潜在的な役割は決定できなかった。
HER3
FACSにおける、HER3 ECD変異体への、0.25μg/mlのPG3178 IgGの結合分析により、コントロールmAbの結合が保持されつつ、アラニンへの変 異がWT HER3と比較して結合の実質的な喪失を引き起こした、2つのいわゆる「重要」残基(F409、R426)が同定された(表14および図23)。両方の残基は、HER3のドメインIII中に位置し、空間的に遠位である。さらに、F409は、HE R3疎水性コア中に埋められ、PG3178エピトープの一部である可能性は低くなっている。
FACSにおける、HER3 ECD変異体への、0.25μg/mlのPG3178 IgGの結合分析により、コントロールmAbの結合が保持されつつ、アラニンへの変 異がWT HER3と比較して結合の実質的な喪失を引き起こした、2つのいわゆる「重要」残基(F409、R426)が同定された(表14および図23)。両方の残基は、HER3のドメインIII中に位置し、空間的に遠位である。さらに、F409は、HE R3疎水性コア中に埋められ、PG3178エピトープの一部である可能性は低くなっている。
確認実験HER3エピトープ
CHO-K1細胞に、HER3 ECD変異構築物(表14中に列挙した)、WT H ER3 ECDおよび2つのコントロール構築物(H407AおよびY424A)をトランスフェクトした。HER3 ECDバリアントへのPG3178結合を、FACS滴定実験において試験した。HER3のドメインI(MM-121)およびドメインIII( MEHD7945A)に結合する2つのコントロール抗体を、細胞表面上のHER3 E CD発現を検証するために含めた。平均MFI値をプロットし、各曲線について、AUC を、GraphPad Prism 5ソフトウェアを使用して計算した。WT HER 3結合を使用して、データを標準化した。R426A変異は、PG3178結合に重要であることが示されたが、F409Aへの結合は、細胞表面での発現の喪失に起因して確認できなかった(図24)。
CHO-K1細胞に、HER3 ECD変異構築物(表14中に列挙した)、WT H ER3 ECDおよび2つのコントロール構築物(H407AおよびY424A)をトランスフェクトした。HER3 ECDバリアントへのPG3178結合を、FACS滴定実験において試験した。HER3のドメインI(MM-121)およびドメインIII( MEHD7945A)に結合する2つのコントロール抗体を、細胞表面上のHER3 E CD発現を検証するために含めた。平均MFI値をプロットし、各曲線について、AUC を、GraphPad Prism 5ソフトウェアを使用して計算した。WT HER 3結合を使用して、データを標準化した。R426A変異は、PG3178結合に重要であることが示されたが、F409Aへの結合は、細胞表面での発現の喪失に起因して確認できなかった(図24)。
in vitroの心筋細胞に対するPB4188活性
HER2は、ヘレグリン受容体複合体HER2:HER4が関与するシグナル伝達ネットワークの一部として、成体心筋細胞の成長、修復および生存に関与する。心臓毒性は、HER2標的化における公知の危険因子であり、合併症の頻度は、トラスツズマブがアントラサイクリンと併せて使用される場合に増加し、それによって、心臓負荷を誘導する。ヒト幹細胞由来の心筋細胞に基づくモデル系を使用して、PB4188の潜在的毒性を試験し、アントラサイクリン・ドキソルビシンの存在下で、トラスツズマブならびにトラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせに対して、その潜在的毒性を評価した。ヒト幹細胞由来の心筋細胞(Pluriomics BV)を、白色平底アッセイ・プレート( corning 655098)中に、20.000ウェルの濃度で播種した。培養の5 日目に、培地を、10ng/mlのHRGを補充したグルコースおよびガラクトース・フリーの培養培地に置き換えた。7日目に、試験抗体を、ドキソルビシン(3μM)と組み合わせて添加した。細胞生存度を、Promega Cell力価Gloアッセイを使用して、9日目にアッセイした。単一特異性抗体は、68nMの単一濃度で試験したが、P B4188は、3μMのドキソルビシンの存在下で3つの濃度で試験した。図25は、心筋細胞の生存度が、試験した全てのPB4188濃度によって影響を受けなかったことを示している。対照的に、トラスツズマブならびにトラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせの両方が、心筋細胞の細胞生存度を低減させた。
HER2は、ヘレグリン受容体複合体HER2:HER4が関与するシグナル伝達ネットワークの一部として、成体心筋細胞の成長、修復および生存に関与する。心臓毒性は、HER2標的化における公知の危険因子であり、合併症の頻度は、トラスツズマブがアントラサイクリンと併せて使用される場合に増加し、それによって、心臓負荷を誘導する。ヒト幹細胞由来の心筋細胞に基づくモデル系を使用して、PB4188の潜在的毒性を試験し、アントラサイクリン・ドキソルビシンの存在下で、トラスツズマブならびにトラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせに対して、その潜在的毒性を評価した。ヒト幹細胞由来の心筋細胞(Pluriomics BV)を、白色平底アッセイ・プレート( corning 655098)中に、20.000ウェルの濃度で播種した。培養の5 日目に、培地を、10ng/mlのHRGを補充したグルコースおよびガラクトース・フリーの培養培地に置き換えた。7日目に、試験抗体を、ドキソルビシン(3μM)と組み合わせて添加した。細胞生存度を、Promega Cell力価Gloアッセイを使用して、9日目にアッセイした。単一特異性抗体は、68nMの単一濃度で試験したが、P B4188は、3μMのドキソルビシンの存在下で3つの濃度で試験した。図25は、心筋細胞の生存度が、試験した全てのPB4188濃度によって影響を受けなかったことを示している。対照的に、トラスツズマブならびにトラスツズマブおよびペルツズマブの組み合わせの両方が、心筋細胞の細胞生存度を低減させた。
異なるHER2レベルを有する細胞へのPB4188の結合
トラスツズマブおよびHER3抗体U1-59と比較した、PB4188の結合を、異なるレベルのHER2を発現する乳癌細胞株および胃癌細胞株に対するFACSによって分析した。細胞を、それらが数百万のHER2コピーを発現する場合、および/またはH ER2遺伝子増幅されている場合、HER2+++とみなした。以下の細胞株を使用した:MCF-7(HER2+);MDA-MB-468(HER2+、MKN-45(HE R2+)、MDA-MB-175(HER2+)、MDA-MB-453(HER2++)、MDA-MB-361(HER2++)、ZR-75-1(HER2++)、JIM T-1(HER2+++)、BT-474(HER2+++)、SKBR-3(HER2+++)、SK-OV-3(HER2+++)、N87(HER2+++)。指数関数 的に成長した培養物の細胞を、トリプシンによって回収し、FACS緩衝液(PBS/0. 5% BSA/0.5mM EDTA)中106細胞/mlに希釈した。1~2×105細胞を、U底96ウェル・プレート中の各ウェルに添加した。細胞を、4℃で300gで 2分間遠心分離した。上清を、上記のプレート(複数可)を反転させ、その後1回はじくことによって廃棄した。50μlの各IgGサンプルを、3.16ng~10μg/mlの連続希釈で添加し、氷上で1時間インキュベートした。細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。50μlの1:100希釈したマウス抗ヒトIgGガンマPE(Invitrogen) を添加し、暗中で氷上で30~60分間インキュベートした。細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。細胞を、HTS設定のFACSCantoフロー・サイトメーターで分析した。結合した抗体の量を、中央値蛍光によって評価した。データをプロットし、曲線下面積(AUC、中央値蛍光強度の累積測定値)を、試験した細胞株当たりで、各抗体について決定した(図26)。
トラスツズマブおよびHER3抗体U1-59と比較した、PB4188の結合を、異なるレベルのHER2を発現する乳癌細胞株および胃癌細胞株に対するFACSによって分析した。細胞を、それらが数百万のHER2コピーを発現する場合、および/またはH ER2遺伝子増幅されている場合、HER2+++とみなした。以下の細胞株を使用した:MCF-7(HER2+);MDA-MB-468(HER2+、MKN-45(HE R2+)、MDA-MB-175(HER2+)、MDA-MB-453(HER2++)、MDA-MB-361(HER2++)、ZR-75-1(HER2++)、JIM T-1(HER2+++)、BT-474(HER2+++)、SKBR-3(HER2+++)、SK-OV-3(HER2+++)、N87(HER2+++)。指数関数 的に成長した培養物の細胞を、トリプシンによって回収し、FACS緩衝液(PBS/0. 5% BSA/0.5mM EDTA)中106細胞/mlに希釈した。1~2×105細胞を、U底96ウェル・プレート中の各ウェルに添加した。細胞を、4℃で300gで 2分間遠心分離した。上清を、上記のプレート(複数可)を反転させ、その後1回はじくことによって廃棄した。50μlの各IgGサンプルを、3.16ng~10μg/mlの連続希釈で添加し、氷上で1時間インキュベートした。細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。50μlの1:100希釈したマウス抗ヒトIgGガンマPE(Invitrogen) を添加し、暗中で氷上で30~60分間インキュベートした。細胞を、1回遠心分離し、上清を除去し、細胞を、FACS緩衝液で2回洗浄した。細胞を、HTS設定のFACSCantoフロー・サイトメーターで分析した。結合した抗体の量を、中央値蛍光によって評価した。データをプロットし、曲線下面積(AUC、中央値蛍光強度の累積測定値)を、試験した細胞株当たりで、各抗体について決定した(図26)。
この実験から、PB4188が、トラスツズマブと比較して、HER2+++細胞、H ER++細胞およびHER+細胞に対するより高い結合親和性を有すると結論付けられる。
トラスツズマブとの同時結合
PB4188およびトラスツズマブは、HER2への結合について競合しないPB4188は、HER2タンパク質のドメインIに結合するが、トラスツズマブの結合エピトープは、ドメインIV中に局在する。両方の抗体がHER2結合について競合しないことを実証するために、HER2増幅されたSKBR-3乳房細胞を用いた結合アッセイを実施した。最初に、未標識の抗体を、飽和濃度でSKBR-3に結合させた。次に、FITC標識されたPB4188を、滴定範囲内で添加し、蛍光をFACSによって測定した。図27は、PB4188FITCが、トラスツズマブまたは陰性コントロールの 存在下で細胞に効率的に結合したことを実証している。SKBR-3細胞とPB4188 とのプレインキュベーションは、PB4188FITCが結合することを防止した。従っ て、トラスツズマブおよびPB4188は、HER2への結合について競合しない。
PB4188およびトラスツズマブは、HER2への結合について競合しないPB4188は、HER2タンパク質のドメインIに結合するが、トラスツズマブの結合エピトープは、ドメインIV中に局在する。両方の抗体がHER2結合について競合しないことを実証するために、HER2増幅されたSKBR-3乳房細胞を用いた結合アッセイを実施した。最初に、未標識の抗体を、飽和濃度でSKBR-3に結合させた。次に、FITC標識されたPB4188を、滴定範囲内で添加し、蛍光をFACSによって測定した。図27は、PB4188FITCが、トラスツズマブまたは陰性コントロールの 存在下で細胞に効率的に結合したことを実証している。SKBR-3細胞とPB4188 とのプレインキュベーションは、PB4188FITCが結合することを防止した。従っ て、トラスツズマブおよびPB4188は、HER2への結合について競合しない。
HER2×HER3二重特異性分子によるHER2のドメインIの標的化は、ヘレグリン耐性を克服できる
HER2×HER3二量体上でのPB4188の配向が、HRGストレス条件下での細胞増殖を阻害するのに好ましいかどうかを試験するために、3178のHER3アーム、およびドメインI、II、IIIまたはIVのいずれかを標的化するHER2アームから構成される二重特異性抗体を作製した。2つのHER2×HER3二重特異性抗体を、HER2ドメインI~IVの各々のために作製した。HER2アームは以下を含んだ:ドメインIを標的化するMF3958およびMF3003;ドメインIIを標的化するMF2 889およびMF2913;ドメインIIIを標的化するMF1847およびMF300 1、ならびにドメインIVを標的化するMF1849およびMF1898。各HER2 Fabアームを、3178のHER3 Fabアームと組み合わせ、高濃度のヘレグリンの存在下での細胞増殖を阻害するそれらの強度について試験した。抗体滴定を、HER2 低発現性MCF-7細胞ならびに、HER2過剰発現性のN87およびSK-BR-3細胞に対して実施した。N87、SK-BR-3およびMCF-7細胞のコンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% BSAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1640培地)中で2回洗浄した。抗体を、片対数滴定で希釈した。細胞を、実験的に規定されたストレス濃度のH RG(SK-BR-3は10nM、N87およびMCF-7は100nM)の存在下で、 10000細胞/ウェル(N87、SKB-BR-3)および5000細胞/ウェルMC F-7の密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で3~4日間培養 した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を添加して、増殖を評価した。吸光度を、590nmの発光波長を用いて550nmの励起波長で測定した。試験した全てのアッセイにおいて、HER2のドメインIを標的化する二重特異性抗体のみが、高いヘレグリン濃度の存在下で増殖を阻害することができた(図2 8)。
HER2×HER3二量体上でのPB4188の配向が、HRGストレス条件下での細胞増殖を阻害するのに好ましいかどうかを試験するために、3178のHER3アーム、およびドメインI、II、IIIまたはIVのいずれかを標的化するHER2アームから構成される二重特異性抗体を作製した。2つのHER2×HER3二重特異性抗体を、HER2ドメインI~IVの各々のために作製した。HER2アームは以下を含んだ:ドメインIを標的化するMF3958およびMF3003;ドメインIIを標的化するMF2 889およびMF2913;ドメインIIIを標的化するMF1847およびMF300 1、ならびにドメインIVを標的化するMF1849およびMF1898。各HER2 Fabアームを、3178のHER3 Fabアームと組み合わせ、高濃度のヘレグリンの存在下での細胞増殖を阻害するそれらの強度について試験した。抗体滴定を、HER2 低発現性MCF-7細胞ならびに、HER2過剰発現性のN87およびSK-BR-3細胞に対して実施した。N87、SK-BR-3およびMCF-7細胞のコンフルエント未満の細胞培養物を、PBSで洗浄し、トリプシン処理し、トリプシンを培養培地を添加することによって不活化した。細胞を、大きい体積のアッセイ培地(0.05% BSAおよび10μg/mlのホロ・トランスフェリンを含むRPMI1640培地)中で2回洗浄した。抗体を、片対数滴定で希釈した。細胞を、実験的に規定されたストレス濃度のH RG(SK-BR-3は10nM、N87およびMCF-7は100nM)の存在下で、 10000細胞/ウェル(N87、SKB-BR-3)および5000細胞/ウェルMC F-7の密度で添加した。これらの細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で3~4日間培養 した。Alamar Blue(商標)(Invitrogen)を添加して、増殖を評価した。吸光度を、590nmの発光波長を用いて550nmの励起波長で測定した。試験した全てのアッセイにおいて、HER2のドメインIを標的化する二重特異性抗体のみが、高いヘレグリン濃度の存在下で増殖を阻害することができた(図2 8)。
in vitroでのPB4188との薬物組み合わせ。
PB4188を小分子薬物と組み合わせる可能性を調査するために、PB4188を、PI3KまたはMAPK経路の異なるレベルにおいて妨害する薬物と組み合わせた。さらに、化学療法薬物およびサイクリン阻害剤との組み合わせを試験した。組み合わせを、マトリゲルにおいてHRGの存在下で(SK-BR-3およびBT-474)、またはHR Gストレス濃度の存在下で(増殖アッセイに記載したように、N87およびSK-BR- 3)成長しているHER2過剰発現性細胞に対して試験した。薬物組み合わせの阻害効果を、画像化によって、またはAlamar Blueを本明細書で上に記載したように使用して増殖を測定することによって、試験した。最初に、EC20 PB4188および試験する薬物を決定した。次に、交差力価測定を、PB4188および薬物を用いて実施した。相乗作用が、チロシン・キナーゼ阻害剤(アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ)、PI3Ka阻害剤BYL719、Akt阻害剤MK-2206、mTOR阻害剤エベロリムス、Src阻害剤サラカチニブ、微小管破壊薬物パクリタキセルおよびHDAC阻害剤ボリノスタット(図40中で「ボロニスタット(voronistat)」とスペルミスされている)を用いて試験した全ての細胞株において観察された。図29は、形態学的変化および細胞成長の低減を結果的に生じる、マトリゲルにおいて増殖したSKBR- 3細胞に対する、PB4188とラパチニブとの相乗的組み合わせの一例を示す。各組み合わせで得られた成長阻害の程度を計算した。強度のシフトは、その効果に到達するために必要とされる単剤と比較した場合に、所望のレベルを達成するために組み合わせにおいて必要とされる薬物の量がどれだけ少ないかを示すアイソボログラム(Grecoら、1 995)を使用して示され得る。CHALICE(商標)Analyzerソフトウェアが組み合わせ実験の阻害値を使用して、アイソボログラムを生成した。HER2増幅された細胞に対する異なる薬物組み合わせのアイソボログラムを、図40に示す。アイソボログラム分析により、PB4188が、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL7 19、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルとの相乗的な薬物組み合わせを示したことが示された。
PB4188を小分子薬物と組み合わせる可能性を調査するために、PB4188を、PI3KまたはMAPK経路の異なるレベルにおいて妨害する薬物と組み合わせた。さらに、化学療法薬物およびサイクリン阻害剤との組み合わせを試験した。組み合わせを、マトリゲルにおいてHRGの存在下で(SK-BR-3およびBT-474)、またはHR Gストレス濃度の存在下で(増殖アッセイに記載したように、N87およびSK-BR- 3)成長しているHER2過剰発現性細胞に対して試験した。薬物組み合わせの阻害効果を、画像化によって、またはAlamar Blueを本明細書で上に記載したように使用して増殖を測定することによって、試験した。最初に、EC20 PB4188および試験する薬物を決定した。次に、交差力価測定を、PB4188および薬物を用いて実施した。相乗作用が、チロシン・キナーゼ阻害剤(アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ)、PI3Ka阻害剤BYL719、Akt阻害剤MK-2206、mTOR阻害剤エベロリムス、Src阻害剤サラカチニブ、微小管破壊薬物パクリタキセルおよびHDAC阻害剤ボリノスタット(図40中で「ボロニスタット(voronistat)」とスペルミスされている)を用いて試験した全ての細胞株において観察された。図29は、形態学的変化および細胞成長の低減を結果的に生じる、マトリゲルにおいて増殖したSKBR- 3細胞に対する、PB4188とラパチニブとの相乗的組み合わせの一例を示す。各組み合わせで得られた成長阻害の程度を計算した。強度のシフトは、その効果に到達するために必要とされる単剤と比較した場合に、所望のレベルを達成するために組み合わせにおいて必要とされる薬物の量がどれだけ少ないかを示すアイソボログラム(Grecoら、1 995)を使用して示され得る。CHALICE(商標)Analyzerソフトウェアが組み合わせ実験の阻害値を使用して、アイソボログラムを生成した。HER2増幅された細胞に対する異なる薬物組み合わせのアイソボログラムを、図40に示す。アイソボログラム分析により、PB4188が、アファチニブ、ラパチニブ、ネラチニブ、BYL7 19、MK-2206、エベロリムス、サラカチニブ、ボリノスタットおよびパクリタキセルとの相乗的な薬物組み合わせを示したことが示された。
これらのデータは、PI3K経路に対して作用する薬物が、PB4188との組み合わせで特に有効であったことを実証している。さらに、チロシン・キナーゼ阻害剤との組み合わせが有効である。さらに、成長および遊走/浸潤薬物サラカチニブとの組み合わせが、転移の状況において好都合であり得る。
PB4188のin vitroでのリン酸化の阻害
指数関数的に成長した培養物の細胞を回収し、飢餓培地(N87細胞:RPMI-16 40、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン;SKBR-3細胞:DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/m l ホロ・トランスフェリン)中で6ウェル・プレート中に播種し(N87について3. 75×106細胞およびSKBR-3について1.5×106細胞)、95%の相対湿度 中で、37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、抗体を、5nMの最終濃度になるように添加し、細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で1時間インキュベートした。次いで、HRGを、100ng/mlの最終濃度になるように添加した。95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で1、3、6または24時間の後、プレートを氷上に配置し、細胞を冷PBSで2回洗浄した。引き続いて、0.3mlの氷冷溶解緩衝液を添加し(Cell signaling RTK #9803またはIC # 7018)、細胞を、氷上で最低30分間溶解させた。次に、タンパク質濃度を、BCA(Pierce #23235)を使用して測定した。タンパク質濃度を、溶解緩衝液を用いて2mg/mlに調整した。次に、溶解物を、PathScan RTK Sign aling Antibody Arrays(Cell signaling #79 49)またはPathScan Intracellular Signaling A ntibody Arraysに適用した。全てのインキュベーションを、オービタル・シェーカー上の密封ウェルを用いて室温で実施した。溶解物(75μl)を、プロテアーゼ阻害剤のカクテルを補充した75μlのアレイ希釈剤緩衝液で0.8mg/mlの濃度まで2回希釈し、氷上で維持した。アレイ・ウェルを、100μlのアレイブロック緩衝液で15分間ブロッキングした。ブロック緩衝液を除去し、溶解物をウェルに適用し、2 時間インキュベートした。溶解物を吸引し、ウェルを、100μlの洗浄緩衝液で4回洗浄した。次に、1ウェル当たり100μlの検出抗体のカクテルを適用し、1時間インキュベートした。抗体のカクテルを吸引し、ウェルを、100μlの洗浄緩衝液で4回洗浄した。75μlのDylight80(商標)ストレプトアビジンを、各ウェルに添加した。Dylight80(商標)ストレプトアビジンを吸引し、ウェルを、100μlの洗浄緩衝液で4回洗浄した。マルチ-ガスケット(multi-gasket)を除去し、スライドを、脱イオン水中10mlで10秒間洗浄した。スライドを乾燥させ、Ody see(登録商標)Clxでの画像化のために処理した。スポット蛍光強度を、Imag e Studioソフトウェアを使用して計算した。
指数関数的に成長した培養物の細胞を回収し、飢餓培地(N87細胞:RPMI-16 40、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン;SKBR-3細胞:DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/m l ホロ・トランスフェリン)中で6ウェル・プレート中に播種し(N87について3. 75×106細胞およびSKBR-3について1.5×106細胞)、95%の相対湿度 中で、37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、抗体を、5nMの最終濃度になるように添加し、細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で1時間インキュベートした。次いで、HRGを、100ng/mlの最終濃度になるように添加した。95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で1、3、6または24時間の後、プレートを氷上に配置し、細胞を冷PBSで2回洗浄した。引き続いて、0.3mlの氷冷溶解緩衝液を添加し(Cell signaling RTK #9803またはIC # 7018)、細胞を、氷上で最低30分間溶解させた。次に、タンパク質濃度を、BCA(Pierce #23235)を使用して測定した。タンパク質濃度を、溶解緩衝液を用いて2mg/mlに調整した。次に、溶解物を、PathScan RTK Sign aling Antibody Arrays(Cell signaling #79 49)またはPathScan Intracellular Signaling A ntibody Arraysに適用した。全てのインキュベーションを、オービタル・シェーカー上の密封ウェルを用いて室温で実施した。溶解物(75μl)を、プロテアーゼ阻害剤のカクテルを補充した75μlのアレイ希釈剤緩衝液で0.8mg/mlの濃度まで2回希釈し、氷上で維持した。アレイ・ウェルを、100μlのアレイブロック緩衝液で15分間ブロッキングした。ブロック緩衝液を除去し、溶解物をウェルに適用し、2 時間インキュベートした。溶解物を吸引し、ウェルを、100μlの洗浄緩衝液で4回洗浄した。次に、1ウェル当たり100μlの検出抗体のカクテルを適用し、1時間インキュベートした。抗体のカクテルを吸引し、ウェルを、100μlの洗浄緩衝液で4回洗浄した。75μlのDylight80(商標)ストレプトアビジンを、各ウェルに添加した。Dylight80(商標)ストレプトアビジンを吸引し、ウェルを、100μlの洗浄緩衝液で4回洗浄した。マルチ-ガスケット(multi-gasket)を除去し、スライドを、脱イオン水中10mlで10秒間洗浄した。スライドを乾燥させ、Ody see(登録商標)Clxでの画像化のために処理した。スポット蛍光強度を、Imag e Studioソフトウェアを使用して計算した。
N87およびSKBR-3では、PB4188は、トラスツズマブ+ペルツズマブの組み合わせとは対照的に、インキュベーションの最初の6時間の間、AKTのリン酸化を完全に遮断する。さらに、強い阻害が、トラスツズマブ+ペルツズマブの組み合わせとは対照的に、ERKおよびS6のリン酸化において観察される。PB4188は、HER2のリン酸化を阻害しない(図30)。
ウエスタン・ブロット分析
RTKおよび細胞内Pathscanアレイにおいて観察されたリン酸化阻害を検証するために、ウエスタン・ブロットを、HRGストレス濃度の存在下で、PB4188、ペルツズマブおよびトラスツズマブの組合せ、ならびにコントロール抗体で処置した細胞に対して実施した。指数関数的に成長した培養物の細胞を回収し、飢餓培地(N87細胞: RPMI-1640、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン; SKBR-3細胞:DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン)中で、10cmディッシュ中に播種した( N87について20×106細胞およびSKBR-3について7×106細胞)。次の日、抗体を、5nMの最終濃度になるように添加し、細胞を1時間インキュベートした。次いで、HRGを、100ng/mlの最終濃度になるように添加した。1、3、6または24時間後、ディッシュを氷上に配置し、細胞を、冷PBSで2回洗浄し、エッペンドルフチューブに移し、250μlのRIPA溶解緩衝液(20mM Tris-HCl p H7.5、150mM NaCl、1mM Na2EDTA、1mM EGTA、1% NP-40、1% デオキシコール酸ナトリウム、0.1% SDS、2.5mM ピロリン酸ナトリウム、1mM ベータ-グリセロホスフェート、1mM Na3VO4、1 μg/ml ロイペプチン)で溶解した。溶解を、氷上で30分間進行させた。細胞溶解物を遠心分離し、上清を、新しいエッペンドルフチューブ中に収集した。タンパク質濃度を、BCA法(Pierce)を使用して決定した。30μgの溶解物を、4~12%のBis-Tris NuPageゲル(Invitrogen)上で分離し、ゲル上のタンパク質を、ニトロセルロースのメンブレンに移した。メンブレンを、5% BSAを含むTBS-Tで1時間ブロッキングし、製造者の指示(Cell Signaling Technology)に従って、示された抗体で染色した。次いで、メンブレンを、H RPコンジュゲート化二次抗体と共にインキュベートし、ECL基質と共にインキュベートし、X線フィルム(Amersham)を使用するオートラジオグラフィーに供した。全ての検出抗体は、Cell Signaling Technologyからであった:ホスホ(Phospho)-Akt(ser 473)#4060、総(Total) Akt #4691、ホスホPhospho-HER2(Tyr 1221/1222)#2243、総 HER2 #2242、ホスホ-HER3(Tyr 1289)#4 791、総HER3 #4754、ホスホ-ERK1/2(Thr 202/Tyr 2 04)#4377、総ERK1/2 #4695、ホスホ-S6 RP(Ser 235
/236)#2211、総S6 RP #2217、ヤギ抗ウサギHRP-linked#7074。
RTKおよび細胞内Pathscanアレイにおいて観察されたリン酸化阻害を検証するために、ウエスタン・ブロットを、HRGストレス濃度の存在下で、PB4188、ペルツズマブおよびトラスツズマブの組合せ、ならびにコントロール抗体で処置した細胞に対して実施した。指数関数的に成長した培養物の細胞を回収し、飢餓培地(N87細胞: RPMI-1640、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン; SKBR-3細胞:DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン)中で、10cmディッシュ中に播種した( N87について20×106細胞およびSKBR-3について7×106細胞)。次の日、抗体を、5nMの最終濃度になるように添加し、細胞を1時間インキュベートした。次いで、HRGを、100ng/mlの最終濃度になるように添加した。1、3、6または24時間後、ディッシュを氷上に配置し、細胞を、冷PBSで2回洗浄し、エッペンドルフチューブに移し、250μlのRIPA溶解緩衝液(20mM Tris-HCl p H7.5、150mM NaCl、1mM Na2EDTA、1mM EGTA、1% NP-40、1% デオキシコール酸ナトリウム、0.1% SDS、2.5mM ピロリン酸ナトリウム、1mM ベータ-グリセロホスフェート、1mM Na3VO4、1 μg/ml ロイペプチン)で溶解した。溶解を、氷上で30分間進行させた。細胞溶解物を遠心分離し、上清を、新しいエッペンドルフチューブ中に収集した。タンパク質濃度を、BCA法(Pierce)を使用して決定した。30μgの溶解物を、4~12%のBis-Tris NuPageゲル(Invitrogen)上で分離し、ゲル上のタンパク質を、ニトロセルロースのメンブレンに移した。メンブレンを、5% BSAを含むTBS-Tで1時間ブロッキングし、製造者の指示(Cell Signaling Technology)に従って、示された抗体で染色した。次いで、メンブレンを、H RPコンジュゲート化二次抗体と共にインキュベートし、ECL基質と共にインキュベートし、X線フィルム(Amersham)を使用するオートラジオグラフィーに供した。全ての検出抗体は、Cell Signaling Technologyからであった:ホスホ(Phospho)-Akt(ser 473)#4060、総(Total) Akt #4691、ホスホPhospho-HER2(Tyr 1221/1222)#2243、総 HER2 #2242、ホスホ-HER3(Tyr 1289)#4 791、総HER3 #4754、ホスホ-ERK1/2(Thr 202/Tyr 2 04)#4377、総ERK1/2 #4695、ホスホ-S6 RP(Ser 235
/236)#2211、総S6 RP #2217、ヤギ抗ウサギHRP-linked#7074。
これらの結果は、PB4188が、AKTリン酸化阻害に対して顕著な影響を有するM APKおよびPI3キナーゼ経路の両方の阻害を生じる、HER3リン酸化の延長された阻害を示すことを示している(図31)。
PB4188のin vivo薬物動力学Luminexによるリンタンパク質分析
2用量のPB4188および4用量のPB4188で処置したJIMT-1移植マウスの腫瘍(100mm3)を、投薬の24時間後に取り出した。腫瘍を、瞬間凍結し、粉末に加工した。腫瘍溶解物を、凍結粉末サンプルへの冷BioRad溶解緩衝液(0.4% BioRad Factor 1、0.2% BioRad Factor 2および2mM PMSFを補充した)の使用により、50mg腫瘍/mLの濃度に調製し、ロッカー上で4℃で60分間インキュベートして、完全な溶解を確実にした。これらのサンプルを、16000×gで4℃で10分間遠心分離し、アリコート化した。総タンパク質を、製造業者の指示に従ってBiorad DC Protein Assay試薬を使用して決定した。Luminexアッセイ:JIMT-1腫瘍溶解物サンプルを処理し、M illiporeからの市販のLuminexキット(カタログ番号48-618MAG(ロット番号2532050)、46-645MAG(ロット番号46645M-1K) を使用して、総AKT、AKT(Ser473)およびAKT(Thr308)について分析した。各サンプルを、2連で試験した。希釈物を、全ての総分析物およびリン酸化分析物の決定のために、1ウェル当たりおよそ25μgタンパク質の標的をロードするよう、サンプル希釈剤中に調製した。製造業者の仕様書に従って、Milliporeキットを使用した。
2用量のPB4188および4用量のPB4188で処置したJIMT-1移植マウスの腫瘍(100mm3)を、投薬の24時間後に取り出した。腫瘍を、瞬間凍結し、粉末に加工した。腫瘍溶解物を、凍結粉末サンプルへの冷BioRad溶解緩衝液(0.4% BioRad Factor 1、0.2% BioRad Factor 2および2mM PMSFを補充した)の使用により、50mg腫瘍/mLの濃度に調製し、ロッカー上で4℃で60分間インキュベートして、完全な溶解を確実にした。これらのサンプルを、16000×gで4℃で10分間遠心分離し、アリコート化した。総タンパク質を、製造業者の指示に従ってBiorad DC Protein Assay試薬を使用して決定した。Luminexアッセイ:JIMT-1腫瘍溶解物サンプルを処理し、M illiporeからの市販のLuminexキット(カタログ番号48-618MAG(ロット番号2532050)、46-645MAG(ロット番号46645M-1K) を使用して、総AKT、AKT(Ser473)およびAKT(Thr308)について分析した。各サンプルを、2連で試験した。希釈物を、全ての総分析物およびリン酸化分析物の決定のために、1ウェル当たりおよそ25μgタンパク質の標的をロードするよう、サンプル希釈剤中に調製した。製造業者の仕様書に従って、Milliporeキットを使用した。
PB4188で処置した腫瘍は、未処置の腫瘍と比較して、Akt発現における増加を示した。AKTのリン酸化は、2回の週1回の用量の後および4回の週1回の用量の後の両方に、PB4188によって完全に阻害された(図32)。
VeraTagアッセイによるリン酸化タンパク質分析
1または2用量のPB4188で処置したJIMT-1移植マウスの腫瘍(100mm3または400mm3)を取り出し、10%中性緩衝ホルマリン中で固定した。100mm3腫瘍を保有するマウスは、単一PB4188用量(25mg/kg)の24時間後に屠殺したが、400mm3腫瘍を保有するマウスは、25mg/kgの2回の週1回の用量を投与され、投薬の4時間後に屠殺した。次に、サンプルをパラフィン包埋した。厚さ7umの切片を、ミクロトーム(LEICA)を用いてスライスし、通し番号で標識した、正に荷電したガラス・スライド(VWR)上に配置した。スライドを、30分間風乾し、次いで、60℃に設定した加熱オーブン中で焼いた。次のサンプルを、異なるVera Tag分析のために処理した。米国特許出願第12/340,436号に従う総HER2 分析(HT2)、米国特許第8,349,574号と米国特許出願公開第2013/00 71859号に従う総HER3分析(H3T)、ならびに最後に、国際特許出願PCT/ US2014/033208に従うHER2-HER3ヘテロ二量体(H23D)、HE R3pY1289(H3pY1289)およびHER3-PI3キナーゼ(H3PI3K)。両方の投薬レジメンにおいて、未処置のコントロールと比較して、HER2:HER 3二量体における顕著なPB4188媒介性の低減が、明らかになった。PB4188処置した腫瘍とコントロールとの間で、総HER2、HER3またはリン酸化HER3における差異は観察されなかった。PB4188投薬の4時間後に分析した腫瘍は、未処置のコントロールと比較して、HER3-p85(PI3K)における顕著な低減を示した。
1または2用量のPB4188で処置したJIMT-1移植マウスの腫瘍(100mm3または400mm3)を取り出し、10%中性緩衝ホルマリン中で固定した。100mm3腫瘍を保有するマウスは、単一PB4188用量(25mg/kg)の24時間後に屠殺したが、400mm3腫瘍を保有するマウスは、25mg/kgの2回の週1回の用量を投与され、投薬の4時間後に屠殺した。次に、サンプルをパラフィン包埋した。厚さ7umの切片を、ミクロトーム(LEICA)を用いてスライスし、通し番号で標識した、正に荷電したガラス・スライド(VWR)上に配置した。スライドを、30分間風乾し、次いで、60℃に設定した加熱オーブン中で焼いた。次のサンプルを、異なるVera Tag分析のために処理した。米国特許出願第12/340,436号に従う総HER2 分析(HT2)、米国特許第8,349,574号と米国特許出願公開第2013/00 71859号に従う総HER3分析(H3T)、ならびに最後に、国際特許出願PCT/ US2014/033208に従うHER2-HER3ヘテロ二量体(H23D)、HE R3pY1289(H3pY1289)およびHER3-PI3キナーゼ(H3PI3K)。両方の投薬レジメンにおいて、未処置のコントロールと比較して、HER2:HER 3二量体における顕著なPB4188媒介性の低減が、明らかになった。PB4188処置した腫瘍とコントロールとの間で、総HER2、HER3またはリン酸化HER3における差異は観察されなかった。PB4188投薬の4時間後に分析した腫瘍は、未処置のコントロールと比較して、HER3-p85(PI3K)における顕著な低減を示した。
PB4188は、HRG刺激された癌細胞において細胞周期の進行を低減するPB4188が細胞周期の進行に影響を与える能力を、種々のタンパク質レベルのHER2を発現する癌細胞株において調査した。HER2+(MCF-7)、HER2+++(JIMT-1、SK-BR-3およびN87細胞)細胞を、アッセイ培地(MCF-7 細胞については、RPMI-1640、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン、1mM ピルビン酸ナトリウム、MEM NEAA。JIMT-1については、DMEM、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン。S K-BR-3細胞については、DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン。N87細胞については、RPM I-1640、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン)中に播種した。24ウェル・プレートの1ウェル当たり、300.000のMCF-7、または400.000のN87または150.000のSK-BR-3または150.000 の JIMT-1または細胞を、1mlのアッセイ培地中に播種し、95%の相対湿度中で、 37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、PB4188またはペルツズマブ+トラスツズマブまたはPG3178またはPG1337を、1ng/mlまたは10 0ng/mlの最終濃度のHRGの存在下で、細胞に添加した。95%の相対湿度中で、 37℃、5%CO2における24時間のインキュベーション(JIMT-1、N87またはSK-BR-3細胞について)または48時間のインキュベーション(MCF-7細胞について)の後、細胞に、回収する前に2時間にわたってEdU(10μM最終濃度)を補充し、製造業者の指示に従ってClick-iT EdU AlexaFluor48 8キット(LifeTechnologies、カタログ番号C10425)を使用して、EdU取込みについて染色した。FACSCantoでのフロー・サイトメトリーによって細胞を分析する少なくとも30分前に、細胞を、200nMのFxCycle遠赤色色素(LifeTechnologies、カタログ番号F10348)および100μ g/mlのRNAse A(LifeTechnologies、カタログ番号1209 1-039)と共にインキュベートした。事象を、AlexFluor488チャネル( EdU検出について)およびAPCチャネル(FxCycle色素による総DNA染色について)において獲得した。データを、FSC幅対FSC高さ散布図上で単一細胞をゲーティングし、APC対AlexaFluor488散布図上でG0/G1、SおよびG2 M期の細胞周期をサブゲーティングすることによって、それぞれEdU陰性APC低、E dU陽性およびEdU陰性APC高集団として、分析した。
データは、SおよびG2/M期にある細胞の百分率を、G0/G1期にある細胞の百分率によって除算することによって計算した増殖指数として表す。図34は、PB4188 が、標準的(1ng/ml)または高い(100ng/ml)濃度のHRGによって誘導された増殖を阻害することにおいて、PG3178またはペルツズマブ+トラスツズマブよりも一貫してより強力であることを示している。高濃度のHRGにおいても、PB41 88は、細胞周期の進行を阻害する。
PB4188は、受容体内部移行を誘導する
抗体の内部移行パターンを、pH感受性色素を使用して測定した。これは、WO201 3134686 A1において当技術分野で記載されており、ここで、かかる色素は、抗体とカップリングされた場合、より低いpHに曝露されたときに増加した蛍光シグナルを示す。これは、色素カップリングした抗体が、標的細胞の表面から、穏やかに酸性のエンドソーム(pH6~6.5)や酸性のリソソーム(5.5より低いpH)中に内部移行する場合に生じる。PB4188が癌細胞において内部移行するかどうかを調査するために、抗体を、製造者の指示に従って、スクシンイミジル・エステル反応性基を有するpHセンサー色素(Promega、カタログ番号CS1783A01)にカップリングさせた。コンパレーターとして、抗HER2(トラスツズマブ、ペルツズマブ、PG3958)、抗HER3(PG3178、#Ab6)および陰性コントロール(抗破傷風毒素、PG 1337)の色素標識された抗体を含めた。指数関数的に成長した培養物のHER2過剰発現性SKBR-3およびN87癌細胞を回収し、1ng/mlのHRGを含む100μ lのアッセイ培地(N87細胞については、RPMI-1640、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン。SKBR-3細胞については、DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン)中で96ウェル・プレート上に播種し(1ウェル当たり15×103細胞 )、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、20 μlのpH感受性色素標識した抗体を添加して、100nMの最終濃度に到達させ、細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、非接着性細胞を収集し、接着性細胞をトリプシン処理することによって、細胞を回収した。FACS緩衝液(PBS 0.5% BSA 0.1% アジ化ナトリウム)で細胞を洗浄した後、細胞を、APC標識した抗ヒトIgG(Jackson Immunores earch、カタログ番号109-136-098、1:100希釈)で染色した。細 胞を、PEおよびAPCチャネルの中央値蛍光強度(MFI)を測定するFACSCant o(BD Biosciences)でのフロー・サイトメトリーによって分析して、それぞれ、抗体の内部移行および残留表面結合を決定した。図35に示されるデータは、P B4188がトラスツズマブと同じ程度まで内部移行するが、組み合わせトラスツズマブ+ペルツズマブは、増強された内部移行をもたらすことを示している。トラスツズマブ+ ペルツズマブの組み合わせは、トラスツズマブ単独と比較して、ADCCを低減する(図36)。従って、PB4188内部移行のレベルは、ADCC強度に影響を与えないと理解される。
抗体の内部移行パターンを、pH感受性色素を使用して測定した。これは、WO201 3134686 A1において当技術分野で記載されており、ここで、かかる色素は、抗体とカップリングされた場合、より低いpHに曝露されたときに増加した蛍光シグナルを示す。これは、色素カップリングした抗体が、標的細胞の表面から、穏やかに酸性のエンドソーム(pH6~6.5)や酸性のリソソーム(5.5より低いpH)中に内部移行する場合に生じる。PB4188が癌細胞において内部移行するかどうかを調査するために、抗体を、製造者の指示に従って、スクシンイミジル・エステル反応性基を有するpHセンサー色素(Promega、カタログ番号CS1783A01)にカップリングさせた。コンパレーターとして、抗HER2(トラスツズマブ、ペルツズマブ、PG3958)、抗HER3(PG3178、#Ab6)および陰性コントロール(抗破傷風毒素、PG 1337)の色素標識された抗体を含めた。指数関数的に成長した培養物のHER2過剰発現性SKBR-3およびN87癌細胞を回収し、1ng/mlのHRGを含む100μ lのアッセイ培地(N87細胞については、RPMI-1640、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン。SKBR-3細胞については、DMEM/F-12、2mM L-グルタミン、0.05% BSA、10μg/ml ホロ・トランスフェリン)中で96ウェル・プレート上に播種し(1ウェル当たり15×103細胞 )、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、20 μlのpH感受性色素標識した抗体を添加して、100nMの最終濃度に到達させ、細胞を、95%の相対湿度中で、37℃、5%CO2で終夜インキュベートした。次の日、非接着性細胞を収集し、接着性細胞をトリプシン処理することによって、細胞を回収した。FACS緩衝液(PBS 0.5% BSA 0.1% アジ化ナトリウム)で細胞を洗浄した後、細胞を、APC標識した抗ヒトIgG(Jackson Immunores earch、カタログ番号109-136-098、1:100希釈)で染色した。細 胞を、PEおよびAPCチャネルの中央値蛍光強度(MFI)を測定するFACSCant o(BD Biosciences)でのフロー・サイトメトリーによって分析して、それぞれ、抗体の内部移行および残留表面結合を決定した。図35に示されるデータは、P B4188がトラスツズマブと同じ程度まで内部移行するが、組み合わせトラスツズマブ+ペルツズマブは、増強された内部移行をもたらすことを示している。トラスツズマブ+ ペルツズマブの組み合わせは、トラスツズマブ単独と比較して、ADCCを低減する(図36)。従って、PB4188内部移行のレベルは、ADCC強度に影響を与えないと理解される。
抗HER3抗体3178バリアントの作製および特徴付け
抗HER3抗体MF3178のバリアントを、抗体特性を改善することを目的として設計した。変異を、VH遺伝子フレームワーク領域1(FR1)、相補性決定領域1(CD R1)、FR2、CDR2および/またはFR3中に導入したが、CDR3およびFR4 は改変しなかった。この設計は、翻訳後修飾(PTM)モチーフを除去するため(例えば、脱アミド・モチーフNSをNQに変化させることによる)、表面疎水性を低減するため(例えば、IをTに変化させることによる)または等電点を増加させるため(pI;例えば、QをKに変化させることによる)に導入された変異を含むが、それらに限定されない。20全てのバリアント(図37を参照のこと)を、破傷風トキソイド(TT)アームと組み合わせた二重特異性抗体として発現させ、MCF-7機能的アッセイにおいて試験したところ、20全てのバリアントが、この形式でMF3178抗体と類似の強度を有していた。20全てのバリアントを、MCF-7への結合について滴定でFACSにおいてもこの形式で試験したところ、全てのバリアントが、非常に類似の結合プロファイルを有し、これは、全てのバリアントの親和性が類似していることを示唆している。それぞれ、1 0、3および7つのアミノ酸変異を含む3つのリード・バリアントMF6058、MF6 061およびMF6065を、さらなる実験のために選択した(図16Eおよび図37の配列を参照のこと)。対応する単一特異性IgG1 PG6058、PG6061およびPG6065を大規模で産生し、精製した。図38に示されるように、HRG依存的N8 7細胞株増殖アッセイにおける3つのバリアントの阻害活性は、PG3178のものと類似である。3つのバリアントのCIEX-HPLCプロファイルは、図39に示されるように、電荷不均一性ならびにピーク幅および対称性に関して、PG3178のものと類似であった。主要ピークの保持時間(tR)は、抗体のpIと大まかに相関した。即ち、p Iが高いほど、より長い保持時間を生じた。二重特異性抗体または抗体の混合物の設計において、最適なtRを有する抗体バリアントを選択することは有用であるが、それは、C IEXを使用した所望の抗体成分の精製が促進され得るからである。
抗HER3抗体MF3178のバリアントを、抗体特性を改善することを目的として設計した。変異を、VH遺伝子フレームワーク領域1(FR1)、相補性決定領域1(CD R1)、FR2、CDR2および/またはFR3中に導入したが、CDR3およびFR4 は改変しなかった。この設計は、翻訳後修飾(PTM)モチーフを除去するため(例えば、脱アミド・モチーフNSをNQに変化させることによる)、表面疎水性を低減するため(例えば、IをTに変化させることによる)または等電点を増加させるため(pI;例えば、QをKに変化させることによる)に導入された変異を含むが、それらに限定されない。20全てのバリアント(図37を参照のこと)を、破傷風トキソイド(TT)アームと組み合わせた二重特異性抗体として発現させ、MCF-7機能的アッセイにおいて試験したところ、20全てのバリアントが、この形式でMF3178抗体と類似の強度を有していた。20全てのバリアントを、MCF-7への結合について滴定でFACSにおいてもこの形式で試験したところ、全てのバリアントが、非常に類似の結合プロファイルを有し、これは、全てのバリアントの親和性が類似していることを示唆している。それぞれ、1 0、3および7つのアミノ酸変異を含む3つのリード・バリアントMF6058、MF6 061およびMF6065を、さらなる実験のために選択した(図16Eおよび図37の配列を参照のこと)。対応する単一特異性IgG1 PG6058、PG6061およびPG6065を大規模で産生し、精製した。図38に示されるように、HRG依存的N8 7細胞株増殖アッセイにおける3つのバリアントの阻害活性は、PG3178のものと類似である。3つのバリアントのCIEX-HPLCプロファイルは、図39に示されるように、電荷不均一性ならびにピーク幅および対称性に関して、PG3178のものと類似であった。主要ピークの保持時間(tR)は、抗体のpIと大まかに相関した。即ち、p Iが高いほど、より長い保持時間を生じた。二重特異性抗体または抗体の混合物の設計において、最適なtRを有する抗体バリアントを選択することは有用であるが、それは、C IEXを使用した所望の抗体成分の精製が促進され得るからである。
FACSによって決定された、免疫化したマウスの異なるコホートの血清力価。D=抗体力価決定の日。表1:HER2に対する応答。表2:HER3に対する応答。使用した細胞株が示される(MCF7、SKBR3、BT474)。異なるマウスを各列に示す。
[参考文献]
Claims (57)
- ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体であって、
ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上の、ErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減できる、二重特異性抗体。 - 請求項1に記載の二重特異性抗体において、
前記抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞のリガンド誘導性成長を低減できる、二重特異性抗体。 - 請求項2に記載の二重特異性抗体において、
前記抗体が、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞のリガンド誘導性成長を低減でき、該細胞が、細胞1つ当たり少なくとも100.000の細胞表面のErbB-2受容体を有する、二重特異性抗体。 - 請求項1から3までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
前記細胞が、MCF-7細胞、SKBR-3細胞、NCI-N87細胞、BxPC-3 細胞、BT-474細胞またはJIMT-1細胞である、二重特異性抗体。 - 請求項1から4までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
前記第1の抗原結合部位が、ErbB-2のドメインIまたはドメインIVに結合する、二重特異性抗体。 - 請求項1から5までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
前記第2の抗原結合部位が、ErbB-3へのErbB-3リガンドの結合を妨害する、二重特異性抗体。 - ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体であって、
前記第1の抗原結合部位が、ErbB-2のドメインIに結合し、前記第2の抗原結合部位が、ErbB-3のドメインIIIに結合する、二重特異性抗体。 - ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体であって、
ErbB-3陽性細胞に対する前記第2の抗原結合部位の親和性(KD)が、ErbB-2陽性細胞に対する前記第1の抗原結合部位の親和性と等しいか、またはそれよりも高い、二重特異性抗体。 - 請求項1から8までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
前記抗体は、ErbB-2およびErbB-3陽性細胞上のErbB-3のリガンド誘導性受容体機能を低減できる、二重特異性抗体。 - 請求項1から9までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
ErbB-2およびErbB-3陽性細胞のリガンド誘導性成長を低減できる、二重特異性抗体。 - 請求項1から10までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
ErbB-3陽性細胞に対する前記第2の抗原結合部位の親和性(KD)が、2.0nM以下、好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である、二重特異性抗体。 - 請求項1から11までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
ErbB-2陽性細胞に対する前記第1の抗原結合部位の親和性(KD)が、5.0nM以下、好ましくは4.5nM以下、好ましくは4.0nM以下である、二重特異性抗体。 - 請求項1から12までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
BT-474細胞に対する前記二重特異性抗体の親和性(KD)が、5.0nM以下、好ましくは4.0nM以下、より好ましくは3.2nM以下であり、および/またはSK-BR-3細胞に対する前記二重特異性抗体の親和性が、5.0nM以下、好ましくは3.0nM以下、より好ましくは2.0nM以下である、二重特異性抗体。 - ErbB-2に結合する2つの抗原結合部位を含む抗体であって、前記抗原結合部位のうち少なくとも一方が、ErbB-2のドメインIに結合する、抗体。
- 請求項14に記載の二重特異性抗体において、
ErbB-2陽性細胞に対する前記抗原結合部位のうち少なくとも一方の親和性(KD)が、5.0nM以下、好ましくは4.0nM以下、より好ましくは4.0nM以下である、抗体。 - ErbB-3に結合する2つの抗原結合部位を含む抗体であって、前記抗原結合部位のうち少なくとも一方が、ErbB-3のドメインIIIに結合する、抗体。
- 請求項16に記載の抗体において、
ErbB-3陽性細胞に対する前記抗原結合部位のうち少なくとも一方の親和性(KD)が、2.0nM以下、好ましくは1.39nM以下、より好ましくは0.99nM以下である、抗体。 - 請求項1から17までのいずれか一項に記載の抗体において、
前記ErbB-3陽性細胞および/または前記ErbB-2陽性細胞が、BT-474 細胞またはSK-BR-3細胞である、抗体。 - 請求項1から18までのいずれか一項に記載の抗体において、
T144、T164、R166、P172、G179、S180およびR181、ならびにT144、T164、R166、P172、G179、S180またはR181から約5アミノ酸位置以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、ErbB-2のドメインIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む、抗体。 - 請求項1から19までのいずれか一項に記載の抗体において、
R426およびネイティブErbB-3タンパク質中のR426から11.2オングストローム以内に位置する、表面に露出したアミノ酸残基からなる群から選択される、Er bB-3のドメインIIIの少なくとも1つのアミノ酸に結合する抗原結合部位を含む、抗体。 - 請求項1から20までのいずれか一項に記載の抗体において、
図16Aまたは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849、MF 2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域のCDR3配列を少なくとも含む、抗体。 - 請求項1から21のいずれか一項に記載の抗体において、
図16Bまたは図16Eまたは図37に示されるMF3178、MF3176、MF3 163、MF3099、MF3307、MF6055、MF6056、MF6057、M F6058、MF6059、MF6060、MF6061、MF6062、MF6063、MF6064、MF6065、MF6066、MF6067、MF6068、MF60 69、MF6070、MF6071、MF6072、MF6073およびMF6074からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域のCDR3配列を少なくとも含む、抗体。 - 請求項1から22までのいずれか一項に記載の抗体において、
図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849、M F2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF30 01、MF3003およびMF1898からなる群から選択されるErbB-2特異的重鎖可変領域のCDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含む、またはMF29 26、MF2930、MF1849、MF2973、MF3004、MF3958、MF 2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003もしくはMF1898のCD R1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3アミノ酸、好ましくは多くて2アミノ酸、好ましくは多くて1アミノ酸が異なるCDR配列を含む、抗体。 - 請求項1から23までのいずれか一項に記載の抗体において、
図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178、MF3176、M F3163、MF3099、MF3307、MF6055、MF6056、MF6057、MF6058、MF6059、MF6060、MF6061、MF6062、MF60 63、MF6064、MF6065、MF6066、MF6067、MF6068、MF 6069、MF6070、MF6071、MF6072、MF6073およびMF607 4からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域のCDR1、CDR2およびCDR3配列を少なくとも含む、またはMF3178、MF3176、MF3163、MF3099、MF3307、MF6055、MF6056、MF6057、MF605 8、MF6059、MF6060、MF6061、MF6062、MF6063、MF6 064、MF6065、MF6066、MF6067、MF6068、MF6069、M F6070、MF6071、MF6072、MF6073もしくはMF6074のCDR 1、CDR2およびCDR3配列と、多くて3アミノ酸、好ましくは多くて2アミノ酸、好ましくは多くて1アミノ酸が異なるCDR配列を含む、抗体。 - 請求項1から24のいずれか一項に記載の抗体において、
図16Aもしくは図16Eに示されるMF2926、MF2930、MF1849、M F2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、MF2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF30 01、MF3003およびMF1898の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるE rbB-2特異的重鎖可変領域配列を含む、またはMF2926、MF2930、MF1 849、MF2973、MF3004、MF3958、MF2971、MF3025、M F2916、MF3991、MF3031、MF2889、MF2913、MF1847、MF3001、MF3003もしくはMF1898の重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列を含む、抗体。 - 請求項1から25までのいずれか一項に記載の抗体において、
図16Bもしくは図16Eもしくは図37に示されるMF3178、MF3176、M F3163、MF3099、MF3307、MF6055、MF6056、MF6057、MF6058、MF6059、MF6060、MF6061、MF6062、MF60 63、MF6064、MF6065、MF6066、MF6067、MF6068、MF 6069、MF6070、MF6071、MF6072、MF6073およびMF607 4の重鎖可変領域配列からなる群から選択されるErbB-3特異的重鎖可変領域配列を含む、またはMF3178、MF3176、MF3163、MF3099、MF3307、MF6055、MF6056、MF6057、MF6058、MF6059、MF60 60、MF6061、MF6062、MF6063、MF6064、MF6065、MF 6066、MF6067、MF6068、MF6069、MF6070、MF6071、MF6072、MF6073もしくはMF6074の重鎖可変領域配列と多くて15アミノ酸が異なる重鎖可変領域配列を含む、抗体。 - 請求項1から26までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、抗体依存性細胞介在性細胞傷害(ADCC)を示す、二重特異性抗体。
- 請求項1から27までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、ADCCを増強するために非フコシル化されている、二重特異性抗体。
- 請求項1から28までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、ヒトまたはヒト化抗体である、二重特異性抗体。
- 請求項1から29までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
適合的なヘテロ二量体化ドメインを有する2つの異なる免疫グロブリン重鎖を含む、二重特異性抗体。 - 請求項30に記載の二重特異性抗体において、
前記適合的なヘテロ二量体化ドメインが、適合的な免疫グロブリン重鎖CH3ヘテロ二量体化ドメインである、二重特異性抗体。 - 請求項1から31までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、両方のアームが共通の軽鎖を含む、二重特異性抗体。
- 請求項32に記載の二重特異性抗体において、
前記共通の軽鎖が、生殖系列軽鎖、好ましくは、IgVKl-39遺伝子セグメントを含む再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖、最も好ましくは、再編成された生殖系列ヒト・カッパ軽鎖IgVKl-39*01/IGJKl*01である、二重特異性抗体。 - 請求項1から33までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体において、
標識、好ましくは、in vivo画像化のための標識をさらに含む、二重特異性抗体。 - 請求項1から34までのいずれか一項に記載の二重特異性抗体を含む医薬組成物。
- ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、または前記腫瘍を有するリスクがある対象の処置のための方法であって、
請求項1から35までのいずれか一項に記載の抗体または医薬組成物を対象に投与することを含む方法。 - 請求項1から34までのいずれか一項に記載の抗体において、
ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、または有するリスクがある対象の処置における使用のための抗体。 - 請求項37に記載の、使用のための抗体において、
前記二重特異性抗体は、心筋細胞の生存に顕著に影響を与えない、使用のための抗体。 - 請求項37または38に記載の、使用のための抗体において、
前記二重特異性抗体は、健康な心機能と比較して90%未満の心機能を有する対象への使用のための抗体。 - ErbB-2、ErbB-3もしくはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、または前記腫瘍を有するリスクがある対象の処置のための方法であって、
・ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第 2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体、ならびに
・PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される1または複数の化合物、好ましくは、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、Sr c阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される1または複数の化合物、を対象に投与することを含む方法。 - ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍の処置における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結 合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体であって、
前記処置が、ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫 瘍を有する対象に、前記二重特異性抗体、ならびに、PI3キナーゼ経路の成分の阻害剤、MAPK経路の成分の阻害剤、微小管破壊薬物およびHDAC阻害剤からなる群から選択される少なくとも1つの化合物を投与すること、好ましくは、前記二重特異性抗体、ならびに、チロシン・キナーゼ阻害剤、PI3Ka阻害剤、Akt阻害剤、mTOR阻害剤、 Src阻害剤、ボリノスタットおよびパクリタキセルからなる群から選択される少なくとも1つの化合物を投与することを含む、二重特異性抗体。 - 請求項40または41に記載の使用のための方法または抗体において、
前記チロシン・キナーゼ阻害剤は、アファチニブ、ラパチニブおよび/またはネラチニブを含む、使用のための方法または抗体。 - 請求項40から42までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記PI3K阻害剤がBYL719である、使用のための方法または抗体。 - 請求項40から43までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記Akt阻害剤はMK-2206である、使用のための方法または抗体。 - 請求項40から44までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記mTOR阻害剤がエベロリムスである、使用のための方法または抗体。 - 請求項40から45までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記Src阻害剤はサラカチニブである、使用のための方法または抗体。 - 請求項40から46までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記微小管標的化薬物はパクリタキセルである、使用のための方法または抗体。 - 請求項40から47までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記HDAC阻害剤がボリノスタットである、使用のための方法または抗体。 - ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する対象において転移の形成に対抗するための方法であって、
前記ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞は 、 BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有し、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体を対象に投与することを含む方法。 - ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞の転移の形成の処置または予防における使用のための、ErbB-2に結合する第1の抗原結合部位およびErbB-3に結合する第2の抗原結合部位を含む二重特異性抗体であって、
前記ErbB-2、ErbB-3またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍細胞が 、 BXPC3またはMCF7細胞のヘレグリン発現レベルの少なくとも60%、好ましくは少なくとも70%、より好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%または95%であるヘレグリン発現レベルを有する、二重特異性抗体。 - 請求項36から50までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記対象が、細胞1つ当たり1.000.000未満の細胞表面にあるErbB-2受容体を有するErbB-2またはErbB-2/ErbB-3陽性腫瘍を有する、使用の ための方法または抗体。 - 請求項36から51までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記抗体は、請求項1から34までのいずれか一項に記載の抗体である、使用のための方法または抗体。 - 請求項36から52までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記腫瘍細胞が、乳癌、胃癌、大腸癌、結腸癌、胃食道癌、食道癌、子宮内膜癌、卵巣癌、肝臓癌、非小細胞肺癌を含む肺癌、明細胞肉腫、唾液腺癌、頭頸部癌、脳腫瘍、膀胱癌、膵臓癌、前立腺癌、腎臓癌、皮膚癌または黒色腫の細胞である、使用のための方法または抗体。 - 請求項36から53までのいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記対象が、健康な心機能と比較して90%未満の心機能を有する、使用のための方法または抗体。 - 請求項39または54に記載の使用のための方法または抗体において、
前記心機能が、左室駆出分画(LVEF)を含む、使用のための方法または抗体。 - 請求項39、54または55のいずれか一項に記載の使用のための方法または抗体において、
前記対象は、うっ血性心不全(CHF)、左室機能不全(LVD)および/もしくは1 0%以上減少した左室駆出分画(LVEF)に罹患している、ならびに/または前記対象は、心筋梗塞を有している、使用のための方法または抗体。 - Akt、ERKおよび/またはS6リボソーム・タンパク質のリン酸化に対抗する、好ましくは阻害する、請求項1~34のいずれか一項に記載の抗体の使用。
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