JP2023517660A - シグレック3/cd33に結合させるための材料及び方法 - Google Patents

シグレック3/cd33に結合させるための材料及び方法 Download PDF

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Abstract

本発明は、CD33に結合する抗原結合ドメインを含む骨髄細胞表面抗原CD33タンパク質に結合する抗原結合ドメイン、それらをコードするポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、それらを作製及び使用する方法を提供する。

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2020年3月13日出願の米国仮特許出願第62/989093号明細書、2020年3月13日出願の米国仮特許出願第62/989071号明細書、2020年3月13日出願の米国仮特許出願第62/989120号明細書、2020年3月13日出願の米国仮特許出願第62/989187号明細書及び2020年3月13日出願の米国仮特許出願第62/989230号明細書の優先権を主張する。
本発明は、CD33に結合する抗原結合ドメインを含む骨髄細胞表面抗原CD33タンパク質に結合する抗原結合ドメイン、それらをコードするポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、それらを作製及び使用する方法を提供する。
シアル酸結合免疫グロブリン様レクチン3(シグレック-3)としても知られる骨髄細胞表面抗原CD33は、タンパク質のシアル酸結合ファミリーのメンバーである。CD33は、その細胞外ドメイン(ECD)及び細胞内免疫受容体チロシンベース阻害剤モチーフ(ITIM)モチーフにおいてN末端シアル酸結合ドメインを有するI型一回膜貫通タンパク質である(Uniprot.org)[4]。
正常な細胞において、CD33は、免疫細胞の維持及び細胞-細胞相互作用に関与する[5]。CD33タンパク質は、少なくとも骨髄、肺、皮膚、虫垂、脾臓、リンパ節及び扁桃腺で発現される。CD33mRNAの発現は、骨髄、脳、眼、肺、内分泌組織、唾液腺、食道、胃、結腸、直腸、肝臓、胆嚢、膵臓、腎臓、膀胱、男性及び女性生殖器組織、前立腺、乳房、心臓、平滑筋、骨格筋、脂肪組織、皮膚、胸腺、虫垂、脾臓、リンパ節、扁桃腺、顆粒球及び血液(例えば、PBMC、樹状細胞及びリンパ球)を含むが、限定されない多岐にわたる組織及び臓器で見出されている。例えば、www.proteinatlas.org/ENSG00000105383-CD33/tissueを参照されたい。
CD33は、AML患者の90%で発現され[6]、AML免疫療法に対して最も広く調べられている表面抗原の1つである。抗体-薬物/抗体-毒素複合体、キメラ抗原受容体(CAR)及びT細胞リダイレクト二特異性抗体を含めて、CD33を標的とするためのいくつかのアプローチが調べられている[7]。治療及び診断目的のためのさらなるCD33結合ドメインが必要とされている。
急性骨髄性白血病(AML)は、急速な発症及び進行を特徴とする、骨髄細胞系列の白血病のタイプである[1]。AMLは、不均一な疾患であり、分子変化が広く変動しており、それに併せて臨床転帰が様々である。さらに、AMLは、AML芽細胞又は白血病細胞の自己再生し、継続的に増殖し、免疫系を回避する能力を特徴とし、その結果、少数クローンからの疾患再発が起こる[2]。従って、AMLは、歴史的に、長期生存率が最低であるものの1つであると考えられており、成人AMLの全5年生存率は、約27%である。生存率は、年齢と強く逆相関している[3]。歴史的に、主要なAML治療ストラテジーは、幹細胞移植とともに化学療法を含む。しかし、近年、重要な表面抗原を探索して、AMLに対する免疫療法を開発するために積極的な努力がなされてきた。AML細胞で高発現される表面抗原の1つは、CD33である。
一態様では、本開示は、CD33に結合する単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、
a)配列番号18の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
j)配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
又はそれらのCD33結合断片
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、VHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Fabである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFvである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。
別の態様では、本開示は、CD33に結合する単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHHを含む。
別の態様では、本開示は、CD33に結合する単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;
j)それぞれ配列番号35、42及び51、
k)それぞれ配列番号253、256及び259;
l)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
m)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む。
別の態様では、本開示は、CD33に結合する単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号29、37及び46;
b)それぞれ配列番号32、40及び49;
c)それぞれ配列番号34、43及び51;
d)それぞれ配列番号253、256及び259;
e)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
f)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Fabである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、VHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFvである。いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端で、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLとを含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL;
n)配列番号291のVH及び配列番号271のVL;
o)配列番号292のVH及び配列番号271のVL;
p)配列番号293のVH及び配列番号271のVL;
q)配列番号294のVH及び配列番号271のVL;
r)配列番号295のVH及び配列番号271のVL;
s)配列番号296のVH及び配列番号271のVL;
t)配列番号297のVH及び配列番号271のVL;
u)配列番号298のVH及び配列番号271のVL;
v)配列番号299のVH及び配列番号271のVL;
w)配列番号300のVH及び配列番号271のVL;
x)配列番号301のVH及び配列番号271のVL;
y)配列番号302のVH及び配列番号271のVL;
z)配列番号303のVH及び配列番号271のVL;
aa)配列番号304のVH及び配列番号271のVL;
ab)配列番号305のVH及び配列番号271のVL;
ac)配列番号306のVH及び配列番号271のVL;
ad)配列番号307のVH及び配列番号271のVL;
ae)配列番号308のVH及び配列番号271のVL;
af)配列番号309のVH及び配列番号271のVL;
ag)配列番号310のVH及び配列番号271のVL;
ah)配列番号263のVH及び配列番号311のVL;
ai)配列番号263のVH及び配列番号312のVL;
aj)配列番号263のVH及び配列番号313のVL;
ak)配列番号263のVH及び配列番号314のVL;
al)配列番号263のVH及び配列番号315のVL;
am)配列番号263のVH及び配列番号316のVL;
an)配列番号263のVH及び配列番号317のVL;
ao)配列番号263のVH及び配列番号318のVL;
ap)配列番号263のVH及び配列番号319のVL;
aq)配列番号263のVH及び配列番号320のVL;
ar)配列番号263のVH及び配列番号321のVL;
as)配列番号263のVH及び配列番号322のVL;
at)配列番号263のVH及び配列番号323のVL;
au)配列番号263のVH及び配列番号324のVL;
av)配列番号263のVH及び配列番号325のVL;
aw)配列番号263のVH及び配列番号326のVL;
ax)配列番号263のVH及び配列番号327のVL;
ay)配列番号263のVH及び配列番号328のVL;
az)配列番号263のVH及び配列番号329のVL;
ba)配列番号263のVH及び配列番号330のVL;
bb)配列番号263のVH及び配列番号331のVL;
bc)配列番号263のVH及び配列番号332のVL;
bd)配列番号263のVH及び配列番号333のVL;
be)配列番号263のVH及び配列番号334のVL;
bf)配列番号263のVH及び配列番号335のVL;
bg)配列番号263のVH及び配列番号336のVL;
bh)配列番号337のVH及び配列番号272のVL;
bi)配列番号338のVH及び配列番号272のVL;
bj)配列番号339のVH及び配列番号272のVL;
bk)配列番号340のVH及び配列番号272のVL;
bl)配列番号341のVH及び配列番号272のVL;
bm)配列番号342のVH及び配列番号272のVL;
bn)配列番号343のVH及び配列番号272のVL;
bo)配列番号344のVH及び配列番号272のVL;
bp)配列番号345のVH及び配列番号272のVL;
bq)配列番号346のVH及び配列番号272のVL;
br)配列番号347のVH及び配列番号272のVL;
bs)配列番号348のVH及び配列番号272のVL;
bt)配列番号349のVH及び配列番号272のVL;
bu)配列番号350のVH及び配列番号272のVL;
bv)配列番号351のVH及び配列番号272のVL;
bw)配列番号352のVH及び配列番号272のVL;
bx)配列番号56のVH及び配列番号353のVL;
by)配列番号56のVH及び配列番号354のVL;
bz)配列番号56のVH及び配列番号355のVL;
ca)配列番号56のVH及び配列番号356のVL;
cb)配列番号56のVH及び配列番号357のVL;
cc)配列番号56のVH及び配列番号358のVL;
cd)配列番号56のVH及び配列番号359のVL;
ce)配列番号56のVH及び配列番号360のVL;
cf)配列番号56のVH及び配列番号361のVL;
cg)配列番号56のVH及び配列番号362のVL;
ch)配列番号56のVH及び配列番号363のVL;
ci)配列番号56のVH及び配列番号364のVL;
cj)配列番号56のVH及び配列番号365のVL;
ck)配列番号56のVH及び配列番号366のVL;
cl)配列番号367のVH及び配列番号85のVL;
cm)配列番号368のVH及び配列番号85のVL;
cn)配列番号369のVH及び配列番号85のVL;
co)配列番号370のVH及び配列番号85のVL;
cp)配列番号371のVH及び配列番号85のVL;
cq)配列番号372のVH及び配列番号85のVL;
cr)配列番号373のVH及び配列番号85のVL;
cs)配列番号374のVH及び配列番号85のVL;
ct)配列番号375のVH及び配列番号85のVL;
cu)配列番号376のVH及び配列番号85のVL;
cv)配列番号377のVH及び配列番号85のVL;
cw)配列番号378のVH及び配列番号85のVL;
cx)配列番号379のVH及び配列番号85のVL;
cy)配列番号380のVH及び配列番号85のVL;
cz)配列番号381のVH及び配列番号85のVL;
da)配列番号382のVH及び配列番号85のVL;
db)配列番号53のVH及び配列番号383のVL;
dc)配列番号53のVH及び配列番号384のVL;
dd)配列番号53のVH及び配列番号385のVL;
de)配列番号53のVH及び配列番号386のVL;
df)配列番号53のVH及び配列番号387のVL;
dg)配列番号53のVH及び配列番号388のVL;
dh)配列番号53のVH及び配列番号389のVL;
de)配列番号53のVH及び配列番号390のVL;
df)配列番号53のVH及び配列番号391のVL;
dg)配列番号53のVH及び配列番号392のVL;
dh)配列番号53のVH及び配列番号393のVL;
di)配列番号53のVH及び配列番号394のVL;
dj)配列番号53のVH及び配列番号395のVL;
dk)配列番号53のVH及び配列番号396のVL;
dl)配列番号53のVH及び配列番号397のVL;又は
dm)配列番号53のVH及び配列番号398のVL
を含む。
別の態様では、本開示は、CD33に結合する単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL;
n)配列番号291のVH及び配列番号271のVL;
o)配列番号292のVH及び配列番号271のVL;
p)配列番号293のVH及び配列番号271のVL;
q)配列番号294のVH及び配列番号271のVL;
r)配列番号295のVH及び配列番号271のVL;
s)配列番号296のVH及び配列番号271のVL;
t)配列番号297のVH及び配列番号271のVL;
u)配列番号298のVH及び配列番号271のVL;
v)配列番号299のVH及び配列番号271のVL;
w)配列番号300のVH及び配列番号271のVL;
x)配列番号301のVH及び配列番号271のVL;
y)配列番号302のVH及び配列番号271のVL;
z)配列番号303のVH及び配列番号271のVL;
aa)配列番号304のVH及び配列番号271のVL;
ab)配列番号305のVH及び配列番号271のVL;
ac)配列番号306のVH及び配列番号271のVL;
ad)配列番号307のVH及び配列番号271のVL;
ae)配列番号308のVH及び配列番号271のVL;
af)配列番号309のVH及び配列番号271のVL;
ag)配列番号310のVH及び配列番号271のVL;
ah)配列番号263のVH及び配列番号311のVL;
ai)配列番号263のVH及び配列番号312のVL;
aj)配列番号263のVH及び配列番号313のVL;
ak)配列番号263のVH及び配列番号314のVL;
al)配列番号263のVH及び配列番号315のVL;
am)配列番号263のVH及び配列番号316のVL;
an)配列番号263のVH及び配列番号317のVL;
ao)配列番号263のVH及び配列番号318のVL;
ap)配列番号263のVH及び配列番号319のVL;
aq)配列番号263のVH及び配列番号320のVL;
ar)配列番号263のVH及び配列番号321のVL;
as)配列番号263のVH及び配列番号322のVL;
at)配列番号263のVH及び配列番号323のVL;
au)配列番号263のVH及び配列番号324のVL;
av)配列番号263のVH及び配列番号325のVL;
aw)配列番号263のVH及び配列番号326のVL;
ax)配列番号263のVH及び配列番号327のVL;
ay)配列番号263のVH及び配列番号328のVL;
az)配列番号263のVH及び配列番号329のVL;
ba)配列番号263のVH及び配列番号330のVL;
bb)配列番号263のVH及び配列番号331のVL;
bc)配列番号263のVH及び配列番号332のVL;
bd)配列番号263のVH及び配列番号333のVL;
be)配列番号263のVH及び配列番号334のVL;
bf)配列番号263のVH及び配列番号335のVL;
bg)配列番号263のVH及び配列番号336のVL;
bh)配列番号337のVH及び配列番号272のVL;
bi)配列番号338のVH及び配列番号272のVL;
bj)配列番号339のVH及び配列番号272のVL;
bk)配列番号340のVH及び配列番号272のVL;
bl)配列番号341のVH及び配列番号272のVL;
bm)配列番号342のVH及び配列番号272のVL;
bn)配列番号343のVH及び配列番号272のVL;
bo)配列番号344のVH及び配列番号272のVL;
bp)配列番号345のVH及び配列番号272のVL;
bq)配列番号346のVH及び配列番号272のVL;
br)配列番号347のVH及び配列番号272のVL;
bs)配列番号348のVH及び配列番号272のVL;
bt)配列番号349のVH及び配列番号272のVL;
bu)配列番号350のVH及び配列番号272のVL;
bv)配列番号351のVH及び配列番号272のVL;
bw)配列番号352のVH及び配列番号272のVL;
bx)配列番号56のVH及び配列番号353のVL;
by)配列番号56のVH及び配列番号354のVL;
bz)配列番号56のVH及び配列番号355のVL;
ca)配列番号56のVH及び配列番号356のVL;
cb)配列番号56のVH及び配列番号357のVL;
cc)配列番号56のVH及び配列番号358のVL;
cd)配列番号56のVH及び配列番号359のVL;
ce)配列番号56のVH及び配列番号360のVL;
cf)配列番号56のVH及び配列番号361のVL;
cg)配列番号56のVH及び配列番号362のVL;
ch)配列番号56のVH及び配列番号363のVL;
ci)配列番号56のVH及び配列番号364のVL;
cj)配列番号56のVH及び配列番号365のVL;
ck)配列番号56のVH及び配列番号366のVL;
cl)配列番号367のVH及び配列番号85のVL;
cm)配列番号368のVH及び配列番号85のVL;
cn)配列番号369のVH及び配列番号85のVL;
co)配列番号370のVH及び配列番号85のVL;
cp)配列番号371のVH及び配列番号85のVL;
cq)配列番号372のVH及び配列番号85のVL;
cr)配列番号373のVH及び配列番号85のVL;
cs)配列番号374のVH及び配列番号85のVL;
ct)配列番号375のVH及び配列番号85のVL;
cu)配列番号376のVH及び配列番号85のVL;
cv)配列番号377のVH及び配列番号85のVL;
cw)配列番号378のVH及び配列番号85のVL;
cx)配列番号379のVH及び配列番号85のVL;
cy)配列番号380のVH及び配列番号85のVL;
cz)配列番号381のVH及び配列番号85のVL;
da)配列番号382のVH及び配列番号85のVL;
db)配列番号53のVH及び配列番号383のVL;
dc)配列番号53のVH及び配列番号384のVL;
dd)配列番号53のVH及び配列番号385のVL;
de)配列番号53のVH及び配列番号386のVL;
df)配列番号53のVH及び配列番号387のVL;
dg)配列番号53のVH及び配列番号388のVL;
dh)配列番号53のVH及び配列番号389のVL;
de)配列番号53のVH及び配列番号390のVL;
df)配列番号53のVH及び配列番号391のVL;
dg)配列番号53のVH及び配列番号392のVL;
dh)配列番号53のVH及び配列番号393のVL;
di)配列番号53のVH及び配列番号394のVL;
dj)配列番号53のVH及び配列番号395のVL;
dk)配列番号53のVH及び配列番号396のVL;
dl)配列番号53のVH及び配列番号397のVL;又は
dm)配列番号53のVH及び配列番号398のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Fabである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、VHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFvである。いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、配列番号203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276の何れか1つのアミノ酸配列を含む。特に、配列番号213、216、219、274、275又は276のアミノ酸配列である。
別の態様では、本開示は、骨髄CD33に結合する単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
i)配列番号196のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号89、90及び92;
b)それぞれ配列番号89、90及び93;
c)それぞれ配列番号33、91及び94、
d)それぞれ配列番号167、168及び169;
e)それぞれ配列番号172、173及び174;
f)それぞれ配列番号176、177及び178;
g)それぞれ配列番号89、90及び180;又は
h)それぞれ配列番号89、90及び93
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
別の態様では、本開示は、請求項32又は33に記載の単離タンパク質を提供し、この単離タンパク質は、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Fabである。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、VHHである。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFvである。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
別の態様では、本開示は、CD33に結合する単離タンパク質を提供し、単離タンパク質は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Fabである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、VHHである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、scFvである。いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。いくつかの実施形態では、L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
本開示は、上記の何れかの単離タンパク質を提供し、このタンパク質は、半減期延長部分に複合化される。いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン又はポリエチレングリコールである。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、単一特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、多特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、免疫グロブリン(Ig)定常領域又はそのIg定常領域の断片をさらに含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端に複合化される。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端に複合化される。いくつかの実施形態では、単離タンパク質は、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化される。いくつかの実施形態では、L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、リンパ球は、T細胞である。いくつかの実施形態では、T細胞は、CD8T細胞である。いくつかの実施形態では、リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号141の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプである。いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への本タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、FcγRへの本タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、FcγRへの本タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、FcγRへの本タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片のIg定常領域は、本タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、本タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、本タンパク質は、Ig定常領域のCH3ドメインにおいて少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。
本開示は、上記の何れかの単離タンパク質を提供し、このタンパク質は、キメラ抗原受容体(CAR)である。いくつかの実施形態では、CARは、
a)上記の単離タンパク質の何れかを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む。
いくつかの実施形態では、CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む。いくつかの実施形態では、
a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む。
いくつかの実施形態では、
a)CD8aヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分又はそれらの何れかの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む。
別の態様では、本開示は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインとを含む単離された多特異性タンパク質を提供する。いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、T細胞抗原である。いくつかの実施形態では、T細胞抗原は、CD8T細胞抗原である。いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、NK細胞抗原である。いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cである。特定の実施形態では、リンパ球抗原は、CD3εである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む。いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。いくつかの実施形態では、L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4又は5の何れか1つのHCDR1、配列番号6、7、8、9、10又は11の何れか1つのHCDR2及び配列番号12、13、14、15、16又は17の何れか1つのHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34又は35のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43又は44のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50又は51のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67又は68のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73又は74のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79又は80のLCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLとを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197又は201のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;又は
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号141のHCDR1、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144のLCDR1、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第2のIg定常領域の断片に複合化される。特定の実施形態では、多特異性タンパク質は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む。いくつかの実施形態では、L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである。いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への本多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、FcγRへの本多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである。いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、本多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、単離された多特異性タンパク質は、第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異を含む。いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメイン若しくは第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の突然変異を含む:
a)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
b)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V。
本開示は、治療剤又は造影剤に複合化される上記単離タンパク質の何れかを含む免疫複合体を提供する。本開示は、上記単離タンパク質の何れかと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物を提供する。本開示は、上記単離タンパク質の何れかをコードするポリヌクレオチドを提供する。本開示は、上記単離タンパク質の何れかをコードするポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。本開示は、上記単離タンパク質の何れかをコードするポリヌクレオチドを含むベクターを含む宿主細胞も提供する。
別の態様では、本開示は、上記単離タンパク質の何れかを産生する方法を提供し、この方法は、このタンパク質が発現される条件で宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を回収することとを含む。別の態様では、本開示は、治療剤又は造影剤に複合化される上記単離された多特異性タンパク質の何れかを含む免疫複合体を提供する。
別の態様では、本開示は、上記単離された多特異性タンパク質の何れかを産生する方法を提供し、この方法は、この多特異性タンパク質が発現される条件で上記何れかの宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生される多特異性タンパク質を回収することとを含む。
別の態様では、本開示は、対象においてCD33を発現する癌を処置する方法を提供し、この方法は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の上記単離タンパク質の何れか、上記単離された多特異性タンパク質の何れか、上記免疫複合体の何れか又は上記医薬組成物の何れかを投与することを含む。
別の態様では、本開示は、対象においてCD33発現細胞の量を減少させる方法を提供し、この方法は、CD33発現細胞の量を減少させるために十分な時間にわたり、対象に上記単離タンパク質の何れか、上記単離された多特異性タンパク質の何れか、上記免疫複合体の何れか又は上記医薬組成物の何れかを投与することを含む。いくつかの実施形態では、CD33発現細胞は、癌性細胞である。いくつかの実施形態では、CD33発現細胞は、癌性細胞ではない。
別の態様では、本開示は、対象においてCD33発現癌の確立を予防する方法を提供し、この方法は、対象においてCD33発現癌の確立を予防するために、上記単離タンパク質の何れか、上記単離された多特異性タンパク質の何れか、上記免疫複合体の何れか又は上記医薬組成物の何れかを対象に投与することを含む。
別の態様では、本開示は、CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法を提供し、この方法は、非癌性状態を処置するために、上記単離タンパク質の何れか、上記単離された多特異性タンパク質の何れか、上記免疫複合体の何れか又は上記医薬組成物の何れかを対象に投与することを含む。
上記3つの態様のいくつかの実施形態では、CD33発現癌は、血液癌である。いくつかの実施形態では、血液癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。いくつかの実施形態では、単離タンパク質又は単離された多特異性タンパク質は、第2の治療剤と組み合わせて投与される。いくつかの実施形態では、第2の治療剤は、手術、化学療法若しくは放射線又はそれらの任意の組み合わせである。本開示は、対象において血液癌の存在を検出する方法も提供し、この方法は、血液癌を有することが疑われる対象に上記免疫複合体の何れかを投与し、免疫複合体が結合される生物学的構造を可視化し、それにより血液癌の存在を検出することを含む。
本開示は、上記単離タンパク質の何れか、上記単離された多特異性タンパク質の何れか、上記免疫複合体の何れか又は上記医薬組成物の何れかを含むキットも提供する。
本開示は、上記単離タンパク質の何れかに結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本開示は、
a)CD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含むキメラ抗原受容体(CAR)も提供する。
いくつかの実施形態では、CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む。
a)いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む。
いくつかの実施形態では、
a)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4又は5の何れか1つのHCDR1、配列番号6、7、8、9、10又は11の何れか1つのHCDR2及び配列番号12、13、14、15、16又は17の何れか1つのHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34、35、253、254又は255のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43、44、256、257又は258のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50、51、259、260又は261のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67、68、265又は266のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73、74、267又は268のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79、80、269又は270のLCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273のVLとを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL、
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197又は201のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;又は
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、VHHである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、scFvである。
いくつかの実施形態では、scFvは、VLとVHとの間に第1のリンカー(L1)を含む。
特定の実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARの細胞外ドメインは、シグナルポリペプチドをさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む。いくつかの実施形態では、CD137構成成分は、配列番号163のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD3z構成成分は、配列番号164のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号165のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD8a-TMポリペプチドは、配列番号162のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CARは、多特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、リンパ球は、T細胞である。いくつかの実施形態では、T細胞は、CD8T細胞である。いくつかの実施形態では、リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号141の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む。
別の態様では、本開示は、上記のCARの何れかを発現する単離されたリンパ球を提供する。いくつかの実施形態では、リンパ球は、Tリンパ球である。いくつかの実施形態では、リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である。別の態様では、本開示は、上記CARの何れかをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。本開示は、上記CARの何れかをコードする単離ポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。本開示は、単離されたポリヌクレオチド又はベクターを含む宿主細胞を提供する。本開示は、上記リンパ球の何れかと、薬学的に許容可能な賦形剤とを含む医薬組成物も提供する。
別の態様では、本開示は、CD33発現癌を有する対象を処置する方法を提供し、この方法は、それを必要とする対象に治療的有効量の上記リンパ球の何れかを投与することを含み、それにより、リンパ球は、対象においてCD33発現癌の死滅を媒介する。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、血液癌である。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。
別の態様では、癌細胞の標的化された死滅の方法が提供され、この方法は、癌細胞を上記リンパ球の何れかと接触させることを含み、それにより、リンパ球は、癌細胞の標的化された死滅を誘導する。いくつかの実施形態では、癌細胞は、血液癌である。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。
別の態様では、対象において癌の存在を検出する方法が提供され、この方法は、
a)対象から得られた細胞試料を上記CARの何れかと接触させ、それによりCAR-細胞複合体を形成することと、
b)CAR-細胞複合体を検出することであって、CAR-細胞複合体の検出は、対象における癌の存在を示す、検出することと
を含む。
いくつかの実施形態では、癌細胞は、血液癌である。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。
別の態様では、放射活性剤に複合化される上記単離タンパク質の何れかを含む免疫複合体が提供される。いくつかの実施形態では、放射活性剤は、放射性金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、放射性金属イオンは、32P、47Sc、67Cu、77As、89Sr、90Y、99Tc、105Rh、109Pd、111Ag、131I、153Sm、159Gd、165Dy、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、194Ir、198Au、199Au、211At、212Pb、212Bi、213Bi、223Ra、225Ac、255Fm、227Th、62Cu、64Cu、67Ga、68Ga、86Y、89Zr又は111Inである。特定の実施形態では、放射性金属イオンは、225Ac、111In又は89Zrである。特定の実施形態では、放射性金属イオンは、225Acである。いくつかの実施形態では、免疫複合体の放射性金属イオンは、キレート部分に複合化される。いくつかの実施形態では、キレート部分は、式(I):
Figure 2023517660000001

(式中、R、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキルであり;及び
Zは、(CH2)Yであり、
nは、1~10であり、及び
Yは、第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分又は求核部分であり;
代わりに、Zは、水素であり;及び
、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキル又は第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分若しくは求核部分である)
の構造を有する大環状分子を含み;
代わりに、キレート剤は、開鎖リガンドを含む。
いくつかの実施形態では、キレート部分は、式(II):
Figure 2023517660000002

の構造又は式(III)
Figure 2023517660000003

の構造を有する大環状分子を含む。
本開示は、式(IV)
Figure 2023517660000004

(式中、タンパク質は、上記の単離タンパク質の何れかである)
の免疫複合体も提供する。
本開示は、式(V)
Figure 2023517660000005

(式中、タンパク質は、上記単離タンパク質の何れかである)
の免疫複合体も提供する。
本開示は、対象においてCD33発現癌を処置するための手段を含む医薬組成物を提供する。
本開示は、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させるための手段を含む医薬組成物を提供する。
本開示は、対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む医薬組成物を提供する。
本開示は、CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む医薬組成物を提供する。
本開示は、対象においてCD33発現癌を処置する方法を提供し、この方法は、対象においてCD33発現癌細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む。
本開示は、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法を提供し、この方法は、対象においてCD33発現腫瘍細胞の1つ以上に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む。
本開示は、対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む医薬組成物を提供し、この方法は、対象においてCD33発現細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む。
本開示は、CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む医薬組成物を提供し、この方法は、対象においてCD33発現細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む。
本特許出願ファイルは、色彩を付して作成された少なくとも1つの図面を含む。カラー図面を伴う本特許出願の写しは、請求及び必要な手数料の納付により、特許庁により提供されるであろう。
huCD33抗原(FL ECD及びIgC2ドメイン)に対する抗CD33vHH相互作用の代表的なBIAcore 8Kセンソグラムを示す。 (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) 図2A及び2Bは、標的細胞株に対するCD33抗体の結合を示す。グラフは、4℃での抗ヒトCD33抗体の非線形回帰プロファイルを示す。中央値蛍光強度(MFI)対抗体のlog濃度をプロットする。4℃でこの抗体の連続希釈物とともに細胞を温置することによって結合を行い、続いてPE結合ヤギF(ab’)2抗ヒトIgG-Fc抗体で検出した。各細胞株に対する上位ヒットは、赤色で示され、リンツズマブ結合は、青色の曲線で示される。 (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) 標的細胞株への異なるCD33抗体の時間及び温度依存性の結合を示す。グラフは、37℃及び4℃での抗ヒトCD33抗体の結合の非線形回帰プロファイルを示す。中央値蛍光強度(MFI)対抗体のlog濃度をプロットする。37℃及び4℃で直接複合化抗体の連続希釈物とともに細胞を温置することによって結合を実施した。 (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) 図4A~4Dは、高発現、中程度発現及び低発現標的細胞株におけるCD33抗体の内部移行を示す。96時間にわたりプロテインA-MMAFと一緒にCD33抗体の連続希釈物とともに細胞を培養した。96時間後、CellTitre-Glo試薬を細胞に添加し、細胞生存能を測定した。プロテインA-MMAFのみが入ったウェルを100%生存可能とみなした。発現細胞株なしとしてHDLM-2細胞を使用した。細胞生存能の低下は、抗体の内部移行を示す。グラフは、抗体のlog濃度に対する細胞生存能に対する非線形回帰分析を示す。 (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) CD33抗体内部移行の動態を示す。CD33抗体をpHAb色素で標識し、37℃で指定の時間にわたり100nMの濃度で細胞とともに温置し、その後、細胞を洗浄し、フローサイトメーター上で捕捉した。グラフは、指定される時間点でのMFI値を示す。 (上記の通り。) (上記の通り。) 標的細胞株上でのCD33発現を示す。Biolegendからの抗ヒトCD33抗体を使用して、高、中及び低CD33発現細胞株を同定した。抗体(オレンジ色のヒストグラム)又はマウスIgGアイソタイプ対照(青色のヒストグラム)でMOLM-13、Kasumi-1、OCI-AML-3及びHDLM2細胞を染色し、各細胞株に対するアイソタイプに対する倍率変化を計算した。 (上記の通り。) (上記の通り。) pHAb色素との抱合反応後の抗体の完全性及びDAR値を示す。pHAb色素で抗体を標識し、SDS-PAGE上で分析した。280及び530nmでのODを測定し、280nmでの色素吸収に対して補正することにより、薬物対抗体比(DAR)を計算した。 (上記の通り。) 図8A及び8Bは、pHAbが介在する抗体内部移行の動態決定の特異性を示す。図8Aにおいて、pHAb色素でCD33抗体を標識し、指定の時間点にわたり4℃において100nMの濃度でKasumi-1又はOCI-AML-3細胞とともに温置し、その後、細胞を洗浄し、フローサイトメーター上で捕捉した。グラフは、指定される時間点でのMFI値を示す。4Cでは、内部移行は、観察されなかった。図8Bにおいて、37℃でHDLM-2細胞とも抗体を温置した。MFIの上昇は、観察されなかった。 (上記の通り。) (上記の通り。) (上記の通り。) 高(MOLM-13)、中(Kasumi-1)及び低(OCI-AML-3)細胞株に対するCD33抗体の結合EC50値のまとめを示す。本抗体の連続希釈物を用いて4℃で結合を遂行した。 様々な標的細胞株におけるCD33抗体内部移行のまとめを示す。MOLM-13及びOCI-AML-3に対してEC50値を示す。Kasumi-1に対する、100nM濃度での%生存能。 CD33+である癌細胞にγδT細胞を動員するため及び癌細胞死を誘導するための、抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体の結合を示す概略図を示す。 SDS-PAGE(非還元)ゲルによるVG4二特異性抗体の完全性のアッセイの結果を示す。 腫瘍細胞株のパネルに対する抗CD33抗体(クローンC33B904)の結合のアッセイの結果がFACSによって測定されたことを示す。MOLM-13(高い受容体密度)に対するEC50は、134.3nMであった。 腫瘍細胞株のパネルに対する抗CD33抗体(クローンC33B904)の結合のアッセイの結果がFACSによって測定されたことを示す。Kasumi-1(中程度の密度)に対するEC50は、82.2nMであった。 腫瘍細胞株のパネルに対する抗CD33抗体(クローンC33B904)の結合のアッセイの結果がFACSによって測定されたことを示す。OCI-AML-3(低い表面密度)に対するEC50は、16.4nMであった。 抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体がインビトロでCD33発現Kasumi-3細胞に対するγδT細胞の細胞傷害性に介在することを示す実験の結果を示す。この実験において、12日間にわたりゾレドロン酸+IL-2+IL-15で培養されたPBMCから単離された濃縮γδT細胞(エフェクター)をCFSE標識されたKasumi-3細胞(標的)と1:1のE:T比で様々な濃度の二特異性抗体の存在下において24時間にわたり同時培養した。用量反応曲線は、CD33発現kasumi-3細胞に対する、1:1 E:T比での用量依存的な、抗TRGV9/抗CD33及び抗TRGV9/抗NULL二特異性抗体が介在するγδT細胞の細胞傷害性を示す。ここで与えられる細胞傷害性値から、二特異性抗体非存在下で観察された基底細胞傷害性値を差し引いた。方法に記載されるようにEC50値を計算した。ここで示される代表的なデータは、単一の実験からのものである。 抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体がインビトロでCD33発現Kasumi-3細胞に対するγδT細胞の細胞傷害性に介在することを示す実験の結果を示す。この実験において、12日間にわたりゾレドロン酸+IL-2+IL-15で培養されたPBMCから単離された濃縮γδT細胞(エフェクター)をCFSE標識されたKasumi-3細胞(標的)と5:1のE:T比で様々な濃度の二特異性抗体の存在下において24時間にわたり同時培養した。用量反応曲線は、CD33発現kasumi-3細胞に対する、5:1 E:T比での用量依存的な、抗TRGV9/抗CD33及び抗TRGV9/抗NULL二特異性抗体が介在するγδT細胞の細胞傷害性を示す。ここで与えられる細胞傷害性値から、二特異性抗体非存在下で観察された基底細胞傷害性値を差し引いた。方法に記載されるようにEC50値を計算した。ここで示される代表的なデータは、単一の実験からのものである。 抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体が、インビトロでCD33発現Kasumi-3細胞に対するγδT細胞の細胞傷害性に介在することを示す実験の結果を示す。12日間にわたりゾレドロン酸+IL-2+IL-15で培養した健康なドナー由来のPBMC(エフェクター)を1:1のE:T比でCFSE標識したKasumi-3細胞(標的)とともに様々な濃度の二特異性抗体の存在下で24時間にわたり同時培養した。 潜在的な翻訳後修飾(PTM)リスクのインシリコ分析を示す。いくつかの潜在的なPTMリスクモチーフ(DG、NG、DP)を強調する。 C33B1475(配列番号274)に基づくNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を評価するためのアッセイの結果を示す。熱安定性を評価するために各変異体においてELISAを行った。E.コリ(E.coli)上清を55C、60C、65Cで熱処理し、同じクローンの未処理室温に対して発光シグナルを正規化した。 C33B1516(配列番号275)に基づくNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を評価するためのアッセイの結果を示す。熱安定性を評価するために各変異体においてELISAを行った。E.コリ(E.coli)上清を55C、60C、65Cで熱処理し、同じクローンの未処理の室温に対して発光シグナルを正規化した。 C33B1517(配列番号216)に基づくNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を評価するためのアッセイの結果を示す。熱安定性を評価するために各変異体においてELISAを行った。E.コリ(E.coli)上清を55C、60C、65Cで熱処理し、同じクローンの未処理室温に対して発光シグナルを正規化した。 C33B1522(配列番号213)に基づくNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を評価するためのアッセイの結果を示す。熱安定性を評価するために各変異体においてELISAを行った。E.コリ(E.coli)上清を55C、60C、65Cで熱処理し、同じクローンの未処理室温に対して発光シグナルを正規化した。 NNKライブラリのライブラリスクリーニング中に同定された変異体VH及びVL配列を列挙する表である。 (上記の通り。)
本開示の方法は、本開示の一部を形成する、添付の図面に関連して解釈される以下の詳細な説明を参照することによってより容易に理解され得る。開示される方法が、本明細書中に記載され及び/又は示された特定の方法に限定されないこと、及び本明細書中で使用される用語は、単に例として特定の実施形態を記載する目的のものであり、特許請求の範囲に記載の方法を限定するものではないことが理解されるべきである。
本明細書で引用されている全ての特許、公開済みの特許出願及び刊行物は、本明細書に完全に記載されているかのように、参照により組み込まれる。
リストが提示されている場合、別段の記載がない限り、そのリストの個々の各要素、及びそのリストの全ての組み合わせが、別々の実施形態であることが理解されることになる。例えば、「A、B又はC」として示される実施形態のリストは、実施形態「A」、「B」、「C」、「A又はB」、「A又はC」、「B又はC」又は「A、B又はC」を含むものとして解釈されることになる。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」及び「その」は、文脈上、明らかにそうではないことが示されていない限り、複数の指示対象を含む。従って、例えば「細胞」に対する言及は、2つ以上の細胞の組み合わせなどを含む。
接続句「含む」、「から本質的になる」及び「からなる」は、特許用語においてそれらの一般的に受け入れられる意味を含むことが意図され;即ち、(i)「包含する」、「含有する」又は「特徴とする」と同義である「含む」は、包括的又はオープンエンドであり、追加の列挙されていない要素又は方法段階を排除せず;(ii)「からなる」は、特許請求の範囲において特定されていない任意の要素、段階又は成分を排除し;(iii)「から本質的になる」は、特許請求される本発明の特定された材料又は段階「及び基本的な及び新規の特徴に実質的に影響を及ぼさないもの」に特許請求の範囲を限定する。語句「含む」(又はその均等物)という用語において記載される実施形態は、実施形態として、「からなる」及び「から本質的になる」という用語において独立して記載されるものも提供する。
「約」は、当業者により決定される場合、特定の値に対する許容可能なエラーの範囲内を意味し、これは値がどのように測定又は決定されるか、即ち測定系の限界、に一部依存する。特定のアッセイ、結果又は実施形態に関連して本明細書中の実施例又は他の部分内で別段明らかに述べられない限り、「約」は、当技術分野における実践を通して1標準偏差内又は最大5%の範囲のより大きい方を意味する。
「活性化」又は「刺激」又は「活性化される」又は「刺激される」は、活性化マーカーの発現、サイトカイン産生、増殖又は標的細胞の細胞傷害性の媒介を生じさせる細胞の生物学的状態における変化の誘導を指す。細胞は、一次刺激シグナルにより活性化され得る。同時刺激シグナルは、一次シグナルの大きさを増幅し、一次刺激後の細胞死を抑制し得、その結果、活性化状態がより耐久性になり、従って細胞傷害能がより高くなる。「同時刺激シグナル」は、TCR/CD3連結など、一次シグナルと組み合わせて、T細胞及び/又はNK細胞増殖及び/又はキー分子の上方制御又は下方制御につながるシグナルを指す。
「代替的な骨格」は、高い立体構造耐性の可変ドメインと関連する構造化されたコアを含有する単鎖タンパク質フレームワークを指す。可変ドメインは、骨格の完全性を損なわずに導入しようとする変動を許容し、故に可変ドメインが特異的な抗原への結合のために改変され、選択され得る。
「抗体依存性細胞傷害性」、「抗体依存性細胞介在性細胞傷害性」又は「ADCC」は、エフェクター細胞上で発現されるFcガンマ受容体(FcγR)を介した、ナチュラルキラー細胞(NK)、単球、マクロファージ及び好中球などの溶解活性を保持するエフェクター細胞との、抗体に被覆された標的細胞の相互作用に依存する細胞死を誘導する機序を指す。
「抗体依存性細胞食作用」又は「ADCP」は、マクロファージ又は樹状細胞などの貪食細胞による内部移行による、抗体に被覆された標的細胞の排除の機序を指す。
「抗原」は、免疫反応に介在可能である抗原結合ドメイン又はT細胞受容体が結合可能な何れかの分子(例えばタンパク質、ペプチド、多糖類、糖タンパク質、糖脂質、核酸、それらの一部又はそれらの組み合わせ)を指す。代表的な免疫反応としては、抗体産生及びT細胞、B細胞又はNK細胞などの免疫細胞の活性化が挙げられる。抗原は、遺伝子により発現されるか、合成されるか、又は他の生体構成成分、生物、タンパク質/抗原のサブユニット、死んだ若しくは不活性化された全細胞又は溶解液を伴う、組織試料、腫瘍試料、細胞又は体液などの生体試料から精製され得る。
「抗原結合断片」又は「抗原結合ドメイン」は、抗原に結合するタンパク質の一部を指す。抗原結合断片は、合成、酵素的に入手可能又は遺伝子操作されたポリペプチドであり得、VH、VL、VH及びVL、Fab、Fab’、F(ab’)、Fd及びFv断片など、抗原に結合する免疫グロブリンの部分を含み、ドメイン抗体(dAb)は、1つのVHドメイン又は1つのVLドメイン、サメ可変IgNARドメイン、ラクダ化VHドメイン、VHHドメイン、抗体のCDRを模倣するアミノ酸残基からなる最小認識単位、例えばFR3-CDR3-FR4部分など、HCDR1、HCDR2及び/又はHCDR3及びLCDR1、LCDR2及び/又はLCDR3、抗原に結合する代替的な骨格及び抗原結合断片を含む多特異性タンパク質からなる。合成リンカーを介して抗原結合断片(VH及びVLなど)を一緒に連結して、様々なタイプの単一抗体設計を形成し得、ここで、VH/VLドメインは、分子内又は別々の1本鎖によりVH及びVLドメインが発現される場合には分子間で対合して、単鎖Fv(scFv)又はダイアボディなど、一価抗原結合ドメインを形成し得る。抗原結合断片は、二特異性及び多特異性タンパク質を操作するために、単一特異性又は多特異性であり得る、他の抗体、タンパク質、抗原結合断片又は代替的な骨格にも複合化され得る。
「抗体」は、広義の意味を有し、マウス、ヒト、ヒト化及びキメラモノクローナル抗体を含むモノクローナル抗体を含む免疫グロブリン分子、抗原結合断片、多特異性抗体、例えば二特異性、三特異性、四特異性など、二量体、四量体又は多量体抗体、単鎖抗体、ドメイン抗体及び、必要とされる特異性の抗原結合部位を含む免疫グロブリン分子の何らかの他の修飾された立体配置を含む。「全長抗体」は、ジスルフィド結合により鎖間連結される2本の重鎖(HC)及び2本の軽鎖(LC)並びにその多量体から構成される(例えばIgM)。各重鎖は、重鎖可変領域(VH)及び重鎖定常領域から構成される(ドメインCH1、ヒンジ、CH2及びCH3から構成される)。各軽鎖は、軽鎖可変領域(VL)及び軽鎖定常領域(CL)から構成される。VH及びVL領域は、フレームワーク領域(FR)が散在する、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変性の領域にさらに細分類され得る。各VH及びVLは、3つのCDR及び4つのFRセグメントから構成され、以下の順序でアミノ末端からカルボキシ末端へ配置される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及びFR4。免疫グロブリンは、重鎖定常ドメインアミノ酸配列に依存して、5つの主要なクラス、IgA、IgD、IgE、IgG及びIgMに割り当てられ得る。IgA及びIgGは、アイソタイプIgA1、IgA2、IgG1、IgG2、IgG3及びIgG4にさらに細分類される。何れの脊椎動物種の抗体軽鎖も、その定常ドメインのアミノ酸配列に基づき、2つの明確に異なるタイプ、即ち、カッパ(κ)及びラムダ(λ)の一方に割り当てられ得る。
「二特異性」は、2つの個別の抗原又は同じ抗原内の2つの個別のエピトープと特異的に結合する分子(抗体など)を指す。二特異性分子は、他の関連抗原と、例えば他の種、例えばヒト若しくはサル、例えばマカカ・シノモルグス(Macaca cynomolgus)(カニクイザル、cyno)若しくはパン・トログロディテス(Pan troglodytes)由来の同じ抗原(相同体)と交差反応性を有し得るか、又は2つ以上の個別の抗原の間で共通するエピトープに結合し得る。
「癌」は、身体における異常細胞の無制御増殖を特徴とする様々な疾患の広い群を指す。無制御細胞分裂及び増殖の結果、隣接組織に侵入し、リンパ系又は血流を通して身体の遠隔部分にも転移し得る悪性腫瘍が形成される。「癌」又は「癌組織」は腫瘍を含み得る。
「キメラ抗原受容体」(CAR)は、本明細書中で使用される場合、全て天然では単一タンパク質上で一緒には見られない組み合わせで、細胞外標的結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞表面受容体として定義される。これは、細胞外ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインが単一受容体タンパク質上で天然では一緒に見られない受容体を含む。CARは、T細胞及びナチュラルキラー(NK)細胞などのリンパ球との使用のために主に意図される。
「補体依存性細胞傷害性」又は「CDC」は、標的結合タンパク質のFcエフェクタードメインが補体構成成分C1qに結合し、活性化し、これが順に標的細胞死につながる補体カスケードを活性化する、細胞死を誘導する機序を指す。補体の活性化の結果、また、白血球上での補体受容体(例えばCR3)に結合することによりCDCを促進する標的細胞表面上での補体構成成分の沈着も起こり得る。
「相補性決定領域」(CDR)は、抗原に結合する抗体領域である。VHにおいて3つのCDR(HCDR1、HCDR2、HCDR3)があり、VLにおいて3つのCDR(LCDR1、LCDR2、LCDR3)がある。CDRは、Kabat;Wu et al.(1970)J Exp Med 132:211-50;Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.,1991)、Chothia(Chothia et al.(1987)J Mol Biol 196:901-17)、IMGT(Lefranc et al.(2003)Dev Comp Immunol 27:55-77)、AbM(Martin and Thornton J Bmol Biol 263:800-15,1996)及び利用可能な複合結晶構造の解析に基づくContact(MacCallum,R.M.,Martin,A.C.R.and Thornton,J.T.“Antibody-antigen interactions:Contact analysis and binding site topography”J.Mol.Biol.262:732-745)などの様々な説明を使用して定められ得る。様々な説明と可変領域付番との間の対応が記載される(例えば、Lefranc et al.(2003)Dev Comp Immunol 27:55-77;Honegger and Pluckthun,J Mol Biol(2001)309:657-70;International ImMunoGeneTics(IMGT)データベース;Webソース、www.imgt.orgを参照されたい)。UCL Business PLCによるabYsisなどの利用可能なプログラムを使用して、CDRを描写し得る。「CDR」、「HCDR1」、「HCDR2」、「HCDR3」、「LCDR1」、「LCDR2」及び「LCDR3」という用語は、本明細書中で使用される場合、本明細書中で明確に述べられない限り、上記の、Kabat、Chothia、IMGT、AbM又はContactで記載される方法の何れかにより定められるCDRを含む。配列番号1~17、28~51、62~80、89~94、98~104、141~146、149~154、167~169、172~174、176~178、180、182~184、186、187、189~191、193~195、197~199、201、236~244、253~261及び265~270を有する配列のCDRは、Kabatに従って定められる。配列番号399~434の配列のCDRは、AbMに従って定められる。配列番号435~470の配列のCDRは、Chothiaに従って定められる。配列番号471~506の配列のCDRは、IMGTに従って定められる。配列番号507~542の配列のCDRは、Contactに従って定められる。
「減少させる」、「下げる」、「低下させる」、「低減させる」又は「軽減する」は、一般に、対照又はビヒクルが介在する反応と比較した場合に反応低下(即ち、下流効果)に介在する試験分子の能力を指す。代表的な反応は、T細胞拡大増殖、T細胞活性化又はT細胞介在性の腫瘍細胞死滅又はその抗原若しくは受容体に対するタンパク質の結合、Fcγへの結合促進又はADCC、CDC及び/又はADCP促進などのFcエフェクター機能促進である。低下は、試験分子と対照(又はビヒクル)との間の反応測定値の統計学的に有意な結果又は約1.1、1.2、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20若しくは30倍又はそれを超える、例えば500、600、700、800、900若しくは1000倍又はそれを超える(全ての整数及びその間の小数点及び1を上回る、例えば、1.5、1.6、1.7、1.8などを含む)低下などの反応測定値の低下であり得る。
「分化」は、細胞の効力又は増殖を低下させるか又はより発生学的に制限された状態へ細胞を移動させる方法を指す。
「コードする」又は「コードすること」は、ヌクレオチド(例えば、rRNA、TRNA及びmRNA)の定められる配列又はアミノ酸の定められる配列及びそれからの結果の生物学的特性の何れかを有する生物学的過程における他のポリマー及び巨大分子の合成のための鋳型として働くための、遺伝子、cDNA又はmRNAなどのポリヌクレオチドにおけるヌクレオチドの特異的な配列の固有の特性を指す。従って、遺伝子、cDNA又はRNAは、その遺伝子に対応するmRNAの転写及び翻訳が細胞又は他の生体系におけるタンパク質を生成させる場合、タンパク質をコードする。mRNA配列と同一であるヌクレオチド配列であるコード鎖及び、遺伝子又はcDNAの転写のための鋳型として使用される非コード鎖の両方が、その遺伝子又はcDNAのタンパク質又は他の生成物をコードするものと呼ばれ得る。
「増強する」、「促進する」、「上昇させる」、「拡大する」又は「改善する」は、一般に、対照又はビヒクルにより媒介される反応と比較した場合、試験分子がより大きい反応(即ち下流効果)を媒介する能力を指す。代表的な反応は、T細胞拡大増殖、T細胞活性化又はT細胞介在性腫瘍細胞死滅又はその抗原若しくは受容体へのタンパク質の結合、Fcγへの結合増強又はFcエフェクター機能の増強、例えばADCC、CDC及び/又はADCPの増強などである。増強は、試験分子と対照(又はビヒクル)との間での測定された反応の統計学的に有意な差、又は約1.1、1.2、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20若しくは30倍又はそれを超える、例えば500、600、700、800、900若しくは1000倍又はそれを超える(全ての整数及びその間にあり1を上回る小数点、例えば、1.5、1.6、1.7、1.8などを含む)上昇などの測定された反応の上昇である。
「拡大増殖」は細胞分裂及び細胞死の結果を指す。
「発現する」及び「発現」は、細胞で又はインビトロで起こる周知の転写及び翻訳を指す。発現産物、例えば本タンパク質は、このように細胞により又はインビトロで発現され、細胞内、細胞外又は膜貫通タンパク質であり得る。
「発現ベクター」は、発現ベクター中に存在するポリヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドの翻訳を指示するために、生体系において又は再構成された生体系において利用され得るベクターを指す。
「dAb」又は「dAb断片」は、VHドメインから構成される抗体断片を指す(Ward et al.,Nature 341:544 546(1989))。
「Fab」又は「Fab断片」は、VH、CH1、VL及びCLドメインから構成される抗体断片を指す。
「F(ab’)」又は「F(ab’)断片」は、ヒンジ領域においてジスルフィド架橋により連結される2つのFab断片を含有する抗体断片を指す。
「Fd」又は「Fd断片」は、VH及びCH1ドメインから構成される抗体断片を指す。
「Fv」又は「Fv断片」は、抗体の単一アームからのVH及びVLドメインから構成される抗体断片を指す。
「全長抗体」は、ジスルフィド結合により鎖間連結される2本の重鎖(HC)及び2本の軽鎖(LC)並びにその多量体(例えばIgM)から構成される。各重鎖は、重鎖可変ドメイン(VH)及び重鎖定常ドメインから構成され、重鎖定常ドメインはサブドメインCH1、ヒンジ、CH2及びCH3から構成される。各軽鎖は、軽鎖可変ドメイン(VL)及び軽鎖定常ドメイン(CL)から構成される。VH及びVLは、フレームワーク領域(FR)が散在する、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変性の領域にさらに細分類され得る。各VH及びVLは、3つのCDR及び4つのFRセグメントから構成され、アミノ末端からカルボキシ末端に、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3及びFR4で配置される。
「遺伝子修飾」は、「外来」(即ち外因性又は細胞外)遺伝子、DNA又はRNA配列の宿主細胞への導入を指し、宿主細胞が、所望の物質、一般的には導入された遺伝子又は配列によりコードされるタンパク質又は酵素を産生させるための導入された遺伝子又は配列を発現するようになる。導入された遺伝子又は配列は、「クローン化される」又は「外来の」遺伝子又は配列とも呼ばれ得、細胞の遺伝学的機構により使用される、開始、終止、プロモーター、シグナル、分泌又は他の配列などのキメラ抗原受容体をコードするポリヌクレオチドに操作可能に連結される制御又は調節配列を含み得る。遺伝子又は配列は、非機能性配列又は機能が未知の配列を含み得る。導入されたDNA又はRNAを受容し、発現する宿主細胞は、「遺伝子改変」されている。宿主細胞に導入されたDNA又はRNAは、宿主細胞と同じ属若しくは種の又は異なる属若しくは種由来の細胞を含め、あらゆる供給源由来であり得る。
「異種」は、天然で互いに対して同じ関係にあることが見出されない2つ以上のポリヌクレオチド又は2つ以上のポリペプチドを指す。
「異種ポリヌクレオチド」は、本明細書中に記載のような2つ以上のネオアンチゲンをコードする非天然ポリヌクレオチドを指す。
「異種ポリペプチド」は、本明細書中に記載のような2つ以上のネオアンチゲンポリペプチドを含む非天然ポリペプチドを指す。
「宿主細胞」は、異種核酸を含有する何れかの細胞を指す。代表的な異種核酸はベクター(例えば発現ベクター)である。
「ヒト抗体」は、ヒト対象に投与されたときに最小限の免疫反応を有するように最適化される抗体を指す。ヒト抗体の可変領域は、ヒト免疫グロブリン配列由来である。ヒト抗体が定常領域又は定常領域の一部を含有する場合、定常領域もヒト免疫グロブリン配列に由来する。ヒト抗体は、ヒト抗体の可変領域がヒト生殖細胞系列免疫グロブリン又は再編成免疫グロブリン遺伝子を使用する系から得られる場合、ヒト起源の配列「由来」である重鎖及び軽鎖可変領域を含む。このような代表的な系は、ファージ及びヒト免疫グロブリン遺伝子座を保有するマウス又はラットなどのトランスジェニック非ヒト動物上で提示されるヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリである。「ヒト抗体」は、一般的に、ヒト抗体を得るために使用される系とヒト免疫グロブリン遺伝子座との間の相違、体細胞突然変異の導入又はフレームワーク若しくはCDR若しくはその両方への置換の意図的な導入のため、ヒトで発現される免疫グロブリンと比較した場合、アミノ酸の相違を含有する。一般的には、「ヒト抗体」は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン又は再編成免疫グロブリン遺伝子によりコードされるアミノ酸配列に対して、アミノ酸配列において少なくとも約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%同一である。いくつかの場合、「ヒト抗体」は、例えば、Knappik et al.,(2000)J Mol Biol 296:57-86に記載されるような、ヒトフレームワーク配列分析由来のコンセンサスフレームワーク配列又は例えばShi et al.,(2010)J Mol Biol 397:385-96及び国際公開第2009/085462号パンフレットに記載のようなファージ上で提示されるヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリに組み込まれる合成HCDR3を含有し得る。少なくとも1つのCDRが非ヒト種由来である抗体は、「ヒト抗体」の定義には含まれない。
「ヒト化抗体」は、少なくとも1つのCDRが非ヒト種由来であり、少なくとも1つのフレームワークがヒト免疫グロブリン配列由来である抗体を指す。ヒト化抗体は、フレームワークにおいて置換を含み得、フレームワークが、発現されるヒト免疫グロブリン又はヒト免疫グロブリン生殖細胞系列遺伝子配列の正確なコピーではあり得なくなる。
「~との組み合わせ」は、2つ以上の治療剤が、混合物中で一緒に、単一の薬剤として同時に、又は単一の薬剤としてあらゆる順序で連続的に、対象に投与されることを意味する。
「細胞内シグナル伝達ドメイン」又は「細胞質シグナル伝達ドメイン」は、分子の細胞内の部分を指す。これは、第2のメッセンジャーを生成させるか又はこのようなメッセンジャーに反応することによってエフェクターとして機能することにより、定められたシグナル伝達経路を介して細胞活性を制御するために細胞内で情報を伝達することにより作用するタンパク質の機能性部分である。細胞内シグナル伝達ドメインは、CAR含有細胞、例えばCAR-T細胞の免疫エフェクター機能を促進するシグナルを生じさせる。
「単離される」とは、組み換え細胞並びに少なくとも1つの精製又は単離段階に供されているタンパク質など、分子が産生される系の他の構成成分から実質的に分離及び/又は精製されている分子(合成ポリヌクレオチド又はポリペプチドなど)の均一集団を指す。「単離される」は、他の細胞物質及び/又は化学物質を実質的に含まない分子を指し、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%純度など、より高い純度まで単離されている分子を包含する。
「調整する」は、対照又はビヒクルが介在する反応と比較した場合、反応増強又は反応低下(即ち下流効果)を媒介する試験分子の能力を増強するか又は低下させるかの何れかを指す。
「モノクローナル抗体」は、抗体分子の実質的に均一な集団から得られる抗体を指し、即ちその集団を含む個々の抗体は、抗体重鎖からのC末端リジンの除去などの可能な周知の変更又は翻訳後修飾、例えばアミノ酸異性化又は脱アミド化、メチオニン酸化又はアスパラギン若しくはグルタミン脱アミド化を除き、同一である。モノクローナル抗体は、一般的に、1つの抗原性エピトープに結合する。二特異性モノクローナル抗体は、2つの別個の抗原性エピトープに結合する。モノクローナル抗体は、抗体集団内の不均一なグリコシル化を有し得る。モノクローナル抗体は、単特異性又は多特異性、例えば二特異性、一価、二価又は多価などであり得る。
「多特異性」とは、2つ以上の別個の抗原又は同じ抗原内の2つ以上の別個のエピトープに特異的に結合する抗体などの分子を指す。多特異性分子は、他の関連抗原と、例えばヒト又はサル、例えばマカカ・ファスシキュラリス(Macaca fascicularis)(カニクイザル、cyno)若しくはパン・トログロディテス(Pan troglodytes)などの他の種由来の同じ抗原(相同体)と交差反応性を有し得るか、又は2つ以上の別個の抗原の間で共通するエピトープに結合し得る。
「ナチュラルキラー細胞」及び「NK細胞」は、本明細書中で交換可能に及び同義で使用される。NK細胞は、CD16CD56及び/又はCD57TCR表現型を有する分化したリンパ球を指す。NK細胞は、特異的な細胞溶解酵素の活性化により「自己」MHC/HLA抗原を発現できない細胞に結合し、死滅させるそれらの能力、NKを活性化する受容体に対するリガンドを発現する腫瘍細胞又は他の疾患細胞を死滅させる能力及び免疫反応を刺激又は阻害するサイトカインと呼ばれるタンパク質分子を放出する能力を特徴とする。
「操作的に連結される」及び同様の句は、核酸又はアミノ酸を参照して使用される場合、互いと機能的関連において配置される、それぞれ核酸配列又はアミノ酸配列の操作的連結を指す。例えば、操作的に連結されるプロモーター、エンハンサーエレメント、オープンリーディングフレーム、5’及び3’UTR及びターミネーター配列の結果、核酸分子(例えばRNA)の的確な産生が起こり、一部の例においてポリペプチドの産生(即ちオープンリーディングフレームの発現)に至る。操作的に連結されるペプチドは、ペプチドの機能的ドメインが、各ドメインの意図される機能を付与するために互いからの適切な距離で配置されるペプチドを指す。
「医薬の組み合わせ」は、一緒に又は個別に、の何れかで投与される2つ以上の有効成分の組み合わせを指す。
「医薬組成物」は、有効成分と薬学的に許容可能な担体とを組み合わせる結果から得られる組成物を指す。
「薬学的に許容可能な担体」又は「賦形剤」は、対象にとって無毒性である、有効成分以外の医薬組成物中の成分を指す。代表的な薬学的に許容可能な担体は、緩衝液、安定化剤又は保存剤である。
「ポリヌクレオチド」又は「核酸」は、糖リン酸骨格又は他の均等な共有結合化学により共有結合されるヌクレオチドの鎖を含む合成分子を指す。cDNAは、ポリヌクレオチドの典型例である。ポリヌクレオチドはDNA又はRNA分子であり得る。
疾患又は障害「を予防する」、「を予防すること」、「の予防」又は「の予防法」は、対象において障害が起こることを防ぐことを意味する。
「増殖」は、細胞の対称又は非対称分裂の何れかの細胞分裂における増加を指す。
「プロモーター」は、転写を開始させるために必要とされる最小配列を指す。プロモーターには、それぞれ転写を増強又は抑制する、エンハンサー又はリプレッサーエレメントも含まれ得る。
「タンパク質」又は「ポリペプチド」は本明細書中で交換可能に使用され、ペプチド結合により連結される少なくとも2つのアミノ酸残基からそれぞれ構成される1つ以上のポリペプチドを含む分子を指す。タンパク質は、単量体であり得るか又は2つ以上のサブユニットのタンパク質複合体であり得、このサブユニットは、同一であるか又は別個のものである。50アミノ酸未満の小さいポリペプチドは、「ペプチド」と呼ばれ得る。タンパク質は、異種融合タンパク質、糖タンパク質又はリン酸化、アセチル化、ミリストイル化、パルミトイル化、グリコシル化、酸化、ホルミル化、アミド化、シトルリン化、ポリグルタミル化、ADP-リボシル化、ペグ化又はビオチン化などの翻訳後修飾により修飾されたタンパク質であり得る。タンパク質は、組み換え発現され得る。
「組み換え体」は、組み換え手段によって調製、発現、作製又は単離されるポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、ウイルス及び他の巨大分子を指す。
「調節エレメント」は、核酸配列の発現のいくつかの態様を調節する何らかのシス又はトランス作用遺伝子エレメントを指す。
「再発する」は、治療剤での以前の処置後の改善期間後、疾患若しくは疾患の徴候及び症状が戻ることを指す。
「難治性」は、処置に反応しない疾患を指す。難治性疾患は、処置前又は処置の開始時に処置に抵抗性であり得るか、又は難治性疾患は、処置中に抵抗性になり得る。
「単鎖Fv」又は「scFv」は、軽鎖可変領域(VL)を含む少なくとも1つの抗体断片及び重鎖可変領域(VH)を含む少なくとも1つの抗体断片を含む融合タンパク質を指し、ここで、VL及びVHは、ポリペプチドリンカーを介して近接して連結され、単鎖ポリペプチドとして発現されることが可能である。特定されない限り、本明細書中で使用される場合、scFvは、例えばポリペプチドのN末端及びC末端に関して、何れかの順序でVL及びVH可変領域を有し得、scFvは、VL-リンカー-VHを含み得るか、又はVH-リンカー-VLを含み得る。
「特異的に結合する」「特異的な結合」、「特異的に結合」又は「結合する」は、他の抗原に対する親和性よりも高い親和性を有する、抗原又は抗原内のエピトープに対するタンパク質性分子結合を指す。一般的には、このタンパク質性分子は、約1×10-7M以下、例えば約5×10-8M以下、約1×10-8M以下、約1×10-9M以下、約1×10-10M以下、約1×10-11M以下又は約1×10-12M以下の平衡解離定数(K)で、一般的には非特異的な抗原(例えばBSA、カゼイン)への結合の場合のそのKよりも少なくとも100倍低いKで、抗原又は抗原内のエピトープに結合する。
「対象」は何れかのヒト又は非ヒト動物を含む。「非ヒト動物」は、全ての脊椎動物、例えば、哺乳動物及び非哺乳動物、例えば非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ニワトリ、両生類、爬虫類などを含む。「対象」及び「患者」という用語は、本明細書中で交換可能に使用され得る。
「T細胞」及び「Tリンパ球」は、交換可能であり、本明細書中において同義で使用される。T細胞は、胸腺細胞、ナイーブTリンパ球、記憶T細胞、未熟Tリンパ球、成熟Tリンパ球、休止Tリンパ球又は活性化Tリンパ球を含む。T細胞は、Tヘルパー(Th)細胞、例えばTヘルパー1(Th1)又はTヘルパー2(Th2)細胞であり得る。T細胞は、ヘルパーT細胞(HTL;CD4T細胞)CD4T細胞、細胞傷害性T細胞(CTL;CD8+T細胞)、腫瘍浸潤細胞傷害性T細胞(TIL;CD8T細胞)、CD4CD8T細胞又はT細胞の何れかの他のサブセットであり得る。セミインバリアントなαβT細胞受容体を発現するが、NK1.1などの一般的にNK細胞と関連がある様々な分子マーカーも発現するT細胞の特殊化集団を指す「NKT細胞」も含まれる。NKT細胞には、NK1.1及びNK1.1並びにCD4、CD4、CD8及びCD8細胞が含まれる。NKT細胞上のTCRは、MHC I様分子CD Idにより提示される糖脂質抗原を認識することにおいてユニークである。NKT細胞は、炎症又は免疫寛容の何れかを促進するサイトカインを産生するそれらの能力のために保護的又は有害な効果の何れかを有し得る。それらの表面上の別個のTCRを保持するT細胞の小さいサブセットに対して、TCRがα-及びβ-TCR鎖と呼ばれる2本の糖タンパク質鎖から構成されるT細胞の大部分と異なり、γδT細胞におけるTCRがγ鎖及びδ鎖から構成される、特殊化集団を指す「ガンマ-デルタT細胞(γδT細胞)」も含まれる。γδT細胞は、免疫監視及び免疫調節に寄与し得、IL-17の重要な供給源であり、ロバストなCD8細胞傷害性T細胞反応を誘導することが分かった。異常又は過剰な免疫反応を抑制し、免疫寛容に寄与するT細胞を指す「制御性T細胞」又は「Treg」も含まれる。Tregは、一般的には転写因子Foxp3-陽性のCD4T細胞であり、IL-10産生CD4T細胞である、転写因子Foxp3陰性の制御性T細胞も含み得る。
本明細書中で交換可能に使用される「治療的有効量」又は「有効量」は、所望の治療結果を達成するために必要な投与量で、必要な時間にわたり有効な量を指す。治療的有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別及び体重及び個体において所望の反応を惹起するための治療剤又は治療剤の組み合わせの能力などの要因に従い変動し得る。例えば患者の福祉の改善、腫瘍量の低下、腫瘍増殖の停止又は緩徐化及び/又は身体の他の場所への癌細胞の転移がないことを含む、有効な治療剤又は治療剤の組み合わせの例となる指示因子。
「形質導入」は、ウイルスベクターを使用した細胞への外来核酸の導入を指す。
癌などの疾患又は障害「処置する」、「処置すること」又は「処置」は、以下の1つ以上を完遂することを指す:重症度の低下及び/又は障害の持続時間の短縮、処置されている障害の特徴となる症状の悪化の阻害、以前障害を有していた対象における障害の再発の制限若しくは予防又は障害に対する以前症候性であった対象における症状再発の制限若しくは予防。
「腫瘍細胞」又は「癌細胞」は、自然発生又は誘導性の表現型変化を有する、インビボ、エクスビボ又は組織培養の何れかにおける、癌性、前癌性又は形質転換された細胞を指す。これらの変化は、必ずしも新しい遺伝物質の取り込みを含まない。形質転換は、形質転換させるウイルスによる感染及び新しいゲノム核酸の組み込みから生じ得るものの、外来核酸又はそれの取り込みは、自然発生的に又はそれにより内在遺伝子を変異させる発癌物質への曝露後にも起こり得る。形質転換/癌は、インビトロ、インビボ及びエクスビボでの、形態学的変化、細胞の不死化、異常増殖調節、病巣形成、増殖、悪性度、腫瘍特異的なマーカーレベルの調整、侵襲性、ヌードマウスなどの適切な動物宿主における腫瘍増殖などにより例示される。
「変異体」、「突然変異体」又は「変化した」は、1つ以上の修飾、例えば1つ以上の置換、挿入又は欠失により、参照ポリペプチド又は参照ポリヌクレオチドと異なるポリペプチド又はポリヌクレオチドを指す。
本明細書全体を通した抗体定常領域におけるアミノ酸残基の付番は、別段の指示がない限り、Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991)に記載のように、EUインデックスに従う。
Ig定常領域における突然変異は、以下のように示される:L351Y_F405A_Y407Vは、1つの免疫グロブリン定常領域におけるL351Y、F405A及びY407V突然変異を指す。L351Y_F405A_Y407V/T394Wは、第1のIg定常領域におけるL351Y、F405A及びY407V突然変異及び第2のIg定常領域におけるT394W突然変異を指し、これらは1つの多量体タンパク質に存在する。
物質の組成
CD33に結合する抗原結合ドメイン
本開示は、CD33に結合する抗原結合ドメイン、CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単一特異性及び多特異性タンパク質、CD33に結合する抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)、前述のものをコードするポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞及び前述のものを作製及び使用する方法を提供する。本明細書中で同定されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、熱安定性の改善に関して改善された特性を示す。
本開示は、CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質を提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2及びHCDR3;配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
CDR(例えばHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3)を同定するための方法及び技術は、当技術分野で公知であり、本明細書中で開示される重鎖可変領域の何れか及び/又は軽鎖可変領域の何れか内でCDRを同定するために使用され得る。CDRの境界を同定するために使用され得る慣習には、Kabat定義、Chothia定義、AbM定義、IMGT定義及びContact定義が含まれるが、限定されない。理論により縛られることを望むものではないが、Kabat定義は配列の可変性に基づき、Chothia定義は構造ループ領域の位置に基づき、AbM定義はChothiaアプローチとKabatアプローチとの間での妥協策である。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、単離タンパク質も提供し、この単離タンパク質は、それぞれ配列番号1、6及び12;それぞれ配列番号2、7及び13;それぞれ配列番号1、8及び14;それぞれ配列番号3、9及び13;それぞれ配列番号4、10及び15;それぞれ配列番号5、11及び16;又はそれぞれ配列番号5、11及び17のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、ここで、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
代表的なHCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載される。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLとを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;又は
j)それぞれ配列番号35、42及び51;
k)それぞれ配列番号253、256及び259;
l)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
m)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む単離タンパク質も提供する。
特定の実施形態では、単離タンパク質は、それぞれ配列番号29、37及び46のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、それぞれ配列番号32、40及び49のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、それぞれ配列番号34、43及び51のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、それぞれ配列番号253、256及び259のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、それぞれ配列番号254、257及び260のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、それぞれ配列番号255、258及び361のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLとを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインも提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
代表的なHCDR及びLCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載されている。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインも提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
特定の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、単離タンパク質は、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインは、VHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインは、VHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号89、90及び92のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号33、91及び94のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号167、168及び169のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号172、173及び174のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号176、177及び178のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び180のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又はそれぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又はi)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95のVH及び配列番号105のVL;配列番号96のVH及び配列番号106のVL;配列番号97のVH及び配列番号107のVL;配列番号170のVH及び配列番号185のVL;配列番号171のVH及び配列番号188のVL;配列番号175のVH及び配列番号192のVL;配列番号179のVH及び配列番号196のVL;配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は配列番号96のVH及び配列番号202のVLを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
本開示は、骨髄細胞表面抗原CD33に結合する抗原結合ドメインを含む単離タンパク質も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95のVH及び配列番号105のVL;配列番号96のVH及び配列番号106のVL;配列番号97のVH及び配列番号107のVL;配列番号170のVH及び配列番号185のVL;配列番号171のVH及び配列番号188のVL;配列番号175のVH及び配列番号192のVL;配列番号179のVH及び配列番号196のVL;配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は配列番号96のVH及び配列番号202のVLを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはscFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは(scFv)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFvである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFabである。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはF(ab’)である。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインはFdである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはdAbである。いくつかの実施形態では、CD33抗原結合ドメインはVHHである。
CD33結合scFv
CD33に結合する本明細書中で同定されたVH及びVLドメインの何れも、VH-リンカー-VL又はVL-リンカー-VH方向の何れかでscFv方式に改変され得る。本明細書中で特定されるVH及びVLドメインの何れも、また、sc(Fv)構造、例えばVH-リンカー-VL-リンカー-VL-リンカー-VH、VH-リンカー-VL-リンカー-VH-リンカー-VLなどを作製するためにも使用され得る。VH-リンカー-VH-リンカー-VL-リンカー-VL。VL-リンカー-VH-リンカー-VH-リンカー-VL。VL-リンカー-VH-リンカー-VL-リンカー-VH又はVL-リンカー-VL-リンカー-VH-リンカー-VH。
本明細書中で同定されたVH及びVLドメインは、scFv方式に組み込まれ得、CD33への得られたscFvの結合及び熱安定性は公知の方法を使用して評価され得る。結合は、ProteOn XPR36、Biacore 3000又はKinExA機器、ELISA又は当業者にとって公知の競合的結合アッセイを使用して評価され得る。結合は、精製scFv又はE.コリ(E.coli)上清又は発現されたscFvを含有する溶解細胞を使用して評価され得る。CD33に対する試験scFvの測定された親和性は、異なる条件(例えば浸透圧、pH)下で測定された場合、変動し得る。従って、親和性及び他の結合パラメーター(例えばK、Kon、Koff)の測定は、一般的には、標準化された条件及び標準化された緩衝液を使用して行われる。熱安定性は、5分(min)、10分、15分、20分、25分又は30分などの時間にわたり50℃、55℃又は60℃などの高温で試験scFvを加熱し、CD33への試験scFvの結合を測定することによって評価され得る。非加熱scFv試料と比較した場合にCD33への同等の結合を保持するscFvは、熱安定性であると言われる。
組み換え発現系において、リンカーは、ペプチドリンカーであり、何らかの天然アミノ酸を含み得る。リンカーに含まれ得る代表的なアミノ酸は、Gly、Ser、Pro、Thr、Glu、Lys、Arg、Ile、Leu、His及びTheである。リンカーは、CD33への結合など、所望の活性を保持するように、互いと比較して正確な高次構造を形成するようにVH及びVLを連結させるのに適正である長さを有するべきである。
リンカーは、約5~50アミノ酸長であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~40アミノ酸長であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~35アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~30アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~25アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約10~20アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、約15~20アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、6アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、7アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、8アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、9アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、10アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、11アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、12アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、13アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、14アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、15アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、16アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、17アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、18アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、19アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、20アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、21アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、22アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、23アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、24アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、25アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、26アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、27アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、28アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、29アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、30アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、31アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、32アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、33アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、34アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、35アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、36アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、37アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、38アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、39アミノ酸長である。いくつかの実施形態では、リンカーは、40アミノ酸長である。使用され得る代表的なリンカーは、Glyに富むリンカー、Gly及びSer含有リンカー、Gly及びAla含有リンカー、Ala及びSer含有リンカー及び他のフレキシブルリンカーである。
他のリンカー配列は、何れかの免疫グロブリン重鎖又は軽鎖アイソタイプ由来の免疫グロブリンヒンジ領域の一部、CL又はCH1を含み得る。代わりに、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリプロピレングリコール、ポリオキシアルキレン又はポリエチレングリコール及びポリプロピレングリコールのコポリマーを含む様々な非タンパク質性ポリマーがリンカーとして有用であり得る。使用され得る代表的なリンカーは、表1で示す。さらなるリンカーは、その全体において参照により本明細書中に組み込まれる、例えば国際公開第2019/060695号パンフレットに記載されている。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC-末端に、VL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号109のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号110のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号111のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号112のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号113のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号114のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号115のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号116のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号117のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号118のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号119のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号120のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号121のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号122のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号123のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号124のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号125のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号126のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号127のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号128のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号129のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号130のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号131のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号132のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号133のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号134のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号135のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号136のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号137のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号138のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号139のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号140のアミノ酸配列を含む。
Figure 2023517660000006
Figure 2023517660000007
特定の実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む(例えば配列番号108のアミノ酸配列からなる)。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号18の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2及びHCDR3;配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号1、6及び12;それぞれ配列番号2、7及び13;それぞれ配列番号1、8及び14;それぞれ配列番号3、9及び13;それぞれ配列番号4、10及び15;それぞれ配列番号5、11及び16;又はそれぞれ配列番号5、11及び17のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
特定の実施形態では、scFvは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
代表的なHCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載されている。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。
特定の実施形態では、scFvは、配列番号53のVHを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号56のVHを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号59のVHを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号262のVHを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号263のVHを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号264のVHを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLを含む。
特定の実施形態では、scFvは、配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLとを含む。いくつかの実施形態では、scFvは、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;
j)それぞれ配列番号35、42及び51;
k)それぞれ配列番号253、256及び259;
l)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
m)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
特定の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号29、37及び46のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号32、40及び49のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号34、43及び51のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号253、256及び259のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号254、257及び260のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号255、258及び261のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、scFvは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
代表的なHCDR及びLCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載されている。
いくつかの実施形態では、scFvは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
他の実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
特定の実施形態では、scFvは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。特定のこのような実施形態では、scFvは、配列番号108のアミノ酸配列のリンカー配列を含む。従って、いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号53のVH、配列番号108の第1のリンカー(L1)及び配列番号82のVL(VH-L1-VL)を含む。他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号82のVL、配列番号108の第1のリンカー及び配列番号53のVL(VL-L1-VH)を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。特定のこのような実施形態では、scFvは、配列番号108のアミノ酸配列のリンカー配列を含む。従って、いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号56のVH、配列番号108の第1のリンカー(L1)及び配列番号85のVL(VH-L1-VL)を含む。他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号56のVL、配列番号108の第1のリンカー及び配列番号85のVL(VL-L1-VH)を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。特定のこのような実施形態では、scFvは、配列番号108のアミノ酸配列のリンカー配列を含む。従って、いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号59のVH、配列番号108の第1のリンカー(L1)及び配列番号87のVL(VH-L1-VL)を含む。他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号59のVL、配列番号108の第1のリンカー及び配列番号87のVL(VL-L1-VH)を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。特定のこのような実施形態では、scFvは、配列番号108のアミノ酸配列のリンカー配列を含む。従って、いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号262のVH、配列番号108の第1のリンカー(L1)及び配列番号271のVL(VH-L1-VL)を含む。他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号271のVL、配列番号108の第1のリンカー及び配列番号262のVL(VL-L1-VH)を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。特定のこのような実施形態では、scFvは、配列番号108のアミノ酸配列のリンカー配列を含む。従って、いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号263のVH、配列番号108の第1のリンカー(L1)及び配列番号272のVL(VH-L1-VL)を含む。他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号272のVL、配列番号108の第1のリンカー及び配列番号263のVL(VL-L1-VH)を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。特定のこのような実施形態では、scFvは、配列番号108のアミノ酸配列のリンカー配列を含む。従って、いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号264のVH、配列番号108の第1のリンカー(L1)及び配列番号273のVL(VH-L1-VL)を含む。他の実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、配列番号273のVL、配列番号108の第1のリンカー及び配列番号264のVL(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、それぞれ配列番号89、90及び92のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号33、91及び94のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号167、168及び169のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号172、173及び174のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号176、177及び178のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び180のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又はそれぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)のLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号95のVH及び配列番号105のVL;配列番号96のVH及び配列番号106のVL;配列番号97のVH及び配列番号107のVL;配列番号170のVH及び配列番号185のVL;配列番号171のVH及び配列番号188のVL;配列番号175のVH及び配列番号192のVL;配列番号179のVH及び配列番号196のVL;配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は配列番号96のVH及び配列番号202のVLを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号203のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号204のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号205のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号206のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号207のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号208のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号209のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号210のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号211のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号212のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号213のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号214のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号215のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号216のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号217のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号218のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号219のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号221のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号274のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号275のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号276のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、scFvは、配列番号213のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号216のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号219のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号274のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号275のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、scFvは、配列番号276のアミノ酸配列を含む。
CD33に結合する他の抗原結合ドメイン
CD33に結合する本明細書中で特定されるVH及びVLドメインの何れかは、Fab、F(ab’)、Fd又はFv方式にも改変され得、それらのCD33への結合及び熱安定性は、本明細書中に記載のアッセイを使用して評価され得る。特定の実施形態では、本明細書中で特定されるVH及びVLドメインは、Fabに改変される。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号18の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号1、6及び12;それぞれ配列番号2、7及び13;それぞれ配列番号1、8及び14;それぞれ配列番号3、9及び13;それぞれ配列番号4、10及び15;それぞれ配列番号5、11及び16;又はそれぞれ配列番号5、11及び17のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
特定の実施形態では、Fabは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
代表的なHCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載されている。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLを含む。いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88、271、272又は273のVLとを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;又は
j)それぞれ配列番号35、42及び51;又は
l)それぞれ配列番号253、256及び259;
m)それぞれ配列番号254、257及び260;
n)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
代表的なHCDR及びLCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載されている。
特定の実施形態では、Fabは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fabは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、それぞれ配列番号89、90及び92のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号33、91及び94のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号167、168及び169のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号172、173及び174のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号176、177及び178のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び180のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又はそれぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)のLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、Fabは、配列番号95のVH及び配列番号105のVL;配列番号96のVH及び配列番号106のVL;配列番号97のVH及び配列番号107のVL;配列番号170のVH及び配列番号185のVL;配列番号171のVH及び配列番号188のVL;配列番号175のVH及び配列番号192のVL;配列番号179のVH及び配列番号196のVL;配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は配列番号96のVH及び配列番号202のVLを含む。
他の実施形態では、本明細書中で特定されるVH及びVLドメインはF(ab’)に改変される。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号18の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、それぞれ配列番号1、6及び12;それぞれ配列番号2、7及び13;それぞれ配列番号1、8及び14;それぞれ配列番号3、9及び13;それぞれ配列番号4、10及び15;それぞれ配列番号5、11及び16;又はそれぞれ配列番号5、11及び17のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLを含む。いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLとを含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;
j)それぞれ配列番号35、42及び51;
k)それぞれ配列番号253、256及び259、
l)それぞれ配列番号254、257及び260、
m)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
k)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
l)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
m)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、それぞれ配列番号89、90及び92のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号33、91及び94のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号167、168及び169のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号172、173及び174のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号176、177及び178のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び180のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又はそれぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)のLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は196のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。いくつかの実施形態では、F(ab’)は、配列番号95のVH及び配列番号105のVL;配列番号96のVH及び配列番号106のVL;配列番号97のVH及び配列番号107のVL;配列番号170のVH及び配列番号185のVL;配列番号171のVH及び配列番号188のVL;配列番号175のVH及び配列番号192のVL;配列番号179のVH及び配列番号196のVL;配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は配列番号96のVH及び配列番号202のVLを含む。
特定の実施形態では、本明細書中で特定されるVH及びVLドメインはFvに改変される。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号18の重鎖可変領域(VH)の重鎖相補性決定領域(HCDR)1、HCDR2及びHCDR3;配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号1、6及び12;それぞれ配列番号2、7及び13;それぞれ配列番号1、8及び14;それぞれ配列番号3、9及び13;それぞれ配列番号4、10及び15;それぞれ配列番号5、11及び16;又はそれぞれ配列番号5、11及び17のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
特定の実施形態では、Fvは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLを含む。いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、r61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273のVLとを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;
j)それぞれ配列番号35、42及び51;
k)それぞれ配列番号253、256及び259、
l)それぞれ配列番号254、257及び260、
m)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、Fvは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fvは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、それぞれ配列番号89、90及び92のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号33、91及び94のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号167、168及び169のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号172、173及び174のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号176、177及び178のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び180のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又はそれぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fvは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)のLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、本明細書中で同定されるVH及びVLドメインは、Fdに改変される。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号18の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、それぞれ配列番号1、6及び12;それぞれ配列番号2、7及び13;それぞれ配列番号1、8及び14;それぞれ配列番号3、9及び13;それぞれ配列番号4、10及び15;それぞれ配列番号5、11及び16;又はそれぞれ配列番号5、11及び17のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
k)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
l)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
m)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む。
特定の実施形態では、Fdは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;
j)それぞれ配列番号35、42及び51;
k)それぞれ配列番号253、256及び259、
l)それぞれ配列番号254、257及び260、
m)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、Fdは、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
他の実施形態では、Fdは、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3とを含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、
a)配列番号52のVH;
b)配列番号53のVH;
c)配列番号54のVH;
d)配列番号55のVH;
e)配列番号56のVH;
f)配列番号57のVH;
g)配列番号58のVH;
h)配列番号59のVH;
i)配列番号60のVH;
j)配列番号61のVH;
k)配列番号262のVH;
l)配列番号263のVH;又は
m)配列番号264のVH
を含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、Fdは、それぞれ配列番号89、90及び92のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号33、91及び94のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号167、168及び169のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号172、173及び174のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号176、177及び178のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;それぞれ配列番号89、90及び180のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又はそれぞれ配列番号89、90及び93のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む。
相同抗原結合ドメイン及び保存的置換がある抗原結合ドメイン
CD33に結合する抗原結合ドメインの変異体は本開示の範囲内である。例えば、変異体は、親抗原結合ドメインと比較した場合、改善した機能特性を保持するか又は有する限り、CD33に結合する抗原結合ドメインにおいて1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28又は29個のアミノ酸置換を含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、CD33に結合する変異抗原結合ドメインは、同じアッセイにおいて親抗原結合ドメインと比較した場合、熱安定性が改善している。いくつかの実施形態では、CD33に結合する変異抗原結合ドメインは、親結合ドメインと比較した場合、翻訳後修飾の可能性が低下している。翻訳後修飾の可能性の低下は、NG、DG又はDPなどのモチーフの置換により生じ得る。いくつかの実施形態では、配列同一性は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインに対して、約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%又は99%であり得る。いくつかの実施形態では、変異はフレームワーク領域にある。いくつかの実施形態では、変異体は保存的置換により生成される。
例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、VH中の残基位置P41、I49、M70及びA88(残基は配列番号5のhu11B6_VHに従い付番)及びVL中のS80、L82、A88及びY91(残基は配列番号2のhu11B6_VLに従い付番)において置換を含み得る。保存的置換は何れかの指定の位置でなされ得、得られたCD33に結合する変異抗原結合ドメインは、本明細書中に記載のアッセイにおいてそれらの所望の特徴について試験される。
以下のものと少なくとも80%同一であるVHを含むCD33に結合する抗原結合ドメインも提供される:
配列番号18のVH;
配列番号19のVH;
配列番号20のVH;
配列番号21のVH;
配列番号22のVH;
配列番号23のVH;
配列番号24のVH;
配列番号25のVH;
配列番号26のVH;
配列番号27のVH;
配列番号52のVH;
配列番号53のVH;
配列番号54のVH;
配列番号55のVH;
配列番号56のVH;
配列番号57のVH;
配列番号58のVH;
配列番号59のVH;
配列番号60のVH;
配列番号61のVH;
配列番号95のVH;
配列番号96のVH;
配列番号97のVH;
配列番号170のVH;
配列番号171のVH;
配列番号175のVH;
配列番号179のVH;
配列番号181のVH;
配列番号96のVH、
配列番号262のVH;
配列番号263のVH;又は
配列番号264のVH。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHを含む。
いくつかの実施形態では、同一性は85%である。いくつかの実施形態では、同一性は90%である。いくつかの実施形態では、同一性は91%である。いくつかの実施形態では、同一性は91%である。いくつかの実施形態では、同一性は92%である。いくつかの実施形態では、同一性は93%である。いくつかの実施形態では、同一性は94%である。いくつかの実施形態では、同一性は94%である。いくつかの実施形態では、同一性は95%である。いくつかの実施形態では、同一性は96%である。いくつかの実施形態では、同一性は97%である。いくつかの実施形態では、同一性は98%である。いくつかの実施形態では、同一性は99%である。
以下のものと少なくとも80%同一であるVH及びVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインも提供される:
配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
配列番号181のVH及び配列番号200のVL;
配列番号96のVH及び配列番号202のVL;
配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
配列番号264のVH及び配列番号273のVL。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVH及びVLを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVHと、配列番号82のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号82のVLと、配列番号53のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHとを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHと、配列番号85のVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVHと、配列番号85のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号85のVLと、配列番号56のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHとを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHと、配列番号87のVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVHと、配列番号87のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号87のVLと、配列番号59のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHとを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHと、配列番号271のVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVHと、配列番号271のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号271のVLと、配列番号262のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHとを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHと、配列番号272のVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVHと、配列番号272のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号272のVLと、配列番号263のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHとを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHと、配列番号273のVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVHと、配列番号273のVLと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVLとを含む。例えば、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号273のVLと、配列番号264のVHと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるVHとを含む。
本発明者らは、翻訳後修飾が起こり易いモチーフを除去するためにVH及び/又はVLドメイン中の位置が突然変異され得ることを見出した。翻訳後修飾は、例えばCD33に結合する抗原結合ドメインの脱アミド化、異性化及び/又は断片化の可能性を向上させ得る。これらの突然変異は、CD33に結合する抗原結合ドメインの熱安定性も促進し得る。
翻訳後修飾が起こり易い配列モチーフの例は、例えばNG、DG及びDPである。
従って、いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、1つ以上のNGモチーフにおいて1又は2個のアミノ酸置換を含むVH及び/又はVLドメインを含む。いくつかの実施形態では、NGモチーフのN残基が置換される。他の実施形態では、NGモチーフのG残基が置換される。いくつかの実施形態では、NGモチーフのN及びG残基が置換される。特定のこのような実施形態では、1つ以上のNGモチーフにおける1又は2個のアミノ酸置換は、VH及び/又はVLドメイン内の唯一の置換である。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、1つ以上のDGモチーフにおいて1又は2個のアミノ酸置換を含むVH及び/又はVLドメインを含む。いくつかの実施形態では、DGモチーフのD残基が置換される。他の実施形態では、DGモチーフのG残基が置換される。いくつかの実施形態では、DGモチーフのD及びG残基が置換される。特定のこのような実施形態では、1つ以上のDGモチーフにおける1又は2個のアミノ酸置換は、VH及び/又はVLドメイン内の唯一の置換である。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、1つ以上のDPモチーフにおいて1又は2個のアミノ酸置換を含むVH及び/又はVLドメインを含む。いくつかの実施形態では、DPモチーフのD残基が置換される。他の実施形態では、DPモチーフのP残基が置換される。いくつかの実施形態では、DPモチーフのD及びP残基が置換される。特定のこのような実施形態では、1つ以上のDPモチーフにおける1又は2個のアミノ酸置換は、VH及び/又はVLドメイン内の唯一の置換である。
本発明の代表的なCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含むタンパク質(例えばscFv)である。本発明者らは、配列番号262のVH内でDGモチーフを突然変異させることにより、CD33結合特性を維持しながら翻訳後修飾の可能性を低下させ得ることを見出した。これらの突然変異も熱安定性を促進し得る。
配列番号262のVH及び配列番号271のVLを有するCD33に結合する抗原結合ドメインは、DGモチーフを除去するために突然変異させられ得る。配列番号262のVHは、位置54~55にDGモチーフを有する(EUインデックスに従う残基の付番を使用)。
従って、いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置54のD残基が置換される(例えばD54G、D54A、D54Y、D54P、D54N、D54S、D54R、D54L、D54V、D54T、D54F又はD54W)配列番号262のVHを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置55のG残基が置換される(例えばG55V、G55P、G55R、G55A、G55L、G55Q、G55T又はG55H)配列番号262のVHを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置54のD残基(例えばD54G、D54A、D54Y、D54P、D54N、D54S、D54R、D54L、D54V、D54T、D54F又はD54W)が置換され、位置55のG残基が置換される(例えばG55V、G55P、G55R、G55A、G55L、G55Q、G55T又はG55H)配列番号262のVHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309又は310のVHを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号291のVH及び配列番号271のVL;
配列番号292のVH及び配列番号271のVL;
配列番号293のVH及び配列番号271のVL;
配列番号294のVH及び配列番号271のVL;
配列番号295のVH及び配列番号271のVL;
配列番号296のVH及び配列番号271のVL;
配列番号297のVH及び配列番号271のVL;
配列番号298のVH及び配列番号271のVL;
配列番号299のVH及び配列番号271のVL;
配列番号300のVH及び配列番号271のVL;
配列番号301のVH及び配列番号271のVL;
配列番号302のVH及び配列番号271のVL;
配列番号303のVH及び配列番号271のVL;
配列番号304のVH及び配列番号271のVL;
配列番号305のVH及び配列番号271のVL;
配列番号306のVH及び配列番号271のVL;
配列番号307のVH及び配列番号271のVL;
配列番号308のVH及び配列番号271のVL;
配列番号309のVH及び配列番号271のVL;又は
配列番号310のVH及び配列番号271のVL
を含む。
本発明の別の代表的なCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含むタンパク質(例えばscFv)である。本発明者らは、配列番号263のVH及び配列番号272のVL内の1つ以上のNGモチーフを突然変異させることにより、CD33結合を維持しながら翻訳後修飾の可能性を低下させ得ることを見出した。これらの突然変異は熱安定性も促進させ得る。
配列番号263のVH及び配列番号272のVLを有するCD33に結合する抗原結合ドメインは、NGモチーフを除去するために突然変異させられ得る。配列番号263のVHは、位置99~100(EUインデックスに従う残基の付番を使用)にNGモチーフを有し、配列番号272のVLは、位置97~98(EUインデックスに従う残基の付番を使用)にNGモチーフを有する。
従って、いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置99のN残基が置換される(例えばN99V、N99S、N99E、N99H、N99A、N99G、N99K、N99T、N99F、N99V、N99R、N99L、N99H又はN99I)配列番号263のVHを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置100のG残基が置換される(例えばG100S、G100A)配列番号263のVHを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置99のN残基が置換され(例えば、N99V、N99S、N99E、N99H、N99A、N99G、N99K、N99T、N99F、N99V、N99R、N99L、N99H又はN99I)、位置100のG残基が置換される(例えばG100S、G100A)配列番号263のVHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351又は352のVHを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置97のN残基が置換される(例えばN97V、N97R、N97P、N97T、N97G、N97Q、N97S、N97A、N97L、N97Y、N97E、N97F、N97D、N97I又はN97H)配列番号272のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置98のG残基が置換される(例えばG98V、G98P、G98R、G98D、G98E、G98W、G98Y、G98A、G98N、G98K、G98L)配列番号272のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置97のN残基が置換され、位置98のG残基が置換される配列番号272のVLを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335又は336のVLを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、
配列番号263のVH及び配列番号311のVL;
配列番号263のVH及び配列番号312のVL;
配列番号263のVH及び配列番号313のVL;
配列番号263のVH及び配列番号314のVL;
配列番号263のVH及び配列番号315のVL;
配列番号263のVH及び配列番号316のVL;
配列番号263のVH及び配列番号317のVL;
配列番号263のVH及び配列番号318のVL;
配列番号263のVH及び配列番号319のVL;
配列番号263のVH及び配列番号320のVL;
配列番号263のVH及び配列番号321のVL;
配列番号263のVH及び配列番号322のVL;
配列番号263のVH及び配列番号323のVL;
配列番号263のVH及び配列番号324のVL;
配列番号263のVH及び配列番号325のVL;
配列番号263のVH及び配列番号326のVL;
配列番号263のVH及び配列番号327のVL;
配列番号263のVH及び配列番号328のVL;
配列番号263のVH及び配列番号329のVL;
配列番号263のVH及び配列番号330のVL;
配列番号263のVH及び配列番号331のVL;
配列番号263のVH及び配列番号332のVL;
配列番号263のVH及び配列番号333のVL;
配列番号263のVH及び配列番号334のVL;
配列番号263のVH及び配列番号335のVL;
配列番号263のVH及び配列番号336のVL;
配列番号337のVH及び配列番号272のVL;
配列番号338のVH及び配列番号272のVL;
配列番号339のVH及び配列番号272のVL;
配列番号340のVH及び配列番号272のVL;
配列番号341のVH及び配列番号272のVL;
配列番号342のVH及び配列番号272のVL;
配列番号343のVH及び配列番号272のVL;
配列番号344のVH及び配列番号272のVL;
配列番号345のVH及び配列番号272のVL;
配列番号346のVH及び配列番号272のVL;
配列番号347のVH及び配列番号272のVL;
配列番号348のVH及び配列番号272のVL;
配列番号349のVH及び配列番号272のVL;
配列番号350のVH及び配列番号272のVL;
配列番号351のVH及び配列番号272のVL;又は
配列番号352のVH及び配列番号272のVL
を含む。
本発明の別の代表的なCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含むタンパク質(例えばscFv)である。本発明者らは、配列番号56のVH及び配列番号85のVL内の1つ以上のNGモチーフを突然変異させることにより、CD33結合特性を維持しながら翻訳後修飾の可能性を低下させ得ることを見出した。これらの突然変異は熱安定性も促進させ得る。
NGモチーフを除去するために、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを有するCD33に結合する抗原結合ドメインが突然変異させられ得る。配列番号56のVHは、位置99~100(EUインデックスに従う残基の付番を使用)にNGモチーフを有し、配列番号85のVLは位置97~98(EUインデックスに従う残基の付番を使用)にNGモチーフを有する。
従って、いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置99のN残基が置換される(例えば、N99R、N99P、N99G、N99V、N99L、N99D、N99E、N99A、N99Q又はN99T)配列番号56のVHを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置100のG残基が置換される(例えば、G100S、G100A、G100L、G100P、G100T又はG100Q)配列番号56のVHを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置99のN残基が置換され(例えば、N99R、N99P、N99G、N99V、N99L、N99D、N99E、N99A、N99Q又はN99T)、位置100のG残基が置換される(例えば、G100S、G100A、G100L、G100P、G100T又はG100Q)配列番号56のVHを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381又は382のVHを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置97のN残基が置換される(例えば、N97G、N97D、N97P、N97K、N97E、N97A、N97R、N97Q、N97I、N97V、N97H、N97K、N97W又はN97S)配列番号85のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置98のG残基が置換される配列番号85のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置97のN残基が置換され(例えば、N97G、N97D、N97P、N97K、N97E、N97A、N97R、N97Q、N97I、N97V、N97H、N97K、N97W又はN97S)、位置98のG残基が置換される配列番号85のVLを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365又は366のVLを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、
配列番号56のVH及び配列番号353のVL;
配列番号56のVH及び配列番号354のVL;
配列番号56のVH及び配列番号355のVL;
配列番号56のVH及び配列番号356のVL;
配列番号56のVH及び配列番号357のVL;
配列番号56のVH及び配列番号358のVL;
配列番号56のVH及び配列番号359のVL;
配列番号56のVH及び配列番号360のVL;
配列番号56のVH及び配列番号361のVL;
配列番号56のVH及び配列番号362のVL;
配列番号56のVH及び配列番号363のVL;
配列番号56のVH及び配列番号364のVL;
配列番号56のVH及び配列番号365のVL;
配列番号56のVH及び配列番号366のVL;
配列番号367のVH及び配列番号85のVL;
配列番号368のVH及び配列番号85のVL;
配列番号369のVH及び配列番号85のVL;
配列番号370のVH及び配列番号85のVL;
配列番号371のVH及び配列番号85のVL;
配列番号372のVH及び配列番号85のVL;
配列番号373のVH及び配列番号85のVL;
配列番号374のVH及び配列番号85のVL;
配列番号375のVH及び配列番号85のVL;
配列番号376のVH及び配列番号85のVL;
配列番号377のVH及び配列番号85のVL;
配列番号378のVH及び配列番号85のVL;
配列番号379のVH及び配列番号85のVL;
配列番号380のVH及び配列番号85のVL;
配列番号381のVH及び配列番号85のVL;又は
配列番号382のVH及び配列番号85のVL
を含む。
本発明の別の代表的なCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含むタンパク質(例えばscFv)である。本発明者らは、配列番号53のVH及び配列番号82のVL内でNGモチーフを突然変異させることにより、CD33結合特性を維持しながら翻訳後修飾の可能性を低下させ得ることを見出した。これらの突然変異は熱安定性も促進し得る。
配列番号53のVH及び配列番号82のVLを有するCD33に結合する抗原結合ドメインは、NGモチーフに対して突然変異させ得る。配列番号82のVLは、位置97~98(EUインデックスに従う残基の付番を使用)でNGモチーフを有する。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置97のN残基が置換される(例えば、N97S、N97Q、N97V、N97G、N97W、N97T、N97I、N97E、N97A、N97R又はN97L)配列番号82のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置98のG残基が置換される(例えば、G98V、G98A、G98P、G98L又はG98T)配列番号272のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、位置97のN残基が置換され(例えば、N97S、N97Q、N97V、N97G、N97W、N97T、N97I、N97E、N97A、N97R又はN97L)、位置98のG残基が置換される(例えば、G98V、G98A、G98P、G98L又はG98T)配列番号82のVLを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、
配列番号53のVH及び配列番号383のVL;
配列番号53のVH及び配列番号384のVL;
配列番号53のVH及び配列番号385のVL;
配列番号53のVH及び配列番号386のVL;
配列番号53のVH及び配列番号387のVL;
配列番号53のVH及び配列番号388のVL;
配列番号53のVH及び配列番号389のVL;
配列番号53のVH及び配列番号390のVL;
配列番号53のVH及び配列番号391のVL;
配列番号53のVH及び配列番号392のVL;
配列番号53のVH及び配列番号393のVL;
配列番号53のVH及び配列番号394のVL;
配列番号53のVH及び配列番号395のVL;
配列番号53のVH及び配列番号396のVL;
配列番号53のVH及び配列番号397のVL;又は
配列番号53のVH及び配列番号398のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHドメインを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLドメインを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)は、配列番号291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHドメインと、配列番号311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLドメインとを含む。
いくつかの実施形態では、同一性は85%である。いくつかの実施形態では、同一性は90%である。いくつかの実施形態では、同一性は91%である。いくつかの実施形態では、同一性は91%である。いくつかの実施形態では、同一性は92%である。いくつかの実施形態では、同一性は93%である。いくつかの実施形態では、同一性は94%である。いくつかの実施形態では、同一性は94%である。いくつかの実施形態では、同一性は95%である。いくつかの実施形態では、同一性は96%である。いくつかの実施形態では、同一性は97%である。いくつかの実施形態では、同一性は98%である。いくつかの実施形態では、同一性は99%である。
2つの配列の間のパーセント同一性は、それらの配列により共有される同一である位置の数の関数であり(即ち、%同一性=同一である位置の数/位置の総数x100)、この2つの配列の最適アライメントのために導入される必要があるギャップ数及び各ギャップの長さを考慮する。
2つのアミノ酸配列の間のパーセント同一性は、PAM120重み残基表、12のギャップ長ペナルティ及び4のギャップペナルティを使用して、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれているE.Meyers及びW.Miller(Comput.Appl.Biosci.4:11-17(1988))のアルゴリズムを使用して決定され得る。さらに、2つの配列の間のパーセント同一性は、Blossum 62マトリクス又はPAM250マトリクスの何れか及び16、14、12、10、8、6又は4のギャップ重み及び1、2、3、4、5又は6の長さ重みを使用して、GCGソフトウェアパッケージ(www_gcg_comで入手可能)においてGAPプログラムに組み込まれているNeedleman及びWunsch(J.Mol.Biol.48:444-453(1970))アルゴリズムを使用して決定され得る。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する変異抗原結合ドメインは、CD33と結合する親抗原結合断片の所望の機能特性を保持しながら、CDR領域の何れかにおいて1又は2個の保存的置換を含む。
「保存的修飾」は、アミノ酸修飾を含有する抗体の結合の特徴に顕著に影響しないか又はそれを変化させないアミノ酸修飾を指す。保存的修飾には、アミノ酸置換、付加及び欠失が含まれる。保存的アミノ酸置換は、同様の側鎖を有するアミノ酸残基でアミノ酸が置き換えられるものである。同様の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、よく定められており、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、塩基性側鎖(例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン)、非荷電極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、スレオニン、チロシン、トリプトファン)、芳香族側鎖(例えば、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシン)、脂肪族側鎖(例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、スレオニン)、アミド(例えば、アスパラギン、グルタミン)、ベータ-分岐状側鎖(例えば、スレオニン、バリン、イソロイシン)及び硫黄含有側鎖(システイン、メチオニン)を有するアミノ酸を含む。さらに、アラニンスキャニング突然変異誘発に対して以前に記載されているように、ポリペプチド中の何れかのネイティブ残基もアラニンで置換され得る(MacLennan et al.,(1988)Acta Physiol Scand Suppl 643:55-67;Sasaki et al.,(1988)Adv Biophys 35:1-24)。本発明の抗体に対するアミノ酸置換は、例えば、PCR突然変異誘発(米国特許第4,683,195号明細書)によって公知の方法により行われ得る。代わりに、変異体のライブラリは、例えば、11アミノ酸(Ala、Cys、Asp、Glu、Gly、Lys、Asn、Arg、Ser、Tyr、Trp)をコードするランダム(NNK)又は非ランダムコドン、例えばDVKコドンを使用して作製され得る。得られる変異体は、本明細書中に記載のアッセイを使用してそれらの特徴について試験され得る。
CD33に結合する抗原結合断片を作製する方法
本開示で提供されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、様々な技術を使用して作製され得る。例えば、Kohler及びMilsteinのハイブリドーマ法は、CD33に結合するVH/VL対を同定するために使用され得る。ハイブリドーマ法において、マウス又は他の宿主動物、例えばハムスター、ラット又はニワトリなどに対して、ヒト及び/又はcyno CD33で免疫付与を行い、続いてハイブリドーマ細胞を形成するための標準的な方法を使用して、免疫付与した動物からの脾臓細胞と骨髄腫細胞との融合を行う。単一不死化ハイブリドーマ細胞から生じたコロニーは、所望の特性、例えば結合特異性、交差反応性又はその欠如、抗原に対する親和性及び何らかの所望の機能を有するCD33に結合する抗原結合ドメインを含有する抗体の産生についてスクリーニングされ得る。
非ヒト動物に免疫付与することによって作製されるCD33に結合する抗原結合ドメインはヒト化され得る。ヒトアクセプターフレームワークの選択を含む代表的なヒト化技術としては、CDR移植法(米国特許第5,225,539号明細書)、SDR移植法(米国特許第6,818,749号明細書)、リサーフェイシング(Padlan,(1991)Mol Immunol 28:489-499)、特異性決定残基リサーフェイシング(米国特許出願公開第2010/0261620号明細書)、ヒトフレームワーク適合化(米国特許第8,748,356号明細書)又は超ヒト化(米国特許第7,709,226号明細書)が挙げられる。これらの方法において、親抗体のCDR又はCDR残基のサブセットは、CDRの長さ又はカノニカル構造同一性又はそれらの組み合わせにおける類似性に基づいて、親フレームワークに対するそれらの全体的な相同性に基づき選択され得るヒトフレームワーク上に移される。
ヒト化抗原結合ドメインは、国際公開第1990/007861号パンフレット及び同第1992/22653号パンフレットに記載のものなどの技術により、又は例えば抗原結合ドメインの親和性を向上させるためにCDRの何れかで変動性を導入することにより、結合親和性を保存するための変更されたフレームワーク支持体残基を組み込むことによって(戻し突然変異)、所望の抗原に対するそれらの選択性又は親和性を改善するためにさらに最適化され得る。
CD33に結合する抗原結合断片を作製するために、そのゲノムにおいてヒト免疫グロブリン(Ig)遺伝子座を保有する、マウス、ラット又はニワトリなどのトランスジェニック動物が使用され得、例えば米国特許第6,150,584号明細書、国際公開第1999/45962号パンフレット、同第2002/066630号パンフレット、同第2002/43478号パンフレット、同第2002/043478号パンフレット及び同第1990/04036号パンフレットに記載されている。このような動物における内在性の免疫グロブリン遺伝子座が破壊又は欠失させられ得、相同又は非相同組み換えを使用して、トランス染色体を使用して、又はミニ遺伝子を使用して、少なくとも1つの完全又は部分的ヒト免疫グロブリン遺伝子座が動物のゲノムに挿入され得る。上記のような技術を使用して、選択された抗原に対するヒト抗体を提供するために、Regeneron(www_regeneron_com)、Harbour Antibody(www_harbourantibodies_com)、Open Monoclonal Technology,Inc.(OMT)(www_omtinc_net)、KyMab(www_kymab_com)、Trianni(www.trianni_com)及びAblexis(www_ablexis_com)などの会社と契約し得る。
CD33に結合する抗原結合ドメインは、ファージディスプレイライブラリから選択され得、このファージは、ヒト免疫グロブリン又はFabなどのそれらの一部、単鎖抗体(scFv)又は非対合若しくは対合抗体可変領域を発現するように改変される。CD33に結合する抗原結合ドメインは、例えば、Shi et al.,(2010)J Mol Biol 397:385-96及び国際公開第09/085462号パンフレット)に記載のようなバクテリオファージpIXコートタンパク質との融合タンパク質として抗体重鎖及び軽鎖可変領域を発現するファージディスプレイライブラリから単離され得る。ライブラリは、ヒト及び/又はcyno CD33に対するファージ結合についてスクリーニングされ得、得られた陽性クローンがさらに特徴評価され得、Fabがクローン溶解物から単離され、scFv又は抗原結合断片の他の立体配置に変換される。
本開示の免疫原性抗原の調製及び抗原結合ドメインの発現及び産生は、組み換えタンパク質産生などの何らかの適切な技術を使用して実施され得る。免疫原性抗原は、全細胞又は細胞又は組織抽出部を含む精製タンパク質又はタンパク質混合物の形態で動物に投与され得るか、この抗原は、前記抗原又はその一部をコードする核酸から動物の体内においてデノボで形成され得る。
半減期延長部分への複合化
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを半減期延長部分に複合化し得る。代表的な半減期延長部分は、アルブミン、アルブミン変異体、アルブミン結合タンパク質及び/又はドメイン、トランスフェリン及びその断片及び類似体、免疫グロブリン(Ig)又はその断片、例えばFc領域などである。上述の半減期伸長部分のアミノ酸配列は公知である。Ig又はその断片は、全てのアイソタイプ、即ちIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA及びIgEを含む。
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインに複合化され得るさらなる半減期延長部分は、所望の特性に対して、ポリエチレングリコール(PEG)分子、例えばPEG5000又はPEG20,000、異なる鎖長の脂肪酸及び脂肪酸エステル、例えばラウラート、ミリステート、ステアラート、アラキダート、ベヘナート、オレアート、アラキドナート、オクタン二酸、テトラデカン二酸、オクタデカン二酸、ドコサン二酸など、ポリリジン、オクタン、炭水化物(デキストラン、セルロース、オリゴ糖又は多糖)を含む。これらの部分は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインとの直接融合であり得、標準的なクローニング及び発現技術によって作製され得る。代わりに、組み換え産生された本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインにその部分を連結させるために周知の化学カップリング法が使用され得る。
ペグ部分は、例えば、システイン残基を本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインのC-末端に組み込むか又はCD33結合部位から離れて面する残基位置にシステインを操作し、周知の方法を使用してシステインにペグ化基を付着させることにより、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインに複合化され得る。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合断片は、半減期延長部分に複合化される。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン又はポリエチレングリコールである。いくつかの実施形態では、半減期延長部分はIg定常領域である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はIgである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はIgの断片である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はIg定常領域である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はIg定常領域の断片である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はFc領域である。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はアルブミンである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はアルブミン結合ドメインである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はトランスフェリンである。
いくつかの実施形態では、半減期延長部分はポリエチレングリコールである。
半減期延長部分に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、既知のインビボモデルを利用して、それらの薬物動態学的特性について評価され得る。
免疫グロブリン(Ig)定常領域又はIg定常領域の断片に対する複合化
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、Fcエフェクター機能C1q結合、補体依存的細胞傷害性(CDC)、Fc受容体結合、抗体依存的細胞介在性細胞傷害性(ADCC)、食作用又は細胞表面受容体(例えばB細胞受容体;BCR)の下方制御を含め、抗体様特性を付与するためにIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化され得る。Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、本明細書中で論じられるような半減期延長部分としても機能する。本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、標準的な方法を使用して従来の全長抗体に改変され得る。CD33に結合する抗原結合ドメインを含む全長抗体は、本明細書中に記載のようにさらに改変され得る。
免疫グロブリン重鎖定常領域は、サブドメインCH1、ヒンジ、CH2及びCH3から構成される。CH1ドメインは、重鎖上において、残基A118~V215、CH2ドメイン残基A231~K340及びCH3ドメイン残基G341-K447にわたり、残基はEUインデックスに従い付番される。一部の例において、G341はCH2ドメイン残基と呼ばれる。「ヒンジ」は、一般に、ヒトIgG1のE216を含み、P230で終わるものとして定義される。Ig Fc領域は、Ig定常領域の少なくともCH2及びCH3ドメインを含み、従って少なくともIg重鎖定常領域のおよそA231~K447の領域を含む。
本発明は、免疫グロブリン(Ig)定常領域又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインも提供する。特定のこのような実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片はIgG1に由来する。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域は重鎖定常領域である。特定のこのような実施形態では、Ig定常領域はIgG1重鎖定常領域である。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域は軽鎖定常領域である。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む。特定のこのような実施形態では、Ig定常領域は、IgG1 Fc領域を含む。いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む。特定のこのような実施形態では、Ig定常領域は、IgG1 CH2ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む。特定のこのような実施形態では、Ig定常領域は、IgG1 CH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。特定のこのような実施形態では、Ig定常領域は、IgG1 CH2及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。特定のこのような実施形態では、IgG1からのヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインである。ヒンジの一部とは、Igヒンジの1つ以上のアミノ酸残基を指す。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。特定のこのような実施形態では、IgG1からの、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインである。
特定の実施形態では、Ig定常領域の断片は、配列番号278のアミノ酸配列を含む。
重鎖の位置220のシステイン残基は、定常領域と軽鎖との間のシステイン架橋の形成を防ぐために突然変異させ得る。従って、特定の実施形態では、Ig定常領域は、位置220にシステインではない残基を含む。一実施形態では、Ig定常領域は、位置220にセリンを含む。
特定の実施形態では、Ig定常領域の断片は、配列番号279のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端に複合化される。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端に複合化される。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化される。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140のアミノ酸配列を含む。
Ig定常領域又はIg定常領域の断片に複合化される本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、いくつかの既知のアッセイを使用してそれらの機能性について評価され得る。CD33への結合は、本明細書中に記載の方法を使用して評価され得る。Ig定常ドメイン又はIg定常領域の断片、例えばFc領域などにより付与される特性の変化は、FcγRI、FcγRII、FcγRIII又はFcRn受容体などの受容体の可溶性形態を使用するか又は例えばADCC、CDC又はADCPを測定する細胞に基づくアッセイを使用して、Fc受容体結合アッセイにおいてアッセイされ得る。
ADCCは、標的細胞としてCD33発現細胞及びエフェクター細胞としてNK細胞を用いるインビトロアッセイを使用して評価され得る。細胞溶解は、溶解された細胞からの標識(例えば放射性基質、蛍光色素又は天然細胞内タンパク質)の放出によって検出され得る。代表的なアッセイにおいて、標的細胞は1標的細胞対4エフェクター細胞の比で使用される。標的細胞は、BATDAで予め標識され、エフェクター細胞及び試験抗体と合わせられる。試料を2時間温置し、上清への放出されたBATDAを測定することによって細胞溶解を測定する。データは、0.67%Triton X-100(Sigma Aldrich)での最大の細胞傷害性に対して正規化され、ミニマルコントロールは、抗体の非存在下での標的細胞からのBATDAの自然放出により決定される。
ADCPは、エフェクター細胞として単球由来マクロファージ及びGFP又は他の標識された分子を発現するように改変されている標的細胞として何れかのCD33発現細胞を使用することによって評価され得る。代表的なアッセイにおいて、エフェクター:標的細胞比は、例えば4:1であり得る。本発明の抗体あり又はなしで4時間にわたり標的細胞とともにエフェクター細胞を温置し得る。温置後、アキュターゼを使用して細胞を剥離し得る。マクロファージは、蛍光標識にカップリングされた抗CD11b及び抗CD14抗体で特定され得、パーセント食作用は、標準的方法を使用してCD11CD14マクロファージにおいて%GFP蛍光に基づいて決定され得る。
細胞のCDCは、例えばRPMI-B(1%BSAを添加したRPMI)中で細胞1x10個/ウェル(50μL/ウェル)でDaudi細胞を播種し、0~100μg/mLの最終濃度でウェルに50μLの試験タンパク質を添加し、室温で15分間反応物を温置し、11μLのプールヒト血清をウェルに添加し、37℃で45分間反応物を温置することによって測定され得る。パーセンテージ(%)溶解された細胞は、標準的な方法を使用したFACSアッセイにおいて%ヨウ化プロピジウム染色された細胞として検出され得る。
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、標準的な方法を使用した様々な設計の単一特異性又は多特異性タンパク質に改変され得る。
本開示は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む単一特異性タンパク質も提供する。
いくつかの実施形態では、単一特異性タンパク質は抗体である。
本開示は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質も提供する。
いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は二特異性である。
いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は三特異性である。
いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は四特異性である。
いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質はCD33への結合に対して1価である。
いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質はCD33への結合に対して2価である。
本開示は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインを含む単離された多特異性タンパク質も提供する。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、T細胞抗原である。
いくつかの実施形態では、T細胞抗原は、CD8T細胞抗原である。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、NK細胞抗原である。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cである。
特定の実施形態では、多特異性タンパク質は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメインとを含む二特異性タンパク質である。TRGV9はVγ9としても知られ、γδT細胞上で発現される。本明細書中で使用される場合、「TRGV9」という用語は、γδT細胞の表面上で発現される場合にT細胞受容体を形成可能なポリペプチドを指す。TRGV9発現γδT細胞は、とりわけヒト胎児において発生するための最初のT細胞であり、健康な成人末梢血細胞中での主なγδT細胞サブセットである。「TRGV9」という用語は、細胞(T細胞を含む)により天然に発現されるか又は本ポリペプチドをコードする遺伝子又はcDNAで形質移入された細胞上で発現され得る何らかのTRGV9変異体、アイソフォーム及び相同種を含む。示されない限り、好ましくは、TRGV9は、ヒトTRGV9である。ヒトTRGV9アミノ酸配列は、GenBank受入番号NG_001336.2により提供される。ヒトにおける主要なγ/δT細胞サブセットであるVγ9Vδ2Tリンパ球は、リン抗原、特定の腫瘍細胞及びアミノビスホスホネートで処理された細胞を認識し得る。Vγ9Vδ2Tリンパ球は、様々な腫瘍細胞に対する細胞傷害活性を示し得る。通常の技術を有する者は、γ/δTCRが、抗原認識に関与する共有結合しているγ及びδ鎖及び非共有結合単系統的タンパク質CD3δ、γ、ε及びζ鎖から構成されるヘテロ二量体TCR複合体であることを認識する。Vγ9TCRは、γ/δT細胞のサブセット上で発現されるTCRγ鎖の変異体である。
理論により縛られることを望むものではないが、TRGV9抗原及びCD33抗原の両方を発現する二特異性抗体は、CD33を発現する癌性細胞にγδT細胞を動員し得る。多特異性抗体(例えば二特異性抗体)は、癌細胞の死滅を引き起こすようにするために、エフェクター細胞(例えばγδT細胞)及び標的細胞を一緒に架橋し得る。γδT細胞は自然免疫を有し得る。理論により縛られることを望むものではないが、γδT細胞は、末梢CD3T細胞の少数集団(約1%~5%)のみに相当するが、上皮組織ではT細胞の主要なサブセット(約20%~50%)を構成する。循環γδT細胞は、Vγ9(TRGV9)及びVδ2(TRVD2)鎖のヘテロ二量体を主に発現し、一方で組織γδT細胞は、異なるVγ鎖に付随するVδ1鎖を選択的に発現する。
ヒトにおいて、γδT細胞は、強力な抗癌機能が付与される(高い細胞傷害性及びインターフェロンγ分泌)。さらに、γδT細胞は、以前は自然骨髄系列細胞にのみ限定される機能であった食作用が可能であり、αβT細胞に対して効率的な抗原提示細胞として挙動し、適応免疫反応を誘導する。γδT細胞は癌性組織、腫瘍及び癌性細胞に浸潤し得る。TRGV9抗原及びCD33抗原の両方を発現する二特異性抗体は、T細胞のリダイレクションをあまり示し得ないか又は全く示し得ず、T細胞のパン活性化をあまり示し得ず、γδT細胞の選択的な動員を介した強力な癌溶解の誘導が向上している。従って、TRGV9抗原及びCD33抗原の両方を発現する二特異性抗体は、サイトカインストーム誘導により生じ得る重篤な副作用につながり得ない。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原は、CD3εである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、F(ab’)を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fvを含む
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fdを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、scFvを含み、リンパ球抗原(例えばTRGV9)に結合する第2の結合ドメインは、VHHを含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約5~50アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約5~40アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約10~30アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、約10~20アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号109のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号110のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号111のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号112のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号113のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号114のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号115のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号116のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号117のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号118のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号119のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号120のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号121のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号122のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号123のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号124のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号125のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号126のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号127のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号128のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号129のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号130のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号131のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号132のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号133のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号134のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号135のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号136のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号137のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号138のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号139のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、L1は、配列番号140のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4、5、28、29、30、31、32、33、34、35、89、167、172、176、253、254又は255のHCDR1、配列番号6、7、8、9、10、11、36、37、38、39、40、41、42、43、44、90、91、168、173、177、256、257又は258のHCDR2、配列番号12、13、14、15、16、17、45、46、47、48、49、50、51、92、93、94、169、174、178、180、259、260又は261のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67、68、98、99、100、182、186、189、193、197、201、265又は266のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73、74、101、102、103、183、187、190、194、198、267又は268のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79、80、104、184、191、195、199、269又は270のLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;
それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80;
それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104;
それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;
それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインはTRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインはTRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインはTRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインはTRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインはTRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、scFvは、それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含み、第2の抗原結合ドメインはTRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号52のVH及び配列番号81のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号54のVH及び配列番号83のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号55のVH及び配列番号84のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号57のVH及び配列番号86のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号58のVH及び配列番号87のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号60のVH及び配列番号87のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号61のVH及び配列番号88のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号95のVH及び配列番号105のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号96のVH及び配列番号106のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号97のVH及び配列番号107のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号170のVH及び配列番号185のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号171のVH及び配列番号188のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号175のVH及び配列番号192のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号179のVH及び配列番号196のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号181のVH及び配列番号200のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号96のVH及び配列番号202のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインは、scFvである。特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインは、TRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインは、TRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含むscFvであり、第2の抗原結合は、TRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインは、TRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインは、TRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含むscFvであり、第2の抗原結合ドメインは、TRGV9に結合する(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のVLとを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号18のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号20のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号21のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号23のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号24のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号26のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号27のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号52のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号54のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号55のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号56のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号57のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号58のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号59のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号60のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号61のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号262のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号263のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号264のアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号53のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号56のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号59のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号262のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号263のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号264のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号95のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号97のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号170のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号171のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号175のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号179のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号181のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号96のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号81のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号82のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号83のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号84のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号85のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号86のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号87のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号88のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号271のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号272のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号273のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号82のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号85のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号87のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号271のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号272のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号273のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、第1の抗原結合ドメインはscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号105のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号106のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号107のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号185のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号188のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号192のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号196のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号200のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号202のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号203のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号204のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号205のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号207のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号208のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号209のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号210のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号211のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号212のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号213のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号215のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号216のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号217のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号218のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号219のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号221のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号274のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号275のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号276のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号213のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号216のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号219のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号274のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号275のアミノ酸配列を含む。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号276のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号213のアミノ酸配列を含むscFvであり、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメイン(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)である。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号216のアミノ酸配列を含むscFvであり、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメイン(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)である。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号219のアミノ酸配列を含むscFvであり、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメイン(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)である。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号274のアミノ酸配列を含むscFvであり、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメイン(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)である。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号275のアミノ酸配列を含むscFvであり、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメイン(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)である。
他の実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号276のアミノ酸配列を含むscFvであり、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメイン(例えば、ここで、第2の結合ドメインは、VHHである)である。いくつかの実施形態では、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
配列番号141のHCDR1、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144のLCDR1、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第2のIg定常領域の断片に複合化される。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、Fc領域を含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、CH2ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、CH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域の断片及び/又は第2のIg定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、多特異性タンパク質は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む。
いくつかの実施形態では、L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG2アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG3アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG4アイソタイプである。
第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、本明細書中に記載のようにさらに改変され得る。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、FcγRへの本多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む。特定のこのような実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。
特定の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、L234A/L235A/D265S突然変異を含み、残基の付番は、EUインデックスに従う。特定のこのような実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への本多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、FcγRへの本多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L、M252Y/S254T/T256E及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。
特定の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、M252Y/S254T/T256E突然変異を含み、残基の付番は、EUインデックスに従う。特定のこのような実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、L234A/L235A/D265S及びM252Y/S254T/T256E突然変異を含み、残基の付番は、EUインデックスに従う。特定の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。いくつかの実施形態では、FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、本多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、プロテインAへの結合を調整する少なくとも1つの突然変異を含む。このような修飾は、抗体産生中の精製目的に有利であり得る。
特定の実施形態では、プロテインAへの結合を調整する少なくとも1つの突然変異はH435/Y436Fであり、残基の付番は、EUインデックスに従う。特定のこのような実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、L234A/L235A/D265S、M252Y/S254T/T256E及びH435/Y436F突然変異を含み、残基の付番は、EUインデックスに従う。特定の実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。いくつかの実施形態では、本多特異性タンパク質は、第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域のCH3ドメインの断片における少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う。
いくつかの実施形態では、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の突然変異を含む:
第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V。
CD33に結合する抗原結合断片を含む多特異性タンパク質の作製
本開示のCD33を結合する抗原結合断片は、本発明の範囲内に包含される多特異性抗体にも改変され得る。
CD33を結合する抗原結合断片は、Fabアーム交換を使用して作製される全長多特異性抗体に改変され得、ここで、インビトロでFabアーム交換を促進するIg定常領域CH3ドメイン内において2つの単一特異性二価抗体に置換が導入される。この方法において、2つの単一特異性二価抗体は、ヘテロ二量体安定性を促進するCH3ドメインでの特定の置換を有するように改変され;この抗体は、ヒンジ領域のシステインがジスルフィド結合異性化を受けることを可能にするのに十分な還元条件下で一緒に温置され;それによりFabアーム交換によって二特異性抗体を生成させる。温置条件は、最適には、非還元に回復され得る。使用され得る代表的な還元剤は、2-メルカプトエチルアミン(2-MEA)、ジチオスレイトール(DTT)、ジチオエリスリトール(DTE)、グルタチオン、トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン(TCEP)、L-システイン及びベータ-メルカプトエタノール、好ましくは2-メルカプトエチルアミン、ジチオスレイトール及びトリス(2-カルボキシエチル)ホスフィンからなる群から選択される還元剤である。例えば、pH5~8での、例えばpH7.0での又はpH7.4での少なくとも25mM 2-MEA存在下での又は少なくとも0.5mMジチオスレイトールの存在下での、少なくとも20℃の温度での少なくとも90分にわたる温置が使用され得る。
使用され得るCH3突然変異は、ノブ-イン-ホール(Knob-in-Hole)突然変異(Genentech)、静電的に合致する突然変異(Chugai、Amgen、NovoNordisk、Oncomed)、鎖交換改変ドメインボディ(SEEDbody)(EMD Serono)、Duobody(登録商標)突然変異(Genmab)及び他の非対称突然変異(例えばZymeworks)などの技術を含む。
ノブ-イン-ホール突然変異は、例えば、国際公開第1996/027011号パンフレットで開示され、小さい側鎖があるアミノ酸(ホールが第1のCH3領域に導入され、大きい側鎖があるアミノ酸(ノブ)が第2のCH3領域に導入され、その結果、第1のCH3領域と第2のCH3領域との間で優先的な相互作用が起こる、CH3領域の界面での突然変異を含む。ノブ及びホールを形成する代表的なCH3領域突然変異は、T366Y/F405A、T366W/F405W、F405W/Y407A、T394W/Y407T、T394S/Y407A、T366W/T394S、F405W/T394S及びT366W/T366S_L368A_Y407Vである。
重鎖ヘテロ二量体形成は、米国特許出願公開第2010/0015133号明細書、同第2009/0182127号明細書、同第2010/028637号明細書又は同第2011/0123532号明細書に記載のように、第1のCH3領域で正荷電残基及び第2のCH3領域で負荷電残基を置換することにより静電気的相互作用を使用することによって促進され得る。
重鎖ヘテロ二量体化を促進するために使用され得る他の非対称突然変異は、米国特許出願公開第2012/0149876号明細書又は同第2013/0195849号明細書(Zymeworks)に記載のような、L351Y_F405A_Y407V/T394W、T366I_K392M_T394W/F405A_Y407V、T366L_K392M_T394W/F405A_Y407V、L351Y_Y407A/T366A_K409F、L351Y_Y407A/T366V_K409F、Y407A/T366A_K409F又はT350V_L351Y_F405A_Y407V/T350V_T366L_K392L_T394Wである。
SEEDbody突然変異は、米国特許出願公開第20070287170号明細書に記載のように、重鎖ヘテロ二量体化を促進するためにIgA残基で選択IgG残基を置換することを含む。
使用され得る他の代表的な突然変異は、国際公開第2007/147901号パンフレット、同第2011/143545号パンフレット、同第2013157954号パンフレット、同第2013096291号パンフレット及び米国特許出願公開第2018/0118849号明細書に記載のように、R409D_K370E/D399K_E357K、S354C_T366W/Y349C_T366S_L368A_Y407V、Y349C_T366W/S354C_T366S_L368A_Y407V、T366K/L351D、L351K/Y349E、L351K/Y349D、L351K/L368E、L351Y_Y407A/T366A_K409F、L351Y_Y407A/T366V_K409F、K392D/D399K、K392D/E356K、K253E_D282K_K322D/D239K_E240K_K292D、K392D_K409D/D356K_D399Kである。
Duobody(登録商標)突然変異(Genmab)は、例えば米国特許第9150663号明細書及び米国特許出願公開第2014/0303356号明細書で開示され、突然変異F405L/K409R、野生型/F405L_R409K、T350I_K370T_F405L/K409R、K370W/K409R、D399AFGHILMNRSTVWY/K409R、T366ADEFGHILMQVY/K409R、L368ADEGHNRSTVQ/K409AGRH、D399FHKRQ/K409AGRH、F405IKLSTVW/K409AGRH及びY407LWQ/K409AGRHを含む。
CD33に結合する抗原結合ドメインが組み込まれ得るさらなる二特異性又は多特異性構造は、二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD)(国際公開第2009/134776号パンフレット;DVDは、構造VH1-リンカー-VH2-CHを有する重鎖及び構造VL1-リンカー-VL2-CLを有する軽鎖を含む全長抗体であり;リンカーは任意選択的である)、ロイシンジッパー又はコラーゲン二量体化ドメインなど、異なる特異性を有する2つの抗体アームを連結するための様々な二量体化ドメインを含む構造(国際公開第2012/022811号パンフレット、米国特許第5,932,448号明細書;同第6,833,441号明細書)、一緒に複合化される2つ以上のドメイン抗体(dAbs)、ダイアボディ、ラクダ抗体及び改変ラクダ抗体などの重鎖のみの抗体、二重標的化(DT)-Ig(GSK/Domantis)、ツーインワン抗体(Genentech)、架橋されたMab(Karmanos Cancer Center)、mAb2(F-Star)及びCovX-body(CovX/Pfizer)、IgG様二特異性(InnClone/Eli Lilly)、Ts2Ab(MedImmune/AZ)及びBsAb(Zymogenetics)、HERCULES(Biogen Idec)及びTvAb(Roche)、ScFv/Fc融合物(Academic Institution)、SCORPION(Emergent BioSolutions/Trubion,Zymogenetics/BMS)、二重親和性再標的化技術(Fc-DART)(MacroGenics)及び二重(ScFv)-Fab(National Research Center for Antibody Medicine--China)、二重作用又はBis-Fab(Genentech)、Dock-and-Lock(DNL)(ImmunoMedics)、二価二特異性(Biotecnol)及びFab-Fv(UCB-Celltech)を含む。ScFv-、ダイアボディに基づく及びドメイン抗体としては、二特異性T細胞Engager(BiTE)(Micromet)、タンデムダイアボディ(Tandab)(Affimed)、二重親和性再標的化技術(DART)(MacroGenics)、単鎖ダイアボディ(Academic)、TCR様抗体(AIT、受容体Logics)、ヒト血清アルブミンScFv融合(Merrimack)及びCOMBODY(Epigen Biotech)、二重標的化ナノボディ(Ablynx)、二重標的化重鎖単独ドメイン抗体が挙げられるが、限定されない。
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、3本のポリペプチド鎖を含む多特異性タンパク質にも改変され得る。このような設計において、少なくとも1つの抗原結合ドメインはscFvの形態である。代表的な設計は、以下のものを含む(ここで、「1」は、第1の抗原結合ドメインを示し、「2」は、第2の抗原結合ドメインを示し、「3」は、第3の抗原結合ドメインを示す:
設計1:鎖A)scFv1-CH2-CH3;鎖B)VL2-CL;鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
設計2:鎖A)scFv1-ヒンジ-CH2-CH3;鎖B)VL2-CL;鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
設計3:鎖A)scFv1-CH1-ヒンジ-CH2-CH3;鎖B)VL2-CL;鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3
設計4:鎖A)CH2-CH3-scFv1;鎖B)VL2-CL;鎖C)VH2-CH1-ヒンジ-CH2-CH3。
CH3改変は、米国特許出願公開第2012/0149876号明細書又は同第2013/0195849号明細書(Zymeworks)に記載のように、突然変異L351Y_F405A_Y407V/T394W、T366I_K392M_T394W/F405A_Y407V、T366L_K392M_T394W/F405A_Y407V、L351Y_Y407A/T366A_K409F、L351Y_Y407A/T366V_K409F、Y407A/T366A_K409F又はT350V_L351Y_F405A_Y407V/T350V_T366L_K392L_T394Wなど、設計1~4に組み込まれ得る。
アイソタイプ、アロタイプ及びFc改変
Ig定常領域又はIg定常領域の断片、例えば本開示のタンパク質に存在するFc領域は、何れかのアロタイプ又はアイソタイプであり得る。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG2アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG3アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG4アイソタイプである。
Ig定常領域又はIg定常領域の断片は何れかのアロタイプであり得る。アロタイプは、結合又はFc介在性エフェクター機能などのIg定常領域の特性に対して影響がないことが予想される。その断片のIg定常領域を含む治療用タンパク質の免疫原性は、急性輸液反応のリスク向上及び治療反応の持続時間の短縮と関連する(Baert et al.,(2003)N Engl J Med 348:602-08)。その断片のIg定常領域を含む治療用タンパク質が宿主において免疫反応を誘導する程度は、一部Ig定常領域のアロタイプにより決定され得る(Stickler et al.,(2011)Genes and Immunity 12:213-21)。Ig定常領域アロタイプは、本抗体の定常領域配列における特異的な位置でのアミノ酸配列のバリエーションに関連する。表2は、選択されるIgG1、IgG2及びIgG4アロタイプを示す。
Figure 2023517660000008
C末端リジン(CTL)は、血流中の内因性循環カルボキシペプチダーゼによりIg定常領域から除去され得る(Cai et al.,(2011)Biotechnol Bioeng 108:404-412)。製造中、CTL除去は、米国特許出願公開第20140273092号明細書に記載のように、細胞外Zn2+、EDTA又はEDTA-Fe3+の濃度の調節により最大レベル未満まで調節され得る。タンパク質のCTL含量は既知の方法を使用して測定され得る。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に複合化されるCD33に結合する抗原結合断片のC末端リジン含量は約10%~約90%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は約20%~約80%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は約40%~約70%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は約55%~約70%である。いくつかの実施形態では、C末端リジン含量は約60%である。
ADCC、ADCP及び/又はADCP及び/又は薬物動態学的特性など、それらのエフェクター機能を調整するために、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインに対してFc領域突然変異が行われ得る。これは、活性化するFcγR(FcγRI、FcγRIIA、FcγRIII)、抑制性のFcγRIIbに及び/又はFcRnに対する突然変異Fcの結合を調整する、Fcへの突然変異を導入することによって達成され得る。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、Ig定常領域において又はIg定常領域の断片において少なくとも1つの突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの突然変異はFc領域にある。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、Fc領域において少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14又は15個の突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、FcRnへの抗体の結合を調整するFc領域における少なくとも1つの突然変異を含む。
半減期(例えばFcRnへの結合)を調整するために突然変異させ得るFc位置としては、位置250、252、253、254、256、257、307、376、380、428、434及び435が挙げられる。単独で又は組み合わせて行われ得る代表的な突然変異は、突然変異T250Q、M252Y、I253A、S254T、T256E、P257I、T307A、D376V、E380A、M428L、H433K、N434S、N434A、N434H、N434F、H435A及びH435Rである。半減期を延長するために行われ得る代表的な単一又は組み合わせ突然変異は、突然変異M428L/N434S、M252Y/S254T/T256E、T250Q/M428L、N434A及びT307A/E380A/N434Aである。半減期を短縮させるため行われ得る代表的な単一又は組み合わせ突然変異は、突然変異H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rである。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、M252Y/S254T/T256E突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、活性化するFcγ受容体(FcγR)へのタンパク質の結合を減少させ、且つ/又はC1q結合、補体依存性細胞傷害性(CDC)、抗体依存性細胞介在性細胞傷害性(ADCC)又は食作用(ADCP)などのFcエフェクター機能を低下させる、Fc領域における少なくとも1つの突然変異を含む。
活性化するFcγRへのタンパク質の結合を減少させ、続いてエフェクター機能を低下させるために突然変異させ得るFc位置としては、位置214、233、234、235、236、237、238、265、267、268、270、295、297、309、327、328、329、330、331及び365が挙げられる。単一で又は組み合わせてなされ得る代表的な突然変異は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4における、突然変異K214T、E233P、L234V、L234A、G236の欠失、V234A、F234A、L235A、G237A、P238A、P238S、D265A、S267E、H268A、H268Q、Q268A、N297A、A327Q、P329A、D270A、Q295A、V309L、A327S、L328F、A330S及びP331Sである。ADCCが低下したタンパク質を生じさせる代表的な組み合わせ突然変異は、IgG1における突然変異L234A/L235A、IgG1におけるL234A/L235A/D265S、IgG2におけるV234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、IgG4におけるF234A/L235A、IgG4におけるS228P/F234A/L235A、全IgアイソタイプにおけるN297A、IgG2におけるV234A/G237A、IgG1におけるK214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、IgG2におけるH268Q/V309L/A330S/P331S、IgG1におけるS267E/L328F、IgG1におけるL234F/L235E/D265A、IgG1におけるL234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、IgG4におけるS228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びIgG4におけるS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sである。IgG2からの残基117~260及びIgG4からの残基261~447を有するFcなど、ハイブリッドIgG2/4Fcドメインも使用され得る。
CDCが低下したタンパク質を生じさせる代表的な突然変異はK322A突然変異である。
IgG4安定性を促進するためにIgG4において周知のS228P突然変異がなされ得る。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、K214T、E233P、L234V、L234A、G236の欠失、V234A、F234A、L235A、G237A、P238A、P238S、D265A、S267E、H268A、H268Q、Q268A、N297A、A327Q、P329A、D270A、Q295A、V309L、A327S、L328F、K322、A330S及びP331Sからなる群から選択される少なくとも1つの突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、L234A/L235A/D265S突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、L234A/L235A突然変異を含む。
いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、Fcγ受容体(FcγR)への本タンパク質の結合を増強し、且つ及び/又はC1q結合、補体依存性細胞傷害性(CDC)、抗体依存性細胞介在性細胞傷害性(ADCC)及び/又は食作用(ADCP)などのFcエフェクター機能を促進するFc領域における少なくとも1つの突然変異を含む。
活性化するFcγRへの本タンパク質の結合を増加させる及び/又はFcエフェクター機能を向上させるために突然変異させ得るFc位置としては、位置236、239、243、256、290、292、298、300、305、312、326、330、332、333、334、345、360、339、378、396又は430(残基はEUインデックスに従い付番)が挙げられる。単一で又は組み合わせて行われ得る代表的な突然変異は、G236A、S239D、F243L、T256A、K290A、R292P、S298A、Y300L、V305L、K326A、A330K、I332E、E333A、K334A、A339T及びP396Lである。ADCC又はADCPが向上したタンパク質を生じさせる代表的な組み合わせ突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eである。
CDCを促進するために突然変異させられ得るFc位置としては、位置267、268、324、326、333、345及び430が挙げられる。単一で又は組み合わせてなされ得る代表的な突然変異は、S267E、F1268F、S324T、K326A、K326W、E333A、E345K、E345Q、E345R、E345Y、E430S、E430F及びE430Tである。CDCが向上したタンパク質を生じさせる代表的な組み合わせ突然変異は、K326A/E333A、K326W/E333A、H268F/S324T、S267E/H268F、S267E/S324T及びS267E/H268F/S324Tである。
本明細書中に記載の具体的な突然変異は、それぞれ配列番号222、223及び224の、IgG1、IgG2及びIgG4野生型アミノ酸配列と比較した場合の突然変異である。
配列番号222、野生型IgG1
Figure 2023517660000009

配列番号223;野生型IgG2
Figure 2023517660000010

配列番号224;野生型IgG4
Figure 2023517660000011
FcγR又はFcRnへの抗体の結合は、フローサイトメトリーを使用して、各受容体を発現するように改変された細胞においてアッセイされ得る。代表的な結合アッセイにおいて、2×10個の細胞/ウェルを96ウェルプレートに播種し、4℃で30分間、BSA染色緩衝液(BD BioscienceS,San Jose,USA)中でブロッキング処理する。4℃において1.5時間、氷上で試験抗体とともに細胞を温置する。BSA染色緩衝液で2回洗浄後、4℃で45分間、R-PE標識された抗ヒトIgG二次抗体(Jackson Immunoresearch Laboratories)とともに細胞を温置する。染色緩衝液中で細胞を2回洗浄し、次いで150μLの1:200希釈DRAQ7live/dead染色(Cell Signaling Technology,Danvers,USA)を含有する染色緩衝液中で再懸濁する。染色された細胞のPE及びDRAQ7シグナルは、それぞれB2及びB4チャネルを使用して、Miltenyi MACSQuantフローサイトメーター(Miltenyi Biotec,Auburn,USA)によって検出する。生細胞をDRAQ7排除でゲーティングし、回収された少なくとも10,000回のライブ事象に対して幾何平均蛍光シグナルを決定する。FlowJoソフトウェア(Tree Star)を分析のために使用する。データは、抗体濃度の対数対平均蛍光シグナルとしてプロットする。非線形回帰分析を行う。
糖鎖工学
Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインがADCCに介在する能力は、Ig定常領域又はIg定常領域オリゴ糖構成成分の断片を改変することによって促進され得る。ヒトIgG1又はIgG3は、周知の二分岐G0、G0F、G1、G1F、G2又はG2F形態においてグリカンの多数によりAsn297でN-グリコシル化される。Ig定常領域を含有するタンパク質は、一般的には少なくとも約85%のグリカンフコース含量を有する非改変CHO細胞により作製され得る。Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインに連結される二分岐複合型オリゴ糖からのコアフコースの除去により、抗原結合又はCDC活性を変化させることなく、FcγRIIIa結合の改善を介して、タンパク質のADCCが増強される。このようなタンパク質は、培養浸透圧の調節(Konno et al.,Cytotechnology 64(:249-65,2012)、宿主細胞株としての変異CHO株Lec13の適用(Shields et al.,J Biol Chem277:26733-26740,2002)、宿主細胞株としての変異CHO株EB66の適用(Olivier et al.,MAbs;2(4):405-415,2010;PMID:20562582)、宿主細胞株としてのラットハイブリドーマ細胞株YB2/0の適用(Shinkawa et al.,J Biol Chem 278:3466-3473,2003)、特異的に1,6-フコシルトランスフェラーゼ(FUT8)遺伝子に対する低分子干渉RNAの導入(Mori et al.,Biotechnol Bioeng 88:901-908,2004)又はβ-1,4-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII及びゴルジα-マンノシダーゼII又は強力なアルファ-マンノシダーゼI阻害剤、キフネンシンの同時発現(Ferrara et al.,J Biol Chem 281:5032-5036,2006,Ferrara et al.,Biotechnol Bioeng 93:851-861、2006;Xhou et al.,Biotechnol Bioeng 99:652-65,2008)など、二分岐複合型のFcオリゴ糖を有する比較的高度に脱フコシル化された免疫グロブリンの良好な発現につながることが報告される様々な方法を使用して達成され得る。
いくつかの実施形態では、本開示のIg定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、フコース含量が約1%~約15%、例えば約15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%又は1%である二分岐グリカン構造を有する。いくつかの実施形態では、Ig定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、フコース含量が約50%、40%、45%、40%、35%、30%、25%又は20%であるグリカン構造を有する。
「フコース含量」は、Asn297での糖鎖内でのフコース単糖の量を意味する。フコースの相対量は、全ての糖構造に関するフコース含有構造のパーセンテージである。これらは、複数の方法、例えば:1)国際公開第2008/077546 2)号明細書に記載のようなN-グリコシダーゼFで処理した試料(例えば複合体、ハイブリッド及びオリゴ-及び高マンノース構造)のMALDI-TOFを使用して;2)続く誘導体化でのAsn297グリカンの酵素的放出及び蛍光検出及び/又はHPLC-MS(UPLC-MS)を用いたHPLC(UPLC)による検出/定量により;3)第1のGlcNAcに連結されるフコースを除去する、Endo S又は第1のGlcNAc単糖と第2のGlcNAc単糖との間で切断する他の酵素でのAsn297グリカンの処理あり又はなしのネイティブ又は還元mAbのインタクトなタンパク質分析;4)酵素性消化(例えばトリプシン又はエンドペプチダーゼLys-C)による構成ペプチドへのmAbの消化及びHPLC-MS(UPLC-MS)によるその後の分離、検出及び定量;5)Asn297におけるPNGase Fでの特異的な酵素性脱グリコシル化によるmAbタンパク質からのmAbオリゴ糖の分離によって特徴評価され、定量され得る。このように放出されたオリゴ糖は、フルオロフォアで標識され、分離され、実験的質量と理論的質量の比較によるマトリクス支援レーザー脱離イオン化(MALDI)質量分析によるグリカン構造の精密な特徴評価、イオン交換HPLC(GlycoSep C)によるシアル酸付加の度合いの決定、順相HPLC(GlycoSep N)による親水性基準に従うオリゴ糖形態の分離及び定量及び高性能キャピラリー電気泳動-レーザー誘起蛍光(HPCE-LIF)によるオリゴ糖の分離及び定量を可能にする様々な補完的技術によって同定され得る。
「低フコース」又は「低フコース含量」は、本明細書中で使用される場合、CD33に結合する抗原結合ドメインが、フコース含量が約1%~15%であるIg定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されることを指す。
「正常なフコース」又は「正常なフコース含量」は、本明細書中で使用される場合、CD33に結合する抗原結合ドメインが、フコース含量が約50%超、一般的には約80%超又は85%超であるIg定常領域に又はIg定常領域の断片に複合化されることを指す。
抗イディオタイプ抗体
抗イディオタイプ抗体は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する抗体である。
本発明は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明は、
配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
配列番号181のVH及び配列番号200のVL;
配列番号96のVH及び配列番号202のVL;
配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
特定の実施形態では、抗イディオタイプ抗体は、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する。
他の実施形態では、抗イディオタイプ抗体は、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する。
他の実施形態では、抗イディオタイプ抗体は、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する。
他の実施形態では、抗イディオタイプ抗体は、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する。
他の実施形態では、抗イディオタイプ抗体は、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する。
他の実施形態では、抗イディオタイプ抗体は、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメインに特異的に結合する。
抗イディオタイプ(Id)抗体は、抗体の抗原決定基(例えばパラトープ又はCDR)を認識する抗体である。Id抗体は、抗原遮断又は非遮断であり得る。抗原遮断Idは、試料中の遊離抗原結合ドメイン(例えば本開示のCD33に結合する抗原結合ドメイン)を検出するために使用され得る。非遮断Idは、試料中の全抗体(遊離、抗原に部分的に結合又は抗原に完全に結合)を検出するために使用され得る。Id抗体は、抗Idが調製される抗体で動物に免疫付与することによって調製され得る。
抗Id抗体は、所謂抗抗Id抗体を産生する、また別の動物において免疫反応を誘導するために免疫原としても使用され得る。抗抗Idは、抗Idを誘導したオリジナルの抗原結合ドメインとエピトープ的に同一であり得る。従って、抗原結合ドメインのイディオタイプ決定基に対する抗体を使用することにより、同一である特異性の抗原結合ドメインを発現する他のクローンを同定することが可能である。抗Id抗体は変動し得(それにより抗Id抗体変異体を産生する)及び/又は何らかの適切な技術、例えば本明細書中の他の箇所に記載されるものなどにより誘導体化され得る。
免疫複合体
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメイン、CD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質又はCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質(まとめて本明細書中でCD33結合タンパク質と呼ぶ)は、異種分子に複合化され得る。CD33結合タンパク質は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)も含む。
いくつかの実施形態では、異種分子は、検出可能な標識又は細胞傷害剤である。
本発明は、検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインも提供する。
本発明は、検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質も提供する。
本発明は、検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質も提供する。
本発明は、検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARも提供する。
本発明は、細胞傷害剤に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインも提供する。
本発明は、細胞傷害剤に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質も提供する。
本発明は、細胞傷害剤に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質も提供する。
本発明は、細胞傷害剤に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARも提供する。
本開示のCD33結合タンパク質は、骨髄系列のものなど、CD33発現細胞に対する治療剤を方向付けるために使用され得る。代わりに、CD33発現細胞は、内部移行したら細胞機能を調整することが意図される治療剤にカップリングされる本開示のCD33結合タンパク質で標的化され得る。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は細胞傷害剤でもある。
検出可能な標識に複合化される本開示のCD33結合タンパク質は、様々な試料においてCD33の発現を評価するために使用され得る。
検出可能な標識は、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的又は化学的手段を介して、本開示のCD33結合タンパク質に複合化された場合に後者を検出可能にする組成物を含む。
代表的な検出可能な標識としては、放射性同位体、磁気ビーズ、金属ビーズ、コロイド粒子、蛍光顔料、高電子密度試薬、酵素(例えばELISAで一般に使用されるような)、ビオチン、ジゴキシンゲニン、ハプテン、発光分子、化学発光分子、蛍光色素、フルオロフォア、蛍光消光剤、着色分子、放射性同位体、シンチレート、アビジン、ストレプトアビジン、プロテインA、タンパク質G、抗体又はその断片、ポリヒスチジン、Ni2+、Flagタグ、mycタグ、重金属、酵素、アルカリホスファターゼ、ペルオキシダーゼ、ルシフェラーゼ、電子供与体/受容体、アクリジニウムエステル及び比色基質が挙げられる。
参照により本明細書中に組み込まれる国際公開第2019/125982号パンフレットで開示される標識の何れかが使用され得る。
検出可能な標識は、検出可能な標識が放射性同位体である場合など、シグナルを自発的に放射し得る。他の場合、検出可能な標識は、外部場により刺激される結果としてシグナルを放射する。
代表的な放射性同位体は、γ-放射、Auger-放射、β-放射、アルファ-放射又は陽電子-放射する、放射性同位体であり得る。代表的な放射性同位体としては、H、11C、13C、15N、18F、19F、55Co、57Co、60Co、61Cu、62Cu、64Cu、67Cu、68Ga、72As、75Br、86Y、89Zr、90Sr、94mTc、99mTc、115In、1231、1241、125I、1311、211At、212Bi、213Bi、223Ra、226Ra、225Ac及び227Acが挙げられる。
いくつかの実施形態では、放射性同位体は、例えば細胞死滅を促進することなどにより、治療目的のために使用される。細胞死滅を促進するために使用される放射性同位体としては、32P、47Sc、67Cu、77As、89Sr、90Y、99Tc、105Rh、109Pd、111Ag、131I、153Sm、159Gd、165Dy、166Ho、169Er、186Re、188Re、194Ir、198Au、199Au、211At、212Pb、212Bi、213Bi、223Ra、255Fm及び227Thが挙げられるが、限定されない。理論により縛られることを望むものではないが、治療目的のために使用される放射性同位体を含むCD33結合タンパク質は、標的細胞により内部移行させられ、標的細胞により死滅させられ得る。
放射性同位体と複合化されたCD33結合タンパク質を使用した放射性免疫療法は、局所的又は散在性の腫瘍を処置するために有益であり得る。いくつかの実施形態では、対象は、腫瘍関連抗原に対して又は腫瘍微小環境に対して特異的に向けられる放射性標識モノクローナル抗体の投与によって処置される。放射性標識(例えばAc225)治療は、CD33を発現する細胞での血液悪性腫瘍の処置に関する場合など、細胞死滅のために低用量を必要とし、非常に有効であり得る。
いくつかの実施形態では、放射性同位体は、CD33結合タンパク質が関心対象の組織に標的化されているか否かを示すための試験のためなど、イメージングを促進するために使用される。イメージングを促進するために使用される代表的な同位体としては、62Cu、64Cu、67Ga、68Ga、86Y、89Zr及び111Inが挙げられるが、限定されない。
代表的な金属原子は、20より大きい原子番号の金属であり、例えばカルシウム原子、スカンジウム原子、チタン原子、バナジウム原子、クロム原子、マンガン原子、鉄原子、コバルト原子、ニッケル原子、銅原子、亜鉛原子、ガリウム原子、ゲルマニウム原子、ヒ素原子、セレン原子、臭素原子、クリプトン原子、ルビジウム原子、ストロンチウム原子、イットリウム原子、ジルコニウム原子、ニオビウム原子、モリブデン原子、テクネチウム原子、ルテニウム原子、ロージウム原子、パラジウム原子、銀原子、カドミウム原子、インジウム原子、スズ原子、アンチモニー原子、テルリウム原子、ヨウ素原子、キセノン原子、セシウム原子、バリウム原子、ランタン原子、ハフニウム原子、タンタルム原子、タングステン原子、レニウム原子、オスミウム原子、イリジウム原子、白金原子、金原子、水銀原子、タリウム原子、鉛原子、ビスマス原子、フランシウム原子、ラジウム原子、アクチニウム原子、セリウム原子、プラセオジム原子、ネオジミウム原子、プロメチウム原子、サマリウム原子、ユーロピウム原子、ガドリニウム原子、テルビウム原子、ジスプロシウム原子、ホルミウム原子、エルビウム原子、タリウム原子、イッテルビウム原子、ルテチウム原子、トリウム原子、プロタクチニウム原子、ウラニウム原子、ネプツニウム原子、プルトニウム原子、アメリシウム原子、キュリウム原子、ベルケリウム原子、カリホルニウム原子、アインスタイニウム原子、フェルミウム原子、メンデレビウム原子、ノベリウム原子又はローレンシウム原子などである。
いくつかの実施形態では、金属原子は、12より大きい原子数のアルカリ土類金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、ランタニドであり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、アクチニドであり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、遷移金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、卑金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、金原子、ビスマス原子、タンタル原子及びガドリニウム原子であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、原子番号が53(即ちヨウ素)~83(即ちビスマス)の金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、磁気共鳴画像法に適切な原子であり得る。
金属原子は、+1、+2又は+3酸化状態の形態の金属イオンであり得、例えばBa2+、Bi3+、Cs、Ca2+、Cr2+、Cr3+、Cr6+、Co2+、Co3+、Cu、Cu2+、Cu3+、Ga3+、Gd3+、Au、Au3+、Fe2+、Fe3+、F3+、Pb2+、Mn2+、Mn3+、Mn4+、Mn7+、Hg2+、Ni2+,、Ni3+、Ag、Sr2+、Sn2+、Sn4+及びZn2+などである。金属原子は、金属酸化物、例えば酸化鉄、酸化マンガン又は酸化ガドリニウムなどを含み得る。
適切な色素としては、何れかの市販の色素、例えば、5(6)-カルボキシフルオレセイン、IRDye 680RDマレイミド又はIRDye 800CW、ルテニウムポリピリジル色素などである。
適切なフルオロフォアは、フルオレセインイソチイオシアネート(FITC)、フルオレセインチオセミカルバジド、ローダミン、Texas Red、CyDyes(例えばCy3、Cy5、Cy5.5)、Alexa Fluors(例えば、Alexa488、Alexa555、Alexa594;Alexa647)、近赤外(NIR)(700~900nm)蛍光色素及びカルボシアニン及びアミノスチリル色素である。
検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインは、造影剤として使用され得る。
検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質は、造影剤として使用され得る。
検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質は、造影剤として使用され得る。
検出可能な標識に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARは、造影剤として使用され得る。
いくつかの実施形態では、細胞傷害剤は、化学療法薬、薬物、成長抑制剤、毒素(例えば、細菌性、真菌性、植物又は動物起源の酵素的に活性の毒素若しくはそれらの断片)又は放射性同位体(即ち放射性複合物)である。
いくつかの実施形態では、細胞傷害剤は、ダウノマイシン、ドキソルビシン、メトトレキサート、ビンデシン、ジフテリア毒素などの細菌性毒素、リシン、ゲルダナマイシン、マイタンシノイド又はカリケアマイシンである。細胞傷害剤は、チューブリン結合、DNA結合又はトポイソメラーゼ阻害を含む機序により、それらの細胞傷害性及び細胞増殖抑制性の効果を発揮し得る。
いくつかの実施形態では、細胞傷害剤は、酵素的に活性のある毒素であり、例えばジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の非結合活性断片、外毒素A鎖(シュードモナス・エアルギノーサ(Pseudomonas aeruginosa)由来)、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデシンA鎖、アルファ-サルシン、アレウリテス・フォルディイ(Aleurites fordii)タンパク質、ジアンチンタンパク質、フィトラカ・アメリカナ(Phytolaca americana)タンパク質(PAPI、PAPII及びPAP-S)、モモルディカ・チャランティア(momordica charantia)阻害剤、クルシン、クロチン、サパオナリア・オフィシナリス(sapaonaria officinalis)阻害剤、ジェロニン、ミトゲリン、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン及びトリコテセンなどである。
いくつかの実施形態では、細胞傷害剤は、放射性核種、例えば212Bi、131I、131In、90Y及び186Reなどである。
いくつかの実施形態では、細胞傷害剤は、ドラスタチン又はドロスタチンペプチド性類似物及び誘導体、オーリスタチン又はモノメチルオーリスタチンフェニルアラニンである。代表的な分子は、米国特許出願公開第5,635,483号明細書及び同第5,780,588号明細書で開示される。ドラスタチン及びオーリスタチンは、微小管ダイナミクス、GTP加水分解並びに核分裂及び細胞分裂を妨害することが示されており(Woyke et al(2001)Antimicrob Agents and Chemother.45(12):3580-3584)、抗癌活性及び抗真菌活性を有する。ドラスタチン又はオーリスタチン薬部分は、ペプチド薬部分のN(アミノ)末端又はC(カルボキシル)末端を通して(国際公開第02/088172号パンフレット)又は抗体に操作された何れかのシステインを介して本発明の抗体に連結され得る。
本開示のCD33結合タンパク質は、既知の方法を使用して検出可能な標識に複合化され得る。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、キレート剤と複合化される。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、リンカーを介して本開示のCD33結合タンパク質に複合化される。
検出可能な標識又は細胞傷害性部分は、既知の方法を使用して、本開示のCD33結合タンパク質に直接又は間接的に連結され得る。適切なリンカーは、当技術分野で公知であり、例えば、補欠分子族、非フェノールリンカー(N-スクシミジル-ベンゾアートの誘導体;ドデカボラート)、大環状及び非環式キレート剤の両方のキレート部分、例えば1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-1,4,7,10,四酢酸(DOTA)の誘導体、ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)の誘導体、S-2-(4-イソチオシアナトベンジル)-1,4,7-トリアザシクロノナン-1,4,7-三酢酸(NOTA)の誘導体及び1,4,8,11-テトラアザシクロドセダン-1,4,8,11-四酢酸(TETA)の誘導体、N-スクシンイミジル-3-(2-ピリジルジチオール)プロピオナート(SPDP)、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの二官能誘導体(アジプイミド酸ジメチルHClなど)、活性エステル(スベリン酸ジスクシンイミジルなど)、アルデヒド(グルタルアルデヒドなど)、ビスアジド化合物(ビス(p-アジドベンゾイル)ヘキサンジアミンなど)、ビスジアゾニウム誘導体(ビス-(p-ジアゾニウムベンゾイル)-エチレンジアミンなど)、ジイソシアネート(トルエン2,6-ジイソシアネートなど)及びビス活性フッ素化合物(1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼンなど)及び他のキレート部分が挙げられる。適切なペプチドリンカーは周知である。
いくつかの実施形態では、本開示のCD33結合タンパク質は、腎臓クリアランスを介して血液から除去される。
キット
本発明は、本明細書中に記載のCD33に結合する抗原結合ドメインの何れかを含むキットも提供する。
本発明は、本明細書中に記載のCD33に結合する抗原結合ドメインの何れかを含むタンパク質を含むキットも提供する。
本発明は、CD33に結合する抗原結合ドメインを含む本明細書中に記載の多特異性タンパク質の何れかを含むキットも提供する。
本発明は、CD33に結合する本明細書中に記載の抗原結合ドメインの何れかを含むCARを含むキットも提供する。
本キットは、治療的使用のために及び診断キットとして使用され得る。
本キットは、試料中でのCD33の存在を検出するために使用され得る。
いくつかの実施形態では、本キットは、本開示のCD33結合タンパク質及びCD33結合タンパク質を検出するための試薬を含む。本キットは、以下のものを含む1つ以上の他の要素を含み得る:使用説明書;他の試薬、例えば、標識、治療剤又はキレート又はそうでなければカップリングに有用な薬剤、標識又は治療剤に対する抗体又は放射線防護組成物;投与のための抗体を調製するための器具又は他の材料;薬学的に許容可能な担体;及び対象への投与のための器具及び他の材料。
いくつかの実施形態では、本キットは、容器中のCD33に結合する抗原結合ドメイン及びキットの使用説明書を含む。
いくつかの実施形態では、本キットは、容器中のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質及びキットの使用説明書を含む。
いくつかの実施形態では、本キットは、容器中のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質及びキットの使用説明書を含む。
いくつかの実施形態では、キット中のCD33に結合する抗原結合ドメインが標識される。
いくつかの実施形態では、本キット中のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質が標識される。
いくつかの実施形態では、本キット中のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質が標識される。
いくつかの実施形態では、本キットは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む、CD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
特定の実施形態では、本キットは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含むCD33に結合する抗原結合ドメイン(例えばscFv)を含む。
いくつかの実施形態では、本キットは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、本キットは、
a)配列番号18のVH;
b)配列番号19のVH;
c)配列番号20のVH;
d)配列番号21のVH;
e)配列番号22のVH;
f)配列番号23のVH;
g)配列番号24のVH;
h)配列番号25のVH;又は
i)配列番号26のVH;又は
j)配列番号27のVH
を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、本キットは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、本キットは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263又は264を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、本キットは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272又は273を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、本キットは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、本キットは、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、本キットは、配列番号203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
特定の実施形態では、本キットは、配列番号213を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号216を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号219を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号274を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号275を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
他の実施形態では、本キットは、配列番号276を含むCD33に結合する抗原結合ドメインを含む。
CD33を検出する方法
本発明は、試料を入手し、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインと試料を接触させ、試料中の結合したCD33を検出することを含む、試料中でCD33を検出する方法も提供する。
いくつかの実施形態では、試料は、尿、血液、血清、血漿、唾液、腹水、循環する細胞、滑液、循環する細胞、組織に付随しない細胞(即ち遊離細胞)、組織(例えば、手術により切除された組織、細針吸引を含む生検)、組織学的標本など由来であり得る。
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、既知の方法を使用して検出され得る。代表的な方法は、蛍光若しくは化学発光標識又は放射活性標識を使用した抗体の直接標識又は例えばビオチン、酵素若しくはエピトープタグなどの容易に検出可能な部分の本発明の抗体への連結を含む。代表的な標識及び部分は、ルテニウム、111In-DOTA、111In-ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ及びベータ-ガラクトシダーゼ、ポリヒスチジン(HISタグ)、アクリジン色素、シアニン色素、フルオロン色素、オキサジン色素、フェナントリジン色素、ローダミン色素及びAlexafluor(登録商標)色素である。
本抗体は、放射性標識の何れかで直接標識され得、参照により本明細書中に組み込まれる国際公開第2019/125982号パンフレットで開示される放射活性剤が使用され得る。
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインは、試料中でCD33を検出するための様々なアッセイにおいて使用され得る。代表的なアッセイは、ウエスタンブロット分析、放射免疫アッセイ、表面プラズモン共鳴、免疫沈降、平衡透析、免疫拡散法、電気化学発光(ECL)免疫アッセイ、免疫組織化学、蛍光励起細胞選別(FACS)又はELISAアッセイである。
本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)
本明細書中で同定されるCD33に結合する抗原結合ドメインの何れかは、CD33に結合するCARを提供するために、キメラ抗原受容体(CAR)に改変され得る。本開示は、CD33を標的とするCAR、このようなCARを含む細胞及び本明細書中に記載のCARを使用したCD33産生癌、例えば血液癌などを処置する方法を提供する。
本発明のCARは、CD33に対する抗原特異性を有する。「抗原特異性を有する」及び「抗原特異的な反応を誘発する」という句は、本明細書中で使用される場合、CARが特異的に抗原に結合し、免疫学的に認識し得、CD33抗原へのCARの結合が免疫反応を誘発するようになることを意味する。抗原特異性について及び標的細胞を認識する能力についてCARを試験する方法は当技術分野で公知である。
本開示は、所望のキメラ抗原受容体を安定に発現するように遺伝子修飾されているT細胞の使用に関する。キメラ抗原受容体(CAR)は、T細胞シグナル伝達ドメインに連結された抗体の抗原結合ドメイン(scFvなど)を含有する人工的に構築された異種タンパク質又はポリペプチドである。CARの特徴には、非MHC制限的に選択された標的に向けてT細胞特異性及び反応性をリダイレクトするためのそれらの能力、モノクローナル抗体の抗原結合特性の利用が含まれる。非MHC制限抗原認識は、CARを発現するT細胞に、抗原プロセシングと独立した抗原認識能力を与え、従って腫瘍回避の主要な機序を迂回する。さらに、T細胞で発現される場合、CARは、有利には、内因性T細胞受容体(TCR)アルファ鎖及びベータ鎖と二量体形成しない。
本明細書中に記載のCARは、少なくとも細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び本明細書中に記載のような刺激分子由来の機能シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン(本明細書中で細胞質シグナル伝達ドメインとも呼ぶ)を含む組み換えポリペプチドコンストラクトを提供する。CARを発現するT細胞は、本明細書中では、CAR T細胞、CAR-T細胞又はCAR修飾T細胞と呼ばれ、これらの用語は、本明細書中で交換可能に使用される。細胞は、その表面上で抗体結合ドメインを安定に発現するために遺伝子修飾され得、これは、MHC非依存的である新規抗原特異性を付与する。
一部の例において、T細胞は、単一キメラタンパク質になるように抗体の抗原認識ドメインをCD3-ゼータ鎖の細胞内ドメイン又はFcγRIタンパク質と組み合わせるCARを安定に発現するように遺伝子修飾される。一実施形態では、刺激分子は、T細胞受容体複合体と連結されるゼータ鎖である。
「細胞内シグナル伝達ドメイン」は、分子の細胞内部分を指す。これは、第2のメッセンジャーを生成させることにより定められたシグナル伝達経路を介して細胞活性を制御するために細胞内で情報を伝達するか、又はこのようなメッセンジャーに応答することによりエフェクターとして機能することによって作用するタンパク質の機能的部分である。細胞内シグナル伝達ドメインは、CAR含有細胞、例えばCAR-T細胞、の免疫エフェクター機能を促進するシグナルを生成する。例えばCAR-T細胞における、免疫エフェクター機能の例には、サイトカイン分泌を含む、細胞溶解活性及びヘルパー活性が含まれる。
一実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、一次細胞内シグナル伝達ドメインを含む。代表的な一次細胞内シグナル伝達ドメインとしては、一次刺激又は抗原依存性刺激に関与する分子に由来するものが挙げられる。一実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、同時刺激細胞内ドメインを含む。代表的な同時刺激細胞内シグナル伝達ドメインとしては、同時刺激シグナル又は抗原非依存性刺激に関与する分子に由来するものが挙げられる。例えば、CAR-Tの場合、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、T細胞受容体の細胞質配列を含み、同時刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共受容体又は同時刺激分子からの細胞質配列を含む。
一次細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシンに基づく活性化モチーフ又はITAMとして知られるシグナル伝達モチーフを含む。代表的なITAM含有一次細胞質シグナル伝達配列は、CD3-ゼータ、FcRγ、FcRベータ、CD3γ、CD3δ、CD3ε、CD5、CD22、CD79a、CD79b、CD66d、DAP10及びDAP12に由来するものが含まれる。
「ゼータ」又は代わりに「ゼータ鎖」、「CD3-ゼータ」若しくは「TCR-ゼータ」という用語は、GenBank受入番号BAG36664.1として提供されるタンパク質として、又は非ヒト種、例えばマウス、ウサギ、霊長類、マウス、げっ歯類、サル、類人猿など由来の均等な残基として定められ、「ゼータ刺激ドメイン」又は代わりに「CD3-ゼータ刺激ドメイン」若しくは「TCR-ゼータ刺激ドメイン」は、T細胞活性化に必要な初期シグナルを機能的に伝達するのに十分であるゼータ鎖の細胞質ドメイン由来のアミノ酸残基として定められる。一態様では、ゼータの細胞質ドメインは、GenBank受入番号BAG36664.1の残基52~164又はその機能的なオルソログである非ヒト種、例えば、マウス、げっ歯類、サル、類人猿など由来の均等な残基を含む。一態様では、「ゼータ刺激ドメイン」又は「CD3-ゼータ刺激ドメイン」は、配列番号28として提供される配列又は配列番号164と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%の配列同一性を有する配列である。
配列番号164 CD3-ゼータ刺激ドメイン
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
「同時刺激分子」という用語は、同時刺激リガンドと特異的に結合し、それにより増殖などであるが、限定されないT細胞による同時刺激応答に介在するT細胞における同族の結合パートナーを指す。同時刺激分子は、有効な免疫反応に必要とされる抗原受容体又はそれらのリガンド以外の細胞表面分子である。同時刺激分子としては、MHCクラス1分子、BTLA及びTollリガンド受容体並びにOX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)及び4-1BB(CD137)が挙げられるが、限定されない。
同時刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、同時刺激分子の細胞内部分であり得る。同時刺激分子は、以下のタンパク質ファミリーにおいて代表され得る:TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAMタンパク質)及び活性化NK細胞受容体。代表的なこのような分子としては、CD27、CD28、4-1BB(CD137)、OX40、GITR、CD30、MyD88、CD40、ICOS、BAFFR、HVEM、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3及びCD83と特異的に結合するリガンドなどが挙げられる。
細胞内シグナル伝達ドメインは、それが由来する分子の、細胞内部分全体又はネイティブ細胞内シグナル伝達ドメイン全体又はそれらの機能的断片を含み得る。
「4-1BB」又は代わりに「CD137」という用語は、アミノ酸配列がGenBank受入番号AAA62478.2として与えられるTNFRスーパーファミリーのメンバー又は非ヒト種、例えば、マウス、げっ歯類、サル、類人猿などからの均等な残基を指し;「4-1BB同時刺激ドメイン」は、GenBank受入番号AAA62478.2のアミノ酸残基214~255又は非ヒト種、例えば、マウス、げっ歯類、サル、類人猿などからの均等な残基として定義される。一態様では、「4-1BB同時刺激ドメイン」又は「CD137同時刺激ドメイン」は、配列番号163(KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL;配列番号163)として提供される配列又は非ヒト種、例えば、マウス、げっ歯類、サル、類人猿などからの均等な残基又は配列番号163と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%若しくは少なくとも99%の配列同一性を有する配列である。
一実施形態では、CARにおける他のドメインの1つと天然で付随する膜貫通ドメインが使用される。別の実施形態では、膜貫通ドメインは、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小化するため、同じか又は異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインへのこのようなドメインの結合を回避するために選択され得るか又はアミノ酸置換により修飾され得る。一実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8αヒンジドメインを含む。
いくつかの実施形態では、細胞質シグナル伝達ドメインは、本明細書中で定義されるような少なくとも1つの同時刺激分子由来の1つ以上の機能シグナル伝達ドメインをさらに含む。一実施形態では、同時刺激分子は、4-1BB(即ちCD137)、CD27、CD3-ゼータ及び/又はCD28から選択される。CD28は、T細胞同時刺激において重要なT細胞マーカーである。CD27は、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーのメンバーであり、同時刺激免疫チェックポイント分子として作用する。4-1BBは、強力な同時刺激シグナルをT細胞に伝達し、分化を促進し、Tリンパ球の長期生存を促進する。CD3-ゼータは、シグナルを生成させるためにTCRと会合し、免疫受容体チロシンに基づく活性化モチーフ(ITAM)を含有する。別の実施形態では、同時刺激分子はMyD88又はCD40である。
一実施形態では、CARは、CD8を含む細胞内ヒンジドメイン及びCD28、4-1BB及びCD3-ゼータを含む細胞内T細胞受容体シグナル伝達ドメインを含む。別の実施形態では、CARは、細胞内ヒンジドメイン及びCD28、4-1BB及びCD3-ゼータを含む細胞内T細胞受容体シグナル伝達ドメインを含み、このヒンジドメインは、CD8、CD4若しくはCD28の細胞外領域の全て若しくは一部;抗体定常領域の全て若しくは一部;FcγRIIIA受容体、IgGヒンジ、IgMヒンジ、IgAヒンジ、IgDヒンジ、IgEヒンジ又はIgヒンジの全て若しくは一部を含む。IgGヒンジは、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM1、IgM2、IgA1、IgA2、IgD、IgE又はそのキメラ由来であり得る。
本明細書中に記載のCARは、少なくとも細胞外抗原結合ドメインと、膜貫通ドメインと、例えば以下で定められるような刺激分子由来の機能シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン(本明細書中で「細胞質シグナル伝達ドメイン」とも呼ばれる)とを含む組み換えポリペプチドコンストラクトを提供する。
一実施形態では、CARは、細胞外抗原認識ドメインと、膜貫通ドメインと、刺激分子に由来する機能シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ融合タンパク質を含む。一実施形態では、CARは、細胞外抗原認識ドメインと、膜貫通ドメインと、同時刺激分子由来の機能シグナル伝達ドメイン及び刺激分子由来の機能シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ融合タンパク質を含む。一実施形態では、CARは、細胞外抗原認識ドメインと、膜貫通ドメインと、1つ以上の同時刺激分子由来の少なくとも2つの機能シグナル伝達ドメイン及び刺激分子由来の機能シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ融合タンパク質を含む。
本開示のCARは、単独で又は本発明のCARに関連して有用な何れかの他の所望の細胞質ドメインと組みわせてCD28及び/又は4-1BBシグナル伝達ドメインを含むように設計され得る。一実施形態では、CARの細胞質ドメインは、CD3-ゼータのシグナル伝達ドメインをさらに含み得る。例えば、CARの細胞質ドメインは、CD3-ゼータ、4-1BB及びCD28シグナル伝達モジュール及びそれらの組み合わせを含み得るが、限定されない。従って、本発明は、CAR T細胞及び養子療法のためのそれらの使用の方法を提供する。
本開示は、CARの変異体、例えば機能的変異体をさらに提供する。「機能的変異体」という用語は、本明細書中で使用される場合、親CARに対して実質的な又は顕著な配列同一性又は類似性を有するCARを指し、機能的変異体は、その変異体の由来であるCARの生物学的活性を保持する。機能的変異体は、例えば、親CARと、同様の程度、同じ程度又はより高い程度まで標的細胞を認識する能力を保持するCARの変異体を包含する。親CARを参照して、機能変異体は、親CARに対して、アミノ酸配列において例えば少なくとも約30%、約40%、約50%、約60%、約75%、約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%又はそれを超えて同一であり得る。
機能的変異体は、例えば、少なくとも1つの保存的アミノ酸置換とともに、親CARのアミノ酸配列を含み得る。一実施形態では、機能的変異体は、少なくとも1つの非保存的アミノ酸置換がある親CARのアミノ酸配列を含む。この場合、この非保存的アミノ酸置換は、機能的変異体の生物学的活性を妨害又は阻害し得ない。この非保存的アミノ酸置換は、機能的変異体の生物学的活性が親CARと比較した場合に上昇しているように、機能的変異体の生物学的活性を促進し得る。
保存的アミノ酸置換は、当技術分野で公知であり、本明細書中に記載されている。
本開示のCARは、基本的に、他の構成成分、例えば他のアミノ酸が機能的変異体の生物学的活性を実質的に変化させないように、本明細書中に記載の指定されるアミノ酸配列又は複数の配列からなり得る。
本開示のCAR(機能的部分及び機能的変異体を含む)は、あらゆる長さであり得、即ちあらゆる数のアミノ酸を含み得るが、ただし、CAR(又は機能的部分若しくはその機能的変異体)は、それらの生物学的活性、例えば、宿主において抗原に特異的に結合し、疾患細胞(例えば癌細胞)を検出するか、又は宿主において疾患を処置若しくは予防する能力などを保持するものとする。例えば、CARは、約50~約5000アミノ酸長、例えば約50、約70、約75、約100、約125、約150、約175、約200、約225、約250、約275、約300、約325、約350、約375、約400、約425、約450、約475、約500、約525、約550、約575、約600、約625、約650、約675、約700、約725、約750、約775、約800、約825、約850、約875、約900、約925、約950、約975、約1000又はそれより長いアミノ酸長であり得る。
本開示のCAR(本発明の機能的部分及び機能的変異体を含む)は、1つ以上の天然アミノ酸の代わりに合成アミノ酸を含み得る。このような合成アミノ酸は、当技術分野で公知であり、例えば、アミノシクロヘキサンカルボン酸、ノルロイシン、α-アミノn-デカン酸、ホモセリン、S-アセチルアミノメチル-システイン、トランス-3-及びトランス-4-ヒドロキシプロリン、4-アミノフェニルアラニン、4-ニトロフェニルアラニン、α-(2-アミノ-2-ノルボルナン)-カルボン酸、α,γ-ジアミノ酪酸、α,β-ジアミノプロピオン酸、ホモフェニルアラニン、4-クロロフェニルアラニン、4-カルボキシフェニルアラニン、β-フェニルセリンβ-ヒドロキシフェニルアラニン、フェニルグリシン、α-ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニン、シクロヘキシルグリシン、N’-ベンジル-N’-メチル-リジン、N’,N’-ジベンジル-リジン、6-ヒドロキシリジン、オルニチン、α-アミノシクロペンタンカルボン酸、α-アミノシクロヘキサンカルボン酸、α-アミノシクロヘプタンカルボン酸、インドリン-2-カルボン酸、1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-3-カルボン酸、アミノマロン酸、アミノマロン酸モノアミド及びα-tert-ブチルグリシンが挙げられる。
本開示のCAR(機能的部分及び機能的変異体を含む)は、翻訳後修飾の対象であり得る。これらは、例えばジスルフィド架橋を介して、グリコシル化、エステル化、N-アシル化、アミド化、カルボキシル化、リン酸化、エステル化、環化され得るか、又は酸付加塩に変換され得る。いくつかの実施形態では、これらは、二量体化又は多量体化又は複合化される。
本開示のCAR(機能的部分及びその機能的変異体を含む)は、当技術分野で公知である方法により得られ得る。ポリペプチド及びタンパク質をデノボ合成する適切な方法は、Chan et al.,Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis,Oxford University Press,Oxford,United Kingdom,2000;Peptide and Protein Drug Analysis,ed.Reid,R.,Marcel Dekker,Inc.,2000;及びEpitope Mapping,ed.Westwood et al.,Oxford University Press,Oxford,United Kingdom,2001などの参考文献に記載されている。また、CARは、標準的な組み換え方法を用いて、本明細書中に記載の核酸を使用して、組み換えにより作製され得る。さらに、CAR(機能的部分及びその機能的変異体を含む)のいくつかは、植物、細菌、昆虫、哺乳動物などの供給源から単離及び/又は精製され得る。単離及び精製の方法は当技術分野で公知である。代わりに、本開示のCAR(機能的部分及びその機能的変異体を含む)は、商業的に合成され得る。これに関して、CAR、ポリペプチド及びタンパク質は、合成、組み換え、単離及び/又は精製され得る。
本開示は、本開示のCARのエピトープに結合する抗体又はそれらの抗原結合断片も提供する。本抗体又はそれらの抗原結合断片は、CARの機能的部分に対してあらゆるレベルの親和性又は結合活性を有し得る。いくつかの実施形態では、本抗体又は抗原結合断片は、一連の親和性(K)でCD33に結合し得る。一実施形態では、本抗体は、当業者によって実施されるように、表面プラズモン共鳴又はKinexa法により決定した場合、約10-7Mと等しいか又はそれ未満、例えば1~9.9(又は1、2、3、4、5、6、7、8又は9などのその中にあるあらゆる範囲若しくは値)x10-8M、10-9M、10-10M、10-11M、10-12M、10-13M、10-14M、10-15M又はその中の何れかの範囲若しくは値などであるが、限定されないKでCD33に結合する。1つの代表的な親和性は、1x10-8Mと等しいか又はそれ未満である。別の代表的な親和性は、1x10-9Mと等しいか又はそれ未満である。
本開示のCARの何れかの機能的部分に結合する抗体の能力について抗体を試験する方法は当技術分野で公知であり、何れかの抗体-抗原結合アッセイ、例えば、放射性免疫アッセイ(RIA)、ウエスタンブロット、酵素連結免疫吸着アッセイ(ELISA)、免疫沈降及び競合的阻害アッセイを含む。
抗体又はその抗体断片を含むCARの部分は、例えば単一ドメイン抗体断片(sdAb)、scFv及びヒトキメラ又はヒト化抗体を含む近接しているポリペプチド鎖の一部として抗原結合ドメインが発現される、様々な形態で存在し得る(Harlow et al.,1999,In:Using Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,N.Y.;Harlow et al.,1989,In:Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,N.Y.;Houston et al.,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883;Bird et al.,1988,Science 242:423-426)。一態様では、本開示のCARの抗原結合ドメインは、抗体断片を含む。一実施形態では、本開示のCARは、scFvを含む抗体断片を含む。
本開示は、細胞外抗原結合ドメインと、膜貫通ドメインと、細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCARも提供し、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合する。
本開示は、
CD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメインと;
膜貫通ドメインと;
任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインと
を含むCARも提供する。
いくつかの実施形態では、CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む。
いくつかの実施形態では、CARは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドと、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメイン及びT細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含む。
いくつかの実施形態では、CARは、
配列番号157と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むCD8a-ヒンジ領域;
配列番号162と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含む膜貫通ドメイン;及び/又は
配列番号163と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む。
本開示は、細胞外抗原結合ドメインと、膜貫通ドメインと、細胞内シグナル伝達ドメインとを含むCARも提供し、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、
配列番号81のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号52のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号105のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号95のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3と、
を含む。
特定の実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3とを含む。
特定の実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3とを含む。
特定の実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3とを含む。
特定の実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3とを含む。
特定の実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3とを含む。
特定の実施形態では、CARは、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、細胞外抗原結合ドメインは、CD33に結合し、配列番号273のVLのLCDR1、LCDR1、LCDR2及びLCDR3と、配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3とを含む。
代表的なHCDR及びLCDR配列は、表4a、4b、4c、4d、4e及び4fに記載されている。
いくつかの実施形態では、CDRは、Kabatに従って定義される。
いくつかの実施形態では、CDRは、Chothiaに従って定義される。
いくつかの実施形態では、CDRは、IMGTに従って定義される。
いくつかの実施形態では、CDRは、AbMに従って定義される。
いくつかの実施形態では、CDRは、Contactに従って定義される。
本開示は、細胞外CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34、35、253、254又は255のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43、44、256、257又は258のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50、51、259、260又は261のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67、68、265又は266のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73、74、267又は268のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79、80、269又は270のLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197又は201のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34、35、253、254若しくは255のHCDR1又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172若しくは176のHCDR1又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43、44、256、257若しくは258のHCDR2又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号90、91、168、173若しくは177のHCDR2又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号45、46、47、48、49、50、51、259、260若しくは261のHCDR3又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号92、93、94、169、174、178若しくは180のHCDR3又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号62、63、64、65、66、67、68、265若しくは266のLCDR1又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197若しくは201のLCDR1又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号69、70、71、72、73、74、267若しくは268のLCDR2又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号101、102、103、183、187、190、194若しくは198のLCDR2又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号71若しくは146のLCDR3又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号75、76、77、78、79、80、269若しくは270のLCDR3又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号104、184、191、195若しくは199のLCDR3又はその保存的置換を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
細胞外抗原結合ドメインは、他の箇所に記載のようなCD33結合ドメインの変異体でもあり得る(例えば、実施例19~20に記載のような変異体ドメイン)。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号52のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号81のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号53のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号82のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号54のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号83のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号55のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号84のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号56のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号85のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号57のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号86のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号58のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号87のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号59のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号87のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号60のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号87のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号61のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号88のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号95のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号105のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号96のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号106のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号97のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号107のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号170のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号185のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号171のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号188のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号175のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号192のポリペプチドの少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列とを含むVLを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号179のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号196のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号181のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号200のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号96のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号202のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号262のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号271のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号263のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号272のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、細胞外抗原結合ドメインは、配列番号264のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVHと、配列番号273のポリペプチドと少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含むVLとを含む。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、scFvを含む。いくつかの実施形態では、scFvは、VLとVHとの間にリンカーポリペプチドを含む。
いくつかの実施形態では、リンカーポリペプチドは、配列番号7のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、リンカーポリペプチドは、配列番号108と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、リンカーポリペプチドは、配列番号108のアミノ酸配列を含む(例えば、ここで、リンカーポリペプチドは、配列番号108のアミノ酸配列からなる)。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275及び276からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号203を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号204を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号205を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号206を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号207を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号208を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号209を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号210を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号211を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号212を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号213を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号214を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号215を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号216を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号217を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号218を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号219を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号220を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号221を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号274を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号275を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号276を含むscFvである。
特定の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号213を含むscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号216を含むscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号219を含むscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号274を含むscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号275を含むscFvである。
他の実施形態では、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、アミノ酸配列の配列番号276を含むscFvである。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号203のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号204のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号205のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号206のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号207のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号208のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号209のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号210のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号211のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号212のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号213のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号214のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号215のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号216のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号217のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号218のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号219のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号220のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号221のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号274のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号275のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、scFvは、配列番号276のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、CARは、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含み、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号213、216、219、274、275又は276からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号18のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号18のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号19のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号19のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号20のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号20のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号21のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号22のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号22のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号23のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号23のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号24のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号24のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号25のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号25のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号26のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号26のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号27のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号27のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号203のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号203のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号204のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号204のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号205のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号205のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号206のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号206のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号207のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号207のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号208のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号208のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号209のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号209のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号210のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号210のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号211のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号211のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号212のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号212のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号213のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号213のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号214のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号214のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号215のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号215のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号216のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号216のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号217のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号217のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号218のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号218のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号219のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号219のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号220のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号220のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号221のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号221のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号274のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号274のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号275のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号275のアミノ酸配列を含む。
本開示は、配列番号276のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む細胞外抗原結合ドメインを含むCARを提供する。
本開示は、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARも提供し、ここで、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインは、配列番号276のアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー(例えば、CD28又は誘導性T細胞同時刺激剤(ICOS)構成成分及びそれらの組み合わせなど)からなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む。
いくつかの実施形態では、CD137構成成分は、配列番号163のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD137構成成分は、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、CD3z構成成分は、配列番号164のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、CD3z構成成分は、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号165のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号165のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
配列番号165
Figure 2023517660000012
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、CD8a-TMポリペプチドは、配列番号162のアミノ酸配列を含む。(IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC;配列番号162)。
いくつかの実施形態では、CD8a-TMポリペプチドは、配列番号26のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、少なくとも、T細胞受容体のα、β又はζ鎖、CD28、CD3イプシロン、CD45、CD4、CD5、CD8、CD8α、CD9、CD16、CD22、CD33、CD37、CD40、CD64、CD80、CD86、CD134、CD137、CD154の膜貫通領域を含む。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、少なくともζ、η又はFcεR1γ及び-β、MB1(Igα.)、B29又はCD3-γ、ζ又はηの膜貫通ドメインを含む。いくつかの実施形態では、膜貫通ドメインは、例えば、ロイシン及びバリン、フェニルアラニンのトリプレット又はトリプトファンなど、主に疎水性残基を含む、合成物である。
いくつかの実施形態では、CARは、CD33に結合する細胞外抗原結合ドメインに膜貫通ドメインを連結するヒンジ領域をさらに含む。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域はCD8a-ヒンジ領域である。いくつかの実施形態では、CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列を含む(TSTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD;配列番号157)。
いくつかの実施形態では、CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%同一であるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域は、アミノ酸配列EPKSCDKTHTCPPCP(配列番号158)を含むか、又はEPKSCDKTHTCPPCP(配列番号158)と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域は、配列ERKCCVECPPCP(配列番号159)を含むか、又はERKCCVECPPCP(配列番号159)と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域は、配列ELKTPLGDTTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)、(配列番号160)を含むか、又はELKTPLGDTTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)(配列番号160)と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジ領域は、配列ESKYGPPCPSCP(配列番号161)を含むか、又はESKYGPPCPSCP(配列番号161)と少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
CARコンストラクト及びCARを発現する免疫応答細胞
本開示は、本明細書中に記載のCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
別途指定されない限り、「アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチド」は、相互の縮重バージョンであり、同じアミノ酸配列をコードする全てのポリヌクレオチド配列を含む。タンパク質又はRNAをコードするポリヌクレオチドという句は、本タンパク質をコードするポリヌクレオチドが、いくつかの変異体において、発現されるタンパク質にスプライシングされるイントロンを含有し得る限り、イントロンも含み得る。
本開示は、本開示のCARをコードする核酸分子を含む発現ベクターも提供する。
「発現ベクター」という用語は、発現させようとするヌクレオチド配列に操作可能に連結される発現調節配列を含む組み換えポリヌクレオチドを含むベクターを指す。発現ベクターは、発現のための十分なシス作用エレメントを含み;発現のための他のエレメントは、宿主細胞により又はインビトロ発現系で供給され得る。発現ベクターは、組み換えポリヌクレオチドを組み込むコスミド、プラスミド(例えば、裸の又はリポソームに含有される)及びウイルス(例えば、レンチウイルス、レトロウイルス、アデノウイルス及びアデノ随伴ウイルス)を含む、当技術分野で公知である全てのものを含む。
本開示は、本開示のCARを含む単離された免疫応答細胞も提供する。いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、CARで形質導入され、例えばCARは、免疫応答細胞の表面上で構成的に発現される。特定の実施形態では、単離された免疫応答細胞は、免疫応答細胞が少なくとも1つの同時刺激リガンドを発現するように、少なくとも1つの同時刺激リガンドでさらに形質導入される。特定の実施形態では、少なくとも1つの同時刺激リガンドは、4-1BBL、CD48、CD70、CD80、CD86、OX40L、TNFRSF14及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。特定の実施形態では、単離された免疫応答細胞は、免疫応答細胞が少なくとも1つのサイトカインを分泌するように、少なくとも1つのサイトカインでさらに形質導入される。特定の実施形態では、少なくともサイトカインは、IL-2、IL-3、IL-6、IL-7、IL-11、IL-12、IL-15、IL-17、IL-21及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、Tリンパ球(T細胞)、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞(Treg)、ヒト胚幹細胞、リンパ前駆細胞、T細胞-前駆細胞及びリンパ球系細胞に分化し得る多能性幹細胞からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞はT細胞である。
本明細書中の目的に対して、T細胞は、何れかのT細胞、例えば培養T細胞、例えば初代T細胞又は培養T細胞株からのT細胞、例えば、Jurkat、SupT1など又は哺乳動物から得られたT細胞などであり得る。哺乳動物から得られた場合、T細胞は、骨髄、血液、リンパ節、胸腺又は他の組織若しくは体液を含むが、限定されない多くの供給源から得られ得る。T細胞は、濃縮又は精製することもできる。T細胞は、ヒトT細胞であり得る。T細胞は、ヒトから単離されるT細胞であり得る。T細胞は、T細胞の何れかのタイプであり得、CD4/CD8二重陽性T細胞、CD8T細胞(例えば、細胞傷害性T細胞)、CD4ヘルパーT細胞、例えばTh1及びTh2細胞、末梢血単核細胞(PBMC)、末梢血白血球(PBL)、腫瘍浸潤細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞などを含むが、限定されない何れかの発生段階のものであり得る。T細胞は、CD8T細胞又はCD4T細胞であり得る。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、NK細胞である。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、CTLである。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、Tregである。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、ヒト胚幹細胞である。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、リンパ前駆細胞である。
いくつかの実施形態では、単離された免疫応答細胞は、多能性幹細胞である。
一実施形態では、本開示のCAR T細胞は、所望のCAR、例えばCD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン、CD8αヒンジ及び膜貫通ドメイン及びヒト4-1BB及びCD3-ゼータシグナル伝達ドメインを含むCARを含むレンチウイルスベクターを細胞に導入することによって作製され得る。本開示のCAR T細胞は、インビボで複製可能であり、その結果、持続的な腫瘍調節につながり得る長期持続が起こる。
本発明の実施形態は、本明細書中に記載の組み換え発現ベクターの何れかを含む宿主細胞をさらに提供する。本明細書中で使用される場合、「宿主細胞」という用語は、組み換え発現ベクターを含有し得る細胞の何れかのタイプを指す。宿主細胞は、真核細胞、例えば植物、動物又は藻類、真菌であり得るか、又は原核細胞、例えば細菌又は原生動物、であり得る。宿主細胞は、培養細胞又は初代細胞であり得、即ち生物、例えばヒトから直接単離され得る。宿主細胞は、接着細胞又は懸濁細胞、即ち懸濁液中で増殖する細胞であり得る。適切な宿主細胞は当技術分野で公知であり、例えば、DH5αE.コリ(E.coli)細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞、サルVERO細胞、COS細胞、HEK293細胞などが挙げられる。組み換え発現ベクターを増幅するか又は複製する目的のために、宿主細胞は、原核細胞、例えばDH5α細胞であり得る。組み換えCAR、ポリペプチド又はタンパク質を作製する目的のために、宿主細胞は哺乳動物細胞であり得る。宿主細胞はヒト細胞であり得る。宿主細胞が、何れかの細胞タイプであり得、あらゆるタイプの組織由来であり得、あらゆる発生段階であり得る一方で、宿主細胞は、末梢血リンパ球(PBL)であり得る。宿主細胞はT細胞であり得る。
本明細書中に記載の少なくとも1つの宿主細胞を含む細胞の集団も提供される。細胞の集団は、少なくとも1つの他の細胞、例えば組み換え発現ベクターの何れも含まない宿主細胞(例えばT細胞)、又はT細胞以外の細胞、例えばB細胞、マクロファージ、赤血球、好中球、肝細胞、内皮細胞、上皮細胞、筋肉細胞、脳細胞などに加えて、記載の組み換え発現ベクターの何れかを含む宿主細胞を含む不均一集団であり得る。代わりに、細胞集団は、実質的に均一な集団であり得、ここで、この集団は、組み換え発現ベクターを含む宿主細胞を主に含む(例えば、基本的にそれらからなる)。この集団は、細胞のクローン集団でもあり得、ここで、この集団の全ての細胞は、組み換え発現ベクターを含む単一の宿主細胞のクローンであり、この集団の全ての細胞が組み換え発現ベクターを含むようになる。一実施形態では、細胞集団は、本明細書中に記載のような組み換え発現ベクターを含む宿主細胞を含むクローン集団である。
ポリヌクレオチド、宿主細胞及びベクター
本開示は、本開示のCD33結合タンパク質の何れかをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。CD33結合タンパク質は、CD33に結合する抗原結合ドメイン、CD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質、CD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質及び本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むキメラ抗原受容体を含む。
本発明は、CD33結合タンパク質又はその断片の何れかをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
特定の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号53のVHをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号56のVHをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号59のVHをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号262のVHをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号263のVHをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号264のVHをコードする。
本発明は、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
特定の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号82のVLをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号85のVLをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号87のVLをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号271のVLをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号272のVLをコードする。
他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号273のVLをコードする。本発明は、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27のVHをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
いくつかの実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLとをコードする。
本発明は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL又は
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
をコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
特定の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLをコードする。
本発明は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
をコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。本発明は、配列番号18のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号19のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号20のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号21のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号22のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号23のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号24のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号25のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号26のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号27のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号203のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号204のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号205のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号206のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号207のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号208のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号209のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号210のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号211のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号212のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号213のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号214のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号215のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号216のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号217のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号218のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号219のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号220のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号221のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号274のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号275のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号276のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
特定の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号213のポリペプチドをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号216のポリペプチドをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号219のポリペプチドをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号274のポリペプチドをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号275のポリペプチドをコードする。他の実施形態では、単離ポリヌクレオチドは、配列番号276のポリペプチドをコードする。
本開示は、本開示のCAR又は機能的部分又はそれらの機能的変異体の何れかをコードする単離又は精製されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号18のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号19のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号20のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号21のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号22のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号23のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号24のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号25のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号26のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号27のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号203のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号204のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号205のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号206のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号207のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号208のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号209のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号210のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号211のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号212のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号213のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号214のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号215のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号216のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号217のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号218のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号219のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号220のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号221のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号274のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号275のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本発明は、配列番号276のアミノ酸配列を含むCARをコードする単離ポリヌクレオチドも提供する。
本開示のいくつかの実施形態は、本開示のCD33結合タンパク質をコードするポリヌクレオチド又は本開示のCD33結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリッド形成するポリヌクレオチドと相補的であるポリヌクレオチドを含む単離又は精製された核酸も提供する。
ストリンジェントな条件下でハイブリッド形成するポリヌクレオチドは、高ストリンジェンシーの条件下でハイブリッド形成し得る。「高ストリンジェンシー条件」は、ポリヌクレオチドが、非特異的なハイブリッド形成よりも、検出できるほどにより強い量で標的配列(本明細書中に記載の核酸の何れかのヌクレオチド配列)と特異的にハイブリッド形成することを意味する。高ストリンジェンシー条件は、正確な相補配列を有するポリヌクレオチド又は本ヌクレオチド配列と一致した数個の小さい領域(例えば、3~12塩基)を偶然有したランダム配列からの散在するミスマッチを数個のみ含有するものを区別する条件を含む。相補性のこのような小さい領域は、14~17又はそれを超える塩基の全長コンプリメントよりも容易に溶融され、高ストリンジェンシーハイブリッド形成により、それらが容易に区別可能になる。比較的高いストリンジェンシー条件は、例えば、低塩及び/又は高温条件を含み、例えば約50~70℃の温度で約0.02~0.1M NaCl又は均等物により提供される。このような高ストリンジェンシー条件は、ヌクレオチド配列と鋳型又は標的鎖との間で、ミスマッチを、存在するとしてもわずかにのみ許容し、本明細書中に記載のCARの何れかの発現を検出するために特に適切である。一般に、ホルムアミドの漸増量の添加によって条件をよりストリンジェントにし得ることが認められている。
本開示のポリヌクレオチド配列は、目的の宿主細胞においてヌクレオチド配列の発現を可能にする1つ以上の調節エレメント、例えばプロモーター又はエンハンサーなどに操作可能に連結され得る。本ポリヌクレオチドはcDNAであり得る。本プロモーターは、強力、弱い、組織特異的な、誘導性又は発生特異的なプロモーターであり得る。使用され得る代表的なプロモーターは、ヒポキサンチンホスホリボシルトランスフェラーゼ(HPRT)、アデノシンデアミナーゼ、ピルビン酸キナーゼ、ベータ-アクチン、ヒトミオシン、ヒトヘモグロビン、ヒト筋肉クレアチンなどである。さらに、多くのウイルスプロモーターは真核細胞において構成的に機能し、記載の実施形態による使用に適切である。このようなウイルスプロモーターとしては、サイトメガロウイルス(CMV)前初期プロモーター、SV40の初期及び後期プロモーター、マウス乳癌ウイルス(MMTV)プロモーター、モロニー白血病ウイルスの末端反復配列(LTR)、ヒト免疫不全ウイルス(HIV)、エプスタインバーウイルス(EBV)、ラウス肉腫ウイルス(RSV)及び他のレトロウイルス及び単純ヘルペスウイルスのチミジンキナーゼプロモーターが挙げられる。誘導性プロモーター、例えば、メタロチオネインプロモーター、テトラサイクリン誘導性プロモーター、ドキシサイクリン誘導性プロモーター、タンパク質キナーゼR2’,5’-オリゴアデニレートシンテターゼなどの1つ以上のインターフェロン刺激応答エレメント(ISRE)を含有するプロモーター、Mx遺伝子、ADAR1なども使用され得る。
本発明は、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。本開示は、本発明のポリヌクレオチドを含む発現ベクターも提供する。このようなベクターは、プラスミドベクター、ウイルスベクター、バキュロウイルス発現のためのベクター、トランスポゾンに基づくベクター又は何らかの手段によるある生物又は遺伝学的背景への本発明の合成ポリヌクレオチドの導入に適切な何らかの他のベクターであり得る。本開示のCD33結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、CD33結合タンパク質の発現を確実にする発現ベクターにおいて調節配列に操作可能に連結され得る。このような調節エレメントは、転写プロモーター、適切なmRNAリボソーム結合部位をコードする配列及び転写及び翻訳の終結を調節する配列を含み得る。発現ベクターは、複製起点、発現させようとする遺伝子に連結される適切なプロモーター及びエンハンサー、他の5’又は3’隣接非転写配列、5’又は3’非翻訳配列(必要なリボソーム結合部位など)、ポリアデニル化部位、スプライスドナー及びアクセプター部位又は転写終結配列などの1つ以上の非転写エレメントも含み得る。宿主において複製する能力を付与する複製起点も組み込まれ得る。
発現ベクターは、天然又は非天然ヌクレオチド間結合又は両方のタイプの結合を含み得る。非天然の又は改変されたヌクレオチド又はヌクレオチド間結合は、ベクターの転写又は複製を邪魔しない。
ベクターが適切な宿主に組み込まれたら、宿主は、組み込まれたポリヌクレオチドによりコードされる本開示のCD33結合タンパク質の高レベル発現に適切な条件下で維持される。脊椎動物細胞の形質転換において使用しようとする発現ベクターにおける転写及び翻訳調節配列は、ウイルス供給源により提供され得る。代表的なベクターは、Okayama and Berg,3Mol.Cell.Biol.280(1983)により記載されるように構築され得る。
本開示のベクターは、1つ以上の配列内リボソーム進入部位(IRES)も含有し得る。融合ベクターへのIRES配列の封入は、いくつかのタンパク質の発現促進に有益であり得る。いくつかの実施形態では、本ベクター系は、1つ以上のポリアデニル化部位(例えばSV40)を含み、これは、前述の核酸配列の何れかの上流又は下流であり得る。ベクター構成成分は、遺伝子産物を発現するための最適なスペーシングを提供するように近接して連結若しくは配置され得るか(即ちORF間の「スペーサー」ヌクレオチドの導入による)又は別の方法で置かれ得る。調節エレメント、例えばIRESモチーフなども、発現に最適なスペーシングを提供するように配置される。
本開示のベクターは、環状又は直鎖状であり得る。これらは、原核又は真核宿主細胞において機能的である複製系を含有するように調製され得る。複製系は、例えばColE1、SV40、2μプラスミド、λ、ウシパピローマウイルスなど由来であり得る。
組み換え発現ベクターは、一過性発現、安定発現の何れか又はその両方のために設計され得る。また、組み換え発現ベクターは、構成的発現のために又は誘導性発現のためにおいて作製され得る。
さらに、本組み換え発現ベクターは、自殺遺伝子を含むように作製され得る。本明細書中で使用される場合、「自殺遺伝子」という用語は、自殺遺伝子を発現する細胞の死滅を引き起こす遺伝子を指す。自殺遺伝子は、細胞がある薬剤と接触するか又はそれに曝露された場合、自殺遺伝子が発現される細胞において薬剤、例えば薬物に対する感受性を付与し、その細胞の死滅を引き起こす遺伝子であり得る。自殺遺伝子は当技術分野で公知であり、例えば、単純ヘルペスウイルス(HSV)チミジンキナーゼ(TK)遺伝子、シトシンデアミナーゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ及びニトロレダクターゼが挙げられる。
ベクターは、当技術分野で周知である選択マーカーも含み得る。選択マーカーは陽性及び陰性選択マーカーを含む。マーカー遺伝子としては、殺生物剤耐性、例えば抗生物質に対する耐性、重金属など、原栄養性を提供するための栄養要求性宿主における補完などが挙げられる。代表的なマーカー遺伝子としては、抗生物質耐性遺伝子(例えば、ネオマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子、カナマイシン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子、ペニシリン耐性遺伝子、ヒスチジノール耐性遺伝子、ヒスチジノールx耐性遺伝子)、グルタミンシンターゼ遺伝子、HSV-TK、ガンシクロビル選択のためのHSV-TK誘導体又は6-メチルプリン選択のための細菌プリンヌクレオシドホスホリラーゼ遺伝子が挙げられる(Gadi et al.,7 Gene Ther.1738-1743(2000))。選択マーカー又はクローニング部位をコードする核酸配列は、関心対象のポリペプチドをコードする核酸配列又はクローニング部位の上流又は下流であり得る。
使用され得る代表的なベクターは、細菌性:pBs、phagescript、PsiX174、pBluescript SK、pBs KS、pNH8a、pNH16a、pNH18a、pNH46a(Stratagene,La Jolla,Calif.,USA);pTrc99A、pKK223-3、pKK233-3、pDR540及びpRIT5(Pharmacia,Uppsala,Sweden)である。真核性:pWLneo、pSV2cat、pOG44、PXR1、pSG(Stratagene)pSVK3、pBPV、pMSG及びpSVL(Pharmacia)、pEE6.4(Lonza)及びpEE12.4(Lonza)である。さらなるベクターとしては、pUCシリーズ(Fermentas Life ScienceS,Glen Burnie,Md.)、pBluescriptシリーズ(Stratagene,LaJolla,Calif.)、pETシリーズ(Novagen,Madison,Wis.)、pGEXシリーズ(Pharmacia Biotech,UppsalA,Sweden)及びpEXシリーズ(Clontech,Palo Alto,Calif.)が挙げられる。バクテリオファージベクター、例えばλGT10、λGT11、λEMBL4及びλNM1149、λZapII(Stratagene)などが使用され得る。代表的な植物発現ベクターとしては、pBI01、pBI01.2、pBI121、pBI101.3及びpBIN19(Clontech)が挙げられる。代表的な動物発現ベクターとしては、pEUK-Cl、pMAM及びpMAMneo(Clontech)が挙げられる。本発現ベクターは、ウイルスベクター、例えばレトロウイルスベクター、例えばガンマレトロウイルスベクターであり得る。
いくつかの実施形態では、本ベクターは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
特定の実施形態では、ベクターは、配列番号53のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号56のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号59のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号262のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号263のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号264のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
特定の実施形態では、ベクターは、配列番号82のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号85のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号87のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号271のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号272のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号273のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27のVHをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87、88、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLとをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、本ベクターは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
k)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;
m)配列番号264のVH及び配列番号273のVL
をコードする単離ポリヌクレオチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
特定の実施形態では、ベクターは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。他の実施形態では、ベクターは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
をコードする単離ポリヌクレオチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号:配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号18のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号19のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号20のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号21のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号22のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号23のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号24のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号25のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号26のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号27のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号203のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号204のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号205のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号206のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号207のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号208のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号209のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号210のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号211のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号212のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号213のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号214のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号215のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号216のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号217のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号218のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号219のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号220のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号221のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号274のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号275のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号276のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、本開示のCAR又は機能的部分又はそれらの機能的変異体の何れかをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号18のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号19のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号20のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号21のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号22のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号23のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号24のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号25のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号26のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号27のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号203のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号204のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号205のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号206のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号207のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号208のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号209のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号210のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号211のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号212のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号213のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号214のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号215のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号216のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号217のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号218のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号219のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号220のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号221のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号274のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号275のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号276のアミノ酸配列を含むCARをコードするポリヌクレオチドを含む。
本発明は、1つ以上の本発明のベクターを含む宿主細胞も提供する。「宿主細胞」は、ベクターが導入されている細胞を指す。宿主細胞という用語は、特定の対象細胞のみを指すものではなく、このような細胞の子孫及びまた特定の対象細胞から作製された安定な細胞株も指すものであることが理解される。ある種の修飾は、突然変異又は環境の影響の何れかのため、その後の世代において起こり得ることから、このような子孫は、親細胞と同一ではないものであり得るが、本明細書中で使用される場合の「宿主細胞」という用語の範囲内に依然として含まれる。このような宿主細胞は、真核細胞、原核細胞、植物細胞又は古細菌の細胞であり得る。エスケリキア・コリ(Escherichia coli)、バチリ(bacilli)、例えばバチルス・サブチリス(Bacillus subtilis)及び他のエンテロバクテリアセア(enterobacteriacae)、例えばサルモネラ(Salmonella)、セラチア(Serratia)及び様々なシュードモナス種(Pseudomonas species)は原核宿主細胞の例である。他の微生物、例えば酵母なども発現に有用である。サッカロミセス(Saccharomyces)(例えばS.セレビシエ(S.cerevisiae))及びピキア(Pichia)は、適切な酵母宿主細胞の例である。代表的な真核細胞は、哺乳動物、昆虫、鳥類又は他の動物起源のものであり得る。哺乳動物真核細胞には、ハイブリドーマなどの不死化細胞株又はSP2/0(American Type Culture Collection(ATCC),ManassaS,VA,CRL-1581)、NS0(European Collection of Cell Cultures(ECACC),Salisbury,Wiltshire UK,ECACC No.85110503)、FO(ATCC CRL-1646)及びAg653(ATCC CRL-1580)マウス細胞株などの骨髄腫細胞株が含まれる。代表的なヒト骨髄腫細胞株は、U266(ATTC CRL-TIB-196)である。他の有用な細胞株としては、CHO-K1SV(Lonza Biologics,Walkersville,MD)、CHO-K1(ATCC CRL-61)又はDG44などのチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞由来のものが挙げられる。
本開示は、本開示のCD33結合タンパク質を作製する方法であって、K2結合タンパク質が発現される条件で本開示の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されるCD33結合タンパク質を回収することとを含む方法も提供する。タンパク質を作製し、それらを精製する方法は公知である。合成されたら(化学的又は組み換えの何れか)、硫酸アンモニウム沈殿、アフィニティーカラム、カラムクロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)精製、ゲル電気泳動など(一般にScopes,Protein Purification(Springer-Verlag,N.Y.,(1982)を参照されたい)を含む標準的な手順に従い、CD33結合タンパク質が精製され得る。対象タンパク質は、実質的に純粋、例えば、少なくとも約80%~85%純粋、少なくとも約85%~90%純粋、少なくとも約90%~95%純粋又は少なくとも約98%~99%又はそれを超えて純粋、例えば、細胞残屑、対象タンパク質以外の巨大分子などの夾雑物不含であり得る。
本開示のCD33結合タンパク質をコードするポリヌクレオチドは、標準的な分子生物学方法を使用してベクターに組み込まれ得る。宿主細胞形質転換、培養、抗体発現及び精製は、周知の方法を使用して行われる。
従って、本発明は、本発明のポリペプチドをコードする本発明のヌクレオチドを発現させることを含む、ポリペプチドを作製する方法を提供する。特定の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号262のVH及び配列番号82のVLをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLをコードする。
この方法の特定の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号53のVHを含むポリペプチド及び配列番号82のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号56のVHを含むポリペプチド及び配列番号85のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号59のVHを含むポリペプチド及び配列番号87のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号262のVHを含むポリペプチド及び配列番号271のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号263のVHを含むポリペプチド及び配列番号272のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本ポリヌクレオチドは、配列番号264のVHを含むポリペプチド及び配列番号273のVLを含むポリペプチドをコードする。
本ポリペプチドが、異なる核酸によりコードされる個別の鎖から形成される場合、本発明は、本発明のポリペプチドをコードする本発明のヌクレオチドを発現させることを含む、ポリペプチドを作製する方法を提供する。特定の実施形態では、本発明の第1のポリヌクレオチドは、配列番号53のVHを含むポリペプチドをコードし、本発明の第2のポリヌクレオチドは、配列番号82のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本発明の第1のポリヌクレオチドは、配列番号56のVHを含むポリペプチドをコードし、本発明の第2のポリヌクレオチドは、配列番号85のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本発明の第1のポリヌクレオチドは、配列番号59のVHを含むポリペプチドをコードし、本発明の第2のポリヌクレオチドは、配列番号87のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本発明の第1のポリヌクレオチドは、配列番号262のVHを含むポリペプチドをコードし、本発明の第2のポリヌクレオチドは、配列番号271のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本発明の第1のポリヌクレオチドは、配列番号263のVHを含むポリペプチドをコードし、本発明の第2のポリヌクレオチドは、配列番号272のVLを含むポリペプチドをコードする。他の実施形態では、本発明の第1のポリヌクレオチドは、配列番号264のVHを含むポリペプチドをコードし、本発明の第2のポリヌクレオチドは、配列番号273のVLを含むポリペプチドをコードする。
本開示のポリヌクレオチドを作製するために、修飾されたヌクレオチドが使用され得る。代表的な修飾されたヌクレオチドは、5-フルオロウラシル、5-ブロモウラシル、5-クロロウラシル、5-ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、4-アセチルシトシン、5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウラシル、カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、N-置換アデニン、7-メチルグアニン、5-メチルアミノメチルウラシル、5-メトキシアミノメチル-2-チオウラシル、ベータ-D-マンノシルケオシン、5”-メトキシカルボキシメチルウラシル、5-メトキシウラシル、2-メチルチオ-N-イソペンテニルアデニン、ウラシル-5-オキシ酢酸(v)、ワイブトキソシン、シュードウラシル、ケオシン、ベータ-D-ガラクトシルケオシン、イノシン、N-イソペンテニルアデニン、1-メチルグアニン、1-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアニン、2-メチルアデニン、2-メチルグアニン、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、2-チオシトシン、5-メチル-2-チオウラシル、2-チオウラシル、4-チオウラシル、5-メチルウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸メチルエステル、3-(3-アミノ-3-N-2-カルボキシプロピル)ウラシル及び2,6-ジアミノプリンである。
医薬組成物/投与
本開示は、本開示のCD33結合タンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物も提供する。
本開示は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物も提供する。
本開示は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物も提供する。
本開示は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物も提供する。
本開示は、本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物も提供する。治療用途のために、本開示のCD33結合タンパク質は、薬学的に許容可能な担体中に有効成分として有効量の本抗体を含有する医薬組成物として調製され得る。「担体」は、本発明の抗体が一緒に投与される希釈剤、アジュバント、賦形剤又はビヒクルを指す。このようなビヒクルは、液体、例えば水及び石油、動物、植物又は合成起源のもの、例えば落花生油、ダイズ油、鉱物油、ゴマ油などを含む油などであり得る。例えば、0.4%ブライン及び0.3%グリシンが使用され得る。これらの溶液は、無菌であり、一般的に粒状物質不含である。これらは、従来の周知の滅菌技術(例えばろ過)によって滅菌され得る。本組成物は、pH調整剤及び緩衝剤、安定化剤、増粘剤、滑沢剤及び着色剤など、生理的状態に近似させるために必要に応じて、薬学的に許容可能な補助物質を含有し得る。このような製剤処方物中の本発明の抗体の濃度は、約0.5%未満から、通常は少なくとも約1%~15又は20重量%まで変動し得、選択される投与方式に従い、流体体積、粘性など、主に求められる用量に基づいて選択され得る。適切なビヒクル及び処方物は、他のヒトタンパク質、例えばヒト血清アルブミンを含め、例えば、例えばRemington:The Science and Practice of Pharmacy,21st Edition,Troy,D.B.ed.,Lipincott Williams and Wilkins,Philadelphia,PA 2006,Part 5,Pharmaceutical Manufacturing pp 691-1092において記載されており、特にpp.958-989を参照されたい。
本開示のCD33結合タンパク質の投与方式は、非経口投与などの何れかの適切な経路、例えば、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内又は皮下、経粘膜(経口、鼻腔内、膣内、直腸)又は当業者により認められ、当技術分野で周知であるような他の手段であり得る。
本発明の本開示のCD33結合タンパク質は、癌などの疾患を発症するリスクを低下させるために予防的にも投与され得る。
従って、筋肉内注射のための本発明の医薬組成物は、1mlの滅菌緩衝水及び約1ng~約100mg/kg、例えば約50ng~約30mg/kg又はそれを超える、好ましくは約5mg~約25mg/kgの本発明の本開示のCD33結合タンパク質を含有するように調製され得る。
本開示の実施形態では、CAR発現細胞は、CAR発現細胞と、薬学的に許容可能な担体とを含む組成物、例えば適切な医薬組成物で提供され得る。一態様では、本開示は、有効量の記載されるCARの1つ以上を発現するリンパ球と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含む医薬組成物を提供する。本開示の医薬組成物は、1つ以上の薬学的又は生理学的に許容可能な担体、賦形剤又は希釈剤と組みわせて、本明細書中に記載のような、CAR発現細胞、例えば複数のCAR発現細胞を含み得る。薬学的に許容可能な担体は、対象にとって無毒性である、有効成分以外の医薬組成物中の成分であり得る。
薬学的に許容可能な担体は、緩衝剤、賦形剤、安定化剤又は保存剤を含み得る。薬学的に許容可能な担体の例は、溶媒、分散媒、コーティング、抗菌及び抗真菌剤、等張及び吸収遅延剤など、例えば、塩、緩衝剤、抗酸化剤、糖類、水性又は非水性担体、保存剤、湿潤剤、界面活性剤又は乳化剤又はそれらの組み合わせなど、生理学的に適合するものである。本医薬組成物中の薬学的に許容可能な担体の量は、担体の活性及び安定性及び/又は最小酸化など、処方物の所望の特徴に基づき実験的に決定され得る。
医薬組成物は、緩衝液、例えば酢酸、クエン酸、ギ酸、コハク酸、リン酸、炭酸、リンゴ酸、アスパラギン酸、ヒスチジン、ホウ酸、Tris緩衝液、HEPPSO、HEPES、中性緩衝食塩水、リン酸緩衝食塩水など;糖類、例えばグルコース、マンノース、スクロース又はデキストラン、マンニトールなど;タンパク質;ポリペプチド又はアミノ酸、例えばグリシンなど;抗酸化剤;キレート剤、例えばEDTA又はグルタチオンなど;アジュバント(例えば水酸化アルミニウム);抗菌及び抗真菌剤;及び保存剤を含み得る。
本開示の医薬組成物は、非経口又は非-非経口投与の様々な手段のために処方され得る。一実施形態では、本組成物は、点滴又は静脈内投与のために処方され得る。本明細書中で開示される医薬組成物は、例えば滅菌液体調製物、例えば等張水溶液、エマルション、懸濁液、分散液又は粘性組成物として提供され得、それは所望のpHまで緩衝され得る。経口投与に適切な処方物は、適切な液体及びエマルション中での、液体溶液、カプセル、サシェ、錠剤、薬用キャンディー及びトローチ、粉末懸濁液を含み得る。
「薬学的に許容可能な」という用語は、医薬組成物に関して、本明細書中で使用される場合、連邦政府若しくは州政府の規制官庁により承認されるか、又は動物及び/又はヒトにおける使用のための米国薬局方若しくは他の一般的に認識される薬局方で列挙されることを意味する。
処置及び使用の方法
本開示は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、それを必要とする対象に、治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを投与することを含む、対象においてCD33発現癌を処置する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を処置する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を処置する方法も提供する。
特定の実施形態では、本方法は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びTRGV9に結合する第2の抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質(例えば二特異性タンパク質)を投与することを含む。特定のこのような実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインはscFvであり、任意選択的に、TRGV9に結合する第2の結合ドメインはVHHである。
いくつかの実施形態では、本方法は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量のCD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びTRGV9に結合する第2の抗原を含む多特異性タンパク質(例えば二特異性タンパク質)を投与することを含み、このCD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。特定のこのような実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインはscFvであり、任意選択的に、TRGV9に結合する第2の結合ドメインはVHHである。
いくつかの実施形態では、本方法は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に、治療的有効量のCD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びTRGV9に結合する第2の抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質(例えば二特異性タンパク質)を投与することを含み、このCD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号213、216、219、274、275又は276のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、TRGV9に結合する第2の結合ドメインはVHHである。
本開示は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARを投与することを含む、対象においてCD33発現癌を処置する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む免疫複合体を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を処置する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に、治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む医薬組成物を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を処置する方法も提供する。特定のこのような実施形態では、本医薬組成物は、本開示のCD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、TRGV9に結合する第2の抗原結合ドメインとを含む多特異性タンパク質(例えば二特異性タンパク質)を含む。いくつかの実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインはscFvであり、任意選択的に、TRGV9に結合する第2の結合ドメインはVHHである。
いくつかの実施形態では、本方法は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象にCD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びTRGV9に結合する第2の抗原を含む多特異性タンパク質(例えば二特異性タンパク質)を含む治療的有効量の医薬組成物を投与することを含み、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。特定のこのような実施形態では、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインはscFvであり、任意選択的に、TRGV9に結合する第2の結合ドメインはVHHである。
いくつかの実施形態では、本方法は、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に多特異性タンパク質(例えば二特異性タンパク質)を含む治療的有効量の医薬組成物を投与することを含み、この多特異性タンパク質は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びTRGV9に結合する第2の抗原結合ドメインを含み、このCD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号213、216、219、274、275又は276のアミノ酸配列を含む。特定のこのような実施形態では、TRGV9に結合する第2の結合ドメインはVHHである。
本開示は、リンパ球注入を使用して、癌を有するか又は癌を有するリスクがある対象の処置のために、CARを発現する遺伝子修飾されたT細胞を投与する方法も提供する。
少なくとも1つの実施形態では、処置において自己リンパ球注入が使用される。自家PBMCは、処置を必要とする対象から回収され、T細胞が活性化され、本明細書中に記載され、当技術分野で公知である方法を使用して拡大増殖させ、次いで対象に注入し戻される。
一態様では、本開示は、一般に、癌を発症するリスクがある対象の処置に関する。本発明は、化学療法及び/又は免疫療法の結果、対象において顕著な免疫抑制が起こり、それにより癌を発症する対象のリスクが上昇する、悪性腫瘍又は自己免疫疾患を処置することも含む。
本開示は、非癌性状態を処置するために、対象に本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを投与することを含む、癌性状態を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法も提供する。
本開示は、非癌性状態を処置するために対象に本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質を投与することを含む、癌性状態を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法も提供する。
本開示は、非癌性状態を処置するために対象に本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、癌性状態を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法も提供する。
本開示は、非癌性状態を処置するために対象に本開示の免疫複合体を投与することを含む、癌性状態を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法も提供する。
本開示は、非癌性状態を処置するために対象に本開示の医薬組成物を投与することを含む、癌性状態を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法も提供する。
本開示は、非癌性状態を処置するために本開示のCARを対象に投与することを含む、癌性状態を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を予防するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する何れかの抗原結合ドメインを投与することを含む、対象においてCD33発現癌を予防する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を予防するのに十分な時間にわたり、対象に、治療的有効量の本開示のCD33に結合する何れかの抗原結合ドメインを含むタンパク質を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を予防する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を予防するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を予防する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を予防するのに十分な時間にわたり、対象に、治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARを投与することを含む、対象においてCD33発現癌を予防する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を予防するのに十分な時間にわたり、対象に、治療的有効量の本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む免疫複合体を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を予防する方法も提供する。
本開示は、CD33発現癌を予防するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の本開示のCD33に結合する何れかの抗原結合ドメインを含む医薬組成物を投与することを含む、対象においてCD33発現癌を予防する方法も提供する。
本開示は、CD33発現腫瘍細胞の量を減少させるのに十分な時間にわたり、対象に本開示のCD33に結合する何れかの抗原結合ドメインを投与することを含む、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法も提供する。
本開示は、CD33発現腫瘍細胞の量を減少させるのに十分な時間にわたり、対象に本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含むタンパク質を投与することを含む、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法も提供する。
本開示は、CD33発現腫瘍細胞の量を減少させるのに十分な時間にわたり、対象に本開示のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法も提供する。
本開示は、CD33発現腫瘍細胞の量を減少させるのに十分な時間にわたり、対象に本開示のCD33に結合する何れかの抗原結合ドメインを含むCARを投与することを含む、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法も提供する。
本開示は、CD33発現腫瘍細胞の量を減少させるのに十分な時間にわたり、対象に本開示の免疫複合体を投与することを含む、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法も提供する。
本開示は、CD33発現腫瘍細胞の量を減少させるのに十分な時間にわたり、対象に本開示の医薬組成物を投与することを含む、対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法も提供する。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、血液癌である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、白血病である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、リンパ腫である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、多発性骨髄腫である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、骨髄異形成症候群(MDS)である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、急性リンパ球性白血病(ALL)である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、慢性骨髄性白血病(CML)である。
いくつかの実施形態では、CD33発現癌は、芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。
特定の実施形態では、CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)である。
いくつかの実施形態では、癌は、再発、難治性、悪性又はそれらの何れかの組み合わせである。
本開示は、血液癌を処置するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象において血液癌(例えば、白血病(特にAML)、リンパ腫又は多発性骨髄腫)を処置する方法も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、
配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
配列番号60のVH及び配列番号87のVL;
配列番号61のVH及び配列番号88のVL;
配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
配列番号263のVH及び配列番号272のVL;又は
配列番号264のVH及び配列番号273のVL
を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号53のVH及び配列番号82のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号56のVH及び配列番号85のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号59のVH及び配列番号87のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号262のVH及び配列番号271のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号263のVH及び配列番号272のVLを含む。他の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号264のVH及び配列番号273のVLを含む。
本開示は、血液癌を処置するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象において血液癌(例えば白血病(特にAML)、リンパ腫又は多発性骨髄腫)を処置する方法も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、
配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む。
本開示は、血液癌を処置するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象において血液癌(例えば白血病(特にAML)、リンパ腫又は多発性骨髄腫)を処置する方法も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、
配列番号18のVH;
配列番号19のVH;
配列番号20のVH、
配列番号21のVH;
配列番号22のVH;
配列番号23のVH;
配列番号24のVH;
配列番号25のVH;
配列番号26のVH;又は
配列番号27のVH
を含む。
本開示は、血液癌を処置するのに十分な時間にわたり、対象に治療的有効量のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む多特異性タンパク質を投与することを含む、対象において血液癌(例えば白血病(特にAML)、リンパ腫又は多発性骨髄腫)を処置する方法も提供し、このCD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、203、204、205、206、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、274、275又は276のアミノ酸配列を含む。
特定の実施形態では、CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号213、216、219、274、275又は276のアミノ酸配列を含む。
一態様では、本開示は、癌を予防する方法を提供し、この方法は、それを必要とする対象に記載のCARの1つ以上を発現するリンパ球の量を投与することを含む。
一態様では、本開示は、癌を有する対象を処置する方法を提供し、この方法は、それを必要とする対象に治療的有効量の記載のCARの1つ以上を発現するリンパ球を投与することを含み、それによりリンパ球は、対象において癌細胞の死滅を誘導するか又は調整する。
別の態様では、本開示は、癌を有する対象において腫瘍量を減少させる方法を提供し、この方法は、それを必要とする対象に治療的有効量の本明細書中に記載のCARの1つ以上を発現するリンパ球を投与することを含み、それによりリンパ球は、対象において血液癌細胞の死滅を誘導する。別の態様では、本開示は、癌を有する対象の生存を延長させる方法を提供し、この方法は、それを必要とする対象に治療的有効量の記載のCARの1つ以上を発現するリンパ球を投与することを含み、それにより対象の生存期間が長くなる。一般に、CARを発現するリンパ球は、対象において血液癌細胞の死滅を誘導し、その結果、対象において血液腫瘍/癌細胞の減少又は根絶が起こる。標的とされ得る転移性病変を含む血液癌の非限定リストには、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫が含まれる。いくつかの実施形態では、血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。
一態様では、処置を必要とする対象に、治療的有効量のCARを発現するリンパ球、CD33抗原に結合する細胞外抗原結合ドメインを有するCARを投与することを含み、それによりリンパ球が対象において癌細胞の死滅を誘導する、癌を有する対象を処置する方法が提供される。
一態様では、癌細胞の標的化された死滅の方法が開示され、この方法は、記載されるCARの1つ以上を発現するリンパ球と癌細胞を接触させ、それによりリンパ球が癌細胞の死滅を誘導することを含む。標的とされ得る血液癌細胞を含む癌細胞の非限定リストには、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫が含まれる。いくつかの実施形態では、血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である。
治療的有効量が指定される場合、投与しようとする本開示のCAR又はCAR-Tの正確な量は、対象の、年齢、体重、腫瘍サイズ、感染又は転移の程度及び状態における個々の差異を考慮して医師により決定され得る。本明細書中に記載のT細胞を含む医薬組成物が、細胞約10~約1010個/kg体重、一部の例において細胞約10~約10個/kg体重の投与量(これらの範囲内の全ての整数値を含む)で投与され得ることが一般に述べられ得る。いくつかの実施形態では、本明細書中に記載のT細胞を含む医薬組成物は、約10個の細胞/kg体重の投与量で投与され得る。T細胞組成物はまた、これらの投与量で複数回投与され得る。この細胞は、免疫療法において一般的に知られる注入技術を使用することによって投与され得る(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.319:1676-1988を参照されたい)。
本発明のCAR-Tに関連して有用な送達系は、T細胞組成物の送達が、処置しようとする部位の感受性を引き起こす前に及び引き起こすのに十分な時間を伴って起こるような、時間放出、遅延放出及び持続放出送達系を含み得る。本組成物は、他の治療剤又は治療と組み合わせて使用され得る。このような系は、本組成物の反復投与を回避し得、それによって対象及び医師にとってさらに好都合なものとなり、本発明の特定の組成物の実施形態に対して特に適切であり得る。
放出送達系の多くのタイプが利用可能であり、当業者にとって公知である。これらは、ポリ(ラクチド-グリコリド)、コポリオキサレート、ポリエステルアミド、ポリオルトエステル、ポリカプロラクトン、ポリヒドロキシ酪酸及びポリ無水物などのポリマーベース系を含む。薬物を含有する前述のポリマーのマイクロカプセルは、例えば米国特許第5,075,109号明細書に記載されている。送達系は、コレステロールなどのステロール、コレステロールエステル及び脂肪酸又は中性脂肪、例えばモノ-ジ-及びトリ-グリセリドを含む脂質である非ポリマー系;シラスティック(sylastic)系;ペプチドに基づく系;ヒドロゲル放出系;ワックスコーティング;従来の結合剤及び賦形剤を用いた圧縮錠剤;部分的に融合した埋め込み物なども含む。具体例としては、(a)活性組成物がマトリクス内の形態で含有される浸食系、例えば米国特許第4,452,775号明細書;同第4,667,014号明細書;同第4,748,034号明細書;及び同第5,239,660号明細書に記載のものなど、及び(b)ポリマーから調節された速度で活性構成成分が浸透する拡散系、例えば米国特許第3,854,480号明細書及び同第3,832,253号明細書に記載されるものなどが挙げられるが、限定されない。さらに、ポンプに基づくハードウェア送達系が使用され得、その一部は、埋め込みに適応される。
特定の態様では、対象に活性化されたT細胞を投与し、その後、次に血液を再び引き出し(又はアフェレーシスが行われる)、本開示に従いT細胞を活性化し、これらの活性化され、拡大増殖されたT細胞を対象に再び注入することが所望され得る。この過程は、数週間ごとに複数回行われ得る。特定の態様では、T細胞は、10cc~400ccの血液採取物から活性化され得る。特定の態様では、T細胞は、20cc、30cc、40cc、50cc、60cc、70cc、80cc、90cc又は100ccの血液採取物から活性化される。
CAR-T細胞及び組成物の投与は、例えば、エアロゾル吸入、注射、点滴、摂取、輸血、埋め込み又は移植によるものなどを含む、非経口又は非非経口投与により、何れかの方式で行われ得る。例えば、本明細書中に記載のCAR-T細胞及び組成物は、経動脈的、皮内、皮下、腫瘍内、髄内、節内、筋肉内、静脈内(i.v.)注射により、又は腹腔内で患者に投与され得る。一態様では、本開示の組成物は、i.v.注射により投与される。一態様では、本開示の組成物は、皮内又は皮下注射によって対象に投与される。T細胞の組成物は、例えば、腫瘍、リンパ節、組織、臓器又は感染部位に直接注射され得る。
投与は、自己又は非自己であり得る。例えば、CD33特異的なCARを発現する免疫応答細胞は、ある一人の対象から得られ、同じ対象又は異なる適合対象に投与され得る。本開示の末梢血由来T細胞又は拡大増殖されたT細胞(例えばインビボ、エクスビボ又はインビトロ由来)は、例えば、静脈内注射、局所化注射、全身注射、カテーテル投与又は非経口投与を介して投与され得る。
特定の実施形態では、対象は、白血球除去を受け得、ここで、白血球が回収され、例えばT細胞など関心対象の細胞を選択及び/又は単離するために、エクスビボで濃縮又は枯渇が行われる。これらのT細胞単離物は、当技術分野で公知の方法により拡大増殖され得、本開示の1つ以上のCARコンストラクトが導入され得るように処理され得、それによりCAR-T細胞を作製する。それを必要とする対象は、その後、高用量化学療法とそれに続く末梢血幹細胞移植での標準治療を受け得る。特定の態様では、移植後又はそれと同時に、対象は、拡大増殖させたCAR-T細胞の注入を受ける。一態様では、手術前又は手術後、拡大増殖された細胞が投与される。
悪性腫瘍を有する患者に投与される投与量は、処置されている疾患を緩和するか又は少なくとも部分的に抑止するのに十分である(「治療的有効量」)。対象に投与しようとする上記処置の投与量は、処置している状態及び処置のレシピエントの正確な性質で変動する。ヒト投与のための投与量の調整は、当技術分野で一般に受容される実施に従い行われ得る。
本発明のCAR T細胞は、インビボT細胞拡大増殖を受け得、血液及び骨髄中で延長された時間量にわたり高レベルで持続するCD33特異的なメモリー細胞を確立し得る。一部の例において、対象に注入される本発明のCAR T細胞は、進行した化学療法抵抗性の癌がある対象においてインビボで癌細胞、例えば、血液癌細胞を排除し得る。
一実施形態では、本開示のCARは、例えばインビトロ転写を使用してT細胞に導入され、対象(例えばヒト)は、本開示のCAR-T細胞の初回投与及び1回以上のCAR-T細胞の続く投与を受け、この1回以上の続く投与は、前回投与後、15日未満、例えば、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3又は2日間投与される。一実施形態では、1週間あたりCAR-T細胞の複数回の投与が対象(例えばヒト)に施され、例えば1週間あたり2、3又は4回のCAR-T細胞の投与が施される。一実施形態では、対象は、1週間あたり複数回のCAR-T細胞の投与を受け(例えば1週間あたり2、3又は4回の投与)(本明細書中でサイクルとも呼ぶ)、続いてCAR-T細胞投与がない週があり、次いで1回以上のCAR-T細胞のさらなる投与(例えば1週間あたり複数回のCAR-T細胞の投与)が対象に施される。別の実施形態では、対象は、CAR-T細胞の複数回のサイクルを受け、各サイクル間の時間は10、9、8、7、6、5、4又は3日未満である。一実施形態では、CAR-T細胞は、週に3回の投与のために1日おきに投与される。一実施形態では、CAR-T細胞は、少なくとも2、3、4、5、6、7、8週間又はそれを超える週数にわたり投与される。
一実施形態では、投与は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、1週間、2週間、3週間、1ヶ月、5週間、6週間、7週間、2ヶ月、3ヶ月、4ヶ月、5ヶ月、6ヶ月又はそれより長い期間後に反復され得る。慢性投与のように、反復処置コースも可能である。反復投与は、同じ用量又は異なる用量のものであり得る。
CAR-T細胞は、例えば、6ヶ月以上にわたり週1回など、維持療法によって本発明の方法で投与され得る。
一実施形態では、CAR-T細胞は、レンチウイルスのウイルスベクター、例えばレンチウイルスなどを使用して作製される。このようなウイルスベクターで作製されたCAR-T細胞は、一般に、安定なCAR発現を有する。
一実施形態では、CAR-T細胞は、形質導入後、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15日間、CARベクターを一過性に発現する。CARの一過性発現は、RNA CARベクター送達によって影響を受け得る。一実施形態では、CAR RNAは、エレクトロポレーションによってT細胞に形質導入される。
一過性CAR療法のコース中に患者が抗CAR抗体応答を生じるリスクが高い場合(RNA形質導入によって生成されるものなど)、CAR-T注入の中断が10~14日を超えて続くべきではない。
組み合わせ療法
本開示のCD33結合タンパク質は、少なくとも1つのさらなる治療と組み合わせて投与され得る。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つのさらなる治療は、手術、化学療法若しくは放射線又はそれらの任意の組み合わせである。
いくつかの実施形態では、1つの処置の送達は、投与の期間において重複があるように、第2の送達が始まるときに依然として起こっている。これは、本明細書中では、「同時」又は「同時送達」と呼ばれることがある。他の実施形態では、一方の処置の送達が、他方の処置の送達が始まる前に終了する。何れかの場合のいくつかの実施形態では、この処置は、組み合わせ投与であるためにより有効である。例えば、第2の処置は、より有効であり、例えば第2の治療未満で同等の効果が見られるか、又は第2の処置は、第2の処置が第1の処置なく投与された場合に見られるものよりも大きい程度まで症状を軽減するか、又は第1の治療と類似の状況が見られる。いくつかの実施形態では、送達は、障害に関連する症状又は他のパラメーターの軽減が、一方の処置が、他方がなく送達された場合に観察されるものよりも大きくなるようなものである。この2回の処置の効果は、部分的に相加的、全体的に相加的又は相加的を超えるものであり得る。送達は、送達される第1の処置の効果が、第2の処置が送達されるときに依然として検出可能であるようなものであり得る。
一実施形態では、因子などの他の治療剤は、インターロイキン並びにコロニー刺激因子、例えばG-、M-及びGM-CSF及びインターフェロンを含むが、限定されない、CAR-T細胞などのCD33結合タンパク質の前、その後又はそれと同じときに(それと同時に)投与され得る。
本明細書中に記載のCAR発現細胞などのCD33結合タンパク質及び少なくとも1つのさらなる治療剤が、同時に、同じか若しくは別個の組成物中において又は連続的に投与され得る。連続投与の場合、本明細書中に記載のCARなどのCD33結合タンパク質を発現する細胞が最初に投与され得、さらなる薬剤が2番目に投与され得るか又は投与の順序を逆にし得る。
さらなる実施形態では、本明細書中に記載のCARなどのCD33結合タンパク質を発現する細胞は、手術、放射線、化学療法、免疫抑制剤、抗体又は他のイムノアブレーション剤と組み合わせて治療レジメンにおいて使用され得る。一実施形態では、対象に、CAR発現細胞の活性を増強する薬剤が投与され得る。例えば、一実施形態では、この薬剤は、阻害分子を阻害する薬剤であり得る。
以下の実施例は、本明細書中で開示される実施形態のいくつかをさらに説明するために提供される。これらの実施例は、開示される実施形態に対する例示であり限定するものではない。
本発明は、以下の例によっても説明され、示される。しかし、これら及び他の実施例の使用は、本明細書中の何れの箇所でも単なる例示であり、本発明又はあらゆる例証される用語の範囲及び意味を限定するものではない。同様に、本発明は、本明細書中に記載の何らかの特定の好ましい実施形態に限定されない。実際に、本発明の多くの改変及び変形例が、本明細書を読んだ際に当業者にとって明らかとなり得、このような変形例は、精神又は範囲において本発明から逸脱することなくなされ得る。従って、本発明は、これらの特許請求の範囲が権利を与えられる均等物の全範囲とともに添付の特許請求の範囲によってのみ限定されるものとする。
実施例1:抗原作製
6X His-タグ配列の何れかを伴うか又はC末端の6X His-タグ配列付きのヒト血清アルブミン(HSA)のC34S変異体に対する融合タンパク質として、骨髄細胞表面抗原CD33(Uniprot受入番号P20138)及びそのドメインアノテーションの配列に基づいて、ヒトCD33細胞外ドメイン(ECD)又はそのサブドメインをコードする発現コンストラクトを設計した。マカカ・ファスシキュラリス(Macaca fascicularis)からのCD33(ECD)又はそのサブドメインをコードする同様の発現コンストラクトは、NCBI受入番号XP_005590138.1に基づいて設計された。作製された抗原のアミノ酸配列を表3で示す。
製造者のプロトコールに従い、Expifectamineを使用して、ヒト及びcyno CD33全長ECD又はサブドメイン発現コンストラクトをHEK293由来細胞、Expi293(Gibco/Thermo Fisher Scientific)に一過性に形質移入した。回収前にオービタル振盪器上で37℃、8%COで5日間細胞を温置した。発現させられた細胞を遠心分離によって取り除き、Niセファロース6 Fast Flowレジン(GE Healthcare)を用いた固定化金属アフィニティークロマトグラフィーを使用して、hisタグ付きの可溶性CD33タンパク質を培地から精製し、続いて、Zeba(商標)Spin Desalting Columns、7K MWCO、10mL;ThermoScientificカタログ番号89893を使用して、製造者の仕様に従い、カルシウム又はマグネシウムなしの1Xダルベッコリン酸食塩水緩衝液pH7.2に緩衝液交換を行った。
Figure 2023517660000013
Figure 2023517660000014
Figure 2023517660000015
実施例2.抗CD33抗体の作製
以下のようにOpen Monoclonal Technologies(OMT)又はAblexis トランスジェニックマウス技術の何れかを使用して、抗体を作製した。ヒト/マウス免疫グロブリンを産生するようにAlivaMab及びOMTトランスジェニックマウスの両方を改変した。組み換えヒトCD33タンパク質(表1からの抗原の選択)を用いてAlivaMab又はOMTトランスジェニックマウスに免疫付与した。二次リンパ器官からリンパ球を抽出し、ハイブリドーマ作製のためにFOマウス骨髄腫細胞株と融合させるか、又はFACSを介した単一細胞選別に供するかの何れかを行った。過剰発現ヒトCD33ECD HEK細胞への結合について、MSD電気化学発光よってハイブリドーマ上清をスクリーニングした。親HEK細胞(負のシグナル)と比較して、過剰発現ヒトCD33ECD HEK細胞(正のシグナル)への結合について、スクリーニングから同定された試料をFACSでさらにアッセイした。ELISAを使用して、確認された細胞結合物質を軽鎖アイソタイプで分けた。MSD電気化学発光により、組み換えヒトCD33タンパク質への結合について単一細胞選別上清をスクリーニングした。所望の結合プロファイルを有するいくつかのヒットを選択し、シーケンシングを行った。
以下のようにV領域クローニングを行った。Smarter cDNA合成キット(Clontech,Mount View,CA)を使用して、cDNA合成を行うために、Qiagen(登録商標)RNeasy Plus Miniキットにより精製したRNA及びB細胞溶解液の両方を使用した。cDNA合成を促進するために、オリゴdTを使用して全てのメッセンジャーRNAの逆転写を刺激し、続いてSmarter IIAオリゴヌクレオチドでの「5’キャッピング」を行った。Smarter IIA capを標的とする5’プライマー及びCH1におけるコンセンサス領域を標的とする3’プライマーを用いて、2段階PCR増幅を使用して、VH及びVL断片の続く増幅を行った。簡潔に述べると、各50μl PCR反応は、20μMのフォワード及びリバースプライマーミックス、25μlのPrimeStar Max DNAポリメラーゼプレミックス(Clontech)、2μlの未精製cDNA及び21μlの二重蒸留H2Oからなる。サイクリングプログラムは94℃において3分で開始し、続いて35サイクル(94℃で30秒、55℃で1分間、68で1分間)及び72℃において7分で終了する。それらの個々のLonzaマザーベクター(VH及びVL)における個々の領域と「重複」する15bpの相補的伸長部を含有するVL及びVH第2ラウンドプライマーを使用して、PCRの第2ラウンドを行った。第2ラウンドPCRは、以下のプログラムで実施した:94℃で3分;35サイクル(94℃で30秒、55℃で1分、68℃で1分)及び72℃において7分で終了。Lonza huIgK又はLambdaベクターへのVL遺伝子及びLonza huIgG1ベクターへのVH遺伝子の定方向クローニングのために、In-Fusion(登録商標)HD Cloningキット(Clonetech,U.S.A.)を使用した。In-Fusion(登録商標)HDクローニングを促進するために、In-Fusion(登録商標)HDクローニングを行う前に、クローニングエンハンサーを用いてPCR産物を処理した。製造者のプロトコール(Clonetech,U.S.A.)に従い、クローニング及び形質転換を行った。完全V-遺伝子断片が得られたことを確認するために、Mini-prep DNAをSangerシーケンシングに供した。
表4は、上記方法により作製される抗体のそれぞれの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000016
Figure 2023517660000017
Figure 2023517660000018
Figure 2023517660000019
Figure 2023517660000020
Figure 2023517660000021
表4aは、AbM、Kabat、Chothia、IMGT及びContact系に従って定められるような、C33B1522抗体(配列番号53のVH及び配列番号82のVLを有する抗体)のCDR配列のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000022
表4bは、AbM、Kabat、Chothia、IMGT及びContact系に従って定められるような、C33B1477抗体(配列番号59のVH及び配列番号87のVLを有する抗体)のCDR配列のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000023
表4cは、AbM、Kabat、Chothia、IMGT及びContact系に従って定められるような、C33B1475抗体(配列番号262のVH及び配列番号271のVLを有する抗体)のCDR配列のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000024
表4dは、AbM、Kabat、Chothia、IMGT及びContact系に従って定められるような、C33B1517抗体(配列番号56のVH及び配列番号85のVLを有する抗体)のCDR配列のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000025
表4eは、AbM、Kabat、Chothia、IMGT及びContact系に従って定められるような、C33B1516抗体(配列番号263のVH及び配列番号272のVLを有する抗体)のCDR配列のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000026
表4fは、AbM、Kabat、Chothia、IMGT及びContact系に従って定められるような、C33B1481抗体(配列番号264のVH及び配列番号273のVLを有する抗体)のCDR配列のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000027
抗体をラマにおいて以下のように作製した。完全フロイントアジュバント中の初回の注射及び不完全フロイントアジュバント中のその後の注射で、3回の注射(第0、14及び28日)に対して表3からのhCD33-IgC2抗原を3匹のラマに皮下注射した。初回の注射に続いて、表3からのhCD33-FL ECD抗原の3回の注射を行った(第61、76及び91日)。第14、35及び86日に単一B細胞選別のためのPBMCを得て、凍結した。凍結PBMCを凍結融解し、ビオチン化又はAlexa Fluor 647との複合化の何れかを行った組み換え抗原ベイトで染色した。抗原ベイトは、組み換えヒトCD33-ECD及び組み換えヒトCD33-IgCドメインであった。PE標識ストレプトアビジン(SA)を使用してビオチン化ベイトを検出した。BD FACSAria Fusionソーターを使用して、抗原特異的な細胞(両方の抗原ベイトに対して陽性)をRLT溶解緩衝液(Qiagen)中に直接バルク選別した。この細胞溶解液を-80℃で凍結し、さらなる処理のためにGenewizに輸送した。
ラマvHH V-領域クローニング及びモノFc融合コンストラクト設計を以下のように行った。RealTime Ready Cell Lysis緩衝液(Roche)中でB細胞を溶解させた。次いで、RNeasy Plus(登録商標)Miniキット(Qiagen 74134)を使用してRNAを精製した。SuperScript(登録商標)cDNAキット(Invitrogen 18091-050)を用いたcDNA合成のために新鮮なRNAを直接使用した。cDNA合成を促進するために、オリゴdTを使用して、全てのメッセンジャーRNAの逆転写を刺激した。CH2中のコンセンサス領域を標的とするラマSP及び3’プライマーを用いて、2-段階PCR増幅を使用して、VHH断片のその後の増幅を行った。簡潔に述べると、各50μlのPCR反応物は、20μMのフォワード及びリバースプライマーミックス、25μlのPrimeStar Max DNAポリメラーゼプレミックス(Clontech)、2μlの未精製cDNA及び21μlの二重蒸留HOから構成された。サイクリングプログラムは94℃において3分で開始し、続いて35サイクル(94℃で30秒、55℃で1分、68℃で1分)を行い、72℃において7分で終了した。
第1ラウンドPCRからのVHH DNAをゲル精製した。それらの個々のLonzaマザーベクターにおいて個々の領域と重複する15bp相補伸長部を含有する第2ラウンドのプライマーを用いて第2ラウンドのVHH PCRを行った。以下のプログラムで第2ラウンドのPCRを行った:94℃で3分;35サイクル(94℃で30秒、55℃で1分、68℃で1分)及び72℃において7分で終了。モノ-Fcを用いたLonzaベクターへのVHH遺伝子の定方向クローニングのために、In-fusion(登録商標)HDクローニングキット(Clonetech,U.S.A.)を使用した。In-Fusion(登録商標)HDクローニングを促進するために、In-Fusion HDクローニングの前にPCR産物をクローニング促進剤で処理した。製造者のプロトコール(Clonetech,U.S.A.)に従い、クローニング及び形質転換を行った。完全なV-遺伝子断片が得られたことを確認するために、Mini-prep DNAをサンガーシーケンシングに供した。表5は、上記の方法により作製されたラマ抗体の重鎖のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000028
Figure 2023517660000029
製造者の推奨に従い、本タンパク質をコードする精製プラスミドDNAを用いた一過性形質移入により、ExpiCHO-S(商標)細胞(ThermoFisher Scientific;Waltham,MA,Cat#A29127)において抗CD33抗体及びvHH-monoFc融合タンパク質を発現させた。簡潔に述べると、37℃、8%CO及び125RPMに設定したオービタル振盪インキュベーターにおいてExpiCHO(商標)発現培地(ThermoFisher Scientific,Cat#A29100)の懸濁液中でExpiCHO-S(商標)細胞を維持した。この細胞を継代し、形質移入前に細胞6.0×10個/mlに希釈し、細胞生存能を99.0%以上に維持した。ExpiFectamine(商標)CHO形質移入キット(ThermoFisher Scientific,Cat#A29131)を使用して、一過性形質移入を行った。形質移入しようとする希釈された細胞の各mlに対して、0.5マイクログラムのscFv Fc融合物をコードするDNA及び0.5マイクログラムのpAdVAntage DNA(Promega,Cat#E1711)を使用し、OptiPRO(商標)SFM完全培地中に希釈した。1:4の比(v/v、DNA:試薬)でExpiFectamine(商標)CHO試薬を使用し、OptiPRO(商標)に希釈した。希釈したDNA及び形質移入試薬を1分間合わせ、DNA/脂質複合体を形成させ、次いで細胞に添加した。一晩温置後、製造者の標準的プロトコールに従い、ExpiCHO(商標)フィード及びExpiFectamine(商標)CHOエンハンサーを細胞に添加した。培養ブロスを回収する前に、オービタル振盪器(125rpm)を用いて37℃で7日間細胞を温置した。遠心分離(30分、3000rcf)と続くろ過(0.2μm PES膜、Corning;Corning,NY)により、一過性形質移入ExpiCHO-S(商標)細胞からの培養上清を透明化した。
タンパク質精製を以下のように行った。AKTAXpressクロマトグラフィー系を使用して、予め平衡化した(1×DPBS、pH7.2)MabSelect Sure プロテインAカラム(GE Healthcare)上にろ過した細胞培養上清を添加した。添加後、10カラム体積の1×DPBS、pH7.2でカラムを洗浄した。10カラム体積の0.1M酢酸ナトリウム(Na)、pH3.5でタンパク質を溶出させた。溶出分画体積の20%(v/v)までの2.5M Tris HCl、pH7.5の添加により、タンパク質分画を直ちに中和した。ピーク分画をプールし、ろ過した(0.2μm)。分析的サイズ排除HPLC(Agilent HPLC系)によって精製タンパク質の質を評価した。
実施例3.表面プラズモン共鳴(SPR;Biacore)による抗CD33抗体及びラマvHHの特徴評価
抗CD33抗体ヒトCD33(全長ECD及びIgC2ドメイン)の相互作用に対する親和性(K)をSPRにより得た。抗ヒトFc抗体を使用して、抗CD33抗体を捕捉し、溶液中で抗原を注射した。データを以下の表6で示す。
Figure 2023517660000030
Biacore 8K機器を使用して、表面プラズモン共鳴(SPR)により、組み換えヒトCD33(FL ECD又はIgC2ドメイン)に対する抗CD33抗体及びラマvHHの結合親和性を決定した。ヤギ抗Fc抗体修飾GLCチップを使用してFc融合scFvs又はモノ-Fc融合vHHを捕捉し、40nM~1.6nMの濃度に及ぶCD33抗原の5倍連続希釈液を用いて滴定した。50μl/分の流速を使用して、それぞれ2分及び30分、会合及び解離を監視した。検体結合シグナルをブランクから差し引くことにより生の結合データを参照し、結合親和性を計算するために使用する動態を得るためにBiacoreソフトウェアを用い、1:1 Langmuir結合モデルを使用して分析した。
ヒトCD33(FL ECD又はIgC2ドメイン)との抗CD33ラマvHHの相互作用に対する親和性(K)。抗ヒトFc抗体を使用してモノ-Fc骨格上の抗CD33ラマvHHを捕捉し、抗原を溶液中で注入した。データを以下の表7で示す。huCD33抗原(FL ECD及びIgC2ドメイン)に対する抗CD33vHH相互作用の代表的なBiacore 8Kセンソグラムも図1で示す。
Figure 2023517660000031
Prometheus(登録商標)NT.Plex機器(NanoTemper Technologies)上でナノDSFによって抗CD33 scFv-Fc融合抗体及びラマVHHの熱安定性を決定した。試料を384ウェル試料プレートから標準キャピラリー(NanoTemper Technologies)に添加することによって測定を行った。2つ組又は3つ組の操作を行った。20℃~95℃において1.0℃/分の温度勾配で熱変性を監視した。熱屈曲温度(中間点Tm)及び凝集開始温度(Tagg)をPR ThermControlソフトウェア(NanoTemper Technologies)によって自動的に決定し、PR.安定性分析ソフトウェア(NanoTemper Technologies)を使用してさらに分析した。データを以下の表8で示す。
Figure 2023517660000032
表8a:ナノDSF機器を使用して得られた場合の抗CD33 scFvs及びvHH抗体に対する熱安定性データ。配列番号277のIgG1 Fc骨格を使用した。リンカー配列を使用せずにscFvsをこのIgG1骨格に直接連結した。
Figure 2023517660000033
実施例4:CD33 scFv CARの構築及び発現
以下のscFv配列を含むCD33 CARコンストラクトを構築する。
Figure 2023517660000034

Figure 2023517660000035

Figure 2023517660000036

Figure 2023517660000037
DynabeadsヒトT-Expander CD3/CD28で刺激したT細胞をエレクトロポレーションに供し、次いでOPTI-MEM(Invitrogen)で3回洗浄し、50E6/mlの最終濃度でOPTI-MEM中で再懸濁した。続いて、0.1mlの細胞(5E6)を10μgのIVT CARをコードするRNAと混合し、「パルス」ボタンを1回押すことによってBTX ECM830(Harvard Apparatus BTX,Holliston,MA,USA)を使用して2-mm Gapキュベット(Harvard Apparatus BTX,Holliston,MA,USA)中でエレクトロポレーションを行った。(設定:500ボルト、750μsecパルス長及び単(1)パルス、100mSec間隔)。エレクトロポレーション後、細胞を6ウェルプレートに移し、37℃のインキュベーターに直ちに戻した。初代ヒトT細胞に対して、mRNAなし(MOCK)又は10μgのCD33scFv CAR又は無関係の対照CARの何れかを発現するmRNAを用いてエレクトロポレーションを行った。エレクトロポレーションの24時間後、2μg/mlビオチン化L-タンパク質及びストレプトアビジン複合化PE又はビオチン化CD33(1μg/ml)及びストレプトアビジン複合化PEで染色した後にフローサイトメトリーによってCAR表面発現を測定する。
エレクトロポレーションの24時間後、T細胞を数える。1E5 T細胞をそれぞれに対して回収する。マイクロタイタープレートに対して200μL/ウェルのFACS緩衝液を用いて、細胞をFACS緩衝液で2回洗浄し、上清を廃棄する。プロテインLを含有する100μl染色緩衝液(Genscript,カタログ番号M000971:500;2ug/ml)で全ウェルを染色し、遮光しながら4℃で少なくとも30分間温置する。FACS緩衝液入りのマイクロタイタープレートに対して150μL/ウェルを使用して、FACS緩衝液を2回添加することによって細胞を洗浄する。400×gでの遠心分離を室温で4分間行う。次に、上清を廃棄する。100μlストレプトアビジン-R-フィコエリスリン(SA-PE;1:250)及びLive/dead Fixable Near-IR Dead Cell Stain色素(1:1000)で全てのウェルを染色し、遮光しながら4℃で少なくとも30分間、温置する。次に、フローサイトメトリー分析に対して細胞が準備される。
プロテインL染色の観察はCD33 CARに対して観察され、一方で、mRNAエレクトロポレーションなしのT細胞であった対照T細胞において、バックグラウンド染色のみ(~5.5%)が見られる。J&J内部のビオチン-標識組み換えKLK2タンパク質、続いてSA-PEを介して、初代ヒトT細胞上でのCAR発現も検出され得る。示されるように、T細胞は、フローサイトメトリーにより測定される場合、CD33 CARを効率的に発現し、一方でmRNAエレクトロポレーションなしのT細胞である対照T細胞又は非開示対照CAR(非CD33特異的)で見られるのはバックグラウンド染色のみである。
実施例5:CD33 CAR-T細胞による腫瘍細胞死滅
フローサイトメトリーを用いたCellTrace Violet(CTV,Thermo Fisher Scientificカタログ番号:C34557)に基づく細胞傷害性アッセイのための同時培養を以下のように行う。
T細胞を以下のように調製する。EPの24時間後、T細胞をカウントし、最大濃縮/所望のE:Tのために必要とされる濃度で再懸濁する。T細胞を100μl/アッセイのウェルで添加する(細胞2×10個/ml;10:1 E:T比で100μlを播種、即ち2E5個のT細胞/2E4個の標的細胞)。10:1のE:T濃縮の保存液を作製し、完全T細胞培地を用いて2倍連続希釈液を0.3125:1に調製する(Optimizer w/CTS、5%ヒト血清、1%GlutaMax)。96ウェル丸底組織培養処理プレートを使用してT細胞を三つ組みで播種する(100ul/ウェル)。
CTV標識される標的細胞を以下のように調製する。20μL DMSOをCTV染色溶液のバイアルに添加する。この保存溶液を20mlのPBS(37℃に温める)に入れて希釈し、5μM染色溶液とする。10E6個の腫瘍細胞を回収し、PBSで2回洗浄し、4E6個/ml(2.5ml)で再懸濁する。等体積(2.5ml)のCTV染色溶液が添加される。37℃インキュベーター中で細胞を20分間温置する。40ml PRMI+20%FBSを細胞に添加して、未結合色素を全て吸収させる。細胞を5分間温置する。400×gで細胞を5分間再懸濁する。予め温めたRPMI+10%FBS培地中で細胞ペレットを再懸濁する。合間に、上記の所望のE/T比でT細胞を播種する。CD33+腫瘍細胞株及びCD33腫瘍細胞株を再カウントし、次に、三つ組みで、この細胞を2E5/ml及び100ul中で再懸濁する。平底96ウェルプレートにおいて、この細胞を標識された腫瘍細胞株と同時温置する。
フローサイトメーターを使用して以下のように細胞傷害性アッセイを行う。同時培養の20時間後、細胞全てをU底96ウェルプレートに移し、洗浄する。同時培養の20時間後、平底96ウェルプレートから細胞全てを回収し、U底96ウェルプレートに移し、次に洗浄する。30μlの0.25%トリプシンを全ウェルに添加し、37℃インキュベーター中で5分間温置する。5分後、腫瘍細胞全てをU底96ウェルプレートに回収する。細胞を400×gで5分間、2回、遠心分離し、洗浄する。次に、細胞ペレットを希釈した(1:1000)LIVE/DEAD(商標)Fixable Near-IR染色色素(100μl)中で再懸濁する。細胞を4℃で30分間温置し、細胞を400×gで5分間遠心分離することによりFACS緩衝液で2回洗浄する。洗浄後、100μlのBD Cytofix(商標)固定緩衝液(50ul FACS緩衝液+50ul固定緩衝液)を使用して10分間、細胞全てを固定する。細胞を遠心分離し、400×gで5分間、1回洗浄する。FACS緩衝液中で細胞ペレットを再懸濁する。温置時間終了後、多色フローサイトメトリーにより、染色した試料を分析する。以下の式を使用して、細胞傷害性活性のパーセンテージを計算する:
%特異的な死滅=%NearIR+CTV+(死滅)細胞-%自然発生Near IR+CTV+/(100%-%自然発生NearIR+CTV+(死滅)細胞)×100%。
一過性形質移入の24時間後、標的細胞(CD33陽性Vcap及びCD33陰性DU145細胞)をCell Trace Violet(CTV)蛍光色素で標識し、次いでCD33 CAR-T細胞とともに同時培養する。モックT細胞は陰性のエフェクター対照とする。0.3125:1~10:1の範囲のエフェクター対標的細胞(E/T)比で20時間にわたり細胞を同時培養する。CAR-T細胞なしで培養される生きている標的細胞の数と比較して、同時培養中に残っている生きている(生存性色素陰性)標的(CTV陽性)細胞の絶対数の比としてパーセント死滅を測定する。示されるように、CD33CAR T細胞は、特異的に及び効率的にCD33(+)ヒト癌細胞株を溶解させるが、10:1~0.3125:1のE/T比でCD33(-)細胞は溶解させず、一方でモック又はCD33 CARであったT細胞ではバックグラウンド細胞傷害性のみが見られる。
標的細胞の免疫細胞介在性細胞溶解に対する効力アッセイとして、リアルタイム細胞分析系としてxCELLigenceを使用して、リアルタイム細胞傷害性についてCD33 CAR-T細胞も試験する。
50μlの標的癌細胞培養培地を96ウェルE-プレート(ACEA Biosciences)の各ウェルに添加し、バックグラウンドインピーダンスを測定し、細胞インデックスとして示す。次に、接着標的細胞CD33(+)及びCD33(-)を剥離し、100μlの体積で細胞5E4(VCap)、5E3個/E-Plateウェルの密度で播種し、電極表面上に受動的に接着させる。播種後、E-Plateは、30分間、層流フードの内部で周囲温度において維持し、次に細胞培養インキュベーター内のRTCA MP機器に移す。実験の全体の時間(96時間)にわたり15分間隔でデータ記録を直ちに開始する。
その時に、処理を適用し(癌細胞播種後24時間)、データ獲得を休止し、50μlの培地を各ウェルから取り出し、50μlの体積中でCAR-T細胞を異なるエフェクター対標的(E:T)比で添加する。CD33(+)CAR-T及び非開示対照CAR(非CD33特異的)T細胞を再懸濁する。次に、96ウェルプレートにおいて二つ組で2倍希釈を行う(5:1~0.156:1 E/T比)。標的+モックエフェクター対照(RNAエレクトロポレーションがないT細胞)も標的細胞に添加する。
標的細胞CD33(+)及びCD33(-)を、およそ72時間、異なるE/T比で、モック、CD33(+)及びCD33(-)CAR-T細胞にエレクトロポレーションされる(形質移入から24時間後)10μg mRNAとともに温置する。CD33(+)及びCD33(-)に対する正規化した細胞インデックス(CI)プロットを作成する。単独で播種する場合、標的細胞をプレートに接着させ、増殖させ、CI読み取りを増加させる。
実施例6:CD33 CAR-T細胞によるサイトカイン産生
細胞傷害性T細胞により産生されるIFN-γは、腫瘍の免疫監視の発揮を可能にし、これは、インビボ及びインビトロで一部の悪性腫瘍の増殖を直接阻害し、アポトーシスを誘導し得る。CD33 CAR-T細胞がCD33(+)腫瘍細胞を認識し、これにより活性化され得るか否かを判定するために、実施例5に記載のように、上清をxCELLigenceに基づく死滅アッセイから回収した。約70時間の同時培養後、上清を回収し、ELISAキット(ヒトIFN-γELISA MAX(商標)Deluxe,BioLegend,Cat#:430106)で提供される指示に従い、ELISAによりアッセイした。
抗原刺激されたCAR-T細胞のIFN-γ産生が起こる。CD33 CAR及び対照CAR-T細胞は、E:T比依存的にCD33発現細胞との同時培養中にIFN-γを分泌したが、CD33陰性細胞との同時培養中には分泌しなかった。非開示対照CARは、CD33よりも抗原発現レベルがかなり高かったため、大幅により多くの量のIFN-γを分泌した。
実施例7:CD33 CAR-T細胞による腫瘍細胞死滅
抗原依存性細胞傷害性について、リアルタイムIncuCyte腫瘍死滅アッセイにおいてCD33 CAR-T細胞を評価する。CAR発現データに基づいて計算した1:1又は0.5:1のエフェクター:標的比で、CD33 CAR-T細胞を標的細胞とともに88時間、同時温置する。リアルタイム方式でIncuCyteイメージング系により測定した場合に赤い核色素を安定して発現する標的細胞を同定する。以下の計算を行う:腫瘍細胞増殖阻害(%)=(初期生存標的細胞数-現在の生存標的細胞数)/初期生存細胞数*100(%)。
実施例8:CD33 CAR-T細胞によるサイトカイン産生
1:1のE/T比での細胞とのCD33 CAR-T細胞の一晩(およそ20時間)同時培養物から上清を回収し、13-plex Milliplexヒト高感度T細胞キット(HSTCMAG28SPMX13)を使用して分析した。CD33 CAR修飾T細胞は、CD33発現細胞との同時培養中にサイトカインを分泌したが、非形質導入T細胞(UTD)については最小であった。
1:1のE/T比での細胞とのCD33 CAR-T細胞の一晩(およそ20時間)同時培養物から上清を回収した。CD33 CAR T細胞は、CD33発現細胞との同時培養中にIFN-γを分泌したが、CD33陰性細胞との同時培養中には分泌しなかった。CD3/28ビーズで刺激したT細胞及びT細胞のみを陽性及び陰性対照としてそれぞれ使用した。CD33 CAR-T細胞によるIFN-γ放出。二つ組培養物からの平均IFN-γ濃度±SD(pg/ml)を示す。異なる熱安定化されたCAR-T細胞は、CD33(+)細胞と同時培養した場合、異なる量のIFN-γを産生した。
実施例9:CD33 CAR-T細胞の増殖
増殖アッセイにおいてCD33 CAR-T細胞を評価する。T細胞増殖は、インビボ免疫機能の重要なインビトロパラメーターである。CD33 CAR-T細胞の機能をさらに評価するために、CD33 CAR-T細胞をCTVで標識して、T細胞増殖を評価する。
CellTrace Violet(CTV;5μM)でCD33 CAR-T及び非形質導入(UTD)T細胞を標識し、CD33(+)及びCD33(-)細胞とともに同時培養する。同時培養の5日後、細胞を回収し、CD3、CD25、NearIR live/dead色素及びCD33CARで染色する。Flowjoソフトウェアを用いて、Fortessaフローサイトメトリー上でフローサイトメトリー分析を行う。生存CD3及びCTV色素希釈があるCAR-T細胞の頻度によってリンパ球を同定し、活性化マーカーCD25を調べる。示されるように、CD33 CAR+T細胞においてゲーティングすることにより、CD33(+)細胞は、全てのCARコンストラクトを促進するが、CD33(-)細胞を促進しない。CD3/28ビーズで刺激したT細胞及びT細胞のみをそれぞれ陽性及び陰性対照として使用する。刺激が全くないT細胞単独は増殖せず、CD3/28ビーズで刺激されたT細胞は、均等な増殖パターンを示した。CD33 CAR-T細胞は、細胞との同時培養の5日後、CD3/28ビーズ陽性対照よりもロバストに増殖した。異なるCARコンストラクト改変T細胞は、異なる増殖活性を有し、異なるCAR-T細胞数を示した。CAR-T細胞数は、3回の技術的な反復からの平均絶対細胞数+/-SEMに基づく。
以下のようにプロトコールを実施する。腫瘍細胞を回収し、PBSで2回洗浄し、腫瘍細胞増殖を阻止するために、37℃インキュベーターにおいて1.5時間、100ug/mlマイトマイシンC(MMC)を含有するPBS中、10E6/mlで再懸濁する。20μLのDMSOをCTV染色溶液のバイアルに添加する。5μlの溶液を5mL(1:1000)PBS(37℃に温める)に入れて希釈して、5μMの染色溶液を提供する。2E6 T細胞をカウントし、回収し、PBSで2回洗浄し、4E6/ml(0.5ml)で再懸濁する。等体積(0.5ml)のCTV染色溶液を添加する。細胞を37℃で20分間温置する。次に、未結合の色素を全て吸収させるために、4ml PRMI+20%FBSを細胞に添加する。細胞を5分間温置し、400×gで5分間遠心分離する。予め温めたRPMI+10%FBS中で細胞ペレットを再懸濁する。T細胞をカウントし、96ウェル平底プレートにおいて1E5細胞(100ul)を播種する。
合間に、MMC処理した腫瘍細胞を回収し、1.5時間後にカウントし、次に1E6/mlで再懸濁する。96ウェルプレートにおいて1E5の細胞(100μl)をT細胞とともに同時培養する。T細胞単独及び3:1のCD3/28ビーズ対細胞比が添加されたT細胞をそれぞれ陰性及び陽性対照として使用する。
同時培養5日後、全ての細胞を各ウェルから回収する。細胞を400×gで5分間、2回、遠心分離して洗浄し、次いで、96-ウェルU底プレートにおいてCD33 CAR、CD3、CD8及びCD25、live/dead(Near-IR)で染色する。洗浄後、100μl BD Cytofix(商標)固定緩衝液(50ul FACS緩衝液+50ul固定緩衝液)を使用して全ての細胞を10分間固定する。温置時間終了後、多色フローサイトメトリーにより、染色した試料を分析する。
データ分析を以下のように行う。CTVヒストグラムを準備する。単独培養したT細胞の一番右端のピーク(CTV bright)を包含し、CTV希釈ゲートが集団の残りを捕捉するようにCTV非希釈ゲートを設定する。これは、全ての試料に適用される。
実施例10:CAR17、CAR18、CAR19又はCAR20で形質導入されたCAR-T細胞の特徴評価
抗原依存性活性に対するJNLレポーターアッセイにおいて、作製されたCAR-T細胞を評価する。簡潔に述べると、シグナル伝達応答NFATプロモーターにより推進されるルシフェラーゼ遺伝子を含有するJurkat細胞(JNL細胞と呼ばれる)に対して、CAR17(KL2B413_HL)、CAR18(KL2B413_LH)、CAR19(KL2B359_HL)又はCAR20(KL2B359_LH)コンストラクトを用いて形質導入を行った。ビオチン化CD33、続いてストレプトアビジン複合化PEにより、各CARの発現を決定する。
CD33CARコンストラクトとその同族細胞抗原(標的細胞上のCD33)との間の結合は、JNL細胞におけるルシフェラーゼ発現につながる。その目的で、試験CARコンストラクトで形質導入したJNL細胞又は非形質導入JNL細胞(UTD)を標的腫瘍細胞株と同時培養し、発光強度としてルシフェラーゼ活性を測定した。発光強度が抗原発現細胞の存在下でUTD細胞のレベルの1.5倍を超えた場合、コンストラクトを活性があるものとみなした。試験したCARコンストラクトに対して、抗原依存性活性化は見られなかった。
CAR-T細胞は、抗原依存性に腫瘍細胞死滅に介在する。
CAR17、CAR18、CAR19及びCAR20を用いてCAR-T細胞に対して形質導入を行い、T細胞でのCAR発現に基づいて計算した1:1又は0.5:1のエフェクター対標的(ET)比で96時間にわたりCD33陽性細胞及びCD33陰性細胞と同時温置する。標的細胞は、赤色の核色素を安定して発現しており、これは、リアルタイムでIncuCyteイメージング系によって測定された。腫瘍細胞増殖阻害(TGI)(%)=(初期生存標的細胞数-現在の生存標的細胞数)/初期生存細胞数*100(%)。試験したCAR-T細胞は、およそ100%TGIを達成し、一方で、非形質導入対照は、TGIを示さなかった。CD33陰性細胞において、試験したCAR-T細胞では、TGIは観察されなかった。
CAR-T細胞は、抗原刺激時にサイトカインを産生する。
細胞傷害性T細胞により産生されるIFN-γは、腫瘍の免疫監視を発揮するために必須であり、これは直接、インビボ及びインビトロで一部の悪性腫瘍の増殖を阻害し、アポトーシスを誘導し得る。CD33 CAR修飾ヒトT細胞が認識可能であるか又はCD33陽性腫瘍細胞により活性化されるようになることが可能であるか否かを判定するために、指定のCARクローンで形質導入された初代T細胞及び対照非形質導入T細胞(UTD)を標的細胞株とともに同時培養し、IFN-γ濃度測定のために上清を回収した。CD33 CAR細胞で形質導入されたCAR-T細胞は、CD33細胞を組み換え発現するLNCaP細胞との同時培養中及び超低CD33発現細胞との同時培養中にもIFN-γを分泌したが、CD33陰性細胞の場合には分泌しなかった。
CAR-T細胞は、抗原依存的に活性化され、脱顆粒のマーカーを上方制御する。
腫瘍細胞は、主に標的腫瘍細胞を死滅させる溶解性顆粒の免疫分泌を通して、CD8+Tリンパ球及びナチュラルキラー(NK)細胞など、細胞傷害性リンパ球により認識され、死滅させられ得る。この過程は、免疫エフェクター細胞の細胞質膜との顆粒膜の融合を含み、その結果、一般的にCD107aなどの溶解性顆粒を取り囲む脂質二重層上に存在するリソソーム結合タンパク質の表面曝露が起こる。従って、CD107aの膜発現は、免疫細胞活性化及び細胞傷害性脱顆粒のマーカーを構成する。
以下に記載のように脱顆粒アッセイを行う。96ウェルプレート中で0.1ml/ウェルにおいて、等しい数のエフェクター細胞とともに標的細胞(5x10)を同時培養した。対照ウェルはT細胞のみを含有した。モネシンの1μl/試料(BD Biosciences)に加えて、抗CD107a(5μl/ウェル)を添加し、37℃で4時間温置する。細胞をPBSで2回洗浄し、CD33 CAR、CD3及びCD8の発現について染色し、フローサイトメトリーBD Fortessaにおいて分析する。
CD33 CAR-T細胞は、抗原依存性に増殖する。
実施例9に記載のT-細胞増殖アッセイプロトコールを使用して、CAR-T細胞をそれらの増殖について評価する。CD33 CAR-T及び非形質導入(UTD)T細胞をCellTrace Violet(CTV;5μM)で標識し、CD33陽性及びCD33陰性細胞とともに同時培養する。同時培養の5日後、細胞を回収し、CD3、CD25、NearIR live/dead色素及びCD33 CARで染色した。Flowjoソフトウェアにより、Fortessaフローサイトメーター上でフローサイトメトリック分析を実施した。ライブ(live)CD3によってリンパ球を同定し、CTV色素希釈があるCAR-T細胞の頻度及び活性化マーカーCD25を調べた。CD3+T細胞においてゲーティングすることにより、CD33陽性細胞は、試験した各CAR-T細胞株の増殖を促進したが、CD33陰性細胞を促進しなかった。刺激がないT細胞単独は、増殖せず、CD3/28ビーズで刺激したT細胞は、均等な増殖パターンを示した。CD33 CAR+T細胞は、細胞との同時培養の5日後、CD3/28ビーズ陽性対照よりもロバストに増殖した。異なる試験CAR-T細胞は、異なる増殖活性を有し、異なるCAR-T細胞数を示した。増殖するT細胞及びCD25発現T細胞のパーセンテージは、二つ組からの平均絶対細胞数+/-SEMに基づいた。
実施例11:二特異性CD33×CD3抗体の作製
上の実施例で作製される抗CD33抗体のVH/VL領域及び抗CD3抗体CD3B219及びCD3B376のVH/VL領域は、二特異性方式になるように改変され、IgG1として発現される。CD3B219及びCD3B376は、Fabとして改変され、CD33VH/VL領域は、二特異性抗体になるように両方向でscFvとして改変され、scFv-ヒンジ-CH2-CH3の形式でCD33結合アームが得られ、重鎖:VH-CH1-リンカー-CH2-CH3及び軽鎖:VL-CLの方式でCD3結合アームが得られる。代わりに、抗CD3抗体のVH/VL領域は、scFvとして改変され、抗CD33抗体のVH/VL領域は、Fabとして改変される。scFvにおいて使用されるリンカーは、配列番号7のリンカーである。CD3B219は、米国特許第9,850,310号明細書に記載されている。
T350V_L351Y_F405A_Y407V CH3突然変異は、1本の重鎖に改変され、T350V_T366L_K392L_T394W CH3突然変異は、他の重鎖に改変される。さらに、CD33及びCD3結合アームの両方は、Fcエフェクター抑制突然変異L235A_L235A_D265Sを含有するように改変される。
改変された鎖が発現され、得られた二特異性抗体は標準的方法を使用して精製する。二特異性抗体は、本明細書中で記載のようにCD33及びCD3に対するそれらの結合及びそれらのインビトロ及びインビボ細胞傷害性について特徴評価される。表10は、抗CD3抗体CD3B219及びCD3B376のアミノ酸配列を示す。
Figure 2023517660000038
実施例12:作製された二特異性CD33×CD3抗体はインビトロで細胞傷害性がある。
Incucyteプラットフォーム上でライブタイムラプスイメージングを使用して、インビトロで作製された二特異性抗体の細胞傷害能を評価するためにT細胞介在性細胞傷害性アッセイが使用される。CD33陽性細胞株細胞において、3:1の(エフェクター:標的)エフェクター:標的比(E:T比)において、健康なドナー由来の単離panヒトCD3+T細胞の存在下で二特異性抗体を試験する。標的細胞により安定して発現される色素からの蛍光シグナルを測定することにより、アポトーシスによる細胞死を監視する。二特異性抗体は、時間延長とともに、用量依存的な生存細胞の減少を促進し、故に腫瘍細胞のT細胞介在性の死滅を誘導する。腫瘍細胞阻害のパーセント%=(初期播種腫瘍細胞数-現在の生存腫瘍細胞数)/(初期播種腫瘍細胞数)*100%。
実施例13:ADCの作製及び特徴評価
抗体又はCD33に結合する抗原結合ドメインは、In-111、Zr-89、Lu-177又はAc-225などの様々な放射性金属で標識されるべきであり、インビボ腫瘍生体分布又は腫瘍効力は、雄NOD.Cg-PrkdcscidIl2rgtm1Wjl/SzJ(NSG,The Jackson Laboratory,Bar Harbor,ME)又はBalb-c又はSHOヌードマウスにおいて、LNCaP、VCaP又はC4-2Bを含む確立された皮下(SC)ヒト前立腺モデルにおいて評価される。CD33に結合する抗体若しくは抗原結合ドメイン又はアイソタイプ対照抗体の様々な用量を異なる量の放射性物質(10~1000nCi)で標識し、腫瘍取り込み又は効力を測定する。
実施例14:内部移行についての薬物と複合化された抗CD33抗体の試験
色素抗CD33抗体の内部移行度の特徴評価を行うために、及び薬物と複合化された抗CD33抗体の治療効果を判定するために、以下の試験を行った。理論により縛られることを望むものではないが、抗CD33抗体の内部移行は、放射性同位体、例えばIn-111、Zr-89、Lu-177又はAc-225と複合化された場合、抗CD33抗体の治療的有益性の向上を示唆する。
材料及び方法
色素細胞培養を以下のように行った。10%FBS(HiMedia)入りのRPMI1640(Gibco)培地中でMOLM-13、Kasumi-1、OCI-AML-3及びHDLM2細胞を培養した。各細胞株上での受容体密度を決定するために、飽和濃度で抗CD33抗体(クローンWM53,Biolegend)を用いて細胞を染色した。BD Quantibrite PEビーズ(BD Biosciences)を使用して、受容体密度を決定した。
製造者のプロトコールに従い、固定可能な紫色の死細胞染色(L34955,ThermoFisher)により、生存能についてMOLM-13、Kasumi-1、OCI-AML-3及びHDLM-2細胞を染色した。細胞を回収し、PBSで1回洗浄し、次いで、固定可能な生存能色素を用いて室温で30分間染色した。温置後、細胞をFACS緩衝液(PBS+2%FBS)で2回洗浄した。次に、試験抗体を用いた結合アッセイのために細胞を使用した。100ul染色体積において試験抗体で100,000個の細胞を染色した。染色のための抗体をFACS緩衝液中で希釈し、細胞とともに40分間氷上で温置し、続いてFACS緩衝液で2回洗浄した。次に、PE複合化ヤギF(ab’)2抗ヒトIgG-Fc(ab98596;Abcam)を使用して氷上で40分間、試験抗体を検出した。洗浄後、Novocyteフローサイトメトリー(ACEA)上でデータを得た。FSC/SSCで細胞をゲーティングし、続いて生存細胞をゲーティングし、ダブレット除去を行った。Flow Jo(BD)を使用してデータを分析した。
4-パラメーター非線形回帰分析曲線をプロットするために、二次単独試料のMFIを差し引いた後、中央値蛍光強度値を使用した。
37℃での動態結合試験のために、試験抗体で染色するために上記のように細胞を処理した。製造者のプロトコールを用い、AF647標識キット(A20186,ThermoFisher)を使用して試験抗体をAlexa Fluor 647(AF647)色素と複合化させた。抗体添加後、指定された時間点に対して、thermomixer(Eppendorf)において細胞を37℃で温置した。次に、Cytofix(BD Biosciences)を使用して試料を固定し、Novocyte(ACEA Biosciences)上で捕捉した。データを上記ように分析した。
抗体内部移行アッセイを以下のように行った。
プロテインA-MMAFアッセイを以下のように行った。プロテインA-MMAFはLevena Biopharmaから購入した。50μl体積で、底が透明の96ウェル平底暗色ウェルプレート(Corning)において、MOLM-13、Kasumi-1、OCI-AML3及びHDLM2細胞を細胞4000個/ウェルとして播種した。4X濃縮液(400nM)として抗体保存液を調製し、連続希釈した。25μlの各抗体希釈物を細胞に添加した。プロテインA-MMAF保管溶液も4X濃度(400nM)で調製し、25μlを各ウェルに添加した。細胞及びプロテインA-MMAFが入ているが抗体がないウェルを100%生存細胞とみなした。抗体及びプロテインA-MMAFとともに細胞を96時間温置した。温置時間の終了時に100ulのCellTitre-Glo(Promega)を細胞に添加し、Tecanプレートリーダーで発光を読み取った。%生存能を以下のように計算し、Graph Pad Prismを使用して4-パラメーター非線形回帰曲線をプロットするために使用した。
Figure 2023517660000039
pHAb色素に基づく内部移行アッセイを以下のように行った。pHAbアミン反応性色素はPromegaから購入した。400ugの各試験抗体をpHAb色素と複合化した。簡潔に述べると、10mg/mL(11.3mM)の最終濃度になるように12.5uL DMSO+12.5uL水(総体積25uL)中でアミン反応性pHAb色素(Promega,#G9845)を再構成した。10倍モル過剰量の色素において複合化反応を行った。
反応混合物は、抗体(250ul体積中500ug+3ulのpHAb色素+30ulの0.5Mホウ酸ナトリウム緩衝液+水を含有し、最終反応体積が300ulになるようにした。撹拌しながら37℃で2時間、反応物を温置し、その後、10mMの最終濃度になるように1M Tris pH7.5を添加することにより反応を停止させた。Zebaカラム-2mL、40kDaカットオフ(Thermo 87768)で色素標識された試料をPBSに交換した。抗体濃度及びDAR値を以下のように計算した。
NanoDropによる測定濃度
・pHAb濃度(uM)=(吸光度/(EC_pHAb*経路長))×106、ここで、
o吸光度=A532
oEC_pHAb=75,000
・Ab濃度(uM)=(吸光度/(EC-Ab*経路長))×106、ここで、
o吸光度=A280-(0.256*A532)
・0.256は、A280での残留pHAb吸光度に対する補正因子である。
oEC_Ab=210,000
・色素:Ab=conc.pHAb(uM)/conc.Ab(uM)
pHAb色素標識されたCD33抗体の動態を分析するために、100nMのpHAb複合化試験抗体とともに氷上で45分間、MOLM-13、Kasumi-1、OCI-AML-3及びHDLM2細胞を温置した。FACS緩衝液中で抗体希釈液を調製した。標識後、冷却したFACS緩衝液で細胞を洗浄し、指定時間点にわたり37℃で温置した。温置時間終了時に、Novocyteフローサイトメトリー上で細胞を捕捉した。バックグラウンド蛍光を説明するために、全ての時間に対して非染色試料が含まれた。
結果
4℃でCD33抗体の連続希釈液と細胞を温置することによって結合を行い、続いてPE複合化ヤギF(ab’)2抗ヒトIgG-Fc抗体で検出した。標的細胞株へのCD33抗体の結合を示すデータは、4℃での抗ヒトCD33抗体の非線形回帰プロファイルを示すグラフとして図2A及び2Bで示す。中央値蛍光強度(MFI)対抗体のlog濃度をプロットする。各細胞株に対するトップヒットは、赤色で示され、リンツズマブ結合は青色の曲線で示す。
標的細胞株に対するCD33抗体の時間及び温度依存的な結合をアッセイした。37℃及び4℃で直接複合化した抗体の連続希釈液とともに細胞を温置することによって結合を行った。データを図3A及び3Bで示す。これらの図面におけるグラフは、37℃及び4℃での抗ヒトCD33抗体の結合の非線形回帰プロファイルを示す。中央値蛍光強度(MFI)対抗体のlog濃度をプロットする。
高、中及び低発現標的細胞株のCD33抗体での内部移行をアッセイした。プロテインA-MMAFと一緒にCD33抗体の連続希釈液と細胞を96時間培養した。96時間後、CellTitre-Glo試薬を細胞に添加し、細胞生存能を測定した。プロテインA-MMAFのみが入ったウェルを100%生存とみなした。発現なし細胞株としてHDLM-2細胞を使用した。この結果を図4A~4Dで示す。細胞生存能の低下は、抗体内部移行を示す。グラフは、抗体のlog濃度に対する細胞生存能についての非線形回帰分析を示す。
CD33抗体内部移行の動態を評価した。CD33抗体をpHAb色素で標識し、100nMの濃度で細胞とともに37℃で指定時間点にわたり温置し、その後、細胞を洗浄し、フローサイトメトリー上で捕捉した。この結果を図5で示し、ここで、グラフは、指定される時間点でのMFI値を示す。
標的細胞株上でのCD33発現をアッセイした。Biolegendからの抗ヒトCD33抗体を使用して、高、中及び低CD33発現細胞株を同定した。抗体(橙色のヒストグラム)又はマウスIgGアイソタイプ対照(青色のヒストグラム)でMOLM-13、Kasumi-1、OCI-AML-3及びHDLM2細胞を染色し、各細胞株についてのアイソタイプに対する倍率変化を計算した。データを図6で示す。
pHAb色素との複合化後の抗体完全性及びDAR値を評価した。pHAb色素で抗体を標識し、SDS-PAGE上で分析した。280及び530nmでODを測定し、280nmでの色素吸光度に対して補正することにより、薬物対抗体比(DAR)を計算した。データを図7で示す。
pHAb介在性抗体内部移行動態の特異性を調べた。CD33抗体をpHAb色素で標識し、指定時間点にわたり4℃において100nMの濃度でKasumi-1又はOCI-AML-3細胞と温置し、その後、細胞を洗浄し、フローサイトメトリー上で捕捉した。データを図8Aで示す。グラフは、指定される時間点でのMFI値を示す。4℃で内部移行は観察されなかった。抗体をHDLM-2細胞とも37℃で温置した。データを図8Bで示す。MFIの上昇は観察されなかった。
高(MOLM-13)、中(Kasumi-1)及び低(OCI-AML-3)細胞株のCD33抗体の結合EC50値をアッセイした。抗体の連続希釈液を用いて4℃で結合を行った。データを図9で示す。
様々な標的細胞株におけるCD33抗体内部移行をアッセイし、そのデータを図10で示す。MOLM-13及びOCI-AML-3に対して、EC50値を示す。Kasumi-1に対して、100nM濃度での%生存能を示す。
実施例15:CD33細胞表面レベルでのCD33抗体の効果
単球、マクロファージ、樹状細胞、好中球、T細胞及び/又はミクログリアにおいて、CD33の細胞表面レベルに対する抗CD33及びCD33二特異性抗体の効果を試験するために、アッセイを行う。このアッセイにおいて、組織球性リンパ腫細胞株U937並びにCD33発現CHO細胞、ヒト初代単球、末梢血単球由来のヒト初代マクロファージ、末梢血単球由来のヒト初代樹状細胞、末梢血単球由来のヒトミクログリア細胞及びヒト初代T細胞においてCD33の細胞表面レベルを低下させる能力について、抗CD33抗体を評価する。
細胞培養により、末梢血単球からヒトミクログリア細胞を調製する。単球単離抗体を使用して末梢ヒト血液試料からの単球を単離し、樹状細胞に分化させ、5日間培養する。5%CO中で37℃において10%ウシ胎児血清を含有する培地中で細胞を培養する。非接着細胞を回収し、食作用実験のために使用する。ヒトマクロファージを生成させるために、末梢ヒト血液試料からの単球を単離し、マクロファージに又は樹状細胞に分化させる。
10%Hyclone FBS、2mMグルタミン、ペニシリン、ストレプトマイシン及び非必須アミノ酸を添加した2mlのRPMI中、細胞200,000個/mlで細胞試料を播種する。CD33抗体又は対照アイソタイプを1.0μg/mlで添加し、5%COとともに37℃で24時間温置する。
受容体ダイナミクスを評価するために、1時間にわたり抗体を細胞と結合させ、次いで洗い流す。少なくとも24時間後にCD33の表面レベルを決定する。FACS分析により、細胞表面受容体発現を検出する。FITCと複合化された抗CD33抗体と、及び対照表面マーカーとともに細胞を温置する。FACS緩衝液(PBS+2%FBS、2mM EDTA)中で2回、この細胞を洗浄し、フローサイトメトリーを行う。分析に対して、個々のフルオロフォアに対するWI値を使用して、抗体非存在下での受容体発現のパーセントとしてデータを計算する。
実施例16:シグナル伝達分子リン酸化の誘導又は阻害に対する抗CD33抗体及びCD33二特異性抗体のアッセイ
様々な細胞(例えば、J774、RAW264.7、BMM細胞、ヒト初代単球、マクロファージ、樹状細胞、T細胞ミクログリア又は破骨細胞)を個々に培養する。この細胞を培養皿から除去し、カウントする。次に、(i)抗CD33抗体、(ii)抗CD33二特異性抗体又は(iii)アイソタイプ適合対照抗体とこの細胞を温置する。次に、この細胞を溶解し、遠心分離して不溶性物質を除去する。DAP12、ERK、AKT、プロテインA-アガロース及びタンパク質G-アガロースのそれぞれに対する1つ以上の異なる抗体を用いて、各上清において免疫沈降反応を行う。ビーズをRIPA緩衝液で徹底的に洗浄する。SDS-ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)によってこのタンパク質を分離し、次いでウエスタンブロッティングによりニトロセルロース膜に転写する。次に、リン酸化チロシン又はDAP12、ERK、Syk、LCK、FYN、C-Cbl、VAV又はAKTのリン酸化形態を特異的に認識する抗体とともにビーズを温置する。DAP12、ERK、Syk、LCK、FYN、C-Cbl、VAV及びAKTのリン酸化度を定量するために、高感度化学発光(ECL)系でビーズを視覚化する。
実施例17:CD33抗体及び/又は二特異性抗体の抗癌効果のインビボ分析
8週齢(+/-2週齢)の10匹のマウスの群、通常のマウス又はヒトCD33遺伝子を過剰発現するマウスの何れかに1.00μl PBS中で懸濁した腫瘍細胞(例えば1x10~1x10MC38、Lewis肺又はB16細胞)を皮下注射で負荷する。移植前にイソフルランでマウスに麻酔をかける。第2日で開始して、200μgの各アンタゴニスト抗CD33抗体で4回の投与にわたり3日ごとにマウスの群にi.p.注射する。第4日で開始して、腫瘍成長を測定するために、隔週でノギスを用いて腫瘍成長を監視する。実験のエンドポイントは、2000mm又は60日間の腫瘍体積である。腫瘍成長及び%生存率は転帰の目安である。抗CD33が抗癌効果を有する場合、以下の1つ以上を観察する:腫瘍生着及び成長速度の低下、腫瘍浸潤免疫抑制マクロファージ数の減少及び腫瘍へのエフェクターT細胞流入の増加。
実施例18:抗TRGV9及び抗CD33二特異性抗体
γ/δT細胞刺激及び拡大増殖を行った。14日間にわたりrhIL-2(1000IU/mL)、rhIL-15(10ng/mL)及びゾレドロン酸(5μM)を含有する完全RPMI培地中でPBMCを処理することにより、Vγ9-Vδ2T細胞の拡大増殖を行った。
抗Vγ9モノクローナル抗体のデノボシーケンシングを以下のように行った。AbcamからマウスIgG1抗ヒトT細胞受容体抗TRGV9クローン7A5を得た(カタログ番号ab171109)。Lake Pharma(San Carlos,CA)が試料調製及びLC-MS/MS分析を行った。試料を還元し、アルキル化し、7つのアリコートに分け、トリプシン/LysC、キモトリプシン、LysC、ペプシン及びAspN、エラスターゼ及びプロテイナーゼK酵素でタンパク分解的に消化した。ZipTip C18 Pipette Tipsを使用して、得られたペプチドを脱塩し、逆相クロマトグラフィーを使用してライン上で分離した。HCD断片化を使用して、Thermo Q-Exactive分光光度計上で質量分析を行った。IMGTに基づく抗体配列データベースにデノボ配列タグを適合させることにより、PEAKSソフトウェアを使用してMSデータセットを分析した。デノボ同定ペプチドのコンティグ配列アセンブリーを使用して、配列中のギャップを割り当てた。MS/MSスペクトルを調べることにより、全てのCDR及び超変異を確認した。
上記に従い作製される4つのモノクローナル抗体の配列並びにそれらのCDR配列を以下の表11~15で示す。
Figure 2023517660000040
Figure 2023517660000041
Figure 2023517660000042
Figure 2023517660000043
Figure 2023517660000044
Vγ9×CD33二特異性抗体の調製を以下のように行った。7A5(抗TRGV9)及びC33B904(抗CD33抗体)の可変領域配列を使用して、T細胞がリダイレクトされた急性骨髄性白血病(AML)細胞の死滅について試験しようとする二特異性抗体を作製した。二特異性抗体VG4(抗TRGV9×CD33)及びVG3(抗TRGV9×Null)をヒトIgG4としてのノブ-イントゥ-ホール方式の全長抗体として作製した。標準的PCR制限酵素に基づく標準的なクローニング技術を使用して、ヒトIgG4発現カセットの定常領域を含有するカスタム哺乳動物発現ベクターに、可変領域をコードする核酸配列をサブクローニングし、シーケンシングして検証した。チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞株において、一過性形質移入により、二特異性抗体を発現させた。CHO細胞で発現される二特異性抗体の配列を以下の表16で示す。
Figure 2023517660000045
本抗体は最初にMab Select SuRe Protein Aカラム(GE Healthcare)によって精製した。このカラムをPBS pH7.2で平衡化し、2mL/minの流速で発酵上清を負荷した。負荷後、このカラムを4カラム体積のPBSで洗浄し、続いて30mM酢酸ナトリウム、pH3.5中で溶出した。280nmの吸光度により監視される場合にタンパク質ピークを含有する分画をプールし、1%3M酢酸ナトリウムpH9.0を添加することによってpH5.0に中和した。PBS緩衝液で平衡化した分取Superdex 200 10/300GL(GE healthcare)サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)カラム上で二特異性mAbをさらに精製した。内毒素測定及び還元及び非還元条件下でのSDS-PAGEにより、試料の完全性を評価した。VG68に対する代表的なゲルを図12で示す。最終タンパク質濃度は、抗TRGV9/抗CD33に対して1.0mg/mlであり、抗TRGV9/Nullに対して1.0mg/mLであった。これらに基づく抗TRGV9/抗CD33及び抗TRGV9/Nullの最終EUレベルは<3.0EU/mgであった。
標的細胞株に対する抗CD33抗体の結合活性を評価した。パネルCD33+細胞株に対する抗CD33クローンC33B904の結合をFACSにより測定した。MOLM-13(図13)、Kasumi-1(図14)及びOCI-AML-3(図16)に対してEC50及びEC90を計算した。
Vγ9+(γδ)T細胞及びPan T-細胞の特徴評価を以下のように行った。PBMC全体からVγ9γδT細胞を選択的に拡大増殖させるために、ゾレドロン酸を使用した。製造者の説明書に従い、EasySep(商標)ヒトγδT細胞単離キット(Stem cell Technologies;Vancouver,CA)を使用して、PBMCを新鮮PBMC全体から単離した。1000IU/mLの最終濃度までの組み換えヒトIL-2(rhIL-2)、10ng/mLの最終濃度までの組み換えヒトIL-15(rhIL-15)及び5μMの最終濃度までのゾレドロン酸とともに、14日間、RPMI-10(10%FBS、1×Pen/Strepを添加したRPMI)培地中で単離PBMCを培養した。
Kasumi-3細胞及びヒトγδT細胞を使用した抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体の結合及び細胞傷害特性の評価を以下のように行った。ゾレドロン酸+IL-2+IL-15とともに12日間培養した、PBMCから単離した濃縮γδT細胞(エフェクター)を、CFSE標識したKasumi-3細胞(標的)とともに、1:1及び5:1のE:T比で、様々な濃度の二特異性抗体の存在下において24時間にわたり、同時培養した。用量反応曲線は、1:1(図6)及び5:1(図7)E:T比での、用量依存的な、CD33発現kasumi-3細胞に対する、抗TRGV9/抗CD33及び抗TRGV9/抗NULL二特異性が介在するγδT細胞の細胞傷害性を示す。ここで示される細胞傷害値から二特異性抗体の非存在下で観察される基底細胞傷害値を差し引いた。方法に記載のように、EC50値を計算した。単一の実験から示される代表的なデータを図16~17で提供し、これらは、抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体が、インビトロでCD33発現Kasumi-3細胞に対するγδT細胞の細胞傷害性に介在することを示す。
ゾレドロン酸+IL-2+IL-15とともに12日間培養した健康なドナー由来のPBMC(エフェクター)を、24時間にわたり、様々な濃度の二特異性抗体存在下で1:1 E:T比でCFSE標識MOLM-13細胞(標的)とともに同時培養した。図18は、抗TRGV9/抗CD33二特異性抗体が、インビトロでCD33発現MOLM-13細胞に対するγδT細胞の細胞傷害性(全PBMCから)に介在することを示す。図18の用量反応曲線は、用量依存的な、CD33発現kasumi-3細胞に対する、抗TRGV9/抗CD33及び抗TRGV9/抗NULL二特異性介在性のγδT細胞の細胞傷害性を示す。そこで表される細胞傷害値から二特異性抗体の非存在下で観察される基底細胞傷害値を差し引いた。方法で記載のようにEC50値を計算した。ここで示される代表的データは、単一実験からのものである。
実施例19:インシリコ分析及びNKKライブラリ設計
これらのVH及びVLドメインが翻訳後修飾(PTM)を受ける可能性を評価するために、本明細書中で同定されるVH及びVLドメインのインシリコ分析を行った。特定のPTM部位でNNKライブラリを作製し、潜在的なPTMにおけるアミノ酸の突然変異の効果を決定するためにスクリーニングを行った。
NG、DG及びDPを含むモチーフを同定することに焦点を合わせた内部配列分析ツールを使用して、潜在的なPTMリスクを同定した。各モチーフの第1及び第2の位置に対してNNK飽和突然変異誘発ライブラリを設計した。NNKライブラリは、全ての20アミノ酸がライブラリで表されるように、コドン(N=A、G、C、T;K=G、T)を利用した。インフュージョンクローニングにより、ライブラリをE.コリ(E.coli)発現プラスミドにクローニングした。ライブラリを播種し、変異したPTMを表すためにコロニーを単離した。図19は、PTMのインシリコ分析を示し、PTMがボックスにおいてNNKライブラリに対して選択される。
実施例20:NNKライブラリから作製されたscFv変異体の熱安定性の試験
親及び実施例19で作製された突然変異scFvクローンの熱安定性を評価した。親クローン及び突然変異誘発ライブラリの培養物を接種し、一晩増殖させた。発現を誘導し、ELISAによって上清を分析した。96ウェルプレート上にCD33をプレーティングし、結合ELISAを行った。加熱のために上清を4つの個別のプレートに分けた。熱安定性を評価するために、未処理RT、55℃、60℃、65℃で、アッセイを行った。同じクローンの未処理室温に対して発光シグナルを正規化した。
図20は、C33B1475(配列番号277)に基づきNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を示す。図21は、C33B1516(配列番号278)に基づきNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を示す。図22は、C33B1517SEQ(配列番号216)に基づきNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を示す。図23は、C33B1522(配列番号213)に基づきNNKライブラリから作製されたscFvの熱安定性を示す。図24は、NNKライブラリのライブラリスクリーニング中に識別された好ましい残基がある表である。
これらの図面は、突然変異による潜在的なPTM部位の除去がCD33への結合を損なわなかったか又は熱安定性を低下させなかったことを例示する。いくつかのscFvクローンにおいて安定性の予想外の改善が見られた。
番号付き実施形態
本発明は、以下の番号付きの実施形態も提供する。
番号付き実施形態のリスト(A)
1)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号18の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
j)配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
又はそのCD33結合断片
を含む単離タンパク質。
2)a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、実施形態1の単離タンパク質。
3)scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態1又は2の単離タンパク質。
4)VHHである、実施形態3の単離タンパク質。
5)Fabである、実施形態3の単離タンパク質。
6)scFvである、実施形態3の単離タンパク質。
7)配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態1~6の何れかの単離タンパク質。
8)CD33に結合する単離タンパク質であって、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHH又はそのCD33結合断片を含む単離タンパク質。
9)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む単離タンパク質。
10)a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;又は
j)それぞれ配列番号35、42及び51
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、実施形態9の単離タンパク質。
11)a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む、実施形態9又は10の単離タンパク質。
12)a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
の、HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態11の単離タンパク質。
13)scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態9~12の何れか1つの単離タンパク質。
14)Fabである、実施形態13の単離タンパク質。
15)VHHである、実施形態13の単離タンパク質。
16)scFvである、実施形態13の単離タンパク質。
17)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態16の単離タンパク質。
18)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態17の単離タンパク質。
19)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態18の単離タンパク質。
20)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態19の単離タンパク質。
21)配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態9~20の何れか1つの単離タンパク質。
22)a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態21の単離タンパク質。
23)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む単離タンパク質。
24)scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態23の単離タンパク質。
25)Fabである、実施形態24の単離タンパク質。
26)VHHである、実施形態24の単離タンパク質。
27)scFvである、実施形態24の単離タンパク質。
28)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態27の単離タンパク質。
29)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態28に記載の単離タンパク質。
30)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態29の単離タンパク質。
31)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態30の単離タンパク質。
32)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む単離タンパク質。
33)a)それぞれ配列番号89、90及び92;
b)それぞれ配列番号89、90及び93;
c)それぞれ配列番号33、91及び94;
d)それぞれ配列番号167、168及び169;
e)それぞれ配列番号172、173及び174;
f)それぞれ配列番号176、177及び178;
g)それぞれ配列番号89、90及び180;又は
h)それぞれ配列番号89、90及び93
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、実施形態32の単離タンパク質。
34)a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む、実施形態32又は33の単離タンパク質。
35)a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態34の単離タンパク質。
36)scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態32~35の何れかの1つの単離タンパク質。
37)Fabである、実施形態36の単離タンパク質。
38)VHHである、実施形態36の単離タンパク質。
39)scFvである、実施形態36の単離タンパク質。
40)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態39の単離タンパク質。
41)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態40の単離タンパク質。
42)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態41の単離タンパク質。
43)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態42の単離タンパク質。
44)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態32~43の何れか1つの単離タンパク質。
45)CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態44の単離タンパク質。
46)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む単離タンパク質。
47)scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態46の単離タンパク質。
48)Fabである、実施形態47の単離タンパク質。
49)VHHである、実施形態47の単離タンパク質。
50)scFvである、実施形態47の単離タンパク質。
51)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態50の単離タンパク質。
52)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態51の単離タンパク質。
53)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態52の単離タンパク質。
54)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態53の単離タンパク質。
55)半減期延長部分に複合化される、実施形態1~54の何れか1つの単離タンパク質。
56)半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン又はポリエチレングリコールである、実施形態55の単離タンパク質。
57)単一特異性タンパク質である、実施形態1~56の何れか1つの単離タンパク質。
58)多特異性タンパク質である、実施形態1~57の何れか1つの単離タンパク質。
59)多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である、実施形態58の単離タンパク質。
60)多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である、実施形態59の単離タンパク質。
61)免疫グロブリン(Ig)定常領域又はそのIg定常領域の断片をさらに含む、実施形態1~60の何れか1つの単離タンパク質。
62)Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む、実施形態61の単離タンパク質。
63)Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む、実施形態61の単離タンパク質。
64)Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む、実施形態61の単離タンパク質。
65)Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の単離タンパク質。
66)Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の単離タンパク質。
67)Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の単離タンパク質。
68)Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態61~67の何れか1つの単離タンパク質。
69)Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態61~67の何れか1つの単離タンパク質。
70)第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態61~69の何れか1つの単離タンパク質。
71)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態70の単離タンパク質。
72)多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態58~71の何れか1つの単離タンパク質。
73)リンパ球は、T細胞である、実施形態72の単離タンパク質。
74)T細胞は、CD8T細胞である、実施形態72の単離タンパク質。
75)リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である、実施形態72の単離タンパク質。
76)多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態58~75の何れか1つの単離タンパク質。
77)多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態76の単離タンパク質。
78)CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号141の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態77の単離タンパク質。
79)多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態76の単離タンパク質。
80)TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態79の単離タンパク質。
81)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプである、実施形態61~80の何れか1つの単離タンパク質。
82)実施形態61~81の何れか1つの単離タンパク質であって、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)へのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、単離タンパク質。
83)FcγRへのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態82の単離タンパク質。
84)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、FcγRへのタンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~81の何れか1つの単離タンパク質。
85)FcγRへのタンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態84の単離タンパク質。
86)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態82~85の何れか1つの単離タンパク質。
87)実施形態61~86の何れか1つの単離タンパク質であって、Ig定常領域の断片のIg定常領域は、タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、単離タンパク質。
88)タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態87の単離タンパク質。
89)Ig定常領域のCH3ドメインにおいて少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~88の何れか1つの単離タンパク質。
90)Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態89の単離タンパク質。
91)キメラ抗原受容体(CAR)である、実施形態1~54の何れか1つの単離タンパク質。
92)CARは、
a)実施形態1~54の何れか1つのCD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、実施形態91の単離タンパク質。
93)CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、実施形態91又は92の単離タンパク質。
94)a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態91~93の何れか1つの単離タンパク質。
95)a)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態91~93の何れか1つの単離タンパク質。
96)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分又はそれらの何れかの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む、実施形態95の単離タンパク質。
97)実施形態1~96の何れか1つの単離タンパク質と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
98)実施形態1~96の何れか1つの単離タンパク質をコードするポリヌクレオチド。
99)実施形態98のポリヌクレオチドを含むベクター。
100)実施形態99のベクターを含む宿主細胞。
101)実施形態1~96の何れか1つの単離タンパク質を作製する方法であって、タンパク質が発現される条件で実施形態100の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を回収することとを含む方法。
102)実施形態1~96の何れか1つの単離タンパク質に結合する抗イディオタイプ抗体。
103)実施形態1~96の何れか1つの単離タンパク質を含む、キット。
104)対象においてCD33発現癌を処置するための手段を含む、医薬組成物。
105)対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させるための手段を含む、医薬組成物。
106)対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む、医薬組成物。
107)CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む、医薬組成物。
番号付けされた実施形態のリスト(B)
1)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインとを含む、単離された多特異性タンパク質。
2)リンパ球抗原は、T細胞抗原である、実施形態1の単離された多特異性タンパク質。
3)T細胞抗原は、CD8T細胞抗原である、実施形態1の単離された多特異性タンパク質
4)リンパ球抗原は、NK細胞抗原である、実施形態1の単離された多特異性タンパク質。
5)リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cである、実施形態1~4の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
6)リンパ球抗原は、CD3εである、実施形態5の単離された多特異性タンパク質。
7)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHを含む、実施形態1~6の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
8)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む、実施形態7の単離された多特異性タンパク質。
9)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む、実施形態7の単離された多特異性タンパク質。
10)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む、実施形態7の単離された多特異性タンパク質。
11)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態10の単離された多特異性タンパク質。
12)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態11の単離された多特異性タンパク質
13)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態12の単離された多特異性タンパク質。
14)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態13の単離された多特異性タンパク質。
15)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4又は5の何れか1つのHCDR1、配列番号6、7、8、9、10又は11の何れか1つのHCDR2及び配列番号12、13、14、15、16又は17の何れか1つのHCDR3を含む、実施形態1~14の何れか1つの単離された多特異性。
16)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3
又はそれらのCD33結合断片
を含む、実施形態1~15の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
17)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態1~16の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
18)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34又は35のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43又は44のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50又は51のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67又は68のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73又は74のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79又は80のLCDR3を含む、実施形態1~14の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
19)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77、
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態1~14及び18の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
20)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態1~14、18及び19の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
21)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態1~14及び18~20の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
22)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197又は201のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む、実施形態1~14の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
23)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;又は
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態1~14及び22の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
24)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態1~14、22及び23の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
25)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態1~14及び22~24の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
26)リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号141のHCDR1、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144のLCDR1、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態1~25の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
27)リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態1~25の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
28)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第2のIg定常領域の断片に複合化される、実施形態1~27の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
29)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む、実施形態28の単離された多特異性タンパク質。
30)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態29の単離された多特異性タンパク質。
31)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである、実施形態27~29の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
32)実施形態28~31の単離された多特異性タンパク質であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、多特異性タンパク質。
33)FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態32の単離された多特異性タンパク質。
34)実施形態28~31の何れか1つの単離された多特異性タンパク質であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、単離された多特異性タンパク質。
35)FcγRへの多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態34の単離された多特異性タンパク質。
36)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態32~35の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
37)実施形態28~36の何れか1つの単離された多特異性タンパク質であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、単離された多特異性タンパク質。
38)多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態37の単離された多特異性タンパク質。
39)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態28~38の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
40)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態39の単離された多特異性タンパク質。
41)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の突然変異:
a)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
b)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及びを第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V
を含む、実施形態28~40の何れか1つの単離された多特異性タンパク質。
41)実施形態1~41の何れか1つの単離された多特異性タンパク質を含む、キット。
42)対象においてCD33発現癌を処置するための手段を含む、医薬組成物。
43)対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させるための手段を含む、医薬組成物。
44)対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む、医薬組成物。
45)CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置する手段を含む、医薬組成物。
番号付けされた実施形態のリスト(C):
1)薬剤に複合化された単離タンパク質を含む免疫複合体であって、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号18の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
j)配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
又はそれらのCD33結合断片
を含む、免疫複合体。
2)単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、実施形態1の免疫複合体。
3)CD33に結合する抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態1又は2の免疫複合体。
4)CD33に結合する抗原結合ドメインは、VHHである、実施形態3の免疫複合体。
5)CD33に結合する抗原結合ドメインは、Fabである、実施形態3の免疫複合体。
6)CD33に結合する抗原結合ドメインは、scFvである、実施形態3の免疫複合体。
7)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態1~6の何れかの免疫複合体。
8)薬剤に複合化された単離タンパク質を含む免疫複合体であって、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHHを含む、免疫複合体。
9)薬剤に複合化された単離タンパク質を含む免疫複合体であって、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む、免疫複合体。
10)単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;又は
j)それぞれ配列番号35、42及び51
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、実施形態9に記載の免疫複合体。
11)単離タンパク質は、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む、実施形態9又は10の免疫複合体。
12)単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態11の免疫複合体。
13)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態9~12の何れか1つの免疫複合体。
14)単離タンパク質は、Fabである、実施形態13の免疫複合体。
15)単離タンパク質は、VHHである、実施形態13の免疫複合体。
16)単離タンパク質は、scFvである、実施形態13の免疫複合体。
17)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態16の免疫複合体。
18)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態17の免疫複合体。
19)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態18の免疫複合体。
20)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態19の免疫複合体。
21)単離タンパク質は、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態9~20の何れか1つの免疫複合体。
22)単離タンパク質は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態21の免疫複合体。
23)薬剤に複合化される単離タンパク質を含む免疫複合体であって、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、免疫複合体。
24)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態23の免疫複合体。
25)単離タンパク質は、Fabである、実施形態24の免疫複合体。
26)単離タンパク質は、VHHである、実施形態24の免疫複合体。
27)単離タンパク質は、scFvである、実施形態24の免疫複合体。
28)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態27の免疫複合体。
29)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態28の免疫複合体。
30)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態29の免疫複合体。
31)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態30の免疫複合体。
32)薬剤に複合化される単離タンパク質を含む免疫複合体であって、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む、免疫複合体。
33)a)それぞれ配列番号89、90及び92;
b)それぞれ配列番号89、90及び93;
c)それぞれ配列番号33、91及び94、
d)それぞれ配列番号167、168及び169;
e)それぞれ配列番号172、173及び174;
f)それぞれ配列番号176、177及び178;
g)それぞれ配列番号89、90及び180;又は
h)それぞれ配列番号89、90及び93
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、実施形態32の免疫複合体。
34)単離タンパク質は、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む、実施形態32又は33の免疫複合体。
35)a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態34の免疫複合体。
36)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態32~35の何れか1つの免疫複合体。
37)単離タンパク質は、Fabである、実施形態36の免疫複合体。
38)単離タンパク質は、VHHである、実施形態36の免疫複合体。
39)単離タンパク質は、scFvである、実施形態36の免疫複合体。
40)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態39の免疫複合体。
41)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態40の免疫複合体。
42)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態41の免疫複合体。
43)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態42の免疫複合体。
44)単離タンパク質は、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態32~43の何れか1つの免疫複合体。
45)単離タンパク質は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態44の免疫複合体。
46)薬剤に複合化される単離タンパク質を含む免疫複合体であって、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、免疫複合体。
47)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態46の免疫複合体。
48)単離タンパク質は、Fabである。実施形態47の免疫複合体。
49)単離タンパク質は、VHHである、実施形態47の免疫複合体。
50)単離タンパク質は、scFvである、実施形態47の免疫複合体。
51)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態50の免疫複合体。
52)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態51の免疫複合体。
53)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態52の免疫複合体。
54)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態53の免疫複合体。
55)単離タンパク質は、半減期延長部分に複合化される、実施形態1~54の何れか1つの免疫複合体。
56)半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン又はポリエチレングリコールである、実施形態55の免疫複合体。
57)単離タンパク質は、単一特異性タンパク質である、実施形態1~56の何れか1つの免疫複合体。
58)単離タンパク質は、多特異性タンパク質である、実施形態1~57の何れか1つの免疫複合体。
59)多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である、実施形態58の免疫複合体。
60)多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である、実施形態59の免疫複合体。
61)免疫グロブリン(Ig)定常領域又はそのIg定常領域の断片をさらに含む、実施形態1~60の何れか1つの免疫複合体。
62)Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む、実施形態61の免疫複合体。
63)Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む、実施形態61の免疫複合体。
64)Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む、実施形態61の免疫複合体。
65)Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の免疫複合体。
66)Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の免疫複合体。
67)Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の免疫複合体。
68)単離タンパク質は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端に複合化される、実施形態61~67の何れか1つの免疫複合体。
69)単離タンパク質は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端に複合化される、実施形態61~67の何れか1つの免疫複合体。
70)単離タンパク質は、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化される、実施形態61~69の何れか1つの免疫複合体。
71)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態70の免疫複合体。
72)多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態58~71の何れか1つの免疫複合体。
73)リンパ球は、T細胞である、実施形態72の免疫複合体。
74)T細胞は、CD8T細胞である、実施形態72の免疫複合体。
75)リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である、実施形態72の免疫複合体。
76)多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態58~75の何れか1つの免疫複合体。
77)多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態76の免疫複合体。
78)CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号141の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態77の免疫複合体。
79)多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態76の免疫複合体。
80)TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態77の免疫複合体。
81)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプである、実施形態61~80の何れか1つの免疫複合体。
82)実施形態61~81の何れか1つの免疫複合体であって、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)へのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、免疫複合体。
83)FcγRへのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態82の免疫複合体。
84)実施形態61~81の何れか1つの免疫複合体であって、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、FcγRへの増強された結合をもたらすタンパク質の少なくとも1つの突然変異を含む、免疫複合体。
85)FcγRへのタンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態84の免疫複合体。
86)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態80~85の何れか1つの免疫複合体。
87)実施形態61~86の何れか1つの免疫複合体であって、Ig定常領域の断片のIg定常領域は、タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、免疫複合体。
88)タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態87の免疫複合体。
89)単離タンパク質は、Ig定常領域のCH3ドメインにおいて少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~88の何れか1つの免疫複合体。
90)Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態89の免疫複合体。
91)単離タンパク質は、キメラ抗原受容体(CAR)である、実施形態1~54の何れか1つの免疫複合体。
92)CARは、
a)実施形態1~54の何れか1つで定められるようなCD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、実施形態91の免疫複合体。
93)CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、実施形態91又は92の免疫複合体。
94)a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態91~93の何れか1つの免疫複合体。
95)a)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態91~93の何れか1つの免疫複合体。
96)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分又はそれらの何れかの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む、実施形態95の免疫複合体。
97)薬剤は、治療剤又は造影剤である、実施形態1~96の何れか1つの免疫複合体。
98)実施形態1~96の何れか1つの免疫複合体と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
99)実施形態1~96の何れか1つの免疫複合体の単離タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
100)実施形態99のポリヌクレオチドを含むベクター。
101)実施形態100のベクター含む宿主細胞。
102)実施形態1~96の何れか1つの免疫複合体を作製する方法であって、タンパク質が発現される条件で実施形態101の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を回収することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を薬剤と複合化することとを含む方法。
103)薬剤と複合化される単離された多特異性タンパク質を含む免疫複合体であって、単離された多特異性タンパク質は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインとを含む、免疫複合体。
104)リンパ球抗原は、T細胞抗原である、実施形態103の免疫複合体。
105)T細胞抗原は、CD8T細胞抗原である、実施形態103の免疫複合体タンパク質。
106)リンパ球抗原は、NK細胞抗原である、実施形態103の免疫複合体。
107)リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cである、実施形態103~106の何れか1つの免疫複合体。
108)リンパ球抗原は、CD3εである、実施形態107の免疫複合体。
109)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHを含む、実施形態103~108の何れか1つの免疫複合体。
110)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む、実施形態109の免疫複合体。
111)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む、実施形態109の免疫複合体。
112)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む、実施形態110の免疫複合体。
113)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態112の免疫複合体。
114)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態113の免疫複合体。
115)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態114の免疫複合体。
116)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態115の免疫複合体。
117)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4又は5の何れか1つのHCDR1、配列番号6、7、8、9、10又は11の何れか1つのHCDR2及び配列番号12、13、14、15、16又は17の何れか1つのHCDR3を含む、実施形態103~116の何れか1つの免疫複合体。
118)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR1、HCDR3を含む、103~117の何れか1つの免疫複合体。
119)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態103~118の何れか1つの免疫複合体。
120)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34又は35のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43又は44のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50又は51のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67又は68のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73又は74のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79又は80のLCDR3を含む、実施形態103~116の何れか1つの免疫複合体。
121)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態103~116及び120の何れか1つの免疫複合体。
122)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態103~116、120及び121の何れか1つの免疫複合体。
123)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態103~116及び120~122の何れか1つの免疫複合体。
124)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197又は201のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む、実施形態103~116の何れか1つの免疫複合体。
125)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;又は
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態103~116及び124の何れか1つの免疫複合体。
126)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175又は179のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態103~116、124及び125の何れか1つの免疫複合体。
127)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態103~116及び124~126の何れか1つの免疫複合体。
128)リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号141のHCDR1、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144のLCDR1、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態103~127の何れか1つの免疫複合体。
129)リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態101~128の何れか1つの免疫複合体。
130)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第2のIg定常領域の断片に複合化される、実施形態103~129の何れか1つの免疫複合体。
131)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む、実施形態130の免疫複合体。
132)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態131の免疫複合体。
133)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである、実施形態130~132の何れか1つの免疫複合体。
134)実施形態130~133の何れか1つの免疫複合体であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、免疫複合体。
135)FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態134の免疫複合体。
136)実施形態130~133の何れか1つの免疫複合体であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす多特異性タンパク質の少なくとも1つの突然変異を含む、免疫複合体。
137)FcγRへの多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態136の免疫複合体。
138)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態134~137の何れか1つの免疫複合体。
139)実施形態130~138の何れか1つの免疫複合体であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、免疫複合体。
140)多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態139の免疫複合体。
141)タンパク質は、第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態130~140の何れか1つの免疫複合体。
142)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態141の免疫複合体。
143)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の突然変異:
a)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
b)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及びを第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V
を含む、実施形態130~142の何れか1つの免疫複合体。
144)薬剤は、治療剤又は造影剤である、実施形態103~143の何れか1つの免疫複合体。
145)実施形態103~143の何れか1つの免疫複合体と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
146)実施形態103~143の何れか1つの免疫複合体の単離された多特異性タンパク質をコードする、ポリヌクレオチド。
147)実施形態146のポリヌクレオチドを含むベクター。
148)実施形態147のベクターを含む宿主細胞。
149)多特異性タンパク質が発現される条件で実施形態148の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生された多特異性タンパク質を回収することと、多特異性タンパク質を薬剤に複合化することとを含む、実施形態103~143の何れか1つの免疫複合体を作製する方法。
150)薬剤は、放射活性剤である、実施形態1~96及び103~143の何れか1つの免疫複合体。
151)放射活性剤は、放射性金属イオンを含む、実施形態150の免疫複合体。
152)放射性金属イオンは、32P、47Sc、67Cu、77As、89Sr、90Y、99Tc、105Rh、109Pd、111Ag、131I、153Sm、159Gd、165Dy、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、194Ir、198Au、199Au、211At、212Pb、212Bi、213Bi、223Ra、225Ac、255Fm、227Th、62Cu、64Cu、67Ga、68Ga、86Y、89Zr又は111Inである、実施形態151の免疫複合体。
153)放射性金属イオンは、225Ac、111In又は89Zrである、実施形態151の免疫複合体。
154)放射性金属イオンは、225Acである、実施形態151の免疫複合体。
155)放射性金属イオンは、キレート部分に複合化される、実施形態151~154の何れか1つの免疫複合体。
156)キレート部分は、式(I):
Figure 2023517660000046

(式中、R、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C-~アルキルであり;
Zは、(CH2)Yであり、
nは、1~10であり、及び
Yは、第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分又は求核部分であり;
代わりに、Zは、水素であり;及び
、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキル又は第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分若しくは求核部分である)
の構造を有する大環状分子を含み;
代わりに、キレート剤は、開鎖リガンドを含む、実施形態155の免疫複合体。
157)キレート部分は、式(II):
Figure 2023517660000047

の構造又は式(III):
Figure 2023517660000048

の構造を有する大環状分子を含む、実施形態155の免疫複合体。
158)式(IV)
Figure 2023517660000049

(式中、タンパク質は、実施形態1~96の何れか1つで定められるような単離タンパク質である)
の免疫複合体。
159)式(V)
Figure 2023517660000050

(式中、タンパク質は、実施形態1~96の何れか1つで定められるような単離タンパク質である)
の免疫複合体。
160)対象においてCD33発現癌を処置するための手段を含む、医薬組成物。
161)対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させるための手段を含む、医薬組成物。
162)対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む、医薬組成物。
163)CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む、医薬組成物。
番号付き実施形態のリスト(D):
1)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離タンパク質を投与することを含み、単離タンパク質は、CD33に結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号18の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号19のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号20のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号21のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号22のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号23のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号24のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号25のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号26のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;若しくは
j)配列番号27のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
又はそれらのCD33結合断片
を含む、方法。
2)単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、実施形態1の方法。
3)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態1又は2の方法。
4)単離タンパク質は、VHHである、実施形態3の方法。
5)単離タンパク質は、Fabである、実施形態3の方法。
6)単離タンパク質は、scFvである、実施形態3の方法。
7)単離タンパク質は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態1~6の何れかの方法。
8)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離タンパク質を投与することを含み、単離タンパク質は、CD33と結合し、単離タンパク質は、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHHを含む、方法。
9)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離タンパク質を投与することを含み、単離タンパク質は、CD33と結合し、CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
又はそれらのCD33結合断片
を含む、方法。
10)単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号28、36及び45;
b)それぞれ配列番号29、37及び46;
c)それぞれ配列番号30、38及び47;
d)それぞれ配列番号31、39及び48;
e)それぞれ配列番号32、40及び49;
f)それぞれ配列番号33、41及び50;
g)それぞれ配列番号34、42及び51;
h)それぞれ配列番号34、43及び51;
i)それぞれ配列番号34、44及び51;又は
j)それぞれ配列番号35、42及び51
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、実施形態9の方法。
11)単離タンパク質は、
a)配列番号52の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号81の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号54のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号83のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号55のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号84のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号57のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号86のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号58のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
i)配列番号60のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
j)配列番号61のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号88のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む、実施形態9又は10の方法。
12)a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77、
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態11の方法。
13)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態9~12の何れか1つの方法。
14)単離タンパク質は、Fabである、実施形態13の方法。
15)単離タンパク質は、VHHである、実施形態13の方法。
16)単離タンパク質は、scFvである、実施形態13の方法。
17)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態16の方法。
18)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態17の方法。
19)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態18の方法。
20)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態19の方法。
21)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態9~20の何れか1つの方法。
22)単離タンパク質は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態21の方法。
23)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離タンパク質を投与することを含み、単離タンパク質は、CD33と結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、方法。
24)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態23の方法。
25)単離タンパク質は、Fabである、実施形態24の方法。
26)単離タンパク質は、VHHである、実施形態24の方法。
27)単離タンパク質は、scFvである、実施形態24の方法。
28)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態27の方法。
29)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態28の方法。
30)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態29の方法。
31)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態30の方法。
32)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離タンパク質を投与することを含み、単離タンパク質は、CD33と結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む、方法。
33)a)それぞれ配列番号89、90及び92;
b)それぞれ配列番号89、90及び93;
c)それぞれ配列番号33、91及び94、
d)それぞれ配列番号167、168及び169;
e)それぞれ配列番号172、173及び174;
f)それぞれ配列番号176、177及び178;
g)それぞれ配列番号89、90及び180;又は
h)それぞれ配列番号89、90及び93
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、実施形態32の方法。
34)単離タンパク質は、
a)配列番号95の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号105の軽鎖可変領域(VL)の軽鎖相補性決定領域(LCDR)1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号106のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号97のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号107のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号170のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号185のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号171のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号188のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
f)配列番号175のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号192のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
g)配列番号179のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号196のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
h)配列番号181のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号200のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
i)配列番号96のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号202のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
を含む、実施形態32又は33の方法。
35)単離タンパク質は、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態34の方法。
36)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態32~35の何れか1つの方法。
37)単離タンパク質は、Fabである、実施形態36の方法。
38)単離タンパク質は、VHHである、実施形態36の方法。
39)単離タンパク質は、scFvである、実施形態36の方法。
40)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態39の方法。
41)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態40の方法。
42)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態41の方法。
43)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態42の方法。
44)単離タンパク質は、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態32~43の何れか1つの方法。
45)単離タンパク質は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態44の方法。
46)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離タンパク質を投与することを含み、単離タンパク質は、CD33と結合し、単離タンパク質は、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、方法。
47)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、実施形態46の方法。
48)単離タンパク質は、Fabである、実施形態47の方法。
49)単離タンパク質は、VHHである、実施形態47の方法。
50)単離タンパク質は、scFvである、実施形態47の方法。
51)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態50の方法。
52)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態51の方法。
53)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態52の方法。
54)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態53の方法。
55)単離タンパク質は、半減期延長部分に複合化される、実施形態1~54の何れか1つの方法。
56)半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン又はポリエチレングリコールである、実施形態55の方法。
57)単離タンパク質は、単一特異性タンパク質である、実施形態1~56の何れか1つの方法。
58)単離タンパク質は、多特異性タンパク質である、実施形態1~57の何れか1つの方法。
59)多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である、実施形態58の方法。
60)多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である、実施形態59の方法。
61)免疫グロブリン(Ig)定常領域又はそのIg定常領域の断片をさらに含む、実施形態1~60の何れか1つの方法。
62)Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む、実施形態61の方法。
63)Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む、実施形態61の方法。
64)Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む、実施形態61の方法。
65)Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の方法。
66)Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の方法。
67)Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、実施形態61の方法。
68)単離タンパク質は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端に複合化される、実施形態61~67の何れか1つの方法。
69)単離タンパク質は、Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端に複合化される、実施形態61~67の何れか1つの方法。
70)単離タンパク質は、第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化される、実施形態61~69の何れか1つの方法。
71)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態70の方法。
72)多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態58~71の何れか1つの方法。
73)リンパ球は、T細胞である、実施形態72の方法。
74)T細胞は、CD8T細胞である、実施形態72の方法。
75)リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である、実施形態72の方法。
76)多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態58~75の何れか1つの方法。
77)多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態76の方法。
78)CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号141の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態77の方法。
79)多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態76の単離タンパク質。
80)TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態79の単離タンパク質。
81)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプである、実施形態61~80の何れか1つの方法。
82)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)へのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~81の何れか1つの方法。
83)FcγRへのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態82の方法。
84)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、FcγRへの増強された結合をもたらすタンパク質の少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~81の何れか1つの方法。
85)FcγRへのタンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態84の方法。
86)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態82~85の何れか1つの方法。
87)Ig定常領域の断片のIg定常領域は、タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~86の何れか1つの方法。
88)タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態87の方法。
89)単離タンパク質は、Ig定常領域のCH3ドメインにおいて少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態61~88の何れか1つの方法。
90)Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態89の方法。
91)単離タンパク質は、キメラ抗原受容体(CAR)である、実施形態1~54の何れか1つの方法。
92)CARは、
a)実施形態1~54の何れか1つで定められるようなCD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、実施形態91の方法。
93)CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、実施形態91又は92の方法。
94)a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態91~93の何れか1つの方法。
95)a)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態91~93の何れか1つの方法。
96)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分又はそれらの何れかの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む、実施形態95の方法。
97)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の単離された多特異性タンパク質を投与することを含み、単離された多特異性タンパク質は、CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインを含む、方法。
98)リンパ球抗原は、T細胞抗原である、実施形態97の方法。
99)T細胞抗原は、CD8T細胞抗原である、実施形態97の方法。
100)リンパ球抗原は、NK細胞抗原である、実施形態97の方法。
101)リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cである、実施形態97~100の何れか1つの方法。
102)リンパ球抗原は、CD3εである、実施形態101の方法。
103)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHを含む、実施形態97~102の何れか1つの方法。
104)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む、実施形態103の方法。
105)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む、実施形態103の方法。
106)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む、実施形態103の方法。
107)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、実施形態106の方法。
108)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、実施形態107の方法。
109)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態108の方法。
110)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態109の方法。
111)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4又は5の何れか1つのHCDR1、配列番号6、7、8、9、10又は11の何れか1つのHCDR2及び配列番号12、13、14、15、16又は17の何れか1つのHCDR3を含む、実施形態97~110の何れか1つの方法。
112)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、97~111の何れか1つの方法。
113)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態97~112の何れか1つの方法。
114)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34又は35のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43又は44のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50又は51のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67又は68のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73又は74のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79又は80のLCDR3を含む、実施形態97~110の何れか1つの方法。
115)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77、
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態97~110及び114の何れか1つの方法。
116)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態97~110、114及び115の何れか1つの方法。
117)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態97~110及び114~116の何れか1つの方法。
118)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197又は201のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む、実施形態97~110の何れか1つの方法。
119)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;又は
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態97~110及び118の何れか1つの方法。
120)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179、181又は96のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態97~110、118及び119の何れか1つの方法。
121)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態97~110及び118~120の何れか1つの方法。
122)リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、
a)配列番号141のHCDR1、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144のLCDR1、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態97~121の何れか1つの方法。
123)TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態95~119の何れか1つの方法。
124)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第2のIg定常領域の断片に複合化される、実施形態97~123の何れか1つの方法。
125)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む、実施形態124の方法。
126)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態125の方法。
127)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである、実施形態124~136の何れか1つの方法。
128)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態124~127の何れか1つの方法。
129)FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態128の方法。
130)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす多特異性タンパク質の少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態124~127の何れか1つの方法。
131)FcγRへの多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態130の方法。
132)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態128~131の何れか1つの方法。
133)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態124~132の何れか1つの方法。
134)多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態133の方法。
135)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインの断片における少なくとも1つの突然変異を含む、実施形態124~134の何れか1つの方法。
136)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A,Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、実施形態135の方法。
137)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の突然変異:
a)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
b)第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及びを第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V
を含む、実施形態124~136の何れか1つの方法。
138)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に治療的有効量の免疫複合体を投与することを含み、免疫複合体は、薬剤に複合化される実施形態1~137の何れか1つで定められるような単離タンパク質を含む、方法。
139)薬剤は、放射活性剤である、実施形態138の方法。
140)放射活性剤は、放射性金属イオンを含む、実施形態139の免疫複合体。
141)放射性金属イオンは、32P、47Sc、67Cu、77As、89Sr、90Y、99Tc、105Rh、109Pd、111Ag、131I、153Sm、159Gd、165Dy、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、194Ir、198Au、199Au、211At、212Pb、212Bi、213Bi、223Ra、225Ac、255Fm、227Th、62Cu、64Cu、67Ga、68Ga、86Y、89Zr又は111Inである、実施形態140の免疫複合体。
142)放射性金属イオンは、225Ac、111In又は89Zrである、実施形態140の免疫複合体。
143)放射性金属イオンは、225Acである、実施形態140の免疫複合体。
144)放射性金属イオンは、キレート部分に複合化される、実施形態140~143の何れか1つの免疫複合体。
145)キレート部分は、式(I):
Figure 2023517660000051

(式中、R、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキルであり;及び
Zは、(CH2)Yであり、
nは、1~10であり、及び
Yは、第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分又は求核部分であり;
代わりに、Zは、水素であり;及び
、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキル又は第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分若しくは求核部分である)
の構造を有する大環状分子を含み;
代わりに、キレート剤は、開鎖リガンドを含む、実施形態144の免疫複合体。
146)キレート部分は、式(II):
Figure 2023517660000052

の構造又は式(III):
Figure 2023517660000053

の構造を有する大環状分子を含む、実施形態144の免疫複合体。
147)式(IV)
Figure 2023517660000054

(式中、タンパク質は、実施形態1~96の何れか1つで定められるような単離タンパク質である)
の免疫複合体。
148)式(V)
Figure 2023517660000055

(式中、タンパク質は実施形態1~96の何れか1つで定められるような単離タンパク質である)
の免疫複合体。
149)対象においてCD33発現細胞の量を減少させるために有効であり、CD33発現細胞は、癌性細胞であるか、又はCD33発現細胞は、非癌性細胞である、実施形態1~148の何れか1つの方法。
150)対象においてCD33発現癌の確立を予防するために有効である、実施形態1~149の何れか1つの方法。
151)CD33発現癌は、血液癌である、実施形態148~150の何れか1つの方法。
152)血液癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である、実施形態151の方法。
153)血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、実施形態151の方法。
154)単離タンパク質又は単離された多特異性タンパク質は、第2の治療剤と組み合わせて投与される、実施形態148~153の何れか1つの方法。
155)第2の治療剤は、手術、化学療法、アンドロゲン欠乏療法若しくは放射線又はそれらの任意の組み合わせである、実施形態154の方法。
156)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、対象においてCD33発現癌細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、方法。
157)対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法であって、対象においてCD33発現腫瘍細胞の1つ以上に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、方法。
158)対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む医薬組成物であって、方法は、対象においてCD33発現細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、医薬組成物。
159)CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む医薬組成物であって、方法は、対象においてCD33発現細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、医薬組成物。
番号付き実施形態のリスト(E):
1)キメラ抗原受容体(CAR)であって、
a)CD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含むキメラ抗原受容体(CAR)。
2)CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、実施形態1のCAR。
3)a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態1又は2のCAR。
4)a)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む、実施形態2又は3のCAR。
5)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号1、2、3、4又は5の何れか1つのHCDR1、配列番号6、7、8、9、10又は11の何れか1つのHCDR2及び配列番号12、13、14、15、16又は17の何れか1つのHCDR3を含む、実施形態1~4の何れか1つのCAR。
6)CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号1、6及び12;
b)それぞれ配列番号2、7及び13;
c)それぞれ配列番号1、8及び14;
d)それぞれ配列番号3、9及び13;
e)それぞれ配列番号4、10及び15;
f)それぞれ配列番号5、11及び16;又は
g)それぞれ配列番号5、11及び17
のHCDR1、HCDR1、HCDR3を含む、実施形態1~5の何れか1つのCAR。
7)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号18、19、20、21、22、23、24、25、26又は27の何れか1つのVHを含む、実施形態1~6の何れか1つのCAR。
8)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号28、29、30、31、32、33、34又は35のHCDR1、配列番号36、37、38、39、40、41、42、43又は44のHCDR2、配列番号45、46、47、48、49、50又は51のHCDR3、配列番号62、63、64、65、66、67又は68のLCDR1、配列番号69、70、71、72、73又は74のLCDR2及び配列番号75、76、77、78、79又は80のLCDR3を含む、実施形態1~4の何れか1つのCAR。
9)CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号28、36、45、62、69及び75;
b)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
c)それぞれ配列番号30、38、47、64、71及び77;
d)それぞれ配列番号31、39、48、65、72及び78;
e)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
f)それぞれ配列番号33、41、50、67、73及び79;
g)それぞれ配列番号34、42、51、68、74及び80;
h)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
i)それぞれ配列番号34、44、51、68、74及び80;又は
j)それぞれ配列番号35、42、51、68、74及び80
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態1~4及び8の何れか1つのCAR。
10)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号52、53、54、55、56、57、58、59、60又は61のVHと、配列番号81、82、83、84、85、86、87又は88のVLとを含む、実施形態1~4、8及び9の何れか1つのCAR。
11)CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号52のVH及び配列番号81のVL;
b)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
c)配列番号54のVH及び配列番号83のVL;
d)配列番号55のVH及び配列番号84のVL;
e)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
f)配列番号57のVH及び配列番号86のVL;
g)配列番号58のVH及び配列番号87のVL;
h)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
i)配列番号60のVH及び配列番号87のVL;又は
j)配列番号61のVH及び配列番号88のVL
を含む、実施形態1~4及び8~10の何れか1つのCAR。
12)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号33、89、167、172又は176のHCDR1、配列番号90、91、168、173又は177のHCDR2、配列番号92、93、94、169、174、178又は180のHCDR3、配列番号98、99、100、182、186、189、193、197のLCDR1、配列番号101、102、103、183、187、190、194又は198のLCDR2及び配列番号104、184、191、195又は199のLCDR3を含む、実施形態1~4の何れか1つのCAR。
13)CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)それぞれ配列番号89、90、92、98、101及び104;
b)それぞれ配列番号89、90、93、99、102及び104;
c)それぞれ配列番号33、91、94、100、103及び104;
d)それぞれ配列番号167、168、169、182、183及び184;
e)それぞれ配列番号33、91、94、186、187及び104;
f)それぞれ配列番号172、173、174、189、190及び191;
g)それぞれ配列番号176、177、178、193、194及び195;
h)それぞれ配列番号89、90、180、197、198及び199;又は
i)それぞれ配列番号89、90、93、201、102及び104
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、実施形態1~4及び12の何れか1つのCAR。
14)CD33に結合する抗原結合ドメインは、配列番号95、96、97、170、171、175、179又は181のVHと、配列番号105、106、107、185、188、192、196、200又は202のVLとを含む、実施形態1~4、12及び13の何れか1つのCAR。
15)CD33に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号95のVH及び配列番号105のVL;
b)配列番号96のVH及び配列番号106のVL;
c)配列番号97のVH及び配列番号107のVL;
d)配列番号170のVH及び配列番号185のVL;
e)配列番号171のVH及び配列番号188のVL;
f)配列番号175のVH及び配列番号192のVL;
g)配列番号179のVH及び配列番号196のVL;
h)配列番号181のVH及び配列番号200のVL;又は
i)配列番号96のVH及び配列番号202のVL
を含む、実施形態1~4及び12~14の何れか1つのCAR。
16)CD33に結合する抗原結合ドメインは、VHHである、実施形態1~15の何れか1つのCAR。
17)CD33に結合する抗原結合ドメインは、scFvである、実施形態1~16の何れか1つのCAR。
18)scFvは、VLとVHとの間に第1のリンカー(L1)を含む、実施形態17のCAR。
19)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、実施形態18のCAR。
20)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、実施形態19のCAR。
21)CD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメインは、シグナルポリペプチドをさらに含む、実施形態1~20の何れかのCAR。
22)シグナルポリペプチドは、配列番号166のアミノ酸配列を含む、実施形態21のCAR。
23)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む、実施形態1~22の何れか1つのCAR。
24)CD137構成成分は、配列番号163のアミノ酸配列を含む、実施形態3~23の何れか1つのCAR。
25)CD3z構成成分は、配列番号164のアミノ酸配列を含む、実施形態3~24の何れか1つのCAR。
26)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号165のアミノ酸配列を含む、実施形態3~25の何れか1つのCAR。
27)CD8a-TMポリペプチドは、配列番号162のアミノ酸配列を含む、実施形態3~26の何れか1つのCAR。
28)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列を含む、実施形態3~27の何れか1つのCAR。
29)CARは多特異性タンパク質である、実施形態1~28の何れか1つのCAR。
30)多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である、実施形態29のCAR。
31)多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である、実施形態30のCAR。
32)多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態29~31の何れか1つのCAR。
33)リンパ球は、T細胞である、実施形態32のCAR。
34)T細胞は、CD8T細胞である、実施形態32のCAR。
35)リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である、実施形態32のCAR。
36)多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態29~35の何れか1つのCAR。
37)多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態36のCAR。
38)CD3εに結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号141の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号142のHCDR2、配列番号143のHCDR3、配列番号144の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号145のLCDR2及び配列番号146のLCDR3;
b)配列番号147のVH及び配列番号148のVL;
c)配列番号149のHCDR1、配列番号150のHCDR2、配列番号151のHCDR3、配列番号152のLCDR1、配列番号153のLCDR2及び配列番号154のLCDR3;又は
d)配列番号155のVH及び配列番号156のVL
を含む、実施形態37のCAR。
39)多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む、実施形態36のCAR。
40)TRGV9に結合する抗原結合ドメインは、
a)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号238のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
b)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号242のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
c)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号243のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
d)配列番号236の重鎖相補性決定領域1(HCDR1)、配列番号237のHCDR2、配列番号244のHCDR3、配列番号239の軽鎖相補性決定領域1(LCDR1)、配列番号240のLCDR2及び配列番号241のLCDR3;
e)配列番号245のVH及び配列番号249のVL;
f)配列番号246のVH及び配列番号249のVL;
g)配列番号247のVH及び配列番号249のVL;又は
h)配列番号248のVH及び配列番号249のVL
を含む、実施形態39のCAR。
41)実施形態1~40の何れか1つのCARを発現する、単離されたリンパ球。
42)Tリンパ球である、実施形態41の単離されたリンパ球。
43)ナチュラルキラー(NK)細胞である、実施形態41の単離されたリンパ球。
44)実施形態1~40の何れか1つのCARをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
45)実施形態44のポリヌクレオチドを含むベクター。
46)実施形態44のポリヌクレオチド又は実施形態45のベクターを含む宿主細胞。
47)実施形態41~43の何れか1つのリンパ球と、薬学的に許容可能な賦形剤とを含む医薬組成物。
48)CD33発現癌を有する対象を処置する方法であって、それを必要とする対象に治療的有効量の実施形態41~43の何れか1つのリンパ球を投与することを含み、それにより、リンパ球は、対象におけるCD33発現癌の死滅に介在する、方法。
49)CD33発現癌は、血液癌である、実施形態48の方法。
50)CD33発現癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である、実施形態49の方法。
51)CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、実施形態50の方法。
52)癌細胞の標的化された死滅の方法であって、実施形態41~43の何れか1つのリンパ球と癌細胞を接触させることを含み、それにより、リンパ球は、癌細胞の標的化された死滅を誘導する、方法。
53)癌細胞は、血液癌である、実施形態52の方法。
54)CD33発現癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である、実施形態53の方法。
55)CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、実施形態54の方法。
56)対象において癌の存在を検出する方法であって、
a)対象から得られた細胞試料を実施形態1~40の何れか1つのCARと接触させ、それによりCAR-細胞複合体を形成することと、
b)CAR-細胞複合体を検出することであって、CAR-細胞複合体の検出は、対象における癌の存在を示す、検出することと
を含む方法。
57)癌細胞は、血液癌である、実施形態56の方法。
58)CD33発現癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である、実施形態57の方法。
59)CD33発現癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、実施形態58の方法。
60)実施形態1~40の何れか1つのCARを含むキット。
61)対象においてCD33発現癌を処置するための手段を含む医薬組成物。
62)対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させるための手段を含む医薬組成物。
63)対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む医薬組成物。
64)CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む医薬組成物。
65)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、対象においてCD33発現癌細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、方法。
66)対象においてCD33発現腫瘍細胞の量を減少させる方法であって、対象においてCD33発現腫瘍細胞の1つ以上に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、方法。
67)対象においてCD33発現癌の確立を予防するための手段を含む医薬組成物であって、方法は、対象においてCD33発現細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、医薬組成物。
68)CD33発現癌を発症するリスクがある対象において非癌性状態を処置するための手段を含む医薬組成物であって、方法は、対象においてCD33発現細胞に治療剤を標的化するための手段を対象に投与することを含む、医薬組成物。
番号付き実施形態のリスト(F):
1)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号53の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
b)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
c)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
d)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
e)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
f)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
を含む単離タンパク質。
2)a)それぞれ配列番号29、37及び46;
b)それぞれ配列番号32、40及び49;
c)それぞれ配列番号34、43及び51;
d)それぞれ配列番号253、256及び259;
e)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
f)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、請求項1の単離タンパク質。
3)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)それぞれ配列番号29、37及び46;
b)それぞれ配列番号32、40及び49;
c)それぞれ配列番号34、43及び51;
d)それぞれ配列番号253、256及び259;
e)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
f)それぞれ配列番号255、258及び261
のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む単離タンパク質。
4)a)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
b)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
c)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
d)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
e)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
f)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、請求項1又は2の単離タンパク質。
5)a)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
b)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
c)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
d)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
e)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
f)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、請求項3又は4の単離タンパク質。
6)単離タンパク質は、配列番号53、56、59、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHと、配列番号82、85、87、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLとを含む、請求項1~5の何れか一項に記載の単離タンパク質。
7)a)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
b)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
c)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
d)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
e)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;
f)配列番号264のVH及び配列番号273のVL;
g)配列番号291のVH及び配列番号271のVL;
h)配列番号292のVH及び配列番号271のVL;
i)配列番号293のVH及び配列番号271のVL;
j)配列番号294のVH及び配列番号271のVL;
k)配列番号295のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号296のVH及び配列番号271のVL;
m)配列番号297のVH及び配列番号271のVL;
n)配列番号298のVH及び配列番号271のVL;
o)配列番号299のVH及び配列番号271のVL;
p)配列番号300のVH及び配列番号271のVL;
q)配列番号301のVH及び配列番号271のVL;
r)配列番号302のVH及び配列番号271のVL;
s)配列番号303のVH及び配列番号271のVL;
t)配列番号304のVH及び配列番号271のVL;
u)配列番号305のVH及び配列番号271のVL;
v)配列番号306のVH及び配列番号271のVL;
w)配列番号307のVH及び配列番号271のVL;
x)配列番号308のVH及び配列番号271のVL;
y)配列番号309のVH及び配列番号271のVL;
z)配列番号310のVH及び配列番号271のVL;
aa)配列番号263のVH及び配列番号311のVL;
ab)配列番号263のVH及び配列番号312のVL;
ac)配列番号263のVH及び配列番号313のVL;
ad)配列番号263のVH及び配列番号314のVL;
ae)配列番号263のVH及び配列番号315のVL;
af)配列番号263のVH及び配列番号316のVL;
ag)配列番号263のVH及び配列番号317のVL;
ah)配列番号263のVH及び配列番号318のVL;
ai)配列番号263のVH及び配列番号319のVL;
aj)配列番号263のVH及び配列番号320のVL;
ak)配列番号263のVH及び配列番号321のVL;
al)配列番号263のVH及び配列番号322のVL;
am)配列番号263のVH及び配列番号323のVL;
an)配列番号263のVH及び配列番号324のVL;
ao)配列番号263のVH及び配列番号325のVL;
ap)配列番号263のVH及び配列番号326のVL;
aq)配列番号263のVH及び配列番号327のVL;
ar)配列番号263のVH及び配列番号328のVL;
as)配列番号263のVH及び配列番号329のVL;
at)配列番号263のVH及び配列番号330のVL;
au)配列番号263のVH及び配列番号331のVL;
av)配列番号263のVH及び配列番号332のVL;
aw)配列番号263のVH及び配列番号333のVL;
ax)配列番号263のVH及び配列番号334のVL;
ay)配列番号263のVH及び配列番号335のVL;
az)配列番号263のVH及び配列番号336のVL;
ba)配列番号337のVH及び配列番号272のVL;
bb)配列番号338のVH及び配列番号272のVL;
bc)配列番号339のVH及び配列番号272のVL;
bd)配列番号340のVH及び配列番号272のVL;
be)配列番号341のVH及び配列番号272のVL;
bf)配列番号342のVH及び配列番号272のVL;
bg)配列番号343のVH及び配列番号272のVL;
bh)配列番号344のVH及び配列番号272のVL;
bi)配列番号345のVH及び配列番号272のVL;
bj)配列番号346のVH及び配列番号272のVL;
bk)配列番号347のVH及び配列番号272のVL;
bl)配列番号348のVH及び配列番号272のVL;
bm)配列番号349のVH及び配列番号272のVL;
bn)配列番号350のVH及び配列番号272のVL;
bo)配列番号351のVH及び配列番号272のVL;
bp)配列番号352のVH及び配列番号272のVL;
bq)配列番号56のVH及び配列番号353のVL;
br)配列番号56のVH及び配列番号354のVL;
bs)配列番号56のVH及び配列番号355のVL;
bt)配列番号56のVH及び配列番号356のVL;
bu)配列番号56のVH及び配列番号357のVL;
bv)配列番号56のVH及び配列番号358のVL;
bw)配列番号56のVH及び配列番号359のVL;
bx)配列番号56のVH及び配列番号360のVL;
by)配列番号56のVH及び配列番号361のVL;
bz)配列番号56のVH及び配列番号362のVL;
ca)配列番号56のVH及び配列番号363のVL;
cb)配列番号56のVH及び配列番号364のVL;
cc)配列番号56のVH及び配列番号365のVL;
cd)配列番号56のVH及び配列番号366のVL;
ce)配列番号367のVH及び配列番号85のVL;
cf)配列番号368のVH及び配列番号85のVL;
cg)配列番号369のVH及び配列番号85のVL;
ch)配列番号370のVH及び配列番号85のVL;
ci)配列番号371のVH及び配列番号85のVL;
cj)配列番号372のVH及び配列番号85のVL;
ck)配列番号373のVH及び配列番号85のVL;
cl)配列番号374のVH及び配列番号85のVL;
cm)配列番号375のVH及び配列番号85のVL;
cn)配列番号376のVH及び配列番号85のVL;
co)配列番号377のVH及び配列番号85のVL;
cp)配列番号378のVH及び配列番号85のVL;
cq)配列番号379のVH及び配列番号85のVL;
cr)配列番号380のVH及び配列番号85のVL;
cs)配列番号381のVH及び配列番号85のVL;
ct)配列番号382のVH及び配列番号85のVL;
cu)配列番号53のVH及び配列番号383のVL;
cv)配列番号53のVH及び配列番号384のVL;
cw)配列番号53のVH及び配列番号385のVL;
cx)配列番号53のVH及び配列番号386のVL;
cy)配列番号53のVH及び配列番号387のVL;
cz)配列番号53のVH及び配列番号388のVL;
da)配列番号53のVH及び配列番号389のVL;
db)配列番号53のVH及び配列番号390のVL;
dc)配列番号53のVH及び配列番号391のVL;
dd)配列番号53のVH及び配列番号392のVL;
de)配列番号53のVH及び配列番号393のVL;
df)配列番号53のVH及び配列番号394のVL;
dg)配列番号53のVH及び配列番号395のVL;
dh)配列番号53のVH及び配列番号396のVL;
di)配列番号53のVH及び配列番号397のVL;又は
dj)配列番号53のVH及び配列番号398のVL
を含む、請求項6に記載の単離タンパク質。
8)CD33に結合する単離タンパク質であって、
a)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
b)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
c)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
d)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
e)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;
f)配列番号264のVH及び配列番号273のVL;
g)配列番号291のVH及び配列番号271のVL;
h)配列番号292のVH及び配列番号271のVL;
i)配列番号293のVH及び配列番号271のVL;
j)配列番号294のVH及び配列番号271のVL;
k)配列番号295のVH及び配列番号271のVL;
l)配列番号296のVH及び配列番号271のVL;
m)配列番号297のVH及び配列番号271のVL;
n)配列番号298のVH及び配列番号271のVL;
o)配列番号299のVH及び配列番号271のVL;
p)配列番号300のVH及び配列番号271のVL;
q)配列番号301のVH及び配列番号271のVL;
r)配列番号302のVH及び配列番号271のVL;
s)配列番号303のVH及び配列番号271のVL;
t)配列番号304のVH及び配列番号271のVL;
u)配列番号305のVH及び配列番号271のVL;
v)配列番号306のVH及び配列番号271のVL;
w)配列番号307のVH及び配列番号271のVL;
x)配列番号308のVH及び配列番号271のVL;
y)配列番号309のVH及び配列番号271のVL;
z)配列番号310のVH及び配列番号271のVL;
aa)配列番号263のVH及び配列番号311のVL;
ab)配列番号263のVH及び配列番号312のVL;
ac)配列番号263のVH及び配列番号313のVL;
ad)配列番号263のVH及び配列番号314のVL;
ae)配列番号263のVH及び配列番号315のVL;
af)配列番号263のVH及び配列番号316のVL;
ag)配列番号263のVH及び配列番号317のVL;
ah)配列番号263のVH及び配列番号318のVL;
ai)配列番号263のVH及び配列番号319のVL;
aj)配列番号263のVH及び配列番号320のVL;
ak)配列番号263のVH及び配列番号321のVL;
al)配列番号263のVH及び配列番号322のVL;
am)配列番号263のVH及び配列番号323のVL;
an)配列番号263のVH及び配列番号324のVL;
ao)配列番号263のVH及び配列番号325のVL;
ap)配列番号263のVH及び配列番号326のVL;
aq)配列番号263のVH及び配列番号327のVL;
ar)配列番号263のVH及び配列番号328のVL;
as)配列番号263のVH及び配列番号329のVL;
at)配列番号263のVH及び配列番号330のVL;
au)配列番号263のVH及び配列番号331のVL;
av)配列番号263のVH及び配列番号332のVL;
aw)配列番号263のVH及び配列番号333のVL;
ax)配列番号263のVH及び配列番号334のVL;
ay)配列番号263のVH及び配列番号335のVL;
az)配列番号263のVH及び配列番号336のVL;
ba)配列番号337のVH及び配列番号272のVL;
bb)配列番号338のVH及び配列番号272のVL;
bc)配列番号339のVH及び配列番号272のVL;
bd)配列番号340のVH及び配列番号272のVL;
be)配列番号341のVH及び配列番号272のVL;
bf)配列番号342のVH及び配列番号272のVL;
bg)配列番号343のVH及び配列番号272のVL;
bh)配列番号344のVH及び配列番号272のVL;
bi)配列番号345のVH及び配列番号272のVL;
bj)配列番号346のVH及び配列番号272のVL;
bk)配列番号347のVH及び配列番号272のVL;
bl)配列番号348のVH及び配列番号272のVL;
bm)配列番号349のVH及び配列番号272のVL;
bn)配列番号350のVH及び配列番号272のVL;
bo)配列番号351のVH及び配列番号272のVL;
bp)配列番号352のVH及び配列番号272のVL;
bq)配列番号56のVH及び配列番号353のVL;
br)配列番号56のVH及び配列番号354のVL;
bs)配列番号56のVH及び配列番号355のVL;
bt)配列番号56のVH及び配列番号356のVL;
bu)配列番号56のVH及び配列番号357のVL;
bv)配列番号56のVH及び配列番号358のVL;
bw)配列番号56のVH及び配列番号359のVL;
bx)配列番号56のVH及び配列番号360のVL;
by)配列番号56のVH及び配列番号361のVL;
bz)配列番号56のVH及び配列番号362のVL;
ca)配列番号56のVH及び配列番号363のVL;
cb)配列番号56のVH及び配列番号364のVL;
cc)配列番号56のVH及び配列番号365のVL;
cd)配列番号56のVH及び配列番号366のVL;
ce)配列番号367のVH及び配列番号85のVL;
cf)配列番号368のVH及び配列番号85のVL;
cg)配列番号369のVH及び配列番号85のVL;
ch)配列番号370のVH及び配列番号85のVL;
ci)配列番号371のVH及び配列番号85のVL;
cj)配列番号372のVH及び配列番号85のVL;
ck)配列番号373のVH及び配列番号85のVL;
cl)配列番号374のVH及び配列番号85のVL;
cm)配列番号375のVH及び配列番号85のVL;
cn)配列番号376のVH及び配列番号85のVL;
co)配列番号377のVH及び配列番号85のVL;
cp)配列番号378のVH及び配列番号85のVL;
cq)配列番号379のVH及び配列番号85のVL;
cr)配列番号380のVH及び配列番号85のVL;
cs)配列番号381のVH及び配列番号85のVL;
ct)配列番号382のVH及び配列番号85のVL;
cu)配列番号53のVH及び配列番号383のVL;
cv)配列番号53のVH及び配列番号384のVL;
cw)配列番号53のVH及び配列番号385のVL;
cx)配列番号53のVH及び配列番号386のVL;
cy)配列番号53のVH及び配列番号387のVL;
cz)配列番号53のVH及び配列番号388のVL;
da)配列番号53のVH及び配列番号389のVL;
db)配列番号53のVH及び配列番号390のVL;
dc)配列番号53のVH及び配列番号391のVL;
dd)配列番号53のVH及び配列番号392のVL;
de)配列番号53のVH及び配列番号393のVL;
df)配列番号53のVH及び配列番号394のVL;
dg)配列番号53のVH及び配列番号395のVL;
dh)配列番号53のVH及び配列番号396のVL;
di)配列番号53のVH及び配列番号397のVL;又は
dj)配列番号53のVH及び配列番号398のVL
を含む単離タンパク質。
9)単離タンパク質は、scFv、(scFv)、Fv、Fab、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、請求項1~8の何れか一項に記載の単離タンパク質。
10)Fabである、請求項9に記載の単離タンパク質。
11)scFvである、請求項9に記載の単離タンパク質。
12)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、請求項11に記載の単離タンパク質。
13)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、請求項12に記載の単離タンパク質。
14)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、請求項13に記載の単離タンパク質。
15)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、請求項14に記載の単離タンパク質。
16)配列番号213、216、219、274、275又は276のアミノ酸配列を含む、請求項15に記載の単離タンパク質。
17)半減期延長部分に複合化される、請求項1~16の何れか一項に記載の単離タンパク質。
18)半減期延長部分は、免疫グロブリン(Ig)、Igの断片、Ig定常領域、Ig定常領域の断片、Fc領域、トランスフェリン、アルブミン、アルブミン結合ドメイン又はポリエチレングリコールである、請求項17に記載の単離タンパク質。
19)単一特異性タンパク質である、請求項1~18の何れか一項に記載の単離タンパク質。
20)多特異性タンパク質である、請求項1~19の何れか一項に記載の単離タンパク質。
21)多特異性タンパク質は、二特異性タンパク質である、請求項20に記載の単離タンパク質。
22)多特異性タンパク質は、三特異性タンパク質である、請求項20に記載の単離タンパク質。
23)免疫グロブリン(Ig)定常領域又はそのIg定常領域の断片をさらに含む、請求項1~22の何れか一項に記載の単離タンパク質。
24)Ig定常領域の断片は、Fc領域を含む、請求項23に記載の単離タンパク質。
25)Ig定常領域の断片は、CH2ドメインを含む、請求項23に記載の単離タンパク質。
26)Ig定常領域の断片は、CH3ドメインを含む、請求項23に記載の単離タンパク質。
27)Ig定常領域の断片は、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、請求項23に記載の単離タンパク質。
28)Ig定常領域の断片は、ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、請求項23に記載の単離タンパク質。
29)Ig定常領域の断片は、ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む、請求項23に記載の単離タンパク質。
30)Ig定常領域又はIg定常領域の断片のN末端に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項23~29の何れか一項に記載の単離タンパク質。
31)Ig定常領域又はIg定常領域の断片のC末端に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項23~29の何れか一項に記載の単離タンパク質。
32)第2のリンカー(L2)を介してIg定常領域又はIg定常領域の断片に複合化されるCD33に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項23~31の何れか一項に記載の単離タンパク質。
33)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、請求項32に記載の単離タンパク質。
34)多特異性タンパク質は、リンパ球上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項20~33の何れか一項に記載の単離タンパク質。
35)リンパ球は、T細胞である、請求項34に記載の単離タンパク質。
36)T細胞は、CD8T細胞である、請求項35に記載の単離タンパク質。
37)リンパ球は、ナチュラルキラー(NK)細胞である、請求項34に記載の単離タンパク質。
38)多特異性タンパク質は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、請求項20~37の何れか一項に記載の単離タンパク質。
39)多特異性タンパク質は、CD3εに結合する抗原結合ドメインを含む、請求項38に記載の単離タンパク質。
40)多特異性タンパク質は、TRGV9に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項38に記載の単離タンパク質。
41)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)2、Fv、Fab、F(ab’)2、Fd、dAb又はVHHを含む、請求項34~40の何れか一項に記載の単離タンパク質。
42)a)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む;
b)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む;
c)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む;又は
d)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、scFvを含み、リンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む、請求項41に記載の単離タンパク質。
43)Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプであり、任意選択的にIg定常領域又はIg定常領域の断片は、IgG1である、請求項23~42の何れか一項に記載の単離タンパク質。
44)Ig定常領域の断片は、配列番号277又は278の配列を有する、請求項43に記載の単離タンパク質。
45)請求項23~43の何れか一項に記載の単離タンパク質であって、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)へのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、単離タンパク質。
46)FcγRへのタンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項45に記載の単離タンパク質。
47)請求項23~43の何れか一項に記載の単離タンパク質であって、Ig定常領域又はIg定常領域の断片は、FcγRへの増強された結合をもたらすタンパク質の少なくとも1つの突然変異を含む、単離タンパク質。
48)FcγRへのタンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項47に記載の単離タンパク質。
49)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、請求項45~48の何れか一項に記載の単離タンパク質。
50)請求項23~49の何れか一項に記載の単離タンパク質であって、Ig定常領域の断片のIg定常領域は、タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、単離タンパク質。
51)タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項50に記載の単離タンパク質。
52)Ig定常領域のCH3ドメインにおいて少なくとも1つの突然変異を含む、請求項23~51の何れか一項に記載の単離タンパク質。
53)Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項52に記載の単離タンパク質。
54)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインを含む単離された多特異性タンパク質であって、CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、請求項1~16の何れか一項で定められるような結合ドメインを含む、単離された多特異性タンパク質。
55)リンパ球抗原は、T細胞抗原である、請求項54の単離された多特異性タンパク質。
56)T細胞抗原は、CD8+T細胞抗原である、請求項55に記載の単離された多特異性タンパク質。
57)リンパ球抗原は、NK細胞抗原である、請求項54に記載の単離された多特異性タンパク質。
58)リンパ球抗原は、CD3、CD3イプシロン(CD3ε)、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195、TRGV9又はNKG2Cである、請求項54~57の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
59)リンパ球抗原は、CD3εである、請求項58に記載の単離された多特異性タンパク質。
60)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFv、(scFv)2、Fv、Fab、F(ab’)2、Fd、dAb又はVHHを含む、請求項54~59の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
61)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fabを含む、請求項60に記載の単離された多特異性タンパク質。
62)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、VHHを含む、請求項60に記載の単離された多特異性タンパク質。
63)CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、scFvを含む、請求項60に記載の単離された多特異性タンパク質。
64)scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又はVL、L1及びVH(VL-L1-VH)を含む、請求項60又は63に記載の単離された多特異性タンパク質。
65)L1は、
a)約5~50アミノ酸;
b)約5~40アミノ酸;
c)約10~30アミノ酸;又は
d)約10~20アミノ酸
を含む、請求項64に記載の単離された多特異性タンパク質。
66)L1は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、請求項65に記載の単離された多特異性タンパク質。
67)L1は、配列番号108のアミノ酸配列を含む、請求項66に記載の単離された多特異性タンパク質。
68)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は第2のIg定常領域の断片に複合化される、請求項54~67の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
69)CD33に結合する第1の抗原結合ドメインと、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片との間及びリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインと、第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む、請求項68に記載の単離された多特異性タンパク質。
70)L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、請求項69に記載の単離された多特異性タンパク質。
71)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである、請求項68~70の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
72)請求項68~71に記載の単離された多特異性タンパク質であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含む、単離された多特異性タンパク質。
73)FcγRへの多特異性タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項72に記載の単離された多特異性タンパク質。
74)請求項68~71の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、Fcγ受容体(FcγR)への増強された結合をもたらす多特異性タンパク質の少なくとも1つの突然変異を含む、単離された多特異性タンパク質。
75)FcγRへの多特異性タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項74に記載の単離された多特異性タンパク質。
76)FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、請求項72~75の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
77)請求項67~76の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質であって、第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含む、単離された多特異性タンパク質。
78)多特異性タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項77に記載の単離された多特異性タンパク質。
79)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異を含む、請求項68~78の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
80)第1のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第1のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異及び/又は第2のIg定常領域のCH3ドメインにおける又は第2のIg定常領域の断片のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異は、T350V、L351Y、F405A,Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項79に記載の単離された多特異性タンパク質。
81)第1のIg定常領域又は第1のIg定常領域の断片及び第2のIg定常領域又は第2のIg定常領域の断片は、以下の突然変異:
第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及びを第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V
を含む、請求項68~80の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質。
82)キメラ抗原受容体(CAR)である、請求項1~16の何れか一項に記載の単離タンパク質。
83)CARは、
a)請求項1~16の何れか一項に記載のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、請求項82に記載の単離タンパク質。
84)CARは、CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、請求項82又は83に記載の単離タンパク質。
85)a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む、請求項82~84の何れか一項に記載の単離タンパク質。
86)a)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
b)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
c)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む、請求項82~84の何れか一項に記載の単離タンパク質。
87)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分又はそれらの何れかの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む、請求項86に記載の単離タンパク質。
88)キメラ抗原受容体(CAR)であって、
a)CD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
b)膜貫通ドメイン;及び
c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
を含む、キメラ抗原受容体(CAR)であって、
CD33に結合する抗原結合ドメインは、請求項1~16、20~22又は34~40の何れか一項で定められるような結合ドメインを含むキメラ抗原受容体(CAR)。
89)CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、請求項88に記載のCAR。
90)a)膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
b)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分を含む同時刺激ドメインと、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分を含む一次シグナル伝達ドメインとを含む、請求項88又は89に記載のCAR。
91)d)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
e)膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
f)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインと、配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を有する一次シグナル伝達ドメインとを含む、請求項89又は90に記載のCAR。
92)CD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメインは、シグナルポリペプチドをさらに含む、請求項88~91の何れか一項に記載のCAR。
93)シグナルポリペプチドは、配列番号166のアミノ酸配列を含む、請求項92に記載のCAR。
94)細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるポリペプチド構成成分を含む、請求項88~93の何れか一項に記載のCAR。
95)CD137構成成分は、配列番号163のアミノ酸配列を含む、請求項90~94の何れか一項に記載のCAR。
96)CD3z構成成分は、配列番号164のアミノ酸配列を含む、請求項90~95の何れか一項に記載のCAR。
97)細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号165のアミノ酸配列を含む、請求項90~96の何れか一項に記載のCAR。
98)CD8a-TMポリペプチドは、配列番号162のアミノ酸配列を含む、請求項90~97の何れか一項に記載のCAR。
99)CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列を含む、請求項90~98の何れか一項に記載のCAR。
100)請求項90~99の何れか一項に記載のCARを発現する、単離されたリンパ球。
101)Tリンパ球である、請求項100に記載の単離されたリンパ球。
102)ナチュラルキラー(NK)細胞である、請求項100に記載の単離されたリンパ球。
103)薬剤に複合化された、請求項1~53の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項54~81の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質を含む、免疫複合体。
104)薬剤は、治療剤又は造影剤である、請求項103に記載の免疫複合体。
105)薬剤は、放射活性剤である、請求項103に記載の免疫複合体。
106)放射活性剤は、放射性金属イオンを含む、請求項105に記載の免疫複合体。
107)放射性金属イオンは、32P、47Sc、67Cu、77As、89Sr、90Y、99Tc、105Rh、109Pd、111Ag、131I、153Sm、159Gd、165Dy、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、194Ir、198Au、199Au、211At、212Pb、212Bi、213Bi、223Ra、225Ac、255Fm、227Th、62Cu、64Cu、67Ga、68Ga、86Y、89Zr又は111Inである、請求項106に記載の免疫複合体。
108)放射性金属イオンは、225Ac、111In又は89Zrである、請求項107に記載の免疫複合体。
109)放射性金属イオンは、225Acである、請求項107に記載の免疫複合体。
110)放射性金属イオンは、キレート部分に複合化される、請求項106~109の何れか一項に記載の免疫複合体。
111)キレート部分は、式(I):
Figure 2023517660000056

(式中、R、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキルであり;及び
Zは、(CH2)Yであり、
nは、1~10であり、及び
Yは、第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分又は求核部分であり;
代わりに、Zは、水素であり;及び
、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキル又は第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分若しくは求核部分である)
の構造を有する大環状分子を含み;
代わりに、キレート剤は、開鎖リガンドを含む、請求項110に記載の免疫複合体。
112)キレート部分は、式(II):
Figure 2023517660000057

の構造又は式(III):
Figure 2023517660000058

の構造を有する大環状分子を含む、請求項110に記載の免疫複合体。
113)式(IV)
Figure 2023517660000059

(式中、タンパク質は、請求項1~53、82~87の何れか一項で定められるような単離タンパク質又は請求項54~81の何れか一項で定められるような単離された多特異性タンパク質である)
の免疫複合体。
114)式(V)
Figure 2023517660000060

(式中、タンパク質は、請求項1~53、82~87の何れか一項で定められるような単離タンパク質又は請求項54~81の何れか一項で定められるような単離された多特異性タンパク質である)
の免疫複合体。
115)請求項1~53、82~87の何れか一項に記載の単離タンパク質、請求項54~81の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質、請求項88~99の何れか一項に記載のCAR、請求項100~102の何れか一項に記載のリンパ球又は請求項103~114の何れか一項に記載の免疫複合体と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
116)請求項1~53、82~87の何れか一項に記載の単離タンパク質、請求項54~81の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質、請求項88~99の何れか一項に記載のCAR又は請求項103~114の何れか一項に記載の免疫複合体をコードするポリヌクレオチド。
117)請求項116に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
118)請求項117に記載のベクター又は請求項116に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
119)請求項1~53、82~87の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項54~81の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質を作製する方法であって、タンパク質が発現される条件において、請求項118に記載の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を回収することとを含む方法。
120)請求項103~114の何れか一項に記載の免疫複合体を作製する方法であって、タンパク質が発現される条件において、請求項118に記載の宿主細胞を培養することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を回収することと、宿主細胞によって産生されるタンパク質を薬剤と複合化することとを含む方法。
121)請求項1~53又は82~87の何れか一項に記載の単離タンパク質に結合する抗イディオタイプ抗体。
122)請求項1~53、82~87の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項54~81の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質又は請求項88~99の何れか一項に記載のCARを含むキット。
123)対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、対象に、治療的有効量の請求項1~53、82~87の何れか一項に記載の単離タンパク質、請求項54~81の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質又は請求項103~114の何れか一項に記載の免疫複合体を投与することを含む方法。
124)対象においてCD33発現細胞の量を減少させるために有効であり、CD33発現細胞は、癌性細胞であるか、又はCD33発現細胞は、非癌性細胞である、請求項123に記載の方法。
125)対象においてCD33発現癌の確立を予防するために有効である、請求項123又は124に記載の方法。
126)CD33発現癌を有する対象を処置する方法であって、それを必要とする対象に治療的有効量の請求項100~102の何れか一項に記載のリンパ球を投与することを含み、それにより、リンパ球は、対象においてCD33発現癌の死滅に介在する、方法。
127)癌細胞の標的化された死滅の方法であって、癌細胞を請求項100~102の何れか一項に記載のリンパ球と接触させることを含み、それにより、リンパ球は、癌細胞の標的化された死滅を誘導する、方法。
128)対象において癌の存在を検出する方法であって、
a)対象から得られた細胞試料を、請求項88~99の何れか一項に記載のCARと接触させ、それによりCAR-細胞複合体を形成することと、
b)CAR-細胞複合体を検出することであって、CAR-細胞複合体の検出は、対象における癌の存在を示す、検出することと
を含む方法。
129)CD33発現癌は、血液癌である、請求項123~128の何れか一項に記載の方法。
130)血液癌は、白血病、リンパ腫又は多発性骨髄腫である、請求項129に記載の方法。
131)血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、請求項130に記載の方法。
132)血液癌は、急性骨髄性白血病(AML)である、請求項131に記載の方法。
133)単離タンパク質、単離された多特異性タンパク質又は免疫複合体は、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項123~132の何れか一項に記載の方法。
134)第2の治療剤は、手術、化学療法、アンドロゲン欠乏療法若しくは放射線又はそれらの任意の組み合わせである、請求項133に記載の方法。
配列
配列番号1 CDR1(C33B1785;C33B1787;C33B1780;C33B1789;C33B1788)
DYAIG
配列番号2 CDR1(C33B1784)
TYVMG
配列番号3 CDR1(C33B1786)
FSTMD
配列番号4 CDR1(C33B1781)
INAMG
配列番号5 CDR1(C33B1783;C33B1782)
DYAVG
配列番号6 CDR2(C33B1785;C33B1780;C33B1789;C33B1788)
CISESDGRTYLSDSVKS
配列番号7 CDR2(C33B1784)
AIVSGRNPTYADSVKS
配列番号8 CDR2(C33B1787)
CISSSDGSTYYVDSVKG
配列番号9 CDR2(C33B1786)
CIRPRYSTTTHADSIKG
配列番号10 CDR2(C33B1781)
RITGGGATDYVDSVKG
配列番号11 CDR2(C33B1783;C33B1782)
CISSSDGATYYADSVKG
配列番号12 CDR3(C33B1785;C33B1780;C33B1789;C33B1788)
VDQAISESSYHCEKGFGS
配列番号13 CDR3(C33B1784;C33B1786)
YHYSSQY
配列番号14 CDR3(C33B1787)
LIIMYGSGSERAAAACRYKYEY
配列番号15 CDR3(C33B1781)
DLVTRVGSDLLYDDY
配列番号16 CDR3(C33B1783)
IIVRGSGWERAAAACRYEYSY
配列番号17 CDR3(C33B1782)
VIVRGTGWERAAAACRYEYAY
配列番号18 VHH配列(C33B1785)
QVQLVESGGGSVQPGGSLRLSCAVFGFSLSDYAIGWFRQAPGKEREKVSCISESDGRTYLSDSVKSRFTISRDNGKNTVYLQMNNLKPDDTGVYYCATVDQAISESSYHCEKGFGSWGQGTQVTVSS
配列番号19 VHH配列(C33B1784)
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGRTFSTYVMGWFRQAPGQERELVAAIVSGRNPTYADSVKSRFTISRDNAKNTIYLHMNSLQPEDTAVYYCHMYHYSSQYWGQGTQVTVSS
配列番号20 VHH配列(C33B1787)
Figure 2023517660000061

配列番号21 VHH配列(C33B1786)
EVQVVESGGGVVQSGGSLTLSCEASESILSFSTMDWFRQAPGKEREGVSCIRPRYSTTTHADSIKGRFKMYSDNAKNTIYLHMNSLQPEDTAVYYCHMYHYSSQYWGQGTQVTVSS
配列番号22 VHH配列(C33B1781)
EVQVVESGGGLVQGGGSLRLSCAASGSIFSINAMGWYHQAPGKQRELVARITGGGATDYVDSVKGRFTISLDSAKSTVYLQMNSLKPEDTAVYHCYADLVTRVGSDLLYDDYWGQGTQVTVSS
配列番号23 VHH配列(C33B1780)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVFGFSLSDYAIGWFRQAPGKEREKVSCISESDGRTYLSDSVKSRFTISRDNGKNTVYLQMNNLKPDDTGVYYCATVDQAISESSYHCEKGFGSWGQGTQVTVSS
配列番号24 VHH配列(C33B1783)
Figure 2023517660000062

配列番号25 VHH配列(C33B1782)
Figure 2023517660000063

配列番号26 VHH配列(C33B1789)
QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAVFGFSLSDYAIGWFRQAPGKEREKVSCISESDGRTYLSDSVKSRFTISRDNGKNTVYLQMNNLKPDDTGVYYCATVDQAISESSYHCEKGFGSWGQGTQVTVSS
配列番号27 VHH配列(C33B1788)
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAVFGFSLSDYAIGWFRQAPGKEREKVSCISESDGRTYLSDSVKSRFTISRDNGKNTVYLQMNNLKPDDTGVYYCATVDQAISESSYHCEKGFGSWGQGTQVTVSS
配列番号28 VHのCDR1(C33B1474)
SFGMS
配列番号29 VHのCDR1(C33B1522)
SYYWG
配列番号30 VHのCDR1(C33B1607)
DYNIN
配列番号31 VHのCDR1(C33B1601)
NYAMS
配列番号32 VHのCDR1(C33B1517)
NYYWS
配列番号33 VHのCDR1(C33B1495;C33B931;C33B782)
SYWMS
配列番号34 VHのCDR1(C33B1478;C33B1477;C33B1476)
VSAIH
配列番号35 VHのCDR1(C33B1484)
VFAIH
配列番号36 VHのCDR2(C33B1474)
NIKRDGSEKYYVDSVKG
配列番号37 VHのCDR2(C33B1522)
YIYYSGSTNYNPSLKS
配列番号38 VHのCDR2(C33B1607)
TINPNNGVTFYNQRFKG
配列番号39 VHのCDR2(C33B1601)
GISNSGYSLYYPDTLKG
配列番号40 VHのCDR2(C33B1517)
HIYSTGNIHYNPSLKS
配列番号41 VHのCDR2(C33B1495)
NIKRDGSEKHYVDSVKG
配列番号42 VHのCDR2(C33B1478;C33B1484)
RIRSKGNSYATAYDVSVKG
配列番号43 VHのCDR2(C33B1477)
RIRSKGNSYATAYAASVKG
配列番号44 VHのCDR2(C33B1476)
RIRSKGNSYATAYNVSVKG
配列番号45 VHのCDR3(C33B1474)
DYGYFDF
配列番号46 VHのCDR3(C33B1522)
MWEILGFDP
配列番号47 VHのCDR3(C33B1607)
DGYDTYYAMDY
配列番号48 VHのCDR3(C33B1601)
DGGSYPYAMDY
配列番号49 VHのCDR3(C33B1517)
DNGAALFDY
配列番号50 VHのCDR3(C33B1495)
DYGYFDY
配列番号51 VHのCDR3(C33B1478;C33B1477;C33B1476;C33B1484)
HNDKWNYYGLDV
配列番号52 VH配列(C33B1474)
QVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVANIKRDGSEKYYVDSVKGRFTISRDNAKNSLFLQMSSLRAEDTAVYYCVRDYGYFDFWGQGTLVTVSS
配列番号53 VH配列(C33B1522)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSYYWGWIRQPPGKGLEWIGYIYYSGSTNYNPSLKSRVTISVDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARMWEILGFDPWGQGTLVTVS
配列番号54 VH配列(C33B1607)
EVQLQQSGPELVKPGSSVKISCKASGYTFTDYNINWVKQSHGKNLEWIGTINPNNGVTFYNQRFKGQATLTVDKSSSTAYMELRSLTSEDSAVYYCSRDGYDTYYAMDYWGQGTTLTVSS
配列番号55 VH配列(C33B1607)
EVQLVESGGGLVRPGGSLKLSCAASGFTFSNYAMSWVRQTPEKRLEWVAGISNSGYSLYYPDTLKGRFTISRDNARNTLYLQMISLRSEDTAMYYCARDGGSYPYAMDYWGHGTSVTVSS
配列番号56 VH配列(C33B1517)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号57 VH配列(C33B1495)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLDWVANIKRDGSEKHYVDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDSAVYYCTRDYGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号58 VH配列(C33B1478)
EVQLVESGGGLVQPGGSLKVSCEASGFTFSVSAIHWVRQASGKGLEWIGRIRSKGNSYATAYDVSVKGRFTISRDDSKNTAYLQMDSLKTEDTAVYYCTRHNDKWNYYGLDVWGQGTTVTVSS
配列番号59 VH配列(C33B1477)
EVQLVESGGGLVQPGGSLKVSCEASGFTFSVSAIHWVRQASGKGLEWIGRIRSKGNSYATAYAASVKGRFTISRDDSKNTAYLQMDSLKTEDTAVYYCTRHNDKWNYYGLDVWGQGTTVTVSS
配列番号60 VH配列(C33B1476)
EVQLVESGGGLVQPGGSLKVSCEASGFTFSVSAIHWVRQASGKGLEWIGRIRSKGNSYATAYNVSVKGRFTISRDDSKNTAYLQMDSLKTEDTAVYYCTRHNDKWNYYGLDVWGQGTTVTVSS
配列番号61 VH配列(C33B1484)
EVQLVESGGGLVQPGGSLKVSCEASGFTFSVFAIHWVRQASGKGLEWIGRIRSKGNSYATAYDVSVKGRFTISRDDSKNTAYLQMDSLKTEDTAVYYCTRHNDKWNYYGLDVWGQGTTVTVSS
配列番号62 VLのCDR1(C33B1474)
QASQAISNYLN
配列番号63 VLのCDR1(C33B1522)
SGSSSNIGSNPVN
配列番号64 VLのCDR1(C33B1607)
KASQDVRTAEA
配列番号65 VLのCDR1(C33B1601)
KASQNVGTYVA
配列番号66 VLのCDR1(C33B1517;C33B1516)
SGSSSNIGSNIVN
配列番号67 VLのCDR1(C33B1495)
RASQGISSYLA
配列番号68 VLのCDR1(C33B1478;C33B1477;C33B1476;C33B1484)
KSSQSLLFSNGYKFLD
配列番号69 VLのCDR2(C33B1474)
DASNLET
配列番号70 VLのCDR2(C33B1522;C33B1517)
SNNQRPS
配列番号71 VLのCDR2(C33B1607)
SASNRYT
配列番号72 VLのCDR2(C33B1601)
SASYRYS
配列番号73 VLのCDR2(C33B1495)
AASTLQS
配列番号74 VLのCDR2(C33B1478;C33B1477;C33B1476;C33B1484;C33B1475)
LGSYRAS
配列番号75 VLのCDR3(C33B1474)
QHYDNLPYT
配列番号76 VLのCDR3(C33B1522;C33B1517;C33B1516)
AAWDDSLNGPV
配列番号77 VLのCDR3(C33B1607)
QQYYTTPRT
配列番号78 VLのCDR3(C33B1601)
QQYKSYPLT
配列番号79 VLのCDR3(C33B1495)
QQLNSYPVT
配列番号80 VLのCDR3(C33B1478;C33B1477;C33B1476;C33B1484)
MQALQTPPT
配列番号81 VL配列(C33B1474)
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQAISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYDASNLETGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDFSTYFCQHYDNLPYTFGQGTKLEIK
配列番号82 VL配列(C33B1522)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLNGPVFGGGTKLTVL
配列番号83 VL配列(C33B1607)
DIVMTQSHKFMSTSVGDRVSITCKASQDVRTAEAWYQQKPGQSPKLLIYSASNRYTGVPDRFTGSGSGTDFTFTISSVQAEDLAVYYCQQYYTTPRTFGGGTKLEIK
配列番号84 VL配列(C33B1601)
DIVMTQSQKFMSTSVGDRVSVTCKASQNVGTYVAWYQQKPGHSPKALIYSASYRYSGVPDRFTGSGSGTDFTLTISNVQSEDLADYFCQQYKSYPLTFGAGTKLELK
配列番号85 VL配列(C33B1517)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNGPVFGPGTKVTVL
配列番号86 VL配列(C33B1495)
DIQLTQSPSFLSASVGDRVTITCRASQGISSYLAWYQQKPGKAPKVLIYAASTLQSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYFCQQLNSYPVTFGGGTKVEIK
配列番号87 VL配列(C33B1478;C33B1477;C33B1476)
DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCKSSQSLLFSNGYKFLDWYLQRPGQSPQLLIYLGSYRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGLYYCMQALQTPPTFGGGTKVEIK
配列番号88 VL配列(C33B1484)
DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCKSSQSLLFSNGYKFLDWYLQRPGQSPQLLIYLGSYRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGLYYCMQALQTPPTFGQGTKVEIK
配列番号89 VHのCDR1(C33B933;C33B919;C33B937;C33B125)
SYGMH
配列番号90 VHのCDR2(C33B933;C33B919;C33B937;C33B125)
VISYDGSNKYYADSVKG
配列番号91 VHのCDR2(C33B931;C33B782)
NIKQHGSEKYYVDSVKG
配列番号92 VHのCDR3(C33B933)
DFRSLDWLPPDSTSYDGMDV
配列番号93 VHのCDR3(C33B933)
DFRSFDWLPPDSTSYYGMDV
配列番号94 VHのCDR3(C33B931)
DRDLGYFDY
配列番号95 VH配列(C33B933)
Figure 2023517660000064

配列番号96 VH配列(C33B919;C33B125)
Figure 2023517660000065

配列番号97 VH配列(C33B931)
EVQLVESGGGFVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQHGSEKYYVDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRDLGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号98 VLのCDR1(C33B933)
SGHKLGDKYAS
配列番号99 VLのCDR1(C33B919)
SGDKLGDKYVS
配列番号100 VLのCDR1(C33B931)
SGDKLGSKFAS
配列番号101 VLのCDR2(C33B933)
KDSKRPS
配列番号102 VLのCDR2(C33B919;C33B125)
QDRKRPS
配列番号103 VLのCDR2(C33B931)
QDSKRPS
配列番号104 VLのCDR3(C33B933;C33B919;C33B931;C33B782;C33B125)
QAWDSSTVV
配列番号105 VL配列(C33B933)
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGHKLGDKYASWYQQKPGQSPVVVIYKDSKRPSGIPERFSGSNFGNTATLTISGTQAMDEADYYCQAWDSSTVVFGGGTKLTVL
配列番号106 VL配列(C33B919)
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGDKLGDKYVSWYQQKPGQSPVVVIHQDRKRPSGIPERFSGSNFGNTATLTISGTQAMDEADYYCQAWDSSTVVFGGGTKLTVL
配列番号107 VL配列(C33B931)
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGDKLGSKFASWYQQKPGQSPVLVIYQDSKRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISGTQAMDEADYYCQAWDSSTVVFGGGTKLTVL
配列番号108 リンカー配列
GGSEGKSSGSGSESKSTGGS
配列番号109 リンカー配列
GGGSGGGS
配列番号110 リンカー配列
GGGSGGGSGGGS
配列番号111 リンカー配列
GGGSGGGSGGGSGGGS
配列番号112 リンカー配列
GGGSGGGSGGGSGGGSGGGS
配列番号113 リンカー配列
GGGGSGGGGSGGGGS
配列番号114 リンカー配列
GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
配列番号115 リンカー配列
GGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
配列番号116 リンカー配列
GSTSGSGKPGSGEGSTKG
配列番号117 リンカー配列
IRPRAIGGSKPRVA
配列番号118 リンカー配列
GKGGSGKGGSGKGGS
配列番号119 リンカー配列
GGKGSGGKGSGGKGS
配列番号120 リンカー配列
GGGKSGGGKSGGGKS
配列番号121 リンカー配列
GKGKSGKGKSGKGKS
配列番号122 リンカー配列
GGGKSGGKGSGKGGS
配列番号123 リンカー配列
GKPGSGKPGSGKPGS
配列番号124 リンカー配列
GKPGSGKPGSGKPGSGKPGS
配列番号125 リンカー配列
GKGKSGKGKSGKGKSGKGKS
配列番号126 リンカー配列
STAGDTHLGGEDFD
配列番号127 リンカー配列
GEGGSGEGGSGEGGS
配列番号128 リンカー配列
GGEGSGGEGSGGEGS
配列番号129 リンカー配列
GEGESGEGESGEGES
配列番号130 リンカー配列
GGGESGGEGSGEGGS
配列番号131 リンカー配列
GEGESGEGESGEGESGEGES
配列番号132 リンカー配列
GSTSGSGKPGSGEGSTKG
配列番号133 リンカー配列
PRGASKSGSASQTGSAPGS
配列番号134 リンカー配列
GTAAAGAGAAGGAAAGAAG
配列番号135 リンカー配列
GTSGSSGSGSGGSGSGGGG
配列番号136 リンカー配列
GKPGSGKPGSGKPGSGKPGS
配列番号137 リンカー配列
GSGS
配列番号138 リンカー配列
APAPAPAPAP
配列番号139 リンカー配列
APAPAPAPAPAPAPAPAPAP
配列番号140 リンカー配列
AEAAAKEAAAKEAAAAKEAAAAKEAAAAKAAA
配列番号141 CD3εに結合する抗原結合ドメインのHCDR1(CD3B219)
TYAMN
配列番号142 CD3εに結合する抗原結合ドメインのHCDR2(CD3B219)
RIRSKYNNYATYYAASVKG
配列番号143 CD3εに結合する抗原結合ドメインのHCDR3(CD3B219)
HGNFGNSYVSWFAY
配列番号144 CD3εに結合する抗原結合ドメインのLCDR1(CD3B219)
RSSTGAVTTSNYAN
配列番号145 CD3εに結合する抗原結合ドメインのLCDR2(CD3B219)
GTNKRAP
配列番号146 CD3εに結合する抗原結合ドメインのLCDR3(CD3B219)
ALWYSNLWV
配列番号147 CD3εに結合する抗原結合ドメインのVH(CD3B219)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNTYAMNWVRQAPGKGLEWVARIRSKYNNYATYYAASVKGRFTISRDDSKNSLYLQMNSLKTEDTAVYYCARHGNFGNSYVSWFAYWGQGTLVTVSS
配列番号148 CD3εに結合する抗原結合ドメインのVL(CD3B219)
QTVVTQEPSLTVSPGGTVTLTCRSSTGAVTTSNYANWVQQKPGQAPRGLIGGTNKRAPGTPARFSGSLLGGKAALTLSGVQPEDEAEYYCALWYSNLWVFGGGTKLTVL
配列番号149 CD3εに結合する抗原結合ドメインのHCDR1(CD3B376)
NNNAAWS
配列番号150 CD3εに結合する抗原結合ドメインのHCDR2(CD3B376)
RTYYRSKWLYDYAVSVKS
配列番号151 CD3εに結合する抗原結合ドメインのHCDR3(CD3B376)
GYSSSFDY
配列番号152 CD3εに結合する抗原結合ドメインのLCDR1(CD3B376)
TGTSSNIGTYKFVS
配列番号153 CD3εに結合する抗原結合ドメインのLCDR2(CD3B376)
EVSKRPS
配列番号154 CD3εに結合する抗原結合ドメインのLCDR3(CD3B376)
VSYAGSGTLL
配列番号155 CD3εに結合する抗原結合ドメインのVH(CD3B376)
QVQLQQSGPRLVRPSQTLSLTCAISGDSVFNNNAAWSWIRQSPSRGLEWLGRTYYRSKWLYDYAVSVKSRITVNPDTSRNQFTLQLNSVTPEDTALYYCARGYSSSFDYWGQGTLVTVSS
配列番号156 CD3εに結合する抗原結合ドメインのVL(CD3B376)
QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSNIGTYKFVSWYQQHPDKAPKVLLYEVSKRPSGVSSRFSGSKSGNTASLTISGLQAEDQADYHCVSYAGSGTLLFGGGTKLTVL
配列番号157 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのCD8a-ヒンジ領域
TSTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACD
配列番号158 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのヒンジ領域
EPKSCDKTHTCPPCP
配列番号159 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのヒンジ領域
ERKCCVECPPCP
配列番号160 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのヒンジ領域
ELKTPLGDTTHTCPRCP(EPKSCDTPPPCPRCP)
配列番号161 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのヒンジ領域
ESKYGPPCPSCP
配列番号162 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのCD8a膜貫通領域
IYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC
配列番号163 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのCD137同時刺激ドメイン
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL
配列番号164 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのCD137同時刺激ドメイン
RVKFSRSADAPAYKQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR
配列番号165 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARの細胞内シグナル伝達ドメイン
Figure 2023517660000066

配列番号166 CD33に結合する抗原結合ドメインを含むCARのヒンジ領域
ESKYGPPCPSCP
配列番号167 VHのCDR1(C33B836)
NYAMN
配列番号168 VHのCDR2(C33B836)
WINTNTGNPTYAQGFTG
配列番号169 VHのCDR3(C33B836)
DRDRGTDY
配列番号170 VH配列(C33B836)
QVQLVQSGSELRKPGASVKVSCKASGYTFTNYAMNWVRQAPGQGLEWMGWINTNTGNPTYAQGFTGRFVFSLDTSVSSAYLQISSLKAEDTAMYYCATDRDRGTDYWGQGTLVTVSS
配列番号171 VH配列(C33B782)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYWMSWVRQAPGKGLEWVANIKQHGSEKYYVDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRDLGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号172 VHのCDR1(C33B806)
SSSYYWG
配列番号173 VHのCDR2(C33B806)
SINYSGSTYYNPSLKS
配列番号174 VHのCDR3(C33B806)
LDGYESPFDY
配列番号175 VH配列(C33B806)
QLQLQESGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSISSSSYYWGWIRQPPGKGLDWIGSINYSGSTYYNPSLKSRVTISVDTSKIQFSLKLRSVTAADTAVYYCARLDGYESPFDYWGQGTLVTVSS
配列番号176 VHのCDR1(C33B904)
DYAMH
配列番号177 VHのCDR2(C33B904)
GIGWSGGSIVYADSVKG
配列番号178 VHのCDR3(C33B904)
DSPYGDFFDY
配列番号179 VH配列(C33B904)
EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLEWVSGIGWSGGSIVYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTALYYCAKDSPYGDFFDYWGQGTLVTVSS
配列番号180 VHのCDR3(C33B937)
DFRSFDWLPPDSASYHGMDV
配列番号181 VH配列(C33B937)
Figure 2023517660000067

配列番号182 VLのCDR1(C33B836)
TGTSSDVGDYNYVS
配列番号183 VLのCDR2(C33B836)
DVSNRPS
配列番号184 VLのCDR3(C33B836)
SSYSSSSALEV
配列番号185 VL配列(C33B836)
QSALTQPASVSGSPGQSITISCTGTSSDVGDYNYVSWYQQHPGKVPKLMIYDVSNRPSGVSNRFSGSMSGNTASLTISGLQAEDEADYYCSSYSSSSALEVFGGGTKLTVL
配列番号186 VLのCDR1(C33B782)
SGNKLGAKFAS
配列番号187 VLのCDR2(C33B782)
QDNKRPS
配列番号188 VL配列(C33B782)
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGNKLGAKFASWYQQKPGQSPVLVIYQDNKRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISGTQAVDEADYYCQAWDSSTVVFGGGTKLTVL
配列番号189 VLのCDR1(C33B806)
RASQGISSWLA
配列番号190 VLのCDR2(C33B806)
AASSLQS
配列番号191 VLのCDR3(C33B806)
QQANSFPFT
配列番号192 VL配列(C33B806)
DIQMTQSPSSVSASVGDRVTITCRASQGISSWLAWYQQKPGKAPKLLIYAASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQANSFPFTFGPGTKVDIK
配列番号193 VLのCDR1(C33B904)
KSSQTVFYSSNNKNYLA
配列番号194 VLのCDR2(C33B904)
WASTRKS
配列番号195 VLのCDR3(C33B904)
QHYYSTPYT
配列番号196 VL配列(C33B904)
DIVMTQSPDSLAVSLGERATINCKSSQTVFYSSNNKNYLAWYQQKPGQPPKLLISWASTRKSGVPDRFSGSGSGTDFTLTVSSLQAEDVAVYYCQHYYSTPYTFGQGTKLEIK
配列番号197 VLのCDR1(C33B937)
SGDKLGDKYAS
配列番号198 VLのCDR2(C33B937)
QDGKRPS
配列番号199 VLのCDR3(C33B937)
QAWDRNTVV
配列番号200 VL配列(C33B937)
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGDKLGDKYASWYQQKPGQSPVLVIYQDGKRPSGIPERFSGSNFGNKATLTISGTQAMDEADYYCQAWDRNTVVFGGGTKLTVL
配列番号201 VLのCDR1(C33B125)
SGDKLGDKYVC
配列番号202 VL配列(C33B125)
SYELTQPPSVSVSPGQTASITCSGDKLGDKYVCWYQQKPGQSPVVVIHQDRKRPSGIPERFSGSNFGNTATLTISGTQAMDEADYYCQAWDSSTVVFGGGTKLTVL
配列番号203 scFv(C33B836)
Figure 2023517660000068

配列番号204 scFv(C33B782)
Figure 2023517660000069

配列番号205 scFv(C33B806)
Figure 2023517660000070

配列番号206 scFv(C33B904)
Figure 2023517660000071

配列番号207 scFv(C33B933)
Figure 2023517660000072

配列番号208 scFv(C33B937)
Figure 2023517660000073

配列番号209 scFv(C33B919)
Figure 2023517660000074

配列番号210 scFv(C33B125)
Figure 2023517660000075

配列番号211 scFv(C33B931)
Figure 2023517660000076

配列番号212 scFv(C33B1474)
Figure 2023517660000077

配列番号213 scFv(C33B1522)
Figure 2023517660000078

配列番号214 scFv(C33B1607)
Figure 2023517660000079

配列番号215 scFv(C33B1601)
Figure 2023517660000080

配列番号216 scFv(C33B1517)
Figure 2023517660000081

配列番号217 scFv(C33B1495)
Figure 2023517660000082

配列番号218 scFv(C33B1478)
Figure 2023517660000083

配列番号219 scFv(C33B1477)
Figure 2023517660000084

配列番号220 scFv(C33B1476)
Figure 2023517660000085

配列番号221 scFv(C33B1484)
Figure 2023517660000086

配列番号222 野生型IgG1
Figure 2023517660000087

配列番号223 野生型IgG2
Figure 2023517660000088

配列番号224 野生型IgG4
Figure 2023517660000089

配列番号225 CD33抗原:HSA N末端融合;CynoCD33ECD-HSA(C34S)-6xHis
Figure 2023517660000090

配列番号226 CD33抗原:HSA N末端融合;ヒトCD33ECD-Tev-HSA(C34S)-6xHis
Figure 2023517660000091

配列番号227 CD33抗原:HSA N末端融合;C-末端でHSA及び6xHisタグに融合されるhCD33Ig様V型ドメイン(Uniprot P20138、V136-H259)
Figure 2023517660000092

配列番号228 CD33抗原:HSA N末端融合;C-末端でHSA及び6xHisタグに融合されるhCD33Ig様C2型ドメイン(Uniprot P20138、V136-H259)
Figure 2023517660000093

配列番号229 CD33抗原:hCD33_Ig様V型ドメイン
Figure 2023517660000094

配列番号230 CD33抗原:hCD33 Ig様C2型ドメイン
Figure 2023517660000095

配列番号231 CD33抗原:MuIgV_Hu IgC2キメラCD33-6xHis_v1
Figure 2023517660000096

配列番号232 CD33抗原:MuIgV_cyno IgC2キメラCD33-6xHis_v1
Figure 2023517660000097

配列番号233 CD33抗原:C末端6xHisタグ付きのUniprot P20138からのヒトCD33 ECD(D18-H259)
Figure 2023517660000098

配列番号234 CD33抗原:C末端6xHisタグ付きのXP_005590138.1からのCyno CD33 ECD(D37-Q274)
Figure 2023517660000099

配列番号235 CD33抗原:6xHisタグ付きのUniprot P20138からのヒトCD33 ECD(D18-G241)
Figure 2023517660000100

配列番号236 抗TRGV9 mAb LP7A5_1、LP7A5_2、LP7A5_3、LP7A5_4のHCDR1配列
DHYIN
配列番号237 抗TRGV9mAb LP7A5_1、LP7A5_2、LP7A5_3、LP7A5_4のHCDR2配列
QIYPGDGNTYYNQKFKG
配列番号238 抗TRGV9mAb LP7A5_1のHCDR3配列
NYGDYTIDF
配列番号239 抗TRGV9mAb LP7A5_1、LP7A5_2、LP7A5_3、LP7A5_4のLCDR1配列
KSSQSLLYSSNQKNYLA
配列番号240 抗TRGV9mAb LP7A5_1、LP7A5_2、LP7A5_3、LP7A5_4のLCDR2配列
WASTRES
配列番号241 抗TRGV9 mAb LP7A5_1、LP7A5_2、LP7A5_3、LP7A5_4のLCDR3配列
QQYYRYHT
配列番号242 抗TRGV9mAb LP7A5_2のHCDR3配列
NMGMYTIDF
配列番号243 抗TRGV9 mAb LP7A5_3のHCDR3配列
NMGMYTLDF
配列番号244 抗TRGV9mAb LP7A5_4のHCDR3配列
NYGDYTLDF
配列番号245 LP7A5_1の重鎖配列
EVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGFTFTDHYINWVKQRTGQGLEWIGQIYPGDGNTYYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYFCAPNYGDYTIDFWGQGTSVTVSS
配列番号246 LP7A5_2の重鎖配列
EVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGFTFTDHYINWVKQRTGQGLEWIGQIYPGDGNTYYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYFCAPNMGMYTIDFWGQGTSVTVSS
配列番号247 LP7A5_3の重鎖配列
EVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGFTFTDHYINWVKQRTGQGLEWIGQIYPGDGNTYYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYFCAPNMGMYTLDFWGQGTSVTVSS
配列番号248 LP7A5_4の重鎖配列
EVQLQQSGAELARPGASVKLSCKASGFTFTDHYINWVKQRTGQGLEWIGQIYPGDGNTYYNQKFKGKATLTADKSSSTAYMQLSSLTSEDSAVYFCAPNMGMYTLDFWGQGTSVTVSS
配列番号249 LP7A5_1の軽鎖配列
DIVMSQSPSSLAVSVGEKVTMSCKSSQSLLYSSNQKNYLAWYQQKPGQSPKLLIYWASTRESGVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVKAEDLAVYYCQQYYRYHTFGTGTKLEIK
配列番号250 抗TRGV9ホールアーム配列
Figure 2023517660000101

配列番号251 抗CD33ノブアーム配列
Figure 2023517660000102

配列番号252 抗RSVノブアーム配列
Figure 2023517660000103

配列番号253 VHのCDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000104

配列番号254 VHのCDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000105

配列番号255 VHのCDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000106

配列番号256 VHのCDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000107

配列番号257 VHのCDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000108

配列番号258 VHのCDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000109

配列番号259 VHのCDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000110

配列番号260 VHのCDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000111

配列番号261 VHのCDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000112

配列番号262 VH配列(C33B1475)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号263 VH配列(C33B1516)
Figure 2023517660000113

配列番号264 VH配列(C33B1481)
Figure 2023517660000114

配列番号265 VLのCDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000115

配列番号266 VLのCDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000116

配列番号267 VLのCDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000117

配列番号268 VLのCDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000118

配列番号269 VLのCDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000119

配列番号270 VLのCDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000120

配列番号271 VL配列(C33B1475)
DIVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLLHSDGYNYLDWYLQKSGQSPQLLIYLGSYRASGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGIYYCMQVLQTPWTFGQGTKVEIK
配列番号272 VL配列(C33B1516)
Figure 2023517660000121

配列番号273 VL配列(C33B1481)
Figure 2023517660000122

配列番号274 scFv(C33B1475)
Figure 2023517660000123

配列番号275 scFv(C33B1516)
Figure 2023517660000124

配列番号276 scFv(C33B1481)
Figure 2023517660000125

配列番号277 huIgG1_G1m(17)-ヒンジ-FC_C220S|IgG1|(C33B1475;C33B1516;C33B1481;C33B1477;C33B1517;C33B1522)
Figure 2023517660000126

配列番号278:huIgG1_G1m(17)
Figure 2023517660000127

配列番号279 Fab HC(C33B1475)
Figure 2023517660000128

配列番号280 Fab HC(C33B1516)
Figure 2023517660000129

配列番号281 Fab HC(C33B1481)
Figure 2023517660000130

配列番号282 Fab HC(C33B1477)
Figure 2023517660000131

配列番号283 Fab HC(C33B1517)
Figure 2023517660000132

配列番号284 Fab HC(C33B1522)
Figure 2023517660000133

配列番号285 Fab LC(C33B1475)
Figure 2023517660000134

配列番号286 Fab LC(C33B1516)
Figure 2023517660000135

配列番号287 Fab LC(C33B1481)
Figure 2023517660000136

配列番号288 Fab LC(C33B1477)
Figure 2023517660000137

配列番号289 Fab LC(C33B1517)
Figure 2023517660000138

配列番号290 Fab LC(C33B1522)
Figure 2023517660000139

配列番号291(C33B1475VH1-2)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQGGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号292(C33B1475VH1-3)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQAGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号293(C33B1475VH1-5)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQYGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号294(C33B1475VH1-12)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQPGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号295(C33B1475VH1-14)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQNGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号296(C33B1475VH1-22)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQSGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号297(C33B1475VH1-27)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQRGSERYYVDS
VKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号298(C33B1475VH1-32)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQLGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号299(C33B1475VH1-36)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQVGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号300(C33B1475VH1-46)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQTGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号301(C33B1475VH1-63)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQFGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号302(C33B1475VH1-89)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQWGSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号303(C33B1475VH2-12)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDVSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号304(C33B1475VH2-16)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDPSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号305(C33B1475VH2-20)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDRSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号306(C33B1475VH2-22)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDASERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号307(C33B1475VH2-24)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDLSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号308(C33B1475VH2-35)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDQSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号309(C33B1475VH2-58)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDTSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号310(C33B1475VH2-86)
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCVVSGFTFSSYWMTWVRQAPGKGLEWVANIKQDHSERYYVDSVKGRFTISRDSAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREVGYNWNQGGYFDYWGQGTLVTVSS
配列番号311(C33B1516 VL1-1)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLVGPVFGTGTKVTVL
配列番号312(C33B1516 VL1-2)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLRGPVFGTGTKVTVL
配列番号313(C33B1516 VL1-4)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLPGPVFGTGTKVTVL
配列番号314(C33B1516 VL1-10)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLTGPVFGTGTKVTVL
配列番号315(C33B1516 VL1-11)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLGGPVFGTGTKVTVL
配列番号316(C33B1516 VL1-14)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLQGPVFGTGTKVTVL
配列番号317(C33B1516 VL1-16)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLSGPVFGTGTKVTVL
配列番号328(C33B1516 VL1-20)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLAGPVFGTGTKVTVL
配列番号319(C33B1516 VL1-22)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLLGPVFGTGTKVTVL
配列番号320(C33B1516 VL1-23)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLYGPVFGTGTKVTVL
配列番号321(C33B1516 VL1-30)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLEGPVFGTGTKVTVL
配列番号322(C33B1516VL1-39)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLFGPVFGTGTKVTVL
配列番号323(C33B1516VL1-41)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLDGPVFGTGTKVTVL
配列番号324(C33B1516VL1-63)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLIGPVFGTGTKVTVL
配列番号325(C33B1516VL1-90)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLHGPVFGTGTKVTVL
配列番号326(C33B1516 VL2-3)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNVPVFGTGTKVTVL
配列番号327(C33B1516 VL2-4)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNPPVFGTGTKVTVL
配列番号328(C33B1516 VL2-7)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNRPVFGTGTKVTVL
配列番号329(C33B1516 VL2-8)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNDPVFGTGTKVTVL
配列番号330(C33B1516 VL2-10)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNEPVFGTGTKVTVL
配列番号331(C33B1516 VL2-11)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNWPVFGTGTKVTVL
配列番号332(C33B1516 VL2-29)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNYPVFGTGTKVTVL
配列番号333(C33B1516 VL2-35)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNAPVFGTGTKVTVL
配列番号334(C33B1516VL2-37)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNNPVFGTGTKVTVL
配列番号335(C33B1516VL2-38)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNKPVFGTGTKVTVL
配列番号336(C33B1516VL2-90)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLLYSDNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLNLPVFGTGTKVTVL
配列番号337(C33B1516VH1-1)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDVGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号338(C33B1516VH1-3)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDSGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号339(C33B1516VH1-4)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDEGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号340(C33B1516VH1-6)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDHGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号341(C33B1516VH1-7)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDAGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号342(C33B1516VH1-8)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDGGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号343(C33B1516VH1-10)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDKGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号344(C33B1516VH1-13)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDTGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号345(C33B1516VH1-17)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDFGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号346(C33B1516VH1-20)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDVGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号347(C33B1516VH1-21)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDRGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号348(C33B1516VH1-27)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDLGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号349(C33B1516VH1-38)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDHGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号350(C33B1516VH1-56)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDIGAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号351(C33B1516VH2-8)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNSAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号352(C33B1516VH2-9)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGGSIRNYYWSWIRQSAGKELEWFGHIFSTGHINYDSSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNAAALFDFWGQGTLVTVSS
配列番号353(C33B1517VL1-1)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLGGPVFGPGTKVTVL
配列番号354(C33B1517VL1-7)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLDGPVFGPGTKVTVL
配列番号355(C33B1517VL1-8)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLPGPVFGPGTKVTVL
配列番号356(C33B1517VL1-12)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLKGPVFGPGTKVTVL
配列番号357(C33B1517VL1-13)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLEGPVFGPGTKVTVL
配列番号358(C33B1517VL1-16)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLAGPVFGPGTKVTVL
配列番号359(C33B1517VL1-22)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLRGPVFGPGTKVTVL
配列番号360(C33B1517VL1-24)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLQGPVFGPGTKVTVL
配列番号361(C33B1517VL1-27)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLIGPVFGPGTKVTVL
配列番号362(C33B1517VL1-35)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLVGPVFGPGTKVTVL
配列番号363(C33B1517VL1-49)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLHGPVFGPGTKVTVL
配列番号364(C33B1517VL1-66)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLKGPVFGPGTKVTVL
配列番号365(C33B1517VL1-69)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLWGPVFGPGTKVTVL
配列番号366(C33B1517VL1-71)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNIVNWYQQFPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRVSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYYCAAWDDSLSGPVFGPGTKVTVL
配列番号367(C33B1517VH1-1)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDRGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号368(C33B1517VH1-3)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDPGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号369(C33B1517VH1-4)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDGGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号370(C33B1517VH1-6)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDVGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号371(C33B1517VH1-8)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDLGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号372(C33B1517VH1-11)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDDGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号373(C33B1517VH1-17)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDEGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号374(C33B1517VH1-33)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDAGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号375(C33B1517VH1-60)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDQGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号376(C33B1517VH1-71)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDTGAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号377(C33B1517VH2-7)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNSAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号378(C33B1517VH2-30)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNAAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号379(C33B1517VH2-31)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNLAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号380(C33B1517VH2-60)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNPAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号381(C33B1517VH2-68)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNTAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号382(C33B1517VH2-76)
QVQLQESGPGLVKPSETLSLTCSVSGASIRNYYWSWIRQTAGKGLEWLGHIYSTGNIHYNPSLKSRVTMSVDTSNNQFSLKLRSVTAADTAVYYCARDNQAALFDYWGQGTLVTVSS
配列番号383(C33B1522VL1-2)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLSGPVFGGGTKLTVL
配列番号384(C33B1522VL1-3)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLQGPVFGGGTKLTVL
配列番号385(C33B1522VL1-4)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLVGPVFGGGTKLTVL
配列番号386(C33B1522VL1-5)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLGGPVFGGGTKLTVL
配列番号387(C33B1522VL1-7)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLWGPVFGGGTKLTVL
配列番号388(C33B1522VL1-12)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLTGPVFGGGTKLTVL
配列番号389(C33B1522VL1-15)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLIGPVFGGGTKLTVL
配列番号390(C33B1522VL1-27)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLEGPVFGGGTKLTVL
配列番号391(C33B1522VL1-29)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLAGPVFGGGTKLTVL
配列番号392(C33B1522VL1-32)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLRGPVFGGGTKLTVL
配列番号393(C33B1522VL1-47)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLLGPVFGGGTKLTVL
配列番号394(C33B1522VL2-82)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLNVPVFGGGTKLTVL
配列番号395(C33B1522VL2-1)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLNAPVFGGGTKLTVL
配列番号396(C33B1522VL2-2)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLNPPVFGGGTKLTVL
配列番号397(C33B1522VL2-8)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLNLPVFGGGTKLTVL
配列番号398(C33B1522VL2-17)
QSVLTQPPSASGTPGQRVTISCSGSSSNIGSNPVNWYQQLPGTAPKLLIYSNNQRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAISGLQSEDEADYFCAAWDDSLNTPVFGGGTKLTVL
配列番号399 HC AbM CDR1(C33B1522)
GGSISSYYWG
配列番号400 HC AbM CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000140

配列番号401 HC AbM CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000141

配列番号402 HC AbM CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000142

配列番号403 HC AbM CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000143

配列番号404 HC AbM CDR1(C33B1481)
GITFSNYWMS
配列番号405 HC AbM CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000144

配列番号406 HC AbM CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000145

配列番号407 HC AbM CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000146

配列番号408 HC AbM CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000147

配列番号409 HC AbM CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000148

配列番号410 HC AbM CDR2(C33B1481)
SIKRDGSDKY
配列番号411 HC AbM CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000149

配列番号412 HC AbM CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000150

配列番号413 HC AbM CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000151

配列番号414 HC AbM CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000152

配列番号415 HC AbM CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000153

配列番号416 HC AbM CDR3(C33B1481)
GEFDY
配列番号417 LC AbM CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000154

配列番号418 LC AbM CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000155

配列番号419 LC AbM CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000156

配列番号420 LC AbM CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000157

配列番号421 LC AbM CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000158

配列番号422 LC AbM CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000159

配列番号423 LC AbM CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000160

配列番号424 LC AbM CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000161

配列番号425 LC AbM CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000162

配列番号426 LC AbM CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000163

配列番号427 LC AbM CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000164

配列番号428 LC AbM CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000165

配列番号429 LC AbM CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000166

配列番号430 LC AbM CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000167

配列番号431 LC AbM CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000168

配列番号432 LC AbM CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000169

配列番号433 LC AbM CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000170

配列番号434 LC AbM CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000171

配列番号435 HC CHOTHIA CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000172

配列番号436 HC CHOTHIA CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000173

配列番号437 HC CHOTHIA CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000174

配列番号438 HC CHOTHIA CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000175

配列番号439 HC CHOTHIA CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000176

配列番号440 HC CHOTHIA CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000177

配列番号441 HC CHOTHIA CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000178

配列番号442 HC CHOTHIA CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000179

配列番号443 HC CHOTHIA CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000180

配列番号444 HC CHOTHIA CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000181

配列番号445 HC CHOTHIA CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000182

配列番号446 HC CHOTHIA CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000183

配列番号447 HC CHOTHIA CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000184

配列番号448 HC CHOTHIA CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000185

配列番号449 HC CHOTHIA CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000186

配列番号450 HC CHOTHIA CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000187

配列番号451 HC CHOTHIA CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000188

配列番号452 HC CHOTHIA CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000189

配列番号453 LC CHOTHIA CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000190

配列番号454 LC CHOTHIA CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000191

配列番号455 LC CHOTHIA CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000192

配列番号456 LC CHOTHIA CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000193

配列番号457 LC CHOTHIA CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000194

配列番号458 LC CHOTHIA CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000195

配列番号459 LC CHOTHIA CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000196

配列番号460 LC CHOTHIA CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000197

配列番号461 LC CHOTHIA CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000198

配列番号462 LC CHOTHIA CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000199

配列番号463 LC CHOTHIA CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000200

配列番号464 LC CHOTHIA CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000201

配列番号465 LC CHOTHIA CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000202

配列番号466 LC CHOTHIA CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000203

配列番号467 LC CHOTHIA CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000204

配列番号468 LC CHOTHIA CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000205

配列番号469 LC CHOTHIA CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000206

配列番号470 LC CHOTHIA CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000207

配列番号471 HC IMGT CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000208

配列番号472 HC IMGT CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000209

配列番号473 HC IMGT CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000210

配列番号474 HC IMGT CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000211

配列番号475 HC IMGT CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000212

配列番号476 HC IMGT CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000213

配列番号477 HC IMGT CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000214

配列番号478 HC IMGT CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000215

配列番号479 HC IMGT CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000216

配列番号480 HC IMGT CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000217

配列番号481 HC IMGT CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000218

配列番号482 HC IMGT CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000219

配列番号483 HC IMGT CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000220

配列番号484 HCIMGT CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000221

配列番号485 HC IMGT CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000222

配列番号486 HC IMGT CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000223

配列番号487 HC IMGT CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000224

配列番号488 HC IMGT CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000225

配列番号489 LC IMGT CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000226

配列番号490 LC IMGT CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000227

配列番号491 LC IMGT CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000228

配列番号492 LC IMGT CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000229

配列番号493 LC IMGT CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000230

配列番号494 LC IMGT CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000231

配列番号495 LC IMGT CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000232

配列番号496 LC IMGT CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000233

配列番号497 LC IMGT CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000234

配列番号498 LC IMGT CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000235

配列番号499 LC IMGT CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000236

配列番号500 LC IMGT CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000237

配列番号501 LC IMGT CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000238

配列番号502 LC IMGT CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000239

配列番号503 LC IMGT CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000240

配列番号504 LC IMGT CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000241

配列番号505 LC IMGT CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000242

配列番号506 LC IMGT CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000243

配列番号507 HC CONTACT CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000244

配列番号508 HC CONTACT CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000245

配列番号509 HC CONTACT CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000246

配列番号510 HC CONTACT CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000247

配列番号511 HC CONTACT CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000248

配列番号512 HC CONTACT CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000249

配列番号513 HC CONTACT CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000250

配列番号514 HC CONTACT CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000251

配列番号515 HC CONTACT CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000252

配列番号516 HC CONTACT CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000253

配列番号517 HC CONTACT CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000254

配列番号518 HC CONTACT CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000255

配列番号519 HC CONTACT CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000256

配列番号520 HC CONTACT CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000257

配列番号521 HC CONTACT CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000258

配列番号522 HC CONTACT CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000259

配列番号523 HC CONTACT CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000260

配列番号524 HC CONTACT CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000261

配列番号525 LC CONTACT CDR1(C33B1522)
Figure 2023517660000262

配列番号526 LC CONTACT CDR1(C33B1477)
Figure 2023517660000263

配列番号527 LC CONTACT CDR1(C33B1475)
Figure 2023517660000264

配列番号528 LC CONTACT CDR1(C33B1517)
Figure 2023517660000265

配列番号529 LC CONTACT CDR1(C33B1516)
Figure 2023517660000266

配列番号530 LC CONTACT CDR1(C33B1481)
Figure 2023517660000267

配列番号531 LC CONTACT CDR2(C33B1522)
Figure 2023517660000268

配列番号532 LC CONTACT CDR2(C33B1477)
Figure 2023517660000269

配列番号533 LC CONTACT CDR2(C33B1475)
Figure 2023517660000270

配列番号534 LC CONTACT CDR2(C33B1517)
Figure 2023517660000271

配列番号535 LC CONTACT CDR2(C33B1516)
Figure 2023517660000272

配列番号536 LC CONTACT CDR2(C33B1481)
Figure 2023517660000273

配列番号537 LC CONTACT CDR3(C33B1522)
Figure 2023517660000274

配列番号538 LC CONTACT CDR3(C33B1477)
Figure 2023517660000275

配列番号539 LC CONTACT CDR3(C33B1475)
Figure 2023517660000276

配列番号540 LC CONTACT CDR3(C33B1517)
Figure 2023517660000277

配列番号541 LC CONTACT CDR3(C33B1516)
Figure 2023517660000278

配列番号542 LC CONTACT CDR3(C33B1481)
Figure 2023517660000279
参考文献
1.www_lls_org/sites/default/files/file_assets/PS32_AML_Booklet_2019_FINAL.pdf
2.D H Wiseman,B F Greystoke&T C P Somervaille,The variety of leukemic stem cells in myeloid malignancy,,Oncogene volume 33,pages3091-3098(2014)
3.American Cancer Society:Cancer Facts and Figures 2014.Atlanta,Ga:American Cancer Society,2014.Available onlineExit Disclaimer
4.www.uniprot.org/uniprot/P20138
5.Engagement of p75/AIRM1 or CD33 inhibits the proliferation of normal or leukemic myeloid cells,Vitale C.,Romagnani C.,Falco M.,Ponte M.,Vitale M.,Moretta A.,Bacigalupo A.,Moretta L.,Mingari M.C.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.96:15091-15096(1999)
6.hninger A.Et al(2015)Blood Cancer Journal(2014)4,e218
7.Felix S.Lichtenegger,et al.,Recent developments in immunotherapy of acute myeloid leukemia,J Hematol Oncol.2017;10:142
本発明は、本明細書中に記載の具体的な実施形態による範囲において限定されないものとする。実際に、本明細書中に記載のものに加えて本発明の様々な変更形態が前述の説明及び添付の図面から当業者に明らかになるであろう。そのような変更形態は、添付の特許請求の範囲内に含まれることが意図される。全ての値は、近似であり、説明のために提供されることがさらに理解されるであろう。
本出願全体を通して、特許、特許出願、刊行物、製品説明及びプロトコールが引用され、これらの開示は、全ての目的のためにそれらの全体において参照により本明細書中に組み込まれる。

Claims (65)

  1. CD33に結合する単離タンパク質であって、
    a)配列番号53の重鎖可変領域(VH)のHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
    b)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
    c)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
    d)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;
    e)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3;又は
    f)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3
    を含む単離タンパク質。
  2. a)それぞれ配列番号29、37及び46;
    b)それぞれ配列番号32、40及び49;
    c)それぞれ配列番号34、43及び51;
    d)それぞれ配列番号253、256及び259;
    e)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
    f)それぞれ配列番号255、258及び261
    のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む、請求項1に記載の単離タンパク質。
  3. CD33に結合する単離タンパク質であって、
    a)それぞれ配列番号29、37及び46;
    b)それぞれ配列番号32、40及び49;
    c)それぞれ配列番号34、43及び51;
    d)それぞれ配列番号253、256及び259;
    e)それぞれ配列番号254、257及び260;又は
    f)それぞれ配列番号255、258及び261
    のHCDR1、HCDR2及びHCDR3を含む単離タンパク質。
  4. a)配列番号53のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号82のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
    b)配列番号56のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号85のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
    c)配列番号59のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号87のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
    d)配列番号262のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号271のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;
    e)配列番号263のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号272のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3;又は
    f)配列番号264のVHのHCDR1、HCDR2及びHCDR3並びに配列番号273のVLのLCDR1、LCDR2及びLCDR3
    を含む、請求項1又は2に記載の単離タンパク質。
  5. a)それぞれ配列番号29、37、46、63、70及び76;
    b)それぞれ配列番号32、40、49、66、70及び76;
    c)それぞれ配列番号34、43、51、68、74及び80;
    d)それぞれ配列番号253、256、259、265、74及び269;
    e)それぞれ配列番号254、257、260、66、267及び76;又は
    f)それぞれ配列番号255、258、261、266、268及び270
    のHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2及びLCDR3を含む、請求項3又は4に記載の単離タンパク質。
  6. 配列番号53、56、59、262、263、264、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300、301、302、303、304、305、306、307、308、309、310、337、338、339、340、341、342、343、344、345、346、347、348、349、350、351、352、367、368、369、370、371、372、373、374、375、376、377、378、379、380、381、382又は382のVHと、配列番号82、85、87、271、272、273、311、312、313、314、315、316、317、318、319、320、321、322、323、324、325、326、327、328、329、330、331、332、333、334、335、336、353、354、355、356、357、358、359、360、361、362、363、364、365、366、383、384、385、386、387、388、389、390、391、392、393、394、395、396、397又は398のVLとを含む、請求項1~5の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  7. a)配列番号53のVH及び配列番号82のVL;
    b)配列番号56のVH及び配列番号85のVL;
    c)配列番号59のVH及び配列番号87のVL;
    d)配列番号262のVH及び配列番号271のVL;
    e)配列番号263のVH及び配列番号272のVL;
    f)配列番号264のVH及び配列番号273のVL;
    g)配列番号291のVH及び配列番号271のVL;
    h)配列番号292のVH及び配列番号271のVL;
    i)配列番号293のVH及び配列番号271のVL;
    j)配列番号294のVH及び配列番号271のVL;
    k)配列番号295のVH及び配列番号271のVL;
    l)配列番号296のVH及び配列番号271のVL;
    m)配列番号297のVH及び配列番号271のVL;
    n)配列番号298のVH及び配列番号271のVL;
    o)配列番号299のVH及び配列番号271のVL;
    p)配列番号300のVH及び配列番号271のVL;
    q)配列番号301のVH及び配列番号271のVL;
    r)配列番号302のVH及び配列番号271のVL;
    s)配列番号303のVH及び配列番号271のVL;
    t)配列番号304のVH及び配列番号271のVL;
    u)配列番号305のVH及び配列番号271のVL;
    v)配列番号306のVH及び配列番号271のVL;
    w)配列番号307のVH及び配列番号271のVL;
    x)配列番号308のVH及び配列番号271のVL;
    y)配列番号309のVH及び配列番号271のVL;
    z)配列番号310のVH及び配列番号271のVL;
    aa)配列番号263のVH及び配列番号311のVL;
    ab)配列番号263のVH及び配列番号312のVL;
    ac)配列番号263のVH及び配列番号313のVL;
    ad)配列番号263のVH及び配列番号314のVL;
    ae)配列番号263のVH及び配列番号315のVL;
    af)配列番号263のVH及び配列番号316のVL;
    ag)配列番号263のVH及び配列番号317のVL;
    ah)配列番号263のVH及び配列番号318のVL;
    ai)配列番号263のVH及び配列番号319のVL;
    aj)配列番号263のVH及び配列番号320のVL;
    ak)配列番号263のVH及び配列番号321のVL;
    al)配列番号263のVH及び配列番号322のVL;
    am)配列番号263のVH及び配列番号323のVL;
    an)配列番号263のVH及び配列番号324のVL;
    ao)配列番号263のVH及び配列番号325のVL;
    ap)配列番号263のVH及び配列番号326のVL;
    aq)配列番号263のVH及び配列番号327のVL;
    ar)配列番号263のVH及び配列番号328のVL;
    as)配列番号263のVH及び配列番号329のVL;
    at)配列番号263のVH及び配列番号330のVL;
    au)配列番号263のVH及び配列番号331のVL;
    av)配列番号263のVH及び配列番号332のVL;
    aw)配列番号263のVH及び配列番号333のVL;
    ax)配列番号263のVH及び配列番号334のVL;
    ay)配列番号263のVH及び配列番号335のVL;
    az)配列番号263のVH及び配列番号336のVL;
    ba)配列番号337のVH及び配列番号272のVL;
    bb)配列番号338のVH及び配列番号272のVL;
    bc)配列番号339のVH及び配列番号272のVL;
    bd)配列番号340のVH及び配列番号272のVL;
    be)配列番号341のVH及び配列番号272のVL;
    bf)配列番号342のVH及び配列番号272のVL;
    bg)配列番号343のVH及び配列番号272のVL;
    bh)配列番号344のVH及び配列番号272のVL;
    bi)配列番号345のVH及び配列番号272のVL;
    bj)配列番号346のVH及び配列番号272のVL;
    bk)配列番号347のVH及び配列番号272のVL;
    bl)配列番号348のVH及び配列番号272のVL;
    bm)配列番号349のVH及び配列番号272のVL;
    bn)配列番号350のVH及び配列番号272のVL;
    bo)配列番号351のVH及び配列番号272のVL;
    bp)配列番号352のVH及び配列番号272のVL;
    bq)配列番号56のVH及び配列番号353のVL;
    br)配列番号56のVH及び配列番号354のVL;
    bs)配列番号56のVH及び配列番号355のVL;
    bt)配列番号56のVH及び配列番号356のVL;
    bu)配列番号56のVH及び配列番号357のVL;
    bv)配列番号56のVH及び配列番号358のVL;
    bw)配列番号56のVH及び配列番号359のVL;
    bx)配列番号56のVH及び配列番号360のVL;
    by)配列番号56のVH及び配列番号361のVL;
    bz)配列番号56のVH及び配列番号362のVL;
    ca)配列番号56のVH及び配列番号363のVL;
    cb)配列番号56のVH及び配列番号364のVL;
    cc)配列番号56のVH及び配列番号365のVL;
    cd)配列番号56のVH及び配列番号366のVL;
    ce)配列番号367のVH及び配列番号85のVL;
    cf)配列番号368のVH及び配列番号85のVL;
    cg)配列番号369のVH及び配列番号85のVL;
    ch)配列番号370のVH及び配列番号85のVL;
    ci)配列番号371のVH及び配列番号85のVL;
    cj)配列番号372のVH及び配列番号85のVL;
    ck)配列番号373のVH及び配列番号85のVL;
    cl)配列番号374のVH及び配列番号85のVL;
    cm)配列番号375のVH及び配列番号85のVL;
    cn)配列番号376のVH及び配列番号85のVL;
    co)配列番号377のVH及び配列番号85のVL;
    cp)配列番号378のVH及び配列番号85のVL;
    cq)配列番号379のVH及び配列番号85のVL;
    cr)配列番号380のVH及び配列番号85のVL;
    cs)配列番号381のVH及び配列番号85のVL;
    ct)配列番号382のVH及び配列番号85のVL;
    cu)配列番号53のVH及び配列番号383のVL;
    cv)配列番号53のVH及び配列番号384のVL;
    cw)配列番号53のVH及び配列番号385のVL;
    cx)配列番号53のVH及び配列番号386のVL;
    cy)配列番号53のVH及び配列番号387のVL;
    cz)配列番号53のVH及び配列番号388のVL;
    da)配列番号53のVH及び配列番号389のVL;
    db)配列番号53のVH及び配列番号390のVL;
    dc)配列番号53のVH及び配列番号391のVL;
    dd)配列番号53のVH及び配列番号392のVL;
    de)配列番号53のVH及び配列番号393のVL;
    df)配列番号53のVH及び配列番号394のVL;
    dg)配列番号53のVH及び配列番号395のVL;
    dh)配列番号53のVH及び配列番号396のVL;
    di)配列番号53のVH及び配列番号397のVL;又は
    dj)配列番号53のVH及び配列番号398のVL
    を含む、請求項6に記載の単離タンパク質。
  8. Fab、scFv、(scFv)、Fv、F(ab’)、Fd、dAb又はVHHである、請求項1~7の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  9. 前記scFvは、N末端からC末端に、VH、第1のリンカー(L1)及びVL(VH-L1-VL)又は前記VL、前記L1及び前記VH(VL-L1-VH)を含む、請求項8に記載の単離タンパク質。
  10. 前記L1は、
    a)配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列;
    b)約5~50アミノ酸;約5~40アミノ酸;約10~30アミノ酸;又は約10~20アミノ酸
    を含む、請求項9に記載の単離タンパク質。
  11. 配列番号213、216、219、274、275又は276のアミノ酸配列を含むscFvである、請求項10に記載の単離タンパク質。
  12. 免疫グロブリン(Ig);前記Igの断片;Ig定常領域;前記Ig定常領域の断片;Fc領域;Fc領域を含む前記Ig定常領域の断片;CH2ドメインを含む前記Ig定常領域の断片;CH3ドメインを含む前記Ig定常領域の断片;CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む前記Ig定常領域の断片;ヒンジの少なくとも一部、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む前記Ig定常領域の断片;ヒンジ、CH2ドメイン及びCH3ドメインを含む前記Ig定常領域の断片;トランスフェリン;アルブミン;アルブミン結合ドメイン;又はポリエチレングリコールから選択される半減期延長又は調整部分に複合化される、請求項1~11の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  13. CD33に結合する抗原結合ドメインを含み、
    a)前記抗原結合ドメインは、前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片のN末端に複合化されるか;
    b)前記抗原結合ドメインは、前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片のC末端に複合化されるか;又は
    c)前記抗原結合ドメインは、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む第2のリンカー(L2)を介して前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片に複合化される、請求項12に記載の単離タンパク質。
  14. 単一特異性タンパク質、多特異性タンパク質、二特異性タンパク質又は三特異性タンパク質である、請求項1~13の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  15. 前記多特異性タンパク質、前記二特異性タンパク質又は前記三特異性タンパク質は、それぞれ独立に、リンパ球、T細胞、CD8T細胞又はナチュラルキラー(NK)細胞上の抗原に結合する抗原結合ドメインを含む、請求項14に記載の単離タンパク質。
  16. 前記多特異性タンパク質、前記二特異性タンパク質又は前記三特異性タンパク質は、それぞれ独立に、TRGV9、CD3イプシロン(CD3ε)、CD3、CD8、KI2L4、NKG2E、NKG2D、NKG2F、BTNL3、CD186、BTNL8、PD-1、CD195又はNKG2Cに結合する抗原結合ドメインを含む、請求項15に記載の単離タンパク質。
  17. CD33に結合する第1の抗原結合ドメイン及び/又はリンパ球抗原に結合する第2の抗原結合ドメインは、Fab、scFv、VHH、(scFv)2、Fv、F(ab’)2、Fd又はdAbを含むか;又はCD33に結合する前記第1の抗原結合ドメインは、前記scFvを含み、及びリンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインは、前記VHHを含む、請求項15又は16に記載の単離タンパク質。
  18. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片は、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4アイソタイプであり、任意選択的に、前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片は、IgG1である、請求項12~17の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  19. 前記Ig定常領域の前記断片は、配列番号277又は278の配列を有する、請求項18に記載の単離タンパク質。
  20. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片は、Fcγ受容体(FcγR)への前記タンパク質の減少した結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含み;前記FcγRへの前記タンパク質の減少した結合をもたらす前記少なくとも1つの突然変異は、F234A/L235A、L234A/L235A、L234A/L235A/D265S、V234A/G237A/P238S/H268A/V309L/A330S/P331S、F234A/L235A、S228P/F234A/L235A、N297A、V234A/G237A、K214T/E233P/L234V/L235A/G236欠失/A327G/P331A/D365E/L358M、H268Q/V309L/A330S/P331S、S267E/L328F、L234F/L235E/D265A、L234A/L235A/G237A/P238S/H268A/A330S/P331S、S228P/F234A/L235A/G237A/P238S及びS228P/F234A/L235A/G236欠失/G237A/P238Sからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項12~19の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  21. 前記Ig定常領域又は前記Ig定常領域の前記断片は、FcγRへの前記タンパク質の増強された結合をもたらす少なくとも1つの突然変異を含み;前記FcγRへの前記タンパク質の増強された結合をもたらす前記少なくとも1つの突然変異は、S239D/I332E、S298A/E333A/K334A、F243L/R292P/Y300L、F243L/R292P/Y300L/P396L、F243L/R292P/Y300L/V305I/P396L及びG236A/S239D/I332Eからなる群から選択され、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項12~19の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  22. 前記FcγRは、FcγRI、FcγRIIA、FcγRIIB若しくはFcγRIII又はそれらの任意の組み合わせである、請求項20又は21に記載の単離タンパク質。
  23. 前記Ig定常領域の前記断片の前記Ig定常領域は、H435A、P257I/N434H、D376V/N434H、M252Y/S254T/T256E/H433K/N434F、T308P/N434A及びH435Rからなる群から選択される、前記タンパク質の半減期を調整する少なくとも1つの突然変異を含み、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項12~22の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  24. T350V、L351Y、F405A、Y407V、T366Y、T366W、F405W、T394W、T394S、Y407T、Y407A、T366S/L368A/Y407V、L351Y/F405A/Y407V、T366I/K392M/T394W、F405A/Y407V、T366L/K392M/T394W、L351Y/Y407A、T366A/K409F、L351Y/Y407A、T366V/K409F、T366A/K409F、T350V/L351Y/F405A/Y407V及びT350V/T366L/K392L/T394Wからなる群から選択される、前記Ig定常領域のCH3ドメインにおける少なくとも1つの突然変異を含み、残基の付番は、EUインデックスに従う、請求項12~23の何れか一項に記載の単離タンパク質。
  25. CD33に結合する前記第1の抗原結合ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は前記第1のIg定常領域の断片に複合化され、及び/又はリンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインは、第2の免疫グロブリン(Ig)定常領域又は前記第2のIg定常領域の断片に複合化される、それぞれ独立に請求項14~24の何れか一項に記載の単離された多特異性タンパク質、二特異性タンパク質又は三特異性タンパク質。
  26. CD33に結合する前記第1の抗原結合ドメインと、前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片との間及びリンパ球抗原に結合する前記第2の抗原結合ドメインと、前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片との間に第2のリンカー(L2)をさらに含む、それぞれ独立に請求項25に記載の単離された多特異性タンパク質、二特異性タンパク質又は三特異性タンパク質。
  27. 前記L2は、配列番号108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139又は140の何れか1つのアミノ酸配列を含む、それぞれ独立に請求項26に記載の単離された多特異性タンパク質、二特異性タンパク質又は三特異性タンパク質。
  28. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片は、IgG1、IgG2及びIgG3又はIgG4アイソタイプである、請求項25~27の何れか一項に記載の単離された二特異性タンパク質。
  29. 前記第1のIg定常領域又は前記第1のIg定常領域の前記断片及び前記第2のIg定常領域又は前記第2のIg定常領域の前記断片は、以下の突然変異:
    前記第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V及び前記第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W;又は
    前記第1のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_T366L_K392L_T394W及び前記第2のIg定常領域におけるL235A_L235A_D265S_T350V_L351Y_F405A_Y407V
    を含む、請求項25~28の何れか一項に記載の単離された二特異性タンパク質。
  30. キメラ抗原受容体(CAR)であって、
    a)請求項1~11の何れか一項に記載のCD33に結合する抗原結合ドメインを含む細胞外ドメイン;
    b)膜貫通ドメイン;及び
    c)任意選択的に少なくとも1つの同時刺激ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン
    を含むキメラ抗原受容体(CAR)。
  31. CD8a-ヒンジ領域をさらに含む、請求項30に記載のCAR。
  32. a)前記膜貫通ドメインは、CD8a膜貫通領域(CD8a-TM)ポリペプチドを含み;及び
    b)前記細胞内シグナル伝達ドメインは、TNF受容体スーパーファミリーメンバー9(CD137)構成成分、T細胞表面糖タンパク質CD3ゼータ鎖(CD3z)構成成分、表面抗原分類(CD27)構成成分、表面抗原分類スーパーファミリーメンバー構成成分及びそれらの組み合わせを含む同時刺激ドメインを含む、請求項30又は31に記載のCAR。
  33. a)前記CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;
    b)前記膜貫通ドメインは、配列番号162のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含み;及び/又は
    c)前記細胞内シグナル伝達ドメインは、配列番号163のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むCD137構成成分;配列番号164のアミノ酸配列と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列を含むCD3z構成成分;又は配列番号165のアミノ酸配列を有する同時刺激ドメインを含む、請求項30~32の何れか一項に記載のCAR。
  34. CD33に結合する前記抗原結合ドメインを含む前記細胞外ドメインは、シグナルポリペプチドをさらに含む、請求項30~33の何れか一項に記載のCAR。
  35. 前記シグナルポリペプチドは、配列番号166のアミノ酸配列を含む、請求項34に記載のCAR。
  36. 前記CD8a-TMポリペプチドは、配列番号162のアミノ酸配列を含む、請求項30~35の何れか一項に記載のCAR。
  37. 前記CD8a-ヒンジ領域は、配列番号157のアミノ酸配列を含む、請求項30~36の何れか一項に記載のCAR。
  38. 請求項30~37の何れか一項に記載のCARを発現する、単離されたリンパ球。
  39. Tリンパ球又はナチュラルキラー(NK)細胞である、請求項38に記載の単離されたリンパ球。
  40. 治療剤、造影剤又は放射活性剤に複合化される、請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項30~37の何れか一項に記載のCARを含む免疫複合体。
  41. 前記放射活性剤は、225Ac、111In、89Zr、32P、47Sc、67Cu、77As、89Sr、90Y、99Tc、105Rh、109Pd、111Ag、131I、153Sm、159Gd、165Dy、166Ho、169Er、177Lu、186Re、188Re、194Ir、198Au、199Au、211At、212Pb、212Bi、213Bi、223Ra、255Fm、227Th、62Cu、64Cu、67Ga、68Ga又は86Yから選択される放射性金属イオンを含む、請求項40に記載の免疫複合体。
  42. 前記放射性金属イオンは、キレート部分に複合化され、
    (a)前記キレート部分は、式(I):
    Figure 2023517660000280

    (式中、R、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
    Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
    Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキルであり;及び
    Zは、(CH2)Yであり、
    nは、1~10であり、及び
    Yは、第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分又は求核部分であり;
    代わりに、Zは、水素であり;及び
    、R、R及びRのそれぞれは、独立に、CHQCOXであり、
    Qは、独立に、水素、C~Cアルキル又は(C~Cアルキル)フェニルであり、及び
    Xは、独立に、水素、ベンジル、C~Cアルキル又は第2のクリック反応パートナーに共有結合される求電子部分若しくは求核部分である)
    の構造を有する大環状分子を含み;
    代わりに、前記キレート剤は、開鎖リガンドを含むか;又は
    (b)前記キレート部分は、式(II):
    Figure 2023517660000281

    の構造又は式(III):
    Figure 2023517660000282

    の構造を有する大環状分子を含む、請求項41に記載の免疫複合体。
  43. 式(IV)
    Figure 2023517660000283

    (式中、前記タンパク質は、請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項30~37の何れか一項に記載のCARである)
    の免疫複合体。
  44. 式(V)
    Figure 2023517660000284

    (式中、前記タンパク質は、請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項30~37の何れか一項に記載のCARである)
    の免疫複合体。
  45. 請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質、請求項30~37の何れか一項に記載のCAR、請求項38若しくは39に記載の単離されたリンパ球又は請求項40~44の何れか一項に記載の免疫複合体と、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物。
  46. 請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質、請求項30~37の何れか一項に記載のCAR又は請求項40~44の何れか一項に記載の免疫複合体をコードするポリヌクレオチド。
  47. 請求項46に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  48. 請求項47に記載のベクター又は請求項46に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
  49. 請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質を作製する方法であって、前記タンパク質が発現される条件において、請求項48に記載の宿主細胞を培養することと、前記宿主細胞によって産生される前記タンパク質を回収することとを含む方法。
  50. 請求項40~44の何れか一項に記載の免疫複合体を作製する方法であって、前記タンパク質が発現される条件において、請求項48に記載の宿主細胞を培養することと、前記宿主細胞によって産生される前記タンパク質を回収することと、前記宿主細胞によって産生される前記タンパク質を前記薬剤と複合化することとを含む方法。
  51. 請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質に結合する抗イディオタイプ抗体。
  52. 請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項30~37の何れか一項に記載のCARを含むキット。
  53. 対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、前記CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、前記対象に、治療的有効量の、請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項40~44の何れか一項に記載の免疫複合体を投与することを含む方法。
  54. CD33発現癌を有する対象を処置する方法であって、それを必要とする対象に、治療的有効量の、請求項38又は39に記載のリンパ球を投与することを含み、それにより、前記リンパ球は、前記対象において前記CD33発現癌の死滅に介在する、方法。
  55. 前記CD33発現癌は、血液癌である、請求項53又は54に記載の方法。
  56. 前記血液癌は、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、請求項55に記載の方法。
  57. 前記単離タンパク質又は前記免疫複合体は、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項53~56の何れか一項に記載の方法。
  58. 前記第2の治療剤は、手術、化学療法、アンドロゲン欠乏療法若しくは放射線又はそれらの任意の組み合わせである、請求項57に記載の方法。
  59. 対象においてCD33発現癌を処置する方法であって、前記CD33発現癌を処置するために十分な時間にわたり、前記対象に治療的有効量の前記を投与することを含む方法での使用のための、請求項1~29の何れか一項に記載の単離タンパク質又は請求項40~44の何れか一項に記載の免疫複合体。
  60. CD33発現癌を有する対象を処置する方法であって、それを必要とする対象に、治療的有効量の、請求項38又は39に記載のリンパ球を投与することを含み、それにより、前記リンパ球は、前記対象において前記CD33発現癌の死滅に介在する、方法での使用のための、請求項38又は39に記載のリンパ球。
  61. 前記CD33発現癌は、血液癌である、請求項59又は60に記載の使用のための単離タンパク質、免疫複合体又はリンパ球。
  62. 前記血液癌は、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ球性白血病(ALL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、慢性骨髄性白血病(CML)又は芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(DPDCN)である、請求項61に記載の使用のための単離タンパク質、免疫複合体又はリンパ球。
  63. 前記単離タンパク質又は前記免疫複合体は、第2の治療剤と組み合わせて投与される、請求項59~62の何れか一項に記載の使用のための単離タンパク質、免疫複合体又はリンパ球。
  64. 前記第2の治療剤は、手術、化学療法、アンドロゲン欠乏療法若しくは放射線又はそれらの任意の組み合わせである、請求項63に記載の使用のための単離タンパク質、免疫複合体又はリンパ球。
  65. 対象において癌の存在を検出する方法であって、
    a)前記対象から得られた細胞試料を、請求項30~37の何れか一項に記載のCARと接触させ、それによりCAR-細胞複合体を形成することと、
    b)前記CAR-細胞複合体を検出することであって、前記CAR-細胞複合体の検出は、前記対象における前記癌の存在を示す、検出することと
    を含む方法。
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