JP2023514566A - 卵巣癌におけるネオ抗原の発現及びその使用 - Google Patents

卵巣癌におけるネオ抗原の発現及びその使用 Download PDF

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Abstract

本開示は、卵巣癌ネオ抗原、それをコードしているポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、組換えウイルス粒子、当該ネオ抗原を含むワクチン、当該卵巣癌ネオ抗原に結合するタンパク質性分子、並びにこれらを作製及び使用する方法に関する。

Description

（関連出願の相互参照）
本出願は、参照によりその全体が組み込まれる、「ＮＥＯＡＮＴＩＧＥＮＳ ＥＸＰＲＥＳＳＥＤ ＩＮ ＯＶＡＲＩＡＮ ＣＡＮＣＥＲ ＡＮＤ ＴＨＥＩＲ ＵＳＥＳ」と題された２０２０年２月１４日に出願の米国仮特許出願第６２／９７６，３８４号に対して優先権を主張する。
（配列表）
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に提出済みである、その全体が参照により本明細書に組み込まれる配列表を含む。上記ＡＳＣＩＩコピーは、２０２１年１月２２日に作成され、名称はＪＢＩ６２３８ＷＯＰＣＴ１＿ＳＬ．ｔｘｔであり、サイズは１６５，７３９バイトである。
（発明の分野）
本開示は、卵巣癌ネオ抗原、それをコードしているポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、当該ネオ抗原を含むワクチン、当該卵巣癌ネオ抗原に結合するタンパク質性分子、並びにこれらを作製及び使用する方法に関する。
卵巣癌は、女性の癌関連死の５番目に多い原因である。女性が生涯で卵巣癌になるリスクは、約７８人に１人である。アメリカ癌協会（American Cancer Society）は、２０２０年、米国では約２１，７５０人の卵巣癌の新規患者が発生し、１３，９４０人が卵巣癌で死亡すると予測している。
卵巣癌は、卵巣の内側、近く、又は外側の層で異常な細胞が制御されずに成長することによって発生する。癌性成長を除去する手術は、卵巣癌の最も一般的な治療である。外科的処置としては、腹式子宮全摘出術、両側付属器切除術、大網切除術、全腹膜面の可視化、及びランダムな腹膜生検と腹膜洗浄が挙げられ得る。手術後、アジュバント化学療法は、準最適減量（１ｃｍ以上の残存病変）、進行期、又は再発のリスクが高い初期段階の場合に必須である。２０００年代初頭から、プラチナ－パクリタキセル化学療法の併用は、アジュバント及び第一選択の設定における標準的なケアであった。
プラチナ－パクリタキセル化学療法の併用を用いた第一選択治療は、進行性卵巣癌の患者において８０％超の奏効率を有することが示されているが、ほとんどの患者は最終的に再発し、無増悪生存の中央値は１８か月である。プラチナ系化学療法への抵抗性は、卵巣癌に関連する全生存率の低下の主な原因である。リポソーマルドキソルビシン、ゲムシタビン、又はトポテカンなどの第二選択薬剤への奏効率は、化学抵抗性に起因するその後の各再発により減少し、５年全生存率は３０～４０％になる。
したがって、再発性、難治性、及び／又はプラチナ抵抗性卵巣癌を含む卵巣癌に対する治療法が、依然として必要とされている。
本開示は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片のアミノ酸配列を含む、単離ポリペプチドを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、単離異種ポリペプチドを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片の配列を含む、単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、本明細書に開示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
本開示はまた、本開示のベクターを含むウイルス又は組換えウイルスを提供する。
本開示はまた、本開示のベクターを含む自己複製ＲＮＡ分子を提供する。
本開示はまた、本開示のベクター若しくは本開示の組換えウイルスを含むか又は本開示のベクター若しくは本開示の組換えウイルスが形質導入された細胞を提供する。
本開示はまた、本開示のポリヌクレオチドを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のポリペプチドを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のベクターを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示の組換えウイルスを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示の自己複製ＲＮＡ分子を含むワクチンを提供する。
本開示はまた、対象における卵巣癌を治療又は予防する方法であって、治療有効量の本開示の１つ以上のワクチン、本開示の１つ以上ウイルス若しくは組換えウイルス、又は本開示の１つ以上の医薬組成物を、当該対象に投与することを含む、方法を提供する。
本開示はまた、対象における配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、又は４０５のうち１つ以上のアミノ酸配列に対する免疫応答を誘導する方法であって、組換えウイルスがＡｄ２６、ＧＡｄ２０、ＭＶＡである、本開示のポリヌクレオチドを含む本開示の１つ以上の組換えウイルスを当該対象に投与すること、及び／又は本開示のポリペプチドをコードする自己複製ＲＮＡ分子を投与することを含む、方法を提供する。
本開示はまた、対象における卵巣癌を治療又は予防する方法であって、
組換えウイルスを含む治療有効量の組成物、及び／又は配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２３、１２４、１２５、１２６、１２７、１２８、１２９、１３０、１３１、１３２、１３３、１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、１３９、１４０、１４１、１４２、１４３、１４４、１４５、１４６、１４７、１４８、１４９、１５０、１５１、１５２、１５３、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４、１６５、１６６、１６７、１６８、１６９、１７０、１７１、１７２、１７３、１７４、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、１８３、１８４、１８５、１８６、１８７、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、１９３、１９４、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、２０２、又は２０３個のポリペプチドを含む、異種ポリペプチドをコードする自己複製ＲＮＡ分子を含む治療有効量の組成物を、対象に投与することを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、又はＭＶＡウイルスである。いくつかの実施形態では、投与は、１回以上の投与を含む。
本開示はまた、対象における卵巣癌を治療又は予防する方法であって、
第１の異種ポリペプチドをコードする第１の異種ポリヌクレオチドを含む、第１の組成物であって、第１の異種ポリペプチドは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、第１の組成物と、
第２の異種ポリペプチドをコードする第２の異種ポリヌクレオチドを含む、第２の組成物であって、第２の異種ポリペプチドは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、第２の組成物と、
を対象に投与することを含み、当該第１の異種ポリペプチド及び当該第２の異種ポリペプチドが、異なるアミノ酸配列を有する、方法を提供する。
本開示はまた、対象における卵巣癌を治療又は予防する方法であって、組換えウイルスを含む治療有効量の組成物、及び／又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにそれらの断片から選択される異種ポリペプチドをコードする、自己複製ＲＮＡ分子を含む治療有効量の組成物を、対象に投与することを含む、方法を提供する。
本開示はまた、本明細書に開示されるポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、若しくはウイルスを含む組成物のいずれかと組み合わせて、抗ＣＴＬＡ－４抗体、抗ＰＤ－１、又は抗ＰＤ－Ｌ１抗体を投与することを提供する。
本発明の上記の実施形態は、具体的に列挙されたポリペプチド及びその断片に加えて、具体的に列挙されたものとは異なる１つ以上のポリペプチドを含む追加のポリペプチド配列も含むポリペプチドを包含することを理解されたい。同様に、本発明の上記の実施形態は、具体的に列挙されたポリヌクレオチド及びその断片に加えて、具体的に列挙されたものとは異なる１つ以上のポリヌクレオチドを含む追加のポリヌクレオチド配列も含むポリヌクレオチドを包含する。
キメラリードスルー融合から生じる遺伝子融合の模式図を示す。ネオ抗原ペプチド配列はブレイクポイント接合部で生じる。 ＤＮＡ転座などの染色体変化によって生じる遺伝子融合の模式図を示す。 選択的５’又は３’スプライス部位、保持されたイントロン、除外されたエキソン、又は選択的終止若しくは挿入を有するスプライスバリアントの模式図を示す。 スプライスバリアントを同定するアプローチの模式図を示す。 卵巣癌ネオ抗原候補の腫瘍制限発現を表すヒートマップを示す。これらの抗原は、健康なドナーに由来する健康な組織又は免疫細胞のいずれにおいても検出可能な発現を有しない。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 卵巣癌ネオ抗原候補の腫瘍制限発現を表すヒートマップを示す。これらの抗原は、健康なドナーに由来する健康な組織又は免疫細胞のいずれにおいても検出可能な発現を有しない。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 卵巣癌ネオ抗原候補の腫瘍制限発現を表すヒートマップを示す。これらの抗原は、健康なドナーに由来する健康な組織又は免疫細胞のいずれにおいても検出可能な発現を有しない。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 卵巣癌ネオ抗原候補の腫瘍制限発現を表すヒートマップを示す。これらの抗原は、健康なドナーに由来する健康な組織又は免疫細胞のいずれにおいても検出可能な発現を有しない。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 対照（健康なドナーに由来する組織及び免疫細胞）及び腫瘍試料の両方で発現する、卵巣癌ネオ抗原候補を表すヒートマップを示す。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 対照（健康なドナーに由来する組織及び免疫細胞）及び腫瘍試料の両方で発現する、卵巣癌ネオ抗原候補を表すヒートマップを示す。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 対照（健康なドナーに由来する組織及び免疫細胞）及び腫瘍試料の両方で発現する、卵巣癌ネオ抗原候補を表すヒートマップを示す。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 対照（健康なドナーに由来する組織及び免疫細胞）及び腫瘍試料の両方で発現する、卵巣癌ネオ抗原候補を表すヒートマップを示す。免疫細胞型（最初の１５行）は、３体の健康なドナー（ドナーＩＤ：Ｄ００１００３１０３、Ｄ００１０００６８２、及びＤ００１００４６２２）に由来した。卵巣癌試料には「ＯＶ＿ＣＡ」という接頭語が付される。生のＣｔ値は内因性対照遺伝子であるＲＰＬ１９の発現に対して正規化された。黒いセルは、各試料での高い発現（ΔＣｔが１５未満）を表す。 外因性自家健康ドナー再刺激アッセイを用いることによる、ネオ抗原の陽性免疫原性応答を図示する代表的なドットプロットを示す。免疫原性応答は、ＣＤ４＋及び／又はＣＤ８＋細胞集団におけるＩＦＮγ ＴＮＦα二重陽性細胞を推定することによって測定された。ＩＦＮγ ＴＮＦα二重陽性画分が、非刺激細胞（ＤＭＳＯ陰性対照）にわたって３倍以上であり、最小頻度０．０１％以上であった場合、応答は陽性と見なす。 外因性自家健康ドナー再刺激アッセイを用いることによる、ネオ抗原の陽性免疫原性応答を図示する代表的なドットプロットを示す。免疫原性応答は、ＣＤ４＋及び／又はＣＤ８＋細胞集団におけるＩＦＮγ ＴＮＦα二重陽性細胞を推定することによって測定された。ＩＦＮγ ＴＮＦα二重陽性画分が、非刺激細胞（ＤＭＳＯ陰性対照）にわたって３倍以上であり、最小頻度０．０１％以上であった場合、応答は陽性と見なす。 遺伝子融合関連ネオ抗原に対する陽性免疫原性応答（ＣＤ８＋及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞）を有するドナーの数を示す。 図９Ａ及び図９Ｂは、選択的スプライシング関連ネオ抗原に対する陽性免疫原性応答（ＣＤ８＋及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞）を有するドナーの数を示す。 図９Ａ及び図９Ｂは、選択的スプライシング関連ネオ抗原に対する陽性免疫原性応答（ＣＤ８＋及び／又はＣＤ４＋Ｔ細胞）を有するドナーの数を示す。
定義
本明細書に引用されている特許及び特許出願を含む（但しそれらに限定されない）全ての刊行物は、完全に記載されているかのように、参照により本明細書に援用される。
本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明するためだけに使用され、限定することを意図するものではないと理解すべきである。特に断らない限り、本明細書において使用される全ての技術用語及び科学用語は、本開示が属する技術分野における当業者によって一般的に理解されているものと同じ意味を有する。
本明細書に記載されているものと同様又は同等の任意の方法及び材料を、本開示の試験を実施するために使用することができるが、例示となる材料及び方法を本明細書に記載する。本開示を説明及び特許請求する上で以下の用語が使用される。
本明細書及び添付の「特許請求の範囲」において使用されるとき、「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」という単数形は、その内容について別段の明確な指示がない限り、複数の指示対象を包含する。したがって、例えば、「細胞（a cell）」という言及には、２つ又は３つ以上の細胞の組合せ、及びこれに類するものなどが含まれる。
移行句「備える／含む（comprising）」、「から本質的になる（consisting essentially of）」、及び「からなる（consisting）」は、特許用語において全般的に受け入れられている意味を含意することを意図しており、すなわち、（ｉ）「備える／含む（comprising）」は、「含む」、「含有する」、又は「特徴とする」と同義であり、包括的又は非制限的なものであり、その他の列挙されていない要素又は方法工程を除外するものではなく、（ｉｉ）「からなる（consisting of）」は、特許請求の範囲において指定されていない、あらゆる要素、工程、又は成分を除外し、そして、（ｉｉｉ）「から本質的になる（consisting essentially of）」は、指定の材料又は工程、及び特許請求される開示の「基本的かつ新規の特徴に実質的に影響を与えないもの」に、特許請求の範囲の範囲を制限する。句「備える／含む（comprising）」（又はその同等語）に関して記載される実施形態はまた、実施形態として、「からなる」及び「から本質的になる」に関して独立して記載されるものを提供する。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用するとき、語句「並びにこれらの断片」は、リストに付け加えられている場合、関連するリストの全メンバーを含む。リストは、一例として、語句「ペプチドＡ、Ｂ、及びＣ、並びにこれらの断片からなる群」は、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ａの断片、Ｂの断片、及びＣの断片を含むマーカッシュ群を指定又は列挙するように、マーカッシュ群を含んでいてもよい。
「単離／単離された」とは、組換え細胞などにおける分子が産生される系の他の成分から離して実質的に分離及び／又は精製された分子の均質な集団（例えば、合成ポリヌクレオチド又はポリペプチド）に加えて、少なくとも１つの精製又は単離工程に供されたタンパク質を指す。「単離／単離された」とは、他の細胞材料及び／又は化学物質を実質的に含まない分子を指し、より高い純度、例えば８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の純度まで単離された分子を包含する。
「ポリヌクレオチド」は、糖－リン酸骨格鎖又は他の同等の共有結合化学によって共有結合されたヌクレオチド鎖を含む合成分子を指す。
「ポリペプチド」又は「タンパク質」は、ペプチド結合によって連結されてポリペプチドを形成する少なくとも２つのアミノ酸残基を含む分子を指す。
「免疫原性断片」は、断片がＭＨＣクラスＩ又はＭＨＣクラスＩＩ分子との複合体であるとき、細胞傷害性Ｔリンパ球、ヘルパーＴリンパ球、又はＢ細胞によって認識されるポリペプチドを指す。
「インフレーム」は、第１のポリヌクレオチドにおけるコドンのリーティングフレームが、互いに接合して異種ポリヌクレオチドを形成する第２のポリヌクレオチドにおけるコドンのリーティングフレームと同じであることを指す。インフレーム異種ポリヌクレオチドは、第１のポリヌクレオチド及び第２のポリヌクレオチドの両方によってコードされている異種ポリペプチドをコードしている。
「免疫原性」は、１つ以上の免疫原性断片を含むポリペプチドを指す。
「異種」は、自然界では互いに対して同じ関係で見出されることのない、２つ以上のポリヌクレオチド又は２つ以上のポリペプチドを指す。
「異種ポリヌクレオチド」は、本明細書に記載の２つ以上のネオ抗原をコードしている天然には存在しないポリヌクレオチドを指す。
「異種ポリペプチド」は、本明細書に記載の２つ以上のネオ抗原ポリペプチドを含む天然には存在しないポリペプチドを指す。
「天然には存在しない」とは、自然界に存在しない分子を指す。
「ベクター」は、生物系内で複製可能な、又はそのような系間を移動することができる、ポリヌクレオチドを指す。ベクターポリヌクレオチドは、典型的には、生物系内でこれらのポリヌクレオチドの複製又は維持を促進するように機能する複製起点、ポリアデニル化シグナル又は選択マーカーなどの要素を含んでいる。このような生物系の例としては、細胞、ウイルス、動物、植物、及びベクターを複製することができる生物学的成分を利用する再構成生物系を挙げることができる。ベクターを構成するポリヌクレオチドは、ＤＮＡ若しくはＲＮＡ分子又はこれらのハイブリッド分子であり得る。
「発現ベクター」は、発現ベクター中に存在するポリヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドの翻訳を指令するために、生物系又は再構成された生物系において利用できるベクターを指す。
「ウイルスベクター」とは、ウイルス起源の少なくとも１つのポリヌクレオチドエレメントを含み、ウイルスベクター粒子にパッケージングされる能力を有するベクターコンストラクトを指す。
「ネオ抗原」とは、例えば、腫瘍細胞内の変異又は腫瘍細胞に特異的な翻訳後修飾を介して、非悪性組織中に存在する対応する野生型ポリペプチドとは異ならしめる少なくとも１つの変化を有する、卵巣腫瘍組織内に存在するポリペプチドを指す。変異は、フレームシフト又は非フレームシフト挿入又は欠失、ミスセンス又はナンセンス置換、スプライス部位変化、異常スプライスバリアント、ゲノム再編成若しくは遺伝子融合、又はネオ抗原を生じさせる任意のゲノム若しくは発現の変化を含み得る。
「有病率」とは、卵巣ネオ抗原を保有している、研究された集団の割合を指す。
「組換え体」は、組換え手段によって調製、発現、作製、又は単離されたポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、ウイルス、及び他の巨大分子を指す。
「ワクチン」は、レシピエント（例えば、対象）において獲得免疫を誘導するために意図的に投与される、１つ以上の免疫原性ポリペプチド、免疫原性ポリヌクレオチド若しくは断片、又はこれらの任意の組合せを含む組成物を指す。
癌などの疾患又は障害を「治療する」、「治療している」、又はこれらの「治療」は、以下、障害の重篤度及び／若しくは期間を低減する、治療される障害に特徴的な症状の悪化を阻害する、以前に障害を有していた対象における障害の再発を制限若しくは予防する、又は以前に障害について症候性であった対象における症状の再発を制限若しくは予防する、のうちの１つ以上を達成することを指す。
疾患若しくは障害を「予防する」、「予防すること」、「予防（prevention）」、又は「予防（prophylaxis）」は、障害が対象に発生することを予防することを意味する。
「治療に有効な量」とは、必要な用量及び期間で所望の治療結果を得るための有効量を指す。治療有効量は、個体の病態、年齢、性別、及び体重などの要因、並びに個体において所望の応答を引き出す１つの治療薬又は治療薬の組合せの能力によって様々であってよい。有効な１つの治療薬、又は治療薬の組合せの例示的な指標としては、例えば、患者の改善された健康が挙げられる。
「再発性」とは、治療薬による前治療後の改善期間後に疾患又は疾患の徴候及び症状が再開することを指す。
「難治性」とは、治療に応答しない疾患を指す。難治性疾患は、治療前又は治療開始時に治療に抵抗性であり得るか、又は難治性疾患は、治療中に抵抗性疾患となり得る。
「レプリコン」とは、それ自体のコピーの生成を指示することができ、ＲＮＡ及びＤＮＡを含むウイルス核酸を指す。例えば、アルテリウイルスゲノムの二本鎖ＤＮＡバージョンを使用して、アルテリウイルスレプリコンを構成する一本鎖ＲＮＡ転写物を生成することができる。一般に、ウイルスレプリコンは、ウイルスの完全なゲノムを含有する。「サブゲノムレプリコン」とは、ウイルスゲノムの遺伝子及び他の機構の完全相補体よりも少ないものを含有するが、それでもなお、それ自体のコピーの生成を指示することができるウイルス核酸を指す。例えば、アルテリウイルスのサブゲノムレプリコンは、ウイルスの非構造タンパク質については遺伝子の大部分を含有し得るが、構造タンパク質をコードしている遺伝子の大部分を欠いている。サブゲノムレプリコンは、ウイルス粒子を生成することなく、ウイルスサブゲノムの複製（サブゲノムレプリコンの複製）に必要なウイルス遺伝子の全ての発現を指示することができる。
「ＲＮＡレプリコン」（又は「自己複製ＲＮＡ分子」）とは、許容細胞内でそれ自体の増幅又は自己複製を指示するために必要とされる遺伝情報の全てを含有するＲＮＡを指す。それ自体の複製を指示するために、ＲＮＡ分子は、１）ポリメラーゼ、レプリカーゼ、又はＲＮＡ増幅プロセスを触媒するためにウイルス若しくは宿主細胞に由来するタンパク質、核酸、若しくはリボ核タンパク質と相互作用し得る他のタンパク質をコードしており、かつ２）レプリコンをコードしているＲＮＡの複製及び転写に必要なシス作用性ＲＮＡ配列を含有する。自己複製ＲＮＡは、典型的には、プラス鎖ＲＮＡウイルスのゲノムに由来し、構造若しくは非構造遺伝子をコードしているウイルス配列を置換することにより、又は構造若しくは非構造遺伝子をコードしている配列の５’若しくは３’に外来配列を挿入することによって、宿主細胞への外来配列の導入の基礎として使用することができる。外来配列はまた、アルファウイルスのサブゲノム領域に導入されてもよい。自己複製ＲＮＡは、組換えアルファウイルス粒子などの組換えウイルス粒子にパッケージングされてもよく、あるいは脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）を使用して宿主に送達されてもよい。自己複製ＲＮＡは、少なくとも１ｋｂ、又は少なくとも２ｋｂ、又は少なくとも３ｋｂ、又は少なくとも４ｋｂ、又は少なくとも５ｋｂ、又は少なくとも６ｋｂ、又は少なくとも７ｋｂ、又は少なくとも８ｋｂ、又は少なくとも１０ｋｂ、又は少なくとも１２ｋｂ、又は少なくとも１５ｋｂ、又は少なくとも１７ｋｂ、又は少なくとも１９ｋｂ、又は少なくとも２０ｋｂのサイズであってもよく、１００ｂｐ～８ｋｂ、又は５００ｂｐ～８ｋｂ、又は５００ｂｐ～７ｋｂ、又は１～７ｋｂ、又は１～８ｋｂ、又は２～１５ｋｂ、又は２～２０ｋｂ、又は５～１５ｋｂ、又は５～２０ｋｂ、又は７～１５ｋｂ、又は７～１８ｋｂ、又は７～２０ｋｂのサイズであってもよい。自己複製ＲＮＡは、例えば、国際公開第２０１７／１８０７７０号、同第２０１８／０７５２３５号、同第２０１９１４３９４９（Ａ２）号に記載されている。
「対象」は、任意のヒト又は非ヒト動物を含む。「非ヒト動物」としては、あらゆる脊椎動物、例えば哺乳類及び非哺乳類、例えば非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ウシ、ニワトリ、両生類、爬虫類などが挙げられる。用語「対象」及び「患者」は、本明細書で互換的に使用することができる。
「～と組み合わせて」は、２つ以上の治療薬を、混合物の状態で一緒に、単剤として同時に又は単剤として任意の順序で順次、対象に投与することを意味する。
「強化する」又は「誘導する」は、免疫応答に関する場合、免疫応答のスケール及び／若しくは効率を増大させること、又は免疫応答の持続時間を延長することを指す。これらの用語は、「増強する」と互換的に使用される。
「免疫応答」とは、脊椎動物対象の免疫系による免疫原性ポリペプチド又はポリヌクレオチド又は断片に対する任意の応答を指す。例示的な免疫応答としては、局所及び全身の細胞性及び体液性免疫、例えば、ＣＤ８＋細胞傷害性Ｔリンパ球（cytotoxic T lymphocyte、ＣＴＬ）の抗原特異的誘導を含むＣＴＬ応答、Ｔ細胞増殖応答及びサイトカイン放出を含むヘルパーＴ細胞応答、並びに抗体応答を含むＢ細胞応答が挙げられる。
「特異的に結合する」、「特異的結合」、「特異的に結合している」、又は「結合する」とは、タンパク質性分子が、抗原又は当該抗原内のエピトープ（例えば、卵巣ネオ抗原）に、他の抗原に対する親和性よりも高い親和性で結合することを指す。典型的には、タンパク質性分子は、約１×１０－７Ｍ以下、例えば約５×１０－８Ｍ以下、約１×１０－８Ｍ以下、約１×１０－９Ｍ以下、約１×１０－１０Ｍ以下、約１×１０－１１Ｍ以下、又は約１×１０－１２Ｍ以下の平衡解離定数（ＫＤ）で抗原又は当該抗原内のエピトープに結合し、典型的には、ＫＤは、非特異的抗原（例えば、ＢＳＡ、カゼイン）への結合についてのＫＤよりも少なくとも１００倍小さい。本明細書に記載の卵巣ネオ抗原の文脈において、「特異的結合」とは、タンパク質性分子が、卵巣ネオ抗原がそのバリアントである野生型タンパク質に検出可能には結合することなく、卵巣ネオ抗原に結合することを指す。
「変異体」、「突然変異」又は「変化した」とは、１つ以上の改変、例えば、１つ以上の置換、挿入、又は欠失によって参照ポリペプチド又は参照ポリヌクレオチドとは異なるポリペプチド又はポリヌクレオチドを指す。
「抗体」とは、ネズミ、ヒト、ヒト化及びキメラモノクローナル抗体を含むモノクローナル抗体、抗原結合断片、二重特異性又は多重特異性抗体、二量体、四量体又は多量体抗体、単鎖抗体、ドメイン抗体、並びに必要とされる特異性の抗原結合部位を含む任意の他の修飾された立体配置の免疫グロブリン分子を含む、免疫グロブリン分子を指す。
「選択的スカフォールド」は、立体構造の許容度が高い可変ドメインに会合する構造化コアを含有する単鎖タンパク質フレームワークを指す。可変ドメインは、スカフォールドの完全性を損なうことなく導入される多型を許容するため、可変ドメインは、特異的抗原に結合するように遺伝子操作及び選択され得る。
「キメラ抗原受容体」又は「ＣＡＲ」は、Ｔ細胞上にリガンド又は抗原特異性を移植する遺伝子操作されたＴ細胞受容体（例えば、ナイーブＴ細胞、セントラルメモリーＴ細胞、エフェクターメモリーＴ細胞又はこれらの組合せ）を指す。ＣＡＲはまた、人工Ｔ細胞受容体、キメラＴ細胞受容体、又はキメラ免疫受容体としても知られている。ＣＡＲは、抗原、膜貫通ドメイン、及び少なくとも１つの細胞内ドメインに結合することができる細胞外ドメインを含む。ＣＡＲ細胞内ドメインは、細胞内の生物学的プロセスの活性化又は阻害を引き起こすシグナルを伝達するドメインとして機能することが知られているポリペプチドを含む。膜貫通ドメインは、細胞膜に及ぶことが知られており、細胞外ドメイン及びシグナル伝達ドメインを結合するように機能し得る任意のペプチド又はポリペプチドを含む。キメラ抗原受容体は、任意で、細胞外ドメインと膜貫通ドメインとの間のリンカーとして機能するヒンジドメインを含んでもよい。
「Ｔ細胞受容体」又は「ＴＣＲ」は、ＭＨＣ分子によって提示されたときにペプチドを認識することができる分子を指す。天然に存在するＴＣＲヘテロ二量体は、Ｔ細胞の約９５％においてはアルファ（α）鎖及びベータ（β）鎖からなり、一方、Ｔ細胞の約５％は、ガンマ（γ）鎖及びデルタ（δ）鎖からなるＴＣＲを有する。天然ＴＣＲの各鎖は、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであり、１つのＮ末端免疫グロブリン（Ｉｇ）可変（Ｖ）ドメイン、１つのＩｇ定常（Ｃ）ドメイン、膜横断／細胞膜貫通領域、及びＣ末端に短い細胞質側末端を有する。ＴＣＲのα鎖及びβ鎖の両方の可変ドメインは、ＭＨＣ上に提示されるプロセシングされた抗原を認識する役割を担う、３つの超可変又は相補性決定領域（ＣＤＲ）、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２、及びＣＤＲ３を有する。
ＴＣＲは、完全長α／β又はγ／δヘテロ二量体であってもよく、又はペプチド／ＭＨＣ複合体の結合を保持するＴＣＲの細胞外ドメインの一部を含む可溶性分子であってもよい。ＴＣＲは、単鎖ＴＣＲに遺伝子操作されてもよい。
「Ｔ細胞受容体複合体」又は「ＴＣＲ複合体」とは、ＴＣＲα及びＴＣＲβ鎖、ＣＤ３ε、ＣＤ３γ、ＣＤ３δ並びにＣＤ３ζ分子から構成される、公知のＴＣＲ複合体を指す。いくつかの例において、ＴＣＲα及びＴＣＲβ鎖は、ＴＣＲγ及びＴＣＲδ鎖によって置換される。ＴＣＲ複合体を形成する様々なタンパク質のアミノ酸配列は周知である。
「Ｔ細胞」及び「Ｔリンパ球」は交換可能であり、本明細書では同義的に使用される。Ｔ細胞は、胸腺細胞、ナイーブＴリンパ球、メモリＴ細胞、未成熟Ｔリンパ球、成熟Ｔリンパ球、静止Ｔリンパ球、又は活性化Ｔリンパ球を含む。Ｔ細胞は、Ｔヘルパー（Ｔｈ）細胞、例えば、Ｔヘルパー１（Ｔｈ１）又はＴヘルパー２（Ｔｈ２）細胞であってよい。Ｔ細胞は、ヘルパーＴ細胞（ＨＴＬ、ＣＤ４＋Ｔ細胞）、ＣＤ４＋Ｔ細胞、細胞傷害性Ｔ細胞（cytotoxic T cell：ＣＴＬ、ＣＤ８＋Ｔ細胞）、腫瘍浸潤細胞傷害性Ｔ細胞（ＴＩＬ、ＣＤ８＋Ｔ細胞）、ＣＤ４＋ＣＤ８＋Ｔ細胞、又はＴ細胞の任意の他のサブセットであってもよい。また、「ＮＫＴ細胞」も含まれ、これは、半不変αβＴ細胞受容体を発現するだけでなく、ＮＫ１．１などの通常ＮＫ細胞に関連する様々な分子マーカーも発現するＴ細胞の特殊な集団を指す。ＮＫＴ細胞としては、ＮＫ１．１＋及びＮＫ１．１－、並びにＣＤ４＋、ＣＤ４－、ＣＤ８＋及びＣＤ８－細胞が挙げられる。ＮＫＴ細胞のＴＣＲは、ＭＨＣ Ｉ様分子ＣＤ Ｉｄによって提示される糖脂質抗原を認識するという点で独特である。ＮＫＴ細胞は、炎症又は免疫寛容のいずれかを促進するサイトカインを産生する能力により、保護効果又は有害効果のいずれかを有し得る。また、「ガンマデルタＴ細胞（γδ Ｔ細胞）」も含まれ、これは、表面に異なるＴＣＲを有するＴ細胞の小さなサブセットの特殊な集団を指し、ＴＣＲがα及びβ－ＴＣＲ鎖と呼ばれる２つの糖タンパク質鎖で構成されるＴ細胞の大部分とは異なり、γδ Ｔ細胞におけるＴＣＲは、γ鎖及びδ鎖で構成される。γδ Ｔ細胞は、免疫監視及び免疫調節において役割を果たすことができ、ＩＬ－１７の重要な供給源であること、及び強力なＣＤ８＋細胞傷害性Ｔ細胞応答を誘導することが見出された。また、異常又は過剰な免疫応答を抑制し、免疫寛容における役割を果たすＴ細胞を指す「調節性Ｔ細胞」又は「Ｔｒｅｇ」も含まれる。Ｔｒｅｇは、典型的には、転写因子Ｆｏｘｐ３陽性ＣＤ４＋Ｔ細胞であり、また、ＩＬ－１０産生ＣＤ４＋Ｔ細胞である転写因子Ｆｏｘｐ３陰性調節性Ｔ細胞も含み得る。
「ナチュラルキラー細胞」又は「ＮＫ細胞」は、ＣＤ１６＋ＣＤ５６＋及び／又はＣＤ５７＋ＴＣＲ－表現型を有する、分化リンパ球を指す。ＮＫは、特定の細胞溶解性酵素の活性化によって「自己」ＭＨＣ／ＨＬＡ抗原を発現できない細胞に結合し、殺傷する能力、腫瘍細胞又はＮＫ活性化受容体のリガンドを発現する他の疾患細胞を殺傷する能力、及び免疫応答を刺激又は阻害するサイトカインと呼ばれるタンパク質分子を放出する能力を特徴とする。
「約」は、当業者によって決定される特定の値について許容される誤差範囲内であることを意味し、これは、その値が測定又は決定される方法、すなわち、測定システムの制限事項にある程度依存する。特定のアッセイ、結果、又は実施形態の文脈において実施例又は明細書のその他の箇所に別途明示的に記載のない限り、「約」は、当該技術分野の実施に従う１つの標準偏差又は５％までの範囲のいずれか大きい方の範囲内であることを意味する。
「抗原提示細胞」（antigen presenting cell、ＡＰＣ）とは、ＭＨＣクラスＩ若しくはＭＨＣクラスＩＩ分子のいずれか又は両方の主要組織適合性複合体分子と会合してその表面上に抗原を提示する任意の細胞を指す。
「プライム－ブースト」又は「プライム－ブーストレジメン」とは、第１のワクチンでＴ細胞応答を初回免疫し、続いて、第２のワクチンで免疫応答を追加免疫することを含む、対象を治療する方法を指す。第１のワクチン及び第２のワクチンは、典型的には異なる。これらのプライム－ブースト免疫は、同じワクチンで初回免疫及び追加免疫することによって達成され得るよりも大きくかつ広い免疫応答を惹起する。初回免疫工程は、メモリ細胞を開始させ、追加免疫工程は、メモリ応答を拡大する。追加免疫は、１回又は複数回行われ得る。
「促進エレメント」は、ポリヌクレオチド又はポリペプチドに操作可能に連結された任意のポリヌクレオチド又はポリペプチドエレメントを指し、プロモーター、エンハンサー、ポリアデニル化シグナル、終止コドン、ヒスチジンタグなどのタンパク質タグなどを含む。本明細書における促進エレメントは、調節エレメントを含む。
ポリペプチド又はポリヌクレオチド配列の文脈における「異なる」は、同一ではないポリペプチド又はポリヌクレオチド配列を指す。
物質の組成
本開示は、卵巣癌ネオ抗原、それをコードしているポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞、ネオ抗原又はネオ抗原をコードしているポリヌクレオチドを含むワクチン、卵巣ネオ抗原に結合するタンパク質性分子、並びにこれらを作製及び使用する方法に関する。本開示はまた、卵巣癌患者の集団において有病率の高い本開示の卵巣癌ネオ抗原を含むワクチンを提供し、それによって、限局性又は転移性卵巣癌などの卵巣癌の様々なステージであると診断された患者の広範な集団を治療するのに有用であり得る汎ワクチンを提供する。
癌細胞は、ゲノム変化及び異常な転写プログラムから生じるネオ抗原を産生する。患者におけるネオ抗原負荷は、免疫療法に対する応答に関連している（Ｓｎｙｄｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ．２０１４ Ｄｅｃ ４；３７１（２３）：２１８９－２１９９；Ｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ．２０１５ Ｊｕｎ ２５；３７２（２６）：２５０９－２０；Ｒｉｚｖｉ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ．２０１５ Ａｐｒ ３；３４８（６２３０）：１２４－８；Ｖａｎ Ａｌｌｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ．２０１５ Ｏｃｔ ９；３５０（６２５７）：２０７－２１１。本開示は、卵巣癌患者に共通する卵巣癌ネオ抗原の同定に少なくとも部分的に基づいており、したがって、広範囲の卵巣癌患者の治療に受け入れられる治療法を開発するために利用することができる。本開示のネオ抗原をコードしている１つ以上のネオ抗原又はポリヌクレオチドは、診断又は予後診断の目的のために使用することもできる。
ポリペプチド
対象の免疫応答を誘発し得る卵巣癌ネオ抗原配列を含むポリペプチドが本明細書で開示される。
いくつかの実施形態では、本開示は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片のアミノ酸配列を含む、単離ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、単離ポリペプチドは、少なくとも２つ以上の卵巣癌ネオ抗原配列を含み得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む単離異種ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される２つ以上のポリペプチドは、任意の順序でタンデム反復で存在し得る。
本開示は、また、配列番号１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号１１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号１３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号１５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号１７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号１９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号２１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号２３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号２５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号２７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号２９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号５１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号５３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号５５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号５７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号５９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号６１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号６３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号６５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号６７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号６９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号７１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号７３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号７５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号７７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号７９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
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本開示は、また、配列番号３８５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３８７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３８９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３９１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３９３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３９５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３９７のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号３９９のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４０１のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４０３のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
本開示は、また、配列番号４０５のアミノ酸配列又はその断片を含む単離ポリペプチドを提供する。
いくつかの実施形態では、断片は、約６～２４アミノ酸長を含む。
いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも６アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも７アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも８アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも９アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１０アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１１アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１２アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１３アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１６アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１７アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１８アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１９アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２０アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２１アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２２アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２３アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約６アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約７アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約９アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１０アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１１アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１２アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１３アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１６アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１７アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１８アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１９アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２０アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２１アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２２アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２３アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約６～２５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約７～２５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～２５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～２４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～２３アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～２２アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～２１アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～２０アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～１９アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～１８アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～１７アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～１６アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～１５アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約８～１４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約９～１４アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約９～１３アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約９～１２アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約９～１１アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、断片は、約９～１０アミノ酸を含む。
いくつかの実施形態では、断片は、免疫原性断片である。
免疫原性断片は、一般に、Ｔ細胞を活性化するペプチド、例えば、ＭＨＣ上に提示されたときに細胞傷害性Ｔ細胞を誘導するものである。Ｔ細胞の活性化及び／又は細胞傷害性Ｔリンパ球の誘導を評価するための方法は周知である。例示的なアッセイでは、卵巣癌患者から単離されたＰＢＭＣは、試験ネオ抗原又はその断片及びＩＬ－２５の存在下においてインビトロで培養される。培養物にＩＬ－１５及びＩＬ－２を定期的に補給し、更に１２日間培養してよい。１２日目に、培養物を試験ネオ抗原又はその断片で再刺激し、次の日、対照培養物と比較してＩＦＮγ＋ＴＮＡα＋ＣＤ８＋細胞の割合を測定することによって、Ｔ細胞の活性化を評価することができる。
本開示のポリペプチド及び異種ポリペプチドは、本開示の組換えウイルス、細胞、及びワクチン、並びに本開示の１つ以上の卵巣ネオ抗原に特異的に結合するタンパク質性分子を作製するのに有用であるか、又は様々な技術を用いて卵巣癌を有する対象に送達することによって治療剤として直接使用されてもよい。標準的なクローニング方法を使用して、２つ以上のネオ抗原（例えば、ポリペプチド）を任意の順序でワクチンに組み込んでよい。
検証プロセスを通じて、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５の９５個のネオ抗原ポリペプチドは、その発現プロファイル、有病率、及びインビトロ免疫原性に基づいて、卵巣癌ワクチンに含めるのに特に有用であると同定された。９５個のネオ抗原うち２つ以上の任意の組合せを利用して、任意の利用可能な送達ビヒクル及び任意の利用可能な形態、例えば、ペプチド、ＤＮＡ、ＲＮＡ、レプリコンを利用して又はウイルス送達を使用して対象に送達され得る卵巣癌ワクチンを生成することができると予想される。標準的なクローニング方法を使用して、２つ以上のネオ抗原（例えば、ポリペプチド）を任意の順序でワクチンに組み込んでよい。
９５個のポリペプチドのうち２つ以上は、任意の順序で異種ポリペプチドをコードしている異種ポリヌクレオチドに組み立ててもよく、ポリペプチドの順序は、様々な送達の選択肢間で異なっていてよい。一般に、特定の順序でのポリペプチドの組み立ては、既知のアルゴリズムを利用した最小数の接合エピトープの生成に基づいていてよい。
いくつかの実施形態では、本開示は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドを含む、ポリペプチドを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片の２つ以上のタンデム反復を含む、ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、本開示のポリペプチドの２、３、４、５個の反復、又は５個超の反復を含む。
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、先頭部と尾部とが接合されている。
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、リンカーによって分離され得る。
例示的なリンカー配列には、ＡＡＹ、ＲＲ、ＤＰＰ、ＨＨＡＡ、ＨＨＡ、ＨＨＬ、ＲＫＳＹＬ、ＲＫＳＹ、ＳＳＬ、又はＲＥＫＲが含まれる。いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるリンカーは、異種ポリペプチドが、対象のインビボでネオ抗原配列を含むペプチド断片に切断され得、免疫応答の改善をもたらすように、プロテアーゼ切断部位を含み得る。
いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、リンカーを含まずにリンカーなしで互いに直接接合される。
いくつかの実施形態では、本開示のポリペプチドは、Ｎ末端にリーダー配列又はＴ細胞エンハンサー配列（T-cell enhancer sequence、ＴＣＥ）を更に含み得る。リーダー配列は、発現を増加させ、かつ／又は免疫学的応答を増加させることができる。例示的なリーダー配列としては、Ｔ２リンパ球のＴＣＲ受容体のα鎖（ＨＡＶＴ２０）（ＭＡＣＰＧＦＬＷＡＬＶＩＳＴＣ ＬＥＦＳＭＡ；）、配列番号４１９）、ユビキチンシグナル配列（Ｕｂｉｑ）（ＭＱＩＦＶＫＴＬＴＧＫＴＩＴＬＥＶＥＰ ＳＤＴＩＥＮＶＫＡＫＩＱＤＫＥＧＩＰＰＤＱＱＲＬＩＦＡＧＫＱＬＥＤＧＲＴＬＳＤＹＮＩＱＫＥＳＴＬＨＬＶＬＲＬＲＧＶＲ；配列番号４２０）、又はニシキテグリ不変鎖からの２８ａａ長のペプチド断片などの、Ｔ細胞エンハンサー（ＴＣＥ）配列（ＭＧＱＫＥＱＩＨＴＬＱＫＮＳＥＲＭＳＫＱＬＴＲＳＳＱＡＶ；配列番号４２１）が挙げられる。リーダー配列は、本明細書に開示されるエピトープに対する免疫応答を増加させるのに役立ち得ると考えられている。
ポリヌクレオチド
本開示はまた、本明細書に開示されるポリペプチドのうちのいずれかをコードする、ポリヌクレオチドを提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片のポリペプチドをコードする単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片のポリペプチドと少なくとも９０％同一であるポリペプチドをコードする、単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片のポリヌクレオチド配列を含む、単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片のポリヌクレオチド配列と少なくとも９０％同一であるポリヌクレオチド配列を含む、単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、及び４０６、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリヌクレオチドを含む、単離異種ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む異種ポリペプチドをコードする、単離異種ポリヌクレオチドを提供する。
いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも１８ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２１ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２４ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも２７ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも３０ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも３３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも３６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも３９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも４２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも４５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも４８ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも５１ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも５４ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも５７ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも６０ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも６３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも６６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも６９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも７２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、少なくとも７５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１８ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２１ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２７ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約３０ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約３３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約３６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約３９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約４２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約４５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約４８ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約５１ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約５４ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約５７ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約６０ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約６３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約６６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約６９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約７２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約７５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約１８～７５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２１～７５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～７５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～７２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～６９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～６６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～６３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～６０ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～５７ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～５４ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～５１ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～４８ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～４５ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２４～４２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２７～４２ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２７～３９ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２７～３６ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２７～３３ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、断片は、約２７～３０ヌクレオチドを含む。
本開示のポリヌクレオチド及び異種ポリヌクレオチドは、卵巣ネオ抗原及び本明細書に記載の２つ以上の卵巣ネオ抗原を含む異種ポリペプチドをコードしている。本開示のポリヌクレオチド及び異種ポリヌクレオチドは、本開示のポリペプチド、異種ポリペプチド、ベクター、組換えウイルス、細胞、及びワクチンを作製するのに有用である。本開示のポリヌクレオチド及び異種ポリヌクレオチドは、本明細書に記載のウイルスベクター又は同様に本明細書に記載されている他の送達技術を含む様々な技術を用いて、卵巣癌を有する対象に送達することによって治療薬として利用することができる。
本開示はまた、配列番号１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３のポリペプチド又はその断片は、配列番号４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号５のポリペプチド又はその断片は、配列番号６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号７のポリペプチド又はその断片は、配列番号８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３９のポリペプチド又はその断片は、配列番号４０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４１のポリペプチド又はその断片は、配列番号４２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４３のポリペプチド又はその断片は、配列番号４４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４５のポリペプチド又はその断片は、配列番号４６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４７のポリペプチド又はその断片は、配列番号４８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４９のポリペプチド又はその断片は、配列番号５０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号５１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号５１のポリペプチド又はその断片は、配列番号５２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号５３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号５３のポリペプチド又はその断片は、配列番号５４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号５５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号５５のポリペプチド又はその断片は、配列番号５６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号５７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号５７のポリペプチド又はその断片は、配列番号５８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号５９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号５９のポリペプチド又はその断片は、配列番号６０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号６１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号６１のポリペプチド又はその断片は、配列番号６２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号６３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号６３のポリペプチド又はその断片は、配列番号６４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号６５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号６５のポリペプチド又はその断片は、配列番号６６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号６７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号６７のポリペプチド又はその断片は、配列番号６８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号６９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号６９のポリペプチド又はその断片は、配列番号７０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号７１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号７１のポリペプチド又はその断片は、配列番号７２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号７３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号７３のポリペプチド又はその断片は、配列番号７４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号７５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号７５のポリペプチド又はその断片は、配列番号７６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号７７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号７７のポリペプチド又はその断片は、配列番号７８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号７９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号７９のポリペプチド又はその断片は、配列番号８０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号８１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号８１のポリペプチド又はその断片は、配列番号８２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号８３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号８３のポリペプチド又はその断片は、配列番号８４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号８５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号８５のポリペプチド又はその断片は、配列番号８６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号８７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号８７のポリペプチド又はその断片は、配列番号８８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号８９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号８９のポリペプチド又はその断片は、配列番号９０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号９１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号９１のポリペプチド又はその断片は、配列番号９２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号９３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号９３のポリペプチド又はその断片は、配列番号９４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号９５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号９５のポリペプチド又はその断片は、配列番号９６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号９７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号９７のポリペプチド又はその断片は、配列番号９８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号９９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号９９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１００のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１０１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１０１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１０２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１０３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１０３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１０４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１０５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１０５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１０６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１０７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１０７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１０８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１０９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１０９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１１０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１１１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１１１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１１２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１１３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１１３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１１４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１１５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１１５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１１６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１１７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１１７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１１８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１１９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１１９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１２０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１２１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１２１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１２２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１２３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１２３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１２４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１２５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１２５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１２６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１２７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１２７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１２８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１２９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１２９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１３０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１３１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１３１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１３２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１３３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１３３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１３４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１３５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１３５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１３６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１３７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１３７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１３８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１３９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１３９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１４０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１４１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１４１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１４２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１４３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１４３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１４４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１４５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１４５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１４６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１４７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１４７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１４８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１４９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１４９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１５０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１５１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１５１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１５２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１５３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１５３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１５４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１５５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１５５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１５６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１５７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１５７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１５８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１５９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１５９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１６０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１６１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１６１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１６２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１６３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１６３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１６４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１６５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１６５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１６６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１６７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１６７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１６８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１６９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１６９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１７０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１７１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１７１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１７２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１７３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１７３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１７４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１７５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１７５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１７６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１７７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１７７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１７８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１７９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１７９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１８０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１８１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１８１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１８２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１８３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１８３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１８４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１８５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１８５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１８６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１８７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１８７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１８８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１８９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１８９のポリペプチド又はその断片は、配列番号１９０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１９１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１９１のポリペプチド又はその断片は、配列番号１９２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１９３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１９３のポリペプチド又はその断片は、配列番号１９４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１９５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１９５のポリペプチド又はその断片は、配列番号１９６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１９７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１９７のポリペプチド又はその断片は、配列番号１９８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号１９９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号１９９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２００のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２０１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２０１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２０２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２０３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２０３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２０４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２０５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２０５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２０６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２０７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２０７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２０８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２０９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２０９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２１０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２１１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２１１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２１２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２１３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２１３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２１４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２１５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２１５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２１６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２１７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２１７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２１８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２１９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２１９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２２０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２２１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２２１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２２２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２２３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２２３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２２４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２２５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２２５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２２６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２２７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２２７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２２８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２２９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２２９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２３０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２３１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２３１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２３２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２３３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２３３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２３４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２３５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２３５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２３６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２３７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２３７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２３８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２３９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２３９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２４０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２４１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２４１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２４２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２４３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２４３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２４４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２４５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２４５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２４６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２４７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２４７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２４８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２４９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２４９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２５０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２５１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２５１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２５２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２５３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２５３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２５４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２５５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２５５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２５６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２５７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２５７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２５８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２５９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２５９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２６０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２６１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２６１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２６２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２６３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２６３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２６４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２６５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２６５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２６６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２６７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２６７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２６８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２６９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２６９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２７０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２７１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２７１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２７２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２７３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２７３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２７４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２７５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２７５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２７６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２７７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２７７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２７８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２７９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２７９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２８０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２８１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２８１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２８２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２８３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２８３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２８４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２８５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２８５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２８６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２８７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２８７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２８８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２８９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２８９のポリペプチド又はその断片は、配列番号２９０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２９１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２９１のポリペプチド又はその断片は、配列番号２９２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２９３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２９３のポリペプチド又はその断片は、配列番号２９４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２９５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２９５のポリペプチド又はその断片は、配列番号２９６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２９７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２９７のポリペプチド又はその断片は、配列番号２９８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号２９９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号２９９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３００のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３０１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３０１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３０２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３０３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３０３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３０４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３０５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３０５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３０６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３０７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３０７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３０８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３０９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３０９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３１０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３１１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３１１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３１２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３１３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３１３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３１４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３１５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３１５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３１６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３１７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３１７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３１８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３１９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３１９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３２０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３２１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３２１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３２２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３２３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３２３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３２４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３２５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３２５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３２６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３２７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３２７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３２８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３２９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３２９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３３０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３３１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３３１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３３２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３３３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３３３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３３４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３３５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３３５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３３６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３３７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３３７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３３８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３３９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３３９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３４０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３４１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３４１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３４２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３４３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３４３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３４４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３４５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３４５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３４６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３４７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３４７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３４８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３４９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３４９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３５０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３５１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３５１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３５２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３５３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３５３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３５４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３５５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３５５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３５６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３５７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３５７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３５８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３５９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３５９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３６０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３６１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３６１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３６２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３６３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３６３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３６４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３６５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３６５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３６６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３６７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３６７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３６８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３６９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３６９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３７０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３７１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３７１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３７２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３７３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３７３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３７４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３７５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３７５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３７６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３７７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３７７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３７８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３７９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３７９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３８０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３８１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３８１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３８２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３８３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３８３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３８４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３８５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３８５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３８６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３８７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３８７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３８８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３８９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３８９のポリペプチド又はその断片は、配列番号３９０のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３９１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３９１のポリペプチド又はその断片は、配列番号３９２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３９３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３９３のポリペプチド又はその断片は、配列番号３９４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３９５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３９５のポリペプチド又はその断片は、配列番号３９６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３９７のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３９７のポリペプチド又はその断片は、配列番号３９８のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号３９９のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号３９９のポリペプチド又はその断片は、配列番号４００のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４０１のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４０１のポリペプチド又はその断片は、配列番号４０２のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４０３のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４０３のポリペプチド又はその断片は、配列番号４０４のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
本開示はまた、配列番号４０５のポリペプチド又はその断片をコードしている単離ポリヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、配列番号４０５のポリペプチド又はその断片は、配列番号４０６のポリヌクレオチド又はその断片によってコードされている。
いくつかの実施形態では、異種ポリヌクレオチドは、インフレーム異種ポリヌクレオチドである。
様々な宿主において発現させるために、既知の方法を利用してポリヌクレオチドをコドン最適化してもよい。
いくつかの実施形態では、単離異種ポリヌクレオチドは、インフレーム異種ポリヌクレオチドである。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ＤＮＡ又はＲＮＡを含む。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ＲＮＡを含む。
いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、ｍＲＮＡである。
本開示の遺伝子操作されたポリヌクレオチド、ポリペプチド、異種ポリヌクレオチド、及び異種ポリペプチドのバリアント及び
ポリヌクレオチド、ポリペプチド、異種ポリヌクレオチド、及び異種ポリペプチドのバリアント、又はこれらの断片は、本開示の範囲内である。例えば、バリアントは、親と比較したときにバリアントが改善された特徴（免疫原性又は安定性など）を保持しているか又は有している限り、１つ以上の置換、欠失、又は挿入を含んでいてよい。いくつかの実施形態では、配列同一性は、親とバリアントとの間で約８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％であってよい。いくつかの実施形態では、バリアントは保存的置換により生成される。
いくつかの実施形態では、同一性は、約８０％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約８５％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９０％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９１％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９１％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９２％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９３％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９４％である。いくつかの実施形態では、同一性は、９４％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９５％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９６％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９７％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９８％である。いくつかの実施形態では、同一性は、約９９％である。
２つの配列間の同一性パーセントは、２つの配列の最適なアライメントのために導入する必要があるギャップの数及び各ギャップの長さを考慮した、配列により共有される同一の位置の数の関数である（即ち、同一性％＝同一の位置の数／位置の総数×１００）。２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＡＬＩＧＮプログラム（ｖｅｒｓｉｏｎ２．０）に組み込まれているＥ．Ｍｅｙｅｒｓ及びＷ．Ｍｉｌｌｅｒ（「Ｃｏｍｐｕｔ Ａｐｐｌ Ｂｉｏｓｃｉ、第４巻、第１１～１７頁（１９８８年））のアルゴリズムを使用して、ＰＡＭ１２０重み付き残基表を使用してギャップ長ペナルティ１２及びギャップペナルティ４で、決定することができる。更に、２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｇｃｇ＿ｃｏｍで入手可能）のＧＡＰプログラムに組み込まれているＮｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈのアルゴリズム（Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ４８：４４４－４５３ （１９７０））を使用して、Ｂｌｏｓｓｕｍ ６２マトリクス又はＰＡＭ２５０マトリクスのいずれか、ギャップ重み付け（gap weight）１６、１４、１２、１０、８、６、又は４、長さ重み付け（length weight）１、２、３、４、５、又は６を使用して決定することもできる。
１つのアミノ酸変化を含有するポリペプチド若しくは異種ポリペプチドのバリアント又はこれらの断片は、一般に、親に対して同様の三次構造及び抗原性を保持している。場合によっては、バリアントはまた、バリアントの抗原性を増大させる、ＴＣＲ若しくは抗体、又は両方に対する結合親和性を増大させる少なくとも１つのアミノ酸変化を含有していてもよい。ポリペプチド又は異種ポリペプチドのバリアントはまた、ＨＬＡ分子に結合する能力が改善されていてもよい。
本開示のバリアントは、保存的置換を含有するように遺伝子操作することができる。保存的置換は、本明細書では、以下の５つのグループのうちの１つ内での交換として定義される：グループ１－小さな脂肪族の非極性又はわずかに極性の残基（Ａｌａ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｐｒｏ、Ｇｌｙ）；グループ２－極性の負に帯電した残基及びそのアミド（Ａｓｐ、Ａｓｎ、Ｇｌｕ、Ｇｉｎ）；グループ３－極性の正に帯電した残基（Ｈｉｓ、Ａｒｇ、Ｌｙｓ）；グループ４－大きな脂肪族の非極性残基（Ｍｅｔ、Ｌｅｕ、ｌｉｅ、Ｖａｌ、Ｃｙｓ）；並びにグループ５－大きな芳香族残基（Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ）。
本開示のバリアントは、それほど保存的ではない置換、例えば、アラニンのイソロイシン残基による置換など、あるアミノ酸の、類似の特徴を有するが大きさが若干異なる別のアミノ酸による置換を含有するように遺伝子操作されていてもよい。本開示のバリアントはまた、極性である、又は更には塩基性の特徴であるものを酸性アミノ酸で置換することを含み得る、高度に非保存的な置換を含有するように遺伝子操作されていてもよい。
本開示のバリアントを作製するために行うことができる更なる置換としては、共通のＬ－アミノ酸以外の構造を伴い得る置換が挙げられる。したがって、Ｄ－アミノ及び非標準アミノ酸（すなわち、一般的な天然に存在するタンパク質原性アミノ酸以外）も、親と比較したときに強化された免疫原性を有するバリアントを生成するために置換目的で使用することができる。
１ヶ所超で置換がみられ、その結果、実質的に等価又はより高い免疫原性を有するポリペプチド又は異種ポリペプチドが得られた場合、これらの置換の組合せについて試験して、組み合わされた置換がバリアントの免疫原性に対して相加効果又は相乗効果をもたらすかどうかを判定することができる。
ＴＣＲとの相互作用に実質的に寄与しないアミノ酸残基は、組み込まれてもＴ細胞応答性に実質的に影響を及ぼさず、関連するＭＨＣへの結合を排除しない他のアミノ酸で置換することによって改変され得る。ＴＣＲとの相互作用に実質的に寄与しないアミノ酸残基はまた、Ｔ細胞応答性に実質的に影響を及ぼさず、関連するＭＨＣへの結合を排除しない限り、欠失させてもよい。
加えて、ポリペプチド若しくは異種ポリペプチド、又はこれらの断片、又はバリアントは、より強力な免疫応答を惹起するために、安定性及び／又はＭＨＣ分子に対する結合を改善するように更に改変されてもよい。ペプチド配列をこのように最適化する方法は、当該技術分野において周知であり、例えば、逆ペプチド結合又は非ペプチド結合の導入が挙げられる。逆ペプチド結合では、アミノ酸残基は、ペプチド（－ＣＯ－ＮＨ－）結合によって接合されるのではなく、ペプチド結合が逆である。そのようなレトロインベルソ（retro-inverso）ペプチド模倣体は、例えば、Ｍｅｚｉｅｒｅら（１９９７年）（Ｍｅｚｉｅｒｅら、１９９７年）に記載されているものなど、当該技術分野で既知の方法を用いて作製され得る。このアプローチは、側鎖の配向ではなく、主鎖に関与する変化を含有する疑ペプチドを作製することを伴う。Ｍｅｚｉｅｒｅら（Ｍｅｚｉｅｒｅら、１９９７年）は、ＭＨＣ結合及びＴヘルパー細胞応答のために、これらの偽ペプチドが有用であることを示す。ＣＯ－ＮＨペプチド結合の代わりにＮＨ－ＣＯ結合を含有するレトロインベルソ型ペプチドは、タンパク質分解に対する抵抗性がはるかに強い。使用され得る追加の非ペプチド結合は、例えば、－ＣＨ２－ＮＨ、－ＣＨ２Ｓ－、－ＣＨ２ＣＨ２－、－ＣＨ＝ＣＨ－、－ＣＯＣＨ２－、－ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２－、及び－ＣＨ２ＳＯ－であり得る。
ペプチドの安定性、生物学的利用能、及び／又は親和性を強化するために、アミノ及び／又はカルボキシ末端に追加の化学基が存在する本開示のポリペプチド若しくは異種ポリペプチド、又はこれらの断片、又はバリアントを合成してもよい。例えば、カルボベンゾキシル、ダンシル、又はｔ－ブチルオキシカルボニル基などの疎水性基をアミノ末端に付加してもよい。同様に、アセチル基又は９－フルオレニルメトキシ－カルボニル基をアミノ末端に配置してもよい。更に、疎水基、ｔ－ブチルオキシカルボニル、又はアミド基をカルボキシ末端に付加してもよい。
更に、本開示のポリペプチド若しくは異種ポリペプチド、又はこれらの断片、又はバリアントは、その立体配置を変化させるように合成されてもよい。例えば、通常のＬ－異性体ではなく、ペプチドのアミノ酸残基のうちの１つ以上のＤ－異性体を使用することができる。
同様に、本開示のポリペプチド若しくは異種ポリペプチド、又はこれらの断片、又はバリアントは、本開示のポリペプチド若しくは異種ポリペプチド、又はこれらの断片、又はバリアントを合成する前又は後のいずれかに特定のアミノ酸を反応させることによって化学的に修飾してもよい。このような修飾の例は、当該技術分野において周知であり、例えば、参照により本明細書に援用される、Ｒ．Ｌｕｎｄｂｌａｄ，Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｒｅａｇｅｎｔｓ ｆｏｒ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎ，３ｒｄ ｅｄ．ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，２００４（Ｌｕｎｄｂｌａｄ，２００４）にまとめられている。アミノ酸の化学修飾としては、限定するものではないが、アシル化による修飾、アミド化、リジンのピリドキシル化、還元的アルキル化、２，４，６－トリニトロベンゼンスルホン酸（ＴＮＢＳ）によるアミノ基のトリニトロベンジル化、カルボキシル基のアミド修飾及びシステインのシステイン酸への過ギ酸酸化によるスルフヒドリル修飾、水銀誘導体の形成、他のチオール化合物との混合ジスルフィドの形成、マレイミドとの反応、ヨード酢酸又はヨードアセトアミドによるカルボキシメチル化、並びにアルカリｐＨでのシアン酸によるカルバモイル化が挙げられるが、これらに限定されない。この点に関して、当業者は、タンパク質の化学修飾に関するより広範な方法論についてＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ Ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｅｄｓ．Ｃｏｌｉｇａｎ ｅｔ ａｌ．（Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ ＮＹ １９９５－２０００）（Ｃｏｌｉｇａｎ ｅｔ ａ ｌ．，１９９５）のＣｈａｐｔｅｒ１５を参照する。
簡潔に述べると、例えば、タンパク質中のアルギニン残基の修飾は、多くの場合、付加体を形成するための、フェニルグリオキサール、２，３－ブタンジオン、及び１，２－シクロヘキサンジオンなどの近接するジカルボニル化合物の反応に基づく。別の例は、メチルグリオキサールとアルギニン残基との反応である。システインは、リジン及びヒスチジンなどの他の求核部位を同時に修飾することなく修飾することができる。その結果、システインを修飾するために多数の試薬が利用可能である。Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈなどの企業のウェブサイト（ｈｔｔｐ＿：／／ｗｗｗ．ｓｉｇｍａ－ａｌｄｒｉｃｈ．ｃｏｍ）が、特定の試薬に関する情報を提供している。タンパク質中のジスルフィド結合の選択的還元も一般的である。ジスルフィド結合は、バイオ医薬品の熱処理中に形成され、酸化され得る。ウッドワード試薬Ｋを使用して、特定のグルタミン酸残基を修飾することもできる。Ｎ－（３－（ジメチルアミノ）プロピル）－Ｎ’－エチルカルボジイミドを使用して、リジン残基とグルタミン酸残基との間に分子内架橋を形成することができる。例えば、ジエチルピロカーボネートは、タンパク質中のヒスチジル残基を修飾するための試薬である。ヒスチジンは、４－ヒドロキシ－２－ノネナールを使用して修飾することもできる。リジン残基及び他のα－アミノ基の反応は、例えば、ペプチドの表面への結合又はタンパク質／ペプチドの架橋に有用である。リジンは、ポリ（エチレン）グリコールの結合部位、及びタンパク質のグリコシル化における修飾の主要部位である。タンパク質中のメチオニン残基は、例えば、ヨードアセトアミド、ブロモエチルアミン、及びクロルアミンＴで修飾することができる。チロシン残基の修飾には、テトラニトロメタン及びＮ－アセチルイミダゾールを使用することができる。ジチロシンの形成を介した架橋は、過酸化水素／銅イオンで達成することができる。トリプトファンの修飾に関する最近の研究では、Ｎ－ブロモスクシンイミド、２－ヒドロキシ－５－ニトロベンジルブロミド、又は３－ブロモ－３－メチル－２－（２－ニトロフェニルメルカプト）－３Ｈ－インドール（ＢＰＮＳ－スカトール）が使用されている。治療用タンパク質及びペプチドのＰＥＧによる修飾の成功は、多くの場合、循環半減期の延長に関連するが、ヒドロゲルの調製にはタンパク質とグルタルアルデヒド、ポリエチレングリコールジアクリレート、及びホルムアルデヒドとの架橋が使用される。免疫療法のためのアレルゲンの化学修飾は、多くの場合、シアン酸カリウムによるカルバミン化によって達成される。
本開示は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、又は４０５のポリペプチドと、約８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％同一である単離ポリペプチドを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、又は４０６のポリヌクレオチドと約８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、又は９９％同一である単離ポリヌクレオチドを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、又は４０５、及びこれらの断片のアミノ酸配列を含む単離ポリペプチドであって、ポリペプチドが１つ以上の逆ペプチド結合を含む、単離ポリペプチドを提供する。
いくつかの実施形態では、逆ペプチド結合は、ＮＨ－ＣＯ結合を含む。
いくつかの実施形態では、逆ペプチド結合は、ＣＨ２－ＮＨ、－ＣＨ２Ｓ－、－ＣＨ２ＣＨ２－、－ＣＨ＝ＣＨ－、－ＣＯＣＨ２－、－ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ２－、又は－ＣＨ２ＳＯ－結合を含む。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、又は４０５のアミノ酸配列含む単離ポリペプチドであって、ポリペプチドが１つ以上の化学修飾を含む、単離ポリペプチドを提供する。
いくつかの実施形態では、１つ以上の化学修飾は、カルボベンゾキシル、ダンシル、ｔ－ブチルオキシカルボニル、９－フルオレニルメトキシ－カルボニル、又はアミノ酸のＤ－異性体による修飾を含む。
本開示のポリヌクレオチド及びポリペプチドの作製方法
本開示のポリヌクレオチド又はバリアントは、クローニングによって得られる又は合成的に生成される、ＲＮＡの形態又はＤＮＡの形態であってよい。ＤＮＡは、二本鎖であっても一本鎖であってもよい。
本開示のポリヌクレオチド及び異種ポリヌクレオチド又はバリアントを生成する方法は、当該技術分野において既知であり、化学合成、酵素合成（例えば、インビトロ転写）、より長い前駆体の酵素的又は化学的切断、ポリヌクレオチドのより小さな断片を化学合成した後に断片をライゲーションする、又は既知のＰＣＲ方法が挙げられる。合成されるポリヌクレオチド配列は、所望のアミノ酸配列に適切なコドンを用いて設計することができる。一般に、好ましいコドンは、その配列が発現のために使用される、意図する宿主のために選択してよい。
本開示のポリペプチド及び異種ポリペプチドを作製する方法は、当該技術分野において既知であり、ポリペプチドのクローニング及び発現、並びにポリペプチドの化学合成のための標準的な分子生物学的技術が挙げられる。
ペプチドは、Ｌｕｋａｓら（Ｌｕｋａｓ ｅｔ ａｌ．，１９８１）及び本明細書に引用されている参照文献によって開示される固相ペプチド合成のＦｍｏｃ－ポリアミドモードによって合成され得る。９－フルオレニルメチルオキシカルボニル（Ｆｍｏｃ）基によって、一時的なＮ－アミノ基保護が与えられる。この高度に塩基不安定性である保護基の反復開裂は、Ｎ，Ｎ－ジメチルホルムアミド中２０％ピペリジンを用いて行われる。側鎖官能基は、そのブチルエーテル（セリントレオニン及びチロシンの場合）、ブチルエステル（グルタミン酸及びアスパラギン酸の場合）、ブチルオキシカルボニル誘導体（リジン及びヒスチジンの場合）、トリチル誘導体（システインの場合）、及び４－メトキシ－２，３，６－トリメチルベンゼンスルホニル誘導体（アルギニンの場合）として保護され得る。グルタミン又はアスパラギンがＣ末端残基である場合、側鎖アミド官能基を保護するために４，４’－ジメトキシベンズヒドリル基が使用される。固相支持体は、３つのモノマー、ジメチルアクリルアミド（主鎖モノマー）、ビスアクリロイルエチレンジアミン（架橋剤）、及びアクリロイルサルコシンメチルエステル（官能化剤）から構成されるポリジメチル－アクリルアミドポリマーに基づく。使用されるペプチド－樹脂開裂可能連結剤は、酸不安定性の４－ヒドロキシメチル－フェノキシ酢酸誘導体である。全てのアミノ酸誘導体は、アスパラギン及びグルタミンを除いて、その予め形成された対称無水物誘導体として付加され、これは、逆Ｎ，Ｎ－ジシクロヘキシル－カルボジイミド／１ヒドロキシベンゾトリアゾール介在カップリング手順を用いて付加される。全てのカップリング及び脱保護反応は、ニンヒドリン、トリニトロベンゼンスルホン酸、又はイソチン（isotin）試験手順を使用してモニタリングされる。合成が完了すると、５０％スカベンジャーミックスを含有する９５％トリフルオロ酢酸で処理することにより側鎖保護基を除去すると同時に、ペプチドを樹脂支持体から切断する。一般に使用されるスカベンジャーとしては、エタンジチオール、フェノール、アニソール、及び水が挙げられ、的確な選択は、合成されるペプチドの構成アミノ酸に依存する。また、ペプチドを合成するための固相及び液相方法の組合せも可能である（例えば、（Ｂｒｕｃｋｄｏｒｆｅｒ ｅｔ ａｌ．，２００４）及びその中に引用されている参照文献を参照されたい）。
米国特許第４，８９７，４４５号は、標準的な手順によって合成されるポリペプチド含むポリペプチド鎖中の非ペプチド結合（－ＣＨ２－ＮＨ）、及びＮａＣＮＢＨ３の存在下でアミノアルデヒドとアミノ酸とを反応させることによって合成される非ペプチド結合の固相合成方法を提供している。
本開示のベクター及び組換えウイルス
本開示はまた、本開示のポリヌクレオチド若しくは異種ポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。本開示はまた、本明細書に開示される１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片の１つ以上のポリヌクレオチドを含むベクターを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む異種ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、及び４０６、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリヌクレオチドを含む異種ポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
本開示はまた、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２３、１２４、１２５、１２６、１２７、１２８、１２９、１３０、１３１、１３２、１３３、１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、１３９、１４０、１４１、１４２、１４３、１４４、１４５、１４６、１４７、１４８、１４９、１５０、１５１、１５２、１５３、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４、１６５、１６６、１６７、１６８、１６９、１７０、１７１、１７２、１７３、１７４、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、１８３、１８４、１８５、１８６、１８７、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、１９３、１９４、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、２０２、又は２０３個のポリペプチドを含む異種ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
本開示はまた、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、及び４０６、並びにこれらの断片からなる群から選択される、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、７８、７９、８０、８１、８２、８３、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０１、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２、１１３、１１４、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２３、１２４、１２５、１２６、１２７、１２８、１２９、１３０、１３１、１３２、１３３、１３４、１３５、１３６、１３７、１３８、１３９、１４０、１４１、１４２、１４３、１４４、１４５、１４６、１４７、１４８、１４９、１５０、１５１、１５２、１５３、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４、１６５、１６６、１６７、１６８、１６９、１７０、１７１、１７２、１７３、１７４、１７５、１７６、１７７、１７８、１７９、１８０、１８１、１８２、１８３、１８４、１８５、１８６、１８７、１８８、１８９、１９０、１９１、１９２、１９３、１９４、１９５、１９６、１９７、１９８、１９９、２００、２０１、２０２、又は２０３個のポリヌクレオチドを含む異種ポリヌクレオチドを含む、ベクターを提供する。
いくつかの実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。
いくつかの実施形態では、ベクターは、発現ベクターである。ベクターは、細菌、酵母、又は哺乳類などの任意の宿主における本開示のポリヌクレオチド又は異種ポリヌクレオチドの発現を意図するベクターであってよい。好適な発現ベクターは、典型的には、エピソームとして、又は宿主染色体ＤＮＡの不可欠な部分として、宿主生物において複製可能である。通常、発現ベクターは、所望のＤＮＡ配列で形質転換若しくは形質導入された細胞の検出を可能にするため、アンピシリン抵抗性、ヒグロマイシン抵抗性、テトラサイクリン抵抗性、カナマイシン抵抗性、又はネオマイシン抵抗性などの選択マーカーを含有する。例示的なベクターは、プラスミド、コスミド、ファージ、ウイルスベクター、トランスポゾン、又は人工染色体である。
好適なベクターは既知であり、多くが、組換えコンストラクトを生成するために市販されている。例えば以下のベクターが提供されている。細菌系：ｐＢｓ、ｐｈａｇｅｓｃｒｉｐｔ、ＰｓｉＸ１７４、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫ、ｐＢｓ ＫＳ、ｐＮＨ８ａ、ｐＮＨ１６ａ、ｐＮＨ１８ａ、ｐＮＨ４６ａ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｌａ Ｊｏｌｌａ，Ｃａｌｉｆ．，ＵＳＡ）；ｐＴｒｃ９９Ａ、ｐＫＫ２２３－３、ｐＫＫ２３３－３、ｐＤＲ５４０、及びｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）である。真核生物：ｐＷＬｎｅｏ、ｐＳＶ２ｃａｔ、ｐＯＧ４４、ＰＸＲ１、ｐＳＧ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）、ｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧ、及びｐＳＶＬ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）。トランスポストンベクター：Ｓｌｅｅｐ Ｂｅａｕｔｙトランスポゾン及びＰｉｇｇｙＢａｃトランスポゾン。
いくつかの実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。本開示のベクターを利用して、本開示のベクターを含む組換えウイルスを作製する、又は本開示のポリペプチドを発現させることができる。ウイルスベクターは、天然に存在するウイルスゲノムに由来し、典型的には複製不全、例えば、非複製性になるように改変される。非複製ウイルスは、複製のためにトランスにタンパク質を提供することを必要とする。典型的には、これらのタンパク質は、ウイルス生成細胞株において安定的に又は一過的に発現し、それによってウイルスの複製を可能にする。したがって、ウイルスベクターは、典型的には感染性及び非複製性である。ウイルスベクターは、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクター（例えば、ＡＡＶ５型及び２型）、アルファウイルスベクター（例えば、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＶＥＥ）、シンドビスウイルス（ＳＩＮ）、セムリキ森林ウイルス（ＳＦＶ）、及びＶＥＥ－ＳＩＮキメラ）、ヘルペスウイルスベクター（例えば、アカゲザルサイトメガロウイルス（ＲｈＣＭＶ）のようなサイトメガロウイルスに由来するベクター）、アレナウイルスベクター（例えば、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス（ＬＣＭＶ）ベクター）、麻疹ウイルスベクター、ポックスウイルスベクター（例えば、ワクシニアウイルス、改変ワクシニアウイルアンカラ（ＭＶＡ）、ＮＹＶＡＣ（ワクシニアのコペンハーゲン株に由来）、及びトリポックスベクター：カナリアポックス（ＡＬＶＡＣ）及び鶏痘（ＦＰＶ）ベクター）、水疱性口内炎ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター、ウイルス様粒子、バキュロウイルスベクター、及び細菌胞子であってよい。
本開示のベクターは、既知の技術を使用して作製することができる。本開示はまた、本開示のベクターを含む組換えウイルスを提供する。
アデノウイルスベクター
いくつかの実施形態では、ウイルスベクターは、アデノウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ベクターを含む組換えウイルスは、アデノウイルスに由来する。
アデノウイルスベクターは、ヒトアデノウイルス（Ａｄ）由来だけでなく、ウシアデノウイルス（例えば、ウシアデノウイルス３、ＢＡｄＶ３）、イヌアデノウイルス（例えばＣＡｄＶ２）、ブタアデノウイルス（例えば、ＰＡｄＶ３又は５）、又はチンパンジー（Ｐａｎ）、ゴリラ（Ｇｏｒｉｌｌａ）、オランウータン（Ｐｏｎｇｏ）、ボノボ（Ｐａｎ ｐａｎｉｓｃｕｓ）、及びナミチンパンジー（Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ）などの大型類人猿などの他の種に感染するアデノウイルス由来であってもよい。典型的には、天然に存在する大型類人猿アデノウイルスは、それぞれの大型類人猿の糞便サンプルから単離される。
ヒトアデノウイルスベクターは、様々なアデノウイルス血清型、例えば、ヒトアデノウイルス血清型ｈＡｄ５、ｈＡｄ７、ｈＡｄ１１、ｈＡｄ２６、ｈＡｄ３４、ｈＡｄ３５、ｈＡｄ４８、ｈＡｄ４９、又はｈＡｄ５０（血清型は、Ａｄ５、Ａｄ７、Ａｄ１１、Ａｄ２６、Ａｄ３４、Ａｄ３５、Ａｄ４８、Ａｄ４９、又はＡｄ５０とも称される）に由来していてよい。
大型類人猿アデノウイルスベクターは、様々なアデノウイルス血清型、例えば、大型類人猿アデノウイルス血清型ＧＡｄ２０、Ｇａｄ１９、ＧＡｄ２１、ＧＡｄ２５、ＧＡｄ２６、ＧＡｄ２７、ＧＡｄ２８、ＧＡｄ２９、ＧＡｄ３０、ＧＡｄ３１、ＣｈＡｄ３、ＣｈＡｄ４、ＣｈＡｄ５、ＣｈＡｄ６、ＣｈＡｄ７、ＣｈＡｄ８、ＣｈＡｄ９、ＣｈＡｄ１０、ＣｈＡｄ１１、ＣｈＡｄ１６、ＣｈＡｄＩ７、ＣｈＡｄ１９、ＣｈＡｄ２０、ＣｈＡｄ２２、ＣｈＡｄ２４、ＣｈＡｄ２６、ＣｈＡｄ３０、ＣｈＡｄ３１、ＣｈＡｄ３７、ＣｈＡｄ３８、ＣｈＡｄ４４、ＣｈＡｄ５５、ＣｈＡｄ６３、ＣｈＡｄ７３、ＣｈＡｄ８２、ＣｈＡｄ８３、ＣｈＡｄ１４６、ＣｈＡｄ１４７、ＰａｎＡｄ１、ＰａｎＡｄ２、又はＰａｎＡｄ３に由来していてよい。
アデノウイルスベクターは、当該技術分野において既知である。ヒト及び非ヒトアデノウイルスの大部分の配列は既知であり、その他については、常法を用いて得ることができる。Ａｄ２６の例示的なゲノム配列は、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号ＥＦ１５３４７４及び国際公開第２００７／１０４７９２号の配列番号１に見出される。Ａｄ３５の例示的なゲノム配列は、国際公開第２０００／７００７１号の図６に見出される。Ａｄ２６に基づくベクターは、例えば、国際公開第２００７／１０４７９２号に記載されている。Ａｄ３５に基づくベクターは、例えば、米国特許第７，２７０，８１１号及び国際公開第２０００／７００７１号に記載されている。ＣｈＡｄ３、ＣｈＡｄ４、ＣｈＡｄ５、ＣｈＡｄ６、ＣｈＡｄ７、ＣｈＡｄ８、ＣｈＡｄ９、ＣｈＡｄ１０、ＣｈＡｄ１１、ＣｈＡｄ１６、ＣｈＡｄ１７、ＣｈＡｄ１９、ＣｈＡｄ２０、ＣｈＡｄ２２、ＣｈＡｄ２４、ＣｈＡｄ２６、ＣｈＡｄ３０、ＣｈＡｄ３１、ＣｈＡｄ３７、ＣｈＡｄ３８、ＣｈＡｄ４４、ＣｈＡｄ６３、及びＣｈＡｄ８２に基づくベクターは、国際公開第２００５／０７１０９３号に記載されている。ＰａｎＡｄ１、ＰａｎＡｄ２、ＰａｎＡｄ３、ＣｈＡｄ５５、ＣｈＡｄ７３、ＣｈＡｄ８３、ＣｈＡｄ１４６、及びＣｈＡｄ１４７に基づくベクターは、国際公開第２０１０／０８６１８９号に記載されている。
アデノウイルスベクターは、アデノウイルス領域Ｅ１、Ｅ２、及びＥ４のうちの１つ以上などのウイルス複製に必須である遺伝子産物の少なくとも１つが機能的に欠失するか又は完全に除去され、それによって、アデノウイルスが複製できなくなるように遺伝子操作される。Ｅｌ領域の欠失は、ＥＩＡ、ＥＩＢ ５５Ｋ、若しくはＥＩＢ ２１Ｋの欠失、又はこれらの任意の組合せを含んでいてよい。複製欠損アデノウイルスは、ヘルパープラスミドを利用して欠失領域にコードされているタンパク質を生成細胞によりトランスに提供することによって、又は生成細胞を遺伝子操作して必要なタンパク質を発現させることによって増殖する。アデノウイルスベクターはまた、複製に不要であるＥ３領域に欠失を有していてもよく、したがって、このような欠失は、相補される必要はない。本開示のアデノウイルスベクターは、Ｅ１領域、及びＥ３領域の少なくとも一部が機能的に欠失しているか又は完全に除去されていてもよい。本開示のアデノウイルスベクターは、更に、Ｅ４領域及び／又はＥ２領域が機能的に欠失しているか又は完全に除去されていてもよい。利用することができる好適な生成細胞は、Ｅｌによって不死化したヒト網膜細胞、例えば、９１１又はＰＥＲ．Ｃ６細胞（例えば、米国特許第５，９９４，１２８号を参照されたい）、Ｅｌ－形質転換羊膜細胞（例えば、欧州特許第１２３０３５４号を参照されたい）、Ｅ１－形質転換Ａ５４９細胞（例えば、国際公開第１９９８／３９４１１号、米国特許第５，８９１，６９０号を参照されたい）である。使用することができる例示的なベクターは、Ｅ４オープンリーディングフレーム６／７が欠失していない限り、ウイルス複製に十分な機能的Ｅ１コード領域を含み、Ｅ３コード領域が欠失しており、かつＥ４コード領域が欠失しているＡｄ２６である（例えば、米国特許第９，７５０，８０１号を参照されたい）。
いくつかの実施形態では、アデノウイルスベクターは、ヒトアデノウイルス（Ａｄ）ベクターである。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ５に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ１１に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ２６に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ３４に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ３５に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ４８に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ４９に由来する。いくつかの実施形態では、Ａｄベクターは、Ａｄ５０に由来する。
いくつかの実施形態では、アデノウイルスベクターは、大型類人猿アデノウイルス（ＧＡｄ）ベクターである。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２０に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ１９に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２１に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２５に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２６に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２７に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２８に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ２９に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ３０に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＧＡｄ３１に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ４に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ５に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ６に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ７に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ８に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ９に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ２０に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ２２に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ２４に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ２６に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ３０に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ３１に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ３２に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ３３に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ３７に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ３８に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ４４に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ５５に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ６３に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ６８に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ７３に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ８２に由来する。いくつかの実施形態では、ＧＡｄベクターは、ＣｈＡｄ８３に由来する。
本開示のポリペプチド又は異種ポリペプチドは、得られる組換えウイルスのウイルス生存能力に影響を及ぼさないベクター内の部位又は領域（挿入領域）に挿入することができる。本開示のポリペプチド又は異種ポリペプチドは、欠失したＥ１領域に平行に（５’→３’に転写）又は逆平行（ベクター主鎖に対して３’→５’方向に転写）の配向で挿入され得る。加えて、使用のためにベクターが調製される哺乳類宿主細胞において本開示のポリペプチド又は異種ポリペプチドの発現を指示することができる適切な転写調節エレメントは、本開示のポリペプチド又は異種ポリペプチドに操作可能に連結され得る。「操作可能に連結された」配列は、この配列が調節する核酸配列に隣接する発現制御配列と、トランスに作用するか又は調節される核酸配列を制御するための距離にある調節配列とを両方含む。
組換えアデノウイルス粒子は、ウイルス複製に必要な欠損ウイルス遺伝子をトランスに供給する相補細胞株又はヘルパーウイルスを使用して、当該技術分野における任意の従来技術（例えば、国際公開第１９９６／１７０７０号）に従って調製し、増殖させることができる。細胞株２９３（Ｇｒａｈａｍ ｅｔ ａｌ．，１９７７，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．３６：５９－７２）、ＰＥＲ．Ｃ６（例えば、米国特許第５，９９４，１２８号を参照されたい）、Ｅ１ Ａ５４９、及び９１１は、Ｅｌ欠失を相補するために一般的に使用される。他の細胞株は、欠陥ベクターを相補するように遺伝子操作されている（Ｙｅｈ，ｅｔ ａｌ．，１９９６，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７０：５５９－５６５；Ｋｒｏｕｇｈａｋ ａｎｄ Ｇｒａｈａｍ，１９９５，Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．６：１５７５－１５８６；Ｗａｎｇ，ｅｔ ａｌ．，１９９５，Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．２：７７５－７８３；Ｌｕｓｋｙ，ｅｔ ａｌ．，１９９８，Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７２：２０２２－２０３；欧州特許第９１９６２７号、及び国際公開第１９９７／０４１１９号）。アデノウイルス粒子は、培養上清からだけでなく、溶解後の細胞からも回収することができ、任意選択で、標準的な技術に従って更に精製してよい（例えば、国際公開第１９９６／２７６７７号、国際公開第１９９８／００５２４号、国際公開第１９９８／２６０４８号、及び国際公開第２０００／５０５７３号に記載されているようなクロマトグラフィー、超遠心分離）。アデノウイルスベクターの構築及び増殖方法は、例えば、米国特許第５，５５９，０９９号、同第５，８３７，５１１号、同第５，８４６，７８２号、同第５，８５１，８０６号、同第５，９９４，１０６号、同第５，９９４，１２８号、同第５，９６５，５４１号、同第５，９８１，２２５号、同第６，０４０，１７４号、同第６，０２０，１９１号及び同第６，１１３，９１３号に記載されている。
本開示は、本開示のベクターを含む組換えアデノウイルスを提供する。本開示はまた、本開示のベクターを含む組換えヒトアデノウイルス（ｒＡｄ）を提供する。本開示はまた、本開示のベクターを含む血清型２６に由来する組換えヒトアデノウイルス（ｒＡｄ２６）を提供する。
本開示のポリヌクレオチドのうちのいずれかを含むウイルスベクターが、本明細書で提供され、ベクターは、ｈＡｄ２６に由来する（Ａｄ２６を有するとも呼ばれる）。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１の、又は配列番号１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３の、又は配列番号３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号５の、又は配列番号５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号７の、又は配列番号７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号９の、又は配列番号９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１１の、又は配列番号１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１３の、又は配列番号１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１５の、又は配列番号１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１７の、又は配列番号１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１９の、又は配列番号１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは配列番号１９と少なくとも９９％の配列同一性を有する、ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２１のポリペプチド、又は配列番号２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有するポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２３のポリペプチド、又は配列番号２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有するポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２５の、又は配列番号２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２７の、又は配列番号２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２９の、又は配列番号２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３１の、又は配列番号３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３３の、又は配列番号３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３５の、又は配列番号３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３７の、又は配列番号３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３９の、又は配列番号３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４１の、又は配列番号４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４３の、又は配列番号４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４５の、又は配列番号４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４７の、又は配列番号４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４９の、又は配列番号４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号５１の、又は配列番号５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号５３の、又は配列番号５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号５５の、又は配列番号５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号５７の、又は配列番号５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号５９の、又は配列番号５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号６１の、又は配列番号６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号６３の、又は配列番号６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号６５の、又は配列番号６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号６７の、又は配列番号６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号６９の、又は配列番号６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号７１の、又は配列番号７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号７３の、又は配列番号７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号７５の、又は配列番号７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号７７の、又は配列番号７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号７９の、又は配列番号７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号８１の、又は配列番号８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号８３の、又は配列番号８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号８５の、又は配列番号８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号８７の、又は配列番号８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号８９の、又は配列番号８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号９１の、又は配列番号９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号９３の、又は配列番号９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号９５の、又は配列番号９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号９７の、又は配列番号９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号９９の、又は配列番号９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１０１の、又は配列番号１０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１０３の、又は配列番号１０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１０５の、又は配列番号１０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１０７の、又は配列番号１０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１０９の、又は配列番号１０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１１１の、又は配列番号１１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１１３の、又は配列番号１１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１１５の、又は配列番号１１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１１７の、又は配列番号１１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１１９の、又は配列番号１１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１２１の、又は配列番号１２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１２３の、又は配列番号１２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１２５の、又は配列番号１２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１２７の、又は配列番号１２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１２９の、又は配列番号１２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１３１の、又は配列番号１３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１３３の、又は配列番号１３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１３５の、又は配列番号１３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１３７の、又は配列番号１３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１３９の、又は配列番号１３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１４１の、又は配列番号１４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１４３の、又は配列番号１４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１４５の、又は配列番号１４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１４７の、又は配列番号１４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１４９の、又は配列番号１４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１５１の、又は配列番号１５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１５３の、又は配列番号１５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１５５の、又は配列番号１５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１５７の、又は配列番号１５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１５９の、又は配列番号１５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１６１の、又は配列番号１６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１６３の、又は配列番号１６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１６５の、又は配列番号１６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１６７の、又は配列番号１６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１６９の、又は配列番号１６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１７１の、又は配列番号１７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１７３の、又は配列番号１７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１７５の、又は配列番号１７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１７７の、又は配列番号１７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１７９の、又は配列番号１７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１８１の、又は配列番号１８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１８３の、又は配列番号１８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１８５の、又は配列番号１８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１８７の、又は配列番号１８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１８９の、又は配列番号１８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１９１の、又は配列番号１９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１９３の、又は配列番号１９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１９５の、又は配列番号１９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１９７の、又は配列番号１９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１９９の、又は配列番号１９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２０１の、又は配列番号２０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２０３の、又は配列番号２０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２０５の、又は配列番号２０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２０７の、又は配列番号２０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２０９の、又は配列番号２０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２１１の、又は配列番号２１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２１３の、又は配列番号２１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２１５の、又は配列番号２１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２１７の、又は配列番号２１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２１９の、又は配列番号２１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２２１の、又は配列番号２２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２２３の、又は配列番号２２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２２５の、又は配列番号２２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２２７の、又は配列番号２２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２２９の、又は配列番号２２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２３１の、又は配列番号２３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２３３の、又は配列番号２３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２３５の、又は配列番号２３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２３７の、又は配列番号２３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２３９の、又は配列番号２３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２４１の、又は配列番号２４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２４３の、又は配列番号２４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２４５の、又は配列番号２４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２４７の、又は配列番号２４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２４９の、又は配列番号２４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２５１の、又は配列番号２５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２５３の、又は配列番号２５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２５５の、又は配列番号２５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２５７の、又は配列番号２５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２５９の、又は配列番号２５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２６１の、又は配列番号２６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２６３の、又は配列番号２６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２６５の、又は配列番号２６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２６７の、又は配列番号２６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２６９の、又は配列番号２６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２７１の、又は配列番号２７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２７３の、又は配列番号２７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２７５の、又は配列番号２７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２７７の、又は配列番号２７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２７９の、又は配列番号２７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２８１の、又は配列番号２８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２８３の、又は配列番号２８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２８５の、又は配列番号２８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２８７の、又は配列番号２８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２８９の、又は配列番号２８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２９１の、又は配列番号２９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２９３の、又は配列番号２９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２９５の、又は配列番号２９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２９７の、又は配列番号２９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号２９９の、又は配列番号２９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３０１の、又は配列番号３０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３０３の、又は配列番号３０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３０５の、又は配列番号３０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３０７の、又は配列番号３０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３０９の、又は配列番号３０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３１１の、又は配列番号３１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３１３の、又は配列番号３１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３１５の、又は配列番号３１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３１７の、又は配列番号３１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３１９の、又は配列番号３１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３２１の、又は配列番号３２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３２３の、又は配列番号３２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３２５の、又は配列番号３２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３２７の、又は配列番号３２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３２９の、又は配列番号３２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３３１の、又は配列番号３３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３３３の、又は配列番号３３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３３５の、又は配列番号３３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３３７の、又は配列番号３３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３３９の、又は配列番号３３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３４１の、又は配列番号３４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３４３の、又は配列番号３４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３４５の、又は配列番号３４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３４７の、又は配列番号３４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３４９の、又は配列番号３４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３５１の、又は配列番号３５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３５３の、又は配列番号３５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３５５の、又は配列番号３５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３５７の、又は配列番号３５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３５９の、又は配列番号３５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３６１の、又は配列番号３６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３６３の、又は配列番号３６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３６５の、又は配列番号３６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３６７の、又は配列番号３６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３６９の、又は配列番号３６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３７１の、又は配列番号３７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３７３の、又は配列番号３７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３７５の、又は配列番号３７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３７７の、又は配列番号３７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３７９の、又は配列番号３７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３８１の、又は配列番号３８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３８３の、又は配列番号３８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３８５の、又は配列番号３８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３８７の、又は配列番号３８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３８９の、又は配列番号３８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３９１の、又は配列番号３９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３９３の、又は配列番号３９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３９５の、又は配列番号３９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３９７の、又は配列番号３９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号３９９の、又は配列番号３９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４０１の、又は配列番号４０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４０３の、又は配列番号４０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号４０５の、又は配列番号４０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、Ａｄ２６ベクターは、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの断片から選択されるポリペプチドの２つ以上のアミノ酸配列をコードする、ポリヌクレオチドを含む。
本開示はまた、本開示のベクターを含む組換え大型類人猿アデノウイルス（ｒＧＡｄ）を提供する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２０に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ１９に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２１に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２５に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２６に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２７に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２８に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ２９に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ３０に由来する。いくつかの実施形態では、ｒＧＡｄは、ＧＡｄ３１に由来する。ＧＡｄ１９－２１及びＧＡｄ２５－３１は、国際公開第２０１９／００８１１１号に記載されており、一般的なヒト集団において高い免疫原性を有し、既存の免疫は有しない株を表す。ＧＡｄ２０ゲノムのポリヌクレオチド配列は、国際公開第２０１９／００８１１１号に開示されている。
本明細書はまた、本開示のベクターを含む血清型２０に由来する組換えチンパンジーアデノウイルス（ｒＣｈＡｄ２０）を提供する。いくつかの実施形態では、本開示のポリヌクレオチドのうちのいずれかを含むウイルスベクターは、ＧＡｄ２０に由来するベクターである。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１の、又は配列番号１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３の、又は配列番号３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号５の、又は配列番号５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号７の、又は配列番号７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号９の、又は配列番号９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１１の、又は配列番号１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１３の、又は配列番号１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１５の、又は配列番号１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１７の、又は配列番号１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１９の、又は配列番号１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは配列番号１９と少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２１の、又は配列番号２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２３の、又は配列番号２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２５の、又は配列番号２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２７の、又は配列番号２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２９の、又は配列番号２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３１の、又は配列番号３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３３の、又は配列番号３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３５の、又は配列番号３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３７の、又は配列番号３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３９の、又は配列番号３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４１の、又は配列番号４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４３の、又は配列番号４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４５の、又は配列番号４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４７の、又は配列番号４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４９の、又は配列番号４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号５１の、又は配列番号５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号５３の、又は配列番号５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号５５の、又は配列番号５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号５７の、又は配列番号５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号５９の、又は配列番号５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号６１の、又は配列番号６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号６３の、又は配列番号６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号６５の、又は配列番号６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号６７の、又は配列番号６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号６９の、又は配列番号６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号７１の、又は配列番号７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号７３の、又は配列番号７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号７５の、又は配列番号７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号７７の、又は配列番号７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号７９の、又は配列番号７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号８１の、又は配列番号８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号８３の、又は配列番号８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号８５の、又は配列番号８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号８７の、又は配列番号８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号８９の、又は配列番号８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号９１の、又は配列番号９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号９３の、又は配列番号９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号９５の、又は配列番号９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号９７の、又は配列番号９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号９９の、又は配列番号９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１０１の、又は配列番号１０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１０３の、又は配列番号１０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１０５の、又は配列番号１０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１０７の、又は配列番号１０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１０９の、又は配列番号１０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１１１の、又は配列番号１１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１１３の、又は配列番号１１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１１５の、又は配列番号１１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１１７の、又は配列番号１１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１１９の、又は配列番号１１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１２１の、又は配列番号１２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１２３の、又は配列番号１２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１２５の、又は配列番号１２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１２７の、又は配列番号１２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１２９の、又は配列番号１２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１３１の、又は配列番号１３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１３３の、又は配列番号１３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１３５の、又は配列番号１３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１３７の、又は配列番号１３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１３９の、又は配列番号１３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１４１の、又は配列番号１４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１４３の、又は配列番号１４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１４５の、又は配列番号１４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１４７の、又は配列番号１４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１４９の、又は配列番号１４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１５１の、又は配列番号１５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１５３の、又は配列番号１５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１５５の、又は配列番号１５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１５７の、又は配列番号１５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１５９の、又は配列番号１５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１６１の、又は配列番号１６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１６３の、又は配列番号１６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１６５の、又は配列番号１６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１６７の、又は配列番号１６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１６９の、又は配列番号１６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１７１の、又は配列番号１７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１７３の、又は配列番号１７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１７５の、又は配列番号１７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１７７の、又は配列番号１７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１７９の、又は配列番号１７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１８１の、又は配列番号１８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１８３の、又は配列番号１８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１８５の、又は配列番号１８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１８７の、又は配列番号１８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１８９の、又は配列番号１８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１９１の、又は配列番号１９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１９３の、又は配列番号１９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１９５の、又は配列番号１９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１９７の、又は配列番号１９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１９９の、又は配列番号１９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２０１の、又は配列番号２０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２０３の、又は配列番号２０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２０５の、又は配列番号２０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２０７の、又は配列番号２０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２０９の、又は配列番号２０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２１１の、又は配列番号２１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２１３の、又は配列番号２１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２１５の、又は配列番号２１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２１７の、又は配列番号２１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２１９の、又は配列番号２１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２２１の、又は配列番号２２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２２３の、又は配列番号２２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２２５の、又は配列番号２２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２２７の、又は配列番号２２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２２９の、又は配列番号２２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２３１の、又は配列番号２３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２３３の、又は配列番号２３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２３５の、又は配列番号２３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２３７の、又は配列番号２３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２３９の、又は配列番号２３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２４１の、又は配列番号２４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２４３の、又は配列番号２４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２４５の、又は配列番号２４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２４７の、又は配列番号２４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２４９の、又は配列番号２４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２５１の、又は配列番号２５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２５３の、又は配列番号２５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２５５の、又は配列番号２５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２５７の、又は配列番号２５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２５９の、又は配列番号２５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２６１の、又は配列番号２６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２６３の、又は配列番号２６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２６５の、又は配列番号２６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２６７の、又は配列番号２６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２６９の、又は配列番号２６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２７１の、又は配列番号２７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２７３の、又は配列番号２７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２７５の、又は配列番号２７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２７７の、又は配列番号２７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２７９の、又は配列番号２７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２８１の、又は配列番号２８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２８３の、又は配列番号２８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２８５の、又は配列番号２８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２８７の、又は配列番号２８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２８９の、又は配列番号２８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２９１の、又は配列番号２９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２９３の、又は配列番号２９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２９５の、又は配列番号２９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２９７の、又は配列番号２９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号２９９の、又は配列番号２９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３０１の、又は配列番号３０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３０３の、又は配列番号３０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３０５の、又は配列番号３０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３０７の、又は配列番号３０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３０９の、又は配列番号３０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３１１の、又は配列番号３１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３１３の、又は配列番号３１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３１５の、又は配列番号３１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３１７の、又は配列番号３１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３１９の、又は配列番号３１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３２１の、又は配列番号３２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３２３の、又は配列番号３２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３２５の、又は配列番号３２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３２７の、又は配列番号３２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３２９の、又は配列番号３２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３３１の、又は配列番号３３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３３３の、又は配列番号３３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３３５の、又は配列番号３３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３３７の、又は配列番号３３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３３９の、又は配列番号３３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３４１の、又は配列番号３４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３４３の、又は配列番号３４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３４５の、又は配列番号３４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３４７の、又は配列番号３４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３４９の、又は配列番号３４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３５１の、又は配列番号３５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３５３の、又は配列番号３５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３５５の、又は配列番号３５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３５７の、又は配列番号３５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３５９の、又は配列番号３５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３６１の、又は配列番号３６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３６３の、又は配列番号３６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３６５の、又は配列番号３６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３６７の、又は配列番号３６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３６９の、又は配列番号３６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３７１の、又は配列番号３７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３７３の、又は配列番号３７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３７５の、又は配列番号３７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３７７の、又は配列番号３７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３７９の、又は配列番号３７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３８１の、又は配列番号３８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３８３の、又は配列番号３８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３８５の、又は配列番号３８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３８７の、又は配列番号３８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３８９の、又は配列番号３８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３９１の、又は配列番号３９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３９３の、又は配列番号３９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３９５の、又は配列番号３９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３９７の、又は配列番号３９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号３９９の、又は配列番号３９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４０１の、又は配列番号４０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４０３の、又は配列番号４０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号４０５の、又は配列番号４０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＧＡｄ２０ベクターは、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの断片から選択されるポリペプチドの２つ以上のアミノ酸配列をコードする、ポリヌクレオチドを含む。
ポックスウイルスベクター
いくつかの実施形態では、ウイルスベクターは、ポックスウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ベクターを含む組換えウイルスは、ポックスウイルスに由来する。
ポックスウイルス（ポックスウイルス科）ベクターは、天然痘ウイルス（痘瘡）、ワクシニアウイルス、牛痘ウイルス、又はサル痘ウイルスに由来していてよい。例示的なワクシニアウウイルスは、コペンハーゲンワクシニアウイルス（Ｗ）、ニューヨーク弱毒ワクシニアウイルス（ＮＹＶＡＣ）、ＡＬＶＡＣ、ＴＲＯＶＡＣ、及び改変ワクシニアウイルス（ＭＶＡ）である。
ＭＶＡは、Ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ（Ａｎｋａｒａ， Ｔｕｒｋｅｙ）において長年維持され、ヒトのワクチン接種の基礎として使用されてきた皮膚ワクシニア株アンカラ（アンカラ絨毛尿膜ワクシニア（ＣＶＡ）ウイルス）を起源とする。しかしながら、ワクシニアウイルス（ＶＡＣＶ）に関連する重度のワクチン後合併症が多いことから、より弱毒化された、より安全な天然痘ワクチンを作製するいくつかの試みが行われた。
ＭＶＡは、ＣＶＡウイルスのニワトリ胚線維芽細胞を５１６回連続継代することによって生成されている（Ｍｅｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．，７２：１０３１－１０３８（１９９１）、及び米国特許第１０，０３５，８３２号を参照されたい）。これらの長期継代の結果として、得られたＭＶＡウイルスは、そのゲノム配列の約３１キロベースが欠失しており、したがって、高度にトリ細胞に限定された宿主細胞として記載されていた（Ｍｅｙｅｒ，Ｈ．ｅｔ ａｌ．，Ｍａｐｐｉｎｇ ｏｆ ｄｅｌｅｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｔｈｅ ｈｉｇｈｌｙ ａｔｔｅｎｕａｔｅｄ ｖａｃｃｉｎｉａ ｖｉｒｕｓ ＭＶＡ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｉｎｆｌｕｅｎｃｅ ｏｎ ｖｉｒｕｌｅｎｃｅ，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．７２，１０３１－１０３８，１９９１；Ｍｅｉｓｉｎｇｅｒ－Ｈｅｎｓｃｈｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｏｍｉｃ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ｃｈｏｒｉｏａｌｌａｎｔｏｉｓ ｖａｃｃｉｎｉａ ｖｉｒｕｓ Ａｎｋａｒａ，ｔｈｅ ａｎｃｅｓｔｏｒ ｏｆ ｍｏｄｉｆｉｅｄ ｖａｃｃｉｎｉａ ｖｉｒｕｓ Ａｎｋａｒａ，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８８，３２４９－３２５９，２００７）。ＭＶＡゲノムをその親ＣＶＡと比較すると、合計３１，０００塩基対のゲノムＤＮＡの６つの主要な欠失（欠失Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ、ＩＶ、Ｖ、及びＶＩ）が明らかになった。（Ｍｅｙｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．７２：１０３１－８（１９９１））。得られたＭＶＡは著しく弱毒性であることが、様々な動物モデルで示された（Ｍａｙｒ，Ａ．＆ Ｄａｎｎｅｒ，Ｋ．Ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ ａｇａｉｎｓｔ ｐｏｘ ｄｉｓｅａｓｅｓ ｕｎｄｅｒ ｉｍｍｕｎｏｓｕｐｐｒｅｓｓｉｖｅ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎｓ，Ｄｅｖ．Ｂｉｏｌ．Ｓｔａｎｄ．４１：２２５－３４，１９７８）。多くの継代を使用してＭＶＡを弱毒化させることで、ＭＶＡ ４７６ ＭＧ／１４／７８、ＭＶＡ－５７１、ＭＶＡ－５７２、ＭＶＡ－５７４、ＭＶＡ－５７５、及びＭＶＡ－ＢＮなどの、ＣＥＦ細胞における継代数に応じて多数の異なる株又は単離株が存在する。ＭＶＡ ４７６ ＭＧ／１４／７８は、例えば国際公開第２０１９／１１５８１６（Ａ１）号に記載されている。ＭＶＡ－５７２株は、１９９４年１月２７日に寄託番号ＥＣＡＣＣ ９４０１２７０７でＥｕｒｏｐｅａｎ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（「ＥＣＡＣＣ」），Ｈｅａｌｔｈ Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ Ａｇｅｎｃｙ，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌｏｇｙ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ（Ｐｏｒｔｏｎ Ｄｏｗｎ，Ｓａｌｉｓｂｕｒｙ ＳＰ４ ０ＪＧ，Ｕｎｉｔｅｄ Ｋｉｎｇｄｏｍ（「ＵＫ」））に寄託された。ＭＶＡ－５７５株は、２０００年１２月７日に寄託番号ＥＣＡＣＣ ００１２０７０７でＥＣＡＣＣに寄託された。ＭＶＡ－Ｂａｖａｒｉａｎ Ｎｏｒｄｉｃ（「ＭＶＡ－ＢＮ」）株は、２０００年８月３０日に寄託番号Ｖ０００８００３８でＥＣＡＣＣに寄託された。ＭＶＡ－ＢＮ及びＭＶＡ－５７２のゲノム配列は、ＧｅｎＢａｎｋ（それぞれ、アクセッション番号ＤＱ９８３２３８及びＤＱ９８３２３７）で入手可能である。他のＭＶＡ株のゲノム配列は、標準的なシーケンシング法を用いて得ることができる。
本開示のベクター及びウイルスは、任意のＭＶＡ株又はＭＶＡ株の更なる誘導体に由来し得る。更なる例示的なＭＶＡ株は、Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）（Ｍａｎａｓｓａｓ，Ｖａ．２０１０８，ＵＳＡ）に寄託された寄託物ＶＲ－１５０８である。
ＭＶＡの「誘導体」とは、親ＭＶＡと本質的に同一の特徴を呈するが、そのゲノムの１つ以上の部分において相違を呈するウイルスを指す。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、ＭＶＡ４７６ＭＧ／１４／７８に由来する。いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、ＭＶＡ－５７１に由来する。いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、ＭＶＡ－５７２に由来する。いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、ＭＶＡ－５７４に由来する。いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、ＭＶＡ－５７５に由来する。いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、ＭＶＡ－ＢＮに由来する。
本開示のポリヌクレオチド又は異種ポリヌクレオチドは、得られる組換えウイルスのウイルス生存能力に影響を及ぼさないＭＶＡベクター内の部位又は領域（挿入領域）に挿入することができる。このような領域は、組換えウイルスのウイルス生存能力に深刻な影響を及ぼすことなく組換え体形成を可能にする領域について、ウイルスＤＮＡのセグメントを試験することによって容易に同定することができる。チミジンキナーゼ（ＴＫ）遺伝子は、使用することができる挿入領域であり、例えば、全ての調べられたポックスウイルスゲノム中など、多くのウイルスに存在する。更に、ＭＶＡは、６つの天然欠失部位を含有し、これらはそれぞれ、挿入部位として使用され得る（例えば、欠失Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ、ＩＶ、Ｖ、及びＶＩ；例えば、米国特許第５，１８５，１４６号及び米国特許第６．４４０，４４２号を参照されたい）。ＭＶＡの１つ以上の遺伝子間領域（ＩＧＲ）、例えば、ＩＧＲ ＩＧＲ０７／０８、ＩＧＲ ４４／４５、ＩＧＲ ６４／６５、ＩＧＲ ８８／８９、ＩＧＲ １３６／１３７、及びＩＧＲ １４８／１４９を挿入部位として使用してもよい（例えば、米国特許出願公開第２０１８／００６４８０３号を参照されたい）。更なる好適な挿入部位は、国際公開第２００５／０４８９５７号に記載されている。
ｒＭＶＡなどの組換えポックスウイルス粒子は、当該技術分野において記載されているように調製される（Ｐｉｃｃｉｎｉ，ｅｔ ａｌ．，１９８７，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ １５３：５４５－５６３；米国特許第４，７６９，３３０号、米国特許第４，７７２，８４８号、米国特許第４，６０３，１１２号、米国特許第５，１００，５８７号、及び米国特許第５，１７９，９９３号を参照されたい）。例示的な方法では、ウイルスに挿入されるＤＮＡ配列を、ＭＶＡのＤＮＡの一部に対して相同なＤＮＡが挿入されている大腸菌プラスミドコンストラクトに入れることができる。別々に、挿入されるＤＮＡ配列をプロモーターにライゲーションすることができる。プロモーター遺伝子連結は、非必須遺伝子座を含有するＭＶＡ ＤＮＡ領域に隣接するＤＮＡ配列に相同なＤＮＡに両末端が隣接するように、プラスミドコンストラクト内に位置していてよい。得られたプラスミドコンストラクトは、大腸菌細菌内で増殖することによって増幅され、単離され得る。挿入されるＤＮＡ遺伝子配列を含有する単離プラスミドを、例えばニワトリ胚線維芽細胞（ＣＥＦ）の細胞培養物にトランスフェクトしてよく、同時に培養物にＭＶＡを感染させる。それぞれプラスミド及びウイルスゲノムにおける相同ＭＶＡ ＤＮＡ間の組換えによって、外来ＤＮＡ配列の存在によって改変されたＭＶＡを作製することができる。ｒＭＶＡ粒子は、溶解工程（例えば、化学溶解、凍結／解凍、浸透性ショック、超音波処理など）後に培養上清又は培養細胞から回収することができる。溶菌斑の連続精製ラウンドを使用して、夾雑野生型ウイルスを除去することができる。次いで、当該技術分野において既知の技術（例えば、クロマトグラフィー法、又は塩化セシウム若しくはスクロース勾配における超遠心分離）を使用して、ウイルス粒子を精製することができる。
本開示のポリヌクレオチドのうちのいずれかを含むウイルスベクターが、本明細書で提供され、ベクターは、ＭＶＡに由来する。本開示はまた、本開示のベクターを含む組換え改変ワクシニアアンカラ（ｒＭＶＡ）を提供する。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１の、又は配列番号１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３の、又は配列番号３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号５の、又は配列番号５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号７の、又は配列番号７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号９の、又は配列番号９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１１の、又は配列番号１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１３の、又は配列番号１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１５の、又は配列番号１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１７の、又は配列番号１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１９の、又は配列番号１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは配列番号１９と少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２１の、又は配列番号２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２３の、又は配列番号２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２５の、又は配列番号２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２７の、又は配列番号２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２９の、又は配列番号２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３１の、又は配列番号３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３３の、又は配列番号３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３５の、又は配列番号３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３７の、又は配列番号３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３９の、又は配列番号３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４１の、又は配列番号４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４３の、又は配列番号４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４５の、又は配列番号４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４７の、又は配列番号４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４９の、又は配列番号４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号５１の、又は配列番号５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号５３の、又は配列番号５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号５５の、又は配列番号５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号５７の、又は配列番号５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号５９の、又は配列番号５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号６１の、又は配列番号６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号６３の、又は配列番号６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号６５の、又は配列番号６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号６７の、又は配列番号６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号６９の、又は配列番号６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号７１の、又は配列番号７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号７３の、又は配列番号７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号７５の、又は配列番号７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号７７の、又は配列番号７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号７９の、又は配列番号７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号８１の、又は配列番号８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号８３の、又は配列番号８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号８５の、又は配列番号８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号８７の、又は配列番号８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号８９の、又は配列番号８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号９１の、又は配列番号９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号９３の、又は配列番号９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号９５の、又は配列番号９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号９７の、又は配列番号９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号９９の、又は配列番号９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１０１の、又は配列番号１０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１０３の、又は配列番号１０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１０５の、又は配列番号１０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１０７の、又は配列番号１０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１０９の、又は配列番号１０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１１１の、又は配列番号１１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１１３の、又は配列番号１１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１１５の、又は配列番号１１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１１７の、又は配列番号１１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１１９の、又は配列番号１１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１２１の、又は配列番号１２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１２３の、又は配列番号１２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１２５の、又は配列番号１２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１２７の、又は配列番号１２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１２９の、又は配列番号１２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１３１の、又は配列番号１３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１３３の、又は配列番号１３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１３５の、又は配列番号１３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１３７の、又は配列番号１３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１３９の、又は配列番号１３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１４１の、又は配列番号１４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１４３の、又は配列番号１４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１４５の、又は配列番号１４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１４７の、又は配列番号１４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１４９の、又は配列番号１４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１５１の、又は配列番号１５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１５３の、又は配列番号１５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１５５の、又は配列番号１５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１５７の、又は配列番号１５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１５９の、又は配列番号１５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１６１の、又は配列番号１６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１６３の、又は配列番号１６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１６５の、又は配列番号１６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１６７の、又は配列番号１６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１６９の、又は配列番号１６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１７１の、又は配列番号１７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１７３の、又は配列番号１７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１７５の、又は配列番号１７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１７７の、又は配列番号１７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１７９の、又は配列番号１７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１８１の、又は配列番号１８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１８３の、又は配列番号１８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１８５の、又は配列番号１８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１８７の、又は配列番号１８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１８９の、又は配列番号１８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１９１の、又は配列番号１９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１９３の、又は配列番号１９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１９５の、又は配列番号１９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１９７の、又は配列番号１９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１９９の、又は配列番号１９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２０１の、又は配列番号２０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２０３の、又は配列番号２０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２０５の、又は配列番号２０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２０７の、又は配列番号２０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２０９の、又は配列番号２０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２１１の、又は配列番号２１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２１３の、又は配列番号２１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２１５の、又は配列番号２１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２１７の、又は配列番号２１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２１９の、又は配列番号２１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２２１の、又は配列番号２２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２２３の、又は配列番号２２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２２５の、又は配列番号２２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２２７の、又は配列番号２２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２２９の、又は配列番号２２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２３１の、又は配列番号２３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２３３の、又は配列番号２３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２３５の、又は配列番号２３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２３７の、又は配列番号２３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２３９の、又は配列番号２３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２４１の、又は配列番号２４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２４３の、又は配列番号２４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２４５の、又は配列番号２４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２４７の、又は配列番号２４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２４９の、又は配列番号２４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２５１の、又は配列番号２５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２５３の、又は配列番号２５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２５５の、又は配列番号２５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２５７の、又は配列番号２５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２５９の、又は配列番号２５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２６１の、又は配列番号２６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２６３の、又は配列番号２６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２６５の、又は配列番号２６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２６７の、又は配列番号２６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２６９の、又は配列番号２６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２７１の、又は配列番号２７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２７３の、又は配列番号２７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２７５の、又は配列番号２７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２７７の、又は配列番号２７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２７９の、又は配列番号２７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２８１の、又は配列番号２８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２８３の、又は配列番号２８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２８５の、又は配列番号２８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２８７の、又は配列番号２８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２８９の、又は配列番号２８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２９１の、又は配列番号２９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２９３の、又は配列番号２９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２９５の、又は配列番号２９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２９７の、又は配列番号２９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号２９９の、又は配列番号２９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３０１の、又は配列番号３０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３０３の、又は配列番号３０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３０５の、又は配列番号３０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３０７の、又は配列番号３０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３０９の、又は配列番号３０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３１１の、又は配列番号３１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３１３の、又は配列番号３１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３１５の、又は配列番号３１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３１７の、又は配列番号３１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３１９の、又は配列番号３１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３２１の、又は配列番号３２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３２３の、又は配列番号３２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３２５の、又は配列番号３２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３２７の、又は配列番号３２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３２９の、又は配列番号３２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３３１の、又は配列番号３３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３３３の、又は配列番号３３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３３５の、又は配列番号３３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３３７の、又は配列番号３３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３３９の、又は配列番号３３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３４１の、又は配列番号３４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３４３の、又は配列番号３４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３４５の、又は配列番号３４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３４７の、又は配列番号３４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３４９の、又は配列番号３４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３５１の、又は配列番号３５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３５３の、又は配列番号３５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３５５の、又は配列番号３５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３５７の、又は配列番号３５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３５９の、又は配列番号３５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３６１の、又は配列番号３６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３６３の、又は配列番号３６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３６５の、又は配列番号３６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３６７の、又は配列番号３６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３６９の、又は配列番号３６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３７１の、又は配列番号３７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３７３の、又は配列番号３７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３７５の、又は配列番号３７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３７７の、又は配列番号３７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３７９の、又は配列番号３７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３８１の、又は配列番号３８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３８３の、又は配列番号３８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３８５の、又は配列番号３８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３８７の、又は配列番号３８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３８９の、又は配列番号３８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３９１の、又は配列番号３９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３９３の、又は配列番号３９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３９５の、又は配列番号３９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３９７の、又は配列番号３９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号３９９の、又は配列番号３９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４０１の、又は配列番号４０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４０３の、又は配列番号４０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号４０５の、又は配列番号４０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ＭＶＡベクターは、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの断片から選択されるポリペプチドの２つ以上のアミノ酸配列をコードする、ポリヌクレオチドを含む。
自己複製ＲＮＡ分子
いくつかの実施形態では、ウイルスベクターは、αウイルスに由来する自己複製ＲＭＡ分子である。
自己複製ＲＮＡ分子は、αウイルスに由来し得る。αウイルスは、ＶＥＥＶ／ＥＥＥＶ群、又はＳＦ群、又はＳＩＮ群に属し得る。ＳＦ群αウイルスの非限定的な例としては、セムリキ森林ウイルス、オニョンニョンウイルス、ロスリバーウイルス、ミドルバーグウイルス、チクングニアウイルス、バーマ森林ウイルス、ゲタウイルス、マヤロウイルス、サギヤマウイルス、ベバルウイルス、及びウナウイルスが挙げられる。ＳＩＮ群αウイルスの非限定的な例としては、シンドビスウイルス、ガードウッドＳ．Ａ．ウイルス、南アフリカアルボウイルスＮｏ．８６、オケルボウイルス、アウラウイルス、ババンキウイルス、ワタロアウイルス、及びキジラガウイルスが挙げられる。ＶＥＥＶ／ＥＥＥＶ群αウイルスの非限定的な例としては、東部ウマ脳炎ウイルス（Eastern equine encephalitis virus、ＥＥＥＶ）、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（Venezuelan equine encephalitis virus、ＶＥＥＶ）、エバーグレーズウイルス（Everglades virus、ＥＶＥＶ）、ムカンボウイルス（Mucambo virus、ＭＵＣＶ）、ピクスナウイルス（Pixuna virus、ＰＩＸＶ）、ミドルバーグウイルス（Middleburg virus、ＭＩＤＶ）、チクングニアウイルス（Chikungunya virus、ＣＨＩＫＶ）、オニョンニョンウイルス（O'Nyong-Nyong virus、ＯＮＮＶ）、ロスリバーウイルス（Ross River virus、ＲＲＶ）、バーマ森林ウイルス（Barmah Forest virus、ＢＦ）、ゲタウイルス（Getah virus、ＧＥＴ）、サギヤマウイルス（Sagiyama virus、ＳＡＧＶ）、ベバルウイルス（Bebaru virus、ＢＥＢＶ）、マヤロウイルス（Mayaro virus、ＭＡＹＶ）、及びウナウイルス（Una virus、ＵＮＡＶ）が挙げられる。
自己複製ＲＮＡ分子は、αウイルスゲノムに由来し得、これは、それらがαウイルスゲノムの構造的特徴のいくつかを有するか、又はそれらと同様であることを意味する。自己複製ＲＮＡ分子は、改変αウイルスゲノムに由来し得る。
自己複製ＲＮＡ分子は、東部ウマ脳炎ウイルス（ＥＥＥＶ）、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＶＥＥＶ）、エバーグレーズウイルス（ＥＶＥＶ）、ムカンボウイルス（ＭＵＣＶ）、セムリキ森林ウイルス（ＳＦＶ）、ピクスナウイルス（ＰＩＸＶ）、ミドルバーグウイルス（ＭＩＤＶ）、チクングニアウイルス（ＣＨＩＫＶ）、オニョンニョンウイルス（ＯＮＮＶ）、ロスリバーウイルス（ＲＲＶ）、バーマ森林ウイルス（ＢＦ）、ゲタウイルス（ＧＥＴ）、サギヤマウイルス（ＳＡＧＶ）、ベバルウイルス（ＢＥＢＶ）、マヤロウイルス（ＭＡＹＶ）、ウナウイルス（ＵＮＡＶ）、シンドビスウイルス（Ｓｉｎｄｂｉｓ ｖｉｒｕｓ、ＳＩＮＶ）、アウラウイルス（Aura virus、ＡＵＲＡＶ）、ワタロアウイルス（Whataroa virus、ＷＨＡＶ）、ババンキウイルス（Ｂａｂａｎｋｉ ｖｉｒｕｓ、ＢＡＢＶ）、キジラガウイルス（Kyzylagach virus、ＫＹＺＶ）、西部ウマ脳炎ウイルス（Western equine encephalitis virus、ＷＥＥＶ）、ハイランドＪウイルス（Highland J virus、ＨＪＶ）、フォートモーガンウイルス（Fort Morgan virus、ＦＭＶ）、ヌドゥムウイルス（Ndumu、ＮＤＵＶ）、及びバギークリークウイルスに由来し得る。病原性及び非病原性αウイルス株は、両方とも適切である。いくつかの実施形態では、αウイルスＲＮＡレプリコンは、シンドビスウイルス（ＳＩＮ）、セムリキ森林ウイルス（ＳＦＶ）、ロスリバーウイルス（ＲＲＶ）、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＶＥＥＶ）、又は東部ウマ脳炎ウイルス（ＥＥＥＶ）のものである。
いくつかの実施形態では、αウイルス由来の自己複製ＲＮＡ分子は、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＶＥＥＶ）である。
自己複製ＲＮＡ分子は、野生型新世界型又は旧世界型αウイルスゲノム（又は、それによってコードされるアミノ酸配列）からのＲＮＡ配列を含有することができる。本明細書に開示される自己複製ＲＮＡ分子のいずれかは、野生型αウイルスゲノム配列に「由来する」又は「基づく」ＲＮＡ配列を含むことができ、これは、それが、新世界型又は旧世界型αウイルスゲノムであり得る、野生型ＲＮＡαウイルスゲノム由来のＲＮＡ配列（対応するＲＮＡ配列であり得る）と、少なくとも６０％、若しくは少なくとも６５％、若しくは少なくとも６８％、若しくは少なくとも７０％、若しくは少なくとも８０％、若しくは少なくとも８５％、若しくは少なくとも９０％、若しくは少なくとも９５％、若しくは少なくとも９７％、若しくは少なくとも９８％、若しくは少なくとも９９％、若しくは１００％、又は８０～９９％、若しくは９０～１００％、若しくは９５～９９％、若しくは９５～１００％、若しくは９７～９９％、若しくは９８～９９％同一の配列を有することを意味する。
自己複製ＲＮＡ分子は、許容細胞内でそれら自体の増幅又は自己複製を指示するために必要な全ての遺伝情報を含有する。それら自体の複製を指示するために、自己複製ＲＮＡ分子は、ポリメラーゼ、レプリカーゼ、又はＲＮＡ増幅プロセスを触媒するためにウイルス若しくは宿主細胞に由来するタンパク質、核酸、若しくはリボ核タンパク質と相互作用し得る他のタンパク質をコードしており、レプリコンをコードしているＲＮＡの複製及び転写に必要なシス作用性ＲＮＡ配列を含有する。したがって、ＲＮＡ複製は、複数の娘ＲＮＡの生成につながる。これらの娘ＲＮＡ、及び同一線上のサブゲノム転写物は、目的の遺伝子のｉｎ ｓｉｔｕ発現を提供するように翻訳され得るか、又は目的の遺伝子のｉｎ ｓｉｔｕ発現を提供するように翻訳される、送達されたＲＮＡと同じセンスの転写物を更に提供するように転写され得る。この転写の配列の全体的な結果として、導入されたレプリコンＲＮＡの数が大きく増幅されるため、目的のコード化遺伝子は、細胞の主要なポリペプチド産物になる。
αウイルス、非構造（ｎｓ）及び構造遺伝子のゲノムには、２つのオープンリーディングフレーム（open reading frame、ＯＲＦ）がある。ｎｓＯＲＦは、ウイルスＲＮＡの転写及び複製に必要なタンパク質（ｎｓＰ１－ｎｓＰ４）をコードし、ポリタンパク質として生成され、ウイルス複製機構である。構造ＯＲＦは、コアヌクレオカプシドタンパク質Ｃ、並びにヘテロ二量体として会合するエンベロープタンパク質Ｐ６２及びＥｌの３つの構造タンパク質をコードする。ウイルス膜アンカード表面糖タンパク質は、受容体認識を担い、膜融合によって標的細胞内に入る。４つのｎｓタンパク質遺伝子は、ゲノムの５’２／３の遺伝子によってコードされ、３つの構造タンパク質は、ゲノムの３’１／３で同一線上のサブゲノムｍＲＮＡから翻訳される。
自己複製ＲＮＡ分子は、構造遺伝子をコードしているウイルス配列を置換することにより、又は構造遺伝子をコードしている配列の５’若しくは３’に外来配列を挿入することによって、宿主細胞への外来配列の導入の基礎として使用することができる。それらは、サブゲノムプロモーターの制御下にあるレプリカーゼの下流にあるウイルス構造遺伝子を、目的の遺伝子（genes of interest：ＧＯＩ）によって、例えば、本開示のポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドのいずれかを置き換えるように遺伝子操作され得る。トランスフェクションにより、直ちに翻訳されたレプリカーゼは、ゲノムＲＮＡの５’及び３’末端と相互作用し、相補的ゲノムＲＮＡコピーを合成する。これらは、新規のプラス鎖キャップ化かつポリアデニル化ゲノムコピー、及びサブゲノム転写物の合成のためのテンプレートとして機能する。増幅は最終的に、細胞あたり最大２×１０５個のコピーの非常に多いＲＮＡコピー数をもたらす。その結果、ワクチンの有効性又は治療の治療的影響に影響を及ぼし得る、ＧＯＩ（例えば、本開示のポリペプチドの１つ以上をコードするポリヌクレオチド）の均一なかつ／又は増強された発現が生じる。したがって、自己複製ＲＮＡ分子に基づくワクチンは、従来のウイルスベクターと比較して、生成されたＲＮＡの非常に多いコピーに起因して、非常に低いレベルで投与され得る。
本開示の卵巣癌ネオ抗原ポリペプチドの１つ以上をコードするＲＮＡを含む、本開示の自己複製ＲＮＡ分子は、本明細書に記載のウイルスベクター又は本明細書にまた記載の他の送達技術を含む、様々な技術を用いて、卵巣癌を有する対象又は卵巣（ovararian）癌のリスクを有する対象にそれらを送達することによって、治療薬として利用され得る。
本開示の卵巣癌ネオ抗原ポリヌクレオチドはサブゲノムプロモーターの制御下において発現し得る。特定の実施形態では、天然サブゲノムプロモーターの代わりに、サブゲノムＲＮＡは、脳性心筋炎ウイルス（encephalomyocarditis virus、ＥＭＣＶ）、ウシウイルス性下痢症ウイルス（Bovine Viral Diarrhea Virus、ＢＶＤＶ）、ポリオウイルス、口蹄疫ウイルス（ＦＭＤ）、エンテロウイルス７１、又はＣ型肝炎ウイルスに由来する配列内リボソーム進入部位（internal ribosome entry site、ＩＲＥＳ）の制御下に置かれ得る。サブゲノムプロモーターは、２４ヌクレオチド（シンドビスウイルス）から１００ヌクレオチド超（ビート壊疽性葉脈黄化ウイルス）の範囲であり、通常、転写開始の上流に見られる。
本開示は、許容細胞内でそれ自体の増幅又は自己複製を指示するために必要な全ての遺伝情報を含有する、自己複製ＲＮＡ分子を提供する。
本開示はまた、構造遺伝子をコードするウイルス配列を置き換えることによって、宿主細胞に外来配列（例えば、本開示の卵巣ネオ抗原ポリペプチド）を導入することの基礎として使用することができる、自己複製ＲＮＡ分子を提供する。
本開示のポリヌクレオチドのうちのいずれかを含むウイルスベクターが、本明細書で提供され、ベクターは、自己複製ＲＮＡ分子に由来する。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１の、又は配列番号１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするＲＮＡ配列を含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３の、又は配列番号３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号５の、又は配列番号５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号７の、又は配列番号７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号９の、又は配列番号９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１１の、又は配列番号１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１３の、又は配列番号１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１５の、又は配列番号１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１７の、又は配列番号１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１９の、又は配列番号１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２１の、又は配列番号２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２３の、又は配列番号２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２５の、又は配列番号２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２７の、又は配列番号２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２９の、又は配列番号２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３１の、又は配列番号３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３３の、又は配列番号３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３５の、又は配列番号３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３７の、又は配列番号３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３９の、又は配列番号３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４１の、又は配列番号４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４３の、又は配列番号４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４５の、又は配列番号４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４７の、又は配列番号４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４９の、又は配列番号４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号５１の、又は配列番号５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号５３の、又は配列番号５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号５５の、又は配列番号５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号５７の、又は配列番号５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号５９の、又は配列番号５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号６１の、又は配列番号６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号６３の、又は配列番号６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号６５の、又は配列番号６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号６７の、又は配列番号６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号６９の、又は配列番号６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号７１の、又は配列番号７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号７３の、又は配列番号７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号７５の、又は配列番号７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号７７の、又は配列番号７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号７９の、又は配列番号７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号８１の、又は配列番号８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号８３の、又は配列番号８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号８５の、又は配列番号８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号８７の、又は配列番号８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号８９の、又は配列番号８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号９１の、又は配列番号９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号９３の、又は配列番号９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号９５の、又は配列番号９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号９７の、又は配列番号９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号９９の、又は配列番号９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１０１の、又は配列番号１０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１０３の、又は配列番号１０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１０５の、又は配列番号１０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１０７の、又は配列番号１０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１０９の、又は配列番号１０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１１１の、又は配列番号１１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１１３の、又は配列番号１１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１１５の、又は配列番号１１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１１７の、又は配列番号１１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１１９の、又は配列番号１１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１２１の、又は配列番号１２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１２３の、又は配列番号１２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１２５の、又は配列番号１２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１２７の、又は配列番号１２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１２９の、又は配列番号１２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１３１の、又は配列番号１３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１３３の、又は配列番号１３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１３５の、又は配列番号１３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１３７の、又は配列番号１３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１３９の、又は配列番号１３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１４１の、又は配列番号１４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１４３の、又は配列番号１４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１４５の、又は配列番号１４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１４７の、又は配列番号１４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１４９の、又は配列番号１４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１５１の、又は配列番号１５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１５３の、又は配列番号１５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１５５の、又は配列番号１５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１５７の、又は配列番号１５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１５９の、又は配列番号１５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１６１の、又は配列番号１６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１６３の、又は配列番号１６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１６５の、又は配列番号１６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１６７の、又は配列番号１６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１６９の、又は配列番号１６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１７１の、又は配列番号１７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１７３の、又は配列番号１７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１７５の、又は配列番号１７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１７７の、又は配列番号１７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１７９の、又は配列番号１７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１８１の、又は配列番号１８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１８３の、又は配列番号１８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１８５の、又は配列番号１８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１８７の、又は配列番号１８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１８９の、又は配列番号１８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１９１の、又は配列番号１９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１９３の、又は配列番号１９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１９５の、又は配列番号１９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１９７の、又は配列番号１９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１９９の、又は配列番号１９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２０１の、又は配列番号２０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２０３の、又は配列番号２０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２０５の、又は配列番号２０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２０７の、又は配列番号２０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２０９の、又は配列番号２０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２１１の、又は配列番号２１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２１３の、又は配列番号２１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２１５の、又は配列番号２１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２１７の、又は配列番号２１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２１９の、又は配列番号２１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２２１の、又は配列番号２２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２２３の、又は配列番号２２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２２５の、又は配列番号２２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２２７の、又は配列番号２２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２２９の、又は配列番号２２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２３１の、又は配列番号２３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２３３の、又は配列番号２３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２３５の、又は配列番号２３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２３７の、又は配列番号２３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２３９の、又は配列番号２３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２４１の、又は配列番号２４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２４３の、又は配列番号２４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２４５の、又は配列番号２４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２４７の、又は配列番号２４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２４９の、又は配列番号２４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２５１の、又は配列番号２５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２５３の、又は配列番号２５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２５５の、又は配列番号２５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２５７の、又は配列番号２５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２５９の、又は配列番号２５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２６１の、又は配列番号２６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２６３の、又は配列番号２６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２６５の、又は配列番号２６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２６７の、又は配列番号２６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２６９の、又は配列番号２６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２７１の、又は配列番号２７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２７３の、又は配列番号２７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２７５の、又は配列番号２７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２７７の、又は配列番号２７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２７９の、又は配列番号２７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２８１の、又は配列番号２８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２８３の、又は配列番号２８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２８５の、又は配列番号２８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２８７の、又は配列番号２８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２８９の、又は配列番号２８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２９１の、又は配列番号２９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２９３の、又は配列番号２９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２９５の、又は配列番号２９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２９７の、又は配列番号２９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号２９９の、又は配列番号２９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３０１の、又は配列番号３０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３０３の、又は配列番号３０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３０５の、又は配列番号３０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３０７の、又は配列番号３０７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３０９の、又は配列番号３０９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３１１の、又は配列番号３１１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３１３の、又は配列番号３１３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３１５の、又は配列番号３１５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３１７の、又は配列番号３１７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３１９の、又は配列番号３１９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３２１の、又は配列番号３２１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３２３の、又は配列番号３２３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３２５の、又は配列番号３２５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３２７の、又は配列番号３２７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３２９の、又は配列番号３２９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３３１の、又は配列番号３３１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３３３の、又は配列番号３３３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３３５の、又は配列番号３３５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３３７の、又は配列番号３３７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３３９の、又は配列番号３３９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３４１の、又は配列番号３４１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３４３の、又は配列番号３４３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３４５の、又は配列番号３４５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３４７の、又は配列番号３４７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３４９の、又は配列番号３４９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３５１の、又は配列番号３５１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３５３の、又は配列番号３５３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３５５の、又は配列番号３５５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３５７の、又は配列番号３５７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３５９の、又は配列番号３５９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３６１の、又は配列番号３６１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３６３の、又は配列番号３６３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３６５の、又は配列番号３６５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３６７の、又は配列番号３６７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３６９の、又は配列番号３６９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３７１の、又は配列番号３７１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３７３の、又は配列番号３７３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３７５の、又は配列番号３７５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３７７の、又は配列番号３７７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３７９の、又は配列番号３７９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３８１の、又は配列番号３８１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３８３の、又は配列番号３８３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３８５の、又は配列番号３８５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３８７の、又は配列番号３８７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３８９の、又は配列番号３８９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３９１の、又は配列番号３９１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３９３の、又は配列番号３９３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３９５の、又は配列番号３９５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３９７の、又は配列番号３９７と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号３９９の、又は配列番号３９９と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４０１の、又は配列番号４０１と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４０３の、又は配列番号４０３と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号４０５の、又は配列番号４０５と少なくとも９０％の配列同一性、若しくは少なくとも９５％の配列同一性、若しくは少なくとも９９％の配列同一性を有する、アミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの断片から選択されるポリペプチドの２つ以上のアミノ酸配列をコードする、ポリヌクレオチドを含む。
上記の自己複製ＲＮＡ分子のうちのいずれかは、
・ １つ以上の非構造遺伝子、ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３、及びｎｓＰ４、
・ ＤＬＰモチーフ、５’ＵＴＲ、３’ＵＴＲ、及びポリＡのうちの少なくとも１つ、並びに
・ サブゲノムプロモーター、のうち１つ以上を更に含み得る。
いくつかの実施形態では、例えば、自己複製ＲＮＡ分子は、
・ １つ以上の非構造遺伝子、ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３、及びｎｓＰ４、
・ ＤＬＰモチーフ、５’ＵＴＲ、３’ＵＴＲ、及びポリＡのうちの少なくとも１つ、及び
・ サブゲノムプロモーター、並びに
・ 本開示のポリペプチドのうちいずれかをコードするＲＮＡ、及びサブゲノムプロモーターに操作可能に連結されたＲＮＡ、のうち１つ以上を含み得る。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、タンパク質又はペプチドをコードするＲＮＡ配列、５’及び３’αウイルス非翻訳領域、新世界型αウイルスＶＥＥＶ非構造タンパク質ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３、及びｎｓＰ４に由来するアミノ酸配列をコードするＲＮＡ配列、タンパク質をコードするＲＮＡ配列に操作可能に連結され、その翻訳を調節するサブゲノムプロモーター、５’キャップ及び３’ポリＡ尾部、プラス鎖一本鎖ＲＮＡ、非構造タンパク質１（ｎｓＰ１）の上流のシンドビスウイルスウイルスからのＤＬＰ、２Ａリボソームスキッピングエレメント、並びに５’－ＵＴＲの下流及びＤＬＰの上流でのｎｓｐ１ヌクレオチド反復を含む。
いくつかの実施形態で、自己複製ＲＮＡ分子は、少なくとも１ｋｂ、又は少なくとも２ｋｂ、又は少なくとも３ｋｂ、又は少なくとも４ｋｂ、又は少なくとも５ｋｂ、又は少なくとも６ｋｂ、又は少なくとも７ｋｂ、又は少なくとも８ｋｂ、又は少なくとも１０ｋｂ、又は少なくとも１２ｋｂ、又は少なくとも１５ｋｂ、又は少なくとも１７ｋｂ、又は少なくとも１９ｋｂ、又は少なくとも２０ｋｂのサイズであってもよく、１００ｂｐ～８ｋｂ、又は５００ｂｐ～８ｋｂ、又は５００ｂｐ～７ｋｂ、又は１～７ｋｂ、又は１～８ｋｂ、又は２～１５ｋｂ、又は２～２０ｋｂ、又は５～１５ｋｂ、又は５～２０ｋｂ、又は７～１５ｋｂ、又は７～１８ｋｂ、又は７～２０ｋｂのサイズであってもよい。
上で開示した自己複製ＲＮＡ分子のいずれかは、自己プロテアーゼペプチド（例えば、自己触媒的自己切断ペプチド）のコード配列を更に含むことができ、自己プロテアーゼのコード配列は、任意選択で第２の核酸配列の上流に操作可能に連結される。
一般に、当該技術分野で既知の任意のタンパク質分解切断部位は、本開示の核酸分子内に組み込まれることができ、例えば、プロテアーゼによる生産後に切断される、タンパク質分解切断配列であり得る。更に好適なタンパク質分解切断部位には、外部プロテアーゼの添加後に切断され得る、タンパク質分解切断配列も含まれる。本明細書で使用する場合、「自己プロテアーゼ」という用語は、自己タンパク質分解活性を有し、それ自体をより大きなポリペプチド部分から切断することができる「自己切断」ペプチドを指す。口蹄疫ウイルス（foot-and-mouth disease virus、ＦＭＤＶ）で初めて同定され、ピコルナウイルス群のメンバーであるウマ鼻炎Ａウイルス（Equine Rhinitis A Virus、Ｅ２Ａ）、ブタテッショウウイルス－１（Ｐ２Ａ）、Ｔｈｏｓｅａ ａｓｉｇｎａウイルス（Ｔ２Ａ）からの「２Ａ様」ペプチドのようないくつかの自己プロテアーゼがその後同定され、タンパク質分解切断でのそれらの活性は、様々なｅｘ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏ真核生物系にて示されている。したがって、多くの天然に存在する自己プロテアーゼ系が同定されているので、自己プロテアーゼの概念は、当業者に利用可能である。十分に研究された自己プロテアーゼ系は、例えば、ウイルスプロテアーゼ、発生タンパク質（例えば、ＨｅｔＲ、ヘッジホッグタンパク質）、ＲｕｍＡ自己プロテアーゼドメイン、ＵｍｕＤなど）である。本開示の組成物及び方法に好適な自己プロテアーゼペプチドの非限定的な例としては、ブタテッショウウイルス－１ ２Ａ（Ｐ２Ａ）、口蹄疫ウイルス（ＦＭＤＶ）２Ａ（Ｆ２Ａ）、ウマ鼻炎Ａウイルス（Equine Rhinitis A Virus、ＥＲＡＶ）２Ａ（Ｅ２Ａ）、Ｔｈｏｓｅａ ａｓｉｇｎａウイルス２Ａ（Ｔ２Ａ）、細胞質多角体病ウイルス２Ａ（ＢｍＣＰＶ２Ａ）、軟化病ウイルス２Ａ（ＢｍＩＦＶ２Ａ）、又はこれらの組合せからのペプチド配列が挙げられる。
いくつかの実施形態では、自己プロテアーゼペプチドのコード配列は、ＤＬＰモチーフの下流、並びに第１及び第２のポリヌクレオチドの上流に操作可能に連結される。
いくつかの実施形態では、自己プロテアーゼペプチドは、ブタテッショウウイルス－１ ２Ａ（Ｐ２Ａ）、口蹄疫ウイルス（ＦＭＤＶ）２Ａ（Ｆ２Ａ）、ウマ鼻炎Ａウイルス（ＥＲＡＶ）２Ａ（Ｅ２Ａ）、Ｔｈｏｓｅａ ａｓｉｇｎａウイルス２Ａ（Ｔ２Ａ）、細胞質多角体病ウイルス２Ａ（ＢｍＣＰＶ２Ａ）、軟化病ウイルス２Ａ（ＢｍＩＦＶ２Ａ）、及びこれらの組合せからなる群から選択される、ペプチド配列を含むか、又はそれからなる。いくつかの実施形態では、自己プロテアーゼペプチドは、ブタテッショウウイルス－１ ２Ａ（Ｐ２Ａ）のペプチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、自己プロテアーゼペプチドは、ブタテッショウウイルス－１ ２Ａ（Ｐ２Ａ）である。
本開示の改変ウイルスＲＮＡレプリコンにおけるＰ２Ａペプチドの組み込みは、カプシド－ＧＯＩ融合からのＧＯＩによってコードされるタンパク質（例えば、本開示の卵巣（ovararian）ネオ抗原ポリペプチド）の放出を可能にする。
本明細書に開示されるいくつかの実施形態では、ブタテッショウウイルス－１ ２Ａ（Ｐ２Ａ）ペプチド配列は、ＤＬＰ配列の直後にインフレームで操作され、全てのＧＯＩのすぐ上流にインフレームで操作される。
上に開示される自己複製ＲＮＡ分子のいずれかは、コード配列下流ループ（downstream Loop、ＤＬＰ）モチーフを更に含み得る。
いくつかのウイルスは、カプシド遺伝子発現を調節する、例えば増加させる、１つ以上のステムループ構造を形成することができる、配列を有する。本明細書で使用されるウイルスカプシド増強剤は、そのようなステムループ構造を形成することができる配列を含む、調節エレメントを指す。いくつかの例では、ステムループ構造は、カプシドタンパク質のコード配列内の配列によって形成され、下流ループ（ＤＬＰ）配列と呼ばれる。本明細書に開示されるように、これらのステムループ構造又はその変異体は、例えば、目的の遺伝子の発現レベルを調節する、例えば増加させる、ために使用することができる。例えば、これらのステムループ構造又はその変異体は、その下流に操作可能に連結されたコード配列の転写及び／又は翻訳を増強するために、組換えベクター（例えば、異種ウイルスゲノム中）で使用することができる。
宿主細胞でのαウイルス複製は、二本鎖ＲＮＡ依存性タンパク質キナーゼ（ＰＫＲ）を誘導することが知られている。ＰＫＲは、真核生物翻訳開始因子２α（eukaryotic translation initiation factor 2α、ｅＩＦ２α）をリン酸化する。ｅＩＦ２αのリン酸化は、ｍＲＮＡの翻訳開始を阻害し、そうすることで、ウイルスが生産的複製サイクルを完了できないようにする。αウイルス属のメンバーは、ウイルス２６Ｓ転写物内に存在する下流ループ（ＤＬＰ）による抗ウイルスＲＮＡ活性化タンパク質キナーゼ（ＰＫＲ）の活性化に抵抗し得、これにより、これらのｍＲＮＡのｅＩＦ２非依存性翻訳開始が可能になる。ＤＬＰ構造は、野生型ＡＵＧ上でリボソームを停止させることができ、これは、機能的ｅＩＦ２αを必要とせずに、サブゲノムｍＲＮＡの翻訳をサポートする。ＤＬＰ構造は、最初にシンドビスウイルス（ＳＩＮＶ）２６ＳｍＲＮＡで特徴付けられ、セムリキ森林ウイルス（ＳＦＶ）でも検出された。同様のＤＬＰ構造は、新世界（例えば、ＭＡＹＶ、ＵＮＡＶ、ＥＥＥＶ（ＮＡ）、ＥＥＥＶ（ＳＡ）、ＡＵＲＡＶ）及び旧世界（ＳＶ、ＳＦＶ、ＢＥＢＶ、ＲＲＶ、ＳＡＧ、ＧＥＴＶ、ＭＩＤＶ、ＣＨＩＫＶ及びＯＮＮＶ）メンバーを含む、αウイルス属の少なくとも１４個の他のメンバーに存在することが報告されている。ＤＬＰは、ＳＩＮＶ ２６Ｓ ｍＲＮＡ及びαウイルス属の他のメンバーにて、ＡＵＧの下流に位置する。
いくつかの実施形態では、本開示の核酸分子は、ＤＬＰモチーフ（複数可）及び／又はＤＬＰモチーフのコード配列に操作可能に連結された、目的の遺伝子（ＧＯＩ）のコード配列を含み得る。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子のＤＬＰは、Ｓｉｎｄｂｉｓウイルスに由来する。
いくつかの実施形態では、下流ループ（ＤＬＰ）は、少なくとも１つのＲＮＡ－ステムループを含む。
場合によっては、ＤＬＰ活性は、ＤＬＰモチーフと開始コドンＡＵＧ（ＡＵＧｉ）との間の距離に依存する。αウイルス２６ＳｍＲＮＡのＡＵＧ－ＤＬＰ間隔は、ＤＬＰによって停止した４０ＳサブユニットのＰ部位にＡＵＧｉを配置し、ｅＩＦ２の関与なしにＭｅｔ－ｔＲＮＡの組み込みを可能にする方法で、リボソーム１８ＳｒＲＮＡのＥＳ６Ｓ領域のトポロジーに調整される。シンドビスウイルスの場合、ＤＬＰモチーフは、シンドビスサブゲノムＲＮＡの最初の約１５０ｎｔに見られる。ヘアピンは、シンドビスカプシドＡＵＧ開始コドンの下流に位置し（シンドビスサブゲノムＲＮＡのｎｔ５０にあるＡＵＧ）、その結果、正しいカプシド遺伝子ＡＵＧを使用して翻訳を開始するように、リボソームを停止させる。
いかなる特定の理論にも束縛されるものではないが、任意のＧＯＩのコード配列の上流にＤＬＰモチーフを配置すると、通常、ヘアピン領域でコードされるＮ末端キャプシドアミノ酸とＧＯＩコード化タンパク質との融合タンパク質が生成されると考えられており、なぜなら、開始は、ＧＯＩ ＡＵＧではなく、カプシドＡＵＧで起こるからである。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、非構造タンパク質１（ｎｓＰ１）の上流に配置された、下流ループを含む。
いくつかの実施形態では、下流ループは、非構造タンパク質１（ｎｓＰ１）の上流に配置され、ブタテッショウウイルス－１ ２Ａ（Ｐ２Ａ）リボソームスキッピングエレメントによってｎｓＰ１に結合される。
本開示のＤＬＰ含有自己複製ＲＮＡはまた、対象における自然免疫系に対する抵抗性を付与するのに有用であり得る。非改変ＲＮＡレプリコンは、それらが導入される、細胞の初期自然免疫系状態に感受性である。細胞／個体が高度に活性な自然免疫系状態にある場合、ＲＮＡレプリコンの性能（例えば、ＧＯＩの複製及び発現）が悪影響を受ける可能性がある。ＤＬＰを操作して、特に非構造タンパク質のタンパク質翻訳の開始を制御することによって、自然免疫系の既存の活性化状態が、効率的なＲＮＡレプリコン複製に及ぼす影響を除去又は軽減させる。その結果、ワクチンの有効性又は治療の治療的影響に影響を及ぼし得る、ＧＯＩのより均一なかつ／又は増強された発現が生じる。
本開示の自己複製ＲＮＡのＤＬＰモチーフは、細胞ｍＲＮＡ翻訳が阻害される細胞環境において、効率的なｍＲＮＡ翻訳を付与することができる。ＤＬＰがレプリコンベクターの非構造タンパク質遺伝子の翻訳と連結している場合、レプリカーゼ及び転写酵素タンパク質は、ＰＫＲ活性化細胞環境で機能的複製を開始することができる。ＤＬＰがサブゲノムｍＲＮＡの翻訳と連結している場合、自然免疫活性化により細胞内ｍＲＮＡが制限されても、強固なＧＯＩ発現が可能である。したがって、非構造タンパク質遺伝子及びサブゲノムｍＲＮＡの両方の翻訳を駆動するのを助けるためにＤＬＰ構造を含有する、自己複製ＲＮＡを操作することは、自然免疫活性化を克服する強力な方法を提供する。
ＤＬＰモチーフを含む自己複製ＲＮＡベクターの例は、米国特許出願公開第２０１８／０１７１３４０号、及び国際公開第２０１８１０６６１５号に記載されており、その内容は参照によりその全体が本明細書に援用される。
上に開示した自己複製ＲＮＡ分子のいずれかは、非構造遺伝子ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３、及び／又はｎｓＰ４を更に含み得る。
αウイルスゲノムは、非構造タンパク質ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３及びｎｓＰ４をコードし、これは、Ｐ１２３４（又はｎｓＰ１－４若しくはｎｓＰ１２３４）と呼ばれることもある、単一のポリプロテイン前駆体として生成され、タンパク質分解によって成熟タンパク質に切断される。ｎｓＰ１は約６０ｋＤａの大きさで、メチルトランスフェラーゼ活性を持ち得、ウイルスのキャッピング反応に関与し得る。ｎｓＰ２は約９０ｋＤａの大きさで、ヘリカーゼ及びプロテアーゼ活性を有し得、ｎｓＰ３は約６０ｋＤａで、マクロドメイン、中心（又はαウイルス固有）ドメイン、及び超可変ドメイン（ＨＶＤ）の３つのドメインを含有する。ｎｓＰ４は約７０ｋＤａの大きさで、コアＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ（ＲｄＲｐ）触媒ドメインを含有する。感染後、αウイルスゲノムＲＮＡを翻訳して、Ｐ１２３４ポリタンパク質を得る。これは、個々のタンパク質に切断される。
αウイルスゲノムはまた、コアヌクレオカプシドタンパク質Ｃ、並びにヘテロ二量体として会合するエンベロープタンパク質Ｐ６２及びＥ１の３つの構造タンパク質をコードする。構造タンパク質は、サブゲノムプロモーターの制御下にあり、目的の遺伝子（ＧＩＯ）によって置き換えることができる。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、機能的ウイルス構造タンパク質をコードしない。
本開示のいくつかの実施形態で、自己複製ＲＮＡは、構造ウイルスタンパク質（例えば、ヌクレオカプシドタンパク質Ｃ、エンベロープタンパク質Ｐ６２、６Ｋ、及びＥ１）のうちの少なくとも１つ（又は、全て）の配列を欠く（又は、含まない）ことができる。これらの実施形態では、１つ以上の構造遺伝子をコードする配列は、例えば、少なくとも１つのタンパク質又はペプチド（又は、他の目的の遺伝子（ＧＯＩ））のコード配列、例えば、本開示の卵巣癌ネオ抗原ポリペプチドなどの、１つ以上の配列で置換され得る。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡは、αウイルス構造タンパク質をコードする配列を欠くか、又はαウイルス（又は、任意選択で他の任意の）構造タンパク質をコードしない。いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、１つ以上のウイルス構造タンパク質の一部又は全コード領域を更に欠く。例えば、αウイルス発現系は、ウイルスカプシドタンパク質Ｃ、Ｅ１糖タンパク質、Ｅ２糖タンパク質、Ｅ３タンパク質、及び６Ｋタンパク質のうちの１つ以上のコード配列の一部、又は全体を欠いていてもよい。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、構造的ウイルスタンパク質のうちの少なくとも１つのコード配列を含有しない。これらの例において、構造遺伝子をコードする配列は、例えば、本開示の卵巣ネオ抗原ポリヌクレオチドのコード配列など、１つ以上の配列で置換され得る。
本開示はまた、非構造遺伝子ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３及びｎｓＰ４を含む自己複製ＲＮＡ分子を提供し、自己複製ＲＮＡ分子は、機能的ウイルス構造タンパク質をコードしない。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、１つ以上の非構造ウイルス構造タンパク質を含み得る。特定の実施形態では、１つ以上の非構造ウイルスタンパク質は、同じウイルスに由来する。他の実施形態では、１つ以上の非構造タンパク質は、異なるウイルスに由来する。
いくつかの実施形態では、本開示は、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、又は少なくとも４つの非構造ウイルスタンパク質（例えば、ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３、ｎｓＰ４）のコード配列を含む、自己複製ＲＮＡ分子を提供する。レプリコンによってコードされるｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３及びｎｓＰ４タンパク質は、機能的又は生物学的活性タンパク質である。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、少なくとも１つの非構造ウイルスタンパク質の一部のコード配列を含む。例えば、自己複製ＲＮＡ分子は、少なくとも１つの非構造ウイルスタンパク質のコード配列の約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９５％、１００％、又はこれらの値のうちのいずれか２つの間の範囲を含み得る。いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、少なくとも１つの非構造ウイルスタンパク質の実質的な部分のコード配列を含むことができる。本明細書で使用する場合、非構造ウイルスタンパク質をコードする核酸配列の「実質的な部分」とは、当業者による配列の手動評価、又はＢＬＡＳＴなどのアルゴリズムを用いたコンピュータによる自動配列比較及び同定のいずれかによって、そのタンパク質の推定上の識別を可能にするのに十分な非構造ウイルスタンパク質をコードする核酸配列を含む（例えば、「Ｂａｓｉｃ Ｌｏｃａｌ Ａｌｉｇｎｍｅｎｔ Ｓｅａｒｃｈ Ｔｏｏｌ」；Ａｌｔｓｃｈｕｌ Ｓ Ｆ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３－４１０，１９９３を参照）。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、少なくとも１つの非構造タンパク質のコード配列全体を含み得る。いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、天然のウイルス非構造タンパク質の実質的に全てのコード配列を含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（ＶＥＥＶ）由来のｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３及びｎｓＰ４配列、並びにシンドビスウイルス（ＳＩＮ）由来のＤＬＰモチーフを含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子はまた、αウイルスｎｓＰ３マクロドメインに由来するアミノ酸配列をコードするＲＮＡサブ配列、及びαウイルスｎｓＰ３中央ドメインに由来するアミノ酸配列をコードするＲＮＡサブ配列を有する。様々な実施形態では、マクロドメイン及び中央ドメイン（複数可）は、両方とも新世界型野生型αウイルスｎｓＰ３に由来し得るか、又は両方とも旧世界型野生型αウイルスｎｓＰ３タンパク質に由来し得る。他の実施形態では、マクロドメインは、新世界型野生型αウイルスマクロドメインに由来し得、中央ドメインは、旧世界型野生型αウイルス中央ドメインに由来し得るか、又はその逆であり得る。様々なドメインは、本明細書に記載の任意の配列のものであり得る。自己複製ＲＮＡ分子はまた、旧世界型αウイルスｎｓＰ３超可変ドメインに完全に由来する、アミノ酸配列をコードするＲＮＡサブ配列を有し得、又は、新世界型αウイルスｎｓＰ３超可変ドメインに由来する部分と、旧世界型αウイルスｎｓＰ３超可変ドメインに由来する部分と、を有するアミノ酸配列を有することができ、すなわち、超可変ドメイン（hyper variable domain、ＨＶＤ）は、ハイブリッド又はキメラ新世界型／旧世界型配列であり得る。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、野生型新世界型αウイルスｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３及びｎｓＰ４タンパク質配列に由来するアミノ酸配列をコードする、ＲＮＡ配列を有することができる。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、非ＶＥＥＶ非構造タンパク質ｎｓＰ１、ｎｓＰ２、ｎｓＰ３、及びｎｓＰ４を含有する。
蓄積された実験的証拠により、ＶＥＥＶ及び他のαウイルスゲノムの複製／増幅が示され、それらの欠陥干渉（defective interfering、ＤＩ）ＲＮＡは、３つのプロモーターエレメント、（ｉ）保存３’末端配列エレメント（３’ＣＳＥ）及びそれに続くポリ（Ａ）尾部と、（ｉｉ）マイナス鎖及びプラス鎖両方のＲＮＡ合成のための重要なプロモーターエレメントとして機能する５’ＵＴＲと、（ｉｉｉ）ｎｓＰ１コード配列に存在し、αウイルスゲノム複製のエンハンサーとして機能する、５１－ｎｔ保存配列エレメント（５１－ｎｔＣＳＥ）とによって決定される（Ｋｉｍ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ，２０１４，１１１：１０７０８－１０７１３）。
５’及び３’非翻訳領域は、レプリコンによってコードされる他の配列のいずれかに操作可能に連結され得る。ＵＴＲは、他のコード化配列の認識及び転写に必要な配列及び間隔を提供することによって、タンパク質若しくはペプチドをコードする、プロモーター及び／又は配列に操作可能に連結され得る。
上に開示した自己複製ＲＮＡ分子のいずれかは、非改変５’非翻訳領域（5'untranslated region、５’ＵＴＲ）を更に含み得る。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、改変５’非翻訳領域（５’－ＵＴＲ）を含む。例えば、改変５’－ＵＴＲは、１位、２位、４位、又はこれらの組合せで１つ以上のヌクレオチド置換を含み得る。好ましくは、改変５’－ＵＴＲは、２位にヌクレオチド置換を含み、より好ましくは、改変５’－ＵＴＲは、２位にＵ－＞Ｇ置換を有する。そのような自己複製ＲＮＡ分子の例は、米国特許出願公開第２０１８／０１０４３５９号、及び国際公開第２０１８１０７５２３５号に記載されており、その内容は参照によりその全体が本明細書に援用される。
いくつかの実施形態では、ＵＴＲは、野生型新世界型又は旧世界型αウイルスＵＴＲ配列、又はそれらのいずれかに由来する配列であり得る。５’ＵＴＲは、約６０ｎｔ、又は５０～７０ｎｔ、又は４０～８０ｎｔなどの任意の好適な長さであり得る。いくつかの実施形態では、５’ＵＴＲはまた、保存された一次又は二次構造（例えば、１つ以上のステムループ（複数可））を有し得、αウイルス又はレプリコンＲＮＡの複製に関与し得る。３’ＵＴＲは、最大数百個のヌクレオチドであり得、例えば、５０～９００、又は１００～９００、又は５０～８００、又は１００～７００、又は２００ｎｔ～７００ｎｔであり得る。３’ＵＴＲはまた、二次構造、例えばステップループを有することができ、その後にポリアデニル化域又はポリＡ尾部が続くことができる。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、３’ポリＡ尾部を有することができる。それはまた、その３’末端近くにポリＡポリメラーゼ認識配列（例えば、ＡＡＵＡＡＡ）を含むことができる。
自己複製ＲＮＡ分子が組換えαウイルス粒子内にパッケージングされる場合、それは、粒子形成につながるαウイルス構造タンパク質との相互作用を開始する役割を果たす、いわゆるパッケージングシグナルと呼ばれる、１つ以上の配列を含有し得る。いくつかの実施形態では、αウイルス粒子は、１つ以上のαウイルスに由来するＲＮＡ、及び構造タンパク質のうちの少なくとも１つが２つ以上のαウイルスに由来する、当該構造タンパク質を含む。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、構造ウイルスタンパク質（例えば、ヌクレオカプシドタンパク質Ｃ、及びエンベロープタンパク質Ｐ６２、６Ｋ、及びＥ１）が除去され、本開示の卵巣ネオ抗原ポリヌクレオチドのコード配列によって置き換えられる、ＶＥＥＶ由来ベクターを含む。
これまでの研究で、ＶＥＥＶ及びシンドビスウイルス感染時には、ウイルスの非構造タンパク質（nonstructural protein、ｎｓＰ）のごく一部だけがｄｓＲＮＡ複製中間体に共在化することが明らかにされている。したがって、ｎｓＰの大部分はＲＮＡ複製に関与していない（Ｇｏｒｃｈａｋｏｖ Ｒ，ｅｔ ａｌ．（２００８）Ａ ｎｅｗ ｒｏｌｅ ｆｏｒ ｎｓ ｐｏｌｙｐｒｏｔｅｉｎ ｃｌｅａｖａｇｅ ｉｎ Ｓｉｎｄｂｉｓ ｖｉｒｕｓ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ．Ｊ Ｖｉｒｏｌ８２（１３）：６２１８～６２３１）。これは、通常、サブゲノムプロモーターから転写され、更に増幅されない、目的のタンパク質をコードするサブゲノムＲＮＡの増幅に十分に使用されていないｎｓタンパク質を利用する機会を提供している。
いくつかの実施形態では、本開示の自己複製ＲＮＡ分子のｎｓＰ１の断片は、５’－ＵＴＲの下流及びＤＬＰの上流に複製される。いくつかの実施形態では、ｎｓＰ１の最初の１９３個のヌクレオチドは、５’ＵＴＲの下流及びＤＬＰの上流に複製される。
他のウイルスベクター及び組換えウイルス
本開示のポリヌクレオチドを含むウイルスベクターは、ＡＡＶ－２（ａｄｅｎｏ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｖｉｒｕｓ ｔｙｐｅ ２、アデノ随伴ウイルス２型）などのヒトアデノ随伴ウイルスに由来するベクターを含む、プザー（ｐｔｈｅｒ）ウイルスベクターに由来し得る。ＡＡＶベクターの魅力的な特徴は、
いかなるウイルス遺伝子も発現しないことである。ＡＡＶベクターに含まれる唯一のウイルスＤＮＡ配列は、１４５ｂｐの逆位末端反復（ＩＴＲ）である。したがって、ネイキッドＤＮＡによる免疫においてみられるように、発現する唯一の遺伝子は、抗原又は抗原キメラのものである。加えて、ＡＡＶベクターは、ヒト末梢血単球由来樹状細胞などの分裂及び非分裂細胞の両方を、持続的に導入遺伝子が発現するように、並びに粘膜免疫を生じさせるための経口及び鼻腔内送達が可能であるように形質導入することが知られている。更に、必要とされるＤＮＡの量は、数桁とはるかに少ないと考えられ、５０μｇ又は約１０１５個のコピーのネイキッドＤＮＡの用量とは対照的に、１０１０～１０１１個の粒子又はＤＮＡのコピーの用量で応答が最大になる。ＡＡＶベクターは、ＡＡＶ ＩＴＲキメラタンパク質をコードしているコンストラクトに含まれるＤＮＡと、ＩＴＲを含まずにＡＡＶコード領域（ＡＡＶ ｒｅｐ及びｃａｐ遺伝子）を含有するＡＡＶヘルパープラスミドＡＣＧ２とを好適な細胞株（例えば、ヒト２９３細胞）にコトランスフェクションすることによってパッケージングされる。続いて、細胞にアデノウイルスＡｄ５を感染させる。ベクターは、当該技術分野において既知の方法（例えば、塩化セシウム密度勾配超遠心分離など）を使用して細胞溶解物から精製することができ、（例えば、細胞変性効果バイオアッセイによって）検出可能な複製可能ＡＡＶ又はアデノウイルスを確実に含まないことが検証される。
レトロウイルスベクターを用いてもよい。レトロウイルスは、ウイルスＲＮＡゲノムを複製して、感染細胞（例えば、標的細胞）の染色体ＤＮＡに組み込まれる二本鎖ＤＮＡにするために、ウイルスにコードされている逆転写酵素を使用して複製する統合ウイルスの分類である。このようなベクターとしては、マウス白血病ウイルス、特にモロニー（Ｇｉｌｂｏａ，ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ａｄｖ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．ＢｉＢｉｏｌ ２４１：２９）又はフレンドＦＢ２９株（国際公開第１９９５／０１４４７号）に由来するものが挙げられる。一般に、レトロウイルスベクターは、ウイルス遺伝子ｇａｇ、ｐｏｌ、及びｅｎｖの全て又は一部が欠失しており、５’及び３’ＬＴＲ並びにキャプシド形成配列は保持している。これらのエレメントは、レトロウイルスベクターの発現レベル又は安定性を増大させるように改変され得る。このような改変としては、ＶＬ３０などのレトロトランスポゾンのうちの１つによるレトロウイルスキャプシド形成配列の置換が挙げられる（例えば、米国特許第５，７４７，３２３号を参照されたい）。
本開示のポリヌクレオチドは、レトロウイルスゲノムに対して反対方向など、キャプシド形成配列の下流に挿入されてもよい。レトロウイルス粒子は、ヘルパーウイルスの存在下で、又はレトロウイルスベクターが欠いているレトロウイルス遺伝子（例えば、ｇａｇ／ｐｏｌ及びｅｎｖ）がゲノムに組み込まれている、適切な相補（パッケージング）細胞株において調製される。このような細胞株は、先行技術に記載されている（Ｍｉｌｌｅｒ ａｎｄ Ｒｏｓｍａｎ，１９８９，ＢｉｏＴｅｃｈｎｉｑｕｅｓ ７：９８０；Ｄａｎｏｓ ａｎｄ Ｍｕｌｌｉｇａｎ，１９８８，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８５：６４６０；Ｍａｒｋｏｗｉｔｚ，ｅｔ ａｌ．，１９８８，Ｖｉｒｏｌ．１６７：４００）。ｅｎｖ遺伝子の生成物は、標的細胞の表面上に存在するウイルス受容体へのウイルス粒子の結合に関与し、したがって、レトロウイルス粒子の宿主範囲を決定する。したがって、広宿主性エンベロープタンパク質を含有するＰＡ３１７細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ ９０７８）又は２９３ＥＩ６（国際公開第９７／３５９９６号）などのパッケージング細胞株を使用して、ヒト及び他の種の標的細胞に感染させられるようにすることができる。レトロウイルス粒子は、培養上清から回収され、任意選択で、標準的な技術（例えば、クロマトグラフィー、超遠心分離）に従って更に精製され得る。
調節エレメント
本開示のポリヌクレオチド又は異種ポリヌクレオチドは、ベクター内の１つ以上の調節エレメントに操作可能に連結され得る。調節エレメントは、プロモーター、エンハンサー、ポリアデニル化シグナル、リプレッサーなどを含んでいてよい。本明細書で使用する場合、「操作可能に連結された」という用語は、その最も広い妥当な文脈で解釈されるべきであり、機能的な関係にあるポリヌクレオチド要素の連結を指す。ポリヌクレオチドは、別のポリヌクレオチドと機能的関係に置かれるときに「操作可能に連結されて」いる。例えば、プロモーターは、コード配列の転写に影響する場合、コード配列に操作可能に連結している。
発現ベクター及びウイルスベクターで一般的に使用されるエンハンサー及びプロモーター配列の一部は、例えば、ヒトサイトメガロウイルス（ｈＣＭＶ）、ワクシニアＰ７．５初期／後期プロモーター、ＣＡＧ、ＳＶ４０、マウスＣＭＶ（ｍＣＭＶ）、ＥＦ－ｌ、及びｈＰＧＫプロモーターである。その高い効力及び約０．８ｋＢの中程度の大きさから、ｈＣＭＶプロモーターが、これらのプロモーターのうちで最も一般的に使用されているものの１つである。ｈＰＧＫプロモーターは、小さなサイズ（約０．４ｋＢ）を特徴とするが、ｈＣＭＶプロモーターよりも効力が低い。他方、サイトメガロウイルス初期エンハンサーエレメント、プロモーター、ニワトリベータ－アクチン遺伝子の第１エキソン及びイントロン、並びにウサギベータグロビン遺伝子のスプライス受容体からなるＣＡＧプロモーターは、ｈＣＭＶプロモーターに匹敵する非常に強力な遺伝子発現を指示することができるが、サイズが大きいことから、例えば、アデノウイルスベクター（ＡｄＶ）、アデノ随伴ウイルスベクター（ＡＡＶ）、又はレンチウイルスベクター（ＬＶ）において、空間的制約が重大な懸念となり得るウイルスベクターにはあまり適していない。
使用することができる追加のプロモーターは、国際公開第２０１８／１４６２０５号に記載されているヨザルヘルペスウイルス１主要最初期プロモーター（ＡｏＨＶ－１プロモーター）である。プロモーターは、リプレッサータンパク質の存在下でプロモーターの発現を抑制するために、リプレッサータンパク質が結合することができるリプレッサー作動配列に操作可能に結合され得る。特定の実施形態では、リプレッサー作動配列は、ＴｅｔＯ配列又はＣｕＯ配列である（例えば、米国特許第９７９０２５６号を参照されたい）。
特定の場合では、同じベクターから少なくとも２つの別個のポリペプチドを発現させることが望ましい場合がある。この場合、各ポリヌクレオチドは、同じ又は異なるプロモーター及び／若しくはエンハンサー配列に操作可能に連結されてもよく、又は例えば脳性心筋炎ウイルスからの配列内リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）を利用することによって周知のバイシストロニックな発現系を使用してもよい。あるいは、ｈＣＭＶ－ｒｈＣＭＶプロモーター及び国際公開第２０１７／２２０４９９号に記載の他のプロモーターなどの双方向合成プロモーターを使用してもよい。ポリアデニル化シグナルは、ＳＶ４０又はウシ成長ホルモン（ＢＧＨ）に由来していてよい。
本開示のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、自己複製ＲＮＡベクターは、ベクターのポリヌクレオチド配列によってコードされる、本開示のポリペプチドの複製及び発現を含むが、これらに限定されない、ベクターの従来の機能（複数可）を確立するための任意の調節エレメントを更に含み得る。調節エレメントとしては、プロモーター、エンハンサー、ポリアデニル化シグナル、翻訳終止コドン、リボソーム結合エレメント、転写ターミネーター、選択マーカー、複製起点などが挙げられるが、これらに限定されない。ベクターは、１つ以上の発現カセットを含むことができる。「発現カセット」は、ＲＮＡ及びタンパク質を作製するための細胞機構を指向するベクターの一部である。発現カセットは、通常、プロモーター配列と、オープンリーディングフレームと、任意選択でポリアデニル化シグナルを含む３’非翻訳領域（ＵＴＲ）と、の３つの構成要素を含む。オープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）は、開始コドンから終止コドンへの目的のタンパク質（例えば、本開示のポリペプチド）のコード配列を含むリーディングフレームである。発現カセットの調節エレメントは、目的のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列に操作可能に連結され得る。本明細書に記載の発現カセットでの使用に好適な任意の構成要素は、本出願のベクターを調製するために任意の組合せで、かつ任意の順序で使用することができる。
ベクターは、本開示のポリペプチドの発現を制御するために、好ましくは発現カセット内にプロモーター配列を含むことができる。
自己複製ＲＮＡでは、ベクターは、発現転写物を安定化させ、ＲＮＡ転写物の核輸送を向上させ、かつ／又は転写翻訳カップリングを改善する、追加のポリヌクレオチド配列を更に含むことができる。そのような配列の例としては、ポリアデニル化シグナル及びエンハンサー配列が挙げられる。ポリアデニル化シグナルは、通常、ベクターの発現カセット内の目的のタンパク質（例えば、本開示のポリペプチド）のコード配列の下流に位置する。エンハンサー配列は、転写因子によって結合したときに関連する遺伝子の転写を向上させる調節ＤＮＡ配列である。エンハンサー配列は、好ましくは、本開示のポリペプチドをコードするが、ベクターの発現カセット内のプロモーター配列の下流にある、ポリヌクレオチド配列の上流に位置する。
本開示を考慮して当業者に既知の任意のエンハンサー配列を使用することができる。
本開示の自己複製ＲＮＡベクターの構成要素又は配列のいずれかは、構成要素又は配列のうちの他の任意のものに機能的又は操作可能に連結され得る。
コード配列に機能的に連結しているプロモーター又はＵＴＲは、適当な酵素が存在しているとき、コード配列の転写及び発現に影響を及ぼすことができる。プロモーターは、その発現を導くように機能する限り、コード配列に隣接している必要はない。したがって、タンパク質又はペプチドをコードするＲＮＡ配列と調節配列（例えば、プロモーター又はＵＴＲ）との間の操作可能な連結は、目的のポリヌクレオチドの発現を可能にする機能的連結である。操作可能に連結されているとは、また、ＲｄＲｐ（例えば、ｎｓＰ４）、ｎｓＰ１－４、ＵＴＲ、プロモーターをコードする配列、及びＲＮＡレプリコンでコードする他の配列が、ポリペプチドの転写及び翻訳、並びに／又はレプリコンの複製を可能にするように連結されているような配列を指すことができる。ＵＴＲは、他のコード化配列のリボソームによる認識及び翻訳に必要な配列及び間隔を提供することによって、操作可能に連結することができる。
分子は、天然（又は野生型）対応分子と同じ活性の少なくとも５０％を実行する場合、機能的又は生物学的活性であるが、機能的分子は、その天然（又は野生型）対応分子と同じ活性の少なくとも６０％、又は少なくとも７０％、又は少なくとも９０％、又は少なくとも９５％、又は１００％を実行することもできる。自己複製ＲＮＡ分子はまた、野生型αウイルスアミノ酸配列に由来する、又はそれに基づくアミノ酸配列をコードすることができ、これは、新世界型又は旧世界型αウイルスゲノムであり得る、野生型ＲＮＡαウイルスゲノムによってコードされるアミノ酸配列（対応する配列であり得る）と少なくとも６０％、又は少なくとも６５％、又は少なくとも６８％、又は少なくとも７０％、又は少なくとも８０％、又は少なくとも７０％、又は少なくとも８０％、又は少なくとも９０％、又は少なくとも９５％、又は少なくとも９７％、又は少なくとも９８％、又は少なくとも９９％、又は１００％、又は８０～９９％、又は９０～１００％、又は９５～９９％、又は９５～１００％、又は９７～９９％、又は９８～９９％同一の配列を有することを意味する。他の配列に由来する配列は、元の配列よりも最大５％、若しくは最大１０％、若しくは最大２０％、若しくは最大３０％長くてもよく又は短くてもよい。実施形態のいずれかにおいて、配列同一性は、上にＧ３ＢＰ又はＦＸＲ結合部位（又はＧ３ＢＰ又はＦＸＲ結合部位を有するアミノ酸配列）をコードする任意のヌクレオチド配列について、少なくとも９５％、又は少なくとも９７％、又は少なくとも９８％、又は少なくとも９９％、又は１００％であり得る。これらの配列はまた、元の配列よりも最大５％、若しくは最大１０％、若しくは最大２０％、若しくは最大３０％長くてもよく又は短くてもよい。
本開示の細胞
本開示はまた、本開示の１つ以上のベクター若しくは本開示の１つ以上の組換えウイルスを含むか又は本開示の１つ以上のベクター若しくは本開示の１つ以上の組換えウイルスが形質導入された細胞を提供する。
好適な細胞としては、原核細胞及び真核細胞、例えば、Ｈｅｋ２９３、ＣＨＯ、ＰＥＲ．Ｃ６、又はニワトリ胚線維芽細胞（ＣＥＦ）細胞などの哺乳類細胞、酵母、真菌、及び細菌（例えば、大腸菌（E.coli））が挙げられる。細胞は、例えば研究のため、若しくはポリペプチド若しくはウイルスを産生するためにインビトロで使用することができるか、又は細胞は、インビボで使用することができる。いくつかの実施形態では、細胞は、筋肉細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）である。好適な抗原提示細胞としては、樹状細胞、Ｂリンパ球、単球、及びマクロファージが挙げられる。
本開示のポリヌクレオチド又はベクターでトランスフェクトされた細胞は、典型的には、ＡＴＣＣなどの細胞培養リポジトリを介して得ることができる。ＡＰＣは、白血球フェレーシス及び「フィコール／ハイパック」密度勾配遠心分離（フィコール及び不連続なパーコール密度勾配による段階的遠心分離）を使用して末梢血から得ることができる。ＡＰＣは、既知の方法を用いて単離、培養、及び遺伝子操作することができる。例えば、未成熟及び成熟樹状細胞は、既知の方法を使用して末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）から生成され得る。例示的な方法では、単離したＰＢＭＣを前処理して、免疫磁気技術によってＴ細胞及びＢ細胞を枯渇させる。次いで、リンパ球が枯渇したＰＢＭＣを、ヒト血漿（好ましくは自家血漿）及びＧＭ－ＣＳＦ／ＩＬ－４を補給したＲＰＭＩ培地９中で培養（例えば、約７日間）して樹状細胞を生成する。樹状細胞は、その単球前駆細胞と比較して非接着性である。したがって、約７日目に、更なる処理のために非接着細胞を収集する。ＧＭ－ＣＳＦ及びＩＬ－４の存在下でＰＢＭＣから誘導された樹状細胞は、非接着特性を失い、サイトカイン刺激が培養から除去された場合にマクロファージ細胞運命に戻ることができるという点で、未成熟である。未成熟状態の樹状細胞は、ＭＨＣクラスＩＩ制限経路のネイティブタンパク質抗原のプロセシングにおいて有効である（Ｒｏｍａｎｉ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１６９：１１６９，１９８９）。培養樹状細胞の更なる成熟は、必要な成熟因子を含有するマクロファージ馴化培地（ＣＭ）中で３日間培養することによって達成される。成熟樹状細胞は、提示のために新たなタンパク質を捕捉することはあまりできないが、成長及び分化のための静止Ｔ細胞（ＣＤ４及びＣＤ８の両方）の刺激についてははるかに優れている。成熟樹状細胞は、より多くの運動性細胞質突起の形成などの形態の変化によって、その非接着性によって、以下のマーカー：ＣＤ８３、ＣＤ６８、ＨＬＡ－ＤＲ、若しくはＣＤ８６のうちの少なくとも１つの存在によって、又はＣＤ１１５などのＦｃ受容体の喪失によって、同定することができる（Ｓｔｅｉｎｍａｎ，Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：２７１，１９９１に概説されている）。成熟樹状細胞は、ＦＡＣＳｃａｎ及びＦＡＣＳｔａｒなどの典型的な細胞蛍光法並びに細胞選別技術及び装置を使用して回収及び分析することができる。フローサイトメトリーに使用される一次抗体は、成熟樹状細胞の細胞表面抗原に特異的なものであり、市販されている。二次抗体は、ビオチン化されたＩｇ、続いて、ＦＩＴＣ又はＰＥコンジュゲートストレプトアビジンであってよい。本開示のベクター及び組換えウイルスは、トランスフェクション、エレクトロポレーション、融合、マイクロインジェクション、ウイルスベースの送達、又は細胞ベースの送達を含むがこれらに限定されない、当該技術分野において既知の方法を用いて、ＡＰＣを含む細胞に導入することができる。
ワクチン及び医薬組成物
本開示はまた、本明細書に開示されるポリヌクレオチドのうちのいずれか、ポリペプチドのうちのいずれか、及びベクターのうちのいずれかを含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に開示されるヌクレオチドのうちのいずれかを含むベクターを含み得、ベクターは、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、ＭＶＡ、又は自己複製ＲＮＡ分子から選択される。いくつかの実施形態では、組成物は、本明細書に開示されるポリペプチド又はネオ抗原のいずれかを発現する組換えウイルス又は自己複製ＲＮＡ分子を含み得る。いくつかの実施形態では、組換えウイルスは、Ａｄ２６ウイルス、ＧＡｄ２０ウイルス、又はＭＶＡウイルスであり得る。
上述の組成物のうちのいずれかは、組成物及び医薬的に許容される賦形剤を含む医薬組成物を含んでいてもよく、又は医薬組成物内に製剤化されてもよい。
ポリペプチド若しくは異種ポリペプチド、又はこれらの断片、又はこれらをコードしているポリヌクレオチドは、対象に投与するのに好適な任意の既知の送達ビヒクルを利用して対象に送達されてもよい。ポリペプチド、異種ポリペプチド、又はこれらの断片は、使用される送達ビヒクルにかかわらず、対象において免疫原性であることが予想される。ポリヌクレオチドは、ＤＮＡ若しくはＲＮＡ、又はこれらの誘導体であってよい。ＲＮＡは、オリゴヌクレオチドＲＮＡ、ｔＲＮＡ（トランスファーＲＮＡ）、ｓｎＲＮＡ（核内低分子ＲＮＡ）、ｒＲＮＡ（リボソームＲＮＡ）、ｍＲＮＡ（メッセンジャーＲＮＡ）、アンチセンスＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ（低分子干渉ＲＮＡ）、自己複製ＲＮＡ、リボザイム、キメラ配列、又はこれらの群の誘導体の形態であってよい。
本開示はまた、本開示のポリヌクレオチドを含むワクチンを提供する。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ＤＮＡである。
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ＲＮＡである。
いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、ｍＲＮＡである。
本開示はまた、本開示のベクターを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のｒＡｄ２６を含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のｒＭＶＡを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のｒＧＡｄを含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のｒＧＡｄ２０を含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示のＣｈＡｄ２０を含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示の自己複製ＲＮＡ分子を含むワクチンを提供する。
本開示はまた、本開示の細胞を含むワクチンを提供する。
ワクチン組成物の調製は周知である。ワクチンは、ワクチン及び医薬的に許容される賦形剤を含む医薬組成物を含んでいてもよく、又は当該医薬組成物に製剤化されてもよい。
「医薬的に許容される」とは、使用される投与量及び濃度で、投与される対象において望ましくない効果も有害な効果も引き起こさず、担体、バッファ、安定剤、又は当業者に周知の他の材料を含む賦形剤を指す。担体又は他の材料の厳密な性質は、投与経路、例えば、筋肉内、皮下、経口、静脈内、皮膚、粘膜内（例えば、腸内）、鼻腔内、又は腹腔内経路に依存し得る。水、石油、動物油又は植物油、鉱油又は合成油などの液体担体が含まれていてよい。生理食塩水、デキストロース若しくは他の糖液、又はエチレングリコール、プロピレングリコール若しくはポリエチレングリコールなどのグリコールが含まれていてもよい。例示的なウイルス処方は、アデノウイルス世界標準（Ｈｏｇａｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ，２００２）：２０ｍＭ Ｔｒｉｓ ｐＨ８、２５ｍＭ ＮａＣｌ、２．５％グリセロール；又は２０ｍＭ Ｔｒｉｓ、２ｍＭ ＭｇＣｌ２、２５ｍＭ ＮａＣｌ、スクロース１０％ ｗ／ｖ、ポリソルベート８０ ０．０２％ｗ／ｖ、又は１０～２５ｍＭクエン酸バッファｐＨ５．９～６．２、４～６％（ｗ／ｗ）ヒドロキシプロピル－β－シクロデキストリン（ＨＢＣＤ）、７０～１００ｍＭ ＮａＣｌ、０．０１８～０．０３５％（ｗ／ｗ）ポリソルベート－８０、及び任意選択で０．３～０．４５％（ｗ／ｗ）エタノールである。多くの他のバッファを使用することができ、精製された医薬製剤の保管及び医薬投与のための好適な処方の例が知られている。
アジュバント
医薬組成物は、１つ以上のアジュバントを含み得る。そのようなアジュバントの例としては、無機アジュバント（例えば、リン酸アルミニウム又は水酸化アルミニウムなどの無機金属塩）、有機アジュバント（例えば、サポニン又はスクアレン）、油性アジュバント（フロイント完全アジュバント及びフロイント不完全アジュバント）、リポソーム、又は生分解性微小球）、ビロソーム、細菌アジュバント（例えば、モノホスホリル脂質Ａ、又はムラミルペプチド）、合成アジュバント（例えば、非イオン性ブロックコポリマー、ムラミルペプチド類似体、又は合成脂質Ａ）、又は合成ポリヌクレオチドアジュバント（例えば、ポリアルギニン又はポリリジン）が挙げられるが、これらに限定されない。好適なアジュバントとしては、ＱＳ－２１、Ｄｅｔｏｘ－ＰＣ、ＭＰＬ－ＳＥ、ＭｏＧＭ－ＣＳＦ、ＴｉｔｅｒＭａｘ－Ｇ、ＣＲＬ－１００５、ＧＥＲＢＵ、ＴＥＲａｍｉｄｅ、ＰＳＣ９７Ｂ、Ａｄｊｕｍｅｒ、ＰＧ－０２６、ＧＳＫ－Ｉ、ＧｃＭＡＦ、Ｂ－アレチン、ＭＰＣ－０２６、Ａｄｊｕｖａｘ、ＣｐＧ ＯＤＮ、ベータフェクチン、アラム、及びＭＦ５９が挙げられる。使用することができる他のアジュバントとしては、レクチン、成長因子、サイトカイン及びリンホカイン、例えば、アルファインターフェロン、ガンマインターフェロン、血小板由来成長因子（platelet derived growth factor、ＰＤＧＦ）、顆粒球コロニー刺激因子（granulocyte-colony stimulating factor、ｇＭＣＳＦ））、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（granulocyte macrophage colony stimulating factor、ｇＣＳＦ）、腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）、上皮成長因子（ＥＧＦ）、ＩＬ－１、ＩＬ－２、ＩＬ－４、ＩＬ－６、ＩＬ－８、ＩＬ－１０、ＩＬ－１２、又はＴＬＲアゴニスト、及び粒子状アジュバント（例えば、免疫刺激性複合体（immuno-stimulatory complex、ＩＳＣＯＭ））が挙げられる。
「アジュバント」及び「免疫刺激剤」は、本明細書において互換的に使用され、免疫系の刺激を引き起こす１つ以上の物質として定義される。この文脈において、アジュバントは、本明細書に記載のワクチン又はウイルスベクターに対する免疫応答を強化するために使用される。
本開示による医薬組成物は、特定の実施形態では、本開示のワクチンであり得る。
同様に、本開示のポリヌクレオチド、異種ポリヌクレオチド、ポリペプチド、及び異種ポリペプチドは、ポリヌクレオチド、異種ポリヌクレオチド、ポリペプチド、及び異種ポリペプチド、並びに医薬的に許容される賦形剤を含む医薬組成物に製剤化してもよい。
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、アジュバントを欠いていてもよい。
ナノ粒子
いくつかの実施形態では、組成物はナノ粒子を含んでもよい。本開示のポリヌクレオチドのうちのいずれかは、対象への送達のためにナノ粒子に結合するか、又はそれと接触し得る。ナノ粒子を使用する本開示のポリヌクレオチド又はポリペプチドのうちのいずれかの送達は、ワクチン組成物中にウイルス又はアジュバントを含む必要性を排除し得る。ナノ粒子は、ペプチドに対する免疫応答を有効に誘導するのに役立つ免疫危険シグナルを含有し得る。ナノ粒子は、ロバストな免疫応答に必要な樹状細胞（ＤＣ）の活性化及び成熟を誘導し得る。ナノ粒子は、細胞、例えば、抗原提示細胞によるナノ粒子、ひいては、ペプチドの取り込みを改善する非自己成分を含有していてもよい。
ナノ粒子は、典型的には、直径約１ｎｍ～約１００ｎｍ、例えば約２０ｎｍ～約４０ｎｍである。２０～４０ｎｍの平均直径を有するナノ粒子は、ナノ粒子のサイトゾルへの取り込みを促進し得る（例えば、国際公開第２０１９／１３５０８６号を参照されたい）。例示的なナノ粒子は、ポリマーナノ粒子、無機ナノ粒子、リポソーム、脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）、免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）、ウイルス様粒子（ＶＬＰ）、又は自己集合タンパク質である。
ナノ粒子は、リン酸カルシウムナノ粒子、シリコンナノ粒子、又は金ナノ粒子であり得る。ポリマーナノ粒子は、ポリ（ｄ，ｌ－ラクチド－コ－グリコリド）（ＰＬＧ）、ポリ（ｄ，ｌ－乳酸－コグリコール酸）（ＰＬＧＡ）、ポリ（ｇ－グルタミン酸）（ｇ－ＰＧＡ）ｍポリ（エチレングリコール）（ＰＥＧ）、若しくはポリスチレンなどの１つ以上の合成ポリマー、又は多糖類、例えば、プルラン、アルギネート、イヌリン、及びキトサンなどの１つ以上の天然ポリマーを含んでいてよい。ポリマーナノ粒子の使用は、ナノ粒子中に含まれ得るポリマーの特性に起因して有利であり得る。例えば、上に列挙した天然ポリマー及び合成ポリマーは、良好な生体適合性及び生分解性、非毒性の性質、並びに／又は所望の形状及びサイズに加工される能力を有し得る。ポリマーナノ粒子はまた、可撓性メッシュサイズ、多価コンジュゲーションのための大きな表面積、高い含水量、及び抗原についての高い負荷容量を含む好ましい特性を有する、ヒドロゲルナノ粒子、親水性三次元ポリマーネットワークを形成することができる。ポリ（Ｌ－乳酸）（ＰＬＡ）、ＰＬＧＡ、ＰＥＧ、及び多糖類などのポリマーは、ヒドロゲルナノ粒子を形成するのに好適である。無機ナノ粒子は、典型的には、強固な構造を有し、抗原が封入されるシェル、又は抗原が共有結合し得るコアを含む。コアは、金（Ａｕ）、銀（Ａｇ）、銅（Ｃｕ）原子、Ａｕ／Ａｇ、Ａｕ／Ｃｕ、Ａｕ／Ａｇ／Ｃｕ、Ａｕ／Ｐｔ、Ａｕ／Ｐｄ、又はＡｕ／Ａｇ／Ｃｕ／Ｐｄ、又はリン酸カルシウム（ＣａＰ）などの１つ以上の原子を含んでいてよい。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、リポソームであってもよい。リポソームは、典型的には、生分解性の非毒性リン脂質から形成され、水性コアを有する自己集合リン脂質二重層シェルを含む。リポソームは、単一のリン脂質二重層を含む単層ベシクル、又は水層によって分離されているいくつかの同心性リン脂質シェルを含む多層ベシクルであってもよい。結果として、リポソームは、リン脂質二重層内の水性コア又は疎水性分子に親水性分子を組み込むように調整され得る。リポソームは、本開示のポリヌクレオチド、又はポリペプチド、又はこれらの断片を、送達のためにコア内に封入し得る。リポソーム及びリポソーム製剤は、標準的な方法に従って調製することができ、当該技術分野において周知であり、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ；Ａｋｉｍａｒｕ，１９９５，Ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．１：１９７－２１０；Ａｌｖｉｎｇ，１９９５，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．１４５：５－３１；Ｓｚｏｋａ，１９８０，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｂｉｏｅｎｇ．９：４６７；米国特許第４，２３５，８７１号、同第４，５０１，７２８号、及び同第４，８３７，０２８号を参照されたい。リポソームは、リポソーム複合体に特定の細胞型を標的とさせるための標的分子を含み得る。標的分子は、血管又は標的組織にみられる細胞の表面上の生体分子（例えば、受容体又はリガンド）の結合パートナー（例えば、リガンド又は受容体）を含んでいてよい。リポソームの電荷は、血液からのリポソームクリアランスにおける重要な決定因子であり、負に帯電したリポソームは、細網内皮系によってより急速に取り込まれ（Ｊｕｌｉａｎｏ，１９７５，Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ｒｅｓ．Ｃｏｍｍｕｎ．６３：６５１）、したがって、血流中でより短い半減期を有する。ホスファチジルエタノールアミン誘導体が組み込まれると、リポソームの凝集を防止することにより循環時間が延長される。例えば、Ｎ－（ω－カルボキシ）アシルアミドホスファチジルエタノールアミンをＬ－α－ジステアロイルホスファチジルコリンの大きな単層ベシクルに組み込むと、ｉｎ ｖｉｖｏにおけるリポソーム循環寿命が劇的に増加する（例えば、Ａｈｌ，１９９７，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ １３２９：３７０－３８２を参照されたい）。典型的には、リポソームは、約５～１５モルパーセントの負に帯電したリン脂質、例えば、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルセリン、又はホスファチジルイノシトールを用いて調製される。また、ホスファチジルグリセロールなどの負に帯電したリン脂質の添加は、自発的なリポソーム凝集を防止する機能を有し、したがって、小ぶりのリポソーム凝集体形成のリスクが最小限に抑えられる。少なくとも約５０モルパーセントの濃度のスフィンゴミエリン又は飽和中性リン脂質及び５～１５モルパーセントのモノシアリルガングリオシドなどの膜硬化剤はまた、望ましくは、剛性などのリポソーム特性を付与し得る（例えば、米国特許第４，８３７，０２８号を参照されたい）。加えて、リポソーム懸濁液は、保管時に脂質を遊離ラジカル及び脂質過酸化的損傷から保護する脂質保護剤を含んでいてよい。α－トコフェロールなどの親油性フリーラジカルクエンチャー及びフェリオキシアニンなどの水溶性鉄特異的キレート剤が好ましい。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、不均一なサイズの多層膜小胞を含み得る。例えば、ベシクル形成脂質を好適な有機溶媒又は溶媒系に溶解させ、真空下又は不活性ガス下で乾燥させて、薄い脂質膜を形成することができる。必要に応じて、膜を三級ブタノールなどの好適な溶媒に再溶解させ、次いで凍結乾燥して、より容易に水和する粉末状の形態であるより均質な脂質混合物を形成することができる。この膜を、ポリペプチド又はポリヌクレオチドの水溶液で被覆し、典型的には撹拌しながら１５～６０分間にわたって水和させる。
得られた多層ベシクルのサイズ分布は、より激しい撹拌条件下で脂質を水和させることによって、又はデオキシコール酸塩などの可溶化洗剤を添加することによって、より小さいサイズにシフトさせることができる。水和培地は、最終的なリポソーム懸濁液中のリポソームの内部容積において望ましい濃度の核酸を含み得る。多層ベシクルを形成するために使用され得る好適な脂質としては、ＤＯＴＭＡ、ＤＯＧＳ又はＴｒａｎｓｆｅｃｔａｉｎ（商標）、ＤＮＥＲＩＥ又はＤＯＲＩＥ、ＤＣ－ＣＨＯＬ、ＤＯＴＡＰ（商標）、Ｌｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ（商標）、及びグリセロ脂質化合物が挙げられる。
いくつかの実施形態で、ナノ粒子は、免疫刺激複合体（ＩＳＣＯＭ）であってもよい。ＩＳＣＯＭは、典型的にはコロイド状サポニン含有ミセルから形成される、かご様粒子である。ＩＳＣＯＭは、コレステロール、リン脂質（ホスファチジルエタノールアミン又はホスファチジルコリンなど）、及びサポニン（ｔｒｅｅ Ｑｕｉｌｌａｉａ ｓａｐｏｎａｒｉａ製のＱｕｉｌ Ａなど）を含み得る。
いくつかの実施形態で、ナノ粒子は、ウイルス様粒子（virus-like particle、ＶＬＰ）であってもよい。ＶＬＰは、生体適合性カプシドタンパク質の自己集合によって形成される、感染性核酸を有しない自己集合性ナノ粒子である。ＶＬＰの直径は、典型的には約２０～約ｌ５０ｎｍ、例えば、約２０～約４０ｎｍ、約３０～約ｌ４０ｎｍ、約４０～約ｌ３０ｎｍ、約５０～約ｌ２０ｎｍ、約６０～約１１０ｎｍ、約７０～約１００ｎｍ、又は約８０～約９０ｎｍである。ＶＬＰは、有利には、免疫系との相互作用のために天然に最適化されている、進化したウイルス構造の力を利用する。天然に最適化されたナノ粒子サイズ及び反復構造秩序とは、アジュバントの非存在下であってもＶＬＰが強力な免疫応答を誘導することを意味する。
カプセル化自己複製ＲＮＡ分子
自己複製ＲＮＡ分子及び／又はそれを含む組成物はまた、これらに限定されないが、リン酸カルシウム、ポリマーなどのポリマー、脂質、及び／又は他の生分解性薬剤の組合せを使用して、ナノ粒子として製剤化することができる。構成成分は、本開示の分子及び／又は組成物の送達を向上させることができるように、コアシェル、ハイブリッド、及び／又は多層構造で組み合わせて、ナノ粒子の微調整を可能にすることができる。
開示された自己複製ＲＮＡ分子及び／又は本開示のポリペプチドのうちのいずれかをコードする自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物は、１つ以上のリポソーム、リポプレックス、及び／又は脂質ナノ粒子を使用してカプセル化され得る。リポソームは、主に脂質二重層からなり得、ポリヌクレオチド及び自己複製ＲＮＡ分子の投与のための送達ビヒクルとして使用され得る、人工的に調製された小胞である。リポソームは、これに限定されないが、直径数百ナノメートルであり得る多層膜小胞（multilamellar vesicle、ＭＬＶ）などの異なるサイズのものであり得、狭い水性区画によって分離された一連の同心二層、直径５０ｎｍ未満であり得る小さな単細胞小胞（small unicellular vesicle、ＳＵＶ）、及び直径５０ｎｍ～５００ｎｍであり得る大きな単層小胞（large unilamellar vesicle、ＬＵＶ）を含有し得る。リポソーム設計には、不健康な組織へのリポソームの付着を改善するため、又はエンドサイトーシスなどであるがこれらに限定されないイベントを活性化するために、オプソニン又はリガンドが含まれ得るが、これらに限定されない。リポソームは、本明細書に開示されるポリヌクレオチド及び自己複製ＲＮＡ分子の送達を改善するために、低ｐＨ又は高ｐＨを含有し得る。
リポソームの形成は、限定するものではないが、封入される医薬製剤及びリポソーム成分、脂質小胞が分散される媒質の性質、封入される物質の有効濃度及びその潜在的毒性などの物理化学的特徴、小胞の適用及び／又は送達に関与する任意の追加プロセス、意図する用途に対する小胞の最適化サイズ、多分散性及び保存期間、並びに安全かつ効率的なリポソーム製品のバッチ間の再現性及び大規模生産の可能性に依存し得る。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、リポソーム、リポプレックス、脂質ナノ粒子、又はこれらの組合せにカプセル化、結合、又は吸着され、好ましくは、自己複製ＲＮＡ分子は、脂質ナノ粒子中にカプセル化される。
いくつかの実施形態では、本開示のポリペプチドのうちのいずれかをコードする自己複製ＲＮＡ分子は、粒子の脂質部分内に完全にカプセル化され得、それによってＲＮＡをヌクレアーゼ分解から保護する。「完全にカプセル化される」とは、血清又は遊離ＲＮＡを著しく分解するヌクレアーゼアッセイに暴露した後、ＲＮＡが著しく分解されないことを意味する。完全にカプセル化されると、通常、遊離核酸を１００％分解する処理で、好ましくは粒子中の核酸の２５％未満、より好ましくは１０％未満、最も好ましくは粒子中の核酸の５％未満が分解される。「完全にカプセル化される」とはまた、ｉｎ ｖｉｖｏ投与の際に、核酸－脂質粒子が、それらの構成成分部分に急速に分解されないことを意味する。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子及び／又はそれを含む本開示の組成物は、機能化脂質二層間に架橋を有し得る脂質小胞中に製剤化することができる。いくつかの実施形態では、本開示の自己複製ＲＮＡ分子及び／又は組成物は、脂質－ポリカチオン複合体中に製剤化することができる。脂質－ポリカチオン複合体の形成は、当該技術分野で既知の方法によって達成することができる。非限定的な例として、ポリカチオンは、ポリリジン、ポリオルニチン及び／又はポリアルギニン並びにカチオン性ペプチドなどであるが、これらに限定されない、カチオン性ペプチド又はポリペプチドを含み得る。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される自己複製ＲＮＡ分子及び／又は組成物は、これらに限定されないが、コレステロール又はジオレオイルホスファチジルエタノールアミン（ＤＯＰＥ）などの中性脂質を更に含み得る、脂質－ポリカチオン複合体中に製剤化され得る。脂質ナノ粒子製剤は、限定するものではないが、カチオン性脂質成分の選択、カチオン性脂質飽和度、ＰＥＧ化の性質、全ての成分の比率、及びサイズなどの生物物理学的パラメータによって影響され得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される自己複製ＲＮＡ分子は、脂質ナノ粒子（ＬＮＰ）にカプセル化される。脂質ナノ粒子は、通常、４つの異なる脂質－イオン化可能な脂質、中性ヘルパー脂質、コレステロール、及び拡散性ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）脂質を含む。ＬＮＰは、リポソームと類似しているが、わずかに異なる機能及び組成を有する。ＬＮＰは、ＤＮＡ、ｍＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、及びｓＲＮＡなどのポリヌクレオチドを封入するように設計される。従来のリポソームは、１つ以上の脂質二重層によって取り囲まれた水性コアを含有する。ＬＮＰは、非水性コア内にポリヌクレオチドを封入するミセル様構造を想定し得る。ＬＮＰは、典型的には、カチオン性脂質、非カチオン性脂質、及び粒子の凝集を防止する脂質（例えば、ＰＥＧ－脂質コンジュゲート）を含有する。静脈内（ｉ．ｅ．）注射後に長期にわたる循環寿命を呈し、遠位部位（すなわち、投与部位から物理的に離れている部位）に蓄積するので、ＬＮＰは全身用途に有用である。ＬＮＰは、約５０ｎｍ～約１５０ｎｍ、例えば、約６０ｎｍ～約１３０ｎｍ、又は約７０ｎｍ～約１１０ｎｍ、又は約７０ｎｍ～約９０ｎｍの平均直径を有し得、実質的に非毒性である。ポリヌクレオチドがロードされたＬＮＰの調製は、例えば、米国特許第５，９７６，５６７号、同第５，９８１，５０１号；同第６，５３４，４８４号；同第６，５８６，４１０号；同第６，８１５，４３２号、及び国際公開第９６／４０９６４号に開示されている。ポリヌクレオチド含有ＬＮＰは、例えば、国際公開第２０１９／１９１７８０号に記載されている。
いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、カチオン性脂質（例えば、本明細書に記載の１つ以上のカチオン性脂質又はその塩）、リン脂質、及び粒子の凝集を阻害するコンジュゲート化脂質（例えば、１つ以上のＰＥＧ－脂質コンジュゲート）を含む。脂質粒子はまた、コレステロールを含み得る。脂質粒子は、１つ以上のポリペプチドをコードする、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、又はそれ以上の自己複製ＲＮＡ分子をカプセル化し得る。
いくつかの実施形態では、ポリカチオン性組成物を含むＬＮＰ製剤は、ｉｎ ｖｉｖｏ及び／又はｅｘ ｖｉｔｒｏで本明細書に記載の自己複製ＲＮＡ分子の送達に使用することができる。本開示は、カチオン性脂質を含むＬＮＰ製剤を更に提供する。
「カチオン性脂質」及び「アミノ脂質」という用語は、１、２、３、又はそれ以上の脂肪酸又は脂肪アルキル鎖、及びｐＨ調整可能なアミノ先頭基（例えば、アルキルアミノ又はジアルキルアミノ先頭基）を有する、それらの脂質並びにその塩を含むように、互換的に使用される。カチオン性脂質は、通常、カチオン性脂質のｐＫａ未満のｐＨでプロトン化（すなわち、正に帯電）され、ｐＫａ超のｐＨで実質的に中性である。カチオン性脂質はまた、滴定可能なカチオン性脂質とも呼ばれ得る。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質は、プロトン化可能な３級アミン（例えば、ｐＨ滴定可能な）先頭基と、各アルキル鎖が独立して０～３個（例えば、０、１、２、又は３個）の二重結合を有するＣ１８アルキル鎖と、先頭基とアルキル鎖との間のエーテル、エステル又はケタール結合と、を含む。そのようなカチオン性脂質には、ＤＳＤＭＡ、ＤＯＤＭＡ、ＤＬｉｎＤＭＡ、ＤＬｅｎＤＭＡ、γ－ＤＬｅｎＤＭＡ、ＤＬｉｎ－Ｋ－ＤＭＡ、ＤＬｉｎ－Ｋ－Ｃ２－ＤＭＡ（ＤＬｉｎ－Ｃ２Ｋ－ＤＭＡ、ＸＴＣ２、及びＣ２Ｋとしても知られる）、ＤＬｉｎ－Ｋ－Ｃ３－ＤＭＡ、ＤＬｉｎ－Ｋ－Ｃ４－ＤＭＡ、ＤＬｅｎ－Ｃ２Ｋ－ＤＭＡ、ｙ－ＤＬｅｎ－Ｃ２Ｋ－ＤＭＡ、ＤＬｉｎ－Ｍ－Ｃ２－ＤＭＡ（ＭＣ２としても知られる）、ＤＬｉｎ－Ｍ－Ｃ３－ＤＭＡ（ＭＣ３としても知られる）、及び（ＤＬｉｎ－ＭＰ－ＤＭＡ）（１－Ｂ１ １としても知られる）が含まれるが、これらに限定されない。
本開示はまた、カチオン性脂質がプロトン化可能な３級アミンを含む、カプセル化された自己複製ＲＮＡ分子を提供する。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質は、ジ（（Ｚ）－ノン－２－エン－１－イル）８，８’－（（（（２－（ジメチルアミノ）エチル）チオ）カルボニル）アザンジイル）ジオクタノエートである。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質化合物は、相対的に非細胞毒性である。カチオン性脂質化合物は、生体適合性及び生分解性であり得る。カチオン性脂質は、約５．５～約７．５の範囲、より好ましくは約６．０～約７．０の範囲のｐＫａを有し得る。
本明細書に記載のカチオン性脂質化合物は、いくつかの理由のための薬物送達にとって特に魅力的である。それらの理由は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、他のポリヌクレオチド及び他の負に帯電した物質と相互作用するため、ｐＨの緩衝化のため、エンド－オスモライシスを生じさせるため、送達される自己複製ＲＮＡ分子の保護のためのアミノ基を包含している、市販の出発材料から合成され得る、及び／又はｐＨ応答性があり、所望のｐＫａで設計することができる、である。
カチオン性脂質を、急速に排除される脂質ナノ粒子（ｒｅＬＮＰ）として知られている生分解性カチオン性脂質と置き換えることによって、脂質ナノ粒子製剤を改善することができる。これらに限定されないが、ＤＬｉｎＤＭＡ、ＤＬｉｎ－ＫＣ２－ＤＭＡ、及びＤＬｉｎ－ＭＣ３－ＤＭＡなどのイオン化可能なカチオン性脂質は、経時的に血漿及び組織に蓄積され、潜在的な毒性源であり得ることが示されている。急速に排除される脂質の迅速な代謝は、ラットの１ｍｇ／ｋｇ投与から１０ｍｇ／ｋｇ投与まで、脂質ナノ粒子の忍容性及び治療指数を１桁改善することができる。酵素分解されたエステル結合を含めることにより、ｒｅＬＮＰ製剤の活性を維持したまま、カチオン性成分の分解及び代謝プロファイルを改善することができる。エステル結合は、脂質鎖内に内部配置されるか、又は脂質鎖の末端に末端配置されることができる。内部エステル結合は、脂質鎖中の任意の炭素を置き換えることができる。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子は、ポリアミドアミン、樹状ポリリジン、ポリエチレンイリニン（polyethylene irinine）又はポリプロピレンｈ－９、ポリリジン、キトサン、ＤＮＡ－ゼラチンのコアルセルベート（coarcervate）若しくはＤＥＡＥデキストラン、デンドリマー、又はポリエチレンイミン（ＰＥＩ）などのカチオン性分子中にパッケージング又はカプセル化され得る。
いくつかの実施形態では、脂質粒子は、脂質コンジュゲートを含み得る。コンジュゲート化脂質は、粒子の凝集を防止するという点で有用である。好適なコンジュゲート化脂質には、ＰＥＧ－脂質コンジュゲート、カチオン性ポリマー－脂質コンジュゲート、及びそれらの混合物が含まれるが、これらに限定されない。
ＰＥＧは、２つの末端ヒドロキシル基を有するエチレンＰＥＧ反復単位の直鎖水溶性ポリマーである。ＰＥＧは、それらの分子量によって分類され、以下のモノメトキシポリエチレングリコール（ＭｅＰＥＧ－ＯＨ）、モノメトキシポリエチレングリコール－スクシナート（ＭｅＰＥＧ－Ｓ）、モノメトキシポリエチレングリコール－スクシンイミジルスクシナート（ＭｅＰＥＧ－Ｓ－ＮＨＳ）、モノメトキシポリエチレングリコール－アミン（ＭｅＰＥＧ－ＮＨ２）、モノメトキシポリエチレングリコール－トレシラート（ＭｅＰＥＧ－ＴＲＥＳ）、モノメトキシポリエチレングリコール－イミダゾリル－カルボニル（ＭｅＰＥＧ－ＩＭ）、及び末端メトキシ基の代わりに末端水酸基を含有するような化合物（例えば、ＨＯ－ＰＥＧ－Ｓ、ＨＯ－ＰＥＧ－Ｓ－ＮＨＳ、ＨＯ－ＰＥＧ－ＮＨ２）を含む。
本明細書に記載のＰＥＧ－脂質コンジュゲートのＰＥＧ部分は、５５０ダルトン～１０，０００ダルトンの範囲の平均分子量を含み得る。ＰＥＧ－脂質の例としては、ジアルキルオキシプロピルに結合したＰＥＧ（ＰＥＧ－ＤＡＡ）、ジアシルグリセロールに結合したＰＥＧ（ＰＥＧ－ＤＡＧ）、ホスファチジルエタノールアミンなどのリン脂質に結合したＰＥＧ（ＰＥＧ－ＰＥ）、セラミドにコンジュゲートしたＰＥＧ、コレステロールにコンジュゲートしたＰＥＧ、又はそれらの誘導体、及びそれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ＰＥＧコンジュゲート化脂質は、ＤＭＧ－ＰＥＧ－２０００である。
自己複製ＲＮＡ分子はまた、非カチオン性脂質を含む粒子中に製剤化することができる。好適な非カチオン性脂質としては、例えば、安定した複合体を生成することができる、中性非荷電性、双性イオン性、又はアニオン性脂質が挙げられる。非カチオン性脂質の非限定的な例としては、レシチン、ホスファチジルエタノールアミン、リゾレシチン、リゾホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルイノシトール、スフィンゴミエリン、卵スフィンゴミエリン（egg sphingomyelin、ＥＳＭ）、セファリン、カルジオリピン、ホスファチジン酸、セレブロシド、ジセチルホスフェート、ジステアロイルホスファチジルコリン（distearoylphosphatidylcholine、ＤＳＰＣ）、ジオレオイルホスファチジルコリン（dioleoylphosphatidylcholine、ＤＯＰＣ）、ジパルミトイルホスファチジルコリン（dipalmitoylphosphatidylcholine、ＤＰＰＣ）、ジオレオイルホスファチジルグリセロール（dioleoylphosphatidylglycerol、ＤＯＰＧ）、ジパルミトイルホスファチジルグリセロール（dipalmitoylphosphatidylglycerol、ＤＰＰＧ）、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン（dioleoylphosphatidylethanolamine、ＤＯＰＥ）、パルミトイルオレオイル－ホスファチジルコリン（palmitoyloleoyl-phosphatidylcholine、ＰＯＰＣ）、パルミトイルオ－レオイル－ホスファチジルエタノールアミン（palmitoylo-leoyl-phosphatidylethanolamine、ＰＯＰＥ）、パルミトイルオレオイル－ホスファチジルグリセロール（palmitoyloleyol-phosphatidylglycerol、ＰＯＰＧ）、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン４－（Ｎ－マレイミドメチル）－シクロヘキサン－１－カルボキシレート（ＤＯＰＥ－ｍａｌ）、ホスファチジルエタノールアミン ホスファチジルエタノールアミン ホスファチジルエタノールアミン ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルエタノールアミンジパルミトイル－ ジミリストイル－ ジステアロイル－ モノメチル－ ジメチル－ ジエライドイル－ ステアロイルオレオイル－ ホスファチジルエタノールアミン（ＳＯＰＥ）、リゾホスファチジルコリン、ジリノレイルホスファチジルコリン、及びそれらの混合物などのリン脂質が挙げられる。他のジアシルホスファチジルコリン及びジアシルホスファチジルエタノールアミンリン脂質も使用することができる。これらの脂質中のアシル基は、好ましくは、Ｃ１０～Ｃ２４炭素鎖を有する脂肪酸、例えば、ラウロイル、ミリストイル、パルミトイル、ステアロイル、又はオレオイルに由来するアシル基である。
非カチオン性脂質の追加の例としては、コレステロール及びその誘導体などのステロールが挙げられる。コレステロール誘導体の非限定的な例としては、５ａ－コレスタノール、５ａ－コプロスタノール、コレステリル－（２’－ヒドロキシ）－エチルエーテル、コレステリル－（４’－ヒドロキシ）－ブチルエーテル、及び６－ケトコレスタノールなどの極性類似体；５ａ－コレスタン、コレステノン、５ａ－コレスタノン、５ａ－コレスタノン、及びコレステリルデカノエートなどの非極性類似体；並びにそれらの混合物が挙げられる。好ましい実施形態では、コレステロール誘導体は、コレステリル－（４’－ヒドロキシ）－ブチルエーテルなどの極性類似体である。いくつかの実施形態では、リン脂質は、ＤＳＰＣである。いくつかの実施形態では、脂質粒子中に存在する非カチオン性脂質は、１つ以上のリン脂質、及びコレステロール若しくはその誘導体の混合物を含むか、又はそれからなる。脂質粒子が、リン脂質、及びコレステロール又はその誘導体の混合物を含有するいくつかの実施形態では、混合物は、粒子中に存在する全脂質の最大４０モル％、４５モル％、５０モル％、５５モル％、又は６０モル％を含み得る。
いくつかの実施形態では、ＬＮＰは、３０～７０％のカチオン性脂質化合物、０～６０％のコレステロール、０～３０％のリン脂質、及び１～１０％のポリエチレングリコール（ＰＥＧ）を含み得る。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質、双性イオン脂質、コレステロール、及びコンジュゲート化脂質は、それぞれ、脂質ナノ粒子中に５０：７：４０：３のモル比で組み合わされる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のＬＮＰ製剤は、透過性エンハンサー分子を更に含むことができる。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子製剤は、炭水化物担体及び自己複製ＲＮＡ分子を含む、炭水化物ナノ粒子であり得る。非限定的な例として、炭水化物担体は、無水変性フィトグリコーゲン又はグリコーゲン型材料、フィトグリコーゲンオクテニルスクシナート、フィトグリコーゲンβ－デキストリン、及び無水変性フィトグリコーゲンβ－デキストリンを含むことができるが、これらに限定されない。
キット
本開示はまた、本開示の１つ以上の組成物、１つ以上のポリヌクレオチド、１つ以上のポリペプチド、又は１つ以上のベクターを含む、キットを提供する。本開示はまた、本開示の１つ以上の組換えウイルスを含むキットを提供する。キットは、本明細書に記載の方法の実施を容易にするために使用することができる。いくつかの実施形態では、キットは、脂質ベースの製剤又はウイルスパッケージング材料などの、本開示のワクチンの細胞への進入を容易にするための試薬を更に含む。
いくつかの実施形態では、キットは、本開示のポリヌクレオチドのいずれかを含む、１つ以上のＡｄ２６ベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示のポリヌクレオチドのいずれかを含む、１つ以上のＭＶＡベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示のポリヌクレオチドのいずれかを含む、１つ以上のＧＡｄ２０ベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示のポリヌクレオチドのいずれかを含む、１つ以上の自己複製ＲＮＡ分子を含む。
いくつかの実施形態では、キットは、本開示のＡｄ２６ベクター、及び本開示のＭＶＡベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示のＧＡｄ２０ベクター、及び本開示のＭＶＡベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示のＡｄ２６ベクター、及び本開示のＧａｄ２０ベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示の自己複製ＲＮＡ分子、及び本開示のＧａｄ２０ベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示の自己複製ＲＮＡ分子、及び本開示のＭＶＡベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示の自己複製ＲＮＡ分子、及び本開示のＡｄ２６ベクターを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示の１つ以上のポリヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示の１つ以上のポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、キットは、本開示の１つ以上の細胞を含む。
いくつかの実施形態では、キットは、
Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡに由来する組換えウイルス、又は異種ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む、第１のワクチンであって、異種ポリペプチドは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、第１のワクチンと、
Ａｄ２６、Ｇａｄ２０、若しくはＭＶＡに由来する組換えウイルス、又は異種ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む、第２のワクチンであって、異種ポリペプチドは、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、第２のワクチンと、
を含む。
いくつかの実施形態では、キットは、
Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡに由来する組換えウイルス、又は異種ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む、第１のワクチンであって、異種ポリペプチドは、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、第１のワクチンと、
Ａｄ２６、Ｇａｄ２０、若しくはＭＶＡに由来する組換えウイルス、又は異種ポリペプチドをコードする異種ポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む、第２のワクチンであって、異種ポリペプチドは、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの断片からなる群から選択される２つ以上のポリペプチドを含む、第２のワクチンと、
を含む。
他の分子
卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体
本開示はまた、卵巣癌ネオ抗原及びＨＬＡを含むタンパク質複合体を提供する。本開示はまた、卵巣癌ネオ抗原及びＨＬＡの断片を含むタンパク質複合体を提供する。本開示はまた、卵巣癌ネオ抗原及びＨＬＡのバリアントを含むタンパク質複合体を提供する。本開示はまた、卵巣癌ネオ抗原及びＨＬＡの断片のバリアントを含むタンパク質複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、卵巣癌ネオ抗原は、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、及び４０５、並びにこれらの断片の群から選択されるポリペプチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、クラスＩ ＨＬＡである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、クラスＩＩ ＨＬＡである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ａである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ｂである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ｃである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－ＤＰである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－ＤＱである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－ＤＲである。いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１、Ａ＊０２：０１、Ａ＊０３：０１、Ａ＊２４：０２、Ｂ＊０７：０２、又はＢ＊０８：０１である。いくつかの実施形態では、タンパク質複合体は、検出剤又は細胞毒性物質とコンジュゲートしている。
卵巣癌ネオ抗原とＨＬＡとの複合体は、例えば、インビトロ又はインビボで同種Ｔ細胞を単離するために使用してもよい。卵巣癌ネオ抗原とＨＬＡとの複合体はまた、検出可能な標識にコンジュゲートさせ、同種ＴＣＲ又は同種ＴＣＲを発現しているＴ細胞を検出、可視化、又は単離するための検出剤として使用してもよい。卵巣癌ネオ抗原とＨＬＡとの複合体はまた、細胞傷害性剤にコンジュゲートさせ、同種ＴＣＲを発現する細胞を枯渇させるか又は数を減少させるために使用してもよい。複合体は、そのネイティブな構成であってもよく、あるいは、卵巣癌ネオ抗原及び／又はＨＬＡを遺伝子操作してもよい。
遺伝子操作の概念は、例えば、切断可能であり得る共有結合性リンカーを使用することによって、ペプチドをＨＬＡに共有結合させることを含む。卵巣癌ネオ抗原及びＨＬＡ複合体は、単量体であっても多量体であってもよい。卵巣癌ネオ抗原及びＨＬＡ複合体は、毒素又は検出剤に結合させてもよい。様々な遺伝子操作の概念には、共有結合性卵巣癌ネオ抗原β２－α２－α１－β１鎖又は卵巣癌ネオ抗原β鎖として、例えば可溶性複合体として、複合体を発現させることが含まれる。少なくとも１５アミノ酸長であるリンカーを、卵巣癌ネオ抗原とＨＬＡとの間で使用することができる。あるいは、複合体は、共有結合した卵巣癌ネオ抗原単鎖β１－α１として発現させてもよい。卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体はまた、卵巣癌ネオ抗原がα鎖のＮ末端に共有結合している完全長ＨＬＡαβ鎖として発現させてもよく、あるいは、卵巣癌ネオ抗原は、非共有結合性相互作用を介してαβ鎖に会合する。様々な発現フォーマットが、米国特許第５９７６５５１号、同第５７３４０２３号、同第５８２０８６６号、同第７１４１６５６（Ｂ２）号、同第６２７０７７２（Ｂ１）号、及び同第７０７４９０５（Ｂ２）号に開示されている。加えて、ＨＬＡは、米国特許第８３７７４４７（Ｂ２）号及び同第８８２８３７９（Ｂ２）号に記載されているように、α１鎖が変異しているか、又はα２及びβ２ドメインを介したジスルフィド結合を介して安定化されている単鎖コンストラクトとして発現させてもよい。卵巣癌ネオ抗原又はその断片は、米国特許第９０７９９４１（Ｂ２）号に記載の通り、感光性又は過ヨウ素酸感受性の切断可能なリンカーを介して、ＨＬＡに結合し得る。卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体は、多量体フォーマットに遺伝子操作されてもよい。米国特許第７０７４９０４（Ｂ２）号に記載の通り、２つ以上の卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体の架橋を促進するために、ＨＬＡのα又はβ鎖のＣ末端に反応性側鎖を組み込むことによって、多量体フォーマットを生成することができる。あるいは、米国特許第５６３５３６号に記載の通り、ビオチン化認識配列ＢｉｒＡを、後でビオチン化されるＨＬＡのα又はβ鎖のＣ末端に組み込んでもよく、アビジン／ストレプトアビジンに結合することよって多量体が形成される。多量体卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体は、更に、米国特許第６１９７３０２（Ｂ１号）、同第６２６８４１１（Ｂ１号）、米国特許出願公開第２０１５０３２９６１７（Ａ１）号、欧州特許第１６７０８２３（Ｂ１号）、欧州特許第１８８２７００（Ｂ１号）、同第２０６１８０７（Ｂ１号）、米国特許出願公開第２０１２００９３９３４（Ａ１）号、同第２０１３０２８９２５３（Ａ１）号、同第２０１７００９５５４４（Ａ１）号、同第２０１７０００３２８８（Ａ１）号、及び国際公開第２０１７０１５０６４（Ａ１）号に記載されているように、Ｆｃ融合を利用して、卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体をデキストラン担体に結合させて、コイルドコイルドメインを介してオリゴマー化して、追加のビオチン化ペプチドを利用して、又は卵巣癌ネオ抗原／ＨＬＡ複合体をナノ粒子又はキレート担体にコンジュゲートして、生成され得る。
本開示はまた、ヒト白血球抗原（ＨＬＡ）、並びに配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、４０５、又はこれらの断片のアミノ酸配列を含む本開示のポリペプチドを含む、タンパク質複合体を提供する。
いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、クラスＩ又はクラスＩＩを含み得る。
いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－Ｂ、又はＨＬＡ－Ｃを含み得る。
いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、ＨＬＡ－ＤＰ、ＨＬＡ－ＤＱ、又はＨＬＡ－ＤＲを含み得る。
いくつかの実施形態では、ＨＬＡは、クラスＩ対立遺伝子ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１、Ａ＊０２：０１、Ａ＊０３：０１、Ａ＊２４：０２、Ｂ＊０７：０２、又はＢ＊０８：０１を含み得る。
タンパク質性分子
本開示はまた、本開示のポリペプチド、又はＨＬＡとポリペプチドの複合体に特異的に結合する、単離されたタンパク質性分子を提供する。
いくつかの実施形態で、タンパク質性分子は、抗体、選択的スカフォールド、キメラ抗原受容体（chimeric antigen receptor、ＣＡＲ）、又はＴ細胞受容体（T cell receptor、ＴＣＲ）である。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、抗体の抗原結合断片である。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、多重特異的分子である。いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、二重特異的分子である。いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、三重特異的分子である。いくつかの実施形態では、多重特異性分子は、２つ以上の異なる卵巣ネオ抗原に結合する。いくつかの実施形態では、多重特異性分子は、卵巣ネオ抗原及びＴ細胞受容体（ＴＣＲ）複合体に結合する。いくつかの実施形態では、多重特異性分子は、２つ以上の異なる卵巣ネオ抗原及びＴ細胞受容体（ＴＣＲ）複合体に結合する。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、抗体である。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、多重特異的抗体である。いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、二重特異的抗体である。いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、三重特異的抗体である。いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、Ｔ細胞リダイレクティング分子である。
本開示の卵巣ネオ抗原がタンパク質の細胞外ドメインの一部である場合、卵巣ネオ抗原は、腫瘍細胞上の卵巣ネオ抗原に選択的に結合する抗原結合ドメインを利用して、Ｔ細胞を腫瘍に動員するか、又はＣＡＲ－Ｔ及び他の細胞療法に腫瘍を標的とさせるための腫瘍関連抗原として使用することができる。
卵巣ネオ抗原が細胞内ドメインの一部である場合、細胞傷害性剤又は治療剤にコンジュゲートした細胞内区画に送達される能力を有する抗原結合ドメインを治療薬として使用することができる。あるいは、卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に結合する同種ＴＣＲを発現するように遺伝子操作された細胞を治療薬として使用してもよい。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、選択的スカフォールドである。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）である。
いくつかの実施形態では、タンパク質性分子は、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）である。
本開示の卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体へのタンパク質性分子の結合は、任意の好適な方法を用いて実験的に決定され得る。このような方法では、ＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６、Ｂｉａｃｏｒｅ３０００、若しくはＫｉｎＥｘＡ装置、ＥＬＩＳＡ、又は当業者に公知の競合的結合アッセイを利用することができる。測定される結合は、異なる条件（例えば、オスモル濃度、ｐＨ）下で測定した場合に異なり得る。したがって、親和性及びその他の結合パラメータ（例えば、ＫＤ、Ｋｏｎ、Ｋｏｆｆ）の測定は、典型的には、標準的な条件、及び例えば本明細書に記載の緩衝液などの標準化緩衝液を用いて行われる。例えばＢｉａｃｏｒｅ ３０００又はＰｒｏｔｅＯｎを用いた親和性測定での内部誤差（標準偏差（ＳＤ）として測定されるもの）は通常、典型的な検出範囲内で測定した場合、５～３３％の範囲内であり得ることが当業者には分かるであろう。「ごくわずかな（insubstantial）」とは、本開示の卵巣ネオ抗原に対するタンパク質性分子の測定された結合と比較して１００倍未満である結合を指す。本開示のタンパク質性分子は、卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体を発現している細胞を殺傷するタンパク質性分子の能力など、既知の方法及び本明細書に記載されているものを使用して、その活性及び機能を更に特性評価することができる。
抗体及び抗原結合ドメイン
卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗体及び抗原結合ドメインは、既知の方法を使用して生成され得る。このような抗体は、任意の種類（例えば、ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡ、及びＩｇＹ）、クラス（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１、及びＩｇＡ２）、又はサブクラスの免疫グロブリン分子を含み得る。
例えば、Ｋｏｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５，１９７５のハイブリドーマ法を使用してモノクローナル抗体を作製することができる。ハイブリドーマ法では、マウス又は他の宿主動物、例えばハムスター、ラット、若しくはサルを、１つ以上の卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体で免疫した後、標準的な方法を用いて免疫させた動物からの脾臓細胞を骨髄腫細胞と融合させて、ハイブリドーマ細胞を形成する（Ｇｏｄｉｎｇ、「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ」、第５９～１０３頁（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、１９８６年））。単一の不死化したハイブリドーマ細胞から発生したコロニーを、本開示の卵巣ネオ抗原に対する結合特異性及び親和性などの所望の特性を有する抗体の産生についてスクリーニングする。
様々な宿主動物を使用して、抗体を生成することができる。例えば、Ｂａｌｂ／ｃマウス、ラット、又はニワトリを使用して、ＶＨ／ＶＬ対を含有する抗体を作製することができ、ラマ及びアルパカを使用して、標準的な免疫化プロトコルを用いて重鎖のみ（ＶＨＨ）抗体を生成することができる。非ヒト動物において作製された抗体を、よりヒトに近い配列を作製するための様々な技術を使用してヒト化してもよい。
ヒト受容体フレームワークの選択を含む代表的なヒト化技術は既知であり、ＣＤＲ移植（米国特許第５，２２５，５３９号）、ＳＤＲ移植（米国特許第６，８１８，７４９号）、リサーフェシング（Ｐａｄｌａｎ，（１９９１）Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２８：４８９－４９９）、特異性決定残基リサーフェシング（米国特許出願公開第２０１０／０２６１６２０号）、ヒトフレームワーク適合（米国特許第８，７４８，３５６号）及び超ヒト化（米国特許第７，７０９，２２６号）が挙げられる。これらの方法では、親フレームワークに対する全体的な相同性に基づいて、ＣＤＲの長さの類似性若しくはカノニカル構造の同一性に基づいて、又はこれらの任意の組合せで選択され得るヒトフレームワークに親抗体のＣＤＲを移植する。
ヒト化抗体は、国際公開第１０９０／００７８６１号及び同第１９９２／２２６５３号に記載されているものなどの技術によって、結合親和性を保存するように変化させたフレームワーク支持残基を組み込むことによって（復帰変異）、又は任意のＣＤＲに変異を導入して、例えば抗体の親和性を改善することによって、所望の抗原に対するその選択性又は親和性を改善するように更に最適化させてもよい。
ゲノム中にヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）遺伝子座を有するマウス又はラットなどのトランスジェニック動物を使用して、卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に対するヒト抗体を生成することができ、これは、例えば、以下に記載されている：米国特許第６，１５０，５８４号、国際公開第９９／４５９６２号、同第２００２／０６６６３０号、同第２００２／４３４７８号、同第２００２／０４３４７８号、及び同第１９９０／０４０３６号、Ｌｏｎｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ（１９９４）Ｎａｔｕｒｅ ３６８：８５６－９；Ｇｒｅｅｎ ｅｔ ａｌ（１９９４）Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔ．７：１３－２１；７：１３－２１；Ｇｒｅｅｎ ＆ Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ（１９９８）Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８８：４８３－９５；Ｌｏｎｂｅｒｇ ａｎｄ Ｈｕｓｚａｒ（１９９５）Ｉｎｔ Ｒｅｖ Ｉｍｍｕｎｏｌ １３：６５－９３；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２１：１３２３－ １３２６；Ｆｉｓｈｗｉｌｄ ｅｔ ａｌ．，（１９９６）Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ １４：８４５－８５１；Ｍｅｎｄｅｚ ｅｔ ａｌ．，（１９９７）Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ １５：１４６－１５６；Ｇｒｅｅｎ（１９９９）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２３１：１１－２３；Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ．，（１９９９）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５９：１２３６－１２４３；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ａｎｄ Ｔａｕｓｓｉｇ（１９９７）Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ８：４５５－４５８。このような動物の内在的な免疫グロブリン遺伝子座を破壊又は欠失させてもよく、相同又は非相同組換えを使用して、導入染色体（transchromosome）を使用して、又はミニ遺伝子を使用して、少なくとも１つの完全な又は部分的なヒト免疫グロブリン遺伝子座を動物のゲノムに挿入してもよい。Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ＿ｃｏｍ）、Ｈａｒｂｏｕｒ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｈａｒｂｏｕｒａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ＿ｃｏｍ）、Ｏｐｅｎ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．（ＯＭＴ）（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｏｍｔｉｎｃ＿ｎｅｔ）、ＫｙＭａｂ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｋｙｍａｂ＿ｃｏｍ）、Ｔｒｉａｎｎｉ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ．ｔｒｉａｎｎｉ＿ｃｏｍ）、及びＡｂｌｅｘｉｓ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ａｂｌｅｘｉｓ＿ｃｏｍ）などの企業は、上記の技術を使用して、選択抗原を標的としたヒト抗体を提供するべく取り組んでいる場合がある。
ヒト抗体は、ファージディスプレイライブラリから選択することができ、この場合、ファージは、ヒト免疫グロブリン又はその一部、例えば、Ｆａｂ、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）、ドメイン抗体、又は不対若しくは対合抗体の可変領域を発現するように遺伝子操作されている（Ｋｎａｐｐｉｋ ｅｔ ａｌ．，（２０００）Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２９６：５７－８６；Ｋｒｅｂｓ ｅｔ ａｌ．，（２００１）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈ ２５４：６７－８４；Ｖａｕｇｈａｎ ｅｔ ａｌ．，（１９９６）Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４：３０９－３１４；Ｓｈｅｅｔｓ ｅｔ ａｌ．，（１９９８）ＰＩＴＡＳ（ＵＳＡ）９５：６１５７－６１６２；Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ（１９９１）Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２２７：３８１；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２２２：５８１）。本開示の抗体は、例えば、Ｓｈｉら、（２０１０）Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３９７：３８５－９６、及び国際公開第０９／０８５４６２号）に記載の通り、バクテリオファージｐＩＸコートタンパク質を含む異種ポリペプチドとして抗体の重鎖及び軽鎖可変領域を発現しているファージディスプレイライブラリから単離され得る。卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に結合するファージについてライブラリをスクリーニングしてよく、得られた陽性クローンを更に特性評価してよく、クローン溶解物からＦａｂを単離し、完全長ＩｇＧとして発現させる。ヒト抗体を単離するためのそのようなファージディスプレイ法は、例えば、米国特許第５，２２３，４０９号、同第５，４０３，４８４号、同第５，５７１，６９８号、同第５，４２７，９０８号、同第５，５８０，７１７号、同第５，９６９，１０８号、同第６，１７２，１９７号、同第５，８８５，７９３号、同第６，５２１，４０４号；同第６，５４４，７３１号；同第６，５５５，３１３号；同第６，５８２，９１５号、及び同第６，５９３，０８１号に記載されている。ＨＬＡ／ネオ抗原複合体又はネオ抗原単独への結合について、抗体を更に試験してもよい。
免疫原性抗原の調製及びモノクローナル抗体の生成は、組換えタンパク質生成又はペプチドの化学合成などの任意の好適な技術を使用して実施することができる。免疫原性抗原は、精製タンパク質、あるいは全細胞又は細胞若しくは組織抽出物を含むタンパク質混合物の形態で動物に投与されてもよく、抗原は、当該抗原又はその一部分をコードしている核酸から動物の体内で新規に（de novo）形成されてもよい。
卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗原結合ドメインは、本明細書に記載の抗体に由来していてもよい。抗原結合ドメインとしては、単鎖抗体、Ｆａｂ断片、Ｆｖ断片、単鎖Ｆｖ断片（ｓｃＦｖ）、ＶＨＨドメイン、ＶＨ、ＶＬ、選択的スカフォールド（例えば、非抗体抗原結合ドメイン）、二価抗体断片、例えば、（Ｆａｂ）２’－断片、Ｆ（ａｂ’）断片、ジスルフィド結合Ｆｖ（ｓｄＦｖ）、イントラボディ、ミニボディ、ダイアボディ、トリアボディ、及びデカボディが挙げられる。
卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体及び第２の抗原に特異的に結合する二重特異性及び多重特異性抗体は、既知の方法を使用して生成することができる。第２の抗原は、Ｔ細胞受容体複合体（ＴＣＲ複合体）であってよい。第２の抗原は、ＴＣＲ複合体内のＣＤ３であってもよい。本開示の卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体及び第２の抗原に特異的に結合する二重特異性及び多重特異性抗体は、卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体及び第２抗原に特異的に結合する任意の既知の抗原結合ドメインフォーマットを使用して任意の多価フォーマットに遺伝子操作することができる。卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗原結合ドメインは、１つ以上のＦｃドメイン若しくはその断片に、又は任意選択でアルブミン、ＰＥＧ、若しくはトランスフェリンを含む半減期延長部分などの他のスカフォールドにコンジュゲートさせてもよい。
２つ以上の卵巣ネオ抗原に特異的に結合する多重特異性抗体は、卵巣ネオ抗原を発現している腫瘍細胞の標的化における特異性の改善という観点から利益をもたらし得る。
卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗原結合ドメインは、Ｆａｂアーム交換を用いて生成され、インビトロでＦａｂアーム交換を促進するＩｇ定常領域ＣＨ３ドメイン内の２つの単一特異性二価抗体に置換が導入されている完全長多重特異性抗体に遺伝子操作されてもよい。この方法では、ヘテロ二量体の安定性を促進する特定の置換をＣＨ３ドメインに有するように、２つの単一特異性二価抗体を遺伝子操作する。これらの抗体は、ヒンジ領域におけるシステインがジスルフィド結合を異性化させるために十分な還元条件下において共にインキュベーションされ、それにより、Ｆａｂアーム交換により二重特異性抗体が生成される。インキュベート条件は、最適には、非還元条件に戻され得る。使用され得る代表的な還元剤は、２－メルカプトエチルアミン（２－ＭＥＡ）、ジチオスレイトール（ＤＴＴ）、ジチオエリスリトール（ＤＴＥ）、グルタチオン、トリス（２－カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）、Ｌ－システイン、及びβ－メルカプトエタノールであり、好ましくは、２－メルカプトエチルアミン、ジチオスレイトール、及びトリス（２－カルボキシエチル）ホスフィンからなる群から選択される還元剤である。例えば、少なくとも２０℃の温度で、少なくとも２５ｍＭの２－ＭＥＡの存在下又は少なくとも０．５ｍＭのジチオスレイトールの存在下で、ｐＨ５～８、例えばｐＨ７．０又はｐＨ７．４で、少なくとも９０分間のインキュベートを用いることができる。
使用され得るＣＨ３変異としては、ノブインホール変異（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、静電的マッチ変異（Ｃｈｕｇａｉ、Ａｍｇｅｎ、ＮｏｖｏＮｏｒｄｉｓｋ、Ｏｎｃｏｍｅｄ）、鎖交換遺伝子操作ドメインボディ（ＳＥＥＤｂｏｄｙ）（ＥＭＤ Ｓｅｒｏｎｏ）、Ｄｕｏｂｏｄｙ（登録商標）変異（Ｇｅｎｍａｂ）、及び他の非対称変異（例えば、Ｚｙｍｅｗｏｒｋｓ）などの技術が挙げられる。
ノブインホール変異は、例えば、国際公開第１９９６／０２７０１１号に開示されており、小さい側鎖（ホール）を有するアミノ酸が第１のＣＨ３領域に導入され、大きな側鎖（ノブ）を有するアミノ酸が第２のＣＨ３領域に導入され、第１のＣＨ３領域と第２のＣＨ３領域との間に優先的な相互作用をもたらす、ＣＨ３領域の界面上の変異が含まれる。ノブ及びホールを形成する例示的なＣＨ３領域変異は、Ｔ３６６Ｙ／Ｆ４０５Ａ、Ｔ３６６Ｗ／Ｆ４０５Ｗ、Ｆ４０５Ｗ／Ｙ４０７Ａ、Ｔ３９４Ｗ／Ｙ４０７Ｔ、Ｔ３９４Ｓ／Ｙ４０７Ａ、Ｔ３６６Ｗ／Ｔ３９４Ｓ、Ｆ４０５Ｗ／Ｔ３９４Ｓ、及びＴ３６６Ｗ／Ｔ３６６Ｓ＿Ｌ３６８Ａ＿Ｙ４０７Ｖである。
重鎖ヘテロ二量体形成は、米国特許出願公開第２０１０／００１５１３３号、同第２００９／０１８２１２７号、同第２０１０／０２８６３７号、又は同第２０１１／０１２３５３２号に記載のように、第１のＣＨ３領域上の正に荷電した残基及び第２のＣＨ３領域上の負に荷電した残基を置換することにより、静電相互作用を使用することによって促進され得る。
重鎖ヘテロ二量体化を促進するために使用することができる他の非対称変異は、米国特許出願公開第２０１２／０１４９８７６号又は同第２０１３／０１９５８４９号（Ｚｙｍｅｗｏｒｋｓ）に記載のＬ３５１Ｙ＿Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ／Ｔ３９４Ｗ、Ｔ３６６Ｉ＿Ｋ３９２Ｍ＿Ｔ３９４Ｗ／Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ、Ｔ３６６Ｌ＿Ｋ３９２Ｍ＿Ｔ３９４Ｗ／Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ、Ｌ３５１Ｙ＿Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ａ＿Ｋ４０９Ｆ、Ｌ３５１Ｙ＿Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ｖ＿Ｋ４０９Ｆ、Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ａ＿Ｋ４０９Ｆ、又はＴ３５０Ｖ＿Ｌ３５１Ｙ＿Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ／Ｔ３５０Ｖ＿Ｔ３６６Ｌ＿Ｋ３９２Ｌ＿Ｔ３９４Ｗである。
ＳＥＥＤボディ変異は、米国特許出願公開第２００７／０２８７１７０号に記載のように、選択されたＩｇＧ残基をＩｇＡ残基と置換して、重鎖ヘテロ二量体化を促進することを伴う。
使用され得る他の例示的な変異は、国際公開第２００７／１４７９０１号、国際公開第２０１１／１４３５４５号、国際公開第２０１３／１５７９５４号、国際公開第２０１３／０９６２９１号、及び米国特許出願公開第２０１８／０１１８８４９号に記載のＲ４０９Ｄ＿Ｋ３７０Ｅ／Ｄ３９９Ｋ＿Ｅ３５７Ｋ、Ｓ３５４Ｃ＿Ｔ３６６Ｗ／Ｙ３４９Ｃ＿Ｔ３６６Ｓ＿Ｌ３６８Ａ＿Ｙ４０７Ｖ、Ｙ３４９Ｃ＿Ｔ３６６Ｗ／Ｓ３５４Ｃ＿Ｔ３６６Ｓ＿Ｌ３６８Ａ＿Ｙ４０７Ｖ、Ｔ３６６Ｋ／Ｌ３５１Ｄ、Ｌ３５１Ｋ／Ｙ３４９Ｅ、Ｌ３５１Ｋ／Ｙ３４９Ｄ、Ｌ３５１Ｋ／Ｌ３６８Ｅ、Ｌ３５１Ｙ＿Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ａ＿Ｋ４０９Ｆ、Ｌ３５１Ｙ＿Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ｖ＿Ｋ４０９Ｆ、Ｋ３９２Ｄ／Ｄ３９９Ｋ、Ｋ３９２Ｄ／Ｅ３５６Ｋ、Ｋ２５３Ｅ＿Ｄ２８２Ｋ＿Ｋ３２２Ｄ／Ｄ２３９Ｋ＿Ｅ２４０Ｋ＿Ｋ２９２Ｄ、Ｋ３９２Ｄ＿Ｋ４０９Ｄ／Ｄ３５６Ｋ＿Ｄ３９９Ｋである。
Ｄｕｏｂｏｄｙ（登録商標）変異（Ｇｅｎｍａｂ）は、例えば、米国特許第９１５０６６３号及び米国特許出願公開第２０１４／０３０３３５６号に開示されており、Ｆ４０５Ｌ／Ｋ４０９Ｒ、野生型／Ｆ４０５Ｌ＿Ｒ４０９Ｋ、Ｔ３５０Ｉ＿Ｋ３７０Ｔ＿Ｆ４０５Ｌ／Ｋ４０９Ｒ、Ｋ３７０Ｗ／Ｋ４０９Ｒ、Ｄ３９９ＡＦＧＨＩＬＭＮＲＳＴＶＷＹ／Ｋ４０９Ｒ、Ｔ３６６ＡＤＥＦＧＨＩＬＭＱＶＹ／Ｋ４０９Ｒ、Ｌ３６８ＡＤＥＧＨＮＲＳＴＶＱ／Ｋ４０９ＡＧＲＨ、Ｄ３９９ＦＨＫＲＱ／Ｋ４０９ＡＧＲＨ、Ｆ４０５ＩＫＬＳＴＶＷ／Ｋ４０９ＡＧＲＨ、及びＹ４０７ＬＷＱ／Ｋ４０９ＡＧＲＨの変異が含まれる。
卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗原結合ドメインを組み込むことができる、更なる二重特異性又は多重特異性構造としては、二重可変ドメイン免疫グロブリン（Variable Domain Immunoglobulin：ＤＶＤ）（国際公開第２００９／１３４７７６号が挙げられ；ＤＶＤは、ＶＨ１－リンカー－ＶＨ２－ＣＨ構造を有する重鎖と、ＶＬ１－リンカー－ＶＬ２－ＣＬ構造を有する軽鎖とを含む完全長抗体であり、リンカーは任意である）、ロイシンジッパー又はコラーゲン二量化ドメインなどの、異なる特異性を有する２つの抗体アームを結合するための様々な二量化ドメインを含む構造（国際公開第２０１２／０２２８１１号、米国特許第５，９３２，４４８号、米国特許第６，８３３，４４１号）、一緒にコンジュゲートされた２つ以上のドメイン抗体（ｄＡｂ）、ダイアボディ、ラクダ類抗体及び遺伝子操作されたラクダ類抗体などの重鎖のみ抗体、二重標的（ＤＴ）－Ｉｇ（ＧＳＫ／Ｄｏｍａｎｔｉｓ）、２ｉｎ１抗体（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、架橋Ｍａｂ（Ｋａｒｍａｎｏｓ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｎｔｅｒ）、ｍＡｂ２（Ｆ－Ｓｔａｒ）、及びＣｏｖＸボディ（ＣｏｖＸ／Ｐｆｉｚｅｒ）、ＩｇＧ様二重特異性（ＩｎｎＣｌｏｎｅ／Ｅｌｉ Ｌｉｌｌｙ）、Ｔｓ２Ａｂ（ＭｅｄＩｍｍｕｎｅ／ＡＺ）、及びＢｓＡｂ（Ｚｙｍｏｇｅｎｅｔｉｃｓ）、ＨＥＲＣＵＬＥＳ（Ｂｉｏｇｅｎ Ｉｄｅｃ）、及びＴｖＡｂ（Ｒｏｃｈｅ）、ＳｃＦｖ／Ｆｃ融合体（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎ）、ＳＣＯＲＰＩＯＮ（Ｅｍｅｒｇｅｎｔ ＢｉｏＳｏｌｕｔｉｏｎｓ／Ｔｒｕｂｉｏｎ、Ｚｙｍｏｇｅｎｅｔｉｃｓ／ＢＭＳ）、二重親和性再標的技術（Ｆｃ－ＤＡＲＴ）（ＭａｃｒｏＧｅｎｉｃｓ）、及び二重（ＳｃＦｖ）２－Ｆａｂ（Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ－－Ｃｈｉｎａ）、二重活性又はＢｉｓ－Ｆａｂ（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、Ｄｏｃｋ－ａｎｄ－Ｌｏｃｋ（ＤＮＬ）（ＩｍｍｕｎｏＭｅｄｉｃｓ）、二価二重特異性（Ｂｉｏｔｅｃｎｏｌ）、及びＦａｂ－Ｆｖ（ＵＣＢ－Ｃｅｌｌｔｅｃｈ）が含まれる。ＳｃＦｖ抗体、ダイアボディに基づく抗体、及びドメイン抗体には、二重特異性Ｔ細胞エンゲージャー（ＢｉＴＥ）（Ｍｉｃｒｏｍｅｔ）、タンデムダイアボディ（Ｔａｎｄａｂ）（Ａｆｆｉｍｅｄ）、二重親和性再標的技術（ＤＡＲＴ）（ＭａｃｒｏＧｅｎｉｃｓ）、一本鎖ダイアボディ（Ａｃａｄｅｍｉｃ）、ＴＣＲ様抗体（ＡＩＴ、ＲｅｃｅｐｔｏｒＬｏｇｉｃｓ）、ヒト血清アルブミンＳｃＦｖ融合体（Ｍｅｒｒｉｍａｃｋ）、及びＣＯＭＢＯＤＹ（Ｅｐｉｇｅｎ Ｂｉｏｔｅｃｈ）、二重標的ナノボディ（Ａｂｌｙｎｘ）、二重標的重鎖のみドメイン抗体が含まれるが、これらに限定されない。
選択的スカフォールド
当該技術分野において既知であり、本明細書に記載されている様々なスカフォールドを用いて、卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する選択的スカフォールド（抗体模倣物質とも称される）を生成することができる。選択的スカフォールドは、タンパク質スカフォールドとしてのフィブロネクチン若しくはテネイシンのフィブロネクチンＩＩＩ型ドメイン（Ｆｎ３）（米国特許第６，６７３，９０１号；同第６，３４８，５８４号）、又は米国特許出願公開第２０１０／０２１６７０８及び米国特許公開第２０１０／０２５５０５６号に記載されているテンコンなどの合成ＦＮ３ドメインを組み込むように設計されたモノボディであってもよい。追加の選択的スカフォールドは、Ａｄｎｅｃｔｉｎ（商標）、ｉＭａｂ、Ａｎｔｉｃａｌｉｎ（登録商標）、ＥＥＴＴＩ ＩＩ／ＡＧＲＰ、クニッツドメイン、チオレドキシンペプチドアプタマー、Ａｆｆｉｂｏｄｙ（登録商標）、ＤＡＲＰｉｎ、Ａｆｆｉｌｉｎ、Ｔｅｔｒａｎｅｃｔｉｎ、Ｆｙｎｏｍｅｒ、及びＡｖｉｍｅｒを含む。選択的スカフォールドは、可変ドメイン内の挿入、欠失、又は他の置換を許容する立体構造許容性の高い可変ドメインに会合する高度に構造化されたコアを含有する単鎖ポリペプチドフレームワークである。多様性を１つ以上の可変ドメインに、場合によっては構造化コアに導入するライブラリは、既知のプロトコルを使用して作製することができ、得られたライブラリは、本開示のネオ抗原への結合についてスクリーニングすることができ、同定された結合剤は、既知の方法を使用して、その特異性について更に特性評価することができる。選択的スカフォールドは、プロテインＡ、特にそのＺドメイン（アフィボディ）、ＩｍｍＥ７（免疫タンパク質）、ＢＰＴＩ／ＡＰＰＩ（クニッツドメイン）、Ｒａｓ結合タンパク質ＡＦ－６（ＰＤＺ－ドメイン）、カリブドトキシン（サソリ毒）、ＣＴＬＡ－４、Ｍｉｎ－２３（ノッチン）、リポカリン（アンチカリン）、ネオカリジノスタチン、フィブロネクチンドメイン、アンキリンコンセンサスリピートドメイン、又はチオレドキシン（Ｓｋｅｒｒａ，Ａ．，「Ａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅ Ｎｏｎ－Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｓｃａｆｆｏｌｄｓ ｆｏｒ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ，」Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１８：２９５－３０４（２００５）；Ｈｏｓｓｅ ｅｔ ａｌ．，「Ａ Ｎｅｗ Ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｄｉｓｐｌａｙ Ｓｃａｆｆｏｌｄｓ ｆｏｒ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ，」Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉ．１５：１４－２７（２００６）；Ｎｉｃａｉｓｅ ｅｔ ａｌ．，「Ａｆｆｉｎｉｔｙ Ｔｒａｎｓｆｅｒ ｂｙ ＣＤＲ Ｇｒａｆｔｉｎｇ ｏｎ ａ Ｎｏｎｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｓｃａｆｆｏｌｄ，」Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉ．１３：１８８２－１８９１（２００４）；Ｎｙｇｒｅｎ ａｎｄ Ｕｈｌｅｎ，「Ｓｃａｆｆｏｌｄｓ ｆｏｒ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ Ｎｏｖｅｌ Ｂｉｎｄｉｎｇ Ｓｉｔｅｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，」Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｓｔｒｕｃ．Ｂｉｏｌ．７：４６３－４６９（１９９７）を参照のこと）から導出され得る。
キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）
卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗原結合ドメインをＣＡＲの細胞外ドメインに組み込むことにより、卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に結合するＣＡＲを生成することができる。ＣＡＲは、遺伝的に操作された受容体である。これらの操作された受容体は、当該技術分野で既知の技術に従って、Ｔ細胞を含む免疫細胞に容易に挿入し、それらによって発現させることができる。ＣＡＲによって、単一の受容体は、特定の抗原を認識し、その抗原に結合したときに、免疫細胞を活性化して、その抗原を担持する細胞を攻撃及び破壊するようにプログラミングすることができる。これらの抗原が腫瘍細胞上に存在する場合、ＣＡＲを発現する免疫細胞は、腫瘍細胞を標的とし、それらを殺傷することができる。
ＣＡＲは、典型的には、抗原（例えば、卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体）に結合する細胞外ドメイン、任意選択のリンカー、膜貫通ドメイン、並びに共刺激ドメイン及び／又はシグナル伝達ドメインを含む細胞質ドメインを含む。
ＣＡＲの細胞外ドメインは、所望の抗原（例えば、卵巣ネオ抗原）に特異的に結合する任意のポリペプチドを含有してもよい。細胞外ドメインは、抗体の一部分又は代替的な足場であるｓｃＦｖを含み得る。ＣＡＲはまた、タンデムに配置され、リンカー配列によって分離され得る２つ以上の所望の抗原に結合するように遺伝子操作されてもよい。例えば、１つ又は２つ以上のドメイン抗体、ｓｃＦｖ、ラマＶＨＨ抗体、又は他のＶＨのみ抗体断片を、リンカーを介してタンデムに構成して、ＣＡＲに二重特異性又は多重特異性を提供してもよい。
ＣＡＲの膜貫通ドメインは、ＣＤ８の膜貫通ドメイン、Ｔ細胞受容体のアルファ、ベータ、若しくはゼータ鎖、ＣＤ２８、ＣＤ３イプシロン、ＣＤ４５、ＣＤ４、ＣＤ５、ＣＤ８、ＣＤ９、ＣＤ１６、ＣＤ２２、ＣＤ３３、ＣＤ３７、ＣＤ６４、ＣＤ８０、ＣＤ８６、ＣＤ１３４、ＣＤ１３７、ＣＤ１５４、ＫＩＲＤＳ２、ＯＸ４０、ＣＤ２、ＣＤ２７、ＬＦＡ－１（ＣＤＩ ｌａ、ＣＤ１８）、ＩＣＯＳ（ＣＤ２７８）、４－１ＢＢ（ＣＤ１３７）、４－１ＢＢＬ、ＧＩＴＲ、ＣＤ４０、ＢＡＦＦＲ、ＨＶＥＭ（ＬＩＧＨＴＲ）、ＳＬＡＭＦ７、ＮＫｐ８０（ＫＬＲＦＩ）、ＣＤ１６０、ＣＤ１９、ＩＬ２Ｒベータ、ＩＬ２Ｒガンマ、ＩＬ７Ｒ ａ、ＩＴＧＡ１、ＶＬＡ１、ＣＤ４９ａ、ＩＴＧＡ４、ＩＡ４、ＣＤ４９Ｄ、ＩＴＧＡ６、ＶＬＡ－６、ＣＤ４９ｆ、ＩＴＧＡＤ、ＣＤＩ Ｉｄ、ＩＴＧＡＥ、ＣＤ１０３、ＩＴＧＡＬ、ＣＤＩ ｌａ、ＬＦＡ－１、ＩＴＧＡＭ、ＣＤＩ ｌｂ、ＩＴＧＡＸ、ＣＤＩ ｌｃ、ＩＴＧＢ１、ＣＤ２９、ＩＴＧＢ２、ＣＤ１８、ＬＦＡ－１、ＩＴＧＢ７、ＴＮＦＲ２、ＤＮＡＭ１（ＣＤ２２６）、ＳＬＡＭＦ４（ＣＤ２４４、２Ｂ４）、ＣＤ８４、ＣＤ９６（Ｔａｃｔｉｌｅ）、ＣＥＡＣＡＭ１、ＣＲＴ ＡＭ、Ｌｙ９（ＣＤ２２９）、ＣＤ１６０（ＢＹ５５）、ＰＳＧＬ１、ＣＤ１００（ＳＥＭＡ４Ｄ）、ＳＬＡＭＦ６（ＮＴＢ－Ａ、Ｌｙｌ０８）、ＳＬＡＭ（ＳＬＡＭＦ１、ＣＤ１５０、ＩＰＯ－３）、ＢＬＡＭＥ（ＳＬＡＭＦ８）、ＳＥＬＰＬＧ（ＣＤ１６２）、ＬＴＢＲ、ＰＡＧ／Ｃｂｐ、ＮＫｐ４４、ＮＫｐ３０、ＮＫｐ４６、ＮＫＧ２Ｄ、及び／又はＮＫＧ２Ｃに由来し得る。
ＣＡＲの細胞内共刺激ドメインは、１つ又は２つ以上の共刺激分子の細胞内ドメインに由来し得る。共刺激分子は、抗原への結合時にＴリンパ球の効率的な活性化及び機能に必要な第２のシグナルを提供する、抗原受容体又はＦｃ受容体以外の周知の細胞表面分子である。ＣＡＲにおいて使用され得る例示的な共刺激ドメインは、４－１ＢＢ、ＣＤ２、ＣＤ７、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ３０、ＣＤ４０、ＣＤ５４（ＩＣＡＭ）、ＣＤ８３、ＣＤ１３４（ＯＸ４０）、ＣＤ１５０（ＳＬＡＭＦ１）、ＣＤ１５２（ＣＴＬＡ４）、ＣＤ２２３（ＬＡＧ３）、ＣＤ２７０（ＨＶＥＭ）、ＣＤ２７８（ＩＣＯＳ）、ＤＡＰ１０、ＬＡＴ、ＮＫＤ２Ｃ ＳＬＰ７６、ＴＲＩＭ、ＢＴＬＡ、ＧＩＴＲ、ＣＤ２２６、ＨＶＥＭ、及びＺＡＰ７０の細胞内ドメインである。
ＣＡＲの細胞内シグナル伝達ドメインは、例えば、ＣＤ３ζ、ＣＤ３ε、ＣＤ２２、ＣＤ７９ａ、ＣＤ６６ｄ、ＣＤ３９ ＤＡＰ１０、ＤＡＰ１２、Ｆｃ ε受容体Ｉガンマ鎖（ＦＣＥＲ１Ｇ）、ＦｃＲ β、ＣＤ３δ、ＣＤ３γ、ＣＤ５、ＣＤ２２６、又はＣＤ７９Ｂのシグナル伝達ドメインに由来し得る。「細胞内シグナル伝達ドメイン」は、エフェクター細胞機能を誘発するために、標的抗原への有効なＣＡＲ結合のメッセージの、免疫エフェクター細胞の内部への形質導入に関与して、エフェクター細胞機能、例えば、活性化、サイトカイン産生、増殖、及び細胞傷害性活性（細胞傷害性因子のＣＡＲ結合標的細胞への放出、又は細胞外ＣＡＲドメインへの抗原結合後に引き出される他の細胞応答を含む）を引き出すＣＡＲポリペプチドの一部を指す。
細胞外ドメインと膜貫通ドメインとの間に位置するＣＡＲの任意選択のリンカーは、約２～１００アミノ酸長のポリペプチドであってよい。リンカーは、隣接するタンパク質ドメインが互いに対して自由に移動するように、グリシン及びセリンなどの柔軟性残基を含み得るか、又は残基で構成され得る。２つの隣接するドメインが互いに立体的に干渉しないことを確実にすることが望ましい場合、より長いリンカーを使用することができる。リンカーは、開裂可能であっても開裂不可能であってもよい。開裂可能なリンカーの例には、２Ａリンカー（例えば、Ｔ２Ａ）、２Ａ様リンカー、又はこれらの機能的等価物及びこれらの組合せが含まれる。リンカーはまた、任意の免疫グロブリンのヒンジ領域又はヒンジ領域の一部分に由来し得る。リンカーの非限定的な例としては、ヒトＣＤ８α鎖の一部、ＣＤ２８の部分的細胞外ドメイン、ＦｃｙＲｌｌｌａ受容体、ＩｇＧ、ＩｇＭ、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、Ｉｇヒンジ、又はこれらの機能断片が挙げられる。
使用することができる例示的なＣＡＲは、例えば、本開示の卵巣ネオ抗原に結合する細胞外ドメイン、ＣＤ８膜貫通ドメイン、及びＣＤ３ζシグナル伝達ドメインを含有するＣＡＲである。他の例示的なＣＡＲは、本開示の卵巣ネオ抗原に結合する細胞外ドメイン、ＣＤ８又はＣＤ２８膜貫通ドメイン、ＣＤ２８、４１ＢＢ、又はＯＸ４０共刺激ドメイン、及びＣＤ３ζシグナル伝達ドメインを含有する。
ＣＡＲは、標準的な分子生物学的技術によって作製される。所望の抗原に結合する細胞外ドメインは、本明細書に記載の技術を使用して生成された抗体又はそれらの抗原結合断片に由来し得る。
Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）
卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に結合するＴＣＲを生成することができる。ＴＣＲは、卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体へのＴ細胞結合、Ｔ細胞の単離、及びＴ細胞で発現したＴＣＲのシーケンシングに基づいて同定することができる。同定されたＴＣＲは、αβＴ細胞又はγδＴ細胞から同定することができる。同定されたＴＣＲは、その親和性、安定性、溶解度などを改善するために更に遺伝子操作されてもよい。ＴＣＲは、免疫グロブリンを親和性成熟させるために利用されるのと同じ技術を利用して親和性成熟させることができる。ＴＣＲは、システイン安定化された可溶性ＴＣＲとして発現させてもよく、これらは、遺伝子操作してα／β相互作用表面における変異、例えば、α鎖上のＧ１９２Ｒ及びβ鎖上のＲ２０８Ｇを導入することによって安定化され得る。ＴＣＲは、米国特許第７３２９７３１号、同第７８７１８１７（Ｂ２）号、同第７５６９６６４号、同第９１３３２６４号、同第９６２４２９２号、米国特許出願公開第２０１２０２５２７４２（Ａ１）号、同第２０１６／０１３０３１９号、欧州特許第３２１５１６４（Ａ１）号、同第３２８６２１０（Ａ１）号、国際公開第２０１７０９１９０５（Ａ１）号、又は米国特許第９８８４０７５号に記載の通り、ジスルフィド結合を形成するシステイン残基を遺伝子操作してＴＣＲ定常ドメインに導入することによって、α鎖の１１、１３、１９、２１、５３、７６、８９、９１又は９４位などの疎水性コアに変異を導入することによって、α及びβ鎖Ｖドメイン、膜貫通ドメイン又は定常ドメインの間の交換を含むドメイン交換を利用して、安定化することもできる。
本開示のＣＡＲ又はＴＣＲを発現する細胞
本開示の卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体の本開示の卵巣ネオ抗原に特異的に結合するＣＡＲ又はＴＣＲを発現する細胞は、本開示の範囲内である。本開示はまた、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞を提供する。いくつかの実施形態では、単離細胞に本開示のＣＡＲ又はＴＣＲを形質導入し、その結果、本開示のＣＡＲ又はＴＣＲが細胞表面上で構成的に発現する。本開示のＣＡＲ又はＴＣＲを発現する細胞は、１つ以上の共刺激分子を発現するように更に遺伝子操作してもよい。例示的な共刺激分子は、ＣＤ２８、ＩＣＯＳ、ＬＩＧＨＴ、ＧＩＴＲ、４－１ＢＢ、及びＯＸ４０である。本開示のＣＡＲ又はＴＣＲを発現する細胞は、更に、ＴＮＦα、ＩＦＮγ、ＩＬ－２、ＩＬ－３、ＩＬ－６、ＩＬ－７、ＩＬ－１１、ＩＬ－１２、ＩＬ－１５、ＩＬ－１７、又はＩＬ－２１などの１つ以上のサイトカイン又はケモカイン又は炎症促進性メディエータを産生するよう遺伝子操作してもよい。細胞は、既知の遺伝子編集技術を使用して不活性化された内因性ＴＣＲ遺伝子座及び／又はＨＬＡ遺伝子座を有し得る。いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又はＴＣＲを含む細胞は、リンパ系細胞を分化させることができるＴ細胞、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、細胞傷害性Ｔリンパ球（ＣＴＬ）、調節性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）、ヒト胚性幹細胞、リンパ球前駆細胞、Ｔ細胞前駆細胞、又は多能性幹細胞若しくは誘導多能性幹細胞（ｉＰＳＣ）である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又はＴＣＲを含む単離細胞は、Ｔ細胞である。Ｔ細胞は、例えば初代Ｔ細胞などの培養Ｔ細胞、又は例えばＪｕｒｋａｔ、ＳｕｐＴ１などの培養Ｔ細胞株からのＴ細胞、又は哺乳類から得られるＴ細胞などの任意のＴ細胞であってよい。哺乳類から得られる場合、Ｔ細胞は、骨髄、血液、リンパ節、胸腺、又は他の組織若しくは体液を含む任意の供給源から得ることができる。Ｔ細胞はまた、富化又は精製されてもよい。Ｔ細胞は、ヒトＴ細胞であり得る。Ｔ細胞は、ヒトから単離されたＴ細胞であり得る。Ｔ細胞は、任意のタイプのＴ細胞であり得、任意の発達段階のものであってもよく、ＣＤ４＋ＣＤ８＋二重陽性Ｔ細胞、ＣＤ８＋Ｔ細胞（例えば、細胞傷害性Ｔ細胞）、例えばＴｈ１及びＴｈ２細胞などのＣＤ４＋ヘルパーＴ細胞、末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）、末梢血白血球（ＰＢＬ）、腫瘍浸潤細胞、メモリＴ細胞、及びナイーブＴ細胞などを含む。Ｔ細胞は、ＣＤ８＋Ｔ細胞又はＣＤ４＋Ｔ細胞であり得る。Ｔ細胞は、αβＴ細胞又はγδＴ細胞であり得る。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、ＮＫ細胞である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、αβＴ細胞である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、γδＴ細胞である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、ＣＴＬである。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、ヒト胚性幹細胞である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、リンパ球前駆細胞である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、多能性幹細胞である。
いくつかの実施形態では、本開示のＣＡＲ又は本開示のＴＣＲを含む単離細胞は、誘導多能性幹細胞（ｉＰＳＣ）である。
本開示の細胞は、既知の方法を使用して、所望のＣＡＲ又はＴＣＲを含むレンチウイルスベクターを細胞に導入することによって作製することができる。本開示の細胞は、インビボで複製することができ、その結果、持続的な腫瘍制御をもたらし得る長期持続性が得られる。
細胞傷害性剤、薬物、検出可能な標識などとのコンジュゲート
ポリペプチド、異種ポリペプチド、及びこれらに結合するタンパク質性分子は、細胞傷害性剤、治療薬、検出可能な標識などにコンジュゲートさせてもよい。これらの分子は、本明細書では免疫複合体と称される。卵巣ネオ抗原を含む免疫複合体を使用して、卵巣ネオ抗原に結合するＨＬＡ分子を発現している細胞を検出し、ペイロードを送達するか又は殺傷することができる。卵巣ネオ抗原又は卵巣ネオ抗原／ＨＬＡ複合体に特異的に結合する抗体、抗原結合断片、又は選択的スカフォールドを含む免疫複合体を使用して、より大きなタンパク質の状況で若しくはＨＬＡとの複合体で表面上に卵巣ネオ抗原を発現する細胞を検出し、ペイロードを送達するか若しくは殺傷することができる、又は細胞の溶解後に細胞内卵巣ネオ抗原を検出することができる。
いくつかの実施形態では、免疫複合体は、検出可能な標識を含む。
いくつかの実施形態では、免疫複合体は、細胞傷害性剤を含む。
いくつかの実施形態では、免疫複合体は、治療薬を含む。
検出可能な標識としては、分光学的、光化学的、生化学的、免疫化学的、又は化学的手段を介して可視化することができる組成物が挙げられる。検出可能な標識はまた、細胞傷害性剤を含んでいてもよく、細胞傷害性剤は検出可能な標識を含んでいてもよい。
例示的な検出可能な標識としては、放射性同位体、磁気ビーズ、金属ビーズ、コロイド粒子、蛍光染料、電子密度試薬、酵素（例えば、一般的にＥＬＩＳＡにおいて使用される）、ビオチン、ジゴキシゲニン、ハプテン、発光分子、化学発光分子、蛍光色素、フルオロフォア、蛍光消光剤、有色分子、放射性同位体、シンシレート（scintillates）、アビジン、ストレプトアビジン、プロテインＡ、プロテインＧ、抗体又はその断片、ポリヒスチジン、Ｎｉ２＋、Ｆｌａｇタグ、ｍｙｃタグ、重金属、酵素、アルカリホスファターゼ、ペルオキシダーゼ、ルシフェラーゼ、電子供与体／受容体、アクリジニウムエステル、及び比色基質が挙げられる。
検出可能な標識は、例えば、検出可能な標識が放射性同位体であるときなど、自発的にシグナルを発し得る。他の場合、検出可能な標識は、外部場によって刺激された結果として、シグナルを発する。
例示的な放射性同位体は、γ放出、オージェ放出、β放出、アルファ放出、又はポジトロン放出性の放射性同位体であり得る。例示的な放射性同位体としては、３Ｈ、１１Ｃ、１３Ｃ、１５Ｎ、１８Ｆ、１９Ｆ、５５Ｃｏ、５７Ｃｏ、６０Ｃｏ、６１Ｃｕ、６２Ｃｕ、６４Ｃｕ、６７Ｃｕ、６８Ｇａ、７２Ａｓ、７５Ｂｒ、８６Ｙ、８９Ｚｒ、９０Ｓｒ、９４ｍＴｃ、９９ｍＴｃ、１１５Ｉｎ、１２３１、１２４１、１２５Ｉ、１３１１、２１１Ａｔ、２１２Ｂｉ、２１３Ｂｉ、２２３Ｒａ、２２６Ｒａ、２２５Ａｃ、及び２２７Ａｃが挙げられる。
例示的な金属原子は、２０超の原子番号を有する金属、例えば、カルシウム原子、スカンジウム原子、チタン原子、バナジウム原子、クロム原子、マンガン原子、鉄原子、コバルト原子、ニッケル原子、銅原子、亜鉛原子、ガリウム原子、ゲルマニウム原子、ヒ素原子、セレン原子、臭素原子、クリプトン原子、ルビジウム原子、ストロンチウム原子、イットリウム原子、ジルコニウム原子、ニオブ原子、モリブデン原子、テクネチウム原子、ルテニウム原子、ロジウム原子、パラジウム原子、銀原子、カドミウム原子、インジウム原子、スズ原子、アンチモン原子、テルル原子、ヨウ素原子、キセノン原子、セシウム原子、バリウム原子、ランタン原子、ハフニウム原子、タンタル原子、タングステン原子、レニウム原子、オスミウム原子、イリジウム原子、白金原子、金原子、水銀原子、タリウム原子、鉛原子、ビスマス原子、フランシウム原子、ラジウム原子、アクチニウム原子、セリウム原子、プラセオジム原子、ネオジム原子、プロメチウム原子、サマリウム原子、ユウロピウム原子、ガドリニウム原子、テルビウム原子、ジスプロシウム原子、ホルミウム原子、エルビウム原子、ツリウム原子、イッテルビウム原子、ルテチウム原子、トリウム原子、プロトアクチニウム原子、ウラン原子、ネプツニウム原子、プルトニウム原子、アメリシウム原子、キュリウム原子、バーケリウム原子、カリホルニウム原子、アインスタイニウム原子、フェルミウム原子、メンデレビウム原子、ノーベリウム原子、又はローレンシウム原子である。
いくつかの実施形態では、金属原子は、２０超の原子番号を有するアルカリ土類金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、ランタニドであり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、アクチニドであり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、遷移金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、卑金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、金原子、ビスマス原子、タンタル原子、及びガドリニウム原子であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、５３（すなわち、ヨウ素）～８３（すなわち、ビスマス）の原子番号を有する金属であり得る。
いくつかの実施形態では、金属原子は、磁気共鳴映像法に好適な原子であり得る。
金属原子は、Ｂａ２＋、Ｂｉ３＋、Ｃｓ＋、Ｃａ２＋、Ｃｒ２＋、Ｃｒ３＋、Ｃｒ６＋、Ｃｏ２＋、Ｃｏ３＋、Ｃｕ＋、Ｃｕ２＋、Ｃｕ３＋、Ｇａ３＋、Ｇｄ３＋、Ａｕ＋、Ａｕ３＋、Ｆｅ２＋、Ｆｅ３＋、Ｆ３＋、Ｐｂ２＋、Ｍｎ２＋、Ｍｎ３＋、Ｍｎ４＋、Ｍｎ７＋、Ｈｇ２＋、Ｎｉ２＋、Ｎｉ３＋、Ａｇ＋、Ｓｒ２＋、Ｓｎ２＋、Ｓｎ４＋、及びＺｎ２＋などの＋１、＋２、又は＋３の酸化状態の形態である金属イオンであってもよい。金属原子は、金属酸化物、例えば、酸化鉄、酸化マンガン、又は酸化ガドリニウムを含み得る。
好適な色素としては、例えば、５（６）－カルボキシフルオレセイン、ＩＲＤｙｅ ６８０ＲＤマレイミド、又はＩＲＤｙｅ ８００ＣＷ、ルテニウムポリピリジル色素などの任意の市販の色素が挙げられる。
好適なフルオロフォアは、フルオレセインイソチオシアネート（fluorescein isothiocyante、ＦＩＴＣ）、フルオレセインチオセミカルバジド、ローダミン、テキサスレッド、ＣｙＤｙｅ（例えば、Ｃｙ３、Ｃｙ５、Ｃｙ５．５）、Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒｓ（例えば、Ａｌｅｘａ４８８、Ａｌｅｘａ５５５、Ａｌｅｘａ５９４、Ａｌｅｘａ６４７）、近赤外（near infrared、ＮＩＲ）（７００～９００ｎｍ）蛍光染料、並びにカルボシアニン及びアミノスチリル染料である。
検出可能な標識を含む免疫複合体は、造影剤として使用することもできる。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、化学療法剤、薬物、増殖阻害剤、毒素（例えば、細菌、真菌、植物、若しくは動物由来の酵素活性を有する毒素、又はその断片）、又は放射性同位体（即ち、放射性コンジュゲート）である。
いくつかの実施形態では、細胞毒性剤は、ダウノマイシン、ドキソルビシン、メトトレキサート、ビンデシン、ジフテリア毒素などの細菌毒素、リシン、ゲルダナマイシン、マイタンシノイド、又はカリケアマイシンである。細胞毒性剤は、チューブリン結合、ＤＮＡ結合、又はトポイソメラーゼ阻害を含む機構によってその細胞毒性又は細胞増殖抑制作用を引き起こし得る。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、ジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の未結合活性断片、エキソトキシンＡ鎖（シュードモナス・エルジノーサ（Pseudomonas aeruginosa））、リシンＡ鎖、アブリンＡ鎖、モデシンＡ鎖、α－サルシン、シナアブラギリ（Aleurites fordii）タンパク質、ジアンチンタンパク質、ヨウシュヤマゴボウ（Phytolaca americana）タンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ、及びＰＡＰ－Ｓ）、ニガウリ（momordica charantia）阻害剤、クルシン、クロチン、サボン草（sapaonaria officinalis）阻害剤、ゲロニン、マイトジェリン（mitogellin）、レストリクトシン、フェノマイシン、エノマイシン、並びにトリコテセン（tricothecenes）などの、酵素活性毒素である。
いくつかの実施形態では、細胞傷害性剤は、２１２Ｂｉ、１３１Ｉ、１３１Ｉｎ、９０Ｙ、及び１８６Ｒｅなどの放射性核種である。
いくつかの実施形態では、細胞毒性剤は、ドラスタチン又はドラスタチンのペプチド類似体及び誘導体、アウリスタチン又はモノメチルアウリスタチンフェニルアラニンである。例示的な分子は、米国特許第５，６３５，４８３号及び同第５，７８０，５８８号に開示されている。ドラスタチン及びアウリスタチンは、微小管動態、ＧＴＰの加水分解、並びに核及び細胞の分裂に干渉し（Ｗｏｙｋｅ ｅｔ ａｌ（２００１）Ａｎｔｉｍｉｃｒｏｂ Ａｇｅｎｔｓ ａｎｄ Ｃｈｅｍｏｔｈｅｒ．４５（１２）：３５８０～３５８４）、抗癌及び抗真菌活性を有することが示されている。ドラスタチン及びアウリスタチン薬剤部位は、ペプチド薬剤部位のＮ（アミノ）末端若しくはＣ（カルボキシル）末端を介して（国際公開第０２／０８８１７２号）、又は抗体内に遺伝子操作された任意のシステインを介して、本発明の抗体に結合することができる。
免疫複合体は、既知の方法を用いて作製することができる。
いくつかの実施形態では、検出可能な標識は、キレート剤と複合体を形成している。
検出可能な標識、細胞傷害性剤、又は治療薬は、ポリペプチド、異種ポリペプチド、又は当該ポリペプチド若しくは異種ポリペプチドに結合するタンパク質性分子に直接又はリンカーを介して間接的に連結し得る。好適なリンカーは、当該技術分野において既知であり、例えば、補欠分子族、非フェノールリンカー（Ｎ－スクシミジル－ベンゾエートの誘導体、ドデカボラート）、大環状及び非環式の両キレート剤のキレート部分、例えば、１，４，７，１０－テトラアザシクロドデカン－１，４，７，１０，四酢酸（ＤＯＴＡ）の誘導体、ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）の誘導体、Ｓ－２－（４－イソチオシアナトベンジル）－１，４，７－トリアザシクロノナン－１，４，７－三酢酸（ＮＯＴＡ）の誘導体、及び１，４，８，１１－テトラアザシクロドデカン－１，４，８，１１－四酢酸（ＴＥＴＡ）の誘導体、Ｎ－スクシンイミジル－３－（２－ピリジルジチオール）プロピオナート（ＳＰＤＰ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの二官能性誘導体（例えば、ジメチルアジピミダートＨＣｌ）、活性エステル（例えば、ジスクシンイミジルスベラート）、アルデヒド（例えば、グルタルアルデヒド）、ビスアジド化合物（例えば、ビス（ｐ－アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン）、ビス－ジアゾニウム誘導体（例えば、ビス－（ｐ－ジアゾニウムベンゾイル）－エチレンジアミン）、ジイソシアナート（例えば、トルエン２，６－ジイソシアナート）、及びビス－活性フッ素化合物（例えば、１，５－ジフルオロ－２，４－ジニトロベンゼン）、並びに他のキレート部分が挙げられる。好適なペプチドリンカーは周知である。
本明細書の組成物のいずれかの治療、使用、及び投与の方法
本明細書に開示される組成物を用いて対象を治療するための方法が、本明細書に提供される。本明細書で提供される方法は、本開示のポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、及び組換えウイルスのいずれかを含む組成物を投与することを含む。本開示のポリヌクレオチド、ポリペプチド、ベクター、組換えウイルスを含む組成物、及び投与レジメンは、臨床状態のリスクを治療、予防、又は低減するために使用されてもよい。
いくつかの実施形態では、臨床状態は、卵巣癌である。
「卵巣癌」は、病理学的な種類又は侵襲性の段階に関係なく、卵巣内における全ての種類の癌性成長又は発癌プロセス、転移性組織又は悪性腫瘍形質転換細胞、組織、又は器官を含むことを意味する。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、腺癌である。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、転移性卵巣癌である。いくつかの実施形態では、卵巣癌は、骨盤、卵管、膀胱、直腸、子宮、腹部内層、腹部、リンパ節、肝臓、肺、脾臓、皮膚、脳、若しくは骨、又はこれらの任意の組合せへと転移している。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、上皮卵巣癌、生殖細胞卵巣癌、間質細胞卵巣癌、若しくは小細胞癌、又はこれらの組合せである。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、ステージ１卵巣癌である。いくつかの実施形態では、卵巣癌は、ステージ２卵巣癌である。いくつかの実施形態では、卵巣癌は、ステージ３卵巣癌である。いくつかの実施形態では、卵巣癌は、ステージ４卵巣癌である。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、上皮卵巣癌である。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、再発性又は難治性卵巣癌である。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、プラチナ抵抗性卵巣癌である。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、化学療法に対して感受性である。
いくつかの実施形態では、卵巣癌は、化学療法に対して非感受性である。
いくつかの実施形態では、対象は、治療未経験である。
いくつかの実施形態では、対象は、手術を受けたことがある。
いくつかの実施形態では、対象は、上昇したレベルの癌抗原１２５（ＣＡ１２５）を有する。ＣＡ１２５は、レベルが典型的には約≧３５Ｕ／ｍＬである場合に、対象において上昇する。ＣＡ１２５レベルはまた、手術後のレベルと比較してもよい。
本明細書では、対象における卵巣癌を治療する、予防する、そのリスクを低減させる方法であって、当該対象に本開示の卵巣癌ネオ抗原を導入するために使用することができる本開示の様々な組成物、例えば、本開示のポリヌクレオチド、異種ポリヌクレオチド、ポリペプチド、異種ポリペプチド、ベクター、組換えウイルス、及びワクチンを投与することを含む、方法が提供される。加えて、本開示の卵巣癌ネオ抗原に結合するタンパク質性分子は、本開示の方法で使用することができる。
本開示はまた、対象における免疫応答を誘導する方法であって、当該対象に本開示の卵巣癌ネオ抗原を導入するために使用することができる本開示の様々な組成物、例えば、本開示のポリヌクレオチド、異種ポリヌクレオチド、ポリペプチド、異種ポリペプチド、ベクター、組換えウイルス、及びワクチンを投与することを含む、方法も提供する。
いくつかの実施形態では、本明細書で同定される卵巣癌ネオ抗原は、卵巣癌を有する対象集団において、少なくとも約１％以上、約２％以上、約３％以上、約４％以上、約５％以上、約６％以上、約７％以上、約８％以上、約９％以上、約１０％以上、約１１％以上、約１２％以上、約１３％以上、約１４％以上、約１５％以上、約１６％以上、約１７％以上、約１８％以上、約１９％以上、約２０％以上、約２１％以上、約２２％以上、約２３％以上、約２４％以上、約２５％以上、約２６％以上、約２７％以上、約２８％以上、約２９％以上、約３０％以上、約３５％以上、約４０％以上、約４５％以上、約５０％以上、約５５％以上、約６０％以上、約６５％以上、又は約７０％以上の頻度で存在する。
いくつかの実施形態では、対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法は、当該卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを必要とする当該対象に、本明細書に開示される組成物のいずれかを投与することを含み、投与は、組成物の１回以上の投与を含む。いくつかの実施形態では、卵巣癌は、上皮卵巣癌、生殖細胞卵巣癌、間質細胞卵巣癌、小細胞卵巣癌、再発性若しくは難治性卵巣癌、プラチナ抵抗性卵巣癌、ステージ１卵巣癌、ステージ２卵巣癌、ステージ３卵巣癌、及びステージ４卵巣癌から選択される。
いくつかの実施形態では、免疫応答を誘導する方法は、免疫応答を誘導する方法を必要とする対象に、本明細書に開示される組成物のいずれかを投与することを含み、投与は、組成物の１回以上の投与を含む。
本明細書に開示される方法のいずれかでは、対象に投与される組成物は、アデノウイルス、αウイルス、ポックスウイルス、アデノ随伴ウイルス、レトロウイルスから選択される組換えウイルスを含んでもよく、又は自己複製ＲＮＡ分子若しくはその組合せを含んでもよい。
いくつかの実施形態では、組換えウイルスは、本開示の卵巣癌ネオ抗原、例えば、本開示のポリヌクレオチド、異種ポリヌクレオチド、ポリペプチド、異種ポリペプチド、及びベクターを含む。
いくつかの実施形態では、ウイルス又は組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、ＧＡｄ２０、及びこれらの組合せから選択される。
いくつかの実施形態では、組成物（conposition）は、本開示のｒＡｄ２６を含む。
いくつかの実施形態では、組成物は、本開示のｒＭＶＡを含む。
いくつかの実施形態では、組成物は、本開示のｒＧＡｄを含む。
いくつかの実施形態では、組成物は、本開示のｒＧＡｄ２０を含む。
いくつかの実施形態では、組成物は、本開示のｒＣｈ２０を含む。
いくつかの実施形態では、組成物は、本開示の自己複製ＲＮＡを含む。
第２の投与
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法は、本開示で提供される組成物の１回以上の投与を含む。例えば、方法は、第１の投与、その後、２回の投与の間の期間を伴う、第２の投与を含む。
いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、同じ又は異なる組成物を含み得る。例えば、第１の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルス、又は本開示のポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含む、組成物を含み得る。いくつかの実施形態では、第２の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルス、又は本開示のポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含む、組成物を含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、対象の寿命中に１回投与される。いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、対象の寿命中に２回以上投与される。いくつかの実施形態では、第１の投与と第２の投与との間の期間は、約１週間～約２週間、約１週間～約４週間、約１週間～約６週間、約１週間～約８週間、約１週間～約１２週間、約１週間～約２０週間、約１週間～約２４週間、又は約１週間～約５２週間である。いくつかの実施形態では、第１の投与と第２の投与との間の期間は、約２週間、約３週間、約４週間、約５週間、約６週間、約７週間、約８週間、約９週間、約１０週間、約１１週間、約１２週間、約１３週間、約１４週間、約１５週間、約１６週間、約１７週間、約１８週間、約１９週間、約２０週間、約２１週間、約２２週間、約２３週間、約２４週間、約２５週間、約２６週間、約２７週間、約２８週間、約２９週間、約３０週間、約３１週間、約３２週間、約３３週間、約３４週間、約３５週間、約３６週間、約３７週間、約３８週間、約３９週間、約４０週間、約４１週間、約４２週間、約４３週間、約４４週間、約４５週間、約４６週間、約４７週間、約４８週間、約４９週間、約５０週間、約５１週間、又は約５２週間である。
いくつかの実施形態では、第１の投与と第２の投与との間の期間は、約２週間である。
いくつかの実施形態では、第１の投与と第２の投与との間の期間は、約４週間である。
いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、サイクルを構成し、治療レジメンは、２つ以上のサイクルを含むことができ、各サイクルは、約１か月、約２か月、約３か月、約４か月、約５か月、約６か月、約７か月、約８か月、約９か月、約１０か月、約１１か月、又は約１２か月間離間される。
本明細書に開示された実施形態の一部を更に記載するために、以下の実施例が提供される。これらの実施例は、例示を目的とするものであって、本開示の実施形態を制限するものではない。いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、組換えウイルスの任意の組合せ、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む表１に提示される自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの任意の組合せを含み得る。
Figure 2023514566000002
いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、本開示の任意のポリペプチド又はその組合せをコードするポリヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの組合せからなる群から選択される任意のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、本開示の任意のポリペプチドの２つ以上のタンデム反復をコードするポリヌクレオチドを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、異なる組換えウイルスを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与及び第２の投与は、異なるアミノ酸配列のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、組換えウイルスを含む。
いくつかの実施形態では、対象において、免疫応答を誘導する方法、又は卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、若しくはその発症を遅延させる方法は、治療サイクルを含み、各サイクルは、
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含む第１の組成物を含む、第１の投与であって、ウイルス又は組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第１の投与と、
組換えウイルス、又は本開示の任意のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含む第２の組成物を含む、第２の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第２の投与と、
を含む。
第３の投与
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のうちのいずれかは、第３の投与を更に含み得る。例えば、方法は、各投与の間の期間を伴う、第１の投与、第２の投与、その後の第３の投与を含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与及び第３の投与は、同じ又は異なる組成物を含み得る。例えば、第１の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルスを含む組成物、又は組成物のポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含み得る。いくつかの実施形態では、第２の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルス、又は組成物のポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含み得る。いくつかの実施形態では、第３の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルスを含む組成物、又は組成物のポリペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、又はこれらの組合せを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与、及び第３の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子、並びにこれらの組合せを含む組成物を含む。
いくつかの実施形態では、第１、第２、又は第３の投与は、本開示の任意のポリペプチドの２つ以上のタンデム反復をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、第１、第２、又は第３の投与は、異なる組換えウイルスを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１、第２、又は第３の投与は、異なるアミノ酸配列のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、組換えウイルスを含み得る。
例えば、第１の投与は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの組合せからなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態では、第２の投与は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの組合せからなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含み得る。いくつかの実施形態では、第３の投与は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５、並びにこれらの組合せからなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチドを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与及び第３の投与は、対象の寿命中に１回投与される。いくつかの実施形態では、第１、第２、及び第３の投与は、対象の寿命中に２回以上投与される。いくつかの実施形態では、第２の投与と第３の投与との間の期間は、約１週間～約２週間、約１週間～約４週間、約１週間～約６週間、約１週間～約８週間、約１週間～約１２週間、約１週間～約２０週間、約１週間～約２４週間、又は約１週間～約５２週間である。
いくつかの実施形態では、第２の投与と第３の投与との間の期間は、約２週間、約３週間、約４週間、約５週間、約６週間、約７週間、約８週間、約９週間、約１０週間、約１１週間、約１２週間、約１３週間、約１４週間、約１５週間、約１６週間、約１７週間、約１８週間、約１９週間、約２０週間、約２１週間、約２２週間、約２３週間、約２４週間、約２５週間、約２６週間、約２７週間。約２８週間、約２９週間、約３０週間、約３１週間、約３２週間、約３３週間、約３４週間、約３５週間、約３６週間、約３７週間、約３８週間、約３９週間、約４０週間、約４１週間、約４２週間、約４３週間、約４４週間、約４５週間、約４６週間、約４７週間、約４８週間、約４９週間、約５０週間、約５１週間、又は約５２週間である。
いくつかの実施形態では、第２の投与と第３の投与との間の期間は、約６週間である。
いくつかの実施形態では、第２の投与と第３の投与との間の期間は、約８週間である。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与、及び第３の投与は、一緒にサイクルを構成し、治療レジメンは、２つ以上のサイクルを含むことができ、各サイクルは、約１か月、約２か月、約３か月、約４か月、約５か月、約６か月、約７か月、約８か月、約９か月、約１０か月、約１１か月、又は約１２か月間隔てられる。
本明細書にて開示した実施形態のいくつかを更に説明するために、以下の実施例を提供する。本明細書に開示される方法で使用される第１、第２、及び第３の投与は、以下の表２に提示されるエピトープ及び組成物の任意の組合せを含み得る。
Figure 2023514566000003
Figure 2023514566000004
いくつかの実施形態では、対象において、免疫応答を誘導する方法、又は卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、若しくはその発症を遅延させる方法は、治療サイクルを含み、各サイクルは、
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第１の組成物を含む、第１の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第１の投与と、
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第２の組成物を含む、第２の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第２の投与と、
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第３の組成物を含む、第３の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第３の投与と、
を含む。
第４の投与
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法のうちのいずれかは、第４の投与を更に含み得る。例えば、方法は、各投与の間の期間を伴う、第１の投与、第２の投与、第３の投与、その後の第４の投与を含み得る。いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与、第３の投与、及び第４の投与は、同じ又は異なる組成物を含み得る。例えば、第４の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードする自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物を含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与、第３の投与、及び第４の投与は、Ａｄ２６、ＧＡｄ２０、若しくはＭＶＡから選択される組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、及び３７５からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする自己複製ＲＮＡ分子、並びにこれらの組合せを含む、組成物を含む。
いくつかの実施形態では、第１、第２、第３、又は第４の投与は、本開示の任意のポリペプチドの２つ以上のタンデム反復をコードするポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、第１、第２、第３、又は第４の投与は、異なる組換えウイルスを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１、第２、第３、又は第４の投与は、異なるアミノ酸配列のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、組換えウイルスを含み得る。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与、第３の投与、及び第４の投与は、対象の寿命中に１回投与される。いくつかの実施形態では、第１、第２、第３、及び第４の投与は、対象の寿命中に２回以上投与される。
いくつかの実施形態では、第３の投与と第４の投与との間の期間は、約１週間～約２週間、約１週間～約４週間、約１週間～約６週間、約１週間～約８週間、約１週間～約１２週間、約１週間～約２０週間、約１週間～約２４週間、又は約１週間～約５２週間である。いくつかの実施形態では、第３の投与と第４の投与との間の期間は、約２週間、約３週間、約４週間、約５週間、約６週間、約７週間、約８週間、約９週間、約１０週間、約１１週間、約１２週間、約１３週間、約１４週間、約１５週間、約１６週間、約１７週間、約１８週間、約１９週間、約２０週間、約２１週間、約２２週間、約２３週間、約２４週間、約２５週間、約２６週間、約２７週間。約２８週間、約２９週間、約３０週間、約３１週間、約３２週間、約３３週間、約３４週間、約３５週間、約３６週間、約３７週間、約３８週間、約３９週間、約４０週間、約４１週間、約４２週間、約４３週間、約４４週間、約４５週間、約４６週間、約４７週間、約４８週間、約４９週間、約５０週間、約５１週間、又は約５２週間である。
いくつかの実施形態では、第３の投与と第４の投与との間の期間は、約４週間である。
いくつかの実施形態では、第３の投与と第４の投与との間の期間は、約８週間である。
いくつかの実施形態では、第１の投与、第２の投与、第３の投与、及び第４の投与は、一緒にサイクルを構成し、治療レジメンは、２つ以上のサイクルを含むことができ、各サイクルは、約１か月、約２か月、約３か月、約４か月、約５か月、約６か月、約７か月、約８か月、約９か月、約１０か月、約１１か月、又は約１２か月間隔てられる。
いくつかの実施形態では、対象において、免疫応答を誘導する方法、又は卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、若しくはその発症を遅延させる方法は、治療サイクルを含み、各サイクルは、
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第１の組成物を含む、第１の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第１の投与と；
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第２の組成物を含む、第２の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第２の投与と；
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第３の組成物を含む、第３の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、ＧＡｄ２０、又は自己複製ＲＮＡ分子から選択される、第３の投与と；
組換えウイルス、又は本開示の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第４の組成物を含む、第４の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第４の投与）と、
を含む。
維持投与
いくつかの実施形態では、方法は、治療サイクル中に一定間隔で組成物を対象に投与することを更に含み、治療サイクルが終了した後でも継続し得る。例えば、組成物は、治療レジメン中に毎月対象に投与され得、更に６か月間継続され得る。いくつかの実施形態では、組成物を２つの治療サイクルの間に投与できる。いくつかの実施形態では、組成物は、エピトープ配列をコードするＡｄ２６ベクター、ＧＡｄ２０ベクター、ＭＶＡベクター、又は自己複製ＲＮＡ分子から選択される、ベクターを含む組成物など、本明細書に開示される組成物のいずれかであり得る。
投与量及び投与経路
本開示の組成物は、皮下、局所、経口、及び筋肉内などの様々な経路によって対象へ投与してもよい。組成物の投与は、経口的又は非経口的に達成され得る。非経口送達の方法としては、局所、動脈内（組織へ直接）、筋肉内、真皮内、皮下、髄内、髄腔内、脳室内、静脈内、腹腔内、又は鼻腔内投与が挙げられる。本開示はまた、予防及び治療方法で使用するための好適な局所、経口、全身及び非経口製剤を提供する目的を有する。
いくつかの実施形態で、ワクチン組成物の筋肉内投与は、針を使用することによって達成することができる。代替案は、組成物を投与するための無針注射装置（例えば、Ｂｉｏｊｅｃｔｏｒ（商標）の使用）又はワクチンを含有する凍結乾燥粉末の使用である。
静脈内、皮膚若しくは皮下注射、又は罹患部位への注射では、ワクチン組成物は、パイロジェンフリーであり、好適なｐＨ、等張性、及び安定性を有する非経口的に許容される水溶液の形態であり得る。当業者は、例えば、塩化ナトリウム注射剤、リンゲル注射剤、乳酸リンゲル注射剤などの等張性ビヒクルを使用して好適な溶液を調製することが可能である。必要に応じて、防腐剤、安定剤、緩衝剤、酸化防止剤、及び／又は他の添加剤を含めることができる。徐放性製剤を使用することもできる。
典型的には、投与は、卵巣癌の症状の発症前に卵巣ネオ抗原に対する免疫応答を生じさせる予防的目的を有する。
本開示の組成物は、対象に投与されて、対象における免疫応答を引き起こす。検出可能な免疫応答を誘導するためのワクチン又は組成物の量は、「免疫学的に有効な用量」であると定義される。本開示の組成物は、体液性及び細胞性免疫応答を誘導し得る。典型的な実施形態では、免疫応答は、保護免疫応答である。
いくつかの実施形態では、対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法は、治療有効量である本開示の１つ以上のワクチンを対象へ投与することを含む。
いくつかの実施形態では、対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法は、治療有効量である本開示の１つ以上の組成物を対象へ投与することを含む。
いくつかの実施形態では、対象における免疫（immunre）応答を生成する方法は、免疫学的治療有効量である本開示の１つ以上の組成物を対象に投与することを含む。
いくつかの実施形態では、対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法は、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片の１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド含む、治療有効量のワクチン又は組成物を対象に投与し、それにより、対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを含み、ここで、投与は、組成物の１回以上の投与を含む。
本明細書に開示される方法のいずれかでは、対象に投与される組成物は、アデノウイルス、αウイルス、ポックスウイルス、アデノ随伴ウイルス、レトロウイルスから選択される組換えウイルスを含んでもよく、又は自己複製ＲＮＡ分子若しくはその組合せを含んでもよい。
いくつかの実施形態では、対象は、卵巣癌を有すると疑われるか又は発症すると疑われる。
実際の投与量、並びに投与速度及び時間経過は、治療対象の性質及び重篤度によって決まる。治療の処方、例えば、投与量などの決定は、一般開業医及び他の医師の責任の範囲内であり、典型的には、治療される障害、個々の患者の状態、送達部位、投与の方法、及び開業医に既知の他の要因を考慮する。
いくつかの実施形態では、組換えアデノウイルスを含む組成物は、約１×１０４ＩＦＵ（Ｉｎｆｅｃｔｉｏｕｓ Ｕｎｉｔ、感染単位）～約１×１０１２ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０１１ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０１０ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０９ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０８ＩＦＵ／用量、又は約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０６ＩＦＵ／用量の投与量で投与される。
いくつかの実施形態では、組換えアデノウイルスを含む組成物は、約１×１０６ＶＰ（ウイルス粒子）～約１×１０１４ＶＰ／用量、約１×１０６ＶＰ～約１×１０１２ＶＰ／用量、約１×１０６ＶＰ～約１×１０１０ＶＰ／用量、約１×１０６ＶＰ～約１×１０８ＶＰ／用量、又は約１×１０６ＶＰ～約１×１０７ＶＰ／用量の投与量で投与される。
いくつかの実施形態では、組換えＡｄ２６ウイルスを含む組成物は、約１×１０１０ＩＦＵ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＡｄ２６ウイルスを含む組成物は、約１×１０１１ＩＦＵ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＡｄ２６ウイルスを含む組成物は、約１×１０１０ＶＰ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＡｄ２６ウイルスを含む組成物は、約１×１０１１ＶＰ／用量で投与される。
いくつかの実施形態では、組換えＧＡｄ２０ウイルスを含む組成物は、約１×１０８ＩＦＵ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＧＡｄ２０ウイルスを含む組成物は、約１×１０１０ＩＦＵ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＧＡｄ２０ウイルスを含む組成物は、約１×１０１０ＶＰ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＧＡｄ２０ウイルスを含む組成物は、約１×１０１１ＶＰ／用量で投与される。
いくつかの実施形態では、組換えポックスウイルスを含む組成物は、約１×１０４ＩＦＵ（感染単位）～約１×１０１２ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０１１ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０１０ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０９ＩＦＵ／用量、約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０８ＩＦＵ／用量、又は約１×１０４ＩＦＵ～約１×１０６ＩＦＵ／用量の投与量で投与される。
いくつかの実施形態では、組換えＭＶＡウイルスを含む組成物は、約１×１０８ＩＦＵ／用量で投与される。いくつかの実施形態では、組換えＭＶＡウイルスを含む組成物は、約１×１０１０ＩＦＵ／用量で投与される。
いくつかの実施形態では、自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物は、約１マイクログラム～約１００マイクログラム、約１マイクログラム～約９０マイクログラム、約１マイクログラム～約８０マイクログラム、約１マイクログラム～約７０マイクログラム、約１マイクログラム～約６０マイクログラム、約１マイクログラム～約５０マイクログラム、約１マイクログラム～約４０マイクログラム、約１マイクログラム～約３０マイクログラム、約１マイクログラム～約２０マイクログラム、約１マイクログラム～約１０マイクログラム、又は約１マイクログラム～約５マイクログラムの自己複製ＲＮＡ分子の投与量で投与される。
１つの例示的なレジメンでは、アデノウイルスを含む組成物を、約１０４～１０１２個のウイルス粒子／ｍＬの濃度を含有する、約１００μＬ～約１０ｍＬの範囲の体積で（例えば、筋肉内に）投与する。アデノウイルスベクターは、０．２５～１．０ｍＬの範囲の体積、例えば０．５ｍＬの体積で投与してよい。
アデノウイルスは、１回の投与中に、約１０９～約１０１２個のウイルス粒子（ｖｐ）の量で、より典型的には約１０１０～約１０１２個のｖｐ量で、ヒト対象に投与され得る。
１つの例示的なレジメンでは、本開示のｒＭＶＡウイルスを含む組成物を、約１×１０７ＴＣＩＤ５０～１×１０９ＴＣＩＤ５０（５０％組織培養感染量）又はＩｎｆ．Ｕ．（感染単位）の用量を含有する、約１００μＬ～約１０ｍＬの範囲の体積の生理食塩水で（例えば、筋肉内に）投与する。ｒＭＶＡウイルスは０．２５～１．０ｍＬの範囲の体積で投与してもよい。組成物は、第１の組成物の第１の投与の数週間又は数か月後、例えば、第１の免疫組成物の投与の約１又は２週間、又は３週間、又は４週間、又は６週間、又は８週間、又は１２週間、又は１６週間、又は２０週間、又は２４週間、又は２８週間、又は３２週間、又は１～２年間後に２回以上投与してよい。組成物の追加投与を、追加免疫工程（ｂ）の６週間～５年間後、例えば、最初の追加免疫接種の６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、若しくは２５週間、又は７、８、９、１０、１１、若しくは１２か月、又は２、３、４、若しくは５年後に投与してもよい。任意選択で、更なる投与工程（ｃ）を必要に応じて１回以上繰り返すことができる。
併用療法
本開示のワクチン及び組成物は、卵巣癌を治療するための少なくとも１つの追加の癌治療剤と組み合わせて使用してもよい。
追加の癌治療剤は、手術、放射線療法、化学療法、ホルモン療法、標的療法、チェックポイント阻害剤、抗生物質、免疫刺激剤、若しくは細胞療法、又はこれらの任意の組合せであり得る。
手術としては、腹式子宮全摘出術、両側付属器切除術、大網切除術、全腹膜面の可視化、及びランダムな腹膜生検と腹膜洗浄、又はこれらの組合せが挙げられ得る。
例示的な化学療法剤としては、プラチナ剤（例えば、カルボプラチン、シスプラチン、オキサリプラチン）、アルキル化剤；ニトロソウレア；代謝拮抗薬；抗腫瘍性抗生物質；植物アルキロイド；タキサン（例えば、パクリタキセル、ドセタキセル）；ホルモン剤、ブスルファン、クロラムブシル、シクロホスファミド、ダカルバジン、イホスファミド、塩酸メクロレタミン、メルファラン、プロカルバジン、チオテパ、ウラシルマスタード、５－フルオロウラシル、６－メルカプトプリン、カペシタビン、シトシンアラビノシド、フロクスウリジン、フルダラビン、ゲムシタビン、メトトレキサート、チオグアニン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、イダルビシン、マイトマイシン－Ｃ及びミトキサントロン、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビノレルビン、アルブミン結合パクリタキセル（ｎａｂ－パクリタキセル、Ａｂｒａｘａｎｅ（登録商標））、アルトレタミン（Ｈｅｘａｌｅｎ（登録商標））、エトポシド（ＶＰ－１６）、イリノテカン（ＣＰＴ－１１、Ｃａｍｐｔｏｓａｒ（登録商標））、リポソーマルドキソルビシン（Ｄｏｘｉｌ（登録商標））、ペメトレキセド（Ａｌｉｍｔａ（登録商標））、並びにトポテカン、又はこれらの組合せが挙げられるが、これらに限定されない。例示的なホルモン療法としては、黄体形成ホルモン放出ホルモン（ＬＨＲＨ）アゴニスト、タモキシフェン及びアロマターゼ阻害剤ＦＥＭＡＲＡ（登録商標）（レトロゾール）、ＡＲＩＭＩＤＥＸ（登録商標）（アナストロゾール）、及びＡＲＯＭＡＳＩＮ（登録商標）（エキセメスタン）が挙げられる。
いくつかの実施形態では、化学療法剤は、プラチナ剤及びタキサンを含む。
いくつかの実施形態では、化学療法剤は、カルボプラチン及びパクリタキセルを含む。
いくつかの実施形態では、化学療法剤は、シスプラチン及びパクリタキセルを含む。
いくつかの実施形態では、化学療法は、静脈内（ＩＶ）化学療法及び／又は腹腔内（ＩＰ）化学療法を含む。
いくつかの実施形態では、化学療法は、ドースデンス化学療法を含む。非限定的な例として、化学療法は、３週間毎にＩＶカルボプラチンと併用して、毎週のＩＶドーズデンスパクリタキセル（例えば、８０ｍｇ／ｍ２）を含み得る。
放射線療法は、外部照射療法、内部放射線療法、インプラント放射線、定位放射線手術、全身放射線療法、放射線療法、及び永久的又は一時的な間質近接照射療法を含む、様々な方法を使用して投与され得る。外部照射療法は、照射野が設計されている三次元原体照射療法、局所放射線（例えば、予め選択された標的又は器官を対象とする放射線）、又は集束放射線を含む。集中放射線は、定位放射線手術、分割定位放射線手術、又は強度変調放射線療法から選択され得る。集束放射線は、放射線源として、粒子ビーム（プロトン）、コバルト－６０（光子）直線加速器（Ｘ線）を有し得る（例えば、国際公開第２０１２／１７７６２４号を参照されたい）。「近接照射療法」は、腫瘍又は他の増殖性組織疾患部位又はその付近で体内に挿入された空間的に閉じ込められた放射性材料によって送達される放射線療法を指し、放射性同位体（例えば、Ａｔ－２１１、Ｉ－１３１、Ｉ－１２５、Ｙ－９０、Ｒｅ－１８６、Ｒｅ－１８８、Ｓｍ－１５３、Ｂｉ－２１２、Ｐ－３２、及びＬｕ放射性同位体）への曝露を含む。細胞コンディショナとして使用するのに好適な放射線源は、固体と液体との両方を含む。放射線源は、固体源としてのＩ－１２５、Ｉ－１３１、Ｙｂ－１６９、Ｉｒ－１９２、固体源としてのＩ－１２５などの放射性核種、又は光子、ベータ粒子、ガンマ線、若しくは他の治療用光線を放出する他の放射性核種であり得る。放射性材料はまた、放射性核種の任意の溶液、例えばＩ－１２５若しくはＩ－１３１の溶液から作製された流体であってもよく、又はＡｕ－１９８、Ｙ－９０などの固体放射性核種の小粒子を含有する好適な流体のスラリーを使用して、放射性流体を生成することができる。放射性核種は、ゲル又は放射性ミクロスフィア中で具現化されてもよい。放射性流体は腹膜に導入され得る。
標的療法としては、ベバシズマブ（AVASTIN）（登録商標）、ペンブロリズマブ、カツマキソマブ、セツキシマブなどのモノクローナル抗体療法；スニチニブ、ソラフェニブ、パゾパニブ、セジラニブ、カボザンチニブ、エルロチニブ、ゲフィチニブ、及びニンテダニブ（ＢＩＢＦ１１２０）などのチロシンキナーゼ阻害剤；オラパリブ（Ｌｙｎｐａｒｚａ）、ルカパリブ（Ｒｕｂｒａｃａ）、及びニラパリブ（Ｚｅｊｕｌａ）などのポリ（ＡＤＰ－リボース）ポリメラーゼ（ＰＡＲＰ）阻害剤；並びに、アフリベルセプト及びトレバナニブ（ＡＭＧ３８６）などの他のアンジオンジェネシス（angiongenesis）阻害剤が挙げられるが、これらに限定されない。
追加の癌治療剤はまた、ＢＲＣＡ１標的化マイクロＲＮＡなどの遺伝療法も含み得る。
例示的なチェックポイント阻害剤は、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１、ＰＤ－Ｌ２、ＶＩＳＴＡ、ＢＴＮＬ２、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、ＨＶＥＭ、ＨＨＬＡ２、ＣＴＬＡ－４、ＬＡＧ－３、ＴＩＭ－３、ＢＴＬＡ、ＣＤ１６０、ＣＥＡＣＡＭ－１、ＬＡＩＲ１、ＴＧＦβ、ＩＬ－１０、Ｓｉｇｌｅｃファミリータンパク質、ＫＩＲ、ＣＤ９６、ＴＩＧＩＴ、ＮＫＧ２Ａ、ＣＤ１１２、ＣＤ４７、ＳＩＲＰＡ、又はＣＤ２４４のアンタゴニストである。「アンタゴニスト」とは、細胞タンパク質に結合したとき、該タンパク質の天然のリガンドによって誘導される少なくとも１つの反応又は活性を抑制する分子を指す。少なくとも１つの反応若しくは活性が、アンタゴニストの非存在下（例えば、陰性対照）で抑制される少なくとも１つの反応若しくは活性よりも少なくとも約３０％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、若しくは１００％多く抑制された場合、又はアンタゴニストの非存在下における抑制と比較して抑制が統計的に有意である場合、その分子はアンタゴニストである。アンタゴニストは、抗体、可溶性リガンド、低分子、ＤＮＡ、又はｓｉＲＮＡなどのＲＮＡであってよい。チェックポイント阻害剤の例示的なアンタゴニストは、米国特許出願公開第２０１７／０１２１４０９号に記載されている。
いくつかの実施形態では、本開示の１つ以上のワクチン又は組成物は、ＣＴＬＡ－４抗体、ＣＴＬＡ４リガンド、ＰＤ－１軸阻害剤、ＰＤ－Ｌ１軸阻害剤、ＴＬＲアゴニスト、ＣＤ４０アゴニスト、ＯＸ４０アゴニスト、ヒドロキシウレア、ルキソリチニブ、フェドラチニブ、４１ＢＢアゴニスト、ＣＤ２８アゴニスト、ＳＴＩＮＧアゴニスト、ＲＩＧ－１アゴニスト、ＴＣＲ－Ｔ療法、ＣＡＲ－Ｔ療法、ＦＬＴ３リガンド、硫酸アルミニウム、ＢＴＫ阻害剤、ＣＤ３８抗体、ＣＤＫ阻害剤、ＣＤ３３抗体、ＣＤ３７抗体、ＣＤ２５抗体、ＧＭ－ＣＳＦ阻害剤、ＩＬ－２、ＩＬ－１５、ＩＬ－７、ＣＤ３リダイレクション分子、ポマリミブ、ＩＦＮγ、ＩＦＮα、ＴＮＦα、ＶＥＧＦ抗体、ＣＤ７０抗体、ＣＤ２７抗体、ＢＣＭＡ抗体、若しくはＧＰＲＣ５Ｄ抗体、又はこれらの任意の組合せと併用して投与される。
いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、イピリムマブ、セトレリマブ、ペンブロリズマブ、ニボルマブ、シンチリマブ、セミプリマブ、トリパリマブ、カムレリズマブ、チスレリズマブ、ドストラリマブ、スパルタリズマブ、プロルゴリマブ、ＡＫ－１０５、ＨＬＸ－１０、バルスチリマブ、ＭＥＤＩ－０６８０、ＨＸ－００８、ＧＬＳ－０１０、ＢＩ－７５４０９１、ゲノリムズマブ、ＡＫ－１０４、ＭＧＡ－０１２、Ｆ－５２０、６０９Ａ、ＬＹ－３４３４１７２、ＡＭＧ－４０４、ＳＬ－２７９２５２、ＳＣＴ－Ｉ１０Ａ、ＲＯ－７１２１６６１、ＩＣＴＣＡＲ－０１４、ＭＥＤＩ－５７５２、ＣＳ－１００３、ＸｍＡｂ－２３１０４、Ｓｙｍ－０２１、ＬＺＭ－００９、ｈＡＢ２１、ＢＡＴ－１３０６、ＭＧＤ－０１９、ＪＴＸ－４０１４、ブジガリマブ、ＸｍＡｂ－２０７１７、ＡＫ－１０３、ＭＧＤ－０１３、ＩＢＩ－３１８、ササンリマブ、ＣＣ－９０００６、アベルマブ、アテゾリズマブ、デュルバルマブ、ＣＳ－１００１、ビントラフスプアルファ、エンバホリマブ、ＣＸ－０７２、ＧＥＮ－１０４６、ＧＳ－４２２４、ＫＬ－Ａ１６７、ＢＧＢ－Ａ３３３、ＳＨＲ－１３１６、ＣＢＴ－５０２、ＩＬ－１０３、ＫＮ－０４６、ＺＫＡＢ－００１、ＣＡ－１７０、ＴＧ＿１５０１、ＬＰ－００２、ＩＮＣＢ－８６５５０、ＡＤＧ－１０４、ＳＨＲ－１７０１、ＢＣＤ－１３５、ＩＭＣ－００１、ＭＳＢ－２３１１、ＦＰＴ－１５５、ＦＡＺ－０５３、ＨＬＸ－２０、ヨーダポリマブ、ＦＳ－１１８、ＢＭＳ－９８６１８９、ＡＫ－１０６、ＭＣＬＡ－１４５、ＩＢＩ－３１８、若しくはＣＫ－３０１、又はこれらの任意の組合せである。
いくつかの実施形態では、本開示の１つ以上のワクチン又は組成物は、イピリムマブ、セトレリマブ、ペンブロリズマブ、ニボルマブ、シンチリマブ．セミプリマブ、トリパリマブ、カムレリズマブ、チスレリズマブ、ドストラリマブ、スパルタリズマブ、プロルゴリマブ、バルスチリマブ、ブジガリマブ、ササンリマブ、アベルマブ、アテゾリズマブ、デュルバルマブ、エンバホリマブ、若しくはヨーダポリマブ、又はこれらの任意の組合せと併用して投与される。
いくつかの実施形態では、第２の治療剤は、第１の投与の第１の組成物、又は第２の投与の第２の組成物、又は第３の投与の第３の組成物、又は第４の投与の第４の組成物と併用して投与され得る。
いくつかの実施形態では、抗ＣＴＬＡ－４抗体は、本開示の組成物の第１、又は第２、又は第３、又は第４の投与のいずれかと組み合わされる。いくつかの実施形態では、抗ＰＤ－１又は抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、本開示の組成物の第１、又は第２、又は第３、又は第４の投与のいずれかと組み合わされる。
いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、約０．５～約５ｍｇ／ｋｇ、約５～約１０ｍｇ／ｋｇ、約１０～約１５ｍｇ／ｋｇ、約１５～約２０ｍｇ／ｋｇ、約２０～約２５ｍｇ／ｋｇ、約２０～約５０ｍｇ／ｋｇ、約２５～約５０ｍｇ／ｋｇ、約５０～約７５ｍｇ／ｋｇ、約５０～約１００ｍｇ／ｋｇ、約７５～約１００ｍｇ／ｋｇ、約１００～約１２５ｍｇ／ｋｇ、約１２５～約１５０ｍｇ／ｋｇ、約１５０～約１７５ｍｇ／ｋｇ、約１７５～約２００ｍｇ／ｋｇ、約２００～約２２５ｍｇ／ｋｇ、約２２５～約２５０ｍｇ／ｋｇ、又は約２５０～約３００ｍｇ／ｋｇの用量で投与される。
本明細書にて開示した実施形態のいくつかを更に説明するために、以下の実施例を提供する。これらの実施例は、例示を目的とするものであって、本開示の実施形態を制限するものではない。
実施例１：バイオインフォマティクスによるネオ抗原の同定
新規ペプチド配列の生成、イントロン保持、選択的にスプライシングされたバリアント、発生的にサイレンシングされた遺伝子の異常発現、又は点変異をもたらす遺伝子融合事象から生じた共通の癌ネオ抗原を同定するために、バイオインフォマティクス手段によって様々な癌ＲＮＡ－ｓｅｑデータセットを分析するためのコンピュテーショナルフレームワークを開発した。
検索したデータセットは、以下の通りであった：
・ Ｇｅｎｏｔｙｐｅ－Ｔｉｓｓｕｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ（ＧＴＥｘ）Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ。このデータセットは、４９個の正常組織からの６１３７個のＲＮＡ－ｓｅｑデータセットを包含し、正常組織におけるＲＮＡのフィーチャーをアノテーションし、正常組織における潜在的な卵巣癌ネオ抗原候補の頻度を評価するために使用した。
・ 免疫細胞型特異的ＲＮＡ－ｓｅｑデータセット。この内部研究は、５体の健康なドナーに由来する２０種の免疫細胞型（Ｔ細胞、Ｂ細胞、ＮＫ細胞、及び骨髄細胞型）から得られた１１０の個ＲＮＡ－ｓｅｑデータセットからなる。
・ ＴＣＧＡ卵巣癌。この研究は、局所的卵巣癌を有する治療未経験患者から得られた３３０個のＲＮＡ－ｓｅｑデータセットからなる。
・ 内部卵巣癌研究。この研究は、局所的卵巣癌を有する患者から得られた４３個のＲＮＡ－ｓｅｑデータセットからなる。
分析前に生データのクオリティコントロール（ＱＣ）を実施した。まず、シーケンシングリードをトリミングしてＩｌｌｕｍｉｎａのアダプター配列を除去し、ヒトｔＲＮＡ及びｒＲＮＡにマッピングされたリードを、下流分析から除去した。リードでは、両端の低品質なベースコール（Ｐｈｒｅｄクオリティスコア１０未満；１０分の１の塩基が誤っていることを示す）もトリミングした。２５塩基対（ｂｐ）未満のトリミングされたリードをデータセットから除去した。加えて、続くＱＣ工程は、クオリティの低いリードを除去すると見なされた：最高塩基クオリティスコアが１５未満であるリードを除去し、平均塩基クオリティスコアが１０未満であるリードを除去し、ｐｏｌｙＡＴＣＧレートが８０％超であるリードを除去し、２つのリードのうちの１つが失敗したＲＮＡ配列を除去する。
リードは後ほど、ＡｒｒａｙＳｔｕｄｉｏ（（ｈｔｔｐｓ＿／／ｗｗｗ＿ｏｍｉｃｓｏｆｔ＿ｃｏｍ／ａｒｒａｙ－ｓｔｕｄｉｏ／）プラットフォームを用いてＨｕｍａｎ Ｇｅｎｏｍｅ Ｂｕｉｌｄ ３８にマッピングした。ＮＣＢＩのＲｅｆｓｅｑ遺伝子モデル（２０１７年６月６日リリース）を使用して、リードをヒトゲノムの既知のエキソン領域にマッピングした。
遺伝子融合事象の同定
ＦｕｓｉｏｎＭａｐアルゴリズムを使用して、上記の癌データセットにおける遺伝子融合事象を同定した。Ｇｅ Ｈ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．２０１１；２７（１４）：１９２２－８．を参照されたく、全ての目的のためその全体は参照により本明細書に援用される。ＦｕｓｉｏｎＭａｐは、シーケンシングリードの中央領域に融合位置を含むリードに基づいて融合接合部を検出した。これに続いて、シードリードのコンセンサスから可能な融合接合部を検索した。ＦｕｓｉｏｎＭａｐは疑似融合ライブラリに基づいて参照インデックスを構築し、この疑似参照にマッピングされていない潜在的な融合リードをアラインメントさせる。この工程中にマッピングされたリードはレスキューリードと見なされた。
このアルゴリズムは、図１に示されるようなキメラリードスルー融合体と、図２に示されるような染色体転座から生じる遺伝子融合事象との両方を同定した。以下の基準を満たした場合、遺伝子融合事象をＲＮＡ－ｓｅｑデータセットで呼び出した：ゲノムにおけるマッピング位置が異なる少なくとも２つのシードリード、融合接合部をサポートする少なくとも４つのシード及びレスキューリード、並びにリード対にまたがる少なくとも１つの接合部。高い配列類似性を共有する遺伝子対に由来する遺伝子融合事象（オルソログ及びタンパク質ファミリー）は、下流分析から無視された。
遺伝子融合事象に由来する共有ネオ抗原は、以下の基準を用いて同定された：疾患コホートにおける遺伝子融合事象の発生率は５％超（内部卵巣癌データセットについて１０％）であるべきであり、遺伝子融合事象の発生は、寛大な基準（少なくとも２つのシードリード及びリードにまたがる１つの接合部）を用いてＧＴＥｘ全体で１％未満とし、遺伝子融合事象の発生は、正常な免疫細胞型に由来する２個以下のＲＮＡ－ｓｅｑデータセットであるとした。遺伝子Ａ（図１及び図２）からのオープンリーディングフレームを使用して、同定された新規接合部に由来するタンパク質配列を得た。
スプライスバリアントの同定
ペアエンドＲＮＡ－ｓｅｑデータを分析して選択的スプライシング事象から生じる潜在的なネオ抗原を同定するために、カスタムバイオインフォマティックプロセスを開発した。開発されたプロセスを利用して、図３に示す通り、選択的５’又は３’スプライス部位、保持されたイントロン、除外されたエキソン、選択的終止、又は新規カセットの挿入を有するスプライスバリアントを同定した。プロセスは、次の２つの主要な機能を介してＮＣＢＩのＲｅｆＳｅｑ遺伝子モデルには存在しなかったスプライスバリアントを同定した：（１）５塩基対を超えるアラインメントギャップ及びギャップの各側にアラインメントされた１５塩基対を超える以上のアラインメントギャップを有するシーケンシングリードに基づく、新規接合部の同定（以後スプリットマッピングされたリードと称される）。各ＲＮＡ－ｓｅｑデータセットについて、新規接合部は、それらが少なくとも５個のスプリットマッピングされたリード及び、１対の接合部にわたるリードによってサポートされていた場合に呼び出された：（２）アラインメントされたリードのアイランドの同定（以後、カバレッジアイランドと称される）。図４は、アプローチの模式図を示す。
ゲノムＤＮＡ及びプレｍＲＮＡがノイズに対する潜在的な寄与である、各試料におけるシグナル対ノイズ比を評価するために、２００個の高度に発現したハウスキーピング遺伝子のセットから２つのパラメータを計算した。
１．イントロンのカバレッジ深度（ＩＤＣ）：全ハウスキーピングイントロン塩基についての９０パーセンタイルのカバレッジ深度。特定の領域のカバレッジがこの値を下回った場合、これが生じた第１の塩基をカバレッジアイランド境界として定義した。
２．イントロン／エキソンカバレッジ比率（ＩＥＣＲ）：イントロンカバレッジの中央値と、全ハウスキーピング遺伝子イントロンの最近接上流エキソンのカバレッジの中央値との比の９０パーセンタイル
以下の基準を使用して様々なスプライスバリアントを分類した。
選択的３’／５’スプライス部位の同定：
－ 新規スプライス部位境界はスプリットマッピングされたリードにより定義した。
－ スプライス部位を用いて得られたイントロン領域（適用可能な場合）はＩＥＣＲを超え、領域全体はＩＤＣを超えていた。
新規カセットの同定：
－ スプリットマッピングされたリードによって定義されるイントロン領域内の２つの新規スプライス部位。
－ ２つのスプライス部位間の領域はＩＥＣＲを超え、領域全体はＩＤＣを超えていた。
イントロン保持の同定：
－ イントロン領域はＩＥＣＲを超え、領域全体はＩＤＣを超えていた。
－ 少なくとも５つのリードが、イントロン－エキソン境界の両方にまたがり、境界の各側に少なくとも１５ｂｐがアラインメントされる。
選択的終止の同定：
－ ３’境界は、カノニカルエキソンの３’末端の６０ｂｐ以内に収まらなかったカバレッジアイランドの縁部として定義される。
－ カノニカルエキソンの５’末端と３’境界との間の任意のイントロン領域はＩＥＣＲを超え、領域全体はＩＤＣを超えていた。
エキソン排除の同定：
－ １つ以上のカノニカルエキソンがスキップされた、スプリットマッピングされたリードによって定義された新規接合部
異常なスプライシング事象に由来する共有ネオ抗原は、以下の基準を用いて同定された：疾患コホートにおけるスプライシング事象の発生率は５％超（内部卵巣癌データセットについて１０％）であり、スプライシング事象の発生は、寛大な基準（少なくとも２つのスプリットマッピングされたリード）を用いてＧＴＥｘ全体で１％未満とし、スプライシング事象は、正常な免疫細胞型に由来する２個以下のＲＮＡ－ｓｅｑデータセットで存在するとした。エキソン排除、新規カセット、及び選択的３’／５’スプライス部位について、事象は、マッピングリード１００万当たりのスプリットマッピングされたリード数（ＣＰＭ）の中央値≧０．０５、及びスプライスインパーセント（ＰＳＩ）の中央値≧０．１を有し、以下の式を用いて計算された：
Figure 2023514566000005
 異常にスプライシングされた遺伝子が疾患コホート対健康組織の差次的遺伝子発現分析において２倍アップレギュレートされることが見出された場合、０．０５≧ＰＳＩ≧０．１の中央値である事象を選択した。選択的終止及び保持イントロンでは、事象は、スプリットマッピングされたＣＰＭ≧０．１の中央値数、及びＰＳＩ＞０．５の中央値を有する必要があった。遺伝子ＭＵＣ１６及びＮＲ２Ｆ２に由来するネオ抗原は、スプリットマッピングされたＣＰＭ及びＰＳＩ値の中央値に関係なく含まれた。
アイソフォーム予測及び翻訳：
選択的にスプライシングされたネオ抗原を含有するアイソフォームを組み立てるために、新規のスプライシングされた特徴に隣接するカノニカルエキソンを、スプリットマッピングされたリードを用いて同定した。予測ネオエピトープを潜在的に含有し得た最も高度に発現されたアイソフォームは、適切なオープンリーディングフレームの選択により、対応するタンパク質への翻訳のために選択された。タンパク質配列のネオ抗原部分を抽出し、最初の変化したアミノ酸の上流に追加の８個のアミノ酸残基により連結した。次いで、このタンパク質配列を、その後の検証研究に使用した。
ＤＮＡ変異及びフレームシフトベースのネオ抗原の同定
卵巣癌の患者からエキソームシーケンシングデータを含有する癌ゲノムアトラス（Ｔｈｅ Ｃａｎｃｅｒ Ｇｅｎｏｍｅ Ａｔｌａｓ：ＴＣＧＡ）コンソーシアムによって生成されたデータセットを調べた。Ｂｅｒｇｅｒ Ａ．Ｃ．ｅｔ．ａｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｌｌ ２０１８，；３３（４）６９０－７０５を参照されたく、全ての目的のためその全体は参照により本明細書に援用される。このデータセットを生成したコンソーシアムによって公開された変異コールをダウンロードし、患者集団の１０％超に又は癌の決定的なドライバであることが知られている遺伝子内に存在していた遺伝子変異を同定した。選択された各単一点変異について、その中心に変異したアミノ酸を有する１７ｍｅｒペプチドを、更なる検証研究のために同定した。
表３は、遺伝子の起源、及び遺伝子融合（ＦＵＳ）事象から生じた、同定されたネオ抗原のアミノ酸配列を示す。表３では、太字は遺伝子１のカノニカルアミノ酸を示す。イタリック体は、インフレーム遺伝子融合事象に対する遺伝子２からのカノニカルアミノ酸を示す。太字でない文字は、アウト・オブ・フレームの遺伝子融合事象から生成された新規アミノ酸配列を示す。表４は、これらに対応するポリヌクレオチド配列を示す。表５は、各遺伝子融合を形成するために融合した遺伝子の長い形式の名前を列挙する。
Figure 2023514566000006
Figure 2023514566000007
Figure 2023514566000008
Figure 2023514566000009
表６は、遺伝子の起源、及び選択的スプライシング（ＡＳ）事象から生じた、同定されたネオ抗原のアミノ酸配列を示す。太字は野生型タンパク質の配列を表し、通常の文字は選択的スプライシング事象に起因する突然変異配列を表す。表７は、これらに対応するポリヌクレオチド配列を示す。表８は、各遺伝子の長い形式の名前及び選択的スプライシング事象のゲノム座標を示す。
Figure 2023514566000010
Figure 2023514566000011
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Figure 2023514566000022
Figure 2023514566000023
Figure 2023514566000024
Figure 2023514566000025
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Figure 2023514566000027
Figure 2023514566000028
Figure 2023514566000029
Figure 2023514566000030
表９は、遺伝子の起源、遺伝子フルネーム、突然変異、及び点変異事象（Ｍ）から生じた、同定されたネオ抗原のアミノ酸配列を示す。点変異は太字で示されている。表１０は、これらに対応するポリヌクレオチド配列を示す。点変異は太字で示され、変異残基のコドンには下線が引かれている。
Figure 2023514566000031
Figure 2023514566000032
実施例２：腫瘍及び正常組織における卵巣癌ネオ抗原の定量的ＰＣＲ分析
卵巣癌（ＯＶ）ネオ抗原候補を、以下の試料におけるそれらの発現について試験した：
・ 卵巣癌患者からの８０個の原発性腫瘍切除。
・ ３体の健康なドナー由来の選別された免疫細胞（Ｂ細胞、プラズマ細胞、Ｔ細胞、ＰＢＭＣ、及び単球）並びに
・ １７体の健康なドナー由来の組織（肝臓、腎臓、膵臓、乳腺、結腸、胃、骨格筋、肺、卵巣、胎盤、小腸、脊髄、子宮、脾臓、脳、心臓、及び膀胱）。
定量的ＰＣＲプライマは、Ｐｒｉｍｅｒ Ｅｘｐｒｅｓｓソフトウェア（バージョン３．０．１）を用いてブレイクポイント接合部配列にまたがるように設計された。６０℃がＴｍ、ＧＣ含有量が３０～８０％、及び安定な二次構造を形成する可能性が低いプライマを発現分析のために選択した。
これらの試料からのＲＮＡを、製造元のプロトコルに従ってＱｉａｇｅｎ ＲＮＡ単離キット（＃４３００９８０９４）を用いて単離した。相補的ＤＮＡライブラリは、高容量ｃＤＮＡ逆転写キット（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎパート＃１１９０４０１８）で提供されるオリゴｄＴプライマを用いて、２００ｎｇの全ＲＮＡから調製した。次に、ＴａｑＭａｎ事前増幅キット（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、＃４３８４２６７）を用いて、１５μＬの事前増幅混合物中において、１０回のＰＣＲサイクルで３～１０ｎｇのｃＤＮＡを事前増幅した。各試料について、入力ｃＤＮＡは、１３～１５Ｃｔ値の範囲内の内因性対照（ＲＰＬ１９、ＲＰＬ１３Ａ、ＧＡＰＤＨ、ＧＵＳＢ、ＰＧＫ１）のＣｔ値を維持するために予測された。試験対照遺伝子の中で、ＲＰＬ１９は、健康な組織間で最も一貫した発現を示した。最後に、事前増幅されたｃＤＮＡを５回希釈し、Ｆｌｕｉｄｉｇｍ Ｂｉｏｍａｒｋｔｈｅ（商標）ＨＤにロードし、４０サイクルのＰＣＲ増幅を行った。
ネオ抗原候補（Ｃｔ値）の発現は、内因性対照であるＲＰＬ１９に対して正規化した。ΔＣｔ＜１５のカットオフ値（約３２，０００の倍率変化）を使用して、生体試料中のネオ抗原候補の発現を決定した。全ての腫瘍制限ネオ抗原候補についての発現プロファイルの結果を、図５Ａ、図５Ｂ、図５Ｄ、及び図５Ｄの図に示す。対照試料及び腫瘍試料の両方で発現を有する抗原を、図６Ａ、図６Ｂ、図６Ｃ、及び図６Ｄに示す。
実施例３：ネオ抗原のインビトロ免疫原性評価
ネオ抗原の免疫原性を、外因性自家正常ドナー再刺激アッセイを用いて評価した。８０％を超える純度のＧｅｎＳｃｒｉｐｔによってペプチドを合成した。凍結乾燥させたペプチドを１００％ ＤＭＳＯに可溶化した。
ヒト健康ＰＢＭＣから単離されたＣＤ１ｃ＋樹状細胞（ＣＤ１ｃ＋ＤＣ）を、培地（グルタミン、ＨＥＰＥＳ、５％ヒト血清（Ｓｉｇｍａ）、及び１×Ｐｅｎ－Ｓｔｒｅｐを補給したＩＭＤＭ（Ｇｉｂｃｏ））を使用して解凍した。ＩＬ－４（Ｐｅｐｒｏｔｅｃｈ、２０ｎｇ／ｍＬ）及びＧＭ－ＣＳＦ（Ｇｉｂｃｏ、２０ｎｇ／ｍＬ）を補給した培地にＤＣ細胞を再懸濁させ、６ウェルマイクロプレートにプレーティングし、３７℃及び５％のＣＯ２インキュベータで一晩静置した。次の日、ＤＣ細胞を計数し、３０，０００生細胞／ウェルの濃度で９６ウェル丸底マイクロプレートにプレーティングした。凍結乾燥したネオ抗原ペプチドプール（８ｍｅｒ重複ペプチド配列を有する１５ｍｅｒペプチド）を、２０ｍｇ／ｍＬのＮｅｏ抗原ペプチドプールのストック濃度である１００％ＤＭＳＯ中に可溶化した。ネオ抗原ペプチドプールを１０μｇ／ｍＬの最終濃度でＤＣに添加し、３７℃及び５％のＣＯ２インキュベータで２時間静置した。ＣＥＦペプチドプール「Ｐｌｕｓ」（Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｌｔｄ．）を陽性対照（各ウイルスペプチドの最終濃度は４ｕｇ／ｍＬ）として利用し、実験ペプチドと同じ最終濃度（０．０５％）のＤＭＳＯを陰性対照として利用した。２時間後、ＤＣ細胞に５０グレイの電離放射線を照射した。ヒト正常ＰＢＭＣから単離された自家ＣＤ３＋汎Ｔ細胞を、培地を使用して解凍した。照射後、１ウェル当たり３００，０００個の生細胞で、照射されたＤＣに自家汎Ｔ細胞を添加した。ヒトＩＬ－１５（Ｐｅｐｒｏｔｅｃｈ）を最終濃度１０ｎｇ／ｍＬで全てのウェルに添加した。プレートを３７℃及び５％のＣＯ２インキュベータで合計１２日間インキュベートした。ＩＬ－１５（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍ、最終濃度１０ｎｇ／ｍＬ）及びＩＬ－２（Ｒ＆Ｄ ｓｙｓｔｅｍｓ、最終濃度１０ＩＵ／ｍＬ）を用いて、２～３日毎に培地を新しくした。
１１日目に、１日目のペプチド刺激と同じ濃度の同一の実験ペプチドプール又は対照で細胞を再刺激した。Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ Ｃｏｃｋｔａｉｌ（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）を全てのウェルに添加し、プレートを３７℃及び５％のＣＯ２インキュベータで１４～１６時間、一晩インキュベートした。１２日目に、表面及び細胞内フローサイトメトリー分析のために細胞を染色した。細胞をＰＢＳで洗浄し、Ｌｉｖｅ／Ｄｅａｄ Ｆｉｘａｂｌｅ Ａｑｕａ Ｄｅａｄ Ｃｅｌｌ ｓｔａｉｎ（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ）で染色した。生／死染色に続いて、Ｂｉｏｔｉｎ－Ｆｒｅｅ Ｆｃ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂｌｏｃｋｅｒ（Ａｃｃｕｒａｔｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ ＆ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｃｏｒｐ）を使用して細胞をブロッキングした。細胞外細胞流パネル（５０μＬ中１ウェル当たり１μＬ／抗体）は、ＣＤ３ ＰｅｒＣＰ－Ｃｙ５．５（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ）、ＣＤ４ ＢＶ４２１（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ）、及びＣＤ８ＡＰＣ－Ｃｙ７（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ）からなっていた。細胞外染色後、細胞を、Ｆｏｘｐ３／Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ Ｓｔａｉｎｉｎｇ Ｂｕｆｆｅｒ Ｓｅｔ（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）を用いて固定及び透過処理し、
ＴＮＦα ＦＩＴＣ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）及びＩＦＮγ ＢＶ７８５（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ）を用いて細胞内タンパク質（１：５０希釈）について染色した。細胞を洗浄し、染色緩衝液に再懸濁させ、ＢＤ Ｃｅｌｅｓｔａフローサイトメーターを使用して分析し、記録した。
フローサイトメトリー分析は、ＦｌｏｗＪｏ ｖ１０．６ソフトウェアで行った。細胞を、生細胞、シングレット細胞、ＣＤ３＋、ＣＤ４＋、及びＣＤ８＋ Ｔ細胞でゲーティングした。ＣＤ８＋及びＣＤ４＋Ｔ細胞をＴＮＦα及びＩＦＮγ発現について分析した。
以下の基準が満たされた場合、免疫原性応答は、ペプチドプールについて陽性と見なされた：
・ 実験用ペプチドプールで刺激した際の二重陽性ＴＮＦα／ＩＦＮγ ＣＤ８＋及び／又はＴＮＦα／ＩＦＮγ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の頻度は、ＤＭＳＯ対照の３倍以上であった。
・ 二重陽性ＴＮＦα／ＩＦＮγ ＣＤ８＋及び／又は二重陽性ＴＮＦα／ＩＦＮγ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の頻度は、少なくとも０．０１％であった。
ネオ抗原の免疫原性は、最初に９～１６体の健康なドナーで調査した。非反応性ネオ抗原は、７体の健康なドナーの新規コホートで更に試験された。ネオ抗原についての免疫原性データを表１１に要約する。図７Ａ及び図７Ｂは、ゲーティング戦略と、いくつかのネオ抗原について達成された免疫原性応答とを示す、代表的なドットプロットを示す。興味深いことに、ネオ抗原の大部分は、複数のドナーにおいて免疫原性応答を示した（図８、図９Ａ、及び図９Ｂ）。
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Figure 2023514566000034
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実施例４：ＨＬＡ結合予測
実施例１に記載の様々なアプローチを用いて同定されたネオ抗原のアミノ酸配列を、全ての可能な固有の連続する９ｍｅｒアミノ酸断片へと分割し、ｎｅｔＭＨＣｐａｎ４．０を用いてこれら９ｍｅｒの各々について、６つの共通ＨＬＡ対立遺伝子（ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ－Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４：０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０７：０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０８：０１）に対するＨＬＡの結合予測を実施する。試験したＨＬＡ対立遺伝子のうちの１つ以上に結合する可能性及び卵巣癌患者における有病率によるランキングに基づいて、更なる分析のためにいくつかの９ｍｅｒ断片を選択する。
実施例５：クラスＩ ＭＨＣへのネオ抗原のインビトロ結合
その断片の選択されたネオ抗原の、ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１、ＨＬＡ－Ａ＊０３：０１、ＨＬＡ－Ａ＊２４：０２、ＨＬＡ－Ｂ＊０７：０２、及びＨＬＡ－Ｂ＊０８：０１、又は任意の他のＨＬＡへの結合は、既知の方法を用いて評価される。
バイオインフォマティクス分析により同定された９ｍｅｒペプチドを、６つの共通ＨＬＡクラスＩ対立遺伝子（ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１、Ａ＊０２：０１、Ａ＊０３：０１、Ａ＊２４：０２、Ｂ＊０７：０２、Ｂ＊０８：０１）に対する結合の性質について分析する。方法の原理については以下に簡潔に記載するが、２つの部分からなっており、１つは、紫外線（ＵＶ）放射によって誘導される陽性対照へのペプチドの交換を伴い、２つ目は、安定なＨＬＡ－ペプチド及び空のＨＬＡ複合体を検出するための酵素イムノアッセイである。
ＨＬＡ結合ペプチドは、ＨＬＡ複合体の安定性にとって重要である。コンディショナルＨＬＡクラスＩ複合体は、各ＨＬＡ（Ｐｏｓ：ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１：ＣＴＥＬＫＬＳＤＹ（配列番号４０７）、ＨＬＡ－Ａ＊０２：０１：ＮＬＶＰＭＶＡＴＶ（配列番号４０８），ＨＬＡ－Ａ＊０３：０１：ＬＩＹＲＲＲＬＭＫ（配列番号４０９）、ＨＬＡ－Ａ＊２４：０２：ＬＹＳＡＣＦＷＷＬ（配列番号４１０）、ＨＬＡ－Ｂ＊０７：０２：ＮＰＫＡＳＬＬＳＬ（配列番号４１１）、ＨＬＡ－Ｂ＊０８：０１：ＥＬＲＳＲＹＷＡＩ（配列番号４１２））について、異なるペプチド（Ｐｏｓ）を利用するＵＶ不安定性ペプチドによって安定化される。これは、ＨＬＡ分子に結合した場合、ＵＶ照射によって切断される可能性があった。切断時に、得られたペプチド断片はＨＬＡクラスＩ複合体から解離するが、その理由は、安定的にＨＬＡに結合するのに不十分な長さになるためである。ペプチド切断を実施する条件（中性ｐＨ、溶けかけの氷上）下において、ペプチドを含まないＨＬＡ複合体は安定したままである。したがって、選択した別のＨＬＡクラスＩペプチドの存在下において切断を実施する場合、この反応により、切断されたＵＶ不安定性ペプチドＰｏｓと選択されたペプチドとの正味の交換が生じる（Ｒｏｄｅｎｋｏ，Ｂ ｅｔ ａｌ．（２００６）Ｎａｔｕｒｅ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ １：１１２０－３２，Ｔｏｅｂｅｓ，Ｍ ｅｔ ａｌ．（２００６）Ｎａｔ Ｍｅｄ １２：２４６－５１，Ｂａｋｋｅｒ，ＡＨ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １０５：３８２５－３０）。
目的のペプチドとＰｏｓとの間の交換効率を、ＨＬＡクラスＩ ＥＬＩＳＡを用いて分析する。技術を組み合わせることにより、潜在的に免疫原性である、目的のＨＬＡ分子のリガンドを同定することが可能になる。
交換対照ペプチドＰｏｓは、関連するＨＬＡクラスＩ対立遺伝子に対する高親和性結合剤であり、一方で、交換対照ペプチドＮｅｇは非結合剤である。ＵＶ対照は、レスキューペプチドの非存在下におけるコンディショナルＨＬＡクラスＩ複合体の紫外線照射を表している。交換対照ペプチドＮｅｇ（ＨＬＡ－Ａ＊０１：０１：ＮＰＫＡＳＬＬＳＬ（配列番号４１３）、ＨＬＡ－Ａ＊０２－０１：ＩＶＴＤＦＳＶＩＫ（配列番号４１４）、ＨＬＡ－Ａ＊０３：０１：ＮＰＫＡＳＬＬＳＬ（配列番号４１５）、ＨＬＡ－Ａ＊２４：０２：ＮＬＶＰＭＶＡＴＶ（配列番号４１６）、ＨＬＡ－Ｂ＊０７：０２：ＬＩＹＲＲＲＬＭＫ（配列番号４１７）、ＨＬＡ－Ｂ＊０８：０１：ＮＬＶＰＭＶＡＴＶ（配列番号４１８））、及び全ての実験ペプチドの結合を、交換対照ペプチドＰｏｓと比較して評価する。後者のペプチドの吸収は１００％に設定する。この手順により、使用したＨＬＡ対立遺伝子毎に異なる実験ペプチドの親和性を反映した様々な異なる交換率が得られる。
ＨＬＡクラスＩ ＥＬＩＳＡは、（ペプチド安定化）ＨＬＡクラスＩ複合体のβ２－ミクログロブリン（Ｂ２Ｍ）の検出に基づく酵素イムノアッセイである。この目的のために、ストレプトアビジンをポリスチレンマイクロタイターウェルに結合させる。洗浄及びブロッキング後、交換反応混合物又はＥＬＩＳＡ対照中に存在するＨＬＡ複合体を、そのビオチン化重鎖を介してマイクロタイタープレート上のストレプトアビジンによって捕捉する。非結合材料を洗浄により除去する。続いて、ヒトＢ２Ｍに対する西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）コンジュゲート抗体を添加する。ＨＲＰコンジュゲート抗体は、マイクロタイターウェル中に存在するインタクトなＨＬＡ複合体にのみ結合するが、その理由は、ペプチド交換が不成功であった結果、ＵＶ照射時に元のＵＶ感受性ＨＬＡ複合体が崩壊するためである。後者の場合、洗浄工程中にＢ２Ｍが除去される。洗浄により非結合ＨＲＰコンジュゲートを除去した後、基質溶液をウェルに添加する。試料中に存在するインタクトなＨＬＡ複合体の量に比例して、着色生成物が形成される。停止溶液の添加によって反応を終了させた後、マイクロタイタープレートリーダーで吸光度を測定する。交換対照ペプチドの吸光度（１００％を表す）に対して吸光度を正規化する。ＨＬＡクラスＩ分子に対して中～低の親和性を有するペプチドの準最適ＨＬＡ結合もまた、このＥＬＩＳＡ技術（Ｒｏｄｅｎｋｏ，Ｂ ｅｔ ａｌ．（２００６）Ｎａｔｕｒｅ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ １：１１２０－３２）により検出することができる。
試験したＨＬＡ対立遺伝子は、目的のペプチドが交換された対応する陽性対照（Ｐｏｓ）及び陰性対照（Ｎｅｇ）ペプチドを有する。Ｐｏｓとの交換率が１００％であることは、目的のペプチドのＨＬＡ対立遺伝子に対する結合親和性が、陽性対照ペプチドと同じであることを意味する。更なる評価のために検討した６つのＨＬＡ対立遺伝子のうちの少なくとも１つについて、対応するＰｏｓペプチドと少なくとも１０％の交換率を有するペプチド。より高い百分率は、ＨＬＡ対立遺伝子に対するより強力な結合に対応する。
実施形態
以下の実施形態のリストは、前述の説明に置き換え又は取って代わるものではなく、補完することを意図している。
実施形態１． ポリペプチドであって、配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のペプチドを含む、ポリペプチド。
実施形態２． ポリペプチドであって、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のペプチド配列を含む、ポリペプチド。
実施形態３． ポリペプチドであって、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片の２つ以上のタンデム反復を含む、ポリペプチド。
実施形態４． ポリペプチド配列が、任意の順序で互いに結合している、実施形態１～３のいずれか１つに記載のポリペプチド。
実施形態５． ポリペプチドが、
配列番号１の、又は配列番号１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３の、又は配列番号３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号５の、又は配列番号５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１１の、又は配列番号１１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１５の、又は配列番号１５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１７の、又は配列番号１７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１９の、又は配列番号１９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２１の、又は配列番号２１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２５の、又は配列番号２５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２９の、又は配列番号２９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３１の、又は配列番号３１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３３の、又は配列番号３３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３９の、又は配列番号３９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号４３の、又は配列番号４３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号４５の、又は配列番号４５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号４９の、又は配列番号４９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号５３の、又は配列番号５３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号５９の、又は配列番号５９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号６３の、又は配列番号６３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号６５の、又は配列番号６５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号６７の、又は配列番号６７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号８１の、又は配列番号８１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号８５の、又は配列番号８５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号８７の、又は配列番号８７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号８９の、又は配列番号８９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号９１の、又は配列番号９１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号９５の、又は配列番号９５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号９７の、又は配列番号９７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１１１の、又は配列番号１１１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１１３の、又は配列番号１１３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１１５の、又は配列番号１１５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１１９の、又は配列番号１１９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１２３の、又は配列番号１２３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１２７の、又は配列番号１２７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１２９の、又は配列番号１２９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１４５の、又は配列番号１４５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１７７の、又は配列番号１７７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１７９の、又は配列番号１７９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１８１の、又は配列番号１８１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１８５の、又は配列番号１８５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１８７の、又は配列番号１８７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１９１の、又は配列番号１９１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１９３の、又は配列番号１９３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１９５の、又は配列番号１９５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１９７の、又は配列番号１９７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号１９９の、又は配列番号１９９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２０１の、又は配列番号２０１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２０３の、又は配列番号２０３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２０５の、又は配列番号２０５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２０７の、又は配列番号２０７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２０９の、又は配列番号２０９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２１１の、又は配列番号２１１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２１５の、又は配列番号２１５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２１９の、又は配列番号２１９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２２１の、又は配列番号２２１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２２３の、又は配列番号２２３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２３５の、又は配列番号２３５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２３７の、又は配列番号２３７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２３９の、又は配列番号２３９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２４１の、又は配列番号２４１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２４３の、又は配列番号２４３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２４５の、又は配列番号２４５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２４７の、又は配列番号２４７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２５１の、又は配列番号２５１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２５５の、又は配列番号２５５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２５７の、又は配列番号２５７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２５９の、又は配列番号２５９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２６１の、又は配列番号２６１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２６３の、又は配列番号２６３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２６７の、又は配列番号２６７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２７１の、又は配列番号２７１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２７９の、又は配列番号２７９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２８１の、又は配列番号２８１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２８５の、又は配列番号２８５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２９３の、又は配列番号２９３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２９５の、又は配列番号２９５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号２９７の、又は配列番号２９７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３０１の、又は配列番号３０１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３０５の、又は配列番号３０５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３０７の、又は配列番号３０７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３０９の、又は配列番号３０９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３１９の、又は配列番号３１９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３２３の、又は配列番号３２３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３２５の、又は配列番号３２５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３３７の、又は配列番号３３７と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３３９の、又は配列番号３３９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３４３の、又は配列番号３４３と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３４５の、又は配列番号３４５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３４９の、又は配列番号３４９と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３７１の、又は配列番号３７１と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
配列番号３７５の、又は配列番号３７５と少なくとも９０％の配列同一性を有する、アミノ酸配列；
並びにこれらの組合せから選択される、実施例２に記載のポリペプチド。
実施形態６． 実施形態１～５のいずれか１つに記載のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド。
実施形態７． ポリヌクレオチドが、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片からなる群から選択される、実施形態６に記載のポリヌクレオチド。
実施形態８． 実施形態６又は実施形態７に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
実施形態９． ベクターが、アデノウイルスベクター、αウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、自己複製ＲＮＡ分子、及びこれらの組合せから選択される、実施形態８に記載のベクター。
実施形態１０． アデノウイルスベクターが、ｈＡｄ５、ｈＡｄ７、ｈＡｄ１１、ｈＡｄ２６、ｈＡｄ３４、ｈＡｄ３５、ｈＡｄ４８、ｈＡｄ４９、ｈＡｄ５０、ＧＡｄ２０、Ｇａｄ１９、ＧＡｄ２１、ＧＡｄ２５、ＧＡｄ２６、ＧＡｄ２７、ＧＡｄ２８、ＧＡｄ２９、ＧＡｄ３０、ＧＡｄ３１、ＣｈＡｄ３、ＣｈＡｄ４、ＣｈＡｄ５、ＣｈＡｄ６、ＣｈＡｄ７、ＣｈＡｄ８、ＣｈＡｄ９、ＣｈＡｄ１０、ＣｈＡｄ１１、ＣｈＡｄ１６、ＣｈＡｄＩ７、ＣｈＡｄ１９、ＣｈＡｄ２０、ＣｈＡｄ２２、ＣｈＡｄ２４、ＣｈＡｄ２６、ＣｈＡｄ３０、ＣｈＡｄ３１、ＣｈＡｄ３７、ＣｈＡｄ３８、ＣｈＡｄ４４、ＣｈＡｄ５５、ＣｈＡｄ６３、ＣｈＡｄ７３、ＣｈＡｄ８２、ＣｈＡｄ８３、ＣｈＡｄ１４６、ＣｈＡｄ１４７、ＰａｎＡｄ１、ＰａｎＡｄ２、及びＰａｎＡｄ３から選択される、実施形態９に記載のベクター。
実施形態１１． ポックスウイルスベクターが、天然痘ウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、牛痘ウイルスベクター、サル痘ウイルスベクター、コペンハーゲンワクシニアウイルス（Ｗ）ベクター、ニューヨーク弱毒化ワクシニアウイルス（ＮＹＶＡＣ）ベクター、及び改変ワクシニアアンカラ（ＭＶＡ）ベクターから選択される、実施形態９に記載のベクター。
実施形態１２． ベクターが、実施形態１～５のいずれか１つに記載のポリペプチドのうちいずれか１つをコードするポリヌクレオチドを含むアデノウイルスベクターである、実施形態９に記載のベクター。
実施形態１３． ベクターが、実施形態１～５のいずれか１つに記載のポリペプチドのうちいずれか１つをコードするポリヌクレオチドを含むポックスウイルスベクターである、実施形態９に記載のベクター。
実施形態１４． ベクターが、実施形態１～５のいずれか１つに記載のポリペプチドのうちいずれか１つをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子である、実施形態９に記載のベクター。
実施形態１５． 実施形態１～５のいずれか１つに記載のポリペプチドを含む、医薬組成物。
実施形態１６． 実施形態６及び７のいずれか１つに記載のポリヌクレオチドを含む、医薬組成物。
実施形態１７． 実施形態８～１４のいずれか１つに記載のベクターを含む、医薬組成物。
実施形態１８． ベクターが、Ａｄ２６ベクター、ＭＶＡベクター、ＧＡｄ２０ベクター、自己複製ＲＮＡ分子、及びこれらの組合せから選択される、実施形態１７に記載の医薬組成物。
実施形態１９． ベクターが、
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド又は
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、
を含むＡｄ２６ベクターである、実施形態１８に記載の医薬（pharmceutical）組成物。
実施形態２０． ベクターが、
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド
、を含むＧＡｄ２０ベクターである、実施形態１８に記載の医薬（pharmceutical）組成物。
実施形態２１． ベクターが、
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、
を含むＭＶＡベクターである、実施形態１８に記載の医薬（pharmceutical）組成物。
実施形態２２． ベクターが、
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、
を含む自己複製ＲＮＡ分子である、実施形態１８に記載の医薬（pharmceutical）組成物。
実施形態２３． 対象における免疫応答を誘導する方法であって、当該免疫応答を誘導することを必要とする当該対象に、実施形態１５～２２のいずれか１つに記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
実施形態２４． 対象における免疫応答を誘導する方法であって、当該免疫応答を誘導することを必要とする当該対象に、組換えウイルスを含む組成物及び／又は自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物を投与することを含み、当該組換えウイルス又は当該自己複製ＲＮＡ分子が、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド含む、方法。
実施形態２５． 当該対象が、請求項１に記載の１つ以上のポリペプチドを発現する、又は発現すると疑われる、実施形態２３又は２４に記載の方法。
実施形態２６． 対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法であって、当該卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを必要とする当該対象に、実施形態１５～２２のいずれか１つに記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
実施形態２７． 対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法であって、当該卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを必要とする当該対象に、組換えウイルスを含む組成物及び／又は自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物を投与することを含み、当該組換えウイルス又は当該自己複製ＲＮＡ分子が、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド含む、方法。
実施形態２８． 対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法であって、当該卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを必要とする当該対象に、組換えウイルスを含む組成物及び／又は自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物を投与することを含み、当該組換えウイルス又は当該自己複製ＲＮＡ分子が、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド含み、当該投与が、当該組成物の１回以上の投与を含む、方法。
実施形態２９． ウイルス又は組換えウイルスが、Ａｄ２６、ＭＶＡ、ＧＡｄ２０、及びこれらの組合せから選択される、実施形態２３～２８のいずれか１つに記載の方法。
実施形態３０． 組換えウイルスが、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むＡｄ２６ウイルスである、実施形態２９に記載の方法。
実施形態３１． 組換えウイルスが、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むＧＡｄ２０ウイルスである、実施形態２９に記載の方法。
実施形態３２． 組換えウイルスが、配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むＭＶＡウイルスである、実施形態２９に記載の方法。
実施形態３３． 配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子である、実施形態２９に記載の方法。
実施形態３４． １つ以上の治療サイクルを含み、各サイクルが、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第１の組成物を含む、第１の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第１の投与と、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第２の組成物を含む、第２の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第２の投与と、
を含む、実施形態２２～３３のいずれか１つに記載の方法。
実施形態３５． １つ以上の治療サイクルを含み、各サイクルが、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第１の組成物を含む、第１の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第１の投与と、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第２の組成物を含む、第２の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第２の投与と、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第３の組成物を含む、第３の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第３の投与と、
を含む、実施形態２２～３３のいずれか１つに記載の方法。
実施形態３６． １つ以上の治療サイクルを含み、各サイクルが、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、自己複製ＲＮＡ分子を含む第１の組成物を含む、第１の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第１の投与と、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子を含む第２の組成物を含む、第２の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択され、第２の投与と、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、自己複製ＲＮＡ分子を含む第３の組成物を含む、第３の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第３の投与と、
組換えウイルス、又は配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群からの１つ以上のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む、自己複製ＲＮＡ分子を含む第４の組成物を含む、第４の投与であって、組換えウイルスは、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択される、第４の投与と、
を含む、実施形態２２～３３のいずれか１つに記載の方法。
実施形態３７． 第１、第２、第３、又は第４の投与が、異なる組換えウイルスを含む、実施形態３４～３６の方法。
実施形態３８． 第１、第２、第３、又は第４の投与が、異なるアミノ酸配列のポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む組換えウイルスを含む、実施形態３４～３７に記載の方法。
実施形態３９． ＣＴＬＡ－４抗体、ＰＤ－１抗体、ＰＤ－Ｌ１抗体、ＴＬＲアゴニスト、ＣＤ４０アゴニスト、ＯＸ４０アゴニスト、ヒドロキシウレア、ルキソリチニブ、フェドラチニブ、４１ＢＢアゴニスト、ＣＤ２８アゴニスト、ＦＬＴ３リガンド、硫酸アルミニウム、ＢＴＫ阻害剤、ＪＡＫ阻害剤、ＣＤ３８抗体、ＣＤＫ阻害剤、ＣＤ３３抗体、ＣＤ３７抗体、ＣＤ２５抗体、ＧＭ－ＣＳＦ阻害剤、ＩＬ－２、ＩＬ－１５、ＩＬ－７、ＩＦＮγ、ＩＦＮα、ＴＮＦα、ＶＥＧＦ抗体、ＣＤ７０抗体、ＣＤ２７抗体、ＢＣＭＡ抗体、ＧＰＲＣ５Ｄ抗体、及びこれらの組合せから選択される、第２の治療剤を投与することを更に含む、実施形態２６～３８のいずれか１つに記載の方法。
実施形態４０． 卵巣癌が、上皮卵巣癌、生殖細胞卵巣癌、間質細胞卵巣癌、若しくは小細胞癌、又はこれらの組合せである、実施形態２５～３９に記載の方法。
実施形態４１． 請求項１に記載の１つ以上のポリペプチドが、当該卵巣癌を有する対象集団において、少なくとも約１％以上、約２％以上、約３％以上、約４％以上、約５％以上、約６％以上、約７％以上、約８％以上、約９％以上、約１０％以上、約１１％以上、約１２％以上、約１３％以上、約１４％以上、約１５％以上、約１６％以上、約１７％以上、約１８％以上、約１９％以上、約２０％以上、約２１％以上、約２２％以上、約２３％以上、約２４％以上、約２５％以上、約２６％以上、約２７％以上、約２８％以上、約２９％以上、約３０％以上、約３５％以上、約４０％以上、約４５％以上、約５０％以上、約５５％以上、約６０％以上、約６５％以上、又は約７０％以上の頻度で存在する、実施形態２３～４０に記載の方法。

Claims (37)

  1. ポリペプチドであって、
    （ａ）配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のアミノ酸配列、
    （ｂ）配列番号１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、２１、２３、２５、２７、２９、３１、３３、３５、３７、３９、４１、４３、４５、４７、４９、５１、５３、５５、５７、５９、６１、６３、６５、６７、６９、７１、７３、７５、７７、７９、８１、８３、８５、８７、８９、９１、９３、９５、９７、９９、１０１、１０３、１０５、１０７、１０９、１１１、１１３、１１５、１１７、１１９、１２１、１２３、１２５、１２７、１２９、１３１、１３３、１３５、１３７、１３９、１４１、１４３、１４５、１４７、１４９、１５１、１５３、１５５、１５７、１５９、１６１、１６３、１６５、１６７、１６９、１７１、１７３、１７５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１８９、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１３、２１５、２１７、２１９、２２１、２２３、２２５、２２７、２２９、２３１、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２４９、２５１、２５３、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６５、２６７、２６９、２７１、２７３、２７５、２７７、２７９、２８１、２８３、２８５、２８７、２８９、２９１、２９３、２９５、２９７、２９９、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１１、３１３、３１５、３１７、３１９、３２１、３２３、３２５、３２７、３２９、３３１、３３３、３３５、３３７、３３９、３４１、３４３、３４５、３４７、３４９、３５１、３５３、３５５、３５７、３５９、３６１、３６３、３６５、３６７、３６９、３７１、３７３、３７５、３７７、３７９、３８１、３８３、３８５、３８７、３８９、３９１、３９３、３９５、３９７、３９９、４０１、４０３、若しくは４０５、又はこれらの断片からなる群から選択される前記アミノ酸配列と少なくとも９０％同一である、１つ以上のアミノ酸配列、
    （ｃ）配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のアミノ酸配列、又は
    （ｄ）配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される前記アミノ酸配列と少なくとも９０％同一である、１つ以上のアミノ酸配列、
    を含む、ポリペプチド。
  2. 前記１つ以上のアミノ酸配列が、任意の順序で互いに結合している、請求項１に記載のポリペプチド。
  3. 前記１つ以上のアミノ酸配列が、リンカーを含まない任意の順序で互いに結合している、請求項１に記載のポリペプチド。
  4. 前記ポリペプチドが、１つ以上の逆ペプチド結合、アミノ酸のＤ－異性体、若しくは化学修飾、又はこれらの任意の組合せを含む、請求項１～３のいずれか一項に記載のポリペプチド。
  5. 請求項１～４のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
  6. （ａ）前記ポリヌクレオチドが、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片からなる群から選択される、
    （ｂ）前記ポリヌクレオチドが、配列番号２、４、６、１２、１６、１８、２０、２２、２６、３０、３２、３４、４０、４４、４６、５０、５４、６０、６４、６４、６８、８２、８６、８８、９０、９２、９６、９８、１１２、１１４、１１６、１２０、１２４、１２８、１３０、１４６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１６、２２０、２２２、２２４、２３０、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５２、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６８、２７２、２８０、２８２、２８６、２９４、２９６、２９８、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３２０、３２４、３２６、３３８、３４０、３４４、３４６、３５０、３７２、若しくは３７６、又はこれらの断片からなる群から選択される、
    （ｃ）前記ポリヌクレオチドが、配列番号２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、３２、３４、３６、３８、４０、４２、４４、４６、４８、５０、５２、５４、５６、５８、６０、６２、６４、６６、６８、７０、７２、７４、７６、７８、８０、８２、８４、８６、８８、９０、９２、９４、９６、９８、１００、１０２、１０４、１０６、１０８、１１０、１１２、１１４、１１６、１１８、１２０、１２２、１２４、１２６、１２８、１３０、１３２、１３４、１３６、１３８、１４０、１４２、１４４、１４６、１４８、１５０、１５２、１５４、１５６、１５８、１６０、１６２、１６４、１６６、１６８、１７０、１７２、１７４、１７６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９０、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１４、２１６、２１８、２２０、２２２、２２４、２２６、２２８、２３０、２３２、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５０、２５２、２５４、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６６、２６８、２７０、２７２、２７４、２７６、２７８、２８０、２８２、２８４、２８６、２８８、２９０、２９２、２９４、２９６、２９８、３００、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３１２、３１４、３１６、３１８、３２０、３２２、３２４、３２６、３２８、３３０、３３２、３３４、３３６、３３８、３４０、３４２、３４４、３４６、３４８、３５０、３５２、３５４、３５６、３５８、３６０、３６２、３６４、３６６、３６８、３７０、３７２、３７４、３７６、３７８、３８０、３８２、３８４、３８６、３８８、３９０、３９２、３９４、３９６、３９８、４００、４０２、４０４、若しくは４０６、又はこれらの断片の前記ポリヌクレオチドと少なくとも９０％同一である、又は
    （ｄ）前記ポリヌクレオチドが、配列番号２、４、６、１２、１６、１８、２０、２２、２６、３０、３２、３４、４０、４４、４６、５０、５４、６０、６４、６４、６８、８２、８６、８８、９０、９２、９６、９８、１１２、１１４、１１６、１２０、１２４、１２８、１３０、１４６、１７８、１８０、１８２、１８４、１８６、１８８、１９２、１９４、１９６、１９８、２００、２０２、２０４、２０６、２０８、２１０、２１２、２１６、２２０、２２２、２２４、２３０、２３４、２３６、２３８、２４０、２４２、２４４、２４６、２４８、２５２、２５６、２５８、２６０、２６２、２６４、２６８、２７２、２８０、２８２、２８６、２９４、２９６、２９８、３０２、３０４、３０６、３０８、３１０、３２０、３２４、３２６、３３８、３４０、３４４、３４６、３５０、３７２、若しくは３７６、又はこれらの断片の前記ポリヌクレオチドと少なくとも９０％同一である、
    請求項５に記載のポリヌクレオチド。
  7. 前記ポリヌクレオチドが、ＤＮＡ又はＲＮＡを含む、請求項６に記載の単離ポリヌクレオチド。
  8. ＲＮＡが、ｍＲＮＡである、請求項７に記載の単離ポリヌクレオチド。
  9. 請求項５～８のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含む、ベクター。
  10. 前記ベクターが、アデノウイルスベクター、ポックスウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、自己複製ＲＮＡ分子、及びこれらの組合せから選択される、請求項９に記載のベクター。
  11. 前記アデノウイルスベクターが、ｈＡｄ５、ｈＡｄ７、ｈＡｄ１１、ｈＡｄ２６、ｈＡｄ３４、ｈＡｄ３５、ｈＡｄ４８、ｈＡｄ４９、ｈＡｄ５０、ＧＡｄ２０、Ｇａｄ１９、ＧＡｄ２１、ＧＡｄ２５、ＧＡｄ２６、ＧＡｄ２７、ＧＡｄ２８、ＧＡｄ２９、ＧＡｄ３０、ＧＡｄ３１、ＣｈＡｄ３、ＣｈＡｄ４、ＣｈＡｄ５、ＣｈＡｄ６、ＣｈＡｄ７、ＣｈＡｄ８、ＣｈＡｄ９、ＣｈＡｄ１０、ＣｈＡｄ１１、ＣｈＡｄＩ６、ＣｈＡｄＩ７、ＣｈＡｄＩ９、ＣｈＡｄ２０、ＣｈＡｄ２２、ＣｈＡｄ２４、ＣｈＡｄ２６、ＣｈＡｄ３０、ＣｈＡｄ３１、ＣｈＡｄ３７、ＣｈＡｄ３８、ＣｈＡｄ４４、ＣｈＡｄ５５、ＣｈＡｄ６３、ＣｈＡｄ７３、ＣｈＡｄ８２、ＣｈＡｄ８３、ＣｈＡｄ１４６、ＣｈＡｄ１４７、ＰａｎＡｄ１、ＰａｎＡｄ２、又はＰａｎＡｄ３に由来する、請求項１０に記載のベクター。
  12. 前記ポックスウイルスベクターが、天然痘ウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、牛痘ウイルスベクター、サル痘ウイルスベクター、コペンハーゲンワクシニアウイルス（Ｗ）ベクター、ニューヨーク弱毒化ワクシニアウイルス（ＮＹＶＡＣ）ベクター、及び改変ワクシニアアンカラ（ＭＶＡ）ベクターから選択される、請求項１０に記載のベクター。
  13. 前記ベクターが、請求項１～４のいずれか一項に記載のポリペプチドのうちいずれか１つをコードするポリヌクレオチドを含む前記アデノウイルスベクターである、請求項１０に記載のベクター。
  14. 前記ベクターが、請求項１～４のいずれか一項に記載のポリペプチドのうちいずれか１つをコードするポリヌクレオチドを含む前記ポックスウイルスベクターである、請求項１０に記載のベクター。
  15. 前記ベクターが、請求項１～３のいずれか一項に記載のポリペプチドのうちのいずれか１つをコードするポリヌクレオチドを含む自己複製ＲＮＡ分子である、請求項１０に記載のベクター。
  16. 前記ベクターが、
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド
    、を含むＡｄ２６ベクターである、請求項１１に記載のベクター。
  17. 前記ベクターが、
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド
    、を含むＧＡｄ２０ベクターである、請求項１１に記載のベクター。
  18. 前記ベクターが、
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド
    、を含むＭＶＡベクターである、請求項１１に記載のベクター。
  19. 前記ベクターが、
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド
    、を含む自己複製ＲＮＡ分子である、請求項１１に記載のベクター。
  20. 請求項１～４のいずれか一項に記載のポリペプチドを含む医薬組成物。
  21. 請求項５～７のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含む医薬組成物。
  22. 請求項９～１８のいずれか一項に記載のベクターを含む組換えウイルスを含む医薬組成物。
  23. 前記組換えウイルスが、Ａｄ２６ウイルス、ＭＶＡウイルス、又はＧＡｄ２０ウイルス、及びこれらの組合せから選択される、請求項２２に記載の医薬組成物。
  24. 対象における免疫応答を誘導する方法であって、前記免疫応答を誘導することを必要とする前記対象に、請求項２０～２３のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  25. 対象における免疫応答を誘導する方法であって、前記免疫応答を誘導することを必要とする前記対象に、
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、若しくは３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、
    を含む組換えウイルス又は自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物を投与することを含み、
    前記組換えウイルスが、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択され、
    前記投与が、前記組成物の１回以上の投与を含む、
    方法。
  26. 対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法であって、前記卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを必要とする前記対象に、請求項２０～２３のいずれか一項に記載の医薬組成物を投与することを含む、方法。
  27. 対象における卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させる方法であって、前記卵巣癌を治療する、予防する、その発症のリスクを低減させる、又はその発症を遅延させることを必要とする前記対象に、
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片からなる群から選択される少なくとも１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、又は
    配列番号１、３、５、１１、１５、１７、１９、２１、２５、２９、３１、３３、３９、４３、４５、４９、５３、５９、６３、６５、６７、８１、８５、８７、８９、９１、９５、９７、１１１、１１３、１１５、１１９、１２３、１２７、１２９、１４５、１７７、１７９、１８１、１８３、１８５、１８７、１９１、１９３、１９５、１９７、１９９、２０１、２０３、２０５、２０７、２０９、２１１、２１５、２１９、２２１、２２３、２２９、２３３、２３５、２３７、２３９、２４１、２４３、２４５、２４７、２５１、２５５、２５７、２５９、２６１、２６３、２６７、２７１、２７９、２８１、２８５、２９３、２９５、２９７、３０１、３０３、３０５、３０７、３０９、３１９、３２３、３２５、３３７、３３９、３４３、３４５、３４９、３７１、３７５、又はこれらの断片に対して少なくとも９０％の配列同一性を有する１つ以上のポリペプチドをコードする、ポリヌクレオチド、
    を含む組換えウイルス又は自己複製ＲＮＡ分子を含む組成物を投与することを含み、
    前記組換えウイルスが、Ａｄ２６、ＭＶＡ、又はＧＡｄ２０から選択され、
    前記投与が、前記組成物の１回以上の投与を含む、
    方法。
  28. 前記対象が、請求項１に記載の１つ以上のポリペプチドを発現する、又は発現すると疑われる、請求項２４～２７のいずれか一項に記載の方法。
  29. 請求項１に記載の１つ以上のポリペプチドが、前記卵巣癌を有する対象集団において、少なくとも約１％以上、約２％以上、約３％以上、約４％以上、約５％以上、約６％以上、約７％以上、約８％以上、約９％以上、約１０％以上、約１１％以上、約１２％以上、約１３％以上、約１４％以上、約１５％以上、約１６％以上、約１７％以上、約１８％以上、約１９％以上、約２０％以上、約２１％以上、約２２％以上、約２３％以上、約２４％以上、約２５％以上、約２６％以上、約２７％以上、約２８％以上、約２９％以上、約３０％以上、約３５％以上、約４０％以上、約４５％以上、約５０％以上、約５５％以上、約６０％以上、約６５％以上、又は約７０％以上の頻度で存在する、請求項２８に記載の方法。
  30. 前記卵巣癌が、再発性卵巣癌、難治性卵巣癌、転移性卵巣癌、若しくはプラチナ抵抗性卵巣癌、又はこれらの任意の組合せである、請求項２６又は２７に記載の方法。
  31. 前記対象が、治療未経験である、請求項２８又は２９に記載の方法。
  32. 前記対象が、手術を受けたことがある、請求項２８又は２９に記載の方法。
  33. 前記対象が、上昇したレベルの癌抗原１２５（ＣＡ１２５）を有する、請求項２８又は２９に記載の方法。
  34. 前記対象に追加の癌治療剤を投与することを更に含む、請求項２７～３３のいずれか一項に記載の方法。
  35. 前記追加の癌治療剤が、手術、化学療法、放射線、チェックポイント阻害剤、標的療法、又はこれらの任意の組合せである、請求項３４に記載の方法。
  36. 前記追加の癌治療剤が、ＣＴＬＡ－４抗体、ＣＴＬＡ４リガンド、ＰＤ－１軸阻害剤、ＰＤ－Ｌ１軸阻害剤、ＴＬＲアゴニスト、ＣＤ４０アゴニスト、ＯＸ４０アゴニスト、ヒドロキシウレア、ルキソリチニブ、フェドラチニブ、４１ＢＢアゴニスト、ＣＤ２８アゴニスト、ＳＴＩＮＧアンタゴニスト、ＲＩＧ－１アンタゴニスト、ＴＣＲ－Ｔ療法、ＣＡＲ－Ｔ療法、ＦＬＴ３リガンド、硫酸アルミニウム、ＢＴＫ阻害剤、ＣＤ３８抗体、ＣＤＫ阻害剤、ＣＤ３３抗体、ＣＤ３７抗体、ＣＤ２５抗体、ＧＭ－ＣＳＦ阻害剤、ＩＬ－２、ＩＬ－１５、ＩＬ－７、ＣＤ３リダイレクション分子、ポマリミブ、ＩＦＮγ、ＩＦＮα、ＴＮＦα、ＶＥＧＦ抗体、ＣＤ７０抗体、ＣＤ２７抗体、ＢＣＭＡ抗体、若しくはＧＰＲＣ５Ｄ抗体、又はこれらの任意の組合せである、請求項３５に記載の方法。
  37. 前記チェックポイント阻害剤が、イピリムマブ、セトレリマブ、ペンブロリズマブ、ニボルマブ、シンチリマブ．セミプリマブ、トリパリマブ、カムレリズマブ、チスレリズマブ、ドストラリマブ、スパルタリズマブ、プロルゴリマブ、バルスチリマブ、ブジガリマブ、ササンリマブ、アベルマブ、アテゾリズマブ、デュルバルマブ、エンバホリマブ、若しくはヨーダポリマブ、又はこれらの任意の組合せである、請求項３５に記載の方法。
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