JP2023509005A - 二重特異性融合タンパク質及びその応用 - Google Patents
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Abstract
Description
上記の構造を有する二重特異性融合タンパク質は、Hibody(Hinge-insersion bispecific antibody)構造融合タンパク質(以下に、Hibody構造融合タンパク質又はHibodyと呼ぶ)と命名した。
VIHVTKEVKE VATLSCGHNV SVEELAQTRI YWQKEKKMVL TMMSGDMNIW PEYKNRTIFD 60
ITNNLSIVIL ALRPSDEGTY ECVVLKYEKD AFKREHLAEV TLSVKADFPT PS 112
VIHVTKEVKE VATLSCGHNV SVEELAQTRI YWQKEKKMVL TMMSGDMNIW PEYKNRTIFD 60
ITNNLSIVIL ALRPSDEGTY ECVVLKYEKD AFKREHLAEV TLSVKADFPT PSISDFEIPT 120
SNIRRIICST SGGFPEPHLS WLENGEELNA INTTVSQDPE TELYAVSSKL DFNMTTNHSF 180
MCLIKYGHLR VNQTFNWN 198
MGHTRRQGTS PSKCPYLNFF QLLVLAGLSH FCSGVIHVTK EVKEVATLSC GHNVSVEELA 60
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YEKDAFKREH LAEVTLSVKA DFPTPSISDF EIPTSNIRRI ICSTSGGFPE PHLSWLENGE 180
ELNAINTTVS QDPETELYAV SSKLDFNMTT NHSFMCLIKY GHLRVNQTFN WNTTKQEHFP 240
DNLLPSWAIT LISVNGIFVI CCLTYCFAPR CRERRRNERL RRESVRPV 288
MGHTRRQGTS PSKCPYLNFF QLLVLAGLSH FCSGVIHVTK EVKEVATLSC GHNVSVEELA 60
QTRIYWQKEK KMVLTMMSGD MNIWPEYKNR TIFDITNNLS IVILALRPSD EGTYECVVLK 120
YEKDAFKREH LAEVTLSVKA DFPTPSISDF EIPTSNIRRI ICSTSGGFPE PHLSWLENGE 180
ELNAINTTVS QDPETELYAV SSKLDFNMTT NHSFMCLIKY GHLRVNQTFN WNTSFAPRCR 240
ERRRNERLRR ESVRPV 256
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QTRIYWQKEK KMVLTMMSGD MNIWPEYKNR TIFDITNNLS IVILALRPSD EGTYECVVLK 120
YEKDAFKREH LAEVTLSVKG FAPRCRERRR NERLRRESVR PV 162
(1)前記第1の結合ドメインが、PD-L1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトTGF-β、VEGF、FGL1、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合するか、或いは
(2)前記第1の結合ドメインが、PD-1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトCTLA-4、VEGF、HGF、EGF、CD28、LAG3、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(3)前記第1の結合ドメインが、CTLA-4を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトCD28、VEGF、HGF、EGF、LAG3、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(4)前記第1の結合ドメインがLAG-3を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトCD28、VEGF、HGF、EGF、CTLA-4、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(5)前記第1の結合ドメインが、FGL1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトTGF-β、VEGF、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合するか、或いは
(6)前記第1の結合ドメインが、TIM-3標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトVEGF、HGF、EGF、LAG3、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(7)前記第1の結合ドメインが、Galectin-9を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトTGF-β、VEGF、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合するか、或いは
(8)前記第1の結合ドメインが、TIGITを標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトTGF-β、HGF、EGF又はVEGFを標的として結合するか、或いは
(9)前記第1の結合ドメインが、CD155を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトTGF-β、VEGF、HGF、EGF、CD47又はCD155を標的として結合するか、或いは
(10)前記第1の結合ドメインが、Claudin 18.2、HER-2、mesothelin、BCMA、SSTR2、GPRC5D、PSMA、FCRH5、CD33、CD123、CD20、A33、CEA、CD28、DLL3、EGFR、VEGFR、VEGFR2、VEGF-A、Nectin-4、FGFR、C-met、RANKL、PDGF、PDGFR、PDGFRα、DLL-4、Ang-1、Ang-2を標的として結合し、前記第2の結合ドメインが、ヒトCTLA-4,TGF-β、VEGF、FGL1、LAG3、4-1BB、OX40、CD27、CD28、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合する、という組み合わせから選択される。
(1)前記第1の結合ドメインが、PD-L1を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、TGF-βRII、VEGFR、LAG-3、SIRPα、TIGIT、C-MET、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択されるか、或いは
(2)前記第1の結合ドメインが、PD-1を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトCD80、CD86、VEGFR、c-MET、EGFR、FGL1、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(3)前記第1の結合ドメインが、CTLA-4を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトCD80、CD86、VEGFR、c-MET、EGFR、FGL1、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(4)前記第1の結合ドメインが、LAG-3を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトVEGFR、c-MET、EGFR、CD80、CD86、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(5)前記第1の結合ドメインが、FGL1を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトTGF-βRII、VEGFR、SIRPα、TIGIT、c-MET、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択されるか、或いは
(6)前記第1の結合ドメインが、TIM-3を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトVEGFR、c-MET、EGFR、FGL1、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(7)前記第1の結合ドメインが、Galectin-9を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトTGF-βRII、VEGFR、SIRPα、TIGIT、c-MET、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択されるか、或いは
(8)前記第1の結合ドメインが、TIGITを標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトTGF-βRII、c-MET、EGFR又はVEGFRから選択されるか、或いは
(9)前記第1の結合ドメインは、CD155を標的として結合し、前記受容体、リガンドは、ヒトTGF-βRII、VEGFR、c-MET、EGFR、SIRPα又はTIGITから選択されるか、或いは
(10)前記第1の結合ドメインが、Claudin 18.2、HER-2、mesothelin、BCMA、SSTR2、GPRC5D、PSMA、FCRH5、CD33、CD123、CD20、A33、CEA、CD28、DLL3、EGFR、VEGFR、VEGFR2、Nectin-4、FGFR、c-MET、RANKL、PDGF、PDGFR、PDGFRα、DLL4、Ang-1又はAng-2を標的として結合し、前記受容体、リガンドが、ヒトCTLA-4、CD80、CD86、TGF-βRII、VEGFR、FGL1、LAG3、4-1BB、OX40、CD27、CD28、CD70、c-MET、SIRPα、TIGIT、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択される、という組み合わせから選択される。
(1)配列番号31、131若しくは132に示される配列を含むヒトTGF-βRII、又は配列番号31、131若しくは132に示される配列と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列、又は配列番号31、131若しくは132に示される配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9若しくは10個のアミノ酸が置換又は欠失されたアミノ酸配列、或いは
(2)配列番号32若しくは133に示される配列を含むCD80 ECD又は配列番号32若しくは133に示される配列と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列、又は配列番号32若しくは133に示される配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9若しくは10個のアミノ酸が置換又は欠失されたアミノ酸配列、或いは
(3)配列番号33に示される配列を含むVEGFR1の第2の細胞外領域とVEGFR2の第3の細胞外領域のフラグメント組み合わせ、又は配列番号33に示される配列と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列、又は配列番号33に示される配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9若しくは10個のアミノ酸が置換又は欠失されたアミノ酸配列、から選択される。
(1)(GGGGS)n、又は
(2)AKTTPKLEEGEFSEAR(配列番号80)、又は
(3)AKTTPKLEEGEFSEARV(配列番号81)、又は
(4)AKTTPKLGG(配列番号82)、又は
(5)SAKTTPKLGG(配列番号83)、又は
(6)SAKTTP(配列番号84)、又は
(7)RADAAP(配列番号85)、又は
(8)RADAAPTVS(配列番号86)、又は
(9)RADAAAAGGPGS(配列番号87)、又は
(10)RADAAAA(配列番号88)、又は
(11)SAKTTPKLEEGEFSEARV(配列番号89)、又は
(12)ADAAP(配列番号90)、又は
(13)DAAPTVSIFPP(配列番号91)、又は
(14)TVAAP(配列番号92)、又は
(15)TVAAPSVFIFPP(配列番号93)、又は
(16)QPKAAP(配列番号94)、又は
(17)QPKAAPSVTLFPP(配列番号95)、又は
(18)AKTTPP(配列番号96)、又は
(19)AKTTPPSVTPLAP(配列番号97)、又は
(20)AKTTAP(配列番号98)、又は
(21)AKTTAPSVYPLAP(配列番号99)、又は
(22)ASTKGP(配列番号100)、又は
(23)ASTKGPSVFPLAP(配列番号101)、又は
(24)GENKVEYAPALMALS(配列番号102)、又は
(25)GPAKELTPLKEAKVS(配列番号103)、又は
(26)GHEAAAVMQVQYPAS(配列番号104)、又は
(27)GGGGSGGGGSGGGGSA(配列番号105)(ただし、前記nは、1、2、3又は4に等しい)であってもよい。
n=1の場合、前記の(GGGGS)nは、GGGGS(配列番号120)である。
n=2の場合、前記の(GGGGS)nは、GGGGSGGGGS(配列番号121)又は(GGGGS)2である。
n=3の場合、前記の(GGGGS)nは、GGGGSGGGGSGGGGS(配列番号122)又は(GGGGS)3である。
n=4の場合、前記の(GGGGS)nは、GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号123)又は(GGGGS)4である。
(1)重鎖可変領域のアミノ酸配列が、配列番号66に示され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のアミノ酸配列が、配列番号67に示されるものである。
(1)重鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号1~5及び配列番号1~5に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号6~10及び配列番号6~10に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号11~15及び配列番号11~15に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号16~20及び配列番号16~20に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号21~25及び配列番号21~25に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号26~30及び配列番号26~30に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択されるものである。
(1)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号1、6、11又は配列番号1、6、11に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号16、21、26又は配列番号16、21、26に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(2)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号2、7、12又は配列番号2、7、12に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号17、22、27、又は配列番号17、22、27に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(3)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号3、8、13、又は配列番号3、8、13に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号18、23、28、又は配列番号18、23、28に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(4)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号4、9、14又は配列番号4、9、14に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号19、24、29又は配列番号19、24、29に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(5)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号5、10、15又は配列番号5、10、15に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号20、25、30又は配列番号20、25、30に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列である、CDR配列を含む。
(1)重鎖可変領域の配列が、配列番号66に示されるか、配列番号66と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号66と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、及び/又は
(2)軽鎖可変領域の配列が、配列番号67に示されるか、配列番号67と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号67と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ものである。
(1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号72に示されるか、配列番号72と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、それぞれ配列番号73に示されるか、配列番号73と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ものである。
(1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号72と比較して1~15個のアミノ酸部位変異を有するか、又は置換されたペプチドリンカーを有し、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号73と比較して1~10個のアミノ酸部位変異を有する、ものである。
(1)重鎖可変領域のアミノ酸配列が、配列番号64に示され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のアミノ酸配列が、配列番号65に示される、ものである。
(1)重鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号34~38及び配列番号34~38に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号39~43及び配列番号39~43に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号44~48及び配列番号44~48に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号49~53及び配列番号49~53に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号54~58及び配列番号54~58に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号59~63及び配列番号59~63に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択される、ものである。
(1)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号34、39、44又は配列番号34、39、44に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号49、54、59又は配列番号49、54、59に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(2)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号35、40、45又は配列番号35、40、45に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号50、55、60又は配列番号50、55、60に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(3)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号36、41、46又は配列番号36、41、46に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号51、56、61又は配列番号51、56、61に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(4)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号37、42、47又は配列番号37、42、47に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号52、57、62又は配列番号52、57、62に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(5)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号38、43、48又は配列番号38、43、48に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号53、58、63又は配列番号53、58、63に1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるものとして、定義される。
(1)重鎖可変領域の配列が、配列番号64に示されるか、配列番号64と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号64と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、及び/又は
(2)軽鎖可変領域の配列が、配列番号65に示されるか、配列番号65と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号65と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ものである。
(1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号68に示されるか、配列番号68と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号69に示されるか、配列番号69と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ものとして定義される。
(1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号68と比較して1~15個のアミノ酸部位変異を有するか、又は置換されたペプチドリンカーを有し、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号69と比較して1~10個のアミノ酸部位変異を有する、ものである。
(1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号70に示されるか、配列番号70と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列は、それぞれ配列番号71に示されるか、配列番号71と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ものとして定義される。
(1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号70と比較して1~15個のアミノ酸部位変異を有するか、又は置換されたペプチドリンカーを有し、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号71と比較して1~10個のアミノ酸部位変異を有する、ものである。
別段の定義がない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明にかかる当業者によって一般に理解されるのと同じ意味を有する。当業者なら、具体的に『細胞及び分子生物学の辞書』(The Dictionary of Cell and Molecular Biology)、第三版、1999、学術出版社(Academic Press);『生物医学及び分子生物学簡明辞書』(the Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology)、Juo,Pei-Show、第二版、2002、CRC出版社;及び『生物化学及び分子生物学オックスフォード辞書』(the Oxford Dictionary Of Biochemistry And Molecular Biology)、改訂版、2000、オックスフォード大学出版社(Oxford University Press)を参照すればよい。
本実施例は、当技術分野における従来の方法を採用して、以下のタンパク質分子:
(1)3つのHibody二重特異性融合タンパク質:Hib-PLT、Hib-PDC、Hib-PDV、
(2)対照タンパク質1~3:WO2015/118175における二機能性分子構造に従って構築したもの、
(3)他の対照タンパク質:TGF-β-R-His、VEGF-R-His、CD80-His、PD-L1対照抗体、を構築し、また、当技術分野における従来の方法に従って、それらを一時的又は安定的に発現した。
注:太字の四角で囲まれたフラグメントはヒンジ領域の配列、斜体はペプチドリンカー、下線が引かれた太字の配列はTGF-βRIIのアミノ酸配列である。
GATATCGTGCTGACCCAGTCTCCAGCTTCCCTGGCCGTGTCCCCAGGACAGAGGGCCACCATCACATGTCGGGCTTCCAAGAGCGTGCACACAAGCGGCTACTCTTATATGCATTGGTACCAGCAGAAGCCCGGCCAGCCCCCTAAGCTGCTGATCTATCTGGCTTCCAACCTGGAGAGCGGAGTGCCAGCTAGGTTCTCTGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTTACCCTGACAATCAATCCTGTGGAGGCCAACGATACAGCTAATTACTATTGCCAGCACTCCGGAGAGCTGCCATACACCTTCGGCGGAGGCACAAAGGTGGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
DIVLTQSPAS LAVSPGQRAT ITCRASKSVH TSGYSYMHWY QQKPGQPPKL LIYLASNLES 60
GVPARFSGSG SGTDFTLTIN PVEANDTANY YCQHSGELPY TFGGGTKVEI KRTVAAPSVF 120
IFPPSDEQLK SGTASVVCLL NNFYPREAKV QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS 180
STLTLSKADY EKHKVYACEV THQGLSSPVT KSFNRGEC 218
GAGATCGTGCTGACACAGAGCCCAGCCACTCTGTCACTGTCCCCAGGAGAAAGGGCTACTCTGTCTTGCCGGGCAAGCCAGTCTGTCTCCAGCTACCTGGCCTGGTATCAGCAGAAGCCCGGACAGGCTCCTAGACTGCTGATCTACGACGCAAGTAACAGAGCCACCGGCATCCCCGCACGCTTCAGTGGCTCAGGCTCCGGAACAGACTTTACTCTGACCATCTCTAGTCTGGAGCCTGAAGATTTCGCCGTGTACTATTGTCAGCAGAGCTCTAATTGGCCTAGAACCTTCGGCCAGGGCACCAAAGTCGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSVS SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD ASNRATGIPA 60
RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ SSNWPRTFGQ GTKVEIKRTV AAPSVFIFPP 120
SDEQLKSGTA SVVCLLNNFY PREAKVQWKV DNALQSGNSQ ESVTEQDSKD STYSLSSTLT 180
LSKADYEKHK VYACEVTHQG LSSPVTKSFN RGEC 214
GAGATCGTGCTGACACAGAGCCCAGCCACTCTGTCACTGTCCCCAGGAGAAAGGGCTACTCTGTCTTGCCGGGCAAGCCAGTCTGTCTCCAGCTACCTGGCCTGGTATCAGCAGAAGCCCGGACAGGCTCCTAGACTGCTGATCTACGACGCAAGTAACAGAGCCACCGGCATCCCCGCACGCTTCAGTGGCTCAGGCTCCGGAACAGACTTTACTCTGACCATCTCTAGTCTGGAGCCTGAAGATTTCGCCGTGTACTATTGTCAGCAGAGCTCTAATTGGCCTAGAACCTTCGGCCAGGGCACCAAAGTCGAGATCAAGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSVS SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD ASNRATGIPA 60
RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ SSNWPRTFGQ GTKVEIKRTV AAPSVFIFPP 120
SDEQLKSGTA SVVCLLNNFY PREAKVQWKV DNALQSGNSQ ESVTEQDSKD STYSLSSTLT 180
LSKADYEKHK VYACEVTHQG LSSPVTKSFN RGEC 214
DIVLTQSPAS LAVSPGQRAT ITCRASKSVH TSGYSYMHWY QQKPGQPPKL LIYLASNLES 60
GVPARFSGSG SGTDFTLTIN PVEANDTANY YCQHSGELPY TFGGGTKVEI KRTVAAPSVF 120
IFPPSDEQLK SGTASVVCLL NNFYPREAKV QWKVDNALQS GNSQESVTEQ DSKDSTYSLS 180
STLTLSKADY EKHKVYACEV THQGLSSPVT KSFNRGEC 218
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSVS SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD ASNRATGIPA 60
RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ SSNWPRTFGQ GTKVEIKRTV AAPSVFIFPP 120
SDEQLKSGTA SVVCLLNNFY PREAKVQWKV DNALQSGNSQ ESVTEQDSKD STYSLSSTLT 180
LSKADYEKHK VYACEVTHQG LSSPVTKSFN RGEC 214
EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQSVS SYLAWYQQKP GQAPRLLIYD ASNRATGIPA 60
RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCQQ SSNWPRTFGQ GTKVEIKRTV AAPSVFIFPP 120
SDEQLKSGTA SVVCLLNNFY PREAKVQWKV DNALQSGNSQ ESVTEQDSKD STYSLSSTLT 180
LSKADYEKHK VYACEVTHQG LSSPVTKSFN RGEC 214
。前記のTGF-βRIIの細胞外領域フラグメントのアミノ酸配列(配列番号137):
TIPPHVQKSV NNDMIVTDNN GAVKFPQLCK FCDVRFSTCD NQKSCMSNCS ITSICEKPQE 60
VCVAVWRKND ENITLETVCH DPKLPYHDFI LEDAASPKCI MKEKKKPGET FFMCSCSSDE 120
CNDNIIFSEE YNTSNPD 137
GRPFVEMYSE IPEIIHMTEG RELVIPCRVT SPNITVTLKK FPLDTLIPDG KRIIWDSRKG 60
FIISNATYKE IGLLTCEATV NGHLYKTNYL THRQTNTIID VVLSPSHGIE LSVGEKLVLN 120
CTARTELNVG IDFNWEYPSS KHQHKKLVNR DLKTQSGSEM KKFLSTLTID GVTRSDQGLY 180
TCAASSGLMT KKNSTFVRVH EP 202
VIHVTKEVKE VATLSCGHNV SVEELAQTRI YWQKEKKMVL TMMSGDMNIW PEYKNRTIFD 60
ITNNLSIVIL ALRPSDEGTY ECVVLKYEKD AFKREHLAEV TLSVKADFPT PSISDFEIPT 120
SNIRRIICST SGGFPEPHLS WLENGEELNA INTTVSQDPE TELYAVSSKL DFNMTTNHSF 180
MCLIKYGHLR VNQTFNWN 198
A.細胞の蘇生と増幅:
CHO宿主細胞を蘇生させ、蘇生培養体積を10mLとし、培養条件を37.0℃、200rpm、8%CO2、80%湿度とした。蘇生後の細胞密度が2.82×105個/mLで、生存率が95.41%であった。
トランスフェクション試薬は、LTX及びPlus試薬を内含するLipofectamineRLTX Reagent(インビトロジェン、カタログ番号15338-100)であった。
トランスフェクション完了48h後、6ウェルプレートの細胞を消化して収集し、細胞培養チューブに入れ、細胞密度3×105個/mLで懸濁成長させて適応させ、細胞生存率が90%程度に回復したときにHib-PLTの発現細胞プールと対照タンパク質1の発現細胞プールをバッチ培養し、Hib-PDC、対照タンパク質2、Hib-PDV、対照タンパク質3を流加培養した。
1.Hib-PLT結合活性の測定:
(1)抗原のコーティング:TGF-β1をコーティング緩衝液で2μg/mlに希釈し、96ウェルプレートにウェルあたり100μlを加え、2~8℃で一晩静置した。
(2)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを3回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(3)プレートのブロッキング:3%BSA-PBSTをブロッキング溶液とし、ウェルあたり300μl、37℃で2時間インキュベートした。
(4)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを3回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(5)サンプルの添加:下表に示される各濃度点を有するサンプルをウェルあたり100μlに96ウェルプレート順次に加え、濃度点ごとに2つの重複ウェルを設置し、37℃で2時間インキュベートした。
(7)二次抗体の添加:
●Hib-PLTサンプルウェル:Goat-anti-Human-Fc-HRPを1:5000で希釈した後、ウェルあたり100μl、37℃で2時間インキュベートした。
●TGF-β-R-Hisウェル:Anti-His-HRPを1:5000で希釈した後、ウェルあたり100μl、37℃で2時間インキュベートした。
(8)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを5回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(9)発色:TMBを発色溶液とし、ウェルあたり100μlで2分間発色させた。
(10)発色の停止:2M H2SO4を停止液とし、ウェルあたり50μlで発色を停止した。
(11)読み取り:MDマイクロプレートリーダーによりそれぞれ450nm及び655nmで吸光値を読み取り、受試サンプルの濃度を横軸とし、吸光値を縦軸とし、4-PL曲線を作成した。EC50値がソフトウェアにより自動的に得られた。
(1)抗原のコーティング:VEGFをコーティング緩衝液で1μg/mlに希釈し、96ウェルプレートにウェルあたり100μlを加え、2~8℃で一晩静置した。
(2)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを3回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(3)プレートのブロッキング:3%BSA-PBSTをブロッキング溶液とし、ウェルあたり300μl、37℃で2時間インキュベートした。
(4)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを3回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(5)サンプルの添加:下表に示される各濃度点を有するサンプルをウェルあたり100μlに96ウェルプレート順次に加え、濃度点ごとに2つの重複ウェルを設置し、37℃で2時間インキュベートした。
(7)二次抗体の添加:
●Hib-PDVサンプルウェル:Goat-anti-Human-Fc-HRPを1:50 00で希釈した後、ウェルあたり100μl、37℃で2時間インキュベートした。
●VEGFR-Hisウェル:Anti-His-HRPを1:5000で希釈した後、ウェル あたり100μl、37℃で2時間インキュベートした
(8)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを5回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(9)発色:TMBを発色溶液とし、ウェルあたり100μlで2分間発色させた。
(10)発色の停止:2M H2SO4を停止液とし、ウェルあたり50μlで発色を停止した。
(11)読み取り:MDマイクロプレートリーダーはそれぞれ450nm、655nmで吸光値を読み取り、受試サンプルの濃度を横軸とし、吸光値を縦軸とし、4-PL曲線を作成した。EC50値がソフトウェアにより自動的に得られた。
(1)抗原のコーティング:CTLA-4 Proteinを1mLの滅菌水で濃度が200ug/mLとなるように再溶解した。コーティング緩衝液で20μg/mlに希釈し、96ウェルプレートにウェルあたり100μlを加え、2~8℃で一晩静置した。
(2)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを3回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(3)プレートのブロッキング:3%BSA-PBSTをブロッキング溶液とし、ウェルあたり300μl、37℃で2h±20minインキュベートした。
(4)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを3回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(5)サンプルの添加:ビオチン化サンプルをPBSTで希釈し、下表に示される各濃度点を有するサンプルをウェルあたり100μlに96ウェルプレート順次に加え、濃度点ごとに2つの重複ウェルを設置し、ブランクウェルをPBSTで、37℃で2h±20minインキュベートした。
(7)二次抗体の添加:
●Hib-PDCサンプルウェル及びCD80-Hisウェル:Streptavidin-HRPを1:2000で希釈した後、ウェルあたり100μl、37℃で1h±10minインキュベートした。
(8)プレートの洗浄:PBSTを溶離液とし、ウェルあたり350μlでプレートを5回自動的に洗浄し、洗浄後にプレートをたたいて乾かした。
(9)発色:100μl/ウェルのTMB Double Slow substrateを加え、室温で暗所で6分間発色させた。
(10)発色の停止:2M H2SO4を停止液とし、ウェルあたり50μlで発色を停止した。
(11)読み取り:MDマイクロプレートリーダーによりそれぞれ450nm、655nmで吸光値を読み取り、受試サンプルの濃度を横軸とし、吸光値を縦軸とし、4-PL曲線を作成した。EC50値がソフトウェアにより自動的に得られた(表7を参照)。
32匹の7週齢のC57BL/6Jヒト化PD-1トランスジェニックマウス(Shanghai Model Organisms Center,Inc.から)を取った。0.1mLの結腸がんMC38細胞の懸濁液(1×106cells/匹)をマウスの右脇腹に皮下接種した。腫瘍が約100mm3程度に成長したとき、腫瘍体積のサイズに応じてランダムにVehicle(PBS)群、Hib-PDV(1.25mg/kg)群、Hib-PDV(2.5mg/kg)群及びHib-PDV(5mg/kg)群の4群に分け、各群における8匹の担癌マウスを週1回、合計3回に腹腔内投与した。投与期間中、腫瘍の長径、短径及び体重を週に2回測定した。投与後の21日目に、腫瘍阻害率(TGIRTV)を算出して薬効評価を行い、表8に示した。
腫瘍体積:TV=D1×D2 2/2、ここでは、D1、D2はそれぞれ腫瘍の長径、腫瘍の短径を表す。
相対腫瘍体積:RTV=TVT/TV1、ここでは、TV1は投与前の腫瘍体積、TVTは各測定時の腫瘍体積である。
相対の腫瘍阻害率:TGIRTV(%)=(1-TRTV/CRTV)×100%、ここでは、TRTVは投与群又は陽性対照群RTV、CRTVは陰性対照群RTVを表す。
32匹の7~9週齢のC57BL/6Jヒト化PD-1トランスジェニック雌性マウス(Shanghai Model Organisms Center,Inc.から)を取り、0.1mLのトランスジェニックhPD-L1 MC38細胞懸濁液(1×106cells/匹)をマウス右前肢の脇の下の後ろに皮下移植した。腫瘍が約100mm3程度に成長したとき、腫瘍体積のサイズに応じてランダムにVehicle(PBS)群、Hib-PDC(1.25mg/kg)群、Hib-PDC(2.5mg/kg)群、Hib-PDC(5mg/kg)群の4群に分け、各群8匹の担癌マウスを週1回、合計3回に腹腔内投与し、投与期間中、腫瘍の長径、短径及び体重を週2回測定した。投与後21日目に、腫瘍阻害率(TGIRTV)を算出して薬効評価を行い、表10に示した。
腫瘍体積:TV=D1×D22/2、ここでは、D1、D2はそれぞれ腫瘍の長径、腫瘍の短径を表す。
相対腫瘍体積:RTV=TVT/TV1、TV1は投与前の腫瘍体積、TVTは各測定時の腫瘍体積である。
相対の腫瘍阻害率:TGIRTV(%)=(1-TRTV/CRTV)×100%、TRTVは投与群又は陽性対照群RTV、CRTVは陰性対照群RTVを表す。
細胞上清中のサイトカインIFN-γ濃度をELISA法で検出し、CD4+T細胞の活性化におけるHib-PLTの効果を評価した。DC細胞インビトロ急速成熟キット(cat:CT-004、三一造血)によりインビトロでドナー1の単核リンパ球を成熟樹状細胞に誘導し、48h後に細胞を収集し、2×105個/mLに希釈した。ドナー2のCD4+T細胞(EasySepTM Human CD4+T Cell Enrichment Kit、StemCell、cat:19052)を磁気ビーズで濃化して1×106個/mLに希釈した。成熟樹状細胞とCD4+T細胞を体積比1:1の割合で混合し、混合細胞懸濁液をウェルあたり100μLの体積で96ウェルプレートに加えた。Hib-PLT、PD-L1対照抗体+TGF-β Trap(併用投与)、PD-L1対照抗体、TGF-β Trap、ヒトIgG1(Biolegend)を、終濃度が0.01~100nMになるように、混合細胞懸濁液を含む96ウェルプレートに加えた。37℃、5%CO2のインキュベーターに入れて120時間培養し、2000rpmで5min遠心し、細胞上清150~200μLを収集した。ELISAキット(Human IL-2 Quantikine ELISA Kit、R&D、cat:S2050;Human IFN-gamma Quantikine ELISA Kit、R&D、cat:SIF50C)を用いて同種異系リンパ混合反応の上澄み中のIFN-γ因子を検出した。一元配置分散で群間の差異を分析した。
Claims (45)
- 完全長免疫グロブリンG(IgG)のヒンジ領域に選択的なペプチドリンカーを介して第2の結合ドメインが挿入されており、
前記IgGのFab領域が第1の結合ドメインであり、
第2の結合ドメインが挿入された前記IgGの重鎖が前記融合タンパク質の重鎖であり、前記IgGの軽鎖が前記融合タンパク質の軽鎖である、構造を有する融合タンパク質であって、
前記第2の結合ドメインが、ヒト受容体、リガンド、又は前記受容体のフラグメン、リガンドのフラグメント、及びフラグメントの組み合わせから選択され、
ここで、前記受容体、リガンドが、自然のシグナル経路において二量体化又は多量体化の構造を形成してシグナル経路を活性化又は阻害する受容体又はリガンドであり、
前記第2の結合ドメインと前記第1の結合ドメインとが、異なる標的を標的とする、二重特異性融合タンパク質。 - 前記第1の結合ドメインが、免疫チェックポイント分子又は腫瘍抗原を標的として結合する、ことを特徴とする請求項1に記載の融合タンパク質。
- 前記免疫チェックポイント分子には、PD-1、PD-L1、CTLA-4、LAG-3、FGL1、TIM-3、Galectin-9、TIGIT、CD155、CD47が含まれ、
前記腫瘍抗原には、Claudin 18.2、HER-2、Mesothelin、BCMA、SSTR2、GPRC5D、PSMA、FCRH5、CD33、CD123、CD20、A33、CEA、CD28、DLL3、EGFR、VEGFR、VEGFR2、VEGF-A、Nectin-4、FGFR、C-met、RANKL、PDGF、PDGFR、PDGFRα、DLL4、Ang-1、Ang-2が含まれる、ことを特徴とする請求項2に記載の融合タンパク質。 - 前記第2の結合ドメインが、ヒトTGF-β、CTLA-4、VEGF、LAG3、CD27、4-1BB、OX40、CD47、FGL1、TLT-2、CD28、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、GITR、EGF、ICOSLを標的として結合する、ことを特徴とする請求項3に記載の融合タンパク質。
- 前記受容体又はリガンドが、ヒトTGF-β受容体(TGF-βR)、CD80、CD86、VEGFR、VEGF-trap、FGL1、CD70、4-1BBL、OX40L、SIRPα、B7-H3、C-met、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、GITRL、EGFR、ICOSである、ことを特徴とする請求項4に記載の融合タンパク質。
- 前記第1の結合ドメイン及び前記第2の結合ドメインが、以下:
(1)前記第1の結合ドメインがPD-L1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトTGF-β、VEGF、FGL1、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合するか、或いは
(2)前記第1の結合ドメインがPD-1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトCTLA-4、VEGF、HGF、EGF、CD28、LAG3、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(3)前記第1の結合ドメインがCTLA-4を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトCD28、VEGF、HGF、EGF、LAG3、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(4)前記第1の結合ドメインがLAG-3を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトCD28、VEGF、HGF、EGF、CTLA-4、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(5)前記第1の結合ドメインがFGL1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトTGF-β、VEGF、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合するか、或いは
(6)前記第1の結合ドメインがTIM-3を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトVEGF、HGF、EGF、LAG3、CD27、4-1BB、又はOX40を標的として結合するか、或いは
(7)前記第1の結合ドメインがGalectin-9を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトTGF-β、VEGF、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合するか、或いは
(8)前記第1の結合ドメインがTIGITを標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトTGF-β、HGF、EGF又はVEGFを標的として結合するか、或いは
(9)前記第1の結合ドメインがCD155を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトTGF-β、VEGF、HGF、EGF、CD47又はCD155を標的として結合するか、或いは
(10)前記第1の結合ドメインがClaudin 18.2、HER-2、mesothelin、BCMA、SSTR2、GPRC5D、PSMA、FCRH5、CD33、CD123、CD20、A33、CEA、CD28、DLL3、EGFR、VEGFR、VEGFR2、VEGF-A、Nectin-4、FGFR、C-met、RANKL、PDGF、PDGFR、PDGFRα、DLL-4、Ang-1、Ang-2を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトCTLA-4,TGF-β、VEGF、FGL1、LAG3、4-1BB、OX40、CD27、CD28、CD47、CD155、HGF、CSF1、CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5、CXCL6、CXCL7、CXCL8、CXCL9、CXCL10、CXCL12、EGF、又はICOSLを標的として結合する、という組み合わせから選択される、ことを特徴とする請求項4に記載の融合タンパク質。 - 前記第1の結合ドメイン、及び前記受容体、リガンドが、以下:
(1)前記第1の結合ドメインがPD-L1を標的として結合し、前記受容体、リガンドがTGF-βRII、VEGFR、LAG-3、SIRPα、TIGIT、C-MET、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択されるか、或いは
(2)前記第1の結合ドメインがPD-1を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトCD80、CD86、VEGFR、c-MET、EGFR、FGL1、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(3)前記第1の結合ドメインがCTLA-4を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトCD80、CD86、VEGFR、c-MET、EGFR、FGL1、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(4)前記第1の結合ドメインがLAG-3を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトVEGFR、c-MET、EGFR、CD80、CD86、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(5)前記第1の結合ドメインがFGL1を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトTGF-βRII、VEGFR、SIRPα、TIGIT、c-MET、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択されるか、或いは
(6)前記第1の結合ドメインがTIM-3を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトVEGFR、c-MET、EGFR、FGL1、CD70、4-1BBL又はOX40Lから選択されるか、或いは
(7)前記第1の結合ドメインがGalectin-9を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトTGF-βRII、VEGFR、SIRPα、TIGIT、c-MET、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択されるか、或いは
(8)前記第1の結合ドメインがTIGITを標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトTGF-βRII、c-MET、EGFR又はVEGFRから選択されるか、或いは
(9)前記第1の結合ドメインがCD155を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトTGF-βRII、VEGFR、c-MET、EGFR、SIRPα又はTIGITから選択されるか、或いは
(10)前記第1の結合ドメインがClaudin 18.2、HER-2、mesothelin、BCMA、SSTR2、GPRC5D、PSMA、FCRH5、CD33、CD123、CD20、A33、CEA、CD28、DLL3、EGFR、VEGFR、VEGFR2、Nectin-4、FGFR、c-MET、RANKL、PDGF、PDGFR、PDGFRα、DLL4、Ang-1又はAng-2を標的として結合し、前記受容体、リガンドがヒトCTLA-4、CD80、CD86、TGF-βRII、VEGFR、FGL1、LAG3、4-1BB、OX40、CD27、CD28、CD70、c-MET、SIRPα、TIGIT、CSF1R、CXCR2、CXCR3、CXCR4、EGFR又はICOSから選択される、という組み合わせから選択される、ことを特徴とする請求項6に記載の融合タンパク質。 - 前記受容体のフラグメン、リガンドのフラグメントには、受容体又はリガンドの細胞外領域フラグメント、結合ドメインフラグメントが含まれる、ことを特徴とする請求項1~7のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
- 前記第1の結合ドメインがPD-L1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトTGF-βRIIのフラグメントであるか、或いは
前記第1の結合ドメインがPD-1を標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトCD80 ECD、CD80 IgV領域、ヒトCD80IgVIgC、VEGFR1 ECD、VEGFR2 ECD、又はVEGFR1の第2の細胞外領域とVEGFR2の第3の細胞外領域との組み合わせから選択されるか、或いは
前記第1の結合ドメインがClaudin 18.2又はHER-2、EGFRを標的として結合し、前記第2の結合ドメインがヒトCD80 ECD、CD80 IgV領域、ヒトCD80IgVIgC、VEGFR1 ECD、VEGFR2 ECD、又はVEGFR1の第2の細胞外領域とVEGFR2の第3の細胞外領域との組み合わせから選択される、ことを特徴とする請求項7に記載の融合タンパク質。 - 前記第2の結合ドメインが、以下:
(1)配列番号31、131若しくは132に示される配列を含むヒトTGF-βRII、又は配列番号31、131若しくは132に示される配列と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列、又は配列番号31、131若しくは132に示される配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9若しくは10個のアミノ酸が置換又は欠失されたアミノ酸配列、或いは
(2)配列番号32若しくは133に示される配列を含むCD80 ECD、又は配列番号32若しくは133に示される配列と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列、又は配列番号32若しくは133に示される配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9若しくは10個のアミノ酸が置換又は欠失されたアミノ酸配列、或いは
(3)配列番号33に示される配列を含むVEGFR1の第2の細胞外領域とVEGFR2の第3の細胞外領域のフラグメント組み合わせ、又は配列番号33に示される配列と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列、又は配列番号33に示される配列と比較して1、2、3、4、5、6、7、8、9若しくは10個のアミノ酸が置換又は欠失されたアミノ酸配列、から選択されることを特徴とする請求項9に記載の融合タンパク質。 - 前記第1の結合ドメインは、PD-L1を標的として結合し、
前記IgGのFabにおける重鎖可変領域のCDR及び/又は前記軽鎖可変領域のCDRは、
(1)重鎖可変領域のアミノ酸配列が配列番号66に示され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のアミノ酸配列が配列番号67に示される配列で特定された抗体と同じのCDR配列を有するか、又は前記の特定された抗体のCDRの上に1~2個のアミノ酸が置換されている、ことを特徴とする請求項9又は10に記載の融合タンパク質。 - 前記IgGのFabにおける重鎖可変領域のCDR及び/又は前記軽鎖可変領域のCDRは、
(1)重鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号1~5及び配列番号1~5に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号6~10及び配列番号6~10に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号11~15及び配列番号11~15に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号16~20及び配列番号16~20に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号21~25及び配列番号21~25に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号26~30及び配列番号26~30に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択されるものである、ことを特徴とする請求項11に記載の融合タンパク質。 - (1)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号1、6、11、又は配列番号1、6、11に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号16、21、26、又は配列番号16、21、26に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(2)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号2、7、12又は配列番号2、7、12に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号17、22、27、又は配列番号17、22、27に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(3)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号3、8、13、又は配列番号3、8、13に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号18、23、28、又は配列番号18、23、28に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(4)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号4、9、14、又は配列番号4、9、14に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号19、24、29、又は配列番号19、24、29に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(5)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号5、10、15、又は配列番号5、10、15に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が、配列番号20、25、30、又は配列番号20、25、30に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列である、ことを特徴とする請求項12に記載の融合タンパク質。 - 重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号3、8、13であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号18、23、28である、ことを特徴とする請求項13に記載の融合タンパク質。
- (1)重鎖可変領域の配列が、配列番号66に示されるか、配列番号66と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号66と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%を超えた同一性を有する配列であり、及び/又は
(2)軽鎖可変領域の配列が、配列番号67に示されるか、配列番号67と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号67と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ことを特徴とする請求項14に記載の融合タンパク質。 - (1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号72に示されるか、配列番号72と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、それぞれ配列番号73に示されるか、配列番号73と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ことを特徴とする請求項15に記載の融合タンパク質。 - (1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が配列番号72と比較して1~15個のアミノ酸部位変異を有するか、又は置換されたペプチドリンカーを有し、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が配列番号73と比較して1~10個のアミノ酸部位変異を有する、ことを特徴とする請求項16に記載の融合タンパク質。 - 前記第1の結合ドメインは、PD-1を標的として結合し、前記IgGのFabにおける重鎖可変領域のCDR及び/又は前記軽鎖可変領域のCDRは、
(1)重鎖可変領域のアミノ酸配列が配列番号64に示され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のアミノ酸配列が配列番号65に示される配列で特定された抗体と同じのCDR配列を有するか、又は前記の特定された抗体のCDRの上に1~2個のアミノ酸が置換されている、ことを特徴とする請求項9に記載の融合タンパク質。 - 前記IgGのFabにおける重鎖可変領域のCDR及び/又は前記軽鎖可変領域のCDRは、
(1)重鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号34~38及び配列番号34~38に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号39~43及び配列番号39~43に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号44~48及び配列番号44~48に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、及び/又は
(2)軽鎖可変領域のCDR1アミノ酸配列が配列番号49~53及び配列番号49~53に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR2アミノ酸配列が配列番号54~58及び配列番号54~58に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択され、CDR3アミノ酸配列が配列番号59~63及び配列番号59~63に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列から選択されるものである、ことを特徴とする請求項18に記載の融合タンパク質。 - (1)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号34、39、44又は配列番号34、39、44に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号49、54、59又は配列番号49、54、59に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(2)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号35、40、45又は配列番号35、40、45に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号50、55、60又は配列番号50、55、60に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(3)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号36、41、46又は配列番号36、41、46に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号51、56、61又は配列番号51、56、61に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(4)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号37、42、47又は配列番号37、42、47に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号52、57、62又は配列番号52、57、62に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であるか、或いは
(5)重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号38、43、48又は配列番号38、43、48に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号53、58、63又は配列番号53、58、63に対して1若しくは2個のアミノ酸を置換したアミノ酸配列である、ことを特徴とする請求項19に記載の融合タンパク質。 - 重鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号36、41、46であり、及び/又は軽鎖可変領域のCDR1~3のアミノ酸配列が配列番号51、56、61である、ことを特徴とする請求項20に記載の融合タンパク質。
- (1)重鎖可変領域の配列が、配列番号64に示されるか、配列番号64と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号64と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、及び/又は
(2)軽鎖可変領域の配列が、配列番号65に示されるか、配列番号65と同じのCDR1~3を有し、かつ配列番号65と比較して80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ことを特徴とする請求項21に記載の融合タンパク質。 - (1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号68に示されるか、配列番号68と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号69に示されるか、配列番号69と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ことを特徴とする請求項22に記載の融合タンパク質。 - (1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号68と比較して1~15個のアミノ酸部位変異を有するか、又は置換されたペプチドリンカーを有し、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号69と比較して1~10個のアミノ酸部位変異を有する、ことを特徴とする請求項23に記載の融合タンパク質。 - (1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号70に示されるか、配列番号70と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列であり、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号71に示されるか、配列番号71と比較して90%、95%、96%、97%、98%若しくは99%を超えた同一性を有する配列である、ことを特徴とする請求項22に記載の融合タンパク質。 - (1)前記融合タンパク質の重鎖のアミノ酸配列が、配列番号70と比較して1~15個のアミノ酸部位変異有するか、又は置換されたペプチドリンカーを有し、
(2)前記融合タンパク質の軽鎖のアミノ酸配列が、配列番号71と比較して1~10個のアミノ酸部位変異を有する、ことを特徴とする請求項25に記載の融合タンパク質。 - 前記IgGが、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、セミプリマブ、イピリムマブである、ことを特徴とする請求項1~10のいずれか1項に記載の融合タンパク質。
- 前記第2の結合ドメインのC端又は/及びN端が、2~30個のアミノ酸からなるペプチドリンカーを有する、ことを特徴とする請求項1~27のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記ペプチドリンカーが、
(1)(GGGGS)n、又は
(2)AKTTPKLEEGEFSEAR(配列番号80)、又は
(3)AKTTPKLEEGEFSEARV(配列番号81)、又は
(4)AKTTPKLGG(配列番号82)、又は
(5)SAKTTPKLGG(配列番号83)、又は
(6)SAKTTP(配列番号84)、又は
(7)RADAAP(配列番号85)、又は
(8)RADAAPTVS(配列番号86)、又は
(9)RADAAAAGGPGS(配列番号87)、又は
(10)RADAAAA(配列番号88)、又は
(11)SAKTTPKLEEGEFSEARV(配列番号89)、又は
(12)ADAAP(配列番号90)、又は
(13)DAAPTVSIFPP(配列番号91)、又は
(14)TVAAP(配列番号92)、又は
(15)TVAAPSVFIFPP(配列番号93)、又は
(16)QPKAAP(配列番号94)、又は
(17)QPKAAPSVTLFPP(配列番号95)、又は
(18)AKTTPP(配列番号96)、又は
(19)AKTTPPSVTPLAP(配列番号97)、又は
(20)AKTTAP(配列番号98)、又は
(21)AKTTAPSVYPLAP(配列番号99)、又は
(22)ASTKGP(配列番号100)、又は
(23)ASTKGPSVFPLAP(配列番号101)、又は
(24)GENKVEYAPALMALS(配列番号102)、又は
(25)GPAKELTPLKEAKVS(配列番号103)、又は
(26)GHEAAAVMQVQYPAS(配列番号104)、又は
(27)GGGGSGGGGSGGGGSA(配列番号105)である(ただし、前記nは 、1、2、3又は4に等しい。)ことを特徴とする請求項28に記載の融合タンパク質。 - 挿入された前記第2の結合ドメインのサイズが、300個のアミノ酸を超えない、ことを特徴とする請求項1~29のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記第2の結合ドメインの挿入部位が、免疫グロブリンのジスルフィド結合の形成に影響を及ぼさないように、ヒンジ領域の中央前部に位置する、ことを特徴とする請求項1~30のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記ヒンジ領域の中央前部とは、231Aより前の部分を指す、ことを特徴とする請求項31に記載の融合タンパク質。
- 前記挿入部位の前後のヒンジ領域のアミノ酸の一部が置換又は欠失されている、ことを特徴とする請求項1~32のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記ヒンジ領域が、D221G及び/又はC220V変異を含む、ことを特徴とする請求項33に記載の融合タンパク質。
- 前記IgGが、哺乳動物IgG、ヒト化IgG及びヒトIgGから選択され、
前記哺乳動物には、マウス、ラット、兔が含まれ、
好ましくは、前記IgGが、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4である、ことを特徴とする請求項1~34のいずれか一項に記載の融合タンパク質。 - この融合タンパク質のFc領域が、非グリコシル化若しくは脱グリコシル化されたものであるか、又は減少したフコース化若しくは非フコシル化されたものである、ことを特徴とする請求項1~35のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 請求項1~36のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードする、単離されたポリヌクレオチド。
- 好ましくは、キャリアである核酸構築物であって、
請求項37に記載のポリヌクレオチドを含む、核酸構築物。 - 好ましくは、原核細胞、真核細胞、酵母細胞、哺乳動物の細胞、大腸菌細胞又はCHO細胞、NS0細胞、Sp2/0細胞、BHK細胞である細胞であって、請求項37に記載のポリヌクレオチド又は請求項38に記載の核酸構築物若しくは前記キャリアを含む、宿主細胞。
- 請求項1~36のいずれか一項に記載の融合タンパク質と、薬学的に許容されるキャリアとを含む医薬組成物。
- 治療又は軽減を必要とする被検者に請求項1~36のいずれか一項に記載の融合タンパク質又は請求項40に記載の医薬組成物を投与する工程を含む、腫瘍又はがんを治療するための方法。
- 腫瘍又はがんを治療又は予防するための医薬品の製造における、請求項1~36のいずれか一項に記載の融合タンパク質、請求項37に記載のポリヌクレオチド、請求項38に記載の核酸構築物若しくは前記キャリア、又は請求項40に記載の医薬組成物の、使用。
- 前記腫瘍又はがんには、固形腫瘍又は非固形腫瘍が含まれる、ことを特徴とする請求項42に記載の使用。
- 請求項1~36のいずれか一項に記載の融合タンパク質を含む診断キット。
- 請求項38に記載の核酸構築物の発現を可能にする条件下で、請求項39に記載の宿主細胞を培養し、得られた融合タンパク質を培養物から回収することを含む、請求項1~36のいずれか一項に記載の融合タンパク質の製造方法。
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