JP2022504392A - 腫瘍および/または転移の治療のための抗-met fab-fc - Google Patents

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Abstract

単一の抗原結合アームおよびFc領域を含む抗-Met抗体フラグメントであって、ここで、抗原結合アームは、配列番号7、8に示されるアミノ酸配列を有する可変領域によって定義され、ここで、抗-Met抗体フラグメントは、腫瘍および/または転移の治療に有用である。

Description

本開示は、腫瘍および/または転移の治療のための、新規の抗体由来の治療的薬剤に関する。
がんは、体細胞内因性遺伝子が突然変異を受ける遺伝子疾患である。ほんの少しの遺伝子-がん遺伝子および腫瘍抑制遺伝子として知られる-が、がん細胞において変更されて、腫瘍形成をもたらす。活性化されたがん遺伝子は促進剤であり、不活化された腫瘍抑制遺伝子は、がん細胞の増殖に関するブレーキを失っている。がんを生じさせる突然変異遺伝子の発見後に、がん遺伝子に関する新たな概念:「がん遺伝子依存性(oncogene addiction)」が出現し、それは、がん細胞が、多数の遺伝子変異にもかかわらず、それでもなお、その持続的な増殖または生存のために単一の発がんタンパク質に依存していることを示す。したがって、がんを治癒させるための「標的療法」を開発すべく、新たな治療的侵略の試みがなされた。ここ20年間では、がんを生じさせる突然変異遺伝子によってコードされるタンパク質の薬理学的標的化-化学薬物または抗体を用いる-が、突然変異細胞を取り除いてがん疾患と闘うための最前線の医療設備(armamentarium)を代表している。標的治療は、従来の細胞傷害性化学療法よりも効果的で、しばしば、副作用がより少ないと見込まれている。しかしながら、腫瘍の中に変更された特定の標的遺伝子を保有している患者だけが、標的療法の恩恵を受けると思われる。したがって、患者腫瘍の総合的なゲノムプロファイリングを通して新薬の開発につながるような遺伝子病変を評価するために、個別化医療が並行して必要とされている。
METがん遺伝子は、多面的機能を有する独特な受容体チロシンキナーゼをコードしている。(点突然変異、遺伝子融合、転座、および/または増幅によって)遺伝学的に変更されると、METは、侵襲性の増殖プログラムを活性化するその能力のおかげで細胞の形質転換を開始する。したがって、構成的なMetキナーゼ過剰活性化をもたらすMETの遺伝子病変は、形質転換された表現型を開始して維持する(「MET依存性」)
MET遺伝子病変は、大部分の固形腫瘍において1~4%の合計頻度で生じ、そのキナーゼ活性を上方調節することができる。点突然変異は、肝細胞増殖因子(HGF)リガンド結合または受容体シグナル伝達に重要なドメイン(SEMAドメイン、膜近傍ドメイン、および触媒ドメイン)に集中している。最近になって、次世代シーケンシングによって、非小細胞肺がんの3%においてエクソン14スプライス部位突然変異が明らかになり、それは、MET転写産物の膜近傍領域のエクソンスキッピングおよび欠失を生じさせるものであり、ここで、セリン残基(Ser985)は、Metキナーゼ活性を負に調節し、チロシン残基(Tyr1003)は、Metの内在化および分解に必要である
METによって誘発される「侵襲性の増殖」プログラムでは、増殖性応答は、遊走、生存、細胞外マトリックス分解、および細胞極性の誘導を伴う。これらの生物学的応答は、細胞が、不利な条件に適応および/またはより便利な環境を見つけようと回避するために行なわれる。適さないコンテキストでは、Metは、低酸素状態、炎症性サイトカイン、血管新生誘導因子、分裂促進因子、およびHGF自体などの様々な刺激によって-転写の上方調節を介して-過剰発現される。ついには、Metは、放射線によって誘導されるDNA損傷の条件下で過剰発現されて、DNA修復の活性化とがん細胞のプログラム細胞死の回避を促進することにより、放射線療法に対する抵抗性に寄与する。
過剰活性のMetシグナル伝達を、選択的で、ロバスト性で、非常に効果的な様式で消去するために、いくつかのMet-標的化分子が開発されている。これらの薬物は、HGFアンタゴニスト(ブロッキング抗体またはデコイ)、Met受容体を標的化するmAb、および化学的チロシンキナーゼ阻害剤(TKI)を含む。抗-Met mAbは、MET駆動性の(driven by MET)がんに対する闘いにおける主なステップを潜在的に代表している。近頃になって、4つの抗-Met mAb:MetMab(オナルツズマブ(Onartuzumab),Roche)、LY2875358(エミベツズマブ(Emibetuzumab),Eli Lilly&Company)、ARGX-111(Argenx)、SAIT301(Samsung)、および、2つの抗体の混合物であるSym015(Symphogen A/S)が初期の臨床試験に入った。それらは、競合する様式でMETへのHGF結合をブロックすることにより作用し(オナルツズマブ、ARGX-111)、および/または、METを下方調節することにより作用する(エミベツズマブ、SAIT301、Sym015)。
ミューリンDN30 mAb(WO2007/090807に開示)は、ヒトMet受容体の細胞外ドメインに結合して、Metによってトリガーされる生物学的効果のほんの一部を誘導するIgG2Aである。それは、2つの別個の抗原分子に同時に結合するのを可能にするその二価の性質に起因して受容体リン酸化を部分的に活性化して、天然リガンドによって達成されるのと同様の様式で受容体複合体の安定化をもたらす。Metに対するこの不必要な部分アゴニスト活性は、一価DN30 Fabフラグメント(MvDN30)では観察されなかった。二価DN30親抗体を一価Fabフラグメントに変換することは、DN30抗-Met抗体の治療可能性の制限をなくし(unleash)、完全なアンタゴニスト分子へと導く。しかしながら、Fabは低分子量のせいで半減期が短いことが、治療の展開に関する重大な制約となる。したがって、本発明者らは、DN30 Fabに存在する定常ドメインの重複によって特徴付けられるDCD(二重定常ドメインFab)と呼ばれる新規の改変分子:DCD-1(重複をタンデムで行なった)、および、DCD-2(軽鎖および重鎖の定常ドメインを相互に交換した)を開発した(WO2014/108829に開示)。新規の組み換え分子は両方とも、インビトロで元のFabと同等の生化学的特性を示し、完全なMetアンタゴニストとして作用する。インビボでは、全身投与すると、新規の組み換え分子は、Met依存性(addicted)腫瘍増殖を減少させる。DCD-1およびDCD-2は、2つとも元のmAbと同等の挙動には到達しないにもかかわらず、元のDN30 Fabよりも改善された薬物動態プロファイルを示す
抗体の二価から一価形態への変換は、2つの抗体アームのうちの1つを-分子工学手法により-除去することによっても達成することができると以前に報告されている(WO2005/063816に開示)。データは、臓器内に発現されたFc受容体に結合するFcドメインの活性に主に起因して、分子のインビボ安定性の改善を報告した。
本開示の目的は、腫瘍患者の治療に有用なモノクローナル抗体、すなわち、DN30モノクローナル抗体に由来する、新規の抗-腫瘍剤を提供することである。
本発明によれば、上記目的は、本開示の不可欠な部分を形成していると理解される後の特許請求の範囲において特に想起される要旨によって達成される。
本発明は、単一の抗原結合アームおよびFc領域を含む抗-Met抗体フラグメントに関し、ここで、Fc領域は、第1および第2のFcポリペプチドの複合体を含む。抗体フラグメントは、以下を含む:
(i)1つのヒト化軽鎖可変(VL)ドメインおよび1つのヒト軽鎖定常(CL)ドメインを含む第1のポリペプチド(ここで、ヒト化軽鎖可変(VL)ドメインは、N末端からC末端の方向で、ヒト軽鎖定常(CL)ドメインに融合されて、ここで、ヒト化軽鎖可変(VL)ドメインは、配列番号1、2および3に示されるアミノ酸配列を有する3つの相補性決定領域(CDR)を含み、ここで、ヒト化VLドメインは、配列番号7に示されるアミノ酸配列を有する);
(ii)1つのヒト化重鎖可変(VH)ドメイン、1つのヒト重鎖定常CH1ドメインおよび第1のFcポリペプチドを含む第2のポリペプチド(ここで、第1のFcポリペプチドは、1つのヒトヒンジ領域、1つのヒト定常CH2ドメインおよび1つのヒト定常CH3ドメインを含み、ここで、N末端からC末端の方向で、ヒト化重鎖可変(VH)ドメインがヒト重鎖定常CH1ドメインに融合されて、それがヒトヒンジ領域に融合されて、それがヒト定常CH2ドメインに融合されて、それがヒト定常CH3ドメインに融合されて、ここで、ヒト化重鎖可変(VH)ドメインは、配列番号4、5および6に示されるアミノ酸配列を有する3つの相補性決定領域(CDR)を含み、ここで、ヒト化VHドメインは、配列番号8に示されるアミノ酸配列を有する);
(iii)第2のヒトFcポリペプチドを含む第3のポリペプチド(ここで、第2のヒトFcポリペプチドは、1つのヒンジ領域、1つのヒト定常CH2ドメイン、および、1つのヒト定常CH3ドメインを含み、ここで、N末端からC末端の方向で、ヒンジ領域がヒトCH2定常ドメインに融合されて、それがヒトCH3定常ドメインに融合されて、ここで、ヒンジ領域は、N末端がトランケートされている)。
上述の抗体フラグメントの改善された治療的特性は、可変領域の構造に依存し、抗体の一価形態および/またはFc領域の存在に単に起因するものではなない。
本発明はまた、単一のボトル内または2つのボトル内に、(a)上記に定義した抗-Met抗体フラグメントおよび薬学的に許容できるビヒクル、および(b)ヒトMetの細胞外部分および薬学的に許容できるビヒクルを含む生産物にも関し、ここで、ヒトMetの細胞外部分は、安定した様式で肝細胞増殖因子(HGF)に結合することが可能であり、抗-Met抗体フラグメントによって認識されるエピトープにおいて、抗-Met抗体フラグメントがそれに結合するのを防ぐための少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。
本発明は、純粋に例示的かつ非限定的な実施例によって、および、付随する図面を参照して、ここに詳細に説明される。
DN30抗体およびその一価誘導体の略図。(A)元のミューリン二価mAb;(B)MvDN30、キメラFab;(C)chOA-DN30、キメラ一価「1本アーム」抗体;(D)hOA-DN30、ヒト化一価「1本アーム」抗体;(E)OA-DN30抗体を、還元および非還元条件下でSDS-PAGEに供した。ゲルをGel Code blueで染色した。 一価DN30由来分子のMetへの結合。(A)ヒトMet-Fcキメラ(固相)に対する、MvDN30、chOA-DN30、hOA-DN30抗体(液相)のELISA結合分析。(B)Met-Fcキメラ(固相)に対するhOA-DN30-cl03E08(液相)のELISA結合分析;ヒト、ミューリン、ラット、サル起源のMetをアッセイに含めた。抗-ヒトk鎖抗体を用いて結合を明らかにした。O.D.:光学濃度;AU:任意単位。各ポイントは、三重の値の平均である;バーは標準偏差を示す。グラフの下の表は、Kd値、結合最大値(Bmax)、およびフィッティング・スコア(R)を報告する。(C)異なる種(EBC-1、ヒト肺がん;C2C12 マウス筋肉の筋芽細胞;H9C2 ラット心臓の筋芽細胞;MDCK イヌ腎臓細胞;Cos-7 サル腎臓細胞)に由来する細胞株のパネルの表面に発現されたMetへのhOA-DN30-cl03E08結合のフローサイトメーター分析。新規の分子は、ヒトMet-Fcに高い親和性で結合する;抗体は、ヒト、ラット、イヌ、およびサルMetと交差反応する。 一価DN30由来分子のアゴニスト活性。分散アッセイ。HPAF-II細胞を、示された濃度のHGF(Metリガンド)、DN30 mAb(部分アゴニスト)、MvDN30(完全アンタゴニスト)およびキメラまたはヒト化1本アーム抗体と24時間インキュベートした。DN30由来の一価分子は全て、細胞散乱(Metが介在する生物学的応答)を誘導しない。 一価DN30由来分子によって処理された細胞における、Metシェディングおよび下方調節。A549細胞を、示された増加する濃度のMvDN30、chOA-DN30、またはhOA-DN30誘導体と、血清フリー培地内で48時間インキュベートした。全体のMetレベルを、抗-Met抗体を用いた細胞抽出物のウエスタンブロット分析によって決定した。検出されたバンドは、受容体の成熟型(p145 Met)に対応する。ローディングコントロールとして、フィルターを、関係のないタンパク質(ビンキュリン)でプローブした。Metシェディングを、抗-Met抗体を用いた馴化培地のウエスタンブロット分析によって決定した。検出されたバンドは、受容体のシェディングされた細胞外ドメイン(p80 Met外部ドメイン)に対応する。表は、ImageJソフトウェアを用いたデンシトメトリーによって測定される、対応するビンキュリンシグナルに対して正規化された各ウエスタンブロットバンドのピクセル強度の定量化を報告する。一価の1本アーム抗体は全て、Metを下方調節し、Metシェディングを誘導する。 一価DN30由来分子によるMet-活性化の阻害。GTL-16(MET遺伝子増幅によって維持される受容体過剰発現に起因して構成的に活性のMetを保有するMET依存性細胞)を、血清フリー培地プラスhOA-DN30またはchOA-DN30抗体(1000または250nM)中で24時間インキュベートした。Met活性化を、リン酸化Tyr1234/1235Met残基(主なリン酸化部位)に特異的な抗-Met抗体を用いたウエスタンブロッティングによって全細胞溶解物において決定した。同じブロットを、抗-Met抗体で再プローブした。タンパク質のローディングをコントロールするために、フィルターを抗-ビンキュリン抗体でもプローブした。キメラおよびヒト化1本アーム抗体は、Metリン酸化を阻害する。 一価DN30由来分子で処理したMET依存性細胞の生命力。GTL-16ヒト胃癌腫細胞を、10%FCS培地中、96ウェルプレート内にプレーティングした。24時間後、増加する濃度のMvDN30、chOA-DN30、またはhOA-DN30抗体で細胞をさらに72時間処理した。細胞の数をCell titer-gloによって評価した。プロットは、未処理コントロールに対する生存細胞のパーセンテージを示す。各ポイントは、三重の値の平均である。表は、計算されたIC50値およびフィッティング・スコア(R)を報告する。1本アーム分子は、MET依存性細胞の細胞増殖を阻害する。 一価DN30由来分子を用いた処理によって誘導されるMET依存性細胞の増殖および死滅。(A)増殖アッセイ:GTL-16ヒト胃癌腫細胞を、10%FCS培地中、6ウェルプレート内にプレーティングした。24時間後、固定濃度(1μM)のMvDN30、chOA-DN30、またはhOA-DN30-cl03E08で細胞をさらに48時間処理した。それから、さらに2時間、EdU(10n μM)を培養培地へ添加した。S相の細胞のパーセンテージを、ClicK-iT EdUフローサイトメトリーアッセイの手順後、細胞蛍光光度(cytofluorimeter)分析によって決定した。プロットは、APC染色に関してネガティブおよびポジティブの細胞を示す(EdU+、S相細胞)。表は、S相の細胞のパーセンテージを報告する。(B)細胞毒性アッセイ:GTL-16ヒト胃癌腫細胞を、10%FCS培地中、96ウェル内にプレーティングした。24時間後、増加する濃度のMvDN30、chOA-DN30、またはhOA-DN30-cl03E08で細胞をさらに48時間処理した。細胞毒性を、Cell-Tox greenアッセイによって評価した。グラフは、未処理コントロールに対する細胞毒性の増加を示す。各ポイントは、三重の値の平均である。表は、計算されたEC50値、およびフィッティング・スコア(R)を報告する。1本アーム分子は、MET依存性細胞において効率的に増殖をブロックして細胞毒性を誘導する。 hOA-DN30-cl03E08で処理した細胞における、HGFによって誘導される細胞運動。HPAF-II細胞を、示された濃度のhOA-DN30-cl03E08を単独またはDecoyMetK842Eと組み合わせて(hOA-DN30-cl03E08と同量)用いて、18時間、予め処理して、それから、HGF(6.25ng/ml)とともに24時間インキュベートする。hOA-DN30-cl03E08は、HGFによって誘導される細胞運動を阻害する;DecoyMetK842Eとの組み合わせは、細胞応答をより効果的に妨害する。 hOA-DN30-cl03E08で処理された細胞の浸潤。HPAF-II細胞を、0.5μMのhOA-DN30-cl03E08を単独または1μMのDecoyMetK842Eと組み合わせて含む血清フリー培地中、マトリゲルでコーティングされたトランスウェルフィルターの上側チャンバー内にプレーティングした。HGF(25ng/ml)を含む培地を、下側チャンバーに添加した。24時間後、フィルターの下側部分に遊走した細胞を、染色および顕微鏡観察によって評価した。hOA-DN30-cl03E08は、HGFによって誘導される細胞浸潤を阻害し;DecoyMetK842Eとの組み合わせは、生物学的応答をブロックする。 hOA-DN30-cl03E08によるPD-L1発現の調節。GTL-16細胞を、50ng/mlのIFN-γを単独または250nMのhOA-DN30-cl03E08と組み合わせて処理した。48時間後、細胞を溶解させた;全タンパク質抽出物に対するPD-L1発現およびMet活性化をウエスタンブロットによって評価した。ローディングコントロールとして、フィルターを抗-GAPDH抗体でプローブした。 MvDN30、DN30 mAb、およびhOA-DN30-cl03E08の、インビボでの薬物動態プロファイル。免疫欠損マウスに、単回投与(100μg)のMvDN30、DN30 mAb、またはhOA-DN30を静脈内注入した。末梢血を異なる時点で回収した。治療的分子の血清濃度をELISAによって測定した。グラフは、循環している分子の量を時間の関数として示す。サンプルは三重であり;バーは標準偏差を示す。 一価DN30誘導体を用いた処置による、インビボでのMET依存性腫瘍増殖の阻害。1×10 GTL-16 MET依存性胃癌腫細胞を、免疫欠損NOD-SCIDマウスの脇腹に接種した。腫瘍が68.4±5.4mmの平均体積に到達したときに、マウスを4つの均一なグループにランダム化して、30mg/kgのMvDN30、chOA-DN30、またはhOA-DN30-cl03E08を用いて、静脈内注入によって1週間に2回処置した。コントロールとして、1グループを同一容量のPBS(ビヒクル)で処置した。カリパスを用いて腫瘍増殖を定期的にモニターした。15日後、マウスを屠殺した。(A)腫瘍増殖のカイネティクス;(B)未処置グループのパーセンテージとして報告される、実験の最後における腫瘍体積。hOA-DN30-cl03E08は、MET依存性腫瘍増殖を、chOA-DN30よりも効果的に阻害する。 hOA-DN30-cl03E08処理による、インビボでのMET依存性腫瘍増殖の用量応答阻害。1×10 GTL-16 MET依存性胃癌腫細胞を、免疫不全NOD-SCIDマウスの脇腹に接種した。8日後、腫瘍は80.7±2mmの平均体積に到達し、マウスを5つの均一なグループにランダム化して、増加する濃度のhOA-DN30-cl03E08を用いて静脈内注入によって処置した。コントロールとして、1グループを同一容量のPBS(ビヒクル)で処置した。カリパスを用いて腫瘍増殖を定期的にモニターした。17日後、マウスを屠殺して、腫瘍を切除して計量した。(A)腫瘍増殖のカイネティクス;(B)腫瘍重量。hOA-DN30-cl03E08は、用量応答プロファイルでMET依存性腫瘍増殖を阻害する。 chOA-DN30およびhOA-DN30-cl03E08抗体のVL、VH、CLおよびCH1ドメインのアミノ酸配列。相補性決定領域配列を太字下線文字によって強調する。 OA-DN30の第1および第2のFcポリペプチドのアミノ酸配列。第1および第2のFcポリペプチドのCH3ドメイン内のアミノ酸突然変異-それぞれ、ノブおよびホールを生じさせるために必要-を太字下線文字によって強調する。 DecoyMetの突然変異型のアミノ酸配列。アミノ酸突然変異K842Eを太字下線文字によって強調する。
以下の説明において、実施態様の徹底的な理解を提供するための非常に多くの具体的な詳細が提供される。実施態様は、具体的な詳細の1つまたは複数を用いずに、または他の方法、構成要素、材料などを用いて実施され得る。他の例では、よく知られた構造、材料、または操作は、実施態様の態様が分かりにくくなるのを避けるために、示されないか、または詳細に説明されない。
本明細書全体を通して、「一実施態様(one embodiment)」または「一実施態様(an embodiment)」との言及は、実施態様に関連して説明される特定の特質、構造、または特徴が、少なくとも1つの実施態様に含まれることを意味する。したがって、本明細書全体を通して、様々な場所における語句「一実施態様では(in one embodiment)」または「一実施態様では(in an embodiment)」という表現は、必ずしも全てが同一の実施態様を指しているわけではない。さらに、特定の特質、構造、または特徴は、任意の適切な様式で、1つまたは複数の実施態様において組み合わされてよい。
本明細書において提供される見出しは、便宜のためのみであり、実施態様の範囲または意味を説明するものではない。
本開示は、腫瘍および/または転移の治療のための新規の治療的薬剤に関する。
1年に200,000人を超える患者が「MET依存性(addicted)」であると概算され、Met阻害は疾患の寛解を潜在的にもたらし得る。突然変異は老化とともに蓄積すること、および、次の20年にかけて老年人口が増加することを考慮すると、がんによる重荷は上がり、患者管理のための包括的な健康管理方策に大きな影響を持つことが予想される。「MET依存性」の原因となる遺伝子変異は、胃、食道、結腸直腸、腎臓、および肺の癌腫、黒色腫、および脳腫瘍に見られている(COSMICデータベース:www.sanger.ac.ukを参照)。さらに、MET遺伝子病変の選択は、結腸直腸および非小細胞肺がん(NSCLC)における複数の他の標的化治療に対する獲得耐性メカニズムとして発見されている
転移におけるMetの役割は、過酷環境に適応するように細胞を助けるMetの能力とも関連する。Met駆動性の転移能力は、遺伝的および後成的変異だけでなく、線維芽細胞、常在性の上皮細胞、周皮細胞、筋線維芽細胞、血管およびリンパ血管内皮細胞、ならびに免疫系の浸潤細胞を含む、多種多様な細胞型によって構成される腫瘍間質組織によるHGFのパラクリン分泌にも依存する。
Metは、近頃では、(i)MET突然変異/増幅を有する腫瘍(「METへの依存性」)の個別化治療;(ii)他の標的化がん治療に対するMet駆動性(driven)の一次および二次耐性の予防/復帰(reversion);および(iii)Met駆動性の浸潤性/転移表現型の予防/復帰のための、がん特異的な標的として認識されている
DN30阻害活性は、細胞表面で作用するメタロプロテアーゼADAM-10の生理学的活性を促進するその能力によるものであり(lies on)10、それは、受容体の無傷の細胞外部分を細胞膜から放出し(Met-シェディング)、Met細胞内キナーゼドメインの迅速な分解がその後に続く11。これらのプロセスの結果として、Metは細胞表面から物理的に取り除かれて、細胞外ドメインは可溶性「デコイ」として作用して、HGFを隔離することによってリガンド結合を防止する。したがって、DN30の利点は、HGF-依存性およびHGF-非依存性の両方のMet活性化を阻害することである12
他の抗-Met抗体と比較して、DN30は、異なる相乗的な(different and synergic)活性:(i)外部ドメインの「シェディング」による細胞表面からのMetの除去;(ii)HGFリガンドの隔離;(iii)膜におけるMet受容体のホモ-またはヘテロ-二量体化の阻害;(iv)受容体分解の刺激を生じさせる独特なメカニズムにより、受容体機能をブロックする。したがって、DN30は、がん細胞だけでなく腫瘍微小環境に対しても潜在的に作用することができるので(内皮細胞、線維芽細胞、およびマクロファージの、HGF駆動性の生物学的応答)、一石二鳥を得る機会を提供し、Metパスウェイの最適なブロックを可能にする。
本発明は、抗-Met抗体を用いて腫瘍に対する最大の治療可能性に到達するために、i)Met活性化の際に引き起こされる細胞内応答を部分的にさえ誘発しない、すなわち、アゴニストまたは部分アゴニストでない;ii)リガンド(HGF)の排除(displacement)とは異なる作用メカニズムによりMet活性化を減じさせ;iii)病院における展開に適切な、好適な薬物動態プロファイルを有し;iv)当然、ヒトにおいて免疫応答を与えない分子を適用することが必須であるという考えに基づく。上記の全ての考慮を満たすために、本発明者らは、ミューリンDN30抗体-シェディング・メカニズムによってMet活性化をブロックする-を、「1本アーム」形態でフォーマティングする(formatting)ことによって、以下で「hOA-DN30」と命名される完全ヒト化の一価の非常に安定した分子に変換した。
一実施態様では、本発明は、単一の抗原結合アームおよびFc領域を含む抗-Met抗体フラグメントに関し、ここで、Fc領域は、第1および第2のFcポリペプチドの複合体を含む。抗体フラグメントは、以下を含み、好ましくはからなる:
(i)1つのヒト化軽鎖可変(VL)ドメインおよび1つのヒト軽鎖定常(CL)ドメインを含む、好ましくはからなる、第1のポリペプチド(ここで、ヒト化軽鎖可変(VL)ドメインは、N末端からC末端の方向で、ヒト軽鎖定常(CL)ドメインに融合されて、ここで、ヒト化軽鎖可変(VL)ドメインは、配列番号1、2および3に示されるアミノ酸配列を有する3つの相補性決定領域(CDR)を含み、ここで、ヒト化軽鎖可変(VL)ドメインは、配列番号7に示されるアミノ酸配列を有する);
(ii)1つのヒト化重鎖可変(VH)ドメイン、1つのヒト重鎖定常CH1ドメインおよび第1のFcポリペプチドを含む第2のポリペプチド(ここで、第1のFcポリペプチドは、1つのヒトヒンジ領域、1つのヒト定常CH2ドメイン、および、1つのヒト定常CH3ドメインを含み、ここで、N末端からC末端の方向で、ヒト化重鎖可変(VH)ドメインがヒト重鎖定常CH1ドメインに融合されて、それがヒトヒンジ領域に融合されて、それがヒト定常CH2ドメインに融合されて、それがヒト定常CH3ドメインに融合されて、ここで、ヒト化重鎖可変(VH)ドメインは、配列番号4、5および6に示されるアミノ酸配列を有する3つの相補性決定領域(CDR)を含み、ここで、ヒト化重鎖可変(VH)ドメインは、配列番号8に示されるアミノ酸配列を有する);
(iii)第2のヒトFcポリペプチドを含む、好ましくはからなる、第3のポリペプチド(ここで、第2のヒトFcポリペプチドは、1つのヒトヒンジ領域、1つのヒト定常CH2ドメイン、および、1つのヒト定常CH3ドメインを含み、好ましくはからなり、ここで、N末端からC末端の方向で、ヒンジ領域がヒトCH2定常ドメインに融合されて、それがヒトCH3定常ドメインに融合されて、ここで、ヒンジ領域は、N末端がトランケートされている)。
一実施態様では、ヒト軽鎖定常(CL)ドメインは、ヒト軽鎖κタイプドメインである。
一実施態様では、ヒトヒンジ領域およびヒト定常ドメインCH1、CH2およびCH3は、ヒトIgG1由来である。
一実施態様では、2つのFcポリペプチドは、ヒンジ領域において分子間ジスルフィド結合によって連結されている。
一実施態様では、第1のFcポリペプチドおよび第2のFcポリペプチドは、境界面において接触していて(meet)、第1および第2のFcポリペプチドの間の一方は境界面にノブを含み、第1および第2のFcポリペプチドの間の他方は境界面にホールを含み、ここで、ノブはホール内に配置可能である。
好ましい実施態様では、第1および第2のFcポリペプチドの間の一方は、突然変異したCH3定常ドメインを含み、ここで、突然変異したCH3定常ドメインは、389位にアミノ酸突然変異を保有し、ここで、389位の元のアミノ酸は、元のアミノ酸よりも大きな側鎖体積を有するアミノ酸を取り込むように突然変異されていて、それにより、Fcポリペプチドの間の境界面にノブを生じさせ;ここで、第1および第2のFcポリペプチドの間の他方は、突然変異したCH3定常ドメインを含み、ここで、突然変異したCH3定常ドメインは、3つのアミノ酸突然変異を389位、391位および438位に保有し、ここで、元のアミノ酸は、元のアミノ酸よりも小さな側鎖体積を有するアミノ酸を取り込むように突然変異されていて、それにより、Fcポリペプチドの間の境界面にホールを生じさせ、ここで、ノブはホールの中に配置可能であり、ここで、アミノ酸ナンバリングはKabatのEUナンバリング・スキームに従っている(Sequences of proteins of immunological interest,5th ed.,Vol.1,1991;NIH,Bethesda,MDのpp.688-696)。
さらに好ましい実施態様では、389位、391位および438位の元のアミノ酸は、それぞれ、トレオニン、ロイシンおよびチロシンであり;ここで、第1および第2のFcポリペプチドの間の一方において、389位のトレオニンはトリプトファンに突然変異されていて;ここで、第1および第2のFcポリペプチドの間の他方において、389位のトレオニンはセリンに突然変異されていて、391位のロイシンはアラニンに突然変異されていて、438位のチロシンはバリンに突然変異されている。
好ましい実施態様では、ヒト軽鎖定常(CL)ドメインは、配列番号9に示されるアミノ酸配列を有し、ヒト重鎖定常CH1ドメインは、配列番号10に示されるアミノ酸配列を有する。
好ましい実施態様では、第1のヒトFcポリペプチドは、配列番号11に示されるアミノ酸配列を有し、第2のヒトFcポリペプチドは、配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する。
一実施態様では、本発明は、上記に開示される抗-Met抗体フラグメントをコードする単離された核酸に関する。
一実施態様では、本発明は、上記に開示される抗-Met抗体フラグメントを集合的に(collectively)コードする2以上の組み換え核酸を含む組成物に関する。
本明細書において開示される抗-Met抗体フラグメントは、Metに結合すると、Metの細胞外ドメインのシェディングを誘導する。抗-Met抗体フラグメントは、Metに結合したときに、Metに対するアゴニスト活性を与えない。抗-Met抗体フラグメントは、Metに結合すると、Metリン酸化を阻害する。抗-Met抗体フラグメントは、Metに結合すると、MET依存性細胞において、さらに増殖をブロックして細胞毒性を誘導する。抗-Met抗体フラグメントは、Metに結合すると、肝細胞増殖因子(HGF)によって誘導される細胞運動および細胞浸潤をさらに阻害する。当該説明の抗-Met抗体フラグメント対象物(object)の前述の特性は、前記抗体フラグメントに、抗-腫瘍および/または抗-転移活性を与える。
本明細書において用いられる表現「抗原結合アーム」は、目的の標的分子に特異的に結合する能力を有している本発明の抗体フラグメントの構成要素部分を指す。抗原結合アームは、免疫グロブリン軽鎖および重鎖のCDRおよびフレーム領域を含んでいる可変ドメイン配列(VLおよびVH)と、免疫グロブリン軽鎖および重鎖の定常ドメイン配列(CLおよびCH)の複合体である。
非ヒト(例えば、ミューリン)抗体の「ヒト化」形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限のアミノ酸残基を含む非天然組み換え抗体である。大部分について、ヒト化抗体はヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)であって、その中で、レシピエントの超可変領域由来の残基(すなわち、相補性決定領域-CDR)が、所望の特異性、親和性、および特性を有する非ヒト種(ドナー抗体)の超可変領域由来の残基で置換されている。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのフレームワーク領域(FR)残基は、対応する非ヒト残基で置換されてよい。
さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体内またはドナー抗体内に見られない残基を含んでよい。これらの改変は、抗体の能力をさらに精緻にするためになされる。一般に、ヒト化抗体は、超可変ループの全てまたは実質的に全てが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、フレーム残基(FR)の全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリン配列のものである、2つの可変ドメインを含む。ヒト化抗体はまた、典型的にヒト免疫グロブリンのものである免疫グロブリン定常領域(Fc)の一部を含む。さらなる詳細については13~15を参照。以下のレビュー論文および本明細書中に挙げられる参考文献:16~18も参照。
本明細書において用いられる用語「Fc領域」は、一般に、免疫グロブリン重鎖のC末端ポリペプチド配列を含んでいる二量体の複合体を指し、ここで、C末端ポリペプチド配列は、無傷抗体のパパイン消化によって取得可能なものである。Fc領域は、本来または変異Fc配列を含んでよい。免疫グロブリン重鎖のFc配列の境界は変化し得るが、ヒトIgG1重鎖Fc配列は通常、KabatのEUナンバリング・スキームに従って、Asp234とThr238の間に含まれるアミノ酸残基から、Fc配列のカルボキシル末端まで伸びるように定義される。免疫グロブリンのFc配列は通常、1つのヒンジ領域、2つの定常ドメイン(CH2ドメインおよびCH3ドメイン)を含み、任意選択でCH4ドメインを含んでもよい。本明細書において「Fcポリペプチド」とは、Fc領域を構成するポリペプチドの1つを意味する。Fc領域は、抗原結合アームを含んでいるFab分子と比較して抗体フラグメントの安定性を増大させる。
本明細書において用いられる「ヒンジ領域」、「ヒンジ配列」、およびそれらのバリエーションは、当技術分野で知られている意味を含み、それは例えば、Janeway et al.,Immuno Biology:the immune system in health and disease,(Elsevier Science Ltd.,NY)(4th ed.,1999)、および、19、20において説明されている。
本明細書において用いられる語句「トランケートされたヒンジ領域」は、ヒンジ配列の全てではないが一部を含んでいるポリペプチドを指す。トランケートされたヒンジ領域は、「第1の」Fcポリペプチドへの連結が可能である。野生型ヒンジ配列が存在しない場合は、「第2の」Fcポリペプチド内の残りの配列が「第1の」Fcポリペプチドへの連結が可能な構成要素を含む。例えば、前記構成要素は、ジスルフィド結合を形成することが可能な改変された残基または付加されたシステイン残基であってよい。
「ノブ」は、例えば、第1のFcポリペプチドの境界面から突出して、したがって、隣接境界面(すなわち第2のFcポリペプチドの境界面)内の補完的なホール内に配置可能であり、それによりヘテロ多量体を安定化させ、したがってホモ多量体形成よりもヘテロ多量体形成が好都合である、少なくとも1つのアミノ酸側鎖を指す。ノブは、元の境界面内に存在してよく、または、(例えば、境界面をコードする核酸を変更することにより)合成的に導入されてよい。通常は、第1のポリペプチドの境界面をコードする核酸は、ノブをコードするように変更される。これを達成するために、第1のポリペプチドの境界面内の少なくとも1つの「元の」アミノ酸残基をコードする核酸は、元のアミノ酸残基よりも大きな側鎖体積を有する少なくとも1つの「インポート」アミノ酸残基をコードする核酸で置換される。1を超える元の残基および対応するインポート残基が存在し得ることが理解されよう。置換される元の残基の数に関する上限は、第1のポリペプチドの境界面内の残基の合計数である。
「ホール」は、第2のFcポリペプチドの境界面から窪んでいて、したがって、第1のFcポリペプチドの隣接境界面にある対応するノブを収容する少なくとも1つのアミノ酸側鎖を指す。ホールは、元の境界面内に存在してよく、または、(例えば、境界面をコードする核酸を変更することにより)合成的に導入されてよい。通常は、第2のポリペプチドの境界面をコードする核酸は、ホールをコードするように変更される。これを達成するために、第2のポリペプチドの境界面内の少なくとも1つの「元の」アミノ酸残基をコードする核酸は、元のアミノ酸残基よりも小さな側鎖体積を有する少なくとも1つの「インポート」アミノ酸残基をコードする核酸で置換される。1を超える元の残基および対応するインポート残基が存在し得ることが理解されよう。置換される元の残基の数に関する上限は、第2のポリペプチドの境界面内の残基の合計数である。
ノブがホールの中に「配置可能」」であるというのは、第1のFcポリペプチドと第2のFcポリペプチドの境界面のノブとホールのそれぞれの空間的な位置およびノブとホールのサイズが、境界面における第1および第2のポリペプチドの正常な関連性を著しく混乱させずにノブがホールの中に配置され得るものであることを意味する。ノブは典型的に、境界面の軸から垂直に伸びず、好ましいコンフォメーションを有しないので(Since knobs do not typically extend perpendicularly from the axis of the interface and have preferred conformations)、対応するホールとノブの配置は、X線結晶解析または核磁気共鳴(NMR)によって得られるもののような三次元構造に基づくノブ/ホールのペアの形成に依拠する。これは、当該分野において広く認められている技術を用いて達成することができる。
本明細書において用いられる、抗-Met抗体フラグメントの「非アゴニスト活性」という表現は、Met活性化の際に引き起こされる細胞応答を誘発するいかなる活性も、部分的にさえも発揮しない、抗-Met抗体フラグメントを指す。抗-Met抗体フラグメントの非アゴニスト活性は、前記非アゴニスト抗体を用いた細胞のインキュベーションの際に、Met、またはリン酸化の場合はMet残基Tyr1234/1235(すなわちMetの主なリン酸化部位21)、またはリン酸化の場合はMet残基Tyr1349/1356(すなわちMetのドッキング部位22)を特異的に認識する抗体の使用を含む、ウエスタンブロット、免疫蛍光、免疫組織化学、ELISA、細胞蛍光光度分析または任意の他の方法のような従来の技術によるMetリン酸化レベルの評価によって測定することができる。代替法として、HGF治療によって誘導される応答と比較した抗体治療の際の細胞の生物学的応答の評価を適用することができる。
本発明はさらに、単一のボトル内または2つのボトル内に、(a)本明細書において開示される抗-Met抗体フラグメントおよび薬学的に許容できるビヒクル、および(b)ヒトMetの細胞外部分および薬学的に許容できるビヒクルを含む生産物に関し、ここで、ヒトMetの細胞外部分は、安定した様式で肝細胞増殖因子(HGF)に結合することが可能であり、抗-Met抗体フラグメントによって認識されるエピトープにおいて、抗-Met抗体フラグメントがそれに結合するのを防ぐための少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む。
一実施態様では、ヒトMetの細胞外部分は、SEMA、PSI、IPT-1、IPT-2、IPT-3およびIPT-4ドメインを含む。
好ましい一実施態様では、ヒトMetの細胞外部分は、配列番号13に示されるアミノ酸配列を有し、ここで、配列番号13の797位と875位の間のアミノ酸の少なくとも1つは、抗-Met抗体フラグメントがそれに結合するのを防ぐために突然変異されている。
より好ましい一実施態様では、ヒトMetの細胞外部分は、配列番号14に示されるアミノ酸配列を有する。
本明細書はまた、安定した様式で肝細胞増殖因子(HGF)に結合することが可能であって、抗-Met抗体フラグメントによって認識されるエピトープにおいて、抗-Met抗体フラグメントがそれに結合するのを防ぐための少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含んでいる、ヒトMetの細胞外部分をコードする核酸分子に関し、好ましくは、ヒトMetの細胞外部分は、配列番号14に示されるアミノ酸配列を有する。
本明細書において用いられる表現「ヒトMetの細胞外部分は、安定した様式でヒトHGFに結合することが可能」とは、ヒトMetの細胞外部分が、100nMよりも高くない計算されたKdでHGFに結合することを意味する。
本明細書において用いられる表現「ヒトMetの細胞外部分は、抗-Met抗体フラグメントによって認識されるエピトープにおいて、少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む」とは、抗-Met抗体可変ドメインによる上記領域の結合を防ぐMetの細胞外部分内の改変を誘導することが可能な、Metの細胞外部分内の1つまたは複数の突然変異(すなわちアミノ酸置換および/または欠失および/または挿入)の存在を意味する。当業者は、その共通の一般的知識(例えば(i.a.)DNA複製中に特異的プライマーを用いて所定のDNA配列内に単一ヌクレオチドの変更を含んでいるcDNAを産生する可能性によって示される;Maniatis T.Molecular cloning:A laboratory manual Cold Spring Harbor Laboratory,1982を参照)を考慮して、ヒトHGFに結合する能力は維持しているが抗-Met抗体フラグメントに結合する能力は維持していないヒトMetの細胞外部分の突然変異型の認識についてさらなる詳細を必要としない。したがって、当業者は、共通の一般的知識を考慮して、抗-Met抗体が結合するのを防ぐ、配列番号13を有しているヒトMetの細胞外部分のさらなる突然変異バージョンを生産することができるので、本発明は、本明細書において開示されるヒトMetの突然変異した細胞外部分(すなわち配列番号14)のみを包含していると解釈されるべきでない。
用語「SEMA」、「PSI」、「IPT-1」、「IPT-2」、「IPT-3」および「IPT-4」は、Metの細胞外領域を構成しているMetドメインを指す。かかるドメインの名称は、例えば(i.a.)23、24によって示されるように、当業者の共通の一般的知識に属している。SEMAドメインは、セマフォリンおよびプレキシンに共通したタンパク質相互作用モジュールであり、Met(配列番号13)のアミノ酸25~516の間に含まれる領域を包含していて;PSIは、プレキシン、セマフォリン、およびインテグリンに共通したドメインであり、Met(配列番号13)のアミノ酸519~561の間に含まれる領域を包含していて;IPTドメイン-4回繰り返し-は、プレキシンおよび転写因子に共通した免疫グロブリン様領域であり、MET(配列番号13)のアミノ酸563~934の間に含まれる領域を包含している。詳しくは、IPTリピート1は配列番号13のアミノ酸563位~656位をカバーし、IPTリピート2は配列番号13のアミノ酸657位~740位をカバーし、IPTリピート3は配列番号13のアミノ酸741位~837位をカバーし、IPTリピート4は配列番号13のアミノ酸838位~934位をカバーする。
本発明はさらに、腫瘍および/または転移を患っている患者の治療における使用のための、本明細書において開示される抗-Met抗体フラグメントの治療的使用に関し、本明細書において開示されるヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよく、ここで、患者はMET遺伝子の遺伝子変異を保有している。
本発明はさらに、腫瘍および/または転移を患っている患者の治療における使用のための、本明細書において開示されるヒトMetの細胞外部分と組み合わせた本明細書において開示される抗-Met抗体フラグメントの治療的使用に関し、ここで、患者は、野生型MET遺伝子を保有している。
一態様では、本発明は、対象における腫瘍および/または転移を治療する方法を提供し、前記方法は、有効量の抗-Met抗体フラグメント(ヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよい)の対象への投与を含み、それにより、前記症状が治療される。
一態様では、本発明は、Metを発現する細胞の増殖を阻害する方法を提供し、前記方法は、前記細胞を、本明細書において開示される抗-Met抗体フラグメント(本発明のヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよい)と接触させるステップを含み、それにより、前記細胞の増殖の阻害を生じさせる。
一態様では、本発明は、がん性腫瘍および/または転移を有する哺乳類を治療的に処置する方法を提供し、前記方法は、有効量の本明細書において開示される抗-Met抗体フラグメント(ヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよい)の前記哺乳類への投与を含み、それにより、前記哺乳類を効果的に処置する。
一態様では、本発明は、細胞増殖性障害を治療する方法を提供し、前記方法は、かかる治療を必要とする対象への、有効量の本開示の抗-Met抗体フラグメント対象物(object)(ヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよい)の投与を含み、それにより、前記細胞増殖性障害を効果的に治療または予防する。
一態様では、本発明は、哺乳類における腫瘍および/または転移を治療的に処置する方法を提供し、ここで、前記腫瘍の増殖は、細胞増殖の増加、アポトーシスからの保護のいずれかまたはその両方の結果として、Met/HGF系の増殖増強効果に少なくとも部分的に依存している。前記方法は、腫瘍細胞を、有効量の抗-Met抗体フラグメント(有効量の本発明のヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよい)と接触させるステップを含み、それにより、前記腫瘍および/または転移を効果的に治療する。
抗-Met抗体(ヒトMetの細胞外部分と組み合わせてもよい)を用いて効果的に治療することのできる腫瘍は、胸部、結腸直腸、肺、結腸、膵臓、前立腺、卵巣、頸部、中枢神経系、腎臓、肝細胞、膀胱、胃、頭頚部の腫瘍細胞、乳頭がん(例えば甲状腺)、黒色腫、リンパ腫、骨髄腫、神経膠腫/膠芽腫(例えば未分化星状細胞腫、多形性膠芽腫、退形成性乏突起神経膠腫、退形成性乏突起星状細胞腫(anaplastic oligodendroastrocytoma))、白血病細胞、肉腫、横紋筋肉腫、または、未知の原発性がん(CUP)由来の腫瘍から選択される。
一実施態様では、本発明の方法において治療的に標的化される細胞は、過剰増殖性および/または過形成性の細胞である。一実施態様では、本発明の方法において標的化される細胞は、形成異常細胞である。さらに別の実施態様では、本発明の方法において標的化される細胞は、転移細胞である。さらなる一実施態様では、本発明の方法において標的化される細胞は、腫瘍および/または転移を維持している微小環境に属するMet発現細胞である。
本発明者らは、1本アーム構造(CH3ドメインの選択された点突然変異によって得られ、効率的なFcヘテロ二量体化をもたらす)が、抗体を一価形態にさせることを示した。
一価性(Monovalency)は、抗体の二価の本来の構造に起因するDN30の結果として生じるアゴニスト活性を避けるために必須である。
予期せず、驚くべきことに、本発明者らは、DN30のヒト化1本アーム形式の1つ(すなわちhOA-DN30-cl03E08)が、インビトロおよびインビボで強い阻害特性を示すことを発見した。
インビトロで、hOA-DN30-cl03E08は、対応するキメラ形態(以下「chOA-DN30」と命名する)および本明細書において開示される全ての他のヒト化1本アーム誘導体(「hOA-DN30抗体」と命名する)と比較して優れた活性を示す(DN30に由来する全ての1本アーム抗体の詳細な説明については材料および方法のセクションを参照)。予期せず、hOA-DN30-cl03E08は、他の試験されたOA-DN30抗体(キメラまたはヒト)と比較して、より高い親和性でMetに結合する。予期され得ないことに、本発明者らは、シェディング応答が、Metに関するDN30抗体の親和性を増大させることによって増強されることを見いだした。その結果として、リン酸化Met受容体の量として測定されるMet活性化の阻害は、より強かった。これらの活性は、Metが介在する生物学的応答の抑制に換算される。MET依存性の腫瘍細胞増殖の欠陥(impairment)は、非常に少ない用量で生じ;hOA-DN30-cl03E08 IC50は、分析に含まれたOA-DN30抗体(キメラまたはヒト)に関して測定されたもの全てのうち最も低い。腫瘍細胞増殖のより良好な阻害は、細胞増殖のより広範囲のブロック、および/または細胞毒性のより顕著な増加に起因し得る。
hOA-DN30-cl03E08は、インビボにおいても改善された治療可能性を示す。このことは、MvDN30(低分子量であることに起因して高い腎臓クリアランスに供される分子)と比較すれば予想されることである。MvDN30の低い薬物動態特性は、インビボ実験モデルにおける分子の能力にかなり影響する。
腎臓クリアランスのカットオフよりも高い分子量に到達することが、それ自体で、最も良い治療的応答を誘発するのに十分であると考える人がいるかもしれないが、そうではない。実際に、DN30 mAbのDCD-1およびDCD-2誘導体-MvDN30に対して増大したサイズを有する組み換え分子-を用いて得られた結果は、薬物動態プロファイルは部分的に改善するだけであること、および、治療的応答は腫瘍増殖速度の減少に制限されることを明らかに示している
hOA-DN30-cl03E08の優れた活性は、Fc受容体への結合に起因して抗体の組織/臓器分布における違いを生じさせ、したがって非常に好ましい薬物動態プロファイルを与える、Fc領域の存在に部分的に起因し得る。
Fc領域の存在に起因するインビボ安定性に関するポジティブな態様は、既に議論されていて、オナルツズマブの出願中に開示されている。これは、1本アーム形式で設計された抗-Met抗体である25。それにもかかわらず、この抗体は細菌において産生され、したがって、グリコシル化されない。その結果として、それは、抗体依存性細胞傷害(ADCC)および/または補体依存性細胞傷害(CDC)を活性化する能力がない。それとは対照的に、hOA-DN30-cl03E08は、哺乳類細胞において産生され、したがって、Fcエフェクター機能を誘発することが十分に可能であると考えられるはずである。
hOA-DN30-cl03E08は、オナルツズマブとは作用機序に関しても異なる。1つめの抗体は、Met受容体シェディングを誘導し、Metを細胞表面から取り除いて、細胞外環境内のHGFを吸い取るが、2つめの抗体は、Met結合に関してHGFと競合する。結果として、hOA-DN30は、腫瘍受容体の異常な活性化を維持するメカニズムとは独立にMetを阻害するが、オナルツズマブは、リガンド依存性活性化の場合にのみ効果的である。
Fc領域の存在は、このドメインは試験された全てのヒト化およびキメラ1本アーム抗体に存在するので、hOA-DN30-cl03E08によって得られるインビボでの治療的応答の著しい改善の要因とはなり得ない。ヒト化およびキメラ1本アーム抗体が共有していないものは可変領域であり、そこには、抗体の結合部位が存在する。特に、DN30 CDR-全ての誘導体において同一-は、フレーム領域内に挿入されている。抗体のこれらの部分は、たとえ結合ポケットの形成に直接関与しないとしても、バーニヤゾーン残基26と呼ばれる特定のアミノ酸を含み、CDR構造の最終的なコンフォメーションに影響し得て、したがって、抗原に関する抗体の最終的な親和性を決定し得る。cl03E08の、フレーム配列と組み合わせたDN30 CDR(すなわち、重鎖および軽鎖可変ドメインの配列)は、おそらくその配列の組み合わせはMet受容体上の対応するエピトープとより良好にフィットする結合ポケットを産生するので、より強い親和性を有する抗-Met抗体を生じさせる。抗体とMetの間のより強固な相互作用は、受容体のシェディングおよびMetが介在する生物学的応答のその後の欠陥(impairment)をさらに実行する。このことは、1本アーム形式に起因する改善された血漿安定性と組み合わせて、MET依存性/駆動性がんに対して予期せぬ優れた活性を有する抗体-すなわちcl03E08-を生じさせる。
Basilico et al.27において報告されるデータは、HGFおよびMetの両方の同時性の標的化は、腫瘍および/または転移の治療においてより高い治療的ロバスト性を生じさせることを示す。本明細書において証明される実験的データは、予期せずに、DecoyMetK842Eと組み合わせてhOA-DN30を用いたMET/HGF軸の阻害が、DecoyMetK842Eと組み合わせたMvDN30の適用で得られる阻害よりも優れていることを示している。実際に、浸潤アッセイにおいて得られた結果(本明細書中、図9において報告される)を、Basilico etal.27において公表された結果と比較すると、hOA-DN30は、がん細胞のHGF駆動性の浸潤を抑制し、一方で、MvDN30が組み合わせの一部である場合は、残りの活性はまだなお存在する。
MET遺伝子変異を伴わないがん細胞は、低酸素状態、電離放射線または化学療法のようなストレス状態に応答して、悪性表現型をブーストして浸潤性転移表現型の制限をなくす(unleash)「好都合性(expedient)」として、METがん遺伝子によってトリガーされる「生理学的」プログラムを利用する。「好都合性(Expedience)」は、そのリガンドHGFによる野生型METの刺激を必要とする。本明細書において提供されるデータは、MET「好都合性」の状態において、MET/HGF軸の両側を攻撃する同時性の介入が、阻害活性の改善をもたらすことを示す。hOA-DN30-cl03E08は、外部ドメインの「シェディング」により細胞表面からMETの物理的除去を誘導する。後者は、細胞外環境において放出され、HGFに関する「デコイ」として作用する。組み換えDecoyMetの外因的な供給は、hOA-DN30-cl03E08によって生産される内因性DecoyMetのHGF隔離活性を強化する。hOA-DN30-cl03E08とDecoyMetK842Eの組み合わせは、Met発現がん細胞およびHGF分泌腫瘍間質に対して同時に作用する。このことは、HGF駆動性のMetシグナル伝達の最適なブロックを可能にし、したがって、浸潤性/転移表現型を維持するためにMETに依拠する野生型METを発現している腫瘍を保有する患者の大きなコホートに関する信頼できる治療的選択肢を示す。
本明細書において開示されるタンパク質(例えば(i.a.)ヒト化抗-Met抗体およびヒトMetの細胞外部分)は、例えば(i.a.)、Maniatis T.Molecular cloning:A laboratory manual Cold Spring Harbor Laboratory(1982)によって示されるように、組み換えDNA技術に関する分野の共通の一般的知識を考慮して当業者によって、タンパク質の形態またはタンパク質をコードする核酸分子の形態のいずれかで簡単に製造され得る。例えば、以下の標準的な手順:(i)対応するcDNA配列の合成、(ii)従来の組み換えDNA方法による哺乳類における発現に適切なプラスミド内へのcDNAの挿入、(iii)哺乳類細胞株の上述のプラスミドを用いた一過的または安定した共トランスフェクション、(iv)培養上清の回収、(v)組み換えタンパク質のアフィニティークロマトグラフィーによる精製に従ってよい。
本発明の活性成分(単数または複数)、すなわち、ヒト化抗-Met抗体フラグメントを、単独またはヒトMetの細胞外部分と組み合わせて含む治療的組成物は、生理的に許容できる担体、賦形剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.,1980)を用いて、水溶液、凍結乾燥、または他の乾燥された製剤の形態で調製され得る。許容できる担体、賦形剤、または安定剤は、用いられる用量および濃度でレシピエントに対して非毒性であり、バッファー;抗酸化剤;防腐剤;低分子量(約10残基よりも小さい)ポリペプチド;タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン;ポリビニルピロリドンなどの親水性ポリマー;アミノ酸;単糖類、二糖類、および他の炭水化物;キレート剤;糖類;塩形成対イオン;金属複合体および/または非イオン性界面活性剤を含む。製剤は、必要に応じて、治療される特定の適応症のための他の活性の化合物(単数または複数)、好ましくは、hOA-DN30単独またはヒトMetの細胞外部分と組み合わせた治療的活性に負の影響を及ぼさない相補活性を有するものを含んでもよい。かかる分子は、意図する目的に効果的な量の組み合わせで適切に存在する。
活性成分(単数または複数)は、例えば(i.a.)Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980)に開示される技術を用いて調製されるマイクロカプセル内に封入されてもよい。
徐放性製剤が調製されてもよい。徐放製剤の適切な例は、本発明の活性成分を含んでいる固形疎水性ポリマーの半透性マトリックスを含み、そのマトリックスは、成形品、例えばフィルム、またはマイクロカプセルの形態である。
本発明の活性成分(単数または複数)は、単独で、または、他の抗体、小分子チロシンキナーゼ阻害剤、化学療法剤(単数または複数)(化学療法剤のカクテルを含む)、他の細胞傷害剤(単数または複数)、抗-血管新生剤(単数または複数)、サイトカイン、および/または、増殖阻害剤(単数または複数)と組み合わせて用いられ得る。上記のような組み合わせの治療は、組み合わせの投与(2以上の薬剤が同一または別個の製剤内に含まれる)、および別個の投与(その場合、hOA-DN30の投与は補助療法または治療の投与の前および/または後に生じてよい)を含む。
本発明の活性成分(単数または複数)(および補助の治療的薬剤(単数または複数))は、非経口、皮下、腹腔内、肺内、および鼻腔内を含む任意の適切な手段によって投与され、局所治療のために所望されるならば病巣内投与される。本発明の活性成分(単数または複数)は、パルスインフュージョンによって、特に、減少する用量の活性成分を用いて、適切に投与され得る。投与は、投与が短期または慢性であるかどうかに部分的に依存して、任意の適切な経路、例えば、静脈内注入または皮下注入によるものであってよい。
本発明の活性成分(単数または複数)は、適した医療行為と一貫した様式で処方され、投薬され、および投与される。このコンテキストにおいて考慮される因子は、治療される特定の障害、治療される特定の哺乳類、個々の患者の臨床状態、障害の原因、薬剤の送達部位、投与方法、投与スケジュール、および、医師に公知の他の因子を含む。本発明の活性成分(単数または複数)は、問題となっている障害を予防または治療するために現在のところ用いられる1つまたは複数の薬剤とともに処方される必要はないが、処方されてもよい。かかる他の薬剤の有効量は、製剤内に存在する本発明の活性成分(単数または複数)の量、障害または治療のタイプ、および、上述の他の因子に依存する。これらは一般に、上記で用いられるのと同一の用量および投与経路で、または従前に用いられている用量の約1~99%で用いられる。
疾患の治療のために、本発明の活性成分(単数または複数)の適切な用量は(単独で、または他の薬剤(単数または複数)、例えば化学療法剤(単数または複数)と組み合わせて用いられる場合)、治療される疾患のタイプ、疾患の重症度および経過、活性成分が予防的または治療的な目的で投与されるのかどうかに依存し、患者の病歴および本発明の活性成分に対する応答を正当に考慮し、主治医の裁量である。
hOA-DN30は、1度に、または一連の治療にわたって患者に適切に投与される。疾患のタイプおよび重症度に応じて、約1mg/kg~30mg/kgの抗体が、例えば、1または複数の別個の投与によるにしても、または連続的インフュージョンによるにしても、患者への投与に関する最初の候補用量である。1つの典型的な毎日の用量は、上述の因子に応じて、約1μg/kg~100mg/kgの範囲またはそれよりも多い。数日またはより長くにわたる繰り返しの投与に関しては、症状に応じて、疾患症候の所望の抑制が生じるまで治療が維持される。抗体フラグメントの1つの例示的な用量は、約0.05mg/kg~約20mg/kgの範囲内である。したがって、約0.5mg/kg、2.0mg/kg、4.0mg/kgまたは10mg/kg(またはそれらの任意の組み合わせ)の1以上の用量が、患者に投与されてよい。かかる用量は、間欠的に、例えば毎週または3週ごとに(例えば、約2~約20、例えば約6の用量の抗体を患者が受け取るように)、投与されてよい。最初のより高い負荷投与量の後に、1以上のより低い用量が投与されてよい。例示的な投与レジメンは、約4mg/kgの最初の負荷投与量の後に、約2mg/kgの抗体の毎週の維持投与量を含む。しかしながら、他の投与レジメが有用であり得る。この療法の経過は、従来の技術およびアッセイによって簡単にモニターされる。併用療法に関して、ヒトMetの細胞外部分は、好ましくは、hOA-DN30と同時に送達され、疾患のタイプおよび重症度に応じて、優先的に、制限されないが、モル比1:1のhOA-DN30:DecoyMetK842Eで、hOA-DN30と比例して投与される。
結果
DN30抗体のキメラおよびヒト化1本アーム形式の作製。
古典的な分子生物学技術によって、本発明者らは、DN30 mAb重鎖および軽鎖の定常ドメインを、ヒト免疫グロブリンに由来する定常ドメインで置換した。軽鎖定常ドメインをヒトκタイプのドメイン(天然ヒト抗体においてより代表的なもの)で置換して、重鎖定常ドメインをヒトIgG1に由来する相同ドメイン(ADCC/CDCを誘導することのできるもの)で置換した。
DN30マウス抗体のヒト化は、ファージディスプレイライブラリー手法を用いてFair Journey Biologicsによって行なった。それらは、利用可能なツールおよびデータベース:abYsistool(UCLのDr.Andrew Martin)プラス、http://www.bioc.uzh.ch/plueckthun/antibody/およびhttp://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/vbase/を用いて、逸脱する(deviating)FR(フレーム)残基の同定および最も近いヒトV生殖細胞系の分析(CDR1-CDR2に関する同一の規準的な折りたたみの組み合わせ(canonical fold combination)を有する生殖細胞系から選択される)から始めた。ファージディスプレイライブラリーの作製の際(その際、VHおよびVL領域のランダム化が行なわれた)、4回の親和性-駆動性ファージディスプレイの選択ラウンドが行なわれた。プロセスの最後に、最も高いヒト同一性および相同性を有するDN30ヒト化変異を選択した。可変領域を、古典的な分子生物学技術によって、ヒト免疫グロブリン由来の定常ドメイン配列、すなわちヒトκ軽鎖およびIgG1重鎖定常ドメインに連結させた。
キメラおよびヒト化抗体を1本アームの単一鎖形態にフォーマットする(format)ために、特定のアミノ酸改変をCH3領域内に挿入して、「ノブ・イントゥー・ホール」構造28、29を生産した;一方のCH3ドメインはノブ突然変異:389T→Wを保有し、他方のCH3ドメインはホール突然変異:389T→S;391L→A;438Y→Vを保有する。キメラまたはヒト化軽鎖、キメラまたはヒト化重鎖(CH3ドメインにおいて突然変異)、および、ヒトFcドメイン(CH3ドメインにおいて突然変異)をコードするcDNAを、発現プラスミド内にクローニングして、それから、真核生物細胞内に発現させた。アセンブルした1本アーム抗体を、細胞培養上清からアフィニティークロマトグラフィーおよびゲル濾過によって精製した。図1は、DN30誘導体の略図および精製された組み換えOA-DN30分子の非還元および還元条件下でのSDS-Page分離を示す。
DN30 1本アーム抗体は、高い親和性でMetを認識する。
キメラまたはヒト化DN30抗体の精製された1本アーム形態を、ELISAアッセイによって、Met受容体に対する結合に関して分析した。参照として、キメラDN30 Fab(MvDN30)12を分析に含めた。固相中にMet-Fcおよび液相中にDN30誘導体を含むようにアッセイをアセンブルした。抗-ヒトk鎖抗体を用いて結合を明らかにした。データは、キメラおよびヒト化抗体の両方ともMetに結合することを示し、hOA-DN30-cl03E08が最も高い親和性を示した(図2A)。
非ヒトMet受容体とのhOA-DN30-cl03E08の交差反応性の分析。
本発明者らは、(i)ヒト、マウス、ラット、およびサル起源の精製されたMet細胞外ドメインを用いたELISAアッセイ(図2B);(ii)ヒト、マウス、ラット、イヌおよびサル起源の細胞によって発現された表面Metに結合する抗体のフローサイトメーター分析(図2C)を行ない、hOA-DN30-cl03E08の種交差反応性を分析した。実験結果は、hOA-DN30-cl03E08が、ヒト、ラット、イヌ、サル起源のMetに結合するが、マウスMetとの相互作用は非常に弱いことを示した。
DN30 1本アーム抗体は、アゴニスト特性を発揮しない。
本発明者らは、新規のDN30誘導体が、高感度のアッセイである分散アッセイにおいてMetアゴニスト活性を示すことができるかどうか試験した。HGF刺激に応答する細胞運動を判定するための標準的な系を代表するHPAF-IIヒト膵臓癌腫細胞を、増加する濃度の抗体を用いて24時間刺激した。陽性コントロールとして、HGFおよび二価DN30 mAbをアッセイに含めた。陽性コントロールを用いて刺激された細胞は明らかに分散したが、一価DN30誘導体(MvDN30、chOA-DN30、およびhOA-DN30抗体)で処理した細胞の表現型は全て、未処理のものから区別できなかった(図3)。
hOA-DN30は、Met「シェディング」を強く誘導する。
また、本発明者らは、hOA-DN30が、受容体シェディングおよび下方調節を促進する能力を維持するかどうか試験した。A549細胞を、増加する濃度のchOA-DN30およびhOA-DN30抗体とともにインキュベートした。参照として、MvDN30をアッセイに含めた。48時間後、馴化培地内に放出されたMet外部ドメインを、Metの細胞外部分に対して向けられるモノクローナル抗体を用いた免疫ブロッティングによってスコア化した。また、Metの全細胞レベルを、同一抗体を用いて細胞溶解物に対して決定した。この分析により、全てのOA-DN30抗体がMetシェディングを誘導し、細胞外空間における可溶性Met外部ドメインの放出をもたらし、細胞表面からMetを物理的に除去することが明らかにされた(図4)。予期せずに、hOA-DN30-cl03E08の活性は、試験に含められた全ての他のDN30誘導体と比較して優れていた。
hOA-DN30-cl03E08は、Metリン酸化を強く阻害する。
本発明者らは、chOA-DN30およびhOA-DN30抗体が、ヒト癌腫に由来する細胞(すなわちGTL-16)においてMetリン酸化を阻害するかどうか試験した。これらの細胞は、遺伝子増幅に起因する受容体過剰発現の結果として構成的に活性のMetを有する。Met活性化を、抗-phosphoMet抗体を用いた免疫ブロッティングによって判定した。図5に示されるように、全ての分子が、用量応答モダリティでMetリン酸化/活性化を損なった。hOA-DN30-cl03E08は、細胞においてMetレベルの最も強い欠陥(impairment)を誘導し、より活性のDN30誘導体であった。
hOA-DN30-cl03E08は、MET依存性細胞増殖を強力に阻害する。
細胞増殖(生存能力)は、増殖/生存のためにMetシグナル伝達に頼っているMET依存性細胞においてのみ、Met-阻害剤によって損なわれ得る。DN30誘導体の活性を試験するために、指数関数的に増殖しているGTL-16細胞(MET依存性ヒト胃癌腫細胞)を、増加する濃度のchOA-DN30またはhOA-DN30抗体とともにインキュベートした。MvDN30を陽性コントロールとしてアッセイ内に含めた。72時間後、細胞生存能力を、発光に基づくATPアッセイを用いて判定した。全てのDN30誘導体は、MET依存性細胞増殖を用量依存的な様式で阻害した(図6)。hOA-DN30-cl03E08は、最も高い阻害を示し、IC50は、MvDN30よりも2.5倍低く、chOA-DN30よりも5.4倍低く、他のhOA-DN30抗体よりも少なくとも5.2倍低かった(図6の表を参照)。
hOA-DN30-cl03E08は、MET依存性細胞における増殖のブロックおよび細胞毒性の誘導に非常に効果的である。
DN30誘導体によって発揮されるMET依存性細胞増殖の阻害を強調する(underlining)メカニズムをさらに分析するために、本発明者らは、MvDN30、chOA-DN30、およびhOA-DN30-cl03E08と比較して、細胞増殖および細胞毒性を評価した。GTL-16細胞を、単回投与(1μM)のDN30誘導体でインキュベートして、細胞周期S相中の細胞によるEdU-チミジンアナログ-の取り込みを、ClickIT Eduフローサイトメトリーアッセイを用いて測定することによって、細胞増殖を評価した。MvDN30を陽性コントロールとしてアッセイに含めた。この分析は、S相の処理された細胞のパーセンテージがコントロールと比較して劇的に減少したので、DN30誘導体が増殖に影響を及ぼすことが明らかになった。特に、最も効果的な分子はhOA-DN30-cl03E08であり、増殖している細胞はたった4.9%であった(コントロールに対して84.2%減少)。chOA-DN30を用いて処理された集団における増殖性細胞は14.97%であった(コントロールに対して52%減少)(図7A)。
DN30誘導体が、増殖のブロックのみを誘導したのか、または、細胞毒性も生じさせたのかを試験するために、指数関数的に増殖しているMET依存性GTL-16細胞を、増加する濃度のchOA-DN30またはhOA-DN30-cl03E08とともにインキュベートした。MvDN30を陽性コントロールとしてアッセイに含めた。72時間時間後、CellTox(商標)グリーン色素を細胞に添加して、死滅細胞の数に直接比例する細胞の蛍光を測定することによって細胞毒性を判定した。全てのDN30誘導体が、GTL-16細胞において用量依存的な様式で細胞毒性を誘導した(図7B)。hOA-DN30-cl03E08が最も高い誘導を示し、EC50は、MvDN30およびchOA-DN30と比較してそれぞれ1.3倍および6.1倍低かった。
hOA-DN30-cl03E08は、HGFによって誘導される細胞運動を、単独およびDecoyMetと組み合わせて阻害する。
本発明者らは、HPAF-IIヒト膵臓癌腫細胞のHGF-依存性の細胞運動をhOA-DN30-cl03E08が阻害する能力を試験した。細胞を、HGFとインキュベートし、またはインキュベートせずに、増大する用量のhOA-DN30-cl03E08を用いて処理した。24時間後、細胞コロニーを染色して分析した。このアッセイにおいて、hOA-DN30-cl03E08は、HGF依存性の細胞散乱を強く減少させた(図8)。
上記の細胞系において、HGFによって誘導される生物学的応答のより効果的な阻害が、リガンド(HGF)および受容体(Met)を同時性にブロックすることによって達成され得ることが報告されている27。本発明者らは、したがって、hOA-DN30-cl03E08が、DecoyMetK842Eと組み合わせて、より高い治療的応答を誘導するかどうか試験した。DecoyMetK842Eは、DN30との相互作用を消失させる突然変異を保有しているMetの細胞外領域全体を包含している組み換え可溶性受容体であり;それは、HGFと高い親和性で結合して、そして、HGFを吸い取って中和することにより、および、細胞表面上にまだ存在する無傷のMet受容体とヘテロ二量体を形成してそれらを不活性にさせることにより、リガンド-駆動性の生物学的活性を阻害する。等モル量の2分子を組み合わせると、分散表現型を完全に復帰させる効果的な用量は、hOA-DN30-cl03E08が単独で同様の細胞表現型を誘発することが可能な用量よりも、4倍低かった(図8)。
hOA-DN30-cl03E08は、HGFによって誘導される細胞浸潤を、単独およびDecoyMetと組み合わせて阻害する。
本発明者らは、HPAF-II細胞のHGF依存性の細胞浸潤をhOA-DN30-cl03E08が阻害する能力を試験した。hOA-DN30-cl03E08(0.5μM)を単独またはDecoyMetK842E(1μM)と組み合わせて含む血清フリー培地中、マトリゲルでコーティングされたトランスウェルフィルターの上側チャンバー内に細胞を蒔いた。下側チャンバーを、HGF(25ng/ml)を含んでいる培地で満たした。24時間後、フィルターの下側部分に遊走している細胞を、染色および顕微鏡観察によって評価した。このアッセイにおいて、hOA-DN30-cl03E08は、HGF依存性の細胞浸潤を強く減少させて;細胞応答は、hOA-DN30-cl03E08とDecoyMetK842Eの組み合わせによってほとんど消失した(図9)。
hOA-DN30-cl03E08は、PD-L1発現のインターフェロン-γ誘導を消滅させる。
プログラム細胞死リガンド1(PD-L1)およびプログラム細胞死受容体1(PD-1)は、重要な調節分子であり、免疫応答と腫瘍微小環境の間の境界面で中心的な役割を果たす免疫チェックポイントとして知られている30。それらは、免疫系が腫瘍進行を制御する能力を著しく損ない得る。腫瘍細胞によるPD-L1の発現は誘導性であり、インターフェロンγ(IFNγ)が最も強力な誘導因子である31
本発明者らは、hOA-DN30-cl03E08によるMetの阻害がIFNγパスウェイを調節し、その結果としてPD-L1を調節することができるかどうか分析した(図10)。MET依存性GTL-16細胞をINFγで48時間時間処理して、IFNγ誘導性のPD-L1発現について分析した。無刺激条件では、PD-L1は検出不可能であったが、IFNγに暴露すると、一貫して上方調節された。hOA-DN30-Cl03E08を用いて48時間処理すると、IFNγによって誘導されるPD-L1の上方調節は著しく損なわれた。
hOA-DN30-cl03E08は、インビボで好ましい薬物動態プロファイルを示す。
本発明者らは、MvDN30およびキメラDN30 mAbと比較して、hOA-DN30-Cl03E08の薬物動態特性を試験した。上述の分子の単回投与を、静脈内注入によって免疫不全マウスに送達した。処置されたマウス由来の末梢血を、送達後の異なる時点に回収した。試験分子の循環濃度を、血清サンプルに対して行なわれるELISAによって決定した。hOA-DN30-cl03E08の循環レベルは、mAbに関して測定されるものと同等であり、常にMvDN30よりも高かった(図11)。
hOA-DN30-cl03E08は、インビボでMET-依存性腫瘍の増殖を損なわせる。
DN30誘導体がインビボで腫瘍増殖を阻害する能力を、MET依存性モデルに対して試験した。1×10 GTL-16細胞を、NOD-SCIDマウスの脇腹に皮下注入した。1週後、触知可能な腫瘍を保有するマウスを4つの均一な処置グループ:ビヒクル(n=6)、MvDN30(n=6)、hOA-DN30-cl03E08(n=5)、chOA-DN30(n=5)にランダム化した。抗体を、静脈内注入によって、2回/週、30mg/Kgで送達して;同量の分子を投与するために、MvDN30を、1本アーム抗体の分子量はMvDN30に対して2倍なので、同様のスケジュールに従って15mg/kgで送達した(すなわち、OA-DN30形式に関して約100KDaおよびMvDN30に関して約50KDa)。MvDN30は-その短い血漿半減期から予想されるとおり-効果的でなかったが、1本アーム誘導体は両方とも、腫瘍増殖を阻害した(図12A)(hOA-DN30-cl03E08およびchOA-DN30に関してそれぞれ、ビヒクルに対してP=0.0007および0.05)。驚くべきことに、hOA-DN30-cl03E08は、chOA-DN30よりも非常に効果的であった:処置後の腫瘤(treated masses)は、コントロールよりも、hOA-DN30-cl03E08の場合では87.8%、chOA-DN30の場合では52.9%小さかった(図12B)(hOA-DN30-cl03E08対chOA-DN30に関してP=0.009)。本発明者らは、用量応答実験を行なってhOA-DN30-cl03E08の阻害活性をさらに分析した。上述の実験的条件を維持して、マウスを5つの均一なグループにランダム化して、異なる用量のhOA-DN30-cl03E08を用いて、3回/週、i.v.注入によって処置した。10、30、および60mg/kgの用量は、腫瘍増殖をブロックするのに非常に効果的であったが、3.3mg/kgによる処置はコントロールから統計的に差がなかった(図13)。
[材料および方法]
細胞培養
A549ヒト肺腺がん細胞、HPAF-IIヒト膵臓腺がん細胞、C2C12マウス筋肉の筋芽細胞、H9C2(2-1)ラット心臓の筋芽細胞、MDCKイヌ腎臓細胞、およびCos-7サル腎臓細胞は、ATCC/LGC Standards S.r.l.(Sesto San Giovanni,Italy)から取得した;GTL-16細胞株は、MKN-45細胞(Japanese Collection of Research Bioresources,Osaka,Japanによって利用可能なヒト胃癌腫細胞)から得られたクローンであり、親細胞株とはMET遺伝子コピー数が異なる32。GTL-16細胞株は、Advanced Biotechnology Center(ABC)、Interlab Cell Line Collection(ICLC)Italyによって、アクセッションナンバーICLC PD 08003で利用可能である。EBC-1、ヒト肺がんは、Japanese Collection of Research Bioresources)由来である。DN30ハイブリドーマは、Advanced Biotechnology Center(ABC)、Interlab Cell Line Collection(ICLC)Italyによって、アクセッションナンバーICLC PD 05006で利用可能である。
全ての細胞は、供給元によって示唆されるとおりに培養した。全ての細胞培養物を、マイコプラズマ汚染について試験した。
DN30抗体のキメラおよびヒト1本アーム形態の作製。
キメラDN30抗体について:軽鎖(VL-CL)、重鎖(VH-CH1-cH2-CH3)、およびFcドメイン(CH2-CH3)をそれぞれコードする3つの別個のcDNAを、遺伝子合成によって生産した。可変領域(マウス配列)はDN30抗体由来であり(配列番号15および16);ヒト免疫グロブリン由来のヒト起源の定常領域、特に軽鎖は、ヒトκタイプ定常ドメイン(GenBank配列番号:DI165992)を含み、重鎖はヒトIgG1定常ドメイン(GenBank配列番号:DJ392898)を含む。コード配列のC末端において、重鎖はHis-TAG(配列番号38、39)を含み、Fcはstrep-TAG(配列番号40、41)を含む。
ヒト化DN30抗体について:DN30マウス抗体の細菌株スクリーニングによるヒト化を、Fair Journey Biologicsによって、ファージディスプレイライブラリー手法を用いて行なった。それらは、利用可能なツールおよびデータベース:abYsistool(UCLのDr.Andrew Martin)プラス、http://www.bioc.uzh.ch/plueckthun/antibody/およびhttp://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/vbase/を用いて、逸脱するFR(フレーム)残基の同定および最も近いヒトV生殖細胞系の分析(CDR1-CDR2に関する同一の規準的な折りたたみの組み合わせを有する生殖細胞系から選択される)から始めた。ファージディスプレイライブラリーの作製の際(その際、VHおよびVL領域のランダム化が行なわれた)、4の親和性-駆動性ファージディスプレイの選択ラウンドが行なわれた。プロセスの最後に、最も高いヒト同一性および相同性を有する5つの異なるDN30ヒト化変異体、すなわちクローン03E08、03G05、03F04、03H08および04H08を選択した。可変領域を、古典的な分子生物学技術によって、ヒト免疫グロブリン由来の定常ドメイン配列、すなわちヒトκ軽鎖およびIgG1重鎖定常ドメインに連結させた。
キメラおよびヒト化抗体の、1本アーム形態(chOA-DN30およびhOA-DN30抗体)へのフォーマティングについて:特定のアミノ酸改変をCH3領域内に挿入して、「ノブ・イントゥー・ホール」構造28、29を生産した。「ノブ・イントゥー・ホール」は、ホモ二量体よりもヘテロ二量体の形成を増大させるための効果的な設計ストラテジーであることが示された。そのストラテジーは、ドメイン境界面の再構築に基づき、抗体FcフラグメントのCH3領域(ヒトIgG分子のH鎖間のタンパク質間相互作用の最も広範囲の部位)において、立体的に相補の突然変異を導入する。一方の鎖、VH-CH1-CH2-CH3ポリペプチドは、389T→W(ノブ突然変異)を含み、小さなアミノ酸がより大きなアミノ酸によって置換されており;反対に、他方の鎖、CH2-CH3ポリペプチドは、より小さな残基による大きい残基の置換:389T→S;391L→A;438Y→V(ホール突然変異)を含む。これらの突然変異は、ファージディスプレイ技術による最適化の際に選択されたものであり33、そこでは、残基389、391および438(パートナーCH3ドメイン上のノブに近接している)が、ランダムに置換された。ノブ・イントゥー・ホール工学は、ホモ二量体すなわち本物の抗体(VL-CL+VH-CH1-CH2-CH3)またはFcドメインのみ(CH2-CH3)の代わりに、3つの異なるアミノ酸鎖(VL-CL+VH-CH1-CH2-CH3+CH2-CH3)を含んでいるヘテロ二量体のアセンブリを促進する。
N末端において、CH2-CH3ポリペプチドは、トランケートされたヒトヒンジ領域に対応する配列を含む。欠失は、KabatのEUナンバリング・スキームに従って233位におけるシステインを除去するために必要であり、それは、軽鎖定常ドメイン(CL)のC末端位置におけるシステインとの鎖間ジスルフィド結合の形成に関与するものである。さらに、CH2-CH3ポリペプチドがタンパク質合成のRER/ゴルジ体パスウェイに入るのを可能にするために-抗体の軽鎖(VL-CL)および重鎖(VH-CH1-CH2-CH3)がそうであるように-N末端において、トランケートされたヒンジ領域の前に、DN30重鎖のシグナルペプチドに対応する配列が含められる。
本明細書において開示されるキメラ抗-Met抗体フラグメント(chOA-DN30)は、以下で構成される:
(i)配列番号15に示されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメイン;
(ii)配列番号16に示されるアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメイン;
(iii)配列番号9に示されるアミノ酸配列を有するヒト軽鎖定常(CL)ドメイン;
(iv)配列番号10に示されるアミノ酸配列を有するヒト重鎖定常CH1ドメイン;
(v)配列番号11に示されるアミノ酸配列を有する第1のヒトFcポリペプチド;および
(vi)配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する第2のヒトFcポリペプチド。
本開示のヒト化抗-Met抗体フラグメント(hOA-DN30-cl03E08)対象物(object)は以下で構成される:
(i)配列番号7に示されるアミノ酸配列を有するヒト化軽鎖可変ドメイン;
(ii)配列番号8に示されるアミノ酸配列を有するヒト化重鎖可変ドメイン;
(iii)配列番号9に示されるアミノ酸配列を有するヒト軽鎖定常(CL)ドメイン;
(iv)配列番号10に示されるアミノ酸配列を有するヒト重鎖定常CH1ドメイン;
(v)配列番号11に示されるアミノ酸配列を有する第1のヒトFcポリペプチド;および
(vi)配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する第2のヒトFcポリペプチド。
ヒト化抗-Met抗体フラグメント(hOA-DN30-cl03G05)は以下で構成される:
(i)配列番号17に示されるアミノ酸配列を有するヒト化軽鎖可変ドメイン;
(ii)配列番号18に示されるアミノ酸配列を有するヒト化重鎖可変ドメイン;
(iii)配列番号9に示されるアミノ酸配列を有するヒト軽鎖定常(CL)ドメイン;
(iv)配列番号10に示されるアミノ酸配列を有するヒト重鎖定常CH1ドメイン;
(v)配列番号11に示されるアミノ酸配列を有する第1のヒトFcポリペプチド;および
(vi)配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する第2のヒトFcポリペプチド。
ヒト化抗-Met抗体フラグメント(hOA-DN30-cl03F04)は以下で構成される:
(i)配列番号19に示されるアミノ酸配列を有するヒト化軽鎖可変ドメイン;
(ii)配列番号20に示されるアミノ酸配列を有するヒト化重鎖可変ドメイン;
(iii)配列番号9に示されるアミノ酸配列を有するヒト軽鎖定常(CL)ドメイン;
(iv)配列番号10に示されるアミノ酸配列を有するヒト重鎖定常CH1ドメイン;
(v)配列番号11に示されるアミノ酸配列を有する第1のヒトFcポリペプチド;および
(vi)配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する第2のヒトFcポリペプチド。
本開示のヒト化抗-Met抗体フラグメント(hOA-DN30-cl03H08)対象物(object)は以下で構成される:
(i)配列番号21に示されるアミノ酸配列を有するヒト化軽鎖可変ドメイン;
(ii)配列番号22に示されるアミノ酸配列を有するヒト化重鎖可変ドメイン;
(iii)配列番号9に示されるアミノ酸配列を有するヒト軽鎖定常(CL)ドメイン;
(iv)配列番号10に示されるアミノ酸配列を有するヒト重鎖定常CH1ドメイン;
(v)配列番号11に示されるアミノ酸配列を有する第1のヒトFcポリペプチド;および
(vi)配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する第2のヒトFcポリペプチド。
本開示のヒト化抗-Met抗体フラグメント(hOA-DN30-cl04H08)対象物(object)は以下で構成される:
(i)配列番号23に示されるアミノ酸配列を有するヒト化軽鎖可変ドメイン;
(ii)配列番号24に示されるアミノ酸配列を有するヒト化重鎖可変ドメイン;
(iii)配列番号9に示されるアミノ酸配列を有するヒト軽鎖定常(CL)ドメイン;
(iv)配列番号10に示されるアミノ酸配列を有するヒト重鎖定常CH1ドメイン;
(v)配列番号11に示されるアミノ酸配列を有する第1のヒトFcポリペプチド;および
(vi)配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する第2のヒトFcポリペプチド。
キメラおよびヒト1本アーム抗体の発現および精製
上述の軽鎖(ヌクレオチド配列は、ヒト化軽鎖に関して配列番号25、26、27、28、29に示され、キメラ軽鎖に関して配列番号30に示される)、重鎖(ヌクレオチド配列は、ヒト化重鎖に関して配列番号31、32、33、34、35に示され、キメラ重鎖に関して配列番号36に示される)、および、Fc(ヌクレオチド配列は、配列番号37に示される)をコードするcDNAを、一般に利用可能な発現ベクター(例えばpcDNA3.1プラスミドcat.# V79020 Invitrogen Corporation,Camarillo,CA)内にクローニングして、ExpiCHO-S細胞(cat.#:A29127,ThermoFisher Scientific)をトランスフェクトするために用いた。ベクター比は、所望の97.5kDaヘテロ二量体(OA-Ab)の産出を最大にして、いかなる150kDa二価ホモ二量体(本物のMab)の存在も最小にするように最適化された。最適な比は、軽鎖、重鎖の全サイズ(「ノブ」ベクター)およびFc(「ホール」ベクター)に関してそれぞれ1:1:2であった。この条件は、最少量のホモ二量体の存在をもたらし、ヘテロ二量体は全タンパク質のおよそ85%であった。一過性発現を、ExpiFectamine(商標)CHOトランスフェクション試薬(cat.# A29130,ThermoFisher Scientific)によって生じさせた(powered)。生産の9日後に上清を回収した。OA-DN30抗体を、AKTA Pure 25クロマトグラフィーシステム上のHitrap MabSelect Sureカラム(cat.# GE29-0491-04,Sigma Aldrich)を用いて精製した。OA-DN30抗体をその後、0.1Mクエン酸バッファー(pH3.0)を用いて溶出させた。溶出画分を回収して、1M Tris-HCl(pH9.0)を用いて中和させた(溶出タンパク質1mlあたり0.15mlの比で)。OA-DN30抗体を、GE AKTA Prime Liquid Chromatography System(GE Healthcare Life Sciences)上の1×PBS(pH7.4)-平衡化Superdex 200 26/600サイズの溶出カラム(cat.# GE28-9893-36,Sigma Aldrich)に対してさらに精製して、OA-Abを含む画分を、ホモ二量体画分(mAbまたはFc)から分離した。OA-DN30抗体を含む予備SEC画分をプールして、SDS-PAGEによって分析して純度を確認した。プールした画分は、エンドトキシンレベルに関しても試験した。予備SEC精製からの最終的なプール画分は、いかなる二価ホモ二量体も存在しないこと、および、ノブ-ノブFcホモ二量体に相当する少量(<5%)のより小さな約70kDaのバンドの存在を示した。
突然変異Met外部ドメインの作製、発現、および精製
単一アミノ酸置換を保有するヒトMET外部ドメイン(DecoyMet)のcDNA配列を、GenBankにおいて寄託番号X54559で開示されるヒトMet外部ドメイン配列からスタートして、QuickChange II部位特異的突然変異誘発キット(cat.# 200524 Agilent Technologies,Santa Clara,CA)を用いて、製造元の説明書に従って合成的に生産した。手順は、所望の点突然変異を含むセンスおよびアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計が必要である。以下のオリゴを用いた:
-突然変異K842E:
sn. 5’-gtacataatcctgtgtttgagccttttgaaaagccagtg-3’(配列番号42);
as. 5’-cactggcttttcaaaaggctcaaacacaggattatgtac-3’(配列番号43)。
改変された可溶性受容体を、DecoyMet突然変異体をコードするcDNAを発現するpcDNA3.1プラスミド(cat.# V79020 Invitrogen Corporation,Camarillo,CA)を用いたHEK-293T細胞の一過的トランスフェクションによって生産した。トランスフェクトされた細胞を3日間飢餓状態にさせて、可溶性受容体を含んでいる細胞培養上清を回収した。組み換えタンパク質の精製を、HisTrap HPカラム(cat.# 17524701 GE Healthcare,Freiburg,Germany)を用いたアフィニティークロマトグラフィーによって、製造元の説明書に従って行なった。大スケールのタンパク質生産および精製を、U-Protein Express BV(Utrecht,The Netherlands)によって行なった。
ヒトDecoyMet(DecoyMetK842E)の変異体は、配列番号14に示されるアミノ酸配列を有する。
SDS-PAGE+ブルークーマシーによる精製されたタンパク質の分析。
精製されたOA-DN30抗体(1μg)を、標準的な方法に従って、β-メルカプトエタノールの不存在下で、存在下で、SDS-PAGEによって4~12%アクリルアミドの勾配ゲル内へ分離させた。分子量マーカー(cat.# 1610374,Bio-Rad)を分析に含めた。ゲル内で分離したポリペプチドを、Gel Code Blue Stain試薬によって明らかにした(cat.# 24590,Thermo Fisher Scientific)。
ELISA結合アッセイ
MetとDN30誘導体の間の相互作用の分析のために、精製されたMet-Fcキメラ(cat #. 358-MT-100 R&D Systems,100ng/ウェル)をELISAプレート上に固定化した。37℃で1時間、0.5%BSAのインキュベートにより飽和させた後、増加する濃度の抗体(MvDN30、chOA-DN30またはhOA-DN30抗体(PBS-BSA 0.5%-Tween0.1%中、0~500nMに調製))を液相内に添加した。結合を、HRP-コンジュゲート抗-ヒトk鎖抗体(cat.# A7164,Sigma-Aldrich)を用いて、その後に、TMB(cat.# T8665,Sigma Aldrich)とのインキュベーションにより明らかにした。比色分析法を、マルチラベルプレートリーダーVICTOR-X4(Perkin Elmer Instruments INC.,Whaltman,MA)によって定量化した。データを分析して、Prismソフトウェア(GraphPad)を用いてフィットさせた。
異なる種に由来するMet-Fcキメラ(固相)に対するhOA-DN30-cl03E08(液相)のELISA結合分析のために、ヒト(cat#. 358-MT-100 R&D Systems)、ミューリン(cat.# 50622-M02H,Sino Biological)、ラット(cat.# 80004-R02H,Sino Biological)、およびサル(cat.# 90304-C02H、Sino Biological)起源のMetをアッセイに含めた。手順は上述したものと同様であった。
フローサイトメーター結合分析
細胞の表面に発現されたMetに対するhOA-DN30-cl03E08結合について、2×10のEBC-1、C2C12、H9C2、MDCK、またはCos-7細胞を、StemPro(商標)Accutase(商標)細胞解離試薬(cat.# A1110501,ThermoFisher Scientific)で処理して、回収し、PBS-2% FCS中で4℃にて1時間インキュベートした。抗体染色を、PBS-2% BSA中、10μg/mlのhOA-DN30-cl03E08と4℃にて30分間、細胞をインキュベートすることによって、抗体染色を行なった。PBS-2% BSAを用いて6回洗浄した後、細胞を、1:100に希釈された抗-ヒトIgG-APC(cat.# 109-606-088 Jackson Immuno Research)と4℃にて30分間インキュベートして、それから洗浄して、結合しなかった抗体を除去した。DAPI(3μlの1μg/ml使用液、Sigma-Aldrich,cat.# 10236276001)を用いて4℃にて5分間、細胞を共染色して、Summit 4.3ソフトウェア(Dako)によってMet発現について分析した。アイソタイプコントロール(抗-ヒトAPC IgG)に由来する蛍光シグナルを閾値(0<MFI<10)として設定した。細胞は、平均蛍光強度(MFI)が閾値よりも高い場合に(MFI>10)、Met発現に関してポジティブと考えた。
Metシェディングの分析
サブコンフルエントなA549単層をPBSで2回洗浄して、それから、増加する濃度(37、111、333、1000nM)のDN-30誘導体とともに血清フリー培地内でインキュベートした。48時間後、馴化培地を回収して、Laemmliバッファーで細胞を溶解させた。Metタンパク質レベルを、抗-Met抗体(3D4,cat.# 08-1366 Invitrogen Corporation)を用いたウエスタンブロットによって15μgの全細胞タンパク質において決定して;ローディングコントロールとして、フィルターを抗-ビンキュリン抗体(クローンhVIN-1,cat.# V9131 Sigma Life Science)でもプローブした。Met外部ドメインレベルを、受容体の細胞外ドメインに対して向けられた抗-ヒトHGFR/Met抗体(cat.# AF276,R&D Systems)を用いたウエスタンブロッティングにより、15μlの細胞培養上清において決定した。抗‐マウスIgG1 HRP-コンジュゲート二次抗体(cat.# JI115035003,Jackson ImmunoResearch)およびECL System(cat.# W1015,Promega,)をタンパク質検出に用いた。ウエスタンブロットバンドを、ImageJソフトウェアを用いて定量化した。
METリン酸化アッセイ
血清不足のGTL-16細胞を、DN30誘導体とともに24時間インキュベートした(1000または250nM)。全細胞溶解物を、以下の一次抗体:抗-Met phospho-Tyr1234/1235(D26,cat.# 3077 Cell Signaling Technology);抗-Met(3D4,cat.# 08-1366 Invitrogen Corporation);および抗-ビンキュリン(クローンhVIN-1、cat.# V9131 Sigma Life Science)を用いて、ウエスタンブロットにより分析した。抗-マウスIgG1および抗-ウサギIgG(cat.# JI111035003)HRP-コンジュゲート二次抗体およびECL Systemをタンパク質検出に用いた。ウエスタンブロットバンドを、ImageJソフトウェアを用いて定量化した。
インビトロ生物学的アッセイ
細胞散乱アッセイのために、HPAF-II細胞(8000/ウェル)を、完全培養培地中、96ウェルプレート内に蒔いた。抗体のアゴニスト活性を分析するために、24時間後、HGF(8ng/ml、ポジティブコントロール、cat.# 294-HG-025,R&D Systems)または抗体(DN30 mAb、MvDN30、chOA-DN30、hOA-DN30抗体、全て200nMの濃度)を、培養培地に添加した。阻害活性を分析するために、増加する濃度(0~4μM)のhOA-DN30-cl03E08を、単独またはDecoyMetK842Eとの1:1の組み合わせで添加した。さらに24時間後、細胞を6.25ng/ml HGFで24時間刺激した。それから、細胞を11%グルタルアルデヒド(cat.# 340855 Sigma-Aldrich)で固定化して、0.1% Crystal Violet(cat.# C3886 Sigma-Aldrich)で染色して、顕微鏡観察(顕微鏡Leica DM2000)によって分析した。画像を、QICAM Fast 1394カラーデジタルカメラ(QImaging)を用いてキャプチャーした。
細胞浸潤アッセイのために、HPAF-II細胞(1.5×10/ウェル)を、0.5μMのhOA-DN30-cl03E08が単独または1μM DecoyMetK842Eと組み合わせて存在する血清フリー培養培地内に懸濁して、30μg/ウェルのマトリゲルマトリックス(cat.# 354234,Corning Inc.)で予めコーティングされたトランスウェルチャンバーの上側区画に蒔いた。2% FBSおよび6.25ng/ml HGFで補充された培養培地をチャンバーの下側区画に添加した。24時間後、トランスウェルフィルターの上側の細胞を機械的に除去して、膜を通って遊走した細胞を11%グルタルアルデヒドで固定化して、0.1% Crystal Violetで染色した。細胞浸潤をImage-Jソフトウェアで定量化した。
生命力アッセイのために、GTL-16細胞を、10%FBS培養培地中、96ウェルプレート内に2000細胞/ウェル蒔いた。24時間後、培地を、10%FBSプラス試験される分子(増加する濃度-0~10μM)を含む新鮮な培地で交換した。72時間後に、細胞生存能力を、CellTiter-Glo(cat.# G7573 Promega Corp)を用いて、製造元の説明書に従って評価した。化学発光をVICTOR X4で検出した。
増殖アッセイのために、350000 GTL-16細胞を、10%FCS培地中、6ウェルプレート内にプレーティングした。24時間後、細胞を、固定濃度(1μM)のDN30誘導体を用いてさらに48時間処理した。それから、さらに2時間、10μM EdU(cat.# A10044,Thermo Fisher)を培養培地に添加した。S相の細胞の%を、Click-iT(商標)EdU Alexa Fluor(商標)488フローサイトメトリーアッセイ(cat.# C10425,Thermo Fisher)の手順に従って細胞蛍光光度分析によって決定した。
細胞毒性アッセイのために、2000 GTL-16細胞を、10%FCS培地中、96ウェルプレート内にプレーティングした。24時間後、細胞を、増加する濃度のDN30誘導体を用いてさらに48時間処理した。細胞毒性を、製造元の説明書に従ってCell-Tox(商標)Green細胞毒性アッセイ(cat.# G8741,Promega)によって評価した。
PD-L1発現分析
サブコンフルエントなGTl-16細胞を、50ng/mlのIFNγ-1b(Miltenyi Biotec,cat.# 130-096-484)を用いて48時間(24時間ごとに交換)、250nMのhOA-DN30-cl03E08と組み合わせて処理した。それから、単層をLaemmliバッファー中に溶解させて、45μgの全タンパク質を8%SDS-PAGEゲルに供した。標準的な方法に従って、タンパク質をゲルからiBlot Transferニトロセルロース膜(Life technologies,cat.# IB23001)上に移した。PD-L1発現を、抗-PD-L1抗体(E1L3N,cat.# 13684,Cell Signaling Technology)によって検出した。P-Metレベルを、抗-MET phospho-Tyr1234/1235(D26)抗体によってチェックした。ローディングコントロールとして、フィルターを抗-GAPDH(D4C6R,cat.# 97166Cell Signaling Technology)でプローブした。二次HRP-コンジュゲートヤギ抗-マウスIgG(cat.# JI115035003)または抗-ウサギIgG(cat.# JI111035144)(両方ともJackson Immuno Research)およびECL Systemをタンパク質検出に用いた。
インビボ実験
全ての動物手順は、Fondazione Piemontese per la Ricerca sul Cancroの動物実験に関する倫理委員会およびイタリア保健省によって承認されたプロトコルに従って行われた。NOD-SCIDマウスはCharles River(Calco,Italy)から購入した。
薬物動態分析のために、NOD-SCIDマウスに単回投与(100μg)のhOA-DN30-cl03E08を静脈内注入した。末梢血を異なる時点:10分、30分、1時間、4時間、8時間、24時間、48時間、72時間、120時間に回収した。治療的分子の血清濃度を、結合アッセイのセクションにおいて上述したとおりにELISAによって測定して、異なる精製分子の段階希釈によって得られた検量線の直線部分上にサンプルの吸光度の値を挿入した。それぞれの時点は、4匹のマウスの平均値であった。
腫瘍増殖分析のために、1×10 GTL-16細胞をNOD-SCIDマウスの脇腹に接種した。腫瘍増殖をカリパス測定によって1週間に2回モニターした。腫瘍体積を、式:V=4/3π(x/2)(y/2)(z/2)を用いて計算した(x、yおよびzは、腫瘍体積の高さ、幅および深さである)。腫瘍が70~100mmの体積に到達したときに(細胞注入のおよそ1週後)、マウスを均一なグループにランダム化した。1つの場合では、4つのグループが作製されて(PBS-ビヒクル、MvDN30、chOA-DN30、hOA-DN30-cl03E08;全ての抗体は30mg/kg、1週あたり2回);他方の場合では、5つのグループが作製された(PBS-ビヒクル、hOA-DN30-cl03E08 60mg/kg、30mg/kg、10mg/kg、3.3mg/kg;全ての用量は1週あたり3回)。分子を静脈内注入によって投与した。実験の終わりに(15日または17日の処置)、マウスを屠殺して、腫瘍を切除して計量した。
統計分析
平均および標準偏差(SD)は、Microsoft Office Excel 2010ソフトウェア(Microsoft Corporation)を用いて計算した。K値を計算するために、GraphPad Prismソフトウェア(GraphPadソフトウェア)を用いて、非線形回帰、1サイト結合双曲線に従って、ELISAアッセイからのデータを分析およびフィッティングした。IC50およびEC50値を計算するために、GraphPad Prismソフトウェアを用いて、非線形回帰、シグモイド用量応答曲線に従ってデータを分析およびフィッティングした。全ての実験は、少なくとも2回繰り返した。図は1つの代表的な実験を示す。

Figure 2022504392000001

Figure 2022504392000002
Figure 2022504392000003
Figure 2022504392000004
Figure 2022504392000005
Figure 2022504392000006

Claims (18)

  1. 単一の抗原結合アームおよびFc領域を含む抗-Met抗体フラグメントであって(Fc領域は、前記抗原結合アームを含むFab分子と比較して前記抗体フラグメントの安定性を増大させる)、
    前記Fc領域は、第1および第2のFcポリペプチドの複合体を含み、ここで、前記抗体フラグメントは、以下を含む:
    (i)1つのヒト化軽鎖可変(VL)ドメインおよび1つのヒト軽鎖定常(CL)ドメインを含む第1のポリペプチド、
    ここで前記ヒト化VLドメインは、N末端からC末端の方向で、前記ヒトCLドメインに融合されて、ここで、前記ヒト化VLドメインは、配列番号1、2および3に示されるアミノ酸配列を有する3つの相補性決定領域(CDR)を含み、ここで、前記ヒト化VLドメインは、配列番号7に示されるアミノ酸配列を有する;
    (ii)1つのヒト化重鎖可変(VH)ドメイン、1つのヒト重鎖定常CH1ドメインおよび前記第1のFcポリペプチドを含む第2のポリペプチド、
    ここで前記第1のFcポリペプチドは、1つのヒンジ領域、1つのヒト定常CH2ドメインおよび1つのヒトCH3定常ドメインを含み、ここで、N末端からC末端の方向で、前記ヒト化VHドメインが前記ヒトCH1ドメインに融合されて、それがヒトヒンジ領域に融合されて、それが前記ヒトCH2ドメインに融合されて、それが前記ヒトCH3ドメインに融合されて、ここで、前記ヒト化VHドメインは、配列番号4、5および6に示されるアミノ酸配列を有する3つの相補性決定領域(CDR)を含み、ここで前記ヒト化VHドメインは、配列番号8に示されるアミノ酸配列を有する;および
    (iii)第2のヒトFcポリペプチドを含む第3のポリペプチド、
    ここで前記第2のヒトFcポリペプチドは、1つのヒトヒンジ領域、1つのヒト定常CH2ドメインおよび1つのヒトCH3定常ドメインを含み、ここで、N末端からC末端の方向で、前記ヒトヒンジ領域が前記CH2ドメインに融合されて、それが前記ヒトCH3ドメインに融合されて、ここで、前記ヒトヒンジ領域は、N末端がトランケートされている、
    抗-Met抗体フラグメント。
  2. 請求項1に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記ヒトCLドメインは、ヒト軽鎖κタイプドメインである、
    抗-Met抗体フラグメント。
  3. 請求項1または2に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記ヒトヒンジ領域および前記ヒト定常ドメインCH1、CH2およびCH3は、ヒトIgG1由来である、
    抗-Met抗体フラグメント。
  4. 請求項1から3のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記の2つのFcポリペプチドは、ヒンジ領域において分子間ジスルフィド結合によって連結されている、
    抗-Met抗体フラグメント。
  5. 請求項1から4のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記第1のFcポリペプチドおよび前記第2のFcポリペプチドは、境界面において接触していて(meet)、前記第1および前記第2のFcポリペプチドの間の一方は前記境界面にノブを含み、前記第1および前記第2のFcポリペプチドの間の他方は前記境界面にホールを含み、ここで、前記ノブは前記ホール内に配置可能である、
    抗-Met抗体フラグメント。
  6. 請求項5に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記第1および前記第2のFcポリペプチドの間の一方は、突然変異したCH3定常ドメインを含み、ここで、前記の突然変異したCH3定常ドメインは、389位にアミノ酸突然変異を保有し、ここで、389位の元のアミノ酸は、元のアミノ酸よりも大きな側鎖体積を有するアミノ酸を取り込むように突然変異されていて;
    前記第1および前記第2のFcポリペプチドの間の他方は、突然変異したCH3定常ドメインを含み、ここで、前記の突然変異したCH3定常ドメインは、3つのアミノ酸突然変異を389位、391位および438位に保有し、ここで、元のアミノ酸は、元のアミノ酸よりも小さな側鎖体積を有するアミノ酸を取り込むように突然変異されていて、
    ここで、アミノ酸ナンバリングはKabatのEUナンバリング・スキームに従っている、
    抗-Met抗体フラグメント。
  7. 請求項6に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    389位、391位および438位の元のアミノ酸は、それぞれ、トレオニン、ロイシンおよびチロシンであり;
    ここで、前記第1および前記第2のFcポリペプチドの間の一方において、389位のトレオニンはトリプトファンに突然変異されていて;
    ここで、前記第1および前記第2のFcポリペプチドの間の他方において、389位のトレオニンはセリンに突然変異されていて、391位のロイシンはアラニンに突然変異されていて、438位のチロシンはバリンに突然変異されている、
    抗-Met抗体フラグメント。
  8. 請求項1から7のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記ヒトCLドメインは、配列番号9に示されるアミノ酸配列を有し、前記ヒトCH1ドメインは、配列番号10に示されるアミノ酸配列を有する、
    抗-Met抗体フラグメント。
  9. 請求項1から8のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    第1のヒトFcポリペプチドは、配列番号11に示されるアミノ酸配列を有し、第2のヒトFcポリペプチドは、配列番号12に示されるアミノ酸配列を有する、
    抗-Met抗体フラグメント。
  10. 請求項1から9のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントであって、
    前記抗-Met抗体フラグメントは、Metに結合すると、Metの細胞外ドメインのシェディングを誘導する、
    抗-Met抗体フラグメント。
  11. 請求項1から10のいずれかの抗-Met抗体フラグメントをコードする、
    単離された核酸。
  12. 請求項1から10のいずれかの抗-Met抗体フラグメントを、集合的に(collectively)コードする2以上の組み換え核酸を含む、
    組成物。
  13. 単一のボトル内または2つのボトル内に、(a)請求項1から10のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントおよび薬学的に許容できるビヒクル、および(b)ヒトMetの細胞外部分および薬学的に許容できるビヒクルを含む生産物であって、
    ヒトMetの前記細胞外部分は、安定した様式で肝細胞増殖因子(HGF)に結合することが可能であり、前記抗-Met抗体フラグメントによって認識されるエピトープにおいて、前記抗-Met抗体フラグメントがそれに結合するのを防ぐための少なくとも1つのアミノ酸突然変異を含む、
    生産物。
  14. 請求項13に記載の生産物であって、
    ヒトMetの前記細胞外部分は、SEMA、PSI、IPT-1、IPT-2、IPT-3およびIPT-4ドメインを含む、
    生産物。
  15. 請求項13または14に記載の生産物であって、
    ヒトMetの前記細胞外部分は、配列番号13に示されるアミノ酸配列を有し、
    ここで、配列番号13の797位と875位の間のアミノ酸の少なくとも1つは、前記抗-Met抗体フラグメントがそれに結合するのを防ぐために突然変異されている、
    生産物。
  16. 請求項13から15のいずれか一項に記載の生産物であって、
    ヒトMetの前記細胞外部分は、配列番号14に示されるアミノ酸配列を有する、
    生産物。
  17. 腫瘍および/または転移を患っている患者の治療での使用のための、請求項1から10のいずれか一項に記載の抗-Met抗体フラグメントまたは請求項13から16のいずれか一項に記載の生産物であって、
    前記患者は、MET遺伝子の遺伝子変異を保有している、
    抗-Met抗体フラグメントまたは生産物。
  18. 腫瘍および/または転移を患っている患者の治療での使用のための、請求項13から16のいずれか一項に記載の生産物であって、
    前記患者は、野生型MET遺伝子を保有している、
    生産物。
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