JP2022174247A - 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 - Google Patents
前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2022174247A JP2022174247A JP2022147510A JP2022147510A JP2022174247A JP 2022174247 A JP2022174247 A JP 2022174247A JP 2022147510 A JP2022147510 A JP 2022147510A JP 2022147510 A JP2022147510 A JP 2022147510A JP 2022174247 A JP2022174247 A JP 2022174247A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- mir
- hsa
- gene
- seq
- mirbase accession
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 title claims abstract description 323
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 title claims abstract description 322
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title abstract description 11
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 220
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims abstract description 65
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims abstract description 65
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims abstract description 65
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims abstract description 3
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 238
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims description 135
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims description 135
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims description 135
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 67
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 65
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 47
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 47
- -1 miR-1273g-3p Proteins 0.000 claims description 46
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 39
- 108091093160 Homo sapiens miR-1343 stem-loop Proteins 0.000 claims description 30
- 108091044921 Homo sapiens miR-1225 stem-loop Proteins 0.000 claims description 28
- 108091079276 Homo sapiens miR-1908 stem-loop Proteins 0.000 claims description 28
- 108091079265 Homo sapiens miR-1915 stem-loop Proteins 0.000 claims description 28
- 108091059229 Homo sapiens miR-486-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 28
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 28
- 108091023095 Homo sapiens miR-4707 stem-loop Proteins 0.000 claims description 27
- 108091024622 Homo sapiens miR-6765 stem-loop Proteins 0.000 claims description 27
- 108091053840 Homo sapiens miR-486 stem-loop Proteins 0.000 claims description 26
- 108091055493 Homo sapiens miR-4443 stem-loop Proteins 0.000 claims description 18
- 108091089762 miR-1225 stem-loop Proteins 0.000 claims description 18
- 108091024510 Homo sapiens miR-6820 stem-loop Proteins 0.000 claims description 17
- 108091070381 Homo sapiens miR-92a-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 17
- 108091093187 Homo sapiens miR-4745 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091067481 miR-1343 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091083606 miR-1908 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091023567 miR-1915 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091025224 miR-4707 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091039994 miR-486 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091093039 miR-6765 stem-loop Proteins 0.000 claims description 16
- 108091044911 Homo sapiens miR-1203 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091044940 Homo sapiens miR-1231 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091069004 Homo sapiens miR-125a stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091067635 Homo sapiens miR-187 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091067269 Homo sapiens miR-371a stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091061778 Homo sapiens miR-615 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091044906 Homo sapiens miR-663b stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091092101 Homo sapiens miR-711 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091086475 Homo sapiens miR-760 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091087068 Homo sapiens miR-920 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091063740 Homo sapiens miR-92b stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 108091087105 Homo sapiens miR-939 stem-loop Proteins 0.000 claims description 15
- 239000000439 tumor marker Substances 0.000 claims description 15
- 108091044937 Homo sapiens miR-1237 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091044882 Homo sapiens miR-1247 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091044759 Homo sapiens miR-1268a stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091065160 Homo sapiens miR-128-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091079295 Homo sapiens miR-1914 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055169 Homo sapiens miR-2392 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091072863 Homo sapiens miR-3131 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055458 Homo sapiens miR-3135b stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091072712 Homo sapiens miR-3178 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091056148 Homo sapiens miR-3180-4 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091056152 Homo sapiens miR-3180-5 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091072666 Homo sapiens miR-3185 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091072638 Homo sapiens miR-3197 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091056758 Homo sapiens miR-3619 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091056640 Homo sapiens miR-3663 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091056608 Homo sapiens miR-3679 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055974 Homo sapiens miR-3917 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091035083 Homo sapiens miR-4257 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091035089 Homo sapiens miR-4258 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055494 Homo sapiens miR-4446 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055376 Homo sapiens miR-4448 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055444 Homo sapiens miR-4454 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055456 Homo sapiens miR-4467 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055280 Homo sapiens miR-4497 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055320 Homo sapiens miR-4516 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055357 Homo sapiens miR-4525 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091055349 Homo sapiens miR-4530 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091054145 Homo sapiens miR-4534 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023067 Homo sapiens miR-4648 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023065 Homo sapiens miR-4649 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023071 Homo sapiens miR-4651 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023136 Homo sapiens miR-4674 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023135 Homo sapiens miR-4675 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023077 Homo sapiens miR-4695 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091093166 Homo sapiens miR-4741 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091093188 Homo sapiens miR-4746 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091062311 Homo sapiens miR-5090 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091030816 Homo sapiens miR-5195 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091090411 Homo sapiens miR-5572 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091039975 Homo sapiens miR-6090 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091058649 Homo sapiens miR-6125 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091058658 Homo sapiens miR-6126 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091058618 Homo sapiens miR-6132 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091054791 Homo sapiens miR-642b stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091060463 Homo sapiens miR-671 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024723 Homo sapiens miR-6722 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024748 Homo sapiens miR-6726 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024747 Homo sapiens miR-6727 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024745 Homo sapiens miR-6729 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024560 Homo sapiens miR-6741 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024549 Homo sapiens miR-6749 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024516 Homo sapiens miR-6756 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024515 Homo sapiens miR-6757 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024409 Homo sapiens miR-6780b stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024434 Homo sapiens miR-6781 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024422 Homo sapiens miR-6791 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024604 Homo sapiens miR-6799 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024603 Homo sapiens miR-6800 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024504 Homo sapiens miR-6816 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024495 Homo sapiens miR-6825 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024494 Homo sapiens miR-6826 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024415 Homo sapiens miR-6840 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024386 Homo sapiens miR-6861 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024296 Homo sapiens miR-6870 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024294 Homo sapiens miR-6872 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091024284 Homo sapiens miR-6880 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091023504 Homo sapiens miR-7108 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091059213 Homo sapiens miR-7150 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091086454 Homo sapiens miR-744 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091082619 Homo sapiens miR-7845 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091082621 Homo sapiens miR-7847 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091083060 Homo sapiens miR-7975 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091083050 Homo sapiens miR-7977 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091080300 Homo sapiens miR-8063 stem-loop Proteins 0.000 claims description 14
- 108091038941 Homo sapiens miR-1199 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091044902 Homo sapiens miR-1202 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091044803 Homo sapiens miR-1207 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091044926 Homo sapiens miR-1227 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091044953 Homo sapiens miR-1228 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091044862 Homo sapiens miR-1260a stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055552 Homo sapiens miR-1268b stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091044777 Homo sapiens miR-1275 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091069005 Homo sapiens miR-128-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091064840 Homo sapiens miR-1469 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091070491 Homo sapiens miR-16-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091068927 Homo sapiens miR-16-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091067470 Homo sapiens miR-204 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091067471 Homo sapiens miR-211 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091065453 Homo sapiens miR-296 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091072943 Homo sapiens miR-3141 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091072941 Homo sapiens miR-3154 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091072956 Homo sapiens miR-3162 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091072670 Homo sapiens miR-3184 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091072682 Homo sapiens miR-3188 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091072554 Homo sapiens miR-3195 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091056649 Homo sapiens miR-3622a stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091056642 Homo sapiens miR-3665 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055993 Homo sapiens miR-3928 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091054965 Homo sapiens miR-3940 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091032109 Homo sapiens miR-423 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091035151 Homo sapiens miR-4270 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091034228 Homo sapiens miR-4286 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091082535 Homo sapiens miR-4433b stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055492 Homo sapiens miR-4442 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055517 Homo sapiens miR-4450 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055455 Homo sapiens miR-4466 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055360 Homo sapiens miR-4486 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055364 Homo sapiens miR-4488 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055282 Homo sapiens miR-4492 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055251 Homo sapiens miR-4505 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055170 Homo sapiens miR-4508 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091055184 Homo sapiens miR-4513 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091032683 Homo sapiens miR-451a stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023289 Homo sapiens miR-4632 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023268 Homo sapiens miR-4638 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023171 Homo sapiens miR-4655 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023059 Homo sapiens miR-4656 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023225 Homo sapiens miR-4667 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023075 Homo sapiens miR-4689 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023121 Homo sapiens miR-4706 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093197 Homo sapiens miR-4723 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093120 Homo sapiens miR-4725 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093121 Homo sapiens miR-4726 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093112 Homo sapiens miR-4728 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093115 Homo sapiens miR-4730 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093164 Homo sapiens miR-4739 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091093140 Homo sapiens miR-4758 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091064344 Homo sapiens miR-4763 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091064270 Homo sapiens miR-4787 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091063720 Homo sapiens miR-575 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091087715 Homo sapiens miR-5787 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091039968 Homo sapiens miR-6085 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091040081 Homo sapiens miR-6088 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091040080 Homo sapiens miR-6089-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091059355 Homo sapiens miR-6089-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091058648 Homo sapiens miR-6124 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091061773 Homo sapiens miR-614 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091061629 Homo sapiens miR-642a stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091061569 Homo sapiens miR-663a stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091086478 Homo sapiens miR-665 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024578 Homo sapiens miR-6717 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024752 Homo sapiens miR-6732 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024563 Homo sapiens miR-6738 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024552 Homo sapiens miR-6746 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024546 Homo sapiens miR-6752 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024626 Homo sapiens miR-6763 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024619 Homo sapiens miR-6768 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024617 Homo sapiens miR-6769a stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024615 Homo sapiens miR-6771 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024438 Homo sapiens miR-6777 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024437 Homo sapiens miR-6778 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024433 Homo sapiens miR-6782 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024429 Homo sapiens miR-6784 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024418 Homo sapiens miR-6785 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024427 Homo sapiens miR-6787 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024424 Homo sapiens miR-6789 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024598 Homo sapiens miR-6795 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024605 Homo sapiens miR-6798 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024587 Homo sapiens miR-6806 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024511 Homo sapiens miR-6819 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024509 Homo sapiens miR-6821 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024413 Homo sapiens miR-6842 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024399 Homo sapiens miR-6845 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024285 Homo sapiens miR-6879 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024279 Homo sapiens miR-6885 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024277 Homo sapiens miR-6887 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091024275 Homo sapiens miR-6889 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023502 Homo sapiens miR-7110 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023499 Homo sapiens miR-7113 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091023498 Homo sapiens miR-7114 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091062103 Homo sapiens miR-762 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091080210 Homo sapiens miR-8072 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091086472 Homo sapiens miR-887 stem-loop Proteins 0.000 claims description 13
- 108091065163 Homo sapiens miR-30c-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091056656 Homo sapiens miR-3648-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091045458 Homo sapiens miR-3648-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091054963 Homo sapiens miR-3937 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091035223 Homo sapiens miR-4294 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091055300 Homo sapiens miR-4476 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091063727 Homo sapiens miR-564 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091024581 Homo sapiens miR-6724-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091045544 Homo sapiens miR-6724-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091045545 Homo sapiens miR-6724-3 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091045536 Homo sapiens miR-6724-4 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091080216 Homo sapiens miR-8069-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091045537 Homo sapiens miR-8069-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 12
- 108091065418 miR-3196 stem-loop Proteins 0.000 claims description 10
- 108091066065 miR-6893 stem-loop Proteins 0.000 claims description 10
- 108091007699 MIR665 Proteins 0.000 claims description 9
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 9
- 108091047658 miR-564 stem-loop Proteins 0.000 claims description 9
- 108091059194 miR-1199 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091023403 miR-1202 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091061661 miR-1203 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091054042 miR-1207 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091069563 miR-1227 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091038228 miR-1228 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091026639 miR-1231 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091029235 miR-1237 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091063365 miR-1247 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091044988 miR-125a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091030503 miR-1260 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091046552 miR-1260a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091051364 miR-1268a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091051216 miR-1268b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091046573 miR-1275 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091059786 miR-128-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091084874 miR-128-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091025226 miR-1469 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091027943 miR-16 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091074057 miR-16-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056204 miR-16-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091058104 miR-187 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091092658 miR-1914 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091031479 miR-204 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091050113 miR-211 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056350 miR-2392 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091072917 miR-30c-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091024450 miR-3131 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091067577 miR-3135b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091049132 miR-3141 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091050341 miR-3154 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091049091 miR-3162 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091024889 miR-3178 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091074280 miR-3180-4 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091071422 miR-3180-5 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091054011 miR-3184 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091058499 miR-3185 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091084051 miR-3188 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091041315 miR-3195 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091072864 miR-3197 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091070943 miR-3619 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091049175 miR-3622a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091074917 miR-3648-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091068682 miR-3648-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091074983 miR-3663 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091031765 miR-3665 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091063862 miR-3679 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091084261 miR-371a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091089984 miR-3917 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091023797 miR-3928 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091044896 miR-3937 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091067045 miR-3940 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091037240 miR-423 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091083981 miR-4257 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091087307 miR-4258 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091040106 miR-4270 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091045749 miR-4286 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091042852 miR-4286-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091026483 miR-4286-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091044119 miR-4294 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091081490 miR-4433b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091080785 miR-4442 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091050001 miR-4443 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091026561 miR-4446 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091049213 miR-4448 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091069249 miR-4450 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091086296 miR-4454 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091024081 miR-4466 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091063838 miR-4467 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091091760 miR-4476 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091031945 miR-4486 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091023265 miR-4488 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091051303 miR-4492 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091085600 miR-4497 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091030677 miR-4505 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091067289 miR-4508 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091032770 miR-451 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091024689 miR-4513 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091076510 miR-4516 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091030646 miR-451a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091039747 miR-4525 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091069755 miR-4530 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091061755 miR-4534 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091072900 miR-4632 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091076448 miR-4638 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091059107 miR-4648 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091045645 miR-4649 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091084610 miR-4651 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091037723 miR-4655 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091027339 miR-4656 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091048511 miR-4667 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091064820 miR-4674 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091042724 miR-4675 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091039779 miR-4689 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091073101 miR-4695 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091055058 miR-4706 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091029231 miR-4723 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091091975 miR-4725 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091051365 miR-4726 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091026023 miR-4730 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091070033 miR-4739 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091051063 miR-4741 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091086598 miR-4745 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091047134 miR-4746 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091028942 miR-4758 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091042192 miR-4763 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091046922 miR-4787 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091066143 miR-5090 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091046447 miR-5195 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091081539 miR-5572 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091023843 miR-575 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091053849 miR-5787 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091076992 miR-6085 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091028954 miR-6088 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091041816 miR-6089-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091050321 miR-6089-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091026149 miR-6090 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091070938 miR-6124 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056045 miR-6125 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091063759 miR-6126 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091049487 miR-6132 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091080596 miR-614 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091090051 miR-615 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056346 miR-642a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091037880 miR-642b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091047242 miR-663a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056912 miR-663b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091074443 miR-665 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091080656 miR-6717 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091080977 miR-6722 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091033500 miR-6724-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091028790 miR-6724-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091027189 miR-6724-3 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091091376 miR-6724-4 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091079237 miR-6726 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091072770 miR-6727 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091029501 miR-6729 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091089272 miR-6732 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091043302 miR-6738 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091076592 miR-6741 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091087858 miR-6746 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091031642 miR-6749 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091029996 miR-6752 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091057536 miR-6756 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091055008 miR-6757 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091068741 miR-6763 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091043300 miR-6769a stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091078360 miR-6771 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091038301 miR-6777 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056166 miR-6778 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091091172 miR-6780b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091026002 miR-6781 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091044566 miR-6782 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091063398 miR-6784 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091036652 miR-6785 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091092662 miR-6787 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091069334 miR-6789 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091050497 miR-6791 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091089501 miR-6795 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091080905 miR-6798 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091039096 miR-6799 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091088263 miR-6806 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091035366 miR-6816 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091045240 miR-6819 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091080655 miR-6821 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091025839 miR-6825 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091091327 miR-6826 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091059935 miR-6840 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091044703 miR-6842 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091027924 miR-6861 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091082565 miR-6870 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091048968 miR-6872 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091081168 miR-6879 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091067341 miR-6880 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091048812 miR-6885 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091054079 miR-6887 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091041558 miR-6889 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091056340 miR-7108 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091050357 miR-711 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091025547 miR-7110 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091051217 miR-7113 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091047496 miR-7114 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091049877 miR-7150 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091084078 miR-744 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091088163 miR-760 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091076478 miR-762 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091066925 miR-762-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091069941 miR-762-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091042292 miR-762-3 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091041880 miR-7845 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091035453 miR-7847 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091090965 miR-7975 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091073127 miR-7977 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091090499 miR-8063 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091086363 miR-8069-1 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091062539 miR-8069-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091074949 miR-8072 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091092836 miR-887 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091092043 miR-920 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091025616 miR-92a-2 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091038507 miR-92b stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 108091062136 miR-939 stem-loop Proteins 0.000 claims description 8
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 8
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 7
- 108091036689 miR-296 stem-loop Proteins 0.000 claims description 7
- 108091060492 miR-4728 stem-loop Proteins 0.000 claims description 7
- 108091092761 miR-671 stem-loop Proteins 0.000 claims description 7
- 108091049732 miR-6768 stem-loop Proteins 0.000 claims description 7
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 6
- 108091061921 miR-6779 stem-loop Proteins 0.000 claims description 6
- 108091045873 miR-6800 stem-loop Proteins 0.000 claims description 6
- 108091086261 miR-6820 stem-loop Proteins 0.000 claims description 6
- 108091058515 miR-6845 stem-loop Proteins 0.000 claims description 6
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 claims description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 claims description 4
- 238000003499 nucleic acid array Methods 0.000 claims description 2
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 abstract description 47
- 108091070501 miRNA Proteins 0.000 abstract description 14
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1346
- 108091030146 MiRBase Proteins 0.000 description 444
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 226
- 241000894007 species Species 0.000 description 219
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 187
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 48
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 46
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 28
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 22
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 17
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 14
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 14
- 108010072866 Prostate-Specific Antigen Proteins 0.000 description 13
- 102100038358 Prostate-specific antigen Human genes 0.000 description 13
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 12
- 108091024436 Homo sapiens miR-6779 stem-loop Proteins 0.000 description 11
- 108091024339 Homo sapiens miR-6893 stem-loop Proteins 0.000 description 11
- 108091072632 Homo sapiens miR-3196 stem-loop Proteins 0.000 description 9
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 8
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 8
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 7
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 7
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 6
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 6
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- 210000001808 exosome Anatomy 0.000 description 5
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 4
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 4
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 4
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 4
- 108091058688 miR-141 stem-loop Proteins 0.000 description 4
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 4
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 4
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 3
- 108091027558 IsomiR Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 108091033411 PCA3 Proteins 0.000 description 3
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 3
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 3
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 3
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 3
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 3
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 3
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 3
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 108091007428 primary miRNA Proteins 0.000 description 3
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 3
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 101150084967 EPCAM gene Proteins 0.000 description 2
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 2
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 2
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- 108020005093 RNA Precursors Proteins 0.000 description 2
- 208000008383 Wilms tumor Diseases 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008827 biological function Effects 0.000 description 2
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 210000000582 semen Anatomy 0.000 description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 206010004446 Benign prostatic hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 108091070395 Homo sapiens miR-31 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 239000000232 Lipid Bilayer Substances 0.000 description 1
- 208000007433 Lymphatic Metastasis Diseases 0.000 description 1
- 108091007701 MIR3162 Proteins 0.000 description 1
- 108091007707 MIR4454 Proteins 0.000 description 1
- 108091036422 MiR-296 Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 241000282579 Pan Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 1
- 241000288906 Primates Species 0.000 description 1
- 208000004403 Prostatic Hyperplasia Diseases 0.000 description 1
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 1
- 102000003661 Ribonuclease III Human genes 0.000 description 1
- 108010057163 Ribonuclease III Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 108091081021 Sense strand Proteins 0.000 description 1
- 108020004688 Small Nuclear RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000039471 Small Nuclear RNA Human genes 0.000 description 1
- 108020003224 Small Nucleolar RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000042773 Small Nucleolar RNA Human genes 0.000 description 1
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical class [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 1
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000037429 base substitution Effects 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 238000007469 bone scintigraphy Methods 0.000 description 1
- 238000002725 brachytherapy Methods 0.000 description 1
- 125000002057 carboxymethyl group Chemical group [H]OC(=O)C([H])([H])[*] 0.000 description 1
- 238000002681 cryosurgery Methods 0.000 description 1
- 230000002498 deadly effect Effects 0.000 description 1
- 230000009615 deamination Effects 0.000 description 1
- 238000006481 deamination reaction Methods 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 231100000517 death Toxicity 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000009261 endocrine therapy Methods 0.000 description 1
- 229940034984 endocrine therapy antineoplastic and immunomodulating agent Drugs 0.000 description 1
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000011347 external beam therapy Methods 0.000 description 1
- 210000000416 exudates and transudate Anatomy 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 1
- 208000024200 hematopoietic and lymphoid system neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000001794 hormone therapy Methods 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 1
- 210000002751 lymph Anatomy 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 1
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 1
- 108091029294 miR472 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 238000004223 overdiagnosis Methods 0.000 description 1
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 1
- 230000002028 premature Effects 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 210000005267 prostate cell Anatomy 0.000 description 1
- 201000007094 prostatitis Diseases 0.000 description 1
- 238000011472 radical prostatectomy Methods 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 210000000664 rectum Anatomy 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000000528 statistical test Methods 0.000 description 1
- 125000000446 sulfanediyl group Chemical group *S* 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 210000004243 sweat Anatomy 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
- C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N37/00—Details not covered by any other group of this subclass
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
Abstract
【課題】本発明は、前立腺がんの検出用キット又はデバイス、並びに、検出方法を提供することを課題とする。【解決手段】本発明によれば、被験体の検体中のmiRNAと特異的に結合可能な核酸を含む、前立腺がん検出用キット又はデバイス、並びに、該miRNAをin vitroで測定することを含む、前立腺がんを検出する方法が提供される。【選択図】なし
Description
本発明は、被験体において前立腺がんへの罹患の有無の検査のために使用される、特定のmiRNAと特異的に結合可能な核酸を含む前立腺がんの検出用キット又はデバイス、及び当該核酸を用いて当該miRNAの発現量を測定することを含む前立腺がんの検出方法に関する。
前立腺は男性の精液の一部を作る臓器で、膀胱の下、直腸の前に位置する。前立腺がんは、この前立腺の細胞が無秩序に増殖を繰り返す疾患である。独立行政法人国立がん研究センターがん対策情報センターが開示する2011年の日本国内における部位別のがんの統計によると、前立腺がんの罹患者数は51,534人、つまり日本人男性の14人に1人が罹患するとされ、男性における罹患数が第4位のがん部位である。また、前立腺がんによる死亡者数は10,823人にのぼり、男性における死亡者数が第6位のがん部位である。また米国では、7人に1人の割合で男性が前立腺がんを発症すると言われており、特に高齢者で多く、65歳以上では10人に6人の男性が前立腺がんと診断される(非特許文献1)。米国の2014年の推定前立腺がん罹患者数は233,000人にも上り、そのうち約29,480人が死亡するとされる(非特許文献1)。
前立腺がんの進行度は非特許文献2に定められており、腫瘍の広がり(T1a~c、T2a~c、T3a~b、T4)、リンパ節転移(N0、N1)、遠隔転移(M0、M1a~c)などによって、ステージI(T1~T2a/N0/M0)、ステージII(T2b~c/N0/M0)、ステージIII(T3/N0/M0)、ステージIV(T4/N0/M0及びN1及びcM1)に分類される。
前立腺がんの多くは進行が比較的ゆっくりであることから、5年相対生存率はほぼ100%と最も予後が良いがんの一つである(非特許文献1)。しかしながら、前立腺がんの中には比較的早く進行し、様々な障害や症状を引き起こすものもあり、ステージ4で遠隔転移が認められる前立腺がんは、5年相対生存率が28%と格段に低い(非特許文献1)。
前立腺がんの治療は原則的には外科治療、放射線治療、内分泌療法(ホルモン療法)、更には特別な治療を実施せず、腫瘍マーカーであるPSAを監視しながら経過観察を続ける待機療法がある。特に、早期の前立腺がんの治療には幾つか選択肢があり、待機療法の他に、放射線外照射療法、内部放射線療法(小線源治療)、根治的前立腺摘除術、凍結手術などがある(非特許文献1)。
非特許文献1に記載されているように、前立腺がんの1次検査には、血中腫瘍マーカーであるPSA検査が広く用いられている。PSA測定値が高い場合に、直腸診や経直腸的前立腺超音波検査が実施され、さらに前立腺がんが疑われる場合に確定診断として生体組織検査が実施される。また、遠隔転移が疑われる場合には、CT検査、MRI検査、骨シンチグラフィ検査などの画像検査も行われる。
前立腺特異的抗原であるPSAは、前立腺で生成され精液に含まれるが、血中にも僅かながら存在する。一般男性の通常血中PSA濃度は4ng/mL以下とされており、この基準値を超えた場合、前立腺がんが疑われる(非特許文献1)。血中PSA濃度は、無症状のうちの早期の前立腺がんでも上昇すること、がんの進行度にも相関すること、などから有用であるとされ広く普及している。また、米国がん協会は前立腺がんの早期検出を推奨し、前立腺がんのスクリーニングを望む被験者はPSA検査を受診すべき、と進言している(非特許文献1)。
研究段階ではあるが、特許文献1~3に示されるように、血液をはじめとする生体サンプル中のマイクロRNA(miRNA)の発現量、又はmiRNAの発現量と他のマーカーの発現量とを組み合わせることによって、前立腺がんを検出するという報告がある。
特許文献1には血液中のhsa-miR-760、hsa-miR-920、has-miR-887-3p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-663b、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-371a-5p、has-miR-575、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-1915-5pなどを用いて前立腺がんをはじめとし、その他、ウィルムス腫瘍およびCOPDを検出する方法が示されている。
特許文献2には血液中の小胞をEpCamを用いて単離し、小胞に含まれるhsa-miR-92b-5pなどのmiRNAを用いて前立腺がんなどを検出する方法が示されている。
特許文献3には、PCA3遺伝子の発現量とmiR-141の発現量を組み合わせることによって、前立腺がんを判別するという報告がある。
American Cancer Society 「Prostate Cancer」、2013年監修、 p5、14~26、32~54、68~70
Sobin、 L.ら、「TNM Classification of Malignant Tumours 第7版」2010年、p.230~234
Wolf、 AM.ら、2010年、A Cancer Journal for Clinicians、第60(2)巻、p.70-98
Mitchell PS.ら、2008年、Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Status of America、第105(30)巻、p.10513-10518
本発明の課題は、新規な前立腺がん腫瘍マーカーを見出し、当該マーカーに特異的に結合可能な核酸を用いて前立腺がんを効果的に検出できる方法を提供することである。前立腺がんの腫瘍マーカー検査としては、PSA検査が広く普及している。しかしながら、PSA検査は、血中濃度基準値である4ng/mL以下の男性の15%でも生体組織検査で前立腺がん陽性と判定されることが知られており、また一方で、がんが無くとも、良性の前立腺肥大や前立腺炎を患っている男性、及び一般男性高齢者であれば血中PSA濃度は上昇することから、偽陽性が高いことでも知られる(非特許文献1)。また、前立腺がん以外のがんを誤って検出してしまう場合も偽陽性につながる。このようなPSA検査における高い偽陽性は過剰診断、過剰治療へと繋がり、不要な前立腺がん治療による様々な後遺症が近年問題視されている(非特許文献3)。具体的なPSA検査の性能は、5000名以上の被験者をリクルートした大規模研究(非特許文献3)によると、前立腺がん全体で感度は20.5%と低く、悪性度が高い前立腺がんに限っても51%に留まっており、術前検査としての腫瘍マーカー測定の意義は乏しいとされている。
また研究段階ではあるが血液をはじめとする生体サンプル中のマイクロRNA(miRNA)の発現量を用いて前立腺がんを判別するという報告が下記のようにあるが、いずれも実用化に至っていない。
特許文献1には血液中のhsa-miR-760、hsa-miR-920、has-miR-887-3p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-663b、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-371a-5p、has-miR-575、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-711、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-1915-5pなどを用いて前立腺がんをはじめとし、その他、ウィルムス腫瘍およびCOPDを検出する方法が示されている。しかしながら、特許文献1には多くのmiRNAが記載されている一方、上記miRNAマーカーが前立腺がんのマーカーであることを示した直接的な記述はなく、上記miRNAマーカーの前立腺がんマーカーとしての有用性の証明に欠けている。
特許文献2には血液中の小胞をEpCamを用いて単離し、小胞に含まれるhsa-miR-92b-5pなどのmiRNAを用いて前立腺がんを検出する方法が示されているが、上記miRNAマーカーは独立した検体群で再現検証されておらず、前立腺がんを検出するための基準も記載されていないため、信頼性に欠ける。
特許文献3には具体的にmiR-141とPCA3の発現量を組み合わせることで、前立腺がんを100%の感度、特異度で判別できるとしているが、単一のマーカーで簡便に、かつ高精度に判別できるという記載はない。実際に、特許文献3には、非特許文献4が引用されているが、非特許文献4では血清中のmiR-141による前立腺がん判別が報告されており、判別の精度は特異度100%のとき、感度60%とされている。また、現在一般に用いられているPCA3検査の対象検体は尿であり、特に直腸指診後の尿を用いるとされている。一方、miR-141による前立腺がん判別の対象検体は上述のように血液(血清)であり、両者を組み合わせて高い感度・特異度の結果を得るには、2種の検体の採取が必要である。
本発明者らは上記課題を解決すべく鋭意検討の結果、低侵襲に採取できる血液から前立腺がんの検出マーカーに使用可能な数個の遺伝子を見出し、これに特異的に結合可能な核酸を用いることにより、前立腺がんを有意に検出できることを見いだし、本発明を完成するに至った。
<発明の概要>
すなわち、本発明は、以下の特徴を有する。
(1)前立腺がんマーカーである、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、前立腺がんの検出用キット。
すなわち、本発明は、以下の特徴を有する。
(1)前立腺がんマーカーである、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、前立腺がんの検出用キット。
(2)miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-4257がhsa-miR-4257であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-4745-5pがhsa-miR-4745-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-4258がhsa-miR-4258であり、miR-4448がhsa-miR-4448であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-2392がhsa-miR-2392であり、miR-1273g-3pがhsa-miR-1273g-3pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-3619-3pがhsa-miR-3619-3pであり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-4525がhsa-miR-4525であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-7150がhsa-miR-7150であり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-4497がhsa-miR-4497であり、miR-6090がhsa-miR-6090であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4530がhsa-miR-4530であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-4674がhsa-miR-4674であり、miR-3917がhsa-miR-3917であり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-6800-5pがhsa-miR-6800-5pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-6872-3pがhsa-miR-6872-3pであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-1908-3pがhsa-miR-1908-3pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-6799-5pがhsa-miR-6799-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-5090がhsa-miR-5090であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-1237-5pがhsa-miR-1237-5pであり、miR-4758-5pがhsa-miR-4758-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6768-5pがhsa-miR-6768-5pであり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-6821-5pがhsa-miR-6821-5pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-4726-5pがhsa-miR-4726-5pであり、miR-6124がhsa-miR-6124であり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-4508がhsa-miR-4508であり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-6763-5pがhsa-miR-6763-5pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3928-3pがhsa-miR-3928-3pであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-4505がhsa-miR-4505であり、miR-3154がhsa-miR-3154であり、miR-3648がhsa-miR-3648であり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、miR-7113-3pがhsa-miR-7113-3pであり、miR-6819-5pがhsa-miR-6819-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pであり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-4656がhsa-miR-4656であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-1202がhsa-miR-1202であり、miR-3162-5pがhsa-miR-3162-5pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-3665がhsa-miR-3665であり、miR-3940-5pがhsa-miR-3940-5pであり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-4723-5pがhsa-miR-4723-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-4730がhsa-miR-4730であり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-4787-5pがhsa-miR-4787-5pであり、miR-5787がhsa-miR-5787であり、miR-6085がhsa-miR-6085であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-6778-5pがhsa-miR-6778-5pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6789-5pがhsa-miR-6789-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、及び、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pである、(1)に記載のキット。
(3)前記核酸が、下記の(a)~(e)に示すポリヌクレオチド:
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(1)又は(2)に記載のキット。
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(1)又は(2)に記載のキット。
(4)前記キットが、別の前立腺がんマーカーである、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、(1)~(3)のいずれかに記載のキット。
(5)miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-760がhsa-miR-760であり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-575がhsa-miR-575であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-920がhsa-miR-920であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-16-5pがhsa-miR-16-5pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-564がhsa-miR-564であり、及び、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pである、(4)に記載のキット。
(6)前記核酸が、下記の(f)~(j)に示すポリヌクレオチド:
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(4)又は(5)に記載のキット。
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(4)又は(5)に記載のキット。
(7)前記キットが、別の前立腺がんマーカーである、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、(1)~(6)のいずれかに記載のキット。
(8)miR-4763-3pがhsa-miR-4763-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-4488がhsa-miR-4488であり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-1228-5pがhsa-miR-1228-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-1207-5pがhsa-miR-1207-5pであり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6879-5pがhsa-miR-6879-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4638-5pがhsa-miR-4638-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-4270がhsa-miR-4270であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-665がhsa-miR-665であり、miR-486-5pがhsa-miR-486-5pであり、miR-4655-5pがhsa-miR-4655-5pであり、miR-1275がhsa-miR-1275であり、miR-6806-5pがhsa-miR-6806-5pであり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-6752-5pがhsa-miR-6752-5pであり、miR-6771-5pがhsa-miR-6771-5pであり、miR-4450がhsa-miR-4450であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-7114-5pがhsa-miR-7114-5pであり、及び、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pである、(7)に記載のキット。
(9)前記核酸が、下記の(k)~(o)に示すポリヌクレオチド:
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(7)又は(8)に記載のキット。
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(7)又は(8)に記載のキット。
(10)前記キットが、(1)又は(2)に記載のすべての前立腺がんマーカーから選択される少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2つ以上の核酸を含む、(1)~(9)のいずれかに記載のキット。
(11)前立腺がんマーカーである、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、前立腺がんの検出用デバイス。
(12)miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-4257がhsa-miR-4257であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-4745-5pがhsa-miR-4745-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-4258がhsa-miR-4258であり、miR-4448がhsa-miR-4448であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-2392がhsa-miR-2392であり、miR-1273g-3pがhsa-miR-1273g-3pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-3619-3pがhsa-miR-3619-3pであり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-4525がhsa-miR-4525であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-7150がhsa-miR-7150であり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-4497がhsa-miR-4497であり、miR-6090がhsa-miR-6090であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4530がhsa-miR-4530であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-4674がhsa-miR-4674であり、miR-3917がhsa-miR-3917であり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-6800-5pがhsa-miR-6800-5pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-6872-3pがhsa-miR-6872-3pであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-1908-3pがhsa-miR-1908-3pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-6799-5pがhsa-miR-6799-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-5090がhsa-miR-5090であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-1237-5pがhsa-miR-1237-5pであり、miR-4758-5pがhsa-miR-4758-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6768-5pがhsa-miR-6768-5pであり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-6821-5pがhsa-miR-6821-5pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-4726-5pがhsa-miR-4726-5pであり、miR-6124がhsa-miR-6124であり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-4508がhsa-miR-4508であり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-6763-5pがhsa-miR-6763-5pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3928-3pがhsa-miR-3928-3pであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-4505がhsa-miR-4505であり、miR-3154がhsa-miR-3154であり、miR-3648がhsa-miR-3648であり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、miR-7113-3pがhsa-miR-7113-3pであり、miR-6819-5pがhsa-miR-6819-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pであり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-4656がhsa-miR-4656であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-1202がhsa-miR-1202であり、miR-3162-5pがhsa-miR-3162-5pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-3665がhsa-miR-3665であり、miR-3940-5pがhsa-miR-3940-5pであり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-4723-5pがhsa-miR-4723-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-4730がhsa-miR-4730であり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-4787-5pがhsa-miR-4787-5pであり、miR-5787がhsa-miR-5787であり、miR-6085がhsa-miR-6085であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-6778-5pがhsa-miR-6778-5pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6789-5pがhsa-miR-6789-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、及び、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pである、(11)に記載のデバイス。
(13)前記核酸が、下記の(a)~(e)に示すポリヌクレオチド:
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(11)又は(12)に記載のデバイス。
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(11)又は(12)に記載のデバイス。
(14)前記デバイスが、別の前立腺がんマーカーである、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、(11)~(13)のいずれかに記載のデバイス。
(15)miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-760がhsa-miR-760であり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-575がhsa-miR-575であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-920がhsa-miR-920であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-16-5pがhsa-miR-16-5pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-564がhsa-miR-564であり、及び、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pである、(14)に記載のデバイス。
(16)前記核酸が、下記の(f)~(j)に示すポリヌクレオチド:
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(14)又は(15)に記載のデバイス。
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(14)又は(15)に記載のデバイス。
(17)前記デバイスが、別の前立腺がんマーカーである、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、(11)~(16)のいずれかに記載のデバイス。
(18)miR-4763-3pがhsa-miR-4763-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-4488がhsa-miR-4488であり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-1228-5pがhsa-miR-1228-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-1207-5pがhsa-miR-1207-5pであり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6879-5pがhsa-miR-6879-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4638-5pがhsa-miR-4638-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-4270がhsa-miR-4270であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-665がhsa-miR-665であり、miR-486-5pがhsa-miR-486-5pであり、miR-4655-5pがhsa-miR-4655-5pであり、miR-1275がhsa-miR-1275であり、miR-6806-5pがhsa-miR-6806-5pであり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-6752-5pがhsa-miR-6752-5pであり、miR-6771-5pがhsa-miR-6771-5pであり、miR-4450がhsa-miR-4450であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-7114-5pがhsa-miR-7114-5pであり、及び、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pである、(17)に記載のデバイス。
(19)前記核酸が、下記の(k)~(o)に示すポリヌクレオチド:
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(17)又は(18)に記載のデバイス。
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、(17)又は(18)に記載のデバイス。
(20)前記デバイスが、ハイブリダイゼーション技術による測定のためのデバイスである、(11)~(19)のいずれかに記載のデバイス。
(21)前記ハイブリダイゼーション技術が、核酸アレイ技術である、(20)に記載のデバイス。
(22)前記デバイスが、(11)又は(12)に記載のすべての前立腺がんマーカーから選択される少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2つ以上の核酸を含む、(11)~(21)のいずれかに記載のデバイス。
(23)(1)~(10)のいずれかに記載のキット又は(11)~(22)のいずれかに記載のデバイスを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が前立腺がんに罹患していること、又は前立腺がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、前立腺がんの検出方法。
(24)前記被験体が、ヒトである、(23)に記載の方法。
(25)前記検体が、血液、血清又は血漿である、(23)または(24)に記載の方法。
<用語の定義>
本明細書中で使用する用語は、以下の定義を有する。
本明細書中で使用する用語は、以下の定義を有する。
ヌクレオチド、ポリヌクレオチド、DNA、RNAなどの略号による表示は、「塩基配列又はアミノ酸配列を含む明細書等の作成のためのガイドライン」(日本国特許庁編)及び当技術分野における慣用に従うものとする。
本明細書において「ポリヌクレオチド」とは、RNA、DNA、及びRNA/DNA(キメラ)のいずれも包含する核酸に対して用いられる。なお、上記DNAには、cDNA、ゲノムDNA、及び合成DNAのいずれもが含まれる。また上記RNAには、total RNA、mRNA、rRNA、miRNA、siRNA、snoRNA、snRNA、non-coding RNA及び合成RNAのいずれもが含まれる。本明細書において「合成DNA」及び「合成RNA」は、所定の塩基配列(天然型配列又は非天然型配列のいずれでもよい。)に基づいて、例えば自動核酸合成機を用いて、人工的に作製されたDNA及びRNAをいう。本明細書において「非天然型配列」は、広義の意味に用いることを意図しており、天然型配列と異なる、たとえば1以上のヌクレオチドの置換、欠失、挿入及び/又は付加を含む配列(すなわち、変異配列)、1以上の修飾ヌクレオチドを含む配列(すなわち、修飾配列)、などを包含する。また、本明細書では、ポリヌクレオチドは核酸と互換的に使用される。
本明細書において「断片」とは、ポリヌクレオチドの連続した一部分の塩基配列を有するポリヌクレオチドであり、15塩基以上、好ましくは17塩基以上、より好ましくは19塩基以上の長さを有することが望ましい。
本明細書において「遺伝子」とは、RNA、及び2本鎖DNAのみならず、それを構成する正鎖(又はセンス鎖)又は相補鎖(又はアンチセンス鎖)などの各1本鎖DNAを包含することを意図して用いられる。またその長さによって特に制限されるものではない。
従って、本明細書において「遺伝子」は、特に言及しない限り、ヒトゲノムDNAを含む2本鎖DNA、cDNAを含む1本鎖DNA(正鎖)、当該正鎖と相補的な配列を有する1本鎖DNA(相補鎖)、マイクロRNA(miRNA)、及びこれらの断片、及びそれらの転写産物のいずれも含む。また当該「遺伝子」は特定の塩基配列(又は配列番号)で表される「遺伝子」だけではなく、これらによってコードされるRNAと生物学的機能が同等であるRNA、例えば同族体(すなわち、ホモログもしくはオーソログ)、遺伝子多型などの変異体、及び誘導体をコードする「核酸」が包含される。かかる同族体、変異体又は誘導体をコードする「核酸」としては、具体的には、後に記載したストリンジェントな条件下で、配列番号1~684のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、の相補配列とハイブリダイズする塩基配列を有する「核酸」を挙げることができる。なお、「遺伝子」は、機能領域の別を問うものではなく、例えば発現制御領域、コード領域、エキソン又はイントロンを含むことができる。また、「遺伝子」は細胞に含まれていてもよく、細胞外に放出されて単独で存在していてもよく、またエキソソームと呼ばれる小胞に内包された状態にあってもよい。
本明細書において「エキソソーム」(別称「エクソソーム」)とは、細胞から分泌される脂質二重膜に包まれた小胞である。エキソソームは多胞エンドソームに由来し、細胞外環境に放出される際にRNA、DNA等の「遺伝子」やタンパク質などの生体物質を内部に含むことがある。エキソソームは血液、血清、血漿、血清、リンパ液等の体液に含まれることが知られている。
本明細書において「転写産物」とは、遺伝子のDNA配列を鋳型にして合成されたRNAのことをいう。RNAポリメラーゼが遺伝子の上流にあるプロモーターと呼ばれる部位に結合し、DNAの塩基配列に相補的になるように3’末端にリボヌクレオチドを結合させていく形でRNAが合成される。このRNAには遺伝子そのもののみならず、発現制御領域、コード領域、エキソン又はイントロンをはじめとする転写開始点からポリA配列の末端にいたるまでの全配列が含まれる。
また、本明細書において「マイクロRNA(miRNA)」は、特に言及しない限り、ヘアピン様構造のRNA前駆体として転写され、RNase III切断活性を有するdsRNA切断酵素により切断され、RISCと称するタンパク質複合体に取り込まれ、mRNAの翻訳抑制に関与する15~25塩基の非コーディングRNAを意図して用いられる。また本明細書で使用する「miRNA」は特定の塩基配列(又は配列番号)で表される「miRNA」だけではなく、当該「miRNA」の前駆体(pre-miRNA、pri-miRNA)、これらと生物学的機能が同等であるmiRNA、例えば同族体(すなわち、ホモログもしくはオーソログ)、遺伝子多型などの変異体、及び誘導体も包含する。かかる前駆体、同族体、変異体又は誘導体としては、具体的には、miRBase release 20(http://www.mirbase.org/)により同定することができ、後に記載したストリンジェントな条件下で、配列番号1~684のいずれかで表されるいずれかの特定塩基配列の相補配列とハイブリダイズする塩基配列を有する「miRNA」を挙げることができる。さらにまた、本明細書で使用する「miRNA」は、miR遺伝子の遺伝子産物であってもよく、そのような遺伝子産物は、成熟miRNA(例えば、上記のようなmRNAの翻訳抑制に関与する15~25塩基、又は19~25塩基、の非コーディングRNA)又はmiRNA前駆体(例えば、前記のようなpre-miRNA又はpri-miRNA)を包含する。
本明細書において「プローブ」とは、遺伝子の発現によって生じたRNA又はそれに由来するポリヌクレオチドを特異的に検出するために使用されるポリヌクレオチド及び/又はそれに相補的なポリヌクレオチドを包含する。
本明細書において「プライマー」とは、遺伝子の発現によって生じたRNA又はそれに由来するポリヌクレオチドを特異的に認識し、増幅するポリヌクレオチド及び/又はそれに相補的なポリヌクレオチドを包含する。
ここで相補的なポリヌクレオチド(相補鎖、逆鎖)とは、配列番号1~684のいずれかによって定義される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチドの全長配列、又はその部分配列、(ここでは便宜上、これを正鎖と呼ぶ)に対してA:T(U)、G:Cといった塩基対関係に基づいて、塩基的に相補的な関係にあるポリヌクレオチドを意味する。ただし、かかる相補鎖は、対象とする正鎖の塩基配列と完全に相補配列を形成する場合に限らず、対象とする正鎖とストリンジェントな条件でハイブリダイズできる程度の相補関係を有するものであってもよい。
本明細書において「ストリンジェントな条件」とは、核酸プローブが他の配列に対するよりも大きな程度(例えばバックグラウンド測定値の平均+バックグラウンド測定値の標準誤差×2以上の測定値)で、その標的配列に対してハイブリダイズする条件をいう。ストリンジェントな条件は配列依存性であり、ハイブリダイゼーションが行われる環境によって異なる。ハイブリダイゼーション及び/又は洗浄条件のストリンジェンシーを制御することにより、核酸プローブに対して100%相補的である標的配列が同定され得る。「ストリンジェントな条件」の具体例は、後述する。
本明細書において「Tm値」とは、ポリヌクレオチドの二本鎖部分が一本鎖へと変性し、二本鎖と一本鎖が1:1の比で存在する温度を意味する。
本明細書において「変異体」とは、核酸の場合、多型性、突然変異などに起因した天然の変異体、あるいは配列番号1~684のいずれかの塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、又はその部分配列において1、2もしくは3又はそれ以上の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む変異体、あるいは配列番号1~684のいずれかの配列の前駆体RNA(premature miRNA)の塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、又はその部分配列において1又は2以上の塩基の欠失、置換、付加又は挿入を含む変異体、あるいは当該塩基配列の各々又はその部分配列と約90%以上、約95%以上、約97%以上、約98%以上、約99%以上の%同一性を示す変異体、あるいは当該塩基配列又はその部分配列を含むポリヌクレオチド又はオリゴヌクレオチドと上記定義のストリンジェントな条件でハイブリダイズする核酸を意味する。
本明細書において「数個」とは、約10、9、8、7、6、5、4、3又は2個の整数を意味する。
本明細書において、変異体は、部位特異的突然変異誘発法、PCR法を利用した突然変異導入法などの周知の技術を用いて作製可能である。
本明細書において「%同一性」は、上記のBLASTやFASTAによるタンパク質又は遺伝子の検索システムを用いて、ギャップを導入して、又はギャップを導入しないで、決定することができる(Zheng Zhangら、2000年、J.Comput. Biol.、7巻、p203-214;Altschul、S.F.ら、1990年、Journal of Molecular Biology、第215巻、p403-410;Pearson、W.R.ら、1988年、Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.、第85巻、p2444-2448)。
本明細書において「誘導体」とは、修飾核酸、非限定的に例えば、蛍光団などによるラベル化誘導体、修飾ヌクレオチド(例えばハロゲン、メチルなどのアルキル、メトキシなどのアルコキシ、チオ、カルボキシメチルなどの基を含むヌクレオチド及び塩基の再構成、二重結合の飽和、脱アミノ化、酸素分子の硫黄分子への置換などを受けたヌクレオチドなど)を含む誘導体、PNA(peptide nucleic acid; Nielsen、P.E.ら、1991年、Science、254巻、p1497-500)、LNA(locked nucleic acid; Obika、S.ら、1998年、Tetrahedron Lett.、39巻、p5401-5404)などを含むことを意味する。
本明細書において、上記の前立腺がんマーカーであるmiRNAから選択されるポリヌクレオチドと特異的に結合可能な「核酸」は、合成又は調製された核酸であり、具体的には「核酸プローブ」又は「プライマー」を含み、被験体中の前立腺がんの存在の有無を検出するために、又は前立腺がんの罹患の有無、罹患の程度、前立腺がんの改善の有無や改善の程度、前立腺がんの治療に対する感受性を診断するために、あるいは前立腺がんの予防、改善又は治療に有用な候補物質をスクリーニングするために、直接又は間接的に利用される。これらには前立腺がんの罹患に関連して生体内、特に血液、尿等の体液等の検体において配列番号1~684のいずれかで表される転写産物又はそのcDNA合成核酸を特異的に認識し結合することのできるヌクレオチド、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドを包含する。これらのヌクレオチド、オリゴヌクレオチド及びポリヌクレオチドは、上記性質に基づいて生体内、組織や細胞内などで発現した上記遺伝子を検出するためのプローブとして、また生体内で発現した上記遺伝子を増幅するためのプライマーとして有効に利用することができる。
本明細書で使用する「検出」という用語は、検査、測定、検出又は、判定支援という用語で置換しうる。また、本明細書において「評価」という用語は、検査結果又は測定結果に基づいて診断又は評価を支援することを含む意味で使用される。
本明細書で使用される「被験体」は、ヒト、チンパンジーを含む霊長類、イヌ、ネコなどのペット動物、ウシ、ウマ、ヒツジ、ヤギなどの家畜動物、マウス、ラットなどの齧歯類などの哺乳動物を意味する。また、「健常体」もまた、このような哺乳動物であって、検出しようとするがんに罹患していない動物を意味する。
本明細書で使用される「P」又は「P値」とは、統計学的検定において、帰無仮説の下で実際にデータから計算された統計量よりも極端な統計量が観測される確率を示す。したがって「P」又は「P値」が小さいほど、比較対象間に有意差があるとみなせる。
本明細書において、「感度」は、(真陽性の数)/(真陽性の数+偽陰性の数)の値を意味する。感度が高ければ前立腺がんを早期に発見することが可能となり、完全ながん部の切除や再発率の低下につながる。
本明細書において、「特異度」は、(真陰性の数)/(真陰性の数+偽陽性の数)を意味する。特異度が高ければ健常体を前立腺がん患者と誤判別することによる無駄な追加検査の実施を防ぎ、患者の負担の軽減や医療費の削減につながる。
本明細書において、「精度」は(真陽性の数+真陰性の数)/(全症例数)の値を意味する。精度は全検体に対しての判別結果が正しかった割合を示しており、検出性能を評価する第一の指標となる。
本明細書において判定、検出又は診断の対象となる「検体」とは、前立腺がんの発生、前立腺がんの進行、及び前立腺がんに対する治療効果の発揮にともない本発明の遺伝子が発現変化する組織及び生体材料を指す。具体的には前立腺組織及びその周辺の脈管、リンパ節及び臓器、また転移が疑われる臓器、皮膚、及び血液、尿、唾液、汗、組織浸出液などの体液、血液から調製された血清、血漿、その他、便、毛髪などを指す。更にこれらから抽出された生体試料、具体的にはRNAやmiRNAなどの遺伝子を指す。
本明細書で使用される「hsa-miR-4443遺伝子」又は「hsa-miR-4443」という用語は、配列番号1に記載のhsa-miR-4443遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018961)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4443遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4443」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4443」(miRBase Accession No.MI0016786、配列番号188)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1908-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1908-5p」という用語は、配列番号2に記載のhsa-miR-1908-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007881)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1908-5p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p2496-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1908-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1908」(miRBase Accession No.MI0008329、配列番号189)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4257遺伝子」又は「hsa-miR-4257」という用語は、配列番号3に記載のhsa-miR-4257遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0016878)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4257遺伝子は、Goff LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4257」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4257」(miRBase Accession No.MI0015856、配列番号190)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3197遺伝子」又は「hsa-miR-3197」という用語は、配列番号4に記載のhsa-miR-3197遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015082)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3197遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3197」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3197」(miRBase Accession No.MI0014245、配列番号191)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3188遺伝子」又は「hsa-miR-3188」という用語は、配列番号5に記載のhsa-miR-3188遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015070)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3188遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3188」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3188」(miRBase Accession No.MI0014232、配列番号192)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4649-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4649-5p」という用語は、配列番号6に記載のhsa-miR-4649-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019711)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4649-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4649-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4649」(miRBase Accession No.MI0017276、配列番号193)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1343-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1343-3p」という用語は、配列番号7に記載のhsa-miR-1343-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019776)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1343-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1343-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1343」(miRBase Accession No.MI0017320、配列番号194)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6861-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6861-5p」という用語は、配列番号8に記載のhsa-miR-6861-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027623)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6861-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6861-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6861」(miRBase Accession No.MI0022708、配列番号195)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1343-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1343-5p」という用語は、配列番号9に記載のhsa-miR-1343-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027038)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1343-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1343-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1343」(miRBase Accession No.MI0017320、配列番号194)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-642b-3p遺伝子」又は「hsa-miR-642b-3p」という用語は、配列番号10に記載のhsa-miR-642b-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018444)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-642b-3p遺伝子は、Witten Dら、2010年、BMC Biol、8巻、p58に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-642b-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-642b」(miRBase Accession No.MI0016685、配列番号196)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6741-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6741-5p」という用語は、配列番号11に記載のhsa-miR-6741-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027383)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6741-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6741-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6741」(miRBase Accession No.MI0022586、配列番号197)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4745-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4745-5p」という用語は、配列番号12に記載のhsa-miR-4745-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019878)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4745-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4745-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4745」(miRBase Accession No.MI0017384、配列番号198)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6826-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6826-5p」という用語は、配列番号13に記載のhsa-miR-6826-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027552)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6826-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6826-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6826」(miRBase Accession No.MI0022671、配列番号199)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3663-3p遺伝子」又は「hsa-miR-3663-3p」という用語は、配列番号14に記載のhsa-miR-3663-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018085)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3663-3p遺伝子は、Liao JYら、2010年、PLoS One、5巻、e10563に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3663-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3663」(miRBase Accession No.MI0016064、配列番号200)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3131遺伝子」又は「hsa-miR-3131」という用語は、配列番号15に記載のhsa-miR-3131遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0014996)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3131遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3131」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3131」(miRBase Accession No.MI0014151、配列番号201)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-92a-2-5p遺伝子」又は「hsa-miR-92a-2-5p」という用語は、配列番号16に記載のhsa-miR-92a-2-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004508)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-92a-2-5p遺伝子は、Mourelatos Zら、2002年、Genes Dev、16巻、p720-728に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-92a-2-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-92a-2」(miRBase Accession No.MI0000094、配列番号202)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4258遺伝子」又は「hsa-miR-4258」という用語は、配列番号17に記載のhsa-miR-4258遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0016879)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4258遺伝子は、Goff LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4258」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4258」(miRBase Accession No.MI0015857、配列番号203)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4448遺伝子」又は「hsa-miR-4448」という用語は、配列番号18に記載のhsa-miR-4448遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018967)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4448遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4448」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4448」(miRBase Accession No.MI0016791、配列番号204)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6125遺伝子」又は「hsa-miR-6125」という用語は、配列番号19に記載のhsa-miR-6125遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0024598)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6125遺伝子は、Smith JLら、2012年、J Virol、86巻、p5278-5287に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6125」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6125」(miRBase Accession No.MI0021259、配列番号205)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6880-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6880-5p」という用語は、配列番号20に記載のhsa-miR-6880-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027660)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6880-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6880-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6880」(miRBase Accession No.MI0022727、配列番号206)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6132遺伝子」又は「hsa-miR-6132」という用語は、配列番号21に記載のhsa-miR-6132遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0024616)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6132遺伝子は、Dannemann Mら、2012年、Genome Biol Evol、4巻、p552-564に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6132」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6132」(miRBase Accession No.MI0021277、配列番号207)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4467遺伝子」又は「hsa-miR-4467」という用語は、配列番号22に記載のhsa-miR-4467遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018994)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4467遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4467」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4467」(miRBase Accession No.MI0016818、配列番号208)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6749-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6749-5p」という用語は、配列番号23に記載のhsa-miR-6749-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027398)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6749-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6749-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6749」(miRBase Accession No.MI0022594、配列番号209)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-2392遺伝子」又は「hsa-miR-2392」という用語は、配列番号24に記載のhsa-miR-2392遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019043)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-2392遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-2392」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-2392」(miRBase Accession No.MI0016870、配列番号210)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1273g-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1273g-3p」という用語は、配列番号25に記載のhsa-miR-1273g-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022742)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1273g-3p遺伝子は、Reshmi Gら、2011年、Genomics、97巻、p333-340に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1273g-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1273g」(miRBase Accession No.MI0018003、配列番号211)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4746-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4746-3p」という用語は、配列番号26に記載のhsa-miR-4746-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019881)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4746-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4746-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4746」(miRBase Accession No.MI0017385、配列番号212)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1914-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1914-3p」という用語は、配列番号27に記載のhsa-miR-1914-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007890)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1914-3p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p2496-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1914-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1914」(miRBase Accession No.MI0008335、配列番号213)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7845-5p遺伝子」又は「hsa-miR-7845-5p」という用語は、配列番号28に記載のhsa-miR-7845-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030420)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7845-5p遺伝子は、Ple Hら、2012年、PLoS One、7巻、e50746に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7845-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7845」(miRBase Accession No.MI0025515、配列番号214)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6726-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6726-5p」という用語は、配列番号29に記載のhsa-miR-6726-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027353)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6726-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6726-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6726」(miRBase Accession No.MI0022571、配列番号215)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-128-2-5p遺伝子」又は「hsa-miR-128-2-5p」という用語は、配列番号30に記載のhsa-miR-128-2-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0031095)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-128-2-5p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-128-2-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-128-2」(miRBase Accession No.MI0000727、配列番号216)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4651遺伝子」又は「hsa-miR-4651」という用語は、配列番号31に記載のhsa-miR-4651遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019715)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4651遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4651」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4651」(miRBase Accession No.MI0017279、配列番号217)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6765-3p遺伝子」又は「hsa-miR-6765-3p」という用語は、配列番号32に記載のhsa-miR-6765-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027431)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6765-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6765-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6765」(miRBase Accession No.MI0022610、配列番号218)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3185遺伝子」又は「hsa-miR-3185」という用語は、配列番号33に記載のhsa-miR-3185遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015065)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3185遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3185」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3185」(miRBase Accession No.MI0014227、配列番号219)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4792遺伝子」又は「hsa-miR-4792」という用語は、配列番号34に記載のhsa-miR-4792遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019964)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4792遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4792」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4792」(miRBase Accession No.MI0017439、配列番号220)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6887-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6887-5p」という用語は、配列番号35に記載のhsa-miR-6887-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027674)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6887-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6887-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6887」(miRBase Accession No.MI0022734、配列番号221)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-5572遺伝子」又は「hsa-miR-5572」という用語は、配列番号36に記載のhsa-miR-5572遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022260)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-5572遺伝子は、Tandon Mら、2012年、Oral Dis、18巻、p127-131に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-5572」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-5572」(miRBase Accession No.MI0019117、配列番号222)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3619-3p遺伝子」又は「hsa-miR-3619-3p」という用語は、配列番号37に記載のhsa-miR-3619-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019219)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3619-3p遺伝子は、Witten Dら、2010年、BMC Biol、8巻、p58に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3619-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3619」(miRBase Accession No.MI0016009、配列番号223)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6780b-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6780b-5p」という用語は、配列番号38に記載のhsa-miR-6780b-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027572)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6780b-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6780b-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6780b」(miRBase Accession No.MI0022681、配列番号224)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4707-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4707-5p」という用語は、配列番号39に記載のhsa-miR-4707-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019807)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4707-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4707-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4707」(miRBase Accession No.MI0017340、配列番号225)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-8063遺伝子」又は「hsa-miR-8063」という用語は、配列番号40に記載のhsa-miR-8063遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030990)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-8063遺伝子は、Wang HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-8063」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-8063」(miRBase Accession No.MI0025899、配列番号226)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4454遺伝子」又は「hsa-miR-4454」という用語は、配列番号41に記載のhsa-miR-4454遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018976)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4454遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4454」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4454」(miRBase Accession No.MI0016800、配列番号227)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4525遺伝子」又は「hsa-miR-4525」という用語は、配列番号42に記載のhsa-miR-4525遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019064)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4525遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4525」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4525」(miRBase Accession No.MI0016892、配列番号228)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7975遺伝子」又は「hsa-miR-7975」という用語は、配列番号43に記載のhsa-miR-7975遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0031178)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7975遺伝子は、Velthut-Meikas Aら、2013年、Mol Endocrinol、オンライン版、に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7975」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7975」(miRBase Accession No.MI0025751、配列番号229)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-744-5p遺伝子」又は「hsa-miR-744-5p」という用語は、配列番号44に記載のhsa-miR-744-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004945)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-744-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-744-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-744」(miRBase Accession No.MI0005559、配列番号230)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3135b遺伝子」又は「hsa-miR-3135b」という用語は、配列番号45に記載のhsa-miR-3135b遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018985)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3135b遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3135b」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3135b」(miRBase Accession No.MI0016809、配列番号231)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4648遺伝子」又は「hsa-miR-4648」という用語は、配列番号46に記載のhsa-miR-4648遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019710)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4648遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4648」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4648」(miRBase Accession No.MI0017275、配列番号232)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6816-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6816-5p」という用語は、配列番号47に記載のhsa-miR-6816-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027532)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6816-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6816-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6816」(miRBase Accession No.MI0022661、配列番号233)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4741遺伝子」又は「hsa-miR-4741」という用語は、配列番号48に記載のhsa-miR-4741遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019871)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4741遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4741」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4741」(miRBase Accession No.MI0017379、配列番号234)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7150遺伝子」又は「hsa-miR-7150」という用語は、配列番号49に記載のhsa-miR-7150遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028211)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7150遺伝子は、Oulas Aら、2009年、Nucleic Acids Res、37巻、p3276-3287に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7150」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7150」(miRBase Accession No.MI0023610、配列番号235)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6791-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6791-5p」という用語は、配列番号50に記載のhsa-miR-6791-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027482)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6791-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6791-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6791」(miRBase Accession No.MI0022636、配列番号236)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1247-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1247-3p」という用語は、配列番号51に記載のhsa-miR-1247-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022721)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1247-3p遺伝子は、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1247-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1247」(miRBase Accession No.MI0006382、配列番号237)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7977遺伝子」又は「hsa-miR-7977」という用語は、配列番号52に記載のhsa-miR-7977遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0031180)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7977遺伝子は、Velthut-Meikas Aら、2013年、Mol Endocrinol、オンライン版、に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7977」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7977」(miRBase Accession No.MI0025753、配列番号238)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4497遺伝子」又は「hsa-miR-4497」という用語は、配列番号53に記載のhsa-miR-4497遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019032)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4497遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4497」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4497」(miRBase Accession No.MI0016859、配列番号239)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6090遺伝子」又は「hsa-miR-6090」という用語は、配列番号54に記載のhsa-miR-6090遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0023715)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6090遺伝子は、Yoo JKら、2012年、Stem Cells Dev、21巻、p2049-2057に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6090」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6090」(miRBase Accession No.MI0020367、配列番号240)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6781-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6781-5p」という用語は、配列番号55に記載のhsa-miR-6781-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027462)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6781-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6781-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6781」(miRBase Accession No.MI0022626、配列番号241)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6870-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6870-5p」という用語は、配列番号56に記載のhsa-miR-6870-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027640)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6870-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6870-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6870」(miRBase Accession No.MI0022717、配列番号242)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6729-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6729-5p」という用語は、配列番号57に記載のhsa-miR-6729-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027359)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6729-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6729-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6729」(miRBase Accession No.MI0022574、配列番号243)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4530遺伝子」又は「hsa-miR-4530」という用語は、配列番号58に記載のhsa-miR-4530遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019069)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4530遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4530」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4530」(miRBase Accession No.MI0016897、配列番号244)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7847-3p遺伝子」又は「hsa-miR-7847-3p」という用語は、配列番号59に記載のhsa-miR-7847-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030422)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7847-3p遺伝子は、Ple Hら、2012年、PLoS One、7巻、e50746に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7847-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7847」(miRBase Accession No.MI0025517、配列番号245)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6825-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6825-5p」という用語は、配列番号60に記載のhsa-miR-6825-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027550)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6825-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6825-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6825」(miRBase Accession No.MI0022670、配列番号246)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4674遺伝子」又は「hsa-miR-4674」という用語は、配列番号61に記載のhsa-miR-4674遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019756)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4674遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4674」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4674」(miRBase Accession No.MI0017305、配列番号247)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3917遺伝子」又は「hsa-miR-3917」という用語は、配列番号62に記載のhsa-miR-3917遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018191)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3917遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3917」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3917」(miRBase Accession No.MI0016423、配列番号248)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4707-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4707-3p」という用語は、配列番号63に記載のhsa-miR-4707-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019808)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4707-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4707-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4707」(miRBase Accession No.MI0017340、配列番号225)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6885-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6885-5p」という用語は、配列番号64に記載のhsa-miR-6885-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027670)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6885-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6885-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6885」(miRBase Accession No.MI0022732、配列番号249)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6722-3p遺伝子」又は「hsa-miR-6722-3p」という用語は、配列番号65に記載のhsa-miR-6722-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025854)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6722-3p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6722-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6722」(miRBase Accession No.MI0022557、配列番号250)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4516遺伝子」又は「hsa-miR-4516」という用語は、配列番号66に記載のhsa-miR-4516遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019053)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4516遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4516」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4516」(miRBase Accession No.MI0016882、配列番号251)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6757-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6757-5p」という用語は、配列番号67に記載のhsa-miR-6757-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027414)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6757-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6757-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6757」(miRBase Accession No.MI0022602、配列番号252)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6840-3p遺伝子」又は「hsa-miR-6840-3p」という用語は、配列番号68に記載のhsa-miR-6840-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027583)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6840-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6840-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6840」(miRBase Accession No.MI0022686、配列番号253)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-5195-3p遺伝子」又は「hsa-miR-5195-3p」という用語は、配列番号69に記載のhsa-miR-5195-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0021127)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-5195-3p遺伝子は、Schotte Dら、2011年、Leukemia、25巻、p1389-1399に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-5195-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-5195」(miRBase Accession No.MI0018174、配列番号254)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6756-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6756-5p」という用語は、配列番号70に記載のhsa-miR-6756-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027412)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6756-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6756-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6756」(miRBase Accession No.MI0022601、配列番号255)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6800-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6800-5p」という用語は、配列番号71に記載のhsa-miR-6800-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027500)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6800-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6800-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6800」(miRBase Accession No.MI0022645、配列番号256)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6727-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6727-5p」という用語は、配列番号72に記載のhsa-miR-6727-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027355)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6727-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6727-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6727」(miRBase Accession No.MI0022572、配列番号257)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6126遺伝子」又は「hsa-miR-6126」という用語は、配列番号73に記載のhsa-miR-6126遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0024599)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6126遺伝子は、Smith JLら、2012年、J Virol、86巻、p5278-5287に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6126」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6126」(miRBase Accession No.MI0021260、配列番号258)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6872-3p遺伝子」又は「hsa-miR-6872-3p」という用語は、配列番号74に記載のhsa-miR-6872-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027645)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6872-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6872-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6872」(miRBase Accession No.MI0022719、配列番号259)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4446-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4446-3p」という用語は、配列番号75に記載のhsa-miR-4446-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018965)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4446-3p遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4446-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4446」(miRBase Accession No.MI0016789、配列番号260)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1268a遺伝子」又は「hsa-miR-1268a」という用語は、配列番号76に記載のhsa-miR-1268a遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005922)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1268a遺伝子は、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1268a」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1268a」(miRBase Accession No.MI0006405、配列番号261)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1908-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1908-3p」という用語は、配列番号77に記載のhsa-miR-1908-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0026916)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1908-3p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p2496-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1908-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1908」(miRBase Accession No.MI0008329、配列番号189)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3679-5p遺伝子」又は「hsa-miR-3679-5p」という用語は、配列番号78に記載のhsa-miR-3679-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018104)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3679-5p遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3679-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3679」(miRBase Accession No.MI0016080、配列番号262)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4534遺伝子」又は「hsa-miR-4534」という用語は、配列番号79に記載のhsa-miR-4534遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019073)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4534遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4534」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4534」(miRBase Accession No.MI0016901、配列番号263)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4675遺伝子」又は「hsa-miR-4675」という用語は、配列番号80に記載のhsa-miR-4675遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019757)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4675遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4675」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4675」(miRBase Accession No.MI0017306、配列番号264)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7108-5p遺伝子」又は「hsa-miR-7108-5p」という用語は、配列番号81に記載のhsa-miR-7108-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028113)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7108-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7108-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7108」(miRBase Accession No.MI0022959、配列番号265)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6799-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6799-5p」という用語は、配列番号82に記載のhsa-miR-6799-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027498)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6799-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6799-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6799」(miRBase Accession No.MI0022644、配列番号266)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4695-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4695-5p」という用語は、配列番号83に記載のhsa-miR-4695-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019788)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4695-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4695-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4695」(miRBase Accession No.MI0017328、配列番号267)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3178遺伝子」又は「hsa-miR-3178」という用語は、配列番号84に記載のhsa-miR-3178遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015055)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3178遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3178」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3178」(miRBase Accession No.MI0014212、配列番号268)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-5090遺伝子」又は「hsa-miR-5090」という用語は、配列番号85に記載のhsa-miR-5090遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0021082)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-5090遺伝子は、Ding Nら、2011年、J Radiat Res、52巻、p425-432に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-5090」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-5090」(miRBase Accession No.MI0017979、配列番号269)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3180遺伝子」又は「hsa-miR-3180」という用語は、配列番号86に記載のhsa-miR-3180遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018178)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3180遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3180」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3180-4、hsa-mir-3180-5」(miRBase Accession No.MI0016408、MI0016409、配列番号270、271)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1237-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1237-5p」という用語は、配列番号87に記載のhsa-miR-1237-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022946)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1237-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1237-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1237」(miRBase Accession No.MI0006327、配列番号272)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4758-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4758-5p」という用語は、配列番号88に記載のhsa-miR-4758-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019903)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4758-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4758-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4758」(miRBase Accession No.MI0017399、配列番号273)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3184-5p遺伝子」又は「hsa-miR-3184-5p」という用語は、配列番号89に記載のhsa-miR-3184-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015064)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3184-5p遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3184-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3184」(miRBase Accession No.MI0014226、配列番号274)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4286遺伝子」又は「hsa-miR-4286」という用語は、配列番号90に記載のhsa-miR-4286遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0016916)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4286遺伝子は、Goff LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4286」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4286」(miRBase Accession No.MI0015894、配列番号275)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6784-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6784-5p」という用語は、配列番号91に記載のhsa-miR-6784-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027468)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6784-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6784-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6784」(miRBase Accession No.MI0022629、配列番号276)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6768-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6768-5p」という用語は、配列番号92に記載のhsa-miR-6768-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027436)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6768-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6768-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6768」(miRBase Accession No.MI0022613、配列番号277)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6785-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6785-5p」という用語は、配列番号93に記載のhsa-miR-6785-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027470)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6785-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6785-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6785」(miRBase Accession No.MI0022630、配列番号278)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4706遺伝子」又は「hsa-miR-4706」という用語は、配列番号94に記載のhsa-miR-4706遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019806)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4706遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4706」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4706」(miRBase Accession No.MI0017339、配列番号279)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-711遺伝子」又は「hsa-miR-711」という用語は、配列番号95に記載のhsa-miR-711遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0012734)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-711遺伝子は、Artzi Sら、2008年、BMC Bioinformatics、9巻、p39に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-711」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-711」(miRBase Accession No.MI0012488、配列番号280)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1260a遺伝子」又は「hsa-miR-1260a」という用語は、配列番号96に記載のhsa-miR-1260a遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005911)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1260a遺伝子は、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1260a」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1260a」(miRBase Accession No.MI0006394、配列番号281)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6746-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6746-5p」という用語は、配列番号97に記載のhsa-miR-6746-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027392)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6746-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6746-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6746」(miRBase Accession No.MI0022591、配列番号282)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6089遺伝子」又は「hsa-miR-6089」という用語は、配列番号98に記載のhsa-miR-6089遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0023714)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6089遺伝子は、Yoo JKら、2012年、Stem Cells Dev、21巻、p2049-2057に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6089」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6089-1、hsa-mir-6089-2」(miRBase Accession No.MI0020366、MI0023563、配列番号283、284)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6821-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6821-5p」という用語は、配列番号99に記載のhsa-miR-6821-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027542)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6821-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6821-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6821」(miRBase Accession No.MI0022666、配列番号285)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4667-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4667-5p」という用語は、配列番号100に記載のhsa-miR-4667-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019743)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4667-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4667-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4667」(miRBase Accession No.MI0017297、配列番号286)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-8069遺伝子」又は「hsa-miR-8069」という用語は、配列番号101に記載のhsa-miR-8069遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030996)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-8069遺伝子は、Wang HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-8069」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-8069」(miRBase Accession No.MI0025905、配列番号287)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4726-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4726-5p」という用語は、配列番号102に記載のhsa-miR-4726-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019845)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4726-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4726-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4726」(miRBase Accession No.MI0017363、配列番号288)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6124遺伝子」又は「hsa-miR-6124」という用語は、配列番号103に記載のhsa-miR-6124遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0024597)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6124遺伝子は、Smith JLら、2012年、J Virol、86巻、p5278-5287に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6124」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6124」(miRBase Accession No.MI0021258、配列番号289)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4532遺伝子」又は「hsa-miR-4532」という用語は、配列番号104に記載のhsa-miR-4532遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019071)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4532遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4532」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4532」(miRBase Accession No.MI0016899、配列番号290)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4486遺伝子」又は「hsa-miR-4486」という用語は、配列番号105に記載のhsa-miR-4486遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019020)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4486遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4486」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4486」(miRBase Accession No.MI0016847、配列番号291)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4728-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4728-5p」という用語は、配列番号106に記載のhsa-miR-4728-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019849)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4728-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4728-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4728」(miRBase Accession No.MI0017365、配列番号292)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4508遺伝子」又は「hsa-miR-4508」という用語は、配列番号107に記載のhsa-miR-4508遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019045)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4508遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4508」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4508」(miRBase Accession No.MI0016872、配列番号293)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-128-1-5p遺伝子」又は「hsa-miR-128-1-5p」という用語は、配列番号108に記載のhsa-miR-128-1-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0026477)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-128-1-5p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-128-1-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-128-1」(miRBase Accession No.MI0000447、配列番号294)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4513遺伝子」又は「hsa-miR-4513」という用語は、配列番号109に記載のhsa-miR-4513遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019050)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4513遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4513」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4513」(miRBase Accession No.MI0016879、配列番号295)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6795-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6795-5p」という用語は、配列番号110に記載のhsa-miR-6795-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027490)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6795-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6795-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6795」(miRBase Accession No.MI0022640、配列番号296)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4689遺伝子」又は「hsa-miR-4689」という用語は、配列番号111に記載のhsa-miR-4689遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019778)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4689遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4689」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4689」(miRBase Accession No.MI0017322、配列番号297)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6763-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6763-5p」という用語は、配列番号112に記載のhsa-miR-6763-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027426)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6763-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6763-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6763」(miRBase Accession No.MI0022608、配列番号298)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-8072遺伝子」又は「hsa-miR-8072」という用語は、配列番号113に記載のhsa-miR-8072遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030999)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-8072遺伝子は、Wang HJら、2013年、Shock、39巻、p480-487に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-8072」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-8072」(miRBase Accession No.MI0025908、配列番号299)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6765-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6765-5p」という用語は、配列番号114に記載のhsa-miR-6765-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027430)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6765-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6765-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6765」(miRBase Accession No.MI0022610、配列番号218)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4419b遺伝子」又は「hsa-miR-4419b」という用語は、配列番号115に記載のhsa-miR-4419b遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019034)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4419b遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4419b」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4419b」(miRBase Accession No.MI0016861、配列番号300)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7641遺伝子」又は「hsa-miR-7641」という用語は、配列番号116に記載のhsa-miR-7641遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0029782)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7641遺伝子は、Yoo JKら、2013年、Arch Pharm Res、36巻、p353-358に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7641」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7641-1、hsa-mir-7641-2」(miRBase Accession No.MI0024975、MI0024976、配列番号301、302)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3928-3p遺伝子」又は「hsa-miR-3928-3p」という用語は、配列番号117に記載のhsa-miR-3928-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018205)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3928-3p遺伝子は、Creighton CJら、2010年、PLoS One、5巻、e9637に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3928-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3928」(miRBase Accession No.MI0016438、配列番号303)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1227-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1227-5p」という用語は、配列番号118に記載のhsa-miR-1227-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022941)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1227-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1227-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1227」(miRBase Accession No.MI0006316、配列番号304)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4492遺伝子」又は「hsa-miR-4492」という用語は、配列番号119に記載のhsa-miR-4492遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019027)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4492遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4492」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4492」(miRBase Accession No.MI0016854、配列番号305)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-296-3p遺伝子」又は「hsa-miR-296-3p」という用語は、配列番号120に記載のhsa-miR-296-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004679)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-296-3p遺伝子は、Houbaviy HBら、2003年、Dev Cell、5巻、p351-358に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-296-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-296」(miRBase Accession No.MI0000747、配列番号306)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6769a-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6769a-5p」という用語は、配列番号121に記載のhsa-miR-6769a-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027438)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6769a-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6769a-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6769a」(miRBase Accession No.MI0022614、配列番号307)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6889-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6889-5p」という用語は、配列番号122に記載のhsa-miR-6889-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027678)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6889-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6889-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6889」(miRBase Accession No.MI0022736、配列番号308)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4632-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4632-5p」という用語は、配列番号123に記載のhsa-miR-4632-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022977)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4632-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4632-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4632」(miRBase Accession No.MI0017259、配列番号309)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4505遺伝子」又は「hsa-miR-4505」という用語は、配列番号124に記載のhsa-miR-4505遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019041)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4505遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4505」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4505」(miRBase Accession No.MI0016868、配列番号310)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3154遺伝子」又は「hsa-miR-3154」という用語は、配列番号125に記載のhsa-miR-3154遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015028)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3154遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3154」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3154」(miRBase Accession No.MI0014182、配列番号311)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3648遺伝子」又は「hsa-miR-3648」という用語は、配列番号126に記載のhsa-miR-3648遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018068)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3648遺伝子は、Meiri Eら、2010年、Nucleic Acids Res、38巻、p6234-6246に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3648」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3648」(miRBase Accession No.MI0016048、配列番号312)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4442遺伝子」又は「hsa-miR-4442」という用語は、配列番号127に記載のhsa-miR-4442遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018960)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4442遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4442」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4442」(miRBase Accession No.MI0016785、配列番号313)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3141遺伝子」又は「hsa-miR-3141」という用語は、配列番号128に記載のhsa-miR-3141遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015010)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3141遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3141」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3141」(miRBase Accession No.MI0014165、配列番号314)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7113-3p遺伝子」又は「hsa-miR-7113-3p」という用語は、配列番号129に記載のhsa-miR-7113-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028124)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7113-3p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7113-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7113」(miRBase Accession No.MI0022964、配列番号315)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6819-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6819-5p」という用語は、配列番号130に記載のhsa-miR-6819-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027538)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6819-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6819-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6819」(miRBase Accession No.MI0022664、配列番号316)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3195遺伝子」又は「hsa-miR-3195」という用語は、配列番号131に記載のhsa-miR-3195遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015079)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3195遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3195」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3195」(miRBase Accession No.MI0014240、配列番号317)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1199-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1199-5p」という用語は、配列番号132に記載のhsa-miR-1199-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0031119)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1199-5p遺伝子は、Salvi Aら、2013年、Int J Oncol、42巻、p391-402に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1199-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1199」(miRBase Accession No.MI0020340、配列番号318)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6738-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6738-5p」という用語は、配列番号133に記載のhsa-miR-6738-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027377)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6738-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6738-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6738」(miRBase Accession No.MI0022583、配列番号319)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4656遺伝子」又は「hsa-miR-4656」という用語は、配列番号134に記載のhsa-miR-4656遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019723)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4656遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4656」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4656」(miRBase Accession No.MI0017284、配列番号320)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6820-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6820-5p」という用語は、配列番号135に記載のhsa-miR-6820-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027540)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6820-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6820-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6820」(miRBase Accession No.MI0022665、配列番号321)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-615-5p遺伝子」又は「hsa-miR-615-5p」という用語は、配列番号136に記載のhsa-miR-615-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004804)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-615-5p遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-615-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-615」(miRBase Accession No.MI0003628、配列番号322)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-486-3p遺伝子」又は「hsa-miR-486-3p」という用語は、配列番号137に記載のhsa-miR-486-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004762)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-486-3p遺伝子は、Fu Hら、2005年、FEBS Lett、579巻、p3849-3854に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-486-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-486、hsa-mir-486-2」(miRBase Accession No.MI0002470、MI0023622、配列番号323、324)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1225-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1225-3p」という用語は、配列番号138に記載のhsa-miR-1225-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005573)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1225-3p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1225-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1225」(miRBase Accession No.MI0006311、配列番号325)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-760遺伝子」又は「hsa-miR-760」という用語は、配列番号139に記載のhsa-miR-760遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004957)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-760遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-760」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-760」(miRBase Accession No.MI0005567、配列番号326)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-187-5p遺伝子」又は「hsa-miR-187-5p」という用語は、配列番号140に記載のhsa-miR-187-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004561)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-187-5p遺伝子は、Lim LPら、2003年、Science、299巻、p1540に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-187-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-187」(miRBase Accession No.MI0000274、配列番号327)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1203遺伝子」又は「hsa-miR-1203」という用語は、配列番号141に記載のhsa-miR-1203遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005866)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1203遺伝子は、Marton Sら、2008年、Leukemia、22巻、p330-338に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1203」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1203」(miRBase Accession No.MI0006335、配列番号328)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7110-5p遺伝子」又は「hsa-miR-7110-5p」という用語は、配列番号142に記載のhsa-miR-7110-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028117)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7110-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7110-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7110」(miRBase Accession No.MI0022961、配列番号329)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-371a-5p遺伝子」又は「hsa-miR-371a-5p」という用語は、配列番号143に記載のhsa-miR-371a-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004687)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-371a-5p遺伝子は、Suh MRら、2004年、Dev Biol、270巻、p488-498に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-371a-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-371a」(miRBase Accession No.MI0000779、配列番号330)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-939-5p遺伝子」又は「hsa-miR-939-5p」という用語は、配列番号144に記載のhsa-miR-939-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004982)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-939-5p遺伝子は、Lui WOら、2007年、Cancer Res、67巻、p6031-6043に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-939-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-939」(miRBase Accession No.MI0005761、配列番号331)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-575遺伝子」又は「hsa-miR-575」という用語は、配列番号145に記載のhsa-miR-575遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0003240)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-575遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-575」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-575」(miRBase Accession No.MI0003582、配列番号332)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-92b-5p遺伝子」又は「hsa-miR-92b-5p」という用語は、配列番号146に記載のhsa-miR-92b-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004792)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-92b-5p遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-92b-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-92b」(miRBase Accession No.MI0003560、配列番号333)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-887-3p遺伝子」又は「hsa-miR-887-3p」という用語は、配列番号147に記載のhsa-miR-887-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004951)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-887-3p遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-887-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-887」(miRBase Accession No.MI0005562、配列番号334)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-920遺伝子」又は「hsa-miR-920」という用語は、配列番号148に記載のhsa-miR-920遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004970)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-920遺伝子は、Novotny GWら、2007年、Int J Androl、30巻、p316-326に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-920」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-920」(miRBase Accession No.MI0005712、配列番号335)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1915-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1915-5p」という用語は、配列番号149に記載のhsa-miR-1915-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007891)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1915-5p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p2496-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1915-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1915」(miRBase Accession No.MI0008336、配列番号336)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1231遺伝子」又は「hsa-miR-1231」という用語は、配列番号150に記載のhsa-miR-1231遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005586)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1231遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1231」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1231」(miRBase Accession No.MI0006321、配列番号337)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-663b遺伝子」又は「hsa-miR-663b」という用語は、配列番号151に記載のhsa-miR-663b遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005867)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-663b遺伝子は、Takada Sら、2008年、Leukemia、22巻、p1274-1278に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-663b」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-663b」(miRBase Accession No.MI0006336、配列番号338)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1225-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1225-5p」という用語は、配列番号152に記載のhsa-miR-1225-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005572)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1225-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1225-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1225」(miRBase Accession No.MI0006311、配列番号325)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4763-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4763-3p」という用語は、配列番号153に記載のhsa-miR-4763-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019913)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4763-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4763-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4763」(miRBase Accession No.MI0017404、配列番号339)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3656遺伝子」又は「hsa-miR-3656」という用語は、配列番号154に記載のhsa-miR-3656遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018076)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3656遺伝子は、Meiri Eら、2010年、Nucleic Acids Res、38巻、p6234-6246に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3656」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3656」(miRBase Accession No.MI0016056、配列番号340)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4488遺伝子」又は「hsa-miR-4488」という用語は、配列番号155に記載のhsa-miR-4488遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019022)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4488遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4488」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4488」(miRBase Accession No.MI0016849、配列番号341)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-125a-3p遺伝子」又は「hsa-miR-125a-3p」という用語は、配列番号156に記載のhsa-miR-125a-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004602)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-125a-3p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-125a-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-125a」(miRBase Accession No.MI0000469、配列番号342)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1469遺伝子」又は「hsa-miR-1469」という用語は、配列番号157に記載のhsa-miR-1469遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007347)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1469遺伝子は、Kawaji Hら、2008年、BMC Genomics、9巻、p157に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1469」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1469」(miRBase Accession No.MI0007074、配列番号343)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1228-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1228-5p」という用語は、配列番号158に記載のhsa-miR-1228-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005582)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1228-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2007年、Mol Cell、28巻、p328-336に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1228-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1228」(miRBase Accession No.MI0006318、配列番号344)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6798-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6798-5p」という用語は、配列番号159に記載のhsa-miR-6798-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027496)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6798-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6798-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6798」(miRBase Accession No.MI0022643、配列番号345)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1268b遺伝子」又は「hsa-miR-1268b」という用語は、配列番号160に記載のhsa-miR-1268b遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018925)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1268b遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1268b」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1268b」(miRBase Accession No.MI0016748、配列番号346)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6732-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6732-5p」という用語は、配列番号161に記載のhsa-miR-6732-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027365)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6732-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6732-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6732」(miRBase Accession No.MI0022577、配列番号347)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1915-3p遺伝子」又は「hsa-miR-1915-3p」という用語は、配列番号162に記載のhsa-miR-1915-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0007892)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1915-3p遺伝子は、Bar Mら、2008年、Stem Cells、26巻、p2496-2505に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1915-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1915」(miRBase Accession No.MI0008336、配列番号336)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4433b-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4433b-3p」という用語は、配列番号163に記載のhsa-miR-4433b-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0030414)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4433b-3p遺伝子は、Ple Hら、2012年、PLoS One、7巻、e50746に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4433b-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4433b」(miRBase Accession No.MI0025511、配列番号348)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1207-5p遺伝子」又は「hsa-miR-1207-5p」という用語は、配列番号164に記載のhsa-miR-1207-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005871)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1207-5p遺伝子は、Huppi Kら、2008年、Mol Cancer Res、6巻、p212-221に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1207-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1207」(miRBase Accession No.MI0006340、配列番号349)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4433-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4433-3p」という用語は、配列番号165に記載のhsa-miR-4433-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018949)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4433-3p遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4433-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4433」(miRBase Accession No.MI0016773、配列番号350)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6879-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6879-5p」という用語は、配列番号166に記載のhsa-miR-6879-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027658)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6879-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6879-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6879」(miRBase Accession No.MI0022726、配列番号351)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4417遺伝子」又は「hsa-miR-4417」という用語は、配列番号167に記載のhsa-miR-4417遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018929)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4417遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4417」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4417」(miRBase Accession No.MI0016753、配列番号352)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-30c-1-3p遺伝子」又は「hsa-miR-30c-1-3p」という用語は、配列番号168に記載のhsa-miR-30c-1-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004674)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-30c-1-3p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-30c-1-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-30c-1」(miRBase Accession No.MI0000736、配列番号353)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4638-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4638-5p」という用語は、配列番号169に記載のhsa-miR-4638-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019695)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4638-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4638-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4638」(miRBase Accession No.MI0017265、配列番号354)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6088遺伝子」又は「hsa-miR-6088」という用語は、配列番号170に記載のhsa-miR-6088遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0023713)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6088遺伝子は、Yoo JKら、2012年、Stem Cells Dev、21巻、p2049-2057に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6088」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6088」(miRBase Accession No.MI0020365、配列番号355)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4270遺伝子」又は「hsa-miR-4270」という用語は、配列番号171に記載のhsa-miR-4270遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0016900)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4270遺伝子は、Goff LAら、2009年、PLoS One、4巻、e7192に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4270」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4270」(miRBase Accession No.MI0015878、配列番号356)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6782-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6782-5p」という用語は、配列番号172に記載のhsa-miR-6782-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027464)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6782-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6782-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6782」(miRBase Accession No.MI0022627、配列番号357)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-665遺伝子」又は「hsa-miR-665」という用語は、配列番号173に記載のhsa-miR-665遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004952)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-665遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-665」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-665」(miRBase Accession No.MI0005563、配列番号358)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-486-5p遺伝子」又は「hsa-miR-486-5p」という用語は、配列番号174に記載のhsa-miR-486-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0002177)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-486-5p遺伝子は、Fu Hら、2005年、FEBS Lett、579巻、p3849-3854に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-486-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-486、hsa-mir-486-2」(miRBase Accession No.MI0002470、MI0023622、配列番号323、324)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4655-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4655-5p」という用語は、配列番号175に記載のhsa-miR-4655-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019721)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4655-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4655-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4655」(miRBase Accession No.MI0017283、配列番号359)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1275遺伝子」又は「hsa-miR-1275」という用語は、配列番号176に記載のhsa-miR-1275遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005929)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1275遺伝子は、Morin RDら、2008年、Genome Res、18巻、p610-621に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1275」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1275」(miRBase Accession No.MI0006415、配列番号360)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6806-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6806-5p」という用語は、配列番号177に記載のhsa-miR-6806-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027512)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6806-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6806-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6806」(miRBase Accession No.MI0022651、配列番号361)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-614遺伝子」又は「hsa-miR-614」という用語は、配列番号178に記載のhsa-miR-614遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0003282)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-614遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-614」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-614」(miRBase Accession No.MI0003627、配列番号362)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3937遺伝子」又は「hsa-miR-3937」という用語は、配列番号179に記載のhsa-miR-3937遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018352)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3937遺伝子は、Liao JYら、2010年、PLoS One、5巻、e10563に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3937」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3937」(miRBase Accession No.MI0016593、配列番号363)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6752-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6752-5p」という用語は、配列番号180に記載のhsa-miR-6752-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027404)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6752-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6752-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6752」(miRBase Accession No.MI0022597、配列番号364)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6771-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6771-5p」という用語は、配列番号181に記載のhsa-miR-6771-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027442)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6771-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6771-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6771」(miRBase Accession No.MI0022616、配列番号365)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4450遺伝子」又は「hsa-miR-4450」という用語は、配列番号182に記載のhsa-miR-4450遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018971)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4450遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4450」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4450」(miRBase Accession No.MI0016795、配列番号366)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-211-3p遺伝子」又は「hsa-miR-211-3p」という用語は、配列番号183に記載のhsa-miR-211-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022694)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-211-3p遺伝子は、Lim LPら、2003年、Science、299巻、p1540に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-211-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-211」(miRBase Accession No.MI0000287、配列番号367)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-663a遺伝子」又は「hsa-miR-663a」という用語は、配列番号184に記載のhsa-miR-663a遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0003326)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-663a遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-663a」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-663a」(miRBase Accession No.MI0003672、配列番号368)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6842-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6842-5p」という用語は、配列番号185に記載のhsa-miR-6842-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027586)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6842-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6842-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6842」(miRBase Accession No.MI0022688、配列番号369)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-7114-5p遺伝子」又は「hsa-miR-7114-5p」という用語は、配列番号186に記載のhsa-miR-7114-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0028125)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-7114-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-7114-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-7114」(miRBase Accession No.MI0022965、配列番号370)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6779-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6779-5p」という用語は、配列番号187に記載のhsa-miR-6779-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027458)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6779-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6779-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6779」(miRBase Accession No.MI0022624、配列番号371)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-204-3p遺伝子」又は「hsa-miR-204-3p」という用語は、配列番号580に記載のhsa-miR-204-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0022693)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-204-3p遺伝子は、Lim LPら、2003年、Science.、299巻、p1540に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-204-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-204」(miRBase Accession No.MI0000284、配列番号612)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-642a-3p遺伝子」又は「hsa-miR-642a-3p」という用語は、配列番号581に記載のhsa-miR-642a-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0020924)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-642a-3p遺伝子は、Cummins JMら、2006年、Proc Natl Acad Sci U S A、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-642a-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-642a」(miRBase Accession No.MI0003657、配列番号613)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-762遺伝子」又は「hsa-miR-762」という用語は、配列番号582に記載のhsa-miR-762遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0010313)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-762遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-762」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-762」(miRBase Accession No.MI0003892、配列番号614)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-1202遺伝子」又は「hsa-miR-1202」という用語は、配列番号583に記載のhsa-miR-1202遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0005865)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-1202遺伝子は、Marton Sら、2008年、Leukemia.、22巻、p330-338に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-1202」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-1202」(miRBase Accession No.MI0006334、配列番号615)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3162-5p遺伝子」又は「hsa-miR-3162-5p」という用語は、配列番号584に記載のhsa-miR-3162-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015036)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3162-5p遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One.、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3162-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3162」(miRBase Accession No.MI0014192、配列番号616)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3196遺伝子」又は「hsa-miR-3196」という用語は、配列番号585に記載のhsa-miR-3196遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0015080)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3196遺伝子は、Stark MSら、2010年、PLoS One、5巻、e9685に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3196」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3196」(miRBase Accession No.MI0014241、配列番号617)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3622a-5p遺伝子」又は「hsa-miR-3622a-5p」という用語は、配列番号586に記載のhsa-miR-3622a-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018003)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3622a-5p遺伝子は、Witten Dら、2010年、BMC Biol.、8巻、p58に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3622a-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3622a」(miRBase Accession No.MI0016013、配列番号618)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3665遺伝子」又は「hsa-miR-3665」という用語は、配列番号587に記載のhsa-miR-3665遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018087)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3665遺伝子は、Xie Xら、2005年、Nature、434巻、p338-345に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3665」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3665」(miRBase Accession No.MI0016066、配列番号619)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-3940-5p遺伝子」又は「hsa-miR-3940-5p」という用語は、配列番号588に記載のhsa-miR-3940-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019229)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-3940-5p遺伝子は、Liao JYら、2010年、PLoS One、5巻、e10563に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-3940-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-3940」(miRBase Accession No.MI0016597、配列番号620)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4294遺伝子」又は「hsa-miR-4294」という用語は、配列番号589に記載のhsa-miR-4294遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0016849)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4294遺伝子は、Goff LAら、2009年、PLoS One.、4巻、e7192に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4294」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4294」(miRBase Accession No.MI0015827、配列番号621)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4466遺伝子」又は「hsa-miR-4466」という用語は、配列番号590に記載のhsa-miR-4466遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0018993)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4466遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4466」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4466」(miRBase Accession No.MI0016817、配列番号622)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4476遺伝子」又は「hsa-miR-4476」という用語は、配列番号591に記載のhsa-miR-4476遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019003)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4476遺伝子は、Jima DDら、2010年、Blood.、116巻、e118-e127に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4476」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4476」(miRBase Accession No.MI0016828、配列番号623)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4723-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4723-5p」という用語は、配列番号592に記載のhsa-miR-4723-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019838)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4723-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res.、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4723-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4723」(miRBase Accession No.MI0017359、配列番号624)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4725-3p遺伝子」又は「hsa-miR-4725-3p」という用語は、配列番号593に記載のhsa-miR-4725-3p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019844)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4725-3p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4725-3p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4725」(miRBase Accession No.MI0017362、配列番号625)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4730遺伝子」又は「hsa-miR-4730」という用語は、配列番号594に記載のhsa-miR-4730遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019852)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4730遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4730」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4730」(miRBase Accession No.MI0017367、配列番号626)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4739遺伝子」又は「hsa-miR-4739」という用語は、配列番号595に記載のhsa-miR-4739遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019868)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4739遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4739」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4739」(miRBase Accession No.MI0017377、配列番号627)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-4787-5p遺伝子」又は「hsa-miR-4787-5p」という用語は、配列番号596に記載のhsa-miR-4787-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0019956)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-4787-5p遺伝子は、Persson Hら、2011年、Cancer Res、71巻、p78-86に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-4787-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-4787」(miRBase Accession No.MI0017434、配列番号628)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-5787遺伝子」又は「hsa-miR-5787」という用語は、配列番号597に記載のhsa-miR-5787遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0023252)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-5787遺伝子は、Yoo Hら、2011年、Biochem Biophys Res Commun、415巻、p567-572に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-5787」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-5787」(miRBase Accession No.MI0019797、配列番号629)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6085遺伝子」又は「hsa-miR-6085」という用語は、配列番号598に記載のhsa-miR-6085遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0023710)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6085遺伝子は、Voellenkle Cら、2012年、RNA.、18巻、p472-484に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6085」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6085」(miRBase Accession No.MI0020362、配列番号630)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6717-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6717-5p」という用語は、配列番号599に記載のhsa-miR-6717-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025846)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6717-5p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene、497巻、p330-335に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6717-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6717」(miRBase Accession No.MI0022551、配列番号631)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6724-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6724-5p」という用語は、配列番号600に記載のhsa-miR-6724-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0025856)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6724-5p遺伝子は、Li Yら、2012年、Gene.、497巻、p330-335に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6724-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6724」(miRBase Accession No.MI0022559、配列番号632)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6777-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6777-5p」という用語は、配列番号601に記載のhsa-miR-6777-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027454)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6777-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6777-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6777」(miRBase Accession No.MI0022622、配列番号633)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6778-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6778-5p」という用語は、配列番号602に記載のhsa-miR-6778-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027456)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6778-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res.、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6778-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6778」(miRBase Accession No.MI0022623、配列番号634)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6787-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6787-5p」という用語は、配列番号603に記載のhsa-miR-6787-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027474)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6787-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6787-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6787」(miRBase Accession No.MI0022632、配列番号635)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6789-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6789-5p」という用語は、配列番号604に記載のhsa-miR-6789-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027478)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6789-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res.、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6789-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6789」(miRBase Accession No.MI0022634、配列番号636)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6845-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6845-5p」という用語は、配列番号605に記載のhsa-miR-6845-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027590)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6845-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res.、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6845-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6845」(miRBase Accession No.MI0022691、配列番号637)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-6893-5p遺伝子」又は「hsa-miR-6893-5p」という用語は、配列番号606に記載のhsa-miR-6893-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0027686)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-6893-5p遺伝子は、Ladewig Eら、2012年、Genome Res.、22巻、p1634-1645に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-6893-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-6893」(miRBase Accession No.MI0022740、配列番号638)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-16-5p遺伝子」又は「hsa-miR-16-5p」という用語は、配列番号607に記載のhsa-miR-16-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0000069)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-16-5p遺伝子は、Lagos-Quintana Mら、2002年、Curr Biol.、12巻、p735-739に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-16-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-16-1、hsa-mir-16-2 」(miRBase Accession No.MI0000070、MI0000115、配列番号639、640)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-423-5p遺伝子」又は「hsa-miR-423-5p」という用語は、配列番号608に記載のhsa-miR-423-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0004748)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-423-5p遺伝子は、Kasashima Kら、2004年、Biochem Biophys Res Commun.、322巻、p403-410に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-423-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-423」(miRBase Accession No.MI0001445、配列番号641)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-451a遺伝子」又は「hsa-miR-451a」という用語は、配列番号609に記載のhsa-miR-451a遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0001631)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-451a遺伝子は、Altuvia Yら、2005年、Nucleic Acids Res.、33巻、p2697-2706に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-451a」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-451a」(miRBase Accession No.MI0001729、配列番号642)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-564遺伝子」又は「hsa-miR-564」という用語は、配列番号610に記載のhsa-miR-564遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0003228)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-564遺伝子は、Cummins JM、2006年、Proc Natl Acad Sci、103巻、p3687-3692に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-564」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-564」(miRBase Accession No.MI0003570、配列番号643)が知られている。
本明細書で使用される「hsa-miR-671-5p遺伝子」又は「hsa-miR-671-5p」という用語は、配列番号611に記載のhsa-miR-671-5p遺伝子(miRBase Accession No.MIMAT0003880)やその他生物種ホモログもしくはオーソログなどが包含される。hsa-miR-671-5p遺伝子は、Berezikov Eら、2006年、Genome Res、16巻、p1289-1298に記載される方法によって得ることができる。また、「hsa-miR-671-5p」は、その前駆体としてヘアピン様構造をとる「hsa-mir-671」(miRBase Accession No.MI0003760、配列番号644)が知られている。
また、成熟型のmiRNAは、ヘアピン様構造をとるRNA前駆体から成熟型miRNAとして切出されるときに、配列の前後で1から数塩基が短く、又は長く切出されることや、塩基の置換が生じて変異体となることがあり、isomiRと称される(Morin RD.ら、2008年、Genome Res.、第18巻、p.610-621)。miRBase Release20では、配列番号1~187及び580~611のいずれかで表される塩基配列のほかに、数々のisomiRと呼ばれる配列番号372~579及び645~684のいずれかで表される塩基配列の変異体及び断片も示されている。これらの変異体もまた、配列番号1~187及び580~611のいずれかで表される塩基配列のmiRNAとして得ることができる。すなわち、本発明の配列番号1、2、4、5、6、7、10、12、15、16、18、19、21、22、24、25、27、30、31、33、34、36、39、41、42、43、44、45、46、48、51、53、58、61、62、63、66、69、73、75、76、77、78、83、84、85、86、87、88、90、94、95、96、98、100、102、103、104、105、106、107、108、109、111、115、117、119、120、123、124、125、126、127、128、131、136、137、139、140、143、144、147、149、151、153、154、155、156、158、160、162、165、167、168、169、170、173、174、175、176、178、182、183、184、580、581、584、585、587、588、590、591、592、593、594、595、597、599、600、607、608、609及び611で表される塩基配列もしくは該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチドの変異体のうち、例えばmiRBase Release 20に登録されている最も長い変異体として、それぞれ配列番号372、374、376、378、380、382、384、386、388、390、392、394、396、398、400、402、404、406、408、410、412、414、416、418、420、422、424、426、428、430、432、434、436、438、440、442、444、446、448、450、452、454、456、458、460、462、464、466、468、470、472、474、476、478、480、482、484、486、488、490、492、494、496、498、500、502、504、506、508、510、512、514、516、518、520、522、524、526、528、530、532、534、536、538、540、542、544、546、548、550、552、554、556、558、560、562、564、566、568、570、572、574、576、578、645、647、650、652、655、657、659、661、663、665、667、669、671、673、675、677、679、681及び683で表されるポリヌクレオチドが挙げられる。また、本発明の配列番号1、2、4、5、6、7、10、12、15、16、18、19、21、22、24、25、27、30、31、33、34、36、39、41、42、43、44、45、46、48、51、53、58、61、62、63、66、69、73、75、76、77、78、83、84、85、86、87、88、90、94、95、96、98、100、102、103、104、105、106、107、108、109、111、115、117、119、120、123、124、125、126、127、128、131、136、137、139、140、143、144、147、149、151、153、154、155、156、158、160、162、165、167、168、169、170、173、174、175、176、178、182、183、184、580、581、583、584、585、586、587、588、590、591、592、593、594、595、597、599、600、607、608、609及び611で表される塩基配列もしくは該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、の変異体のうち、例えばmiRBase Release 20に登録されている最も短い変異体として、それぞれ配列番号373、375、377、379、381、383、385、387、389、391、393、395、397、399、401、403、405、407、409、411、413、415、417、419、421、423、425、427、429、431、433、435、437、439、441、443、445、447、449、451、453、455、457、459、461、463、465、467、469、471、473、475、477、479、481、483、485、487、489、491、493、495、497、499、501、503、505、507、509、511、513、515、517、519、521、523、525、527、529、531、533、535、537、539、541、543、545、547、549、551、553、555、557、559、561、563、565、567、569、571、573、575、577、579、646、648、649、651、653、654、656、658、660、662、664、666、668、670、672、674、676、678、680、682及び684で表される配列のポリヌクレオチドが挙げられる。また、これらの変異体及び断片以外にも、miRBaseに登録された、配列番号1~187及び580~611の数々のisomiRであるポリヌクレオチドが挙げられる。さらに、配列番号1~187及び580~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチドの例としては、それぞれ前駆体である配列番号188~371及び612~644のいずれかで表されるポリヌクレオチドが挙げられる。
配列番号1~684で表される遺伝子の名称とmiRBase Accession No.(登録番号)を表1に記載した。
本明細書において「特異的に結合可能な」とは、本発明で使用する核酸プローブ又はプライマーが、特定の標的核酸と結合し、他の核酸と実質的に結合できないことを意味する。
本発明により、前立腺がんを容易にかつ高い精度で検出することが可能になった。
例えば、低侵襲的に採取できる患者の血液、血清及び又は血漿中の数個のmiRNA測定値を指標とし、容易に患者が前立腺がんであるか否かを検出することができる。
例えば、低侵襲的に採取できる患者の血液、血清及び又は血漿中の数個のmiRNA測定値を指標とし、容易に患者が前立腺がんであるか否かを検出することができる。
以下に本発明をさらに具体的に説明する
1.前立腺がんの標的核酸
本発明の上記定義の前立腺がん検出用の核酸プローブ又はプライマーを使用して、前立腺がん又は前立腺がん細胞の存在及び/又は不存在を検出するための、前立腺がんマーカーとしての主要な標的核酸には、hsa-miR-4443、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-3197、hsa-miR-3188、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4258、hsa-miR-4448、hsa-miR-6125、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-6132、hsa-miR-4467、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-2392、hsa-miR-1273g-3p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4792、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-5572、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-8063、hsa-miR-4454、hsa-miR-4525、hsa-miR-7975、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-4648、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-7150、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4497、hsa-miR-6090、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4530、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-4674、hsa-miR-3917、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6800-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-6872-3p、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-1908-3p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4675、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-6799-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-5090、hsa-miR-3180、hsa-miR-1237-5p、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-711、hsa-miR-1260a、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-6089、hsa-miR-6821-5p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-6124、hsa-miR-4532、hsa-miR-4486、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-4508、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6763-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7641、hsa-miR-3928-3p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-3154、hsa-miR-3648、hsa-miR-4442、hsa-miR-3141、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-6819-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-4656、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-762、hsa-miR-1202、hsa-miR-3162-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-3665、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-4466、hsa-miR-4476、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-4730、hsa-miR-4739、hsa-miR-4787-5p、hsa-miR-5787、hsa-miR-6085、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6778-5p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-6845-5p及びhsa-miR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAが含まれる。さらにこれらのmiRNAと組み合わせることができる他の前立腺がんマーカー、すなわち、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-575、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-920、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-663b、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-564及びhsa-miR-671-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。さらにこれらのmiRNAと組み合わせることができる他の前立腺がんマーカー、すなわち、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-3656、hsa-miR-4488、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-1469、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-1207-5p、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-30c-1-3p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-4270、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-4655-5p、hsa-miR-1275、hsa-miR-6806-5p、hsa-miR-614、hsa-miR-3937、hsa-miR-6752-5p、hsa-miR-6771-5p、hsa-miR-4450、hsa-miR-211-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-7114-5p及びhsa-miR-6779-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。
本発明の上記定義の前立腺がん検出用の核酸プローブ又はプライマーを使用して、前立腺がん又は前立腺がん細胞の存在及び/又は不存在を検出するための、前立腺がんマーカーとしての主要な標的核酸には、hsa-miR-4443、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-3197、hsa-miR-3188、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4258、hsa-miR-4448、hsa-miR-6125、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-6132、hsa-miR-4467、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-2392、hsa-miR-1273g-3p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4792、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-5572、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-8063、hsa-miR-4454、hsa-miR-4525、hsa-miR-7975、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-4648、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-7150、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4497、hsa-miR-6090、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4530、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-4674、hsa-miR-3917、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6800-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-6872-3p、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-1908-3p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4675、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-6799-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-5090、hsa-miR-3180、hsa-miR-1237-5p、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-711、hsa-miR-1260a、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-6089、hsa-miR-6821-5p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-6124、hsa-miR-4532、hsa-miR-4486、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-4508、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6763-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7641、hsa-miR-3928-3p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-3154、hsa-miR-3648、hsa-miR-4442、hsa-miR-3141、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-6819-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-4656、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-762、hsa-miR-1202、hsa-miR-3162-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-3665、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-4466、hsa-miR-4476、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-4730、hsa-miR-4739、hsa-miR-4787-5p、hsa-miR-5787、hsa-miR-6085、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6778-5p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-6845-5p及びhsa-miR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAが含まれる。さらにこれらのmiRNAと組み合わせることができる他の前立腺がんマーカー、すなわち、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-575、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-920、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-663b、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-564及びhsa-miR-671-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。さらにこれらのmiRNAと組み合わせることができる他の前立腺がんマーカー、すなわち、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-3656、hsa-miR-4488、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-1469、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-1207-5p、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-30c-1-3p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-4270、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-4655-5p、hsa-miR-1275、hsa-miR-6806-5p、hsa-miR-614、hsa-miR-3937、hsa-miR-6752-5p、hsa-miR-6771-5p、hsa-miR-4450、hsa-miR-211-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-7114-5p及びhsa-miR-6779-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のmiRNAも標的核酸として好ましく用いることができる。
上記のmiRNAには、例えば、配列番号1~187及び580~611のいずれかで表される塩基配列を含むヒト遺伝子(すなわち、それぞれ、hsa-miR-4443、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-3197、hsa-miR-3188、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4258、hsa-miR-4448、hsa-miR-6125、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-6132、hsa-miR-4467、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-2392、hsa-miR-1273g-3p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4792、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-5572、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-8063、hsa-miR-4454、hsa-miR-4525、hsa-miR-7975、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-4648、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-7150、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4497、hsa-miR-6090、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4530、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-4674、hsa-miR-3917、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6800-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-6872-3p、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-1908-3p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4675、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-6799-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-5090、hsa-miR-3180、hsa-miR-1237-5p、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-711、hsa-miR-1260a、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-6089、hsa-miR-6821-5p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-6124、hsa-miR-4532、hsa-miR-4486、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-4508、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6763-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7641、hsa-miR-3928-3p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-3154、hsa-miR-3648、hsa-miR-4442、hsa-miR-3141、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-6819-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-4656、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-762、hsa-miR-1202、hsa-miR-3162-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-3665、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-4466、hsa-miR-4476、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-4730、hsa-miR-4739、hsa-miR-4787-5p、hsa-miR-5787、hsa-miR-6085、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6778-5p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-6845-5p及びhsa-miR-6893-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-575、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-920、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-663b、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-564及びhsa-miR-671-5p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-3656、hsa-miR-4488、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-1469、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-1207-5p、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-30c-1-3p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-4270、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-4655-5p、hsa-miR-1275、hsa-miR-6806-5p、hsa-miR-614、hsa-miR-3937、hsa-miR-6752-5p、hsa-miR-6771-5p、hsa-miR-4450、hsa-miR-211-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-7114-5p及びhsa-miR-6779-5p)、その同族体、その転写産物、及びその変異体又は誘導体が含まれる。ここで、遺伝子、同族体、転写産物、変異体及び誘導体は、上記定義のとおりである。
好ましい標的核酸は、配列番号1~684のいずれかで表される塩基配列を含むヒト遺伝子、又はその転写産物であり、より好ましくは当該転写産物、すなわちmiRNA、その前駆体RNAであるpri-miRNA又はpre-miRNAである。
第1の標的遺伝子は、hsa-miR-4443遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第2の標的遺伝子は、hsa-miR-1908-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第3の標的遺伝子は、hsa-miR-4257遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第4の標的遺伝子は、hsa-miR-3197遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第5の標的遺伝子は、hsa-miR-3188遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第6の標的遺伝子は、hsa-miR-4649-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第7の標的遺伝子は、hsa-miR-1343-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第8の標的遺伝子は、hsa-miR-6861-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第9の標的遺伝子は、hsa-miR-1343-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第10の標的遺伝子は、hsa-miR-642b-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第11の標的遺伝子は、hsa-miR-6741-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第12の標的遺伝子は、hsa-miR-4745-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第13の標的遺伝子は、hsa-miR-6826-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第14の標的遺伝子は、hsa-miR-3663-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第15の標的遺伝子は、hsa-miR-3131遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第16の標的遺伝子は、hsa-miR-92a-2-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第17の標的遺伝子は、hsa-miR-4258遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第18の標的遺伝子は、hsa-miR-4448遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第19の標的遺伝子は、hsa-miR-6125遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第20の標的遺伝子は、hsa-miR-6880-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第21の標的遺伝子は、hsa-miR-6132遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第22の標的遺伝子は、hsa-miR-4467遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第23の標的遺伝子は、hsa-miR-6749-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第24の標的遺伝子は、hsa-miR-2392遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第25の標的遺伝子は、hsa-miR-1273g-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第26の標的遺伝子は、hsa-miR-4746-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第27の標的遺伝子は、hsa-miR-1914-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第28の標的遺伝子は、hsa-miR-7845-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第29の標的遺伝子は、hsa-miR-6726-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第30の標的遺伝子は、hsa-miR-128-2-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第31の標的遺伝子は、hsa-miR-4651遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第32の標的遺伝子は、hsa-miR-6765-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第33の標的遺伝子は、hsa-miR-3185遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第34の標的遺伝子は、hsa-miR-4792遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第35の標的遺伝子は、hsa-miR-6887-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第36の標的遺伝子は、hsa-miR-5572遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第37の標的遺伝子は、hsa-miR-3619-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第38の標的遺伝子は、hsa-miR-6780b-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第39の標的遺伝子は、hsa-miR-4707-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第40の標的遺伝子は、hsa-miR-8063遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第41の標的遺伝子は、hsa-miR-4454遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第42の標的遺伝子は、hsa-miR-4525遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第43の標的遺伝子は、hsa-miR-7975遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第44の標的遺伝子は、hsa-miR-744-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第45の標的遺伝子は、hsa-miR-3135b遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第46の標的遺伝子は、hsa-miR-4648遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第47の標的遺伝子は、hsa-miR-6816-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第48の標的遺伝子は、hsa-miR-4741遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第49の標的遺伝子は、hsa-miR-7150遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺本伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第50の標的遺伝子は、hsa-miR-6791-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第51の標的遺伝子は、hsa-miR-1247-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第52の標的遺伝子は、hsa-miR-7977遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第53の標的遺伝子は、hsa-miR-4497遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第54の標的遺伝子は、hsa-miR-6090遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第55の標的遺伝子は、hsa-miR-6781-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第56の標的遺伝子は、hsa-miR-6870-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第57の標的遺伝子は、hsa-miR-6729-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第58の標的遺伝子は、hsa-miR-4530遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第59の標的遺伝子は、hsa-miR-7847-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第60の標的遺伝子は、hsa-miR-6825-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第61の標的遺伝子は、hsa-miR-4674遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第62の標的遺伝子は、hsa-miR-3917遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第63の標的遺伝子は、hsa-miR-4707-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第64の標的遺伝子は、hsa-miR-6885-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第65の標的遺伝子は、hsa-miR-6722-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第66の標的遺伝子は、hsa-miR-4516遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第67の標的遺伝子は、hsa-miR-6757-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第68の標的遺伝子は、hsa-miR-6840-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第69の標的遺伝子は、hsa-miR-5195-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第70の標的遺伝子は、hsa-miR-6756-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第71の標的遺伝子は、hsa-miR-6800-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第72の標的遺伝子は、hsa-miR-6727-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第73の標的遺伝子は、hsa-miR-6126遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第74の標的遺伝子は、hsa-miR-6872-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第75の標的遺伝子は、hsa-miR-4446-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第76の標的遺伝子は、hsa-miR-1268a遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第77の標的遺伝子は、hsa-miR-1908-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第78の標的遺伝子は、hsa-miR-3679-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第79の標的遺伝子は、hsa-miR-4534遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第80の標的遺伝子は、hsa-miR-4675遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第81の標的遺伝子は、hsa-miR-7108-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第82の標的遺伝子は、hsa-miR-6799-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第83の標的遺伝子は、hsa-miR-4695-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第84の標的遺伝子は、hsa-miR-3178遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第85の標的遺伝子は、hsa-miR-5090遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第86の標的遺伝子は、hsa-miR-3180遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第87の標的遺伝子は、hsa-miR-1237-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第88の標的遺伝子は、hsa-miR-4758-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第89の標的遺伝子は、hsa-miR-3184-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第90の標的遺伝子は、hsa-miR-4286遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第91の標的遺伝子は、hsa-miR-6784-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第92の標的遺伝子は、hsa-miR-6768-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第93の標的遺伝子は、hsa-miR-6785-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第94の標的遺伝子は、hsa-miR-4706遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第95の標的遺伝子は、hsa-miR-711遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第96の標的遺伝子は、hsa-miR-1260a遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第97の標的遺伝子は、hsa-miR-6746-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第98の標的遺伝子は、hsa-miR-6089遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第99の標的遺伝子は、hsa-miR-6821-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第100の標的遺伝子は、hsa-miR-4667-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第101の標的遺伝子は、hsa-miR-8069遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第102の標的遺伝子は、hsa-miR-4726-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第103の標的遺伝子は、hsa-miR-6124遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第104の標的遺伝子は、hsa-miR-4532遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第105の標的遺伝子は、hsa-miR-4486遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第106の標的遺伝子は、hsa-miR-4728-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第107の標的遺伝子は、hsa-miR-4508遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第108の標的遺伝子は、hsa-miR-128-1-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第109の標的遺伝子は、hsa-miR-4513遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第110の標的遺伝子は、hsa-miR-6795-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第111の標的遺伝子は、hsa-miR-4689遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第112の標的遺伝子は、hsa-miR-6763-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第113の標的遺伝子は、hsa-miR-8072遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第114の標的遺伝子は、hsa-miR-6765-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第115の標的遺伝子は、hsa-miR-4419b遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第116の標的遺伝子は、hsa-miR-7641遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第117の標的遺伝子は、hsa-miR-3928-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第118の標的遺伝子は、hsa-miR-1227-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第119の標的遺伝子は、hsa-miR-4492遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第120の標的遺伝子は、hsa-miR-296-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第121の標的遺伝子は、hsa-miR-6769a-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第122の標的遺伝子は、hsa-miR-6889-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第123の標的遺伝子は、hsa-miR-4632-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第124の標的遺伝子は、hsa-miR-4505遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第125の標的遺伝子は、hsa-miR-3154遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第126の標的遺伝子は、hsa-miR-3648遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第127の標的遺伝子は、hsa-miR-4442遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第128の標的遺伝子は、hsa-miR-3141遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第129の標的遺伝子は、hsa-miR-7113-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第130の標的遺伝子は、hsa-miR-6819-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第131の標的遺伝子は、hsa-miR-3195遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第132の標的遺伝子は、hsa-miR-1199-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第133の標的遺伝子は、hsa-miR-6738-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第134の標的遺伝子は、hsa-miR-4656遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第135の標的遺伝子は、hsa-miR-6820-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第136の標的遺伝子は、hsa-miR-615-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第137の標的遺伝子は、hsa-miR-486-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第138の標的遺伝子は、hsa-miR-1225-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第139の標的遺伝子は、hsa-miR-760遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第140の標的遺伝子は、hsa-miR-187-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第141の標的遺伝子は、hsa-miR-1203遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第142の標的遺伝子は、hsa-miR-7110-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第143の標的遺伝子は、hsa-miR-371a-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第144の標的遺伝子は、hsa-miR-939-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第145の標的遺伝子は、hsa-miR-575遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第146の標的遺伝子は、hsa-miR-92b-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献2)。
第147の標的遺伝子は、hsa-miR-887-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第148の標的遺伝子は、hsa-miR-920遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第149の標的遺伝子は、hsa-miR-1915-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第150の標的遺伝子は、hsa-miR-1231遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第151の標的遺伝子は、hsa-miR-663b遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第152の標的遺伝子は、hsa-miR-1225-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第153の標的遺伝子は、hsa-miR-4763-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第154の標的遺伝子は、hsa-miR-3656遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第155の標的遺伝子は、hsa-miR-4488遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第156の標的遺伝子は、hsa-miR-125a-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第157の標的遺伝子は、hsa-miR-1469遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第158の標的遺伝子は、hsa-miR-1228-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第159の標的遺伝子は、hsa-miR-6798-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第160の標的遺伝子は、hsa-miR-1268b遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第161の標的遺伝子は、hsa-miR-6732-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第162の標的遺伝子は、hsa-miR-1915-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第163の標的遺伝子は、hsa-miR-4433b-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第164の標的遺伝子は、hsa-miR-1207-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第165の標的遺伝子は、hsa-miR-4433-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第166の標的遺伝子は、hsa-miR-6879-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第167の標的遺伝子は、hsa-miR-4417遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第168の標的遺伝子は、hsa-miR-30c-1-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第169の標的遺伝子は、hsa-miR-4638-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第170の標的遺伝子は、hsa-miR-6088遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第171の標的遺伝子は、hsa-miR-4270遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第172の標的遺伝子は、hsa-miR-6782-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第173の標的遺伝子は、hsa-miR-665遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第174の標的遺伝子は、hsa-miR-486-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第175の標的遺伝子は、hsa-miR-4655-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第176の標的遺伝子は、hsa-miR-1275遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第177の標的遺伝子は、hsa-miR-6806-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第178の標的遺伝子は、hsa-miR-614遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第179の標的遺伝子は、hsa-miR-3937遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第180の標的遺伝子は、hsa-miR-6752-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第181の標的遺伝子は、hsa-miR-6771-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第182の標的遺伝子は、hsa-miR-4450遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第183の標的遺伝子は、hsa-miR-211-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第184の標的遺伝子は、hsa-miR-663a遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献1)。
第185の標的遺伝子は、hsa-miR-6842-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第186の標的遺伝子は、hsa-miR-7114-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第187の標的遺伝子は、hsa-miR-6779-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに本遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第580の標的遺伝子はhsa-miR-204-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第581の標的遺伝子はhsa-miR-642a-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第582の標的遺伝子はhsa-miR-762遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第583の標的遺伝子はhsa-miR-1202遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第584の標的遺伝子はhsa-miR-3162-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第585の標的遺伝子はhsa-miR-3196遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第586の標的遺伝子はhsa-miR-3622a-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第587の標的遺伝子はhsa-miR-3665遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第588の標的遺伝子はhsa-miR-3940-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第589の標的遺伝子はhsa-miR-4294遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第590の標的遺伝子はhsa-miR-4466遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第591の標的遺伝子はhsa-miR-4476遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第592の標的遺伝子はhsa-miR-4723-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第593の標的遺伝子はhsa-miR-4725-3p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第594の標的遺伝子はhsa-miR-4730遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第595の標的遺伝子はhsa-miR-4739遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第596の標的遺伝子はhsa-miR-4787-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第597の標的遺伝子はhsa-miR-5787遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第598の標的遺伝子はhsa-miR-6085遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第599の標的遺伝子はhsa-miR-6717-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第600の標的遺伝子はhsa-miR-6724-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第601の標的遺伝子はhsa-miR-6777-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第602の標的遺伝子はhsa-miR-6778-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第603の標的遺伝子はhsa-miR-6787-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第604の標的遺伝子はhsa-miR-6789-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第605の標的遺伝子はhsa-miR-6845-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第606の標的遺伝子はhsa-miR-6893-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告は知られていない。
第607の標的遺伝子はhsa-miR-16-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献2)。
第608の標的遺伝子はhsa-miR-423-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献2)。
第609の標的遺伝子はhsa-miR-451a遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献2)。
第610の標的遺伝子はhsa-miR-564遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献2)。
第611の標的遺伝子はhsa-miR-671-5p遺伝子、それらの同族体、それらの転写産物、あるいはそれらの変異体又は誘導体である。これまでに遺伝子又はその転写産物の発現の変化が前立腺がんのマーカーになりうるという報告がある(特許文献2)。
2.前立腺がんの検出用の核酸プローブ又はプライマー
本発明においては、上記の前立腺がんマーカーとしての標的核酸に特異的に結合可能な核酸を、前立腺がんを検出又は診断するための核酸、例えば核酸プローブ又はプライマーとして用いることができる。
本発明においては、上記の前立腺がんマーカーとしての標的核酸に特異的に結合可能な核酸を、前立腺がんを検出又は診断するための核酸、例えば核酸プローブ又はプライマーとして用いることができる。
本発明において、前立腺がんを検出するための、あるいは前立腺がんを診断するために使用可能な核酸プローブ又はプライマーは、上記の前立腺がんマーカーとしての標的核酸、例えば、ヒト由来の、hsa-miR-4443、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-3197、hsa-miR-3188、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4258、hsa-miR-4448、hsa-miR-6125、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-6132、hsa-miR-4467、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-2392、hsa-miR-1273g-3p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4792、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-5572、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-8063、hsa-miR-4454、hsa-miR-4525、hsa-miR-7975、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-4648、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-7150、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4497、hsa-miR-6090、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4530、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-4674、hsa-miR-3917、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6800-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-6872-3p、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-1908-3p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4675、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-6799-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-5090、hsa-miR-3180、hsa-miR-1237-5p、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-711、hsa-miR-1260a、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-6089、hsa-miR-6821-5p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-6124、hsa-miR-4532、hsa-miR-4486、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-4508、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6763-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7641、hsa-miR-3928-3p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-3154、hsa-miR-3648、hsa-miR-4442、hsa-miR-3141、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-6819-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-4656、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-762、hsa-miR-1202、hsa-miR-3162-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-3665、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-4466、hsa-miR-4476、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-4730、hsa-miR-4739、hsa-miR-4787-5p、hsa-miR-5787、hsa-miR-6085、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6778-5p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-6845-5p、若しくはhsa-miR-6893-5p、又はそれらの組み合わせ、又はそれらの同族体、それらの転写産物、それらの変異体若しくは誘導体の存在、発現量又は存在量を定性的及び/又は定量的に測定することを可能にする。
上記の標的核酸は、健常体と比べて前立腺がんに罹患した被験体において、該標的核酸の種類に応じてそれらの発現量が増加するものもあれば、又は低下するものもある(以下、「増加/低下」と称する。)。それゆえ、本発明の核酸は、前立腺がんの罹患が疑われる被験体(例えばヒト)由来の体液と健常体由来の体液について上記標的核酸の発現量を測定し、それらを比較して、前立腺がんを検出するために有効に使用することができる。
本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーは、配列番号1~135、580~606の少なくとも1つで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸プローブ、あるいは、配列番号1~135、580~606の少なくとも1つで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを増幅するためのプライマーである。
本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーはさらに、配列番号136~152、607~611の少なくとも1つで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸プローブ、あるいは、配列番号136~152、607~611の少なくとも1つで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを増幅するためのプライマーを含むことができる。
本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーはさらに、配列番号153~187の少なくとも1つで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸プローブ、あるいは、配列番号153~187の少なくとも1つで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを増幅するためのプライマーをさらに含むことができる。
具体的には、上記の核酸プローブ又はプライマーは、配列番号1~684のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含むポリヌクレオチド群及びその相補的ポリヌクレオチド群、当該塩基配列に相補的な塩基配列からなるDNAとストリンジェントな条件(後述)でそれぞれハイブリダイズするポリヌクレオチド群及びその相補的ポリヌクレオチド群、並びにそれらのポリヌクレオチド群の塩基配列において15以上、好ましくは17以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド群から選ばれた1又は複数のポリヌクレオチドの組み合わせを含む。これらのポリヌクレオチドは、標的核酸である上記前立腺がんマーカーを検出するための核酸プローブ及びプライマーとして使用できる。
さらに具体的には、本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーの例は、以下のポリヌクレオチド(a)~(e)のいずれかからなる群から選択される1又は複数のポリヌクレオチドである。
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーはさらに、上記のポリヌクレオチド(a)~(e)のいずれかから選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドの他に、下記の(f)~(j)のいずれかに示すポリヌクレオチドを含むことができる。
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーはさらに、上記のポリヌクレオチド(a)~(j)のいずれかから選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドの他に、下記の(k)~(o)のいずれかに示すポリヌクレオチドを含むことができる。
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、並びに、
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド。
上記のポリヌクレオチドにおいて「15以上の連続した塩基を含むその断片」は、各ポリヌクレオチドの塩基配列において、例えば、連続する15から配列の全塩基数未満、17から配列の全塩基数未満、19から配列の全塩基数未満、などの範囲の塩基数を含むことができるが、これらに限定されないものとする。
本発明で使用される上記ポリヌクレオチド類又はその断片類はいずれもDNAでもよいしRNAでもよい。
本発明で使用可能な上記のポリヌクレオチドは、DNA組換え技術、PCR法、DNA/RNA自動合成機による方法などの一般的な技術を用いて作製することができる。
DNA組換え技術及びPCR法は、例えばAusubelら、Current Protocols in Molecular Biology、John Willey & Sons、US(1993);Sambrookら、Molecular Cloning A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory Press、US(1989)などに記載される技術を使用することができる。
配列番号1~187及び580~611で表されるヒト由来の、hsa-miR-4443、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-3197、hsa-miR-3188、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4258、hsa-miR-4448、hsa-miR-6125、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-6132、hsa-miR-4467、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-2392、hsa-miR-1273g-3p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4792、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-5572、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-8063、hsa-miR-4454、hsa-miR-4525、hsa-miR-7975、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-4648、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-7150、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4497、hsa-miR-6090、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4530、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-4674、hsa-miR-3917、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6800-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-6872-3p、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-1908-3p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4675、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-6799-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-5090、hsa-miR-3180、hsa-miR-1237-5p、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-711、hsa-miR-1260a、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-6089、hsa-miR-6821-5p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-6124、hsa-miR-4532、hsa-miR-4486、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-4508、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6763-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7641、hsa-miR-3928-3p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-3154、hsa-miR-3648、hsa-miR-4442、hsa-miR-3141、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-6819-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-4656、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-204-3p、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-762、hsa-miR-1202、hsa-miR-3162-5p、hsa-miR-3196、hsa-miR-3622a-5p、hsa-miR-3665、hsa-miR-3940-5p、hsa-miR-4294、hsa-miR-4466、hsa-miR-4476、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-4730、hsa-miR-4739、hsa-miR-4787-5p、hsa-miR-5787、hsa-miR-6085、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-6724-5p、hsa-miR-6777-5p、hsa-miR-6778-5p、hsa-miR-6787-5p、hsa-miR-6789-5p、hsa-miR-6845-5p、hsa-miR-6893-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-575、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-920、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-663b、hsa-miR-1225-5p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-451a、hsa-miR-564、hsa-miR-671-5p、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-3656、hsa-miR-4488、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-1469、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-1207-5p、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-30c-1-3p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-4270、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-4655-5p、hsa-miR-1275、hsa-miR-6806-5p、hsa-miR-614、hsa-miR-3937、hsa-miR-6752-5p、hsa-miR-6771-5p、hsa-miR-4450、hsa-miR-211-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-7114-5p及びhsa-miR-6779-5pは公知であり、前述のようにその取得方法も知られている。このため、この遺伝子をクローニングすることによって、本発明で使用可能な核酸プローブ又はプライマーとしてのポリヌクレオチドを作製することができる。
そのような核酸プローブ又はプライマーは、DNA自動合成装置を用いて化学的に合成することができる。この合成には一般にホスホアミダイト法が使用され、この方法によって約100塩基までの一本鎖DNAを自動合成することができる。DNA自動合成装置は、例えばPolygen社、ABI社、Applied BioSystems社などから市販されている。
あるいは、本発明のポリヌクレオチドは、cDNAクローニング法によって作製することもできる。cDNAクローニング技術は、例えばmicroRNA Cloning Kit Wakoなどを利用できる。
ここで、配列番号1~187及び580~611のいずれかで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを検出するための核酸プローブ及びプライマーの配列は、miRNA又はその前駆体としては生体内に存在していない。例えば、配列番号7及び配列番号9で表される塩基配列は、配列番号194で表される前駆体から生成されるが、この前駆体は図1に示すようなヘアピン様構造を有しており、配列番号7及び配列番号9で表される塩基配列は互いにミスマッチ配列を有している。このため、配列番号7又は配列番号9で表される塩基配列に対する、完全に相補的な塩基配列が生体内で自然に生成されることはない。同様に、配列番号1~187及び580~611のいずれかで表される塩基配列を検出するための核酸プローブ及びプライマーは生体内に存在しない人工的な塩基配列を有することになる。
3.前立腺がん検出用キット又はデバイス
本発明はまた、前立腺がんマーカーである標的核酸を測定するための、本発明において核酸プローブ又はプライマーとして使用可能なポリヌクレオチド(これには、変異体、断片、又は誘導体を含みうる。;以下、検出用ポリヌクレオチドと称することがある。)の1つ又は複数を含む前立腺がん検出用のキット又はデバイスを提供する。
本発明はまた、前立腺がんマーカーである標的核酸を測定するための、本発明において核酸プローブ又はプライマーとして使用可能なポリヌクレオチド(これには、変異体、断片、又は誘導体を含みうる。;以下、検出用ポリヌクレオチドと称することがある。)の1つ又は複数を含む前立腺がん検出用のキット又はデバイスを提供する。
本発明における前立腺がんマーカーである標的核酸は、以下の群1から選択される。
miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5p。
miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5p。
場合により測定に使用しうる追加の標的核酸は、以下の群2から選択される、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pである。
場合によりさらに測定に使用しうる追加の標的核酸は、以下の群3から選択される、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5p。
本発明のキット又はデバイスは、上記の前立腺がんマーカーである標的核酸と特異的に結合可能な核酸、好ましくは、上記2に記載の核酸プローブ又はプライマー、具体的には、上記2に記載したポリヌクレオチド類から選択される1又は複数のポリヌクレオチド又はその変異体等を含む。
具体的には、本発明のキット又はデバイスは、配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、その相補的配列を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらのポリヌクレオチド配列の15以上の連続した塩基を含む変異体又は断片、を少なくとも1つ以上含むことができる。
本発明のキット又はデバイスはさらに、配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、その相補的配列を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらのポリヌクレオチド配列の15以上の連続した塩基を含む変異体又は断片、を1つ以上含むことができる。
本発明のキット又はデバイスはさらに、配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、その相補的配列を含む(もしくは、からなる)ポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらのポリヌクレオチド配列の15以上の連続した塩基を含む変異体又は断片、を1つ以上含むことができる。
本発明のキット又はデバイスに含むことができる断片は、例えば下記の(1)~(3)からなる群より選択される1つ以上、好ましくは2つ以上のポリヌクレオチドである。
(1)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(2)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(3)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(1)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(2)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
(3)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列においてuがtである塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチド。
好ましい実施形態では、前記ポリヌクレオチドが、配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その相補的配列からなるポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらの15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含む変異体である。
また、好ましい実施形態では、前記ポリヌクレオチドが、配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その相補的配列からなるポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらの15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含む変異体である。
また、好ましい実施形態では、前記ポリヌクレオチドが、配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その相補的配列からなるポリヌクレオチド、それらのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、又はそれらの15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含む変異体である。
好ましい実施形態では、前記断片は、15以上、好ましくは17以上、より好ましくは19以上の連続した塩基を含むポリヌクレオチドであることができる。
本発明において、ポリヌクレオチドの断片のサイズは、各ポリヌクレオチドの塩基配列において、例えば、連続する15から配列の全塩基数未満、17から配列の全塩基数未満、19から配列の全塩基数未満などの範囲の塩基数である。
本発明のキット又はデバイスを構成する上記のポリヌクレオチドの組み合わせとしては、具体的には表1に示されるような配列番号(表中のmiRNAマーカーに対応する、配列番号1~187及び580~611)に表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドを1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数を組み合わせた場合を挙げることができるが、それらはあくまでも例示であり、他の種々の可能な組み合わせのすべてが本発明に包含されるものとする。
例えば、本発明において前立腺がんと健常体を判別するためのキット又はデバイスを構成する上記の組み合わせとしては、表1に示される配列番号に表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドを2個以上組み合わせることが望ましく、通常では2個の組み合わせで充分な性能を得ることができる。
具体的に前立腺がんと健常体を判別するための塩基配列若しくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドの2個の組み合わせとして、配列番号1~187及び580~611に表される塩基配列からなる上記のポリヌクレオチドで構成される2個の組み合わせのうち、新規に見出された配列番号1~135で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ以上含む組み合わせが好ましい。
また、前立腺がんを健常体だけではなく他のがんとも判別できるがん種特異性のあるポリヌクレオチドの組み合わせとして、例えば配列番号1、3、4、5、6、7、9、10、12、14、15、16、17、18、20、24、29、35、37、42、51、55、58、61、63、64、67、70、72、79、82、89、91、97、98、101、103、104、112、113、114、116、119、126、135、136、139、140、141、145、147、154、155、156、158、169、173、175、178、182、580、581、582、583、584、585、586、587、588、589、590、591、592、593、594、595、596、597、598、599、600、601、602、603、604、605、606、607、608、609、610及び611のポリヌクレオチドからなる群(以降、本群を「がん種特異性ポリヌクレオチド群1」とする)から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチドと、その他の配列番号のポリヌクレオチドとの複数個の組み合わせが好ましい。
更に、前立腺がんを健常体だけではなく他のがんとも判別できるがん種特異性のあるポリヌクレオチドの組み合わせとして、がん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される複数個のポリヌクレオチドの組み合わせがより好ましい。
更に、前立腺がんを健常体だけではなく他のがんとも判別できるがん種特異性のあるポリヌクレオチドの組み合わせとして、がん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される複数個のポリヌクレオチドの組み合わせのうち、がん種特異性ポリヌクレオチド群1に含まれる、配列番号1、12、16、37、42、63、119、126、139、173、178、599、609及び611のポリヌクレオチからなる群(以降、本群を「がん種特異性ポリヌクレオチド群2」とする)から選択されるポリヌクレオチドを少なくとも1つ以上含む組み合わせがより好ましい。
上記のがん種特異性のあるポリヌクレオチドの組み合わせの個数としては、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数を組み合わせが可能であるが、より好ましくは4個以上の組み合わせであり、通常では4個の組み合わせで充分な性能を得ることができる。
以下に、非限定的に、配列番号1で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号1、63、139、600(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-6724-5p)の組み合わせ
(2)配列番号1、12、63、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(3)配列番号1、141、173、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-1203、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号1、16、139、178(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614)の組み合わせ
(5)配列番号1、63、173、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号1、12、63、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(3)配列番号1、141、173、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-1203、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号1、16、139、178(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614)の組み合わせ
(5)配列番号1、63、173、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号12で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号12、42、63、609(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(2)配列番号12、16、135、156(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-125a-3p)の組み合わせ
(3)配列番号12、16、169、178(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、139、601(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(5)配列番号12、16、42、607(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-16-5p)の組み合わせ
(2)配列番号12、16、135、156(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-125a-3p)の組み合わせ
(3)配列番号12、16、169、178(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、139、601(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(5)配列番号12、16、42、607(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-16-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号16で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号16、18、139、178(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4448、hsa-miR-760、hsa-miR-614)の組み合わせ
(2)配列番号12、16、37、178(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号12、16、37、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、37、97(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6746-5p)の組み合わせ
(5)配列番号12、14、16、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号12、16、37、178(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号12、16、37、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、37、97(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6746-5p)の組み合わせ
(5)配列番号12、14、16、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号37で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号37、63、139、611(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(2)配列番号37、42、63、178(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号37、42、63、599(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号37、42、63、139(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760)の組み合わせ
(5)配列番号12、16、37、603(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6787-5p)の組み合わせ
(2)配列番号37、42、63、178(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号37、42、63、599(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号37、42、63、139(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760)の組み合わせ
(5)配列番号12、16、37、603(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6787-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号42で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号42、63、607、611(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-16-5p、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(2)配列番号42、63、609、611(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-451a、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(3)配列番号42、63、173、599(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、42、609(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(5)配列番号42、63、91、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(2)配列番号42、63、609、611(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-451a、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(3)配列番号42、63、173、599(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、42、609(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(5)配列番号42、63、91、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号63で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号10、42、63、599(マーカー:hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号42、63、599、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(3)配列番号42、63、583、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-1202、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(4)配列番号37、42、63、611(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(5)配列番号12、63、70、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号42、63、599、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(3)配列番号42、63、583、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-1202、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(4)配列番号37、42、63、611(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(5)配列番号12、63、70、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号119で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号12、16、37、119(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4492)の組み合わせ
(2)配列番号37、63、119、584(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-3162-5p)の組み合わせ
(3)配列番号63、119、173、178(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(4)配列番号63、119、158、173(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-665)の組み合わせ
(5)配列番号63、119、173、605(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-6845-5p)の組み合わせ
(2)配列番号37、63、119、584(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-3162-5p)の組み合わせ
(3)配列番号63、119、173、178(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(4)配列番号63、119、158、173(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-665)の組み合わせ
(5)配列番号63、119、173、605(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-6845-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号126で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号16、126、597、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-5787、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号16、42、126、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-3648、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(3)配列番号16、126、139、601(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-760、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(4)配列番号16、126、593、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(5)配列番号15、16、126、599(マーカー:hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号16、42、126、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4525、hsa-miR-3648、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(3)配列番号16、126、139、601(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-760、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(4)配列番号16、126、593、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-4725-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(5)配列番号15、16、126、599(マーカー:hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号139で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号37、63、139、584(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-3162-5p)の組み合わせ
(2)配列番号63、139、173、178(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号16、63、139、601(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(4)配列番号37、63、139、600(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-6724-5p)の組み合わせ
(5)配列番号16、139、178、586(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614、hsa-miR-3622a-5p)の組み合わせ
(2)配列番号63、139、173、178(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号16、63、139、601(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(4)配列番号37、63、139、600(マーカー:hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-6724-5p)の組み合わせ
(5)配列番号16、139、178、586(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614、hsa-miR-3622a-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号173で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号63、139、173、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号63、119、173、581(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-642a-3p)の組み合わせ
(3)配列番号63、173、582、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-762、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号63、136、173、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(5)配列番号29、63、173、178(マーカー:hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(2)配列番号63、119、173、581(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-642a-3p)の組み合わせ
(3)配列番号63、173、582、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-762、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号63、136、173、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(5)配列番号29、63、173、178(マーカー:hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号178で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号16、139、178、601(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614、hsa-miR-6777-5p)の組み合わせ
(2)配列番号16、37、139、178(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号1、12、16、178(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(4)配列番号1、63、173、178(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(5)配列番号16、139、178、597(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614、hsa-miR-5787)の組み合わせ
(2)配列番号16、37、139、178(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-614)の組み合わせ
(3)配列番号1、12、16、178(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-614)の組み合わせ
(4)配列番号1、63、173、178(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-665、hsa-miR-614)の組み合わせ
(5)配列番号16、139、178、597(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-614、hsa-miR-5787)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号599で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号12、37、63、599(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号42、58、63、599(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4530、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(3)配列番号1、12、16、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号63、119、173、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(5)配列番号16、18、139、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4448、hsa-miR-760、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(2)配列番号42、58、63、599(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4530、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(3)配列番号1、12、16、599(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(4)配列番号63、119、173、599(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4492、hsa-miR-665、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
(5)配列番号16、18、139、599(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4448、hsa-miR-760、hsa-miR-6717-5p)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号609で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号42、63、585、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-3196、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(2)配列番号42、63、592、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(3)配列番号18、42、581、609(マーカー:hsa-miR-4448、hsa-miR-4525、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、599、609(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(5)配列番号16、126、599、609(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(2)配列番号42、63、592、609(マーカー:hsa-miR-4525、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-4723-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(3)配列番号18、42、581、609(マーカー:hsa-miR-4448、hsa-miR-4525、hsa-miR-642a-3p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(4)配列番号12、16、599、609(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
(5)配列番号16、126、599、609(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3648、hsa-miR-6717-5p、hsa-miR-451a)の組み合わせ
更に、非限定的に、配列番号611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとがん種特異性ポリヌクレオチド群1から選択される3つのポリヌクレオチドの配列番号で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドとの組み合わせを例示する。
(1)配列番号12、16、37、611(マーカー:hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(2)配列番号1、63、139、611(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(3)配列番号63、158、173、611(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(4)配列番号16、37、139、611(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(5)配列番号16、37、595、611(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4739、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(2)配列番号1、63、139、611(マーカー:hsa-miR-4443、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(3)配列番号63、158、173、611(マーカー:hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(4)配列番号16、37、139、611(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
(5)配列番号16、37、595、611(マーカー:hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-4739、hsa-miR-671-5p)の組み合わせ
本発明のキット又はデバイスには、上で説明した本発明におけるポリヌクレオチド(これには、変異体、断片又は誘導体を包含しうる。)に加えて、前立腺がん検出を可能とする既知のポリヌクレオチド又は将来見出されるであろうポリヌクレオチドも包含させることができる。
本発明のキットには、上で説明した本発明におけるポリヌクレオチド、及びその変異体又はその断片に加えて、PSAなどの公知の前立腺がん検査用マーカーを測定するための抗体も包含させることができる。
本発明のキットに含まれるポリヌクレオチド、及びその変異体又はその断片は、個別に又は任意に組み合わせて異なる容器に包装されうる。
本発明のキットには、体液、細胞又は組織から核酸(例えばtotal RNA)を抽出するためのキット、標識用蛍光物質、核酸増幅用酵素及び培地、使用説明書、などを含めることができる。
本発明のデバイスは、上で説明した本発明におけるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又はその断片などの核酸が、例えば、固相に結合もしくは付着されたがんマーカー測定のためのデバイスである。固相の材質の例は、プラスチック、紙、ガラス、シリコン、などであり、加工のしやすさから、好ましい固相の材質はプラスチックである。固相の形状は、任意であり、たとえば方形、丸形、短冊形、フィルム形などである。本発明のデバイスには、たとえば、ハイブリダイゼーション技術による測定のためのデバイスが含まれ、具体的にはブロッティングデバイス、核酸アレイ(例えばマイクロアレイ、DNAチップ、RNAチップなど)などが例示される。
核酸アレイ技術は、必要に応じてLリジンコートやアミノ基、カルボキシル基などの官能基導入などの表面処理が施された固相の表面に、スポッター又はアレイヤーと呼ばれる高密度分注機を用いて核酸をスポットする方法、ノズルより微少な液滴を圧電素子などにより噴射するインクジェットを用いて核酸を固相に吹き付ける方法、固相上で順次ヌクレオチド合成を行う方法などの方法を用いて、上記の核酸を1つずつ結合もしくは付着させることによりチップなどのアレイを作製し、このアレイを用いてハイブリダイゼーションを利用して標的核酸を測定する技術である。
本発明のキット又はデバイスは、上記の群1の前立腺がんマーカーであるmiRNAの少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上、さらに好ましくは少なくとも3つ以上、最も好ましくは少なくとも5つ以上から全部のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な核酸を含む。本発明のキット又はデバイスはさらに、場合により、上記の群2の前立腺がんマーカーであるmiRNAの少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上、さらに好ましくは少なくとも3つ以上、最も好ましくは少なくとも5つ以上から全部のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な核酸を含むことができる。本発明のキット又はデバイスはさらに、場合により、上記の群3の前立腺がんマーカーであるmiRNAの少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上、さらに好ましくは少なくとも3つ以上、最も好ましくは少なくとも5つ以上から全部のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な核酸を含むことができる。
本発明のキット又はデバイスは、下記4の前立腺がんの検出のために使用することができる。
4.前立腺がんの検出方法
本発明はさらに、上記3で説明した本発明のキット又はデバイス(本発明で使用可能な上記の核酸を含む。)を用いて、検体中の、以下の群から選択される、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pで表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群から選択される、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pで表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群から選択される、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pで表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、の1つ以上で表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、をin vitroで測定し、さらに、前立腺がんの罹患が疑われる被験体と、健常体(非前立腺がん患者を含む)とから採取した血液、血清、血漿等の検体について、検体中の上記遺伝子の発現量と、健常体の対照発現量とを用いて、たとえば両発現量を比較して、当該検体中の標的核酸の発現量に統計学的に有意に差がある場合、被験体が、前立腺がんに罹患していると評価することを含む、前立腺がんの検出方法を提供する。
本発明はさらに、上記3で説明した本発明のキット又はデバイス(本発明で使用可能な上記の核酸を含む。)を用いて、検体中の、以下の群から選択される、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pで表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群から選択される、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pで表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、並びに場合により、以下の群から選択される、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pで表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、の1つ以上で表される前立腺がん由来の遺伝子の発現量、をin vitroで測定し、さらに、前立腺がんの罹患が疑われる被験体と、健常体(非前立腺がん患者を含む)とから採取した血液、血清、血漿等の検体について、検体中の上記遺伝子の発現量と、健常体の対照発現量とを用いて、たとえば両発現量を比較して、当該検体中の標的核酸の発現量に統計学的に有意に差がある場合、被験体が、前立腺がんに罹患していると評価することを含む、前立腺がんの検出方法を提供する。
本発明の上記方法は、低侵襲的に、感度及び特異度の高い、がんの早期診断を可能とし、これにより、早期の治療及び予後の改善をもたらし、さらに、疾病憎悪のモニターや外科的、放射線療法的、及び化学療法的な治療の有効性のモニターを可能にする。
本発明の血液、血清、血漿等の検体から前立腺がん由来の遺伝子を抽出する方法としては、3D-Gene(登録商標)RNA extraction reagent from liquid sample kit(東レ株式会社)中のRNA抽出用試薬を加えて調製するのが特に好ましいが、一般的な酸性フェノール法(Acid Guanidinium-Phenol-Chloroform(AGPC)法)を用いてもよいし、Trizol(登録商標)(Life Technologies社)用いてもよいし、Trizol(life technologies社)やIsogen(ニッポンジーン社)などの酸性フェノールを含むRNA抽出用試薬を加えて調製してもよい。さらに、miRNeasy(登録商標)Mini Kit(Qiagen社)などのキットを利用できるが、これらの方法に限定されない。
本発明はまた、本発明のキット又はデバイスの、被験体由来の検体中の前立腺がん由来のmiRNA遺伝子の発現産物のin vitroでの検出のための使用を提供する。
本発明の上記方法において、上記キット又はデバイスは、上で説明したような、本発明で使用可能なポリヌクレオチドを単一であるいはあらゆる可能な組み合わせで含むものが使用される。
本発明の前立腺がんの検出又は(遺伝子)診断において、本発明のキット又はデバイスに含まれるポリヌクレオチドは、プローブ又はプライマーとして用いることができる。プライマーとして用いる場合には、Life Technologies社のTaqMan(登録商標) MicroRNA Assays、Qiagen社のmiScript PCR Systemなどを利用できるが、これらの方法に限定されない。
本発明のキット又はデバイスに含まれるポリヌクレオチドは、ノーザンブロット法、サザンブロット法、in situ ハイブリダイゼーション法、ノーザンハイブリダイゼーション法、サザンハイブリダイゼーション法などのハイブリダイゼーション技術、定量RT-PCR法などの定量増幅技術などの、特定遺伝子を特異的に検出する公知の方法において、定法に従ってプライマー又はプローブとして利用することができる。測定対象検体としては、使用する検出方法の種類に応じて、被験体の血液、血清、血漿、尿等の体液を採取する。あるいは、そのような体液上記の方法によって調製したtotal RNAを用いてもよいし、さらに当該RNAをもとにして調製される、cDNAを含む各種のポリヌクレオチドを用いてもよい。
本発明のキット又はデバイスは、前立腺がんの診断又は罹患の有無の検出のために有用である。具体的には、当該キット又はデバイスを使用した前立腺がんの検出は、前立腺がんの罹患が疑われる被験体から、血液、血清、血漿、尿等の検体を用いて、当該キット又はデバイスに含まれる核酸プローブ又はプライマーで検出される遺伝子の発現量をin vitroで検出することによって行うことができる。前立腺がんの罹患が疑われる被験体の血液、血清、血漿、尿等の検体中の、配列番号1~135、580~606の少なくとも1つ以上で表される塩基配列若しくはその相補的配列、並びに場合により配列番号136~152、607~611の1つ以上で表される塩基配列若しくはその相補的配列、並びに場合により配列番号153~187の1つ以上で表される塩基配列若しくはその相補的配列、からなるポリヌクレオチド(その変異体、断片又は誘導体を包含する。)によって測定される標的miRNAマーカーの発現量が、健常体の血液、血清、又は血漿、尿等の検体中のそれらの発現量と比べて統計学的に有意に差がある場合、当該被験体は前立腺がんに罹患していると評価することができる。
本発明の方法は、直腸診や経直腸的前立腺超音波検査、CT検査、MRI検査、骨シンチグラフィ検査などの画像診断法と組み合わせることができる。本発明の方法は、前立腺がんを特異的に検出することが可能であり、前立腺がん以外のがんから実質的に識別することができる。
本発明のキット又はデバイスを利用した検体中に前立腺がん由来の遺伝子の発現産物が含まれないこと、又は前立腺がん由来の遺伝子の発現産物が含まれること、の検出方法は、被験体の血液、血清、血漿、尿等の体液を採取して、そこに含まれる標的遺伝子の発現量を、本発明のポリヌクレオチド群から選ばれた単数又は複数のポリヌクレオチド(変異体、断片又は誘導体を包含する。)を用いて測定することにより、前立腺がんの有無を評価する又は前立腺がんを検出することを含む。また本発明の前立腺がんの検出方法は、例えば前立腺がん患者において、該疾患の改善のために治療薬を投与した場合における当該疾患の改善の有無又は改善の程度を評価又は診断することもできる。
本発明の方法は、例えば以下の(a)、(b)及び(c)のステップ:
(a)被験体由来の検体を、in vitroで、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと接触させるステップ、
(b)検体中の標的核酸の発現量を、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブ又はプライマーとして用いて測定するステップ、
(c)(b)の結果をもとに、当該被験体中の前立腺がん(細胞)の存在又は不存在を評価するステップ、
を含むことができる。
(a)被験体由来の検体を、in vitroで、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと接触させるステップ、
(b)検体中の標的核酸の発現量を、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブ又はプライマーとして用いて測定するステップ、
(c)(b)の結果をもとに、当該被験体中の前立腺がん(細胞)の存在又は不存在を評価するステップ、
を含むことができる。
具体的には、本発明は、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上、好ましくは少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて被験体が前立腺がんに罹患していること、又は前立腺がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、前立腺がんの検出方法を提供する。
本明細書において「評価」するとは、医師による判定ではなく、in vitroでの検査による結果に基づいた評価支援である。
上記のとおり、本発明の方法において、具体的には、miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-4257がhsa-miR-4257であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-4745-5pがhsa-miR-4745-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-4258がhsa-miR-4258であり、miR-4448がhsa-miR-4448であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-2392がhsa-miR-2392であり、miR-1273g-3pがhsa-miR-1273g-3pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-3619-3pがhsa-miR-3619-3pであり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-4525がhsa-miR-4525であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-7150がhsa-miR-7150であり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-4497がhsa-miR-4497であり、miR-6090がhsa-miR-6090であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4530がhsa-miR-4530であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-4674がhsa-miR-4674であり、miR-3917がhsa-miR-3917であり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-6800-5pがhsa-miR-6800-5pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-6872-3pがhsa-miR-6872-3pであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-1908-3pがhsa-miR-1908-3pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-6799-5pがhsa-miR-6799-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-5090がhsa-miR-5090であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-1237-5pがhsa-miR-1237-5pであり、miR-4758-5pがhsa-miR-4758-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6768-5pがhsa-miR-6768-5pであり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-6821-5pがhsa-miR-6821-5pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-4726-5pがhsa-miR-4726-5pであり、miR-6124がhsa-miR-6124であり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-4508がhsa-miR-4508であり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-6763-5pがhsa-miR-6763-5pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3928-3pがhsa-miR-3928-3pであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-4505がhsa-miR-4505であり、miR-3154がhsa-miR-3154であり、miR-3648がhsa-miR-3648であり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、miR-7113-3pがhsa-miR-7113-3pであり、miR-6819-5pがhsa-miR-6819-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pであり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-4656がhsa-miR-4656であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-1202がhsa-miR-1202であり、miR-3162-5pがhsa-miR-3162-5pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-3665がhsa-miR-3665であり、miR-3940-5pがhsa-miR-3940-5pであり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-4723-5pがhsa-miR-4723-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-4730がhsa-miR-4730であり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-4787-5pがhsa-miR-4787-5pであり、miR-5787がhsa-miR-5787であり、miR-6085がhsa-miR-6085であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-6778-5pがhsa-miR-6778-5pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6789-5pがhsa-miR-6789-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、及び、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pである。
また、本発明の方法において、具体的には、核酸(具体的には、プローブ又はプライマー)が、下記の(a)~(e)に示すポリヌクレオチド:
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
本発明の方法ではさらに、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pから選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を用いることができる。
具体的には、miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-760がhsa-miR-760であり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-575がhsa-miR-575であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-920がhsa-miR-920であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-16-5pがhsa-miR-16-5pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-564がhsa-miR-564であり、及び、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pである。
さらに、具体的には、核酸が、下記の(f)~(j)に示すポリヌクレオチド:
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択される。
本発明の方法ではさらに、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pから選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を用いることができる。
具体的には、miR-4763-3pがhsa-miR-4763-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-4488がhsa-miR-4488であり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-1228-5pがhsa-miR-1228-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-1207-5pがhsa-miR-1207-5pであり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6879-5pがhsa-miR-6879-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4638-5pがhsa-miR-4638-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-4270がhsa-miR-4270であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-665がhsa-miR-665であり、miR-486-5pがhsa-miR-486-5pであり、miR-4655-5pがhsa-miR-4655-5pであり、miR-1275がhsa-miR-1275であり、miR-6806-5pがhsa-miR-6806-5pであり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-6752-5pがhsa-miR-6752-5pであり、miR-6771-5pがhsa-miR-6771-5pであり、miR-4450がhsa-miR-4450であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-7114-5pがhsa-miR-7114-5pであり、及び、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pである。
さらに、具体的には、核酸が、下記の(k)~(o)に示すポリヌクレオチド:
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである。
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列、もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列、に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである。
本発明方法で用いられる検体としては、被験体の生体組織(好ましくは、前立腺組織)、血液、血清、血漿、尿等の体液など、から調製される検体を挙げることができる。具体的には、当該組織から調製されるRNA含有検体、それからさらに調製されるポリヌクレオチドを含む検体、血液、血清、血漿、尿等の体液、被験体の生体組織の一部又は全部をバイオプシーなどで採取するか、手術によって摘出した生体組織、などであり、これらから、測定のための検体を調製することができる。
本明細書で被験体とは、哺乳動物、例えば非限定的にヒト、サル、マウス、ラットなどを指し、好ましくはヒトである。
本発明の方法は、測定対象として用いる検体の種類に応じてステップを変更することができる。
測定対象物としてRNAを利用する場合、前立腺がん(細胞)の検出は、例えば下記のステップ(a)、(b)及び(c):
(a)被験体の検体から調製されたRNA又はそれから転写された相補的ポリヌクレオチド(cDNA)を、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと結合させるステップ、
(b)当該ポリヌクレオチドに結合した検体由来のRNA又は当該RNAから合成されたcDNAを、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブとして用いるハイブリダイゼーションによって、あるいは、上記ポリヌクレオチドをプライマーとして用いる定量RT-PCRによって測定するステップ、
(c)上記(b)の測定結果に基づいて、前立腺がん(由来の遺伝子の発現)の存在又は不存在を評価するステップ、
を含むことができる。
(a)被験体の検体から調製されたRNA又はそれから転写された相補的ポリヌクレオチド(cDNA)を、本発明のキット又はデバイス中のポリヌクレオチドと結合させるステップ、
(b)当該ポリヌクレオチドに結合した検体由来のRNA又は当該RNAから合成されたcDNAを、上記ポリヌクレオチドを核酸プローブとして用いるハイブリダイゼーションによって、あるいは、上記ポリヌクレオチドをプライマーとして用いる定量RT-PCRによって測定するステップ、
(c)上記(b)の測定結果に基づいて、前立腺がん(由来の遺伝子の発現)の存在又は不存在を評価するステップ、
を含むことができる。
本発明によって前立腺がん(由来の遺伝子の発現)をin vitroで検出、検査、評価又は診断するために、例えば種々のハイブリダイゼーション法を使用することができる。このようなハイブリダイゼーション法には、例えばノーザンブロット法、サザンブロット法、RT-PCR法、DNAチップ解析法、in situハイブリダイゼーション法、ノーザンハイブリダイゼーション法、サザンハイブリダイゼーション法などを使用することができる。
ノーザンブロット法を利用する場合は、本発明で使用可能な上記核酸プローブを用いることによって、RNA中の各遺伝子発現の有無やその発現量を検出、測定することができる。具体的には、核酸プローブ(相補鎖)を放射性同位元素(32P、33P、35Sなど)や蛍光物質などで標識し、それを常法にしたがってナイロンメンブレンなどにトランスファーした被検者の生体組織由来のRNAとハイブリダイズさせたのち、形成されたDNA/RNA二重鎖の標識物(放射性同位元素又は蛍光物質)に由来するシグナルを放射線検出器(BAS-1800II(富士写真フィルム株式会社)、などを例示できる)又は蛍光検出器(STORM 865(GEヘルスケア社)、などを例示できる)で検出、測定する方法を例示することができる。
定量RT―PCR法を利用する場合には、本発明で使用可能な上記プライマーを用いることによって、RNA中の遺伝子発現の有無やその発現量を検出、測定することができる。具体的には、被検体の生体組織由来のRNAから常法にしたがってcDNAを調製して、これを鋳型として標的の各遺伝子の領域が増幅できるように、本発明の検出用ポリヌクレオチドから調製した1対のプライマー(上記cDNAに結合する正鎖と逆鎖からなる)をcDNAとハイブリダイズさせて常法によりPCR法を行い、得られた二本鎖DNAを検出する方法を例示することができる。なお、二本鎖DNAの検出法としては、上記PCRをあらかじめ放射性同位元素や蛍光物質で標識しておいたプライマーを用いて行う方法、PCR産物をアガロースゲルで電気泳動し、エチジウムブロマイドなどで二本鎖DNAを染色して検出する方法、産生された二本鎖DNAを常法にしたがってナイロンメンブレンなどにトランスファーさせ、標識した核酸プローブとハイブリダイズさせて検出する方法を含むことができる。
核酸アレイ解析を利用する場合は、本発明の核酸プローブ(一本鎖又は二本鎖)を基板(固相)に貼り付けたRNAチップ又はDNAチップを用いる。核酸プローブを貼り付けた領域をプローブスポット、核酸プローブを貼り付けていない領域をブランクスポットと称する。遺伝子群を基板に固相化したものには、一般に核酸チップ、核酸アレイ、マイクロアレイなどという名称があり、DNAもしくはRNAアレイにはDNAもしくはRNAマクロアレイとDNAもしくはRNAマイクロアレイが包含されるが、本明細書ではチップといった場合、当該アレイの全てを含むものとする。DNAチップとしては3D-Gene(登録商標)Human miRNA Oligo chip(東レ株式会社)を用いることができるが、これに限られない。
DNAチップの測定は、限定されないが、例えば核酸プローブの標識物に由来するシグナルを画像検出器(Typhoon 9410(GEヘルスケア社)、3D-Gene(登録商標)スキャナー(東レ株式会社)などを例示できる)で検出、測定する方法を例示することができる。
本明細書中で使用する「ストリンジェントな条件」とは、上述のように核酸プローブが他の配列に対するよりも大きな程度(例えばバックグラウンド測定値の平均+バックグラウンド測定値の標準誤差×2以上の測定値)で、その標的配列に対してハイブリダイズする条件である。
ストリンジェントな条件はハイブリダイゼーションとその後の洗浄の条件によって、規定される。そのハイブリダイゼーションの条件は、限定されないが、例えば30℃~60℃で、SSC、界面活性剤、ホルムアミド、デキストラン硫酸塩、ブロッキング剤などを含む溶液中で1~24時間の条件とする。ここで、1×SSCは、150mM塩化ナトリウム及び15mMクエン酸ナトリウムを含む水溶液(pH7.0)であり、界面活性剤はSDS(ドデシル硫酸ナトリウム)、Triton、もしくはTweenなどを含む。ハイブリダイゼーション条件としては、より好ましくは3~10×SSC、0.1~1%SDSを含む。ストリンジェントな条件を規定するもうひとつの条件である、ハイブリダイゼーション後の洗浄条件としては、例えば、30℃の0.5×SSCと0.1%SDSを含む溶液、及び30℃の0.2×SSCと0.1%SDSを含む溶液、及び30℃の0.05×SSC溶液による連続した洗浄などの条件を挙げることができる。相補鎖はかかる条件で洗浄しても対象とする正鎖とハイブリダイズ状態を維持するものであることが望ましい。具体的にはこのような相補鎖として、対象の正鎖の塩基配列と完全に相補的な関係にある塩基配列からなる鎖、並びに当該鎖と少なくとも80%、好ましくは少なくとも85%、より好ましくは少なくとも90%又は少なくとも95%、例えば少なくとも98%又は少なくとも99%の同一性を有する塩基配列からなる鎖を例示することができる。
これらのハイブリダイゼーションにおける「ストリンジェントな条件」の他の例については、例えばSambrook、J.& Russel、D.著、Molecular Cloning、A LABORATORY MANUAL、Cold Spring Harbor Laboratory Press、2001年1月15日発行、の第1巻7.42~7.45、第2巻8.9~8.17などに記載されており、本発明において利用できる。
本発明のキットのポリヌクレオチド断片をプライマーとしてPCRを実施する際の条件の例としては、例えば10mM Tris-HCL(pH8.3)、50mM KCL、1~2mM MgCl2などの組成のPCRバッファーを用い、当該プライマーの配列から計算されたTm値+5~10℃において15秒から1分程度処理することなどが挙げられる。かかるTm値の計算方法としてTm値=2×(アデニン残基数+チミン残基数)+4×(グアニン残基数+シトシン残基数)などが挙げられる。
また、定量RT-PCR法を用いる場合には、TaqMan(登録商標) MicroRNA Assays(Life Technologies社):LNA(登録商標)-based MicroRNA PCR(Exiqon社):Ncode(登録商標) miRNA qRT-PCT キット(invitrogen社)などの、miRNAを定量的に測定するために特別に工夫された市販の測定用キットを用いてもよい。
また、定量RT-PCR法を用いる場合には、TaqMan(登録商標) MicroRNA Assays(Life Technologies社):LNA(登録商標)-based MicroRNA PCR(Exiqon社):Ncode(登録商標) miRNA qRT-PCT キット(invitrogen社)などの、miRNAを定量的に測定するために特別に工夫された市販の測定用キットを用いてもよい。
遺伝子発現量の算出には、限定されないが、例えばStatistical analysis of gene expression microarray data(Speed T.著、Chapman and Hall/CRC)、及びA beginner’s guide Microarray gene expression data analysis(Causton H.C.ら著、Blackwell publishing)などに記載された統計学的処理を、本発明において利用できる。例えばDNAチップ上のブランクスポットの測定値の平均値に、ブランクスポットの測定値の標準偏差の2倍、好ましくは3倍、より好ましくは6倍を加算し、その値以上のシグナル値を有するプローブスポットを検出スポットとみなすことができる。さらに、ブランクスポットの測定値の平均値をバックグラウンドとみなし、プローブスポットの測定値から減算し、遺伝子発現量とすることができる。遺伝子発現量の欠損値については、解析対象から除外するか、好ましくは各DNAチップにおける遺伝子発現量の最小値で置換するか、より好ましくは遺伝子発現量の最小値の対数値から0.1を減算した値、で置換することができる。さらに、低シグナルの遺伝子を除去するために、測定サンプル数の20%以上、好ましくは50%、より好ましくは80%以上において2の6乗、好ましくは2の8乗、より好ましくは2の10乗以上の遺伝子発現量を有する遺伝子のみを解析対象として選択することができる。遺伝子発現量の正規化(ノーマライゼーション)としては、限定されないが、例えばglobal normalizationやquantile normalization(Bolstad、 B. M.ら、2003年、Bioinformatics、19巻、p185-193)、などが挙げられる。
本発明はまた、本発明の検出用ポリヌクレオチド、キット、デバイス(例えばチップ)、又はそれらの組み合わせを用いて、被験体由来の検体中の標的遺伝子又は遺伝子の発現量を測定し、前立腺がん患者由来の検体と健常体由来の検体の遺伝子発現量を教師サンプルとして判別式(判別関数)を作成し、検体が前立腺がん由来の遺伝子を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価する方法を提供する。
すなわち、本発明はさらに、本発明の検出用ポリヌクレオチド、キット、デバイス(例えばチップ)、又はそれらの組み合わせを用いて、検体が前立腺がん由来の遺伝子を含むこと/又は前立腺がん由来の遺伝子を含まないことを決定又は評価することが既知の複数の検体中の標的遺伝子の発現量をin vitroで測定する第1のステップ、前記第1のステップで得られた当該標的遺伝子(標的核酸)の発現量の測定値を教師サンプルとした判別式を作成する第2のステップ、被験体由来の検体中の当該標的遺伝子の発現量を第1のステップと同様にin vitroで測定する第3のステップ、前記第2のステップで得られた判別式に第3のステップで得られた当該標的遺伝子の発現量の測定値を代入し、当該判別式から得られた結果に基づいて、検体が前立腺がん由来の遺伝子を含むこと/又は前立腺がん由来の遺伝子を含まないことを決定又は評価する第4のステップを含む、ここで、当該標的遺伝子が当該ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばチップ)に含まれる検出用ポリヌクレオチド、及びその変異体又はその断片によって検出可能なものである、前記方法を提供する。ここで、フィッシャーの判別分析、マハラノビス距離による非線形判別分析、ニューラルネットワーク、Support Vector Machine(SVM)などを用いて判別式を作成できるが、これらに限定されない。
線形判別分析は群分けの境界が直線あるいは超平面である場合、式1を判別式として用いて群の所属を判別する方法である。ここで、xは説明変数、wは説明変数の係数、w0は定数項とする。
判別式で得られた値を判別得点と呼び、新たに与えられたデータセットの測定値を説明変数として当該判別式に代入し、判別得点の符号で群分けを判別することができる。
線形判別分析の一種であるフィッシャーの判別分析はクラス判別を行うのに適した次元を選択するための次元削減法であり、合成変数の分散に着目して、同じラベルを持つデータの分散を最小化することで識別力の高い合成変数を構成する(Venables、W.N.ら著 Modern Applied Statistics with S.Fourth edition. Springer.、2002年)。フィッシャーの判別分析では式2を最大にするような射影方向wを求める。ここで、μは入力の平均、ngはクラスgに属するデータ数、μgはクラスgに属するデータの入力の平均とする。分子・分母はそれぞれデータをベクトルwの方向に射影したときのクラス間分散、クラス内分散となっており、この比を最大化することで判別式係数wiを求める(金森敬文ら著、「パターン認識」、共立出版(2009年)、Richard O.ら著、Pattern Classification Second Edition.、Wiley-Interscience、2000年)。
マハラノビス距離はデータの相関を考慮した式3で算出され、各群からのマハラノビス距離の近い群を所属群として判別する非線形判別分析として用いることができる。ここで、μは各群の中心ベクトル、S-1はその群の分散共分散行列の逆行列である。中心ベクトルは説明変数xから算出され、平均ベクトルや中央値ベクトルなどを用いることができる。
SVMとはV.Vapnikが考案した判別分析法である(The Nature of Statistical Leaning Theory、Springer、1995年)。分類すべき群分けが既知のデータセットの特定のデータ項目を説明変数、分類すべき群分けを目的変数として、当該データセットを既知の群分けに正しく分類するための超平面と呼ばれる境界面を決定し、当該境界面を用いてデータを分類する判別式を決定する。そして当該判別式は、新たに与えられるデータセットの測定値を説明変数として当該判別式に代入することにより、群分けを判別することができる。また、このときの判別結果は分類すべき群でも良く、分類すべき群に分類されうる確率でも良く、超平面からの距離でも良い。SVMでは非線形な問題に対応するための方法として、特徴ベクトルを高次元へ非線形変換し、その空間で線形の識別を行う方法が知られている。非線形に写像した空間での二つの要素の内積がそれぞれのもとの空間での入力のみで表現されるような式のことをカーネルと呼び、カーネルの一例としてリニアカーネル、RBF(Radial Basis Function)カーネル、ガウシアンカーネルを挙げることができる。カーネルによって高次元に写像しながら、実際には写像された空間での特徴の計算を避けてカーネルの計算のみで最適な判別式、すなわち判別式を構成することができる(例えば、麻生英樹ら著、統計科学のフロンテイア6「パターン認識と学習の統計学 新しい概念と手法」、岩波書店(2004年)、Nello Cristianiniら著、SVM入門、共立出版(2008年))。
SVM法の一種であるC-support vector classification(C-SVC)は、2群の説明変数で学習を行って超平面を作成し、未知のデータセットがどちらの群に分類されるかを判別する(C.Cortesら、1995年、Machine Learning、20巻、p273-297)。
本発明の方法で使用可能なC-SVCの判別式の算出例を以下に示す。まず全被験体を前立腺がん患者と健常体の2群に群分けする。被験体が前立腺がん患者である、もしくは健常体であると判断する基準としては、例えば前立腺組織検査を用いることができる。
次に、分けられた2群の血清由来の検体の網羅的遺伝子発現量からなるデータセット(以下、学習検体群)を用意し、当該2群の間で遺伝子発現量に明確な差が見られる遺伝子を説明変数、当該群分けを目的変数(例えば-1と+1)としたC-SVCによる判別式を決定する。式4は最適化する目的関数であり、ここで、eは全ての入力ベクトル、yは目的変数、aはLagrange未定乗数ベクトル、Qは正定値行列、Cは制約条件を調整するパラメータを表す。
式5は最終的に得られた判別式であり、判別式によって得られた値の符号で所属する群を決定できる。ここで、xはサポートベクトル、yは群の所属を示すラベル、aは対応する係数、bは定数項、Kはカーネル関数である。
カーネル関数としては例えば式6で定義されるRBFカーネルを用いることができる。ここで、xはサポートベクトル、γは超平面の複雑さを調整するカーネルパラメータを表す。
これらのほかにも被験体由来の検体が前立腺がん由来の標的遺伝子の発現を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価する、あるいはその発現量を健常体由来の対照と比較し評価する、方法として、ニューラルネットワーク、k-近傍法、決定木、ロジスティック回帰分析などの手法を選択することができる。
本発明の方法は、例えば下記のステップ(a)、(b)及び(c):
(a)前立腺がん患者由来の前立腺がん由来遺伝子を含む組織及び/又は健常体由来の前立腺がん由来遺伝子を含まない組織であることが既に知られている検体中の標的遺伝子の発現量を、本発明による検出用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定するステップ、
(b)(a)で測定された発現量の測定値から、上記の式1~3、5及び6の判別式を作成するステップ、
(c)被験体由来の検体中の当該標的遺伝子の発現量を、本発明による検出用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定し、(b)で作成した判別式に測定値を代入して、得られた結果に基づいて検体が前立腺がん由来の標的遺伝子を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価するステップ、あるいはその発現量を健常体由来の対照と比較し評価するステップ、
を含むことができる。ここで、式1~3、5及び6の式中のxは説明変数であり、上記2節に記載したポリヌクレオチド類から選択されるポリヌクレオチド又はその断片を測定することによって得られる値を含み、具体的には本発明の前立腺がん患者と健常体を判別するための説明変数は、例えば下記の(1)~(3)のいずれかより選択される遺伝子発現量である。
(a)前立腺がん患者由来の前立腺がん由来遺伝子を含む組織及び/又は健常体由来の前立腺がん由来遺伝子を含まない組織であることが既に知られている検体中の標的遺伝子の発現量を、本発明による検出用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定するステップ、
(b)(a)で測定された発現量の測定値から、上記の式1~3、5及び6の判別式を作成するステップ、
(c)被験体由来の検体中の当該標的遺伝子の発現量を、本発明による検出用ポリヌクレオチド、キット又はデバイス(例えばDNAチップ)を用いて測定し、(b)で作成した判別式に測定値を代入して、得られた結果に基づいて検体が前立腺がん由来の標的遺伝子を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価するステップ、あるいはその発現量を健常体由来の対照と比較し評価するステップ、
を含むことができる。ここで、式1~3、5及び6の式中のxは説明変数であり、上記2節に記載したポリヌクレオチド類から選択されるポリヌクレオチド又はその断片を測定することによって得られる値を含み、具体的には本発明の前立腺がん患者と健常体を判別するための説明変数は、例えば下記の(1)~(3)のいずれかより選択される遺伝子発現量である。
(1)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される前立腺がん患者もしくは健常体の血清における遺伝子発現量。
(2)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される前立腺がん患者もしくは健常体の血清における遺伝子発現量。
(3)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される前立腺がん患者もしくは健常体の血清における遺伝子発現量。
(2)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される前立腺がん患者もしくは健常体の血清における遺伝子発現量。
(3)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列又はその相補的配列において、15以上の連続した塩基を含むDNAのいずれかによって測定される前立腺がん患者もしくは健常体の血清における遺伝子発現量。
以上に示すように、被験体由来の検体が前立腺がん由来の遺伝子を含むこと及び/又は含まないことを決定又は評価する方法として、判別式の作成には、学習検体群から作成した判別式が必要であり、当該判別式の判別精度を上げるためには、学習検体群中の2群間に明確な差がある遺伝子を判別式に用いることが必要である。
また、判別式の説明変数に用いる遺伝子の決定は、次のように行うことが好ましい。まず、学習検体群である、前立腺がん患者群の網羅的遺伝子発現量と健常体群の網羅的遺伝子発現量をデータセットとし、パラメトリック解析であるt検定のP値、ノンパラメトリック解析であるMann-WhitneyのU検定のP値、又はWilcoxon検定のP値などを利用して、当該2群間における各遺伝子の発現量の差の大きさを求める。
検定によって得られたP値の危険率(有意水準)が例えば5%、1%又は0.01%より小さい場合に統計学的に有意とみなすことができる。
検定を繰り返し行うことに起因する第一種の過誤の確率の増大を補正するために公知の方法、例えばボンフェローニ、ホルムなどの方法によって補正することができる(例えば、永田靖ら著、「統計的多重比較法の基礎」、サイエンティスト社(2007年))。ボンフェローニ補正を例示すると、例えば検定によって得られたP値を検定の繰り返し回数、即ち、解析に用いる遺伝子数で乗じ、所望の有意水準と比較することにより検定全体での第一種の過誤を生じる確率を抑制できる。
また、検定ではなく前立腺がん患者群の遺伝子発現量と健常体群の遺伝子発現量の間で、各々の遺伝子発現量の中央値の発現比の絶対値(Fold change)を算出し、判別式の説明変数に用いる遺伝子を選択してもよい。また、前立腺がん患者群と健常体群の遺伝子発現量を用いてROC曲線を作成し、AUROC値を基準にして判別式の説明変数に用いる遺伝子を選択してもよい。
次に、ここで求めた遺伝子発現量の差が大きい任意の数の遺伝子を用いて、上記の種々の方法で算出することができる判別式を作成する。最大の判別精度を得る判別式を構築する方法として、例えばP値の有意水準を満たした遺伝子のあらゆる組み合わせで判別式を構築する方法や、判別式を作成するために使用する遺伝子を、遺伝子発現量の差の大きい順に一つずつ増やしながら繰り返して評価する方法などがある(Furey TS.ら、2000年、Bioinformatics.、16巻、p906-14)。この判別式に対し、別の独立の前立腺がん患者もしくは健常体の遺伝子発現量を説明変数に代入して、この独立の前立腺がん患者もしくは健常体について所属する群の判別結果を算出する。すなわち、見出した診断用遺伝子セット及び診断用遺伝子セットを用いて構築した判別式を、独立の検体群で評価することにより、より普遍的な前立腺がんを検出することができる診断用遺伝子セット及び前立腺がんを判別する方法を見出すことができる。
また、当該判別式の判別性能(汎化性)の評価には、Split-sample法を用いることが好ましい。すなわち、データセットを学習検体群とテスト検体群に分割し、学習検体群で統計学的検定による遺伝子の選択と判別式作成を行い、該判別式でテスト検体群を判別した結果とテスト検体群が所属する真の群を用いて精度・感度・特異度を算出し、判別性能を評価する。一方、データセットを分割せずに、全検体を用いて統計学的検定による遺伝子の選択と判別式作成を行い、新規に用意した検体を該判別式で判別して精度・感度・特異度を算出し、判別性能を評価することもできる。
本発明は、前立腺がんの診断及び治療に有用な検出用又は疾患診断用ポリヌクレオチド、当該ポリヌクレオチドを用いた前立腺がんの検出方法、及び当該ポリヌクレオチドを含む前立腺がんの検出キット及びデバイスを提供する。特に、既存の腫瘍マーカーPSAによる前立腺がん診断法を超える精度を示す診断用遺伝子の選定と判別式の作成を実施するため、本発明の方法において、例えば、PSAによって陰性と判断されたにもかかわらず、造影剤を用いたコンピュータ断層撮影等の精密検査によって最終的に前立腺がんが存在することが明らかとなった患者由来の血清中の発現遺伝子と、前立腺がんが存在しない患者由来の血清中の発現遺伝子を比較することによって、PSAを超える精度を示す、診断用遺伝子セット及び判別式を構築できる。
例えば、上に記載したような配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列若しくはその相補的配列、に基づく1又は2以上の上記ポリヌクレオチド、並びに場合により、配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列若しくはその相補的配列、に基づく1又は2以上の上記ポリヌクレオチド、並びに場合により、配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列若しくはその相補的配列、に基づく1又は2以上の上記ポリヌクレオチド、からの任意の組み合わせを診断用遺伝子セットとする。さらに、組織診断の診断結果がクラスIの前立腺がん患者由来の検体と、クラスIIの健常体由来の検体における該診断用遺伝子セットの発現量を用いて判別式を構築する。その結果、未知の検体の該診断用遺伝子セットの発現量を測定することにより、未知の検体が前立腺がん由来遺伝子を含むこと又は前立腺がん由来遺伝子を含まないことを最高で100%の精度で見分けることができる。
本発明を以下の実施例によってさらに具体的に説明する。しかし、本発明の範囲は、この実施例によって制限されないものとする。
[参考例1]
<前立腺がん患者と健常体の検体の採取>
インフォームドコンセントを得た健常体男性94人と前立腺以外の臓器にがんが認められていない前立腺がん患者35人(ステージIIが30例、ステージIIIが1例、ステージIVが4例)(表2-1)からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た健常体男性47人と前立腺以外の臓器にがんが認められていない前立腺がん患者17人(ステージIIが15例、ステージIIIが2例)(表2-2)からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、テスト検体群とした。
<前立腺がん患者と健常体の検体の採取>
インフォームドコンセントを得た健常体男性94人と前立腺以外の臓器にがんが認められていない前立腺がん患者35人(ステージIIが30例、ステージIIIが1例、ステージIVが4例)(表2-1)からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た健常体男性47人と前立腺以外の臓器にがんが認められていない前立腺がん患者17人(ステージIIが15例、ステージIIIが2例)(表2-2)からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、テスト検体群とした。
<totalRNAの抽出>
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体男性141人と前立腺がん患者52人の合計193人からそれぞれ得られた血清300μLから、3D-Gene(登録商標)RNA extraction reagent from liquid sample kit(東レ株式会社)中のRNA抽出用試薬を用いて、同社の定めるプロトコールに従ってtotal RNAを得た。
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体男性141人と前立腺がん患者52人の合計193人からそれぞれ得られた血清300μLから、3D-Gene(登録商標)RNA extraction reagent from liquid sample kit(東レ株式会社)中のRNA抽出用試薬を用いて、同社の定めるプロトコールに従ってtotal RNAを得た。
<遺伝子発現量の測定>
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体男性141人と前立腺がん患者52人の合計193人の血清から得たtotal RNAに対して、3D-Gene(登録商標)miRNA Labeling kit(東レ株式会社)を用いて同社が定めるプロトコール(ver2.20)に基づいてmiRNAを蛍光標識した。オリゴDNAチップとして、miRBase release 20に登録されているmiRNAの中で、2、555種のmiRNAと相補的な配列を有するプローブを搭載した3D-Gene(登録商標)Human miRNA Oligo chip(東レ株式会社)を用い、同社が定めるプロトコールに基づいてストリンジェントな条件で、total RNA中のmiRNAとDNAチップ上のプローブとのハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼーション後の洗浄を行った。DNAチップを3D-Gene(登録商標)スキャナー(東レ株式会社)を用いてスキャンし、画像を取得して3D-Gene(登録商標)Extraction(東レ株式会社)にて蛍光強度を数値化した。数値化された蛍光強度を、底が2の対数値に変換して遺伝子発現量とし、ブランク値の減算を行い、欠損値は各DNAチップにおける遺伝子発現量の最小値の対数値から0.1を減算した値で置換した。その結果、前立腺がん患者52人の血清及び健常体男性141人の血清に対する、網羅的なmiRNAの遺伝子発現量を得た。数値化されたmiRNAの遺伝子発現量を用いた計算及び統計解析は、R言語3.0.2(R Development Core Team (2013). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing、 URL http://www.R-project.org/)及びMASSパッケージ7.3-30(Venables、 W. N. & Ripley、 B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer、New York. ISBN 0-387-95457-0)を用いて実施した。
検体として上記学習検体群、テスト検体群合わせて健常体男性141人と前立腺がん患者52人の合計193人の血清から得たtotal RNAに対して、3D-Gene(登録商標)miRNA Labeling kit(東レ株式会社)を用いて同社が定めるプロトコール(ver2.20)に基づいてmiRNAを蛍光標識した。オリゴDNAチップとして、miRBase release 20に登録されているmiRNAの中で、2、555種のmiRNAと相補的な配列を有するプローブを搭載した3D-Gene(登録商標)Human miRNA Oligo chip(東レ株式会社)を用い、同社が定めるプロトコールに基づいてストリンジェントな条件で、total RNA中のmiRNAとDNAチップ上のプローブとのハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼーション後の洗浄を行った。DNAチップを3D-Gene(登録商標)スキャナー(東レ株式会社)を用いてスキャンし、画像を取得して3D-Gene(登録商標)Extraction(東レ株式会社)にて蛍光強度を数値化した。数値化された蛍光強度を、底が2の対数値に変換して遺伝子発現量とし、ブランク値の減算を行い、欠損値は各DNAチップにおける遺伝子発現量の最小値の対数値から0.1を減算した値で置換した。その結果、前立腺がん患者52人の血清及び健常体男性141人の血清に対する、網羅的なmiRNAの遺伝子発現量を得た。数値化されたmiRNAの遺伝子発現量を用いた計算及び統計解析は、R言語3.0.2(R Development Core Team (2013). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing、 URL http://www.R-project.org/)及びMASSパッケージ7.3-30(Venables、 W. N. & Ripley、 B. D. (2002) Modern Applied Statistics with S. Fourth Edition. Springer、New York. ISBN 0-387-95457-0)を用いて実施した。
[参考例2]
<前立腺がん以外のがんの検体の採取>
インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない乳がん患者63人からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の前立腺がん患者35人と健常体男性99人と合わせて学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない乳がん患者30人からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の前立腺以外の臓器にがんが認められていない前立腺がん患者17人、健常体男性51人と合わせてテスト検体群とした。以降の操作は参考例1と同様に行った。
<前立腺がん以外のがんの検体の採取>
インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない乳がん患者63人からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の前立腺がん患者35人と健常体男性99人と合わせて学習検体群とした。同様に、インフォームドコンセントを得た他の臓器にがんが認められていない乳がん患者30人からベノジェクトII真空採血管VP-AS109K60(テルモ株式会社)を用いてそれぞれ血清を採取し、参考例1の前立腺以外の臓器にがんが認められていない前立腺がん患者17人、健常体男性51人と合わせてテスト検体群とした。以降の操作は参考例1と同様に行った。
[実施例1]
<学習検体群の検体を用いた遺伝子マーカーの選定とテスト検体群の検体を用いた単独の遺伝子マーカーの前立腺がん判別性能の評価方法>
本実施例では、学習検体群から前立腺がんを健常体と判別するための遺伝子マーカーを選定し、学習検体群とは独立したテスト検体群の検体において検討した。
<学習検体群の検体を用いた遺伝子マーカーの選定とテスト検体群の検体を用いた単独の遺伝子マーカーの前立腺がん判別性能の評価方法>
本実施例では、学習検体群から前立腺がんを健常体と判別するための遺伝子マーカーを選定し、学習検体群とは独立したテスト検体群の検体において検討した。
具体的には、まず上記の参考例1で得た学習検体群とテスト検体群のmiRNA発現量を合わせてquantile normalizationで正規化した。
次に、学習検体群を用いて診断用遺伝子の選定を行った。ここで、より信頼性の高い診断マーカーを獲得するため、学習検体群の前立腺がん患者群または学習検体群の健常体群のいずれかにおいて、50%以上の検体で2の6乗以上の遺伝子発現量を有する遺伝子のみを選択した。更に前立腺がん患者群と健常体群を判別するための統計的有意性がある遺伝子として、各々の遺伝子発現量について等分散を仮定した両側t検定で得られたP値をボンフェローニ補正し、p<0.01を満たす遺伝子を、判別式の説明変数に用いる遺伝子マーカーとして獲得し、表3に記載した。
このようにして、hsa-miR-4443、hsa-miR-1908-5p、hsa-miR-4257、hsa-miR-3197、hsa-miR-3188、hsa-miR-4649-5p、hsa-miR-1343-3p、hsa-miR-6861-5p、hsa-miR-1343-5p、hsa-miR-642b-3p、hsa-miR-6741-5p、hsa-miR-4745-5p、hsa-miR-6826-5p、hsa-miR-3663-3p、hsa-miR-3131、hsa-miR-92a-2-5p、hsa-miR-4258、hsa-miR-4448、hsa-miR-6125、hsa-miR-6880-5p、hsa-miR-6132、hsa-miR-4467、hsa-miR-6749-5p、hsa-miR-2392、hsa-miR-1273g-3p、hsa-miR-4746-3p、hsa-miR-1914-3p、hsa-miR-7845-5p、hsa-miR-6726-5p、hsa-miR-128-2-5p、hsa-miR-4651、hsa-miR-6765-3p、hsa-miR-3185、hsa-miR-4792、hsa-miR-6887-5p、hsa-miR-5572、hsa-miR-3619-3p、hsa-miR-6780b-5p、hsa-miR-4707-5p、hsa-miR-8063、hsa-miR-4454、hsa-miR-4525、hsa-miR-7975、hsa-miR-744-5p、hsa-miR-3135b、hsa-miR-4648、hsa-miR-6816-5p、hsa-miR-4741、hsa-miR-7150、hsa-miR-6791-5p、hsa-miR-1247-3p、hsa-miR-7977、hsa-miR-4497、hsa-miR-6090、hsa-miR-6781-5p、hsa-miR-6870-5p、hsa-miR-6729-5p、hsa-miR-4530、hsa-miR-7847-3p、hsa-miR-6825-5p、hsa-miR-4674、hsa-miR-3917、hsa-miR-4707-3p、hsa-miR-6885-5p、hsa-miR-6722-3p、hsa-miR-4516、hsa-miR-6757-5p、hsa-miR-6840-3p、hsa-miR-5195-3p、hsa-miR-6756-5p、hsa-miR-6800-5p、hsa-miR-6727-5p、hsa-miR-6126、hsa-miR-6872-3p、hsa-miR-4446-3p、hsa-miR-1268a、hsa-miR-1908-3p、hsa-miR-3679-5p、hsa-miR-4534、hsa-miR-4675、hsa-miR-7108-5p、hsa-miR-6799-5p、hsa-miR-4695-5p、hsa-miR-3178、hsa-miR-5090、hsa-miR-3180、hsa-miR-1237-5p、hsa-miR-4758-5p、hsa-miR-3184-5p、hsa-miR-4286、hsa-miR-6784-5p、hsa-miR-6768-5p、hsa-miR-6785-5p、hsa-miR-4706、hsa-miR-711、hsa-miR-1260a、hsa-miR-6746-5p、hsa-miR-6089、hsa-miR-6821-5p、hsa-miR-4667-5p、hsa-miR-8069、hsa-miR-4726-5p、hsa-miR-6124、hsa-miR-4532、hsa-miR-4486、hsa-miR-4728-5p、hsa-miR-4508、hsa-miR-128-1-5p、hsa-miR-4513、hsa-miR-6795-5p、hsa-miR-4689、hsa-miR-6763-5p、hsa-miR-8072、hsa-miR-6765-5p、hsa-miR-4419b、hsa-miR-7641、hsa-miR-3928-3p、hsa-miR-1227-5p、hsa-miR-4492、hsa-miR-296-3p、hsa-miR-6769a-5p、hsa-miR-6889-5p、hsa-miR-4632-5p、hsa-miR-4505、hsa-miR-3154、hsa-miR-3648、hsa-miR-4442、hsa-miR-3141、hsa-miR-7113-3p、hsa-miR-6819-5p、hsa-miR-3195、hsa-miR-1199-5p、hsa-miR-6738-5p、hsa-miR-4656、hsa-miR-6820-5p、hsa-miR-615-5p、hsa-miR-486-3p、hsa-miR-1225-3p、hsa-miR-760、hsa-miR-187-5p、hsa-miR-1203、hsa-miR-7110-5p、hsa-miR-371a-5p、hsa-miR-939-5p、hsa-miR-575、hsa-miR-92b-5p、hsa-miR-887-3p、hsa-miR-920、hsa-miR-1915-5p、hsa-miR-1231、hsa-miR-663及びhsa-miR-1225-5p遺伝子、これらに関連する配列番号1~152の塩基配列を見出した。
更に、これらの遺伝子の発現量を指標として、フィッシャーの判別分析により前立腺がんの有無を判別する判別式を作成した。すなわち、学習検体群において選択された152個の遺伝子の中で、新規に見出された配列番号1~135のいずれかで表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを式2に入力して判別式を作成し、算出した精度・感度・特異度を表4に示した。またそのときの判別式係数と定数項を表5に示した。
次に、上記で作成した判別式を用いてテスト検体群における精度・感度・特異度を算出し、選定されたポリヌクレオチドの判別性能を独立した検体で検証した(表4)。例えば、配列番号1で示される塩基配列の発現量測定値をテスト検体中の健常体(47人)と前立腺がん患者(17人)で比較した場合、学習検体群では健常体群に対し前立腺がん患者群の遺伝子発現量測定値が有意に低いことが示された結果(図2左参照)はテスト検体群でも再現できた(図2右参照)。同様に配列番号2~152に示される他のポリヌクレオチドにおいても、健常体群に対し前立腺がん患者群の遺伝子発現量測定値が有意に低い(-)又は高い(+)結果が得られ、これらの結果はテスト検体群で検証ができた。また、例えばこの配列番号1で示される塩基配列に関し、学習検体群で設定した両群を判別する閾値(6.84)を用いて前立腺がん検出の的中数を算出したところ、真陽性15例、真陰性44例、偽陽性3例、偽陰性2例であり、これらの値から検出性能として精度92.2%、感度88.2%、特異度93.6%が得られた。このようにして配列番号1~152に示される全てのポリヌクレオチドの検出性能を算出し表4に記載した。
表3に示す配列番号1~152で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのうち、例えば配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、116、119、120、121、123、124、126、127、128、131、132、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151及び152で表される塩基配列からなる141個のポリヌクレオチドは、テスト検体群においてそれぞれ感度88.2%、94.1%、76.5%、88.2%、88.2%、94.1%、76.5%、64.7%、88.2%、76.5%、64.7%、82.4%、70.6%、88.2%、52.9%、47.1%、70.6%、94.1%、70.6%、76.5%、76.5%、70.6%、70.6%、29.4%、58.8%、88.2%、58.8%、76.5%、64.7%、76.5%、64.7%、47.1%、76.5%、82.4%、70.6%、47.1%、64.7%、58.8%、52.9%、82.4%、64.7%、70.6%、64.7%、70.6%、70.6%、76.5%、58.8%、58.8%、52.9%、64.7%、47.1%、41.2%、70.6%、52.9%、29.4%、35.3%、41.2%、58.8%、52.9%、41.2%、70.6%、52.9%、35.3%、64.7%、29.4%、70.6%、70.6%、76.5%、58.8%、70.6%、35.3%、58.8%、58.8%、47.1%、70.6%、76.5%、58.8%、82.4%、23.5%、52.9%、41.2%、47.1%、64.7%、41.2%、41.2%、35.3%、47.1%、47.1%、41.2%、29.4%、41.2%、64.7%、35.3%、70.6%、29.4%、47.1%、29.4%、52.9%、64.7%、47.1%、23.5%、35.3%、47.1%、35.3%、35.3%、52.9%、23.5%、35.3%、47.1%、52.9%、23.5%、23.5%、29.4%、52.9%、41.2%、23.5%、23.5%、41.2%、47.1%、29.4%、58.8%、29.4%、23.5%、29.4%、58.8%、88.2%、76.5%、58.8%、52.9%、47.1%、35.3%、52.9%、29.4%、47.1%、76.5%、58.8%、29.4%、29.4%、29.4%、41.2%及び23.5%を示した(表4)。ここで、非特許文献3より、既存の前立腺がんマーカーPSAの一般的な感度は20.5%と報告されている。すなわち、テスト検体群において、例えば配列番号1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、103、104、105、106、107、108、109、110、111、112、113、114、116、119、120、121、123、124、126、127、128、131、132、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151及び152で表される塩基配列からなる141個のポリヌクレオチドは、単独でPSAを上回る感度で前立腺がんを判別することが証明できた。
[実施例2]
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組み合わせによる前立腺がん判別性能の評価方法>
本実施例では、実施例1で選定された遺伝子マーカーを組み合わせて前立腺がん判別性能を評価する方法を検討した。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組み合わせによる前立腺がん判別性能の評価方法>
本実施例では、実施例1で選定された遺伝子マーカーを組み合わせて前立腺がん判別性能を評価する方法を検討した。
具体的には、実施例1において選択された配列番号1~152で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのうち、新規に見出された配列番号1~135で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む2個の組み合わせ11,340通りについてフィッシャーの判別分析を行い、前立腺がんの存在の有無を判別する判別式を構築した。次に、上記で作成した判別式を用いてテスト検体群における精度・感度・特異度を算出し、選定されたポリヌクレオチドの判別性能を独立した検体で検証した。例えば、配列番号1と配列番号2で示される塩基配列の発現量測定値を用いて、テスト検体中の健常体(47人)と前立腺がん患者(17人)で比較した場合、学習検体群では健常体群と前立腺がん患者群の遺伝子発現量測定値が有意に分離する散布図が得られ(図3左参照)、更にこの結果はテスト検体群でも再現ができた(図3右参照)。同様に、配列番号1~152で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのうち、新規に見出された配列番号1~135で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む2個の、他の組み合わせにおいても、健常体群と前立腺がん患者群の遺伝子発現量測定値を有意に分離する散布図が得られ、これらの結果はテスト検体群で検証ができた。また、例えばこの配列番号1と配列番号2で示される塩基配列に関し、学習検体群で設定した両群を判別する閾値(0=1.15x+y+19.53)を用いて前立腺がん検出の的中数を算出したところ、真陽性16例、真陰性45例、偽陽性2例、偽陰性1例であり、これらの値から検出性能として精度95.3%、感度94.1%、特異度95.7%が得られた。
このようにして、配列番号1~152で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのうち、新規に見出された配列番号1~135で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む2個の組み合わせ全通り(11,340通り)の検出性能を算出した。このうち例として、配列番号1で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドの発現量測定値を含む組み合わせ151通りとその検出性能について表6に記載した。例えば配列番号1と配列番号2、配列番号1と配列番号3、配列番号1と配列番号4、及び、配列番号1と配列番号5、で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドの発現量測定値の組み合わせについては、テスト検体群において感度がそれぞれ94.1%、88.2%、88.2%、94.1%、を示した(表6)。このように既存の前立腺がんマーカーであるPSAの一般感度(20.5%)を上回るポリヌクレオチドの発現量測定値2個の組み合わせは、テスト検体群で11,326通り得られ、この組み合わせには実施例1で得られた表3に記載の塩基配列1~152で表されるポリヌクレオチドの全てが少なくとも1回は使用された。すなわち、配列番号1~152で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドは、新規に見出された配列番号1~135で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む2個の組み合わせにおいて、PSAを上回る感度で前立腺がんを検出する性能を持つことが証明できた。
このようにして、配列番号1~152で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドの発現量測定値を3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数を組み合わせても、優れた感度で前立腺がんを検出するマーカーが得られる。例えば、実施例1で新規に見出された配列番号1~135で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドについて、統計的有意性を示すP値の降順に順位付けし、上位のポリヌクレオチド(miRNA)から1個づつ加えた1個から複数個のポリヌクレオチドの組み合わせを用いて前立腺がん検出感度を評価した。すなわち、この評価におけるポリヌクレオチド(miRNA)の組み合わせの順番は、配列番号で示すと、表3に示す配列番号135から、134、133、と順番に遡った順となる。その結果、テスト検体群における感度は、1個のポリヌクレオチドで29.4%、2個のポリヌクレオチドで47.1%、3個のポリヌクレオチドで76.5%、5個のポリヌクレオチドで82.4%、10個のポリヌクレオチドで82.4%、20個のポリヌクレオチドで88.2%、50個のポリヌクレオチドで100%、100個のポリヌクレオチドで100%であった。これらの感度は既存の前立腺がんマーカーPSAの一般感度(20.5%)よりも高いことから、2個以上の複数のmiRNAを組み合わせても前立腺がんを検出する優れたマーカーと成り得ることが示された。ここで、複数のmiRNAの組み合わせは、上記のように統計的有意差の順に加算する場合に限らず、どのような複数個のポリヌクレオチド(miRNA)の組み合わせも前立腺がんの検出に用いることができる。
これらの結果から配列番号1~152で表される塩基配列からなる全てのポリヌクレオチドは、優れた診断マーカーであるといえる。
[実施例3]
<全検体を用いた場合の遺伝子マーカーの選定と獲られた遺伝子マーカーの前立腺がん判別性能の評価方法>
本実施例では、上記実施例1及び2で用いた学習検体群及びテスト検体群の検体を統合し全検体を用いて、遺伝子マーカーの選定及びその前立腺がん判別性能評価を行った。
<全検体を用いた場合の遺伝子マーカーの選定と獲られた遺伝子マーカーの前立腺がん判別性能の評価方法>
本実施例では、上記実施例1及び2で用いた学習検体群及びテスト検体群の検体を統合し全検体を用いて、遺伝子マーカーの選定及びその前立腺がん判別性能評価を行った。
具体的には、上記の参考例1で得た前立腺がん患者52人の血清及び健常体男性141人の血清に対するmiRNA発現量について、quantile normalizationで正規化した。より信頼性の高い診断マーカーを獲得するため、遺伝子マーカーの選定では前立腺がん患者群または健常体群のいずれかにおいて、50%以上の検体で2の6乗以上の遺伝子発現量を有する遺伝子のみを選択した。更に前立腺がん患者群と健常体群を判別するための統計的有意性を得るために、各々の遺伝子発現量について等分散を仮定した両側t検定で得られたP値をボンフェローニ補正し、p<0.01を満たす遺伝子を判別式の説明変数に用いる遺伝子マーカーとして選択し表7に記載した。このようにして、表3に記載した遺伝子に加え、hsa-miR-4763-3p、hsa-miR-3656、hsa-miR-4488、hsa-miR-125a-3p、hsa-miR-1469、hsa-miR-1228-5p、hsa-miR-6798-5p、hsa-miR-1268b、hsa-miR-6732-5p、hsa-miR-1915-3p、hsa-miR-4433b-3p、hsa-miR-1207-5p、hsa-miR-4433-3p、hsa-miR-6879-5p、hsa-miR-4417、hsa-miR-30c-1-3p、hsa-miR-4638-5p、hsa-miR-6088、hsa-miR-4270、hsa-miR-6782-5p、hsa-miR-665、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-4655-5p、hsa-miR-1275、hsa-miR-6806-5p、hsa-miR-614、hsa-miR-3937、hsa-miR-6752-5p、hsa-miR-6771-5p、hsa-miR-4450、hsa-miR-211-3p、hsa-miR-663a、hsa-miR-6842-5p、hsa-miR-7114-5p及びhsa-miR-6779-5p遺伝子、これらに関連する配列番号153~187の塩基配列を見出した。配列番号1~152の塩基配列と同様に、配列番号153~187の塩基配列に示されるポリヌクレオチドにおいても、健常体群に対し前立腺がん患者群の測定値が有意に低い(-)又は高い(+)結果(表7)が得られ、これらの結果はテスト検体群で検証できた。従って、表7に記載した遺伝子の発現量測定値を単独又は表3に記載の遺伝子の発現量測定値と組み合わせて用いることにより、実施例1及び2に記載した方法で新規に得た検体を判別することができる。
[実施例4]
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組み合わせによる前立腺がん特異的な判別性能の評価方法>
本実施例では、参考例2で得た学習検体群を用い、実施例1に記載の方法と同様の方法で、前立腺がん患者と、健常体及び乳がん患者からなる対照群との血清中のmiRNAの遺伝子発現量の比較を行い、統計的有意性がある診断用遺伝子を選択した。その結果、新たに選択された、配列番号580~611で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを、実施例1で選定された遺伝子マーカーに更に組み合わせて前立腺がん特異的な判別性能を評価する方法を検討した。
<テスト検体群検体を用いた複数の遺伝子マーカーの組み合わせによる前立腺がん特異的な判別性能の評価方法>
本実施例では、参考例2で得た学習検体群を用い、実施例1に記載の方法と同様の方法で、前立腺がん患者と、健常体及び乳がん患者からなる対照群との血清中のmiRNAの遺伝子発現量の比較を行い、統計的有意性がある診断用遺伝子を選択した。その結果、新たに選択された、配列番号580~611で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドを、実施例1で選定された遺伝子マーカーに更に組み合わせて前立腺がん特異的な判別性能を評価する方法を検討した。
具体的には、まず上記の参考例2で得た学習検体群とテスト検体群のmiRNA発現量を合わせてquantile normalizationで正規化した。次に、配列番号1~187、580~611で表される塩基配列からなるポリヌクレオチドのいずれかの発現量測定値を少なくとも1つ以上含む1~4個の組み合わせについてフィッシャーの判別分析を行い、前立腺がんの存在の有無を判別する判別式を構築した。次に、前立腺がん患者群を陽性検体群、一方で、健常体群と乳がん患者群を陰性検体群として、上記で作成した判別式を用いて参考例2で得たテスト検体群における精度・感度・特異度を算出し、選定されたポリヌクレオチドの判別性能を独立した検体で検証した。
上記の配列番号(表1のmiRNAマーカーに対応する、配列番号1~187及び580~611)で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドの多くが前立腺がんの存在の有無の判別において比較的高い精度、感度、特異度を提供することができるうえに、前立腺がんをその他のがんから特異的に識別可能であった。標的マーカーと特異的に結合可能なポリヌクレオチドとして、例えば、配列番号1、3、4、5、6、7、9、10、12、14、15、16、17、18、20、24、29、35、37、42、51、55、58、61、63、64、67、70、72、79、82、89、91、97、98、101、103、104、112、113、114、116、119、126、135、136、139、140、141、145、147、154、155、156、158、169、173、175、178、182、580、581、582、583、584、585、586、587、588、589、590、591、592、593、594、595、596、597、598、599、600、601、602、603、604、605、606、607、608、609、610及び611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドからなる群(がん種特異性ポリヌクレオチド群1)から選択される複数個のポリヌクレオチドの組み合わせのうち、がん種特異性ポリヌクレオチド群1に含まれる、配列番号1、12、16、37、42、63、119、126、139、173、178、599、609及び611のポリヌクレオチからなる群(がん種特異性ポリヌクレオチド群2)から選択されるポリヌクレオチドを少なくとも1つ以上含む組み合わせにおいて、高精度に、前立腺がんをその他のがんから特異的に識別可能であった。
上記のがん種特異性のあるポリヌクレオチドの組み合わせの個数としては、1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個又はそれ以上の個数を組み合わせが可能であるが、4個以上の組み合わせにおいて判別精度85%以上を示すことができた。
具体的には、配列番号1で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-1に示す。配列番号1で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において94.4%、テスト検体群において精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号1で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度90.8%を示した。また、例えば、配列番号1で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で98.5%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。また、例えば、配列番号1で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で95.4%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。
また更に、配列番号12で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-2に示す。配列番号12で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において65.5%、テスト検体群において精度56.1%を示した。また、例えば、配列番号12で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.9%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号12で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で98.0%、テスト検体群において最高で精度93.9%を示した。また、例えば、配列番号12で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で98.5%、テスト検体群において最高で精度94.9%を示した。
また更に、配列番号16で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-3に示す。配列番号16で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において71.6%、テスト検体群において精度74.5%を示した。また、例えば、配列番号16で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で95.4%、テスト検体群において最高で精度93.9%を示した。また、例えば、配列番号16で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.5%、テスト検体群において最高で精度94.9%を示した。また、例えば、配列番号16で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で98.0%、テスト検体群において最高で精度88.8%を示した。
また更に、配列番号37で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-4に示す。配列番号37で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において73.6%、テスト検体群において精度72.4%を示した。また、例えば、配列番号37で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で95.9%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。また、例えば、配列番号37で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.0%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。また、例えば、配列番号37で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.0%、テスト検体群において最高で精度89.8%を示した。
また更に、配列番号42で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-5に示す。配列番号42で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において57.4%、テスト検体群において精度59.2%を示した。また、例えば、配列番号42で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で95.4%、テスト検体群において最高で精度93.9%を示した。また、例えば、配列番号42で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.5%、テスト検体群において最高で精度95.9%を示した。また、例えば、配列番号42で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.9%、テスト検体群において最高で精度94.9%を示した。
また更に、配列番号63で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-6に示す。配列番号63で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において72.6%、テスト検体群において精度73.5%を示した。また、例えば、配列番号63で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.9%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。また、例えば、配列番号63で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で95.9%、テスト検体群において最高で精度95.9%を示した。また、例えば、配列番号63で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.4%、テスト検体群において最高で精度89.8%を示した。
また更に、配列番号119で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-7に示す。配列番号119で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において46.9%、テスト検体群において精度48.0%を示した。また、例えば、配列番号119で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.9%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号119で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号119で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度89.8%を示した。
また更に、配列番号126で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-8に示す。配列番号126で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において66.0%、テスト検体群において精度53.1%を示した。また、例えば、配列番号126で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号126で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度90.8%を示した。また、例えば、配列番号126で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で93.9%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。
また更に、配列番号139で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-9に示す。配列番号139で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において43.7%、テスト検体群において精度40.8%を示した。また、例えば、配列番号139で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.4%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。また、例えば、配列番号139で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度94.9%を示した。また、例えば、配列番号139で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で92.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。
また更に、配列番号173で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-10に示す。配列番号173で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において43.7%、テスト検体群において精度55.1%を示した。また、例えば、配列番号173で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.9%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号173で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.0%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号173で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で92.4%、テスト検体群において最高で精度95.9%を示した。
また更に、配列番号178で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-11に示す。配列番号178で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において68.0%、テスト検体群において最高で精度72.4%を示した。また、例えば、配列番号178で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号178で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度94.9%を示した。また、例えば、配列番号178で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度93.9%を示した。
また更に、配列番号599で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-12に示す。配列番号599で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において61.4%、テスト検体群において最高で精度65.3%を示した。また、例えば、配列番号599で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号599で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で97.5%、テスト検体群において最高で精度92.9%を示した。また、例えば、配列番号599で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度94.9%を示した。
また更に、配列番号609で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-13に示す。配列番号609で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において59.7%、テスト検体群において精度65.3%を示した。また、例えば、配列番号609で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で95.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号609で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号609で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度88.8%を示した。
また更に、配列番号611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを用いて測定した場合の判別精度を表8-14に示す。配列番号611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む1個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において55.8%、テスト検体群において精度62.2%を示した。また、例えば、配列番号611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む2個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で94.9%、テスト検体群において最高で精度91.8%を示した。また、例えば、配列番号611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む3個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で98.0%、テスト検体群において最高で精度90.8%を示した。また、例えば、配列番号611で表される塩基配列もしくはその相補的配列からなるポリヌクレオチドを少なくとも1つ含む4個の組み合わせを用いて測定した場合、学習検体群において最高で96.4%、テスト検体群において最高で精度90.8%を示した。
さらにまた、配列番号12、16、135、156で示される塩基配列の発現量測定値を用いて、学習検体群の前立腺がん患者35人、健常体99人、及び、乳がん患者63人で比較した場合、学習検体群では前立腺がん患者群とその他の群の判別得点が有意に分離する散布図が得られ(図4上図参照)、更にこの結果はテスト検体群でも再現ができた(図4下図参照)。
以上の実施例に示すように、本発明のキット、デバイス及び方法によれば、既存の腫瘍マーカーよりも前立腺がんを感度よく検出できるので、外科手術によるがん部の切除実施の早期判断が可能となり、その結果、5年生存率の向上や、再発率を低くすることが可能となる。
本発明により、簡易かつ安価な方法で、前立腺がんを効果的に検出することができるため、前立腺がんの早期発見、診断及び治療が可能になる。また、本発明の方法により、患者血液を用いて前立腺がんを低侵襲的に検出できるため、前立腺がんを簡便かつ迅速に検出することが可能になる。
本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願をそのまま参考として本明細書に組み入れるものとする。
本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願をそのまま参考として本明細書に組み入れるものとする。
Claims (25)
- 前立腺がんマーカーである、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、前立腺がんの検出用キット。
- miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-4257がhsa-miR-4257であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-4745-5pがhsa-miR-4745-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-4258がhsa-miR-4258であり、miR-4448がhsa-miR-4448であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-2392がhsa-miR-2392であり、miR-1273g-3pがhsa-miR-1273g-3pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-3619-3pがhsa-miR-3619-3pであり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-4525がhsa-miR-4525であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-7150がhsa-miR-7150であり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-4497がhsa-miR-4497であり、miR-6090がhsa-miR-6090であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4530がhsa-miR-4530であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-4674がhsa-miR-4674であり、miR-3917がhsa-miR-3917であり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-6800-5pがhsa-miR-6800-5pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-6872-3pがhsa-miR-6872-3pであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-1908-3pがhsa-miR-1908-3pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-6799-5pがhsa-miR-6799-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-5090がhsa-miR-5090であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-1237-5pがhsa-miR-1237-5pであり、miR-4758-5pがhsa-miR-4758-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6768-5pがhsa-miR-6768-5pであり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-6821-5pがhsa-miR-6821-5pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-4726-5pがhsa-miR-4726-5pであり、miR-6124がhsa-miR-6124であり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-4508がhsa-miR-4508であり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-6763-5pがhsa-miR-6763-5pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3928-3pがhsa-miR-3928-3pであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-4505がhsa-miR-4505であり、miR-3154がhsa-miR-3154であり、miR-3648がhsa-miR-3648であり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、miR-7113-3pがhsa-miR-7113-3pであり、miR-6819-5pがhsa-miR-6819-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pであり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-4656がhsa-miR-4656であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-1202がhsa-miR-1202であり、miR-3162-5pがhsa-miR-3162-5pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-3665がhsa-miR-3665であり、miR-3940-5pがhsa-miR-3940-5pであり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-4723-5pがhsa-miR-4723-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-4730がhsa-miR-4730であり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-4787-5pがhsa-miR-4787-5pであり、miR-5787がhsa-miR-5787であり、miR-6085がhsa-miR-6085であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-6778-5pがhsa-miR-6778-5pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6789-5pがhsa-miR-6789-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、及び、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pである、請求項1に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(a)~(e)に示すポリヌクレオチド:
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、請求項1又は2に記載のキット。 - 前記キットが、別の前立腺がんマーカーである、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1~3のいずれかに記載のキット。
- miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-760がhsa-miR-760であり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-575がhsa-miR-575であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-920がhsa-miR-920であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-16-5pがhsa-miR-16-5pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-564がhsa-miR-564であり、及び、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pである、請求項4に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(f)~(j)に示すポリヌクレオチド:
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、請求項4又は5に記載のキット。 - 前記キットが、別の前立腺がんマーカーである、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項1~6のいずれかに記載のキット。
- miR-4763-3pがhsa-miR-4763-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-4488がhsa-miR-4488であり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-1228-5pがhsa-miR-1228-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-1207-5pがhsa-miR-1207-5pであり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6879-5pがhsa-miR-6879-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4638-5pがhsa-miR-4638-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-4270がhsa-miR-4270であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-665がhsa-miR-665であり、miR-486-5pがhsa-miR-486-5pであり、miR-4655-5pがhsa-miR-4655-5pであり、miR-1275がhsa-miR-1275であり、miR-6806-5pがhsa-miR-6806-5pであり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-6752-5pがhsa-miR-6752-5pであり、miR-6771-5pがhsa-miR-6771-5pであり、miR-4450がhsa-miR-4450であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-7114-5pがhsa-miR-7114-5pであり、及び、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pである、請求項7に記載のキット。
- 前記核酸が、下記の(k)~(o)に示すポリヌクレオチド:
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、請求項7又は8に記載のキット。 - 前記キットが、請求項1又は2に記載のすべての前立腺がんマーカーから選択される少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2つ以上の核酸を含む、請求項1~9のいずれかに記載のキット。
- 前立腺がんマーカーである、miR-4443、miR-1908-5p、miR-4257、miR-3197、miR-3188、miR-4649-5p、miR-1343-3p、miR-6861-5p、miR-1343-5p、miR-642b-3p、miR-6741-5p、miR-4745-5p、miR-6826-5p、miR-3663-3p、miR-3131、miR-92a-2-5p、miR-4258、miR-4448、miR-6125、miR-6880-5p、miR-6132、miR-4467、miR-6749-5p、miR-2392、miR-1273g-3p、miR-4746-3p、miR-1914-3p、miR-7845-5p、miR-6726-5p、miR-128-2-5p、miR-4651、miR-6765-3p、miR-3185、miR-4792、miR-6887-5p、miR-5572、miR-3619-3p、miR-6780b-5p、miR-4707-5p、miR-8063、miR-4454、miR-4525、miR-7975、miR-744-5p、miR-3135b、miR-4648、miR-6816-5p、miR-4741、miR-7150、miR-6791-5p、miR-1247-3p、miR-7977、miR-4497、miR-6090、miR-6781-5p、miR-6870-5p、miR-6729-5p、miR-4530、miR-7847-3p、miR-6825-5p、miR-4674、miR-3917、miR-4707-3p、miR-6885-5p、miR-6722-3p、miR-4516、miR-6757-5p、miR-6840-3p、miR-5195-3p、miR-6756-5p、miR-6800-5p、miR-6727-5p、miR-6126、miR-6872-3p、miR-4446-3p、miR-1268a、miR-1908-3p、miR-3679-5p、miR-4534、miR-4675、miR-7108-5p、miR-6799-5p、miR-4695-5p、miR-3178、miR-5090、miR-3180、miR-1237-5p、miR-4758-5p、miR-3184-5p、miR-4286、miR-6784-5p、miR-6768-5p、miR-6785-5p、miR-4706、miR-711、miR-1260a、miR-6746-5p、miR-6089、miR-6821-5p、miR-4667-5p、miR-8069、miR-4726-5p、miR-6124、miR-4532、miR-4486、miR-4728-5p、miR-4508、miR-128-1-5p、miR-4513、miR-6795-5p、miR-4689、miR-6763-5p、miR-8072、miR-6765-5p、miR-4419b、miR-7641、miR-3928-3p、miR-1227-5p、miR-4492、miR-296-3p、miR-6769a-5p、miR-6889-5p、miR-4632-5p、miR-4505、miR-3154、miR-3648、miR-4442、miR-3141、miR-7113-3p、miR-6819-5p、miR-3195、miR-1199-5p、miR-6738-5p、miR-4656、miR-6820-5p、miR-204-3p、miR-642a-3p、miR-762、miR-1202、miR-3162-5p、miR-3196、miR-3622a-5p、miR-3665、miR-3940-5p、miR-4294、miR-4466、miR-4476、miR-4723-5p、miR-4725-3p、miR-4730、miR-4739、miR-4787-5p、miR-5787、miR-6085、miR-6717-5p、miR-6724-5p、miR-6777-5p、miR-6778-5p、miR-6787-5p、miR-6789-5p、miR-6845-5p及びmiR-6893-5pから選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸を含む、前立腺がんの検出用デバイス。
- miR-4443がhsa-miR-4443であり、miR-1908-5pがhsa-miR-1908-5pであり、miR-4257がhsa-miR-4257であり、miR-3197がhsa-miR-3197であり、miR-3188がhsa-miR-3188であり、miR-4649-5pがhsa-miR-4649-5pであり、miR-1343-3pがhsa-miR-1343-3pであり、miR-6861-5pがhsa-miR-6861-5pであり、miR-1343-5pがhsa-miR-1343-5pであり、miR-642b-3pがhsa-miR-642b-3pであり、miR-6741-5pがhsa-miR-6741-5pであり、miR-4745-5pがhsa-miR-4745-5pであり、miR-6826-5pがhsa-miR-6826-5pであり、miR-3663-3pがhsa-miR-3663-3pであり、miR-3131がhsa-miR-3131であり、miR-92a-2-5pがhsa-miR-92a-2-5pであり、miR-4258がhsa-miR-4258であり、miR-4448がhsa-miR-4448であり、miR-6125がhsa-miR-6125であり、miR-6880-5pがhsa-miR-6880-5pであり、miR-6132がhsa-miR-6132であり、miR-4467がhsa-miR-4467であり、miR-6749-5pがhsa-miR-6749-5pであり、miR-2392がhsa-miR-2392であり、miR-1273g-3pがhsa-miR-1273g-3pであり、miR-4746-3pがhsa-miR-4746-3pであり、miR-1914-3pがhsa-miR-1914-3pであり、miR-7845-5pがhsa-miR-7845-5pであり、miR-6726-5pがhsa-miR-6726-5pであり、miR-128-2-5pがhsa-miR-128-2-5pであり、miR-4651がhsa-miR-4651であり、miR-6765-3pがhsa-miR-6765-3pであり、miR-3185がhsa-miR-3185であり、miR-4792がhsa-miR-4792であり、miR-6887-5pがhsa-miR-6887-5pであり、miR-5572がhsa-miR-5572であり、miR-3619-3pがhsa-miR-3619-3pであり、miR-6780b-5pがhsa-miR-6780b-5pであり、miR-4707-5pがhsa-miR-4707-5pであり、miR-8063がhsa-miR-8063であり、miR-4454がhsa-miR-4454であり、miR-4525がhsa-miR-4525であり、miR-7975がhsa-miR-7975であり、miR-744-5pがhsa-miR-744-5pであり、miR-3135bがhsa-miR-3135bであり、miR-4648がhsa-miR-4648であり、miR-6816-5pがhsa-miR-6816-5pであり、miR-4741がhsa-miR-4741であり、miR-7150がhsa-miR-7150であり、miR-6791-5pがhsa-miR-6791-5pであり、miR-1247-3pがhsa-miR-1247-3pであり、miR-7977がhsa-miR-7977であり、miR-4497がhsa-miR-4497であり、miR-6090がhsa-miR-6090であり、miR-6781-5pがhsa-miR-6781-5pであり、miR-6870-5pがhsa-miR-6870-5pであり、miR-6729-5pがhsa-miR-6729-5pであり、miR-4530がhsa-miR-4530であり、miR-7847-3pがhsa-miR-7847-3pであり、miR-6825-5pがhsa-miR-6825-5pであり、miR-4674がhsa-miR-4674であり、miR-3917がhsa-miR-3917であり、miR-4707-3pがhsa-miR-4707-3pであり、miR-6885-5pがhsa-miR-6885-5pであり、miR-6722-3pがhsa-miR-6722-3pであり、miR-4516がhsa-miR-4516であり、miR-6757-5pがhsa-miR-6757-5pであり、miR-6840-3pがhsa-miR-6840-3pであり、miR-5195-3pがhsa-miR-5195-3pであり、miR-6756-5pがhsa-miR-6756-5pであり、miR-6800-5pがhsa-miR-6800-5pであり、miR-6727-5pがhsa-miR-6727-5pであり、miR-6126がhsa-miR-6126であり、miR-6872-3pがhsa-miR-6872-3pであり、miR-4446-3pがhsa-miR-4446-3pであり、miR-1268aがhsa-miR-1268aであり、miR-1908-3pがhsa-miR-1908-3pであり、miR-3679-5pがhsa-miR-3679-5pであり、miR-4534がhsa-miR-4534であり、miR-4675がhsa-miR-4675であり、miR-7108-5pがhsa-miR-7108-5pであり、miR-6799-5pがhsa-miR-6799-5pであり、miR-4695-5pがhsa-miR-4695-5pであり、miR-3178がhsa-miR-3178であり、miR-5090がhsa-miR-5090であり、miR-3180がhsa-miR-3180であり、miR-1237-5pがhsa-miR-1237-5pであり、miR-4758-5pがhsa-miR-4758-5pであり、miR-3184-5pがhsa-miR-3184-5pであり、miR-4286がhsa-miR-4286であり、miR-6784-5pがhsa-miR-6784-5pであり、miR-6768-5pがhsa-miR-6768-5pであり、miR-6785-5pがhsa-miR-6785-5pであり、miR-4706がhsa-miR-4706であり、miR-711がhsa-miR-711であり、miR-1260aがhsa-miR-1260aであり、miR-6746-5pがhsa-miR-6746-5pであり、miR-6089がhsa-miR-6089であり、miR-6821-5pがhsa-miR-6821-5pであり、miR-4667-5pがhsa-miR-4667-5pであり、miR-8069がhsa-miR-8069であり、miR-4726-5pがhsa-miR-4726-5pであり、miR-6124がhsa-miR-6124であり、miR-4532がhsa-miR-4532であり、miR-4486がhsa-miR-4486であり、miR-4728-5pがhsa-miR-4728-5pであり、miR-4508がhsa-miR-4508であり、miR-128-1-5pがhsa-miR-128-1-5pであり、miR-4513がhsa-miR-4513であり、miR-6795-5pがhsa-miR-6795-5pであり、miR-4689がhsa-miR-4689であり、miR-6763-5pがhsa-miR-6763-5pであり、miR-8072がhsa-miR-8072であり、miR-6765-5pがhsa-miR-6765-5pであり、miR-4419bがhsa-miR-4419bであり、miR-7641がhsa-miR-7641であり、miR-3928-3pがhsa-miR-3928-3pであり、miR-1227-5pがhsa-miR-1227-5pであり、miR-4492がhsa-miR-4492であり、miR-296-3pがhsa-miR-296-3pであり、miR-6769a-5pがhsa-miR-6769a-5pであり、miR-6889-5pがhsa-miR-6889-5pであり、miR-4632-5pがhsa-miR-4632-5pであり、miR-4505がhsa-miR-4505であり、miR-3154がhsa-miR-3154であり、miR-3648がhsa-miR-3648であり、miR-4442がhsa-miR-4442であり、miR-3141がhsa-miR-3141であり、miR-7113-3pがhsa-miR-7113-3pであり、miR-6819-5pがhsa-miR-6819-5pであり、miR-3195がhsa-miR-3195であり、miR-1199-5pがhsa-miR-1199-5pであり、miR-6738-5pがhsa-miR-6738-5pであり、miR-4656がhsa-miR-4656であり、miR-6820-5pがhsa-miR-6820-5pであり、miR-204-3pがhsa-miR-204-3pであり、miR-642a-3pがhsa-miR-642a-3pであり、miR-762がhsa-miR-762であり、miR-1202がhsa-miR-1202であり、miR-3162-5pがhsa-miR-3162-5pであり、miR-3196がhsa-miR-3196であり、miR-3622a-5pがhsa-miR-3622a-5pであり、miR-3665がhsa-miR-3665であり、miR-3940-5pがhsa-miR-3940-5pであり、miR-4294がhsa-miR-4294であり、miR-4466がhsa-miR-4466であり、miR-4476がhsa-miR-4476であり、miR-4723-5pがhsa-miR-4723-5pであり、miR-4725-3pがhsa-miR-4725-3pであり、miR-4730がhsa-miR-4730であり、miR-4739がhsa-miR-4739であり、miR-4787-5pがhsa-miR-4787-5pであり、miR-5787がhsa-miR-5787であり、miR-6085がhsa-miR-6085であり、miR-6717-5pがhsa-miR-6717-5pであり、miR-6724-5pがhsa-miR-6724-5pであり、miR-6777-5pがhsa-miR-6777-5pであり、miR-6778-5pがhsa-miR-6778-5pであり、miR-6787-5pがhsa-miR-6787-5pであり、miR-6789-5pがhsa-miR-6789-5pであり、miR-6845-5pがhsa-miR-6845-5pであり、及び、miR-6893-5pがhsa-miR-6893-5pである、請求項11に記載のデバイス。
- 前記核酸が、下記の(a)~(e)に示すポリヌクレオチド:
(a)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(b)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(c)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(d)配列番号1~135、580~606のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(e)前記(a)~(d)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、請求項11又は12に記載のデバイス。 - 前記デバイスが、別の前立腺がんマーカーである、miR-615-5p、miR-486-3p、miR-1225-3p、miR-760、miR-187-5p、miR-1203、miR-7110-5p、miR-371a-5p、miR-939-5p、miR-575、miR-92b-5p、miR-887-3p、miR-920、miR-1915-5p、miR-1231、miR-663b、miR-1225-5p、miR-16-5p、miR-423-5p、miR-451a、miR-564及びmiR-671-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項11~13のいずれかに記載のデバイス。
- miR-615-5pがhsa-miR-615-5pであり、miR-486-3pがhsa-miR-486-3pであり、miR-1225-3pがhsa-miR-1225-3pであり、miR-760がhsa-miR-760であり、miR-187-5pがhsa-miR-187-5pであり、miR-1203がhsa-miR-1203であり、miR-7110-5pがhsa-miR-7110-5pであり、miR-371a-5pがhsa-miR-371a-5pであり、miR-939-5pがhsa-miR-939-5pであり、miR-575がhsa-miR-575であり、miR-92b-5pがhsa-miR-92b-5pであり、miR-887-3pがhsa-miR-887-3pであり、miR-920がhsa-miR-920であり、miR-1915-5pがhsa-miR-1915-5pであり、miR-1231がhsa-miR-1231であり、miR-663bがhsa-miR-663bであり、miR-1225-5pがhsa-miR-1225-5pであり、miR-16-5pがhsa-miR-16-5pであり、miR-423-5pがhsa-miR-423-5pであり、miR-451aがhsa-miR-451aであり、miR-564がhsa-miR-564であり、及び、miR-671-5pがhsa-miR-671-5pである、請求項14に記載のデバイス。
- 前記核酸が、下記の(f)~(j)に示すポリヌクレオチド:
(f)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(g)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、
(h)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(i)配列番号136~152、607~611のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(j)前記(f)~(i)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、請求項14又は15に記載のデバイス。 - 前記デバイスが、別の前立腺がんマーカーである、miR-4763-3p、miR-3656、miR-4488、miR-125a-3p、miR-1469、miR-1228-5p、miR-6798-5p、miR-1268b、miR-6732-5p、miR-1915-3p、miR-4433b-3p、miR-1207-5p、miR-4433-3p、miR-6879-5p、miR-4417、miR-30c-1-3p、miR-4638-5p、miR-6088、miR-4270、miR-6782-5p、miR-665、miR-486-5p、miR-4655-5p、miR-1275、miR-6806-5p、miR-614、miR-3937、miR-6752-5p、miR-6771-5p、miR-4450、miR-211-3p、miR-663a、miR-6842-5p、miR-7114-5p及びmiR-6779-5pからなる群から選択される少なくとも1つ以上のポリヌクレオチドと特異的に結合可能な核酸をさらに含む、請求項11~16のいずれかに記載のデバイス。
- miR-4763-3pがhsa-miR-4763-3pであり、miR-3656がhsa-miR-3656であり、miR-4488がhsa-miR-4488であり、miR-125a-3pがhsa-miR-125a-3pであり、miR-1469がhsa-miR-1469であり、miR-1228-5pがhsa-miR-1228-5pであり、miR-6798-5pがhsa-miR-6798-5pであり、miR-1268bがhsa-miR-1268bであり、miR-6732-5pがhsa-miR-6732-5pであり、miR-1915-3pがhsa-miR-1915-3pであり、miR-4433b-3pがhsa-miR-4433b-3pであり、miR-1207-5pがhsa-miR-1207-5pであり、miR-4433-3pがhsa-miR-4433-3pであり、miR-6879-5pがhsa-miR-6879-5pであり、miR-4417がhsa-miR-4417であり、miR-30c-1-3pがhsa-miR-30c-1-3pであり、miR-4638-5pがhsa-miR-4638-5pであり、miR-6088がhsa-miR-6088であり、miR-4270がhsa-miR-4270であり、miR-6782-5pがhsa-miR-6782-5pであり、miR-665がhsa-miR-665であり、miR-486-5pがhsa-miR-486-5pであり、miR-4655-5pがhsa-miR-4655-5pであり、miR-1275がhsa-miR-1275であり、miR-6806-5pがhsa-miR-6806-5pであり、miR-614がhsa-miR-614であり、miR-3937がhsa-miR-3937であり、miR-6752-5pがhsa-miR-6752-5pであり、miR-6771-5pがhsa-miR-6771-5pであり、miR-4450がhsa-miR-4450であり、miR-211-3pがhsa-miR-211-3pであり、miR-663aがhsa-miR-663aであり、miR-6842-5pがhsa-miR-6842-5pであり、miR-7114-5pがhsa-miR-7114-5pであり、及び、miR-6779-5pがhsa-miR-6779-5pである、請求項17に記載のデバイス。
- 前記核酸が、下記の(k)~(o)に示すポリヌクレオチド:
(k)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(l)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列を含むポリヌクレオチド、(m)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチド、その変異体、その誘導体、又は15以上の連続した塩基を含むその断片、
(n)配列番号153~187のいずれかで表される塩基配列もしくは当該塩基配列においてuがtである塩基配列に相補的な塩基配列を含むポリヌクレオチド、及び
(o)前記(k)~(n)のいずれかのポリヌクレオチドとストリンジェントな条件でハイブリダイズするポリヌクレオチド、
からなる群から選択されるポリヌクレオチドである、請求項17又は18に記載のデバイス。 - 前記デバイスが、ハイブリダイゼーション技術による測定のためのデバイスである、請求項11~19のいずれかに記載のデバイス。
- 前記ハイブリダイゼーション技術が、核酸アレイ技術である、請求項20に記載のデバイス。
- 前記デバイスが、請求項11又は12に記載のすべての前立腺がんマーカーから選択される少なくとも2つ以上のポリヌクレオチドのそれぞれと特異的に結合可能な少なくとも2つ以上の核酸を含む、請求項11~21のいずれかに記載のデバイス。
- 請求項1~10のいずれか1項に記載のキット又は11~22のいずれか1項に記載のデバイスを用いて、被験体の検体における標的核酸の発現量を測定し、該測定された発現量と、同様に測定された健常体の対照発現量とを用いて、被験体が前立腺がんに罹患していること、又は前立腺がんに罹患していないことをin vitroで評価することを含む、前立腺がんの検出方法。
- 前記被験体が、ヒトである、請求項23に記載の方法。
- 前記検体が、血液、血清又は血漿である、請求項23又は24に記載の方法。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2014121377 | 2014-06-12 | ||
JP2014121377 | 2014-06-12 | ||
JP2015071756 | 2015-03-31 | ||
JP2015071756 | 2015-03-31 | ||
JP2020075338A JP7448144B2 (ja) | 2014-06-12 | 2020-04-21 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2020075338A Division JP7448144B2 (ja) | 2014-06-12 | 2020-04-21 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2022174247A true JP2022174247A (ja) | 2022-11-22 |
Family
ID=54833667
Family Applications (3)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2016527882A Active JP6824736B2 (ja) | 2014-06-12 | 2015-06-12 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
JP2020075338A Active JP7448144B2 (ja) | 2014-06-12 | 2020-04-21 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
JP2022147510A Pending JP2022174247A (ja) | 2014-06-12 | 2022-09-16 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
Family Applications Before (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2016527882A Active JP6824736B2 (ja) | 2014-06-12 | 2015-06-12 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
JP2020075338A Active JP7448144B2 (ja) | 2014-06-12 | 2020-04-21 | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
US (4) | US10619213B2 (ja) |
EP (2) | EP3156483B1 (ja) |
JP (3) | JP6824736B2 (ja) |
KR (5) | KR102510768B1 (ja) |
CN (2) | CN106459963B (ja) |
CA (1) | CA2951016A1 (ja) |
RU (1) | RU2017100253A (ja) |
WO (1) | WO2015190584A1 (ja) |
Families Citing this family (20)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN117965741A (zh) | 2014-05-30 | 2024-05-03 | 东丽株式会社 | 胰腺癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
CN106459963B (zh) | 2014-06-12 | 2020-08-18 | 东丽株式会社 | 前列腺癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
BR112016029634A2 (pt) | 2014-06-18 | 2017-10-24 | Nat Cancer Ct | kit, dispositivo e método para a detecção de câncer de fígado |
WO2015194610A1 (ja) | 2014-06-18 | 2015-12-23 | 東レ株式会社 | 肺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 |
WO2016127998A1 (en) * | 2015-02-11 | 2016-08-18 | Exiqon | A microrna-based method for early detection of prostate cancer in urine samples |
CN105483230B (zh) * | 2015-12-23 | 2018-07-27 | 宁波大学 | 用于检测2型糖尿病视网膜病变的miR-3197分子标记物及其扩增引物和应用 |
KR102574024B1 (ko) * | 2016-03-31 | 2023-09-04 | 국립연구개발법인 고쿠리츠간켄큐센터 | 조기 췌장암 또는 췌장암 전구 병변의 검출 키트 또는 디바이스 및 검출 방법 |
WO2018049506A1 (en) * | 2016-09-14 | 2018-03-22 | Ontario Institute For Cancer Research (Oicr) | Mirna prostate cancer marker |
CN106834470A (zh) * | 2017-02-17 | 2017-06-13 | 张灏 | miRNA在制备癌症诊断试剂盒中的用途 |
US11634778B2 (en) | 2017-06-29 | 2023-04-25 | Toray Industries, Inc. | Kit, device, and method for detecting lung cancer |
CN107400732A (zh) * | 2017-09-26 | 2017-11-28 | 苏州立豪生物科技有限公司 | 一种用于检测胃癌的试剂盒 |
TWI688655B (zh) * | 2017-11-06 | 2020-03-21 | 高雄醫學大學 | 甘胺酸n-甲基轉移酶剔除小鼠應用高通量定序法建立新穎微小核醣核酸癌症與肝臟疾病標誌物與套組 |
CN107904310B (zh) * | 2017-11-28 | 2020-09-01 | 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 | 用于大肠癌诊断的尿液microRNA生物标志物、试剂盒及其应用 |
KR102052398B1 (ko) * | 2018-04-18 | 2019-12-05 | (주)유로테크 | 전립선암 진단용 바이오마커 및 이의 용도 |
US11535899B2 (en) | 2018-08-10 | 2022-12-27 | Toray Industries, Inc. | Kit, device and method for detecting prostate cancer |
KR20210003502A (ko) * | 2019-07-02 | 2021-01-12 | 연세대학교 산학협력단 | 암의 예방, 개선 또는 치료용 조성물 |
WO2021124455A1 (ja) * | 2019-12-17 | 2021-06-24 | 株式会社 東芝 | 分析方法及びキット |
EP4212632A4 (en) * | 2020-09-08 | 2024-07-17 | Urotech Co Ltd | PROSTATE CANCER DIAGNOSIS SCORE CALCULATION METHOD AND ASSOCIATED USES |
KR102497196B1 (ko) | 2020-09-08 | 2023-02-07 | (주)유로테크 | 전립선암 진단 점수 계산 방법 및 그 용도 |
CN114032241B (zh) * | 2021-11-11 | 2024-03-15 | 上海裕隆生物科技有限公司 | 检测离体前列腺细胞circKIF4A的m6A甲基化修饰程度的方法 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011080315A1 (en) * | 2009-12-30 | 2011-07-07 | Febit Holding Gmbh | Mirna fingerprint in the diagnosis of prostate cancer |
WO2014071226A1 (en) * | 2012-11-02 | 2014-05-08 | The Regents Of The University Of California | Methods and systems for determining a likelihood of adverse prostate cancer pathology |
Family Cites Families (20)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20090209621A1 (en) | 2005-06-03 | 2009-08-20 | The Johns Hopkins University | Compositions and methods for decreasing microrna expression for the treatment of neoplasia |
ES2545119T3 (es) | 2006-01-05 | 2015-09-08 | The Ohio State University Research Foundation | Métodos basados en microARN y composiciones para el diagnóstico y el tratamiento de cánceres sólidos |
CN103276062A (zh) | 2007-07-25 | 2013-09-04 | 路易斯维尔大学研究基金会公司 | 作为诊断标记物的外来体相关微rna |
ES2600165T3 (es) | 2008-02-28 | 2017-02-07 | The Ohio State University Research Foundation | Antagonistas de miR-32 para aumentar la respuesta del cáncer de próstata a la apoptosis |
US20110160290A1 (en) * | 2008-05-21 | 2011-06-30 | Muneesh Tewari | Use of extracellular rna to measure disease |
EP2358912B1 (en) | 2008-10-30 | 2016-10-12 | Caris Life Sciences Switzerland Holdings GmbH | Methods for assessing rna patterns |
EP2364367B8 (en) * | 2008-11-10 | 2017-08-23 | Battelle Memorial Institute | Method utilizing microrna for detecting interstitial lung disease |
AU2010249421A1 (en) * | 2009-05-22 | 2011-12-08 | Asuragen, Inc. | miRNA biomarkers of prostate disease |
EP2316972A1 (en) * | 2009-10-29 | 2011-05-04 | Deutsches Krebsforschungszentrum | Circulating miRNAs as non-invasive markers for diagnosis and staging in prostate cancer |
EP3372684B1 (en) | 2010-08-24 | 2020-10-07 | Sirna Therapeutics, Inc. | Single-stranded rnai agents containing an internal, non-nucleic acid spacer |
CN103874770A (zh) | 2011-08-08 | 2014-06-18 | 卡里斯生命科学卢森堡控股有限责任公司 | 生物标志物组合物和方法 |
US9944991B2 (en) | 2012-11-02 | 2018-04-17 | Dana-Farber Cancer Institute, Inc. | Compositions and methods for diagnosis, prognosis and treatment of hematological malignancies |
US9416369B2 (en) | 2012-12-18 | 2016-08-16 | University Of Washington Through Its Center For Commercialization | Methods and compositions to modulate RNA processing |
JP2014121377A (ja) | 2012-12-20 | 2014-07-03 | Toyo Seat Co Ltd | リクライニング装置 |
JP2015039365A (ja) | 2013-08-23 | 2015-03-02 | 東レ株式会社 | 前立腺がんの検出用キットおよび検出方法 |
FR3010414B1 (fr) | 2013-09-09 | 2015-09-25 | Arkema France | Procede d'obtention de films epais nano-structures obtenus a partir d'une composition de copolymeres a blocs |
CN106459963B (zh) * | 2014-06-12 | 2020-08-18 | 东丽株式会社 | 前列腺癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 |
US10406593B2 (en) | 2014-07-09 | 2019-09-10 | The Boeing Company | Method of using a tower for accessing an interior of a fuselage assembly |
US20170356903A1 (en) | 2014-11-21 | 2017-12-14 | Caris Science, Inc. | Oligonucleotide probes and uses thereof |
CA3134991A1 (en) | 2015-02-25 | 2016-09-01 | Bioneer Corporation | Pharmaceutical composition for treating cancer comprising microrna as active ingredient |
-
2015
- 2015-06-12 CN CN201580030849.6A patent/CN106459963B/zh active Active
- 2015-06-12 US US15/317,882 patent/US10619213B2/en active Active
- 2015-06-12 KR KR1020227016906A patent/KR102510768B1/ko active IP Right Grant
- 2015-06-12 KR KR1020237024282A patent/KR102669353B1/ko active IP Right Grant
- 2015-06-12 KR KR1020177000938A patent/KR102401689B1/ko active IP Right Grant
- 2015-06-12 KR KR1020237008564A patent/KR102557689B1/ko active IP Right Grant
- 2015-06-12 CN CN202010727753.8A patent/CN111996254A/zh active Pending
- 2015-06-12 EP EP15806052.5A patent/EP3156483B1/en active Active
- 2015-06-12 RU RU2017100253A patent/RU2017100253A/ru not_active Application Discontinuation
- 2015-06-12 CA CA2951016A patent/CA2951016A1/en active Pending
- 2015-06-12 KR KR1020247016808A patent/KR20240093833A/ko unknown
- 2015-06-12 WO PCT/JP2015/066964 patent/WO2015190584A1/ja active Application Filing
- 2015-06-12 EP EP20207829.1A patent/EP3800253A3/en active Pending
- 2015-06-12 JP JP2016527882A patent/JP6824736B2/ja active Active
-
2020
- 2020-03-03 US US16/808,095 patent/US11519038B2/en active Active
- 2020-04-21 JP JP2020075338A patent/JP7448144B2/ja active Active
-
2022
- 2022-09-16 JP JP2022147510A patent/JP2022174247A/ja active Pending
- 2022-10-31 US US17/977,451 patent/US11959144B2/en active Active
-
2024
- 2024-03-14 US US18/604,659 patent/US20240218455A1/en active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2011080315A1 (en) * | 2009-12-30 | 2011-07-07 | Febit Holding Gmbh | Mirna fingerprint in the diagnosis of prostate cancer |
WO2014071226A1 (en) * | 2012-11-02 | 2014-05-08 | The Regents Of The University Of California | Methods and systems for determining a likelihood of adverse prostate cancer pathology |
Non-Patent Citations (6)
Title |
---|
ALHASAN A. H. ET AL., ANAL. CHEM., vol. Vol. 84(9), JPN6021050365, 2012, pages 4153 - 4160, ISSN: 0005175505 * |
HUANG, X., ET AL., INT. J. MOL. SCI., vol. 14, no. 7, JPN6015034400, 2013, pages 14785 - 14799, ISSN: 0005175501 * |
MAHN, R., ET AL., UROLOGY, vol. 77, no. 5, JPN6015034401, 2011, pages 1265 - 9, ISSN: 0005175502 * |
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, vol. 42, JPN6015034403, 25 November 2013 (2013-11-25), pages 68 - 73, ISSN: 0005175500 * |
WANG., J., ET AL., MOLECULES, vol. 19, no. 2, JPN6015034402, February 2014 (2014-02-01), pages 1912 - 1938, ISSN: 0005175503 * |
滝澤 聡子 ほか, BIO CLINICA, vol. 29, no. 6, JPN6015034404, 10 June 2014 (2014-06-10), pages 588 - 589, ISSN: 0005175504 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US20170121779A1 (en) | 2017-05-04 |
KR20220070345A (ko) | 2022-05-30 |
KR20230041831A (ko) | 2023-03-24 |
EP3800253A2 (en) | 2021-04-07 |
RU2017100253A (ru) | 2018-07-17 |
KR102557689B1 (ko) | 2023-07-20 |
US20230137844A1 (en) | 2023-05-04 |
JPWO2015190584A1 (ja) | 2017-04-20 |
KR102401689B1 (ko) | 2022-05-25 |
EP3156483B1 (en) | 2020-12-23 |
KR102510768B1 (ko) | 2023-03-16 |
EP3156483A4 (en) | 2018-04-18 |
US20240218455A1 (en) | 2024-07-04 |
US11959144B2 (en) | 2024-04-16 |
KR20170016490A (ko) | 2017-02-13 |
US11519038B2 (en) | 2022-12-06 |
EP3156483A1 (en) | 2017-04-19 |
BR112016028967A2 (ja) | 2018-06-05 |
CA2951016A1 (en) | 2015-12-17 |
CN106459963A (zh) | 2017-02-22 |
KR20240093833A (ko) | 2024-06-24 |
US10619213B2 (en) | 2020-04-14 |
KR20230113827A (ko) | 2023-08-01 |
US20200199688A1 (en) | 2020-06-25 |
JP7448144B2 (ja) | 2024-03-12 |
KR102669353B1 (ko) | 2024-05-28 |
CN106459963B (zh) | 2020-08-18 |
WO2015190584A1 (ja) | 2015-12-17 |
EP3800253A3 (en) | 2021-07-28 |
JP6824736B2 (ja) | 2021-02-03 |
CN111996254A (zh) | 2020-11-27 |
JP2020120676A (ja) | 2020-08-13 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7143990B2 (ja) | 肝臓がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP7153283B2 (ja) | 食道がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP7292653B2 (ja) | 肺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP7158687B2 (ja) | 大腸がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP2022174247A (ja) | 前立腺がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP7215694B2 (ja) | 胆道がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP7156650B2 (ja) | 胃がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP2022122899A (ja) | 膵臓がんの検出キット又はデバイス及び検出方法 | |
JP7165329B2 (ja) | 卵巣腫瘍の検出のためのキット、デバイス及び方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20221013 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20221013 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20231017 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20240416 |