JP2022002524A - ポリオーマウイルス中和抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
本開示は、抗VP1抗体、抗体断片、ならびにポリオーマウイルス感染の可能性の低減
または処置のためのそれらの使用に関する。
ヒトポリオーマウイルスのうち、BKウイルス(BKV)およびJCウイルス(JCV
)が同定された最初の2つであった。これらの2つのポリオーマウイルスは、免疫抑制患
者から単離され、1971年にLancetの同じ号で公開された(Gardner et al., La
ncet 1971 1:1253-1527、およびPadgett et al., Lancet 1971 1:1257-1260)。ポリオー
マウイルスは、20面体の非エンベロープ型二本鎖DNAウイルスである。それらは直径
40〜45nmの寸法であり、88%のタンパク質および12%DNAを含む。
ード領域、後期コード領域、および非コード制御領域を含有する。初期コード領域は、3
つの調節タンパク質(ラージ腫瘍抗原[TAg]、スモール腫瘍抗原[tAg]、および
トランケート型腫瘍抗原[truncTAg])をコードし、新しく感染した細胞中で発
現される最初のウイルスタンパク質であり、ウイルスDNAの複製を容易にし、好ましい
細胞環境を確立するのを担う。後期コード領域は、ウイルスキャプシドを作り上げる3つ
の構造タンパク質(VP1、VP2、およびVP3)、ならびにアグノタンパク質をコー
ドし、ウイルス複製中のその役割はあまり明確ではない。非コード制御領域は、複製起点
ならびにウイルス遺伝子生成物の発現を誘導する初期および後期プロモーターを含有する
。
ならびにリンパ球(一次感染および播種の提唱部位)を含む多くの異なる細胞型において
検出されている(Chatterjee et al., J. Med. Virol. 2000; 60:353-362、Goudsmit et
al., J. Med. Virol. 1982; 10:91-99、Heritage et al., J. Med. Virol. 1981; 8:143-
150、Shinohara et al., J. Med. Virol. 1993; 41(4):301-305)。BKVの主要な細胞
表面受容体は、ガングリオシドGT1b、GD1b、およびGD3であり、それらは全て
末端α2,8−結合シアル酸を有し、かなり遍在性であり、様々な細胞型の感染を可能に
する(Neu et al., PLos Patholog. 2013; 9(10):e1003714およびe1003688、O’Hara et
al., Virus Res. 2014; 189:208-285も参照されたい)。BKVの非エンベロープ型20
面体ビリオンは、3つの異なるウイルスタンパク質:72個の五量体に整列された360
コピーの主要ウイルスキャプシドタンパク質VP1ならびに各VP1五量体と結合した1
個のVP2またはVP3分子と組み合わせた72コピーのマイナーウイルスキャプシドタ
ンパク質VP2およびVP3から構成される。VP1のみが進入時にビリオン表面上に露
出し、各五量体はガングリオシド受容体のための5つの低親和性結合部位を有する。細胞
表面上のガングリオシド受容体へのVP1五量体の結合は、カベオラ媒介性エンドサイト
ーシス経路を介する内在化、次いで、小胞体、最終的には核へのウイルスの輸送を開始さ
せる(Tsai and Qian, J. Virol 2010;84(19):9840-9852)。
団の80〜90%が感染していると推定される(Knowles W.A., Adv. Exp. Med. Biol.
2006;577:19-45)。一次感染は、ほとんどの場合、小児期(すなわち、10歳前)に起こ
り、軽度な、非特異的な、自己限定的な疾病をもたらすか、または症状を全くもたらさな
い。持続感染は、尿細管、尿管、および膀胱の上皮細胞で確立され、免疫系によって有効
に制御される。免疫応答性の成人の尿中への一過的な無症状性のウイルス出芽が散発的に
起こるが、疾患または後遺症をもたらさない。しかしながら、免疫機能障害、特に、腎移
植または造血幹細胞移植後の免疫抑制は、制御されないBKV複製、究極的には、痛みの
ある膀胱疾患である、BKV関連ネフロパシー(BKVAN)または出血性膀胱炎(HC
)をもたらし得る。BKVに対する有効な抗ウイルス療法はなく、現在の標準治療は、免
疫抑制の低減であり、急性拒絶のリスクを増大させる。現在のより積極的なモニタリング
および防止のための手法を用いても、最大で10%の腎移植レシピエントがBKVANを
発症し、これらの患者の15〜30%がBKVANに起因して移植片喪失に罹患する。B
KVウイルス血症の検出時の免疫抑制レジメンにおけるこれらの経験している低減のうち
、最大で30%が結果として急性拒絶エピソードを経験する。
ロパシー(BKVAN)は腎臓移植傷害の原因として文献中に報告されなかった(Purigh
alla et al., Am. J. Kidney Dis. 1995; 26:671-673およびRandhawa et al., Transplan
tation 1999; 67:103-109)。BKVANの初期管理において、BK検査陽性は重大な結
果を有し、50%を超える患者が移植片機能障害および移植片喪失を有していた(Hirsch
et al., New Engl. J. Med. 2002; 347:488-496)。BKウイルスの再活性化は、移植後
に開始することがあり、移植後3カ月までに約30%〜50%の患者において見られる(
Bressollette-Bodin et al., Am J. Transplant. 2005; 5(8):1926-1933およびBrennan e
t al., Am. J. Transplant. 2004;4(12):2132-2134)。BKウイルスの再活性化は、最初
は尿中、次いで血漿中、最後に腎臓中のウイルスおよびウイルスDNAによって認められ
得る(Brennan et al., Am. J. Transplant. 2005;5(3):582-594およびHirsch et al., N
Eng. J. Med. 2002;347(7):488-496)。腎臓移植患者の約80%が尿中にBKウイルス
を有し(BKウイルス尿症)、これらの患者の5〜10%がBKVANに進行する(Bine
t et al., Transplantation 1999; 67(6):918-922およびBressollette-Bodin et al., Am
J. Transplant. 2005; 5(8):1926-1933)。BKVは基底膜の露出と共に、尿細管上皮細
胞の壊死および溶解的破壊を引き起こし、間質に管腔液を蓄積させ、間質性線維症および
尿細管萎縮をもたらし(Nickeleit et al., J. Am. Soc. Neprol. 1999; 10(5):1080-108
9)、これらは全て移植片の状態に影響し得る。患者は、腎機能の低下、尿細管−間質性
腎炎および尿管狭窄を呈し得る(Garner et al., Lancet 1971; 1(7712):1253-1257およ
びHirsch Am. J. Transplant 2002; 2(1)25-30)。
oeg et al., Clin. Infect. Dis. 2001;33(2):191-202)。造血幹細胞移植(HSCT)
レシピエントにおけるBKV疾患は、典型的には、出血性膀胱炎(HC)として現れ、重
症度において変化してもよい。ウイルス尿症(ウイルス血症ではない)および痛みのある
血尿は、HCの臨床所見と関連する。現在の標準治療は、主として、強制補液/利尿およ
び疼痛管理手段を含む、事実上支持的なものである。最も重篤な事例では、輸血、血餅排
出を要し、一部の例では死亡をもたらし得る。任意の原因(例えば、薬物、放射線、ウイ
ルス)のHCは、HSCTレシピエント間では比較的一般的であるが、BKVと関連する
HCは、通常、移植後6カ月以内に約10〜12%の患者において生じる。HCの他のウ
イルス病因があり、アデノウイルスは、成人HSCTレシピエントと比較して、小児HS
CTレシピエント間でHCのより一般的な原因である。BKウイルスはまた、全身性エリ
テマトーデス、他の固形臓器移植などの他の免疫不全状態およびHIV/AIDS患者に
おいても観察されている(Jiang et al., Virol. 2009; 384:266-273)。
片喪失を防止する試みにおける免疫抑制の低減である(Wiseman et al., Am. J. Kidney
Dis. 2009; 54(1): 131-142およびHirsch et al., Transplantation 2005; 79(1): 1277-
1286)。免疫抑制の低減はウイルス血症から臨床ネフロパシーと関連する広範な損傷への
進行を防止するのに役立ち得るため、低減のための固定された臨床レジメンは存在しない
が、これは急性臓器拒絶のリスクも増大させる(Brennan et al., Am. J. Transplant 20
05; 5(3):582-594)。医師は、免疫抑制剤の低減と組み合わせた、シドフォビル、レフル
ノミドまたはキノロンなどの治療剤の使用を報告したが、この報告により、この手法が無
効であり、追加の副作用を管理する負担が増すことがわかる(Randhawa and Brennan Am.
J. Transplant 2006; 6(9):2000-2005)。そのようなものとして、BKなどのポリオー
マウイルスを中和し、免疫不全宿主において使用することができる療法に関する分野にお
ける満たされない有用な必要性がある。
であるが、JCウイルスは一般的には、BKウイルスよりも後に獲得される(Padgett et
al., J. Infect. Dis. 1973;127(4):467-470およびSabath et al., J. Infect. Dis. 20
02; 186 Suppl. 2:5180-5186)。初期感染後、JCウイルスはリンパ器官および腎臓にお
いて潜伏を確立し、再活性化された場合、感染したBリンパ球を介して中枢神経系に侵入
する。一度、CNSに入れば、JCウイルスは、進行性脱髄性中枢神経系障害である進行
性多巣性白質脳症(PML)を引き起こす。PMLは、HIV/AIDS患者における日
和見感染として見つかることが最も多く、免疫抑制患者においても報告されている(Angs
trom et al., Brain 1958; 81(1):93-111およびGarcia-Suarez et al., Am. J. Hematol.
2005; 80(4):271-281)。PML患者は、混乱、精神状態の変化、歩行運動失調、片側不
全麻痺、四肢不全麻痺などの局所神経学的異常および視覚変化を呈する(Richardson E.P
., N. Eng. J. Med. 1961; 265:815-823)。PMLを有する患者の予後は不良であり、H
IV/AIDSを有する患者においては特に不良である(Antinori et al., J. Neurovir
ol. 2003;9 suppl.1:47-53)。これは、JCなどのポリオーマウイルスを中和する療法に
関する分野における満たされない有用な必要性をさらに強調するものである。
本開示は、ヒトポリオーマウイルスおよび/またはその断片に対する中和抗体、BKウ
イルスおよび/またはJCウイルスを認識する抗体ならびにその対応するVP1五量体お
よびその断片に関する。
。
異的に結合する、抗体。一実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、5.0pM
以下の結合親和性でBKV血清型IのVP1に結合し、29.0pM以下の結合親和性で
BKV血清型IIのVP1に結合し、6.0pM以下の結合親和性でBKV血清型III
のVP1に結合し、および/または185.0pM以下の結合親和性でBKV血清型IV
のVP1に結合する。別の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片はさらに、高ナ
ノモル濃度範囲の結合親和性でJCV VP1および特異的JCV VP1突然変異体に
結合する。
では、抗体またはその抗原結合性断片は、表1の2つ以上のVP1に結合する。一実施形
態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV VP1血清型IおよびBKV VP
1血清型IIに結合する。別の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV
VP1血清型IおよびBKV VP1血清型IIIに結合する。別の実施形態では、抗
体またはその抗原結合性断片は、BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型I
Vに結合する。別の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV VP1血
清型IIおよびBKV VP1血清型IIIに結合する。別の実施形態では、抗体または
その抗原結合性断片は、BKV VP1血清型IIおよびBKV VP1血清型IVに結
合する。別の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV VP1血清型I
およびJCV VP1に結合する。好ましい実施形態では、抗体またはその抗原結合性断
片は、BKV VP1血清型I、II、IIIおよびIVに結合する。さらに、抗体また
はその抗原結合性断片は、BKV VP1血清型I、II、IIIおよびIVならびにJ
CV VP1に結合する。
01)の1つまたは複数のアミノ酸残基に特異的に結合する、抗体。一実施形態では、抗
体または抗原結合性断片は、アミノ酸Y169、R170およびK172のうちの1つま
たは複数に特異的に結合する、例えば、本明細書に記載される走査アラニン突然変異誘発
による決定された場合、例えば、Y169およびR170に結合する。
中、Xは任意のアミノ酸(Xaa)であってもよい)を含む、抗体。別の実施形態では、
Xは、N(Asn)、S(Ser)、K(Lys)またはQ(Gln)であってもよい。
(i)(a)配列番号6のHCDR1(CDR−相補性決定領域)、(b)配列番号7
のHCDR2、(c)配列番号8のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号1
6のLCDR1、(e)配列番号17のLCDR2、および(f)配列番号18のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(ii)(a)配列番号26のHCDR1、(b)配列番号27のHCDR2、(c)
配列番号28のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号36のLCDR1、(
e)配列番号37のLCDR2、および(f)配列番号38のLCDR3を含む軽鎖可変
領域;
(iii)(a)配列番号46のHCDR1、(b)配列番号47のHCDR2、(c
)配列番号48のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号56のLCDR1、
(e)配列番号57のLCDR2、および(f)配列番号58のLCDR3を含む軽鎖可
変領域;
(iv)(a)配列番号66のHCDR1、(b)配列番号67のHCDR2、(c)
配列番号68のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号76のLCDR1、(
e)配列番号77のLCDR2、および(f)配列番号78のLCDR3を含む軽鎖可変
領域;
(v)(a)配列番号86のHCDR1、(b)配列番号87のHCDR2、(c)配
列番号88のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号96のLCDR1、(e
)配列番号97のLCDR2、および(f)配列番号98のLCDR3を含む軽鎖可変領
域;
(vi)(a)配列番号106のHCDR1、(b)配列番号107のHCDR2、(
c)配列番号108のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号116のLCD
R1、(e)配列番号117のLCDR2、および(f)配列番号118のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(vii)(a)配列番号126のHCDR1、(b)配列番号127のHCDR2、
(c)配列番号128のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号136のLC
DR1、(e)配列番号137のLCDR2、および(f)配列番号138のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(viii)(a)配列番号146のHCDR1、(b)配列番号147のHCDR2
、(c)配列番号148のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号156のL
CDR1、(e)配列番号157のLCDR2、および(f)配列番号158のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(ix)(a)配列番号166のHCDR1、(b)配列番号167のHCDR2、(
c)配列番号168のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号176のLCD
R1、(e)配列番号177のLCDR2、および(f)配列番号178のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(x)(a)配列番号186のHCDR1、(b)配列番号187のHCDR2、(c
)配列番号188のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号196のLCDR
1、(e)配列番号197のLCDR2、および(f)配列番号198のLCDR3を含
む軽鎖可変領域;
(xi)(a)配列番号206のHCDR1、(b)配列番号207のHCDR2、(
c)配列番号208のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号216のLCD
R1、(e)配列番号217のLCDR2、および(f)配列番号218のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xii)(a)配列番号226のHCDR1、(b)配列番号227のHCDR2、
(c)配列番号228のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号236のLC
DR1、(e)配列番号237のLCDR2、および(f)配列番号238のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xiii)(a)配列番号246のHCDR1、(b)配列番号247のHCDR2
、(c)配列番号248のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号256のL
CDR1、(e)配列番号257のLCDR2、および(f)配列番号258のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xiv)(a)配列番号266のHCDR1、(b)配列番号267のHCDR2、
(c)配列番号268のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号276のLC
DR1、(e)配列番号277のLCDR2、および(f)配列番号278のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xv)(a)配列番号286のHCDR1、(b)配列番号287のHCDR2、(
c)配列番号288のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号296のLCD
R1、(e)配列番号297のLCDR2、および(f)配列番号298のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xvi)(a)配列番号306のHCDR1、(b)配列番号307のHCDR2、
(c)配列番号308のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号314のLC
DR1、(e)配列番号315のLCDR2、および(f)配列番号316のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xvii)(a)配列番号322のHCDR1、(b)配列番号323のHCDR2
、(c)配列番号324のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号332のL
CDR1、(e)配列番号333のLCDR2、および(f)配列番号334のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xviii)(a)配列番号342のHCDR1、(b)配列番号343のHCDR
2、(c)配列番号344のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号349の
LCDR1、(e)配列番号350のLCDR2、および(f)配列番号351のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xix)(a)配列番号356のHCDR1、(b)配列番号357のHCDR2、
(c)配列番号358のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号363のLC
DR1、(e)配列番号364のLCDR2、および(f)配列番号365のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xx)(a)配列番号370のHCDR1、(b)配列番号371のHCDR2、(
c)配列番号372のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号377のLCD
R1、(e)配列番号378のLCDR2、および(f)配列番号379のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xxi)(a)配列番号384のHCDR1、(b)配列番号385のHCDR2、
(c)配列番号386のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号391のLC
DR1、(e)配列番号392のLCDR2、および(f)配列番号393のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xxii)(a)配列番号398のHCDR1、(b)配列番号399のHCDR2
、(c)配列番号400のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号405のL
CDR1、(e)配列番号406のLCDR2、および(f)配列番号407のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxiii)(a)配列番号412のHCDR1、(b)配列番号413のHCDR
2、(c)配列番号414のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号419の
LCDR1、(e)配列番号420のLCDR2、および(f)配列番号421のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xxiv)(a)配列番号426のHCDR1、(b)配列番号427のHCDR2
、(c)配列番号428のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号433のL
CDR1、(e)配列番号434のLCDR2、および(f)配列番号435のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxv)(a)配列番号440のHCDR1、(b)配列番号441のHCDR2、
(c)配列番号442のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号447のLC
DR1、(e)配列番号448のLCDR2、および(f)配列番号449のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xxvi)(a)配列番号454のHCDR1、(b)配列番号455のHCDR2
、(c)配列番号456のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号461のL
CDR1、(e)配列番号462のLCDR2、および(f)配列番号463のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxvii)(a)配列番号468のHCDR1、(b)配列番号469のHCDR
2、(c)配列番号470のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号475の
LCDR1、(e)配列番号476のLCDR2、および(f)配列番号477のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xxviii)(a)配列番号482のHCDR1、(b)配列番号483のHCD
R2、(c)配列番号484のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号489
のLCDR1、(e)配列番号490のLCDR2、および(f)配列番号491のLC
DR3を含む軽鎖可変領域
を含む、抗体。
(i)(a)配列番号508のHCDR1(CDR−相補性決定領域)、(b)配列番
号509のHCDR2、(c)配列番号510のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d
)配列番号511のLCDR1、(e)配列番号512のLCDR2、および(f)配列
番号513のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(ii)(a)配列番号514のHCDR1、(b)配列番号515のHCDR2、(
c)配列番号516のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号517のLCD
R1、(e)配列番号518のLCDR2、および(f)配列番号519のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(iii)(a)配列番号520のHCDR1、(b)配列番号521のHCDR2、
(c)配列番号522のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号523のLC
DR1、(e)配列番号524のLCDR2、および(f)配列番号525のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(iv)(a)配列番号526のHCDR1、(b)配列番号527のHCDR2、(
c)配列番号528のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号529のLCD
R1、(e)配列番号530のLCDR2、および(f)配列番号531のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(v)(a)配列番号532のHCDR1、(b)配列番号533のHCDR2、(c
)配列番号534のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号535のLCDR
1、(e)配列番号536のLCDR2、および(f)配列番号537のLCDR3を含
む軽鎖可変領域;
(vi)(a)配列番号538のHCDR1、(b)配列番号539のHCDR2、(
c)配列番号540のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号541のLCD
R1、(e)配列番号542のLCDR2、および(f)配列番号543のLCDR3を
含む軽鎖可変領域
を含む、抗体。
対応する残基により置換される、抗体。
93、94、95、96、97、98または99%の同一性を保持する、抗体。
(scFv)または抗体断片である、抗体。
(i)配列番号12を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号22を含む軽鎖可変領域
(vL);
(ii)配列番号32を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号42を含む軽鎖可変領
域(vL);
(iii)配列番号52を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号62を含む軽鎖可変
領域(vL);
(iv)配列番号72を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号82を含む軽鎖可変領
域(vL);
(v)配列番号92を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号102を含む軽鎖可変領
域(vL);
(vi)配列番号112を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号122を含む軽鎖可
変領域(vL);
(vii)配列番号132を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号142を含む軽鎖
可変領域(vL);
(viii)配列番号152を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号162を含む軽
鎖可変領域(vL);
(ix)配列番号172を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号182を含む軽鎖可
変領域(vL);
(x)配列番号192を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号202を含む軽鎖可変
領域(vL);
(xi)配列番号212を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号222を含む軽鎖可
変領域(vL);
(xii)配列番号232を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号242を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xiii)配列番号252を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号262を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xiv)配列番号272を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号282を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xv)配列番号292を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号302を含む軽鎖可
変領域(vL);
(xvi)配列番号312を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号320を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xvii)配列番号328を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号338を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xviii)配列番号348を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号355を含む
軽鎖可変領域(vL);
(xix)配列番号362を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号369を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xx)配列番号376を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号383を含む軽鎖可
変領域(vL);
(xxi)配列番号390を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号397を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xxii)配列番号404を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号411を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xxiii)配列番号418を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号425を含む
軽鎖可変領域(vL);
(xxiv)配列番号432を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号439を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xxv)配列番号446を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号453を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xxvi)配列番号460を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号467を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xxvii)配列番号474を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号481を含む
軽鎖可変領域(vL);または、
(xxviii)配列番号488を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号495を含
む軽鎖可変領域(vL)
を含む、抗体。
93、94、95、96、97、98または99%の同一性を保持する、抗体。
のアミノ酸が改変、欠失または置換されている、抗体。
(scFv)または抗体断片である、抗体。
ないか、または低フコシル化されている、前記実施形態のいずれかに記載の抗体。
って、組成物中の抗体の少なくとも0.05%、0.1%、0.5%、1%、2%、3%
、5%以上がα2,3−結合したシアル酸残基を有し、前記抗体またはその抗原結合性断
片が、(i)(a)配列番号6のHCDR1(CDR−相補性決定領域)、(b)配列番
号7のHCDR2、(c)配列番号8のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番
号16のLCDR1、(e)配列番号17のLCDR2、および(f)配列番号18のL
CDR3を含む軽鎖可変領域;
(ii)(a)配列番号26のHCDR1、(b)配列番号27のHCDR2、(c)
配列番号28のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号36のLCDR1、(
e)配列番号37のLCDR2、および(f)配列番号38のLCDR3を含む軽鎖可変
領域;
(iii)(a)配列番号46のHCDR1、(b)配列番号47のHCDR2、(c
)配列番号48のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号56のLCDR1、
(e)配列番号57のLCDR2、および(f)配列番号58のLCDR3を含む軽鎖可
変領域;
(iv)(a)配列番号66のHCDR1、(b)配列番号67のHCDR2、(c)
配列番号68のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号76のLCDR1、(
e)配列番号77のLCDR2、および(f)配列番号78のLCDR3を含む軽鎖可変
領域;
(v)(a)配列番号86のHCDR1、(b)配列番号87のHCDR2、(c)配
列番号88のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号96のLCDR1、(e
)配列番号97のLCDR2、および(f)配列番号98のLCDR3を含む軽鎖可変領
域;
(vi)(a)配列番号106のHCDR1、(b)配列番号107のHCDR2、(
c)配列番号108のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号116のLCD
R1、(e)配列番号117のLCDR2、および(f)配列番号118のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(vii)(a)配列番号126のHCDR1、(b)配列番号127のHCDR2、
(c)配列番号128のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号136のLC
DR1、(e)配列番号137のLCDR2、および(f)配列番号138のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(viii)(a)配列番号146のHCDR1、(b)配列番号147のHCDR2
、(c)配列番号148のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号156のL
CDR1、(e)配列番号157のLCDR2、および(f)配列番号158のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(ix)(a)配列番号166のHCDR1、(b)配列番号167のHCDR2、(
c)配列番号168のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号176のLCD
R1、(e)配列番号177のLCDR2、および(f)配列番号178のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(x)(a)配列番号186のHCDR1、(b)配列番号187のHCDR2、(c
)配列番号188のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号196のLCDR
1、(e)配列番号197のLCDR2、および(f)配列番号198のLCDR3を含
む軽鎖可変領域;
(xi)(a)配列番号206のHCDR1、(b)配列番号207のHCDR2、(
c)配列番号208のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号216のLCD
R1、(e)配列番号217のLCDR2、および(f)配列番号218のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xii)(a)配列番号226のHCDR1、(b)配列番号227のHCDR2、
(c)配列番号228のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号236のLC
DR1、(e)配列番号237のLCDR2、および(f)配列番号238のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xiii)(a)配列番号246のHCDR1、(b)配列番号247のHCDR2
、(c)配列番号248のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号256のL
CDR1、(e)配列番号257のLCDR2、および(f)配列番号258のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xiv)(a)配列番号266のHCDR1、(b)配列番号267のHCDR2、
(c)配列番号268のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号276のLC
DR1、(e)配列番号277のLCDR2、および(f)配列番号278のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xv)(a)配列番号286のHCDR1、(b)配列番号287のHCDR2、(
c)配列番号288のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号296のLCD
R1、(e)配列番号297のLCDR2、および(f)配列番号298のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xvi)(a)配列番号306のHCDR1、(b)配列番号307のHCDR2、
(c)配列番号308のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号314のLC
DR1、(e)配列番号315のLCDR2、および(f)配列番号316のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xvii)(a)配列番号322のHCDR1、(b)配列番号323のHCDR2
、(c)配列番号324のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号332のL
CDR1、(e)配列番号333のLCDR2、および(f)配列番号334のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xviii)(a)配列番号342のHCDR1、(b)配列番号343のHCDR
2、(c)配列番号344のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号349の
LCDR1、(e)配列番号350のLCDR2、および(f)配列番号351のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xix)(a)配列番号356のHCDR1、(b)配列番号357のHCDR2、
(c)配列番号358のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号363のLC
DR1、(e)配列番号364のLCDR2、および(f)配列番号365のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xx)(a)配列番号370のHCDR1、(b)配列番号371のHCDR2、(
c)配列番号372のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号377のLCD
R1、(e)配列番号378のLCDR2、および(f)配列番号379のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xxi)(a)配列番号384のHCDR1、(b)配列番号385のHCDR2、
(c)配列番号386のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号391のLC
DR1、(e)配列番号392のLCDR2、および(f)配列番号393のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xxii)(a)配列番号398のHCDR1、(b)配列番号399のHCDR2
、(c)配列番号400のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号405のL
CDR1、(e)配列番号406のLCDR2、および(f)配列番号407のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxiii)(a)配列番号412のHCDR1、(b)配列番号413のHCDR
2、(c)配列番号414のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号419の
LCDR1、(e)配列番号420のLCDR2、および(f)配列番号421のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xxiv)(a)配列番号426のHCDR1、(b)配列番号427のHCDR2
、(c)配列番号428のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号433のL
CDR1、(e)配列番号434のLCDR2、および(f)配列番号435のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxv)(a)配列番号440のHCDR1、(b)配列番号441のHCDR2、
(c)配列番号442のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号447のLC
DR1、(e)配列番号448のLCDR2、および(f)配列番号449のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xxvi)(a)配列番号454のHCDR1、(b)配列番号455のHCDR2
、(c)配列番号456のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号461のL
CDR1、(e)配列番号462のLCDR2、および(f)配列番号463のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxvii)(a)配列番号468のHCDR1、(b)配列番号469のHCDR
2、(c)配列番号470のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号475の
LCDR1、(e)配列番号476のLCDR2、および(f)配列番号477のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xxviii)(a)配列番号482のHCDR1、(b)配列番号483のHCD
R2、(c)配列番号484のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号489
のLCDR1、(e)配列番号490のLCDR2、および(f)配列番号491のLC
DR3を含む軽鎖可変領域
を含む、組成物。
、抗体がいずれもバイセクティングGlcNAcを含まない、組成物。
の断片を含む医薬組成物。
含む医薬組成物。一実施形態では、担体は、ヒスチジンバッファーである。一実施形態で
は、医薬組成物は、糖(例えば、スクロース)を含む。
とを含む、BKウイルスまたはJCウイルス感染を中和する方法。抗体またはその抗原結
合性断片がBKV血清型IおよびBKV血清型IIを中和する、方法。別の実施形態では
、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV血清型IおよびBKV血清型IIIを中和す
る。別の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV血清型IおよびBKV
血清型IVを中和する。別の実施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV血
清型IIおよびBKV血清型IIIを中和する。別の実施形態では、抗体またはその抗原
結合性断片は、BKV血清型IIおよびBKV血清型IVを中和する。別の実施形態では
、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV血清型IおよびJCVを中和する。特定の実
施形態では、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV血清型I、II、IIIおよびI
Vを中和する。さらに、抗体またはその抗原結合性断片は、BKV血清型I、II、II
IおよびIVならびにJCVを中和する。好ましい実施形態では、抗VP1抗体は、BK
Vの4種全部の血清型(I〜IV)による感染を中和したが、これらの抗VP1抗体は、
特に、P8D11、P8D11の改変、およびEBB−C1975−B5を含む。
とを含む、BKウイルスまたはJCウイルスと関連する障害を処置する、またはその可能
性を低減させる方法であって、障害がネフロパシー、BKVAN、出血性膀胱炎(HC)
、進行性多巣性白質脳症(PML)、顆粒細胞ニューロパシー(GCN)、間質性腎疾患
、尿管狭窄、血管炎、大腸炎、網膜炎、髄膜炎、および免疫再構築症候群(IRIS)で
ある、方法。
ルシニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤である、方法。
アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスまたはシクロスポリンである、方法。
断片または医薬組成物。
、顆粒細胞ニューロパシー(GCN)、間質性腎疾患、尿管狭窄、血管炎、大腸炎、網膜
炎、髄膜炎、および免疫再構築症候群(IRIS)の処置またはその可能性の低減におけ
る使用のための、抗体もしくはその断片または医薬組成物。
シニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤である、抗体またはその断片の使用。
ム、アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスまたはシクロスポリンである、抗体また
はその断片の使用。
を生成するための方法。
群から選択される、診断剤。
別途記述しない限り、本明細書で使用される以下の用語および語句は、以下の意味を有
することが意図される。
対応する抗原に結合することができる免疫グロブリンファミリーのポリペプチドを指す。
例えば、天然のIgG抗体は、ジスルフィド結合により相互接続された少なくとも2つの
重鎖(H)と2つの軽鎖(L)とを含む四量体である。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細
書でVHと省略される)と、重鎖定常領域とから構成される。重鎖定常領域は、3つのド
メイン、CH1、CH2およびCH3から構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細
書でVLと省略される)と、軽鎖定常領域とから構成される。軽鎖定常領域は、1つのド
メイン、CLから構成される。VHおよびVL領域は、フレームワーク領域(FR)と呼
ばれる、より保存された領域が散在する、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変領
域にさらに細分することができる。各VHおよびVLは、アミノ末端からカルボキシ末端
に向かって、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、お
よびFR4に配置される3つのCDRと、4つのFRから構成される。重鎖および軽鎖の
可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫系の
様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)および古典的補体系の第1成分(C1q)など
の、宿主組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介することができる。
抗体、ラクダ科抗体、キメラ抗体、および抗イディオタイプ(抗Id)抗体(例えば、本
開示の抗体に対する抗Id抗体など)を含む。抗体は、任意のアイソタイプ/クラス(例
えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgAおよびIgY)、またはサブクラス(例
えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1およびIgA2)のものであ
ってもよい。
の超可変領域を互換的に指す。CDRは、そのような標的タンパク質に対する特異性を担
持する抗体鎖の標的タンパク質結合部位である。各ヒトVLまたはVH中には3つのCD
R(CDR1〜3、N末端から連続的に番号付けられる)が存在し、可変ドメインの約1
5〜20%を占める。CDRを、その領域および順序により記載することができる。例え
ば、「VHCDR1」または「HCDR1」は両方とも、重鎖可変領域の第1のCDRを
指す。CDRは標的タンパク質のエピトープと構造的に相補的であり、かくして、結合特
異性を直接担う。VLまたはVHの残りのストレッチ、いわゆるフレームワーク領域は、
アミノ酸配列の変化をあまり示さない(Kuby, Immunology, 4th ed., Chapter 4. W.H. F
reeman & Co., New York, 2000)。
abat、Chothia、およびAbM(例えば、Johnson et al., Nucleic Acids Re
s., 29:205-206 (2001); Chothia and Lesk, J. Mol. Biol., 196:901-917 (1987); Chot
hia et al., Nature, 342:877-883 (1989); Chothia et al., J. Mol. Biol., 227:799-8
17 (1992); Al-Lazikani et al., J.Mol.Biol., 273:927-748 (1997)を参照されたい)を
使用して決定することができる。抗原結合部位の定義は、以下にも記載されている:Ruiz
et al., Nucleic Acids Res., 28:219-221 (2000); およびLefranc, M.P., Nucleic Aci
ds Res., 29:207-209 (2001); MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262:732-745 (1996);
およびMartin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86:9268-9272 (1989); Martin et
al., Methods Enzymol., 203:121-153 (1991); およびRees et al., In Sternberg M.J.
E. (ed.), Protein Structure Prediction, Oxford University Press, Oxford, 141-172
(1996)。一部の実施形態では、KabatとChothiaの組合せナンバリングスキ
ームにおいて、CDRは、KabatのCDR、ChothiaのCDR、またはその両
方の一部であるアミノ酸残基に対応する。例えば、一部の実施形態では、CDRは、VH
、例えば、哺乳動物VH、例えば、ヒトVH中のアミノ酸残基26〜35(HC CDR
1)、50〜65(HC CDR2)、および95〜102(HC CDR3);ならび
にVL、例えば、哺乳動物VL、例えば、ヒトVL中のアミノ酸残基24〜34(LC
CDR1)、50〜56(LC CDR2)、および89〜97(LC CDR3)に対
応する。
および「可変」は機能的に使用される。これに関して、軽鎖(VL)と重鎖(VH)部分
の両方の可変ドメインポーションが抗原認識および特異性を決定付けることが理解される
。逆に、軽鎖(CL)および重鎖(CH1、CH2またはCH3)の定常ドメインは、分
泌、経胎盤移動、Fc受容体結合、補体結合などの重要な生物学的特性を付与する。慣例
により、定常領域ドメインの番号付けは、それらが抗体の抗原結合部位またはアミノ末端
からより遠くなるにつれて増大する。N末端は可変領域であり、C末端は定常領域である
;CH3およびCLドメインは、それぞれ、重鎖および軽鎖のカルボキシ末端ドメインを
実際に含む。
作用する(例えば、結合、立体障害、安定化/脱安定化、空間分布により)能力を保持す
る抗体の1または複数のポーションを指す。結合断片の例としては、限定されるものでは
ないが、一本鎖Fv(scFv)、ジスルフィド結合Fv(sdFv)、Fab断片、F
(ab’)断片、VL、VH、CLおよびCH1ドメインからなる一価断片;F(ab)
2断片、ヒンジ領域でジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片を含む二価断
片;VHおよびCH1ドメインからなるFd断片;抗体の単一アームのVLおよびVHド
メインからなるFv断片;VHドメインからなるdAb断片(Ward et al., Nature 341:
544-546, 1989);ならびに単離された相補性決定領域(CDR)、または抗体の他のエ
ピトープ結合断片が挙げられる。
るが、それらを、組換え方法を使用して、VLおよびVH領域が対形成して一価分子(一
本鎖Fv(「scFv」)を形成する単一タンパク質鎖として作製することができる合成
リンカーにより連結することができる;例えば、Bird et al., Science 242:423-426, 19
88;およびHuston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879-5883, 1988を参照されたい
。そのような一本鎖抗体も、用語「抗原結合性断片」内に包含されることが意図される。
これらの抗原結合性断片は、当業者には公知の従来の技術を使用して得られ、その断片は
無傷抗体と同じ様式で有用性についてスクリーニングされる。
トラボディ、ダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ、v−NARおよびビス−sc
Fv(例えば、Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005を参
照されたい)中に組み込むこともできる。抗原結合性断片を、III型フィブロネクチン
(Fn3)などのポリペプチドに基づく足場中に移植することができる(フィブロネクチ
ンポリペプチドモノボディを記載する米国特許第6,703,199号明細書を参照され
たい)。
列Fvセグメント対(VH−CH1−VH−CH1)を含む一本鎖分子に組み込むことが
できる(Zapata et al., Protein Eng. 8:1057-1062, 1995; および米国特許第5,64
1,870号明細書)。
」は、実質的に同一のアミノ酸配列を有するか、または同じ遺伝的起源から誘導される抗
体および抗原結合性断片などのポリペプチドを指す。この用語はまた、単一分子組成の抗
体分子の調製物も含む。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対する単一の
結合特異性および親和性を示す。
ヒト起源の配列から誘導される可変領域を有する抗体を含む。さらに、抗体が定常領域を
含有する場合、定常領域はまた、そのようなヒト配列、例えば、ヒト生殖系列配列、また
はヒト生殖系列配列の変異型または例えば、Knappik et al., J. Mol. Biol. 296:57-86,
2000に記載のような、ヒトフレームワーク配列分析から誘導されるコンセンサスフレー
ムワーク配列を含有する抗体から誘導される。
えば、in vitroでの無作為もしくは部位特異的突然変異誘発により、またはin
vivoでの体細胞変異により、または安定性もしくは製造を促進するための保存的置
換により導入される突然変異)。
も、そのエピトープを発見し、それと相互作用する(例えば、結合する)抗体またはその
抗原結合性断片を指す。用語「エピトープ」とは、本開示の抗体または抗原結合性断片が
特異的に結合する抗原上の部位を指す。エピトープは、タンパク質の三次元折畳みにより
並置される連続的アミノ酸または非連続的アミノ酸の両方から形成させることができる。
連続的アミノ酸から形成されるエピトープは、典型的には、変性溶媒への曝露の際に保持
されるが、三次元折畳みにより形成されるエピトープは典型的には、変性溶媒による処理
の際に失われる。エピトープは、典型的には、ユニークな空間的コンフォメーション中に
少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14または15個の
アミノ酸を含む。エピトープの空間的コンフォメーションを決定する方法は、当業界にお
ける技術、例えば、x線結晶学および2次元核磁気共鳴を含む(例えば、Epitope Mappin
g Protocols in Methods in Molecular Biology, Vol. 66, G. E. Morris, Ed. (1996)を
参照されたい)。「パラトープ」は、抗原のエピトープを認識する抗体の部分である。
用を記述する文脈で使用される場合の語句「特異的に結合する」または「選択的に結合す
る」は、タンパク質および他の生物製剤の異種集団中の、例えば、生物試料、例えば、血
液、血清、血漿または組織試料中の、抗原の存在を決定する結合反応を指す。かくして、
ある特定の指定されたイムノアッセイ条件下では、特定の結合特異性を有する抗体または
結合剤は、バックグラウンドの少なくとも2倍、特定の抗原に結合し、試料中に存在する
他の抗原に有意な量で実質的に結合しない。一態様では、指定のイムノアッセイ条件下で
、特定の結合特異性を有する抗体または結合剤は、バックグラウンドの少なくとも10倍
、特定の抗原に結合し、試料中に存在する他の抗原に有意な量で実質的に結合しない。そ
のような条件下での抗体または結合剤への特異的結合は、特定のタンパク質に対するその
特異性について抗体または薬剤を選択する必要があってもよい。望ましい場合または適切
な場合、この選択を、他の種(例えば、マウスもしくはラット)または他のサブタイプに
由来する分子と交差反応する抗体を除去することにより達成することができる。あるいは
、いくつかの態様では、ある特定の所望の分子と交差反応する抗体または抗体断片を選択
する。
用の強度を指す。それぞれの抗原部位内で、抗体「アーム」の可変領域は、弱い非共有力
を介して、いくつかの部位で抗原と相互作用する;相互作用が大きくなるほど、親和性が
強くなる。
抗体を指す。しかしながら、1つの抗原に特異的に結合する単離された抗体は、他の抗原
との交差反応性を有してもよい。さらに、単離された抗体は、他の細胞材料および/また
は化学物質を実質的に含まなくてもよい。
よりコードされる他の全ての既知の可変領域アミノ酸配列と比較して、参照可変領域アミ
ノ酸配列またはサブ配列と最も高い決定されたアミノ酸配列同一性を有するヒト可変領域
アミノ酸配列またはサブ配列をコードする核酸配列を指す。対応するヒト生殖系列配列は
また、他の全ての評価された可変領域アミノ酸配列と比較して、参照可変領域アミノ酸配
列またはサブ配列と最も高いアミノ酸配列同一性を有するヒト可変領域アミノ酸配列また
はサブ配列を指してもよい。対応するヒト生殖系列配列は、フレームワーク領域のみ、相
補性決定領域のみ、フレームワーク領域と相補性決定領域、可変セグメント(上記で定義
されたもの)、または可変領域を含む配列もしくはサブ配列の他の組合せであってもよい
。例えば、BLAST、ALIGN、または当業界で公知の別のアラインメントアルゴリ
ズムを使用して2つの配列を整列させる、本明細書に記載の方法を使用して、配列同一性
を決定することができる。対応するヒト生殖系列核酸またはアミノ酸配列は、参照可変領
域核酸またはアミノ酸配列との少なくとも約90%、91%、92%、93%、94%、
95%、96%、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有してもよい
。
を選択することができる。例えば、タンパク質と特異的に免疫反応する抗体を選択するた
めには、固相ELISAイムノアッセイが日常的に使用される(例えば、特異的免疫反応
性を決定するのに使用することができるイムノアッセイ形式および条件の説明については
、Harlow & Lane, Using Antibodies, A Laboratory Manual (1998)を参照されたい)。
典型的には、特異的または選択的結合反応は、バックグラウンドシグナルの少なくとも2
倍、より典型的には、バックグラウンドの少なくとも10〜100倍のシグナルをもたら
す。
定数(ka、時間−1、M−1)で除算したものを指す。当業界における任意の公知の方
法を使用して、平衡解離定数を測定することができる。本開示の抗体は一般に、約10−
7または10−8M未満、例えば、約10−9Mまたは10−10M未満、いくつかの態
様では、約10−11M、10−12Mまたは10−13M未満の平衡解離定数を有する
。
(すなわち、血液/血漿レベル)を指す。バイオアベイラビリティは、投与される剤形か
ら全身循環に達する薬物の時間(速度)と総量(程度)の両方の尺度を示す絶対項である
。
活性薬剤の属または種、ならびに方法または組成物の意図される目的にとって不活性な任
意の賦形剤を指す。いくつかの態様では、語句「から本質的になる」は、本開示の抗VP
1抗体以外の1または複数のさらなる活性剤の含有を明確に排除する。いくつかの態様で
は、語句「から本質的になる」は、本開示の抗VP1抗体以外の1または複数のさらなる
活性剤と、第2の同時投与される薬剤との含有を明確に排除する。
ミノ酸と類似する様式で機能するアミノ酸類似体およびアミノ酸模倣体を指す。天然アミ
ノ酸は、遺伝子コードによりコードされるもの、ならびに後に改変されるアミノ酸、例え
ば、ヒドロキシプロリン、γ−カルボキシグルタミン酸、およびO−ホスホセリンである
。アミノ酸類似体とは、天然アミノ酸と同じ基本化学構造を有する化合物、すなわち、水
素、カルボキシル基、アミノ基、およびR基、例えば、ホモセリン、ノルロイシン、メチ
オニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウムに結合したα−炭素を指す。そのよ
うな類似体は改変されたR基(例えば、ノルロイシン)または改変ペプチド骨格を有する
が、天然アミノ酸と同じ基本化学構造を保持する。アミノ酸模倣体とは、アミノ酸の一般
的化学構造とは異なる構造を有するが、天然アミノ酸と類似する様式で機能する化合物を
指す。
る。特定の核酸配列に関して、保存的に改変されたバリアントとは、同一の、もしくは本
質的に同一のアミノ酸配列をコードする核酸、または核酸がアミノ酸配列をコードしない
場合、本質的に同一の配列を指す。遺伝子コードの縮重性のため、多数の機能的に同一の
核酸が、任意の所与のタンパク質をコードする。例えば、コドンGCA、GCC、GCG
およびGCUは全て、アミノ酸アラニンをコードする。かくして、アラニンがあるコドン
によって特定される全ての位置で、そのコドンを、コードされるポリペプチドを変化させ
ることなく記載される対応するコドンのいずれかに変化させてもよい。そのような核酸変
化は「サイレント変異」であり、保存的に改変されたバリアントの1種である。ポリペプ
チドをコードする全ての核酸配列はまた、核酸の全ての可能なサイレント変異を記述する
。当業者であれば、核酸中のそれぞれのコドン(通常はメチオニンのための唯一のコドン
であるAUGと、通常はトリプトファンのための唯一のコドンであるTGGを除く)を改
変して、機能的に同一の分子を得ることができることを認識できる。したがって、ポリペ
プチドをコードする核酸のそれぞれのサイレント変異は、それぞれ記載される配列中で暗
黙的である。
化学的に類似するアミノ酸との置換をもたらすポリペプチド配列に対する個々の置換、欠
失または付加を含む。機能的に類似するアミノ酸を提供する保存的置換表は、当業界で周
知である。そのような保存的に改変されたバリアントは、多型バリアント、種間相同体、
および対立遺伝子だけでなく、それを排除しない。以下の8群は、互いに保存的置換であ
るアミノ酸を含有する:1)アラニン(A)、グリシン(G);2)アスパラギン酸(D
)、グルタミン酸(E);3)アスパラギン(N)、グルタミン(Q);4)アルギニン
(R)、リシン(K);5)イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、
バリン(V);6)フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、トリプトファン(W);
7)セリン(S)、トレオニン(T);および8)システイン(C)、メチオニン(M)
(例えば、Creighton, Proteins (1984)を参照されたい)。いくつかの態様では、用語「
保存的配列改変」は、アミノ酸配列を含有する抗体の結合特性に有意に影響しないか、ま
たはそれを変化させないアミノ酸改変を指すように使用される。
核細胞、例えば、酵母細胞、ピチア(Pichia)細胞、真菌細胞、トリコデルマ(Trichode
rma)細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO)またはヒト細胞において好まし
いコドンを使用してアミノ酸配列をコードするように変化させたヌクレオチド配列を指す
。最適化されたヌクレオチド配列は、「親」配列としても知られる、出発ヌクレオチド配
列により元々コードされるアミノ酸配列を完全に、またはできるだけ多く保持するように
操作される。
または「同一性パーセント」とは、2つ以上の配列またはサブ配列が同じである程度を指
す。2つの配列は、それらが比較される領域にわたってアミノ酸またはヌクレオチドの同
じ配列を有する場合、「同一」である。2つの配列が、以下の配列比較アルゴリズムの1
つを使用して、もしくは手動によるアラインメントおよび視覚的検査により測定される比
較ウィンドウ、または指定の領域にわたって最大の一致のために比較および整列された場
合、同じであるアミノ酸残基またはヌクレオチドの特定のパーセンテージ(すなわち、特
定の領域にわたって、または特定されない場合、配列全体にわたって60%の同一性、任
意選択で、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、または99%の
同一性)を有する場合、2つの配列は「実質的に同一」である。任意選択で、同一性は、
長さ少なくとも約30ヌクレオチド(または10アミノ酸)である領域にわたって、また
はより好ましくは、長さ100〜500もしくは1000以上のヌクレオチド(または2
0、50、200以上のアミノ酸)である領域にわたって存在する。
作用する。配列比較アルゴリズムを使用する場合、試験配列と参照配列とをコンピュータ
に入力し、サブ配列座標を指定し、必要に応じて、配列アルゴリズムプログラムパラメー
タを指定する。デフォルトプログラムパラメータを使用するか、または代替パラメータを
指定することができる。次いで、配列比較アルゴリズムは、プログラムパラメータに基づ
いて、参照配列と比較した試験配列に関する配列同一性パーセントを算出する。
に、配列を同じ数の連続する位置の参照配列と比較することができる、20〜600、通
常は約50〜約200、より通常は約100〜約150からなる群から選択される連続す
る位置数の任意の1つのセグメントに対する参照を含む。比較のための配列のアラインメ
ントの方法は、当業界で周知である。比較のための配列の最適なアラインメントを、例え
ば、Smith and Waterman, Adv. Appl. Math. 2:482c (1970)の部分相同性アルゴリズムに
より、Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443 (1970)の相同性アラインメントア
ルゴリズムにより、Pearson and Lipman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444 (1988)
の類似性検索法により、これらのアルゴリズムのコンピュータ化された実装(Wisco
nsin Genetics Software Package、Genetics
Computer Group、575 Science Dr.、Madison、W
IにおけるGAP、BESTFIT、FASTA、およびTFASTA)により、または
手動によるアラインメントおよび視覚的検査(例えば、Brent et al., Current Protocol
s in Molecular Biology, 2003を参照されたい)により行うことができる。
つの例は、BLASTおよびBLAST2.0アルゴリズムであり、これらは、それぞれ
、Altschul et al., Nuc. Acids Res. 25:3389-3402, 1977;およびAltschul et al., J.
Mol. Biol. 215:403-410, 1990に記載されている。BLAST分析を実施するためのソ
フトウェアは、National Center for Biotechnology
Informationにより公共的に利用可能である。このアルゴリズムは、データ
ベース配列中の同じ長さのワードと整列させた場合に、いくつかの正の値の閾値スコアT
と一致するか、またはそれを満足する、クエリー配列中の短いワード長Wを同定すること
により高スコアリング配列対(HSP)を最初に同定することを含む。Tは、近隣ワード
スコア閾値と呼ばれる(Altschul et al.、supra)。これらの初期近隣ワードヒットは、
それらを含有するより長いHSPを発見するための検索を開始するための種子として作用
する。ワードヒットは、累積アラインメントスコアを増大させることができる限りそれぞ
れの配列に沿った両方の方向に伸長される。累積スコアを、ヌクレオチド配列については
、パラメータM(一致する残基の対に関するリワードスコア;常に>0)およびN(不一
致の残基のためのペナルティスコア;常に<0)を使用して算出する。アミノ酸配列につ
いては、スコアリングマトリックスを使用して、累積スコアを算出する。それぞれの方向
におけるワードヒットの伸長は、累積アラインメントスコアがその最大達成値から量X減
少する場合、停止される;1または複数の負のスコアの残基アラインメントの累積のため
、累積スコアはゼロ以下になる;またはいずれかの配列の末端に到達する。BLASTア
ルゴリズムパラメータW、T、およびXは、アラインメントの感度および速度を決定する
。BLASTNプログラム(ヌクレオチド配列に関する)は、デフォルトとして、11の
ワード長(W)、10の期待値(E)、M=5、N=−4および両方の鎖の比較を使用す
る。アミノ酸配列については、BLASTPプログラムは、デフォルトとして、3のワー
ド長、および10の期待値(E)、およびBLOSUM62スコアリングマトリックス(
Henikoff and Henikoff, (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915を参照されたい
)、50のアラインメント(B)、10の期待値(E)、M=5、N=−4、および両方
の鎖の比較を使用する。
、Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787, 1993を参照された
い)。BLASTアルゴリズムにより提供される類似性の1つの尺度は、2つのヌクレオ
チドまたはアミノ酸配列間の一致が偶然生じる確率の指示を提供する、最小合計確率(P
(N))である。例えば、試験核酸と参照核酸との比較における最小合計確率が約0.2
未満、より好ましくは、約0.01未満、および最も好ましくは、約0.001未満であ
る場合、核酸は参照配列と類似すると考えられる。
ht residue table)、12のギャップ長ペナルティおよび4のギャップペナルティを使用
して、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれたE. Meyers and W. Mil
ler, Comput. Appl. Biosci. 4:11-17, 1988のアルゴリズムを使用して決定することもで
きる。さらに、2つのアミノ酸配列間の同一性パーセントを、BLOSUM 62マトリ
ックスまたはPAM250マトリックス、ならびに16、14、12、10、8、6、ま
たは4のギャップ重量および1、2、3、4、5または6の長さ重量を使用して、GCG
ソフトウェアパッケージ中のGAPプログラム(University of Sout
h Floridaから利用可能)に組み込まれたNeedleman and Wunsch, (J. Mol. Bio
l. 48:444-453, 1970)のアルゴリズムを使用して決定することができる。
的に同一であることの別の指示は、以下に記載のように、第1の核酸によりコードされる
ポリペプチドが、第2の核酸によりコードされるポリペプチドに対して生じた抗体と免疫
学的に交差反応することである。かくして、例えば、2つのペプチドが保存的置換によっ
てのみ異なる場合、ポリペプチドは典型的には第2のポリペプチドと実質的に同一である
。2つの核酸配列が実質的に同一であることの別の指示は、以下に記載のように、2つの
分子またはその相補体が、ストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズすることで
ある。2つの核酸配列が実質的に同一であることのさらに別の指示は、同じプライマーを
使用してその配列を増幅することができることである。
鎖または二本鎖形態のデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチドおよびそのポリ
マーを指す。この用語は、合成である、天然である、および非天然である、参照核酸と類
似する結合特性を有する、ならびに参照ヌクレオチドと類似する様式で代謝される、公知
のヌクレオチド類似体または改変された骨格残基もしくは結合を含有する核酸を包含する
。そのような類似体の例としては、限定されるものではないが、ホスホロチオエート(ph
osphorothioate)、ホスホルアミデート(phosphoroamidate)、メチルホスホン酸、キラ
ル−メチルホスホン酸、2−O−メチルリボヌクレオチド、ペプチド核酸(PNA)が挙
げられる。
、縮重コドン置換)および相補配列、ならびに明示的に示される配列も暗示的に包含する
。特に、以下に詳述されるように、1または複数の選択された(または全ての)コドンの
第3の位置が混合塩基および/またはデオキシイノシン残基で置換された配列を作成する
ことにより、縮重コドン置換を達成することができる(Batzer et al., (1991) Nucleic
Acid Res. 19:5081; Ohtsuka et al., (1985) J. Biol. Chem. 260:2605-2608; およびRo
ssolini et al., (1994) Mol. Cell. Probes 8:91-98)。
(例えば、DNA)セグメント間の機能的関係を指す。典型的には、それは、転写される
配列に対する転写調節配列の機能的関係を指す。例えば、プロモーターまたはエンハンサ
ー配列が適切な宿主細胞または他の発現系においてコード配列の転写を刺激またはモジュ
レートする場合、それはコード配列に作動可能に連結されている。一般に、転写される配
列に作動可能に連結されたプロモーター転写調節配列は、転写される配列に対して物理的
に連続している、すなわち、それらはcis作用性である。しかしながら、エンハンサー
などのいくつかの転写調節配列は、それらが転写を増強するコード配列に対して物理的に
連続しているか、またはそれに近接して位置する必要はない。
明細書では互換的に使用される。この用語は、1または複数のアミノ酸残基が対応する天
然アミノ酸の人工化学模倣体であるアミノ酸ポリマー、ならびに天然アミノ酸ポリマーお
よび非天然アミノ酸ポリマーに適用される。別途指摘しない限り、特定のポリペプチド配
列は、保存的に改変されたそのバリアントも暗示的に包含する。
ば、哺乳動物および非哺乳動物、例えば、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ニワトリ
、両生類、および爬虫類を含む。注記しない限り、用語「患者」または「対象」は、互換
的に本明細書に使用される。
科、オルトポリオーマウイルス(Orthopolyomavirus)属の一員を指す。ポリオーマウイ
ルスは、約5,000塩基対のゲノムを有する20面体の非エンベロープ型二本鎖DNA
ウイルスである。それらは直径約40〜45nMの寸法である(Bennett et al., Microb
es and Infection. 2012:14(9):672-683)。
オルトポリオーマウイルス(Orthopolyomavirus)属の一員を指す。JCVは、BKVと
関連し、これも約5,000塩基対のゲノムを有する20面体の非エンベロープ型二本鎖
DNAウイルスである。それらは、直径約40〜45nMの寸法である(Johne et al.,
Arch. Virol. 2011;156(9):1627-1634)。
とは、主に、尿細管上皮における、ウイルス細胞病理学的変化およびウイルス遺伝子発現
を特徴とする、BKVによる溶解感染の結果生じる炎症性間質性ネフロパシーを指す。
す。「VP1五量体」は、VP1の5つの単量体から構成される。
体である。VLPは、72個のVP1五量体から構成される。VLPは、実際のウイルス
と構造的に非常に類似するが、マイナーキャプシドタンパク質(VP2およびVP3)な
らびにウイルスDNAゲノムを欠き、したがって、非感染性である。VLPは、ウイルス
エピトープが実際のウイルスと類似するコンフォメーションで提示されるため、有用であ
る。
間(50%)のシグナルを誘導する特定の抗体の濃度を指す。例えば、IC50は、VP
1抗原上の利用可能な結合部位の50%が占有される抗体の濃度である。
照と最大可能効果との間の中間(50%)の応答を誘導する特定の抗体の濃度を指す。例
えば、EC50は、ウイルス感染が50%中和される抗体の濃度である。
答を誘導する特定の抗体の濃度を指す。例えば、EC90は、ウイルス感染が90%中和
される抗体の濃度である。
染の阻害を指す。いかなる理論にも束縛されるものではないが、特定の抗体による中和の
機構は、ウイルスキャプシドタンパク質と、細胞表面受容体との相互作用の遮断または宿
主細胞の核へのウイルスゲノムの送達前の任意の段階の進入および輸送プロセスの破壊を
誘導することができる。
と」または「処置」とは、一態様では、疾患または障害を改善すること(すなわち、疾患
または少なくとも1つのその臨床症状の発生を減速させるか、または停止させるか、また
は軽減すること)を指す。別の態様では、「処置する」、「処置すること」または「処置
」とは、患者によって認識できないものを含む少なくとも1つの物理的パラメータを軽減
または改善することを指す。さらに別の態様では、「処置する」、「処置すること」また
は「処置」とは、疾患または障害を、物理的に(例えば、認識できる症状の安定化)、生
理的に(例えば、物理的パラメータの安定化)、またはその両方で調節することを指す。
進行を遅延させることを指す。
瘍サイズの低下、腫瘍成長の阻害、転移の防止、ウイルス、細菌、真菌または寄生虫感染
の阻害または防止)を得るのに十分な量を互換的に指す。いくつかの態様では、治療的に
許容される量は、望ましくない副作用を誘導しない、または引き起こさない。治療的に許
容される量を、最初は低用量を投与し、次いで、所望の効果が達成されるまでその用量を
徐々に増加させることにより決定することができる。「予防有効用量」および「治療有効
用量」の本開示の分子は、ポリオーマウイルス感染と関連する症状などの疾患症状の、そ
れぞれ、開始を防止するか、またはその重症度の低下をもたらし得る。
投与される活性薬剤を、同時に、または連続的に送達することができる。
本開示は、BKVに結合し、これを中和する抗体、抗体断片(例えば、抗原結合性断片
)を提供する。特に、本開示は、VP1タンパク質に結合し、そのような結合の際にウイ
ルス感染を中和する抗体および抗体断片(例えば、抗原結合性断片)に関する。さらに、
本開示は、望ましい薬物動態特性および他の望ましい属性を有し、かくして、BKウイル
ス関連ネフロパシー(例えば、BKVAN)の可能性を低減させる、またはそれを処置す
るために使用することができる抗体を提供する。本開示はさらに、抗体を含む医薬組成物
、ならびにポリオーマウイルス感染および関連障害の防止および処置のためにそのような
医薬組成物を作製し、使用する方法を提供する。
本開示は、VP1に特異的に結合する抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)
を提供する。本開示の抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)としては、限定さ
れるものではないが、以下の実施例に記載のように単離された、ヒトモノクローナル抗体
またはその断片が挙げられる。
ば、抗原結合性断片)であって、配列番号12、32、52、72、92、112、13
2、152、172、192、212、232、252、272、292、312、32
8、348、362、376、390、404、418、432、446、460、47
4、および488に記載のアミノ酸配列を有するVHドメインを含む、前記抗体または抗
体断片(例えば、抗原結合性断片)(表2)を提供する。本開示はまた、VP1に特異的
に結合する抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)であって、表2に列挙される
VH CDRのいずれか1つのアミノ酸配列を有するVH CDRを含む、前記抗体また
は抗体断片(例えば、抗原結合性断片)も提供する。特定の態様では、本開示は、VP1
に特異的に結合する抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)であって、以下の表
2に列挙されるVH CDRのいずれかのアミノ酸配列を有する1、2、3以上のVH
CDRを含む(またはあるいは、からなる)前記抗体を提供する。
であって、配列番号22、42、62、82、102、122、142、162、182
、202、222、242、262、282、302、320、338、355、369
、383、397、411、425、439、453、467、481、および495の
アミノ酸配列を有するVLドメインを含む前記抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性
断片)(表2)を提供する。本開示はまた、VP1に特異的に結合する抗体または抗体断
片(例えば、抗原結合性断片)であって、以下の表2に列挙されるVL CDRのいずれ
か1つのアミノ酸配列を有するVL CDRを含む、前記抗体または抗体断片(例えば、
抗原結合性断片)も提供する。特に、VP1に特異的に結合する抗体または抗体断片(例
えば、抗原結合性断片)であって、表2に列挙されるVL CDRのいずれかのアミノ酸
配列を有する1、2、3以上のVL CDRを含む(またはあるいは、からなる)前記抗
体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)を提供する。
2に記載の配列に記載のCDR領域と、CDR領域において少なくとも60、70、80
、90または95パーセントの同一性を有するアミノ酸を含む。いくつかの態様では、そ
れは、表2に記載の配列に記載のCDR領域と比較した場合、1、2、3、4または5個
以下のアミノ酸がCDR領域中で変異しているアミノ酸配列変異体を含む。
長軽鎖をコードする核酸配列も提供する。そのような核酸配列を、哺乳動物細胞中での発
現のために最適化することができる。
が、表2に記載の配列に対する少なくとも60、70、80、90または95パーセント
の同一性を有するものが挙げられる。いくつかの態様では、それは、表2に記載の配列に
記載の可変領域と比較した場合、1、2、3、4または5個以下のアミノ酸が可変領域中
で変異しているが、実質的に同じ治療活性を保持するアミノ酸配列変異体を含む。
、および完全長重鎖配列(アミノ酸配列およびアミノ酸配列をコードするヌクレオチド配
列)を「混合および一致」させて、他のVP1結合抗体を作出することができる。そのよ
うな「混合および一致」したVP1結合抗体を、当業界で公知の結合アッセイ(例えば、
ELISA、および実施例のセクションに記載の他のアッセイ)を使用して試験すること
ができる。これらの鎖を混合および一致させる場合、特定のVH/VL対に由来するVH
配列を、構造的に類似するVH配列と置き換えるべきである。同様に、特定の完全長重鎖
/完全長軽鎖対に由来する完全長重鎖配列を、構造的に類似する完全長重鎖配列と置き換
えるべきである。同様に、特定のVH/VL対に由来するVL配列を、構造的に類似する
VL配列と置き換えるべきである。同様に、特定の完全長重鎖/完全長軽鎖対に由来する
完全長軽鎖配列を、構造的に類似する完全長軽鎖配列と置き換えるべきである。したがっ
て、一態様では、本開示は、抗体がVP1に特異的に結合する、配列番号12、32、5
2、72、92、112、132、152、172、192、212、232、252、
272、292、312、328、348、362、376、390、404、418、
432、446、460、474、および488(表2)からなる群から選択されるアミ
ノ酸配列を含む重鎖可変領域;および配列番号22、42、62、82、102、122
、142、162、182、202、222、242、262、282、302、320
、338、355、369、383、397、411、425、439、453、467
、481および495(表2)からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領
域を有する単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合領域を提供する。
34、154、174、194、214、234、254、274、294、313およ
び330;からなる群から選択される哺乳動物細胞中での発現のために最適化されたアミ
ノ酸配列を含む完全長重鎖;および配列番号24、44、64、84、104、124、
144、164、184、204、224、244、264、284、304、321、
340からなる群から選択される哺乳動物細胞中での発現のために最適化されたアミノ酸
配列を含む完全長軽鎖を有する単離されたモノクローナル抗体;または(ii)その抗原
結合ポーションを含む機能的タンパク質を提供する。
R3、またはその組合せを含むVP1結合抗体を提供する。抗体のVH CDR1のアミ
ノ酸配列を、配列番号6、26、46、66、86、106、126、146、166、
186、206、226、246、266、286、306、322、342、356、
370、384、398、412、426、440、454、468、および482に示
す。抗体のVH CDR2のアミノ酸配列を、配列番号7、27、47、67、87、1
07、127、147、167、187、207、227、247、267、287、3
07、323、343、357、371、385、399、413、427、441、4
55、469、および483に示す。抗体のVH CDR3のアミノ酸配列を、配列番号
8、28、48、68、88、108、128、148、168、188、208、22
8、248、268、288、308、324、344、358、372、386、40
0、414、428、442、456、470、および484に示す。抗体のVL CD
R1のアミノ酸配列を、配列番号16、36、56、76、96、116、136、15
6、176、196、216、236、256、276、296、314、332、34
9、363、377、391、405、419、433、447、461、475および
489に示す。抗体のVL CDR2のアミノ酸配列を、配列番号17、37、57、7
7、97、117、137、157、177、197、217、237、257、277
、297、315、333、350、364、378、392、406、420、434
、448、462、476および490に示す。抗体のVL CDR3のアミノ酸配列を
、配列番号18、38、58、78、98、118、138、158、178、198、
218、238、258、278、298、316、334、351、365、379、
393、407、421、435、449、463、477および491に示す。
、2および3領域によって提供されることを考慮して、VH CDR1、2および3配列
と、VL CDR1、2および3配列とを、「混合および一致」させることができる(す
なわち、異なる抗体に由来するCDRを混合および一致させることができるが、それぞれ
の抗体はVH CDR1、2および3と、VL CDR1、2および3とを含有し、他の
VP1結合結合分子を作出しなければならない)。そのような「混合および一致」したV
P1結合抗体を、当業界で公知の結合アッセイおよび実施例に記載のアッセイ(例えば、
ELISA)を使用して試験することができる。VH CDR配列を混合および一致させ
る場合、特定のVH配列に由来するCDR1、CDR2および/またはCDR3配列を、
構造的に類似するCDR配列(複数可)と置き換えるべきである。同様に、VL CDR
配列を混合および一致させる場合、特定のVL配列に由来するCDR1、CDR2および
/またはCDR3配列を、構造的に類似するCDR配列(複数可)と置き換えるべきであ
る。新規VHおよびVL配列を、1または複数のVHおよび/またはVL CDR領域配
列を、本開示のモノクローナル抗体について本明細書に示されるCDR配列に由来する構
造的に類似する配列と置換することにより、新しいVHおよびVL配列を作出することが
できることが当業者には容易に明らかである。
66、86、106、126、146、166、186、206、226、246、26
6、286、306、322、342、356、370、384、398、412、42
6、440、454、468、および482;からなる群から選択されるアミノ酸配列を
含む重鎖CDR1;配列番号7、27、47、67、87、107、127、147、1
67、187、207、227、247、267、287、307、323、343、3
57、371、385、399、413、427、441、455、469、および48
3;からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖CDR2;配列番号8、28、4
8、68、88、108、128、148、168、188、208、228、248、
268、288、308、324、344、358、372、386、400、414、
428、442、456、470、および484;からなる群から選択されるアミノ酸配
列を含む重鎖CDR3;配列番号16、36、56、76、96、116、136、15
6、176、196、216、236、256、276、296、314、332、34
9、363、377、391、405、419、433、447、461、475および
489;からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR1;配列番号17、3
7、57、77、97、117、137、157、177、197、217、237、2
57、277、297、315、333、350、364、378、392、406、4
20、434、448、462、476および490;からなる群から選択されるアミノ
酸配列を含む軽鎖CDR2;ならびに配列番号18、38、58、78、98、118、
138、158、178、198、218、238、258、278、298、316、
334、351、365、379、393、407、421、435、449、463、
477および491;からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖CDR3を含む
、単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合領域を提供する。
抗体断片(例えば、抗原結合性断片)である。
本開示は、VP1のエピトープに結合する抗体および抗体断片(例えば、抗原結合性断
片)を提供する。ある特定の態様では、抗体および抗体断片は、4種全てのBKV血清型
および/またはJCV内の同じエピトープに結合することができる。
断片(例えば、抗原結合性断片)も提供する。したがって、さらなる抗体および抗体断片
(例えば、抗原結合性断片)を、結合アッセイにおいて他の抗体と交差競合する(例えば
、統計的に有意な様式で、その結合を競合的に阻害する)その能力に基づいて同定するこ
とができる。VP1(例えば、ヒトBKVまたはJCV VP1)への本開示の抗体およ
び抗体断片(例えば、抗原結合性断片)の結合を阻害する試験抗体の能力は、試験抗体が
VP1への結合について抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)と競合すること
ができることを示す;そのような抗体は、非限定的理論によれば、それが競合する抗体ま
たは抗体断片(例えば、抗原結合性断片)と、VP1上の同じか、または関連する(例え
ば、構造的に類似するか、または空間的に近い)エピトープに結合することができる。あ
る特定の態様では、本開示の抗体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)と同じVP
1上のエピトープに結合する抗体は、ヒトまたはヒト化モノクローナル抗体である。その
ようなヒトまたはヒト化モノクローナル抗体を、本明細書に記載のように調製および単離
することができる。
本開示は、特異的抗VP1抗体を開示した。これらの抗体は、例えば、抗体の特性を改
善するための、VHおよび/またはVL内のフレームワーク残基に対する改変をさらに含
む改変された抗体またはその抗原結合性断片を含んでもよい。典型的には、そのようなフ
レームワーク改変を行って、抗体の免疫原性を低下させる。例えば、1つの手法は、1ま
たは複数のフレームワーク残基を、対応する生殖系列配列に「復帰変異」させることであ
る。より特には、体細胞変異を受けた抗体は、抗体が誘導される生殖系列配列とは異なる
フレームワーク残基を含有してもよい。抗体フレームワーク配列を、抗体が誘導される生
殖系列配列と比較することにより、そのような残基を同定することができる。フレームワ
ーク領域配列をその生殖系列構成に戻すために、例えば、部位特異的突然変異誘発により
、体細胞変異を生殖系列配列に「復帰変異」させることができる。そのような「復帰変異
」した抗体もまた、包含されることが意図される。
複数のCDR領域内の1または複数の残基を変異させて、T細胞エピトープを除去するこ
とによって、抗体の潜在的な免疫原性を低下させることを含む。この手法はまた、「脱免
疫化」とも呼ばれ、Carr et al.による米国特許出願公開第2003/0153043号
明細書にさらに詳細に記載されている。
Fc領域内に改変を含む、典型的には、血清半減期、補体固定化、Fc受容体結合、およ
び/または抗原依存的細胞性細胞毒性などの、抗体の1または複数の機能的特性を変化さ
せるように、抗体を操作することができる。さらに、抗体を化学的に改変する(例えば、
1もしくは複数の化学的部分を抗体に結合することができる)か、または改変してそのグ
リコシル化を変化させ、再度、抗体の1または複数の機能的特性を変化させることができ
る。これらの態様はそれぞれ、以下にさらに詳細に記載される。
たは減少するように、CH1のヒンジ領域を改変する。この手法は、Bodmer et al.によ
る米国特許第5,677,425号明細書にさらに記載されている。CH1のヒンジ領域
中のシステイン残基の数を変化させて、例えば、軽鎖および重鎖の集合を容易にするか、
または抗体の安定性を増加もしくは減少させる。
る。より特には、抗体が天然のFc−ヒンジドメインSpA結合と比較して弱いスタフィ
ロコッカス(Staphylococcyl)タンパク質A(SpA)結合を有するように、1または複
数のアミノ酸変異をFc−ヒンジ断片のCH2−CH3ドメイン境界領域中に導入する。
この手法は、Ward et al.による米国特許第6,165,745号明細書にさらに詳細に
記載されている。
えて、抗体のエフェクター機能を変化させることにより、Fc領域を変化させる。例えば
、抗体がエフェクターリガンドに対する変化した親和性を有するが、親抗体の抗原結合能
力を保持するように、1または複数のアミノ酸を、異なるアミノ酸残基と置き換えること
ができる。親和性を変化させるエフェクターリガンドは、例えば、Fc受容体または補体
のC1成分であってもよい。この手法は、例えば、両方ともWinter et al.による米国特
許第5,624,821号明細書および第5,648,260号明細書に記載されている
。
れる補体依存的細胞毒性(CDC)を有するように、アミノ酸残基から選択される1また
は複数のアミノ酸を、異なるアミノ酸残基と置き換えることができる。
る抗体の能力を変化させる。この手法は、例えば、Bodmer et al.によるPCT国際公開
第94/29351号パンフレットに記載されている。特定の態様では、本開示の抗体ま
たはその抗原結合性断片の1または複数のアミノ酸を、1または複数のアロタイプアミノ
酸残基により、IgG1サブクラスおよびカッパアイソタイプに置き換える。アロタイプ
アミノ酸残基としては、限定されるものではないが、IgG1、IgG2およびIgG3
サブクラスの重鎖の定常領域、ならびにJefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009)によ
り記載されたようなカッパアイソタイプの軽鎖の定常領域も挙げられる。
媒介する抗体の能力を増加させる、および/または1もしくは複数のアミノ酸を改変する
ことによりFcγ受容体に対する抗体の親和性を増加させる。この手法は、例えば、Pres
taによるPCT国際公開第00/42072号パンフレットに記載されている。さらに、
FcγRI、FcγRII、FcγRIIIおよびFcRnに対するヒトIgG1上の結
合部位がマッピングされており、結合が改善されたバリアントが記載されている(Shield
s et al., J. Biol. Chem. 276:6591-6604, 2001を参照されたい)。
作製することができる(すなわち、抗体はグリコシル化を欠く)。グリコシル化を変化さ
せて、例えば、「抗原」に対する抗体の親和性を増加させることができる。そのような炭
水化物改変を、例えば、抗体配列内の1または複数のグリコシル化部位を変化させること
により達成することができる。例えば、1または複数の可変領域フレームワークグリコシ
ル化部位の除去をもたらす1または複数のアミノ酸置換を作製することによって、その部
位でのグリコシル化を除去することができる。そのような無グリコシル化は、抗原に対す
る抗体の親和性を増加させることができる。そのような手法は、例えば、Co et al.によ
る米国特許第5,714,350号明細書および第6,350,861号明細書に記載さ
れている。
クティングGlcNac構造が増加した抗体などの、変化した型のグリコシル化を有する
抗体を作製することができる。そのような変化したグリコシル化パターンは、抗体のAD
CC能力を増加させることが証明されている。そのような炭水化物改変を、例えば、グリ
コシル化機構が変化した宿主細胞中で抗体を発現させることにより達成することができる
。グリコシル化機構が変化した細胞は当業界で記載されており、組換え抗体を発現させる
ことによって、グリコシル化が変化した抗体を生成する宿主細胞として使用することがで
きる。例えば、Hang et al.による欧州特許第1,176,195号明細書は、フコシル
トランスフェラーゼをコードするFUT8遺伝子が機能的に破壊された細胞系を記載し、
そのような細胞系中で発現された抗体は低グリコシル化を示す。PrestaによるPCT国際
公開第03/035835号パンフレットは、フコースをAsn(297)に連結された
炭水化物に結合させる能力が低下し、その宿主細胞中で発現される抗体の低フコシル化を
ももたらす、バリアントCHO細胞系、Lecl3細胞を記載している(Shields et al.
, (2002) J. Biol. Chem. 277:26733-26740も参照されたい)。Umama et al.によるPC
T国際公開第99/54342号パンフレットは、操作された細胞系中で発現される抗体
が、抗体のADCC活性の増加をもたらすバイセクティングGlcNac構造の増加を示
すように、糖タンパク質改変グリコシルトランスフェラーゼ(例えば、ベータ(1,4)
−NアセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII))を発現するよ
うに操作された細胞系を記載している(Umana et al., Nat. Biotech. 17:176-180, 1999
も参照されたい)。
可能である。例えば、Wardの米国特許第6,277,375号明細書に記載のような、1
または複数の以下の変異を導入することができる:T252L、T254S、T256F
。あるいは、生物学的半減期を増加させるために、Presta et al.による米国特許第5,
869,046号明細書および第6,121,022号明細書に記載のように、IgGの
Fc領域のCH2ドメインの2つのループから取られたサルベージ受容体結合エピトープ
を含有するように、抗体をCH1またはCL領域内で変化させることができる。
胞との最小の相互作用を有する「Fcサイレント」抗体をもたらす。一般に、「IgG
Fc領域」を使用して、天然配列Fc領域およびバリアントFc領域などの、免疫グロブ
リン重鎖のC末端領域を定義する。ヒトIgG重鎖Fc領域は一般に、IgG抗体の位置
C226から、または位置P230からカルボキシル末端までのアミノ酸残基を含むと定
義される。Fc領域中の残基の番号は、KabatのEUインデックスのものである。F
c領域のC末端リシン(残基K447)を、例えば、抗体の生成または精製の間に除去す
ることができる。
ができ、当業界で記載されている:LALAおよびN297A(Strohl, W., 2009, Curr
. Opin. Biotechnol. vol. 20(6):685-691);ならびにD265A(Baudino et al., 20
08, J. Immunol. 181 : 6664-69)、Heusser et al.,国際公開第2012065950号
パンフレットも参照されたい。サイレントFc IgG1抗体の例は、IgG1 Fcア
ミノ酸配列中にL234AおよびL235A変異を含むLALA変異体である。サイレン
トIgG1抗体の別の例は、DAPA(D265A、P329A)変異(米国特許第6,
737,056号明細書)である。別のサイレントIgG1抗体は、N297A変異を含
み、無グリコシル化/非グリコシル化抗体をもたらす。
抗体が特異的細胞溶解が50%未満(ADCC活性が低い)であるか、または特異的細胞
溶解が1%未満(ADCC活性がない)であることを意味する。
限定されるものではないが、組換え発現、化学的合成、および抗体四量体の酵素的消化
などの、当業界で公知の任意の手段によって抗VP1抗体およびその抗体断片(例えば、
抗原結合性断片)を生成することができるが、完全長モノクローナル抗体を、例えば、ハ
イブリドーマまたは組換え生成によって取得することができる。組換え発現は、当業界で
公知の任意の適切な宿主細胞、例えば、哺乳動物宿主細胞、細菌宿主細胞、酵母宿主細胞
、昆虫宿主細胞などに由来するものであってよい。
記載のような重鎖もしくは軽鎖可変領域または相補性決定領域を含むセグメントをコード
するポリヌクレオチドをさらに提供する。いくつかの態様では、重鎖可変領域をコードす
るポリヌクレオチドは、配列番号13、33、53、73、93、113、133、15
3、173、193、213、233、253、273および293からなる群から選択
されるポリヌクレオチドとの少なくとも85%、89%、90%、91%、92%、93
%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の核酸配列同一
性を有する。いくつかの態様では、軽鎖可変領域をコードするポリヌクレオチドは、配列
番号23、43、63、83、103、123、143、163、183、203、22
3、243、263、283および303からなる群から選択されるポリヌクレオチドと
の少なくとも85%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96
%、97%、98%、99%、または100%の核酸配列同一性を有する。
5、75、95、115、135、155、175、195、215、235、255、
275および295のポリヌクレオチドとの少なくとも85%、89%、90%、91%
、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%
の核酸配列同一性を有する。いくつかの態様では、軽鎖をコードするポリヌクレオチドは
、配列番号25、45、65、85、105、125、145、165、185、205
、225、245、265、285および305のポリヌクレオチドとの少なくとも85
%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98
%、99%、または100%の核酸配列同一性を有する。
それらはまた、抗体の可変領域と定常領域との両方をコードしてもよい。いくつかのポリ
ヌクレオチド配列は、例示的抗VP1抗体の1つの重鎖と軽鎖の両方の可変領域を含むポ
リペプチドをコードする。いくつかの他のポリヌクレオチドは、マウス抗体の1つの重鎖
と軽鎖の可変領域とそれぞれ実質的に同一である2つのポリペプチドセグメントをコード
する。
(例えば、以下の実施例に記載の配列)のde novo固相DNA合成によるか、また
はPCR突然変異誘発により生成することができる。Narang et al., Meth. Enzymol. 68
:90, 1979のホスホトリエステル法;Brown et al., Meth. Enzymol. 68:109, 1979のホス
ホジエステル法;Beaucage et al., Tetra. Lett., 22:1859, 1981のジエチルホスホロア
ミダイト法;および米国特許第4,458,066号明細書の固相支持体法などの、当業
界で公知の方法により、核酸の直接化学合成を達成することができる。PCRによるポリ
ヌクレオチド配列への変異の導入を、例えば、PCR Technology: Principles and Applica
tions for DNA Amplification, H.A. Erlich (Ed.), Freeman Press, NY, NY, 1992; PCR
Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis et al. (Ed.), Academic Pr
ess, San Diego, CA, 1990; Mattila et al., Nucleic Acids Res. 19:967, 1991; およ
びEckert et al., PCR Methods and Applications 1:17, 1991に記載のように実施するこ
とができる。
おいて提供される。様々な発現ベクターを使用して、抗VP1抗体鎖または結合断片をコ
ードするポリヌクレオチドを発現させることができる。ウイルスに基づく発現ベクターと
非ウイルス発現ベクターの両方を使用して、哺乳動物宿主細胞中で抗体を生成することが
できる。非ウイルスベクターおよび系としては、典型的には、タンパク質またはRNAを
発現させるための発現カセットを含む、プラスミド、エピソームベクター、およびヒト人
工染色体(例えば、Harrington et al., Nat Genet 15:345, 1997を参照されたい)が挙
げられる。例えば、哺乳動物(例えば、ヒト)細胞中での抗VP1ポリヌクレオチドおよ
びポリペプチドの発現にとって有用な非ウイルスベクターとしては、pThioHis
A、BおよびC、pcDNA3.1/His、pEBVHisA、BおよびC(Invi
trogen、San Diego、CA)、MPSVベクター、ならびに他のタンパク
質を発現させるための当業界で公知のいくつかの他のベクターが挙げられる。有用なウイ
ルスベクターとしては、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペ
スウイルスに基づくベクター、SV40に基づくベクター、パピローマウイルス、HBP
エプスタイン・バーウイルス、ワクシニアウイルスベクターおよびセムリキ森林熱ウイル
ス(SFV)が挙げられる。Brent et al., supra; Smith, Annu. Rev. Microbiol. 49:8
07, 1995; およびRosenfeld et al., Cell 68:143, 1992を参照されたい。
には、発現ベクターは、抗VP1抗体鎖または断片をコードするポリヌクレオチドに作動
可能に連結されるプロモーターおよび他の調節配列(例えば、エンハンサー)を含有する
。いくつかの態様では、誘導性プロモーターを使用して、誘導条件下以外では挿入された
配列の発現を防止する。誘導性プロモーターとしては、例えば、アラビノース、lacZ
、メタロチオネインプロモーターまたは熱ショックプロモーターが挙げられる。形質転換
された生物の培養物を、発現生成物が宿主細胞によってより良好に許容されるコード配列
について集団を偏らせることなく、非誘導条件下で拡張することができる。プロモーター
に加えて、他の調節エレメントも、抗VP1抗体鎖または断片の効率的発現にとって必要
とされるか、または望まれる。これらのエレメントは、典型的には、ATG開始コドンお
よび隣接するリボソーム結合部位または他の配列を含む。さらに、発現の効率を、使用に
おいて細胞系にとって適切なエンハンサーの含有により増強することができる(例えば、
Scharf et al., Results Probl. Cell Differ. 20:125, 1994;およびBittner et al., M
eth. Enzymol., 153:516, 1987を参照されたい)。例えば、SV40エンハンサーまたは
CMVエンハンサーを使用して、哺乳動物宿主細胞中での発現を増加させることができる
。
の融合タンパク質を形成するための分泌シグナル配列位置も提供することができる。より
頻繁には、挿入される抗VP1抗体配列を、ベクター中に含有させる前にシグナル配列に
連結する。抗VP1抗体軽鎖および重鎖可変ドメインをコードする配列を受容するために
使用されるベクターは、その定常領域または部分もコードすることがある。そのようなベ
クターにより、定常領域との融合タンパク質としての可変領域の発現が可能になり、それ
により、無傷抗体またはその断片の生成がもたらされる。典型的には、そのような定常領
域はヒトである。
よい。大腸菌(E.coli)は、本開示のポリヌクレオチドをクローニングし、発現させるの
に有用な1つの原核宿主である。使用にとって好適な他の微生物宿主としては、バチルス
・サブチリス(Bacillus subtilis)などの桿菌、ならびにサルモネラ(Salmonella)、
セラチア(Serratia)、および様々なシュードモナス(Pseudomonas)種などの他の腸内
細菌科が挙げられる。これらの原核宿主においては、当業者であれば、典型的には宿主細
胞と適合する発現制御配列(例えば、複製起点)を含有する発現ベクターを作製すること
もできる。さらに、ラクトースプロモーター系、トリプトファン(trp)プロモーター
系、ベータ−ラクタマーゼプロモーター系、またはラムダファージに由来するプロモータ
ー系などの、任意数の様々な周知のプロモーターが存在する。プロモーターは、典型的に
は、任意選択でオペレーター配列と共に発現を制御し、転写および翻訳を開始および完了
させるためのリボソーム結合部位配列などを有する。酵母などの他の微生物を使用して、
抗VP1ポリペプチドを発現させることもできる。バキュロウイルスベクターと組み合わ
せた昆虫細胞を使用することもできる。
よび生成させる。例えば、それらは、内因性免疫グロブリン遺伝子を発現するハイブリド
ーマ細胞系(例えば、実施例に記載のミエローマハイブリドーマクローン)または外因性
発現ベクターを担持する哺乳動物細胞系であってもよい。これらのものは、任意の正常な
死滅する、または正常もしくは異常な不死の動物もしくはヒト細胞を含む。例えば、CH
O細胞系、様々なCOS細胞系、HeLa細胞、ミエローマ細胞系、形質転換されたB細
胞およびハイブリドーマなどの、無傷の免疫グロブリンを分泌することができるいくつか
の好適な宿主細胞系が開発されている。ポリペプチドを発現させるための哺乳動物組織細
胞培養の使用は、例えば、Winnacker, From Genes to Clones, VCH Publishers, N.Y., N
.Y., 1987で一般的に考察されている。哺乳動物宿主細胞のための発現ベクターは、複製
起点、プロモーター、およびエンハンサーなどの発現制御配列(例えば、Queen et al.,
Immunol. Rev. 89:49-68, 1986を参照されたい)、ならびにリボソーム結合部位、RNA
スプライス部位、ポリアデニル化部位、および転写ターミネーター配列などの必要なプロ
セッシング情報部位を含んでもよい。これらの発現ベクターは通常、哺乳動物遺伝子また
は哺乳動物ウイルスから誘導されるプロモーターを含有する。好適なプロモーターは、構
成的である、細胞型特異的である、段階特異的である、および/またはモジュレート可能
もしくは調節可能であってもよい。有用なプロモーターとしては、限定されるものではな
いが、メタロチオネインプロモーター、構成的アデノウイルス主要後期プロモーター、デ
キサメタゾン誘導性MMTVプロモーター、SV40プロモーター、MRP polII
Iプロモーター、構成的MPSVプロモーター、テトラサイクリン誘導性CMVプロモー
ター(ヒト極初期CMVプロモーターなど)、構成的CMVプロモーター、および当業界
で公知のプロモーター−エンハンサーの組合せが挙げられる。
主の型に応じて変化する。例えば、原核細胞のためには塩化カルシウムトランスフェクシ
ョンが一般的に使用されるが、他の細胞宿主のためにはリン酸カルシウム処理またはエレ
クトロポレーションを使用してもよい(一般的には、Sambrook et al., supraを参照され
たい)。他の方法としては、例えば、エレクトロポレーション、リン酸カルシウム処理、
リポソーム媒介性形質転換、インジェクションおよびマイクロインジェクション、弾道法
、ビロソーム、イムノリポソーム、ポリカチオン:核酸コンジュゲート、ネイキッドDN
A、人工ビリオン、ヘルペスウイルス構造タンパク質VP22との融合(Elliot and O'H
are, Cell 88:223, 1997)、DNAの薬剤増強性取込み、およびex vivoでの形質
導入が挙げられる。組換えタンパク質の長期的な、高収率の生成のためには、安定な発現
が望ましいことが多い。例えば、抗VP1抗体鎖または結合断片を安定に発現する細胞系
を、ウイルスの複製起点または内因性発現エレメントと、選択マーカー遺伝子とを含有す
る発現ベクターを使用して調製することができる。ベクターの導入後、細胞を富化培地中
で1〜2日間成長させた後、選択培地に切替えることができる。選択マーカーの目的は、
選択に対する耐性を付与することであり、その存在により、選択培地中で導入された配列
を上手く発現する細胞の成長が可能となる。耐性の安定にトランスフェクトされた細胞を
、細胞型にとって適切な組織培養技術を使用して増殖させることができる。
本開示の抗体、抗体断片(例えば、抗原結合性断片)は、限定されるものではないが、
ポリオーマウイルス感染および疾患などの様々な適用において有用である。ある特定の態
様では、抗体、抗体断片(例えば、抗原結合性断片)は、BKVまたはJCV感染の中和
およびBKウイルスネフロパシー、例えば、BKVANの防止または処置にとって有用で
ある。使用方法は、in vitro、ex vivo、またはin vivoでの方法
であってもよい。
在を検出するのに有用である。本明細書で使用される用語「検出すること」は、定量的ま
たは定性的検出を包含する。ある特定の態様では、生物試料は細胞または組織を含む。あ
る特定の態様では、そのような組織は、他の組織と比較してより高いレベルでBKVを発
現する正常および/またはがん性組織を含む。
定の態様では、この方法は、抗体の抗原への結合を可能にする条件下で、生物試料を抗V
P1抗体と接触させること、および抗体と抗原との間で複合体が形成されるかどうかを検
出することを含む。生物試料は、限定されるものではないが、尿または血液試料を含んで
もよい。
ある特定の態様では、この方法は、試験細胞を抗VP1抗体と接触させること;抗VP1
抗体のBKウイルスへの結合を検出することにより試験細胞中でのBKウイルスの発現レ
ベルを決定すること(定量的または定性的に);および試験細胞中での感染のレベルを、
対照細胞(例えば、試験細胞と同じ組織起源の正常細胞または非BKウイルス感染細胞)
中でのBKウイルスの感染のレベルと比較することを含み、対照細胞と比較して、試験細
胞中でのBKウイルスの存在のレベルが高い場合、BKウイルスによる感染と関連する障
害の存在を示す。ある特定の態様では、試験細胞は、BKウイルス感染を有することが疑
われる個体から得られる。
抗VP1抗体の結合を検出することを含む。BKV感染細胞への抗VP1抗体の結合を検
出するための例示的アッセイは、「FACS」アッセイである。
うな方法としては、限定されるものではないが、ウェスタンブロット、ラジオイムノアッ
セイ、ELISA(酵素結合免疫吸着アッセイ)、「サンドイッチ」イムノアッセイ、免
疫沈降アッセイ、蛍光イムノアッセイ、プロテインAイムノアッセイ、および免疫組織化
学(IHC)などの、当業界で周知である抗原結合アッセイが挙げられる。
いが、直接検出される標識または部分(蛍光、発色、高電子密度、化学発光、および放射
性標識など)、ならびに例えば、酵素反応または分子相互作用を介して間接的に検出され
る、酵素またはリガンドなどの部分が挙げられる。
液中で遊離したままである任意のBKVまたはJCVタンパク質から抗VP1抗体を分離
することを必要とする。これは、水に不溶性のマトリックスもしくは表面への吸着(Benn
ich et al, 米国特許第3,720,760号明細書)により、もしくは共有カップリン
グ(例えば、グルタルアルデヒド架橋を使用する)により、アッセイ手順の前に抗VP1
抗体を不溶化することによって、または例えば、免疫沈降により、抗VP1抗体とBKV
またはJCVタンパク質との複合体の形成後に抗VP1抗体を不溶化することによって、
都合良く達成される。
加えて、本開示の抗VP1抗体を使用して実行することができる。
ことによって、疾患を処置することを含む、疾患を処置する、その可能性を低減する、ま
たはそれを改善する方法を提供する。ある特定の態様では、抗体、抗体断片(例えば、抗
原結合性断片)を使用して処置される疾患は、BKウイルスまたはJCウイルス感染であ
る。処置および/または防止することができるBKVおよびJCV疾患の例としては、限
定されるものではないが、ネフロパシー、出血性膀胱炎、進行性多巣性白質脳症(PML
)、間質性腎疾患、尿管狭窄、顆粒細胞ニューロパシー(GCN)、血管炎、大腸炎、網
膜炎、髄膜炎、および免疫再構築症候群(IRIS)が挙げられる。ある特定の態様では
、感染は、抗VP1抗体、抗体断片(例えば、抗原結合性断片)が特異的に結合すること
ができるBKVまたはJCV発現細胞を特徴とする。
含む、BKウイルス感染およびBKVANを処置する方法を提供する。ある特定の態様で
は、対象はヒトである。
体または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)を投与することを含む。ある特定の態様で
は、対象はヒトである。ある特定の態様では、対象は免疫抑制されている。免疫抑制され
た対象について、免疫抑制の量は、抗VP1抗体の治療効果に起因して増加または減少し
てもよい。
している。一般的な集団におけるBK感染の発生率は高いため、腎臓移植の場合、腎臓を
受け入れる患者がBKウイルス陽性であるか、または腎臓を提供するドナーがBKウイル
ス陽性であるか、または両者がBKウイルス陽性である確率は高い。BKVANを防止す
るために、腎臓のドナーまたは移植レシピエントの血清反応陽性に応じて、腎臓移植手順
の前および/または後に、抗VP1抗体を腎臓移植レシピエントに投与することができる
。別の態様では、ウイルスが尿中で検出される場合(ウイルス尿症)、またはウイルスが
血液中で検出される場合(ウイルス血症)、抗VP1抗体を患者に投与することができる
。
結合性断片)の適切な用量は、処置しようとする感染の種類、感染の重症度および経過、
感染の応答性、療法に対するウイルス耐性の生成、以前の療法、患者の病歴などの様々な
因子に依存する。抗体を1回で、または数日から数カ月継続する一連の処置にわたって、
または治癒が行われるか、もしくは感染の縮小(例えば、ウイルス尿症または腎臓に対す
るウイルスによる損傷の減少)が達成されるまで投与することができる。最適な投薬スケ
ジュールは、患者の体内での薬物蓄積の測定値から算出することができ、個々の抗体、ま
たは抗体断片(例えば、抗原結合性断片)の相対的効力に応じて変化する。ある特定の態
様では、用量は0.01mg〜10mg(例えば、0.01mg、0.05mg、0.1
mg、0.5mg、1mg、2mg、3mg、4mg、5mg、7mg、8mg、9mg
、または10mg)/kg体重であり、1日、1週間、1カ月または1年に1回またはそ
れ以上投与することができる。ある特定の態様では、本開示の抗体、または抗体断片(例
えば、抗原結合性断片)は、2週間毎に1回または3週間毎に1回投与される。処置する
医師であれば、体液または組織中での測定された半減期および抗体濃度に基づいて、投与
のための反復速度を見積もることができる。
ある特定の例では、本開示の抗体、または抗体断片(例えば、抗原結合性断片)を、他
の抗ウイルス剤、抗アレルギー剤、抗嘔吐剤(または制吐剤)、疼痛緩和剤、細胞保護剤
、免疫抑制剤、およびその組合せなどの他の治療剤と組み合わせる。
たは2つ以上の治療剤を同時に独立に、もしくは特に、組合せパートナーが協調的な、例
えば、相乗効果を示すことができる時間間隔内で別々に投与することができる非固定的組
合せもしくは組み合わせ投与のための部分のキットを指す。
上の治療剤の投与を指す。そのような投与は、固定比の活性成分を有する単一のカプセル
などの、実質的に同時的な様式でのこれらの治療剤の同時投与を包含する。あるいは、そ
のような投与は、それぞれの活性成分について、複数の、または別々の容器(例えば、カ
プセル、粉末、および液体)中での同時投与を包含する。粉末および/または液体を、投
与前に所望の用量に再構成または希釈することができる。さらに、そのような投与はまた
、ほぼ同時に、または異なる時間に、連続的様式でのそれぞれの種類の治療剤の使用も包
含する。いずれかの場合、処置レジメンは、本明細書に記載の状態または障害の処置にお
いて組合せ薬物の有益な効果を提供する。
わち、活性成分を一緒に使用した場合に達成される効果は、化合物を別々に使用すること
から得られる効果の合計よりも大きい。活性成分が(1)組み合わせた単位用量製剤中で
同時製剤化および投与されるか、もしくは同時に送達される;(2)別々の製剤として交
互に、もしくは同時に送達される;または(3)いくつかの他のレジメンによるものであ
る場合、相乗効果を達成することができる。交互療法において送達される場合、化合物が
例えば、別々の注射筒中の異なる注射液により連続的に投与または送達される場合、相乗
効果を達成することができる。一般に、交互療法中では、有効用量の各活性成分は連続的
に、すなわち、順次投与されるが、組合せ療法においては、有効用量の2つ以上の活性成
分は一緒に投与される。
ることによってBKVまたはJCV感染を処置する方法を提供する。抗VP1抗体は、予
防的に作用して、移植前または移植後の免疫抑制療法の結果生じる、BKVもしくはJC
V一次感染またはウイルス再活性化を中和する。免疫抑制療法の例としては、限定される
ものではないが、モノホスフェートデヒドロゲナーゼ阻害剤、プリン合成阻害剤、カルシ
ニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤が挙げられる。免疫抑制療法剤の特定例としては
、限定されるものではないが、ミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール
酸ナトリウム、アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスおよびシクロスポリンが挙げ
られる。
抗VP1抗体を含む医薬組成物または滅菌組成物を調製するために、本開示の抗体を、
薬学的に許容される担体または賦形剤と混合する。組成物は、BKVまたはJCV感染を
中和するのに好適である1または複数の他の治療剤をさらに含有してもよい。
ン、または懸濁液の形態で生理的に許容される担体、賦形剤、または安定化剤と混合する
ことにより調製することができる(例えば、Hardman et al., Goodman and Gilman's The
Pharmacological Basis of Therapeutics, McGraw-Hill, New York, N.Y., 2001; Genna
ro, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott, Williams, and W
ilkins, New York, N.Y., 2000; Avis, et al. (eds.), Pharmaceutical Dosage Forms:
Parenteral Medications, Marcel Dekker, NY, 1993; Lieberman, et al. (eds.), Pharm
aceutical Dosage Forms: Tablets, Marcel Dekker, NY, 1990; Lieberman, et al. (eds
.) Pharmaceutical Dosage Forms: Disperse Systems, Marcel Dekker, NY, 1990; Weine
r and Kotkoskie, Excipient Toxicity and Safety, Marcel Dekker, Inc., New York, N
.Y., 2000を参照されたい)。
結乾燥物を水または注射にとって好適な薬学的担体で再構成させることができる。その後
の静脈内投与のために、得られる溶液は通常、担体溶液中にさらに希釈される。
またはJCVの中和において有用であり、したがって、CytoGam(登録商標)を受
けている骨髄移植患者において以前に使用されたスクロースおよびヒトアルブミンの薬学
的担体を使用することができる(DeRienzo et al. Pharmacotherapy 2000; 20:1175-8)
。あるいは、抗VP1抗体を、WO2003/105894に記載された別の抗ウイルス
抗体であるSynagis(登録商標)について記載された薬学的担体を介して移植患者
に導入することができる。この刊行物では、薬学的担体は、ヒスチジンおよび/またはグ
リシン、サッカリド(例えば、スクロース)およびポリオール(例えば、ポリソルベート
)を含んでいた。
マトリックス中の標的細胞の接近可能性などのいくつかの因子に依存する。ある特定の態
様において、投与レジメンは、許容される副作用レベルと一致する患者に送達される治療
剤の量を最大化する。したがって、送達される生物製剤の量は、特定の実体および処置さ
れる状態の重症度に一部依存する。適切な用量の抗体、サイトカイン、および小分子を選
択する際の指針が利用可能である(例えば、Wawrzynczak, Antibody Therapy, Bios Scie
ntific Pub. Ltd, Oxfordshire, UK, 1996; Kresina (ed.), Monoclonal Antibodies, Cy
tokines and Arthritis, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1991; Bach (ed.), Monoclon
al Antibodies and Peptide Therapy in Autoimmune Diseases, Marcel Dekker, New Yor
k, N.Y., 1993; Baert et al., New Engl. J. Med. 348:601-608, 2003; Milgrom et al.
, New Engl. J. Med. 341:1966-1973, 1999; Slamon et al., New Engl. J. Med. 344:78
3-792, 2001; Beniaminovitz et al., New Engl. J. Med. 342:613-619, 2000; Ghosh et
al., New Engl. J. Med. 348:24-32, 2003; Lipsky et al., New Engl. J. Med. 343:15
94-1602, 2000を参照されたい)。
ことが当業界で公知の、または疑われるパラメータまたは因子を使用して、医師によって
行われる。一般に、用量は最適用量よりもいくらか低い量から開始し、その後、任意の負
の副作用と比較して所望の、または最適な効果が達成されるまで少しずつ増加させる。重
要な診断尺度は、例えば、輸注反応を含む。
ならないように、特定の患者、組成物、および投与様式に対する所望の治療応答を達成す
るのに有効である活性成分の量を得るために変化させることができる。選択される用量レ
ベルは、抗体の中和活性、投与経路、投与の時間、患者における抗体の半減期、処置の持
続期間、使用される特定の組成物と共に使用される他の薬物、化合物および/または材料
、処置される患者の年齢、性別、体重、状態、一般的健康および以前の病歴、ならびに医
学界で公知の同様の因子を含む様々な薬物動態因子に依存する。
もしくは週に1〜7回の間隔での用量により提供することができる。用量を、静脈内、皮
下、局所、経口、経鼻、直腸、筋肉内、大脳内で、または吸入により提供することができ
る。特定の用量プロトコールは、有意な望ましくない副作用を回避する最大用量または用
量頻度を含むものである。
100mg/kg患者体重であってもよい。用量は、0.0001mg/kg〜20mg
/kg、0.0001mg/kg〜10mg/kg、0.0001mg/kg〜5mg/
kg、0.0001〜2mg/kg、0.0001〜1mg/kg、0.0001mg/
kg〜0.75mg/kg、0.0001mg/kg〜0.5mg/kg、0.0001
mg/kg〜0.25mg/kg、0.0001〜0.15mg/kg、0.0001〜
0.10mg/kg、0.001〜0.5mg/kg、0.01〜0.25mg/kgま
たは0.01〜0.10mg/kg患者体重であってもよい。抗体またはその断片の用量
を、キログラム患者体重(kg)に、mg/kgで投与される用量を掛けたものを使用し
て算出することができる。
5日、30日、45日、2カ月、75日、3カ月、または少なくとも6カ月空けてもよい
。
路および用量ならびに副作用の重症度などの因子に応じて変化してもよい(例えば、Mayn
ard et al., A Handbook of SOPs for Good Clinical Practice, Interpharm Press, Boc
a Raton, Fla., 1996; Dent, Good Laboratory and Good Clinical Practice, Urch Publ
., London, UK, 2001を参照されたい)。
、動脈内、脳脊髄内、病変内による注射もしくは輸注、または持続放出系もしくは埋込み
体によるものであってもよい(例えば、Sidman et al., Biopolymers 22:547-556, 1983;
Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277, 1981; Langer, Chem. Tech. 12:
98-105, 1982; Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:3688-3692, 1985; Hwa
ng et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4030-4034, 1980; 米国特許第6,350,
466号明細書および第6,316,024号明細書を参照されたい)。必要に応じて、
組成物はまた、可溶化剤または注射部位での疼痛を軽減するためのリドカインなどの局所
麻酔剤、またはその両方を含んでもよい。さらに、例えば、吸入器または噴霧器、および
エアゾール化剤を含む製剤の使用により、肺投与を使用することもできる。例えば、米国
特許第6,019,968号明細書、第5,985,320号明細書、第5,985,3
09号明細書、第5,934,272号明細書、第5,874,064号明細書、第5,
855,913号明細書、第5,290,540号明細書、および第4,880,078
号明細書;ならびにPCT国際公開第92/19244号パンフレット、第97/325
72号パンフレット、第97/44013号パンフレット、第98/31346号パンフ
レット、および第99/66903号パンフレット(それぞれ、その全体が参照により本
明細書に組み込まれる)を参照されたい。
数の投与経路により投与することもできる。当業者であれば理解できるように、投与の経
路および/または様式は、所望の結果に応じて変化する。抗体のために選択される投与経
路としては、静脈内、筋肉内、皮内、腹腔内、皮下、脊髄または例えば、注射もしくは輸
注による他の非経口投与経路が挙げられる。非経口投与は、通常は注射による、腸内投与
および局所投与以外の投与様式であってよく、限定されるものではないが、静脈内、筋肉
内、動脈内、鞘内、嚢内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節
内、被膜下、くも膜下、脊髄内、硬膜外および胸骨内注射および輸注が挙げられる。ある
いは、本開示の組成物を、局所、表皮または粘膜投与経路などの非経口経路により、例え
ば、鼻内的、経口的、経膣的、直腸的、舌下的または局所的に投与することができる。一
態様において、本開示の抗体は、輸注により投与される。別の態様において、抗体は皮下
投与される。
制御放出または持続放出を達成することができる(Langer, supra; Sefton, CRC Crit. R
ef Biomed. Eng. 14:20, 1987; Buchwald et al., Surgery 88:507, 1980; Saudek et al
., N. Engl. J. Med. 321:574, 1989を参照されたい)。ポリマー材料を使用して、抗体
の療法の制御放出または持続放出を達成することができる(例えば、Medical Applicatio
ns of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), CRC Pres., Boca Raton, Fla., 1
974; Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance, Smole
n and Ball (eds.), Wiley, New York, 1984; Ranger and Peppas, J. Macromol. Sci. R
ev. Macromol. Chem. 23:61, 1983を参照されたい;また、Levy et al., Science 228:19
0, 1985; During et al., Ann. Neurol. 25:351, 1989; Howard et al., J. Neurosurg.
7 1:105, 1989; 米国特許第5,679,377号明細書;米国特許第5,916,59
7号明細書;米国特許第5,912,015号明細書;米国特許第5,989,463号
明細書;米国特許第5,128,326号明細書;PCT公開第99/15154号パン
フレット;およびPCT国際公開第99/20253号パンフレットも参照されたい)。
持続放出製剤において使用されるポリマーの例としては、限定されるものではないが、ポ
リ(2−ヒドロキシエチルメタクリレート)、ポリ(メチルメタクリレート)、ポリ(ア
クリル酸)、ポリ(エチレン−コ−ビニルアセテート)、ポリ(メタクリル酸)、ポリグ
リコリド(PLG)、ポリ無水物、ポリ(N−ビニルピロリドン)、ポリ(ビニルアルコ
ール)、ポリアクリルアミド、ポリ(エチレングリコール)、ポリラクチド(PLA)、
ポリ(ラクチド−コ−グリコリド)(PLGA)、およびポリオルトエステルが挙げられ
る。一態様において、持続放出製剤において使用されるポリマーは、不活性であり、浸出
性不純物を含まず、保存時に安定であり、無菌であり、および生分解性である。制御放出
系または持続放出系を、予防または治療標的の近くに置き、かくして、全身用量のほんの
一部のみを要するようにすることができる(例えば、Goodson, in Medical Applications
of Controlled Release, supra, vol. 2, pp. 115-138, 1984を参照されたい)。
当業者には公知の任意の技術を使用して、本開示の1または複数の抗体を含む持続放出製
剤を生成することができる。例えば、米国特許第4,526,938号明細書、PCT国
際公開第91/05548号パンフレット、PCT国際公開第96/20698号パンフ
レット、Ning et al., Radiotherapy & Oncology 39:179-189, 1996;Song et al., PDA
Journal of Pharmaceutical Science & Technology 50:372-397, 1995;Cleek et al., P
ro. Int'l. Symp. Control. Rel. Bioact. Mater. 24:853-854, 1997;およびLam et al.
, Proc. Int'l. Symp. Control Rel. Bioact. Mater. 24:759-760, 1997(それぞれ、そ
の全体が参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
、ゲル、スプレー、エアゾール、溶液、乳濁液の形態、または当業者には周知の他の形態
で製剤化することができる。例えば、Remington's Pharmaceutical Sciences and Introd
uction to Pharmaceutical Dosage Forms, 19th ed., Mack Pub. Co., Easton, Pa. (199
5)を参照されたい。非スプレー可能局所剤形については、局所適用と適合する担体または
1もしくは複数の賦形剤を含み、いくつかの場合、水よりも高い動的粘度を有する粘性か
ら半固体または固体の形態が典型的に使用される。好適な製剤としては、限定されるもの
ではないが、必要に応じて、滅菌されるか、または例えば、浸透圧などの様々な特性に影
響を及ぼすための補助剤(例えば、保存剤、安定化剤、湿潤剤、バッファー、もしくは塩
)と混合される、溶液剤、懸濁液剤、乳濁液剤、クリーム剤、軟膏剤、散剤、リミネント
剤、蝋膏剤などが挙げられる。他の好適な局所剤形としては、いくつかの場合、固体また
は液体の不活性担体と組み合わせた活性成分が、加圧された揮発性物質(例えば、フレオ
ンなどの気体噴射剤)との混合物中、またはスクイーズボトル中に充填される、スプレー
可能なエアゾール調製物が挙げられる。必要に応じて、モイスチャライザーまたは保湿剤
を医薬組成物および剤形に添加することもできる。そのような追加の成分の例は、当業界
で周知である。
は液滴の形態で製剤化することができる。特に、本開示による使用のための予防剤または
治療剤を、好適な噴射剤(例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタ
ン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素または他の好適な気体)の使用と共に、
加圧パックまたは噴霧器からのエアゾールスプレー提示物の形態で都合良く送達すること
ができる。加圧エアゾールの場合、一定量を送達するためのバルブを提供することにより
、用量単位を決定することができる。化合物と、ラクトースまたはデンプンなどの好適な
粉末基剤との粉末混合物を含有する、吸入器または散布器における使用のためのカプセル
およびカートリッジ(例えば、ゼラチンから構成される)を製剤化することができる。
質、または放射線療法との同時投与または処置のための方法は、当業界で公知である(例
えば、Hardman et al., (eds.) (2001) Goodman and Gilman's The Pharmacological Bas
is of Therapeutics, 10th ed., McGraw-Hill, New York, N.Y.; Poole and Peterson (e
ds.) (2001) Pharmacotherapeutics for Advanced Practice:A Practical Approach, Lip
pincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.; Chabner and Longo (eds.) (2001) Cancer
Chemotherapy and Biotherapy, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.を参照
されたい)。治療剤の有効量は、症状を少なくとも10%;少なくとも20%;少なくと
も約30%;少なくとも40%、または少なくとも50%減少させることができる。
)を、本開示の抗VP1抗体から5分未満空けて、30分未満空けて、1時間空けて、約
1時間空けて、約1〜約2時間空けて、約2時間〜約3時間空けて、約3時間〜約4時間
空けて、約4時間〜約5時間空けて、約5時間〜約6時間空けて、約6時間〜約7時間空
けて、約7時間〜約8時間空けて、約8時間〜約9時間空けて、約9時間〜約10時間空
けて、約10時間〜約11時間空けて、約11時間〜約12時間空けて、約12時間〜約
18時間空けて、18時間〜24時間空けて、24時間〜36時間空けて、36時間〜4
8時間空けて、48時間〜52時間空けて、52時間〜60時間空けて、60時間〜72
時間空けて、72時間〜84時間空けて、84時間〜96時間空けて、または96時間〜
120時間空けて投与することができる。2つ以上の療法を、1回の同じ患者訪問のうち
に投与してもよい。
に製剤化することができる。例えば、血液脳関門(BBB)は多くの高親水性化合物を排
除する。抗VP1抗体がBBBを通過することを確保するために(必要に応じて)、それ
らを、例えば、リポソーム中で製剤化することができる。リポソームを製造する方法につ
いては、例えば、米国特許第4,522,811号明細書;第5,374,548号明細
書;および第5,399,331号明細書を参照されたい。リポソームは、特定の細胞ま
たは臓器中に選択的に輸送される1または複数の部分を含み、かくして、標的化薬物送達
を増強してもよい(例えば、Ranade, (1989) J. Clin. Pharmacol. 29:685を参照された
い)。標的化部分の例としては、葉酸またはビオチン(例えば、Low et al.の米国特許第
5,416,016号明細書を参照されたい);マンノシド(Umezawa et al., (1988) B
iochem. Biophys. Res. Commun. 153:1038);抗体(Bloeman et al., (1995) FEBS Lett
. 357:140; Owais et al., (1995) Antimicrob. Agents Chemother. 39:180);界面活性
プロテインA受容体(Briscoe et al., (1995) Am. J. Physiol. 1233:134);p120
(Schreier et al, (1994) J. Biol. Chem. 269:9090)が挙げられ、K. Keinanen; M. L.
Laukkanen (1994) FEBS Lett. 346:123; J. J. Killion; I. J. Fidler (1994) Immunom
ethods 4:273も参照されたい。
要とする対象に投与するためのプロトコールを提供する。組合せ療法(例えば、予防剤ま
たは治療剤)を、同時的または連続的に対象に投与することができる。組合せ療法の療法
(例えば、予防剤または治療剤)を、周期的に投与することもできる。周期的療法は、療
法(例えば、薬剤)の1つに対する耐性の発生を軽減するため、療法(例えば、薬剤)の
1つの副作用を回避もしくは軽減する、および/または療法の効能を改善するための、一
定期間、第1の療法(例えば、第1の予防剤または治療剤)の投与、次いで、一定期間、
第2の療法(例えば、第2の予防剤または治療剤)の投与、およびこの連続的投与の反復
、すなわち、周期を含む。
ことができる。用語「同時に」は、正確に同時の療法(例えば、予防剤または治療剤)の
投与に限定されないが、むしろ、抗体またはその断片を含む医薬組成物が対象に連続して
、および抗体が他の療法(複数可)と一緒に作用して、それらを別途投与した場合よりも
増大した利益を提供し得るような時間間隔で投与されることを意味する。例えば、それぞ
れの療法を同時に、または異なる時点で任意の順序で連続的に投与することができる;し
かしながら、同時に投与しない場合、それらを十分に近い時間で投与して、所望の治療ま
たは予防効果を提供するべきである。それぞれの療法を、任意の適切な形態で、および任
意の好適な経路により、別々に対象に投与することができる。様々な態様において、療法
(例えば、予防剤または治療剤)を、15分未満空けて、30分未満空けて、1時間未満
空けて、約1時間空けて、約1〜約2時間空けて、約2時間〜約3時間空けて、約3時間
〜約4時間空けて、約4時間〜約5時間空けて、約5時間〜約6時間空けて、約6時間〜
約7時間空けて、約7時間〜約8時間空けて、約8時間〜約9時間空けて、約9時間〜約
10時間空けて、約10時間〜約11時間空けて、約11時間〜約12時間空けて、24
時間空けて、48時間空けて、72時間空けて、または1週間空けて対象に投与する。他
の態様において、2以上の療法(例えば、予防剤または治療剤)を、同じ患者訪問のうち
に投与する。
。あるいは、組合せ療法の予防剤または治療剤を、別々の医薬組成物中、対象に同時に投
与することができる。予防剤または治療剤を、同じか、または異なる投与経路により対象
に投与してもよい。
抗VP1抗体を発現するB細胞を溶解し、VH(重)およびVL(軽)鎖をRT−PC
Rによって配列決定し、分析して、重要な翻訳後改変(PTM)部位を同定した。次いで
、VHおよびVL鎖のプラスミドを、完全なIgG1抗体の発現のためのIgG1骨格ベ
クター中、CHO哺乳動物細胞株中にトランスフェクトした。
知である(Antibody Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology vol. 901,
2012, Chapter 7: 117)。簡単に述べると、様々な初回−追加戦略、免疫原の用量、お
よびアジュバント(限定されるものではないが、FreundのアジュバントおよびMF
59アジュバントを含む)を使用して、メスのBalb/cマウスを、BKV血清型I、
血清型IV、およびJCVに由来するVLPで免疫した(個別に、または組み合わせて)
。上手く融合した(増殖している)ハイブリドーマの上清を、ELISAによって抗VP
1抗体の存在についてスクリーニングした後、中和アッセイにおいて機能的活性について
スクリーニングした。選択されたマウスIgGに由来するCDRを、ヒトフレームワーク
アクセプター鋳型上に移植することによってヒト化し、哺乳動物IgG1骨格発現ベクタ
ー中にクローニングし、完全なIgG1抗体の発現のためにCHO哺乳動物細胞株中にト
ランスフェクトした。
界で公知である(Antibody Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology vol
. 901, 2012, Chapter 3: 33)。簡単に述べると、Vκを有するscFv形式のヒトB細
胞抗体ライブラリーを、増大するストリンジェンシーで3ラウンドの選択にわたって、ビ
オチン化されたBKV血清型IVのVLPと複合体化したストレプトアビジン結合磁気ビ
ーズを用いる溶液パンニングによって抗VP1抗体についてスクリーニングした。単離物
をscFvとして最初に発現させ、ELISAによってBKV血清型IVのVLPと五量
体の両方への結合についてスクリーニングした。次いで、選択された単離物をクローニン
グし、IgG1として発現させ、ELISAによってVP1(血清型IおよびIV)への
結合について、および中和アッセイにおいて機能的活性について再分析し、完全なIgG
1抗体の発現のためにCHO哺乳動物細胞株中にトランスフェクトした。
抗VP1抗体を、変異性PCRまたはCDR特異的突然変異誘発によって酵母中で親和
性成熟させた。BKVの4種の血清型のそれぞれに由来するVP1タンパク質(表4に示
される)を、FACS分析によって最大3ラウンドの選択における抗原として使用した。
次いで、FACS分析によってVP1への結合親和性が増強されたVH(重)鎖および/
またはVL(軽)鎖を、哺乳動物IgG1骨格発現ベクター中にクローニングし、完全な
IgG1抗体の発現のためにCHO哺乳動物細胞株中にトランスフェクトした。
BKV血清型Iのゲノムクローンを、ATCC(pBR322−BKV MM、カタロ
グ番号45026;pBR322−BKV Dunlop、カタログ番号45025)か
ら取得した。血清型II、IIIおよびIVのキメラウイルスの感染性ゲノムクローンを
、以前に記載されたクローニング戦略(Broekema et al, Virology 2010 407:368-373)
を使用して生成した。簡単に述べると、ユニークな制限部位(SacII、PmlI)を
、部位特異的突然変異誘発を使用して、VP1−VP2−VP3コード領域にフランキン
グするBKV血清型Iゲノム中に導入した。血清型IIの単離物SB(GenBank受
託番号CAA79596.1)、血清型IIIの単離物AS(GenBank受託番号A
AA46882.1)および血清型IVの株ITA−4(GenBank受託番号BAF
75132)に由来するVP1のコード領域を、合成される断片がBroekema et al.,上掲
に記載されたスワップ組合せのために使用されるSacII−PmlI領域を包含するよ
うに、血清型Iの単離物(Genewiz、La Jolla、CA)からVP2/VP
3コード領域の文脈で合成した。次いで、得られるキメラゲノムクローンを使用して、以
前に記載されたように(Abend et al, J. Virology 2007 81:272-279)、一次腎臓近位尿
細管上皮(RPTE)細胞(ATCC、カタログ番号PCS−400−010)中で高力
価感染性ウイルスストックを生成した。
現によって生成し、マイクロチップ超音波処理(3x45秒パルス、パルス間、氷上で5
min休止)、20%スクロースクッションを介してVLPをペレット化させることによ
る単離(116,000gで2.5時間)、および5mlのGE HiTrap Q H
Pカラム(GE Healthcare、Pittsburgh、PA)を用いる陰イオ
ン交換による精製によって1L培養物に由来する凍結細胞ペレットから抽出した後、10
mlのCapto(商標)Core700(GE Healthcare、Pittsb
urgh、PA)樹脂に基づくサイズ排除カラムを使用して精製し、最後にGE Sep
hacryl S500 26/60(GE Healthcare、Pittsbur
gh、PA)サイズ排除カラム上で精製した。調製されたVLPを、実施例6および7で
ELISAおよびSPRに基づく結合アッセイにおいて使用した。
BKVの4種の血清型のそれぞれに由来するVP1タンパク質(以下の表5に示される
配列)を、N末端GST−6xHis−TEV配列を用いてクローニングし、pGEX目
的ベクター(GE Healthcare、Pittsburgh、PA)中にサブクロ
ーニングした。GST融合タンパク質を大腸菌(E.coli)中で発現させ、マイクロフルイ
ダイザー(15,000PSI)を使用して細胞ペレットから抽出し、20mlのニッケ
ルセファロース6 Fast Flowカラム(GE Healthcare、Pitt
sburg、PA)を使用して固定化金属イオンアフィニティクロマトグラフィー(IM
AC)により精製した。GST−6xHis−TEVタグを、TEVプロテアーゼと一晩
インキュベートすることによって切断し、5mlのHis−Trap Fast Flo
wカラム(GE Healthcare、Pittsburg、PA)、次いで、Sup
erdex 200 26/60サイズ排除カラム(GE Healthcare、Pi
ttsburg、PA)を使用して最後の精製を実施した。
溶液平衡滴定(SET)アッセイを使用して、抗体と4種全部の血清型に由来するBK
V VP1五量体との相互作用親和性(KD)を決定した。抗体を、1pM濃度(一定)
でアッセイし、VP1五量体を10nMの出発濃度から連続希釈した。抗体:VP1五量
体溶液を一晩インキュベートした後、VP1五量体で被覆されたMSDアレイプレート(
Meso Scale Discovery、カタログ番号L21XA、Rockvil
le MD)を使用して未結合の抗体についてアッセイした。プロットを1:1の適合モ
デルと適合させることによって、KDを決定した(Piehler et al. J. Immunol. Methods
. 1997; 201(2):189-206による)。
量体への抗VP1抗体の結合と類似していた。P8D11およびP8D11の誘導体は、
BKV血清型II、III、およびIVの五量体への結合について同等のKD値を有し、
他の抗体と比較した場合、血清型IIの五量体に対しては少なくとも3.5倍高い親和性
を有し、血清型IVの五量体に対しては47倍高い親和性を有していた。これを、図1A
〜1Dに示す。さらに、P8D11およびP8D11の誘導体は、血清型IIIの五量体
に対する2.5〜6.0pMの範囲の結合親和性を示したが、他の抗体は、試験した条件
内で血清型IIIの五量体に検出可能に結合しなかった。これらの抗VP1抗体に関する
SET親和性データの概要は、図2に見出される。
VP1五量体およびVLPへの抗VP1抗体の結合を、ELISAによって分析した。
簡単に述べると、Immulon 2HBプレート(VWR、62402−972)を、
100ng/ウェルのBKV VLPまたはVP1五量体で一晩被覆した。抗体を、0.
5%BSAを含むPBS中で連続希釈し、抗原で被覆されたプレートに2h結合させた。
プレートをPBSで洗浄した後、PBS中の0.5%BSA中に1:6000に希釈され
た二次抗体(HRPコンジュゲート化ウサギ抗体ヒトIgG、Southern Bio
techカタログ番号6140−05)と共にインキュベートした。プレートをPBSで
洗浄し、テトラメチルベンジジン(TMB)マイクロウェルペルオキシダーゼ基質(KP
L、52−00−03 1L)を使用して、反応を起こさせた。
に由来するVLP(0.044〜0.1nMの範囲のIC50)またはVP1五量体(0
.026〜0.078nMの範囲のIC50)への類似する結合を示したが、血清型Iの
VLPへの低下した、より変動する結合活性を示した(4.32〜85.7nMの範囲の
IC50)。このデータを、図4〜6に図示し、図7にまとめる。対照的に、2081お
よび2075シリーズに由来する抗VP1抗体は、血清型IのVLPに対する増強された
結合活性を示し、そのIC50は0.046〜0.267nMの範囲であり、このデータ
を、図8および9に示す。2077シリーズのJCV特異的抗VP1抗体は、0.034
〜0.651nMの範囲のJCV VLPに対する結合活性を示し、このデータを図10
および11に提供する。
VP1五量体およびVLPへの抗VP1抗体の結合を、表面プラズモン共鳴(SPR)
によって分析した。簡単に述べると、ビオチン化されたプロテインAを、ストレプトアビ
ジン被覆SPRチップ表面上に固定し、プロテインAへの結合により、得られる表面上に
抗VP1抗体を捕捉する。次いで、BKV VP1五量体またはVLPを表面上に流し、
結合段階中に抗VP1抗体に結合させた後、解離段階中にバッファー洗浄する。
抗VP1抗体EBB−C1975−A3、A7、E7、およびB5の結合を評価した。4
種の抗体は全て、VP1五量体に対する非常に類似する結合プロファイルを有していた:
血清型IおよびIIIの五量体には結合しない、血清型IIの五量体に対する非定型的結
合(大きいバルクシフトおよびベースラインへの復帰なし)、およびP165E2と類似
するが、より低い親和性で血清型IVの五量体に結合する(図3A、3Cおよび3E)。
VLPについては、EBB−C1975−A3、A7、およびE7は、類似する結合プロ
ファイルを共有していた:血清型IのVLPへの非定型的結合および血清型IIIのVL
Pに結合しない。しかしながら、EBB−C1975−B5の結合プロファイルは、血清
型IおよびIIIのVLPへの有意な結合と異なっていたが、VP1上の異なるエピトー
プへの結合を示している(図3Bおよび3D)。
1抗体P165E2、NEG447、P7G11A、およびP8D11の結合を特徴付け
た(図13A〜Fおよび図14)。全ての抗VP1抗体が、VP1五量体構造に対する突
然変異の全体的影響のため、F66AおよびI145A VP1突然変異体への結合の低
下を示した(図13Bおよび13F)。さらに、K69AおよびE82Aは、P165E
2、NEG447、およびP7G11Aの結合に影響した(図13Dおよび13E)。
抗VP1抗体が立体状エピトープに結合するかどうかを決定するために、SDS−PA
GEによる変性タンパク質のウェスタンブロットおよび天然コンフォメーションにあるタ
ンパク質のドットブロットを使用した。簡単に述べると、BKV血清型IまたはIVのV
P1五量体をSDS−PAGE上で泳動し、ニトロセルロース膜に転写する(ウェスタン
ブロット)か、またはニトロセルロース膜上に直接スポットした(ドットブロット)。両
方の膜を、抗VP1抗体、次いで、Licor Odysseyシステムを使用する検出
のための赤外蛍光染料にコンジュゲートされた抗ヒトIgG二次抗体と共にインキュベー
トした。
m 53977)は、変性および非変性VP1の両方を検出した。しかしながら、P16
5E2、P7G11およびP8D11は、ウェスタンブロット上では変性VP1を検出す
ることができず、ドットブロット上では天然のVP1のみを認識したが、これは、これら
の抗体がVP1の立体状(非線状)エピトープに結合することを示している(図12Aお
よび12B)。
ることが知られるVP1 BCループ中の、細胞表面受容体のための主要な相互作用部位
内にある残基について、走査アラニン突然変異誘発を実施した。これらの突然変異体VP
1五量体を、実施例7に上記された表面プラズモン共鳴(SPR)試験においてP8D1
1およびP7G11Aへの結合についてアッセイした。いくつかの位置での突然変異は、
P7G11Aの結合に影響した(F66A、K69A、E82A、I145A)(図13
A〜Fおよび図14)。しかしながら、ただ2つだけの部位での突然変異が、P8D11
結合の低下をもたらした(F66A、I145A)(図14)。F66およびI145で
の突然変異は試験した全ての抗体の結合の喪失をもたらしたため、いずれか1つの理論に
よって束縛されるものではないが、これらの突然変異はVP1五量体構造の全体的な破壊
をもたらすと考えられる。試験したBCループ突然変異を有する他の全てのVP1五量体
は、P8D11結合を保持した。対照的に、水素−重水素交換試験により、P8D11
Fab断片の結合の際のVP1のEFループ内の保護された領域が同定された。フォロー
アップ走査アラニン突然変異誘発試験により、この領域内のP8D11結合のための重要
な接触残基がY169、R170およびK172を含み、D/E175、K181、N1
82、T184およびQ186からM190までが、重水素交換によって決定される重要
な残基であることが確認される((YRXKXX(D/E)XXXXXKNXTXQ)(
配列番号500))。これは、実施例14〜実施例17にさらに記載される。
感染性BKV血清型Iならびに血清型II、IIIおよびIVを代表するキメラウイル
スを、精製抗体と共に1時間予備インキュベートして、結合および中和を可能にした。次
いで、一次腎臓近位尿細管上皮(RPTE)細胞(ATCC、カタログ番号PCS−40
0−010)をウイルス−抗体混合物に4時間曝露し、新鮮な培地と交換し、48時間イ
ンキュベートして、ウイルス進入および遺伝子発現を可能にした。細胞を4%パラホルム
アルデヒドで固定し、免疫蛍光によって分析して、TAg発現を検出した(Calbio
chem DP02、pAb416マウス抗SV40 TAg抗体)。Cellomic
s ArrayScan(登録商標)VTI HCS Readerを使用する高含量画
像分析によって免疫蛍光を分析して、BKV感染細胞(TAg陽性、DAP1陽性)のパ
ーセントを定量し、そのデータを、未処置対照ウェルと比較した感染の阻害パーセントと
して提示した。
中和する抗体のサブセットを含む、抗VP1抗体は、BKVによる感染を中和した。これ
らの抗VP1抗体は、P8D11、P8D11の改変、およびEBB−C1975−B5
を特に含む。
感染性JCV単離物Mad−1およびMad−4は、同一のVP1配列を有する(Ge
nBank受託番号NP_043511)。これらのJCV単離物を、精製抗体と共に1
時間予備インキュベートして、結合および中和を可能にした。次いで、COS7細胞(S
V40 TAgを発現するアフリカミドリザル腎臓線維芽細胞様細胞株、ATCCカタロ
グ番号CRL−1651)を、ウイルス−抗体混合物に4時間曝露し、新鮮な培地と交換
し、72時間インキュベートして、ウイルス進入および遺伝子発現を可能にした。細胞を
4%パラホルムアルデヒドで固定し、免疫蛍光によって分析して、JCV VP1発現を
検出した(Abcam 53977、ウサギポリクローナル抗SV40 VP1抗体)。
Cellomics ArrayScan(登録商標)VTI HCS Reader(
Thermo Fisher、Waltham MA)を使用する高含量画像分析によっ
てアッセイを分析して、JCV感染細胞(VP1陽性、DAP1陽性)のパーセントを定
量し、そのデータを、未処置対照ウェルと比較した感染の阻害パーセントとして提示した
。図24〜26に示されるように、P8D11および2077シリーズの抗体を含む、抗
VP1抗体のサブセットは、JCVによる感染を中和する。
P8D11抗体を用いる耐性選択実験を、BKV血清型Iまたは血清型IVを感染させ
た腎臓近位尿細管上皮(RPTE)細胞培養物中で実行した。血清型Iの試験では、6回
の継代(84日)でP8D11を含む培養物中でウイルスの急上昇は観察されず、かくし
て、耐性関連バリアント(RAV)は同定されなかった。ウイルスを検出することができ
なかったため、この時点を超えてさらなる継代は行わなかった。対照的に、別の抗体に関
しては、継代3(42日目)でウイルスの急上昇が検出された。これらの培養物からのB
KV VP1の配列決定により、VP1を通して20個のアミノ酸変化を有する耐性関連
バリアント(RAV)が同定されたが、VP1配列中の特定のアミノ酸の周囲のクラスタ
ーに変化はなかった。このプールされたRAVウイルスのその後の表現型特性評価により
、野生型ウイルスと比較した場合、中和活性の完全な喪失(EC50の7,692倍を超
えるシフト)が示されたが、P8D11のEC50の変化はわずかであった(3.9倍)
。さらに、VP1突然変異体E82Kが、別の抗VP1抗体を用いる選択中にRAVとし
て同定され(実施例8を参照)、クローニングされたE82K突然変異体ウイルスの特性
評価により、このバリアントが野生型ウイルスと比較した場合、EC50の15,880
倍のシフトを提供することが示されたが、P8D11に対する交差耐性は示されなかった
。
して耐性は検出されなかった。再度、ウイルスを検出することができなかったため、この
時点を超えてさらなる継代は行わなかった。しかしながら、異なる抗BK抗体に対する耐
性は、早くも継代1(14日)に選択された。参照からの変化の突然変異としてアミノ酸
L68RおよびE73Kの変化が同定され、それぞれ、EC50値の600倍および22
7倍のシフトを提供したが、P8D11に対する交差耐性を示さなかった。まとめると、
P8D11は、高い耐性に対する障壁を有し、血清型IとIVの両方の耐性バリアントに
対する中和活性を維持する。
VP1は、細胞表面上に発現されない外因性の非ヒト標的であるため、本明細書に開示
される抗VP1抗体は、ヒトにおける毒性のリスクが低い。TCR試験により、P8D1
1による42のヒト組織および血液スメアの染色がないことが示されたが、ヒトタンパク
質との抗VP1抗体の交差反応性がないことを支持している。抗VP1抗体は、in v
itroで抗体依存的細胞媒介性細胞傷害性(ADCC)を示さなかったが、これは、V
P1タンパク質が宿主細胞表面上で発現されないという事実と一致している。
進行性多巣性白質脳症(PML)は、JCウイルスによる免疫不全患者の脳の稀だが致
死性であることが多い感染である。JCウイルスの主要キャプシドタンパク質(VP1)
は、宿主細胞の表面上のシアル酸受容体への結合に関与する。アミノ酸L55およびS2
69などの、VP1のある特定の突然変異は、シアル酸認識を無効化し、PMLの発病に
おいて役割を果たす(Chen et al., mAbs 2015; 7(4), 681-692)。これらの2つの突然
変異は、PML患者において頻繁に生じる(Gorelik et al., J.Infect. Dis. 2011 204:
103-114およびReid et al., J. Infect. Dis. 2011; 204:237-244)。本開示の抗体を試
験して、それらが、これらの位置に突然変異を有する突然変異したJCV VLPに結合
するかどうかを見た。これらのVLPへの抗VP1抗体の結合は、これらの共通のVP1
突然変異を担持するJCウイルスが療法に対して耐性ではないことを示している。
濃度のP8D11抗体を添加した。使用したP8D11抗体の濃度は、9nMまたは1p
Mのいずれかであった。JCVコンセンサスの濃度範囲は、105μg/ml〜72pg
/mlであった。JCV L55F突然変異体の濃度範囲は、300μg/ml〜143
pg/mlであった。JCV S269F突然変異体の濃度範囲は、300μg/ml〜
143pg/mlであった。60μlの容量のそれぞれのVLP:抗体混合物を、384
ウェルのポリプロピレンマイクロタイタープレート(PP MTP)に2回分配した。試
料バッファーは陰性対照として作用し、抗原を含有しない試料は陽性対照として作用した
(Bmax)。プレートを密封し、室温(RT)で一晩(o/n)インキュベートした。
384ウェルの標準MSDアレイプレートを、2および0.002μg/mlのBKV−
VP1血清型I五量体タンパク質でo/n被覆した。50μl/ウェルの洗浄バッファー
で3回洗浄した後、プレートを、RTで1時間、50μl/ウェルのブロッキングバッフ
ァーでブロッキングした。洗浄した後、30μl/ウェル容量のそれぞれのVLP:抗体
混合物を、PP MTPから被覆されたMSDプレートに移し、RTで20minインキ
ュベートした。さらなる洗浄ステップの後、試料バッファー中の30μlの検出抗体(1
:2000希釈)を各ウェルに添加し、RTで30minインキュベートした。MSDプ
レートを洗浄し、35μl/ウェルの読取りバッファーを添加し、5minインキュベー
トした。MSD SECTOR Imager 6000を用いて、ECLシグナルを測
定した。
)、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)10x(Teknovaカタログ番号P0195)
、MSD Read Buffer T 4x(Meso Scale Discove
ryカタログ番号R92TC−1)、Tris緩衝生理食塩水(TBS)20x(Tek
novaカタログ番号T1680)、Tween−20(VWRカタログ番号43708
2Q)であった。使用したバッファーは、ブロッキングバッファー:1xPBS+5%(
w/v)BSA、被覆バッファー:1xPBS、試料バッファー:1xPBS+0.5%
(w/v)BSA+0.02%(v/v)Tween−20、洗浄バッファー:1xTB
S+0.05%(v/v)Tween−20および読取りバッファー:1xMSD Re
ad Bufferであった。
CV VLPとの相互作用親和性(KD)を決定した。P8D11抗体を、9nMまたは
1pMの濃度(一定)でアッセイし、JCV VLPを以下のように連続希釈した:コン
センサスVLPは105μg/ml〜72pg/mlの範囲であり、L55FおよびS2
69F突然変異体VLPは両方とも300μg/ml〜143pg/mlの範囲であった
。抗体:VP1五量体溶液を一晩インキュベートした後、VP1五量体で被覆したMSD
アレイプレート(Meso Scale Discovery、カタログ番号L21XA
、Rockville MD)を使用して未結合の抗体についてアッセイした。プロット
を1:1の適合モデルと適合させることによって、KDを決定した(Piehler et al. J.
Immunol. Methods. 1997; 201(2):189-206による)。Sapidyne(Boise I
D)からのKinExA(登録商標)Proおよびn−Curve Analysisソ
フトウェアを使用することにより、分析を実施した。
CV VLPおよびPMLと一般的に関連するVP1突然変異を含有するVLPに対する
P8D11抗体の親和性の決定(KD)を提供する。P8D11は、低ナノモル濃度範囲
で全てのJCV VLPに対する結合親和性を示した。しかしながら、L55F突然変異
体に対する結合親和性は、野生型(コンセンサス)およびS269F突然変異体VLPに
対する親和性の約1/2であった。したがって、これは、P8D11抗体が野生型JCウ
イルスまたはPMLと一般的に関連する突然変異を有するJCウイルスのいずれかに対し
て依然として有効な療法であることを示している。
の複合体にあるP8D11 Fab)
重水素交換質量分析(HDx−MS)は、タンパク質のアミド骨格への重水素取込みを
測定するものである。これらの測定値は、アミドの溶媒接近性および骨格アミドの水素結
合ネットワークの変化に対して高感度である。HDx−MSは、アポおよびリガンド結合
などの2つの異なる状態のタンパク質を比較するために使用されることが多く、ペプシン
による迅速な消化とカップリングする。そのような実験において、当業者であれば、2つ
の異なる状態間で異なる重水素取込みを示す領域、典型的には、10〜15アミノ酸を見
つけることができる。保護される領域は、リガンド結合に直接関与するか、またはリガン
ドへの抗体の結合によりアロステリックに影響される。
P8D11 Fab断片の非存在下および存在下で測定した。Fab断片の結合時に重水
素取込みの低下を示すVP1中の領域はエピトープ中に含まれる可能性が高いが、測定の
性質のため、直接的な結合部位から遠い変化を検出することも可能である(アロステリッ
ク効果)。一般に、最も多い量の保護を有する領域は、直接結合に関与する。
QUITY(登録商標)UPLC System、およびSynapt(登録商標)G2
質量分析計を含む、Waters Synapt(登録商標)G2 HDx−MSプラッ
トフォーム上で行う。この方法においては、3組の対照実験を以下のように実行する。B
KV血清型IのVP1五量体を、110μlの95%重水素化PBSバッファー(pH7
.4)中に希釈し、ベンチローテータ上、室温で25分間インキュベートする(%D=8
5.5%)。重水素交換を、氷上で5min、冷クエンチバッファー(6M尿素および1
M TCEP pH=2.5)で1:1希釈することによりクエンチする。クエンチした
後、チューブをLEAPシステム(サーモボックスは2℃に設定する)上に移し、クエン
チした試料を、分析のためにLEAPシステムによりUPLCシステム上に注入する。U
PLCシステムは、12℃に維持された固定化ペプシンカラム2.1mm x 30mm
(Life Technologies 2−3131−00)を組み込む。8分で2〜
35%のアセトニトリル勾配およびWaters UPLC CSH C18 1.0x
100mmカラムを分離のために使用する。次に、3組の実験を、抗体を使用して実行す
る。P8D11 Fab断片を、標準的な技術を使用してプロテインGアガロースビーズ
(Thermo Scientific Cat#22851)上に固定する。簡単に述
べると、抗体を遠心分離して、保存バッファーを除去する。次いで、200μlのPBS
バッファー(pH7.4)およびある濃度のVP1五量体を、固定されたP8D11 F
ab断片に添加し、室温で30minインキュベートする。インキュベーション後、複合
体を遠心分離し、200μlのPBSバッファーで洗浄し、再度遠心分離する。重水素交
換のために、200μlの重水素化PBSを、室温で25分間のインキュベーションのた
めに抗原−抗体複合体に添加する(%D=85.5%)。次いで、重水素バッファーを除
去し、すぐに、125μlの氷冷クエンチバッファーを添加する。5分間クエンチした後
、カラムを遠心分離し、流出液を、予め冷却したHPLCバイアルに移す。対照実験とし
て同じオンラインペプシン消化/LC−MS設定を使用して、試料を分析する。
た試料との間のベースライン補正された差異を、測定の標準誤差で除算したものを示す。
このプロットにおいて、負の値が大きいほど、BKV血清型IのVP1五量体へのP8D
11 Fab断片の結合時に所与の領域における保護の量が大きいことを示す。P8D1
1 Fab断片の結合時に、本発明者らは、VP1タンパク質のアミノ酸168〜190
において最も有意な量の保護を観察する。表1中で太字および下線付きの配列((NYR
TKYPXGTXXPKNXTXQSQVM)(配列番号501))について見ることが
できるように、EFループのこの領域は、BKウイルスの4種全部の血清型およびJCウ
イルスの間で高度に保存されている。
プ内のエピトープに結合することを示している。この領域は、4種全部のBKV血清型お
よびJCウイルスの間で高度に保存されており、かくして、P8D11が4種全部のBK
V血清型およびJCウイルスにわたって中和活性を有するという結果を支持する。
PR
Biacore表面プラズモン共鳴(SPR)を使用して、走査アラニン突然変異誘発
によりエピトープマッピングのために生成されたVP1五量体への抗VP1抗体の結合を
特徴付けた。実験を、0.005%Tween 20界面活性剤(Calbiochem
、カタログ番号655206)を添加したリン酸緩衝生理食塩水(PBS)中、25℃で
実施し、Biacore T−200機器(GE Healthcare Life S
ciences)上で泳動した。ビオチン化されたプロテインA(Sigma、カタログ
番号P2165)を、約1200応答単位(RU)でシリーズSのストレプトアビジンセ
ンサーチップ上に固定し、残存する遊離ストレプトアビジン部位を、ビオチン−PEG(
Pierce EZ−Link、カタログ番号PI21346)でブロッキングした。3
0μl/分の流量で4秒間の注入により、調製されたプロテインAセンサーチップ上で抗
体を捕捉した。抗体をフローセル2、3および4上に20〜40RUで固定したが、フロ
ーセル1は抗体を含まない参照セルとして残した。次いで、VP1五量体を、100μl
/minで200秒間、チップ上に注入した後、解離をモニタリングするためにバッファ
ーを注入した。それぞれの五量体と五量体濃度との間で、センサーチップ表面を、30μ
l/分で60秒間、25mM NaOHの注入により再生して、次のサイクルのためにプ
ロテインA表面上での抗体の再捕捉の前に抗体を除去した。二重参照減算を適用するGE
BiaEvaluationソフトウェア中でデータ分析を行った。VP1五量体結合
に対するアラニン突然変異誘発の効果の評価を、結合RUレベルの比較により達成し、結
合曲線の形状を、野生型五量体のものと比較した。
立体状であり、非連続的である(図12A〜B)。ここで、BKV VP1のEFループ
中のY169、R170およびK172でのアラニンへの単一突然変異は、P8D11の
結合を無効化する(図29Aおよび29B)。Y169およびR170での突然変異はま
た、P7G11A抗体の結合も無効化するが、この抗体の結合は、BKV VP1のEF
ループのK172位での変化によって影響されない(図29Aおよび29C)。
五量体形式のBKV主要キャプシドタンパク質VP1に結合した抗体P8D11のsc
Fv鎖の結晶構造を決定した。以下に詳述されるように、scFv:BKV−VP1五量
体の5.5:1の溶液を使用して、それぞれの五量体に結合した5つのscFv鎖から構
成される結晶学的に好適な複合体を生成した。次いで、タンパク質結晶学を使用して、原
子分解構造を生成し、エピトープを定義した。
P8D11 scFv/BKV−VP1複合体を5.2mg/mlに濃縮し、結晶化に
ついてスクリーニングした。データ収集のための結晶を、18℃での懸滴蒸気拡散によっ
て成長させた。1.0μlの複合体と、25%(w/v)PEG3350、0.2M塩化
マグネシウムおよび0.1M Bis−Tris pH7.0を含有する1.0μlのリ
ザーバ溶液とを混合し、350μlの同じリザーバ溶液に対して液滴を平衡化させること
によって、結晶を成長させた。結晶は一晩成長し、数日間、成長し続けた。データ収集の
前に、結晶を75%のリザーバ溶液+25%のグリセロールに移し、液体窒素中で簡易冷
却した。
た。データを、Autoproc(Global Phasing,LTD)を使用して
プロセッシングおよびスケーリングした。BKV−VP1のデータを、セル寸法a=22
4.4Å、b=224.4Å、c=144.04Å、アルファ=90°、ベータ=90°
、ガンマ=90°を有する空間群P42212中、2.66Åにプロセッシングした。複
合体の構造を、検索モデルとしてBKV−VP1五量体とのPhaser(McCoy et al.
, (2007) J. Appl. Cryst. 40:658-674)を使用する分子置き換えにより分解した。最終
モデルを、COOT(Emsley & Cowtan (2004) Acta Cryst. D60:2126-2132)中で構築し
、Buster(Global Phasing,LTD、Cambridge、UK)
を用いて改良した。RworkおよびRfree値は、それぞれ、17.1%および21
.4%である;結合長さおよび結合角の二乗平均平方根(r.m.s)偏差値は、それぞ
れ、0.010Åおよび1.18°である。
び埋没表面積は、全てPISA(Krissinel et al., (2007) J Mol Biol. 372:774-97)
により同定され、以下の表6に列挙される。VP1五量体のそれぞれの単量体は、P8D
11抗体のための単一の単離されたエピトープを含有することが見出された。かくして、
5つのscFvドメインは、5つの化学的および立体的に等価な位置でそれぞれの五量体
に結合する。それぞれのエピトープでの相互作用に関する詳細は本質的に同一であり、た
だ1つのscFv/VP1−エピトープ境界面がここで分析される。
全体的構造
それぞれのポリオーマウイルスVP1五量体構造の全体的な折畳みは、三次構造のレベ
ルで高度に相同性である。一次配列は、69〜85%で同一性に関してよく保存されてい
る。それぞれの五量体は、別の5つの鎖のβシートに対してスタッキングする3鎖βシー
ト、次いで、4鎖βシートによりそれぞれ構成される、5つの単量体から構成される。P
8D11 scFvは、VHとVLドメインとの間に20アミノ酸のリンカーを有するV
H−VL融合タンパク質である。図30に示されるように、VH−VL融合タンパク質は
、BKV−VP1五量体の側部外表面上に位置するエピトープに結合する。
BKV−VP1/P8D11複合体の結晶構造を使用して、BKV−VP1上のP8D
11エピトープを同定する。P8D11−scFvによるVP1上の相互作用表面は、い
くつかの連続的および不連続的(すなわち、非連続的)配列:すなわち、表6に詳述され
る残基77〜80、169〜186、および191〜192によって形成される。これら
の残基は、P8D11−scFvによって認識される三次元立体状エピトープを形成する
(図31A〜B)。結晶学により定義されるこのエピトープは、水素重水素交換質量分析
(HDx−MS)により定義されるものと良好に一致し、残基168〜190はP8D1
1−Fabによって実質的に保護される(図28)。また、エピトープの重要アミノ酸に
対して行われたアラニン走査とも良好に一致し(図29A〜C)、TYR169、ARG
170およびLYS172は、P8D11抗体のエピトープの一部である接触残基である
ことが示された。
Fvと接触するBKV−VP1の全ての残基を、PISAによって同定し、P8D11−
scFvによるその埋没表面積によって列挙および選別する。適用可能な場合、相互作用
の種類も列挙する。
本明細書に記載の抗VP1抗体は、ラムダ軽鎖を有するモノクローナル抗体、IgG1
アイソタイプであり、凍結乾燥することができる。これらの抗体は、ヒスチジン−スクロ
ース製剤バッファー中に可溶性であり、4週間安定である。さらに、抗VP1抗体は、最
小限に製剤化される薬物物質(例えば、安定剤の非存在下でヒスチジンバッファー中の)
として200mg/ml超で可溶性であった。
輸注用のすぐに使える抗体溶液にする。
定するためのサイズ排除クロマトグラフィー、肉眼では見ることができない粒子状物質の
試験、および効力試験を包含していた。
たは変更が当業者に対して示唆され、本出願および添付の特許請求の範囲の精神および範
囲の中に含まれることが理解される。
以下の態様を包含し得る。
[1] 抗体であって、前記抗体またはその抗原結合性断片がVP1に特異的に結合する、抗体。
[2] 前記抗体またはその抗原結合性断片が、BKウイルス血清型I〜血清型IVのVP1に特異的に結合する、上記[1]に記載の抗体。
[3] 前記抗体または抗原結合性断片が、表1の少なくとも1つのVP1に特異的に結合する、上記[1]に記載の抗体。
[4] 前記抗体またはその抗原結合性断片が、表1の2つ以上のVP1血清型に結合する、上記[1]に記載の抗体。
[5] 前記抗体またはその抗原結合性断片が、
a)BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型II;
b)BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型III;
c)BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型IV;
d)BKV VP1血清型IIおよびBKV VP1血清型III;ならびに
e)BKV VP1血清型IおよびJCV VP1
に結合する、上記[4]に記載の抗体。
[6] 前記抗体またはその抗原結合性断片が、5.0pM以下の結合親和性でBKV血清型Iに結合し、または29.0pM以下の結合親和性でBKV血清型IIに結合し、または6.0pM以下の結合親和性でBKV血清型IIIに結合し、または185.0pM以下の結合親和性でBKV血清型IVに結合し、または436pM以下の結合親和性でJCVに結合する、上記[1]に記載の抗体。
[7] 前記抗体または抗原結合性断片が、VP1エピトープ(配列番号500または配列番号501)に特異的に結合する、上記[1]に記載の抗体。
[8] 抗体であって、前記抗体またはその抗原結合性断片が、
(i)(a)配列番号6のHCDR1(CDR−相補性決定領域)、(b)配列番号7のHCDR2、(c)配列番号8のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号16のLCDR1、(e)配列番号17のLCDR2、および(f)配列番号18のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(ii)(a)配列番号26のHCDR1、(b)配列番号27のHCDR2、(c)配列番号28のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号36のLCDR1、(e)配列番号37のLCDR2、および(f)配列番号38のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(iii)(a)配列番号46のHCDR1、(b)配列番号47のHCDR2、(c)配列番号48のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号56のLCDR1、(e)配列番号57のLCDR2、および(f)配列番号58のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(iv)(a)配列番号66のHCDR1、(b)配列番号67のHCDR2、(c)配列番号68のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号76のLCDR1、(e)配列番号77のLCDR2、および(f)配列番号78のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(v)(a)配列番号86のHCDR1、(b)配列番号87のHCDR2、(c)配列番号88のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号96のLCDR1、(e)配列番号97のLCDR2、および(f)配列番号98のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(vi)(a)配列番号106のHCDR1、(b)配列番号107のHCDR2、(c)配列番号108のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号116のLCDR1、(e)配列番号117のLCDR2、および(f)配列番号118のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(vii)(a)配列番号126のHCDR1、(b)配列番号127のHCDR2、(c)配列番号128のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号136のLCDR1、(e)配列番号137のLCDR2、および(f)配列番号138のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(viii)(a)配列番号146のHCDR1、(b)配列番号147のHCDR2、(c)配列番号148のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号156のLCDR1、(e)配列番号157のLCDR2、および(f)配列番号158のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(ix)(a)配列番号166のHCDR1、(b)配列番号167のHCDR2、(c)配列番号168のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号176のLCDR1、(e)配列番号177のLCDR2、および(f)配列番号178のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(x)(a)配列番号186のHCDR1、(b)配列番号187のHCDR2、(c)配列番号188のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号196のLCDR1、(e)配列番号197のLCDR2、および(f)配列番号198のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xi)(a)配列番号206のHCDR1、(b)配列番号207のHCDR2、(c)配列番号208のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号216のLCDR1、(e)配列番号217のLCDR2、および(f)配列番号218のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xii)(a)配列番号226のHCDR1、(b)配列番号227のHCDR2、(c)配列番号228のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号236のLCDR1、(e)配列番号237のLCDR2、および(f)配列番号238のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xiii)(a)配列番号246のHCDR1、(b)配列番号247のHCDR2、(c)配列番号248のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号256のLCDR1、(e)配列番号257のLCDR2、および(f)配列番号258のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xiv)(a)配列番号266のHCDR1、(b)配列番号267のHCDR2、(c)配列番号268のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号276のLCDR1、(e)配列番号277のLCDR2、および(f)配列番号278のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xv)(a)配列番号286のHCDR1、(b)配列番号287のHCDR2、(c)配列番号288のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号296のLCDR1、(e)配列番号297のLCDR2、および(f)配列番号298のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xvi)(a)配列番号306のHCDR1、(b)配列番号307のHCDR2、(c)配列番号308のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号314のLCDR1、(e)配列番号315のLCDR2、および(f)配列番号316のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xvii)(a)配列番号322のHCDR1、(b)配列番号323のHCDR2、(c)配列番号324のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号332のLCDR1、(e)配列番号333のLCDR2、および(f)配列番号334のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xviii)(a)配列番号342のHCDR1、(b)配列番号343のHCDR2、(c)配列番号344のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号349のLCDR1、(e)配列番号350のLCDR2、および(f)配列番号351のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xix)(a)配列番号356のHCDR1、(b)配列番号357のHCDR2、(c)配列番号358のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号363のLCDR1、(e)配列番号364のLCDR2、および(f)配列番号365のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xx)(a)配列番号370のHCDR1、(b)配列番号371のHCDR2、(c)配列番号372のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号377のLCDR1、(e)配列番号378のLCDR2、および(f)配列番号379のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxi)(a)配列番号384のHCDR1、(b)配列番号385のHCDR2、(c)配列番号386のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号391のLCDR1、(e)配列番号392のLCDR2、および(f)配列番号393のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxii)(a)配列番号398のHCDR1、(b)配列番号399のHCDR2、(c)配列番号400のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号405のLCDR1、(e)配列番号406のLCDR2、および(f)配列番号407のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxiii)(a)配列番号412のHCDR1、(b)配列番号413のHCDR2、(c)配列番号414のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号419のLCDR1、(e)配列番号420のLCDR2、および(f)配列番号421のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxiv)(a)配列番号426のHCDR1、(b)配列番号427のHCDR2、(c)配列番号428のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号433のLCDR1、(e)配列番号434のLCDR2、および(f)配列番号435のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxv)(a)配列番号440のHCDR1、(b)配列番号441のHCDR2、(c)配列番号442のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号447のLCDR1、(e)配列番号448のLCDR2、および(f)配列番号449のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxvi)(a)配列番号454のHCDR1、(b)配列番号455のHCDR2、(c)配列番号456のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号461のLCDR1、(e)配列番号462のLCDR2、および(f)配列番号463のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxvii)(a)配列番号468のHCDR1、(b)配列番号469のHCDR2、(c)配列番号470のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号475のLCDR1、(e)配列番号476のLCDR2、および(f)配列番号477のLCDR3を含む軽鎖可変領域;
(xxviii)(a)配列番号482のHCDR1、(b)配列番号483のHCDR2、(c)配列番号484のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号489のLCDR1、(e)配列番号490のLCDR2、および(f)配列番号491のLCDR3を含む軽鎖可変領域
を含む、抗体。
[9] CDR内の少なくとも1つのアミノ酸が、表2の別の抗VP1抗体の対応するCDRの対応する残基により置換される、上記[8]に記載の抗体。
[10] CDR内の1または2つのアミノ酸が改変、欠失または置換されている、上記[8]に記載の抗体。
[11] 表3中の改変を含有する、上記[8]に記載の抗体。
[12] 前記可変重鎖領域または前記可変軽鎖領域のいずれかにわたって少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98または99%の同一性を保持する、上記[8]に記載の抗体。
[13] モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト操作抗体、ヒト抗体、一本鎖抗体(scFv)または抗体断片である、上記[8]に記載の抗体。
[14] 前記抗体またはその抗原結合性断片が、
(i)配列番号12を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号22を含む軽鎖可変領域(vL);
(ii)配列番号32を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号42を含む軽鎖可変領域(vL);
(iii)配列番号52を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号62を含む軽鎖可変領域(vL);
(iv)配列番号72を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号82を含む軽鎖可変領域(vL);
(v)配列番号92を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号102を含む軽鎖可変領域(vL);
(vi)配列番号112を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号122を含む軽鎖可変領域(vL);
(vii)配列番号132を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号142を含む軽鎖可変領域(vL);
(viii)配列番号152を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号162を含む軽鎖可変領域(vL);
(ix)配列番号172を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号182を含む軽鎖可変領域(vL);
(x)配列番号192を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号202を含む軽鎖可変領域(vL);
(xi)配列番号212を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号222を含む軽鎖可変領域(vL);
(xii)配列番号232を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号242を含む軽鎖可変領域(vL);
(xiii)配列番号252を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号262を含む軽鎖可変領域(vL);
(xiv)配列番号272を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号282を含む軽鎖可変領域(vL);
(xv)配列番号292を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号302を含む軽鎖可変領域(vL);
(xvi)配列番号312を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号320を含む軽鎖可変領域(vL);
(xvii)配列番号328を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号338を含む軽鎖可変領域(vL);
(xviii)配列番号348を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号355を含む軽鎖可変領域(vL);
(xix)配列番号362を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号369を含む軽鎖可変領域(vL);
(xx)配列番号376を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号383を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxi)配列番号390を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号397を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxii)配列番号404を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号411を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxiii)配列番号418を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号425を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxiv)配列番号432を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号439を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxv)配列番号446を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号453を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxvi)配列番号460を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号467を含む軽鎖可変領域(vL);
(xxvii)配列番号474を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号481を含む軽鎖可変領域(vL);または、
(xxviii)配列番号488を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号495を含む軽鎖可変領域(vL)
を含む、上記[1]に記載の抗体。
[15] 前記可変軽鎖領域または可変重鎖領域のいずれかにわたって少なくとも90、91、92、93、94、95、96、97、98または99%の同一性を保持する、上記[14]に記載の抗体またはその断片。
[16] 前記可変軽鎖領域または可変重鎖領域内の1、2、3、4または5個であるが、10個未満のアミノ酸が改変、欠失または置換されている、上記[14]に記載の抗体。
[17] モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト操作抗体、ヒト抗体、一本鎖抗体(scFv)または抗体断片である、上記[14]に記載の抗体。
[18] 前記抗体またはその断片が減少したグリコシル化を有するか、もしくはグリコシル化を有さないか、または低フコシル化されている、上記[1]〜[17]のいずれか1項に記載の抗体。
[19] 薬学的に許容される担体をさらに含む、上記[1]〜[18]のいずれか1項に記載の抗体またはその断片を含む医薬組成物。
[20] 前記薬学的に許容される担体がヒスチジンまたは糖を含有する、上記[19]に記載の医薬組成物。
[21] 前記糖がスクロースである、上記[20]に記載の医薬組成物。
[22] 前記のいずれか1項に記載の抗体または抗原結合性断片を複数含む医薬組成物であって、前記組成物中の抗体の少なくとも0.05%、0.1%、0.5%、1%、2%、3%、5%以上が、α2,3−結合シアル酸残基を有する、医薬組成物。
[23] 前記のいずれか1項に記載の抗体または抗原結合性断片を複数含む医薬組成物であって、前記抗体がいずれもバイセクティングGlcNAcを含まない、医薬組成物。
[24] 凍結乾燥物として調製される、前記のいずれか1項に記載の抗体またはその断片を含む医薬組成物。
[25] 上記[1]または上記[19]に記載の抗体または医薬組成物の有効量を、必要とする患者に注射または輸注により投与することを含む、BKウイルスまたはJCウイルス感染を中和する方法。
[26] 必要とする患者がBKウイルス尿症またはBKウイルス血症と診断される、上記[25]に記載の方法。
[27] 上記[1]または上記[19]に記載の抗体または医薬組成物の有効量を、必要とする患者に注射または輸注により投与することを含む、BKウイルスまたはJCウイルスと関連する障害を処置する、またはその可能性を低減させる方法であって、前記障害がネフロパシー、BKVAN、出血性膀胱炎(HC)、進行性多巣性白質脳症(PML)、顆粒細胞ニューロパシー(GCN)、間質性腎疾患、尿管狭窄、血管炎、大腸炎、網膜炎、髄膜炎、および免疫再構築症候群(IRIS)である、方法。
[28] 前記抗体または組成物が注射または輸注の前に再構成される、上記[25]または[27]に記載の方法。
[29] 前記抗体または医薬組成物が、別の治療剤と組み合わせて投与される、上記[25]または[27]に記載の方法。
[30] 前記治療剤が免疫抑制剤である、上記[29]に記載の方法。
[31] 前記免疫抑制剤が、モノホスフェートデヒドロゲナーゼ阻害剤、プリン合成阻害剤、カルシニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤である、上記[30]に記載の方法。
[32] 免疫抑制剤がミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール酸ナトリウム、アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスまたはシクロスポリンである、上記[31]に記載の方法。
[33] 前記治療剤がさらなる抗VP1抗体である、上記[29]に記載の方法。
[34] 医薬としての使用のための、上記[1]〜[18]のいずれか1項に記載の抗体またはその断片。
[35] BKウイルスまたはJCウイルス感染の中和における使用のための、上記[1]に記載の抗体もしくはその断片、または上記[19]〜[24]に記載の医薬組成物。
[36] ネフロパシー、BKVAN、出血性膀胱炎(HC)、進行性多巣性白質脳症(PML)、顆粒細胞ニューロパシー(GCN)、間質性腎疾患、尿管狭窄、血管炎、大腸炎、網膜炎、髄膜炎、および免疫再構築症候群(IRIS)の処置またはその可能性の低減における使用のための、上記[1]に記載の抗体もしくはその断片、または上記[19]〜[24]のいずれか1項に記載の医薬組成物。
[37] 別の治療剤と組み合わせて投与される、上記[35]に記載の抗体またはその断片の使用。
[38] 前記治療剤が免疫抑制剤である、上記[37]に記載の抗体またはその断片の使用。
[39] 前記免疫抑制剤がモノホスフェートデヒドロゲナーゼ阻害剤、プリン合成阻害剤、カルシニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤である、上記[38]に記載の抗体またはその断片の使用。
[40] 前記免疫抑制剤がミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール酸ナトリウム、アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスまたはシクロスポリンである、上記[39]に記載の抗体またはその断片の使用。
[41] 前記治療剤がさらなる抗VP1抗体である、上記[37]に記載の抗体またはその断片の使用。
[42] 上記[1]に記載の抗体または抗原結合性断片をコードする核酸。
[43] 上記[42]に記載の核酸を含むベクター。
[44] 上記[43]に記載のベクターを含む宿主細胞。
[45] 宿主細胞を培養すること、および培養物から抗体を回収することを含む、抗体または抗原結合性断片を生成するための方法。
[46] 標識された上記[1]に記載の抗体またはその抗原結合性断片を含む診断剤。
[47] 標識が、放射性標識、フルオロフォア、発色団、画像化剤、および金属イオンからなる群から選択される、上記[46]に記載の診断剤。
Claims (47)
- 抗体であって、前記抗体またはその抗原結合性断片がVP1に特異的に結合する、抗体
。 - 前記抗体またはその抗原結合性断片が、BKウイルス血清型I〜血清型IVのVP1に
特異的に結合する、請求項1に記載の抗体。 - 前記抗体または抗原結合性断片が、表1の少なくとも1つのVP1に特異的に結合する
、請求項1に記載の抗体。 - 前記抗体またはその抗原結合性断片が、表1の2つ以上のVP1血清型に結合する、請
求項1に記載の抗体。 - 前記抗体またはその抗原結合性断片が、
a)BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型II;
b)BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型III;
c)BKV VP1血清型IおよびBKV VP1血清型IV;
d)BKV VP1血清型IIおよびBKV VP1血清型III;ならびに
e)BKV VP1血清型IおよびJCV VP1
に結合する、請求項4に記載の抗体。 - 前記抗体またはその抗原結合性断片が、5.0pM以下の結合親和性でBKV血清型I
に結合し、または29.0pM以下の結合親和性でBKV血清型IIに結合し、または6
.0pM以下の結合親和性でBKV血清型IIIに結合し、または185.0pM以下の
結合親和性でBKV血清型IVに結合し、または436pM以下の結合親和性でJCVに
結合する、請求項1に記載の抗体。 - 前記抗体または抗原結合性断片が、VP1エピトープ(配列番号500または配列番号
501)に特異的に結合する、請求項1に記載の抗体。 - 抗体であって、前記抗体またはその抗原結合性断片が、
(i)(a)配列番号6のHCDR1(CDR−相補性決定領域)、(b)配列番号7
のHCDR2、(c)配列番号8のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号1
6のLCDR1、(e)配列番号17のLCDR2、および(f)配列番号18のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(ii)(a)配列番号26のHCDR1、(b)配列番号27のHCDR2、(c)
配列番号28のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号36のLCDR1、(
e)配列番号37のLCDR2、および(f)配列番号38のLCDR3を含む軽鎖可変
領域;
(iii)(a)配列番号46のHCDR1、(b)配列番号47のHCDR2、(c
)配列番号48のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号56のLCDR1、
(e)配列番号57のLCDR2、および(f)配列番号58のLCDR3を含む軽鎖可
変領域;
(iv)(a)配列番号66のHCDR1、(b)配列番号67のHCDR2、(c)
配列番号68のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号76のLCDR1、(
e)配列番号77のLCDR2、および(f)配列番号78のLCDR3を含む軽鎖可変
領域;
(v)(a)配列番号86のHCDR1、(b)配列番号87のHCDR2、(c)配
列番号88のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号96のLCDR1、(e
)配列番号97のLCDR2、および(f)配列番号98のLCDR3を含む軽鎖可変領
域;
(vi)(a)配列番号106のHCDR1、(b)配列番号107のHCDR2、(
c)配列番号108のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号116のLCD
R1、(e)配列番号117のLCDR2、および(f)配列番号118のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(vii)(a)配列番号126のHCDR1、(b)配列番号127のHCDR2、
(c)配列番号128のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号136のLC
DR1、(e)配列番号137のLCDR2、および(f)配列番号138のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(viii)(a)配列番号146のHCDR1、(b)配列番号147のHCDR2
、(c)配列番号148のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号156のL
CDR1、(e)配列番号157のLCDR2、および(f)配列番号158のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(ix)(a)配列番号166のHCDR1、(b)配列番号167のHCDR2、(
c)配列番号168のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号176のLCD
R1、(e)配列番号177のLCDR2、および(f)配列番号178のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(x)(a)配列番号186のHCDR1、(b)配列番号187のHCDR2、(c
)配列番号188のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号196のLCDR
1、(e)配列番号197のLCDR2、および(f)配列番号198のLCDR3を含
む軽鎖可変領域;
(xi)(a)配列番号206のHCDR1、(b)配列番号207のHCDR2、(
c)配列番号208のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号216のLCD
R1、(e)配列番号217のLCDR2、および(f)配列番号218のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xii)(a)配列番号226のHCDR1、(b)配列番号227のHCDR2、
(c)配列番号228のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号236のLC
DR1、(e)配列番号237のLCDR2、および(f)配列番号238のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xiii)(a)配列番号246のHCDR1、(b)配列番号247のHCDR2
、(c)配列番号248のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号256のL
CDR1、(e)配列番号257のLCDR2、および(f)配列番号258のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xiv)(a)配列番号266のHCDR1、(b)配列番号267のHCDR2、
(c)配列番号268のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号276のLC
DR1、(e)配列番号277のLCDR2、および(f)配列番号278のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xv)(a)配列番号286のHCDR1、(b)配列番号287のHCDR2、(
c)配列番号288のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号296のLCD
R1、(e)配列番号297のLCDR2、および(f)配列番号298のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xvi)(a)配列番号306のHCDR1、(b)配列番号307のHCDR2、
(c)配列番号308のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号314のLC
DR1、(e)配列番号315のLCDR2、および(f)配列番号316のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xvii)(a)配列番号322のHCDR1、(b)配列番号323のHCDR2
、(c)配列番号324のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号332のL
CDR1、(e)配列番号333のLCDR2、および(f)配列番号334のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xviii)(a)配列番号342のHCDR1、(b)配列番号343のHCDR
2、(c)配列番号344のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号349の
LCDR1、(e)配列番号350のLCDR2、および(f)配列番号351のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xix)(a)配列番号356のHCDR1、(b)配列番号357のHCDR2、
(c)配列番号358のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号363のLC
DR1、(e)配列番号364のLCDR2、および(f)配列番号365のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xx)(a)配列番号370のHCDR1、(b)配列番号371のHCDR2、(
c)配列番号372のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号377のLCD
R1、(e)配列番号378のLCDR2、および(f)配列番号379のLCDR3を
含む軽鎖可変領域;
(xxi)(a)配列番号384のHCDR1、(b)配列番号385のHCDR2、
(c)配列番号386のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号391のLC
DR1、(e)配列番号392のLCDR2、および(f)配列番号393のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xxii)(a)配列番号398のHCDR1、(b)配列番号399のHCDR2
、(c)配列番号400のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号405のL
CDR1、(e)配列番号406のLCDR2、および(f)配列番号407のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxiii)(a)配列番号412のHCDR1、(b)配列番号413のHCDR
2、(c)配列番号414のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号419の
LCDR1、(e)配列番号420のLCDR2、および(f)配列番号421のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xxiv)(a)配列番号426のHCDR1、(b)配列番号427のHCDR2
、(c)配列番号428のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号433のL
CDR1、(e)配列番号434のLCDR2、および(f)配列番号435のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxv)(a)配列番号440のHCDR1、(b)配列番号441のHCDR2、
(c)配列番号442のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号447のLC
DR1、(e)配列番号448のLCDR2、および(f)配列番号449のLCDR3
を含む軽鎖可変領域;
(xxvi)(a)配列番号454のHCDR1、(b)配列番号455のHCDR2
、(c)配列番号456のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号461のL
CDR1、(e)配列番号462のLCDR2、および(f)配列番号463のLCDR
3を含む軽鎖可変領域;
(xxvii)(a)配列番号468のHCDR1、(b)配列番号469のHCDR
2、(c)配列番号470のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号475の
LCDR1、(e)配列番号476のLCDR2、および(f)配列番号477のLCD
R3を含む軽鎖可変領域;
(xxviii)(a)配列番号482のHCDR1、(b)配列番号483のHCD
R2、(c)配列番号484のHCDR3を含む重鎖可変領域と、(d)配列番号489
のLCDR1、(e)配列番号490のLCDR2、および(f)配列番号491のLC
DR3を含む軽鎖可変領域
を含む、抗体。 - CDR内の少なくとも1つのアミノ酸が、表2の別の抗VP1抗体の対応するCDRの
対応する残基により置換される、請求項8に記載の抗体。 - CDR内の1または2つのアミノ酸が改変、欠失または置換されている、請求項8に記
載の抗体。 - 表3中の改変を含有する、請求項8に記載の抗体。
- 前記可変重鎖領域または前記可変軽鎖領域のいずれかにわたって少なくとも90、91
、92、93、94、95、96、97、98または99%の同一性を保持する、請求項
8に記載の抗体。 - モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト操作抗体、ヒト抗体、一本鎖抗体
(scFv)または抗体断片である、請求項8に記載の抗体。 - 前記抗体またはその抗原結合性断片が、
(i)配列番号12を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号22を含む軽鎖可変領域
(vL);
(ii)配列番号32を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号42を含む軽鎖可変領
域(vL);
(iii)配列番号52を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号62を含む軽鎖可変
領域(vL);
(iv)配列番号72を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号82を含む軽鎖可変領
域(vL);
(v)配列番号92を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号102を含む軽鎖可変領
域(vL);
(vi)配列番号112を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号122を含む軽鎖可
変領域(vL);
(vii)配列番号132を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号142を含む軽鎖
可変領域(vL);
(viii)配列番号152を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号162を含む軽
鎖可変領域(vL);
(ix)配列番号172を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号182を含む軽鎖可
変領域(vL);
(x)配列番号192を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号202を含む軽鎖可変
領域(vL);
(xi)配列番号212を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号222を含む軽鎖可
変領域(vL);
(xii)配列番号232を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号242を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xiii)配列番号252を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号262を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xiv)配列番号272を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号282を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xv)配列番号292を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号302を含む軽鎖可
変領域(vL);
(xvi)配列番号312を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号320を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xvii)配列番号328を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号338を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xviii)配列番号348を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号355を含む
軽鎖可変領域(vL);
(xix)配列番号362を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号369を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xx)配列番号376を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号383を含む軽鎖可
変領域(vL);
(xxi)配列番号390を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号397を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xxii)配列番号404を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号411を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xxiii)配列番号418を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号425を含む
軽鎖可変領域(vL);
(xxiv)配列番号432を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号439を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xxv)配列番号446を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号453を含む軽鎖
可変領域(vL);
(xxvi)配列番号460を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号467を含む軽
鎖可変領域(vL);
(xxvii)配列番号474を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号481を含む
軽鎖可変領域(vL);または、
(xxviii)配列番号488を含む重鎖可変領域(vH)と、配列番号495を含
む軽鎖可変領域(vL)
を含む、請求項1に記載の抗体。 - 前記可変軽鎖領域または可変重鎖領域のいずれかにわたって少なくとも90、91、9
2、93、94、95、96、97、98または99%の同一性を保持する、請求項14
に記載の抗体またはその断片。 - 前記可変軽鎖領域または可変重鎖領域内の1、2、3、4または5個であるが、10個
未満のアミノ酸が改変、欠失または置換されている、請求項14に記載の抗体。 - モノクローナル抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト操作抗体、ヒト抗体、一本鎖抗体
(scFv)または抗体断片である、請求項14に記載の抗体。 - 前記抗体またはその断片が減少したグリコシル化を有するか、もしくはグリコシル化を
有さないか、または低フコシル化されている、請求項1〜17のいずれか1項に記載の抗
体。 - 薬学的に許容される担体をさらに含む、請求項1〜18のいずれか1項に記載の抗体ま
たはその断片を含む医薬組成物。 - 前記薬学的に許容される担体がヒスチジンまたは糖を含有する、請求項19に記載の医
薬組成物。 - 前記糖がスクロースである、請求項20に記載の医薬組成物。
- 前記請求項のいずれか1項に記載の抗体または抗原結合性断片を複数含む医薬組成物で
あって、前記組成物中の抗体の少なくとも0.05%、0.1%、0.5%、1%、2%
、3%、5%以上が、α2,3−結合シアル酸残基を有する、医薬組成物。 - 前記請求項のいずれか1項に記載の抗体または抗原結合性断片を複数含む医薬組成物で
あって、前記抗体がいずれもバイセクティングGlcNAcを含まない、医薬組成物。 - 凍結乾燥物として調製される、前記請求項のいずれか1項に記載の抗体またはその断片
を含む医薬組成物。 - 請求項1または請求項19に記載の抗体または医薬組成物の有効量を、必要とする患者
に注射または輸注により投与することを含む、BKウイルスまたはJCウイルス感染を中
和する方法。 - 必要とする患者がBKウイルス尿症またはBKウイルス血症と診断される、請求項25
に記載の方法。 - 請求項1または請求項19に記載の抗体または医薬組成物の有効量を、必要とする患者
に注射または輸注により投与することを含む、BKウイルスまたはJCウイルスと関連す
る障害を処置する、またはその可能性を低減させる方法であって、前記障害がネフロパシ
ー、BKVAN、出血性膀胱炎(HC)、進行性多巣性白質脳症(PML)、顆粒細胞ニ
ューロパシー(GCN)、間質性腎疾患、尿管狭窄、血管炎、大腸炎、網膜炎、髄膜炎、
および免疫再構築症候群(IRIS)である、方法。 - 前記抗体または組成物が注射または輸注の前に再構成される、請求項25または27に
記載の方法。 - 前記抗体または医薬組成物が、別の治療剤と組み合わせて投与される、請求項25また
は27に記載の方法。 - 前記治療剤が免疫抑制剤である、請求項29に記載の方法。
- 前記免疫抑制剤が、モノホスフェートデヒドロゲナーゼ阻害剤、プリン合成阻害剤、カ
ルシニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤である、請求項30に記載の方法。 - 免疫抑制剤がミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール酸ナトリウム、
アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスまたはシクロスポリンである、請求項31に
記載の方法。 - 前記治療剤がさらなる抗VP1抗体である、請求項29に記載の方法。
- 医薬としての使用のための、請求項1〜18のいずれか1項に記載の抗体またはその断
片。 - BKウイルスまたはJCウイルス感染の中和における使用のための、請求項1に記載の
抗体もしくはその断片、または請求項19〜24に記載の医薬組成物。 - ネフロパシー、BKVAN、出血性膀胱炎(HC)、進行性多巣性白質脳症(PML)
、顆粒細胞ニューロパシー(GCN)、間質性腎疾患、尿管狭窄、血管炎、大腸炎、網膜
炎、髄膜炎、および免疫再構築症候群(IRIS)の処置またはその可能性の低減におけ
る使用のための、請求項1に記載の抗体もしくはその断片、または請求項19〜24のい
ずれか1項に記載の医薬組成物。 - 別の治療剤と組み合わせて投与される、請求項35に記載の抗体またはその断片の使用
。 - 前記治療剤が免疫抑制剤である、請求項37に記載の抗体またはその断片の使用。
- 前記免疫抑制剤がモノホスフェートデヒドロゲナーゼ阻害剤、プリン合成阻害剤、カル
シニューリン阻害剤またはmTOR阻害剤である、請求項38に記載の抗体またはその断
片の使用。 - 前記免疫抑制剤がミコフェノール酸モフェチル(MMF)、ミコフェノール酸ナトリウ
ム、アザチオプリン、タクロリムス、シロリムスまたはシクロスポリンである、請求項3
9に記載の抗体またはその断片の使用。 - 前記治療剤がさらなる抗VP1抗体である、請求項37に記載の抗体またはその断片の
使用。 - 請求項1に記載の抗体または抗原結合性断片をコードする核酸。
- 請求項42に記載の核酸を含むベクター。
- 請求項43に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 宿主細胞を培養すること、および培養物から抗体を回収することを含む、抗体または抗
原結合性断片を生成するための方法。 - 標識された請求項1に記載の抗体またはその抗原結合性断片を含む診断剤。
- 標識が、放射性標識、フルオロフォア、発色団、画像化剤、および金属イオンからなる
群から選択される、請求項46に記載の診断剤。
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