JP2021506318A - 免疫原性組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
i)グリコシルトランスフェラーゼ(複数可)をコードする1つ以上の核酸、
ii)オリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸、
iii)本発明のポリペプチドをコードする核酸、及び任意選択的に
iv)ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸
を含む宿主細胞が提供される。
図1:黄色ブドウ球菌由来のクランピング因子におけるタンパク質ドメインの概要を示す図である。図1は、黄色ブドウ球菌クランピング因子ClfAのドメイン構成の概略図である。フィブリノーゲン結合サブドメインN1-N2-N3を強調し、サブドメインN2に位置する解毒突然変異の位置と性質を示す。数字は、アミノ酸位置(各ドメインの開始点)を指す。SS=シグナル配列;N1-N3:フィブリノーゲン結合サブドメイン;R=セリン-アスパラギン酸ジペプチドリピート領域;W=細胞壁貫通領域;M=膜貫通領域。
図2:非常にN末端(突然変異体1)又は非常にC末端(突然変異体30)のいずれかに導入されたグリコシル化部位の遺伝子座を示す、黄色ブドウ球菌クランピング因子ドメインN2及びN3(ClfAN2N3、PDB識別子1N67)の結晶構造を示す図である。図2は、黄色ブドウ球菌クランピング因子ドメインN2N3(ClfAN2N3、Deivanayagamら、EMBO J.、2002年、PDB識別子1N67)の結晶構造を表し、試験された極端なN末端及びC末端グリコシル化部位A:非常にN末端にある部位(D244KDQNATK=突然変異体1)、及びB:非常にC末端にある部位(I557KDQNATK=突然変異体30)を示す。
図3、4:異なるClfAグリコサイト突然変異体バイオコンジュゲートの抗Hisウエスタンブロットを示す図である。陽性対照としてのD328KDQNRTK(プラスミド633)及びEPA-CP8を用いて、実施例1に記載される突然変異体1〜30のためのCP8-ClfAN2N3バイオコンジュゲート生成の抗Hisウエスタンブロット分析。レーン1:タンパク質マーカー(M)。ブロット:ウサギα-His 1:2000、ヤギα-マウス1:20,000。
図5、6:異なるClfAグリコサイト突然変異体バイオコンジュゲートの抗CP8ウエスタンブロットを示す図である。陽性対照としてのD328KDQNRTK(プラスミド633)及びEPA-CP8を用いた、実施例1に記載される突然変異体1〜30のためのCP8-ClfAN2N3バイオコンジュゲート生成の抗CP8ウエスタンブロット分析。ブロット:ウサギα-CP8-EPA-His 1:1000、ヤギα-ウサギ1:10000。
図7:CP8-ClfAN2N3突然変異体1(D244KDQNATK)バイオコンジュゲートの発現及び精製を示す図である。図7は、20Lバイオリアクター中の3つのプラスミドシステムから発現され、均質に精製された、CP8-ClfAN2N3突然変異体1の最終生成物の抗ClfA及び抗CP8ウエスタンブロット分析であるSDS-PAGE SimplyBlue SafeStainを示す。A) SimplyBlue Safe Stain、B) 抗ClfAN2N3ウエスタンブロット分析、C) 均一に精製されたCP8-ClfAN2N3 mut1(mut1)及び非グリコシル化ClfAN2N3 wt(U-wt)の抗CP8ウエスタンブロット。
図8:CP8-ClfAN2N3突然変異体30(I557KDQNATK)バイオコンジュゲートの発現及び精製を示す図である。図8は、20Lバイオリアクター中の1つのプラスミドシステムから発現され、均質に精製された、CP8-ClfAN2N3突然変異体30の最終生成物の抗ClfA及び抗CP8ウエスタンブロット分析であるSDS-PAGE SimplyBlue SafeStainを示す。A) SimplyBlue Safe Stain、及びB)抗ClfAN2N3ウエスタンブロット分析、並びにC) 均一に精製されたCP8-ClfAN2N3 mut30(mut30)及び非グリコシル化ClfAN2N3 mut30(U-mut30)の抗CP8ウエスタンブロット。
図9:グリコサイト突然変異体1と比較した、担体タンパク質ClfAN2N3グリコサイト突然変異体30との関連における黄色ブドウ球菌バイオコンジュゲート生成のタンパク質安定性の改善を示す図である。3つのプラスミドシステムを用いたCP8-ClfAN2N3バイオコンジュゲート生成のウエスタンブロット分析は、グリコサイト突然変異体1(レーン2)と比較してグリコサイト突然変異体30(レーン3)のタンパク質分解が減少していることを示す。レーン1=タンパク質マーカー。
図10:ClfAN2N3突然変異体30に対する異なるシグナル配列による生成収量への影響を示す図である。異なるシグナル配列:大腸菌(E. coli)ジスルフィドオキシドレダクターゼDsbAシグナル配列(DsbA)、S. フレキシネル(S. flexneri)鞭毛Pリングタンパク質シグナル配列(Flgl)、大腸菌易熱性エンテロトキシンIIB、B鎖シグナル配列(LTIIb)、大腸菌マルトース結合タンパク質MalEシグナル配列(MalE)、P. カロトボラム(P. carotovorum)ペクターゼリアーゼ2前駆体シグナル配列(PelB)、S. アガラクティエ(S. agalactiae)表面免疫原性タンパク質シグナル配列(SipA)、大腸菌トランスロケーションタンパク質シグナル配列(TolB)、大腸菌外膜タンパク質シグナル配列(OmpA)を用いて生成されたHRHRタグを有するClfA-CP8-ClfAN2N3突然変異体30の抗Hisウエスタンブロット。レーン1: PageRulerプレステインドタンパク質マーカー、レーンA: DsbAシグナル配列、レーンB: Flglシグナル配列、レーンC: LTIIbシグナル配列、レーンD: MalEシグナル配列、レーンE: PelBシグナル配列、レーンF: SipAシグナル配列、レーンG: TolBシグナル配列、レーンH: OmpAシグナル配列。
専門用語
担体タンパク質:コンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)を作製するために抗原(例えば、糖抗原)に共有結合したタンパク質。担体タンパク質は、T細胞がコンジュゲートした抗原に対してT細胞性免疫を活性化する。
ClfA:黄色ブドウ球菌由来のクランピング因子A
CP:莢膜多糖。
LPS:リポ多糖。
wzy:多糖重合を触媒する酵素をコードする多糖ポリメラーゼ遺伝子。コードされた酵素は、オリゴ糖単位を非還元末端に転移し、グリコシド結合を形成する。
waaL:膜結合酵素をコードするO抗原リガーゼ遺伝子。コードされた酵素は、ウンデカプレニル-二リン酸(UPP)結合O抗原をリピドAコアオリゴ糖に転移し、リポ多糖を形成する。
Und-PP:ウンデカプレニルピロリン酸。
Und-P:ウンデカプレニルリン酸。
還元末端:オリゴ糖又は多糖の還元末端は、グリコシド結合に関与せず、したがって開鎖型に変換することができる遊離アノマー炭素を有する単糖である。
クランピング因子A(ClfA)は、フィブリノーゲンγ鎖を結合する黄色ブドウ球菌接着タンパク質であり、ほとんどすべての黄色ブドウ球菌株に存在する。これは、重要な毒素因子であり、敗血症性関節炎及び心内膜炎の病因に寄与する。ClfAは、フィブリノーゲンのγ鎖のC末端に結合し、それによってフィブリノーゲン溶液中で細菌のクランピングを誘導することができる。黄色ブドウ球菌上でのClfAの発現は、マクロファージと好中球の両方による食作用を阻害する。好中球では、これは、フィブリノーゲン依存性とフィブリノーゲン非依存性の機構の両方に起因する。対照的に、血小板は、GPIIb/IIIaとの相互作用を介してClfAを発現する細菌によって活性化され、凝集をもたらす。これは、フィブリノーゲンが存在する場合に最も効率的に実行されるが、血小板活性化のためのフィブリノーゲン非依存性経路も存在する。
本発明はまた、本発明のポリペプチドを含む(又はそれからなる)コンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)を提供し、ポリペプチドは、例えば、抗原、好ましくは多糖又はオリゴ糖抗原に共有結合で連結されている。
A)カルボキシル(例えば、アスパラギン酸又はグルタミン酸を介する)。一実施形態では、この基は、直接糖上のアミノ基に、又はカルボジイミド化学、例えばEDACを有するリンカー上のアミノ基に連結される。
B)アミノ基(例えば、リジンを介する)。一実施形態では、この基は、直接糖上のカルボキシル基に、又はカルボジイミド化学、例えばEDACを有するリンカー上のカルボキシル基に連結される。別の実施形態では、この基は、直接糖上の、CDAP若しくはCNBrで活性化されたヒドロキシル基に又はリンカー上のこのような基に、アルデヒド基を有する糖若しくはリンカーに、スクシンイミドエステル基を有する糖又はリンカーに結合される。
C)スルフィドリル(例えば、システインを介する)。一実施形態では、この基は、ブロモ若しくはクロロアセチル化された糖、又はマレイミド化学を有するリンカーに連結される。一実施形態では、この基は、ビスジアゾベンジジンで活性化/修飾(改変)される。
D)ヒドロキシル基(例えば、チロシンを介する)。一実施形態では、この基は、ビスジアゾベンジジンで活性化/修飾(改変)される。
E)イミダゾリル基(例えば、ヒスチジンを介する)。一実施形態では、この基は、ビスジアゾベンジジンで活性化/修飾(改変)される。
F)グアニジル基(例えば、アルギニンを介する)。
G)インドリル基(例えば、トリプトファンを介する)。
糖-OH+CNBr又はCDAP----->シアン酸エステル+NH2-タンパク質---->コンジュゲート
糖-アルデヒド+NH2-タンパク質---->シッフ塩基+NaCNBH3---->コンジュゲート
糖-COOH+NH2-タンパク質+EDAC---->コンジュゲート
糖-NH2+COOH-タンパク質+EDAC---->コンジュゲート
スペーサー(リンカー)を介した間接的カップリングアプローチ:
糖-OH+CNBr又はCDAP--->シアン酸エステル+NH2----NH2---->糖----NH2+COOH-タンパク質+EDAC----->コンジュゲート
糖-OH+CNBr又はCDAP---->シアン酸エステル+NH2-----SH----->糖----SH+SH-タンパク質(露出したシステインを有する天然タンパク質、又は例えばSPDPによるタンパク質のアミノ基の修飾(改変)後に得られたタンパク質)-----糖-S-S-タンパク質
糖-OH+CNBr又はCDAP--->シアン酸エステル+NH2----SH------->糖----SH+マレイミド-タンパク質(アミノ基の修飾(改変))---->コンジュゲート
糖-OH+CNBr又はCDAP--->シアン酸エステル+NH2-----SH--->糖-SH+ハロアセチル化タンパク質---->コンジュゲート
糖-COOH+EDAC+NH2-----NH2--->糖------NH2+EDAC+COOH-タンパク質---->コンジュゲート
糖-COOH+EDAC+NH2----SH----->糖----SH+SH-タンパク質(露出したシステインを有する天然タンパク質、又は例えばSPDPによるタンパク質のアミノ基の修飾(改変)後に得られたタンパク質)----->糖-S-S-タンパク質
糖-COOH+EDAC+NH2----SH----->糖----SH+マレイミド-タンパク質(アミノ基の修飾(改変))---->コンジュゲート
糖-COOH+EDAC+NH2----SH--->糖-SH+ハロアセチル化タンパク---->コンジュゲート
糖-アルデヒド+NH2-----NH2---->糖---NH2+EDAC+COOH-タンパク質---->コンジュゲート
注釈:上記のEDACの代わりに、任意の適切なカルボジイミドを使用することができる。
ある実施形態では、本発明のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)中の抗原の1つは、糖、例えば、細菌莢膜糖、細菌リポ多糖又は細菌オリゴ糖である。ある実施形態では、抗原は、細菌莢膜糖である。
本発明はまた、以下:
i)グリコシルトランスフェラーゼ(複数可)をコードする1つ以上の核酸、
ii)オリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸、
iii)本発明のポリペプチドをコードする核酸、及び任意選択的に
iv)ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸
含む宿主細胞を提供する。
i)グリコシルトランスフェラーゼ(複数可)をコードする1つ以上の核酸、
ii)オリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸、
iii)本発明のポリペプチドをコードする核酸、
iv)ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸、及び
vi)フリッパーゼ(例えば、wxy)をコードする核酸
を含む宿主細胞を提供する。
本発明の宿主細胞は、ハイブリッドオリゴ糖及び/又は多糖を生成することができる遺伝子機構(例えば、グリコシルトランスフェラーゼ、フリッパーゼ、ポリメラーゼ、及び/又はオリゴサッカリルトランスフェラーゼ)をコードする核酸、並びに抗原を本発明のポリペプチドに連結することができる遺伝子機構を含み、及び/又は含むように改変することができる。
本発明の宿主細胞は、オリゴ糖又は多糖のリピート単位を生成するグリコシルトランスフェラーゼをコードする核酸を含む。ある実施形態では、前記リピート単位は、還元末端にヘキソースを含まず、前記オリゴ糖又は多糖のリピート単位は、還元末端にヘキソースを含むドナーオリゴ糖又は多糖のリピート単位に由来する。
N-結合タンパク質のグリコシル化-標的タンパク質のポリペプチド鎖中のアスパラギン残基への炭水化物分子の付加-は、真核生物の小胞体で起こる翻訳後修飾の最も一般的なタイプである。このプロセスは、小胞体内の保存配列Asn-X-Ser/Thr(Xは、プロリンを除く任意のアミノ酸である)内の新生タンパク質のアスパラギン残基に、脂質担体(ドリコールリン酸)から予めアセンブルしたオリゴ糖の転移に関与する酵素オリゴサッカリルトランスフェラーゼ複合体(OST)によって達成される。
ある実施形態では、ポリメラーゼ(例えば、wzy)は、本発明の宿主細胞に導入される(すなわち、ポリメラーゼは宿主細胞に対して異種である)。ある実施形態では、ポリメラーゼは、細菌ポリメラーゼである。ある実施形態では、ポリメラーゼは、莢膜多糖ポリメラーゼ(例えば、wzy)又はO抗原ポリメラーゼ(例えば、wzy)である。ある実施形態では、ポリメラーゼは、莢膜多糖ポリメラーゼ(例えば、wzy)である。
ある実施形態では、フリッパーゼ(wzx又は相同体)は、本発明の宿主細胞に導入される(すなわち、フリッパーゼは宿主細胞に対して異種である)。したがって、本発明の宿主細胞は、フリッパーゼをさらに含むことができる。ある実施形態では、フリッパーゼは、細菌フリッパーゼである。フリッパーゼは、野生型リピート単位、及び/又はそれらに対応する操作された(ハイブリッド)リピート単位を細胞質から宿主細胞(例えば、大腸菌)のペリプラズムに移行させる。したがって、本発明の宿主細胞は、フリッパーゼ(wzx)をコードする核酸を含み得る。
アクセサリー酵素
ある実施形態では、1つ以上のアクセサリー酵素をコードする核酸は、本発明の宿主細胞に導入される。したがって、本発明の宿主細胞は、これらのアクセサリー酵素の1つ以上をさらに含み得る。1つ以上の補助酵素をコードするこのような核酸は、プラスミド媒介性であるか、又は本発明の宿主細胞のゲノムに組み込まれ得る。例示的なアクセサリー酵素には、限定されないが、エピメラーゼ、分枝、修飾(改変)(例えば、コリン、グリセリンリン酸、ピルビン酸を付加するため)、アミド化、鎖長調節、アセチル化、ホルミル化、重合化酵素が含まれる。
本発明の宿主細胞を生じさせるために用いることができる例示的な宿主細胞には、限定されないが、エシェリキア属種、シゲラ属種、クレブシエラ属種、キサントモナス属種、サルモネラ属種、エルシニア属種、ラクトコッカス属種、ラクトバチルス属種、シュードモナス属種、コリネバクテリウム属種、ストレプトマイセス属種、ストレプトコッカス属種、スタフィロコッカス属種、バチルス属種、及びクロストリジウム属種が挙げられる。特定の実施形態では、本明細書で使用される宿主細胞は、大腸菌である。
本発明の宿主細胞は、抗原、例えば多糖又はオリゴ糖抗原、例えば、本発明のポリペプチドに連結された黄色ブドウ球菌糖抗原を含むバイオコンジュゲートを生成するために使用することができる。宿主細胞を用いてバイオコンジュゲートを生成する方法は、例えば、国際公開第WO2003/074687号、同第WO2006/119987号及び同第WO2011/138361号に記載されている。本明細書に記載されているように、バイオコンジュゲートは、それらが製造においてより少ない化学物質を必要とし、生じる最終生成物に関してより一貫性があるという点において、抗原-担体タンパク質の化学的コンジュゲートを上回る有利な特性を有する。
種々の方法を用いて、本発明のバイオコンジュゲートの構造組成及び糖鎖長を分析することができる。
特定のタンパク質における部位の使用が、挿入された系とは対照的に、複数のプラスミド系において変化することを示すために、グリコシル化部位の使用を定量化する必要がある。そうする方法を以下に列挙する。
バイオコンジュゲートの均一性(すなわち、結合した糖残基の均一性)は、グリカン長及び流体力学的半径を測定する方法を用いて評価することができる。
収量:収量は、制御され、最適化された条件下でバイオリアクター中で増殖させた1リットルの細菌生成培養物から得られた炭水化物量として測定される。バイオコンジュゲートの精製後、炭水化物収量は、アントロンアッセイ又は炭水化物特異的抗血清を用いるELISAのいずれかによって直接測定することができる。タンパク質量(BCA、Lowry、又はBradfordアッセイで測定される)及び糖鎖長と構造を用いて、タンパク質1gあたりの理論的な炭水化物量を計算することにより、間接的な測定が可能である。さらに、収量はまた、揮発性緩衝液から糖タンパク質調製物を乾燥させ、天秤を用いて重量を測定することによって測定することができる。
本発明のポリペプチド及びコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)は、免疫原性組成物及びワクチンに含めるのに特に適している。本発明は、本発明のポリペプチド、又は本発明のコンジュゲート、又は本発明のバイオコンジュゲートを含む免疫原性組成物を提供する。
本発明はまた、本発明の免疫原性組成物及び薬学的に許容される賦形剤又は担体を含むワクチンを提供する。
ある実施形態では、本発明の免疫原性組成物又はワクチンは、アジュバントを含むか又はアジュバントと組み合わせて投与される。本発明の免疫原性組成物又はワクチンと組み合わせて投与するためのアジュバントは、前記免疫原性組成物又はワクチンの投与前、同時、又は投与後に投与することができる。一部の実施形態では、用語「アジュバント」とは、本発明のワクチンの免疫原性組成物と組み合わせて又はその一部として投与された場合、バイオコンジュゲートに対する免疫応答を増強し、増大し、及び/又は強化するが、化合物が単独で投与された場合には、ポリペプチド/コンジュゲート/バイオコンジュゲートに対する免疫応答を生じさせない化合物を指す。一部の実施形態では、アジュバントは、ポリペプチド、コンジュゲート又はバイオコンジュゲートに対する免疫応答を生じさせ、アレルギー又は他の有害反応を生成しない。
本発明の免疫原性組成物又はワクチンを使用して、前記免疫原性組成物又はワクチンを全身又は粘膜経路を介して投与することによって、感染に感受性の哺乳動物を保護又は治療することができる。これらの投与には、筋肉内(IM)、腹腔内、皮内(ID)若しくは皮下経路による注射、又は口腔/消化管、呼吸器、泌尿生殖器への粘膜投与が含まれ得る。例えば、鼻腔内(IN)投与は、肺炎又は中耳炎の治療に使用され得る(肺炎球菌の鼻咽頭保菌がより効果的に予防され、したがって、その初期段階での感染を減弱させることができるためである)。本発明の免疫原性組成物又はワクチンは、単回用量として投与することができるが、それらの成分はまた、同時に又は異なる時間に、一緒に同時投与され得る(例えば、肺炎球菌多糖は、互いに対する免疫応答の最適な調整のために、別々に、同時に、又はワクチンのいずれかの細菌タンパク質成分の投与後の1〜2週間に投与することができる)。同時投与について、任意選択のTh1アジュバントは、異なる投与のいずれか又は全てに存在し得るが、しかしながら、本発明の1つの具体的な態様では、それは、免疫原性組成物又はワクチンのポリペプチド成分と組み合わせて存在する。単一の投与経路に加えて、2つの異なる投与経路を使用することができる。例えば、多糖は、IM(又はID)に投与することができ、細菌タンパク質は、IN(又はID)に投与することができる。さらに、本発明のワクチンは、初回用量のためにIMで、及び追加免疫用量のためにINで投与することができる。
各免疫原性組成物又はワクチン用量中のコンジュゲート抗原の量は、典型的なワクチンにおいて有意な副作用なしに免疫防御応答を誘導する量として選択される。このような量は、どの特定の免疫原が使用され、どのようにしてそれが示されるかに依存して変化する。ポリペプチドの含有量は、典型的には1〜100μg、適切には5〜50μgの範囲である。糖の含有量は、典型的には0.1〜10μg、適切には1〜5μgの範囲である。
本発明はまた、本発明のポリペプチド、コンジュゲート又はバイオコンジュゲートを対象に投与することを含む、対象の細菌感染を治療及び/又は予防する方法を提供する。ポリペプチド、コンジュゲート又はバイオコンジュゲートは、免疫原性組成物又はワクチンの形態であり得る。特定の実施形態では、本発明の免疫原性組成物又はワクチンは、細菌による対象(例えば、ヒト対象)の感染の予防に使用される。本発明のポリペプチド、コンジュゲート又はバイオコンジュゲートを用いて治療及び/又は予防することができる細菌感染には、スタフィロコッカス属種、エシェリキア属種、シゲラ属種、クレブシエラ属種、キサントモナス属種、サルモネラ属種、エルシニア属種、アエロモナス属種、フランシセラ属種、ヘリコバクター属種、プロテウス属種、ラクトコッカス属種、ラクトバチルス属種、シュードモナス属種、コリネバクテリウム属種、ストレプトマイセス属種、ストレプトコッカス属種、エンテロコッカス属種、バチルス属種、クロストリジウム属種、リステリア属種、又はカンピロバクター属種によって引き起こされるものが含まれる。特定の実施形態では、本発明の免疫原性組成物又はワクチンは、スタフィロコッカス属種(例えば、黄色ブドウ球菌)による感染を治療又は予防するために使用される。
1. 配列番号3のアミノ酸配列、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、アミノ酸配列が、D/E-X-N-Z-S/T(配列番号21)及びK-D/E-X-N-Z-S/T-K(配列番号22)(X及びZは、独立して、プロリンとは別の任意のアミノ酸である)から選択される1つ以上のコンセンサス配列(複数可)を含み、前記コンセンサス配列が、配列番号3のアミノ酸残基313〜340の間の1つ以上のアミノ酸で、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列内の同等の位置で付加され又はそれと置換されているという点で改変されているポリペプチド。
2. 前記コンセンサス配列が、配列番号3におけるアミノ酸残基Q327、D329、P331又若しくはI337と置換され、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列において配列番号3におけるアミノ酸残基Q327、D329、若しくはI337と同等であるアミノ酸位置で置換されている、段落1に記載のポリペプチド。
3. 配列番号3においてアミノ酸残基I337と置換され、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列において配列番号3におけるアミノ酸残基I337と同等であるアミノ酸位置で置換されている単一のコンセンサス配列を含有する、段落2に記載のポリペプチド。
4. XがQ(グルタミン)であり、ZがA(アラニン)である、段落1〜3のいずれか1つに記載のポリペプチド(例えば、K-D-Q-N-A-T-K(配列番号23))。
5. アミノ酸配列が、配列番号3のアミノ酸配列に関してP116からS及びY118からA(又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列における同等の位置)から選択される少なくとも1つのアミノ酸置換によってさらに改変され、任意選択的に配列番号4〜5又は10〜12のいずれか1つの配列を含む、段落1〜4のいずれか1つに記載のポリペプチド。
6. 配列番号3の配列と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含み(又はそれらからなり)、前記アミノ酸配列は、D/E-X-N-Z-S/T(配列番号21)又はK-D/E-X-N-Z-S/T-K(配列番号22)(X及びZは、独立してプロリンとは別の任意のアミノ酸である)コンセンサス配列を含み、該コンセンサス配列が配列番号3のI337位のアミノ酸と置換され、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列において配列番号3のアミノ酸残基Q327、D329、又はI337と同等であるアミノ酸位置で置換されている、段落5に記載のポリペプチド。
7. N末端にさらなるセリン残基を有するポリペプチドであって、任意選択的に前記ポリペプチドは、配列番号6若しくは配列番号12と少なくとも97%、98%、99%若しくは100%同一であるアミノ酸配列を有し、及び/又はC末端にさらなるグリシン又はグリシン-セリン残基を有するポリペプチドであって、任意選択的に前記ポリペプチドは、配列番号32と少なくとも97%、98%、99%若しくは100%同一であるアミノ酸配列を有する、段落1〜6のいずれか1つに記載のポリペプチド。
8. アミノ酸配列が、宿主細胞(例えば、細菌)のペリプラズムにポリペプチドを方向付けることができるシグナル配列をさらに含み、任意選択的に前記シグナル配列は配列番号13〜20から選択され、任意選択的に前記ポリペプチドは配列番号5若しくは配列番号11と少なくとも97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を有する、段落1〜7のいずれか1つに記載のポリペプチド。
9. アミノ酸配列が、ClfAタンパク質の精製に有用であるペプチドタグをさらに含み、任意選択的に前記ペプチドタグは6個のヒスチジン残基を含み、任意選択的に前記ペプチドタグはアミノ酸配列のC末端に配置され、任意選択的に前記ポリペプチドは配列番号25、配列番号26若しくは配列番号27と少なくとも97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を有する、段落1〜8に記載のいずれか1つのポリペプチド。
10. 前記ポリペプチドがグリコシル化されている、段落1〜9のいずれか1つに記載のポリペプチド。
11. 抗原、例えば、多糖又はオリゴ糖抗原に連結されている、段落1〜10のいずれか1つに記載のポリペプチドを含むコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
12. コンジュゲートが、任意選択的に、カルボジイミド化学、還元アミノ化(animation)、シアニル化化学(例えば、CDAP化学)、マレイミド化学、ヒドラジド化学、エステル化学、及びN-ヒドロイルスクシンイミド化学からなる群から選択される化学コンジュゲーション法を用いて得られる化学連結を通じて、直接的に又はリンカーを介して抗原に共有結合されている、段落11に記載のコンジュゲート。
13.抗原が、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リジン、システイン、チロシン、ヒスチジン、アルギニン又はトリプトファン(例えば、アスパラギン)から選択される、ポリペプチド上のアミノ酸に連結されている、段落11又は段落12に記載のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
14. 抗原が、糖、任意選択的に、黄色ブドウ球菌血清型5又は8の莢膜糖から任意選択的に選択される細菌莢膜糖(例えば、黄色ブドウ球菌由来)である、段落11〜13のいずれか1つに記載のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
15. 抗原は、黄色ブドウ球菌血清型8由来の細菌莢膜糖である、段落14に記載のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
16.段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
17.段落16に記載のポリヌクレオチドを含むベクター
18.グリコシルトランスフェラーゼ(複数可)をコードする1つ以上の核酸、
オリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸、
段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチドをコードする核酸、及び任意選択的に
ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸
を含む宿主細胞。
19.(a)ウンデカプレニルピロリン酸(Und-PP)上にヘキソース単糖誘導体をアセンブルされたグリコシルトランスフェラーゼ、及び(b)Und-PP上にアセンブルされたヘキソース単糖誘導体に単糖を付加することができる1以上のグリコシルトランスフェラーゼを含む、段落18に記載の宿主細胞。
20.Und-PP上にヘキソース単糖誘導体をアセンブルさせる前記グリコシルトランスフェラーゼは、宿主細胞に対して異種であり、及び/又はグリコシルトランスフェラーゼ(複数可)をコードする1つ以上の遺伝子に対して異種であり、任意選択的に、Und-PP上にヘキソース単糖誘導体をアセンブルさせる前記グリコシルトランスフェラーゼは、エシェリキア属種、シゲラ属種、クレブシエラ属種、キサントモナス属種、サルモネラ属種、エルシニア属種、アエロモナス属種、フランシセラ属種、ヘリコバクター属種、プロテウス属種、ラクトコッカス属種、ラクトバチルス属種、シュードモナス属種、コリネバクテリウム属種、ストレプトマイセス属種、ストレプトコッカス属種、エンテロコッカス属種、スタフィロコッカス属種、バチルス属種、クロストリジウム属種、リステリア属種、又はカンピロバクター属種由来であり、任意選択的にwecA(例えば、大腸菌由来のwecA)である、段落19に記載の宿主細胞。
21.前記ヘキソース単糖誘導体が、C-2位がアセトアミド基で修飾(改変)される任意の単糖、例えばN-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、2,4-ジアセトアミド-2,4,6-トリデオキシヘキソース(DATDH)、N-アセチルフコサミン(FucNAc)、又はN-アセチルキノボサミン(QuiNAc)である、段落18〜20のいずれか一つに記載の宿主細胞。
22.Und-PP上にアセンブルされたヘキソース単糖誘導体に単糖を付加することができる前記1つ以上のグリコシルトランスフェラーゼが、大腸菌O28由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wbeY)、若しくは大腸菌O167由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wfdK)であり、又は大腸菌O28由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wbeY)及び大腸菌O167由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wfdK)である、段落18〜21のいずれか一つに記載の宿主細胞。
23.黄色ブドウ球菌CP5由来のcapH、capI、capJ、及び/又はcapK、並びに任意選択的に黄色ブドウ球菌CP5由来のcapD、capE、capF、capG、capL、capM、capN、capO及び/又はcapPを含む黄色ブドウ球菌CP5糖のリピート単位の合成に十分なグリコシルトランスフェラーゼを含む、段落18〜22のいずれか一つに記載の宿主細胞。
24.黄色ブドウ球菌CP5由来のcapH、capI、capJ、及び/又はcapK、並びに任意選択的に緑膿菌O11由来のwbjB、wbjC、wbjD、wbjE、wbjF、wbjL、wbpM、wzz及び/又はwzx、並びに大腸菌O16由来のwecB及び/又はwecCを含む黄色ブドウ球菌CP5糖のリピート単位を合成するのに十分なグリコシルトランスフェラーゼを含む、段落18〜23のいずれか一つに記載の宿主細胞。
25.オリゴサッカリルトランスフェラーゼは、カンピロバクター・ジェジュニに由来し、任意選択的に前記オリゴサッカリルトランスフェラーゼはカンピロバクター・ジェジュニのpglBであり、任意選択的にカンピロバクター・ジェジュニのpglB遺伝子は宿主細胞ゲノムに組み込まれ、任意選択的に宿主細胞の少なくとも1つの遺伝子は機能的に不活化又は欠失されており、任意選択的に宿主細胞のwaaL遺伝子は機能的に不活化又は欠失されており、任意選択的に宿主細胞のwaaL遺伝子はオリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸によって置き換えられており、任意選択的に宿主細胞のwaaL遺伝子はカンピロバクター・ジェジュニpglBによって置き換えられている、段落18〜24のいずれか一つに記載の宿主細胞。
26.前記宿主細胞が、莢膜多糖ポリメラーゼ(例えば、wzy)又はO抗原ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸を含み、任意選択的に前記莢膜多糖ポリメラーゼは、黄色ブドウ球菌由来であり、任意選択的に黄色ブドウ球菌CP5又はCP8由来である、段落18〜25のいずれか一つに記載の宿主細胞。
27.前記宿主細胞が、フリッパーゼ(wzx)をコードする核酸を含み、任意選択的に、前記フリッパーゼは黄色ブドウ球菌由来であり、任意選択的に黄色ブドウ球菌CP5又はCP8由来である、段落18〜26のいずれか一つに記載の宿主細胞。
28.前記宿主細胞が、単糖を修飾することができる酵素、任意選択的にエピメラーゼをさらに含み、任意選択的に、前記エピメラーゼは、エシェリキア属種、シゲラ属種、クレブシエラ属種、キサントモナス属種、サルモネラ属種、エルシニア属種、アエロモナス属種、フランシセラ属種、ヘリコバクター属種、プロテウス属種、ラクトコッカス属種、ラクトバチルス属種、シュードモナス属種、コリネバクテリウム属種、ストレプトマイセス属種、ストレプトコッカス属種、エンテロコッカス属種、スタフィロコッカス属種、バチルス属種、クロストリジウム属種、リステリア属種、又はカンピロバクター属種由来であり、任意選択的に前記エピメラーゼは、大腸菌由来であり、任意選択的に大腸菌O157由来のZ3206又はgalEである、段落18〜27のいずれか一つに記載の宿主細胞。
29.ポリペプチドをコードする核酸が、宿主細胞中のプラスミドにある、段落18〜28のいずれか一つに記載の宿主細胞。
30.大腸菌である、段落18〜29のいずれか一つに記載の宿主細胞。
31.糖に連結された、ポリペプチドを含むバイオコンジュゲートを生成する方法であって、(i)タンパク質の生成に適した条件下で、段落18〜30のいずれか一つに記載の宿主細胞を培養すること、及び(ii)バイオコンジュゲートを単離することを含む方法。
32. 前記バイオコンジュゲートは、ポリペプチド、例えば、段落1〜10のいずれか1つに記載のポリペプチドに連結された糖を含む、段落31の方法によって生成されるバイオコンジュゲート。
33.段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチド、又は段落11〜15のいずれか一つに記載のコンジュゲート、又は段落32に記載のバイオコンジュゲートを含む免疫原性組成物。
34.ポリペプチド又はコンジュゲート若しくはバイオコンジュゲートを薬学的に許容される賦形剤又は担体と混合する工程を含む、段落33に記載の免疫原性組成物を作製する方法。
35.段落34に記載の免疫原性組成物及び薬学的に許容される賦形剤又は担体を含むワクチン。
36.それを必要とする対象における黄色ブドウ球菌感染を治療又は予防する方法であって、段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチド、又は段落11〜15のいずれか一つに記載のコンジュゲート、又は段落32に記載のバイオコンジュゲートの治療有効量を前記対象に投与することを含む方法。
37.ヒト宿主を黄色ブドウ球菌感染に対して免疫する方法であって、段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチド、又は段落11〜15のいずれか一つに記載のコンジュゲート、又は段落32に記載のバイオコンジュゲートの免疫防御用量を宿主に投与することを含む方法。
38.対象において黄色ブドウ球菌に対する免疫応答を誘導する方法であって、該方法は、段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチド、又は段落11〜15のいずれか一つに記載のコンジュゲート、又は段落32に記載のバイオコンジュゲートの治療有効量又は予防有効量を投与することを含む方法。
39.黄色ブドウ球菌感染により引き起こされる疾患の治療又は予防に使用するための、段落1〜10のいずれか一つに記載のポリペプチド、又は段落11〜15のいずれか一つに記載のコンジュゲート、又は段落32に記載のバイオコンジュゲート。
ClfAグリコサイト突然変異体のスクリーニング
黄色ブドウ球菌莢膜多糖CP8をコードするプラスミド(CPS8;pGVXN564)及びカンピロバクター・ジェジュニのオリゴサッカリルトランスフェラーゼPglB N534Q突然変異体のコドン使用を最適化したバージョンをコードするプラスミド(pGVXN971)を有する大腸菌株StGVXN1690、クローン6D(W3110ΔwaaL;ΔECA(rffG-rffM)::cat)の化学コンピテント細胞は、大腸菌OmpAシグナル配列を有し、C末端ヘキサヒスチジン親和性タグを有する、指示された(表を参照されたい)黄色ブドウ球菌クランピング因子N2N3グリコサイト突然変異体をコードするプラスミドを用いて形質転換された。
グリコサイト突然変異体1と比較した担体タンパク質ClfAN2N3グリコサイト突然変異体30との関連での黄色ブドウ球菌バイオコンジュゲート生成のタンパク質安定性の改善
実施例1に記載される突然変異体1及び30のグリコシル化効率及び安定性を直接比較した。
3つのプラスミドシステムからのCP8-ClfAN2N3突然変異体1バイオコンジュゲートの発現及び精製
図7は、20Lバイオリアクター中の3つのプラスミドシステムから発現され、均質に精製された、CP8-ClfAN2N3 mut1の最終生成物の抗ClfA及び抗CP8のウエスタンブロット分析であるSDS-PAGE SimplyBlue SafeStainを示す。
1つのプラスミドシステムからのCP8-ClfAN2N3 mut30バイオコンジュゲートの発現及び精製
図8は、2Lバイオリアクター中の1プラスミドシステムから発現され、均質に精製された、CP8-ClfAN2N3 mut30の最終生成物の抗ClfA及び抗CP8のウエスタンブロット分析であるSDS-PAGE SimplyBlue SafeStainを示す。
フラジェリンシグナル配列対OmpAシグナル配列からの担体発現を伴う黄色ブドウ球菌CP8-ClfAN2N3 mut30バイオコンジュゲート生成性の増大
図10は、ClfAN2N3 mut30に対する異なるシグナル配列による生成収量への影響を示し、S. フレキシネル鞭毛Pリングタンパク質Flglからのシグナル配列を有するCP8-ClfAN2N3 mut30バイオコンジュゲート生成性の増大を強調する。
Claims (40)
- 配列番号3のアミノ酸配列、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列を含むポリペプチドであって、アミノ酸配列が、D/E-X-N-Z-S/T(配列番号21)及びK-D/E-X-N-Z-S/T-K(配列番号22)(X及びZは、独立してプロリンとは別の任意のアミノ酸である)から選択される1つ以上のコンセンサス配列を含み、前記コンセンサス配列が、配列番号3のアミノ酸残基313〜340の間の1つ以上のアミノ酸で、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列内の同等の位置で付加され又はそれと置換されているという点で改変されているポリペプチド。
- 前記コンセンサス配列が、配列番号3におけるアミノ酸残基Q327、D329、P331又はI337と置換され、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列において配列番号3のアミノ酸残基Q327、D329、若しくはI337と同等であるアミノ酸位置で置換されている、請求項1に記載のポリペプチド。
- 配列番号3におけるアミノ酸残基I337と置換され、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列において配列番号3のアミノ酸残基I337と同等であるアミノ酸位置で置換されている単一のコンセンサス配列を含有する、請求項2に記載のポリペプチド。
- XがQ(グルタミン)であり、ZがA(アラニン)である(例えば、K-D-Q-N-A-T-K(配列番号23))、請求項1〜3のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- アミノ酸配列が、配列番号3のアミノ酸配列に関してP116からS及びY118からA(又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列における同等の位置)から選択される少なくとも1つのアミノ酸置換をさらに含み、任意選択的に配列番号4〜5又は10〜12のいずれか1つの配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 配列番号3の配列と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を含み(又はそれらからなり)、前記アミノ酸配列は、D/E-X-N-Z-S/T(配列番号21)又はK-D/E-X-N-Z-S/T-K(配列番号22)(X及びZは、独立して、プロリンとは別の任意のアミノ酸である)コンセンサス配列を含み、該コンセンサス配列が配列番号3のI337位のアミノ酸と置換され、又は配列番号3と少なくとも80%、85%、90%、92%、95%、96%、97%、98%若しくは99%同一であるアミノ酸配列において配列番号3のアミノ酸残基Q327、D329、又はI337に同等であるアミノ酸位置で置換されている、請求項5に記載のポリペプチド。
- N末端にさらなるセリン残基を有し、任意選択的に、配列番号6若しくは12と少なくとも97%、98%、99%若しくは100%同一であるアミノ酸配列を有し、及び/又はC末端にさらなるグリシン又はグリシン-セリン残基を有し、任意選択的に、配列番号32と少なくとも97%、98%、99%若しくは100%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1〜6のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記アミノ酸配列が、宿主細胞(例えば、細菌)のペリプラズムにポリペプチドを方向付けることができるシグナル配列をさらに含み、任意選択的に前記シグナル配列は配列番号13〜20から選択され、任意選択的に前記ポリペプチドは配列番号5若しくは配列番号11と少なくとも97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1〜7のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- アミノ酸配列が、ClfAタンパク質の精製に有用であるペプチドタグをさらに含み、任意選択的に前記ペプチドタグは6個のヒスチジン残基を含み、任意選択的に前記ペプチドタグはアミノ酸配列のC末端に位置し、任意選択的に前記ポリペプチドは配列番号25、配列番号26若しくは配列番号27と少なくとも97%、98%、99%又は100%同一であるアミノ酸配列を有する、請求項1〜8のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 前記ポリペプチドがグリコシル化されている、請求項1〜9のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- 抗原、例えば、多糖又はオリゴ糖抗原に連結されている、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチドを含むコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
- コンジュゲートが、任意選択的に、カルボジイミド化学、還元アミノ化(animation)、シアニル化化学(例えば、CDAP化学)、マレイミド化学、ヒドラジド化学、エステル化学、及びN-ヒドロイルスクシンイミド化学からなる群から選択される化学コンジュゲーション法を用いて得られる化学連結を通じて、直接的に又はリンカーを介して抗原に共有結合されている、請求項11に記載のコンジュゲート。
- 抗原が、アスパラギン、アスパラギン酸、グルタミン酸、リジン、システイン、チロシン、ヒスチジン、アルギニン又はトリプトファン(例えばアスパラギン)から選択される、ポリペプチド上のアミノ酸に連結されている、請求項11又は12に記載のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
- 抗原が、糖、任意選択的に、黄色ブドウ球菌血清型5又は8の莢膜糖から任意選択的に選択される細菌莢膜糖(例えば、黄色ブドウ球菌由来)である、請求項11〜13のいずれか一項に記載のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
- 抗原が、黄色ブドウ球菌血清型8由来の細菌莢膜糖である、請求項14に記載のコンジュゲート(例えば、バイオコンジュゲート)。
- 請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- 請求項16に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
- グリコシルトランスフェラーゼをコードする1つ以上の核酸、
オリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸、
請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチドをコードする核酸、及び任意選択的に
ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸
を含む宿主細胞。 - (a)ウンデカプレニルピロリン酸(Und-PP)上にヘキソース単糖誘導体をアセンブルさせるグリコシルトランスフェラーゼ、及び(b)Und-PP上にアセンブルされたヘキソース単糖誘導体に単糖を付加することができる1以上のグリコシルトランスフェラーゼを含む、請求項18に記載の宿主細胞。
- Und-PP上にヘキソース単糖誘導体をアセンブルさせる前記グリコシルトランスフェラーゼが、宿主細胞に対して異種であり、及び/又はグリコシルトランスフェラーゼをコードする1つ以上の遺伝子に対して異種であり、任意選択的に、Und-PP上にヘキソース単糖誘導体をアセンブルさせる前記グリコシルトランスフェラーゼが、エシェリキア属(Escherichia)種、シゲラ属(Shigella)種、クレブシエラ属(Klebsiella)種、キサントモナス属(Xhantomonas)種、サルモネラ属(Salmonella)種、エルシニア属(Yersinia)種、アエロモナス属(Aeromonas)種、フランシセラ属(Francisella)種、ヘリコバクター属(Helicobacter)種、プロテウス属(Proteus)種、ラクトコッカス属(Lactococcus)種、ラクトバチルス属(Lactobacillus)種、シュードモナス属(Pseudomonas)種、コリネバクテリウム属(Corynebacterium)種、ストレプトマイセス属(Streptomyces)種、ストレプトコッカス属(Streptococcus)種、エンテロコッカス属(Enterococcus)種、スタフィロコッカス属(Staphylococcus)種、バチルス属(Bacillus)種、クロストリジウム属(Clostridium)種、リステリア属(Listeria)種、又はカンピロバクター属(Campylobacter)種由来であり、任意選択的にwecA(例えば、大腸菌由来のwecA)である、請求項19に記載の宿主細胞。
- 前記ヘキソース単糖誘導体が、C-2位がアセトアミド基で修飾される任意の単糖、例えばN-アセチルグルコサミン(GlcNAc)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)、2,4-ジアセトアミド-2,4,6-トリデオキシヘキソース(DATDH)、N-アセチルフコサミン(FucNAc)、又はN-アセチルキノボサミン(QuiNAc)である、請求項18〜20のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- Und-PP上にアセンブルされたヘキソース単糖誘導体に単糖を付加することができる前記1つ以上のグリコシルトランスフェラーゼが、大腸菌(E. coli)O28由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wbeY)若しくは大腸菌O167由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wfdK)であるか、又は大腸菌O28由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wbeY)及び大腸菌O167由来のガラクトフラノシルトランスフェラーゼ(wfdK)である、請求項18〜21のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 黄色ブドウ球菌CP5由来のcapH、capI、capJ及び/又はcapK、並びに任意選択的に、黄色ブドウ球菌CP5由来のcapD、capE、capF、capG、capL、capM、capN、capO及び/又はcapPを含む黄色ブドウ球菌CP5糖のリピート単位の合成に十分なグリコシルトランスフェラーゼを含む、請求項18〜22のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 黄色ブドウ球菌CP5由来のcapH、capI、capJ及び/又はcapK、並びに任意選択的に、緑膿菌(P. aeruginosa)O11由来のwbjB、wbjC、wbjD、wbjE、wbjF、wbjL、wbpM、wzz及び/又はwzx、並びに大腸菌O16由来のwecB及び/又はwecCを含む、黄色ブドウ球菌CP5糖のリピート単位の合成に十分なグリコシルトランスフェラーゼを含む、請求項18〜23のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- オリゴサッカリルトランスフェラーゼがカンピロバクター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni)に由来し、任意選択的に前記オリゴサッカリルトランスフェラーゼがカンピロバクター・ジェジュニのpglBであり、任意選択的にカンピロバクター・ジェジュニのpglB遺伝子が宿主細胞ゲノムに組み込まれ、任意選択的に宿主細胞の少なくとも1つの遺伝子が機能的に不活化又は欠失されており、任意選択的に宿主細胞のwaaL遺伝子が機能的に不活化又は欠失されており、任意選択的に宿主細胞のwaaL遺伝子がオリゴサッカリルトランスフェラーゼをコードする核酸によって置き換えられており、任意選択的に宿主細胞のwaaL遺伝子がカンピロバクター・ジェジュニpglBによって置き換えられている、請求項18〜24のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞が、莢膜多糖ポリメラーゼ(例えば、wzy)又はO抗原ポリメラーゼ(例えば、wzy)をコードする核酸を含み、任意選択的に、前記莢膜多糖ポリメラーゼが、黄色ブドウ球菌由来であり、任意選択的に、黄色ブドウ球菌CP5又はCP8由来である、請求項18〜25のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞が、フリッパーゼ(wzx)をコードする核酸を含み、任意選択的に、前記フリッパーゼが、黄色ブドウ球菌由来であり、任意選択的に、黄色ブドウ球菌CP5又はCP8由来である、請求項18〜26のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 前記宿主細胞が、単糖を修飾することができる酵素、任意選択的にエピメラーゼをさらに含み、任意選択的に、前記エピメラーゼが、エシェリキア属種、シゲラ属種、クレブシエラ属種、キサントモナス属種、サルモネラ属種、エルシニア属種、アエロモナス属種、フランシセラ属種、ヘリコバクター属種、プロテウス属種、ラクトコッカス属種、ラクトバチルス属種、シュードモナス属種、コリネバクテリウム属種、ストレプトマイセス属種、ストレプトコッカス属種、エンテロコッカス属種、スタフィロコッカス属種、バチルス属種、クロストリジウム属種、リステリア属種、又はカンピロバクター属種由来であり、任意選択的に前記エピメラーゼが、大腸菌由来であり、任意選択的に大腸菌O157由来のZ3206又はgalEである、請求項18〜27のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- ポリペプチドをコードする核酸が、宿主細胞中のプラスミドにある、請求項18〜28のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 大腸菌である、請求項18〜29のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 糖に連結された、ポリペプチドを含むバイオコンジュゲートを生産する方法であって、(i)タンパク質の生産に適した条件下で、請求項18〜30のいずれか一項に記載の宿主細胞を培養すること、及び(ii)バイオコンジュゲートを単離することを含む方法。
- ポリペプチド、例えば請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチドに連結された糖を含む、請求項31に記載の方法によって生産されるバイオコンジュゲート。
- 請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチド、又は請求項11〜15のいずれか一項に記載のコンジュゲート、又は請求項32に記載のバイオコンジュゲートを含む免疫原性組成物。
- ポリペプチド又はコンジュゲート又はバイオコンジュゲートを薬学的に許容される賦形剤又は担体と混合する工程を含む、請求項33に記載の免疫原性組成物を作製する方法。
- 請求項34に記載の免疫原性組成物、及び薬学的に許容される賦形剤又は担体を含むワクチン。
- それを必要とする対象における黄色ブドウ球菌感染を治療又は予防するための方法であって、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチド、又は請求項11〜15のいずれか一項に記載のコンジュゲート、又は請求項32に記載のバイオコンジュゲート、又は請求項35に記載のワクチンの治療有効量を前記対象に投与することを含む方法。
- ヒト宿主を黄色ブドウ球菌感染に対して免疫化する方法であって、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチド、又は請求項11〜15のいずれか一項に記載のコンジュゲート、又は請求項32に記載のバイオコンジュゲート、又は請求項35に記載のワクチンの免疫防御用量を宿主に投与することを含む方法。
- 対象において黄色ブドウ球菌に対する免疫応答を誘導する方法であって、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチド、又は請求項11〜15のいずれか一項に記載のコンジュゲート、又は請求項32に記載のバイオコンジュゲート、又は請求項35に記載のワクチンの治療的又は予防的に有効な量を投与することを含む方法。
- 黄色ブドウ球菌感染によって引き起こされる疾患の治療又は予防に使用するための、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチド、又は請求項11〜15のいずれか一項に記載のコンジュゲート、又は請求項32に記載のバイオコンジュゲート、又は請求項35に記載のワクチン。
- 黄色ブドウ球菌感染によって引き起こされる疾患の治療又は予防のための医薬の製造における、請求項1〜10のいずれか一項に記載のポリペプチド、又は請求項11〜15のいずれか一項に記載のコンジュゲート、又は請求項32に記載のバイオコンジュゲート、又は請求項35に記載のワクチンの使用。
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