JP2021035395A - キメラサイトカイン受容体 - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、キメラサイトカイン受容体(CCR)、ならびにそのようなキメラサイトカイン受容体および必要に応じてキメラ抗原受容体を細胞表面に発現する細胞に関する。
キメラ抗原受容体(CAR)
若干の免疫治療剤が、治療用モノクローナル抗体(mAb)、二重特異性T細胞エンゲージャーおよびキメラ抗原受容体(CAR)を含め、がん処置での使用について記載されている。
前立腺がんは、世界中の男性において2番目に最も一般的ながんであり、がん関連死の主な原因の第6位である。世界的には、毎年およそ1,100,000例の新しい症例および300,000の死亡数があり、すべてのがんによる死亡の4パーセントを構成する。男性の6人に1人が、生涯の間にこの疾患と診断されると推定されている。
がんは特異性を喪失させ得るため、がんを単一抗原の存在によって効果的に説明することは比較的稀である。
本発明は、例えば、以下の項目を提供する。
(項目1)
腫瘍分泌因子、ケモカインおよび細胞表面抗原から選択されるリガンドに結合するエキソドメイン;および
サイトカイン受容体エンドドメイン
を含む、キメラサイトカイン受容体(CCR)。
(項目2)
2つのポリペプチド:
(i)
(a)前記リガンドの第1のエピトープに結合する第1の抗原結合ドメイン
(b)前記サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)前記リガンドの第2のエピトープに結合する第2の抗原結合ドメイン
(b)前記サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含む、項目1に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目3)
前記第1および第2の抗原結合ドメインの各々が、一本鎖可変フラグメント(scFv)である、項目2に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目4)
前記第1および第2の抗原結合ドメインの各々が、単一ドメインバインダー(dAb)である、項目2に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目5)
2つのポリペプチド:
(i)
(a)重鎖可変ドメイン(VH)
(b)前記サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)軽鎖可変ドメイン(VL)
(b)前記サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含む、項目1に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目6)
前記サイトカイン受容体エンドドメインについての第1の鎖と第2の鎖が、異なり、I型サイトカイン受容体エンドドメインのα鎖、β鎖およびγ鎖から選択される、項目5に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目7)
前記サイトカイン受容体エンドドメインに対する第1の鎖と第2の鎖が、同じであり、I型サイトカイン受容体エンドドメインのα鎖、β鎖およびγ鎖から選択される、項目5に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目8)
前記サイトカイン受容体エンドドメインが、
(i)IL−2受容体のβ鎖エンドドメイン
(ii)IL−7受容体のα鎖エンドドメイン;もしく
(iii)IL−15受容体のα鎖エンドドメイン;および/または
(iv)共通γ鎖受容体エンドドメイン
を含む、前述のいずれかの項目に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目9)
前記リガンドが、前立腺特異的抗原(PSA)、がん胎児抗原(CEA)および血管内皮成長因子(VEGF)およびCA125から選択される腫瘍分泌因子である、前述のいずれかの項目に記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目10)
前記リガンドが、CXCL12、CCL2、CCL4、CCL5およびCCL22から選択されるケモカインである、項目1〜7のいずれかに記載のキメラサイトカイン受容体。
(項目11)
前述のいずれかの項目に記載のキメラサイトカイン受容体を含む細胞。
(項目12)
同じリガンド上の異なるエピトープに結合する、第1のキメラサイトカイン受容体および第2のキメラサイトカイン受容体を含む、項目11に記載の細胞。
(項目13)
前記第1のキメラサイトカイン受容体および前記第2のサイトカイン受容体が、前記リガンドに結合したとき、I型サイトカイン受容体エンドドメインのα/β鎖およびγ鎖を介して、組み合わされたシグナル伝達が生じるように、前記第1のキメラサイトカイン受容体が、I型サイトカイン受容体エンドドメインのα鎖またはβ鎖を含み、前記第2のキメラサイトカイン受容体が、I型サイトカイン受容体エンドドメインのγ鎖を含む、項目12に記載の細胞。
(項目14)
キメラ抗原受容体も含む、項目11〜13のいずれかに記載の細胞。
(項目15)
前記キメラ抗原受容体が、腫瘍関連細胞表面抗原に結合する、項目14に記載の細胞。
(項目16)
前記キメラ抗原受容体が、前立腺がんに関連する細胞表面抗原に結合する、項目15に記載の細胞。
(項目17)
前記細胞表面抗原が、前立腺幹細胞抗原(PSCA)または前立腺特異的膜抗原(PSMA)である、項目16に記載の細胞。
(項目18)
項目1〜10のいずれかに記載のキメラサイトカイン受容体(CCR)をコードする、核酸配列。
(項目19)
第1のCCRをコードする第1の核酸配列および第2のCCRをコードする第2の核酸配列を含む核酸構築物であって、該核酸構築物は、構造:
AgB1−スペーサー1−TM1−エンド1−coexpr−AbB2−スペーサー2−TM2−エンド2
(ここで、
AgB1は、前記第1のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー1は、前記第1のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM1は、前記第1のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド1は、前記第1のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
coexprは、両CCRの共発現を可能にする核酸配列であり、
AgB2は、前記第2のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー2は、前記第2のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM2は、前記第2のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド2は、前記第2のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有する、核酸構築物。
(項目20)
キメラ抗原受容体(CAR)もコードする項目19に記載の核酸構築物であって、該核酸構築物は、構造:
(i)CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr1−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2−coexpr2−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド;
(ii)CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr1−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr2−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2;または
(iii)CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr1−CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr2−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2;
(ここで、
CCRAgB1は、前記第1のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;CCRスペーサー1は、前記第1のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTM1は、前記第1のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンド1は、前記第1のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
CCRAgB2は、前記第2のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;CCRスペーサー2は、前記第2のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTM2は、前記第2のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンド2は、前記第2のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
Coexpr1およびcoexpr2は、隣接する2つの配列の共発現を可能にする核酸配列であり;
CARAgBは、該CARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CARスペーサーは、該CARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CARTMは、該CARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CARエンドは、該CARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有する、項目19に記載の核酸構築物。
(項目21)
coexprが、自己切断性ペプチドを含む配列をコードする、項目19または20に記載の核酸構築物。
(項目22)
相同組換えを回避するために、代替的コドンが、同一または類似のアミノ酸配列をコードする配列の領域で使用される、項目19〜21のいずれかに記載の核酸構築物。
(項目23)
項目19〜22のいずれかに記載の核酸構築物を含む、ベクター。
(項目24)
項目23に記載の、レトロウイルスベクターまたはレンチウイルスベクターまたはトランスポゾン。
(項目25)
i)項目1〜10のいずれかにおいて定義されたような第1のCCRをコードする核酸配列を含むベクター;および
ii)項目1〜10のいずれかにおいて定義されたような第2のCCRをコードする核酸配列を含むベクター
を含む、キット。
(項目26)
キメラ抗原受容体をコードする核酸配列を含むベクターも含む、項目25に記載のキット。
(項目27)
i)項目1〜10のいずれかにおいて定義されたようなCCRをコードする核酸配列を含むベクター;および
ii)キメラ抗原受容体をコードする核酸配列を含むベクター
を含む、キット。
(項目28)
項目11〜17のいずれかに記載の細胞を作製するための方法であって、項目18に記載の核酸配列;項目19〜22のいずれかに記載の核酸構築物;項目23もしくは24に記載のベクター;または項目25〜27のいずれかに記載のベクターのキットを細胞に導入する工程を含む、方法。
(項目29)
前記細胞が、被験体から単離された試料に由来する、項目28に記載の方法。
(項目30)
項目11〜17のいずれかに記載の複数の細胞を含む、医薬組成物。
(項目31)
疾患を処置および/または予防するための方法であって、項目30に記載の医薬組成物を被験体に投与する工程を含む、方法。
(項目32)
以下の工程:
(i)被験体からの細胞含有試料の単離;
(ii)項目18に記載の核酸配列;項目19〜22のいずれかに記載の核酸構築物;項目23もしくは24に記載のベクター;または項目25〜27のいずれかに記載のベクターのキットでの前記細胞の形質導入またはトランスフェクション;および
(iii)該被験体に(ii)からの該細胞を投与すること
を含む、項目31に記載の方法。
(項目33)
前記試料が、T細胞含有試料である、項目32に記載の方法。
(項目34)
前記疾患が、がんである、項目32または33に記載の方法。
(項目35)
疾患の処置および/または予防において使用するための項目30に記載の医薬組成物。
(項目36)
疾患を処置および/または予防するための医薬の製造における項目11〜17のいずれかに記載の細胞の使用。
本発明者らは、非サイトカイン結合分子の結合特異性をサイトカイン受容体のエンドドメインに移植した「キメラサイトカイン受容体」(CCR)を開発した。そのようなCCRとキメラ抗原受容体(CAR)との共発現は、CAR T細胞が、厳しい腫瘍微小環境に生着し、拡大するのを助ける。存在するべきCCRに対するリガンドならびにCARに対するリガンドに対する要件は、別の層の選択性を追加し、オンターゲットオフ腫瘍毒性の防止に役立つ。
腫瘍分泌因子(tumour secreted factor)、ケモカインおよび細胞表面抗原から選択されるリガンドに結合するエキソドメイン;および
サイトカイン受容体エンドドメイン
を含むキメラサイトカイン受容体(CCR)を提供する。
(i)
(a)リガンドの第1のエピトープに結合する第1の抗原結合ドメイン
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)リガンドの第2のエピトープに結合する第2の抗原結合ドメイン
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含む。図2bは、そのような配置を図示している。
(i)
(a)重鎖可変ドメイン(VH)
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)軽鎖可変ドメイン(VL)
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含む。
(i)IL−2受容体のβ鎖エンドドメイン
(ii)IL−7受容体のα鎖エンドドメイン;
(iii)IL−15受容体のα鎖エンドドメイン;または
(iv)共通γ鎖受容体エンドドメイン
を含み得る。
AgB1−スペーサー1−TM1−エンド1−coexpr−AbB2−スペーサー2−TM2−エンド2
(ここで、
AgB1は、第1のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー1は、第1のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM1は、第1のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド1は、第1のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
coexprは、両CCRの共発現を可能にする核酸配列であり、
AgB2は、第2のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー2は、第2のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM2は、第2のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド2は、第2のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有する。
この核酸構築物は、キメラ抗原受容体(CAR)もコードし得る。この実施形態において、核酸構築物は、構造:
(i)CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr1−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2−coexpr2−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド;
(ii)CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr1−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr2−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2;または
(iii)CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr1−CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr2−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2;
(ここで、
CCRAgB1は、第1のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRスペーサー1は、第1のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTM1は、第1のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンド1は、第1のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
CCRAgB2は、第2のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRスペーサー2は、第2のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTM2は、第2のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンド2は、第2のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
Coexpr1およびcoexpr2は、隣接する2つの配列の共発現を可能にする核酸配列であり;
CARAgBは、CARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CARスペーサーは、CARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CARTMは、CARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CARエンドは、CARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有し得る。
i)本発明の第1の態様に記載の第1のCCRをコードする核酸配列を含むベクター;および
ii)本発明の第2の態様に記載の第2のCCRをコードする核酸配列を含むベクター
を含むキットを提供する。
i)本発明の第1の態様に記載のCCRをコードする核酸配列を含むベクター;および
ii)キメラ抗原受容体をコードする核酸配列を含むベクター
を含み得る。
(i)被験体からの細胞含有試料の単離;
(ii)本発明の第3の態様に記載の核酸配列;本発明の第4の態様に記載の核酸構築物;本発明の第5の態様に記載のベクター;または本発明の第6の態様に記載のベクターのキットでの細胞の形質導入またはトランスフェクション;および
(iii)その被験体に(ii)からの細胞を投与すること
を含み得る。
サイトカイン受容体エンドドメイン
を含むキメラ膜貫通タンパク質。
(i)
(a)第1の二量体化ドメイン;および
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)第1の二量体化ドメインと二量体化する第2の二量体化ドメイン;および
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含む、前述のいずれかのパラグラフに記載のキメラ膜貫通タンパク質。
(i)
(a)重鎖定常ドメイン(CH)
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)軽鎖定常ドメイン(CL)
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含む、パラグラフ2、3または4に記載のキメラ膜貫通タンパク質。
(i)IL−2受容体のβ鎖エンドドメイン
(ii)IL−7受容体のα鎖エンドドメイン;または
(iii)IL−15受容体のα鎖エンドドメイン;および/または
(iv)共通γ鎖受容体エンドドメイン
を含む、前述のいずれかのパラグラフに記載のキメラ膜貫通タンパク質。
Dim1−TM1−エンド1−coexpr−Dim2−TM2−エンド2
(ここで、
Dim1は、第1の二量体化ドメインをコードする核酸配列であり;
TM1は、第1のポリペプチドの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド1は、第1のポリペプチドのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
coexprは、両CCRの共発現を可能にする核酸配列であり、
Dim2は、第2の二量体化ドメインをコードする核酸配列であり;
TM2は、第2のポリペプチドの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド2は、第2のポリペプチドのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有する。
i)パラグラフ3において定義されたような第1のポリペプチドをコードする核酸配列を含むベクター;および
ii)パラグラフ3において定義されたような第2のポリペプチドをコードする核酸配列を含むベクター
を含む、キット。
i)パラグラフ1〜10のいずれかにおいて定義されたようなキメラ膜貫通タンパク質(proetin)をコードする核酸配列を含むベクター;および
ii)キメラ抗原受容体をコードする核酸配列を含むベクターを含む、キット。
(i)被験体からの細胞含有試料の単離;
(ii)パラグラフ14に記載の核酸配列;パラグラフ15〜18のいずれかに記載の核酸構築物;パラグラフ19もしくは20に記載のベクター;またはパラグラフ21〜23のいずれかに記載のベクターのキットでの細胞の形質導入またはトランスフェクション;および
(iii)その被験体に(ii)からの細胞を投与すること
を含む、請求項27に記載の方法。
キメラサイトカイン受容体(CCR)
キメラサイトカイン受容体(CCR)は、サイトカイン受容体エンドドメインおよび異種リガンド結合エキソドメインを含む分子である。その異種エキソドメインは、エンドドメインが由来したサイトカイン受容体に対して選択的であるサイトカイン以外のリガンドに結合する。このように、異種結合特異性に移植することによって、サイトカイン受容体のリガンド特異性を変更することが可能である。
(i)リガンド結合エキソドメイン;
(ii)任意選択のスペーサー;
(iii)膜貫通ドメイン;および
(iv)サイトカイン受容体エンドドメイン
を含む。
多くの細胞の機能が、サイトカイン受容体スーパーファミリーのメンバーによって制御される。これらの受容体によるシグナル伝達は、これらの受容体とJanusキナーゼ(JAK)との会合に依存する。Janusキナーゼは、リガンドの結合と、受容体複合体にリクルートされたシグナル伝達タンパク質のチロシンリン酸化とをつなぐ。これらには、サイトカイン応答の多様性に寄与する転写因子のファミリーであるシグナル伝達性転写因子(STAT)が含まれる。
(i)JAK−STAT経路
(ii)MAPキナーゼ経路;および
(iii)ホスホイノシチド3−キナーゼ(PI3K)経路。
本発明のキメラサイトカイン受容体は、エキソドメインがそのリガンドに結合したとき、「サイトカイン型」の細胞シグナル伝達を(単独で、または別のキメラサイトカイン受容体の存在下において)引き起こすエンドドメインを含む。
(i)インターロイキン受容体(例えば、IL−2、IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−7、IL−9、IL−11、IL−12、IL13、IL−15、IL−21、IL−23およびIL−27に対する受容体);
(ii)コロニー刺激因子受容体(例えば、エリトロポイエチン、GM−CSFおよびG−CSFに対する受容体);および
(iii)ホルモン受容体/神経ペプチド受容体(例えば、ホルモン受容体およびプロラクチン受容体)
が含まれる。
IL−2は、α、βおよびγ「鎖」と称されることが多い3つの異なるタンパク質の異なる組み合わせによって生成される3つの形態を有するIL−2受容体に結合する;これらのサブユニットは、他のサイトカインに対する受容体の一部でもある。IL−2Rのβおよびγ鎖は、I型サイトカイン受容体ファミリーのメンバーである。
配列番号1:ヒト共通ガンマ鎖に由来するエンドドメイン:
インターロイキン−7受容体は、2本の鎖:インターロイキン−7受容体−α鎖(CD127)および共通γ鎖受容体(CD132)で構成されている。この共通γ鎖受容体は、インターロイキン−2、−4、−9および−15をはじめとした様々なサイトカインと共有される。インターロイキン−7受容体は、ナイーブT細胞およびメモリーT細胞をはじめとした様々な細胞型上で発現される。
配列番号3−ヒトIL−7Rαに由来するエンドドメイン:
インターロイキン15(IL−15)は、IL−2と構造的類似性を有するサイトカインである。IL−2と同様に、IL−15は、IL−2/IL−15受容体ベータ鎖(CD122)および共通ガンマ鎖(ガンマ−C、CD132)から構成される複合体に結合し、その複合体を通じてシグナル伝達する。IL−15は、ウイルス感染後に単核食細胞(およびいくつかの他の細胞)によって分泌される。IL−15は、ナチュラルキラー細胞の細胞増殖を誘導する。
本発明のキメラサイトカイン受容体は、抗原結合ドメインを膜貫通ドメインと接続し、抗原結合ドメインをエンドドメインと空間的に分離する、スペーサーを含み得る。フレキシブルスペーサーは、抗原結合ドメインが、抗原結合を可能にする種々の方向に向くことを可能にする。
配列番号4(ヒトIgG1のヒンジ−CH2CH3)
膜貫通ドメインは、膜にまたがるCCRの配列である。膜貫通ドメインは、疎水性アルファヘリックスを含み得る。膜貫通ドメインは、CD28に由来し得、良好な受容体安定性をもたらす。
リガンド結合ドメインは、抗原結合ドメインを含む。抗原結合ドメインは、CCRに対する標的リガンド、すなわち、腫瘍分泌因子またはケモカインまたは細胞表面抗原に結合する。
本発明のCCRは、リガンドに結合する。
CCRによって認識されるリガンドは、腫瘍によって分泌されたまたは腫瘍から脱落した可溶性リガンドであり得る。
可溶性リガンドは、前立腺特異的抗原(PSA)であり得る。
可溶性リガンドは、CEAであり得る。
可溶性リガンドは、VEGFであり得る。
CA−125は、卵巣がんに関連し、卵巣がんの検出のために最も高頻度で使用されるバイオマーカーである。CA−125は、卵巣がんに対するマーカーとして最もよく知られているが、子宮体がん、ファロピウス管がん、肺がん、乳がんおよび消化器がんをはじめとした他のがんでも増加していることがある。
アルファ−フェトプロテイン(AFP)
ベータ−2−ミクログロブリン(B2M)
ベータ−ヒト絨毛性ゴナドトロピン(ベータ−hCG)
変異したB−REFタンパク質をもたらすBRAF V600変異
C−kit/CD117
CA15−3/CA27.29
CA19−9
カルシトニン
CD20
クロモグラニンA(CgA)
サイトケラチンフラグメント21−1
EGFR遺伝子変異解析
エストロゲン受容体(ER)/プロゲステロン受容体(PR)
フィブリン/フィブリノゲン
HE4
HER2/neu遺伝子の増幅またはタンパク質の過剰発現
免疫グロブリン
KRAS遺伝子変異解析
乳酸デヒドロゲナーゼ
ニューロン特異的エノラーゼ(NSE)
核マトリックスタンパク質22
プログラム死リガンド1(PD−L1)
チログロブリン
ウロキナーゼプラスミノーゲン活性化因子(uPA)およびプラスミノーゲン活性化因子阻害剤(PAI−1)
ケモカインは、走化性サイトカインである。細胞遊走は、細胞外マトリックスに埋め込まれて固定化されたケモカインの勾配によってガイドされる。CXCL12のような正に帯電したケモカインは、負に帯電したECM分子に結合する。これらの勾配は、がん細胞および免疫細胞のホーミングのための道を提供する。T細胞に対する作用は、細胞傷害性T細胞のホーミングに対して阻害性であるとみられるが、制御性T細胞は、引きつけられるとみられる。
CCケモカイン(またはβ−ケモカイン)タンパク質は、隣接した2つのシステイン(アミノ酸)をアミノ末端付近に有する。哺乳動物について報告されているこのサブグループの異なるメンバーは、少なくとも27個あり、CCケモカインリガンド(CCL)−1から−28と呼ばれ;CCL10は、CCL9と同じである。このサブファミリーのケモカインは、通常、4つのシステインを含む(C4−CCケモカイン)が、少数のCCケモカインが、6つのシステインを有する(C6−CCケモカイン)。C6−CCケモカインとしては、CCL1、CCL15、CCL21、CCL23およびCCL28が挙げられる。CCケモカインは、単球および他の細胞型(例えば、NK細胞および樹状細胞)の遊走を誘導する。
CXCケモカイン(またはα−ケモカイン)の2つのN末端システインは、この名称において「X」で表されている1つのアミノ酸によって分断されている。哺乳動物において報告されている異なるCXCケモカインは17個あり、それらは、CXCモチーフの最初のシステインの直前にグルタミン酸−ロイシン−アルギニン(または短縮してELR)という特異的なアミノ酸配列(またはモチーフ)を有するもの(ELR陽性)とELRモチーフを有しないもの(ELR陰性)という2つのカテゴリーに細分される。ELR陽性CXCケモカインは、好中球の遊走を特異的に誘導し、ケモカイン受容体CXCR1およびCXCR2と相互作用する。
ケモカインの第3の群は、Cケモカイン(またはγケモカイン)として知られており、2つのシステイン;N末端の1つのシステインおよび下流の1つのシステインしか有しないという点において他のすべてのケモカインと異なる。このサブグループに対して2つのケモカインが報告されており、XCL1(リンホタクチン−α)およびXCL2(リンホタクチン−β)と呼ばれている。
CX3Cケモカインは、2つのシステインの間に3つのアミノ酸を有する。これまでに発見された唯一のCX3Cケモカインは、フラクタルカイン(またはCX3CL1)と呼ばれている。CX3Cケモカインは、分泌され、かつそれを発現する細胞の表面に結合され、それにより、化学誘引物質と接着分子の両方として働く。
CXCL12は、リンパ球に対して強い走化性を有する。CXCL12は、CXCR4依存性機構を通じて内皮前駆細胞(EPC)を骨髄からリクルートすることによって、血管新生において重要な役割を果たす。このCXCL12の機能は、CXCL12を発がん、および腫瘍進行に結びつく新生血管形成における非常に重要な因子にする。CXCL12は、腫瘍転移における役割も有し、受容体CXCR4を発現するがん細胞が、リガンドであるCXCL12を放出する転移標的組織に引きつけられる。
ケモカイン(C−Cモチーフ)リガンド2(CCL2)は、単球走化性タンパク質1(MCP1)および小誘導性サイトカインA2とも称される。CCL2は、組織損傷または感染によってもたらされる炎症部位に単球、メモリーT細胞および樹状細胞をリクルートする。
リガンドは、膜貫通タンパク質などの細胞表面抗原であり得る。
本発明の細胞は、1つまたはそれを超えるキメラ抗原受容体も含み得る。CARは、腫瘍関連抗原に特異的であり得る。
CAR抗原結合ドメイン
抗原結合ドメインは、抗原を認識するCARの一部である。
CARは、細胞表面抗原、すなわち、腫瘍細胞などの標的細胞の表面上に発現される膜貫通タンパク質などの実体を認識し得る。
CARは、前立腺がんに関連する細胞表面抗原(例えば、前立腺幹細胞抗原(PSCA)または前立腺特異的膜抗原(PSMA))に特異的に結合し得る。
膜貫通ドメインは、膜にまたがるCARの配列である。CAR膜貫通ドメインは、疎水性アルファヘリックスを含み得る。膜貫通ドメインは、良好な受容体安定性をもたらすCD28に由来し得る。
本明細書に記載のCARおよびCCRはシグナルペプチドを含み得、その結果、それらがT細胞などの細胞において発現されるとき、新生タンパク質を小胞体、それに続いて細胞表面へと指向させ、そこで発現される。
エンドドメインは、膜の細胞内の側に位置する古典的CARの一部である。
本発明は、本発明のCCRをコードする核酸も提供する。
AgB−スペーサー−TM−エンド
(ここで、
AgB1は、CCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー1は、CCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM1は、CCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド1は、CCRのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有し得る。
本発明はさらに、本発明の第1の態様に関連して規定されたような第1のCARをコードする第1の核酸配列;および本発明の第1の態様に関連して規定されたような第2のCARをコードする第2の核酸配列を含む核酸構築物を提供する。
AgB1−スペーサー1−TM1−エンド1−coexpr−AgB2−スペーサー2−TM2−エンド2
(ここで、
AgB1は、第1のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー1は、第1のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM1は、第1のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド1は、第1のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
coexprは、両CCRの共発現を可能にする核酸配列であり、
AgB2は、第2のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
スペーサー2は、第2のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
TM2は、第2のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
エンド2は、第2のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有し得る。
CCRAgB−CCRスペーサー−CCRTM−CCRエンド−coexpr−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド
またはCARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr−C
CRAgB−CCRスペーサー−CCRTM−CCRエンド
(ここで、
CCRAgBは、CCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRスペーサーは、CCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTMは、CCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンドは、CCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
coexprは、CCRとCARの両方の共発現を可能にする核酸配列であり、
CARAgBは、CARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CARスペーサーは、CARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CARTMは、CARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CARエンドは、CARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有し得る。
(i)CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr1−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2−coexpr2−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド;
(ii)CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr1−CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr2−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2;または
(iii)CARAgB−CARスペーサー−CARTM−CARエンド−coexpr1−CCRAgB1−CCRスペーサー1−CCRTM1−CCRエンド1−coexpr2−CCRAgB2−CCRスペーサー2−CCRTM2−CCRエンド2;
(ここで、
CCRAgB1は、第1のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRスペーサー1は、第1のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTM1は、第1のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンド1は、第1のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
CCRAgB2は、第2のCCRの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRスペーサー2は、第2のCCRのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CCRTM2は、第2のCCRの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CCRエンド2は、第2のCCRのエンドドメインをコードする核酸配列であり;
Coexpr1およびcoexpr2は、隣接する2つの配列の共発現を可能にする核酸配列であり;
CARAgBは、CARの抗原結合ドメインをコードする核酸配列であり;
CARスペーサーは、CARのスペーサーをコードする核酸配列であり;
CARTMは、CARの膜貫通ドメインをコードする核酸配列であり;
CARエンドは、CARのエンドドメインをコードする核酸配列である)
を有し得る。
配列番号45−IL−2Rベータ鎖を有する例証的な構築物
ヒトCD8aに由来するシグナル配列:
SDPA
ヒトIgG1Fcスペーサー(HCH2CH3pvaa):
ヒトCD8aに由来するシグナル配列:
SDPA
ヒトIgG1Fcスペーサー(HCH2CH3pvaa):
本発明は、本発明の第1の態様に記載の1つまたはそれより多くのCCRおよび必要に応じて1つまたはそれより多くのCARをコードする1つまたはそれを超える核酸配列を含むベクターまたはベクターのキットも提供する。そのようなベクターは、本発明の第1の態様に記載のCCRを発現するようにそ(れら)の核酸配列を宿主細胞に導入するために使用され得る。
本発明は、本発明の1つまたはそれを超えるCCRおよび必要に応じて1つまたはそれを超える(one of more)CARを含む細胞を提供する。
(i)被験体または上に列挙された他の起源からのTまたはNK細胞含有試料の単離;および
(ii)CCRをコードする1つまたはそれを超える核酸配列によるTまたはNK細胞の形質導入またはトランスフェクション
によって作製され得る。
本発明はまた、本発明による複数の細胞を含む医薬組成物に関する。
本発明は、疾患を処置および/または予防するための方法を提供し、その方法は、本発明の細胞(例えば、上に記載されたような医薬組成物中の本発明の細胞)を被験体に投与する工程を含む。
(i)TまたはNK細胞含有試料を単離する工程;
(ii)そのような細胞に、本発明によって提供される核酸配列もしくはベクターを形質導入するか、またはそのような細胞を、本発明によって提供される核酸配列もしくはベクターでトランスフェクトする工程;
(iii)被験体に(ii)からの細胞を投与する工程
を含み得る。
本発明は、二量体化ドメイン;およびサイトカイン受容体エンドドメインを含むキメラ膜貫通タンパク質も提供する。
(i)
(a)第1の二量体化ドメイン;および
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第1の鎖
を含む第1のポリペプチド;および
(ii)
(a)第1の二量体化ドメインと二量体化する第2の二量体化ドメイン;および
(b)サイトカイン受容体エンドドメインの第2の鎖
を含む第2のポリペプチド
を含み得る。
T細胞に、PSMA特異的CARを形質導入するか、またはPSMA特異的CARをPSA特異的CCRと共発現する構築物を形質導入する。T細胞を、PSAを分泌するかまたは分泌しないPSMA発現標的細胞と共培養する。この共培養は、外来性IL2の存在下または非存在下で行う。この共培養は、異なるエフェクター対標的比で行う。この共培養は、反復して標的細胞でチャレンジされたT細胞を用いて連続的に繰り返す。T細胞の増殖および標的細胞の殺滅を測定する。このようにして、CCRがもたらすT細胞の増殖および生存への寄与を計測できる。さらに、連続能力を繰り返し再チャレンジする寄与能力。
PSMAを発現し、PSAを分泌し、ホタルルシフェラーゼを発現するヒト前立腺がん細胞株をNSGマウスに移植する。T細胞に、PSMA特異的CARを形質導入するか、またはPSMA特異的CARをPSA特異的CCRと共発現する構築物を形質導入する。それらのマウスにT細胞を投与する。腫瘍量を、生物発光イメージングを用いて連続的に計測することができ、CAR T細胞への応答を評価することができる。各コホート内のマウスを種々の時点で屠殺し得、巨視的計測および免疫組織化学によって腫瘍量を直接計測し得る。さらに、腫瘍床またはリンパ系組織(例えば、リンパ節、脾臓および骨髄)内におけるT細胞の生着/拡大が、前記組織のフローサイトメトリーによって計測される。
構成的に活性なサイトカインシグナル伝達キメラ膜貫通タンパク質を、サイトカイン受容体エンドドメインを「Fab」型エキソドメインに連結することによって作製した(図5)。この構造は、抗体の天然の二量体化構成要素、すなわち、重鎖定常領域および軽鎖定常領域由来の二量体化ドメインを使用する。キメラ膜貫通タンパク質は、2本の鎖;エンドドメインとして抗体軽鎖κ鎖およびIL2受容体共通γ鎖を含む第1のポリペプチド;ならびに抗体重鎖CH1およびIL2受容体β鎖(構成的に活性なIL2−シグナル伝達分子をもたらす);またはIL7受容体(構成的に活性なIL7−シグナル伝達分子をもたらす)のいずれかを含むエンドドメインを含む第2のポリペプチドを有する。この研究において試験された構成的に活性なサイトカインシグナル伝達キメラ膜貫通タンパク質は、scFvの重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含んだ。これらのドメインは、二量体化が生じるために必要ではない。そのシグナルは、抗原結合と無関係であり、その構造は、等しく「無頭部(headless)」であり得る(図5に示されているように)か、またはタグタンパク質などの別の実体を含み得る。
PSAを標的にするキメラサイトカイン受容体のパネルを、異なるPSAエピトープに結合する2つの抗体:5D5A5および5D3D11に由来するscFvを用いて開発した。PSAの結晶構造は、これらの2つとのサンドイッチ複合体として得られた(上記のようなSturaら(2011))。
A5−CD8stk−IL2Rg_D11−ヒンジ−IL2Rb:共通γ鎖を有する鎖上にA5およびIL2Rβ鎖を有する鎖上にD11を有するIL−2Rエンドドメインを有するCCR;
D11−CD8stk−IL2Rg_A5−ヒンジ−IL2Rb:共通γ鎖を有する鎖上にD11およびIL2Rβ鎖を有する鎖上にA5を有するIL−2Rエンドドメインを有するCCR;
D11−CD8stk−RL_A5−ヒンジ−IL2Rb:D11−CD8stk−IL2Rg_A5−ヒンジ−IL2Rbと等価であるが、IL2Rγ鎖が堅いリンカーによって置換されている、ネガティブコントロール構築物;
D11−CD8stk−IL2Rg_A5−ヒンジ−IL7Ra:共通γ鎖を有する鎖上にD11およびIL7Rα鎖を有する鎖上にA5を有するIL−7Rエンドドメインを有するCCR;および
D11−CD8stk−RL_A5−ヒンジ−IL7Ra:D11−CD8stk−IL2Rg_A5−ヒンジ−IL7Raと等価であるが、IL2Rγ鎖が堅いリンカーによって置換されているネガティブコントロール構築物
が含まれた。
Claims (1)
- 明細書に記載の発明。
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