JP2020535799A5

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Publication number: JP2020535799A5
Application number: JP2020515647A
Authority: JP
Filing date: 2018-09-19
Publication date: 2021-11-04

Claims

以下を含む抗体、またはその機能的断片：
（ａ）可変軽鎖、
ここで、可変軽鎖は、Ｎ末端からＣ末端までの領域ＬＦＷ１−ＬＣＤＲ１−ＬＦＷ２−ＬＣＤＲ２−ＬＦＷ３−ＬＣＤＲ３−ＬＦＷ４を含み、ここで各ＬＦＷは軽鎖フレームワーク領域を示し、および各ＬＣＤＲは軽鎖相補性決定領域を示し、ここで前記ＬＦＷ１、ＬＦＷ２、およびＬＦＷ３領域は一緒になって、配列番号４１に記載のＶΚ１配列の対応するフレームワーク領域に対して；または配列番号５１に記載のＶΚ３配列の対応するフレームワーク領域に対して、少なくとも９０％の配列同一性を示す；
ならびに、
（ｂ）可変重鎖、
ここで、可変重鎖は、Ｎ末端からＣ末端までの領域ＨＦＷ１−ＨＣＤＲ１−ＨＦＷ２−ＨＣＤＲ２−ＨＦＷ３−ＨＣＤＲ３−ＨＦＷ４を含み、ここで各ＨＦＷは重鎖フレームワーク領域を示し、および各ＨＣＤＲは重鎖相補性決定領域を示し、
ここで前記ＨＦＷ１、ＨＦＷ２、ＨＦＷ３、およびＨＦＷ４領域は一緒になって配列番号１に記載のＶＨ１Ａ配列の対応するフレームワーク領域に対して、少なくとも９０％の配列同一性を示す、可変重鎖
であって、ここで前記抗体またはその機能的断片は、前記ＶΚベースのＬＦＷ１、ＬＦＷ２、およびＬＦＷ３領域は、配列番号６３と少なくとも９０％同一であるＶΚベースのＬＦＷ４配列と組み合わされることを特徴とする、特にここで前記ＬＦ４は配列番号６３に記載の配列を有する、抗体、またはその機能的断片。
前記可変重鎖は配列番号２に記載のＨＦＷ１、配列番号３に記載のＨＦＷ２、配列番号４に記載のＨＦＷ３、および配列番号５に記載のＨＦＷ４を含む、請求項１に記載の抗体、またはその機能的断片。
前記可変軽鎖は、配列番号４１に記載のＶ_Κ１配列の、または配列番号５１に記載のＶΚ３配列の、ＬＦＷ１、ＬＦＷ２、およびＬＦＷ３領域を含み、ここで特に可変軽鎖は以下を含む、請求項１または２に記載の抗体、またはその機能的断片：
（ａ）配列番号４２に記載のＬＦＷ１、配列番号４３に記載のＬＦＷ２、および配列番号４４に記載のＬＦＷ３；または
（ｂ）配列番号５２に記載のＬＦＷ１、配列番号５３に記載のＬＦＷ２、および配列番号５４に記載のＬＦＷ３。
前記ＨＦＷ１、ＨＦＷ２、ＨＦＷ３、およびＨＦＷ４領域は、配列番号１に記載のＶＨ１Ａ配列から得られた対応するフレームワーク領域に対して少なくとも９０％の配列同一性、より好ましくは少なくとも９５％の配列同一性を示し、前記ＬＦＷ１、ＬＦＷ２、およびＬＦＷ３領域は一緒になって、配列番号４１に記載のＶΚ１配列の対応するフレームワーク領域に対して少なくとも９０％の配列同一性、より好ましくは少なくとも９５％の配列同一性を示し、特に
ここで前記可変重鎖は、配列番号２に記載のＨＦＷ１、配列番号３に記載のＨＦＷ２、配列番号４に記載のＨＦＷ３、および配列番号５に記載のＨＦＷ４を含み；前記可変軽鎖は、配列番号４２に記載のＬＦＷ１、配列番号４３に記載のＬＦＷ２、および配列番号４４に記載のＬＦＷ３を含む、
請求項１に記載の抗体、またはその機能的断片。
前記ＨＦＷ１、ＨＦＷ２、ＨＦＷ３、およびＨＦＷ４領域は、配列番号１に記載のＶＨ１Ａ配列から得られた対応するフレームワーク領域に対して少なくとも９０％の配列同一性、より好ましくは少なくとも９５％の配列同一性を示し、ここで前記ＬＦＷ１、ＬＦＷ２、およびＬＦＷ３領域は一緒になって、配列番号５１に記載のＶΚ３配列の対応するフレームワーク領域に対して少なくとも９０％、より好ましくは少なくとも９５％の配列同一性の配列同一性を示し、特に
ここで前記可変重鎖は、配列番号２に記載のＨＦＷ１、配列番号３に記載のＨＦＷ２、配列番号４に記載のＨＦＷ３、および配列番号５に記載のＨＦＷ４を含み；前記可変軽鎖は、配列番号５２に記載のＬＦＷ１、配列番号５３に記載のＬＦＷ２、および配列番号５４に記載のＬＦＷ３を含む、請求項１に記載の抗体、またはその機能的断片。
前記ＣＤＲ領域、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３は、
（ｉ）対象抗原に対する特異性を有する親の非ヒト抗体由来、特に親のウサギ抗体または親のげっ歯類抗体由来、特に親のマウスまたはラット抗体由来のＣＤＲ領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３；
（ｉｉ）ＶΚドメインを含む親のヒト抗体由来の、特に治療用に承認された、または市販されている抗体由来のＣＤＲ領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３；
（ｉｉｉ）（ｉ）または（ｉｉ）に記載のＣＤＲ領域由来の、ＣＤＲ領域ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、およびＬＣＤＲ３、特に一つまたは複数の（ｉ）または（ｉｉ）に記載のＣＤＲ領域の最適化により得られるＣＤＲ領域；ならびに
（ｉｖ）（ｉ）、（ｉｉ）、および／または（ｉｉｉ）に記載の一つまたは複数のＣＤＲ領域に置換されるＣＤＲ領域、
から独立して選択される、請求項１〜５のいずれか一項に記載の抗体、またはその機能的断片。
請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体、またはその機能的断片、および任意に薬学的に許容される担体および／または賦形剤を含む医薬組成物。
請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体、またはその機能的断片をコードする、核酸配列または核酸配列のコレクション。
請求項８の核酸配列または核酸配列のコレクションを含むベクターまたはベクターのコレクション。
請求項８に記載の核酸配列もしくは核酸配列のコレクション、または請求項９に記載のベクターもしくはベクターのコレクションを発現する工程を含む、
請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体、またはその機能的断片を産生する方法。
一つまたは複数の工程で、前記非ヒト抗体の可変重鎖（ＶＨ）ＣＤＲ、および可変軽鎖（ＶＬ）ＣＤＲをコードする核酸配列を、請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片をコードする一つまたは複数の核酸配列にクローニングする、ただしここで前記非ヒト抗体の少なくともＶＨＣＤＲ３およびＶＬＣＤＲ３がクローニングされ、任意でＶＨＣＤＲ２および／またはＶＬＣＤＲ１、特にＶＨＣＤＲ２およびＶＬＣＤＲ１の両方のクローニングをさらに含み、任意でＶＨＣＤＲ１および／またはＶＬＣＤＲ２、特にＶＨＣＤＲ１およびＶＬＣＤＲ２の両方のクローニングをさらに含む、工程を含む、非ヒト抗体、特にウサギまたはげっ歯類抗体をヒト化する方法。
以下の一つまたは複数の工程をさらに含む、請求項１１に記載の方法：
（ａａ）非ヒト動物、特にウサギまたはげっ歯類の、目的の抗原による免疫化；および
（ａｂ）少なくとも一つの目的の抗体の分離
任意で以下の一つまたは複数の工程をさらに含む：
（ａｃ）特に経口活性化セルソーティングを使用した目的の抗原と相互作用する、親和性成熟記憶Ｂ細胞のクローン単離；
（ａｄ）単一Ｂ細胞クローンの不死化を必要としない共培養システムでの単一Ｂ細胞の培養；
（ａｅ）目的の抗原に結合する少なくとも一つの抗体を同定するための、細胞ベースのＥＬＩＳＡでのＢ細胞培養上清のスクリーニング；および／または
（ａｆ）ヒト抗体ＶＨドメインをコードする核酸配列への、少なくとも一つの抗体のＶＨＣＤＲのクローニング。
ここで、前記非ヒト抗体のフレームワーク領域は、ヒトＶＨ１Ａファミリー（配列番号１）、ならびにＶΚ１（配列番号４１）およびＶΚ３（配列番号５１）から選択されるヒトＶＬファミリーの組み合わせの対応するフレームワーク領域に対してともに最高の相同性を有する、請求項１１または１２に記載の方法。
目的の親抗体を最適化する方法であって、以下の工程を含む方法：
一つまたは複数の工程で、前記親抗体のＶＨＣＤＲ、およびＶＬＣＤＲをコードする核酸配列を、請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片をコードする一つまたは複数の核酸配列にクローニングする、ただしここで前記親抗体の少なくともＶＨＣＤＲ３およびＶＬＣＤＲ３がクローニングされ、任意でＶＨＣＤＲ２および／またはＶＬＣＤＲ１、特にＶＨＣＤＲ２およびＶＬＣＤＲ１の両方のクローニングをさらに含み、任意でＶＨＣＤＲ１および／またはＶＬＣＤＲ２、特にＶＨＣＤＲ１およびＶＬＣＤＲ２の両方のクローニングをさらに含む、
特に、
ここで、前記親抗体のフレームワーク領域は、全体的に、ヒトＶＨ１Ａファミリー（配列番号１）、ならびにＶΚ１（配列番号４１）およびＶΚ３（配列番号５１）から選択されるヒトＶＬファミリーの組み合わせの対応するフレームワーク領域に対してともに最高の相同性を有する。
抗体、またはその機能的断片の多様なコレクションを生成する方法であって、以下の工程を含む方法：
一つまたは複数の工程で、ＶＨＣＤＲおよび／またはＶＬＣＤＲの一つまたは複数の多様なコレクションをコードする核酸配列の、一つまたは複数の多様なコレクションを、請求項１〜６のいずれか一項に記載の抗体またはその機能的断片をコードする一つまたは複数の核酸配列にクローニングする、任意にここでＶＨＣＤＲ３の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクションがクローニングされ、任意にここでＶＬＣＤＲ３の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクションがクローニングされ、
特に、
ここで、ＶＨＣＤＲ２の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクション、および／またはＶＬＣＤＲ１の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクションがクローニングされ、特にＶＨＣＤＲ２の多様なコレクションおよびＶＬＣＤＲ１の多様なコレクションの両方がクローニングされる、
ここで、ＶＨＣＤＲ２の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクション、および／またはＶＬＣＤＲ１の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクションがクローニングされ、特にＶＨＣＤＲ２の多様なコレクションおよびＶＬＣＤＲ１の多様なコレクションの両方がクローニングされる、および／または
ここで、ＶＨＣＤＲ１の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクション、および／またはＶＬＣＤＲ２の多様なコレクションをコードする核酸配列の多様なコレクションがクローニングされ、特にＶＨＣＤＲ１の多様なコレクションおよびＶＬＣＤＲ２の多様なコレクションの両方がクローニングされる。