JP2020533595A - 子癇前症バイオマーカならびに関連するシステムおよび方法 - Google Patents

子癇前症バイオマーカならびに関連するシステムおよび方法 Download PDF

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Abstract

妊娠している女性において子癇前症を検出、予測、監視、または除外するための方法、キット、試験、およびシステムを本明細書に開示する。また、新規診断マーカ、データ分析の方法、アッセイ形式、およびそのようなマーカを用いて、患者試料からのバイオマーカに基づいて、子癇前症を識別または除外するための試験の1つ以上の特性を改善するためのキットを本明細書に提供する。本方法、組成物、システム、およびキットは、子癇前症(PreE)または非子癇前症(NonPreE)などの妊娠している対象の症状を検出または予測するのに好適である。いくつかの実施形態では、子癇前症は、さらに、非常に早期の発症(妊娠の25週前)、早期発症(妊娠の34週前)、および晩期発症(妊娠の34週後)の子癇前症に分割される。【選択図】図17

Description

相互参照
本出願は、2017年9月13日に出願された、「PRECCLAMPSIA MARKERS」と題された、米国仮特許出願第62/558,184号の利益を主張し、その全体は参照により本明細書に組み込まれる。
子癇前症は、妊娠の深刻な多系合併症である。障害の発症は、一般に、すべての妊娠のうちの2%〜8%であると考えられており、障害は、母親および幼児の両方について有意な罹患率および死亡率のリスクを保有する。子癇前症は、母体/胎児死亡の2番目に大きい原因であり、毎年医療費におよそ20億ドルかかっている。米国では、毎年、子癇前症(妊娠の20か月後の高血圧および/またはタンパク尿)の標準的な症候を有するおよそ100万人の女性が存在する。
子癇前症の原因(複数可)および病因は、依然として不確かであり、疾患の標準的な臨床症候を使用した子癇前症の識別(または除外)は、理想的でない。標準的な臨床症候の提示は、非常に変わりやすい可能出会いがあり、症候は、慢性高血圧、妊娠高血圧、一時的な高血圧、および妊娠糖尿病などの他の明確な障害を示す可能性がある。現在の実験室試験(例えば、タンパク尿についての試験)は、不正確である傾向があり得るか、または障害の進行の比較的遅い時期の間のみの子癇前症の検出に有効である。妊娠している女性が子癇前症を有するか、または有していないかどうかをより信頼可能に決定するための方法は、他のものの中でも特に、(1)より時宜を得た診断をもたらし、(2)診断の正確さを改善し、かつ/または(3)子癇前症の治療を含む女性の不要な治療を防止し得る。
参照による組み込み
本明細書に記述されているすべての公報、特許、および特許出願は、各個々の公報、特許、または特許出願が、特にかつ個々に、参照により組み込まれると示されているものと同じ程度に参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に記載の発明の特徴は、添付の請求項に特に記載されている。本発明の特徴および利点のより良い理解は、本発明の原則が利用される例示的な実施形態を記載している以下の詳細な記載、および以下の添付の図面を参照することによって得られるであろう。
実施例3に提示される対象となるマーカについての初期の分散分析に基づくスクリーニングからのLogWorth対効果量の図を示す。 子癇前症と非子癇前症との間を区別するためのマーカについてのデータ拡散の例示を提供する。 サブコホートについてのsFlt1/PlGF比の予測的有用性に基づく4つのサブコホート(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)に分割された実施例3で識別される上位9つのバイオマーカの散布図を示す。 文献で識別された候補分析物のフィブロネクチン、sFlt1、PlGF、およびPAPP−Aについて図2の4つのサブコホート分析と同様の4つのサブコホート分析を示す。 実施例7の多変量段階的反応に基づく分析において識別された上位9つの予測因子から構築された、非子癇前症対子癇前症についてのロジスティック回帰モデルについてのROC曲線および要約統計量を示す。 sFlt1およびPlGFプラス実施例3で識別された上位2つの予測因子から構築された、非子癇前症(非PreE)対子癇前症(PreE)についての実施例7で構築されたロジスティック回帰モデルについてのROC曲線および要約統計量を示す。 本開示の方法を実行するためのシステムを示す。 サブコホートによって提示された発現レベル(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)を含む、AlphaScreen(商標)による追加の候補バイオマーカの単一分析を示す。 サブコホートによって提示された発現レベル(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)を含む、AlphaScreen(商標)による追加の候補バイオマーカの単一分析を示す。 サブコホートによって提示された発現レベル(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)を含む、AlphaScreen(商標)による追加の候補バイオマーカの単一分析を示す。 サブコホートによって提示された発現レベル(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)を含む、AlphaScreen(商標)による追加の候補バイオマーカの単一分析を示す。 サブコホートによって提示された発現レベル(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)を含む、AlphaScreen(商標)による追加の候補バイオマーカの単一分析を示す。 サブコホートによって提示された発現レベル(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)を含む、AlphaScreen(商標)による追加の候補バイオマーカの単一分析を示す。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 子癇前症試料および非子癇前症試料の両方において子癇前症を検出するために識別された上位11個のマーカの発現レベルのログ変換を図示する。 バイオマーカ(PlGF)発現レベルの妊娠期間補正を行うためにLoessモデルが使用される例示的な手順を図示する。 非子癇前症試料を含む偽の陰性試料クラスタを示、非子癇前症(−)、子癇前症(+)、偽の陽性(O)、および偽の陰性(X)の試料の主成分分析のグラフを図示する。 子癇前症の病態生理における様々なマーカについての例示的な機能的役割を示す図表である。 子癇前症の識別に好適なバイオマーカモデルを構築するための方法のフロー図表を提供する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 本明細書に開示のいくつかの実施形態において使用するための様々な抗体または他の抗原結合剤を列挙する。 子癇前症を除外するための「積み重ね」決定構造についてのフロー図を提供する。 様々なマーカが子癇前症を除外するための直交情報を明らかにする程度を、カラーを介して示す図である。 子癇前症を除外するための様々な個々のバイオマーカの相対的な予測的重みを示す図表である。
疾患の標準的な臨床症候を使用した子癇前症の検出は、エラーを生じやすく、患者にとって非常に有害な結果となるリスクがあり、誤診のために医療システムにさらなる負担をかける。タンパク尿の測定は、不正確(例えば、偽の陰性および偽の陽性)である傾向があり、子癇前症合併症は、タンパク尿が顕著になる前に生じる場合があり、子癇前症の臨床提示は、非常に変わりやすい可能性があり(重度、急速な進行、および早期発症〜晩期発症、およびそれほど重度でない)、症候(高血圧、タンパク尿、または両方)は、より積極的でない治療コースを利用することができる他の明確な障害(慢性高血圧、妊娠高血圧、一時的な高血圧、および妊娠糖尿病)を示す場合がある。したがって、単に子癇前症の疑いがあるだけの患者が過剰に治療される大きなリスクがあり(例えば、早期に分娩または誘導され、それによって幼児を不要に早産合併症のリスクにさらす、かつ/または母親を不要に手術合併症のリスクにさらす)、静かにまたは急速に進行する子癇前症を有する患者が不十分に積極的に治療されるリスクがある(例えば、幼児を子宮内胎児発育遅延または死のリスクにさらす、母親を子癇発作、腎臓または肝臓損傷、肺水腫、常位胎盤早期剥離、および昏睡などの子癇前症性続発症のリスクにさらす)。
換言すると、高血圧およびタンパク尿は、単に、実際の子癇前症の疾患工程の下流の結果を反映しているだけである。子癇前症の従来の診断は、唯一の信頼できる治療が分娩であるため、疾患の隠蔽につながる。子癇前症の検出の改善のため、子癇前症と関連する機能障害性血管新生工程への調査を行って、子癇前症のより良好かつ/またはより直接的な指標を発見した。この調査の1つの手段は、子癇前症を識別するための方法として患者の血清におけるsFlt1/PlGF比の使用につながった(例えば、Zeisler et al.NEJM 274(2017):13−22 or Verlohren et al.Hypertension.63(2014):346−52を参照されたい)。しかしながら、この方法は、最大80%の感受性および78.3%の特異性を有するのみであるため、かなりの割合の偽の陰性および陽性を伴い、子癇前症の診断を除外し、過剰治療/治療が困難な状況を回避する際にこれを限定的な使用にする。
したがって、妊娠している患者における子癇前症の検出または予測を改善するための方法、組成物、システム、およびキット、具体的には、高い陰性的中率での子癇前症を可能にし、かつ/または医療従事者が長時間の子癇前症の診断を除外することを可能にする方法、組成物、システム、およびキットが必要である。
本開示は、子癇前症のリスクを評価するための改善された特性を有する1つ以上の試験を提供し、試験は、子癇前症の治療をされるべきでない対象を識別する(例えば、いくつかの例では、子癇前症の1つ以上の徴候、症候、またはリスク因子を示すが、子癇前症の治療をされるべきでない対象を識別する)ために使用され得る。いくつかの実施形態では、この試験は、複数マーカ血清または血漿タンパク質アッセイである。いくつかの実施形態では、試験は、多重血清/血漿タンパク質アッセイである。子癇前症と関連する1つ以上の症候は、糖尿病(例えば、妊娠、I型またはII型)、正常なグルコースレベルよりも高い、高血圧(例えば、慢性または非慢性)、過剰なまたは突然の体重増加、正常な体重よりも高い、肥満、正常な肥満度指数(BMI)よりも高い、異常な体重増加、異常な血圧、水毒、遺伝因子、異常なタンパク尿、頭痛、浮腫、異常なタンパク質/クレアチニン比、異常な血小板数、ストレス、未産、異常なパパニコロー試験の結果(子宮頸部細胞診)、以前の子癇前症事例(例えば、PreEの個人歴)、子癇前症の家族歴、以前の妊娠における子癇前症、腎臓疾患、血栓形成傾向、またはそれらの任意の組み合わせであり得る。
本開示は、子癇前症を有するか、またはその治療を必要とする患者を除外するなど、対象における子癇前症のリスクを評価するための試験、システム、および方法を提供する。いくつかの実施形態では、試験を使用して、子癇前症と関連する1つ以上の症候またはリスク因子を有する患者が子癇前症について治療されるべきかどうかを判別する。子癇前症と関連する1つ以上の症候またはリスク因子は、糖尿病(例えば、妊娠、I型またはII型)、正常なグルコースレベルより高い、高血圧(例えば、慢性または非慢性)、過剰なまたは突然の体重増加、正常な体重よりも高い、肥満、正常な肥満度指数(BMI)よりも高い、異常な体重増加、異常な血圧、水毒、遺伝因子、異常なタンパク尿、頭痛、浮腫、異常なタンパク質/クレアチニン比、異常な血小板数、ストレス、未産、異常なパパニコロー試験の結果(子宮頸部細胞診)、以前の子癇前症事例(例えば、PreEの個人歴)、子癇前症の家族歴、以前の妊娠における子癇前症、腎臓疾患、血栓形成傾向、またはそれらの任意の組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において別の言い方をすれば、本明細書に開示の試験を使用して、症候を示す(かつ/または子癇前症についての1つ以上のリスク因子を有する)が、早産を必要とする可能性の高い子癇前症を有しない、妊娠している女性を識別することができる。いくつかの実施形態では、試験は、症候を示している患者、または識別されるリスク(または識別可能な)リスク因子がほとんどないか、もしくは全くない患者に対して使用され得る。
定義
明細書および特許請求の範囲において使用される場合、「1つ」、「1つ」、および「その」という単数形は、別段文脈が明確に示していない限り、複数の参照を含む。
「高血圧」という用語は、異常に高い血圧を指す。高血圧は、140mmHgを上回る座位収縮期血圧(sSBP)または90mmHgを上回る座位拡張期血圧(sDBP)を参照することによってなど、任意の好適な様式で識別され得る。高血圧は、さらに、140〜149mmHgのsSBPまたは90〜99mmHgのsDBPを示すクラス1、および160mmHgを上回るsSBPまたは100mmHgを上回るsDBPを示すクラス2を有する、クラス1またはクラス2の高血圧に分類され得る。(例えば、The Seventh Report of the Joint National Committee on Prevention,Detection,Evaluation,and Treatment of High Blood Pressure.JAMA 2003;289:2560−71.を参照されたい)他の好適な基準を使用して、130mmHgを上回る座位収縮期血圧および/または90mmHgを上回る座位拡張期血圧を有するなど、高血圧を識別することができる。高血圧はまた、2017 AHAガイドラインに従って決定され得る(Whelton et al.2017 ACC/AHA/AAPA/ABC/ACPM/AGS/APhA/ASH/ASPC/NMA/PCNA Guideline for the Prevention,Detection,Evaluation,and Management of High Blood Pressure in Adults,Journal of the American College of Cardiology(2017),doi:10.1016/j.jacc.2017.11.006を参照されたい)。このようなガイドラインは、「正常な」血圧を、120/80mmHg未満、「上昇した」血圧を、120〜129mmHgの収縮期および80mmHg未満の拡張期として、「ステージ1」を、120〜139mmHgの収縮期または80〜89mmHgの拡張期として、「ステージ2」を、少なくとも140mmHgの収縮期または少なくとも90mmHgの拡張期として、「高血圧性クリーゼ」を、180を超える収縮期および/または120を超える拡張期として識別する。
本明細書で使用される場合、「タンパク尿」という用語は、尿中の異常なたんぱく質の存在として定義される。いくつかの指標色素および試薬を使用して、タンパク尿を半定量的に(例えば、ブロモフェノールブルー)測定することができる。いくつかの実施形態では、尿中のタンパク質の濃度は、半定量的な「尿試験紙」分析によって決定することができ、陰性、トレース(10〜20mg/dL)、1+(〜30mg/dL)、2+(〜100mg/dL)、3+(〜300mg/dL)、または4+(〜1,000mg/dL)として等級付けることができ、2+は、一般に、問題のあるタンパク尿についての閾値として使用される。代替的なスキームでは、尿中のタンパク質の濃度はまた、24時間あたりの尿の回収として測定することができ、300mg以上のタンパク質は、タンパク尿を示す。代替的なスキームでは、尿中のタンパク質の濃度は、スポット尿試料において測定することができ、デシリットルあたり30mg以上のタンパク質は、タンパク尿を示す。さらに代替的なスキームでは、タンパク尿はまた、尿中のタンパク質/クレアチニン比(Pr/Cr)として発現され得、≧0.3のPr/Cr比は、問題のあるタンパク尿を示す。
本明細書で使用される場合、「その抗体または断片」という用語は、最広義の意味で使用され、少なくとも2つの完全な抗体、および抗体断片から形成される完全なモノクロ−ナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)を包含する。抗体断片は、抗原結合活性を保持する完全な抗体の一部分を含み、例には、Fab、Fab’、F(ab)、F(abc)、およびFv断片、ならびに二重特異性抗体、直鎖状抗体、scFvs、および抗体断片から形成された多特異性抗体が含まれる。
本明細書で使用される場合、「アプタマ」という用語は、意図される標的物質と共に複合体を形成することができるオリゴヌクレオチドを指す。このような複合体の形成は、標的を伴い得る他の材料がアプタマに対して複雑でないという意味で標的特異的である。複合体の形成および親和性は、程度の問題であるが、この文脈において、「標的特異的」とは、アプタマが、汚染または「標的外」材料に結合するよりも非常に高程度の親和性を有する標的に結合することを意味すると認識される。
本明細書で使用される場合、「子癇前症」(または「PreE」)という用語は、母親における異常な胎盤形成、機能障害性栄養芽層発展、欠陥のある胎盤性血管新生、および全身性炎症反応の増強から生じると考えられる複数の臓器系を伴う妊娠特異的障害を指す。子癇前症は、治療されない場合、子癇発作、HELLP症候群、出血性または虚血性脳卒中、肝臓損傷、急性腎臓傷害、および急性呼吸窮迫症候群(ARDS)に進行し得る。したがって、子癇前症は、高血圧およびタンパク尿などの症候と共に現れることが多いが、単純な血管緊張障害および腎機能障害(治療されない場合に生じる非重複セットの合併症によって証拠として)とは区別されるため、血管緊張障害および腎機能障害自体を反映している症候は、子癇前症についての理想的な予測/診断値ではない。さらに、子癇前症の病態生理に関する情報は、例えば、Phipps et al.Clin J Am Soc Nephrol 11(2016):1102−1113に見られ得る。いくつかの実施形態では、子癇前症の従来の診断は、上記に定義される高血圧およびタンパク尿が同時に検出された場合に行われる。他の実施形態では(American College of Obstetricians and Gynecologists;Task Force on Hypertension in Pregnancy.Obstet Gynecol.122(2013):1122−31(参照により明確に本明細書に組み込まれる))、子癇前症の従来の診断は、高血圧(以前に正常な血圧を有する女性における妊娠の20週後から少なくとも4時間離れた2つの場合に対する、収縮期の140mmHg以上の血圧、もしくは拡張期の90mmHg以上の血圧、または数分の短い間隔内の、収縮期の160mmHg以上の血圧、もしくは拡張期の110mmHg以上の血圧)およびタンパク尿(測定または推定される24時間あたり300mgの尿回収、または0.3以上のタンパク質・クレアチニン比、または1+の尿試験紙の読み取り)の同時の検出時に、または(a)血液血小板数がミリリットルあたり100,000未満であるか、(b)血清クレアチニンが患者について1.1mg/dL未満または2倍のベースラインであるか、または(c)肝臓トランスアミナーゼの血液濃度が正常の2倍以上である場合に、タンパク質尿素の不存在下で新たに発症した高血圧時に)行われる。いくつかの場合では、子癇前症は、タンパク質尿素の診断、例えば、他の末期の臓器損傷の証拠が存在することなしに行われる。
「対象」という用語は、ヒトまたは非ヒト動物を含み得る。したがって、本明細書に記載の方法は、ヒトおよび獣医学的疾患および動物モデルの両方に適用可能である。好ましい対象は、「患者」、すなわち、疾患または症状に対する医療を受けている、生きているヒトである。これには、病理の徴候について調査されている、定義された疾患を有しない人が含まれる。
「FRET対」という用語は、色素分子のうちの一方が、他方が光を放出し(ドナー色素)、2つの色素がエネルギー移動を許容する距離で空間的に分離される波長で光(アクセプタまたはクエンチャ色素)を吸収する一対の色素分子を指し、開示される実施形態は、概して、互いに約50、20、または10オングストローム内など、約100オングストローム内である(例えば、同じ基板部分に結合されたため)。ドナー色素の励起は、FRET機構を通してアクセプタ色素の励起につながり、およびより低いレベルの蛍光がドナー色素から観察される。FRETの効率は、色素間の距離、ドナー色素の量子収率、ドナー色素の蛍光寿命、およびドナーの発光スペクトルおよびアクセプタの吸収スペクトルの重複に依存する。
「光増感剤」という用語は、生体分子に対する光化学効果を有する反応種(例えば、酸素について)を生成する、光活性化化合物、または光活性化化合物の生物学的前駆体を指す。
「酸素感受性色素」という用語は、分子酸素に結合した後にその蛍光強度もしくは放出最大値を変更する蛍光色素(このような色素はFOCIアッセイに対して使用される)、または分子酸素に結合した後に光を放出する化学発光色素(このような色素はLOCIアッセイに対して使用される)を指す。
本明細書で使用される場合、「アフィマ」という用語は、抗体と同様の特異性および親和性を有する標的分子に結合する小さく高度に安定したタンパク質を指す。
「子癇前症の不要な治療」という用語は、医療従事者が、様々なタンパク質バイオマーカの濃度の量の判定に基づく試験など、本明細書に記載の試験または手順の結果を考慮したときに、統計的に言うと、正当化されない子癇前症の治療を指し得る。このような不要な治療は、子癇前症についての1つ以上の症候またはリスク因子に基づく早期の誘導を含み得る。
対象
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、妊娠の任意の段階の妊娠しているヒト対象の症状を検出または予測するのに有用である。他の実施形態では、妊娠しているヒト対象は、妊娠の20週目後である。他の実施形態では、妊娠しているヒト対象は、妊娠の第1のまたは第2の3か月の後である。いくつかの実施形態では、妊娠しているヒト対象は、妊娠の21週目、22週目、23週目、24週目、25週目、26週目、27週目、28週目、29週目、30週目、31週目、32週目、33週目、34週目、35週目、36週目、37週目、38週目、39週目、40週目、41週目、または42週目後である。
本方法、組成物、システム、およびキットは、子癇前症(PreE)または非子癇前症(NonPreE)などの妊娠している対象の症状を検出または予測するのに好適である。いくつかの実施形態では、子癇前症は、さらに、非常に早期の発症(妊娠の25週前)、早期発症(妊娠の34週前)、および晩期発症(妊娠の34週後)の子癇前症に分割される。典型的には、妊娠している患者が高血圧または腎臓の症候を示さないとき、患者は、NonPreEと考えられる。さらに、妊娠している患者が、タンパク尿の徴候を有さない高血圧の症候のみを示している場合、患者は、概して、子癇前症を有することのみを疑われる。しかしながら、タンパク尿の測定が不正確である傾向がある(例えば、偽の陰性および偽の陽性)ため、子癇前症合併症は、タンパク尿が大きくなる前に生じる可能性があり、子癇前症の臨床提示は、非常に変化する可能性があり(重度、急速な進行、および早期発症〜晩期発症およびそれほど重度でないまで)、症候(高血圧、タンパク尿、または両方)は、異なる治療コースを利用することができる他の明確な障害を示し得る。したがって、単に子癇前症の疑いがあるだけの患者が不要に治療される(例えば、早期に分娩/誘発され、幼児を早産合併症のリスクにさらすか、または母親を手術合併症のリスクにさらす)大きなリスクがあり、静かにまたは急激に進行する子癇前症を有する患者が不十分に積極的に治療される(例えば、幼児を子宮内胎児発育遅延または死のリスクにさらす、母親を子癇発作、腎臓または肝臓損傷、肺水腫、常位胎盤早期剥離、および昏睡などの子癇前症続発症のリスクにさらす)リスクがある。
したがって、対象は、既知のリスク因子を有しないか、またはPreEなどの症状について1つ以上のリスク因子を有する妊娠している女性であり得る。いくつかの例では、高血圧および/またはタンパク尿は、子癇前症のリスクがある対象を示し得る。いくつかの例では、子癇前症のリスクのある対象は、尿試験紙アッセイによって2+(100mg/dL)以上、24時間あたり300mg以上の尿回収、スポット尿試料においてデシリットルあたり30mg以上のタンパク質、またはミリモルあたり≧30mgの尿中のPr/Cr比として測定された尿タンパク質含有量を有し得る。いくつかの例では、子癇前症のリスクがある対象は、140mmHgを上回る座位収縮期血圧(sSBP)、または90mmHgを上回る座位拡張期血圧(sDBP)、または両方を有し得る。いくつかの例では、sFlt1/PlGF比を使用して、子癇前症のリスクのある対象を識別することができる(例えば、Zeisler et al.NEJM 274(2017):13−22 or Verlohren et al.Hypertension.63(2014):346−52を参照されたい)。いくつかの例では、高血圧およびタンパク尿の両方を使用して、子癇前症のリスクのある対象を識別することができる。いくつかの例では、(a)血液血小板数がミリリットルあたり100,000未満であること、(b)血清クレアチニンが患者について1.1mg/dLを上回るかまたは2倍のベースラインであること、または(c)肝臓トランスアミナーゼの血液濃度が正常の2倍以上であることから選択される1つ以上の症候と組み合わせて、新たに発症した高血圧を使用して、子癇前症のリスクのある対象を識別することができる。
試料
妊娠の状態または結果を検出、診断、監視、予測、または評価するために、妊娠している対象において分子(例えば、核酸、タンパク質など)を検出するための方法を、本開示に記載する。いくつかの場合では、分子は、循環分子である(例えば、細胞に結合されず、血液、血液血漿、または血液血清などの体液中を自由に循環する)。いくつかの場合では、分子は、血液の細胞質、内皮、または臓器細胞中に発現される。いくつかの場合では、分子は、血液の表面、内皮、または臓器細胞上に発現される。
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムを使用して、1つ以上の対象から1つ以上の試料を分類することができる。試料は、試験される対象の組織、細胞、核酸、遺伝子、遺伝子断片、発現生成物、タンパク質、ポリペプチド、エキソソーム、遺伝子発現生成物、または遺伝子発現生成物断片を含有する任意の材料であり得る。試料は、組織、細胞、血漿、血清、または細胞からの、または個体の細胞に由来する任意の他の生物学的材料を含み得るがこれらに限定されない。試料は、細胞または組織の異種または同種割合であり得る。試料は、無細胞であるか、または細胞が枯渇した流体(例えば、血漿または血清)流体であり得る。いくつかの場合では、試料は、単一の患者からのものである。いくつかの場合では、本方法は、例えば、タンパク質アッセイなどに対する大規模並列多重発現分析を介して、複数の試料を一度で分析することを含む。
試料は、好ましくは、体液である。体液は、唾液、尿、血液、および/または羊水であり得る。試料は、血漿、血清、またはエキソソームなど、これらの流体のうちのいずれかの画分であり得る(例示的なエキソソーム単離技術は、例えば、Li et al.Theranostics.7(2017):789−804に見られ得る)。好ましい実施形態では、試料は、血液試料、血漿試料、または血清試料である。
試料は、本明細書に記載の分析方法に好適な資料を提供し得る任意の方法を使用して得られ得る。試料は、咽頭スワブ、頬側スワブ、気管支洗浄、尿回収、頸部の掻き取り、頸膣部試料の分泌回収(例えば、Weck−Celスポンジなどの眼科用スポンジで)、唾液の回収、または糞便の回収などの非侵襲的方法によって得られ得る。試料は、採血などの最小侵襲的方法によって得られ得る。試料は、静脈穿刺によって得られ得る。
本明細書で使用される場合、「試料を得ること」は、直接または間接的に試料を得ることを含む。いくつかの実施形態では、試料は、その後、試料からバイオマーカを取得する同じ関係者によって対象(例えば、試験実験室)から採取される。いくつかの実施形態では、試料は、対象(例えば、内科医、看護師、瀉血専門医、または介護士)からそれを回収した別の実体から受容される(例えば、試験実験室によって)。いくつかの実施形態では、試料は、個別の実体(例えば、試験実験室)の方向下で医療従事者によって対象から採取され、その後、当該実体(例えば、試験実験室)に提供される。いくつかの実施形態では、試料は、自宅にいる対象または対象の介護士によって採取され、その後、試料からバイオマーカデータを取得する関係者(例えば、試験実験室)に提供される。生体試料の自己または自宅回収に好適な様々なキットが、商業的かつ文献に記載されており、例えば、US20170023446A1およびUS4777964Aを参照されたい。
試料データ
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、1つ以上の試料またはそれらの使用に関するデータを含み得る。データは、本明細書に記載の様々なタンパク質など、1つ以上のバイオマーカの量または濃度を表し得る。別の言い方をすれば、データは、タンパク質またはポリペプチドの発現レベルデータであり得る。本明細書に記載のバイオマーカの発現レベルデータは、タンパク質アレイ、プロテオミクス、発現プロテオミクス、質量分析(例えば、液体クロマトグラフィ質量分析(LC−MS)、多重反応モニタリング(MRM)、選択的反応モニタリング(SRM)、定期MRM、定期SRM)、2D PAGE、3D PAGE、電気泳動、プロテオミクスチップ、プロテオミクスマイクロアレイ、エドマン分析、直接または間接的ELISA、免疫吸着アッセイ、イムノPCR(例えば、Sano et al.Science.258(1992):120−2.を参照されたい)、近接延伸法(proximity extension assay)(例えば、Thorsen et al.Journal of Translational Medicine.11(2013):253、US20130288249A1、US9777315B2を参照されたい)、ルミネックスアッセイ、またはアルファスクリーンなどの同種(例えば、Application Note.Nature Methods 5,(2008)、US5898005A、US5861319Aを参照されたい)、時間分解蛍光共鳴エネルギー移動(TR−FRET、例えば、US20130203068A1およびWO1998015830A2を参照されたい)、時間分解蛍光(TRF)、蛍光酸素チャネリングイムノアッセイ(FOCI)、または発光酸素チャネリング免疫測定法(LOCI(商標)、例えば、例示的な方法および試薬について、Ullman et al.Proc Natl Acad Sci U S A.91(1994):5426−5430またはUllman et al.ClinChem.1996 Sep;42(9):1518−26を参照されたい)によって決定され得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物、方法、およびデバイスは、様々なサンドイッチ、競合的、または非競合的アッセイ形式におけるラベル付き分子を使用して、本明細書に記載のバイオマーカの発現レベルを決定する。このような方法は、本明細書に記載のタンパク質のうちの1つ以上の存在または量に関連するシグナルを作成する。好適なアッセイ形式はまた、クロマトグラフィ、質量分析、およびタンパク質「ブロッティング」方法を含む。さらに、バイオセンサ、光学イムノアッセイ、免疫吸着アッセイ、および酵素イムノアッセイなどの特定の方法およびデバイスを用いて、ラベル付き分子を必要とせずに、分析物の存在または量を決定し得る。酵素イムノアッセイ(EIA)の実施例には、化学発光酵素イムノアッセイ、電気化学発光イムノアッセイ(ECLIA)、および酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)が含まれ、これらは、さらに、Kuhle,Jens,et al.“Comparison of three analytical platforms for quantification of the neurofilament light chain in blood samples:ELISA,electrochemiluminescence immunoassay and Simoa.”Clinical Chemistry and Laboratory Medicine (CCLM)54.10(2016):1655−1661.に記載されている。Abbott AXSYM(登録商標)、IMx(登録商標)、またはCommander(登録商標)システム、Biolog 24i(登録商標)またはCLC480システム、Beckman Coulter ACCESS(登録商標)、ACCESS 2(登録商標)、またはUnicel Dxl 600/800システム、bioMerieux VIDAS(登録商標)またはミニVIDAS(登録商標)システム、Chimera Biotec GmbH Imperacer(登録商標)アッセイ、Dade Behring STRATUS(登録商標)システム、DiaSorin LIAISON XL(登録商標)またはETI−Max 300システム、Dynex Agility(登録商標)システム、Gold Standard Diagnostics Thunderbolt(登録商標)分析器、Gyrolab xPlore/xPand(登録商標)システム、Hudson Robotics ELISA Workstation、Ortho Clinical Diagnostics Vitros(登録商標)ECLまたは3600システム、Hamiltorn Robotics ELISA NIMBUSまたはSTARletシステム、Luminex xMAP(登録商標)システム、PerkinElmer ALPHAscreen(登録商標)またはAlphaLISA(登録商標)、Phadia Laboratory System 100E、250、1000、2500、または5000、Quanterix SIMOA(登録商標)システム、Quidel Sofia(登録商標)2 POCシステム、Radiometer AQT90 Flexシステム、Roche Diagnostics ElecSys(登録商標)2010、Cobas(登録商標)4000/6000/8000分析器、またはIntegra(登録商標)400 Plus、分析器のc111、c311、c501、c502ファミリー、Seikisui Diagnostics FastPack(登録商標)IP自動化システム、Siemens Dimension Vista(登録商標)1500システム、DPC Immulite 1000/2000システム、またはDCA Vantage(登録商標)分析器、Singulex Single Molecule Counting(SMC(商標))アッセイ、Stratus(登録商標)CS Acute Care Diagnostic System、Sysmex Eurolyser(登録商標)、ThermoFisher MGC 240 Benchtop Analyzer、Tosoh Bioscience AIA(登録商標)−360またはAIA−600IIシステム、UniCel Dxl 860i Synchron Access Clinical System、UniCel DxC 680i Synchron Access Clinical System、Access/Access 2 Immunoassay System、600 Access Immunoassay System、600i Synchron Access Clinical System、Dxl 800 Access Immunoassay System、DxC 880i Synchron Access Clinical System、およびVital Diagnostics PathFast(登録商標)ポイントオブケア化学発光イムノアッセイ分析器を含むがこれらに限定されない、これらのイムノアッセイを行うためのロボット器具は、市販されている。しかしながら、いかなる好適なイムノアッセイ、例えば、酵素結合イムノアッセイ(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、競合的結合アッセイなどを用いることができる。
他の例示的な分析システムには、例えば、1つ以上の放射線の供給源および/またはさらに1つの検出器を含む、光学システムなどのアッセイシステムを含む。このようなシステムは、例えば、試料を照明する光源、試料によって放出される光を検出するように構成された検出器(例えば、蛍光分光法)、光学密度(例えば、試料を通過する光の部分)、および/または試料によって回折される光(例えば、回折光学)を使用し得る。分析システムは、例えば、ELISA(酵素結合免疫吸着測定法)を使用し得る。分析システムは、例えば、LOCI(発光酸素チャネリング)、FOCI(蛍光酸素チャネリング)、またはAlphaScreenを使用し得る。分析技術は、試料の分析/アッセイ前または中に試料を培養および/または希釈することを伴い得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物、方法、およびデバイスは、蛍光酸素チャネリングイムノアッセイ(FOCI)組成物および方法を使用する。FOCIは、概して、米国特許第5,807,675号、第5,616,719号、および第7,635,571号に記載されており、これらの内容全体が、参照により本明細書に明示的に組み込まれる。いくつかの実施形態では、分析物に結合することができ、光増感剤を含む、第1の分析物結合剤が、蛍光色素を含む第2の分析物結合剤と組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、第1の分析物結合剤の光増感剤は、励起状態で一重項酸素を作成し、それによって第2の分析物結合剤の蛍光色素に、一重項酸素と反応する際に蛍光を放出させる。いくつかの実施形態では、放出された蛍光を検出して、例えば、分析物の存在および/または不存在を決定し、かつ/または試料中の分析物を定量化および/または分析することができる。いくつかの実施形態では、第1および第2の分析物結合剤は、分析物(例えば、タンパク質)の同じ領域(例えば、エピトープ)に結合する。例えば、いくつかの実施形態では、第1および第2の分析物結合剤は、同じ種類の分析物結合部分または試薬(例えば、同じ抗体)を含む。いくつかの実施形態では、第1および第2の分析物結合剤は、分析物(例えば、タンパク質)の個別の領域(例えば、エピトープ)に結合する。いくつかの実施形態では、第1および第2の分析物結合剤は、空間的に重ならない分析物(例えば、タンパク質)の個別の領域に結合する。いくつかの実施形態では、第1の分析物結合剤および第2の分析物結合剤は、分析物結合剤の両方が分析物に結合された場合に、第1の分析物結合剤の光増感剤によって作成された一重項酸素が、第2の分析物結合剤の蛍光色素に非常に近接するように構成されている。いくつかの実施形態では、第1および/または第2の分析物結合剤(複数可)は、抗原結合剤(例えば、抗体)である。いくつかの実施形態では、第1および/または第2の分析物結合剤(複数可)は、アフィマである。いくつかの実施形態では、第1および/または第2の分析物結合剤(複数可)は、抗原結合剤およびアプタマである。いくつかの実施形態では、光増感剤および蛍光色素の両方が、ビーズの形態で提供される。
いくつかの場合では、アレイは、異なる粒子またはビーズに取り付けられた異なるプローブ(例えば、抗体、scFvs、Fab断片)を使用することができる。このようなアレイでは、プローブが粒子またはビーズに取り付けられる同一性は、コード化システムから決定可能であり得る。プローブは、抗体もしくは抗原結合断片またはそれらの誘導体であり得る。
試料に関するデータを、1つ以上の対照試料に関するデータと比較し得る。いくつかの場合では、対照試料は、異なる時点での同じ患者からの試料であり得る。いくつかの場合では、1つ以上の対照試料は、健康な対象、不健康な対象、またはそれらの組み合わせからの1つ以上の試料を含み得る。1つ以上の対照試料は、健康な対象、子癇前症以外の妊娠関連の症状を有する対象、妊娠関連の症状と共に慢性症状を有する対象、または慢性症状のみを有する対象からの1つ以上の試料を含み得る。
いくつかの例では、様々な資料についての発現レベルデータを使用して、本明細書に提供されるアルゴリズムまたは分類子を展開または訓練する。対象が妊娠している女性などの患者であるいくつかの例では、遺伝子発現レベルが、患者からの試料において測定され、分類子またはアルゴリズム(例えば、訓練されたアルゴリズム)は、子癇前症などの妊娠関連の症状のリスクを検出、予測、監視、除外、または推定するために、得られたデータに適用される。
いくつかの場合では、発現レベルの分析は、最初に、いくつかの個々のバイオマーカのうちのそれぞれの発現レベルの測定を提供する。発現レベルは、バイオマーカの濃度に関して絶対的であり得るか、または試料における別のバイオマーカに対する対象となる発現生成物の関連する濃度に関して相対的であり得る。例えば、タンパク質の相対的な発現レベルは、試料におけるハウスキーピングまたは構造タンパク質の発現レベルに関して発現され得る。相対的な発現レベルはまた、同じアレイに結合された示差的にラベル付けられた試料を号時に分析することによって決定され得る。発現レベルはまた、例えば、シグナル強度に関して、任意単位で発現され得る。
分類子および分類子プローブセット
1つ以上の分類子を含む分類システムの使用を本明細書に開示する。いくつかの例では、分類子は、両方向分類子である。いくつかの例では、二元分類子は、妊娠している患者からの試料を、子癇前症(PreE)および非子癇前症(非PreE)を含む2つのクラスのうちの1つに分類し得る。いくつかの例では、分類子を使用して、子癇前症についての治療を必要としないものとして対象を分類し得る。いくつかの例では、多方向分類子を使用し得る(例えば、子癇前症、非子癇前症、および不明)。
分類子および/または分類子プローブセット(例えば、抗体セット)を使用して、子癇前症について治療される患者からのものとして試料を規定または除外のいずれかを行うことができる。例えば、分類子を使用して、健康な対象からのものとして試料を分類することができる。代替的に、分類子を使用して、不健康な対象からのものとしてしりょ試料を分類することができる。代替的に、またはさらに、分類子を使用して、子癇前症について治療されるべき対象からのものであるとして試料を規定または除外のいずれかを行うことができる。
データ分析システムおよび方法
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、アルゴリズムまたはそれらの使用を含み得る。1つ以上のアルゴリズムを使用して、1つ以上の対象から1つ以上試料を分類することができる。1つ以上のアルゴリズムを、1つ以上の試料からのデータに適用することができる。データは、バイオマーカ発現データを含み得る。
本明細書に開示の方法は、1つ以上の対象からの1つ以上の試料に分類を割り当てることを含み得る。分類の試料への割り当ては、アルゴリズムを発現レベルに適用することを含み得る。いくつかの場合では、遺伝子発現レベルは、子癇前症、子癇、非子癇前症、慢性高血圧、妊娠高血圧、またはHELLP(溶血、肝臓酵素の上昇、および低血小板数、例えば、Weinstein et al.Am J Obstet Gynecol.142(1982):159−67を参照されたい)症候群を含む症状のうちの1つとして試料を分類するための訓練されたアルゴリズムを含むデータ分析システムに入力される。いくつかの実施形態では、アルゴリズムは、その実行の一部として、試料についての指数を計算し、試料指数を閾値と比較することができ、所定の関係は、特定の分類に属する試料の可能性を示し得る。
アルゴリズムは、試料の分類および/または信頼レベルを含むその出力の記録を提供し得る。いくつかの例では、アルゴリズムの出力は、子癇前症、子癇、慢性高血圧、妊娠高血圧、またはHELLP症候群を含む症状を有する対象の可能性であり得る。
データ分析システムは、訓練されたアルゴリズムであり得る。アルゴリズムは、直鎖状分類子を含み得る。いくつかの例では、直鎖状分類子は、直鎖状判別分析、フィッシャの直鎖状判別子、ナイーブベイズ分類子、ロジスティック回帰、パーセプトロン、サポートベクターマシン、またはそれらの組み合わせのうちの1つ以上を含む。直鎖状分類子は、サポートベクターマシン(SVM)アルゴリズムであり得る。アルゴリズムは、二元分類子を含み得る。二元分類子は、1つ以上の決定木、ランダムフォレスト、ベイジアンネットワーク、サポートベクターマシン、ニューラルネットワーク、またはロジスティック回帰アルゴリズムを含み得る。
アルゴリズムは、1つ以上の直鎖状判別分析(LDA)、基礎パーセプトロン、エラスティックネット、ロジスティック回帰、(カーネル)サポートベクターマシン(SVM)、斜方直鎖状判別分析(DLDA)、Golub分類子、Parzenに基づく(カーネル)フィッシャ判別分類子、k−最近接反復RELIEF、分類木、最大尤度分類子、ランダムフォレスト、直近重心、マイクロアッセイの予測分析(PAM)、k−中央クラスタリング、Fuzzy C−中央クラスタリング、ガウシアン混合物モデル、段階的反応(GR)、勾配ブースティング方法(GBM)、エラスティックネットロジスティック回帰、ロジスティック回帰、またはそれらの組み合わせを含み得る。アルゴリズムは、斜方直鎖状判別分析(DLDA)アルゴリズムを含み得る。アルゴリズムは、直近重心アルゴリズムを含み得る。アルゴリズムは、ランダムフォレストアルゴリズムを含み得る。いくつかの実施形態では、子癇前症および非子癇前症の判別について、ロジスティック回帰、ランダムフォレスト、および勾配ブースティング方法(GBM)の性能は、直鎖状判別分析(LDA)、ニューラルネットワーク、およびサポートベクターマシン(SVM)の性能よりも優れている。
バイオマーカ/遺伝子発現生成物
「バイオマーカ」という用語は、いくつかの生体状態または症状の測定可能な指標を指す。いくつかの例では、バイオマーカは、対象において見られる物質、物質の分量、またはいくつかの他の指標であり得る。例えば、バイオマーカは、試料におけるタンパク質および/または他の遺伝子発現生成物の量であり得る。いくつかの実施形態では、バイオマーカは、完全長の非変性タンパク質である。他の実施形態では、バイオマーカは、代替的にスライスされたか、翻訳後に切断されたか、または翻訳後に化学的に変性された(例えば、メチル化、リン酸化、グリコシル化、ホルミル化など)タンパク質である。
本明細書に記載の方法、組成物、およびシステムはまた、識別、診断、分類、治療の目的のための、または別様に、NonPreE、PreE、慢性高血圧、妊娠高血圧、またはHELLP症候群を含む妊娠している患者の様々な症状を特徴付けるための、バイオマーカパネルおよび/または遺伝子発現生成物の使用に関する。生体試料を分類するのに有用なバイオマーカおよび/または遺伝子発現生成物のセット、ならびにそのようなバイオマーカのセットを得る方法を提供する。多くの場合、パネルにおける遺伝子発現バイオマーカのレベルのパターン(シグネチャとしても知られる)は、1つ以上の参照試料から決定され、次に、これを使用して、試験試料シグネチャと参照試料シグネチャとの間の類似性の尺度などによって、試験試料におけるバイオマーカの同じパネルのシグネチャを評価する。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法、組成物、およびシステムは、子癇前症の1つ以上の病態生理学的特徴(様々な病態生理学的特徴または子癇前症を示す図16を参照されたい)に関連するバイオマーカの特定の機能的クラスに属する1つ以上のバイオマーカの検出を伴い得る。図16は、子癇前症に関連すると考えられる様々な病態生理学的特徴、および関連するバイオマーカを示しているが、病態生理およびマーカ間の関係を記載するために多数の他の方法が可能である。例えば、KIM−1、CD274、およびデコリンは、タンパク質に関連する腎臓損傷と考えられ得る。同様に、sFlt1、エンドグリン、パッパリシン2、およびデコリンは、血管新生関連のタンパク質と考えられ得る。当業者であれば、様々な他の分類スキームが同様に使用され得ることを認識するであろう。
理論に限定されることを望まないが、子癇前症は、異常なトロホブラスト浸潤から発生すると考えられ、これが、不完全ならせん動脈再モデル化および胎盤の血流低下をもたらし、この胎盤の血液低下が、複数の体組織における機能障害をトリガし、子癇前症の徴候および症候を引き起こす。このような機能障害性システムは、例えば、それらのうちの多くが、子癇前症の異常な生理機能に応答して胎盤によって放出され、母親の体における血管恒常性を乱す、前および抗血管新生因子における不均衡によって明らかであるように、胎盤性血流低の結果として、血管新生および内皮機能を含み得る。SFLT1(可溶性FMS様チロシンキナーゼ1、VEGFA、VEGFB、およびPlGFに対する細胞表面受容体として作用し、出産期に向かって減少し、胎児の血管系の成長に重要な役割を果たすチロシン−タンパク質キナーゼ)、PlGF(胎盤成長因子、内皮細胞成長、増殖、および移動を刺激する妊娠30週でピークになる血管新生誘導タンパク質)、DCN(細胞外マトリクスの機能的構成要素であり、ECM分子に結合することによる細胞修復および細胞接着および移動の制御に役割を果たすデコリン)、ENG(その可溶性形態において、sENGが、強力な抗血管新生分子であり、TGF−β1結合を阻害することによって作用するエンドグリン)、およびFGF21(胎盤性合胞体栄養細胞において発現されることが実証されており、アディポカインおよびグルコース輸送の調整器の両方である、線維芽細胞成長因子21)は、子癇前症における血管新生機能障害のマーカであると考えられる。別のこのような機能障害性システムは、胎盤の血流低下から生じ、酸化ストレス因子の上方制御につながる酸素シグナル伝達である。KIM−1(腎臓傷害分子−1)は、その発現が、近位腎尿細管細胞における局所的な低酸素状態/局所貧血に応答して増加することが知られているため、子癇前症における酸素シグナル伝達の機能障害のマーカであると考えられる。別のこのような機能障害性システムは、免疫反応の変化であり、これは、それらの血流低下の結果としての胎盤性組織の炎症からもたらされ得る。CLEC4A(ナイーブTh細胞のTh1およびTh2エフェクタ細胞への分極化の均衡を維持する、C型レクチンドメインファミリーメンバA)、TFF2(炎症中の粘膜表面上で上方制御された、トレフォイル因子2)、およびCD274/PD−L1(分化のクラスタ274またはプログラムされた死リガンド1)は、子癇前症における機能障害性免疫反応のマーカであると考えられる。これらのシステムは、互いに相互作用し、互いを増幅させると考えられ、子癇前症から得られ得る、幅広い母体の血管機能障害および臓器損傷をもたらす。
本明細書の方法は、以下の表(表A)に列挙された1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書の方法は、以下の表(表B)に列挙された1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される1つ以上のバイオマーカから(例えば、これらからの分析に基づいて)症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される2つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される3つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される1つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される2つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される3つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される4つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される5つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bにおいて識別されるすべてのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される3つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される4つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される5つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される6つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される7つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される8つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される9つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される10個以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aおよび表Bから選択される11個以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以上のバイオマーカおよび表Bから選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される2つ以上のバイオマーカおよび表Bから選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つ以上のバイオマーカおよび表Bから選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される4つのバイオマーカおよび表Bから選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される2つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される3つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される4つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される5つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される6つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される1つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される2つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される3つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される4つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される5つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される6つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つのバイオマーカおよび表Bから選択される7つのバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される2つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される2つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される2つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される2つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される2つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される3つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される2つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される3つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される3つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される3つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される4つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される2つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される4つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される3つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される4つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。本明細書に提供されている方法は、表Aから選択される1つ以下のバイオマーカおよび表Bから選択される4つ以下のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法は、sFLT−1、PlGF、FGF21、CLEC4a、エンドグリン、CD274、およびデコリンを含むマーカのパネルから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、sFlt.1、PlGF、KIM1、およびCLEC4A、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびFGF21、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびエンドグリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、およびエンドグリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、CD274、およびデコリン、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびエンドグリン、PlGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、TFF2、FGF21、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、CD2741、およびエンドグリン、またはHGF、SYND1、CLEC4A、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびFGF21から(例えば、これらからの分析に基づいて)症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、任意選択的に、PlGF:SFLT1、KIM1、CLEC4A、FGF21、SFLT1、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、SFLT1、KIM1、CLEC4A、デコリン、SFLT1、KIM1、CLEC4A、CD274、SFLT1、KIM1、CLEC4A、HGF、SFLT1、KIM1、CLEC4A、TFF2、SFLT1、KIM1、CLEC4A、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、FGF21、エンドグリン、SFLT1、KIM1、FGF21、デコリン、SFLT1、KIM1、FGF21、CD274、SFLT1、KIM1、FGF21、HGF、SFLT1、KIM1、FGF21、TFF2、SFLT1、KIM1、FGF21、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、エンドグリン、デコリン、SFLT1、KIM1、エンドグリン、CD274、SFLT1、KIM1、エンドグリン、HGF、SFLT1、KIM1、エンドグリン、TFF2、SFLT1、KIM1、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、デコリン、CD274、SFLT1、KIM1、デコリン、HGF、SFLT1、KIM1、デコリン、TFF2、SFLT1、KIM1、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、CD274、HGF、SFLT1、KIM1、CD274、TFF2、SFLT1、KIM1、CD274、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、HGF、TFF2、SFLT1、KIM1、HGF、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、SFLT1、CLEC4A、FGF21、デコリン、SFLT1、CLEC4A、FGF21、CD274、SFLT1、CLEC4A、FGF21、HGF、SFLT1、CLEC4A、FGF21、TFF2、SFLT1、CLEC4A、FGF21、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、CD274、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、HGF、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、デコリン、CD274、SFLT1、CLEC4A、デコリン、HGF、SFLT1、CLEC4A、デコリン、TFF2、SFLT1、CLEC4A、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、CD274、HGF、SFLT1、CLEC4A、CD274、TFF2、SFLT1、CLEC4A、CD274、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、HGF、TFF2、SFLT1、CLEC4A、HGF、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、エンドグリン、デコリン、SFLT1、FGF21、エンドグリン、CD274、SFLT1、FGF21、エンドグリン、HGF、SFLT1、FGF21、エンドグリン、TFF2、SFLT1、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、デコリン、CD274、SFLT1、FGF21、デコリン、HGF、SFLT1、FGF21、デコリン、TFF2、SFLT1、FGF21、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、CD274、HGF、SFLT1、FGF21、CD274、TFF2、SFLT1、FGF21、CD274、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、HGF、TFF2、SFLT1、FGF21、HGF、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、デコリン、CD274、SFLT1、エンドグリン、デコリン、HGF、SFLT1、エンドグリン、デコリン、TFF2、SFLT1、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、CD274、HGF、SFLT1、エンドグリン、CD274、TFF2、SFLT1、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、HGF、TFF2、SFLT1、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、CD274、HGF、SFLT1、デコリン、CD274、TFF2、SFLT1、デコリン、CD274、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、HGF、TFF2、SFLT1、デコリン、HGF、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、CD274、HGF、TFF2、SFLT1、CD274、HGF、PAPP.A2、SFLT1、CD274、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、HGF、TFF2、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、KIM1、CLEC4A、FGF21、デコリン、KIM1、CLEC4A、FGF21、CD274、KIM1、CLEC4A、FGF21、HGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、TFF2、KIM1、CLEC4A、FGF21、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、CD274、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、HGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、デコリン、CD274、KIM1、CLEC4A、デコリン、HGF、KIM1、CLEC4A、デコリン、TFF2、KIM1、CLEC4A、デコリン、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、CD274、HGF、KIM1、CLEC4A、CD274、TFF2、KIM1、CLEC4A、CD274、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、HGF、TFF2、KIM1、CLEC4A、HGF、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、TFF2、PAPP.A2、KIM1、FGF21、エンドグリン、デコリン、KIM1、FGF21、エンドグリン、CD274、KIM1、FGF21、エンドグリン、HGF、KIM1、FGF21、エンドグリン、TFF2、KIM1、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、KIM1、FGF21、デコリン、CD274、KIM1、FGF21、デコリン、HGF、KIM1、FGF21、デコリン、TFF2、KIM1、FGF21、デコリン、PAPP.A2、KIM1、FGF21、CD274、HGF、KIM1、FGF21、CD274、TFF2、KIM1、FGF21、CD274、PAPP.A2、KIM1、FGF21、HGF、TFF2、KIM1、FGF21、HGF、PAPP.A2、KIM1、FGF21、TFF2、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、デコリン、CD274、KIM1、エンドグリン、デコリン、HGF、KIM1、エンドグリン、デコリン、TFF2、KIM1、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、CD274、HGF、KIM1、エンドグリン、CD274、TFF2、KIM1、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、HGF、TFF2、KIM1、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、KIM1、デコリン、CD274、HGF、KIM1、デコリン、CD274、TFF2、KIM1、デコリン、CD274、PAPP.A2、KIM1、デコリン、HGF、TFF2、KIM1、デコリン、HGF、PAPP.A2、KIM1、デコリン、TFF2、PAPP.A2、KIM1、CD274、HGF、TFF2、KIM1、CD274、HGF、PAPP.A2、KIM1、CD274、TFF2、PAPP.A2、KIM1、HGF、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、デコリン、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、CD274、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、HGF、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、TFF2、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、デコリン、CD274、CLEC4A、FGF21、デコリン、HGF、CLEC4A、FGF21、デコリン、TFF2、CLEC4A、FGF21、デコリン、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、CD274、HGF、CLEC4A、FGF21、CD274、TFF2、CLEC4A、FGF21、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、HGF、TFF2、CLEC4A、FGF21、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、CD274、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、HGF、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、CD274、HGF、CLEC4A、エンドグリン、CD274、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、HGF、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、CD274、HGF、CLEC4A、デコリン、CD274、TFF2、CLEC4A、デコリン、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、HGF、TFF2、CLEC4A、デコリン、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、CD274、HGF、TFF2、CLEC4A、CD274、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、CD274、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、HGF、TFF2、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、デコリン、CD274、FGF21、エンドグリン、デコリン、HGF、FGF21、エンドグリン、デコリン、TFF2、FGF21、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、CD274、HGF、FGF21、エンドグリン、CD274、TFF2、FGF21、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、HGF、TFF2、FGF21、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、FGF21、デコリン、CD274、HGF、FGF21、デコリン、CD274、TFF2、FGF21、デコリン、CD274、PAPP.A2、FGF21、デコリン、HGF、TFF2、FGF21、デコリン、HGF、PAPP.A2、FGF21、デコリン、TFF2、PAPP.A2、FGF21、CD274、HGF、TFF2、FGF21、CD274、HGF、PAPP.A2、FGF21、CD274、TFF2、PAPP.A2、FGF21、HGF、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、CD274、HGF、エンドグリン、デコリン、CD274、TFF2、エンドグリン、デコリン、CD274、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、HGF、TFF2、エンドグリン、デコリン、HGF、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、CD274、HGF、TFF2、エンドグリン、CD274、HGF、PAPP.A2、エンドグリン、CD274、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、HGF、TFF2、PAPP.A2、デコリン、CD274、HGF、TFF2、デコリン、CD274、HGF、PAPP.A2、デコリン、CD274、TFF2、PAPP.A2、またはデコリン、HGF、TFF2、PAPP.A2、CD274、HGF、TFF2、PAPP.A2と組み合わせた以下の4つのバイオマーカのセットから(例えば、これらからの分析に基づいて)症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、任意選択的に、PlGF:SFLT1、KIM1、CLEC4A、SFLT1、KIM1、FGF21、SFLT1、KIM1、エンドグリン、SFLT1、KIM1、デコリン、SFLT1、KIM1、CD274、SFLT1、KIM1、HGF、SFLT1、KIM1、TFF2、SFLT1、KIM1、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、FGF21、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、SFLT1、CLEC4A、デコリン、SFLT1、CLEC4A、CD274、SFLT1、CLEC4A、HGF、SFLT1、CLEC4A、TFF2、SFLT1、CLEC4A、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、エンドグリン、SFLT1、FGF21、デコリン、SFLT1、FGF21、CD274、SFLT1、FGF21、HGF、SFLT1、FGF21、TFF2、SFLT1、FGF21、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、デコリン、SFLT1、エンドグリン、CD274、SFLT1、エンドグリン、HGF、SFLT1、エンドグリン、TFF2、SFLT1、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、CD274、SFLT1、デコリン、HGF、SFLT1、デコリン、TFF2、SFLT1、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、CD274、HGF、SFLT1、CD274、TFF2、SFLT1、CD274、PAPP.A2、SFLT1、HGF、TFF2、SFLT1、HGF、PAPP.A2、SFLT1、TFF2、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、FGF21、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、KIM1、CLEC4A、デコリン、KIM1、CLEC4A、CD274、KIM1、CLEC4A、HGF、KIM1、CLEC4A、TFF2、KIM1、CLEC4A、PAPP.A2、KIM1、FGF21、エンドグリン、KIM1、FGF21、デコリン、KIM1、FGF21、CD274、KIM1、FGF21、HGF、KIM1、FGF21、TFF2、KIM1、FGF21、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、デコリン、KIM1、エンドグリン、CD274、KIM1、エンドグリン、HGF、KIM1、エンドグリン、TFF2、KIM1、エンドグリン、PAPP.A2、KIM1、デコリン、CD274、KIM1、デコリン、HGF、KIM1、デコリン、TFF2、KIM1、デコリン、PAPP.A2、KIM1、CD274、HGF、KIM1、CD274、TFF2、KIM1、CD274、PAPP.A2、KIM1、HGF、TFF2、KIM1、HGF、PAPP.A2、KIM1、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、CLEC4A、FGF21、デコリン、CLEC4A、FGF21、CD274、CLEC4A、FGF21、HGF、CLEC4A、FGF21、TFF2、CLEC4A、FGF21、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、CLEC4A、エンドグリン、CD274、CLEC4A、エンドグリン、HGF、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、CD274、CLEC4A、デコリン、HGF、CLEC4A、デコリン、TFF2、CLEC4A、デコリン、PAPP.A2、CLEC4A、CD274、HGF、CLEC4A、CD274、TFF2、CLEC4A、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、HGF、TFF2、CLEC4A、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、TFF2、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、デコリン、FGF21、エンドグリン、CD274、FGF21、エンドグリン、HGF、FGF21、エンドグリン、TFF2、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、FGF21、デコリン、CD274、FGF21、デコリン、HGF、FGF21、デコリン、TFF2、FGF21、デコリン、PAPP.A2、FGF21、CD274、HGF、FGF21、CD274、TFF2、FGF21、CD274、PAPP.A2、FGF21、HGF、TFF2、FGF21、HGF、PAPP.A2、FGF21、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、CD274、エンドグリン、デコリン、HGF、エンドグリン、デコリン、TFF2、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、エンドグリン、CD274、HGF、エンドグリン、CD274、TFF2、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、エンドグリン、HGF、TFF2、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、デコリン、CD274、HGF、デコリン、CD274、TFF2、デコリン、CD274、PAPP.A2、デコリン、HGF、TFF2、デコリン、HGF、PAPP.A2、デコリン、TFF2、PAPP.A2、CD274、HGF、TFF2、CD274、HGF、PAPP.A2、CD274、TFF2、PAPP.A2、またはHGF、TFF2、PAPP.A2と組み合わせて以下の3つのバイオマーカのセットから(例えば、これらからの分析に基づいて)症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、任意選択的に、PlGF:SFLT1、KIM1、SFLT1、CLEC4A、SFLT1、FGF21、SFLT1、エンドグリン、SFLT1、デコリン、SFLT1、CD274、SFLT1、HGF、SFLT1、TFF2、SFLT1、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、KIM1、FGF21、KIM1、エンドグリン、KIM1、デコリン、KIM1、CD274、KIM1、HGF、KIM1、TFF2、KIM1、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、CLEC4A、エンドグリン、CLEC4A、デコリン、CLEC4A、CD274、CLEC4A、HGF、CLEC4A、TFF2、CLEC4A、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、FGF21、デコリン、FGF21、CD274、FGF21、HGF、FGF21、TFF2、FGF21、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、エンドグリン、CD274、エンドグリン、HGF、エンドグリン、TFF2、エンドグリン、PAPP.A2、デコリン、CD274、デコリン、HGF、デコリン、TFF2、デコリン、PAPP.A2、CD274、HGF、CD274、TFF2、CD274、PAPP.A2、HGF、TFF2、HGF、PAPP.A2、TFF2、PAPP.A2と組み合わせて以下の3つのバイオマーカのセットから(例えば、これらからの分析に基づいて)症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、以下のバイオマーカのセット:PlGF、sFLT1、KIM1、PlGF、sFLT1、CLEC4A、PlGF、sFLT1、FGF21、PlGF、sFLT1、デコリン、PlGF、sFLT1、CD274、PlGF、sFLT1、HGF、PlGF、sFLT1、TFF2、PlGF、sFLT1、PAPP−A2、PlGF、エンドグリン、KIM1、PlGF、エンドグリン、CLEC4A、PlGF、エンドグリン、FGF21、PlGF、エンドグリン、デコリン、PlGF、エンドグリン、CD274、PlGF、エンドグリン、HGF、PlGF、エンドグリン、TFF2、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、PlGF、KIM1、CLEC4A、PlGF、KIM1、FGF21、PlGF、KIM1、デコリン、PlGF、KIM1、CD274、PlGF、KIM1、HGF、PlGF、KIM1、TFF2、PlGF、KIM1、PAPP−A2、PlGF、CLEC4A、FGF21、PlGF、CLEC4A、デコリン、PlGF、CLEC4A、CD274、PlGF、CLEC4A、HGF、PlGF、CLEC4A、TFF2、PlGF、CLEC4A、PAPP−A2、PlGF、CD274、CLEC4A、PlGF、CD274、FGF21、PlGF、CD274、HGF、PlGF、CD274、TFF2、PlGF、CD274、PAPP−A2、PlGF、デコリン、CLEC4A、PlGF、デコリン、FGF21、PlGF、デコリン、HGF、PlGF、デコリン、TFF2、PlGF、デコリン、PAPP−A2、PlGF、FGF21、TFF2、デコリン、PlGF、FGF21、TFF2、CD274、PlGF、FGF21、TFF2、HGF、PlGF、FGF21、TFF2、PlGF、FGF21、TFF2、PAPP−A2、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、KIM1、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、CLEC4A、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、FGF21、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、CD274、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、HGF、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、TFF2から(例えば、これらからの分析に基づいて)症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。
本明細書に提供されている方法は、表2、表3、表4、表5、CCL2(ケモカインC−Cモチーフリガンド2)、CD134(分化のクラスタ134)、DCN、HGF(肝細胞成長因子)、NOS3(一酸化窒素合成酵素3)、PlGF、CD274、CDCP1(タンパク質1を含有するcubドメイン)、FGF−21、TGFa(成長因子アルファを変換する)、UPA(ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子)、CLEC4A、CLEC4C(C型レクチンドメインファミリー4メンバC)、ZBTB16(16を含む亜鉛フィンガおよびBTBドメイン)、APLP1(アミロイドベータ前駆体様タンパク質1)、DPP7(ジペプチジルペプチダーゼ7)、GRAP2(GRB2関連のアダプタタンパク質2)、ITGB7(インテグリンサブユニットベータ7)、PAG1(スフィンゴ糖脂質マイクロドメイン1を含むリン酸化タンパク質膜アンカ)、TFF2、AMN(羊膜関連膜貫通タンパク質)、CAPG(キャッピングアクチンタンパク質、ゲルソリン様)、CLEC1A5、FES(チロシン−タンパク質キナーゼFes/Fps)、KIM1、PGF(胎盤成長因子)、ERBB4(Erb−B2受容体チロシンキナーゼ4)、GPNMB(糖タンパク質Nmb)、PPY(膵臓ポリペプチド)、またはSYND1(シンデカン1)、およびそれらの任意の組み合わせ(「グループ1」)から選択される1つ以上のバイオマーカから症状を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせ.から選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される12個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される13個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される14個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される15個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される16個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される17個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される18個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlG
F、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される20個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される19個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される18個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される17個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される16個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される15個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される14個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される13個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される12個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせ(「グループ2」)から選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される12個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される13個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される14個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される15個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される16個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される17個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される18個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される20個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される19個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される18個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される17個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される16個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される15個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される14個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される13個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される12個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、表4、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせ(「グループ3」)から選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される12個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される13個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される14個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される15個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される16個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される17個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される18個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される20個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される19個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される18個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される17個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される16個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される15個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される14個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される13個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される12個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表4、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2、表3、または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせ(「グループ4」)から選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、または19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される20個、19個、18個、17個、16個、15個、14個、13個、12個、または11個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2または表5、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせ(「グループ5」)から選択される1つ以上のバイオマーカから症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、または19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される20個、19個、18個、17個、16個、15個、14個、13個、12個、または11個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、CCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、
PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、またはSYND1、およびそれらの任意の組み合わせから選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表5から選択される1つ以上のバイマ−化から症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される9つのバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表5から選択される1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、または9個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表2から選択される1つ以上のバイマ−化から症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される9つのバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表2から選択される1個、2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、または9個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表3から選択される1つ以上のバイマ−化から症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、4から選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、4から選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、4から選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、または19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される20個、19個、18個、17個、16個、15個、14個、13個、12個、または11個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表3から選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
本明細書に提供されている方法は、表4から選択される1つ以上のバイマ−化から症状(例えば、子癇前症)を識別または除外することを含み得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、5から選択される1つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、5から選択される2つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、5から選択される3つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される4つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される5つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される6つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される7つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される8つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される9つ以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される10個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、または19個以上のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される10個以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される9つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される8つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される7つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される6つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される5つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される4つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される3つ以下のバイオマーカから検出され得る。いくつかの場合では、妊娠している患者の子癇前症は、表4から選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから検出され得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法は、(a)文献において報告されている既知の子癇前症候補バイオマーカ(PAPP−A、sFlt1、PlGF、またはフィブロネクチンなど)、(b)本明細書で特に識別された子癇前症バイオマーカ(グループ1、グループ2、グループ3、グループ4、グループ5、表2、表3、表4、または表5から選択されるものなど)、または(c)(a)および(b)の任意の組み合わせから選択される1つ以上のバイオマーカから症状(子癇前症など)を検出することを含み得る。他の実施形態では、本明細書に提供されている方法は、(a)、(b)、または(c)から選択される2つ以上、3つ以上、4つ以上の、5つ以上の、6つ以上、または7つ以上のバイオマーカから症状(子癇前症など)を検出すすることを含み得る。他の実施形態では、本明細書に提供されている方法は、(a)、(b)、または(c)から選択される10個以下、9つ以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、4つ以下、または3つ以下のバイオマーカから症状(子癇前症など)を検出することを含み得る。他の実施形態では、本明細書に提供されている方法は、(a)、(b)、または(c)またはから選択される1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、または20個のバイオマーカから症状(子癇前症など)を検出することを含み得る。
臨床/治療用途
本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットを使用して、妊娠している患者の症状を検出、診断、予測、または監視することができる。いくつかの例では、本明細書に記載の方法、組成物、システム、およびキットは、臨床治療決定を行う際に有用であり得る情報を医療従事者に提供する。臨床および治療決定は、特定の治療を続ける決定、特定の治療を変更する決定、特定の治療の投薬量を変える決定、特定の治療を停止または終了する決定、治療の頻度を変える決定、新たな治療を導入する決定、新たな治療を導入して現在の治療と組み合わせて使用する決定、または上記の任意の組み合わせを含み得る。いくつかの例では、行われる医療行為は、経過観察または同じもしくは異なる性質の1つ以上の追加の診断試験の投与を含み得る。いくつかの場合では、臨床決定は、分娩を誘発しないため、または対象の歩行監視を進めるために行われ得る。いくつかの場合では、本明細書に提供されている方法は、実験的設定、例えば、臨床試行において適用され得る。いくつかの例では、本明細書に提供されている方法を使用して、血管新生/抗血管新生薬、化合物、または治療細胞型などの実験薬で治療されている妊娠している患者を監視することができる。いくつかの例では、本明細書に提供されている方法は、子癇前症のリスクを低減するために、対象に実験薬(例えば、アゴニスト、拮抗薬、ペプチド模倣、タンパク質、ペプチド、核酸、治療細胞、小分子、または他の薬物候補)を投与することができるかどうかを決定するために有用であり得る。したがって、本明細書に記載の方法は、対象を実験薬で有効に治療することができるかどうかを決定する際に、かつ子癇前症のリスクについて対象を監視するために有用であり得る。
妊娠している患者の症状の検出/診断
本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、妊娠している患者が試験の時に有する症状など、妊娠している患者の症状を検出、診断、または除外するのに特に有用である。本発明の方法により検出、診断、または除外され得る例示的な方法は、子癇前症を含む。本明細書に提供される方法、組成物、システム、およびキットはまた、子癇前症、高血圧、妊娠高血圧、またはHELLP症候群の診断を規定または除外するために、妊娠している患者について回収された他の標準的な臨床データとの組み合わせにおいて有用であり得る。本明細書に提供されている方法は、試験前に子癇前症と関連する1つ以上の新たに発症した症候(例えば、高血圧、タンパク尿、低血小板数、血清クレアチニンレベルの上昇、肝臓酵素の上昇、肺水腫、または脳/視覚症候)を示し、そのため患者が子癇前症を有すると疑われる、妊娠している患者に特に有用である。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、将来における特定の日数の間、子癇前症の診断を除外することができる。いくつかの例では、将来における特定の日数は、1〜30日である。いくつかの例では、将来における特定の日数は、少なくとも1日である。いくつかの例では、将来における特定の日数は、最大でも30日である。いくつかの例では、将来における特定の日数は、1日〜5日、1日〜10日、1日〜30日、5日〜10日、5日〜30日、または10日〜30日である。いくつかの例では、将来における特定の日数は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30日である。いくつかの好ましい実施形態では、将来における特定の日数は、5日〜10日である。他の好ましい実施形態では、将来における特定の日数は、5、6、7、8、9、または10日である。いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、入院および早期の分娩について母親を除外することができる。いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、将来における特定の週数について子癇前症の診断を除外することができる。いくつかの例では、特定の週数は、少なくとも1週である。いくつかの例では、特定の週数は、少なくとも2週である。いくつかの例では、特定の週数は、少なくとも3週である。いくつかの例では、特定の週数は、少なくとも4週である。いくつかの例では、特定の週数は、少なくとも5週である。いくつかの例では、特定の週数は、少なくとも6週である。いくつかの例では、特定の週数は、最大でも1週である。いくつかの例では、特定の週数は、最大でも2週である。いくつかの例では、特定の週数は、最大でも3週である。いくつかの例では、特定の週数は、最大でも4週である。いくつかの例では、特定の週数は、最大でも5週である。いくつかの例では、特定の週数は、最大でも6週である。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、特定のPPVを有する将来における特定の週数の間の子癇前症の診断を除外することができる。いくつかの場合では、陽性的中率(PPV)は、少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、または57%、またはこれらの値の間の任意の範囲である。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、特定のNPVを有する将来における特定の週数の間の子癇前症の診断を除外することができる。NPVは、少なくとも約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、95.2%、95.5%、95.7%、96%、96.2%、96.5%、96.7%、97%、97.2%、97.5%、97.7%、98%、98.2%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、99.5%、99.7%、または99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、特定のAUCを有する将来における特定の週数の間の子癇前症の診断を除外することができる。いくつかの場合では、AUCは、少なくとも約50%、53%、55%、57%、60%、63%、65%、67%、70%、72%、75%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、特定のAUPを有する将来における特定の週数の間の子癇前症の診断を除外することができる。AUPは、少なくとも約50%、53%、55%、57%、60%、63%、65%、67%、70%、72%、75%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
妊娠している患者の症状の診断、検出、または除外は、患者に投与される不要な侵襲的医療介入の数を制限し、かつ/または薬物療法(抗けいれん薬、抗高血圧薬、中心アルファアゴニスト、アルファ遮断薬、ベータ遮断薬、カルシウムチャネル遮断薬、血管拡張薬、シクロオキシゲナーゼ阻害剤)などの代替的なより侵襲的でない治療介入を示す際に特に有用であり得る。例えば、本明細書に提供されている方法は、妊娠している患者における子癇前症の診断を除外する高い信頼を介して子癇前症を有すると疑われる患者において早期の帝王切開分娩または分娩誘発の使用を制限、遅延、または除去することができる(例えば、本明細書に提供される方法、組成物、システム、およびキットの高い陰性的中率を介して)。
さらなる実施形態では、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットは、単独で、または血圧測定、尿タンパク質測定、血液血小板計数、血清クレアチニンレベル測定、クレアチニンクリアランス測定、尿タンパク質/クレアチニン比測定、血清トランスアミナーゼレベル測定、血清LDHレベル測定、血清ビリルビンレベル測定、またはドプラ超音波指数(例えば、子宮動脈指数)を含むがこれらに限定されない、妊娠している患者の症状を検出、診断、または除外するために現在使用されている他の標準的な診断方法と組み合わせて、使用され得る。例えば、妊娠している患者における高血圧は、慢性高血圧、妊娠高血圧、または子癇前症などの症状を示す場合があり、本明細書に提供されている方法、組成物、システム、およびキットを介した子癇前症の診断の除外は、患者を慢性高血圧または妊娠高血圧と共に正しく診断することを可能にする。
妊娠している患者の症状の予測
いくつかの実施形態では、本明細書に提供されている方法は、症状(例えば、高血圧またはタンパク尿)と関連する症状または症候の実際の発症前に子癇前症を予測することができる。いくつかの例では、本明細書に提供されている方法は、症状と関連する症状または症候の発症の少なくとも1日、1週、2週、3週、1か月、2か月前に、妊娠している患者における子癇前症または他の障害を予測することができる。他の例では、本明細書に提供されている方法は、発症の少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、または31日前に、妊娠している患者における子癇前症または他の障害を予測することができる。他の例では、本明細書に提供されている方法は、発症の少なくとも1、2、3、または4か月前に、妊娠している患者における子癇前症または他の障害を予測することができる。
妊娠している患者の症状の監視
妊娠している患者の症状を監視するための方法、システム、キット、および組成物を本明細書に提供する。多くの場合、監視は、一連の非侵襲的な試験、一連の最小侵襲的な試験(例えば、採血)、またはそれらのいくつかの組み合わせなどの一連の試験によって行われる。好ましくは、監視は、一連の非侵襲的な試験または一連の最小侵襲的な試験(例えば、採血)を施すことによって行われる。
いくつかの例では、妊娠している患者は、本明細書に記載の方法を使用して、必要に応じて(例えば、必要性を基準として)監視される。さらにまたは代替的に、妊娠している患者は、毎週、毎月、または任意の予め特定された間隔で監視され得る。いくつかの例では、妊娠している患者は、少なくとも24時間ごとに1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、少なくとも1日〜30日ごとに1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、少なくとも1日ごとに1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、少なくとも最大でも30日ごとに1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、1日〜5日、1日〜10日、1日〜15日、1日〜20日、1日〜25日、1日〜30日、5日〜10日、5日〜15日、5日〜20日、5日〜25日、5日〜30日、10日〜15日、10日〜20日、10日〜25日、10日〜30日、15日〜20日、15日〜25日、15日〜30日、20日〜25日、20日〜30日、または25日〜30日ごとに少なくとも(任意選択的に、平均して)1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、28、29、30または31日ごとに少なくとも1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、1、2、または3か月ごとに少なくとも1回監視される。いくつかの例では、妊娠している患者は、本明細書に記載の方法を介して、1週、10日、2週、3週、または1か月以下の頻度で監視される。換言すると、本明細書に記載の方法のうちのいくつかの予測値は、少なくとも1週、少なくとも10日、少なくとも2週、少なくとも3週、または少なくとも1か月の間の臨床使用のものであり得る。
いくつかの例では、患者におけるバイオマーカ発現レベルは、例えば、子癇前症(例えば、高血圧またはタンパク尿)と関連する1つ以上の症候の検出後1週、2週、3週、または4週以内に測定され得る。いくつかの方法では、バイオマーカ発現レベルは、一定の間隔で、例えば、受胎後1週、2週、3週、1か月、2か月または3か月ごとに、第2の3か月の開始後、第3の3か月の開始後、または妊娠の20週後に、無期限に、または症状の証拠が観察されるまでのいずれかで決定される。いくつかの方法では、バイオマーカ発現レベルは、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、または42週後に一定の間隔で決定される。症状の証拠が観察された場合、監視の頻度が増加されることがある。いくつかの方法では、発現レベルのベースライン値は、症候の発症後の発現レベルの決定と組み合わせて、子癇前症(例えば、高血圧またはタンパク尿)と関連する1つ以上の症候の検出前に、対象において決定される。
治療決定/計画
妊娠している患者の症状を診断、予測、除外、または監視した結果は、治療計画の決定または監視など、臨床または治療決定を報告するのに有用であり得る。
いくつかの実施形態では、試料データを取得し、かつ/または子癇前症を有するものとして患者からの試料を分類する実体は、内科医、介護士、または治療を行う医療機関以外のものである。いくつかの実施形態では、試料データ(例えば、表A、B、2、3、4、および5からの2つ以上のタンパク質のレベルのレベル)を取得し、(少なくとも部分的に)複数のタンパク質バイオマーカのレベルに基づいて指数を計算し、かつ/または子癇前症のリスクを決定する実体は、第三者試験サービスである。したがって、いくつかの実施形態では、治療計画の決定または監視は、第1に、例えば(これらに限定されない)、子癇前症のリスクがあるかもしくはないものとしての試料の分類、子癇前症を有する妊娠している患者のリスク、子癇前症に関連する資料からの複数のタンパク質バイオマーカのレベル(例えば、表A、B、2、3、4、および5からの2つ以上のタンパク質のレベル)、または妊娠している患者が早期に分娩する可能性を含み得る、第三者試験サービスから情報を受信することを含む。
いくつかの実施形態では、試料データを取得し、試料から患者の早産のリスクを決定し、かつ/または早産の有意なリスクを有するものとして患者からの試料を分類する実体は、治療を行う実体と同じ実体である。
いくつかの例では、治療計画の決定は、治療薬を投与することを含み得る。いくつかの例では、治療計画の決定は、治療計画を変更、継続、開始、または停止することを含む。いくつかの例では、治療計画の決定は、疾患または症状(例えば、子癇前症、子癇、妊娠高血圧、高血圧、またはHELLP症候群)を治療することを含む。いくつかの例では、治療は、抗高血圧治療である。いくつかの例では、治療は、抗シクロオキシゲナーゼ(COX)治療である。いくつかの例では、治療は、抗けいれん治療である。
治療計画の変更は、治療を終了することを含み得る。治療計画の変更は、治療の投薬量を変えることを含み得る。治療計画の変更は、治療の頻度を変えることを含み得る。治療計画の変更は、異なる治療を投与することを含み得る。いくつかの例では、妊娠している患者の症状を診断、予測、または監視する結果は、帝王切開分娩などの治療決定を報告するのに有用であり得る。治療決定の他の例は、子宮頸部熟化および/または分娩誘発であり得る。子宮頸部熟化および/または分娩誘発のために使用され得る薬剤の例には、プロスタグランジン、ミソプロストール、ミフェプリストン、リラキシン、およびオキシトシンが含まれる。治療決定の他の例は、帝王切開分娩であり得る。
治療計画の例は、抗高血圧特性を有する化合物もしくは薬剤(例えば、メチルドパなどの中心アルファアゴニスト、クロニジン、ジアゾキシド、ヒドララジン、およびプラゾシンなどの血管拡張薬、ニフェジピンおよびベラパミルなどのカルシウムチャネル遮断薬、ラベタロールなどのアルファ遮断薬、またはオクスプレノロールなどのベータ遮断薬)、抗シクロオキシゲナーゼ活性を有する化合物もしくは薬剤(例えば、アセチルサリチル酸)、または抗けいれん活性を有する化合物(例えば、フェニトインまたは硫酸マグネシウム)を投与することを含み得る。これらの化合物は、単独でまたは組み合わせて使用され得る。
いくつかの場合では、治療計画の変更は、子癇前症の不要な治療を回避する様式で、当該妊娠しているヒトの治療を進めることを含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、子癇前症のリスクがないものとして識別された妊娠しているヒト対象の管理は、歩行の監視、または子癇前症を治療するための任意の薬物の投与を控えることを含む。いくつかの例では、子癇前症について治療されるべきではない患者ではないと識別された患者において、高血圧薬(分娩ではなく)が、患者に処方および/または投与され得る。
感受性、特異性、NPV、PPV、AUC、AUP、および正確さ
試料を識別、分類(または分類を除外)、または特徴付ける際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、本明細書に開示の方法を使用して少なくとも約80%の特異性を有することによって特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、本方法の特異性は、少なくとも約85%である。いくつかの実施形態では、本方法の特異性は、少なくとも約90%である。いくつかの実施形態では、本方法の特異性は、少なくとも約95%である。本方法の特異性は、少なくとも約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
いくつかの実施形態では、本発明は、本明細書に開示の方法を使用して少なくとも80%の感受性を与える試料を識別、分類(または分類を除外)、または特徴付ける方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法の感受性は、少なくとも85%である。いくつかの実施形態では、本方法の感受性は、少なくとも90%である。いくつかの実施形態では、本方法の感受性は、少なくとも95%である。本方法の感受性は、少なくとも約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、妊娠の状態もしくは結果(例えば、子癇前症)を監視または予測するか、あるいは試料を識別または試料の分類を除外する現在の方法の正確さを改善することができる。本明細書に開示の方法、キット、およびシステムの正確さは、少なくとも約50%、53%、55%、57%、60%、63%、65%、67%、70%、72%、75%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
試料を識別、分類(または分類を除外)、または特徴付ける際に使用するための方法、キット、およびシステムは、90%以上の陰性的中率(NPV)を有することによって特徴付けられ得る。NPVは、少なくとも約80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、95.2%、95.5%、95.7%、96%、96.2%、96.5%、96.7%、97%、97.2%、97.5%、97.7%、98%、98.2%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、99.5%、99.7%、または99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。NPVは、95%以上であり得る。NPVは、96%以上であり得る。NPVは、97%以上であり得る。NPVは、98%以上であり得る。
試料(例えば、子癇前症について)を識別、分類(または分類を除外)、または特徴付ける際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、および/またはシステムは、本明細書に開示の方法を使用して、少なくとも約30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、または57%、またはこれらの値の間の任意の範囲の陽性的中率(PPV)を有することによって特徴付けられ得る。
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、妊娠の状態または結果(例えば、子癇前症)を監視または予測するか、あるいは試料を識別または試料の分類を除外する現在の方法のAUCを改善することができる。本明細書に開示の方法、キット、およびシステムのAUCは、少なくとも約50%、53%、55%、57%、60%、63%、65%、67%、70%、72%、75%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、妊娠の状態または結果(例えば、子癇前症)を監視または予測するか、あるいは試料を識別または試料の分類を除外する現在の方法のAUPを改善することができる。本明細書に開示の方法、キット、およびシステムのAUPは、少なくとも約50%、53%、55%、57%、60%、63%、65%、67%、70%、72%、75%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、99.1%、99.2%、99.3%、99.4%、99.5%、99.6%、99.7%、99.8%、99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。
妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも約80%、82%、85%、87%、90%、92%、95%、または97%またはこれらの値の間の任意の範囲の正確さを有することによって特徴付けられ得る。
妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも約80%、82%、85%、87%、90%、92%、95%、または97%、またはこれらの値の間の任意の範囲の特異性を有することによって特徴付けられ得る。
妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも約80%、82%、85%、87%、90%、92%、95%、または97%、またはこれらの値の間の任意の範囲の感受性を有することによって特徴付けられ得る。
妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、90%以上の陰性的中率(NPV)を有することによって特徴付けられ得る。NPVは、少なくとも約90%、91%、92%、93%、94%、95%、95.2%、95.5%、95.7%、96%、96.2%、96.5%、96.7%、97%、97.2%、97.5%、97.7%、98%、98.2%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、99.5%、99.7%、または99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。NPVは、95%以上であり得る。NPVは、96%以上であり得る。NPVは、97%以上であり得る。NPVは、98%以上であり得る。
妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも約80%の陽性的中率(PPV)を有することによって特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも約85%の陽性的中率(PPV)を有することによって特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、妊娠の状態または結果の診断、予後、および/または監視を、それらを必要とする対象において行う際に使用するための本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも約90%の陽性的中率(PPV)を有することによって特徴付けられ得る。PPVは、少なくとも約80%、85%、90%、95%、95.2%、95.5%、95.7%、96%、96.2%、96.5%、96.7%、97%、97.2%、97.5%、97.7%、98%、98.2%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、99.5%、99.7%、または99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲であり得る。PPVは、95%以上であり得る。PPVは、98%以上であり得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、対象、好ましくは、妊娠している対象における子癇前症を確認するための試験であって、試験が、少なくとも約90%、91%、92%、93%、94%、95%、95.2%、95.5%、95.7%、96%、96.2%、96.5%、96.7%、97%、97.2%、97.5%、97.7%、98%、98.2%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、99.5%、99.7%、または99.9%、またはこれらの値の間の任意の範囲のNPVを有する子癇前症を有する対象から、子癇前症を有しないが、子癇前症と関連する1つ以上の症候を有する対象を判別することができる、試験を提供する。子癇前症と関連する1つ以上の症候は、糖尿病(例えば、妊娠、I型またはII型)、正常なグルコースレベルより高い、高血圧(例えば、慢性または非慢性)、過剰なまたは突然の体重増加、正常な体重よりも高い、肥満、正常な肥満度指数(BMI)よりも高い、異常な体重増加、異常な血圧、水毒、遺伝因子、異常なタンパク尿、頭痛、浮腫、異常なタンパク質/クレアチニン比、異常な血小板数、ストレス、未産、異常なパパニコロー試験の結果(子宮頸部細胞診)、以前の子癇前症事例(例えば、PreEの個人歴)、子癇前症の家族歴、以前の妊娠における子癇前症、腎臓疾患、血栓形成傾向、またはそれらの任意の組み合わせであり得る。妊娠期間はまた、子癇前症を除外するための試験などの試験において使用され得る。
いくつかの実施形態では、本開示は、少なくとも79%の感受性および少なくとも94%の特異性を有する方法、キット、システム、または試験を提供する。いくつかの実施形態では、方法、キット、システム、または試験は、少なくとも82%の感受性および少なくとも80%の特異性を有する。いくつかの実施形態では、試験の方法、キット、システムは、少なくとも90%の感受性および少なくとも80%の特異性を有する。
コンピュータプログラム
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、少なくとも1つのコンピュータプログラム、またはその使用を含み得る。コンピュータプログラムは、特定のタスクを行うために書かれた、デジタル処理デバイスのCPU(すなわち、プロセッサ)において実行可能な一連の指示を含み得る。コンピュータ可読指示は、特定のタスクを行うか、または特定の中小データ型を実行する、関数、オブジェクト、アプリケーションプログラミングインターフェース(API)、データ構造などのプログラムモジュールとして実行され得る。本明細書に提供される開示に鑑みて、当業者であれば、コンピュータプログラムが、様々なバージョンの様々な言語で書かれ得ることを認識するであろう。
コンピュータ可読指示の機能は、様々な環境において必要に応じて組み合わせるか、または分配され得る。コンピュータプログラムは、通常、1つの場所または複数の場所からの一連の指示を提供するであろう。
さらに、1つ以上の試料およびそれらの使用を分類する(または分類を除外する)ためのシステムを本明細書に開示する。本システムは、(a)実行可能な指示を行うように構成された動作システムおよびメモリデバイスを含むデジタル処理デバイスと、(b)対象からの試料を分類するためにデジタル処理デバイスによって実行可能な指示を含むコンピュータプログラムであって、(i)対象からの試料から1つ以上のバイオマーカのバイオマーカ発現プロファイルを受信するように構成された第1のソフトウエアモジュール、(ii)対象からのバイオマーカ発現プロファイルを分析するように構成された第2のソフトウエアモジュール、および(iii)分類システムに基づいて対象からの試料を分類するように構成された第3のソフトウエアモジュールを含む、コンピュータプログラムと、を含み得る。いくつかの実施形態では、分類システムは、2つのクラスを含む。他の実施形態では、分類システムは、2つ以上のクラスを含む。クラスの内の少なくとも2つは、子癇前症、非子癇前症(例えば、少なくともある期間)、正常な妊娠、合併症を伴う妊娠、および妊娠高血圧から選択され得る。対象からのバイオマーカ発現プロファイルの分析は、アルゴリズムを適用することを含み得る。バイオマーカ発現プロファイルの分析は、対象からバイオマーカ発現プロファイルを正規化することを含み得る。
図6は、セレクタセットの生成、および/またはデータ分析のためなど、本開示の方法を実行するためにプログラムされるか、または別様に構成されるコンピュータシステム(また、本明細書では「システム」)401を示す。システム401は、中央処理装置(CPU、また、本明細書では「プロセッサ」および「コンピュータプロセッサ」)405を含み、これは、単芯または多芯プロセッサ、または平行処理のための複数のプロセッサであり得る。システム401はまた、メモリ410(例えば、ランダムアクセスメモリ、読み取り専用メモリ、フラッシュメモリ)、電子記憶装置415(例えば、ハードディスク)、1つ以上の他のシステムと通信するための通信インターフェース420(例えば、ネットワークアダプタ)、およびキャッシュ、他のメモリ、データ記憶および/または電子ディスプレイアダプタなどの周辺デバイス425を含む。メモリ410、記憶装置415、インターフェース420、および周辺デバイス425は、マザーボードなどの通信バス(実線)を通してCPU405と通信する。記憶装置415は、データを記憶するためのデータ記憶装置(またはデータ保管場所)であり得る。システム401は、通信インターフェース420の助けを借りて、コンピュータネットワーク(「ネットワーク」)430に動作可能に連結される。ネットワーク430は、インターネット、インターネットおよび/もしくはエクストラネット、またはインターネットと通信するイントラネットおよび/もしくはエクストラネットであり得る。いくつかの例では、ネットワーク430は、テレコミュニケーションおよび/またはデータネットワークである。ネットワーク430は、クラウドコンピューティングなどのコンピューティングの分配を可能にし得る1つ以上のコンピュータを含み得る。いくつかの例では、ネットワーク430は、システム401の助けを借りて、システム401に連結されたデバイスがクライアントまたはサーバとして行為することを可能にし得るピアツーピアネットワークを実装することができる。
システム401は、処理システム435と通信する。処理システム435は、本明細書に開示の方法を実行するように構成され得る。いくつかの例では、処理システム435は、マイクロ流体qPCRシステムである。他の例では、処理システム435は、アルファスクリーンまたは他のプレートリーダである。他の例では、処理システム435は、FACS選別器または分析器である。処理システム435は、ネットワーク430を通して、または直接(例えば、有線、無線)接続によって、システム401と通信し得る。いくつかの実施形態では、処理システムからの未加工データ(例えば、バイオマーカ発現プロファイル)は、処理(例えば、試料分類または特定の分類の可能性の決定)のためのシステムにネットワークを通して更新される。このデータ転送は、直接(例えば、FTP、TCP、または処理システム435とシステム401との間の他の直接ネットワーク接続)、または間接的な(例えば、システム401によってアクセスされ得るクラウド記憶システムへの転送)であり得る。
本明細書に記載の方法は、例えば、メモリ410または電子記憶装置415上など、システム401の電子記憶場所上に記憶された機械(またはコンピュータプロセッサ)実行可能なコード(またはソフトウエア)の方法によって実装され得る。使用中、コードは、プロセッサ405によって実行され得る。いくつかの例では、コードは、記憶装置415から検索され得、プロセッサ405による容易なアクセスのためのメモリ410上に記憶され得る。いくつかの状況では、電子記憶装置415は、排除することができ、機械実行可能な指示は、メモリ410に記憶される。
デジタル処理デバイス
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、デジタル処理デバイス、またはその使用を含み得る。さらなる実施形態では、デジタル処理デバイスは、デバイスの機能を実行する1つ以上のハードウエア中央処理装置(CPU)を含む。またさらなる実施形態では、デジタル処理デバイスは、さらに、実行可能な指示を行うように構成された動作システムを含む。いくつかの実施形態では、デジタル処理デバイスは、任意選択的に、コンピュータネットワークに接続される。さらなる実施形態では、デジタル処理デバイスは、任意選択的に、World Wide Webにアクセスするようにインターネットに接続される。またさらなる実施形態では、デジタル処理デバイスは、任意選択的に、クラウドコンピューティングインフラストラクチャに接続される。他の実施形態では、デジタル処理デバイスは、任意選択的に、イントラネットに接続される。他の実施形態では、デジタル処理デバイスは、任意選択的に、データ記憶デバイスに接続される。
本明細書の記載によると、好適なデジタル処理デバイスには、非限定的な例示の方法により、サーバコンピュータ、デスクトップコンピュータ、ラップトップコンピュータ、ノートブックコンピュータ、サブノートブックコンピュータ、ネットブックコンピュータ、ノートパッドコンピュータ、セットトップコンピュータ、手持ちコンピュータ、インターネットアプライアンス、モバイルスマートフォン、タブレットコンピュータ、携帯情報端末、ビデオゲームコンソール、および車両が含まれる。当業者であれば、多くのスマートフォンが、本明細書に記載のシステムにおいて使用するのに好適であることを認識するであろう。当業者であれば、任意選択的なコンピュータネットワーク接続性を有するセレクトテレビ、ビデオプレイヤ、デジタル音楽プレイヤが、本明細書に記載のシステムにおいて使用するのに好適であることを認識するであろう。好適なタブレットコンピュータには、当業者に知られているブックレット、スレート、および変換可能な構成を有するタブレットコンピュータが含まれる。
デジタル処理デバイスは、通常、実行可能な指示を行うように構成された動作システムを含むであろう。動作システムは、例えば、デバイスのハードウエアを管理し、アプリケーションの実行のためのサービスを提供する、プログラムおよびデータを含む、ソフトウエアである。当業者であれば、好適なサーバ動作システムが、非限定的な例示の方法により、FreeBSD、OpenBSD、NetBSD(登録商標)、Linux、Apple(登録商標)Mac OS X Server(登録商標)、Oracle(登録商標)Solaris(登録商標)、Windows Server(登録商標)、およびNovell(登録商標)NetWare(登録商標)を含むことを認識するであろう。当業者であれば、好適な個人コンピュータ動作システムが、非限定的な例示の方法により、Microsoft(登録商標)Windows(登録商標)、Apple(登録商標)Mac OS X(登録商標)、UNIX(登録商標)、およびGNU/Linux(登録商標)などのUNIX様動作システムを含むことを認識するであろう。いくつかの実施形態では、動作システムは、クラウドコンピューティングによって提供される。また、当業者であれば、好適なモバイルスマートフォン動作システムが、非限定的な例示の方法により、Nokia(登録商標)Symbian(登録商標)OS、Apple(登録商標)iOS(登録商標)、Research In Motion(登録商標)BlackBerry OS(登録商標)、Google(登録商標)Android(登録商標)、Microsoft(登録商標)Windows Phone(登録商標)OS、Microsoft(登録商標)Windows Mobile(登録商標)OS、Linux(登録商標)、およびPalm(登録商標)WebOS(登録商標)を含むことを認識するであろう。
デバイスは、一般に、記憶および/またはメモリデバイスを含む。記憶および/またはメモリデバイスは、一時的または永久的にデータまたはプログラムを記憶するために使用される1つ以上の物理的装置である。いくつかの実施形態では、デバイスは、揮発性メモリであり、記憶された情報を維持するための電力を必要とする。いくつかの実施形態では、デバイスは、非揮発性メモリであり、デジタル処理デバイスに給電されない場合に記憶された情報を保持する。さらなる実施形態では、非揮発性メモリは、フラッシュメモリを含む。いくつかの実施形態では、非揮発性メモリは、動的ランダムアクセスメモリ(DRAM)を含む。いくつかの実施形態では、非揮発性メモリは、強誘電体ランダムアクセスメモリ(FRAM)を含む。いくつかの実施形態では、非揮発性メモリは、相変化ランダムアクセスメモリ(PRAM)を含む。他の実施形態では、デバイスは、非限定的な例示の方法により、CD−ROM、DVD、フラッシュメモリデバイス、磁気ディスクドライブ、磁気テープドライブ、光学ディスクドライブ、およびクラウドコンピューティングベースの記憶装置を含む、記憶デバイスである。さらなる実施形態では、記憶および/またはメモリデバイスは、本明細書に開示されるものなど、デバイスの組み合わせである。
ユーザに視覚情報を送信するためのディスプレイは、通常、初期化されるであろう。ディスプレイの例には、陰極線管(CRT、液晶表示器(LCD)、薄膜トランジスタ液晶ディスプレイ(TFT−LCD、有機発光ダイオード(OLED)ディスプレイが含まれる。様々なさらなる実施形態では、OLEDディスプレイ上に、パッシブマトリクスOLED(PMOLED)またはアクティブマトリクスOLED(AMOLED)ディスプレイがある。いくつかの実施形態では、ディスプレイは、プラズマディスプレイ、ビデオプロジェクタ、または本明細書に開示のデバイスなどのデバイスの組み合わせであり得る。
デジタル処理デバイスは、通常、ユーザからの情報を受信するための入力デバイスを含むであろう。入力デバイスは、例えば、キーボード、非限定的な例示の方法により、マウス、トラックボール、トラックパッド、ジョイスティック、ゲームコントローラ、またはスタイラス、タッチスクリーン、またはマルチタッチスクリーン、音声もしくは他の音入力を捕捉するためのマイクロフォン、動作もしくは視覚入力を捕捉するためのビデオカメラ、または本明細書に開示されるデバイスなどのデバイスの組み合わせを含む、ポインティングデバイスであり得る。
非一時的コンピュータ可読保存媒体
本明細書に開示の方法、キット、およびシステムは、好ましくは、ネットワークを介したデジタル処理デバイスに接続された、本明細書に記載の試験を行い、これを分析するための動作システムによって実行可能な指示を含むプログラムによりコードされた1つ以上の非一時的コンピュータ可読記憶媒体を含み得る。コンピュータ可読保存媒体は、任意選択的に、デジタル処理デバイスから取り外し可能なデジタルデバイスの有形構成要素である。コンピュータ可読保存媒体には、非限定的な例示の方法により、CD−ROM、DVD、flashメモリデバイス、固体回路記憶装置、磁気ディスクドライブ、磁気テープドライブ、光学ディスクドライブ、クラウドコンピューティングシステム、およびサービスなどが含まれる。いくつかの例では、プログラムおよび指示は、永久的に、実質的に永久的に、半永久的に、または非一時的に、媒体上でコードされる。
非一時的コンピュータ可読保存媒体は、分類システムを作成または使用するためにプロセッサによって実行可能な指示を含むコンピュータプログラムと共にコードされ得る。記憶媒体は、(a)2つ以上の対照試料の1つ以上の臨床特徴の、コンピュータメモリにおけるデータベースであって、(i)2つ以上の対照試料が、2つ以上対象からのものであり得、(ii)2つ以上の対照試料が、2つ以上のクラスを含む分類システムに基づいて示差的に分類され得る、データベースと、(b)2つ以上の対照試料の1つ以上の臨床特徴を比較するように構成された第1のソフトウエアモジュールと、(c)1つ以上の臨床特徴の比較に基づいて分類子セットを生成するように構成された第2のソフトウエアモジュールと、を含み得る。クラスのうちの少なくとも2つは、子癇前症、非子癇前症、正常な妊娠、合併症を伴う妊娠、および妊娠高血圧から選択され得る。
抗原検出(例えば、抗体)
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの抗原結合試薬を使用して、本明細書で識別されるバイオマーカのうちのいずれかを検出する。いくつかの実施形態では、抗原結合試薬は、抗体(モノクロ−ナルまたはポリクローナル)、抗体の抗原結合断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab)2、F(abc)2、またはFv断片)、または抗体誘導体(例えば、二重特異性抗体、直鎖状抗体、またはscFv)であり得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの抗原検出部分は、図18からの抗体である。いくつかの実施形態では、抗原結合試薬は、図18に提供される抗体のうちのいずれかの抗原結合断片(例えば、Fab、Fab’、F(ab)2、F(abc)2、またはFv断片)または抗体誘導体(例えば、二重特異性抗体、直鎖状抗体、またはscFv)である。
キット
いくつかの実施形態では、本開示は、子癇前症の検出について本明細書に含まれるバイオマーカのセットのうちのいずれかの分析のためのアッセイキットを提供する。いくつかの場合では、アッセイキットは、1つ以上の抗原結合試薬(例えば、図18に提供されるモノクロ−ナルもしくはポリクローナル抗体、または図18に提供される抗体の抗原結合断片もしくは抗体誘導体)を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上の抗原結合試薬は、以下に提示される抗原/バイオマーカに対する特異性を有する抗原結合試薬の組み合わせを含む。
いくつかの実施形態では、提供されているアッセイキットは、以下のセット:sFlt.1、PlGF、KIM1、およびCLEC4A、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびFGF21、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびエンドグリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、およびエンドグリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、およびCD274、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、CD274、およびデコリン、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびエンドグリン、PlGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、TFF2、FGF21、およびデコリン、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、CD2741、およびエンドグリン、またはHGF、SYND1、CLEC4A、sFlt.1、PlGF、KIM1、CLEC4A、およびFGF21のうちの1つにおいてそれぞれのバイオマーカに対して特異的な少なくとも1つの抗体、抗体断片、または抗体誘導体を含む。
いくつかの実施形態では、提供されているアッセイキットは、任意選択的にPlGFと組み合わせて、以下の4つのバイオマーカのセット:SFLT1、KIM1、CLEC4A、FGF21、SFLT1、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、SFLT1、KIM1、CLEC4A、デコリン、SFLT1、KIM1、CLEC4A、CD274、SFLT1、KIM1、CLEC4A、HGF、SFLT1、KIM1、CLEC4A、TFF2、SFLT1、KIM1、CLEC4A、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、FGF21、エンドグリン、SFLT1、KIM1、FGF21、デコリン、SFLT1、KIM1、FGF21、CD274、SFLT1、KIM1、FGF21、HGF、SFLT1、KIM1、FGF21、TFF2、SFLT1、KIM1、FGF21、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、エンドグリン、デコリン、SFLT1、KIM1、エンドグリン、CD274、SFLT1、KIM1、エンドグリン、HGF、SFLT1、KIM1、エンドグリン、TFF2、SFLT1、KIM1、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、デコリン、CD274、SFLT1、KIM1、デコリン、HGF、SFLT1、KIM1、デコリン、TFF2、SFLT1、KIM1、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、CD274、HGF、SFLT1、KIM1、CD274、TFF2、SFLT1、KIM1、CD274、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、HGF、TFF2、SFLT1、KIM1、HGF、PAPP.A2、SFLT1、KIM1、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、SFLT1、CLEC4A、FGF21、デコリン、SFLT1、CLEC4A、FGF21、CD274、SFLT1、CLEC4A、FGF21、HGF、SFLT1、CLEC4A、FGF21、TFF2、SFLT1、CLEC4A、FGF21、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、CD274、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、HGF、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、デコリン、CD274、SFLT1、CLEC4A、デコリン、HGF、SFLT1、CLEC4A、デコリン、TFF2、SFLT1、CLEC4A、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、CD274、HGF、SFLT1、CLEC4A、CD274、TFF2、SFLT1、CLEC4A、CD274、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、HGF、TFF2、SFLT1、CLEC4A、HGF、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、エンドグリン、デコリン、SFLT1、FGF21、エンドグリン、CD274、SFLT1、FGF21、エンドグリン、HGF、SFLT1、FGF21、エンドグリン、TFF2、SFLT1、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、デコリン、CD274、SFLT1、FGF21、デコリン、HGF、SFLT1、FGF21、デコリン、TFF2、SFLT1、FGF21、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、CD274、HGF、SFLT1、FGF21、CD274、TFF2、SFLT1、FGF21、CD274、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、HGF、TFF2、SFLT1、FGF21、HGF、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、デコリン、CD274、SFLT1、エンドグリン、デコリン、HGF、SFLT1、エンドグリン、デコリン、TFF2、SFLT1、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、CD274、HGF、SFLT1、エンドグリン、CD274、TFF2、SFLT1、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、HGF、TFF2、SFLT1、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、CD274、HGF、SFLT1、デコリン、CD274、TFF2、SFLT1、デコリン、CD274、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、HGF、TFF2、SFLT1、デコリン、HGF、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、CD274、HGF、TFF2、SFLT1、CD274、HGF、PAPP.A2、SFLT1、CD274、TFF2、PAPP.A2、SFLT1、HGF、TFF2、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、KIM1、CLEC4A、FGF21、デコリン、KIM1、CLEC4A、FGF21、CD274、KIM1、CLEC4A、FGF21、HGF、KIM1、CLEC4A、FGF21、TFF2、KIM1、CLEC4A、FGF21、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、CD274、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、HGF、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、デコリン、CD274、KIM1、CLEC4A、デコリン、HGF、KIM1、CLEC4A、デコリン、TFF2、KIM1、CLEC4A、デコリン、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、CD274、HGF、KIM1、CLEC4A、CD274、TFF2、KIM1、CLEC4A、CD274、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、HGF、TFF2、KIM1、CLEC4A、HGF、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、TFF2、PAPP.A2、KIM1、FGF21、エンドグリン、デコリン、KIM1、FGF21、エンドグリン、CD274、KIM1、FGF21、エンドグリン、HGF、KIM1、FGF21、エンドグリン、TFF2、KIM1、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、KIM1、FGF21、デコリン、CD274、KIM1、FGF21、デコリン、HGF、KIM1、FGF21、デコリン、TFF2、KIM1、FGF21、デコリン、PAPP.A2、KIM1、FGF21、CD274、HGF、KIM1、FGF21、CD274、TFF2、KIM1、FGF21、CD274、PAPP.A2、KIM1、FGF21、HGF、TFF2、KIM1、FGF21、HGF、PAPP.A2、KIM1、FGF21、TFF2、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、デコリン、CD274、KIM1、エンドグリン、デコリン、HGF、KIM1、エンドグリン、デコリン、TFF2、KIM1、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、CD274、HGF、KIM1、エンドグリン、CD274、TFF2、KIM1、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、HGF、TFF2、KIM1、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、KIM1、デコリン、CD274、HGF、KIM1、デコリン、CD274、TFF2、KIM1、デコリン、CD274、PAPP.A2、KIM1、デコリン、HGF、TFF2、KIM1、デコリン、HGF、PAPP.A2、KIM1、デコリン、TFF2、PAPP.A2、KIM1、CD274、HGF、TFF2、KIM1、CD274、HGF、PAPP.A2、KIM1、CD274、TFF2、PAPP.A2、KIM1、HGF、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、デコリン、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、CD274、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、HGF、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、TFF2、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、デコリン、CD274、CLEC4A、FGF21、デコリン、HGF、CLEC4A、FGF21、デコリン、TFF2、CLEC4A、FGF21、デコリン、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、CD274、HGF、CLEC4A、FGF21、CD274、TFF2、CLEC4A、FGF21、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、HGF、TFF2、CLEC4A、FGF21、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、CD274、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、HGF、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、CD274、HGF、CLEC4A、エンドグリン、CD274、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、HGF、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、CD274、HGF、CLEC4A、デコリン、CD274、TFF2、CLEC4A、デコリン、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、HGF、TFF2、CLEC4A、デコリン、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、CD274、HGF、TFF2、CLEC4A、CD274、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、CD274、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、HGF、TFF2、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、デコリン、CD274、FGF21、エンドグリン、デコリン、HGF、FGF21、エンドグリン、デコリン、TFF2、FGF21、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、CD274、HGF、FGF21、エンドグリン、CD274、TFF2、FGF21、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、HGF、TFF2、FGF21、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、FGF21、デコリン、CD274、HGF、FGF21、デコリン、CD274、TFF2、FGF21、デコリン、CD274、PAPP.A2、FGF21、デコリン、HGF、TFF2、FGF21、デコリン、HGF、PAPP.A2、FGF21、デコリン、TFF2、PAPP.A2、FGF21、CD274、HGF、TFF2、FGF21、CD274、HGF、PAPP.A2、FGF21、CD274、TFF2、PAPP.A2、FGF21、HGF、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、CD274、HGF、エンドグリン、デコリン、CD274、TFF2、エンドグリン、デコリン、CD274、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、HGF、TFF2、エンドグリン、デコリン、HGF、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、CD274、HGF、TFF2、エンドグリン、CD274、HGF、PAPP.A2、エンドグリン、CD274、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、HGF、TFF2、PAPP.A2、デコリン、CD274、HGF、TFF2、デコリン、CD274、HGF、PAPP.A2、デコリン、CD274、TFF2、PAPP.A2、またはデコリン、HGF、TFF2、PAPP.A2、CD274、HGF、TFF2、PAPP.A2のうちの1つにおいてそれぞれのバイオマーカに対して特異的な少なくとも1つの抗体、抗体断片、または抗体誘導体を含む。
いくつかの実施形態では、提供されているアッセイキットは、任意選択的にPlGFと組み合わせて以下の3つのバイオマーカのセット:SFLT1、KIM1、CLEC4A、SFLT1、KIM1、FGF21、SFLT1、KIM1、エンドグリン、SFLT1、KIM1、デコリン、SFLT1、KIM1、CD274、SFLT1、KIM1、HGF、SFLT1、KIM1、TFF2、SFLT1、KIM1、PAPP.A2、SFLT1、CLEC4A、FGF21、SFLT1、CLEC4A、エンドグリン、SFLT1、CLEC4A、デコリン、SFLT1、CLEC4A、CD274、SFLT1、CLEC4A、HGF、SFLT1、CLEC4A、TFF2、SFLT1、CLEC4A、PAPP.A2、SFLT1、FGF21、エンドグリン、SFLT1、FGF21、デコリン、SFLT1、FGF21、CD274、SFLT1、FGF21、HGF、SFLT1、FGF21、TFF2、SFLT1、FGF21、PAPP.A2、SFLT1、エンドグリン、デコリン、SFLT1、エンドグリン、CD274、SFLT1、エンドグリン、HGF、SFLT1、エンドグリン、TFF2、SFLT1、エンドグリン、PAPP.A2、SFLT1、デコリン、CD274、SFLT1、デコリン、HGF、SFLT1、デコリン、TFF2、SFLT1、デコリン、PAPP.A2、SFLT1、CD274、HGF、SFLT1、CD274、TFF2、SFLT1、CD274、PAPP.A2、SFLT1、HGF、TFF2、SFLT1、HGF、PAPP.A2、SFLT1、TFF2、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、FGF21、KIM1、CLEC4A、エンドグリン、KIM1、CLEC4A、デコリン、KIM1、CLEC4A、CD274、KIM1、CLEC4A、HGF、KIM1、CLEC4A、TFF2、KIM1、CLEC4A、PAPP.A2、KIM1、FGF21、エンドグリン、KIM1、FGF21、デコリン、KIM1、FGF21、CD274、KIM1、FGF21、HGF、KIM1、FGF21、TFF2、KIM1、FGF21、PAPP.A2、KIM1、エンドグリン、デコリン、KIM1、エンドグリン、CD274、KIM1、エンドグリン、HGF、KIM1、エンドグリン、TFF2、KIM1、エンドグリン、PAPP.A2、KIM1、デコリン、CD274、KIM1、デコリン、HGF、KIM1、デコリン、TFF2、KIM1、デコリン、PAPP.A2、KIM1、CD274、HGF、KIM1、CD274、TFF2、KIM1、CD274、PAPP.A2、KIM1、HGF、TFF2、KIM1、HGF、PAPP.A2、KIM1、TFF2、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、エンドグリン、CLEC4A、FGF21、デコリン、CLEC4A、FGF21、CD274、CLEC4A、FGF21、HGF、CLEC4A、FGF21、TFF2、CLEC4A、FGF21、PAPP.A2、CLEC4A、エンドグリン、デコリン、CLEC4A、エンドグリン、CD274、CLEC4A、エンドグリン、HGF、CLEC4A、エンドグリン、TFF2、CLEC4A、エンドグリン、PAPP.A2、CLEC4A、デコリン、CD274、CLEC4A、デコリン、HGF、CLEC4A、デコリン、TFF2、CLEC4A、デコリン、PAPP.A2、CLEC4A、CD274、HGF、CLEC4A、CD274、TFF2、CLEC4A、CD274、PAPP.A2、CLEC4A、HGF、TFF2、CLEC4A、HGF、PAPP.A2、CLEC4A、TFF2、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、デコリン、FGF21、エンドグリン、CD274、FGF21、エンドグリン、HGF、FGF21、エンドグリン、TFF2、FGF21、エンドグリン、PAPP.A2、FGF21、デコリン、CD274、FGF21、デコリン、HGF、FGF21、デコリン、TFF2、FGF21、デコリン、PAPP.A2、FGF21、CD274、HGF、FGF21、CD274、TFF2、FGF21、CD274、PAPP.A2、FGF21、HGF、TFF2、FGF21、HGF、PAPP.A2、FGF21、TFF2、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、CD274、エンドグリン、デコリン、HGF、エンドグリン、デコリン、TFF2、エンドグリン、デコリン、PAPP.A2、エンドグリン、CD274、HGF、エンドグリン、CD274、TFF2、エンドグリン、CD274、PAPP.A2、エンドグリン、HGF、TFF2、エンドグリン、HGF、PAPP.A2、エンドグリン、TFF2、PAPP.A2、デコリン、CD274、HGF、デコリン、CD274、TFF2、デコリン、CD274、PAPP.A2、デコリン、HGF、TFF2、デコリン、HGF、PAPP.A2、デコリン、TFF2、PAPP.A2、CD274、HGF、TFF2、CD274、HGF、PAPP.A2、CD274、TFF2、PAPP.A2、またはHGF、TFF2、PAPP.A2のうちの1つにおいてそれぞれのバイオマーカに対して特異的な少なくとも1つの抗体、抗体断片、または抗体誘導体を含む。
いくつかの実施形態では、提供されているアッセイキットは、任意選択的にPlGFと組み合わせて、以下の2つのセット:SFLT1、KIM1、SFLT1、CLEC4A、SFLT1、FGF21、SFLT1、エンドグリン、SFLT1、デコリン、SFLT1、CD274、SFLT1、HGF、SFLT1、TFF2、SFLT1、PAPP.A2、KIM1、CLEC4A、KIM1、FGF21、KIM1、エンドグリン、KIM1、デコリン、KIM1、CD274、KIM1、HGF、KIM1、TFF2、KIM1、PAPP.A2、CLEC4A、FGF21、CLEC4A、エンドグリン、CLEC4A、デコリン、CLEC4A、CD274、CLEC4A、HGF、CLEC4A、TFF2、CLEC4A、PAPP.A2、FGF21、エンドグリン、FGF21、デコリン、FGF21、CD274、FGF21、HGF、FGF21、TFF2、FGF21、PAPP.A2、エンドグリン、デコリン、エンドグリン、CD274、エンドグリン、HGF、エンドグリン、TFF2、エンドグリン、PAPP.A2、デコリン、CD274、デコリン、HGF、デコリン、TFF2、デコリン、PAPP.A2、CD274、HGF、CD274、TFF2、CD274、PAPP.A2、HGF、TFF2、HGF、PAPP.A2、TFF2、PAPP.A2のうちの1つにおいてそれぞれのバイオマーカに対して特異的な少なくとも1つの抗体、抗体断片、または抗体誘導体を含む。
いくつかの実施形態では、提供されているアッセイキットは、以下のセット:PlGF、sFLT1、KIM1、PlGF、sFLT1、CLEC4A、PlGF、sFLT1、FGF21、PlGF、sFLT1、デコリン、PlGF、sFLT1、CD274、PlGF、sFLT1、HGF、PlGF、sFLT1、TFF2、PlGF、sFLT1、PAPP−A2、PlGF、エンドグリン、KIM1、PlGF、エンドグリン、CLEC4A、PlGF、エンドグリン、FGF21、PlGF、エンドグリン、デコリン、PlGF、エンドグリン、CD274、PlGF、エンドグリン、HGF、PlGF、エンドグリン、TFF2、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、PlGF、KIM1、CLEC4A、PlGF、KIM1、FGF21、PlGF、KIM1、デコリン、PlGF、KIM1、CD274、PlGF、KIM1、HGF、PlGF、KIM1、TFF2、PlGF、KIM1、PAPP−A2、PlGF、CLEC4A、FGF21、PlGF、CLEC4A、デコリン、PlGF、CLEC4A、CD274、PlGF、CLEC4A、HGF、PlGF、CLEC4A、TFF2、PlGF、CLEC4A、PAPP−A2、PlGF、CD274、CLEC4A、PlGF、CD274、FGF21、PlGF、CD274、HGF、PlGF、CD274、TFF2、PlGF、CD274、PAPP−A2、PlGF、デコリン、CLEC4A、PlGF、デコリン、FGF21、PlGF、デコリン、HGF、PlGF、デコリン、TFF2、PlGF、デコリン、PAPP−A2、PlGF、FGF21、TFF2、デコリン、PlGF、FGF21、TFF2、CD274、PlGF、FGF21、TFF2、HGF、PlGF、FGF21、TFF2、PlGF、FGF21、TFF2、PAPP−A2、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、KIM1、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、CLEC4A、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、FGF21、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、CD274、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、HGF、PlGF、エンドグリン、PAPP−A2、デコリン、TFF2のうちの1つにおいてそれぞれのバイオマーカに対して特異的な少なくとも1つの抗体、抗体断片、または抗体誘導体を含む。
いくつかの実施形態では、提供されるアッセイキットは、単一の反応での(例えば、同じ輸液室において)分析物すべての検出に好適な多重同種バイオマーカアッセイに好適である。このようなアッセイでは、個別のエピトープに結合する複数の抗体または抗原検出試薬が、同じ分析物/バイオマーカに対して提供され、分析物/バイオマーカの同じ分子に対する両方の結合の同時の結合/相互作用の検出が、試料において分析物/バイオマーカを検出する機能を果たす。したがって、このようなキットは、各分析物に対して2つの抗体または抗原結合試薬を提供する。
TR−FRETによって検出可能な多重同種バイオマーカアッセイの場合、このようなキットは、相補的対のFRET色素に接合された各分析物に対する一対の抗体または抗原結合試薬を提供し、対のうちの1つの抗体または抗原結合試薬は、FRETドナーに接合され、他方は、FRETアクセプタに接合される。LOCIによって検出可能な多重同種バイオマーカアッセイの場合、このようなキットは、一対の抗体または抗原結合試薬を提供し、対のうちの1つの抗体または抗原結合試薬は、光増感剤に接合され、対のうちの他方の抗体または抗原結合試薬は、酸素感受性色素に接合される。
いくつかの実施形態では、提供されるアッセイキットは、個別の反応において(例えば、個別の輸液室において)分析物すべての検出に好適な多重非同種バイオマーカアッセイに好適である。このようなアッセイ(例えば、サンドイッチELISA)のいくつかの実施形態では、基板に取り付けられた(例えば、マルチウエルプレートのウエルにおいて、または側方流動アッセイレーンにおいて)バイオマーカの関連するセットに対する抗体または抗原結合試薬が提供される。基板に取り付けられた、提供されるバイオマーカのうちのそれぞれに対する第2の遊離抗体も提供され、この抗体は、ラベル付けされ得るか(例えば、蛍光色素により、化学発光酵素、または発光酵素により)、またはラベル付けされない場合がある。ラベル付けされない抗体が提供された場合に、第2の遊離抗体に対して結合特異性を有する二次的なラベル付け(例えば、蛍光色素により、化学発光酵素、または発光酵素により)抗体または抗原結合試薬が提供される。
いくつかの実施形態では、キットは、第三者プラットフォームについて試験するための試薬を有する1つ以上のカートリッジを含む生体外診断キットとして使用するためのものである。第三者から回収されたデータは、サーバ(クラウド)にアップロードされ、モデル/アルゴリズムを課すことができ、結果は、医師または他の医療従事者と共有することができる。キットはまた、使用のための指示を含み得る。
例示的な実施形態
いくつかの態様では、本開示は、子癇前症の不要な治療を回避するための方法であって、(a)妊娠しているヒトの女性から回収されている生体試料を複数の異なるプローブと接触させることであって、複数の異なるプローブが、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質について特異的親和性を有するプローブを含む、接触させることと、(b)複数の異なるプローブの対応するタンパク質への結合に基づいて、4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれについての量または濃度を決定することと、(c)少なくとも部分的に、工程(b)で決定された4つ以上のタンパク質の量または濃度に基づいて、子癇前症の不要な治療を回避する様式で当該妊娠している人の治療を進めることと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、(a)胎盤成長因子(PlGF)、(b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質、および(c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、さらに、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、線維芽細胞成長因子21(FGF21)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、FGF21を含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、エンドグリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、エンドグリンを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、デコリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、デコリンを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、分化のクラスタ274(CD274)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、CD274を含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、肝細胞成長因子(HGF)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、HGFを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、トレフォイル因子2(TFF2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、TFF2を含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、パッパリシン−2(PAPP−A2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、PAPP−A2を含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠20週後に妊娠している女性から得られる。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠30週前に妊娠している女性から回収された。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、分類子アルゴリズムを4つ以上のタンパク質の発現プロファイルに適用することであって、分類子アルゴリズムが指数を計算する、適用することと、指数を基準値と比較して、子癇前症の不要な治療を回避するべきかどうかを決定することと、を含む。いくつかの実施形態では、分類子アルゴリズムは、さらに、妊娠期間についての補正を含む。いくつかの実施形態では、妊娠期間についての補正は、LOESS補正を含む。いくつかの実施形態では、分類子アルゴリズムは、ロジスティック回帰を含む。いくつかの実施形態では、分類子アルゴリズムは、エラスティックネット規則化を有するロジスティック回帰を含む。いくつかの実施形態では、分類子アルゴリズムは、ランダムフォレストを含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、尿、血液、羊水、エキソソーム、血漿、または血清試料である。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠しているヒトの女性の血液からのものである。いくつかの実施形態では、20個以下、15個以下、10個以下、9つ以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質の量または濃度を決定する。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブのうちの1つ以上は、抗体、抗体断片、または抗体誘導体である。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブのうちのそれぞれが、抗体、抗体断片、または抗体誘導体である。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つ(またはすべて(例えば、SYND1および/またはCLEC4A))の量または濃度は、発光酸素チャネリング免疫測定法を使用して決定される。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つ(またはすべて)の量または濃度は、時間分解蛍光共鳴エネルギー移動(TR−FRET)法を使用して決定される。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つ(またはすべて)の量または濃度は、近接延伸法(proximity extension assay)を使用して決定される。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つ(またはすべて)の量または濃度は、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)を使用して決定される。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つ(またはすべて)の量または濃度は、増幅発光近接均一性アッセイを使用して決定される。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つ(またはすべて)の量または濃度は、側方流動アッセイを使用して決定される。いくつかの実施形態では、生体試料は、周産期専門医の診療所、分娩室、またはトリアージ(ER)にいる間の妊娠しているヒトから得られる。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、生体試料を複数の異なる反応容器に分離することを含み、複数の反応容器が、第1の反応容器、第2の反応容器、第3の反応容器、および第4の反応容器を含み、生体試料を複数の異なるプローブと接触させることが、第1の反応容器においてPIGFに対する特異的親和性を有するプローブを送達することと、sFlt1に対する特異的親和性を有するプローブを第2の反応容器に送達することと、KIM1に対する特異的親和性を有するプローブを第3の反応容器に送達することと、CLEC4Aに対する特異的親和性を有するプローブを第4の反応容器に送達することと、を含む。いくつかの実施形態では、生体試料を複数の異なるプローブに接触させる工程は、単一の反応容器において生じる。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠している女性が子癇前症の1つ以上の症候を示した後に妊娠している女性から得られ、子癇前症の症候は、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される。いくつかの実施形態では、試料は、妊娠している女性が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後に妊娠している女性から得られた。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれに対する特異的親和性を有する2つのセットのプローブを含み、2つのセットのプローブの各セットは、異なるエピトープに結合する。
いくつかの態様では、本開示は、妊娠しているヒトの女性からの試料において複数のタンパク質を検出および/または定量化するための実験室方法などの方法であって、本方法が、妊娠しているヒトの女性からの生体試料を複数のプローブと接触させることであって、複数のプローブが、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質に対する特異的親和性を有するプローブを含む、接触させることと、複数の異なるプローブの対応するタンパク質への結合に基づいて、4つ以上のタンパク質の存在および/または分量を検出することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、(a)胎盤成長因子、(b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質、および(c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、さらに、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、線維芽細胞成長因子21(FGF21)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、FGF21を含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、エンドグリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、エンドグリンを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、デコリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、デコリンを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、分化のクラスタ274(CD274)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、CD274を含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、肝細胞成長因子(HGF)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、HGFを含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、トレフォイル因子2(TFF2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、TFF2を含む。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブは、パッパリシン−2(PAPP−A2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、4つ以上のタンパク質は、PAPP−A2を含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠20週後に妊娠しているヒトの女性から回収された。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠30週前に妊娠している女性から回収された。いくつかの実施形態では、生体試料は、尿、血液、羊水、エキソソーム、血漿、または血清試料である。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠しているヒトの女性の血液からのものである。いくつかの実施形態では、20個以下、15個以下、10個以下、9つ以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質の量または濃度を決定する。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブのうちの1つ以上は、抗体、抗体断片、または抗体誘導体である。いくつかの実施形態では、複数の異なるプローブのうちのそれぞれが、抗体、抗体断片、または抗体誘導体である。いくつかの実施形態では、複数のプローブは、単一の反応容器において生体試料またはその画分に接触する。いくつかの実施形態では、複数のプローブは、4つ以上のタンパク質の各タンパク質についての個別の反応容器において生体試料またはその画分に接触する。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、第2の複数のプローブを含み、第2の複数のプローブは、PlGFに結合するのに特異的なプローブセット、sFlt1に結合するのに特異的なプローブセット、KIM1に結合するのに特異的なプローブセット、およびCLEC4Aに結合するのに特異的なプローブセットを含み、第2の複数のプローブは、第1の複数のプローブのうちのそれぞれが結合するエピトープとは異なるエピトープで対応するタンパク質に結合する。いくつかの実施形態では、発光酸素チャネリング免疫測定法(LOCI)、時間分解蛍光共鳴エネルギー移動(TR−FRET)アッセイ、増幅発光近接均一性アッセイ、酵素結合免疫吸着測定法、近接延伸法(proximity extension assay)、または側方流動アッセイによって、少なくとも一対の第1および第2の複数のプローブの試料における同じタンパク質分子との同時の結合が検出される。
いくつかの態様では、本開示は、妊娠しているヒト対象を管理し、子癇前症のリスクがないものとして特定の期間妊娠しているヒト対象を識別するための方法であって、(a)(1)80%を上回る特異性および(2)85%を上回る感受性を有する試験を介して、妊娠している対象を、特定の期間内に子癇前症を発症するリスクがないものとして識別することであって、特定の期間が、1週間〜6週間である、識別することと、(b)当該妊娠している患者の歩行監視治療を進めることによって、子癇前症について患者を治療せずに、特定の期間内に子癇前症を発症するリスクがないものとして識別された妊娠しているヒト対象を管理することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、試験は、少なくとも82.0%、少なくとも84.0%、少なくとも85.0%、少なくとも87.0%、少なくとも88.0%、少なくとも89.0%、少なくとも90.0%、少なくとも90.5%、少なくとも91.0%、または少なくとも91.5%の特異性を有する。いくつかの実施形態では、試験は、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、または少なくとも95%の感受性を有する。いくつかの実施形態では、試験は、(1)高血圧および(2)タンパク尿のうちの1つ以上を示す妊娠20週後の人種的に多様な妊娠している女性のランダムンな集団に適用された場合に、少なくとも約95.0%、96.0%、97.0%、98.0%、98.2%、98.4%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、または99.5%の陰性的中率を有する。いくつかの実施形態では、試験は、(1)高血圧および(2)タンパク尿のうちの1つ以上を示す妊娠20週後の人種的に多様な妊娠している女性のランダムンな集団に適用された場合に、少なくとも約30%、少なくとも約32%、少なくとも約35%、少なくとも約37%、少なくとも約40%、少なくとも約42%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、または少なくとも約57%の陽性的中率を有する。いくつかの実施形態では、試験の陰性的中率は、試験の陽性的中率よりも高い。いくつかの実施形態では、特定の期間は、1週間〜4週間、1週間〜3週間、または1週間〜2週間である。いくつかの実施形態では、試験は、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれの量または濃度を決定することを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PlGF、sFlt−1、KIM1、およびCLEC4Aを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、さらに、FGF21を含む。
いくつかの態様では、本開示は、妊娠しているヒト対象を治療する方法であって、少なくとも部分的に、表Aまたは表Bに列挙された4つ以上のタンパク質についてのレベルの決定から作成されたしるしを得ることと、少なくとも部分的に得られたしるしに基づいて、妊娠しているヒト対象についてのリン両計画を変更することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、しるしを得ることは、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aについてのレベルを決定することを含み、レベルは、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aのうちのそれぞれの対応するプローブへの結合から決定される。いくつかの実施形態では、しるしを得ることは、さらに、FGF21についてのレベルを決定することを含み、FGF21のレベルは、FGF21の対応するプローブへの結合から決定される。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、特定の期間内に子癇前症を有するか、または子癇前症を発症するリスクが低いものとして妊娠している対象を分類(または分類を除外)することを含む。いくつかの実施形態では、妊娠している対象は、本明細書に記載の任意の方法によって分類される。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、高血圧薬を患者に投与することを含む。いくつかの実施形態では、高血圧薬は、中心アルファアゴニスト、血管拡張薬、カルシウムチャネル遮断薬、アルファ遮断薬、またはベータ遮断薬である。いくつかの実施形態では、高血圧薬は、メチルドパ、ラベタロール、ニフェジピン、ベラパミル、クロニジン、ヒドララジン、ジアゾキシド、プラゾシン、またはオクスプレノロールである。
いくつかの態様では、本開示は、妊娠している女性対象からの流体試料、第1の複数の異なるプローブを含む混合物であって、第1の複数の異なるプローブが、異なるプローブを含み、それぞれが、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質について特異的親和性を有する、混合物を提供する。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、(a)胎盤成長因子(PlGF)、(b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質、ならびに(c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、さらに、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、FGF21を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、エンドグリンを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、デコリンを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、CD274を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、HGFを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、TFF2を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PAPP−A2を含む。いくつかの実施形態では、流体試料は、妊娠20週後に回収された。いくつかの実施形態では、流体試料は、妊娠30週前に妊娠している女性から回収された。いくつかの実施形態では、混合物は、流体試料において異なるタンパク質に結合するように設計された、20個以下、16個以下、14個以下、12個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のセットのプローブを含む。いくつかの実施形態では、流体試料は、血液、血漿、血清、またはエキソソーム試料からのものである。いくつかの実施形態では、流体試料は、対象が子癇前症の1つ以上の症候を示した後に対象から得られ、子癇前症の症候は、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される。いくつかの実施形態では、流体試料は、対象が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後に対象から得られた。いくつかの実施形態では、第1の複数の異なるプローブは、4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれに対する特異的親和性を有する第1のセットのプローブと、4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれに対する特異的親和性を有する第2のセットのプローブと、を含み、2つのセットのプローブの各セットは、異なるエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、第1のセットのプローブおよび第2のセットのプローブは、各タンパク質特異的プローブ対に対する相補的ハイブリダイゼーション領域を含有するオリゴヌクレオチド対に接合される。いくつかの実施形態では、第1のセットのプローブおよび第2のセットのプローブは、各タンパク質特異的プローブ対に対する一意のFRET対の蛍光体に接合される。いくつかの実施形態では、各タンパク質特異的プローブ対について、1つのプローブは、そのビオチンまたはストレプトアビジン結合類似体に接合される。いくつかの実施形態では、混合物は、さらに、(a)光増感剤、および(b)酸素感受性色素を含み、(a)および(b)のうちの一方は、第1のセットのプローブに結合することができ、他方は、第2のセットのプローブに結合することができる。いくつかの実施形態では、第1の複数の異なるプローブのうちの1つ以上は、抗体、抗体断片、または抗体誘導体である。いくつかの実施形態では、第1の複数の異なるプローブのうちのそれぞれは、抗体、抗体断片、または抗体誘導体である。
いくつかの態様では、本開示は、複数の反応ウエルを含む反応プレートであって、複数の反応ウエルが、(1)妊娠しているヒト対象からの生体試料の第1の部分であって、生体試料が、妊娠の20週後に妊娠しているヒト対象から得られた第1の部分、および(2)PIGFに結合するための第1のセットのプローブを含む第1のウエルと、(1)妊娠しているヒト対象からの生体試料の第2の部分、および(2)sFlt1、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、またはデコリンに結合するための第2のセットのプローブを含む第2のウエルと、(1)妊娠しているヒト対象からの生体試料の第3の部分、および(2)KIM1に結合するための第3のセットのプローブ、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、またはデコリンを含む第3のウエルと、(1)妊娠しているヒト対象からの生体試料の第4の部分、および(2)CLEC4A、FGF21、TFF2、またはHGFに結合するための第4のセットのプローブと、を含む、反応プレートを提供する。いくつかの実施形態では、第2のウエルにおける第2のセットのプローブは、sFlt1に結合するように構成される。いくつかの実施形態では、第3のウエルにおける第3のセットのプローブは、KIM1に結合するように構成される。いくつかの実施形態では、第4のウエルにおける第4のセットのプローブは、CLEC4Aに結合するように構成される。いくつかの実施形態では、複数のウエルは、第5のウエルを含み、第5のウエルは、(1)妊娠しているヒト対象からの生体試料の第5の部分、および(2)FGF21に結合するための第5のセットのプローブを含む。いくつかの実施形態では、複数の反応ウエルは、ウエルを含み、ウエルは、生体試料の一部分、およびエンドグリンに結合するためのプローブのセットを含む。いくつかの実施形態では、複数の反応ウエルは、ウエルを含み、ウエルは、生体試料の一部分、およびデコリンに結合するためのプローブのセットを含む。いくつかの実施形態では、複数の反応ウエルは、ウエルを含み、ウエルは、生体試料の一部分、およびCD274に結合するためのプローブのセットを含む。いくつかの実施形態では、複数の反応ウエルは、ウエルを含み、ウエルは、生体試料の一部分、およびHGFに結合するためのプローブのセットを含む。いくつかの実施形態では、複数の反応ウエルは、ウエルを含み、ウエルは、生体試料の一部分、およびTFF2に結合するためのプローブのセットを含む。いくつかの実施形態では、複数の反応ウエルは、ウエルを含み、ウエルは、生体試料の一部分、およびPAPP−A2に結合するためのプローブのセットを含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠30週前に妊娠している女性から回収された。いくつかの実施形態では、生体試料は、妊娠しているヒトの女性の血液からのものである。いくつかの実施形態では、反応の複数のウエルは、20個以下、15個以下、12個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質に特異的に結合するためのプローブを含む。いくつかの実施形態では、プローブは、抗体、抗体断片、または抗体誘導体を含む。いくつかの実施形態では、生体試料は、対象が子癇前症の1つ以上の症候を示した後の対象からのものであり、子癇前症の症候は、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される。いくつかの実施形態では、試料は、対象が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後の対象からのものである。いくつかの実施形態では、プローブの各セットは、異なるエピトープに特異的に結合するプローブを含む。
いくつかの態様では、本開示は、妊娠している女性対象における子癇前症を除外するためのキットであって、キットが、(a)表AおよびBに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質のレベルを決定するためのプローブを含み、(b)キットが、20個以下、15個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質のレベルを測定するように設計される、キットを提供する。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、(a)胎盤成長因子(PlGF)、(b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質、ならびに(c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、FGF21を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、エンドグリンを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、デコリンを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、CD274を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、HGFを含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、TFF2を含む。いくつかの実施形態では、4つ以上のタンパク質は、PAPP−A2を含む。いくつかの実施形態では、キットは、さらに、イムノアッセイを実行するための指示を含む。いくつかの実施形態では、キットは、酵素結合免疫吸着測定法キットである。いくつかの実施形態では、プローブのうちの1つ以上が、基板に取り付けられる。いくつかの実施形態では、キットは、側方流動イムノアッセイのためのものである。
いくつかの態様では、本開示は、妊娠している女性対象における子癇前症を特定の期間除外するためのシステムであって、プロセッサと、生体試料における少なくとも4つのタンパク質のレベルを入力するための入力モジュールであって、少なくとも4つのタンパク質が表AおよびBから選択される、入力モジュールと、プロセッサによって実施された場合に、少なくとも4つのタンパク質の入力レベルに対して第1のアルゴリズムを行う指示を含む、コンピュータ可読媒体と、少なくとも4つのタンパク質の入力レベルに基づいて1つ以上のしるしを提供する出力モジュールであって、1つ以上のしるしが少なくとも特定の期間、子癇前症を有しない対象を示す、出力モジュールと、を含む、システムを提供する。いくつかの実施形態では、本システムは、さらに、それぞれの少なくとも4つのタンパク質に対するプローブを含む。いくつかの実施形態では、本システムは、15個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質についての出力レベルに基づいて1つ以上のしるしを出力するように設計される。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、(a)胎盤成長因子(PlGF)、(b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質、ならびに(c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、FGF21を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、デコリンを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、CD274を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、HGFを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、TFF2を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも4つのタンパク質は、PAPP−A2を含む。いくつかの実施形態では、アルゴリズムは、妊娠期間に基づく補正を含む。いくつかの実施形態では、アルゴリズムは、ロジスティック回帰を含む。
一態様では、本開示は、特定の期間内に子癇前症を有するか、または発症する女性の対象のリスクを評価するための方法であって、(a)妊娠している女性対象から試料を得ることと、(b)妊娠している女性対象に由来する試料から複数のタンパク質のレベルを測定することであって、複数のタンパク質の少なくとも2つが、表2、3、4、および5からなる群(「グループ2」)から選択される、測定することと、(c)少なくとも部分的に、複数のタンパク質のレベルに基づいて指数を計算することと、(d)指数に基づいて女性の対象における子癇前症を有するか、または発症するリスクを決定することであって、特定の期間が少なくとも1週である、決定することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、試料は、尿、血液、羊水、子宮頚膣、エキソソーム、血漿、または血清試料である。いくつかの実施形態では、試料は、血液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、血清試料である。いくつかの実施形態では、試料は、血漿試料である。いくつかの実施形態では、試料からの複数のタンパク質のレベルの測定は、タンパク質を、各タンパク質に特異的な複数のプローブと接触させることを含む。いくつかの実施形態では、プローブは、抗体を含み得る。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のうちの少なくとも2つは、グループ2から選択される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のうちの少なくとも3つは、グループ2から選択される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のうちの少なくとも4つは、グループ2から選択される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のうちの少なくとも5つは、グループ2から選択される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のうちの少なくとも6つは、グループ2から選択される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のうちの少なくとも7つは、グループ2から選択される。いくつかの実施形態では、レベルは、10個以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、9つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、8つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、7つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、6つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、5つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、4つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、レベルは、3つ以下のタンパク質について測定される。いくつかの実施形態では、試料は、対象が子癇前症のうちの1つ以上の症候を示した後に対象から得られ、子癇前症の症候は、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される。いくつかの実施形態では、試料は、対象が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後に対象から得られた。いくつかの実施形態では、試料は、妊娠の20週後に対象から得られる。いくつかの実施形態では、女性の対象における子癇前症のリスクの識別は、指数を閾値と比較することを含む。いくつかの実施形態では、指数と閾値との間の所定の関係が示され、高血圧およびタンパク尿の両方を有する妊娠している女性の公正な割合に対して使用された場合に、対象のうちの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも97.5%、少なくとも98%、少なくとも98.5%、または少なくとも99%が子癇前症を有しないか、またはこれを発症しない陰性的中率を有する。いくつかの実施形態では、指数と閾値との間の所定の関係が示され、対象のうちの少なくとも90%が、子癇前症を有しない、またはこれを発症しない陰性的中率を有する。いくつかの実施形態では、陰性的中率は、sFLT−1、PlGF、エンドグリン、およびPAPP−Aのうちの1つ以上のみを測定する任意の試験の任意の陰性的中率よりも高い。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質は、可溶性fms様チロシンキナーゼ−1(「sFLT−1」)を含み、指数は、部分的に、対象におけるsFLT−1のレベルに基づいて計算される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質は、胎盤成長因子(「PlGF」)を含み、指数は、部分的に、試料におけるPlGFのレベルに基づいて計算される。いくつかの実施形態では、指数は、少なくとも部分的に、sFLT−1およびPlGFの両方のレベルに基づいて計算される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質は、妊娠関連の血漿のタンパク質A(PAPP−A)を含み、指数は、部分的に、試料におけるPAPP−Aのレベルに基づいて計算される。いくつかの実施形態では、指数は、グループ1のタンパク質、sFLT−1、PlGF、エンドグリン、およびPAPP−Aよりもタンパク質を有しないレベルに基づいて計算される。いくつかの実施形態では、複数のタンパク質のレベルは、イムノアッセイを介して決定される。いくつかの実施形態では、少なくとも2つのタンパク質のレベルは、1つ以上の酵素結合免疫吸着測定法によって決定される。いくつかの実施形態では、少なくとも2つのタンパク質のレベルは、1つ以上の発光酸素チャネリング免疫測定法(LOCI)によって決定される。いくつかの実施形態では、少なくとも2つのタンパク質のレベルは、質量分析、ELISPOT、ナノ粒子、またはラジオイムノアッセイのうちの1つ以上によって決定される。いくつかの実施形態では、試料は、周産期専門医の診療所、分娩室、またはトリアージ(ER)における対象から得られる。
さらなる態様では、本開示は、妊娠している女性対象が子癇前症を現在有するか、または特定の期間内にこれを発症する(または発症しない)かどうかを評価するための方法であって、本方法が、高血圧およびタンパク尿の両方を有する妊娠している女性対象に由来する第1の試料に対して二値分類試験を行うことを含み、試験が、第1の試料において1つ以上のタンパク質のレベルを測定することを含み、1つ以上のタンパク質が、表2、3、4、および5からなる群から選択され、特定の期間が、1週間〜6週間であり、試験が、高血圧およびタンパク尿の両方を有する妊娠している女性の公正な割合に対して使用された場合に、90%を超える陰性的中率を有する、方法を提供する。いくつかの実施形態では、二値分類試験は、コンピュータ実行二元分類アルゴリズムである。いくつかの実施形態では、二値分類試験は、決定木、ランダムフォレスト、ベイジアンネットワーク、サポートベクターマシン、ニューラルネットワーク、直鎖状判別分析(LDA)、勾配ブースティング方法(GBM)、エラスティックネットロジスティック回帰、またはロジスティック回帰試験である。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、対象からの試料を得ることを含む。いくつかの実施形態では、試料は、尿、血液、羊水、エキソソーム、血漿、または血清試料である。いくつかの実施形態では、試料は、血清試料である。いくつかの実施形態では、試料は、血漿試料である。いくつかの実施形態では、二値分類試験は、高血圧およびタンパク尿の両方を有する妊娠している女性の公正な割合に対して使用される場合に、少なくとも85%の予測力を有する。いくつかの実施形態では、二値分類試験は、その陽性的中率よりも大きい陰性的中率を有する。いくつかの実施形態では、二値分類試験は、少なくとも85%の特異性を有する。いくつかの実施形態では、二値分類試験は、少なくとも85%の感受性を有する。いくつかの実施形態では、特定の期間は、10日〜3週である。
別の態様では、本開示は、子癇前症を有するか、または特定の期間内に子癇前症を発症するリスクが低いものとして妊娠しているヒト対象を分類する方法であって、(a)高血圧またはタンパク尿を有するものとして識別された妊娠しているヒト対象から試料を得ることと、(b)試験を行って、タンパク質の発現プロファイルを得ることであって、タンパク質の発現プロファイルが、表2、3、4、および5から2つ以上のタンパク質のレベルを含む、得ることと、(c)分類子アルゴリズムを発現プロファイルに適用することであって、分類子アルゴリズムが、指数を計算する、適用することと、妊娠しているヒト対象が子癇前症を有するか、またはこれを発症するリスクが低いかどうかを決定することと、を含む、方法を提供する。
別の態様では、本開示は、治療の方法であって、(a)本明細書に記載の任意の方法に従って子癇前症を有するか、またはこれを発症するリスクが低いものとして妊娠している対象を分類することと、(b)分類に基づいて対象のための治療計画を変更することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法は、さらに、妊娠している女性対象が、特定の期間、子癇前症を発症しないことを試験が示す場合に、患者に高血圧薬を投与することを含む。いくつかの実施形態では、高血圧薬は、中心アルファアゴニスト、血管拡張薬、カルシウムチャネル遮断薬、アルファ遮断薬、またはベータ遮断薬である。いくつかの実施形態では、高血圧薬は、メチルドパ、ラベタロール、ニフェジピン、ベラパミル、クロニジン、ヒドララジン、ジアゾキシド、プラゾシン、またはオクスプレノロールである。
また別の態様では、本開示は、女性の対象における子癇前症の存在または不存在を確認するためのキットであって、キットが、(a)表2、3、4、および5からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を検出するための試薬と、任意選択的に、(b)PlGFおよび/またはsFLT−1を検出するための試薬であって、キットが、10個以上のタンパク質のレベルを測定するように設計される、試薬と、を含む、キットを提供する。いくつかの実施形態では、キットは、さらに、PAPP−Aのレベルを測定するための試薬を含む。いくつかの実施形態では、キットは、酵素結合免疫吸着測定法キットである。
別の態様では、本開示は、妊娠している対象が、子癇前症を有するか、または特定の期間内に子癇前症を発症する可能性を評価するためのシステムであって、(a)妊娠している対象からの試料における1つ以上のタンパク質に選択的に結合する第1の薬剤であって、1つ以上のタンパク質が、グループ2からなる群から選択される、第1の薬剤と、(b)任意選択的に、胎盤成長因子(PlGF)に選択的に結合する第2の薬剤と、(c)任意選択的に、可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt−1)に選択的に結合する第3の薬剤と、(d)任意選択的にPlGF、任意選択的にsFlt−1、および表2、3、4、および5からなる群からの1つ以上のタンパク質のレベルを入力するための入力モジュールと、(d)プロセッサと、(e)プロセッサによって実行された場合に、任意選択的にPlGF、任意選択的にsFlt−1、およびグループ2からの1つ以上のタンパク質の入力レベルに対して第1のアルゴリズムを行う指示を含むコンピュータ可読媒体と、(f)任意選択的にPlGF、任意選択的にsFlt−1、およびグループ2からの1つ以上のタンパク質の入力レベルに基づいて1つ以上のしるしを提供する出力モジュールであって、1つ以上のしるしが、妊娠している対象における子癇前症の存在または不存在を表す、出力モジュールと、を含む、システムを提供する。一実施形態では、第1および第2の薬剤は、同じタンパク質に結合しない。別の実施形態では、システムは、10個以下のタンパク質についての入力レベルに基づいて1つ以上のしるしを出力するように設計される。
別の態様では、本開示は、妊娠している対象が、子癇前症を有するか、または特定の期間内に子癇前症を発症する可能性を評価するコンピュータ実行方法であって、(a)コンピュータで、妊娠している対象から血漿または血清試料に由来する発現レベルデータを受信することと、(b)コンピュータによって、分類子アルゴリズムを、分類ルールまたはクラス確率方程式を使用して妊娠している対象から血漿または血清試料に由来する発現レベルデータに適用することと、(c)コンピュータによって、分類ルールまたはクラス確率方程式を使用して、試料についての分類を出力することであって、分類が、80パーセントを超える陰性的中率を有する子癇前症を有する可能性を有するものとして試料を分類し、妊娠している対象が、高血圧またはタンパク尿を有する、出力することと、を含む、コンピュータ実行方法を提供する。いくつかの実施形態では、発現レベルデータは、表2、3、4、および5からなる群から選択されるタンパク質のレベルを含む。いくつかの実施形態では、分類子アルゴリズムは、ロジスティック回帰である。いくつかの実施形態では、分類子アルゴリズムは、決定木、ランダムフォレスト、ベイジアンネットワーク、サポートベクターマシン、ニューラルネットワーク、またはロジスティック回帰アルゴリズムである。
実施例1〜7は、子癇前症の治療の必要性を除外するために使用され得るマーカを識別するための最初のより小さい研究設計を記載している。実施例8〜16は、例えば、子癇前症の1つ以上の症候を有する女性と関連するリスクを評価する文脈において、バイオマーカおよびバイオマーカの組み合わせの識別に関する追加の情報を提供した、後続のより大きい研究を記載している。
実施例1−初期予備研究設計
バイオマーカ分析についての血清および尿の試料は、Zeisler et al.(NEJM 274(2017):13−22)によって記載されるsFlt/PlGF比方法に関する改善された性能を有する、子癇前症の検出または除外を改善するバイオマーカを、とりわけ識別するように設計された、Progenity Multicenter見本調達研究から得られた。より具体的には、子癇前症が疑われる(新たに発症した症候、血圧の上昇、タンパク尿、浮腫などに基づいて)18歳以上(第1の訪問で妊娠の20週〜39週)の妊娠している女性が、参加するために選択された。人口学的履歴、病歴、および分娩歴、併用薬、体重、身長、血圧、ならびに他の臨床情報のリストの回収、ならびにバイオマーカアッセイにおいて使用するための血液および尿試料を得ることを含む、ベースライン手順を行った。実行後、研究におけるすべての患者が、14日(+/−3日)ごとに中間調査訪問を受けた。PreEを発症した患者について、ベースライン試料採取からの時間(数日における)、診断時の妊娠期間、および疾患の重症度を記録した。分娩前または分娩時に子癇前症を発症しなかった患者は、陰性−PRE−E対照(NonPreE)群に含まれた。これらの陰性PRE−E対照について、ベースライン試料採取から分娩または経過観察不能のいずれかまでの時間(数日における)を記録した。
中間研究訪問は、14日[+/−3日]ごとに行われ、対象が、1)妊娠37週に到達するか、2)PreEを発症するか、3)分娩するか、または4)経過観察不能のいずれかになるまで継続された。
分娩結果(母体および新生児の臨床情報)を、研究に参加したすべての対象にういて回収した。さらに、分娩による入院中に可能である場合、分娩時の分析のために、血液および尿試料を回収した。
さらなる分析のための使用の発見セットは、妊娠37週前に分娩したかどうかに基づいて非子癇前症または子癇前症に分けられた合計70個の試料:40個の非子癇前症(NonPreE)および30個の子癇前症(PreE)から構成された。70個の試料を、子癇前症の状態およびsFlt/PlGF比が予測されたか否かに基づいて、さらに4つのサブコホート:(A)出産期に分娩し、子癇前症と診断されなかった対照患者(真の陰性および偽の陽性、n=20)、(B)38以上のsFlt/PlGF比を有する子癇前症を有すると臨床的に診断された患者(真の陽性、n=20)、(C)38未満のsFlt/PlGF比を有する子癇前症を有すると臨床的に診断された患者(偽の陰性、n=10)、および(D)出産期に分娩し、38以上のsFlt/PlGF比を有する子癇前症を有すると診断されなかった患者(偽の陽性、n=20)にグループ分けした。
現在の研究についてのサブコホート統計の比較を、表1に提供する。ツァイスラ研究におけるように、sFlt1/PlGF比の基準に基づく高程度の偽の分類を観察した:子癇前症を有するとして比によって識別された患者のかなりの割合が、偽の陽性であり、子癇前症を実際に発症した患者のかなりの割合が、比によって検出されなかった(偽の陰性)。
診断基準
タンパク尿(尿試験紙による2+タンパク質のカットオフ、尿回収の24時間あたり≧300mgのタンパク質、スポット尿試料におけるデシリットル当たり≧30mgのタンパク質、またはミリモルあたり≧30mgのタンパク質のクレアチニンに対する比により定義される)を伴う高血圧(sSBP>140mmHgまたはsDBP>90mmHgまたは両方)の新たな発症に基づいて、子癇前症が疑われる患者を診断した。子癇前症の疑いについてのsFlt/PlGF基準は、38以上のsFlt/PlGFであった。分析の目的のために、早期に分娩した子癇前症が疑われると診断された患者を、実際の子癇前症(真の陽性)として分類した。分析の目的のために、早期に分娩しなかった子癇前症が疑われると診断された患者を、合併症を伴う妊娠(偽の陽性)として分類した。
研究からの患者についての除外基準は。男性、妊娠していない、18歳未満または45歳を上回る年齢、多胎妊娠を有する妊娠、20未満または39週を上回る妊娠期間を有する妊娠、または既知の胎児異常を有する妊娠を含んだ。
実施例2−タンパク質バイオマーカの定量化
68人の患者からの標準的な手順に従って回収された血清試料(1つの非子癇前症および1つの子癇前症試料は、品質管理チェックを満たさなかった)を、遡及的に.分析した。簡単に言うと、充填された赤い上血液回収管を、30〜60分間室温で凝固させ、1300gで20分遠心分離して塊を除去し、次に、等分して−80℃未満で長期保存した。溶血、血液回収の日および時間、ならびに凍結の日および時間を記録した。疑いのあるバイオマーカの単一の分析物分析(フィブロネクチン、PlGF、sFlt1、およびPAPP−Aの)、ならびに炎症、免疫反応、腫瘍、臓器損傷、免疫腫瘍、および代謝に関連するタンパク質の公正なパネル分析(各パネルにおいて92個のバイオマーカを含む)の両方を行った。PlGFは、単一の分析物分析および公正なパネル分析の両方において表され、sFlt1、PAPP−A、およびフィブロネクチンは表されなかった。
単一の候補分析物分析
sFlt1、PAPP−A、PlGF、およびフィブロネクチンの単一の分析物を、ビオチン/フルオレセインに基づくアルファスクリーン(商標)アッセイによって測定した。ビオチンおよびフルオレセインでラベル付けされた抗体を、毎回、125μlの希釈緩衝液との2.5抗体混合物を組み合わせ、混合物を氷上に置くことによって新たに調製した。この近接混合物を、標準的な白い96ウエルプレートの単一のウエル(Biorad、Hemel Hempstead、UK)、続いて2μlの標的抗原または試料中に置き、必要に応じて、1×血清希釈緩衝液(SDB II、4483013、Life Technologies)で適切に希釈した。どのタンパク質対照(NPC)も、2μlの近接混合物および2μlの1×SDB IIからならない。プレートを、PX1 PCRプレートシーラ(Biorad、Hemel Hempstead,UK)を有する光学的に透明な熱シールを使用して封止し、780gで2分間遠心分離し(Rotina 380R Hettich Zentrifuge,Germany)、20℃で1時間培養した。シールの除去後、16μlの抗フルオレセインアクセプタビーズ(10μgs)およびSt/.AV増感剤ビーズ(2μgs)(Perkin Elmer)を各ウエルに加え、プレートを再び封止し、以前のように回転させ、37℃で60分間培養を行った。標準的なアルファスクリーンリーダ上でアッセイを読み取った。
公正な多重分析物分析
バイオマーカの公正な発見について、近接延伸法(proximity extension assay)を使用した。各パネルタンパク質に対して特異的な一対のオリゴヌクレオチド接合抗体を、1μLの血清に加えた。非常に近接したヌクレオチド対のハイブリダイゼーション、続いて伸長反応によって、抗体−タンパク質抗体サンドイッチを検出し、一意の連続した生成物を作成した。次に、これらの連続物を、マイクロ流体qPCRによって定量化した。炎症、免疫反応、腫瘍、臓器損傷、免疫腫瘍、および代謝に関与するマーカを含む合計552個の明確なマーカレベルを、このアッセイで測定した。
実施例3−非子癇前症を子癇前症から区別するための単一のタンパク質スクリーニング
552個のマーカのうちのそれぞれについて分散分析を使用した非子癇前症対子癇前症の反応スクリーニングを行い、FDR LogWorth>2を有意として定義した。FDR LogWorth対効果量のプロット(図1A)を作成して、非子癇前症対PreEを区別するために単一のバイオマーカの値を分析した。3つのバイオマーカ(CLEC4A、SYND1、およびPlGF)は、有意(>2)についてのFDR LogWorth基準を満たし、6つの追加のバイオマーカ(PGF、FES、TGF−アルファ2、APLP1、KIM1、およびNOS32)は、バイオマーカのうちの大部分よりも有意なFDR LogWorthを示している。これらの上位に区別されたマーカの要約を、表2に提供し、非子癇前症対子癇前症についての上位3つのバイオマーカのうちのそれぞれにゆいてのデータ拡散の視覚的表示を、図1Bに示す。
実施例4−実施例3からの9つのバイオマーカのサブコホート分析
実施例3で識別された上位9つのバイオマーカのうちのそれぞれの発現レベルを、実施例1で識別された各サブコホートにおけるそれらの発現レベルに対してさらに分析した(A=非PreE/真の陰性、B=PreE/真の陽性、C=PreE/偽の陰性、D=非PreE/偽の陽性)。結果を図2にグラフで提示する。sFlt1/PlGF比アッセイの高い偽の陽性/陰性割合と一致して、PlGF(図2、右上のパネル)は、AをBから区別する場合であっても、CおよびDグループについて不良な判別力を示す。しかしながら、他のバイオマーカ(CLEC4A、図2、左上およびSYND1、図2、中央)は、AおよびBのコホートならびにCおよびDのコホートの間で区別する能力を示す。
実施例5−予測バイオマーカのランダムブートストラップフォレスト識別
実施例3の方法に対する代替物として、ランダムブートストラップフォレスト予測因子スクリーニングを、多重スクリーニングにおいて評価される552個の公正なバイオマーカからの発現レベルデータに対して行った。寄与によってランク付けされたこの方法によって発見された上位20個の予測因子を表3に示す。
実施例6−単一の候補分析物の4つのコホート分析
以前の作業で識別された候補分析物:sFlt1、PlGF(例えば、Zeisler et al.NEJM 274(2017):13−22)、PAPP−A(例えば、Spencer et al.Prenat Diagn.28(2008):7−10.を参照された)、およびフィブロネクチン(例えば、Taylor et al.Am J Obstet Gynecol.165(1991):895−901を参照されたい)を、上記のように4つのコホート分析によって測定および分析した。分析の散布図を図3に示す。すべてが、非子癇前症対子癇前症(A対B)を区別する能力を示すが、AおよびC、BおよびDの対がより類似しているため(理想的な関係がA〜B、C〜Dであるべきである場合)、すべてがコホートの混同を示す。
実施例7−子癇前症についての複数予測因子モデルの展開
ランダムブートストラップフォレスト予測因子スクリーニング(10ラウンド)を、単一の包括的なデータセット(556個のマーカ)への4つの候補バイオマーカ発現レベルと組み合わされた多重分析において分析された552個のバイオマーカ発現レベルに適用した。この分析から得られた上位50個のマーカを、中央ランクによって表3に表示し、上の列は、上位10個のマーカを表し、2番目の列は、第2の10個のマーカを表すなどである。
公正な様式でのロジスティックモデルの可能性のある構成要素を識別するために、次に、これらのマーカの上位19個を、段階的反応(GR)モデルに適合させ、次に、250個のブートストラップに適合させた。これは、p値<1を有した(それらがブートストラップ試料から構築された>50%の250モデルにおいて非ゼロ係数を有したことを意味する)9つのマーカ(CAPG、ZBTB16、SYND1、CLEC4C、TGFアルファ2、uPA、CLEC4A、PGF、およびAMN)をもたらした。これらのマーカを表5に提示する。
表5の9つの予測因子を使用して、非子癇前症を子癇前症から区別するために構築されたロジスティック回帰モデルについての要約統計量およびROC曲線を、図4に提示する。この研究において作成されたデータに適用された場合、モデルは、0.992のAUCを有した。このデータのROC曲線からの仮推定値は、95%の特異性値についておよそ90%の特異性を与える。
比較のために、CLEC4AおよびSYND1(実施例3で識別された上位2つの単一のマーカ)の追加と共に、Zeisler et al.からの2つの候補マーカ(sFlt1、PlGF)を使用して、追加のロジスティック回帰モデルを行った。これら4つのマーカを使用して、非子癇前症を子癇前症から区別するために構築されたロジスティック回帰モデルについての要約統計量およびROC曲線を、図5に提示する。この研究において作成されたデータに適用された場合、モデルは、0.908のAUCを有した。
実施例8−追加のバイオマーカ分析
実施例2のようなAlphaScreen(商標)アッセイ、および実施例4のようにサブコホートによって提示される発現レベルを使用して、血清試料に対して、追加の候補バイオマーカCCL2、CD134、DCN、HGF、NOS3、PlGF、CD274、CDCP1、FGF−21、TGFa、UPA、CLEC4A、CLEC4C、ZBTB16、APLP1、DPP7、GRAP2、ITGB7、PAG1、TFF2、AMN、CAPG、CLEC1A5、FES、KIM1、PGF、ERBB4、GPNMB、PPY、およびSYND1の追加の単一分析を行った。バイオマーカ発現レベルの散布図を、図7〜12に提示する。
実施例9−研究設計の拡張
子癇前症についてのバイオマーカをさらに識別および検証するために、実施例1と同じ包含/除外基準を使用した拡張された研究を行った。使用される工程の概要は、バイオマーカのレベルが決定される101、方法100を示す図17のフロー図表に記載されており、得られたデータは、ログ変換102および妊娠期間についてのLoess補正103を受ける。次に、機械学習104を使用して、子癇前症に対する治療を行う必要のない対象を識別するのに好適なアルゴリズムを決定する。患者から回収された試料の分類を、表6に詳述する。フィルタ処理した(重複する試料を除去した)後、研究から回収された本物の(−)および本物の(+)の試料を、(−)と(+)との試料比を保存しながら、75/25比に従って訓練および試験セットにさらに分離した。本物のPreE陽性(+)試料は、臨床的に2013 ACOG基準を使用した、早期に分娩した(すなわち、37週未満の妊娠期間における)患者からのものであり、試料は、臨床診断後および分娩前に回収され、試料は、子癇前症の診断の2週以内に回収された。本物のPreE陰性(−)試料は、現在の妊娠において子癇前症の臨床診断を有しなかった、正常満期出産(すなわち、37週以降の妊娠期間の分娩)で出産した、ACOG 2013ガイドラインによって定義される子癇前症の症候のうちの少なくとも1つを有する患者からのものであり、試料は、妊娠期間38週前に回収された。
本物のPreE陽性(+)試料は、2013 ACOG基準を使用して臨床的に診断された早期に分娩した患者からのものである。本物のPreE陰性(−)試料は、2013 ACOG基準に従って少なくとも1つの症状を示したが、正期に分娩した。(+)または(−)カテゴリに適合しなかった試料を、アルゴリズム展開および試験から除外した。このコホートについての民族性/人種情報を、表6Aに提供する。
実施例10子癇前症についてのナイーブ多変量モデルの展開
一連の16個のマーカ(CLEC4A、HGF、PlGF、KIM1、FGF−21、FN、DCN、SYND1、CD−274、TFF−2、PAPP−A、ADAM−12、sFLT1、PAPP−A2、ENG、およびUPA)を、実施例9の本物の(+)および(−)試料に対する高スループットタンパク質の発現の階層的クラスタリングによって選択した(本物の基準は、実施例9と同じである)。選択後、各分析物のタンパク質レベルについてのアッセイを展開し、それらの二変数相互作用期間を有し、かつ有しないログ(タンパク質レベル)またはログ比(タンパク質レベル)を、特徴としてこれらのマーカについて使用して、子癇前症を予測するナイーブ多変量モデルを構築した。実施例9に記載された「訓練」セットにおけるログ変換された発現データのセットから始まり、モデルは、(RF)を使用して構築されたランダムフォレスト、GBM(勾配ブースティング・マシン)、および電気ネットロジスティック回帰(「Enet LR」)アルゴリズムであった。16個の発現マーカの完全なセットと関連して、以下の手順を使用した。
1)試料を、10:1の比でのさらなる「訓練」および「試験」のサブセットにランダムに分けた。
2)訓練セットをダウンサンプリングして、クラスを平衡化した。
3)感受性について最適化するために10倍の交差検証を行った。
4)工程2〜3を、25回繰り返した。
5)工程1〜4を、40回繰り返した。
6)58のsFlt1/PlGF発現比のみを使用して、子癇前症を検出する「ベースライン」モデルと比較して、各アルゴリズムアプローチについてNPV、PPV、感受性、特異性、AUC、およびAUP(精度再現率曲線下の面積)を報告した。この手順から得られた各ナイーブアルゴリズムおよびそれらの寄与についての特長を、表7に示し、性能特性を、表8を提示する。
新規モデルはすべて、特異性およびPPVにおいて改善を示した。
偽の陰性検出(NPV/感受性)。を改善するために、最初に、アルゴリズム最適化を行った。各アルゴリズムの性能を、「偽の陰性」カテゴリからの個々の試料において検査した。10/20個の試料を、RF/GBM/LRによって陰性として分類し、7/20つの試料を、GBM/LRによって陰性として分類し、2/20つのみの試料を、LRによって陰性として分類した。
したがって、エラスティックネットロジスティック回帰およびランダムフォレストの組み合わせを伴う「積み重ね」構造を、偽の陰性を低減するための方法として調査した。積み重ねモデルの性能を、表8に示す。子癇前症を診断または除外する際に使用するための積み重ねモデルの例示的な説明を、図19に示す。仮定されるように、積み重ねモデル構造は、感受性、NPV、およびAUC対個々のモデル、ならびにsFlt1/PlGFモデルを改善した。
モデル性能特性の静的かをさらに改善するために、次に、特徴の最適化を行った。
I.合理的な選択およびクラスタリングを使用した特徴選択
第1の適用されたアプローチは、検出を改善するために、特徴として遺伝子をより合理的に選択することを求めた。各バイオマーカの特徴の倍数上方制御/下方制御を、「偽の陰性試料」においてグラフで分析した。この分析を、図20に例示する。これらの試料について、PlGF、END、PAPP−A2、およびsFlt1はすべて、低いシグナル(倍数発現の変化に関して)、これは、子癇前症試料のサブセットの検出について不十分であることを示唆している。しかしながら、KIM−1、FGF−21、およびCLEC4Aは、偽の陰性および真の陰性試料の両方においてシグナルを有し、これは、それらが子癇前症試料のすべてのサブセットの検出を広く検出し得ることを示唆している。したがって、KIM−1、FGF−21、およびCLEC4Aのみを特徴として使用して、正規のEnetおよび「積み重ね」RF/Enetモデルの両方を構築した(表8を参照されたい)。このモデルは、NPVにおける改善、および感受性対sFlt1/PlGFベースラインモデルにおける何らかの改善をマークしており、KIM−1、FGF−21、およびCLEC4Aを使用したモデルが、子癇前症の検出の感受性を改善することを確認している。
II.主成分分析を使用した特徴選択
第2の適用されたアプローチは、特徴として主成分を検査し(発現データに対して行われたPCAから)、本物の陽性試料における各主成分のシグナルを検査した(本物の基準は、実施例9と同じである)。この分析は、第1の4つの主成分(PC1、PC2、PC4、およびPC9)が変動の61.5%を説明し、特にPC4は、偽の陰性試料PC1およびPC2におけるシグナルがそうでないことを示した。このシグナルのうちの大部分は、PC4に対する誘因であるCLEC4A、HGF、FGF21、KIM1、およびTFF2から生じるように思われた。4つの主成分が分類についての最小のセットを形成するとの想定に基づいて、上記に使用される同じアルゴリズムを使用して、上位4つの主成分を使用したモデルを作成した。これらのアルゴリズムを使用して構築されたモデルの性能を、表9に提示する。上位4つの主成分を特徴として使用した積み重ねモデルは、NPV、PPV、特異性、感受性、およびAUCにおける改善された特性対sFlt1/PlGFモデルを示した。
III.Lasso−LRを使用した特徴選択
第3のアプローチは、普遍的な偽の陰性および偽の陽性の除去後に試料発現データの完全なセットに対してLasso−LRを利用して、性能を最適化するバイオマーカの特徴のセットを識別した(最小2つの予測方法による偽の陰性が>=0.9であると試料の頻度が報告された場合に普遍的な偽の陰性として、かつ最小3つの予測方法による偽の陽性が>=0.8であると試料の頻度が報告された場合に普遍的な偽の陰性として、試料が指定される)。Lasso−LRを行い(アルファ=1、ラムダ=0.01を使用して)、10個の異なるシードについて10倍の交差検証を500回繰り返して、図21に提示された特徴のランク付けを作成した。これらのマーカの上位11個について子癇前症対非子癇前症試料における発現レベルのグラフを、図13に提示する。これらのランク付けから上位2〜10個の特徴を使用して、LRモデルを作成し、その性能を、表10に提示する。
4〜5つの特徴(PlGF/sFLT1/KIM1/CLEC4AまたはPlGF/sFLT1/KIM1/CLEC4A/CD274)を使用して、感受性を最大化し、その後、追加のタンパク質のマーカ特徴が、感受性の減少を引き起こした。いずれかのうち、5つ目のマーカのうちのいずれがモデルにおける感受性および他のパラメータに最も寄与するかを推定するために、4つのマーカの組み合わせ(PlGF/sFLT1/KIM1/CLEC4A)プラス5つ目のマーカのすべての組み合わせ(CD274またはTFF2またはADAM12またはDCNまたはENDまたはHGFまたはFGF21またはPAPP−A1またはFNまたはSYND1またはUPAまたはPAPP−A)を使用したモデルを作成し、それらの性能特性を比較した(表11)。
実施例11妊娠期間依存的発現についての最適化多変量モデルの補正
次に、実施例10で展開および評価されたモデルを試験して、ロジスティック回帰の適用前のバイオマーカ発現レベルのLoessモデル調節の追加を介した妊娠期間の包含が、モデルの性能パラメータを改善するかどうかを調べた。図14は、Loessモデルを使用して、バイオマーカ(PlGF)発現レベルの妊娠期間補正を行う例示的な手順を図示し、図17は、これがモデル構築ワークフローに組み込まれ得る手順を例示する。表12は、Loess妊娠期間(GA)を補正したモデルおよび補正していないモデルの性能パラメータを図示し、「Loess GA除去」は、妊娠期間を占めるモデルに対応し、「GA除去なでぃ」は、妊娠期間を占めないモデルに対応する。表12は、5つおよび4つのバイオマーカモデルについて、妊娠期間の補正が、モデルの性能パラメータを改善することを実証している。
実施例12分類が困難な試料の再分類時の最適化多変量モデルの性能(判定)
実施例12を通したモデル構築/分析において、子癇前症研究からの試料のうちのいくつかを、反対の臨床ラベルを有するにもかかわらず、子癇前症について陰性または陽性としてモベルによって分類した。これらの試料のうちの30個を、臨床医による盲検様式において子癇前症について再評価し、30個の試料のうちの9つは、ラベルを変更した。独立した専門医のグループを用いて、本物のPreE陽性およびPreE陰性試料の初期拡張研究分類状態を判定および確認または変更した(本物の基準は、実施例9と同じである)。利用可能な臨床データに適用されるACOG(American College of Obstetricians and Gynecologists)ガイドラインに基づく予め設定された基準に従って、見直しを行った。この更新された患者割合に対して訓練されたモデルの性能パラメータを、計算し、表13に示す。
それにもかかわらず、臨床医による判定後、偽の陰性として高い頻度を有する4つの試料の分類を続けた。これらの4つの高い頻度の偽の陰性を欠いている、更新された患者割合に対して訓練することによって、再びモデルを再構築した(最小2つの予測方法による偽の陰性が>=0.9であると試料の頻度が報告された場合の普遍的な偽の陰性として試料を設計した)。これらの更新されたモデルについての性能パラメータは、表14に提示され、訓練パラダイムからのこれらの偽の陰性試料の除外が、AUPおよびAUCに関するモデル性能を改善することを示唆している。
実施例13閾値調節時の最適化多変量モデルの性能
次に、いくつかの値を使用して感受性閾値を調節して、最高の性能のモデルの特異性閾値を最適化することができるかどうかを調べた。いくつかの異なる閾値を有するモデルの結果を、表15に提示する。結果は、特異性を81.7%までトレードダウンさせて、感受性を最大94.77%増加させることができることを実証している。
実施例14分娩時間分析における最適化多変量モデルの性能
上位5つまたは4つのバイオマーカを特徴として使用したEnet−LRモデルの性能を、分娩から1、2、4、または6週の妊娠している患者からの試料において評価した。各シナリオにおけるモデルについての性能特性を、表12に提示する。概して、感受性およびPPVは、分娩時間の増加に従って減少し、特異性およびNPVは、分娩時間と共に増加した。
実施例15最高の性能のモデルにおける高徴候マーカの互換性
この分析で発見された最高の性能のマーカ、sFLT−1、KIM−1、およびCLEC−4Aを検査して、この研究で発見された他のより低い徴候のマーカの組み合わせをそれらと置換することができるかどうかを調べた。
sFLT−1について、エンドグリン、PAPP−A2、およびデコリンの組み合わせは、sFLT−1、PlGF、KIM−1、およびCLEC−4Aを伴うものと同様の性能特性を有するモデルを生成することができることが発見された。表17の結果は、sFLT−1と置換されたエンドグリン、PAPP−A2、およびデコリンを伴うモデルが、AUC/AUPの微量の喪失のみを有する、sFLT−1を伴うものと同様の性能特性を有することを実証している。
KIM−1について、CD274および/またはデコリンとの置換物は、同様の性能パラメータを有するが、デコリンを有しないCD274のみを伴うモデルは、CD274を有しないデコリンのみを伴うものよりも優位に良好なAUPを有することが発見された(表18を参照されたい)。
CLEC4Aについて、CLEC4AをFGF21、TFF2および/またはHGFと置換したモデルは、同様の性能特性をもたらすことが発見された(表19)。表19はまた、これらのモデルのうち、HGFまたはFGF21を使用したものは、TFF2を使用したものよりも優位に優れたAUP/AUCを有することを実証している。
実施例16高性能モデルの独立したコホート検証
実施例1および実施例9に記載のように回収された患者の試料の独立したコホートを使用して、以前の実施例において展開された高性能モデルの性能を検証した。これらは、元々、451個の試料からなり、子癇前症試料について、342個の本物の陽性または陰性に低減された(308個の本物の陰性および34個の本物の陽性)。独立した専門医のグループを用いて、本物のPreE陽性およびPreE陰性試料の初期の拡張された研究分類状態を判定および確認または変更した判定手順(実施例12のように)後に、このコホートは、最終セットの331個の患者試料に低減され、221個は、子癇前症についての本物の陰性であり、32個は、子癇前症についての本物の陽性である。331個の患者試料に対する検証について選択されるモデルを表20に示す。表20では、訓練セットからのデータの除外が示されており、最小2つの予測方法による偽の陰性が>=0.9であると試料の頻度が報告された場合、試料は、偽の陰性(FN)と称され、最小3つの予測方法による偽の陽性が>=0.8であると試料の頻度が報告された場合、試料は、偽の要請(FP)と称される。
表20において構築されたモデルの性能パラメータについての検証データを表21に示す。モデルが性能によってランク付けされた場合、4.1モデル(sFLT−1、PlGF、KIM1、およびENDを使用した、偽の陽性および陰性試料の除外を含む、0.3のカットオフを使用した、および妊娠期間についてのloess補正を使用した、Enetロジスティック回帰)は、最高の性能を有する。注目すべきことに、この独立したコホートに対する上位3つのモデルのAUCは、以前の例(例えば、実施例14)に見られる性能と一致(同等またはより良好)である。
この正の性能データに基づいて、追加の29個のモデルを構築し(合計44個を作成する)、独立したコホートに対する性能特性を計算し、表22に提示する。モデル係数(ロジスティック回帰の場合における各特徴/バイオマーカについての「ベータ」値、およびランダムフォレストまたはGBMの場合における各特徴/バイオマーカについての「特徴重要性」値)と共に、各モデルで使用される対応するバイオマーカ/特徴を表23に提示する。「積み重ね」モデルが提示される場合、各工程についての関連する係数は、表23の個別の列に分離される。
この例における検証のために使用される331人の患者試料セットについての民族性情報を表24に提供する。
本発明の好ましい実施形態が、本明細書に示され、記載されているが、当業者であれば、このような実施形態が例示の方法のみによって提供されることは、当業者に明らかであろう。多数の変形、変更、および置換が、これより、本発明から逸脱することなく当業者に生じるであろう。本明細書に記載の本発明の実施形態に対する様々な代替物が、本発明の実践において用いられ得ることが理解されるべきである。以下の請求項が、本発明の範囲を定義し、これらの請求項およびそれらの等価物の範囲内の方法および構造が、それによって変換されることが意図される。

Claims (154)

  1. 子癇前症の不要な治療を回避するための方法であって、
    (a)妊娠しているヒトの女性から回収された生体試料を複数の異なるプローブと接触させることであって、前記複数の異なるプローブが、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質に対する特異的親和性を有するプローブを含む、接触させることと、
    (b)前記複数の異なるプローブの対応するタンパク質への結合に基づいて、前記4つ以上のタンパク質のそれぞれに対する量または濃度を判定することと、
    (c)少なくとも部分的に、工程(b)で判定された前記4つ以上のタンパク質の前記量または濃度に基づいて、子癇前症の不要な治療を回避する様式で、前記妊娠しているヒトの治療を進めることと、を含む、方法。
  2. 前記4つ以上のタンパク質が、
    (a)胎盤成長因子(PlGF)と、
    (b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質と、
    (c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、および(3)デコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質と、を含む、請求項1に記載の方法。
  3. 前記4つ以上のタンパク質が、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質をさらに含む、請求項2に記載の方法。
  4. 前記4つ以上のタンパク質が、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
  5. 前記複数の異なるプローブが、線維芽細胞成長因子21(FGF21)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、FGF21を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
  6. 前記複数の異なるプローブが、エンドグリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、エンドグリンを含む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
  7. 前記複数の異なるプローブが、プローブデコリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、デコリンを含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。
  8. 前記複数の異なるプローブが、分化のクラスタ274(CD274)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、CD274を含む、請求項1〜7のいずれか一項に記載の方法。
  9. 前記複数の異なるプローブが、肝細胞成長因子(HGF)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、HGFを含む、請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。
  10. 前記複数の異なるプローブが、トレフォイル因子2(TFF2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、TFF2を含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記複数の異なるプローブが、パッパリシン−2(PAPP−A2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、PAPP−A2を含む、請求項1〜10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 前記生体試料が、妊娠20週後に前記妊娠している女性から得られる、請求項1〜11のいずれか一項に記載の方法。
  13. 前記生体試料が、妊娠30週前に前記妊娠している女性から回収されている、請求項1〜12のいずれか一項に記載の方法。
  14. 分類子アルゴリズムを前記4つ以上のタンパク質の発現プロファイルに適用することであって、前記分類子アルゴリズムが、指数を計算する、適用することと、
    前記指数を基準値と比較して、前記子癇前症の不要な治療を回避するかどうかを決定することと、をさらに含む、請求項1〜13のいずれか一項に記載の方法。
  15. 前記分類子アルゴリズムが、妊娠期間の補正をさらに含む、請求項1〜14のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記妊娠期間の補正が、LOESS補正を含む、請求項15に記載の方法。
  17. 前記分類子アルゴリズムが、ロジスティック回帰を含む、請求項14〜16のいずれか一項に記載の方法。
  18. 前記分類子アルゴリズムが、エラスティックネット規則化によるロジスティック回帰を含む、請求項14〜17のいずれか一項に記載の方法。
  19. 前記分類子アルゴリズムが、ランダムフォレストを含む、請求項14〜16のいずれか一項に記載の方法。
  20. 前記生体試料が、尿、血液、羊水、エキソソーム、血漿、または血清試料である、請求項1〜19のいずれか一項に記載の方法。
  21. 前記生体試料が、前記妊娠しているヒトの女性の血液からのものである、請求項1〜19のいずれか一項に記載の方法。
  22. 20個以下、15個以下、10個以下、9つ以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質の量または濃度が決定される、請求項1〜21のいずれか一項に記載の方法。
  23. 前記複数の異なるプローブのうちの1つ以上が、抗体または抗体断片である、請求項1〜22のいずれか一項に記載の方法。
  24. 前記複数の異なるプローブのそれぞれが、抗体または抗体断片である、請求項1〜23のいずれか一項に記載の方法。
  25. 前記4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つの量または濃度が、発光酸素チャネリング免疫測定法を使用して決定される、請求項1〜24のいずれか一項に記載の方法。
  26. 前記4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つの量または濃度が、時間分解蛍光共鳴エネルギー移動(TR−FRET)法を使用して決定される、請求項1〜25のいずれか一項に記載の方法。
  27. 前記4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つの量または濃度が、近接延伸法(proximity extension assay)を使用して決定される、請求項1〜26のいずれか一項に記載の方法。
  28. 前記4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つの量または濃度が、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)を使用して決定される、請求項1〜27のいずれか一項に記載の方法。
  29. 前記4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つの量または濃度が、増幅発光近接均一性アッセイを使用して決定される、請求項1〜28のいずれか一項に記載の方法。
  30. 前記4つ以上のタンパク質のうちの少なくとも1つの量または濃度が、側方流動アッセイを使用して決定される、請求項1〜29のいずれか一項に記載の方法。
  31. 前記生体試料が、周産期専門医の診療所、分娩室、またはトリアージ(ER)にいる間の妊娠しているヒトから得られる、請求項1〜30のいずれか一項に記載の方法。
  32. 前記生体試料を複数の異なる反応容器に分離することをさらに含み、前記複数の反応容器が、第1の反応容器、第2の反応容器、第3の反応容器、および第4の反応容器を含み、前記生体試料を前記複数の異なるプローブに接触させることが、PlGFに対する特異的親和性を有するプローブを第1の反応容器に送達することと、sFlt1に対する特異的親和性を有するプローブを第2の反応容器に送達することと、KIM1に対する特異的親和性を有するプローブを第3の反応容器に送達することと、CLEC4Aに対する特異的親和性を有するプローブを第4の反応容器に送達することと、を含む、請求項1〜31のいずれか一項に記載の方法。
  33. 前記生体試料を前記複数の異なるプローブに接触させる工程が、単一の反応容器において行われる、請求項1〜29のいずれか一項に記載の方法。
  34. 前記生体試料が、前記妊娠している女性が子癇前症の1つ以上の症候を示した後に前記妊娠している女性から得られ、前記子癇前症の症候が、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される、請求項1〜33のいずれか一項に記載の方法。
  35. 前記試料が、前記妊娠している女性が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後に前記妊娠している女性から得られたものである、請求項34に記載の方法。
  36. 前記複数の異なるプローブが、前記4つ以上のタンパク質のそれぞれに対する特異的親和性を有する2つのセットのプローブを含み、前記2つのセットのプローブの各セットが、異なるエピトープに結合する、請求項1〜35のいずれか一項に記載の方法。
  37. 妊娠しているヒトの女性からの試料において複数のタンパク質を検出および/または定量化するための、実験室方法などの方法であって、
    妊娠しているヒトの女性からの生体試料を複数のプローブに接触させることであって、前記複数のプローブが、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質に対する特異的親和性を有するプローブを含む、接触させることと、
    前記複数の異なるプローブの対応するタンパク質への結合に基づいて、前記4つ以上のタンパク質の存在および/または分量を検出することと、を含む、方法。
  38. 前記4つ以上のタンパク質が、
    (a)胎盤成長因子と、
    (b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質と、
    (c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質と、を含む、請求項37に記載の方法。
  39. 前記4つ以上のタンパク質が、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質をさらに含む、請求項38に記載の方法。
  40. 前記4つ以上のタンパク質が、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む、請求項37〜39のいずれか一項に記載の方法。
  41. 前記複数の異なるプローブが、線維芽細胞成長因子21(FGF21)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、FGF21を含む、請求項37〜40のいずれか一項に記載の方法。
  42. 前記複数の異なるプローブが、エンドグリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、エンドグリンを含む、請求項37〜41のいずれか一項に記載の方法。
  43. 前記複数の異なるプローブが、デコリンに対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、デコリンを含む、請求項37〜42のいずれか一項に記載の方法。
  44. 前記複数の異なるプローブが、分化のクラスタ274(CD274)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、CD274を含む、請求項37〜43のいずれか一項に記載の方法。
  45. 前記複数の異なるプローブが、肝細胞成長因子(HGF)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、HGFを含む、請求項37〜44のいずれか一項に記載の方法。
  46. 前記複数の異なるプローブが、トレフォイル因子2(TFF2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、TFF2を含む、請求項37〜45のいずれか一項に記載の方法。
  47. 前記複数の異なるプローブが、パッパリシン−2(PAPP−A2)に対する特異的親和性を有するプローブを含み、前記4つ以上のタンパク質が、PAPP−A2を含む、請求項37〜46のいずれか一項に記載の方法。
  48. 前記生体試料が、妊娠20週後に前記妊娠しているヒトの女性から回収されている、請求項37〜47のいずれか一項に記載の方法。
  49. 前記生体試料が、妊娠30週前に前記妊娠している女性から回収されている、請求項37〜48のいずれか一項に記載の方法。
  50. 前記生体試料が、尿、血液、羊水、エキソソーム、血漿、または血清試料である、請求項37〜49のいずれか一項に記載の方法。
  51. 前記生体試料が、前記妊娠しているヒトの女性の血液からのものである、請求項37〜49のいずれか一項に記載の方法。
  52. 20個以下、15個以下、10個以下、9つ以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質の量または濃度が決定される、請求項37〜51のいずれか一項に記載の方法。
  53. 前記複数の異なるプローブのうちの1つ以上が、抗体または抗体断片である、請求項37〜52のいずれか一項に記載の方法。
  54. 前記複数の異なるプローブのそれぞれが、抗体または抗体断片である、請求項37〜53のいずれか一項に記載の方法。
  55. 前記複数のプローブが、単一の反応容器において前記生体試料またはその画分に接触する、請求項37〜54のいずれか一項に記載の方法。
  56. 前記複数のプローブが、前記4つ以上のタンパク質の各タンパク質に対する個別の反応容器において、前記生体試料またはその画分に接触する、請求項37〜54のいずれか一項に記載の方法。
  57. 第2の複数のプローブをさらに含み、前記第2の複数のプローブが、PlGFへの結合に特異的なプローブセット、sFlt1への結合に特異的なプローブセット、KIM1への結合に特異的なプローブセット、およびCLEC4Aへの結合に特異的なプローブセットを含み、前記第2の複数のプローブが、第1の複数のプローブのそれぞれが結合するエピトープとは異なるエピトープでその対応するタンパク質に結合する、請求項37〜56のいずれか一項に記載の方法。
  58. 前記試料における少なくとも一対の前記第1および第2の複数のプローブの同じタンパク質分子への同時の結合が、発光酸素チャネリング免疫測定法(LOCI)、時間分解蛍光共鳴エネルギー移動(TR−FRET)法、増幅発光近接均一性アッセイ、酵素結合免疫吸着測定法、近接延伸法(proximity extension assay)、または側方流動アッセイによって検出される、請求項57に記載の方法。
  59. 妊娠しているヒト対象を管理し、前記妊娠しているヒト対象を特定の期間子癇前症のリスクがないものとして識別するための方法であって、
    (a)(1)80%を上回る特異性および(2)85%を上回る感受性を有する試験を介して、前記妊娠している対象を、前記特定の期間内に子癇前症を発症するリスクがないものとして識別することであって、前記特定の期間が、1週間〜6週間である、識別することと、
    (b)前記妊娠している患者の歩行監視治療を進めることによって、子癇前症について前記患者を治療せずに、前記特定の期間内に子癇前症を発症するリスクがないものとして識別された前記妊娠しているヒト対象を管理することと、を含む、方法。
  60. 前記試験が、少なくとも82.0%、少なくとも84.0%、少なくとも85.0%、少なくとも87.0%、少なくとも88.0%、少なくとも89.0%、少なくとも90.0%、少なくとも90.5%、少なくとも91.0%、または少なくとも91.5%の特異性を有する、請求項59に記載の方法。
  61. 前記試験が、少なくとも86%、少なくとも87%、少なくとも88%、少なくとも89%、少なくとも90%、少なくとも91%、少なくとも92%、少なくとも93%、少なくとも94%、または少なくとも95%の感受性を有する、請求項59または60に記載の方法。
  62. 前記試験が、(1)高血圧および(2)タンパク尿のうちの1つ以上を示す、妊娠20週後に人種的に多様な妊娠している女性のランダムな集団に適用されたときに、少なくとも約95.0%、96.0%、97.0%、98.0%、98.2%、98.4%、98.5%、98.7%、99%、99.2%、または99.5%の陰性的中率を有する、請求項59〜61のいずれか一項に記載の方法。
  63. 前記試験が、(1)高血圧および(2)タンパク尿のうちの1つ以上を示す、妊娠20週後に人種的に多様な妊娠している女性のランダムな集団に適用されたときに、少なくとも約30%、少なくとも約32%、少なくとも約35%、少なくとも約37%、少なくとも約40%、少なくとも約42%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、または少なくとも約57%の陽性的中率を有する、請求項59〜62のいずれか一項に記載の方法。
  64. 前記試験の陰性的中率が、前記試験の陽性的中率よりも高い、請求項59〜63のいずれか一項に記載の方法。
  65. 前記特定の期間が、1週間〜4週間、1週間〜3週間、または1週間〜2週間である、請求項59〜63のいずれか一項に記載の方法。
  66. 前記試験が、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれの量または濃度を決定することを含む、請求項59〜65のいずれか一項に記載の方法。
  67. 前記4つ以上のタンパク質が、PlGF、sFlt−1、KIM1、およびCLEC4Aを含む、請求項66に記載の方法。
  68. 前記4つ以上のタンパク質が、FGF21をさらに含む、請求項67に記載の方法。
  69. 妊娠しているヒト対象を治療する方法であって、
    少なくとも部分的に、表Aまたは表Bに列挙された4つ以上のタンパク質についてのレベルの決定から作成されたしるしを得ることと、
    少なくとも部分的に、前記得られたしるしに基づいて、前記妊娠しているヒト対象についての臨床計画を変更することと、を含む、方法。
  70. 前記しるしを得ることが、
    PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aについての前記レベルを決定することを含み、前記レベルが、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aのうちのそれぞれの対応するプローブへの結合から決定される、請求項69に記載の方法。
  71. 前記しるしを得ることが、FGF21についての前記レベルを決定することをさらに含み、FGF21の前記レベルが、FGF21の対応するプローブへの結合から決定される、請求項70に記載の方法。
  72. 前記妊娠している対象を、子癇前症を有するか、または特定の期間内に子癇前症を発症するリスクが低いものとして分類することをさらに含む、請求項69〜71のいずれか一項に記載の方法。
  73. 前記妊娠している対象が、本明細書に記載の任意の方法によって分類される、請求項72に記載の方法。
  74. 前記患者に高血圧薬を投与することをさらに含む、請求項69〜73のいずれか一項に記載の方法。
  75. 前記高血圧薬が、中心アルファアゴニスト、血管拡張薬、カルシウムチャネル遮断薬、アルファ遮断薬、またはベータ遮断薬である、請求項74に記載の方法。
  76. 前記高血圧薬が、メチルドパ、ラベタロール、ニフェジピン、ベラパミル、クロニジン、ヒドララジン、ジアゾキシド、プラゾシン、またはオクスプレノロールである、請求項74に記載の方法。
  77. 混合物であって、
    妊娠している女性対象からの流体試料と、
    第1の複数の異なるプローブであって、前記第1の複数の異なるプローブが、異なるプローブを含み、それぞれが、表Aまたは表Bに列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質に対する特異的親和性を有する、プローブと、を含む、混合物。
  78. 前記4つ以上のタンパク質が、
    (a)胎盤成長因子(PlGF)と、
    (b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質と、
    (c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質と、を含む、請求項77に記載の混合物。
  79. 前記4つ以上のタンパク質が、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質をさらに含む、請求項78に記載の方法。
  80. 前記4つ以上のタンパク質が、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む、請求項77〜79のいずれか一項に記載の混合物。
  81. 前記4つ以上のタンパク質が、FGF21を含む、請求項77〜80のいずれか一項に記載の混合物。
  82. 前記4つ以上のタンパク質が、エンドグリンを含む、請求項77〜81のいずれか一項に記載の混合物。
  83. 前記4つ以上のタンパク質が、デコリンを含む、請求項77〜82のいずれか一項に記載の混合物。
  84. 前記4つ以上のタンパク質が、CD274を含む、請求項77〜83のいずれか一項に記載の混合物。
  85. 前記4つ以上のタンパク質が、HGFを含む、請求項77〜84のいずれか一項に記載の混合物。
  86. 前記4つ以上のタンパク質が、TFF2を含む、請求項77〜85のいずれか一項に記載の混合物。
  87. 前記4つ以上のタンパク質が、PAPP−A2を含む、請求項77〜86のいずれか一項に記載の混合物。
  88. 前記流体試料が、妊娠20週後に回収されている、請求項77〜87のいずれか一項に記載の混合物。
  89. 前記流体試料が、妊娠30週前に前記妊娠している女性から回収されている、請求項77〜88のいずれか一項に記載の混合物。
  90. 前記混合物が、前記流体試料において異なるタンパク質に結合するように設計された、20個以下、16個以下、14個以下、12個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のセットのプローブを含む、請求項77〜89のいずれか一項に記載の混合物。
  91. 前記流体試料が、血液、血漿、血清、またはエキソソーム試料からのものである、請求項77〜90のいずれか一項に記載の混合物。
  92. 前記流体試料が、前記対象が子癇前症の1つ以上の症候を示した後に前記対象から得られたものであり、前記子癇前症の症候が、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される、請求項77〜91のいずれか一項に記載の方法。
  93. 前記流体試料が、前記対象が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後に前記対象から得られたものである、請求項77〜92のいずれか一項に記載の方法。
  94. 前記第1の複数の異なるプローブが、前記4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれに対する特異的親和性を有する第1のセットのプローブと、前記4つ以上のタンパク質のうちのそれぞれに対する特異的親和性を有する第2のセットのプローブと、を含み、前記2つのセットのプローブの各セットが、異なるエピトープに結合する、請求項77〜93のいずれか一項に記載の方法。
  95. 前記第1のセットのプローブおよび前記第2のセットのプローブが、各タンパク質特異的プローブ対に対する相補的ハイブリダイゼーション領域を含むオリゴヌクレオチド対に接合される、請求項94に記載の混合物。
  96. 前記第1のセットのプローブおよび前記第2のセットのプローブが、各タンパク質特異的プローブ対に対する一意のFRET対の蛍光体に接合される、請求王94に記載の混合物。
  97. 各タンパク質特異的プローブ対について、1つのプローブは、そのビオチンまたはストレプトアビジン結合類似体に接合される、請求項94に記載の混合物。
  98. (a)光増感剤および(b)酸素感受性色素をさらに含み、(a)および(b)のうちの一方が、前記第1のセットのプローブに結合することができ、他方が、前記第2のセットのプローブに結合することができる、請求項94に記載の混合物。
  99. 前記第1の複数の異なるプローブのうちの1つ以上が、抗体または抗体断片である、請求項77〜98のいずれか一項に記載の混合物。
  100. 前記第1の複数の異なるプローブのうちのそれぞれが、抗体または抗体断片である、請求項77〜99のいずれか一項に記載の混合物。
  101. 複数の反応ウエルを含む反応プレートであって、前記複数の反応ウエルが、
    (1)妊娠しているヒト対象からの生体試料の第1の部分であって、前記生体試料が、妊娠の20週後に妊娠しているヒト対象から得られたものである、第1の部分、および(2)PlGFに結合するための第1のセットのプローブを含む第1のウエルと、
    (1)前記妊娠しているヒト対象からの前記生体試料の第2の部分、および(2)sFlt1、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、またはデコリンに結合するための第2のセットのプローブを含む第2のウエルと、
    (1)前記妊娠しているヒト対象からの前記生体試料の第3の部分、および(2)KIM1、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、またはデコリンに結合するための第3のセットのプローブを含む第3のウエルと、
    (1)前記妊娠しているヒト対象からの前記生体試料の第4の部分、および(2)CLEC4A、FGF21、TFF2、またはHGFに結合するための第4のセットのプローブを含む第4のウエルと、を含む、反応プレート。
  102. 前記第2のウエルにおける前記第2のセットのプローブが、sFlt1に結合するように構成される、請求項101に記載の反応プレート。
  103. 前記第3のウエルにおける前記第3のセットのプローブが、KIM1に結合するように構成される、請求項101または102に記載の反応プレート。
  104. 前記第4のウエルにおける前記第4のセットのプローブが、CLEC4Aに結合するように構成される、請求項101〜103のいずれか一項に記載の反応プレート。
  105. 前記複数のウエルが、第5のウエルを含み、前記第5のウエルが、(1)前記妊娠しているヒト対象からの前記生体試料の第5の部分、および(2)FGF21に結合するための第5のセットのプローブを含む、請求項101〜104のいずれか一項に記載の反応プレート。
  106. 前記複数の反応ウエルが、ウエルを含み、前記ウエルが、前記生体試料の一部分、およびエンドグリンに結合するためのプローブのセットを含む、請求項101〜105のいずれか一項に記載の反応プレート。
  107. 前記複数の反応ウエルが、ウエルを含み、前記ウエルが、前記生体試料の一部分、およびデコリンに結合するためのプローブのセットを含む、請求項101〜106のいずれか一項に記載の反応プレート。
  108. 前記複数の反応ウエルが、ウエルを含み、前記ウエルが、前記生体試料の一部分、およびCD274に結合するためのプローブのセットを含む、請求項101〜107のいずれか一項に記載の反応プレート。
  109. 前記複数の反応ウエルが、ウエルを含み、前記ウエルが、前記生体試料の一部分、およびHGFに結合するためのプローブのセットを含む、請求項101〜108のいずれか一項に記載の反応プレート。
  110. 前記複数の反応ウエルが、ウエルを含み、前記ウエルが、前記生体試料の一部分、およびTFF2に結合するためのプローブのセットを含む、請求項101〜109のいずれか一項に記載の反応プレート。
  111. 前記複数の反応ウエルが、ウエルを含み、前記ウエルが、前記生体試料の一部分、およびPAPP−A2に結合するためのプローブのセットを含む、請求項101〜110のいずれか一項に記載の反応プレート。
  112. 前記生体試料が、妊娠30週前に前記妊娠している女性から回収されている、請求項101〜111のいずれか一項に記載の反応プレート。
  113. 前記生体試料が、前記妊娠しているヒトの女性の血液からのものである、請求項101〜112のいずれか一項に記載の反応プレート。
  114. 前記反応の前記複数のウエルが、20個以下、15個以下、12個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質に特異的に結合するためのプローブを含む、請求項101〜113のいずれか一項に記載の反応プレート。
  115. 前記プローブが、抗体または抗体断片を含む、請求項101〜114のいずれか一項に記載の反応プレート。
  116. 前記生体試料が、前記対象が子癇前症の1つ以上の症候を示した後の前記対象からのものであり、前記子癇前症の症候が、(1)高血圧および(2)タンパク尿から選択される、請求項101〜115のいずれか一項に記載の反応プレート。
  117. 前記試料が、前記対象が(1)高血圧および(2)タンパク尿の両方を示した後の前記対象からのものである、請求項101〜116のいずれか一項に記載の反応プレート。
  118. プローブの各セットが、異なるエピトープに特異的に結合するプローブを含む、請求項101〜117のいずれか一項に記載の反応プレート。
  119. 妊娠している女性対象において子癇前症を除外するためのキットであって、
    (a)表6および7に列挙されたタンパク質から選択される4つ以上のタンパク質のレベルを決定するためのプローブを含み、
    (b)前記キットが、20個以下、15個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質のレベルを測定するように設計される、キット。
  120. 前記4つ以上のタンパク質が、
    (a)胎盤成長因子(PlGF)と、
    (b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質と、
    (c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質と、を含む、請求項119に記載のキット。
  121. 前記4つ以上のタンパク質が、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む、請求項120に記載のキット。
  122. 前記4つ以上のタンパク質が、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む、請求項119〜121のいずれか一項に記載のキット。
  123. 前記4つ以上のタンパク質が、FGF21を含む、請求項119〜122のいずれか一項に記載のキット。
  124. 前記4つ以上のタンパク質が、エンドグリンを含む、請求項119〜123のいずれか一項に記載のキット。
  125. 前記4つ以上のタンパク質が、デコリンを含む、請求項119〜124のいずれか一項に記載のキット。
  126. 前記4つ以上のタンパク質が、CD274を含む、請求項119〜125のいずれか一項に記載のキット。
  127. 前記4つ以上のタンパク質が、HGFを含む、請求項119〜126のいずれか一項に記載のキット。
  128. 前記4つ以上のタンパク質が、TFF2を含む、請求項119〜127のいずれか一項に記載のキット。
  129. 前記4つ以上のタンパク質が、PAPP−A2を含む、請求項119〜128のいずれか一項に記載のキット。
  130. イムノアッセイを実行するための指示をさらに含む、請求項119〜129のいずれか一項に記載のキット。
  131. 前記キットが、酵素結合免疫吸着測定法キットである。請求項119〜130のいずれか一項に記載のキット。
  132. 前記プローブのうちの1つ以上が、基板に取り付けられる、請求項119〜131のいずれか一項に記載のキット。
  133. 前記キットが、側方流動イムノアッセイのためのものである、請求項119〜132のいずれか一項に記載のキット。
  134. 妊娠している女性対象において特定の期間子癇前症を除外するためのシステムであって、
    プロセッサと、
    生体試料において少なくとも4つのタンパク質のレベルを入力するための入力モジュールであって、前記少なくとも4つのタンパク質が、表6および7から選択される、入力モジュールと、
    前記プロセッサによって実行されたときに、前記少なくとも4つのタンパク質の入力レベルに対して第1のアルゴリズムを行う指示を含むコンピュータ可読媒体と、
    前記少なくとも4つのタンパク質の入力レベルに基づいて1つ以上のしるしを提供する出力モジュールであって、前記1つ以上のしるしが、少なくとも特定の期間、子癇前症を有しない対象を示す、出力モジュールと、を含む、システム。
  135. それぞれの前記少なくとも4つのタンパク質に対するプローブをさらに含む、請求項134に記載のシステム。
  136. 前記システムが、15個以下、10個以下、8つ以下、7つ以下、6つ以下、5つ以下、または4つ以下のタンパク質についての入力レベルに基づいて前記1つ以上のしるしを出力するように設計される、請求項134または135に記載のシステム。
  137. 前記少なくとも4つのタンパク質が、
    (a)胎盤成長因子(PlGF)と、
    (b)可溶性fms様チロシンキナーゼ1(sFlt1)、エンドグリン、パッパリシン2(PAPP−A2)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の血管新生関連のタンパク質と、
    (c)(1)腎臓傷害分子−1(KIM1)、(2)プログラム細胞死1リガンド1(CD274)、およびデコリンからなる群から選択される1つ以上の腎臓損傷関連のタンパク質と、を含む、請求項134〜136のいずれか一項に記載のシステム。
  138. 前記少なくとも4つのタンパク質が、C型レクチンドメインファミリー4メンバA(CLEC4A)、線維芽細胞成長因子21(FGF21)、トレフォイル因子2(TFF2)、および肝細胞成長因子(HGF)からなる群から選択される1つ以上のタンパク質を含む、請求項134〜137のいずれか一項に記載のシステム。
  139. 前記少なくとも4つのタンパク質が、PlGF、sFlt1、KIM1、およびCLEC4Aを含む、請求項134〜138のいずれか一項に記載のシステム。
  140. 前記少なくとも4つのタンパク質が、FGF21を含む、請求項134〜139のいずれか一項に記載のシステム。
  141. 前記少なくとも4つのタンパク質が、デコリンを含む、請求項134〜140のいずれか一項に記載のシステム。
  142. 前記少なくとも4つのタンパク質が、CD274を含む、請求項134〜141のいずれか一項に記載のシステム。
  143. 前記少なくとも4つのタンパク質が、HGFを含む、請求項134〜142のいずれか一項に記載のシステム。
  144. 前記少なくとも4つのタンパク質が、TFF2を含む、請求項134〜143のいずれか一項に記載のシステム。
  145. 前記少なくとも4つのタンパク質が、PAPP−A2を含む、請求項134〜144のいずれか一項に記載のシステム。
  146. 前記アルゴリズムが、妊娠期間に基づく補正を含む、請求項134〜145のいずれか一項に記載のシステム。
  147. 前記アルゴリズムが、ロジスティック回帰を含む、請求項134〜146のいずれか一項に記載のシステム。妊娠しているヒト対象を、特定の期間内に子癇前症を有しない、かつ/または発症することはないものとして分類するための方法であって、
    子癇前症についての1つ以上の症候またはリスク因子を有するものと識別された妊娠しているヒト対象からの試料を得ることと、
    タンパク質の発現プロファイル得るために試験を行うことであって、前記タンパク質の発現プロファイルが、表AおよびBから2つ以上のタンパク質のレベルを含む、行うことと、
    分類子アルゴリズムを前記発現プロファイルに適用することであって、前記分類子アルゴリズムが、指数を計算する、適用することと、
    前記指数を基準値と比較して、前記妊娠しているヒト対象を、前記特定の期間内に子癇前症を有しない、かつ/または発症することがないものとして分類すべきがどうかを決定することと、を含む、方法。
  148. 前記試験が、
    少なくとも80%、少なくとも82%、少なくとも85%、少なくとも87%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%の特異性、および
    少なくとも80%、少なくとも82%、少なくとも85%、少なくとも87%、少なくとも90%、少なくとも92%、少なくとも95%、少なくとも97%、または少なくとも99%の感受性を有する、請求項147に記載の方法。
  149. 前記1つ以上の症候が、高血圧およびタンパク尿の一方または両方を含む、請求項147または148に記載の方法。
  150. 前記特定の期間が、1〜6週(例えば、1〜4週)である、請求項147〜149のいずれか一項に記載の方法。
  151. 前記タンパク質の発現プロファイルが、表AおよびBからの3つ以上のタンパク質のレベルを含む、請求項147〜150のいずれか一項に記載の方法。
  152. 前記タンパク質の発現プロファイルが、表AおよびBからの4つ以上のタンパク質のレベルを含む、請求項147〜151のいずれか一項に記載の方法。
  153. 前記タンパク質の発現プロファイルが、表AおよびBからの5つ以上のタンパク質のレベルを含む、請求項147〜152のいずれか一項に記載の方法。
  154. 15個、10個、8つ、または6つ以下のタンパク質の発現プロファイルが決定される、請求項147〜153のいずれか一項に記載の方法。

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