JP2020146066A5 - - Google Patents
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Claims (12)
- 試料中のＺｉｋａウイルス核酸を増幅するための少なくとも２つの増幅オリゴマーの組み合わせ物であって、該オリゴマーの組み合わせ物が、
Ｚｉｋａウイルス標的核酸に対応する標的配列を増幅するように構成された少なくとも２つの増幅オリゴマーであって、該標的配列が、配列番号１８７、配列番号１８７のＲＮＡ等価物、または配列番号１８７のＤＮＡ相補体もしくはＲＮＡ相補体からなり、第１の増幅オリゴマーおよび第２の増幅オリゴマーが、該標的配列の反対の末端にハイブリダイズして増幅産物を生成するように構成される、少なくとも２つの増幅オリゴマーを含み、
該第１の増幅オリゴマーが、配列番号４の１９〜２３個の長さの連続した核酸塩基からなり、配列番号２を含む標的ハイブリダイズ配列を含み、
該第２の増幅オリゴマーが、配列番号１５２の１９〜２５個の長さの連続した核酸塩基からなり、配列番号１４８または配列番号１４９を含む標的ハイブリダイズ配列を含み、該第２の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、その５’末端においてＴ７プロモーター配列に結合されている、組み合わせ物。 - 前記第１の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、および配列番号３５からなる群から選択される、請求項１に記載の組み合わせ物。
- 前記第２の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、配列番号１１７および配列番号１３７からなる群から選択される、請求項２に記載の組み合わせ物。
- 前記第２の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、配列番号１１１、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１２２、配列番号１３５、配列番号１３６、配列番号１３７、および配列番号１３８からなる群から選択される、請求項１〜３のいずれか一項に記載の組み合わせ物。
- 前記第２の増幅オリゴマーのヌクレオチド配列が、配列番号９０、配列番号９１、配列番号９２、配列番号９３、配列番号９４、配列番号９５、配列番号９６、および配列番号９７からなる群から選択される、請求項４に記載の組み合わせ物。
- 前記Ｔ７プロモーター配列が、配列番号１７９からなる、請求項１に記載の組み合わせ物。
- 請求項１に記載の少なくとも２つの増幅オリゴマーを含む増幅反応混合物であって、（ｉ）該混合物が緩衝水溶液であるか、または（ｉｉ）該混合物が乾燥組成物である、増幅反応混合物。
- 請求項１に記載の少なくとも２つの増幅オリゴマーを含むキット。
- 試料中のＺｉｋａウイルス核酸の有無を判定するための方法であって、該方法が、
（Ａ）試料をＺｉｋａウイルス標的核酸に対応する標的配列を増幅するように構成された少なくとも２つの増幅オリゴマーの組み合わせ物と接触させるステップであって、該標的配列が、配列番号１８７、配列番号１８７のＲＮＡ等価物、または配列番号１８７のＤＮＡ相補体もしくはＲＮＡ相補体からなり、第１の増幅オリゴマーおよび第２の増幅オリゴマーが、該標的配列の反対の末端にハイブリダイズして増幅産物を生成するように構成され、該第１の増幅オリゴマーが、配列番号４の１９〜２３個の長さの連続した核酸塩基からなり、配列番号２を含む標的ハイブリダイズ配列を含み、該第２の増幅オリゴマーが、配列番号１５２の１９〜２５個の長さの連続した核酸塩基からなり、配列番号１４８または配列番号１４９を含む標的ハイブリダイズ配列を含み、該第２の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、その５’末端においてＴ７プロモーター配列に結合されている、ステップと
（Ｂ）インビトロ核酸増幅反応を実施するステップであって、該試料中に存在する任意のＺｉｋａウイルス標的核酸が、増幅産物を生成するための鋳型として使用される、ステップと、
（Ｃ）該増幅産物の有無を検出し、それにより、該試料中のＺｉｋａウイルス核酸の有無を判定するステップと
を含む、方法。 - 前記第１の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、配列番号２８、配列番号２９、配列番号３０、配列番号３１、配列番号３２、配列番号３３、配列番号３４、および配列番号３５からなる群から選択される、請求項９に記載の方法。
- 前記第２の増幅オリゴマーの標的ハイブリダイズ配列が、配列番号１１１、配列番号１１６、配列番号１１７、配列番号１２２、配列番号１３５、配列番号１３６、配列番号１３７、および配列番号１３８からなる群から選択される、請求項９または１０に記載の方法。
- 前記第２の増幅オリゴマーのヌクレオチド配列が、配列番号９０、配列番号９１、配列番号９２、配列番号９３、配列番号９４、配列番号９５、配列番号９６、および配列番号９７からなる群から選択される、請求項１１に記載の方法。
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