JP2018527919A - 抗tigit抗体 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は2015年8月14日付け出願の米国仮特許出願第62/205,048号(その全体を参照により本明細書に組み入れることとする)の利益を主張するものである。
本出願の配列表は、ファイル名「24178WOPCTSEQ.txt」、2016年7月29日の作成日および111KBのサイズを有するASCII形式の配列表としてEFS−Web経由で電子的に提出されている。EFS−Web経由で提出されたこの配列表は本明細書の一部であり、その全体を参照により本明細書に組み入れることとする。
本発明は、抗TIGIT抗体、ならびに癌および感染症のような疾患の治療におけるこれらの抗体の使用に関する。
本発明は、以下に特定する構造的および機能的特徴を含む抗TIGIT抗体およびその抗原結合性フラグメントを提供する。
略語
本発明の詳細な説明および実施例の全体にわたって、以下の略語を用いる。
CDC 補体依存性細胞傷害;
CDR Kabat(カバト)番号付け系を用いて定められた、免疫グロブリン可変領域内の相補性決定領域;
CHO チャイニーズハムスター卵巣;
ELISA 酵素結合イムノソルベントアッセイ;
FR 抗体フレームワーク領域:CDR領域を除く免疫グロブリン可変領域;
HRP ホースラディッシュペルオキシダーゼ;
IFN インターフェロン;
IC50 50%の抑制をもたらす濃度;
IgG 免疫グロブリンG;
Kabat Elvin A.Kabat((1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest,5th Ed.Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,Md.)により開発された免疫グロブリンアライメントおよび番号付け系;
mAbまたはMabまたはMAb モノクローナル抗体;
SEB スタヒロコッカスエンテロトキシンB;
TT 破傷風トキソイド;
V領域 異なる抗体間で配列が可変性であるIgG鎖のセグメント。それは軽鎖内のKabat残基109および重鎖内の113まで伸長する;
VH 免疫グロブリン重鎖可変領域;
VK 免疫グロブリンカッパ軽鎖可変領域。
本発明がより容易に理解されうるように、幾つかの科学技術用語を以下に具体的に定義する。本明細書中の他の箇所で特に定義されていない限り、本明細書中で用いる他の全ての科学技術用語は、本発明が属する技術分野の当業者に一般に理解される意味を有する。
TIGITなる語はヒトTIGIT、カニクイザルTIGITおよびアカゲザルTIGIT、ならびにそれらの断片、例えば、シグナルペプチドを欠くそれらの成熟断片を含む。本発明の1つの実施形態においては、ヒトTIGITのアミノ酸配列は、Genbankアクセッション番号NP 776160.2(配列番号33)のアミノ酸残基25〜244において開示されているアミノ酸配列を含む(配列番号33のアミノ酸残基1〜24は、成熟TIGITタンパク質から除去されるリーダーペプチドに対応する)。
本発明は、ヒトTIGITに結合する抗体またはその抗原結合性フラグメント、およびそのような抗体またはフラグメントの用途を提供する。幾つかの実施形態においては、抗TIGIT抗体は単離されている。
本発明は、特定されている構造的および機能的特徴を有する抗TIGIT抗体およびその抗原結合性フラグメント、ならびに疾患(例えば、癌または感染症)の治療または予防における該抗体またはその抗原結合性フラグメントの使用方法を提供する。
本発明は更に、本発明の抗TIGIT抗体およびその抗原結合性フラグメントのポリペプチドまたは免疫グロブリン鎖のいずれかをコードするポリヌクレオチドを含む。例えば、本発明は、配列番号1〜32または45〜112に記載されているアミノ酸をコードするポリヌクレオチド、ならびにそれらにハイブリダイズするポリヌクレオチド、そしてまた、そのようなハイブリダイズするポリヌクレオチドによりコードされる任意のポリペプチドを含む。
限定的なものではなく一例に過ぎないが、本明細書に開示されている抗体およびその抗原結合性フラグメントは、表面プラズモン共鳴(例えば、BIACORE)または類似技術(例えば、KinExaまたはOCTET)により測定された場合に少なくとも約1×10−9MのKD値(すなわち、1×10−9M以下のKD値)でヒトTIGITに結合しうる。1つの実施形態においては、本明細書に開示されている抗体および抗原結合性フラグメントは、表面プラズモン共鳴(例えば、BIACORE)または類似技術(例えば、KinExaまたはOCTET)により測定された場合に少なくとも約1×10−9M〜約1×10−12MのKD値でヒトTIGITに結合しうる。1つの実施形態においては、本明細書に開示されている抗体および抗原結合性フラグメントは、表面プラズモン共鳴(例えば、BIACORE)または類似技術(例えば、KinExaまたはOCTET)により測定された場合に約1×10−9M〜約1×10−12MのKD値でヒトTIGITに結合しうる。1つの実施形態においては、本明細書に開示されている抗体および抗原結合性フラグメントは、BIACOREまたは類似技術により測定された場合に少なくとも約50pMのKD値(すなわち、約50pM以下のKD値)でヒトTIGITに結合しうる。1つの実施形態においては、本明細書に開示されている抗体および抗原結合性フラグメントは、BIACOREまたは類似技術により測定された場合に少なくとも約10pMのKD値(すなわち、約10pm以下のKD値)でヒトTIGITに結合しうる。1つの実施形態においては、本発明の抗体および抗原結合性フラグメントは、BIACOREまたは類似技術により測定された場合に約50pM〜約1pMのKD値でヒトTIGITに結合しうる。
幾つかの実施形態においては、本発明の抗体または抗原結合性フラグメントは免疫細胞の活性を増強する。免疫細胞の活性の増強は、当技術分野で公知のいずれかの方法を用いて検出されうる。1つの実施形態においては、免疫細胞の活性の増強は、免疫細胞の増殖を測定することにより検出されうる。例えば、T細胞の活性の増強は、シグナル伝達事象、例えば、転写調節因子にシグナルを伝達する免疫受容体もしくは下流キナーゼのチロシンリン酸化、またはT細胞の増殖を測定することにより検出されうる。他の実施形態においては、免疫細胞の活性の増強は、特定の標的細胞に対するCTLもしくはNK細胞の細胞傷害機能、またはIFNγサイトカイン応答(これは抗腫瘍免疫の刺激に関連している)を測定することにより検出されうる。更に他の実施形態においては、免疫細胞の活性の増強は、対象由来のサンプルにおいてエクスビボでT細胞活性化を測定することにより検出されうる。1つの実施形態においては、T細胞活性の増強は、(i)IL−2、TNFα、IL−17、IFNγ、IL−1β、GM−CSF、RANTES、IL−6、IL−8、IL−5およびIL−13からなる群から選択される1以上の炎症性サイトカインのSEB(スタヒロコッカスエンテロトキシンB)誘導性産生を測定し、あるいは(ii)IL−2、TNFα、IL−17、IFNγ、IL−1β、GM−CSF、RANTES、IL−6、IL−8、IL−5およびIL−13からなる群から選択されるサイトカインの産生を誘導するためのT細胞受容体(TCR)シグナリングの直接抗CD3 mAb刺激または混合リンパ球反応を測定することにより決定される。ある実施形態においては、本発明の抗TIGIT抗体またはその抗原結合性フラグメントはIL−2および/またはIFNγの抗原特異的T細胞産生を少なくとも1.5倍刺激する。
幾つかの実施形態においては、本発明の抗TIGIT抗体または抗原結合性フラグメントはヒトCD155およびヒトCD112へのヒトTIGITの結合を遮断しうる。ヒトCD155およびヒトCD112へのヒトTIGITの結合を遮断する能力は、当技術分野で公知のいずれかの方法を用いて測定されうる。1つの実施形態においては、ヒトCD155およびヒトCD112へのヒトTIGITの結合を遮断する能力は、実施例2に記載されているとおり、ELISAアッセイを用いて測定される。
本明細書に記載されている親(例えば、ラットまたはマウス)モノクローナル抗TIGIT抗体またはその抗原結合性フラグメントを産生するハイブリドーマ細胞は当技術分野で一般に公知の方法により製造されうる。そのような単離されたハイブリドーマは本発明の一部である。これらの方法には、Kohlerら(1975)(Nature 256:495−497)により最初に開発されたハイブリドーマ技術およびトリオーマ技術(Heringら(1988)Biomed.Biochim.Acta.47:211−216およびHagiwaraら(1993)Hum.Antibod.Hybridomas 4:15)、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術(Kozborら(1983)Immunology Today 4:72およびCoteら(1983)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 80:2026−2030)、EBV−ハイブリドーマ技術(Coleら,Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,Inc.,pp.77−96,1985)およびサイトパルス大チャンバ細胞融合エレクトロポレーター(Cyto Pulse large chamber cull fusion electroporator)(Cyto Pulse Sciences,Inc.,Glen Burnie,MD)を使用する電場に基づく電気融合が含まれるが、これらに限定されるものではない。好ましくは、マウス脾細胞を単離し、標準的なプロトコールに従い、PEGで又は電気融合によりマウス骨髄腫細胞系と融合させる。ついで、生じたハイブリドーマを抗原特異的抗体の産生に関してスクリーニングすることが可能である。例えば、免疫化マウスからの脾臓リンパ球の単細胞浮遊液を、50% PEGを使用して、P3X63−Ag8.653非分泌マウス骨髄腫細胞(ATCC,CRL 1580)の数の6分の1と融合させることが可能である。細胞を平底マイクロタイタープレート内で約2×105細胞/mLでプレーティングし、ついで、20% 胎児クローン血清、18%「653」馴らし培地、5% オリジン(origen)(IGEN)、4mM L−グルタミン、1mM L−グルタミン、1mM ピルビン酸ナトリウム、5mM HEPES、0.055mM 2−メルカプトエタノール、50単位/ml ペニシリン、50mg/ml ストレプトマイシン、50mg/ml ゲンタマイシンおよび1×HAT(Sigma;該融合の24時間後にHATを加える)を含有する選択培地内で2週間のインキュベーションを行うことが可能である。2週間後、該HATがHTで置換された培地内で細胞を培養することが可能である。ついで個々のウェルを抗TIGITモノクローナルIgG抗体に関してELISAによりスクリーニングすることが可能である。十分なハイブリドーマ増殖が生じたら、培地を通常10〜14日後に観察することが可能である。該抗体分泌ハイブリドーマを再プレーティングし、再びスクリーニングし、ヒトIgGに関して尚も陽性である場合には、抗TIGITモノクローナル抗体を限界希釈により少なくとも2回サブクローニングすることが可能である。ついで、特徴づけのために組織培養培地内で少量の抗体を産生させるために安定サブクローンをインビトロで培養することが可能である。
親(例えば、マウスまたはラット)モノクローナル抗体の可変ドメイン内のフレームワーク残基に対する修飾を含むように、例えば、該抗体またはフラグメントの特性を改善するために、該抗TIGIT抗体およびその抗原結合性タンパク質が、改変(操作)された抗体である実施形態が更に含まれる。典型的には、そのようなフレームワーク修飾は、該抗体またはフラグメントの免疫原性を低下させるために行われる。これは通常、親(例えば、げっ歯類)抗体またはフラグメント(ドナー抗体またはフラグメント)における可変ドメイン内の非CDR残基(すなわち、フレームワーク残基)を、該抗体が使用されることになる種の免疫レパトワからの類似残基、例えば、ヒト用治療剤の場合にはヒト残基(アクセプター抗体)で置換することにより達成される。そのような抗体またはフラグメントは「ヒト化」抗体またはフラグメントと称される。幾つかの場合には、改変(例えば、ヒト化)抗体の特異性を変化させ、またはアフィニティを増強することが望ましい。所望の免疫グロブリン特性は親抗体およびアクセプター抗体からのフレームワーク残基の選択および組合せにより得られうる。1つのアプローチは親抗体における1以上のフレームワーク残基を対応ヒト生殖系列配列へと突然変異させることである。より詳しくは、体細胞突然変異を受けた抗体またはフラグメントは、該抗体が由来する生殖系列配列とは異なるフレームワーク残基を含有しうる。そのような残基は、該抗体またはフラグメントが由来するヒト生殖系列配列と親抗体またはフラグメントのフレームワーク配列を比較すること、および該抗体における1以上のフレームワーク残基を対応ヒト生殖系列配列のものへと突然変異させることにより特定されうる。もう1つのアプローチは、該改変(例えば、ヒト化)抗体の位置の1以上において元の親(例えば、げっ歯類)残基へと復帰突然変異(「逆突然変異(backmutate)」)させること、例えば、フレームワーク残基の置換の過程において喪失した可能性がある結合アフィニティを回復させることである(例えば、米国特許第5,693,762号、米国特許第5,585,089号、米国特許第5,530,101号、WO9222653およびWO9404679を参照されたい)。
本明細書に開示されている抗体(例えば、ヒト化抗体)およびその抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10およびそれらのヒト化形態)はまた、Fc領域内の修飾を含むように、典型的には、該抗体の特性、例えば血清半減期、補体固定、Fc受容体結合および/またはエフェクター機能(例えば、抗原依存性細胞傷害性)の1以上を変化させるために改変(操作)されうる。更に、本明細書に開示されている抗体およびその抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10およびそれらのヒト化形態)は化学的に修飾可能であり(例えば、1以上の化学的部分が該抗体に結合可能である)、あるいは、再び該抗体またはフラグメントの特性の1以上を改変するために、そのグリコシル化を改変するように修飾されうる。これらの実施形態のそれぞれは後記に更に詳細に記載されている。Fc領域内の残基の番号付けはKabatのEUインデックスのものである。
幾つかの実施形態においては、エフェクター機能をもたらす該抗体もしくは抗原結合性フラグメントの能力を増強するために、および/またはFcガンマ受容体(FcγR)へのそれらの結合を増強するために、抗TIGIT抗体のFc領域を修飾する。
更にもう1つの実施形態においては、本発明の抗体または抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10およびそれらのヒト化形態)は特定のグリコシル化パターンを含む。例えば、アフコシル化または非グリコシル化(アグリコシル化)(aglycosylated)抗体またはフラグメント(すなわち、該抗体は、それぞれ、フコースまたはグリコシル化を欠く)が製造されうる。抗体またはフラグメントのグリコシル化パターンは、例えば、TIGIT抗原に対する該抗体またはフラグメントのアフィニティまたはアビディティを増強するために改変されうる。そのような修飾は、例えば、該抗体またはフラグメント配列内のグリコシル化部位の1以上を改変することにより達成されうる。例えば、可変領域フレームワークグリコシル化部位の1以上の除去をもたらし、それによりその部位におけるグリコシル化を排除する1以上のアミノ酸置換が施されうる。そのような非グリコシル化は抗原に対する該抗体またはフラグメントのアフィニティまたはアビディティを増強しうる。例えば、米国特許第5,714,350号および第6,350,861号を参照されたい。
本明細書に開示されている抗体およびその抗原結合性フラグメント(例えば、1414D7、26B10およびそれらのヒト化形態)は更に、軽鎖または重鎖免疫グロブリン可変領域内に1以上のグリコシル化部位を含有しうる。そのようなグリコシル化部位は抗原結合の変化による該抗体のpKの変化または該抗体もしくはフラグメントの免疫原性の増強をもたらしうる(Marshallら(1972)Annu Rev Biochem 41:673−702;GalaおよびMorrison(2004)J Immunol 172:5489−94;Wallickら(1988)J Exp Med 168:1099−109;Spiro(2002)Glycobiology 12:43R−56R;Parekhら(1985)Nature 316:452−7;Mimuraら(2000)Mol Immunol 37:697−706)。グリコシル化は、N−X−S/T配列を含有するモチーフにおいて生じることが公知である。
本明細書に開示されている抗TIGIT抗体およびその抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10およびそれらのヒト化形態)は化学的部分にコンジュゲート化(結合)されることも可能である。該化学的部分は、とりわけ、重合体、放射性核種、細胞毒性因子でありうる。特定の実施形態においては、該化学的部分は、対象の体内の該抗体またはフラグメントの半減期を増加させる重合体である。適当な重合体には、ポリエチレングリコール(PEG)(例えば、2kDa、5kDa、10kDa、12kDa、20kDa、30kDaまたは40kDaの分子量を有するPEG)、デキストランおよびモノメトキシポリエチレングリコール(mPEG)(これらに限定されるものではない)を包含する親水性重合体が含まれるが、これらに限定されるものではない。Leeら(1999)(Bioconj.Chem.10:973−981)はPEGコンジュゲート化一本鎖抗体を開示している。Wenら,(2001)(Bioconj.Chem.12:545−553)は、放射性金属キレーター(ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA))に結合したPEGに対して抗体をコンジュゲート化することを開示している。
更に、本明細書に開示されている単離された抗体またはその抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10およびそれらのヒト化形態)での治療を要する対象(ヒト対象を含む)の治療方法を提供する。本発明の1つの実施形態においては、そのような対象は感染または感染症に罹患している。本発明のもう1つの実施形態においては、そのような対象は癌に罹患している。1つの実施形態においては、該癌は、TIGITを発現する腫瘍浸潤性リンパ球により浸潤する固形腫瘍である。1つの実施形態においては、該癌としては、例えば以下のものが挙げられる:骨肉腫、横紋筋肉腫、神経芽細胞腫、腎臓癌、白血病、腎移行細胞癌、膀胱癌、ウィルムス癌、卵巣癌、膵臓癌、乳癌、前立腺癌、骨癌、肺癌(例えば、非小細胞肺癌)、胃癌、結腸直腸癌、子宮頸癌、滑膜肉腫、頭頸部癌、扁平上皮癌、多発性骨髄腫、腎細胞癌、網膜芽細胞腫、肝芽腫、肝細胞癌、黒色腫、腎臓のラブドイド腫瘍、ユーイング肉腫、軟骨肉腫、脳腫瘍、神経膠芽腫、髄膜腫、下垂体腺腫、前庭神経鞘腫、原始神経外胚葉性腫瘍、髄芽腫、星細胞腫、退形成性星細胞腫、乏突起膠腫、上衣腫、脈絡叢乳頭腫、真性多血症、血小板血症、特発性筋線維症、軟部組織肉腫、甲状腺癌、子宮内膜癌、カルチノイド癌または肝臓癌、乳癌または胃癌。本発明の1つの実施形態においては、該癌は、例えば前記の種々のものの、転移癌である。
本明細書に開示されている抗TIGIT抗体およびその抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10またはそれらのヒト化形態)はアフィニティ精製剤として使用されうる。このプロセスにおいては、当技術分野でよく知られた方法を用いて、該抗TIGIT抗体およびその抗原結合性フラグメントを固相、例えばセファデックス、ガラスもしくはアガロース樹脂または濾紙上に固定化する。該固定化抗体またはフラグメントを、精製すべきTIGITタンパク質(またはその断片)を含有するサンプルと接触させ、ついで、該固定化抗体またはフラグメントに結合したTIGITタンパク質以外のサンプル中の実質的に全ての物質を除去する適当な溶媒で支持体を洗浄する。最後に、該結合TIGIT(例えば、プロテインA)を溶出する溶媒で該支持体を洗浄する。そのような固定化抗体およびフラグメントは本発明の一部を構成する。
(a)抗TIGIT抗体またはその抗原結合性フラグメントで基体(例えば、マイクロタイタープレートウェル、例えばプラスチックプレートの表面)をコーティングすること;
(b)TIGITの存在に関して試験されるべきサンプルを該基体に適用すること;
(c)該プレートを洗浄して、該サンプル中の未結合物質を除去すること;
(d)TIGIT抗原に同様に特異的である検出可能な様態で標識された抗体(例えば、酵素結合抗体)を適用すること;
(e)該基体を洗浄して、未結合標識抗体を除去すること;
(f)標識抗体が酵素結合体である場合には、酵素により蛍光シグナルに変換される化学物質を適用すること;および
(g)標識抗体の存在を検出すること。
本発明の抗TIGIT抗体および抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10およびそれらのヒト化形態)の医薬組成物または無菌組成物を製造するためには、該抗体またはその抗原結合性フラグメントを医薬上許容される担体または賦形剤と混合する。例えば、Remington’s Pharmaceutical SciencesおよびU.S. Pharmacopeia:National Formulary,Mack Publishing Company,Easton,PA(1984)を参照されたい。
更に、本明細書に記載されているもう1つの治療剤および/または医薬上許容される担体(これらに限定されるものではない)を含む1以上の追加的成分と共に、本明細書に開示されている抗TIGIT抗体または抗原結合性フラグメント(例えば、ヒト化14D7またはヒト化26B10)(これらに限定されるものではない)を含む1以上の成分を含むキットを提供する。該抗体もしくはフラグメントおよび/または該治療剤は、純粋な組成物として、または医薬組成物において医薬上許容される担体と組合せて製剤化されうる。
便宜上、本発明の抗TIGIT抗体またはその抗原結合性フラグメント(例えば、14D7、26B10またはそれらのヒト化形態)は、キットとして、すなわち、診断用または検出用アッセイを行うための説明を伴う所定量の試薬のパッケージ化された組合せとして提供されうる。該抗体またはフラグメントが酵素で標識されている場合には、該キットは、該酵素により要求される基質および補因子(例えば、検出可能な発色団または発蛍光団を与える基質前駆体)を含む。また、他の添加物、例えば安定剤、バッファー(例えば、ブロッキングバッファーまたは細胞溶解バッファー)などが含まれうる。種々の試薬の相対量は、アッセイの感度を実質的に最適化する試薬の溶液中濃度をもたらすように大きく変動しうる。特に、該試薬は、適当な濃度を有する試薬溶液を溶解時に与える賦形剤を含む乾燥粉末、通常は凍結乾燥粉末として提供されうる。
分子生物学における標準的な方法は、Sambrook,FritschおよびManiatis(1982 & 1989 2nd Edition,2001 3rd Edition)Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY;SambrookおよびRussell(2001)Molecular Cloning,3rded,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,NY;Wu(1993)Recombinant DNA,Vol.217,Academic Press,San Diego,CA.に記載されている。標準的な方法は、Ausbelら(2001)Current Protocols in Molecular Biology,VoIs.1−4,John Wiley and Sons,Inc.New York,NYにも記載されており、これは、細菌細胞におけるクローニングおよびDNA突然変異誘発(Vol.1)、哺乳類細胞および酵母におけるクローニング(Vol.2)、複合糖質およびタンパク質発現(Vol.3)、ならびにバイオインフォマティクス(Vol.4)を記載している。
マウス抗hTIGIT抗体の作製
ヒトTIGITに対する抗体を作製するために、RIBIアジュバントおよび足蹠注射を隔週のスケジュールで用いて、Balb/CマウスをヒトFcタグ付きヒトTIGIT組換えタンパク質で免疫化した。免疫化動物を採血し、細胞に基づくELISA(後記)を用いてヒトTIGITトランスフェクト化CHOK1細胞への結合に関して血清力価を決定した。最高力価を有する動物に組換えタンパク質で最終ブーストを行い、4日後、流入領域膝窩リンパ節を単離した。Cytopulse Hybrimmune電気融合系を使用して、単離リンパ球を骨髄腫融合相手P3X63−AG8.653と電気融合させることにより、ハイブリドーマを作製した。融合した細胞をDMEM/F12、15% BCS、HAT、IL−6、OPIサプリメントおよびゲンタマイシン中で96ウェルプレートにおいてプレーティングした。
抗hTIGIT抗体の特徴づけ
陽性クローンからの上清を、hTIGIT COK1細胞への組換えヒトCD155−huFcタンパク質の結合を遮断するそれらの能力に関して、細胞ベースELISA法で試験した。ヒトTIGIT−CHO−K1細胞を前記のとおりに96ウェルプレート内でプレーティングした。該プレートから培地を除去し、50μlのハイブリドーマ上清をヒトTIGIT CHO−K1細胞と共に4℃で30分間インキュベートした。50マイクロリットルのヒトCD155−huFcを、ヒトCD155−huFcの最終濃度が0.5μg/mlになるように該プレートに加え、それを4℃で30分間インキュベートした。前記のとおりにアッセイプレートをPBS/0.05% Tween20で3回洗浄した。HRP結合F(ab)’2ヤギ抗ヒトIgG二次抗体(Jackson 109−036−098)をCHO−K1培地内の1:2000希釈で使用して、hTIGIT−CHOK1細胞へのヒトCD155−huFcの結合を検出した。TMBを使用してプレートを現像し、前記のとおりにTMB停止溶液を使用して、それを停止させ、A450〜620nmを測定した。
Biacore T200システム(Biacore,GE Healthcare,Piscataway,NJ)を使用する表面プラズモン共鳴により、抗ヒトTIGIT抗体14D7および26B10(実施例1に記載されているとおりに製造されたもの)ならびに市販抗体MBSA43の動力学的結合活性を測定した。約5000 RUの抗マウスIgG(GE Healthcareカタログ番号BR−1008−38)または約13,000 RUのヤギ抗ラットIgG Fcガンマ、フラグメント特異的(Jackson ImmunoResearchカタログ番号112−006−071)を、アミンカップリング化学法により、シリーズ(Series)S CM5センサーチップ(カタログ番号BR−1005−30)上に固定化した。マウス抗ヒトTIGITクローン14D7、26B10およびMBSA43のそれぞれを40RUの捕捉レベルのための1μg/mLで該固定化抗マウス表面上に注入した。ラット抗ヒトTIGITクローン14A6を40RUの捕捉レベルのための1μg/mLで該固定化抗ラット表面上に注入した。HBS−EP+バッファー(BR−1006−69)を30μL/分の流速でランニングバッファーとして使用した。0.29nM〜40nMの範囲の種々の濃度のヒトTIGIT−Hisタンパク質を45μL/分の流速で抗体表面上に注入した。各マウス抗ヒトTIGIT注入サイクルの後、10μL/分の流速での10mM グリシン(pH1.7)溶液の3分間の1回の注入により、シリーズS CM5チップ表面を再生させた。
遮断性ヒトTIGIT受容体の機能的結果を特徴づけるために本発明者らが開発した1つのアッセイは、ヒトTIGITを過剰発現するように操作されたヒトTリンパ球細胞(クローン,E6−1;ATCC TIB−152)の不死化系であるJurkat細胞(hTIGIT−Jurkat)を使用するものであった。該細胞を、ヒト単球細胞系であるTHP−1細胞と共に、TIGITリガンドCD155およびCD112の1つの存在下または非存在下で共培養した。THP−1細胞と共に共培養されプレート結合抗CD3 mAbで刺激されたhTIGIT−Jurkat細胞はIL−2を産生するが、TIGITリガンド(CD155またはCD112)を該共培養に加えた場合には、IL−2レベルがリガンド依存的に低下した。CD155−またはCD112−TIGIT相互作用を遮断した抗体[例えば、商業的に入手可能なhTIGIT Ab,クローンMBSA43(eBioscience Cat# 12−9500−42;10μg/mL)]での処理は、CD155またはCD112の非存在下で活性化hTIGIT Jurkat細胞をTHP−1と共に培養した場合と同等なレベルまで、IL−2をレスキューする(図3)。
抗体のヒト化
本明細書に記載されている方法を用いて、14D7および26B10マウス抗体をヒト化した。抗体14D7から、ヒト化可変重鎖、すなわち、配列番号9〜12を構築し、ヒト化可変軽鎖、すなわち、配列番号13〜16を構築した。マウス抗体26B10から、ヒト化可変重鎖、すなわち、配列番号25〜28を構築し、ヒト化可変軽鎖、すなわち、配列番号29〜32を構築した。
水素重水素交換質量分析によるヒトTIGIT抗体のエピトープマッピング
抗TIGIT抗体14D7とヒトTIGITとの接触領域を、水素重水素交換質量分析(HDX−MS)分析を用いて決定した。HDX−MSはタンパク質のアミドバックボーン内への水素との重水素の交換を測定する。交換速度に影響を及ぼす要因の1つは溶媒への水素の曝露である。抗体が結合する際の抗原における交換レベルの比較は、抗体が結合するタンパク質の領域を特定しうる。
・ヒトTIGIT−His(配列番号35) − ヒトTIGIT(配列番号33の残基25〜145)およびヒスチジンタグを含む。
質量分析計はThermo Scientific Orbitrap−Eliteであった。重水素標識サンプルの測定のために、120,000の分解能、1E6の標的イオン数、500ミリ秒の最大イオン注入時間および2マイクロスキャンで、オービトラップ(orbitrap)において1つのフルスキャンMSデータを取得するように、質量分析計を設定した。ペプチド同定のためのMS/MSデータの取得のために、120,000の分解能で1つのフルスキャンスペクトルを取得するように、ついでイオントラップにおいて10個のデータ依存性MS/MSスペクトルを取得するように、質量分析計を設定した。
ヒトTIGIT−Hisを抗体14D7と、ヒトTIGIT−hisに関しては30μMおよび14D7に関しては15μMの最終濃度まで混合した。ヒトTIGIT−hisを50mM 酢酸ナトリウム(pH5.5)中でインキュベートすることにより、非結合対照を調製した。該抗体結合サンプルおよび該非結合対照を室温で1時間インキュベートした後、標識実験を開始した。
タンパク質の消化が成功したことを確認するために、そしてペプシン消化からのペプチドの一覧を作製するために、未標識サンプルのLC−MS/MSデータを取得し、データベースを検索した。Proteome Discoverer 1.4およびSEQUEST HT検索アルゴリズム(ThermoFisher Scientific)を使用して、データベース検索を行った。使用したタンパク質データベースは、酵母サッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)ユニプロット(Uniprot)(5/20/13)データベースに連結されたヒトTIGIT−Hisおよび抗ヒトhTIGIT抗体配列であった。
14D7抗体により保護されたヒトTIGITペプチドはヒートマップ(図4)に示されており、配列番号33に示されているヒトTIGITのアミノ酸残基24〜41(SSTTAQVNWEQQDQL,配列番号113)、44〜46(ICN)、85〜93(IYHTYPDGT,配列番号114)および96〜100(GRIFL,配列番号115)に対応する。
Claims (27)
- a.配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2、配列番号3、45、46または47のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3、配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1、配列番号5のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2、および配列番号6、57、58、59、60、61または62のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む抗体または抗原結合性フラグメント;ならびに
b.配列番号17のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1、配列番号18、81、82、83、84、85、86、87または88のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2、配列番号19のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3、配列番号20のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1、配列番号21のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2、および配列番号22のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む抗体または抗原結合性フラグメント
からなる群から選択される、ヒトTIGITに結合する抗体またはその抗原結合性フラグメント。 - 該抗体が、配列番号1のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2、配列番号3、45、46または47のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3、配列番号4のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1、配列番号5のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2、および配列番号6、57、58、59、60、61または62のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む、請求項1記載の抗体または抗原結合性フラグメント。
- 該抗体が、配列番号17のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR1、配列番号18、81、82、83、84、85、86、87または88のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR2、配列番号19のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域CDR3、配列番号20のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR1、配列番号21のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR2、および配列番号22のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域CDR3を含む、請求項1記載の抗体または抗原結合性フラグメント。
- a.配列番号7のアミノ酸配列を含む可変重鎖および/または配列番号8のアミノ酸配列を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
b.配列番号9のアミノ酸配列を含む可変重鎖および/または配列番号13のアミノ酸配列を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
c.配列番号23のアミノ酸配列を含む可変重鎖および/または配列番号24のアミノ酸配列を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
d.配列番号25のアミノ酸配列を含む可変重鎖および/または配列番号29のアミノ酸配列を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
e.配列番号10、11、12、48、49、50、51、52、53、54、55もしくは56からなる群から選択される可変重鎖および/または配列番号14、15、16、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79もしくは80のいずれか1つからなる群から選択される可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
f.配列番号26、27、28、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111および112からなる群から選択される可変重鎖ならびに/または配列番号30、31および32のいずれか1つからなる群から選択される可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
g.配列番号10、11、12、48、49、50、51、52、53、54、55もしくは56のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変重鎖および/または配列番号14、15、16、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79もしくは80のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
h.配列番号26、27、28、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111もしくは112のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変重鎖および/または配列番号30、31もしくは32のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメント;
i.配列番号10、11、12、48、49、50、51、52、53、54、55もしくは56のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変重鎖および/または配列番号14、15、16、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79もしくは80のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメントであって、該抗体のフレームワーク領域内にいずれかの配列変異が存在する抗体またはその抗原結合性フラグメント;ならびに
j.配列番号26、27、28、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111もしくは112のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変重鎖および/または配列番号30、32もしくは32のいずれか1つに対して少なくとも90%、95%、96%、97%、98%もしくは99%の同一性を含む可変軽鎖を含む抗体またはその抗原結合性フラグメントであって、該抗体のフレームワーク領域内にいずれかの配列変異が存在する抗体またはその抗原結合性フラグメント
からなる群から選択される軽鎖免疫グロブリン、重鎖免疫グロブリンまたは軽鎖免疫グロブリンと重鎖免疫グロブリンとの両方を含む、ヒトTIGITに結合する抗体またはその抗原結合性フラグメント。 - 該抗体が、表面プラズモン共鳴(例えば、BIACORE)または類似技術(例えば、KinExaまたはOCTET)により測定された場合に約1×10−9M〜約1×10−12MのKD値でヒトTIGITに結合する、請求項1〜5のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメント。
- 2本の重鎖と2本の軽鎖とを含むヒト化抗体である、請求項1〜5のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメント。
- ヒトIgG1定常ドメインとヒトカッパ定常ドメインとを含むヒト化抗体である、請求項1〜6のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメント。
- CHO細胞において産生される抗体である、請求項1〜7のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメント。
- 配列番号7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、48、49、50、51、52、53、54、55、56、63、54、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、106、107、108、109、110、111または112のいずれか1つのアミノ酸配列を含む単離されたポリペプチド。
- 請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体もしくは抗原結合性フラグメントのいずれか1つ又は請求項9記載のポリペプチドのいずれか1つをコードする単離された核酸。
- 請求項10記載の単離された核酸を含む発現ベクター。
- 請求項1〜11のいずれか1項記載の抗体、結合性フラグメント、ポリペプチド、ポリヌクレオチドまたは発現ベクターを含む宿主細胞。
- ピチア(Pichia)細胞またはチャイニーズハムスター卵巣細胞である、請求項12記載の宿主細胞。
- 請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントと医薬上許容される担体または希釈剤とを含む組成物。
- a.抗PD1抗体またはその抗原結合性フラグメント、
b.抗LAG3抗体またはその抗原結合性フラグメント、
c.抗VISTA抗体またはその抗原結合性フラグメント、
d.抗BTLA抗体またはその抗原結合性フラグメント、
e.抗TIM3抗体またはその抗原結合性フラグメント、
f.抗CTLA4抗体またはその抗原結合性フラグメント、
g.抗HVEM抗体またはその抗原結合性フラグメント、
h.抗CD27抗体またはその抗原結合性フラグメント、
i.抗CD137抗体またはその抗原結合性フラグメント、
j.抗OX40抗体またはその抗原結合性フラグメント、
k.抗CD28抗体またはその抗原結合性フラグメント、
l.抗PDL1抗体またはその抗原結合性フラグメント、
m.抗PDL2抗体またはその抗原結合性フラグメント、
n.抗GITR抗体またはその抗原結合性フラグメント、
o.抗ICOS抗体またはその抗原結合性フラグメント、
p.抗SIRPα抗体またはその抗原結合性フラグメント、
q.抗ILT2抗体またはその抗原結合性フラグメント、
r.抗ILT3抗体またはその抗原結合性フラグメント、
s.抗ILT4抗体またはその抗原結合性フラグメント、および
t.抗ILT5抗体またはその抗原結合性フラグメント
からなる群から選択される物質を更に含む、請求項14記載の組成物。 - 該抗PD1抗体またはその抗原結合性フラグメントが、ペンブロリズマブまたはその抗原結合性フラグメントおよびニボルマブまたはその抗原結合性フラグメントからなる群から選択される、請求項15記載の組成物。
- a.請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントのいずれか1つの重鎖および/または軽鎖をコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞を、該ポリヌクレオチドの発現に好ましい条件下で培養し、
b.所望により、該抗体または抗原結合性フラグメントを該宿主細胞および/または培地から回収することを含む、抗体または抗原結合性フラグメントの製造方法。 - 請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントの有効量を、所望によりもう1つの治療剤または治療手技と組合せて対象に投与することを含む、ヒト対象における癌の治療方法。
- 請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントの有効量を、所望によりもう1つの治療剤または治療手技と組合せて対象に投与することを含む、ヒト対象における感染または感染症の治療方法。
- 請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントと抗原とを含むワクチン。
- サンプルにおけるTIGITペプチドまたはその断片の存在を検出するための方法であって、該方法が、サンプルを請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体またはフラグメントと接触させ、該抗体またはフラグメントと該ペプチドとの複合体の存在を検出することを含み、該複合体の検出がTIGITペプチドの存在を示す、方法。
- 免疫細胞を請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントのいずれか1つと接触させることを含む、免疫細胞の活性を増強する方法。
- 請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントの有効量を、免疫細胞の活性の増強を要する対象に投与することを含む、免疫細胞の活性を増強する方法。
- 該方法が、
a.癌の治療のために、
b.感染もしくは感染症の治療のために、または
c.ワクチンアジュバントとして使用される、請求項23記載の方法。 - a.免疫細胞活性化を増強する、
b.癌を治療する、または
c.感染もしくは感染症を治療するための医薬の製造における使用のための、請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメント。 - 免疫細胞活性化の増強、癌の治療、または感染もしくは感染症の治療のための癌治療用医薬の製造用の請求項1〜8のいずれか1項記載の抗体または抗原結合性フラグメントの使用。
- アミノ酸SSTTAQVNWEQQDQL(配列番号113)、ICN、IYHTYPGT(配列番号114)およびGRIFL(配列番号115)を含む、ヒトTIGIT上のエピトープに結合する抗体または抗原結合性フラグメント。
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