JP2018523227A - 実験室の実験の管理、実行および分析のためのシステムおよび方法 - Google Patents
実験室の実験の管理、実行および分析のためのシステムおよび方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2018523227A JP2018523227A JP2017568418A JP2017568418A JP2018523227A JP 2018523227 A JP2018523227 A JP 2018523227A JP 2017568418 A JP2017568418 A JP 2017568418A JP 2017568418 A JP2017568418 A JP 2017568418A JP 2018523227 A JP2018523227 A JP 2018523227A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- experiment
- user
- experimental
- data
- parameters
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 83
- 238000009533 lab test Methods 0.000 title claims abstract description 13
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 title claims description 63
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 claims abstract description 459
- 238000013515 script Methods 0.000 claims description 47
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 claims description 40
- 230000006870 function Effects 0.000 claims description 36
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 27
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 26
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 25
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 25
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 25
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 25
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims description 24
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 claims description 21
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 21
- 238000011161 development Methods 0.000 claims description 19
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims description 18
- 238000005481 NMR spectroscopy Methods 0.000 claims description 17
- 238000011160 research Methods 0.000 claims description 17
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 16
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 16
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 15
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 claims description 14
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 14
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 claims description 12
- 239000012071 phase Substances 0.000 claims description 12
- 238000001262 western blot Methods 0.000 claims description 11
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims description 10
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 9
- 238000000386 microscopy Methods 0.000 claims description 9
- 238000001668 nucleic acid synthesis Methods 0.000 claims description 9
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 claims description 9
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 8
- 238000002983 circular dichroism Methods 0.000 claims description 8
- 238000009295 crossflow filtration Methods 0.000 claims description 8
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 claims description 8
- 238000002296 dynamic light scattering Methods 0.000 claims description 8
- 238000000132 electrospray ionisation Methods 0.000 claims description 8
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 claims description 8
- 238000001095 inductively coupled plasma mass spectrometry Methods 0.000 claims description 8
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 claims description 8
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 8
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 claims description 8
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 claims description 8
- 238000004885 tandem mass spectrometry Methods 0.000 claims description 8
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 8
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 claims description 7
- 239000007788 liquid Substances 0.000 claims description 7
- 238000000816 matrix-assisted laser desorption--ionisation Methods 0.000 claims description 7
- 238000001243 protein synthesis Methods 0.000 claims description 7
- 230000014616 translation Effects 0.000 claims description 7
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 claims description 6
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 claims description 6
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 claims description 6
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 claims description 5
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 5
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 5
- 238000003818 flash chromatography Methods 0.000 claims description 5
- 238000004817 gas chromatography Methods 0.000 claims description 5
- 238000002290 gas chromatography-mass spectrometry Methods 0.000 claims description 5
- 238000011068 loading method Methods 0.000 claims description 5
- 238000002844 melting Methods 0.000 claims description 5
- 230000008018 melting Effects 0.000 claims description 5
- 238000010208 microarray analysis Methods 0.000 claims description 5
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 claims description 5
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 5
- 238000004808 supercritical fluid chromatography Methods 0.000 claims description 5
- 238000012546 transfer Methods 0.000 claims description 5
- 238000000870 ultraviolet spectroscopy Methods 0.000 claims description 5
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 claims description 4
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 241000255581 Drosophila <fruit fly, genus> Species 0.000 claims description 4
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 claims description 4
- 230000006819 RNA synthesis Effects 0.000 claims description 4
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 4
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 claims description 4
- 238000001479 atomic absorption spectroscopy Methods 0.000 claims description 4
- 238000001636 atomic emission spectroscopy Methods 0.000 claims description 4
- 238000004630 atomic force microscopy Methods 0.000 claims description 4
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 4
- 238000011095 buffer preparation Methods 0.000 claims description 4
- 238000005251 capillar electrophoresis Methods 0.000 claims description 4
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 claims description 4
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 4
- 238000004624 confocal microscopy Methods 0.000 claims description 4
- 238000004825 constant-volume calorimetry Methods 0.000 claims description 4
- 238000010276 construction Methods 0.000 claims description 4
- 239000013078 crystal Substances 0.000 claims description 4
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 claims description 4
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 claims description 4
- 238000001493 electron microscopy Methods 0.000 claims description 4
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 claims description 4
- 238000001317 epifluorescence microscopy Methods 0.000 claims description 4
- 238000005111 flow chemistry technique Methods 0.000 claims description 4
- 238000002875 fluorescence polarization Methods 0.000 claims description 4
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 claims description 4
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 claims description 4
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 claims description 4
- 238000001114 immunoprecipitation Methods 0.000 claims description 4
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 claims description 4
- 238000004895 liquid chromatography mass spectrometry Methods 0.000 claims description 4
- 238000000622 liquid--liquid extraction Methods 0.000 claims description 4
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 claims description 4
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 claims description 4
- 238000002414 normal-phase solid-phase extraction Methods 0.000 claims description 4
- 238000000399 optical microscopy Methods 0.000 claims description 4
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 claims description 4
- 238000000751 protein extraction Methods 0.000 claims description 4
- 238000002390 rotary evaporation Methods 0.000 claims description 4
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 claims description 4
- 238000004448 titration Methods 0.000 claims description 4
- 238000005199 ultracentrifugation Methods 0.000 claims description 4
- 238000003828 vacuum filtration Methods 0.000 claims description 4
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 claims description 4
- 238000000113 differential scanning calorimetry Methods 0.000 claims description 3
- 239000003547 immunosorbent Substances 0.000 claims description 3
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims description 3
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 3
- 230000005641 tunneling Effects 0.000 claims description 3
- 238000013461 design Methods 0.000 abstract description 17
- 230000010354 integration Effects 0.000 abstract description 10
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 164
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 27
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 26
- 230000008569 process Effects 0.000 description 24
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 18
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 16
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 15
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 13
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 12
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 9
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 7
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 7
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 7
- 239000000463 material Substances 0.000 description 7
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 7
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 7
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 6
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 5
- 230000008859 change Effects 0.000 description 5
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 5
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 5
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 5
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 5
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 5
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 4
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 4
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 4
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 4
- 238000007726 management method Methods 0.000 description 4
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 4
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 4
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 235000000177 Indigofera tinctoria Nutrition 0.000 description 3
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 3
- 238000013079 data visualisation Methods 0.000 description 3
- 229940097275 indigo Drugs 0.000 description 3
- COHYTHOBJLSHDF-UHFFFAOYSA-N indigo powder Natural products N1C2=CC=CC=C2C(=O)C1=C1C(=O)C2=CC=CC=C2N1 COHYTHOBJLSHDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 3
- 238000006257 total synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- 108010026552 Proteome Proteins 0.000 description 2
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 2
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 150000005829 chemical entities Chemical class 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 238000013075 data extraction Methods 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 2
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 238000013401 experimental design Methods 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 238000013383 initial experiment Methods 0.000 description 2
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 2
- 239000000543 intermediate Substances 0.000 description 2
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 150000002978 peroxides Chemical class 0.000 description 2
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 2
- 238000000275 quality assurance Methods 0.000 description 2
- 230000004044 response Effects 0.000 description 2
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 239000012899 standard injection Substances 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 2
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 2
- WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N tungsten Chemical compound [W] WFKWXMTUELFFGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 2
- 238000007794 visualization technique Methods 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 1
- 101100412970 Escherichia coli (strain K12) rimL gene Proteins 0.000 description 1
- 241001646716 Escherichia coli K-12 Species 0.000 description 1
- 108010074124 Escherichia coli Proteins Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 238000004566 IR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000012404 In vitro experiment Methods 0.000 description 1
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000004378 air conditioning Methods 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 1
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 1
- 238000007707 calorimetry Methods 0.000 description 1
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 1
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000013480 data collection Methods 0.000 description 1
- 238000013479 data entry Methods 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- -1 eg type Substances 0.000 description 1
- 230000005611 electricity Effects 0.000 description 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 1
- 238000009434 installation Methods 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 239000006101 laboratory sample Substances 0.000 description 1
- 150000002605 large molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 238000001819 mass spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 1
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 1
- 238000001823 molecular biology technique Methods 0.000 description 1
- 238000001821 nucleic acid purification Methods 0.000 description 1
- 238000001921 nucleic acid quantification Methods 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 230000008520 organization Effects 0.000 description 1
- 238000010979 pH adjustment Methods 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 230000037081 physical activity Effects 0.000 description 1
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 238000012827 research and development Methods 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 101150006434 rimI gene Proteins 0.000 description 1
- 101150065135 rimJ gene Proteins 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 239000011343 solid material Substances 0.000 description 1
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000003696 structure analysis method Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 230000026676 system process Effects 0.000 description 1
- 230000036962 time dependent Effects 0.000 description 1
- 238000012549 training Methods 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000013024 troubleshooting Methods 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 238000009423 ventilation Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B5/00—ICT specially adapted for modelling or simulations in systems biology, e.g. gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06Q—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES; SYSTEMS OR METHODS SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL OR SUPERVISORY PURPOSES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
- G06Q10/00—Administration; Management
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B45/00—ICT specially adapted for bioinformatics-related data visualisation, e.g. displaying of maps or networks
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
- G16B50/30—Data warehousing; Computing architectures
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
- G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
- G16C20/80—Data visualisation
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16C—COMPUTATIONAL CHEMISTRY; CHEMOINFORMATICS; COMPUTATIONAL MATERIALS SCIENCE
- G16C20/00—Chemoinformatics, i.e. ICT specially adapted for the handling of physicochemical or structural data of chemical particles, elements, compounds or mixtures
- G16C20/90—Programming languages; Computing architectures; Database systems; Data warehousing
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H10/00—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
- G16H10/40—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H40/00—ICT specially adapted for the management or administration of healthcare resources or facilities; ICT specially adapted for the management or operation of medical equipment or devices
- G16H40/40—ICT specially adapted for the management or administration of healthcare resources or facilities; ICT specially adapted for the management or operation of medical equipment or devices for the management of medical equipment or devices, e.g. scheduling maintenance or upgrades
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H40/00—ICT specially adapted for the management or administration of healthcare resources or facilities; ICT specially adapted for the management or operation of medical equipment or devices
- G16H40/60—ICT specially adapted for the management or administration of healthcare resources or facilities; ICT specially adapted for the management or operation of medical equipment or devices for the operation of medical equipment or devices
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H50/00—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics
- G16H50/50—ICT specially adapted for medical diagnosis, medical simulation or medical data mining; ICT specially adapted for detecting, monitoring or modelling epidemics or pandemics for simulation or modelling of medical disorders
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
- Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Business, Economics & Management (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- General Business, Economics & Management (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Computing Systems (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Entrepreneurship & Innovation (AREA)
- Human Resources & Organizations (AREA)
- Marketing (AREA)
- Operations Research (AREA)
- Quality & Reliability (AREA)
- Strategic Management (AREA)
- Economics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Software Systems (AREA)
- Tourism & Hospitality (AREA)
- Physiology (AREA)
- Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
Description
本出願は、共に2015年6月30日に提出された、米国仮特許出願第62/186,928号および第62/186,936号の、米国特許法第119セクション(e)に基づく利益を主張し、それらのそれぞれの内容は、それの全体で参照によって本明細書に組み込まれる。
[実験の設計および管理のためのユーザインタフェース]
[実験の形式]
[スクリプトの変換および表示]
info[]−データオブジェクトに関するinfoの呼び出し、例えば、info[data[44,NMR]]は、データベースに接続して、その後、その実験に関連づけられたすべてのデータのリストを戻す。いくつかの実施形態において、info[]へのさらなる呼び出しが、データベースに接続するのではなく、(より速い実行時間のために)ローカルにキャッシュされたコピーを自動的に参照するように、infoは、ローカルにそのデータをキャッシュすべく構成される。
inform[]−置換規則の形態で実験に関連づけられたすべてのデータのリスト上でのinformの呼び出しは、そのデータが既にデータベースに挿入されているかどうか参照するためにチェックを行い、そうである場合、以前に挿入されたdata[]オブジェクトを戻し、そうでない場合、そのデータをデータベースに挿入し、そのオブジェクトへの新たなdata[]ポインタを戻すであろう。
オブジェクトは物理的サンプルを表す。sample["サンプル名",<type>]、例えばsample["Nearest Neighbor Strand 4(直近ストランド4)","DNA"]は、それの作成に関わる材料、日付、および関わる生成実験からの実験結果、それの体積、pH、濃度などのサンプルの属性、ならびに、それの実験室における物理的位置(どこに格納されているか)などの、そのサンプルを含む情報をカプセル化する。
group["グループ名"]、例えば、group["Nearest Neighbor Strands(直近ストランド)"]は、実験者が大量に操作することを望む、収集されたサンプルを指す。グループは、任意のサイズの収集されたサンプルを指し得、サンプルは複数のグループの部材であり得る。
[サンプル選択]
[実験パラメータ調整]
[パラメータ解決]
ExperimentHPLC["Sample 1"]
以下の、かなり手に負えない威圧的なものではない。
ExperimentHPLC["Sample 1", Inform→User Value, Accept→User Value, Options→User Value, Scale→User Value, CollectFractions→User Value, InjectionVolume→User Value, FlushFrequency→User Value,StandardAfterFlush→User Value,InjectionAmount→User Value,Column→User Value,Instrument→User Value,Type→User Value,BufferA→User Value,BufferB→User Value,BufferC→User Value,BatchStandardInjectionVolume→User Value,BatchStandardSample→User Value,BatchStandardMethod→User Value,FlushMethod→User Value,ShutdownMethod→User Value,GradientStandard→User Value,GradientStandardInjectionVolume→User Value,Temperature→User Value,FlowRate→User Value,DetectionWavelength→User Value,GradientB→User Value,GradientC→User Value,GradientStart→User Value,GradientEnd→User Value,GradientDuration→User Value,EquilibrationTime→User Value,FlushTime→User Value,GradientMethod→User Value,FractionCollectionStartTime→User Value,FractionCollectionEndTime→User Value,FractionCollectionMode→User Value,MaxFractionVolume→User Value,AbsoluteThreshold→User Value,PeakSlope→User Value,PeakSlopeDuration→User Value,MaxCollectionPeriod→User Value,PeakEndThreshold→User Value,およびFractionCollectionMethod→User Value]
ここで、「User Value」は、ユーザが所望のパラメータ値を指定しているであろうことを意味している。重要なことは、パラメータがシステムによって決定されたかユーザによって決定されたかに関係なく、すべてのパラメータ値は将来の参照のために保存されることである。人は保存されたパラメータ値を単にコピーするだけでよいので、このことは、今後にユーザが正確に同じ実験を再び実行することが容易であることを意味する。これは、システムによって自動的に、またはユーザによって手動で成され得る。コンパクトだが、さらに計算的に完全なスクリプトを容易に読むために、実験のすべてのパラメータを柔軟に指定できることは、当技術分野における強力な進歩を表す。
[サンプルの受け取りおよびロード]
[化合物実験]
段階I:
1)ExperimentDNASynthesis⇒DNAサンプルを生成する
2)ExperimentHPLC(イオン交換)⇒(1)で生成されたサンプルを精製する
3)AnalyzePeaks⇒(2)で生成されたピークを分析し、それらのピークに基づいてフラクションサンプルを選択する
段階II:
今、(3)で選択されたフラクションサンプルを取得し、以下の4つの実験を並行して、または、ユーザが所望する任意の順序で実行する。さらなる分析のための各生成データは:
4)ExperimentHPLC(分析)
5)ExperimentPAGE
6)ExperimentMassSpectrometry
7)ExperimentAbsorbanceQuantification
段階III:
必要に応じて、任意の順序で任意の1または複数分析を実行する。
8)AnalyzePeaks
9)PlotPAGE
10)PlotMassSpectrometry
11)AnalyzeAbsorbanceQuantification
12)ExperimentAbsorbanceThermodynamics
13)ExperimentFluorescenceKinetics
14)ExperimentTransfection
Strains(歪み)
baseLine=model(モデル)["BW25113",Cells(細胞)];
rimLLine=model["BW25113ΔrimL",Cells];
rimJLine=model["BW25113ΔrimJ",Cells];
rimILine=model["BW25113ΔrimI",Cells];
altCellLines={model["MG1655",Cells],model["NCM3722",Cells]};
Primers(プライマー)
rimLFowardPrimer=model["rimLFoward",Oligomer(オリゴマー)];
rimLReversePrimer=model["rimLReverse",Oligomer];
rimLBeacon=model["rimLBeacon",Oligomer];
rimJFowardPrimer=model["rimJFoward",Oligomer];
rimJReversePrimer=model["rimJReverse",Oligomer];
rimJBeacon=model["rimJBeacon",Oligomer];
rimIFowardPrimer=model["rimIFoward",Oligomer];
rimIReversePrimer=model["rimIReverse",Oligomer];
rimIBeacon=model["rimIBeacon",Oligomer];
[実験]
ExperimentcDNAPrep[{rimLLine,rimJPrimerSet,rimIPrimerSet},PBSSample→model["PBS",StockSolution],LysisSolutionSample→model["ABIcDNAPrepLysis",Chemical(化学)],MediaVolume→150 MicroLiter(マイクロリットル),WashVolume→100 MicroLiter,AnnealingTemperature→45 Celsius(℃)]
protocol(プロトコル)[123123,cDNAPrep]
lysisSamples=SamplesOut/. Info[cellPrep]
{sample[12451,Lysate(ライセート)],sample[12452,Lysate],sample[12453,Lysate]}
ExperimentqPCR[lysisSamples,FowardPrimers→{rimLFowardPrimer,rimJFowardPrimer,rimIFowardPrimer},ReversePrimers→{rimLReversePrimer,rimJReversePrimer,rimIReversePrimer},Beacons→{rimLBeacon,rimJBeacon,rimIBeacon},TemplateVolume→2 MicroLiter、ForwardConcentration→0.5 Micro Molar(マイクロモル),ReverseConcentration→0.5 Micro Molar,BeaconConcentration→250 Nano Molar(ナノモル),DenaturationTemperature→95 Celsius,DenaturationTime→15 Second(秒),AnnealingTemperature→60 Celsius,AnnealingTime→30 Second,NumberOfCycles→50]
protocol[123141,qPCR]
qPCRData=Data/.Info[protocol[123141,qPCR]]]
{data[124584,qPCR],data[124608,qPCR],data[124602,qPCR]}
PlotObject[qPCRData].
このコマンドによって生成される例となるプロットは、図12Dに示される。
[実験プロトコルの生成]
[実験の実行]
[データ統合モジュール]
− Operator(操作者):実験の操作者
− Instrument(機器):実験が実行される機器
− Samples In(サンプル):実験に用いられるサンプル
− Data(データ):実験から生成されるデータ
− Environmental(環境):測定された環境データ、例えば、実験室の温度、空気圧、および湿度を示す環境記録の識別子
− Date(日付):実験の日時
− このタイプの実験に特有の他の情報、例えば、流量および流路
− Experiment(実験):データが生成された実験
− Figures(図):実験中の機器から、またはデータから生成された図
− Analysis(分析):データに関して利用可能な分析
− Date(日付):実験の日時
− このタイプのデータに特有の他の情報、例えば、ゲーティング、クラスタリング
− Source Data(ソースデータ):分析の生成のときに用いられるデータ
− Processed Data(処理データ):分析の目的に関して処理されたデータ
− Figures(図):分析から生成される図
− Date(日付):分析の日時
− 分析に特有の他の情報、例えば、分析の技術的詳細(例えば、クラスタリング分析、クラスタリングのためのK平均法、および類似性測定のためのユークリッド距離)
− Supplier(供給業者):サンプルを提供した人または企業
− Experiment(実験):サンプルに実行される実験
− Source Experiment(ソース実験):サンプルが生成された実験
− Container/Location(コンテナ/位置):サンプルが格納されるコンテナおよび/または位置の識別子
− Model(モデル):サンプルおよび関連する分野、パラメータなどのエンティティタイプ(例えば、化学構造、タンパク質配列、細胞型)
− Control(対照):好適な対照サンプルの識別子
− Date(日付):サンプルが生成された、または受け取られた日時
− サンプルに特有の他の情報、例えば、タイプ、溶媒、濃度
− Model(モデル)(列1003参照):機器製造業者のモデル番号(列1004参照)(モデルオブジェクトまたはSLLの一般的なモデル概念と混同しないように)
− Experiment(実験):機器で実行された実験の一覧
− Maintenance(整備):機器に関して実行された整備の一覧
− Controls(対照):機器で実行された対照実験/サンプル
− Data(データ):機器で実行された実験から生成されたデータセット
− Date of Installation(取り付けの日付):機器取り付けの日時
− Visualization(可視化):機器の画像
− Manual(マニュアル):マニュアル文書
− 機器に特有の他の情報、例えば、シリアル番号、ソフトウェア
− Sample(サンプル):対照実験の実行のために用いられるサンプル
− Instrument(機器):対照実験が実行された機器
− Result(結果):対照実験が成功したか失敗したかを示す
− Data(データ):対照実験から生成されたデータ
− Expected Values(期待値):結果における特定のデータ点に関する、期待される値または値の範囲
− Visualization(可視化):データからのデータ可視化
− Date(日付):対照実験が実行された日時
− 対照実験に特有の他の情報、例えば、対照のタイプ
− Sample(サンプル):ユーザまたはユーザ群によって提供される、またはそれのために生成されるサンプルの一覧
− Experiments(実験):ユーザまたはユーザ群によって設計される、またはそれのために実行される実験の一覧
− Data(データ):列挙された実験から生成されるデータ
− User(ユーザ):ユーザまたはユーザ群(例えば、企業)
− 在庫に特有の他の情報、例えば、最後の編集時刻
[データ調査および可視化]
(項目1)
メモリと、プロセッサと、1または複数の機器と、
(a)複数の実験モジュールを有するソフトウェアベースの開発環境であって、上記複数の実験モジュールのそれぞれが、1または複数のパラメータと、各パラメータに関する1または複数の基準とを含み、かつ、上記1または複数のパラメータによって実験技法を実行するための複数の命令を生成する、ソフトウェアベースの開発環境と、
(b)ユーザから、2またはより多くの実験を実行するためのコマンドを受信するユーザインタフェースモジュールであって、各コマンドは、上記実験技法のうち1つに関する1または複数のパラメータに関する入力値を含む、ユーザインタフェースモジュールと、
(c)(i)入力値が受信される各パラメータに関して、上記各パラメータに関する上記1または複数の基準のうち少なくとも1つに基づいて、上記入力値が有効かどうか決定する段階、
(ii)入力値が受信されないが計算が可能である各パラメータに関して、上記各パラメータに関する上記1または複数の基準のうち少なくとも1つに基づいて、値を計算する段階、および、
(iii)段階(i)および(ii)の後に、少なくとも1つのパラメータが入力値を欠く場合には、警告を生成する段階
によって、各受信されたコマンドを解決するパラメータ解決モジュールと、
(d)各受信されたコマンドの解決が、1または複数の状態に合致するかどうかに基づいてコマンドを実行する実行モジュールと
を備える、科学的実験を開発するためのシステム。
(項目2)
実験技法が、化学天秤読み取り値、アポトーシス分析、オートクレーブ、バッファ調合、遠心分離、DNA/RNA合成、落射蛍光顕微鏡検査、高速タンパク質液体クロマトグラフィー(FPLC)、フラッシュクロマトグラフィー、フローサイトメトリー、蛍光動力学、蛍光偏光、蛍光分光法、蛍光熱力学、ゲノムDNA調合、HPLC(イオン交換)、HPLC(逆相)、光学顕微鏡検査、液体取扱い、凍結乾燥、MALDI質量分析、哺乳類細胞培養、pH読み取り、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、タンパク質抽出、定量的リアルタイムPCR(qPCR)、RNA抽出/cDNA調合、回転蒸発、固相抽出、スピードバック濃縮、温度計読み取り、薄層クロマトグラフィー(TLC)、全タンパク質量、遺伝子導入、UV/Vis速動性、UV/Vis分光法、UV/Vis熱力学、真空濾過、ウイルス調合、体積チェック、ウエスタンブロット、アガロースゲル電気泳動、シロイヌナズナ研究、原子吸光分光法、原子発光分光法、原子間力顕微鏡検査、細菌性細胞培養、生物反応槽、ボム熱量測定法、C.エレガンス研究、キャピラリー電気泳動、円偏光二色性(CD)、コロニーピッキング、共焦点顕微鏡検査、交差流濾過法(TFF)、結晶化、透析(平衡)、透析(調合)、示差走査熱量測定(DSC)、デジタルドロップレットPCR、DNA配列(次世代)、DNA配列(サンガー)、ショウジョウバエ研究、動的光散乱(DLS)、電子顕微鏡検査、電気穿孔、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、フローケミストリー、蛍光活性化細胞選別(FACS)、蛍光原位置ハイブリッド形成(FISH)、ガスクロマトグラフィー、ガスクロマトグラフィー質量分析(GC−MS)、HPLC(順相)、HPLC(調合)、免疫沈降、誘導的結合プラズマ質量分析(ICP−MS)、赤外線分光法、等温滴定熱量計(ITC)、液体クロマトグラフィー質量分析(LC−MS)、液−液抽出、溶融点決定、マイクロアレイ分析、マイクロ波反応、分子クローニング、NMR(2D/構造的)、NMR(炭素)、NMR(プロトン)、有機合成(ミリグラムからグラムスケール)、パッチクランプ記録、ペプチド合成、光刺激発光(PSL)、プラスミド構築、屈折率測定法、スキャントンネリング顕微鏡検査、溶解度試験、音波処理、超臨界流体クロマトグラフィー(SFC)、表面プラズモン共鳴(SPR)、タンデム質量分析(MS−MS)、組織均質化、全内部反射蛍光(TIRF)顕微鏡検査、超遠心分離法、X線結晶構造解析法、および酵母細胞培養からなるグループから選択された少なくとも2つを含む、項目1に記載のシステム。
(項目3)
上記1または複数の状態のうち上記1つは、警告が一切生成されないことである、項目1または2に記載のシステム。
(項目4)
上記1または複数の状態のうち上記1つは、非クリティカルな警告のみが生成されることである、項目1または2に記載のシステム。
(項目5)
上記実行モジュールはさらに、上記受信されたコマンドを送り返すオブジェクトを生成する、項目1から4のいずれか一項に記載のシステム。
(項目6)
上記実行モジュールはさらに、上記受信されたコマンドによって指定された上記実験技法を実行すべく、生成された上記オブジェクトを物理的な実験室で利用する、項目5に記載のシステム。
(項目7)
上記受信されたコマンドの上記実行によって生成されるデータを受信するためのモジュールをさらに含む、項目1から6のいずれか一項に記載のシステム。
(項目8)
上記ソフトウェアベースの開発環境において、受信された上記データの一部を表示するためのモジュールをさらに含む、項目7に記載のシステム。
(項目9)
上記ソフトウェアベースの開発環境において、受信された上記データの一部を分析するためのモジュールをさらに含む、項目7または8に記載のシステム。
(項目10)
上記受信されたデータの上記分析に基づいてグラフィック要素を生成するモジュールをさらに含む、項目9に記載のシステム。
(項目11)
上記データの受信後に上記ユーザから1または複数の追加の実行可能コマンドを受信するためのモジュールをさらに含む、項目7から10のいずれか一項に記載のシステム。
(項目12)
上記ソフトウェアベースの開発環境は、実行可能コマンドを選択するためのグラフィック要素を含む、項目1から11のいずれか一項に記載のシステム。
(項目13)
上記ソフトウェアベースの開発環境は、受信されたデータをグラフィック的に表示するための機能を含む、項目1から12のいずれか一項に記載のシステム。
(項目14)
複数の実験タイプを列挙するインタフェースをユーザに示す段階であって、上記複数の実験タイプは、少なくとも核酸またはタンパク質合成、核酸またはタンパク質分析、および核酸増幅を含む、段階と、
上記ユーザから、上記インタフェースを介して、上記複数の実験タイプから1つの実験タイプを選択するための第1の入力を受信する段階と、
選択された上記実験タイプで使用するための1または複数のサンプルを特定するための第2の入力を受信する段階と、
上記1または複数のサンプルに関して、選択された上記実験タイプと、実験パラメータに関するデフォルト値とに対して、調整され得る上記実験パラメータを決定する段階と、
上記実験パラメータおよび上記実験パラメータに関する上記デフォルト値を上記インタフェース上に表示する段階と、
上記デフォルト値のうち1つを調整値に調整するための第3の入力を受信して、その他の上記デフォルト値をそれに従って調整する段階と、
上記1または複数のサンプルが実験室機器内にロードされた旨の通知を受信する段階と、
上記1または複数のサンプルの特性に基づいて、1または複数の上記実験パラメータの値を調整する段階と、
選択された上記実験タイプに関する上記1または複数のサンプルで、上記実験パラメータの値に従って、実験を実行する段階と、
上記実験中に収集されたデータを記録する段階と、
を含む、実験室の実験を実行するための方法。
(項目15)
上記実験パラメータから、ユーザ調整のために推奨される1または複数の実験パラメータを決定する段階と、上記推奨される実験パラメータを上記インタフェース上で強調する段階とをさらに含む、項目14に記載の方法。
(項目16)
上記推奨される実験パラメータのうち少なくとも1つは、所望の実験結果を定義する、項目15に記載の方法。
(項目17)
上記実験タイプは精製であり、上記所望の実験結果は純度である、項目16に記載の方法。
(項目18)
上記インタフェースは、各ユーザ入力の後に、コンピュータスクリプトの1または複数の行を表示するスクリプトパネルをさらに含み、上記方法は、上記各ユーザ入力を上記コンピュータスクリプトに変換することをさらに含む、項目14から17のいずれか一項に記載の方法。
(項目19)
ユーザに複数の実験タイプを列挙するインタフェースを示す段階であって、上記複数の実験タイプは、少なくとも、核酸またはタンパク質合成、核酸またはタンパク質分析、および核酸増幅を含む、段階と、
上記ユーザから、上記インタフェースを介して、上記複数の実験タイプから第1の実験タイプを選択するための第1の入力を受信する段階と、
上記複数の実験タイプから第2の実験タイプを選択するための第2の入力を受信する段階であって、上記第1の実験タイプは、上記第2の実験タイプへの入力サンプルとしての役割を果たす出力サンプルを生成する、段階と、
選択された上記第1の実験タイプで使用するための1または複数のサンプルを特定するための第3の入力を受信する段階と、
上記1または複数のサンプルに関して、最初に選択された上記第2の実験タイプと、実験パラメータに関するデフォルト値とに対して、調整され得る上記実験パラメータを決定する段階と、
上記実験パラメータおよび上記実験パラメータに関する上記デフォルト値を上記インタフェース上に表示する段階と、
上記デフォルト値のうち1つを調整値に調整するための第4の入力を受信して、その他の上記デフォルト値をそれに従って調整する段階と、
上記1または複数のサンプルが実験室機器内にロードされた旨の通知を受信する段階と、
上記1または複数のサンプルの特性に基づいて、上記第1の実験タイプに関する1または複数の上記実験パラメータに関する値を調整する段階と、
選択された上記第1の実験タイプに関する上記1または複数のサンプルで、上記実験パラメータの値に従って、第1の実験を実行する段階と、
上記第1の実験から生成された出力サンプルを第2の実験室機器へロードする段階と、
上記1または複数の実験パラメータに関して、上記出力サンプルの特性に基づいて上記第2の実験タイプに関する値を調整する段階と、
選択された上記第2の実験タイプに関する上記出力サンプルで、上記実験パラメータの値に従って、第2の実験を実行する段階と、
上記第1の実験および上記第2の実験中に収集されたデータを記録する段階と、
を含む、一連の実験室の実験を実行するための方法。
Claims (19)
- メモリと、プロセッサと、1または複数の機器と、
(a)複数の実験モジュールを有するソフトウェアベースの開発環境であって、前記複数の実験モジュールのそれぞれが、1または複数のパラメータと、各パラメータに関する1または複数の基準とを含み、かつ、前記1または複数のパラメータによって実験技法を実行するための複数の命令を生成する、ソフトウェアベースの開発環境と、
(b)ユーザから、2またはより多くの実験を実行するためのコマンドを受信するユーザインタフェースモジュールであって、各コマンドは、前記実験技法のうち1つに関する1または複数のパラメータに関する入力値を含む、ユーザインタフェースモジュールと、
(c)(i)入力値が受信される各パラメータに関して、前記各パラメータに関する前記1または複数の基準のうち少なくとも1つに基づいて、前記入力値が有効かどうか決定する段階、
(ii)入力値が受信されないが計算が可能である各パラメータに関して、前記各パラメータに関する前記1または複数の基準のうち少なくとも1つに基づいて、値を計算する段階、および、
(iii)段階(i)および(ii)の後に、少なくとも1つのパラメータが入力値を欠く場合には、警告を生成する段階
によって、各受信されたコマンドを解決するパラメータ解決モジュールと、
(d)各受信されたコマンドの解決が、1または複数の状態に合致するかどうかに基づいてコマンドを実行する実行モジュールと
を備える、科学的実験を開発するためのシステム。 - 実験技法が、化学天秤読み取り値、アポトーシス分析、オートクレーブ、バッファ調合、遠心分離、DNA/RNA合成、落射蛍光顕微鏡検査、高速タンパク質液体クロマトグラフィー(FPLC)、フラッシュクロマトグラフィー、フローサイトメトリー、蛍光動力学、蛍光偏光、蛍光分光法、蛍光熱力学、ゲノムDNA調合、HPLC(イオン交換)、HPLC(逆相)、光学顕微鏡検査、液体取扱い、凍結乾燥、MALDI質量分析、哺乳類細胞培養、pH読み取り、ポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、タンパク質抽出、定量的リアルタイムPCR(qPCR)、RNA抽出/cDNA調合、回転蒸発、固相抽出、スピードバック濃縮、温度計読み取り、薄層クロマトグラフィー(TLC)、全タンパク質量、遺伝子導入、UV/Vis速動性、UV/Vis分光法、UV/Vis熱力学、真空濾過、ウイルス調合、体積チェック、ウエスタンブロット、アガロースゲル電気泳動、シロイヌナズナ研究、原子吸光分光法、原子発光分光法、原子間力顕微鏡検査、細菌性細胞培養、生物反応槽、ボム熱量測定法、C.エレガンス研究、キャピラリー電気泳動、円偏光二色性(CD)、コロニーピッキング、共焦点顕微鏡検査、交差流濾過法(TFF)、結晶化、透析(平衡)、透析(調合)、示差走査熱量測定(DSC)、デジタルドロップレットPCR、DNA配列(次世代)、DNA配列(サンガー)、ショウジョウバエ研究、動的光散乱(DLS)、電子顕微鏡検査、電気穿孔、エレクトロスプレーイオン化(ESI)質量分析、酵素結合免疫吸着法(ELISA)、フローケミストリー、蛍光活性化細胞選別(FACS)、蛍光原位置ハイブリッド形成(FISH)、ガスクロマトグラフィー、ガスクロマトグラフィー質量分析(GC−MS)、HPLC(順相)、HPLC(調合)、免疫沈降、誘導的結合プラズマ質量分析(ICP−MS)、赤外線分光法、等温滴定熱量計(ITC)、液体クロマトグラフィー質量分析(LC−MS)、液−液抽出、溶融点決定、マイクロアレイ分析、マイクロ波反応、分子クローニング、NMR(2D/構造的)、NMR(炭素)、NMR(プロトン)、有機合成(ミリグラムからグラムスケール)、パッチクランプ記録、ペプチド合成、光刺激発光(PSL)、プラスミド構築、屈折率測定法、スキャントンネリング顕微鏡検査、溶解度試験、音波処理、超臨界流体クロマトグラフィー(SFC)、表面プラズモン共鳴(SPR)、タンデム質量分析(MS−MS)、組織均質化、全内部反射蛍光(TIRF)顕微鏡検査、超遠心分離法、X線結晶構造解析法、および酵母細胞培養からなるグループから選択された少なくとも2つを含む、請求項1に記載のシステム。
- 前記1または複数の状態のうち前記1つは、警告が一切生成されないことである、請求項1または2に記載のシステム。
- 前記1または複数の状態のうち前記1つは、非クリティカルな警告のみが生成されることである、請求項1または2に記載のシステム。
- 前記実行モジュールはさらに、前記受信されたコマンドを送り返すオブジェクトを生成する、請求項1から4のいずれか一項に記載のシステム。
- 前記実行モジュールはさらに、前記受信されたコマンドによって指定された前記実験技法を実行すべく、生成された前記オブジェクトを物理的な実験室で利用する、請求項5に記載のシステム。
- 前記受信されたコマンドの前記実行によって生成されるデータを受信するためのモジュールをさらに含む、請求項1から6のいずれか一項に記載のシステム。
- 前記ソフトウェアベースの開発環境において、受信された前記データの一部を表示するためのモジュールをさらに含む、請求項7に記載のシステム。
- 前記ソフトウェアベースの開発環境において、受信された前記データの一部を分析するためのモジュールをさらに含む、請求項7または8に記載のシステム。
- 前記受信されたデータの前記分析に基づいてグラフィック要素を生成するモジュールをさらに含む、請求項9に記載のシステム。
- 前記データの受信後に前記ユーザから1または複数の追加の実行可能コマンドを受信するためのモジュールをさらに含む、請求項7から10のいずれか一項に記載のシステム。
- 前記ソフトウェアベースの開発環境は、実行可能コマンドを選択するためのグラフィック要素を含む、請求項1から11のいずれか一項に記載のシステム。
- 前記ソフトウェアベースの開発環境は、受信されたデータをグラフィック的に表示するための機能を含む、請求項1から12のいずれか一項に記載のシステム。
- 複数の実験タイプを列挙するインタフェースをユーザに示す段階であって、前記複数の実験タイプは、少なくとも核酸またはタンパク質合成、核酸またはタンパク質分析、および核酸増幅を含む、段階と、
前記ユーザから、前記インタフェースを介して、前記複数の実験タイプから1つの実験タイプを選択するための第1の入力を受信する段階と、
選択された前記実験タイプで使用するための1または複数のサンプルを特定するための第2の入力を受信する段階と、
前記1または複数のサンプルに関して、選択された前記実験タイプと、実験パラメータに関するデフォルト値とに対して、調整され得る前記実験パラメータを決定する段階と、
前記実験パラメータおよび前記実験パラメータに関する前記デフォルト値を前記インタフェース上に表示する段階と、
前記デフォルト値のうち1つを調整値に調整するための第3の入力を受信して、その他の前記デフォルト値をそれに従って調整する段階と、
前記1または複数のサンプルが実験室機器内にロードされた旨の通知を受信する段階と、
前記1または複数のサンプルの特性に基づいて、1または複数の前記実験パラメータの値を調整する段階と、
選択された前記実験タイプに関する前記1または複数のサンプルで、前記実験パラメータの値に従って、実験を実行する段階と、
前記実験中に収集されたデータを記録する段階と、
を含む、実験室の実験を実行するための方法。 - 前記実験パラメータから、ユーザ調整のために推奨される1または複数の実験パラメータを決定する段階と、前記推奨される実験パラメータを前記インタフェース上で強調する段階とをさらに含む、請求項14に記載の方法。
- 前記推奨される実験パラメータのうち少なくとも1つは、所望の実験結果を定義する、請求項15に記載の方法。
- 前記実験タイプは精製であり、前記所望の実験結果は純度である、請求項16に記載の方法。
- 前記インタフェースは、各ユーザ入力の後に、コンピュータスクリプトの1または複数の行を表示するスクリプトパネルをさらに含み、前記方法は、前記各ユーザ入力を前記コンピュータスクリプトに変換することをさらに含む、請求項14から17のいずれか一項に記載の方法。
- ユーザに複数の実験タイプを列挙するインタフェースを示す段階であって、前記複数の実験タイプは、少なくとも、核酸またはタンパク質合成、核酸またはタンパク質分析、および核酸増幅を含む、段階と、
前記ユーザから、前記インタフェースを介して、前記複数の実験タイプから第1の実験タイプを選択するための第1の入力を受信する段階と、
前記複数の実験タイプから第2の実験タイプを選択するための第2の入力を受信する段階であって、前記第1の実験タイプは、前記第2の実験タイプへの入力サンプルとしての役割を果たす出力サンプルを生成する、段階と、
選択された前記第1の実験タイプで使用するための1または複数のサンプルを特定するための第3の入力を受信する段階と、
前記1または複数のサンプルに関して、最初に選択された前記第2の実験タイプと、実験パラメータに関するデフォルト値とに対して、調整され得る前記実験パラメータを決定する段階と、
前記実験パラメータおよび前記実験パラメータに関する前記デフォルト値を前記インタフェース上に表示する段階と、
前記デフォルト値のうち1つを調整値に調整するための第4の入力を受信して、その他の前記デフォルト値をそれに従って調整する段階と、
前記1または複数のサンプルが実験室機器内にロードされた旨の通知を受信する段階と、
前記1または複数のサンプルの特性に基づいて、前記第1の実験タイプに関する1または複数の前記実験パラメータに関する値を調整する段階と、
選択された前記第1の実験タイプに関する前記1または複数のサンプルで、前記実験パラメータの値に従って、第1の実験を実行する段階と、
前記第1の実験から生成された出力サンプルを第2の実験室機器へロードする段階と、
前記1または複数の実験パラメータに関して、前記出力サンプルの特性に基づいて前記第2の実験タイプに関する値を調整する段階と、
選択された前記第2の実験タイプに関する前記出力サンプルで、前記実験パラメータの値に従って、第2の実験を実行する段階と、
前記第1の実験および前記第2の実験中に収集されたデータを記録する段階と、
を含む、一連の実験室の実験を実行するための方法。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201562186936P | 2015-06-30 | 2015-06-30 | |
US201562186928P | 2015-06-30 | 2015-06-30 | |
US62/186,936 | 2015-06-30 | ||
US62/186,928 | 2015-06-30 | ||
PCT/US2016/040588 WO2017004468A1 (en) | 2015-06-30 | 2016-06-30 | System and method for management, execution, and analysis of laboratory experiments |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2018523227A true JP2018523227A (ja) | 2018-08-16 |
JP6920220B2 JP6920220B2 (ja) | 2021-08-18 |
Family
ID=57609212
Family Applications (4)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017568424A Active JP6882211B2 (ja) | 2015-06-30 | 2016-06-30 | 実験室の実験データ調査および可視化 |
JP2017568418A Active JP6920220B2 (ja) | 2015-06-30 | 2016-06-30 | 実験室の実験の管理、実行および分析のためのシステム、方法及びコンピュータプログラム |
JP2021078607A Active JP7297810B2 (ja) | 2015-06-30 | 2021-05-06 | 実験室の実験データ調査および可視化 |
JP2023097790A Pending JP2023123585A (ja) | 2015-06-30 | 2023-06-14 | 実験室の実験データ調査および可視化 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017568424A Active JP6882211B2 (ja) | 2015-06-30 | 2016-06-30 | 実験室の実験データ調査および可視化 |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2021078607A Active JP7297810B2 (ja) | 2015-06-30 | 2021-05-06 | 実験室の実験データ調査および可視化 |
JP2023097790A Pending JP2023123585A (ja) | 2015-06-30 | 2023-06-14 | 実験室の実験データ調査および可視化 |
Country Status (10)
Country | Link |
---|---|
US (3) | US11955207B2 (ja) |
EP (2) | EP3317826A4 (ja) |
JP (4) | JP6882211B2 (ja) |
CN (2) | CN110300982A (ja) |
AU (5) | AU2016287730A1 (ja) |
CA (2) | CA2991095A1 (ja) |
HK (2) | HK1255231A1 (ja) |
IL (4) | IL256647B1 (ja) |
SG (1) | SG10202105478TA (ja) |
WO (2) | WO2017004468A1 (ja) |
Families Citing this family (23)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2017004468A1 (en) * | 2015-06-30 | 2017-01-05 | Yoshikawa Alex M | System and method for management, execution, and analysis of laboratory experiments |
GB2554334A (en) | 2016-05-17 | 2018-04-04 | Tap Biosystems Phc Ltd | Automated bioprocess development |
US20180341975A1 (en) * | 2017-05-23 | 2018-11-29 | Streamlet Data | Methods for web optimization and experimentation |
US20190034047A1 (en) * | 2017-07-31 | 2019-01-31 | Wisconsin Alumni Research Foundation | Web-Based Data Upload and Visualization Platform Enabling Creation of Code-Free Exploration of MS-Based Omics Data |
JP6967402B2 (ja) * | 2017-08-22 | 2021-11-17 | 株式会社日立ハイテクサイエンス | 分析装置及び分析方法 |
KR102531008B1 (ko) * | 2017-09-28 | 2023-05-11 | 주식회사 씨젠 | 증폭 데이터 표시 방법 및 장치 |
JP7107526B2 (ja) * | 2018-08-27 | 2022-07-27 | 株式会社エビデント | 実験情報管理システム、実験ノートシステム、実験ノート生成装置、画面生成装置、実験情報管理方法、及び、プログラム |
JP7352340B2 (ja) | 2018-09-28 | 2023-09-28 | シスメックス株式会社 | 測定装置及び精度管理方法 |
US11294928B1 (en) * | 2018-10-12 | 2022-04-05 | Palantir Technologies Inc. | System architecture for relating and linking data objects |
DE102019103078A1 (de) * | 2019-02-07 | 2020-08-13 | Labtwin Gmbh | Verfahren zur Unterstützung von Arbeitsabläufen in einer Laborumgebung mittels eines Assistenzsystems |
US11568430B2 (en) * | 2019-04-08 | 2023-01-31 | Ebay Inc. | Third-party testing platform |
US11500528B2 (en) * | 2019-07-01 | 2022-11-15 | Palantir Technologies Inc. | System architecture for cohorting sensor data |
CN112649772B (zh) * | 2019-10-11 | 2023-03-28 | 上海联影医疗科技股份有限公司 | 磁共振关联协议的参数调整方法、系统和磁共振系统 |
CN112216178A (zh) * | 2020-10-21 | 2021-01-12 | 北京高途云集教育科技有限公司 | 实验现象模拟方法、装置、系统和电子设备 |
CN112419108A (zh) * | 2020-11-03 | 2021-02-26 | 广州理工学院 | 一种物联网实验云管理系统 |
JP2022091322A (ja) * | 2020-12-09 | 2022-06-21 | 株式会社島津製作所 | 液体クロマトグラフのpH管理システムおよびプログラム |
CN112581092A (zh) * | 2020-12-23 | 2021-03-30 | 上海研鼎信息技术有限公司 | 一种实验室管理方法、设备及存储介质 |
WO2022141234A1 (zh) * | 2020-12-30 | 2022-07-07 | 深圳晶泰科技有限公司 | 实验工作流模型建立方法 |
CN113126755B (zh) * | 2021-03-23 | 2021-09-03 | 北京润尼尔网络科技有限公司 | Vr资源的协同开发方法 |
CN113495772A (zh) * | 2021-07-01 | 2021-10-12 | 电子科技大学 | 一种实验操作信息显示方法、装置、设备及可读存储介质 |
CN113764032B (zh) * | 2021-10-21 | 2022-02-25 | 北京安智因生物技术有限公司 | 一种荧光定量pcr平台基因智能识别和报告自动化系统 |
CN113947377B (zh) * | 2021-10-22 | 2023-05-30 | 浙江正泰仪器仪表有限责任公司 | 一种实验室管理系统 |
KR20230059277A (ko) * | 2021-10-26 | 2023-05-03 | 정아연 | 과학실험장치 실험 데이터 분석 시스템 및 방법 |
Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002352092A (ja) * | 2001-05-24 | 2002-12-06 | Casio Comput Co Ltd | 代行処理サービスシステム及び代行処理方法 |
US20030207243A1 (en) * | 2000-08-01 | 2003-11-06 | Hong Shen | Conducting remote instructor-controlled experimentation |
JP2004333290A (ja) * | 2003-05-07 | 2004-11-25 | Canon Inc | 情報処理システム |
US20060047697A1 (en) * | 2004-08-04 | 2006-03-02 | Tyrell Conway | Microarray database system |
JP2006146369A (ja) * | 2004-11-16 | 2006-06-08 | Canon Inc | パラメータ設定支援装置、その制御方法、及びプログラム |
JP2006275895A (ja) * | 2005-03-30 | 2006-10-12 | Olympus Corp | 生体関連物質の測定情報の表示方法 |
JP2009080645A (ja) * | 2007-09-26 | 2009-04-16 | Hitachi Software Eng Co Ltd | 論文作成支援システム |
JP2009283003A (ja) * | 1999-04-16 | 2009-12-03 | Entelos Inc | コンピュータ・ベースのシステム・モデルを使用して、連結シミュレーション演算を実施する方法および装置 |
US20130013221A1 (en) * | 2007-05-18 | 2013-01-10 | S-Matrix | System and method for automating scientific and engineering experimentation for deriving surrogate response data |
Family Cites Families (26)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0720737B1 (en) | 1994-06-25 | 2002-01-16 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Analysing a material sample |
US6389380B1 (en) | 1997-09-16 | 2002-05-14 | Evolving Logic Associates | System and method for performing compound computational experiments |
US20020144905A1 (en) | 1997-12-17 | 2002-10-10 | Christian Schmidt | Sample positioning and analysis system |
JP2002530748A (ja) * | 1998-11-13 | 2002-09-17 | セロミックス インコーポレイテッド | 実験データを効率的に収集して記憶するための方法及びシステム |
IL131195A0 (en) | 1999-08-01 | 2001-01-28 | Fourier Systems Ltd | Remote laboratory |
JP2001215230A (ja) * | 2000-02-03 | 2001-08-10 | Shimadzu Corp | 分析装置 |
US7216113B1 (en) | 2000-03-24 | 2007-05-08 | Symyx Technologies, Inc. | Remote Execution of Materials Library Designs |
JP3867046B2 (ja) | 2001-02-23 | 2007-01-10 | 株式会社日立製作所 | 分析システム |
US7850912B2 (en) | 2003-05-14 | 2010-12-14 | Dako Denmark A/S | Method and apparatus for automated pre-treatment and processing of biological samples |
JP2005106746A (ja) | 2003-10-01 | 2005-04-21 | Olympus Corp | 自動分析装置の遠隔監視システム |
JP4579525B2 (ja) | 2003-10-27 | 2010-11-10 | 日立ソフトウエアエンジニアリング株式会社 | 遺伝子発現データ管理表示方法 |
JP2008504845A (ja) | 2004-06-07 | 2008-02-21 | バイオプロセッサーズ コーポレイション | リアクター環境条件の制御 |
US20060241868A1 (en) | 2005-04-08 | 2006-10-26 | Affymetrix, Inc. | System, method, and computer product for simplified instrument control and file management |
WO2007075488A2 (en) | 2005-12-16 | 2007-07-05 | Nextbio | System and method for scientific information knowledge management |
US20070156382A1 (en) | 2005-12-29 | 2007-07-05 | Graham James L Ii | Systems and methods for designing experiments |
US8112232B2 (en) * | 2007-02-02 | 2012-02-07 | Beckman Coulter, Inc. | System and method for autoverifying laboratory test results |
AU2008242910A1 (en) * | 2007-04-17 | 2008-10-30 | Emd Millipore Corporation | Graphical user interface for analysis and comparison of location-specific multiparameter data sets |
EP2116851B1 (en) * | 2008-02-13 | 2018-09-19 | Hitachi High-Technologies Corporation | Automatic analyzer |
WO2010086862A1 (en) * | 2009-02-01 | 2010-08-05 | Sparklix Ltd. | Comprehensive electronic laboratory notebook |
JP5452254B2 (ja) * | 2010-01-28 | 2014-03-26 | シスメックス株式会社 | 検体分析装置 |
CN103282873B (zh) * | 2010-11-12 | 2016-08-24 | 生命科技公司 | 用于实验室测定确认或验证的系统和方法 |
CN102208058A (zh) * | 2010-12-02 | 2011-10-05 | 上海电机学院 | 基于虚拟仪器技术的实验管理方法及其系统 |
CN103988078B (zh) | 2011-09-22 | 2016-11-02 | 生物辐射实验室股份有限公司 | 用于生化数据分析的系统和方法 |
US20140095191A1 (en) * | 2012-09-28 | 2014-04-03 | Issam Kabbani | Integrated lab management system |
WO2017004468A1 (en) * | 2015-06-30 | 2017-01-05 | Yoshikawa Alex M | System and method for management, execution, and analysis of laboratory experiments |
KR102531008B1 (ko) | 2017-09-28 | 2023-05-11 | 주식회사 씨젠 | 증폭 데이터 표시 방법 및 장치 |
-
2016
- 2016-06-30 WO PCT/US2016/040588 patent/WO2017004468A1/en active Application Filing
- 2016-06-30 JP JP2017568424A patent/JP6882211B2/ja active Active
- 2016-06-30 EP EP16818855.5A patent/EP3317826A4/en active Pending
- 2016-06-30 SG SG10202105478TA patent/SG10202105478TA/en unknown
- 2016-06-30 JP JP2017568418A patent/JP6920220B2/ja active Active
- 2016-06-30 US US15/740,581 patent/US11955207B2/en active Active
- 2016-06-30 EP EP16818856.3A patent/EP3317824A4/en active Pending
- 2016-06-30 IL IL256647A patent/IL256647B1/en unknown
- 2016-06-30 AU AU2016287730A patent/AU2016287730A1/en not_active Abandoned
- 2016-06-30 IL IL292791A patent/IL292791A/en unknown
- 2016-06-30 US US15/740,645 patent/US10978172B2/en active Active
- 2016-06-30 WO PCT/US2016/040589 patent/WO2017004469A1/en active Application Filing
- 2016-06-30 CA CA2991095A patent/CA2991095A1/en active Pending
- 2016-06-30 CN CN201680051489.2A patent/CN110300982A/zh active Pending
- 2016-06-30 IL IL310917A patent/IL310917A/en unknown
- 2016-06-30 CA CA2991094A patent/CA2991094A1/en active Pending
- 2016-06-30 AU AU2016287731A patent/AU2016287731B2/en active Active
- 2016-06-30 CN CN201680049795.2A patent/CN110300980B/zh active Active
-
2017
- 2017-12-28 IL IL256644A patent/IL256644B/en unknown
-
2018
- 2018-11-09 HK HK18114360.3A patent/HK1255231A1/zh unknown
- 2018-11-09 HK HK18114359.6A patent/HK1255230A1/zh unknown
-
2021
- 2021-04-12 US US17/228,294 patent/US20210233605A1/en active Pending
- 2021-05-06 JP JP2021078607A patent/JP7297810B2/ja active Active
-
2022
- 2022-02-25 AU AU2022201311A patent/AU2022201311B2/en active Active
- 2022-03-11 AU AU2022201694A patent/AU2022201694A1/en not_active Abandoned
-
2023
- 2023-04-27 AU AU2023202565A patent/AU2023202565A1/en active Pending
- 2023-06-14 JP JP2023097790A patent/JP2023123585A/ja active Pending
Patent Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2009283003A (ja) * | 1999-04-16 | 2009-12-03 | Entelos Inc | コンピュータ・ベースのシステム・モデルを使用して、連結シミュレーション演算を実施する方法および装置 |
US20030207243A1 (en) * | 2000-08-01 | 2003-11-06 | Hong Shen | Conducting remote instructor-controlled experimentation |
JP2002352092A (ja) * | 2001-05-24 | 2002-12-06 | Casio Comput Co Ltd | 代行処理サービスシステム及び代行処理方法 |
JP2004333290A (ja) * | 2003-05-07 | 2004-11-25 | Canon Inc | 情報処理システム |
US20060047697A1 (en) * | 2004-08-04 | 2006-03-02 | Tyrell Conway | Microarray database system |
JP2006146369A (ja) * | 2004-11-16 | 2006-06-08 | Canon Inc | パラメータ設定支援装置、その制御方法、及びプログラム |
JP2006275895A (ja) * | 2005-03-30 | 2006-10-12 | Olympus Corp | 生体関連物質の測定情報の表示方法 |
US20130013221A1 (en) * | 2007-05-18 | 2013-01-10 | S-Matrix | System and method for automating scientific and engineering experimentation for deriving surrogate response data |
JP2009080645A (ja) * | 2007-09-26 | 2009-04-16 | Hitachi Software Eng Co Ltd | 論文作成支援システム |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7297810B2 (ja) | 実験室の実験データ調査および可視化 | |
JP2018531367A6 (ja) | 実験室の実験データ調査および可視化 | |
Müller et al. | The proteome landscape of the kingdoms of life | |
Schwenk et al. | The human plasma proteome draft of 2017: building on the human plasma PeptideAtlas from mass spectrometry and complementary assays | |
US9977862B2 (en) | Bioprocess method and system | |
Morsy et al. | Charting plant interactomes: possibilities and challenges | |
Chen et al. | Automated “cells-to-peptides” sample preparation workflow for high-throughput, quantitative proteomic assays of microbes | |
Yang et al. | The Quartet Data Portal: integration of community-wide resources for multiomics quality control | |
Ramírez Rojas et al. | DuBA. flow─ A Low-Cost, Long-Read Amplicon Sequencing Workflow for the Validation of Synthetic DNA Constructs | |
CN118098379A (zh) | 实验室数据的探索与可视化 | |
Martínez-Bartolomé et al. | Proteomics INTegrator (PINT): An Online Tool To Store, Query, and Visualize Large Proteomics Experiment Results | |
Zhang et al. | FGCD: a database of fungal gene clusters related to secondary metabolism | |
Wang et al. | Insights of new tools in glycomic research | |
Hamacher et al. | The HUPO Brain Proteome Project Wish List–Summary of the 9th HUPO BPP Workshop 9–10 January 2008, Barbados | |
Clancy | 23 Visualization of Protein Microarray Data |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180302 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20190514 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20191127 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200107 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200406 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200602 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200707 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20210105 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20210402 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20210525 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20210623 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210726 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6920220 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |