JP2018513966A - 生物学的又は化学的な解析用のサンプルを撮像する方法、キャリヤ組立体、及びシステム - Google Patents
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Abstract
Description
本件出願は、2015年3月24日出願の米国仮出願第62/137,600号の恩典を主張し、この米国仮出願は参照により全体が本明細書に組み入れられるものとする。
Claims (74)
- 第1キャリヤ組立体をシステム台上に位置決めする位置決めステップであって、前記第1キャリヤ組立体は、支持フレームであり前記支持フレームの窓を画定する内側フレーム端縁を持つ支持フレームを有し、前記第1キャリヤ組立体は、前記窓内に位置決めされ、また前記内側フレーム端縁によって包囲される取外し可能な第1基板を有し、前記第1基板は、光学系の結像ゾーン内に位置決めされるサンプルを前記第1基板上に有するものである、位置決めステップと、
第1撮像プロトコールにより前記光学系を使用して前記第1基板の前記サンプルから光学的信号を検出するステップと、
前記システム台上で前記第1キャリヤ組立体を第2キャリヤ組立体と交換する交換ステップであって、前記第2キャリヤ組立体は取外し可能な第2基板を有するものであり、前記第2基板は、前記光学系の結像ゾーン内に位置決めされるサンプルを前記第2基板上に有するものであり、前記第1基板及び前記第2基板は互いに異なるタイプの基板であるものとする、交換ステップと、
前記第1撮像プロトコールとは異なる第2撮像プロトコールにより前記光学系を使用して前記第2基板の前記サンプルから光学的信号を検出するステップと、
を備える、方法。 - 請求項1記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体及び前記第2キャリヤ組立体それぞれは、それぞれ対応のキャリヤ組立体内に延在する開孔を有し、前記開孔は、各キャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき、前記システム台の対応基準を収容するものであり、前記第2キャリヤ組立体は、前記第2基板を保持するアダプタプレートを有するものであり、前記基準は、前記第1キャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき前記第1基板に係合し、また、前記第2キャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき前記アダプタプレートに係合するものである、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記光学系は対物レンズを有し、前記第1基板から前記光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第1基板を互いに相対移動させるステップを含み、また前記第2基板から前記光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第2基板を互いに相対移動させるステップを含み、前記光学系は、第1結像ゾーンに沿って前記第1基板からの前記光学的信号を検出し、前記光学系は、第2結像ゾーンに沿って前記第2基板からの前記光学的信号を検出し、前記第1結像ゾーン及び前記第2結像ゾーンは互いにサイズが異なるものであり、前記第1撮像プロトコール及び前記第2撮像プロトコールは、前記対物レンズを前記第1基板及び前記第2基板に対してそれぞれ異なる経路に沿って自動的に相対移動させるステップを含む、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第2キャリヤ組立体は、可動基準ブロックを含む保持機構を有し、前記方法は、さらに、前記基準ブロックを押圧するステップ、前記第2基板を前記第2キャリヤ組立体に位置決めするステップ、及び前記基準ブロックを釈放するステップを備え、前記基準ブロックは前記第2基板に係合して、前記第2基板を前記第2キャリヤ組立体に保持し、この場合、前記基準ブロックは前記第1基板を前記第1キャリヤ組立体に保持しないものである、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第1基板及び前記第2基板は、異なる厚さと、それぞれ第1基板表面及び第2基板表面とを有し、前記第1基板及び前記第2基板からの光学的信号を検出するステップは、それぞれ前記第1基板表面及び前記第2基板表面からの光学的信号を検出するステップを含み、前記第1基板表面及び前記第2基板表面は、共通平面に沿って存在する、又は100ミクロン以下の距離だけオフセットしているものである、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第2基板は形体のマイクロアレイを有し、前記第2基板から光学的信号を検出するステップは、前記形体のマイクロアレイにおける一連のオーバーラップする部分の画像シリーズを取得するステップを備え、前記形体それぞれは、その形体上に固定化した指定プローブ分子を有するものであり、前記マイクロアレイは、そこに付着した標的検体を有するものであり、前記方法は、さらに、
前記画像における形体それぞれに関連する光強度を解析し、また前記画像のデータ表現を決定する光強度解析ステップであって、前記データ表現は、前記マイクロアレイにおける形体それぞれに基づくデータ形体のサブアレイを有し、前記各データ形体は、他のデータ形体に対する対応場所、及び1つ又はそれ以上の光強度に基づく信号値を有するものである、光強度解析ステップと、
隣接画像のデータ表現における前記データ形体の信号値を比較することに基づいて隣接画像のデータ表現を組み合わせて、前記マイクロアレイのデータ表現を生成するステップと、
を備え、
前記マイクロアレイの前記データ表現を解析して、サンプルの特性又は特徴を決定する、方法。 - 請求項1記載の方法において、前記第1基板はフローセルである、方法。
- 請求項2記載の方法において、フローセルは、前記フローセルの入口ポートと出口ポートとの間に延在するフローチャンネルを有し、前記入口ポート及び出口ポートは、前記フローチャンネルに液体を流すためのマニホルドに流体的に接続する、方法。
- 請求項2記載の方法において、フローセルは、前記フローセルにおけるそれぞれ対応の入口ポートと出口ポートと間に延在する複数個のフローチャンネルを有し、前記入口ポート及び出口ポートは、前記フローチャンネルに液体を流すためのマニホルドに流体的に接続する、方法。
- 請求項2記載の方法において、さらに、シークエンシング・バイ・シンセシス(SBS)プロトコールを行うためフローセルに反復して試薬を流すステップを備える、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第1撮像プロトコール及び前記第2撮像プロトコールは、対物レンズ及び/又は前記システム台を互いに異なる経路に沿って相対移動させるステップを含む、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第2基板は開放面付き基板であり、前記開放面付き基板は、生物学的又は化学的な物質を前記開放面付き基板の外面に固定化して持つ、方法。
- 請求項7記載の方法において、開放面付き前記基板は、外面に沿ってマイクロアレイを有する、方法。
- 請求項8記載の方法において、マイクロアレイは、互いに平行な複数個の形体ストライプを有し、前記形体ストライプそれぞれは反応部位のアレイを有する、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体及び前記第2キャリヤ組立体それぞれは、それぞれのキャリヤ組立体に延在する開孔を有し、前記開孔は、それぞれのキャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき、対応の基準を収容するものである、方法。
- 請求項10記載の方法において、前記第1基板は前記基準に係合し、かつ前記第2基板は前記基準に係合しない、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第1基板は、前記第2基板よりも大きいものである、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記光学系は対物レンズを有し、前記第1基板から光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第1基板を互いに相対移動させるステップを含み、前記第2基板から光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第2基板を互いに相対移動させるステップを含む、方法。
- 請求項13記載の方法において、前記光学系は、前記第1基板からの光学的信号を第1結像ゾーンに沿って検出し、前記光学系は、前記第2基板からの光学的信号を第2結像ゾーンに沿って検出し、前記第1結像ゾーン及び前記第2結像ゾーンは互いに異なるサイズである、方法。
- 請求項13記載の方法において、前記第1撮像プロトコール及び前記第2撮像プロトコールは、対物レンズをそれぞれ前記第1基板及び前記第2基板に対して異なる経路に沿って自動的に相対移動させるステップを含む、方法。
- 請求項1記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体及び前記第2キャリヤ組立体は、効果的には同一様態で前記システム台に係合する、方法。
- 第1キャリヤ組立体をシステム台上で位置決めする位置決めステップであって、前記第1キャリヤ組立体は、支持フレームであり前記支持フレームの窓を画定する内側フレーム端縁を持つ支持フレームを有し、前記第1キャリヤ組立体は、前記窓内に位置決めされ、また前記内側フレーム端縁によって包囲される第1基板を有し、前記第1基板は前記第1基板の上にサンプルを有し、前記サンプルは光学系の結像ゾーン内に位置決めされるものである、位置決めステップと、
前記光学系を用いて前記第1基板の前記サンプルからの光学的信号を検出するステップと、
前記システム台上で前記第1キャリヤ組立体を第2キャリヤ組立体と交換する交換ステップであって、前記第2キャリヤ組立体は、支持フレームと、この支持フレームに連結されるアダプタプレートとを有し、前記第2キャリヤ組立体は、第2基板であり前記アダプタプレートによって保持されて前記第2基板の上にサンプルを持つ第2基板を有し、前記第2基板のサンプルは、光学系の結像ゾーン内に位置決めされるものである、交換ステップと、
前記光学系を用いて前記第2基板の前記サンプルからの光学的信号を検出するステップと、
を備える、方法。 - 請求項22記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体及び前記第2キャリヤ組立体それぞれは、それぞれ対応のキャリヤ組立体内に延在する開孔を有し、前記開孔は、各キャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき、前記システム台の対応基準を収容するものであり、前記基準は、前記第1キャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき前記第1基板に係合し、また、前記第2キャリヤ組立体を前記システム台上に位置決めするとき前記アダプタプレートに係合するものである、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記光学系は対物レンズを有し、前記第1基板から前記光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第1基板を互いに相対移動させるステップを含み、また前記第2基板から前記光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第2基板を互いに相対移動させるステップを含み、前記光学系は、第1結像ゾーンに沿って前記第1基板からの前記光学的信号を検出し、前記光学系は、第2結像ゾーンに沿って前記第2基板からの前記光学的信号を検出し、前記第1結像ゾーン及び前記第2結像ゾーンは互いにサイズが異なるものであり、第1撮像プロトコール及び第2撮像プロトコールは、前記対物レンズを前記第1基板及び前記第2基板に対してそれぞれ異なる経路に沿って自動的に相対移動させるステップを含む、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第2キャリヤ組立体は、可動基準ブロックを含む保持機構を有し、前記方法は、さらに、前記基準ブロックを押圧するステップ、前記第2基板を前記第2キャリヤ組立体に位置決めするステップ、及び前記基準ブロックを釈放するステップを備え、前記基準ブロックは前記第2基板に係合して、前記第2基板を前記第2キャリヤ組立体に保持し、この場合、前記基準ブロックは前記第1基板を前記第1キャリヤ組立体に保持しないものである、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第1基板及び前記第2基板は、異なる厚さと、それぞれ第1基板表面及び第2基板表面とを有し、前記第1基板及び前記第2基板からの光学的信号を検出するステップは、それぞれ前記第1基板表面及び前記第2基板表面からの光学的信号を検出するステップを含み、前記第1基板表面及び前記第2基板表面は、共通平面に沿って存在する、又は100ミクロン以下の距離だけオフセットしているものである、方法。
- 請求項26記載の方法において、前記第2基板は形体のマイクロアレイを有し、前記第2基板から光学的信号を検出するステップは、前記形体のマイクロアレイにおける一連のオーバーラップする部分の画像シリーズを取得するステップを備え、前記形体それぞれは、その形体上に固定化した指定プローブ分子を有するものであり、前記マイクロアレイは、そこに付着した標的検体を有するものであり、前記方法は、さらに、
前記画像における形体それぞれに関連する光強度を解析し、また前記画像のデータ表現を決定する光強度解析ステップであって、前記データ表現は、前記マイクロアレイにおける形体それぞれに基づくデータ形体のサブアレイを有し、前記各データ形体は、他のデータ形体に対する対応場所、及び1つ又はそれ以上の光強度に基づく信号値を有するものである、光強度解析ステップと、
隣接画像のデータ表現における前記データ形体の信号値を比較することに基づいて隣接画像のデータ表現を組み合わせて、前記マイクロアレイのデータ表現を生成するステップと、
を備え、
前記マイクロアレイの前記データ表現を解析して、サンプルの特性又は特徴を決定する、方法。 - 請求項22記載の方法において、前記第1基板はフローセルである、方法。
- 請求項23記載の方法において、フローセルは、前記フローセルの入口ポートと出口ポートとの間に延在するフローチャンネルを有し、前記入口ポート及び出口ポートは、前記フローチャンネルに液体を流すためのマニホルドに流体的に接続する、方法。
- 請求項23記載の方法において、フローセルは、前記フローセルにおけるそれぞれ対応の入口ポートと出口ポートと間に延在する複数個のフローチャンネルを有し、前記入口ポート及び出口ポートは、前記フローチャンネルに液体を流すためのマニホルドに流体的に接続する、方法。
- 請求項30記載の方法において、前記フローチャンネルは、互いに平行に前記結像ゾーンを貫通する、方法。
- 請求項22記載の方法において、さらに、シークエンシング・バイ・シンセシス(SBS)プロトコールを行うためフローセルに反復して試薬を流すステップを備える、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第2基板は、生物学的又は化学的な物質を開放面付き基板の外面に固定化して持つ、開放面付き基板である、方法。
- 請求項33記載の方法において、前記開放面付き基板は、前記外面に沿ってマイクロアレイを有する、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第1基板は前記第2基板よりも大きいものである、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体の前記支持フレーム及び前記第2キャリヤ組立体の前記支持フレームは、同一の支持フレームである、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体の前記支持フレーム及び前記第2キャリヤ組立体の前記支持フレームは、同一周縁を画定するそれぞれの端縁を有する異なる支持フレームである、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第1基板は、前記内側フレーム端縁に平行に延在するXY平面に沿って前記窓内で摺動可能であり、前記アダプタプレートは前記XY平面に沿って窓内で摺動可能である、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記システム台は複数個の基準を有し、前記基準は、位置決め操作中に前記第1基板に係合し、また交換操作中に前記アダプタプレートに係合する、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記アダプタプレートはポケットを画定する内側プレート端縁を有し、前記第2基板は、前記ポケット内に配置されかつプレート端縁に係合する、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記光学系は対物レンズを有し、前記第1基板から光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第1基板を互いに相対移動させるステップを含み、前記第2基板から光学的信号を検出するステップは、前記対物レンズ及び前記第2基板を互いに相対移動させるステップを含む、方法。
- 請求項41記載の方法において、前記光学系は、前記第1基板からの光学的信号を第1結像ゾーンに沿って検出し、前記光学系は、前記第2基板からの光学的信号を第2結像ゾーンに沿って検出し、前記第1結像ゾーン及び前記第2結像ゾーンは互いに異なるサイズである、方法。
- 請求項41記載の方法において、前記第1基板及び前記第2基板におけるサンプルは前記窓の異なる区域内に位置決めする、方法。
- 請求項22記載の方法において、前記第1キャリヤ組立体を前記第2キャリヤ組立体と交換するステップは、前記第1基板を前記支持フレームから取り外すステップと、及び前記第2基板を前記アダプタプレート内に位置決めするステップとを含む、方法。
- 請求項22記載の方法において、さらに、ポケットの一部分内に配置される可動の基準ブロックを持つ保持機構を有し、前記方法は、さらに、前記基準ブロックを押圧するステップ、前記第2基板を前記ポケット内に位置決めするステップ、及び前記基準ブロックを釈放するステップを備え、前記基準ブロックは前記第2基板に係合して、前記第2基板を前記ポケット内に保持する、方法。
- 請求項45記載の方法において、前記保持機構は、前記第2基板を前記ポケット内に保持する弾性力を生ずるバイアス付与ばねを有する、方法。
- 支持フレームであり前記支持フレームの窓を画定する内側フレーム端縁を持つ支持フレームと、
前記支持フレームに連結されかつ前記窓内に位置決めされるアダプタプレートであり、前記窓よりも小さいサイズの基板を収容するポケットを画定する内側プレート端縁を持つプレート本体を有し、前記内側プレート端縁は、さらに、前記ポケットに開口する保持窪みを画定する、アダプタプレートと、
前記保持窪み内に位置決めされ、後退位置と係合位置との間で移動可能である可動の基準ブロックであり、前記基準ブロックが前記係合位置にあるとき基板に係合し、また前記基板を前記アダプタプレートの対向する表面に押し付けて前記基板を前記ポケット内に保持するよう構成される、可動の基準ブロックと、
を備える、キャリヤ組立体。 - 請求項47記載のキャリヤ組立体において、前記アダプタプレートはXY平面に平行に延在し、またZ軸に沿う方向に対面し、前記基準ブロックは前記XY平面に沿って指向する保持力を生ずる、キャリヤ組立体。
- 請求項47記載のキャリヤ組立体において、前記ポケットは、前記内側フレーム端縁に交差する収容平面に一致するか、又は前記収容平面の下方に位置するかの少なくとも一方である、キャリヤ組立体。
- 請求項47記載のキャリヤ組立体において、前記内側フレーム端縁は前記窓に開口する開孔を画定し、前記開孔は、前記キャリヤ組立体をシステム台上に位置決めするとき基準を収容するよう構成されている、キャリヤ組立体。
- 請求項50記載のキャリヤ組立体において、前記支持フレームは、第1本体側面及び第2本体側面を有するものであり、前記第1本体側面は撮像操作中に対物レンズに対面するよう構成され、また前記第2本体側面は撮像操作中にベース表面上に位置決めされるよう構成され、前記支持フレームの開孔は、前記第2本体側面に開口し、かつ前記第2本体側面から前記第1本体側面に向かって延在する、キャリヤ組立体。
- 請求項47記載のキャリヤ組立体において、前記アダプタプレートは前記窓内でXY平面に沿って摺動可能である、キャリヤ組立体。
- 請求項47記載のキャリヤ組立体において、前記アダプタプレートは前記ポケットに開口する開口を有するものである、キャリヤ組立体。
- 請求項47記載のキャリヤ組立体において、前記ポケットは平面状のチップ又はスライドを収容するサイズ及び形状である、キャリヤ組立体。
- 支持フレームであり前記支持フレームの窓を画定する内側フレーム端縁を持つ支持フレームと、
前記支持フレームに連結しかつ前記窓内に位置決めされるアダプタプレートであり、前記内側フレーム端縁は前記アダプタプレート上方に位置する基板収容窪みを画定し、前記基板収容窪みは第1平面状基板を収容するよう構成され、前記アダプタプレートは、前記第1平面状基板よりも小さいサイズの第2平面状基板を収容するためのポケットを画定する内側プレート端縁を持つプレート本体を有し、前記ポケットは前記基板収容窪みの下方に少なくとも部分的に存在する、アダプタプレートと、
を備えるキャリヤ組立体。 - 請求項55記載のキャリヤ組立体において、さらに、後退位置と係合位置との間で移動可能な基準ブロックを備え、前記基準ブロックは、基準ブロックが前記係合位置にあって、前記基板を前記アダプタプレートの対向表面に押し付けて前記基板をポケット内に保持するとき、前記基板に係合するよう構成されている、キャリヤ組立体。
- 請求項56記載のキャリヤ組立体において、前記アダプタプレートはXY平面に平行に延在し、またZ軸に沿う方向に対面し、前記基準ブロックは前記XY平面に沿って指向する保持力を生ずる、キャリヤ組立体。
- 請求項55記載のキャリヤ組立体において、前記内側フレーム端縁は前記窓に開口する開孔を画定し、前記開孔は、前記キャリヤ組立体をシステム台上に位置決めするとき基準を収容するよう構成されている、キャリヤ組立体。
- 請求項58記載のキャリヤ組立体において、前記支持フレームは、第1本体側面及び第2本体側面を有し、前記第1本体側面は撮像操作中に対物レンズに対面するよう構成され、また前記第2本体側面は撮像操作中にベース表面上に位置決めされるよう構成され、前記支持フレームの前記開孔は、前記第2本体側面に開口し、かつ前記第2本体側面から前記第1本体側面に向かって延在する、キャリヤ組立体。
- 請求項55記載のキャリヤ組立体において、前記アダプタプレートは前記窓内でXY平面に沿って摺動可能である、キャリヤ組立体。
- 請求項55記載のキャリヤ組立体において、前記ポケットは平面状のチップ又はスライドを収容するサイズ及び形状である、キャリヤ組立体。
- 請求項55記載のキャリヤ組立体において、前記アダプタプレートは、前記基板収容窪みにアクセスする流体開口を有する、キャリヤ組立体。
- 請求項62記載のキャリヤ組立体において、前記流体開口のうち少なくとも1つは前記アダプタプレートの第1端部に位置し、また前記流体開口のうち少なくとも1つは、前記アダプタプレートの反対側の第2端部に位置する、キャリヤ組立体。
- XY平面に平行に延在するベース表面と、前記ベース表面に連結した複数個の基準とを持つシステム台であって、前記基準は、前記XY平面に直交するZ軸に沿って前記ベース表面から離れるよう突出する突起を含む、システム台と、
対物レンズを有する光学系であって、前記対物レンズは、前記XY平面に沿って前記システム台に対して相対移動するよう構成されている、光学系と、
フローセルを前記システム台上に取り付けるとき前記フローセルを流れる1つ又はそれ以上の流体フローを制御するよう構成されている流体制御システムと、
前記流体制御システム及び前記光学系を制御して、第1サンプル及び第2サンプルに対してそれぞれ異なる第1分析プロトコール及び第2分析プロトコールを行うよう構成されたシステムコントローラであって、前記第1分析プロトコール中前記システムコントローラは、前記流体制御システムに指令して1つ又はそれ以上の流体を前記システム台上のフローセルに導き、また前記光学系に指令して前記フローセルにおける第1サンプルから光学的信号を検出させ、前記第2分析プロトコール中前記システムコントローラは、前記光学系に指令して、前記第2サンプルに流体を流すことなく、前記システム台上の開放面付き基板における前記第2サンプルから光学的信号を検出させる、システムコントローラと、
を備える、分析システム。 - 請求項64記載の分析システムにおいて、前記第1分析プロトコールはシークエンシング・バイ・シンセシス(SBS)プロトコールであり、また前記第2分析プロトコールはマイクロアレイを撮像するステップを含む、分析システム。
- 請求項64記載の分析システムにおいて、さらに、前記システム台上に取り付けたキャリヤ組立体のタイプを検出するよう構成されたキャリヤセンサを備え、前記分析システムは、前記キャリヤ組立体及び選択した前記分析プロトコールが適合しないとき通知を発生するよう構成されている、分析システム。
- 請求項64記載の分析システムにおいて、さらに、窓を画定する支持フレームを有するキャリヤ組立体を備え、前記支持フレームは、前記窓にわたって延在しかつ前記窓をカバーするアダプタプレートに連結するよう構成されている、分析システム。
- 形体のマイクロアレイに関する一連のオーバーラップ部分の画像シリーズを取得する画像取得ステップであり、前記各形体は、その形体に固定化した指定プローブ分子を有し、前記マイクロアレイは、前記マイクロアレイに付着した標的検体を有する、画像取得ステップと、
前記画像における形体それぞれに関連する光強度を解析し、前記画像のデータ表現を決定する光強度解析ステップであり、前記データ表現は、マイクロアレイにおける形体それぞれに基づくデータ形体のサブアレイを有し、前記各データ形体は、他のデータ形体に対する対応場所、及び1つ又はそれ以上の光強度に基づく信号値を有するものである、光強度解析ステップと、
隣接画像の前記データ表現におけるデータ形体の信号値を比較することに基づいて前記隣接画像のデータ表現を組み合わせて、前記マイクロアレイのデータ表現を生成するステップと、
前記マイクロアレイの前記データ表現を解析して、サンプルの特性又は特徴を決定するデータ表現解析ステップと、を備える方法。 - 請求項68記載の方法において、前記データ表現それぞれは複数個の形体の列を有し、前記比較は、1つのデータ表現の1列における信号値を隣接するデータ表現の1列における信号値と比較するステップを有し、前記方法は、さらに、前記比較に基づいて相関値を計算するステップを備え、前記相関値が指定閾値を満足する場合、前記列は、同一形体を有するオーバーラップ列として指定される、方法。
- 請求項68記載の方法において、前記データ表現それぞれは複数個の形体の列を有し、前記比較は、1つのデータ表現の複数列における信号値を隣接するデータ表現の複数列における信号値と比較するステップを有し、前記方法は、さらに、前記比較に基づいて相関値を計算するステップを備え、前記相関値が指定閾値を満足する場合、前記列は、同一形体を有するオーバーラップ列として指定される、方法。
- 請求項68記載の方法において、組合せ操作は隣接画像の各対に対して反復して行って、前記マイクロアレイのデータ表現を生成する、方法。
- 請求項68記載の方法において、前記マイクロアレイのデータ表現を解析するステップは、前記マイクロアレイのデータ表現内における形体数を期待形体数と比較した後に実施する、方法。
- 請求項68記載の方法において、前記マイクロアレイの形体は、既知のサイズ及び形状、並びに前記マイクロアレイ内での形体相互間における既知の順序又は配列を有する、方法。
- 請求項68記載の方法において、前記形体それぞれは、対応画像における複数個のピクセルに対応する、方法。
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