JP2018502120A - 組合せ腫瘍免疫療法 - Google Patents

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Abstract

ある特定のCpGオリゴヌクレオチド(CpG ODN)の局所投与、ならびに抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、および/または抗CTLA−4抗体など、チェックポイント阻害剤の全身投与を使用して、がんを処置するための方法が提供される。好ましい実施形態では、CpG ODNは、インターロイキン10(IL−10)およびB細胞活性化と比べて、高量のインターフェロンアルファ(IFN−α)およびT細胞の活性化を誘導するそれらの傾向に基づき選択する。ある特定の実施形態では、方法は、組合せ免疫療法を強化するために、放射線療法による前処置をさらに含む。

Description

関連出願
この出願は、2014年12月31日に出願された米国仮特許出願第62/098,568号;2015年1月22日に出願された米国仮特許出願第62/106,526号および2015年2月19日に出願された米国仮特許出願第62/118,165号からの優先権を主張する。
多くの研究者は、腫瘍に対する免疫系を活性化させることにより、がんを処置しようと望んできた。しかし、時折の成功にも拘らず、免疫療法への持続的な応答は、希少であり、いくつかの腫瘍型だけに限定されている。当業者におけるがん免疫療法についての最新の理解については、例えば、ChenおよびMellman、Immunity、2013年、39巻(1号):1〜10頁を含む、近年の総説論文にまとめられている。腫瘍に対する治療的免疫応答を誘導するためのサイクルは、7つの、顕著に異なるステップ(図1):
1.がん細胞抗原の放出;
2.抗原提示細胞(APC;通例、流入領域リンパ節内のAPC)によるがん細胞抗原の提示;
3.T細胞のプライミングおよび活性化;
4.CD8T細胞の、腫瘍への輸送;
5.CD8T細胞の、腫瘍内への浸潤;
6.浸潤CD8T細胞によるがん細胞の認識;ならびに
7.がん細胞の殺滅
へと分けることができる。
当技術分野では、抗腫瘍応答の各ステップの、複数の負のメディエーターおよび正のメディエーターが教示されている。近年の研究上の関心は、負のメディエーターが、抗腫瘍免疫応答の阻害において果たす役割の理解およびこれに対する対処に焦点を当てている。例えば、インターロイキン10(IL−10)は、複雑な効果を有し、局所的には、腫瘍内で免疫抑制性であるが、全身では、実際に抗腫瘍活性を有する因子である(VicariおよびTrinchieri、Immunol. Rev.、2004年において、総説されている)。TLR9活性化CpGオリゴヌクレオチド(CpG ODN)などのToll様受容体(TLR)アゴニストは、抗腫瘍応答を促進しうる免疫刺激性効果を及ぼすが、当技術分野ではまた、IL−10などの免疫抑制性因子を誘導することも公知である(Lu、Frontiers Immunol、2014年において、総説されている)。当技術分野では、低量のIL−10の産生を誘導する結果として、抗腫瘍効果を改善した、TLR9アゴニストのデザインについては教示されていない。以上にも拘らず、腫瘍免疫のサイクルについての、近年におけるこの理解の増大により、腫瘍に対する治療的免疫応答を誘導するために、このサイクル内の異なる地点で作用する薬剤の組合せを使用することにより、がん免疫療法の臨床有効性を増大させることが可能でありうるという認識が高まっているが、当技術分野は、多くの異なる可能な組合せのうちのいずれが好ましいのかを予測するのに十分に深い、がんの免疫生物学についての理解をもたらしてはいない。
抗がんT細胞応答の発生について考慮する、別の可能な方途は、KimおよびCantor、Cancer Immunol Res、2014年、2巻:929〜936頁によりまとめられ、図2に提示された、T細胞応答の誘導についての3シグナルモデルである。このモデルでは、T細胞へのシグナル1は、APCによる、適切なMHC上における、T細胞受容体への、抗原の提示から生じる。シグナル2は、T細胞上のCD28の、APC上のB7−1またはB7−2による相互作用を介する共刺激性シグナルの必要条件である(このシグナルは、Treg上に存在するCTLA−4によりアンタゴナイズされる:がん免疫療法における、抗CTLA−4抗体の有効性は、それらによる、この「オフ」シグナルに対する阻害から生じる)。最後に、シグナル3は、炎症性サイトカイン受容体およびPD−1を介するシグナルから生じる、T細胞機能のモジュレーションである。特に、がん免疫療法の成功に極めて重要であることが公知である、最適のCD8T細胞応答を誘導するために、I型IFNシグナル伝達は、極めて正のシグナルであるが、慢性化し、長引くと、逆説的にまた、PD−1発現の上方調節により媒介されるT細胞疲弊および非応答性ももたらしうる。したがって、それに対する抗体、または抗腫瘍免疫を調節する、その主要なリガンドである、PD−L1に対する抗体による、PD−1の遮断は、腫瘍微小環境内で増殖し、サイトカインを産生するT細胞の能力を回復させる。
ChenおよびMellman、Immunity(2013年)39巻(1号):1〜10頁 KimおよびCantor、Cancer Immunol Res(2014年)2巻:929〜936頁
近年、CTLA−4、PD−1、およびそのリガンドであるPD−L1などのチェックポイント分子の負の免疫効果を遮断する抗体などの「チェックポイント阻害剤」(CPI)化合物の使用による、いくつかの早期臨床における成功がなされている。抗CTLA−4抗体の全身投与は、黒色腫を伴う患者のうちの約10%において、持続的な応答をもたらし、他の腫瘍型においても、何らかの有望な早期結果をもたらしたが、その代償として、一部の患者における、死を含む、高比率の有害作用が生じた。抗PD−1/PD−L1ヒト臨床試験もまた、見かけ上、重度の毒性の比率が低い、有望な結果について報告している。しかし、応答患者についての解析は、複数の異なる種類のがんにわたって、抗PD−L1療法への応答は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)、および腫瘍内の遺伝子発現のTh1パターンを伴う患者に比較的制約されていることを明らかにした(Powlesら、Nature、2014年、515巻:558頁;Herbstら、Nature、2014年、515巻:563頁;Tumehら、Nature、2014年、515巻:568頁)。すなわち、腫瘍に対する既存の免疫を伴う一部の患者では、応答が見られうるが、これを伴わない患者では、応答が生じる可能性は全く低い。既存の抗腫瘍免疫が比較的一般的である黒色腫を別とすると、他の大半の腫瘍型では、TILが、比較的まれであることから、大半の種類のがんでは、CPIの利益は限定されうることが指し示される。こうして、がん治療のためのCPIの有効性を改善することが必要とされている。
本発明は、免疫活性化を促進し、かつ、免疫阻害を低減し、こうして、比喩的には、免疫系の「アクセルを踏み」、かつ、「ブレーキを外し」て、がんを処置するための方法を提供する。本発明を使用して、例えば、「冷たい」(処置抵抗性または不応性の)がんまたは腫瘍を、チェックポイント阻害による処置を含む処置に適する、「熱い」がんまたは腫瘍へと転換することができる。
本発明は、過去のがん免疫療法において最も広く使用されたCpG ODNと比較して、ホスホロチオエート修飾の量が低減された、CpG ODNの特異的亜型、ならびにこれらの治療単独、または他の組合せのいずれかに応答する可能性が低いがんを含むがんの免疫療法を改善するために、CPIおよび/または放射線療法(XRT)と組み合わせた、それらの腫瘍内投与および腫瘍周囲投与のための方法を提供する。
CpG ODNは、2つの種類のヒト免疫細胞:増殖し、免疫グロブリンを分泌することにより、TLR9刺激に応答するB細胞、および大量のI型IFN(IFN−αおよびIFN−β)を分泌することにより、TLR9刺激に応答する形質細胞様樹状細胞(pDC)だけにおいて構成的に発現する生得免疫受容体であるTLR9に結合し、これを刺激する。本発明は、少なくとも部分的に、CpG ODNに対するIFN−α応答が、腫瘍免疫療法に重要であるという知見に基づく。本発明は、少なくとも部分的に、CpG ODNに対する強力なIFN−α応答が、CpG ODNの腫瘍内投与を使用する腫瘍免疫療法を含む腫瘍免疫療法に重要であるという知見に基づく。
本発明の、好ましいCpG ODNは、少なくとも部分的に、高量のI型IFNを誘導する、それらの傾向により特徴付けられる。
I型IFNは、腫瘍の拒絶において、鍵となる役割を果たすと考えられる。例えば、I型IFNは、CD8T細胞の、生存、拡大、およびエフェクター分化を増進し;樹状細胞(DC)の成熟、腫瘍関連抗原の、CD8T細胞への交差提示を促進し;発癌物質誘導性腫瘍に対する免疫監視に要求され;移植された腫瘍の拒絶に要求される。加えて、I型IFN関連mRNAのレベルは、ヒト転移における腫瘍浸潤リンパ球(TIL)とも相関する。
他の何よりも高レベルのI型IFNを誘導することに加えて、CpG ODNなどのTLR9リガンドはまた、pDCも活性化させ、何百もの他のTh1促進性遺伝子およびTh1促進性因子の分泌を誘導し;pDCを、未成熟/寛容促進性表現型から、成熟、活性化、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)誘導性表現型へと転換する。
本発明はまた、少なくとも部分的に、CpG ODNの、腫瘍への送達は、腫瘍内および腫瘍近傍の局所血管系における接着分子の発現を、(直接的または間接的に)誘導し、活性化T細胞(CD4およびCD8)の、毛細血管から、腫瘍および周囲領域への放出を促進するという知見にも基づく。これらのT細胞のうちの一部は、変異していない腫瘍関連抗原(TAA)にも、変異したTAAにも特異的であろう。チェックポイント阻害剤および/またはXRTの非存在下では、これらのT細胞は、腫瘍により阻害されうるが、組み合わせると、これは、CpGまたはチェックポイント阻害剤またはXRT自体により達成されうる抗腫瘍効果より、はるかにより強力な抗腫瘍効果を創出する。
ある特定の態様における本発明は、がん免疫療法のために従来使用されてきたもの以外のCpG ODNクラスの使用に基づく。特に、ある特定の態様における本発明は、高IFN−α分泌クラスであるクラスAおよびクラスE(過去において広く使用されてきたクラスB CpG ODNと比較して、ホスホロチオエート(PS)修飾の量が低減している)の使用に基づく。クラスB CpG ODNは、ヌクレアーゼに対するそれらの抵抗性およびB細胞活性化の大きさを増大させるように、完全にホスホロチオエート修飾されていることが典型的である。これに対し、本発明の焦点は、B細胞活性化ではなく、高度なI型IFN応答を達成することであるので、本発明の、好ましいCpG ODNは、ホスホロチオエート修飾を有さないか、または5’末端における1もしくは2カ所だけのホスホロチオエート修飾、および3’末端における1〜4カ所のホスホロチオエート修飾を有する。本発明の、好ましいクラスE ODNはまた、CpGジヌクレオチドにおいて、ホスホジエステル(PO)連結も含有し、任意選択で、B細胞活性化(ならびに、共時的な、IL−10およびインドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO)の誘導)を低減するために、ODN内の他の位置においても、PO連結を含有し、また、二重鎖またはコンカタマーを形成するように、1または複数のパリンドロームを含有することも好ましい。
当業者は、ヒトがん患者における、腫瘍内CpGまたは腫瘍周囲CpGは、腫瘍流入領域リンパ節内のAPCを活性化させ、がん免疫サイクルのステップ2(図3を参照されたい)を増強することを理解する。しかし、当業者により十分に理解されていないことは、高IFN誘導性CpG ODNの、この投与経路がまた、TILも誘導し、腫瘍の微小環境を、臨床的に有益な抗腫瘍免疫の誘導を助長する、よりTh1様の状態へと転換することである。高IFN誘導性CpG ODNの腫瘍内投与は、とりわけ、CD8T細胞浸潤を含む、腫瘍へのT細胞浸潤を誘導する。このことの重要性は、腫瘍への、このCD8T細胞浸潤は、抗PD−1または抗PD−L1による処置に対する応答についての、最良の予測因子と考えられることである。過去において実施された、CpGオリゴヌクレオチドの腫瘍内投与を伴うヒト臨床試験では、クラスB ODNが使用されたため、腫瘍内のIL−10の著明な局所産生がなされ、抗腫瘍免疫応答を阻害したであろう。本発明は、改善された、好ましいCpG ODNを特色とするほか、過去において使用されたクラスB ODNと比較して、低量のIL−10産生および高量のI型IFN分泌を誘導するCpG ODNをデザインし、その同定のためにスクリーニングする。このような好ましいCpG ODNは、本発明の方法を使用して、チェックポイント阻害剤と組み合わせた場合のがん治療において、相乗作用の改善をもたらすであろう。
本発明の態様は、がん性腫瘍を処置する方法であって、それを必要とする被験体へと、有効量のTLR9アゴニストおよびチェックポイント阻害剤(CPI)を投与するステップを含み、TLR9アゴニストを、腫瘍内に投与するか、または腫瘍に実質的に隣接させて投与する方法である。
本発明の態様は、がん性腫瘍を処置する方法であって、それを必要とする被験体へと、有効量の放射線療法、TLR9アゴニスト、およびチェックポイント阻害剤(CPI)を投与するステップを含み、放射線療法を、TLR9アゴニストの投与の前に開始し、TLR9アゴニストを、腫瘍内に投与するか、または腫瘍に実質的に隣接させて投与する方法である。
本発明の態様は、がん性腫瘍を処置する方法であって、それを必要とする被験体へと、有効量のTLR9アゴニスト、第1のチェックポイント阻害剤(CPI)、および第2のCPIを投与するステップを含み、TLR9アゴニストおよび第1のCPIを、腫瘍内に投与するか、または腫瘍に実質的に隣接させて投与し、第2のCPIを全身投与する方法である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、IFN−αを誘導する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、CpG DNA、例えば、CpG ODNである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、クラスA CpG DNAの配列は、GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG(配列番号82)である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスC CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスE CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA/E CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスP CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、CpG DNAを含むTLR9アゴニストは、全体がホスホジエステル骨格により連結されている。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、5‘末端における、ただ1つのホスホロチオエートヌクレオチド間連結と、3‘末端における、ただ1つのホスホロチオエートヌクレオチド間連結とを伴う、CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、単一のホスホロチオエート連結を伴うCpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、環状であり、天然のホスホジエステルDNA骨格を伴う。
ある特定の実施形態では、CPIを全身投与する。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1、PD−L1、CTLA−4、TIM3、およびLAG3からなる群より選択される抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1、PD−L1、およびCTLA−4からなる群より選択される、1または複数の抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1、PD−L1、およびCTLA−4からなる群より選択される抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される臓器もしくは組織のがん性腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、黒色腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、骨髄のがんである。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、カルチノイド腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、神経芽細胞腫である。
ある特定の実施形態では、被験体は、ヒトである。
図1(先行技術)は、7つのステップについて描示する、がん免疫サイクルについての概略表示である。ChenおよびMellman、Immunity、2013年による。
図2は、抗腫瘍免疫を誘導するために必要とされる、3つのシグナルについての概略表示である。各T細胞は、特異的MHCとの関係で特異的抗原を認識する、固有のTCRを発現させる(シグナル1)。CD4/CD8共受容体は、TCRによる抗原認識の感受性を増大させる。最適なT細胞の拡大およびエフェクター機能の獲得は、共刺激性受容体により伝達されるシグナル(シグナル2)を要求する。CD28−B7−1/B7−2相互作用が、活性化シグナルを送達するのに対し、CTLA−4−B7−1/B7−2相互作用は、T細胞活性化を阻害する。CD28およびCTLA−4を介するシグナル伝達はまた、CD4 Tregの発生および機能に極めて重要でもある。炎症性シグナルは、PD−1を含む、表面サイトカイン受容体および他の受容体の上方調節を誘導することが多い(シグナル3)。PD−1の発現は、感染症およびがんにおける、T細胞内の疲弊表現型の獲得と関連する。PD−1−PD−L1相互作用は、TFR活性の阻害に関与し、また、pTregの生成にも関与している。抗CTLA−4 Ab、抗PD−1 Ab、および抗PD−L1 Abを使用する、チェックポイントの遮断に関する、前臨床データおよび臨床データは、抗腫瘍免疫の増大は、Teff活性の増強と、CD4 Tregによる枯渇または低減された抑制との組合せ効果により達成されることを示唆する。KimおよびCantor、Cancer Immunol. Res.、2014年、2巻:926〜936頁による。
図3は、CpG ODN、CPI、およびXRTについての役割を描示する、がん免疫サイクルについての概略表示である。出典:ChenおよびMellman、Immunity、2013年。
図4は、セット1のCpG−Aオリゴヌクレオチドについて、IFN−α誘導を描示するグラフである。PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照である。
図5は、選択されたセット1のCpG−Aオリゴヌクレオチドについて、IFN−α誘導を描示するグラフである。PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照である。
図6は、セット2のCpG−Aオリゴヌクレオチドについて、IFN−α誘導を描示するグラフである。Y軸:pg/mL単位のIFN−αである。PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照であり;TE:トリス−EDTAである。
図7は、セット2のCpG−Aオリゴヌクレオチドについて、インターロイキン10(IL−10)誘導を描示するグラフである。Y軸:pg/mL単位のIL−10である。PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照であり;TE:トリス−EDTAである。
図8は、ホスホロジチオエート骨格修飾の、セット3のCpG−AオリゴヌクレオチドによるIFN−α誘導に対する効果について描示するグラフである。
図9は、CpG−AオリゴヌクレオチドであるG10における、5’側Gおよび/もしくは3’側Gの数を低減すること、またはパリンドロームを変化させることの、正常ヒト末梢血単核細胞(PBMC)からのIFN−α分泌の誘導に対する構造−活性関係について描示するグラフである。nAb:新型の抗Qb抗体;oAb:旧型の抗Qb抗体;PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照である。
図10は、CpG−AオリゴヌクレオチドであるG10における、5’側Gおよび/もしくは3’側Gの数を低減すること、またはパリンドロームを変化させることの、正常ヒト末梢血単核細胞(PBMC)からのIP−10分泌の誘導に対する構造−活性関係について描示するグラフである。nAb:新型の抗Qb抗体;oAb:旧型の抗Qb抗体;PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照である。
図11は、CpG−AオリゴヌクレオチドであるG10における、5’側Gおよび/もしくは3’側Gの数を低減すること、またはパリンドロームを変化させることの、正常ヒト末梢血単核細胞(PBMC)からのIL−10分泌の誘導に対する構造−活性関係について描示するグラフである。nAb:新型の抗Qb抗体;oAb:旧型の抗Qb抗体;PBS:リン酸緩衝生理食塩水対照である。
図12は、A20リンパ腫保有マウスにおける腫瘍体積について描示するグラフの対である。処置を開始したら、ウイルス様粒子(VLP)がオプソニン化され、DCを活性化させるように、全てのマウスを、低用量(20μg)のCMP−001でプライミングして、抗Qb抗体を誘導した。0日目に、マウスの両方の脇腹に、リンパ腫細胞を接種した。7日目に開始して、マウスの一方の側(処置側)における腫瘍に、CpG(CMP−001)または生理食塩水を直接注射する一方、他方の側(非処置側)における腫瘍には、これらを注射しなかった。次いで、マウスにはまた、表示の通り、毎週2回、腹腔内抗PD−1または生理食塩水も施した。パネルAにおけるグラフは、「非処置」(遠位側)腫瘍について、平均腫瘍体積を描示する。パネルBにおけるグラフは、「処置」腫瘍について、平均腫瘍体積を描示する。各群について、N=10とする。
図13は、図12の実験におけるマウスについて、生存曲線を描示するグラフである。
Toll様受容体(TLR)リガンドは一般に、APCによるがん細胞抗原の提示の潜在的な誘導因子であることが公知である。しかし、どのような特定のTLRリガンドが好ましいのかは、いまだかつて知られておらず、TLR9リガンドの場合であってもなお、存在する場合に、どのクラスのCpG ODNが好ましいのかも、それらの好ましい用量および投与経路も、いまだかつて知られていない。腫瘍学における、CpG ODNについての、ほぼ全てのヒト臨床試験では、全身経路を介して投与されるクラスB ODNが使用されているが、いくつかの試験では、腫瘍内投与について探索されている(下記でさらに論じる)。
免疫刺激性CpGオリゴデオキシヌクレオチド(ODN)についての本発明ならびにCpG ODNの多様なクラスおよびデザインについてのその後の発明は、がん免疫療法のための新たな機会をもたらしている。齧歯動物モデルにおける有望な前臨床データに基づき、CpG ODNについてのヒト臨床試験が、腫瘍学患者において、いくつかの異なるCpG ODNの全身投与および腫瘍内投与を、単独で、または多様な化学療法レジメン、ワクチン、抗体、および放射線療法と組み合わせて使用して実施されているが、ここでもまた、臨床応答は、一部の有望な早期臨床試験結果にも拘らず、まれであり、フェーズ3試験は、これまでのところ、失敗している(Krieg、Nucleic Acid Ther.、2012年、22巻(2号):77〜89頁において、総説されている)。したがって、がん免疫療法の成功率を増大させるように改善された、オリゴヌクレオチド治療アプローチが必要とされている。
がん患者に、保存的な、変異していない自己抗原を、アジュバントと併せてワクチン接種する腫瘍ワクチンは、多年にわたり、免疫腫瘍学者の目標であったが、選択された抗原に対して免疫を誘導することには成功したにも拘らず、明確な臨床利益を送達することには、ほぼ一様に失敗している。クラスB CpG ODNは、複数のがんワクチン臨床試験において、抗腫瘍CD8T細胞応答の誘導を増強しており(例えば、Kruitら、J Clin Oncol、2013年;Tarhiniら、J Immunother、2013年;Lovgrenら、Cancer Immunol Immunother、2012年;Karbachら、Clin Cancer Res、2011年;Karbachら、Int J Cancer、2010年;Speiserら、JCI、2005年)、単一の試験では、非修飾クラスA CpG ODNが、ワクチンアジュバントとして使用された(Speiserら、J. Immunother、2010年)が、これらは、臨床応答とほとんど関連しておらず、MAGE−3腫瘍抗原を使用して、GSK(GlaxoSmithKline)により行われた、この手法についてのフェーズ3臨床試験も、これまでのところ、失敗したと考えられている。特に、クラスA CpG ODNを使用するワクチン臨床試験が、CTL応答の比較的弱い誘導であって、当技術分野の最新技術を指し示す、クラスB CpG ODNを使用して、かつてワクチン接種された黒色腫患者における、CTL応答の、平均約10倍の増大と比較して、患者の約半数だけにおける、ベースラインから約2倍増大させる誘導を示したことは、注目に値する。免疫系は、変異していない自己抗原に対する自己寛容を、腫瘍を拒絶するのに十分な程度まで容易には克服しない可能性があることから、当業者の多くは、代替的な、変異した腫瘍抗原に対する腫瘍免疫を誘導する方途への探索に向かった。腫瘍トランスクリプトームのディープシーケンシングを使用する、近年の研究は、全てのがんは、腫瘍特異的新生抗原と称する、可変数の固有の変異した抗原を含有することを明らかにしており(Rajasagiら、Blood、2014年、124巻(3号):453〜462頁)、当業者は、抗腫瘍免疫応答を、このような抗原に対して方向付ける方途を探索している。追求されている1つの手法は、これらの新生抗原の一部または全部を、ペプチドとして合成し、ウイルス様粒子などの製剤により、かつ、CpGクラスB ODNなど、極めて強力なアジュバントを使用して、がん患者に、クラスII MHC上に提示される、適切な抗原性ペプチドをワクチン接種することである。このような手法は、極めて複雑であり、開発が極めて高価であろう。したがって、腫瘍特異的新生抗原に対する抗腫瘍免疫応答を誘導する、改善された方法が必要とされている。
本発明は、TLR9アゴニストを使用して、強力な細胞介在性免疫を誘導しながら、チェックポイント阻害剤の「ブレーキ」を解除するように、腫瘍の微小環境を変更することにより、腫瘍自体を、ワクチンへと変換することを介する、優れた手法を提供する。
放射線療法は、がんの処置において、長く使用されており、現在、充実性腫瘍を伴う患者のうちの、約60%の処置で利用されている(Prasannaら、J Thoracic Dis. 2014年、6巻(4号):287〜302頁において、総説されている)。放射線療法は、腫瘍を退縮させうることが多いが、この効果は、待期的であることが極めて多く、持続的な応答は、極めてまれである。さらに、放射線療法は一般に、1つまたは少数の腫瘍病変の処置だけに適し、このため、転移性がんの処置では一般に使用されない。
一部のまれな場合には、XRTは、照射された病変だけでなく、また、遠隔転移においても存在する腫瘍抗原に対する特異的免疫応答の誘導の結果として、遠隔腫瘍塊の退縮をもたらしうる。これを、「アブスコパル効果」と称し、特に、Postowら(N. Engl. J. Med.、2012年、366巻(10号):925〜31頁)による近年の症例報告以来、この用語は、放射線療法だけでなく、局所化された腫瘍治療の他の形態も含むように使用されている。
アブスコパル効果は、XRTを、抗CTLA−4療法の前または後に施す場合に見ることができる:例えば、抗CTLA−4療法後において、XRTで処置された、21例の黒色腫患者のうちの半数を超える患者は、遠位腫瘍退縮についての証拠を示した(Grimaldiら、Oncoimmunol.、2014年、3巻:e28780頁)。
I.定義
本明細書でそうでないことが規定されない限り、本発明との関連で使用される科学用語および技術用語は、当業者により一般的に理解される意味を有するものとする。さらに、文脈によりそうでないことが要求されない限り、単数形の用語は、複数形を含むものとし、複数形の用語は、単数形を含むものとする。一般に、本明細書で記載される、細胞培養および組織培養、分子生物学、免疫学、微生物学、遺伝学、ならびにタンパク質化学および核酸化学およびハイブリダイゼーションとの関連で使用される命名法、ならびにこれらについての技法は、周知の命名法および技法であり、当技術分野において一般的に使用されている命名法および技法である。
本発明の方法および技法は一般に、そうでないことが指し示されない限り、当技術分野において周知の方法、ならびに本明細書を通して引用され、論じられている、多様な、一般的参考文献およびより特殊な参考文献において記載されている方法に従い実施される。このような参考文献は、例えば、参照により本明細書に組み込まれる、SambrookおよびRussell、「Molecular Cloning, A Laboratory Approach」、Cold Spring Harbor Press、Cold Spring Harbor、N.Y.(2001年)、Ausubelら、「Current Protocols in Molecular Biology」、John WileyおよびSons、NY(2002年)、ならびにHarlowおよびLane、「Antibodies: A Laboratory Manual」、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.(1990年)を含む。酵素的反応技術および精製技術は、当技術分野において一般的に達せられる通り、または本明細書で記載されている通り、製造元の仕様に従い実施される。本明細書で記載される、分析化学、有機合成化学、ならびに創薬化学および製薬化学との関連で使用される命名法、ならびにこれらについての実験室手順および実験室技法は、周知であり、かつ、当技術分野において一般的に使用されている、命名法ならびに実験室手順および実験室技法である。化学合成、化学的分析、医薬の調製、製剤化、および送達、ならびに患者の処置のためには、標準的な技法が使用される。
本明細書で使用される、以下の用語の各々は、本節において、これと関連する意味を有する。
本明細書では、冠詞の「ある(a)」および「ある(an)」を、冠詞の文法的対象物のうちの1つまたは1つを超える対象物(すなわち、少なくとも1つの対象物)を指すのに使用する。例としては、「ある要素」とは、1つの要素または1つを超える要素を意味する。
本明細書で使用される、従来の20のアミノ酸およびそれらの略号は、従来の使用法に従う。参照により本明細書に組み込まれる、「Immunology−−A Synthesis」(2版、E. S. GolubおよびD. R. Gren編、Sinauer Associates、Sunderland、Mass.(1991年))を参照されたい。
本明細書では、従来の表記法を使用して、ポリペプチド配列を書き表す。ポリペプチド配列の左端を、アミノ末端とし、ポリペプチド配列の右端を、カルボキシル末端とする。
「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基を、化学的特性(例えば、電荷または疎水性)が類似する側鎖R基を有する、別のアミノ酸残基で置換する置換である。一般に、保存的アミノ酸置換は、タンパク質の機能的特性を、実質的に変化させないであろう。2つまたはそれ超のアミノ酸配列が、保存的置換により互いと異なる場合、配列同一性パーセントまたは類似性の程度を上方に調整して、置換の保存的性質について補正することができる。当業者には、この調整を行うための手段が周知である。例えば、Pearson、Methods Mol. Biol.、243巻:307〜31頁(1994年)を参照されたい。
化学的特性が類似する側鎖を有するアミノ酸の群の例は、1)脂肪族側鎖:グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシン;2)脂肪族−ヒドロキシル側鎖:セリンおよびトレオニン;3)アミド含有側鎖:アスパラギンおよびグルタミン;4)芳香族側鎖:フェニルアラニン、チロシン、およびトリプトファン;5)塩基性側鎖:リシン、アルギニン、およびヒスチジン;6)酸性側鎖:アスパラギン酸およびグルタミン酸;ならびに7)硫黄含有側鎖:システインおよびメチオニンを含む。好ましい保存的アミノ酸置換基は、バリン−ロイシン−イソロイシン、フェニルアラニン−チロシン、リシン−アルギニン、アラニン−バリン、グルタメート−アスパルテート、およびアスパラギン−グルタミンである。
代替的に、保存的置き換えとは、参照により本明細書に組み込まれる、Gonnetら、Science、256巻:1443〜45頁(1992年)において開示されている、PAM250対数尤度行列において正の値を有する、任意の変化でもある。「中程度に保存的」置き換えとは、PAM250対数尤度行列において、負でない値を有する、任意の変化である。
好ましいアミノ酸置換は、(1)タンパク質分解に対する感受性を低減するアミノ酸置換、(2)酸化に対する感受性を低減するアミノ酸置換、(3)タンパク質複合体を形成するために、結合アフィニティーを変更するアミノ酸置換、および(4)このような類似体の、他の物理化学的特性または機能的特性を付与するかまたは改変するアミノ酸置換である。置換、欠失、および/または挿入を含む類似体は、天然に存在するペプチド配列以外の配列の多様な変異タンパク質を含みうる。例えば、単一または複数のアミノ酸置換(好ましくは、保存的アミノ酸置換)を、天然に存在する配列内(好ましくは、分子間接触を形成するドメインの外部のポリペプチドの部分内)に施すことができる。保存的アミノ酸置換は、親配列の構造的特徴を実質的に変化させないものとする(例えば、置き換えアミノ酸は、親配列内に生じるヘリックスを切断したり、親配列を特徴付ける、他の種類の二次構造を破壊したりする傾向がないものとする)。当技術分野で認知されたポリペプチドの二次構造および三次構造の例については、それらの各々が参照により本明細書に組み込まれる、「Proteins, Structures and Molecular Principles」(Creighton編、W. H. Freeman and Company、New York(1984年));「Introduction to Protein Structure」(C. BrandenおよびJ. Tooze編、Garland Publishing、New York、N.Y.(1991年));ならびにThorntonら、Nature、354巻:105頁(1991年)において記載されている。
ポリペプチドの配列類似性は、配列解析ソフトウェアを使用して測定することが典型的であり、ポリペプチドの配列同一性についても同様である。タンパク質解析ソフトウェアは、保存的アミノ酸置換を含む、多様な置換、欠失、および他の修飾へと割り当てられる、類似性の尺度を使用して、類似する配列をマッチさせる。例えば、GCGは、異なる種の生物に由来する、相同なポリペプチドなど、近縁のポリペプチドの間の配列相同性もしくは配列同一性、または野生型タンパク質とその変異タンパク質との配列相同性もしくは配列同一性を決定するのに、デフォルトのパラメータで使用しうる、「Gap」および「Bestfit」などのプログラムを含有する。例えば、GCG Version 6.1を参照されたい。ポリペプチド配列はまた、、デフォルトまたは推奨されるパラメータを使用するFASTA(GCG Version 6.1内のプログラム)を使用して比較することもできる。FASTA(例えば、FASTA2およびFASTA3)は、クェリー配列および検索配列の間のアラインメント、および最良の重複領域の配列同一性パーセントを提示する(Pearson、Methods Enzymol.、183巻:63〜98頁(1990年);Pearson、Methods Mol. Biol.、132巻:185〜219頁(2000年))。本発明の配列を、異なる生物に由来する多数の配列を含有するデータベースと比較する場合の、別の好ましいアルゴリズムは、デフォルトのパラメータを使用するコンピュータプログラムである、BLAST、とりわけ、blastpまたはtblastnである。例えば、参照により本明細書に組み込まれる、Altschulら、J. Mol. Biol.、215巻:403〜410頁(1990年);Altschulら、Nucleic Acids Res.、25巻:3389〜402頁(1997年)を参照されたい。
インタクトな「抗体」は、ジスルフィド結合により相互接続された、少なくとも2つの重(H)鎖および2つの軽(L)鎖を含む。一般に、「Fundamental Immunology」、7章(Paul, W.編、2版、Raven Press、N.Y.(1989年))(全ての目的で、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。各重鎖は、重鎖可変領域(HCVRまたはV)および重鎖定常領域(C)から構成される。重鎖定常領域は、3つのドメインである、CH1、CH2、およびCH3から構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(LCVRまたはV)および軽鎖定常領域から構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメインである、Cから構成される。V領域およびV領域は、フレームワーク領域(FR)と称する、より保存的な領域を散在させた、相補性決定領域(CDR)と称する、超可変性を有する領域へと、さらに細分することができる。各VおよびVは、アミノ末端から、カルボキシ末端へと、以下の順序:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4で並べられる、3つのCDRおよび4つのFRから構成される。アミノ酸の、各ドメインへの割当ては、Kabat、「Sequences of Proteins of Immunological Interest」(National Institutes of Health、Bethesda、Md.(1987年および1991年))、またはChothiaおよびLesk、J. Mol. Biol.、196巻:901〜917頁(1987年);Chothiaら、Nature、342巻:878〜883頁(1989年)による定義に従う。
重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合性ドメインを含有する。抗体の定常領域は、免疫系の多様な細胞(例えば、エフェクター細胞)および古典的補体系の第1成分(C1q)を含む、宿主組織または因子への、免疫グロブリンの結合を媒介しうる。
「抗体」という用語は、インタクトな抗体の抗原結合性部分であって、インタクトな抗体の抗原、例えば、PD−1に特異的に結合する能力を保持する抗原結合性部分を含みうる。抗原結合性部分は、組換えDNA技術により作製することもでき、インタクトな抗体の酵素的切断または化学的切断により作製することもできる。
抗原結合性断片の例は、(i)Vドメイン、Vドメイン、Cドメイン、およびCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片;(ii)ヒンジ領域におけるジスルフィド架橋により連結された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab’)断片;(iii)VドメインおよびCH1ドメインからなる、Fd断片;(iv)抗体の単一のアームのVドメインおよびVドメインからなる、Fv断片;(v)Wardら、Nature、341巻:544〜546頁(1989年)において記載されている、Vドメインからなる、単一ドメイン抗体(「dAb」);ならびに(vi)単離相補性決定領域(CDR)を含む。さらに、Fv断片の2つのドメイン、VとVとを、別個の遺伝子によりコードさせるが、組換え法を使用して、それらが単一のタンパク質鎖となることを可能とする合成リンカーにより接合することができ、この場合、V領域とV領域とは、対合して、一価分子を形成する(単鎖Fv(scFv)として公知である;例えば、Birdら、Science、242巻:423〜426頁(1988年);およびHustonら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、85巻:5879〜5883頁(1988年)を参照されたい)。「抗体」という用語への言及により、このような単鎖抗体も含まれる。
「二特異性抗体」は、2つの異なる結合特異性を有する(例えば、米国特許第5,922,845号および米国特許第5,837,243号;Zeilder、J. Immunol.、163巻:1246〜1252頁(1999年);Somasundaram、Hum. Antibodies、9巻:47〜54頁(1999年);Keler、Cancer Res.、57巻:4008〜4014頁(1997年)を参照されたい)。例えば、本発明は、ヒトPD−1などの細胞表面抗原に対する、1つの結合性部位と、エフェクター細胞の表面上のFc受容体に対する、第2の結合性部位とを有する二特異性抗体を提供する。本発明はまた、少なくとも3つの結合性部位を有する、多特異性抗体も提供する。
本発明では、任意の2つの異なるチェックポイント阻害剤に結合する二特異性抗体が企図される。例えば、異なるCPIは、PD−1、PD−L1、CTLA−4、TIM3、およびLAG3からなる群より選択することができる。こうして、例えば、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1、PD−1およびCTLA−4、PD−1およびTIM3、PD−1およびLAG3、PD−L1およびCTLA−4、PD−L1およびTIM3、PD−L1およびLAG3、CTLA−4およびTIM3、ならびにCTLA−4およびLAG3、またはTIM3およびLAG3に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1、PD−1およびCTLA−4、PD−1およびTIM3、またはPD−1およびLAG3に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−L1およびCTLA−4、PD−L1およびTIM3、PD−L1およびLAG3に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1、またはPD−1およびCTLA−4に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−L1およびCTLA−4に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−L1およびCTLA−4に結合しうる。
本発明ではまた、任意の2つの異なるチェックポイント阻害剤に結合する二特異性抗体を使用する、本発明の方法も企図される。例えば、異なるCPIは、PD−1、PD−L1、CTLA−4、TIM3、およびLAG3からなる群より選択することができる。こうして、例えば、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1、PD−1およびCTLA−4、PD−1およびTIM3、PD−1およびLAG3、PD−L1およびCTLA−4、PD−L1およびTIM3、PD−L1およびLAG3、CTLA−4およびTIM3、ならびにCTLA−4およびLAG3、またはTIM3およびLAG3に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1、PD−1およびCTLA−4、PD−1およびTIM3、またはPD−1およびLAG3に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−L1およびCTLA−4、PD−L1およびTIM3、PD−L1およびLAG3に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1、またはPD−1およびCTLA−4に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−1およびPD−L1に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−L1およびCTLA−4に結合しうる。ある特定の実施形態では、二特異性抗体は、PD−L1およびCTLA−4に結合しうる。
「二特異性抗体」という用語は、「ダイアボディ(diabody)」をさらに含む。ダイアボディとは、VドメインおよびVドメインを、単一のポリペプチド鎖上で発現させるが、同じ鎖上の2つのドメインの間の対合を可能とするには短過ぎるリンカーを使用することにより、ドメインを、別の鎖の相補的なドメインと対合させ、2つの抗原結合性部位を創出する、二価の二特異性抗体(例えば、Holligerら、Proc. Natl. Acad. Sci. USA、90巻:6444〜6448頁(1993年);Pollakら、Structure、2巻:1121〜1123頁(1994年)を参照されたい)である。
本明細書で互換的に使用される「ヒト抗体」または「ヒト配列抗体」という用語は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列に由来する、可変領域および定常領域(存在する場合)を有する抗体を含む。本発明のヒト配列抗体は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列によりコードされないアミノ酸残基(例えば、in vitroにおけるランダム変異誘発もしくは部位特異的変異誘発、またはin vivoにおける体細胞変異により導入される変異)を含みうる。しかし、本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、マウスなど、別の哺乳動物種の生殖細胞系列に由来するCDR配列を、ヒトフレームワーク配列へとグラフトした「キメラ」抗体(すなわち、「ヒト化」抗体またはPRIMATIZED(商標)抗体)を含むことを意図しない。
本明細書で使用される「キメラ抗体」という用語は、2つまたはそれ超の異なる抗体に由来する領域を含む抗体を意味する。例えば、一実施形態では、CDRのうちの1または複数を、ヒト抗CTLA−4抗体から導出する。別の実施形態では、CDRの全てを、ヒト抗CTLA−4抗体から導出する。別の実施形態では、1つを超えるヒト抗CTLA−4抗体に由来するCDRを、キメラヒト抗体内で組み合わせる。例えば、キメラ抗体は、第1のヒト抗CTLA−4抗体の軽鎖に由来するCDR1、第2のヒト抗CTLA−4抗体の軽鎖に由来するCDR2、および第3のヒト抗CTLA−4抗体の軽鎖に由来するCDR3を含むことが可能であり、同様に、重鎖に由来するCDRも、1または複数の他の抗CTLA−4抗体から導出することができる。さらに、フレームワーク領域は、同じ抗CTLA−4抗体のうちの1つから導出することもでき、1または複数の異なるヒトから導出することもできる。
さらに別の例として、一実施形態では、CDRのうちの1または複数を、ヒト抗PD−1抗体から導出する。別の実施形態では、CDRの全てを、ヒト抗PD−1抗体から導出する。別の実施形態では、1つを超えるヒト抗PD−1抗体に由来するCDRを、キメラヒト抗体内で組み合わせる。例えば、キメラ抗体は、第1のヒト抗PD−1抗体の軽鎖に由来するCDR1、第2のヒト抗PD−1抗体の軽鎖に由来するCDR2、および第3のヒト抗PD−1抗体の軽鎖に由来するCDR3を含むことが可能であり、同様に、重鎖に由来するCDRは、1または複数の他の抗PD−1抗体から導出することができる。さらに、フレームワーク領域は、同じ抗PD−1抗体のうちの1つから導出することもでき、1または複数の異なるヒトから導出することもできる。
さらに別の例として、一実施形態では、CDRのうちの1または複数を、ヒト抗PD−L1抗体から導出する。別の実施形態では、CDRの全てを、ヒト抗PD−L1抗体から導出する。別の実施形態では、1つを超えるヒト抗PD−L1抗体に由来するCDRを、キメラヒト抗体内で組み合わせる。例えば、キメラ抗体は、第1のヒト抗PD−L1抗体の軽鎖に由来するCDR1、第2のヒト抗PD−L1抗体の軽鎖に由来するCDR2、および第3のヒト抗PD−L1抗体の軽鎖に由来するCDR3を含むことが可能であり、同様に、重鎖に由来するCDRは、1または複数の他の抗PD−L1抗体から導出することができる。さらに、フレームワーク領域は、同じ抗PD−L1抗体のうちの1つから導出することもでき、1または複数の異なるヒトから導出することもできる。
さらに、本明細書で既に論じた通り、キメラ抗体は、1つを超える種の生殖細胞系列配列から導出される部分を含む抗体を含む。
抗体に関して本明細書で使用される「競合する」という用語は、第1の抗体またはその抗原結合性部分が、結合について、第2の抗体またはその抗原結合性部分と競合することを意味し、この場合、第1の抗体の、その同族エピトープとの結合は、第2の抗体の存在下で、第2の抗体の非存在下における第1の抗体の結合と比較して、検出可能に減殺される。代替的に、第2の抗体の、そのエピトープとの結合が、第1の抗体の存在下で、検出可能に減殺される場合もありうるが、そうである必要はない。すなわち、第1の抗体は、第2の抗体が、第1の抗体の、そのそれぞれのエピトープへの結合を阻害することなしに、第2の抗体の、そのエピトープへの結合を阻害しうる。しかし、各抗体が、他の抗体の、その同族エピトープまたはリガンドとの結合を、検出可能に阻害する場合、それが同じ程度であれ、より大きな程度であれ、より小さな程度であれ、抗体は、互いと、それらのそれぞれのエピトープの結合について、「交差競合する」という。例えば、交差競合抗体は、本発明の抗体が結合するエピトープまたはエピトープの部分に結合しうる。本発明には、競合抗体および交差競合抗体のいずれもが包含される。このような競合または交差競合が生じる機構(例えば、立体障害、コンフォメーション変化、または共通のエピトープもしくはその部分への結合など)に関わらず、当業者は、本明細書で提示される教示に基づき、このような競合抗体および/または交差競合抗体が包含され、本明細書で開示される方法に有用でありうることを認識するであろう。
「エピトープ」という用語は、免疫グロブリンまたはT細胞受容体への特異的な結合が可能な、任意のタンパク質決定基を含む。エピトープ決定基は通例、アミノ酸または糖側鎖など、化学的に活性な表面分子群からなり、通例、特異的な三次元構造特徴のほか、特異的な電荷特徴も有する。コンフォメーショナルエピトープと非コンフォメーショナルエピトープとは、前者への結合は、変性溶媒の存在下で失われるが、後者への結合は失われないという点で区別される。
本明細書で使用される「〜に特異的に結合する」という語句は、試料中の特異的分子を認識し、これに結合するが、他の分子は、実質的に認識せず、またこれらに結合しない化合物、例えば、タンパク質、核酸、抗体などを意味する。例えば、「〜に特異的に結合する」という語句により、試料中の同族リガンドは認識し、これに結合する(例えば、その同族抗原であるPD−1と結合する抗PD−1抗体)が、試料中の他の分子は、実質的に認識せず、またこれらに結合しない、抗体またはペプチド阻害剤を特徴付けることができる。こうして、指定されたアッセイ条件下で、明示された結合性部分(例えば、抗体またはその抗原結合性部分)は、特定の標的分子に、優先的に結合し、被験試料中に存在する他の構成要素には、かなりの量でも結合しない。様々なアッセイフォーマットを使用して、目的の分子に特異的に結合する抗体を選択することができる。例えば、固相ELISAイムノアッセイ、免疫沈降、BIAcore、およびウェスタンブロット解析を使用して、PD−1と特異的に反応する抗体を同定する。典型的には、特異的反応または選択的反応は、バックグラウンドシグナルまたはノイズの少なくとも2倍であり、より典型的には、バックグラウンドの10倍を超え、なおより具体的には、抗体は、平衡解離定数(K)が、≦1μM、好ましくは、≦100nMであり、最も好ましくは、≦10nMである場合に、抗原「に特異的に結合する」という。
好ましくは、「CPIに特異的に結合する抗体」とは、その標的であるCPIへの結合に加えて、結合した標的CPIと、その同族リガンドとの相互作用(reciprocal interaction)にも干渉する、抗体またはその抗原結合性断片である。例えば、PD−1に特異的に結合する抗体は、PD−1への結合に加えて、PD−1と、その同族リガンドであるPD−L1との相互作用にも干渉する、抗体またはその抗原結合性断片であることが好ましい。
「K」という用語は、特定の抗体−抗原相互作用についての平衡解離定数を指す。
本明細書で使用される「実質的に純粋な」とは、目的の分子種が、存在する主要な分子種である(すなわち、モル濃度ベースで、組成物中の他の任意の個々の分子種より豊富である)ことを意味し、好ましくは、実質的に精製された画分は、目的の分子種(例えば、抗PD−1抗体)が、存在する全ての高分子種のうちの、少なくとも約50パーセント(モル濃度ベースで)を構成する組成物中である。一般に、実質的に純粋な組成物は、組成物中に存在する全ての高分子種のうちの約80パーセントを超える高分子種、より好ましくは、約85%、90%、95%、および99%を超える高分子種を含むであろう。最も好ましくは、目的の種は、本質的な均質性まで精製され(従来の検出法では、夾雑種を、組成物中に検出することができない)、この場合、組成物は、単一の高分子種から本質的になる。
本明細書で使用される「治療有効量」という用語は、哺乳動物、好ましくは、ヒトへと投与されると、化合物の非存在下で検出される応答と比較して、検出可能な治療的応答を媒介する量を意味する。腫瘍成長、腫瘍サイズ、転移などの阻害および/または減殺(腫瘍サイズの静止を含む)などであるがこれらに限定されない治療的応答は、当技術分野で認知されている、大多数の方法であって、例えば、本明細書で開示されているような方法を含む方法によりたやすく評価することができる。
当業者は、本明細書で投与される化合物または組成物の有効量は、変動するが、処置される疾患または状態、病期、処置される哺乳動物の年齢、健康、および全身状態、疾患の重症度、投与される特定の化合物など、いくつかの因子に基づきたやすく決定しうることを理解するであろう。
「治療有効量」とは、1)がん細胞の数の低減;2)腫瘍サイズの低減;3)がん細胞の、周辺臓器への浸潤の阻害(すなわち、ある程度の緩徐化、好ましくは、停止);4)腫瘍転移の阻害(すなわち、ある程度の緩徐化、好ましくは、停止);5)腫瘍成長のある程度の阻害;6)障害と関連する症状のうちの1または複数の、ある程度の緩和もしくは軽減;および/または7)抗がん剤の投与と関連する副作用の緩和もしくは軽減を含むがこれらに限定されない、新生物性障害の症状のうちの1または複数を、検出可能に、ある程度軽減するのに要求される薬剤の量を特定する(qualify)ことを意図する。
TLR9アゴニストの「治療有効量」はまた、当業者に周知の、TLR9活性化についての、十分に規定された血液マーカーまたは組織マーカーのうちのいずれかを使用して、バイオマーカー応答に基づき規定することもできる。本発明のCpG ODNは、血清中、血漿中、PBMC中、および/または組織中もしくは生検材料中の、Th1様サイトカインおよびTh1様ケモカインの応答の、それらによる誘導であって、Kriegら、J. Immunother.、2004年、27巻:460〜471頁により記載されている通り、例えば、処置の約24時間後に回収された血清または血漿に由来するIP−10、I−TAC、MIG、MIP−1β、MIP−3β、IL−6、IL−12p40、またはIFN−αについてのサイトカインアッセイを使用して測定することもでき、また、PBMCについてのRT−PCRアッセイにより評価することもできる誘導において、他のCpG ODN(例えば、クラスB)と、ほぼ類似する。がん患者へと腫瘍内注射される、治療有効量のCpG ODNは、血清IP−10レベルを、24時間までに、少なくとも100pg/mlへと上昇させ、好ましくは、100〜100,000pg/mlの間へと上昇させ、最も好ましくは、1,000〜10,000pg/mLの間へと上昇させる。
一般に用量を最大耐量(MTD)まで漸増させる化学療法薬とは対照的に、本発明のCpG ODNなどの免疫刺激性薬は一般に、MTDを下回る生物学的至適用量(OBD)で、最も良好に機能する。血清サイトカインおよび血清ケモカインは、生物学的至適用量を推定する、1つの簡素な尺度をもたらす。本発明のCpG ODNの、意図される生物学的効果は、腫瘍微小環境(および流入領域リンパ節の微小環境)を、免疫抑制性(IFN産生レベルが低度であり、活性化TILを欠く)微小環境から、IFN、とりわけ、I型IFNの産生の増大を示し、今や、PD−L1などの活性化マーカーを提示するTILを増大させた免疫活性化微小環境であって、例えば、それぞれ、Tumehら、Nature、2014年、515巻:568〜571頁;およびHerbstら、Nature、2014年、515巻:563〜567頁、または加えて、Taubeら、Clin Cancer Res.、2014年により報告されている、抗PD−1または抗PD−L1による処置に応答する患者の腫瘍生検特徴において反映されている免疫活性化微小環境へと転換することである。言い換えれば、近年の研究は、抗PD−1療法または抗PD−L1療法は一般に、TILを既に有し、IFN効果(IFNにより誘導されるPD−L1の発現など)を反映する腫瘍微小環境を既に有する患者だけにおいて有効であることを裏付けている。処置前の腫瘍生検においてこれらの特徴を欠く患者は、また、TILおよびI型IFNの高産生を誘導する薬剤による処置も施されない限り、抗PD−1または抗PD−L1による治療に応答する可能性が低い:本発明のCpG ODNは、この目的で完全な薬剤である。
ヒトおよび他の動物における、I型IFNの主要な内因性供給源は、形質細胞様樹状細胞(pDC)である。pDCは、病原体感染に応答して作られるI型IFNのうちの、99%を超えるI型IFNを産生する(Siegalら、Science、1999年)。しかし、分子的に規定された、極めて微小な刺激でも、高レベルのI型IFNを分泌するように、pDCを活性化させることが示されている。実際、現在のところ、クラスA CpG ODNは、学術文献で報告されている、pDCによるI型IFNの産生のための、抜群に最も強力な刺激であるが、驚くべきことに、本発明のCpG ODNは、当技術分野で既に公知のCpG ODNよりなお有効である。
ある特定の好ましいCpG ODNは、高量または大量のI型IFNを誘導する。当技術分野では、I型IFNを測定するためのアッセイが周知であり、本明細書で記載されているアッセイなどの、in vitro酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)および細胞ベースのアッセイを含む。限定的であることを意図せずに、大量または高量のI型IFNとは、このようなin vitroアッセイに従い測定される、約1000pg/mLを超えるかまたはこれと同等のIFN−αを指す場合がある。ある特定の実施形態では、大量または高量のI型IFNとは、このようなin vitroアッセイに従い測定される、約2000pg/mLを超えるかまたはこれと同等のIFN−αを指す場合がある。ある特定の実施形態では、大量または高量のI型IFNとは、このようなin vitroアッセイに従い測定される、約3000pg/mLを超えるかまたはこれと同等のIFN−αを指す場合がある。ある特定の実施形態では、大量または高量のI型IFNとは、このようなin vitroアッセイに従い測定される、約4000pg/mLを超えるかまたはこれと同等のIFN−αを指す場合がある。ある特定の実施形態では、大量または高量のI型IFNとは、このようなin vitroアッセイに従い測定される、約5,000pg/mLを超えるかまたはこれと同等のIFN−αを指す場合がある。
本明細書で提示される教示と組み合わせて、多様な活性化合物から選び出し、効力、相対バイオアベイラビリティー、患者体重、有害な副作用の重症度、および好ましい投与方式などの要因を重みづけすることにより、実質的な毒性を引き起こさないが、特定の被験体を処置するのに有効である、有効な予防的処置レジメンまたは治療的処置レジメンを計画することができる。任意の特定の適用のための有効量は、処置される疾患または状態、疾患または状態の重症度、ならびに被験体の健康およびサイズなどの要因に応じて変動しうる。当業者は、過度の実験を必要とせずに、TLR9アゴニスト(例えば、CpG ODN)、CPI(例えば、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、抗CTLA−4抗体)、および/または他の治療剤の有効量を、経験的に決定することができる。
例えば、抗CTLA−4抗体と併せた、クラスB CpG ODNについてのヒト臨床試験は、Millwardら、2013年により報告されている。臨床試験は、皮下注射により施されるTLR9アゴニストを、全身に施される抗CTLA−4抗体と組み合わせる方途であって、他のCpG ODNおよび他のチェックポイント阻害剤についての、将来の臨床試験において使用されうる方途について裏付けたが、この臨床試験は、組合せからの、著明で明確な臨床利益を実証できなかった。この失敗は、本発明の進歩性を裏付けている。高IFN−α分泌を伴うクラスA CpG ODNについての刊行物は存在するが、クラスB CpG ODNではなく、このようなCpG ODNを使用する臨床試験を行うことは、研究者にとって容易に想到できるものではなかった。CpG ODNまたは抗CTLA−4抗体を、全身経路によるのではなく、腫瘍へと、局所に施すことは、容易に想到できるものではなかった。結果として、試験の完了後、この手法は放棄された。同様に、Mangsboら(J. Immunother、2010年、33巻:225頁)も、マウス腫瘍モデルにおける、腫瘍内クラスB CpG ODNの、抗CTLA−4または抗PD−1との組合せについて報告した。組合せについては、肯定的な結果が見られたが、ここでもまた、本発明のクラスA ODNまたは他のODNなど、高IFN誘導型のCpG ODNを使用して、このような治療を実施する指針は存在しなかった。
現在のところ、当業者間には、高IFN誘導性クラスのCpG ODNを、チェックポイント阻害剤療法と併せて組み合わせることの所望性および利点についての認識はなされていないと考えられる。がん免疫療法において最適の相乗作用を及ぼす薬剤の組合せのためには、1つの薬剤の免疫抑制効果を、別の薬剤によって逆転しなければならない。例えば、IFNは、腫瘍上のPD−L1の発現を誘導するが、これは、免疫応答を抑制する。本発明の高IFN誘導性CpG ODNは、PD−L1の発現を誘導するが、これらを、抗PD−L1抗体または抗PD−L1抗体と組み合わせて使用すると、PD−L1の、潜在的な免疫抑制効果は、抗体により克服される。他方、本発明は、少なくとも部分的に、IL−10の誘導が、チェックポイント阻害剤療法により逆転されない、多面的な免疫抑制性効果を結果としてもたらすため、腫瘍内クラスB CpG ODNの、全身チェックポイント阻害剤との組合せは、相乗性が最適未満である(または全く相乗的でない)という発見に基づく。こうして、本発明は、がん免疫療法において、予測外の利益、例えば、相乗的利益を、併せてもたらす、薬剤の組合せを提供する。
単独の、または併せた、CpG ODNおよび/または抗体の治療有効量は当初、in vitroかつ/または動物モデルから決定することができる。治療有効用量はまた、特異的CpG ODNおよび/もしくは特異的抗体、または同様な薬理学的活性を呈することが公知の、他の化合物についてのヒトデータからも決定することができる。適用される用量は、投与された化合物の相対バイオアベイラビリティーおよび効力に基づき調整することができる。上記で記載した方法および当技術分野で周知の他の方法に基づき、最大の有効性を達成するように、用量を調整することは十分に、当業者の能力の範囲内にある。
本明細書で使用される「指示材料」は、本明細書で列挙される、多様な疾患または障害に影響を及ぼすか、これを和らげるか、または処置するために、キット中の本発明の化合物、組合せ、および/または組成物の有用性について伝達するのに使用しうる、刊行物、記録、図表、または他の任意の表現媒体を含む。任意選択で、または代替的に、指示材料は、細胞、組織、または哺乳動物における疾患または障害を和らげる、1または複数の方法であって、本明細書の別の箇所で開示される方法を含む方法について記載しうる。
キットの指示材料は、例えば、本発明の化合物および/または組成物を含有する容器に貼付することもでき、化合物および/または組成物を含有する容器と併せて配送することもできる。代替的に、指示材料は、受領者が、指示材料と化合物とを組み合わせて使用するように意図するが、容器とは別個に配送することもできる。
本発明のCpG ODNおよび/または抗体は、医薬ディスペンサーにより提供することができる。医薬用ディスペンサーとは、各区画が、個々の医薬単位を格納するためのものである複数の医薬保管区画を規定するパッケージである。ある実施形態では、処置の医薬クール全体を、複数の医薬保管区画内に格納する。
複数の医薬保管区画を規定するパッケージは、個々の区画内に医薬を保持する、任意の種類の、使い捨ての医薬パッケージまたはカードでありうる。例えば、パッケージは、硬質の紙材料から作製されうるカード(ブリスターシートおよび裏当てシート)から構築されるブリスターパッケージである。このようなカードは、当業者に周知である。
例として、医薬ディスペンサーは、処置の医薬クール全体を格納しうる。ディスペンサーは、どの日に個々の医薬単位を服用すべきなのかを指し示す日付表示を含みうる。これらは、医薬パッケージの第1の面に沿ってマークすることができる。また、用量表示も、例えば、医薬パッケージの第1の面と垂直な、医薬パッケージの第2の面に沿ってマークし、これにより、個々の医薬単位を服用すべき時点を指し示すことができる。単位用量は、ブリスターパックである、ディスペンサー内に含有されうる。
言及される場合を除き、「患者」または「被験体」という用語は、互換的に使用され、ヒト患者および非ヒト霊長類のほか、ウサギ、ラット、およびマウス、ならびに他の動物などの獣医学的被験体などの哺乳動物を指す。好ましくは、「患者」または「被験体」は、ヒトを指す。
ある特定の実施形態では、被験体は、成人のヒトである。
ある特定の実施形態では、被験体は、小児である。ある特定の実施形態では、被験体は、約18歳未満である。ある特定の実施形態では、被験体は、約12歳未満である。
本明細書で使用される「〜を処置する」とは、患者が疾患の症状(すなわち、腫瘍成長および/もしくは転移、または免疫細胞の数および/または活性により媒介される他の作用など)を経験する頻度を低減することを意味する。処置は、予防的抑制もしくは予防的緩和(疾患の開始を防止するかもしくは遅延させるか、またはその臨床症状もしくは亜臨床症状の発現を防止する)、または疾患の発現後における、症状の治療的抑制もしくは治療的緩和でありうる。「〜を処置する」という用語は、本発明の化合物または薬剤の投与であって、(i)疾患、状態、もしくは障害の症状、合併症、もしくは生化学的徴候の開始を防止するかもしくは遅延させ、(ii)疾患、状態、もしくは障害の症状を緩和し、かつ/または(iii)疾患、状態、もしくは障害のさらなる発症を阻害するか、もしくは停止させる投与を含む。
「組合せ療法」は、これらの治療剤の共作用(co−action)から、有益な効果をもたらすように意図される、特異的処置レジメンの一部としての、TLR9アゴニスト、例えば、ある特定のCpG ODN、およびチェックポイント阻害剤の投与を包含する。一部の実施形態では、チェックポイント阻害剤は、CPI特異的抗体またはその抗原結合性断片である。一部の実施形態では、チェックポイント阻害剤は、二特異性CPI特異的抗体またはその二特異性抗原結合性断片である。組合せの有益な効果は、治療剤の組合せから生じる、薬物動態的共作用または薬力学的共作用を含むがこれらに限定されない。組合せでのこれらの治療剤の投与は、規定された時間(選択される組合せに応じて、通例、数分間、数時間、数日間、または数週間)にわたり実行することが典型的である。「組合せ療法」は一般に、これらの治療剤のうちの、2つまたはそれ超の治療剤の投与であって、本発明の組合せを、偶発的かつ任意の結果としてもたらす、別々の単剤療法レジメンの一部としての投与を包含することを意図しない。
「組合せ療法」は、これらの治療剤の、逐次的な様式での投与、すなわち、各治療剤を、異なる時点において投与する投与のほか、これらの治療剤、または治療剤のうちの少なくとも2つの、実質的に同時の様式での投与も包含する。各治療剤の逐次的投与または実質的に同時的な投与は、腫瘍内経路および腫瘍周囲経路;全身経路、例えば、静脈内経路、腹腔内経路、腸内(経口を含む)経路、筋内経路、皮下経路、および経粘膜経路;ならびに局所的経路および経皮経路を含むがこれらに限定されない、本明細書で記載される、任意の適切な経路により実施することができる。本明細書で記載される通り、一般に第1の治療剤(例えば、CpG ODN)は、腫瘍内注射または腫瘍周囲注射により投与することができ、第2の薬剤(例えば、抗PD−1抗体)は、全身(例えば、静脈内)投与することができる。
「組合せ療法」はまた、非薬物療法(放射線療法(XRT)または手術などであるがこれらに限定されない)とのさらなる組合せにおける、TLR9アゴニスト、例えば、ある特定のCpG ODN、および上記で記載したチェックポイント阻害剤による治療剤の投与も包含しうる。一部の実施形態では、チェックポイント阻害剤は、CPI特異的抗体またはその抗原結合性断片である。一部の実施形態では、チェックポイント阻害剤は、二特異性CPI特異的抗体またはその二特異性抗原結合性断片である。組合せ療法が、放射線処置をさらに含む場合、放射線処置は、治療剤と放射線処置との組合せの共作用からの有益な効果が達成される限り、任意の適切な時点において行うことができる。例えば、適切な場合、有益な効果は、放射線処置を、治療剤の投与から、一時的に、数日間、またはさらには数週間解除する場合にもやはり達成される。
「組合せ療法」はまた、他の生物学的な有効成分(さらなる抗新生物剤および異なる抗新生物剤、樹状細胞ワクチン、または他の腫瘍ワクチンなどであるがこれらに限定されない)とのさらなる組合せにおける、TLR9アゴニスト、例えば、ある特定のCpG ODN、および上記で記載したチェックポイント阻害剤による治療剤の投与も包含しうる。一部の実施形態では、チェックポイント阻害剤は、抗体またはその抗原結合性断片である。一部の実施形態では、チェックポイント阻害剤は、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片である。しかし、ある特定の実施形態では、「組合せ療法」は、樹状細胞ワクチンまたは腫瘍ワクチンの投与を具体的に除外する。
II.CpG DNA
CpGオリゴヌクレオチド(CpG DNA;CpG ODN)は、免疫応答を誘発することが見出されている特異的配列を含有する。これらの特異的配列を、「免疫刺激性モチーフ」と称し、免疫刺激性モチーフを含有するオリゴヌクレオチドを、「免疫刺激性オリゴヌクレオチド分子」と称し、同等に、「免疫刺激性オリゴヌクレオチド」と称する。免疫刺激性オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの免疫刺激性モチーフを含み、このモチーフは、内部モチーフであることが好ましい。「内部免疫刺激性モチーフ」という用語は、モチーフ配列より少なくとも1ヌクレオチド長い(5’末端および3’末端の両方)、オリゴヌクレオチド配列内のモチーフ配列の位置を指す。
CpGオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの、非メチル化CpGジヌクレオチドを含む。少なくとも1つの、非メチル化CpGジヌクレオチドを含有するオリゴヌクレオチドは、シトシン−グアニンジヌクレオチド配列(すなわち、「CpG DNA」またはリン酸結合により、3’グアニンへと連結された5’シトシンを含有するDNA)を含有し、免疫系を活性化させるオリゴヌクレオチド分子である。CpGオリゴヌクレオチドの全体を非メチル化することもでき、部分を非メチル化することもできるが、5’CG 3’のうちの少なくともCは、非メチル化しなければならない。
CpG ODNは一般に、約8〜100ヌクレオチドの長さである。ある特定の実施形態では、CpG ODNは、約8〜50ヌクレオチドの長さ、約8〜40ヌクレオチドの長さ、約8〜30ヌクレオチドの長さ、約8〜24ヌクレオチドの長さ、約8〜20ヌクレオチドの長さ、または約8〜16ヌクレオチドの長さである。
2004年までに、CpG ODNについての構造−活性関係研究は、構造的特徴および生物学的特徴が顕著に異なる、3つのファミリーを規定していた(Hartmannら、Eur. J. Immunol.、2003年、33巻:1633〜1641頁;Marshallら、J. Leukocyte Biol.、2003年、73巻:781〜792頁;Vollmerら、Eur. J. Immunol.、2004年、34巻:251〜262頁)。典型的なクラスB ODNは、完全ホスホロチオエート骨格を有し、高次構造を形成せず、強力なB細胞刺激因子であり、比較的高レベルのIL−10分泌を誘導するが、比較的小さなNK活性またはIFN−α分泌を誘導する(Krieg、2002年、およびKrieg、非公表の観察)。クラスB CpG ODNは、IL−10の分泌だけでなく、また、IDOの発現も含む、免疫抑制性の対抗調節的効果を誘導し、これは、in vitroにおけるTreg細胞の発生を促進し得る(Mosemanら、J. Immunol.、2004年、173巻(7号):4433〜4442頁;Chenら、J. Immunol.、2008年、181巻(8号):5396〜5404頁)。これらのin vitroデータの、in vivoにおける腫瘍免疫療法における関連性はは、不確定であり、クラスB ODNの臨床開発を遅延させなかったが、本発明は部分的に、クラスB ODNのこれらの効果は、抗腫瘍免疫応答を抑制するが、これは、IL−10分泌をもたらす、NF−κB経路を活性化させないように、構造的にデザインされた、他のクラスのCpG ODNを使用して回避されうるという新たな発見に基づく。
クラスB CpG ODN内で使用されるホスホロチオエート骨格は、結果として得られる免疫応答に対して、同じ配列を伴うが、ホスホロチオエート骨格を伴わないCpG ODNに関して見られる免疫応答と比較して、複数の複雑な効果を及ぼす。ホスホロチオエート(PS)骨格の、1つの極めて重要な効果は、ヌクレアーゼによる分解に対する保護である。完全PS修飾ODNが、血清中および組織中で、少なくとも24時間にわたり、ほぼ完全に安定であるのに対し、修飾されておらずかつ保護されていないODNは、数分間以内に分解される。血清中で、主要なヌクレアーゼ活性は、3’エクソヌクレアーゼであるが、これに対して、CpG ODNは、ODNの3’末端における、1カ所または数カ所のPS連結だけで保護されうる。しかし、組織中ではまた、5’エクソヌクレアーゼのほか、エンドヌクレアーゼも存在し、これらは、他の形で保護されない限り、天然DNAを分解しうる。天然DNAは、文献において十分に記載されている技法を使用する環化により、エクソヌクレアーゼに対して保護することができる。例えば、それらの全ての全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第8,017,591号;同第7,635,468号;同第7,074,772号;同第6,849,725号;同第6,451,593号;および同第6,451,563号;ならびに米国特許出願公開第2003/0125279号を参照されたい。代替的に、または加えて、天然(すなわち、他の形で修飾も保護もされていない)ODNは、ヌクレアーゼの、ODNへのアクセスを遮断するように、ナノ粒子、または当技術分野で周知の他の製剤により製剤化することもできる。
一般に、天然CpG DNA(ホスホジエステル)は、B細胞内およびpDC内のいずれにおいても、TLR9を活性化させる。B細胞は、サイトカインを産生し、増殖し始める(これは主に、NF−κBの活性化により駆動される)が、TLR9の刺激が持続的でない限り、増殖は通例、低度であり、Igの分泌およびクラススイッチングに対して生じる刺激も、比較的弱い。天然CpG DNAは、I型IFNを分泌し、共刺激性受容体を発現させるように、pDCを活性化させるが、刺激の大きさは、DNAの形態に大きく依存する。天然CpG DNAのこれらの効果とは対照的に、クラスBホスホロチオエートCpG DNAは、文献で報告されている通り、B細胞に対して、はるかにより強力で持続的なTLR9シグナルをもたらし、それらの増殖を強力に誘導し、Igの分泌およびクラススイッチングをもたらす。しかし、ホスホロチオエート骨格は、TLR9介在性pDC応答に対して、極めて異なる作用を及ぼし、実質的にIFN分泌を低減する(見かけ上、IRF7介在性シグナル伝達の抑制により)が、通例、共刺激性分子発現の強力な誘導は依然としてもたらす。こうして、本発明のためには、天然DNAを、分解から保護する限り、天然DNAの使用が通例、より高いI型IFN応答をもたらし、治療的にも有効となるであろう。1〜3カ所のホスホロチオエート修飾を、天然DNAの5’末端および3’末端へと付加して、I型IFN応答を減殺せずに、天然DNAを、ヌクレアーゼによる分解から保護することができる。
がん免疫療法のための、CpG ODNの開発の早期において、当業者は一般に、B細胞活性化が所望であると考え、したがって、開発努力の焦点を、クラスB ODNに当てた。実際、おそらく、B細胞活性化は、抗腫瘍応答に寄与することが可能であると、当技術分野で周知である、抗腫瘍Abの産生を駆動するために、腫瘍ワクチンに所望される。クラスB CpGの腫瘍内投与を利用する、一部の早期ヒト臨床試験は、腫瘍流入領域リンパ節内の、樹状細胞活性化についての有望な証拠をもたらした(例えば、Molenkamp BGら、Clin Cancer Res.、2007年、13巻(10号):2961〜2969頁)。しかし、この局所腫瘍内療法に対する臨床応答は、全く限定されたものであり、流入領域リンパ節内の総リンパ球集団についての研究は、CpGで処置された患者における、IL−10の放出の、約2倍の増大を示した(Molenkampらによる、表2)。腫瘍免疫療法に対するIL−10の負の作用、その産生を誘導しないか、またはこの産生の誘導が低レベルである改善されたCpG ODNに対する必要を考慮して、本発明は、IL−10の誘導を低減した、改善されたCpG ODNをさらに提供する。
以上にも拘らず、本発明に従い、腫瘍内投与のために、特に、共時的なIL−10およびIDOの誘導を伴う、B細胞活性化は、望ましくなく、おそらく、有害であることがここで発見された。これは、TLR9発現の種特異的差違およびサイトカイン応答の差違のために、マウスモデルを使用して裏付けることが、困難または不可能である。本発明は、他のがん免疫療法およびXRTの免疫効果および欠損についての新たな解析と併せた、多様なCpG ODNに対する、ヒト免疫細胞応答についての、既に公表されたデータおよび非公表のデータの新たな解析に基づく。
がん免疫療法のために、IL−10は、場合によって、正の効果も及ぼしうる(とりわけ、全身治療に関して;例えば、MummおよびOft、Bioessays、2013年、35巻(7号):623〜631頁を参照されたい)が、IL−10は一般に、局所腫瘍微小環境において、負の免疫効果を及ぼし、免疫拒絶を阻害すると考えられる(Satoら、Immunol Res.、2011年、51巻(2〜3号):170〜182頁において、総説されている)。こうして、本発明は部分的に、高レベルのIL−10を誘導するクラスB CpG ODNは、腫瘍内治療に好ましくないという発見に基づく。
クラスBのCpGオリゴヌクレオチドは、式:
5’XCGX 3’
[式中、XおよびXは、ヌクレオチドである。一部の実施形態では、Xは、アデニン、グアニン、もしくはチミンであることが可能であり、かつ/またはXは、シトシン、アデニン、またはチミンでありうる]により表される。
クラスBのCpGオリゴヌクレオチドはまた、式:
5’XCGX 3’
[式中、X、X、X、およびXは、ヌクレオチドである。Xは、アデニン、グアニン、またはチミンでありうる。Xは、シトシン、アデニン、またはチミンでありうる]によっても表される。
クラスBのCpGオリゴヌクレオチドはまた、少なくとも式:
5’NCGX 3’
[式中、X、X、X、およびXは、ヌクレオチドであり、Nは、任意のヌクレオチドであり、NおよびNは、約0〜25個ずつのNから構成されるオリゴヌクレオチド配列である。Xは、GpT、GpG、GpA、ApA、ApT、ApG、CpT、CpA、CpG、TpA、TpT、およびTpGからなる群より選択されるジヌクレオチドであることが可能であり;Xは、TpT、ApT、TpG、ApG、CpG、TpC、ApC、CpC、TpA、ApA、およびCpAからなる群より選択されるジヌクレオチドでありうる]により表されるオリゴヌクレオチドも含む。
クラスBのCpGオリゴヌクレオチドは、PCT特許出願公開PCT/US95/01570およびPCT/US97/19791、ならびに、それぞれ、2001年2月27日および2001年5月29日に交付された、米国特許第6,194,388B1号および米国特許第6,239,116B1号において開示されている。
クラスB CpG ODNに対し、クラスA CpG ODNは、ナチュラルキラー細胞および形質細胞様樹状細胞(pDC)からのIFN−α分泌の強力な活性化因子であるが、B細胞への刺激は弱く、IL−10分泌の誘導は極めて微小である。標準的なクラスA ODNは、Gテトラッドとして公知の複雑な高次構造を形成することが可能な5’末端および/または3’末端におけるポリGモチーフ、および自己相補的なパリンドローム内に1または複数のCpGモチーフを含有する中央のホスホジエステル領域を含有する(Krieg、2006年において、総説されている)。例えば、米国特許第6,949,520号および同第7,776,344号は、ある特定の好ましい実施形態では、クラスA CpG ODNが、以下:
[式中、各小文字は、ホスホロチオエート(PS)連結により、その3’側隣接ヌクレオチドへと連結されたヌクレオチドを表し、3’末端ヌクレオチドは、3’側隣接ヌクレオチドを有さないので、大文字で表されることを除き、各大文字は、ホスホジエステル(PO)連結により、その3’側隣接ヌクレオチド(存在する場合)へと連結されたヌクレオチドを表す]のうちのいずれかに対応する配列を有することを示す。
ある特定のより好ましい実施形態では、免疫刺激性核酸は、
[式中、各小文字は、ホスホロチオエート(PS)連結により、その3’側隣接ヌクレオチドへと連結されたヌクレオチドを表し、3’末端ヌクレオチドは、3’側隣接ヌクレオチドを有さないので、大文字で表されることを除き、各大文字は、ホスホジエステル(PO)連結により、その3’側隣接ヌクレオチド(存在する場合)へと連結されたヌクレオチドを表す]に対応する配列を有する。
ある特定の実施形態では、本発明の方法に従う使用のための、クラスA CpG ODNは、5’−GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG−3’(配列番号82;本明細書ではまた、「G10」とも称する)として提示される配列を有する。本発明に従う、このようなオリゴヌクレオチドおよびその有用な製剤については、それらの各々の全内容が、参照により本明細書に組み込まれる、WO2003/024481;US2003/0099668;US2012/0301499;WO2004/084940;US7,517,520;US2010/0098722;WO2007/068747;US2007/0184068;US8,574,564;WO2007/144150;US8,541,559;WO2008/073960;およびUS8,586,728において記載されている。
クラスC ODNの構造は典型的に、ホスホロチオエート骨格に基づくが、CpGモチーフが、二重鎖を形成しうる、3’側パリンドロームを後続させるという点で、顕著に異なる。クラスC ODNについては、Kriegらによる米国特許第7,566,703号;Vollmerらによる米国特許第8,198,251号;およびKriegらによる米国特許第8,834,900号において記載されている。クラスC CpG ODNは、クラスAとクラスBとの間の、中間的な免疫特性を有する(Hartmannら、2003年;Marshallら、2003年;Marshallら、2005年;Vollmerら、2004年)。
クラスC ODNの例は、
[式中、各Zは、5−メチルシトシンである]を含む。
ある特定の実施形態に従い、免疫刺激性核酸は、配列TCGGCGCGCGCCGTCGTCGTTT(配列番号92)を含む。
オリゴヌクレオチドは、5’TC_GC_GC_GC_GT 3’(配列番号106)[式中、は、安定化ヌクレオチド間連結を表す]を含みうる。任意選択で、具体的に述べると、5’は、オリゴヌクレオチドの遊離5’末端を指す場合があり、3’は、オリゴヌクレオチドの遊離3’末端を指す場合がある。
本発明の一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、以下の式:TCGTCGTTCGGCGCGCCG(配列番号107)、TCGTCGTCGTTCGGCGCGCGCCG(配列番号108)、TCGTCGACGATCGGCGCGCGCCG(配列番号109)、TTCGTCGTTTTGTCGTT(配列番号110)、またはTTTCGTCGTTTCGTCGTT(配列番号106)のうちの1つを有する。
本発明の他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、以下の式:TCGTCGTC、CGTCGTCG、GTCGTCGT、TCGTCGTT、CGTCGTTC、GTCGTTCG、TCGTTCGG、CGTTCGGC、GTTCGGCG、TTCGGCGC、TCGGCGCG、CGGCGCGC、GGCGCGCG、GCGCGCGC、CGCGCGCC、またはGCGCGCCGのうちの1つを有する。
本発明の他の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、以下の式:TC_GC_GC、C_GC_GC_G、GC_GC_GT、TC_GC_GT、C_GC_GC、GC_GC_G、TC_GC_GG、C_GC_GC、GC_GG、TC_GC、TC_GC_G、C_GC_GC、GC_GG、GC_GC、CC_GC、またはGC_GG[式中、は、安定化ヌクレオチド間連結を表す]のうちの1つを有する。
本発明の他の実施形態では、TC_GC_GC[式中、は、安定化ヌクレオチド間連結を表し、_は、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結を表す]を含むオリゴヌクレオチドが提供される。任意選択で、オリゴヌクレオチドは、5’TC_GC_GC_GC_GC_GC 3’(配列番号111)、5’TC_GC_GC_GC_GC 3’(配列番号112)、または5’TC_GC_GC_GC_GC_GC 3’(配列番号113)[式中、5’は、オリゴヌクレオチドの遊離5’末端を指し、3’は、オリゴヌクレオチドの遊離3’末端を指す]でありうる。
他の実施形態では、TC_GC_GG[式中、は、安定化ヌクレオチド間連結を表し、_は、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結を表す]を含むオリゴヌクレオチドが提供される。任意選択で、オリゴヌクレオチドは、
5’C_GC_GC_GC_GC_GG 3’(配列番号114);
5’GC_GC_GC_GC_GG 3’(配列番号115);
5’TC_GC_GC_GC_GG 3’(配列番号116);
5’C_GC_GC_GC_GG 3’(配列番号117);
5’GC_GC_GC_GG 3’(配列番号118);または
5’TC_GC_GC_GG 3’(配列番号119)
[式中、5’は、オリゴヌクレオチドの遊離5’末端を指し、3’は、オリゴヌクレオチドの遊離3’末端を指す]でありうる。
より近年になって、2つのパリンドローム(クラスCにおける、単一のパリンドロームと対比して)という構造的特色を伴う、新たなクラスのCpGオリゴが同定された。例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2008/0045473号を参照されたい。2つのパリンドロームのために、これらのクラスP CpG ODNは、直鎖状のクラスB ODNまたは二重鎖状のクラスC ODNとは異なる方式でTLR9と相互作用すると仮定される、高次コンカタマーを形成することが可能であり、クラスP ODNは、クラスC(またはクラスB)と比較して、より高レベルのI型IFNおよび実質的により低レベルのIL−10を誘導するという結果が観察されている。
クラスP ODNの例は、
[式中、−は、ホスホジエステル連結を表し;は、安定化ヌクレオチド間連結を表し;biotは、ビオチンを表し;butは、ブチレートを表し;cholは、コレステロールを表し;Cy3は、ビス−ヒドロキシプロピル−3,3,3’,3’−テトラメチル−4,5−ベンズインドカルボシアニンクロリド(Glen Research)を表し;Dは、Dスペーサー(1’2’−ジデオキシリボース、Glen Research、Sterling、VA)を表し;digは、ジゴキシゲニンを表し;doub−は、ダブラーを表し;iNは、逆ヌクレオチド(逆の配向性:3’と5’との交換)を表し;Jは、1,3−プロパンジオールを表し;Lは、ヘキサエチレングリコールを表し;mNは、2’−O−メチルヌクレオシドを表し;rNは、リボヌクレオシドを表し;tegは、トリエチレングリコールを表し;vitEは、ビタミンEを表し;Zは、5−メチルデオキシシチジンを表す]を含む。
別の、近年発見されたCpG ODNのクラスは、それらの両方の全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第8,580,268号および米国出願公開第2014/0163213号において記載されている通り、ハロゲン修飾されたヌクレオチドを、CpGモチーフのすぐの5’側に置いたクラスEである。これらのODNはまた、低度のIL−10の産生と比べて、はるかに高レベルのI型IFNも誘導する。
クラスE ODNの例は、
[式中、−は、ホスホジエステルヌクレオチド間連結を表し;は、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結を表し;2doubは、ダブラー2(Chemgenes)を表し;3mGは、3’−O−メチル−rGを表し;6NBは、6−ニトロベンズイミダゾールを表し;BUは、5−ブロモ−2’−デオキシウリジンを表し;BVUは、5−(d−ブロモ−ビニル)−ウリジンを表し;CUは、5−クロロ−2’−デオキシウリジンを表し;Eは、7−デアザ−dGを表し;EUは、5−エチル−2’−デオキシウリジンを表し;Fは、5−フルオロ−dUを表し;FFは、2,4−ジフルオロトルエンを表し;FTは、a,a,a−トリフルオロ−dTを表し;FUは、5−フルオロ−dUを表し;hexは、ヘキサデシルグリセリルを表し;Iは、イノシンを表し;iTは、逆ヌクレオチド(3’と5’との交換)を表し;JUは、5−ヨード−2’−デオキシウリジンを表し;Lは、スペーサー18(ヘキサエチレングリコールホスフェート)を表し;NIは、ニトロインドールを表し;NPは、ニトロピロールを表し;PUは、5−プロピニル(proynyl)−dUを表し;tegは、スペーサー9(トリエチレングリコールホスフェート)を表し;Uは、ウリジンを表し;Zは、5−メチル−dCを表す]を含む。
当業者には、CpG ODNによるB細胞活性化の量を低減し、IFN−α誘導の量を増大させるか、または維持する方法が周知ではないが、本発明の根底をなす、特定の作用機構に委ねることなく、本発明に従い、B細胞増殖およびIL−10の分泌は、IFN−αを分泌するように、形質細胞様樹状細胞(pDC)を誘導するのに要求されるTLR9シグナルと比較して、より持続的なTLR9シグナルを要求するように見えることが発見された。このような持続的なTLR9シグナルは、クラスB CpG ODNにより、上記で言及された他のCpG ODNクラスより大きな程度でもたらされる。加えて、TLR9シグナルの持続時間は、ホスホジエステル(PO)連結を、CpG(「セミソフト」デザイン)および/またはODN内の他の位置に位置させることにより短縮することができる。持続的なB細胞活性化が最小である「最もソフトな」CpG ODNは、完全ホスホジエステル骨格を伴うCpG ODNであるが、これらは、in vivoにおいて、極めて急速に分解されるので、ODNが、環状(エクソヌクレアーゼに対して保護するように)であるか、または、ヌクレアーゼに対しても保護する、ウイルス様粒子(VLP)、ナノ粒子(NP)、免疫刺激性複合体(ISCOM)などの製剤により送達されない限り、IFN−α応答もまた、損なわれる。
免疫刺激性オリゴヌクレオチド分子は、均質な骨格(例えば、全体がホスホジエステル(PO)または全体がホスホロチオエート(PS))を有する場合もあり、キメラ骨格を有する場合もある。この例外は、少なくとも8つのヌクレオチドを含み、好ましくは、10またはそれ超のヌクレオチドを含むODNの中心部分が、最適の活性のためには、ホスホジエステルでなければならない、クラスA(およびクラスA/E)CpGデザインである。本発明の目的では、キメラ骨格とは、部分的な安定化骨格をいい、少なくとも1カ所のヌクレオチド間連結が、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様であり、少なくとも1カ所の、他のヌクレオチド間連結が、安定化ヌクレオチド間連結であり、少なくとも1カ所のホスホジエステル連結またはホスホジエステル様連結と、少なくとも1カ所の安定化連結とが異なる。末端をエクソヌクレアーゼから保護するために、安定化連結を、オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に、優先的に置く:ホスホジエステル連結は、中央に置かれ、PS単独により容易に達成されうるより強力なIFN−α応答の誘導に寄与する。
ボラノホスホネート連結は、ホスホジエステル連結と比べて安定化していることが報告されているので、骨格のキメラ的性質の目的で、ボラノホスホネート連結は、文脈に応じて、ホスホジエステル様として分類することもでき、安定化されているとして分類することもできる。例えば、一実施形態では、本発明に従うキメラ骨格は、少なくとも1カ所のホスホジエステル(ホスホジエステルまたはホスホジエステル様)連結と、少なくとも1カ所のボラノホスホネート(安定化)連結とを含みうるであろう。別の実施形態では、本発明に従うキメラ骨格は、ボラノホスホネート(ホスホジエステルまたはホスホジエステル様)連結と、ホスホロチオエート(安定化)連結とを含みうるであろう。「安定化ヌクレオチド間連結」とは、in vivoにおける分解(例えば、エクソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼを介する)に対して、ホスホジエステルヌクレオチド間連結と比較して、比較的抵抗性であるヌクレオチド間連結を意味するものとする。好ましい安定化ヌクレオチド間連結は、限定せずに、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、メチルホスホネート、およびメチルホスホロチオエートを含む。他の安定化ヌクレオチド間連結は、限定せずに、ペプチド型連結、アルキル型連結、脱リン酸化型(dephospho)連結、および上記で記載した、他の型の連結を含む。
ホスホロチオエートなどの修飾骨格は、ホスホルアミデート化学反応またはH−ホスホネート化学反応を利用する自動化技法を使用して合成することができる。アリールホスホネートおよびアルキルホスホネートは、例えば、米国特許第4,469,863号において記載されている通りに作製することができ;例えば、米国特許第5,023,243号および欧州特許第092,574号において記載されているアルキルホスホトリエステル(この場合、荷電酸素部分がアルキル化される)は、市販の試薬を使用する自動式固相合成により調製することができる。他のDNA骨格修飾およびDNA骨格置換を施すための方法も記載されている(Uhlmann Eら(1990年)、Chem Rev、90巻:544頁;Goodchild J(1990年)、Bioconjugate Chem、1巻:165頁)。キメラオリゴヌクレオチドを調製するための方法もまた公知である。例えば、Uhlmannらに交付された特許であって、例えば、米国特許第7,566,703号、同第7,795,235号、同第8,283,328号、および同第8,304,396号を含む特許は、このような技法について記載している。
混合型骨格修飾ODNは、市販のDNA合成器および標準的なホスホルアミダイト化学反応を使用して合成することができる。(F. E. Eckstein、「Oligonucleotides and Analogues−−A Practical Approach」、IRL Press、Oxford、UK、1991年;ならびにM. D. MatteucciおよびM. H. Caruthers、Tetrahedron Lett.、21巻、719頁(1980年)。カップリングの後で、ボケージ試薬(R. P. Iyer、W. Egan、J. B. Regan、およびS. L. Beaucage、J. Am. Chem. Soc.、112巻、1253頁(1990年))(アセトニトリル中に0.075M)またはフェニルアセチルジスルフィド(PADS)を使用する硫黄化に続く、無水酢酸、テトラヒドロフラン中の2,6−ルチジン(1:1:8;v:v:v)、およびN−メチルイミダゾール(テトラヒドロフラン中に16%)によるキャッピングにより、ホスホロチオエート(PS)連結を導入する。ホスホロチオエート連結を配置すべき位置における、所望されないホスホジエステル(PO)連結の形成を最小化するように、このキャッピングステップは、硫黄化反応の後で実施する。例えば、CpGジヌクレオチドに、ホスホジエステル連結を導入する場合は、中間体であるリン−IIIを、水/ピリジン中のヨウ素溶液による処理で酸化する。固体支持体からの切断および濃縮アンモニアでの処理(50℃で15時間にわたる)による最終的な脱保護の後で、ODNは、NaCl勾配(例えば、緩衝液A:アセトニトリル/水=1:4/v:v、pH6.8中に、10mMのNaHPO4;緩衝液B:アセトニトリル/水=1:4/v:v中に、10mMのNaHPO、1.5MのNaCl;1ml/分で30分間にわたり、5〜60%のB)を使用する、Gen−Pak Faxカラム(Millipore−Waters)上のHPLC、またはキャピラリーゲル電気泳動により解析する。ODNは、HPLCにより精製することもでき、Source High Performanceカラム(Amersham Pharmacia)上のFPLCにより精製することもできる。HPLCにおける均質な画分を組み合わせ、C18カラムを介して、または限外濾過により、脱塩処理する。MALDI−TOF質量分析により、ODNを解析して、計算された質量を確認する。
本発明のオリゴヌクレオチドはまた、他の修飾も含みうる。これらは、アルキルホスフェートおよびアリール−ホスフェート(荷電ホスホネート酸素を、アルキル基またはアリール基で置き換えた)、ホスホジエステル、およびアルキルホスホトリエステル(荷電酸素部分をアルキル化した)などの非イオン性DNA類似体を含む。一方または両方の末端において、テトラエチレングリコールまたはヘキサエチレングリコールなどのジオールを含有するオリゴヌクレオチドもまた、ヌクレアーゼによる分解に対して実質的に抵抗性であることが示されている。
一部の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、「ソフト」オリゴヌクレオチドまたは「セミソフト」オリゴヌクレオチドでありうる。ソフトオリゴヌクレオチドとは、骨格を部分的に安定化させた免疫刺激性オリゴヌクレオチドであって、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結が、少なくとも1つの内部ピリミジン−プリンジヌクレオチド(YZ)内およびこれに直に隣接してしか存在しない免疫刺激性オリゴヌクレオチドである。YZは、ピリミジン−グアノシン(YG)ジヌクレオチドである、YGであることが好ましい。少なくとも1つの内部YZジヌクレオチド自体が、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結を有する。少なくとも1つの内部YZジヌクレオチドに直に隣接して生じる、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結は、少なくとも1つの内部YZジヌクレオチドに対して、5’側の場合もあり、3’側の場合もあり、5’側および3’側の両方の場合もある。
特に、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結は、「内部ジヌクレオチド」を伴う。内部ジヌクレオチドとは一般に、ヌクレオチド間連結により接続された、隣接する任意のヌクレオチド対を意味し、ここでヌクレオチド対内のいずれのヌクレオチドも、末端ヌクレオチドではない、すなわち、ヌクレオチド対内のいずれのヌクレオチドも、オリゴヌクレオチドの5’末端または3’末端を規定するヌクレオチドではない。こうして、nヌクレオチドの長さの直鎖状オリゴヌクレオチドは、合計n−1個のジヌクレオチドを有し、n−3個だけの内部ジヌクレオチドを有する。内部ジヌクレオチド内の各ヌクレオチド間連結は、内部ヌクレオチド間連結である。こうして、nヌクレオチドの長さの直鎖状オリゴヌクレオチドは、合計n−1カ所のヌクレオチド間連結を有し、n−3カ所だけの内部ヌクレオチド間連結を有する。したがって、戦略的に置かれたホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結とは、オリゴヌクレオチド配列内の任意のヌクレオチド対の間に位置したホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結を指す。一部の実施形態では、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結は、5’末端または3’末端に最も近接する、いずれのヌクレオチド対の間に位置していない。
少なくとも1つの内部YZジヌクレオチドに直に隣接して生じる、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結はそれ自体、内部ヌクレオチド間連結であることが好ましい。こうして、配列NYZN[式中、NおよびNは各々、他方から独立である]では、任意の単一のヌクレオチドである、YZジヌクレオチドは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結を有し、加えて、(a)Nが、内部ヌクレオチドである場合、NとYとは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結により連結されるか、(b)Nが、内部ヌクレオチドである場合、ZとNとは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結により連結されるか、または(c)Nが、内部ヌクレオチドである場合、NとYとは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結により連結され、かつ、Nが、内部ヌクレオチドである場合、ZとNとは、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結により連結される。
本発明に従うソフトオリゴヌクレオチドは、完全に安定化させたオリゴヌクレオチドと比較して、ヌクレアーゼによる切断を比較的受けやすいと考えられる。特定の理論または機構に束縛されることを意図せずに、本発明のソフトオリゴヌクレオチドは、全長ソフトオリゴヌクレオチドと比べて免疫刺激性活性が低減されているか、またはこれを伴わない断片を結果としてもたらす切断を受けやすいと考えられる。特に、オリゴヌクレオチドの近傍または中央部における、少なくとも1カ所のヌクレアーゼ感受性ヌクレオチド間連結の組込みは、オリゴヌクレオチドの最大の免疫刺激性活性の持続時間を短縮するように、オリゴヌクレオチドの薬物動態および薬力学を変更する「オフスイッチ」をもたらすと考えられる。特に、ヌクレアーゼ感受性連結は、NF−κB誘導の大きさを低減しうる一方で、IRF3および/またはIRF7の誘導の大きさを増大させうる。TLR9活性化は、NF−κB経路(IL−6など、サイトカインの発現および共刺激性分子の発現をもたらす)およびIFN−α分泌をもたらすIRF3/7経路の一方または両方の強力な活性化をもたらしうる。これらの経路の間には一般に、ある程度のアンタゴニズムが存在すると考えられている。例えば、クラスB CpG ODNが主に、前者を活性化させるのに対し、クラスA CpG ODNは、後者を活性化させる。NF−κBの強力な誘導は、クラスB CpGオリゴと関連し、IL−10分泌の増大をもたらしうる。これは、全身CpGオリゴ療法には有用でありうるが、腫瘍内療法には所望されない。ヌクレアーゼ感受性ヌクレオチド間連結によりもたらされるIRF3/7誘導の増大は、腫瘍微小環境内のIFN−αの大きな産生をもたらし、これは、腫瘍内療法の後における、生産的で治療的な、抗腫瘍免疫応答の可能性を、所望されないIL−10の産生の増大を伴わずに改善する。オリゴは、組織内に、高濃度まで蓄積する可能性が低いので、ヌクレアーゼ感受性連結を含有するCpGオリゴの、半減期のこの短縮は、慢性局所炎症または免疫刺激と関連する損傷を回避することが所望される組織および臨床適用において、例えば、腎臓内において特に価値が高い。
セミソフトオリゴヌクレオチドとは、骨格を部分的に安定化させた免疫刺激性オリゴヌクレオチドであって、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結が、少なくとも1つの内部ピリミジン−プリン(YZ)ジヌクレオチド内のみに存在する免疫刺激性オリゴヌクレオチドである。セミソフトオリゴヌクレオチドは一般に、対応する、完全安定化免疫刺激性オリゴヌクレオチドと比べて、免疫刺激性効力を増大させている。セミソフトオリゴヌクレオチドの効力の増大に起因して、セミソフトオリゴヌクレオチドは、場合によって、所望の生物学的効果を達成するために、従来の、完全安定化免疫刺激性オリゴヌクレオチドより低度の有効濃度で使用することもでき、有効用量が低量でありうる。
セミソフトオリゴヌクレオチドの前出の特性は一般に、内部YZジヌクレオチドを伴う、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結の「用量」の増大と共に、増大すると考えられる。こうして、例えば、4つの内部YZジヌクレオチドを伴う、所与のオリゴヌクレオチド配列について一般に、4カ所の内部ホスホジエステルまたはホスホジエステル様YZヌクレオチド間連結を伴うオリゴヌクレオチドは、3カ所の内部ホスホジエステルまたはホスホジエステル様YZヌクレオチド間連結を伴うオリゴヌクレオチドより免疫刺激性が大きく、これは、2カ所の内部ホスホジエステルまたはホスホジエステル様YZヌクレオチド間連結を伴うオリゴヌクレオチドより免疫刺激性が大きく、これは、1カ所の内部ホスホジエステルまたはホスホジエステル様YZヌクレオチド間連結を伴うオリゴヌクレオチドより免疫刺激性が大きいと考えられる。1つの内部ホスホジエステルまたはホスホジエステル様YZヌクレオチド間連結の包含であってもなお、内部ホスホジエステルまたはホスホジエステル様YZヌクレオチド間連結を伴わない場合より、しばしば有利でありうることは重要である。ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結の数に加えて、オリゴヌクレオチドの長さに沿った位置もまた、効力を及ぼしうる。
ソフトオリゴヌクレオチドおよびセミソフトオリゴヌクレオチドは一般に、好ましい内部位置における、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結に加えて、分解に対して抵抗性の、5’末端および3’末端を含むであろう。このような分解抵抗性末端は、エクソヌクレアーゼによる消化に対する抵抗性の、対応する非修飾末端を上回る増大を結果としてもたらす、任意の適切な修飾を伴いうる。例えば、5’末端および3’末端は、骨格の、少なくとも1カ所のホスフェート修飾の、5’末端および3’末端への包含により、安定化させることができる。好ましい実施形態では、各末端における、骨格の少なくとも1カ所のホスフェート修飾は独立に、ホスホロチオエートヌクレオチド間連結、ホスホロジチオエートヌクレオチド間連結、メチルホスホネートヌクレオチド間連結、またはメチルホスホロチオエートヌクレオチド間連結である。別の実施形態では、分解抵抗性末端は、3’末端において、ペプチド連結またはアミド連結により接続された、1または複数のヌクレオチド単位を含む。
ホスホジエステルヌクレオチド間連結は、天然で見出されるオリゴヌクレオチドに特徴的な連結の種類である。ホスホジエステルヌクレオチド間連結は、2つの架橋酸素原子に挟まれ、また、一方は荷電原子であり、他方は非荷電原子である、2つのさらなる酸素原子も結合させたリン原子を含む。ホスホジエステルヌクレオチド間連結は、オリゴヌクレオチドの組織内半減期を短縮するか、I型IFNの、pDCからの分泌の、可能な限りで最も強力な誘導をもたらすことが重要な場合に、特に好ましい。
ホスホジエステル様ヌクレオチド間連結とは、ホスホジエステルと、化学的におよび/またはジアステレオマー的に類似するリン含有架橋基である。ホスホジエステルとの類似性の尺度は、ヌクレアーゼによる消化に対する感受性、およびRNアーゼHを活性化させる能力を含む。こうして、例えば、ホスホジエステルオリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼによる消化を受けやすいが、ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼによる消化を受けやすくないのに対し、ホスホジエステルオリゴヌクレオチドおよびホスホロチオエートオリゴヌクレオチドのいずれも、RNアーゼHを活性化させる。好ましい実施形態では、ホスホジエステル様ヌクレオチド間連結は、ボラノホスフェート(またはボラノホスホネートと同等である)連結である(米国特許第5,177,198号;米国特許第5,859,231号;米国特許第6,160,109号;米国特許第6,207,819号;Sergueevら(1998年)、J Am Chem Soc、120巻:9417〜27頁)。別の好ましい実施形態では、ホスホジエステル様ヌクレオチド間連結は、ジアステレオマー的に純粋な、Rpホスホロチオエートである。ジアステレオマー的に純粋なRpホスホロチオエートは、ヌクレアーゼによる消化をいっそう受けやすく、混合型Spホスホロチオエート、またはジアステレオマー的に純粋なSpホスホロチオエートより、RNアーゼHの活性化が良好であると考えられる。CpGオリゴヌクレオチドの立体異性体は、PCT出願公開PCT/US99/17100(WO00/06588)の主題である。本発明の目的では、「ホスホジエステル様ヌクレオチド間連結」という用語はとりわけ、ホスホロジチオエート間連結およびメチルホスホネートヌクレオチド間連結を除外することに注目すべきである。
上記で記載した通り、本発明のソフトオリゴヌクレオチドおよびセミソフトオリゴヌクレオチドは、CとGとの間に、ホスホジエステル様連結を有しうる。ホスホジエステル様連結の一例は、Rpコンフォメーションにあるホスホロチオエート連結である。p−キラリティーのオリゴヌクレオチドは、活性を測定する時点に応じて、CpGオリゴヌクレオチドの免疫活性に対して、見かけ上、逆の効果を有し得る(Kriegら、Oligonucleotides、2003年、13巻(6号):491〜499頁)。40分という早期の時点では、ホスホロチオエートCpGオリゴヌクレオチドのRp立体異性体は、マウス脾臓細胞内のJNKリン酸化を誘導するが、Sp立体異性体は、これを誘導しない。これに対し、44時間という後期の時点でアッセイすると、Sp立体異性体は、脾臓細胞増殖の刺激において活性であるが、Rp立体異性体は、これにおいて活性ではない。Rp立体異性体と、Sp立体異性体との、反応速度および生物活性のこの差違は、細胞への取込みの差違から生じるものではなく、p−キラリティーの2つの反対の生物学的役割に起因する可能性が高い。第1に、早期の時点における、免疫細胞の刺激に対する、Sp立体異性体と比較した、Rp立体異性体の活性の増強は、Rpが、CpG受容体、TLR9との相互作用、または下流のシグナル伝達経路の誘導において、より有効でありうることを指し示す。他方、Sp PSオリゴヌクレオチドと比較した、Rp PSオリゴヌクレオチドの急速な分解は、シグナル伝達の、はるかに短い持続時間を結果としてもたらすので、後期の時点で調べると、おそらく、Sp連結のヌクレアーゼ抵抗性が大きいために、Sp PSオリゴヌクレオチドの生物学的活性が見かけ上大きくなり、Sp連結により、TLR9による、B細胞増殖のための、より持続的なシグナルがもたらされる。
こうして、オリゴヌクレオチドは、骨格組成が異質性であることが可能であり、これにより、併せて連結されるポリマー単位の、任意の可能な組合せを含有する。
「オリゴヌクレオチド」という用語はまた、糖内の置換または修飾などの置換または修飾を伴うオリゴヌクレオチドも包含する。例えば、これは、2’位におけるヒドロキシル基以外の低分子量有機基および5’位におけるリン酸基またはヒドロキシ基以外の低分子量有機基へと共有結合的に接合させた骨格糖を有するオリゴヌクレオチドを含む。こうして、修飾オリゴヌクレオチドは、2’−O−アルキル化リボース基を含みうる。加えて、修飾オリゴヌクレオチドは、リボースではなく、アラビノースまたは2’−フルオロアラビノースなどの糖を含みうる。
本発明の免疫刺激性オリゴヌクレオチドは、ホスホジエステルヌクレオチド間架橋または13−D−リボース単位を伴う、天然のRNAおよびDNAと比較して、多様な化学修飾および置換を包含しうる。当業者には、化学修飾の例が公知であり、例えば、Uhlmann Eら(1990年)、Chem Rev、90巻:543頁;「Protocols for Oligonucleotides and Analogs」、「Synthesis and PropertiesおよびSynthesis and Analytical Techniques」、S. Agrawal編、Humana Press、Totowa、USA、1993年;Crooke S Tら(1996年)、Annu Rev Pharmacol Toxicol、36巻:107〜129頁;およびHunziker Jら(1995年)、Mod Synth Methods、7巻:331〜417頁において記載されている。本発明に従うオリゴヌクレオチドは、1カ所または複数カ所の修飾を有することが可能であり、各修飾は、天然DNAまたはRNAから構成される、同じ配列のオリゴヌクレオチドと比較して、特定のホスホジエステルヌクレオチド間架橋および/または特定のβ−D−リボース単位に位置する。
例えば、本発明は、1カ所または複数カ所の修飾を含むことが可能であり、各修飾が独立に、a)修飾ヌクレオチド間架橋による、ヌクレオチドの3’末端および/または5’末端に位置するホスホジエステルヌクレオチド間架橋の置き換え;b)脱リン酸化架橋による、ヌクレオチドの3’末端および/または5’末端に位置するホスホジエステル架橋の置き換え;c)別の単位による、糖リン酸骨格に由来する糖リン酸単位の置き換え;ならびにd)修飾糖単位による、β−D−リボース単位の置き換えから選択されるオリゴヌクレオチドに関する。
オリゴヌクレオチドの化学修飾についての、より詳細な例は、以下の通りである。
ヌクレオチドの3’末端および/または5’末端に位置するホスホジエステルヌクレオチド間架橋は、修飾ヌクレオチド間架橋で置き換えることができ、修飾ヌクレオチド間架橋は、例えば、ホスホロチオエート架橋、ホスホロジチオエート架橋、NR−ホスホルアミデート架橋、ボラノホスフェート架橋、α−ヒドロキシベンジルホスホネート架橋、ホスフェート−(C〜C21)−O−アルキルエステル架橋、ホスフェート−[(C〜C12)アリール(C〜C21)−O−アルキル]エステル架橋、(C〜C)アルキルホスホネート架橋、および/または(C〜C12)アリールホスホネート架橋、(C〜C12)−α−ヒドロキシメチルアリール架橋(例えば、WO95/01363において開示されている)から選択され、この場合、(C〜C12)アリール、(C〜C20)アリール、および(C〜C14)アリールは、任意選択で、ハロゲン、アルキル、アルコキシ、ニトロ、シアノにより置換され、RおよびRは、互いから独立に、水素、(C〜C18)アルキル、(C〜C20)アリール、(C〜C14)アリール(C〜C)アルキル、好ましくは、水素、(C〜C)アルキル、好ましくは、(C〜C)アルキル、および/もしくはメトキシエチルであるか、またはRおよびRは、それらを保有する窒素原子と併せて、5〜6員の複素環を形成するが、これは、加えて、O、S、およびNの群に由来する、さらなるヘテロ原子も含有しうる。
ヌクレオチドの3’末端および/または5’末端に位置するホスホジエステル架橋の、脱リン酸化架橋(脱リン酸化架橋については、例えば、Uhlmann EおよびPeyman A、「Methods in Molecular Biology」、20巻、「Protocols for Oligonucleotides and Analogs」、S. Agrawal編、Humana Press、Totowa、1993年、16章、355頁以下において記載されている)による置き換えでは、脱リン酸化架橋は、例えば、脱リン酸化架橋である、ホルムアセタール基、3’−チオホルムアセタール基、メチルヒドロキシルアミン基、オキシム基、メチレンジメチルヒドラゾ基、ジメチレンスルホン基、および/またはシリル基から選択される。
糖リン酸骨格(すなわち、糖リン酸骨格は、糖リン酸単位から構成されている)に由来する糖リン酸単位(すなわち、糖リン酸単位を併せて形成する、β−D−リボースおよびホスホジエステルヌクレオチド間架橋)は、別の単位で置き換えることができ、他の単位は、例えば、「モルホリノ誘導体」オリゴマー(例えば、Stirchak E Pら(1989年)、Oligonucleotides Res、17巻:6129〜41頁において記載されている)を構築すること、すなわち、例えば、モルホリノ誘導体単位による置き換え、またはポリアミドオリゴヌクレオチド(例えば、Nielsen P Eら(1994年)、Bioconjug Chem、5巻:3〜7頁において記載されている「PNA」)を構築すること、すなわち、例えば、PNA骨格単位、例えば、2−アミノエチルグリシンによる置き換えに適する。
3−リボース単位またはβ−D−2’−デオキシリボース単位は、修飾糖単位で置き換えることができ、修飾糖単位は、例えば、β−D−リボース、α−D−2’−デオキシリボース、L−2’−デオキシリボース、2’−F−2’−デオキシリボース、2’−F−アラビノース、2’−O−(C〜C)アルキルリボースから選択され、好ましくは、2’−O−(C〜C)アルキルリボースは、2’−O−メチルリボース、2’−O−(C〜C)アルケニルリボース、2’−[O−(C〜C)アルキル−O−(C〜C)アルキル]リボース、2’−NH−2’−デオキシリボース、β−D−キシロフラノース、α−アラビノフラノース、2,4−ジデオキシ−β−D−エリスロヘキソピラノース、ならびに炭素環式糖類似体(例えば、Froehler J(1992年)、J Am Chem Soc、114巻:8320頁において記載されている)および/または鎖状糖類似体(例えば、Vandendriesscheら(1993年)、Tetrahedron、49巻:7223頁において記載されている)、および/または二環式糖類似体(例えば、Tarkov Mら(1993年)、Helv Chim Acta、76巻:481頁において記載されている)である。
一部の実施形態では、糖は、特に、ホスホジエステルまたはホスホジエステル様ヌクレオチド間連結により連結されたヌクレオチドの一方または両方について、2’−O−メチルリボースである。
本明細書で記載される特定の配列内では、修飾塩基のセットが規定される。例えば、文字Yを使用して、シトシンまたは修飾シトシンを含有するヌクレオチドを指す。本明細書で使用される修飾シトシンとは、シトシンの、天然に存在するまたは天然に存在しないピリミジン塩基類似体であって、オリゴヌクレオチドの免疫刺激性活性を損なわずにこの塩基を置き換えうる類似体である。修飾シトシンは、5−置換シトシン(例えば、5−メチルシトシン、5−フルオロシトシン、5−クロロシトシン、5−ブロモシトシン、5−ヨードシトシン、5−ヒドロキシシトシン、5−ヒドロキシメチルシトシン、5−ジフルオロメチルシトシン、および非置換5−アルキニルシトシンまたは置換5−アルキニルシトシン)、6−置換シトシン、N4−置換シトシン(例えば、N4−エチルシトシン)、5−アザシトシン、2−メルカプトシトシン、イソシトシン、シュードイソシトシン、縮合環系を伴うシトシン類似体(例えば、N,N’−プロピレンシトシンまたはフェノキサジン)、ならびにウラシルおよびその誘導体(例えば、5−フルオロウラシル、5−ブロモウラシル、5−ブロモビニルウラシル、4−チオウラシル、5−ヒドロキシウラシル、5−プロピニルウラシル)を含むがこれらに限定されない。好ましいシトシンのうちの一部は、5−メチルシトシン、5−フルオロシトシン、5−ヒドロキシシトシン、5−ヒドロキシメチルシトシン、およびN4−エチルシトシンを含む。本発明の別の実施形態では、シトシン塩基を、ユニバーサル塩基(例えば、3−ニトロピロール、P−塩基)、芳香族環系(例えば、フルオロベンゼンまたはジフルオロベンゼン)、または水素原子(dSpacer)で置換する。
文字Zを使用して、グアニンまたは修飾グアニン塩基を指す。本明細書で使用される修飾グアニンとは、グアニンの、天然に存在するまたは天然に存在しないプリン塩基類似体であって、オリゴヌクレオチドの免疫刺激性活性を損なわずに、グアニンを置き換えうる類似体である。修飾グアニンは、7−デアザグアニン、7−デアザ−7−置換グアニン(7−デアザ−7−(C2〜C6)アルキニルグアニンなど)、7−デアザ−8−置換グアニン、ヒポキサンチン、N2−置換グアニン(例えば、N2−メチルグアニン)、5−アミノ−3−メチル−3H,6H−チアゾロ[4,5−d]ピリミジン−2,7−ジオン、2,6−ジアミノプリン、2−アミノプリン、プリン、インドール、アデニン、置換アデニン(例えば、N6−メチルアデニン、8−オキソアデニン)8−置換グアニン(例えば、8−ヒドロキシグアニンおよび8−ブロモグアニン)、および6−チオグアニンを含むがこれらに限定されない。本発明の別の実施形態では、グアニン塩基を、ユニバーサル塩基(例えば、4−メチルインドール、5−ニトロインドール、およびK−塩基)、芳香族環系(例えば、ベンズイミダゾールまたはジクロロ−ベンズイミダゾール、1−メチル−1H−[1,2,4]トリアゾール−3−カルボン酸アミド)、または水素原子(dSpacer)で置換する。
オリゴヌクレオチドは、1または複数のアクセス可能な5’末端を有しうる。2つのこのような5’末端を有する修飾オリゴヌクレオチドを創出することが可能である。これは、例えば、3’−3’連結を介して、2つのオリゴヌクレオチドを接合させて、1つまたは2つのアクセス可能な5’末端を有するオリゴヌクレオチドを作出することにより達成することができる。3’−3’連結は、ホスホジエステル架橋、ホスホロチオエート架橋、または他の任意の修飾ヌクレオチド間架橋でありうる。当技術分野では、このような連結を達成するための方法が公知である。例えば、このような連結については、Seliger, H.ら、「Oligonucleotide analogs with terminal 3’−3’− and 5’−5’−internucleotidic linkages as antisense inhibitors of viral gene expression」、NucleosidesおよびNucleotides(1991年)、10巻(1〜3号)、469〜77頁;およびJiangら、「Pseudo−cyclic oligonucleotides: in vitro and in vivo properties」、BioorganicおよびMedicinal Chemistry(1999年)、7巻(12号)、2727〜2735頁において記載されている。
加えて、3’末端ヌクレオチド間の連結が、ホスホジエステル架橋でもホスホロチオエート架橋でも他の修飾架橋でもない、3’−3’連結オリゴヌクレオチドも、トリエチレングリコールホスフェート部分またはテトラエチレングリコールホスフェート部分(Durand, M.ら、「Triple−helix formation by an oligonucleotide containing one (dA)12 and two (dT)12 sequences bridged by two hexaethylene glycol chains」、Biochemistry(1992年)、31巻(38号)、9197〜204頁、米国特許第5,658,738号、および米国特許第5,668,265号)など、さらなるスペーサーを使用して調製することができる。代替的に、非ヌクレオチド性リンカーは、標準的なホスホルアミダイト化学反応を使用して、エタンジオール、プロパンジオール、または非塩基性デオキシリボース(dSpacer)単位(Fontanel, Marie Laurenceら、「Sterical recognition by T4 polynucleotide kinase of non−nucleosidic moieties 5’−attached to oligonucleotides」、Oligonucleotides Research(1994年)、22巻(11号)、2022〜7頁)から導出することができる。非ヌクレオチド性リンカーを、1回もしくは複数回にわたり組み込むか、または互いと組み合わせ、連結される、2つのODNの3’末端の間の、任意の所望の距離を可能とする。
オリゴヌクレオチドは、分解に対して部分的に抵抗性でありうる(例えば、安定化している)。「安定化オリゴヌクレオチド分子」とは、in vivoにおける分解(例えば、エクソヌクレアーゼまたはエンドヌクレアーゼを介する)に対して比較的抵抗性のオリゴヌクレオチドを意味するものとする。オリゴヌクレオチドの安定化は、骨格修飾を介して達することができる。ホスホロチオエート連結を有するオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの、細胞内のエクソヌクレアーゼおよびエンドヌクレアーゼによる分解からの最大の保護をもたらす。他の修飾オリゴヌクレオチドは、ホスホジエステル修飾オリゴヌクレオチド、ホスホジエステルオリゴヌクレオチドとホスホロチオエートオリゴヌクレオチドとの組合せ、メチルホスホネート、メチルホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、p−エトキシ、およびこれらの組合せを含む。一方または両方の末端において、テトラエチレングリコールまたはヘキサエチレングリコールなどのジオールを含有するオリゴヌクレオチドもまた、ヌクレアーゼによる分解に対して実質的に抵抗性であることが示されている。環状ODNは、エクソヌクレアーゼによる分解に対して保護される。例えば、Mologen製の、二重ステムループ免疫モジュレーターである、MGN1703(旧称:dSLIM−30L1)とは、共有結合的に閉じられた116ヌクレオチドの、ダンベル形のCpG含有ホスホジエステル骨格オリゴヌクレオチドであって、配列5’−AGGTGGTAACCCCTAGGGGTTACCACCTTCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGTTCTTAGGTGGTAACCCCTAGGGGTTACCACCTTCATTGGAAAACGTTCTTCGGGGCGTTCTT−3’(配列番号501)を有するオリゴヌクレオチド(Schmidt Mら、Allergy、2006年、61巻:56〜63頁;Kapp, Kら、Mol Ther Nucleic Acids、2014年、3巻:e170頁)である。
免疫刺激性オリゴヌクレオチドはまた、ヌクレオチドまたはヌクレオチド類似部分の間の、1カ所または複数カ所の異例の連結も含有しうる。通常のヌクレオシド間連結は、3’−5’連結である。2’−5’連結、5’−5’連結、3’−3’連結、2’−2’連結、2’−3’連結など、他の全ての連結は、異例のヌクレオシド間連結であると考えられる。2‘から5’という命名法は、リボースの炭素原子に従い選び出される。しかし、環拡張型糖類似体(例えば、ヘキサノース、シクロヘキセン、またはピラノース)または二環式糖類似体もしくは三環式糖類似体などの非天然糖部分を利用する場合、この命名法は、単量体の命名法に従い変化する。3’−デオキシ−β−D−リボピラノース類似体(p−DNAともまた呼ばれる)では、モノヌクレオチドは、例えば、4’−2’連結を介して接続される。
オリゴヌクレオチドが、1カ所の3’−3’連結を含有する場合、このオリゴヌクレオチドは、2つの非連結5’末端を有しうる。同様に、オリゴヌクレオチドが、1カ所の5’−5’連結を含有する場合、このオリゴヌクレオチドは、2つの非連結3’末端を有しうる。ヌクレオチドの非連結末端のアクセス可能性は、それらの受容体により、より良好にアクセス可能でありうる。異例の連結の両方の種類(3’−3’連結および5’−5’連結)については、3’−3’連結を有するオリゴヌクレオチドが、ヌクレアーゼによる切断に対する安定性の増強を示すことを報告する、Ramalho Ortigaoら(Antisense Research and Development(1992年)2巻、129〜46頁)により記載された。
また、異なる種類の連結を、1つの分子内で組み合わせることもでき、これは、オリゴマーの分枝をもたらしうる。オリゴヌクレオチドの1つの部分を、3’末端において、3’−3’連結を介して、第2のオリゴヌクレオチド部分へと接続し、2’末端において、2’−3’連結を介して、分子の第3の部分へと接続する場合、これは、例えば、3つの5’末端を伴う分枝状オリゴヌクレオチド(3’−3’、2’−3’分枝)を結果としてもたらす。
III.チェックポイント阻害剤
A.PD−1
CD279としてもまた公知の、プログラム死1受容体(PD−1)とは、活性化T細胞(CD8T細胞を含む)上、B細胞上、およびマクロファージ上で発現する1型膜タンパク質である。その同族リガンドは、PD−L1およびPD−L2であり、特に、PD−L1による、PD−1への結合は、T細胞内の「シグナル3」を遮断し、例えば、PD−1を発現させるT細胞の死をもたらすことにより、獲得免疫応答のエフェクターアームを強力に阻害する。
ヒトでは、PD−1は、GenBank受託番号:NP_005009として公開されているアミノ酸配列を有する、268アミノ酸のポリペプチドである。タンパク質は、細胞外IgVドメイン、膜貫通ドメイン、および2つのリン酸化部位を有する細胞内ドメインを含む。
PD−1とPD−L1との相互作用についてのKは、770nMである。
本発明の好ましい実施形態では、抗体は、PD−1とPD−L1との結合を阻害する。好ましくは、抗体は、PD−L1との結合を、約100nMもしくはそれ未満;より好ましくは、約10nMもしくはそれ未満、例えば、約5nMもしくはそれ未満;さらにより好ましくは、約2nMもしくはそれ未満;または、さらにより好ましくは、例えば、約1nMもしくはそれ未満のIC50で阻害しうる。
さらに、別の実施形態では、抗PD−1抗体は、PD−L1のものと少なくとも同等な強さのPD−1に対する結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗PD−1抗体は、PD−1に対する結合アフィニティーであって、PD−L1による結合アフィニティーの、少なくとも10倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗PD−1抗体は、PD−1に対する結合アフィニティーであって、PD−L1による結合アフィニティーの、少なくとも100倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗PD−1抗体は、PD−1に対する結合アフィニティーであって、PD−L1による結合アフィニティーの、少なくとも1000倍の強さの結合アフィニティーを有する。
当技術分野では、抗PD−1抗体が公知であり、例えば、Woodらによる米国特許第6,808,710号、Collinsらによる米国特許第7,488,802号、およびHonjoらによる米国特許第8,728,474号において開示されている抗PD−1抗体を含む。抗PD−1抗体は、ペムブロリズマブ(かつては、ランブロリズマブとして公知であり、MK−3475、KEYTRUDA(登録商標)、Merck、K:29pMである)およびニボルマブ(OPDIVO(登録商標)、Bristol−Myers Squibb、K:2.6nM)として市販されている。現在開発下にある、さらなる抗PD−1抗体は、ピジリズマブ(CT−011、Cure Tech)を含む。
B.PD−L1
CD274およびB7相同体1(B7−H1)としてもまた公知の、プログラム死リガンド1受容体(PD−L1)とは、活性化T細胞(CD8T細胞およびいわゆる腫瘍浸潤リンパ球(TIL細胞)を含む)上、B細胞上、マクロファージ上、および樹状細胞上のほか、多くの種類の腫瘍細胞上で発現する、1型膜タンパク質である。その同族リガンドは、PD−1およびB7.1(CD80)であり、PD−L1による、PD−1への結合は、T細胞内の「シグナル3」を遮断し、例えば、PD−1を発現させるT細胞の死をもたらすことにより、獲得免疫応答を媒介する、T細胞のエフェクター機能を強力に阻害しうる。
PD−L1の発現は、インターフェロンガンマ(IFN−γ)に応答して、T細胞上、NK細胞上、マクロファージ上、骨髄樹状細胞上、B細胞上、上皮細胞上、および血管内皮細胞上で上方調節される。PD−L1の発現はまた、IFN−γに応答して、腫瘍上、例えば、腎細胞癌上および卵巣がん上でも上方調節される。
ヒトでは、PD−L1は、2つのアイソフォームである、長いアイソフォームa、または短いアイソフォームbで発現する。アイソフォームaは、GenBank受託番号:NP_054862として公開されているアミノ酸配列を有する290アミノ酸のポリペプチドであり、成熟ペプチドは、アミノ酸残基19〜290を含み、残基239〜259は、膜貫通ドメインを表す。アイソフォームbは、GenBank:NP_001254635として公開されているアミノ酸配列を有する176アミノ酸のポリペプチドであり、成熟ペプチドは、アミノ酸残基19〜259を含む。
上述の通り、PD−1とPD−L1との相互作用についてのKは、770nMである。
本発明の好ましい実施形態では、抗体は、PD−1とPD−L1との結合を阻害する。好ましくは、抗体は、PD−1との結合を、約100nMもしくはそれ未満;より好ましくは、約10nMもしくはそれ未満、例えば、約5nMもしくはそれ未満;さらにより好ましくは、約2nMもしくはそれ未満;または、さらにより好ましくは、例えば、約1nMもしくはそれ未満のIC50で阻害しうる。
さらに、別の実施形態では、抗PD−L1抗体は、PD−1のものと少なくとも同等な強さのPD−L1に対する結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗PD−L1抗体は、PD−L1に対する結合アフィニティーであって、PD−1による結合アフィニティーの、少なくとも10倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗PD−L1抗体は、PD−L1に対する結合アフィニティーであって、PD−1による結合アフィニティーの、少なくとも100倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗PD−L1抗体は、PD−L1に対する結合アフィニティーであって、PD−1による結合アフィニティーの、少なくとも1000倍の強さの結合アフィニティーを有する。
当技術分野では、抗PD−L1抗体が公知であり、例えば、Kormanらによる米国特許第7,943,743号において開示されている抗PD−L1抗体を含む。米国では、抗PD−L1抗体は、FDAにより、市販化について承認されていないが、MPDL3280A(Genetech/Roche、K:0.4nM)、BMS−936559(Bristol−Myers Squibb)、およびMEDI−4736(AstraZeneca)を含む、いくつかの抗PD−L1抗体が、現在、ヒト臨床試験において、開発下にある。
C.CTLA−4
CTLA4またはCD152としてもまた公知の、細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA−4)は、T細胞上および調節性T細胞(Treg)上で発現する膜タンパク質である。その同族リガンドは、抗原提示細胞(APC)上の、B7−1(CD80)およびB7−2(CD86)を含む。CTLA−4による、B7−1またはB7−2への結合は、T細胞内の「シグナル2」を遮断し、獲得免疫応答の開始を阻害する。
ヒトでは、CTLA−4は、GenBank受託番号:NP_001032720として公開されているアミノ酸配列を伴うアイソフォームを含む、多様なアイソフォームでコードされている。
好ましい抗CTLA−4抗体は、ヒトCTLA−4に特異的に結合するヒト抗体である。より具体的には、抗CTLA−4抗体は、ヒトCTLA−4の細胞外ドメイン内のエピトープに特異的に結合し、CTLA−4と、その同族リガンドである、B7−1およびB7−2の一方または両方との結合を阻害する。
好ましい抗CTLA−4抗体は、ヒトCTLA−4に特異的に結合するヒト抗体である。より具体的には、抗CTLA−4抗体は、ヒトCTLA−4の細胞外ドメイン内のエピトープに特異的に結合し、CTLA−4と、その同族リガンドである、B7−1およびB7−2の一方または両方との結合を阻害する。例示的なヒト抗CTLA−4抗体については、それらの全ての開示が、参照により本明細書に組み込まれる、2000年6月29日に、WO00/37504として公開された、国際出願PCT/US99/30895;2002年4月12日に公開された、欧州特許出願EP1262193A1;現在、米国特許第6,682,736号として交付されている、Hansonらによる、米国特許出願第09/472,087号;US2002/0086014として公開されている、米国特許出願第09/948,939号;US2009/0117132として公開されている、米国特許出願第11/988,396号;およびUS2012/0003179として公開されている、米国特許出願第13/168,206号において、詳細に記載されている。このような抗体は、3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1のほか、MDX−010を含むがこれらに限定されない。ヒト抗体は、ヒト患者における非ヒト抗体の使用と関連する免疫原性およびアレルギー反応を最小化することが期待されるので、本発明の処置法において、実質的な利点をもたらす。
抗CTLA−4抗体は具体的に、イピリムマブ(YERVOY(登録商標)、Bristol−Myers Squibb)を含む。
本発明の有用なヒト抗CTLA−4抗体の特徴については、WO00/37504、EP1262193、および米国特許第6,682,736号のほか、米国特許出願公開第US2002/0086014および同第US2003/0086930号において広範に論じられており、その中で明示されているアミノ酸配列および核酸配列は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。略述すると、本発明の抗体は、抗体3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、12.9.1.1、およびMDX−010などであるがこれらに限定されない抗体のアミノ酸配列を有する抗体を含む。本発明はまた、これらの抗体の重鎖および軽鎖の、CDRのアミノ酸配列を有する抗体のほか、上記で引用した出願および特許において記載されている、CDR領域の変化を有する抗体にも関する。本発明はまた、これらの抗体の重鎖および軽鎖の可変領域を有する抗体にも関する。別の実施形態では、抗体を、抗体3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1、およびMDX−010の重鎖および軽鎖の、全長アミノ酸配列、可変領域のアミノ酸配列、またはCDRのアミノ酸配列を有する抗体から選択する。
当技術分野では、抗CTLA−4抗体を投与する方法が周知である。抗体は、全身投与、一般にIVにより施すことが最も一般的である。動物モデルでは、用量および毒性を低減するように、腫瘍内投与もまた、探索されているが、ヒトでは探索されていない(Fransen MFら、Oncoimmunology、2013年11月1日、2巻(11号):e26493頁)。
一実施形態では、本発明は、米国特許出願公開第2002/0086014および同第2003/0086930号として公開されている、米国特許出願第09/948,939号、およびその中で引用されている参考文献において開示されているヒト抗CTLA−4抗体であって、MAb 10D1(MDX−010、Medarex、Princeton、N.J.)を含むがこれに限定されないヒト抗CTLA−4抗体を含む抗体−治療剤の組合せを含む。なおより好ましくは、抗CTLA−4抗体は、MDX−010である。代替的に、抗CTLA−4抗体は、11.2.1(ティシリムマブ(ticilimumab);CP−675,206)である。
本発明の好ましい実施形態では、抗体は、CTLA−4と、B7−1、B7−2、またはこれらの両方との結合を阻害する。好ましくは、抗体は、B7−1との結合を、約100nMもしくはそれ未満;より好ましくは、約10nMもしくはそれ未満、例えば、約5nMもしくはそれ未満;さらにより好ましくは、約2nMもしくはそれ未満;または、さらにより好ましくは、例えば、約1nMもしくはそれ未満のIC50で阻害しうる。同様に、抗体は、B7−2との結合を、約100nMもしくはそれ未満;より好ましくは、10nMもしくはそれ未満、例えば、なおより好ましくは、約5nMもしくはそれ未満;さらにより好ましくは、約2nMもしくはそれ未満;または、さらにより好ましくは、約1nMもしくはそれ未満のIC50で阻害しうる。
さらに、別の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−1による結合アフィニティーと、少なくとも同等な強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−1による結合アフィニティーの、少なくとも10倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−1による結合アフィニティーの、少なくとも100倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−1による結合アフィニティーの、少なくとも1000倍の強さの結合アフィニティーを有する。
さらに、別の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−2による結合アフィニティーと、少なくとも同等な強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−2による結合アフィニティーの、少なくとも10倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−2による結合アフィニティーの、少なくとも100倍の強さの結合アフィニティーを有する。ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、B7−2による結合アフィニティーの、少なくとも1000倍の強さの結合アフィニティーを有する。
さらに、別の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、CTLA−4に対する結合アフィニティーであって、約10−8Mまたはそれ超のアフィニティー、より好ましくは、約10−9Mまたはそれ超のアフィニティー、より好ましくは、約10−10Mまたはそれ超のアフィニティーであり、なおより好ましくは、約10−11Mまたはそれ超のアフィニティーを有する。
ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、結合について、4.1.1、6.1.1、11.2.1、4.13.1、および4.14.3からなる群より選択される抗体の重鎖アミノ酸配列および軽鎖アミノ酸配列を有する抗体と競合しうる。さらに、ある特定の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、結合について、MDX−010抗体と競合しうる。
別の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、抗体4.1.1、4.13.1、4.14.3、6.1.1、または11.2.1の重鎖配列および軽鎖配列、可変重鎖配列および可変軽鎖配列、ならびに/または重鎖CDR配列および軽鎖CDR配列を有する抗体と交差競合することが好ましい。例えば、抗体は、4.1.1、4.13.1、4.14.3、6.1.1、または11.2.1からなる群より選択される抗体の重鎖アミノ酸配列および軽鎖アミノ酸配列、重鎖可変配列および軽鎖可変配列、ならびに/または重鎖CDR配列および軽鎖CDR配列を有する抗体が結合するエピトープに結合しうる。別の実施形態では、抗CTLA−4抗体は、MDX−010の重鎖配列および軽鎖配列または抗原結合性配列を有する抗体と交差競合する。
別の実施形態では、本発明を、3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1からなる群より選択される抗体の、CDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列を含む重鎖、ならびにCDR1、CDR2、およびCDR3のアミノ酸配列を含む軽鎖、または前記CDR配列からの変化であって、非極性残基の、他の非極性残基による置き換え、極性荷電残基の、他の極性非荷電残基による置き換え、極性荷電残基の、他の極性荷電残基による置き換え、および構造的に類似する残基の置換からなる群より選択される、保存的変化;極性荷電残基による、極性非荷電残基の置換および非極性残基による、極性残基の置換からなる群より選択される、非保存的置換;付加;ならびに欠失からなる群より選択される変化を有する配列を含む抗CTLA−4抗体を使用して実施する。
本発明のさらなる実施形態では、抗体は、フレームワーク領域またはCDR領域内の、生殖細胞系列配列からの、10、7、5、または3カ所未満のアミノ酸変化を含有する。別の実施形態では、抗体は、フレームワーク領域内の、5カ所未満のアミノ酸変化、およびCDR領域内の、10カ所未満の変化を含有する。1つの好ましい実施形態では、抗体は、フレームワーク領域内の、3カ所未満のアミノ酸変化、およびCDR領域内の、7カ所未満の変化を含有する。好ましい実施形態では、フレームワーク領域内の変化は、保存的であり、CDR領域内の変化は、体細胞変異である。
別の実施形態では、抗体は、重鎖および軽鎖のCDR1配列、CDR2配列、およびCDR3配列にわたり、抗体3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1のCDR配列との少なくとも80%、より好ましくは、少なくとも85%、なおより好ましくは、少なくとも90%、さらにより好ましくは、少なくとも95%、より好ましくは、少なくとも99%の配列同一性を有する。なおより好ましくは、抗体は、重鎖および軽鎖のCDR1、CDR2、およびCDR3にわたり、抗体3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1の配列との100%の配列同一性を共有する。
さらに別の実施形態では、抗体は、重鎖および軽鎖の可変領域配列にわたり、抗体3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1の可変領域配列との少なくとも80%、より好ましくは、少なくとも85%、なおより好ましくは、少なくとも90%、さらにより好ましくは、少なくとも95%、より好ましくは、少なくとも99%の配列同一性を有する。なおより好ましくは、抗体は、重鎖および軽鎖の可変領域配列にわたり、抗体3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、および12.9.1.1の配列との100%の配列同一性を共有する。
D.他のチェックポイント阻害剤
当技術分野では、上記で列挙したものに加えて、他のチェックポイントも公知であり、それらの阻害剤も、本発明に含まれる。例えば、BTLAは、HVEMに応答して、負のシグナルをもたらし、TIM3は、Gal9に応答して、負のシグナルをもたらす。アデノシンは、アデノシンA2a受容体を介して、抑制性効果を誘発することが可能であり、IDOおよびTDOは、抗腫瘍免疫に関与すると考えられる、周知の免疫抑制性経路である。LAG3は、CD4より高アフィニティーで、MHCクラスIIに結合する。LAG3は、細胞増殖、活性化、およびT細胞のホメオスタシスを、CTLA−4およびPD−1と同様に、負に調節し、Tregの抑制性機能においても役割を果たすことが報告されている。LAG3はまた、CD8T細胞を、寛容原性状態に維持する一助ともなり、PD−1と共に働いて、慢性ウイルス感染時のCD8疲弊を維持する一助ともなる。LAG3は、樹状細胞の成熟および活性化に関与することが公知である。本発明における使用のための、さらなるチェックポイント阻害剤は、限定せずに、BTLA、TIM3、およびLAG3のうちの、任意の1または複数に特異的に結合することが可能な、抗体およびその抗原結合性断片を含む。本発明はまた、BTLA、TIM3、およびLAG3のうちの、任意の1または複数に特異的に結合することが可能な、二特異性抗体およびその二特異性抗原結合性断片も企図する。
本発明は、TLR9アゴニストと、チェックポイント阻害剤との組合せを企図するが、この場合、チェックポイント阻害剤は、単一のCPIの場合もあり、2つまたはそれ超のCPIの任意の組合せの場合もある。臨床使用では、1つのCPIだけ、または1対のCPIだけを使用する可能性が高いが、本発明は、例えば、CTLA−4、PD−1、PD−L1、TIM3、LAG3またはBTLAの阻害剤から選択される、任意の1つ、任意の2つ、任意の3つ、もしくは任意の4つ、またはそれ超のCPIの使用も企図する。
E.抗体の由来
本明細書で既に論じた、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、および抗CTLA−4抗体が、好ましい場合があるが、当業者は、本明細書で提示される本開示に基づき、本発明は、多種多様な抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、および抗CTLA−4抗体を包含し、これらの特定の抗体に限定されないことを認識するであろう。より具体的には、ヒトにおける使用のためには、ヒト抗体が好ましいが、本発明は、ヒト抗体に限定されず、本発明は、種の由来に関わらず、有用な抗体を包含し、他の抗体の中でも、キメラ抗体、ヒト化抗体、および/または霊長類化(primatized)抗体を含む。本明細書で例示される抗体のうちのある特定の抗体は、ヒト免疫レパートリーを含むトランスジェニック哺乳動物、例えば、マウスを使用して得たが、当業者はまた、本明細書で提示される本開示に基づき、本発明が、この方法または他の任意の特定の方法により作製された抗体に限定されないことも理解するであろう。代わりに、本発明は、本発明の抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体をもたらすための任意の方法であって、当技術分野で公知の方法(例えば、ファージディスプレイライブラリーのスクリーニングなど)または将来において開発される方法を含むがこれらに限定されない方法により作製される、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体を含む。本明細書、および、例えば、Bedianらによる米国特許第6,682,736号、および米国特許出願公開第2002/0088014号において提示される広範な開示に基づき、当業者は、本明細書で開示される新規の方法を使用して、CpG ODNと組み合わせたがんの処置に有用な、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体を、たやすく作製し、同定することができる。
本発明は、Hansonらによる米国特許第6,682,736号において開示されている通り、トランスジェニックの非ヒト哺乳動物、すなわち、XenoMouse(商標)(Abgenix,Inc.、Fremont、Calif.)を使用して作製されるヒト抗体を包含する。
「ヒト」抗体を作製するための、別のトランスジェニックマウス系を、「HuMAb−Mouse(商標)」(Medarex、Princeton、N.J.)と称するが、これは、非再配列ヒト重(ミューおよびガンマ)鎖免疫グロブリン配列および非再配列ヒトカッパ軽鎖免疫グロブリン配列をコードするヒト免疫グロブリン遺伝子のミニ遺伝子座を、内因性ミュー鎖遺伝子座および内因性カッパ鎖遺伝子座を不活化させる標的化変異と併せて含有する(Lonbergら、Nature、368巻:856〜859頁(1994年)、および米国特許第5,770,429号)。
しかし、本発明では、例えば、Tomizukaら、Proc Natl Acad Sci USA、97巻:722頁(2000年);Kuroiwaら、Nature、Biotechnol、18巻:1086頁(2000年);Mikayamaらによる米国特許出願公開第2004/0120948号において記載されている、Kirin TC Mouse(商標)(日本、東京、キリン株式会社);ならびにHuMAb−Mouse(商標)(Medarex、Princeton、N.J.)および前出のXenoMouse(商標)(Abgenix,Inc.、Fremont、Calif.)などであるがこれらに限定されない、任意のトランスジェニック哺乳動物を使用して作製された、ヒト抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体も使用する。こうして、本発明は、任意のトランスジェニック動物、または他の非ヒト動物を使用して作製された、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体の使用を包含する。
さらに、ヒト抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体を作製する、好ましい方法は、ヒト免疫レパートリーを含む、非ヒトトランスジェニック哺乳動物を使用する、抗体の作出を含むが、本発明は、この手法に限定されない。そうではなくて、本明細書で提示される本開示を得た当業者により認識される通り、本発明は、目的の抗原に特異的に結合する抗体の作製のための、当技術分野で公知であるか、または将来において開発される、任意の方法に従い作製される、PD−1、PD−L1、またはCTLA−4に特異的なヒト抗体、または他の任意の抗体を作製するための、任意の方法の使用を包含する。
ヒト抗体は、ファージディスプレイ抗体ライブラリーの使用を含むがこれらに限定されない方法により開発することができる。例えば、これらの技法を使用して、CTLA−4発現細胞、CTLA−4自体、CTLA−4の形態、そのエピトープまたはペプチドに対する抗体、そしてこれらに対する発現ライブラリー(例えば、米国特許第5,703,057号を参照されたい)も作出することができ、これは、後に上記で記載した活性についてスクリーニングすることができる。
別の実施形態では、本発明の方法において利用される抗体は、完全ヒト抗体ではなく、「ヒト化」抗体である。特に、当技術分野で周知の技法を使用して、マウス抗体または他の種に由来する抗体を、「ヒト化」または「霊長類化」することができる。例えば、WinterおよびHarris、Immunol. Today、14巻:43〜46頁(1993年)、Wrightら、Crit. Reviews in Immunol.、12巻:125〜168頁(1992年)、ならびにCabillyらによる、米国特許第4,816,567号、ならびにMageおよびLamoyi、「Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications」、79〜97頁、Marcel Dekker, Inc.、New York、N.Y.(1987年)を参照されたい。
本明細書で提示される本開示に基づき認識される通り、本発明における使用のための抗体は、トランスジェニックの非ヒト哺乳動物、およびそれから導出されたハイブリドーマから得ることができるが、また、ハイブリドーマ以外の細胞株内で発現させることもできる。
当技術分野では、発現のための宿主として利用可能な哺乳動物細胞株が周知であり、The American Type Culture Collection(ATCC)から入手可能な、多くの不死化細胞株であって、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、NS0、HeLa細胞、ベビーハムスター腎臓(BHK)細胞、サル腎臓細胞(COS)、ならびにヒト肝細胞癌細胞(例えば、HepG2)を含むがこれらに限定されない不死化細胞株を含む。また、細菌、酵母、昆虫、および植物細胞を含む、哺乳動物細胞以外の原核細胞および真核細胞も、利用することができる。
当技術分野で周知の、多様な発現系であって、例えば、SambrookおよびRussell、「Molecular Cloning, A Laboratory Approach」、Cold Spring Harbor Press、Cold Spring Harbor、N.Y.(2001年)、ならびにAusubelら、「Current Protocols in Molecular Biology」、John WileyおよびSons、NY(2002年)において記載されている発現系などであるがこれらに限定されない発現系を使用することができる。これらの発現系は、他の多くの中でも、ジヒドロ葉酸レダクターゼ(DHFR)ベースの系を含む。グルタミンシンターゼ発現系は、欧州特許EP216846、EP256055、およびEP323997、および欧州特許出願第89303964号との関連で、全体または一部において論じられている。一実施形態では、使用される抗体は、グルタミンシンターゼ系(GS−NS0)を使用して、NS0細胞により作製する。別の実施形態では、抗体は、DHFR系を使用するCHO細胞により作製する。当技術分野では、いずれの系も周知であり、他の文献の中でも、Barnesら、BiotechおよびBioengineering、73巻:261〜270頁(2001年)、およびその中で引用されている参考文献において記載されている。
非ヒトグリコシル化から生じる、免疫原性、薬物動態、および/またはエフェクター機能の変化を防止するために、グリコシル化を消失させる、抗体のCH2ドメインの部位指向変異誘発が好ましい場合がある。さらに、抗体は、酵素的方法(例えば、Thotakuraら、Meth. Enzymol.、138巻:350頁(1987年)を参照されたい)および/または化学的方法(例えば、Hakimuddinら、Arch. Biochem. Biophys.、259巻:52頁(1987年)を参照されたい)により脱グリコシル化させることもできる。
さらに、本発明は、グリコシル化パターンの変更を含む、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体の使用を包含する。当業者は、本明細書で提示される本開示に基づき、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体を、対応する変更されていない抗体と比較して、追加の、より少ないまたは異なるグリコシル化部位を含むように修飾しうることを認識するであろう。このような修飾は、例えば、米国特許出願公開第2003/0207336号および同第2003/0157108号、ならびに国際特許公開WO01/81405および同第00/24893号において記載されている。
加えて、本発明は、(存在する場合)抗体上に存在するグリコフォームと関係なく、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体の使用を含む。さらに、当技術分野では、糖タンパク質上に存在するグリコフォームを、広範にリモデリングするための方法が周知であり、例えば、国際特許公開WO03/031464、WO98/58964、およびWO99/22764、ならびに米国特許出願公開第2004/0063911号、同第2004/0132640号、同第2004/0142856号、同第2004/0072290号、ならびにUmanaらによる米国特許第6,602,684号において記載されている方法を含む。
さらに、本発明は、例えば、米国特許出願公開第2003/0207346号および同第2004/0132640号、ならびに米国特許第4,640,835号;同第4,496,689号;同第4,301,144号;同第4,670,417号;同第4,791,192号;および同第4,179,337号において明示されている形で、ポリペプチドを、様々な非タンパク質性ポリマー、例えば、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、またはポリオキシアルキレンのうちの1つへと連結することを含むがこれらに限定されない、当技術分野で公知の、任意の共有結合的修飾および非共有結合的修飾を伴う、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体の使用を包含する。
加えて、本発明は、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、もしくは抗CTLA−4抗体、またはその抗原結合性部分、例えば、ヒト血清アルブミンポリペプチドまたはその断片を含むキメラタンパク質の使用を包含する。キメラタンパク質が、例えば、キメラタンパク質をコードするキメラ核酸のクローニングによる組換え法を使用して作製されたのであれ、2つのペプチド部分の化学的連結により作製されたのであれ、本明細書で提示される教示を得た当業者であれば、このようなキメラタンパク質は、当技術分野で周知であり、安定性の増大および血清半減期の延長などであるがこれらに限定されない、所望の生物学的特性を、本発明の抗体へと付与することが可能であり、したがって、このような分子は、本明細書に含まれることを理解するであろう。
本発明における使用のために作出される抗体は、初期に、特定の所望のアイソタイプを有する必要はない。そうではなくて、作出される抗体は、任意のアイソタイプを有することが可能であり、したがって、従来の技法を使用してスイッチングされるアイソタイプでありうる。これらは、直接的な組換え技術(例えば、米国特許第4,816,397号を参照されたい)および細胞間融合技術(例えば、米国特許第5,916,771号を参照されたい)を含む。
本発明の抗体のエフェクター機能は、多様な治療的使用のために、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgD、IgA、IgE、またはIgMへのアイソタイプスイッチングにより変化させることができる。さらに、細胞殺滅のための補体への依存も、例えば、二特異性剤(bispecifics)、免疫毒素、または放射性標識の使用により回避することができる。
したがって、本発明で使用される、好ましい抗CTLA−4抗体は、3.1.1、4.1.1、4.8.1、4.10.2、4.13.1、4.14.3、6.1.1、11.2.1、11.6.1、11.7.1、12.3.1.1、12.9.1.1、およびMDX−010のアミノ酸配列、または、例えば、V領域もしくはそのCDRの配列を有する抗体により例示されるが、本発明は、いかなる形でも、これらの特定の抗CTLA−4抗体、または他の任意の特定の抗CTLA−4抗体の使用に限定されない。好ましくは、抗体は、4.1.1、4.13.1、11.2.1、および/またはMDX−010である。しかし、本発明の方法では、本明細書の別の箇所で記載されるか、または当技術分野で公知であるか、または将来において開発される、任意の抗CTLA−4抗体またはその抗原結合性部分を使用することができる。より具体的には、任意の種に由来する抗CTLA−4抗体である、ヒト化キメラ抗体(例えば、CastermanおよびHamersによる、米国特許第5,759,808号および同第6,765,087号において記載されている、ラクダ科動物(camelid)から得られる単鎖抗体を含む)のほか、任意のヒト抗体を、CpG ODNと組み合わせて、本明細書で開示される新規の方法を実施することができる。
本発明はまた、他の多くの抗体の中でも、とりわけ、国際特許公開WO00/37504(2000年6月29日に公表された);WO01/14424(2001年3月1日に公表された);WO93/00431(1993年1月7日に公表された);およびWO00/32231(2000年6月8日に公表された)において開示されている抗体も包含する。
こうして、本明細書で提示される教示を得た当業者であれば、本発明の抗CTLA−4抗体−治療剤の組合せが、多種多様な抗CTLA−4抗体を含みうることをたやすく認識するであろう。
さらに、当業者は、本明細書で提示される本開示に基づき、本発明が、単一の抗体だけの投与に限定されず、少なくとも1つの抗CTLA−4抗体、例えば、4.1.1、4.13.1、および11.2.1の、CpG ODNと組み合わせた投与も包含することを理解するであろう。さらに、本発明は、任意の公知の抗CTLA−4抗体の任意の組合せの投与であって、CpG ODNの、例えば、4.1.1、4.13.1、11.2.1、およびMDX−010と組み合わせた投与を含むがこれらに限定されない投与を包含する。こうして、抗CTLA−4抗体の任意の組合せを、少なくとも1つの治療剤と組み合わせることができ、本発明は、これらについての、任意のこのような組合せおよび順列を包含する。
IV.CpG DNAおよびチェックポイント阻害剤の組合せ免疫療法
本発明は、CpG ODNを、がん性腫瘍の内部または近傍へと局所投与し、かつ、抗PD−1抗体、抗PD−L1抗体、または抗CTLA−4抗体などのチェックポイント阻害剤を全身投与して、がんを処置するステップを含む、組合せ腫瘍免疫療法に関する。患者を、CpG ODN(最大0.15mg/kg/週で皮下投与されるクラスB)と、抗CTLA−4抗体との組合せで処置した、単一のヒト臨床試験について報告されている(Millward Mら、Br. J. Cancer、2013年、108巻(10号):1998〜2004頁)。この研究は、病期IVの黒色腫を伴う、21例の患者における、毎週のIV抗CTLA−4および皮下CpGによる、12週間にわたる組合せ療法のためのMTDを確立した。研究の結果は、腫瘍学におけるTLR9アゴニストの開発の継続を保証するのに、十分に有望であるとは考えられなかった(出資者による、全ての免疫腫瘍学薬の開発は終了した)が、研究による、いくつかの興味深い知見は、本発明の有用性を裏付ける。第1に、TLR9アゴニストと、チェックポイント阻害剤との組合せは、比較的十分に耐容され(全身性自己免疫疾患は観察されず)、あらかじめ指定された初期の6週間において、用量制限毒性を発症したのは、3例の患者だけであり、このうちの2例は、抗CTLA−4抗体の最高用量群であった。第2に、組合せレジメンによる抗CTLA−4抗体に対する、抗体応答の誘導は見られなかった。第3に、2例の患者は、処置に対する部分応答を達成し、他の何例かは、異例の長期にわたる安定病態を達成した。
高IFN誘導性CpG ODNと、抗PD−1、抗PD−L1、または抗CTLA−4との組合せは、原発性がんおよび続発性(すなわち、転移性)がんの処置に有用である。より具体的には、多くの潜在的な処置選択肢の中で、CpG ODNと、抗チェックポイントとの組合せ療法を使用して、がんを処置することができる。ある特定の実施形態では、処置されるがんは、がん性腫瘍であるか、またはこれを含む。本明細書で使用される「がん性腫瘍」とは、正常な外部シグナルにより調節されないそれらの成長または増殖によって特徴付けられる、異常な細胞を含む、細胞の異常な腫脹または目視可能な収集物を指す。ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、癌腫、肉腫、または腺がんであるが、これらは、場合によって、充実性腫瘍と称される。ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、血液悪性疾患を除外する。ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、ある特定の血液悪性疾患、例えば、リンパ腫を含む。
本発明の方法により処置可能な、代表的ながんは、限定せずに、具体的に、皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨のがんを含む。本発明の方法により処置可能ながんにはまた、黒色腫、腎細胞癌、および非小細胞肺がん(NSCLC)も具体的に含まれる。本発明の方法により処置可能ながんにはまた、リンパ腫、骨髄のがん、カルチノイド腫瘍、および神経芽細胞腫も具体的に含まれる。
一部の実施形態では、前出のがんが好ましいが、本発明は、カポジ肉腫、滑膜肉腫、中皮腫、肝胆道(hepatobiliary)(肝臓および胆道)、原発性脳腫瘍または続発性脳腫瘍、肺がん(NSCLCおよびSCLC)、骨がん、皮膚がん、頭頚部がん、皮膚黒色腫または眼内黒色腫、肛門領域がん、胃(stomach(gastric))がん、消化器(胃、結腸直腸、および十二指腸)がん、結腸がん、子宮がん、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頚癌、膣癌、外陰癌、食道がん、小腸がん、内分泌系がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、副腎がん、軟組織肉腫、尿道がん、前立腺がん、陰茎がん、精巣がん、膀胱がん、腎臓がんまたは尿路がん、腎盂癌、膵臓がん、原発性CNS腫瘍または続発性CNS腫瘍を含む中枢神経系(CNS)の新生物、脊髄軸腫瘍(spinal axis tumor)、脳幹グリオーマ、神経膠芽腫、髄膜腫、筋芽細胞腫、星状細胞腫、下垂体腺腫、副腎皮質がん、胆嚢がん、胆管癌、線維肉腫、神経芽細胞腫、および網膜芽細胞腫のほか;一部の実施形態では、非ホジキンリンパ腫(NHL;無痛性NHLおよび侵襲性NHLを含む)、ホジキンリンパ腫、皮膚T細胞性リンパ腫、リンパ球性リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、慢性骨髄性白血病または急性骨髄性白血病、慢性リンパ性白血病または急性リンパ性白血病、赤芽球腫(erythroblastoma)、および多発性骨髄腫;または前出のがんのうちの、2つもしくはそれ超の組合せを含むがこれらに限定されない、多種多様な悪性細胞増殖障害の処置にも関する。
処置されるがんは、不応性がんでありうる。本明細書で使用される不応性がんは、通常処方される標準治療に対して抵抗性のがんである。これらのがんは、初期に、処置に対して見かけ上応答性の(次いで、再発する)場合もあり、処置に対して完全に非応答性の場合もある。通常の標準治療は、がんの種類、および被験体における進行の程度に応じて変動するであろう。通常の標準治療は、化学療法、免疫療法、手術、放射線、またはこれらの組合せでありうる。当業者は、このような標準治療について承知している。したがって、不応性がんのために、本発明に従い処置される被験体は既に、それらのがんのための別の処置へと曝露されている場合がある。代替的に、がんが、不応性である可能性が高い場合(例えば、がん細胞についての解析または被験体の既往歴を踏まえ)、被験体は、いまだ別の処置へと曝露されていない可能性もある。
ある特定の実施形態では、不応性がんは、チェックポイント阻害剤による処置に対して不応性のがんを含む。この種類のがんを、場合によって、「冷たい」がんと称する。本発明の方法を使用して、このような「冷たい」がんまたは腫瘍を処置して、それらを、「熱い」がんまたは腫瘍、すなわち、同じチェックポイント阻害剤による処置であっても、チェックポイント阻害剤による処置を含む処置に応答するがんまたは腫瘍へと転換することができる。
不応性がんの例は、黒色腫、腎細胞癌、結腸がん、肝臓(liver(hepatic))がん、膵臓がん、非ホジキンリンパ腫、肺がん、および白血病を含むがこれらに限定されない。
ある特定の場合において、本発明の方法は、既存の手術手順または薬物療法を代替するために有用でありうるが、他の場合には、本発明は、このような状態を処置するために、既存の治療の有効性を改善するのに有用である。したがって、組合せ療法を使用して、がんのための処置を受けているか、または受ける予定の被験体を処置することができる。例えば、薬剤は、被験体へと、別の抗増殖(例えば、抗がん)治療と組み合わせて投与することができる。適切な抗がん治療は、腫瘍塊を除去する手術手順、化学療法、または限局性放射線を含む。他の抗増殖治療は、本発明のCpG ODN/CPIの組合せによる処置の前に、これと共時的に、またはこの後で投与することができる。また、CpG ODN/CPIの組合せを、他の処置の前に、またはこの後で投与しうるように、異なる処置の投与の間に、数時間、数日間であり、場合によって、数週間である遅延を置く場合もある。本発明はさらに、手術、放射線、または化学療法の前および後のがん被験体における、CpG ODN/CPIの組合せの使用も企図する。
一実施形態では、本発明は、CpG ODN−CPIの組合せを使用して、抗腫瘍応答をもたらすか、または増大させる組成物および方法を提供し、ここでCpG ODNにより、別途単独で使用される場合に、同じレベルの抗腫瘍応答を誘導するためには最適未満の量のCPIによる抗腫瘍応答を増強する。抗腫瘍応答を誘発するのに、CpG ODNを、CPIと共に使用しない、ある特定の実施形態では、CpG ODN単独の投与は、抗腫瘍応答をもたらすことも、増大させることもない。代替的な実施形態では、CpG ODNおよびCPIのいずれも、単独で、および/または組み合わせて投与する場合、抗腫瘍応答を誘発しうる。
一実施形態では、本発明は、CpG ODN−CPI抗体の組合せを使用して、抗腫瘍応答をもたらすか、または増大させる組成物および方法を提供し、ここでCpG ODNにより、別途単独で使用される場合に、同じレベルの抗腫瘍応答を誘導するためには最適未満の量の抗体による抗腫瘍応答を増強する。抗腫瘍応答を誘発するのに、CpG ODNを、CPI抗体と共に使用しない、ある特定の実施形態では、CpG ODN単独の投与は、抗腫瘍応答をもたらすことも、増大させることもない。代替的な実施形態では、CpG ODNおよびCPI抗体のいずれも、単独で、および/または組み合わせて投与する場合、抗体抗腫瘍応答を誘発しうる。
ある特定の実施形態では、CpG ODNは、CPIの効果を、相加的に増強しうる(この逆も成り立つ)。好ましい実施形態では、CpG ODNは、CPIの効果を、相乗的に増強しうる(この逆も成り立つ)。別の実施形態では、CPIは、CpG ODNの効果を、相加的に増強する。効果は、相乗的に増強されることが好ましい。こうして、ある特定の実施形態では、本発明は、疾患の処置または防止の方法であって、CpG ODN単独およびCPI単独の投与に基づき期待される治療プロファイルより良好な治療プロファイルをもたらす方法を包含する。
ある特定の実施形態では、CpG ODNは、CPI抗体の効果を、相加的に増強しうる(この逆も成り立つ)。好ましい実施形態では、CpG ODNは、CPI抗体の効果を、相乗的に増強しうる(この逆も成り立つ)。別の実施形態では、CPI抗体は、CpG ODNの効果を、相加的に増強する。効果は、相乗的に増強されることが好ましい。こうして、ある特定の実施形態では、本発明は、疾患の処置または防止の方法であって、CpG ODN単独およびCPI抗体単独の投与に基づき期待される治療プロファイルより良好な治療プロファイルをもたらす方法を包含する。
ある特定の実施形態では、治癒的手術を可能とする抗腫瘍効果を達成するネオアジュバント療法レジメンの一部として、CpG ODNを、CPI(放射線療法など、他のモダリティーを伴うかまたは伴わない)と共に投与する。
ある特定の実施形態では、原発性腫瘍もしくは転移性腫瘍の、手術による切除後、または腫瘍の再発を防止するために、微小残存病変の状況下において、CpG ODNを、CPI(放射線療法など、他のモダリティーを伴うかまたは伴わない)と併せて投与する。
本発明にはまた、望ましくない作用または有害作用を低減または回避しながら、相加的効力または相加的治療効果を及ぼす組合せ療法も包含される。本発明はまた、望ましくない作用または有害作用を低減または回避しながら、治療有効性が相加的組合せを超える相乗的組合せも包含する。ある特定の実施形態では、本発明の方法は、CpG ODNおよび/またはCPIのより低い頻度および/またはより少ない頻度の用量を使用する、抗腫瘍応答の増強であって、処置の有効性を維持もしくは増強し、好ましくは、患者の服薬遵守を増大させ、治療を改善し、かつ/または望ましくない作用もしくは有害作用を低減しながら、CpG ODN単独および/またはCPI単独の投与により引き起こされる、望ましくない作用または有害作用の発生率を低減する増強により処置を改善する、疾患および障害の処置または防止を可能とする。
本発明の方法
本発明の態様は、がん性腫瘍を処置する方法であって、それを必要とする被験体へと、有効量のTLR9アゴニストおよびチェックポイント阻害剤(CPI)を投与するステップを含み、TLR9アゴニストを、腫瘍内に投与するか、または腫瘍に実質的に隣接させて投与する方法である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、IFN−αを誘導する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスC CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスE CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA/E CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスP CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、5’−GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG−3’(配列番号82)として提示される配列を有する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、天然の骨格を伴う、環状CpG DNA、例えば、MGN1703である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、ナノ粒子、VLP、ISCOM、または他のヌクレアーゼ抵抗性送達ビヒクルを含む製剤により投与される、非修飾の天然CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、CPIを全身投与する。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1、PD−L1、およびCTLA−4からなる群より選択される抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1に特異的に結合する抗体でもその抗原結合性断片でもない。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体でもその抗原結合性断片でもない。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体でもその抗原結合性断片でもない。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1およびPD−L1からなる群より選択される抗原に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)TIM3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)TIM3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−L1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)TIM3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−L1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)TIM3に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、PD−1およびPD−L1からなる群より選択される抗原とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、PD−1とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、PD−L1とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、TIM3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1と、PD−L1とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1と、TIM3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1と、TIM3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、TIM3と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストを、CPIの投与の前に投与する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストと、CPIとを、実質的に同時に投与する。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される組織のがん性腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、黒色腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、骨髄のがんである。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、カルチノイド腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、神経芽細胞腫である。
ある特定の実施形態では、被験体は、ヒトである。
本発明の態様は、がん性腫瘍を処置する方法であって、それを必要とする被験体へと、有効量の放射線療法、TLR9アゴニスト、およびチェックポイント阻害剤(CPI)を投与するステップを含み、放射線療法を、TLR9アゴニストの投与の前に開始し、TLR9アゴニストを、腫瘍内に投与するか、または腫瘍に実質的に隣接させて投与する方法である。
ある特定の実施形態では、放射線療法は、放射線療法である。
ある特定の実施形態では、放射線療法は、低分割放射線療法である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、IFN−αを誘導する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスC CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスE CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA/E CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスP CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、5’−GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG−3’(配列番号82)として提示される配列を有する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、天然の骨格を伴う、環状CpG DNA、例えば、MGN1703である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、ナノ粒子、VLP、ISCOM、または他のヌクレアーゼ抵抗性送達ビヒクルを含む製剤により投与される、非修飾の天然CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、CPIを全身投与する。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1、PD−L1、およびCTLA−4からなる群より選択される抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1に特異的に結合する抗体でもその抗原結合性断片でもない。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体でもその抗原結合性断片でもない。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体でもその抗原結合性断片でもない。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1およびPD−L1からなる群より選択される抗原に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)TIM3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)TIM3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−L1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)TIM3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)PD−L1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、(i)TIM3に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)LAG3に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、PD−1およびPD−L1からなる群より選択される抗原とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、PD−1とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、PD−L1とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、TIM3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、CTLA−4と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1と、PD−L1とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1と、TIM3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−1と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1と、TIM3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、PD−L1と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、CPIは、TIM3と、LAG3とに特異的に結合する、二特異性抗体またはその二特異性抗原結合性断片を含む。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストを、CPIの投与の前に投与する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストと、CPIとを、実質的に同時に投与する。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される組織のがん性腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、黒色腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、骨髄のがんである。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、カルチノイド腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、神経芽細胞腫である。
ある特定の実施形態では、被験体は、ヒトである。
本発明の態様は、がん性腫瘍を処置する方法であって、それを必要とする被験体へと、有効量のTLR9アゴニスト、第1のチェックポイント阻害剤(CPI)、および第2のCPIを投与するステップを含み、TLR9アゴニストおよび第1のCPIを、腫瘍内に投与するか、または腫瘍に実質的に隣接させて投与し、第2のCPIを全身投与する方法である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、IFN−αを誘導する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスC CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスE CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスA/E CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、クラスP CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、5’−GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG−3’(配列番号82)として提示される配列を有する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、天然の骨格を伴う、環状CpG DNA、例えば、MGN1703である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストは、ナノ粒子、VLP、ISCOM、または他のヌクレアーゼ抵抗性送達ビヒクルを含む製剤により投与される、非修飾の天然CpG DNAである。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、第1のCPIは、LAG3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、第2のCPIは、TIM3に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストを、第1のCPIの投与の前に投与する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストと、第1のCPIとを、実質的に同時に投与する。
ある特定の実施形態では、TLR9アゴニストを、第1のCPIの投与の後で投与する。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される組織のがん性腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、黒色腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、リンパ腫である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、骨髄のがんである。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、カルチノイド腫瘍である。
ある特定の実施形態では、がん性腫瘍は、神経芽細胞腫である。
ある特定の実施形態では、被験体は、ヒトである。
ある特定の実施形態では、方法は、それを必要とする被験体へと、有効量の放射線療法(XRT)を投与するステップを含む。標準的なXRT線量は、1.8〜2.2Gy/日の範囲であるが、近年の研究は、XRTによる、腫瘍に対する免疫効果が、3〜20Gy/日の線量で、1〜3日間にわたるXRTの使用により増大しうることを指し示す。当業者は、異なる腫瘍が、異なるレベルの放射線感受性を有することを認識し、これに応じて、XRTの量および強度を調整するであろう。
ある特定の実施形態では、放射線療法は、放射線療法である。
ある特定の実施形態では、放射線療法は、低分割放射線療法である。
V.さらなる組合せ療法
本発明の方法は、化学療法、他の免疫療法、放射線療法、ホルモン療法などを含む、他の抗がん治療と共に使用することができる。従来の化学療法薬および標的化抗新生物剤は、がんが、細胞自律的な、遺伝子疾患または後成的な疾患を構成するという、単純化した考えに基づき開発されている。しかし、のべ数百万もの生存年数を救ってきた、利用可能な抗がん薬の多くは、既存の腫瘍特異的免疫応答を、デノボで誘発するか、または再活性化させることにより、治療効果を媒介することが明らかとなりつつある。蓄積されつつある証拠は、いくつかの抗新生物剤の治療有効性が、悪性細胞に特異的な免疫応答の活性化の側に平衡をずらしながら、腫瘍−宿主相互作用に影響を及ぼす、それらの能力に依拠することを指し示す。
例えば、表1は、FDAにより承認された、免疫不全性によりその有効性が低減されるある特定の抗がん剤を列挙する(Zitvogel L.ら、Immunity、2013年、39巻(1号):74〜88頁)。
VI.投薬レジメン
投薬レジメンは、所望される最適の応答をもたらすように調整することができる。例えば、単回のボーラスを投与することもでき、いくつかに分割された用量を、ある期間にわたり投与することもでき、治療状況の要求により指し示される通り、用量を、これに応じて、低減するか、または増大させることもできる。投与の容易さおよび投与量の均一性のために、非経口組成物を、単位剤形で製剤化することが、とりわけ有利である。本明細書で使用される単位剤形とは、処置される哺乳動物被験体のための単位投与量として適する、物理的に個別の単位であって、各単位が、要求される医薬担体を随伴させて、所望の治療効果をもたらすように計算された、所定数量の活性化合物を含有する単位を指す。本発明の単位剤形についての仕様は、(a)活性化合物の固有の特徴、および、達成される、特定の治療的効果または予防的効果、ならびに(b)当技術分野における固有の限界であって、個体における感受性の処置のために、このような活性化合物を調合させる限界により規定され、かつ、これに直接左右される。
こうして、当業者は、本明細書で提示される本開示に基づき、用量および投与レジメンが、治療技術分野において周知の方法に従い調整されることを認識するであろう。すなわち、最大耐量は、たやすく確立することができ、検出可能な治療利益を、患者にもたらす有効量もまた、各薬剤を投与して、患者へと、検出可能な治療利益をもたらすための時間的要件と同様に、決定することができる。したがって、本明細書では、ある特定の用量および投与レジメンを例示するが、これらの例は断じて、本発明の実施により、患者へと施されうる用量および投与レジメンを限定するものではない。さらに、本明細書で提示される教示を得た当業者であれば、他の多くのパラメータの中でも、腫瘍のサイズおよび/または転移の検出可能な減少、ならびに再発までの時間の延長などであるがこれらに限定されない治療利益は、がんの処置の有効性を評価するための、当技術分野で公知の、多種多様な方法により評価することができ、これらの方法は、本明細書のほか、将来において開発される方法にも包含されることを理解するであろう。
投与量値は、緩和される状態の種類および重症度と共に変動し、単回用量または複数回用量を含みうることに注目すべきである。任意の特定の被験体のために、具体的な投薬レジメンを、ある期間にわたり、個体の必要、および組成物の投与を施行または管理する人物の専門家としての判断に従い調整すべきであり、本明細書で明示される投与量範囲は、例示的なものであるに過ぎず、特許請求される組成物についての範囲または実施を限定することを意図するものではないことをさらに理解されたい。例えば、用量は、毒性作用および/または実験室値などの臨床効果を含みうる、薬物動態パラメータまたは薬力学的パラメータに基づき調整することができる。こうして、本発明は、当業者により決定される、患者内用量漸増を包含する。関連する技術分野では、活性化合物または化合物の投与に適切な投与量およびレジメンの決定が周知であり、本明細書で開示される教示を提供された当業者によって、包含されることが理解される。
CpG ODNの投与
本発明の方法に従い、CpG ODNを、がん性腫瘍へと局所投与する、すなわち、腫瘍内投与または腫瘍周囲投与により局所投与する。代替的に、または加えて、ある特定の実施形態では、CpG ODNを、がん性腫瘍へと、例えば、腹腔内注射または注入または小胞内(intravesicular)点滴により局所投与する。
CpGに関する先行技術の大半は、腫瘍内投与でも腫瘍周囲投与でもなく、皮下投与を使用した。腫瘍学における腫瘍内療法は一般に、原発性病変の処置のためだけに好ましく、転移性疾患の状況においては好ましくない。この理由は、大半の腫瘍内療法が、局所効果を及ぼすに過ぎないことである。一部のまれな場合には、腫瘍内療法は、注射された病変だけでなく、また、遠隔転移においても存在する腫瘍抗原に対する特異的免疫応答の誘導の結果として、遠隔腫瘍塊の退縮をもたらしうる。放射線療法(XRT)の場合、上記で記載した通り、これは、「アブスコパル効果」と称されている。一部の著者らは、アブスコパル効果が、腫瘍内TLR9を含むTLRアゴニストにより誘導された症例について言及している(Brodyら、J. Clin. Oncol.、2010年、28巻(28号):4324〜4332頁;Kimら、Blood、2012年、119巻(2号):355〜363頁)が、これらの応答は、まれであり、一般に、持続時間が短い。
CpG ODN投与の前に施されたXRTによる免疫効果は、通常では、CpG誘導性応答の有効性を限定する阻害性機構を破壊し、臨床応答の潜在的可能性を増大させるであろう。加えて、腫瘍内のIFN−αの産生は、XRTに対する応答の改善と関連し、かつこれに必要とされ(Burnetteら、Cancer Res.、2011年、71巻:2488〜2496頁)、XRT後における腫瘍内高IFN CpGの使用からの利益についてのさらなる証拠をもたらしている。
一形態では、本発明は、XRT、好ましくは、低分割XRT(Prasannaらにおいて記載されている)を、がん患者へと投与し、次いで、腫瘍内または腫瘍周囲の高IFN誘導性CpG ODNを、同じ領域内またはリンパ排出内に投与することにより、XRTからのアブスコパル応答の誘導を改善するための方法を含む。好ましい腫瘍周囲注射は、同じAPCが、腫瘍へのXRTの後において放出される腫瘍Ag、およびTLRリガンドの両方へと曝露されることを容易とするために、腫瘍と同じリンパ排出内におけるものである。
CpG ODNの腫瘍内送達または腫瘍周囲送達の方法は、直接的な注射を含むだけでなく、また、局所的送達、卵巣、膵臓、結腸、または胃の腫瘍などの腹部腫瘍のための腹腔内送達、眼の悪性疾患のための眼内送達、胃がんおよび腸がんのための経口送達、ならびに膀胱がんのための小胞内投与も含みうる。CpG ODNの腫瘍内投与のためにはまた、腫瘍標的化アプタマー、抗体コンジュゲート、ナノ粒子、ISCOM、VLP、多層型小胞、pH感受性ペプチド、およびカチオン性ペプチドなどの腫瘍送達ビヒクルを使用する全身送達も企図される。
全身治療の場合、CpG ODNは、体重、体表面積に基づき、可変的に投与することもでき、固定用量を使用して投与することもできる。腫瘍内投与または腫瘍周囲投与では、CpG ODN用量は、固定することが典型的である。CpG ODNを、本発明のCPIなど他の治療剤と組み合わせて投与する場合に免疫応答を誘導するための非経口送達(腫瘍内送達または腫瘍周囲送達を含む)用のCpG ODNの用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1μg〜100mgの範囲であることが典型的である。
ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約10μg〜約100mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約100μg〜約100mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1mg〜約100mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約10mg〜約100mgの範囲であることが典型的である。
さらに他の実施形態では、CpG ODNを、本発明のCPIなど、他の治療剤と組み合わせて投与する場合に免疫応答を誘導するための非経口送達(腫瘍内送達または腫瘍周囲送達を含む)用のCpG ODNの用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1μg〜約50mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約10μg〜約50mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約100μg〜約50mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1mg〜約50mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約10mg〜約50mgの範囲であることが典型的である。
さらに他の実施形態では、CpG ODNを、本発明のCPIなど、他の治療剤と組み合わせて投与する場合に免疫応答を誘導するための非経口送達(腫瘍内送達または腫瘍周囲送達を含む)用のCpG ODNの用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1μg〜約10mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約10μg〜約10mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約100μg〜約10mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1mg〜約10mgの範囲であることが典型的である。
さらに他の実施形態では、CpG ODNを、本発明のCPIなど、他の治療剤と組み合わせて投与する場合に免疫応答を誘導するための非経口送達(腫瘍内送達または腫瘍周囲送達を含む)用のCpG ODNの用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約1μg〜約1mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約10μg〜約1mgの範囲であることが典型的である。ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、適用に応じて、毎日、毎週、または毎月、および、これらの間の他の任意の時間量で与えられ得る投与1回当たり、約100μg〜約1mgの範囲であることが典型的である。
ある特定の実施形態では、上記で記載した固定用量の各々について、用量を、約1mL未満またはこれと等しい体積で投与する。ある特定の実施形態では、用量を、約0.1mLから最大約1mLの体積で投与する。他の実施形態では、用量体積は、最大4mLであり、これは一般に、タリモジェンラヘルパレプベク(T−vec)など、ある特定の腫瘍溶解性ウイルスの、腫瘍内注射のために使用される。
本発明のある特定の実施形態では、例えば、ナノ粒子、ISCOM、VLP、およびデンドリマーを含む、持続放出送達系(例えば、Gomes Dos Santos ALら、Curr Pharm Biotechnol.、2005年、6巻(1号):7〜15頁;Joshi VBら、AAPS J.、2013年、15巻(1号):85〜94頁;およびArima Hら、Curr Top Med Chem.、2014年、14巻(4号):465〜77頁において総説されている)を使用して、CpG ODNの、単回腫瘍内療法用量または単回腫瘍周囲療法用量を投与することができる。本発明のある特定の実施形態では、例えば、ナノ粒子、ISCOM、VLP、およびデンドリマーを含む、持続放出送達系を使用して、さらなるCpG ODNを要求せずに、CpG ODNの、単回腫瘍内療法用量または単回腫瘍周囲療法用量を投与することができる。
当技術分野で周知の通り、文献において十分に記載されている、任意の種類の持続送達系を使用する場合は、個々の用量を増大させる。
CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約0.1mg〜約500mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約1mg〜約500mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約10mg〜約500mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約100mg〜約500mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。
CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約0.1mg〜約250mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約1mg〜約250mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約10mg〜約250mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約100mg〜約250mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。
CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約0.1mg〜約100mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約1mg〜約100mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。CpG ODNの持続放出製剤の単回投与を使用する、ある特定の実施形態では、腫瘍内送達および腫瘍周囲送達のための、CpG ODNの対象用量は、投与1回当たり、約10mg〜約100mgの範囲であることが典型的であり、XRTの1週間以内;チェックポイント阻害剤の1週間以内;またはXRTおよびチェックポイント阻害剤の両方の1週間以内に施される。
投与されたCpG ODNの用量の所望の臨床効果は、当業者に周知の標準的なアッセイおよび方法を使用してたやすく追跡することができる。例えば、TLR9の刺激に対するバイオマーカー応答は、本明細書の別の箇所で記載される通りに測定することができる。
CPI抗体の投与
ある特定の市販の抗PD−1抗体は現在、体重1kg当たり2mgで、3週間ごとに1回投与する静脈内注入について、米国で承認されている。他の市販の抗PD−1抗体は現在、体重1kg当たり3mgで、2週間ごとに1回投与する静脈内注入について、米国で承認されている。市販の抗CTLA−4抗体は現在、体重1kg当たり3mgで、3週間ごとに1回投与する静脈内注入について、米国で承認されている。
本発明の方法に従い、ある特定の実施形態では、CPI抗体を、少なくとも部分的に、全身投与、例えば、静脈内投与する。
本発明に従い全身投与されるCPI抗体の治療有効量のための、例示的な、非限定的な用量は、体重1kg当たり少なくとも約0.1mg、体重1kg当たり少なくとも約0.3mg、体重1kg当たり少なくとも約0.5mg、体重1kg当たり少なくとも約1mg、体重1kg当たり少なくとも約2mg、体重1kg当たり少なくとも約3mg、体重1kg当たり少なくとも約4mg、体重1kg当たり少なくとも約5mg、および体重1kg当たり少なくとも約6mgである。
ある特定の実施形態では、全身投与されるCPI抗体の治療有効量は、体重1kg当たり約0.1mg〜約30mg、体重1kg当たり約0.3mg〜約25mg、体重1kg当たり約1mg〜約20mg、体重1kg当たり約2mg〜約20mg、体重1kg当たり約3mg〜約20mg、体重1kg当たり約5mg〜約20mg、体重1kg当たり約10mg〜約20mg、体重1kg当たり約1mg〜約15mg、体重1kg当たり約2mg〜約15mg、体重1kg当たり約3mg〜約15mg、体重1kg当たり約5mg〜約15mg、体重1kg当たり約10mg〜約15mg、体重1kg当たり約1mg〜約10mg、体重1kg当たり約2mg〜約10mg、体重1kg当たり約3mg〜約10mg、または体重1kg当たり約5mg〜約10mgの範囲でありうる。
ある特定の実施形態では、CPI抗体を、体重1kg当たり少なくとも約0.3mg、体重1kg当たり少なくとも約1mg、体重1kg当たり少なくとも約2mg、体重1kg当たり少なくとも約3mg、体重1kg当たり少なくとも約5mg、体重1kg当たり少なくとも約6mg、体重1kg当たり少なくとも10mg、体重1kg当たり少なくとも約15mg、または体重1kg当たり少なくとも約20mgの用量で、全身投与する。
ある特定の実施形態では、CPI抗体を、体重1kg当たり約0.1mg〜約50mg、体重1kg当たり約0.3mg〜約20mg、体重1kg当たり約1mg〜約15mg、体重1kg当たり約2mg〜約15mg、体重1kg当たり約3mg〜約15mg、または体重1kg当たり約6mg〜約15mgの範囲の用量で、静脈内(i.v.)注入により投与する。
ある特定の実施形態では、CPI抗体を、適切な緩衝液系中に、約5〜約20mg/mLのCPI抗体を含有する、滅菌水溶液としての静脈内製剤により投与する。
本発明の方法に従い、ある特定の実施形態では、CPI抗体を、少なくとも部分的に、がん性腫瘍へと、局所投与する、すなわち、腫瘍内投与または腫瘍周囲投与により投与する。ある特定の実施形態では、このような局所投与は、直接的な注射による投与であるが、他の実施形態では、このような投与は、局所的送達、卵巣腫瘍、膵臓腫瘍などの腹部腫瘍のための腹腔内送達、眼の悪性疾患のための眼内送達、胃がんおよび腸がんのための経口送達、ならびに膀胱がんのための小胞内投与でありうる。CPI抗体の腫瘍内投与のためにはまた、腫瘍標的化アプタマー、ナノ粒子、ISCOM、VLP、およびカチオン性ペプチドなどの腫瘍送達ビヒクルを使用する全身送達も企図される。
局所投与、すなわち、腫瘍内投与または腫瘍周囲投与のために、CPI抗体は、上記で列挙したばかりの全身用量の、約10分の1〜約20分の1の用量で有利に投与され得る。
本発明に従い、CPI抗体の投与は、CpG ODNの投与より低頻度となることが典型的であろう。例えば、抗PD−1抗体を、3週間ごとに約1回〜3カ月間ごとに約1回投与することができる。同様に、抗PD−L1抗体を、3週間ごとに約1回〜3カ月間ごとに約1回投与することができる。同様に、抗CTLA−4抗体を、3週間ごとに約1回〜3カ月間ごとに約1回投与することができる。本発明はさらに、3週間ごとに約1回より高頻度であり、そして3カ月間ごとに約1回より低頻度である、CPI抗体の投与を具体的に企図する。
腫瘍内CpGまたは腫瘍周囲CpGと、全身CPIとは、同じ日に施すこともでき、異なる日に施すこともできる。例えば、腫瘍内CpGまたは腫瘍周囲CpGと、静脈内抗PD−1または抗PD−L1とは、同じ日に施すこともでき、異なる日に施すこともできる。
さらに、CpG ODN、CPI抗体、またはCpG ODNおよびCPI抗体の両方に関する、例示的な用量漸増プロトコールを使用して、存在する場合、CpG ODN−CPI抗体の組合せ療法の投与と関連する用量制限毒性(DLT)を評価するように、最大耐量(MTD)を決定することができる。例えば、CpG ODNを所与の用量とするときの、CPI抗体の用量漸増に関して、このようなプロトコールは、約0.1mg/kg、0.3mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、3mg/kg、4mg/kg、5mg/kg、6mg/kg、7mg/kg、10mg/kg、12mg/kg、15mg/kg、もしくは15mg/kgを超えるか、またはこれらの任意の組合せなどであるがこれらに限定されない、用量を増大させる投与を含むことが可能であり、より好ましくは、0.1mg/kg、0.3mg/kg、1mg/kg、2mg/kg、3mg/kg、6mg/kg、10mg/kg、15mg/kg、または20mg/kgの一連の用量を投与し、患者を、毒性があれば毒性のほか、他のパラメータの中でも、処置の有効性について評価する。当技術分野では、投与レジメンの毒性および有効性を決定するこのような研究が周知である。例えば、Millward M.ら、Br. J. Cancer、2013年、108巻(10号):1998〜2004頁を参照されたい。
VII.医薬組成物
ある特定の実施形態では、CpG ODNを、マーカー、例えば、処置される腫瘍内へのCpG ODN投与、および/または処置される腫瘍に隣接させたCpG ODN投与の視覚化を容易とする、放射線不透過性マーカーまたは放射線不透過性色素と共に製剤化する。代替的に、CpG ODNを、投与領域の検出を可能とする化合物へと、共有結合的にコンジュゲートさせるか、またはこれにより他の形で標識する。当技術分野では、このような標識の例が周知であり、蛍光色素、アプタマー、Spinachおよびその誘導体などの蛍光RNA、量子ドット、金、および他のナノ粒子、抗体などを含む。
CpG ODNは、被験体へと直接投与することもでき、核酸送達複合体と共に投与することもできる。核酸送達複合体とは、標的化手段(例えば、標的細胞への高アフィニティー結合を結果としてもたらす分子)と会合させた(例えば、これにイオン結合もしくは共有結合させるか;またはこの中に封入した)核酸分子を意味するものとする。核酸送達複合体の例は、ステロール(例えば、コレステロール)、脂質(例えば、カチオン性脂質、ビロソーム、またはリポソーム)、または標的細胞特異的結合剤(例えば、標的細胞特異的受容体により認識されるリガンド)と会合するオリゴヌクレオチドを含む。好ましい複合体は、標的細胞による内部化の前における、著明なアンカップリングを防止するように、in vivoにおいて十分に安定でありうる。しかし、複合体は、核酸が、機能的形態で放出されるように、細胞内の適切な条件下で切断可能でありうる。
オリゴヌクレオチドおよび/または抗原を、表面へと送達するための送達ビヒクルまたは送達デバイスについては、記載されている。CpG ODNおよび/または抗原および/または他の治療薬は、単独(例えば、生理食塩水中または緩衝液中)で投与することもでき、当技術分野で公知の、任意の送達ビヒクルを使用して投与することもできる。例えば、以下の送達ビヒクル:コクリエート(cochleate);エマルソーム(emulsome)、ISCOM;リポソーム;生細菌ベクター(例えば、Salmonella、Escherichia coli、Bacillus Calmette−Guerin、Shigella、Lactobacillus);生ウイルスベクター(例えば、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、単純ヘルペスウイルス);マイクロスフェア;オリゴヌクレオチドワクチン;ポリマー;ポリマー環;プロテオソーム;フッ化ナトリウム;トランスジェニック植物;ビロソーム;ウイルス様粒子、およびカチオン性脂質、ペプチド、またはポリアニオン性オリゴヌクレオチドとの電荷相互作用を示す他の担体について記載されている。当技術分野では、他の送達ビヒクルも公知であり、一部のさらなる例を、下記の、ベクターについての議論において提示する。
一実施形態では、CPIを、水溶液中で非経口(例えば、静脈内)投与する一方で、CpG ODNを、腫瘍内注射または腫瘍周囲注射により投与する。CpG ODNの、好ましい製剤および剤形については、その開示が参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第US2004/0198680号において記載されている。しかし、当業者は、本明細書で提示される本開示に基づき、本発明が、これらの、または他の任意の、製剤、用量、投与経路などに限定されないことを理解するであろう。こうして、以下の議論は、CpG ODNと組み合わせた、任意のCPI抗体の投与を含む、本発明の方法を実施するための多様な製剤について記載するが、本発明は、これらの製剤に限定されず、本発明の方法における使用のための本明細書で提示される教示を得た当業者によりたやすく決定されうる通り、任意の製剤を含みうる。
本発明で利用される抗体は、被験体への投与に適する医薬組成物へと組み込むことができる。医薬組成物は、抗体と、薬学的に許容される担体とを含むことが典型的である。本明細書で使用される「薬学的に許容される担体」は、任意および全ての、溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤および吸収遅延剤などを含み、これらは、生理学的に適合性である。薬学的に許容される担体の例は、水、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、デキストロース、トレハロース、グリセロール、エタノールなどのうちの1または複数のほか、これらの組合せを含む。多くの場合、等張剤、例えば、糖、マンニトール、ソルビトールなどのポリアルコール、または塩化ナトリウムを、組成物中に含むことが好ましい。薬学的に許容される物質は、湿潤剤または乳化剤、抗体または抗体部分の保管寿命または有効性を増強する、保存剤または緩衝剤など、少量の補助物質を含む。
抗体は、様々な形態でありうる。これらは例えば、液体溶液(例えば、注射用溶液および注入用溶液)、分散物、または懸濁物、錠剤、丸剤、散剤、リポソーム、および坐剤などの、液体剤形、半固体剤形、および固体剤形を含む。好ましい形態は、意図される投与方式および治療的適用に依存する。典型的な、好ましい組成物は、他の抗体によるヒトの受動免疫化のために使用されるものと同様な組成物など、注射用溶液および注入用溶液の形態である。好ましい投与方式は、非経口(例えば、静脈内、皮下、腹腔内、筋内)投与である。好ましい実施形態では、抗体を、静脈内注入または静脈内注射により投与する。別の好ましい実施形態では、抗体を、筋内注射または皮下注射により投与する。
治療用組成物は、滅菌でなければならず、製造条件および保管条件下で安定でなければならないことが典型的である。組成物は、溶液、マイクロエマルジョン、分散物、リポソーム、または高薬物濃度に適する、他の秩序化構造として製剤化することができる。滅菌注射用溶液は、要求に応じて、上記で数え上げた成分の1つまたは組合せと共に、適切な溶媒中に、要求される量で、抗体を組み込むことに続く濾過滅菌により調製することができる。一般に、分散物は、活性化合物を、基本分散媒と、上記で数え上げたものに由来する要求される他の成分とを含有する滅菌ビヒクルへと組み込むことにより調製する。滅菌注射用溶液を調製するための滅菌散剤の場合、調製の好ましい方法は、有効成分に、あらかじめ滅菌濾過されたその溶液に由来する、任意のさらなる所望の成分を加えた粉末をもたらす、真空乾燥および凍結乾燥である。溶液の適正な流動性は、例えば、レシチンなど、コーティングの使用により維持することができ、分散物の場合は、要求される粒子サイズの維持により維持することができ、界面活性剤の使用により維持することができる。注射用組成物の長期吸収は、組成物中に、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸塩およびゼラチンを含ませることによりもたらすことができる。
CpG ODNは、当技術分野で公知の様々な方法であって、限定せずに、腫瘍内への局所注射もしくは局所注入および/または腫瘍に隣接させた局所注射もしくは局所注入を含む方法により投与することができる。本明細書で使用される「腫瘍内に」または「腫瘍内」とは、一般に、腫瘍の周縁部(margin)内の任意の場所を意味する。本明細書で使用される「腫瘍に隣接させて」または「腫瘍周囲」とは、一般に、腫瘍の周縁部を囲む約2.5cmの厚さの帯域内の任意の場所を意味する。本発明はまた、手術による腫瘍の切除後における、腫瘍床内へのCpG ODNの局所注射もしくは局所注入および/または腫瘍床に隣接させたCpG ODNの局所注射もしくは局所注入も企図する。所望の場合は、無針注射を利用することができる。ある特定の実施形態では、CpG ODNは、吸入または気管支肺胞洗浄により、肺へと局所投与することができる。当業者により認識される通り、投与経路および/または投与方式は、所望される結果に応じて変動するであろう。
CPIは、当技術分野で公知の様々な方法であって、限定せずに、経口投与、非経口投与、粘膜投与、吸入による投与、局所的投与、口腔内投与、鼻投与、および直腸投与を含む方法により投与することができる。ある特定の治療適用では、好ましい経路/投与方式は、皮下注入、筋内注入、静脈内注入である。所望の場合は、無針注射を利用することができる。当業者により認識される通り、投与経路および/または投与方式は、所望される結果に応じて変動するであろう。
投薬レジメンは、所望される最適の応答をもたらすように調整することができる。例えば、単回のボーラスを投与することもでき、いくつかに分割された用量を、ある期間にわたり投与することもでき、治療状況の要求により指し示される通り、用量を、比例して低減するか、または増大させることもできる。投与の容易さおよび投与量の均一性のために、非経口組成物を、単位剤形で製剤化することが、とりわけ有利である。本明細書で使用される単位剤形は、処置される哺乳動物被験体のための単位投与量として適する、物理的に個別の単位であって、各単位が、要求される医薬担体を随伴させて、所望の治療効果をもたらすように計算された、所定数量の活性化合物を含有する単位を指す。本発明の単位剤形についての仕様は、(a)抗体の固有の特徴、および、達成される、特定の治療的効果または予防的効果、ならびに(b)当技術分野における固有の限界であって、個体における感受性の処置のために、このような活性化合物を調合させる限界により規定され、かつ、これに直接左右される。
投与量値は、緩和される状態の種類および重症度と共に変動し、単回用量または複数回用量を含みうることに注目すべきである。任意の特定の被験体のために、具体的な投薬レジメンを、ある期間にわたり、個体の必要、および組成物の投与を施行または管理する人物の専門家としての判断に従い調整することができ、本明細書で明示される投与量範囲は、例示的なものであるに過ぎず、特許請求される組成物についての範囲または実施を限定することを意図するものではないことをさらに理解されたい。
一実施形態では、抗体を、5または10mg/mLの抗体を、酢酸ナトリウム、ポリソルベート80、および塩化ナトリウムと共に、約5〜6の範囲のpHで含有する、滅菌水溶液としての静脈内製剤により投与する。好ましくは、静脈内製剤は、5または10mg/mLの抗体を、20mMの酢酸ナトリウム、0.2mg/mlのポリソルベート80、および140mMの塩化ナトリウムと共に、pH5.5で含有する、滅菌水溶液である。
一実施形態では、用量の一部を、静脈内ボーラスにより投与し、残りを、抗体製剤の注入により投与する。例えば、抗体の0.01mg/kgの静脈内注射を、ボーラスとして施すことができ、所定の抗体用量の残りを、静脈内注射により投与することができる。所定用量の抗体を、例えば、1時間半〜2時間〜5時間の期間にわたり投与することができる。
本明細書で記載される医薬組成物の製剤は、薬理学の技術分野において公知であるか、または今後開発される、任意の方法により調製することができる。一般に、このような調製法は、有効成分を、担体または1もしくは複数の他の補助成分へと会合させ、次いで、必要であるかまたは所望の場合、生成物を、所望の単回用量単位または複数回用量単位へと、成形またはパッケージングするステップを含む。
本発明の医薬組成物は、バルクで、1つの単回の単位用量として、または複数の単回の単位用量として、調製、パッケージング、または販売することができる。本明細書で使用される「単位用量」とは、所定量の有効成分を含む、医薬組成物の個別量である。有効成分の量は一般に、被験体へと投与される、有効成分の投与量、または、例えば、このような投与量の2分の1もしくは3分の1など、このような投与量の好都合な画分と等しい。
本発明の医薬組成物中の、有効成分、薬学的に許容される担体、および任意のさらなる成分の相対量は、処置される被験体の正体、サイズ、および状態に応じて変動し、組成物を投与する経路にもさらに応じて変動するであろう。例としては、組成物は、0.1%〜100%(w/w)の間の有効成分を含みうる。
有効成分に加えて、本発明の医薬組成物は、1または複数のさらなる薬学的に活性の薬剤もさらに含みうる。特に企図される、さらなる薬剤は、制吐剤、止瀉剤、化学療法剤、サイトカインなどを含む。
本発明の医薬組成物の制御放出製剤または持続放出製剤は、従来の技術を使用して作製することができる。
本明細書で使用される、医薬組成物の「非経口投与」は、被験体の組織の物理的侵害(physical breaching)によって特徴付けられる投与、および組織の侵害部(breach)を介する医薬組成物の投与の任意の経路を含む。こうして、非経口投与は、組成物の注射による医薬組成物の投与、手術による切開による組成物の適用、組織を貫通する、手術以外による創傷などによる組成物の適用を含むがこれらに限定されない。特に、静脈内注入技術、腹腔内注入技術、筋内注入技術、皮下注入技術、槽内注入技術、および腎臓透析注入技術を含むがこれらに限定されない、非経口投与が企図される。
非経口投与に適する医薬組成物の製剤は、滅菌水または滅菌等張性生理食塩水などの、薬学的に許容される担体と組み合わされた有効成分を含む。このような製剤は、ボーラス投与または継続投与に適する形態で調製、パッケージング、または販売することができる。注射用製剤は、アンプル内または保存剤を含有する複数回用量容器内の単位剤形などの単位剤形で調製、パッケージング、または販売することができる。非経口投与のための製剤は、懸濁物、溶液、油性ビヒクルまたは水性ビヒクル中のエマルジョン、ペースト、および下記で論じられる、植込み用持続放出製剤または生体分解性製剤を含むがこれらに限定されない。このような製剤は、懸濁剤、安定化剤、または分散剤を含むがこれらに限定されない、1または複数のさらなる成分もさらに含みうる。非経口投与のための製剤についての一実施形態では、有効成分を、再構成された組成物の非経口投与の前に、適切なビヒクル(例えば、滅菌の発熱物質非含有水)による再構成のための乾燥(例えば、粉末または顆粒)形態で提供する。
本発明の組成物は、当技術分野で公知の様々な方法により投与することができる。投与経路および/または投与方式は、所望の結果に応じて変動する。活性化合物は、インプラント、経皮パッチ、およびマイクロカプセル化送達系を含む制御放出製剤など、化合物を、急速な放出に対して保護する担体と共に調製することができる。エチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、コラーゲン、ポリオルトエステル、およびポリ乳酸などの、生体分解性ポリマー、生体適合性ポリマーを使用することができる。このような製剤を調製するための多くの方法は、例えば、「Sustained and Controlled Release Drug Delivery Systems」、J. R. Robinson編、Marcel Dekker, Inc.、New York(1978年)により記載されている。医薬組成物は、GMP条件下で製造することが好ましい。
医薬組成物は、滅菌注射用水性懸濁物もしくは滅菌注射用油性懸濁物または滅菌注射用水溶液もしくは滅菌注射用油性溶液の形態で調製、パッケージング、または販売することができる。この懸濁物または溶液は、公知の技術に従い製剤化することができ、有効成分に加えて、本明細書で記載される、分散剤、湿潤剤、または懸濁剤など、さらなる成分を含みうる。このような滅菌注射用製剤は、例えば、水または1,3−ブタンジオールなど、非毒性の非経口的に許容可能な希釈剤または溶媒を使用して調製することができる。他の許容可能な希釈剤および溶媒は、リンゲル液、等張性塩化ナトリウム溶液、および合成モノグリセリドまたはジグリセリドなどの固定油を含むがこれらに限定されない。他の有用な非経口的に投与可能な製剤は、有効成分を、微晶質形態で含むか、リポソーム調製物中に含むか、または生体分解性ポリマー系の成分として含む製剤を含む。持続放出または植込みのための組成物は、エマルジョン、イオン交換樹脂、難溶性ポリマー、または難溶性塩など、薬学的に許容されるポリマー性材料または疎水性材料を含みうる。
本発明の有効成分の、CpG ODN成分およびCPI成分は、動物、好ましくは、哺乳動物、より好ましくは、ヒトへと投与することができる。各有効成分の、投与される正確な投与量は、処置される動物の種類および処置される疾患状態の種類、動物の年齢、ならびに投与経路を含むがこれらに限定されない、様々な要因に応じて変動するであろう。
本発明の有効成分の、CpG ODN成分およびCPI成分は、他の多数の化合物(他の多くの化合物の中でも、抗ホルモン治療薬剤、サイトカイン、抗サイトカイン抗体、もしくは抗サイトカイン受容体抗体、インドールアミン2,3−ジオキシゲナーゼ(IDO)もしくはトリプトファン2,3−ジオキシゲナーゼ(TDO)の阻害剤、化学療法薬、抗生薬および/または抗ウイルス薬)のうちのいずれかと共に、共投与することができる。代替的に、このような他の化合物を、CpG ODN−CPIの組合せ、またはこれらの任意の順列の、1時間前、1日前、1週間前、1カ月前、またはこれよりさらに前に投与することができる。さらに、このような他の化合物を、放射線の投与、幹細胞移植、もしくは任意の治療剤(例えば、サイトカイン、化学療法化合物など)の投与、またはこれらの任意の順列の1時間後、1日後、1週間後、またはこれよりさらに後に投与することができる。当業者には、頻度および投与レジメンがたやすく明らかであり、処置される疾患の種類および重症度、動物の年齢および健康状態、投与される1または複数の化合物の正体、多様な化合物の投与経路などであるがこれらに限定されない、様々な要因に依存するであろう。CpG ODN−CPIの組合せを共投与して、がんを処置する方法を裏付ける、いくつかの、有益な実施例を提示するが、本発明は断じて、これらの例に限定されるものではなく、これらは、本発明により包含される方法を例示するように用いられるに過ぎない。
VIII.キット
本発明は、がんを処置するための、多様なキットを含む。キットは、本発明の方法を実施する、組合せの使用について記載する指示材料と共に、治療有効量のCpG ODNおよび治療有効量のCPIを含む。ある特定の実施形態では、キットは、本発明の方法を実施する、組合せの使用について記載する指示材料と共に、治療有効量のCpG ODNおよび治療有効量のCPI抗体を含む。例示的なキットについては、下記で記載するが、当業者には、本開示に照らして、他の有用なキットの内容物が明らかであろう。これらのキットの各々は、本発明の中に含まれる。
一実施形態では、本発明は、CpG ODNと抗PD−1抗体との任意の組合せを含むキットを包含する。このようなキットが好ましいが、本発明は、この特定の組合せに限定されない。さらに、キットは、がんを処置するための、多種多様なさらなる薬剤を含みうる。このような薬剤は、既に明示されており、他の多くの薬剤の中でも、化学療法化合物、がんワクチン、CpG ODN以外のTLRアゴニスト、他のCpG ODN、受容体チロシンキナーゼ阻害剤(SU11248などであるがこれらに限定されない)、異常な細胞成長またはがんの処置において有用な薬剤、IGF−1Rに結合することにより腫瘍成長を阻害する抗体または他のリガンド、化学療法剤(他の多くの化学療法剤の中でも、タキサン、ビンカアルカロイド、白金化合物、挿入抗生剤)、およびサイトカインのほか、例えば、処置時に生じる任意の毒性を処置する緩和剤(palliative agent)であって、止瀉剤、制吐剤などであるがこれらに限定されない緩和剤を含む。
一実施形態では、本発明は、CpG ODNと抗PD−1抗体との任意の組合せを含むキットを包含する。このようなキットが好ましいが、本発明は、この特定の組合せに限定されない。さらに、キットは、がんを処置するための、多種多様なさらなる薬剤を含みうる。このような薬剤は、既に明示されており、他の多くの薬剤の中でも、化学療法化合物、がんワクチン、CpG ODN以外のTLRアゴニスト、他のCpG ODN、受容体チロシンキナーゼ阻害剤(SU11248などであるがこれらに限定されない)、異常な細胞成長またはがんの処置において有用な薬剤、IGF−1Rに結合することにより腫瘍成長を阻害する抗体または他のリガンド、化学療法剤(他の多くの化学療法剤の中でも、タキサン、ビンカアルカロイド、白金化合物、挿入抗生剤)、およびサイトカインのほか、例えば、処置時に生じる任意の毒性を処置する緩和剤であって、止瀉剤、制吐剤などであるがこれらに限定されない緩和剤を含む。
一実施形態では、本発明は、CpG ODNと、抗CTLA−4抗体との任意の組合せを含むキットを包含する。一実施形態では、キットを使用して、両方の薬剤を、治療クールのために、腫瘍内経路または腫瘍周囲経路を介して、毎週、併せて投与する。抗CTLA−4抗体を、全身投与ではなく、腫瘍内投与または腫瘍周囲投与により送達する場合、用量は、当業者が精通している通りに調整される:腫瘍内抗CTLA−4抗体の、好ましい用量は、一般に、0.1mg〜10mgの範囲であり、最も好ましくは、1mg〜5mgの範囲の固定用量として施される。当技術分野において標準的である通り、治療クールの持続時間は変動しうるが、典型的には、少なくとも12週間の持続時間であろう。患者が、重篤な毒性を発症せず、測定可能な腫瘍を有し続ける限り、処置は、数年の期間にわたってもなお継続することができる。休薬日および処置の中断も、包含される。処置の中断は、1週間、2週間、またはそれ超の長さであることが可能であり1カ月ごとまたはそれ未満ごとに施すこともでき、患者の耐容性に応じて施すこともできる。このようなキットが好ましいが、本発明は、この特定の組合せに限定されない。さらに、キットは、がんを処置するための、多種多様なさらなる薬剤を含みうる。このような薬剤は、既に明示されており、他の多くの薬剤の中でも、化学療法化合物、がんワクチン、CpG ODN以外のTLRアゴニスト、他のCpG ODN、受容体チロシンキナーゼ阻害剤(SU11248などであるがこれらに限定されない)、異常な細胞成長またはがんの処置において有用な薬剤、IGF−1Rに結合することにより腫瘍成長を阻害する抗体または他のリガンド、化学療法剤(他の多くの化学療法剤の中でも、タキサン、ビンカアルカロイド、白金化合物、挿入抗生剤)、およびサイトカインのほか、例えば、処置時に生じる任意の毒性を処置する緩和剤であって、止瀉剤、制吐剤などであるがこれらに限定されない緩和剤を含む。
以上で、本発明について、詳細に記載したが、これは、例示だけを目的とするものであり、本発明に対して限定的であることを意図せずに本明細書に含まれる、以下の実施例を参照することにより、いっそう明確に理解されるであろう。
(実施例1)
CpG ODNおよびチェックポイント阻害剤(±XRT)の組合せについて、最適の相乗作用を達成するために、可能な最高レベルのI型IFNを、可能な最低レベルのIL−10と共に誘導するように、CpG ODNをデザインするものとする。上記で記載したCpG ODNクラスのうち、この理念に最も近いのは、クラスAである。クラスA ODNを改善するために、それらを、2つの半独立構成要素:(i)クラスA CpG ODNの5’末端および3’末端、ならびに(ii)コアパリンドロームの観点で理解することができる。5’末端および3’末端におけるポリGドメインの目的は、ナノ粒子へと自己組織化するGテトラッドを形成し、パリンドロームを、TLR9を活性化させるのに好適な形で位置させ、早期エンドソーム内の、TLR9の、極めて強力な多量体化をもたらし、B細胞活性化および強力なIL−10の産生をもたらすより持続的なシグナルを誘発せずに強力なIRF3/7の活性化(および下流のIFN−α分泌)を生ずることである。ポリGドメインにより形成されるGテトラッドはまた、スカベンジャー受容体、およびGテトラッドに結合する、他の細胞表面受容体と相互作用することにより、細胞外におけるODNを安定化させ、樹状細胞(DC)および他のAPCへの、ODNの取込みを改善する一助ともなりうる。ポリGドメインは、5’末端および3’末端において、1つまたはいくつかのPS連結を有することが多いが、これは、とりわけ、投与量を増大させるか、またはナノ粒子、VLP、ISCOMなどの安定化製剤を使用して、ODNを送達する場合、高レベルのpDC IFN−α分泌の刺激に要求されない。パリンドロームの目的は、細胞の外部に二重鎖を形成し、標的DCにより、エンドソームへと有効に取り込まれ、次いで、強力なNF−κBの活性化を伴わずに、IRF3/7を誘導するように、一過性にTLR9を活性化させる構造を安定化させることである。
クラスA ODNの5’末端および3’末端の最適化
1.Gの数:先行技術において記載されているクラスA ODNは、ほとんど常に、両方の末端、または少なくとも1つの末端において、5つまたはそれ超の連続Gを含有する。しかし、これは、ODN活性には要求されず、実のところ、Gの組入れを少なくするほうが、ODNの合成をはるかに容易とし、誘導されるIFN−αの量には、必ずしも、劇的な影響を及ぼさない。本発明に従い、ある特定の好ましいクラスA ODNが、一方または両方の末端において、4つのGを有するのに対し、他の好ましいクラスA ODNは、ODNの5’末端および3’末端、または少なくとも3’末端において、6つを超えるG、10個のG、または10を超えるGを有する。
2.ホスホロチオエート(PS)連結の数:先行技術において記載されている一部のクラスA ODNは、ホスホロチオエート連結を全く含有しないが、それらは通例、ODNの5’末端において、2カ所のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を有し、3’末端において、5カ所のホスホロチオエートヌクレオチド間連結を有する。これらのホスホロチオエート連結は、ODNを、ヌクレアーゼに対して安定化させ、タンパク質の結合および細胞表面への取込みを、ある程度増大させるが、これらはまた、キラル中心も導入し、製造の複雑性も増大させる。本発明の、ある特定の好ましいクラスA ODNは、5’末端において、0、1、または2カ所のPS連結を含有し、3‘末端において、2、3、または4カ所のPS連結を含有する。ある特定の実施形態では、本発明の、好ましいクラスA ODNは、5’末端において、1または2カ所のPS連結を含有し、3‘末端において、2、3、または4カ所のPS連結を含有する。
3.ホスホロチオエート(PS)連結のキラリティー:先行技術において開示されているクラスA ODNは、PS連結を有するが、それらは常に、ステレオランダムであった。しかし、既に公表されている(Krieg AMら、Oligonucleotide、2003年、13巻(6号):491〜9頁)通り、2つの立体異性体は、TLR9シグナル伝達に対して、全く異なる免疫効果を及ぼす。改善されたクラスA CpGは、ポリGドメイン内の各位置の全てにRキラリティーを有する場合もあり、全てにSキラリティーを有する場合もあり、指定されたRキラリティーおよびSキラリティーを有する場合もある。CpG ODNが、任意のPS連結を含有する場合、CpG ODNの少なくとも3’末端は、ヌクレアーゼによる分解に対するその抵抗性が大きいため、Sp連結を有することが好ましい。
クラスA CpG ODNのパリンドロームの最適化
1.デオキシアデノシンヌクレオチドの位置決め:好ましいパリンドロームは、少なくとも1つのデオキシアデノシンを含有し、2つまたはそれ超のデオキシアデノシンを含有することが好ましい。これらを、パリンドロームの5’側の半分に配置し、その結果、相補的なチミジンが、好ましいパリンドロームの3’側の半分に位置することが好ましい(チミジンを、ハロゲンで修飾する場合、下記の論点3に記載される通り、好ましいパリンドロームは、パリンドロームの、5’領域内もしくは3’領域内またはこれらの両方の領域内に、デオキシアデノシンまたはチミジンを有しうることを除く)。
2.CpGジヌクレオチドの位置:好ましいパリンドロームは、5’側にTが先行する少なくとも1つのCpGジヌクレオチド、および/または5’側にAが先行する少なくとも1つのCpGジヌクレオチドを含有する。
3.チミジンヌクレオシドの修飾:本発明者らは、本発明において、新たな種類のクラスA CpG ODNを規定したが、本発明者らは、上記で列挙した新規のデザイン特色を含有するだけでなく、1または複数のチミジンヌクレオシドに対する修飾であって、米国特許第8,580,268号および米国出願公開第2014/0163213号において記載されている通り、クラスE CpG ODNとして既に記載されている修飾もまた含有する、クラスA CpG ODNを、ここで、クラスA/E CpG ODNと呼ぶ。具体的に、本発明の、好ましいクラスA/E CpG ODNは、パリンドローム内の、チミジンのうちの1または複数の代わりに、ハロゲン修飾ウラシルを含有する。ハロゲン修飾ウラシルは、5−ヨード−2’−デオキシウリジン(「I」)であることが最も好ましいが、また、5−ブロモ−2’−デオキシウリジンまたは5−クロロ−2’−デオキシウリジンでもありうる。
好ましいクラスA CpG ODNの例は、
[式中、各小文字は、ホスホロチオエート(PS)連結により、その3’側隣接ヌクレオチドへと連結されたヌクレオチドを表し、3’末端ヌクレオチドは、3’側隣接ヌクレオチドを有さないので、大文字で表されることを除き、各大文字は、ホスホジエステル(PO)連結により、その3’側隣接ヌクレオチド(存在する場合)へと連結されたヌクレオチドを表す]である。
好ましい、新規のクラスA CpG ODN配列の例は、
[式中、ここでもまた、各小文字は、ホスホロチオエート(PS)連結により、その3’側隣接ヌクレオチドへと連結されたヌクレオチドを表し、3’末端ヌクレオチドは、3’側隣接ヌクレオチドを有さないので、大文字で表されることを除き、各大文字は、ホスホジエステル(PO)連結により、その3’側隣接ヌクレオチド(存在する場合)へと連結されたヌクレオチドを表す]である。
好ましい、新規のクラスA/E CpG ODN配列の例は、
[式中、「I」は、5−ヨード−2’−デオキシウリジンを表す;各小文字は、ホスホロチオエート(PS)連結により、その3’側隣接ヌクレオチドへと連結されたヌクレオチドを表し、3’末端ヌクレオチドは、3’側隣接ヌクレオチドを有さないので、大文字で表されることを除き、各大文字は、ホスホジエステル(PO)連結により、その3’側隣接ヌクレオチド(存在する場合)へと連結されたヌクレオチドを表す]である。
本発明の、好ましいCpG ODNは、当技術分野で周知であり、上記で記載した、標準的な方法を使用して合成する。ODNの活性は、クラスAの特許およびクラスEの特許(例えば、IFN−αについては、米国特許第8,580,268号の図27、およびIL−10については、米国特許第7,795,235号の図27)において記載されている通り、ヒト末梢血単核細胞(PBMC)に対して、IFN−αおよびIL−10の分泌について、in vitroにおける用量−反応アッセイを使用して評価する。ヒトは、TLR9刺激に対するIFN−α応答の大きさで、個体間変動を示すため、全てのサイトカインアッセイ、ケモカインアッセイ、およびIFNアッセイについて、最小で3例ずつの異なる個体に由来するPBMCについて調べる。最大の応答性のためには、新鮮に回収されたPBMCが、特に好ましい(24時間後には、in vitroにおける、TLR9へのリガンド結合に対する応答の大きさは、著明に低下するであろう)。クラスA CpG ODNは、ヒトPBMC上、約0.1μM〜約10μMの濃度で調べることが典型的である。上清は、約24、48、または72時間後に回収し、IFN−α(通例、アッセイは、IFN−αの多くのアイソフォームのうちの1または複数だけについて測定する)ならびに/または他のIFN誘導性ケモカインおよびIFN誘導性サイトカインの量について、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、または他の標準的なアッセイにより調べる。
本発明の、好ましいクラスA CpG ODNおよびクラスA/E CpG ODNは、アッセイにおける最も有効な濃度で(効力は、この点で、ピーク有効性より重要ではない)、平均1000pg/mlを超えるIFN−α、またはより好ましくは、3,000pg/mlを超えるIFN−αを誘導し、最も好ましくは、10,000pg/mlを超えるIFN−αを誘導するが、いずれにせよ、好ましいODNは、陽性対照である、クラスB CpG ODNにより誘導されるIFN−αの、少なくとも10倍を超える産生を誘導する。また、同様のELISAアッセイを使用して、同じ実験に由来する上清を、IL−10の分泌についても調べる。本発明の、好ましいクラスA ODNまたはクラスA/E ODNは、これらのアッセイ条件下で、1000pg/ml未満、好ましくは、300pg/ml未満のIL−10分泌を誘導し、最も好ましくは、100pg/ml未満のIL−10分泌を誘導するであろう。
次いで、これらのin vitroアッセイから選択された最も好ましいCpG ODNを、当技術分野で周知の標準的な系を使用するマウス腫瘍モデルにおいて評価する。ODNのランク順位は、マウスTLR9とヒトTLR9との構造的差違、およびTLR9を発現させる細胞型の種特異的差違の結果として異なるので、ヒト臨床試験へと採用される、最も活性のODNを選択するのに、マウスアッセイを使用しない。これらの理由で、ヒト臨床試験へと採用される、リード候補CpG ODNのための一次選択は、ヒト細胞を使用するin vitroアッセイからの結果に基づくであろう。
(実施例2)
in vitro実験を実施して、パリンドローム配列の変化、5’側および3’側のGの数、5’側および3’側のホスホロチオエートヌクレオチド間連結の数、ならびにパリンドローム内の、5−ヨード−2’−デオキシウリジンによる置換の、ヒト末梢血単核細胞(PBMC)によるIFN−α分泌に対する効果について検討した。
正常ヒトドナーに由来するPBMCを、表示のODNの存在下または非存在下、3連で培養し、結果を、2例の異なるヒトドナーについて、図4および5に、平均値±標準偏差(SD)としてプロットした。PBMCを、histopaque−1077(Sigma)により単離し、96ウェルU型底組織培養プレート内のRPMI 1640(10%のFBS、グルタミン、Pen/Strep)中、1mL当たり1.25×10個、ウェル1つ当たり220μLで播種した。ODNを、5、1または0.2μg/mL(図4)の最終濃度まで、または0.5μg/mL(図5)の最低濃度で添加し、細胞を、48時間にわたりインキュベートした。次いで、細胞を、スピンダウンし、上清を、新たなプレートへと移し、使用まで、−20℃で凍結させた。その後、上清を、解凍し、製造元の指示書に従って、IFN−α ELISA(PBL Verikine human IFN−α)のために使用した。
この実験セットに由来するデータは、以下を示唆する:
オリゴの3’末端における、4つを超えるGは、良好な活性を付与すること:例えば、ODN 2247a〜c(5つまたはそれ超の3’側G)を、ODN 2247d(3’末端における4つのG)と比較されたい;
3’末端における5つのGは、6つのGに劣る場合がある(5つのGを伴うODN 2334dを、6つまたはそれ超の3’側Gを伴うODN 2334a〜cと比較されたい)こと;
5’末端において、1カ所のPS連結が存在するのか、2カ所のPS連結が存在するのかは重要でないこと:ODN 2334b(2PS)を、ODN 2334c(1PS)と比較されたい;
少なくとも一部の場合、5’末端における1カ所のPS連結は、5’末端における2カ所のPSより優れていると考えられる:ODN 2336cは、2カ所の5’側PS連結を有する、2336の唯一のバージョンであり、1カ所のPSを有する、他のバージョンより、IFN−αの誘導について弱いと考えられること;
3’末端に少なくとも5つのGが存在する限り、3’末端における3カ所のPSは、4カ所のPSと全く同等に強力であると考えられること:ODN 2336aおよび2336e(3’末端における3カ所のPS)を、それぞれ、5カ所または4カ所のPSを伴う、ODN 2336bおよび2336dと比較されたい;
ODN 2301内に存在するパリンドロームは、他の要素に関わらず、弱い(が、CpG−Bよりはやはり強力である):したがって、全てのパリンドロームが十分に働くわけではないこと;
パリンドローム内の1または2カ所のハロゲン置換は、CpG−A内で十分に許容されるが、IFN−α誘導活性を増大させない(例えば、ODN 2329aと2329b、2329c、2329dとを;またはODN 2336aとODN 2336bとを;またはODN 2216と2216aとを比較されたい)こと。
(実施例3)
in vitro実験を実施して、パリンドローム配列の変化、5’側および3’側のホスホロチオエートヌクレオチド間連結の数、ウイルス様粒子(VLP)内の天然DNA CpG−A ODNの製剤、およびCpG−A ODNの3’末端内の、2−O−メチル糖の置換の、効力およびヒトPBMCによるピークIFN−α分泌に対する効果について検討した。
実験条件は一般に、この場合、表示のODNを、PBMCと共に、2つの試料:
1.完全PO ODN G10(図6および7において、「CYT003」と記す)を、50μg/mL(図6および7における「conc A」)、10μg/mL(「conc B」)、および2μg/mL(「conc C」)のODN濃度で培養した;および
2.図6および7において「CytQbAb」と記す試料は、CYT003またはQbG10の名称の下に、Cytosにより出資された臨床開発により、またはこの臨床開発において既に記載されている(Beehら、J Allergy Clin Immunol、2013年、131巻:866〜74頁)通り、VLPの、免疫細胞への取込みを容易とする抗Qb抗体と併せて、バクテリオファージタンパク質Qbを含むウイルス様粒子内にパッケージングされたG10 ODNを含有した。これらの試料中のVLPは、G10と同様、50μg/mL(図6および7における「conc A」)、10μg/mL(「conc B」)、および2μg/mL(「conc C」)で培養したが、用量は、全VLPに基づくものの、VLPの質量のうちの20%だけが、G10を含むので、各ウェル内のG10の実際の質量は、10μg/mL(図6および7における「conc A」)、2μg/mL(「conc B」)、および0.5μg/mL(「conc C」)に近かった
を除き、全てのODNについて、5μg/mL(図6および7における濃度または「conc A」);1μg/mL(図6および7における「conc B」);および0.5μg/mL(「conc C」)の濃度で、3連で培養したことを除き、実施例2と同様であった。
この実験セットに由来するデータは、以下を示唆する:
3’末端において、PS連結が3カ所未満であり、5’末端において、PS連結がなければ、CpG−Aの効力の大きな低減がもたらされるが、最高のODN濃度において達成可能な、ピークIFN−α誘導の明らかな低減はもたらされないこと(0.5μg/mLだけであってもなお、検出可能な、ODN 2336aおよびODN 2336a1による極めて強力なIFN−α誘導(それぞれ、3’末端における、3または4カ所のPS連結)を、それぞれ2、0、または1カ所のPS連結を伴うODN 2336a2、ODN 2336POおよびODN 2336STによるIFN−α誘導のほぼ同様なピークレベルと比較されたい);
5’末端において、1カ所を超えるPSを有し、3’末端において、3カ所のPSを有することに、明らかな効力の利点は見られないこと(両方の末端において、1カ所のPS連結の差違を伴う、ODN 2336cとODN 2336eとの、同様な活性レベルを比較されたい);
ODN 2329内のパリンドローム(TCGTCGACGA)(配列番号524)は、IFN−αの誘導について、ODN 2216シリーズ内のパリンドローム(GACGATCGTC)(配列番号525)またはODN 2336シリーズ内のパリンドローム(ACGACGTCGT)(配列番号526)より強力でないと考えられること;
ODN 2329内のパリンドロームなど、それほど強力でないパリンドロームに基づくCpG−A ODNは、5’末端および3’末端におけるPS連結の数を低減する場合、これに応じて、効力の大幅な低減を被りうること(ODN 2329aを、PS連結が低減されたODN 2329a1と比較されたい);
CpG−A ODNの5’末端および/または3’末端における、1または複数の2’−O−メチル塩基の置換は、効力および達成可能なピークIFN−α誘導の大幅な低減をもたらすこと(2−O−メチル置換された、ODN 2336m1、ODN 2336m2、およびODN 2336mUを、ODN 2336の、元の非メチル化バージョンと比較されたい);
任意のODNについて見られる、最高のピークIFN−α誘導は、G10(図6の「CYT003」)およびG10を含有するVLP(図6の「CytQbAb」)に由来した。G10は、PS修飾を全く伴わない天然DNAであるので、これは、高濃度のCpG−A ODNが使用されるか、またはODNが、この実験で使用されているVLP内など、ヌクレアーゼに対して保護するように、パッケージングされているか、もしくは送達されている限り、PS修飾が、IFN−αの誘導に要求されないことを指し示す。「ネイキッド」G10(「CYT003」)の用量−反応は、VLP内にパッケージングされたG10と極めて類似するので、後者が含有するのは、ODN質量のうちの約20%だけであるが、VLPパッケージングは、CpG−A ODNの効力を大幅に増大させると考えられること。
本発明に従い、CpG−B(「2006」)対照ODNおよびCpG−C(「SD−101」)対照ODNによるIL−10誘導は、任意のCpG−A ODNによるIL−10誘導より著明に高度である(図7)。これは、IL−10の局所誘導(例えば、CpG−B ODNによる)が所望されない場合の、本発明の、腫瘍内注射されたCpG−A ODNの、がん免疫療法のための使用を裏付ける。
(実施例4)
in vitro実験を実施して、天然DNA(PO)と比較した、ホスホロジチオエート(PS2)またはホスホロチオエート(PS)によるCpG−A ODN骨格の変化の、効力および正常ヒトPBMCによるピークIFN−α分泌に対する効果について検討した。
実験条件は一般に、この場合、表示のODNを、PBMCと共に、0.5μg/mLまたは5μg/mLの濃度で、3連で、72時間にわたり培養したことを除き、実施例2と同様であった。
この実験セットに由来するデータ(図8)は、以下を示唆する:
5’末端および3’末端における、1または2カ所のPS2修飾(例えば、ODN AF185AおよびODN AF185H)を含有するCpG−A ODNは、PO(G10)末端またはPS末端(ODN 2216は、5’末端および3’末端において、PS連結を有する)とほぼ同様に有効であること;
パリンドローム内のPS2は、PS2を伴わない場合、またはポリG内の末端におけるPS2と比較して、活性を大幅に低減すること。
PS2末端は、タンパク質への結合およびヌクレアーゼ抵抗性の増大に起因して、in vivoにおいて、POまたはPSより優れている可能性がある。
(実施例5)
in vitro実験を実施して、天然骨格のDNAを保持しながら、G10 CpG−A ODNの5’末端および/または3’末端におけるGの数を低減するか、またはパリンドロームを変化させることの効果について検討した。
実験条件は一般に、この場合、表示のODN(表5)を、PBMCと共に、2.5μg/mLの濃度で、2連で、48時間にわたり培養したことを除き、実施例2と同様であった。
この実験セットに由来するデータは、以下を示唆する:
G10(表5の1〜3と同様に)の5’末端および/または3’末端におけるGの数の低減は、IP−10誘導の低減を伴わずに(図10)、IFN−α発現の誘導を低減する(図9)こと;
5’末端および3’末端において、10個のGにより挟まれる場合、新たなパリンドロームのほぼ全てが、CpG−B(ODN 2006)より優れているが、対照CpG−C(ODN SD−101)より必ずしも優れていないIFN−α分泌およびIP−10分泌を誘導したこと;
CpG−BおよびCpG−Cは、新たなCpG−A ODNのいずれよりも、高IL−10分泌を誘導する、所望されない特性を有すること(図11)。
(実施例6)
in vivoにおける実験を実施して、クラスA CpGオリゴヌクレオチドの腫瘍内投与と、抗PD−1チェックポイント阻害剤の全身投与とを伴う、組合せ腫瘍免疫療法による、リンパ腫の処置の有効性を評価した。
40匹の雌BALB/cマウスを、12.5μgのCMP001(VLP内で製剤化されたCpG−A G10)で、−14日目にプライミングした。このプライミングステップは、その後の注射により、VLPがオプソニン化され、pDCにより速やかに取り込まれるように、Qb VLPに対する抗Qb抗体応答を誘導する目的で組み入れた。次いで、プライミングされたマウスの各脇腹に、0日目に、5×10個のA20リンパ腫細胞を接種した。次いで、マウスを、群1つ当たりのN=10とする、4つの処置群へと分けた。群1(陰性対照)のマウスには、7、12、および15日目に、1つの脇腹のリンパ腫の腫瘍内に直接、生理食塩水の注射を施し、7日目に開始して、毎週2回、生理食塩水のi.p.注射を施した。群2(CpG単独)のマウスには、7、12、および15日目に、1つの脇腹のリンパ腫の腫瘍内に直接、100μgのCMP001の注射を施し、7日目に開始して、毎週2回、生理食塩水のi.p.注射を施した。群3(CPI単独)のマウスには、7、12、および15日目に、1つの脇腹のリンパ腫の腫瘍内に直接、生理食塩水の注射を施し、7日目に開始して、毎週2回、175μgの抗PD−1抗体のi.p.注射を施した。群4(CpG+CPI)のマウスには、7、12、および15日目に、1つの脇腹のリンパ腫の腫瘍内に直接、100μgのCMP001の注射を施し、7日目に開始して、毎週2回、175μgの抗PD−1抗体のi.p.注射を施した。全てのマウスを、腫瘍サイズ(処置および非処置(すなわち、遠位側))および生存についてモニタリングした。結果を、表6および図12および図13に示す。
図12に示される通り、処置腫瘍および非処置(遠位側)腫瘍のいずれも、群2(CpG単独)および群3(CPI単独)では、陰性対照(群1)より緩徐に増殖した。顕著に、処置腫瘍および非処置(遠位側)腫瘍のいずれも、はるかにより緩徐に増殖し、群4(CpG+CPI)のいくつかの症例では、消失さえし、この効果は、明らかに相乗的であった。
図13に示される通り、群1(陰性対照)のマウスの、腫瘍接種(「腫瘍チャレンジ」)後の生存期間中央値は、15日間であり;群2(CpG単独)のマウスの生存期間中央値は、19日間であり、約60日目を超えて生存するマウスは見られず;群3(CPI単独)のマウスの生存期間中央値は、20.5日間であり、約60日目を超えて生存するマウスは見られず;群4(CpG+CPI)のマウスの生存期間中央値は、48.5日間であり、マウスは、60日後を超えてもなお生存した。
参照による組込み
上記の記載で言及した、全ての特許および特許出願公開は、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
同等物
以上で、理解の明確さを目的とする例示および例として、本発明のある程度の詳細について、十分に記載したが、当業者には、条件、処方、および他のパラメータの、広範かつ同等な範囲内で、本発明を改変または変化させることにより、本発明の範囲、またはその任意の具体的な実施形態に影響を及ぼさずに、本発明を実施することができ、このような改変または変化を、付属の特許請求の範囲内に包含するように意図することが明らかであろう。

Claims (69)

  1. がん性腫瘍を処置する方法であって、
    がん性腫瘍の処置を必要とする被験体へと、有効量のTLR9アゴニストおよびチェックポイント阻害剤(CPI)を投与するステップ
    を含み、前記TLR9アゴニストを、前記腫瘍内に投与するか、または前記腫瘍に実質的に隣接させて投与する、方法。
  2. 前記TLR9アゴニストが、IFN−αを誘導する、請求項1に記載の方法。
  3. 前記TLR9アゴニストが、CpG DNAである、請求項1または2に記載の方法。
  4. 前記TLR9アゴニストが、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスA/E CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  5. 前記TLR9アゴニストが、クラスA CpG DNAである、請求項1から4のいずれか一項に記載の方法。
  6. 前記クラスA CpG DNAの配列が、GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG(配列番号82)である、請求項5に記載の方法。
  7. 前記クラスA CpG DNAを、ウイルス様粒子として製剤化する、請求項5または6に記載の方法。
  8. 前記TLR9アゴニストが、クラスC CpG DNAである、請求項1から4のいずれか一項に記載の方法。
  9. 前記CPIを全身投与する、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  10. 前記CPIが、PD−1、PD−L1、およびCTLA−4からなる群より選択される抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  11. 前記CPIが、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 前記CPIが、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  13. 前記CPIが、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  14. 前記CPIが、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1およびPD−L1からなる群より選択される抗原に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  15. 前記CPIが、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記CPIが、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  17. 前記CPIが、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項1から10のいずれか一項に記載の方法。
  18. 前記TLR9アゴニストを、前記CPIの投与の前に投与する、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  19. 前記TLR9アゴニストと、前記CPIとを、実質的に同時に投与する、請求項1から17のいずれか一項に記載の方法。
  20. 前記がん性腫瘍が、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される組織もしくは臓器のがん性腫瘍である、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  21. 前記がん性腫瘍が、黒色腫である、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  22. 前記がん性腫瘍が、リンパ腫である、請求項20に記載の方法。
  23. 前記がん性腫瘍が、前記TLR9アゴニストの投与を伴わずに、前記CPIの投与を含む処置レジメンに対して抵抗性である、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  24. 前記被験体が、ヒトである、上記請求項のいずれか一項に記載の方法。
  25. がん性腫瘍を処置する方法であって、
    がん性腫瘍の処置を必要とする被験体へと、有効量の放射線療法、TLR9アゴニスト、およびチェックポイント阻害剤(CPI)を投与するステップ
    を含み、前記放射線療法を、前記TLR9アゴニストの投与の前に開始し、前記TLR9アゴニストを、前記腫瘍内に投与するか、または前記腫瘍に実質的に隣接させて投与する、方法。
  26. 前記TLR9アゴニストが、IFN−αを誘導する、請求項25に記載の方法。
  27. 前記TLR9アゴニストが、CpG DNAである、請求項25または26に記載の方法。
  28. 前記TLR9アゴニストが、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスA/E CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される、請求項25から27のいずれか一項に記載の方法。
  29. 前記TLR9アゴニストが、クラスA CpG DNAである、請求項25から27のいずれか一項に記載の方法。
  30. 前記クラスA CpG DNAの配列が、GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG(配列番号82)である、請求項29に記載の方法。
  31. 前記クラスA CpG DNAを、ウイルス様粒子として製剤化する、請求項29または30に記載の方法。
  32. 前記TLR9アゴニストが、クラスC CpG DNAである、請求項25から27のいずれか一項に記載の方法。
  33. 前記CPIを全身投与する、請求項25から32のいずれか一項に記載の方法。
  34. 前記CPIが、PD−1、PD−L1、およびCTLA−4からなる群より選択される抗原に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項25から33のいずれか一項に記載の方法。
  35. 前記CPIが、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  36. 前記CPIが、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  37. 前記CPIが、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  38. 前記CPIが、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1およびPD−L1からなる群より選択される抗原に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  39. 前記CPIが、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  40. 前記CPIが、(i)CTLA−4に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  41. 前記CPIが、(i)PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片と、(ii)PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片とを含む、請求項25から34のいずれか一項に記載の方法。
  42. 前記TLR9アゴニストを、前記CPIの投与の前に投与する、請求項25から41のいずれか一項に記載の方法。
  43. 前記TLR9アゴニストと、前記CPIとを、実質的に同時に投与する、請求項25から41のいずれか一項に記載の方法。
  44. 前記がん性腫瘍が、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される組織もしくは臓器のがん性腫瘍である、請求項25から43のいずれか一項に記載の方法。
  45. 前記がん性腫瘍が、黒色腫である、請求項25から44のいずれか一項に記載の方法。
  46. 前記がん性腫瘍が、リンパ腫である、請求項44に記載の方法。
  47. 前記がん性腫瘍が、前記TLR9アゴニストの投与を伴わずに、前記CPIの投与を含む処置レジメンに対して抵抗性である、請求項25から46のいずれか一項に記載の方法。
  48. 前記被験体が、ヒトである、請求項25から47のいずれか一項に記載の方法。
  49. がん性腫瘍を処置する方法であって、
    がん性腫瘍の処置を必要とする被験体へと、有効量のTLR9アゴニスト、第1のチェックポイント阻害剤(CPI)、および第2のCPIを投与するステップ
    を含み、前記TLR9アゴニストおよび前記第1のCPIを、前記腫瘍内に投与するか、または前記腫瘍に実質的に隣接させて投与し、前記第2のCPIを全身投与する、方法。
  50. 前記TLR9アゴニストが、IFN−αを誘導する、請求項49に記載の方法。
  51. 前記TLR9アゴニストが、CpG DNAである、請求項49または50に記載の方法。
  52. 前記TLR9アゴニストが、クラスA CpG DNA、クラスC CpG DNA、クラスE CpG DNA、クラスA/E CpG DNA、クラスP CpG DNA、およびこれらの任意の組合せからなる群より選択される、請求項49から51のいずれか一項に記載の方法。
  53. 前記TLR9アゴニストが、クラスA CpG DNAである、請求項49から51のいずれか一項に記載の方法。
  54. 前記クラスA CpG DNAの配列が、GGGGGGGGGGGACGATCGTCGGGGGGGGGG(配列番号82)である、請求項53に記載の方法。
  55. 前記クラスA CpG DNAを、ウイルス様粒子として製剤化する、請求項53または54に記載の方法。
  56. 前記TLR9アゴニストが、クラスC CpG DNAである、請求項49から51のいずれか一項に記載の方法。
  57. 前記第1のCPIが、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項49から56のいずれか一項に記載の方法。
  58. 前記第1のCPIが、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、前記第2のCPIが、PD−1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項49から56のいずれか一項に記載の方法。
  59. 前記第1のCPIが、CTLA−4に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片であり、前記第2のCPIが、PD−L1に特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片である、請求項49から56のいずれか一項に記載の方法。
  60. 前記第1のCPIが、PD−1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片を含み、前記第2のCPIが、PD−L1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片を含む、請求項49から56のいずれか一項に記載の方法。
  61. 前記第1のCPIが、PD−L1に特異的に結合する第1の抗体またはその抗原結合性断片を含み、前記第2のCPIが、PD−1に特異的に結合する第2の抗体またはその抗原結合性断片を含む、請求項49から56のいずれか一項に記載の方法。
  62. 前記TLR9アゴニストを、前記第1のCPIの投与の前に投与する、請求項49から61のいずれか一項に記載の方法。
  63. 前記TLR9アゴニストと、前記第1のCPIとを、実質的に同時に投与する、請求項49から61のいずれか一項に記載の方法。
  64. 前記TLR9アゴニストを、前記第1のCPIの投与の後で投与する、請求項49から61のいずれか一項に記載の方法。
  65. 前記がん性腫瘍が、リンパ腫、または皮膚、頭頚部、食道、胃、肝臓、結腸、直腸、膵臓、肺、乳房、子宮頸部、卵巣、腎臓、膀胱、前立腺、甲状腺、脳、筋肉、および骨からなる群より選択される組織もしくは臓器のがん性腫瘍である、請求項49から64のいずれか一項に記載の方法。
  66. 前記がん性腫瘍が、黒色腫である、請求項49から65のいずれか一項に記載の方法。
  67. 前記がん性腫瘍が、リンパ腫である、請求項65に記載の方法。
  68. 前記がん性腫瘍が、前記TLR9アゴニストの投与を伴わずに、前記第1のCPIの投与を含む処置レジメンに対して抵抗性である、請求項49から67のいずれか一項に記載の方法。
  69. 前記被験体が、ヒトである、請求項49から68のいずれか一項に記載の方法。
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