JP2017537627A - Cs1標的化キメラ抗原レセプター改変t細胞 - Google Patents

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Abstract

悪性黒色腫及びCS1を発現する他の癌を治療する際に使用するためのキメラ抗原レセプターが記載される。【選択図】 図1

Description

関連出願とのクロスリファレンス
本出願は、「多発性骨髄腫を治療するためのセントラルメモリー由来CS1キメラ抗原レセプター改変T細胞の使用」と題された2014年12月5日に出願された米国非仮出願第62/088,423号の利益を主張し、その全体が本明細書に組み込まれる。
操作されたT細胞を用いる治療を含む、腫瘍特異的T細胞に基づく免疫療法が、抗腫瘍治療のために研究されている。ある場合には、このような療法において使用されるT細胞は、十分に長い期間、in vivoで活性を維持しない。ある場合には、T細胞の抗腫瘍活性は比較的低い。従って、より長期の抗腫瘍機能を有する腫瘍特異的癌治療のための当該技術分野における必要性が存在する。
CAR T細胞は、MHC非依存的なやり方で抗原特異的腫瘍集団を特異的に認識するように操作することができるので、キメラ抗原レセプター(chimeric antigen receptor,CAR)により操作されたT細胞を利用する養子T細胞療法(adoptive T cell therapy,ACT)は、様々な癌の再発率を低減するための安全かつ有効な方法を提供し得る。
多発性骨髄腫(multiple myeloma,MM)は、形質細胞のクローン増殖を特徴とするB細胞悪性腫瘍(malignancy)である。MMは、全癌の約1%、及び米国における血液悪性腫瘍の10%強を占めている。米国だけでも、今年、約2万例の新たな症例が診断され、且つ、11,000人以上がこの疾患で死亡する。MMの現在の治療法はしばしば寛解を誘導するが、ほぼすべての患者は最終的に再発して死亡する。
CS1は、正常な形質細胞及びMM細胞上で高度に且つ選択的に発現されるシグナル伝達リンパ球活性化分子(signaling lymphocyte activation molecule,SLAM)レセプターファミリーの細胞表面糖タンパク質であり、NK細胞上の発現が低く、且つ、正常組織上での発現がほとんど又は全くない。エロツズマブ(Elotuzumabc)(HuLuc63)は、再発したMM患者のボルテゾミブと共に投与されたヒト化(humanized)CS1モノクローナル抗体で、患者の48%において≧PRを生じる。MM細胞上でのCS1の高発現は、正常組織における形質細胞へのその制限と相まって、CS1をCAR T細胞療法の合理的な標的とする(Hsi et al. 2008 Clin Cancer Res 14:2775)。
概要
本明細書には、細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARが記載される。細胞外ドメインは、CS1特異的scFv領域又はその変異体(variant)、及び任意に、例えばヒトFcドメインの一部を含むスペーサーを含む。細胞外ドメインは、T細胞の表面上に発現されたときにCARがT細胞活性を、MMの表面上に発現されるレセプターであるCS1を発現する細胞に向けることを可能にする。膜貫通ドメインは、例えば、CD4膜貫通ドメイン、CD8膜貫通ドメイン、CD28膜貫通ドメイン、又はCD3膜貫通ドメインを含む。細胞内シグナル伝達ドメインは、ヒトCD3複合体(CD3ζ)のゼータ(ζ)鎖由来のシグナル伝達ドメイン及び1つ以上の共刺激(costimulatory)ドメイン、例えば、4−1BB共刺激ドメインを含む。細胞内領域にCD3ζと直列の4−1BB(CD137)共刺激ドメインなどの共刺激ドメインを含めることにより、T細胞は共刺激シグナルを受け取ることができる。T細胞、例えば患者特異的な自己(autologous)T細胞は、本明細書に記載のCARを発現するように操作することができ、且つ、操作された細胞を増殖して(expanded)、ACTで使用することができる。アルファベータ(αβ)T細胞及びガンマデルタ(γδ)T細胞の両方を含む様々なT細胞サブセットを使用することができる。さらに、CARは、NK細胞などの他の免疫細胞において発現され得る。患者が、本明細書に記載のCARを発現する免疫細胞で処置される場合、細胞は、自己T細胞又は同種異系(allogenic,アロジェニック)T細胞であり得る。場合によっては、使用される細胞は、CD8+セントラルメモリーT細胞(central memory T cells,TCM)の両方を含む細胞集団であって、これらはCD62L+、CCR7+、CD45RO+、及びCD45RA−である。細胞集団は他のタイプのT細胞も同様に含むことができる。
本明細書に記載のCS1 CARは、ある有益な特徴、例えば養子移入後の持続性及び増強された抗腫瘍活性を有する。
CS1を標的とするCARを発現するT細胞は、MMなどの癌、並びにCS1を発現する他の癌、の治療に有用であり得る。したがって、本開示は、本明細書に記載のCARを発現するT細胞を用いてCS1発現癌を治療するための方法を含む。
本明細書に記載されるのは、CARをコードする核酸分子であって、当該核酸分子は、
CS1 scFv(例えば、
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFDFSRYWMSWVRQAPGKGLEWIGEINPDSSTINYAPSLKDKFIISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARPDGNYWYFDVWGQGTLVTVSSGSTSGGGSGGGSGGGGSSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDVGIAVAWYQQKPGKVPKLLIYWASTRHTGVPDRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQQYSSYPYTFGQGTKVEIK; SEQ ID NO:1)又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその改変体;
CD4膜貫通ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体、CD8膜貫通ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体、CD28膜貫通ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体、及びCD3ζ膜貫通ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体、から選択される膜貫通ドメイン;
共刺激ドメイン(例えば、CD28共刺激ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその改変体);又は、
4−1BB共刺激ドメイン又は(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体;又は、
CD28共刺激ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその改変体、及び4−1BB共刺激ドメイン又は(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体の両方;並びに、
CD3ζシグナル伝達ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変を有するその変異体;
を含む。
本開示はまた、本明細書に記載のCARのいずれかをコードする核酸分子(例えば、CARのうちの1つをコードする核酸配列を含むベクター)及び本明細書に記載のCARのいずれかを発現する単離されたT細胞、である。
本明細書に記載されるのは、キメラ抗原レセプターをコードする核酸分子であって、キメラ抗原レセプターが:
CS1 scFv;
スペーサ領域;
CD28もしくはCD4膜貫通領域、CD28共刺激ドメイン又は4−IBB共刺激ドメイン、任意のGlyGlyGlyリンカー、及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
を含む。
一実施形態では、CS1 CARは、配列番号31,34,37,40,43、及び46のいずれかのアミノ酸配列(シグナル配列を欠く成熟CAR)からなるかもしくはそれを含むか、又はCS1 CARは、配列番号30,33,36,39,42、および45のいずれかのアミノ酸配列(GMCSFRaシグナル配列を有する未成熟CAR)からなるか、もしくはそれを含む。CARは(The CAR and)、シグナル配列、例えば、ヒトGM−CSFレセプターアルファシグナル配列(MLLLVTSLLLCELPHPAFLLIP; SEQ ID NO:26)を含む形態で発現され得る。CARは、例えばT2Aスキップ配列及び短縮型(truncated)EGFRtなど、発現をモニタリングするために有用なさらなる配列で発現され得る。したがって、CARは、配列番号29〜46のいずれかのアミノ酸配列を含むかもしくはそれからなり得るか、又は、配列番号29〜46のいずれかと少なくとも95%、96%、97%、98%もしくは99%同一であるアミノ酸配列を含むかもしくはそれからなり得る。CARは、1,2,3,4又は5までのアミノ酸変化(changes)(好ましくは、保存的(conservative)アミノ酸変化)を有する配列番号29〜46のいずれかのアミノ酸配列を含むかもしくはそれからなり得る。
本明細書に記載のCS1キメラ抗原レセプターをコードする発現カセットを含むベクターによって形質導入されたヒトT細胞の集団もまた開示される(例えば、CARは、配列番号29〜46のいずれかのアミノ酸配列、配列番号29〜46のいずれかと少なくとも95%、96%、97%、98%もしくは99%同一であるアミノ酸配列、又は1,2,3,4又は5までのアミノ酸変化(changes)(好ましくは、保存的(conservative)アミノ酸変化)を有する配列番号29〜46のいずれかのアミノ酸配列、を含むかもしくはそれからなる)。
様々な実施形態において、: ヒトT細胞の集団は、セントラルメモリーT細胞(central memory T cells,Tcm)、例えば、CD8+/CD4+Tcmである。
「アミノ酸改変(modification)」は、タンパク質又はペプチド配列におけるアミノ酸の置換、挿入及び/又は欠失を指す。「アミノ酸置換」又は「置換」は、親(parent)ペプチド又はタンパク質配列中の特定の位置のアミノ酸を別のアミノ酸に置換することを指す。非保存的な(non-conservative)やり方で(すなわち、特定のサイズ又は特徴を有するアミノ酸のグループに属するアミノ酸から、別のグループに属するアミノ酸へのコドンをへんかさせることによる)、又は保存的なやり方で(すなわち、特定のサイズ又は特徴を有するアミノ酸のグループに属するアミノ酸から同じグループに属するアミノ酸へのコドンを変化させることによる)、得られたタンパク質中のアミノ酸を変化させるために、置換を行うことができる。このような保存的変化は、一般に、得られるタンパク質の構造及び機能の変化をより少なくする。以下は、アミノ酸の様々なグループの例である:
1)非極性R基を有するアミノ酸: アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、トリプトファン、メチオニン;
2)非荷電極性R基を有するアミノ酸: グリシン、セリン、トレオニン、システイン、チロシン、アスパラギン、グルタミン;
3)荷電した極性R基を有するアミノ酸(pH6.0で負に荷電した): アスパラギン酸、グルタミン酸;
4)塩基性アミノ酸(pH6.0で正に帯電): リジン、アルギニン、ヒスチジン(pH6.0)。
別のグループは、フェニル基を有するアミノ酸であり得る: フェニルアラニン、トリプトファン及びチロシン。
CS1 ScFvドメイン
CS1 ScFvドメインは、CS1に結合するいずれのScFvであり得る。ある場合には、CS1 ScFvドメインは、配列番号1と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一である、又は同一である配列を含む。ある場合には、CS1 scFvは、配列番号1と比較して1,2,3,4もしくは5のアミノ酸変化(好ましくは保存的)を有する。ScFvはヒト化ScFvであり得る。
スペーサー地域
本明細書に記載のCARは、CS1標的ドメイン(すなわち、CS1 ScFv又はその変異体)と膜貫通ドメインとの間に位置するスペーサー領域を含むことができる。様々な異なるスペーサーを使用することができる。それらのいくつかは、ヒトFc領域の少なくとも一部、例えばヒトFc領域のヒンジ(hinge)部分、又はCH3ドメイン又はその変異体を含む。以下の表1は、本明細書に記載されるCARにおいて使用され得る様々なスペーサーを提供する。
表1:スペーサの例

いくつかのスペーサー領域は、免疫グロブリン(例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4)ヒンジ領域の全部又は一部、すなわち免疫グロブリンのCH1ドメインとCH2ドメインとの間に入る配列、例えばIgG4 Fcヒンジ又はCD8ヒンジを含む。いくつかのスペーサー領域は、免疫グロブリンCH3ドメイン、又はCH3ドメイン及びCH2ドメインの両方を含む。免疫グロブリン由来配列は、1つ以上のアミノ酸改変、例えば、1,2,3,4又は5の置換、例えば、オフターゲット結合を減少させる置換を含むことができる。
特定の実施形態では、スペーサーは、改変されていないヒンジに存在するものとは異なるアミノ酸残基で置換された1以上のアミノ酸残基を含む、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来するヒンジ/リンカー(linger)である。1以上の置換されたアミノ酸残基は、位置220,226,228,229,230,233,234,235,234,237,238,239,243,247,267,268,280,290,292,297,298,299,300,305,309,218,326,330,331,332,333,334,336,339における1以上のアミノ酸残基、又はそれらの組み合わせから選択されるが、それらに限定されない。
いくつかの実施形態では、ヒンジ/リンカー(liker)の改変ヒンジは、以下のアミノ酸残基置換の1以上を含むが、それらに限定されない、IgG1、IgG2、IgG3又はIgG4に由来する。:
C220S、C226S、S228P、C229S、P230S、E233P、V234A、L234V、L234F、L234A、L235A、L235E、G236A、G237A、P238S、S239D、F243L、P247I、S267E、H268Q、S280H、K290S、K290E、K290N、R292P、N297A、N297Q、S298A、S298G、S298D、S298V、T299A、Y300L、V305I、V309L、E318A、K326A、K326W、K326E、L328F、A330L、A330S、A331S、P331S、I332E、E333A、E333S、E333S、K334A、A339D、A339Q、P396L、又はそれらの組み合わせ。
いくつかの実施形態では、改変ヒンジは、配列番号10もしくは11のアミノ酸配列を有するヒトIgG4ヒンジ/CH2/CH3領域、又は配列番号10もしくは11に少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一であるアミノ酸配列に由来する。
特定の実施形態では、改変ヒンジは、改変されていないヒンジに存在するものとは異なるアミノ酸残基で置換された1以上のアミノ酸残基を含むIgG4に由来する。1以上の置換されたアミノ酸残基は、位置220、226、228、229、230、233、234、235、234、237、238、239、243、247、267、268、280、290、292、297、298、299、300、305、309、218、326、330、331、332、333、334、336、339、又はそれらの組み合わせにおける1以上のアミノ酸残基から選択されるが、それらに限定されない。
いくつかの実施形態では、改変ヒンジは、以下のアミノ酸残基置換のうちの1つ以上を含むが、それらに限定されないIgG4に由来する。:
220S、226S、228P、229S、230S、233P、234A、234V、234F、234A、235A、235E、236A、237A、238S、239D、243L、247I、267E、268Q、280H、290S、290E、290N、292P、297A、297Q、298A、298G、298D、298V、299A、300L、305I、309L、318A、326A、326W、326E、328F、330L、330S、331S、331S、332E、333A、333S、333S、334A、339D、339Q、396L、又はそれらの組み合わせ。ここで、改変されていないヒンジにおけるアミノ酸は、示された位置で上記の同定されたアミノ酸で置換される。一例において、当該配列は、以下のアミノ酸変化S228P、L235E、及びN297Qを含む。
本明細書で論じる免疫グロブリン中のアミノ酸位置については、ナンバリング(numbering)は、EUインデックス又はEUナンバリングスキームによる。(Kabat et al. 1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed., United States Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda、本明細書にその全体が参考として援用される)。EUインデックス、又はKabatもしくはEUナンバリングスキームにおけるEUインデックスは、EU抗体の番号付け(numbering)を指す(Edelman et al. 1969 Proc Natl Acad Sci USA 63:78−85)。
ヒンジ/リンカー領域はまた、配列ESKYGPPCPSCP(配列番号4)又はESKYGPPCPPCP(配列番号3)を有するIgG4ヒンジ領域を含むことができる。
ヒンジ/リンカー(linger)領域はまた、配列ESKYGPPCPPCP(配列番号3)、続いてリンカー配列GGGSSGGGSG(配列番号2)、続いてIgG4 CH3配列
GQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号12)を含むことができる。したがって、リンカー/スペーサー領域全体は、以下の配列を含むことができる:
ESKYGPPCPPCPGGGSSGGGSGGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号11)。いくつかの場合において、スペーサーは、配列番号11と比較して1,2,3,4又は5個の単一アミノ酸変化(例えば、保存的変化)を有する。いくつかの場合には、IgG4 Fcヒンジ/リンカー領域は、Fcレセプター(FcR)による結合を低下させるやり方で、2つの位置(L235E;N297Q)において突然変異している。
膜貫通領域
様々な膜貫通ドメインが、本明細書中で使用され得る。表2は、適切な膜貫通ドメインの例を含む。スペーサー領域が存在する場合、膜貫通領域はスペーサー領域のカルボキシ末端に位置する。
表2:膜貫通ドメインの例
共刺激ドメイン
共刺激ドメインは、CD3ζシグナル伝達ドメインとの使用に適したいずれのドメインであり得る。RSKRSRGGHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS(配列番号23;LLからGGへのアミノ酸変化に二重下線)に対して、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一である、又は同一である配列を含むCD28共刺激ドメインである。いくつかの場合において、CD28共シグナル伝達(co-signaling)ドメインは、配列番号23と比べて1、2、3、4もしくは5個のアミノ酸変化を有する(好ましくは保存的であり、且つ、好ましくは下線を引かれたGG配列においてはない(not))。いくつかの場合においては、共シグナル伝達ドメインは、
KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL(配列番号24)に対して、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一である、又は同一である配列を含む4−1BB共シグナル伝達ドメインである。いくつかの場合においては、4−1BB共シグナル伝達ドメインは、配列番号24と比較して1,2,3,4もしくは5個のアミノ酸変化(好ましくは保存的)を有する。
共刺激ドメイン(複数可)は、膜貫通ドメインとCD3ζシグナル伝達ドメインとの間に位置する。表3は、CD3ζシグナル伝達ドメインの配列と共に適切な共刺激ドメインの例を含む。
表3:CD3ζドメイン及び共刺激ドメインの例
種々の実施形態において、: 共刺激ドメインは、
表3に示される共刺激ドメイン又は1〜5(例えば1又は2)のアミノ酸改変を有するその変異体、CD28共刺激ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変を有するその変異体、4−1BB共刺激ドメイン又は1〜5(例えば1又は2)のアミノ酸改変を有するその変異体及びOX40共刺激ドメイン又は1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変を有するその変異体、
からなる群から選択される。特定の実施形態では、4−1BB共刺激ドメイン又は1〜5(例えば1又は2)のアミノ酸改変を有するその変異体が存在する。いくつかの実施形態では、2つの共刺激ドメイン、例えばCD28共刺激ドメイン1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体及び4−1BB共刺激ドメイン又は1〜5(例えば1又は2)のアミノ酸改変(例えば、置換)を有するその変異体、が存在する。様々な実施形態では、1〜5(例えば、1又は2)のアミノ酸改変が置換である。共刺激ドメインは、CD3ζシグナル伝達ドメインに対するアミノ末端であり、且つ、いくつかの場合、2〜10、例えば3アミノ酸(例えば、GGG)からなる短いリンカーは、共刺激ドメインとCD3ζシグナル伝達ドメインとの間に位置する。
CD3ζシグナル伝達ドメイン
CD3ζシグナル伝達ドメインは、CD3ζシグナル伝達ドメインとの使用に適したいずれのドメインであり得る。いくつかの場合、CD3ζシグナル伝達ドメインは、
RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR(配列番号21)に対して、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一である、又は同一である配列を含む。いくつかの場合、CD3ζシグナル伝達(signaling)は、配列番号21と比較して1,2,3,4もしくは5のアミノ酸変化(好ましくは保存的)を有する。
短縮型(truncated)EGFR
CD3ζシグナル伝達ドメインの後には、リボソームスキップ配列(例えば、LEGGGEGRGSLLTCGDVEENPGPR;配列番号27)、及び
LVTSLLLCELPHPAFLLIPRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVVALGIGLFM(配列番号28)に対して、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一である、又は同一である配列を有する短縮型EGFRが続いてもよい。いくつかの場合、短縮型EGFRは、配列番号28と比較して1,2,3,4もしくは5のアミノ酸変化(好ましくは保存的)を有する。
CS1 CAR
CS1 CARは、図2、図6、図7、図8、図9もしくは図10に示されたアミノ酸配列と少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%同一である、又は同一である配列を含むことができる(配列番号29〜46;GMCSFRaシグナル配列を含むか又は除外するかのいずれかであり、且つ、T2Aリボソームスキップ配列及び短縮型EGFRtを含むか又は除外するかのいずれかである)。
本明細書に記載のCAR標的化CS1の中には、スペーサー領域、膜貫通ドメイン及び各CARの共刺激ドメイン(複数可)が示されている表4にまとめたものがある。
表4:CAR標的化CS1の例
* SEQ ID NO: GMCSFRaシグナル配列、T2A及びEGFRtを含めて描かれた配列全体//GMCSFRaシグナル配列を含むが、T2A及びEGFRtを除く配列//GMCSFRaシグナル配列、T2A及びEGFRtを除く配列のための配列
についての配列番号。
図面の説明
図1は、CS1 CAR発現レンチウイルスベクター(CS1scFv−IgG4(HL−CH3)−CD28gg−Zeta(CO)−T2A−EGFRt_epHIV7)の模式図である。CS1 CAR構築物は、GMCSFシグナル配列、CS1 scFv、IgG4ヒンジ領域、リンカー、CH3ドメイン、CD28共刺激ドメイン及びCD3ζシグナル伝達ドメインを含む。CAR構築物に続いて、T2Aリボソームスキップ配列、及び次いで自殺遺伝子EGFRtコード配列が続く。CAR及びEGFRt分子は、単一の転写産物(transcript)から発現される。 図2は、シグナルペプチド、リボソームスキップ配列及びEGFRtを含むCS1 CARのアミノ酸配列を示す(配列番号29)。 図3は、CS1 CARリダイレクトされた(re-directed)TcmがMM細胞に対して細胞傷害性を示したことを示す研究の結果を示す一対のグラフである。増殖した(propagated)CS1 CAR T細胞の細胞傷害性を、51Cr標識標的細胞との共培養後、4時間の51Crリリースアッセイを用いて評価した。OKT3発現LCLはすべてのTCRに関与したので、それらを陽性対照として使用し、且つ、CS1陰性AML細胞(KG1a)は陰性対照として使用した。CS1 CAR、但し未処理(un-engineered)モック(mock)T細胞は、MM細胞に対して特異的な細胞毒性を示した。 図4は、CS1 CARリダイレクトされたTcm細胞がMM細胞の刺激に応答してエフェクター機能を示したことを示す研究の結果を示す。CS1 CAR T細胞(10)を、刺激剤としてMM.1S細胞の10と共に96ウェル組織培養プレート中で6時間共培養した。107a脱顆粒及び細胞内IFNガンマ産生を、フローサイトメトリーで分析した。Erbitumによって同定されたCAR T細胞の大部分は、MM細胞との関与の後に脱顆粒するように誘導され、且つ、抗原刺激に応答してIFNガンマ陽性細胞が検出された。 図5は、CS1 CARリダイレクトされたTcm細胞がin vivoで多発性骨髄腫を根絶することを示す研究の結果を示す。MM.1S細胞を発現するおよそ2×10個のホタルルシフェラーゼが、脛骨内注射によってNSGマウスに接種された。腫瘍接種の7日後、1×10 CS−1 CAR T細胞を静脈内注射によって腫瘍を有するマウスに注入した。腫瘍の負担は、1週間に1回、Xenogen(登録商標)イメージングでモニターした。未処理細胞を受けたマウスを対照(control)として使用した。CS1 CAR T細胞は、T細胞注入の14日後にMM腫瘍を完全に根絶したが、未処理T細胞は腫瘍阻害に効果がない。 図6は、CSlscFv−IgG4(HL−CH3)−CD4tm−41BB−Zeta−T2A−EGFRtのアミノ酸配列を示す(配列番号32)。 図7は、CS1scFv−IgG4(L235E,N297Q)−CD4tm−41BB−Zeta−T2A−EGFRtのアミノ酸配列を示す(配列番号35)。 図8は、CS1scFv−IgG4(L235E,N297Q)−CD28tm−CD28gg−Zeta−T2A−EGFRtのアミノ酸配列を示す(配列番号38)。 図9は、CS1scFv−Linker−CD4tm−41BB−Zeta−T2A−EGFRtのアミノ酸配列を示す(配列番号41)。 図10は、CS1scFv−Linker−CD28tm−CD28gg−Zeta−T2A−EGFRtのアミノ酸配列を示す(配列番号44)。 図11は、CS1scFv−IgG4(HL−CH3)−CD28gg−Zeta−T2A−EGFRt_epHIV7の完全なヌクレオチド配列である(配列番号47)。 図12は、CS1 CARリダイレクトされたTcm細胞がin vivoで多発性骨髄腫を根絶することを示す研究の結果を示す。2×10 GFPffluc+MM.1S細胞を、−7日目にNSGマウスに脛骨内注射により接種した。1×10のセントラルメモリーT細胞(Tcm)由来のCS1 CAR+ T細胞を0日目に腫瘍を有するマウスに静脈内注入した。同じドナーからT細胞又は非形質導入Tcmを受けなかったマウスを、ネガティブコントロールとして使用した。腫瘍シグナルは、生体光イメージングによってモニターした。複数のマウスからのフォントン(phonton)/秒の平均±SEMが示されている。CARは図2(CH2 CD28);図6(CH2 4IBB);図8(EQ CD28);図7(EQ 4IBB);図10(L CD28)及び図9(L CD4 IBB);のものであった。
詳細な説明
いくつかのCS1特異的キメラ抗原レセプター(chimeric antigen receptors,「CAR」)の構造、構築及び特徴付けについて以下に記載する。CARは、細胞外認識ドメイン、膜貫通領域、及び細胞内シグナル伝達ドメインを収容する(contains)組換え生体分子である。したがって、用語「抗原」は、抗体に結合する分子に限定されないが、いずれのレセプターに特異的に結合し得るいずれの分子に限定される。したがって、「抗原」は、CARの認識ドメインを指す。細胞外認識ドメインは(単に細胞外ドメインとも呼ばれ、又は単にそれが含有する認識要素により)、標的細胞の細胞表面上に存在する分子に特異的に結合する認識要素を含む。膜貫通領域は膜中のCARを固定する(anchors)。細胞内シグナル伝達ドメインは、ヒトCD3複合体のζ鎖由来のシグナル伝達ドメインを含み、且つ、任意には1つ以上の共刺激シグナル伝達ドメインを含む。CARは、MHC制限とは無関係に、抗原に結合し、且つ、T細胞活性化を形質導入(transduce)ことができる。従って、CARは、それらのHLA遺伝子型にかかわらず、抗原陽性腫瘍を有する患者集団を治療することができる「普遍的な(universal)」免疫レセプターである。腫瘍特異的CARを発現するTリンパ球を用いる養子免疫療法は、癌の治療のための強力な治療戦略であり得る。
場合によっては、CS1 CARは、CARオープンリーディングフレームの後に、T2Aリボソームスキップ配列及び細胞質シグナル伝達尾部を欠く短縮型(truncated)EGFR(EGFRt)が続くベクターを用いて作製することができる。この配置において、EGFRtの同時発現は、遺伝子改変細胞の正確な測定を可能にする、不活性で非免疫原性の表面マーカーを提供し、且つ、遺伝子改変細胞のポジティブな選択、並びに、養子移植後のin vivoでの治療用T細胞の効率的な細胞追跡を可能にする。サイトカインストーム及び標的外の(off-target)毒性を避けるために増殖を効率的に制御することは、T細胞免疫療法の成功にとって重要なハードルである。CS1CARレンチウイルスベクターに組み込まれたEGFRtは、治療関連の毒性の場合にCAR+ T細胞を切除するための自殺遺伝子として作用することができる。
本明細書に記載のCARは、当技術分野で公知の任意の手段によって製造することができるが、好ましくは組換えDNA技術を用いて製造される。キメラレセプターのいくつかの領域をコードする核酸は、当該分野で公知の標準的な分子クローニング技術(ゲノムライブラリースクリーニング、重複PCR、プライマーアシストライゲーション、部位特異的変異誘発など)によって完全なコード配列に調製し、組み立てることができ、便利である。得られたコード領域は、好ましくは発現ベクターに挿入され、且つ、適切な発現宿主細胞株、好ましくはTリンパ球細胞株、及び最も好ましくは自己Tリンパ球細胞株、を形質転換するために使用される。
患者から単離された様々なT細胞サブセットは、CAR発現のためのベクターで形質導入され得る。セントラルメモリーT細胞は、1つの有用なT細胞サブセットである。セントラルメモリーT細胞は、所望のレセプターを発現する細胞を免疫学的に選択するために、例えばCliniMACS(登録商標)装置を使用して、CD45RO+/CD62L+細胞を選択することにより末梢血単核細胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)から単離することができる。セントラルメモリーT細胞が富化された細胞は、例えば、CS1 CARの発現を指示するレンチウイルスベクター、ならびにin vivo検出、アブレーション、及び潜在的な生体外(ex vivo)選択のための非免疫原性表面マーカーで形質導入された抗CD3/CD28で活性化することができる。活性化/遺伝子改変されたCS1セントラルメモリーT細胞は、IL−2/IL−15でin vitroで増殖され、及び次いで凍結保存され得る。
実施例1: CS1特異的CARの発現に使用されるepHIV7の構築及び構造
pHIV7プラスミドは、CS1 CARを発現する臨床ベクターを誘導することができる親プラスミドである。CARの発現に使用したepHIV7ベクターは、pHIV7ベクターから産生された(Wang et al. 2011 Blood 118:1255)。重要なことに、このベクターは、ヒトEF1プロモーターを用いてCARの発現を駆動する。ベクターの5’及び3’配列の両方は、以前にHXBc2プロウイルス由来のpv653RSNに由来した。ポリプリントラクトDNAフラップ配列(cPPT)は、NIH AIDS Reagent RepositoryからのHIV−1株pNL4−3由来であった。
pHIV7の構築は以下のように行った。簡潔には、介在SL3−ネオマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子(Neo)を有するgag−polプラス5’及び3’末端反復配列(long-terminal repeats,LTR)からの653bpを含むpv653RSNを以下のようにpBluescriptにサブクローニングした。ステップ1では、5’LTRからrev応答配列(rev-responsive element)(RRE)まで配列は、p5’HIV−151を作製し、及び次いで5’LTRをTATAボックスの上流の配列を除去することにより改変し、及び最初にCMVエンハンサーに連結し、及び次に複製(p5’HIV−2)のSV40起点に連結した。ステップ2では、3’LTRをpBluescriptにクローニングしてp3’HIV−1を作製した後、3’LTRエンハンサー/プロモーターにおける400bpの欠失を行い、HIV U3中のcis調節エレメントを除去し、且つ、p3’HIV−2を形成した。ステップ3では、p5’HIV−3及びp3’HIV−2から単離した断片をライゲーションしてpHIV−3を作製した。ステップ4では、p3’HIV−2は、追加の上流のHIV配列を除去してp3’HIV−3を生成することによりさらに改変し、且つ、WPREを含有する600bpのBamHI−SalIフラグメントをp3’HIV−3に加えてp3’HIV−4を作製した。ステップ5では、pHIV−3 RREをPCRによりサイズを減少させ、且つ、pHIV−3(図示せず)由来の5’断片に、及びp3’HIV−4に連結して、pHIV−6を作製した。ステップ6では、HIV−1 pNL4−3(55)由来のcPPT DNAフラップ配列を含有する190bpのBglII−BamHI断片をpNL4−3から増幅し、且つ、pHIV6におけるRRE配列とWPRE配列との間に配置してpHIV−7を作製した。この親プラスミドpHIV7−GFP(GFP、緑色蛍光タンパク質)を用いて、4−プラスミド系を用いて親ベクターをパッケージングした。
ウイルスゲノムをベクターに効率的にパッケージングするためには、パッケージングシグナルpsiΨが必要である。RRE及びWPREは、RNA転写物の輸送及び導入遺伝子の発現を増強する。フラップ配列は、WPREと組み合わせて、哺乳動物細胞におけるレンチウイルスベクターの形質導入効率を高めることが実証されている。
ウイルスベクターの産生に必要なヘルパー機能は、3つの別個のプラスミドに分割され、組換えによる複製コンピテントレンチウイルスの生成の可能性を減少させる:
1)pCgpはウイルスベクター構築(assembly)に必要なgag/polタンパク質をコードする。;
2)pCMV−Rev2は、効率的なパッケージングのためにウイルスゲノムの輸送を助けるためにRRE配列に作用するRevタンパク質をコードする。;及び
3)pCMV−Gは、ウイルスベクターの感染性のために必要とされる水疱性−口内炎ウイルス(vesiculo-stomatitis virus,VSV)の糖タンパク質をコードする。
pHIV7にコードされたベクターゲノムとヘルパープラスミドとの間に最小のDNA配列相同性が存在する。相同性の領域は、
pCgpヘルパープラスミドのgag/pol配列中に位置する約600ヌクレオチドのパッケージングシグナル領域;
3種全てのヘルパープラスミド中のCMVプロモーター配列;及び
ヘルパープラスミドpCgp中のRRE配列;
を含む。多数の組換え事象(events)を必要とするので、これらの領域の相同性のために複製コンピテント組換えウイルスが生成される可能性は非常に低い。さらに、得られたいずれの組換え体は、レンチウイルス複製に必要な機能的LTR及びtat配列を欠いているであろう。
CMVプロモーターをEF1α−HTLVプロモーター(EF1p)に置き換え、且つ、新しいプラスミドをepHIV7と命名した。EF1pは563bpを有し、且つ、CMVプロモーターを切除した後、NruI及びNheIを用いてepHIV7に導入した。
野生型ウイルスの病原性に必要であり、且つ、標的細胞の生産的感染に必要とされるgag/pol及びrevを除くレンチウイルスゲノムは、この系から除かれている。さらに、epHIV7ベクター構築物はインタクトな3’LTRプロモーターを含有しないため、結果として生じる標的細胞中の発現された、且つ、逆転写DNAプロウイルスゲノムは不活性なLTRを有するであろう。この設計の結果、HIV−I由来配列はプロウイルスから転写されず、且つ、治療配列のみがそれぞれのプロモーターから発現されるであろう。SINベクターにおけるLTRプロモーター活性の除去は、宿主遺伝子の意図しない活性化の可能性を有意に減少させることが期待される。表5は、epHIV7に存在する種々のレギュレーター要素をまとめたものである。
図1は、CS1 CAR(CS1scFv−IgG4(HL−CH3)−CD28gg−Zeta(CO)−T2A−EGFRt_epHIV7)CS1 scFv、CS1 scFv、IgG4ヒンジ領域、リンカー、CD28共刺激ドメイン及びCD3ζシグナル伝達ドメイン、からなるCAR構築物を含有するレンチウイルスベクター、の模式的な描写である。CAR構築物に続いて、T2Aリボソームスキップ配列、及び次いで自殺遺伝子EGFRtコード配列が続く。CAR及びEGFRt分子は、単一の転写産物から発現される。ベクターの全ヌクレオチド配列を図11に示し、且つ、表5はベクターの種々の要素の位置を示す。
表5:CS1 CAR_epHIV7の機能要素
実施例2: 患者T細胞の形質導入のためのベクターの作製
各プラスミド(CS1 CAR_epHIV7;pCgp;pCMV−G;及びpCMV−Rev2)について、十分な量のプラスミドDNAを産生するために発酵槽に接種するために使用されるシードバンクが生成される。プラスミドDNAは、レンチウイルスベクターの産生に使用する前に、同一性、無菌性及びエンドトキシンについて試験される。
簡単に説明すると、細胞は、無菌性及びウイルス汚染の存在を確認するために試験された293T作業(working)細胞(WCB)から増殖される。293T WCBからの293T細胞のバイアルを解凍する。十分な数の細胞が存在して、ベクター産生及び細胞培養の維持(cell train maintenance)のために適切な数の10層細胞工場(cell factroies,CFs)をプレートするまで、細胞を増殖(grown)及び拡大する(expanded)。単一の細胞列を生産に使用することができる。
レンチウイルスベクターは、10CFまでのサブバッチで産生された。同じ週に2つのサブバッチを産生しすることができ、約20Lのレンチウイルス上清/週になる。1つのロットの製品を製造するために、すべてのサブバッチから製造された材料を下流の処理段階でプールした。293T細胞を293T培地(10%FBSを含むDMEM)中でCF中に播種した(plated)。ファクトリーを37℃のインキュベーターに置き、且つ、CFのすべての層上に細胞の均一な分布を得るために水平に平らにした(leveled)。2日後、Tris:EDTA、2M CaCl、2X HBS及び4つのDNAプラスミドの混合物を含むCaPO法を用いて、上記の4つのレンチウイルスプラスミドを細胞にトランスフェクトした。トランスフェクション後3日目に、分泌されたレンチウイルスベクターを含有する上清を回収し、精製し、濃縮した。上清をCFから除去した後、各CFから最終生産細胞(End-of-Production Cells)を回収した。各工場から細胞をトリプシン処理し、遠心分離により収集した。細胞を凍結培地に再懸濁し、及び凍結保存した。これらの細胞は、その後、複製能力のあるレンチウイルス(RCL)試験に使用された。
ベクターを精製及び製剤化する(formulate)ために、細胞の破片(debris)
を除去するために膜濾過によって粗製上清を清澄化した。宿主細胞DNA及び残留プラスミドDNAは、エンドヌクレアーゼ消化(Benzonase(登録商標))によって分解された。ウイルス上清を0.45μmのフィルターを用いて細胞破片を清澄化した。清澄化された上清を予め秤量した容器に採取し、そこにBenzonase(登録商標)を加えた(最終濃度50U/mL)。残留プラスミドDNA及び宿主ゲノムDNAに対するエンドヌクレアーゼ消化は、37℃で6時間行った。エンドヌクレアーゼ処理した上清の初期接線流限外濾過(tangential flow ultrafiltration,TFF)濃度を用いて、粗上清から残留低分子量成分を除去し、ウイルスを約20倍濃縮した。浄化されたエンドヌクレアーゼ処理ウイルス上清を、500kDのNMWCOを有する中空繊維カートリッジに、流速を最大にしながら、剪断速度を約4,000秒−1以下に維持するように設計された流速で循環させた。ヌクレアーゼ処理された上清のダイアフィルトレーションは、カートリッジの性能を維持するために濃縮プロセスの間に開始された。ダイアフィルトレーション緩衝液としてPBS中に4%ラクトースを使用して、80%透過物置換率を確立した。ウイルス上清を標的体積に持ってきて、20倍濃度の粗上清を示し、且つ、透析液交換率を100%として4回の追加交換容量でダイアフィルトレーションを続けた。
ウイルス産物のさらなる濃縮は、高速遠心分離技術を用いて達成された。レンチウイルスの各サブバッチを、Sorvall RC−26プラス6000RPM(6,088 RCF)で、6℃、16〜20時間遠心分離してペレット化した。次いで、各サブバッチからのウイルスペレットをPBS中の4%ラクトースを含む50mL容量で再構成した。この緩衝液中の再構成されたペレットは、ウイルス調製のための最終製剤(formulation)を表す。ベクター濃縮プロセス全体は約200倍の体積減少をもたらした。全ての部分バッチの完了後、材料を次に−80℃に置き、その間、各部分バッチからの試料を無菌性について試験した。サンプルの無菌性を確認した後、サブバッチを頻繁に攪拌しながら37℃で急速に解凍した。次いで、この物質をプールし、且つ、ウイルスベクタースイート(suite)のクラスII型A/B3バイオセーフティキャビネット内に手でアリコートした。滅菌USPクラス6、雄ネジ(externally threaded)Oリングクリオバイアル中の濃縮レンチウイルス1mLの充填構成を使用した。COHにおける応用技術開発センター(CATD)の品質システム(QS)は、CBGのためのポリシーと標準的な運用手順に従って、そして現在のグッド・マニュファクチャリング・プラクティス(current Good Manufacturing Practics,cGMPs)に準拠してすべての材料をリリースした。
レンチウイルスベクター調製物の純度を保証するために、残留宿主DNA混入物、及び残留宿主及びプラスミドDNAの移入について試験する。他の試験の中でも、正確なベクターが存在することを確実にするために、RT−PCRによってベクター同一性を評価する。すべての放出基準は、本研究での使用を意図したベクターについて満たされている。
実施例3: ACTでの使用に適したTcm細胞の調製
Tリンパ球は、白血球フェレーシス(leukopheresis)によって患者から得られ、且つ、適切な同種異系又は自己T細胞サブセット、例えばセントラルメモリーT細胞(Tcm)は、CARを発現するように遺伝的に改変され、次いで、抗癌治療を達成するために、臨床上許容される手段を提供する。
CD8+であるTcmは、Wang et alに記載されるように本質的に単離される(J Immunology 35:689,2012)。簡潔には、白血球フェレーシスの当日に、PBMCをFicoll−Paqueによる密度勾配遠心分離により単離し、続いてPBS/EDTAで2回洗浄した。次いで、PBMCをPBS中で1回洗浄し、10%ウシ胎仔血清(FCS)を含有するX Vivo15培地に再懸濁し、300ccのトランスファーバッグに移し、室温(RT)で一晩3−Dローテーター上に保存した。翌日、臨床グレードの抗CD4(2.5mL)、抗CD14(1.25mL)、及び抗CD45RA(2.5mL)マイクロビーズ(Miltenyi Biotec)を含む300ccトランスファーバッグ中で、5×10 PBMCをインキュベートした10%FCSを含有するX Vivo15を、30分間RTでインキュベートした。CD4+、CD14+及びCD45RA+細胞は、製造業者の指示(Miltenyi Biotec)に従ってCliniMACS(商標)枯渇様式を用いて直ちに枯渇させた。遠心分離後、0.5%ヒト血清アルブミン(HSA)を含有するCliniMACS(商標)PBS/EDTA緩衝液(Miltenyi Biotec)に細胞の非標識陰性画分を再懸濁し、且つ、臨床グレードビオチン化DREG56 mAb(COHNMC CBG)で0.1mg/106細胞を室温で30分間インキュベートした。次いで、細胞を洗浄し、0.5%HSAを含有する100mLのCliniMACS(商標)PBS/EDTAの最終容量に再懸濁し、新しい300ccのトランスファーバッグに移した。1.25mLの抗ビオチンマイクロビーズ(Miltenyi Biotec)との30分間のインキュベーション後、PBMC(CD8+ TCM)のCD62L+画分をCliniMACS(商標)でのポジティブ選択により製造業者の説明書に従って精製し、且つ、10%FCSを含むX Vivo15に再懸濁した。
CD8+/CD4+であるTcmは、CD4+、CD14+及びCD45RA+選択をCD14+及びCD45RA+選択に改変することによって、上記プロセスの改変を用いて調製される。この方法は、CliniMACS(商標)デバイス上の2段階プロセスを使用して、まずCD14+及びCD45RA+細胞を枯渇させ、次いでCD62L+細胞を陽性選択する。この改変されたプラットフォームは、単一の白血球フェレーシスから50×10バルクTcmを生成する。
富化後、Tcm細胞を、完全なX−Vivo15プラス50IU/mLのIL−2及び0.5ng/mLのIL−15中に配合し、且つ、Teflon(登録商標)細胞培養バッグに移し、Dynal ClinEx(登録商標) Vivo CD3/CD28ビーズで刺激した。刺激後5日目まで、細胞を約3の感染多重度(multiplicity of infection,MOI)でCS1 CARをコードするレンチウイルスベクターで形質導入する。細胞増殖に必要とされる完全なX−Vivo15及びIL−2及び」IL−15サイトカインの添加により、培養物を最大42日間維持する(3×10〜2×10生存細胞/mL、及び培養の月曜日、水曜日及び金曜日ごとにサイトカイン補充の間の細胞密度を維持するため)。細胞は、典型的には、21日以内にこれらの条件下で約10細胞に拡大する。培養期間の終わりに、細胞を採取し、2回洗浄し、且つ、臨床グレードの凍結保存培地中で処方する。
T細胞注入の日(複数可)に、低温保存及び放出された生成物を解凍し、洗浄し、再注入のために調合する(formulated)。放出された細胞産物を含む凍結保存バイアルを液体窒素貯蔵から取り出し、解凍し、冷却し、且つ、PBS/2%ヒト血清アルブミン(HSA)洗浄緩衝液で洗浄する。遠心分離後、上清を除去し、且つ、細胞を保存料なし遊離生理食塩水(Preservative-Free Normal Saline,PFNS)/2%HSA輸液希釈液に再懸濁する。サンプルは品質管理テストのために削除される。
実施例4:CS1 CAR(CS1scFv−IgG4(HL−CH3)−CD28tm−CD28gg−Zeta−T2A−EGFRt)のアミノ酸配列
CS1scFv−IgG4(HL−CH3)−CD28tm−CD28gg−Zeta−T2A−EGFRtの完全アミノ酸配列を図2に示す。全配列(配列番号29)は、
22アミノ酸のGMCSFシグナルペプチド(配列番号26)、CS1 scFv配列(配列番号1);
IgG4ヒンジ配列(配列番号3;斜線で示すアミノ酸置換S〜Pを有する);
10アミノ酸のリンカー(配列番号2);
IgG4 CH3配列(配列番号12);
28アミノ酸のCD28膜貫通ドメイン配列(配列番号14);
CD28gg共刺激ドメイン配列(配列番号23;LL to GGアミノ酸の変化が強調表示されている);
3アミノ酸のGlyリンカー;
112アミノ酸のCD3ζ配列(配列番号21);
24アミノ酸のT2Aスキップ配列(配列番号27);及び
EGFRt配列(配列番号28);
を含む。
実施例5:CS1 CARの活性
図2に示すCARを発現する増殖したCS1 CAR T細胞の細胞傷害性を、51Cr標識MM細胞(MM.1S)との共培養後の4時間51Crリリースアッセイを用いて評価した。図3に示すように、操作されたCS1 CAR T細胞は、MM細胞の特異的かつ効率的な死滅を示し、非形質導入のモック(mock)T細胞は、MM細胞に対して細胞毒性を示さない。MM細胞と共培養した場合、図4に示すように、107a脱顆粒及びIFNガンマによって示されるように操作されたCS1 CAR Tcm媒介性強力エフェクター機能を有する。NSGマウスを有するMM腫瘍に養子移入されたとき、CS1特異的T細胞は、図5に示すように効率的な抗腫瘍活性を示した。
追加のCS1 CAR(図2及び図6〜10)を用いた別の研究では、2×10個のGFPffluc+MM.1S細胞を、−7日目にNSGマウスに脛骨内注射によって接種した。1×10のセントラルメモリーT細胞(Tcm)由来のCS1 CAR+ T細胞を0日目に腫瘍を有するマウスに静脈内注入した。同じドナーからT細胞又は非形質導入Tcmを受けなかったマウスは、ネガティブコントロールとして使用した。腫瘍シグナルは、生体光イメージングによってモニターした。複数のマウスからのフォントン(phonton)/秒の平均±SEMが示されている。この分析の結果を図12に示す。

Claims (79)

  1. キメラ抗原レセプターをコードする核酸分子であって、前記キメラ抗原レセプターが:
    CS1 scFv;任意のスペーサー領域;膜貫通ドメイン;共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、核酸分子。
  2. 前記キメラ抗原レセプターが、前記共シグナル伝達ドメインと前記CD3ζシグナル伝達ドメインとの間に位置する1〜15個のアミノ酸のリンカー配列をさらに含む、請求項1に記載の核酸分子。
  3. 前記共シグナル伝達ドメインが、CD28共シグナル伝達ドメイン及び4−IBB共シグナル伝達ドメインから選択される、請求項1に記載の核酸分子。
  4. 膜貫通ドメインがCD28膜貫通ドメイン及びCD4膜貫通ドメインから選択される、請求項1に記載の核酸分子。
  5. 前記CS1 scFvが、配列番号1のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  6. 前記リンカー配列が3〜10個の連続するGlyを含むか、又はそれからなる、請求項2に記載の核酸分子。
  7. 前記スペーサー領域が、IgG定常領域又はヒンジ領域の少なくとも10個の連続したアミノ酸を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  8. 前記IgGがIgG4である、請求項7に記載の核酸分子。
  9. 前記スペーサー領域がIgG4 CD3ドメインを含む、請求項1に記載の核酸分子。
  10. 前記スペーサー領域がIgG4 Fcドメイン又はその変異体を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  11. 前記スペーサー領域が4〜12個のアミノ酸を含むか、又はそれからなる、請求項1に記載の核酸分子。
  12. 前記スペーサー領域が、配列ESKYGPPCPPCPGGGSSGGGSG及び配列GGGSSGGGSGからなる群から選択される、請求項1に記載の核酸分子。
  13. 前記スペーサー領域が、
    a)IgG4 Fcドメイン;
    b)IgG4ヒンジ領域、リンカー配列、及びIgG4 CH3ドメイン;及び
    c)リンカー配列;
    からなる群から選択される、請求項1の核酸分子。
  14. スペーサー領域が、配列番号2〜12のいずれかのアミノ酸配列を含むスペーサー領域から選択される、請求項1に記載の核酸分子。
  15. 前記IgG4 Fcヒンジ領域が、配列番号3又は4のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  16. 前記CD28共シグナル伝達ドメインが、配列番号22又は23のアミノ酸配列を含む、請求項3に記載の核酸分子。
  17. 前記4−1BB共シグナル伝達ドメインが、配列番号24のアミノ酸配列を含む、請求項3に記載の核酸分子。
  18. 前記CD3ζシグナル伝達ドメインが、配列番号21のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  19. 前記CD28膜貫通ドメインが、配列番号14又は15を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  20. 前記CD4膜貫通ドメインが、配列番号16を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  21. 前記CD3ζシグナル伝達ドメインが、配列番号21のアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  22. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  23. 前記キメラ抗原レセプターが、前記CD28共シグナル伝達ドメインと前記CD3ζシグナル伝達ドメインとの間に位置するリンカーアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の核酸分子。
  24. 前記リンカーアミノ酸配列が、GlyGlyGlyである、請求項23に記載の核酸分子。
  25. 前記スペーサーが、IgG4ヒンジ領域、リンカー配列及びIgG4 CH3ドメインを含む、請求項1に記載の核酸分子。
  26. IgG4ヒンジ領域が配列番号6を含む、請求項22に記載の核酸分子。
  27. 前記リンカー配列が配列番号7を含む、請求項22に記載の核酸分子。
  28. IgG4 CH3ドメインが配列番号8を含む、請求項22に記載の核酸分子。
  29. 前記リンカー領域が配列番号25を含む、請求項22に記載の核酸分子。
  30. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号1のアミノ酸配列を含む、請求項22に記載の核酸分子。
  31. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号1と90%又は95%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  32. 前記キメラ抗原レセプターをコードする配列が、シグナル配列をコードする核酸配列の直前にある、請求項1に記載の核酸分子。
  33. 前記シグナル配列が配列番号4を含む、請求項32に記載の核酸分子。
  34. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;ヒンジ/リンカー領域;CD4膜貫通ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  35. 前記キメラ抗原レセプターが、4−1BBコシグナル伝達ドメインとCD3ζシグナリングドメインとの間に位置するリンカーアミノ酸配列を含む、請求項34に記載の核酸分子。
  36. 前記リンカーアミノ酸配列がGlyGlyGlyである、請求項35に記載の核酸分子。
  37. 前記ヒンジ/リンカー領域が、IgG4ヒンジ領域、リンカー配列及びIgG4 CH3ドメインを含む、請求項34に記載の核酸分子。
  38. IgG4ヒンジ領域が配列番号3又は4を含む、請求項34に記載の核酸分子。
  39. 前記スペーサー配列が配列番号2を含む、請求項34に記載の核酸分子。
  40. 前記スペーサーが、配列番号9〜12から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  41. 前記スペーサー領域が、配列番号2〜12から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  42. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号18のアミノ酸配列を含む、請求項34に記載の核酸分子。
  43. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号29〜46のいずれかと90%又は95%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  44. 前記キメラ抗原レセプターをコードする前記配列が、シグナル配列をコードする核酸配列の直前にある、請求項1に記載の核酸分子。
  45. 前記シグナル配列が配列番号26を含む、請求項44に記載の核酸分子。
  46. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD4膜貫通ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項1に記載の核酸分子。
  47. 前記キメラ抗原レセプターが、前記4−1BB共シグナル伝達ドメインと前記CD3ζシグナリングドメインとの間に位置するリンカーアミノ酸配列を含む、請求項46に記載の核酸分子。
  48. 前記リンカーアミノ酸配列がGlyGlyGlyである、請求項47に記載の核酸分子。
  49. 前記ヒンジ/リンカー領域が、IgG4ヒンジ−CH2−CH3領域を含む、請求項46に記載の核酸分子。
  50. 前記IgG4ヒンジ−CH2−CH3領域が配列番号__を含む、請求項46に記載の核酸分子。
  51. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号__のアミノ酸配列を含む、請求項46に記載の核酸分子。
  52. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号__と90%又は95%同一であるアミノ酸配列を含む、請求項46に記載の核酸分子。
  53. 前記キメラ抗原レセプターをコードする前記配列が、シグナル配列をコードする核酸配列の直前にある、請求項46に記載の核酸分子。
  54. 前記シグナル配列が配列番号26を含む、請求項53に記載の核酸分子。
  55. キメラ抗原レセプターをコードする発現カセットを含むベクターによって形質導入されたヒトT細胞の集団であって、キメラ抗原レセプターが:
    CS1 scFv;任意のスペーサー領域;膜貫通ドメイン共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、ヒトT細胞の集団。
  56. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  57. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD4膜貫通ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  58. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー、配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD4膜貫通ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  59. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー、配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  60. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー、配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD4膜貫通ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  61. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    スペーサー、配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  62. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号30、31、33、34、36、37、39、40、42、43、44及び45から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも90%又は95%が同一であるアミノ酸配列を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  63. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号30、31、33、34、36、37、39、40、42、43、44及び45から選択されるアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  64. 前記キメラ抗原レセプターが、配列番号30、31、33、34、36、37、39、40、42、43、44及び45、それぞれ5個のアミノ酸置換を有する、から選択されるアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を含む、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  65. 前記形質導入されたヒトT細胞の少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%又は80%がセントラルメモリーT細胞である、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  66. 前記形質導入されたセントラルメモリーT細胞の少なくとも10%又は20%がCD4+である、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  67. 前記形質導入されたセントラルメモリーT細胞の少なくとも10%又は20%がCD8+である、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  68. 前記セントラルメモリーT細胞の少なくとも10%がCD4+であり、且つ、少なくとも10%がCD8+である、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  69. 前記形質導入されたヒトT細胞の少なくとも80%がCD4+又はCD8+及びCD62L+である、請求項55に記載のヒトT細胞の集団。
  70. 請求項55〜69のいずれかに記載のヒトT細胞を含む医薬組成物を、それを必要とする患者に投与することを含む、癌を治療する方法。
  71. 前記ヒトT細胞の集団が前記患者に対して自己由来である、請求項70に記載の方法。
  72. 前記ヒトT細胞の集団が前記患者に対して同種異系である、請求項70に記載の方法。
  73. 前記形質導入されたヒトT細胞が、前記患者からT細胞を得ること、又は前記患者に対して同種異系のT細胞を得ること、前記得られたT細胞を処理してCD4+/CD8+に富む細胞の集団を単離すること、及び前記単離した細胞集団の少なくとも一部にキメラ抗原レセプターをコードする発現カセットを含むウイルスベクターを形質導入すること、
    を含み、ここで、キメラ抗原レセプターは、:
    CS1 scFv;スペーサー;膜貫通ドメイン共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項70に記載の方法。
  74. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項73に記載の方法。
  75. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD4膜貫通ドメイン;4−1BBコシグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項73に記載の方法。
  76. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;スペーサー;CD28ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項73に記載の方法。
  77. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項73に記載の方法。
  78. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    CS1 scFv;配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD4膜貫通ドメイン;4−1BB共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項73に記載の方法。
  79. 前記キメラ抗原レセプターが、:
    配列番号2〜5及び9〜12から選択されるアミノ酸配列を含むスペーサー;CD28膜貫通ドメイン;CD28共シグナル伝達ドメイン;及びCD3ζシグナル伝達ドメイン;
    を含む、請求項73に記載の方法。
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