JP2017525381A - Ｌ−リジン生産能が向上した微生物及びそれを用いたｌ−リジン生産方法 - Google Patents

Abstract

本発明は、新規な変異型ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ（ＳｉｇＡ）ポリペプチド、これをコードするポリヌクレオチド、前記ポリペプチドを含む微生物及び前記微生物を利用したＬ−リジンの生産方法に関する。

Description

本発明は、新規な変異型ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ（SigA）ポリペプチド、これをコードするポリヌクレオチド、前記ポリペプチドを含む微生物及び前記微生物を利用したＬ-リジンの生産方法に関する。

アミノ酸などの有用産物の大量生産のための菌株の開発のために、解糖経路（glycolysis）上の上位レベルで直接的または間接的に関与する遺伝的要因を見出して適切に利用すれば、より高い生産収率を有する菌株を開発することができる。代表的な技術としては、ＲＮＡポリメラーゼのリクルーティングタンパク質（recruiting protein）にランダムに突然変異を起こすことにより、細胞内のすべての遺伝子の発現を調節するｇＴＭＥ（global transcription machinery engineering）技術がある。一例として、マサチューセッツ工科大学（Massachusetts Institute of Technology）の研究グループは、ｇＴＭＥ技術を利用して大腸菌でチロシンの生産量を大幅に増加させるのに成功した（特許文献１）。

微生物の転写段階で用いられるＲＮＡポリメラーゼ（RNA polymerase）は、５つのサブユニットで構成された巨大分子であり、２つのアルファ因子（α）、ベータ（β）、ベータプライム（β’）及びオメガ因子（ω）で構成されており、完全酵素（holoenzyme）は、α_２ββ’ωで表示される。これら完全酵素と共にシグマ因子（σ）は、ＲＮＡポリメラーゼのプロモーター結合特異性を付与する転写の開始段階に必須の要素である。コリネバクテリウム属の菌株は、７種のシグマ因子（ＳｉｇＡ、ＳｉｇＢ、ＳｉｇＣ、ＳｉｇＤ、ＳｉｇＥ、ＳｉｇＨ、ＳｉｇＭ）を有しており、外部環境の変化に応じて特定の遺伝子グループの転写を調節する（非特許文献１）。特に、７種のシグマ因子のうち、ＳｉｇＡはほとんどのハウスキーピング遺伝子及びコア遺伝子を調節する主な調節因子であり、ＳｉｇＡにランダムに変異を与えて目的物質の生産性を向上させる研究が報告され（非特許文献２）、コリネバクテリウム属菌株を用いてＬ-リジン生産性を増加させた研究も報告されている（特許文献２）。

米国特許第８７３５１３２号明細書 国際公開特許第ＷＯ２００３−０５４１７９号公報 韓国登録特許第１０−０１５９８１２号公報 韓国登録特許第１０−０９２４０６５号公報 韓国登録特許第１０−００７３６１０号公報

Journal of Biotechnology 154. 2011.101-113 Metabolic Engineering 9. 2007. 258-267 Annu Rev Genet. 2003;37:3-29. Chmiel；Bioprozesstechnik 1 Einfuhrung indie Bioverfahrenstechnik（Gustav Fischer Verlag、Stuttgart、1991） Storhas；Bioreaktoren und periphere Einrichtungen（Vieweg Verlag、Braunschweig/Wiesbaden、1994） J. Biol. Chem. 1948. 176:367-388 Binder et al. Genome Biology 2012、 13:R40

本発明者らは、宿主細胞の成長を阻害することなく高い濃度のＬ−リジンを生産する微生物を開発すべく鋭意努力した結果、新規な変異型ＲＮＡポリメラーゼのシグマ因子Ａ（ＳｉｇＡ）ポリペプチドを開発し、Ｌ−リジン生産能を有するコリネバクテリウム属に導入することにより、Ｌ−リジンの生産能が向上した菌株を開発することができることを確認し、本発明を完成した。

本発明の目的は、配列番号２のアミノ酸配列からなるＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ活性を有する、ポリペプチドの一部のアミノ酸を置換した変異型ポリペプチドを提供することにある。

本発明の他の目的は、前記変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを提供することにある。

本発明のもう一つの目的は、前記ポリペプチドを含むように形質転換された微生物を提供することにある。

本発明のもう一つの目的は、前記微生物を培養して培養物を得る段階；及び前記培養物または微生物からＬ−リジンを回収する段階を含むＬ−リジンの生産方法を提供することにある。

本発明によりＬ−リジンの生産能力を上方調節することができる変異体ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａの変異型ポリペプチドを確認することができる。また、これに基づいて当該変異型ポリペプチドを発現する微生物は、Ｌ−リジンの生産収率が著しく優れるため、産業的な面で生産の便宜性と共に製造原価低減などの効果を期待することができる。

前記目的を達成するための一つの様態として、本発明は、新規なＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ活性を有する変異型ポリペプチドを提供する。

本発明において、用語「ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ（ＳｉｇＡ）」とは、ＲＮＡポリメラーゼと共に作用する転写開始因子としてシグマ因子（sigma factor）のいずれかに該当するタンパク質（ＳｉｇＡ）である。シグマ因子は、特定のプロモーターの上流に存在するｕｐｓｔｒｅａｍ ＤＮＡ（UP element）と様々の転写調節因子が相互作用して転写調節に関与する。特に、シグマ因子Ａ（ＳｉｇＡ）は、コア遺伝子のほとんどを調節する主な調節因子として知られている。前記ＳｉｇＡタンパク質に関する情報は、ＮＣＢＩ ＧｅｎＢａｎｋのような公知のデータベースから得ることができ、その例としてＡｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｕｍｂｅｒがＮＰ_６０１１１７のタンパク質があり得る。具体的には、ＳｉｇＡタンパク質は配列番号２のアミノ酸配列を含むことができ、本発明のＳｉｇＡと同様な活性を有する限り、これに限定されない。

本発明において、用語「変異型ポリペプチド」とは、野生型ポリペプチドのアミノ酸配列の一部または全体が置換されたものであり、本発明ではＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ（ＳｉｇＡ）活性を有するポリペプチドのアミノ酸配列の一部が置換されることにより、野生型（ｗｉｌｄ−ｔｙｐｅ）のアミノ酸配列と一部異なる配列を有するＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ（ＳｉｇＡ）活性を有するポリペプチドである。即ち、野生型であるＳｉｇＡポリペプチドではなく、Ｌ−リジン生産能の向上に寄与するＳｉｇＡ変異型ポリペプチドを提示するものである。

具体的には、前記変異型ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列からなるポリペプチドにおいて、下記位置のアミノ酸のうち、一つ以上のアミノ酸が他のアミノ酸で置換された、ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ活性を有する変異型ポリペプチドである。前記変異位置は、開始メチオニンを１番目のアミノ酸にし、そこから１３６番目のアミノ酸；２５４番目のアミノ酸；２６８番目のアミノ酸；２８１番目のアミノ酸；３８１番目のアミノ酸；４２９番目のアミノ酸；及び４４５番目〜４９５番目のアミノ酸であることができる。即ち、前記変異型ポリペプチドは、前記５７個の変異の位置（１３６番目、２５４番目、２６８番目、２８１番目、３８１番目、４２９番目、４４５−４９５番目）のうち、一つ以上の位置が他のアミノ酸で置換されたポリペプチドであることができる。

より具体的には、前記４４５番目〜４９５番目のアミノ酸のうち、４４７番目のアミノ酸；４５１番目のアミノ酸；４５５番目のアミノ酸；４７９番目のアミノ酸；４８３番目のアミノ酸；４８８番目のアミノ酸；及び４９１番目のアミノ酸からなるアミノ酸の中で、１種以上のアミノ酸が他のアミノ酸で置換されることができるが、これに限定されない。

具体的なアミノ酸の置換は、下記１３種のアミノ酸の置換のうち、１種以上が組み合わされたものであることができ、開始メチオニンから１３６番目のアミノ酸がグリシンで置換（Ｄ１３６Ｇ）；２５４番目のアミノ酸がアスパラギンで置換（Ｉ２５４Ｎ）；２６８番目のアミノ酸がセリンで置換（Ａ２６８Ｓ）；２８１番目のアミノ酸がセリンで置換（Ｔ２８１Ｓ）；３８１番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｌ３８１Ｒ）；４２９番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｑ４２９Ｒ）；４４７番目のアミノ酸がヒスチジンで置換（Ｌ４４７Ｈ）；４５１番目のアミノ酸がイソロイシンで置換（Ｌ４５１Ｉ）；４５５番目のアミノ酸がバリンで置換（Ｍ４５５Ｖ）；４７９番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｋ４７９Ｒ）；４８３番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｋ４８３Ｒ）；４８８番目のアミノ酸がトレオニンで置換（Ｓ４８８Ｔ）；及び４９１番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｑ４９１Ｒ）からなるものであることができる。

より具体的には、前記ポリペプチドは、配列番号２のアミノ酸配列からなるポリペプチドの開始メチオニンから１３６番目及び２８１番目のアミノ酸が、それぞれグリシン及びセリンで置換（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）；２５４番目のアミノ酸がアスパラギンで置換（Ｉ２５４Ｎ）；２６８番目のアミノ酸がセリンで置換（Ａ２６８Ｓ）；３８１番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｌ３８１Ｒ）；４２９番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｑ４２９Ｒ）；４４７番目のアミノ酸がヒスチジンで置換（Ｌ４４７Ｈ）；４５１番目及び４９１番目のアミノ酸がそれぞれイソロイシン及びアルギニンで置換（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）；４５５番目のアミノ酸がバリンで置換（Ｍ４５５Ｖ）；４７９番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｋ４７９Ｒ）；４８３番目のアミノ酸がアルギニンで置換（Ｋ４８３Ｒ）；４８８番目のアミノ酸がトレオニンで置換（Ｓ４８８Ｔ）；または前記１１種のアミノ酸の置換のうち、１種以上が組み合わされたものである変異型ポリペプチドであることができる。

本発明の一具現例によれば、前記変異型ポリペプチドは、配列番号１２〜２２のアミノ酸配列のいずれか一つのアミノ酸配列を有するポリペプチドであることができる。

本発明の変異型ポリペプチドは、前記配列番号１２〜２２で表されるアミノ酸配列だけでなく、前記配列と７０％以上、具体的には８０％以上、より具体的には９０％以上、さらに具体的には９９％以上の相同性を示すアミノ酸配列であり、野生型ＳｉｇＡタンパク質に比べてＬ−リジンの生産能の向上に寄与したタンパク質であれば制限なく含まれる。このような相同性を有する配列として、実質的に変異型ＳｉｇＡタンパク質と同一または相応する生物学的活性を有するアミノ酸配列であれば、一部の配列が欠失、変形、置換または付加されたアミノ酸配列を有する場合であっても、本発明の範囲に含まれることは自明である。

本発明において、用語「相同性」とは、タンパク質をコードする遺伝子のアミノ酸または塩基配列において、特定の比較領域で両配列を最大限に一致するように整列（ａｌｉｇｎ）させた後、配列間の塩基またはアミノ酸残基の同一な程度を意味する。相同性が十分に高い場合は、当該遺伝子の発現産物は同一または類似の活性を有することができる。前記配列同一性のパーセントは、公知となった配列比較プログラムを使用して決定することができ、一例として、ＢＬＡＳＴ（NCBI）、ＣＬＣ Ｍａｉｎ Ｗｏｒｋｂｅｎｃｈ（CLC bio）、ＭｅｇＡｌｉｇｎ^ＴＭ（DNASTAR Inc）などを挙げることができる。

本発明の他の一つの様態は、前記変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、または前記ポリヌクレオチドを含むベクターを含む。

本発明において、用語「ポリヌクレオチド」とは、ヌクレオチド単量体（monomer）が共有結合により長く鎖状につながったヌクレオチドの重合体（polymer）で、一定の長さ以上のＤＮＡまたはＲＮＡ鎖であり、より具体的には、前記変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド断片を意味する。

本発明において、ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ（SigA）のアミノ酸配列をコードする遺伝子はｒｐｏＤ遺伝子であり、具体的にはコリネバクテリウム・グルタミクム由来であり得る。遺伝暗号の縮退性（genetic code degeneracy）に起因し、同一のアミノ酸配列をコードする塩基配列及びその変異体も本発明に含まれ、具体的には配列番号１で表示されることができるが、これに限定されない。

また、変異型ポリヌクレオチドも遺伝暗号の縮退性（genetic code degeneracy）に起因し、同一のアミノ酸配列をコードする塩基配列及びその変異体も本発明に含まれる。具体的には、前記アミノ酸配列の１２〜２２のアミノ酸配列のいずれか一つのアミノ酸配列をコードする塩基配列及びその変異体が含まれることができるが、これに限定されない。

本発明のもう一つの様態として、本発明は前記変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む宿主細胞、及び前記変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクターで形質転換された微生物を提供する。具体的には、前記導入は、形質転換により行うことができるが、これに限定されない。

具体的にＳｉｇＡ変異型ポリペプチドを含む微生物は、野生型ＳｉｇＡポリペプチドを含む微生物に比べて宿主細胞の成長を阻害することなくＬ−リジンの生産能が向上するため、これら微生物からＬ−リジンを高収率で得ることができる。

本発明において、用語「ベクター」とは、宿主細胞に塩基のクローニング及び／または転移のための任意の媒介物を意味する。ベクターは、他のＤＮＡ断片が結合して、結合された断片の複製をもたらす複製単位（replicon）であり得る。「複製単位」とは、生体内でＤＮＡ複製の自己ユニットとして機能する、即ち、自らの調節により複製可能な任意の遺伝的単位（例えば、プラスミド、ファージ、コスミド、染色体、ウイルス）を意味する。前記「ベクター」とは、試験管内、生体外または生体内で宿主細胞に塩基を導入するためのウイルス及び非ウイルス媒介物を含み、また、ミニサークルＤＮＡを含むことができる。例えば、前記ベクターは、バクテリアＤＮＡ配列を有さないプラスミドであることができる。また、前記ベクターは、トランスポゾン（非特許文献３）、または人工染色体を含むことができる。具体的には、ｐＡＣＹＣ１７７、ｐＡＣＹＣ１８４、ｐＣＬ１９２０、ｐＥＣＣＧ１１７、ｐＵＣ１９、ｐＢＲ３２２、ｐＤＺ及びｐＭＷ１１８ベクターなどを使用することができ、これに限定されない。

本発明において、用語「形質転換」とは、遺伝子を宿主細胞内に導入して宿主細胞内で発現させるようにするものであり、形質転換された遺伝子は宿主細胞内で発現することができるものであれば、宿主細胞の染色体内挿入または染色体外に位置しているものであっても、制限なく含まれる。

前記遺伝子は、自体的に発現されるのに必要なすべての要素を含むポリヌクレオチド構造体である発現カセット（expression cassette）の形態で宿主細胞に導入することができる。前記発現カセットは、通常、前記遺伝子に動作可能に連結されているプロモーター、転写終結シグナル、リボソーム結合部位及び翻訳終結シグナルを含む。前記発現カセットは、自体的に複製が可能な発現ベクターの形態であることができる。また、前記遺伝子は、その自体またはポリヌクレオチド構造体の形態で宿主細胞に導入されて、宿主細胞において発現に必要な配列と作動可能に連結されているものであり得るが、これに限定されない。

前記宿主細胞または微生物は、変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むか、または変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクターで形質転換されて変異型ポリペプチドを発現する細胞または微生物であり、本発明の目的上、前記宿主細胞または微生物は、ＳｉｇＡ変異型ポリペプチドを含めてＬ−リジンを生産する微生物であれば、いずれのものでも可能である。具体的な例としては、エシェリキア（Escherichia）属、セラチア（Serratia）属、エルウイニア（Erwinia）属、エンテロバクテリア（Enterobacteria）属、サルモネラ（Salmonella）属、ストレプトマイセス（Streptomyces）属、シュードモナス（Pseudomonas）属、ブレビバクテリウム（Brevibacterium）属またはコリネバクテリウム（Corynebacterium）属などの微生物菌株が含まれることができ、具体的には、コリネバクテリウム属微生物であることができ、より具体的な例としては、コリネバクテリウム・グルタミクム（Corynebacterium glutamicum）であることができるが、これに限定されない。

本発明の一具体例では、Ｌ−リジンの生産能を有するコリネバクテリウム・グルタミクムの種々の菌株（ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ、ＫＦＣＣ１０７５０、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ及びＣＪ３Ｐ）に配列番号１２〜２２のアミノ酸配列のいずれか一つのアミノ酸配列を有する変異型ポリペプチドを導入して前記菌株のＬ−リジン生産能を比較した結果、前記変異型ポリペプチドを導入したすべての菌株で野生型ＳｉｇＡポリペプチドを含む菌株より多くのＬ−リジンを生産することを確認した（実施例７〜１０及び表８〜１１）。このような結果は、本発明の変異型ポリペプチドを含む微生物はＬ−リジンの生産能が向上した菌株であり、前記微生物を培養することにより、高収率のＬ−リジンを得ることができる経済的利益を示唆する。

ここで、本発明者らは前記Ｌ−リジン生産能が向上した菌株であるＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）をコリネバクテリウム・グルタミクム「ＣＡ０１−２２７７」と命名しており、２０１３年１１月２２日にブダペスト条約下の国際寄託機関である韓国微生物保存センター（ＫＣＣＭ）に寄託し、受託番号ＫＣＣＭ１１４７９Ｐが与えられた。

本発明のもう一つの様態として、本発明は、記述された微生物を培養する段階及び培養された微生物または培養培地からＬ−リジンを回収する段階を含む、Ｌ−リジンを生産する方法を提供する。

本発明において、用語「培養」とは、前記微生物を適当に人工的に調節した環境条件で生育させることを意味する。本発明の培養過程は、当業界において公知の適当な培地及び培養条件により行うことができる。具体的な培養温度、培養時間及び培地のｐＨなどの条件は、当業者の一般的な知識または従来の公知となった方法により行うことができ、これにより適切に調節することができる。具体的には、これら公知の培養方法は、非特許文献４及び非特許文献５に詳しく記述されている。また、培養方法は回分式培養（batch culture）、連続式培養（cintinuous culture）及び流加式培養（fed-batch culture）が含まれ、具体的には、バッチ工程または注入バッチまたは反復注入バッチ工程（fed batch or repeated fed batch process）で連続式に培養することができるが、これらに限定されるものではない。

培養に使用される培地は、適切な方式で、特定の菌株の要件を満たさなければならず、前記培地で使用することができる炭素源としては、グルコース、スクロース、ラクトース、フルクトース、マルトース、澱粉、セルロースのような糖及び炭水化物、大豆油、ひまわり油、ヒマシ油、ココナッツ油などのようなオイル及び脂肪、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸のような脂肪酸、グリセロール、エタノールのようなアルコール、酢酸のような有機酸などが含まれることができる。これら物質は、単独または混合物として使用することができ、これに限定されない。使用することができる窒素源としては、ペプトン、酵母抽出物、肉汁、麦芽抽出物、トウモロコシ浸漬液、大豆、小麦及び尿素または無機化合物、例えば、硫酸アンモニウム、塩化アンモニウム、リン酸アンモニウム、炭酸アンモニウム及び硝酸アンモニウムなどが含まれることができ、窒素源も、単独または混合物として使用することができ、これに限定されない。使用することができるリン源としては、リン酸二水素カリウムまたはリン酸水素二カリウムまたは相応するナトリウム−含有塩などが含まれることができる。また、培養培地は、成長に必要な硫酸マグネシウムまたは硫酸鉄のような金属塩を含有することができる。最後に、前記物質に加えて、アミノ酸及びビタミンのような必須成長物質が使用されることができる。また、培養培地で適切な前駆体が使用されることができる。前記原料は、培養過程で培養物に適切な方法により回分式または連続式で添加されることができるが、これに限定されない。

また、培養中に水酸化アンモニウム、水酸化カリウム、アンモニア、リン酸及び硫酸のような化合物を培養物に適切な方式で添加し、培養物のｐＨを調整することができる。培養中には脂肪酸ポリグリコールエステルのような消泡剤を使用して気泡の生成を抑制することができる。また、培養物の好気状態を維持するために、培養物内に酸素または酸素含有気体を注入したり、嫌気及び微好気状態を維持するために気体の注入なしで、あるいは窒素、水素または二酸化炭素ガスを注入することができる。培養物の温度は、通常２７℃〜３７℃、具体的には、３０℃〜３５℃である。培養期間は、所望の有用物質の生成量が得られるまで継続することができ、具体的には１０〜１００時間であることができる。Ｌ−リジンは、培養培地中に排出されたり、微生物中に含まれていることができる。

また、本発明のＬ−リジンを生産する方法には、培養された微生物または培養培地からＬ−リジンを回収する方法は、当業界に広く知られている。前記Ｌ−リジン回収方法には、濾過、陰イオン交換クロマトグラフィー、結晶化及びＨＰＬＣなどが使用されることができるが、これら例に限定されるものではない。

以下、本発明を下記例でより具体的に説明する。しかし、これら例は本発明の理解を助けるためのものであり、これらにより本発明が限定されるものではない。

実施例１：人工突然変異法を用いたＳｉｇＡ変異型ポリペプチドの確保
本実施例では、変異型ＳｉｇＡを獲得するために、下記方法で染色体内の１次交差挿入用ベクターのライブラリを作製した。コリネバクテリウムＳｉｇＡ（配列番号２）をコードするｒｐｏＤ遺伝子（配列番号１）を対象に、Ｅｒｒｏｒ−ｐｒｏｎｅ ＰＣＲ法を行い、塩基置換変異がランダムに導入されたｒｐｏＤ遺伝子変異体の断片（1497bp）を獲得した。前記Ｅｒｒｏｒ−ｐｒｏｎｅ ＰＣＲは、ＧｅｎｅｍｏｒｐｈＩＩ Ｒａｎｄｏｍ Ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ Ｋｉｔ（Stratagene）を使用して行い、コリネバクテリウム・グルタミクムＡＴＣＣ１３０３２のゲノムＤＮＡを鋳型としてプライマー１（配列番号３）及びプライマー２（配列番号４）を使用した。増幅された遺伝子断片内に１ｋｂ当り０〜４．５個の変異が導入されるようにし、ＰＣＲ条件は、変性９６℃、３０秒；アニーリング５３℃、３０秒；及び重合反応７２℃、２分を３０回繰り返した。

前記増幅した遺伝子断片をｐＣＲ２．１−ＴＯＰＯ ＴＡ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｋｉｔ（Invitrogen）を用いてｐＣＲ２．１−ＴＯＰＯベクター（以下、「ｐＣＲ２．１」）に連結し、大腸菌ＤＨ５αで形質転換してカナマイシン（２５ｍｇ／ｌ）が含まれたＬＢ固体培地に塗抹した。形質転換されたコロニーの２０種を選別した後、プラスミドを獲得して塩基配列を分析した結果、１．５ ｍｕｔａｔｉｏｎｓ／ｋｂの頻度で互いに異なる位置に変異が導入されたことを確認した。約２０，０００個の形質転換された大腸菌コロニーを取ってプラスミドを抽出し、これをｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）ライブラリと命名した。

その後、対照群として使用するための野生型のｒｐｏＤ遺伝子を有するプラスミドを作製した。プライマー１（配列番号３）及びプライマー２（配列番号４）を用いてコリネバクテリウム・グルタミクムＡＴＣＣ１３０３２のゲノムＤＮＡを鋳型とし、前記のような条件でＰＣＲした。ポリメラーゼはＰｆｕＵｌｔｒａ^ＴＭ高−信頼ＤＮＡポリメラーゼ（Stratagene）を使用し、それにより製作されたプラスミドをｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）と命名した。

実施例２：Ｌ−リジン生産能が増加したＳｉｇＡ変異株ライブラリ製作
ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ（特許文献３）菌株を親菌株にして、前記製作されたｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）ライブラリを相同染色体組換えにより形質転換し、カナマイシン（２５ｍｇ／ｌ）及び下記のような成分が含まれた複合平板培地に塗抹して、約２５，０００個のコロニーを確保した。これをＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）−１〜ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）−２５０００と命名した。また、前記製作されたｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）ベクターをＫＣＣＭ１１０１６Ｐ菌株に形質転換して対照群菌株を製作し、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）と命名した。

前記確保した形質転換体は、染色体上に２コピーのｒｐｏＤ 遺伝子を有することになるが、ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）ライブラリ及びｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）ベクターは、プロモーターを有していないｒｐｏＤ遺伝子断片が挿入されているため、菌株の染色体内へ相同組換えにより挿入された場合、２コピーのｒｐｏＤ遺伝子のうち１コピーのみが発現され、変異型または野生型のＳｉｇＡタンパク質を発現させることができる。

＜複合平板培地（ｐＨ７．０）＞
グルコース１０ｇ、ペプトン１０ｇ、牛肉抽出物５ｇ、酵母抽出物５ｇ、ブレインハートインフュージョン１８．５ｇ、ＮａＣｌ ２．５ｇ、尿素２ｇ、ソルビトール９１ｇ、寒天２０ｇ（蒸留水１リットル基準）

実施例３：Ｌ−リジン生産能が増加したＳｉｇＡ変異株ライブラリスクリーニング
前記実施例２で確保された約２５，０００個のコロニーをそれぞれ下記のような成分が含まれた３００μｌの選別培地に接種し、９６−ディープウェルプレートで３２℃、１０００ｒｐｍで約２４時間培養した。培養中に生産されたＬ−リジンの生産量を分析するためにニンヒドリン方法を用いた（非特許文献６）。培養が完了した後、培養上層液１０μｌとニンヒドリン反応溶液１９０μｌ（６３％のグリセロール、２７％のニンヒドリン溶液（７．１ｇ／Ｌ ｉｎ ０．５Ｍ ｃｉｔｒａｔｅ ｂｕｆｆｅｒ ｐＨ５．５））とを６５℃で３０分間反応させた。その後、５７０ｎｍの波長で分光光度計を用いて吸光度を測定して、対照群であるＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）菌株の吸光度と比較し、１０％以上増加した吸光度を示す約９３５個の変異菌株のコロニーを選別した。その他のコロニーは対照群に比べて類似または減少した吸光度を示した。

＜選別培地（ｐＨ８．０）＞
グルコース１０ｇ、硫酸アンモニウム ５．５ｇ、ＭｇＳＯ_４・７Ｈ_２Ｏ １．２ｇ、ＫＨ_２ＰＯ_４ ０．８ｇ、Ｋ_２ＨＰＯ_４ １６．４ｇ、ビオチン１００μｇ、チアミンＨＣｌ１０００μｇ、カルシウム−パントテン酸２０００μｇ、ニコチン酸アミド２０００μｇ（蒸留水１リットル基準）

前記で選別された９３５種の菌株を対象にして前記方法を繰り返し行い、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ＰＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）菌株に比べてＬ−リジン生産能が１５％以上向上した変異菌株の中から上位２３１種を選別した。

実施例４：ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１− ｒｐｏＤ（ｍｔ）Ｌ−リジン生産能の分析
前記実施例３で選別した２３１種の菌株のＬ−リジン生産能を以下のような方法で培養して分析した。

下記成分が含まれた種培地２５ｍｌを含有する２５０ｍｌのコーナー−バッフルフラスコに各菌株を接種して、３０℃で２０時間、２００ｒｐｍで振とう培養した。その後、下記成分が含まれた生産培地２４ｍｌを含有する２５０ｍｌのコーナー−バッフルフラスコに１ｍｌの種培養液を接種して、３０℃で７２時間、２００ｒｐｍで振とう培養した。ＨＰＬＣ（高性能液体クロマトグラフィー）を用いてＬ−リジンの濃度を分析した。

＜種培地（ｐＨ７．０）＞
グルコース２０ｇ、ペプトン１０ｇ、酵母抽出物５ｇ、尿素１．５ｇ、ＫＨ_２ＰＯ_４ ４ｇ、Ｋ_２ＨＰＯ_４ ８ｇ、ＭｇＳＯ_４・７Ｈ_２Ｏ ０．５ｇ、ビオチン１００μｇ、チアミンＨＣｌ １０００μｇ、カルシウム−パントテン酸２０００μｇ、ニコチン酸アミド２０００μｇ（蒸留水１リットル基準）

＜生産培地（ｐＨ７．０）＞
グルコース１００ｇ、（ＮＨ_４）_２ＳＯ_４ ４０ｇ、大豆タンパク質２．５ｇ、トウモロコシ浸漬固形分（Corn Steep Solids）５ｇ、尿素３ｇ、ＫＨ_２ＰＯ_４ １ｇ、ＭｇＳＯ_４・７Ｈ_２Ｏ ０．５ｇ、ビオチン１００μｇ、チアミン塩酸塩１０００μｇ、カルシウム−パントテン酸２０００μｇ、ニコチン酸アミド３０００μｇ、ＣａＣＯ_３ ３０ｇ（蒸留水１リットル基準）。

前記で選別された２３１種の変異菌株のうち、対照群に比べてＬ−リジン濃度が再現性のあるように増加した１７種の菌株を選別して前記培養及び分析を繰り返し、分析されたＬ−リジンの濃度は、下記表２の通りである。

前記選別された１７種の菌株のＬ−リジン濃度の分析結果、１７種の選別株の中、２種（ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）−６５８９、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ｍｔ）−１８９０４）を除外した１５種の選別株のＬ−リジン生産能が対照群ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ／ｐＣＲ２．１−ｒｐｏＤ（ＷＴ）菌株に比べて最大２０％増加することを確認した。

実施例５：ＳｉｇＡ人工突然変異ライブラリ選別株のｒｐｏＤ遺伝子変異の確認
前記実施例４で選別した１７種のうち、対照群に比べてＬ−リジン生産能が増加した１５種の菌株のＳｉｇＡに導入された変異を確認するために、ｒｐｏＤ変異体の塩基配列を分析した。塩基配列を決定するためにプライマー１（配列番号３）及びプライマー３（配列番号５）を使用してＰＣＲを行った。

確保した１５種の菌株のそれぞれの変異型ｒｐｏＤ遺伝子断片の塩基配列分析を通じて、アメリカ国立衛生研究所の遺伝子銀行（NIH GenBank）を根拠に変異型ｒｐｏＤ遺伝子の塩基配列を確認し、変異型ＳｉｇＡのアミノ酸配列を確認した。選別した１５種の菌株の変異型ＳｉｇＡアミノ酸配列の分析結果は下記表４の通りである。

その結果、少なくは１つのアミノ酸から多くは４つのアミノ酸が置換されたことを確認した。前記表４の表記において数字はＳｉｇＡのアミノ酸番号を意味し、数字の前のアルファベットは置換前のアミノ酸を、数字の後のアルファベットは置換されたアミノ酸を意味する。

実施例６：高濃度Ｌ−リジン生産株のためのｒｐｏＤ変異染色体導入用ベクター製作
前記実施例４で確認されたＳｉｇＡ変異を適用した効果を確認するために、これを染色体上に導入することができるベクターを作製した。

報告された塩基配列に基づいて、５’末端にＥｃｏＲＩ制限酵素部位を挿入したプライマー４（配列番号６）及び３’末端にＳａｌＩ制限酵素部位を挿入したプライマー５（配列番号７）を合成した。このプライマー対を用いて、前記選別された１５種の染色体をそれぞれ鋳型としてＰＣＲを行い、１５種の変異型ｒｐｏＤ（ｍｔ）遺伝子断片を増幅した。ＰＣＲ条件は、９４℃で５分間変性した後、９４℃で３０秒の変性、５６℃で３０秒のアニーリング、７２℃で２分間の重合を３０回繰り返した後、７２℃で７分間重合反応を行った。

ＰＣＲで増幅した１５種の遺伝子断片を制限酵素ＥｃｏＲＩ及びＳａｌＩで処理し、それぞれのＤＮＡ切片を獲得した後、これを制限酵素ＥｃｏＲＩ及びＳａｌＩ末端を有する染色体導入用ｐＤＺベクター（特許文献４）に連結した後、大腸菌ＤＨ５αに形質転換して、カナマイシン（２５ｍｇ／ｌ）が含まれたＬＢ固体培地に塗抹した。ＰＣＲを用いて目的の遺伝子が挿入されたベクターで形質転換されたコロニーを選別した。その後、一般的に知られているプラスミド抽出法でプラスミドを獲得し、このプラスミドのＳｉｇＡに挿入された変異に応じて、それぞれｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｌ３８１Ｒ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｍ２３０Ｔ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｍ４５５Ｖ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｓ４８８Ｔ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｒ２７９Ｌ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｉ２５４Ｎ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ａ２６８Ｓ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｑ４２９Ｒ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｋ９０Ｅ、Ｋ１０５Ｙ、Ｄ２５０Ｇ、Ｉ２５４Ｌ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｋ４８３Ｒ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｋ４７９Ｒ）、ｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ｄ２３８Ｖ、Ｎ２６３Ｓ、Ｅ３５８Ｄ）と命名した。また、前記変異体に対する他の対照群としてＬ−リジン生産性の増加に効果があると既に報告された（特許文献２）ＳｉｇＡ変異Ａ４１４Ｖを染色体上に挿入するためのベクターを作製するためにプライマー６〜９（配列番号８〜１１）を作製した。コリネバクテリウム・グルタミクムＡＴＣＣ１３０３２のゲノムＤＮＡを鋳型として、プライマー６とプライマー９対及びプライマー７とプライマー８対でそれぞれＰＣＲを行った。ＰＣＲ条件は、９４℃で５分間変性した後、９４℃で３０秒の変性、５６℃で３０秒のアニーリング、７２℃で１分間の重合を３０回繰り返した後、７２℃で７分間重合反応を行った。

その結果、約５００ｂｐの遺伝子断片２つを獲得し、増幅された産物は、Ｉｎｆｕｓｉｏｎ ｃｌｏｎｉｎｇ ｋｉｔ（Invitrogen）を使用してｐＤＺベクターに接合し、製作されたベクターをｐＤＺ−ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）と命名した。

実施例７：高濃度Ｌ−リジン生産株のためにＳｉｇＡ変異型ポリペプチドが導入されたＫＣＣＭ１１０１６Ｐ菌株の製作及びＬ−リジン生産能の比較
前記実施例６で製作した新規変異の導入ベクター１５種及び既に報告された変異の導入ベクター１種を２段階の相同染色体組換えによりＬ−リジン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミクムＫＣＣＭ１１０１６Ｐに形質転換した。その後、染色体上のＳｉｇＡ変異が導入された菌株を塩基配列の分析により選別し、前記ＳｉｇＡ変異が導入された菌株をＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ３８１Ｒ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｍ２３０Ｔ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｍ４５５Ｖ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｓ４８８Ｔ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｒ２７９Ｌ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｉ２５４Ｎ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ２６８Ｓ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｑ４２９Ｒ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ９０Ｅ、Ｋ１０５Ｙ、Ｄ２５０Ｇ、Ｉ２５４Ｌ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ４８３Ｒ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ４７９Ｒ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｄ２３８Ｖ、Ｎ２６３Ｓ、Ｅ３５８Ｄ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）と命名した。

前記実施例４と同様な方法で培養して、そこからＬ−リジンの濃度を分析し、その結果は下記表７の通りである。

その結果、２種の新規変異導入株（ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｍ２３０Ｔ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｒ２７９Ｌ））は、親菌株に比べ同等のＬ−リジン生産能を示し、他の２種の新規変異導入株（ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ９０Ｅ、Ｋ１０５Ｙ、Ｄ２５０Ｇ、Ｉ２５４Ｌ）、ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｄ２３８Ｖ、Ｎ２６３Ｓ、Ｅ３５８Ｄ））は成長速度が著しく遅くなり、Ｌ−リジン生産量が大幅に減少した。しかし、残りの新規変異株１１種は親菌株に比べＬ−リジン生産能が最大１９％増加し、既に報告した変異（ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ））導入株ＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）に比べてもＬ−リジン生産能が１６％増加したことを確認した。これに対し、本発明者らは、前記Ｌ−リジン生産能が向上した菌株であるＫＣＣＭ１１０１６Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）をコリネバクテリウム・グルタミクム「ＣＡ０１−２２７７」と命名し、２０１３年１１月２２日付でブダペスト条約下の国際寄託機関である韓国微生物保存センター（ＫＣＣＭ）に寄託し、受託番号ＫＣＣＭ１１４７９Ｐが与えられた。

このような結果は、新規な１１種のＳｉｇＡ変異型ポリペプチドがＬ−リジン生産能に優れることを示唆する。

実施例８：高濃度Ｌ−リジン生産株のためにＳｉｇＡ変異型ポリペプチドが導入されたＫＦＣＣ１０７５０菌株製作及びＬ−リジン生産能の比較
コリネバクテリウム・グルタミクムに属する他の菌株において、前記実施例７で選別したＳｉｇＡ変異１１種の導入効果を確認するために、前記実施例７と同様の方法でＬ−リジン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミクムＫＦＣＣ１０７５０（ＫＣＣＭ１１３４７Ｐ、特許文献５）に１１種のＳｉｇＡ変異がそれぞれ導入された菌株を製作して、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｌ３８１Ｒ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｍ４５５Ｖ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｓ４８８Ｔ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｉ２５４Ｎ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ａ２６８Ｓ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｑ４２９Ｒ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｋ４８３Ｒ）、ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ｋ４７９Ｒ）と命名した。また、既に報告した変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）を導入した菌株も製作し、これをＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）と命名した。

前記実施例４と同様な方法で培養して、そこからＬ−リジンの濃度を分析し、その結果は下記表８の通りである。

その結果、新規変異導入株１１種は、親菌株に比べてＬ−リジン生産能が最大１７％増加し、既に報告された変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）導入株ＫＦＣＣ１０７５０：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）に比べてもＬ−リジン生産能が約１４％増加したことを確認した。

実施例９：高濃度Ｌ−リジン生産株のためにＳｉｇＡ変異型ポリペプチドが導入されたＫＣＣＭ１０７７０Ｐ菌株製作及びＬ−リジン生産能の比較
コリネバクテリウム・グルタミクムに属する他の菌株において、前記実施例７で選別したＳｉｇＡ変異１１種の効果を確認するために、前記実施例７と同様の方法でＬ−リジン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミクムＫＣＣＭ１０７７０Ｐ（特許文献４）にＳｉｇＡ変異が導入された菌株を製作し、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ３８１Ｒ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｍ４５５Ｖ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｓ４８８Ｔ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｉ２５４Ｎ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ２６８Ｓ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｑ４２９Ｒ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ４８３Ｒ）、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ４７９Ｒ）と命名した。また、既に報告した変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）を導入した菌株も製作し、ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）と命名した。

前記実施例４と同様な方法で培養して、そこからＬ−リジンの濃度を分析し、その結果は下記表９の通りである。

その結果、新規変異導入株１１種は親菌株に比べＬ−リジン生産能が最大２０％増加し、既に報告した変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）導入株ＫＣＣＭ１０７７０Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）に比べてもＬ−リジン生産能は約１６％増加したことを確認した。

実施例１０：高濃度Ｌ−リジン生産株のために、ＳｉｇＡ変異型ポリペプチドが導入されたＣＪ３Ｐ菌株製作及びＬ−リジン生産能の比較
コリネバクテリウム・グルタミクムに属する他の菌株における効果も確認するために、前記実施例７と同様の方法でＬ−リジン生産菌株であるコリネバクテリウム・グルタミクムＣＪ３Ｐ（非特許文献７）にＳｉｇＡ変異が導入された菌株を製作し、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ３８１Ｒ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｍ４５５Ｖ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｓ４８８Ｔ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｉ２５４Ｎ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ２６８Ｓ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｑ４２９Ｒ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ４８３Ｒ）、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ｋ４７９Ｒ）と命名した。また、既に報告した変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）を導入した菌株も製作し、ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）と命名した。ＣＪ３Ｐ菌株は、公知となった技術に基づいて野生株に３種の変異を導入してＬ−リジン生産能を有するようになったコリネバクテリウム・グルタミクム菌株である。

前記実施例４と同様な方法で培養し、そこからＬ−リジンの濃度を分析し、その結果は下記表１０の通りである。

その結果、新規変異導入株１１種は親菌株に比べてＬ−リジン生産能が最大２０％増加し、既に報告した変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）導入株ＣＪ３Ｐ：：ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）に比べてもＬ−リジン生産能は約１５％増加したことを確認した。

前記結果を総合すると、本発明において新規に確保した１１種のＳｉｇＡ活性を有する変異型ポリペプチド（ＳｉｇＡ（Ｄ１３６Ｇ、Ｔ２８１Ｓ）、ＳｉｇＡ（Ｌ３８１Ｒ）、ＳｉｇＡ（Ｍ４５５Ｖ）、ＳｉｇＡ（Ｓ４８８Ｔ）、ＳｉｇＡ（Ｉ２５４Ｎ）、ＳｉｇＡ（Ａ２６８Ｓ）、ＳｉｇＡ（Ｌ４５１Ｉ、Ｑ４９１Ｒ）、ＳｉｇＡ（Ｑ４２９Ｒ）、ＳｉｇＡ（Ｌ４４７Ｈ）、ＳｉｇＡ（Ｋ４８３Ｒ）、ＳｉｇＡ（Ｋ４７９Ｒ））が、多様なコリネバクテリウム属微生物においてそれぞれＬ−リジン生産能の増加に優れた効果があり、これは既に報告した変異ＳｉｇＡ（Ａ４１４Ｖ）よりＬ−リジン生産能の増大効果が優れることを示唆する。

以上の説明から、本発明が属する技術分野の当業者であれば、本発明がその技術的思想や必須の特徴を変更することなく、他の具体的な形態で実施されることがあることを理解できるだろう。これに関連し、以上で記述した例はすべての面で例示的なものであり、限定的なものでないことを理解すべきである。本発明の範囲は前記詳細な説明よりは、後述する特許請求の範囲の意味及び範囲、そしてその等価概念から導かれるあらゆる変更または変形された形態が本発明の範囲に含まれるものと解釈すべきである。

Claims (11)

1. 配列番号２のアミノ酸配列からなるポリペプチドにおいて下記位置のアミノ酸のうち、一つ以上のアミノ酸が他のアミノ酸で置換された、ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ活性を有する変異型ポリペプチド:
   開始メチオニンを１番目のアミノ酸にして、そこから１３６番目のアミノ酸；２５４番目のアミノ酸；２６８番目のアミノ酸；２８１番目のアミノ酸；３８１番目のアミノ酸；４２９番目のアミノ酸；及び４４５番目〜４９５番目のアミノ酸。
2. 前記アミノ酸の置換が、１３６番目のアミノ酸；２５４番目のアミノ酸；２６８番目のアミノ酸；２８１番目のアミノ酸；３８１番目のアミノ酸；４２９番目のアミノ酸；４４７番目のアミノ酸；４５１番目のアミノ酸；４５５番目のアミノ酸；４７９番目のアミノ酸；４８３番目のアミノ酸；４８８番目のアミノ酸；及び４９１番目のアミノ酸からなるアミノ酸のうち、１種以上のアミノ酸が他のアミノ酸で置換された、請求項１に記載の変異型ポリペプチド。
3. 下記アミノ酸の置換のうち、１種以上が組み合わされた、請求項１に記載の変異型ポリペプチド:
   １３６番目のアミノ酸がグリシンで置換；２５４番目のアミノ酸がアスパラギンで置換；２６８番目のアミノ酸がセリンで置換；２８１番目のアミノ酸がセリンで置換；３８１番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４２９番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４４７番目のアミノ酸がヒスチジンで置換；４５１番目のアミノ酸がイソロイシンで置換；４５５番目のアミノ酸がバリンで置換；４７９番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４８３番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４８８番目のアミノ酸がトレオニンで置換；及び４９１番目のアミノ酸がアルギニンで置換。
4. 前記変異型ポリペプチドが、配列番号１２〜２２のアミノ酸配列のいずれか一つのアミノ酸配列を有するものである、請求項１に記載の変異型ポリペプチド。
5. 請求項１に記載の変異型ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
6. 請求項５に記載のポリヌクレオチドを含む宿主細胞。
7. 配列番号２のアミノ酸配列からなるポリペプチドにおいて下記位置のアミノ酸のうち、一つ以上のアミノ酸が他のアミノ酸で置換された、ＲＮＡポリメラーゼシグマ因子Ａ活性を有する変異型ポリペプチドを含むように形質転換されたＬ−リジン生産能が向上したコリネバクテリウム属微生物:
   開始メチオニンを１番目のアミノ酸にして、そこから１３６番目のアミノ酸；２５４番目のアミノ酸；２６８番目のアミノ酸；２８１番目のアミノ酸；３８１番目のアミノ酸；４２９番目のアミノ酸；及び４４５番目〜４９５番目のアミノ酸。
8. 前記アミノ酸の置換が、１３６番目のアミノ酸；２５４番目のアミノ酸；２６８番目のアミノ酸；２８１番目のアミノ酸；３８１番目のアミノ酸；４２９番目のアミノ酸；４４７番目のアミノ酸；４５１番目のアミノ酸；４５５番目のアミノ酸；４７９番目のアミノ酸；４８３番目のアミノ酸；４８８番目のアミノ酸；及び４９１番目のアミノ酸からなるアミノ酸のうち、１種以上のアミノ酸が他のアミノ酸で置換された、請求項７に記載のＬ−リジン生産能が向上したコリネバクテリウム属微生物。
9. 下記アミノ酸の置換のうち、１種以上が組み合わされた、請求項７に記載のＬ−リジン生産能が向上したコリネバクテリウム属微生物:
   １３６番目のアミノ酸がグリシンで置換；２５４番目のアミノ酸がアスパラギンで置換；２６８番目のアミノ酸がセリンで置換；２８１番目のアミノ酸がセリンで置換；３８１番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４２９番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４４７番目のアミノ酸がヒスチジンで置換；４５１番目のアミノ酸がイソロイシンで置換；４５５番目のアミノ酸がバリンで置換；４７９番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４８３番目のアミノ酸がアルギニンで置換；４８８番目のアミノ酸がトレオニンで置換；及び４９１番目のアミノ酸がアルギニンで置換。
10. 前記微生物が、コリネバクテリウム・グルタミクム（Corynebacterium glutamicum）である、請求項７に記載のＬ−リジン生産能が向上したコリネバクテリウム属微生物。
11. 請求項７〜１０のいずれか一項による微生物を培養する段階；及び前記培養された微生物または培養培地からＬ−リジンを回収する段階を含む、Ｌ−リジンを生産する方法。