JP2017522015A5 - - Google Patents
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Claims (8)
- (a)配列番号2を含むフォワードプライマー、配列番号6を含むリバースプライマー、配列番号22を含むプローブ、配列番号27を含むプローブ、配列番号30を含むプローブ、及び配列番号52を含むペプチド核酸オリゴマー；
(b)配列番号2を含むフォワードプライマー、配列番号6を含むリバースプライマー、配列番号13を含むプローブ、配列番号16を含むプローブ、配列番号20を含むプローブ、及び配列番号52を含むペプチド核酸オリゴマー；及び／又は
(c)配列番号2を含む第1フォワードプライマー、配列番号7を含む第2フォワードプライマー、配列番号6を含む第1リバースプライマー、配列番号11を含む第2リバースプライマー、それぞれが配列番号31、配列番号34、配列番号38、及び配列番号40を含む4プローブ、配列番号52を含む第1ペプチド核酸オリゴマー、及び配列番号56を含む第2ペプチド核酸オリゴマー
から成る、プライマー及びプローブのセット。 - 前記1以上のプローブのそれぞれが、検出可能な標識及びクエンチャー部分を含む、請求項1に記載のプライマー及びプローブのセット。
- 前記検出可能な標識がFAM、NED、Cy5、及びVICから選択される蛍光標識である、請求項2に記載のプライマー及びプローブのセット。
- (a)配列番号43、配列番号44、又は配列番号45に記載されたヌクレオチド配列を含むフォワードプライマー;
(b)配列番号46、配列番号47、又は配列番号48に記載されたヌクレオチド配列を含むリバースプライマー;並びに
(c)配列番号49、配列番号50又は配列番号51に記載されたヌクレオチド配列を含むプローブ
を含む内部コントロールセットを更に含む、請求項1〜3のいずれか1項に記載のプライマー及びプローブのセット。 - v-Ki-ras2カーステン・ラット肉腫ウイルスがん遺伝子ホモログ(KRAS)中における1以上の1塩基多型(SNP)の有無を確認する方法であって、該方法が、
(a)(i)被験体から取得された試料（該試料はKRAS標的配列を含有すると疑われる）及び
(ii)請求項1〜4のいずれか1項に記載のプライマー及びプローブのセット
を含む反応混合物を形成すること;
(b)該反応混合物を1以上のアンプリコンの形成に十分な条件に供すること;及び、
(c)該1以上のアンプリコンを検出すること
を含む、方法。 - 前記反応混合物を形成することが、3反応混合物を形成することを含み、各反応混合物が、前記被験体から取得された前記試料並びに請求項1〜4のいずれか1項に記載のプライマー及びプローブのセットを含む、請求項5に記載の方法。
- (a)第1反応混合物が、前記被験体から取得された前記試料、配列番号2の前記フォワードプライマー、配列番号6の前記リバースプライマー、配列番号52の前記ペプチド核酸オリゴマー;並びに配列番号22、配列番号27、及び配列番号30の前記プローブを含み;
(b)第2反応混合物が、前記被験体から取得された前記試料、配列番号2の前記フォワードプライマー、配列番号6の前記リバースプライマー、配列番号52の前記ペプチド核酸オリゴマー;並びに配列番号13、配列番号16、及び配列番号20の前記プローブを含み;且つ
(c)第3反応混合物が、前記被験体から取得された前記試料、配列番号2の前記フォワードプライマー、配列番号6の前記リバースプライマー、配列番号7の前記フォワードプライマー、配列番号11の前記リバースプライマー、配列番号52の前記ペプチド核酸オリゴマー、配列番号56の前記ペプチド核酸オリゴマー、並びに配列番号31、配列番号34、配列番号38、及び配列番号40の前記プローブを含む、
請求項6に記載の方法。 - 前記第1、第2、及び第3反応混合物のそれぞれが内部コントロールを更に含み、該内部コントロールが、
(a)配列番号43に記載されたヌクレオチド配列を含むフォワードプライマー;
(b)配列番号48に記載されたヌクレオチド配列を含むリバースプライマー;及び
(c)配列番号51に記載されたヌクレオチド配列を含むプローブ
を含む、請求項7に記載の方法。
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| DK51092D0 (da) | 1991-05-24 | 1992-04-15 | Ole Buchardt | Oligonucleotid-analoge betegnet pna, monomere synthoner og fremgangsmaade til fremstilling deraf samt anvendelser deraf |
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| US20030211483A1 (en) | 2002-05-09 | 2003-11-13 | Schroeder Benjamin G. | Methods for the enrichment of low-abundance polynucleotides |
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