JP2016528897A5

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Publication number: JP2016528897A5
Application number: JP2016534875A
Authority: JP
Filing date: 2014-08-15
Publication date: 2017-09-28

Description

本発明のいくつかの態様において、本明細書中に開示される１つまたはそれを超えるオリゴヌクレオチドを含む組成物が提供される。いくつかの実施形態において、複数のオリゴヌクレオチドを含む組成物が提供され、ここで、それらのオリゴヌクレオチドの各々の少なくとも７５％は、表３、７、８または９に示されているようなヌクレオチド配列を含むか、またはそのヌクレオチド配列からなる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、一価カチオン（例えば、Ｌｉ＋、Ｎａ＋、Ｋ＋、Ｃｓ＋）と複合体を形成している。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、凍結乾燥された形態で存在する。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、水溶液で存在する。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、キャリア（例えば、薬学的に許容され得るキャリア）とともに提供されるか、そのキャリアと組み合わされるか、または混合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、緩衝液中に提供される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、キャリア（例えば、ペプチド、ステロイドまたは他の分子）と結合体化されている。本発明のいくつかの態様において、組成物が収容されている容器を備えるキットが提供される。
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
細胞において遺伝子発現を増加させる方法であって、該方法は、
一般式５’−Ｘ _１ −Ｘ _２ −３’を含むオリゴヌクレオチドを細胞に送達する工程を含み、
式中、Ｘ _１は、該遺伝子によってコードされるＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を有する５〜２０ヌクレオチドを含み、Ｘ _１の該相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物の転写開始部位におけるヌクレオチドと相補的であり；Ｘ _２は、１〜２０ヌクレオチドを含む、方法。
（項目２）
前記ＲＮＡ転写物が、その５’末端に７−メチルグアノシンキャップを有する、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記ＲＮＡ転写物が、７−メチルグアノシンキャップを有し、Ｘ _１の前記相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドが、該７−メチルグアノシンキャップに対してすぐ内側に存在する該ＲＮＡ転写物のヌクレオチドと相補的である、項目１に記載の方法。
（項目４）
Ｘ _２の５’末端における少なくとも１番目のヌクレオチドが、グアニンと相補的なピリミジンである、項目１に記載の方法。
（項目５）
Ｘ _２の５’末端における２番目のヌクレオチドが、グアニンと相補的なピリミジンである、項目２に記載の方法。
（項目６）
Ｘ _２が、式５’−Ｙ _１ −Ｙ _２ −Ｙ _３ −３’を含み、ここで、Ｘ _２は、Ｙ _２のヌクレオチドを含むループ領域およびＹ _３の少なくとも２個連続したヌクレオチドとハイブリダイズしたＹ _１の少なくとも２個連続したヌクレオチドを含むステム領域を有するステムループ構造を形成する、項目１に記載の方法。
（項目７）
Ｙ _１、Ｙ _２およびＹ _３が、独立して、１〜１０個のヌクレオチドを含む、項目６に記載の方法。
（項目８）
Ｙ _３が、前記ステム領域の３’末端のすぐ後ろの位置に、グアニンと相補的なピリミジンを含む、項目６または７に記載の方法。
（項目９）
グアニンと相補的な前記ピリミジンが、シトシンである、項目２〜８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１０）
Ｘ _２が、Ｘ _１の相補性領域と相補的なＲＮＡ転写物の領域と重複しない該ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含む、項目１に記載の方法。
（項目１１）
Ｘ _２の前記相補性領域が、前記ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションの１００ヌクレオチド以内に存在する、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
Ｘ _２の前記相補性領域が、前記ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションとすぐ隣接しているかまたは重複している該ＲＮＡ転写物と相補的である、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
Ｘ _２が、前記ＲＮＡ転写物のポリ（Ａ）テイルのアデニンヌクレオチドと相補的な少なくとも２個連続したピリミジンヌクレオチドをさらに含む、項目１１または１２に記載の方法。
（項目１４）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡ、非コードＲＮＡ、長い非コードＲＮＡ、ｍｉＲＮＡもしくはｓｎｏＲＮＡまたは他の任意の好適なＲＮＡである、項目１〜１３のいずれか１項に記載の方法。
（項目１５）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡ転写物であり、Ｘ _２が、該転写物の３’−ＵＴＲにおける少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含む、項目１〜１４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１６）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡであり、送達により、該ｍＲＮＡによってコードされるタンパク質のレベルが上昇する、項目１〜１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１７）
前記ｍＲＮＡによってコードされるタンパク質のレベルの上昇が、前記オリゴヌクレオチドが送達されていなかった適切なコントロール細胞と比べて少なくとも５０％の上昇である、項目１６のいずれか１項に記載の方法。
（項目１８）
前記ＲＮＡ転写物が、ＡＢＣＡ１、ＡＰＯＡ１、ＡＴＰ２Ａ２、ＢＤＮＦ、ＦＸＮ、ＨＢＡ２、ＨＢＢ、ＨＢＤ、ＨＢＥ１、ＨＢＧ１、ＨＢＧ２、ＳＭＮ、ＵＴＲＮ、ＰＴＥＮ、ＭＥＣＰ２およびＦＯＸＰ３からなる群より選択される遺伝子から発現されるｍＲＮＡである、項目１〜１５のいずれか１項に記載の方法。
（項目１９）
Ｘ _１が、配列５’−ＣＧＣＣＣＴＣＣＡＧ−３’を含む、項目１に記載の方法。
（項目２０）
Ｘ _２が、配列ＣＣを含む、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
Ｘ _２が、配列５’−ＣＣＡＡＡＧＧＴＣ−３’を含む、任意の前述の項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記オリゴヌクレオチドが、配列５’−ＣＧＣＣＣＴＣＣＡＧＣＣＡＡＡＧＧＴＣ−３’を含む、項目１に記載の方法。
（項目２３）
前記ＲＮＡ転写物が、ＡＢＣＡ４、ＡＢＣＢ１１、ＡＢＣＢ４、ＡＢＣＧ５、ＡＢＣＧ８、ＡＤＩＰＯＱ、ＡＬＢ、ＡＰＯＥ、ＢＣＬ２Ｌ１１、ＢＲＣＡ１、ＣＤ２７４、ＣＥＰ２９０、ＣＦＴＲ、ＥＰＯ、Ｆ７、Ｆ８、ＦＬＩ１、ＦＭＲ１、ＦＮＤＣ５、ＧＣＨ１、ＧＣＫ、ＧＬＰ１Ｒ、ＧＲＮ、ＨＡＭＰ、ＨＰＲＴ１、ＩＤＯ１、ＩＧＦ１、ＩＬ１０、ＩＬ６、ＫＣＮＭＡ１、ＫＣＮＭＢ１、ＫＣＮＭＢ２、ＫＣＮＭＢ３、ＫＣＮＭＢ４、ＫＬＦ１、ＫＬＦ４、ＬＤＬＲ、ＭＳＸ２、ＭＹＢＰＣ３、ＮＡＮＯＧ、ＮＦ１、ＮＫＸ２−１、ＮＫＸ２−１−ＡＳ１、ＰＡＨ、ＰＴＧＳ２、ＲＢ１、ＲＰＳ１４、ＲＰＳ１９、ＳＣＡＲＢ１、ＳＥＲＰＩＮＦ１、ＳＩＲＴ１、ＳＩＲＴ６、ＳＭＡＤ７、ＳＴ７、ＳＴＡＴ３、ＴＳＩＸおよびＸＩＳＴからなる群より選択される遺伝子から発現されるｍＲＮＡである、項目１〜２２のいずれか１項に記載の方法。
（項目２４）
細胞において遺伝子発現を増加させる方法であって、該方法は、該遺伝子によってコードされるｍＲＮＡ転写物の５’−ＵＴＲの少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な第１の領域、および該ｍＲＮＡ転写物の３’−ＵＴＲの、ポリ（Ａ）テイルの、またはポリアデニル化ジャンクションと重複している、少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な第２の領域を有する１０〜５０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドを細胞に送達する工程を含む、方法。
（項目２５）
前記５’−ＵＴＲの少なくとも５個連続したヌクレオチドの１番目が、前記ｍＲＮＡ転写物の５’−メチルグアノシンキャップの１０ヌクレオチド以内に存在する、項目２４に記載の方法。
（項目２６）
前記第２の領域が、前記ポリアデニル化ジャンクションと重複している少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的である、項目２４または２５に記載の方法。
（項目２７）
前記第１の領域の５’末端を前記第２の領域の３’末端と連結する２〜２０ヌクレオチドをさらに含む、項目２４〜２６のいずれか１項に記載の方法。
（項目２８）
前記第１の領域の３’末端を前記第２の領域の５’末端と連結する２〜２０ヌクレオチドをさらに含む、項目２４〜２６のいずれか１項に記載の方法。
（項目２９）
前記オリゴヌクレオチドが、１０〜５０ヌクレオチド長である、項目２４〜２８のいずれか１項に記載の方法。
（項目３０）
前記オリゴヌクレオチドが、９〜２０ヌクレオチド長である、項目２４〜２８のいずれか１項に記載の方法。
（項目３１）
細胞において遺伝子発現を増加させる方法であって、該方法は、一般式５’−Ｘ _１ −Ｘ _２ −３’を含むオリゴヌクレオチドを細胞に送達する工程を含み、式中、Ｘ _１は、アデニンと塩基対を形成する２〜２０個のピリミジンヌクレオチドを含み；Ｘ _２は、該遺伝子によってコードされるポリアデニル化されたＲＮＡ転写物の少なくとも３個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含み、Ｘ _２の相補性領域の５’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションに対してすぐ内側に存在する該ＲＮＡ転写物のヌクレオチドと相補的である、方法。
（項目３２）
Ｘ _１が、２〜２０個のチミジンまたはウリジンを含む、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾されたヌクレオシド間結合を含む、項目１〜３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目３４）
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む、項目１〜３３のいずれか１項に記載の方法。
（項目３５）
少なくとも１つのヌクレオチドが、２’Ｏ−メチルを含む、項目１〜３４のいずれか１項に記載の方法。
（項目３６）
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つのリボヌクレオチド、少なくとも１つのデオキシリボヌクレオチド、少なくとも１つの２’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドまたは少なくとも１つの架橋ヌクレオチドを含む、項目１〜３５のいずれか１項に記載の方法。
（項目３７）
前記架橋ヌクレオチドが、ＬＮＡヌクレオチド、ｃＥｔヌクレオチドまたはＥＮＡ修飾ヌクレオチドである、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、ＬＮＡヌクレオチドである、項目１〜３７のいずれか１項に記載の方法。
（項目３９）
前記オリゴヌクレオチドのヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと２’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルヌクレオチドまたは架橋ヌクレオチドとが交互になっているものを含む、項目１〜３８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目４０）
前記オリゴヌクレオチドが、ミックスマーである、項目１〜３９のいずれか１項に記載の方法。
（項目４１）
前記オリゴヌクレオチドが、モルホリノである、項目１〜４０のいずれか１項に記載の方法。
（項目４２）
前記細胞が、インビトロにおけるものである、項目１〜４１のいずれか１項に記載の方法。
（項目４３）
前記細胞が、インビボにおけるものである、項目１〜４１のいずれか１項に記載の方法。
（項目４４）
細胞において遺伝子発現を増加させる方法であって、該方法は、該遺伝子のＲＮＡ転写物を発現している細胞に、８〜５０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドを送達する工程を含み、該オリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含み、該相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物の転写開始部位の１０ヌクレオチド以内のヌクレオチドと相補的であり、該オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾されたヌクレオシド間結合または少なくとも１つの架橋ヌクレオチドによって連結されたヌクレオチドを含む、方法。
（項目４５）
細胞において遺伝子発現を増加させる方法であって、該方法は、該遺伝子のＲＮＡ転写物を発現している細胞に、２つの相補性領域を含むオリゴヌクレオチドを送達する工程を含み、該２つの相補性領域の各々は、ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的であり、第１の相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物の転写開始部位の１００ヌクレオチド以内のヌクレオチドと相補的であり、第２の相補性領域は、該ＲＮＡ転写物の３’末端の３００ヌクレオチド以内で終わる該ＲＮＡ転写物の領域と相補的である、方法。
（項目４６）
細胞においてＲＮＡ転写物の安定性を高める方法であって、該方法は、該ＲＮＡ転写物の５’領域を標的化する第１の安定化オリゴヌクレオチドおよび該ＲＮＡ転写物の３’領域を標的化する第２の安定化オリゴヌクレオチドを該細胞に送達する工程を含む、方法。
（項目４７）
前記第１の安定化オリゴヌクレオチドが、前記第２の安定化オリゴヌクレオチドと共有結合的に連結されている、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記第１の安定化オリゴヌクレオチドが、前記ＲＮＡ転写物の５’末端における１番目に転写されたヌクレオチドの１０ヌクレオチド以内の位置における該ＲＮＡ転写物と相補的な相補性領域を含む、項目４６または４７に記載の方法。
（項目４９）
前記ＲＮＡ転写物が、５’−メチルグアノシンキャップを含み、前記第１の安定化オリゴヌクレオチドが、該５’−メチルグアノシンキャップに対してすぐ内側のヌクレオチドの１０ヌクレオチド以内の位置における該ＲＮＡ転写物と相補的な相補性領域を含む、項目４６〜４８のいずれか１項に記載の方法。
（項目５０）
前記第２の安定化オリゴヌクレオチドが、前記ＲＮＡ転写物の３’末端の２５０ヌクレオチド以内の位置における該ＲＮＡ転写物と相補的な相補性領域を含む、項目４６〜４９のいずれか１項に記載の方法。
（項目５１）
前記ＲＮＡ転写物が、３’−ポリ（Ａ）テイルを含み、前記第２の安定化オリゴヌクレオチドが、該ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションの１００ヌクレオチド以内の位置における該ＲＮＡ転写物と相補的な相補性領域を含む、項目４６〜５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目５２）
前記第２の安定化オリゴヌクレオチドの相補性領域が、前記ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションとすぐ隣接しているかまたは重複している、項目４６〜５１のいずれか１項に記載の方法。
（項目５３）
細胞においてＲＮＡ転写物の安定性を高める方法であって、該方法は、該ＲＮＡ転写物を標的化する項目６４〜１０４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドを、該ＲＮＡ転写物を発現する細胞に送達し、それにより、該ＲＮＡ転写物の安定性を高める工程を含む、方法。
（項目５４）
前記細胞が、インビトロにおけるものである、項目４６〜５３のいずれか１項に記載の方法。
（項目５５）
前記細胞が、インビボにおけるものである、項目４６〜５３のいずれか１項に記載の方法。
（項目５６）
被験体における低レベルのＲＮＡ転写物に関連する状態または疾患を処置する方法であって、該方法は、項目６４〜１０４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドを該被験体に投与する工程を含む、方法。
（項目５７）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡ、非コードＲＮＡ、長い非コードＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｓｎｏＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｓｎＲＮＡ、細胞外のＲＮＡまたは他の任意の好適なＲＮＡである、項目４６〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目５８）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡである、項目４６〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目５９）
前記ＲＮＡ転写物が、長い非コードＲＮＡである、項目４６〜５６のいずれか１項に記載の方法。
（項目６０）
前記ＲＮＡ転写物が、ＡＢＣＡ１、ＡＰＯＡ１、ＡＴＰ２Ａ２、ＢＤＮＦ、ＦＸＮ、ＨＢＡ２、ＨＢＢ、ＨＢＤ、ＨＢＥ１、ＨＢＧ１、ＨＢＧ２、ＳＭＮ、ＵＴＲＮ、ＰＴＥＮ、ＭＥＣＰ２およびＦＯＸＰ３からなる群より選択される遺伝子から発現されるｍＲＮＡである、項目４６〜５８のいずれか１項に記載の方法。
（項目６１）
前記ＲＮＡ転写物が、ＡＢＣＡ４、ＡＢＣＢ１１、ＡＢＣＢ４、ＡＢＣＧ５、ＡＢＣＧ８、ＡＤＩＰＯＱ、ＡＬＢ、ＡＰＯＥ、ＢＣＬ２Ｌ１１、ＢＲＣＡ１、ＣＤ２７４、ＣＥＰ２９０、ＣＦＴＲ、ＥＰＯ、Ｆ７、Ｆ８、ＦＬＩ１、ＦＭＲ１、ＦＮＤＣ５、ＧＣＨ１、ＧＣＫ、ＧＬＰ１Ｒ、ＧＲＮ、ＨＡＭＰ、ＨＰＲＴ１、ＩＤＯ１、ＩＧＦ１、ＩＬ１０、ＩＬ６、ＫＣＮＭＡ１、ＫＣＮＭＢ１、ＫＣＮＭＢ２、ＫＣＮＭＢ３、ＫＣＮＭＢ４、ＫＬＦ１、ＫＬＦ４、ＬＤＬＲ、ＭＳＸ２、ＭＹＢＰＣ３、ＮＡＮＯＧ、ＮＦ１、ＮＫＸ２−１、ＮＫＸ２−１−ＡＳ１、ＰＡＨ、ＰＴＧＳ２、ＲＢ１、ＲＰＳ１４、ＲＰＳ１９、ＳＣＡＲＢ１、ＳＥＲＰＩＮＦ１、ＳＩＲＴ１、ＳＩＲＴ６、ＳＭＡＤ７、ＳＴ７、ＳＴＡＴ３、ＴＳＩＸおよびＸＩＳＴからなる群より選択される遺伝子から発現されるｍＲＮＡである、項目４６〜５８のいずれか１項に記載の方法。
（項目６２）
８〜５０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチドであって、該オリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含み、該相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物の転写開始部位の１０ヌクレオチド以内のヌクレオチドと相補的であり、該オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つの修飾されたヌクレオシド間結合または少なくとも１つの架橋ヌクレオチドによって連結されたヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
（項目６３）
２つの相補性領域を含むオリゴヌクレオチドであって、該２つの相補性領域の各々は、ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的であり、第１の相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物の転写開始部位の１００ヌクレオチド以内のヌクレオチドと相補的であり、第２の相補性領域は、該ＲＮＡ転写物の３’末端の３００ヌクレオチド以内で終わる該ＲＮＡ転写物の領域と相補的である、オリゴヌクレオチド。
（項目６４）
一般式５’−Ｘ _１ −Ｘ _２ −３’を含むオリゴヌクレオチドであって、式中、
Ｘ _１は、ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を有する５〜２０ヌクレオチドを含み、Ｘ _１の相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物の転写開始部位におけるヌクレオチドと相補的であり；Ｘ _２は、１〜２０ヌクレオチドを含む、オリゴヌクレオチド。
（項目６５）
前記ＲＮＡ転写物が、その５’末端に７−メチルグアノシンキャップを有する、項目６２〜６４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目６６）
前記ＲＮＡ転写物が、７−メチルグアノシンキャップを有し、Ｘ _１の相補性領域の３’末端におけるヌクレオチドは、該７−メチルグアノシンキャップに対してすぐ内側に存在する該ＲＮＡ転写物のヌクレオチドと相補的である、項目６４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目６７）
Ｘ _２の５’末端における少なくとも１番目のヌクレオチドが、グアニンと相補的なピリミジンである、項目６４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目６８）
Ｘ _２の５’末端における２番目のヌクレオチドが、グアニンと相補的なピリミジンである、項目６７に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目６９）
Ｘ _２が、式５’−Ｙ _１ −Ｙ _２ −Ｙ _３ −３’を含み、ここで、Ｘ _２は、Ｙ _２のヌクレオチドを含むループ領域およびＹ _３の少なくとも２個連続したヌクレオチドとハイブリダイズしたＹ _１の少なくとも２個連続したヌクレオチドを含むステム領域を有するステムループ構造を形成する、項目６４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７０）
Ｙ _１、Ｙ _２およびＹ _３が、独立して、１〜１０個のヌクレオチドを含む、項目６９に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７１）
Ｙ _３が、前記ステム領域の３’末端のすぐ後ろの位置に、グアニンと相補的なピリミジンを含む、項目６９または７０に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７２）
グアニンと相補的な前記ピリミジンが、シトシンである、項目６７〜７１のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７３）
Ｘ _２が、Ｘ _１の相補性領域と相補的なＲＮＡ転写物の領域と重複しない該ＲＮＡ転写物の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含む、項目６４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７４）
Ｘ _２の前記相補性領域が、前記ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションの１００ヌクレオチド以内に存在する、項目７３に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７５）
Ｘ _２の前記相補性領域が、前記ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションとすぐ隣接しているかまたは重複している該ＲＮＡ転写物と相補的である、項目７４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７６）
Ｘ _２が、前記ＲＮＡ転写物のポリ（Ａ）テイルのアデニンヌクレオチドと相補的な少なくとも２個連続したピリミジンヌクレオチドをさらに含む、項目７４または７５に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７７）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡ、非コードＲＮＡ、長い非コードＲＮＡ、ｍｉＲＮＡもしくはｓｎｏＲＮＡまたは他の任意の好適なＲＮＡである、項目６２〜７６のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７８）
前記ＲＮＡ転写物が、ｍＲＮＡ転写物であり、Ｘ _２が、該転写物の３’−ＵＴＲにおける少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含む、項目６４〜７７のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目７９）
前記ＲＮＡ転写物が、ＡＢＣＡ１、ＡＰＯＡ１、ＡＴＰ２Ａ２、ＢＤＮＦ、ＦＸＮ、ＨＢＡ２、ＨＢＢ、ＨＢＤ、ＨＢＥ１、ＨＢＧ１、ＨＢＧ２、ＳＭＮ、ＵＴＲＮ、ＰＴＥＮ、ＭＥＣＰ２およびＦＯＸＰ３からなる群より選択される遺伝子から発現されるｍＲＮＡである、項目６２〜７８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８０）
Ｘ _１が、配列５’−ＣＧＣＣＣＴＣＣＡＧ−３’を含む、項目６４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８１）
Ｘ _２が、配列ＣＣを含む、項目７９に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８２）
Ｘ _２が、配列５’−ＣＣＡＡＡＧＧＴＣ−３’を含む、任意の前述の項目７９に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８３）
前記オリゴヌクレオチドが、配列５’−ＣＧＣＣＣＴＣＣＡＧＣＣＡＡＡＧＧＴＣ−３’を含む、項目６４に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８４）
前記ＲＮＡ転写物が、ＡＢＣＡ４、ＡＢＣＢ１１、ＡＢＣＢ４、ＡＢＣＧ５、ＡＢＣＧ８、ＡＤＩＰＯＱ、ＡＬＢ、ＡＰＯＥ、ＢＣＬ２Ｌ１１、ＢＲＣＡ１、ＣＤ２７４、ＣＥＰ２９０、ＣＦＴＲ、ＥＰＯ、Ｆ７、Ｆ８、ＦＬＩ１、ＦＭＲ１、ＦＮＤＣ５、ＧＣＨ１、ＧＣＫ、ＧＬＰ１Ｒ、ＧＲＮ、ＨＡＭＰ、ＨＰＲＴ１、ＩＤＯ１、ＩＧＦ１、ＩＬ１０、ＩＬ６、ＫＣＮＭＡ１、ＫＣＮＭＢ１、ＫＣＮＭＢ２、ＫＣＮＭＢ３、ＫＣＮＭＢ４、ＫＬＦ１、ＫＬＦ４、ＬＤＬＲ、ＭＳＸ２、ＭＹＢＰＣ３、ＮＡＮＯＧ、ＮＦ１、ＮＫＸ２−１、ＮＫＸ２−１−ＡＳ１、ＰＡＨ、ＰＴＧＳ２、ＲＢ１、ＲＰＳ１４、ＲＰＳ１９、ＳＣＡＲＢ１、ＳＥＲＰＩＮＦ１、ＳＩＲＴ１、ＳＩＲＴ６、ＳＭＡＤ７、ＳＴ７、ＳＴＡＴ３、ＴＳＩＸおよびＸＩＳＴからなる群より選択される遺伝子から発現されるｍＲＮＡである、項目６２〜７８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８５）
ｍＲＮＡ転写物の５’−ＵＴＲの少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な第１の領域、および該ｍＲＮＡ転写物の３’−ＵＴＲの、ポリ（Ａ）テイルの、またはポリアデニル化ジャンクションと重複している、少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的な第２の領域を有する１０〜５０ヌクレオチド長のオリゴヌクレオチド。
（項目８６）
前記５’−ＵＴＲの少なくとも５個連続したヌクレオチドの１番目が、前記ｍＲＮＡ転写物の５’−メチルグアノシンキャップの１０ヌクレオチド以内に存在する、項目８５に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８７）
前記第２の領域が、前記ポリアデニル化ジャンクションと重複している少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的である、項目８５または８６に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８８）
前記第１の領域の５’末端を前記第２の領域の３’末端と連結する２〜２０ヌクレオチドをさらに含む、項目８５〜８７のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目８９）
前記第１の領域の３’末端を前記第２の領域の５’末端と連結する２〜２０ヌクレオチドをさらに含む、項目８５〜８７のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９０）
前記オリゴヌクレオチドが、１０〜５０ヌクレオチド長である、項目８５〜８７のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９１）
前記オリゴヌクレオチドが、９〜２０ヌクレオチド長である、項目８５〜８７のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９２）
一般式５’−Ｘ _１ −Ｘ _２ −３’を含むオリゴヌクレオチドであって、式中、
Ｘ _１は、アデニンと塩基対を形成する２〜２０個のピリミジンヌクレオチドを含み；Ｘ _２は、ポリアデニル化されたＲＮＡ転写物の少なくとも３個連続したヌクレオチドと相補的な相補性領域を含み、Ｘ _２の相補性領域の５’末端におけるヌクレオチドは、該ＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションに対してすぐ内側に存在する該ＲＮＡ転写物のヌクレオチドと相補的である、オリゴヌクレオチド。
（項目９３）
Ｘ _１が、２〜２０個のチミジンまたはウリジンを含む、項目８０に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９４）
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾されたヌクレオシド間結合を含む、項目６２〜９３のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９５）
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む、項目６２〜９３のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９６）
少なくとも１つのヌクレオチドが、２’Ｏ−メチルを含む、項目６２〜９５のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９７）
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つのリボヌクレオチド、少なくとも１つのデオキシリボヌクレオチド、少なくとも１つの２’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドまたは少なくとも１つの架橋ヌクレオチドを含む、項目６２〜９３のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９８）
前記架橋ヌクレオチドが、ＬＮＡヌクレオチド、ｃＥｔヌクレオチドまたはＥＮＡ修飾ヌクレオチドである、項目９７に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目９９）
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドが、ＬＮＡヌクレオチドである、項目６４〜９８のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目１００）
前記オリゴヌクレオチドのヌクレオチドが、デオキシリボヌクレオチドと２’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルヌクレオチドまたは架橋ヌクレオチドとが交互になっているものを含む、項目６４〜９９のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目１０１）
前記オリゴヌクレオチドが、ミックスマーである、項目６４〜９４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目１０２）
前記オリゴヌクレオチドが、モルホリノである、項目６４〜９４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチド。
（項目１０３）
表３、７、８または９に示されているようなヌクレオチド配列を含むオリゴヌクレオチド。
（項目１０４）
表３、７、８または９に示されているようなヌクレオチド配列の少なくとも８ヌクレオチドのフラグメントを含むオリゴヌクレオチド。
（項目１０５）
ヌクレオシド間結合を介して連結された５〜２５個のヌクレオチドを有する第１のオリゴヌクレオチドおよびヌクレオシド間結合を介して連結された５〜２５個のヌクレオチドを有する第２のオリゴヌクレオチドを含む組成物であって、ここで、該第１のオリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ転写物の５’末端の１００ヌクレオチド以内の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的であり、該第２のオリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ転写物の３’末端の１００ヌクレオチド以内の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的である、組成物。
（項目１０６）
前記第１のオリゴヌクレオチドと第２のオリゴヌクレオチドとが、前記ＲＮＡ転写物と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドではないリンカーによってつなげられている、項目１０５に記載の組成物。
（項目１０７）
前記リンカーが、オリゴヌクレオチドである、項目１０６に記載の組成物。
（項目１０８）
前記リンカーが、ポリペプチドである、項目１０６に記載の組成物。
（項目１０９）
複数のオリゴヌクレオチドを含む組成物であって、ここで、該オリゴヌクレオチドの少なくとも７５％の各々は、項目６４〜１０４のいずれか１項から選択されるオリゴヌクレオチドである、組成物。
（項目１１０）
前記オリゴヌクレオチドが、一価カチオンと複合体を形成している、項目１０９に記載の組成物。
（項目１１１）
前記オリゴヌクレオチドが、凍結乾燥された形態で存在する、項目１０９または１１０に記載の組成物。
（項目１１２）
前記オリゴヌクレオチドが、水溶液で存在する、項目１０９または１１０に記載の組成物。
（項目１１３）
項目６４〜１０４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドおよびキャリアを含む組成物。
（項目１１４）
項目６４〜１０４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドを緩衝液中に含む組成物。
（項目１１５）
キャリアに結合体化された項目６４〜１０４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドを含む組成物。
（項目１１６）
前記キャリアが、ペプチドである、項目１１５に記載の組成物。
（項目１１７）
前記キャリアが、ステロイドである、項目１１５に記載の組成物。
（項目１１８）
項目６４〜１０４のいずれか１項に記載のオリゴヌクレオチドおよび薬学的に許容され得るキャリアを含む薬学的組成物。
（項目１１９）
項目１０９〜１１８のいずれか１項に記載の組成物が収容されている容器を備えるキット。
（項目１２０）
細胞においてタンパク質の発現を増加させるための方法であって、該方法は、該タンパク質をコードする環状化した合成ＲＮＡを細胞に送達する工程を含み、該細胞における該タンパク質の合成は、該細胞への該環状化した合成ＲＮＡの送達後に増加する、方法。
（項目１２１）
前記環状化した合成ＲＮＡが、１つまたはそれを超える修飾ヌクレオチドを含む、項目１２０に記載の方法。
（項目１２２）
合成ＲＮＡを安定化する方法であって、該方法は、該合成ＲＮＡの５’領域を標的化する第１の安定化オリゴヌクレオチドおよび該合成ＲＮＡの３’領域を標的化する第２の安定化オリゴヌクレオチドと該合成ＲＮＡを、該第１の安定化オリゴヌクレオチドおよび第２の安定化オリゴヌクレオチドが該合成ＲＮＡ上の標的配列とハイブリダイズする条件下で接触させる工程を含み、該合成ＲＮＡが、該第１および第２の安定化オリゴヌクレオチドとハイブリダイズしたとき、環状化した生成物を形成することができるように、該第１の安定化オリゴヌクレオチドは、該第２の安定化オリゴヌクレオチドと共有結合的に連結されている、方法。
（項目１２３）
前記合成ＲＮＡを、前記第１および第２の安定化オリゴヌクレオチドと細胞の外側で接触させる、項目１２２に記載の方法。
（項目１２４）
細胞に合成ＲＮＡを送達する方法であって、該方法は、
該合成ＲＮＡの５’領域を標的化する第１の安定化オリゴヌクレオチドおよび該合成ＲＮＡの３’領域を標的化する第２の安定化オリゴヌクレオチドと該合成ＲＮＡを、該第１の安定化オリゴヌクレオチドおよび第２の安定化オリゴヌクレオチドが該合成ＲＮＡ上の標的配列とハイブリダイズする条件下で接触させる工程であって、該合成ＲＮＡが、該第１および第２の安定化オリゴヌクレオチドとハイブリダイズしたとき、環状化した生成物を形成することができるように、該第１の安定化オリゴヌクレオチドは、該第２の安定化オリゴヌクレオチドと共有結合的に連結されている、工程；および
該環状化した生成物を該細胞に送達する工程
を含む、方法。
（項目１２５）
前記第１の安定化オリゴヌクレオチドと第２の安定化オリゴヌクレオチドとが、ヌクレオシド間結合を介して共有結合的に連結されている、項目１２２〜１２４のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２６）
前記第１の安定化オリゴヌクレオチドと第２の安定化オリゴヌクレオチドとが、オリゴヌクレオチドを介して共有結合的に連結されている、項目１２４または１２５に記載の方法。
（項目１２７）
前記第１の安定化オリゴヌクレオチドと第２の安定化オリゴヌクレオチドとが、本明細書中に開示される任意の適切なリンカーを介して共有結合的に連結されている、項目１２６に記載の組成物。
（項目１２８）
前記第１の安定化オリゴヌクレオチドが、前記合成ＲＮＡの５’末端における１番目のヌクレオチドの１０ヌクレオチド以内の位置における該合成ＲＮＡと相補的な相補性領域を含む、項目１２２〜１２７のいずれか１項に記載の方法。
（項目１２９）
前記合成ＲＮＡが、５’−メチルグアノシンキャップを含み、前記第１の安定化オリゴヌクレオチドが、該５’−メチルグアノシンキャップに対してすぐ内側のヌクレオチドの１０ヌクレオチド以内の位置における該合成ＲＮＡと相補的な相補性領域を含む、項目１２２〜１２８のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３０）
前記第２の安定化オリゴヌクレオチドが、前記合成ＲＮＡの３’末端の２５０ヌクレオチド以内の位置における該合成ＲＮＡと相補的な相補性領域を含む、項目１２２〜１２９のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３１）
前記合成ＲＮＡが、３’−ポリ（Ａ）テイルを含み、前記第２の安定化オリゴヌクレオチドが、該合成ＲＮＡのポリアデニル化ジャンクションの１００ヌクレオチド以内の位置における該合成ＲＮＡと相補的な相補性領域を含む、項目１２２〜１３０のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３２）
前記第２の安定化オリゴヌクレオチドの相補性領域が、前記合成ＲＮＡのポリアデニル化ジャンクションとすぐ隣接しているかまたは重複している、項目１２２〜１３１のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３３）
前記合成ＲＮＡが、１つまたはそれを超える修飾ヌクレオチドを含む、項目１２０〜１３２のいずれか１項に記載の方法。
（項目１３４）
前記１つまたはそれを超える修飾ヌクレオチドが、２’−アミノ−２’−デオキシヌクレオチド、２’−アジド−２’−デオキシヌクレオチド、２’−フルオロ−２’−デオキシヌクレオチド、２’−Ｏ−メチル−ヌクレオチド、２’糖超修飾剤、２’−修飾熱安定性向上剤、２’−フルオロ−２’−デオキシアデノシン−５’−三リン酸、２’−フルオロ−２’−デオキシシチジン−５’−三リン酸、２’−フルオロ−２’−デオキシグアノシン−５’−三リン酸、２’−フルオロ−２’−デオキシウリジン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチルアデノシン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチルシチジン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチルグアノシン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチルウリジン−５’−三リン酸、シュードウリジン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチルイノシン−５’−三リン酸、２’−アミノ−２’−デオキシシチジン−５’−三リン酸、２’−アミノ−２’−デオキシウリジン−５’−三リン酸、２’−アジド−２’−デオキシシチジン−５’−三リン酸、２’−アジド−２’−デオキシウリジン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチルシュードウリジン−５’−三リン酸、２’−Ｏ−メチル−５−メチルウリジン−５’−三リン酸、２’−アジド−２’−デオキシアデノシン−５’−三リン酸、２’−アミノ−２’−デオキシアデノシン−５’−三リン酸、２’−フルオロ−チミジン−５’−三リン酸、２’−アジド−２’−デオキシグアノシン−５’−三リン酸、２’−アミノ−２’−デオキシグアノシン−５’−三リン酸およびＮ４−メチルシチジン−５’−三リン酸からなる群より選択される、項目１３３に記載の方法。
（項目１３５）
１つまたはそれを超える修飾ヌクレオチドを含む環状化した合成ＲＮＡ。
（項目１３６）
合成ＲＮＡの５’領域とハイブリダイズされる第１の安定化オリゴヌクレオチド、および該合成の３’領域とハイブリダイズされる第２の安定化オリゴヌクレオチドを含み、該第１の安定化オリゴヌクレオチドは、該第２の安定化オリゴヌクレオチドと共有結合的に連結され、該合成ＲＮＡとともに、環状化した生成物を形成する、項目１３５に記載の環状化した合成ＲＮＡ。
（項目１３７）
項目１３５または１３６に記載の環状化した合成ＲＮＡおよび薬学的に許容され得るキャリアまたは賦形剤を含む薬学的組成物。
（項目１３８）
項目１３５または１３６に記載の環状化した合成ＲＮＡ、ならびにナノ粒子、ポリ（乳酸−ｃｏ−グリコール酸）（ＰＬＧＡ）ミクロスフェア、リピドイド、リポプレックス、リポソーム、ポリマー、炭水化物（単糖類を含む）、カチオン性脂質、フィブリンゲル、フィブリンヒドロゲル、フィブリン糊、フィブリンシーラント、フィブリノゲン、トロンビンおよび迅速に排除される脂質ナノ粒子（ｒｅＬＮＰ）のうちの１つまたはそれを超えるものを含む組成物。
（項目１３９）
前記環状化した合成ＲＮＡが、ＧａｌＮａｃなどの炭水化物または他の標的化部分に結
合体化される、項目１３５に記載の環状化した合成ＲＮＡ。
（項目１４０）
前記第１または第２の安定化オリゴヌクレオチドが、ＧａｌＮａｃなどの炭水化物また
は他の標的化部分に結合体化される、項目１３５に記載の環状化した合成ＲＮＡ。

Claims

ヌクレオシド間結合を介して結合された５〜２５ヌクレオチドを有する第１のオリゴヌクレオチドと、ヌクレオシド間結合を介して結合された５〜２５ヌクレオチドを有する第２のオリゴヌクレオチドとを含む組成物であって、
ここで、該第１のオリゴヌクレオチドは、ｍＲＮＡ転写物の５’−非翻訳領域（５’−ＵＴＲ）の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的であり、該第２のオリゴヌクレオチドは、該ｍＲＮＡ転写物の３’−ＵＴＲ、ポリ（Ａ）テイル、またはポリアデニル化ジャンクションと重複している領域の少なくとも５個連続したヌクレオチドと相補的である、組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドがリンカーを介して結合されている、請求項１に記載の組成物。
前記リンカーがオリゴヌクレオチドである、請求項２に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドが、翻訳開始部位の少なくとも５０ヌクレオチド上流の前記５’−ＵＴＲの領域と相補的である、請求項１〜３のいずれか１項に記載の組成物。
前記第２のオリゴヌクレオチドが、前記ｍＲＮＡ転写物のポリアデニル化ジャンクションと重複している領域と相補的であり、前記第２のオリゴヌクレオチドが、該ジャンクションの転写された部分５’と相補的である少なくとも３ヌクレオチドおよび前記ポリ（Ａ）テイルと相補的な１、２、３、４、５または６ヌクレオチドを含む、請求項１〜４のいずれか１項に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび／または前記第２のオリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾されたヌクレオシド間結合を含む、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび／または前記第２のオリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオチドを含む、請求項１〜６のいずれか１項に記載の組成物。
修飾ヌクレオチドが２’Ｏ−メチルヌクレオチドである、請求項７に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび／または前記第２のオリゴヌクレオチドが、少なくとも１つのリボヌクレオチド、少なくとも１つのデオキシリボヌクレオチド、少なくとも１つの２’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチドまたは少なくとも１つの架橋ヌクレオチドを含み、任意選択で、該架橋ヌクレオチドは、ＬＮＡヌクレオチド、ｃＥｔヌクレオチドまたはＥＮＡ修飾ヌクレオチドである、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび／または前記第２のオリゴヌクレオチドが、交互になっているデオキシリボヌクレオチドと２’−フルオロ−デオキシリボヌクレオチド、２’−Ｏ−メチルヌクレオチドまたは架橋ヌクレオチドとを含む、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび／または前記第２のオリゴヌクレオチドが、ミックスマーである、請求項１〜５のいずれか１項に記載の組成物。
前記第１のオリゴヌクレオチドおよび前記第２のオリゴヌクレオチドならびに薬学的に許容され得るキャリアを含む薬学的組成物である、請求項１〜１１のいずれか１項に記載の組成物。
インビトロで細胞におけるｍＲＮＡ転写物のレベルを上昇させる方法であって、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の組成物を該細胞に送達する工程を含む、方法。
インビボで細胞におけるｍＲＮＡ転写物のレベルを上昇させるのに使用するための組成物であって、請求項１〜１２のいずれか１項に記載の組成物である、組成物。
請求項１〜１２のいずれか１項に記載の組成物を含むキット。