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  1. SEQ ID NO:57のアミノ酸配列に対して少なくとも90%の配列同一性を含むバリアントアシル-ACPレダクターゼ(AAR)ポリペプチドであって、アミノ酸位置18にS18Wである突然変異を含み、且つアシル-ACPから脂肪アルデヒドへの変換を触媒する、AARポリペプチド
  2. 組換え宿主細胞におけるバリアントAARポリペプチドの発現が、対応する野生型宿主細胞における野生型AARポリペプチドの発現によって産生される力価と比較して、より高い力価の脂肪アルコール組成物をもたらす、請求項1記載のバリアントAARポリペプチド。
  3. 脂肪アルコール組成物が、C12またはC14脂肪アルコール組成物である、請求項2記載のバリアントAARポリペプチド。
  4. アミノ酸8、16、21、24、31、34、35、43、50、63、86、112、113、116、118、120、135、148、153、154、155、157、159、168、172、187、188、191、209、210、211、236、277、281、283、285、291、324、328、335、337および338からなる群より選択されるアミノ酸位置に突然変異をさらに含む、請求項1〜4のいずれか一項記載のバリアントAARポリペプチド。
  5. 突然変異が、L8A、D16L、M21L、D24E、D24Y、D24V、D24P、L31V、L31M、W34F、W35F、D43E、A50Q、C63A、C63G、C63Y、S86G、A112R、S113K、Q116G、R118Q、T120S、A135S、T148C、T148E、T148V、I153P、T154A、Q155C、Q155L、T157V、A159V、I168V、C172L、T187V、T188H、T188V、Q191A、L209R、E210Y、A211W、T236C、Q277V、A281L、E283G、E283S、A285V、M291V、A324T、A328S、Q335N、L337VおよびL338Wからなる群より選択される、請求項4記載のバリアントAARポリペプチド。
  6. M21L突然変異、C63GA突然変異、S113K突然変異、T154A突然変異、A281L突然変異、またはL8A突然変異を含む、請求項5記載のバリアントAARポリペプチド。
  7. (a)M21L突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、T154A、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:58のアミノ酸配列を含む;
    (b)L8A突然変異、M21L突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、T154A突然変異、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:59のアミノ酸配列を含む;
    (c)D16L突然変異、M21L突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、T154A突然変異、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:60のアミノ酸配列を含む;
    (d)L8A突然変異、D24V突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、Q155L突然変異、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:61のアミノ酸配列を含む;
    (e)D24P突然変異、L31M突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、T154A突然変異、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:62のアミノ酸配列を含む;
    (f)L8A突然変異、D16L突然変異、D24V突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、T154A突然変異、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:63のアミノ酸配列を含む;または
    (g)D24E突然変異、C63G突然変異、S113K突然変異、T154A突然変異、およびA281L突然変異をさらに含み、好ましくはSEQ ID NO:64のアミノ酸配列を含む、
    請求項1〜3のいずれか一項記載のバリアントAARポリペプチド。
  8. 請求項1〜7のいずれか一項記載のバリアントAARポリペプチドを発現する組換え宿主細胞。
  9. 炭素源を含有する培地中で、バリアントAARポリペプチドを発現させるのに有効な条件下で培養した時に、対応する野生型AARポリペプチドを発現する宿主細胞によって産生される脂肪アルコール組成物の力価を少なくとも10%上回る、少なくとも15%上回る、少なくとも20%上回る、少なくとも25%上回る、または少なくとも30%上回る力価脂肪アルコール組成物を産生し、好ましくは脂肪アルコール組成物が細胞外に産生される、請求項8記載の組換え宿主細胞。
  10. 脂肪アルコール組成物が約30g/L〜約250g/Lの力価で産生される、請求項9記載の組換え宿主細胞。
  11. 請求項810のいずれか一項記載の組換え宿主細胞を含む細胞培養物。
  12. 脂肪アルコール組成物が、C6、C8、C10、C12、C13、C14、C15、C16、C17、およびC18脂肪アルコールのうち1つまたは複数を含む、請求項11記載の細胞培養物。
  13. 脂肪アルコール組成物が、
    (a)C10:1、C12:1、C14:1、C16:1、およびC18:1不飽和脂肪アルコールのうち1つまたは複数
    (b)不飽和脂肪アルコール;
    (c)脂肪アルコールの還元末端からC 7 〜C 8 の間の炭素鎖の位置7に二重結合を有する脂肪アルコール;または
    (d)飽和脂肪アルコール
    を含む、請求項12記載の細胞培養物。
  14. 力価の増大した脂肪アルコール組成物を生産する方法であって、
    i.請求項8記載の宿主細胞を炭素源とともに培養する段階;および
    ii.脂肪アルコール組成物を採取する段階
    を含む方法。
  15. 脂肪アルコール組成物の力価が、野生型AARを発現する宿主細胞によって産生される脂肪アルコール組成物の力価を少なくとも20%〜30%上回る、請求項14記載の方法。
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Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN102695799A (zh) 2009-09-27 2012-09-26 Opx生物工艺学公司 用于制备3-羟基丙酸和其它产物的方法
US20140051136A1 (en) 2012-08-10 2014-02-20 Opx Biotechnologies, Inc. Micoorganisms and Methods for the Production of Fatty Acids and Fatty Acid Derived Products
JP6063585B2 (ja) * 2013-01-16 2017-01-18 アールイージー ライフ サイエンシズ リミテッド ライアビリティ カンパニー 改良された特性を有するアシル−acpレダクターゼ
WO2014146026A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Opx Biotechnologies, Inc. Bioproduction of chemicals
US11408013B2 (en) 2013-07-19 2022-08-09 Cargill, Incorporated Microorganisms and methods for the production of fatty acids and fatty acid derived products
JP6603658B2 (ja) 2013-07-19 2019-11-06 カーギル インコーポレイテッド 脂肪酸及び脂肪酸誘導体の製造のための微生物及び方法
MY188944A (en) * 2014-07-18 2022-01-14 Genomatica Inc Microbial production of fatty diols
EP2993228B1 (en) 2014-09-02 2019-10-09 Cargill, Incorporated Production of fatty acid esters
EP3577227A4 (en) 2017-02-02 2020-12-30 Cargill Inc. GENETICALLY MODIFIED CELLS PRODUCING C6-C10 FATTY ACID DERIVATIVES
EP3607059A2 (en) 2017-04-03 2020-02-12 Genomatica, Inc. Thioesterase variants having improved activity for the production of medium-chain fatty acid derivatives
WO2020047088A1 (en) * 2018-08-31 2020-03-05 Genomatica, Inc. Production of non-native monounsaturated fatty acids in bacteria
WO2023178193A1 (en) 2022-03-16 2023-09-21 Genomatica, Inc. Acyl-acp thioesterase variants and uses thereof
JP7374260B1 (ja) 2022-05-13 2023-11-06 チャン,ヤ-チン 駆動装置

Family Cites Families (35)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5000000A (en) 1988-08-31 1991-03-19 University Of Florida Ethanol production by Escherichia coli strains co-expressing Zymomonas PDC and ADH genes
US5028539A (en) 1988-08-31 1991-07-02 The University Of Florida Ethanol production using engineered mutant E. coli
US5482846A (en) 1988-08-31 1996-01-09 University Of Florida Ethanol production in Gram-positive microbes
US5424202A (en) 1988-08-31 1995-06-13 The University Of Florida Ethanol production by recombinant hosts
AU7791991A (en) 1990-04-24 1991-11-11 Stratagene Methods for phenotype creation from multiple gene populations
US5602030A (en) 1994-03-28 1997-02-11 University Of Florida Research Foundation Recombinant glucose uptake system
US6428767B1 (en) 1995-05-12 2002-08-06 E. I. Du Pont De Nemours And Company Method for identifying the source of carbon in 1,3-propanediol
US5939250A (en) 1995-12-07 1999-08-17 Diversa Corporation Production of enzymes having desired activities by mutagenesis
US5965408A (en) 1996-07-09 1999-10-12 Diversa Corporation Method of DNA reassembly by interrupting synthesis
ES2331228T3 (es) * 2000-02-09 2009-12-28 Basf Se Nuevo gen de elongasa y proceso para la preparacion de acidos grasos poliinsaturados.
US8110670B2 (en) 2006-05-19 2012-02-07 Ls9, Inc. Enhanced production of fatty acid derivatives
CA2650773C (en) 2006-05-19 2014-12-02 Jay D. Keasling Microorganisms transformed with acetyl-coa carboxylase and wax synthase for production of fatty acid derivatives
US8110093B2 (en) 2007-03-14 2012-02-07 Ls9, Inc. Process for producing low molecular weight hydrocarbons from renewable resources
CA3035878C (en) 2007-03-28 2023-01-03 REG Life Sciences, LLC Enhanced production of fatty acid derivatives
TWI351779B (en) 2007-12-03 2011-11-01 Advance Smart Ind Ltd Apparatus and method for correcting residual capac
WO2009085278A1 (en) 2007-12-21 2009-07-09 Ls9, Inc. Methods and compositions for producing olefins
CN102027109B (zh) 2008-05-16 2016-01-06 Reg生命科学有限责任公司 产生碳氢化合物的方法和组合物
WO2009142983A1 (en) 2008-05-23 2009-11-26 Alliant Techsystems Inc. Broadband patch antenna and antenna system
EP2352824B1 (en) 2008-10-07 2015-09-02 REG Life Sciences, LLC Method and compositions for producing fatty aldehydes
KR101700296B1 (ko) * 2008-10-28 2017-01-26 알이지 라이프 사이언시스, 엘엘씨 지방족 알코올들을 생산하기 위한 방법들과 조성물들
EP2424989A2 (en) 2009-05-01 2012-03-07 The Regents of The University of California Product of fatty acid esters from biomass polymers
EP2432890B1 (en) * 2009-05-22 2015-09-02 Codexis, Inc. Engineered biosynthesis of fatty alcohols
US7794969B1 (en) * 2009-07-09 2010-09-14 Joule Unlimited, Inc. Methods and compositions for the recombinant biosynthesis of n-alkanes
WO2011027409A1 (ja) * 2009-09-07 2011-03-10 独立行政法人情報通信研究機構 複数のマッハツェンダー干渉計を有する光変調器の特性評価方法
ES2707747T3 (es) * 2009-09-25 2019-04-04 Reg Life Sciences Llc Producción de derivados de ácidos grasos
CN102695799A (zh) * 2009-09-27 2012-09-26 Opx生物工艺学公司 用于制备3-羟基丙酸和其它产物的方法
US8530221B2 (en) 2010-01-14 2013-09-10 Ls9, Inc. Production of branched chain fatty acids and derivatives thereof in recombinant microbial cells
US8859259B2 (en) 2010-02-14 2014-10-14 Ls9, Inc. Surfactant and cleaning compositions comprising microbially produced branched fatty alcohols
AR084377A1 (es) * 2010-04-08 2013-05-15 Ls9 Inc Metodos y composiciones relacionados con enzimas de alcohol graso biosintetico
US8372610B2 (en) 2010-09-15 2013-02-12 Ls9, Inc. Production of odd chain fatty acid derivatives in recombinant microbial cells
WO2012087963A1 (en) * 2010-12-20 2012-06-28 Targeted Growth, Inc. Modified photosynthetic microorganisms for producing lipids
CA3087554A1 (en) * 2011-01-14 2012-07-19 REG Life Sciences, LLC Production of branched chain fatty acids and derivatives thereof in recombinant microbial cells
CN102719467A (zh) * 2012-07-09 2012-10-10 武汉大学 一种利用脂肪酰acp还原酶生物合成脂肪醇的方法
JP6063585B2 (ja) * 2013-01-16 2017-01-18 アールイージー ライフ サイエンシズ リミテッド ライアビリティ カンパニー 改良された特性を有するアシル−acpレダクターゼ
JP7478517B2 (ja) 2019-04-24 2024-05-07 三菱商事ライフサイエンス株式会社 脂質活性代謝改善組成物

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