JP2016104031A - MHCクラスI制限hTERTエピトープをコードするポリヌクレオチド、それらの類似体またはポリエピトープ - Google Patents
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Abstract
Description
−HLA-A2に制限されているhTERTペプチドILAKFLHWL(Vonderheideら、Immunity 1999年;10:673〜9頁)、
−HLA-A関連(context)内の情報予測によって同定されたhTERTペプチドMPRAPRCRA、RPAEEATSL、RPSFLLSSL、及びAPRCRAVRS(WO00/02581)。しかし、これらのペプチドは、HLA-B7関連または任意のHLA関連のいずれにおいても、効率的なエピトープであることが実験結果によって確認されていない。
−HLA-A3に制限されているhTERTペプチドKLFGVLRLK(K973)(Vonderheideら、Clin Cancer Res 2001年;7:3343〜8頁)、並びに
−HLA-A24に制限されているhTERTペプチドVYAETKHFL(TEL324)及びVYGFVRACL(TEL461)(Araiら、Blood 2001年;9:2903〜7頁)。
−ペプチドの非存在下(ネガティブコントロール)、
−参照ペプチドの存在下(ポジティブコントロール)、及び
−試験されるペプチド(この場合、hTERTペプチド)の存在下で、
100ng/mlのヒトβ2-ミクログロブリンを補充された無血清培地AIM-V(Invitrogen社、Gibco)中、96ウェルプレート中に2×105細胞/ウェルで一晩インキュベーションする。
ペプチドを、0.1〜100μMの範囲の種々の最終濃度で(1μM及び10μMの中間濃度で)インキュベーションする。次いで、トランスフェクションされた細胞を、特定のHLA MHCクラスI分子を認識する抗体の飽和濃度で標識し、次に2回洗浄し、最終的にフローサイトメトリー前に二次抗体で染色する。結果は相対結合活性値として表され、これは、参照ペプチドの値を参照して最大結合の20%に達するのに必要な試験ペプチドの濃度比率である。それゆえ、この値が低くなるほど、結合が強くなる。この方法の後に、RA<1の場合、ペプチドは特定のHLAクラスI分子に対して高い相対親和性を有するといわれる。対照的に、RAが1〜5、好ましくは1〜3である場合、中程度の相対親和性と結論付けられる。
a. ATGCCGCGCGCTCCCCGCTGCCGAGCC(n1)、
b. GCTCCCCGCTGCCGAGCCGTGCGCTCCCTG(n4)、
c. GCCCCCTCCTTCCGCCAGGTGTCCTGCCTG(n68)、
d. AGACCCGCCGAAGAAGCCACCTCTTTG(n277)、
e. CGGCCCTCCTTCCTACTCAGCTCTCTG(n342)、
f. AGGCCCAGCCTGACTGGCGCTCGGAGGCTC(n351)、
g. GACCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444)、
h. TTCGTGCGGGCCTGCCTGCGCCGGCTG(n464)、
i. GCTGGGAGGAACATGCGTCGCAAACTC(n966)、
j. CTCCCGGGGACGACGCTGACTGCCCTG(n1107)、
k. CTGCCCTCAGACTTCAAGACCATCCTG(n1123)、及び
l. GCCCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444*)
からなる群から選択される少なくとも2つのポリヌクレオチド単位を含むか、またはそれらからなるポリヌクレオチドに関する。
−a. AGGCCCAGCCTGACTGGCGCTCGGAGGCTC(n351)
b. GCCCCCTCCTTCCGCCAGGTGTCCTGCCTG(n68)、
c. GCTCCCCGCTGCCGAGCCGTGCGCTCCCTG(n4)、
d. GACCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444)、
e. TTCGTGCGGGCCTGCCTGCGCCGGCTG(n464)、
f. GCTGGGAGGAACATGCGTCGCAAACTC(n966)、
g. CTCCCGGGGACGACGCTGACTGCCCTG(n1107)、
h. CTGCCCTCAGACTTCAAGACCATCCTG(n1123)、及び
i. GCCCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444*)、または前記に定義されたそれらの類似体から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位、並びに
j. ATGCCGCGCGCTCCCCGCTGCCGAGCC(n1)、
k. AGACCCGCCGAAGAAGCCACCTCTTTG(n277)、
l. CGGCCCTCCTTCCTACTCAGCTCTCTG(n342)、または前記に定義されたそれらの類似体から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位を含むポリヌクレオチド、
−a. AGGCCCAGCCTGACTGGCGCTCGGAGGCTC(n351)
b. GCCCCCTCCTTCCGCCAGGTGTCCTGCCTG(n68)、
c. GCTCCCCGCTGCCGAGCCGTGCGCTCCCTG(n4)、
d. GACCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444)、
e. TTCGTGCGGGCCTGCCTGCGCCGGCTG(n464)、
f. GCTGGGAGGAACATGCGTCGCAAACTC(n966)、
g. CTCCCGGGGACGACGCTGACTGCCCTG(n1107)、
h. CTGCCCTCAGACTTCAAGACCATCCTG(n1123)、及び
i. GCCCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444*)、または前記に定義されたそれらの類似体から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位を含むポリヌクレオチドもまた、本発明の一部を構成する。
a. MPRAPRCRA(p1)、
b. APRCRAVRSL(p4)、
c. APSFRQVSCL(p68)、
d. RPAEEATSL(p277)、
e. RPSFLLSSL(p342)、
f. RPSLTGARRL(p351)、
g. DPRRLVQLL(p444)、
h. FVRACLRRL(p464)、
i. AGRNMRRKL(p966)、
j. LPGTTLTAL(p1107)、及び
k. LPSPKFTIL(p1123)
からなる群から選択されるMHCクラスI制限、特にHLA-B7制限hTERTエピトープである。
a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. APRCRAVRSL(p4)、
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、
h. LPSPKFTIL(p1123)、及び
i. APRRLVQLL(p444*)
からなる群から選択される。
a. MPRAPRCRA(p1)、
b. APRCRAVRSL(p4)、
c. APSFRQVSCL(p68)、及び
d. RPSLTGARRL(p351)
からなる。
a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. APRCRAVRSL(p4)、
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、
h. LPSPKFTIL(p1123)、及び
i. APRRLVQLL(p444*)、
または少なくとも1つのアミノ酸残基の置換によって得られるそれらの類似体からなる群から選択され、且つ少なくとも1つが:
j. MPRAPRCRA(p1)、
k. RPAEEATSL(p277)、
l. RPSFLLSSL(p342)、
または少なくとも1つのアミノ酸残基の置換によって得られるそれらの類似体からなる群から選択され、前記ポリエピトープは、全長hTERTではない。
a. Tリンパ球を提供する工程;及び
b. 前記Tリンパ球を、本発明の少なくとも1つのエピトープまたはエピトープ類似体、またはポリエピトープとともに、前記リンパ球の活性化を可能にする条件でin vitro培養する工程;
を含む、クラスI制限、特にHLA-B7制限hTERTエピトープに対してTリンパ球を活性化させる方法に関する。
特定の実施形態において、活性化Tリンパ球は、細胞毒性Tリンパ球(CTL)である。Tリンパ球を活性化させる従来の条件は、インターロイキン(IL)2、IL-7、IL-12、及び/またはIL-15を用い、参照として本明細書に組み込まれているMinevら(2000年、PNAS;97(9):4796〜4801頁)に記載されている。
a. Tリンパ球を、本発明の少なくとも1つのエピトープまたはエピトープ類似体、またはポリエピトープとともに、適切な条件下でin vitro培養することによる、前記Tリンパ球を活性化させる工程;
b.前記活性化リンパ球を、MHCクラスI分子に結合している本発明のhTERTエピトープを細胞表面で発現している標的細胞とともに、好適な条件下でin vitro培養する工程;及び
c. 前記活性化リンパ球が、前記標的細胞に対して反応するかどうかを判定する工程;
を含む、hTERTペプチドの免疫原性挙動を調査する方法に関する。
a.前記に記載されたTリンパ球を、MPRAPRCRA(p1)、APRCRAVRSL(p4)、APSFRQVSCL(p68)、RPAEEATSL(p277)、RPSFLLSSL(p342)、RPSLTGARRL(p351)、DPRRLVQLL(p444)、FVRACLRRL(p464)、AGRNMRRKL(p966)、LPGTTLTAL(p1107)、及びLPSPKFTIL(p1123)の中から選択されるエピトープまたはAPRRLVQLL(p444*)等のエピトープ類似体、または前記に定義されたポリエピトープで活性化する工程;
b.前記活性化リンパ球を、HLA-B7分子に結合している本発明のhTERTエピトープを細胞表面で発現している標的細胞とともに、好適な条件下でin vitro培養する工程;及び
c. 前記活性化リンパ球が、前記標的細胞に対して反応するかどうかを判定する工程;を含む。
a. 細胞を提供する工程;
b. 少なくとも1つのMHCクラスI制限、特に本発明のHLA-B7制限hTERTエピトープまたはエピトープ類似体、またはポリエピトープを用いて、前記細胞の成熟を可能にする工程;及び
c. 場合によっては、前記成熟細胞の増殖を促進する工程;
を含む。
a. 樹状細胞を提供する工程;
b. 本発明の少なくとも1つのMHCクラスI制限hTERTエピトープまたはエピトープ類似体、またはポリエピトープを用いて、前記樹状細胞の成熟を可能にする工程;及び
c. 場合によっては、前記成熟樹状細胞の増殖を促進する工程;
を含む。
a. MPRAPRCRA(p1)、
b. APRCRAVRSL(p4)、
c. APSFRQVSCL(p68)、
d. RPAEEATSL(p277)、
e. RPSFLLSSL(p342)、
f. RPSLTGARRL(p351)
g. DPRRLVQLL(p444)、
h. FVRACLRRL(p464)、
i. AGRNMRRKL(p966)、
j. LPGTTLTAL(p1107)、及び
k. LPSPKFTIL(p1123)、
からなる群から選択されるHLA-B7-制限hTERTエピトープをコードする少なくとも1つのポリヌクレオチド単位、あるいはAPRRLVQLL(p444*)等の前記HLA-B7-制限hTERTの少なくとも1つの類似体、あるいは前記HLA-B7エピトープ及び/または類似体をコードする少なくとも2つのポリヌクレオチド単位を有するポリヌクレオチドを形成する任意の組合せを含む。
I−材料及び方法
<血液ドナー>
末梢血サンプルは、成人の健常血小板ドナー(centre de transfusion sanguine de I'hopital Mondor、Creteil、フランス)から、書面によるインフォームドコンセントに従って得た。末梢血ドナーのHLA分類は、H.Mondor.Hospital Creteil(フランス)のHLA研究室において実施された。前記試験は、フランス血液バンク機関(French Blood Bank Institute)によって承認された。
構成的マウスβ2-m分子(HLA-B7mα3)及びキメラHLA-A2.1/H2-Db分子を発現しているHHDトランスジェニックマウスと組み合わせて、HLA-B0702α1α2、H2-Kdα3キメラ構築物を発現しているHLA-*B0702トランスジェニック(Tg)マウスは、以前に記載されているように、それらのH2-Db及びH2-kb遺伝子を欠失していた(Pascoloら、J Exp Med、1997年;185:2043〜51頁;Rohrlichら、Int Immunol、2003年;15:765〜72頁)。これらのマウスはC57BL/6をバックグラウンドとしており、本発明者らの動物施設において、特定病原体未感染の条件下で飼育され、維持された。
T-BハイブリッドT1、EBV形質転換B細胞JY、腎臓癌細胞系U293T、及びBurkittリンパ腫細胞Rajiは、アメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(American type Culture Collection:ATCC)から入手した。メラノーマ細胞系(SK23MEL、LB34、及びKUL68)は、P.Coulie(ブリュッセル、ベルギー)からの好意で提供され、EBV形質転換B細胞BBG.1及びBC3は、H.Collandre(R.A.H.P.、グレノーブル、フランス)からの好意で提供された。
HLA-*B0702に結合することが予測される9アミノ酸(9量体)または10アミノ酸(10量体)ペプチドの存在についてhTERTのアミノ酸配列を分析するために、予測的アルゴリズム「SYFPEITHI」(Lu及びCelis E、Cancer Res、2000年;60:5223〜7頁)を用いた。標準的HLA-B7結合アンカー、2位にPro、及びカルボキシル末端に疎水性脂肪族(AlaまたはLeu)を含有する候補ペプチドを、それらの最高予測スコアに従って選択した。6種のペプチド、すなわちp1(MPRAPRCRA、残基1〜9)、p277(RPAEEATSL、残基277〜285)、及びp342(RPSFLLSSL、残基342〜350)と称される3種の10アミノ酸ペプチド、並びにp4(APRCRAVRSL、残基4〜13)、p68(APSFRQVSCL、残基68〜77)、及びp351(RPSLTGARRL、残基351〜360)と称される3種の9アミノ酸ペプチド(アンカー位置に下線を引いた)が保持され、合成された。
HLA-B0702でトランスフェクションされたT2(T2-B7)細胞に関する、MHC安定化アッセイを用いることによって、記載された(Rohrlichら、Int Immunol、2003年;15:765〜72頁)参照ペプチド(R10TV)と比較した、HLA-*B0702に対するhTERT由来ペプチドの相対的結合活性を測定した。要するに、種々の最終濃度(100、10、1、及び0.1μM)における、参照ペプチドR10VまたはhTERTペプチドのいずれかの非存在下(ネガティブコントロール)または存在下で、100ng/mlのヒトβ2-ミクログロブリンを添加した無血清培地AIM-V(Invitrogen社、Gibco)中、96ウェルプレートにおいて、T2-B7を2×105細胞/ウェルで一晩インキュベーションした。T2-B7細胞を飽和濃度の抗HLA-B7mAb、ME.1で標識し、次いで2回洗浄し、最後にFITC接合F(ab')2ヤギ抗マウスIgで染色して、フローサイトメトリーを行った。
8〜10週齢のメスHLA-*B0702トランスジェニックマウスに、フロイント不完全アジュバント(Difco、デトロイト、ミシガン州)中、共乳化された140μgのヘルパーペプチドを補充した50μgの個々のHLA-B0702制限hTERTペプチドを、尾基部に皮下注射(s.c.)した。10日後、個々のマウスの脾臓細胞を6ウェルのプレート中で、関連ペプチドを用いてin vitroで再活性化した。関連ペプチドまたはネガティブコントロールペプチドでパルス化された、HLA-*B0702でトランスフェクションされたRMA細胞(RMA-B7)を用いて、エフェクターCTL細胞を、標準的な4〜5時間51Cr放出アッセイにおいて試験した。特異的溶解≧10%が観察された場合、マウスを応答動物であると見なす。
CMVプロモーターの制御下、hTERT遺伝子をコードするLvCMV-hTERTプラスミドベクターを、エンドトキシンのない条件下でのプラスミドGigaキットカラム(Qiagen)上で精製した。麻酔したHLA-*B0702トランスジェニックマウスの再生前脛骨筋内に、前記プラスミドを注入した(各側に50μg)。14日後、個々のマウスの脾臓細胞を、Con Aで活性化したラット脾臓細胞からの10%上清を補充した完全培地中、ペプチドでパルス化された(10μg/ml)同系のγ照射(50Gy)LPS-リンパ芽球を用いてin vitroで再活性化した。記載されたとおり、細胞毒性アッセイを6日間実施した。
まず、pBABE-hygro-hTERTプラスミド(Counterら、Proc Natl Acad Sci U.S.A.1998年;95:14723〜8頁)由来のEcoRI-SalI hTERT挿入物を、pSP73ベクター(Promega)内にサブクローニングすることによって、pTRIP-デルタU3-CMV-hTERT(TRIPLv-hTERTまたはLv-hTERT、またはpTrip-hTERTと称される)(図7)構築物を作製した。次いで、BamHI及びXhoIで切断されたpTRIP-CMVプラスミド内に、BglII-SalI断片を挿入した。記載されているとおり、293T細胞の一過性の(48時間)トランスフェクションにより、擬似組換えレトロウイルス粒子を作製した(Zennouら、Cell、2000年;14:101:173頁;Firatら、J Gene Med、2002年;4:38〜45頁)。組換えレトロウイルス粒子を、超遠心によって濃縮し、PBS中に再懸濁した。ベクター粒子の量を、市販のELISAアッセイにおけるp24タンパク質のものから推定した(NEN、DUPONT、France Perkin Elmer)。
1500ngのTripLv-hTERT懸濁液またはコントロールベクターの単回皮下(尾基部)注入と同様に、TRIPLv-hTERTを用いた免疫化を実施した。
以前に記載されているようなIFN-γELISPOTアッセイによって、免疫化マウスからのペプチド特異的T細胞を検出した(Miyahiraら、J Immunol Methods、1995年;181:45〜54頁)。抗マウスIFN-γmAb's(3μg/ml;Pharmigen、Becton Dickinson biosciences)を、96ウェルニトロセルロースマイクロプレート(マルチスクリーン;Millipore社、モルスハイム、フランス)上にコーティングした。赤血球溶解後、個々のマウスの新鮮な単離脾臓リンパ球(5×105、2.5×105、及び1.25×105細胞/ウェル)を、5μgの天然hTERTペプチドとともに、またはなしで、37℃で18時間、直接培養した。洗浄後、当該プレートを、ビオチン化抗マウスIFN-γ(2μg/ml;Pharmigen、Becton Dickinson biosciences)とともに2時間インキュベーションした。最後に、当該プレートを洗浄し、アルカリホスファターゼ接合ストレプトアビジン(Roche molecular biochemicals、マンハイム、ドイツ)とともに37℃で1時間インキュベーションした。ポジティブコントロールは、ホルボール・ミリステート・アセテート(100ng/ml、Sigma)、及びイオノマイシン(1μg/ml)で刺激した細胞を含む。ペルオキシダーゼ基質(BCIP/NBT、Promega社、マジソンW;米国)を加えることによって、IFN-γスポット形成細胞(SFC)を展開し、自動化画像分析システムBioreader 2000(Biosys、カルベン、ドイツ)を用いてカウントした。ネガティブコントロール値(<10SFC)を減算した後、特異的SFCの数を算出した。刺激されたウェル中のSFCの平均が、ネガティブコントロールウェル中のSFCの平均+2S.D.よりも大きく、且つ50SFC/106細胞よりも大きい場合、応答は陽性であった。
以前に記載されているような標準的な4〜5時間51Cr放出アッセイを用いることによって、細胞毒性アッセイを実施した(Firatら、J Gene Med、2002年;4:38〜45頁)。コントロールペプチド関して観察された非特異的溶解を減算することことによって、%での特異的溶解を算出した。特異的溶解≧10%が観察された場合、マウスを応答動物と見なした。
以前に記載されているような、HLA-B0702制限のhTERTペプチドを用いた、4週間のin vitroでのPBMC再活性化後、ドナーからヒトCTLを得た(Hernandezら、Proc Natl Acad Sci U.S.A.、2002年;99:12275〜80頁)。要するに、フィコール精製ヒトPBMCを解凍し、加熱不活化10%ヒト血清(Institut Jacques Boy、レイムス、フランス)を補充したRPMI 1640、1mMのピルビン酸ナトリウム、100IU/mlのペニシリン、100μg/mlのストレプトマイシン、10mMのHEPES、5×10〜5Mの2-メルカプトエタノール中、24ウェルプレート中でインキュベーションした(4×106/ウェル)。それらを、各hTERTペプチド(10μg/ml)で刺激し、組換えヒトIL-7(20ng/ml;R&D Systems)を加えた。
1.HLA-*B0702で予測されたhTERT由来のペプチドの免疫原性
T細胞エピトープ予測プログラムを用いることによって、本発明者らは、hTERTタンパク質配列を分析し、それらの高い予測スコア(表1)により、6種のペプチド(3種の9量体、3種の10量体)を維持した。次に、それらのHLA-B0702分子への結合能を、HLA-B0702遺伝子でトランスフェクションされた抗原−トランスポーター(TAP)欠失T2細胞(T2-B7)を用いることによって試験した。3種のペプチド、p1、p4、及びp68は、それぞれ高い相対的親和性(RA≦1)を示し、他の3種、p277、p342、及びp351は、中程度のRA>1を示した(表1)。これらのデータは、これら6種のペプチドがHLA-B0702に対する優れた結合物質であることを示している。従って、小胞体内部で形成されたこのような複合体が腫瘍細胞の表面に到達し、CTL認識に利用可能であることが予測され得る。
同定されたこれら6種のhTERTエピトープに対するHLA-B0702分子との関連で、内在的に合成されたhTERTペプチドの提示を評価するために、HLA-*B0702トランスジェニックマウスを、hTERTをコードするcDNAで免疫化し、40日後、個々のマウスの脾臓細胞内のペプチド特異的CTL応答を評価した。図2に示されるように、p4、p68、p1、p277、及びp351に関して、マウスの50%〜80%の大部分の免疫化マウス(M)において、hTERTペプチド特異的CTLが誘発された。対照的に、p342特異的CTLは、試験されたマウスの約15%で誘発され得た。有意なhTERT特異的CTL応答は、非免疫化無処理マウスからも誘発されなかった。従って、これら6種のhTERTエピトープは、細胞内で効果的にプロセシングされる。さらに、アミノ酸配列または構造の点において合成ペプチドと類似した天然ペプチドは、当該細胞表面上の対応するHLA-*B0702分子によって提示される。
In vitro免疫化プロトコルにおけるHLA-B0702健常ドナーのPBMCを用いることによって、hTERTペプチドがHLA-B7制限CTLの上昇において有効であるかどうかを試験した。10個体のうち8個体(d1〜d8)においてCTL応答が生じ、ペプチド特異的CTL応答は、p342(20%)を除いて、ドナーの少なくとも50%で得られた(図3)。In vitroで生じたCTLによるhTERTエピトープの認識は、それらの遺伝的バックグラウンドに応じてドナー間で変化する(図3)。従って、HLA-B0702健常ドナーのランダム試験によって、これらのhTERTペプチドはヒトにおいて免疫原性であることが明白に確認され、hTERTに対する特異的CTL前駆体は末梢成人レパートリーにおいて欠失していないことが示唆される。従って、健常ドナーから生じたCTL系がHLA適合hTERT+腫瘍細胞を死滅させることができるかどうかを探索した。
種々の由来のヒト腫瘍細胞系を溶解させる能力について、ドナーからのhTERT特異的CTLを試験した。表2に示されている結果は、健常ドナー由来のin vitroで生じたCTL系はHLA-B0702+腫瘍細胞を死滅させるが、他方、HLA-B0702-腫瘍に対する細胞毒性は検出されなかったことを示している。[例えば、KU L268または293-UT標的における、d1、d2、及びd3でのCTLp351(それぞれ、52、25、20%、及び34、41、19%)対T1またはBBG1標的におけるもの(それぞれ、9、2、6%、及び0、0、2%)を参照]。CTL特異性に従って、腫瘍認識に違いが観察されたが、このことは、腫瘍細胞の表面上のhTERTペプチドの差異的な差異によって説明できるであろう。重要なことには、種々のドナーから生じたp351特異的CTL系が、試験された腫瘍細胞系の大多数を認識することである(表2)。対照的に、すべてのp4特異的CTL系が、試験された腫瘍のすべてのタイプを溶解するわけではない。p1及びp68ペプチドに特異的なCTL系は、T1-B7標的のみを認識する。p342特異的CTL系は、メラノーマ細胞(LB 34及びKU 268標的)のみを認識する。最後に、p277特異的CTL系は、腎臓癌(293 UT)を認識するが、メラノーマ細胞もリンパ腫細胞のどちらも認識しない。他方、正常PBMC及びCD40活性化B細胞は、HLAのタイプに関わらず、これらのhTERTペプチド特異的CTL系によって溶解されなかった(表2の最後の2つの系)。
次いで、本発明者らは、HIV由来フラップベクター内に導入された、全長hTERT遺伝子または機能的でないhTERT遺伝子のいずれかを含む候補ワクチンを試験した(図7)。このタイプのレンチウイルスベクターは、in vitro及びin vivoで樹状細胞を標的とし、動物において強い多特異的抗腫瘍CTL応答を誘発することが、以前のデータによって示されている。従って、本発明者らは、組換えLv-hTERTまたはpTRIP-CMV-ΔhTERTを用いて、HLA-*B0702トランスジェニックマウスを免疫化した。12日後、個々のマウスの脾臓細胞を、ex vivo ELISPOTアッセイによって評価した。
In vivo免疫原であり、且つH-2クラスIノックアウトHLA-B0702トランスジェニックマウスにおいてプロセシングされる、新規なhTERTエピトープが同定された。さらに、in vitroにおいて、健常ドナーからのHLA-B702+PBLを用いたhTERTペプチド免疫化は、種々の由来のhTERT+腫瘍を認識する特異的CTL応答を誘発し、ヒトT細胞レパートリーにおいてこれらのエピトープに対する欠失がないことを示唆している。さらに、腫瘍の由来に応じて細胞表面上に発現されるペプチドレパートリーは質的に異なっていることが示され、hTERTを癌細胞の周囲の(circumvent)抗原変異性に対するポリエピトープ腫瘍関連抗原として特徴づけするための有用性を明確に示している。最後に、ヒト化HLA-*B0702及びHLA-A2 1トランスジェニックマウスを用いて、新世代のレンチウイルス由来フラップベクター内に挿入された機能的でないテロメラーゼ遺伝子からなる候補ワクチンを試験した。すべての当該HLAトランスジェニックマウスにおいて、強力なhTERT特異的CD8+T細胞応答が観察された。これらのデータは、癌患者における治療的ワクチン接種の使用を支持し、多くの癌患者を網羅するための治療標的としてのhTERTの潜在的適用性を広げている。
Claims (74)
- HLA-B7制限免疫応答の誘発に使用するための、
a. MPRAPRCRA(p1)、
b. APRCRAVRSL(p4)、
c. APSFRQVSCL(p68)、
d. RPAEEATSL(p277)、
e. RPSFLLSSL(p342)、
f. RPSLTGARRL(p351)
g. DPRRLVQLL(p444)、
h. FVRACLRRL(p464)、
i. AGRNMRRKL(p966)、
j. LPGTTLTAL(p1107)、及び
k. LPSPKFTIL(p1123)
からなる群から選択されるhTERT(ヒトテロメラーゼ逆転写酵素)エピトープをコードするポリヌクレオチド。 - a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. APRCRAVRSL(p4)、
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、及び
h. LPSPKFTIL(p1123)
からなる群から選択されるHLA-B7制限hTERTエピトープをコードするポリヌクレオチド。 - 少なくとも1つのアミノ酸置換によって改変され、且つHLA-B7制限エピトープ類似体をコードする、請求項1または2に記載のポリヌクレオチド。
- 前記少なくとも1つの置換が2位に位置していない、請求項3に記載のポリヌクレオチド。
- 前記少なくとも1つの置換が最後のC末端位に位置していない、請求項3または4に記載のポリヌクレオチド。
- 前記少なくとも1つの置換が1位に位置する、請求項3から5のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 1位に位置したアミノ酸がアラニン(A)によって置換される、請求項3から6のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- ペプチド配列APRRLVQLL(p444*)をコードする、請求項3から7のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記類似体が、その野生型対応物よりもHLA-B7分子に対して高い親和性を有する、請求項3から8のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記類似体が、その野生型対応物よりも高い免疫原性を有する、請求項3から9のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- ポリエピトープをコードし、且つ請求項2に記載のHLA-B7制限hTERTエピトープをコードするポリヌクレオチド及び/または請求項3から9のいずれか一項に記載のHLA-B7制限エピトープ類似体をコードするポリヌクレオチドの間で選択される少なくとも2つのポリヌクレオチド単位を含むポリヌクレオチドであって、全長hTERTのコード配列ではないポリヌクレオチド。
- ポリエピトープをコードし、且つ
a. MPRAPRCRA(p1)、
b. APRCRAVRSL(p4)、
c. APSFRQVSCL(p68)、
d. RPAEEATSL(p277)、
e. RPSFLLSSL(p342)、
f. RPSLTGARRL(p351)、
g. DPRRLVQLL(p444)、
h. FVRACLRRL(p464)、
i. AGRNMRRKL(p966)、
j. LPGTTLTAL(p1107)、及び
k. LPSPKFTIL(p1123)
からなる群から選択されるHLA-B7制限hTERTエピトープをコードするポリヌクレオチド及び/またはそれらの類似体をコードするポリヌクレオチドの間で選択される少なくとも2つのポリヌクレオチド単位を含むポリヌクレオチドであって、全長hTERTのコード配列ではないポリヌクレオチド。 - −請求項2に記載のHLA-B7制限hTERTエピトープをコードするポリヌクレオチド及び/または請求項3から9のいずれか一項に記載のHLA-B7制限エピトープ類似体をコードするポリヌクレオチドの間で選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位;並びに
−配列MPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、またはRPSFLLSSL(p342)、あるいはそれらの類似体の間で選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位であって、前記ポリヌクレオチドが、全長hTERTのコード配列ではないポリヌクレオチド単位;
を含む、ポリエピトープをコードする請求項12に記載のポリヌクレオチド。 - 各ポリヌクレオチド単位がMHCクラスI制限hTERTエピトープをコードする2〜10のポリヌクレオチド単位を含む、請求項11から13のいずれか一項に記載のポリエピトープをコードするポリヌクレオチド。
- hTERTタンパク質の切断型または変異型をコードする核酸分子からなる、請求項11から14のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- hTERTタンパク質の前記切断型または変異型がその触媒活性を失っている、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- hTERTタンパク質の前記切断型または変異型が触媒活性ドメインを欠失している、請求項15に記載のポリヌクレオチド。
- 前記少なくとも2つのポリヌクレオチド単位が連続的に配列されている、請求項11から13のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記p1、p4、p68、p277、p342、及びp351エピトープ、またはそれらの類似体をコードするポリヌクレオチド単位を少なくとも含む、請求項11から18のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- ポリペプチド配列:
MPRAPRCRAAPRCRAVRSLAPSFRQVSCLRPAEEATSLRPSFLLSSLRPSLTGARRLをコードする核酸分子を含むか、またはそれからなる、請求項19に記載のポリヌクレオチド。 - 前記少なくとも2つのポリヌクレオチド単位が、1つのアミノ酸スペーサーまたはペプチドスペーサーをコードするポリヌクレオチドによって分離されている、請求項11から17のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記スペーサーが:
a. C末端位に陽電荷残基または酸性残基を有する4アミノ酸ペプチド;
b. C末端位に陽電荷残基または酸性残基を、且つ他の位置に親水性残基(A、K、D、及び/またはT)を有する4アミノ酸ペプチド;並びに
c. C末端位にアルギニン(R)を、且つ他の位置に親水性残基(A、K、D、及び/またはT)を含む4アミノ酸ペプチド;
の群から選択される、請求項21に記載のポリヌクレオチド。 - 少なくとも2つのエピトープのうち最もN末端側のエピトープをコードするポリヌクレオチド単位に作動可能に連結された、標的シグナルをコードするポリヌクレオチドをさらに含む、請求項11から22のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- 前記標的シグナルが小胞体シグナル配列である、請求項23に記載のポリヌクレオチド。
- 前記最もN末端側のエピトープが、1位にメチオニン残基を有さない場合、少なくとも2つのエピトープのうち前記最もN末端側のエピトープをコードするポリヌクレオチド単位の上流に位置し、且つ作動可能に連結されたメチオニン残基をコードするコドンを含む、請求項11から24のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- HLA-B7制限免疫応答の誘発に使用するための、請求項11から25のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。
- a. AGGCCCAGCCTGACTGGCGCTCGGAGGCTC(n351)、
b. GCCCCCTCCTTCCGCCAGGTGTCCTGCCTG(n68)、
c. GCTCCCCGCTGCCGAGCCGTGCGCTCCCTG(n4)、
d. GACCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444)、
e. TTCGTGCGGGCCTGCCTGCGCCGGCTG(n464)、
f. GCTGGGAGGAACATGCGTCGCAAACTC(n966)、
g. CTCCCGGGGACGACGCTGACTGCCCTG(n1107)、
h. CTGCCCTCAGACTTCAAGACCATCCTG(n1123)、及び
i. GCCCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444*)
から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位を含むか、またはこれらのポリヌクレオチド単位もしくはその類似体のうち少なくとも2つの任意の組合せを含み、前記ポリヌクレオチド単位が、MHCクラスI制限hTERTエピトープをコードする、請求項1から26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。 - a. AGGCCCAGCCTGACTGGCGCTCGGAGGCTC(n351)
b. GCCCCCTCCTTCCGCCAGGTGTCCTGCCTG(n68)、
c. GCTCCCCGCTGCCGAGCCGTGCGCTCCCTG(n4)、
d. GACCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444)、
e. TTCGTGCGGGCCTGCCTGCGCCGGCTG(n464)、
f. GCTGGGAGGAACATGCGTCGCAAACTC(n966)、
g. CTCCCGGGGACGACGCTGACTGCCCTG(n1107)、
h. CTGCCCTCAGACTTCAAGACCATCCTG(n1123)、及び
i. GCCCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444*)、またはそれらの類似体
から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位、並びに
j. ATGCCGCGCGCTCCCCGCTGCCGAGCC(n1)、
k. AGACCCGCCGAAGAAGCCACCTCTTTG(n277)、
l. CGGCCCTCCTTCCTACTCAGCTCTCTG(n342)、またはそれらの類似体
から選択される少なくとも1つのポリヌクレオチド単位を含む、請求項1から26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。 - a. AGGCCCAGCCTGACTGGCGCTCGGAGGCTC(n351)
b. GCCCCCTCCTTCCGCCAGGTGTCCTGCCTG(n68)、
c. GCTCCCCGCTGCCGAGCCGTGCGCTCCCTG(n4)、
d. GACCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444)、
e. TTCGTGCGGGCCTGCCTGCGCCGGCTG(n464)、
f. GCTGGGAGGAACATGCGTCGCAAACTC(n966)、
g. CTCCCGGGGACGACGCTGACTGCCCTG(n1107)、
h. CTGCCCTCAGACTTCAAGACCATCCTG(n1123)、
i. GCCCCCCGTCGCCTGGTGCAGCTGCTC(n444*)
j. ATGCCGCGCGCTCCCCGCTGCCGAGCC(n1)、
k. AGACCCGCCGAAGAAGCCACCTCTTTG(n277)、及び
l. CGGCCCTCCTTCCTACTCAGCTCTCTG(n342)、またはそれらの類似体
から選択される少なくとも2つのポリヌクレオチド単位を含む、請求項1から26のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド。 - 図9または図10に示されているヌクレオチド配列を含むか、またはそれからなる、請求項16に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1から30のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドを含む発現ベクター。
- 2006年7月28日に番号CNCM I-3660の下でCNCM(パスツール研究所、パリ、フランス)に寄託されたpTRIP-CMV-ΔhTERTベクターである、請求項31に記載の発現ベクター。
- 2006年7月28日に番号CNCM I-3660の下でCNCMに寄託されたpTRIP-CMV-ΔhTERTベクターであって、欠失したhTERT配列が請求項1から30のいずれか一項に定義されたポリヌクレオチドによって置換されている、請求項31に記載の発現ベクター。
- 請求項31から33のいずれか一項に記載のベクターを含む宿主細胞。
- 請求項2から30のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドで遺伝的に形質転換された宿主細胞。
- 抗原提示細胞(APC)である、請求項34または35に記載の宿主細胞。
- 樹状細胞(DC)である、請求項36に記載の宿主細胞。
- ex vivoで完全に成熟させたDCである、請求項37に記載の宿主細胞。
- 非ヒト哺乳動物細胞である、請求項34から38のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 単離ヒト細胞である、請求項34から38のいずれか一項に記載の宿主細胞。
- 2006年7月28日に番号CNCM I-3660の下でCNCMに寄託された宿主細胞である、請求項34または35に記載の宿主細胞。
- hTERTに対するHLA-B7制限免疫応答の誘発に使用するための、請求項31から41のいずれか一項に記載の発現ベクターまたは宿主細胞。
- 請求項2から29のいずれか一項に記載のポリヌクレオチドによってコードされているポリペプチド。
- a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. APRCRAVRSL(p4)、
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、
h. LPSPKFTIL(p1123)、及び
i. APRRLVQLL(p444*)
からなる群から選択されるMHCクラスI制限hTERTエピトープまたは類似体。 - a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. MPRAPRCRA(p1)、
d. APRCRAVRSL(p4)、
e. RPAEEATSL(p277)、
f. RPSFLLSSL(p342)、
g. DPRRLVQLL(p444)、
h. FVRACLRRL(p464)、
i. AGRNMRRKL(p966)、
j. LPGTTLTAL(p1107)、及び
k. LPSPKFTIL(p1123)、
または少なくとも1つのアミノ酸残基の置換によって得られるそれらの類似体からなる群から選択される少なくとも2つのエピトープを含むポリエピトープであって、全長hTERTではないポリエピトープ。 - 少なくとも2つのエピトープを含み、少なくとも1つは、
a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. APRCRAVRSL(p4)、
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、及び
h. LPSPKFTIL(p1123)、
または少なくとも1つのアミノ酸残基の置換によって得られるそれらの類似体からなる群から選択され、且つ少なくとも1つが、
j. MPRAPRCRA(p1)、
k. RPAEEATSL(p277)、
l. RPSFLLSSL(p342)、
または少なくとも1つのアミノ酸残基の置換によって得られるそれらの類似体からなる群から選択される請求項45に記載のポリエピトープであって、全長hTERTではないポリエピトープ。 - a. RPSLTGARRL(p351)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. APRCRAVRSL(p4)、
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、及び
h. LPSPKFTIL(p1123)、
または少なくとも1つのアミノ酸残基の置換によって得られるそれらの類似体の群から選択される少なくとも2つのエピトープを含む請求項45に記載のポリエピトープであって、全長hTERTではないポリエピトープ。 - 2〜10のhTERTエピトープまたはそれらの類似体を含む、請求項45から47のいずれか一項に記載のポリエピトープ。
- ペプチド配列:
MPRAPRCRAAPRCRAVRSLAPSFRQVSCLRPAEEATSLRPSFLLSSLRPSLTGARRLを含むか、またはそれからなる、請求項45から48のいずれか一項に記載のポリエピトープ。 - a. 請求項2から30のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド;
b. 請求項31から33のいずれか一項に記載のベクター;
c. 請求項34から41のいずれか一項に記載の宿主細胞;及び
d. 請求項43から49のいずれか一項に記載のポリペプチド;
からなる群から選択される少なくとも1つの成分を含む組成物。 - in vivo投与に適している、請求項50に記載の組成物。
- 前記ポリヌクレオチドが、HLA-B7のものとは異なるMHCクラスI対立遺伝子に制限された、少なくとも1つのhTERTエピトープまたはその類似体、あるいはポリエピトープをさらにコードする、請求項50に記載の組成物。
- 前記ポリヌクレオチドが、MHCクラスIIに制限された、少なくとも1つのhTERTエピトープまたはその類似体、あるいはポリエピトープをさらにコードする、請求項50から52のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ポリヌクレオチドが、少なくとも1つの腫瘍特異的抗原(TSA)をさらにコードする、請求項50から53のいずれか一項に記載の組成物。
- 前記ポリヌクレオチドが、少なくとも1つの腫瘍関連抗原(TAA)をさらにコードする、請求項50から53のいずれか一項に記載の組成物。
- アジュバント、ビヒクル、及び/または製薬上許容され得るキャリアをさらに含む、請求項50から55のいずれか一項に記載の治療用組成物。
- 細胞による前記ポリヌクレオチドの取込みを促進させる少なくとも1つの成分をさらに含む、請求項56に記載の治療用組成物。
- a. Tリンパ球を提供する工程;及び
b. 前記Tリンパ球を、請求項43から49のいずれか一項に記載の少なくとも1つのエピトープ、エピトープ類似体、またはポリエピトープ、あるいはMPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、及びRPSFLLSSL(p342)の中から選択されるエピトープとともに、前記リンパ球の活性化を可能にする条件でin vitro培養する工程;
を含む、HLA-B7制限hTERTエピトープに対するTリンパ球の活性化方法。 - a. 請求項58に記載のTリンパ球を、請求項43から49のいずれか一項に記載のエピトープまたはエピトープ類似体またはポリエピトープで活性化する工程;
b.前記活性化リンパ球を、MHCクラスI分子に結合している請求項2に記載のhTERTエピトープを細胞表面で発現している標的細胞とともに、好適な条件でin vitro培養する工程;及び
c. 前記活性化リンパ球が、前記標的細胞に対して反応するかどうかを判定する工程;
を含む、hTERTペプチドの免疫原性挙動を調査する方法。 - a. 請求項58に記載のTリンパ球を、請求項43から49のいずれか一項に記載のエピトープまたはエピトープ類似体またはポリエピトープ、あるいはMPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、及びRPSFLLSSL(p342)の中から選択されるエピトープで活性化する工程;
b.前記活性化リンパ球を、HLA-B7分子に結合している請求項2に記載の、あるいは配列MPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、またはRPSFLLSSL(p342)を有するhTERTエピトープを細胞表面で発現している標的細胞とともに、好適な条件でin vitro培養する工程;及び
c. 前記活性化リンパ球が、前記標的細胞に対して反応するかどうかを判定する工程;
を含む、hTERTペプチドの免疫原性挙動及びHLA-B7制限性を調査する方法。 - ステップc.において、前記活性化リンパ球が前記標的細胞を死滅させる、請求項60に記載の方法。
- 活性化を可能にする条件が、RPMI培地中、37℃で4時間の接触である、請求項60または61に記載の方法。
- a. 細胞を提供する工程;
b. 請求項43から49に記載の少なくとも1つのHLA-B7制限hTERTエピトープまたはエピトープ類似体またはポリエピトープ、あるいはMPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、RPSFLLSSL(p342)の中から選択されるエピトープを用いて、前記細胞の成熟を可能にする工程;及び
c. 場合によっては、前記成熟細胞の増殖を促進する工程;
を含む、HLA-B7制限hTERTエピトープに対する細胞のin vitro成熟方法。 - 前記細胞が樹状細胞である、請求項63に記載の方法。
- 前記樹状細胞が、循環血液または骨髄細胞のいずれかから単離される、請求項64に記載の方法。
- 前記樹状細胞が、治療を必要としている患者からまたはHLA適合ドナーから単離される、請求項64または65に記載の方法。
- 前記細胞が少なくとも1つのHLA-B7対立遺伝子を発現している、請求項63から66のいずれか一項に記載の方法。
- ステップb.が、請求項2から29のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、または配列MPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、及びRPSFLLSSL(p342)をコードするポリヌクレオチド、または配列ATGCCGCGCGCTCCCCGCTGCCGAGCC(n1)、AGACCCGCCGAAGAAGCCACCTCTTTG(n277)、もしくはCGGCCCTCCTTCCTACTCAGCTCTCTG(n342)からなるポリヌクレオチドによる、前記樹状細胞の遺伝的形質転換を含む、請求項64から67のいずれか一項に記載の方法。
- ステップb.が、請求項30に記載のベクターによる前記樹状細胞の形質転換を含む、請求項64から67のいずれか一項に記載の方法。
- ステップb.が、前記樹状細胞と、請求項39から45に記載の少なくとも1つのエピトープ、エピトープ類似体、またはポリエピトープ、あるいはMPRAPRCRA(p1)、RPAEEATSL(p277)、RPSFLLSSL(p342)の中から選択されるエピトープとの接触を含む、請求項64から67のいずれか一項に記載の方法。
- 癌の予防及び/または治療に使用するための、HLA-B7制限hTERTエピトープまたはその類似体、あるいは少なくとも1つのHLA-B7制限hTERTエピトープまたはその類似体を含むポリエピトープをコードするポリヌクレオチドであって、全長hTERTのコード配列ではないポリヌクレオチド。
- 前記HLA-B7制限hTERTエピトープまたは類似体が、
a. APRCRAVRSL(p4)、
b. APSFRQVSCL(p68)、
c. RPSLTGARRL(p351)
d. DPRRLVQLL(p444)、
e. FVRACLRRL(p464)、
f. AGRNMRRKL(p966)、
g. LPGTTLTAL(p1107)、
h. LPSPKFTIL(p1123)、及び
i. APRRLVQLL(p444*)
からなる群から選択される、請求項71に記載のポリヌクレオチド。 - 癌の予防及び/または治療に使用するための、請求項2から30のいずれか一項に記載のポリヌクレオチド、請求項31から33のいずれか一項に記載のベクター、請求項34から42のいずれか一項に記載の宿主細胞、または請求項43から49のいずれか一項に記載のポリペプチド。
- HLA-B7制限免疫応答の誘発に使用するための、
a. MPRAPRCRA(p1)、
b. APRCRAVRSL(p4)、
c. APSFRQVSCL(p68)、
d. RPAEEATSL(p277)、
e. RPSFLLSSL(p342)、
f. RPSLTGARRL(p351)
g. DPRRLVQLL(p444)、
h. FVRACLRRL(p464)、
i. AGRNMRRKL(p966)、
j. LPGTTLTAL(p1107)、
k. LPSPKFTIL(p1123)、及び
l. APRRLVQLL(p444*)
からなる群から選択されるhTERTエピトープまたは類似体。
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