JP2014530819A - 酢酸グラチラマーに対する臨床的応答性を予測するために有用な一塩基多形 - Google Patents

酢酸グラチラマーに対する臨床的応答性を予測するために有用な一塩基多形 Download PDF

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Abstract

多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物で治療する方法であって:一以上の一塩基多形(SNP)における患者の遺伝子型を決定する工程と;前記決定されたSNP遺伝子型に基づいて、前記患者を酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは非応答者として同定する工程と;前記患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される場合にのみ、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物を前記患者に投与する工程を具備する方法が提供される。

Description

発明の分野
この出願は、2012年4月20日に出願された米国仮出願第61/636,560号、および2011年10月10に出願された米国出願第61/545,282号の利益を主張するものであり、その全ての内容を本明細書の一部として援用する。
この出願を通じて、様々な出版物を括弧内の完全な引用により参照する。これら刊行物の全目録は、特許請求の範囲の直前の明細書の最後に見ることができる。これら刊行物の開示は、ここに記載する発明の発明日における当該技術の状態をより完全に記述するために、それらの全体を本明細書の一部として本願に援用する。
発明の背景
<多発性硬化症>
多発性硬化症(MS)は、中枢神経系(CNS)の慢性かつ衰弱性の自己免疫疾患であり、再発−寛解型(RR)または進行性の経過を辿って神経性の痴呆(deterioration)および能力障害へと導く。初期の診断時においてRRMSは該疾患の最も普通の形態であり(1)、これは神経学的機能不全(再発)の予期し得ない急性の発症と、それに続く多様な回復、および臨床的安定期を特徴とする。RRMS患者の大多数は、最終的には、重畳した再発を伴った、または伴わない二次的進行性(SP)の疾患を発症する。患者の約15%は、開始時から彼らの神経学的機能の持続的痴呆(deterioration)を発症する;この形態は一次的進行性(PP)のMSと称される。単回の臨床的事象(臨床的に摘出された症候群または「CIS」)を経験した患者、およびそれに続く磁気共鳴撮像(MRI)走査の際に、マクドナルドの基準に従って病巣播種を示す患者はまた、再発性MSを有すると看做される(2)。
MSは、罹病率が世界中で顕著に変化すると共に、成人青年における慢性の神経学的能力障害の最も共通の原因である(3,4)。アンダーソン等は、1990年に、合衆国には医師が診断した約350,000人のMS患者(人口100,000人当たり約140人)が存在すると見積もった(5)。世界中では約250億人が罹患していると見積もられる(6)。一般に、MSの罹病率および発症は世界中で増大する傾向にあるが、この傾向についての理由は十分には理解されていない(5)。
現在の治療的アプローチは、i)対症的治療、ii)副腎皮質ステロイドを用いた急性再発の治療、およびiii)該疾患の経過を修飾することを目的とした治療からなっている。現在のところ承認された治療は、該疾患の炎症プロセスを標的としている。その殆どは免疫調節剤として作用すると考えられるが、それらの作用機構は未だ完全には解明されていない。従来の治療が失敗した後に、免疫抑制剤または細胞障害剤もまた幾人かの患者に使用される。RR−MSの治療のために幾つかの薬剤が承認され、効果的であることが臨床的に確認されている;これにはベタステロン(BETASERON)[登録商標]、アボネックス(AVONEX)[登録商標]およびレビフ(EBIF)[登録商標]が含まれが、これらはサイトカインであるインターフェロンβの誘導体で、そのMSにおける作用機序は一般にその免疫調節効果に起因するものであり、炎症促進反応に拮抗し、またサプレッサー細胞を誘導することにある(7)。MSの治療のための他の承認された薬物には、ミトキサントロン(Mitoxantrone)およびナタリズマブ(Natalizumab)が含まれる。
<酢酸グラチラマー>
酢酸グラチラマー(GA)は、コパキソン(COPAXONE)[登録商標]における活性物質であり、再発寛解型多発性硬化症(RRMS)における再発の頻度低減を適応対象として認可されている。RR−MSにおける再発率および能力障害の蓄積を低下させるその効果は、他の入手可能な免疫調節療法のそれに匹敵する(8,9,10)。酢酸グラチラマーは、四つの天然に存在するアミノ酸:即ち、L−グルタミン酸、L−アラニン、L−チロシン、およびL−リジンを含む合成ポリペプチドの酢酸塩からなっている。酢酸グラチラマーの平均分子量は、5,000〜9,000ダルトンである。20mgの標準1日投与量において、GAは一般に良好な耐容性を示すが、該薬物に対する反応は不定である。種々の臨床試験において、GAはRR−MSの患者における再発率および能力障害の進行を減少させた。GAの治療効果は、種々の臨床センターからの磁気共鳴撮像(MRE)所見の結果(11)によって支持されるが、GA治療に対する応答性が確認された予測的バイオマーカーは存在しない。
GAの可能な初期モードの作用は、MHC分子に対する結合と、その結果として生じるT細胞への呈示についての、種々のミエリン抗原との競合に関連している(12)。その作用モードの更なる側面は、Tヘルパー2(Th2)型細胞の強力な誘導であり、これは恐らくは脳へと遊走して、インサイチューのバイスタンダー抑制(bystander suppression)に導くことができる(13)。MSにおけるGA治療は、GAおよび交差反応性ミエリン抗原の両者に応答して、優勢なTh2発現型を備えたGA特異的T細胞の誘導をもたらすことが示されてきた(13,14)。更に、脳由来の神経栄養因子(BDNF)と共に、IL−10およびトランスフォーミング成長因子β(TGF−β)のような抗炎症性サイトカインを発現するGA特異的な浸潤性細胞の能力は、EAEにおけるGAの治療活性と相関するように思える(15,16,17)。
GAを用いた臨床実験は、完了した臨床試験および進行中の臨床試験から、並びに過去に市販されている実験から得られた情報からなっている。この臨床プログラムには、20mg/日のGAで治療されたRRMS患者における三つの二重盲検プラセボ対照研究が含まれる(18,19,20)。プラセボと比較して、再発の症例数における有意な減少が見られた。最大の対照研究において、再発率は、プラセボ下での1.98から20mgのGA下での1.34まで32%減少した。20mgのGAはまた、RRMSに関連して、MRIパラメータ上ではプラセボよりも有益な効果を示した。9月の治療期間に亘って、Gd増強病巣の中央累積数における有意な効果(プラセボ下での17病巣に比較して20mg群では11病巣)が示された。
GAを用いた臨床プログラムにはまた、慢性の進行性MS患者における一つの二重盲検研究(21)、一次進行性患者における一つの二重冒険プラセボ対照研究(22)、CIS患者における一つの二重盲検プラセボ対照研究(23)、および殆どがRRMSにおける多くの非盲検かつ人道的な使用が含まれる。GAのこれら臨床的使用は広範に検討されており、また現在の文献に公表されている(24,25,26,27)。
米国特許第7,855,176号は、再発−寛解型多発性硬化症(RRMS)に罹患した患者に、20mgの酢酸グラチラマーおよび20mgのマンニトールを溶液中に含有する0.5mLの医薬水溶液の皮下注射により、酢酸グラチラマーを投与することを開示している。
米国特許出願公開番号US2011−0046065A1は、酢酸グラチラマーを、7日の期間に亘り、毎回の皮下注射の間に少なくとも1日を置いた三回の皮下注射により、再発−寛解型の多発性硬化症に罹患した患者に治療的有効量の酢酸グラチラマーを投与することを開示している(35)。
<薬理ゲノミクス>
薬理ゲノミクスとは、遺伝子的多様性を、薬物に対する生理学的反応に関連付ける方法論である。薬理遺伝学は薬理ゲノミクスの主題であり、「薬物反応に関連したものとしてのDNA配列の多様性の研究」として定義される(ICH E15; http://www.fda.gov/downloads/RegulatoryInformation/Guidances/ucm129296.pdf)。薬理遺伝学は、薬物代謝、薬物の作用機構、疾患タイプ、および副作用に関連した、遺伝子における遺伝的多形に焦点を当てるものである。薬理遺伝学はオーダーメード医薬の礎石であり、より効果的かつ安全な療法を得るために、特定の個人に適合するように個別化された薬物療法の開発を可能にする。
薬理遺伝学は、多くの薬物開発プログラムのコア要素であり、臨床試験での患者間での薬物反応の多様性を説明するために、副作用のような予期しない新たな臨床的問題に対処するために、試験の成果を最適化するように臨床試験についての適格性を決定するために(前スクリーニング)、当該療法から利益を得る可能性の高い、または可能性の低い患者、または副作用のリスクが高い患者を同定するための薬物にリンクした診断試験を開発するために、医師の治療決定をガイドするための薬物ラベルの情報を提供するために、新規な薬物または現存の薬物の作用機構または代謝機構をより良く理解するために、および疾患の機構のより良い理解を提供するために使用される。
一般に、薬理遺伝学の解析は、二つの方法論的アプローチの何れかで行われる:即ち、候補遺伝子調査技術、およびゲノム全般に亘る関連研究(Genome Wide Association Study;GWAS)である。候補遺伝子調査技術は、当該疾患、薬物の作用モード、薬物の毒性もしくは代謝に関する知識を用いて予め選択された、候補遺伝子における多形の検出に基づいている。ゲノム全般に亘る関連研究(GWAS)は、ゲノム全体に亘って1M(百万)を超える多形の検出を可能にする。このアプローチは、関連の遺伝子が未知であるときに用いられる。GWASのために使用されるDNAアレイは、候補遺伝子アプローチのように、各ゲノム当たりでも解析されることができる。
<薬理遺伝学研究>
MS患者において種々の薬理遺伝学研究が行われた。例えば、ゲノム全般の関連研究(Byun et al.(36)による)は、インターフェロンβに反応する患者(応答者)と反応しない患者(非応答者)の間での遺伝的相違を検出する能力を最大化するために、極端な臨床的発現型に焦点が当てられた。多重解析アプローチによって、幾つかのSNPと治療応答性との間に有意な関連性が検出された。応答者および非応答者は、グリピカン5(glypican 5)、XXVα1型コラーゲン、ヒアルロナン・プロテオグリカン連結タンパク質、カルパスタチン、およびニューロンPASドメインタンパク質3を含む多くの遺伝子に位置するSNPについて、有意に異なる遺伝子型頻度を有していた。他の研究では、IFNの応答者および非応答者のゲノムプロファイルおよび遺伝子発現プロファイルを特徴付けするために、薬理遺伝学的解析が用いられた。
他の薬理遺伝学的研究は、酢酸グラチラマーに対する反応性または応答性に関連した遺伝子的背景を解析した。例えば、フスコC等(Fusco C et al;37)は、HLA対立遺伝子とGAに対する応答性との間の可能な関連を評価した(N=83RRMS)。DRB1*1501対立遺伝子頻度は、健康な対照に比較してMS患者では増大した(10.8% vs 2.7%; p=0.001)。DRB1*1501のキャリアにおける応答率は81.8%であったのに比較して、DRB1*1501の非キャリアでの応答率は39.4%であり、また全体の研究集団における応答率は50%であった。グロスマン等(Grossman et al;38)は、二つの臨床試験コホート由来のDNAについて、HLA−DRB1*1501と、27の他の候補遺伝子内における61のSNPについて遺伝子型を同定した。この研究により、HLA−DRB1*1501とGAに対する応答性の間に関連がないことが明らかになった。該研究の結果は、WO2006/116602として刊行された国際出願の中に開示されている(39)。
薬理遺伝学はオーダーメード医薬の礎石であり、より効果的かつ安全な療法を得るように、特定の個人に適合するように個別化された薬物療法の開発を可能にする。多発性硬化症は、臨床的不均一性を伴った複雑な疾患である。多発性硬化症に罹患した患者、または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患した患者において、治療が成功する可能性を決定する能力は、患者の治療管理を改善する重要なツールになるであろう。MSおよびCISのための治療オプションが増大するので、誰がこの療法、特にGAに有利に反応するかを決定できることの重要性は、その意義がますます増大してきている。
本発明は、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物で治療する方法であって:
i.下記からなる群から選択される一以上の一塩基多形(SNP)における患者の遺伝子型を決定する工程と:rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305
623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、 rs496486、 rs552994、 rs6015147、 rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051(以下ではグループ1という);
ii.前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定する工程と:
次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs10214633、rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11694344、rs12256889、rs12340584、rs12494606、rs1415557、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs17807327、rs1892974、rs2088713、rs214526、rs2374730、rs4255033、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs496486、rs6015147、rs6097790、rs6584894、rs6713772、rs6909321、rs702355、rs7086707、rs7180867、rs7317000、rs844608、rs844610、rs933863、rs9392358、rs948029、もしくはrs9508834 (以下ではグループ2という);
次のSNPにおける遺伝子型がATである; rs12524041もしくはrs7806265;
次のSNPにおける遺伝子型がAGである; rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626:
次のSNPにおける遺伝子型がACである;rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610、
次のSNPにおける遺伝子型がTTである; rs1007328、rs10931091、rs11617134、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12532459、rs12593600、rs1264423、rs13042992、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs2461319、rs2508806、rs2722396、rs2722398、rs2895215、rs401618、rs4369324、rs4483642、rs4565951、rs4811492、rs552994、rs6025923、rs6025927、rs6097797、rs657302、rs7232734、rs751370、rs7633210、rs7714122、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs8118441、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995(以下ではグループ3という);
次のSNPにおける遺伝子型がGTである; rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
次のSNPにおける遺伝子型がCTである; rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603;
次のSNPにおける遺伝子型がGGである; rs10083547、rs10136012、rs10950359、rs11599624、rs12055694、rs1229558、rs1237625、rs12496278、rs12540494、rs12633010、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13245980、rs16999008、rs17104665、rs17104742、rs2033471、rs2155262、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs2521643、rs2530121、rs2530123、rs28861531、rs3135391、rs4148871、rs4289164、rs4445746、rs6097801、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs6971202、rs7093143、rs7244801、rs752979、rs7619350、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9315048、rs9332420、rs933864、rs948032、rs949298、もしくはrs998051(以下ではグループ4という);
次のSNPにおける遺伝子型がCGである; rs11618546 もしくはrs860722;
または
次のSNPにおける遺伝子型がCCである; rs1041897、rs10853605、rs10935016、rs10950371、rs11009827、rs11009835、rs11618546、rs11907046、rs1229542、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12488259、rs12639443、rs13021482、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs17575455、rs17807445、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2685484、rs2937395、rs4281882、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs4799760、rs6091820、rs6097782、rs6097793、rs6123749、rs660075、rs7080507、rs7789703、rs7963693、rs8099595、rs844602、rs860722、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、もしくはrs9944913 (以下ではグループ5という);
iii.前記患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される場合にのみ、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物を前記患者に投与する工程とを含んでなる方法を提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患した患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として、または予測される非応答者として同定する方法であって:該方法は、前記グループ1におけるSNPからなる群から選択される一以上の一塩基多形(SNP)における前記患者の遺伝子型を決定することを含んでなり、
前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定され:
次のSNPにおける遺伝子型がAAである:グループ2におけるSNPの一つ;
次のSNPにおける遺伝子型がATである: rs12524041 またはrs780626;
次のSNPにおける遺伝子型がAGである: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
次のSNPにおける遺伝子型がACである: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
次のSNPにおける遺伝子型がTTである: グループ3におけるSNPの一つ;
次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143
次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603
次のSNPにおける遺伝子型がGGである: グループ4におけるSNPの一つ;
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs11618546 もしくはrs860722;
または
次のSNPにおける遺伝子型がCCである: グループ5におけるSNPの一つ;
また、前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される非応答者として同定され:
次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs1040194、rs10935016、rs10950359、rs11009827、rs11599624、rs12055694、rs1229542、rs1229558、rs1237625、rs12488259、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs13245980、rs16999008、rs17575455、rs2177073、rs2511064、rs2521643、rs4281882、rs4289164、rs4445746、rs4811492、rs6097793、rs6097801、rs6558102、rs7244801、rs7619350、rs7806265、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9332420、もしくはrs948032 (以下ではグループ6という);
次のSNPにおける遺伝子型がAGである:rs1040194、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs12055694、rs1229558、rs12340584、rs1237625、rs12494606、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs2374730、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs3742228、rs4148871、rs4343256、rs4445746、rs4809955、rs6097801、rs6713772、rs7244801、rs7619350、rs7955917、rs894857、rs933863、rs9392358、もしくはrs9508834;
次のSNPにおける遺伝子型がACである:rs10214633、rs10935016、rs11009827、rs12488259、rs2088713、rs2177073、rs4306478、rs496486、rs6097790、もしくはrs7317000;
次のSNPにおける遺伝子型がTTである: rs10136012、rs1041897、rs10853605、rs10950371、rs11009835、rs11907046、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs1892974、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs6091820、rs6097782、rs6543934、rs660075、rs7789703、rs8099595、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、もしくはrs9944913(以下ではグループ7という);
次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs11719825、rs13042992、rs1886308、rs2305623、もしくはrs998051;
次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs1041897、rs10931091、rs11009835、rs11617134、rs11709339、rs1229553、rs1229555、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs1234567、rs1234947、rs12593600、rs12639443、rs1320648、rs1573706、rs1683691、rs17134651、rs17666347、rs2187495、rs2277431、rs2508806、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs552994、rs6091820、rs6097782、rs657302、rs660075、rs7232734、rs7714122、rs8099595、rs9378319、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs9944913、もしくはrs9952995;
次のSNPにおける遺伝子型がGGである: rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11618546、rs11719825、rs12340584、rs12494606、rs12532459、rs13042992、rs17007730、rs17087180、rs17588454、rs1886308、rs2305623、rs2722398、rs3742228、rs4255033、rs4343256、rs4369324、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs6123749、rs6584894、rs6713772、rs7916897、rs7963693、rs9392358、もしくはrs9508834 (以下ではグループ9という);
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs10083547、rs12496278、rs1299325、rs2155262、rs28861531、rs656975、rs7963693、もしくは933864;または
次のSNPにおける遺伝子型がCCである: rs1007328、rs10083547、rs10214633、rs10931091、rs11617134、rs11694344、rs11709339、rs11761457、rs12256889、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12496278、rs12593600、rs1299325、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs1941973、rs214526、rs2461319、rs2508806、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs4306478、rs4344916、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6097790、rs6097797、rs656975、rs657302、rs7178587、rs7232734、rs7238006、rs7317000、rs751370、rs7714122、rs7803164、rs844608、rs844610、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995 (以下ではグループ9という);
それによって、前記患者を酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定する方法を提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を治療するための方法であって:
(i)酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物の治療的量を、前記ヒト患者に投与する工程と;
(ii)グループ1の一塩基多形(SNP)からなる群から選択される1以上のSNPにおける患者の遺伝子型を決定することにより、前記ヒト患者が、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを同定する工程と;
ここで、前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される:
グループ2におけるSNPの一つにおける遺伝子型が、AAである;
次のSNPにおける遺伝子型がATである: rs12524041もしくはrs7806265;
次のSNPにおける遺伝子型がAGである: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
次のSNPにおける遺伝子型がACである: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
グループ3におけるSNPの一つがTTである;
次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603;
グループ4におけるSNPの一つの遺伝子型がGGである:
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs11618546もしくはrs860722;
グループ5における一つのSNPの遺伝子型がCCである;
(iii)前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者と同定されれば前記医薬組成物の投与を継続し、または前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者と同定されなければ、前記ヒト患者に対する医薬組成物の投与を変更する工程を具備してなる方法を提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するためのキットであって:
(i)グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPについて特異的な少なくとも一つのプローブ
を具備してなるキットを提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するためのキットであって:グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPを含んだDNA切片を増幅するように設計された、少なくとも一対のPCRプライマーを具備してなるキットを提供する。
本発明はまた、PCR増幅キットであって:
(i)グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPを含んだDNA切片を増幅するように設計された、少なくとも一対のPCRプライマーと;
(ii)前記DNAの切片を増幅するように前記PCRプライマーを使用するための指示書
を具備してなるキットを提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するためのキットであって:グループ1のSNPからなる群から選択された少なくとも一つのSNPのアイデンティティーを決定するために設計された、TaqManオープンアレイアッセイのための試薬を具備してなるキットを提供する。
本発明はまた、グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPの遺伝子型を同定するためのプローブを提供する。
図1は、広義の発現型定義のための、大部分が富化された二つのネットワークの併合(細胞区画によって組織された)。明るい灰色の記号を持った遺伝子は、GWAS研究成果に由来する一方、「中抜き」の記号を持った他の遺伝子はそれら経路の特異的メンバーであり、何れのGWAS研究によっても未だ同定されていない。 図2は、狭義の発現型定義のための、大部分が富化された二つのネットワークの併合(細胞区画によって組織された)。明るい灰色の記号を持った遺伝子は、GWAS研究成果に由来する一方、「中抜き」の記号を持った他の遺伝子は、それら経路の特異的メンバーであり、何れのGWAS研究によっても未だ同定されていない。 図3は、狭義の発現型定義のための、大部分が富化された二つのネットワークの併合(細胞区画によって組織された)。明るい灰色の記号を持った遺伝子は、GWAS研究成果に由来する一方、「中抜き」の記号を持った他の遺伝子は、それら経路の特異的メンバーであり、何れのGWAS研究によっても未だ同定されていない。
発明の詳細な説明
本発明は、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物で治療する方法であって:
i.下記からなる群から選択される一以上の一塩基多形(SNP)における患者の遺伝子型を決定する工程と:rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305
623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、 rs496486、 rs552994、 rs6015147、 rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051(以下ではグループ1という);
ii.前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定する工程と:
次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs10214633、rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11694344、rs12256889、rs12340584、rs12494606、rs1415557、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs17807327、rs1892974、rs2088713、rs214526、rs2374730、rs4255033、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs496486、rs6015147、rs6097790、rs6584894、rs6713772、rs6909321、rs702355、rs7086707、rs7180867、rs7317000、rs844608、rs844610、rs933863、rs9392358、rs948029、もしくはrs9508834 (以下ではグループ2という);
次のSNPにおける遺伝子型がATである; rs12524041もしくはrs7806265;
次のSNPにおける遺伝子型がAGである; rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626:
次のSNPにおける遺伝子型がACである;rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610、
次のSNPにおける遺伝子型がTTである; rs1007328、rs10931091、rs11617134、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12532459、rs12593600、rs1264423、rs13042992、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs2461319、rs2508806、rs2722396、rs2722398、rs2895215、rs401618、rs4369324、rs4483642、rs4565951、rs4811492、rs552994、rs6025923、rs6025927、rs6097797、rs657302、rs7232734、rs751370、rs7633210、rs7714122、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs8118441、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995(以下ではグループ3という);
次のSNPにおける遺伝子型がGTである; rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
次のSNPにおける遺伝子型がCTである; rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603;
次のSNPにおける遺伝子型がGGである; rs10083547、rs10136012、rs10950359、rs11599624、rs12055694、rs1229558、rs1237625、rs12496278、rs12540494、rs12633010、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13245980、rs16999008、rs17104665、rs17104742、rs2033471、rs2155262、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs2521643、rs2530121、rs2530123、rs28861531、rs3135391、rs4148871、rs4289164、rs4445746、rs6097801、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs6971202、rs7093143、rs7244801、rs752979、rs7619350、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9315048、rs9332420、rs933864、rs948032、rs949298、もしくはrs998051(以下ではグループ4という);
次のSNPにおける遺伝子型がCGである; rs11618546 もしくはrs860722;
または
次のSNPにおける遺伝子型がCCである; rs1041897、rs10853605、rs10935016、rs10950371、rs11009827、rs11009835、rs11618546、rs11907046、rs1229542、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12488259、rs12639443、rs13021482、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs17575455、rs17807445、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2685484、rs2937395、rs4281882、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs4799760、rs6091820、rs6097782、rs6097793、rs6123749、rs660075、rs7080507、rs7789703、rs7963693、rs8099595、rs844602、rs860722、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、もしくはrs9944913 (以下ではグループ5という);
iii.前記患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される場合にのみ、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物を前記患者に投与する工程とを含んでなる方法を提供する。
幾つかの実施形態において、前記酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有する医薬組成物を投与することは、前記ヒト患者に対して、7日間に亘り、前記医薬組成物の3回の皮下注射を、毎回の皮下注射の間に少なくとも1日を置いて投与することを含んでいる。
幾つかの実施形態において、前記医薬組成物は、40mgの酢酸グラチラマーを含有する1mLの水溶液の単位投与量形態である。
幾つかの実施形態において、前記医薬組成物は、20mgの酢酸グラチラマーを含有する1mLの水溶液の単位投与量形態である。
幾つかの実施形態において、前記医薬組成物は、20mgの酢酸グラチラマーを含有する0.5mLの水溶液の単位投与量形態である。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患した患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として、または予測される非応答者として同定する方法であって、該方法は、前記グループ1のSNPからなる群から選択される一以上の一塩基多形(SNP)における前記患者の遺伝子型を決定することを含んでなり、
・前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定され:
次のSNPにおける遺伝子型がAAである: グループ2のSNPの一つ;
次のSNPにおける遺伝子型がATである: rs12524041 またはrs780626;
次のSNPにおける遺伝子型がAGである: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
次のSNPにおける遺伝子型がACである: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
次のSNPにおける遺伝子型がTTである: グループ3のSNPの一つ;
次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143
次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603
次のSNPにおける遺伝子型がGGである: グループ4のSNPの一つ;
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs11618546 もしくはrs860722;または
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: グループ5のSNPの一つ;
・また、前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される非応答者として同定され:
次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs1040194、rs10935016、rs10950359、rs11009827、rs11599624、rs12055694、rs1229542、rs1229558、rs1237625、rs12488259、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs13245980、rs16999008、rs17575455、rs2177073、rs2511064、rs2521643、rs4281882、rs4289164、rs4445746、rs4811492、rs6097793、rs6097801、rs6558102、rs7244801、rs7619350、rs7806265、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9332420、もしくはrs948032 (以下ではグループ6という);
次のSNPにおける遺伝子型がAGである:rs1040194、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs12055694、rs1229558、rs12340584、rs1237625、rs12494606、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs2374730、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs3742228、rs4148871、rs4343256、rs4445746、rs4809955、rs6097801、rs6713772、rs7244801、rs7619350、rs7955917、rs894857、rs933863、rs9392358、もしくはrs9508834;
次のSNPにおける遺伝子型がACである:rs10214633、rs10935016、rs11009827、rs12488259、rs2088713、rs2177073、rs4306478、rs496486、rs6097790、もしくはrs7317000;
次のSNPにおける遺伝子型がTTである: rs10136012、rs1041897、rs10853605、rs10950371、rs11009835、rs11907046、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs1892974、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs6091820、rs6097782、rs6543934、rs660075、rs7789703、rs8099595、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、もしくはrs9944913(以下ではグループ7という);
次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs11719825、rs13042992、rs1886308、rs2305623、もしくはrs998051;
次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs1041897、rs10931091、rs11009835、rs11617134、rs11709339、rs1229553、rs1229555、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs1234567、rs1234947、rs12593600、rs12639443、rs1320648、rs1573706、rs1683691、rs17134651、rs17666347、rs2187495、rs2277431、rs2508806、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs552994、rs6091820、rs6097782、rs657302、rs660075、rs7232734、rs7714122、rs8099595、rs9378319、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs9944913、もしくはrs9952995;
次のSNPにおける遺伝子型がGGである: rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11618546、rs11719825、rs12340584、rs12494606、rs12532459、rs13042992、rs17007730、rs17087180、rs17588454、rs1886308、rs2305623、rs2722398、rs3742228、rs4255033、rs4343256、rs4369324、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs6123749、rs6584894、rs6713772、rs7916897、rs7963693、rs9392358、もしくはrs9508834 (以下ではグループ9という);
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs10083547、rs12496278、rs1299325、rs2155262、rs28861531、rs656975、rs7963693、もしくは933864;または
次のSNPにおける遺伝子型がCCである: rs1007328、rs10083547、rs10214633、rs10931091、rs11617134、rs11694344、rs11709339、rs11761457、rs12256889、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12496278、rs12593600、rs1299325、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs1941973、rs214526、rs2461319、rs2508806、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs4306478、rs4344916、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6097790、rs6097797、rs656975、rs657302、rs7178587、rs7232734、rs7238006、rs7317000、rs751370、rs7714122、rs7803164、rs844608、rs844610、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995 (以下ではグループ9という);
・それによって、前記患者を酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定する方法を提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を治療するための方法であって:
(i)酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物の治療的量を、前記ヒト患者に投与する工程と;
(ii)グループ1のSNPからなる群から選択される1以上の一塩基多形における患者の遺伝子型を決定することにより、前記ヒト患者が、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを同定する工程と;
ここで、前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される:
グループ2におけるSNPの一つにおける遺伝子型が、AAである;
次のSNPにおける遺伝子型がATである: rs12524041もしくはrs7806265;
次のSNPにおける遺伝子型がAGである: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
次のSNPにおける遺伝子型がACである: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
グループ3におけるSNPの一つがTTである;
次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603;
グループ4におけるSNPの一つの遺伝子型がGGである:
次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs11618546もしくはrs860722;
グループ5における一つのSNPの遺伝子型がCCである;
(iii)前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者と同定されれば、前記医薬組成物の投与を継続し、または前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される反応者と同同定されなければ、前記ヒト患者に対する医薬組成物の投与を変更する工程を具備してなる方法を提供する。
幾つかの実施形態において、前記酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有する医薬組成物を投与することは、前記ヒト患者に対して、7日間に亘り、前記医薬組成物の3回の皮下注射を、毎回の皮下注射の間に少なくとも1日を置いて投与することを含んでいる
幾つかの実施形態において、前記医薬組成物は、40mgの酢酸グラチラマーを含有する1mLの水溶液の単位投与量形態である。
幾つかの実施形態において、前記医薬組成物は、20mgの酢酸グラチラマーを含有する1mLの水溶液の単位投与量形態である。
幾つかの実施形態において、前記医薬組成物は、20mgの酢酸グラチラマーを含有する0.5mLの水溶液の単位投与量形態である。
幾つかの実施形態において、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定されれば、前記ヒト患者はその後、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有する医薬組成物を単剤療法として投与される。
幾つかの実施形態において、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定されれば、前記ヒト患者はその後、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有する医薬組成物を、少なくとも一つの他の多発性硬化症薬物と組み合わせて投与される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、 rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939 およびrs17807327からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939において決定される。他の実施形態において、前記遺伝子型は更に、SNPであるrs9508834 またはrs17807327において決定される。他の実施形態において、前記遺伝子型は更に、SNPであるrs9508834 またはrs17807327において決定される。
幾つかの実施形態において、当該方法は、前記SNPの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14個またはそれ以上において、前記患者の遺伝子型を決定することを含んでいる。
幾つかの実施形態において、当該方法は、前記SNPの4、6、10、11、12、13個において、前記患者の遺伝子型を決定することを含んでいる。
幾つかの実施形態において、当該方法は、前記SNPの6または8個において、前記患者の遺伝子型を決定することを含んでいる。
幾つかの実施形態において、当該方法は、6個のSNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定することを含んでいる。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs949298において決定される。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対してスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表7a〜fに示した通りである。
幾つかの実施形態では、前記遺伝子型は、SNPであるrs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs2511064において決定される。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対してスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表9a〜fに示した通りである。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対して相対的重み付けが当てられ、該相対的重み付けは概ね表10に示した通りである。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs12256889、 rs17771939、 rs2511064、 およびrs2521644において決定される。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対してスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表9a〜fに示した通りである。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対して重み付けが割り当てられ、該重み付けは概ね表11に示した通りである。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs11599624、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs12256889、 rs12639443、 rs13238613、 rs1573706、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2487896、rs4343256、rs4344916、 rs4369324、 rs4445746、 およびrs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、 rs12639443、 rs13042992、 rs13238613、 rs1573706、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs4148871、 rs4344916、rs6097801、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、 rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2177073、rs2521644、 rs4344916、 rs4369324、 rs6097801、rs9508834、およびrs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、 rs11617134、rs12639443、 rs13042992、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2487896、 rs4148871、 rs4344916、 rs4445746、 rs6097801、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、 rs11617134、 rs12639443、 rs13042992、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2487896、 rs2521644、 rs4148871、 rs4344916、 rs4445746、およびrs6097801において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、 rs12256889、 rs12639443、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2487896、 rs4148871、 rs4344916、 rs6097801、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs1007328、 rs11617134、rs12639443、rs13238613、 rs1573706、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs4343256、 rs4344916、 rs9508834、およびrs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs12639443、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2487896、 rs4148871、 rs4343256、 rs4344916、 rs4369324、 rs4445746、 rs6097801、 rs9508834、およびrs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs11617134、 rs12639443、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2487896、 rs3135391、 rs4148871、rs4344916、rs4369324、 rs6097801、 rs9508834、およびrs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、 rs12639443、 rs13238613、 rs17087180、rs17771939、 rs2487896、 rs4148871、 rs4343256、rs4344916、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs11617134、 rs12256889、 rs12639443、 rs13042992、 rs17087180、rs17771939、 rs17807327、 rs2177073、 rs2487896、 rs4343256、 rs4344916、 rs6097801、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10950359、 rs11617134、 rs12639443、 rs17087180、 rs17771939、 rs2487896、 rs2511064、 rs3135391、 rs4148871、 rs4343256、 rs4344916、 rs9508834、およびrs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4344916、およびrs6097801において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs10950359、rs10988087、 rs11599624、rs12256889、 rs12639443、 rs13042992、 rs17087180、 rs17771939、 rs17807327、 rs2521644、 rs3135391、 rs4344916、および rs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs1007328、rs10950359、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs947603、およびrs9508834において決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、SNPであるrs11599624、rs12256889、rs12639443、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4344916、rs6097801、rs9508834、および rs9944913において決定される。
幾つかの実施形態において、当該方法は更に、酢酸グラチラマー療法に対する応答性または非応答性を示す少なくとも一つの臨床的変数の測定を含んでなるものである。
幾つかの実施形態において、前記少なくとも一つの臨床的変数は、患者の年齢およびT1脳病巣容積から選ばれる。
幾つかの実施形態において、前記方法は更に、前記ヒト患者の血液中のバイオマーカーの値を測定することを含んでいる。
幾つかの実施形態において、前記バイオマーカーは、IL−10濃度、IL−17濃度、IL−18濃度、TNF−α濃度、脳由来の神経栄養性因子濃度、カスパーゼ−1濃度、IL―10/IL−18比、IL―10/IL−17比、IL−2濃度およびIFN−γ濃度、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は前記患者から得られた核酸含有サンプルから決定される。
幾つかの実施形態では、前記遺伝子型はアレイを用いて決定される。
幾つかの実施形態では、前記アレイは、遺伝子アレイ、遺伝子チップ、DNAアレイ、DNAマイクロアレイ、TAqManオープンアレイ(TaqMan Open Array)、およびビーズアレイからなる群から選択される。
幾つかの実施形態において、前記アレイはTAqManオープンアレイである。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型を決定することは、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、およびアレイ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される方法を使用することを含んでいる。
幾つかの実施形態では、前記遺伝子型は、少なくとも一対のPCRプライマーおよび少なくとも一つのプローブを使用して決定される。
幾つかの実施形態において、前記遺伝子型は、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、遺伝子チップ、および変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)からなる群から選択される方法によって決定される。
幾つかの実施形態において、前記1以上のSNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定することは:
(i)前記患者から得られたサンプルからDNAを得ることと;
(ii)任意に該DNAを増幅することと;
(iii)前記DNAまたは増幅されたDNAを、前記1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために適した複数のプローブを含んでなるアレイと接触させること
を含んでいる。
幾つかの実施形態において、前記1以上のSNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定することは:
(i)前記患者から得られたサンプルからDNAを得ることと;
(ii)任意に該DNAを増幅することと;
(iii)前記DNAまたは増幅されたDNAを、前記1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、遺伝子チップ、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)およびアレイ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される方法にかけること
を含んでいる。
幾つかの実施形態において、前記アレイは、前記1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために適した複数のプローブを含んでいる。
幾つかの実施例において、前記ヒト患者は未処置の患者である。
幾つかの実施形態において、前記ヒト患者は、以前に酢酸グラチラマーを投与されたことがある。
幾つかの実施形態において、前記ヒト患者は、以前に酢酸グラチラマー以外の多発性硬化症用の薬物を投与されたことがある。
幾つかの実施形態において、前記1以上のSNPにおける前記患者の遺伝子型は、前記1以上のSNPとの連鎖不平衡にあるSNPにおいて、前記患者の遺伝子型を決定することにより間接的に得られる。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、グループ1におけるSNPからなる群から選択されるSNPに特異的な少なくとも一つのプローブを具備してなるキットを提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPを含んだDNAを増幅するように設計された少なくとも一対のPCRプライマーを具備してなるキットを提供する。
本発明はまた、PCR増幅キットであって:
(i)グループ1におけるSNPからなる群から選択されるSNPを含んだDNA切片を増幅するように設計された少なくとも一対のPCRプライマーと;
(ii)前記DNAの切片を増幅するように前記PCRプライマーを使用するための指示書
を備えてなるキットを提供する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、グループ1のSNPからなる群から選択される少なくとも一つのSNPのアイデンティティーを決定するために、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、遺伝子チップ、および変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)からなる群から選択される方法を実施するための試薬を備えてなるキットを提供する。
幾つかの実施形態において、前記キットは、
(i)グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPを含んだDNA切片を増幅するように設計された、少なくとも一対のPCRプライマーと;
(ii)グループ1のSNPからなる群から選択されるSNPに特異的な少なくとも一つのプローブ
を具備する。
本発明はまた、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、グループ1のSNPからなる群から選択される少なくとも一つのSNPのアイデンティティーを決定するために設計されたTaqManオープンアレイ検定のための試薬を具備するキットを提供する。
幾つかの実施形態において、該キットは更に、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するキットの使用のための指示書を具備する。
幾つかの実施形態において、前記1以上の一塩基多形(SNP)は下記からなる群から選択される: rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、 rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939 およびrs17807327。
幾つかの実施形態において、前記1以上の一塩基多形(SNP)は下記からなる群から選択される: rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939。
幾つかの実施形態において、前記1以上の一塩基多形(SNP)は下記からなる群から選択される: rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs949298。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、および rs2511064。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs12256889、rs17771939、rs2511064、および rs2521644。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs11599624、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、および rs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs12256889、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、およびrs9944913。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10988087、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2177073、rs2521644、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs4445746、rs6097801、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4148871、rs4344916、rs4445746、およびrs6097801。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs1007328、rs11617134、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10988087、rs12639443、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10950359、rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4344916、およびrs6097801。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される:rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2521644、rs3135391、rs4344916、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs1007328、rs10950359、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs947603、およびrs9508834。
幾つかの実施形態において、前記キットは、下記のSNPにおける遺伝子型を決定するように設計される: rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4344916、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型にスコアが割り当てられ、ここでの該スコアは概ね表18a〜sおよび表19a〜hに示された通りである。
幾つかの実施形態では、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPに対して相対的な重みが割り当てられ、ここでの相対的重みは概ね表20〜表36の一つに示した通りであり、ここで選択される表は遺伝子型が決定されるSNPに対応する。
ここで使用するとき、遺伝子マーカーとは、染色体上において既知の位置を有するDNA配列を言う。遺伝子マーカーの幾つかの非限定的な例は、SNP(一塩基多形)、STR(短いタンデム反復)およびSFP(単一特徴多形)、VNTR(可変数のタンデム反復)、マイクロサテライト多形、挿入および欠失である。本発明に関連した遺伝子マーカーはSNPである。
ここで使用するとき、SNPまたは「一塩基多形」とは、個体間でDNA塩基に相違が存在するゲノムの特定の部位を言う。幾つかの実施形態において、該SNPは遺伝子のコード領域に位置する。他の実施形態において、該SNPは遺伝子の非コード領域に位置する。更に他の実施形態において、SNPは遺伝子間領域に位置する。
幾つかの非限定的な例は、SNPまたは遺伝子に関する情報を検索できるデータベースであり、次のものが含まれる:KNCBI資源、SNPコンソーシアムLTD、NCBI・dbSNPデータベース、インターナショナルHapMapプロジェクト、1000ゲノムプロジェクト、グローバー変異ブラウザ、SNPStats、PharmGKB、GEN−SniP、およびSNPedia。
幾つかの実施形態において、本発明に関連したSNPは、表1〜表3および表16に列記した1以上のSNPを含んでいる。幾つかの実施形態では複数のSNPが同時に評価される一方、他の実施形態では、SNPは別々に評価される。SNPは、ここではhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP/において公的に入手可能なNCBI・dbSNPデータベースに従い、rs識別子番号を用いて同定される。
幾つかの実施形態では、GAに対する応答性または非応答性と関連することが見いだされたSNPと連鎖不平衡にあるSNPは、同様の結果を得るために有用である。
ここで用いるとき、連鎖不平衡とは、一つの部位における複数のSNPの非ランダムな関連を言う。連鎖不平衡の測定のための技術は、当該技術において知られている。2つのSNPは、それらが一緒に遺伝するときに連鎖不平衡にあるので、それらが提供する情報は一定の範囲で相関している。モデルに含まれるSNPと連鎖不平衡にあるSNPは、HapMapまたは他の関連のデータバースのようなデータベースから、実験室で行われる実験構成から、またはコンピュータ支援のインシリコ(in-silico)実験から得ることができる。
ここで特定されたSNP、例えばNCBI・dbSNPのrs識別子により特定されたSNP位置での患者の遺伝子型を決定することは、例えばSNPの遺伝子座での各対立遺伝子のヌクレオチドのアイデンティティーを決定することによる直接的な遺伝子タイピング、および/または間接的な遺伝子タイピングを含むことができる。該間接的遺伝子タイピングは、例えば、問題のSNPとの連鎖不平衡にあり、且つ問題のSNPの遺伝子座での各対立遺伝子のアイデンティティーをかなりの程度の信頼性で推測することを可能にする1以上の遺伝子座において、各対立遺伝子のアイデンティティーを決定することによるものである。
幾つかの場合に、間接的な遺伝子タイピングは、少なくとも85%、少なくとも90%または少なくとも99%の確かさの確率をもって、問題のSNPの遺伝子座における各対立遺伝子のアイデンティティーを推測することを可能にするように、問題のSNPとの十分に高い連鎖不平衡にある1以上の遺伝子座において各対立遺伝子のアイデンティティーを決定することを含むことができる。
一つのSNP位置での遺伝子型(或るSNPでの遺伝子型)は、SNPでのヌクレオチドのアイデンティティーに対応する1文字により表現されてよく、ここでAはアデニンを表し、Tはチミンを表し、Cはシトシンを表し、Gはグアニンを表す。単一のSNPにおける2つの対立遺伝子のアイデンティティーは、A,T,CおよびGのうちの2文字の組み合わせによって表されてよく、ここでの2文字組み合わせの最初の文字は一つの対立遺伝子を表し、また2番目の文字は第二の対立遺伝子を表し、ここでAはアデニンを表し、Tはチミンを表し、Cはシトシンを表し、Gはグアニンを表す。こうして、SNPにおける二つの対立遺伝子型は、例えば、それぞれAA、AT、AG、AC、TT、TG、TC、GG、GC、またはCCとして表すことができる。
本発明のSNPは、多発性硬化症に罹患した患者または多発性硬化症に一致する単回臨床発作に罹患した患者における、GAに対する応答性の予測指標として使用することができる。本発明の側面は、患者のDNAサンプルを得ること、および1以上のSNPまたは一定の組のSNPにおいて該患者のサンプルを遺伝子タイピングすることを通して、SNPの存在を決定することに関する。当業者に知られた何等かの手段を介して、患者のDNAサンプルを抽出することができ、また該サンプルにおいてSNPを検出できると思われる。既知の技術の幾つかの非限定的例には、制限酵素断片長多形(RFLP)解析、マイクロアレイ(平面マイクロアレイまたはビーズアレイを含むがこれらに限定されない)、遺伝子アレイ、TaqManオープンアレイを含むPCRアレイ、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、および変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)を介しての検出が含まれる。
幾つかの実施形態において、SNPは、SNPを含んでなるDNA領域のPCR増幅およびシーケンシングによって検出される。
幾つかの実施形態において、SNPに特異的なプローブの存在下でのPCR増幅を通して検出される。
プローブおよびSNPの検出においてそれを使用する方法は当業者に周知であり、例えば、文献(Barnes MR. Genetic Variation: Methods and Protocols 1st ed. New York: Humana Press, 2010)および別の文献(Komar, AA. Single Nucleotide Polymorphisms: Methods and Protocols 2nd ed. York: Humana Press, 2009)に記載されている。
幾つかの実施形態において、SNPは、DNAチップを含むDNAマイクロアレイを使用して検出される。DNA配列におけるSNPのような遺伝子多形、変化または突然変異(一般的には遺伝子変異)の検出のためのマイクロアレイは、個体表面(典型的にはガラス)を備えており、その上には、研究すべき遺伝子変異に対して相補的な多数のDNA配列(プローブ)が固定される。アレイにプローブを適用するための標準のロボットプリンタを使用して、高密度の個々のプローブフィーチャーを得ることができ、例えば、典型的には1平方センチメータ当たり600フィーチャー以上のプローブ密度を達成できる。アレイ上でのプローブの位置決めは、印刷装置(ロボット、インクジェットプリンタ、フォトリソグラフィーマスク等)によって正確に制御され、またプローブは格子状に整列される。アレイ上でのプローブの組織化は、その後の特異的プローブ−標的相互作用の同定を容易にする。
加えて、アレイ構造を、これも格子形状の小区分(以下ではサブアレイと称する)に分割することは、普通ではあるが必要ではない。サブアレイは、典型的には32の個別のプローブフィーチャーを含んでいるが、より少ない(例えば16)またはより多い(例えば64以上)フィーチャーが各サブアレイを構成することができる。
幾つかの実施形態において、SNPの存在のような遺伝子変異の検出は、被験サンプル由来のDNA断片中の正常な対立遺伝子および変異体対立遺伝子を特異的に認識する配列に対するハイブリダイゼーションを含んでいる。典型的には、該断片は、例えばポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を使用することにより増幅され、また蛍光分子で標識される。レーザを使用してチップ上で結合および標識された断片を検出でき、その正常な対立遺伝子についてホモ接合である個体を、ヘテロ接合の個体(常染色体の優勢な条件の場合はこれら個体をキャリアと称する)または変異体対立遺伝子についてホモ接合である個体から特異的に識別することができる。
幾つかの実施形態において、増幅反応および/または伸長反応は、マイクロアレイまたはビーズ自身の上で行われる。ディファレンシャルハイブリダイゼーションに基づく方法については、遺伝子タイピングのためのハイブリダイゼーションデータを解析するための多くの方法が存在する:ハイブリダイゼーションレベルにおける増大:正常体対立遺伝子および変異体対立遺伝子に対して相補的なプローブのハイブリダイゼーションレベルが比較される。ハイブリダイゼーションレベルの減少:対照サンプルと被験サンプルの間の配列における相違は、全体的に相補的なオリゴヌクレオチドの参照配列とのハイブリダイゼーションレベルにおける減少によって同定することができる。変異体ホモ接合個体においては約100%に近いロスが生じるのに対して、ヘテロ接合体では約50%のロスが生じるに過ぎない。
両方の鎖の長さが「n」ヌクレオチド(「オリゴヌクレオチド」)の配列の全ての塩基を調べるためのマイクロアレイにおいては、当該ヌクレオチドにおけるものを除く全ての配列において以前のオリゴヌクレオチドと重なる、最小限「2n」のオリゴヌクレオチドが必要である。典型的には、オリゴヌクレオチドのサイズは約25ヌクレオチドである。しかしながら、該オリゴヌクレオチドは、当業者に理解されるように、適切な如何なる長さであってもよいと思われる。
配列を再構築するために使用されるオリゴヌクレオチドの増大した数は、ハイブリダイゼーションレベルの変動に由来するエラーを低減する。しかし、配列における正確な変化はこの方法では同定できない;幾つかの実施形態において、この方法は、変異体を同定するために配列決定と組み合わされる。増幅または伸長がマイクロアレイまたはビーズ上で行われる場合、例えば次の三つの方法が提示される:微小シーケンシング戦略においては、変異特異的プライマーがスライド上に固定され、蛍光ジデオキシヌクレオチドを用いた伸長反応の後に、当該マイクロアレイの画像がスキャナーで補足される。プライマー伸長戦略においては、二つのオリゴヌクレオチドが、それぞれ野生型および変異型の配列の検出のために設計される。その後、一つの蛍光標識されたヌクレオチドおよび残りの非標識ヌクレオチドを用いて、伸長反応が実施される。何れの場合も、出発材料はRNAサンプルまたはPCRにより増幅されたDNA産物であることができる。タグアレイ戦略では、伸長反応は、決定された5配列または「タグ」を有する特異的プライマーを用いて溶液中で行われる。これら配列または「タグ」に対して相補的なオリゴヌクレオチドと共にマイクロアレイを使用することは、得られた伸長生成物の捕捉を可能にする。この例には、高密度マイクロアレイの「フレックス−フレックス("Flex-flex")」(アフィメトリックス社)が含まれる。イルミナ1Mドウ・ビーズチップアレイ(Illumina 1M Dou BeadChip array)
(http://www.illumina.com/products/human1m_duo_dna_analysis_beadchip_kits.ilmn)においては、SNP遺伝子型は、製造業者の標準クラスター設定を用いて蛍光強度から生成される。
本発明の幾つかの側面においては、表1〜3または表16からのSNPを含む予測モデルが、GAに対する応答性を予測するために使用される。
本発明の幾つかの側面において、予測モデルは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、または14以上のSNPを含んでいる。
本発明の幾つかの側面において、予測モデルは 4、6、10、11、12、13 または14のSNPを含んでいる。
本発明の幾つかの側面において、予測モデルは、該モデルを構成する特異的な一組のSNPを含んでいる。
本発明のモデルを構成する幾つかの特異的なSNPの組は、表5,8および17に提示されている。
本発明の幾つかの側面において、予測モデル(または「モデル」)は、特定のモデルに含まれるSNPでの患者の遺伝子型に基づいて、患者の応答可能性p(応答性)を計算するために使用される。
本発明の幾つかの側面において、特定の閾値を超えるp(応答性)をもつ患者は、GAに対する応答者であると予測されるのに対して、同予測閾値未満のp(応答性)を持った患者は、GAに対する非応答者と予測される。
本発明の他の側面において、第一の予測閾値(例えば0.8)を超えるp(応答性)を持った患者は、GAに対する応答者と予測されるのに対して、第一の予測閾値よりも低い第二の予測閾値(例えば0.2)未満のp(応答性)を持った患者は、GAに対する非応答者であると予測される。
本発明の幾つかの側面において、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8または0.9を超えるp(応答性)をもつ患者は、応答者であると予測される。
本発明の幾つかの側面において、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8または0.9未満のp(応答性)を持つ患者は、非応答者であると予測される。
本発明の一定の側面において、前記予測閾値は0.5であり、その結果として0.5を超える応答可能性p(応答性)を持った患者はGA治療に対する応答者であると予測され、0.5未満の(応答性)を持った患者はGA治療に対する非応答者であると予測される。
本発明のもう一つの側面では、前記予測閾値が0.8であり、その結果として、0.8を超える応答可能性p(応答性)を持った患者はが治療に対する応答者であると予測され、0.8未満のp(応答性)を持つ患者はGA治療に対する非応答者であると予測される。
本発明の幾つかの側面では、患者をGAで治療すべきかどうかを決定するために、前記p(応答性)が、予め定められた閾値または複数の閾値と比較される。
本発明の一定の側面において、このような比較は、患者および/または介護者によって行われ、介護者にはヘルスケア提供者および家族構成員が含まれるがこれらに限定されない。或いは、医療もしくは科学の事業体によって行われ、これには病院、医学的研究所またはラボが含まれるが、これらに限定されない。
本発明の他の側面においては、特定の/予め定められた一つまたは複数の予測閾値を参照することなく、患者をGAで治療すべきかどうかを決定するために、p(応答者)は患者および/または介護者によって使用され、介護者にはヘルスケア提供者および家族構成員が含まれるがこれらに限定されない。或いは、医療もしくは科学の事業体によって行われ、これには病院、医学的研究所またはラボが含まれるが、これらに限定されない。
本発明の幾つかの側面において、前記p(応答性)の計算にはキットを使用することが含まれる。
本発明の幾つかの側面において、前記キットの使用には、患者の遺伝子タイピングが含まれる。
本発明の幾つかの側面において、前記キットの使用には、患者のp(応答性)を計算することが含まれる。
本発明の幾つかの側面において、前記キットの使用には、前記患者が遺伝子的に予測されるときに、ユーザ患者のp(応答性)を計算することが含まれる。
本発明の一定の側面において、前記キットの使用には、前記患者がGAに対する応答者または非応答者であるかが遺伝子的に予測されるかどうかを、ユーザに指示することが含まれる。
本発明の幾つかの側面において、臨床的変数の測定には、遺伝子的変数と共にGAに対する応答を予測する予測モデルの一部が含まれる。臨床的変数の幾つかの非限定的な例は、患者の年齢(年)、患者の性別、臨床的徴候およびMRIパラメータである。「臨床的徴候」にはEDSSスコアおよび再発率が含まれるが、これらに限定されない。「MRIパラメータ」には、T1増強病巣および/またはT2増強病巣が含まれるが、これらに限定されない。本発明の一定の側面において、考慮に入れられる臨床的変数は、患者にとって適切な治療に関する決定の時点で測定されるもの、または臨床医、研究者または当該決定に関与する他の専門家にとって合理的と思える時点で測定されるものである。
GAに対する応答者または非応答者としての患者の同定は、表1〜3または表16からの少なくとも一つのSNP、表1〜3、表5、表8、表16または表17からの一組のSNP、または表1〜3、表5、表8、表16または表17からのSNPの組み合わせもしくは一組のSNPの存在は、上記で述べた1以上の臨床的変数と共に、GAに対する応答者を予測するために使用してよい。
また、キットおよびそれを使用するための指示書もまた、本発明の範囲内である。
本発明の幾つかの実施形態において、前記キットは診断キットである。
本発明の幾つかの実施形態において、前記キットはPCR増幅キットである。
幾つかの実施形態において、本発明に関連するキットは、患者サンプル内で1以上のSNPを同定するためのキットである。
幾つかの実施形態において、キットは、特定の遺伝子座を増幅するためのプライマーを含んでよい。
幾つかの実施形態において、キットは、特定のSNPにハイブリダイズするためのプローブを含んでよい。
幾つかの実施形態において、本発明に関連したキットは、本発明のSNPを含むDNA切片を増幅するように設計された少なくとも一対のPCRプライマーを含んでいる。
幾つかの実施形態において、本発明に関連したキットは、本発明のモデルを構成するSNPの特定の組を増幅するように設計された、一組のPCRプライマー対を含んでいる。
幾つかの実施形態において、本発明に関連したキットは、本発明のSNPに特異的な少なくとも一つのプローブを含んでいる。
幾つかの実施形態において、本発明に関連したキットは、本発明のモデルを構成する特定組のSNPに対して特異的な一組のプローブを含んでいる。
本発明のキットは、限定するものではないが、制限断片長多形(RFLP)解析、マイクロアレイ(平面マイクロアレイまたはビーズアレイが含まれるが、これらに限定されない)、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)、PCR増幅、および当該SNPを含むDNA領域のシーケンシングを含む検定の各々を実施するための試薬を含むことができる。
本発明の幾つかの側面において、当該キットは、TaqManオープンアレイ、またはTaqManオープンアレイ検定を実施するための試薬を含んでいる。
本発明の幾つかの側面において、前記TaqManオープンアレイは、本発明の遺伝子タイピングのために設計される。本発明の幾つかの側面において、前記TaqManオープンアレイは、本発明のモデルを構成する特異的なSNP組を遺伝子タピングするために設計される。
本発明のキットは、その中に開示されている何れかの生物学的または化学的メカニズムに関与するための、キット内容物の使用説明書を含むことができる。
キットは、該キットの構成要素を単独で、またはサンプルをスクリーニングもしくは診断すること、および/または患者がGAに対する応答者もしくは非応答者として予測されるかどうかを決定することを補助するために、他の方法もしくは組成物と組み合わせて使用するための指示書を含むことができる。
幾つかの実施形態において、本発明のキットは、特定のSNPにおける患者の遺伝子型に基づいて、患者のp(応答性)値を計算するための指示書を含んでいる。幾つかの実施形態では、該指示書には、一つまたは複数の予測閾値、並びに該計算されたp(応答性)値を如何にして前記閾値と比較するかの説明書もしくは推奨が含まれる。
<多発性硬化症の形態>
MSの5つの異なる疾患段階および/またはタイプが存在する:
1)良性の多発性硬化症;
2)再発−寛解性の多発性硬化症(RRMS);
3)二次進行性の多発性硬化症(SPMS);
4)進行性再発性の多発性硬化症(PRMS);および
5)一次進行性の多発性硬化症(PPMS)。
良性の多発性硬化症は、1〜2の完全な回復を伴った増悪を特徴とする遡及的な診断であり、能力障害は継続せず、且つ最初の発病後10〜15年間は病気の進行がない。しかしながら、良性の多発性硬化症は、他の形態の多発性硬化症へと進行する可能性がある。
RRMSに罹患している患者は、散発性の悪化もしくは再発、並びに周期的な寛解を経験する。軸索喪失の病巣および証拠は、RRMS患者のMRI上で視認可能であるかもしれず、または視認不能であるかもしれない。
SPMSは、RRMSから進化する可能性がある。SPMSに罹患した患者は再発、寛解の際の回復程度の減少、寛解の頻度の減少、およびRRMS患者よりも顕著な神経学的損傷を有する。脳梁、正中線中央、および脊髄の萎縮についてのマーカーである拡大した脳室が、SPMSの患者のMRI上で視認可能である。
PPMSは、明確な発作または寛解を伴わずに増大する神経学的損傷の定常的な進行を特徴とするものである。PPMSの患者のMRI上では、大脳病巣、拡散性脊髄損傷および軸索喪失の証拠が明らかである。PPMSは、寛解を伴わずに増大する神経学的損傷のコースに沿って進行する一方、急性悪化の周期を有する。PRMSに罹患した患者のMRI上では病巣が明らかである(28)。
臨床的に摘出された症候群(CIS)は、視神経炎、脳幹症状、および部分的脊髄炎のようなMSに適合した一回の単一症状発作である。二回目の臨床発作を経験するCISの患者は、一般に、臨床的に明確な多発性硬化症(CDMS)を有すると看做される。CISおよびMRI病巣を持った患者の80パーセント超がMSを発症するに至るのに対して、約20パーセントは自己制限的プロセスを有する(29,30)。MSに合致する一回の臨床的発作を経験するCISの患者は、臨床的に明確な多発性硬化症の発症に先立って、多発性硬化症に合致する少なくとも一つの病巣を有する可能性がある。
多発性硬化症は、視神経炎、視野の曇り、複視、不随意の迅速な目の動き、失明、平衡喪失、震顫、運動失調症、眩暈、四肢のぎこちなさ、運動協調性の欠失、1以上の四肢の虚弱、異常な筋肉緊張、筋肉硬直、痙攣、刺痛、感覚異常、灼熱感、筋肉痛、顔面痛、三叉神経痛、刺すような鋭い痛み、灼熱刺痛、スピーチの遅さ、言語不明瞭、スピーチのリズム変化、嚥下障害、疲労、膀胱トラブル(逼迫尿、頻尿、残尿および失禁を含む)、腸トラブル(便秘症および腸制御喪失を含む)、性交不能、性欲減退、感覚喪失、熱過敏症、短期記憶の喪失、集中力喪失、または判断力または推理力の喪失を呈する可能性がある。
<多発性硬化症の再発形態>
再発性MSの用語には次のものが含まれる:
1)RRMSの患者
2)SPMSおよび重畳された再発の患者;および
3)マクドナルドの基準に従って、その後のMRIスキャンで病巣播種を示すCISの患者。
ここで使用するとき、多発性硬化症の再発形態には次のものが含まれる:神経学的機能不全の非予測性急性発作(再発)と、不定の回復および臨床的に安定な期間を特徴とする、再発−寛解型の多発性硬化症(RRMS)。
二次的進行性MS(SPMS)、ここでのRRMSを有する患者は重畳される再発を伴って、または伴わずに持続的な痴呆(deterioration)を発症する。
一次的進行−再発性の多発性硬化症または進行―再発性の多発性硬化症(PRMS)、最初から進行性の痴呆を発症する患者が、後で再発を発症し得る珍しい形態。
<クルツケの拡大された能力障害状態スケール(EDSS)>:
クルツケの拡大された能力障害状態スケール(EDSS)は、多発性硬化症における能力障害を定量化するための方法である。EDSSは、MSをもった人々を下方の括弧内に一団に束ねるために使用される以前の能力障害状態スケールを置き換えたものである。EDSSは、八つの機能的システム(FS)における能力障害を定量化し、神経内科医がこれらの各々に機能システムスコア(FSS)を割り当てることを可能にする。この機能的システムは次の通りである:錘体路、小脳、脳幹、感覚、腸および膀胱、視覚&大脳(www.mult-sclerosis.org/expandeddisabil itystatusscaleによる)。
<臨床的再発>:
ここでは「再発」、「確認される再発」または「臨床的に明確な再発」としても使用される臨床的再発は、1以上の新たな神経学的異常の出現、または1以上の先に観察された神経学的異常の再出現として定義される。
臨床的状態におけるこの変化は、少なくとも48時間継続しなければならず、またその直前に比較的安定な、または少なくとも30日の改善された神経学的状態が先行していなければならない。この基準は、「再発評価」の節で詳述したように、「少なくとも24時間の症状の持続」(31)の増悪の臨床的定義とは異なっている。
一つの事象は、患者の症状が、下記のものと一致する観察された目的の神経学的変化が付随するときにのみ、再発としてカウントされる:
a)EDSSスコアにおける少なくとも0.5の増大、または7つのFSの2以上のスコアにおける1等級の増大(32);または
b)以前の評価と比較したときに、一つのFSのスコアにおける2等級の増大。
患者は、発熱または他の医学的異常のような、何らかの急性の代謝変化を経験していてはならない。腸/膀胱の機能または認識機能における変化は、全体的にEDSSまたはFSスコアにおける変化の原因であってはならない。
ここで用いる「酢酸グラチラマーに対する予測される応答者/遺伝子的に予測される応答者」の語は、SNP、一組のSNPまたは本発明のモデルにおける患者の遺伝子型に基づいて酢酸グラチラマーに対する応答者であると予測される、多発性硬化症に罹患した、または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者である。同様に、患者の遺伝子型に基づいて酢酸グラチラマー療法に対する非応答者であると予測される患者は、「酢酸グラチラマーに対する予測される非応答者/遺伝子的に予測される非応答者」と称される。
ここで使用するとき、「多発性硬化症薬」とは、臨床的に明確なMS、CIS、何らかの形態の神経変性的または脱髄性の疾患、または上記で述べた疾患の何れかの症状を治療することを意図した薬物または薬剤である。「多発性硬化症約」には、抗体、免疫抑制剤、抗炎症剤、免疫調節剤、サイトカイン、細胞毒剤、およびステロイドが含まれるがこれらに限定されず、また臨床的に明確なMS、CISまたは何れかの形態の神経変性疾患もしくは脱髄性疾患を治療することを意図した承認薬、臨床試験中の薬物、または代替治療が含まれてもよい。「多発性硬化症薬」には、インターフェロンおよびその誘導体(ベタステロン[BETASERON:登録商標]、アボネックス[AVONEX:登録商標]およびレビフ[REBIF:登録商標]を含む)、ミトキサントロン(Mitoxantrone)およびナタリズマブ(Natalizumab)が含まれるが、これらに限定されない。他の自己免疫疾患の治療のために承認された、または臨床試験中の薬剤であるが、MSまたはCISを治療するためにMSまたはCIS患者において使用される薬剤もまた、多発性硬化症約として定義される。
ここで使用するとき、「未処置の患者」とは、上記の段落で定義した何れの多発性硬化症薬でも治療されたことのない患者である。
酢酸グラチラマーの投与は、経口、経鼻、肺、非経腸的、静脈内、関節内、経皮、皮内、皮下、局所、筋肉内、直腸、くも膜下腔内、眼内、バッカル、または胃管栄養法であってよい。
実験の詳細
実施例: GAに対する応答者または非応答者に分類された患者におけるDNA配列多型の分析
[方法]:
<被験者>
再発寛解型多発性硬化症の患者が、テバ社のFORTE治験において、20mg/日または40mg/日のGAで治療された
(www.medicalnewstoday.com/articles/48863.php)。薬理遺伝学研究に関するインフォームド・コンセントに署名した各被験者から血液サンプルが抽出され、以下のように分析された。
後述の2つの定義、「広い定義」および「狭い定義」に基づき、臨床的再発率および12月の治療後のMRIデータ(T1およびT2増強病巣)を用いて、患者を応答者または非応答者と定義した。第1の分析では、以下で「広い」と定められる定義に基づき、被験者が「応答者」(R)と「非応答者」(NR)とに二分された。その後さらなる分析が、先に応答者と分類された一部の患者を除外することで、サンプル数を大幅に減らし、狭い定義を用いて行われた。さらに、第3の分析では、後述の患者の臨床データおよびMRIパラメータに基づいて計算された、GAに対する応答の連続測定を用いた(「連続測定」)。
<応答性の定義>
「広い定義」すなわち「広義の発現型」:広い定義による応答者は、12月の治療期間において再発のない治療群の患者であり、12月(12月の治療の終わり)において、T1増強病巣およびT2増強病巣が新たに観察されない患者と定義された。非応答者は、12月の治療期間において少なくとも一度再発し、12月に1を超える新たなT2増強病巣を有する患者と定義された。
「狭い定義」すなわち「狭義の発現型」:狭い定義による応答者は、「広い」定義と同様に、12月の治療期間において再発のない治療群の患者であり、12月において、T1増強病巣およびT2増強病巣が新たに観察されない患者と定義された。また、健康回復時にT1増強病巣が観察されない患者、および実験中にT2病巣の量が著しく(1000mmまで)増加した被験者は、応答者と定義されなかった。非応答者の定義は、「広い」定義と同様である。
「複合測定」、「複合発現型」、「連続測定」は、臨床およびMRIパラメータ(12月の治療での再発率ならびに12月におけるT1およびT2増強病巣)に基づいて計算される。(「応答者/非応答者」の二分法とは対照的に)連続測定であるこの測定は、GA R/NRに関連するSNPを求める定量的GWASで用いられた。
<再発評価>
臨床的再発は、1以上の新しい神経学的異常が発現すること、もしくは過去に観察された1以上の神経学的異常が再発することと定義された。
臨床的状態の変化は少なくとも48時間継続し、少なくとも30日間の比較的安定的な、もしくは改善中の神経学的状態の直後に生じた。該調査で用いた基準は、増悪の臨床的定義、「少なくとも24時間持続する症状」とは異なっていた(31)。「調査における」増悪の定義は客観的な神経学的評価に裏付けなければならないため(次段落参照)、神経学的欠損は擬似増悪を除外する程度に長く持続しなくてはならない。
被験者の症状が、観察される客観的な神経学的変化を伴うときに限り、事象は以下の条件において再発と見なされる。
a)EDSSスコアの少なくとも0.5増加、または7つのFS(32)のうち2つ以上におけるスコアの1段階増加、もしくは
b)過去の評価と比較して、FSのうち1つにおけるスコアの2段階増加
被験者は、発熱など急性の代謝性変化、あるいは他の医学的異常を受けなかった。腸/膀胱機能および認知機能の変化は、完全にEDSSまたはFSスコアの変化によるものというわけではない。
<検査担当の神経科医による被験者評価>
完全な神経学的判定が、−1(スクリーニング)、0(ベースライン)、3、6、9、12(二重盲検期の終わり)18、および24月目(終了/早期中止)に行われた。
<治療担当の神経科医による再発判定>
神経学的変化が確実に再発と看做せるか否かの決定は、検査担当の神経科医により判定された、実際の(変換されていない)EDSS/FSスコアに基づいて、治療担当医によりなされた。
次回通院時の判定に加え、再発の過程を観察するために、治療医の裁量で追跡通院が行われたが、神経学的判定は検査担当の神経科医によってなされた。
<再発評価の手順>
被験者は、再発を示唆する症状が現れた場合、48時間以内に治験現場に電話をするよう指示された。
検査担当の神経科医は、症状出現期が48時間以下であることを条件として、発症から7日以内に被験者を評価した。治療担当の神経科医/治療医は、再発を示唆する症状が現れた時点で、被験者を評価した。
予定された通院または予定されていない通院時に再発の兆候が見られた場合、治療担当の神経科医/治療医は、被験者を検査担当の神経科医/検査医に紹介した。
<分析>
GWAS用に選択されたDNAチップは、イルミナ社の1Mドウ・ビーズチップ( Dou BeadChip)であった
(http://www.illumina.com/products/human1m_duo_dna_analysis_beadchip_kits.ilmn)。蛍光強度から製造業者の初期クラスタ設定で(異なるホモ接合体およびヘテロ接合体を含む)SNP遺伝子型を生み出した、イルミナ社のGenome Studio v1.0.2ソフトウェアを用いて、各サンプル用に得られた正規化されたビーズ強度データが分析された。品質管理(Quality Control;QC)は、コール率評価、ならびに(1)コールなし、(2)MAF0.05未満、および(3)遺伝子型決定率0.9未満でのSNP確認を含んだ。これらの基準を満たさないSNPは、その後の分析から除外された。欠損した遺伝子型決定が10%を超える個体からのデータも、分析から除外された。さらなる品質管理ステップが行われ、メンデルの法則に則した誤差率(PLINK;56)(version1.04)に基づく個体および/またはマーカーが除外された。10%を超えるメンデルの法則に則した誤差率を含むSNP、および5%を超えるメンデルの法則に則した誤差率を含む家族も除外された。次に、ハーディ・ワインベルグ平衡(HWE −p<0.00001)からの著しい逸脱を示すSNPには評価のために印を付け、その後さらなる分析から除外した。
二分または連続計測を分析するための適切なサブルーチンを用いたPLINKソフトウェア(http://pngu.mgh.harvard.edu/~purcell/plink/)を利用して、GWAS分析が行われた。なお、結果は多重検定用に修正されなかった。上記3つの分析から、p値が10−4以下であるSNPは、GA応答の予測能力を有すると考えられる。二分測定(広い定義および狭い定義)において、応答者の遺伝子型分布が非応答者と著しく異なる場合は、マーカーが選択された。
<予測モデル>
治療に対する応答者(R)と非応答者(NR)とを区別する遺伝子型プロファイルを発見するために、狭い定義(例えばp値が10−4以下)を用いて、有意差の生じたSNPに後方段階的ロジスティック回帰手法を用いた。他のモデルは、組み合わせ最適化経験則に基づいて生成された。モデルのプールが生み出されると、選択されたモデルは、赤池の情報量基準(Akaike’s Information Criterion;AIC)の低値およびモデル内の低数字のSNPに基づいて選ばれた。前のステップで選ばれたモデルは、「一つ抜き」交差確認法により、ROC曲線下面積の高値を求めた。
特定患者の応答確率p(応答性)は、それぞれの特定モデルに示された表および式に従って計算された。
SNPはさらにTaqManオープンアレイ検定による遺伝子型であり、FORTEコホートおよび他コホート内の予測値が評価された。いくつかの予測モデルは、同コホート内で評価された。
<結果>
3つのR/NR発現型を用いたGWASにおいて、GAを用いた治療への応答に関して予測値を有する86のSNPが発見された。
「方法」の項で説明した通り、上記3つの分析から、p値が10−4以下であるSNPはGA応答の予測能力を有すると考えられた。
広い定義に基づいてGWAS分析を行った際、p値が10−4以下である17のSNPが見つかった。これらのSNPは、表1に示されている。
狭い定義による応答者および非応答者に基づいて、第2の分析が行われた。この定義を用いたところ、p値が10−4以下である31のSNPが見つかった。これらのSNPは、表2に示されている。
複合発現型を用いた分析を行ったところ、ゲノムワイド(GW)有意性が、p値が10−4以下である38のSNPに見られた。これらのSNPは、表3に示されている。
Figure 2014530819
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表1〜3は、GAへの応答に対する予測値を有すると同定されるSNP(GWAS有意型SNP)に最も近い遺伝子、および「タグ付きSNP」(GWAS有意型SNPと連鎖不平衡にあるSNP)の識別をも含む。GWAS有意型SNPと連鎖不平衡にあるSNP、および/または最も近い遺伝子に存在するSNPは、被験者がGAに対する応答者もしくは非応答者であるかを予測するのに有用でもある。
その後、広い定義を用いて発見したSNPのp値を、狭い定義の分析から得られた結果と比較した。この比較により、表4に示されるように、両分析において、同じSNPがGAへの応答に有意な関連性を有することが確認された。
Figure 2014530819
<GA治療に対する応答への予測値を有するSNPに基づく予測モデル>
表2のSNPを用いた予測モデルを、ある遺伝子型とSNPとの一定の組み合わせにより、予測値を改善するために作成した。ここで強調しておきたいのは、この特異的モデルは、ある特異的な段階的後退手続きにより作成され、ゆえに発明のある一定の好ましい形態を詳述するのを目的とし、発明を限定するものではまったくないということである。当業者にとっては、他のSNPのセットおよび一定の臨床的変数を伴うあるSNPの組み合わせが、GAへの応答に対する予測値を実証し得る、当業者にとって周知の方法によって得られることは認識され得るだろう。表1〜3および表16のSNPから作成された他の予測モデルは、表17〜36に示される。
狭い定義による応答者および非応答者に基づいて分析が行われた。狭い定義に従って、応答者と分類される33人の患者、および非応答者と分類される41人の患者からデータが得られた。これらのデータは全31のSNPの遺伝子型を含む。6つのSNPからなる下記予測モデルに含まれる患者は、FORTEコホート中の599人の患者から選ばれ、51人が応答者として分類され、61人が非応答者として分類された。
段階的後退ロジスティック回帰手順により、下記の6つのSNPのセットを含む予測モデルが導かれた。6つのSNPと予測値は表5に示されている。このモデルは、FM1とも称される。
Figure 2014530819
加えて、GA治療に対する応答を予測する、予測モデルの有効性を決定するため、感度、特異度、陽性予測値(positive predictive value;PPV)および陰性予測値(negative predictive value;NPV)を分析した。検査の感度は、正しく識別された臨床的応答者の比率として定義される。一方、検査の特異度は、正しく識別された非応答者の比率を測定する。検査のPPVは、正しく識別された、陽性の検査結果が得られた患者の比率として定義される。一方、検査のNPVは、正しく識別された、陰性の検査結果が得られた患者の比率として定義される。
表5のロジスティック回帰から得られた予測値を表6に示す。
Figure 2014530819
このモデルに基づけば、表5中に示されている特定のSNPのセットを用いて、患者がGAに対する応答者であるか否かを判定することができると結論づけられる。
ある特定の患者の応答可能性が、モデルに従って計算された。関連するSNPにおける患者の遺伝子型決定に続き、6つのSNPの値が以下の表(7a〜f)に記載のように数値に再コードされた。
Figure 2014530819
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このあと、βXが以下の式に従って計算された。
Figure 2014530819
そして、応答可能性p(応答性)が以下の式を用いて計算された。
Figure 2014530819
p(応答性)が0.5より大きい患者は応答者と予測され、0.5より小さい患者は非応答者と予測された。モデルを599人のFORTE患者の完全コホートに対して遡及的に適用したところ、遺伝的に応答者と予測された患者の年再発率(annualized relapse rate;ARR)が、対全患者比62%の減少を見せ、対非応答者比で76%もの減少を見せた(p<.0001)。モデルを79人の患者の第2独立コホートに遡及的に適用したところ、モデルは遺伝的に応答者および非応答者と予測された部分母集団を同定し、それぞれ(応答者においては)比較的低い、および(非応答者においては)比較的高い再発率が見られた。プラセボ治療の集団においては、特異的なパターンは観察されなかった。このことは、この遺伝子モデルが特異的にGAに応答するものであり、MS疾病の自然過程には応答しないことを示しているようである。
表5中に示されたモデルの他の2つの変種が、表8に示されるようにさらに作成された。
Figure 2014530819
ある特定の患者の応答可能性が、各モデルに従って計算された。関連するSNPにおける患者の遺伝子型決定に続き、SNPの値が以下の表(9a〜f)に記載のように数値に再コードされた。
Figure 2014530819
Figure 2014530819
Figure 2014530819
Figure 2014530819
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その後、定義された数値変数のそれぞれの再コード値に、表中の係数を乗じることで、βXが算出された(表10はFM1モデル、表11はFM2モデル)。
Figure 2014530819
Figure 2014530819
そして、応答可能性p(応答性)が以下の式を用いて計算された。
Figure 2014530819
<複合/連続基準を用いたGWAS>
コパキソン応答の特定量基準内の各種基準(再発回数、新T2病巣の数、およびT1病巣の数)を考慮した多変量アルゴリズムを用いて、複合基準が作成された。その後、NR患者からRを区別すると考えられるSNPを探す目的で、定量的GWASが行われた。上記のように、複合基準を用いた分析により、表3に提示された、p値が10−4以下である38のSNPの同定に至った。
<経路分析>
広義および狭義の発現型へのGWAS分析によってSNP経由で同定される遺伝子のリストが作成された。表12に2つのリストが示される。これら遺伝子に基づき、広いもしくは狭い定義を用いて、著しく富化されたいくつかの標準的経路が同定された。表12に示された「遺伝子」のリストから始めることで、どの標準的経路が、広義の発現型(表13)または狭義の発現型(表14)を用いて、著しく富化されるのかを最初に発見することができた。
Figure 2014530819
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同様の富化手法を用いて、この発見が示唆する多様な経路を生成することができる。この経路は、疾患関連の経路、分子および細胞機能、生理学的システムの発達および機能に関する。表15(aおよびb)は経路知見のまとめを表す。
Figure 2014530819
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例として、図1および2はインジェニュイティ・システムズ社の経路分析ソフトウェアを用いて作成され、表15で報告された幾つかの富化された経路からの一組の遺伝子が、どのように細胞レイアウトの設計図の中に配置され得るのかを、プロキシSNPによるコパキソンへの反応に間接的に関連する遺伝子が如何にして働くかという、可能性のある機能的仮説を示唆するために示す。
図1は広義の発現型発見に関しており、炎症反応、細胞間信号伝達・相互作用、および血液学的系統の発展と機能に関連する遺伝子を提示する(AIM2、ANXA11、ASNS、CAK、CYB561、CYP24A1、DDR2、DNAJB4、DNAJB6、DNAJB7、DNAJC13、EOMES、ESM1、GDPマンノース4,6−デヒドラターゼ、GLS、GMDS、GPNMB、H6PD、HLAクラスI、HLA−DMA、HNF4A、Hsp70、IFI30、IFNG、IGH−2、IL17RB、LY6A、MEFV、MRC1、NDRG4、PTEN、ROBO3、SMTN、TAC1、TAC4、TGFB1、TTC28、TYMP、ZFPM1)。
図2は狭義の発現型知見に関しており、細胞死、細胞間信号伝達・相互作用、狭義の発現型でのGWASから結果として生じる重要なSNPにより再び識別されたもう一組の遺伝子を経た細胞発生に関連する経路を提示する(ALOX5AP、ASNS、B4GALNT1、BBX、BCKDHB、ベータ・エストラジオール、CCRN4L、CD276、CEP55、CYP24A1、CYP26C、CYP26C1、DEK、DNAJC13、GCAT、GMDS、GRIK4、HCG1787519、HCRTR1、HRAS、Hsp90、IL17B、IL4、LAD1、NFRKB、NPY、NUDT1、PGLYRP1、PTEN、SLC14A1、SPRR2B、SPRR2G(EG:6706を含む)、TAC1、TACR3、TCRB−V8.3、TNF、ZNF267)。
インジェニュイティ・システムズ社の経路分析ソフトウェア(Ingenuity Systems Pathway Analysis software)を用いて、さらに分析が繰り返され、修正した経路分析が作成された。
図3は狭義の発現型所見に関しており、細胞周期、DNA複製・組み換え・修復、細胞の成長及び増殖に関連する別の一組の遺伝子を経た結合組織疾患、代謝性疾患、脂質代謝に関連する経路を提示する。この2つのネットワークは互いに機能的に連関し、TNFαおよびCEBPBによって組織化された単一の大きな遺伝子調節ネットワークをともに作る。第3の独立した経路は、GRIK4(グルタミン酸作動性伝達)に関連している。
<R/NRの広義、狭義、複合の定義を用いた予測>
確認調査では、表1〜3からの81のGWAS有意型SNP、およびこれらのSNPとの連鎖不平衡にあるSNP(「タグ付きSNP」)を検査した。SNPはTaqManオープンアレイ検定による遺伝子型であり、FORTEコホートにおける予測値が評価された。表16は、狭い定義による応答/非応答予測に対する遺伝子型データの解釈を示唆する。広義および狭義の発現型に由来するSNPおよびタグ付きSNPについては、PPV、NPV、特異度および感度の値が与えられる。複合発現型に由来するSNPおよびタグ付きSNPについては、Rスクエアが与えられる。(CORAL調査からの)無治療患者において検査された時、FORTE調査における反応に高く関連付けられると認められたSNPのいずれもが、反応に関連付けられるとは認められない。表16aは広義の発現型についてのデータを示し、表16bは狭義および複合の発現型についてのデータを示す。
Figure 2014530819
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<GWAS有意型SNPおよびタグ付きSNPを用いた予測モデル>
追加的なモデルが、表16に記載された201のSNPの中から選ばれた低いP値を有する30のSNPに基づいて定められた。その選ばれた30のSNPとは、rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939およびrs17807327であった。
モデル対象のプールは、組み合わせ最適化経験則に基づいて生成された。選択されたモデルは、赤池情報量基準(AIC)の低値および低数字のSNPに基づいて選ばれた。前のステップで選ばれたモデルは、「一つ抜き(Leave one out)」交差確認法により、ROC曲線下面積の高値を求めた。
Figure 2014530819
ある特定の患者の応答確率は、各モデルに応じて計算された。関連したSNPでの患者の遺伝子型決定に続いて、SNPの値は、以下の表(18a〜s)に記載されるように、数値に再コード化された。
Figure 2014530819
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次のSNPのそれぞれについて、以下の表(19a〜h)に記載されるように、2つの新たな数値変数が定義される。
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βXは、定義された数値変数のそれぞれの再コード化された値に表中の係数を乗じることにより計算された(各表はモデルを定義する)。
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応答確率は、数式を用いて計算された。
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次の4つのSNP、rs4344916、rs12639443、rs17087180およびrs17771939が全てのモデルの共通であることが認められた。2つの追加のSNP、rs9508834およびrs17807327は、上記4つのSNPを含む少なくとも25/30のモデルに共通であった。それゆえ、rs4344916、rs12639443、rs17087180およびrs17771939を具備するSNPのセットが、GAへの反応を予測するのに効果的であるモデルを構成するように期待されていることを、当業者によって十分理解されるだろう。該モデルは、rs9508834、rs17807327の両方、もしくはほかのSNPを含む、rs4344916、rs12639443、rs17087180およびrs17771939に加えて、ほかのSNPを含んでよい。
該モデルは、異なる予測閾値を用いて599のFORTE患者の完全なコホートに遡及的に適用された。遺伝的に予測された非応答者患者(NR)における平均の年再発率(ARR)に比較された遺伝的に予測された応答者患者(R)のARR間の割合、および全調査対象母集団(全体)における平均ARRに比較された遺伝的に予測された応答者患者(R)で観察された平均ARR間の割合が、各予測閾値または2つの予測閾値に応じて、表37に示される。表37aは、FM1、FM2、FM1aおよびGM1003の各モデルのためのデータを示し、表37bは、GM1006、GM1011、GM1012およびGM2004の各モデルのためのデータを示し、表37cは、GM2014、GM2022、GM2027および2043の各モデルのためのデータを示し、表37dは、GM2068、GM2090、GM2094およびGM2277の各モデルのためのデータを示し、表37eは、GM2338、GM3102、GM3150およびGM3332の各モデルのためのデータを示す。
FORTEコホートおよびほかの2つのコホート(ヨーロッパ/カナダの調査およびCORAL)における(表5〜7に示された)FM1モデルのための0.8の閾値を適用し、FORTEおよびヨーロッパ/カナダの調査において、応答者として遺伝的に予測されたGA治療患者の平均ARRが、NRとして予測された患者よりも、それぞれ76%および81%低く、また全調査対象母集団よりもそれぞれ64%および77%低いことがわかった。それに比べて、応答者として遺伝的に予測された(それぞれヨーロッパ/カナダの調査およびCORALからの)プラセボ治療患者および無治療患者のいずれかにおける平均ARRは、非応答者として予測された患者よりも、それぞれ−7%および26%低く、全調査対象母集団よりも、それぞれ10%および11%低かった。ヨーロッパ/カナダの調査での応答者母集団におけるGAによるプラセボ治療患者への平均ARRの減少は79%であった。
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<考察>
GWASを用いて、表1〜3または表16に示された、GA応答性の予測的能力を持つSNPが発見された。表1〜3または表16からの、あるSNPのセットに基づいて、GAへの応答性を高精度で予測する予測モデルも作成された。GAへの応答性を予測するために他のモデルを作製することができ、ここでは表1〜3または表16からの1以上のSNPが使用され、または表1〜3または表16に示された1以上のSNPと本願に記載された臨床変数あるいは当業者によって企画され得る他のものとの組み合わせが使用される。さらに、患者がGAへの応答者であるか、非応答者であるかを予測するために、本願のSNPまたはモデルに基づくキットを使用してもよい。多発性硬化症、または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患した被験者が、表1〜3または表16からの1以上のSNP、または表1〜3に示されたSNPの臨床変数との組み合わせで、患者の遺伝子型の決定に基づいて、GAへの応答者であるかを予測することは、多発性硬化症,または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患した患者のための効果的な治療を計画することを助けるであろう。
参照文献
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Claims (98)

  1. 多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物で治療する方法であって:
    i.下記からなる群から選択される一以上の一塩基多形(SNP)における患者の遺伝子型を決定する工程と: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs230
    5623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、および rs998051;
    ii.前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定する工程と:
    次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs10214633、rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11694344、rs12256889、rs12340584、rs12494606、rs1415557、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs17807327、rs1892974、rs2088713、rs214526、rs2374730、rs4255033、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs496486、rs6015147、rs6097790、rs6584894、rs6713772、rs6909321、rs702355、rs7086707、rs7180867、rs7317000、rs844608、rs844610、rs933863、rs9392358、rs948029、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおける遺伝子型がATである; rs12524041もしくはrs7806265;
    次のSNPにおける遺伝子型がAGである; rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
    次のSNPにおける遺伝子型がACである; rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
    次のSNPにおける遺伝子型がTTである; rs1007328、rs10931091、rs11617134、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12532459、rs12593600、rs1264423、rs13042992、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs2461319、rs2508806、rs2722396、rs2722398、rs2895215、rs401618、rs4369324、rs4483642、rs4565951、rs4811492、rs552994、rs6025923、rs6025927、rs6097797、rs657302、rs7232734、rs751370、rs7633210、rs7714122、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs8118441、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995;
    次のSNPにおける遺伝子型がGTである; rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
    次のSNPにおける遺伝子型がCTである; rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603;
    次のSNPにおける遺伝子型がGGである; rs10083547、rs10136012、rs10950359、rs11599624、rs12055694、rs1229558、rs1237625、rs12496278、rs12540494、rs12633010、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13245980、rs16999008、rs17104665、rs17104742、rs2033471、rs2155262、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs2521643、rs2530121、rs2530123、rs28861531、rs3135391、rs4148871、rs4289164、rs4445746、rs6097801、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs6971202、rs7093143、rs7244801、rs752979、rs7619350、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9315048、rs9332420、rs933864、rs948032、rs949298、もしくはrs998051;
    次のSNPにおける遺伝子型がCGである; rs11618546 もしくはrs860722;
    または
    次のSNPにおける遺伝子型がCCである; rs1041897、rs10853605、rs10935016、rs10950371、rs11009827、rs11009835、rs11618546、rs11907046、rs1229542、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12488259、rs12639443、rs13021482、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs17575455、rs17807445、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2685484、rs2937395、rs4281882、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs4799760、rs6091820、rs6097782、rs6097793、rs6123749、rs660075、rs7080507、rs7789703、rs7963693、rs8099595、rs844602、rs860722、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、もしくはrs9944913 ;
    iii.前記患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される場合にのみ、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる医薬組成物を前記患者に投与する工程とを含んでなる方法。
  2. 請求項1に記載の方法であって、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含有してなる前記医薬組成物を投与することは、前記ヒト患者に対して、7日間に亘り、前記医薬組成物の3回の皮下注射を、毎回の皮下注射の間に少なくとも1日を置いて投与することを含んでなる方法。
  3. 請求項1または2に記載の方法であって、前記医薬組成物は、40mgの酢酸グラチラマーを含んでなる1mLの水溶液の単位投与量形態である方法。
  4. 請求項1または2に記載の方法であって、前記医薬組成物は、20mgの酢酸グラチラマーを含んでなる1mLの水溶液の単位投与量形態である方法。
  5. 請求項1または2に記載の方法であって、前記医薬組成物は、20mgの酢酸グラチラマーを含んでなる0.5mLの水溶液の単位投与量形態である方法。
  6. 多発性硬化症に罹患した患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として、または予測される非応答者として同定する方法であって、該方法は、下記からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)における前記患者の遺伝子型を決定することを含んでなり:rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051,
    ・前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定され:
    次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs10214633、rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11694344、rs12256889、rs12340584、rs12494606、rs1415557、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs17807327、rs1892974、rs2088713、rs214526、rs2374730、rs4255033、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs496486、rs6015147、rs6097790、rs6584894、rs6713772、rs6909321、rs702355、rs7086707、rs7180867、rs7317000、rs844608、rs844610、rs933863、rs9392358、rs948029、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおける遺伝子型がATである: rs12524041 またはrs780626;
    次のSNPにおける遺伝子型がAGである: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
    次のSNPにおける遺伝子型がACである: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
    次のSNPにおける遺伝子型がTTである: rs1007328、rs10931091、rs11617134、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12532459、rs12593600、rs1264423、rs13042992、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs2461319、rs2508806、rs2722396、rs2722398、rs2895215、rs401618、rs4369324、rs4483642、rs4565951、rs4811492、rs552994、rs6025923、rs6025927、rs6097797、rs657302、rs7232734、rs751370、rs7633210、rs7714122、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs8118441、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995;
    次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143
    次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603
    次のSNPにおける遺伝子型がGGである: rs10083547、rs10136012、rs10950359、rs11599624、rs12055694、rs1229558、rs1237625、rs12496278、rs12540494、rs12633010、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13245980、rs16999008、rs17104665、rs17104742、rs2033471、rs2155262、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs2521643、rs2530121、rs2530123、rs28861531、rs3135391、rs4148871、rs4289164、rs4445746、rs6097801、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs6971202、rs7093143、rs7244801、rs752979、rs7619350、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9315048、rs9332420、rs933864、rs948032、rs949298、もしくはrs998051;
    次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs11618546 もしくはrs860722;または
    次のSNPにおける遺伝子型がCCである: rs1041897、rs10853605、rs10935016、rs10950371、rs11009827、rs11009835、rs11618546、rs11907046、rs1229542、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12488259、rs12639443、rs13021482、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs17575455、rs17807445、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2685484、rs2937395、rs4281882、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs4799760、rs6091820、rs6097782、rs6097793、rs6123749、rs660075、rs7080507、rs7789703、rs7963693、rs8099595、rs844602、rs860722、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、もしくはrs9944913;
    ・また、前記遺伝子型が次のものであれば、前記患者は、酢酸グラチラマーに対する予測される非応答者として同定され:
    次のSNPにおける遺伝子型がAAである: rs1040194、rs10935016、rs10950359、rs11009827、rs11599624、rs12055694、rs1229542、rs1229558、rs1237625、rs12488259、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs13245980、rs16999008、rs17575455、rs2177073、rs2511064、rs2521643、rs4281882、rs4289164、rs4445746、rs4811492、rs6097793、rs6097801、rs6558102、rs7244801、rs7619350、rs7806265、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9332420、もしくはrs948032;
    次のSNPにおける遺伝子型がAGである:rs1040194、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs12055694、rs1229558、rs12340584、rs1237625、rs12494606、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs2374730、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs3742228、rs4148871、rs4343256、rs4445746、rs4809955、rs6097801、rs6713772、rs7244801、rs7619350、rs7955917、rs894857、rs933863、rs9392358、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおける遺伝子型がACである:rs10214633、rs10935016、rs11009827、rs12488259、rs2088713、rs2177073、rs4306478、rs496486、rs6097790、もしくはrs7317000;
    次のSNPにおける遺伝子型がTTである: rs10136012、rs1041897、rs10853605、rs10950371、rs11009835、rs11907046、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs1892974、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs6091820、rs6097782、rs6543934、rs660075、rs7789703、rs8099595、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、もしくはrs9944913;
    次のSNPにおける遺伝子型がGTである: rs11719825、rs13042992、rs1886308、rs2305623、もしくはrs998051;
    次のSNPにおける遺伝子型がCTである: rs1041897、rs10931091、rs11009835、rs11617134、rs11709339、rs1229553、rs1229555、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs1234567、rs1234947、rs12593600、rs12639443、rs1320648、rs1573706、rs1683691、rs17134651、rs17666347、rs2187495、rs2277431、rs2508806、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs552994、rs6091820、rs6097782、rs657302、rs660075、rs7232734、rs7714122、rs8099595、rs9378319、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs9944913、もしくはrs9952995;
    次のSNPにおける遺伝子型がGGである: rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11618546、rs11719825、rs12340584、rs12494606、rs12532459、rs13042992、rs17007730、rs17087180、rs17588454、rs1886308、rs2305623、rs2722398、rs3742228、rs4255033、rs4343256、rs4369324、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs6123749、rs6584894、rs6713772、rs7916897、rs7963693、rs9392358、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおける遺伝子型がCGである: rs10083547、rs12496278、rs1299325、rs2155262、rs28861531、rs656975、rs7963693、もしくは933864;または
    次のSNPにおける遺伝子型がCCである: rs1007328、rs10083547、rs10214633、rs10931091、rs11617134、rs11694344、rs11709339、rs11761457、rs12256889、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12496278、rs12593600、rs1299325、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs1941973、rs214526、rs2461319、rs2508806、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs4306478、rs4344916、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6097790、rs6097797、rs656975、rs657302、rs7178587、rs7232734、rs7238006、rs7317000、rs751370、rs7714122、rs7803164、rs844608、rs844610、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995;
    ・それによって、前記患者を酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定する方法。
  7. 請求項1〜5の何れか1項に記載の方法であって、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含んでなる前記医薬組成物が、単一療法として投与される方法。
  8. 請求項1〜5の何れか1項に記載の方法であって、酢酸グラチラマーおよび医薬的に許容可能な担体を含んでなる前記医薬組成物が、少なくとも一つの他の多発性硬化症薬と組み合わせて投与される方法。
  9. 請求項1〜8の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、下記からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)において決定される方法: rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939 および rs17807327。
  10. 請求項1〜9の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、下記からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)において決定される方法: rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939。
  11. 請求項1〜10の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPである rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939において決定される方法。
  12. 請求項1〜9の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs4344916、rs12639443、rs17087180および rs17771939において決定される方法。
  13. 請求項12に記載の方法であって、更に、前記遺伝子型がSNPであるrs9508834 またはrs17807327において決定される方法。
  14. 請求項12に記載の方法であって、更に、前記遺伝子型がSNPであるrs9508834 およびrs17807327において決定される方法。
  15. 請求項1〜9の何れか1項に記載の方法であって、前記SNPのうちの1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、または14以上において前記患者の遺伝子型を決定することを含んでなる方法。
  16. 請求項14に記載の方法であって、前記SNPのうちの4、6、10、11、12、または13において前記患者の遺伝子型を決定することを含んでなる方法。
  17. 請求項1〜8の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs949298において決定される方法。
  18. 請求項17に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型にスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表7a〜7fに示す通りである方法。
  19. 請求項1〜8の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs2511064において決定される方法。
  20. 請求項19に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対してスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表9a〜9fに示す通りである方法。
  21. 請求項19に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPに対して相対的な重みが割り当てられ、該相対的な重みは概ね表10に示す通りである方法。
  22. 請求項1〜8の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs12256889、rs17771939、rs2511064、および rs2521644において決定される方法。
  23. 請求項22に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対してスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表9a〜9fに示す通りである方法。
  24. 請求項22に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPに対して相対的な重みが割り当てられ、該相対的な重みは概ね表11に示す通りである方法。
  25. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs11599624、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834において決定される方法。
  26. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs12256889、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、およびrs9944913において決定される方法。
  27. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834において決定される方法。
  28. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2177073、rs2521644、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913において決定される方法。
  29. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs4445746、rs6097801、およびrs9508834において決定される方法。
  30. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4148871、rs4344916、rs4445746、および rs6097801において決定される方法。
  31. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834において決定される方法。
  32. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs1007328、rs11617134、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913において決定される方法。
  33. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、および rs9944913において決定される方法。
  34. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、および rs9944913において決定される方法。
  35. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10988087、rs12639443、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834において決定される方法。
  36. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834において決定される方法。
  37. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10950359、rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913において決定される方法。
  38. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4344916、およびrs6097801において決定される方法。
  39. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs10950359、rs10988087、rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2521644、rs3135391、rs4344916、およびrs9508834において決定される方法。
  40. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs1007328、rs10950359、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs947603、およびrs9508834において決定される方法。
  41. 請求項1〜9または請求項15〜16の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、SNPであるrs11599624、rs12256889、rs12639443、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4344916、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913において決定される方法。
  42. 請求項9〜41の何れか1項に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型に対してスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表18a〜sおよび表19a〜hに示す通りである方法。
  43. 請求項9〜41の何れか1項に記載の方法であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPに対して相対的な重みが割り当てられ、該相対的な重みは概ね表20〜表36に示す通りであり、該選択される表は遺伝子型が決定されたSNPに対応する方法。
  44. 請求項14〜43の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型は、前記患者から得られている核酸含有サンプルから決定される方法。
  45. 請求項1〜44の何れか1項に記載の方法であって、前記遺伝子型を決定することは、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、およびアレイ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される方法を使用することを含んでなる方法。
  46. 請求項45に記載の方法であって、前記遺伝子型は、少なくとも一対のPCRプライマーおよび少なくとも一つのプローブを使用して決定される方法。
  47. 請求項45に記載の方法であって、前記アレイは、遺伝子アレイ、遺伝子チップ、DNAアレイ、DNAマイクロアレイ、TaqManオープンアレイ、およびビーズアレイからなる群から選択される方法。
  48. 請求項45に記載の方法であって、前記アレイがTaqManオープンアレイである方法。
  49. 請求項1〜43の何れか1項に記載の方法であって、前記1以上のSNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定することは、
    (i)前記患者から得られたサンプルからDNAを得ることと;
    (ii)任意に該DNAを増幅することと;
    (iii)前記DNAまたは増幅されたDNAを、前記1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、遺伝子チップ、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)およびアレイ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される方法にかけること
    を含んでなる方法。
  50. 請求項47に記載の方法であって、前記アレイは、前記1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために適した複数のプローブを含んでなる方法。
  51. 請求項1〜50の何れか1項に記載の方法であって、前記ヒト患者は未処置の患者である方法。
  52. 請求項1〜50の何れか1項に記載の方法であって、前記ヒト患者は以前に酢酸グラチラマーを投与されたことがある方法。
  53. 請求項1〜50の何れか1項に記載の方法であって、前記ヒト患者は、以前に酢酸グラチラマー以外の多発性硬化症薬を投与されたことがある方法。
  54. 請求項1〜53の何れか1項に記載の方法であって、前記1以上のSNPにおける前記患者の遺伝子型は、前記1以上のSNPと連鎖不平衡にあるSNPにおいて、前記患者の遺伝子型を決定することによって間接的に得られる方法。
  55. 多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、該キットは、下記からなる群から選択されるSNPに特異的な少なくとも一つのプローブを含んでなるキット: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051。
  56. 多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、該キットは、下記からなる群から選択されるSNPを含むDNA切片を増幅するように設計された少なくとも一対のPCRプライマーを含んでなるキット: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、および rs998051。
  57. 多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、該キットは、下記からなる群から選択される少なくとも一つののアイデンティティーを決定するために、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、遺伝子チップ、および変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)からなる群から選択される方法を実施するための試薬を含んでなるキット: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、および rs998051。
  58. 請求項55または請求項56に記載のキットであって、該キットは、
    (i)下記からなる群から選択されるSNPを含むDNA切片を増幅するように設計された少なくとも1対のPCRプライマーと: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277
    431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、および rs998051;
    (ii)下記からなる群から選択されるSNPについて特異的な少なくとも一つのプローブ; rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、および rs998051
    を含んでなるキット。
  59. 多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するためのキットであって、下記からなる群から選択される少なくとも一つのSNPのアイデンティティーを決定するために設計されたTaqManオープンアレイ検定のための試薬を含んでなるキット: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、および rs998051。
  60. 請求項55〜59の何れか1項に記載のキットであって、更に、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者もしくは予測される非応答者として同定するために、該キットを使用するための指示書を含んでなるキット。
  61. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、前記1以上の一塩基多形(SNP)が下記からなる群から選択されるキット:: rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939 およびrs17807327。
  62. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、前記1以上の一塩基多形(SNP)が下記からなる群から選択されるキット:: rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939。
  63. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、前記1以上の一塩基多形(SNP)が下記からなる群から選択されるキット:: rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939。
  64. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939。
  65. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939。
  66. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs949298。
  67. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs2511064。
  68. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs12256889、rs17771939、rs2511064、およびrs2521644。
  69. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs11599624、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834。
  70. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs12256889、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、およびrs9944913。
  71. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10988087、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834。
  72. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2177073、rs2521644、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
  73. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs4445746、rs6097801、およびrs9508834。
  74. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4148871、rs4344916、rs4445746、およびrs6097801。
  75. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834。
  76. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs1007328、rs11617134、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913。
  77. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
  78. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
  79. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10988087、rs12639443、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834。
  80. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834。
  81. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10950359、rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913。
  82. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4344916、およびrs6097801。
  83. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2521644、rs3135391、rs4344916、およびrs9508834。
  84. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs1007328、rs10950359、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs947603、およびrs9508834。
  85. 請求項55〜60の何れか1項に記載のキットであって、該キットは下記SNPにおける遺伝子型を決定するように設計されるキット: rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4344916、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
  86. 下記からなる群から選択されるSNPの遺伝子型を同定するためのプローブ: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051。
  87. 下記からなる群から選択されるSNPの遺伝子型を同定するためのプローブ: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051。
  88. 多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するためのキットであって:
    a)少なくとも一つのSNPについて特異的な少なくとも一つのプローブ;
    b)少なくとも一つのSNPを含んだDNA切片を増幅するように設計された少なくとも一対のPCRプライマー;
    c)少なくとも一つのSNPを含んだDNA切片を増幅するように設計された少なくとも一対のPCRプライマー、および少なくとも一つのSNPについて特異的な少なくとも一つのプローブ;
    d)少なくとも一つのSNPのアイデンティティーを決定するための、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、遺伝子チップ、および変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)からなる群から選択される方法を実施するための試薬;または
    e)少なくとも一つのSNPのアイデンティティーを決定するために設計されたTaqManオープンアレイ検定のための試薬
    を含んでなり、
    前記少なくとも一つのSNPは下記からなる群から選択されるキット: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051。
  89. 請求項88に記載のキットであって、前記少なくとも一つの一塩基多形(SNP)が
    a)下記からなる群から選択されるか: rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939 およびrs17807327;
    b)下記からなる群から選択されるか: rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939;または
    c)下記からなる群から選択され: rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939、
    好ましくは、前記キットは更に、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するために、該キットを使用するために指示書を含んでなるキット。
  90. 請求項88に記載のキットであって、前記少なくとも一つのSNPが、
    a)rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939;
    b)rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939;
    c)rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs949298;
    d)rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs2511064;
    e)rs12256889、rs17771939、rs2511064、およびrs2521644;
    f)rs11599624、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、および rs9508834;
    g)rs12256889、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、およびrs9944913;
    h)rs10988087、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834;
    i)rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2177073、rs2521644、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs994;
    j)rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs4445746、rs6097801、およびrs9508834;
    k)rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4148871、rs4344916、rs4445746、およびrs6097801;
    l)rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834;
    m)rs1007328、rs11617134、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913;
    n)rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913;
    o)rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913;
    p)rs10988087、rs12639443、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834;
    q)rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834;
    r)rs10950359、rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913;
    s)rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4344916、およびrs6097801;
    t)rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2521644、rs3135391、rs4344916、およびrs9508834;
    u)rs1007328、rs10950359、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs947603、およびrs9508834;または
    v)rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4344916、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913であり、
    好ましくは、更に、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を、酢酸グラチラマーに対する予測される応答者または予測される非応答者として同定するために、該キットを使用するための指示書を含んでなるキット。
  91. 下記のa)およびb)の方法によって酢酸グラチラマーに対する予測される応答者として同定される、多発性硬化症に罹患したヒト患者または多発性硬化症に一致する単回の臨床的発作に罹患したヒト患者を治療することにおいて使用するための、酢酸グラチラマー、または酢酸グラチラマーを含有する医薬組成物:
    a)下記からなる群から選択される1以上の一塩基多形(SNP)において患者の遺伝子型を決定すること: rs1007328、rs10083547、rs10136012、rs10214633、rs10277267、rs1040194、rs1041897、rs10853605、rs10931091、rs10935015、rs10935016、rs10935019、rs10950359、rs10950371、rs10988087、rs11009827、rs11009835、rs11081859、rs11599624、rs11617134、rs11618546、rs11694344、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs11907046、rs12055694、rs12256889、rs1229542、rs1229553、rs1229555、rs1229558、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12340584、rs1234567、rs1234947、rs1237625、rs12488259、rs12494606、rs12496278、rs12524041、rs12529764、rs12532459、rs12540494、rs12593600、rs12633010、rs12637073、rs12639443、rs1264423、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13021482、rs13042992、rs1320648、rs13238613、rs13245980、rs1415557、rs1538123、rs1573706、rs1591661、rs1611185、rs1683691、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17134651、rs17575455、rs17588454、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs17807445、rs1886308、rs1892974、rs1941973、rs2033471、rs2088713、rs214526、rs2155262、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2305623、rs2374730、rs2461319、rs2487889、rs2487896、rs2508806、rs2511064、rs2521643、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2722396、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs2937395、rs3135391、rs35831078、rs3742228、rs401618、rs4148871、rs4255033、rs4281882、rs4289164、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4435429、rs4445746、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs4578835、rs4634524、rs4799760、rs4809955、rs4811492、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6091820、rs6097782、rs6097790、rs6097793、rs6097797、rs6097801、rs6123749、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs657302、rs6584894、rs660075、rs6713772、rs6909321、rs6971202、rs702355、rs7080507、rs7086707、rs7093143、rs7178587、rs7180867、rs7232734、rs7238006、rs7244801、rs7317000、rs751370、rs752979、rs7619350、rs7633210、rs7714122、rs7789703、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs7955917、rs7963693、rs8099595、rs8118441、rs844602、rs844608、rs844610、rs844612、rs844626、rs860722、rs873216、rs884266、rs894857、rs913882、rs9315048、rs9332420、rs933863、rs933864、rs9378319、rs9378684、rs9392358、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、rs948032、rs949298、rs9508834、rs9944913、rs9952995、およびrs998051;および
    b)前記遺伝子型が下記の通りであれば、前記患者を酢酸グラチラマーに対する予測された応答者として同定すること:
    次のSNPにおいてAA: rs10214633、rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11694344、rs12256889、rs12340584、rs12494606、rs1415557、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs17807327、rs1892974、rs2088713、rs214526、rs2374730、rs4255033、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs496486、rs6015147、rs6097790、rs6584894、rs6713772、rs6909321、rs702355、rs7086707、rs7180867、rs7317000、rs844608、rs844610、rs933863、rs9392358、rs948029、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおいてAT: rs12524041 もしくはrs7806265;
    次のSNPにおいてAG: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
    次のSNPにおいてAC: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
    次のSNPにおいてTT: rs1007328、rs10931091、rs11617134、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12532459、rs12593600、rs1264423、rs13042992、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs2461319、rs2508806、rs2722396、rs2722398、rs2895215、rs401618、rs4369324、rs4483642、rs4565951、rs4811492、rs552994、rs6025923、rs6025927、rs6097797、rs657302、rs7232734、rs751370、rs7633210、rs7714122、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs8118441、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995;
    次のSNPにおいてGT: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
    次のSNPにおいてCT: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603、
    GG at rs10083547、rs10136012、rs10950359、rs11599624、rs12055694、rs1229558、rs1237625、rs12496278、rs12540494、rs12633010、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13245980、rs16999008、rs17104665、rs17104742、rs2033471、rs2155262、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs2521643、rs2530121、rs2530123、rs28861531、rs3135391、rs4148871、rs4289164、rs4445746、rs6097801、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs6971202、rs7093143、rs7244801、rs752979、rs7619350、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9315048、rs9332420、rs933864、rs948032、rs949298、もしくはrs998051;
    次のSNPにおいてCG: rs11618546 もしくはrs860722;
    または
    次のSNPにおいてCC: rs1041897、rs10853605、rs10935016、rs10950371、rs11009827、rs11009835、rs11618546、rs11907046、rs1229542、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12488259、rs12639443、rs13021482、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs17575455、rs17807445、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2685484、rs2937395、rs4281882、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs4799760、rs6091820、rs6097782、rs6097793、rs6123749、rs660075、rs7080507、rs7789703、rs7963693、rs8099595、rs844602、rs860722、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、もしくはrs9944913。
  92. 請求項91に記載の使用のための、酢酸グラチラマーまたは酢酸グラチラマーを含有する医薬組成物であって、前記ヒト患者に対して、7日間に亘り前記医薬組成物の3回の皮下注射を、毎回の皮下注射の間に少なくとも1日を置いて投与するための、下記のようにして調製された酢酸グラチラマーまたは医薬組成物:
    40mgの酢酸グラチラマーを含有する1mL水溶液の単位投与量形態として調製されたもの;
    20mgの酢酸グラチラマーを含有する1mL水溶液の単位投与量形態として調製されたもの;
    20mgの酢酸グラチラマーを含有する0.5mL水溶液の単位投与量形態として調製されたもの;
    単剤療法として使用するために調製されたもの;または
    少なくとも一つの他の多発性硬化症薬と併用して使用するために調製されたもの。
  93. ヒト患者の遺伝子型を決定する方法であって、ヒト患者の遺伝子型が下記の何れであるかを同定することを含んでなる方法:
    次のSNPにおいてAA: rs10214633、rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11694344、rs12256889、rs12340584、rs12494606、rs1415557、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs17807327、rs1892974、rs2088713、rs214526、rs2374730、rs4255033、rs4306478、rs4343256、rs4344916、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs496486、rs6015147、rs6097790、rs6584894、rs6713772、rs6909321、rs702355、rs7086707、rs7180867、rs7317000、rs844608、rs844610、rs933863、rs9392358、rs948029、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおいてAT: rs12524041 もしくはrs7806265;
    次のSNPにおいてAG: rs10277267、rs10950359、rs11599624、rs13245980、rs1415557、rs2521643、rs4255033、rs6584894、rs6909321、rs702355、もしくはrs844626;
    次のSNPにおいてAC: rs12256889、rs1229542、rs214526、rs6097793、rs7086707、rs7180867、rs844608、もしくはrs844610;
    次のSNPにおいてTT: rs1007328、rs10931091、rs11617134、rs11709339、rs11719825、rs11761457、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12532459、rs12593600、rs1264423、rs13042992、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs2461319、rs2508806、rs2722396、rs2722398、rs2895215、rs401618、rs4369324、rs4483642、rs4565951、rs4811492、rs552994、rs6025923、rs6025927、rs6097797、rs657302、rs7232734、rs751370、rs7633210、rs7714122、rs7803164、rs7806265、rs7916897、rs8118441、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995;
    次のSNPにおいてGT: rs12532459、rs2722398、rs4369324、もしくはrs7093143;
    次のSNPにおいてCT: rs10950371、rs11761457、rs1229562、rs12529764、rs13021482、rs13238613、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17807445、rs1941973、rs2461319、rs2685484、rs2895215、rs4634524、rs4799760、rs6097797、rs7080507、rs7238006、rs7789703、rs7803164、rs844612、もしくはrs947603;
    次のSNPにおいてGG: rs10083547、rs10136012、rs10950359、rs11599624、rs12055694、rs1229558、rs1237625、rs12496278、rs12540494、rs12633010、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs1299325、rs13245980、rs16999008、rs17104665、rs17104742、rs2033471、rs2155262、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs2521643、rs2530121、rs2530123、rs28861531、rs3135391、rs4148871、rs4289164、rs4445746、rs6097801、rs6543934、rs6558102、rs656975、rs6971202、rs7093143、rs7244801、rs752979、rs7619350、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9315048、rs9332420、rs933864、rs948032、rs949298、もしくはrs998051;
    次のSNPにおいてCG: rs11618546 もしくはrs860722;
    次のSNPにおいてCC: rs1041897、rs10853605、rs10935016、rs10950371、rs11009827、rs11009835、rs11618546、rs11907046、rs1229542、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12488259、rs12639443、rs13021482、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs17575455、rs17807445、rs2177073、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2685484、rs2937395、rs4281882、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs4799760、rs6091820、rs6097782、rs6097793、rs6123749、rs660075、rs7080507、rs7789703、rs7963693、rs8099595、rs844602、rs860722、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、もしくはrs9944913;
    次のSNPにおいてAA: rs1040194、rs10935016、rs10950359、rs11009827、rs11599624、rs12055694、rs1229542、rs1229558、rs1237625、rs12488259、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs13245980、rs16999008、rs17575455、rs2177073、rs2511064、rs2521643、rs4281882、rs4289164、rs4445746、rs4811492、rs6097793、rs6097801、rs6558102、rs7244801、rs7619350、rs7806265、rs7955917、rs844626、rs873216、rs894857、rs9332420、もしくはrs948032;
    次のSNPにおいてAG: rs1040194、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs12055694、rs1229558、rs12340584、rs1237625、rs12494606、rs12540494、rs12637073、rs1282540、rs1282546、rs12968586、rs16999008、rs17007730、rs17087180、rs17104665、rs17104742、rs17588454、rs2374730、rs2487889、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs3742228、rs4148871、rs4343256、rs4445746、rs4809955、rs6097801、rs6713772、rs7244801、rs7619350、rs7955917、rs894857、rs933863、rs9392358、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおいてAC: rs10214633、rs10935016、rs11009827、rs12488259、rs2088713、rs2177073、rs4306478、rs496486、rs6097790、もしくはrs7317000;
    次のSNPにおいてTT: rs10136012、rs1041897、rs10853605、rs10950371、rs11009835、rs11907046、rs1229555、rs1229562、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs1683691、rs1892974、rs2187495、rs2277431、rs2521644、rs2530121、rs2530123、rs2685484、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4634524、rs6091820、rs6097782、rs6543934、rs660075、rs7789703、rs8099595、rs884266、rs913882、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs947603、rs948029、もしくはrs9944913;
    次のSNPにおいてGT: rs11719825、rs13042992、rs1886308、rs2305623、もしくはrs998051;
    次のSNPにおいてCT: rs1041897、rs10931091、rs11009835、rs11617134、rs11709339、rs1229553、rs1229555、rs1229563、rs1229564、rs1229568、rs1234567、rs1234947、rs12593600、rs12639443、rs1320648、rs1573706、rs1683691、rs17134651、rs17666347、rs2187495、rs2277431、rs2508806、rs2937395、rs35831078、rs4466940、rs4468448、rs4483642、rs4565951、rs552994、rs6091820、rs6097782、rs657302、rs660075、rs7232734、rs7714122、rs8099595、rs9378319、rs9378684、rs9405541、rs9405546、rs9944913、もしくはrs9952995;
    次のSNPにおいてGG: rs10277267、rs10935015、rs10935019、rs10988087、rs11081859、rs11618546、rs11719825、rs12340584、rs12494606、rs12532459、rs13042992、rs17007730、rs17087180、rs17588454、rs1886308、rs2305623、rs2722398、rs3742228、rs4255033、rs4343256、rs4369324、rs4435429、rs4578835、rs4809955、rs6123749、rs6584894、rs6713772、rs7916897、rs7963693、rs9392358、もしくはrs9508834;
    次のSNPにおいてCG: rs10083547、rs12496278、rs1299325、rs2155262、rs28861531、rs656975、rs7963693、もしくはrs933864;
    または
    次のSNPにおいてCC: rs1007328、rs10083547、rs10214633、rs10931091、rs11617134、rs11694344、rs11709339、rs11761457、rs12256889、rs1229553、rs1234567、rs1234947、rs12496278、rs12593600、rs1299325、rs1320648、rs1538123、rs1591661、rs1611185、rs17134651、rs17666347、rs17771939、rs17807327、rs1941973、rs214526、rs2461319、rs2508806、rs2722398、rs28861531、rs2895215、rs4306478、rs4344916、rs496486、rs552994、rs6015147、rs6025923、rs6025927、rs6097790、rs6097797、rs656975、rs657302、rs7178587、rs7232734、rs7238006、rs7317000、rs751370、rs7714122、rs7803164、rs844608、rs844610、rs844612、rs9378319、もしくはrs9952995。
  94. 請求項91〜92の何れか1項に記載の使用のため、または請求項93に記載の方法のための、酢酸グラチラマーまたは酢酸グラチラマーを含有する医薬組成物であって、
    前記患者の遺伝子型を決定することは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14またはそれ以上の前記SNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定すること;好ましくは4、6、10、11、12または13の前記SNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定することを含んでなり;
    または
    前記遺伝子型は1以上の一塩基多形(SNP)において決定され、
    a)は、次のSNPからなる群から選択され: rs947603、rs1007328、rs1573706、rs2177073、rs2487896、rs2511064、rs2521644、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、rs9944913、rs10853605、rs10931091、rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17575455、rs17771939 およびrs17807327;
    b)は、次のSNPからなる群から選択され: rs9508834、rs17807327、rs4344916、rs12639443、rs17087180 および rs17771939;または
    c)は、次のSNPからなる群から選択される; rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939。
  95. 請求項91〜94の何れか1項に記載の使用のため、または請求項93または請求項94に記載の方法のための、酢酸グラチラマーまたは酢酸グラチラマーを含有する医薬組成物であって、前記遺伝子型は下記のSNPにおいて決定される酢酸グラチラマーまたは医薬組成物:
    a)rs4344916、rs12639443、rs17087180 およびrs17771939;
    b)rs4344916、rs12639443、rs17087180、rs17771939 およびrs9508834;
    c)rs4344916、rs12639443、rs17087180、rs17771939 およびrs17807327;
    d)rs4344916、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs9508834 およびrs17807327;
    e)rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs949298;
    f)rs2521644、rs12256889、rs214526、rs17771939、rs496486、およびrs2511064;
    g)rs12256889、rs17771939、rs2511064、およびrs2521644;
    h)rs11599624、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834;
    i)rs12256889、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、およびrs9944913;
    j)rs10988087、rs12639443、rs13042992、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834;
    k)rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2177073、rs2521644、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913;
    l)rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs4445746、rs6097801、およびrs9508834;
    m)rs10988087、rs11617134、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4148871、rs4344916、rs4445746、およびrs6097801;
    n)rs10988087、rs12256889、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834;
    o)rs1007328、rs11617134、rs12639443、rs13238613、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913;
    p)rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs4369324、rs4445746、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913;
    q)rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs3135391、rs4148871、rs4344916、rs4369324、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913;
    r)rs10988087、rs12639443、rs13238613、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs4148871、rs4343256、rs4344916、およびrs9508834;
    s)rs11617134、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4343256、rs4344916、rs6097801、およびrs9508834;
    t)rs10950359、rs11617134、rs12639443、rs17087180、rs17771939、rs2487896、rs2511064、rs3135391、rs4148871、rs4343256、rs4344916、rs9508834、およびrs9944913;
    u)rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2487896、rs2521644、rs4344916、およびrs6097801;
    v)rs10950359、rs10988087、rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2521644、rs3135391、rs4344916、およびrs9508834;
    w)rs1007328、rs10950359、rs12256889、rs12639443、rs13042992、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs4343256、rs4344916、rs947603、およびrs9508834;
    または
    x)rs11599624、rs12256889、rs12639443、rs1573706、rs17087180、rs17771939、rs17807327、rs2177073、rs2487896、rs4344916、rs6097801、rs9508834、およびrs9944913。
  96. 請求項91〜95の何れか1項に記載の使用のため、または請求項93〜95の何れか1項に記載の方法のための、酢酸グラチラマーまたは酢酸グラチラマーを含有する医薬組成物であって、前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPの各遺伝子型にスコアが割り当てられ、該スコアは概ね表7a〜f、表9a〜f、表18a〜sおよび表19a〜hに示され;
    または
    前記ヒト患者が酢酸グラチラマーに対する予測される応答者であるかどうかを決定する目的で、各SNPに相対的な重みが割り当てられ、ここでの相対的な重みは表10〜11または表20〜36に示す通りであり;
    前記選択される表は、遺伝子型が決定されたSNPに対応するものである酢酸グラチラマーまたは医薬組成物。
  97. 請求項4〜10の何れか1項に記載の使用のため、または請求項7〜10の何れか1項に記載の方法のための酢酸グラチラマーであって、前記遺伝子型は前記患者から得られている核酸含有サンプルから決定され;
    ここで、前記遺伝子型を決定することは、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、およびアレイ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される方法を使用することを含み;好ましくは、前記アレイは遺伝子アレイ、遺伝子チップ、DNAアレイ、DNAマイクロアレイ、TaqManオープンアレイおよびビーズアレイからなる群から選択され;より好ましくは、前記アレイはTaqManオープンアレイであり;最も好ましくは、前記アレイは1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために適した複数のプローブを含んでなり;
    前記遺伝子型は、少なくとも一対のPCRプライマーおよび少なくとも一つのプローブを使用して決定され、
    前記1以上のSNPにおいて前記患者の遺伝子型を決定することは、
    a)前記患者から得られているサンプルからDNAを得ること;
    b)任意に、前記DNAを増幅すること;
    c)前記1以上のSNPのアイデンティティーを決定するために、前記DNAまたは前記増幅されたDNAに、制限断片長多形(RFLP)解析、シーケンシング、一本鎖コンホメーション多形解析(SSCP)、ミスマッチの化学的開裂(CCM)、変性高速液体クロマトグラフィー(DHPLC)、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、およびアレイ、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される方法を適用することを含み;
    または、前記1以上のSNPにおける前記患者の遺伝子型は、前記1以上のSNPと連鎖不平衡にあるSNPにおいて、前記患者の遺伝子型を決定することによって間接的に得られる酢酸グラチラマー。
  98. 請求項91〜97の何れか1項に記載の使用または請求項93〜97の何れか1項に記載の方法のための、酢酸グラチラマーまたは該酢酸グラチラマーを含有する医薬組成物であって:前記ヒト患者は未処置の患者であるか;または前記ヒト患者は以前ン委酢酸グラチラマー以外の多発性硬化症薬を投与されたことがある酢酸グラチラマーまたは医薬組成物。
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