JP2014525586A5 - - Google Patents

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他の実施形態において、本発明は、a)対象から試料を得ること;b)対象から得られた試料を、遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体によりコードされたマーカーのパネルの発現を検出する1種以上の薬剤と接触させること;c)非癌性細胞をb)の1種以上の薬剤と接触させること;およびd)対象から得られた試料中の遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体によりコードされたマーカーのパネルの発現レベルを、非癌性細胞中の遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体によりコードされたマーカーのパネルの発現レベルと比較すること、を含み、ここで非癌性細胞に比較して試料中の遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体によりコードされたマーカーのパネルの発現レベルが高ければ、対象が大腸癌を有すること、または対象癌が癌を有することが示される、対象における大腸癌を検出する方法を提供する。
幾つかの実施形態において、本発明は、a)対象から試料を得ること;b)対象から得られた試料を、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体から選択された遺伝子によりコードされたマーカーの1種以上の発現を検出する1種以上の薬剤と接触させること;c)非癌性細胞をb)の1種以上の薬剤と接触させること;およびd)対象から得られた試料中のSPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体から選択される遺伝子によりコードされたマーカーの1種以上の発現レベルを、非癌性細胞中のSPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体から選択される遺伝子によりコードされたマーカーの1種以上の発現レベルと比較すること、を含み、ここで非癌性細胞に比較して対象から得られた試料中のSPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体から選択される遺伝子によりコードされたマーカーの1種以上の発現レベルが高ければ、対象が大腸癌を有することが示される、対象における大腸癌を検出する方法を提供する。
特定の実施形態において、本発明は、a)試料を、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aから選択されるマーカーの少なくとも1種の発現を検出する1種以上の薬剤と接触させること;c)非癌性細胞をb)の1種以上の薬剤と接触させること;およびd)試料中の、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aから選択されるマーカーの1種以上の発現レベルを、非癌性細胞中のSPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aから選択されるマーカーの1種以上の発現レベルと比較すること、を含み、ここで非癌性細胞に比較して試料中のSPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aから選択される試料中のマーカーの1種以上の発現レベルが高ければ、試料が大腸癌細胞を有することが示される、試料中の大腸癌細胞を検出する方法を提供する。
更なる実施形態において、本発明は、大腸癌細胞により発現される分子のパネルに特異的に結合する、複数の抗体などの複数の蛋白質を含む物質の組成物を提供し、マーカーの該パネルは、遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体によりコードされた分子を含む。マーカーのパネルは、非癌性細胞内のマーカーのパネルのレベルよりも高いレベルで発現され得る。
更に別の実施形態において、本発明は、試料中の大腸癌細胞を検出するキットを提供する。該キットは、以下に開示される任意の「癌に関連する配列」の発現を検出する1種以上の薬剤を含んでいてもよい。該キットは、例えば蛋白質および/または核酸である薬剤を含んでいてもよい。一実施形態において、キットは、複数の薬剤を提供する。薬剤は、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aまたはその相補体を含む遺伝子によりコードされたマーカーのパネルを検出することができてもよい。
更に別の実施形態において、本発明は、遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10Aによりコードされた分子に特異的に結合する複数の薬剤を含む、試料中の大腸癌を検出するキットを提供する。
悪性大腸腫瘍と対比させた正常組織におけるSPINK4の発現を示す。 大腸腫瘍、正常組織および他の悪性腫瘍タイプにおけるL1TD1の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるLY6G6Dの発現を示す。 正常組織に対比させた大腸腫瘍および他の悪性腫瘍におけるAPOBEC1の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるLOC729669の発現を示す。 正常組織に対比させた大腸腫瘍および他の悪性腫瘍におけるNOTUMの発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるGRPの発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるKRT20の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるMUC17の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるNOTUMの発現を示す。 大腸腫瘍および他の癌に対比させた正常組織におけるCOL11A1の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるMMP11の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるMMP12の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるMMP7の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるDKK4の発現を示す。 qRT−PCRにより測定された、正常組織および結腸癌組織におけるLY6G6D mRNA発現を示す。LY6G6D発現レベルを、定量PCR(qPCR)により測定し、ACTB発現レベルに標準化して、2^(−delta Ct)値として表す。投入されたcDNA試料は、TissueScan(商標)cDNA Arrays(Colon Cancer Disease Panel II, Origene)として得た。LY6G6D:プライマー:UPL479_LY6G6D−FおよびUPL480_LY6G6D−R、プローブ:UPLプローブ#20。ACTB:SYBR(登録商標)Green I(Applied Biosystems/Life Technologies)と組み合わせたTissueScanプライマー(Origene)。 qRT−PCRにより測定された、正常組織および結腸癌組織におけるSPINK4 mRNA発現を示す。SPINK4発現レベルを、定量PCR(qPCR)により測定し、ACTB発現レベルに標準化して、2^(−delta Ct)値として表す。投入されたcDNA試料は、TissueScan(商標)cDNA Arrays(Colon Cancer Disease Panel II, Origene)として得た。SPINK4:プライマー:UPL475_SPINK4−FおよびUPL476_SPINK4−R、プローブ:UPLプローブ#18。ACTB:SYBR(登録商標)Green I(Applied Biosystems/Life Technologies)と組み合わせたTissueScanプライマー(Origene)。 qRT−PCRにより測定された、正常組織および結腸癌組織におけるL1TD1 mRNA発現を示す。L1TD1発現レベルを、定量PCR(qPCR)により測定し、ACTB発現レベルに標準化して、2^(−delta Ct)値として表す。投入されたcDNA試料は、TissueScan(商標)cDNA Arrays(Colon Cancer Disease Panel II, Origene)として得た。L1TD1:プライマー:UPL485_L1TD1−FおよびUPL486_L1TD1−R、プローブ:UPLプローブ#42。ACTB:SYBR(登録商標)Green I(Applied Biosystems/Life Technologies)と組み合わせたTissueScanプライマー(Origene)。 qRT−PCRにより測定された、正常組織および結腸癌組織におけるDKK4 mRNA発現を示す。1つの正常組織(N1)および5つの結腸癌組織(C1〜C5)のDKK4発現レベルを、GUSB発現レベルに標準化して、2^(−delta Ct)値として表す。DKK4:プライマー:UPL495_DKK4−F3およびUPL496_DKK4−R3、プローブ:UPL#19。GUSB:プライマー:UPL081_GUSB−FおよびUPL082_GUSB−R、プローブ:UPLプローブ#57。 qRT−PCRにより測定された、正常組織および結腸癌組織におけるNOTUM mRNA発現を示す。1つの正常組織(N1)および3つの結腸癌組織(C1〜C3)のNOTUM発現レベルを、GUSB発現レベルに標準化して、2^(−delta Ct)値として表す。NOTUM:プライマー:UPL489_NOTUM−FおよびUPL490_NOTUM−R、プローブ:UPL#34。GUSB:プライマー:UPL081_GUSB−FおよびUPL082_GUSB−R、プローブ:UPLプローブ#57。 大腸腫瘍および他の腫瘍に対比させた正常組織におけるCOL10Aの発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるSLC35D3の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるCOLX(COL10Aによりコードされた蛋白質)の発現を示す。 大腸腫瘍に対比させた正常組織におけるMMP11の発現を示す。
実施例9
qPCRを利用して、様々な癌、良性腫瘍および正常組織における以下の遺伝子:AMH_1038;ASCL1_1095;C12orf56;C2orf70_1010;COL10A;DSCR6_1066;DSCR8_1036;LHX8_1283;MMP11;MMP12;NMU;SLC35Dの発現レベルを検討した。
COL10Aのフォワードプライマーは、GGGCCTCAATGGACCCACCG(SEQ ID NO:)、リバースプライマーは、CTGGGCCTTTGGCCTGCCTT(SEQ ID NO: 16)であった。SLC35Dのフォワードプライマーは、GCTATTTTGAAAATATGAGTTCTTAGC(SEQ ID NO:)、リバースプライマーは、CTTTACAGGTGGTCCCTCTTC(SEQ ID NO: 17)であった。
結果を図21〜22に示すが、それらはCOL10A、SLC35D3マーカーの大腸癌における増加を示している。
実施例10
COLX(遺伝子COL10Aをコードする蛋白質)の発現を、結腸癌組織および正常な結腸組織で免疫細胞化学検査を実施することにより検討した。

Claims (19)

  1. 試料中の大腸癌を検出する方法であって、a)前記試料を、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11から選択された遺伝子によりコードされた少なくとも1種のマーカーの発現を検出する1種以上の薬剤と接触させること;b)非癌性細胞をa)の前記1種以上の薬剤と接触させること;およびc)前記試料中の、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11から選択された遺伝子によりコードされた前記マーカーの1種以上の発現レベルを、前記非癌性細胞中の、SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11から選択された前記マーカーの1種以上の発現レベルと比較すること、を含み、ここで前記非癌性細胞に比較して前記試料中のSPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11から選択された遺伝子によりコードされた前記マーカーの1種以上の前記試料中での発現レベルが高ければ、前記試料が大腸癌細胞を有することが示される、方法。
  2. 前記試料が、対象から得られる、請求項1に記載の方法。
  3. 前記対象が、ヒトである、請求項2に記載の方法。
  4. 前記試料が、体液である、請求項3に記載の方法。
  5. 前記体液が、血清である、請求項4に記載の方法。
  6. 前記薬剤が、蛋白質である、請求項1に記載の方法。
  7. 前記薬剤が、抗体である、請求項6に記載の方法。
  8. 前記薬剤が、核酸である、請求項1に記載の方法。
  9. 前記核酸が、DNA分子である、請求項8に記載の方法。
  10. 前記核酸分子が、約10〜500ヌクレオチドの長さである、請求項8に記載の方法。
  11. 前記薬剤が、それに結合された検出可能な物質を含む、請求項1に記載の方法。
  12. a)前記試料を、遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11によりコードされた前記マーカーの発現を検出する1種以上の薬剤と接触させること;b)非癌性細胞をa)の前記1種以上の薬剤と接触させること;およびc)前記試料中の前記マーカーの発現レベルを、前記非癌性細胞中の前記マーカーの発現レベルと比較すること、を含み、ここで前記非癌性細胞に比較して前記試料中の遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11によりコードされた前記マーカーの少なくとも1種の発現レベルが高ければ、前記試料が癌細胞を有することが示される、請求項1に記載の方法。
  13. 遺伝子SPINK4、L1TD1、LY6G6D、APOBEC1、LOC729669、COL10A、SLC35D、MMP7、MMP12、NMU、WNT10A、MMP11によりコードされた分子に特異的に結合する複数の薬剤を含む、試料中の癌を検出するキット。
  14. 前記薬剤が、核酸分子である、請求項14に記載のキット。
  15. 前記核酸分子が、DNA分子である、請求項15に記載のキット。
  16. 前記薬剤が、蛋白質である、請求項14に記載のキット。
  17. 前記蛋白質が、抗体である、請求項17に記載のキット。
  18. 前記薬剤が、検出可能な物質で標識されている、請求項14に記載のキット。
  19. a)対象から試料を得ること;b)前記対象から得られた前記試料を、ホモサピエンスセリンペプチダーゼ阻害剤Kazak type4(SPINK4)、ホモサピエンスLINE−1 typeトランスポザーゼドメイン含有1(L1TD1)、ホモサピエンス溶質キャリアファミリー35メンバーD3(SLC35D3)、ホモサピエンスリンパ球抗原6複合体遺伝子座G6D(LY6G6D)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ12(マクロファージエラスターゼ)(MMP12)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ12(マクロファージエラスターゼ)(MMP12)、ホモサピエンスアポリポ蛋白質B mRNA編集酵素触媒ポリペプチド1(APOBEC1)、ホモサピエンスdickkopf相同体4(キセノパス・ラエビス(Xenopus laevis))(DKK4)、ホモサピエンスNADPHオキシダーゼ1(NOX1)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ11(ストロメリシン3)(MMP11)、ホモサピエンスリングフィンガー蛋白質43(RNF43)、AGENCOURT_10229596 NIH_MGC_141ホモサピエンスcDNAクローンIMAGE:6563923 5(BU536065)、ホモサピエンスKIAA1199(KIAA1199)、ホモサピエンス癌胎児性抗原関連接着分子5(CEACAM5)、ホモサピエンスアーケイトスクート複合体相同体2(ドロスフィラ)(Drosophila)(ASCL2)、ホモサピエンスビリン1(VIL1)、ホモサピエンスネイキッドキューティクル相同体1(ドロスフィラ)(NKD1)、プレディクティッド:ホモサピエンスハイポセティカルLOC729669(LOC729669)、ホモサピエンスムチン17細胞表面結合型(cell surface associated)(MUC17)、ホモサピエンスnotumペクチンアセチルエステラーゼ相同体(ドロソフィラ)(NOTUM)、ホモサピエンスコラーゲンXI型α1(COL11A1)、ホモサピエンスデフェンシンα5パネル細胞特異型(DEFA5)、ホモサピエンスnotumペクチンアセチルエステラーゼ相同体(ドロソフィラ)(NOTUM)、ホモサピエンスホスホリパーゼ阻害剤(LOC646627)、ホモサピエンスNADPHオキシダーゼオーガナイザー1(NOXO1)、ホモサピエンスリポカリン15(LCN15)、ホモサピエンスケモカイン(C−Cモチーフ)リガンド24(CCL24)、ホモサピエンスガストリン放出ペプチド(GRP)、ホモサピエンスプレグナンシー特異性β1糖蛋白質1(PSG1)、ホモサピエンスクラウディン2(CLDN2)、ホモサピエンスディフェンシンα6ぺネス細胞特異型(DEFA6)、ホモサピエンスニューロペプチドSレセプター1(NPSR1)、ホモサピエンスシスタチンSN(CST1)、ホモサピエンスケラチン23(ヒストンデアセチラーゼ誘導性)(KRT23)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ7(マトリライシン、ウテリン)(MMP7)、ホモサピエンス膜貫通4−ドメインサブファミリーA膜12(MS4A12)、ホモサピエンスケラチン20(KRT20)、またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされたマーカーの1種以上の発現を検出する1周以上の薬剤と接触させること;c)非癌性細胞をb)の前記1種以上の薬剤と接触させること;およびd)前記非癌性細胞中の、ホモサピエンスセリンペプチダーゼ阻害剤Kazak type4(SPINK4)、ホモサピエンスLINE−1 typeトランスポザーゼドメイン含有1(L1TD1)、ホモサピエンス溶質キャリアファミリー35メンバーD3(SLC35D3)、ホモサピエンスリンパ球抗原6複合体遺伝子座G6D(LY6G6D)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ12(マクロファージエラスターゼ)(MMP12)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ12(マクロファージエラスターゼ)(MMP12)、ホモサピエンスアポリポ蛋白質B mRNA編集酵素触媒ポリペプチド1(APOBEC1)、ホモサピエンスdickkopf相同体4(キセノパス・ラエビス)(DKK4)、ホモサピエンスNADPHオキシダーゼ1(NOX1)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ11(ストロメリシン3)(MMP11)、ホモサピエンスリングフィンガー蛋白質43(RNF43)、AGENCOURT_10229596 NIH_MGC_141ホモサピエンスcDNAクローンIMAGE:6563923 5(BU536065)、ホモサピエンスKIAA1199(KIAA1199)、ホモサピエンス癌胎児性抗原関連接着分子5(CEACAM5)、ホモサピエンスアーケイトスクート複合体相同体2(ドロスフィラ)(ASCL2)、ホモサピエンスビリン1(VIL1)、ホモサピエンスネイキッドキューティクル相同体1(ドロスフィラ)(NKD1)、プレディクティッド:ホモサピエンスハイポセティカルLOC729669(LOC729669)、ホモサピエンスムチン17細胞表面結合型(MUC17)、ホモサピエンスnotumペクチンアセチルエステラーゼ相同体(ドロソフィラ)(NOTUM)、ホモサピエンスコラーゲンXI型α1(COL11A1)、ホモサピエンスデフェンシンα5パネル細胞特異型(DEFA5)、ホモサピエンスnotumペクチンアセチルエステラーゼ相同体(ドロソフィラ)(NOTUM)、ホモサピエンスホスホリパーゼ阻害剤(LOC646627)、ホモサピエンスNADPHオキシダーゼオーガナイザー1(NOXO1)、ホモサピエンスリポカリン15(LCN15)、ホモサピエンスケモカイン(C−Cモチーフ)リガンド24(CCL24)、ホモサピエンスガストリン放出ペプチド(GRP)、ホモサピエンスプレグナンシー特異性β1糖蛋白質1(PSG1)、ホモサピエンスクラウディン2(CLDN2)、ホモサピエンスディフェンシンα6ぺネス細胞特異型(DEFA6)、ホモサピエンスニューロペプチドSレセプター1(NPSR1)、ホモサピエンスシスタチンSN(CST1)、ホモサピエンスケラチン23(ヒストンデアセチラーゼ誘導性)(KRT23)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ7(マトリライシン、ウテリン)(MMP7)、ホモサピエンス膜貫通4−ドメインサブファミリーA膜12(MS4A12)、ホモサピエンスケラチン20(KRT20)、またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされた前記マーカーの1種以上の発現レベルを比較すること、を含み、ここで前記非癌性細胞に比較して前記対象から得られた前記試料中の、ホモサピエンスセリンペプチダーゼ阻害剤Kazak type4(SPINK4)、ホモサピエンスLINE−1 typeトランスポザーゼドメイン含有1(L1TD1)、ホモサピエンス溶質キャリアファミリー35メンバーD3(SLC35D3)、ホモサピエンスリンパ球抗原6複合体遺伝子座G6D(LY6G6D)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ12(マクロファージエラスターゼ)(MMP12)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ12(マクロファージエラスターゼ)(MMP12)、ホモサピエンスアポリポ蛋白質B mRNA編集酵素触媒ポリペプチド1(APOBEC1)、ホモサピエンスdickkopf相同体4(キセノパス・ラエビス)(DKK4)、ホモサピエンスNADPHオキシダーゼ1(NOX1)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ11(ストロメリシン3)(MMP11)、ホモサピエンスリングフィンガー蛋白質43(RNF43)、AGENCOURT_10229596 NIH_MGC_141ホモサピエンスcDNAクローンIMAGE:6563923 5(BU536065)、ホモサピエンスKIAA1199(KIAA1199)、ホモサピエンス癌胎児性抗原関連接着分子5(CEACAM5)、ホモサピエンスアーケイトスクート複合体相同体2(ドロスフィラ)(ASCL2)、ホモサピエンスビリン1(VIL1)、ホモサピエンスネイキッドキューティクル相同体1(ドロスフィラ)(NKD1)、プレディクティッド:ホモサピエンスハイポセティカルLOC729669(LOC729669)、ホモサピエンスムチン17細胞表面結合型(MUC17)、ホモサピエンスnotumペクチンアセチルエステラーゼ相同体(ドロソフィラ)(NOTUM)、ホモサピエンスコラーゲンXI型α1(COL11A1)、ホモサピエンスデフェンシンα5パネル細胞特異型(DEFA5)、ホモサピエンスnotumペクチンアセチルエステラーゼ相同体(ドロソフィラ)(NOTUM)、ホモサピエンスホスホリパーゼ阻害剤(LOC646627)、ホモサピエンスNADPHオキシダーゼオーガナイザー1(NOXO1)、ホモサピエンスリポカリン15(LCN15)、ホモサピエンスケモカイン(C−Cモチーフ)リガンド24(CCL24)、ホモサピエンスガストリン放出ペプチド(GRP)、ホモサピエンスプレグナンシー特異性β1糖蛋白質1(PSG1)、ホモサピエンスクラウディン2(CLDN2)、ホモサピエンスディフェンシンα6ぺネス細胞特異型(DEFA6)、ホモサピエンスニューロペプチドSレセプター1(NPSR1)、ホモサピエンスシスタチンSN(CST1)、ホモサピエンスケラチン23(ヒストンデアセチラーゼ誘導性)(KRT23)、ホモサピエンスマトリックスメタロペプチダーゼ7(マトリライシン、ウテリン)(MMP7)、ホモサピエンス膜貫通4−ドメインサブファミリーA膜12(MS4A12)、ホモサピエンスケラチン20(KRT20)、またはその相補体から選択される遺伝子によりコードされた前記マーカーの1種以上の発現レベルが高ければ、前記対象が大腸癌を有することが示される、対象における大腸癌を検出する方法。
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Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN103901205B (zh) * 2013-05-07 2016-06-15 普世华康江苏医疗技术有限公司 Cystatin SN与CYFRA21-1在制备诊断和预示食管癌标志物中的应用
CN103529220B (zh) * 2013-10-12 2015-09-23 上海交通大学 CTx在制备诊断结直肠癌药物中的用途
KR20150105505A (ko) * 2014-03-06 2015-09-17 (주)노바셀테크놀로지 신규 대장암의 바이오마커 및 그를 표적으로 하는 항암제
PT3388075T (pt) 2015-03-27 2023-08-18 Immatics Biotechnologies Gmbh Novos péptidos e combinações de péptidos para uso em imunoterapia contra vários tumores
GB201505305D0 (en) 2015-03-27 2015-05-13 Immatics Biotechnologies Gmbh Novel Peptides and combination of peptides for use in immunotherapy against various tumors
WO2017018735A1 (ko) * 2015-07-24 2017-02-02 고려대학교 산학협력단 노화 판별용, 비만 판별용, 암 진단용 바이오마커 및 이를 이용한 진단키트
WO2017113565A1 (zh) * 2015-12-29 2017-07-06 中国医学科学院肿瘤医院 基于蛋白标志物psg3辅助诊断肝癌或消化道癌症患者的试剂盒
CN106928352B (zh) * 2015-12-29 2020-01-14 中国医学科学院肿瘤医院 一种抗psg3蛋白的单克隆抗体及其杂交瘤细胞株与应用
CN105567846A (zh) * 2016-02-14 2016-05-11 上海交通大学医学院附属仁济医院 检测粪便中细菌dna的试剂盒及其在大肠癌诊断中的应用
SE540173C2 (en) * 2016-04-20 2018-04-24 Hiloprobe Ab Marker genes for colorectal cancer classification, method for judging lymph node metastasis for prognosis of colorectal cancer and kit therefor
EP3532637A4 (en) 2016-10-27 2020-10-14 Geneoscopy, LLC PROOF PROCEDURE
WO2018144782A1 (en) * 2017-02-01 2018-08-09 The Translational Genomics Research Institute Methods of detecting somatic and germline variants in impure tumors
WO2019229302A1 (en) * 2018-05-29 2019-12-05 Turun Yliopisto L1td1 as predictive biomarker of colon cancer
JP2021526375A (ja) 2018-06-01 2021-10-07 ジェネオスコピー インコーポレイテッド 検出方法
CN108893534A (zh) * 2018-06-26 2018-11-27 华中科技大学鄂州工业技术研究院 泛癌症诊断标记物
WO2020085458A1 (ja) * 2018-10-24 2020-04-30 味の素株式会社 哺乳動物の嗅粘膜または嗅粘液の検査方法
CN109402246B (zh) * 2018-11-01 2021-07-06 固安博健生物技术有限公司 L1td1基因及其表达产物的新用途
WO2020205299A1 (en) * 2019-03-29 2020-10-08 Case Western Reserve University Detecting cancer biomarker proteins in blood
JP2020191834A (ja) * 2019-05-29 2020-12-03 学校法人慶應義塾 消化器癌患者への癌免疫療法の適用の有効性を判定する方法
KR102398735B1 (ko) * 2019-07-02 2022-05-18 연세대학교 산학협력단 면역분석을 이용한 대장암의 분자적 분류방법
MX2022007158A (es) * 2019-12-13 2022-07-11 Genentech Inc Anticuerpos anti-ly6g6d y metodos de uso.
CN112501302A (zh) * 2020-12-11 2021-03-16 山东大学第二医院 一种结直肠癌血清学诊断标志物及其应用
WO2022182661A1 (en) * 2021-02-23 2022-09-01 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods for prognosing, diagnosing, and treating colorectal cancer
CN113466458A (zh) * 2021-06-29 2021-10-01 复旦大学附属中山医院 Gpx4、nox1和acsl4在结直肠癌预后评价上的应用

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH09124698A (ja) * 1995-10-27 1997-05-13 Sagami Chem Res Center ヒトpec−60様蛋白質およびそれをコードするdna
US5851987A (en) * 1997-04-14 1998-12-22 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Human tumor-associated Kazal inhibitor-like polypeptides and encoding polynucleotides
US6682890B2 (en) * 2000-08-17 2004-01-27 Protein Design Labs, Inc. Methods of diagnosing and determining prognosis of colorectal cancer
US20040157278A1 (en) * 2002-12-13 2004-08-12 Bayer Corporation Detection methods using TIMP 1
US20060188889A1 (en) * 2003-11-04 2006-08-24 Christopher Burgess Use of differentially expressed nucleic acid sequences as biomarkers for cancer
WO2007018316A1 (ja) * 2005-08-09 2007-02-15 Takeda Pharmaceutical Company Limited 癌の予防・治療剤
US20100196889A1 (en) * 2006-11-13 2010-08-05 Bankaitis-Davis Danute M Gene Expression Profiling for Identification, Monitoring and Treatment of Colorectal Cancer
EP1986010A1 (en) * 2007-04-05 2008-10-29 Vereniging voor christelijk hoger onderwijs, wetenschappelijk onderzoek en patiëntenzorg Methods and tools for discriminating colorectal adenomas and adenocarcinomas
US20110160072A1 (en) * 2007-10-23 2011-06-30 Clinical Genomics Pty. Ltd. Method of diagnosing neoplasms
KR101007567B1 (ko) * 2007-10-30 2011-01-14 한국생명공학연구원 대장암 과발현 유전자를 이용한 대장암 진단 마커
CN101386889A (zh) * 2008-10-31 2009-03-18 芮屈生物技术(上海)有限公司 一种amacr基因的原位杂交检测试剂盒及其检测方法和应用
CN101498700A (zh) * 2009-02-16 2009-08-05 桑建利 人血液样本中脂类分子含量测定及其结直肠癌诊断试剂盒制备与应用
WO2010125566A2 (en) * 2009-04-27 2010-11-04 Technion Research And Development Foundation Ltd. Markers for cancer detection
CN103097548A (zh) * 2010-04-13 2013-05-08 纽约市哥伦比亚大学托管会 基于多癌症侵袭相关机制的生物标记
US20140141996A1 (en) * 2011-06-22 2014-05-22 Oncocyte Corporation Methods and Compositions for the Treatment and Diagnosis of Cancer

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