JP2013539014A - 結核菌感染の診断及び防止のためのマイコバクテリウム・ツベルクローシス由来のアミノ酸配列又はその対応する核酸の使用、並びにそれらに由来する診断キット及びワクチン - Google Patents
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Abstract
Description
当該方法は、マイコバクテリウム・ツベルクローシスに由来し、かつESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7に関係する少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、少なくとも1つのペプチドの存在下において、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、
上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下においてインキュベートすることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、マイコバクテリウム種に感染した対象又はマイコバクテリウム種に以前さらされた対象に由来するリンパ球を示し、
上記少なくとも1つのペプチドは、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される、方法である。例えば、上記ペプチドは、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)又はTAWITAVVPGLMV(配列番号24)であり得る。
当該方法は、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、ESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7と共にインキュベートすること、並びに、上記リンパ球によるインターフェロンγの放出を測定することを含み、
当該方法は、上記インキュベートが、さらにTAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される少なくとも6つのペプチドの存在下において実施されることを特徴とし、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスの検出に関する感度及び/又は選択性のレベルが、ESAT6及びCFP10、任意にTB7.7を用いた場合の感度及び/又は選択性と比較して高い、方法である。本発明の実施形態によれば、上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである:ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)及びGEIIFISGRLNGaa(配列番号13)。本発明のさらなる実施形態によれば、上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである:ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)及びGEIIFISGRLNG(配列番号86)。本発明の別の実施形態によれば、上記ペプチドが、以下の9つのペプチド全てである:TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)及びSALLRRLSTCPPES(配列番号87)。
当該方法は、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、ESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7と共にインキュベートすること、並びに、上記リンパ球によるインターフェロンγの放出を測定することを含み、
当該方法は、上記インキュベートが、さらにTAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される少なくとも1つのペプチドの存在下において実施されることを特徴とし、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスの検出に関する感度及び/又は選択性のレベルが、ESAT6及びCFP10、任意にTB7.7を用いた場合の感度及び/又は選択性と比較して高い、方法に関する。上記少なくとも1つのペプチドは、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)又はTAWITAVVPGLMV(配列番号24)であり得る。
対象、即ちヒト又は非ヒト動物対象におけるマイコバクテリウム感染症の検出のためのインビトロ試験における、以下からなるリストから選択される少なくとも1つのバイオマーカーの使用である:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。
対象、即ちヒト又は非ヒト動物対象におけるマイコバクテリウム感染症の検出のためのインビトロ試験における、以下からなるリストから選択される少なくとも1つのバイオマーカーの使用である:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;及び
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片;並びに
(iv)以下からなるリストから選択される、マイコバクテリウム由来タンパク質、又はその断片、又はその化学アナログ:
(a)ESAT;
(b)CFP10;
(c)TB7.7;及び
(d)PPD。
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。
当該方法は、以下からなるリストから選択される少なくとも1つのバイオマーカーの存在下で、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下においてインキュベートすることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、マイコバクテリウム種に感染した対象又はマイコバクテリウム種に以前さらされた対象に由来するリンパ球を示す、方法に関する:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。上記対象はヒト又は非ヒト動物であってよい。血液とバイオマーカーとの間におけるインキュベートは試験管で、任意にヘパリンの存在下で、添加された炭水化物の存在下で生じ得る。本発明の実施形態によれば、上記インキュベートが、さらにESAT6、CFP10、TB7.7及びPPDから選択されるマイコバクテリウムタンパク質、又はそのペプチド断片、又はそれらに由来するその化学アナログ、又はそれらの混合物の存在下で生じ得る。マイコバクテリウム種は、
M.ツベルクローシス(M. tuberculosis)、M.ボビス(M. bovis)、M.ボビスBCG(M. bovis BCG)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.カネッティ(M. canetti)、M.カプラエ(M. caprae)、M.ミクロティ(M. microti)、M.ピンニペディイ(M. pinnipedii)、M.アビウム(M. avium)、M.アビウム・パラツベルクローシス(M. Avium paratuberculosis)、M.アビウム・シルバティカム(M. Avium silvaticum)、M.アビウム「ホミニッスイス」(M. Avium "hominissuis")、M.コロンビエンス(M. colombiense)、M.アジアティカム(M. asiaticum)、M.ゴードナエ(M. gordonae)、M.ガストリ(M. gastri)、M.カンサシイ(M. kansasii)、M.ヒベルニアエ(M. hiberniae)、M.ノンクロモゲニカム(M. nonchromogenicum)、M.テラエ(M. terrae)、M.トリビアレ(M. triviale)、M.アルセランス(M. ulcerans)、M.シュードショットシイ(M. pseudoshottsii)、M.ショットシイ(M. shottsii)、M.トリプレックス(M. triplex)、M.ゲナベンス(M. genavense)、M.フロレンティナム(M. florentinum)、M.レンティフラバム(M. lentiflavum)、M.パルストレ(M. palustre)、M.クビカエ(M. kubicae)、M.パラスクロフラセウム(M. parascrofulaceum)、M.ハイデルベルゲンス(M. heidelbergense)、M.インテルジェクツム(M. interjectum)、M.シミアエ(M.simiae)、M.ブランデリ(M.branderi)、M.クッキイ(M. cookii)、M.セラータム(M. celatum)、M.ボヘミカム(M. bohemicum)、M.ヘモフィルム(M. haemophilum)、M.マルモエンス(M. malmoense)、M.スルガイ(M. szulgai)、M.レプラ(M. leprae)、M.レプラムリウム(M. lepraemurium)、M.レプロマトーシス(M. lepromatosis)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.ボトニエンス(M. botniense)、M.キマエラ(M. chimaera)、M.コンスピキュウム(M. conspicuum)、M.ドリカム(M. doricum)、M.ファルシノゲネス(M. farcinogenes)、M.ヘッケスホルネンス(M. heckeshornense)、M.イントラセルラレ(M. intracellulare)、M.ラクス(M. lacus)、M.マリナム(M. marinum)、M.モナセンス(M. monacense)、M.モンテフィオレンス(M. montefiorense)、M.ムラーレ(M. murale)、M.ネブラスケンス(M. nebraskense)、M.サスカチェワネンス(M. saskatchewanense)、M.スクロフラセウム(M. scrofulaceum)、M.シモイデイ(M. shimoidei)、M.トゥシアエ(M. tusciae)、M.ゼノピ(M. xenopi)、M.インターメディウム(M. intermedium)、M.アブセサス(M. abscessus)、M.ケロナエ(M. chelonae)、M.ボルレティイ(M. bolletii)、M.フォルトゥイタム(M. fortuitum)、M.フォルトゥイタム亜種アセトアミドリティカム(M.fortuitum subsp. acetamidolyticum)、M.ボエニッキイ(M. boenickei)、M.ペレグリナム(M. peregrinum)、M.ポルシナム(M. porcinum)、M.セネガレンス(M. senegalense)、M.セプティカム(M. septicum)、M.ニューオルレアンセンス(M. neworleansense)、M.ヒューストネンス(M. houstonense)、M.ムコゲニカム(M. mucogenicum)、M.マゲリテンス(M. mageritense)、M.ブリスベネンス(M. brisbanense)、M.コスメティカム(M. cosmeticum)、M.パラフォルトゥイタム(M. parafortuitum)、M.オーストロアフリカーナム(M. austroafricanum)、M.ディエルンホフェリ(M. diernhoferi)、M.ホドレリ(M. hodleri)、M.ネオオーラム(M. neoaurum)、M.フレデリクスバーゲンス(M. frederiksbergense)、M.オーラム(M. aurum)、M.ワクカエ(M. vaccae)、M.チタエ(M. chitae)、M.ファラックス(M. fallax)、M.コンフルエンティス(M. confluentis)、M.フラベッセンス(M. flavescens)、M.マダガスカリエンス(M. madagascariense)、M.フレイ(M. phlei)、M.スメグマチス(M. smegmatis)、M.グッディイ(M. goodii)、M.ウォリンスキイ(M. wolinskyi)、M.サーモレジスティバイル(M. thermoresistibile)、M.ガディウム(M. gadium)、M.コモセンス(M. komossense)、M.オブエンス(M. obuense)、M.スファグニ(M. sphagni)、M.アグリ(M. agri)、M.アイチエンス(M. aichiense)、M.アルベイ(M. alvei)、M.アルペンス(M. arupense)、M.ブルマエ(M. brumae)、M.カナリアセンス(M. canariasense)、M.チュブエンス(M. chubuense)、M.コンセプショネンス(M. conceptionense)、M.ドゥバリイ(M. duvalii)、M.エレファンティス(M. elephantis)、M.ギルバム(M. gilvum)、M.ハシアカム(M. hassiacum)、M.ホルサティカム(M. holsaticum)、M.イムノゲナム(M. immunogenum)、M.マッシリエンス(M. massiliense)、M.モリオカエンス(M. moriokaense)、M.サイクロトレランス(M. psychrotolerans)、M.ピレニボランス(M. pyrenivorans)、M.バンバアレニイ(M. vanbaalenii)、M.プルベリス(M. pulveris)、M.アロシエンス(M. arosiense)、M.オーバネンス(M. aubagnense)、M.カプラエ(M. caprae)、M.クロロフェノリカム(M. chlorophenolicum)、M.フルオロアンテニボランス(M.fluoroanthenivorans)、M.クマモトネンス(M. kumamotonense)、M.ノボカストレンス(M. novocastrense)、M.パルメンス(M. parmense)、M.フォカイクム(M. phocaicum)、M.ポリフェラエ(M. poriferae)、M.ローデシアエ(M. rhodesiae)、M.セオウレンス(M. seoulense)及びM.トーカイエンス(M. tokaiense)から選択される。好ましくは、マイコバクテリウム種はマイコバクテイルム・ツベルクローシス(Mycobacteriumtuberculosis)である。
当該方法は、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、ESAT6、CFP10、TB7.7、及び/又はPPDの1以上と共にインキュベートすること、並びに、上記リンパ球によるインターフェロンγの放出を測定することを含み、
当該方法は、上記インキュベートが、さらに
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後にi)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片
から選択される少なくとも1つのバイオマーカーの存在下で実施されることを特徴とし、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスの検出に関する感度及び/又は選択性のレベルが、ESAT6、CFP10、TB7.7、及び/又はPPDだけを用いた場合の感度及び/又は選択性と比較して高い、方法に関する。
上記ワクチンは、
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;及び
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片
からなるリストから選択される少なくとも1つの物質;
並びに1つ以上の医薬的に許容されるアジュバント、担体、賦形剤、及び/又は希釈剤を含むか、又はそれらからなる、ワクチンに関する。
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。
当該方法は、
マイコバクテリウム種、又はそれに由来するTリンパ球エピトープを含む抗原若しくはタンパク質に感作されたTリンパ球を含む試料を、以下から選択される少なくとも1つの物質と、上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下において接触させることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、細胞性免疫反応を開始する、上記対象の能力を示す、方法に関する:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。
材料と方法
エリスポット免疫診断試験
被覆:一次抗体(5μg/mL)の無菌リン酸塩緩衝(PBS)溶液を1ウェル当たり100μL入れた96ウェルプレートの処理。プレートを被覆し、4℃で20時間インキュベートし、その後1ウェル当たり200μLの無菌PBSでプレートを4回洗浄する。最後の洗浄では、吸着性の紙の上でプレートを軽くはじいて余分な液体を除去する。
1.白血球を分離するためのろ過管[ロイコセップ(LeucoSep)(商標)、アルニカ(ARNIKA)、ミラノ]の使用に基づく迅速法を用いた、密度勾配遠心法[フィコール−ハイパック(Ficoll-Hypaque)、ファルマシア;ウプサラ;スウェーデン]による、静脈血(7ml、EDTAを含む)からの単核細胞(PBMC)の単離。1×PBS(リン酸緩衝生理食塩水)で2回洗浄した後、細胞が100μL当たり2×105個になるように沈殿物を完全培地[25mMのHEPES、10%(v/v)のFCS、2mMのL−グルタミン、10U/mLのペニシリン/ストレプトマイシンを含むRPMI1640]に再懸濁する。
2.1ウェル当たり100μLの細胞懸濁液と、100μLのそれぞれ異なる刺激物を添加する。
3.プレートを40時間、37℃で、5%CO2のインキュベーター内でインキュベートする。
4.細胞を除去する。
5.プレートを1ウェル当たり200μLのPBSで4回、その後1ウェル当たり200μLの「洗浄バッファー」[PBS/0.05%ツイーン20(シグマ)]で4回洗浄する。
6.最後の洗浄では、吸着性の紙の上でプレートを軽くはじいて余分な液体を除去する。
PBS/4%ウシ血清アルブミン(画分V、シグマ)で1μg/mlの濃度に希釈したビオチン化抗体を、1ウェル当たり100μl入れた。その後プレートを100分間、37℃で、5%CO2のインキュベーター内でインキュベートし、プレートを「洗浄バッファー」で4回洗浄した。最後の洗浄では、吸着性の紙の上でプレートを軽くはじいて過剰な液体を除去した。
検出のために、「洗浄バッファー」で1000分の1に希釈した「ストレプトアビジン−HRP」を、1ウェル当たり100μl加えた。プレートを30分間、室温、暗所でインキュベートし、その後「洗浄バッファー」で4回洗浄した。最後の洗浄では、吸着性の紙の上でプレートを軽くはじいて余分な液体を除去した。1ウェル当たり100μLの基質を加えた。並行して、酵素−基質反応が生じるコントロールとして、同様に調製した基質と100μlの「希釈したストレプトアビジン−HRP」を数分間インキュベートした。反応が上手くいけば、基質は薄茶色から桃色へと変化する。
著者らは、インビトロ及びエクスビボの両方で分析した生体試料から、被感染ヒトマクロファージにおいてM.ツベルクローシスが発現したタンパク質群を同定した。3種類の異なる環境、即ち合成培地[Sauton's(ソートン)]、培地中でM.ツベルクローシスを感染させた単球由来のヒトマクロファージ(MDM)、肺TBに罹患しているが抗生物質による治療を受ける前の患者由来の気管支肺胞洗浄(BAL)試料からの肺胞マクロファージ(AM)でのM.ツベルクローシスの遺伝子発現を比較した。
A:MDMに対しAMで上方調節された;
B:AM及びMDMで常に発現した;
C:AMに対しMDMで上方調節された;
D:MDM及び/又はAMに対しソートン(Sauton)で上方調節された;
E:ソートン(Sauton's)に対しMDM及び/又はAMで上方調節された。
1.EWコーネマン、SDアレン、WMジャンダ、P.シュレッケンベルガー、WCウィン。診断的微生物学のカラーアトラス及び教科書。第5版。リッピンコット、1997(EW Koneman、 SD Allen、 WM Janda、 P. Schreckenberger、 WC Winn. Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. 5a edizione. Lippincot、 1997)。
2.メンジーズD、パイM、コムストックG。米国内科学会紀要。2007年3月6日;146(5):340−54。メタ解析:潜在性結核感染の診断のための新規試験:不確実性及び研究への提言の分野(Menzies D、 Pai M、 Comstock G. Ann Intern Med. 2007 Mar 6;146(5):340-54. Meta-analysis: new tests for the diagnosis of latent tuberculosis infection: areas of uncertainty and recommendations for research)。
3.ベレーB、コベリーJ、バーンズGL、コーC、チャイソンRE、コムストックGW、ビシャイWR。米国感染症学会誌。200234:1449−56(Bellete B、 Coberly J、 Barnes GL、 Ko C、 Chaisson RE、 Comstock GW、 Bishai WR. Clin Infect Dis. 2002 34 :1449-56.)。
4.パイM、ゴクヘイルK、ジョシR、ドグラS、カラントリS、メンディラッタDK、ナランP、ダレイCL、グラニッチRM、マズレクGH、ラインゴールドAL、リレイLW、コルフォードJMJr。米国医師会雑誌。2005293:2746−55(Pai M、 Gokhale K、 Joshi R、 Dogra S、 Kalantri S、 Mendiratta DK、 Narang P、 Daley CL、 Granich RM、 Mazurek GH、 Reingold AL、 Riley LW、 Colford JM Jr. JAMA. 2005 293 :2746-55.)。
5.ラルバニA、パソンAA、ドゥルカンH、ウィルキンソンKA、ウェランA、ディークスJJ、リースWH、ラチフM、パスボルG、ヒルAV。ランセット。2001;357:2017−21(Lalvani A、 Pathan AA、 Durkan H、 Wilkinson KA、 Whelan A、 Deeks JJ、 Reece WH、 Latif M、 Pasvol G、 Hill AV. Lancet. 2001; 357: 2017-21.)。
6.米国防疫センター。MMWRの勧告及びレポート。1997年9月5日;46(RR−15):1−10(Centers for Disease Control and Prevention. MMWR Recomm Rep. 1997 Sep 5;46(RR-15):1-10.)。
7.ウルリクスT、ムンクME、モレンコフHら。欧州免疫学雑誌。1998;28:3949−3958( Ulrichs T、 Munk ME、 Mollenkopf H、 et al. Eur J Immunol 1998; 28:3949-3958.)。
8.ラブンP、デミシエA、イグエールTら。米国感染症学会誌。1999;179:637−645(Ravn P、 Demissie A、 Eguale T、 et al. J Infect Dis 1999; 179:637-645.)。
9.ドハーティTM、デミシエA、オロボJら。臨床微生物学雑誌。2002;40:704−706(Doherty TM、 Demissie A、 Olobo J、 et al. J Clin Microbiol 2002; 40:704-706.)。
10.ラルバニA、パソンAA、ドゥルカンHら。ランセット。2001;357:2017−2021(Lalvani A、 Pathan AA、 Durkan H、 et al. Lancet 2001; 357:2017-2021.)。
11.ラルバニA、ナグベンカルP、ウドワディアZら。米国感染症学会誌。2001;183:469−477(Lalvani A、 Nagvenkar P、 Udwadia Z、 et al. J Infect Dis 2001; 183:469-477.)。
12.チャプマンAL、ムンカンタM、ウィルキンソンKAら。AIDS。2002;16:2285−2293(Chapman AL、 Munkanta M、 Wilkinson KA、 et al. AIDS 2002; 16:2285-2293.)。
13.ラルバニA、パソンAA、マクシェーンHら。米国胸部学会誌(AJRCCM)2001;163:824−828(Lalvani A、 Pathan AA、 McShane H、 et al. Am J Respir Crit Care Med 2001; 163:824-828.)。
14.パソンAA、ウィルキンソンKA、クレネルマンPら。免疫学雑誌。2001;167:5217−5225(Pathan AA、 Wilkinson KA、 Klenerman P、 et al. J Immunol 2001; 167:5217-5225.)。
15.リンクスローンSD、バンガニN、ボグトM、ベッカーLG、バドリM、ントボングワナM、ドックレルHM、ウィルキンソンRJ、ウッドR。南アフリカでの進行性HIV感染者の高度結核曝露におけるインターフェロンγエリスポット検定の利用。BMC感染性疾患。2007年8月28日;7:99(LinksLawn SD、 Bangani N、 Vogt M、 Bekker LG、 Badri M、 Ntobongwana M、 Dockrell HM、 Wilkinson RJ、 Wood R. Utility of interferonγ ELISPOT assay responses in highly tuberculosis-exposed patients with advanced HIV infection in South Africa.BMC Infect Dis. 2007 Aug 28;7:99)。
16.デグルートAS、ボスマA、チナイN、フロストJ、ジェスデールBM、ゴンザレスMA、マーティンW、サン−オービンC。ワクチン2001、19:4385−4395(De Groot AS、 Bosma A、 Chinai N、 Frost J、 Jesdale BM、 Gonzalez MA、 Martin W、 Saint-Aubin C. Vaccine 2001、 19:4385-4395.)。
17.ブランデールC、ゴウルダーPJR。コルベールBTM、ブランデールC、ヘインズB、コウプRA、クイケンC、ムーアJ、ウォーカーB、ワトキンスD編。ロスアラモス国立研究所、ロスアラモス、ニューメキシコ、2000;I1−I3(Brander C、 Goulder PJR. Edited by Korber BTM、 Brander C、 Haynes B、 Koup RA、 Kuiken C、 Moore J、 Walker B、 Watkins D. Los Alamos National Laboratory、 Los Alamos、 N.Mex. 2000; I1-I3.)。
Claims (68)
- 対象におけるマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症の検出のためのインビトロ試験におけるバイオマーカーとしての、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスに由来し、かつESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7に関係する少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、少なくとも6つのペプチドの使用であって、
上記ペプチドは、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、 LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される、使用。 - 上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである、請求項1に記載の使用:
ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)及びGEIIFISGRLNGaa(配列番号13)。 - 上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである、請求項1に記載の使用:
ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)及びGEIIFISGRLNG(配列番号86)。 - 上記ペプチドが、以下の9つのペプチド全てである、請求項1に記載の使用:
TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)及びSALLRRLSTCPPES(配列番号87)。 - 対象におけるマイコバクテリウム・ツベルクローシス感染症の検出のためのインビトロ試験におけるバイオマーカーとしての、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスに由来し、かつESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7に関係する少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、少なくとも1つのペプチドの使用であって、
上記ペプチドは、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される、使用。 - 上記ペプチドが、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)又はTAWITAVVPGLMV(配列番号24)である、請求項5に記載の使用。
- 対象においてマイコバクテリウム・ツベルクローシスによる感染症をインビトロで診断する方法であって、
当該方法は、マイコバクテリウム・ツベルクローシスに由来し、かつESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7に関係する少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、少なくとも6つのペプチドの存在下において、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、
上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下においてインキュベートすることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、マイコバクテリウム種に感染した対象又はマイコバクテリウム種に以前さらされた対象に由来するリンパ球を示し、
上記少なくとも6つのペプチドは、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される、方法。 - 上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである、請求項7に記載の方法:
ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)及びGEIIFISGRLNGaa(配列番号13)。 - 上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである、請求項7に記載の方法:
ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)及GEIIFISGRLNG(配列番号86)。 - 上記ペプチドが以下の9つのペプチド全てである、請求項7に記載の方法:
TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)及びSALLRRLSTCPPES(配列番号87)。 - 対象においてマイコバクテリウム・ツベルクローシスによる感染症をインビトロで診断する方法であって、
当該方法は、マイコバクテリウム・ツベルクローシスに由来し、かつESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7に関係する少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、少なくとも1つのペプチドの存在下において、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、
上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下においてインキュベートすることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、マイコバクテリウム種に感染した対象又はマイコバクテリウム種に以前さらされた対象に由来するリンパ球を示し、
上記少なくとも1つのペプチドは、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される、方法。 - 上記ペプチドが、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)又はTAWITAVVPGLMV(配列番号24)である、請求項11に記載の方法。
- 対象におけるマイコバクテリウム・ツベルクローシスによる感染症のインビトロ診断のための方法であって、
当該方法は、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、ESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7と共にインキュベートすること、並びに、上記リンパ球によるインターフェロンγの放出を測定することを含み、
当該方法は、上記インキュベートが、さらにTAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される少なくとも6つのペプチドの存在下において実施されることを特徴とし、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスの検出に関する感度及び/又は選択性のレベルが、ESAT6及びCFP10、任意にTB7.7を用いた場合の感度及び/又は選択性と比較して高い、方法。 - 上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである、請求項13に記載の方法:
ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)及びGEIIFISGRLNGaa(配列番号13)。 - 上記ペプチドが、以下の6つのペプチドである、請求項13に記載の方法:
ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)及びGEIIFISGRLNG(配列番号86)。 - 上記ペプチドが、以下の9つのペプチド全てである、請求項13に記載の方法:
TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)及びSALLRRLSTCPPES(配列番号87)。 - 対象におけるマイコバクテリウム・ツベルクローシスによる感染症のインビトロ診断のための方法であって、
当該方法は、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、ESAT6及びCFP10、並びに任意にTB7.7と共にインキュベートすること、並びに、上記リンパ球によるインターフェロンγの放出を測定することを含み、
当該方法は、上記インキュベートが、さらにTAWITAVVPGLMV(配列番号24)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)又はSALLRRLSTCPPES(配列番号87)からなる群から選択される少なくとも1つのペプチドの存在下において実施されることを特徴とし、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスの検出に関する感度及び/又は選択性のレベルが、ESAT6及びCFP10、任意にTB7.7を用いた場合の感度及び/又は選択性と比較して高い、方法。 - 上記ペプチドが、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)又はTAWITAVVPGLMV(配列番号24)である、請求項17に記載の方法。
- 対象におけるマイコバクテリウム感染症の検出のためのインビトロ試験における、以下からなるリストから選択される少なくとも1つのバイオマーカーの使用:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。 - 上記マイコバクテリウム種が、M.ツベルクローシス(M. tuberculosis)、M.ボビス(M. bovis)、M.ボビスBCG(M. bovis BCG)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.カネッティ(M. canetti)、M.カプラエ(M. caprae)、M.ミクロティ(M. microti)、M.ピンニペディイ(M. pinnipedii)、M.アビウム(M. avium)、M.アビウム・パラツベルクローシス(M. Avium paratuberculosis)、M.アビウム・シルバティカム(M. Avium silvaticum)、M.アビウム「ホミニッスイス」(M. Avium "hominissuis")、M.コロンビエンス(M. colombiense)、M.アジアティカム(M. asiaticum)、M.ゴードナエ(M. gordonae)、M.ガストリ(M. gastri)、M.カンサシイ(M. kansasii)、M.ヒベルニアエ(M. hiberniae)、M.ノンクロモゲニカム(M. nonchromogenicum)、M.テラエ(M. terrae)、M.トリビアレ(M. triviale)、M.アルセランス(M. ulcerans)、M.シュードショットシイ(M. pseudoshottsii)、M.ショットシイ(M. shottsii)、M.トリプレックス(M. triplex)、M.ゲナベンス(M. genavense)、M.フロレンティナム(M. florentinum)、M.レンティフラバム(M. lentiflavum)、M.パルストレ(M. palustre)、M.クビカエ(M. kubicae)、M.パラスクロフラセウム(M. parascrofulaceum)、M.ハイデルベルゲンス(M. heidelbergense)、M.インテルジェクツム(M. interjectum)、M.シミアエ(M.simiae)、M.ブランデリ(M.branderi)、M.クッキイ(M. cookii)、M.セラータム(M. celatum)、M.ボヘミカム(M. bohemicum)、M.ヘモフィルム(M. haemophilum)、M.マルモエンス(M. malmoense)、M.スルガイ(M. szulgai)、M.レプラ(M. leprae)、M.レプラムリウム(M. lepraemurium)、M.レプロマトーシス(M. lepromatosis)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.ボトニエンス(M. botniense)、M.キマエラ(M. chimaera)、M.コンスピキュウム(M. conspicuum)、M.ドリカム(M. doricum)、M.ファルシノゲネス(M. farcinogenes)、M.ヘッケスホルネンス(M. heckeshornense)、M.イントラセルラレ(M. intracellulare)、M.ラクス(M. lacus)、M.マリナム(M. marinum)、M.モナセンス(M. monacense)、M.モンテフィオレンス(M. montefiorense)、M.ムラーレ(M. murale)、M.ネブラスケンス(M. nebraskense)、M.サスカチェワネンス(M. saskatchewanense)、M.スクロフラセウム(M. scrofulaceum)、M.シモイデイ(M. shimoidei)、M.トゥシアエ(M. tusciae)、M.ゼノピ(M. xenopi)、M.インターメディウム(M. intermedium)、M.アブセサス(M. abscessus)、M.ケロナエ(M. chelonae)、M.ボルレティイ(M. bolletii)、M.フォルトゥイタム(M. fortuitum)、M.フォルトゥイタム亜種アセトアミドリティカム(M.fortuitum subsp. acetamidolyticum)、M.ボエニッキイ(M. boenickei)、M.ペレグリナム(M. peregrinum)、M.ポルシナム(M. porcinum)、M.セネガレンス(M. senegalense)、M.セプティカム(M. septicum)、M.ニューオルレアンセンス(M. neworleansense)、M.ヒューストネンス(M. houstonense)、M.ムコゲニカム(M. mucogenicum)、M.マゲリテンス(M. mageritense)、M.ブリスベネンス(M. brisbanense)、M.コスメティカム(M. cosmeticum)、M.パラフォルトゥイタム(M. parafortuitum)、M.オーストロアフリカーナム(M. austroafricanum)、M.ディエルンホフェリ(M. diernhoferi)、M.ホドレリ(M. hodleri)、M.ネオオーラム(M. neoaurum)、M.フレデリクスバーゲンス(M. frederiksbergense)、M.オーラム(M. aurum)、M.ワクカエ(M. vaccae)、M.チタエ(M. chitae)、M.ファラックス(M. fallax)、M.コンフルエンティス(M. confluentis)、M.フラベッセンス(M. flavescens)、M.マダガスカリエンス(M. madagascariense)、M.フレイ(M. phlei)、M.スメグマチス(M. smegmatis)、M.グッディイ(M. goodii)、M.ウォリンスキイ(M. wolinskyi)、M.サーモレジスティバイル(M. thermoresistibile)、M.ガディウム(M. gadium)、M.コモセンス(M. komossense)、M.オブエンス(M. obuense)、M.スファグニ(M. sphagni)、M.アグリ(M. agri)、M.アイチエンス(M. aichiense)、M.アルベイ(M. alvei)、M.アルペンス(M. arupense)、M.ブルマエ(M. brumae)、M.カナリアセンス(M. canariasense)、M.チュブエンス(M. chubuense)、M.コンセプショネンス(M. conceptionense)、M.ドゥバリイ(M. duvalii)、M.エレファンティス(M. elephantis)、M.ギルバム(M. gilvum)、M.ハシアカム(M. hassiacum)、M.ホルサティカム(M. holsaticum)、M.イムノゲナム(M. immunogenum)、M.マッシリエンス(M. massiliense)、M.モリオカエンス(M. moriokaense)、M.サイクロトレランス(M. psychrotolerans)、M.ピレニボランス(M. pyrenivorans)、M.バンバアレニイ(M. vanbaalenii)、M.プルベリス(M. pulveris)、M.アロシエンス(M. arosiense)、M.オーバネンス(M. aubagnense)、M.カプラエ(M. caprae)、M.クロロフェノリカム(M. chlorophenolicum)、M.フルオロアンテニボランス(M.fluoroanthenivorans)、M.クマモトネンス(M. kumamotonense)、M.ノボカストレンス(M. novocastrense)、M.パルメンス(M. parmense)、M.フォカイクム(M. phocaicum)、M.ポリフェラエ(M. poriferae)、M.ローデシアエ(M. rhodesiae)、M.セオウレンス(M. seoulense)及びM.トーカイエンス(M. tokaiense)から選択される、請求項19に記載の使用。
- 上記マイコバクテリウム種が、マイコバクテリウム・ツベルクローシスである、請求項20に記載の使用。
- 上記対象がヒトである、請求項19又は20又は21に記載の使用。
- 上記対象が非ヒト動物である、請求項19又は20又は21に記載の使用。
- (iii)に定義されるペプチド断片が、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)、SALLRRLSTCPPES(配列番号87)から選択されるアミノ酸配列を含むか、又は該アミノ酸配列からなる、請求項19に記載の使用。
- ESAT6、CFP10、TB7.7及びPPDから選択される1以上のマイコバクテリウムタンパク質又はそのペプチド断片又はそれに由来する化学アナログの使用を含む、請求項19から24の何れか1項に記載の使用。
- 対象におけるマイコバクテリウム感染症の検出のためのインビトロ試験における、以下からなるリストから選択される少なくとも1つのバイオマーカーの使用:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;及び
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片;並びに
(iv)以下からなるリストから選択される、マイコバクテリウム由来タンパク質、又はその断片、又はその化学アナログ:
(a)ESAT;
(b)CFP10;
(c)TB7.7;及び
(d)PPD。 - 上記マイコバクテリウム種が、M.ツベルクローシス(M. tuberculosis)、M.ボビス(M. bovis)、M.ボビスBCG(M. bovis BCG)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.カネッティ(M. canetti)、M.カプラエ(M. caprae)、M.ミクロティ(M. microti)、M.ピンニペディイ(M. pinnipedii)、M.アビウム(M. avium)、M.アビウム・パラツベルクローシス(M. Avium paratuberculosis)、M.アビウム・シルバティカム(M. Avium silvaticum)、M.アビウム「ホミニッスイス」(M. Avium "hominissuis")、M.コロンビエンス(M. colombiense)、M.アジアティカム(M. asiaticum)、M.ゴードナエ(M. gordonae)、M.ガストリ(M. gastri)、M.カンサシイ(M. kansasii)、M.ヒベルニアエ(M. hiberniae)、M.ノンクロモゲニカム(M. nonchromogenicum)、M.テラエ(M. terrae)、M.トリビアレ(M. triviale)、M.アルセランス(M. ulcerans)、M.シュードショットシイ(M. pseudoshottsii)、M.ショットシイ(M. shottsii)、M.トリプレックス(M. triplex)、M.ゲナベンス(M. genavense)、M.フロレンティナム(M. florentinum)、M.レンティフラバム(M. lentiflavum)、M.パルストレ(M. palustre)、M.クビカエ(M. kubicae)、M.パラスクロフラセウム(M. parascrofulaceum)、M.ハイデルベルゲンス(M. heidelbergense)、M.インテルジェクツム(M. interjectum)、M.シミアエ(M.simiae)、M.ブランデリ(M.branderi)、M.クッキイ(M. cookii)、M.セラータム(M. celatum)、M.ボヘミカム(M. bohemicum)、M.ヘモフィルム(M. haemophilum)、M.マルモエンス(M. malmoense)、M.スルガイ(M. szulgai)、M.レプラ(M. leprae)、M.レプラムリウム(M. lepraemurium)、M.レプロマトーシス(M. lepromatosis)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.ボトニエンス(M. botniense)、M.キマエラ(M. chimaera)、M.コンスピキュウム(M. conspicuum)、M.ドリカム(M. doricum)、M.ファルシノゲネス(M. farcinogenes)、M.ヘッケスホルネンス(M. heckeshornense)、M.イントラセルラレ(M. intracellulare)、M.ラクス(M. lacus)、M.マリナム(M. marinum)、M.モナセンス(M. monacense)、M.モンテフィオレンス(M. montefiorense)、M.ムラーレ(M. murale)、M.ネブラスケンス(M. nebraskense)、M.サスカチェワネンス(M. saskatchewanense)、M.スクロフラセウム(M. scrofulaceum)、M.シモイデイ(M. shimoidei)、M.トゥシアエ(M. tusciae)、M.ゼノピ(M. xenopi)、M.インターメディウム(M. intermedium)、M.アブセサス(M. abscessus)、M.ケロナエ(M. chelonae)、M.ボルレティイ(M. bolletii)、M.フォルトゥイタム(M. fortuitum)、M.フォルトゥイタム亜種アセトアミドリティカム(M.fortuitum subsp. acetamidolyticum)、M.ボエニッキイ(M. boenickei)、M.ペレグリナム(M. peregrinum)、M.ポルシナム(M. porcinum)、M.セネガレンス(M. senegalense)、M.セプティカム(M. septicum)、M.ニューオルレアンセンス(M. neworleansense)、M.ヒューストネンス(M. houstonense)、M.ムコゲニカム(M. mucogenicum)、M.マゲリテンス(M. mageritense)、M.ブリスベネンス(M. brisbanense)、M.コスメティカム(M. cosmeticum)、M.パラフォルトゥイタム(M. parafortuitum)、M.オーストロアフリカーナム(M. austroafricanum)、M.ディエルンホフェリ(M. diernhoferi)、M.ホドレリ(M. hodleri)、M.ネオオーラム(M. neoaurum)、M.フレデリクスバーゲンス(M. frederiksbergense)、M.オーラム(M. aurum)、M.ワクカエ(M. vaccae)、M.チタエ(M. chitae)、M.ファラックス(M. fallax)、M.コンフルエンティス(M. confluentis)、M.フラベッセンス(M. flavescens)、M.マダガスカリエンス(M. madagascariense)、M.フレイ(M. phlei)、M.スメグマチス(M. smegmatis)、M.グッディイ(M. goodii)、M.ウォリンスキイ(M. wolinskyi)、M.サーモレジスティバイル(M. thermoresistibile)、M.ガディウム(M. gadium)、M.コモセンス(M. komossense)、M.オブエンス(M. obuense)、M.スファグニ(M. sphagni)、M.アグリ(M. agri)、M.アイチエンス(M. aichiense)、M.アルベイ(M. alvei)、M.アルペンス(M. arupense)、M.ブルマエ(M. brumae)、M.カナリアセンス(M. canariasense)、M.チュブエンス(M. chubuense)、M.コンセプショネンス(M. conceptionense)、M.ドゥバリイ(M. duvalii)、M.エレファンティス(M. elephantis)、M.ギルバム(M. gilvum)、M.ハシアカム(M. hassiacum)、M.ホルサティカム(M. holsaticum)、M.イムノゲナム(M. immunogenum)、M.マッシリエンス(M. massiliense)、M.モリオカエンス(M. moriokaense)、M.サイクロトレランス(M. psychrotolerans)、M.ピレニボランス(M. pyrenivorans)、M.バンバアレニイ(M. vanbaalenii)、M.プルベリス(M. pulveris)、M.アロシエンス(M. arosiense)、M.オーバネンス(M. aubagnense)、M.カプラエ(M. caprae)、M.クロロフェノリカム(M. chlorophenolicum)、M.フルオロアンテニボランス(M.fluoroanthenivorans)、M.クマモトネンス(M. kumamotonense)、M.ノボカストレンス(M. novocastrense)、M.パルメンス(M. parmense)、M.フォカイクム(M. phocaicum)、M.ポリフェラエ(M. poriferae)、M.ローデシアエ(M. rhodesiae)、M.セオウレンス(M. seoulense)及びM.トーカイエンス(M. tokaiense)から選択される、請求項26に記載の使用。
- 上記マイコバクテリウム種が、マイコバクテリウム・ツベルクローシスである、請求項27に記載の使用。
- 上記対象がヒトである、請求項26に記載の使用。
- 上記対象が非ヒト動物である、請求項26に記載の使用。
- (iii)に定義されるペプチド断片が、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)、SALLRRLSTCPPES(配列番号87)から選択されるアミノ酸配列を含むか、又は該アミノ酸配列からなる、請求項26に記載の使用。
- 対象におけるマイコバクテリウム感染症の検出のためのインビトロ試験における、以下からなるリストから選択されるバイオマーカーをコードする少なくとも1つの核酸分子の使用:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。 - 上記マイコバクテリウム種が、M.ツベルクローシス(M. tuberculosis)、M.ボビス(M. bovis)、M.ボビスBCG(M. bovis BCG)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.カネッティ(M. canetti)、M.カプラエ(M. caprae)、M.ミクロティ(M. microti)、M.ピンニペディイ(M. pinnipedii)、M.アビウム(M. avium)、M.アビウム・パラツベルクローシス(M. Avium paratuberculosis)、M.アビウム・シルバティカム(M. Avium silvaticum)、M.アビウム「ホミニッスイス」(M. Avium "hominissuis")、M.コロンビエンス(M. colombiense)、M.アジアティカム(M. asiaticum)、M.ゴードナエ(M. gordonae)、M.ガストリ(M. gastri)、M.カンサシイ(M. kansasii)、M.ヒベルニアエ(M. hiberniae)、M.ノンクロモゲニカム(M. nonchromogenicum)、M.テラエ(M. terrae)、M.トリビアレ(M. triviale)、M.アルセランス(M. ulcerans)、M.シュードショットシイ(M. pseudoshottsii)、M.ショットシイ(M. shottsii)、M.トリプレックス(M. triplex)、M.ゲナベンス(M. genavense)、M.フロレンティナム(M. florentinum)、M.レンティフラバム(M. lentiflavum)、M.パルストレ(M. palustre)、M.クビカエ(M. kubicae)、M.パラスクロフラセウム(M. parascrofulaceum)、M.ハイデルベルゲンス(M. heidelbergense)、M.インテルジェクツム(M. interjectum)、M.シミアエ(M.simiae)、M.ブランデリ(M.branderi)、M.クッキイ(M. cookii)、M.セラータム(M. celatum)、M.ボヘミカム(M. bohemicum)、M.ヘモフィルム(M. haemophilum)、M.マルモエンス(M. malmoense)、M.スルガイ(M. szulgai)、M.レプラ(M. leprae)、M.レプラムリウム(M. lepraemurium)、M.レプロマトーシス(M. lepromatosis)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.ボトニエンス(M. botniense)、M.キマエラ(M. chimaera)、M.コンスピキュウム(M. conspicuum)、M.ドリカム(M. doricum)、M.ファルシノゲネス(M. farcinogenes)、M.ヘッケスホルネンス(M. heckeshornense)、M.イントラセルラレ(M. intracellulare)、M.ラクス(M. lacus)、M.マリナム(M. marinum)、M.モナセンス(M. monacense)、M.モンテフィオレンス(M. montefiorense)、M.ムラーレ(M. murale)、M.ネブラスケンス(M. nebraskense)、M.サスカチェワネンス(M. saskatchewanense)、M.スクロフラセウム(M. scrofulaceum)、M.シモイデイ(M. shimoidei)、M.トゥシアエ(M. tusciae)、M.ゼノピ(M. xenopi)、M.インターメディウム(M. intermedium)、M.アブセサス(M. abscessus)、M.ケロナエ(M. chelonae)、M.ボルレティイ(M. bolletii)、M.フォルトゥイタム(M. fortuitum)、M.フォルトゥイタム亜種アセトアミドリティカム(M.fortuitum subsp. acetamidolyticum)、M.ボエニッキイ(M. boenickei)、M.ペレグリナム(M. peregrinum)、M.ポルシナム(M. porcinum)、M.セネガレンス(M. senegalense)、M.セプティカム(M. septicum)、M.ニューオルレアンセンス(M. neworleansense)、M.ヒューストネンス(M. houstonense)、M.ムコゲニカム(M. mucogenicum)、M.マゲリテンス(M. mageritense)、M.ブリスベネンス(M. brisbanense)、M.コスメティカム(M. cosmeticum)、M.パラフォルトゥイタム(M. parafortuitum)、M.オーストロアフリカーナム(M. austroafricanum)、M.ディエルンホフェリ(M. diernhoferi)、M.ホドレリ(M. hodleri)、M.ネオオーラム(M. neoaurum)、M.フレデリクスバーゲンス(M. frederiksbergense)、M.オーラム(M. aurum)、M.ワクカエ(M. vaccae)、M.チタエ(M. chitae)、M.ファラックス(M. fallax)、M.コンフルエンティス(M. confluentis)、M.フラベッセンス(M. flavescens)、M.マダガスカリエンス(M. madagascariense)、M.フレイ(M. phlei)、M.スメグマチス(M. smegmatis)、M.グッディイ(M. goodii)、M.ウォリンスキイ(M. wolinskyi)、M.サーモレジスティバイル(M. thermoresistibile)、M.ガディウム(M. gadium)、M.コモセンス(M. komossense)、M.オブエンス(M. obuense)、M.スファグニ(M. sphagni)、M.アグリ(M. agri)、M.アイチエンス(M. aichiense)、M.アルベイ(M. alvei)、M.アルペンス(M. arupense)、M.ブルマエ(M. brumae)、M.カナリアセンス(M. canariasense)、M.チュブエンス(M. chubuense)、M.コンセプショネンス(M. conceptionense)、M.ドゥバリイ(M. duvalii)、M.エレファンティス(M. elephantis)、M.ギルバム(M. gilvum)、M.ハシアカム(M. hassiacum)、M.ホルサティカム(M. holsaticum)、M.イムノゲナム(M. immunogenum)、M.マッシリエンス(M. massiliense)、M.モリオカエンス(M. moriokaense)、M.サイクロトレランス(M. psychrotolerans)、M.ピレニボランス(M. pyrenivorans)、M.バンバアレニイ(M. vanbaalenii)、M.プルベリス(M. pulveris)、M.アロシエンス(M. arosiense)、M.オーバネンス(M. aubagnense)、M.カプラエ(M. caprae)、M.クロロフェノリカム(M. chlorophenolicum)、M.フルオロアンテニボランス(M.fluoroanthenivorans)、M.クマモトネンス(M. kumamotonense)、M.ノボカストレンス(M. novocastrense)、M.パルメンス(M. parmense)、M.フォカイクム(M. phocaicum)、M.ポリフェラエ(M. poriferae)、M.ローデシアエ(M. rhodesiae)、M.セオウレンス(M. seoulense)及びM.トーカイエンス(M. tokaiense)から選択される、請求項32に記載の使用。
- 上記マイコバクテリウム種が、マイコバクテリウム・ツベルクローシスである、請求項33に記載の使用。
- 上記対象がヒトである、請求項32に記載の使用。
- 上記対象が非ヒト動物である、請求項32に記載の使用。
- (iii)におけるペプチド断片が、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)、SALLRRLSTCPPES(配列番号87)から選択されるアミノ酸配列を含むか、又は該アミノ酸配列からなる、請求項32に記載の使用。
- ESAT6、CFP10、TB7.7及びPPD、又はそのホモログから選択されるマイコバクテリウムタンパク質又はそれに由来するペプチド断片をコードする核酸分子の使用をさらに含む、請求項32から37の何れか1項に記載の使用。
- マイコバクテリウム種に由来し、かつT細胞エピトープを含む、
Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780からなるリストから選択される、単離されたタンパク質。 - T細胞エピトープ又はその化学アナログを含む、請求項39に記載のタンパク質の単離されたペプチド。
- TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)、SALLRRLSTCPPES(配列番号87)から選択されるアミノ酸配列を含むか、又は該アミノ酸配列からなる、請求項39に記載の単離されたペプチド。
- 請求項39に記載のタンパク質、又は請求項40若しくは41に記載のペプチドをコードする、単離された核酸分子。
- 請求項42に記載の核酸分子を含むベクター。
- 請求項43に記載のベクターを含む単離された細胞。
- 容器を含むキットであって、上記容器は、請求項39に記載の少なくとも1つのタンパク質、又は請求項40若しくは41に記載の少なくとも1つのペプチド、又は請求項42に記載の少なくとも1つの核酸分子を含む、キット。
- 対象におけるマイコバクテリウム種による感染症をインビトロで診断するための方法であって、
当該方法は、以下からなるリストから選択される少なくとも1つのバイオマーカーの存在下で、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下においてインキュベートすることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、マイコバクテリウム種に感染した対象又はマイコバクテリウム種に以前さらされた対象に由来するリンパ球を示す、方法:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。 - 血液とバイオマーカーとの間におけるインキュベートが試験管で生じる、請求項46に記載の方法。
- 上記インキュベートが、さらにヘパリンの存在下で生じる、請求項46又は47に記載の方法。
- 上記インキュベートが、さらに、添加された炭水化物の存在下で生じる、請求項46又は47又は48に記載の方法。
- 上記インキュベートが、さらにESAT6、CFP10、TB7.7及びPPDから選択されるマイコバクテリウムタンパク質、又はそのペプチド断片、又はそれらに由来するその化学アナログ、又はそれらの混合物の存在下で生じる、請求項46から49の何れか1項に記載の方法。
- 上記マイコバクテリウム種が、M.ツベルクローシス(M. tuberculosis)、M.ボビス(M. bovis)、M.ボビスBCG(M. bovis BCG)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.カネッティ(M. canetti)、M.カプラエ(M. caprae)、M.ミクロティ(M. microti)、M.ピンニペディイ(M. pinnipedii)、M.アビウム(M. avium)、M.アビウム・パラツベルクローシス(M. Avium paratuberculosis)、M.アビウム・シルバティカム(M. Avium silvaticum)、M.アビウム「ホミニッスイス」(M. Avium "hominissuis")、M.コロンビエンス(M. colombiense)、M.アジアティカム(M. asiaticum)、M.ゴードナエ(M. gordonae)、M.ガストリ(M. gastri)、M.カンサシイ(M. kansasii)、M.ヒベルニアエ(M. hiberniae)、M.ノンクロモゲニカム(M. nonchromogenicum)、M.テラエ(M. terrae)、M.トリビアレ(M. triviale)、M.アルセランス(M. ulcerans)、M.シュードショットシイ(M. pseudoshottsii)、M.ショットシイ(M. shottsii)、M.トリプレックス(M. triplex)、M.ゲナベンス(M. genavense)、M.フロレンティナム(M. florentinum)、M.レンティフラバム(M. lentiflavum)、M.パルストレ(M. palustre)、M.クビカエ(M. kubicae)、M.パラスクロフラセウム(M. parascrofulaceum)、M.ハイデルベルゲンス(M. heidelbergense)、M.インテルジェクツム(M. interjectum)、M.シミアエ(M.simiae)、M.ブランデリ(M.branderi)、M.クッキイ(M. cookii)、M.セラータム(M. celatum)、M.ボヘミカム(M. bohemicum)、M.ヘモフィルム(M. haemophilum)、M.マルモエンス(M. malmoense)、M.スルガイ(M. szulgai)、M.レプラ(M. leprae)、M.レプラムリウム(M. lepraemurium)、M.レプロマトーシス(M. lepromatosis)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.ボトニエンス(M. botniense)、M.キマエラ(M. chimaera)、M.コンスピキュウム(M. conspicuum)、M.ドリカム(M. doricum)、M.ファルシノゲネス(M. farcinogenes)、M.ヘッケスホルネンス(M. heckeshornense)、M.イントラセルラレ(M. intracellulare)、M.ラクス(M. lacus)、M.マリナム(M. marinum)、M.モナセンス(M. monacense)、M.モンテフィオレンス(M. montefiorense)、M.ムラーレ(M. murale)、M.ネブラスケンス(M. nebraskense)、M.サスカチェワネンス(M. saskatchewanense)、M.スクロフラセウム(M. scrofulaceum)、M.シモイデイ(M. shimoidei)、M.トゥシアエ(M. tusciae)、M.ゼノピ(M. xenopi)、M.インターメディウム(M. intermedium)、M.アブセサス(M. abscessus)、M.ケロナエ(M. chelonae)、M.ボルレティイ(M. bolletii)、M.フォルトゥイタム(M. fortuitum)、M.フォルトゥイタム亜種アセトアミドリティカム(M.fortuitum subsp. acetamidolyticum)、M.ボエニッキイ(M. boenickei)、M.ペレグリナム(M. peregrinum)、M.ポルシナム(M. porcinum)、M.セネガレンス(M. senegalense)、M.セプティカム(M. septicum)、M.ニューオルレアンセンス(M. neworleansense)、M.ヒューストネンス(M. houstonense)、M.ムコゲニカム(M. mucogenicum)、M.マゲリテンス(M. mageritense)、M.ブリスベネンス(M. brisbanense)、M.コスメティカム(M. cosmeticum)、M.パラフォルトゥイタム(M. parafortuitum)、M.オーストロアフリカーナム(M. austroafricanum)、M.ディエルンホフェリ(M. diernhoferi)、M.ホドレリ(M. hodleri)、M.ネオオーラム(M. neoaurum)、M.フレデリクスバーゲンス(M. frederiksbergense)、M.オーラム(M. aurum)、M.ワクカエ(M. vaccae)、M.チタエ(M. chitae)、M.ファラックス(M. fallax)、M.コンフルエンティス(M. confluentis)、M.フラベッセンス(M. flavescens)、M.マダガスカリエンス(M. madagascariense)、M.フレイ(M. phlei)、M.スメグマチス(M. smegmatis)、M.グッディイ(M. goodii)、M.ウォリンスキイ(M. wolinskyi)、M.サーモレジスティバイル(M. thermoresistibile)、M.ガディウム(M. gadium)、M.コモセンス(M. komossense)、M.オブエンス(M. obuense)、M.スファグニ(M. sphagni)、M.アグリ(M. agri)、M.アイチエンス(M. aichiense)、M.アルベイ(M. alvei)、M.アルペンス(M. arupense)、M.ブルマエ(M. brumae)、M.カナリアセンス(M. canariasense)、M.チュブエンス(M. chubuense)、M.コンセプショネンス(M. conceptionense)、M.ドゥバリイ(M. duvalii)、M.エレファンティス(M. elephantis)、M.ギルバム(M. gilvum)、M.ハシアカム(M. hassiacum)、M.ホルサティカム(M. holsaticum)、M.イムノゲナム(M. immunogenum)、M.マッシリエンス(M. massiliense)、M.モリオカエンス(M. moriokaense)、M.サイクロトレランス(M. psychrotolerans)、M.ピレニボランス(M. pyrenivorans)、M.バンバアレニイ(M. vanbaalenii)、M.プルベリス(M. pulveris)、M.アロシエンス(M. arosiense)、M.オーバネンス(M. aubagnense)、M.カプラエ(M. caprae)、M.クロロフェノリカム(M. chlorophenolicum)、M.フルオロアンテニボランス(M.fluoroanthenivorans)、M.クマモトネンス(M. kumamotonense)、M.ノボカストレンス(M. novocastrense)、M.パルメンス(M. parmense)、M.フォカイクム(M. phocaicum)、M.ポリフェラエ(M. poriferae)、M.ローデシアエ(M. rhodesiae)、M.セオウレンス(M. seoulense)及びM.トーカイエンス(M. tokaiense)から選択される、請求項46から50の何れか1項に記載の方法。
- 上記マイコバクテリウム種が、マイコバクテリウム・ツベルクローシスである、請求項51に記載の方法。
- 上記対象がヒトである、請求項46に記載の方法。
- 上記対象が非ヒト動物である、請求項46に記載の方法。
- (iii)に定義されるペプチドが、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)、SALLRRLSTCPPES(配列番号87)から選択されるアミノ酸配列を含むか、又は該アミノ酸配列からなる、請求項46に記載の方法。
- 上記エフェクタ分子が、インターフェロンγ、サイトカイン、インターロイキン、及びTNF−αから選択される、請求項46に記載の方法。
- 上記エフェクタ分子が、インターフェロンγである、請求項46に記載の方法。
- 請求項39に記載のタンパク質、又は請求項40若しくは41に記載のペプチドに対して特異的な単離された抗体。
- 対象におけるマイコバクテリウム・ツベルクローシスによる感染症のインビトロ診断のための方法であって、
当該方法は、上記対象からのリンパ球を含む血液試料を、ESAT6、CFP10、TB7.7、及び/又はPPDの1以上と共にインキュベートすること、並びに、上記リンパ球によるインターフェロンγの放出を測定することを含み、
当該方法は、上記インキュベートが、さらに
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後にi)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片
から選択される少なくとも1つのバイオマーカーの存在下で実施されることを特徴とし、
マイコバクテリウム・ツベルクローシスの検出に関する感度及び/又は選択性のレベルが、ESAT6、CFP10、TB7.7、及び/又はPPDだけを用いた場合の感度及び/又は選択性と比較して高い、方法。 - マイコバクテリウム種による感染症の治療又は予防のためのワクチンであって、
上記ワクチンは、
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;及び
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片
からなるリストから選択される少なくとも1つの物質;
並びに1つ以上の医薬的に許容されるアジュバント、担体、賦形剤、及び/又は希釈剤を含むか、又はそれらからなる、ワクチン。 - 上記マイコバクテリウム種が、M.ツベルクローシス(M. tuberculosis)、M.ボビス(M. bovis)、M.ボビスBCG(M. bovis BCG)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.カネッティ(M. canetti)、M.カプラエ(M. caprae)、M.ミクロティ(M. microti)、M.ピンニペディイ(M. pinnipedii)、M.アビウム(M. avium)、M.アビウム・パラツベルクローシス(M. Avium paratuberculosis)、M.アビウム・シルバティカム(M. Avium silvaticum)、M.アビウム「ホミニッスイス」(M. Avium "hominissuis")、M.コロンビエンス(M. colombiense)、M.アジアティカム(M. asiaticum)、M.ゴードナエ(M. gordonae)、M.ガストリ(M. gastri)、M.カンサシイ(M. kansasii)、M.ヒベルニアエ(M. hiberniae)、M.ノンクロモゲニカム(M. nonchromogenicum)、M.テラエ(M. terrae)、M.トリビアレ(M. triviale)、M.アルセランス(M. ulcerans)、M.シュードショットシイ(M. pseudoshottsii)、M.ショットシイ(M. shottsii)、M.トリプレックス(M. triplex)、M.ゲナベンス(M. genavense)、M.フロレンティナム(M. florentinum)、M.レンティフラバム(M. lentiflavum)、M.パルストレ(M. palustre)、M.クビカエ(M. kubicae)、M.パラスクロフラセウム(M. parascrofulaceum)、M.ハイデルベルゲンス(M. heidelbergense)、M.インテルジェクツム(M. interjectum)、M.シミアエ(M.simiae)、M.ブランデリ(M.branderi)、M.クッキイ(M. cookii)、M.セラータム(M. celatum)、M.ボヘミカム(M. bohemicum)、M.ヘモフィルム(M. haemophilum)、M.マルモエンス(M. malmoense)、M.スルガイ(M. szulgai)、M.レプラ(M. leprae)、M.レプラムリウム(M. lepraemurium)、M.レプロマトーシス(M. lepromatosis)、M.アフリカナム(M. africanum)、M.ボトニエンス(M. botniense)、M.キマエラ(M. chimaera)、M.コンスピキュウム(M. conspicuum)、M.ドリカム(M. doricum)、M.ファルシノゲネス(M. farcinogenes)、M.ヘッケスホルネンス(M. heckeshornense)、M.イントラセルラレ(M. intracellulare)、M.ラクス(M. lacus)、M.マリナム(M. marinum)、M.モナセンス(M. monacense)、M.モンテフィオレンス(M. montefiorense)、M.ムラーレ(M. murale)、M.ネブラスケンス(M. nebraskense)、M.サスカチェワネンス(M. saskatchewanense)、M.スクロフラセウム(M. scrofulaceum)、M.シモイデイ(M. shimoidei)、M.トゥシアエ(M. tusciae)、M.ゼノピ(M. xenopi)、M.インターメディウム(M. intermedium)、M.アブセサス(M. abscessus)、M.ケロナエ(M. chelonae)、M.ボルレティイ(M. bolletii)、M.フォルトゥイタム(M. fortuitum)、M.フォルトゥイタム亜種アセトアミドリティカム(M.fortuitum subsp. acetamidolyticum)、M.ボエニッキイ(M. boenickei)、M.ペレグリナム(M. peregrinum)、M.ポルシナム(M. porcinum)、M.セネガレンス(M. senegalense)、M.セプティカム(M. septicum)、M.ニューオルレアンセンス(M. neworleansense)、M.ヒューストネンス(M. houstonense)、M.ムコゲニカム(M. mucogenicum)、M.マゲリテンス(M. mageritense)、M.ブリスベネンス(M. brisbanense)、M.コスメティカム(M. cosmeticum)、M.パラフォルトゥイタム(M. parafortuitum)、M.オーストロアフリカーナム(M. austroafricanum)、M.ディエルンホフェリ(M. diernhoferi)、M.ホドレリ(M. hodleri)、M.ネオオーラム(M. neoaurum)、M.フレデリクスバーゲンス(M. frederiksbergense)、M.オーラム(M. aurum)、M.ワクカエ(M. vaccae)、M.チタエ(M. chitae)、M.ファラックス(M. fallax)、M.コンフルエンティス(M. confluentis)、M.フラベッセンス(M. flavescens)、M.マダガスカリエンス(M. madagascariense)、M.フレイ(M. phlei)、M.スメグマチス(M. smegmatis)、M.グッディイ(M. goodii)、M.ウォリンスキイ(M. wolinskyi)、M.サーモレジスティバイル(M. thermoresistibile)、M.ガディウム(M. gadium)、M.コモセンス(M. komossense)、M.オブエンス(M. obuense)、M.スファグニ(M. sphagni)、M.アグリ(M. agri)、M.アイチエンス(M. aichiense)、M.アルベイ(M. alvei)、M.アルペンス(M. arupense)、M.ブルマエ(M. brumae)、M.カナリアセンス(M. canariasense)、M.チュブエンス(M. chubuense)、M.コンセプショネンス(M. conceptionense)、M.ドゥバリイ(M. duvalii)、M.エレファンティス(M. elephantis)、M.ギルバム(M. gilvum)、M.ハシアカム(M. hassiacum)、M.ホルサティカム(M. holsaticum)、M.イムノゲナム(M. immunogenum)、M.マッシリエンス(M. massiliense)、M.モリオカエンス(M. moriokaense)、M.サイクロトレランス(M. psychrotolerans)、M.ピレニボランス(M. pyrenivorans)、M.バンバアレニイ(M. vanbaalenii)、M.プルベリス(M. pulveris)、M.アロシエンス(M. arosiense)、M.オーバネンス(M. aubagnense)、M.カプラエ(M. caprae)、M.クロロフェノリカム(M. chlorophenolicum)、M.フルオロアンテニボランス(M.fluoroanthenivorans)、M.クマモトネンス(M. kumamotonense)、M.ノボカストレンス(M. novocastrense)、M.パルメンス(M. parmense)、M.フォカイクム(M. phocaicum)、M.ポリフェラエ(M. poriferae)、M.ローデシアエ(M. rhodesiae)、M.セオウレンス(M. seoulense)及びM.トーカイエンス(M. tokaiense)から選択される、請求項61に記載のワクチン。
- 上記マイコバクテリウム種が、マイコバクテリウム・ツベルクローシスである、請求項62に記載のワクチン。
- 上記対象がヒトである、請求項61に記載のワクチン。
- 上記対象が非ヒト動物である、請求項61に記載のワクチン。
- (iii)に定義されるペプチドが、TAWITAVVPGLMV(配列番号24)、AVIVRSELLTQYL(配列番号22)、GSVRQLPSVLKPPLITLRTLTLSG(配列番号71)、RPVRRVLLFVVPSSGPAP(配列番号70)、GEIIFISGRLNGaa(配列番号13)、ELMARAAVLGSAH(配列番号21)、LAWITAVVPGLMV(配列番号85)、GEIIFISGRLNG(配列番号86)、SALLRRLSTCPPES(配列番号87)から選択されるアミノ酸配列を含むか、又は該アミノ酸配列からなる、請求項61に記載のワクチン。
- マイコバクテリウム種による感染症の防止に用いるための、請求項61から66の何れか1項に記載のワクチン。
- マイコバクテリウム種による感染症の治療又は防止に用いるための、以下からなるリストから選択される少なくとも1つの物質:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。 - 対象が細胞性免疫反応を開始する能力をインビトロで評価するための方法であって、
当該方法は、
マイコバクテリウム種、又はそれに由来するTリンパ球エピトープを含む抗原若しくはタンパク質に感作されたTリンパ球を含む試料を、以下から選択される少なくとも1つの物質と、上記リンパ球を刺激してエフェクタ分子を産生するのに十分な時間及び条件下において接触させることを含み、
上記エフェクタ分子の存在又はレベルは、細胞性免疫反応を開始する、上記対象の能力を示す、方法:
(i)マイコバクテリウム種又は関連生物に由来し、かつ少なくとも1つのT細胞エピトープを含む、Rv0023、Rv0182c、Rv0290、Rv0601c、Rv0647c、Rv0724A、Rv0890c、Rv1251c、Rv1398c、Rv1478、Rv1497、Rv1575、Rv1578c、Rv1899c、Rv2137c、Rv2333c、Rv2548、Rv2557、Rv2816c、Rv2990、Rv3094c、Rv3107c、Rv3188、Rv3239c、Rv3296、Rv3425、Rv3446c、Rv3479、Rv3482c、Rv3780から選択されるタンパク質;
(ii)最適アラインメント後に(i)に定義されるタンパク質の1つと比較して少なくとも80%の類似性を有するアミノ酸配列を有する、当該タンパク質のホモログ;並びに
(iii)T細胞エピトープ又はその化学アナログを有する、(i)又は(ii)に定義されるタンパク質のペプチド断片。
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Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2016028028A1 (ko) * | 2014-08-18 | 2016-02-25 | 서울대학교산학협력단 | 신규한 온도 민감성 마이코박테리아 균주를 포함하는 마이코박테리아 감염증에 대한 백신 조성물 |
KR20160097325A (ko) * | 2013-12-16 | 2016-08-17 | 스태튼스 세룸 인스티튜트 | 결핵의 개선된 생체내 또는 시험관내 세포-매개 면역학적 진단을 위한 진단 시약 |
Families Citing this family (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US8168421B2 (en) * | 2005-12-09 | 2012-05-01 | University Of Georgia Research Foundation, Inc. | Microbial vaccine and vaccine vector |
CN103698530B (zh) * | 2013-11-25 | 2015-08-19 | 广东体必康生物科技有限公司 | 结核分支杆菌蛋白在制备诊断活动性肺结核的产品中的用途 |
CN104327159B (zh) * | 2014-10-29 | 2018-02-23 | 南方医科大学 | 结核分枝杆菌特异性cd8+t细胞表位肽p45及其应用 |
CN104387450B (zh) * | 2014-10-29 | 2017-07-18 | 南方医科大学 | 结核分枝杆菌特异性cd8+t细胞表位肽p12及其应用 |
GB201602305D0 (en) * | 2016-02-09 | 2016-03-23 | Medical Res Council And Imp Innovations Ltd | TB Biomarkers |
CN106248934B (zh) * | 2016-08-25 | 2018-04-06 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 | 结核分枝杆菌抗原蛋白Rv0446c及其T细胞表位肽的应用 |
CN106248935B (zh) * | 2016-08-31 | 2018-04-06 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 | 结核分枝杆菌抗原蛋白Rv1798及其T细胞表位肽的应用 |
WO2018111536A1 (en) | 2016-12-14 | 2018-06-21 | Becton, Dickinson And Company | Methods and compositions for obtaining a tuberculosis assessment in a subject |
CN108949783B (zh) * | 2017-05-19 | 2021-03-26 | 复旦大学 | 一种重组卡介苗及其应用 |
CN108872610B (zh) * | 2018-09-07 | 2021-03-09 | 首都医科大学附属北京胸科医院 | 结核感染诊断试剂盒、筛查系统及该试剂盒的应用 |
CN110423279B (zh) * | 2019-06-20 | 2021-07-27 | 扩增生物科技(北京)有限公司 | 结核分枝杆菌重组融合蛋白eecc及其制备方法和应用 |
CN115184603B (zh) * | 2022-06-30 | 2024-02-06 | 首都医科大学附属北京胸科医院 | EspC蛋白在制备结核分枝杆菌分离或富集产品中的应用 |
CN116482361B (zh) * | 2023-06-15 | 2023-08-22 | 中国医学科学院北京协和医院 | 一种检测结核感染状态的试剂、试剂盒及应用 |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002532064A (ja) * | 1998-11-04 | 2002-10-02 | アイシス イノヴェイション リミテッド | 結核診断試験 |
US20030129601A1 (en) * | 2001-02-22 | 2003-07-10 | Cole Stewart T. | Comparative mycobacterial genomics as a tool for identifying targets for the diagnosis, prophylaxis or treatment of mycobacterioses |
JP2004514451A (ja) * | 2000-11-28 | 2004-05-20 | ヘルス プロテクション エージェンシー | マイコバクテリア感染に対する防御 |
WO2005021790A2 (en) * | 2003-08-29 | 2005-03-10 | Consiglio Nazionale Delle Ricerche | Use of gene sequences specific for mycobacterium tuberculosis and their related proteins for diagnosis and prevention of tubercular infection |
JP2010525831A (ja) * | 2007-05-08 | 2010-07-29 | ザ ユニバーシティ オブ バーミンガム | マイコバクテリア感染を検出するためのアッセイ |
Family Cites Families (22)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA1299099C (en) * | 1986-03-06 | 1992-04-21 | Paul Richard Wood | In vitro assay for detecting cell-mediated immune responses |
US20040018574A1 (en) * | 1998-08-25 | 2004-01-29 | Marcel Behr | Molecular differences between species of the M. tuberculosis complex |
US7772386B1 (en) * | 1999-01-29 | 2010-08-10 | Max-Planck-Gesellschaft Zur Forderung Der Wissenschaften E.V. | Identification of specific differentially expressed antigens |
EP2196473A1 (en) * | 2001-07-04 | 2010-06-16 | Health Protection Agency | Mycobacterial antigens expressed during latency |
US7074559B2 (en) * | 2002-03-06 | 2006-07-11 | Refents of the University of Minnesota | Mycobacterial diagnostics |
WO2004099771A1 (en) | 2003-05-08 | 2004-11-18 | Statens Serum Institut | A new specific epitope based immunological diagnosis of tuberculosis |
BRPI0416041A (pt) * | 2003-11-14 | 2007-01-02 | Univ Tennessee | locus da micolactona: uma linha de montagem para produção de novos policetìdeos com usos terapêutico e profilático |
WO2006029248A2 (en) * | 2004-09-04 | 2006-03-16 | Haper Laboratories Llc | Hollow fiber technique for in vivo study of cell populations |
CA2603356A1 (en) * | 2005-03-31 | 2006-10-05 | Leiden University Medical Center | Methods and means for diagnostics, prevention and treatment of mycobacterium infections and tuberculosis disease |
US7601357B2 (en) * | 2005-12-07 | 2009-10-13 | University Of Central Florida Research Foundation, Inc. | Targeting of long chain triacylglycerol hydrolase gene for tuberculosis treatment |
CN1888069A (zh) * | 2006-07-13 | 2007-01-03 | 复旦大学 | 重组蛋白Rv3425及其在制备结核病试剂盒中的应用 |
GB0618127D0 (en) * | 2006-09-14 | 2006-10-25 | Isis Innovation | Biomarker |
EP2368568A1 (en) * | 2006-11-01 | 2011-09-28 | Immport Therapeutics, INC. | Compositions and methods for immunodominant antigens |
BRPI0808553A2 (pt) * | 2007-03-02 | 2014-08-19 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Métodos para elevar uma resposta imune contra um patógeno, para estimar a produção de células t cd4+ e/ou cd8+ e/ou anticorpos específicos de patógeno em mamíferos e para estimular uma resposta imune em um mamífero, composição de vacina, uso da mesma, e, kit |
EP2197908A2 (en) * | 2007-09-27 | 2010-06-23 | Dako Denmark A/S | Mhc multimers in tuberculosis diagnostics, vaccine and therapeutics |
GB0722105D0 (en) * | 2007-11-10 | 2007-12-19 | Sec Dep For Environment Food A | Antigens |
CN101294964B (zh) * | 2007-11-27 | 2012-06-27 | 复旦大学附属华山医院 | 一种检测活动性结核病和结核潜伏感染的试剂和方法 |
US7670609B2 (en) * | 2007-11-27 | 2010-03-02 | Aeras Global Tb Vaccine Foundation | Recombinant BCG tuberculosis vaccine designed to elicit immune responses to Mycobacterium tuberculosis in all physiological stages of infection and disease |
MX344052B (es) * | 2009-05-13 | 2016-12-02 | Immport Therapeutics Inc | Composiciones y metodos para antigenos inmunodominantes de mycobacterium tuberculosis. |
US8058022B2 (en) * | 2009-07-27 | 2011-11-15 | Indian Institute Of Science | Diagnosis and monitoring of mycobacterium tuberculosis infection |
US9885088B2 (en) * | 2010-02-24 | 2018-02-06 | The Broad Institute, Inc. | Rapid phenotypic diagnosis of pathogens and drug resistance using transcriptional expression signatures |
WO2011119484A1 (en) * | 2010-03-23 | 2011-09-29 | Iogenetics, Llc | Bioinformatic processes for determination of peptide binding |
-
2010
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Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2002532064A (ja) * | 1998-11-04 | 2002-10-02 | アイシス イノヴェイション リミテッド | 結核診断試験 |
JP2004514451A (ja) * | 2000-11-28 | 2004-05-20 | ヘルス プロテクション エージェンシー | マイコバクテリア感染に対する防御 |
US20030129601A1 (en) * | 2001-02-22 | 2003-07-10 | Cole Stewart T. | Comparative mycobacterial genomics as a tool for identifying targets for the diagnosis, prophylaxis or treatment of mycobacterioses |
WO2005021790A2 (en) * | 2003-08-29 | 2005-03-10 | Consiglio Nazionale Delle Ricerche | Use of gene sequences specific for mycobacterium tuberculosis and their related proteins for diagnosis and prevention of tubercular infection |
JP2010525831A (ja) * | 2007-05-08 | 2010-07-29 | ザ ユニバーシティ オブ バーミンガム | マイコバクテリア感染を検出するためのアッセイ |
Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
JPN6015001555; Tuberculosis Vol.89, Page.210-217, 2009 * |
JPN6015001556; Mol Biol Rep Vol.37, Page.1793-1799, 2010 * |
JPN6015001558; Nature Vol.33, Page.537-544, 1998 * |
JPN6015001559; Nature genetics Vol.42, No.6, Page.498-503, 2010 * |
JPN6015001560; Clinical and vaccine immunology Vol.17, No.1, Page.168-175, 2010 * |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR20160097325A (ko) * | 2013-12-16 | 2016-08-17 | 스태튼스 세룸 인스티튜트 | 결핵의 개선된 생체내 또는 시험관내 세포-매개 면역학적 진단을 위한 진단 시약 |
JP2017503161A (ja) * | 2013-12-16 | 2017-01-26 | スタテンス セールム インスティトゥート | インビボまたはインビトロでの細胞が介在する結核の免疫学的診断の改善のための診断試薬 |
KR102305770B1 (ko) | 2013-12-16 | 2021-09-29 | 스태튼스 세룸 인스티튜트 | 결핵의 개선된 생체내 또는 시험관내 세포-매개 면역학적 진단을 위한 진단 시약 |
WO2016028028A1 (ko) * | 2014-08-18 | 2016-02-25 | 서울대학교산학협력단 | 신규한 온도 민감성 마이코박테리아 균주를 포함하는 마이코박테리아 감염증에 대한 백신 조성물 |
KR20160021933A (ko) * | 2014-08-18 | 2016-02-29 | 서울대학교산학협력단 | 신규한 온도 민감성 마이코박테리아 균주 및 이를 포함하는 마이코박테리아 감염증에 대한 백신 조성물 |
KR101696514B1 (ko) | 2014-08-18 | 2017-01-24 | 서울대학교산학협력단 | 신규한 온도 민감성 마이코박테리아 균주 및 이를 포함하는 마이코박테리아 감염증에 대한 백신 조성물 |
JP2017524661A (ja) * | 2014-08-18 | 2017-08-31 | ソウル ナショナル ユニバーシティ アールアンドディービー ファウンデーション | 新規な温度敏感性マイコバクテリア菌株を含むマイコバクテリア感染症に対するワクチン組成物 |
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