JP2011519579A - 炎症および新生細胞増殖の治療のためのオリゴヌクレオチド - Google Patents

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Abstract

CCR3レセプター、ならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットに対するオリゴヌクレオチドを提供する。このオリゴヌクレオチドは、喘息、COPD、アレルギー、嚢胞性線維症(CF)、過好酸球増大症、および新生細胞増殖、例えば癌と関連する炎症を含む炎症を抑制するために有用である。

Description

本発明は、特定の細胞レセプターに対するアンチセンスオリゴヌクレオチドの用途であって、単独で、または組み合わせて、喘息、COPD、アレルギー、嚢胞性線維症(CF)、および過好酸球増大症に関連する炎症を含む炎症を抑制するための用途に関する。本発明はまた、癌のような新生細胞増殖を抑制するためのアンチセンスオリゴヌクレオチドの用途に関する。
アンチセンスオリゴヌクレオチド(AON)は、標的遺伝子のある領域に対して相補的であって、かつ標的遺伝子配列にハイブリダイズして、遺伝子発現を阻害し得る。遺伝子発現は、アデノシンとチミジン(mRNA中ではウラシル)が、またはグアノシンとシチジンが、水素結合を通じて相互作用するワトソン−クリックの塩基対によって特定のメッセンジャーRNA(mRNA)のセンス標的に対するAONのハイブリダイゼーションを通じて阻害される。一般に、2種類の機序がこれらの作用に関与していると考えられ、その第一は標的mRNAの翻訳の障害を伴うハイブリダイゼーション、そして第二はRNase Hまたは標的mRNAの分解を伴う同様の酵素による誘導である。この方法の主な利点は、特に作用部位に対して直接適用される場合に(局所治療)、低い副作用および低い毒性の可能性しか伴わないという、作用の特異性である。この治療方法は、1個またはいくつかの遺伝子の過剰発現が疾患の存在または残留の原因であると考えられているような疾患に対して適用することができる可能性がある。結果的に、癌およびウィルス疾患に対する治療剤として、AONの用途を検討する多数の研究が行われている。
肺胞および気道上皮は、酸化的ストレス、敗血症、内毒血症および肺における他の重病に対する炎症性および代謝性の応答を調節するのに重要な役割を果たす動的な障壁として認識される。この気道上皮は特に、上皮−血液の境界で炎症性の状態/感染の主な標的であり、それ自体が、炎症性細胞を補充することおよび炎症性メディエーターを産生することによって、炎症性シグナルを増幅し得る。
喘息は、過去25年の間に有病率が2倍に増大した、人口の5〜10%に影響を及ぼす疾患である。この増大は特に、気道のウィルス感染(細気管支炎)後の幼児において、小児において、そして職業によって引き起こされる喘息において、顕著であった。喘息と関連する再発性の呼吸の問題は、しばしばアレルゲンにより引き起こされるが、しかし喘息の正確な原因は未だ分かっていない。しかしながら、ウィルスなどの物質が、喘息を有する患者の気道において見いだされる異常な炎症の永続化に関与し、従ってその疾患の持続に関与すると考えられている。
この理由のため、喘息の一次治療についての現在の推奨は、コルチコステロイド類および抗ロイコトリエン類を含有する薬剤などの強力な抗炎症性薬剤である。このアプローチは多くの患者において有効であるが、現在の抗炎症性の薬剤が効かない患者もいる。コルチコステロイド類はまた、長期の副作用を伴う強力な免疫抑制剤でもあり、そしてアレルギーまたは喘息の予防に有効であることは示されていない。抗ロイコトリエン類は、アレルギーおよび喘息においていくらか効用があるが、しかしコルチコステロイド類ほどは効果的ではない。
いくつかの炎症性メディエータ類は、喘息を有する患者の気道における炎症の発生および永続化においてある役割を果たす。いくつかのメディエータ類は、好酸球の走化性を通じて(CCR3と呼ばれるレセプターを通じて喘息性炎症において最も作用するケモカイン類:RANTES、エオタキシン1、2、3、MCP−3、4)、または内皮細胞活性化を通じて(IL−4、IL−13)、気道へと炎症性細胞を誘引する。その他のメディエータ類は、気道における炎症性細胞の刺激および生存の増大を引き起こす(IL−3、IL−4、IL−5、GM−CSF)。従って、これらのメディエータ類は、好酸球のための特異的ケモカイン類またはTヘルパーリンパ球2型表現型のサイトカイン(Th2:IL−3、IL−4、IL−5、IL−6、IL−9、IL−10、IL−13およびGM−CSF)のいずれかから構成されている(非特許文献1;非特許文献2)。喘息および一般的な呼吸器炎症において、気道におけるこれらの炎症性メディエータ類が減少する場合、改善が示されている。
アレルギーは、望ましくない免疫応答を引き起こす、アレルゲンに対する過敏性である。アレルギーは、例えば、人口の30%程度がかかっているアトピー性の鼻炎、皮膚炎およびアレルギー性結膜炎など、非常に一般的な疾患である。アレルギーは、異常なIgEの生成およびアレルゲンに対する炎症により特徴づけられる。IgEおよびアレルゲンの存在下において、マスト細胞などのエフェクター細胞が脱顆粒して炎症性メディエータ類を放出し、これが喘息において見いだされる同一の炎症性細胞の補充を引き起こす。アレルギー性鼻炎(すなわち、花粉症)、アレルギー性結膜炎、鼻茸、慢性副鼻腔炎、鼻炎およびアトピー性皮膚炎において、喘息において見られるのと同様に、炎症性メディエータ類の過剰が見いだされる。IL−4およびIL−13は、IgEの生成およびTh2表現型を有する細胞の誘導に必要とされる(非特許文献3;非特許文献4)。アトピー性疾患は、特に、アレルゲンに対して容易に感作される遺伝的傾向を有する個体における、アレルゲンに対する曝露により発症するアレルギー性疾患の一般名称である。これらの素因因子を有する個体は、食餌性抗原および吸入抗原に対する異常な免疫応答を容易に発症する。アレルギー性疾患のいくつかの具体的な事例は、気管支喘息、アトピー性皮膚炎、蕁麻疹、アレルギー性鼻炎、アレルギー性結膜炎およびアレルギー性胃腸炎である。
慢性閉塞性肺疾患(COPD)は、炎症の持続性上方制御が役割を果たすと考えられる、炎症性気道および肺胞疾患の別の例である。COPDにおける炎症は、好中球、CD8陽性リンパ球、およびマクロファージの気道内への浸潤増大によって特徴づけられる。好中球およびマクロファージは、組織炎症および損傷を促進するエラスターゼ、メタロプロテアーゼ、および酸素ラジカルを含めて多数のメディエータを放出するそれらの能力が原因となり、COPDにおける気道炎症の病因において重要な役割を果たす。COPDがある患者の気道における炎症細胞の蓄積は、炎症細胞を気道に誘引してそれらを活性化し、それらの存在を維持する、炎症促進性サイトカインおよびケモカインの放出増大によって引き起こされることが示唆されている。存在する細胞はまた、組織に対して悪影響を与えて疾患を永続化させる酵素(メタロプロテアーゼなど)および酸素ラジカルを放出する。COPDがある患者の肺において、ありとあらゆる炎症促進性サイトカインおよびケモカインが増大することが示されている。中でも重要な役割を果たすのが、COPDがある患者の気道においてそのレベルが増大する、腫瘍壊死因子α(TNF−α)、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、およびインターロイキン8(IL−8)である。
嚢胞性線維症(CF)は気道炎症性疾患のさらに別の例である。CF膜貫通コンダクタンス制御因子(CFTR)Clチャネル機能の欠失によって進行性の肺の障害がもたらされ、そして最終的には死にいたる。気道上皮細胞における機能的なCFTRの喪失は、気道表面の液体の枯渇および酸化の増大を促進する。気道に存在する活性化された好中球によって、大量のプロテアーゼおよび活性酸素種(ROS)が生じる。これらの変化をまとめると、細菌の粘膜毛様体クリアランスの低下、複数の経路を通じた上皮細胞シグナル伝達の活性化、およびCF気道におけるその後の高炎症性反応に関連している。気道上皮細胞においてNF−κB経路およびCa2+動員の両方が、好中球の補充および活性化、アポトーシスの調節、ならびに上皮性関門の一体性の制御に関与するIL−8のようなメディエータの調節性の産生を介して肺炎症の制御における要因と考えられる。細菌感染および気道の好中球の進行中の蓄積によって維持される過剰でかつ持続的な炎症は、CFの患者における肺の破壊の重要な要因であり、抗炎症性治療の検討が必要となっている。
炎症が役割を果たすようにみえる呼吸器疾患の他の例としては、好酸球性咳、気管支炎、肺同種移植片の急性および慢性の拒絶、サルコイドーシス、肺線維症、鼻炎および副鼻腔炎などが挙げられる。
好酸球性咳は、気道閉塞または応答性亢進の非存在下において、慢性の咳、および患者の気道内の、ほとんどが好酸球である炎症細胞の存在によって特徴づけられる。この疾患ではいくつかのサイトカインおよびケモカインが増大するが、それらはほとんどが好酸球指向性である。好酸球は、気道内で補充され活性化されて、炎症および咳の永続化において役割を果たす酵素および酸素ラジカルを放出する可能性がある。
急性気管支炎は、下気道の感染または刺激的事象(例えば汚染、粉塵、ガスまたは化学物質による)の間に生じる急性疾患である。慢性気管支炎とは、2年間にわたり年に少なくとも3ヶ月間、ほぼ毎日咳の存在および痰の発生があることで定義される。急性または慢性気管支炎の場合は、気道内に広範囲のケモカインおよびサイトカインと共に、ほとんどが好中球である炎症細胞も見られる。これらのメディエータは、これらの疾患の間に起こる炎症、症状、および粘液産生においてある役割を果たすと考えられる。
肺移植術は、末期の肺疾患がある患者において行われる。我々の身体の炎症細胞であるリンパ球が、ドナーの臓器を「自己」と認識しない場合に、急性、およびさらに重要なことには慢性同種移植片拒絶が起きる。炎症細胞はケモカインとサイトカインとによって補充されて、ありとあらゆる酵素類を放出し、この酵素が組織破壊をもたらし、慢性拒絶の場合は閉塞性細気管支炎と呼ばれる疾患をもたらす。
サルコイドーシスは、慢性非乾酪性肉芽腫が組織内で生じる原因不明の疾患である。肺は最も一般に影響を受ける臓器である。肺気管支肺胞の洗浄液は、ほとんどがリンパ球、マクロファージ、時には好中球および好酸球の増大を示す。これらの細胞はまた、サイトカインおよびケモカインによって動員および活性化され、疾患の病因に関与すると考えられる。
肺線維症は、慢性呼吸不全をもたらす進行性および慢性の線維症(瘢痕)によって特徴づけられる肺組織の疾患である。異なるタイプや原因の肺線維症が存在するが、全て肺組織へのコラーゲン沈着と共に、炎症細胞の流入および持続、線維芽細胞の活性化および増殖によって特徴づけられる。これらの事象は、肺組織内のサイトカインおよびケモカインの放出に関連するようである。
急性鼻炎は、鼻または上気道での感染または刺激的事象(例えば汚染、粉塵、ガスまたは化学物質による)の間に起こる急性疾患である。慢性鼻炎は、絶え間ない慢性の鼻水、鼻閉、くしゃみ、および掻痒症の存在によって定義される。急性または慢性の鼻炎の間、上気道内に、広範囲のケモカインおよびサイトカインと共に、炎症細胞も見ることができる。これらのメディエータは、これらの疾患の間に起こる炎症、症状、および粘液産生においてある役割を果たすと考えられる。
急性副鼻腔炎は、発熱の有無、鼻閉、粘性の低い化膿性痰、頭痛または副鼻腔痛によって特徴づけられる、急性で通常は感染性の副鼻腔の疾病である。慢性副鼻腔炎は、急性副鼻腔炎症状の6ヶ月を超える持続によって定義される。急性または慢性副鼻腔炎においては、上気道および副鼻腔内に、広範囲のケモカインおよびサイトカインと共に、炎症細胞も見ることができる。これらのメディエータは、これらの疾患の間に起こる炎症、症状、および痰の産生においてある役割を果たすと考えられる。
新生物は、調節不能でかつ進行性である異常な組織増殖である。悪性新生物はしばしば、癌として特徴づけられる。癌は、ヒトの死因の第二位であり、そして不死化細胞の異常増殖により特徴づけられる100種類を超える疾患についての一般的用語である。これらの細胞の永続性および増殖の増大に関与する機序の一つは、同族のレセプターを通じて作用する成長因子の放出である。これらの成長因子の中でも、GM−CSFは、いくつかの腫瘍細胞にとって重要な成長因子であることが示されている。ケモカインレセプターCCR3は、最近、慢性リンパ球性白血病(CLL)やヘアリー細胞白血病(HCL)を有する患者から回収された悪性Bリンパ球中で特徴づけられた(非特許文献5)。実際、CCR−3ケモカインレセプターを通じた上皮成長因子レセプター(EGFR)のトランス活性化が、気管上皮細胞におけるMAPキナーゼ活性化およびサイトカイン生成を引き起こす重要な経路であることが見いだされた(非特許文献6)。成長因子についてのレセプターおよび/またはケモカイン類についてのレセプターの遮断を介する癌細胞増殖の抑制は、特定の癌の治療において重要である場合がある。
好酸球は、白血球細胞のうち一つの型である。それらは、顆粒性白血球であって、これは細長い糸状のクロマチンにより連結された通常は2葉を有する核と、均一なサイズでありエオジンで染色可能である、素早く動く(course)球状の顆粒を含有する細胞質とを有する。過好酸球増大症は、好酸球数の増大により特徴づけられ、しばしばアレルギー、喘息、および感染と関連している。
炎症反応を抑制するための、レセプターをコードする特異的核酸配列に対するオリゴヌクレオチドの用途は公知である。共有に係る非特許文献7および非特許文献8には、喘息、アレルギー、過好酸球増大症、炎症、および癌を治療および/または予防するために用いられるAONが記載されている。
潜在的な臨床的用途のため、AONは、血清および細胞ヌクレアーゼによる分解に対して安定性を示さなければならず、血清タンパク質および細胞タンパク質に対する低い非特異的結合を示さなければならず、標的mRNA配列への高い認識を示さなければならず、相補的mRNAと複合体化された場合、細胞膜透過性、および細胞ヌクレアーゼの誘導を示さなければならない。天然の糖(D−リボースおよびD−2−デオキシリボース)およびリン酸ジエステル(PO)結合を含有するオリゴヌクレオチドは、血清および細胞内ヌクレアーゼにより迅速に分解され、それが効果的な治療剤としてのそれらの有用性を限定していることは、よく知られている。治療剤としてのそれらの安定性および効率性を向上するための、オリゴヌクレオチドに関する化学的な戦略的修飾が報告されている。主要な化学的変化としては、糖部分の修飾、塩基部分の修飾、および/またはヌクレオチド間リン酸ジエステル結合の修飾もしくは置換が挙げられる。現在までのところ、もっとも広く研究されているアナログは、ホスホロチオエート(PS)オリゴデオキシヌクレオチドであり、これは、リン酸ジエステル骨格中の非架橋性酸素原子の一つが、硫黄原子により置換されたものである(非特許文献9)。いくつかのアンチセンスオリゴヌクレオチド合成が、インビトロおよびインビボの研究のために開発され、用いられている(非特許文献10;非特許文献11)。
炎症促進性のレセプターを阻害するために、これらのレセプターをコードする核酸配列に対する改良されたAONが求められている。このようなAONは、喘息、アレルギー、過好酸球増大症、炎症および癌の治療および/または予防において有用であると考えられる。
ジョン・エー・イー(John AE.)およびルカーチ・エヌ・ダブリュ(Lukacs NW.),サルコイドーシス・バスキュリティス・アンド・ディフューズ・ラング・ディジーズ(Sarcoidosis Vasculitis and Diffuse Lung Diseases),2003年20:180〜189 ブリーズ(Blease)ら,エキスパート・オピニオン・オン・エマージング・ドラッグス(Expert Opinion on Emerging Drugs.)2003年,8:71〜81 バーンズ・ピー・ジェイ(Barnes PJ.),サイトカイン・アンド・グロース・ファクター・レビューズ(Cytokine & Growth Factor Reviews).2003年,14:511〜522 シュー(Schuh)ら,サイトカイン・アンド・グロース・ファクター・レビューズ(Cytokine & Growth Factor Reviews).2003年,14:503〜510 トレンチン(Trentin)ら,ブラッド(Blood),2004年,104,502〜508 アダチ(Adachi)ら,バイオケミカル・アンド・バイオフィジカル・リサーチ・コミュニケーションズ(Biochemical and Biophysical Research Communications)、2004年,320,292〜396 国際公開第WO99/66037号パンフレット 国際公開第WO06/045202号パンフレット エクステイン・エフ(Eckstein F.),アニュアル・レビュー・オブ・バイオケミストリー(Annual Review of Biochemistry)1985年,54:367〜402 グッドチャイルド・ジェイ(Goodchild J.),カレント・オピニオン・モレキュラー・セラピューティクス(Current Opinion Molecular Therapeutics)2004年,6:120〜128 アーバン・イー(Urban E.)およびアール・ノエ・シーアール(R.Noe CR.),ファルマコ(Farmaco.),2003年,58:243〜258
発明の要旨
本発明の一態様は、オリゴヌクレオチドが(i)配列番号1から698のうちのいずれか1つに対応する塩基配列を有し、かつ(ii)配列番号1から698のいずれか1つの修飾オリゴヌクレオチド、のうちの1つである、CCR3ケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列に対するオリゴヌクレオチドである。
好ましくは、上記オリゴヌクレオチドは配列番号1〜698のいずれか1つに対応する塩基配列を有する。
好ましくは、上記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのアデノシンは、修飾されたヌクレオチド、好ましくは、2−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換される。
いくつかの実施形態では、上記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオチドはアラビノース修飾オリゴヌクレオチド、好ましくは、2’−デオキシ−2’−フルオロアラビノヌクレオチド(FANA)である。
いくつかの実施形態では、前記オリゴヌクレオチドは、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ボラノホスホネートおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される少なくとも1つのヌクレオチド間結合を含む。好ましくは、このオリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートもしくはリン酸ジエステルオリゴヌクレオチド、またはホスホロチオエートおよびリン酸ジエステル結合の組み合わせを有するオリゴヌクレオチドである。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドの少なくとも1つおよび薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物である。
本発明のさらなる態様は、患者に対して本明細書に記載の薬学的組成物を投与する工程を包む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防する方法である。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、本明細書に記載の薬学的組成物の用途である。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、薬剤の調製における本明細書に記載の薬学的組成物の用途である。
本発明のさらなる態様は、患者に対して本明細書に記載のオリゴヌクレオチドを投与する工程を含み、該オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させる薬剤の調製における、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドである。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドを患者に対して投与する工程を含む、患者におけるCCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、CCR3ケモカインレセプター発現を低下させる薬剤の調製における、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドである。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための;患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための(オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する);患者におけるCCRケモカインレセプター発現を低下させるための(オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する)、本明細書に記載の薬学的組成物をその使用方法の説明書と一緒に備える商業的パッケージである。
本発明のさらなる態様は、2本の鎖が配列番号699および700;701および702;703および704;705および706;707および708;709および710;711および712;713および714;715および716;717および718;719および720;721および722;723および724;725および726;727および728;729および730;731および732;733および734;735および736;737および738;739および740;741および742;743および744;745および746;747および748;749および750;752および752;753および754;755および756;757および758;759および760;761および762;763および764;765および766;767および768;769および770;771および772;773および774;775および776;777および778;779および780;781および782;783および784;785および786;787および788;789および790;791および792;793および794;795および796;797および798;799および800;801および802;803および804;805および806;807および808;809および810;811および812;813および814;815および816;817および818;819および820;821および822;823および824;825および826;827および828;829および830;831および832;833および834;835および836;837および838;839および840;841および842;843および844;845および846;847および848;849および850;851および852;853および854;855および856;857および858;859および860;861および862;863および864;865および866;867および868;869および870;871および872;873および874;875および876;877および878;879および880;881および882;883および884;885および886;887および888;889および890;891および892;893および894;895および896;897および898;899および900;901および902;903および904;905および906;907および908;909および910;911および912;913および914;915および916;917および918;919および920;921および922;923および924;925および926;927および928;929および930;931および932;933および934;935および936;937および938;939および940;941および942;943および944;945および946;947および948;949および950;951および952;953および954;955および956;957および958;959および960;961および962;963および964;965および966;967および968;969および970;971および972;973および974;975および976;977および978;979および980;981および982;983および984;985および986;987および988;989および990;991および992;993および994;995および996;997および998;999および1000;1001および1002;1003および1004;1005および1006;1007および1008;1009および1010;1011および1012;1013および1014;1015および1016;1017および1018;1019および1020;1021および1022;1023および1024;1025および1026;1027および1028;1029および1030;1031および1032;1033および1034;1035および1036;1037および1038;1039および1040;1041および1042;1043および1044;1045および1046;1047および1048;1049および1050;1051および1052;1053および1054;1055および1056;1057および1058;1059および1060;1061および1062;1063および1064;1065および1066;1067および1068;1069および1070;1071および1072;1073および1074;1075および1076;1077および1078;1079および1080;1081および1082;1083および1084;1085および1086;1087および1088;1089および1090;1091および1092;1093および1094;1095および1096;1097および1098;1099および1100;1101および1102;1103および1104;1105および1106;1107および1108;1109および1110;1111および1112;1113および1114;1115および1116;1117および1118;1119および1120;1121および1122;1123および1124;1125および1126;1127および1128;1129および1130;1131および1132;1133および1134;1135および1136;1137および1138;1139および1140;1141および1142;1143および1144;1145および1146;1147および1148;1149および1150;1151および1152;1153および1154;1155および1156;1157および1158;1159および1160;1161および1162;1163および1164;1165および1166;1167および1168;1169および1170;1171および1172;1173および1174;1175および1176;1177および1178;1179および1180;1181および1182;1183および1184;1185および1186;1187および1188;1189および1190;1191および1192;1193および1194;1195および1196;1197および1198;1199および1200;1201および1202;1203および1204;1205および1206;1207および1208;1209および1210;1211および1212;1213および1214;1215および1216;1217および1218;1219および1220;1221および1222;1223および1224;1225および1226;1227および1228;1229および1230;1231および1232;1233および1234;1235および1236;1237および1238;1239および1240;1241および1242;1243および1244;1245および1246;1247および1248;1249および1250;1251および1252;1253および1254;1255および1256;1257および1258;1259および1260;1261および1262;1263および1264;1265および1266;1267および1268;1269および1270;1271および1272;1273および1274;1275および1276;1277および1278;1279および1280;1281および1282;1283および1284;1285および1286;1287および1288;1289および1290;1291および1292;1293および1294;1295および1296;1297および1298;1299および1300;1301および1302;1303および1304;1305および1306;1307および1308;1309および1310;1311および1312;1313および1314;1315および1316;1317および1318;1319および1320;1321および1322;1323および1324;1325および1326;1327および1328;1329および1330;1331および1332;1333および1334;1335および1336;1337および1338;1339および1340;1341および1342;1343および1344;1345および1346;1347および1348;1349および1350;1351および1352;1353および1354;1355および1356;1357および1358;1359および1360;1361および1362;1363および1364;1365および1366;1367および1368;1369および1370;1371および1372;1373および1374;1375および1376;1377および1378;1379および1380;1381および1382;1383および1384;1385および1386;1387および1388;1389および1390;1391および1392;1393および1394;1395および1396;1397および1398;1399および1400;1401および1402;1403および1404;1405および1406;1407および1408;1409および1410;1411および1412;1413および1414;1415および1416;1417および1418;1419および1420;1421および1422;1423および1424;1425および1426;1427および1428;1429および1430;1431および1432;1433および1434;1435および1436;1437および1438;1439および1440;1441および1442;1443および1444;1445および1446;1447および1448;1449および1450;1451および1452;1453および1454;1455および1456;1457および1458;1459および1460;1461および1462;1463および1464;1465および1466;1467および1468;1469および1470;1471および1472;1473および1474;1475および1476;1477および1478;1479および1480;1481および1482;1483および1484;1485および1486;1487および1488;1489および1490;1491および1492
;1493および1494;1495および1496;1497および1498;1499および1500 ;1501および1502;1503および1504;1505および1506;1507および1508
;1509および1510;1511および1512;1513および1514;1515および1516 ;1517および1518;1519および1520;1521および1522;1523および1524
;1525および1526;1527および1528;1529および1530;1531および1532 ;1533および1534;1535および1536;1537および1538;1539および1540
;1541および1542;1543および1544;1545および1546;1547および1548 ;1549および1550;1551および1552;1553および1554;1555および1556
;1557および1558;1559および1560;1561および1562;1563および1564 ;1565および1566;1567および1568;1569および1570;ならびに1571および1572のうちの1対を含み、好ましくはIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、二本鎖siRNAである。
本発明のさらなる態様は、2本の鎖が、配列番号1573および1574;1575および1576;ならびに1577および1578のうちの1対を含む二本鎖siRNAである。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための本明細書に記載のsiRNAである。
本発明のさらなる態様は、上記siRNAの少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである、本明細書に記載のsiRNAである。
本発明のさらなる態様は、上記siRNAの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている本明細書に記載のsiRNAである。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のsiRNAを投与する工程を含む、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のsiRNAを投与する工程を包む、患者におけるCCR3ケモカンレセプター発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のsiRNAを投与する工程を包む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現もしくはCCR3ケモカインレセプター発現を低下させるため、または喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/もしくは予防するための本明細書に記載のsiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるため;またはCCR3ケモカインレセプター発現を低下させるため;または喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/もしくは予防するための薬剤の調製における本明細書に記載のsiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、配列番号:1634および1635;1636および1637;1638および1639;1640および1641;1642および1643;1644および1645;1646および1647;1648;1649および1650;1651および1652;1653および1654;1655および1656;1657および1658;1659;1660;1661;1662;1663;1664;1665;1666および1667;1668および1669;1670および1671;1672および1673;1674および1675;1676および1677;1678;1679および1680;1681および1682;1683および1684;1685および1686;1687および1688;1689および1690;1691および1692;1693;1694;1695および1696;1697;1698;1699および1700;1701;1702および1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710;1711;1712および1713;1714および1715;1716;1717および1718;1719;1720および1721;1722および1723;1724;1725および1726;1727;1728;1729および1730;1731および1732;1733および1734;1735;1736;1737;1738および1739;1740および1741;1742;1743および1744;1745;1746および1747;1748および1749;1750および1751;1752;1753;1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761および1762;1763;1764および1765;1766;1767および1768;1769;1770;1771;1772;1773;1774および1775;1776;1777;および1778からなる群より選択される1対のオリゴヌクレオチドまたは単一のオリゴヌクレオチドを含み、好ましくはIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下するための、miRNAである。
本発明のさらなる態様は、上記miRNAの少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである、本明細書に記載のmiRNAである。
本発明のさらなる態様は、上記miRNAの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている、本明細書に記載のmiRNAである。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のmiRNAを投与する工程を包む、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のmiRNAを投与する工程を包む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるため、あるいは喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、本明細書に記載のmiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための;あるいは喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための薬剤の調製における、本明細書に記載のmiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つのヌクレオチドが2’−デオキシ−2’−フルオロアラビノヌクレオチド(FANA)であり、高度にストリンジェントな条件下でCCR3ケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列とハイブリダイズし得るAONである。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つのアデノシンが2’−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換されていて、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のサブユニットをコードする核酸配列と高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るAONである。
本発明のさらなる態様は、(a)肺および低い毒性が求められる部位に対する投与用のオリゴヌクレオチドを特定する工程と;(b)少なくとも1つの非FANAヌクレオチドを対応するFANAヌクレオチドで置き換える工程、および/または少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドを2−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換する工程とを含む、哺乳動物に対して投与されるオリゴヌクレオチドの治療有効性対毒性比を改善するための方法である。好ましくは、哺乳動物に対するこの得られたオリゴヌクレオチドの投与が、未修飾のオリゴヌクレオチドの投与に比較して力価の増強および/または毒性の低下を生じさせる。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合がリン酸ジエステル結合およびホスホロチオエート結合の両方を含み、高度にストリンジェントな条件下でCCR3ケモカインレセプター、ならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列とハイブリダイズし得るAONである。
図1は、β鎖のmRNA発現を低下させるAON配列の有効性を示す。図1aは、AONの配列、TOP057(配列番号8)からTOP073(配列番号24)までの有効性を示す。TF−1細胞(668nM)または293−/βc−GFP細胞(267nM)を24時間トランスフェクトして、β鎖のmRNA発現レベルをQuantigeneを用いて定量した。結果は、トランスフェクトされてないコントロール細胞と比較したβ鎖mRNAの阻害(β2Mに対して正規化)の平均の割合±SEM(TF−1細胞株中での2つの実験および293−CCR3−GFP細胞株中での2つの実験を合わせたもの)として表す。AONの配列TOP057(配列番号8)、TOP062(配列番号13)およびTOP063(配列番号14)の比活性を、図1bの293−βc−GFP細胞(267nM)そして;図1cのTF−1細胞(500nM)において、対応するセンスのコントロール配列(TOP057s(配列番号1779)、TOP062s(配列番号1780)およびTOP063s(配列番号1781))と比較した。細胞を24時間トランスフェクトして、β鎖mRNAの発現レベルをQuantigeneを用いて定量した。結果を正規化した比β鎖/β2M±SEMとして表した。対応するセンスのコントロールAONに対するβ鎖のmRNAの阻害割合を示す。統計学的分析をANOVA検定(ダネット事後検定,n=3,**p<0.01)を用いて行った。 図2は、CCR3のmRNA発現の低下におけるAON配列の有効性を示す。図2aは、AONの配列のTOP020(配列番号673)からTOP045(配列番号698)までの有効性を示す。TF−1細胞(668nM)または293−CCR3−GFP細胞(267nM)を、示したAON類でトランスフェクトした。トランスフェクション24時間後のCCR3のmRNA発現レベルをQuantigeneを用いて定量した。結果を、非トランスフェクトのコントロールの細胞と比較して、CCR3 mRNA発現阻害の平均割合±SEM(TF−1での2つの実験、および293−CCR3−GFP細胞での4つの実験を合わせたもの)として示す。図2bは、293−CCR3−GFP細胞(267nM)で、対応するセンスのコントロール配列(TOP030s(配列番号1782)およびTOP031s(配列番号1783))に比較したAONの配列TOP030(配列番号683)およびTOP031(配列番号684)の比活性を示す。図2cは、TF−1細胞で得られた同様の結果を示す(668nM)。細胞をトランスフェクトして、トランスフェクション24時間後のCCR3のmRNA発現レベルをQuantigeneを用いて定量した。結果を、平均±SEM正規化比CCR3/β2M±SEMとして表す。対応するセンスのコントロールAONに対するCCR3のmRNA発現の阻害割合を示す。統計学的分析をANOVA検定(ダネット事後検定,n=3,**p<0.01)を用いて行った。 図3は、β鎖のmRNA発現レベル低下におけるsiRNAの有効性を示す。図3aは、0.04、0.12および0.24μMという用量でトランスフェクション24時間後の293−βc−GFP細胞におけるβ鎖のmRNA発現の低下でのsiRNA配列の有効性を示す。図3bおよび図3cは、TF−1細胞におけるβ鎖のmRNA発現レベルの低下に対するβ鎖のAON(TOP062(配列番号13))およびsiRNA配列の有効性を比較する。用量反応実験では、細胞を、示したAONまたはsiRNAを0.25μM、0.5μMおよび1μMの用量で用いてトランスフェクトした(図3b)。経時変化観察のために、細胞を1μMの示したAONまたはsiRNAでトランスフェクトして、β−鎖のmRNA発現定量を、Quantigeneアッセイを用いてトランスフェクションの24、48または72時間後に行った(図3c)。結果は、β2Mコントロール遺伝子RLUに対して正規化したβ鎖の相対発光量(relative luminescence units)(RLU)の平均比(±SEM)として表す。統計学的分析を、一元ANOVA、続いてダネット事後検定を用いて、コントロールの参照としてTOP062(配列番号13)を用いて行った(*p<0.05,**p<0.01,n=3 条件ごとに繰り返す)。 図4は、CCR3のmRNA発現レベルの低下でのsiRNA配列の有効性を示す。図4aは、293−CCR3−GFP細胞でのトランスフェクション後のCCR3のmRNA発現レベル低下でのsiRNAの有効性を示す。細胞を、0.04μM〜0.24μMにおよぶ用量でsiRNAを用いてトランスフェクトして、CCR3のmRNA発現をトランスフェクションの24時間後に決定した。図4bは、293−CCR3−GFP細胞におけるCCR3のmRNA発現レベルの低下において、示したAONおよびsiRNA配列の有効性を比較する。293−CCR3−GFP細胞を示したAONまたはsiRNAを用いて300nMの濃度でトランスフェクトして、CCR3のmRNA発現の定量をトランスフェクションの24、48または72時間後に行った。総RNAをトランスフェクトされた細胞から抽出し、精製して、Quantigeneアッセイを用いてCCR3のmRNA定量に供した。結果は、β2Mコントロール遺伝子RLUに対して正規化したCCR3の相対発光量(RLU)の平均比(±SEM)として表す。統計学的分析を、一元ANOVA、続いてダネット事後検定を用いて、コントロールの参照としてTOP030(配列番号683)を用いて行った(*p<0.05,**p<0.01,n=3 条件ごとに繰り返す)。 図5は、β鎖またはCCR3タンパク質発現の低下での選択されたAON配列の有効性を示す。細胞を、示したAON類またはそれらのコントロールのセンス配列でトランスフェクトして(267nMのAONを、293−βc−GFPおよび293−CCR3−GFP細胞へトランスフェクトした;667nMのAONを、TF−1細胞中にトランスフェクトした)、タンパク質レベルを、トランスフェクションの24時間後のフローサイトメトリーによって分析した。図5aおよび図5cでは、結果を、それぞれ、βc−GFPおよびCCR3−GFPタンパク質の発現について陽性の293−βc−GFPおよび293−CCR3−GFP細胞の平均の割合±SEMとして表す。図5bおよび5dでは、結果を、TF−1細胞における、それぞれβ鎖およびCCR3タンパク質発現の平均中央蛍光強度(average mean fluorescence intensity)(MFI)±SEMとして表す。対応するセンスコントロールAONに対する標的タンパク質発現の阻害の割合を示す。統計学的分析は、対応のないt検定を用い、n=3、および**p<0.01、***p<0.001を用いて行った。 図6は、それぞれ、β鎖(293−/βc−GFP細胞)およびCCR3(TF−1細胞)のタンパク質レベルの低下でのFANA−含有TOP062(配列番号13)およびTOP030(配列番号683)のAON類の有効性を示す。293−βc−GFP細胞を200nMのAONでトランスフェクトし、一方TF−1細胞は、668nMのAONでトランスフェクトした。タンパク質発現レベルは、トランスフェクション24時間後のフローサイトメトリーによって測定した。結果は、β鎖(図6a)およびCCR3(図6b)のタンパク質発現について陽性の細胞の主要な割合±SEMとして表す。統計学的分析は、ANOVA検定(ダネット事後検定)を用い、n=3または4で、*p<0.05および**p<0.01で行った。 図7は、FANA−含有TOP062(配列番号13)(図7a)およびTOP030(配列番号683)(図7b)のAON類の血清安定性の増大を示す。AON類を50%のウシ胎仔血清を含有するDMEM中、37℃でインキュベートした。サンプルを種々の時点で収集して、陰イオン交換HPLCを用いて分析した。残っているインタクトなAONの割合を、0時間の時点のピーク面積を100%に設定した値に対して対応するピーク面積を比較することによって決定した。 図8は、CCR3発現に対するTOP062−F8(配列番号1588)(β鎖 AON)、およびβ鎖発現に対するTOP030−F2(配列番号1600)(CCR3 AON)の交差標的効果を示す。TF−1細胞は、167nMまたは668nMの濃度でいずれかのAONを単独で用いてトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、細胞を、CCR3(図8aおよび図8b)およびβ鎖(図8cおよび8d)のmRNAおよびタンパク質の発現レベルについて分析した。mRNA発現レベルの結果は、正規化比のCCR3/β2Mまたはβ鎖/β2Mの平均±SEMとして示すが、タンパク質発現の結果は、CCR3またはβ鎖タンパク質を発現する細胞の平均の割合±SEMとして示す。 図9は、CCR3(図9a)およびβ鎖(図9b)のタンパク質発現に対するTOP62−F8(配列番号1588)およびTOP30−F2(配列番号1600)(TPI2200)のAON類の交差標的効果を示す。TF−1細胞を668nMの濃度で示したAONの配列を用いてトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、タンパク質発現レベルをフローサイトメトリーによって測定した。結果を平均蛍光強度として表した(MFI±SEM)。 図10は、CCR3およびβ鎖のmRNAおよびタンパク質発現の阻害に対する、TOP062−F8(配列番号1588)およびTOP030−F2(配列番号1600)を単独でまたは組み合わせての有効性を示す。TF−1細胞を、AONを単独(334nMまたは668nM)でまたは組み合わせて用いて(各々のAONが334nM)トランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、CCR3(図10aおよび10b)およびβ鎖(図10cおよび10d)のmRNAおよびタンパク質のレベルを定量した。mRNA発現の結果は、正規化比CCR3/β2Mまたはβ鎖/β2Mの平均±SEMとして示すが、タンパク質発現の結果は、CCR3またはβ鎖タンパク質を発現する細胞の平均の割合±SEMとして示す。トランスフェクトされてないコントロールの細胞に対する発現阻害の割合を示す。統計学的分析は、対応のないt検定を用いて、n=3,*p<0.05および**p<0.01で行った。 図11は、ラットCCR3のmRNA発現レベルの低下でのFANA−含有TOP007(配列番号1628)AONの活性を示す。NIH−3T3細胞は、ラットのCCR3のcDNA(pCMVscriptラットCCR3)を含む0.2μgの発現プラスミド、および0.2μgの示されたAONを用いて同時トランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、CCR3のmRNA発現レベルを定量した。トランスフェクション後のCCR3のmRNA発現レベルは、コントロールプラスミド(pGL2−Luciferase)の発現レベルに対して正規化した。その結果を、ミスマッチのコントロールのAONを発現する細胞での対応するmRNA発現阻害レベルに対してCCR3のmRNAの発現阻害の割合として表す。 図12は、感作されたBNラットの肺へのアレルゲン誘導性エオシノフィル流入に対する、同じAON(それぞれ、TOP006−F2(配列番号1627)およびTOP007−F8(配列番号1629))をFANAで修飾したものの組み合わせに対するラットβ鎖(TOP006(配列番号1626))およびCCR3(TOP007(配列番号1628))を標的するAONの組み合わせの効果の比較を示す。OVA感作の14日後、OVAチャレンジの前に示したとおり、媒体または25μgの各々のAONの組み合わせ(1個体あたり全部で50μg)の単回の気管内投与を用いて非チャレンジにするかまたは処置した。ラットをOVAチャレンジの15時間後に屠殺し、BAL液からの異なる細胞計数を行った。データは3つの別の実験からの平均の総細胞数+/−SEMを示す。一元ANOVAに続くダネットの多重比較検定(対ビヒクル処置およびOVAチャレンジ)(*p<0.05;**p<0.01);1群あたりn=14〜23のラット。 図13は、長期間の投薬後のげっ歯類(マウスおよびラット)のおよびサルの肺における泡沫状マクロファージの出現割合に対する、FANA修飾AON類(TPI1100)対非FANA修飾AON類(TPI ASM8)の効果の比較を示す。 図14は、Quantigeneを用いて決定されたβ鎖mRNA発現レベルの低下での同じAON(それぞれ、TOP062−DAP(配列番号1621)、TOP057−DAP(配列番号1622)、TOP073−DAP(配列番号1623)およびTOP077−DAP(配列番号1624))のDAP修飾バージョンの有効性に対する、β−鎖を標的する選択AON類(TOP062(配列番号13)、TOP057(配列番号8)、TOP073(配列番号24)およびTOP077(配列番号28))の有効性の比較を示す。293−βc−GFP細胞は、267nMのAONでトランスフェクトして、トランスフェクション24時間後のRNAを抽出して、β鎖のmRNA発現レベルを定量した。mRNA発現レベルは、正規化比β鎖/β2Mの平均±SDとして示す。統計的な分析を、負のコントロールであるオリゴヌクレオチドTOP4005(配列番号1784)に対して1元ANOVAを用いて行った;**p<0.01,n=3。 図15は、β鎖mRNAおよびタンパク質発現のレベルの低下での選択されたmiRNAミミック配列TOP5120(配列番号:1636および1637)、TOP5121(配列番号:1638および1639)、TOP5122(配列番号:1640および1641)、TOP05123(配列番号:1642および1643)およびTOP5124(配列番号:1644および1645)の有効性を示す。TF−1細胞を、0.5または1μMのmiRNAでトランスフェクトした。トランスフェクション24時間後の発現レベルを決定した。図15aおよび図15bは、それぞれβ鎖のmRNA発現およびタンパク質発現のレベルの低下でのmiRNA模倣配列の有効性の比較を示す。mRNA発現レベルの結果は、正規化比β鎖/β2Mの平均±SDとして示す(図15a)が、タンパク質発現の結果は、β鎖タンパク質を発現する細胞の平均割合±SDとして示される(図15b)。統計的分析は、未処理の細胞(コントロールNT)に対して1元ANOVAを用いて行った;** p<0.01,n=3−6。
表の簡単な説明
表1a−1rは、本発明によるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット(β鎖)に特異性を有するAON配列を示す。
表1sは、本発明によるCCR3ケモカインレセプターに対する特異性を有するAON配列を示す。
表2a−2sは、本発明によるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット(β鎖)に対してデザインされたsiRNA配列を示す。
表2tは、本発明によるCC3ケモカインレセプターに対してデザインされたsiRNAを示す。
表3aは、本発明によるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット(β鎖)に対する特異性を有するFANA修飾を含むAON配列を示す。
表3bは、本発明によるCCR3ケモカインレセプターに対する特異性を有するFANA修飾を有するAON配列を示す。
表3cは、本発明によるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット(β鎖)に対する特異性を有するDAP修飾を含むAON配列を示す。
表4は、本発明によるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターのラットの共通のβサブユニット(β鎖)ならびにラットCCR3ケモカインレセプターに対する特異性を有するAON配列を示す。
表5は、2’F−ANA修飾AON類(TPI1100)または非2’F−ANA修飾AON類(TPIASM8)で処置されたサルの肺における主な処置関連の組織病理学的変化を示す。
表6は、AON配列TPI1100およびTPIASM8を示す。
表7a−7dは、本発明によるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット(β鎖)に対する特異性を有するmiRNAミミック配列を示す。
表8は、その各々が、実験に依存する方法でコントロールとして用いられる、センスオリゴヌクレオチド配列TOP057s(配列番号:1779)、TOP062s(配列番号:1780)、TOP063s(配列番号:1781)、TOP030s(配列番号:1782)、およびTOP031s(配列番号:1783)、ならびに非特異的なアンチセンスオリゴヌクレオチド配列TOP4005(配列番号:1784)を示す。
発明の詳細な説明
いくつかの炎症性メディエータ類は、喘息のある患者の気道において、炎症の出現および永続化にある役割を果たしている。いくつかのメディエータ類は、好酸球の走化性を通じて気道中に炎症性細胞を誘引する。これらのケモカイン類の多くは主として、CCR3レセプターを通じて喘息性炎症またはアレルギー性炎症において作用する。IL−3、IL−5、およびGM−CSFなどの他のメディエータ類は、気道または皮膚における炎症性細胞のプライミングをおよび生存の増大を引き起こす。気道中のこれらの炎症性メディエータ類が減少する場合、喘息の改善が示された。
さらに、不死化細胞の異常増殖により特徴づけられる癌は、レセプターを通して作用して細胞増殖を引き起こす、炎症性メディエータ類および/または成長因子の放出により、引き起こされる場合がある。これらの中でも、GM−CSFは、いくつかの腫瘍細胞にとっての重要な成長因子であることが示されている。ケモカインレセプターCCR3は、慢性リンパ球性白血病(CLL)を有し、かつヘアリー細胞白血病(HCL)を有する患者から回収された悪性Bリンパ球に特徴的であった(Trentin et al.,2004,Blood,104,502〜508)。実際、CCR3を通じたEGFRのトランス活性化は、気管上皮細胞におけるMAPキナーゼ活性化およびサイトカイン産生を引き起こす重要な経路であることが見いだされた(Adachi et al.,2004,Biochem.Biophys.Res.Commun.320,292〜396)。成長因子またはケモカインレセプターCCR3についてのレセプターをブロックすることによる癌性細胞の増殖および転移の抑制は、特定のガンの治療において重要である場合がある。
本発明の一態様は、i)配列番号1から698のうちのいずれか1つに対応する塩基配列を有し、かつ(ii)配列番号1から698のいずれか1つの修飾オリゴヌクレオチド、のうちの1つである、CCR3ケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列に対するオリゴヌクレオチドである。
好ましくは、上記オリゴヌクレオチドは配列番号1から698のいずれか1つに対応する塩基配列を有し、好ましくは配列番号1から698のいずれか1つのオリゴヌクレオチドである。
好ましくは、少なくとも1つのアデノシンは、2−アミノ−2’−デオキシアデノシンおよびアナログからなる群より選択されるヌクレオチド置換基で置換される。好ましくは、2−アミノ−2’−デオキシアデノシン類縁体としては、2,6−ジアミノ−デオキシアデノシンヘミ硫酸塩、2−アミノ−9−(β−D−2’−デオキシリボフラノシル)アデノシン、7−デアザ−2’−デオキシアデノシン、N6−メチル−2’−デオキシリボフラノシルアデノシン、2−アミノアデノシン/2,6−ジアミノプリンリボシド、塩およびその官能性誘導体が挙げられる。
好ましくは、上記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオチドは、アラビノース修飾ヌクレオチドであり、好ましくは、フッ素、ヒドロキシル、アミノ、アジド、アルキル、アルコキシ、およびアルコキシアルキル基からなる群より選択される2’置換基を有する。好ましくは、このアルキル基は、メチル、エチル、プロピル、ブチル、および官能性アルキル基類からなる群より選択され、このアルコキシ基は、メトキシ、エトキシ、プロポキシおよび官能性アルコキシ基類からなる群より選択され、このアルコキシアルキル基はメトキシエチル、およびエトキシエチルからなる群より選択される。
好ましくは、上記官能性アルキル基は、エチルアミノ、プロピルアミノおよびブチルアミノ基からなる群より選択され、この官能性アルコキシ基は−O(CH−Rからなる群より選択され、ここでq=2〜4であり、かつ−Rは−NH、−OCH、または−OCHCH基である。
好ましくは、上記アラビノース修飾ヌクレオチドは2’−デオキシ−2’−フルオロアラビノヌクレオチド(FANA)である。
いくつかの実施形態では、上記少なくとも1つのアラビノース修飾ヌクレオチドはオリゴヌクレオチドの5’末端もしくは3’末端;またはその両方の末端である。
いくつかの実施形態では、上記オリゴヌクレオチドは、このオリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端で独立して1〜7個のアラビノース修飾ヌクレオチドを有する。好ましくは、このオリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に独立して1〜6、1〜5、1〜4または1〜3個のアラビノース修飾ヌクレオチドがある。
いくつかの実施形態では、このオリゴヌクレオチドは、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、ホスホロチオエート、メチルホスホネート,ボラノホスホネートおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される少なくとも1つのヌクレオチド間結合を含む。好ましくは、このオリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートまたはリン酸ジエステルオリゴヌクレオチド、またはホスホロチオエートおよびホリン酸エステル結合の組み合わせを有するオリゴヌクレオチドである。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載される少なくとも1つのオリゴヌクレオチドおよび薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物である。
本発明のさらなる態様は、患者に対して本明細書に記載される薬学的組成物を投与する工程を含み、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法である。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための本明細書に記載の薬学的組成物の用途である。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための薬剤の調製における本明細書に記載の薬学的組成物の用途である。
本発明のさらなる態様は、患者に対して本明細書に記載のオリゴヌクレオチドを投与する工程を包み、該オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットの発現を低下するための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットの発現を低下させる薬剤の調製における、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットの発現を低下させための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドである。
本発明のさらなる態様は、塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドを投与する工程を包む、患者におけるCCR3ケモカインレセプター発現を低下するための方法である。
本発明のさらなる態様は、CCR3ケモカインレセプター発現を低下するための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途でる。
本発明のさらなる態様は、CCR3ケモカインレセプター発現を低下させる薬剤の調製における、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673〜698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドの用途である。
本発明のさらなる態様は、CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する本明細書に記載のオリゴヌクレオチドである。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための;患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための(配列番号1から672のうちの1つを有するオリゴヌクレオチドの塩基配列);患者においてCCRケモカインレセプター発現を低下させための(配列番号673から698のうちの1つを有するオリゴヌクレオチドの塩基配列)、本明細書に記載の薬学的組成物をその使用方法の説明書と一緒に備える商業的パッケージである。
本発明のさらなる態様は2本の鎖が、好ましくは、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるために、配列番号699および700;701および702;703および704;705および706;707および708;709および710;711および712;713および714;715および716;717および718;719および720;721および722;723および724;725および726;727および728;729および730;731および732;733および734;735および736;737および738;739および740;741および742;743および744;745および746;747および748;749および750;752および752;753および754;755および756;757および758;759および760;761および762;763および764;765および766;767および768;769および770;771および772;773および774;775および776;777および778;779および780;781および782;783および784;785および786;787および788;789および790;791および792;793および794;795および796;797および798;799および800;801および802;803および804;805および806;807および808;809および810;811および812;813および814;815および816;817および818;819および820;821および822;823および824;825および826;827および828;829および830;831および832;833および834;835および836;837および838;839および840;841および842;843および844;845および846;847および848;849および850;851および852;853および854;855および856;857および858;859および860;861および862;863および864;865および866;867および868;869および870;871および872;873および874;875および876;877および878;879および880;881および882;883および884;885および886;887および888;889および890;891および892;893および894;895および896;897および898;899および900;901および902;903および904;905および906;907および908;909および910;911および912;913および914;915および916;917および918;919および920;921および922;923および924;925および926;927および928;929および930;931および932;933および934;935および936;937および938;939および940;941および942;943および944;945および946;947および948;949および950;951および952;953および954;955および956;957および958;959および960;961および962;963および964;965および966;967および968;969および970;971および972;973および974;975および976;977および978;979および980;981および982;983および984;985および986;987および988;989および990;991および992;993および994;995および996;997および998;999および1000;1001および1002;1003および1004;1005および1006;1007および1008;1009および1010;1011および1012;1013および1014;1015および1016;1017および1018;1019および1020;1021および1022;1023および1024;1025および1026;1027および1028;1029および1030;1031および1032;1033および1034;1035および1036;1037および1038;1039および1040;1041および1042;1043および1044;1045および1046;1047および1048;1049および1050;1051および1052;1053および1054;1055および1056;1057および1058;1059および1060;1061および1062;1063および1064;1065および1066;1067および1068;1069および1070;1071および1072;1073および1074;1075および1076;1077および1078;1079および1080;1081および1082;1083および1084;1085および1086;1087および1088;1089および1090;1091および1092;1093および1094;1095および1096;1097および1098;1099および1100;1101および1102;1103および1104;1105および1106;1107および1108;1109および1110;1111および1112;1113および1114;1115および1116;1117および1118;1119および1120;1121および1122;1123および1124;1125および1126;1127および1128;1129および1130;1131および1132;1133および1134;1135および1136;1137および1138;1139および1140;1141および1142;1143および1144;1145および1146;1147および1148;1149および1150;1151および1152;1153および1154;1155および1156;1157および1158;1159および1160;1161および1162;1163および1164;1165および1166;1167および1168;1169および1170;1171および1172;1173および1174;1175および1176;1177および1178;1179および1180;1181および1182;1183および1184;1185および1186;1187および1188;1189および1190;1191および1192;1193および1194;1195および1196;1197および1198;1199および1200;1201および1202;1203および1204;1205および1206;1207および1208;1209および1210;1211および1212;1213および1214;1215および1216;1217および1218;1219および1220;1221および1222;1223および1224;1225および1226;1227および1228;1229および1230;1231および1232;1233および1234;1235および1236;1237および1238;1239および1240;1241および1242;1243および1244;1245および1246;1247および1248;1249および1250;1251および1252;1253および1254;1255および1256;1257および1258;1259および1260;1261および1262;1263および1264;1265および1266;1267および1268;1269および1270;1271および1272;1273および1274;1275および1276;1277および1278;1279および1280;1281および1282;1283および1284;1285および1286;1287および1288;1289および1290;1291および1292;1293および1294;1295および1296;1297および1298;1299および1300;1301および1302;1303および1304;1305および1306;1307および1308;1309および1310;1311および1312;1313および1314;1315および1316;1317および1318;1319および1320;1321および1322;1323および1324;1325および1326;1327および1328;1329および1330;1331および1332;1333および1334;1335および1336;1337および1338;1339および1340;1341および1342;1343および1344;1345および1346;1347および1348;1349および1350;1351および1352;1353および1354;1355および1356;1357および1358;1359および1360;1361および1362;1363および1364;1365および1366;1367および1368;1369および1370;1371および1372;1373および1374;1375および1376;1377および1378;1379および1380;1381および1382;1383および1384;1385および1386;1387および1388;1389および1390;1391および1392;1393および1394;1395および1396;1397および1398;1399および1400;1401および1402;1403および1404;1405および1406;1407および1408;1409および1410;1411および1412;1413および1414;1415および1416;1417および1418;1419および1420;1421および1422;1423および1424;1425および1426;1427および1428;1429および1430;1431および1432;1433および1434;1435および1436;1437および1438;1439および1440;1441および1442;1443および1444;1445および1446;1447および1448;1449および1450;1451および1452;1453および1454;1455および1456;1457および1458;1459および1460;1461および1462;1463および1464;1465および1466;1467および1468;1469および1470;1471および1472;1473および1474;1475および1476;1477および1478;1479および1480;1481および1482;1483および1484;1485および1486;1487および1488;1489および1490;1491および1492
;1493および1494;1495および1496;1497および1498;1499および1500 ;1501および1502;1503および1504;1505および1506;1507および1508
;1509および1510;1511および1512;1513および1514;1515および1516 ;1517および1518;1519および1520;1521および1522;1523および1524
;1525および1526;1527および1528;1529および1530;1531および1532 ;1533および1534;1535および1536;1537および1538;1539および1540
;1541および1542;1543および1544;1545および1546;1547および1548 ;1549および1550;1551および1552;1553および1554;1555および1556
;1557および1558;1559および1560;1561および1562;1563および1564 ;1565および1566;1567および1568;1569および1570;ならびに1571および1572のうちの1対を含む、二本鎖siRNAである。
本発明のさらなる態様は、2本の鎖が、好ましくは、CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるため、配列番号1573および1574;1575および1576;ならびに1577および1578のうちの1対を含む、二本鎖siRNAである。
本発明のさらなる態様は、上記siRNAの少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである、本明細書に記載のsiRNAである。
本発明のさらなる態様は、上記siRNAの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている本明細書に記載のsiRNAである。
本発明のさらなる態様は、喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための本明細書に記載のsiRNAである。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のsiRNAを投与する工程を包む、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のsiRNAを投与する工程を包む、患者におけるCCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のsiRNAを投与する工程を包む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現もしくはCCR3ケモカインレセプター発現を低下させるため、または喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/もしくは予防するための本明細書に記載のsiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるため;またはCCR3ケモカインレセプター発現を低下するため;または喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/もしくは予防するための薬剤の調製における本明細書に記載のsiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、好ましくはIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるために、配列番号:1634および1635;1636および1637;1638および1639;1640および1641;1642および1643;1644および1645;1646および1647;1648;1649および1650;1651および1652;1653および1654;1655および1656;1657および1658;1659;1660;1661;1662;1663;1664;1665;1666および1667;1668および1669;1670および1671;1672および1673;1674および1675;1676および1677;1678;1679および1680;1681および1682;1683および1684;1685および1686;1687および1688;1689および1690;1691および1692;1693;1694;1695および1696;1697;1698;1699および1700;1701;1702および1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710;1711;1712および1713;1714および1715;1716;1717および1718;1719;1720および1721;1722および1723;1724;1725および1726;1727;1728;1729および1730;1731および1732;1733および1734;1735;1736;1737;1738および1739;1740および1741;1742;1743および1744;1745;1746および1747;1748および1749;1750および1751;1752;1753;1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761および1762;1763;1764および1765;1766;1767および1768;1769;1770;1771;1772;1773;1774および1775;1776;1777;および1778からなる群より選択される1対のオリゴヌクレオチドまたは1つのオリゴヌクレオチドを含む、二本鎖または一本鎖のmiRNAである。
本発明のさらなる態様は、miRNAの少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである、本明細書に記載のmiRNAである。
本発明のさらなる態様は、miRNAの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている、本明細書に記載のmiRNAである。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のmiRNAを投与する工程を包む、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法である。
本発明のさらなる態様は、本明細書に記載のmiRNAを投与する工程を包含む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるため、あるいは喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、本明細書に記載のmiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための;あるいは喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための薬剤の調製における、本明細書に記載のmiRNAの用途である。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つのヌクレオチドが2’−デオキシ−2’−フルオロアラビノヌクレオチド(FANA)であり、CCRケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列と高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るAONである。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドが2’−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換されている、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のサブユニットのタンパク質をコードする核酸配列と高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るAONである。
本発明のさらなる態様は、(a)肺および低い毒性が求められている部位に対する投与用のオリゴヌクレオチドを特定する工程と;(b)少なくとも1つの非FANAヌクレオチドを対応するFANAヌクレオチドで置き換える工程、および/または少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドを2−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換する工程とを包む、哺乳動物に対して投与されるオリゴヌクレオチドの治療有効性対毒性比を改善するための方法である。好ましくは、哺乳動物に対するこの得られたオリゴヌクレオチドの投与は、未修飾のオリゴヌクレオチドの投与に比較してオリゴヌクレオチドの力価の増強および/または毒性の低下を生じる。
本発明のさらなる態様は、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合がリン酸ジエステル結合およびホスホロチオエート結合の両方を含み、CCR3ケモカインレセプター、ならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列と高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズし得るAONである。
従って、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通βサブユニット、ならびにCCR3レセプターに対するAON、ならびにそれらをコードする核酸に対するAONが提供される。オリゴヌクレオチドを薬学的に許容される担体とともに含む薬学的組成物もまた、提供される。オリゴヌクレオチドの用途、ならびに喘息、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症、および癌の少なくとも1つを治療および/または予防するためにオリゴヌクレオチドを投与する工程を包む方法が、記載される。
「核酸」および「核酸分子」という用語は、本明細書中では交換可能に使用され、ヌクレオチドからなる分子、すなわちリボヌクレオチド、デオキシリボヌクレオチド、またはその両方のことを指す。この用語には、ポリマーの場合には、5’から3’への結合を通じて互いに連結されている、リボヌクレオチドおよびデオキシリボヌクレオチドとリボヌクレオチドおよび/またはデオキシリボヌクレオチドとのモノマーおよびポリマーが包含される。しかしながら、結合には、例えば、5’から2’への結合を含む核酸を含む、核酸合成技術において公知の任意の結合が含まれ得る。核酸分子中で用いられるヌクレオチドは、天然に存在するものであってもよいし、または天然に存在する塩基対と塩基対合関係を形成し得る合成的に生成された類縁体であってもよい。
「塩基」としては、天然に存在するプリンおよびピリミジン塩基、アデニン(A)、チミン(T)、シトシン(C)、グアニン(G)およびウラシル(U)のうちのいずれか1つが挙げられるが、またその任意の修飾型または類縁型も挙げられる。塩基対を形成することができる天然には存在しない塩基の例としては、限定するものではないが、アザおよびデアザピリミジンのアナログ、アザおよびデアザプリンの類縁体、ならびに他の複素環式塩基アナログであって、プリン環およびピリミジン環の1つ以上の原子および/または官能基がヘテロ原子、例えば、炭素、フッ素、窒素、酸素、硫黄などによって置換されているものが挙げられる。好ましくは、このような塩基としては、イノシン、5−メチルシトシン、2−チオチミン、4−チオチミン、7−デアザアデニン、9−デアザアデニン、3−デアザアデニン、7−デアザグアニン、9−デアザグアニン、6−チオグアニン、イソグアニン、2,6−ジアミノプリン、ヒポキサンチン、および6−チオヒポキサンチンが挙げられるが、これらに限定されない。塩基としてはまた、5−フルオロシトシン、5−ブロモシトシン、5−ヨードシトシン、イソシトシン、N−メチルシトシン、5−ヨードウラシル、5−フルオロウラシル、4−チオウラシル、2−チオウラシル、(E)−5−(2−ブロモビニル)ウラシル、N−メチルアデニン、2−クロロアデニン、2−フルオロアデニン、2−クロロアデニン、N6−シクロプロピル−2,6−ジアミノプリン、ニコチンアミド、2−アミノプリン、1,2,4−トリアゾール−3−カルボキサミドを挙げることができるが、これらに限定されない。
本明細書中で用いる場合、「核酸骨格」という用語は、分子中のヌクレオチドを連結する化学的部分の構造のことをいう。この構造としては、化学的に結合したヌクレオチドの任意のかつ全ての手段から形成された構造を挙げることができる。本明細書中で用いる場合、修飾骨格としては、ヌクレオチド間の化学的結合に対する修飾、ならびに安定性および親和性を向上させるために用いられ得る他の修飾、例えば、糖構造に対する修飾が挙げられる。例えば、天然のβ−アノマーに関して塩基が反転している、デオキシリボースのα−アノマーを用いてもよい。好ましい実施形態において、糖の2’−OHを、親和性を含むことなく分解に対する抵抗性を提供する、2’−O−アルキル、R−およびS−固定の2’−O−メチル(R−cMOEおよびS−cMOE)または2’−O−アルキル−n(O−アルキル)に変更してもよい。
本明細書中で用いる場合、「オリゴヌクレオチド」という用語は、約1から約100ヌクレオチド、より好ましくは1から80ヌクレオチド、そしてさらにより好ましくは約4から約35ヌクレオチドを含む核酸分子のことをいう。この核酸分子は、センス鎖、または標的核酸配列の非コード鎖のいずれかに対して対応する可変長の核酸分子を含み得る。
本発明におけるオリゴヌクレオチド化合物には、siRNA(低分子干渉RNA)、およびRNAi(RNA干渉)アプローチの結果として生じる、siRNAを含むRISC(RNA−誘導性サイレンシング複合体)もまた、含まれる。RNAiアプローチは、最近記述されたものであるが、標的遺伝子の発現を阻害するための新たなツールと考えられている。数年前にすでに知られているように、RNAiは、下等真核生物における古くから知られている抗ウィルス防御機構に基づくものである。二本鎖RNAおよびそのプロセッシングにより典型的には21から23残基のsiRNAが誘導されて、それがRISC複合体の補助を伴う一本鎖で標的mRNAにハイブリダイズした後、相同な内在性mRNAの分解を引き起こす。RNAiが標的遺伝子発現を阻害する方法は、完全に解明された訳ではないが、すでにRNAiは線虫、ハエ、植物、真菌、および哺乳動物などの幅広く多様な真核生物種にまたがって機能欠損表現型を生成するために、最初に選択されるアプローチとして役立っている。
本発明におけるオリゴヌクレオチド化合物としてはまた、マイクロRNA(miRNA)も挙げられる。マイクロRNAは、典型的には約21から23ヌクレオチド長の一本鎖RNA分子であり、ハイブリダイゼーションに依存した形で遺伝子発現を調節する。典型的には、miRNAはDNAから転写されるが、タンパク質には翻訳されない遺伝子(非コードRNA)によってコードされ;代わりにmiRNAはpri−miRNAとして公知の一次転写物から、pre−miRNAと呼ばれる短いステム−ループ構造に、最終的には機能的なmiRNAに処理される。成熟miRNA分子は、1つ以上のメッセンジャーRNA(mRNA)分子に対して、代表的にはそのmRNAの3’末端で部分的に相補的であり、それらの主な機能は遺伝子発現を下方制御することである。
本発明におけるオリゴヌクレオチド化合物としてはまた、遺伝子転写および/または遺伝子翻訳をインビトロおよび/またはインビボで阻害することができる、上述した化学的修飾を組み込み得る、リボザイムおよび短いヌクレオチド配列、一本鎖または二本鎖の、RNAまたはDNAが挙げられる。
「修飾オリゴヌクレオチド」および「修飾核酸分子」という用語には、例えば、1つ以上の塩基の挿入、置換または欠失によって、それらの活性に対して有意な悪影響を与えることなく修飾されているオリゴヌクレオチド化合物が包含される。特に、オリゴヌクレオチドが対する遺伝子に対して100%の相補性を示すオリゴヌクレオチドの末端で塩基を付加または欠失させることは一般に、阻害活性を有意に喪失することなく、行うことができる。このような修飾は、活性を増強するため、またはオリゴヌクレオチドの安定性の向上を得るためになされる場合がある。さらに、本発明のオリゴヌクレオチド化合物における1つ以上の塩基の置換は、活性に有害な影響を与えることなく、例えば、プリンを別のプリン(アデニン、グアニン)で置換すること、およびピリミジンをピリミジン(シトシン、チミン、ウラシル)で置換することで行うことができる。本明細書中で用いる場合、修飾オリゴヌクレオチドおよび修飾核酸分子としてはまた、核酸、例としては、核酸塩基、糖部分、ヌクレオシド間リン酸結合のすべてまたはいずれかの天然の分子構造の分子レベルで、1つ以上の化学的修飾を有するオリゴヌクレオチド、ならびに、追加的な置換基、例えば、ジアミン、コレステリル、もしくは他の親油性の基またはこれらの部位で修飾の組み合わせを有する分子が挙げられる。修飾されたヌクレオチドとしては、2−アミノ−2’−デオキシアデノシンおよびアナログからなる群より選択されるヌクレオチド置換を挙げることができる。好ましいアデノシンアナログとしては、2,6−ジアミノアデノシンヘミ硫酸塩、2−アミノ−9−(β−D−2’−デオキシリボフラノシル)アデノシン、7−デアザ−2’−デオキシアデノシン、N6−メチル−2’−デオキシリボフラノシルアデノシン、2−アミノアデノシン/2,6−ジアミノプリンリボシド、塩およびその官能性誘導体が挙げられる。ヌクレオシド間リン酸結合は、リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、ホスホロアミデート、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチルエステル、アセトアミデート、カルバメート、チオエーテル、架橋ホスホラニデート(phosphoranidate)、架橋メチレンホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、架橋ホスホロチオエートおよび/またはスルホンヌクレオチド間結合、または3’−3’結合、2’−5’結合、または5’−5’結合、およびそのような類似の結合の組み合わせ(混合骨格修飾オリゴヌクレオチドを生成するためのもの)であってもよい。修飾は、内部に(単一または繰り返し)、またはオリゴヌクレオチド分子の末端(単数または複数)であってもよく、そしてアミノ基と末端リボース、デオキシリボースおよびリン酸修飾(反対側の鎖または関連する酵素もしくは他のタンパク質を切断するかまたは架橋する)との間に様々な数の炭素残基を有するコレステリル、ジアミン化合物などの、ヌクレオシド間リン酸結合の分子への付加を含んでもよい。リボース−ジアルデヒドなどの親電子基は、そのようなタンパク質のリシル残基のイプシロンアミノ基と共有結合することができる。オリゴマーに対して連結されたn−エチルマレイミドなどの求核性基は、mRNAの5’末端に対して、または別の求電子性部位に対して共有結合し得る。修飾オリゴヌクレオチドという用語はまた、いずれも5’−3’結合を介して互いに連結されている、2置換したリボヌクレオチド、またはデオキシリボヌクレオチドモノマーなどの糖部分に対する修飾を含むオリゴヌクレオチドを包含する。修飾オリゴヌクレオチドはまた、配列の標的特異性を維持しているPNAまたはモルホリノ修飾骨格から構成されてもよい。修飾オリゴヌクレオチドという用語はまた、標的タンパク質の活性を低下させる活性にも、またはその発現を阻害する活性にも有意に悪影響を与えないが、この活性を向上し得るという形態の本明細書に規定されるようなオリゴヌクレオチド化合物を包含する。
修飾オリゴヌクレオチドとしてはまた、、アラビノヌクレオチドまたは修飾アラビノヌクレオチド残基に基づくかまたはそれから構築されるオリゴヌクレオチドが挙げられ、β−アラビノフラノースおよびその類縁体に基づくAON構築物を含むがこれらに限定されない。リボヌクレオチドは、糖環の2’位置における構造のみが異なるリボヌクレオシドの立体異性体である。国際公開第99/67378号パンフレットは、相補的メッセンジャーRNAへの結合を介して、遺伝子発現の配列特異性阻害を改善するための、アラビノ核酸(ANA)オリゴマーおよびそのアナログを開示する。国際公開第99/67378号パンフレットはさらに、その標的RNA配列と二重鎖を形成し、その結果RNase Hのための基質を生じる、糖修飾したオリゴヌクレオチドを教示する。具体的には、β−D−アラビノヌクレオチドおよび2’−デオキシ−2’−フルオロ−β−D−アラビノヌクレオシド(FANAまたは2’F−ANA)を含むオリゴマーが開示されている。国際公開第02/20773号パンフレットは、配列特異的様式で遺伝子転写および発現を阻害するために用いられるオリゴヌクレオチドキメラを開示する。具体的には、国際公開第02/20773号パンフレットは、様々な長さの一連のデオキシリボースヌクレオチド残基に隣接するアラビノヌクレオチドから構築されたAON類を教示する。その様に構築されたAON類を用いて、相補性RNAにハイブリダイズさせてその切断を誘導する。国際公開第03/037909号パンフレットは、内部非環状リンカー残基を有するオリゴヌクレオチドを開示する。非環状リンカーを用いて調製されたAON類を用いて、RNAなどの目的の標的核酸の機能を妨げるかまたは消費させる。国際公開第03/064441号パンフレットは、糖修飾されたヌクレオシドのセグメントと2’デオキシヌクレオチドのセグメントとを交互に有するオリゴヌクレオチドを開示し、そしてまた糖修飾されたヌクレオチドのセグメントと2’デオキシヌクレオチドのセグメントとを交互に有するオリゴヌクレオチドも開示する。これらの交互に存在するセグメントを有するAON類は、RNAなどの目的とする標的核酸の機能を妨げるかまたは消費させるために用いられることが開示されている。
さらに、当業者は、本発明に包含される実質的に類似の核酸配列がまた、中程度にストリンジェントな条件(例えば、0.5×SSC、0.1%のSDS、60℃)下で、本明細書に例示される配列と、または本明細書に開示され、かつ本明細書に開示される任意の核酸配列に対して機能的に等価であるヌクレオチド配列の任意の部分に対してハイブリダイズするその核酸配列の能力によって規定されることを理解する。ストリンジェンシー条件は、関連が遠い生物由来の相同な配列などの中度に類似のフラグメントから密接に関連する生物体由来の機能的な酵素を複製する遺伝子などの高度に類似のフラグメントまで、スクリーニングするために調節されてもよい。ハイブリダイゼーション後の洗浄が、ストリンジェンシー条件を決定する。1つの好ましい条件のセットには、一連の洗浄を含み、これは6×SSC、0.5%のSDSを用いて室温で15分間で開始し、次いで2×SSC、0.5%のSDSを用いて45℃で30分間繰り返し、次いで0.2×SSC、0.5%のSDSを用いて50℃で30分間を2回繰り返す。さらに好ましいセットの高度にストリンジェントな条件は、さらに高温での使用を包含し、ここでは洗浄は、0.2×SSC、0.5%SDS中での最後の2回の30分洗浄の温度が60℃に上昇されたことを除いて上記の洗浄と同じである。極めて高度にストリンジェントな条件の別の好ましいセットは、0.1×SSC、0.1%のSDS中で65℃での2回の最終洗浄の使用を包含する。
「実質的にヌクレアーゼ抵抗性」という用語は、天然に存在する核酸または未修飾核酸と比較した場合、ヌクレアーゼ分解に抵抗性を有する核酸のことをいう。本発明の修飾核酸は、それらの未修飾対応物と比較して、ヌクレアーゼ分解に対して少なくとも1.25倍抵抗性が高く、より好ましくは少なくとも2倍抵抗性が高く、さらに好ましくは少なくとも5倍抵抗性が高く、最も好ましくは、それらの未修飾対応物と比較して、少なくとも10倍抵抗性が高い。その様な実質的にヌクレアーゼ抵抗性の核酸としては、修飾骨格、例えばホスホロチオエート、メチルホスホネート、エチルホスホトリエステル、2’−O−メチルホスホロチオエート、2’−O−メチル−p−エトキシリボヌクレオチド、2’−O−アルキル、2’−O−アルキル−n(O−アルキル)、3’−O−アルキル、3’−O−アルキル−n(O−アルキル)、2’−フルオロ、2’−デオキシ−エリスロペントフラノシル、2’−O−メチルリボヌクレオシド、R−およびS−固定2’−O−メチルリボヌクレオシド(R−cMOEおよびS−cMOE)、メチルカルバメート、およびメチルカーボネート;逆位塩基(例えば、逆向きT)などの修飾塩基を有する核酸;または任意の上記のキメラを有する核酸が挙げられるがこれらに限定されない。
本明細書において用いる場合、「CCR3およびIL−3/IL−5/GM−CSFレセプターについて共通のβ鎖のAON」という用語は、CCR3ケモカインレセプターに特異的な配列およびIL−3/IL−5/GM−CSF−レセプターの共通β鎖を標的とし、かつCCR3ならびにIL−3/IL−5/GM−CSF−レセプターの共通β鎖の発現および/または活性を阻害するオリゴヌクレオチドを指す。これらとしては、限定するものではないが、CCR3ケモカインレセプターおよびIL−3/IL−5/GM−CSFレセプターの共通β鎖、DNAコード配列、DNAプロモータ配列、DNAエンハンサ配列、イントロン−エキソン接合部、5’および3’UTR、mRNAコード配列などが挙げられる。
上で考察したように、本発明の一実施形態は、CCR3ケモカインレセプターおよびIL−3/IL−5/GM−CSFレセプターの共通β鎖の発現および/または活性に影響を与える配列を標的とするAONを提供する。一実施形態において、このAONは、当業者によって理解されるように、オリゴヌクレオチドの構成および/または長さを変化させることができるが、オリゴヌクレオチドが遺伝子発現を下方制御する活性を維持しまたは増強させる、これらの配列のフラグメントまたは改変体を含んでもよい。別の実施形態において、本発明は、本明細書に記載される配列由来の少なくとも2つのAONの組合せを提供する。
「治療、処置」、「治療、処置すること」、「療法」などの用語は、本明細書においては一般的に所望の薬理学的効果および/または生理学的効果を得ることを意味するために用いられる。この効果は、疾患もしくはその症候を完全にまたは部分的に予防すると言う観点では予防的であってもよく、ならびに/または疾患について部分的もしくは完全に治癒させることおよび/もしくは疾患に起因する悪影響を改善すると言う観点では治療的であってもよい。本明細書において用いる場合、「治療」とは、既に定義した被験体、特に人における疾患のいずれの治療をもカバーし、これは以下が挙げられる:
(a)疾患に対する素因を有する可能性があるが、それを有するとは未だ診断されていない被験体において、疾患が生じないように予防すること;
(b)疾患を抑制すること、すなわち、その発症を阻むこと;または
(c)疾患を緩和すること、すなわち疾患の退行を引き起こすこと。
「薬学的に許容される」という用語は、本明細書において担体、サーファクタント、および組成物に関して用いられる場合、毒性ではない、またはそうでなければ本明細書において記載するいずれの経路によっても投与することが許容されない、被験患者の治療において使用するために許容される基質を意味する。
本発明は一般的に、siRNA;miRNAおよびmiRNAミミック;リボザイム;短いヌクレオチド配列(標的核酸に対して相補的であってもよいし、または上述したように必要に応じて修飾されていてもよいRNAおよび/またはDNAを含めて一本鎖または二本鎖);RNAとハイブリダイズして、オリゴヌクレオチド−RNA二重鎖を形成することができる、上記RNAオリゴヌクレオチドの少なくとも一部を有するRNAオリゴヌクレオチド;またはインビボで内在性遺伝子の発現を下方制御するかまたは阻害するキメラオリゴヌクレオチド、を含む、治療上有効量の本発明によるAON化合物を投与することによる、被験体の治療に関する。
「治療上有効な」量とは、非毒性であるが、所望の治療効果を得るために十分であるアンチセンスオリゴヌクレオチド化合物の量を意味する。本発明の場合、AON化合物のその用量は、治療している状態または疾患、例えば、アレルギー、喘息、炎症性疾患、例えば炎症性呼吸器疾患の症状を救済するか、寛解するか、または予防するための量である。
本明細書において用いる場合、「アレルギー」という用語は、過敏になっている物質に対する、身体による任意の望ましくない免疫応答を示す。
本発明の製剤は、作用部位に対して直接的に投与することが好ましく、従って、限定するものではないが経口、頬内、肺内、直腸、子宮内、腫瘍内、鼻内、くも膜下(intrathecal)、吸入、経皮、皮内、腔内(intracavitary)、イオントフォレーシス、眼、膣、関節内、耳内(otical)、経粘膜、直腸、徐放性コーディング製剤、または腸溶性コーディング製剤を含めて、局所的であることが好ましい。上記は何ら制限するものではなく、本発明の製剤は頭蓋内、筋肉内、皮下、血管内、腺内、器官内、リンパ内、腹腔内、静脈内、および移植可能なものであってもよい。製剤中で用いられる担体は、例えば、固体担体および/または液体担体であってもよい。
本発明のオリゴヌクレオチド化合物と組み合わせて、呼吸器疾患を治療するために投与するのに適する組成物/製剤となるのに適切である他の担体については、「Remington’s Pharmaceutical Sciences」,第17版,Mack Publishing Company,Easton,Pa.,1985を参照するのがよいであろう。
必要に応じて、現在記載されるオリゴヌクレオチドを、様々な生理学的担体分子と共に製剤化してもよい。現在記載されるオリゴヌクレオチドはまた、標的細胞に進入する能力を向上させる分子と複合体化されてもよい。その様な分子の例としては、限定するものではないが、炭水化物類、ポリアミン類、アミノ酸類、ペプチド類、脂質類、および細胞増殖に重要な分子類が挙げられる。例えば、オリゴヌクレオチドは、脂質と組み合わされてもよく、得られたオリゴヌクレオチド/脂質エマルジョン、またはリポソーム懸濁液は、とりわけ、オリゴヌクレオチドのインビボ半減期を効果的に増大し得る。
本明細書において提供される薬学的組成物は、上述のオリゴヌクレオチド化合物と1つ以上の薬学的に許容されるサーファクタントとを含んでもよい。本発明のオリゴヌクレオチドの取り込みを増強するための適切なサーファクタントまたはサーファクタント成分は、米国特許出願公開第2003/0087845号に以前に記載されており、その内容はサーファクタントに対して本明細書中に援用される。この出願は、適切なサーファクタントは、「・・・サーファクタントタンパク質A、サーファクタントタンパク質B、サーファクタントタンパク質C、サーファクタントタンパク質D、およびサーファクタントタンパク質E、二飽和ホスファチジルコリン(ジパルミトイル以外)、ジパルミトイルホスファチジルコリン、ホスファチジルコリン、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルイノシトール、ホスファチジルエタノールアミン、ホスファチジルセリン;ホスファチジン酸、ユビキノン類、リソホスファチジルエタノールアミン、リソホスファチジルコリン、パルミトイルリソホスファチジルコリン、デヒドロエピアンドロステロン、ドリコール類、スルファチジル酸(sulfatidic acid)、グリセロール−3−リン酸、ジヒドロキシアセトンリン酸、グリセロール、グリセロ−3−ホスホコリン、ジヒドロキシアセトン、パルミテート、シチジンジホスフェート(CDP)ジアシルグリセロール、CDPコリン、コリン、コリンリン酸;ならびにサーファクタントの成分についての天然の担体ビヒクルである天然および人工のラメラ構造、ω−3脂肪酸、ポリエニック酸、ポリエノイック酸、レシチン、パルミチン酸、エチレンまたはプロピレンオキシドの非−イオン性ブロックコポリマー、ポリオキシプロピレン、モノマーおよびポリマーのポリオキシエチレン、デキストランおよび/またはアルカノイル側鎖を有するモノマーおよびポリマーのポリ(ビニルアミン)、Brij 35(商標)、Triton X−100(商標)および合成サーファクタントALEC(商標)、Exosurf(商標)、Survan(商標)およびAtovaquone(商標)などの、合成および天然型、ならびに全長型および短縮型が挙げられる。これらのサーファクタントを、単一成分サーファクタントとしてまたは複数成分サーファクタントの一部として製剤中で用いてもよいし、あるいはAONの5’および/または3’末端に対して共有結合付加物として用いてもよい」ということを述べている。
本発明の組成物のオリゴヌクレオチド成分は、リポソームまたは微結晶などの脂質粒子または小胞内の医薬製剤に含有させてもよい。米国特許第6,025,339号に記載されるように、脂質粒子は、オリゴヌクレオチドがその内部に含有される限り、単層または多層などの任意の適切な構造のものであってもよい。N−[1−(2,3−ジオレオイルオキシ)プロピル]−N,N,N−トリメチル−アンモニウムメチルスルフェート、すなわち「DOTAP」などの正に荷電した脂質が、そのような粒子および小胞として特に好ましい。そのような脂質粒子の調製は、周知である。例えば、Janoffらに対する米国特許第4,880,635号;Kuronoらに対する米国特許第4,906,477号;Wallachに対する米国特許第4,911,928号;Wallachに対する米国特許第4,917,951号;Allenらに対する米国特許第4,920,016号;Wheatleyらに対する米国特許第4,921,757号;などを参照のこと。
本発明の組成物は、例えば肺などの、所望の部位に対してオリゴヌクレオチド化合物を輸送する任意の手段により投与することができる。本明細書中に開示されたオリゴヌクレオチド化合物は、任意の適した手段により患者の肺に対して投与してもよいが、オリゴヌクレオチド化合物を含む呼吸用の粒子からなるエアロゾルの吸入により投与することが好ましい。
このオリゴヌクレオチドは、乾燥粉末吸入器、定量吸入器、ネブライザー、ソフト・ミスト(soft mist)吸入器中で、および吸入経路を介して肺へのオリゴヌクレオチド送達の能力を有する任意の他の適切なデバイスによって投与されるように製剤されてもよい。
本発明の組成物は、呼吸に適したサイズの粒子、例えば吸入に際して鼻、口、および喉頭を通過し、そして気管支および肺の肺胞を通過するために十分小さいサイズの粒子を含む製剤として、呼吸器系に投与することができる。一般的に、呼吸に適した粒子は、約0.5ミクロン〜10ミクロンのサイズ範囲である。エアロゾル中に含まれる呼吸に適していないサイズの粒子は、咽頭に沈着して嚥下される傾向があり、従って、エアロゾル中の呼吸に適していない粒子の量は、最小限にすることが好ましい。鼻投与のためには、10〜500μM(マイクロメートル)の範囲の粒子サイズが、鼻腔における残留を確実にするために好ましい。
オリゴヌクレオチド化合物を含む固体微粒子組成物は必要に応じて、エアロゾルの形成を容易にするように機能する分散剤、および他の治療化合物を含んでもよい。適切な分散剤はラクトースであり、ラクトースは任意の適切な比、例えば、1対1の重量比でアンチセンス化合物と混合されてもよい。
エアロゾルを作製するための活性化合物(オリゴヌクレオチド化合物(単数または複数))の液体の薬学的組成物を、このオリゴヌクレオチド化合物と、適切なビヒクル(例えば、発熱性物質を含まない滅菌水またはリン酸緩衝化塩類溶液)と組み合わせることにより調製してもよい。
このオリゴヌクレオチド組成物は、治療されている疾患の程度、被験患者の状態、特定の製剤、投与経路、被験体への投与のタイミングなどに依存する量である、抗気管支収縮、抗アレルギーおよび/または、抗炎症性の有効量で投与してもよい。一般的に、0.05〜50μMのオリゴヌクレオチドの細胞内濃度、またはより具体的には0.2〜5μMのオリゴヌクレオチドの細胞内濃度が所望される。哺乳動物の患者、例えばヒトの患者に対して投与するため、約0.001、0.01、0.1、または1mg/Kgの用量から、最大で約50または100mg/Kg以上の用量が、典型的には使用される。しかしながら、他の用量もまた企図される。いずれかの特定の製剤中における活性化合物の溶解度に依存して、1日用量を、1回または数回の単位用量投与の間で分割してもよい。
オリゴヌクレオチド化合物を含む液体粒子のエアロゾルを、任意の適切な手段、例えばネブライザーを用いて、作製してもよい。ネブライザーは、狭いベンチュリ(venturi)開口部を通じて圧縮ガス(典型的には空気または酸素)の加速によって、または超音波攪拌によって、活性成分の溶液または懸濁液を、治療用のエアロゾルミスへと変換する市販のデバイスである。ネブライザー中で使用するための適切な製剤は、製剤の最大40%w/w、好ましくは20%w/w未満の量で、液体担体中に活性のオリゴヌクレオチド成分を含む。この担体は、典型的には水または希薄なアルコール水溶液であり、好ましくは例えば、塩化ナトリウムの添加により体液と等張性にしたものである。任意の添加物としては、製剤が無菌で調製されない場合、防腐剤、例えば、メチルヒドロキシ安息香酸、抗酸化剤、抗細菌剤、香味料、揮発性油、緩衝化剤、および乳化剤、およびその他の製剤サーファクタントが挙げられる。
活性なオリゴヌクレオチド化合物(単数または複数)および薬学的に許容されるサーファクタントを含む固体粒子のエアロゾルは、同様に、任意の固体微粒子医薬エアロゾル生成器を用いて生成してもよい。固体微粒子医薬を被験体に投与するためのエアロゾル生成器は、上で説明したように、呼吸に適した粒子を生成し、そして予め決定した一定用量の薬剤を含有するある容積のエアロゾルを、ヒト投与のために適した速度で生成する。活性なオリゴヌクレオチド成分は、典型的には、製剤の0.1〜100w/wを含む。実例となるエアロゾル生成器の第二の型は、定量吸入器を含む。定量吸入器は、加圧エアロゾルディスペンサーであり、典型的には液化噴霧剤中に活性成分の懸濁製剤または溶液製剤を含有する。使用の間、これらのデバイスは、典型的には10〜150μLの一定容積を送達するように適合させたバルブを通じて製剤を放出し、活性成分を含有する微粒子スプレーを生成する。適切な噴霧剤としては、特定のクロロフルオロカーボン化合物、例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリクロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロメタン、またはヒドロフルオロアルカン、およびこれらの混合物が挙げられる。製剤は、1つ以上の共溶媒、例えば、エタノール、乳化剤、およびその他の製剤サーファクタント、例えばオレイン酸またはトリオレイン酸ソルビタン、抗酸化剤、および適切な着香料をさらに含んでもよい。
固体粒子から形成されるか液体粒子から形成されるかに関わらず、エアロゾルは、1分間当たり約1〜150リットルという速度で、エアロゾル生成器により生成することができる。
本発明のさらなる態様では、アレルギー、喘息、鼻炎および炎症性疾患に関連する状態を治療するために治療上有効な薬学的に許容されるオリゴヌクレオチド組成物をその中に含有するパッケージング材料を含んでいる製品が提供される。一実施形態において、この組成物は、CCR3ケモカインレセプターまたはIL−3/IL−5/GM−CSF−レセプターの共通β−鎖の遺伝子発現を阻害するために有効なオリゴヌクレオチド化合物を含み、このオリゴヌクレオチド化合物は、この遺伝子に少なくとも50%相補的である。別の態様において、この組成物は、少なくとも2つのオリゴヌクレオチド化合物を含み、各々のオリゴヌクレオチド化合物は、各々のCCR3ケモカインレセプター遺伝子およびIL−3/IL−5/GM−CSF−レセプターの共通β−鎖遺伝子の発現を下方制御することができ、各々のオリゴヌクレオチド化合物は、そのオリゴヌクレオチド化合物が実際にはそのままではそのオリゴヌクレオチド化合物に対する遺伝子を下方制御するために効果的ではない濃度で存在し、そのオリゴヌクレオチド化合物の組合せが、そのオリゴヌクレオチドが対する少なくとも1つ遺伝子を下方制御するために有効である。
一実施形態では、製品のパッケージング材料は、その組成物を用いて炎症性呼吸器疾患を治療することができることを示すラベルを備え、そしてさらにその疾患がアレルギー、鼻炎、COPD、CFおよび喘息のうちの一つであるという指示を備えてもよい。
別の実施形態において、製品のパッケージング材料は、その組成物を用いて炎症性呼吸器疾患を治療することができることを示すラベルを備え、そしてさらに、その疾患がアレルギー、喘息、過好酸球増大症、気管支炎、COPD、鼻炎、または副鼻腔炎のうちの1つであるという指示を備えてもよい。
本発明の目的のため、パッケージング材料は、本発明によるヌクレオチド含有組成物をパッケージングするために適切な任意の材料であってもよく、これには、ボトルもしくは他の容器(プラスチックまたはガラスのいずれか)、カートン、チューブ、またはその他の保護用ラッピングが挙げられる。理解されるように、このパッケージングは、オリゴヌクレオチド組成物の性質により変更されてもよく、例えば、液体製剤はエアロゾル製剤とは異なる方法でパッケージングされてもよい。
本発明は、本発明の範囲を限定することなく以下の発明を説明するために提供される実施例を参照することにより、さらに容易に理解されるであろう。これらの実施例に関して、以下の方法および材料が、用いられた。
方法
細胞培養
TF−1細胞は、2mMのL−グルタミン、1.5g/lの炭酸水素ナトリウム、4.5g/lのD−グルコース、10mMのHEPES、1mMのピルビン酸ナトリウム、10%のウシ胎仔血清、2ng/mlのrhGM−CSF、100U/mlのペニシリンおよび100μg/mlのストレプトマイシンを含んでいるRPMI−1640培地中で培養した。293−βc−GFP細胞および293−CCR3−GFP細胞(それぞれ安定にβ鎖−GFPおよびCCR3−GFP融合のcDNAを発現する)は、2mMのL−グルタミン、4.5g/lのグルコース、10%のウシ胎仔血清、15μg/mlのブラスチシジン(Blasticidin)、100μg/mlのハイグロマイシン(Hygromycin)B、100U/mlのペニシリンおよび100μg/mlのストレプトマイシン(Streptomycin)を含有するDMEM中で培養した。NIH−3T3細胞は、2mMのL−グルタミン、4.5g/lのグルコース、10%のウシ胎仔血清、100U/mlのペニシリンおよび100μg/mlのストレプトマイシンを含有するDMEM中で培養した。
AON、siRNAおよびmiRNAミミック配列の設計および調製
ホスホロチオエート−DNAのAON類(Sigma Genosys)、DAP−修飾ホスホロチオエート−DNAのAON類(Sigma Genosys)およびホスホロチオエート−2’F−ANAのAON類(Topigen,MontrealまたはUCDNA,Calgary)を、β鎖およびCCR3のmRNAのコード領域を標的するように設計した。ホスホロチオエート−DNA AON類は特に、β鎖のmRNAの全体的なコード領域にそった領域、ならびに5’UTR、3’UTR内およびイントロン/エキソン接合部をまたいで延びる領域を標的するように設計した。β鎖およびCCR3のAONの設計のために用いられるオンラインの参照配列(NCBI Genbank全体)は以下であった:β鎖については、Genbankアクセッション番号BC070085(TOP050(配列番号1)−TOP076(配列番号27)、TOP195(配列番号146)、およびTOP254(配列番号205)−TOP259(配列番号210));NM_000395.2(TOP077(配列番号28)−TOP194(配列番号145)、TOP196(配列番号147)−253(配列番号204)、TOP260(配列番号211)−TOP346(配列番号:297)およびTOP517(配列番号468)−TOP721(配列番号:672));ならびにNG_008040(TOP347(配列番号:298)−TOP516(配列番号467));そしてCCR3についてはNM_001837(TOP020(配列番号673)−TOP045(配列番号698))。SiRNA配列は、従来のTuschlベースのデザイン(Qiagen siRNA design tool)、High Performance (HP) OnGuard algorithm(Genome Wide siRNA,Qiagen),Thermoscientific Dharmacon RNAi Technologies siDESIGN Center Custom siRNA Design Tool(www.thermo.com/sidesign),Invitrogen’s BLOCK−IT(商標) RNAi Designer(https://rnaidesigner.invitrogen.com)、またはEMBOSS(https://anabench.bcm.umontreal .ca/html/EMBOSS/runs/file6LGF4f/index.html)を用いて設計した。
MiRNAミミックは、β鎖遺伝子の3’UTRに対する相同性を有するmiRNAを特定するための公的に利用可能なアルゴリズムを用いて選択した。miRNAの特定のために使用されるアルゴリズムは、TargetScan(http://www.targetscan.org/)、miRBase(http://microrna.Sanger.ac.uk/cgi−bin/targets/v5/search.pi)、miRANDA(http://www.microrna.org/microrna/getGeneForm.do)、miRGEN(http://www.diana.pcbi.upenn.edu/cgi−bin/miRGen/v3/Targets.cgi)およびDIANA microT(http://diana.cslab.ece.ntua.gr/microT/)であった。
全てのオリゴヌクレオチドは、滅菌水中に再懸濁して、その濃度は分光光度法によって決定した。
細胞のトランスフェクション
指数関数的増殖期にあるTF−1細胞(0.6〜0.8×l0細胞/ml)を抗生物質なしの完全増殖培地中で1.25×10細胞/mlの密度で成長させた。細胞を、AON−、siRNA−またはmiRNAミミック−Lipofectamine 2000複合体(Opti−MEM中で希釈した)を用いて直ちにトランスフェクトして、1μgのオリゴヌクレオチド:1μlのLipofectamine 2000という比で、室温で20分間事前にインキュベートした。細胞を、83.5nM〜2.67μMにおよぶAON濃度、0.25〜1.0μMにおよぶsiRNA濃度、および0.5μM〜1μMの濃度のmiRNAミミックを用いてトランスフェクトし、次いで37℃で18〜72時間インキュベートした。
293−βc−GFP細胞および293−CCR3−GFP細胞を、抗生物質なしの完全増殖培地中で培養した。細胞を67nM〜534nMのAON濃度または40nM〜1.0μMのsiRNA濃度で上記のようにトランスフェクトした。CCR3−GFPまたはβ鎖GFP発現を、回収の前に2時間(mRNA)または18時間(タンパク質)、100ng/mlのドキシサイクリンを用いて誘導した。
NIH 3T3細胞を上記のように0.2μgのpCMVscriptラットCCR3または0.3μgのpGL2−ルシフェラーゼ、ならびに0.2μgのAONを用いてトランスフェクトした。
mRNA発現の定量
CCR3およびβ鎖のmRNA発現レベルの定量は、Quantigene 2.0アッセイを用いて行った。要するに、細胞を1×Quantigene溶解混合物中に再懸濁して、53〜55℃で30分間インキュベートした。唯一の例外は、TF−1細胞におけるCCR3 mRNA定量についてであって、これでは総RNAをまず、RNAeasyミニキットを用いて細胞ペレットから抽出し、製造業者のプロトコールに従ってRibogreenアッセイを用いて定量した。次いで、細胞溶解液または精製されたRNAを特異的なプローブセットを用いて55℃で一晩ハイブリダイズして、シグナル検出はQuantigene 2.0アッセイ手順に従って行った。遺伝子発現は、コントロールの遺伝子(β2M)の発現に対して正規化した。
フローサイトメトリーによる、293細胞におけるβc−GFPおよびCCR3−GFPタンパク質の発現の定量
細胞をトランスフェクションの24時間後にトリプシンで回収して、PBSで2回洗浄し、1×透過化溶液中に再懸濁して、室温で10分間インキュベートした。次いで細胞を、0.5%BSAを含有するPBSを用いて2回洗浄し、5μg/mlのFITC−コンジュゲートされた抗−GFP抗体を含有する50μLのPBS中に再懸濁して、4℃で1時間インキュベートした。細胞を、PBSを用いて2回洗浄し、2%のパラホルムアルデヒド中で固定し、その後にGUAVA EasyCyte装置を用いるフローサイトメトリー(488nM)によって分析した。
FACSによるTF−1中の内因性タンパク質発現の定量
TF−1細胞は、トランスフェクション後、示した時点で回収して、PBSを用いて2回洗浄した。染色は、CCR3レセプターの定量についてはEotaxin Fluorokineキットを用い、IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβ−鎖についてはIL−3Fluorokineキットを用いて50,000個の細胞で行った。これらのアッセイでは、ビオチン化エオタキシンまたはビオチン化IL−3は、特定の細胞表面レセプターに結合し、アビジン−フロオレセインを用いて検出される。細胞を4%のパラホルムアルデヒド溶液中で固定し、緑色蛍光をGUAVA EasyCyte装置を用いてFACS(488nM)によって検出した。
AON血清安定性アッセイ
AONは拭いて乾燥し、1μg/mlという最終濃度で50%のウシ胎仔血清を補充されたDMEM中に再懸濁した。AON類は、37℃でインキュベートして、サンプル(20μl)を0〜96時間の間の種々の時点で収集し、分析するまで−80℃で保管した。サンプルを拭いて乾燥し、100μlのdHO中に再懸濁し、HPLC分析のためにタンパク質−Pak(商標)DEAE−5PW陰イオン交換カラム(75×75mm)にロードした。
アレルゲン誘導性気道炎症のラットモデルにおけるアンチセンス有効性
動物の研究は、Mispro Biotech Services,Montreal,QCで行い、Misproの動物倫理委員会(Animal Ethic Committees)によって承認された。Brown Norway(BN)ラット(6〜8週齢)を、Harlan Sprague−Dawley Inc.から入手した。能動感作は、1mgの鶏卵アルブミン(OVA)および3.5mgの水酸化アルミニウムゲルを含有する1mlの生理食塩水の皮下注射によって行った。感作の14日後、ラットに、無菌生理食塩水(50μl)、または50μgの組み合わせのTOP006(配列番号1626)およびTOP007(配列番号1628)(1:1(w/w)比)、もしくは50μgの組み合わせのTOP006−F2(配列番号1627)およびTOP007−F8(配列番号1629)(1:1(w/w)比)が含有される50μlの無菌生理食塩水のいずれかを用いて気管内に(i.t.)注射した。ラットは、閉鎖チャンバ中で15分間OVAエアロゾル(5%が生理食塩水中に含有される)に対する曝露によって10分後にチャレンジした。チャレンジは24時間後に繰り返した。肺に対する細胞流入に対するAON処置の効果を決定するために、ラットを第二のOVAチャレンジの15時間後に屠殺して、気管支肺胞洗浄(BAL)を行った。細胞を遠心分離によって回収して、総白血球計数を血球計を用いて行った。Hema−3染色キットで染色したサイトスピンスライドで種々の細胞計数を行った。少なくとも200個の細胞を、油浸顕微鏡下で計数した。肺をBAL後に収集して、mRNA(右の肺)のため、または免疫組織化学(左の肺)のために処理した。
動物の吸入研究
サルの研究デザイン
全ての研究をGLPの規制に従ってITR Laboratories Canada(Baie d’Urfe,QC)で行った。要するに、雄性および雌性のカニクイザル(1.5〜2.5kgの秤量)に、14の連続用量のビヒクルまたは0.05、0.25もしくは2.5mg/kgのTPI ASM8(生理食塩水中)を与えるか、またはTPI 1100(リン酸塩緩衝化生理食塩水;PBS)を、吸入曝露システムを用いてエアロゾルとして毎日投与した。この動物を、食物消費の定量的アセスメントを含めて臨床的症状について毎日1〜2回検査し、体重を毎週測定した。心電図(ECG)活動を記録して、眼の検査を動物の事前研究のために、かつ14日目に行った。
最終投与の1日後(15日目)、24匹のサル(3匹/性別/群)を安楽死させた。全ての残りの動物を回復期間の終わりに安楽死させた(TPI ASM8研究については最終投与の14日後、またはTPI1100研究については最終投与の28日後)。最終手順は、約40の組織の完全な全体的剖検、収集および保存、ならびに全ての主要な臓器の重量の測定を含んだ。全ての動物由来の呼吸器管組織(鼻腔、鼻咽頭、喉頭、咽頭、気管、気管支、気管支分岐部および気管支リンパ節を含めて肺)を、光学顕微鏡によって検査して、全ての収集された組織を全ての高用量およびコントロール群の動物について検査した。さらに、気管支、肺、肝臓および腎臓の一部をAON含量の分析のために収集した。
げっ歯類研究デザイン
ラットでの研究(TPI ASM8)およびマウスでの研究(TPI 1100)はサルの研究について記載されたとおり行った。雄性および雌性のCD−1マウスに、14の連続用量のビヒクルまたは0.05、0.25もしくは2.5mg/kgのTPI 1100を、吸入曝露システムを用いてエアロゾルとして毎日投与した。雄性および雌性のSprague−Dawleyラットに、14の連続用量のビヒクルまたは0.02、0.07、0.2 0.1もしくは5mg/kgのTPI ASM8を、吸入曝露システムを用いてエアロゾルとして毎日投与した。
実施例1:IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットに対するAON配列の有効性
IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット(β鎖)に対するAON配列の配列および組成を表1a−1rに示す。全てのAON類を精製して、脱塩した。いくつかの選択された配列の力価を図1aに示しており、この図は、293−βc−GFP細胞株およびTF−1細胞株において示されたAONでのトランスフェクション後のインビトロにおける遺伝子発現の低下を示す。表1a−1rに列挙されるAON活性は、トランスフェクトされていないコントロールに対するβ鎖のmRNAの平均阻害割合として表される。293−βc−GFP細胞株は、β鎖/緑色蛍光タンパク質(GFP)融合物のmRNAおよびタンパク質を人工的に発現するように操作し、一方TF−1細胞は、β鎖のmRNAおよびタンパク質を内因性に発現するように操作した。
いくつかの選択されたAON配列の特異性は、そのAON配列の有効性を293−βc−GFP細胞(図1b)およびTF−1細胞(図1c)において、それらのAON配列それぞれのコントロールのセンス配列に比較したβ鎖のmRNA発現レベルの低下において比較することによって評価された。各々の細胞株では、β鎖のmRNAに相補的でないそれぞれのコントロールのセンス配列は不活性であった。さらに、β鎖を標的するAONの阻害活性はまた、フローサイトメトリーによって分析の際にタンパク質レベルで観察された。図5aおよび図5bによって、293−βc−GFP細胞およびTF−1細胞が、特定のAONを用いたトランスフェクションおよび一晩のインキュベーション後にβ鎖タンパク質発現のレベルが低下していたが、コントロール配列では効果がなかったことが示される。
実施例2:CCR3ケモカインレセプターに対するAON配列の有効性
CCR3を標的するAON配列の列挙は、表1sに示される。全てのAONは上記のとおり、調製して精製した。いくつかの選択された配列の力価は、図2aに示されており、この図は、293−CCR3−GFP細胞株およびTF−1細胞株において示されたAONを用いたトランスフェクション後、インビトロにおける遺伝子発現の低下を示す。293−CCR3−GFP細胞株は、CCR3/緑色蛍光タンパク質(GFP)融合産物を発現するように操作したが、TF−1細胞は、CCR3のmRNAおよびタンパク質を内因性に発現する。図2bおよび図2cは、CCR3に対するAON類でのトランスフェクションの24時間後、それぞれ293−CCR3−GFP細胞およびTF−1細胞におけるCCR3のmRNA発現レベルの特異的な減少を示すが、それぞれのコントロールのセンス配列は不活性であった。表1sに示されるAON活性は、トランスフェクトされていないコントロールに対するCCR3のmRNA発現の平均阻害割合として表される。
CCR3を標的するAONの阻害性活性はまた、フローサイトメトリーによって分析の際にタンパク質レベルで観察した。図5cおよび図5dによって、293−CCR3−GFP細胞およびTF−1細胞では、示したAONを用いたトランスフェクションの24時間後、CCR3タンパク質発現のレベルが低下していたが、コントロールの配列では効果はなかったことが示される。
実施例3:β鎖のmRNA発現の低下におけるAONとsiRNA配列との間の比較
AONの配列に加えて、siRNA分子を設計して(表2a−2s)、それらの有効性についてβ鎖のmRNA発現の低下において試験した(図3)。図3aは、トランスフェクトされていない細胞(Ct1 NT)に比べ、および無関係のsiRNA配列(siCtl)に比べて293−βc−GFP細胞でのβ鎖mRNA発現レベルの低下におけるいくつかの選択されたsiRNA配列の有効性を示す。TF−1細胞におけるβ鎖のmRNA発現低下に対するAON TOP062(配列番号13)の有効性を、共通のβ鎖を標的するように設計された種々のsiRNA配列に対して比較した。結果として、AON TOP062(配列番号13)(0.5および1μM)が、siRNA配列(図3b)に比較してβ−鎖のmRNA発現の低下において優れた有効性を呈したことが示された。さらに、経時的実験によって、AON TOP062(配列番号13)でトランスフェクトされた細胞におけるβ鎖のmRNA発現の阻害は、トランスフェクション後最大72時間まで維持されたが、評価した全てのsiRNA配列がこの時点で発現の低下について有効では無かったことが示された(図3c)。
実施例4:CCR3のmRNA発現の低下におけるAONとsiRNA配列との間の比較
AONの配列に加えて、siRNA分子を設計し(表2t)、その有効性についてCCR3のmRNA発現の低下について試験した(図4)。図4aは、トランスフェクトされていない細胞(Ct1 NT)に比べ、および無関係のsiRNA配列(siCtl)に比べて293−βc−GFP細胞でのCCR3のmRNA発現レベルの低下におけるいくつかの選択されたsiRNA配列の有効性を示す。293−CCR3−GFP細胞におけるCCR3のmRNA発現低下に対するAON TOP030(配列番号683)の有効性を、CCR3を標的するように設計された種々のsiRNA配列に対して比較した(図4b)。経時的実験によって、AON TOP030(配列番号683)でトランスフェクトされた細胞におけるCCR3のmRNA発現の阻害は、トランスフェクション後最大72時間まで維持されたが、siRNA配列のうちこの時点で阻害活性を維持していたのは1つだけ(siCCR3_1HP)であったことが示された(図3c)。
実施例5:FANA化学で修飾されたAON類は、有効性の増大および血清安定性の延長を示した。
本実施例は、ANA修飾がAONの化学に組み込まれる場合の、β鎖およびCCR3特異的AON類の有効性の増大および血清安定性の延長に関する。表3aおよび表3bは、FANA残基で修飾されたAONの組成を記載する。図6aでは、β鎖特異的なAON類(示したとおり修飾された、ホスホロチオエート骨格またはFANAを有する未修飾DNA)でトランスフェクトされた293−βc−GFP細胞中のβ鎖発現について得た結果を示す。FANA(TOP062−F2(配列番号1582)およびTOP062−F3(配列番号1583))を用いたTOP062(配列番号13)の修飾は、標的タンパク質発現の阻害の増大によって示されるとおりAONの有効性を増強し、このことはAON活性についてのこの修飾の利点を明確に示している。同様に、FANA(TOP030−F12)(配列番号1610)を用いたTOP030(配列番号683)の修飾は、それがCCR3タンパク質発現を阻害する有効性を増強し、このこともやはり、AON活性についてのこの修飾の利点を支持している(図6b)。このFANA修飾はまた、それぞれのmRNA標的(TQP062−F14(配列番号1594)の発現に対してAONの活性に影響することなく、F18およびTOP030−F12(配列番号1610))に対する、天然のリン酸ジエステル結合の組み込みを可能にした(表3aおよび3b)。これは、驚くべきことである。なぜなら、リン酸ジエステル含有AON類は通常、ヌクレアーゼ分解に対してさらに感受性であると考えられており、ホスホロチオエート含有AON対応物に比較してアンチセンス阻害性活性の低下を生じるからである。
FANA修飾は、AONの安定性を向上すると期待され、これはヌクレオシダーゼ消化に対してAONをさらに耐性にして、さらにAON活性の延長を生じる。図5は、50%のウシ胎仔血清を含有するDMEMで希釈し、37℃で示した期間インキュベートされたTOP062(配列番号13)(β鎖)およびTOP030(配列番号683)(CCR3)の種々の処方物の比較を示す。アリコートは、種々の時点で収集して、インタクトなAONの存在をHPLCを用いて分析した。結果によって、TOP062(配列番号13)(図7a)およびTOP030(配列番号683)(図7b)中のFANA修飾ヌクレオチドの組み込みが血清媒介の変性に対する有意な耐性を付与したことが示された。
実施例6:1つのレセプターに特異的なAONの、別のレセプターの発現に対する交差標的効果
本実施例は、種々のレセプターのmRNA生成に対する単一のレセプターの阻害の効果に関する。この実験は、TF−1細胞で行った。AONの配列は、それらのそれぞれの標的に対して特異的に設計されたが、図8および図9の結果は、いくつかのAONがその特異的な標的を阻害することが見出されただけでなく、他のレセプターに対応するmRNAを下方制御できたことを示す(交差標的効果)。CCR3特異的なAON TOP030−F2(配列番号1600)は、その特異的な標的の阻害を提供するだけでなく(図8aおよび8b)、共通のβ鎖のmRNA(図8c)およびタンパク質(図8d)の発現も下方制御した。
同様に、AON類TOP031(配列番号684)およびTOP037(配列番号690)は、CCR3(図9a)の発現を下方制御し、さらに共通のβ鎖タンパク質発現に向かう阻害活性を下方制御した(図9b)。
逆に、その特異的な標的の発現を下方制御する以外に、共通のβ鎖(図8cおよび8d)、TOP062−F8(配列番号1588)はまた、CCR3のmRNA(図8a)およびタンパク質(図8b)の発現レベルを低下するのにおいて有効であることが示された。この交差標的阻害効果は、TOP062−F8(配列番号1588)に限定されず、またβ鎖を標的とする追加のAONの配列(TOP057(配列番号8)およびTOP073(配列番号24))でも観察された(図9aおよび図9b)。
実施例7:2つの異なる標的遺伝子のヌクレオチド配列由来の2つのAONを組み合わせることの複数の遺伝子ノックダウン効果
本実施例は、β鎖およびCCR3遺伝子発現に対する特異的なAON類の組み合わせの効果に関する。両方のレセプターを内因性に発現するTF−1細胞でのβ鎖およびCCR3のmRNA発現に対する、2つの別々のAON類を組み合わせることの効果を評価した(図10)。各々のAONは、単独でまたは組み合わせて細胞中にトランスフェクトした。細胞をトランスフェクションの24時間後mRNAまたはタンパク質の発現について分析した。TOP030−F2(配列番号1600)およびTOP062−F8(配列番号1588)の組み合わせは、TOP030−F2(配列番号1600)単独に比較してCCR3のmRNA(図10a)およびタンパク質(図10b)の発現レベルを低下することに有意に有効であることが示された。同様に、TOP030−F2(配列番号1600)の濃度に対して低い濃度のTOP062−F8(配列番号1588)の組み合わせによって、TOP062−F8(配列番号1588)単独に比較してβ鎖のmRNAの発現レベル(図10c)およびタンパク質の発現レベル(図10d)に強力な相乗効果が示された。
実施例8:アレルゲン誘発性気道炎症のラットモデルにおけるアンチセンスの有効性
本実施例は、FANA修飾がラットのアレルギー性喘息のインビトロおよびインビボのモデルでAONの化学に組み込まれる場合の、ラットβ−鎖およびラットCCR3を標的するAONの有効性の増大に関する。表4は、ラットβ−鎖およびラットCCR3を標的するAONの組成物、ならびにFANA残基を有する修飾を記載する。図8では、ラットのCCR3のmRNAを一過性に発現するように操作されたNIH 3T3細胞を、ラットのCCR3に特異的なAON(未修飾のDNAであって、ホスホロチオエート結合を有する(TOP007(配列番号1628))かまたは示されるとおりFANA−修飾ヌクレオチド(TOP007−F8)(配列番号1629)を組み込む)を用いてトランスフェクトして、トランスフェクションの24時間後に分析した。その結果によって、TOP007(配列番号1628)配列をFANAモノマーを用いて修飾すれば(TOP007−F8(配列番号1629))、標的のmRNA発現の阻害に対してAONの有効性が増強され、このことは明らかに、AON活性に対するこの修飾の利点を示している(図11)。
ラットβ鎖およびラットCCR3を標的するFANA修飾AON類の活性増強がまた、Brown Norway(BN)ラットでアレルギー性喘息のインビボモデルで示された。このモデルの喘息では、BNラットには、感作の14日後にオボアルブミン(OVA)をチャレンジし、結果としてその動物の肺において好酸球の顕著な流入を生じた(図12)。好酸球は喘息においてアレルギー性の反応の背景にある重要な細胞である。BNラットを、ラットβ鎖(TOP006(配列番号1626))を標的する1つの未修飾のAONおよびラットCCR3(TOP007(配列番号1628))を標的する1つの未修飾のAON(TOP007(配列番号1628))の50μgの組み合わせ(1:1(w/w)の比)でチャレンジする前に処置した場合、アレルゲン誘発性の好酸球流入の有意な減少は観察されなかった(図12)。しかし、感作されたBNラットをFANA−含有AON類(TOP006−F2(配列番号1627)およびTOP007−F8(配列番号1629))の50μgの組み合わせ(1:1(w/w)の比)で処置した場合、肺へのアレルゲン誘発性の好酸球流入は60%まで低下した(図12)。
実施例9:2’F−ANA修飾AON類の長期間送達後の肺へのマクロファージ流入
本実施例は、げっ歯類およびサルでの14日間連続のFANA修飾したAON類の長期間投与後の肺胞マクロファージの浸潤の相対的な低下に関する。図13は、FANA修飾AON類(TPI 1100)および非−2’F−ANA修飾AON類(TPI ASM8(TOP004(配列番号:1630)およびTOP005(配列番号:1631))の長期間投与後のげっ歯類(マウスおよびラット)の肺およびサルの肺における肺胞マクロファージの発生率を示す。肺の組織学的検査は、最終のAON曝露の24時間後に評価した(15日)。結果として、FANA修飾AON類(TPI 1100(TOP1572(配列番号:1632)およびTOP1731(配列番号:1633)、IC50約1mg/kg)を投与された動物では、非−2’F−ANA−含有AON類(TPI ASM8,IC50約0.1mg/kg)を投与されている動物に比較して肺胞マクロファージの頻度が低く、種依存性であった(げっ歯類および霊長類)。
実施例10:β鎖のmRNA発現の低下に対する2−アミノ−2’−デオキシアデノシン−含有AONの配列の有効性
本実施例は、AONの化学において2−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)修飾を組み込むβ鎖特異的AON類の有効性に関する。表3cは、DAP残基で修飾されたAONの組成を記載する。いくつかの選択された配列の力価は、図14に示しており、この図では、293−βc−GFP細胞中で示したAON類を用いたトランスフェクション後のインビトロでの遺伝子発現の減少が示される。AONの配列の特異性は、無関係のAON配列(TOP4005(配列番号1784))に比較してβ鎖のmRNA発現レベル低下についてその配列の有効性を比較することによって評価した。
実施例11:β鎖のmRNAおよびタンパク質の発現を低下するのにおけるmiRNAミミック配列の有効性
AONの配列およびsiRNAに加えて、miRNA模倣分子を設計して(表7a−7d)、その有効性についてβ鎖のmRNAおよびタンパク質の発現を低下するのにおいて試験した(図15)。図15aは、トランスフェクトされていない細胞コントロール(コントロールNT)に比較してTF−1細胞におけるβ鎖のmRNAレベルの低下に対するいくつかの選択されたmiRNAミミック配列の有効性を示す。miRNAの作用機序と一致して、β鎖のmRNAレベルに対する効果は測定されなかった。β鎖タンパク質発現に対するmiRNAの阻害活性はまた、蛍光活性化細胞選別(fluorescence activated cell sorting)(FACS)によっても分析された。図15bは、トランスフェクトされてないコントロールの細胞に比較して、特定のmiRNAでのトランスフェクションおよび一晩のインキュベーション後、TF−1細胞がβ鎖タンパク質発現のレベルの用量依存性の低下を有したことを示す。
引用された全ての参考文献は、本明細書において参照によって援用される。本発明の好ましい実施形態は、本明細書に記載してきたが、本発明の趣旨または特許請求の範囲から逸脱しない範囲において適宜変更することができる。
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Claims (72)

  1. オリゴヌクレオチドが(i)配列番号1から698のうちのいずれか1つに対応する塩基配列を有し、かつ(ii)配列番号1から698のいずれか1つの修飾オリゴヌクレオチド、のうちの1つである、CCR3ケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列に対するオリゴヌクレオチド。
  2. 前記オリゴヌクレオチドが配列番号1から698のいずれか1つに対応する塩基配列を有する請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。
  3. 前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドが、2−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)またはその類縁体で置換されている請求項1または2に記載のオリゴヌクレオチド。
  4. 前記オリゴヌクレオチドの少なくとも1つのヌクレオチドがアラビノース修飾オリゴヌクレオチドである請求項1または2に記載のオリゴヌクレオチド。
  5. 前記アラビノース修飾ヌクレオチドが、フッ素、ヒドロキシル、アミノ、アジド、アルキル、アルコキシ、およびアルコキシアルキル基からなる群より選択される2’置換基を有する請求項4に記載のオリゴヌクレオチド。
  6. 前記アルキル基が、メチル、エチル、プロピル、ブチル、および官能性アルキル基からなる群より選択され、該アルコキシ基が、メトキシ、エトキシ、プロポキシおよび官能性アルコキシ基からなる群より選択され、かつ該アルコキシアルキル基がメトキシエチル、およびエトキシエチルからなる群より選択される請求項5に記載のオリゴヌクレオチド。
  7. 前記官能性アルキル基が、エチルアミノ、プロピルアミノおよびブチルアミノ基からなる群より選択され、かつ前記官能性アルコキシ基が、−O(CH)−Rからなる群より選択され、ここでq=2〜4であって、かつ−Rが−NH、−OCH、または−OCHCH基である請求項6に記載のオリゴヌクレオチド。
  8. 前記少なくとも1つのアラビノース修飾ヌクレオチドが2’−デオキシ−2’−フルオロアラビノヌクレオチド(FANA)である請求項4に記載のオリゴヌクレオチド。
  9. 前記少なくとも1つのアラビノース修飾ヌクレオチドが、オリゴヌクレオチドの5’末端である請求項8に記載のオリゴヌクレオチド。
  10. 前記少なくとも1つのアラビノース修飾ヌクレオチドが前記オリゴヌクレオチドの3’末端である請求項8に記載のオリゴヌクレオチド。
  11. 前記オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端の両方に少なくとも2つのアラビノース修飾ヌクレオチドを有する請求項8に記載のオリゴヌクレオチド。
  12. 前記オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に独立して1から7個のアラビノース修飾ヌクレオチドを有する請求項11に記載のオリゴヌクレオチド。
  13. 前記オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に独立して1から6個のアラビノース修飾ヌクレオチドを有する請求項11に記載のオリゴヌクレオチド。
  14. 前記オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に独立して1から5個のアラビノース修飾ヌクレオチドを有する請求項11に記載のオリゴヌクレオチド。
  15. 前記オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に独立して1から4個のアラビノース修飾ヌクレオチドを有する請求項11に記載のオリゴヌクレオチド。
  16. 前記オリゴヌクレオチドの5’末端および3’末端に独立して1から3個のアラビノース修飾ヌクレオチドを有する請求項11に記載のオリゴヌクレオチド。
  17. リン酸ジエステル、リン酸トリエステル、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ボラノホスホネートおよびそれらの任意の組み合わせからなる群より選択される少なくとも1つのヌクレオチド間結合を含む請求項1から請求項16のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
  18. 前記オリゴヌクレオチドが配列番号1から698のうちの1つである請求項1に記載のオリゴヌクレオチド。
  19. 前記オリゴヌクレオチドが、配列番号8、13、15、24、683、684、1582、1583、1587、1588、1599、1600、1605および1610のうちの1つである請求項18に記載のオリゴヌクレオチド。
  20. 請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも1つおよび薬学的に許容される担体を含む薬学的組成物。
  21. 請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを少なくとも2つを含む薬学的組成物。
  22. 前記2つのオリゴヌクレオチドが配列番号8、13、15、24、683、684、1582、1583、1587、1588、1599、1600、1605および1610からなる群より選択される請求項21に記載の薬学的組成物。
  23. 前記2つのオリゴヌクレオチドが、配列番号1588および1600である請求項22に記載の薬学的組成物。
  24. 患者に対して請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物を投与する工程を包む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防する方法。
  25. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物の用途。
  26. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための薬剤の調製における、請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物の用途。
  27. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物。
  28. 患者に対して請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを投与する工程を含み、該オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法。
  29. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドの用途。
  30. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させる薬剤の調製における、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドの用途。
  31. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
  32. オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドを患者に対して投与する工程を含む、患者におけるCCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための方法。
  33. CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドの用途。
  34. CCR3ケモカインレセプター発現を低下させる薬剤の調製における、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチドの用途。
  35. CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する請求項1から19のいずれかに記載のオリゴヌクレオチド。
  36. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物をその使用方法の説明書と一緒に備える商業的パッケージ。
  37. 患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号1から672のうちの1つを有する請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物をその使用方法の説明書と一緒に備える商業的パッケージ。
  38. 患者におけるCCRケモカインレセプター発現を低下させるための、オリゴヌクレオチドの塩基配列が配列番号673から698のうちの1つを有する請求項20から23のいずれかに記載の薬学的組成物をその使用方法の説明書と一緒に備える商業的パッケージ。
  39. 2本の鎖が、配列番号699および700;701および702;703および704;705および706;707および708;709および710;711および712;713および714;715および716;717および718;719および720;721および722;723および724;725および726;727および728;729および730;731および732;733および734;735および736;737および738;739および740;741および742;743および744;745および746;747および748;749および750;752および752;753および754;755および756;757および758;759および760;761および762;763および764;765および766;767および768;769および770;771および772;773および774;775および776;777および778;779および780;781および782;783および784;785および786;787および788;789および790;791および792;793および794;795および796;797および798;799および800;801および802;803および804;805および806;807および808;809および810;811および812;813および814;815および816;817および818;819および820;821および822;823および824;825および826;827および828;829および830;831および832;833および834;835および836;837および838;839および840;841および842;843および844;845および846;847および848;849および850;851および852;853および854;855および856;857および858;859および860;861および862;863および864;865および866;867および868;869および870;871および872;873および874;875および876;877および878;879および880;881および882;883および884;885および886;887および888;889および890;891および892;893および894;895および896;897および898;899および900;901および902;903および904;905および906;907および908;909および910;911および912;913および914;915および916;917および918;919および920;921および922;923および924;925および926;927および928;929および930;931および932;933および934;935および936;937および938;939および940;941および942;943および944;945および946;947および948;949および950;951および952;953および954;955および956;957および958;959および960;961および962;963および964;965および966;967および968;969および970;971および972;973および974;975および976;977および978;979および980;981および982;983および984;985および986;987および988;989および990;991および992;993および994;995および996;997および998;999および1000;1001および1002;1003および1004;1005および1006;1007および1008;1009および1010;1011および1012;1013および1014;1015および1016;1017および1018;1019および1020;1021および1022;1023および1024;1025および1026;1027および1028;1029および1030;1031および1032;1033および1034;1035および1036;1037および1038;1039および1040;1041および1042;1043および1044;1045および1046;1047および1048;1049および1050;1051および1052;1053および1054;1055および1056;1057および1058;1059および1060;1061および1062;1063および1064;1065および1066;1067および1068;1069および1070;1071および1072;1073および1074;1075および1076;1077および1078;1079および1080;1081および1082;1083および1084;1085および1086;1087および1088;1089および1090;1091および1092;1093および1094;1095および1096;1097および1098;1099および1100;1101および1102;1103および1104;1105および1106;1107および1108;1109および1110;1111および1112;1113および1114;1115および1116;1117および1118;1119および1120;1121および1122;1123および1124;1125および1126;1127および1128;1129および1130;1131および1132;1133および1134;1135および1136;1137および1138;1139および1140;1141および1142;1143および1144;1145および1146;1147および1148;1149および1150;1151および1152;1153および1154;1155および1156;1157および1158;1159および1160;1161および1162;1163および1164;1165および1166;1167および1168;1169および1170;1171および1172;1173および1174;1175および1176;1177および1178;1179および1180;1181および1182;1183および1184;1185および1186;1187および1188;1189および1190;1191および1192;1193および1194;1195および1196;1197および1198;1199および1200;1201および1202;1203および1204;1205および1206;1207および1208;1209および1210;1211および1212;1213および1214;1215および1216;1217および1218;1219および1220;1221および1222;1223および1224;1225および1226;1227および1228;1229および1230;1231および1232;1233および1234;1235および1236;1237および1238;1239および1240;1241および1242;1243および1244;1245および1246;1247および1248;1249および1250;1251および1252;1253および1254;1255および1256;1257および1258;1259および1260;1261および1262;1263および1264;1265および1266;1267および1268;1269および1270;1271および1272;1273および1274;1275および1276;1277および1278;1279および1280;1281および1282;1283および1284;1285および1286;1287および1288;1289および1290;1291および1292;1293および1294;1295および1296;1297および1298;1299および1300;1301および1302;1303および1304;1305および1306;1307および1308;1309および1310;1311および1312;1313および1314;1315および1316;1317および1318;1319および1320;1321および1322;1323および1324;1325および1326;1327および1328;1329および1330;1331および1332;1333および1334;1335および1336;1337および1338;1339および1340;1341および1342;1343および1344;1345および1346;1347および1348;1349および1350;1351および1352;1353および1354;1355および1356;1357および1358;1359および1360;1361および1362;1363および1364;1365および1366;1367および1368;1369および1370;1371および1372;1373および1374;1375および1376;1377および1378;1379および1380;1381および1382;1383および1384;1385および1386;1387および1388;1389および1390;1391および1392;1393および1394;1395および1396;1397および1398;1399および1400;1401および1402;1403および1404;1405および1406;1407および1408;1409および1410;1411および1412;1413および1414;1415および1416;1417および1418;1419および1420;1421および1422;1423および1424;1425および1426;1427および1428;1429および1430;1431および1432;1433および1434;1435および1436;1437および1438;1439および1440;1441および1442;1443および1444;1445および1446;1447および1448;1449および1450;1451および1452;1453および1454;1455および1456;1457および1458;1459および1460;1461および1462;1463および1464;1465および1466;1467および1468;1469および1470;1471および1472;1473および1474;1475および1476;1477および1478;1479および1480;1481および1482;1483および1484;1485および1486;1487および1488;1489および1490;1491および1492
    ;1493および1494;1495および1496;1497および1498;1499および1500 ;1501および1502;1503および1504;1505および1506;1507および1508
    ;1509および1510;1511および1512;1513および1514;1515および1516 ;1517および1518;1519および1520;1521および1522;1523および1524
    ;1525および1526;1527および1528;1529および1530;1531および1532 ;1533および1534;1535および1536;1537および1538;1539および1540
    ;1541および1542;1543および1544;1545および1546;1547および1548 ;1549および1550;1551および1552;1553および1554;1555および1556
    ;1557および1558;1559および1560;1561および1562;1563および1564 ;1565および1566;1567および1568;1569および1570;ならびに1571および1572のうちの1対を含む、二本鎖siRNA。
  40. 前記siRNAの少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである請求項39に記載のsiRNA.
  41. 前記siRNAの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている請求項39または40に記載のsiRNA。
  42. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下するための請求項39から41のいずれかに記載のsiRNA。
  43. 2本の鎖が、配列番号1573および1574;1575および1576;ならびに1577および1578のうちの1対を含む二本鎖siRNA。
  44. 少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである請求項43に記載のsiRNA.
  45. 前記siRNAのうちの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている、請求項43または44に記載のsiRNA。
  46. CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための請求項43から45のいずれかに記載のsiRNA。
  47. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項39から46のいずれかに記載のsiRNA。
  48. 請求項39から41のいずれかに記載のsiRNAを投与する工程を含む、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法。
  49. 請求項43から45のいずれかに記載のsiRNAを投与する工程を含む、患者におけるCR3ケモカンレセプター発現を低下させるための方法。
  50. 請求項39から46のいずれかに記載のsiRNAを投与する工程を含む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法。
  51. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための請求項39から41のいずれかに記載のsiRNAの用途。
  52. CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための請求項43から45のいずれかに記載のsiRNAの用途。
  53. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項39から46のいずれかに記載のsiRNAの用途。
  54. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための薬剤の調製における、請求項39から41のいずれかに記載のsiRNAの用途。
  55. CCR3ケモカインレセプター発現を低下させるための薬剤の調製における、請求項43から45のいずれかに記載のsiRNAの用途。
  56. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための薬剤の調製における、請求項39から46のいずれかに記載のsiRNAの用途。
  57. 好ましくはIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるために、配列番号:1634および1635;1636および1637;1638および1639;1640および1641;1642および1643;1644および1645;1646および1647;1648;1649および1650;1651および1652;1653および1654;1655および1656;1657および1658;1659;1660;1661;1662;1663;1664;1665;1666および1667;1668および1669;1670および1671;1672および1673;1674および1675;1676および1677;1678;1679および1680;1681および1682;1683および1684;1685および1686;1687および1688;1689および1690;1691および1692;1693;1694;1695および1696;1697;1698;1699および1700;1701;1702および1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710;1711;1712および1713;1714および1715;1716;1717および1718;1719;1720および1721;1722および1723;1724;1725および1726;1727;1728;1729および1730;1731および1732;1733および1734;1735;1736;1737;1738および1739;1740および1741;1742;1743および1744;1745;1746および1747;1748および1749;1750および1751;1752;1753;1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761および1762;1763;1764および1765;1766;1767および1768;1769;1770;1771;1772;1773;1774および1775;1776;1777;および1778からなる群より選択される1対のオリゴヌクレオチドまたは1つのオリゴヌクレオチドを含む二本鎖または一本鎖のmiRNA。
  58. 前記miRNAの少なくとも1つのヌクレオチドがFANAである請求項57に記載のmiRNA。
  59. 前記miRNAの少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドがDAPまたはその類縁体で置換されている請求項57または58に記載のmiRNA。
  60. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現の発現を低下させるための、請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNA。
  61. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNA。
  62. 請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNAを投与する工程を含む、患者におけるIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための方法。
  63. 請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNAを投与する工程を含む、患者における喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための方法。
  64. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための、請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNAの用途。
  65. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための、請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNAの用途。
  66. IL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニット発現を低下させるための薬剤の調製における、請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNAの用途。
  67. 喘息、COPD、アレルギー、CF、過好酸球増大症、炎症および癌のうちの少なくとも1つを治療および/または予防するための薬剤の調製における、請求項57から59のいずれかに記載の二本鎖または一本鎖のmiRNAの用途。
  68. オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つのヌクレオチドが2’−デオキシ−2’−フルオロアラビノヌクレオチド(FANA)であり、高度にストリンジェントな条件下でCCR3ケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列とハイブリダイズし得るアンチセンスオリゴヌクレオチド。
  69. オリゴヌクレオチド中の少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドが2’−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換されている、高度にストリンジェントな条件下でCCR3ケモカインレセプターならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列とハイブリダイズし得るアンチセンスオリゴヌクレオチド。
  70. (a)肺および低い毒性が求められる部位に対する投与用のオリゴヌクレオチドを特定する工程と;(b)少なくとも1つの非FANAヌクレオチドを対応するFANAヌクレオチドで置き換える工程、および/または少なくとも1つのアデノシンヌクレオチドを2−アミノ−2’−デオキシアデノシン(DAP)で置換する工程とを含む、哺乳動物に対して投与されるオリゴヌクレオチドの治療有効性対毒性比を改善するための方法。
  71. オリゴヌクレオチドの投与が肺で肺胞マクロファージを減少させる請求項70に記載の方法。
  72. オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合がリン酸ジエステル結合およびホスホロチオエート結合の両方を含み、高度にストリンジェントな条件下でCCR3ケモカインレセプター、ならびにIL−3、IL−5およびGM−CSFレセプターの共通のβサブユニットからなる群より選択されるタンパク質をコードする核酸配列とハイブリダイズし得るアンチセンスオリゴヌクレオチド。
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