JP2009529509A5

JP2009529509A5 -

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Publication number: JP2009529509A5
Application number: JP2008557672A
Authority: JP
Filing date: 2007-03-09
Publication date: 2010-02-25

Claims

・以下に示すアミノ酸のコンセンサス配列を含むペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、Ｗ、ＹまたはＳであり；
Ｘ_８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり；
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０は、プロリンの非保存的置換物であるか；
または、Ｘ_９およびＸ_１０が単一のアミノ酸で置換され；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡであり；
Ｘ_１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸である］、
および
・ＥＰＯミメティック活性を示し、かつ位置Ｘ_１０にプロリンの非保存的置換物を構成す
るアミノ酸を持つか、またはＸ_９およびＸ_１０が単一のアミノ酸で置換される、上記コン
センサス配列によって定義されるペプチドの機能的に等価なフラグメント、誘導体および
変種、
からなる群より選択される、ＥＰＯ受容体に結合することができるペプチド。
ＥＰＯ受容体に結合することができ、アゴニスト活性を含む、少なくとも１０アミノ酸
長のペプチドであって、以下の二つの選択肢から選択されるペプチド：
（ａ）以下に示すアミノ酸の配列を含むペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０は、プロリンの非保存的置換物であるか、またはＸ_９およびＸ_１０が単一のアミノ
酸で置換され；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡであり；
Ｘ_１３は、ナフチルアラニンである］
（ｂ）以下に示すアミノ酸の配列を含むペプチド、とりわけＥＰＯ受容体に結合すること
ができるもの：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_６は、Ｃ、Ａ、Ｅ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）であ
り；
Ｘ_７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷもしくはＹまたはＲ、Ｈ、Ｌ、Ｗ、ＹもしくはＳであり；
Ｘ_８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり；
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０は、プロリンの非保存的置換物であるか；
または、Ｘ_９およびＸ_１０が単一のアミノ酸で置換され；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、ＴまたはＡであり；
Ｘ_１３は、１−ｎａｌ、２−ｎａｌであり、
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、Ｃ、Ａ、Ｋ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）で
ある。
ただしＸ_６かＸ_１５のどちらかはＣまたはｈｏｃであるものとする］
（ｃ）ＥＰＯミメティック活性を示し、かつ位置Ｘ_１０にプロリンの非保存的置換物を構
成するアミノ酸を持つか、またはＸ_９およびＸ_１０が単一のアミノ酸で置換され、位置Ｘ
_１３にはナフチルアラニンを持つ、上記コンセンサス配列によって定義されるペプチドの
機能的に等価なフラグメント、誘導体および変種。
以下に示すアミノ酸のコア配列を含む、請求項２に記載のペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ_８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｙ、Ｈ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり
；
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０は、プロリンの非保存的置換物であるか、またはＸ_９およびＸ_１０が単一のアミノ
酸で置換され；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ_１３は、ナフチルアラニンであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸である］。
以下の追加アミノ酸位置を含む、請求項１〜３のいずれか一項に記載のペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、ＨａｒまたはＴから独
立して選択され；
Ｘ_１７は、任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｇ、Ｐ、Ｒ、Ｋ、Ｙ、Ｈａｒから独立して選
択され；
Ｘ_１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択され；
Ｘ_１９は、任意のアミノ酸から独立して選択される］。
位置Ｘ_１０、Ｘ_１７および／またはＸ_１９の荷電アミノ酸が正または負に荷電していて
、天然アミノ酸、非天然アミノ酸および誘導体化アミノ酸からなる群より選択される、請
求項３または４のいずれか一項に記載のペプチド。
請求項５に記載のペプチドであって、
（ａ）前記負荷電アミノ酸が、
・天然負荷電アミノ酸、とりわけＤまたはＥ；
・好ましくは、Ａａｄ、２−アミノヘプタン二酸、Ａｓｕなどの伸長された側鎖を示す、
非天然負荷電アミノ酸；
・元々は正荷電アミノ酸であるが、負荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択され
（ｂ）前記正荷電アミノ酸が、
・天然正荷電アミノ酸、例えばリジン、アルギニン、ヒスチジンまたはオルニチン；
・位置Ｘ _１０および／またはＸ _１７において、好ましくは、例えばホモアルギニンに見ら
れるような伸長された側鎖を示す、非天然正荷電アミノ酸；
・元々は負荷電アミノ酸であるが、正荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択される
ことを特徴とする、ペプチド。
ＥＰＯ受容体に結合することができ、アゴニスト活性を含む、少なくとも１０アミノ酸
長のペプチドであって、
・以下に示すアミノ酸のコア配列の少なくとも一つを含むペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、位置Ｘ_１０、Ｘ_１７またはＸ_１
_９の少なくとも一つは負荷電アミノ酸であり、
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ_１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、ＨａｒまたはＴから独
立して選択され；
Ｘ_１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択される］；
・ＥＰＯミメティック活性を示し、かつ位置Ｘ_１０、Ｘ_１７またはＸ_１９の少なくとも一
つが負荷電アミノ酸である、上記コンセンサス配列によって定義されるペプチドの機能的
に等価なフラグメント、誘導体および変種
からなる群より選択されるペプチド。
以下の拡大されたコンセンサス配列を含む、請求項７に記載のペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ_８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｙ、Ｈ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり
；
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０が負荷電アミノ酸でない場合、Ｘ_１０はプロリン、プロリンの保存的置換物または
プロリンの非保存的置換物であるか、またはＸ_９およびＸ_１０が単一のアミノ酸で置換さ
れ；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ_１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、Ｓ、ＨａｒまたはＴから独
立して選択され；
Ｘ_１７が負荷電アミノ酸でない場合、Ｘ_１７は任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｇ、Ｐ、
Ｙまたは正電荷天然、非天然または誘導体化アミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈ、オルニチ
ンまたはホモアルギニンから選択され；
Ｘ_１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択され；
Ｘ_１９が負荷電アミノ酸でない場合、Ｘ_１９は任意のアミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈ、
オルニチンまたはホモアルギニンなどの正荷電アミノ酸から独立して選択される。
ただしＸ_１０、Ｘ_１７またはＸ_１９の少なくとも一つ、好ましくはＸ_１９は、負荷電アミ
ノ酸であるものとする］。
前記負荷電アミノ酸が、
・天然負荷電アミノ酸、とりわけＤまたはＥ；
・好ましくは、Ａａｄ、２−アミノヘプタン二酸、Ａｓｕなどの伸長された側鎖を示す、
非天然負荷電アミノ酸；
・元々は正荷電アミノ酸であるが、負荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択されることを特徴とする、請求項７または８に記載のペプチド。
位置Ｘ_１０、Ｘ_１７および／またはＸ_１９の少なくとも一つに正荷電アミノ酸が存在す
る場合、それが、
・天然正荷電アミノ酸、例えばリジン、アルギニン、ヒスチジンおよびオルニチン；
・位置Ｘ_１０および／またはＸ_１７において、好ましくは、例えばホモアルギニンに見ら
れるような伸長された側鎖を示す、非天然正荷電アミノ酸；
・元々は負荷電アミノ酸であるが、正荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択されることを特徴とする、請求項７〜９のいずれか一項に記載の
ペプチド。
からなる群より選択される、請求項７〜１０の少なくとも一つに記載のペプチド。
ＥＰＯ受容体に結合することができ、アゴニスト活性を含む、少なくとも１０アミノ酸
長のペプチドであって、以下に示すペプチドの群から選択されるペプチド：
（ａ）以下に示すアミノ酸のコア配列を含むペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ_１３は、Ｗ、ナフチルアラニン、ＡまたはＦであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸である］
ならびに、ＥＰＯミメティック活性を示す、上記コンセンサス配列によって定義されるペ
プチドの機能的に等価なフラグメント、誘導体および変種（位置Ｘ_１０、Ｘ_１６、Ｘ_１７
またはＸ_１９の少なくとも一つは、リジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タン
パク質構成アミノ酸を表す）；
（ｂ）以下に示すアミノ酸の配列を含むペプチド、とりわけＥＰＯ受容体に結合すること
ができるもの：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_６は、Ｃ、Ａ、Ｅ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）であ
り；
Ｘ_７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ_８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり；
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０は、Ｈａｒであり、
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、ＴまたはＡであり；
Ｘ_１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、Ｃ、Ａ、Ｋ、α−アミノ−γ−ブロモ酪酸またはホモシステイン（ｈｏｃ）で
ある。
ただしＸ_６かＸ_１５のどちらかはＣまたはｈｏｃであるものとする］；
（ｃ）以下のアミノ酸配列を含むペプチド

［Ｘ_６〜Ｘ_１５は、変種（ｂ）の上記の意味を持ち、
Ｘ_３は、任意のアミノ酸、好ましくはＤ、Ｅ、Ｌ、Ｎ、Ｓ、ＴまたはＶから独立して選択
され；
Ｘ_４は、Ｙであり；
Ｘ_５は、任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｈ、Ｋ、Ｌ、Ｍ、Ｓ、ＴまたはＩから独立して
選択され．
Ｘ_１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、ＳまたはＴから独立して選
択され；
Ｘ_１７は、ホモアルギニンであり；
Ｘ_１８は、任意のアミノ酸から独立して選択される］。
以下に示すアミノ酸のコア配列を含む、請求項１２に記載のペプチド：

［各アミノ酸は天然または非天然アミノ酸から選択され、
Ｘ_６は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくはα
−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_７は、Ｒ、Ｈ、Ｌ、ＷまたはＹまたはＳであり；
Ｘ_８は、Ｍ、Ｆ、Ｉ、Ｙ、Ｈ、ホモセリンメチルエーテルまたはノルイソロイシンであり
；
Ｘ_９は、ＧまたはＧの保存的置換物であり；
Ｘ_１０がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ_１０はプロリン、プロリンの保存的置換物またはプロリンの非保存的置換物であ
るか、またはＸ_９およびＸ_１０が単一のアミノ酸で置換され；
Ｘ_１１は、任意のアミノ酸から選択され；
Ｘ_１２は、非荷電極性アミノ酸またはＡ、好ましくはスレオニン、セリン、アスパラギン
またはグルタミンであり；
Ｘ_１３は、Ｗ、１−ｎａｌ、２−ｎａｌ、ＡまたはＦであり；
Ｘ_１４は、Ｄ、Ｅ、Ｉ、ＬまたはＶであり；
Ｘ_１５は、共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸またはＡもしくは
α−アミノ−γ−ブロモ酪酸であり；
Ｘ_１６がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ_１６は、任意のアミノ酸、好ましくはＧ、Ｋ、Ｌ、Ｑ、Ｒ、ＳまたはＴから独立
して選択され；
Ｘ_１７がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ_１７は任意のアミノ酸、好ましくはＡ、Ｇ、Ｐ、Ｙまたは正荷電天然、非天然も
しくは誘導体化アミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈまたはオルニチンから選択され；
Ｘ_１８は、任意のアミノ酸、好ましくはＬまたはＱから独立して選択され；
Ｘ_１９がリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸でない
場合、Ｘ_１９は、任意のアミノ酸、好ましくはＫ、Ｒ、Ｈまたはオルニチンなどの正荷電
アミノ酸から独立して選択される。
ただしＸ_１０、Ｘ_１６、Ｘ_１７またはＸ_１９の少なくとも一つは、リジンと比較して伸長
された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸であるものとする］。
Ｘ_１０、Ｘ_１６、Ｘ_１７またはＸ_１９の少なくとも一つが正荷電アミノ酸であり、その
正荷電アミノ酸が、好ましくは、
・天然正荷電アミノ酸、例えばリジン、アルギニン、ヒスチジンおよびオルニチン；
・好ましくはリジンと比較して伸長された側鎖を示す、非天然正荷電アミノ酸；
・元々は負荷電アミノ酸であるが、正荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの；
からなる群より選択される（ただしＸ_１０、Ｘ_１６、Ｘ_１７またはＸ_１９の少なくとも一
つはリジンと比較して伸長された側鎖を持つ正荷電非タンパク質構成アミノ酸であるもの
とする）、請求項１３に記載のペプチド。
Ｘ _１０、Ｘ _１７および／またはＸ _１９が負荷電アミノ酸であり、そしてここで前記負荷電アミノ酸が、
・天然負荷電アミノ酸、とりわけＤまたはＥ；
・好ましくは、Ａａｄ、２−アミノヘプタン二酸、Ａｓｕなどの伸長された側鎖を示す、
非天然負荷電アミノ酸；
・元々は正荷電アミノ酸であるが、負荷電基が付与されるように適切な化学基で誘導体化
されたもの
からなる群より選択されることを特徴とする、請求項１４に記載のペプチド。
ターゲット分子に結合する化合物であって、
（ｉ）少なくとも二つのペプチドユニットであって、各ペプチドユニットがターゲットへ
の結合能を持つ少なくとも二つのドメインを含むもの；
（ｉｉ）少なくとも一つポリマー担体ユニット；
を含み、前記ペプチドユニットが前記ポリマー担体ユニットに取り付けられ、少なくとも
一つのペプチドユニットの少なくとも一つのドメインが請求項１〜１５の少なくとも一つ
に記載のペプチドである化合物。
少なくとも一つのペプチドユニットが、請求項１〜１４の少なくとも一つに記載の少な
くとも一つの単量体型ペプチドコンセンサス配列を含むペプチド二量体を含む、請求項１
６に記載の化合物。
単量体型ペプチドユニットを二量体化してＥＰＯミメティックペプチド二量体を形成さ
せるための方法であって、単量体型ペプチドユニット間に共有結合を形成させることによ
って二量体が作製され、前記結合が第１単量体型ペプチドユニットのＣ末端アミノ酸と第
２単量体型ペプチドユニットのＮ末端アミノ酸との間に形成される方法。
共有結合を形成することができる側鎖官能性を持つアミノ酸をＣ末端またはＮ末端に保
持する単量体型ペプチドユニットが使用され、共有結合が、第１単量体型ペプチドユニッ
トのＣ末端アミノ酸の側鎖と、第２単量体型ペプチドユニットのＮ末端アミノ酸の側鎖と
の間に形成される、請求項１８に記載の方法。