JP2008523791A - 農作物の真菌病の処置のためのメチオニンシンターゼ阻害剤の使用 - Google Patents
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Abstract
Description
配列番号1:マグナポルテ・グリセアメチオニンシンターゼ遺伝子
配列番号2:マグナポルテ・グリセアメチオニンシンターゼcDNA
配列番号3:マグナポルテ・グリセアメチオニンシンターゼタンパク質配列
配列番号4:Met6−5プライマー
配列番号5:Met6−6プライマー
配列番号6:HphRP10プライマー
配列番号7:Met6−7プライマー
配列番号8:Met6−10プライマー
配列番号9:dCGS−hph−end(−)プライマー
配列番号10:Met6−8プライマー
配列番号11:Met6−9プライマー
配列番号12:Met6−1プライマー
配列番号13:Met6−2プライマー
配列番号14:Met6−3プライマー
配列番号15:Met6−4プライマー
配列番号16:トウモロコシ黒穂病菌メチオニンシンターゼ遺伝子
配列番号17:トウモロコシ黒穂病菌メチオニンシンターゼcDNA
配列番号18:トウモロコシ黒穂病菌メチオニンシンターゼタンパク質配列
配列番号19:フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophtora infestans)メチオニンシンターゼEST配列
配列番号20:推定フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophtora infestans)メチオニンシンターゼタンパク質配列
小麦、以下の種子病害を防除することに関して:フザリア(ミクロドキウム・ニバル(Microdochium nivale)及びフザリウム・ロゼウム(Fusarium roseum))、なまぐさ黒穂病(ティレティア・カリエス(Tilletia caries)、ティレティア・コントロバーサ(Tilletia controversa)又はティレティア・インディカ(Tilletia indica))、セプトリア病(セプトリア・ノドラム(Septoria nodorum));裸黒穂病(ウスチラゴ・トリティキ(Ustilago tritici));
小麦、植物の地上部分の以下の病害を防除することに関して:穀類眼紋病(タペシア・ヤルンダ(Tapesia yallundae)、タペシア・アクイフォルミス(Tapesia acuiformis))、立ち枯れ病(ゲウマノミセス・グラミニス(Gaeumannomyces graminis))、胴枯れ病(foot blight)(F.セルモラム(F. culmorum)、F.グラミネアラム(F. graminearum))、赤かび病(F.セルモラム、F.グラミネアラム、ミクロドキウム・ニバル)、黒斑病(black speck)(リゾクトニア・セレアリス(Rhizoctonia cerealis))、うどん粉病(トリティキ種エリシフェ・グラミニス・フォルマ(Erysiphe graminis forma specie tritici))、さび病(プキニア・ストリイフォルミス(Puccinia striiformis))及びプキニア・レコンディタ(Puccinia recondite))及びセプトリア病(セプトリア・トリティキ(Septoria tritici)及びセプトリア・ノドラム)、網斑病(ドレクスレラ・トリティキ−レペンティス(Drechslera tritici−repentis));
大麦、以下の種子病害を防除することに関して:網斑病(ピレノフォラ・グラミネア(Pyrenophora graminea)、ピレノフォラ・テレス(Pyrenophora teres)及びコクリオボラス・サティバス(Cochliobolus sativus))、裸黒穂病(ウスティラゴ・ヌーダ(Ustilago nuda))及びフザリウム病(ミクロドキウム・ニバル及びフザリウム・ロゼウム(Fusarium roseum));
大麦、植物の地上部分の以下の病害を防除することに関して:穀類眼紋病(タペシア・ヤルンダ)、網斑病(ピレノフォラ・テレス及びコクリオボラス・サティバス)、うどん粉病(ホルデイ種エリシフェ・グラミニス・フォルマ(Erysiphe graminis forma specie hordei))、小さび病(プキニア・ホルデイ(Puccinia hordei))及び葉枯れ病(リンコスポリウム・セカリス(Rhynchosporium secalis));
ジャガイモ、塊茎疾患(特にヘルミントスポリウム・ソラニ(Helminthosporium solani)、フォーマ・ツベローサ(Phoma tuberosa)、リゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani)、フザリウム・ソラニ(Fusarium solani))、及びうどん粉病(フィトフトラ・インフェスタンス(Phytophtora infestans))を防除することに関して;
ジャガイモ、以下の茎葉疾患を防除することに関して、夏疫病(アルテナリア・ソラニ(Alternaria solani))、うどん粉病(フィトフトラ・インフェスタンス);
綿、種子から成長した幼植物の以下の疾患を防除することに関して、立ち枯れ病及び斑点落葉病(collar rot)(リゾクトニア・ソラニ(Rhizoctonia solani)、フザリウム・オキシスポラム(Fusarium oxysporum))、黒根病(チエラビオプシス・バシコラ(Thielaviopsis basicola));
タンパク質生成作物、例えばエンドウ豆、以下の種子疾患を防除することに関して、炭疽病(アスコキタ・ピシ(Ascochyta pisi)、ミコスフェレラ・ピノデス(Mycosphaerella pinodes))、フザリウム病(フザリウム・オキシスポラム)、灰色かび病(ボツリティス・シネレア(Botrytis cinerea))、うどん粉病(ペロノスポラ・ピシ(Peronospora pisi));
油生成作物、例えば菜種、以下の種子疾患を防除することに関して、フォーマ・リンガム(Phoma lingam)、アルテルナリア・ブラシカ(Alternaria brassicae)及びスクレロティニア・スクレロティオラム(Sclerotinia);
トウモロコシ、種子疾患(リゾプス種(Rhizopus sp.)、ペニシリウム種(Penicillium sp.)、トリコデルマ種(Trichoderma sp.)、アスペルギルス種(Aspergillus sp.)及びギベレラ・フジクロイ(Gibberella fujikuroi))を防除することに関して;
亜麻、種子疾患を防除することに関して、アルテルナリア・リニコラ(Alternaria linicola);
林木、立ち枯れ病(フザリウム・オキシスポラム、リゾクトニア・ソラニ)を防除することに関して;
イネ、地上部分の以下の病害を防除することに関して、いもち病(マグナポルテ・グリセア)、黒斑病(リゾクトニア・ソラニ);
野菜作物、種子又は種子から成長した幼植物の以下の疾患を防除することに関して、立ち枯れ病及び斑点落葉病(フザリウム・オキシスポラム、フザリウム・ロゼウム、リゾクトニア・ソラニ、ピチウム種(Pythium sp.));
野菜作物、地上部分の以下の病害を防除することに関して、灰色かび病(ボツリティス種(Botrytis sp.))、うどん粉病(特にエリシフェ・シコラセアラム(Erysiphe cichoracearum)、スフェロテカ・フリギニエ(Sphaerotheca fuliginea)、レヴェイルラ・タウリカ(Leveillula taurica))、フザリウム病(フザリウム・オキシスポラム、フザリウム・ロゼウム)、葉枯れ病(クラドスポリウム種(Cladosporium sp.))、アルテルナリア斑点病(アルテルナリア種(Alternaria))、炭疽病(コレトトリカム種(Colletotrichum sp))、セプトリア葉枯れ病(セプトリア種(Septoria sp.))、黒斑病(リゾクトニア・ソラニ)、うどん粉病(例えばブレミア・ラクチュカ(Bremia lactucae)、ペロノスポラ種(Peronospora sp.)、シュードペルノスポラ種(Pseudoperonospora sp.)、フィトフトラ種(Phytophthora sp.));
果樹、地上部分の病害に関して、モニリア病(モニリア・フルクチゲナ(Monilia fructigenae)、M.ラクサ(M.laxa))、そうか病(ベンチュリア・イナクアリス(Venturia inaequalis))、うどん粉病(ポドスファエラ・リューコトリカ(Podosphaera leucotricha));
ブドウ、茎葉病害に関して、特に灰色かび病(ボツリティス・シネレア(Botrytis cinerea))、うどん粉病(ウンキヌラ・ネカトル(Uncinula necator))、胴枯れ病(ギグナルディア・ビウェリ(Guignardia biwelli))、うどん粉病(プラスモパラ・ヴィティコラ(Plasmopara viticola));
ビートの根、地上部分の以下の病害に関して、セルコスポラ病(セルコスポラ・ベティコラ(Cercospora beticola))、うどん粉病(エリシフェ・ベティコラ(Erysiphe beticola))、葉枯れ病(ラムラリア・ベティコラ(Ramularia beticola))
が挙げられる。
A.ニデュランス7(NCBI、アクセッション番号:AAF82115)のメチオニンシンターゼのタンパク質配列をモデルとして使用して、マグナポルテ・グリセアV2型のゲノムにおいてメチオニンシンターゼ遺伝子を特定した。コンティグ2.150(MG_コンティグ_2.150、6196−8629位、相補鎖、配列番号1)に位置するメチオニンシンターゼ遺伝子の完全なヌクレオチド配列は、766アミノ酸のポリペプチド(配列番号3)をコードする2301bpのcDNA(配列番号2)に対応する3個のエクソンを含む。この遺伝子の配列及び最終的メッセンジャーを生じさせるスプライシングは、様々な公的及び私的ベースで特定される数多くのESTの効力によって確認することができる。マグナポルテ・グリセアメチオニンシンターゼは、A.ニデュランスにおけるように71個の遺伝子によってコードされる。推定cDNAから推測される一次タンパク質配列の分析は、S.セレビシエ(P05694)、A.ニデュランス(AAF82115)、大腸菌(P13009)及びシロイヌナズナ植物(AAF00639)のビタミンB12非依存性メチオニンシンターゼと48%から79%の相同性を示す。
マグナポルテ・グリセアの発生及び感染過程におけるメチオニンシンターゼ遺伝子の役割の検討を、この遺伝子の欠失突然変異体の表現型を試験することによって実施した。欠失突然変異体を得るための戦略は、MET6遺伝子を、MET6オープンリーディングフレームが形質転換体の選択のための抗生物質(ハイグロマイシン)に対する耐性のためのカセットで置換された突然変異型対立遺伝子で置換することに基づく。
一次形質転換体を、ハイグロマイシンの存在下で発生するこれらの能力に関して選択する。1mMメチオニンを添加した又は添加していない、ハイグロマイシンを含む最小培地での形質転換体の異なる増殖を測定することにより、met6Δ::hph突然変異体の特定を実施した。met6Δ::hph突然変異体はこの最小培地で発生することができないが、メチオニンを添加したこの最小培地では正常に増殖する。突然変異体の発生率は、我々の実験条件下で分析した一次形質転換体の約20%である。これらの突然変異体を、その後、単胞子(monosphores)の単離によって遺伝的に精製する。
PCR及びサザンハイブリダイゼーションによるMET6遺伝子の分子分析を実施するために使用するゲノムDNAを抽出するために、メチオニン(1mM)を含む培地でmet6Δ::hph突然変異体を培養する。
マグナポルテ・グリセアmet6Δ::hph突然変異体の病原力を、生存条件下の大麦の葉に関して及び大麦及びイネ植物全体に関する感染試験によって評価した。この分析の後に、胞子発芽率、付着器分化及び大麦葉への貫入測定を実施した。P1.2野生型株及びmet6Δ::hph突然変異体4.1、15.1、22.1、23.1及び24.1の胞子を、1mMを含む米粉ベースの培地での14日間の増殖後に採取する。使用する植物材料は、大麦(cv.Express)及びイネ(cv.Sariceltik)である。
本発明の方法は、この作用が、直接又は間接的手法(メチオニンシンターゼの活性を測定するための「共役」酵素の使用を含む)に従って定量される基質の消費又は生成物の形成を阻害する全ての分子の特性決定を含む。メチオニンシンターゼは、文献12、13、14、15、27に記述されている公知のアッセイに従って様々な補因子(リン酸塩、マグネシウム、亜鉛)の存在下で、ホモシステイン、メチルテトラヒドロ葉酸(n=1)又はこのポリグルタミン酸誘導体(n≧3)の存在下で不可逆的反応を触媒する。この方法は、逆相HPLCクロマトグラフィーによって化合物を分離するための手法16により、生産されるメチオニン又は葉酸誘導体を定量することを含む。メチルテトラヒドロ葉酸基質は手順17に述べられている実験条件下で検出可能ではないので、テトラヒドロ葉酸がメテニルテトラヒドロ葉酸に変換された後、反応の間に生産されたテトラヒドロ葉酸の検定を350nmの分光光度計で実施することができる。提案される代替法は、S−アデノシルメチオニンシンテターゼの存在下でメチオニンシンターゼ活性を検定することである。このアッセイでは、マグナポルテ・グリセアのS−アデノシルメチオニンシンテターゼ(AdoMetS)が好ましく使用されるが、いかなるAdoMetSも「共役」酵素として使用できる。AdoMetS酵素は、メチオニン、ATP及びマグネシウムの存在下で、S−アデノシルメチオニン(SAM)、リン酸塩及びピロリン酸塩を生産する不可逆的反応を触媒する。
大量のメチオニンシンターゼの生産は、細菌又は酵母におけるタンパク質の過剰生産のための発現ベクターを使用する手法を用いて実施される。この手法は、好ましくはタンパク質のN末端又はC末端にヒスチジンタグ延長部を組み込むことを可能にする発現ベクターへのcDNAのクローニングを用いる。例えばpET−28b(+)ベクター(Novagen)24を選択するとき、従来の分子生物学手法に従って2301bpのcDNAをNdEI及びEcoRIにクローニングする。pET−28−MgMET6と呼ばれる、得られた構築物を大腸菌BL21型DE3(pLysS)菌株に導入し、IPTG(0.5mM)による誘導後に発現を生じさせる。組換え細菌を28℃で4時間培養する。その後遠心分離によって細胞を収集し、得られたペレットをタンパク質の安定性に適した溶解緩衝液に再懸濁する。試料の超音波処理後、遠心分離後に得られる、組換えタンパク質を含む可溶性分画をNi−NTAアガロース型のカラムに負荷する。次に、マトリックスをイミダゾール溶液で数回連続的に洗浄した後、酵素の精製及び溶出を実施する。手順はQiagenによって定義されたプロトコール25に従う。
Claims (28)
- 有効量のメチオニンシンターゼ阻害剤を施用することを特徴とする、真菌病に対して作物を処置するための方法。
- メチオニンシンターゼが真菌由来であることを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- メチオニンシンターゼがマグナポルテ・グリセア(Magnaporthe grisea)に由来することを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- メチオニンシンターゼが配列番号3を含む、請求項3に記載の方法。
- メチオニンシンターゼが、配列番号1又は配列番号2を含む配列によってコードされる、請求項3に記載の方法。
- メチオニンシンターゼがトウモロコシ黒穂病菌(Ustilago maydis)に由来することを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- メチオニンシンターゼが配列番号18を含む、請求項6に記載の方法。
- メチオニンシンターゼが、配列番号16又は配列番号17を含む配列によってコードされる、請求項6に記載の方法。
- メチオニンシンターゼがフィトフトラ・インフェスタンス(Phytophthora infestans)に由来することを特徴とする、請求項2に記載の方法。
- メチオニンシンターゼが配列番号20を含む、請求項9に記載の方法。
- メチオニンシンターゼが、配列番号19を含む配列によってコードされる、請求項9に記載の方法。
- メチオニンシンターゼ阻害剤が抗真菌組成物の形態である、請求項1から11のいずれか一項に記載の方法。
- メチオニンシンターゼ阻害剤と抗真菌化合物を含むことを特徴とする、抗真菌組成物。
- メチオニンシンターゼ阻害剤を使用することを特徴とする、抗真菌組成物を生産するための方法。
- メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定を含む、抗真菌化合物を調製するための方法。
- メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
前記化合物を、ホモシステイン及びメチルテトラグルタメート又はこのポリグルタミン酸誘導体、及び補因子の存在下でメチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
前記酵素活性を測定する工程
を含む、請求項15に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
前記化合物を、ホモシステイン及びメチルテトラグルタメート又はこのポリグルタミン酸誘導体、及び補因子の存在下でメチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
メチオニンの形成を測定する工程
を含む、請求項16に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
前記化合物を、ホモシステイン、メチルテトラヒドロ葉酸及びリン酸塩、マグネシウム及び亜鉛の存在下でメチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
メチオニンの形成を測定する工程
を含む、請求項17に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
前記化合物を、ホモシステイン、メチルテトラヒドロ葉酸又はこのポリグルタミン酸誘導体、S−アデノシル−メチオニンシンテターゼ、ATP及びMg、及び補因子の存在下でメチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
S−アデノシル−メチオニン、リン酸塩又はピロリン酸塩の形成を測定する工程
を含む、請求項15に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
前記化合物を、ホモシステイン、メチルテトラヒドロ葉酸又はこのポリグルタミン酸誘導体、S−アデノシル−メチオニンシンテターゼ、ATP及びMg、及び補因子の存在下でメチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
リン酸塩の形成を測定する工程
を含む、請求項19に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
宿主生物においてメチオニンシンターゼを発現させる工程;
前記宿主生物によって生産されたメチオニンシンターゼを精製する工程;
前記化合物を、ホモシステイン及びメチルテトラヒドロ葉酸又はこのポリグルタミン酸誘導体、及び補因子の存在下で前記精製メチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
酵素活性を測定する工程
を含む、請求項15に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
宿主生物においてメチオニンシンターゼを発現させる工程;
前記宿主生物によって生産されたメチオニンシンターゼを精製する工程;
前記化合物を、ホモシステイン、メチルテトラヒドロ葉酸及びリン酸塩、マグネシウム及び亜鉛の存在下で前記精製メチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
メチオニンの形成を測定する工程
を含む、請求項21に記載の方法。 - メチオニンシンターゼの酵素活性を阻害する化合物の特定が、以下の工程、
宿主生物においてメチオニンシンターゼを発現させる工程;
前記宿主生物によって生産されたメチオニンシンターゼを精製する工程;
前記化合物を、ホモシステイン及びメチルテトラヒドロ葉酸又はこのポリグルタミン酸誘導体、S−アデノシル−メチオニンシンテターゼ、ATP及びMg、及び補因子の存在下で前記精製メチオニンシンターゼと接触させる工程;及び
S−アデノシル−メチオニン、リン酸塩又はピロリン酸塩の形成を測定する工程
を含む、請求項15に記載の方法。 - メチオニンシンターゼが真菌由来であることを特徴とする、請求項15から23のいずれか一項に記載の方法。
- 発現されるメチオニンシンターゼが、配列番号1、配列番号2、配列番号16、配列番号17及び/又は配列番号19を含む配列から選択されるポリヌクレオチドによってコードされる、請求項24に記載の方法。
- 発現されるメチオニンシンターゼが、配列番号3、配列番号18及び/又は配列番号20を含む配列から選択される、請求項24に記載の方法。
- MSの酵素活性を阻害する前記化合物が、真菌の増殖及び/又は病原性を阻害するかどうかを測定する追加工程を含む、請求項15から26のいずれか一項に記載の方法。
- 請求項15から27のいずれか一項に記載の方法の一つによって特定されるメチオニンシンターゼ阻害剤。
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