JP2005532533A - 固定化の改善ための官能化組成物 - Google Patents

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Abstract

本発明は、2〜1000個の原子長のリンカー基に連結する1個または複数の新規反応基による、生体分子、ポリマー組成物、有機/無機分子/材料などの、その組合せを含む2つ以上のエンティティの改善された共有結合的カップリングに関する。本発明はまた、橋かけ分子の官能基が本発明の新規の反応性基である、2種以上のエンティティを結合するための二官能性橋かけ分子も考慮する。

Description

関連出願
(関連出願の相互引用)
本出願は2001年11月14日出願の米国仮出願番号第60/331,312号に対する優先権を主張するものである。その開示全体を参照により本明細書に組み込む。
本発明は、2〜1000個の原子長のリンカー基に連結した1個または複数の新規反応基による、生体分子、ポリマー組成物、有機/無機分子/材料など、およびその組合せを含めた2つ以上のエンティティの改善された共有結合的カップリングに関する。
エンティティ(酵素、抗体、タンパク質、DNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、化学発光性化合物、デンドリマー、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、膜(合成または天然)、フラーレン、ナノチューブなど)の固定化は活性化された固体表面との単純な共有結合反応によって実施できる。例えば、粒子(例えばミクロスフェアおよびナノスフェア;任意の大きさ、形状または組成を有する1種もしくは複数の金属を含む金属粒子;半導体粒子、分子インプリントポリマー(MIPS)、磁性粒子;または着色材料)またはマイクロタイタープレートは固定化システムにおける、一般的な固体マトリックスである。活性のある官能化された表面の調製と保持は、高感度アッセイを開発するための十分な生物学的材料の確実な固定化に重要な要素である。現在の固体表面への生体分子の固定化手順では、活性化アミノ基もしくはカルボキシル基誘導固体表面とアミノもしくはチオール修飾生体分子との反応を用いる。活性化後、または官能化スペーサの導入後、これらの基は直接結合部位を提供する。ほとんどの官能基(NHSエステル、イソチオシアナートなど)は水性雰囲気で加水分解しやすく、1時間足らずで活性でなくなる(すなわち化学的に不活性化される)。
反応性ミクロスフェアまたは官能化ミクロスフェアは、通常適切に官能化されたモノマーの共重合、または予備形成されたミクロスフェアの後化学修飾によって製造される。後官能化はUpson(J.Polym.Sci.,Polym.Symp.1985年、72,45)によって先に述べられているように反応性粒子を調製するための一般的な方法である。
タンパク質、オリゴヌクレオチドなどの生体巨大分子のアフィニティクロマトグラフィー、固相合成および固定化の分野における、ここ30年間での進歩によって、ミクロスフェアに基づいた生物医学的応用分野がもたらされた。様々な特製の粒子の製造と評価に関するより最近の研究が、Margelら(J.Polym.Sci.1991年、A−29、347〜355頁;Anal.Biochem.1981年、128、342〜350頁)、Ugelstadら(Makromol.Chem.1979年、第180巻、737〜44頁;Adv.Colloid Interface Sci.1980年、13,102〜140頁)およびRembaumら(Br.Polym.J.1978年、10、275〜280頁;J.Macromol.Sci.Chem.1979年、A−13、603〜632頁)を含む複数のグループによって報告されていた。R.Arshadyによる総説(Biomaterials、1993年、14、5〜15頁)には、反応性があり、かつ標識化したミクロスフェアの合成および物理化学的特性が記載されている。
蛍光性ミクロスフェアに基づいた多重分析のためのアッセイが複数のグループ(FultonらのClin.Chem.1997年、43、1749〜56頁;KettmanらのCytometry、1998年、33、234〜43頁;McDadeらのMed.Dev.Diag.Indust.1997年、第19巻4号、75〜82頁;McHugh、Methods Cell Biol.1994年、42、575〜95頁;NikiforovらのNucleic Acid Res.11994、22、4167〜75頁;米国特許第6,449,562号;同5,981,180号、同6,046,807号、同6,057,107号、同6,268,222号、同6,366,354号、同6,411,904号、同5,736,330号、同6,139,800号)によって報告されている。
Frayらは、粒子を加水分解耐性のあるアルデヒド官能基で予備活性化する戦略を報告しているが、これらのミクロスフェアでは<8%の低い反応収率が観察されている(Bioconjugate Chem.1999年、10、562〜71頁)。Beckman Coulter,Inc.のMiltonは、室温でのフッ化アシル活性化ポリマー表面とアミノ誘導生体分子との反応を報告している(米国特許第6,146,833号、2000年11月14日)。アミド、ペプチド、ヒドロキサム酸、アミン、ウレタン、カーボネート、スルホンアミドとα置換カルボニル化合物の固相合成におけるフルオロフェニル樹脂の使用が公開されている(国際特許出願第99/67228号)。
Medvedkinらは、ペプチド合成でスルホ−テトラフルオロフェニル活性化エステルを使用し、水性貯蔵条件下での良好な安定性と相まったその反応性を実証している(Bioorg.Khim.1995年、第21巻9号、684〜90頁)。本出願以前には明らかに、この薬品によるポリスチレン表面の予備活性化はまだ報告されていない。
Hoechstは1950年(西ドイツ特許第DBP960,534号)に、セルロース繊維と羊毛繊維を染色するための反応性ビニルスルホン(VS)修飾染料の使用を特許請求している。Siegelによる総説で、ビニルスルホン(VS)ならびに保護された2−スルファトエチルや2−チオスルファトエチルスルホン系の反応性染料の全般的な説明がなされている(E.Siegel in The Chemistry of Synthetic Dyes 第VI巻、(Ed.K Venkataraman);2−108,Academic Press、1972年)。Sterling Winthrop IncはPEG−支持ビニルスルホンを用いたタンパク質の修飾を実証している(米国特許第5,414,135号)。
生体分子(オリゴヌクレオチド、タンパク質または炭化水素など)を蛍光性ミクロスフェア上に固定化するために最も頻繁に使用される方法は、表面のカルボキシ基を活性化することによるものである。活性化は、過剰のEDCとカップリングpH4〜6を必要とする。反応は、カルボジイミドとカルボキシル基の間での、活性化されたO−アシル尿素誘導体の中間形成を伴う。続く生体分子のアミノ基の第一窒素による求核的攻撃により、置換された尿素の放出を伴ってアミド結合が形成される。O−アシル尿素生成の最適pHは約pH4〜5である。中間体の半減期は非常に短く、中間体は急速に加水分解を受ける、あるいは転移してN−アシル尿素付加体を生成する。求核試薬の第一アミノ基は約pH4〜5で大部分プロトン化され、したがってほとんど反応性がない。これらの制約によりカップリング収率が大幅に制限される。核酸塩基は低いpHで強いプロトン化を受ける。この種のプロトン化はらせん体の疎水性核を暴露するDNAの融解を誘発し、固体マトリックスとの非特異的な疎水性相互作用を増進させる。これらの欠点にも関わらず、EDC媒介カップリングは現在、生体分子の固体表面への共有結合固定化の主要な方法である(Hermanson,G.T.in Bioconjugate Techniques、Academic Press;N.Y.1996年;Andreas FreyらのBioconjugate Chem.1999年、10、562〜71頁;Maxime A.GillesらのAnal.Biochem.1990年、184、244〜48頁;Vivien W.F.ChanらのBiochem.Biophys.Res.Communications.、1988年、第151巻2号、709〜16頁;Ivan L.ValuevらのBiomaterials、1998年、19、41〜43頁)。
上記および本出願を通しての様々な参考文献の引用は、これらの参考文献が本発明の従来技術を構成することを是認するものではない。しかし、引用した参考文献のそれぞれを、その全体で参照として本出願に組み込む。
本発明は、1種または複数の「新規反応基」(構造体1〜6)による、生体分子、ポリマー組成物、有機および/または無機の分子および/または材料などの2種以上のエンティティ(B、B’等)の共有結合的カップリング(covalent coupling)のための、少なくとも部分的に、改善された方法と組成物に基づいている。本明細書で提供する説明や実施例は、本発明の範囲の制限をなんら意図するものではない。
Figure 2005532533
本発明では、エンティティであるB、B’等は、これらに限定されないが、ガラス、石英、モノマー、ポリマー、デンドリマー、MIPS、膜、金属、クレー、珪藻土、粒子(着色または非着色)、粒子(磁性または非磁性)、粒子(ミクロスフェアもしくはナノスフェア)、フラーレン、ナノチューブ、生体分子、発色団、発蛍光団、化学発光性化合物、半導体粒子、半導体ナノ結晶(量子ドット)、JもしくはH凝集体、細胞、有機体、バクテリア、ウイルス、またはそれらの任意の組合せを含む。エンティティB、B’等は、同一であっても異なっていてもよく、かつ官能化されていてもいなくてもよい。
本発明の新規反応基はリンカー(L)によってエンティティB、B’等にコンジュゲートされており、Lはn個(例えば2〜1000個)のH、C、O、N、Si、P、Sの原子を線状、分枝もしくは環状鎖またはこれらの組合せで有する炭化水素リンカーである。
いくつかの実施態様では、1種または複数のエンティティB、B’等は、求核体含有エンティティ、すなわちこれらはヒドロキシル、アミン、チオール等の基を含む、あるいはエンティティはそうした基にコンジュゲートされている。このような場合、新規反応基の結合は、1種または複数の構造体1〜6の求電子性反応基と、エンティティ上またはエンティティ内に含まれる求核基を化学反応させることによって実行される。そうした化学反応には、これらに限定されないが、当分野の技術者に知られている求核的付加または、求核体をベースとした反応の、置換および/または転位が含まれる。
非限定的な例示としては、本発明の反応は、2つのエンティティBおよびB’を、1種または複数の構造体1〜6で架橋させる反応である。任意の求核体もしくは求電子体含有基をA、A’等と称する。ここで、Aおよび/またはA’は、それぞれ、本発明で考察する新規反応基またはその組合せ、および/または求核体(例えば、アルコール、アミン、チオール等)である。AおよびA’は同一または異なっている新規反応基、および/または同一または異なっている求核体であってよい。BおよびB’は同一エンティティであっても、かつ/または異なったエンティティであってもよい。可能性のあるそうした要素のいくつかの組合せを以下に考察する。
1つの実施形態では、1つのエンティティBであるポリマー性ミクロスフェアは、求電子反応基のそれぞれのリンカーR1〜R6によって、構造体1〜6のうちの1つの求電子反応基でコンジュゲートされている。第2のエンティティB’である半導体ナノ粒子は、その表面で求核基でコンジュゲートされている。直接的な求核置換反応はリンカーによるBとB’の結合をもたらす。
AおよびA’がどちらも構造体1〜6の新規反応基またはそれらの組合せである、BとB’を結合する反応のさらに他の実施形態では、二官能性リンカーまたは橋かけ分子を使用して、2種以上のエンティティを共有結合的にカップリングさせる。1つのそうした実施形態では、リンカーの二官能性は求核的である(例えば、アミン、チオール等)。言い換えれば、橋かけ分子は、BおよびB’がAおよびA’のリンカーアームと橋かけ分子の合体した長さで結合するように、その1つがAおよびA’のそれぞれと反応する2種以上の求核基を含む。
さらに他の実施形態では、BおよびB’はどちらも求核体であるAおよびA’をそれぞれ含む。この実施形態では、2種以上のエンティティをカップリングするために、二官能性リンカーまたは橋かけ分子を用いる。ここで、リンカーまたは橋かけ分子の二官能は、その基が同一であっても異なっていてもよい新規反応基である1種または複数の構造体1〜6の新規求電子性反応基である。橋かけ分子は、構造体1〜6のそれぞれの求電子性反応基のリンカーR1〜R6の自由末端基の結合によって構築されてもされなくてもよい。これらの要素の反応にしたがって、BおよびB’は共有結合的にそれぞれの求核基に結合する二官能性橋かけ分子によって結合される。この実施形態の他の形では、AおよびA’がどちらも求核体である場合、Cおよび/またはC’が求核体AおよびA’と反応することが既知である1種または複数の官能基(例えば、NHSエステル、イソチオシアナート、スルホニルクロリド等)である、二官能性リンカーまたは橋かけ分子を、2種以上のエンティティをカップリングするために用いる。CおよびC’は、1種または複数(n)の構造体1〜6の新規の求電子性反応基(nは新規求電子性反応基の数である)によってリンカーまたは橋かけ分子に結合している、同一でも異なっていてもよい官能基である。
具体的には、本発明は構造体1〜6の1個または複数を任意の組合せで含む新規のコンジュゲート組成物であって、
Figure 2005532533
その際、式中、
nは0、1、2または3であり、
XおよびYは任意の組合せで酸素および/または硫黄であり、
2およびX3は1種もしくは複数のハロゲン、好ましくは塩素またはフッ素であり、
2は窒素または炭素であり、
aromは置換されたもしくは置換されていないフェニル、ナフチルまたは他のポリマー性芳香族構造体であり、
Zはハライド、好ましくはクロリドもしくはフルオリド、2,3,5,6−テトラフルオロ−4−スルホ−フェノキシド、N−ヒドロキシサクシニミドまたは他の求電子(離核性)基であり、
1〜R6は1種もしくは複数のハロゲンまたはO、N、Si、P、Sからなる群から選択されるヘテロ原子を任意選択で、線状もしくは分枝鎖、環またはそれらの組合せで含む2〜1000個の原子を含有する炭化水素リンカー基である、
その際、さらに、任意の組合せの構造体1〜6の1個または複数は、そのそれぞれのリンカー基であるR1〜R6によって、少なくとも1種のエンティティBに連結されており、Bが
2−Dフィルムもしくは基体;
有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、デンドリマー、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマー、またはそれらの任意の組合せ;
発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、またはそれらの任意の組合せ;
そのそれぞれのリンカー基であるR1〜R6によって連結された1種または複数の任意の組合せの構造体1〜6、あるいはそれらの任意の組合せ
である組成物を対象とする。
さらに他の実施態様では、本発明は、R1〜R6が2〜100個の原子を含む、より好ましくはR1〜R6が2〜10個の原子を含む上記の新規組成物を対象とする。
本発明は、上記の構造体1〜6を含む組成物であって、R1〜R6が2〜1000個の原子、好ましくは2〜100個の原子を含む線状もしくは分枝鎖、環またはこれらの組合せで1種または複数のハロゲンまたはO、N、Si、P、Sからなる群から選択されるヘテロ原子を任意選択で含有する炭化水素リンカー基を含む、あるいはより好ましくはR1〜R6が2〜10個の原子を含む組成物も包含する。
本発明は、Bがポリマー性ミクロスフェアまたはナノスフェアである上記の組成物も対象とする。より好ましい実施態様は、ポリマー性ミクロスフェアが少なくとものその表面上に、ポリスチレン/ジビニルベンゼンおよび/またはカルボキシル官能基をさらに含むものであり、さらに好ましい実施態様は識別できる割合で1種または複数の蛍光染料をさらに含むミクロスフェアである。
上記のように、好ましい実施態様では、本発明は官能化ミクロスフェアに関する。原核細胞もしくは真核細胞、遺伝子組み換え細胞、有機体、バクテリア、ウイルス、プラスミド、発現ベクター、酵素、タンパク質、融合タンパク質、抗体、キメラ抗体、DNA、RNA、PNA、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、またはそれらの任意の組合せを含む生体分子を固定化するその能力に関して、ポリスチレンベースのミクロスフェアで一連の反応性官能基を評価した。活性化されたオキソカーボン酸(例えばモノ−フルオロ四角酸(MFS:mono-fluoro squaric acid))、テトラフルオロ−スルホフェニルエステル(TFS)、ビニルスルホン(VS)、ジハロキノキサリン、スルホニルフルオリド、ハロゲン化シアヌル、ハロピリミジンは、これらが(a)生体分子の求核基と自発的に反応する、(b)水性媒体中で実質的に改善された安定性を示す、(c)生体分子と安定したコンジュゲートを形成する、(d)追加の活性剤を必要とせず、かつ(e)より特異的なコンジュゲーションを提供し(すなわち、固体基体との非特異的相互作用/結合が低減される)、それによって生体分子の完全性を保護できるので、生体分子の固定化に対して改善された性能を示す。
さらに他の実施態様では、新規反応基は、最初に生体分子に結合され、次いで求核基含有固体支持体にカップリングされてよい。固体表面への生体分子のカップリング収率を改善することを目的としたリンカー系も開示する。
具体的には、そのそれぞれのリンカー基であるR1〜R6によって、少なくとも1種のエンティティBに連結された任意の組合せの1個または複数の構造体1〜6を有する上記の1種または複数のコンジュゲート組成物を提供するステップと、
2−Dフィルムもしくは基体;
有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体(半導体、半導体ナノ結晶、磁性粒子を含む)、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマーまたはデンドリマー、あるいはそれらの任意の組合せ
を含む1種または複数の求核体含有エンティティを提供するステップと、1種または複数のコンジュゲート組成物と前記1種または複数の求核体含有エンティティとを反応させて、1種または複数の構造体1〜6のリンカー基によって、前記1種または複数の求核体含有エンティティに連結された少なくとも1種のエンティティBを作製するステップとによって2種以上のエンティティを一緒にカップリングする方法を対象とする。
他の実施態様では、本発明は、エンティティBの作製の前、エンティティBの作製の間に任意の組合せの1種または複数の構造体1〜6をコンジュゲートする、エンティティBの作製の後にエンティティBにコンジュゲートする、上記組成物の合成方法も包含する。
本発明の他の好ましい実施態様は、
(a)nが0、1、2または3であり、
(b)XおよびYが任意の組合せで酸素および/または硫黄であり、
(c)ZおよびR1がハロゲン(クロリド、フルオリドを含む);2,3,5,6−テトラフルオロ−4−スルホ−フェノキシド;N−ヒドロキシサクシニミド;および同様の求電子基、またはそれらの任意の組合せである上記の構造1の組成物を、
2−Dフィルムもしくは基体;
有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマーまたはデンドリマー、あるいはそれらの任意の組合せを含む1種または複数の求核体含有エンティティと反応させて、
架橋した1種または複数の求核体含有エンティティを提供する方法を対象とする。
さらに他の実施態様では、本発明は、2種以上のエンティティを互いに結合するための橋かけ分子の生成における構造体1〜6の使用、あるいは橋かけ分子として1種または複数の構造体1〜6を含む組成物を対象とする。本発明の様々な実施態様は、そのそれぞれのリンカー基R1〜R6によって、末端基−末端基という形、分枝鎖、または樹枝という形で結合した2種以上の構造体1〜6からなる多官能性橋かけ分子を含む。そうした橋かけ分子を、求核的付加もしくは置換などの直接的な化学反応、または当分野の技術者に知られている他の任意の化学反応によって、求核基を有する2種以上のエンティティを共有結合的に互いに結合するために用いることができる。
さらに本発明の他の変形態様では、官能基が、構造体1〜6のうちの1種または複数のものであり、かつ1種または複数の求核基である多官能性橋かけ分子を提供する。求核基を有するエンティティが構造体1〜6の橋かけ基の官能基と反応し、構造体1〜6を有するエンティティが求核性橋かけ基の官能基と反応して、互いに結合した2種以上のエンティティをもたらす求核的付加もしくは置換などの直接的な化学反応によって、そうした橋かけ分子を、求核基を有する1種または複数のエンティティと、1種または複数の構造体1〜6にコンジュゲートされた1種または複数のエンティティとを共有結合的に互いに結合するために用いることができる。
そうした多官能性橋かけ基の組成物も考慮する。任意の組合せの1種または複数の構造体1〜6が、そのそれぞれのリンカー基R1〜R6によって、1種または複数の求核基にコンジュゲートされる橋かけ基組成物を想定する。ここで、2種以上の構造体1〜6が結合する場合、これらはそのそれぞれのリンカー基R1〜R6によって互いに結合され、その結合は1種または複数の末端−末端型、分枝型または樹枝型の任意の組合せである。
6.1官能基
現在のカップリング方法に欠点(安定性の欠如または水性媒体中で自発的に生体分子と反応できないこと、あるいはその両方)があるので、本発明者らは、生体分子の固定化のために、加水分解耐性があって使用し易い、予備活性化ミクロスフェアを導入することを決心した。表1は、そうした新規反応性ミクロスフェアの一部を非限定的に示す一覧表である。
スルホニルフルオリドは水性雰囲気でスルホニルクロリドより安定であることが知られており(表1、1a〜1d)、芳香族タイプのものは脂肪族のその対応物と比較してより安定である。ポリスチレンミクロスフェアの表面上にスルホニルフルオリドを合成するために、酸または酸クロリドから出発する複数の経路が用いられてきた(表1、2a〜2e)。
環状オキソカーボン酸(三角状、四角状、五角(クロコン)状、六角(ロジゾン)状)は環の中に2個の酸相当物と1〜4個のカルボニル基を有している。本発明者らは酸相当物のうちの一方を、環を我々のリンカー分子の1つに結合させるのに使用し、他方を活性化させて反応性誘導体とした。ミクロスフェア誘導の四角酸を合成するための複数の経路を表1(3a〜3e)に示す。得られた活性化ビーズはアミン含有分子との反応性が非常に高く、乾燥されていれば、長期間ベースで保存することができる。この種の反応基は、染料と生体分子を活性化させるために、NHSエステルなどに換えて使用することもできる。
フッ化シアヌルは、フッ素原子をアミンの窒素原子に置き換えて最大3当量のアミンと反応することができる。本発明者らはフッ化シアヌルがミクロスフェア(表1、4)と結合している1当量のアミンリンカーと反応したミクロスフェアを単離した。第2および第3のフッ素はなお生体分子との反応に使用できる。塩化シアヌル、2,4,6−トリクロロピリミジンまたは2,4,6−トリフルオロピリミジンなどの関連した分子も同様に用いられる。
ビニルスルホン(VS)ミクロスフェアはジビニルスルホンをヒドロキシ、アミノもしくはチオール基含有ミクロスフェアと反応させて作製した(表1、5a〜5b)。残余のビニル部分はチオールとアミンの両方との反応に使用できる。この基は加水分解の影響をより受けにくいが、アミンとの反応のためには塩基性のpHが必要である。表1、5cに示すように、ビニルスルホン(VS)基をチオ硫酸ナトリウムと反応させることによって、長期間の保存の際の酸化からビニルスルホン(VS)基を保護することができる。ビニル部分は約pH9〜10で再生される。
従来のカップリング化学反応用のN−ヒドロキシサクシニミドに対する、加水分解耐性のある代替品としてペルフルオロ化されたフェノールを開発した。本発明者らはテトラフルオロ−フェノールスルホン酸をカルボン酸基と直接ミクロスフェアの表面上(表1、6)、またはリンカー分子の末端で反応させた。フッ素原子は離脱し易い基を有する部分を提供し、スルホン酸は、水中にそれを分散させるのに必要な、ミクロスフェアの表面上の電荷を維持する。
6.2.リンカー
官能化ミクロスフェアの全体的な性能は、ミクロスフェア電荷、架橋密度、位置、官能基の到達性及び化学的安定性並びにリンカー基の長さ、電荷及び性質などのいくつかのパラメータによって制御される。
リンカーは生体コンジュゲーションにおいて重要な役割を果たす。これらは、その長さだけでなくその化学的性質にも基づいて選択される。リンカーの全体的な性質は薬剤の周囲の全体的な親水性または疎水性を左右することが知られている。拡大したリンカーが検体と固体マトリックスとの間の立体障害を低減できることはよく理解されている。
上記の官能基をミクロスフェアに結合するために複数の異なるクラスのリンカーが用いられる。これらのリンカーの例を表2に示す。
エチレングリコールをベースとしたリンカー(表2、1〜3)は親水性表面の安定性を改善するのに知られている表面修飾剤である。CH2をCF2で置き換えることによってさらなる安定性が確保される。
ジアミンとヒドラジドは疎水性表面を提供することが知られている(表2、5〜8)。ポリエチレンアミン(表2、9)はミクロスフェアの表面電荷を制御するのに用いられる「プロトンスポンジ」効果を示す。ポリアミドとポリスルホンアミド(表2、10〜13)は約1〜2のpKaを有する酸性プロトンを含む。したがって、これらのリンカーは生理学的なpHでポリアニオンを提供し、それによって長期保存安定性がもたらされる。デンドリマーすなわち高度に分枝したリンカー(表2、14)は、十分定義された形態構造に適合することが知られており、反応基に1種のカプセル化をもたらし、これによって反応基を加水分解から保護する。DTPA(ジエチレントリアミン五酢酸)リンカー(表2、15)は多カルボキシレート体を提供する。この種のリンカーは安定した金属錯体を形成することが知られている。固定化の程度を改善するためにポリアクリル酸およびポリシラン鎖(表2、16〜17)を導入することができる。
6.3.具体的な応用例
本発明の具体的な応用例を以下に示す。これらの実施例は本発明の範囲をなんら限定しようとするものではない。
実施例6.3.1
この実施例は、非限定的に、生体分子の共有結合的固定化のための官能化または予備活性化されたミクロスフェアの使用に関する。
(a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
(b)固体支持体が1種または複数の蛍光染料を識別できる割合で含む固体支持体(a)。
(c)少なくとも表面のカルボキシル基が4,7,10−トリオキサ−1,13−トリデカンジアミンリンカーで修飾されている固体支持体(b)。
(d)リンカーが修飾されている、かつ/または新規反応基モノ−フルオロ四角酸(MFS)を含む固体支持体(c)。
(e)第一アミン末端を含む生体分子、特にはオリゴヌクレオチドプローブ。
(f)安定した共有結合を形成するための、固体支持体(d)と生体分子(e)の自発性共有結合カップリング。
(g)単一または多重DNAアッセイでの生体分子カップリング固体支持体(f)の使用。
実施例6.3.2
この実施例は、非限定的に、生体分子の共有結合的固定化のための官能化または予備活性化されたミクロスフェアの使用に関する。
(a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
(b)固体支持体が識別できる割合で1種または複数の蛍光染料を含む固体支持体(a)。
(c)少なくとも表面のカルボキシル基がシスタミンリンカーで修飾されている固体支持体(b)。
(d)リンカーが修飾されている、かつ/または新規のビニルスルホン(VS)反応基を含む固体支持体(c)。
(e)第一アミンまたはチオールを含む生体分子、特に抗体。
(f)安定した共有結合を形成するための固体支持体(d)と生体分子(e)の自発性共有結合カップリング。
(g)単一または多重免疫アッセイにおける生体分子カップリング固体支持体(f)の使用。
実施例6.3.3
この実施例は、非限定的に、生体分子の共有結合的固定化のための官能化または予備活性化されたミクロスフェアの使用に関する。
a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
b)固体支持体が識別できる割合で1種または複数の蛍光染料を含む固体支持体(a)。
c)新規のテトラフルオロ−スルホフェニルエステル(TFS)反応基を含有するためにカルボキシル基が修飾されている固体支持体(b)。
d)第一アミンを含む生体分子、特に抗原。
e)安定した共有結合を形成するための固体支持体(c)と生体分子(d)の自発性共有結合カップリング。
f)単一または多重免疫アッセイにおける生体分子カップリング固体支持体(e)の使用。
実施例6.3.4
この実施例は、非限定的に、予備活性化生体分子の共有結合的固定化のための固体表面の使用に関する。
a)石英を含み、かつ少なくともその表面上にヒドロキシル官能基を含有する二次元固体支持体。
b)少なくとも表面ヒドロキシル基がアミノプロピル−トリエトキシシラン、アミノ末端シランリンカーで修飾されている固体支持体(a)。
c)新規反応基モノ−フルオロ四角酸(MFS)を含むために末端が修飾されている生体分子、特にオリゴヌクレオチド。
d)安定した共有結合形成するための固体支持体(b)と生体分子(c)の自発性共有結合カップリング。
e)単一または多重DNAアッセイにおける生体分子カップリング固体支持体(d)の使用。
実施例6.3.5
この実施例は、非限定的に、半導体ナノ粒子の共有結合的固定化のための官能化または予備活性化されたミクロスフェアの使用に関する。
a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
b)新規のビニルスルホン(VS)反応基を含有するためにカルボキシル基が修飾されている固体支持体(a)。
c)1つまたは複数の識別できる蛍光発光または蛍光波長を有する1種または複数の半導体ナノ粒子。
d)粒子の少なくとも表面上に少なくともチオール官能基を有する半導体ナノ粒子(c)。
e)安定した共有結合を形成するための固体支持体(b)と半導体ナノ粒子(d)の自発性共有結合カップリング。
f)解読のための単一多重アッセイにおける半導体ナノ粒子カップリング固体支持体(e)の使用。
実施例6.3.6
この実施例は、非限定的に、リンカーまたは2粒子間の架橋を用いた官能化または予備活性化ナノスフェアへの、官能化または予備活性化ミクロスフェアの共有結合カップリングに関する。
a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
b)新規のモノ−フルオロ四角酸(MFS)反応基を含むためにカルボキシル基が修飾されている固体支持体(a)。
c)新規のモノ−フルオロ四角酸(MFS)反応基が二官能性リンカー4,7,10−トリオキサ−1,13−トリデカンジアミンで修飾されている固体支持体(b)。
d)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ナノスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む第2の固体支持体。
e)新規のモノ−フルオロ四角酸(MFS)反応基を含むためにカルボキシル基が修飾されている固体支持体(d)。
f)識別できる割合で1種または複数の蛍光染料を含む固体支持体(e)。
g)安定した共有結合を形成するためのミクロスフェア固体支持体(c)とナノスフェア固体支持体(f)の自発性共有結合カップリング。
h)解読のための単一または多重アッセイでのナノスフェアカップリングミクロスフェア固体支持体(g)の使用。
実施例6.3.7
この実施例は、非限定的に、デンドリマーの共有結合的固定化のための官能化または予備活性化されたミクロスフェアの使用に関する。
a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
b)識別できる割合で固体支持体が1種または複数の蛍光染料を含む固体支持体(a)。
c)新規のテトラフルオロ−スルホフェニルエステル(TFS)反応基を含むためにカルボキシル基が修飾されている固体支持体(b)。
d)第一アミン官能基を含むデンドリマー。
e)安定した共有結合を形成するための固体支持体(c)とデンドリマー(d)の自発性共有結合カップリング。
f)リンカーの両末端に新規反応基モノ−フルオロ四角酸(MFS)を含有する二官能性リンカーによるデンドリマーカップリング固体支持体(e)の修飾。
g)第一アミンを含む生体分子、特に抗体。
h)安定した共有結合を形成するための固体支持体(F)と生体分子(g)の自発性共有結合カップリング。
i)単一または多重免疫アッセイにおける生体分子カップリング固体支持体(h)の使用。
実施例6.3.8
この実施例は、非限定的に、新規のリンカーによるミクロスフェアへの生体分子の共有結合カップリングに関する。
a)少なくともその表面上にカルボキシル官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレン/ジビニルベンゼンを含む固体支持体。
b)識別できる割合で固体支持体が1種または複数の蛍光染料を含む固体支持体(a)。
c)少なくとも表面のカルボキシル基が、リンカー鎖中に少なくとも1種または複数の四角酸官能基を含む新規の二官能性アミン末端リンカーで修飾されている固体支持体(b)。
d)1つの末端に新規のテトラフルオロ−スルホフェニルエステル(TFS)反応基を含む生体分子、特にオリゴヌクレオチドプローブ。
e)安定した共有結合を形成するための固体支持体(c)と生体分子(d)の自発性共有結合カップリング。
f)DNA、RNA、PNA等を含む、核酸をベースとしたアッセイでの生体分子カップリング固体支持体(e)の使用。
実施例6.3.9
この実施例は、非限定的に、官能化または予備活性化発蛍光団を用いた生体分子の共有結合標識化に関する。
a)新規反応基モノ−フルオロ四角酸(MFS)を含むために官能化され、修飾されかつ/または合成された発蛍光団。
b)第一アミンを含む生体分子、具体的にはアビジン、ストレプトアビジン、ニュートラアビジンなど。
c)安定した共有結合を形成するための生体分子(b)と予備活性化発蛍光団(a)の自発性共有結合標識化。
d)少なくともその表面上にビオチン官能基を含む、ポリマー性ミクロスフェア、好ましくはポリスチレンジビニルベンゼンを含む固体支持体。
e)識別できる割合で固体支持体が1種または複数の蛍光染料を含む固体支持体(d)。
g)発蛍光団標識化生体分子(c)がリポーター分子として使用される、単一または多重アッセイにおける固体支持体(e)の使用。
実施例6.3.10
この実施例は、非限定的に、固体表面上への共有結合固定化のための官能化または予備活性化生体分子の使用に関する。
a)1種または複数の金属を含む固体支持体。
b)チオール官能基を含むために、固体支持体が自己組織化された単層(SAM)で修飾されている固体支持体(a)。
c)1つの末端で新規反応基ビニルスルホン(VS)を含むために修飾されかつ/または合成された生体分子、特にオリゴヌクレオチド。
d)安定した共有結合を形成するための固体支持体(b)と生体分子(c)の自発性共有結合カップリング。
e)DNA、RNA、PNA等を含む、単一または多重核酸をベースとしたアッセイにおける生体分子カップリング固体支持体(d)の使用。
実施例6.3.11
この実施例は、非限定的に、発蛍光団の共有結合固定化のための官能化または予備活性化粒子の使用に関する。
a)1種または複数の金属を含む固体支持体粒子。
b)新規の官能基モノ−フルオロ四角酸(MFS)を含有するために固体支持体が修飾されている固体支持体(a)。
c)アミンとクエンチャー分子を含むJもしくはH凝集体発蛍光団。
d)安定した共有結合を形成するための固体支持体(b)と発蛍光団(c)の自発性共有結合カップリング。
e)単一または多重アッセイにおけるリポーターとしての発蛍光団標識化粒子(d)の使用。
7.0.新規反応基の調製のための合成手順の例
本発明の態様は組成物、ポリマー粒子を用いたコンジュゲートおよび/または混合物、種々のリンカー、官能基を調製するための材料や手順を含む。これらのリンカーと官能基を以下に記す。(5.0)表面官能基およびスペーサの合成手順、(5.1)新規反応基の評価、(5.2)カップリング手順の例である。本明細書で提供されるこれらの説明は本発明をなんら制限するものではない。
7.0.1.スルホニルクロリド
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例で、カルボキシル化ポリスチレンミクロスフェアをスルホニルクロリド基で活性化する方法を説明する。
100μL(約110万個のミクロスフェア)のカルボキシル化ポリスチレンミクロスフェア溶液(5.5μm)を、遠心分離を用いて13,400×gで1分間、脱イオン水250μLで1回、メタノール250μLで3回、ベンゼン250μLで3回洗浄して、ペレット化し、20秒間の音波処理でミクロスフェアを再懸濁した。最後にこれらをベンゼン250μL中に懸濁し、チオニルクロリド50μLを加え、ミクロスフェアを40℃で2時間加熱した。次いで、ミクロスフェアをベンゼン250μLで2回洗浄し、減圧下(<5トール)で2時間乾燥した。これをカリウム7−アミノ−1,3−ジスルホニルナフタレンのピリジン200μLの溶液に懸濁し、室温で4時間保持した。次いでこれらをピリジン250μLで2回、脱イオン水250μLで4回、メタノール250μLで2回、ベンゼン250μLで2回洗浄し、チオニルクロリド50μLとジメチルホルムアミド(DMF)25μLのベンゼン溶液250μLに懸濁し、室温で20分間、40℃で1時間保持した。続いて、反応性ミクロスフェアをベンゼン250μLで1回、アセトニトリル250μLで3回洗浄し、アセトニトリル中に使用時まで保存した。ここで説明した手順を表1の記入項1cに図示する。
7.0.2.スルホニルフルオリド
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例で、カルボキシル化ポリスチレンミクロスフェアをスルホニルフルオリド基で活性化する方法を説明する。
300μL(320万個のミクロスフェア)のカルボキシル化ポリスチレンミクロスフェア溶液(5.5μm)を、ミクロスフェアをペレット化するために13,400×gで1分間遠心分離し、音波処理で20秒間ミクロスフェアを再懸濁して、脱イオン水500μLで2回、メタノール500μLで2回、ベンゼン500μLで2回洗浄した。ミクロスフェアをチオニルクロリド50μLのベンゼン250μL中への溶液に懸濁し、40℃で2時間保持した。次いで、これらをベンゼン500μLで3回、アセトニトリル500μLで2回洗浄し、続いてアセトニトリル500μL中のカリウム7−アミノ−1,3−ジスルホニルナフタレン12mgの溶液に懸濁し、室温で振とう機にかけた。14時間後、ミクロスフェアをアセトニトリル500μLで2回洗浄した。ミクロスフェアをフッ化シアヌル15μLとピリジン20μLを含有するアセトニトリル溶液中に懸濁し、−15℃で14時間保持し、続いてアセトニトリル500μLで3回洗浄した。ミクロスフェアをアセトニトリル1mL中に懸濁し保存した。ここで説明した手順を表1の記入項2bに図示する。
7.0.3.モノ−フルオロ四角酸(MFS)
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例では、アジピン酸ジヒドラジドをリンカーとして用いて、カルボキシル化ポリスチレンミクロスフェアをモノ−フルオロ四角酸基で活性化する方法を説明する。
300μL(32百万個のミクロスフェア)のカルボキシル化ポリスチレンミクロスフェア溶液(5.5μm)を、ミクロスフェアをペレット化するために13,400×gで1分間遠心分離し、音波処理で20秒間ミクロスフェアを再懸濁して、0.01%トゥイーン(Tween)20と0.1M MES緩衝液(pH6.0)を含む500μLの溶液で3回洗浄した。次いで、ミクロスフェアを32mg/mLのADH(アジピン酸ジヒドラジド)と2g/mLのEDC、0.01%トゥイーン20および0.1M MES緩衝液(pH6.0)を含む500μLの溶液中に懸濁し、光を遮断した回転ミキサーに2時間かけた。ミクロスフェアを水500μLで3回、メタノール500μLで3回、ベンゼン500μLで3回洗浄した。次いで、ミクロスフェアをベンゼン500μL中に懸濁し、ジブトキシシクロブテンジオン1μLを加えた。熱振とう機上で25℃で14時間振とう後、ミクロスフェアをベンゼン500μLで3回、メタノール500μLで3回、500μL脱イオン水で3回洗浄した。ミクロスフェアに1Mの水酸化ナトリウム溶液500μLを加えた。次いで、ミクロスフェアを60℃で2時間熱振とう機にかけた。次いでこれらをメタノール500μLで洗浄してミクロスフェアを回収した。次いで、ミクロスフェアを2Mの塩酸溶液500μLで洗浄した。メタノールを加えミクロスフェアを回収した。次いで、ミクロスフェアをメタノール500μLで3回、アセトニトリル500μLで3回洗浄した。次いで、ミクロスフェアをアセトニトリル500μL中に懸濁した。フッ化シアヌル15μLとピリジン20μLの溶液を加え、ミクロスフェアを−15℃で14時間保存した。次いで、ミクロスフェアをアセトニトリル500μLで3回洗浄した。ミクロスフェアをアセトニトリル1mLに懸濁し保存した。ここで説明した手順を表1の記入項3cに図示する。
7.0.4.フッ化シアヌル
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例で、1,6−ジアミノヘキサンをリンカーとして用いて、カルボキシル化ポリスチレンミクロスフェアをフッ化シアヌルで活性化する方法を説明する。
300μL(32百万個のミクロスフェア)のカルボキシル化ポリスチレンミクロスフェア溶液(5.5μm)を、ミクロスフェアをペレット化するために13,400×gで1分間遠心分離し、音波処理で20秒間ミクロスフェアを再懸濁して、0.01%トゥイーン20と0.1M MES緩衝液(pH6.0)を含有する溶液500μLで3回洗浄した。続いてこれらを、32mg/mLの1,6−ジアミノへキサンと2g/mLのEDC、0.01%トゥイーン20および0.1M MES緩衝液(pH6.0)を含む溶液500μL中に懸濁し、光を遮断した回転ミキサーに2時間かけた。続いて、ミクロスフェアを水500μLで3回、メタノール500μLで3回、アセトニトリル500μLで3回洗浄した。次いで、ミクロスフェアをアセトニトリル500μL、トリメチルアミン20μL、フッ化シアヌル15μLを含む溶液中に懸濁し、−15℃で14時間置いた。最後にこれらをアセトニトリルで3回洗浄した。ミクロスフェアをアセトニトリル1mLに懸濁し保存した。ここで説明した手順を表1の記入項4に図示する。
7.0.5.ビニルスルホン(VS)
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例で、2−アミノエタンチオールをリンカーとして用いて、カルボキシル化ポリスチレンミクロスフェアをビニルスルホン(VS)で活性化する方法を説明する。
300μL(32百万個のミクロスフェア)のカルボキシル化ポリスチレンミクロスフェア溶液(5.5μm)を、ミクロスフェアをペレット化するために13,400×gで1分間遠心分離し、音波処理で20秒間ミクロスフェアを再懸濁して、500μLの0.01%トゥイーン20を含む0.1M MES緩衝液(pH6.0)で3回洗浄した。続いて、ミクロスフェアを、16mg/mL溶液のシステアミンと30mg/mL溶液のEDCとの0.01%トゥイーン20、0.1M MES緩衝液(pH6.0)中の500μL溶液に懸濁し、光を遮断した回転ミキサーに2時間かけた。ミクロスフェアを水500μLで3回、500μLの0.1M塩化ナトリウム/0.1M酢酸ナトリウムの緩衝液(pH4.5)で3回洗浄した。ミクロスフェアを0.1M酢酸ナトリウム/0.1M塩化ナトリウム緩衝液(pH4.5)中の11mg/mL溶液のジチオスレイトール(DTT)の500μL溶液に懸濁して、結合されたシステアミン基のジスルフィド結合を還元した。ミクロスフェアを回転ミキサーに30分間かけ、続いて、メタノール500μLで3回洗浄した。次いでこれらをジクロロメタン500μL中に懸濁し、ビニルスルホン(VS)5μLを加えた。回転ミキサーで14時間攪拌後、メタノール500μLを加え、ミクロスフェアを回収し、メタノール500mLで3回洗浄した。ミクロスフェアをメタノール1mLに懸濁し保存した。ここで説明した手順を表1の記入項5bに図示する。
7.0.6.保護されたビニルスルホン
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例で、上記実施例の活性化ポリスチレンミクロスフェアをより加水分解耐性のある形態に転換する方法を説明する。
実施例5.0.5によって調製されたミクロスフェアを、チオ亜硫酸ナトリウム3mg、0.01%トゥイーン20およびリン酸ナトリウム緩衝液(pH4.0)を含む800μLの溶液中に14時間懸濁した。ミクロスフェアを脱イオン水500μLで3回洗浄した。ミクロスフェアを脱イオン水1mL中に懸濁し保存した。pH9〜10の緩衝液で最初に処理しない限り、ミクロスフェアは求核体と反応しない。ここで説明した手順を表1の記入項5cに図示する。
7.0.7.テトラフルオロスルホ−フェニルエステル(TFS)
生体分子を固定化できる活性化表面の調製方法を本発明によって以下に説明する。具体的には、以下の実施例で、カルボキシル化ポリスチレンミクロスフェアをテトラフルオロスルホフェニルエステルで直接的に活性化する方法を説明する。
300μL(32百万個のミクロスフェア)のカルボキシル化ポリスチレンミクロスフェア溶液(5.5μm)を、ペレット化するために13,400×gで1分間遠心分離し、音波処理で20秒間ミクロスフェアを再懸濁して、0.01%トゥイーン20と0.1M MES緩衝液(pH6.0)を含む500μLの溶液で3回洗浄した。次いで、これらを24mg/mLの2,3,5,6テトラフルオロフェノール−4−サルフェート(Gee,K.R.らの手順、Tetrahedron Lett.、1999年、第40巻、1472〜1474頁によって2,3,5,6テトラフルオロフェノールから合成した)、220mg/mLのEDC、0.01%トゥイーン20および0.1M MES緩衝液(pH6.0)を含む500μLの溶液に懸濁し、次いで、光を遮断した回転ミキサーに2時間かけた。ミクロスフェアを脱イオン水500μLで3回洗浄した。ミクロスフェアを脱イオン水1mLに懸濁し保存した。ここで説明した手順を表1の記入項6に図示する。
7.1.新規反応基評価の例
種々の新規反応性官能基のポリスチレンミクロスフェアに対する反応性を定量化するために、ビオチン−アミン誘導体を用いた簡単なアッセイを開発した。まず、一般的なEDC媒介法を用いて、ビオチン−LC−PEO−アミン(Pierce、Rockford,ILより入手)をカルボキシル化ミクロスフェアにカップリングさせ、続いてストレプトアビジン−PEと反応させた。ビオチン−アミンとストレプトアビジン−PE(Molecular Probes、Eugene,ORより入手)の両方の最適濃度を滴定した。このカップリングアッセイは、新規の反応性官能基で修飾されたミクロスフェアの反応性を測定し比較する「標準」をもたらした。ビオチン−アミンを直接反応させ続いてストレプトアビジン−PEと反応させて、修飾されたミクロスフェアを評価した。ミクロスフェアを緩衝液(pH6、4℃)中またはドライ状態のどちらかで保存し、設定した間隔(例えば、日、週、月等)でビオチン−LC−PEO−アミンアッセイを実施して官能基安定性を評価した。
我々の試験結果によれば、新規反応基は非常に望ましい特性を示している。例えば、新規反応基は求核的化合物との良好な反応性を示し、水性媒体中で実質的に改善された安定性を有し、安定したコンジュゲートを形成し、追加の活性化剤(例えば、EDCおよび/またはNHSエステル)を必要とせず、かつより特異的なコンジュゲーション(すなわち、固体基体との非特異的相互作用/結合を低減する)を提供し、したがって生体分子の完全性を保護することができる。
7.1.1.カップリング反応性および再現性
EDC媒介カップリング法とモノ−フルオロ四角酸(MFS)修飾ミクロスフェアを比較する加速安定性試験を350相当日数にわたって実施した。ビオチン−アミンモデルアッセイを用いると、2つの方法は互いに匹敵する反応性を示した。結果は、モノ−フルオロ四角酸(MFS)修飾ミクロスフェアが、より再現性のあるカップリングを毎日提供することも示している。図1に示すように、EDCカップリング法は、実験全体を通して20%のカップリングの変化を示している。350相当日数の間、モノ−フルオロ四角酸(MFS)修飾ミクロスフェアは活性をある程度徐々に失っているが、試験の最後で80%の活性を保持している(すなわち、活性の最も大きな変化は350相当日数の最後で示されている)。保存手順の改善によって、修飾ミクロスフェアのどんな活性損失も無くすことが期待される。
7.1.2.安定性
新規反応基で修飾されたミクロスフェアは水性媒体中で実質的に改善された安定性を有する結果を示している。図2はビニルスルホン(VS)官能化ミクロスフェアの緩衝液中での少なくとも30日間の安定性の例を示す。これはEDCおよびNHS試薬と比べて実質的に改善されているが、反応性と安定性との間にはトレードオフの関係があるので、修飾されたミクロスフェアの長期間保存(例えば、6カ月、≧約6カ月、6カ月超、6〜9カ月、6カ月〜1年、6カ月〜2年等を含む)のための、様々な乾燥および保存方法も評価した。図3〜6は乾燥保存条件安定性試験の例を示す。本試験で用いたものに対して優れた水分バリアを提供する保存容器は、活性の経時的な損失を防止することになる。
7.1.3.バイオアッセイ
実際のアッセイでCOOHミクロスフェアEDC法と比較した修飾されたミクロスフェアの性能を評価した。図7はアミノ修飾されたDNAプローブのCOOH−官能化ミクロスフェア(EDC媒介反応)と予備活性化ミクロスフェア法に対するカップリング滴定を示す。カップリング滴定はどちらも25℃で実施した。アッセイのためのDNA補充目標濃度は55℃のハイブリダイゼーション温度で20fモルであった。COOH−EDC方法はミクロスフェアにカップリングされているプローブの量に対して非線形の応答をもたらす結果となっている。予備活性化ミクロスフェアプローブ滴定はより線形であり、これはプローブのより特異的なカップリングを示唆している。どちらも再現性のある結果である。注記:予備活性化ミクロスフェアのためには25℃が最適カップリング温度ではない。カップリング温度ならびに他のパラメータを最適化することによってシグナルの改善が見込まれる。
7.2カップリング手順の実施例
7.2.1.ビオチン−LC−PEOアミン
表面修飾されたミクロスフェアをリン酸塩緩衝液(pH6、100mM)で3回洗浄しカウントした。2.5×107個のミクロスフェアを一定分量とり、リン酸塩緩衝液(pH8、100mM)で1回洗浄した。リン酸塩緩衝液(pH8、100mM)中で、PEO−LC−ビオチン−アミン(17.4mg/mL)の溶液を調製した。100μLのこの溶液を900μLのリン酸塩緩衝液(pH8、100mM)中のミクロスフェアに加えた。この懸濁液を37℃で1時間インキュベートした。反応が完了した後、ミクロスフェアをPBS−TBN(リン酸塩緩衝液による生理食塩水(pH7.4)、0.02%トゥイーン20および1g/Lウシ血清アルブミンを有する)で3回洗浄し、再度カウントした。100,000個ミクロスフェア/mLのPBS−TBNの懸濁液を1μgのストレプトアビジン−PEと室温で1時間反応させた。続いて、ミクロスフェアを3回洗浄し1mLのPBS−TBN中に再懸濁させた。ミクロスフェアの蛍光強度をLuminex100(商標)装置で分析した。
7.2.2.ビオチン化したIgG
25×106個の表面修飾ミクロスフェアの懸濁液を1mL炭酸塩緩衝液(pH9、100mM)で洗浄した。IgGの1mLの溶液(0.1MのpH9炭酸塩緩衝液中に50μg/mL)をミクロスフェアに加え、ボルテックスし、音波処理して37℃で1時間インキュベートした。1時間後、サンプルを1mLのPBS−TBN(0.02%トゥイーン20および1g/Lウシ血清アルブミンを有するリン酸塩を緩衝液とした生理食塩水(pH7.4))で洗浄した。100,000個ミクロスフェア/mLのPBS−TBNの懸濁液を1μgのストレプトアビジン−PEと室温で1時間反応させた。続いて、ミクロスフェアを3回洗浄し1mLのPBS−TBN中に再懸濁させた。ミクロスフェアの蛍光強度をLuminex100(商標)装置で分析した。
7.2.3.ビオチン化したオリゴヌクレオチド
5×106個の表面修飾ミクロスフェアを1.5mLの遠心分離管中にとり、1mLの炭酸塩緩衝液(pH9、100mM)で洗浄した。50μLの炭酸塩緩衝液(pH9、100mM)をミクロスフェアに加えた。1μLのアミノ修飾オリゴヌクレオチド1mM溶液を加え、懸濁液を37℃で1時間インキュベートした。1時間後、サンプルをPBS−TBNで洗浄した。100,000個ミクロスフェア/mLのPBS−TBNの懸濁液を1μgのストレプトアビジン−PEと室温で1時間反応させた。続いて、ミクロスフェアを3回洗浄し1mLのPBS−TBN中に再懸濁させた。ミクロスフェアの蛍光強度をLuminex100(商標)装置で分析した。
当分野の技術者は、通常の実験を用いるだけで、本明細書で記述した本発明の具体的な実施形態と同等の多くのものを認識する、または確認できることであろう。そうした同等のものは以下の特許請求の範囲によって包含されるものとする。
Figure 2005532533
Figure 2005532533
Figure 2005532533
Figure 2005532533
Figure 2005532533
Figure 2005532533
COOH−官能化ミクロスフェアであるEDCカップリング方法(A)とモノフルオロ四角酸官能化ミクロスフェア(MFS)(B)の比較を時間にわたって(25℃で加速)示す図である。新規の予備活性化ミクロスフェア(B)は日々にわたって標準のEDC媒介反応(A)より再現性のあるカップリングを提供している。 緩衝液、pH6に4℃で保存したビニルスルホン(VS)官能化ミクロスフェアの安定性試験を示す図である。 ドライ状態で保存したモノ−フルオロ四角酸(MFS)官能化ミクロスフェアの加速安定性試験を示す図である。 図3で示す時間より長くドライ状態で保存したモノ−フルオロ四角酸(MFS)官能化ミクロスフェアの加速安定性試験を示す図である。 ドライ状態で保存したテトラフルオロ−スルフェニルエステル(TFS)官能化ミクロスフェアの加速安定性試験を示す図である。 ドライ状態で保存したビニルスルホン(VS)官能化ミクロスフェアの加速安定性試験を示す図である。 (A)COOH−官能化ミクロスフェア(EDC媒介反応)法と(B)モノ−フルオロ四角酸(MFS)官能化ミクロスフェア(自発反応)法でのアミノ官能化DNAプローブのカップリング滴定を示す図である。カップリング滴定はどちらも25℃で実施した。アッセイのためのDNA補完目標濃度は55℃のハイブリダイゼーション温度で20fモルであった。COOH−EDC法(A)はミクロスフェアにカップリングされたプローブの量に対して非線形の応答をする。モノ−フルオロ四角酸官能化ミクロスフェアのプローブ滴定(B)はより線形である。これらの結果は再現性があり、より特異的なカップリングの結果の可能性がある。注記:25℃はモノ−フルオロ四角酸官能化ミクロスフェアに対する最適のカップリング温度ではない。全てのパラメータを最適化することによってシグナルの改善が見込まれる。

Claims (41)

  1. 構造体1〜6の1個または複数を任意の組合せで含むコンジュゲート組成物であって、
    Figure 2005532533
    (式中、
    nは0、1、2または3であり、
    XおよびYは任意の組合せで酸素および/または硫黄であり、
    2およびX3は塩素またはフッ素であり、
    2は窒素または炭素であり、
    aromは置換されたもしくは置換されていないフェニル、ナフチルまたは他のポリマー性芳香族構造体であり、
    Zはクロリド、フルオリド、2,3,5,6−テトラフルオロ−4−スルホ−フェノキシド、N−ヒドロキシサクシニミドまたは他の求電子基であり、
    1〜R6は1種もしくは複数のハロゲンまたはO、N、Si、PおよびSからなる群から選択されるヘテロ原子を任意選択で含む2〜1000個の原子を含有する炭化水素リンカー基を含む)
    任意の組合せの前記構造体1〜6の1個または複数が、そのそれぞれのリンカー基であるR1〜R6によって、少なくとも1種のエンティティBに連結されており、Bは
    (a)2−Dフィルムもしくは基体、
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子、
    (c)酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、デンドリマー、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマー、またはそれらの任意の組合せ、
    (d)発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、またはそれらの任意の組合せ、
    (e)そのそれぞれのリンカー基であるR1〜R6によって連結された1種または複数の任意の組合せの構造体1〜6、
    あるいはそれらの任意の組合せである組成物。
  2. リンカー基R1〜R6が線状もしくは分枝鎖、環状またはこれらの組合せである請求項1に記載の組成物。
  3. 1〜R6が2〜100個の原子を含む請求項1に記載の組成物。
  4. 1〜R6が2〜10個の原子を含む請求項1に記載の組成物。
  5. Bがポリマー性ミクロスフェアである請求項1に記載の組成物。
  6. 前記ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項5に記載の組成物。
  7. 前記ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項6に記載の組成物。
  8. 構造体1を含む請求項1に記載の組成物。
  9. 1が2〜100個の原子を含む請求項8に記載の組成物。
  10. 1が2〜10個の原子を含む請求項8に記載の組成物。
  11. 構造体1がそのリンカー基R1によってエンティティBに連結されており、Bが
    (a)2−Dフィルムもしくは基体、
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子、
    (c)酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、デンドリマー、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマー、またはそれらの任意の組合せ、
    (d)発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、またはそれらの任意の組合せ、
    (e)そのリンカー基R1〜R6によって連結された1種または複数の構造体1〜6、
    あるいはそれらの任意の組合せである請求項8に記載の組成物。
  12. エンティティBがポリマー性ミクロスフェアである請求項10に記載の組成物。
  13. ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項11に記載の組成物。
  14. 前記ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項12に記載の組成物。
  15. 構造体2が、そのリンカー基R2によって固体支持体Bに連結されており、固体支持体Bが
    (a)2−Dフィルムもしくは基体または
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子
    である請求項1に記載のコンジュゲート組成物。
  16. 固体支持体Bがポリマー性ミクロスフェアである請求項14に記載の組成物。
  17. ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項15に記載の組成物。
  18. 前記ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項16に記載の組成物。
  19. 構造体3が、そのリンカー基R3によって固体支持体Bに連結されており、固体支持体Bが
    (a)2−Dフィルムもしくは基体または
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子
    である請求項1に記載のコンジュゲート組成物。
  20. 固体支持体Bがポリマー性ミクロスフェアである請求項19に記載の組成物。
  21. ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項20に記載の組成物。
  22. 前記ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項21に記載の組成物。
  23. 構造体4が、そのリンカー基R4によって固体支持体Bに連結されており、X2が塩素もしくはフッ素であり、固体支持体Bが
    (a)2−Dフィルムもしくは基体または
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子
    である請求項1に記載のコンジュゲート組成物。
  24. 固体支持体Bがポリマー性ミクロスフェアである請求項23に記載の組成物。
  25. ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項24に記載の組成物。
  26. ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項25に記載の組成物。
  27. 構造体5が、そのリンカー基R5によって固体支持体Bに連結されており、X3が塩素もしくはフッ素であり、Y2が窒素または炭素であり、固体支持体Bが
    (a)2−Dフィルムもしくは基体または
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子
    である請求項1に記載のコンジュゲート組成物。
  28. 固体支持体Bがポリマー性ミクロスフェアである請求項27に記載の組成物。
  29. ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項28に記載の組成物。
  30. ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項29に記載の組成物。
  31. 構造体6が、そのリンカー基R6によって固体支持体Bに連結されており、芳香族基であるaromは置換されたもしくは置換されていないフェニル、ナフチルまたは他の多環式芳香族環であってよく、固体支持体Bが
    (a)2−Dフィルムもしくは基体または
    (b)有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子
    である請求項1に記載のコンジュゲート組成物。
  32. 固体支持体Bがポリマー性ミクロスフェアである請求項31に記載の組成物。
  33. ポリマー性ミクロスフェアが、少なくともその表面上にポリスチレン/ジビニルベンゼンおよびカルボキシル官能基を含む請求項32に記載の組成物。
  34. 前記ミクロスフェアが、異なった識別可能なモル量の1種または複数の蛍光染料をさらに含む請求項33に記載の組成物。
  35. (a)そのそれぞれのリンカー基であるR1〜R6によって、少なくとも1種のエンティティBに連結された任意の組合せの1個または複数の構造体1〜6を有する請求項1に記載の1種または複数のコンジュゲート組成物を提供するステップと、
    (b)2−Dフィルムもしくは基体;
    有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
    酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマーまたはデンドリマー、あるいはそれらの任意の組合せ;
    を含む1種または複数の求核体含有エンティティを提供するステップと、
    (c)前記1種または複数のコンジュゲート組成物と前記1種または複数の求核体含有エンティティとを反応させて、1種または複数の構造体1〜6のリンカー基によって、前記1種または複数の求核体含有エンティティに連結された少なくとも1種のエンティティBを作製するステップ
    を含む2種以上のエンティティを一緒にカップリングする方法。
  36. (a)請求項1に記載の前記構造体1〜6の任意の組合せの1個または複数が、前記エンティティBの作製の前に、前記エンティティBにコンジュゲートされる、
    (b)請求項1に記載の前記構造体1〜6の任意の組合せの1個または複数が、前記エンティティBの作製の間に、前記エンティティBにコンジュゲートされる、または
    (c)請求項1に記載の前記構造体1〜6の任意の組合せの1個または複数が、前記エンティティBの作製の後に、前記エンティティBにコンジュゲートされる
    請求項1に記載の組成物の合成方法。
  37. (a)nが0、1、2または3であり、
    (b)XおよびYが任意の組合せで酸素および/または硫黄であり、
    (c)ZおよびR1がクロリド、フルオリド;2,3,5,6−テトラフルオロ−4−スルホ−フェノキシド;N−ヒドロキシサクシニミド;および同様の求電子基、またはそれらの任意の組合せである請求項1に記載の構造体1を、
    2−Dフィルムもしくは基体;
    有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
    酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマーまたはデンドリマー、あるいはそれらの任意の組合せ;
    を含む1種または複数の求核体含有エンティティと反応させて、少なくとも1種の他のエンティティと架橋した1種または複数の求核体含有エンティティを提供することを含む、1種または複数の求核体含有エンティティを少なくとも1種の他のエンティティと架橋させる方法。
  38. そのそれぞれのリンカー基R1〜R6によって一緒に結合した、2種以上の請求項1に記載の構造体1〜6を任意の組合せで含む橋かけ基組成物であって、前記結合が任意の組合せの1つまたは複数の末端−末端型、分枝型または樹枝型のものである組成物。
  39. (a)請求項38に記載の1種または複数の橋かけ基組成物を提供し、
    (b)2−Dフィルムもしくは基体;
    有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
    酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマーまたはデンドリマー、あるいはそれらの任意の組合せ;
    を含む1種または複数の求核体含有エンティティを提供し、
    (c)前記1種または複数の橋かけ基組成物と前記1種または複数の求核体含有エンティティを反応させて、少なくとも2種の架橋した求核体含有エンティティを作製する、2種以上の求核体含有エンティティの架橋方法。
  40. そのそれぞれのリンカー基R1〜R6によって、1種または複数の求核基にコンジュゲートされた、任意の組合せで請求項1に記載の1種または複数の構造体1〜6を含む橋かけ基組成物であって、2種以上の構造体1〜6が一緒に結合している場合、これらの構造体は、そのそれぞれのリンカー基R1〜R6によって結合しており、前記結合が任意の組合せの1つまたは複数の末端−末端型、分枝型または樹枝型のものである組成物。
  41. 1種または複数の求核体含有エンティティと請求項1に記載の1種または複数の構造体1〜6でコンジュゲートされた1種または複数のエンティティの架橋方法であって、
    (a)請求項40に記載の1種または複数の橋かけ基組成物を提供すること、
    (b)請求項1に記載の1種または複数の組成物を提供すること、
    (c)2−Dフィルムもしくは基体;
    有機ポリマー、MIPS、ガラス、金属、クレー、樹脂、珪藻土、ゼオライト、無機結晶体、半導体粒子、半導体ナノ結晶、磁性粒子、フラーレン、ナノチューブ、またはそれらの任意の組合せからなる任意の大きさもしくは形状のミクロ粒子もしくはナノ粒子;
    酵素、抗体、タンパク質、DNA、RNA、ヌクレオチド、PNA、炭化水素、脂肪酸、レクチン、ペプチド、受容体、発色団、発蛍光団、生物発光性もしくは化学発光性化合物、JもしくはH凝集体、細胞、バクテリア、ウイルス、すべての原核生物もしくは真核生物、合成膜もしくは天然膜、ビオチン、ハプテン、有機モノマーもしくはポリマーまたはデンドリマー、あるいはそれらの任意の組合せ;
    を含む1種または複数の求核体含有エンティティを提供すること、および
    (d)前記1種または複数の橋かけ基組成物を前記1種または複数の求核体含有エンティティおよび請求項1に記載の1種または複数の組成物を反応させて、少なくとも2種の架橋したエンティティを作製すること
    を含む方法。
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