JP2005508599A5 - - Google Patents
Download PDFInfo
- Publication number
- JP2005508599A5 JP2005508599A5 JP2002546688A JP2002546688A JP2005508599A5 JP 2005508599 A5 JP2005508599 A5 JP 2005508599A5 JP 2002546688 A JP2002546688 A JP 2002546688A JP 2002546688 A JP2002546688 A JP 2002546688A JP 2005508599 A5 JP2005508599 A5 JP 2005508599A5
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- probe
- dna
- primer
- complementary
- dna polymerase
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 101700011961 DPOM Proteins 0.000 claims 26
- 101710029649 MDV043 Proteins 0.000 claims 26
- 101700061424 POLB Proteins 0.000 claims 26
- 101700054624 RF1 Proteins 0.000 claims 26
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims 26
- 230000000295 complement Effects 0.000 claims 23
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 22
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 claims 22
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims 18
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims 18
- 108020004999 Messenger RNA Proteins 0.000 claims 13
- 229920002106 messenger RNA Polymers 0.000 claims 13
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 9
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims 8
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims 8
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 claims 8
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 claims 8
- 101710030587 ligN Proteins 0.000 claims 8
- 101700077585 ligd Proteins 0.000 claims 8
- 229920002676 Complementary DNA Polymers 0.000 claims 7
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims 7
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 claims 6
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 claims 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims 6
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 claims 4
- 102000033147 ERVK-25 Human genes 0.000 claims 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 claims 4
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims 3
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims 3
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N Cyanogen bromide Chemical group BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 108010092799 EC 2.7.7.49 Proteins 0.000 claims 2
- 101710003775 ERVK-10 Proteins 0.000 claims 2
- 101710037030 ERVK-11 Proteins 0.000 claims 2
- 101710009283 ERVK-18 Proteins 0.000 claims 2
- 101710009286 ERVK-19 Proteins 0.000 claims 2
- 101710035700 ERVK-25 Proteins 0.000 claims 2
- 101710038044 ERVK-6 Proteins 0.000 claims 2
- 101710014468 ERVK-7 Proteins 0.000 claims 2
- 101710014482 ERVK-8 Proteins 0.000 claims 2
- 101710043924 HERVK_113 Proteins 0.000 claims 2
- 101700085547 ICP0 Proteins 0.000 claims 2
- 229920000272 Oligonucleotide Polymers 0.000 claims 2
- 101710006422 PNK/PNL Proteins 0.000 claims 2
- 101710006375 RNASEH1 Proteins 0.000 claims 2
- 101700078434 RT67 Proteins 0.000 claims 2
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 claims 2
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 claims 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims 2
- 102000038129 antigens Human genes 0.000 claims 2
- 108091007172 antigens Proteins 0.000 claims 2
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 claims 2
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 claims 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 claims 2
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 claims 2
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 claims 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 2
- 101700086982 rnh Proteins 0.000 claims 2
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 claims 1
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 claims 1
- 210000004369 Blood Anatomy 0.000 claims 1
- 210000000265 Leukocytes Anatomy 0.000 claims 1
- 210000003800 Pharynx Anatomy 0.000 claims 1
- 108020004412 RNA 3' Polyadenylation Signals Proteins 0.000 claims 1
- 210000003296 Saliva Anatomy 0.000 claims 1
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 claims 1
- 210000002700 Urine Anatomy 0.000 claims 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 claims 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims 1
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims 1
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 claims 1
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 claims 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 claims 1
- 108091007521 restriction endonucleases Proteins 0.000 claims 1
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 claims 1
- 125000004149 thio group Chemical group *S* 0.000 claims 1
- 210000001519 tissues Anatomy 0.000 claims 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 claims 1
Claims (37)
- 以下の諸工程を含むことを特徴とする、細胞内のターゲット核酸を検出する方法:
(a) 該ターゲット核酸の存在を分析すべき該細胞を、マトリックス内に埋設する工程;
(b) 該ターゲット核酸内の隣接するが不連続の配列と相補的な、3'および5'領域を持つAmp-プローブ-2を添加する工程、ここで該3'および5'領域は、該ターゲット核酸内のヌクレオチド配列と相補的でもハイブリッド化可能でもないリンカー領域によって分離されており、結果として該ターゲット核酸とAmp-プローブ-2とを含む複合体が形成され;
(c) 該環化可能なAmp-プローブ-2の3'および5'末端と、ヌクレオチド配列を接合する結合剤とを結合して、環状のAmp-プローブ-2プローブを形成する工程;
(d) 該複合体を洗浄する工程;および
(e) 該複合体を検出する工程、ここで該複合体の検出が、該埋設された細胞における該ターゲット核酸の存在を意味する。 - 該リンカー領域が、リガンドによって標識され、該ターゲット核酸と環状プローブとを含む複合体が生成される、請求項1記載の方法。
- リガンド結合部分が添加され、該部分は、該リガンドおよびこのリガンドにより内部標識された、オリゴヌクレオチドシグナルプローブと結合し、かつアフィニティー対を形成し、該リガンド結合成分が、該Amp-プローブ-2上の該リガンドおよび該オリゴヌクレオチドシグナルプローブ上の該リガンドと結合して、標識された複合体を形成する、請求項2記載の方法。
- 該リガンドが、ビオチン、抗原、ハプテン、抗体、重金属誘導体、およびポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項2記載の方法。
- 該リガンド結合部分が、ストレプタビジン、アビジン、抗体、抗原、チオ基およびポリヌクレオチドからなる群から選択される、請求項3記載の方法。
- 該細胞が、検査の目的で入手した、臨床的サンプルから得られる、請求項1記載の方法。
- 該サンプルが、全血、分離された白血球、唾液、尿、組織生検および咽口部拭い液を含む、請求項6記載の方法。
- 該マトリックスが、ポリアクリルアミドおよびアガロースを含む、請求項1記載の方法。
- DNAポリメラーゼを添加して、該5'および3'領域間の領域を拡張する、請求項1記載の方法。
- 該環状Amp-プローブ-2を、該複合体と、該Amp-プローブ-2の該リンカー領域の一部に対して相補的かつハイブリッド化可能な1またはそれ以上の前進RAMプライマーおよびdNTP、およびストランド置換活性をもつDNAポリメラーゼとを、所定条件下で接触させることにより増幅し、該前進RAMを、多数回に渡り環の周りに伸張させて、該環状プローブの配列と相補的な繰り返し単位を持つ一本鎖DNAを形成する、請求項1記載の方法。
- 該一本鎖DNAを検出し、その検出が、該埋設された細胞における該ターゲット核酸の存在を意味する、請求項10記載の方法。
- 該環状Amp-プローブ-2を、該複合体と、該Amp-プローブ-2の該リンカー領域の一部に対して相補的かつハイブリッド化可能な1またはそれ以上の前進RAMプライマーおよび該第一の拡張プローブが相補的である該リンカー領域の該部分と重複しない、該Amp-プローブ-2の該リンカー領域の一部に対して実質的に同一の、1またはそれ以上の逆RAMプライマー、dNTPS、およびストランド置換活性をもつDNAポリメラーゼとを、所定条件下で接触させることにより増幅し、該前進RAMプライマーを、多数回サークルの周りに伸張させて、該環状プローブの配列と相補的な繰り返し単位を持つ一本鎖DNAを形成し、かつ該逆RAMプライマーの多数のコピーを、該一本鎖DNAの相補領域とハイブリッド化し、しかも該DNAポリメラーゼによって伸張させて、拡張生成物を得、該逆RAMプライマーの拡張生成物を、該逆RAMプライマーの下流側コピーおよび対応する拡張生成物と置換して、該逆RAMプライマーの多数のコピーが結合しており、該DNAポリメラーゼによって拡張される、置換された一本鎖を得る、請求項11記載の方法。
- 該増幅されたDNAを検出し、その検出が、該埋設された細胞における該ターゲット核酸の存在を意味する、請求項12記載の方法。
- 核酸を増幅する方法であって、
(a) 二本鎖DNAサンプルを、制限エンドヌクレアーゼで消化して、フラグメント化されたDNAを得、
(b) 少なくとも一つの二本鎖Amp-プローブと、該フラグメント化されたDNAの各末端とを、結合剤で結合し、ここで該Amp-プローブは、少なくとも一つのプライマーサイトを含み、
(c) 該フラグメント化されたDNAを変性し、および
(d) 該DNAを、(1) 該AMP-プローブの一部と相補的かつハイブリッド形成可能な、少なくとも一つの前進RAMプライマー、(2) dNTP、(3) 該前進RAMプライマーが、該フラグメント化DNAの末端まで伸張して、各末端に繰り返し単位を持つ、多数の一本鎖DNAを形成する条件下で、ストランド置換活性を示すDNAポリメラーゼ、および(4) 該AMP-プローブの一部と実質的に同一の、少なくとも一つの逆RAMプライマーと、該逆RAMプライマーが該DNAポリメラーゼによって拡張されて、該増幅された核酸の拡張生成物を与える条件下で、接触させることにより、該フラグメント化DNAを増幅する、諸工程を含むことを特徴とする、上記方法。 - 該DNAポリメラーゼが、φ29 DNAポリメラーゼまたはBst DNAポリメラーゼである、請求項14記載の方法。
- 該消化および結合段階をマトリックス内で行う、請求項14記載の方法。
- 該結合剤が、酵素または化学試薬である、請求項14記載の方法。
- 該酵素が、DNAまたはRNAリガーゼである、請求項17記載の方法。
- 該DNAリガーゼが、T4 DNAリガーゼまたはTaq DNAリガーゼである、請求項18記載の方法。
- 該化学試薬が、シアノゲンブロミドまたはカルボジイミドである、請求項17記載の方法。
- (a) 少なくとも一つのプライマーサイトを含む、少なくとも一つの二本鎖Amp-プローブと、(b) 少なくとも一つの前進RAMプライマーと、(c) 少なくとも一つの逆RAMプライマーとを含むことを特徴とする、増幅キット。
- (a) 捕獲/Amp-プローブと、mRNAの3'poly-A配列とをハイブリッド化し、ここで該捕獲/Amp-プローブは、多数のRAMプライマーサイトを含み、
(b) 該mRNAを逆転写して、一本鎖cDNAを生成し、
(c) 該一本鎖cDNAを二本鎖DNAに転化し、
(d) 少なくとも一つの二本鎖Amp-プローブと該二本鎖DNAの各末端とを結合剤で結合し、ここで該Amp-プローブは、少なくとも一つのRAMプライマーサイトを含み、
(e) 該二本鎖DNAを変性し、
(f) 該DNAを、(1) 該AMP-プローブの一部と相補的かつハイブリッド形成可能な、少なくとも一つの前進RAMプライマー、(2) dNTP、(3) 該前進RAMプライマーが、該DNAの末端まで伸張して、各末端に繰り返し単位を持つ、多数の一本鎖DNAを形成する条件下で、ストランド置換活性を示すDNAポリメラーゼ、および(4) 該AMP-プローブの一部と実質的に同一の、少なくとも一つの逆RAMプライマーと、該逆RAMプライマーが該DNAポリメラーゼによって拡張されて、該増幅された核酸の拡張生成物を与える条件下で、接触させることにより、該DNAを増幅する、諸工程を含むことを特徴とする、mRNAを増幅する方法。 - 該DNAポリメラーゼが、φ29 DNAポリメラーゼまたはBst DNAポリメラーゼである、請求項22記載の方法。
- 該消化および結合段階をマトリックス内で行う、請求項22記載の方法。
- 該結合剤が、酵素または化学試薬である、請求項22記載の方法。
- 該酵素が、DNAまたはRNAリガーゼである、請求項25記載の方法。
- 該DNAリガーゼが、T4 DNAリガーゼまたはTaq DNAリガーゼである、請求項26記載の方法。
- 該化学試薬が、シアノゲンブロミドまたはカルボジイミドである、請求項25記載の方法。
- (a) 少なくとも一つのプライマーサイトを含む、少なくとも一つの二本鎖Amp-プローブと、(b) 少なくとも一つの捕獲/Amp-プローブと、(c) 少なくとも一つの前進RAMプライマーと、(d) 少なくとも一つの逆RAMプライマーとを含むことを特徴とする、増幅キット。
- 判別mRNA発現を検出する方法であって、
(a) 5'捕獲/Amp-プローブ-1と3'任意/Amp-プローブ-2とを、核酸中の相補配列間の核酸ハイブリッド化を可能とする条件下で、ハイブリッド化する工程と、ここで該5'捕獲/Amp-プローブ-1は、mRNAに対して相補的かつハイブリッド形成可能なオリゴ(dT)配列および該ターゲット核酸中の配列に対して相補的でもハイブリッド化可能でもないリンカー領域を含み、かつ少なくとも一つの包括的なRAMプライマー結合配列を有し、また該3'任意/Amp-プローブ-2は、mRNAの5'末端と結合可能な縮重配列および該ターゲット核酸中の配列に対して相補的でもハイブリッド化可能でもないリンカー領域を含み、かつ少なくとも一つの包括的なRAMプライマー結合配列を有し、
(b) 逆転写酵素を添加して、該5'捕獲/Amp-プローブ-1の3'末端から、該3'任意/Amp-プローブ-2の5'末端まで伸張して、cDNAを形成する工程と、
(c) 該3'任意/Amp-プローブ-2の5'末端と、該拡張されたcDNAの3'末端とを結合する工程と、
(d) 該cDNAと、(1) 該5'捕獲/Amp-プローブ-1の一部と相補的かつハイブリッド化可能な、少なくとも一つの前進RAMプライマー、(2) dNTP、(3) 該前進RAMプライマーが該cDNAの末端まで伸張して、各末端において繰り返し単位を持つ多数の一本鎖DNAを生成する条件下で、ストランド置換活性をもつDNAポリメラーゼ、および(4) 該5'捕獲/Amp-プローブ-1の一部と実質的に同一の、少なくとも一つの逆RAMプライマーとを、該逆RAMプライマーが、該DNAポリメラーゼによって拡張され、該増幅された核酸の拡張生成物を与える条件下で接触させることによって、該cDNAを増幅する工程と、
(e) 該増幅されたDNAを分析する工程とを含むことを特徴とする、上記方法。 - 該DNAポリメラーゼが、φ29 DNAポリメラーゼまたはBst DNAポリメラーゼである、請求項30記載の方法。
- 更に、上記工程(a)に先立って、(a) 該細胞内で発現された最も豊富なmRNAに対して相補的な配列を含むプライマーを、該mRNAサンプルに添加する工程、および(b) RNA-DNAデュプレックスのRNAを開裂する特異的酵素を添加する工程を含む、請求項30記載の方法。
- 該酵素が、RNアーゼHである、請求項31記載の方法。
- 判別mRNA発現を検出する方法であって、
(a) Amp-プローブ-1と該mRNAの5'末端と結合可能な縮重配列を含む3'末端とを、核酸中の相補配列間の核酸ハイブリッド化を可能とする条件下で、ハイブリッド化する工程と、ここで該Amp-プローブ-1の5'末端は、mRNAに対して相補的かつハイブリッド形成可能なオリゴ(dT)配列および該ターゲット核酸中の配列に対して相補的でもハイブリッド化可能でもないリンカー領域を含み、かつ少なくとも一つの包括的なRAMプライマー結合配列を有し、
(b) 逆転写酵素を添加し、該Amp-プローブ-1の3'末端から5'末端まで伸張する工程と、
(c) 該Amp-プローブ-1の3'末端と5'末端とを、ヌクレオチド配列を接合する結合剤で結合して、環状Amp-プローブ-1を形成する工程と、
(d) 該Amp-プローブ-1を、(1) 該Amp-プローブ-1の該リンカー領域の一部に対して相補的かつハイブリッド化可能な、1以上の前進RAMプライマーおよびdNTP、および該前進RAMプライマーが、多数回に渡り環の周りに伸張して、該環状プローブの配列に対して相補的な繰り返し単位を持つ一本鎖DNAを形成する条件下で、ストランド置換活性をもつDNAポリメラーゼ、および(2) 該一本鎖DNAの相補領域とハイブリッド化し、かつ該DNAポリメラーゼによって拡張されて、拡張生成物を与える、1種以上の逆RAMプライマーと接触させて、該環状Amp-プローブ-1を増幅させ、該逆RAMプライマーの拡張生成物を、該逆RAMプライマーの下流側コピーおよび対応する拡張生成物と置換して、該前進RAMプライマーの多数のコピーが結合し、かつ該DNAポリメラーゼにより拡張される、置換された一本鎖を生成する工程と、
(e) 該増幅されたDNAを分析する工程とを含むことを特徴とする、上記方法。 - 該DNAポリメラーゼが、φ29 DNAポリメラーゼまたはBst DNAポリメラーゼである、請求項34記載の方法。
- 更に、上記工程(a)に先立って、(a) 該細胞内で発現された最も豊富なmRNAに対して相補的な配列を含むプライマーを、該mRNAサンプルに添加する工程、および(b) RNA-DNAデュプレックスのRNAを開裂する特異的酵素を添加する工程を含む、請求項34記載の方法。
- 該酵素が、RNアーゼHである、請求項36記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US09/728,265 US6593086B2 (en) | 1996-05-20 | 2000-12-01 | Nucleic acid amplification methods |
PCT/US2001/045822 WO2002044339A2 (en) | 2000-12-01 | 2001-12-03 | Nucleic acid amplification methods |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2005508599A JP2005508599A (ja) | 2005-04-07 |
JP2005508599A5 true JP2005508599A5 (ja) | 2005-06-23 |
Family
ID=24926117
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2002546688A Pending JP2005508599A (ja) | 2000-12-01 | 2001-12-03 | 核酸の増幅方法 |
Country Status (6)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6593086B2 (ja) |
EP (1) | EP1343916A4 (ja) |
JP (1) | JP2005508599A (ja) |
AU (2) | AU2013202A (ja) |
CA (1) | CA2430373A1 (ja) |
WO (1) | WO2002044339A2 (ja) |
Families Citing this family (46)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20040018491A1 (en) * | 2000-10-26 | 2004-01-29 | Kevin Gunderson | Detection of nucleic acid reactions on bead arrays |
US20030175828A1 (en) * | 2002-03-15 | 2003-09-18 | Lazar James G. | Signal amplification by Hybrid Capture |
US20030236205A1 (en) * | 2002-06-21 | 2003-12-25 | Zhang David Y. | Hybridization signal amplification method (HSAM) nanostructures for diagnostic and therapeutic uses |
US20050118616A1 (en) * | 2002-08-16 | 2005-06-02 | Kawashima Tadashi R. | Amplification of target nucleotide sequence without polymerase chain reaction |
GB0230238D0 (en) * | 2002-12-28 | 2003-02-05 | Fu Guoliang | Combined exponential and linear amplification |
WO2004058989A2 (en) * | 2002-12-23 | 2004-07-15 | Epicentre Technologies | Target-dependent transcription |
ES2284021T3 (es) * | 2003-06-02 | 2007-11-01 | Check-Points Holding B.V. | Procedimiento rapido para detectar microorganismos en muestras de alimentos. |
EP2295569A1 (en) † | 2003-07-25 | 2011-03-16 | Ambion, Inc. | Methods and compositions for preparing rna from a fixed sample |
US20050112591A1 (en) * | 2003-11-25 | 2005-05-26 | Applera Corporation | Novel method for isolating single stranded product |
US7566532B1 (en) | 2004-07-02 | 2009-07-28 | Quest Diagnostics Investments Incorporated | Methods for detecting retroviruses |
JP4980349B2 (ja) * | 2005-06-23 | 2012-07-18 | シーメンス メディカル ソリューションズ ダイアグノスティクス ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング | 閉鎖された超薄シリカ層を有する磁性粒子、その製造方法および使用 |
WO2007019444A2 (en) * | 2005-08-05 | 2007-02-15 | Euclid Diagnostics Llc | Subtractive separation and amplification of non-ribosomal transcribed rna (nrrna) |
WO2007092538A2 (en) | 2006-02-07 | 2007-08-16 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for making nucleotide probes for sequencing and synthesis |
EP2027293B1 (en) * | 2006-05-24 | 2014-11-19 | Gen-Probe Incorporated | Method of lysing mycobacterium and amplifying its nucleic acid |
US8084206B2 (en) | 2006-08-30 | 2011-12-27 | Arizona Board of Regents, a body corporate acting for and on behalf of Arizona State University | High speed, high fidelity, high sensitivity nucleic acid detection |
KR20090046876A (ko) | 2006-08-31 | 2009-05-11 | 도요 세이칸 가부시키가이샤 | 핵산의 증폭방법 |
US20080090238A1 (en) * | 2006-10-12 | 2008-04-17 | Dan-Hui Dorothy Yang | Increased sensitivity of proximity ligation assays |
US20100047792A1 (en) * | 2007-04-10 | 2010-02-25 | Szendroe Istvan | Label-free optical detection method |
US20090181389A1 (en) * | 2008-01-11 | 2009-07-16 | Signosis, Inc., A California Corporation | Quantitative measurement of nucleic acid via ligation-based linear amplification |
US20100151473A1 (en) * | 2008-12-10 | 2010-06-17 | Yeakley Joanne M | Methods and compositions for hybridizing nucleic acids |
EP2744916A4 (en) | 2011-07-13 | 2015-06-17 | Primeradx Inc | MULTIMODAL METHODS FOR SIMULTANEOUS DETECTION AND QUANTIFICATION OF MULTIPLE NUCLEIC ACIDS IN A SAMPLE |
CN104093854A (zh) * | 2011-12-02 | 2014-10-08 | 凯杰有限公司 | 表征组合物中的rna的方法和试剂盒 |
US9528107B2 (en) | 2012-01-31 | 2016-12-27 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Compositions and methods for selection of nucleic acids |
US9193994B2 (en) * | 2012-04-20 | 2015-11-24 | Samsung Electronics Co., Ltd. | Polynucleotide and use thereof |
KR20150029432A (ko) * | 2013-09-10 | 2015-03-18 | 삼성전자주식회사 | 핵산 검출 방법 |
ES2960338T3 (es) | 2013-12-11 | 2024-03-04 | Accuragen Holdings Ltd | Métodos para detectar variantes de secuencia raras |
US11286519B2 (en) | 2013-12-11 | 2022-03-29 | Accuragen Holdings Limited | Methods and compositions for enrichment of amplification products |
US11859246B2 (en) | 2013-12-11 | 2024-01-02 | Accuragen Holdings Limited | Methods and compositions for enrichment of amplification products |
WO2016053638A1 (en) * | 2014-09-30 | 2016-04-07 | Ge Healthcare Bio-Sciences Corp. | Method for nucleic acid analysis directly from an unpurified biological sample |
CN107208137A (zh) * | 2014-10-20 | 2017-09-26 | 龙公司 | 检测rna病毒的组合物和方法 |
EP3209251A4 (en) * | 2014-10-22 | 2018-03-28 | International Partnership for Microbicides, Inc. | Platinum-catalyzed silicone drug delivery devices and methods of use thereof |
CN105803055A (zh) * | 2014-12-31 | 2016-07-27 | 天昊生物医药科技(苏州)有限公司 | 一种基于多重循环延伸连接的靶基因区域富集新方法 |
KR20180055905A (ko) | 2015-10-09 | 2018-05-25 | 아큐라젠 홀딩스 리미티드 | 증폭 산물의 농축을 위한 방법 및 조성물 |
WO2017201102A1 (en) | 2016-05-16 | 2017-11-23 | Accuragen Holdings Limited | Method of improved sequencing by strand identification |
SG11201901296TA (en) | 2016-08-15 | 2019-03-28 | Accuragen Holdings Ltd | Compositions and methods for detecting rare sequence variants |
US10626473B2 (en) * | 2016-10-03 | 2020-04-21 | Genetics & IVG Institute, Inc. | Methods and compositions for detecting Zika virus |
US11634760B2 (en) * | 2017-11-29 | 2023-04-25 | Panagene Inc. | Method for amplifying target nucleic acid and composition for amplifying target nucleic acid |
US10859997B1 (en) | 2017-12-04 | 2020-12-08 | Omax Corporation | Numerically controlled machining |
CN112601823A (zh) | 2018-06-12 | 2021-04-02 | 安可济控股有限公司 | 用于形成连接产物的方法和组合物 |
GB201812192D0 (en) | 2018-07-26 | 2018-09-12 | Ttp Plc | Variable temperature reactor, heater and control circuit for the same |
SG11202101934SA (en) | 2018-07-30 | 2021-03-30 | Readcoor Llc | Methods and systems for sample processing or analysis |
US20210292746A1 (en) * | 2018-08-06 | 2021-09-23 | Northwestern University | Enhanced capture of target nucleic acids |
AU2019321447A1 (en) * | 2018-08-14 | 2021-02-25 | Massachusetts Institute Of Technology | In vitro detection of nucleic acid |
CN110066890A (zh) * | 2019-06-03 | 2019-07-30 | 广西大学 | 一种快速检测ibv二温式纳米pcr试剂盒及应用 |
EP4073250A4 (en) * | 2019-12-10 | 2024-01-10 | Enumerix, Inc. | NUCLEIC ACID AMPLIFICATION COMPOSITIONS AND METHODS |
CN113528513B (zh) * | 2021-08-12 | 2022-11-22 | 基因科技(上海)股份有限公司 | 原位杂交探针复合体、其制备方法及应用 |
Family Cites Families (43)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4957858A (en) | 1986-04-16 | 1990-09-18 | The Salk Instute For Biological Studies | Replicative RNA reporter systems |
US4786600A (en) | 1984-05-25 | 1988-11-22 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Autocatalytic replication of recombinant RNA |
US5118605A (en) | 1984-10-16 | 1992-06-02 | Chiron Corporation | Polynucleotide determination with selectable cleavage sites |
US4883750A (en) | 1984-12-13 | 1989-11-28 | Applied Biosystems, Inc. | Detection of specific sequences in nucleic acids |
US4925785A (en) | 1986-03-07 | 1990-05-15 | Biotechnica Diagnostics, Inc. | Nucleic acid hybridization assays |
US4980456A (en) * | 1987-04-06 | 1990-12-25 | Scripps Clinic And Research Foundation | Recombinant factor VIIIC derived fragments |
US5449602A (en) | 1988-01-13 | 1995-09-12 | Amoco Corporation | Template-directed photoligation |
EP0359789B1 (en) | 1988-01-21 | 1993-08-04 | Genentech, Inc. | Amplification and detection of nucleic acid sequences |
US4988617A (en) | 1988-03-25 | 1991-01-29 | California Institute Of Technology | Method of detecting a nucleotide change in nucleic acids |
JPH04501353A (ja) | 1988-07-26 | 1992-03-12 | ジエネラブス・テクノロジーズ・インコーポレイテツド | Rna及びdna増幅法 |
US5185243A (en) | 1988-08-25 | 1993-02-09 | Syntex (U.S.A.) Inc. | Method for detection of specific nucleic acid sequences |
US5118801A (en) | 1988-09-30 | 1992-06-02 | The Public Health Research Institute | Nucleic acid process containing improved molecular switch |
US5112734A (en) | 1989-05-26 | 1992-05-12 | Gene-Trak Systems | Target-dependent synthesis of an artificial gene for the synthesis of a replicatable rna |
US5200314A (en) | 1990-03-23 | 1993-04-06 | Chiron Corporation | Polynucleotide capture assay employing in vitro amplification |
CA2046713A1 (en) | 1990-10-16 | 1992-04-17 | Richard M. Martinelli | Amplification of midivariant dna templates |
DE69128077T2 (de) | 1990-12-31 | 1998-02-26 | Promega Corp., Madison, Wis. | Nuklein-säure amplifikation mit dns abhängigen rns polymerasen aktivität von rns-replikasen |
JP3080178B2 (ja) | 1991-02-18 | 2000-08-21 | 東洋紡績株式会社 | 核酸配列の増幅方法およびそのための試薬キット |
JP3085409B2 (ja) | 1991-03-29 | 2000-09-11 | 東洋紡績株式会社 | 標的核酸配列の検出方法およびそのための試薬キット |
DE4214112A1 (de) * | 1991-08-02 | 1993-02-04 | Europ Lab Molekularbiolog | Neues verfahren zur sequenzierung von nukleinsaeuren |
WO1993013223A1 (en) | 1991-12-23 | 1993-07-08 | Chiron Corporation | Hiv probes for use in solution phase sandwich hybridization assays |
WO1994003624A1 (en) | 1992-08-04 | 1994-02-17 | Auerbach Jeffrey I | Methods for the isothermal amplification of nucleic acid molecules |
US6261808B1 (en) | 1992-08-04 | 2001-07-17 | Replicon, Inc. | Amplification of nucleic acid molecules via circular replicons |
US5834202A (en) | 1992-08-04 | 1998-11-10 | Replicon, Inc. | Methods for the isothermal amplification of nucleic acid molecules |
AU673245B2 (en) * | 1993-02-01 | 1996-10-31 | Seq, Ltd. | Methods and apparatus for DNA sequencing |
US5422252A (en) | 1993-06-04 | 1995-06-06 | Becton, Dickinson And Company | Simultaneous amplification of multiple targets |
US5601978A (en) | 1993-09-03 | 1997-02-11 | Abbott Laboratories | Oligonucleotides and methods for the detection of chlamydia trachomatis |
NL9301957A (nl) | 1993-11-11 | 1995-06-01 | U Gene Research Bv | Werkwijze voor het identificeren van micro-organismen, en daarvoor bruikbare hulpmiddelen. |
US5523204A (en) | 1993-12-10 | 1996-06-04 | Becton Dickinson And Company | Detection of nucleic acids in cells by strand displacement amplification |
SE9400522D0 (sv) | 1994-02-16 | 1994-02-16 | Ulf Landegren | Method and reagent for detecting specific nucleotide sequences |
US5942391A (en) * | 1994-06-22 | 1999-08-24 | Mount Sinai School Of Medicine | Nucleic acid amplification method: ramification-extension amplification method (RAM) |
EP0717782A1 (en) | 1994-06-22 | 1996-06-26 | Mount Sinai School Of Medicine Of The City University Of New York | Ligation-dependent amplification for the detection of infectious pathogens and abnormal genes |
US5876924A (en) * | 1994-06-22 | 1999-03-02 | Mount Sinai School Of Medicine | Nucleic acid amplification method hybridization signal amplification method (HSAM) |
US5773268A (en) * | 1994-11-09 | 1998-06-30 | Cedars-Sinai Medical Center | Chromosome 21 gene marker, compositions and methods using same |
US5616465A (en) | 1995-08-09 | 1997-04-01 | The Regents Of The University Of California | Detection and isolation of nucleic acid sequences using competitive hybridization probes |
US5854033A (en) | 1995-11-21 | 1998-12-29 | Yale University | Rolling circle replication reporter systems |
DE69612013T2 (de) | 1995-11-21 | 2001-08-02 | Yale University, New Haven | Unimolekulare segmentamplifikation und bestimmung |
US6162965A (en) * | 1997-06-02 | 2000-12-19 | Novartis Ag | Plant transformation methods |
US6124120A (en) | 1997-10-08 | 2000-09-26 | Yale University | Multiple displacement amplification |
US6316229B1 (en) | 1998-07-20 | 2001-11-13 | Yale University | Single molecule analysis target-mediated ligation of bipartite primers |
AU770993B2 (en) | 1998-09-15 | 2004-03-11 | Yale University | Molecular cloning using rolling circle amplification |
AU763890B2 (en) | 1998-09-15 | 2003-07-31 | Yale University | Artificial long terminal repeat vectors |
EP1190092A2 (en) | 1999-04-06 | 2002-03-27 | Yale University | Fixed address analysis of sequence tags |
AU6638000A (en) | 1999-08-13 | 2001-03-13 | Yale University | Binary encoded sequence tags |
-
2000
- 2000-12-01 US US09/728,265 patent/US6593086B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2001
- 2001-12-03 WO PCT/US2001/045822 patent/WO2002044339A2/en active Application Filing
- 2001-12-03 JP JP2002546688A patent/JP2005508599A/ja active Pending
- 2001-12-03 EP EP01998621A patent/EP1343916A4/en not_active Ceased
- 2001-12-03 AU AU2013202A patent/AU2013202A/xx active Pending
- 2001-12-03 CA CA002430373A patent/CA2430373A1/en not_active Abandoned
- 2001-12-03 AU AU2002220132A patent/AU2002220132B2/en not_active Ceased
-
2003
- 2003-06-13 US US10/461,848 patent/US8632999B1/en not_active Expired - Lifetime
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP2005508599A5 (ja) | ||
JP6591521B2 (ja) | ヘアピンコンフォメーションを有するキメラプライマーおよびその使用法 | |
US9309568B2 (en) | Aptamer regulated nucleic acids and uses thereof | |
AU711130B2 (en) | Continuous amplification reaction | |
JP3514630B2 (ja) | 核酸配列の増幅および検出 | |
EP1322782B1 (en) | Method of nucleic acid typing or sequencing | |
EP2920320B1 (en) | Rca reporter probes and their use in detecting nucleic acid molecules | |
JP6963505B2 (ja) | 鎖置換ポリメラーゼを用いた固相核酸標的捕捉及び複製 | |
WO2006086669A2 (en) | Aptamer regulated nucleic acids and uses thereof | |
JPH09510351A (ja) | 等温鎖置換核酸増幅法 | |
EP1723261A1 (en) | Detection of strp, such as fragile x syndrome | |
KR20010012175A (ko) | 폴리뉴클레오티드의 2단계 혼성화 및 포획법 | |
CA2528577A1 (en) | Methods and compositions for whole genome amplification and genotyping | |
JP2005511030A (ja) | 核酸の増幅方法 | |
JP2005508599A (ja) | 核酸の増幅方法 | |
JP2009533066A5 (ja) | ||
JP2002507719A5 (ja) | ||
US6136535A (en) | Continuous amplification reaction | |
Oh et al. | Microparticle-based RT-qPCR for highly selective rare mutation detection | |
EP3565906B1 (en) | Quantifying dna sequences | |
US9657337B2 (en) | Reaction buffer for microarray | |
CN109415762A (zh) | 通过多重扩增双重信号扩增的目标核酸序列的检测方法 | |
WO2012009464A2 (en) | Detection of nucleic acids by agglutination | |
JP2019176860A (ja) | アセンブラ配列を利用する断片化された標的核酸の増幅方法 | |
CN116083582A (zh) | Sdc2基因单一特定位点甲基化检测的应用、肠癌诊断试剂及系统 |