JP2004504347A - ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤としてのバルプロ酸およびその誘導体 - Google Patents

Abstract

本発明は、ヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害剤としての、薬剤バルプロ酸およびその誘導体の使用に関する。本発明はまた、ヒストンの低アセチル化に起因する疾病または、高アセチル化誘導が、例えば形質転換細胞の分化及び／またはアポトーシスの誘導を引き起こすことによって、有効な効果を奏する疾病の治療剤の製造のための、これら化合物の使用に関する。

Description

【０００１】
（技術分野）
本発明は、ヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害剤としての、薬剤バルプロ酸およびその誘導体の使用に関する。本発明はまた、ヒストンの低アセチル化に起因する疾病または、高アセチル化誘導が、例えば形質転換細胞（ｔｒａｎｓｆｏｒｍｅｄ ｃｅｌｌ）の分化及び／またはアポトーシスの誘導を引き起こすことによって、有効な効果を奏する疾病の治療剤の製造のための、これら化合物の使用に関する。
【０００２】
（背景技術）
局所的なクロマチン再構築は遺伝子の転写活性化において重要な段階である。転写タンパク質が鋳型ＤＮＡと接触するには、ＤＮＡのヌクレオソームへのパッケージングにおいて大幅な変化が起こらなくてはならない。クロマチン再構築に関与する最も重要な機構のひとつは、アセチル化によるヒストンの翻訳後修飾である。ＤＮＡとの間に働く静電気的引力の変化および疎水性アセチル基により引き起こされる立体機能障害により、ヒストンとＤＮＡとの関係が不安定となる。
【０００３】
その結果、ヒストンのアセチル化によりヌクレオソームが破壊され、ＤＮＡの転写が可能となる。アセチル基の除去によりヒストンがより強固にＤＮＡおよび隣接するヌクレオソームと結合し、これにより転写抑制されたクロマチン構造を保っている。アセチル化はヒストンアセチル化酵素（ＨＡＴ）活性を有する一連の酵素を介して行われる。逆に、アセチル基は特定のヒストン脱アセチル化酵素（ＨＤＡＣ）によって除去される。これらの機構が破綻すると転写の制御不良が頻発し、白血病性の変異を導く可能性がある。
【０００４】
核内ホルモン受容体はリガンド依存性の転写因子であり、遺伝子発現を正負に制御して発生とホメオスタシスを制御する。これら制御過程における異常が多くの疾病の原因の根底にあり、癌の発生に大きく関与している。
【０００５】
幾つかの核内受容体のスーパーファミリーが、ＴＦＩＩＢを含む基本的な転写因子と相互に作用することが報告されている。しかしながら、標的遺伝子の活性化と抑制化を調節するには、核内受容体がさらに別な因子と相互に作用しなければならないことが多くの証拠により示唆されている。エストロゲン（ＥＲ）、レチノイン酸（ＲＡＲ）、甲状腺ホルモン（Ｔ３Ｒ）、レチノイドＸ（ＲＸＲ）、および他の核内受容体のリガンド結合領域と結びつく数多くの共同因子が近年確認された。想定されるコアクチベータータンパクにはＳＲＣ−１／ＮＣｏＡ−１、ＧＲＩＰ１／ＴＩＦ２／ＮＣｏＡ−２、ｐ／ＣＩＰ／ＡＣＴＲ／ＡＩＢ１、ＣＢＰおよび多様な他の因子がある（Ｘｕら、１９９９年、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ ｉｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ ＆ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ９， １４０−１４７参照）。興味深い点として、ＳＲＣとＣＢＰタンパク質は内因性ヒストンアセチル基転移酵素活性を有し、ヒストンアセチラーゼＰ／ＣＡＦと共に複合体を形成して存在することが明らかにされている。
【０００６】
Ｔ３Ｒ、ＲＡＲおよびＰＰＡＲを含む多くの核内受容体は、リガンド非存在下でコリプレッサーＮ−ＣｏＲおよびＳＭＲＴと相互作用し、それによって転写を抑制することが出来る。さらに、Ｎ−ＣｏＲはアンタゴニストと結合したプロゲステロンおよびエストロゲン受容体と相互作用することも報告されている。Ｎ−ＣｏＲとＳＭＲＴは、ｍＳｉｎ３タンパク質とヒストン脱アセチル化酵素とともに巨大タンパク質複合体を形成して存在することが明らかにされている。従って、リガンドに誘発されて核内受容体が抑制型から活性型へと転換すると、コリプレッサー複合体が影響を受けてアンタゴニスト酵素活性を有するコアクチベーター複合体に変換される。
【０００７】
Ｎ−ＣｏＲコリプレッサー複合体は、核内受容体による抑制を媒介するだけでなく、Ｍａｄ−１、ＢＣＬ−６およびＥＴＯを含む付加的な転写因子と相互に関係する。これらタンパク質の多くは、細胞の異常増殖と異常分化に多大に関係している。例えばＴ３Ｒは、はじめはその相同性からウィルス腫瘍遺伝子ｖ−ｅｒｂＡと同一であるとされていたが、その野生型受容体と対照的にリガンドと結合せず、構成的転写抑制因子として機能する。さらに、ＲＡＲの変異が多くのヒト癌、特に急性前骨髄球性白血病（ＡＰＬ）や肝細胞癌と関連があるとされてきた。ＡＰＬ患者において、染色体転位の結果生成されるＲＡＲ融合タンパク質は、前骨髄球性白血球タンパク質（ＰＭＬ）または前骨髄ジンクフィンガータンパク質（ＰＬＺＦ）のいずれかを含んでいる。両融合タンパク質はコリプレッサー複合体の構成要素と相互作用することが出来るが、レチノイン酸が加わるとコリプレッサー複合体はＰＭＬ−ＲＡＲから離脱し、一方、ＰＬＺＦ−ＲＡＲとは構成的に相互作用する。
【０００８】
これらの知見により、なぜＰＭＬ−ＲＡＲ　ＡＰＬ患者はレチノイン酸治療後に完全寛解するのに、ＰＬＺＦ−ＲＡＲ　ＡＰＬ患者にはあまり効果がないのかということの説明がつく。コリプレッサーが介在する異常抑制が、偶然ＡＰＬの病因となるかもしれないという仮説は、ヒストン脱アセチル化活性阻害剤であるトリコスタチンＡが、該ＰＬＺＦ−ＲＡＲ融合タンパク質を含有している細胞内での分化阻害を克服できるという知見により裏付けられる。さらに最近では、レチノイン酸治療後に何度も再発を繰り返すＰＭＬ−ＲＡＲ患者に対しては、ＨＤＡＣ阻害フェニル酪酸による治療が行われており、白血病からの完全寛解という成果を挙げている（Ｗａｒｒｅｌｌら、１９９８、Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ、９０、１６２１−１６２５）。
【０００９】
ヒストンのアセチル化が癌に関与していることの更なる証拠として、ＡＭＬ１−ＥＴＯ腫瘍タンパク質とＭＬＬ遺伝子座を含む染色体再配列についての研究がある（Ｒｅｎｄｅｒら、１９９９、Ｂｌｏｏｄ ９４、４１７−４２８）
【００１０】
公開公報Ｎｏ．９９／３７１５０には、レチノイド薬剤およびヒストン脱アセチル化酵素阻害剤を投与することを特徴とする癌の遺伝子転写治療法が開示されている。
【００１１】
ＨＤＡＣ阻害剤として複数の化合物が知られている。酪酸または酪酸塩が最初に同定されたＨＤＡＣ阻害剤であった。ミリモラー濃度では、酪酸塩はＨＤＡＣに特異的ではなく、核タンパク質のリン酸化およびメチル化、同様にＤＮＡのメチル化を阻害する。それに類似のフェニル酪酸塩も同様に作用する。さらに特異的なのは、トリコスタチンＡ（ＴＳＡ）とトラポキシン（ＴＰＸ）である。ＴＳＡとＴＰＸは有効なヒストン脱アセチル化酵素阻害剤として取り上げられてきた。ＴＳＡが可逆的に阻害するのに対し、ＴＰＸは不可逆的にＨＤＡＣ酵素に結合して不活化させる。酪酸塩とは異なり、ＴＳＡおよびＴＰＸについては他の酵素系を非特異的に阻害することは報告されていない。しかしＴＳＡおよびＴＰＸは相当な毒性を示し、生体ではほとんど利用することが出来ない。したがって、これらの治療上の用途は限られている。
【００１２】
（発明の開示）
本発明の１つの目的は、多型の形質転換細胞において分化及び／またはアポトーシスを誘導することができ、それゆえに癌の治療に有用である物質を供給することである。
本発明は、バルプロ酸（ＶＰＡ；２−ｎ−プロピルペンタン酸）が、ヒストン脱アセチル化酵素（ｈｉｓｔｏｎｅ ｄｅａｃｅｔｙｌａｓｅ）を阻害することができるという新規知見に依拠している。
【００１３】
バルプロ酸は、様々な分子作用機構に基づく多様な生物活性を有する公知の薬剤である。
ＶＰＡは抗てんかん剤である。
ＶＰＡは催奇性がある。ＶＰＡが妊娠中に抗てんかん剤として使われると、ＶＰＡは生まれてきた子供の数％において先天性異常（神経管閉鎖欠損およびその他の奇形）を誘導しうる。マウスでは、ＶＰＡが適当に投与されると、マウス胎児の大半で催奇性がみられる。
ＶＰＡは、核内ホルモン受容体（ＰＰＡＲδ）を活性化する。また、幾つかの別な転写因子も活性化されるが、顕著に活性化されない因子（グルココルチコイド受容体、ＰＰＡＲδ）もある。
ＶＰＡは、コエンザイムＡとのエステルが完全に代謝されないことに起因しうる肝細胞毒性を示す。
【００１４】
ＶＰＡ誘導体を使用することにより、異なる活性は異なる分子作用機構により調整されているということを判断することができた。催奇性誘因活性と抗てんかん活性は異なる作用形態に従うが、これは化合物が優先的に催奇性を示すか、又は抗てんかん性を示すのどちらかに分かれうるからである（Ｎａｕ ら， １９９１， Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． Ｔｏｘｉｃｏｌ． ６９， ３１０−３２１）。ＰＰＡＲδの活性は催奇性と厳密に関連するということが分かっており（Ｌａｍｐｅｎ ら， １９９９， Ｔｏｘｉｃｏｌ． Ａｐｐｌ． Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． １６０， ２３８−２４９）、このことからＰＰＡＲδの活性と催奇性の両方に同じＶＰＡの分子活性が必要であることが示唆される。また、Ｌａｍｐｅｎらによる示唆（１９９９）および分化マーカーの分析（Ｗｅｒｌｉｎｇ ら， ２００１， Ｍｏｌ． Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． ５９， １２６９−１２７６）により証明されているように、Ｆ９細胞の分化はＰＰＡＲδの活性および催奇性に厳密に関連する。
【００１５】
本明細書には、ＰＰＡＲδの活性化がＶＰＡとその誘導体が有するＨＤＡＣ阻害活性により引き起こされることが示されている。さらに、従来から用いられているＨＤＡＣ阻害剤であるＴＳＡが、ＰＰＡＲδを活性化しＶＰＡと同様の形式によりＦ９細胞の分化を誘導することが示されている。これらの結果より発明者らは、ＰＰＡＲδの活性化のみならずＦ９細胞の分化誘導、およびＶＰＡ又はＶＰＡ誘導体による催奇形性も、ＨＤＡＣの阻害により引き起こされる可能性が非常に高いと判断した。
【００１６】
本発明は、本明細書に記載されたＶＰＡやその誘導体がヒストン脱アセチル化酵素の阻害剤であるとの知見に基づいている。ＶＰＡとＶＰＡから誘導される化合物のこの新規の作用機構、すなわちヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害を発見したことにより、発明者らは（１）これらの酵素は全ての細胞中に存在し、（２）酪酸塩やＴＳＡのような本発明で述べられているものとはモデル化合物を用いた予備実験で、ＨＤＡＣ阻害剤が多岐にわたる細胞において分化を誘導することが示された、という２つの理由に基づき、ＶＰＡがそのＨＤＡＣ阻害活性により様々な多型の癌細胞において細胞分化及び／またはアポトーシスを誘導するのに有用であろうと主張するに至った。
【００１７】
様々な多型の形質転換細胞において、分化及び／またはアポトーシスを誘導する活性は、単に増殖を抑制するよりもはるかに複雑な生物活性である。単に増殖を抑制するケースでは、なぜ形質転換細胞（癌）の増殖だけが阻害されて健常細胞の増殖が阻害されないのかが明らかではない。アポトーシスや細胞分化、または脱分化した癌細胞における特異的な再分化を誘導するということは、本発明の化合物が細胞分化及び／またはアポトーシスの誘導により多岐にわたる癌において有効な効果を奏するということの理論的根拠となる。この説は、様々な多型の癌細胞において証明された（実施例参照）。
【００１８】
抗てんかん性活性と鎮静化活性は、異なる機構の活性の相互作用によるものであり、よって、明らかにＨＤＡＣ阻害とは異なる本来のＶＰＡ活性に起因するものである。
【００１９】
肝細胞毒性を示す機構はあまり解明されておらず、ＶＰＡ−ＣｏＡエステルの形成に関係しているかどうかは知られていない。しかしながら、本発明による使用、例えばＨＤＡＣ阻害では、ＶＰＡ−ＣｏＡエステルを形成する必要はないようである。
【００２０】
米国特許Ｎｏ．５，６７２，７４６とＷＯ ９６／０６８２１では、ＶＰＡとその誘導体を神経退化障害や神経増殖障害の治療に用いることが開示されている。
【００２１】
（発明を実施するための最良の形態）
本発明の一つの特徴は、ＶＰＡおよびその誘導体の、ヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害剤としての使用である。ＶＰＡの誘導体は、式Ｉ；
【化２】

（式中、Ｒ^１およびＲ^２は独立して、任意に１または数個のヘテロ原子を含んでいてもよく、置換されていてもよい、直鎖状または分枝状の、飽和または不飽和の炭素数２〜２５、好ましくは炭素数３〜２５の脂肪族炭化水素鎖であり、Ｒ^３は水酸基、ハロゲン原子、アルコキシ基またはアルキル化されていてもよいアミノ基である。）で表されるα−炭素分岐カルボン酸である。
Ｒ^１およびＲ^２残基が異なっていれば、キラル化合物が生じる。通常、立体異性体の一つは、他方よりも強い催奇性効果を有し（Ｎａｕら， １９９１， Ｐｈａｒｍａｃｏｌ． Ｔｏｘｉｃｏｌ． ６９， ３１０−３２１）、より催奇性の高い異性体は、より効果的にＰＰＡＲδを活性する（Ｌａｍｐｅｎ ら， １９９９）。それゆえこの異性体は、ＨＤＡＣｓをより強く阻害することが期待され得る（本発明）。本発明は、それぞれの化合物のラセミ体の混合物、より活性の低い異性体および、特に、より活性の高い異性体を含む。
【００２２】
炭化水素鎖Ｒ^１およびＲ^２は、炭化水素鎖の炭素原子の代わりに、１または数個のヘテロ原子（例えば、Ｏ，Ｎ，Ｓ）を含んでいてもよい。これはヘテロ原子が対応する炭素置換基と同じ型の混成形成型である場合、ヘテロ原子が炭素置換基の構造とよく似た構造をとり得るという事実によるものである。
Ｒ^１およびＲ^２は、置換されていてもよい。可能な置換基としては、アリール基および複素環基に加え、水酸基、アミノ基、カルボキシル基およびアルコキシ基等が挙げられる。
【００２３】
好ましくは、Ｒ^１およびＲ^２は独立して、２〜１０の、より好ましくは３〜１０または５〜１０の炭素原子を含む。また、Ｒ^１およびＲ^２は独立して、飽和しているかまたは１個の二重結合または１個の三重結合を含んでいることも好ましい。特に、側鎖（Ｒ^１）の一つが２位および３位にｓｐ^１混成軌道を形成している炭素原子を含むか、または類似の構造をもたらすヘテロ原子を含み得ることが好ましい。この側鎖は３つの炭素もしくはヘテロ原子を含むべきであるが、より長い鎖はまたＨＤＡＣ−阻害分子を生じさせうる。さらに、ＨＤＡＣタンパク質の触媒部位は様々な結合分子と適合するようなので、ＨＤＡＣ阻害作用を有する化合物の創製においてＲ^２に芳香環またはヘテロ原子を含有させることが検討される。催奇性のＶＰＡ誘導体がＨＤＡＣ阻害剤であるという新規知見によれば、適切な抗てんかん剤としてはこれまで無視されていた化合物もまた、本発明のもとではＨＤＡＣ阻害剤であると考えられる。特に、Ｒ^１がプロピニル残基で、Ｒ^２が７またはそれ以上の炭素を含む残基である化合物が考えられる（Ｌａｍｐｅｎ ら、１９９９）が、これらの化合物に限定されるわけではない。
【００２４】
置換基ＣＯＲ^３は、カルボキシル基であることが好ましい。また、可能性のあるＨＤＡＣ阻害活性を有する化合物の創製において、カルボキシル基の誘導体化を検討しなければならない。そのような誘導体は、ハロゲン化物（例えば塩化物）、エステルまたはアミドであってもよい。Ｒ^３がアルコキシであるときは、該アルコキシ基は１〜２５、好ましくは１〜１０の炭素原子を含む。Ｒ^３がモノ−またはジ−アルキルアミノ基であるときは、該アルキル置換基は１〜２５、好ましくは１〜１０の炭素原子を含む。しかし、置換されていないアミノ基が好ましい。
【００２５】
本発明によれば、式Ｉで示される化合物の医薬上許容され得る塩もまた使用することができる。本発明によれば、人体で式Ｉで表される化合物に代謝される物質、または例えばエステル加水分解により式Ｉで表される化合物を放出させる物質も使用することができる。
【００２６】
個々の実施態様として、本発明は式Ｉで表されるα−炭素分岐カルボン酸またはその医薬上許容され得る塩の、ヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害剤としての使用に関する。式Ｉで表されるα−炭素分岐カルボン酸において、Ｒ^１は直鎖状または分枝状の、飽和または不飽和の炭素数５〜２５の脂肪族炭化水素鎖であり、Ｒ^２は独立して、直鎖状または分枝状の、飽和または不飽和の炭素数２〜２５の脂肪族炭化水素鎖であるが、−ＣＨ_２−ＣＨ＝ＣＨ_２、−ＣＨ_２−Ｃ≡ＣＨまたは−ＣＨ_２−ＣＨ_２−ＣＨ_３ではなく、Ｒ^１およびＲ^２は任意に水酸基、アミノ基、カルボキシル基、アルコキシ基、アリール基及び／または複素環基で置換されていてもよく、Ｒ^３は水酸基である。
【００２７】
さらに他の実施態様として、本発明は式Ｉで表されるα−炭素分岐カルボン酸またはその医薬上許容される塩の、ヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害剤としての使用に関する。式Ｉで表されるα−炭素分岐カルボン酸において、Ｒ^１は直鎖状または分枝状の、飽和または不飽和の炭素数３〜２５の脂肪族炭化水素鎖であり、Ｒ^２は独立して、直鎖状または分枝状の、飽和または不飽和の炭素数２〜２５の脂肪族炭化水素鎖であって。Ｒ^１またはＲ^２は、炭化水素鎖において炭素原子の代わりに１または数個のヘテロ原子（例えば、Ｏ，Ｎ，Ｓ）を含んでいてもよく、Ｒ^１およびＲ^２は任意に水酸基、アミノ基、カルボキシル基、アルコキシ基、アリール基及び／または複素環基で置換されていてもよく、Ｒ^３は水酸基である。
【００２８】
さらに他の実施態様として、Ｒ^１およびＲ^２はエステル基（−ＣＯ−Ｏ−）を含まない。Ｒ^１において、式Ｉで示されるカルボン酸（誘導体）のα−炭素に隣接する原子および前記α−炭素に共有結合でつながっている原子は、炭素原子であってもよい。Ｒ^２において、式Ｉで示されるカルボン酸（誘導体）のα−炭素に隣接する原子および前記α−炭素に共有結合でつながっている原子は、炭素原子であってもよい。Ｒ^１およびＲ^２は、ヘテロ原子Ｏ、ＮまたはＳを含まない炭化水素鎖であってもよい。
【００２９】
本発明において、最も好ましく用いられる化合物は、ＶＰＡ、 Ｓ−４−ｙｎ ＶＰＡ、２−ＥＨＸＡ（２−エチルヘキサン酸）である。
【００３０】
該化合物は、哺乳類（生体外検定や動物モデル系におけるセルラインの使用で）、および特にヒト（生体内外で）のヒストン脱アセチル化酵素ＨＤＡＣ１〜３（Ｉ類）とＨＤＡＣ４〜８（ＩＩ類）の阻害に有効である。
【００３１】
それらの化合物は未分化癌細胞のような細胞の分化やアポトーシスを誘導するのに用いられ得る。おそらくこれは全般的な機構を示している。なぜなら形態学上の変化や特異的なマーカー遺伝子やタンパク質の発現により評価すると、Ｆ９奇形癌細胞、ＭＴ４５０乳癌細胞、ＨＴ−２９結腸癌細胞およびいくつかの白血病セルラインにおいて分化が誘導され得るからである。更に、例えばＭＴ４５０細胞では、アポトーシスが誘導され得る（実施例６参照）。
【００３２】
本発明はまた、形質転換細胞の分化及び／またはアポトーシス誘導のための式Ｉの化合物の使用に関する。
【００３３】
本発明のもう一つの特徴は、式Ｉの化合物を、遺伝子特異的なヒストンの低アセチル化に起因する疾病の治療薬の製造に用いることである。局所的な標準レベルよりも低いヒストンのアセチル化レベルと相関する、特定遺伝子の異常抑制に起因する疾患が多数ある。
【００３４】
さらに本発明のもう一つの特徴は、式Ｉの化合物を、ヒストンの高アセチル化が誘導されると結果として患者の癌細胞の分化及び／またはアポトーシスが誘導され、患者の症状の臨床的改善につながるため有効である疾患の治療剤を製造するために用いることである。そのような疾患の例として、皮膚癌、エストロゲン受容体依存型および非依存型乳癌、卵巣癌、前立腺癌、腎臓癌、結腸直腸癌、膵臓癌、頭頸部癌、小細胞肺癌および非小細胞肺癌が挙げられる。また、高アセチル化誘導は、甲状腺抵抗性症候群等のヒストン脱アセチル化酵素活性の異常増に起因する疾患において、不適当な遺伝子発現を正常に戻すため、効果的である。
【００３５】
該化合物およびその塩は、少なくともひとつの前述の化合物を単独で、または医薬上許容しうる担体、賦形剤及び／または希釈剤との混合で含むことを特徴とする医薬組成物（例えば粉剤、顆粒剤、錠剤、丸薬、カプセル剤、注射剤、溶液、泡状剤、浣腸剤等）として調整することが出来る。医薬組成物は、公知の方法に従って調整されてよい。患者それぞれに応じた投与量は、投与する化合物の活性、患者の年齢、体重、全体的な健康状態、性別、食事、投与時間、投与経路、排出率、薬の組合せおよび治療をうける特定の病気の重篤さを含む様々な因子によって決定される。有効成分は、例えば１日に経口または静脈注射により、体重１ｋｇあたり約１０ｍｇ〜１００ｍｇの範囲で適切な量で投与されることが好ましい。投与量は、血中濃度が０．０５ｍＭ〜３ｍＭ、好ましくは約０．４ｍＭ〜１．２ｍＭに達している限り、特に限定されるものではない。
【００３６】
本発明のもう一つの特徴は、ヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を有する物質を同定する方法であって、バルプロ酸の誘導体を提供し、そのヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を測定し、ヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を有する物質を選別する方法である。バルプロ酸は、ヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を有する他の化合物を同定するための指示物質として用いることが出来る。それによって、低い投与量及び血中濃度でもＨＤＡＣ阻害活性が高まり、鎮静効果のような中枢神経系への影響が低い化合物が選別され得る。他の最適なパラメーターは、肝細胞毒性の発現状況をみることである。肝毒性を減少させる化合物が選別され得る。誘導体は追加の及び／または修飾された置換基を有する化合物を合成することにより調整することができる。該ＨＤＡＣ阻害活性は、転写抑制検定法、ヒストンＨ３及び／またはヒストンＨ４のアセチル化検出のためのウェスタンブロット法、または酵素検定法等の最新技術により測定される。
【００３７】
リプレッサー活性測定のための転写検定には、Ｇａｌ４依存型リポーター遺伝子の活性化及び抑制解除が活用される。この検定法は、哺乳動物のセルライン（例えばＨｅｌａ、２９３Ｔ、ＣＶ−１）を一時的に形質導入すること、または特別に構築された不変セルラインを用いることにより行われうる。甲状腺ホルモン受容体、ＰＰＡＲδ、レチノイン酸受容体、Ｎ−ＣｏＲ及びＡＭＬ／ＥＴＯ等の転写因子は、酵母Ｇａｌ４タンパク質の異種ＤＮＡ結合領域との融合タンパク質としてＵＡＳ要素を有するプロモーターと結合すると、転写を抑制する。Ｇａｌ４融合タンパク質の非存在下では、リポーター遺伝子は高い基礎転写活性を示すが、これは他の転写因子が結合できる部位がチミジンキナーゼプロモーターに存在するためである。Ｇａｌ４融合タンパク質は、この活性を１４０倍抑制する。ＨＤＡＣ阻害剤はこの抑制効果を解除するが、その解除の度合いはリポーター遺伝子活性の増加により検知（例えば、ルシフェラーゼ検定）される。
【００３８】
ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、Ｎ末端高アセチル化ヒストンＨ３及びＨ４の蓄積を誘導する。これらのアセチル化ヒストンは、全細胞抽出物又はヒストンＨ３及びＨ４のアセチル化Ｎ末端リジン残基に特異的な抗体を用いて、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤により処理を施した細胞から生産されたヒストン生産物を、ウェスタンブロット分析することにより検出することができる。
【００３９】
酵素法によるＨＤＡＣ活性の測定は、高アセチル化物質からの^３Ｈ標識酢酸の遊離を測定して行われる。ＨＤＡＣ活性化源は、Ｎ−ＣｏＲ（又はＨＤＡＣを増加させることが知られている他のリプレッサー）又はヒストン脱アセチル化酵素を有する細胞（例えば、Ｈｅｌａ、２９３Ｔ、Ｆ９）の粗抽出物に対して直接反応をおこす抗体との共免疫沈殿物であり得る。基質は、ヒストンＨ３又はＨ４のＮ末端に相当する、^３Ｈで化学的に標識されたアセチル化ペプチド又はヒストンタンパク質のどちらかであり、ＨＤＡＣ阻害剤で処理されて代謝的に標識された細胞とは区別される。エチル酢酸で抽出後、遊離した^３Ｈ標識酢酸が液体シンチレーションカウンターにより検出される。
【００４０】
さらに、本発明のもう一つの特徴は、化合物のＨＤＡＣへの結合及び／またはＨＤＡＣへの結合の競合を測定することを特徴とする、式Ｉで表される化合物のＨＤＡＣイソ酵素特異性を識別する方法である。
【００４１】
この方法には次の段階が含まれうる：ＨＤＡＣは、イソ型ＨＤＡＣ特異的な抗体、コリプレッサー複合体に直接反応する抗体あるいは遺伝子組換え細胞において過剰発現した組換えＨＤＡＣに反応する特異的な抗体のいずれかと反応して免疫沈澱する。さらにこの方法には、ウェスタンブロット分析により、これらの免疫沈澱物中に存在する個々のＨＤＡＣを同定する方法が含まれていても良い。放射性同位元素で標識されたＶＰＡ又は式Ｉの化合物は、免疫沈澱物中に取り込まれる。取り込まれた化合物の量は、適当な洗浄段階を経た後、化合物中の放射線量を測定することにより求められる。この特徴を変化させたもの、ＶＰＡ、ＴＳＡ又はトラポキシン等の標識されたＨＤＡＣ阻害剤との結合や式Ｉの化合物による結合の競合を測定して識別する方法がある。別の変化させた方法として、代替の標識方法及び／または検出方法がある。
【００４２】
ＨＤＡＣのサブセットのみを特異的に阻害する化合物が選別されることが好ましい。
【００４３】
本発明のもう一つの特徴は、ヒトまたはげっ歯類動物の一次細胞、白血性細胞、他の癌細胞や腫瘍細胞のセルラインのような細胞において上記化合物により誘導される遺伝子を特定するために、ＶＰＡ又はその誘導体を用いることである。ＶＰＡにより誘導される遺伝子を特定する方法には、ｃＤＮＡの長配列、発現配列タグまたはいわゆる単一遺伝子コレクションの公知スクリーニング方法が用いられる。また、サブトラクティブハイブリダイゼーション技術は、ＶＰＡ又はその誘導体により誘導される遺伝子を特定するのに適している。ＨＤＡＣ阻害作用を利用する医薬を開発する際において、可能性のある目的物を同定するためにこれらの方法を用いること、更に適切な医薬組成物を用いて患者に治療を施すための診断方法を確定するために、これらの方法を用いることは本発明に包含される。他のＨＤＡＣ阻害剤、特にトリコスタチンＡのような他のＨＤＡＣ阻害剤と比較して、ＶＰＡが生体内で一般的に毒性が低いことを考慮すれば、ＶＰＡにより選択的に制御を受けるかまた制御を受けない目的遺伝子を特定するためにＶＰＡ又はその誘導体を用いることは、本発明に特有の特徴である。
【００４４】
また本発明は、式Ｉで表される化合物による治療に腫瘍が応答するかを試験することを特徴とする、腫瘍同定のための診断方法に関する。この方法には上記したＶＰＡやその誘導体により誘導される遺伝子を特定する方法が包含されていることが好ましい。１つの特別な実施態様として、その診断方法には核酸技術、好ましくはハイブリダイゼーション又はポリメラーゼ連鎖反応の使用が含まれる。しかしながら、その他のタイプの核酸技術も用いることができる。また別の実施態様としては、検出のために異なった制御を受けるタンパク質に対する特異的な抗体を用いてよい。この目的のために、例えば組換え発現システム内で、ＶＰＡ治療によりその発現が抑制された遺伝子にコードされるタンパク質が発現し、これらのタンパク質に直接反応する抗体が作られる。次いで、治療中及び／または予後判断のために、それらの抗体（又は抗体のパターン）を用いて癌または癌細胞の状態を特徴づけることが出来る。
【００４５】
本発明は、多様な癌疾患を治療できるという新規な可能性を提供する。本発明者は、ＶＰＡとその誘導体が有効なＨＤＡＣ阻害剤であることを見出した。これまでに知られているＨＤＡＣ阻害剤は、酪酸塩のように非特異的なものか、若しくはＴＳＡやＴＰＸのように全ての生体に毒性を示すか、殆ど生体に用いることができない阻害剤であった。ＶＰＡは既に認可された薬剤であり、ヒトのてんかん治療のために数十年以上用いられてきたという利点を有する。よって、医薬上の許容性および重篤な副作用がないことに関する莫大な量のデータが入手可能である。ゆえにＶＰＡは、形質転換細胞における分化及び／またはアポトーシスを誘導し、それにより癌を患っている様々な患者に有益な効果を発揮するため、ヒトに対して使用するのに適した医薬である。
【００４６】
以下の実施例において、本発明を更に詳しく説明する。
【００４７】
＜実施例＞
実施例１
ＰＰＡＲδ−グルココルチコイド受容体ハイブリッドタンパク質のＶＰＡによる活性化
ＰＰＡＲδリガンド結合領域を活性化するためのリポーター遺伝子セルラインをＣＨＯ細胞において構築した。マウス乳癌ウルスのグルココルチコイド受容体依存性ＬＴＲ−プロモーターの制御下にて、分泌型のヒト胎盤のアルカリ性ホスファターゼを発現する組換えリポーター遺伝子を導入したＣＨＯ細胞のサブクローンを使用した（Ｇｏｅｔｔｌｉｃｈｅｒ ら、（１９９２） Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ ８９， ＰＰ． ４６５３−４６５７）。ＰＰＡＲδリガンド結合領域に融合したグルココルチコイド受容体のアミノ末端を有することを特徴とするハイブリッド受容体が、本質的に上述したように対応するＰＰＡＲαとのハイブリッド受容体の発現に代わって、これらの細胞内において発現した（Ｇｏｅｔｔｌｉｃｈｅｒ ら、（１９９２） ｉｂｄ）。ＰＰＡＲδリガンド結合領域は、Ａｍｒｉらにより発表された遺伝子配列から推定される１３８番目のアミノ酸残基からのものが使用された（Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７０ （１９９５） ＰＰ． ２３６７−２３７１）。これらの細胞内におけるＰＰＡＲδリガンド結合領域の活性化によって、細胞培養液上清の酵素検定法により検出可能なアルカリ性ホスファターゼリポーターの発現が誘導される。全長グルココルチコイド受容体を発現する同様の細胞が、受容体活性の特定のための対照として用いられた。
【００４８】
図１に示す実験のために、ＰＰＡＲδハイブリッド受容体発現細胞を２０％コンフルエントで２４−ウェル培養皿に接種し、ＰＰＡＲδリガンド炭素環式プロスタグランディンＩ_２（ＰＧＩ、５μＭ）、ＶＰＡ（１または２ｍＭ）、またはヒストン脱アセチル化酵素阻害剤である酪酸ナトリウム（０．２−５ｍＭ）およびトリコスタチンＡ（ＴＳＡ、３００ｎＭ）で４０時間処理した。リポーター遺伝子活性を酵素検定法（アルカリ性ホスファターゼ）により経過測定した。酪酸塩の場合を除いて、数値は２つの独立した実験において３回測定した値をｃＰＧＩ−誘導活性によって標準化した平均値±標準偏差である（図１）。ＰＰＡＲδリガンドｃＰＧＩとともにＶＰＡを用いて処理した場合（Ｐ＋Ｖ）のリポーター遺伝子の高い相乗的活性は、ｃＰＧＩとともにトリコスタチンＡを用いて処理した場合（Ｐ＋Ｔ）の相乗的活性と同程度であり、トリコスタチンとともに用いた場合（Ｔ＋Ｖ）または酪酸塩とともに用いた場合（データ無し）に相乗的活性化が見られないことは、ＶＰＡがＰＰＡＲδへの真のリガンドのように作用しないことを示している。ＶＰＡはむしろ、コリプレッサー関連型ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤が同様にＰＰＡＲδの転写活性を誘導するのと同じ系列の事象に存する機構に基づいて、ＰＰＡＲδの活性に影響を及ぼす。
【００４９】
実施例２
ＶＰＡによる転写抑制因子の活性化
転写因子である甲状腺ホルモン受容体（ＴＲ）、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体δ（ＰＰＡＲδ）、レチノイン酸受容体（ＲＡＲ）、コリプレッサーＮ−ＣｏＲおよびＡＭＬ／ＥＴＯ融合タンパク質は、これらが酵母Ｇａｌ４タンパク質の異種ＤＮＡ結合領域との融合タンパク質としてＵＡＳ部位（Ｇａｌ４反応要素）を有するプロモーターと結合すると、転写を抑制する。Ｇａｌ４融合タンパク質非存在下において、ルシフェラーゼリポーター遺伝子は、他の転写因子が結合できる結合部位がチミジンキナーゼ （ＴＫ）プロモーター中に存在するため、高い基礎レベルで転写される。ＵＡＳ ＴＫ　ルシフェラーゼリポータープラスミド（Ｈｅｉｎｚｅｌ ら、 １９９７、Ｎａｔｕｒｅ ３８７、ＰＰ． ４３−４８）および指標Ｇａｌ４融合タンパク質発現プラスミドを、リン酸カルシウム沈殿法を用いてＨｅｌａ細胞に導入した。
【００５０】
２４時間後、培養液を交換し、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤と共にさらに２４時間細胞を培養した。Ｇａｌ４ ＤＮＡ結合領域のみに関する発現プラスミドを導入した細胞を基準として、転写抑制をルシフェラーゼ活性を測定することにより評価した（図２）。Ｇａｌ４融合タンパク質はこの基準値の最大１４０倍の抑制活性を示した。１ｍＭ濃度のＶＰＡ（治療での使用の間に到達する血清濃度に近い）はこの抑制を解除し、それがリポーター遺伝子活性を指標として示された。抑制の解除は、ＴＲおよびＰＰＡＲδのそれぞれのリガンドによる部分的活性化後に見られるのと同様に、従来のヒストン脱アセチル化酵素阻害剤（１０ｎＭトラポキシン、１００ｎＭ ＴＳＡ）による処理後にも見られた。リガンドとＨＤＡＣ阻害剤（ＶＰＡを含む）の組合せにより相乗的効果が得られ、このことは異なる分子機構が関連していることを示唆している。
【００５１】
図２は、ＶＰＡがいくつかの個別の転写因子および補助因子の活性に影響を及ぼすことを示す。この発見は、ＶＰＡが個々の転写因子または受容体に作用する（例えばリガンドとして）よりも、むしろ遺伝子発現の制御において、コリプレッサー関与型ヒストン脱アセチル化酵素のような共通の因子に作用することを示唆している。
【００５２】
実施例３
ＶＰＡ処理細胞中の高アセチル化ヒストンの蓄積
ＶＰＡおよび酪酸ナトリウム（ＮａＢｕ）またはトリコスタチンＡ（ＴＳＡ）のような従来のヒストン脱アセチル化酵素阻害剤は、高アセチル化ヒストンＨ３およびＨ４の蓄積を誘導する。適当に処理された細胞の抽出物をウェスタンブロット分析することにより、これらのアセチル化ヒストンを検知し得る。図３は代表的な実験からの前述の分析による結果を示す。この実験で、ＶＰＡにより誘導された高アセチル化の時間的経過による推移（Ａ）および必要なＶＰＡの濃度（Ｂ）を調べた。
【００５３】
（Ａ）　時間的経過分析のために、指示された分析時間の３０時間前にＦ９細胞を６−ウェル培養皿に接種した。分析前の指示された時間に、個々の培養細胞に１０倍濃度のＶＰＡまたはトリコスタチンＡ貯蔵溶液を含む培地を添加した。細胞培養液を氷冷したリン酸塩緩衝生理食塩水で２度洗浄をし、変性ＳＤＳゲル電気泳動法にかけるために２５０μｌ試料緩衝液に溶解して全細胞抽出液を作成した。集めた試料のＤＮＡは音波処理によりせん断され、試料は１５％変性ポリアクリルアミドゲル上で分離された。市場で入手可能なアセチル化された型のヒストンに特異的な抗体（Ａｃ−Ｈ３、Ｃａｔ−Ｎｒ、： ０６−５９９；Ａｃ−Ｈ４、 Ｃａｔ−Ｎｒ、： ０６−５９８）（Ｕｐｓｔａｔｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製）を用いて、ウェスタンブロット分析法によりアセチル化されたＨ３およびＨ４を検知した。ポリアクリルアミドの一部がクーマシーブルーで染色されることによってレーンの等電点を確認した。
【００５４】
（Ｂ）ＶＰＡ必要量を決定するために、設定した濃度のＶＰＡ添加前にＦ９細胞を６−ウェル培養皿で８時間培養した。上述した処理の１６時間後に全細胞抽出液を調製した。アセチル化ヒストンＨ３およびＨ４の分析を（Ａ）に述べた方法で行った。ＶＰＡ濃度がＶＰＡをヒトの抗てんかん剤として治療に使用する間に到達する血清濃度の範囲内の時、ヒストンＨ３およびＨ４の高アセチル化が誘導される。ＶＰＡは、てんかん治療を目的とした血清濃度をほんの僅か上回る血清濃度で、最大の効果を有することが予想される濃度で使用された酪酸ナトリウムまたはトリコスタチンＡと同等の効力のヒストン高アセチル化を誘導する。この実験はＶＰＡまたはＦ９細胞中で産生した代謝産物がヒストン脱アセチル化酵素活性を阻害することを示している。
【００５５】
実施例４
ＶＰＡおよびその誘導体が、ｉｎ ｖｉｔｒｏにおいてヒストン脱アセチル化酵素活性を阻害する。
コリプレッサーＮ−ＣｏＲまたはｍＳｉｎ３に対する抗体を用いて得られた全細胞抽出液からの免疫沈殿物が、ヒストン脱アセチル化酵素活性を抑制する。ヒストンが^３Ｈ−酢酸塩の存在下で高アセチル化された細胞から得られる放射性アセチル化ヒストン基質とともに、該免疫沈殿物を培養することによって、この酵素活性は測定される。酢酸エチルによる抽出およびそれに次ぐ液体シンチレーションカウンターによって、^３Ｈ−酢酸塩の遊離を検出して酵素活性の値とした（図４）。ｉｎ ｖｉｔｒｏにおいて、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤であるトリコスタチンＡ（ＴＳＡ， １０^−７Ｍ）を反応に加えると、酵素活性が強く阻害された。ＶＰＡ（左から右へ０．２ｍＭ、１ｍＭ、５ｍＭ）および関連化合物であるヘキサン酸エチル（ＥＨＸＡ、左から右へ０．００８ｍＭ、０．０４ｍＭ、０．２ｍＭ、１ｍＭ、５ｍＭ）、Ｒ−４−ｙｎ ＶＰＡ（左から右へ０．２ｍＭ、１ｍＭ、５ｍＭ）およびＳ−４−ｙｎ ＶＰＡ（左から右へ０．２ｍＭ、１ｍＭ、５ｍＭ）のＨＤＡＣ阻害活性試験を行った。検定は２９３Ｔ細胞のＮ−ＣｏＲ免疫沈殿物を用いて、２回ずつ行われた。免疫沈殿物は、基質の添加前にＨＤＡＣ阻害剤で１５分間前処理し、その後３７℃で２．５時間培養した（未処理区の酵素活性２，２０５ｃｐｍ＝１００％とする）。前免疫血清の沈殿物を対照とした。ＥＣ_５０値は、ＶＰＡに対して０．６ｍＭ，　ＥＨＸＡに対して０．２ｍＭおよび　Ｓ−４−ｙｎ ＶＰＡに対して０．３ｍＭであるが、Ｓ−４−ｙｎ ＶＰＡ立体異性体には活性がなかった。これらのデータは、細胞内で産生された代謝産物というよりはむしろＶＰＡそのものが、ヒストン脱アセチル化酵素活性を阻害することを示す。
【００５６】
実施例５
Ｆ９奇形癌、ＨＴ−２９結腸癌およびＲｅｎＣａ腎癌各細胞における細胞分化の誘導
ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤および特にＶＰＡが、脱分化した発癌性細胞の分化を誘導する。細胞分化は細胞周期阻害、形態変化および異なった表現型のマーカーの発現状況と関連がある。Ｆ９およびＨＴ−２９の細胞形態的な変化は顕微鏡観察によって評価した。分化のパラメーターの１つである細胞周期阻害は、Ｆ９奇形癌、エストロゲン非依存性ＭＴ−４５０乳癌およびＨＴ−２９結腸癌細胞において、^３Ｈ−チミジンの培養細胞への取り込みの減少によって示された。１ｍＭ ＶＰＡの存在下または非存在下で、Ｆ９およびＨＴ−２９細胞を９６ウェル培養皿で３６時間培養した。３７ｋＢｑの^３Ｈ−チミジンを添加し、更に１２時間培養した。ＭＴ−４５０を７２時間培養し、^３Ｈ−チミジン標識を１時間行った。自動細胞採取および液体シンチレーションカウンターにより、ＤＮＡへの^３Ｈ−チミジンの取り込みを測定した。ＶＰＡ前処理によってチミジンの取り込み率が、Ｆ９、 ＭＴ−４５０およびＨＴ−２９細胞においてそれぞれ４８±５％、６３±８％、および５２±８％低下した。ＨＴ−２９細胞へのチミジン取り込み低下率の用量−反応関係（図５Ａ）を同様の実験方法により測定した。さらにＦ９奇形癌細胞において細胞分化マーカーの誘導状況を示した（図５Ｂ）。
【００５７】
Ｆ９奇形癌細胞をＶＰＡ（１ｍＭ）、酪酸ナトリウム（Ｂ、１ｍＭ）およびトリコスタチンＡ（ＴＳＡ、 ３０ｎＭ）で４８時間処理した。形態的判定基準、細胞数増加率の減少（例えば細胞周期阻害、データは示さず）、１２時間のパルス標識中における^３Ｈ−チミジンの取り込み率４８％低下（上記参照）、およびＦ９細胞においてヒストン脱アセチル化酵素阻害により誘導される分化の特異的なマーカーである核ＡＰ−２タンパク質の出現状況（図５Ｂ）によって、分化は追跡調査された。核ＡＰ−２タンパク質は、処理または未処理のＦ９細胞を穏やかな洗剤で溶解し（２５ｍＭ Ｔｒｉｓ， ｐＨ７．５ ； １ｍＭ ＥＤＴＡ， ０．０５％ＮＰ４０）、遠心分離（３０００×ｇ， ５ｍｉｎ）で核分画を回収し、変性ＳＤＳゲル電気泳動分析に供するためにサンプル緩衝液に溶解することにより作成された核抽出物中で検出された。核抽出物は９％ＳＤＳポリアクリルアミドゲル上で分離した。３％脱脂粉乳および０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０を含むトリス緩衝生理食塩水で１／１０００倍に希釈されたラビットポリクローナル抗体（Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ社製、Ｃａｔ． Ｎｏ．： ＳＣ−１８４）を用いたウェスタンブロット分析によってＡＰ−２タンパク質を検出した。ＶＰＡおよびトリコスタチンＡの両者は核ＡＰ−２タンパク質を誘導するが、酪酸塩はここで選ばれた濃度においては活性が弱かった。ＡＰ−２の出現がＶＰＡ処理の３６〜４０時間後にのみ検出される遅発効果性であることから、酪酸塩の活性が弱いのは、化合物の効率的な代謝のためである可能性がある。そうとは言え、他のヒストン脱アセチル化酵素阻害剤による分化と区別できない程度に、ＶＰＡは上皮Ｆ９セルラインの分化を誘導した 。
【００５８】
ＶＰＡによるＲｅｎＣａ−ＬａｃＺ細胞の分化誘導を細胞形態学的変化から測定した。１ｍＭ ＶＰＡ存在下または非存在下で、ＲｅｎＣａ−ＬａｃＺ細胞を３６時間培養した。位相差顕微鏡により形態的変化を観察し代表的な領域の顕微鏡写真を撮影した（図５Ｃ）。
【００５９】
実施例６
ＭＴ−４５０乳癌細胞のアポトーシス誘導
１ｍＭ ＶＰＡのＡ存在下または非存在下で、ＭＴ−４５０細胞を７２時間培養した。メーカーの取扱説明書に従い、ホスファチジルセリン処理された細胞表面をＦＩＴＣ−接合アネキシンＶ（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ社製）で染色した後、フローサイトメトリー分析法によりアポトーシス細胞を検出した。プロピジウムイオダイド（ｐｒｏｐｉｄｉｕｍ ｉｏｄｉｄｅ）染色により死滅細胞を除いた。アネキシンＶに対して陽性およびプロピジウムイオダイドに対して陰性の細胞（図６の右下４区画部分）を判別し、アポトーシスを起こした細胞としてカウントした。
【００６０】
実施例７
バルプロ酸処理による生存腫瘍細胞の死滅（ＭＴＴテスト）
セルラインおよび細胞培養
ヒトＭＤＡ−ＭＢ４６８、ＭＤＡ−ＭＢ４５３およびＳＫＢＲ３乳癌細胞、Ａ４３１扁平上皮細胞癌細胞、およびＳＫＯＶ３卵巣癌細胞を、加熱により不活化した１０％胎児ウシ血清（ＦＢＳ）、２ｍＭ Ｌ−グルタミン、１００ｕｎｉｔｓ／ｍｌペニシリン、および１００μｇ／ｍｌストレプトマイシンで補完されたダルベッコ修正イーグル培地（ＤＭＥＭ、 ＢｉｏＷｈｉｔｔａｋｅｒ社、 ベルビエ、 ベルギー）中で継代培養した。上記のように補完したＲＰＭＩ培地中でヒトＭＣＦ乳癌細胞を増殖させた。
【００６１】
Ｅ．ｃｏｌｉ由来β−ガラクトシダーゼをコードするプラスミドｐＺｅｏＳＶ２／ｌａｃＺを腎細胞癌細胞（Ｒｅｎｃａ）に安定的に導入した細胞（Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ 細胞） （Ｍａｕｒｅｒ−Ｇｅｂｈａｒｄ ら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ． ５８：２６６１−２６６６、１９９８）を、８％ＦＢＳ、２ｍＭ Ｌ−グルタミン、１００ｕｎｉｔｓ／ｍｌペニシリン、１００μｇ／ｍｌストレプトマイシン、０．２５ｍｇ／ｍｌゼオシンで補完されたＲＰＭＩ−１６４０培地中で増殖させた。ｃ−ｅｒｂＢ２およびネオマイシン耐性をコードするプラスミドｐＳＶ２ＥｒｂＢ２ＮとｐＳＶ２ｎｅｏとを同時に導入したＲｅｎｃａ−ｌａｃＺ 細胞（Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥｒｂＢ２）（Ｍａｕｒｅｒ−Ｇｅｂｈａｒｄ ら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ． ５８：２６６１、１９９８）、または上皮細胞増殖因子（ＥＧＦ）受容体、発癌性活性型ＥＧＦ受容体変異株ＥＧＦＲｖＩＩＩ、およびネオマイシン耐性をコードするプラスミドＰＬＴＲ−ＥＧＦＲ又はＰＬＴＲ−ＥＧＦＲｖＩＩＩとｐＳＶ２ｎｅｏ（Ｓｃｈｍｉｄｔ ら、Ｏｎｃｏｇｅｎｅ １８： １７１１−１７２１、１９９９）とを同時に導入したＲｅｎｃａ−ｌａｃＺ 細胞（Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥＧＦＲおよびＲｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥＧＦＲｖＩＩＩ）を、さらに０．４８ｍｇ／ｍｌ Ｇ４１８を含む同様の培地にて増殖させた。
【００６２】
細胞生存率検定
通常培地に、細胞数が１×１０^４個／ウェルとなるように、腫瘍細胞を９６ウェル培養皿に接種した。バルプロ酸を最終濃度１または３ｍＭになるようにサンプル（それぞれの濃度について３サンプル）に添加し、細胞を４０時間（Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ、Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥｒｂＢ２、 Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥＧＦＲ、Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＳＫＢＲ３およびＳＫＯＶ３細胞）または７０時間（Ａ４３１、ＭＣＦ７、ＭＤＡ−ＭＢ４５３およびＭＤＡ−ＭＢ４６８細胞）培養した。バルプロ酸非存在下で対照細胞を培養した。３−（４，５−ジメチルチアゾール−２−ｙｌ）−２，５ジフェニルテトラゾリウムブロマイド（ＭＴＴ） （Ｓｉｇｍａ社、 ダイゼンホッフェン、ドイツ国）濃度が１０ｍｇ／ｍｌであるＰＢＳ溶液１０μｌを各ウェルに添加し、さらに３時間細胞を培養した。９０μｌの溶解緩衝液（２０％ＳＤＳを含有する５０％ジメチルホルムアミド溶液、ｐＨ ４．７）を添加して細胞を溶解した。ホルマザンを溶解後、５９０ｎｍでの吸光度をマイクロプレートリーダー（Ｄｙｎａｔｅｃｈ社、 デンケンドルフ、ドイツ国）で読み取り、バルプロ酸無添加で培養した細胞と比較した生細胞の相対数を算出した。
【００６３】
結果
図７に示された結果より、バルプロ酸が、濃度に依存してＥｒｂＢ２またはＥＧＦ受容体癌源遺伝子または腫瘍原性活性型ＥＧＦ受容体変異株ＥＧＦＲｖＩＩＩをハイレベルで発現する乳癌細胞、卵巣癌細胞、扁平上皮癌細胞、腎細胞癌細胞の生存率を低減させることが分かった。これらの結果は、バルプロ酸が、上皮起源の固形癌由来の多種多様な腫瘍細胞の数及び／または生存率を著しく低減することを示している。生存率の低下により細胞分化の誘導及び／または細胞死の誘導に基づく細胞数の減少を示唆できた。細胞の形態的変化が見られたことは、細胞分化が少なくともある程度の影響を与えたことを示唆している。この分化の誘導及び／または細胞死の誘導により、バルプロ酸およびその誘導体がこのような腫瘍の治療に使用が可能であることが示唆された。
【００６４】
実施例８
バルプロ酸処理後のヒト癌培養細胞の細胞バイオマスの低減
ＶＰＡが一連のヒト癌細胞の分化及び／または細胞死を誘導し、ヒト癌培養細胞の全細胞バイオマスを低減させる。バイオマスの低減により、細胞周期阻害に関連した細胞死及び／または分化による細胞数低減を示唆することが出来た。定量的パラメーター、例えばバイオマスの低減を３０のヒト癌セルライン（図８ｅ）について測定し、その結果を１２例の用量−反応曲線、例えばＢＴ − ５４９乳癌細胞（１）、エストロゲン依存ＺＲ − ７５乳癌細胞（２）、ＤＳＭ − １１４小細胞肺癌細胞（３）、ＮＣＩ − Ｈ２２６非小細胞肺癌細胞（４）、ＳＫ − ＭＥＬ − ２８皮膚癌細胞（５）、ＯＶＣＡＲ − ３卵巣癌細胞（６）、ＨＵＰ − Ｔ３膵臓癌細胞（７）、ＤＵ − １４５前立腺癌細胞（８）、ＤＥＴＲＯＩＴ − ５６２頭頸部癌細胞（９）、ＬＳ − １７４大腸癌細胞（１０）、Ａ − １７２脳癌細胞（１１）、およびＨＬ − ６０白血病細胞（１２）（図８ａ〜ｄ）に示す。すべての細胞について細胞死及び／または細胞分化の形態的兆候を評価した。試験した中で最高のＶＰＡ濃度値では、すべての培養細胞で死滅細胞数の増加が見られ、ＳＷ−１１１６大腸癌細胞（図８ｅ）等のいくつかの培養細胞においては、既に１ｍＭの濃度で、試験中にほとんどの細胞が死滅していった。ＰＣ − ３（図８ｅ）およびＤＵ − １４５（図８ｃ）細胞は、それら本来の丸型形態から長い繊維芽細胞型に変化する。またＵ８７ＭＧ（図８ｅ）細胞は長さが伸び、蜘蛛のような糸状の伸びを発達させる。
【００６５】
パネル１〜９（図８ａ〜ｃ）の細胞を、細胞数が１ウェル当り３０００〜８０００個になるように９６ウェル培養皿に接種した。２４時間の回復培養後、指示された濃度のＶＰＡ存在下又は非存在下にて、４８時間細胞を培養した。培養細胞を、各ウェルの培養培地の上に５０％冷ＴＣＡを５０μｌ添加してＴＣＡで固定し、ＴＣＡの最終濃度を１０％とした。４℃にて１時間培養後、細胞を水道水で５回水洗して引き続き風乾した。固定細胞を１％酢酸に溶解した０．４％（ｗｔ／ｖｏｌ）スルフォホダミン（Ｓｕｌｆｏｒｈｏｄａｍｉｎｅ）Ｂで３０分間染色し、次いで１％酢酸で４回洗浄して遊離の染料を除去した。風乾後、旋回シェーカーに５分間かけて、吸着した染料を１０ｍＭ非緩衝トリス塩基（ｐＨ１０．５）で溶解した。Ｔｉｔｅｒｔｅｃ Ｍｕｌｔｉｓｋａｎ Ｐｌｕｓプレートリーダー上で、５５０ｎｍ単一波長における吸光度を読み取った。細胞当たり、各々の用量−反応関係のために６個のテストウェルを２連で設定し、１２個の対照ウェルを同時に設定した。テスト皿に薬剤を添加する直前に、ＴＳＡで固定した細胞が入った１２個の参照ウェルの経過時間０（Ｔ_０；薬剤が添加された時間）の細胞群密度を測定した。上記したように固定および染色された５％ＦＢＳ完全培地のバックグラウンド吸光度も、１２個のそれぞれ離れたウェルにて測定した。
【００６６】
未処理吸光度データからバックグラウンド吸光度データ（すなわち、完全培地プラス染料の吸光度およびＴ_０における細胞の吸光度）を差し引いて、細胞の全細胞バイオマスの減少値とした。
【００６７】
パネル１０〜１２（図８ｄ）の細胞を、指示された濃度のＶＰＡの非存在下又は存在下で、指示どおり３６〜５０時間９６ウェル皿にて培養した。３７ｋＢｑの^３Ｈ−チミジンを添加し、さらに１２時間培養した。^３Ｈ−チミジンのＤＮＡへの組み込みを、自動細胞採取装置および液体シンチレーションカウンターによって判定した。
【００６８】
図８ａ〜ｄのグラフに、６回の測定値から算出した平均値±標準偏差の値を示す。
【００６９】
加えて、さらなる臓器由来の癌細胞を、図８ａ〜ｃにて記載した実験と同様の方法でバルプロ酸処理した。図８ｅに、１ｍＭのＶＰＡ処理による様々なヒト癌細胞の全細胞バイオマスの減少についてまとめた。この減少により細胞周期阻害及び／または細胞死の誘導が起こることが示唆される。細胞をＶＰＡで４８時間処理した。２連で行った６個の反応テストから阻害の程度を算出し、細胞バイオマスの減少を未処理細胞に対する％として、標準偏差で表した。
【図面の簡単な説明】
【図１】ＰＰＡＲδのヒストン脱アセチル化酵素阻害剤と同様のＶＰＡによる活性を示す（実施例１）。
【図２】ＶＰＡがＰＰＡＲδ以外にもいくつかの転写因子を活性化することを示す（実施例２）。
【図３】ＶＰＡにより誘導された高アセチル化ヒストンＨ３及びＨ４の蓄積量を示す（実施例３）。
【図４】ＶＰＡ存在下又は非存在下におけるヒストン脱アセチル化酵素活性の生化学的分析値を示す（実施例４）。
【図５Ａ〜図５Ｃ】ＨＴ−２９結腸癌細胞、Ｆ９奇形癌細胞およびＲｅｎＣａ腎癌細胞における、ＶＰＡにより誘導された細胞分化の指標を示す。ＶＰＡまたはヒストン脱アセチル化酵素トリコスタチンＡによって分化したＦ９奇形癌細胞の表現型には相同性がある（実施例５）。
【図６】ＭＴ４５０乳癌細胞におけるアポトーシス誘導を示す（実施例６）。
【図７】バルプロ酸処理後の生細胞数の減少率を示す。（Ａ）Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ、Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥＧＦＲ、Ｒｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥＧＦＲｖＩＩＩ及びＲｅｎｃａ−ｌａｃＺ／ＥｒｂＢ２腎癌細胞または（Ｂ）ＳＫＯＶ３卵巣癌細胞、ＳＫＢＲ３、ＭＣＦ７、ＭＤＡ−ＭＢ４５３及びＭＤＡ−ＭＢ４６８乳癌細胞及びＡ４３１扁平上皮細胞癌細胞は、指定濃度のバルプロ酸とともに培養される。生細胞数の相対値は、実施例７に記載された細胞内代謝活性を測定するＭＴＴ酵素法により求められる。それぞれの点は、３回試験を繰り返すことにより求められたデータの平均値を表している（実施例７）。
【図８ａ〜図８ｅ】培養細胞をＶＰＡ処理した後の細胞バイオマスの減少を示す。

Claims (23)

1. 式Ｉで表される化合物
   

   

   （式中、Ｒ^１およびＲ^２は独立して、任意に１または数個のヘテロ原子を含んでいてもよく、置換されていてもよい、直鎖状または分岐状の、飽和または不飽和の炭素数２〜２５の脂肪族炭化水素鎖を表し、Ｒ^３は水酸基、ハロゲン原子、アルコキシ基またはアルキル化されていてもよいアミノ基を表す。）またはその医薬上許容される塩の、ヒストン脱アセチル化活性を有する酵素の阻害剤としての使用。
2. Ｒ^１およびＲ^２が独立して、１個の二重結合または三重結合を含んでいてもよい直鎖状または分岐状の炭素数２〜１０の炭化水素鎖であることを特徴とする請求項１に記載の使用。
3. 前記化合物がバルプロ酸（ＶＰＡ）、Ｓ−４−ｙｎ　ＶＰＡ、２−ＥＨＸＡ（２−エチルヘキサン酸）およびそれらの医薬上許容される塩から選ばれることを特徴とする請求項１または２に記載の使用。
4. ヒストン脱アセチル化活性を有する前記酵素が、哺乳類の、好ましくはヒトのヒストン脱アセチル化酵素であることを特徴とする請求項１〜３のいずれかに記載の使用。
5. 前記ヒトのヒストン脱アセチル化酵素が、ＨＤＡＣ１〜ＨＤＡＣ８から選ばれることを特徴とする請求項４に記載の使用。
6. 前記化合物が細胞の分化誘導に用いられることを特徴とする請求項１〜５のいずれかに記載の使用。
7. 前記化合物が形質転換細胞の分化誘導に用いられることを特徴とする請求項６に記載の使用。
8. 前記化合物が形質転換細胞のアポトーシス誘導に用いられることを特徴とする請求項１〜５のいずれかに記載の使用。
9. ヒストンの高アセチル化誘導が有効である疾病の治療剤を製造するための請求項１〜３のいずれかに記載の化合物の使用。
10. 患者の体内で請求項１〜３のいずれかに記載の化合物へと代謝される物質の、ヒストンの高アセチル化誘導が有効である疾病の治療剤を製造するための使用。
11. 前記疾病が皮膚癌、エストロゲン受容体依存型および非依存型乳癌、卵巣癌、前立腺癌、腎臓癌、結腸直腸癌、膵臓癌、頭頸部癌、小細胞肺癌および非小細胞肺癌、および甲状腺抵抗性症候群等のヒストン脱アセチル化酵素の異常増に起因する内分泌性疾患であることを特徴とする請求項９または１０に記載の使用。
12. 請求項１〜３のいずれかに記載の化合物を提供し、該化合物の誘導体のヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を測定し、ヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を有する物質を選別することを特徴とするヒストン脱アセチル化酵素阻害活性を有する物質の同定方法。
13. 前記方法が、化合物の鎮静効果を評価する段階、およびヒストン脱アセチル化酵素阻害活性およびバルプロ酸より低い鎮静効果を有する化合物を選別する段階を含むことを特徴とする請求項１２に記載の方法。
14. 前記ヒストン脱アセチル化酵素阻害活性が、転写抑制検定法、ヒストンＨ３またはＨ４のアセチル化検出のためのウェスタンブロット法、または脱アセチル化酵素検定法によって測定されることを特徴とする請求項１２または１３に記載の方法。
15. 化合物のＨＤＡＣへの結合及び／またはＨＤＡＣへの結合の競合を測定することを特徴とする請求項１〜３のいずれかに記載の化合物のＨＤＡＣイソ酵素特異性を識別する方法。
16. ＨＤＡＣのサブセットのみを特異的に阻害する化合物を選別することを特徴とする請求項１５に記載の方法。
17. 実質的に同一な２つの細胞群を提供し、該細胞群の１つをＶＰＡまたはその誘導体に接触させ、ＶＰＡまたはその誘導体と接触した該細胞群において、ＶＰＡまたはその誘導体と接触していない方の細胞群よりも有意に高いレベルで発現する遺伝子または遺伝子産物を検出することを特徴とする、バルプロ酸またはその誘導体に誘導される遺伝子の同定方法。
18. サブトラクティブハイブリダイゼーション、またはｃＤＮＡサンプルの配列、発現配列タグまたは単一遺伝子コレクションのスクリーニング方法が用いられることを特徴とする請求項１７に記載の方法。
19. 請求項１〜３に記載の化合物を用いた治療に腫瘍が応答するかを試験する段階を含むことを特徴とする腫瘍同定のための診断方法。
20. 請求項１７または１８に記載の方法を含むことを特徴とする請求項１９に記載の診断方法。
21. 核酸技術の使用を含むことを特徴とする請求項１９または２０に記載の診断方法。
22. 検出に、ハイブリダイゼーションまたはポリメラーゼ連鎖反応が用いられることを特徴とする請求項２１に記載の診断方法。
23. 検出に、それぞれ異なった制御を受けるタンパク質に対する特異的抗体が用いられることを特徴とする請求項１９または２０に記載の診断方法。

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