JP2003514383A - 磁性ガラス粒子、それらの製造方法、及びそれらの使用 - Google Patents
磁性ガラス粒子、それらの製造方法、及びそれらの使用Info
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Abstract
Description
願発明は、それら及びそれらの懸濁液の作り方、そして特に自動化工程による生
物物質の精製のためのそれらの使用にも関する。
の難題を示す。一方で、それらは非常に低濃度で存在し、そしてもう一方で、そ
れらはそれらの単離又は、特に生物特異的なアッセイにおける計測を難かしくす
る多くの他の固体及び溶解物の存在中にしばしば見出される。
あるポリペプチドの検出を可能にし、そして診断及び生物分析の分野で重要な役
割をもつ。
の分子検出のために特異的な塩基対形成を利用する。したがって、18〜20ヌ
クレオチドの長さをもつオリゴヌクレオチド・プローブは、ヒト・ゲノム内の選
択した配列の特異的な認識を可能にしうる。このオリゴヌクレオチド・プライマ
ーの選択的な結合を利用する他のアッセイはUS 4,683,195に記載の
ポリメラーゼ連鎖反応法(PCR)である。この方法は、数サイクルのうちにデ
オキシヌクレオチド三リン酸の存在下、熱安定性ポリメラーゼにより特定の核酸
領域を検出可能なレベルまで選択的増幅する。
通常は抽出されるべき、比較的複雑な分析物である。
らの核酸の分離のための多くの手段及び材料が提案されている。例えば、Proc.
Natl. Acad. USA 76, 615-691 (1979)においてフリントすりガラスによりヨウ化
ナトリウムの存在するアガロース・ゲル内でフリントすりガラスに核酸を結合す
る手順が提案されている。
製は、Anal. Biochem. 121, 382-387 (1982)に記載されている。
よりグラス・ファイバー・フィルター上の1本鎖M13ファージDNAの分離及
び過塩素酸によるファージ粒子の溶解が記載されている。グラス・ファイバー・
フィルターに結合した核酸は、洗浄され、そしてその後メタノール含有トリス/
EDTA緩衝液により溶出される。
75, 196-201 (1988)に記載されている。
結合、そして夾雑物、例えばアガロース、タンパク質又は細胞残渣からの分離を
伴う。夾雑物からガラス粒子を分離するために、前記粒子が遠心分離されるか又
は液体はグラス・ファイバー・フィルターを通されるかのいずれかでありうる。
しかしながら、これは多量のサンプルの処理に前記方法を使用させない制限的な
ステップである。
が、証明される。磁性粒子が磁場と接触しない場合、重力がそれらを沈殿させる
唯一の力である。それらは溶液を振ることにより再懸濁されうる。磁場を利用し
ない沈殿手順はその粒子表面での生物材料の固定よりもゆっくりと進む。これは
特に核酸に当てはまる。磁性粒子は、磁石を使ってサンプル液中の特定の位置に
容易に集められうる。前記の液体はその後粒子から、つまり固定された生物物質
から分離される。
用は、Anal. Biochem. 201, 166-169 (1992)及びPCT GB91/00212
に記載される。この手順において、核酸は前記磁性粒子に吸着される。前記吸着
物は磁場を利用し、そして洗浄ステップを行なうことによりもとの溶媒から分離
される。1回の洗浄ステップの後、核酸はトリス緩衝液中に溶解される。しかし
ながら、この方法は前記析出が核酸について選択的でないという不利な点をもつ
。それどころか、さまざまな固体及び不溶性物質が同様に吸着される。その結果
、この手順に存在するかもしれない特異的な酵素反応の有意な量の全ての阻害物
質の除去に使用できない。
てストレプトアビジンを含む層に覆われている市販品も使用できる。ビオチンに
共有結合的に結合するように生物学的物質が複合体調製ステップにおいて修飾さ
れるならば、この製品は生物学的物質、例えばタンパク質又は核酸の分離のため
に利用されうる。磁化できる特定の吸着剤が、自動サンプル調製において能率的
であり、そして好適であることを示した。超常磁性色素、並びにフェリ磁性及び
強磁性色素が、この目的のために使用されうる。
はしばしば色素とも呼ばれる。
る磁性体ともしばしば呼ばれる。超常磁性は、当技術分野において有利な、そし
て好ましいものと理解される(例えばUS 5,928,958;US 5,9
25,573;EP 757 106)。ガラス又は有機シラン表面は、生物特
異的捕捉反応に利用するためにしばしば機能的なものにされる、例えばUS 5
,928,958、US 5,898,071、US 5,925,573、E
P 937 497、US 4,554,088、又はUS 4,910,14
8。あるいは、ガラス、又は有機シラン表面は、それらの親水性、及び/又は陽
電性を変更するためにさまざまな溶媒又は塩により処理されうる、例えばUS
5,438,127。しかしながら、ガラス、又はシラン表面の非誘導体化シラ
ノール基が、DE 195 20 964、DE 195 37 985、WO
96/41840、WO96/41811、EP 757 106、又はUS
5,520,899に記載の好適な反応条件下で純粋な物理的−化学的力による
吸着のために使用されうる。典型的には、磁性核又は磁性核集合体は、酸又は塩
基触媒ゾル−ゲル法により形成されるガラス表面により覆われる。これらはコア
−シェル粒子と呼ばれる。そのガラス殻が色素のサイズ及び形状の点で特有な層
の薄さを有するとき(例えばDE 195 20 964を参照のこと)、ガラ
ス殻は、例えば磁性酸化金属に加えて作製された粒子のサイズ及び形状を確認す
る雲母のような非磁性補助物を含みうる(例えばDE 195 37 985及
び関連のWO96/41811を参照のこと)。高い界面活性を得るために、高
い多孔度を有するガラス材料が使用される(例えばEP 757 106;WO
99/26605を参照のこと)。さらに、複合磁性粒子が記載されている、例
えばシリカ粒子からの無機シリカ基質(EP 757 106)又はガラスとシ
リカ・ゲルの混合物(WO95/06652)により覆ったシリカ被覆酸化鉄。
セイのための、特に自動化された方法のための改良された特性を有する磁性ガラ
ス粒子として知られうる。
。
よる磁性ガラス粒子(MGPs)は、ガラス中への小さな磁性核の固体分散系で
ある。MGPsは比較的小さく、そして基本的に球状である。MGPs組成物の
非磁性細粒の含有量は、それらの調製方法のために非常に少ない。これは、MG
Psの懸濁液をゆっくりと沈殿させる効果をもち、そしてそれにより自動化され
うる分子生物学における方法のために有利に使用されうる。本発明の1の態様に
おいて、本発明によるMGPsの組成物及び懸濁液を提供する。本発明の他の態
様において、MGPsの組成物のための方法を提供する。本発明のさらなる他の
態様において、本発明によるMGPsを使用するDNA又はRNAの精製方法を
提供する。
5〜500nmの磁性体を含むところの磁性ガラス粒子組成物を提供することは本
発明の目的の1つである。これは半減時間値t1/2 により定量化される沈殿動力
学における驚くべき結果を有する(実施例6を参照のこと)。前記半減時間値は
、特定の容量の成分から50%の粒子が沈殿するまでの時間の長さである。イソ
プロパノール中での前記組成物の3mg/ml重量毎容量の懸濁液の沈殿に関する半
減期は、3分、好ましくは4分、より好ましくは6分より長い。しかし、最も好
ましい半減期の値は、10分より長いか又は20分より長い。より小さく、そし
て理想的な球により近いことで、より長くMGPsが懸濁されるであろう。これ
は、理想的な球に似ている形態に近づけることで、2以上の粒子が互いに凝集し
、そして沈殿をより早める凝集を構築する可能性をより低くする事実により明ら
かにされる。これらのデータを実施例6に示しそして高解像走査型電子顕微鏡像
を図4〜図10において見ることができる。これは、シリンジに引き込まれる必
要以上の量からの一定のMGP懸濁液容量の反復的な投与がより容易(質量MGP
/容量に関してより正確なデリバリー)にしながら、そのMGP懸濁液を含む保
存容器の厳しくそして頻繁な混合を減らすことが求められる自動化方法のための
利点を有する。
ある。磁性体と呼ばれるそれらのものは、磁石に引きつけられる、すなわち、例
えば強磁性体又は超常磁性体である。特にそれらがまだ前磁化されていない場合
、好ましくは、強磁性材である。本明細書中における前磁化(Premagnetization
)は、残留磁気を増加させる、磁石との接触を意味すると理解される。好ましい
磁性材は、例えば磁鉄鉱(Fe3 O4 )又はFe2 O3 、好ましくはγ−Fe2
O3 のような鉄又は酸化鉄である。原則として、バリウム・フェライト、ニッケ
ル、コバルト、Al−Ni−Fe−Co合金又は他のフェリ若しくは強磁性体を
利用しうるであろう。前記磁性体は、例えば磁性色素でありうる。磁性体のサイ
ズはナノスケールの範囲にある、すなわち本発明により、その直径は5〜500
nm、好ましくは10〜200nm、最も好ましくは15〜50nmである。好適な磁
性色素はCERAC社により製造され、それは23nmの平均直径をもち、そして
γ−Fe2 O3 から成る。(BET−表面50m2 /g、CERAC:P.O. Box
1178, Milwaukee, Wisconsin 53201-1178 USA; 商品番号I−2012)。本発
明による磁性ガラス粒子は、そのMGPsが高解像走査型電子顕微鏡により測定
されるよう0.5μm〜5μm、好ましくは1μm〜2μmの粒子直径をもち、
これに対してその磁性体が上述のように5〜500nm、好ましくは10〜200
nm、最も好ましくは15〜50nmの直径をもつ事実によりさらに特徴づけられる
。したがって、本発明のMGPsは、高解像走査型電子顕微鏡により測定される
磁性色素核に対する磁性ガラス粒子の1対10より小さな直径比により特徴づけ
られる。これらの直径比並びに粒子のサイズ及び形状を決定するであろうあらゆ
る挿入担体の存在により、そのMGPsの外形及び取り込まれる磁性体の数が製
造条件により決定される。本発明によるMGPsは、微細多孔質であるが、しか
し高次な構造がありそのために6m2 /g超の比較的大きな表面を有する。好ま
しくは、本発明による磁性ガラス粒子は5〜100m2 /gの、好ましくは5〜
90m2 /gの、より好ましくは10〜50m2 /gの範囲の、最も好ましくは
15〜30m2 /gの範囲の表面積を有する。この表面は、DE 195 37
985に記載される粒子のサイズの約2倍である。これはオートメーション化
された市販の装置を用いたBraunauer-Emett-Teller法により決定されうる(実施
例4を参照のこと)。普通はBET法と呼ばれる、この方法についての解説は、
S. Braunauer. The Adsorption of Gases and Vapors, Vol. 1, Princeton Univ
ersity Press, 1943を参照のこと。例えば、優先的に着目のサンプルEJ009
6.5R−01(製造条件の概要については実施例1、及び表1〜表3を参照の
こと)は、26.8525m2 /gのBET−表面、2.3058m2 /gの微
細多孔面積、及び24.9132nmの平均細孔直径をもつ。これは細孔表面は全
表面の10%未満であり、そして磁性ガラス粒子が微細多孔質であることを意味
する。
は、表面上の凹部の中に引かれた垂直の線が粒子の隣接環境の方向に少なくとも
1度粒子を切断するところの粒子の中まで及ぶ。加えて、細孔は粒子内の、その
細孔の1の半径より大きな深さにまで及ぶ。ドイツ特許出願第DE 198 5
4 973.3号又は同第DE 198 55 259.9号と比較した際に、
より遅い沈殿動力学、より広い表面、及び凝集を抑える球状の形態は、核酸診断
における吸着剤としてのより良好な機能的な性能の形でそれら自身が明らかにす
る(実施例3,5、及び7を参照のこと)。この特徴は、いわゆるTaqMan
(商標)アッセイにおけるしきいサイクル、シグナル対ノイズ比、及び静的に確
証されたより低い検出限界の変化により定量化されうる。このアッセイ方法は、
WO92/02638、及び関連の米国特許第US 5,210,015号、同
第US 5,804,375号、同第US 5,487,972号に記載される
。放射性トレーシング実験(実施例5.2を参照のこと)は、本技術分野で知ら
れる基準物質と比較した場合、DNA及びRNAについての結合性質が同じであ
ることを示した。驚いたことに、製造条件は、放射性トレーシング実験における
性質に影響する。本発明のMGPタイプのさらなる利点は、乾燥工程の間亀裂、
及び内部構造(ガラス滴内の小さな磁性核の固体分散系)によるガラス殻に関連
する損傷をもたらしうるガラス層の緊張がないことである。これは、画像作製(
image-producing)法により調べられる(実施例3を参照のこと)。
え、そしてその懸濁液を混ぜて均質にすることで懸濁液を作製することは当業者
にとって自明である。本発明による液体は、磁性粒子の安定性に影響しない、そ
して均質な懸濁液の作製のために利用されうるところのあらゆる液体を含みうる
。
ボ核酸(RNA)の精製工程であって、特定の条件下、それらの物質のガラス粒
子への結合を利用する上記工程に好適である液体が使用される。好ましい液体は
、アルコール又はそれらと水とのあらゆる混合物あるいはケトンを含む。アルコ
ールは、本発明により好ましくはRがn>=Oである一般式−(−CH2 )n −
CH3 を意味する一般式R−OHの一級、二級又は三級アルコールを含むであろ
う。しかしながら、他のアルコールもそれらが、例えばグリセロールのように分
子生物学用途に好適であれば使用されうる。特に好適には、前記アルコール、す
なわちイソプロパノール、エタノール又はそれらと水の混合物、好ましくは80
容のイソプロパノールと20容の水の混合物である。本発明の態様において、前
記液体には、例えばアセトンといったケトンが含まれる。本発明の好ましい態様
においてそれらの懸濁液は、5〜60mg/mlのMGPsを含む。本発明の他の態
様において、MGPsは、場合により2〜8 mol/l、そして好ましくは4〜6
mol/lの濃度においてカオトロピック物質を含みうる水性緩衝溶液中に懸濁さ
れる。カオトロピック塩は、ヨウ化ナトリウム、過塩素酸ナトリウム、チオシア
ン酸グアニジニウム、イソチオシアン酸グアニジニウム又は塩酸グアニジニウム
である。他の化合物であることもできる。本発明によるカオトロピック物質は、
液状の水の構造を乱し、そしてDNA又はRNAを含む溶液中にこの作用物質が
存在した場合、DNA又はRNAが本発明によるMGPsに結合することに対し
て効果を有するあらゆる化学物質である。好適な水性緩衝溶液を作り出すことは
、当業者にとって自明のことである。分子生物学の目的において、好適な緩衝液
系は、例えばSambrook et al. (1989), Molecular Cloning, Cold Spring Harbo
r University Press, New York, NY, USA 中に見出されうる。好ましい緩衝物質
は、トリス−ヒドロキシメチルアミン(TRIS)、リン酸、N−(2−ヒドロ
キシエチル)ピペラジン−N′−(2−エタンスルホン酸)(HEPES)、そ
れらの塩又は他の好適な物質である。加えて、例えばNaCl,KCl又はCa
Clのような溶液のイオン強度を変える物質又は、例えばエチレン−ジアミン−
四酢酸(EDTA)若しくはそれらの塩のような金属陽イオン錯化剤である物質
が提供されうる。当業者に知られる生物学的物質もまた提供されうる。本発明の
他の態様において、前記MGPs懸濁液は、DNA又はRNAを場合によりタン
パク質、脂肪酸、炭水化物、及び生物起源の他の材料との混合物の形でさらに含
みうる。本発明の他の態様において、前記液体は、アルコール、ケトン、水性緩
衝溶液、カオトロピック物質、溶液のイオン強度を変更する物質、錯化剤、生物
材料、前記の特徴を有する全てのDNA又はRNAの混合物を含みうる。
提供する。前記の管はプラスチックで作られうるが、しかし大きな構造物の一部
、例えば96又は384ウェル型のマイクロタイタープレートの一部でもありう
る。本発明のさらなる他の態様において、磁性ガラス粒子の組成物又はその懸濁
液を含む保存容器を提供する。
む保存容器を含むキットの部品を提供する。前記キットは、DNA又はRNAの
精製のために使用されうる。本技術分野で知られる前述のキットは、例えば96
又は384ウェル型のマイクロタイタープレートといった精製手順の間に使用さ
れるプラスチック製品又は、例えばEppendorf, Hamburg, Germany により製造さ
れたまさに普通の反応管をさらに含む。前記キットは、DNA又はRNAをそこ
に結合するときの磁性ガラス粒子の洗浄ステップに好適な洗浄溶液をさらに含み
うる。多くの場合、前記洗浄溶液は、使用前に希釈しなくてはならない保存溶液
として提供される。前記キットは、溶出液、すなわち磁性ガラス粒子に結合した
DNA又はRNAを溶出するための溶液又は緩衝液(例えばTE:10mMトリス
、1mM EDTA、pH8.0)あるいは純水をさらに含みうる。さらに、核酸、
すなわちDNA又はRNAの精製方法に使用されうる補足的な試薬を提供しうる
。本発明の1の態様において、本発明によるキットの部品は、核酸の精製に使用
されうる。
に使用されうる。
物質をともなう混成混合物からの核酸、すなわちRNA又はDNAの精製に使用
されうる。それにより、着目の核酸を少量でしか含まない混合であっても、異な
る核酸の混合物を精製しうる。精製効果は、特定の条件のもとでの、例えば特定
の濃度のカオトロピック物質の存在下での磁性ガラス粒子に結合するDNA又は
RNAの性質に起因する。好ましくは、結合DNA又はRNAをともなうMGP
sは、好ましくは70容のエタノールと30容の水の割合の混合物(「70%エ
タノール」)によりその後少なくとも1回洗浄される。その後、条件を逆方向に
変え、例えばカオトロピック物質の濃度を下げて、MGP粒子に結合したDNA
又はRNAを溶出する。好ましくは、これは例えば重力又は磁石の使用による磁
性ガラス粒子の小粒化、そしてごく少量のカオトロピック物質を含むか又はそれ
を全く含まない溶液内への再懸濁により行われる。あるいは、前記溶液は、ごく
少量のカオトロピック物質か又それを全くともなわない溶液により希釈されうる
。精製されたDNA又はRNAは、すぐに他の反応のために使用されうる。
。本発明によるガラスはケイ素を含む非結晶材料であることは理解される。ガラ
スは他の物質、例えばB2 O3 (0〜30%)、Al2 O3 (0〜20%)、C
aO(0〜20%)、BaO(0〜10%)、K2 O(0〜20%)、Na2 O
(0〜20%)、MgO(0〜18%)、Pb2 O3 (0〜15%)を含みうる
。ガラスは、低いパーセンテージ(0〜5%)の多数の他の酸化物、例えばMn 2 O3 ,TiO2 ,As2 O3 ,Fe2 O3 ,CuO,CoO等を含むこともで
きる。
法を用いて形成され、そしてその後乾燥、及び圧縮されるガラスである。この方
法の基本原理は既知であり、そして例えばC.J. Brinker, G.W. Scherer“Sol Ge
l Science-The Physics and Chemistry of Sol Gel Processing”, Academic Pr
ess Inc. 1990, Sol-Gel Optics, Processing and Applications, Lisa C. Klei
n, Ed., Kluwer Academic Publishers 1994, p.450以降、そしてDE−A−19
41191,DE−A−3719339,DE−A−4117041,DE−A
−4217432、及びWO96/41811に記載された。ゲル−ゾル法にお
いて、主に、ネットワーク形成成分であるアルコキシド、例えばSiO2 ,B2
O3 ,Al2 O3 ,TiO2 ,ZrO2 ,GeO2 は、例えばアルコール溶液中
の他の成分の酸化物及び塩と結び付いて、そしてその後加水分解される。以下の
方程式は、ホウ酸アルミニウムケイ酸ナトリウムガラス(sodium boroaluminium
silicate glass)の作成手順を記載する:
テルの加水分解速度に触媒効果を有するため、この反応工程は比較的速い。いっ
たんガラスを形成したら、それを熱処理により乾燥及び密度を上げて(又は圧縮
して)ガラスを形成しうる。
そして実施例1に詳細に記載されるとおり酸又は塩基触媒ゾル−ゲル合成により
作製される。ここで、使用するものは、最初は固体要素を液相中に分散し(=ゾ
ル)、そして処理の後にそれらをハニカム模様(honeycomb pattern)のように連
結する(=gel)ところのコロイド性の系で作られる。析出物の量から計算し
たガラス(コードEJ)の組成は、70.67 Mol% SiO2 、14.33 M
ol% B2 O3 、5.00 Mol% Al2 O3 、4.00 Mol% K2 O、2.
00 Mol% CaO、4.00 Mol% ZnOであった。ガラス(コードRN)
の組成は、74 Mol% SiO2 、15 Mol% B2 O3 、5.00 Mol% A
l2 O3 、4.00 Mol% K2 O、2.00 Mol% CaOであった。ガラス
(コードEP)の組成は、73.61 Mol% SiO2 、14.93 Mol% B 2 O3 、5.21 Mol% Al2 O3 、4.17 Mol% K2 O、2.08 Mol
% CaOであった。
異った水酸化縮合物、すなわち格子間部位を占める金属イオンを有するSiO2
/B2 O3 /Al2 O3 の非結晶性ガラス基質である。先に解説したアルカリ性
及びアルカリ土類金属イオンに加え、例えばZn2+及びZr2+といった遷移金属
イオンがネットワーク変更物質として基質内に取込まれうる。
はCaCO3 の融解による方法で作製されうる。その方法は以下のとおり:
、ホウ酸−アルミン酸−ケイ酸−基質である、すなわちネットワーク構築要素の
一部のSiO2 は、B2 O3 及びAl2 O3 により置き換えられていると考える
。
をもつ。前記ゾルが、当業者の技術により今までとおりポンプで吸い上げ、そし
て吹きつけられうることがこの方法にとって不可欠である。
記載のとおり二流体ノズル(two-fluid nozzle)を通して吹きつける。好適なス
プレードライ装置は、Nubilosa Molekularzerstaeubung, Ladisch GmbH & Co. K
G, Konstanz, Germany、例えば「Labor-Zerstaeubungstrockner (Type LTK) 」
によるか又はBuechi AG, Uster, Switzerland、例えば「Mini Spray Dryer (Typ
e B-191)」により製造される。
0であるため、その動力学、又は取込まれる磁性核若しくはそれらの非活性担体
の数は、粒子の形状及びサイズではなく製造条件、特にスプレードライの間の条
件が決定する。言い換えれば、サイズ分布、ガラス滴の形状を決定し、そしてそ
れによりMGPsを変更するであろうところの、スプレードライ手順の間の圧力
、噴射口温度、出口温度、及び流速の選択は、自由である。
う。スプレードライ工程の温度低下は、溶媒のよりゆっくりとした蒸発をもたら
し、そしてそれによりMGPsの形態は理想の形状により近づくであろう、すな
わちxy及びxz平面における半径の比は約1になるであろう。前記半径の比は
、0.8〜1.2、好ましくは0.9〜1.1の間で変化するであろう。
℃〜500℃、好ましくは170℃〜230℃又は150℃〜230℃、最も好
ましくは150℃〜200℃又は190℃〜210℃又は200℃若しくはわず
かに低いかである。出口温度はゾル及び溶媒の沸点に依存し、そして溶媒の沸点
より高いか、同じか、又はわずかに、すなわち10℃未満下回るかでありうる。
エタノールを溶媒として使用する場合、それは50℃〜300℃、好ましくは7
0℃〜150℃、最も好ましくは80℃〜110℃である。その最適温度は90
℃〜100℃である。ノズル圧は3bar より高く、好ましくはそれは4〜6bar
に調節される。当業者は、厳密なパラメーターが使用されるスプレードライ装置
に依存するであろうことを理解する。しかしながら、当業者は、本発明の教示を
あらゆる他のスプレードライに移し、そして本願発明の開示を考慮することによ
りパラメーターを見つけ出しうる。Master : Spray Drying Handbook, Fifth Ed
ition, John Wiley & Sons, 1991, New Yorkに記載の方策は、他の設定のために
選ぶべきパラメーターを見つけ出す方法に当業者を導きうる。好ましくは、当業
者は彼らのスプレードライ装置のマニュアルを調べるか又はそのスプレードライ
装置製造業者の技術サービスに連絡する。
る、すなわち融解限界をわずかに下回る。しかしながら、それが高すぎる場合、
互いにくっついて、そしてふるい分けされなくてはならない凝集塊を形成するで
あろう。低すぎた場合、MGPsは最適な高密化がなされないであろう。非常に
高温での粒子のさらなる処理は、磁性特性の損失をもたらす。非常な高温は、そ
れゆえ控えられるべきである。厳密な温度はガラスの組成に依存するが、400
℃〜1200℃である。EJガラス組成の場合、焼結温度は720℃〜770℃
、好ましくは約750℃である。本発明の教示を考慮する際に各ガラス組成につ
いて前記温度を見つけ出すことは当業者の技術の範疇である。本発明により、ス
プレードライMGP粉末は、図2に表わされた、そして実施例1.4に記載され
たとおりさらに処理されうる。好ましくは、前記粉末を、200℃で1時間加熱
し、場合により室温まで冷やされ、そして窒素雰囲気中、1K/分の加熱速度に
より750℃(高密化又は焼結温度)まで加熱され、そしてその温度で1時間保
持される。その後、炉を150℃まで冷まし、そして大気中、再度200℃で1
時間加熱する。室温まで冷ました後、その粉末をふるい(50μm)に移し、そ
して30分間ふるいにかける。ふるいがけしたサンプルを瓶に詰め、200℃で
4時間滅菌し、次に80℃まで冷ます。その後そのガラス容器をオーブンから取
り出し、滅菌したホイルで覆い、そして蓋をする。
めに特に適している。さらに、核材料は天然資源であるためほとんど環境問題を
引き起こさない。その上、本発明による粒子は、安価で、そして製造が容易であ
る。
物物質を含むサンプルを本発明による磁性粒子と接触させることにより生物物質
を単離し、そしてその生物物質をその液体から分離する手順である。本発明によ
り前記用語「液体中」は磁性粒子を加える前に加えられうる液体を意味する。し
かしながら、それは、サンプル自体の粘性が低い、及びサンプル自体が液体の場
合にその結果として磁性ガラス粒子を加える前に固形物質の添加により行われう
るサンプル調製のためにサンプルにさらなる液体又は緩衝液が加えられてはなら
ない状況をも含まれるべきである。試薬添加の指示は、方法の要件により変化し
うる。
。それらは、特に細胞、例えばウイルス又は細菌、並びに多細胞生物から分離さ
れた細胞、例えばヒト及び動物細胞、例えば白血球、そして免疫学的活性低分子
、及び高分子である。核酸、例えばDNA又はRNAは特に好ましい。本発明の
1の態様において、標的核酸が濃度の点で微量成分である(又は少量でしか存在
しない)特有の核酸の混合物を精製する。本発明により、標的核酸は着目の核酸
、すなわちその存在がヒト又は動物の特定の症状又は疾患を示すものとして調べ
られるべき核酸であるべきである。例えば、(例えばB型肝炎ウイルス、C型肝
炎ウイルス又はヒト免疫不全ウイルス由来の)ウイルス配列の存在は、個々の個
体が特定のウイルスに感染していることを示す。その後、このウイルス配列は標
的配列となる。他の標的配列は、例えば遺伝性疾患、例えば鎌状赤血球性貧血と
いった特定の疾患又は特定の型の癌に対する個体の素因を示す配列である。この
例は、本発明について説明的であり、範囲を定めるものではない。
脳髄液、痰、便、生検検体、及び骨髄サンプルを含む。前記サンプルは、環境分
析、食品分析又は、例えば細菌培養、ファージ・ライセート、及び増幅手順、例
えばPCRの産物からの分子生物学研究のために使用されるタイプのものでもあ
りうる。
然の生物学的物質は、その構造が天然の生物学的物質と比較して不可逆的に修飾
されることのなかった物質であると理解される。これはどのような方法であって
も修飾することができないサンプルの他の成分を意味するものではない。修飾し
た生物学的物質は、天然に存在しない物質、例えば反応性の、検出が可能な、固
定化の可能なそれらの基に接着することにより修飾される核酸を含む。この1つ
の例は、ビオチン化核酸である。特定の場合において、前記サンプルは前処理な
しに本発明の分離手順に使用されうる。しかしながら、多くの場合においては、
前記サンプルはサンプル中に含まれる生物物質を遊離する適当な方法を用いて溶
解されなくてはならない。
は物理的でありうる。これらの手順の組合わせも応用できる。例えば、溶解は超
音波、高圧を用いて、剪断力により、アルカリを用いて、溶剤又はカオトロピッ
ク生理的食塩溶液、あるいはプロテアーゼ又はリパーゼを使って行われうる。核
酸を得るための溶解手順に関して、専門の文献、Sambrook et al. : Molecular
Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Addition, Cold Spring Harbour Laborato
ry Press, Cold Spring Harbour, NY、及びAusubel et al. : Current Protocol
s in Molecular Biology 1987, J, Wiley and Sons, NYを参照のこと。
渣、タンパク質、塩、及び分離されない他の物質を含むこともできる。好ましく
は生物物質を天然形で含むこのサンプルを、標的生物物質をその粒子表面に結合
する条件下、粒子と接触させる。このための条件は含まれる生物物質のタイプに
依存するが、基本的には既知である。それらは生物物質をその表面に結合させる
方法にも依存する。免疫学的相互作用が結合に利用される場合、免疫複合体の形
成に好適な条件を選ばなくてはならない。修飾された核酸を使用する場合、結合
は修飾に対応する核酸の基を介して行われうる、例えばビオチンを介したストレ
プトアビジン・コートした表面との結合。しかしながら、核酸について、特にガ
ラスへの核酸の直接の結合が好ましい、なぜなら特に、核酸を修飾しなくてもよ
く、そして天然の核酸さえ結合できるからである。ガラス粒への天然核酸の結合
手順は従来技術に記載の手順に類似しうる。それは2〜8 mol/lそして好まし
くは4〜6 mol/lの濃度のカオトロピック塩の存在下で好ましくは行われる。
カオトロピック塩はヨウ化ナトリウム、過塩素酸ナトリウム、チオシアン酸グア
ニジニウム、イソチオシアン酸グアニジニウム又は塩酸グアニジニウムでありう
る。他の化合物でも可能である。
て結合が起こるのに十分な期間インキュベートする。当業者は、非磁性粒子によ
り処理を行う手順からインキュベーション・ステップの継続期間に一般に精通し
ている。このステップは、さまざまな時点で表面に固定された生物物質の量を測
定することにより最適化されうる。10秒間〜30分間のインキュベーション時
間が核酸にとって適当でありうる。
懸濁液は長時間損われずに維持されるかは、磁性粒子のサイズ及びタイプに依存
する。粒子が小さくそして非磁化である場合、懸濁液は長時間損われずに維持さ
れる。粒子が大きなサイズである場合、粒子はインキュベーション期間の間に流
体と分離してしまう。
て行われない。むしろ、固定化は生物特異的相互作用(捕獲分子)又は吸着に基
づく。これは非特異的に含まれることからの混入物を大いに妨げる。
般的に磁場を利用することにより磁性粒子に結合した物質を分離することによっ
て実現される。例えば、前記磁性粒子を、インキュベーションが行われた試験管
壁に引き寄せることができる。次にその磁性粒子に結合されなかったサンプル内
容物を含む液体を除去しうる。用いる除去方法は、インキュベーションを行った
試験管の種類に依存する。好適なステップは、ピペッティング又は吸収による前
記液体の除去を含む。
る。生物学的物質を粒子表面から遊離させることなく、できるだけ徹底的に望ま
しくない夾雑物を洗い流す洗浄液を使用する。好ましくはこの洗浄ステップは、
粒子を前記洗浄液とともにインキュベートすることによって行われる。好ましく
は粒子を、例えば振り混ぜ又は最初の磁場と異なる磁場を利用することにより、
このステップの間に再懸濁させる。好ましくは汚染された洗浄液は、まさに生物
学的物質の結合についての前記ステップのサンプルの様に除去される。
流体を蒸発させうる。アセトンを用いる前処理ステップも行われる。必要とされ
る場合、本方法により精製された生物学的物質は、磁性粒子から分離されうる。
このステップは、その生物学的物質を磁性粒子に結合した方法にも依存する。前
記生物学的物質が天然の核酸であり、そして磁性粒子がガラス・コート粒子であ
る場合、その核酸は本発明による粒子から低い塩含有量を有する溶出緩衝液を用
いて除かれうる。この種類の緩衝液は、DE 3724442及びAnalytical B
iochemistry 175, 196-201 (1988)から知られる。低い塩含有量を有する溶出緩
衝液は、特に0.2 mol/l未満の含有量を有する緩衝液である。特に好ましい
態様において、溶出緩衝液はトリスを含む。特殊な他の態様において、溶出緩衝
液は脱塩した水である。本発明による手順の利点は、流体から生物学的物質を分
離することが非常に容易な点である。従来技術において、夾雑物からガラス粒子
を分離するために遠心分離ステップを用い又はその生物学的物質がガラス繊維フ
ィルターに結合される場合には、流体をフィルターに通した。これは、大量サン
プルの処理を難かしくする制限的なステップである。生物学的物質は、本発明に
よる粒子を用いてより効果的に夾雑物から分離されうる。特に、特定の酵素反応
の阻害剤を本発明により大いに除去しうる。
るのに好適な期間の後−これは機械的な撹拌により最適化されうる−その粒子は
、検出されるべきでない余分な細胞成分を含む周囲の流体から分離される。これ
は、好ましくは磁石を容器壁のそばに置くことにより磁場を利用することで行わ
れる。
定されるべき核酸をガラス表面から遊離させない流体により行われる。ガラス表
面から核酸を分離する試薬条件を有する溶出緩衝液を加え核酸をガラス表面から
外す。これらの条件は、特に低塩条件である。意図された核酸のさらなる使用に
依存して、前記液体はここで粒子から分離され、そしてさらに処理されうる。こ
の分離ステップは、好ましくは粒子を溶出液から分けるための磁場の利用を介し
て行われる。
メーション化しうる方法における本発明のMGPsの使用である。オートメーシ
ョン化しうる方法は、ヒトによる外部からの制御又は力をわずかにともなうか又
は全くともなわずに作動が可能である装置又は機械により実行されるのに好適な
、方法の中のステップを意味する。自動化方法は、方法の中のステップが、ヒト
による外部からの制御又は力をわずかにともなうか又は全くともなわずに作動が
可能である装置又は機械により実行されるのに好適であることを意味する。方法
の準備ステップだけはヒトの手により行われるべきである、例えば保存容器を満
たし、そして備え付けなくてはならず、ヒトによる供されるべきサンプルの選択
であり、そしてさらなるステップは当業者に知られる、例えば制御コンピュータ
ーの操作である。前記装置又は機械は、液体を自動的に加えるか、サンプルを混
ぜるか又は特定の温度でインキュベーション・ステップを実行しうる。典型的に
は、そのような機械又は装置は、1つのステップ又は命令を指定するプログラム
を実行するコンピューターにより制御されたロボットである。好ましい自動化方
法は、高処理量様式で実行される方法であり、これは、方法及び短時間にサンプ
ルの高処理量のために最適化される、利用機械又は装置を意味する。
業により行われることを意味する半自動化過程に使用される。本発明の好ましい
態様において、本発明によるMGPsを含む懸濁液は保存容器から取出され、そ
して一部が別の反応容器に加えられる。反応容器は、究極的にはそこで反応を実
行しうる96又は384以上のウェルを含むマイクロタイタープレート形である
、プラスチック製の反応試験管でありうる。しかしながら、これらの容器は他の
素材、例えば鋼鉄から作られうる。
ステップが引き続く精製方法である。標的核酸(target nucleic or nucleic ac
id)又は着目の核酸は、非標的核酸の混合物中に含まれうる、さらに上述の特定
の核酸の混合物中の微量成分でさえありうる。好適なDNA検出方法は、当業者
に知られ、そしてSambrook et al. : Molecular Cloning, A Laboratory Manual
, 2nd Addition, Cold Spring Harbour Laboratory Press, Cold Spring Harbou
r, NY及びAusubel et al. : Current Protocols in Molecular Biology 1987, J
. Wiley and Sons, NYといった標準的な教本に記載されている。DNA検出ステ
ップの前にもありうるさらなる精製ステップは、例えば沈殿ステップとして行わ
れる。前記検出方法は、二重鎖内に挿入され、そしてその吸光度を変化させる臭
化エチジウムのような特定の染料の結合又は挿入を含みうるがそれだけに制限さ
れない。精製されたDNAは、場合により制限的消化の後に電気泳動により分け
られ、そしてその後に可視化される。特異的な配列へのオリゴヌクレオチドのハ
イブリダイゼーションを利用し、そして引き続いて上記ハイブリッドを検出する
、プローブに基づくアッセイもある。当業者に知られているさらなるステップの
後にDNAの配列決定することも可能である。最近の方法は特異プローブがそれ
に結合されるシリコンチップに多様なDNA配列を適用し、そして相補的な配列
が結合するときにシグナルを発生する。
るところの、リガーゼ連鎖反応、及びポリメラーゼ連鎖反応といった増幅方法で
ある。時に好ましい検出方法は、WO92/02638及びそれに対応する米国
特許第US 5,210,015号、同第US 5,804,375号、同第U
S 5,487,972号に記載のTaqMan(商標)法である。この方法は
、シグナルを発生させるためにポリメラーゼのエキソヌクレアーゼ活性を利用す
る。詳細には、核酸はサンプルと標的核酸の1の領域に対しての相補的な配列を
含むオリゴヌクレオチド及び同じ標的核酸配列の鎖の、しかし上記第1のオリゴ
ヌクレオチドにより定義される核酸配列を含まない第2の領域に対し相補的な配
列を含む標識されたオリゴヌクレオチドを、ハイブリダイゼーション条件の間に
上記第1オリゴヌクレオチドの3′末端が上記標識オリゴヌクレオチドの5′末
端に隣接するような第1オリゴヌクレオチド及び標識オリゴヌクレオチドにアニ
ールした標的核酸を含む二重鎖の混合物を作り出すための接触を含む工程により
検出される。次に5′→3′ヌクレアーゼ活性をもつ鋳型依存性ポリメラーゼに
よりアニールした標識オリゴヌクレオチドを切断するために、上記ポリメラーゼ
の5′→3′ヌクレアーゼ活性をもたせ、そして標識切片が遊離するのに十分な
条件下でこの混合物を処理する;前記標識オリゴヌクレオチドの加水分解により
発生したシグナルを検出及び/又は計測する。TaqMan(商標)技術は、固
層結合された反応複合体を形成し、そして検出可能にする必要性を取除く。
のための均質溶液相多重アッセイ(homogeneous solution-phase multiplex ass
ay)(実施例7.2を参照のこと)である検出ステップがそれに引き続く生物学
的物質の精製手順を開示する。
いた増幅手順、好ましくはブロッキング・オリゴヌクレオチドの使用と組合わせ
る。多くの場合増幅、特に微量の標的核酸の増幅に関係した問題は、低い温度(
40℃までの室温)での耐熱性ポリメラーゼの活性である。この温度でプライマ
ー・オリゴヌクレオチドはしばしば互いに又はバックグラウンド核酸に非特異的
に結合し、そしてポリメラーゼにより伸長される。これは反応成分の損失及び高
いレベルのバックグラウンド・シグナルを引き起こし、そしてその結果として感
度の低下を引き起こす。これは誤った陽性結果をももたらす。ポリメラーゼの非
特異的活性を避けるために、「ホット・スタート」−PCR(Chou et al., 199
2, Nucl. Acid Res 20, 1717-1723)、共有結合性修飾ポリメラーゼ(例えばAmpl
iTaq Gold, Perkin Elmer)又は抗体(Scalice et al., J. Immunol. Methods, 1
72, 147-163, 1994)、及びオリゴヌクレオチド(Dang and Jayasena, JMB 264,
268-278, 1996; US 5,763,173; US 5,693,502)の様ないくつかの方法が示されて
いる。本発明によりブロッキング・オリゴヌクレオチドは、前述の温度までポリ
メラーゼの活性中心を封鎖しうるオリゴヌクレオチドである。これらのオリゴヌ
クレオチドは、例えば実施例7.2.2.1.3に記載のアプタマーでありうる
。
参照のこと)及び/又は修飾プライマー(例えば実施例7.2.2.1.3を参
照のこと)を単独で増幅反応及びこれに続く検出方法に使用しうる。これは有益
な効果をもち、そしてそれ自体が優れた結果を提供する発明であるとみなされう
る。本発明の好ましい態様において、3′末端核酸塩基、アデニンがp−(t−
ブチル)−ベンジル残基により修飾される。3′−1位にそれを含むさらなる修
飾は、EP 866 071 A2(本明細書に援用)に記載される。
ための本発明は、アニーリング温度がポリメラーゼ−アプタマー複合体の分離温
度を8℃未満、好ましくは3℃未満上回る、少なくとも5サイクルのポリメラー
ゼ連鎖反応のために開示される。
,CaCO3 )の様な未加工の原料を一緒に融解した。 反応様式は以下のとおりである:
ートの混成基質を使用する、すなわち、適切な基質構成物質であるSiO2 はB 2 O3 及びAl2 O3 により部分的に置き換えられている。
の塩の再結晶化がない。 したがって、アルコラートを水酸化物に変え、水を排除するために対応の酸化物
を生じる。 次にこれらは、例えば以下:
、SiO2 /B2 O3 /Al2 O3 から成る3次元の非晶性ガラス基質を形成す
る。本明細書に記載した実験のために、ガラス成分を塩基触媒ゾル−ゲル合成に
より製造した。全ての実験で用いたガラスの組成は(別に示されない限り)以下
のとおりであった: 70.67 Mol% SiO2 、14.33 Mol% B2 O3 、5.00 Mol%
Al2 O3 、4.00 Mol% K2 O、2.00 Mol% CaO、4.00 M
ol% ZnO (反応によりもたらされる個々の抽出物の質量から計算) 1.1 調査した磁性色素の説明 異なるタイプの磁性色素を調査し、そして表1に概要を示した。
拌する。液中に浸した温度センサーにより温度を調節する。次にゾルを90℃ま
で加熱し、そしてアルコール/水の混合物(エタノール:3781ml、H2 O:
1512ml)を500ml/hの速さで加える。前述の混合物の添加の後、容器を
20℃まで冷ます。蓋を空け、そして10249gの磁性色素(CERAC)を
強く撹拌しながら加える。調製したゾルをホースによりスプレー・ドライヤーに
移す。
節し、そしてそのノズルをエタノールにより3分間冷却する。次にホースをガラ
ス容器の出口につなぎ、そして色素含有ゾルを超音波デバイス(200w)を通
してスプレー・ドライヤーの二流体ノズル(two fluid nozzle)(開口部の直径
:2mm;部品製造業者:Nubilosa, Type 1B1VVS1)へ110m/分の速さで押し
出す。スプレー・ドライヤー・装置を図3に図解の形で示す。最初の2分間に形
成された粒子を捨てる。ゾルの完璧なスプレーの後、粒子をともなうサイクロン
(AVO、図3を参照のこと)の下の容器を取り出し、そしてその粒子を次のス
テップに記載のとおりさらに処理する。
そのゾルをポンプ(SP)を用いて容器からノズルに移す。電熱器(EWT)に
より加熱した窒素を乾燥用のガスとして使用する。コート色素を乾燥用チャンバ
ー(T)からサイクロン(ZY)に移す。乾燥した粉末をサイクロン下の容器(
AVO)から取り出す。非常に細かい粒子をフィルター(SF)により窒素から
除去する。スプレー・ドライヤーを過度の圧力で使用しドライヤー内への空気の
取込みを防ぐ。ガスの流れをガス送風機(AV)により作り出す。
まで炉の中で加熱する。次に温度を200℃で1時間保持し、そしてその後オー
ブンを室温まで冷ます。ボールを1時間当り60lの窒素によりリンスされる2
7lの容積をもつガス炉(atmosphere furnace)に移す。その炉を1K/分の加
熱速度で750℃まで加熱し、そしてその温度で1時間保持する。次に炉を15
0℃まで冷まし、そして1時間当たり60lの空気によりリンスする。炉を2K
/分の加熱速度で200℃まで加熱し、そしてその温度で1時間保持し、そして
その後室温まで冷ます。粉末をふるい(50μm)に移し、そして30分間ふる
いにかける。その後、ふるいにかけたサンプルをガラス容器に詰め、1K/分の
加熱速度で200℃まで加熱し、その温度で4時間保持し、そして次に80℃ま
で冷まされるオーブンにより蓋をせずに滅菌する。次にそのガラス容器を炉から
取り出し、滅菌したホイルにより覆い、そして蓋により閉じた。
ルをいくつかのデータとともに表3に示す。各サンプルは固有のコードをもつ。
最初の2文字は用いたガラスの化学的性質(以下を参照のこと)を表し、そして
次の4つの数字は製造工程(表2を参照のこと)をコードする。その数字の後に
用いた色素(表1を参照のこと)を記載する。前記の文字Rは微細内容物が除か
れていないことを意味するのに対して、Eは微細内容物がエタノールにより除か
れていることを意味する。最後の2つの数字はロット番号を表す。抽出物の量か
ら計算したガラス(コードEJ)の組成は、70.67 Mol% SiO2 、14
.33 Mol% B2 O3 、5.00 Mol% Al2 O3 、4.00 Mol% K2
O、2.00 Mol% CaO、4.00 Mol% ZnOであった。ガラス(コー
ドRN)の組成は、74 Mol% SiO2 、15 Mol% B2 O3 、5.00 M
ol% Al2 O3 、4.00 Mol% K2 O、2.00 Mol% CaOであった
。ガラス(コードEP)の組成は、73.61 Mol% SiO2 、14.93 M
ol% B2 O3 、5.21 Mol% Al2 O3 、4.17 Mol% K2 O、2.
08 Mol% CaOであった。
り製造された高解像走査型電子顕微鏡(JSM)により調査を行った。サンプル
を電気伝導性の両面接着テープによりサンプル・ホルダー上に広げ、30mAの電
流で36秒間金によりスパッタする。表面を推測するために、放出した2次電子
(トポグラフィー(topography))、及び後方散乱電子(オーダー・ナンバー・
コントラスト)を観察する。使用した主な電子電圧は、10kV(2次電子)又は
25kV(後方散乱電子)であった。
sを示す。非収縮性材料上で層が収縮し始める場合の粒子のスプレードライに由
来するガラス殻の亀裂をはっきりと見ることができる(乾燥性亀裂)。さらによ
り大きな磁性粒子(10〜60μm)を1つも含まない多数の球状粒子を見るこ
とができる。磁性核をもたないこれらの球体(非磁性微細成分)は磁場により除
去できず、PCR反応に移され、そしてこの反応を妨げる。
ライ処理の間に亀裂が作られないため、CERAC色素による粒子(図5を参照
のこと)には亀裂がない。さらに、小さなCERAC粒子は、そこに含まれた非
磁性粒子がないため微細成分内に取込まれもする。その粒子は、雲母による粒子
よりも相当小さくもあり、それは同じ倍率のこれらの図において観察されうる。
他の磁性色素によるMGPsを図6〜図10に同じ倍率で示す。
さらに物理的計測をMGPsについて行った。水中での鉄の溶解度、磁力、微細
成分、密度について知ることは興味深かった。以下にその実験を記載し、そして
結果を示した。
し、そしてふるいがけした粉末を50ml容遠心管(Sarstedt)に量りとり、40
mlの水を加え、そして振りまぜて分散させる。次にその管を、全体を埋める高さ
を有する超音波バス(Sonorex (RX 102H; 120/240W))に入れ、そして磁性分離
機(Roche Diagnostics GmbH RD Art. Nr. 1858 025)に乗せる。3.5分間の磁
性分離の後、液体を磁石の向かい側の15mlマークの高さでパスツール・ガラス
・ピペットにより容器から取り、そして5mm石英キュベット(Type 110-QS, Hel
lma)に満たす。その上清の吸光度をUV−VIS−NIR分光計(Hitachi U-30
00)により脱イオン水で満たした対応のキュベットに対して計測する。計測の範
囲は、偶発的な夾雑物の吸収バンドに関するこの波長範囲を調査するために1nm
きざみで200〜1100nmとした。280nm及び400nmの波長での吸光度を
参考として測った。
)を使用する。ヘリウム6.0をガスとして使用する。装置を市販の標準物質(
容量概知の金属ビーズ)により標準化する。さらに、サンプルを少なくとも15
0℃で1時間乾燥し、そして次に計測容器に満たし、そして計量する。計測容器
をガス・ピクノメーター内に入れた後、10の洗浄サイクル及び5の計測サイク
ルを平均容量及び標準偏差を測定するために用いた。
Emission分光法(JY24,ISA社)により測定する。そのために、1gのサ
ンプルを50ml容ポリプロピレン管に移し、滅菌水で満たし、そして60℃の温
度で20時間保持する。次に、サンプルを0.2μmシリンジ・フィルターによ
りろ過し、そしてそのろ液を計測する。4の単独測定を259.940nmの波長
で実施し、そしてそこから平均値を計算する。
fa社、Art. Nr. V2-3)を計量する。ステンシルの助けにより、このサンプル容器
を、その管の蓋を閉じたままにできるように真ちゅうをのせたLDPE管(Kart
ell社、TS735)の中央に置く。前記容器を他のステンシルの助けにより天秤(検
出精度0.1g)の中央に配置する。天秤の平衡化の後、円柱形の磁石(直径:
30mm;高さ:113.5mm;材質:サマリウム−コバルト2/17)を含むプ
ラスチック・カプセルを天秤の上に配置する。
減少する。平衡状態の調整(1.5分)の後、サンプルの重量損失を測定し、そ
してその値を250mg MGPについて正規化する。
要として示す。吸光度の値はCERAC色素を用いた場合、非常に低いことが注
目に値する。これは、小さなCERAC色素(23nm)が各磁性ガラス粒子内に
取込まれうることでの非磁性微細成分の欠如により説明されうる。CERAC−
MGPsの密度は非常に高いわけではない。これは沈殿速度に決定的な影響をも
つ。磁力は、大きな変動の影響下に置かれるが、しかしながらそれはCERAC
色素の使用により明らかに影響をうける。CERAC−MGPsは水への鉄の比
較的高い漏出を有する。しかしながら、10倍多い量であってもPCR反応にい
かなる影響をも示さなかった。
RAC−MGPsが非常に少ない微細成分を有することを言明しうる。
果 表面をMicromeriticsのデバイス(Type ASAP 2400)を用いて測定した。計測を
液体窒素温度で行った。窒素5.0を計測用ガスとして、そしてヘリウム4.6
を不活性ガスとして用いた。典型的には、5gのサンプルを1回の計測に用いた
。MGPsの表面はDNA及びRNAの分離の役割を果たす。優れた表面はより
多くのDNAを同じ質量のMGPsにより結合しうる。それは少ないMGPsを
使用し、そして同じ成果を得ることをも可能にする。これはPCR反応内に夾雑
物として導入されうるアルコールの減少を意味する粒子間の体積を減らす効果を
もつ。いくつかのサンプルについての計測したBET表面のデータを表4に概要
として示す。大きなスプレー・ドライヤーで製造したサンプルの表面を比較する
場合、小さな色素(BASF FA, STREM、及びCERAC)によるサンプルは比較的大きな
表面を有し、一方大きなMerck色素は小さな表面を有することに留意すべき
である。これは大きな磁気粒子が大きなMGPsを生じるのに対し、小さな磁性
粒子がスプレー・ドライ処理の間の球状滴中に取込まれ、したがって同じような
スプレー条件下で同じような表面を有するという事実により生じうる。BASF
CE−SU粒子は、小さな粒子(BASF FA, STREM、及びCERAC)と大きなMer
ck粒子の間に分類されるサイズを有する。Merck粒子との対比において、
その粒子が非常に滑らかなガラス表面を有するので、それらは構造的な表面を持
たない。これは小さな表面をもたらす。より高い圧力が小さなスプレー・ドライ
ヤーにより用いられ、そしてこのスプレー・ドライヤーのノズルは大きなスプレ
ー・ドライヤーのそれよりも異常に小さい。これはより小さな粒子を生じ、それ
により表面が著しく減少する。これは実施例5.2.1の結果とよく一致してい
る。
、前述の亀裂形成及び微細成分に対する効果を除いて認められない。しかしなが
ら、表面の計測だけは機能的な効果の結果への直接的なつながりを示す。他の物
理的効果の結果はこの直接的なつながりを示さない。
がある。精製前後の260nmでの吸光度の測定は、感度が低く、そして少量の標
的核酸を臨床材料から抽出する状況に類似しない。例えばPCR,RT−PCR
,NASBA又は他の類似物によるような核酸の増幅方法に頼る機能的な評価方
法の結果は、たいてい十分な説得力がない。さらに、標的ゲノムのわずかなコピ
ーの測定に好適なこれらの方法は、サンプル材料又はサンプル調製処理からの物
質による妨害の影響を受けやすい。
析方法である。成果データは完全なデータではないが、必ず言及の粒子の性能に
相関する。
ヌクレオシド−三リン酸の存在下でのPCR又はインビトロにおける転写処理に
より酵素的に合成する。次に、この標識DNA又はRNAを遊離のヌクレオシド
−三リン酸から分離し、含有量を測定し、そして確定した希釈液を調製する。少
量の標識DNA又はRNAを実験前に各サンプルに加える。サンプル調製の間に
、全ての核酸はカオトロピック物質存在下、MGPsに結合する。そのMGPs
を磁力の使用によりペレット形成し、そして上清を捨てることができる。前記ペ
レットを洗浄し、そして結合した核酸を、反応条件の反転により、すなわち低塩
の溶出緩衝液の添加により高めた温度で溶出する。結合の後、そして場合により
洗浄ステップの後、前記粒子上清のアリコートをフィルター上にスポットする。
前記溶出液、及び水中に再分散させたMGPを同様にフィルター上にスポットし
、その後乾かす。最後に、そのフィルターをベータ・カウンターにより計測し、
そして各サンプル調製についての分布を計算する。
測する。
測する。
等)を用いて異なるスプレー・ドライヤー(Buechi又はNubilosa)で製造された
異なるMGPタイプをウイルス−陰性貯留物質からの核酸の抽出でのそれらの振
る舞いに関して実施例5.1.3.2による放射性トレーシング法により特徴づ
けした。RNAパラメーターはその試験の内で最も高感度であることが証明し、
そしてその結果、パラメーターとして選ばれた。図11は、溶出液中に少量の結
合RNAしか見ることができなかったため、BASF−CEが核材料として好適
ではないことを示す。6bar でBuechi装置によりスプレーされたEJ/C
ERAC粒子は、Nubilosa装置によりスプレーされた基準EJ/MMB
の性能を示した。
プを実施例5.1.3.3により比較する。基準粒子は、EJ/MMB MGP
である。DNA及びRNA結合特性を調査する。DNAパラメーターがスプレー
圧への非依存を示すのに対し、RNAパラメーターは顕著な性能の違いを示す。
Nubilosa装置により1.5bar のスプレー圧によって製造したEJ/C
ERACの性能は、基準のそれよりも低い。1.5〜3.4bar 変化したスプレ
ー圧への依存により1連の中でより低い性能が存在する(〜30%)。4.3ba
r でスプレーされる粒子は、1.5bar でスプレーされた粒子の性能の90%に
達する(図12を参照のこと)。前記実験は、MGP製造に関する処理パラメー
ターと試験における性能の直接的なつながりを証明する。スプレー圧の増加は低
い試験性能をもたらすが、特定のスプレー圧からの開始は、粒子特性をより良好
な性能をもたらすように改善することに留意すべきである。
らすかどうかの結果を導くはずである。
bar 、及び6bar の圧力でNubilosa装置により製造する。
さらに下げる。RNA単離に対するこれらの因子の影響を、基準としてEJ/M
MB MGPを用いて実施例5.1.3.3により調査する。
そして予測しえなかった劇的な性能低下の驚くべき効果を示す。スプレー圧の上
昇により基準に似た性質の性能を達成することは可能であった。優れた懸濁液安
定性に付随して、結果として、これらの粒子は基準よりも優れている。
沈殿性質の評価のために使用する。この分光光度計を、物差しの目盛りにそって
キュベットの可変調節を可能にするために変更する。計測のためにキュベットを
、650nmの波長をもつ計測ビームが内容物の高さの2/3の位置(物差しの位
置は7.5)でキュベットを横切る位置にセットする。4mlの容量及び1cmの光
路長を有するポリスチレン製のマクロ・キュベットを用いる。計測に先立ち、較
正を純粋な懸濁溶媒に対して単ビーム法により行う。MGPを、典型的には3mg
/mlの質量/容量比で懸濁媒質中に均質に分散させ、そして直ちに計測する。時
間による吸光度の変化を前述の650nmの波長で連続的に観察する。
媒質における半減期(t1/2)である。これはキュベットの上部3分の1におけ
る懸濁液の吸光度が計測の開始時の半量になるまでの時間である。吸光度の低下
は、粒子の沈殿、及び付随する試験容量の上部3分の1のクリアランスにより生
じる。
のため、磁気分離の速度を計測しうる。
により製造されたいくつかのMGPタイプを、それらの沈殿及び分離性質、すな
わちキュベットの下の磁石の有無について分光光学的に評価する。質量/容量は
、この場合6mg/mlである。前記懸濁媒質は、イソプロパノールと溶解緩衝液の
1:1混合物である。結果は概要を示す。CERACタイプからの粒子は懸濁液
の安定性において明らかな優位性を示すが、磁気分離についての劣性は示さない
(図14も参照のこと)。
Psの沈殿性質を純粋なイソプロパノール中で評価する。
、高次構造表面を有し、そして主に0.5〜5μmのサイズである。低い圧力及
び高温でスプレーされたサンプルEJ0100.5R−01は主に変形したμ−
スケールの粒子から成る(EJ0100.5Rと機能的当量を示す、図16を参
照のこと)。最後に、EJ0096.5R−01のような粒子は、MGP懸濁液
の液体の移動について最も有用である懸濁液の顕著な沈殿の遅延を示す(図14
bを参照のこと)。結果を概要の形で示す。
600(商標)によるPCRにより増幅し、そして変更したElecsys 1
010(商標)による化学発光標識検出プローブを用いる生物特異的結合により
検出する。
ロピック塩、及び界面活性剤の存在により溶解する。次に遊離核酸をガラス表面
に物理学化学的吸収のために微粒子吸収体(=MGP)を加え、その後に磁気に
よる分離及び加えられたビーズ、すなわち結合型/遊離型吸収体の洗浄が引き続
く。最後に、ビーズからの結合した核酸の分離(溶出)を吸収に対して反対にし
た反応条件下、すなわち低い塩の緩衝液によるか又は滅菌水によってでさえ実行
される。次に溶出物のアリコートをPCRマスター・ミックスと混合し、溶出物
内に発見される核酸の増幅を始める。この反応は以下の等式により特徴づけられ
る。
幅物をハイブリダイゼーション緩衝液及び検出プローブと混合する。インキュベ
ーションの後、ストレプトアビジン・コートビーズを加え、引き続いてもう1度
インキュベーションする。最後にそのビーズを洗浄し、シグナル緩衝液を加え、
そして増幅された核酸結合の量、すなわち血漿サンプル中のウイルス混入量に相
関する化学発光シグナル強度を計測する。
A−RNA、1mg/ml、使用レベルは溶解緩衝液による1:1000希釈液溶解
緩衝液、以下の ・トリス緩衝液、50mmol/l、pH7.0(それぞれ、1.0及び抽出器プロト
コール)、又は4.0(1.5mlプロトコール) ・ポリドカノール、15%(v/v)(それぞれ1.0及び抽出器プロトコール
)、又はTriton(商標)X−100 20%(v/v)(15mlプロトコ
ール) ・イソチオシアン酸グアニジニウム、5mol/l ・1mmol/l DTT から成る。
0%(1.5mlプロトコール) ・NaCl,20mmol/l から成る。
V)):250mmol/l ビシン(bicine)/KOH pH8.2,557
mmol/l K−酢酸、40%グリセロール HBV−PCR(B型肝炎ウイルス(HBV)):20mmol トリス−HCL
pH8.3,100mmol/l KCl,0.012% Brij35(=2倍濃
度) 金属陽イオン、MgCl2 (HBV−PCR)3mmol/l又はMnCl2 (R
T−PCR)2.5mmol/l(HCV)、及び1.25mmol/l(HIV) デオキシヌクレオシド三リン酸(dATP,dGTP,dCTP,dTTP,
dUTP) 分析物特異的な正プライマー 分析物特異的な逆プライマー ウラシル−N−グリコシダーゼ(UNG) DNAポリメラーゼ(それぞれ、HBV又はHIV/HCVのためのTaq又
はTthポリメラーゼ)100μlに容量調節するための鉱物質を除いた水(分
子生物学グレード) から成る。 増幅後のUNG停止試薬 − N−ラウロイルサルコシン(例えばRoche Id.Nr.133895)、1%(w/v
); 増幅物100μl当たり5μl 7.1.2.1.2 検出 ハイブリダイゼーション緩衝液(例えばRoche Id.Nr.1930273) 化学発光標識検出プローブ HCV(Roche BMO 28.140336)、作業原液=8.0nmol/l HIV(Roche BMO 28.540948)、作業原液=7.8nmol/l HBV(Roche BMO 28.540917)、作業原液=9.2nmol/l SAで覆ったECLビーズ(例えばRoche Id.Nr.1865943-001) 変性溶液(例えばRoche Id.Nr.1930257) Pro Cell(例えばRoche Id.Nr.1717685) Clean Cell(例えばRoche Id.Nr.1717642) 7.1.2.1.3 プライマー及びプローブ
スし、500μlの溶解緩衝液を加え、機械的な撹拌(Eppendorfミキサーによ
り1300rpm)しながら室温で5分間インキュベートし、 50μlのイソプロパノール中に懸濁したMGP(濃度60mg/ml)を加え、
ボルテックスし、そしてローラー・ミキサーにより室温で20分間インキュベー
トし、 Dynal磁気セパレーターを用いて磁気分離し(2分間); 結合されていない画分を吸引を通して除き、そして700μlまで水を加え、
ボルテックスし、分離し、吸引し; あと4回洗浄手順をくり返し、 120μlのDEPC水を加え、ボルテックスし、そして蓋のないカップによ
りEppendorfサーモミキサーにより1300rpm 、80℃で10分間溶出し、 ビーズをDynal磁気セパレーターにより水性上清(=溶出液)から分離し
(2分間)、 溶出液をこの先使用するまで冷凍しておく。
amoured RNA)内部標準(IC、以下を参照のこと)をそれぞれの、そしてどの
サンプルにもスパイクさせ、抽出工程を約40℃で一定温度とし、そして容量を
2ml総量の溶解ミックス、すなわち以下の 50μl IC 50μl プロテイナーゼK 850μl サンプル 1000μl 溶解緩衝液 100μl MGP懸濁液 2200μl 洗浄緩衝液、5回の洗浄ごとに 125μl 溶出液 に調節する。
スし、 500μlの溶解緩衝液を加え、機械的な撹拌(Eppendorfミキサーにより1
300rpm)をともない室温で5分間インキュベートし、 500μlのイソプロパノール中に懸濁したMGP(濃度60mg/ml)を加え
、ボルテックスし、そしてローラー・ミキサーにより室温で20分間インキュベ
ートし、 Dynal磁気セパレーターを用いて磁気分離し(2分間); 結合されていない画分を吸引を通して除き、そして700μlまで洗浄緩衝液
を加え、ボルテックスし、分離し、吸引し; あと4回洗浄手順をくり返し、 100μlのDEPC水を加え、カップを閉じて、ボルテックスし、そしてEp
pendorfサーモミキサーによって1300rpm 、80℃で15分間溶出し、 ビーズをDynal磁気セパレーターにより水性上清(=溶出液)から分離し
(2分間)、 溶出液をこの先使用するまで冷凍しておく。
より妨害する。
レアーゼ・アッセイ・テクノロジー 7.2.1 全般的な考え方 ウイルス粒子の溶解、並びにサンプルから抽出された核酸の吸着、精製、及び
溶出を前記のとおり実施する(実施例7.1.2を参照のこと)。再び、標的分
子の増幅を以下の等式により説明する。
それぞれは密接に絡み合い、そして溶液相の中で起こっている、すなわち固相の
固定及び対応の洗浄ステップをもたない(=均質系PCR)。この最後に、2の
特有の化学修飾を有する検出プローブをPCRマスターミックスに加える。これ
ら修飾の1つは、プローブの骨格に共有結合させた蛍光発生的レポーター基(R
、例えば6−カルボキシ−フルオレッセインの誘導体)であり、もう1つは上記
レポーターの蛍光発光を吸収することができ、そしてそれをクエンチする色素(
例えばポリメチン−シアニン誘導体)(消光剤)である。前記消光剤はプローブ
骨格の5′末端に典型的には付着する、それに対して前記レポーターは妨害状態
を形成する一定のヌクレオチドだけ消光剤から間隔をおいて置かれるオリゴ配列
中に配置される。これらのプローブは、標的核酸(センス又はアンチセンス鎖)
にプライマー(逆又は正)の3′末端の間近に結合する。プライマーが標的にア
ニールし、そしてDNAポリメラーゼがプライマー:標的ハイブリッドに結合す
るとすぐに伸長が始まる。酵素の5′ヌクレアーゼ活性のために、複製鎖の合成
と並行してポリメラーゼはプローブ結合部位に到達するとすぐに前記プローブを
切断し、レポーターと消光剤が切り離され、そして蛍光シグナルが計測できるよ
うになる。この工程はサイクルごとにくり返され、そして反応の終了時の試薬の
消耗まで溶液中にますます多くの蛍光レポーターを蓄積する。なので、シグナル
対時間のプロットにおいて、シグモイド成長曲線を生じる。より大きなN0 、そ
してより初期のシグナル曲線ほど高いノイズ・レベルを現す。
るところの時間軸上の点は、しきいサイクル(ct)と呼ばれる。ctは分析感
度の指標である:小さなct値ほどその分析は高感度である。ct値は別の数学
的操作、例えば除外(cut−off)法(一定の因子により増幅された平均バ
ックグラウンド・シグナル強度は除外シグナル強度をもたらし正から負を識別す
る)又はシグナル対時間曲線の最初の微分の最大値の位置(すなわち勾配きつさ
の特徴)若しくは時間軸上の第2の微分最大値の位置を計算し、そしてctとし
て定義する方法により算出されうる。
での処理をももたらす、すなわち標準的な手順との比較において、PCR管は溶
出液及びマスターミックスのピペッティングの後、閉じられたままであり、これ
は効果的に汚染の危険性を減らす。
り、異なる分析分子及び標的配列)を1つのマスターミックス中に組合わせて使
用する場合、検査を受けた個体のウイルス感染に依存した同時の多重増幅/検出
反応の実行が可能である。これはいわゆる多重アッセイの基礎である。
在する全ての核酸は、配列の特徴とは無関係に粒子表面への物理化学的吸着によ
り抽出される。これは破裂させたヒトの血球、例えば白血球から放出されるヒト
DNA(hDNA)をも含み、そのタイターは、血液サンプル提供者の個々の生
理学的又は病理学的状態により大きく異なる。例えばSLEのような自己免疫疾
患の場合、hDNAレベルは相当に上昇しているであろう。前述のように、与え
られたサンプル中に存在するhDNA及び1以上の病因性核酸は共に抽出される
、異なる配列特異性のさまざまな核酸の混合物を形成する。それらはポリヌクレ
オチドのマトリックスを形成し、区別なく抽出され、その後には適切な反応条件
下、特異的なプライマー及びプローブを介した標的核酸の配列特異的な増幅及び
検出が続く。
ウイルス・ゲノムRNA50コピー、及びゲノムRNA当たり10000ヌクレ
オチドの低いウイルス感染の病理的レベルが得られる。1ヌクレオチド当たり約
325ダルトン(1ダルトン=1.66×10-24g)とすると、血漿1ml当たり
標的RNA50コピーつまり500000ヌクレオチドは約2.7×10-7ngと
なり、約1:10+12 の標的:非標的核酸の相対量をもたらす、さらに工程全体
を観察するために、人工の核酸構築物、好ましくは天然の標的と共に抽出され、
そして共に増幅される改変ウイルス粒子内に包まれ(外装され)、サンプルに加
えられうる。この内部標準(IC)は、識別しうる放射特徴を有する異なるレポ
ーター基の点で標的特異性プローブと異なるIC検出プローブのための特有のプ
ローブ結合領域が特色となっている。したがって、ICシグナルは標的シグナル
から識別されうる、そして上記ICはサンプル中に存在することが知られている
ので、観察物質として機能しうる。このように、多重ラベルは多重アッセイ・テ
クノロジーの有用性を広げる。前記内部標準(IC)は、WO98/00547
に記載されている。
参照のこと。
異タンパク質)及びUNG(ウラシル−N−グリコシダーゼ)を介して加える。
とおりである:
離) 化学的誘導体化用語 いくつかのオリゴヌクレオチドは、アルキルホスファチジル・リンカーに共役
したペンタメチン−ジ−インドカルボシアニン(Pharmacia Biotech Cy5-N-ホス
ホルアミド酸エチル)であるCy5により誘導体化され、そして消光剤(Q);
λEX=630nm、λEM=665nmとして機能する。いくつかのオリゴヌクレオチ
ドは、2−(アミノ−シクロヘキシル−)プロパン−1,3−ジオール・リンカ
ーと共役した6−カルボキシ−フルオレッセイン(Biogenex, CX-FAM-ホスホル
アミド酸)であるFAMにより誘導体化され、そして標的に対するレポーター(
R);λEX=485nm、λEM=515nmとして機能する。いくつかのオリゴヌク
レオチドは、2−(アミノ−シクロヘキシル−)プロパン−1,3−ジオール・
リンカーに共役したヘキサクロロ−6−カルボキシ−フルオレッセイン(Biogen
ex, CX-HEX-ホスホルアミド酸)により誘導体化され、そして内部標準に対する
レポーター(R);λEX=530nm、λEM=585nmとして機能する。
漿)、 例えばクエン酸血漿又はEDTA血漿 − ウイルス陽性血漿又はウイルス含有培養上清、これらは適切な割合で0− マトリックスと混合することにより特定のウイルス力価に調節するために 使用されうる。
方法により調査する。試験の変数はスプレー圧とした: EJ0100.5R−1.5bar EJ0106.5R−2.5bar EJ0107.5R−3.5bar EJ0108.5R−4.3bar スプレー圧の減少により、すなわち平均ビーズ直径が小さくなる方向に向かう
と、非特異的結合(USB)が減少するのに対して、シグナル対ノイズ比を上昇
させる高い特異的シグナル産生を変化させないことを証明できた。
グナル産生単位)であり、そしてHIVの場合、約150sgu /mlである。デー
タを表7に概要として示す。
)及び個体(PL)血漿サンプルとの結合において、実施例7.2に記載の方法
を用いて機能の上で比較する。EJ0047.2R(MMB)及びEJ0100
.5R(CERAC)は標準的な条件下、すなわち1.5bar 、230℃の噴射
口温度及び約110℃の出口温度でスプレーされる。EJ0102.2R(MM
B)及びEJ0108.5R(CERAC)は、スプレー条件(噴射口温度を2
00℃〔MMB〕まで下げ、そしてスプレー圧を4.3bar 〔CERAC〕まで
上げた)に関する発展的変異型である。結果は表8に概要として示され、より早
いしきいサイクル及び/又は大きなシグナルの差異(飽和シグナルからノイズを
引いたレベルS−N)により例示されるより高い感度を獲得するためのCERA
Cナノ核粒子の性能を示す。
参照のこと)を実施例7.2に記載の方法を用いて機能の上で比較する。結果は
表10に概要として示され、そしてより早いしきいサイクル又は個々のアッセイ
に関係のないより高いヒット率により例示されるより高い感度を獲得するための
EJ0096.5R−01型粒子の性能を示す。
ためのインキュベーションが振り混ぜながらか又はそれなしに実施されるかで、
実施例7.1に記載の方法を用いて機能の上で比較する。それについて、沈殿速
度が決め手となる、すなわち沈殿速度が早いほど分析物との相互作用から外され
、沈殿物を形成する粒子の数が多くなる。それに反して、沈殿速度が遅い場合、
液体からの分析物分子が吸着剤表面に吸着されうる時間はより長くなる。結果は
11(EJ0047.2Rを基準として用いた)に概要として示され、機械的撹
拌をともなわないときの性能の損失は、MMBの場合に最も高く(>40%)(
本願発明の特徴とは著しく異なる)、そしてCERACの場合に最も低いか又は
実質的に損失していない(この組の中で本発明の特徴に最も近い)。
指標を以下の方法により各タイプについて計算した: → 各タイプのMGPについていくつかのバッチの溶出液、及び各力価レベル
のそれぞれを1つの溶出液プールに貯める。
)について行った。
測した。
る。
れぞれについて計算する、すなわち0−マトリックス(陰性)について低い力価
(弱い活性)、及び0−マトリックスについての上昇した力価。
規化S/N因子の合計;感度の側面を明言するために、低い力価範囲に関するS
/N因子を高い力価レベルのそれに関連して2倍に加重する。
。
A、20μg/ml ポリA−RNA、及び0.05% NaN3 を含む希釈液中
にさまざまな力価レベルまで希釈され、そして貯留血漿中にスパイクされたHC
Vインビトロ転写産物の抽出に使用した。
又は4000ng/mlでスパイクした。驚いたことに、表12に提示したデータに
より証明されるとおり、ビーズを選択することによりhBG−DNAによる干渉
の減少が可能である。
ヒト・バックグラウンドDNA(hBG−DNA)をそれぞれのサンプルに0又
は4000ng/mlでスパイクした。再び、ビーズ・サイズ及びビーズ形状の顕著
な影響が観察されている。本発明によるMGP特性を最もよく表すMGP調製物
EJ0096.5Rは、表13に提示したデータにより示されるとおり、ct値
の最小限の移動、及び特異的シグナル産生(S−N)の損失の減少の両方に関し
て非常にはっきりとした利点を示す。
3以降の本明細書中に記載する。
ドライヤー:Buechi(B)又はNubilosa(N))。
(L=空気、N=窒素)、噴射口温度(E)又は出口温度(A))。
GP。
に変形したμ−スケールの粒子により構成される。
Claims (64)
- 【請求項1】 その磁性ガラス粒子が、5〜500nmの平均直径を有する少
なくとも1の磁性体を含む磁性ガラス粒子組成物。 - 【請求項2】 前記磁性体が10〜200nm、好ましくは15〜50nmの平
均直径を有する、請求項1に記載の組成物。 - 【請求項3】 イソプロパノール中、前記組成物の3mg/ml重量毎容量の懸
濁液の沈降の半減期が3分より長い、請求項1又は2に記載の組成物。 - 【請求項4】 前記半減期が6分より長い、請求項3に記載の組成物。
- 【請求項5】 前記磁性体が23nmの平均直径を有する、請求項1〜4のい
ずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項6】 前記磁性体対ガラス殻の直径比が1対10より小さい、請求
項1又は5に記載の組成物。 - 【請求項7】 前記磁性ガラス粒子が0.5μm〜5μmの平均直径を有す
る、請求項1〜6のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項8】 前記磁性ガラス粒子が1μm〜2μmの平均直径を有する、
請求項1〜7のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項9】 前記磁性ガラス粒子が微小孔性である、請求項1〜8のいず
れか1項に記載の組成物。 - 【請求項10】 前記磁性ガラス粒子の多孔質表面(pore surface)が表面
全表面の10%未満である、請求項1〜9のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項11】 前記磁性体が超常磁性である、請求項1〜10のいずれか
1項に記載の組成物。 - 【請求項12】 前記磁性体がフェリ磁性体又は強磁性体である、請求項1
〜10のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項13】 前記磁性体が鉄又は酸化鉄を含む、請求項1〜12のいず
れか1項に記載の組成物。 - 【請求項14】 前記酸化鉄がFe3 O4 又はγ−Fe2 O3 である、請求
項13に記載の組成物。 - 【請求項15】 前記磁性ガラス粒子が4m2 /gより広い表面積を有する
、請求項1〜14のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項16】 前記磁性ガラス粒子が5〜100m2 /gの、好ましくは
10〜50m2 /gの範囲の、最も好ましくは15〜30m2 /gの範囲の表面
積を有する、請求項15に記載の組成物。 - 【請求項17】 前記磁性ガラス粒子が基本的に球状である、請求項1〜1
6のいずれか1項に記載の組成物。 - 【請求項18】 液体中に請求項1〜17のいずれか1項に記載の磁性ガラ
ス粒子の組成物を含む懸濁液。 - 【請求項19】 前記液体がアルコールを含む、請求項18に記載の懸濁液
。 - 【請求項20】 前記アルコールがイソプロパノール又はエタノールである
、請求項19に記載の懸濁液。 - 【請求項21】 前記アルコールが70%(v/v)エタノールである、請
求項19に記載の懸濁液。 - 【請求項22】 前記液体が緩衝化水溶液である、請求項18に記載の懸濁
液。 - 【請求項23】 前記溶液がトリス−ヒドロキシメチルアミン、リン酸、N
−(2−ヒドロキシエチル)ピペラジン−N′−(2−エタンスルホン酸)又は
それらの塩により緩衝化されている、請求項22に記載の懸濁液。 - 【請求項24】 前記溶液がイオン強度を変える物質又は金属錯体をさらに
含む、請求項22又は23に記載の懸濁液。 - 【請求項25】 前記懸濁液がDNA又はRNAをさらに含む、請求項22
〜24のいずれか1項に記載の懸濁液。 - 【請求項26】 前記懸濁液がDNA又はRNA、あるいはその両方を、1
以上の、タンパク質、脂肪酸、炭水化物又はその他の生物物質の群から選ばれる
化合物との混合物としてさらに含む、請求項22〜24のいずれか1項に記載の
懸濁液。 - 【請求項27】 前記懸濁液がカオトロピック物質をさらに含む、請求項1
8〜26のいずれか1項に記載の懸濁液。 - 【請求項28】 前記カオトロピック物質がヨウ化ナトリウム、過塩素酸ナ
トリウム、チオシアン酸グアニジニウム、イソチオシアン酸グアニジニウム又は
塩酸グアニジニウムから成る群から選ばれる、請求項27に記載の懸濁液。 - 【請求項29】 前記カオトロピック物質が2〜8 mol/l、そして好まし
くは4〜6 mol/lの濃度で存在する、請求項28又は29に記載の懸濁液。 - 【請求項30】 前記懸濁液が5〜60mg/mlの請求項1〜17のいずれか
1項に記載の組成物を含む、請求項18〜29のいずれか1項に記載の懸濁液。 - 【請求項31】 請求項1〜17のいずれか1項に記載の組成物又は請求項
18〜30のいずれか1項に記載の懸濁液を含む試験管。 - 【請求項32】 請求項1〜17のいずれか1項に記載の組成物又は請求項
18〜30のいずれか1項に記載の懸濁液を含む保存容器。 - 【請求項33】 請求項31に記載の試験管又は請求項32に記載の保存容
器を含む部品から成るキット。 - 【請求項34】 洗浄液又は溶出液をさらに含む、請求項33に記載の部品
から成るキット。 - 【請求項35】 核酸の精製に好適な試薬をさらに含む、請求項33又は3
4に記載の部品から成るキット。 - 【請求項36】 懸濁液の製造のための、請求項1〜17のいずれか1項に
記載の組成物の使用。 - 【請求項37】 核酸の精製のための、請求項18〜30のいずれか1項に
記載の懸濁液の使用。 - 【請求項38】 核酸の精製のための、請求項33〜35のいずれか1項に
記載の部品から成るキットの使用。 - 【請求項39】 以下の: a)直径5〜500nmを有する磁性体をゾルの中に懸濁し、 b)その懸濁液を2−ノズル・スプレードライヤーによりスプレードライし、
そして c)そのスプレードライ粉末を焼結する、 ステップを含む、請求項1〜17のいずれか1項に記載の磁性ガラス粒子の組成
物の製造方法。 - 【請求項40】 前記2−ノズル・スプレードライヤーの噴射口(inle
t)温度が120℃〜500℃であり、出口(outlet)温度がそのゾルの
沸点により選ばれ、そしてスプレー圧が少なくとも3bar である、請求項39に
記載の方法。 - 【請求項41】 前記2−ノズル・スプレードライヤーの噴射口温度が17
0℃〜230℃、好ましくは190℃〜210℃である、請求項39又は40に
記載の方法。 - 【請求項42】 前記2−ノズル・スプレードライヤーの噴射口温度が20
0℃である、請求項39〜41のいずれか1項に記載の方法。 - 【請求項43】 前記スプレー圧が4〜6bar である、請求項39〜42の
いずれか1項に記載の方法。 - 【請求項44】 前記ゾルが溶媒としてエタノールを含む、請求項39〜4
3のいずれか1項に記載の方法。 - 【請求項45】 前記出口温度が50℃〜300℃である、請求項44に記
載の方法。 - 【請求項46】 前記出口温度が90℃〜100℃である、請求項44又は
45に記載の方法。 - 【請求項47】 前記焼結温度が400℃〜1200℃、好ましくは720
℃〜770℃である、請求項39〜46のいずれか1項に記載の方法。 - 【請求項48】 請求項39〜47のいずれか1項に記載の方法により得る
ことができる磁性ガラス粒子。 - 【請求項49】 以下の: a)その生物物質をそのガラス表面に直接結合する条件下、請求項1〜17の
いずれか1項に記載の組成物、請求項48に記載の磁性ガラス粒子又は請求項1
8〜30のいずれか1項に記載の懸濁液との接触により液体内に生物物質を含む
サンプルをもたらし、そして、 b)その液体から生物物質を分離する、 ことを含む生物材料の単離手順。 - 【請求項50】 前記生物物質が核酸である、請求項49に記載の手順。
- 【請求項51】 前記生物物質が核酸の混合物を含み、ここで単独の又は複
数の標的核酸が少量で存在する、請求項49に記載の手順。 - 【請求項52】 前記分離が磁石の助けにより果たされる、請求項49〜5
1のいずれか1項に記載の手順。 - 【請求項53】 サンプルと接触させるとき、前記磁性粒子が磁化されてい
ない、請求項49〜52のいずれか1項に記載の手順。 - 【請求項54】 前記手順が自動化されている、請求項49〜53のいずれ
か1項に記載の手順。 - 【請求項55】 前記手順が高処理量様式である、請求項49〜54のいず
れか1項に記載の手順。 - 【請求項56】 前記手順の間に、請求項18〜26のいずれか1項に記載
の懸濁液を保存容器から取り出し、そしてその懸濁液の1部を異なる反応容器に
加える、請求項49〜55のいずれか1項に記載の手順。 - 【請求項57】 前記核酸が精製の後に検出される、請求項49〜56のい
ずれか1項に記載の手順。 - 【請求項58】 前記核酸が増幅ステップの後に検出される、請求項49〜
57のいずれか1項に記載の手順。 - 【請求項59】 前記核酸を以下の: a)サンプルを標的核酸の領域に相補的な配列を含むオリゴヌクレオチド、及
び同じ標的核酸配列鎖の、第1のオリゴヌクレオチドにより定義された核酸配列
を含まない第2の領域に相補的な配列を含む標識オリゴヌクレオチドと接触させ
、ハイブリダイゼーション条件の間に二本鎖の混合物を作り、ここで上記二本鎖
が、第1のオリゴヌクレオチドの3′末端が標識オリゴヌクレオチドの5′末端
に隣接するように第1のオリゴヌクレオチド及び標識オリゴヌクレオチドにアニ
ールした標的核酸を含み; b)アニールした標識オリゴヌクレオチドを切断し、標識断片を放出するポリ
メラーゼの5′→3′ヌクレアーゼ活性を可能にするのに十分な条件下、ステッ
プa)の混合物と5′→3′ヌクレアーゼ活性を有する鋳型依存性核酸ポリメラ
ーゼを保持し;そして c)前記標識オリゴヌクレオチドの加水分解により生じたシグナルを検出、及
び/又は計測する、 ことを含む方法により検出する、請求項57又は58に記載の手順。 - 【請求項60】 前記検出がブロッキング・オリゴヌクレオチドの存在下で
行われる、請求項58又は59に記載の手順。 - 【請求項61】 前記ブロッキング・オリゴヌクレオチドがアプタマーであ
る、請求項60に記載の手順。 - 【請求項62】 前記アプタマーが配列番号23の配列をもつ、請求項61
に記載の手順。 - 【請求項63】 増幅及び検出反応が多数の標的の同時検出のための均質溶
液相多重アッセイ(homogeneous solution-phase multiplex assay)様式で行わ
れる、請求項60〜62のいずれか1項に記載の手順。 - 【請求項64】 少なくとも5サイクルのポリメラーゼ連鎖反応法について
、アニーリング温度がポリメラーゼ−アプタマー複合体の解離温度を上回ること
8℃未満、好ましくは3℃未満である、請求項61〜63のいずれか1項に記載
の手順。
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