JP2003510330A5 - - Google Patents
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Description
【特許請求の範囲】
【請求項1】下記式(I)で表わされるオリゴ糖。
【化1】
(式中、
Aは水素原子またはβ−1,3結合したD−グルコピラノシル残基(Glcβ1−3)であり;
単糖残基1は、R 1 が水酸基、R 2 が水素原子、R 3 が水酸基の場合はグルコース(Glc)残基であり、R 1 が水酸基、R 2 が水素原子、R 3 がアシルアミノ基(−NH−Acyl)の場合はN−アシルグルコサミン(GlcNAcyl)残基であり、そしてR 1 が水素原子、R 2 が水酸基、R 3 がアセタミド基(−NHCOCH 3 )の場合はN−アセチルガラクトサミン(GalNAc)残基であり;
Bは水素原子、α−L−フコシル基またはα−L−フコシル基の類似体であり;
単糖残基2は、R 4 が水酸基の場合はフコシル化されていてもよいGlc残基であり、そしてR 4 がアセタミド基(−NHCOCH 3 )の場合はフコシル化されていてもよいN−アセチルグルコサミン(GlcNAc)残基であり;
単糖残基1と単糖残基2の間の曲線は、Bが単糖残基2の3位に結合しているときには単糖残基1が単糖残基2とβ−1,4結合し、Bが単糖残基2の4位に結合しているときには単糖残基1が単糖残基2とβ−1,3結合していることを表わし;
単糖残基1は、単糖残基2がGlc残基であるときにのみGlcNAc残基であり;
nは1〜100の整数であるが、但し、該Bのうち少なくとも1個はα−L−フコシル基またはα−L−フコシル基の類似体であり、そして
該オリゴ糖は以下の条件i):
i)pおよびkはいずれも0であり;
mは1であり;
Xは水素原子、アグリコン残基、場合により還元された状態であってもよい、Glc、GlcNAc、ガラクトース(Gal)およびGalNAcよりなる群から選ばれる単糖の残基、またはこれら単糖の残基を1個以上含むオリゴ糖の残基であり;
該Xが単糖またはオリゴ糖の残基であるとき、該単糖残基2は該Xとβ−1,2結合、β−1,3結合、β−1,4結合、β−1,5結合またはβ−1,6結合し;
但し、該単糖残基1および2の両者がGlcNAc残基であり、該Bがα−L−フコシル基であり、nが1であるときには、該Xは水素原子ではない
または条件ii):
ii)pは1であり;
kは0または1であり;
mは1以上1000以下の整数であり;
Xは単結合、または上記i)において定義された単糖またはオリゴ糖の残基である
のいずれかを満足し、
Yは該単糖残基2または該XがZと結合できるようにするスペーサーまたは結合基であり;
Zは1価または多価の担体分子である。)
【請求項2】Bがα−L−フコシル基であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項3】 AおよびXよりなる群から選ばれる少なくとも1種が水素原子であることを特徴とする、請求項1または2に記載のオリゴ糖。
【請求項4】該単糖残基1がGlc残基またはGlcNAc残基であることを特徴とする、請求項1〜3のいずれかに記載のオリゴ糖。
【請求項5】Xが、β−1,4結合またはβ−1,3結合によって連結した、GlcおよびGlcNAcよりなる群から選ばれる少なくとも1種の単糖の残基2〜10個を包含するオリゴ糖残基であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項6】 mが1〜100の整数であり、nが1〜10の整数であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項7】 mが1〜10の整数であることを特徴とする、請求項6に記載のオリゴ糖。
【請求項8】Xが、炭素数1〜7の低級アルキル基、炭素数2〜7の低級アルケニル基、フェニル基、ベンジル基および4−メチルウンベリフェリル基よりなる群から選ばれるアグリコン残基であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項9】下記式(IA)で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【化2】
(式中、B、R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、m、p、k、X、YおよびZは、各々請求項1の式(1)において定義されたものと同じである。)
【請求項10】 該単糖残基1および2が各々独立にGlc残基またはGlcNAc残基であり、Bがα−L−フコシル基であり、Xが、Glc残基、GlcNAc残基、或いは、Glc単位およびGlcNAc単位よりなる群から選ばれる少なくとも1種の単糖単位がβ−1,4結合またはβ−1,3結合によって連結してなる、10個以下の単糖単位を包含するオリゴ糖残基であることを特徴とする、請求項9に記載のオリゴ糖。
【請求項11】Aが水素原子であり、該単糖残基1および2が各々独立にGlc残基またはGlcNAc残基であり、Bがα−L−フコシル基であり、pおよびkがいずれも0であり、nおよびmがいずれも1であり、Xが、Glc残基、GlcNAc残基、或いは、Glc単位およびGlcNAc単位よりなる群から選ばれる少なくとも1種の単糖単位がβ−1,4結合またはβ−1,3結合によって連結してなる、10個以下の単糖単位を包含するオリゴ糖残基であって、下記式(IB):
【化3】
で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項12】下記式(IC):
【化4】
(式中、n’は1〜8の整数である。)
で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項13】 n’が1〜6の整数であることを特徴とする、請求項12に記載のオリゴ糖。
【請求項14】下記式(ID):
【化5】
(式中、n’は1〜8の整数であり、GlcNAcylにおけるアシル基はアルカノイル基である。)
で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項15】 n’が1〜6の整数であり、該アルカノイル基が、炭素数が8〜24で1〜3個の二重結合を有するものであることを特徴とする、請求項14に記載のオリゴ糖。
【請求項16】 nが1〜100の整数であり、該単糖残基1がGlcNAc残基またはGalNAc残基であり、該単糖残基2が場合によりフコシル化されていてもよいGlc残基であるオリゴ糖であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項17】 下記式(IE):
【化6】
で表わされることを特徴とする、請求項16に記載のオリゴ糖。
【請求項18】請求項1に記載のオリゴ糖の製造方法であって、
出発物質として、上記式(I)で表わされる化合物であるが、但し、式中Bがいずれも水素原子である化合物を提供し、
該化合物を、フコシルトランスフェラーゼの存在下で、糖供与体である、L−フコースを含む糖ヌクレオチドまたはその類似体と反応させて、フコシル化糖質を生成させ;そして
必要に応じて、生成したフコシル化糖質を回収する
ことを含む方法。
【請求項19】該フコシルトランスフェラーゼが、哺乳類由来のα1−3またはα1−3/4フコシルトランスフェラーゼであることを特徴とする、請求項18に記載の方法。
【請求項20】該出発物質がN−アセチルキトオリゴ糖であることを特徴とする、請求項18または19に記載の方法。
【請求項21】糖供与体である、L−フコースを含む該糖ヌクレオチドまたはその類似体が、GDP−L−フコースであることを特徴とする、請求項18〜20のいずれかに記載の方法。
【請求項22】該フコシルトランスフェラーゼが、ヒト由来のα1−3フコシルトランスフェラーゼまたはα1−3/4フコシルトランスフェラーゼIII〜VIIおよびIXのいずれか、またはヒト乳汁由来のα1−3/α1−3/4フコシルトランスフェラーゼであることを特徴とする、請求項18〜21のいずれかに記載の方法。
【請求項23】更に、β−N−アセチルヘキソサミニダーゼによる反応を包含することを特徴とする、請求項18〜22のいずれかに記載の方法。
【請求項1】下記式(I)で表わされるオリゴ糖。
【化1】
(式中、
Aは水素原子またはβ−1,3結合したD−グルコピラノシル残基(Glcβ1−3)であり;
単糖残基1は、R 1 が水酸基、R 2 が水素原子、R 3 が水酸基の場合はグルコース(Glc)残基であり、R 1 が水酸基、R 2 が水素原子、R 3 がアシルアミノ基(−NH−Acyl)の場合はN−アシルグルコサミン(GlcNAcyl)残基であり、そしてR 1 が水素原子、R 2 が水酸基、R 3 がアセタミド基(−NHCOCH 3 )の場合はN−アセチルガラクトサミン(GalNAc)残基であり;
Bは水素原子、α−L−フコシル基またはα−L−フコシル基の類似体であり;
単糖残基2は、R 4 が水酸基の場合はフコシル化されていてもよいGlc残基であり、そしてR 4 がアセタミド基(−NHCOCH 3 )の場合はフコシル化されていてもよいN−アセチルグルコサミン(GlcNAc)残基であり;
単糖残基1と単糖残基2の間の曲線は、Bが単糖残基2の3位に結合しているときには単糖残基1が単糖残基2とβ−1,4結合し、Bが単糖残基2の4位に結合しているときには単糖残基1が単糖残基2とβ−1,3結合していることを表わし;
単糖残基1は、単糖残基2がGlc残基であるときにのみGlcNAc残基であり;
nは1〜100の整数であるが、但し、該Bのうち少なくとも1個はα−L−フコシル基またはα−L−フコシル基の類似体であり、そして
該オリゴ糖は以下の条件i):
i)pおよびkはいずれも0であり;
mは1であり;
Xは水素原子、アグリコン残基、場合により還元された状態であってもよい、Glc、GlcNAc、ガラクトース(Gal)およびGalNAcよりなる群から選ばれる単糖の残基、またはこれら単糖の残基を1個以上含むオリゴ糖の残基であり;
該Xが単糖またはオリゴ糖の残基であるとき、該単糖残基2は該Xとβ−1,2結合、β−1,3結合、β−1,4結合、β−1,5結合またはβ−1,6結合し;
但し、該単糖残基1および2の両者がGlcNAc残基であり、該Bがα−L−フコシル基であり、nが1であるときには、該Xは水素原子ではない
または条件ii):
ii)pは1であり;
kは0または1であり;
mは1以上1000以下の整数であり;
Xは単結合、または上記i)において定義された単糖またはオリゴ糖の残基である
のいずれかを満足し、
Yは該単糖残基2または該XがZと結合できるようにするスペーサーまたは結合基であり;
Zは1価または多価の担体分子である。)
【請求項2】Bがα−L−フコシル基であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項3】 AおよびXよりなる群から選ばれる少なくとも1種が水素原子であることを特徴とする、請求項1または2に記載のオリゴ糖。
【請求項4】該単糖残基1がGlc残基またはGlcNAc残基であることを特徴とする、請求項1〜3のいずれかに記載のオリゴ糖。
【請求項5】Xが、β−1,4結合またはβ−1,3結合によって連結した、GlcおよびGlcNAcよりなる群から選ばれる少なくとも1種の単糖の残基2〜10個を包含するオリゴ糖残基であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項6】 mが1〜100の整数であり、nが1〜10の整数であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項7】 mが1〜10の整数であることを特徴とする、請求項6に記載のオリゴ糖。
【請求項8】Xが、炭素数1〜7の低級アルキル基、炭素数2〜7の低級アルケニル基、フェニル基、ベンジル基および4−メチルウンベリフェリル基よりなる群から選ばれるアグリコン残基であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項9】下記式(IA)で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【化2】
(式中、B、R 1 、R 2 、R 3 、R 4 、m、p、k、X、YおよびZは、各々請求項1の式(1)において定義されたものと同じである。)
【請求項10】 該単糖残基1および2が各々独立にGlc残基またはGlcNAc残基であり、Bがα−L−フコシル基であり、Xが、Glc残基、GlcNAc残基、或いは、Glc単位およびGlcNAc単位よりなる群から選ばれる少なくとも1種の単糖単位がβ−1,4結合またはβ−1,3結合によって連結してなる、10個以下の単糖単位を包含するオリゴ糖残基であることを特徴とする、請求項9に記載のオリゴ糖。
【請求項11】Aが水素原子であり、該単糖残基1および2が各々独立にGlc残基またはGlcNAc残基であり、Bがα−L−フコシル基であり、pおよびkがいずれも0であり、nおよびmがいずれも1であり、Xが、Glc残基、GlcNAc残基、或いは、Glc単位およびGlcNAc単位よりなる群から選ばれる少なくとも1種の単糖単位がβ−1,4結合またはβ−1,3結合によって連結してなる、10個以下の単糖単位を包含するオリゴ糖残基であって、下記式(IB):
【化3】
で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項12】下記式(IC):
【化4】
(式中、n’は1〜8の整数である。)
で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項13】 n’が1〜6の整数であることを特徴とする、請求項12に記載のオリゴ糖。
【請求項14】下記式(ID):
【化5】
(式中、n’は1〜8の整数であり、GlcNAcylにおけるアシル基はアルカノイル基である。)
で表わされることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項15】 n’が1〜6の整数であり、該アルカノイル基が、炭素数が8〜24で1〜3個の二重結合を有するものであることを特徴とする、請求項14に記載のオリゴ糖。
【請求項16】 nが1〜100の整数であり、該単糖残基1がGlcNAc残基またはGalNAc残基であり、該単糖残基2が場合によりフコシル化されていてもよいGlc残基であるオリゴ糖であることを特徴とする、請求項1に記載のオリゴ糖。
【請求項17】 下記式(IE):
【化6】
で表わされることを特徴とする、請求項16に記載のオリゴ糖。
【請求項18】請求項1に記載のオリゴ糖の製造方法であって、
出発物質として、上記式(I)で表わされる化合物であるが、但し、式中Bがいずれも水素原子である化合物を提供し、
該化合物を、フコシルトランスフェラーゼの存在下で、糖供与体である、L−フコースを含む糖ヌクレオチドまたはその類似体と反応させて、フコシル化糖質を生成させ;そして
必要に応じて、生成したフコシル化糖質を回収する
ことを含む方法。
【請求項19】該フコシルトランスフェラーゼが、哺乳類由来のα1−3またはα1−3/4フコシルトランスフェラーゼであることを特徴とする、請求項18に記載の方法。
【請求項20】該出発物質がN−アセチルキトオリゴ糖であることを特徴とする、請求項18または19に記載の方法。
【請求項21】糖供与体である、L−フコースを含む該糖ヌクレオチドまたはその類似体が、GDP−L−フコースであることを特徴とする、請求項18〜20のいずれかに記載の方法。
【請求項22】該フコシルトランスフェラーゼが、ヒト由来のα1−3フコシルトランスフェラーゼまたはα1−3/4フコシルトランスフェラーゼIII〜VIIおよびIXのいずれか、またはヒト乳汁由来のα1−3/α1−3/4フコシルトランスフェラーゼであることを特徴とする、請求項18〜21のいずれかに記載の方法。
【請求項23】更に、β−N−アセチルヘキソサミニダーゼによる反応を包含することを特徴とする、請求項18〜22のいずれかに記載の方法。
実施例3
ヒトFuc−TVを触媒として用いた、N−アセチルキトヘキサオースとGDP−フコースの反応
N−アセチルキトヘキサオース(1.0μmol、5mM)をGDP−フコース(1.0μmol、5mM)と25mUのFuc−TVと共に室温で5日間インキュベートしてN−アセチルキトヘキサオースをフコシル化した。反応生成物であるオリゴ糖の混合物を精製し、MALDI−TOF質量分析に付したところ、N−アセチルキトヘキサオースの31%がフコシル化されていることが判明した(図2B)。オリゴ糖混合物を40mMのNaOHを溶離液(アイソクラティック溶出)として用いたHPAEクロマトグラフィーで更に精製した(図1B)。7.09分の位置に溶出したピークをプールし、脱塩した後に更にゲル濾過HPLCで精製した。生成物である七糖(195nmol)をMALDI−TOFで分析したところ、96%がモノフコシル化N−アセチルキトヘキサオース(以下、「グリカン6」と称する)であり、4%がN−アセチルキトヘキサオースであった(図2C)。グリカン6の一次元プロトンNMRスペクトル(表2)におけるGlcNAc5単位、GlcNAc6単位およびフコース単位のそれぞれのH1シグナルは、グリカン4の対応するシグナルとほぼ同じだった。これはグリカン6がGlcNAcβ1−4(Fucα1−3)GlcNAcβ1−4GlcNAcβ1−4GlcNAcβ1−4GlcNAcβ1−4GlcNAcであることを示している。この考えは、これら2種のグリカンにおいて、末端のGlcNAc6単位のH4のシグナルや、フコースのH5のシグナルが同一であることによっても支持されている。これら2種のグリカンにおける、これらのシグナルの類似性は特に重要である。なぜならば、グリカン4において2つのシグナルは相互に作用することが知られており(上記参照)、構造上の差異に非常に敏感に反応すると考えられるからである。同様に、グリカン6とグリカン4におけるフコースのH5シグナルの類似性は、これら2種の糖質に存在する非還元末端領域が同一であることを表している。
ヒトFuc−TVを触媒として用いた、N−アセチルキトヘキサオースとGDP−フコースの反応
N−アセチルキトヘキサオース(1.0μmol、5mM)をGDP−フコース(1.0μmol、5mM)と25mUのFuc−TVと共に室温で5日間インキュベートしてN−アセチルキトヘキサオースをフコシル化した。反応生成物であるオリゴ糖の混合物を精製し、MALDI−TOF質量分析に付したところ、N−アセチルキトヘキサオースの31%がフコシル化されていることが判明した(図2B)。オリゴ糖混合物を40mMのNaOHを溶離液(アイソクラティック溶出)として用いたHPAEクロマトグラフィーで更に精製した(図1B)。7.09分の位置に溶出したピークをプールし、脱塩した後に更にゲル濾過HPLCで精製した。生成物である七糖(195nmol)をMALDI−TOFで分析したところ、96%がモノフコシル化N−アセチルキトヘキサオース(以下、「グリカン6」と称する)であり、4%がN−アセチルキトヘキサオースであった(図2C)。グリカン6の一次元プロトンNMRスペクトル(表2)におけるGlcNAc5単位、GlcNAc6単位およびフコース単位のそれぞれのH1シグナルは、グリカン4の対応するシグナルとほぼ同じだった。これはグリカン6がGlcNAcβ1−4(Fucα1−3)GlcNAcβ1−4GlcNAcβ1−4GlcNAcβ1−4GlcNAcβ1−4GlcNAcであることを示している。この考えは、これら2種のグリカンにおいて、末端のGlcNAc6単位のH4のシグナルや、フコースのH5のシグナルが同一であることによっても支持されている。これら2種のグリカンにおける、これらのシグナルの類似性は特に重要である。なぜならば、グリカン4において2つのシグナルは相互に作用することが知られており(上記参照)、構造上の差異に非常に敏感に反応すると考えられるからである。同様に、グリカン6とグリカン4におけるフコースのH5シグナルの類似性は、これら2種の糖質に存在する非還元末端領域が同一であることを表している。
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