JP2003325190A - 結腸直腸癌の評価 - Google Patents

結腸直腸癌の評価

Info

Publication number
JP2003325190A
JP2003325190A JP2003094400A JP2003094400A JP2003325190A JP 2003325190 A JP2003325190 A JP 2003325190A JP 2003094400 A JP2003094400 A JP 2003094400A JP 2003094400 A JP2003094400 A JP 2003094400A JP 2003325190 A JP2003325190 A JP 2003325190A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
genes
portfolio
misc
feature
base
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
JP2003094400A
Other languages
English (en)
Other versions
JP4354724B2 (ja
JP2003325190A5 (ja
Inventor
Yixin Wang
ワン イーシン
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Ortho Clinical Diagnostics Inc
Original Assignee
Ortho Clinical Diagnostics Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ortho Clinical Diagnostics Inc filed Critical Ortho Clinical Diagnostics Inc
Publication of JP2003325190A publication Critical patent/JP2003325190A/ja
Publication of JP2003325190A5 publication Critical patent/JP2003325190A5/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP4354724B2 publication Critical patent/JP4354724B2/ja
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6834Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
    • C12Q1/6837Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158Expression markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

(57)【要約】 結腸直腸癌の存在又は不在、又は結腸直腸癌を有すると
思われる個人の同様の状態を評価するための方法は、遺
伝子群の発現を分析することによって行われる。種々の
媒体、例えばマイクロアレイにおける遺伝子発現プロフ
ィールは、それらを含むキットとして包含される。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】背景:本発明は、生物学的サンプルの遺伝
子発現に基づく結腸直腸癌についての診断及び予後に関
する。結腸直腸癌は、次の3種の主要分子機構を通して
出現すると思われる腫瘍から成る異種疾患である:1)
染色体不安定性と組合される、腺腫様結腸ポリポーシス
(APC)遺伝子、又はβ−カテニン遺伝子における突然
変異、2)マイクロサテライト不安定性と連結される、
DNAミスマッチ修復遺伝子、例えばMLH1, MSH2,PMS1, PM
S2及びMSH6における突然変異、及び短い反復体を含む遺
伝子における突然変異、及び3)腫瘍サプレッサー遺伝
子のプロモーター領域の過メチル化により誘発される遺
伝子サイレンシング。
【0002】個々の結腸直腸癌の遺伝的補充は、遺伝的
不安定性、特定の突然変異及び遺伝子サイレンシングの
異なった組み合わせをたぶん包含する。染色体不安定性
(CIN)は、一般的に癌の通常の特徴である。それは、
それらの安全な染色体又は大きな部分が失われているか
又は得られている異数体表現型を包含する。ミクロソー
ム不安定化(MIN)は、短い反復体に高められた突然変
異比率を有する二倍体腫瘍において見出される。両形の
遺伝的不安定性は、結腸直腸癌において通常である。
【0003】従って、結腸直腸癌は、複雑な起源を有
し、そして異なった生物学的経路において多くの相互作
用を包含する。診断、予後又は治療モニターリング決定
を助けるために従来使用されて来た、血清マーカー、組
織学的及び細胞学的試験は、所望する信頼性をしばしば
有さない。同様に、単一の遺伝子マーカー(例えば特定
遺伝子の高められた発現)の使用は有益であるが、癌の
多様性は、遺伝子マーカーのポートフォリオが最良のア
プローチであることをより有望にする。
【0004】発現の要約:本発明は、結腸直腸癌の存在
又は不在、又は結腸直腸癌を有すると思われる個人の適
切な状態の評価方法に関する。この方法においては、患
者サンプルの遺伝子発現プロフィールが、患者が結腸直
腸癌を有するかどうか、患者が結腸直腸癌を有さないか
どうか、患者が結腸直腸癌を得ようとしているかどう
か、又は結腸直腸癌を処理される患者の処理に対する応
答を決定するために分析される。
【0005】前記方法の実施に使用される製品はまた、
本発明の観点である。そのような製品は、遺伝子発現プ
ロフィール、及び機械読み取り可能媒体、例えばコンピ
ューター読み取り可能媒体に固定されるそれらの代表を
包含する。遺伝子発現プロフィールを同定するために使
用される製品はまた、遺伝子発現を捕獲し、そして/又
はその存在、不在又は程度を示すための基質又は表面、
例えばマイクロアレイを包含することができる。
【0006】特定の記載:組織サンプルにおける特定の
核酸配列の単なる存在又は不在が、診断又は予後値を有
することがまれに見出されて来た。他方では、種々のタ
ンパク質、ペプチド又はmRNAの発現についての情報は、
ますます重要なものに見えてきた。ゲノム内のタンパク
質、ペプチド又はmRNA(そのような配列は、“遺伝子”
として言及される)を単独で発現する可能性を有する核
酸配列の単なる存在は、タンパク質、ペプチド又はmRNA
が所定の細胞において発現されるかどうかの決定因子で
はない。
【0007】タンパク質、ペプチド又はmRNAを発現でき
る所定の遺伝子が発現されるか又は否か、及びそのよう
な発現がどれくらいの程度、存在するかは、種々の複雑
な因子により決定される。それらの因子の理解及び評価
における困難性とは関係なく、遺伝子発現のアッセイ
は、重要な現象、例えば腫瘍形成、転移、アポプトシス
及び他の臨床的に適切な現象の発生についての有用な情
報を提供する。遺伝子が活性的であるか又は不活性であ
る程度の相対的表示は、遺伝子発現プロフィールにおい
て見出され得る。本発明の遺伝子発現プロフィールは、
結腸直腸癌について患者を診断し、そして処理するため
に使用される。
【0008】サンプル調製は、患者サンプルの収集を必
要とする。本発明の方法に使用される患者サンプルは、
疾病細胞、例えば結腸サンプル又は手術境界部から採取
される上皮細胞を含むと思われるそれらのサンプルであ
る。疑わしいサンプルを得るための1つの有用な技法
は、Laser Capture Microdisection (LCM) である。LCM
技法は、細胞型異種性により引き起こされる変動性を最
小にする、研究されるべき細胞を選択する手段を提供す
る。従って、正常細胞と癌性細胞との間での遺伝子発現
の適度な又は小さな変化は、容易に検出され得る。
【0009】好ましい方法においては、サンプルは、末
梢血液から抽出される循環性上皮細胞を含んで成る。そ
れらは、多くの方法に従って得られるが、しかし最も好
ましい方法は、引用により本明細書に組み込まれるアメ
リカ特許第6,136,182号(Immunivest Corp.)に記載さ
れる磁気分離方法である。興味ある細胞を含むサンプル
が得られると、RNAが抽出され、そして増幅され、そし
て遺伝子発現プロフィールが、好ましくは適切なポート
フォリオにおける遺伝子について、マイクロアレイを通
して得られる。
【0010】遺伝子発現プロフィールを確立するための
好ましい方法は、タンパク質又はペプチドをコードする
ことができる遺伝子により生成されるRNAの量を決定す
ることを包含する。これは、逆転写酵素PCR(RT−PC
R)、競争RT−PCR、同時RT−PCR、示差表示RT−PCR、ノ
ザンブロット分析及び他の関連する試験により達成され
る。個々のPCR反応を用いて、それらの技法を行うこと
が可能であるが、mRNAから生成されるコピーDNA(cRN
A)を増幅し、そしてマイクロアレイを通してそれを分
析することが最良である。
【0011】多くの異なったアレイ配置及びそれらの生
成方法は、当業者に知られており、そして次のアメリカ
特許(それらは、引用により本明細書に組み込まれる)
に記載されている:アメリカ特許第5,445,934号;第5,5
32,128号;第5,556,752号;第5,242,974号;第5,384,26
1号;第5,405,783号;第5,412,087号;第5,424,186号;
第5,429,807号;第5,436,327号;第5,472,672号;第5,5
27,681号;第5,529,756号;第5,545,531号;第5,554,50
1号;第5,561,071号;第5,571,639号;第5,593,839号;
第5,599,695号;第5,624,711号;第5,658,734号及び第
5,700,637号。
【0012】マイクロアレイ技法は、数千の遺伝子の定
常状態mRNAレベルの同時測定を可能にし、それにより、
制御されていない細胞増殖の開始、阻止又は調節のよう
な効果を同定するための強力な手段を提供する。2種の
マイクロアレイ技法が現在、広く使用されている。第1
の技法はcDNAアレイであり、そして第2の技法はオリゴ
ヌクレオチドアレイである。それらのチップの構成に
は、差異が存在するが、実質的にすべての下流のデータ
分析及び出力は同じである。
【0013】それらの分析の結果は、典型的には、マイ
クロアレイに基づいて既知の位置での核酸配列に対して
ハイブリダイズする、サンプルからのcDNA配列を検出す
るために使用されるラベルされたプローブから受動する
シグナルの強度の測定である。典型的には、シグナルの
強度は、サンプル細胞において発現されるcDNA及び従っ
て、mRNAの量に比例する。多数のそのような技法は入手
でき且つ有用である。遺伝子発現を決定するための好ま
しい方法は、アメリカ特許第6,271,002号(Linsleyな
ど.); 第6,218,122号(Friendなど.);第6,218,114号
(Peckなど.)及び第6,004,755号(Wandなど.)(それ
らの開示は引用により本明細書に組み込まれる)に見出
され得る。
【0014】発現レベルの分析は、そのような強度の比
較によって行われる。これは、試験サンプルにおける遺
伝子の発現強度−対−対照サンプルにおけるそれらの強
度の比率マトリックスを生成することによって最良に行
われる。例えば、疾病組織からの遺伝子発現強度が、同
じタイプの正常組織から生成される発現強度と比較され
得る(例えば、疾病結腸組織サンプル−対−正常結腸組
織サンプル)。それらの発現強度の比は、試験サンプル
と対照サンプルとの間の遺伝子発現における倍率−変化
を示す。
【0015】遺伝子発現プロフィールはまた、多くの手
段で示され得る。最も通常の方法は、縦列が試験サンプ
ルを示し、そして横列が遺伝子を示すグラフ樹状図中
に、原蛍光強度を配置することである。データは、類似
する発現プロフィールを有する遺伝子がお互い、隣接す
るよう配置される。個々の遺伝子についての発現比率
は、色として可視化される。例えば、1未満の比率(ダ
ウン−レギュレーションを示す)は、スペクトルの青色
部分において出現し、そして1以上の比率(アップ−レ
ギュレーションを示す)は、スペクトルの赤色部分にお
ける色として出現する。市販のコンピューターソフトウ
ェアプログラム、例えばSilicon Genetics,Inc. からの
“GENESPRINT”及びPartek, Inc. からの“DISCOVERY”
及び“INFER”ソフトウェアが、そのようなデータを示
すために利用できる。
【0016】本発明の方法に使用される変調された遺伝
子は表1及び表2に示される。差発現される遺伝子は、
疾病細胞においては、アップレギュレートされるか又は
ダウンレギュレートされるかのいずれかであるものとし
て示される。アップレギュレーション及びダウンレギュ
レーションとは、検出できる差異(ノイズを測定するた
めの使用されるシステムにおけるノイズの寄与を越え
て)が、基線に対する遺伝子の発現の量として見出され
ることを意味する相対的用語である。この場合、基線は
正常細胞の測定された遺伝子発現である。次に、非正常
細胞における興味ある遺伝子が、同じ測定方法を用い
て、基線レベルに対してアップレギュレートされるか又
はダウンレギュレートされる。
【0017】この情況下で、疾病とは、細胞の制御され
ていない増殖により生じるような、身体の機能の適切な
性能を中断するか、又は妨げるか、又は妨げる可能性を
有する身体の状態の変更を言及する。個人の遺伝子型又
は表現型のいくらかの観点が疾病の存在と一致する場
合、疾病の個人は診断される。しかしながら、診断又は
予後を行う行為は、傾向疾病/状態論争、例えば治療モ
ニターリングを包含する。治療モニターにおいては、臨
床学的判断は、遺伝子発現プロフィールが変化したか又
は正常組織とより一致するパターンに変化するかどうか
を決定するために、一定時間にわたって遺伝子の発現を
比較することによって、所定の治療経路の効果に関して
行われる。
【0018】好ましくは、アップレギュレーション及び
ダウンレギュレーションのレベルは、ハイブリダイズさ
れたマイクロアレイプローブの強度測定値の倍率変化に
基づいて区別される。2.0倍の差異が、そのような識別
を行うために、又は0.05未満のp−値のために好まし
い。すなわち、遺伝子が疾病細胞−対−正常細胞におい
て示差的に発現されるといわれる前、疾病細胞は、正常
細胞よりも、少なくとも2倍以上、又は2倍以下の強度
を生成することが見出される。倍率差異が大きいほど、
診断としての遺伝子の使用は、より好ましい。本発明の
遺伝子発現プロフィールのために選択された遺伝子は、
臨床学的実験室計測を用いて、バックグラウンドを越え
る量により正常又は変調されていない遺伝子の発現レベ
ルと区別できるシグナルの生成をもたらす発現レベルを
有する。
【0019】統計学的値は、変調された遺伝子及びノイ
ズと変調されていないそれらとを信頼をもって区別する
ために使用され得る。統計学的試験は、種々のグループ
間で最も有意に異なった遺伝子を見出す。スチューデン
トのt−試験は、2種のグループ間での有意な差異を見
出すために使用され得る強い統計学的試験の例である。
p-値が低いほど、遺伝子が異なったグループ間での差異
を示す証拠をより一層、強制する。
【0020】それもかかわらず、マイクロアレイは1つ
よりも多くの遺伝子を同時に測定するので、10,000の統
計学的試験が1度に行われ得る。このために、偶然、低
いp−値を見出す傾向があり、そしてSidak補正及びラン
ダム化/過突然変異誘発実験を用いて、このための調製
が行われ得る。t−試験による0.05以下のp−値は、遺
伝子が有意に異なる証拠である。より強制証拠は、Sida
k補正が計算に入れられた後の0.05以下のp−値であ
る。個々のグループにおける多数のサンプルに関して
は、ランダム化/過突然変異誘発試験の後の0.05以下の
p−値は、有意な差異の最も強制証拠である。
【0021】変調されていない遺伝子又はノイズのシグ
ナルよりも高いシグナルを生成する遺伝子を選択するた
めに使用され得るもう1つのパラメーターは、絶対シグ
ナル差異の測定の使用である。好ましくは、変調された
遺伝子発現により生成されるシグナルは、正常又は変調
されていない遺伝子のシグナルよりも少なくとも20%異
なる(絶対基礎に基づいて)。そのような遺伝子は、正
常又は変調されていない遺伝子の発現パターンよりも少
なくとも30%異なる発現パターンを生成することが、さ
らにより好ましい。
【0022】グループにおける遺伝子組について得られ
る情報が臨床学的に適切な判断、例えば診断、予後又は
処理選択を行うための正常な基礎を提供するよう遺伝子
がグループ分けされ得る。それらの組の遺伝子が本発明
のポートフォリオを構成する。この場合、ポートフォリ
オにより支持される判断は結腸直腸癌を包含する。遺伝
子発現プロフィールのポートフォリオは、例3に記載さ
れる遺伝子の組合せから成ることができる。ほとんどの
診断マーカーに関しては、正しい医学的判断を行うため
に十分な最少のマーカーを用いることがしばしば、所望
される。これは、さらなる分析を継続する処理の遅延、
及び時間及び供給源の不適切な使用を妨げる。この場
合、そのような最少ポートフォリオは、例4からの遺伝
子の組み合わせから成ることができる。
【0023】好ましくは、ポートフォリオは、そのポー
トフォリオにおける遺伝子の組合せが、個々の遺伝子又
は遺伝子のランダムに選択された組み合わせに対して、
改良された感受性及び特異性を示すよう確立される。本
発明の情況下で、ポートフォリオの感受性は、正常状態
に対する疾病状態における遺伝子の発現により示される
倍率差異において影響され得る。特異性は、遺伝子発現
のシグナル化と興味ある条件との相互関係の統計学的測
定において影響され得る。例えば、標準偏差がそのよう
な測定として使用され得る。ポートフォリオに包含され
るグループを考慮する場合、発現測定値における小さな
標準偏差は、より高い特異性と相互関係する。変動の他
の測定値、例えば相関係数がまた、この能力において使
用され得る。
【0024】遺伝子発現ポートフォリオを確立するため
の最も好ましい方法は、最適化アルゴリズム、例えば株
式ポートフォリオの確立において広く使用される平均偏
差アルゴリズムの使用を通してである。この方法は、Ti
m Jatkoe, などによる、“ポートフォリオ選択”と称す
る名称の同時継続出願に詳細に記載されている。実質的
に、この方法は、リターンの変動性を最少にしながら、
リターン(例えば、生成されるシグナル)を最適化する
であろう1組の入力(財政適用における株式、本明細書
における強度により測定されるような発現)の確立を必
要とする。
【0025】多くの市販のソフトウェアプログラムが、
そのような操作を行うために入手できる。本明細書を通
して“Wagnerソフトウェア”として言及される“Wagner
Associates Mean-Variance Optimization Applicatio
n”が好ましい。このソフトウェアは、効果的境界を決
定するために、“Wagner Associates Mean-Variance Op
timization Library”からの機能を使用し、そしてMark
owitzセンスにおける最適ポートフォリオが好ましい。
【0026】このタイプのソフトウェアの使用は、マイ
クロアレイデータが、株式リターンの場合、入力として
処理され、そしてソフトウェアがその意図された財政分
析目的のために使用される場合、リスク測定値が、使用
されるよう、変換され得ることを必要とする。たとえ
ば、Wagnerソフトウェアが、マイクロアレイ強度測定値
を共に使用される場合、次のデータ変換方法が使用され
る。
【0027】遺伝子はまず、その発現が少なくともいく
らかの最少レベルの分化を示すそれらの遺伝子を同定す
ることによって予備選択される。好ましい予備選択方法
は、次に通りにして行われる。基線の種類が選択され
る。典型的には、これは、興味ある条件を有さない集団
からの遺伝子を含んで成るであろう。例えば、乳癌につ
いての診断である遺伝子のポートフォリオを選択するこ
とに興味がある場合、乳癌を有さない患者からのサンプ
ルが基線の種類を製造するために使用され得る。
【0028】基線の種類が選択されると、算術平均及び
標準偏差が基線の種類サンプルのための個々の遺伝子の
遺伝子発現のインジケーターのために計算される。次
に、コンピューター処理された統計学的データが、個々
の遺伝子についての(X*標準偏差+平均)の基線値を計
算するために使用される。これは、すべての他のサンプ
ルが比較される遺伝子についての基線読み取りである。
Xはポートフォリオを処方する個人により選択される緊
縮変数である。Xの値が高いほど、より緊縮性になる。
好ましくは、Xは0.5〜3の範囲であり、2〜3がより好
ましく、そして3が最も好ましい。
【0029】個々の実験サンプル(興味ある状態を表示
するそれら)−対−基線読み取りの間の比率が計算され
る。次に、その比率が、ソフトウェアによるデータ取り
扱いの容易さのために底10の対数値に変換される。これ
は、Wagnerソフトウェアを用いて、Markman平均−分散
アルゴリズムに従って最適化のために必要な負の値への
ダウンレギュレートされた遺伝子の表示を可能にする。
それらの変換された比率を含んで成る予備処理されたデ
ータは、それが財政分析目的のために使用される場合、
Wagnerソフトウェアに通常使用されるリターン値の代わ
りに入力として使用される。
【0030】効果的境界が処方されると、最適化された
ポートフォリオが、前記境界上の点に対応する所定の入
力レベル(リターン)又は分散のために選択される。そ
れらの入力又は分散は、ポートフォリオを処方する個人
により設定される予定された標準である。換言すれば、
最適なポートフォリオを探究する個人は、許容できる入
力レベル(感染性の表示)又は所定レベルの分散(特異
性の表示)を決定し、そしてその入力レベル又は分散に
対応する効果的な境界にそって存在する遺伝子を選択す
る。Wagnerソフトウェアは、入力レベル又は分散が選択
される場合、そのような遺伝子選択することができる。
それはまた、それが株式ポートフォリオにおける株に関
してであるように、ポートフォリオにおける個々の遺伝
子に重量を割り当てることができる。
【0031】サンプルが、ポートフォリオが診断である
条件を有するかどうかの決定は、患者サンプルについて
のポートフォリオにおける遺伝子の発現と、ポートフォ
リオを確立するために使用される、示差的に発現された
遺伝子の計算された値とを比較することによって行われ
得る。好ましくは、ポートフォリオ値が、ポートフォリ
オにおける個々の遺伝子の、強度値のポートフォリオ選
択工程におけるその遺伝子に割り当てられる重量による
積を要約することによって、最初に生成される。次に、
境界値が、(Y*標準偏差+基線グループについてのポー
トフォリオ値の平均)により計算され、ここでYは上記X
と同じ意味を有する緊縮値である。次に、基線の種類の
境界値よりも高いポートフォリオ値を有するサンプル
が、その条件を有するものとして分類される。所望に
は、この工程は、信頼レベルを改良するための良く知ら
れている統計学的方法に従って、反復して行われ得る。
【0032】任意には、最良の予測正確度が得られるま
で、この工程を反復することができる。未知のもののポ
ートフォリオ選択及び特徴づけの工程は次の通りであ
る: 1.基線の種類を選択し: 2.基線の種類のサンプルンついての個々の遺伝子の平
均及び標準偏差を計算し; 3.個々の遺伝子について(X*標準偏差+平均)を計算
する。これは、すべての他のサンプルが比較される基線
読み取りである。Xは緊縮変数であり、高いX値は、低い
X値よりも緊縮性である。 4.個々の実験サンプル−対−段階3で計算された基線
読み取り間の比率を計算し;
【0033】5.1以下の比率が負であるように比率を
変換し(例えば、対数底10を用いて)。(ダウンレギュ
レートされた遺伝子が現在、MV最適化のために必要な負
の値を正確に有する); 6.それらの変換された比率が、ソフトフェアアプリケ
ーションに通常使用される有用なリターンの変わりに入
力として使用され; 7.前記ソフトウェアは、効果的な境界をプロットし、
そしてその効果的な境界にそってのいずれかの点での最
適化されたポートフォリオを戻し; 8.前記効果的な境界上の所望するリターン又は分散を
選択し; 9.ポートフォリオ選択アルゴリズムにより生成される
重量による、個々の遺伝子の強度値の積を要約すること
により、個々のサンプルについてのポートフォリオ値を
計算し;
【0034】10.(Y×基線のポートフォリオ値の標準
差)+平均ポートフォリオ値により境界値を計算する。
この境界値よりも大きな値は、実験種類として分類され
るであろう; 11.任意には、最良の予測正確度が得られるまで、この
工程を反復することができる。 他方では、遺伝子がまず、発現がいくらかの最少レベル
の分化を示すそれらの遺伝子を同定することによって予
備選択され得る。このもう1つの方法における予備選択
は、好ましくは下記式:
【0035】
【数1】
【0036】により与えられる限界に基づかれており、
ここでμiは疾病又は病状を有することが知られている
サブセットの平均であり、μnは正常サンプルのサブセ
ットの平均であり、そしてσi+σnは組合わされた標準
偏差を表す。シグナル:ノイズカットオフはまた、1つ
の関係、例えば下記式:
【0037】
【数2】
【0038】に従って、データを予備選択することによ
って使用され得る。これは、それらの差変調に基づいて
予備選択される遺伝子が臨床学的に有意な手段で識別さ
れることを確実にする。それは、診断パラメーターを測
定する仕事に適切な計測のノイズレベル以上である。そ
れらの基準に従っての予備選択された個々のマーカーに
関しては、縦列がサンプルを表し、横列がマーカーを表
し、そして個々の要素が、下記関係:
【0039】
【数3】
【0040】(ここでIは強度測定値である)に従って
のマーカーの発現についての標準化された強度測定値で
あるマトリックスが確立される。最適なポートフォリオ
を定義するために追加の境界条件を設定することがまた
可能である。例えば、ポートフォリオサイズは、固定さ
れた範囲又は多くのマーカーに制限され得る。これは、
データ予備選択基準をより厳重にすることにより(例え
ば、下記式:
【0041】
【数4】
【0042】の代わりに、下記式:
【数5】
【0043】を用いて)、又は特徴のプログラミング、
例えばポートフォリオサイズの制限を用いることにより
行われ得る。例えば、効果的境界が最適な10の遺伝子の
みから選択されるべき境界条件を定めることができる。
また、効果的境界を決定するために予備選択されたすべ
ての遺伝子を使用し、そして次に、選択された遺伝子の
数を制限することができる(例えば、10以下)。
【0044】ポートフォリオの選択方法はまた、帰納的
規則の適用を包含することができる。好ましくは、その
ような規則は、生物学、及び臨床学的結果を生成するた
めに使用される技術の理解に基づいて生成される。より
好ましくは、それらは、最適化された方法からの出力に
適用される。例えば、ポートフォリオ選択の平均分散方
法は、乳癌を有する対象において示差的に発現される多
くの遺伝子についてのマイクロアレイデータに適用され
得る。
【0045】前記方法からの出力は、末梢血液、及び疾
病の乳房組織において発現されるいくつかの遺伝子を包
含する最適化された遺伝子組である。試験方法に使用さ
れるサンプルが末梢血液から得られ、そして乳癌の場合
に示差的に発現される一定の遺伝子がまた、末梢血液に
おいて示差的に発現される場合、ポートフォリオが、末
梢血液において示差的に発現されるそれらの遺伝子を除
いて、効果的に境界から選択される帰納的規則が適用さ
れ得る。勿論、前記規則は、データ予備選択の間、前記
規則を適用することにより、効果的境界の形式の前、適
用され得る。
【0046】問題の生物学に必ずしも関連しない他の帰
納的規則が適用され得る。例えば、ポートフォリオの所
定の百分率のみが特定の遺伝子により表され得る規則を
適用することができる。市販のソフトウェア、例えばWa
gnerソフトウェアは、それらのタイプの帰納法を容易に
適応する。これは、例えば、正確度及び精度以外の因子
(例えば、予測される実施許諾料)が1又は複数の遺伝
子の所望性に影響を及ぼす場合、有用であり得る。
【0047】本発明の1つの方法は、上記のようにして
診断を行うために種々の遺伝子(又はポートフォリオ)
について遺伝子発現プロフィールを比較することを包含
する。ポートフォリオを含んで成る遺伝子の個々の遺伝
子発現プロフィールが、媒体、例えばコンピューター読
み取り媒体に固定される。これは、多くの形を取ること
ができる。例えば、疾病を示すシグナル(例えば、強度
測定値)の範囲が入力である表が確立され得る。実際の
患者のデータは、患者サンプルが正常であるか又は疾病
であるかどうかを決定するために、表における値に比較
され得る。より精巧な態様においては、発現シグナル
(例えば、蛍光強度)のパターンがデジタル的に又はグ
ラフ的に記録される。次に、患者サンプルと共に使用さ
れる遺伝子ポートフォリオからの遺伝子発現パターン
が、前記発現パターンに比較される。
【0048】次に、パターン比較ソフトウェアが、患者
サンプルが問題の疾病を示すパターンを有するかどうか
を決定するために使用され得る。もちろん、それらの比
較は、患者の結果が正常であるかどうかを決定するため
に使用され得る。次に、サンプルの発現プロフィール
が、正常又は対照細胞のポートフォリオに比較される。
サンプル発現パターンが結腸直腸癌のための発現パター
ンと一致する場合(対抗する医学的考慮の不在下で)、
患者結腸直腸癌について陽性として診断される。サンプ
ル発現パターンが正常/対照細胞からの発現パターンと
一致する場合、患者は結腸直腸癌について陰性として診
断される。
【0049】多くの良く知られたパターン認識方法が利
用できる。次の参照は、いくつかの例を提供する: 加重された投票(Weighted voting):Golub, TR., Slon
im, DK., Tamaya, p., Huard, C., Gaasenbeek, M., Me
sirov, JP., Coller, H., Loh, L., Downing, JR., Cal
igiuri, MA., Bloomfield, CD., Lander, ES. Molecula
r Classification of cancer class discovery and cla
ss Prendiction by gene ezpression monitoring. Scie
nce 286: 531-537, 1999;
【0050】支持ベクター機械(Support Vector Machi
nes):Su, AI., Welsh, JB., Sapinoso, LM., Kern, S
G., Dimitrov, P., Lapp, H.,Schultz, PG., Powell, S
M., Moskaluk, CA., Frierson, HF, Jr., Hampton, GM.
Molecular classification of human carcinomas by u
se of gene expression signatures. Cancer Research
61: 7388-93, 2001;Ramaswamy, S., Tamayo, P., Rifki
n, R., Mukherjee, S., Yeang, CH., Angelo, M., Lad
d, C., Reich, M., Latulippe, E., Mesirov, JP., Pog
gio, T., Gerald, W., Loda, M., Lander, ES., Gould,
TR. Multiclass cancer diagnosisusing tumor gene e
xpression signatures Proceedings of the National A
cademy of Sciences of the USA 98: 15149-15154, 200
1;
【0051】K−隣接(K-nearest Neighbors) Ramaswamy, S., Tamayo, P., Rifkin, R., Mukherjee,
S., Yeang, CH., Angelo, M., Ladd, C., Reich, M., L
atulippe, E., Mesirov, JP., Poggio, T., Gerald,
W., Loda, M., Lander, ES., Gould, TR. Multiclass c
ancer diagnosisusing tumor gene expression signatu
res Proceedings of the National Academy of Science
s of the USA 98: 15149-15154, 2001;
【0052】相関係数:van’t Veer LJ, Dai H, van d
e Vijver MJ, He YD, Hart AA, Mao M, Peterse HL, va
n der Kooy K, Marton MJ, Witteveen AT, Schreiber G
J, Kerkhoven RM, Roberts C, Linsley PS, Bemards R,
Friend SH. Gene expression profiling predicts cli
nical outcome of breast cancer. Nature. 2002 Jan 3
1: 415 (6871):530-6。
【0053】本発明の遺伝子発現プロフィールはまた、
癌診断、予後又は処理モニターリングにおいて有用な他
の非遺伝的診断方法と共に使用され得る。例えば、いく
つかの環境下では、上記の遺伝子発現に基づく方法の診
断力と、従来のマーカー、例えば血清タンパク質マーカ
ー(例えば、癌胚性抗原)からのデータとを組合すこと
は有益である。広範囲のそのようなマーカー、例えばCA
19-9, CA125, CK-BB及びグアニリルシクラーゼCのよう
な分析物が存在する。
【0054】1つのそのような方法においては、血液が
処理された患者から定期的に採血され、そして次に、上
記血清マーカーの1つについて酵素イムノアッセイにゆ
だねられる。マーカーの濃度が腫瘍の再発又は治療の失
敗を示す場合、遺伝子発現分析に敏感に反応するサンプ
ル源が採取される。疑いのある塊状物が存在する場合、
細い針状吸入物が採取され、そして次に、前記塊状物か
ら採取された細胞の遺伝子発現プロフィールが、上記の
ようにして分析される。他方では、組織サンプルが、腫
瘍が以前に除去されている組織に隣接する領域から採取
され得る。このアプロ−トは、他の試験が不明瞭である
場合、特に有用である。
【0055】遺伝子マーカーの使用と他の診断学との組
み合わせは、他の診断学の信頼性が疑わしい場合、最も
好ましい。例えば、CEAの血清レベルは、患者の癌状態
とは無関係な因子により実質的に影響され得ることが知
られている。結腸癌についての処理に続いてモニターさ
れる患者が通常のCEAアッセイの高められたレベルを示
す場合、組合せ遺伝子発現/CEAアッセイを行うことが有
益である。
【0056】本発明の製品は、疾病を処理し、診断し、
予後し、そして他方では、評価するために有用なポート
フォリオを製造する遺伝子発現プロフィールの表示を包
含する。それらの表示は、機械、例えばコンピューター
読み取り可能媒体(磁気、光学及び同様のもの)により
自動的に読み取られ得る媒体に変換される。製品はま
た、そのような媒体において遺伝子発現プロフィールを
評価するための使用説明書を包含することができる。例
えば、製品は、上記遺伝子のポートフォリオの遺伝子発
現プロフィールを比較するためのコンピューター使用説
明書を有するCD ROMを包含することができる。
【0057】製品はまた、そこにおいてデジタル記録さ
れる遺伝子発現プロフィールを有することができ、その
結果、それらは患者サンプルからの遺伝子発現データと
比較され得る。他方では、前記プロフィールは異なった
表示フォーマットで記録され得る。グラフの記録が1つ
のそのようなフォーマットである。クラスターリングア
ルゴリズム、例えば上記に言及される“GENSPRING”及
び“DISCOVER”コンピュータープログラムに組み込まれ
るそれらは、そのようなデータの可視化において最良に
助けることができる。
【0058】本発明の異なったタイプの製品は、遺伝子
発現プロフィールを示すために使用され、媒体又はフォ
ーマットされたアッセイである。それらは、例えば配列
補体又はプローブが、興味ある遺伝子を示す配列が結合
し、それらの存在を読み取ることができる決定因子を創
造するマトリックスに付加されるマイクロアレイを包含
することができる。他方では、本発明の製品は、結腸直
腸癌を検出するための興味ある遺伝子の発現レベルを示
す、ハイブリダイゼーション、増幅及びシグナル生成を
実施するための試薬キットに形成され得る。
【0059】本発明に従って製造されるキットは、遺伝
子発現プロフィールを決定するためのフォーマットされ
たアッセイを包含する。それらは、アッセイを行うため
に必要とされる材料、例えば試薬及び使用説明書のすべ
て又はいくつかを包含することができる。
【0060】本発明は、次の非制限的例によりさらに例
示される。 例:本発明に従って分析される遺伝子は、GenBankデー
タベースにおける遺伝子識別番号により同定される。そ
れらは典型的には、タンパク質又はペプチドの生成をコ
ードする十分な長さの核酸配列に関連する。当業者は、
十分な長さの配列の識別が分析観点から必要でないこと
を認識するであろう。すなわち、配列又はESTの一部
は、プローブがその対応する遺伝子についての遺伝子発
現を評価するために企画され得る、良く知られた原理に
従って選択され得る。
【0061】
【実施例】例1:サンプル取り扱い及びLCM:27種の新
鮮な凍結組織サンプルを、結腸直腸腫瘍についての手術
を受けた患者から採取した。それらのサンプルの19種は
結腸直腸悪性検体であり、そしてサンプルの8種は正常
結腸粘膜の検体であった。組織を、収穫の20〜30分以内
に液体窒素において凍結し、そしてその後、−80℃で貯
蔵した。レーザー捕獲のために、サンプルを切断し(6
μm)、そして1つの切片をガラススライド上に固定
し、そしてガラススライド上に固定されている第2切片
をフィルム(P.A.L.M.)上に固定した(Micro Slides C
olorfrost, VWR Scientific, Media, PA)。
【0062】ガラススライド上に固定された切片を、そ
の後、冷アセトンにおいて固定し、そしてMayer’s Hae
motoxylin (Sigma, St. Louis, MO) により染色した。
病理学者は、診断及び等級についてサンプルを分析し
た。臨床学的段階を、Dukes分類を用いて、付随する手
術病理学及び臨床学的報告から評価した。フィルム上に
固定された切片を、その後、100%エタノールにおいて
5分間、固定し、エオシン/100%エタノール(脱水され
たエタノール100ml中、エオシン100μg)において、1
分間、対比染色し、100%エタノールにより1度、すば
やくソーキングし、遊離染色物を除去し、そして10分
間、空気乾燥した。
【0063】結腸直腸腺癌は、2種が等級1、10種が等
級2、そして5種が等級3のものであった。1つの悪性
サンプルは、盲腸のカルチノイド腫瘍であり、そして1
つは転移性メラノーマ損傷であった。2種の腺癌サンプ
ルがムチンサブタイプを表し、そして1つはシグネット
細胞サブタイプを表した。腺癌のDuke段階はそれらを次
の通りに分割した:Dukes A: 2, Dukes B: 5, Dukes C:
7, Dukes D: 3。6種の腺癌は手術前に照射された。
【0064】LCMにおける使用の前、膜(LPC-MEMBRANE
PEN FOIL, 1.35μm No8100, P.A.L.M. GmbH Mikrolase
r Technologies, Bernried, Germany) 及びスライド
を、RNアーゼを破壊し、そしてフィルムへの組織サンプ
ルの結合を増強するために前処理した。手短に言及すれ
ば、スライドをDEP水により洗浄し、そしてフィルム
を、RNase AWAY (Molecular Bioproducts, Inc., San D
iego, CA) により洗浄し、そしてDEP水によりすすい
だ。
【0065】ガラススライド上へのフィルムの結合の
後、スライドを+120℃で8時間、焼き、TI−SAD(Diagn
ostic Products Corporation, Los Angleles, CA; DEP
水中、1:50、綿羊毛を通して濾過されている)により処
理し、そして+37℃で30分間インキュベートした。使用
の直前、10μlのアリコートのRNアーゼインヒビター溶
液(Rnasin Inhibitor 2500U=33U/μl N211A, Promega
GmbH, Mannheim, Germany, 0.15モルのNaCl, 10mモルの
トリス(pH8.0)、0.25mモルのジチオトレイトールを含
む凍結溶液400μl中、0.5μl)を、組織サンプルが固定
されるべきであるフィルム上に広げた。
【0066】フィルム上に固定された組織の切片を、LC
Mのために使用した。約2000の上皮細胞/サンプルを、PA
LM Robot-Microbeam技法(P.A.L.M. Mikrolaser Techno
logies, Carl Zeiss, Inc., Thornwood, NY)を用いて
捕獲し、vert 135顕微鏡(Carl Zeiss Jena GmbH, Jen
a, Germany)に結合した。正常粘膜における周囲の支
質、及び癌サンプルにおける時折の介在性支質成分を包
含した。捕獲された細胞を、100%エタノールを含む管
に入れ、そして-80℃で保存した。
【0067】例2:RNA抽出及び増幅:Zymo-Spinカラム
(Zymo Research, Orange, CA 92867)を用いて、LCM捕
獲されたサンプルから全RNAを抽出した。約2ngの全RNA
を、10μlの水に再懸濁し、そして2回のT7 RNAポリメ
ラーゼに基づく増幅を行い、約50μgの増幅されたRNAを
生成した。
【0068】例3:cDNAマイクロアレイ ハイブリダイ
ゼーション及び定量化:約20,000のヒトcDNAクローンか
ら成るcDNAマイクロアレイ組を用いて、サンプルを試験
した。約30種の植物遺伝子を、非特異的ハイブリダイゼ
ーションについての対照としてマイクロアレイ上にプリ
ントした。cy3−ラベルされたcDNAプローブを、LCM捕獲
された細胞のcDNA5μgから合成した。プローブを、Qiag
en’s Nucleotide Removal Columnsにより精製し、そし
て次に、14〜16時間、マイクロアレイにハイブリダイズ
した。スライドを、走査の前、洗浄し、そして空気乾燥
した。cDNAマイクロアレイを、cy3蛍光について走査
し、そしてImaGeneソフトウェア(Biodiscovery, Los A
ngeles, CA)を定量化のために使用した。個々のcDNAク
ローンに関して、4個の測定値を、二重スポットを用い
て得、そして二重アレイ及びその強度を平均した。
【0069】cDNAを、Generation III Micro-array Spo
tter (Molecular Dynamics) により、アミノシラン−被
覆されたスライド(Corning)上にプリントした。cDNA
をPCR増幅し、精製し(Qiagen PCR精製キット)、そし
て10MのNaSCNプリント用緩衝液と共に1:1で混合した。
ハイブリダイゼーションの前、マイクロアレイを、イソ
プロパノールにおいて室温で10分間インキュベートし
た。プローブを、95℃で2分間、室温で4分間インキュ
ベートし、そして次に、3個の複製スライドに適用し
た。カバーカラスを、DPX(Fluka)によりスライド上に
密封し、そして42℃で一晩インキュベートした。次に、
スライドを、1×SSC/0.2%SDS及び0.1×SSC/0.2%SDS
により55℃で5分間、洗浄し、0.1×SSCに浸漬し、そし
て乾燥し、その後、Gen III Array Scanner (Molecular
Dynamics) により走査した。個々のスポットについて
の蛍光強度を、AUTOGENEソフトウェア(Biodiscovery,
Los Angeles)により分析した。
【0070】チップ強度を直線的に標準化し、個々のチ
ップ上で100の値に等しい75%でその強度読み取りを行
った。チップ上のあらゆる遺伝子を、すべてのサンプル
上の遺伝子発現値読み取りのメジアンによりその遺伝子
についての強度読み取りを割り算することによって、そ
れ自体に標準化した。クラスター化の前、少なくとも1
つのサンプルにおける100又はそれ以上の強度読み取り
を有さなかった遺伝子を濾過し、類似性マトリックスに
対するバックグラウンド影響を制限した。6,225個の遺
伝子組を、クラスター化分析のために選択した。
【0071】段階的クラスター化を、負の変化について
のいずれの考慮を伴なわないで、同時に正の変化を遺伝
子と共にサンプルを一緒に分類する類似性の尺度として
の相互関係を用いて行った(Silicon Genitics, Sunnyv
ille, CA)。次に樹状図における主要ノードの個々を、
サンプルのサブグループとして考慮した。示差的に発現
された遺伝子を、正常グループに個々の腫瘍サブグルー
プを比較することによって同定した。選択は、下記式:
【0072】
【数6】
【0073】により与えられるシグナル:ノイズ測定限
界に基づかれ、ここでμiは腫瘍サブセットの平均であ
り、μnは正常サンプルのサブセットの平均であり、そ
してσi+σnは組合された標準偏差を表す。遺伝子の強
度読み取りの変動のグループ内係数は、対様比較に包含
される遺伝子に関して、0.33未満であった。正常グルー
プのメジアンに対する腫瘍グループのメジアンは、アッ
プレギュレーションに関して、2以上か又は2に等し
く、そしてダウン−レギュレーションに関しては、0.5
未満か、又は0.5に等しかった。遺伝子が基準のすべて
を満たす場合、それを選択した。すべての比較において
選択された遺伝子は、結腸直腸癌において一貫して異常
調節されるように思えた。統計学的有意性についてのp-
値を、不均等分散を想定するT−試験を用いて計算し
た。
【0074】クラスター化のための遺伝子組をまた、ソ
フトウェアーパッケージ(Partek,St Louis, MO)を用
いて、主成分分析(PCA)にゆだねた。次に、データ
を、縮小された3次元空間上に投影した。正常及び腫瘍
結腸直腸サンプルを、その投影された発現レベルにより
表した。大きなアップ−レギュレートされた示差を有す
る遺伝子の列挙を創造し、腫瘍サンプルと正常サンプル
との間を区別した。123種の遺伝子を、シグナル:ノイ
ズカットオフとして、下記式:
【0075】
【数7】
【0076】を用いることによって予備選択した。1.5
に等しいか又は1.5以上の比率は、アップーレギュレー
ションについての最少基準であった。遺伝子はまた、下
記式:
【0077】
【数8】
【0078】である場合、包含された。4種の遺伝子の
ポートフォリオを確立し、個々は腫瘍細胞と正常細胞と
の間に少なくとも3倍の発現示差を有した。結腸直腸癌
における示差的に発現された遺伝子。39種の遺伝子を、
正常な結腸粘膜に比較して、すべての腫瘍サンプルにお
いて示差的に発現した。それらのうち37種の遺伝子は、
分離物を除くすべての腫瘍において、有意にダウン−レ
ギュレートされた。それらのうち2種はアップ−レギュ
レートされた。遺伝子の識別を、マイクロアレイ上に配
列されたcDNAクローンを配列決定することによって確証
した。結果は表1及び表2に示される。
【0079】
【表1】
【0080】
【表2】
【0081】例4:結腸直腸についての最適化されたポ
ートフォリオ:平均−分散最適化アルゴリズムを用い
て、複数遺伝子に基づく特徴を生成し、ここで包含され
る遺伝子は正常サンプルと腫瘍サンプルとの間を区別す
るために組合して使用され得る。強度測定値を、例1−
3に記載されるサンプル及びマイクロアレイを用いて処
理した。分析されるべきデータをまず、腫瘍細胞と正常
細胞との間での予備−特定された5倍の示差に基づいて
予備選択した。次に、この基準に従って予備選択された
遺伝子からの発現データーを次の通りに使用した。
【0082】個々の遺伝子についての強度測定値の平均
及び標準偏差を、基線として非転移性サンプルを用いて
計算した。次に、X*(標準偏差+平均)の識別値を、個
々の基線遺伝子について計算した(ここでXは3の値を
割り当てられた)。この値を用いて、得られるポートフ
ォリオが緊縮であることを確証した。次に、識別値:基
腺値の比率を、個々の転移サンプルについて計算した。
次に、この比率を通常のアルゴリズムに変換した。次
に、このデータを、4種の遺伝子のポートフォリオが選
択される効果的境界を生成するWagnerソフトウェア中に
導入した。
【0083】前記組は、未知の配列、I型プロコラーゲ
ン、リボソームタンパク質L21の大きなサブユニット及
びフィブロネクチンを包含した。それらの遺伝子は、配
列番号42, 43, 44及び49として同定された(さらに下記
に同定される)。他方では、ポートフォリオを製造する
ために使用される遺伝子の組み合わせを用いて、結腸直
腸癌についての臨床学的決定を行うために有用である診
断情報を生成することができる。これは、ポートフォリ
オから選択された遺伝子の組み合わせが追加のマーカー
(遺伝子的であるか又はそうではない)と共に結合され
る場合、特に有益である。
【0084】最適化されたポートフォリオのために選択
された遺伝子: >gi|1264443|gb|N92134.1|N92134 za23F09.r1 Soares胎
児 脾臓 1NFLS ホモ・サピエンスcDNAクローン IMA
GE: 293417 5’ gb|M87908|HUMALNE32ヒト癌細胞−由
来のAlu RNA転写体に類似する、(rRNA); gb:X57025_rn
a1 インシュリン−様成長因子IA受容体(ヒト)、 >gi|2221047|gb|AA490172.1|AA490172 ab06b08.s1 Soar
es胎児 網膜 937202ホモ・サピエンスcDNAクローン
IMAGE:83991 3’ gb:J03464 プロコラーゲンα2(I) 鎖
受容体(ヒト)に類似する、
【0085】>gi|2188918|gb|AA464034.1|AA464034 zx8
6b09. R1 Soares卵巣 腫瘍 NbHOTホモ・サピエンスcD
NAクローン IMAGE:810617 5’ SW:RL21_HUMAN P46778
60S リボソームタンパク質L21に類似する、 >gi|834491|gb|R62612.1|R62612 yi12d01.s1 Soares胎
盤 Nb2HP ホモ・サピエンスcDNAクローン IMAGE:13
9009 3’ gb:X02761_cds1 フィブロネクチン受容体(ヒ
ト)に類似する。
【0086】同じ方法ではない、異なった組の基準を用
いて、追加の4種の遺伝子ポートフォリオを、ソフトウ
ェアにより選択した。それらは、配列番号46, 47, 48及
び45である。2種の遺伝子は最初の4−遺伝子ポートフ
ォリオとオーバーラップする。それらの2種の最適化さ
れたポートフォリオはまた、6−遺伝子ポートフォリオ
を形成するために結合され得る。
【0087】最適化された遺伝子ポートフォリオ: >gi|2114953|gb|AA431245.1|AA431245 zw78d06.r1 Soar
es_精巣_ NHT ホモ・サピエンスcDNAクローン IMAGE:
782315 5’ WP:F36H1.2 CE05814アンキリン様に類似す
る、 >gi|2156172|gb|AA443497.1|AA443497 zw34d03.s1 Soar
es卵巣 腫瘍 NbHOTホモ・サピエンスcDNAクローン I
MAGE:771173 、 >gi|2221047|gb|2|AA490172.1|AA490172 ab06b08.s1 So
ares胎児 網膜 937202 ホモ・サピエンスcDNAクローン
IMAGE:83991 3’ gb:J03464 プロコラーゲンα2(I)
鎖受容体(ヒト)に類似する、 >gi|1264443|gb|N92134.1|N92134 za23F09.r1 Soares胎
児 脾臓 1NFLS ホモ・サピエンスcDNAクローン IMA
GE: 293417 5’ gb|M87908|HUMALNE32ヒト癌細胞−由
来のAlu RNA転写体に類似する、(rRNA); gb:X57025_rn
a1 インシュリン−様成長因子IA受容体(ヒト)。
【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> Ortho-Clinical Diagnostics,Inc. <120> ASSESSING COLORECTAL CANCER <130> B035650 <140> 2003-094400 <141> 2003-03-21 <150> 60/368,798 <151> 2002-03-29 <160> 49 <170> PatentIn version 3.1 <210> 1 <211> 1500 <212> DNA <213> human <400> 1 atggcttcga ccaccacctg caccaggttc acggacgagt atcagctttt cgaggagctt 60 ggaaaggggg cattctcagt ggtgagaaga tgtatgaaaa ttcctactgg acaaggatat 120 gctgccaaaa ttatcaacac caaaaagctt tctgctaggg atcatcagaa actagaaaga 180 gaagctagaa tctgccgtct tttgaagcac cctaatattg tgcgacttca tgatagcata 240 tcagaagagg gctttcacta cttggtgttt gatttagtta ctggaggtga actgtttgaa 300 gacatagtgg caagagaata ctacagtgaa gctgatgcca gtcattgtat acagcagatt 360 ctagaaagtg ttaatcattg tcacctaaat ggcatagttc acagggacct gaagcctgag 420 aatttgcttt tagctagcaa atccaaggga gcagctgtga aattggcaga ctttggctta 480 gccatagaag ttcaagggga ccagcaggcg tggtttggtt ttgctggcac acctggatat 540 ctttctccag aagttttacg taaagatcct tatggaaagc cagtggatat gtgggcatgt 600 ggtgtcattc tctatattct acttgtgggg tatccaccct tctgggatga agaccaacac 660 agactctatc agcagatcaa ggctggagct tatgattttc catcaccaga atgggacacg 720 gtgactcctg aagccaaaga cctcatcaat aaaatgctta ctatcaaccc tgccaaacgc 780 atcacagcct cagaggcact gaagcaccca tggatctgtc aacgttctac tgttgcttcc 840 atgatgcaca gacaggagac tgtagactgc ttgaagaaat ttaatgctag aagaaaacta 900 aagggtgcca tcttgacaac tatgctggct acaaggaatt tctcagcagc caagagtttg 960 ttgaagaaac cagatggagt aaaggagtca actgagagtt caaatacaac aattgaggat 1020 gaagatgtga aagcacgaaa gcaagagatt atcaaagtca ctgaacaact gatcgaagct 1080 atcaacaatg gggactttga agcctacaca aaaatctgtg acccaggcct tactgctttt 1140 gaacctgaag ctttgggtaa tttagtggaa gggatggatt ttcaccgatt ctactttgaa 1200 aatgctttgt ccaaaagcaa taaaccaatc cacactatta ttctaaaccc tcatgtacat 1260 ctggtagggg atgatgccgc ctgcatagca tatattaggc tcacacagta catggatggc 1320 agtggaatgc caaagacaat gcagtcagaa gagactcgtg tgtggcaccg ccgggatgga 1380 aagtggcaga atgttcattt tcatcgctcg gggtcaccaa cagtacccat caagccaccc 1440 tgtattccaa atgggaaaga aaacttctca ggaggcacct ctttgtggca aaacatctga 1500 <210> 2 <211> 5761 <212> DNA <213> human <400> 2 cacaccgcag tatgcggtgc cctttactct gagctgcgca gccggccggc cggcgctggt 60 tgaacagact gccgctgtac tggcgtggcc tggagggact cagcaaattc tcctgccttc 120 aacttggcaa cagttgcctg gggtagctct acacaactct gtccagccca cagcaatgat 180 tccagaggcc atggggagtg gacagcagct agctgactgg aggaatgccc actctcatgg 240 caaccagtac agcactatca tgcagcagcc atccttgctg actaaccatg tgacattggc 300 cactgctcag cctctgaatg ttggtgttgc ccatgttgtc agacaacaac aatccagttc 360 cctcccttcg aagaagaata agcagtcagc tccagtctct tccaagtcct ctctagatgt 420 tctgccttcc caagtctatt ctctggttgg gagcagtccc ctccgcacca catcttctta 480 taattccttg gtccctgtcc aagatcagca tcagcccatc atcattccag atactcccag 540 ccctcctgtg agtgtcatca ctatccgaag tgacactgat gaggaagagg acaacaaata 600 caagcccagt agctctggac tgaagccaag gtctaatgtc atcagttatg tcactgtcaa 660 tgattctcca gactctgact cttctttgag cagcccttat tccactgata ccctgagtgc 720 tctccgaggc aatagtggat ccgttttgga ggggcctggc agagttgtgg cagatggcac 780 tggcacccgc actatcattg tgcctccact gaaaactcag cttggtgact gcactgtagc 840 aacccaggcc tcaggtctcc tgagcaataa gactaagcca gtcgcttcag tgagtgggca 900 gtcatctgga tgctgtatca cccccacagg gtatcgagct caacgcgggg ggaccagtgc 960 agcacaacca ctcaatctta gccagaacca gcagtcatcg gcggctccaa cctcacagga 1020 gagaagcagc aacccagccc cccgcaggca gcaggcgttt gtggcccctc tctcccaagc 1080 cccctacacc ttccagcatg gcagcccgct acactcgaca gggcacccac accttgcccc 1140 ggcccctgct cacctgccaa gccaggctca tctgtatacg tatgctgccc cgacttctgc 1200 tgctgcactg ggctcaacca gctccattgc tcatcttttc tccccacagg gttcctcaag 1260 gcatgctgca gcctatacca ctcaccctag cactttggtg caccaggtcc ctgtcagtgt 1320 tgggcccagc ctcctcactt ctgccagcgt ggcccctgct cagtaccaac accagtttgc 1380 cacccaatcc tacattgggt cttcccgagg ctcaacaatt tacactggat acccgctgag 1440 tcctaccaag atcagccagt attcctactt atagttggtg agcatgaggg aggaggaatc 1500 atggctacct tctcctggcc ctgcgttctt aatattgggc tatggagaga tcctccttta 1560 ccctcttgaa atttcttagc cagcaacttg ttctgcaggg gcccactgaa gcagaaggtt 1620 tttctctggg ggaacctgtc tcagtgttga ctgcattgtt gtagtcttcc caaagtttgc 1680 cctattttta aattcattat ttttgtgaca gtaattttgg tacttggaag agttcagatg 1740 cccatcttct gcagttacca aggaagagag attgttctga agttaccctc tgaaaaatat 1800 tttgtctctc tgacttgatt tctataaatg cttttaaaaa caagtgaagc ccctctttat 1860 ttcattttgt gttattgtga ttgctggtca ggaaaaatgc tgatagaagg agttgaaatc 1920 tgatgacaaa aaaagaaaaa ttactttttg tttgtttata aactcagact tgcctatttt 1980 attttaaaag cggcttacac aatctccctt ttgtttattg gacatttaaa cttacagagt 2040 ttcagttttg ttttaatgtc atattatact taatgggcaa ttgttatttt tgcaaaactg 2100 gttacgtatt actctgtgtt actattgaga ttctctcaat tgctcctgtg tttgttataa 2160 agtagtgttt aaaaggcagc tcaccatttg ctggtaactt aatgtgagag aatccatatc 2220 tgcgtgaaaa caccaagtat tctttttaaa tgaagcacca tgaattcttt tttaaattat 2280 tttttaaaag tctttctctc tctgattcag cttaaatttt tttatcgaaa aagccattaa 2340 ggtggttatt attacatggt ggtggtggtt ttattatatg caaaatctct gtctattatg 2400 agatactggc attgatgagc tttgcctaaa gattagtatg aattttcagt aatacacctc 2460 tgttttgctc atctctccct tctgttttat gtgatttgtt tggggagaaa gctaaaaaaa 2520 cctgaaacca gataagaaca tttcttgtgt atagctttta tacttcaaag tagcttcctt 2580 tgtatgccag cagcaaattg aatgctctct tattaagact tatataataa gtgcatgtag 2640 gaattgcaaa aaatatttta aaaatttatt actgaattta aaaatatttt agaagttttg 2700 taatggtggt gttttaatat tttacataat taaatatgta catattgatt agaaaaatat 2760 aacaagcaat ttttcctgct aacccaaaat gttatttgta atcaaatgtg tagtgattac 2820 acttgaattg tgtacttagt gtgtatgtga tcctccagtg ttatcccgga gatggattga 2880 tgtctccatt gtatttaaac caaaatgaac tgatacttgt tggaatgtat gtgaactaat 2940 tgcaattata ttagagcata ttactgtagt gctgaatgag caggggcatt gcctgcaagg 3000 agaggagacc cttggaattg ttttgcacag gtgtgtctgg tgaggagttt ttcagtgtgt 3060 gtctcttcct tccctttctt cctccttccc ttattgtagt gccttatatg ataatgtagt 3120 ggttaataga gtttacagtg agcttgcctt aggatggacc agcaagcccc cgtggaccct 3180 aagttgttca ccgggattta tcagaacagg attagtagct gtattgtgta atgcattgtt 3240 ctcagtttcc ctgccaacat tgaaaaataa aaacagcagc ttttctcctt taccaccacc 3300 tctacccctt tccattttgg attctcggct gagttctcac agaagcattt tccccatgtg 3360 gctctctcac tgtgcgttgc taccttgctt ctgtgagaat tcaggaagca ggtgagagga 3420 gtcaagccaa tattaaatat gcattctttt aaagtatgtg caatcacttt tagaatgaat 3480 ttttttttcc ttttcccatg tggcagtcct tcctgcacat agttgacatt cctagtaaaa 3540 tatttgcttg ttgaaaaaaa catgttaaca gatgtgttta taccaaagag cctgttgtat 3600 tgcttaccat gtccccatac tatgaggaga agttttgtgg tgccgctggt gacaaggaac 3660 tcacagaaag gtttcttagc tggtgaagaa tatagagaag gaaccaaagc ctgttgagtc 3720 attgaggctt ttgaggtttc ttttttaaca gcttgtatag tcttggggcc cttcaagctg 3780 tgaaattgtc cttgtactct cagctcctgc atggatctgg gtcaagtaga aggtactggg 3840 gatggggaca ttcctgccca taaaggattt ggggaaagaa gattaatcct aaaatacagg 3900 tgtgttccat ccgaattgaa aatgatatat ttgagatata attttaggac tggttctgtg 3960 tagatagaga tggtgtcaag gaggtgcagg atggagatgg gagatttcat ggagcctggt 4020 cagccagctc tgtaccaggt tgaacaccga ggagctgtca aagtatttgg agtttcttca 4080 ttgtaaggag taagggcttc caagatgggg caggtagtcc gtacagccta ccaggaacat 4140 gttgtgtttt ctttattttt taaaatcatt atattgagtt gtgttttcag cactatattg 4200 gtcaagatag ccaagcagtt tgtataattt ctgtcactag tgtcatacag ttttctggtc 4260 aacatgtgtg atctttgtgt ctcctttttg ccaagcacat tctgattttc ttgttggaac 4320 acaggtctag tttctaaagg acaaattttt tgttccttgt cttttttctg taagggacaa 4380 gatttgttgt ttttgtaaga aatgagatgc aggaaagaaa accaaatccc attcctgcac 4440 cccagtccaa taagcagata ccacttaaga taggagtcta aactccacag aaaaggataa 4500 taccaagagc ttgtattgtt accttagtca cttgcctagc agtgtgtggc tttaaaaact 4560 agagattttt cagtcttagt ctgcaaactg gcatttccga ttttccagca taaaaatcca 4620 cctgtgtctg ctgaatgtgt atgtatgtgc tcactgtggc tttagattct gtccctgggg 4680 ttagccctgt tggccctgac aggaagggag gaagcctggt gaatttagtg agcagctggc 4740 ctgggtcaca gtgacctgac ctcaaaccag cttaaggctt taagtcctct ctcagaactt 4800 ggcatttcca acttcttcct ttccgggtga gagaagaagc ggagaagggt tcagtgtagc 4860 cactctgggc tcatagggac acttggtcac tccagagttt ttaatagctc ccaggaggtg 4920 atattatttt cagtgctcag ctgaaatacc aaccccagga ataagaactc catttcaaac 4980 agttctggcc attctgagcc tgcttttgtg attgctcatc cattgtcctc cactagaggg 5040 gctaagcttg actgccctta gccaggcaag cacagtaatg tgtgttttgt tcagcattat 5100 tatgcaaaaa ttcactagtt gagatggttt gttttaggat aggaaatgaa attgcctctc 5160 agtgacagga gtggcccgag cctgcttcct attttgattt tttttttttt taactgatag 5220 atggtgcagc atgtctacat ggttgtttgt tgctaaactt tatataatgt gtggtttcaa 5280 ttcagcttga aaaataatct cactacatgt agcagtacat tatatgtaca ttatatgtaa 5340 tgttagtatt tctgctttga atccttgata ttgcaatgga attcctactt tattaaatgt 5400 atttgatatg ctagttattg tgtgcgattt aaactttttt tgctttctcc ctttttttgg 5460 ttgtgcgctt tcttttacaa caagcctcta gaaacagata gtttctgaga attactgagc 5520 tatgtttgta atgcagatgt acttagggag tatgtaaaat aatcatttta acaaaagaaa 5580 tagatattta aaatttaata ctaactatgg gaaaagggtc cattgtgtaa aacatagttt 5640 atctttggat tcaatgtttg tctttggttt tacaaagtag cttgtatttt cagtattttc 5700 tacataatat ggtaaaatgt agagcaattg caatgcatca ataaaatggg taaattttct 5760 g 5761 <210> 3 <211> 2129 <212> DNA <213> human <400> 3 ctgtattgag acaaaggaag ggatctgtca gaaagcaaca cttgttatct tgggcttggc 60 agcaaggaag aggacaggta gtggagatcc tgcaatctga aaagcagact gaaaggtgac 120 aaagaagctg aagatgggtg gtggagagag gtataacatt ccagcccctc aatctagaaa 180 tgttagtaag aaccaacaac agcttaacag acagaagacc aaggaacaga attcccagat 240 gaagattgtt cataagaaaa aagaaagagg acatggttat aactcatcag cagctgcctg 300 gcaggccatg caaaatgggg ggaagaacaa aaattttcca aataatcaaa gttggaattc 360 tagcttatca ggtcccaggt tactttttaa atctcaagct aatcagaact atgctggtgc 420 caaatttagt gagccgccat caccaagtgt tcttcccaaa ccaccaagcc actgggtccc 480 tgtttccttt aatccttcag ataaggaaat aatgacattt caacttaaaa ccttacttaa 540 agtacaggta taaaataaga caaatgttta aatttagtta tgttcacggg tagttgtcaa 600 ttggtctgaa acaaatttgc tagggaatct atttgtgtag aactaattaa tgtaaaaaaa 660 atagaccatc tcgtgttgtg tgcactgtga tataatggta gtatcagtgc aacttaaact 720 aatgattgta cttgatatta agtgttctca actgagtaac ttttaagtgg aaaccaagtt 780 tagatttggg gagtggtaaa ggaatcagct ttttctattg ttaggggaag acagtaattt 840 atcattcatg gaccagtaga ttgttgaaag ttggtgaatc ggattataag cttctagcta 900 acacaaggat tcagaattag gtaaacatct gaaggtttag tatattagaa acacccaaac 960 cagtaatatg ctaacctgat gcactgctga aagaaaatgt gaatttttcg taataattgc 1020 attttagtga attgtacagt gggtggaaag ggcatttgga gctcattaga atgagacata 1080 gtacacccca atggccctgt ttattaaatg tagtggatta agtgtctgtc aacaaataca 1140 ccaaaaccat tttttataga aacagtattt aatggtcact caatagcttt caaaatacat 1200 ttttgtatta cagcactgca caagctattc taatagtgct ctggcctcat cattcctgca 1260 aagcttgctt tggggagttg gataatgtga aaattttaag tacctagggg agaaagagcc 1320 atgtaaatat ctgtaataaa cttgtagcat atgtaaagtt ttcttggcct ttatcttaca 1380 aaaatggagt attttagtat gaatttgctg aatgtaagac cgtggactgt tttttataat 1440 atggcctaat tttaaaggtc caaaataact tgtttttaaa gtttgccctt gtgctaaagt 1500 gccagtgtat gtatgttata cttgatttgg ttgtaaacta tatttcaaag taaaccctag 1560 tgtaataagt tttataacta aaaaggttta agctgctaaa actattttta agagatgtga 1620 aatgcagtat gggactatct ttttttcctc ctctaagccc aaagattaac tagagtccct 1680 ccaaccttat agattgttgg ctttcacaat cttataacct aggatacagg tagtttcgag 1740 tatggtgcca gtgatgtttt gtttttgttt ggtcaagggg taggtgcaac ccaatggacc 1800 acttatgcaa aagatgtaaa ctcttgcata atacattgat aacatgtttt gccaacttta 1860 aatgcttaaa cataagcgaa accagtagca agtatgtggg tcagcttaaa aattttgatt 1920 gttaatgccc tattttctaa tttggcacct cttgatgcct aagcaggtaa gcagatgcct 1980 aagctgtatt tctccaaata aatcaagatg aagtactgcc caagttaaat attgatagcc 2040 taaagacaag tttatgtagt acttaatgta catgatatga agcataaaat taaataaaat 2100 ttttccccat tgaaaaaaaa aaaaaaaaa 2129 <210> 4 <211> 3950 <212> DNA <213> human <400> 4 cgagaactag ttttgttccg tgccctctgg actggaacct tttggagaga acccccggca 60 ggaccaaccc cgcacccgcc agcaccgcgg caatgtccag caatagtttt ccttacaatg 120 agcagtccgg aggaggggag gcgacggagc tgggtcagga ggcgacctca accatttccc 180 cctcgggggc cttcggcctc tttagcagcg atttgaagaa gaatgaagat ctaaagcaaa 240 tgttagagag caacaaagat tctgctaaac tggatgctat gaagcggatt gttgggatga 300 ttgcaaaagg gaaaaatgca tctgaactgt ttcctgctgt tgtgaagaat gtggccagta 360 aaaatattga gatcaagaag ttggtatatg tttacctggt tcgatatgct gaagaacagc 420 aggatcttgc actcctgtcc ataagcactt ttcagcgagc tctgaaggac ccaaaccaac 480 taattcgtgc aagcgctttg agagttctgt caagtattag agtgccaatt attgtaccta 540 tcatgatgct tgctattaag gaagcttctg ctgacttatc accatatgtt aggaagaatg 600 cagcccatgc aatacaaaaa ttatacagcc ttgatccaga gcagaaggaa atgttaattg 660 aagtaattga aaaacttctg aaagataaaa gcacattggt agctggcagt gttgtgatgg 720 cttttgaaga agtatgcccg gacagaatag atctgattca taaaaattac cgcaagctat 780 gtaacttact agtggatgtt gaagagtggg ggcaggttgt cataatccac atgctaactc 840 gatatgctcg gacacagttt gtcagccctt ggaaagaggg tgatgaatta gaagacaatg 900 gaaagaattt ctacgaatct gatgatgatc agaaggaaaa gactgacaaa aagaagaagc 960 cgtatactat ggatccagat catagactct taattagaaa tacaaagcct ttgcttcaga 1020 gcaggaatgc tgcggtggtt atggcagttg ctcagctgta ttggcacata tcaccaaaat 1080 ctgaagctgg cataatttct aaatcactag tgcgtttact tcgtagcaat agggaggtgc 1140 agtatattgt cctacaaaat atagcaacta tgtcaattca aagaaagggg atgtttgaac 1200 cttatctgaa gagtttctat gttaggtcaa ctgatccaac tatgatcaag acactgaagc 1260 ttgaaatttt gacaaacttg gcaaatgaag ccaacatatc aactcttctt cgagaatttc 1320 agacctatgt gaaaagccag gataaacaat ttgcagcagc cactattcag actataggca 1380 gatgtgcaac caacatcttg gaagtcactg acacgtgcct caatggcttg gtctgtctgc 1440 tgtccaacag ggatgaaata gttgttgctg aaagtgtggt tgttataaag aaattactgc 1500 aaatgcaacc tgcacaacat ggtgaaatta ttaaacatat ggccaaactc ctggacagta 1560 tcactgttcc tgttgctaga gcaagtattc tttggctaat tggagaaaac tgtgaacgag 1620 ttcctaaaat tgcccctgat gttttgagga agatggctaa aagcttcact agtgaagatg 1680 atctggtaaa actgcagata ttaaatctgg gagcaaaatt gtatttaacc aactccaaac 1740 agacaaaatt gcttacccag tacatattaa atctcggcaa gtatgatcaa aactacgaca 1800 tcagagaccg tacaagattt attaggcagc ttattgttcc gaatgaaaag agtggagctt 1860 taagtaaata tgccaaaaaa atattcctag cacaaaagcc tgcaccactg cttgagtctc 1920 cttttaaaga tagagatcat ttccagcttg gcaccttatc tcatactctc aacattaaag 1980 ctactgggta cctggaatta tctaattggc cagaggtggc gcccgaccca tcagttcgaa 2040 atgtagaagt aatagagttg gcaaaagaat ggaccccagc aggaaaagca aagcaagaga 2100 attctgctaa gaagttttat tctgaatctg aggaagagga ggactcttct gatagtagca 2160 gtgacagtga gagtgaatct ggaagtgaaa gtggagaaca aggcgaaagt ggggaggaag 2220 gagacagcaa tgaggacagc agtgaggact cctccagtga gcaggacagt gagagtggac 2280 gggagtcagg cctagaaaac aaaagaacag ccaagaggaa ctcaaaagcc aaaggaaaaa 2340 gtgattctga agatggggag aaggaaaatg aaaaatctaa aacttcagat tcttcaaatg 2400 acgaatctag ttcaatagaa gacagttctt ccgattctga atcagagtca gaacctgaaa 2460 gtgaatctga atccagaaga gtcactaagg agaaagaaaa gaaaacaaag caagatagaa 2520 ctcctcttac caaagatgtt tcacttctag atctggatga ttttaaccca gtatccactc 2580 cagttgcact tcccacacca gctctttctc caagtttgat ggctgatctt gaaggtttac 2640 acttgtcaac ttcctcttca gtcatcagtg tcagtactcc tgcatttgta ccaacgaaaa 2700 ctcacgtgct gcttcatcga atgagtggaa aaggactagc tgcccattat ttctttccaa 2760 gacagccttg catttttggt gataagatgg tctctataca aataacactg aataacacta 2820 ctgatcgaaa gatagaaaat atccacatag gggaaaaaaa acttcctata ggcatgaaaa 2880 tgcatgtttt taatccaata gactctcttg agcctgaggg atccattaca gtttcaatgg 2940 gtattgactt ttgtgattct actcagactg ccagtttcca gttgtgtacc aaggatgatt 3000 gcttcaatgt taatattcag ccacctgttg gagaactgct tttacctgtg gccatgtcag 3060 agaaagattt taagaaagag caaggagtgc taacaggaat gaatgaaact tctgctgtaa 3120 tcattgctgc accacagaat ttcactccct ctgtgatctt tcagaaggtt gtaaatgtag 3180 ccaatgtagg tgcagtccct tctggccagg ataatataca caggtttgca gctaaaactg 3240 tgcacagtgg gtcattgatg ctagtcacag tggaactgaa ggaaggctct acagcccagc 3300 ttatcataaa cactgagaaa actgtgattg gctctgttct gctgcgggaa ctgaagcctg 3360 tcctgtctca ggggtaacct gcttacatct ggactttaga atctggcaca caacaaaagt 3420 gcctggcatc cactactgct gcctttcatt tataataata gcccttccat ctggcagtgg 3480 gggtagaata cactcttgac attcttgtct cctgctttag aatgctagtg tgtatctatc 3540 atgtatgcaa tactttcccc ctttttgctt tgctaaccga agagcatata ttttactgtc 3600 agttgtctca actcttgaat ccatgtggcg ttttctctgt cctgctgctt cttttggcct 3660 cctcgttttc cttctctttt tcgacaatgg tagacatgaa tgagatattt aaagttcatt 3720 ggaaatcttc ttccctacag cagtaagcaa aaattagcaa agagatagtc taaatggcct 3780 ctcagcttgg tatgtgaaaa tgagatcaca tactttttaa atccaaatac aaaagcatag 3840 tctctgcaag attttgttct ttgaatttct tgatattgta attgattatt gataactgtc 3900 atcatgaaat tatctctcaa taataagata aataaactag catatgaatc 3950 <210> 5 <211> 5191 <212> DNA <213> human <400> 5 gagaaagaaa aacagctcga gacctcatgc aaagagaaaa ctgagtatct acagaaaatg 60 gttcagagga atgaaagata taaacaagat gtggagaggt tctatgaacg gaagcgacat 120 ttagatttaa ttgagatgct tgaagcaaaa aggccatggg tggaatatga aaatgttcgt 180 caggaatatg aagaagtaaa actagttcgt gaccgagtga aggaagaggt cagaaaactt 240 aaagaagggc agattcctat aacatgtcga attgaagaaa tggaaaacga gcgtcacaat 300 ttggaggctc gaatcaaaga aaaggcaaca gatattaagg aggcatctca aaaatgcaaa 360 cagaagcaag atgttataga aaggaaagat aaacatattg aggaacttca gcaggcttta 420 atagtaaagc aaaatgaaga gcttgaccga cagaggagaa taggtaatac ccgcaaaatg 480 atagaggatt tgcaaaatga actaaagacc acggaaaact gcgagaatct tcagccccag 540 attgatgcca ttacaaatga tctgagacgg attcaggatg aaaaggcatt atgtgaaggc 600 gaaataattg ataagcgaag agagagggaa actctagaga aggagaaaaa gagtgtggac 660 gatcatattg tacgttttga caatcttatg aatcagaagg aagataagct aagacagaga 720 ttccgtgaca cgtatgatgc tgttttatgg ctaagaaata acagagacaa atttaaacaa 780 agagtctgtg agcccataat gctcacgatc aatatgaaag ataataaaaa tgccaaatat 840 attgaaaatc atattccatc aaatgactta agagcctttg tatttgaaag tcaagaagat 900 atggaggttt tcctcaaaga ggttcgtgac aataaaaaat taagagtaaa tgctgttatt 960 gctcccaaga gttcatatgc agacaaagca ccttcaagat ctttgaatga acttaaacaa 1020 tacggatttt tctcttattt gagagaatta tttgatgcac ctgatcctgt aatgagttac 1080 ctttgctgtc agtatcatat tcatgaagtt cctgtaggaa ctgaaaagac cagagaaaga 1140 attgaacggg taatacaaga aacccgatta aaacagattt atacagcaga agaaaagtat 1200 gtggtgaaaa cttcttttta ttcaaacaaa gttatttcta gtaacacatc tctaaaagta 1260 gcgcagtttc tcactgtcac tgtggaccta gagcagagaa gacacttaga agaacagcta 1320 aaggaaattc atagaaaatt gcaagcagtg gattcagggt tgattgcctt acgtgaaaca 1380 agcaaacatc tggagcacaa agacaatgaa cttagacaaa agaagaagga gcttcttgag 1440 agaaaaacca agaaaagaca actggaacaa aaaatcagtt ccaaactagg aagtttaaag 1500 ctgatggaac aggatacttg caatcttgaa gaggaagagc gaaaagcaag taccaaaatc 1560 aaagaaataa atgttcaaaa agcgaaactt gttaccgaat taacaaacct aataaagatt 1620 tgtacttctt tgcatataca aaaagtagat ttaattctcc aaaatactac agtgatctct 1680 gagaagaaca aattagaatc agattatatg gccgcatctt cacaactccg tcttacagag 1740 caacatttca ttgaattgga tgaaaataga cagagattat tgcagaaatg caaggaactt 1800 atgaaaagag ctaggcaagt atgtaacctg ggtgcagagc agactcttcc tcaagaatac 1860 cagacacaag tacccaccat tccaaatgga cacaactcct cactccccat ggttttccaa 1920 gaccttccaa acacattgga tgaaattgat gctttattaa ctgaagaaag atcaagagct 1980 tcctgcttca cgggactgaa tcctacaatt gttcaggaat atacaaaaag agaagaagaa 2040 atagaacagt taactgagga actaaaggga aagaaagttg aactagatca atacagggaa 2100 aacatttcac aggtaaaaga aaggtggctt aatcctttaa aagagctggt agaaaaaatt 2160 aatgaaaaat tcagcaattt ttttagttcc atgcagtgtg ctggtgaagt tgatctccat 2220 acagaaaatg aggaagatta tgataaatat ggaattcgaa ttagagtcaa atttcgaagt 2280 agtactcaac tgcatgaatt aactcctcat catcaaagtg gaggtgaaag aagtgtttct 2340 accatgttat acttgatggc acttcaggag ctaaatagat gtccattcag agtagttgat 2400 gaaatcaatc agggaatgga cccaatcaat gaacggagag tgtttgaaat ggttgtaaat 2460 actgcctgta aagaaaatac atctcaatac tttttcataa caccaaagct cctgcaaaat 2520 cttccttatt ctgaaaagat gacagttttg tttgtctaca atggccctca tatgctggaa 2580 ccaaacacat ggaatttaaa ggctttccaa aggcggcggc gccgtattac attcactcaa 2640 ccttcttaat aaaagtaaag agagggaact tgggaatttt ttttgttaaa ttctgtttat 2700 aagtatggct caactgaata aaaggagatt cactaaaacg aaaagcagtt atttttggaa 2760 acctgctttt aaatacaaat aggttgataa tggaaactat aatgaccttt ccaaaatagc 2820 agctggtagt aaaagttaag tcttcttcag tcttggttga acttgagttc ttggcactct 2880 gaccatgagt cattcagttc tcatgttaaa atgtacttaa tattacaaat caaaggtaca 2940 gtggaagaag ggttaatcac aagaagttac ttatatggta gccctgagct ttaattgcag 3000 agtaacttta attactttta gagcctaaag atgactctag agcctaagtc ctagtttctc 3060 ccaatgttat atttaatttt aaaaaattga tatgaaaatg tctaatgtat agtaataatt 3120 tatgacagat ctagtcattt cttcctatta aaaaagatta ccttatctcc agtaggaaat 3180 ggaattttat gggcctttaa aagaaagttt tatgaaactt gatgctataa ttttattggt 3240 atttcaaggg gaaaaaagca ctggggttca aaaatggtag cagaactgct ttgaaatgct 3300 gcaaggtggc cactagatga tgcaaaatac aaccaaaaga ttgactgaga ataaaattag 3360 gtgacaaggg tttttaaaga ataacctttt aaagtgtggg ggcaggggtt gctttttttt 3420 attttattta aagtcaatta tattttacat cttacatttc taaaagcatt ttataattat 3480 ttttagtaag atttttctta aaatttcata tactggtttc tacaatttat atttgaaatt 3540 tctcagtgtt atgtaaagag tgatggaaaa gcattgattt ctttaaaacc gtaatgtttt 3600 tagaacttaa gcctataggg cctttcttac aatgttgatg tacccattat cttagaaaat 3660 ctagtttaaa ctgttttctt tcaccgcaaa agaattaaat gggaaaatca tttgtttatc 3720 tctaagttat actaattagt agaaccaaac aaattatctt cttttaaaaa ataaatctta 3780 taggaaaata gacagtccaa agtcatgtct ttgaacagtg gattggatct gtgccagtaa 3840 tgacaaaatt atttttttga cttgcttgcc tgaataaatt gaagaattgc tttcagtttg 3900 ggttttgtat attcttaagt agccattgaa atttatattc ttaactaggt caaaaaataa 3960 tgagccataa gtttatgtcc tctcacttag acattttctc tttaaaaagg tattttcttc 4020 tttataaaca ttttaaaaga gccttccctt cttaaactaa ctccagtgca tgaagtgtga 4080 aaatatttta aaatgacatt tttactaata tgagcaagtc atgtaaacat tgaagaactt 4140 ggtaacatat tagtaaatgg atattaccaa atgttttcat cgttaattac tttgcgttcc 4200 accaaaatat ctttactaaa atgtgcttgg tgtagtttgt ttattgtcta aattagtacc 4260 agtcatctta tttctgcaaa atgagtatca atgtgaaaaa gacacgtgaa gattaagcat 4320 gtttgaaaat aaaatggtca attacatttc aatttacata ggccaacaac tgttccatac 4380 tttgtttgta aacatttaat ttctctactg gacaaaatta atatttggct ttacattgaa 4440 ttttgagctg tgaagaataa attatgtatc attttagcat attaaacagt agtaagtcta 4500 gcacatagtc tcagccactt aaaacaaaag tttttttgtt tgtttgtttg tttgtttttt 4560 tgagatggag tctcactctg ttgcccaggc tggagtgcag tggcgtgatc tcggcttact 4620 gcaacctccg cctcccgggt tcaagcgatt ctcctgcctc agcctcccaa gtaactggga 4680 caacaggcgc gtcccaccac acccagctaa ttttttatac ttttagtaga gatggggttt 4740 cagcatattg gccaggctgg tctcgaactc ctgaccttgt gatccacccg cctcggcctc 4800 ccaaagtgct gggattatag gcgtgagccc ctgcacccgg ccaaaagttg atttttaatt 4860 acataaaaat cgtaaaaact tctagtaaaa acttgatttg gtgaatacag ttatatttta 4920 aaaccttaag gtgacaagca ttttctatgc ctaaatcttc attggtttgc ctggaaagag 4980 tctctgttaa aagattttcc atattcaaag taaaaggaaa gatttcttgc ttcctaattg 5040 tcttttggac acatgcctat tttctttgag gtataaacct ttagatgtga aaaatgtaat 5100 ttcattctgc tattgtgtgt gcttgtgtgt gtgtaattga aaaaactggg aaatcctgct 5160 ttgttggtaa taaatcaata tttttatatt c 5191 <210> 6 <211> 4755 <212> DNA <213> human <400> 6 aagagatctt ccaggctctc agagccctgg gagggcgatt tccaggaaga ccacaatgcc 60 aacctctgga ggaggctgga gagagaaggc ctaggccaga gcctgtcagg caactttggc 120 aagaccaagt cagccttctc atctctccag aacattcctg agagtctgag aagacacagc 180 agcctggagc taggccgggg aacccaggag ggttaccccg ggggcaggcc cacctgtgca 240 gtcaacacca aggcagaaga ccctgggagg aaagccgctc ctgacctcgg gagccatctg 300 gaccggcagg tttcctaccc gcggcccgag gggaggaccg gtgcctcggc ttctttcaac 360 agcacagacc caagtcccga agagccgcct gccccctcgc acccgcacac atccagtctg 420 ggccggaggg ggcccggccc aggcagcgcc tcggctcttc agggctttca gtacgggaag 480 ccccactgct cggtgctgga gaaggtctcc aaattcgagc agcgagagca agggagccag 540 agaccgagtg tgggcggctc tggttttggc cataactata ggccccacag gaccgtctca 600 acttccagta cttctgggaa tgacttcgag gagacaaaag cacacattcg tttctctgag 660 tcagctgaac ccctaggcaa cggggagcag cacttcaaaa acggggagct gaagttggaa 720 gaggcttccc ggcagccctg cggtcagcag ctgagcggag gagcgtcgga cagcggccgt 780 ggcccccaga ggccggacgc tcggctcctc cgtagccaga gcaccttcca gctctccagc 840 gagccagaga gggagcccga gtggcgggac aggcccggct cgcccgaatc gcccctgctg 900 gatgccccct tcagccgcgc ctaccggaac agcatcaagg acgcacagtc ccgtgtcttg 960 ggggccacct cctttcgacg tcgagacctg gagctggggg cgcccgtggc gtcgaggtcc 1020 tggcggccac ggccttcctc ggcccacgtg gggctgcgga gccccgaggc gtcggcctcc 1080 gcctccccgc acacgccccg ggagcggcac agcgtgaccc ctgctgaggg cgacctggcc 1140 aggcccgtgc cccctgccgc ccggagaggt gctcgccggc gcctgactcc cgagcagaag 1200 aagcgctcct actcggagcc cgagaagatg aacgaggtgg ggatcgtgga ggaggccgaa 1260 ccggcacccc tgggcccgca gagaaatggg atgcgtttcc cggagagcag cgtggccgac 1320 cggcgccgtc tcttcgagcg cgatggcaag gcctgctcca cgctcagcct gtcggggccc 1380 gagctgaagc agttccagca gagcgccctg gcggactaca tccagcgcaa gaccggcaag 1440 cggcctacct ccgccgccgg ctgcagcctc caggagcccg ggccactgcg tgagcgcgcc 1500 cagagtgcct acctccagcc cggccccgcg gcgctcgaag gctccggcct cgcctcggcc 1560 tccagcttga gctcactgcg ggagcccagc ctgcagcccc gcagggaggc cacgctcctg 1620 ccggccacag ttgcagaaac ccagcaggct ccccgagatc gcagcagctc cttcgccggt 1680 ggccgccgcc tcggggaacg gcgacgcggg gacctgctta gcggagcaaa cggtggaaca 1740 aggggcaccc agagagggga tgagaccccc agggagccat cctcctgggg ggccagggcc 1800 gggaagtcca tgtcggccga ggacctgctg gaacgctcgg acgtccttgc gggccctgtc 1860 catgtgaggt ccaggtcatc tcccgccacc gcagacaagc gccaggatgt gcttttgggg 1920 caagacagtg gctttggtct tgtgaaggat ccatgttatt tggctggtcc tggatctagg 1980 tcactcagtt gttcagaaag aggccaagaa gagatgctgc tgctcttcca ccatctcacc 2040 cctcgttggg gtggttcagg ctgcaaagcc attggtgatt cctccgttcc tagtgaatgt 2100 cctggaaccc tggaccatca gaggcaagcc agtaggacac cctgccccag gccaccactg 2160 gcaggaacgc aagggctggt cacagacacc agggctgcac ccctgacccc aattggcacc 2220 cctctgcctt cagccattcc ctctggctac tgctcacagg acggtcagac agggcgacag 2280 cctctcccgc cctacacccc tgccatgatg cacagaagca atggtcacac cctgacccag 2340 cctcccggtc caagaggctg tgagggcgat ggcccagagc atggggtaga agagggaacg 2400 aggaagaggg tctcgctgcc tcagtggcca cctccttctc gagcaaagtg ggcccacgca 2460 gccagagagg acagccttcc tgaggaatcc tcagcccctg attttgcaaa cctgaagcac 2520 tatcaaaaac agcagagtct tccaagttta tgcagcactt ctgacccaga cacacctctt 2580 ggggccccga gcactccagg gaggatctcc ctccgaatat ctgagtctgt cctgcgggac 2640 tccccgccac ctcatgagga ttatgaagac gaagtgtttg tgagggatcc gcaccccaag 2700 gccacgtcca gccccacatt tgaacctctt cccccacccc cacctcctcc accgagtcag 2760 gaaaccccgg tgtatagcat ggatgacttc cctccacctc ctccccacac tgtatgtgag 2820 gcgcagctgg acagtgagga tcccgagggg ccacgcccca gcttcaacaa actttctaaa 2880 gtgacaattg caagggaaag gcacatgcct ggtgcagccc atgtggtagg tagtcagaca 2940 ctggcttcca gactccaaac ttctatcaag ggttcagagg ctgagtccac accaccctcc 3000 ttcatgagcg ttcacgccca acttgctggg tctcttggtg ggcagccagc acccatccag 3060 actcaaagcc tcagccatga tccagtcagt ggaactcagg gtttagaaaa gaaagtcagt 3120 cctgatcctc agaagagttc agaagacatc agaacagagg ctttggccaa ggaaattgtc 3180 caccaagaca aatctctagc agacattttg gatccagact ccaggctgaa gacaacaatg 3240 gacctgatgg aaggtttgtt tccccgagat gtgaacttgc tgaaggaaaa cagtgtaaag 3300 aggaaggcca tacagagaac tgtcagctct tcaggatgtg aaggcaagag gaatgaagac 3360 aaggaagcag tgagcatgtt ggttaactgc cctgcctact acagtgtgtc tgctcccaag 3420 gctgagctac tgaacaaaat caaagagatg ccagcagaag tgaatgagga agaggaacag 3480 gcagatgtca atgaaaagaa ggctgagctc attggaagtc tcacccacaa gctggagacc 3540 ctccaggagg cgaaggggag cctgctcacg gacatcaagc tcaacaacgc cctgggagaa 3600 gaggtggagg ctctgatcag cgagctctgc aagcccaatg agtttgacaa gtataggatg 3660 ttcatagggg atttggacaa ggtggtcaac ctgctgctct ccctctcggg gcgtctagcc 3720 cgtgttgaga atgtccttag cggccttggt gaagatgcca gtaatgaaga aaggagctct 3780 ctttacgaga aaaggaagat cctggctggt cagcatgagg atgcccggga gctgaaggag 3840 aacctggatc gcagggagcg agtagtgctg ggcatcttgg ccaattacct ttcagaggag 3900 cagctccagg actaccagca cttcgtgaaa atgaagtcca cgctcctcat tgagcaacgg 3960 aagctggatg acaagatcaa gctgggccag gagcaggtca agtgtctgct ggagagcctg 4020 ccctcagatt tcattcccaa ggctggggcc ctggctctgc ccccaaacct cacgagtgag 4080 cccattcctg ctgggggctg tactttcagt ggtattttcc caacattaac ctctccactt 4140 taacctcttc taaaataccc aaccaaaaga tcactgtttc tctcaacact atttaatctg 4200 aaaaatgttt cagtacaaac cactgtttga actatctggg ttattggtgt ttgttcctga 4260 tgaaaggaaa aaaattctct ccaggaggaa gcctttttcc ttcttgccct tcctgattga 4320 tcttctgaga gctcgaatgc tgctggacac gtaccccttt ctattattac tttgtagtag 4380 aaagaaagtt aatgaaactg agaactgatt ggagggtgtt tgatcattta gtttttaaca 4440 ggctgaggca acatggatca gtgtgtgtcc ccctcaggaa tgtatccaca gtggccttcc 4500 ttgctggtgg gcagtgtatc ctgatggcag ggtacaagta ccattaatga agggtctgca 4560 acataaagcc ttaaaaagac acacactaag aaaactgtaa aaccttgaac attgttattt 4620 atatttttta aaatggaaaa gatcactatg tttgttgtgc taaccactta tttgattctg 4680 ttttgtggtg gacatagatg attacgtttg agctttgtat tttgtgaaaa ccttaatgaa 4740 atgaattcca aagat 4755 <210> 7 <211> 2045 <212> DNA <213> human <400> 7 gaaacttgac cccggctcat cctgtctctg gctgtggccc ggcaaagcac tgaaaacccc 60 tctggtctca gagacagtag gggcagtgcc actttctaca acctgccaac ccacacactg 120 gagtaattct gaaaaaaatt attcctaaac tctctaagtg tggacggaga atgagcaagc 180 cccagaagta ttttacaacc agagtgggta atgaggaggg ggcttactgg aatcgtcata 240 tctctgaata ttgaaaacaa caactaaaaa agtggacctt ctcagaaaaa aagggcagca 300 aatgaccaag ggcgcccctt ctggccgtgc ttggcttgag taactgtctc tctttcccca 360 cccccatcac agggctttca gtttggcaaa ggaaaagcag ataaaaacag aacattccat 420 atgtttcttt ctccatcggc caaaaacatt ttgacacaat gtttgtgaaa cacctttgga 480 gaggtgcact tctgaatgct gcctctgccg taaatcctgg ggcaagggat cagcctcttc 540 ccaggaacca tcgccttcta taaaccgtga actcaagcag gcattttttt tttcttaccg 600 aaaggctgct attgtgcaag ggcacataat gggtctgttg ctcttattgg cttccaaatg 660 tgcatggcaa agagagagat gtgggcctag agcagatata ttcagcaagg tgacagcttc 720 ccataacaat tctaacactt cttatcttat gtgagaataa aatatttaag ggttgaacct 780 tattttgcca aatgtatctt ttctgctttt gaattgggca gaagatttta gcaactatat 840 tctacaaatg ttacttataa cacacacaca cacatctgaa atatatgccg aaaattgacg 900 tctttgacct cagggagagc acctgtccag gtctgcctaa aggaaatggc tccagtgggt 960 ctaaacaacc acatcctatc catggatagg tctagtcata acactttaga gagaatgtca 1020 gagcaggagg gaggcaagcc gcctcttctc ggccatcaac tgcagatgat gaaagagcgg 1080 gattcaactt tgttttcttt tcctgtggcc ccagtgaaac ctcctgccct ccctgcacgt 1140 ctgtgtcttc atttctaaaa tgggggtgat gctttcatat tgacctcacc ccatactacc 1200 tcacagatgt gttgtgagga ttaataaaat tatgtctatg gtattttcag tttctggaga 1260 aaaatactta tagacagttt aactattaca tagatatata agtgatctca gtttcttgtt 1320 tgctgtgata ctaatgtgtt gttttaactt attccataaa atgacagttg tgtcctagcc 1380 acatcagaca gctatctaag ctctggacta cccctttgtg cagctgaatc actgcagggt 1440 cgaccatgcc tggtgccaca gccatggttt ccatttctag atgaaaggat ggcctaggac 1500 ataggtctca aagactcttg gatcagaatc aggagattag ggaaaacagg atggatacct 1560 gagcactaac agcagtagac gtagacctct gtcctttacc atctgaggtc ttctggattc 1620 tttgtggggt taattttgat ttgatgtcat ctgtttgccc ttcatcttgc ttgcaagtgt 1680 gcatggttca atccctcaca tccaggaaat gaattttgca attgggccag atgctaattt 1740 gcacgttgat tcaccttctt tgcctttaag cctttttttt cttttttttt ttttttggca 1800 aatgaatgta ccatttcaac tttgatttta atagtgctag ttgatattgg taataatgct 1860 aaccaagaga tcaatgccag atttttctct tggggtaagt tagctgaagt catttaaaga 1920 tggaaaggtg ggaaaattct ttgatatttg atgtcattgt atccacattt gttgtaagac 1980 atattgcata ccaattataa ttatatcaat taaagttgat aaaagcttca aaaaaaaaaa 2040 aaaaa 2045 <210> 8 <211> 2096 <212> DNA <213> human <400> 8 atggagaacg agcctgtagc ccttgaggaa actcagaaga cagatcctgc tatggaacca 60 cggttcaaag tggtggattg ggacaaggac ctggtggact ggcgaaagcc tctcctgtgg 120 caggtgggcc acttgggaga gaagtacgat gagtgggttc accagccggt gaccaggccc 180 atccgcctct tccactcaga cctcattgag ggcctctcta agactgtctg gtacagtgtc 240 cccatcatct gggtgcccct ggtgctgtat ctcagctggt cctactaccg aacctttgcc 300 cagggcaacg tccgactctt cacgtcattt acaacagagt acacggtggc agtgcccaag 360 tccatgttcc ccgggctctt catgctgggg acattcctct ggagcctcat cgagtacctc 420 atccaccgct tcctgttcca catgaagccc cccagcgaca gctattacct catcatgctg 480 cacttcgtca tgcacggcca gcaccacaag gcacccttcg acggctcccg cctggtcttc 540 ccccctgtgc cagcctccct ggtgatcggc gtcttctact tgtgcatgca gctcatcctg 600 cccgaggcag tagggggcac tgtgtttgcg gggggcctcc tgggctacgt cctctatgac 660 atgacccatt actacctgca ctttggctcg ccgcacaagg gctcctacct gtacagcctg 720 aaggcccacc acgtcaagca ccactttgca catcagaagt caggatttgg tatcagcact 780 aaattgtggg attactgttt ccacaccctc actccagaga aaccccacct gaagacgcag 840 tgacaactcc caccccctcc gtcctgccct cagcccggcc ctggcccctt cccgaccccc 900 acccgccatt cagaccccat taagaaggtt ggcttggcca ggcaggatgg gctgtgtccg 960 gccctgcagc ctagtggaag gtgctgaggg ggccctgagg caggaccgcc ctcctgaccc 1020 ctggtaggag ggtcacatcc acttggtgca ggtggccctt ggtgacccac ttcttcctgg 1080 agcgtccctg cctagagctc agcccacagg actgcttcag gccgtggcca caggtagcag 1140 ccgcaagggg aaatgaagaa aactgagccc tcgtggccac ctgtgtcacc cttgtgcctt 1200 agcctcatgg gctgcctagg agctgcctgc acggcacagc tcgctttcac agtcagaagt 1260 gggtctgtgg gatctgtggt ccctgtcctc cctgctgtcc cttctgggga ggctttggtg 1320 gctctgaggt ggacaaagag ctctcgcaag aagagacagc gtgatgcctc ccacagtcca 1380 ccccagaccc tggggcagcc cctctggccc tgccagctgc ctgcgtcgtt gggcccaggg 1440 tggctggcag gagtcccagc tgcttgcttt aggacctggc agcttttctt gccgtccctc 1500 ccctgcctcc agaatcacag cccttctccc caagggaggc tgaggaggct tctccaccag 1560 tggcagcccc accccgtccc tggccattct tggcctccac cccgctcagg cccctactcg 1620 ggcgctccca gaaggagcca cctctcagtg cctcacctcc ccctgcctcc cagcctccgc 1680 agatgaggtt cctgcccctt cctcctcgta accaaaaccc tcactgctcc caggacggtc 1740 ttatttataa accagataca tgttcttagt ctggtcccag accaaggagc tggtcagacg 1800 gccctttcta atcctacatg ttgagcttat gtaaaaaatg ttgtttcctc ctgtttttgg 1860 ttcctttctt acccacaaac cattactact tgaaacttaa aaaactcgcc aagtgtaaag 1920 gctaaagaga agcagtttga cggaccttgt gatttgtact gtttgctgcg gagctattta 1980 aagattttgg aataaatata caaaactacg gttgtgaaat aaaaacttaa attgtatatt 2040 ttgaaaaata aaacactgaa aagaaaccaa caaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaa 2096 <210> 9 <211> 5640 <212> DNA <213> human <400> 9 ggaaacgcag aaaacagaga gaggcattct gagtcatctg actggatgaa gactgttcca 60 agttacaacc aaacaaatag ctccatggac tttagaaatt atatgatgag agatgagact 120 ctggaaccac tgcccaaaaa ctgggaaatg gcctacactg acacagggat gatctacttc 180 attgaccaca ataccaagac aaccacctgg ttggatcctc gtctttgtaa gaaagccaaa 240 gcccctgaag actgtgaaga tggagagctt ccttatggct gggagaaaat agaggaccct 300 cagtatggga catactatgt tgatcacctt aaccagaaaa cccagtttga aaatccagtg 360 gaggaagcca aaaggaaaaa gcagttagga caggttgaaa ttgggtcttc aaaaccagat 420 atggaaaaat cacacttcac aagagatcca tcccagctta aaggtgtcct tgttcgagca 480 tcactgaaaa aaagcacaat gggatttggt tttactatta ttggtggaga tagacctgat 540 gagttcctac aagtgaaaaa tgtgctgaaa gatggtcccg cagctcagga tgggaaaatt 600 gcaccaggcg atgttattgt agacatcaat ggcaactgtg tcctcggtca cactcatgca 660 gatgttgtcc agatgtttca attggtacct gtcaatcagt atgtaaacct cactttatgt 720 cgtggttatc cacttcctga tgacagtgaa gatcctgttg tggacattgt tgctgctacc 780 cctgtcatca atggacagtc attaaccaag ggagagactt gcatgaatcc tcaggatttt 840 aagccaggag caatggttct ggagcagaat ggaaaatcgg gacacacttt gactggtgat 900 ggtctcaatg gaccatcaga tgcaagtgag cagagagtat ccatggcatc gtcaggcagc 960 tcccagcctg aactagtgac tatccctttg attaagggcc ctaaagggtt tgggtttgca 1020 attgctgaca gccctactgg acagaaggtg aaaatgatac tggatagtca gtggtgtcaa 1080 ggccttcaga aaggagatat aattaaggaa atataccatc aaaatgtgca gaatttaaca 1140 catctccaag tggtagaggt gctaaagcag tttccagtag gtgctgatgt accattgctt 1200 atcttaagag gaggtcctcc ttcaccaacc aaaactgcca aaatgaaaac agataaaaag 1260 gaaaatgcag gaagtttgga ggccataaat gagcctattc ctcagcctat gccttttcca 1320 ccgagcatta tcaggtcagg atccccaaaa ttggatcctt ctgaggtcta cctgaaatct 1380 aagactttat atgaagataa accaccaaac accaaagatt tggatgtttt tcttcgaaaa 1440 caagagtcag ggtttggctt cagggtgcta ggaggagatg gacctgacca gtctatatat 1500 attggggcta ttattcccct gggagcagct gagaaagatg gtcggctccg cgcagctgat 1560 gaactaatgt gcattgatgg aattcctgtt aaagggaaat cacacaaaca agtcttggac 1620 ctcatgacaa ctgctgctcg aaatggccat gtgttactaa ctgtcagacg gaagatcttc 1680 tatggagaaa aacaacccga ggacgacagc tctcaggcct tcatttcaac acagaatgga 1740 tctccccgcc tgaaccgggc agaggtccca gccaggcctg caccccagga gccctatgat 1800 gttgtcttgc aacgaaaaga aaatgaagga tttggctttg tcatcctcac ctccaaaaac 1860 aaaccacctc caggagttat tcctcataaa attggccgag tcatagaagg aagtccggct 1920 gaccgctgtg gaaaactgaa agttggagat catatctctg cagtgaatgg gcagtccatt 1980 gttgaactgt ctcatgataa cattgttcag ctgatcaaag atgctggtgt caccgtcaca 2040 ctaacggtca ttgctgaaga agagcatcat ggtccaccat caggaacaaa ctcagccagg 2100 caaagcccag ccctgcagca caggcccatg ggacagtcac aggccaacca catacctggg 2160 gacagaagtg ccctagaagg tgaaattgga aaagatgtct ccacttctta cagacattct 2220 tggtcagacc acaagcacct tgcacagcct gacaccgcag taatttcagt tgtaggcagt 2280 cggcacaatc agaaccttgg ttgttatcca gtagagctgg agagaggccc ccggggcttt 2340 ggattcagcc tccgaggggg gaaggagtac aacatggggc tgttcatcct tcgtcttgct 2400 gaagatggtc ctgccatcaa agatggcaga attcatgttg gtgaccagat tgttgaaatc 2460 aatggggaac ctacacaagg aatcacacat actcgagcaa ttgagctcat tcaggctggt 2520 ggaaataaag ttcttcttct tttgaggcca ggaactggct tgatacctga ccatggtttg 2580 gctccttccg gtctgtgctc ctacgtgaaa cccgagcaac attaaggctt tcagggcttt 2640 tcttggtctt tccttaaaaa gacttggtga ttgggatatt aataatcctt cgtcttcaaa 2700 tgtgatttat gatgaacagt caccattacc cccatcttca cattttgctt ccatatttga 2760 agagtctcac gtgccagtaa ttgaagaatc tttgagagtt cagatatgtg aaaaggcaga 2820 agaattaaag gacattgtgc ctgaaaagaa aagcacttta aatgaaaatc agcctgagat 2880 aaagcatcag tctcttctcc agaaaaatgt gagtaagagg gatccaccca gcagtcatgg 2940 gcacagtaac aagaaaaatc tattaaaagt agaaaatggt gttacacgaa gaggtagatc 3000 ggttagtccc aaaaagccag ccagtcaaca ttcagaggaa catttggata agattcctag 3060 tcctctaaaa aataacccca aaagaagacc cagagatcaa tccctcagcc ccagcaaagg 3120 ggaaaataaa agttgtcagg tcagcaccag ggcaggctct ggacaagatc agtgcagaaa 3180 aagcagaggt cggtcggcca gcccaaaaaa gcagcaaaaa attgaaggaa gcaaagctcc 3240 atcaaatgct gaggccaaat tattagaggg taagagtcga agaatagcag gctatacggg 3300 cagtaatgct gagcagatcc cagatgggaa ggaaaaatca gacgtcatca ggaaagatgc 3360 aaagcagaat cagttggaaa aaagcagaac aaggtctcca gagaaaaaaa tcaaaagaat 3420 ggttgagaaa tctcttccat ccaaaatgac taataagact acaagtaaag aagtatctga 3480 aaatgaaaaa ggaaagaaag taaccacagg agaaacaagt tctagtaacg ataaaatagg 3540 agaaaatgtc cagctatcag aaaagaggct gaagcaagaa cctgaagaga aggtagtttc 3600 aaacaaaaca gaagatcaca aagggaaaga actagaggca gctgacaaaa acaaagagac 3660 tggaaggttc aaaccggaaa gcagttctcc agttaagaaa acactgataa ctccagggcc 3720 ctggaaggtt ccaagtggaa ataaagtcac aggcactatt ggtatggctg agaaacggca 3780 gtaaccttta gtataaaaca aagaaaaaca agttgtaatc ttttcttaca gcagcatttt 3840 tccagaaaaa gccttttttt ttttttcaga tattctgaaa cagataagta catgttaatg 3900 tgagcctcaa gttacctagg ctgcatgaag ggcctttagg attgctaaga accaactgtc 3960 cccctggccg gctgccctcc ctcgctctca ggaaggagct gcatccacat gctcatctga 4020 cccgccctgc tcaggctgcc cagctcgtct tcatgagtgt ctgaacaaat gacatatgtt 4080 gatattaaca atgtggtcac aactcacttt gtatttgtgc caagttatct actgtatcat 4140 gtctgttttt atcctttttg ttcagctgtt tccacagtaa tgaaaaagtt aggtttggct 4200 tggaagttga tgatctcaat agcatgttgc atgtttacag agagaaatat gtgagtcctt 4260 gcagaagaag agactgttaa ctcatcgtta aagatggccg ttgtctcttc taacagctac 4320 tgatgatgtc ccactttaaa aataaaaccc ccaaacatca ctactttaag gaaaaaaaaa 4380 atgtagtcca atattgatgc tttcttatgg ctttttattt taatttggct ggataagttg 4440 tttcaaataa ctgttaaaga tattacttac aattgaatgt ttgaaataag aaagtacttt 4500 aagcaataga gttcatctcc tgctgtgtta tccaacctcg atgtatactt acagcatctc 4560 aggtcaccct ttttatttca gttatttaat tatgaaacca taaagaagca tgtggaaata 4620 gtgtttattg ctctttgaag aaaaaccacc aactatttct ggatattttg gctgtaccta 4680 ctactaaagt cattagtctt taatacataa tacatatttg aaaagtaaac atattatata 4740 gattatgtga gggacttaat catgaaacca gtttcacagt ccaagtacca actcttctgg 4800 tagcaggtgc acaagcttgg gtgtttaaaa acaacctgtg tagggtatgc ccagcaaatg 4860 aggacaaatg tgtagacagt acttactgga tcttatttaa cttttagcta cattaactaa 4920 ctttcttatt taaaaacaag aaagggagac taaacatctg cttaacttgt acacattttc 4980 agaattcttt ttaaaagtct agttaaagat gtttcttaga agttggagac tgttaacaac 5040 ttccataaaa tagatccagg tttttcagtt ccctgaagca gcattcagta gcatctatat 5100 aaataaaggc accttctgag aataaaacta ttttatggag tgtgtgaaca cacttgttct 5160 gtcacctggg ttcatcttgt tgtgaagcac attaggtcca ggtccttccc tctgggagtc 5220 tgactgtgaa actctttaac ccaacaactc aattagcccc tgtagataag acatgcttcc 5280 cagagtgaga tttttgaaat ccccttttca tccagaacta tatttaccca cctattgtaa 5340 ctattcaaat agagcaaaat taggaggctt gataaatact aagaatttag taccacagaa 5400 attatttatt attttccctg tagtccacaa ttagtgataa cgaatcctat ttttgttaac 5460 tgtgacataa ctttgatgtc atatgttgtc ctatgtggtt cttcctaagt aaactctgta 5520 ctgattatat actgacttag caatgtggcc ttggaatgct gagcaaaatg tggatgtact 5580 ggttgtaaat gtttatatat tgtacagtac ctttatatat acacttgagg ttctgattag 5640 <210> 10 <211> 457 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (242)..(242) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (369)..(369) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (394)..(394) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (406)..(406) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (457)..(457) <223> any kind of base <400> 10 tcagtcactc tttcaccctg ccaaagcttc actgtcctac tgattgaatt gtatgtgaga 60 aataaaatgt catcatatta agccactggg atttgtatgt ttatctgtta tagcagcaag 120 tcttaattta cctaatacac acattgtgac agatgttctt aatgtcccac cccatattgt 180 tacatgtcca gctttgagga tccctggcat gtgggggtag gagtttctgg gcatgctgga 240 tncaattccc acttttaagg catctgtggc ctctgtggcc tctgtggcct tcactgttat 300 ggaagggatt tatctggggc accataggaa actttaccat ggcacagtgg acaacctagg 360 agggggtgng gaggaggggc cttcaggccc aacngggggg accagngttc gtggggttag 420 ggtggtttgg ggggttttcc ctcttacccg tgggggn 457 <210> 11 <211> 1493 <212> DNA <213> human <400> 11 aatagggttg gcggctgcag cgggcggcaa acagcccgcc cggcaccacc atgctcgccc 60 tggaggctgc acagctcgac gggccacact tcagctgtct gtacccagat ggcgtcttct 120 atgacctgga cagctgcaag cattccagct accctgattc agagggggct cctgactccc 180 tgtgggactg gactgtggcc ccacctgtcc cagccacccc ctatgaagcc ttcgacccgg 240 cagcagccgc ttttagccac ccccaggctg cccagctctg ctacgaaccc cccacctaca 300 gccctgcagg gaacctcgaa ctggccccca gcctggaggc cccggggcct ggcctccccg 360 cataccccac ggagaacttc gctagccaga ccctggttcc cccggcatat gccccgtacc 420 ccagccctgt gctatcagag gaggaagact taccgttgga cagccctgcc ctggaggtct 480 cggacagcga gtcggatgag gccctcgtgg ctggccccga ggggaaggga tccgaggcag 540 ggactcgcaa gaagctgcgc ctgtaccagt tcctgctggg gctactgacg cgcggggaca 600 tgcgtgagtg cgtgtggtgg gtggagccag gcgccggcgt cttccagttc tcctccaagc 660 acaaggaact cctggcgcgc cgctggggcc agcagaaggg gaaccgcaag cgcatgacct 720 accagaagct ggcgcgcgcc ctccgaaact acgccaagac cggcgagatc cgcaaggtca 780 agcgcaagct cacctaccag ttcgacagcg cgctgctgcc tgcagtccgc cgggcctgag 840 cacacccgag gctcccacct gcggagccgc tgggggacct cacgtcccag ccaggatccc 900 cctggaagaa aaagggcgtc cccacactct aggtgatagg acttacgcat ccccaccttt 960 tggggtaagg ggagtgctgc cctgccataa tccccaagcc cagcccgggc ctgtctggga 1020 ttccccactt gtgcctgggg tccctctggg atttctttgt catgtacaga ctccctggga 1080 tcctcatgtt ttgggtgaca ggacctatgg accactatac tcggggaggc agggtagcag 1140 tgcttccaga gtcccaagag cttctctggg attttcttgt gatatctgat tccccagtga 1200 ggcctgggac ctttttaaga tcgctgtgtg tctgtaaacc ctgaatctca tctggggtgg 1260 gggccctgct ggcaaccctg agccctgtcc aaggttccct cttgtcagat ctgagatttc 1320 ctagttatgt ctggggccct ctgggagctg ttatcatctc agatctcttc gcccatctat 1380 ggctgtgttg tcacatctgt cccctcattt ttgagatccc ccaattctct ggaactattc 1440 tgctgcccct ttttatgtgt ctggagttcc ccaatcacat ctagggctcc tcc 1493 <210> 12 <211> 2292 <212> DNA <213> human <400> 12 ccatgggttc cccttcagcc tgtccataca gagtgtgcat tccctggcag gggctcctgc 60 tcacagcctc gcttttaacc ttctggaacc tgccaaacag tgcccagacc aatattgatg 120 tcgtgccgtt caatgtcgca gaagggaagg aggtccttct agtagtccat aatgagtccc 180 agaatcttta tggctacaac tggtacaaag gggaaagggt gcatgccaac tatcgaatta 240 taggatatgt aaaaaatata agtcaagaaa atgccccagg gcccgcacac aacggtcgag 300 agacaatata ccccaatgga accctgctga tccagaacgt tacccacaat gacgcaggat 360 tctataccct acacgttata aaagaaaatc ttgtgaatga agaagtaacc agacaattct 420 acgtattctc ggagccaccc aagccctcca tcaccagcaa caacttcaat ccggtggaga 480 acaaagatat tgtggtttta acctgtcaac ctgagactca gaacacaacc tacctgtggt 540 gggtaaacaa tcagagcctc ctggtcagtc ccaggctgct gctctccact gacaacagga 600 ccctcgttct actcagcgcc acaaagaatg acataggacc ctatgaatgt gaaatacaga 660 acccagtggg tgccagccgc agtgacccag tcaccctgaa tgtccgctat gagtcagtac 720 aagcaagttc acctgacctc tcagctggga ccgctgtcag catcatgatt ggagtactgg 780 ctgggatggc tctgatatag cagccttggt gtagtttctg catttcggga agagtgtttt 840 tattatccac ctgcagactg gactggattc ttctagctcc ttcaatccca ttttctcctg 900 tggcatcact aagtataaga cctgctctct tcctgaagac ctataagctg gaggtggaca 960 actcaatgta aatttcaagg aaaaaccctc atgcctgaga tgtgggccac tcagagctaa 1020 ccaaaatgtt caacaccata actagagaca ctcaaattgc caaccaggac aagaagttga 1080 tgacttcatg ctgtggacag tttttcccaa gatgtcccaa gcctcatcgt gacgaggctc 1140 ttatcccact ccatttttcc ctgctcatgc ctgcctcttt aatttggtaa gataatgctg 1200 taactagaat ttcacaatca gcgccttgtg caggcaattt gacagagtgt tggatgtgtc 1260 atgtcatcat gtcaaaccca aatatttgac ctaagggatc ctttattctg cccagtggct 1320 aactttaaca acatccctaa tacaactgtt tattcaaatg cacggtggtc cctgttagag 1380 ttagacctct agactcacct gttctcacgc cctgttttaa tttaacccag ctatgggatg 1440 ccagataaca gaattgctgc ctacgagctg aacagggagg agtttgtgca gttgctgaca 1500 cttcttgttg cacataaata aatacagtgg gtactataga gactcagttg caaaaattaa 1560 caaatatgct gcttgattaa aatgggtagg cttctcatgt ggctcattct ttaatctatt 1620 ctcttttatt tggtttggtt catggggtct ctgcctatgg atcatacttc aaactcttgg 1680 tgtgatcctc ctgattgtca caatattagt taccctggtg tgctgtattc tctaaaacct 1740 ttaaatgttt gcatgcagcc attcgtcaaa tgtcaaatat tctctctttg gctggaatga 1800 caaaaactca aataaatgta tgattaggag gacatcataa cctatgaatg atggaagtcc 1860 aaaatgatgg taactgacag tagtgttaat gccttatgtt tagtcaaact ctcatttagg 1920 tgacagcctg gtgactccag aatggagcca gtcatgctaa atgccatata ctcacactga 1980 aacatgagga agcaggtaga tcccagaaca gacaaaactt tcctaaaaac atgagagtcc 2040 aggctgtctg agtcagcaca gtaagaaagt cctttctgct ttaactctta gaaaaaagta 2100 atatgaagta ttctgaaatt aaccaatcag tttatttaaa tcaatttatt tatattcttc 2160 tgttcctgga ttcccatttt acaaaaccca ctgttctact gttgtattgc ccagtaggag 2220 ctatcactat attttgcaga atggaaactg ccctgactct tgaatcacaa ataaaagcca 2280 attgtatctg tt 2292 <210> 13 <211> 519 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (212)..(212) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (451)..(451) <223> any kind of base <400> 13 gaaacaacaa cagtgtaatc tttaacaggg atgttaaagg taagaagtca ggaagataaa 60 ccaaaatgat tgagtatgat aaagaatttt gcatggcgat taaaatagaa aacctataaa 120 tgtagaaaaa gcaggtctgg acttagcaaa gaaacaatat agtttggaga aggcatgaaa 180 taagttcttt tcatgttcac tgctggtcac ancataacag agagtgatgt ggagagcttt 240 gggaaggttt cacgttgagt tacatcagtg gtcaacaatg gagcaacaag actccgtaga 300 ggatgccacc ctgggagaat tgcaagggaa aggaggctga agcacaactg gtaatagcct 360 tcagatattt aatggatatg caaataaagc tctgattaat tgtattttca cttattatat 420 atcatctttg gacctttcta aaagtgggac nctagaaaag atatactgaa actccaaaag 480 aatacttcag ctcgagttga atggattcaa gatgttgtt 519 <210> 14 <211> 5294 <212> DNA <213> human <400> 14 ggctcgcatc cccatagtgc tgggttacag tgaaggtacg ccccgcgctc tgctctggag 60 aggcagggtg ggatagggaa cgtctcgagt ggcgcccgca gtcatggtgg tgttcgttgg 120 ccgccgcctc ccggcgctcc tagggctgtt taagaagaag ggctctgcca aggctgagaa 180 tgacaaacat ctaagtgtag ggcctggcca ggggccaggg tctgcagtgg atgagcacca 240 ggacaacgtc ttctttccca gtgggcgacc cccccacctg gaagagctgc acactcaggc 300 ccaggagggg ctccgctccc tacaacacca agagaaacag aaactgaaca agggtggctg 360 ggaccatgga gacacccaga gtatccagtc ctcccggacg gggccggatg aagacaacat 420 ctccttctgc agtcagacca catcctacgt ggctgagagc tccacagcag aggacgcgct 480 ctccatccgc tcggagatga tccagcgcaa aggctccacc ttccgacccc atgactcatt 540 tcccaaatct ggaaagtcag ggcggcgtcg gcgggagcgg cggagcactg tgctgggact 600 cccgcagcat gtgcagaagg agcttggcct gaggaatgag cgtgaggcac caggcacgcc 660 ccgggctcct ggtgcacggg atgccgtacg catccccaca gtggacggcc gcccccgagg 720 cacctcaggg atgggggccc gggtgtccct gcaggcgctg gaggcggagg cagaggctgg 780 cgctgagaca gaggccatgc tgcagcgcca cattgaccgt gtctaccggg atgacacctt 840 tgttggccgg tccacgggta cccgggcccc accattgacc cggcccatgt ccctagcagt 900 gcctggattg acaggagggg cagggcctgc agagcccctg agcccggcca tgtccatctc 960 cccccaggcc acctacctgt cgaagttgat tccacatgct gtgctgccgc ctacagtgga 1020 cgtggtggcc ctaggccgct gcagcctgcg cacactaagc cgctgcagcc tgcactcggc 1080 cagcccagcc tcagtccgct cgctggggcg cttctcctcc gtctccagcc cacagccccg 1140 cagccgccac ccatcctcct ccagtgacac ctggagccac tctcaatcct ccgacaccat 1200 tgtgtctgac ggttccaccc tctcctctaa gggtggctct gagggccagc cggagagctc 1260 tacggctagc aatagcgtgg taccccctcc ccagggaggc agtgggaggg gctctcccag 1320 tgggggcagc actgctgagg cctcagacac actcagcatt cggagcagtg ggcagttgtc 1380 tggccggagt gtgtccctgc gtaagctgaa gcggcctcca ccccctcccc gccggaccca 1440 ctccctccat cagcggggct tagcagtgcc tgatgggcca ttagggttgc cccctaagcc 1500 tgagcgtaag cagcagcccc agctgcctcg gccacccacc actggtggct cagaaggggc 1560 gggggcagca ccctgtccac ccaacccagc caacagctgg gtacctggct tgtctccggg 1620 tggttcccgg cgccccccac ggtccccaga acggacactt tcgccctcca gtggatactc 1680 gagccaaagt ggtactccca ccctccctcc caagggcctg gcaggtcccc ctgcttcccc 1740 aggcaaggcc cagcccccta aaccagagcg tgtcacgtct cttcgctccc ctggggcctc 1800 cgtctcctct tccctcacgt ctttatgttc ctcctcctct gacccagccc cctcagaccg 1860 ctctgggcca cagatattga cccccctggg tgacaggttt gtcatacctc ctcaccccaa 1920 ggtgcctgcc cccttctccc cacctccctc caagcccagg agccctaacc cagctgcccc 1980 tgctctagcc gcccctgctg tggttcctgg gcctgtttct accactgacg ccagtcctca 2040 gtcccctccc actccccaga caaccttgac tccactgcag gagtctcctg tcatctccaa 2100 agaccagtca cccccacctt ccccaccccc atcttatcat ccacccccac cacccactaa 2160 gaagccagag gtggttgtgg aggcaccatc tgcctcagag actgctgagg agcccctcca 2220 agatcccaac tggccccctc ccccaccccc tgcccctgag gagcaggacc tgtccatggc 2280 tgacttcccc ccaccagagg aggctttttt ctctgtggcc agccctgagc ctgcaggccc 2340 ttcaggctcc ccagagcttg tcagctcccc ggctgcttcg tcctcctcag ctactgcttt 2400 gcagattcag cccccgggta gcccagaccc tcctccagct ccgccagccc cagctcctgc 2460 tagttccgcc ccagggcatg tggccaagct ccctcagaag gaaccggtgg gctgtagcaa 2520 gggtggtggg cctcccaggg aggacgtagg tgcgcccctg gtcacgccct cgctcctgca 2580 gatggtgcgg ctgcgctccg tgggtgctcc aggaggggct cccaccccag cactggggcc 2640 atcggccccc cagaaaccac tgcgaagggc cctgtcaggg cgggccagcc cagtgcctgc 2700 cccctcctca gggctccatg ctgcggtccg actcaaggcc tgcagcctgg ccgccagtga 2760 aggcctctca agtgctcagc ccaacggacc gcctgaggca gagccacggc ctccccagtc 2820 ccctgcctca acggccagtt tcatcttctc caagggctct aggaagctgc agctggagcg 2880 gcccgtgtcc cctgagaccc aggctgacct ccagcggaat ctggtggcag aactccggag 2940 catctcagag cagcggccac cccaggcccc aaagaagtca cctaaggctc ccccacctgt 3000 ggcccgcaag ccgtctgtgg gagtcccccc acccgcctcc cccagttacc ctcgagctga 3060 gccccttact gctcctccca ccaatgggct ccctcacacc caggacagga ctaagaggga 3120 gctggcggag aatggaggtg tcctgcagct ggtgggccca gaggagaaga tgggcctccc 3180 gggctcagac tcacagaaag agctggcctg accaccaggc acctcactgg cactgctgac 3240 ccatcccaga aacacaatct cagggacccg agcagctcca aggacgagag gatacagcag 3300 acacaaccta atagagaggg cgcctgcagc cttaacctcc acggccttcg atacttatgc 3360 aagcctggtg ttgctcctgt cctcagagtc atcctgcgct catgcctttt cccgaatggg 3420 ttcacctctg gcagttgccg cttcagtctt ggccttagcc tcatcttgaa gtgggtagct 3480 ggcgggagag ggtggctgcg ccccctgctg gccctgaggc tgcagagttg ggagcaggac 3540 acctcacctg agtttcattt tttttcatgt ccaaaccatg cacatactat agtccagaat 3600 caaagcactt ttgaaaagtg gctgcatggc catcctccag ggcccaggaa gttgcattcc 3660 aagggcctgt ttacatggca gcagaatcca tccccggcag tcagcccata gcttgggacc 3720 agtctgtgcc ctcctgccca gtccagttta ctcctcttgg ttcctgaagg tggccaagtc 3780 attgtgttcc cacaggcttc tctaggctgg gggcaggtgt ggggctgtgg aattccaaag 3840 cacaaaaggt gcagagggga ttggccttcc tgtgcctcaa ctcaccaacc accctcctgc 3900 cttccagttc tgccaggtgc tccatgctgg ggacaagtag gagactgcca gggcccaaag 3960 aaatgggtga gcagtagagt catctcgggg cacttggcag tgtcaagcac ctgccccttg 4020 cctccttgac cacactgggg tgggtgggcc cccagcactt cagaggcagg agcctttggg 4080 ctgagcaagc actgaggagg tggatggaag ggagcatctg gaggggggga gcttccttga 4140 gcagtgggcc caggcctggc cctccacact tcattctctg acctttctct ctcctcattt 4200 cggtgcatgt cctttctgca gctgcctttc agcacaggtg gttccactgg gggcagctaa 4260 cgctgagtga caaggatggg aagccacagg tgcattttac tcaagtcttc tctagtcaat 4320 gaggggcacc cagtgcttct agggcaggct gggtggtggt cccctaggta tcagcctctc 4380 ttactgtact ctccgggaat gttaaccttt ctattttcag cctgtgccac ctgtctaggc 4440 aagctggctt ccccattggc ccctgtgggt ccacagcagc gtggctgccc cccagggcca 4500 ccgcttcttt cttgatcctc tttccttaac agtgacttgg gcttgagtct ggcaaggaac 4560 cttgctttta gcttcaccac caaggagaga ggttgacatg acctccccgc cccctcacca 4620 aggctgggaa cagaggggat gtggtgagag ccaggttcct ctggccctct ccagggtgtt 4680 ttccactagt cactactgtc ttctccttgt agctaatcaa tcaatattct tcccttgcct 4740 gtgggcagtg gagagtgctg ctgggtgtac gctgcacctg cccactgagt tggggaaaga 4800 ggataatcag tgagcactgt tctgctcaga gctcctgatc taccccaccc cctaggatcc 4860 aggactgggt caaagctgca tgaaaccagg ccctggcagc aacctgggaa tggctggagg 4920 tgggagagaa cctgacttct ctttccctct ccctcctcca acattactgg aactctatcc 4980 tgttaggatc ttctgagctt gtttccctgc tgggtgggac agaggacaaa ggagaaggga 5040 gggtctagaa gaggcagccc ttctttgtcc tctggggtaa atgagcttga cctagagtaa 5100 atggagagac caaaagcctc tgatttttaa tttccataaa atgttagaag tatatatata 5160 catatatata tttctttaaa tttttgagtc tttgatatgt ctaaaaatcc attccctctg 5220 ccctgaagcc tgagtgagac acatgaagaa aactgtgttt catttaaaga tgttaattaa 5280 atgattgaaa cttg 5294 <210> 15 <211> 988 <212> DNA <213> human <400> 15 gtcgtgaggc gggccttcgg gctggctcgc cgtcggctgc cggggggttg gcctgggtgt 60 cattggctct gggaagcggc agcagaggca gggaccactc ggggtctggt gtcggcacag 120 ccatggcggg cgcgttggtg cggaaagcgg cggactatgt ccgaagcaag gatttccggg 180 actacctcat gagtacgcac ttctggggcc cagtagccaa ctggggtctt cccattgctg 240 ccatcaatga tatgaaaaag tctccagaga ttatcagtgg gcggatgaca tttgccctct 300 gttgctattc tttgacattc atgagatttg cctacaaggt acagcctcgg aactggcttc 360 tgtttgcatg ccacgcaaca aatgaagtag cccagctcat ccagggaggg cggcttatca 420 aacacgagat gactaaaacg gcatctgcat aacaatggga aaaggaagaa caaggtcttg 480 aagggacagc attgccagct gctgctgagt cacagatttc attataaata gcctccctaa 540 ggaaaataca ctgaatgcta tttttactaa ccattctatt tttatagaaa tagctgagag 600 tttctaaacc aactctctgc tgccttacaa gtattaaata ttttacttct ttccataaag 660 agtagctcaa aatatgcaat taatttaata atttctgatg atgttttatc tgcagtaata 720 tgtatatcat ctattagaat ttacttaatg aaaaactgaa gagaacaaaa tttgtaacca 780 ctagcactta agtactcctg attcttaaca ttgtctttaa tgaccacaag acaaccaaca 840 gctggccacg tacttaaaat tttgtcccca ctgtttaaaa atgttacctg tgtatttcca 900 tgcagtgtat atattgagat gctgtaactt aatggcaata aatgatttaa atatttgtta 960 aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaa 988 <210> 16 <211> 4908 <212> DNA <213> human <400> 16 ggataacctc gcagggtggg ccggagggcg ggcgccgccg ctgcctgtgc tgcggcgatg 60 gcccagtgtg tacaatcagt gcaggagcta atcccggact ccttcgtccc ctgtgtcgct 120 gcgctgtgca gcgacgaagc cgagcggctc actcgtctca atcacctcag cttcgcggag 180 ctgcttaagc ccttctcccg cctcacttcc gaggttcaca tgagagatcc taataatcaa 240 cttcacgtaa ttaaaaattt gaagatagca gtaagcaaca ttgtcaccca gccacctcag 300 cctggagcca tccggaagct tttgaatgat gttgtttctg gcagtcagcc tgcagaagga 360 ttagtagcta atgtgattac agcaggagat tatgacctta acatcagtgc cactactcca 420 tggtttgagt cttacagaga aacctttctt cagtcgatgc cagcatcgga tcatgaattt 480 ctgaaccact atttagcatg tatgttggta gcgtcatcta gtgaagctga acctgtggaa 540 cagttttcaa agttgtcaca agaacagcat cgaattcagc acaacagtga ttattcctac 600 cccaagtggt ttataccaaa tacacttaaa tactatgtac ttttacatga tgtaagtgca 660 ggagatgaac agagagctga atcaatttat gaagaaatga aacagaaata tggaactcag 720 ggttgctatt tacttaaaat taattctcga acatctaatc gagcatcaga tgaacagata 780 ccagatcctt ggagtcagta tctccagaaa aatagtattc aaaaccagga atcatatgaa 840 gatggccctt gtactataac ttcaaataag aattctgata ataacttgct ttcattggat 900 ggattagata acgaagtcaa agatggctta ccaaataact ttagagctca cccacttcag 960 ttggagcaat ccagtgaccc ttctaacagt attgatggcc cagatcatct aagatctgct 1020 tcatcgttac atgaaacaaa gaaaggaaat actggaataa ttcatggtgc atgtttaaca 1080 cttactgatc atgatagaat tcgacagttt atacaagagt tcacatttcg gggccttttg 1140 ccacatatag agaaaacaat taggcaatta aacgatcagc taatatcaag aaaaggtttg 1200 agtcgatctc tattttctgc aactaaaaaa tggtttagtg gcagtaaagt tccagaaaag 1260 agcattaatg acctgaaaaa tacatctggc ttgctgtatc ctccggaagc accagaactt 1320 caaatcagga aaatggctga cttatgtttt ttggtgcagc attatgattt ggcttacagt 1380 tgctatcata ctgcaaagaa agattttctt aatgatcaag caatgcttta tgcagctggt 1440 gccttggaaa tggcagcagt gtctgctttt cttcaaccag gagcacctag gccatatcct 1500 gctcattaca tggatacagc aattcagaca tacagagata tctgcaagaa tatggtgttg 1560 gctgaaagat gtgtgttgct tagtgctgaa cttttaaaaa gccaaagcaa atattcagag 1620 gctgcagctc tcctaatacg gttgaccagt gaggattctg atcttcgaag tgcacttctt 1680 ttggaacagg cagcacattg ctttataaac atgaaaagtc ccatggttag aaaatatgca 1740 tttcatatga tattggcagg ccatcgattt agtaaagcag ggcagaaaaa gcatgcttta 1800 cgctgttatt gtcaagccat gcaagtttac aaaggaaaag gctggtctct tgcagaggat 1860 cacattaatt tcactattgg gcgccagtcc tatactctta gacagctgga taatgctgtg 1920 tctgctttta ggcatattct aattaatgaa agtaaacaat ctgctgctca acagggggct 1980 ttcctcagag aatatcttta tgtttacaag aatgtaagtc agctgtcacc agatggtcct 2040 ttgccacagc ttcctttacc gtatattaac agttcagcaa cacgggtttt ttttggccat 2100 gacagacgac cagcggatgg tgaaaaacaa gcagctactc atgtaagtct tgatcaagaa 2160 tatgattctg aatcctctca gcagtggcga gaacttgagg aacaagttgt ttctgtggtt 2220 aacaaaggag taattccatc caattttcat cccacacaat actgtttgaa cagttactca 2280 gataattcaa gatttccact tgcagttgta gaagaaccaa ttacagtgga agtggctttt 2340 agaaaccctt tgaaagttct acttttgttg actgatttgt cattgctttg gaagtttcat 2400 cctaaagatt tcagtggaaa ggataatgaa gaagttaaac aactagttac aagtgaacct 2460 gaaatgattg gagctgaagt tatttcagag ttcttaatta atggcgaaga atcaaaagtg 2520 gcaagactaa agctctttcc ccatcacata ggggagctgc atattctggg agttgtttat 2580 aatcttggca ctattcaggg ctctatgaca gtagatggca ttggtgctct tcccggatgt 2640 cacacaggaa aatattcctt gagtatgtca gtccgaggga agcaggattt agaaattcaa 2700 ggtcctcgac ttaacaacac aaaagaagag aaaacatctg ttaaatatgg ccctgatcga 2760 cgtttagatc ccataatcac agaagaaatg ccactgttgg aggtgttctt tatacatttt 2820 cctacagggc ttctctgtgg agaaatccga aaagcatatg tagaatttgt caatgtcagc 2880 aaatgtccac ttactggatt gaaggttgtt tctaaacgtc cagagttctt tactttcggt 2940 ggtaatactg ctgttctaac accactaagt ccctcagctt ctgagaattg tagtgcttac 3000 aagactgttg tgacagatgc tacctctgtg tgtacagcac tcatatcatc agcttcttct 3060 gtagactttg gcattggcac aggaagtcaa ccagaggtga ttcctgttcc ccttcctgac 3120 actgttcttc tacccggagc ctcagtgcag ctgccaatgt ggttacgtgg gcctgatgaa 3180 gaaggtgtcc atgaaattaa ctttttgttt tactatgaaa gtgtcaaaaa gcagccaaaa 3240 atacggcaca gaatattaag acacactgca attatttgta ccagtcggtc tttaaatgta 3300 cgggccactg tctgcagaag taattctctt gaaaatgaag aaggcagagg aggcaatatg 3360 ctagtctttg tggatgtgga aaataccaat actagtgaag caggcgttaa ggaattccac 3420 atagtgcaag tatcaagtag tagcaaacac tggaagttac agaaatctgt aaatctttct 3480 gaaaacaaag atgccaaact tgccagtagg gagaagggaa agttttgctt taaggcaata 3540 agatgtgaga aagaagaagc ggccacacag tcctctgaaa aatatacctt tgcagatatc 3600 atctttggaa atgaacagat aataagttca gcaagcccat gtgcagactt cttttatcga 3660 agtttatctt ctgaattgaa aaaaccacaa gctcacttgc ctgtgcatac agaaaaacag 3720 tcaacagagg atgctgtgag attgattcaa aaatgcagtg aggtagattt gaatattgtc 3780 atattatgga aggcatacgt tgtggaagac agtaaacagc ttattttgga aggtcaacat 3840 catgttattc ttcgcactat aggaaaagaa gccttttcat atcctcagaa acaggagcca 3900 ccagaaatgg aactattgaa atttttcagg ccagaaaaca ttacagtttc ctcaaggcca 3960 tcagtagagc agctttctag tctcattaaa acgagtcttc actacccaga atcatttaat 4020 catccatttc atcaaaaaag cctttgttta gtaccagtca ctcttttact ttccaattgt 4080 tctaaggctg atgtagatgt catagttgat cttcggcata aaacaacaag tccagaagca 4140 ctggaaatcc atggatcatt cacatggctt ggacaaacac agtataaact tcaacttaaa 4200 agccaggaga ttcacagtct gcagctgaaa gcatgctttg ttcatacagg tgtttataac 4260 cttggaactc ctagggtatt tgccaagtta tcggaccaag ttacagtgtt tgaaacaagt 4320 cagcagaatt ccatgcctgc cctgatcatc atcagtaatg tgtgacaact tggaaatttg 4380 tactgaaatc cacaataatc agtttttgct ggatgggttt tacagcagta tttgatatac 4440 ctaacttgtt atggaggttg attgatatct gatccctgca aaatactttg acttgtcatt 4500 ttgttgatga tgcaaagcac gttggactga gaatacttaa cattcttttt ctgtatttct 4560 ttaaaccctg agaataattt acatgctcat aatacaggat atcagcatat ttgtgcacct 4620 tattaagccc catcttaaga aaacacaaag tctaagtctg ctgttacaac ttgtcaatgg 4680 tatacgaata ttaggagatg attctgagaa aggaaaggcc ttgttggcag tactcctgtt 4740 aagccattag tctctaaatt ccagctttac tgtgaagttc tatagagtgt taaatacaaa 4800 ttttcctgtc ttgcttcaca cagttcctta aaatcagttt tgaactttgg tcatagagtc 4860 ttcatatttc agtatttggt ggtccctatg acttatacat aactttgt 4908 <210> 17 <211> 435 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (30)..(30) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (49)..(49) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (75)..(75) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (76)..(76) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (78)..(78) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (79)..(79) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (109)..(109) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (136)..(136) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (137)..(137) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (149)..(149) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (227)..(227) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (236)..(236) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (246)..(246) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (342)..(342) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (363)..(363) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (389)..(389) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (426)..(426) <223> any kind of base <400> 17 ggtagaaatg attgtgatgt acaaattttn tattttgatc atacttaana agacagagca 60 gactcacatt cattnncnna atagtatcac tgtacacata gcgaatttnt ggcgctttta 120 gattgctctg aaaatnnctg aagagttgnc catagcagcc tggtaagcct tttcctttcc 180 cccaaagctc tcctgccctt tgcagaaaga ctgttggtga caactgntgc taactnaata 240 gcatgnggtt gaacttcgcc aaaatccttc cacctcctcc catagggcaa caggggtgac 300 ttgggcttaa agggcattga gtaagcaagt aggttatcag anaacagagg gaagattcca 360 ttntagataa tttccaaata ttacaattng tggaactcag agttcaactg ctcagttcct 420 tcttcngctg accct 435 <210> 18 <211> 2224 <212> DNA <213> human <400> 18 ctttagatct gtgcagcctt tgcgtgccaa acttgtgaaa ttccttttac cttttttgga 60 gtacttgcta taaagccacc tgtcaacaaa cccccattat gtacagaata ggacctatcc 120 agtagccagg ccagtaggca gttggggaag gtgggaagga tccagcgagg cccctgagcc 180 tgcacctgga caggtgtacg tctgcaccca tcaccctcag caccaggcca ccctgcagtc 240 cacttactgt actgtgttgt ggaaggatat gctaagtgat gaaagttgcg agcagtctca 300 ctggtcgtgt aaactttttt ttttttttgg aaattgaagc tgtagagtgc tgcccgaaat 360 ctctaggaag ttggtggcaa gggacagcac tcacactctt ctggtcatga tctctgatct 420 ccacctcaaa tgacaataaa aaactggtcc aacgaagaca ctgctcagca cttcagccat 480 caggactaat ccatcgatga ctggaaaaga ggctagcttt gaggaaaaca gcctgggctc 540 ttgggagcag agtccagtgg gtgtgaggct gacttgccga cggtcggcag gtaatggctc 600 tcagccggcg aggcggtccc acagctctcc tcccagggca gcctgaggag gaggaggccg 660 ggtgcctgtt tggtggcagc ttcagcctag ggatacctga agctgttgag caacaccttt 720 atgaaatgtt gccagagcag caacacttcc ctgtgggcac agccccggga aatccggtac 780 caagtgagca aggtggcagg acccacccaa gcctgatacg catctgggcc cgccgggctc 840 agcaggggag gctgctacgg ctgcccactt cccagcaccg tctgtcaggc ttgaacccct 900 ctgtgctgtt cccttcctgg ctaataggga gacccttcgc aggcacccac tgtttcaact 960 tgaccctccc accccctgct actctcctcc acacacccct ccgttccgct agcctaccct 1020 gtcagccttt caataaaagt tatgcacaaa tgtgaacacc tgagatggag ctgaacattt 1080 cttcactttg ttctttttct gaagtcaaac tcttatcaaa tgccctaaaa ttattaccac 1140 ccaagagaaa caggaaaaag gttacatgtt tttgtttact gagagtaaga tcacctgcat 1200 ctggaagacg ggctggtaaa ttggtttggc tacagaacag aaagaaaaca aaaacaaacc 1260 tcgtaaggga agtatcgcac tcagacacca ccacttccta gagccaaatg agcaatccca 1320 aactgcaagt gccgtaagtg ggcctgtgac gtcacaccgc ccggcccgag gtatcgcatg 1380 tgcgggggag gcccacacta cagctgtcct ctcgtctaga aggcaccacc tcgctttcat 1440 gtcccgtgtg ttttggaaaa gcagtatggt gtgtcatgtc tagcggcgaa cacttccctc 1500 cctctgtcct tgaggttgta atataaaaac tgtgtttctg tacgtgtggg tgggaattct 1560 ctgacggtgc tcgttcatag cacaagctta cgctgagttc tgaactgtcg ttcacagctg 1620 cgtgtctgca tggtgtcgca tctgttgtac ctttggggaa aatttgtatg taaatgtaca 1680 gaaataaaaa cgttgcccca ttaacagatt tcctctggaa tgtcttccct acctcacctg 1740 atggtatcca ccgaagggca tttcactacc attaatggtg agtaataaaa tcctccgtgt 1800 tcattcagac ctcactgcgt cactactttg aacgcctctg taagctgtgt cttcacccgc 1860 cccgaggtgg gtggagggag gcctctcact ctgcttcgag tcctggtctt aaaggtagtc 1920 agaggcagag gctggattaa acacacactg tttaccaagt gccactctca gaccacctga 1980 gagacggggg gccatcagta aaattaagag gaattttttt cccttgttcg tgtatgttct 2040 gctgatccgt ggcctgaagg ttcctagaga cgtcaagaaa tgaatatctt acactgtgat 2100 tctgtgagga aagactggta acccaaaact ctcttctcta atgtattttt taacgaaaat 2160 gacaatattt ctttaataaa gtatttatac caaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa 2220 aaaa 2224 <210> 19 <211> 2244 <212> DNA <213> human <400> 19 gttgtttaaa agcaaggcat gcttgtggat gactctgtaa cagactaatt ggaattgttg 60 aagctgctcc ctggttccac tctggagagt aatctgggac atcttagtgt tttgttttgt 120 ttttttccct cctctttttt tgggggggag tgtgtgtggg gtttgttttt tagtcttgtt 180 tttttaattc attaaccagt ggttagcctt aaggggagga ggacggattg attccacatt 240 ccacttccta gatctagttt agaaaacatg ttccccatct ggtgctctta ggaaggagta 300 tagtaaatgc ctcatttaat aacatactcc tttttgaaag ttgccttttc tctccaccct 360 tgagtagatc cagtatttga tgaaactcat gaaagtgggt ggagcccatc ttccccctcc 420 tcttttctag gacgcactat atgtgactgt gactttaagg acatttgttt gccatttgct 480 gatttttttg ggaagttaat ttctaacttc tttcactgat aaatgaagaa aagtattgca 540 cctttgaaat gcaccaaatg aattgagttt gtaattaaaa aaattttttt tccctttcag 600 tcattgtctt atatgcttag catagatttg cagctcagta gtatatgtgt tcctagaatg 660 cagctgaaga cctgttatgt agaggaaata cgaggggtgg tgctagaaga cagacatctg 720 tggaatgatt cacatcctct caagttagga ggatggaggc ctgcttcatt aagaagctgg 780 gggtagggtg ggggtgggga gaacacttaa caacatgggg accagtcagg ggaatcccct 840 tatttctgtt ttgcatatga ggaaccctag agcagccagg tgaggctctc tagtttaata 900 aaaatcatgg aaagactctt aatgcagact cttcttaagt gttaataggg attttttcag 960 cttattttgg ttgcagtttc caatttttaa aaatgttgag gtaatctttc ccaccttccc 1020 aaacctaatt cttgtagatg cattagtgtt gaaccaatgc ttctcatgtc tcaatcttgt 1080 atatcatctt ttcagatgta ttaacaaaca aaaccttaaa aagagtagat gaattgccaa 1140 acacaattcc taccaataat aaatcgatca actctatcta ttcaggaaag caggaagcat 1200 ttggaccaca gtgcatgaaa acttcaacat tctgttatta gataatgaat caaccaaatg 1260 aacaatccag agaaaagaaa attgcaataa taaaaggtaa attaacagaa agataatata 1320 agcaagatag taatagttga ccattctgaa aagcttataa catcactcat catccagcat 1380 cctttctgaa aacaaaggat ttttaaatca ctttatgcac atatacaaca taggaggttg 1440 gcaaaataat gcactatttc ttaacagcca tgtctcttgt agaacttcaa gttaatctac 1500 aaatgaccat tgtgtcttaa tttagattat gaataccaca ttagtcaggt atttgcacta 1560 acccttaata gtatatacag tttctatgga aaattcagtg gtccaaaaat ttccgtagaa 1620 tttgagagga cgttggtggg ctgaagatag ctccttgagg gtcactgatg taggctgcaa 1680 tgggggttca caaggccctg acaccgtatt tatagtctaa cctttttatg aaaatctgac 1740 tacagctatt taaggagtag tcttaatagc tgaaaatgaa gatagagaaa gacaccaaga 1800 atatgacaca gtttacattc tagtgaggga cacaacaaaa tcaaatttaa aaaagagtgt 1860 aatagatgct gataaatact gtagataaag cacataagaa aatagaaata aaggctgtca 1920 atggagaagt catgattttt attttattta tttatttatt tatttgagac agagtcaggc 1980 tctgtgcagg ctggagtgca atggtgtgat ctcgctcact acaacctctg ctcctggctc 2040 aagctatcct cccacctcag ctctcaagta gctgggatca caggtgcgtg ctaccatgcc 2100 cggctaattt tttgtagaga tgaggttttg ccatgttgcc caggctggtc tcgaactcct 2160 ggactcaact gaccccacct cggcctctca aagtgctgag attataggcg tgcagccggc 2220 agctggccat tgtttatgtt ctgc 2244 <210> 20 <211> 351 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (62)..(62) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (121)..(121) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (207)..(207) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (220)..(220) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (276)..(276) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (300)..(300) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (315)..(315) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (336)..(336) <223> any kind of base <400> 20 tctacttcca catcggcgag accgagaagc gctgtttcat cgaggaaatc cccgacgaga 60 cnatggtcat cggcaactat cgtacccaga tgtgggataa gcagaaggag gtcttcctgc 120 nctcgacccc tggcctgggc atgcacgtgg aagtgaagga ccccgacggc aaggtggtgc 180 tgtcctggca gtacggctcg gagggcnctt tcacgttcan ctcccacacg cccggtgacc 240 atcaaatctg tctgcactcc aattcttacc aggatngctc tctttcgctg gtgggcaaan 300 tgcgtgttgc atctngacat ccaggtttgg gggagnatgc caacaaatta c 351 <210> 21 <211> 2631 <212> DNA <213> human <400> 21 accttccaac ccagccctcg gctgagccgc gccgcaccat gcccgccgtg gacaagctcc 60 tgctagagga ggcgttgcag gacagccccc agactcgctc tttactgagc gtgtttgaag 120 aagatgctgg caccctcaca gactatacca accagctgct ccaggcaatg cagcgcgtct 180 atggagccca gaatgagatg tgcctggcca cacaacagct ttctaagcaa ctgctggcat 240 atgaaaaaca gaactttgct cttggcaaag gtgatgaaga agtaatttca acactccact 300 atttttccaa agtggtggat gagcttaatc ttctccatac agagctggct aaacagttgg 360 cagacacaat ggttctacct atcatacaat tccgagaaaa ggatctcaca gaagtaagca 420 ctttaaagga tctatttgga ctcgctagca atgagcatga cctctcaatg gcaaaataca 480 gcaggctgcc taagaaaaag gagaatgaga aggtgaagac cgaagtcgga aaagaggtgg 540 ccgcggcccg gcggaagcag cacctctcct cccttcagta ctactgtgcc ctcaacgcgc 600 tgcagtacag aaagcaaatg gccatgatgg agcccatgat aggctttgcc catggacaga 660 ttaacttttt taagaaggga gcagagatgt tttccaaacg tatggacagc tttttatcct 720 ccgttgcaga catggttcaa agcattcagg tagaactgga accgaggcgg aaaagatgcg 780 ggtgtcccag caagaattac tttctgttga tgaatctgtt tacactccag actctgatgt 840 ggccgcacca cagatcaaca ggaacctcat ccagaaggct ggttacctta atcttagaaa 900 caaaacaggg ctggtcaccg ccacctggga gaggctttat ttcttcaccc aaggcgggaa 960 tctcatgtgt cagcccaggg gagccgtggc tggaggtttg atccaggacc tggacaactg 1020 ctcagtgatg gccgtggatt gcgaagaccg gcgctactgc tttcagatca ccacgcccaa 1080 tggaaaatcg ggaataatcc tccaggctga gagcagaaag gaaaatgaag agtggatatg 1140 tgcaataaac aacatctcca gacagatcta cctgaccgac aaccctgagg cagtcgcgat 1200 caagttgaat cagaccgctc tgcaagcagt gactcctatt acaagttttg gaaaaaaaca 1260 agaaagctca tgccccagcc agaacctgaa aaattcagag atggaaaatg aaaatgacaa 1320 gattgttccc aaagcaacag ccagtctacc tgaagcagag gagctgatcg cgcctggagc 1380 gccgattcaa ttcgatattg tgcttcctgc tacagaattc cttgatcaga acagagggag 1440 caggcgtacc aacccttttg gtgaaactga ggatgaatca tttccagaag cagaagattc 1500 tcttttgcag cagatgttta tagttcggtt tttgggatca atggcagtta aaacagacag 1560 cactactgaa gtgatttatg aagcgatgag acaagtattg gctgctcggg ctattcataa 1620 catcttccgc atgacagaat cccatctgat ggtcaccagc caatctttga ggttgataga 1680 tccacagact caagtatcaa gggccaattt tgaacttacc agtgtcacac aatttgctgc 1740 tcatcaagaa aacaagagac tggttggttt tgtcatccgt gttcctgaat ccactggaga 1800 agaatctctg agtacataca tttttgaaag caactcagaa ggcgaaaaga tatgttatgc 1860 tattaatttg ggaaaagaaa ttattgaggt tcagaaggat ccagaagcac tggctcaatt 1920 aatgctgtcc ataccactaa ccaatgatgg aaaatatgta ctgttaaacg atcaaccaga 1980 tgacgatgat ggaaatccaa atgaacatag aggcgcagaa tccgaagcat aactcacttg 2040 cgcctgtggg ggaagagcga acaggaagga gagctacctc ctaagggttt taacgtctct 2100 gacatacagg cacactgacc tgatttccga aggctgacaa tcgtttgtgg aatgtaatct 2160 tgatgccttg atactgagac ttgggaggga aactaagaaa tggttgacag cgttcccacc 2220 catctacaat gttattttag gtgctttgtg gtaagtcttt tttcttagat tgcgctaaaa 2280 tttcttagat tgttcagcgc tcagaacaaa agtttgaaaa atgcattgtt catatgaatg 2340 tcatctcttt tcagtttcca gtatcctttt taaaaaatgg caaaagccta gatttacaat 2400 ttgatgaaca ctaaatattt cttattaata taatctattt ttgtatttta cttaatgagc 2460 tttaagtgcc tgtcgttctg aaaattgtgt atttataatt cagcttatct cataattgga 2520 cctaatagca tttctttgtg cagttaggtg atgagcactg ctttgaggcc caagcactag 2580 tagagatgcg cgatacaggt ctagtttcgg taactgttcc agacatcaag c 2631 <210> 22 <211> 2851 <212> DNA <213> human <400> 22 agcatctcag gccatcatcc tgaaacttgg cagccttcgt ggagtataag gacagcatta 60 ttagccatca ttgggtttac tgccaacaaa aggagaggga gccataggtt ctctagatta 120 cactcctgag gaaagaagag cacttgccaa aaaatcacaa gatttctgtt gtgaaggatg 180 tggctctgcc atgaaggatg tcctgttgcc tttaaaatct ggaagcgatt caagccaagc 240 tgaccaagaa gccaaagaac tggctaggca aataagcttt aaggcagaag tcaattcatc 300 tggaaagact atctctgagt cagacttaaa ccactctttt tcactaactg atttacaaga 360 tgatatacct acaacattcc agggtgctac ggccagtaca tcgtacggac tccagaattc 420 ctcagcagca tcctttcatc aacctaccca acctgtagct aagaatacct ccatgagccc 480 tcgacagcgc cgggcccagc agcagagtca gagaaggttg tctacttcac cagatgtaat 540 ccagggccac cagccaagag acaaccacac tgatcatggt gggtcagctg tactgattgt 600 catcctgact ttggcattgg cagctcttat attccgacga atatatctgg caaacgaata 660 catatttgac tttgagttat aatatggttt tgtgacttat gagctgtgac tcaactgctt 720 cattaaacat tctgcattgg gtataatcta agaattgttt acaaaaagat tattttgtat 780 ttacccttca ttcctttttt tgatccttgt aagtttagta taaatatatc tagacattca 840 gactgtgtct agcagttacg tcctgcttaa agggactaga agtcaaagtt ccttgtctca 900 ctatttgatc tgctttgcag ggaaataact tgttttttct catgtttcat cttcttttta 960 tgtaaatttg taatactttc ctatattgcc ctttgaaatt tttggataaa agatgatgtt 1020 ttaagttcca atgagtatta ctagttactc aataccactt attgagtact ctgtttctac 1080 gtatgtagaa tgtataggga tagaagagtt gaaaagggaa agcaaaactt cttaagtggc 1140 ttccttaaaa tgtcattcat aggagatgta ctggaattgc tcattctgtg actttatttg 1200 tgtcctaaac attcttcagt gaaaataatt ttatttcagt caaacattta tgaggaaatg 1260 agatcacatc tttgtcactg gatgctactt gaagagggag tactttgtaa ccactttgat 1320 atgctgttat caccaccccc tgccctctgc tgccataatc acacaaattt aaaaagaaag 1380 aaaacagtct tccatagatt tttaaggaag aaagggccca agtcaggaga tcgcttggtt 1440 ttcttccaga agttaaatgg ggggatctga agatttgaat gttcggtctg ctttgaaatg 1500 tatgtctttt gggaatgtat tatatgccta gctttataat caggtataaa attttaatta 1560 ttcccaggaa tatgcataat attgaatatt tcatgtccta ttttaataga aaacctcagg 1620 gcccaagtaa ccagtgatag aagttagaaa aaccccttta cttagaattg tccacctagt 1680 cagagcccaa gaaagaattt tcagtggaaa aatcaatata taacttagtg ctagctagcg 1740 ccacagactc tagtagataa tattatcatc ataatggctg gtgaaaccat ataatcacag 1800 aaaaacattg ccttcagcat gttcagttcg cagcactgag ggcactcttg agggtgttgt 1860 taatgaagat ttaattttta aatacaggtg gttccaagct ttcaaatagg ttatgctcca 1920 aaagtgttat ttgtaagtta atttttttac aagtcaaaca atgttggaag tggtatttag 1980 gttctagatc ggtccacgaa agttagccca tatgtatatc ttgaatagta taggggaggg 2040 tattcataaa gtccttatgt ggttttaact aagtgaaatt atggacaaga gaaataattg 2100 taaaatcgtc ttaaaggcaa atttaatttt tacccctgtt tatgggacat tcgttctatt 2160 aactgtcaga cacaatttct gttttcatct gagagccagg tttcctttat ttctacatct 2220 aaaataagaa catattgtac actattatat aatacagaat tgtcttacac tttaataaat 2280 tcgcatttta aaggtgttta caggattatt ttttatatct gtagctgaat ttgttaaagt 2340 ctaaaaagct caaggacttt atgaagatct cattatatga ggaaaatcat aggttaccat 2400 tttataactc tattgccata agaaaataca ctctaaaatc ttgatttgaa acatattaga 2460 aaccttgatt cagtgctcag tggtctccta gtaagaagtc accgacggta gcgtcatatg 2520 agaagaaaga aatccccacc acctcaacct ctgctgagat tgtgtgctag gaacagcctt 2580 ccctccgttt cccctcagtc aaacttgagc cagcctctgg atcgatgtga tcttattgca 2640 tgtttccatg gggtgtacct atactttaag ccaatcctgc tgcattcact gctaagttaa 2700 ataaaaagcc aagaagaaaa aaaaaatttt gcactgtgca gatcctttgc tatctgactt 2760 gcatctcttc ccccacctgt cagctagcca cctgcttgtt tgtgttggga tattttttag 2820 cacctgaagc accatctgaa aggggcacca t 2851 <210> 23 <211> 3473 <212> DNA <213> human <400> 23 aagagcagcg gcgaggcggc ggtggtggct gagtccgtgg tggcagaggc gaaggcgaca 60 gctctagggg ttggcaccgg ccccgagagg aggatgcggg tccggatagg gctgacgctg 120 ctgctgtgtg cggtgctgct gagcttggcc tcggcgtcct cggatgaaga aggcagccag 180 gatgaatcct tagattccaa gactactttg acatcagatg agtcagtaaa ggaccacact 240 actgcaggca gagtagttgc tggtcaaata tttcttgatt cagaagaatc tgaattagaa 300 tcctctattc aagaagagga agacagcctc aagagccaag agggggagag tgtcacagaa 360 gatatcagct ttctagagtc tccaaatcca gaaaacaagg actatgaaga gccaaagaaa 420 gtacggaaac cagctttgac cgccattgaa ggcacagcac atggggagcc ctgccacttc 480 ccttttcttt tcctagataa ggagtatgat gaatgtacat cagatgggag ggaagatggc 540 agactgtggt gtgctacaac ctatgactac aaagcagatg aaaagtgggg cttttgtgaa 600 actgaagaag aggctgctaa gagacggcag atgcaggaag cagaaatggt gtatcaaact 660 ggaatgaaaa tccttaatgg aagcaataag aaaagccaaa aaagagaagc atatcggtat 720 ctccaaaagg cagcaagcat gaaccatacc aaagccctgg agagagtgtc atatgctctt 780 ttatttggtg attacttgcc acagaatatc caggcagcga gagagatgtt tgagaagctg 840 actgaggaag gctctcccaa gggacagact gctcttggct ttctgtatgc ctctggactt 900 ggtgttaatt caagtcaggc aaaggctctt gtatattata catttggagc tcttgggggc 960 aatctaatag cccacatggt tttgggttac agatactggg ctggcatcgg cgtcctccag 1020 agttgtgaat ctgccctgac tcactatcgt cttgttgcca atcatgttgc tagtgatatc 1080 tcgctaacag gaggctcagt agtacagaga atacggctgc ctgatgaagt ggaaaatcca 1140 ggaatgaaca gtggaatgct agaagaagat ttgattcaat attaccagtt cctagctgaa 1200 aaaggtgatg tacaagcaca ggttggtctt ggacaactgc acctgcacgg agggcgtgga 1260 gtagaacaga atcatcagag agcatttgac tacttcaatt tagcagcaaa tgctggcaat 1320 tcacatgcca tggccttttt gggaaagatg tattcggaag gaagtgacat tgtacctcag 1380 agtaatgaga cagctctcca ctactttaag aaagctgctg acatgggcaa cccagttgga 1440 cagagtgggc ttggaatggc ctacctctat gggagaggag ttcaagttaa ttatgatcta 1500 gcccttaagt atttccagaa agctgctgaa caaggctggg tggatgggca gctacagctt 1560 ggttccatgt actataatgg cattggagtc aagagagatt ataaacaggc cttgaagtat 1620 tttaatttag cttctcaggg aggccatatc ttggctttct ataacctagc tcagatgcat 1680 gccagtggca ccggcgtgat gcgatcatgt cacactgcag tggagttgtt taagaatgta 1740 tgtgaacgag gccgttggtc tgaaaggctt atgactgcct ataacagcta taaagatggc 1800 gattacaatg ctgcagtgat ccagtacctc ctcctggctg aacagggcta tgaagtggca 1860 caaagcaatg cagcctttat tcttgatcag agagaagcaa gcattgtagg tgagaatgaa 1920 acttatccca gagctttgct acattggaac agggccgcct ctcaaggcta tactgtggct 1980 agaattaagc tcggagacta ccatttctat gggtttggca ccgatgtaga ttatgaaact 2040 gcatttattc attaccgtct ggcttctgag cagcaacaca gtgcacaagc tatgtttaat 2100 ctgggatata tgcatgagaa aggactgggc attaaacagg atattcacct tgcgaaacgt 2160 ttttatgaca tggcagctga agccagccca gatgcacaag ttccagtctt cctagccctc 2220 tgcaaattgg gcgtcgtcta tttcttgcag tacatacggg aaacaaacat tcgagatatg 2280 ttcacccaac ttgatatgga ccagcttttg ggacctgagt gggaccttta cctcatgacc 2340 atcattgcgc tgctgttggg aacagtcata gcttacaggc aaaggcagca ccaagacatg 2400 cctgcaccca ggcctccagg gccacggcca gctccacccc agcaggaggg gccaccagag 2460 cagcagccac cacagtaata ggcactgggt ccagccttga tcagtgacag cgaaggaagt 2520 tatctgctgg gaacacttgc atttgattta ggaccttgga tcagtggtca cctcccagaa 2580 gaggcacggc acaaggaagc attgaattcc taaagctgct tagaatctga tgcctttatt 2640 ttcagggata agtaactctt acctaaactg agctgaatgt ttgtttcagt gccatatgga 2700 ataacaactt tcagtggctt ttttttttct tttctggaaa catatgtgag acactcagag 2760 taatgtctac tgtatccagc tatctttctt ggatcctttt ggtcattatt tcagtgtgca 2820 taagttctta atgtcaacca tctttaaggt attgtgcatc gacactaaaa actgatcagt 2880 gtaaaaagga aaacccagtt gcaagtttaa acgtgttcga aagtctgaaa atagaacttg 2940 ccttttaagt taaaaaaaaa aaaagctatc ttgaaaatgt tttggaactg cgataactga 3000 gaaactctta ccagtccaca tgcaattaga catattcagc atatttgtta ttttaaaagg 3060 gagggttggg aggtttctta ttggtgattg tcacacggta taccatactc ctctccttca 3120 aagaatgaaa ggccttgtta aggagttttt tgtgagcttt acttctttgg aatggaatat 3180 acttatgcaa aaccttgtga actgactcct tgcactaacg cgagtttgcc ccacctactc 3240 tgtaatttgc ttgtttgttt tgaatataca gagccttgat ccagaagcca gaggatggac 3300 taagtgggag aaattagaaa acaaaacgaa ctctggttgg ggtactacga tcacagacac 3360 agacatactt ttcctaaagt tgaagcattt gttcccagga tttattttac tttgcatttc 3420 cttttgcaca aagaacacat caccatttcc ttttgcacaa agaacacatc acc 3473 <210> 24 <211> 401 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (252)..(252) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (303)..(303) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (390)..(390) <223> any kind of base <400> 24 ttagattatt ttcaatttat tattcagaat aaatatatct tttttcttta acttctcaaa 60 tagttattga attgtattgg tttaaattaa atgcgtcatg tgtatatatc agtattaatt 120 caagagatac aaaaggaaat tgagtgaaaa ataagtctgc ctccttccca tcactctcat 180 gtctctacct agaggcaatt attgtcaaca gtttttgatg tgtctttcaa aaaatagtcc 240 attaagcctg gngtactaga tctcttttaa aagtttacaa cctgttacag aatatatata 300 aangttcaat tactagtaac accttattac agatacagat tacaacttag gaaatatatt 360 ttcatggacc attgatgtca tttggattcn cccctacaat c 401 <210> 25 <211> 1820 <212> DNA <213> human <400> 25 aatgtcttag aaaaaggctt tctaaaagaa aaagagcaag aggccatttc ttttcaagat 60 agatacaaag aacttcagga aaaacataaa caagaattgg aagacatgag gaaagctggt 120 cacgaagccc tcagcattat tgtggatgaa tataaggcac tactgcagtc ttcagttaag 180 caacaagtag aagctattga aaaacagtac atttctgcaa ttgagaaaca ggcacacaag 240 tgtgaggagt tgctaaatgc tcagcatcag aggctccttg aaatgctaga tacagagaag 300 gaactgttaa aagaaaaaat aaaggaagct ttgattcagc aatctcaaga acagaaggaa 360 atattggaaa agtgtttgga ggaagaaagg caaagaaata aagaggcatt agtatccgct 420 gcaaagcttg aaaaagaagc agtgaaggat gcagttttaa aagtcgtaga agaagaaaga 480 aaaaatttag aaaaagcgca tgctgaagaa agggaattat ggaagacaga acatgcaaaa 540 gatcaagaaa aagtatctca ggaaattcaa aaagctatac aagaacaaag aaaaataagt 600 caggaaactg ttaaggcagc aataatagaa gagcagaaac gaagtgaaaa ggctgtggaa 660 gaggcagtga aaagaacaag agatgaattg atagagtata taaaagaaca gaaaaggctc 720 gatcaagtca tccgccaaag aagcctgtcc agtttggaac tgttcctctc ctgtgcacag 780 aaacagttaa gtgctttaat agctacggaa ccagttgaca ttgaataaaa agaacatgac 840 aaacccacac tggcattgga taaatcatat tacaccttca aaatacacac tctgaattat 900 aaagatgtgt ttgttttctt tccaaatcat gtagaattga tttccagttc aaggataaac 960 caaaacaata tttagaacta tcaagtgatc taatttattt tcttttggtt tcttctttac 1020 atttactgtt attttattat tattagtagt agcagcaaca gagtatgata tgacccaaaa 1080 gccattgtaa agtgccacat taccaaaatt aattaagtaa actttatagc ctgtgggagt 1140 ctattatata ttattttgca aaagtagtaa atatattatt gtttcatgat gactcttgat 1200 gagatgctag aatgtaacca tacatttatc ttattttgag gatagaaata gcatggattt 1260 caacatcact tatttatctg tataattgga aataaaacac cgatatgata gagaatcatt 1320 ccggcattac ctaacctctt ctgcagttgg atctatgtat tttcattggt ctactgaaaa 1380 cgaacaatac aattaaaagc actaaagatt attatattaa ttcaactttg atctgatata 1440 tcacttaaac taaaggggtg tgtgtggtgt atgcttgttt cctatttctg ctctttaaag 1500 atactttgaa tcaataaaac cattagtcta caaatcaaat tgtgaactta atctctagaa 1560 agagaatata actcagccat ttataggaat ttaggttcaa gtacaggata tatgaaatct 1620 tttcccagta tttcagaatg tacttaattc acaggcagga tgcttcaatg caaaatcatg 1680 aatattttta attcaaaact aaaatgtcat taatatgtat gtatgcaaat gttttatctt 1740 attttctgaa atgcatctac tttcatgggc tttgtacgtt tctgagattt ctcagtgtaa 1800 taaaaagagc tcccaaactt 1820 <210> 26 <211> 280 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (261)..(261) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (237)..(237) <223> any kind of base <400> 26 tcaagtcata agataaagtt taatcatttg atcatgttaa aagacacaaa acacagccaa 60 tctaaccaaa tttcaggcat gcatttacat aaatatatta aattaagaaa agaaattgta 120 cacttaaacg tccttttcac ctagaaatca ttaaatccac agatcaacaa taaaaccaat 180 tctctgcatt taccacttca agatacaatt gttctatttt aaagataaca caaactncac 240 tagtctggtt aggaatttat ntgcattata catatattat 280 <210> 27 <211> 392 <212> DNA <213> human <400> 27 ttggtttgaa atggcacccc aggactttgg gcctgcctta cttgatagcc tcgttcagtg 60 agcaaagact tagtgagcag ctcttgtatg ccaagtattt tgctaagctc tggaaaaaag 120 ataaacaaga catggttctt gctttcaagg agtgtgtaat tctttagcca gatatggaaa 180 cctggaccct gagtgggaga aaggagacag atgaaaggag tccgtgattt tgtaaccaag 240 agctgcctgc atggttatga gtatcactga ttttagggac gcccacagag ctaaagcatt 300 tttttaatcc gagaagactt ttgtaactca tattagttaa tcttctagct ctgagatagc 360 aacacagctc ttagaattct gtaagtaagc tt 392 <210> 28 <211> 2299 <212> DNA <213> human <400> 28 cgaaccccca cagctggagg gcgaggccag ctgtacccgg ccccagtgcc ctttcgcggc 60 cacaagcggc cgtcctcctg gtccggtgct ccggcgcctg atctaggttc atggagccgg 120 ggctgtggct ccttttcggg ctcacagtga cctccgccgc aggattcgtg ccttgctccc 180 agtctgggga tgctggcagg cgcggcgtgt cccaggcccc cactgcagcc agatctgagg 240 gggactgtga agagactgtg gctggccctg gcgaggagac tgtggctggc cctggcgagg 300 ggactgtggc cccgacagca ctgcagggtc caagccctgg aagccctggg caggagcagg 360 cggccgaggg ggcccctgag caccaccgat ccaggcgctg cacgtgcttc acctacaagg 420 acaaggagtg tgtctactat tgccacctgg acatcatttg gatcaacact cccgaacaga 480 cggtgcccta tggactgtcc aactacagag gaagcttccg gggcaagagg tctgcggggc 540 cacttccagg gaatctgcag ctctcacatc ggccacactt gcgctgcgct tgtgtgggga 600 gatatgacaa ggcctgcctg cacttttgca cccaaactct ggacgtcagc agacaggttg 660 aagtcaagga ccaacaaagc aagcaggctt tagacctcca ccatccaaag ctcatgcccg 720 gcagtggact cgccctcgct ccatctacct gcccccgctg cctctttcag gaaggagccc 780 cttaggagga caggcctgca gcatcctggt ctcgggaggc ttctgtcatt gctcacacac 840 agttcagatt tccacctctt tatagacaag aagtgaattt gcctggggca gaacacccac 900 ccaaagagtc cccacttaac aatacccccc ccccacggca agaatgccca aatccgaatg 960 accccagttt tcctaatgag taaaatgatc ccagatgtgc cccagagcat gacgcctgca 1020 gctccggttt catgcaggaa attggttttg gagagttttg gcaagttgga aagccactta 1080 ctggcttttg acatgacttc tcttggagaa taagtggact ccaagctaac tctttgcaaa 1140 tgtaaacaca tgtccatctt gtaataaatg caaaatgccc gtgcagcaga agcatgcgac 1200 tttcatatcc ttgcctagaa taggctgcat ggtgtatgtc agtgagggcc acgaggcgtc 1260 ggctttagac acagatcata gctctacagg agtttatgaa tttgaagctt atgggatttt 1320 ggcagagaaa ttttcagctg tgcttgatac ccaccaaaag aatgtatctc gaaagaatga 1380 aggaagaaga aaaaaggatc cttgatgttt gtgacaagaa aatgagaaag ttagtatctg 1440 caatacagag cttgttcctg ttcagtgact gaccctctgt attctgtata gacaccaggc 1500 cgatacacag tggagttccc aggccttgtt tgcaggaagc cgactgtaaa gacagcccca 1560 gctcaaggct attaggttga atatttgctt tcatgagtaa atgtggatct ttggggaatg 1620 gcttcaaaat aagtcacgaa cacaaattct ttgtaaatta tgtaaattcc tgtttatata 1680 aattggcaac aacttatacc gtctgacagt tcaaaatctc tttcagctgc gctcttccca 1740 ccgagccgag cttactgtga gtgtggagat gttatcccac catgtaaagt cgcctgcgca 1800 ggggagggct gcccatctcc ccaacccagt cacagagaga taggaaacgg catttgagtg 1860 ggtgtccagg gccccgtaga gagacattta agatggtgta tgacagagca ttggccttga 1920 ccaaatgtta aatcctctgt gtgtatttca taagttatta caggtataaa agtgatgacc 1980 tatcatgagg aaatgaaagt ggctgatttg ctggtaggat tttgtacagt ttagagaagc 2040 gattatttat tgtgaaactg ttctccactc caactccttt atgtggatct gttcaaagta 2100 gtcactgtat atacgtatag agaggtagat aggtaggtag attttaaatt gcattctgaa 2160 tacaaactca tactccttag agcttgaatt acatttttaa aatgcatatg tgctgtttgg 2220 caccgtggca agatggtatc agagagaaac ccatcaattg ctcaaatact cagaaagtac 2280 tgtcaaaagc ctaataaaa 2299 <210> 29 <211> 1339 <212> DNA <213> human <400> 29 ctaaacaaaa tcattcactt ccctgatttt gataagaaaa ttcctgtaaa gctgtttcct 60 ctgcctctcc tctacgttgg aaaccacata agtggattat caagcacaag taaattaagc 120 ctaccgatgt tcaccgtgct caggaaattc accattccac ttaccttact tctggaaacc 180 atcatacttg ggaagcagta ttcactcaac atcatcctca gtgtctttgc cattattctc 240 ggggctttca tagcagctgg gtctgacctt gcttttaact tagaaggcta tatttttgta 300 ttcctgaatg atatcttcac atcagcaaat ggagtttata ccaaacagaa aatggaccca 360 aaggagctag ggaaatacgg agtacttttc tacaatgcct gcttcatgat tatcccaact 420 cttattatta gtgtctccac tggagacctc caacaggcta ctgaattcaa ccaatggaag 480 aatgttgtgt ttatcctaca gtttcttctt tcctgttttt tggggtttct gctgatgtac 540 tccacggttc tgtgcagcta ttacaattca gccctgacga cagcagtggt tggagccatc 600 aagaatgtat ccgttgccta cattgggata ttaatcggtg gagactacat tttctctttg 660 ttaaactttg tagggttaaa tatttgcatg gcagggggct tgagatattc ctttttaaca 720 ctgagcagcc agttaaaacc taaacctgtg ggtgaagaaa acatctgttt ggatttgaag 780 agctaaagag tctgcagcag gattggagac tgacttgtga ctgcgggctg ggggggcatt 840 cccagtagga atgtgaagcc agaggtttcg gattcgtgac atccaccccc tgggcaagtg 900 agagcatctg caaaatgcaa agagaactac ctcatatgca ggatgagcca atggcagtct 960 caagaaatgt actcgggcga caccttacct gtggaaagca aatcttttca aaataagcca 1020 ctgggactcg gtaggtggag ccccagctgc tcttctaggg acctatgggg ccttcgtggc 1080 atctctgtgc tgtgtgctgg ggaggaggtt gatgtaatgg tgactctttt ctgatcagca 1140 ccttggccgt gattcccaag gtcccagcca aagcaaaggg ccagttgttt cagtttaaac 1200 agacatgtct ttagtctaat aaaattagtt aactgccagt aaagttattt gttagctttg 1260 atgaaagcta tgttggtatc tttccctaat catcaaagta aataaaaaat catttctatg 1320 taaaaaaaaa aaaaaaaaa 1339 <210> 30 <211> 4250 <212> DNA <213> human <400> 30 gaacacatcg cgtttgcatc ccagaaagta gtcgccgcga ctatttcccc caaagagaca 60 agcacacatg taggaatgac aaaggcttgc gaaggagaga gcgcagcccg cggcccggag 120 agatcccctc gataatggat tactaaatgg gatacacgct gtaccagttc gctccgagcc 180 ccggccgcct gtccgtcgat gcaccgaaaa gggtgaagta gagaaataaa gtctccccgc 240 tgaactacta tgaggtcaga agccttgctg ctatatttca cactgctaca ctttgctggg 300 gctggtttcc cagaagattc tgagccaatc agtatttcgc atggcaacta tacaaaacag 360 tatccggtgt ttgtgggcca caagccagga cggaacacca cacagaggca caggctggac 420 atccagatga ttatgatcat gaacggaacc ctctacattg ctgctaggga ccatatttat 480 actgttgata tagacacatc acacacggaa gaaatttatt gtagcaaaaa actgacatgg 540 aaatctagac aggccgatgt agacacatgc agaatgaagg gaaaacataa ggatgagtgc 600 cacaacttta ttaaagttct tctaaagaaa aacgatgatg cattgtttgt ctgtggaact 660 aatgccttca acccttcctg cagaaactat aagatggata cattggaacc attcggggat 720 gaattcagcg gaatggccag atgcccatat gatgccaaac atgccaacgt tgcactgttt 780 gcagatggaa aactatactc agccacagtg actgacttcc ttgccattga cgcagtcatt 840 taccggagtc ttggagaaag ccctaccctg cggaccgtca agcacgattc aaaatggttg 900 aaagaaccat actttgttca agccgtggat tacggagatt atatctactt cttcttcagg 960 gaaatagcag tggagtataa caccatggga aaggtagttt tcccaagagt ggctcaggtt 1020 tgtaagaatg atatgggagg atctcaaaga gtcctggaga aacagtggac gtcgttcctg 1080 aaggcgcgct tgaactgctc agttcctgga gactctcatt tttatttcaa cattctccag 1140 gcagttacag atgtgattcg tatcaacggg cgtgatgttg tcctggcaac gttttctaca 1200 ccttataaca gcatccctgg gtctgcagtc tgtgcctatg acatgcttga cattgccagt 1260 gtttttactg ggagattcaa ggaacagaag tctcctgatt ccacctggac accagttcct 1320 gatgaacgag ttcctaagcc caggccaggt tgctgtgctg gctcatcctc cttagaaaga 1380 tatgcaacct ccaatgagtt ccctgatgat accctgaact tcatcaagac gcacccgctc 1440 atggatgagg cagtgccctc catcttcaac aggccatggt tcctgagaac aatggtcaga 1500 taccgcctta ccaaaattgc agtggacaca gctgctgggc catatcagaa tcacactgtg 1560 gtttttctgg gatcagagaa gggaatcatc ttgaagtttt tggccagaat aggaaatagt 1620 ggttttctaa atgacagcct tttcctggag gagatgagtg tttacaactc tgaaaaatgc 1680 agctatgatg gagtcgaaga caaaaggatc atgggcatgc agctggacag agcaagcagc 1740 tctctgtatg ttgcgttctc tacctgtgtg ataaaggttc cccttggccg gtgtgaacga 1800 catgggaagt gtaaaaaaac ctgtattgcc tccagagacc catattgtgg atggataaag 1860 gaaggtggtg cctgcagcca tttatcaccc aacagcagac tgacttttga gcaggacata 1920 gagcgtggca atacagatgg tctgggggac tgtcacaatt cctttgtggc actgaatgac 1980 atttcaactc ctctaccaga taatgaaatg tcttacaaca cagtgtatgg gcattccagt 2040 tccctcttgc ccagcacaac cacatcagat tcgacggctc aagaggggta tgagtctagg 2100 ggaggaatgc tggactggaa gcatctgctt gactcacctg acagcacaga ccctttgggg 2160 gcagtgtctt cccataatca ccaagacaag aagggagtga ttcgggaaag ttacctcaaa 2220 ggccacgacc agctggttcc cgtcaccctc ttggccattg cagtcatcct ggctttcgtc 2280 atgggggccg tcttctcggg catcaccgtc tactgcgtct gtgatcatcg gcgcaaagac 2340 gtggctgtgg tgcagcgcaa ggagaaggag ctcacccact cgcgccgggg ctccatgagc 2400 agcgtcacca agctcagcgg cctctttggg gacactcaat ccaaagaccc aaagccggag 2460 gccatcctca cgccactcat gcacaacggc aagctcgcca ctcccggcaa cacggccaag 2520 atgctcatta aagcagacca gcaccacctg gacctgacgg ccctccccac cccagagtca 2580 accccaacgc tgcagcagaa gcggaagccc agccgcggca gccgcgagtg ggagaggaac 2640 cagaacctca tcaatgcctg cacaaaggac atgcccccca tgggctcccc tgtgattccc 2700 acggacctgc ccctgcgggc ctcccccagc cacatcccca gcgtggtggt cctgcccatc 2760 acgcagcagg gctaccagca tgagtacgtg gaccagccca aaatgagcga ggtggcccag 2820 atggcgctgg aggaccaggc cgccacactg gagtataaga ccatcaagga acatctcagc 2880 agcaagagtc ccaaccatgg ggtgaacctt gtggagaacc tggacagcct gccccccaaa 2940 gttccacagc gggaggcctc cctgggtccc ccgggagcct ccctgtctca gaccggtcta 3000 agcaagcggc tggaaatgca ccactcctct tcctacgggg ttgactataa gaggagctac 3060 cccacgaact cgctcacgag aagccaccag gccaccactc tcaaaagaaa caacactaac 3120 tcctccaatt cctctcacct ctccagaaac cagagctttg gcaggggaga caacccgccg 3180 cccgccccgc agagggtgga ctccatccag gtgcacagct cccagccatc tggccaggcc 3240 gtgactgtct cgaggcagcc cagcctcaac gcctacaact cactgacaag gtcggggctg 3300 aagcgtacgc cctcgctaaa gccggacgta ccccccaaac catcctttgc tcccctttcc 3360 acatccatga agcccaatga tgcgtgtaca taatcccagg gggagggggt caggtgtcga 3420 accagcaggc aaggcgaggt gcccgctcag ctcagcaagg ttctcaactg cctcgagtac 3480 ccaccagacc aagaaggcct gcggcagagc cgaggacgct gggtcctcct ctctgggaca 3540 caggggtact cacgaaaact gggccgcgtg gtttggtgaa ggtttgcaac ggcggggact 3600 caccttcatt ctcttccttc actttccccc acaccctaca acaggtcgga cccacaaaag 3660 acttcagtta tcatcacaaa catgagccaa aagcacatac ctaccccatc ccccaccccc 3720 acacacacac acacatgcac acaacacata cacacacacg cacagaggtg aacagaaact 3780 gaaacatttt gtccacaact tcacgggacg tggccagact gggtttgcgt tccaacctgc 3840 aaaacacaaa tacatttttt aaaatcaaga aaatttaaaa agacaaaaaa aaaagaattc 3900 attgataatt ctaactcaga ctttaacaat ggcagaagtt tactatgcgc aaatactgtg 3960 aaatgcccgc cagtgttaca gctttctgtt gcagcagata aatgccatgt tgggcaacta 4020 tgtcatagat ttctgctcct cctctctttt aatgaaataa cgtgaccgtt aacgcaagta 4080 actctttatt tattgttcac cctttttttc cttaaggaaa ggactcttcc aaatatcatc 4140 ctatgaacag ctcttcagaa agcccattga aagttaaact atttaacgtg aaatccatta 4200 actggaataa ttgagtttct ttatttttac aataaattca ctgagtaaat 4250 <210> 31 <211> 2785 <212> DNA <213> human <400> 31 ctttagccca acagtcaaaa ataattgatg ctaccctaca aatgtccaaa actctagtat 60 atcatatttc taagttacag caaatattag tcctgctaaa ccagggagct ttggcaaaaa 120 tgttttttga cagtaaattt gtccttgatt atatattaac tagtcaaaga ggtgtttgta 180 acattattag agcttcttgt tgtaggtggg ttaacaccac caatcaagag gtcattctaa 240 cagaaagcct ggatcagaaa accatcaccc taaaaaaaca tgccttacat atttaacaca 300 ctctgaaatc cagtcaaaat atgactaaag gcccttgcca tgactgatgt attctcctgg 360 ccaacgccaa acaaatggga gcctggttac gagtcagcct tcagggactt gtcacatttc 420 tacttggttt cttccttgtt attgtcataa taaaatgttt tctatgctgt ttagtgcaac 480 ttaggcccta ttctgtagaa gtctcctcta ctattcaggc cactcaaaca ccccaaataa 540 ttgagttcaa aatcgacatc aagatataaa ggaatcagtg actaaatata tttcatatat 600 ggtattttta ttgattattg tgctgtcttg acctagtatg gaggccttgg ctagaggctg 660 gtcagtttcc tctcttgagc agctgattaa atccacaccc caaccacttc ccttatcagg 720 ttctcacact ctggggccac tatgtaccca ctctaatcac cacagggcca gacatcagac 780 aattaaggac agcgcccatg ccccaaagcc cgccaaaatt atgcaaatta ttcaaaatta 840 ttcaacctag ctaaccccac cctttttgct gtacataagc tgcccattcc ccctccagcc 900 tgtggtaccc agtcctcagg tgcaaccccc tgcgtggtcc tctgtggcag ccttctctca 960 ttcagagctg ttttccacag aggtagtgaa aagaactgga ttttcaagtt cactttgcaa 1020 gagaaaaaga aaactcagta gaagataatg gcaagtccag actggggata tgatgacaaa 1080 aatggtcctg aacaatggag caagctgtat cccattgcca atggaaataa ccaatcccct 1140 gttgatatta aaaccagtga aaccaaacat gacacctctc tgaaacctat tagtgtctcc 1200 tacaacccag ccacagccaa agaaattatc aatgtggggc attctttcca tgtaaatttt 1260 gaggacaacg ataaccgatc agtgctgaaa ggtggtcctt tctctgacag ctacaggctc 1320 tttcagtttc attttcactg gggcagtaca aatgagcatg gttcagaaca tacagtggat 1380 ggagtcaaat attctgccga gcttcacgta gctcactgga attctgcaaa gtactccagc 1440 cttgctgaag ctgcctcaaa ggctgatggt ttggcagtta ttggtgtttt gatgaaggtt 1500 ggtgaggcca acccaaagct gcagaaagta cttgatgccc tccaagcaat taaaaccaag 1560 ggcaaacgag ccccattcac aaattttgac ccctctactc tccttccttc atccctggat 1620 ttctggacct accctggctc tctgactcat cctcctcttt atgagagtgt aacttggatc 1680 atctgtaagg agagcatcag tgtcagctca gagcagctgg cacaattccg cagccttcta 1740 tcaaatgttg aaggtgataa cgctgtcccc atgcagcaca acaaccgccc aacccaacct 1800 ctgaagggca gaacagtgag agcttcattt tgatgattct gagaagaaac ttgtccttcc 1860 tcaagaacac agccctgctt ctgacataat ccagttaaaa taataatttt taagaaataa 1920 atttatttca atattagcaa gacagcatgc cttcaaatca atctgtaaaa ctaagaaact 1980 taaattttag ttcttactgc ttaattcaaa taataattag taagctagca aatagtaatc 2040 tgtaagcata agcttatctt aaattcaagt ttagtttgag gaattcttta aaattacaac 2100 taagtgattt gtatgtctat ttttttcagt ttatttgaac caataaaata attttatctc 2160 tttctttctg ttgtgcattc agtttctaaa accattaagt ttctactcca tttacattca 2220 aaaatcttaa atactttact tgcaagagta ttttgcttca aatacaacaa cctaagagca 2280 gctggagatg aaatattggg aaattcattt gcttactcct gaagacaaaa atatagctga 2340 gatgaccact ggatttaata tcgttatgct ggcccaacat tgctaccatt tgtgttgtct 2400 gtgatcaaaa tgattatctt ttatatagga agatgacgct tctggatatt gctttcactt 2460 cttctcccca cgttagcaag gacaatgctt ctctgccatt attacaacta gttagtttgc 2520 atggagaatc tttactttaa aattggaaga aaagtcacaa gtgaatggtt tataaaaatg 2580 ctaaagaagt cattcttgct tagaatcata tagaaacatc atgcaatctt ttagtcagat 2640 gtgcgcttca ccttatgcta tttttatctt taattgacac acaataattg tacatgttta 2700 tggagtatag tgtggtgttt tctgtttgtt tgtttgtttt ttgagacaag gtctcactct 2760 gccagtcagg gtggagtgcg atggt 2785 <210> 32 <211> 9588 <212> DNA <213> human <400> 32 ccgaccaaca ccaacaccca gctccgacgc agctcctctg cgcccttgcc gccctccgag 60 ccacagcttt cctcccgctc ctgcccccgg cccgtcgccg tctccgcgct cgcagcggcc 120 tcgggagggc ccaggtagcg agcagcgacc tcgcgagcct tccgcactcc cgcccggttc 180 cccggccgtc cgcctatcct tggccccctc cgctttctcc gcgccggccc gcctcgctta 240 tgcctcggcg ctgagccgct ctcccgattg cccgccgaca tgagctgcaa cggaggctcc 300 cacccgcgga tcaacactct gggccgcatg atccgcgccg agtctggccc ggacctgcgc 360 tacgaggtga ccagcggcgg cgggggcacc agcaggatgt actattctcg gcgcggcgtg 420 atcaccgacc agaactcgga cggctactgt caaaccggca cgatgtccag gcaccagaac 480 cagaacacca tccaggagct gctgcagaac tgctccgact gcttgatgcg agcagagctc 540 atcgtgcagc ctgaattgaa gtatggagat ggaatacaac tgactcggag tcgagaattg 600 gatgagtgtt ttgcccaggc caatgaccaa atggaaatcc tcgacagctt gatcagagag 660 atgcggcaga tgggccagcc ctgtgatgct taccagaaaa ggcttcttca gctccaagag 720 caaatgcgag ccctttataa agccatcagt gtccctcgag tccgcagggc cagctccaag 780 ggtggtggag gctacacttg tcagagtggc tctggctggg atgagttcac caaacatgtc 840 accagtgaat gtttggggtg gatgaggcag caaagggcgg agatggacat ggtggcctgg 900 ggtgtggacc tggcctcagt ggagcagcac attaacagcc accggggcat ccacaactcc 960 atcggcgact atcgctggca gctggacaaa atcaaagccg acctgcgcga gaaatctgcg 1020 atctaccagt tggaggagga gtatgaaaac ctgctgaaag cgtcctttga gaggatggat 1080 cacctgcgac agctgcagaa catcattcag gccacgtcca gggagatcat gtggatcaat 1140 gactgcgagg aggaggagct gctgtacgac tggagcgaca agaacaccaa catcgctcag 1200 aaacaggagg ccttctccat acgcatgagt caactggaag ttaaagaaaa agagctcaat 1260 aagctgaaac aagaaagtga ccaacttgtc ctcaatcagc atccagcttc agacaaaatt 1320 gaggcctata tggacactct gcagacgcag tggagttgga ttcttcagat caccaagtgc 1380 attgatgttc atctgaaaga aaatgctgcc tactttcagt tttttgaaga ggcgcagtct 1440 actgaagcat acctgaaggg gctccaggac tccatcagga agaagtaccc ctgcgacaag 1500 aacatgcccc tgcagcacct gctggaacag atcaaggagc tggagaaaga acgagagaaa 1560 atccttgaat acaagcgtca ggtgcagaac ttggtaaaca agtctaagaa gattgtacag 1620 ctgaagcctc gtaacccaga ctacagaagc aataaaccca ttattctcag agctctctgt 1680 gactacaaac aagatcagaa aatcgtgcat aagggggatg agtgtatcct gaaggacaac 1740 aacgagcgca gcaagtggta cgtgacgggc ccgggaggcg ttgacatgct tgttccctct 1800 gtggggctga tcatccctcc tccgaaccca ctggccgtgg acctctcttg caagattgag 1860 cagtactacg aagccatctt ggctctgtgg aaccagctct acatcaacat gaagagcctg 1920 gtgtcctggc actactgcat gattgacata gagaagatca gggccatgac aatcgccaag 1980 ctgaaaacaa tgcggcagga agattacatg aagacgatag ccgaccttga gttacattac 2040 caagagttca tcagaaatag ccaaggctca gagatgtttg gagatgatga caagcggaaa 2100 atacagtctc agttcaccga tgcccagaag cattaccaga ccctggtcat tcagctccct 2160 ggctatcccc agcaccagac agtgaccaca actgaaatca ctcatcatgg aacctgccaa 2220 gatgtcaacc ataataaagt aattgaaacc aacagagaaa atgacaagca agaaacatgg 2280 atgctgatgg agctgcagaa gattcgcagg cagatagagc actgcgaggg caggatgact 2340 ctcaaaaacc tccctctagc agaccagggg tcttctcacc acatcacagt gaaaattaac 2400 gagcttaaga gtgtgcagaa tgattcacaa gcaattgctg aggttctcaa ccagcttaaa 2460 gatatgcttg ccaacttcag aggttctgaa aagtactgct atttacagaa tgaagtattt 2520 ggactatttc agaaactgga aaatatcaat ggtgttacag atggctactt aaatagctta 2580 tgcacagtaa gggcactgct ccaggctatt ctccaaacag aagacatgtt aaaggtttat 2640 gaagccaggc tcactgagga ggaaactgtc tgcctggacc tggataaagt ggaagcttac 2700 cgctgtggac tgaagaaaat aaaaaatgac ttgaacttga agaagtcgtt gttggccact 2760 atgaagacag aactacagaa agcccagcag atccactctc agacttcaca gcagtatcca 2820 ctttatgatc tggacttggg caagttcggt gaaaaagtca cacagctgac agaccgctgg 2880 caaaggatag ataaacagat cgactttaga ttatgggacc tggagaaaca aatcaagcaa 2940 ttgaggaatt atcgtgataa ctatcaggct ttctgcaagt ggctctatga tcgtaaacgc 3000 cgccaggatt ccttagaatc catgaaattt ggagattcca acacagtcat gcggtttttg 3060 aatgagcaga agaacttgca cagtgaaata tctggcaaac gagacaaatc agaggaagta 3120 caaaaaattg ctgaactttg cgccaattca attaaggatt atgagctcca gctggcctca 3180 tacacctcag gactggaaac tctgctgaac atacctatca agaggaccat gattcagtcc 3240 ccttctgggg tgattctgca agaggctgca gatgttcatg ctcggtacat tgaactactt 3300 acaagatctg gagactatta caggttctta agtgagatgc tgaagagttt ggaagatctg 3360 aagctgaaaa ataccaagat cgaagttttg gaagaggagc tcagactggc ccgagatgcc 3420 aactcggaaa actgtaataa gaacaaattc ctggatcaga acctgcagaa ataccaggca 3480 gagtgttccc agttcaaagc gaagcttgcg agcctggagg agctgaagag acaggctgag 3540 ctggatggga agtcggctaa gcaaaatcta gacaagtgct acggccaaat aaaagaactc 3600 aatgagaaga tcacccgact gacttatgag attgaagatg aaaagagaag aagaaaatct 3660 gtggaagaca gatttgacca acagaagaat gactatgacc aactgcagaa agcaaggcaa 3720 tgtgaaaagg agaaccttgg ttggcagaaa ttagagtctg agaaagccat caaggagaag 3780 gagtacgaga ttgaaaggtt gagggttcta ctgcaggaag aaggcacccg gaagagagaa 3840 tatgaaaatg agctggcaaa ggtaagaaac cactataatg aggagatgag taatttaagg 3900 aacaagtatg aaacagagat taacattacg aagaccacca tcaaggagat atccatgcaa 3960 aaagaggatg attccaaaaa tcttagaaac cagcttgata gactttcaag ggaaaatcga 4020 gatctgaagg atgaaattgt caggctcaat gacagcatct tgcaggccac tgagcagcga 4080 aggcgagctg aagaaaacgc ccttcagcaa aaggcctgtg gctctgagat aatgcagaag 4140 aagcagcatc tggagataga actgaagcag gtcatgcagc agcgctctga ggacaatgcc 4200 cggcacaagc agtccctgga ggaggctgcc aagaccattc aggacaaaaa taaggagatc 4260 gagagactca aagctgagtt tcaggaggag gccaagcgcc gctgggaata tgaaaatgaa 4320 ctgagtaagg taagaaacaa ttatgatgag gagatcatta gcttaaaaaa tcagtttgag 4380 accgagatca acatcaccaa gaccaccatc caccagctca ccatgcagaa ggaagaggat 4440 accagtggct accgggctca gatagacaat ctcacccgag aaaacaggag cttatctgaa 4500 gaaataaaga ggctgaagaa cactctaacc cagaccacag agaatctcag gagggtggaa 4560 gaagacatcc aacagcaaaa ggccactggc tctgaggtgt ctcagaggaa acagcagctg 4620 gaggttgagc tgagacaagt cactcagatg cgaacagagg agagcgtaag atataagcaa 4680 tctcttgatg atgctgccaa aaccatccag gataaaaaca aggagataga aaggttaaaa 4740 caactgatcg acaaagaaac aaatgaccgg aaatgcctgg aagatgaaaa cgcgagatta 4800 caaagggtcc agtatgacct gcagaaagca aacagtagtg cgacggagac aataaacaaa 4860 ctgaaggttc aggagcaaga actgacacgc ctgaggatcg actatgaaag ggtttcccag 4920 gagaggactg tgaaggacca ggatatcacg cggttccaga actctctgaa agagctgcag 4980 ctgcagaagc agaaggtgga agaggagctg aatcggctga agaggaccgc gtcagaagac 5040 tcctgcaaga ggaagaagct ggaggaagag ctggaaggca tgaggaggtc gctgaaggag 5100 caagccatca aaatcaccaa cctgacccag cagctggagc aggcatccat tgttaagaag 5160 aggagtgagg atgacctccg gcagcagagg gacgtgctgg atggccacct gagggaaaag 5220 cagaggaccc aggaagagct gaggaggctc tcttctgagg tcgaggccct gaggcggcag 5280 ttactccagg aacaggaaag tgtcaaacaa gctcacttga ggaatgagca tttccagaag 5340 gcgatagaag ataaaagcag aagcttaaat gaaagcaaaa tagaaattga gaggctgcag 5400 tctctcacag agaacctgac caaggagcac ttgatgttag aagaagaact gcggaacctg 5460 aggctggagt acgatgacct gaggagagga cgaagcgaag cggacagtga taaaaatgca 5520 accatcttgg aactaaggag ccagctgcag atcagcaaca accggaccct ggaactgcag 5580 gggctgatta atgatttaca gagagagagg gaaaatttga gacaggaaat tgagaaattc 5640 caaaagcagg ctttagaggc atctaatagg attcaggaat caaagaatca gtgtactcag 5700 gtggtacagg aaagagagag ccttctggtg aaaatcaaag tcctggagca agacaaggca 5760 aggctgcaga ggctggagga tgagctgaat cgtgcaaaat caactctaga ggcagaaacc 5820 agggtgaaac agcgcctgga gtgtgagaaa cagcaaattc agaatgacct gaatcagtgg 5880 aagactcaat attcccgcaa ggaggaggct attaggaaga tagaatcgga aagagaaaag 5940 agtgagagag agaagaacag tcttaggagt gagatcgaaa gactccaagc agagatcaag 6000 agaattgaag agaggtgcag gcgtaagctg gaggattcta ccagggagac acagtcacag 6060 ttagaaacag aacgctcccg atatcagagg gagattgata aactcagaca gcgcccatat 6120 gggtcccatc gagagaccca gactgagtgt gagtggaccg ttgacacctc caagctggtg 6180 tttgatgggc tgaggaagaa ggtgacagca atgcagctct atgagtgtca gctgatcgac 6240 aaaacaacct tggacaaact attgaagggg aagaagtcag tggaagaagt tgcttctgaa 6300 atccagccat tccttcgggg tgcaggatct atcgctggag catctgcttc tcctaaggaa 6360 aaatactctt tggtagaggc caagagaaag aaattaatca gcccagaatc cacagtcatg 6420 cttctggagg cccaggcagc tacaggtggt ataattgatc cccatcggaa tgagaagctg 6480 actgtcgaca gtgccatagc tcgggacctc attgacttcg atgaccgtca gcagatatat 6540 gcagcagaaa aagctatcac tggttttgat gatccatttt caggcaagac agtatctgtt 6600 tcagaagcca tcaagaaaaa tttgattgat agagaaaccg gaatgcgcct gctggaagcc 6660 cagattgctt cagggggtgt agtagaccct gtgaacagtg tctttttgcc aaaagatgtc 6720 gccttggccc gggggctgat tgatagagat ttgtatcgat ccctgaatga tccccgagat 6780 agtcagaaaa actttgtgga tccagtcacc aaaaagaagg tcagttacgt gcagctgaag 6840 gaacggtgca gaatcgaacc acatactggt ctgctcttgc tttcagtaca gaagagaagc 6900 atgtccttcc aaggaatcag acaacctgtg accgtcactg agctagtaga ttctggtata 6960 ttgagaccgt ccactgtcaa tgaactggaa tctggtcaga tttcttatga cgaggttggt 7020 gagagaatta aggacttcct ccagggttca agctgcatag caggcatata caatgagacc 7080 acaaaacaga agcttggcat ttatgaggcc atgaaaattg gcttagtccg acctggtact 7140 gctctggagt tgctggaagc ccaagcagct actggcttta tagtggatcc tgttagcaac 7200 ttgaggttac cagtggagga agcctacaag agaggtctgg tgggcattga gttcaaagag 7260 aagctcctgt ctgcagaacg agctgtcact gggtataatg atcctgaaac aggaaacatc 7320 atctctttgt tccaagccat gaataaggaa ctcatcgaaa agggccacgg tattcgctta 7380 ttagaagcac agatcgcaac cggggggatc attgacccaa aggagagcca tcgtttacca 7440 gttgacatag catataagag gggctatttc aatgaggaac tcagtgagat tctctcagat 7500 ccaagtgatg ataccaaagg attttttgac cccaacactg aagaaaatct tacctatctg 7560 caactaaaag aaagatgcat taaggatgag gaaacagggc tctgtcttct gcctctgaaa 7620 gaaaagaaga aacaggtgca gacatcacaa aagaataccc tcaggaagcg tagagtggtc 7680 atagttgacc cagaaaccaa taaagaaatg tctgttcagg aggcctacaa gaagggccta 7740 attgattatg aaaccttcaa agaactgtgt gagcaggaat gtgaatggga agaaataacc 7800 atcacgggat cagatggctc caccagggtg gtcctggtag atagaaagac aggcagtcag 7860 tatgatattc aagatgctat tgacaagggc cttgttgaca ggaagttctt tgatcagtac 7920 cgatccggca gcctcagcct cactcaattt gctgacatga tctccttgaa aaatggtgtc 7980 ggcaccagca gcagcatggg cagtggtgtc agcgatgatg tttttagcag ctcccgacat 8040 gaatcagtaa gtaagatttc caccatatcc agcgtcagga atttaaccat aaggagcagc 8100 tctttttcag acaccctgga agaatcgagc cccattgcag ccatctttga cacagaaaac 8160 ctggagaaaa tctccattac agaaggtata gagcggggca tcgttgacag catcacgggt 8220 cagaggcttc tggaggctca ggcctgcaca ggtggcatca tccacccaac cacgggccag 8280 aagctgtcac ttcaggacgc agtctcccag ggtgtgattg accaagacat ggccaccagc 8340 gtgaagcctg ctcagaaagc cttcataggc ttcgagggtg tgaagggaaa gaagaagatg 8400 tcagcagcag aggcagtgaa agaaaaatgg ctcccgtatg aggctggcca gcgcttcctg 8460 gagttccagt acctcacggg aggtcttgtt gacccggaag tgcatgggag gataagcacc 8520 gaagaagcca tccggaaggg gttcatagat ggccgcgccg cacagaggct gcaagacacc 8580 agcagctatg ccaaaatcct gacctgcccc aaaaccaaat taaaaatatc ctataaggat 8640 gccataaatc gctccatggt agaagatatc actgggctgc gccttctgga agccgcctcc 8700 gtgtcgtcca agggcttacc cagcccttac aacatgtctt cggctccggg gtcccgctcc 8760 ggctcccgct cgggatctcg ctccggatct cgctccgggt cccgcagtgg gtcccggaga 8820 ggaagctttg acgccacagg gaattcttcc tactcttatt cctactcatt tagcagtagt 8880 tctattgggc actagtagtc agttgggagt ggttgctata ccttgacttc atttatatga 8940 atttccactt tattaaataa tagaaaagaa aatcccggtg cttgcagtag agtgatagga 9000 cattctatgc ttacagaaaa tatagccatg attgaaatca aatagtaaag gctgttctgg 9060 ctttttatct tcttagctca tcttaaataa gcagtacact tggatgcagt gcgtctgaag 9120 tgctaatcag ttgtaacaat agcacaaatc gaacttagga tttgtttctt ctcttctgtg 9180 tttcgatttt tgatcaattc tttaattttg gaagcctata atacagtttt ctattcttgg 9240 agataaaaat taaatggatc actgatattt tagtcattct gcttctcatc taaatatttc 9300 catattctgt attaggagaa aattaccctc ccagcaccag cccccctctc aaacccccaa 9360 cccaaaacca agcattttgg aatgagtctc ctttagtttc agagtgtgga ttgtataacc 9420 catatactct tcgatgtact tgtttggttt ggtattaatt tgactgtgca tgacagcggc 9480 aatcttttct ttggtcaaag ttttctgttt attttgcttg tcatattcga tgtactttaa 9540 ggtgtcttta tgaagtttgc tattctggca ataaactttt agactttt 9588 <210> 33 <211> 366 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (351)..(351) <223> any kind of base <400> 33 gaagtgccat ttatatttat acaaaaatat tacataattc agttagtatt ggtgacataa 60 tttagttagt atgggtgata taatggtcat aatttttagc atctaataaa gatcttttta 120 tgagtcccat ataaaatatg tgaacaaagc aatcttgtca taagatttgt gatgatttag 180 gagaaagtac tttgagataa tttttttctg tctctttgtg aactctctca acagtagttc 240 tctttagatt agagccagca ggtcggccat aacagttttc ttcaaatttg ggcaacagtt 300 atacaaatgc ttgaatttca agacaacata ttaaagggtc tatgaactgg naatctaacc 360 tgggtt 366 <210> 34 <211> 1466 <212> DNA <213> human <400> 34 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtgtc accatgtggg tcccggttgt 60 cttcctcacc ctgtccgtga cgtggattgg tgctgcaccc ctcatcctgt ctcggattgt 120 gggaggctgg gagtgcgaga agcattccca accctggcag gtgcttgtgg cctctcgtgg 180 cagggcagtc tgcggcggtg ttctggtgca cccccagtgg gtcctcacag ctgcccactg 240 catcaggaac aaaagcgtga tcttgctggg tcggcacagc ctgtttcatc ctgaagacac 300 aggccaggta tttcaggtca gccacagctt cccacacccg ctctacgata tgagcctcct 360 gaagaatcga ttcctcaggc caggtgatga ctccagccac gacctcatgc tgctccgcct 420 gtcagagcct gccgagctca cggatgctgt gaaggtcatg gacctgccca cccaggagcc 480 agcactgggg accacctgct acgcctcagg ctggggcagc attgaaccag aggagttctt 540 gaccccaaag aaacttcagt gtgtggacct ccatgttatt tccaatgacg tgtgtgcgca 600 agttcaccct cagaaggtga ccaagttcat gctgtgtgct ggacgctgga cagggggcaa 660 aagcacctgc tcgggtgatt ctgggggccc acttgtctgt aatggtgtgc ttcaaggtat 720 cacgtcatgg ggcagtgaac catgtgccct gcccgaaagg ccttccctgt acaccaaggt 780 ggtgcattac cggaagtgga tcaaggacac catcgtggcc aacccctgag cacccctatc 840 aaccccctat tgtagtaaac ttggaacctt ggaaatgacc aggccaagac tcaagcctcc 900 ccagttctac tgacctttgt ccttaggtgt gaggtccagg gttgctagga aaagaaatca 960 gcagacacag gtgtagacca gagtgtttct taaatggtgt aattttgtcc tctctgtgtc 1020 ctggggaata ctggccatgc ctggagacat atcactcaat ttctctgagg acacagatag 1080 gatggggtgt ctgtgttatt tgtggggtac agagatgaaa gaggggtggg atccacactg 1140 agagagtgga gagtgacatg tgctggacac tgtccatgaa gcactgagca gaagctggag 1200 gcacaacgca ccagacactc acagcaagga tggagctgaa aacataaccc actctgtcct 1260 ggaggcactg ggaagcctag agaaggctgt gagccaagga gggagggtct tcctttggca 1320 tgggatgggg atgaagtaag gagagggact ggaccccctg gaagctgatt cactatgggg 1380 ggaggtgtat tgaagtcctc cagacaaccc tcagatttga tgatttccta gtagaactca 1440 cagaaataaa gagctgttat actgtg 1466 <210> 35 <211> 187 <212> DNA <213> human <400> 35 gatctggtgc attccggtcg acactctcgt ttatttggac tgtaagtctg acctctatga 60 ataattactt cagcccctga gtgctcccgg gccaagctcc ttggccaaac tttcacctta 120 gcttctgata agtcttgggc caagctaagc agcatctatc aatcatccct tcagctcctg 180 attgatc 187 <210> 36 <211> 2913 <212> DNA <213> human <400> 36 actgggtacc gaggactggg tgtgtttaag gcagacagcc aggtgaggat cccagctact 60 ggggcctgct gtcatctcct gggagtaccc gggggtcagg agcctagggg actcttgcac 120 ttcacatcca gccatgctaa ttacactttt tggcaaagga aacagctagg agcagtttct 180 ttcactccta cagccccgtt ttctcagtgt ttagacctcg aattattact gggctagagg 240 gaaggcagcc tctgaagtgt ggcaggagga ggggaagtct gcctgcatct tggtgtgtct 300 gtcagatgcc agcactaata acctggcttc tgtgaggcct gtcagtgctc tcaggaatga 360 aaggggaccc ctgagaggtg ctcagtacca gcaggctgtg aatgctctct acccaccacc 420 ctcacctcct cgttaaagat ggtgctacct gccacacagc agacatctgg tcgctgcaca 480 cccgaaagac cccaaggcag tctgcccctt gtccagccac acgccagcac ccaccctcct 540 ggcccctgcc tcggcctccc cagaccagct gcacccagcc cccaacacgc accccttctc 600 cagatgtgtg cagggcctca ttttgcagag caaagacaga tgtttcagcc acacgcttta 660 ttaacttcta aaacctgtgc tcaggacact cttcaacagt catgaaaagt ttgatcactt 720 gccacagtca ggacctttgt gtggggctct gatctgatgt tcggtctcat catctcccaa 780 accagcagtc gtttgtaccc caaccctctg ctcaggggct cataccccca aatgattttc 840 ctgatttatg tatttcccta caaagggctt tctataccta gcatctgcct ccagcatgag 900 aagggggaat aggtgagacc catttgccag tagcagacgg ggaccctggg gagaaaatgg 960 cagagcctgt tggagactcc ctgtctccag ctgaccagcc aatgggattc ctcttccctc 1020 cactgtctcc cacaaagtag aagaatcctg gtacatttag cccatgagcc tggcacagat 1080 ccctatctag acatgaggcc ctttagacat gactttggca ttgaccagcc tgttggcaat 1140 gggtcgggga ggcagagggg atgctcacac cagtaattct catcccctga atgcttggga 1200 tcacctgggg agagttcaca aaatactggt gcaggggtcc cacctctgat gatgctgagt 1260 ggtgggtctg gggtgtggcc caggcatcat gatgtttcag gcccccaggt gacttcttag 1320 gcagcccagc taagccccta gagccttgca atttccccca aatgacctca gagggcccga 1380 tttgagggaa atgcctaact tcaggggccg taagaatccc ccagggagca tgtgaaatgc 1440 agataccagg cccaccccca gagatgagct gaggtgggtc aggggtgaag tgcagggatc 1500 agtgtttttc acaagctcca tacctccagg aaatggtgtt gtggttgggc ccgtagaaaa 1560 cattctgaga gtcctgttgc ctgtgccttg gtgcacgtgg ggtggaatcc cagtggccct 1620 gccttgagga ggatgtgcat taacgtggta ggggagacag agacagctcc acctgccccc 1680 tgtcccaccg gggacctcca aaaacttcat ggatgttaga gcaagcagcc atgctgcagc 1740 agaggatgag gctggcggat ttagtaagag ccctctgtgt ttgggctgag ttctttctct 1800 agttgccctg tcatctggcc tctggataac ccacctctcc tccctcatcc taaaattaca 1860 gatggcgaaa gacggccaca tttagtgaga cccctaaggt cctccaacta gggtgggtcc 1920 acagtggccc ctggtgcatg gaccacacac tctcttccct cctctggctc aggactacgg 1980 tctgaaatta gggagatatg aatgtctttc ttgaaaactt ctcttcccag tcttcccact 2040 ttgcttgggg gtccttggtc aaggccagct ttggactagg gcttgttgcg actaccagct 2100 gtctcatttt gctgtactgc aaactcaggc ttggttccaa gcttatgggg gccctgtcct 2160 tcccctagta gggtttgttt tggggtcaca tctggtcata cccttcagag agctcttccc 2220 cagcctctac atcagggaga gaggtaggta gggaggagca ttcaaggatt agaagaagga 2280 ctaaagtaca acagccttgg aggaactgcc aggaactaag ggcgagcact ggagaaggca 2340 acctgggacc ccctgcgctt ctgagcagga agaccaagac cttcaggggc cctaagcact 2400 gaaaacatca ttcctcatcc ccaagccctg gcatccccct gttcttctaa aataattctt 2460 ttctaggtat ttctgattgc aaaattctgg atgggttcat ccaagctgac ctttgctgtt 2520 ttttcccttc ccaacaaggc ctcacttttt ggagccacct tagttggtgc ctaggcagag 2580 gggcagtcag cagtggttat caggatcctg gctctatggg ttgccttcct cctggtctgt 2640 aaagcccctg caggcaggga cttcttagat agctgcttcc ttagggcatg gcatgtggtg 2700 ggtggttaat gaatggaaga gagggaatga gtgatcaagg gagggaggag ggagtggagt 2760 ggagatttct catcctttcc tgttaattta tgacatcctc ctgcctatga gtccttgact 2820 ctggagtttt acaaagcagt cacatttcaa ataaaagtct gggaaagcaa cacatcatcg 2880 ccaactttta attttgctaa ataaggatat tag 2913 <210> 37 <211> 1466 <212> DNA <213> human <400> 37 agccccaagc ttaccacctg cacccggaga gctgtgtgtc accatgtggg tcccggttgt 60 cttcctcacc ctgtccgtga cgtggattgg tgctgcaccc ctcatcctgt ctcggattgt 120 gggaggctgg gagtgcgaga agcattccca accctggcag gtgcttgtgg cctctcgtgg 180 cagggcagtc tgcggcggtg ttctggtgca cccccagtgg gtcctcacag ctgcccactg 240 catcaggaac aaaagcgtga tcttgctggg tcggcacagc ctgtttcatc ctgaagacac 300 aggccaggta tttcaggtca gccacagctt cccacacccg ctctacgata tgagcctcct 360 gaagaatcga ttcctcaggc caggtgatga ctccagccac gacctcatgc tgctccgcct 420 gtcagagcct gccgagctca cggatgctgt gaaggtcatg gacctgccca cccaggagcc 480 agcactgggg accacctgct acgcctcagg ctggggcagc attgaaccag aggagttctt 540 gaccccaaag aaacttcagt gtgtggacct ccatgttatt tccaatgacg tgtgtgcgca 600 agttcaccct cagaaggtga ccaagttcat gctgtgtgct ggacgctgga cagggggcaa 660 aagcacctgc tcgggtgatt ctgggggccc acttgtctgt aatggtgtgc ttcaaggtat 720 cacgtcatgg ggcagtgaac catgtgccct gcccgaaagg ccttccctgt acaccaaggt 780 ggtgcattac cggaagtgga tcaaggacac catcgtggcc aacccctgag cacccctatc 840 aaccccctat tgtagtaaac ttggaacctt ggaaatgacc aggccaagac tcaagcctcc 900 ccagttctac tgacctttgt ccttaggtgt gaggtccagg gttgctagga aaagaaatca 960 gcagacacag gtgtagacca gagtgtttct taaatggtgt aattttgtcc tctctgtgtc 1020 ctggggaata ctggccatgc ctggagacat atcactcaat ttctctgagg acacagatag 1080 gatggggtgt ctgtgttatt tgtggggtac agagatgaaa gaggggtggg atccacactg 1140 agagagtgga gagtgacatg tgctggacac tgtccatgaa gcactgagca gaagctggag 1200 gcacaacgca ccagacactc acagcaagga tggagctgaa aacataaccc actctgtcct 1260 ggaggcactg ggaagcctag agaaggctgt gagccaagga gggagggtct tcctttggca 1320 tgggatgggg atgaagtaag gagagggact ggaccccctg gaagctgatt cactatgggg 1380 ggaggtgtat tgaagtcctc cagacaaccc tcagatttga tgatttccta gtagaactca 1440 cagaaataaa gagctgttat actgtg 1466 <210> 38 <211> 462 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (197)..(197) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (116)..(116) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (334)..(334) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (402)..(402) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (429)..(429) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (438)..(438) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (443)..(443) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (459)..(459) <223> any kind of base <400> 38 taaggtttta taattatttt tatttttctt ttcttttttt tttatggctt ggatgacact 60 ttattttcag atccaatact agaagttgtt tccatgttca cattttcctt cctggnttaa 120 aaaaaagagt tgtatttttt ttttttgctt tttttaaatt atactttaag ttttagggta 180 catgtgcaca acgcagnggt tagctacata tgtatacatg tgccatgttg gcgtgctgca 240 tccagtaact cgtcatttaa cattaggtat atctccaaat gctatccttc cccccattgt 300 atttttcata gcttaaaaat cattgacata ggantaattc caactaaagt acggtattaa 360 atccctgggg gaataaattt tgtcttaaca agggtaaggt tngtgaaaag gatggttttg 420 tcacagggna aaaggganat ccncccattt taaaacccnc ct 462 <210> 39 <211> 1490 <212> DNA <213> human <400> 39 ctcgtgcccc ccacggaggg gactgctctc ccccgctgca tcctttctgt gaggtacctt 60 acccacctca gcacctgaga gggtgaaata gaattctaac ctcgacattc gggaagtgtt 120 tttgagaagt ctcggtcggt aagggaagtc ttccaagtcc gtgcagcact aacgtattgg 180 cacctgcctc ctcttcggcc accccccaga tgaggcagct gtgactgtgt caagggaagc 240 cacgactctg accatagtct tctctcagct tccactgccg tctccacagg aaacccagaa 300 gttctgtgaa caagtccatg ctgccatcaa ggcatttatt gcagtgtact atttgcttcc 360 aaaggatcag gggatcaccc tgagaaagct ggtacggggc gccaccctgg acatcgtgga 420 tggcatggct cagctcatgg aagtactttc cgtcactcca actcagagcc ctgagaacaa 480 tgaccttatt tcctacaaca gtgtctgggt tgcgtgccag cagatgcctc agataccaag 540 agataacaaa gctgcagctc ttttgatgct gaccaagaat gtggattttg tgaaggatgc 600 acatgaagaa atggagcagg ctgtggaaga atgtgaccct tactctggcc tcttgaatga 660 tactgaggag aacaactctg acaaccacaa tcatgaggat gatgtgttgg ggtttcccag 720 caatcaggac ttgtattggt cagaggacga tcaagagctc ataatcccat gccttgcgct 780 ggtgagagca tccaaagcct gcctgaagaa aattcggatg ttagtggcag agaatgggaa 840 gaaggatcag gtggcacagc tggatgacat tgtggatatt tctgatgaaa tcagccctag 900 tgtggatgat ttggctctga gcatatatcc acctatgtgt cacctgaccg tgcgaatcaa 960 ttctgcgaaa cttgtatctg ttttaaagaa ggcacttgaa attacaaaag caagtcatgt 1020 gacccctcag ccagaagata gttggatccc tttacttatt aatgccattg atcattgcat 1080 gaatagaatc aaggagctca ctcagagtga acttgaatta tgacttttca ggctcatttg 1140 tactctcttc ccctctcatc gtcatggtca ggctctgata cctgctttta aaatggagct 1200 agaatgcttg ctggattgaa agggagtgcc tatctatatt tagcaagaga cactattacc 1260 aaagattgtt ggttaggcca gattgacacc tatttataaa ccatatgcgt atatttttct 1320 gtgctatata tgaaaaataa ttgcatgatt tctcattcct gagtcatttc tcagagattc 1380 ctaggaaagc tgccttattc tctttttgca gtaaagtatg ttgttttcat tgtaaagatg 1440 ttgatggtct caataaaatg ctaacttgcc agtgattaaa aaaaaaaaaa 1490 <210> 40 <211> 1677 <212> DNA <213> human <400> 40 cttgacccta tttatagtgg ctctaaaggt ggtgttatta tgttttctag agcacttcga 60 ttatacaaac gtcaaggaat ccgagttaat gtgctttgcc ctgagtttgt tgaaacagac 120 atgggcacaa tgatcggtcc caaattcctt agtatgatgg ggggctttgt acctatggaa 180 atggtggtga aaggtgcttt tgagctcatc actgatgaga ataaagccgg cgattgccta 240 tggattacta atcggcgagg tcttgagtac tggcccaccc catcagaaga agcaaagtac 300 ttgctgcgtt ctacacgttc caggagaaga actgaataca aagctccacc aattaaacta 360 cctgagagtt ttgagaaaat agttgttcag accttgactc acaactttcg gaatgctacc 420 agtgtagtaa gagcaccact gagattacct atcaaaccaa actatgttct tgtgaagata 480 atctatgctg gtgtaaatgc tagtgatgta aattttagct caggtcgcta ttttggtggc 540 aataacagtg acactgcatc ccgtcttccg tttgatgcag gatttgaggc tgtgggagta 600 attgcagcag ttggggattc tgttactgac ttgaaagttg gcatgccttg tgcgttcatg 660 acttttggag gctatgctga atttacaatg attccttcga aatacgccct tccaatgcct 720 agaccagaac cggaaggtgt tgccatgctt acatcaggat taacagcttc aattgctcta 780 gaaaaggcag gacagatgga atctggaaaa gtggtccttg ttactgctgc ggcaggagga 840 actggtcagt ttgctgttca gcttgcaaaa ttagctggta ataccgtggt tgccacttgt 900 ggaggtgggg caaaggccaa gcttctgaaa gaattgggag tcgacagagt catagactat 960 cacagtgaag atataaaaac ggttctaagg aaagagttcc cgaaaggtat tgatatcatc 1020 tacgaatctg ttggtgggga catgttaaag ttgtgcttgg atgctttggc agtccatgga 1080 cgactcattg tcattggcat gatttctcag tatcaaggag aaaatggttg gacgccatca 1140 aaatatcctg gactatgtga gaagctcttg tcaaagagtc aaactgtggc tggctttttc 1200 ctggtgcaat atagtcacat gtaccaagaa caccttaaca agttatttga cctttactct 1260 tccggaaaac taaaggttgc tgtggatcca aagagattta taggccttca ttctgttgct 1320 gatgctgttg agtatctcca ttcaggcaaa agcgttggga aggtggttgt ctgcgtggac 1380 ccgaccttcg gtcatcaagt agccaaatta tgaatgaaca cggtgtcaaa tacagaaaga 1440 agtgaagttt tcaattctta gtctagagat tgttctcgaa tgttactgaa aatagctgct 1500 agaccagtgc tggaatattt attctcaatg ctttttcaat tttggattac ttgaaagaat 1560 aatccattta tgtataccat gtttatgttt acactataca acaactatga gcagaagaaa 1620 gcgagatatc tacaaaataa attataatcc tttcatttta aaaaaaaaaa aaaaaaa 1677 <210> 41 <211> 1330 <212> DNA <213> human <400> 41 atggcgcagt gggacagctt cactgatcaa caggaggaca ctgatagctg ttcagaatct 60 gtgaagtttg atgctcgctc caatacagct ttgcttcccc caaatcctaa aaatggccct 120 ccacttcaag aaaagctgaa atccttcaaa gctgcactga ttgcccttta tctccttgtg 180 tttgctgttc tcattcctat catcgcaata atggcagctc aactcctgaa gtgggaaatg 240 aagaattgca cagttggttc aattaatgca aacagtgtat cctccagtct cctgggaaga 300 ggaaatgaca gtgaagatga agtgagattt cgagaagttg ttatggaaca cattagcaag 360 atggagaaaa gaatccaata tatttcagat actgaagaaa atctcgtaga ttcagagcat 420 tttcaaaatt tcagtgtgac aactgatcaa cgatttgctg atgttcttct ccaactaagt 480 accttggttc ccacagtcca gggacatggg aatgccgtag atgaaatcac caggtcctta 540 ataagtctga ataccacgct gcttgatttg cacctctatg tagaaacact gaatgtcaaa 600 ttccaggaga atacacttaa agggcaagag gaaatcagca aattaaagga gcgtgtgcac 660 aatgcatcag cagaaattat gtctatgaaa gaagaacaag tgcatttgga acaggaaata 720 aaaagagaag tgaaagtcct gaataacatc actaatgatc tcaggctgaa agattgggaa 780 cattctcaga cgttgagaaa tatcacttta attcaaggtc ctcctggacc cccaggagaa 840 aaaggagata gaggtccaac cggagaaagt ggtccaccag gcgttccagg tccagtaggt 900 cctccaggtc ttaagggtga tcgaggatct attggctttc cgggaagtcg aggatatcca 960 ggacaatcag ggaagactgg gaggacagga tatcctggac caaaaggcca aaagggagaa 1020 aaaggcagtg gaagcatcct gactccttct gcgactgtcc gactggttgg tggccgtggc 1080 cctcatgagg gtagagtgga gatattgcac aatggacagt ggggcacagt ttgtgatgat 1140 cactgggaac tgcgtgccgg gcaggttgtc tgcaggagct tgggataccg aggtgttaag 1200 agtgtgcaca agaaagctta ttttggacaa ggtactggtc ccatttggct gaatgaagta 1260 ccctgtttgg ggatggagtc atccattgaa gagtgcaaaa tcagacagtg gggcgtgaga 1320 gtctgttcac 1330 <210> 42 <211> 431 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (97)..(97) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (347)..(347) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (349)..(349) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (361)..(361) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (362)..(362) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (363)..(363) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (401)..(401) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (428)..(428) <223> any kind of base <400> 42 ctttttatat ttattttcat cgctacacaa acatttttta ggagtttgat tctacctcca 60 ttttggttag atatacaaac tctaccccat gagggantgt atggtgtatt tctagattta 120 gcaacaattt tcttgaaaaa tgtacaatac tatagaaaaa tgaagatagt aaataccagg 180 tataagttaa taacagtgtt tcttttgttc agtaataatg aactgtgtac tagcactgaa 240 ctttaggccc tcctatttgc gtattttctg tttgtatatt tttaaataga ggaattgtga 300 ttataatatt attattttgg aatatcctaa atcataaatt caaaacntna tttagttttt 360 nnnttttttt tttaagatgg agtcccgctt tgtcccaggc nggagtgcag tggcatgatc 420 tcagctcnct g 431 <210> 43 <211> 669 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (641)..(641) <223> any kind of base <400> 43 ttcttttgga aaaccaaaca tgctttattt catttttttc acaatttatt taaacatctc 60 acatatacaa aataggtaca atttaatttt tctgcttgcc caagaaacaa agcttctgtg 120 gaaccatgga agaagatgaa aatgagactg gcaaagaaca aatgctgaat ctgaagaaga 180 ggacaacttt gggcaaataa tctgcatact tttaattggg aataagatgg aaaatatgaa 240 tgctaaatca aattttttaa aaaatacacc acacgataca actcaataca ggagtatttc 300 ttctcaaatt cttctagcac catcaacatt cttcaagtat ctgaaatact attaattagc 360 acctttgtat tatgaacaaa acaaaacaag gacctcagtt catctctgtc taggtcagca 420 cctaacaatg tggatcacac tcatgggaaa gtgttttgag gtagtttaaa cctttggaag 480 tttgggtttt aaacttccct ctgtggaaga tattcaaaag ccacaagtgg tgcaaatgtt 540 tatggttttt atttttcaat ttttattttg gttttcttac aaaggttgac atttttcata 600 acaggtgtaa gagtgttgaa aaaaaaattt caatttttgg ngggaacggg ggaaggagtt 660 aatgaaact 669 <210> 44 <211> 287 <212> DNA <213> human <400> 44 gccggagagt ctacaatgtt acccagcatg ctgttggcat tgttgtaaac aaacaagtta 60 agggcaagat tcttgccaag agaattaatg tgcgtattga gcacattaag cactctaaga 120 gccgagatag cttcctgaaa cgtgtgaagg aaaatgatca gaaaaagaaa gaagccaaag 180 agaaaggtac ctgggttcaa ctaaagcgcc acgctgctcc acccagagaa gcacactttg 240 tgagaaccaa tgggaaggag cctgagctgc tggaacctat tccctat 287 <210> 45 <211> 383 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (147)..(147) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (309)..(309) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (349)..(349) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (365)..(365) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (372)..(372) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (380)..(380) <223> any kind of base <400> 45 ggaacggaaa aggagaattc aagtgtgacc ctcatgaggc aacgtgttat gatgatggga 60 agacatacca cgtaggagaa cagtggcaga aggaatatct cggtgccatt tgctcctgca 120 catgctttgg aggccagcgg ggctcgnctt gtgacaactg ccgcagacct ggggggtgaa 180 cccagtcccg aaggcactac tggccagtcc tacaaccagt attcttcaga gataccattc 240 agagaacaaa cactaatgtt taatttgccc aatttgagtg cttcatgcct tttaggatgt 300 tacaggctng acagagaagg ttttcccgag gagttaaatc atctttttnc catttcccga 360 ggggncaagg cntgtttttn ttt 383 <210> 46 <211> 523 <212> DNA <213> human <400> 46 cagaggggca gggcggacgg ctaggagttc aagaaacatc ctggtctgag ggaaaggctg 60 cagctgcacc gccatgaata agcttttcag cttctggaag aggaagaatg agacccgcag 120 ccagggctac aaccttcgag aaaaggattt aaagaaactt cacagagctg cttcagtcgg 180 ggatttgaag aagctgaagg aataccttca gatcaagaaa tatgatgtaa atatgcagga 240 ctatgaatac agaacacctt tgcacctagc ctgtgctaat ggacatacag atgttgtact 300 tttcctaatt gagcaacaat gcaagataaa tgtccgggat agtgaaaaca aatccccatt 360 gattaaggca gtacagtgtc aaaatgagga ttgtgctact attctgctaa actttggtgc 420 agacccagat ctgagggata ttcgttataa tactgttctt cactatgctg tttgtggtca 480 aagtttgtca ttagttgaaa aactgcttga atacgaagct gat 523 <210> 47 <211> 390 <212> DNA <213> human <400> 47 tccaaggtca tggcaaaaca tctgaagttc atcgccagga ctgtgatggt acaggaaggg 60 aacgtggaaa gcgcatacag gaccctaaac agaatcctca ctatggatgg gctcattgag 120 gacattaagc atcggcggta ttatgagaag ccatgccgcc gcgacagagg gaaagctatg 180 aaaggtgccg gcggatctac aacatggaaa tggctcgcaa gatcaacttc ttgatgcgaa 240 agaatcgggc agatccgtgg cagggctgct gaggcctgtg ggtgggacac cagtgcgaaa 300 ccctcatcca gttttctctc catctctttt ctttgtacaa tcccatttcc tattaccatt 360 ctctgcaata aactcaaatc acatgtctgc 390 <210> 48 <211> 669 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (641)..(641) <223> any kind of base <400> 48 ttcttttgga aaaccaaaca tgctttattt catttttttc acaatttatt taaacatctc 60 acatatacaa aataggtaca atttaatttt tctgcttgcc caagaaacaa agcttctgtg 120 gaaccatgga agaagatgaa aatgagactg gcaaagaaca aatgctgaat ctgaagaaga 180 ggacaacttt gggcaaataa tctgcatact tttaattggg aataagatgg aaaatatgaa 240 tgctaaatca aattttttaa aaaatacacc acacgataca actcaataca ggagtatttc 300 ttctcaaatt cttctagcac catcaacatt cttcaagtat ctgaaatact attaattagc 360 acctttgtat tatgaacaaa acaaaacaag gacctcagtt catctctgtc taggtcagca 420 cctaacaatg tggatcacac tcatgggaaa gtgttttgag gtagtttaaa cctttggaag 480 tttgggtttt aaacttccct ctgtggaaga tattcaaaag ccacaagtgg tgcaaatgtt 540 tatggttttt atttttcaat ttttattttg gttttcttac aaaggttgac atttttcata 600 acaggtgtaa gagtgttgaa aaaaaaattt caatttttgg ngggaacggg ggaaggagtt 660 aatgaaact 669 <210> 49 <211> 431 <212> DNA <213> human <220> <221> misc_feature <222> (97)..(97) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (347)..(347) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (349)..(349) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (361)..(361) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (362)..(362) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (363)..(363) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (401)..(401) <223> any kind of base <220> <221> misc_feature <222> (428)..(428) <223> any kind of base <400> 49 ctttttatat ttattttcat cgctacacaa acatttttta ggagtttgat tctacctcca 60 ttttggttag atatacaaac tctaccccat gagggantgt atggtgtatt tctagattta 120 gcaacaattt tcttgaaaaa tgtacaatac tatagaaaaa tgaagatagt aaataccagg 180 tataagttaa taacagtgtt tcttttgttc agtaataatg aactgtgtac tagcactgaa 240 ctttaggccc tcctatttgc gtattttctg tttgtatatt tttaaataga ggaattgtga 300 ttataatatt attattttgg aatatcctaa atcataaatt caaaacntna tttagttttt 360 nnnttttttt tttaagatgg agtcccgctt tgtcccaggc nggagtgcag tggcatgatc 420 tcagctcnct g 431
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 37/00 102 C12N 15/00 ZNAA Fターム(参考) 4B024 AA11 CA04 HA14 HA15 4B063 QA01 QA19 QQ08 QQ38 QQ42 QR32 QR48 QR51 QR56 QR82 QS33 QS34 QS36 QX02

Claims (18)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号42 〜49から成る群から選択さ
    れた遺伝子の組み合わせにおける個々の遺伝子の差変調
    (正常集団における同じ遺伝子発現に対して)を同定す
    ることを含んで成る結腸直腸癌状態の評価方法。
  2. 【請求項2】 前記変調された遺伝子の発現において少
    なくとも2倍の差異が存在する請求項1記載の方法。
  3. 【請求項3】 差変調を示すp-値が0.05末満である請求
    項1記載の方法。
  4. 【請求項4】 遺伝に基づかない結腸直腸診断を使用す
    ることをさらに含んで成る請求項1記載の方法。
  5. 【請求項5】 遺伝に基づかない癌マーカーが、癌胚性
    抗原、CA19-9、CA125、CK-BB及びグアニリル シクラー
    ゼCから成る群から選択される請求項1記載の方法。
  6. 【請求項6】 配列番号42 〜49から成る群から選択さ
    れた遺伝子の組み合わせにおける単離された核酸配列、
    それらの相補体又はそれらの一部を含んで成る診断ポー
    トフォリオ。
  7. 【請求項7】 そこに含まれる遺伝子の差発現を同定す
    るために適切なマトリックスにおける請求項6記載の診
    断ポートフォリオ。
  8. 【請求項8】 前記マトリックスが、マイクロアレイに
    使用される請求項7記載の診断ポートフォリオ。
  9. 【請求項9】 前記マイクロアレイが、cDNAマイクロア
    レイである請求項8記載の診断ポートフォリオ。
  10. 【請求項10】 前記マイクロアレイが、オリゴヌクレ
    オチドマイクロアレイである請求項8記載の診断ポート
    フォリオ。
  11. 【請求項11】 配列番号42 〜49から成る群から選択
    された遺伝子の組み合わせにおける単離された核酸配
    列、それらの相補体、又はそれらの一部を含んで成る診
    断ポートフォリオ。
  12. 【請求項12】 配列番号42 〜49から成る群から選択
    された遺伝子の組み合わせにおける単離された核酸配
    列、それらの相補体、又はそれらの一部を含んで成る、
    結腸直腸癌の診断のためのキット。
  13. 【請求項13】 マイクロアレイ分析を行うための試薬
    をさらに含んで成る請求項12記載のキット。
  14. 【請求項14】 媒体をさらに含んで成り、それを通し
    て、前記核酸配列、そらの相補体又はそれらの一部がア
    ッセイされる請求項12記載のキット。
  15. 【請求項15】 配列番号42 〜49から成る群から選択
    された遺伝子の組み合わせにおける個々の遺伝子の差変
    調(正常集団における同じ遺伝子発現に対して)を同定
    することを含んで成る結腸直腸癌についての処理に対す
    る応答を評価するための方法。
  16. 【請求項16】 前記治療に対する応答の評価が、患者
    が改善するか、改善しないか、再発するか、たぶん改善
    するか、又はたぶん再発するかどうかの決定を包含する
    請求項15記載の方法。
  17. 【請求項17】 配列番号42 〜49から成る群から選択
    された遺伝子の組み合わせにおける単離された核酸配
    列、それらの相補体又はそれらの一部を含んで成る結腸
    直腸癌状態の評価のための製品。
  18. 【請求項18】 配列番号42 〜49から成る群から選択
    された遺伝子の組み合わせにおける単離された核酸配
    列、それらの相補体又はそれらの一部の代表を含んで成
    る結腸直腸癌状態の評価のための製品。
JP2003094400A 2002-03-29 2003-03-31 結腸直腸癌の評価 Expired - Fee Related JP4354724B2 (ja)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US36879802P 2002-03-29 2002-03-29
US60/368798 2002-03-29

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2009087574A Division JP2009153522A (ja) 2002-03-29 2009-03-31 結腸直腸癌の評価

Publications (3)

Publication Number Publication Date
JP2003325190A true JP2003325190A (ja) 2003-11-18
JP2003325190A5 JP2003325190A5 (ja) 2006-03-16
JP4354724B2 JP4354724B2 (ja) 2009-10-28

Family

ID=28675541

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2003094400A Expired - Fee Related JP4354724B2 (ja) 2002-03-29 2003-03-31 結腸直腸癌の評価
JP2009087574A Pending JP2009153522A (ja) 2002-03-29 2009-03-31 結腸直腸癌の評価

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2009087574A Pending JP2009153522A (ja) 2002-03-29 2009-03-31 結腸直腸癌の評価

Country Status (10)

Country Link
US (1) US20030186302A1 (ja)
EP (1) EP1355149A3 (ja)
JP (2) JP4354724B2 (ja)
KR (1) KR100991673B1 (ja)
CN (2) CN100516233C (ja)
AR (1) AR039617A1 (ja)
AU (1) AU2003203562A1 (ja)
BR (1) BR0303091A (ja)
CA (1) CA2422298C (ja)
MX (1) MXPA03002866A (ja)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2005000163A (ja) * 2003-05-19 2005-01-06 National Institute Of Advanced Industrial & Technology 糖ヌクレオチド運搬作用を有するタンパク質、組織の癌化の検出方法

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2009528825A (ja) * 2006-03-03 2009-08-13 ベリデックス・エルエルシー デュークスb大腸がんの再発を予測するための分子的解析
ES2332557B1 (es) * 2007-12-04 2011-02-02 Universidad Autonoma De Madrid Huella genomica para el pronostico de la evolucion de adenocarcinoma colorectal.
TWI483736B (zh) * 2009-10-23 2015-05-11 Millennium Pharm Inc 抗-gcc抗體分子及其相關之組合物及方法
WO2012088146A2 (en) * 2010-12-20 2012-06-28 The University Of Notre Dame Biomarkers and uses thereof in prognosis and treatment strategies for right-side colon cancer disease and left-side colon cancer disease
US20120172244A1 (en) 2010-12-20 2012-07-05 Steven Buechler Biomarkers and uses thereof in prognosis and treatment strategies for right-side colon cancer disease and left-side colon cancer disease
CN102586423B (zh) * 2011-12-27 2015-01-07 盛司潼 一种检测结直肠癌易感基因的方法及试剂盒
CN102586420B (zh) * 2011-12-27 2014-10-22 盛司潼 一种检测乳腺癌易感基因的方法及试剂盒
CN106367527A (zh) * 2016-11-17 2017-02-01 苏州大学附属第二医院 直肠癌放化疗疗效相关靶基因的鉴定
CN112831563A (zh) * 2021-02-08 2021-05-25 复旦大学附属肿瘤医院 一种遗传性结直肠癌的检测panel及检测试剂盒

Family Cites Families (28)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5700637A (en) * 1988-05-03 1997-12-23 Isis Innovation Limited Apparatus and method for analyzing polynucleotide sequences and method of generating oligonucleotide arrays
GB8822228D0 (en) * 1988-09-21 1988-10-26 Southern E M Support-bound oligonucleotides
US5143854A (en) * 1989-06-07 1992-09-01 Affymax Technologies N.V. Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof
US5242974A (en) * 1991-11-22 1993-09-07 Affymax Technologies N.V. Polymer reversal on solid surfaces
US5527681A (en) * 1989-06-07 1996-06-18 Affymax Technologies N.V. Immobilized molecular synthesis of systematically substituted compounds
DE3924454A1 (de) * 1989-07-24 1991-02-07 Cornelis P Prof Dr Hollenberg Die anwendung von dna und dna-technologie fuer die konstruktion von netzwerken zur verwendung in der chip-konstruktion und chip-produktion (dna chips)
IL103674A0 (en) * 1991-11-19 1993-04-04 Houston Advanced Res Center Method and apparatus for molecule detection
US5412087A (en) * 1992-04-24 1995-05-02 Affymax Technologies N.V. Spatially-addressable immobilization of oligonucleotides and other biological polymers on surfaces
US5384261A (en) * 1991-11-22 1995-01-24 Affymax Technologies N.V. Very large scale immobilized polymer synthesis using mechanically directed flow paths
US5554501A (en) * 1992-10-29 1996-09-10 Beckman Instruments, Inc. Biopolymer synthesis using surface activated biaxially oriented polypropylene
US5472672A (en) * 1993-10-22 1995-12-05 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Apparatus and method for polymer synthesis using arrays
US5429807A (en) * 1993-10-28 1995-07-04 Beckman Instruments, Inc. Method and apparatus for creating biopolymer arrays on a solid support surface
US5571639A (en) * 1994-05-24 1996-11-05 Affymax Technologies N.V. Computer-aided engineering system for design of sequence arrays and lithographic masks
US5556752A (en) * 1994-10-24 1996-09-17 Affymetrix, Inc. Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA
US6350576B1 (en) * 1994-12-20 2002-02-26 Cold Spring Harbor Laboratory Cancer detection probes
US5599695A (en) * 1995-02-27 1997-02-04 Affymetrix, Inc. Printing molecular library arrays using deprotection agents solely in the vapor phase
US5624711A (en) * 1995-04-27 1997-04-29 Affymax Technologies, N.V. Derivatization of solid supports and methods for oligomer synthesis
US5545531A (en) * 1995-06-07 1996-08-13 Affymax Technologies N.V. Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays
US5658734A (en) * 1995-10-17 1997-08-19 International Business Machines Corporation Process for synthesizing chemical compounds
US6275814B1 (en) * 1996-11-27 2001-08-14 Investment Strategies Network Investment portfolio selection system and method
US6003018A (en) * 1998-03-27 1999-12-14 Michaud Partners Llp Portfolio optimization by means of resampled efficient frontiers
US6218114B1 (en) * 1998-03-27 2001-04-17 Academia Sinica Methods for detecting differentially expressed genes
US6004755A (en) * 1998-04-07 1999-12-21 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Quantitative microarray hybridizaton assays
US6218122B1 (en) * 1998-06-19 2001-04-17 Rosetta Inpharmatics, Inc. Methods of monitoring disease states and therapies using gene expression profiles
EP1108021A2 (en) * 1998-08-31 2001-06-20 Bayer Corporation Human genes differentially expressed in colorectal cancer
US6175824B1 (en) * 1999-07-14 2001-01-16 Chi Research, Inc. Method and apparatus for choosing a stock portfolio, based on patent indicators
AU780829B2 (en) * 1999-07-15 2005-04-21 Research Development Foundation Corticotropin releasing factor receptor 2 deficient mice and uses thereof
US6271002B1 (en) * 1999-10-04 2001-08-07 Rosetta Inpharmatics, Inc. RNA amplification method

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2005000163A (ja) * 2003-05-19 2005-01-06 National Institute Of Advanced Industrial & Technology 糖ヌクレオチド運搬作用を有するタンパク質、組織の癌化の検出方法
JP4517189B2 (ja) * 2003-05-19 2010-08-04 生化学工業株式会社 糖ヌクレオチド運搬作用を有するタンパク質、組織の癌化の検出方法

Also Published As

Publication number Publication date
AU2003203562A1 (en) 2003-10-23
US20030186302A1 (en) 2003-10-02
CN1495273A (zh) 2004-05-12
MXPA03002866A (es) 2004-08-11
CA2422298A1 (en) 2003-09-29
JP2009153522A (ja) 2009-07-16
CN101603092A (zh) 2009-12-16
AR039617A1 (es) 2005-03-02
EP1355149A3 (en) 2004-08-25
JP4354724B2 (ja) 2009-10-28
KR100991673B1 (ko) 2010-11-04
CN100516233C (zh) 2009-07-22
EP1355149A2 (en) 2003-10-22
KR20030078802A (ko) 2003-10-08
CN101603092B (zh) 2012-11-07
BR0303091A (pt) 2004-02-17
CA2422298C (en) 2013-07-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10889865B2 (en) Thyroid tumors identified
DK2681333T3 (en) EVALUATION OF RESPONSE TO GASTROENTEROPANCREATIC NEUROENDOCRINE NEOPLASIS (GEP-NENE) THERAPY
AU2012381038B2 (en) Interrogatory cell-based assays for identifying drug-induced toxicity markers
CA2442820A1 (en) Microarray gene expression profiling in clear cell renal cell carcinoma: prognosis and drug target identification
KR20150043566A (ko) 심장독성 약제의 동정에 마커를 사용하는 용도
KR20140006898A (ko) 결장암 유전자 발현 시그니처 및 이용 방법
KR100984996B1 (ko) 결장직장암의 검사방법
US20040241725A1 (en) Lung cancer detection
KR100991673B1 (ko) 결장직장암의 검사방법
CA2403946A1 (en) Genes expressed in foam cell differentiation
US20230022417A1 (en) Chemical compositions and methods of use
AU2016377391A1 (en) Triage biomarkers and uses therefor
EP2027290A1 (de) Praediktives genexpressionsmuster fuer kolorektale karzinome
US20070298419A1 (en) K-Ras Oligonucleotide Microarray and Method for Detecting K-Ras Mutations Employing the Same
CN1856573A (zh) 用于神经母细胞瘤预后诊断的微阵列和神经母细胞瘤预后诊断方法
AU2018273844A1 (en) Methods for melanoma detection
KR101141546B1 (ko) Ankrd15, hpd, psmd9, wdr66, gpc6, pax9, lrrc28, tns4, axl, 및 hnrpul1 유전자로부터 유래된 단일염기다형을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 이를 포함하는 마이크로어레이 및 진단키트, 및 이를 이용한 분석방법
JP2002112799A (ja) 癌疾患の予後判定法
CN115362268A (zh) 用于判断色素沉着皮肤类型的基因多态性标记及其用途
US20040146878A1 (en) Method for gene diagnosis of bovine Hsp70 deficiency

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Written amendment

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20060127

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20060127

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20080930

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20081225

A602 Written permission of extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602

Effective date: 20090106

A521 Written amendment

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20090331

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20090421

A521 Written amendment

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20090608

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20090630

A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20090730

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120807

Year of fee payment: 3

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20130807

Year of fee payment: 4

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees