JP2001517075A - 組換え血管内皮細胞増殖因子d(vegf―d) - Google Patents

組換え血管内皮細胞増殖因子d(vegf―d)

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Abstract

(57)【要約】 PDGFファミリーの増殖因子の新規なメンバーであり、特に内皮細胞増殖および血管新生を刺激し、血管透過性を増大させる、VEGF−Dが記載される。また、それをコードするヌクレオチド配列、その生産方法、それに対する抗体およびその他のアンタゴニスト、それが発現するようにトランスフェクトまたはトランスフォームされた宿主細胞、それを含有する医薬組成物、そして医学上および診断上の適用におけるそれらの利用についても記載される。

Description

【発明の詳細な説明】 組換え血管内皮細胞増殖因子D(VEGF−D) 本発明は、内皮細胞に対する増殖因子、そして具体的には新規な血管内皮増殖 因子、その因子をコードするDNA、およびその因子を利用する、またはその因 子に由来する、医薬および診断の組成物ならびに方法に関する。発明の背景 血管新生は、組織の正常な成長および発達に必要とされる基礎的なプロセスで あり、先在血管からの新しい毛細血管の増殖に関する。血管新生は、胚発生およ び正常な組織の成長、修復、および再生に関するだけでなく、女性の生殖周期、 妊娠の確立と維持、および創傷と骨折の修復にも関与している。正常の個体にお いて起こる血管新生の他に、血管形成の現象は、多くの病的プロセス、特に、腫 瘍の増殖および転移、そして特に微小血管系の、血管増殖が増大するその他の状 態、例えば、糖尿病性網膜症、乾癬、および関節症などに関係している。血管新 生の阻害はこれらの病的プロセスの阻止または緩和において有用である。 一方で、血管新生(化)が確立または拡張するべき状況、例えば組織または臓 器移植後、または虚血性心疾患および血栓性閉塞性動脈炎のような、組織の梗塞 または動脈狭窄において側副循環の確立を刺激するためにおいては血管新生の促 進が望ましい。 血管新生が、非常に多くの生理学的および病理学的なプロセスにおいて重大な 役割を果たしているため、血管新生のコントロールに関与する因子について熱心 に研究が行われてきた。多数の増殖因子が血管新生の調節に関与していることが 示されている;これらには、繊維芽細胞増殖因子(FGF)、血小板由来増殖因子 (PDGF)、トランスフォーミング増殖因子α(TGFα)そして肝細胞増殖因 子(HGF)が含まれる。例えば、概説として、フォークマン(Folkman)他,“ Angiogenesis”,J.Biol.Chem.,1992 267 10931-10934を参照。 内皮細胞−特異的増殖因子の特定のファミリーおよびそれらに対応する受容体 は、主として内皮細胞の増殖および分化に対する刺激、および、分化した細胞の 特定の機能についての、原因であると示唆されてきた。これらの因子はPDGF ファミリ ーのメンバーであり、内皮受容体チロシンキナーゼ(RTK)を介して作用する と考えられる。これまでに4つの血管内皮増殖因子のサブタイプが同定されてい る。現在ではVEGF−Aとして知られている、血管内皮増殖因子(VEGF) は、いくつかのソースから単離されている。VEGF−Aは、内皮細胞に対して 高度に特異的な分裂促進活性を示し、血管新生を引き起こす連続した現象全体を 刺激することができる。さらに、それは単球に対する強い化学遊走活性を有し、 内皮細胞においてプラスミノーゲン活性化因子およびプラスミノーゲン活性化因 子阻害剤を誘導することができ、そして微小血管の透過性にも影響を及ぼすこと ができる。後者の活性のために、それは、血管透過性因子(VPF)と称される こともある。VEGFの単離および特性についてはレビューにおいて概説されて いる;ファーララ(Ferrara)他,“The Vascular Endothelial Growth Factor F amily of Polypeptides”J.Cellular Biochem.,1991 47 212-218およびConnolly ,“Vascular Permeability Factor:A Unique Regulator of Blood Vessel Funct ion”,J.Cellular Biochem.,1991 47 219-223を参照。 より最近には、3つの更なるVEGFファミリーのメンバーが同定された。こ れらはVEGF−B、VEGF−CおよびVEGF2と命名されている。VEG F−Bは、Ludwig Institute for Cancer ResearchおよびThe University of He lslnkiによる国際特許出願第PCT/US96/02957(WO96/267 36)において記載されており、VEGF−Cは、ヨウコフ(Joukov)他,The E MBO Journal,1996 15 290-298において記載されており、そしてVEGF2は、H uman Genome Sciences,Inc.による国際特許出願第PCT/US94/0529 1(WO95/24473)において記載されている。VEGF−Bは、VEG Fのものと非常によく似た血管形成およびその他の特性を有するが、VEGFと は異なる組織において分布、発現している。具体的には、VEGF−Bは、心臓 において非常に強く発現しており、そして肺においては弱くしか発現しておらず 、これはVEGFの場合と逆である。これは、VEGFとVEGF−Bは、多く の組織において共発現(co-expressed)しているという事実にかかわらず、機能に おいて異なっている可能性があるということを示唆している。 VEGF−Bは、細胞のレチノイン酸結合タンパク質タイプI(CRABP− I) と相互作用する可能性のある細胞タンパク質のためのスクリーニング法であった 、酵母共ハイブリッド相互作用トラップスクリーニング技術を用いて単離された 。その単離と特徴については、PCT/US96/02957およびオロフソン (Olofsson)他,Proc.Natl.Acad.Sci.,1996 93 2576-2581において詳細に記載さ れている。 VEGF−Cは、PC−3前立腺ガン細胞ライン(CRL1435)の条件培 地から、Ftl4を発現するようにトランスフェクトされた細胞を用いた、内皮 細胞−特異的受容体チロシンキナーゼFtl4のチロシンリン酸化を生じさせる 培地の能力についてのスクリーニングによって単離された。VEGF−Cは、組 換えFtl4を用いたアフィニティークロマトグラフィーを使用して精製され、 PC−3 cDNAライブラリーからクローニングされた。その単離と特徴につ いては、ヨウコフ(Joukov)他,The EMBO Journal,1996 15 290-298において詳 細に記載されている。 VEGF2は、高度に腫瘍形成性の(tumorgenic)、エストロゲン非依存性のヒ ト乳ガン細胞ラインから単離された。この分子はPDGFに対して約22%のホ モロジー、およびVEGFに対して30%のホモロジーを有すると述べられてい るが、VEGF2をコードする遺伝子の単離方法については明らかではなく、生 物活性のキャラクタリゼーションについては開示されていない。 血管内皮増殖因子はPDGF−受容体ファミリーの受容体チロシンキナーゼに 結合することによって作用していると考えられる。5つの内皮細胞−特異的受容 体チロシンキナーゼ、即ち、Flt−1(VEGFR−1)、KDR/Flk−1 (VEGFR−2)、Flt4(VEGFR−3)、TieおよびTek/Tie− 2、が同定されている。これらのすべてがシグナル伝達のために必要な内因性の チロシンキナーゼ活性を有する。重要な、Flt−1、Flk−1、Tieおよ びTek/Tie−2の血管形成と血管新生における特異的な役割は、マウス胚 においてこれら受容体を不活性化するような標的化(targeted)突然変異によって 実証された。VEGFR−1とVEGFR−2とは、VEGFに高いアフィニテ ィーで結合し、そしてVEGFR−1は、VEGF−Bおよび胎盤増殖因子(P lGF)にも結合する。VEGF−CはFlt4(VEGFR−3)に対するリ ガンドである ことが示され、そしてVEGFR−2も活性化する(ヨウコフ(Joukov)他,199 6)。Tek/Tie−2に対するリガンドは記載されている(Regeneron Pharmac euticals,Inc.による国際特許出願第PCT/US95/12935(WO96 /11269));しかしTieに対するリガンドはまだ同定されていない。 受容体Flt−4は胎児においては静脈およびリンパ内皮に発現しており、そ して成人においては主にリンパ内皮に発現している(カイパイネン(Kaipainen) 他,Cancer Res,1994 54 6571-6577;Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1995 92 3566-357 0)。VEGF−Cはリンパ内皮において第一の機能を有しており、血管新生と透 過性の制御において、VEGFと共有される第二の機能を有している可能性があ るということが示唆されている(ヨウコフ(Joukov)他,1996)。 今回我々は血管内皮増殖因子ファミリーの新規なタンパク質をコードするヒト cDNAを単離した。VEGF−Dと称する、その新規なタンパク質は、このフ ァミリーのその他のメンバーと構造的類似性を示す。発明の概要 本発明は、概して、内皮細胞の増殖または分化を刺激および/または増強する 能力を有する新規に単離された増殖因子、その新規な増殖因子をコードする単離 DNA配列、および診断および/または治療上の適用のために有用な組成物を提 供する。 第1の側面によれば、本発明は、VEGF−Dと命名され、VEGF、VEG F−BおよびVEGF−Cに構造的にホモロガスな(homologous)新規なポリペプ チドをコードする、単離および精製された核酸分子を提供する。好適な実施態様 において、前記核酸分子は配列番号1、配列番号4、配列番号6または配列番号 7に示す配列を含むcDNAである。本発明のこの側面は、配列番号1、配列番 号4、配列番号6または配列番号7のDNAに、ストリンジェントな条件下でハ イブリダイズするような配列のDNA分子も包含する。好ましくは前記ストリン ジェントな条件下でハイブリダイズすることができるDNA分子は、VEGF− Dのアミノ酸残基93からアミノ酸残基201の部分をコードするものであり、 任意に(随 意にoptionally)FLAGTMペプチドをコードするDNA配列に、作用するよう に結合される(operatively linked)。 好ましくは前記cDNAは、配列番号4、配列番号6または配列番号7に示す 配列を有し、より好ましくは配列番号4に示す配列を有する。 第2の側面によれば、本発明は、下記の特徴的なアミノ酸配列: を有するポリペプチドを提供する。前記ポリペプチドは内皮細胞の増殖を刺激す る能力を有し、そして前記ポリペプチドは、配列番号3に示すアミノ酸配列、ま たは、内皮細胞の増殖、分化、遊走または生存の内、少なくとも1つを刺激する 能力を有する、そのフラグメントまたはアナログに実質的に対応するアミノ酸配 列を含む。 これらの能力は、ここでは“VEGF−Dの生物活性”と称し、そして当業者 に周知の方法によって簡単にテストすることができる。好ましくは前記ポリペプ チドは、限定されるものではないが、血管内皮細胞および/またはリンパ内皮細 胞の増殖または分化を含む、内皮細胞の増殖または分化を刺激する能力を有する 。 より好ましくは、前記ポリペプチドは、配列番号5、配列番号8または配列番 号9に示す配列を有し、そして最も好ましくは配列番号5に示す配列を有する。 本発明の前記ポリペプチドの、好適なフラグメントは、VEGF−Dのアミノ 酸残基93からアミノ酸残基201の部分であり、任意に(optionally)FLA GTMペプチドに、結合される。前記フラグメントがFLAGTMに結合している例 として、前記フラグメントは、本出願において定義されるVEGFD△N△Cが ある。 したがって、保存的な置換、挿入または欠失を有するが、依然としてVEGF −Dの生物活性を保持しているポリペプチドは、明らかに本発明の範囲内に含ま れることが理解されるべきである。当業者であれば、例えば部位特異的突然変異 誘発の使用、または特異的な酵素による切断およびライゲーション等の、そのよ うなポリペプチドを作成するのに簡単に使用できる方法を熟知しているであろう 。当業者はまた、ペプチド擬態性の化合物(peptidomimetic compounds)または、 1以上のアミノ酸残基が非−自然発生のアミノ酸またはアミノ酸アナログによっ て置換されてい る化合物が、VEGF−Dの生物活性に要求される側面を保持している可能性が あるということについても知っているであろう。そのような化合物は、簡単に作 ることができ、また当業者に周知の方法によってテストすることができ、そして また、本発明の範囲内に含まれる。 さらに、VEGF−Dにおいて起こることが知られている、選択的スプライシ ングの結果生じるVEGF−Dポリペプチドの変異体(variant)形態、および、 VEGF−Dをコードする核酸配列の自然発生の対立遺伝子変異体(allelic var iant)は、本発明の範囲内に含まれる。対立遺伝子変異体は、当業者に周知であ り、置換、欠失、または1以上のヌクレオチドの付加を含むが、その結果として コードされるポリペプチドに何ら実質的な機能的変化を起こさない、別の(alter native)形態または核酸配列を表す。 本出願において使用される“VEGF−D”という用語は、配列番号3、配列 番号5、配列番号8、配列番号9のポリペプチド、および本出願において定義す るVEGF−Dの生物活性を有する、それらのフラグメントまたはアナログを、 集合的に指すものである。 そのようなVEGF−Dの変異体形態は、修飾(modification)のためにVEG F−Dポリペプチドの、非−必須領域を標的化することによって調製することが できる。これらの非−必須領域は、本出願の図面、特に図2および図10におい て示される強く保存された領域の外側にあると予想される。具体的には、VEG Fを含む、PDGFファミリーの増殖因子は二量体であり、そしてVEGF−B 、VEGF−C、PlGF、PDGF−AおよびPDGF−BはN−末端ドメイ ン、即ちPDGF−様ドメインにおいて、8つのシステイン残基の完全な保存を 示す(オロフソン(Olofsson)他,1996;ヨウコフ(Joukov)他,1996)。これらの システインは分子内および分子間ジスルフィド結合に関与すると考えられている 。更に、完全ではないが強く保存された更なるシステイン残基がC−末端ドメイ ンにおいて存在する。分子内ジスルフィド結合によって形成された、各サブユニ ットの、ループ1、2および3は、PDGF/VEGFファミリーの増殖因子に 対する受容体への結合に関与している(アンダーソン(Andersson)他:Growth Fa ctors,1995 12 159-164)。本出願において示すように、以前から知られているV EGFファミリーのメンバー において保存されたシステインは、VEGF−Dにおいても保存されている。 したがって、当業者であれば、提案されるいかなる変異体形態においてもこれ らのシステイン残基は保存されるべきであるということ、そしてループ1、2お よび3に存在する活性部位も保存されるべきであるということを、よく理解する であろう。しかし、この分子のその他の領域は生物学的機能において重要性は低 く、それゆえ修飾(modification)のための好適な標的を提供するということが期 待され得る。修飾された(modified)ポリペプチドは、細胞増殖テストのようなル ーチン活性アッセイ方法によってVEGF−Dの生物活性を示す能力について簡 単にテストすることができる。 修飾されたVEGF−Dポリペプチドの中には、内皮細胞に、即ちVEGF− D受容体に結合する能力を有するが、内皮細胞の増殖、分化、遊走、または生存 を刺激する能力を有さないようなものがあると考えられる。これらの修飾された ポリペプチドは、VEGF−Dの競合性または非競合性の阻害剤として作用する ことができると期待され、VEGF−D作用の阻止または低下が望ましいような 状況において有用であると期待される。したがって、そのような受容体−結合性 であるが、非−分裂促進性、非−分化誘導性、非−遊走誘導性、または非−生存 促進性の、VEGF−Dの変異体も、本発明の範囲内に含まれ、本出願において “受容体−結合性だが、その他の点では不活性な変異体”と称する。 第3の側面によれば、本発明は、本発明のポリペプチドまたはポリペプチドフ ラグメントをコードする、精製および単離された核酸を提供する。前記核酸はD NA、ゲノムDNA、cDNAまたはRNAのいずれでもよく、一本鎖でも二本 鎖でもよい。前記核酸は、細胞または組織ソースから単離しても、または、組換 えあるいは合成起源のものでもよい。遺伝暗号の縮重のために、各配列が、配列 番号3、配列番号5、配列番号8または配列番号9に示すアミノ酸配列、それら の活性フラグメントまたはアナログ、または、受容体−結合性だがその他の点で は不活性あるいは部分的に不活性なそれらの変異体、をコードするような、多く のコード配列が可能であるということを当業者であれば理解するであろう。 本発明の第4の側面は、本発明のcDNAまたは本発明の第3の側面による核 酸を含むベクター、および、本発明の核酸またはベクターでトランスフォームま たは トランスフェクトされた宿主細胞を提供する。これらの細胞は、本発明のポリペ プチドの発現のために特に好適であり、バキュロウイルスベクターでトランスフ ォームされた、ATCC(the American Type Culture Collection)から入手可能 なSf9細胞(ATCC SRL−171)のような昆虫細胞、および好適な発 現プラスミドによってトランスフェクトされたヒト胚腎臓細胞ライン293EB NAを含む。本発明の好適なベクターは、本発明による核酸が、1以上の適切な プロモーターおよび/またはその他の調節配列(制御配列)に、作用するように (operatively)結合される(connected)発現ベクターであり、そのようなベクター でトランスフォームまたはトランスフェクトされた適切な宿主細胞は、本発明の ポリペプチドを発現することが可能となる。その他の好適なベクターは、哺乳動 物細胞のトランスフェクションのため、または遺伝子治療のために好適な、アデ ノウイルスまたはレトロウイルスベクターまたはリポソームなどである。多くの そのようなベクターは当業者に周知である。 本発明はまた、本発明による核酸によってコードされるポリペプチドを発現さ せることができるベクターの製造方法を提供する。この方法は、上述したように 、前記核酸を、1以上の適切なプロモーターおよび/またはその他の調節配列( 制御配列)に、作用するように結合させる工程を含むものである。 本発明は更に、本発明によるポリペプチドの製造方法を提供する。この方法は 、本発明の核酸またはベクターを宿主細胞中で発現させる工程、および前記宿主 細胞または前記宿主細胞の増殖培地から前記ポリペプチドを単離する工程とを含 むものである。本発明のこの側面の1つの好適な実施態様において、アフィニテ ィークロマトグラフィーによる前記ポリペプチドの精製を促進するために、発現 ベクターに更に、FLAGTMまたはヘキサヒスチジン(hexahistidine)などのア フィニティータグをコードする配列を含ませる。 さらに別の側面において、本発明は、本発明のポリペプチドと特異的に反応す る抗体を提供する。本発明のこの側面は、前述したVEGF−Dの変異体形態、 フラグメントおよびアナログに対して特異的な抗体を含む。そのような抗体はV EGF−Dの阻害剤またはアゴニストとして、およびVEGF−Dの検出および 定量化のための診断剤として、有用である。ポリクローナル抗体もモノクローナ ル 抗体も利用できる。モノクローナルおよびポリクローナル抗体は、当該技術分野 における標準的方法を使用して、本発明のポリペプチドに対して産生することが できる。ある種の目的のために、例えば、臨床状況においてVEGF−Dの効果 を阻害するためにモノクローナル抗体を使用するべき場合などでは、ヒト化モノ クローナル抗体またはキメラモノクローナル抗体を使用するのが望ましいであろ う。組換えDNA法を含む、これらの産生方法も、当業者に周知である。 本発明のこの側面はまた、VEGF−Dを認識し、そして適切に標識された抗 体も含む。 本発明によるポリペプチドまたは抗体は、検出可能なラベル(標識)で標識し て、診断目的のために利用することができる。同様にそのように標識された 本 発明のポリペプチドは、それに対応する受容体をin situで同定するために使用 することができる。ポリペプチドまたは抗体を、イメージングのために好適な、 超−磁性の(supermagnetic)、常磁性の、高電子密度の、エコジェニックの(ecog enic)、または放射性の作用剤と、共有結合で、または非−共有結合で、結合さ せることができる。診断アッセイにおける使用のために、放射性または非放射性 ラベルを使用することができ、後者は酵素標識またはビオチン/アビジン系のラ ベルを含む。 本発明の臨床応用は、診断上の応用、創傷治癒、組織または臓器移植において 、または、虚血性心疾患などの、組織梗塞または動脈狭窄における側副循環の確 立のためにおける血管新生の促進、およびガンまたは糖尿病性網膜症の治療にお ける血管新生の阻害を含む。ガンの生検材料におけるVEGF−Dの定量化は、 将来の転移のリスクの指標として利用できる。 VEGF−Dは、肺において高度に発現しており、そしてまた、それは血管透 過性を増大させるので、VEGF−Dは様々な肺の病状に関連する。VEGF− Dアッセイは様々な肺の疾患の診断において利用することができる。VEGF− Dはまた、肺における血液循環および/または肺と血流との間のガス交換を改善 するための、肺の疾患の治療において利用することができる。同様にVEGF− Dは、心不全の場合において、心臓への血液循環およびO2ガス透過性を改善す るために利用することができる。同様に、VEGF−Dは、慢性閉塞性気道疾患 において、血流およびガス交換を改善するために利用することができる。 逆に、VEGF−Dアンタゴニスト(例えば、抗体および/または阻害剤)は 、鬱血心不全などの、例えば肺において、血管透過性の増大によって生じる体液 の蓄積に関連する病状を治療するために利用することができる。これはVEGF −Dアンタゴニストが、体液の蓄積に対して反作用する(体液の蓄積を相殺する )ために、血管透過性を相殺する効果を及ぼすことによる。 VEGF−Dは小腸および大腸においても発現しており、VEGF−Dの投与 は、その血液循環増大活性および血管透過性増大活性により、腸管における吸収 不良症候群を治療するために利用することができる。 したがって、本発明は、血管新生および/または新血管新生を刺激するような 治療を必要とする哺乳類において、血管新生および/または新血管新生を刺激す る方法を提供する。この方法は、有効量の、VEGF−D、または、内皮細胞の 増殖を刺激する能力を有するそのフラグメントまたはアナログを、哺乳類に投与 する工程を含むものである。 VEGF−DをVEGF−A、VEGF−B、VEGF−C、PlGF、PD GF、FGFおよび/またはヘパリンのうち1以上と同時に、あるいは共同させ て任意に投与してもよい。 逆に、本発明は、血管新生および/または新血管新生を阻害するような治療を 必要とする哺乳類において、血管新生および/または新血管新生を阻害する方法 を提供する。この方法は、有効量の、VEGF−Dアンタゴニストを、哺乳類に 投与する工程を含むものである。前記アンタゴニストは、VEGF−Dの、その 対応する受容体または標的細胞への結合を阻止することにより、あるいは、前記 受容体からその細胞の作用部位へのシグナルトランスデューサーの活性化を阻止 することにより、VEGF−Dの作用を阻止する薬剤であればいかなるものであ ってもよい。好適なアンタゴニストは、VEGF−Dに対する抗体;前述した、 受容体−結合性であるが、非−分裂促進性のVEGF−D変異体などの、競合性 または非−競合性の、VEGF−DのVEGF−D受容体への結合の阻害剤;お よびVEGF−DをコードするDNA配列の少なくとも1部分に対して相補的な アンチセンスヌクレオチド配列、を含むが、それらに限定されるものではない。 本発明はまた、生物試料(サンプル)中のVEGF−Dを検出する方法を提供 す る。この方法は、前記試料を、VEGF−Dに結合する能力を有する試薬に接触 させる工程、および結合を検出する工程を含むものである。好ましくは、VEG F−Dに結合する能力を有する試薬は、VEGF−Dに対する抗体であり、より 好ましくはモノクローナル抗体である。好適な実施態様において、結合および/ または結合の程度は検出可能なラベル手段によって検出される;好適なラベルは 前述のものである。 VEGF−Dまたはアンタゴニストが治療の目的のために使用される場合、適 用用量および経路は、治療されるものの状態に依存し、そして主治医または獣医 の判断の自由(裁量)によるであろう。好適な経路は、皮下、筋肉内、または静 脈内の注射、局所適用、インプラント、等を含む。VEGF−Dの局所適用は、 VEGFと同様の方法で行えばよい。 更に別の側面によると、本発明は、典型的にはテストキットの形態の、診断/ 予知(予後prognostic)の手段を提供する。例えば、本発明の1つの実施態様に おいて、VEGF−Dに対する抗体および検出のための手段を含み、そしてより 好ましくは、前記抗体とVEGF−Dの間の結合を評価する工程を含む、診断/ 予知のテストキットを提供する。本発明による前記診断/予知の手段の、1つの 好適な実施態様において、前記抗体または前記VEGF−Dのいずれかが検出可 能なラベル(標識)で標識され、そして前記抗体または前記VEGF−Dのいず れかが基体(substrate)に結合され、そうすることによって前記抗体と前記VE GF−Dの間の結合の後に、前記基体(substrate)に付着したラベルの量を測定 することによって、VEGF−D−抗体相互作用を調べることができる。本発明 の特に好適な実施態様において、前記診断/予知の手段を、通常のELISAキ ットとして提供することができる。 更に別の実施態様において、前記診断/予知の手段は、試験個体のVEGF− D遺伝子のゲノム配列構造を明らかにするための、ポリメラーゼ連鎖反応手段、 および、この配列構造を、VEGF−D発現における何らかの異常が所与の疾患 状態と関連しているか否かを明らかにするために、何らかの異常を検出する目的 で、本出願において開示された配列構造と比較する工程を有するものとすること ができる。 更なる側面によると、本発明は、試験対象における疾患状態と関連している可 能 性がある、試験対象のVEGF−D遺伝子構造における異常を検出する方法に関 する。この方法は、前期試験対象からDNAサンプルを用意する工程;前記DN Aサンプルを、ポリメラーゼに作用するように結合したVEGF−D DNAに 対して特異的なプライマーのセットと接触させ、ポリメラーゼ連鎖反応によって 前記サンプルからのVEGF−D DNAを選択的に増幅する工程、および、前 記サンプルからの前記増幅されたVEGF−D DNAのヌクレオチド配列を、 配列番号1または配列番号4に示すヌクレオチド配列と比較する工程、を含むも のである。本発明はまた、ポリメラーゼに作用するように結合したVEGF−D DNAに対して特異的なプライマー対を含むテストキットの提供も含むもので あり、ここで前記ポリメラーゼはDNAサンプルからのVEGF−D DNAを 選択的に増幅する能力を有するものである。 本発明の別の側面は、VEGF−Dポリペプチド、または、内皮細胞の増殖を 促進するそのフラグメントまたはアナログ、または、それに対する抗体のいずれ かを含む医薬組成物の提供に関する。VEGF−Dポリペプチドを含む組成物は 、任意に、更にVEGF、VEGF−BおよびVEGF−C、および/またはヘ パリンのうち一以上を含むものとすることができる。 更なる側面において、本発明は、VEGF−Dポリペプチドを含むタンパク質 ダイマー、特にジスルフィド結合したダイマーに関する。本発明のタンパク質ダ イマーは、VEGF−Dポリペプチドのホモダイマー、および、VEGF−Dと 、VEGF、VEGF−B、VEGF−C、PlGFまたはPDGFとからなる ヘテロダイマーの両方を含む。 本発明の更に別の側面によると、VEGF−Dの単離のための方法が提供され 、この方法は、VEGF−Dを発現する細胞をヘパリンに曝して前記細胞からの VEGF−Dの放出を促進する工程と、そのようにして放出されたVEGF−D を精製する工程とを含むものである。 本発明の別の側面は、VEGF−Dまたは内皮細胞の増殖を促進するそのフラ グメントまたはアナログをコードするDNA配列の少なくとも一部に対して相補 的なアンチセンスヌクレオチド配列を有する、ベクターの提供に関する。本発明 の更に別の側面によると、アンチセンス配列を有するようなベクターは、VEG F−Dの 発現を阻害するため、または少なくとも弱めるために、利用可能である。 VEGF−Dの発現を阻害するためのこのタイプのベクターの使用は、例えば、 血管新生の用意のために、腫瘍がVEGF−Dを産生する場合などの、VEGF −Dの発現が、疾患に関連しているような場合において好ましい。アンチセンス ヌクレオチド配列を有するベクターでそのような腫瘍細胞をトランスフォーメー ションすることにより、血管新生が抑制または遅延され、そしてその腫瘍の増殖 を阻害、あるいは遅らせることになるであろう。 上述のような本発明のポリヌクレオチド、それらポリヌクレオチドのフラグメ ント、および、それらポリヌクレオチドの非−コード鎖とそれらに対してストリ ンジェントな条件下でハイブリダイズするのに十分な類似性を有するそれらポリ ヌクレオチドの変異体は、すべて、その他の、非−ヒトの、VEGF−Dの哺乳 類の形態をコードするポリヌクレオチドを、同定、精製、および単離するために 有用である。したがって、そのようなポリヌクレオチドのフラグメントおよび変 異体は、本発明の側面であると考えられる。ストリンジェントなハイブリダイゼ ーション条件の例は以下の通りである:5xSSC、20mM NaPO4、p H6.8、50%ホルムアミド中で42℃でのハイブリダイゼーション;そして 0.2xSSC中で42℃での洗浄、である。ハイブリダイズさせる配列の長さ およびGCヌクレオチド塩基含量に基づいて、経験的にこれらの条件を変化させ ることが望ましいということ、およびそのような変化量を決定するための式が存 在するということは、当業者に理解されている。例えば、サムブルック(Sambro ok)他,“Molecular Cloning:A Laboratory Manual”,Second Edition,Cold Sp ring Harbor,New York:Cold Spring Harbor Laboratory(1989)を参照。 更に、精製および単離された、その他の、非−ヒトの、哺乳類のVEGF−D の形態をコードするボリヌクレオチドもまた、それによってコードされるポリペ プチド、そして非−ヒトVEGF−D変異体に対して特異的に免疫反応性である 抗体と同様に、本発明の側面である。したがって、本発明は、精製および単離さ れた哺乳類のVEGF−Dポリペプチド、そしてまた、そのようなポリペプチド をコードする精製および単離されたポリヌクレオチドを含むものである。 本発明の核酸およびポリペプチドは、合成的手段または組換え手段によって調 製 することができ、または、天然のソースから精製することができる、ということ が明らかに理解されるであろう。図面の簡単な説明 図1は、ヒトVEGF−DとヒトVEGF165(図1a)、ヒトVEGF−Dと ヒトVEGF−B(図1b)、ヒトVEGF−DとヒトVEGF−C(図1c)、そ してヒトVEGF−DとヒトPlGF(図1d)の、配列間の比較を示す。箱は、 ヒトVEGF−Dと正確に一致する残基を示す。 図2は、ヒトVEGF−D、ヒトVEGF165、ヒトVEGF−B、ヒトVE GF−C、およびヒトPlGFの配列間の、配列アラインメントを示す。箱は、 VEGF−D配列と正確に一致する残基を示す;そして、 図3は、cDNA配列(配列番号1)から予測した、ヒトVEGF−Dのアミ ノ酸配列(配列番号3)を示す。箱は、N−結合型グリコシル化の可能性のある 部位を示す。 図4は、市販のヒト肺cDNAライブラリーからハイブリダイゼーションによ って単離した、ヒトVEGF−Dをコードする第2のcDNA配列のヌクレオチ ド配列(配列番号4)を示す;このcDNAは、ヒトVEGF−Dの全体のコー ド領域を含む。 図5は、図4のcDNA配列から推定した(deduced)、ヒトVEGF−Dのア ミノ酸配列(配列番号5)を示す。 図6は、市販のマウス肺cDNAライブラリーからハイブリダイゼーションス クリーニングによって単離した、マウスVEGF−D1をコードするcDNAの ヌクレオチド配列(配列番号6)を示す。 図7は、図6と同じライブラリーから単離した、マウスVEGF−D2をコー ドするcDNAのヌクレオチド配列(配列番号7)を示す。 図8は、マウスVEGF−D1の推定アミノ酸配列(配列番号8)とマウスV EGF−D2の推定アミノ酸配列(配列番号9)を示す。 図9は、マウスVEGF−D1、マウスVEGF−D2、およびヒトVEGF −Dの推定アミノ酸配列間の、比較を示す。 図10は、ヒトVEGF−D、ヒトVEGF165、ヒトVEGF−B、ヒトV EGF−C、およびヒトPlGFのアミノ酸配列間の配列アラインメントを示す ;そして、 図11は、VEGF−AまたはVEGF−Dのいずれかを発現するCOS細胞 からの条件培地を、Ba/F3細胞において発現したキメラ受容体の細胞外ドメ インに対して結合する能力についてテストした、バイオアッセイの結果を示す。 図12は、VEGF−Dペプチドの免疫沈降およびウエスタンブロッティング 分析の結果を示す。 (A)pEFBOSVEGFDfullFLAGおよびpCDNA−1VEG F−AをCOS細胞にトランスフェクトし、生合成的に35S−システイン/メチ オニンで4時間標識した。これら培養からの上清を、M2ゲルまたはプロテイン Aに結合したVEGF−Aに対する抗血清のいずれかで免疫沈降した。洗浄した ビーズを等容量の2xSDS−PAGEサンプルバッファーで溶出し、ボイルし た。サンプルを次に12% SDS−PAGEによって分離した。星印()で マークしたレーンは、サンプルをジチオスレイトールで還元し、ヨードアセトア ミドでアルキル化したものを示す。分子量マーカーが示されている。fAおよび fBは、pEFBOSVEGFDfullFLAGを発現するCOS細胞からの 、M2ゲルによって免疫沈降された、43kDおよび25kD種を示す。 (B)精製したVEGFD△N△Cのウエスタンブロッティング分析である。 M2アフィニティーカラムから溶出した物質のアリコット(フラクション#3、 VEGFD△N△C)を、2xSDS−PAGEサンプルバッファーと混合し、 そして15% SDS−PAGEゲルで分離した。タンパク質を次にニトロセル ロースメンブランにトランスファーし、モノクローナル抗体M2またはコントロ ールのアイソタイプが一致した抗体(Neg)のいずれかで探索した(probed)。 ブロットを、ヤギ抗−マウス−HRP二次抗体および化学発光(ECL,Amersham)を 使用して現像した。単量体のVEGFD△N△C、およびこのペプチドの推定上 の二量体形態(VEGFD△N△C")を矢印で示す。分子量マーカーが示され ている。 図13は、VEGFR2バイオアッセイを用いた、VEGFD△N△Cタンパ ク質の分析の結果を示す。組換えVEGFD△N△C、およびM2アフィニティ ーク ロマトグラフィーによって精製した物質を、VEGFR2バイオアッセイを用い て評価した。IL−3を除去するために洗浄されたバイオアッセイ細胞(104 )を、COS細胞でトランスフェクトされたVEGF−Dからの条件培地のアリ コット、アフィニティーカラムからのフラクション#1(ボイド容量)またはア フィニティーカラムからのフラクション#3(VEGFD△N△Cを含有する) とともにインキュベートした。すべてのサンプルは初濃度20%(即ち1/5) で、その後倍加希釈してテストした。細胞を10%CO2の加湿雰囲気において 37℃で48時間インキュベートした。細胞の増殖を、1μCiの3H−チミジ ンを添加し、そして4時間以上かけて取り込まれた量をカウントすることによっ て定量化した。 図14は、VEGF−Dでトランスフォームされた組換えバキュロウイルスベ クターで感染させたHF細胞からの培養上清による、NIH3T3細胞上のVE GFR3受容体(Flt4)のチロシンリン酸化の刺激を示す。 図15は、図14におけるものと同様に調製した培養上清による、PAE細胞 におけるVEGFR2受容体(KDR)のチロシンリン酸化の刺激を示す。 図16は、ウシの大動脈の内皮細胞(BAE)に対するVEGFD△N△Cの 分裂促進効果を示す。BAEを、VEGFD△N△Cを含有するフラクション# 3、およびポジティブコントロールとしてテキストにおいて記載された精製VE GF−Aを用いて処理した。増殖因子を添加していない培地を用いて得られた結 果を、培地コントロールと示す。発明の詳細な説明 本発明を図面および、以下の限定するものではない諸例に言及することによっ て詳細に説明する。例1 VEGFRファミリーにおいて、オーファン受容体は知られていないため、V EGFファミリーの更なるメンバーは見いだされないだろうと考えられてきた。 さらに、我々は従来技術において、その他のそのようなファミリーメンバーが存 在するであろうという示唆について何ら知らない。 核酸データベースのコンピューターサーチを、他のプロジェクトに付随して、 サーチトピックスとしてVEGF、VEGF−B、VEGF−CおよびPlGF のアミノ酸配列を使用して行った。このサーチによっていくつかのcDNA配列 が同定された。これらの配列の1つである、GenBank登録番号H24828は、 VEGF−CのシステインリッチC−末端領域に似た構造のポリペプチドをコー ドしていた。この配列は、ESTデータベース(database of expressed sequenc e tags)(dbEST)から得たものであり、この明細書でこれを特定するため にXPTと命名する。このXPTcDNAは、"Soares Breast 3NbHBst"と称さ れる、成人女性の乳房組織からのmRNAを用いて構築された、ヒトcDNAラ イブラリーから単離されたものである。確認できる限り、これは正常な乳房組織 であった。世界中の研究所からcDNAライブラリーを集め、cDNAクローン の配列を整え(array)、配列決定のために他の組織にそれらを提供している、the Integrated Molecular Analysis of Genome Expression Consortium(IMAGE Con sortium)にしたがってXPT DNAの配列決定を行った。 データベースにおいて示されたXPT配列は、419ヌクレオチド長であり、 VEGF−C(7)C−末端の100アミノ酸、即ちヨウコフ(Joukov)他(199 6)のナンバリング方法を用いると、およそ残基250から350、に類似したア ミノ酸配列をコードしていた。同様にその他のタンパク質においてシステインリ ッチ領域がみられるが、これらは、例えば、ユスリカ類のChironomus tentansの 唾液腺において合成される分泌絹−様タンパク質sp185のように、VEGF ファミリーとは機能において全く無関係のものである。このタンパク質は、バル ビアニ環、即ち、ユスリカ唾液腺における多糸染色体にみられる、組織特異的染 色体“パフ”に位置する、遺伝子BR3によってコードされるものである(Digna m and Case:Gene,1990 88 133-140;ポールソン(Paulsson)他,J.Mol.Biol.,199 0 211 331-349)。ヨウコフ(Joukov)他(1996)においては、VEGF−Cにおける sp185−様構造モチーフは、フォールディングされて独立したドメインにな る可能性があり、それは生合成の後少なくとも部分的に切断されると考えられる ということ、そしてVEGFのC−末端領域において、sp185型の少なくと も一つのシステインモチーフが存在するということが述べられている。 ヨウコフ(Joukov)他の図3は、VEGF−CのC−末端の、システインリッ チ領域の最後の3分の2は、VEGFまたはPlGFと整列化(align)せず、実 際にVEGFまたはPlGFにおいては存在しないVEGF−CのC−末端延長 (部)と考えられるであろうということを示している。XPTによってコードさ れる配列はこの延長部と類似している。XPT cDNAはその5’末端におい て切断されており(切形(truncated)であり)、そのためシステインリッチドメ インに対してN−末端側の領域についてのアミノ酸配列は推定することも予想す ることも全く不可能であった。したがって、XPT−由来の配列に類似している VEGF−Cの部分は、その他のVEGFファミリーのメンバーの間で保存され ているVEGF−Cの領域まで延長していない。 上述のように、全長XPT核酸によってコードされるポリペプチドのN−末端 領域(dbESTにおいて報告されている切形(truncated)のXPT cDN Aとは異なるので)が、VEGFファミリーのメンバーのいずれか、特に、さら にN−末端の250アミノ酸を有する、VEGF−C、に対してなんらかのさら なるホモロジーを示すか否かを予想するのは不可能であった。例えば、全長XP T核酸によってコードされる自然発生のタンパク質が、ユスリカ唾液腺タンパク 質のヒトホモローグであるかもしれない。そうではなく、切形のXPT cDN Aによってコードされるシステインリッチモチーフのタイプが、多くの構造ドメ インと同様に、複数のタンパク質の間に広く分布しているかもしれない。例えば 、システイン残基のクラスターは、金属結合、正確なタンパク質の折りたたみ( フォールディング)を促進するための分子内ジスルフィド結合の形成、または、 タンパク質サブユニットから複合体の構築(アセンブリー)のための分子間ジス ルフィド結合の形成に関与している可能性がある(Dignam and Chase,1990)。切 形のXPT cDNAが、VEGF−関連分子をコードする配列に由来するもの であったかを判定するためには、より長いcDNAを単離する必要があった。例2 VEGF−DをコードするcDNAのクローニング dbESTにおいて報告されているXPT cDNAのサンプルを、the IMAG E Consortiumによって得られたcDNAクローンの登録供給者である、ATCC (the American Type Culture Conection)から入手した。XPT cDNAのアイデン ティティ(同一性)を、ジデオキシチェーンターミネーション法(サンガー(San ger)他,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1977 74 5463-5467)を使用したヌクレオチド 配列決定によって確認した。 XPT cDNAを、Clontechから購入した、ヒト乳房cDNAライブラリー をスクリーニングするためのハイブリダイゼーションプローブとして使用した。 1つの陽性クローンが単離され、そしてこのクローンを次に両鎖について配列決 定した。ヌクレオチド配列を編集し、そしてオープンリーディングフレームを同 定した。この核酸配列を配列番号1に示す。この配列によってコードされるポリ ペプチドをVEGF−Dと命名し、そして配列番号3に表示したその推定アミノ 酸配列を、図3に示す。図3において、コンセンサス配列N−X−S/T、ただ しXは任意のアミノ酸、を有する、推定上のN−結合型グリコシル化部位を箱で 囲って示してある。例3 VEGF−Dの特性 VEGF−Dのアミノ酸配列を、ヒトVEGF−A165,VEGF−B、VE GF−C、およびPlGFのアミノ酸配列と比較した。これらの比較をそれぞれ 、図1aから1dに示す。配列ホモロジーの程度を計算したところ、配列内にア ラインメント(整列化)の目的で導入された間隙を計算において考慮しない場合 、VEGF−Dは、VEGFと31%同一であり、VEGF−Cと48%同一で あり、VEGF−Bと28%同一であり、そしてPlGFと32%同一である。 したがって、確認された最も近い関係にあるタンパク質はVEGF−Cであった 。 The GenBank,EMBLおよびSwissProt核酸データベースでのコンピューターサー チではVEGF−Dと同一の(identical)タンパク質配列は全く見られなかった 。前述の配列アラインメントから予測されるように、これらのデータベースにお いてみられる、最も近い関係にあるタンパク質はVEGF−Cであった。dbE STのサーチも行ったが、VEGF−Dの完全なコード領域を包含する配列は全 く見られなかった。VEGF−Dの配列は、WO96/11269に開示されているTie −2リガンド1の配列とは無関係である。 検出されたホモロジーは単に、アミノ酸配列のレベルにおけるものにすぎない も のであったということを留意することが重要である。したがって他のVEGFフ ァミリーのメンバーをコードする核酸配列による低いストリンジェンシーでのハ イブリダイゼーションのような方法によって、VEGF−DをコードするcDN AまたはgDNAを単離するのは不可能であったであろう。 VEGF−Dは、VEGFファミリーのすべてのメンバーの中でVEGF−C に最も近い関係にあるようである。VEGF−Dアミノ酸配列はVEGF−Cに おいて見られるシステインリッチsp815−様モチーフを含んでいるので、本 発明のこのポリペプチドはリンパ内皮において重要な機能的役割を果たしている 可能性がある。我々は提案されているいかなるメカニズムにも拘束される意図は ないが、VEGF−CとVEGF−Dとは、その上で内皮細胞が成長することが 可能な絹−様マトリックスを構成している可能性があると考えられる。リンパ管 は基底膜を有しておらず、したがって絹−様マトリックスが基底膜−様の物質を 形成することが可能である。これは、細胞増殖の促進および/または細胞分化に おいて重要である可能性があり、そして、ガン、特に転移、薬物療法、ガンの予 後(予知)等に関連している可能性がある。例4 VEGF−Dの生物学的特性 VEGF−DのcDNA配列を使用して、VEGF−Dの推定アミノ酸配列、 強塩基性、強酸性、疎水性および極性アミノ酸の数、分子量、等電点、pH7に おける電荷、およびタンパク質全体の組成分析を含む、コードされるポリペプチ ドの生化学的な特性を予想した。この分析はProteanタンパク質分析プログラム 、バージョン1.20(DATASTAR)を使用して行った。これらの結果を以下の表1と表 2とに要約する。表1はコドンの使用(codon usage)も示している。 コンティグ2: コンティグ長: 2379塩基 平均長/配列: 354塩基 総配列長: 4969塩基 この分析により、プロセシングされていないVEGF−Dモノマーの分子量は 37キロダルトン(kD)であると予想される。これに比べて(完全にプロセシ ングされたペプチドに関する)実験による測定値は、VEGF−Aモノマーにつ いては20から27kDであり、VEGF−Bモノマーについては21kDであ り、そしてVEGF−Cモノマーについては23kDである。例5 例2に記載した、VEGF−Dに対するcDNAの最初の単離は、ヒト乳房 cDNAライブラリーのハイブリダイゼーションスクリーニングによるものであ った。そのようにして単離されたVEGF−Dに対するcDNAクローンはただ 1つだけだったので、他の別個に単離されたVEGF−D cDNAとの比較に よってcDNAの構造を確認することは不可能であった。この例で記載する研究 は、更なるヒトVEGF−D cDNAクローンの単離に関するものであり、ヒ トVEGF−D cDNAの構造を確認するために行われたものである。それに 加えて、マウスVEGF−D cDNAクローンを単離した。 Stratageneから購入した2つのcDNAライブラリー、1つはヒト肺からのも の、そして1つはマウス肺からのもの(それぞれカタログ番号937210、9 36307)、をVEGF−D cDNAプローブを用いたハイブリダイゼーシ ョンスクリーニングのために使用した。例2に記載したヒトVEGF−Dに対す るcDNAのヌクレオチド1817から2495にわたるプローブを、テンプレ ートとしてVEGF−D cDNAを含むプラスミドと、下記の2つのオリゴヌ クレオチド: および を使用してポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって作成した。 およそ200万の組換えバクテリオファージを、前記2つのcDNAライブラ リーのそれぞれから、このプローブでスクリーニングした。9つのヒトの、そし て6つのマウスのVEGF−Dに対するcDNAクローンが続いて単離された。 前記9つのヒトのVEGF−Dに対するcDNAクローンのうち2つについて ジデオキシチェーンターミネーション法(サンガー(Sanger)他,Proc.Natl.Acad .Sci.USA,1977 74 5463-5467)を使用して完全に配列決定した。この2つのcD NAは、ヒトVEGF−Dのコード領域の全体を含んでおり、一方のクローンが 他方よりも5’−末端において5ヌクレオチド長かったということを除いては同 一であった。この短い方のcDNAのヌクレオチド配列を図4に示し、配列番号 4に表示する。このcDNAから推定されるヒトVEGF−D(hVEGF−D )のアミノ酸配列は、354残基長であり、これを図5に示す;これを配列番号 5に表示する。その他のヒトVEGF−D cDNAクローンのうち5つの5' 領域の配列も決定した。それぞれのクローンについて、キャラクタライズされた 配列は、コード領域の翻訳開始部位からすぐに下流に100ヌクレオチド以上の DNAを含んでいた。すべてのケースにおいてこれらの領域の配列は、図4に示 すヒトVEGF−D cDNAの、対応する領域と同一であった。 6つのマウスのVEGF−Dに対するcDNAクローンのすべてを完全に配列 決定した。これらクローンの内、2つだけはVEGF−Dのコード領域全体を含 んでいた;その他のクローンは切形(truncated)であった。コード領域全体を有 する2つのクローンのヌクレオチド配列は異なっており、異なるサイズのアミノ 酸配列をコードしている。長い方のアミノ酸配列をmVEGF−D1と命名し、 そして短い方の配列をmVEGF−D2と命名した。mVEGF−D1およびm VEGF−D2をコードするcDNAのヌクレオチド配列を、それぞれ図6およ び図7に示す。mVEGF−D1およびmVEGF−D2に対する推定アミノ酸 配列を図8に示す。これらの配列をそれぞれ、配列番号6,7,8および9に表 示する。これらアミノ酸配列間の相違は: i)mVEGF−D2との比較において、mVEGF−D1には残基30の後 に5アミノ酸(DFSFE)が挿入されていること; ii)mVEGF−D1の残基317、およびmVEGF−D2の残基312 の後の、C−末端の終わりの部分に完全な相違があり、その結果mVEGF−D 1がかなり長くなっていること、である。 マウスVEGF−Dに対する4つの切形のcDNAのうち3つは、C−末端領 域 をコードしていたが、N−末端の50アミノ酸をコードしていなかった。これら 3つのcDNAのすべては、mVEGF−D2のC−末端と同じ、VEGF−D のC−末端をコードしていた。その他の切形のcDNAは、VEGF−DのN− 末端側の半分のみをコードしていた。このcDNAから推定されるアミノ酸配列 は、mVEGF−D2には見られないがmVEGF−D1には見られる、残基3 0の直後の5アミノ酸、DFSFEを含有していた。 前述のように、この例において報告したヒトVEGF−D cDNAクローン の全体の配列は、第2のヒトクローンの配列との比較によって確証された。さら に、コード領域の5’−末端の配列は5つの他のヒトVEGF−D cDNAク ローンにおいて同一であることが判明した。一方、例2において報告された配列 は、VEGF−Dのコード領域のほとんどを含んでいるが、この領域の5’−末 端付近が不正確であった。これはおそらくVEGF−D cDNAがコード領域 の5’−末端付近で切断され(truncated)、そしてその位置が他の未同定のcD NAと結合し、その結果、真のVEGF−Dのコード配列の最初の30コドンが 欠失し、そしてメチオニン残基と置換したためであると考えられる。このメチオ ニン残基は、例2において示されたVEGF−D配列のN−末端アミノ酸である とされている。 マウスVEGF−D1およびVEGF−D2の推定アミノ酸配列のN−末端領 域は、ヒトVEGF−Dから推定されるものと非常によく似ている(図9を参照) 。これはまた、ヒトVEGF−Dに対する正確な推定アミノ酸配列がこの例にお いて報告されたものであることを示している。ヒトVEGF−DのN−末端の2 5アミノ酸は、非常に疎水性の領域を形成しており、これは、この領域の部分が タンパク質分泌のためのシグナル配列である可能性があるという意見と一致する ものである。図10はヒトVEGF−Dの配列と、VEGFファミリーの増殖因 子のその他のメンバー、即ちヒトVEGF165(hVEGF165)、ヒトVEGF− B(hVEGF−B)、ヒトVEGF−C(hVEGF−C)およびヒト胎盤増殖 因子(hPlGF)、の配列とのアラインメントを示す。アラインメント中の間隙 を計算のために無視した場合、ヒトVEGF−Dはアミノ酸配列において、ヒト VEGF165と31%同一であり、ヒトVEGF−Bと28%同一であり、VE GF−Cと48%同一であり、そしてヒトPlGFと32%同一であることが判 明した。明らかに、 VEGF−Cが、VEGF−Dに最も近い関係にあるこのファミリーのメンバー である。 マウスVEGF−D1およびVEGF−D2の配列における違いは、おそらく ディファレンシャルmRNAスプライシングに起因する可能性が高い。VEGF −D1のC−末端の41アミノ酸残基はVEGF−D2において欠失しており、 そしてVEGF−D1配列とは近い関係にない9残基と置換されている。したが って、VEGF−D1のC−末端付近に存在する4つのシステイン残基はVEG F−D2において欠失している。この変化によって、タンパク質の三次構造また は四次構造が変わる可能性があり、また、細胞内または細胞外の環境におけるタ ンパク質の局在に影響を及ぼす可能性がある。ヒトVEGF−DのC−末端はマ ウスVEGF−D1のものに似ているが、マウスVEGF−D2には似ていない 。マウスVEGF−D1の残基30の後にあり、マウスVEGF−D2にもヒト VEGF−Dにも存在しない、小さな5アミノ酸の挿入がタンパク質のタンパク 分解性プロセシングに影響している可能性がある。 VEGF−Dは、マウスとヒトの間で高度に保存されている。ヒトVEGF− Dのアミノ酸残基の85パーセントがマウスVEGF−D1におけるものと同一 である。これはおそらくタンパク質機能の保存を反映するものである。推定上の VEGF−Dの機能はここで提案した。ヒトVEGF−D cDNAのオルター ナティブな形態は見つからなかったが、マウスVEGF−DのmRNAの多様な 形態を引き起こすRNAスプライシングの異形(variation)が、ヒト組織におい ても起こっているかもしれないという可能性がある。例6 VEGF−DのCOS細胞における発現 図4に示す配列のヌクレオチド1から1520に渡り、全体のコード領域を含 んでいる、VEGF−Dに対するヒトcDNAのフラグメントを、哺乳類の発現 ベクターpCDNA1−ampに挿入した。このベクターを用いて、以前に記載 されたDEAE−デキストラン法(アルッフォ(Aruffo)およびシード(Seed), 1987)によってCOS細胞を一過性にトランスフェクトし、そしてその結果得ら れた条件細胞培養培地(conditioned cell culture media)を7日間のインキュベ ーション後に収集し、 Amicon濃縮器(10,000分子量をカットオフするCentricon 10)を用いて、 製造業者の指示に従って濃縮した。トランスフェクションのために用いたプラス ミドはヒトVEGF−Dのための発現コンストラクトと、ポジティブコントロー ルとして、マウスVEGF−A cDNAをpCDNA1−ampに挿入するこ とによって作成したコンストラクトであった。条件培地を以下に記載するように 2種類のバイオアッセイでテストし、そしてその結果はCOS細胞が実際に生物 学的に活性の(有効な)VEGF−Dを発現および分泌していたということを実 証するものである。例7 VEGF−DがVEGF受容体−2に結合する能力についてのバイオアッ セイ 例5において示したように、VEGF−DはVEGFファミリーの他のメンバ ーに、一次構造において近い関係にある。このタンパク質ファミリーのメンバー のほとんどは、内皮細胞に対して、(細胞)分裂促進性(mitogenic)および/ま たは走化性を有する(ケック(Keck)他,1989;リョン(Leung)他,1989;ヨウコフ (Joukov)他,1996;オロフソン(Olofsson)他,1996)。さらに文献に記載された 最初のVEGFファミリーのメンバーであるVEGF−A(以前はVEGFとし て知られていた)は、血管透過性の強力な誘導物質(インデューサー)である( ケック(Keck)他,1989)。タンパク質の構造は、タンパク質の機能の重要な決定 要因であるので、VEGF−Dも内皮細胞に対して分裂促進性であるか、または 血管透過性を誘導する(induce)可能性があると考えられる。したがって、ヒトV EGF−Dをバイオアッセイにて、それが、VEGF−Aによって活性化される と分裂(促進)シグナルを引き起こすと考えられている内皮細胞−特異的受容体 である、VEGF受容体−2(VEGFR2;Flk−1としても知られている) (ストローン(Strawn)他,1996)に結合する能力についてテストした。 VEGFR2に結合する増殖因子の検出のためのバイオアッセイは、因子-依 存性の細胞ラインBa/F3において開発(develop)されており、我々の以前の 特許出願番号PCT/US95/16755において記載されている。これらの 細胞はインターロイキン−3(IL−3)の存在下で成長する;しかし、この因 子を除去する と、結果として48時間以内に細胞死が起こる。もし増殖刺激を送達する能力の あるその他の受容体がBa/F3細胞にトランスフェクトされたら、それら細胞 は、IL−3を含まない培地において細胞が成長する場合、その受容体を活性化 する特異的な増殖因子によって救出(レスキュー)され得る。受容体−型チロシ ンキナーゼの特定のケースにおいては(例えば、VEGFR2)、受容体チロシン キナーゼの細胞外ドメインとエリスロポエチン受容体(EpoR)の膜貫通およ び細胞質内ドメインとを含むキメラ受容体が利用可能である。この場合、キメラ 受容体の細胞外ドメインに結合するリガンド(例えば、VEGF)による刺激に より、結果としてEpoR細胞質内ドメインを介するシグナル伝達、およびそれ に続いてIL−3を含まない増殖培地における前記細胞ラインの救出(レスキュ ー)が起こる。この研究において使用する、マウスVEGFR2の細胞外ドメイ ンとマウスEpoRの膜貫通および細胞質内ドメインとからなるキメラ受容体の コンストラクションとバイオアッセイ自体について以下に記載する。 プラスミドコンストラクション i)キメラVEGFR2受容体を産生するためのプラスミドのコンストラクショ ン マウスVEGFR2の細胞外ドメインをコードするDNAと、他のタンパク質 ドメインをコードするDNAとを簡単に結合することが可能となるようなプラス ミドコンストラクトを得るために、部位特異的突然変異誘発を使用して、マウス VEGFR2の、細胞外ドメインと膜貫通ドメインとの移行部(ジャンクション )をコードするcDNAの位置に、BglII制限酵素部位を生成した。エルリ ッヒス(Oelrichs)他(1993)によって記載されたマウスVEGFR2 cDNA の全長クローンを哺乳類発現ベクターpCDNA1−amp中に、BstXI制 限酵素部位を利用してサブクローニングした。一本鎖UTP+DNAをM13複 製起点(ori領域)を使用して生成し、そしてこれをテンプレートとして使用し て、所望の位置にBglII部位を含むマウスVEGFR2 cDNAを生成し た。この変更した(altered)VEGFR2 cDNAを含むプラスミドをpV EGFR2Bglと命名した。キメラVEGFR2受容体を産生するために、あ らゆる受容体の膜貫通および細胞質内ドメインをコードするDNAフラグメント をpVEGFR2Bglの BglII部位に挿入することができる。 ii)VEGFR2/EpoRキメラ受容体のコンストラクション マウスEpoR cDNAを発現ベクターpCDNA1−amp中にサブクロ ーニングし、そして突然変異誘発のためのテンプレートとして一本鎖DNAを生 成した。EpoRの、膜貫通ドメインと細胞外ドメインとの移行部(ジャンクシ ョン)をコードする位置において、EpoR cDNAに、BglII制限酵素 部位を挿入し、このDNAフラグメントが、pVEGFR2Bgl中のVEGF R2細胞外ドメインをコードする前記の変更した(modified)cDNAに直接ライ ゲーションできるようにした。さらにEpoRの細胞質内ドメインにおけるBg lII部位を、無変化の(サイレントな)単一ヌクレオチド置換によって除いた 。EpoRの膜貫通ドメインと細胞質内ドメインをコードするDNAフラグメン トを用いて、次にVEGFR2の膜貫通ドメインと細胞質内ドメインをコードす るpVEGFR2Bglの部分と置換した。このようにしてVEGFR2の細胞 外ドメインと、EpoRの膜貫通および細胞質内ドメインとからなるキメラ受容 体をコードする、単一の読み枠が生成した。 このキメラ受容体をコードするDNAフラグメントを発現ベクターpBOSに サブクローニングし、そしてプラスミドpgk−neoとともに、1:20の比 でBa/F3細胞ラインに、共−トランスフェクトした。VEGFR2−Epo Rタンパク質を発現する細胞を、VEGFR2細胞外ドメインに対するモノクロ ーナル抗体(MAb 4H3)を用いたフローサイトメトリー解析によって選抜 した。このモノクローナル抗体は、1994年2月10日に出願されたオースト ラリア特許出願第PM3794号に記載されている。高レベルのVEGFR2− EpoRを発現する細胞ラインを、細胞を、5μg/mlのMAb 4H3、ま たは25ng/mlの組換えVEGF中にて成長させることによって選抜した。 高レベルのVEGFR2−EpoRを発現する細胞ラインを、Ba/F3−NY K−EpoRと命名し、バイオアッセイのために使用した。 バイオアッセイ 前述のBa/F3−NYK−EpoR細胞を、すべてのIL−3を除去するた めにPBS中で3回洗浄し、13.5μlの培地当たり1000細胞の濃度とな るように再懸濁し、そして60穴テラサキプレートの各ウェル当たり13.5μ lのアリコットに分けた。トランスフェクトされたCOS細胞からの条件培地を 次に細胞培養培地中に希釈した。内皮細胞受容体Tie2の細胞外ドメインとE poRの膜貫通および細胞質内ドメインとからなるキメラ受容体を発現する細胞 を非−応答性コントロール細胞ラインとして用いた。細胞を48−96時間イン キュベートし、その間に細胞培養培地単独でインキュベートした細胞は死に、そ の他のウェル(即ちCOS細胞−条件培地の存在下のもの)においてみられた相対 的な生存/増殖を、ウェル当たりに存在する生細胞を数えることによってスコア した。 発現プラスミドで一過性にトランスフェクトされたCOS細胞からの条件培地 を30倍濃縮し、そしてVEGFR2バイオアッセイに使用した。pCDNA1 −ampでトランスフェクトされたCOS細胞からの濃縮された条件培地をネガ ティブコントロールとして使用した。 結果を図11に示す。ここでインキュベーション培地中の30倍濃縮されたC OS細胞−条件培地のパーセンテージ(vol/vol)に対して、48時間の インキュベーション後のウェルにおける生細胞の数がプロットされている。明ら かにVEGF−AまたはVEGF−Dのいずれかを含有する条件培地はこのアッ セイにおいて細胞の生存を促進する能力があり、これはこれら両方のタンパク質 がVEGFR2に結合してそれを活性化することができることを示唆していた。例8 血管透過性アッセイ 例6のように調製して30倍に濃縮されたヒトVEGF−Dを、麻酔されたモ ルモット(アルビノ/白色、300−400g)において行ったMiles血管 透過性アッセイ(マイルズ(Miles)およびマイルズ(Miles),1952)においてテ ストした。pCDNA1−ampでトランスフェクトされたCOS細胞からの濃 縮された条件培地を再びネガティブコントロールとして使用した。モルモットを 抱水クロラールで麻酔した(3.6g/100ml;体重10g当たり0.1m l)。次にこれら動物の背中をクリッパーで注意深く剪毛した。動物に対してエ バンスブルー色素 (MT PBS中0.5%、0.5ml)の心臓内注入を23G針を使用して行 い、そして次に100−150μlの濃縮されたCOS細胞−条件培地を皮内に 注射した。15−20分後これら動物を殺し(sacrificed)、そして背中の皮膚の 層を切除して下にある血管を露出させた。定量化のためにそれぞれの注射部分を 切除しそして2−5mlのホルムアミド中で45℃に加熱した。その結果得られ た血管外遊出した色素を含有する上清を、次に620nmで分光光度的に調べた 。 動物1については、30倍濃縮されたVEGF−A条件培地の注射に起因する 620nmでの吸光度は0.178であり、30倍濃縮されたVEGF−D条件 培地の注射に起因する620nmでの吸光度は0.114であり、そして30倍 濃縮されたpCDNA1−ampでトランスフェクトされた細胞からの培地の注 射に起因する620nmでの吸光度は0.004であった。動物2については、 30倍濃縮された培地を皮内注射の前に細胞培養培地中で4倍希釈した。VEG F−A条件(conditioned)サンプルに起因する620nmでの吸光度は0.14 1であり、VEGF−D条件サンプルに起因する620nmでの吸光度は0.1 16であり、ネガティブコントロールとして血清含量を整合したサンプルに起因 する620nmでの吸光度は0.017であった。VEGF−AまたはVEGF −Dの存在下で両方の動物について観察された、色素の血管外遊出の増強は、こ れらタンパク質の両方が血管透過性を強く誘導することを示すものであった。 ここで記載されたデータはVEGF−Dが分泌タンパク質であり、VEGF− Aの様に、VEGFR2に結合してVEGFR2を活性化し、血管透過性を誘導 することができるということを示している。例9 内部VEGF−Dポリペプチドの生理活性 VEGF−Dの推定アミノ酸配列は、他のすべてのVEGFファミリーのメン バーの配列に類似した中央部分を含んでいる(図10におけるアラインメントに 示すように、ヒトVEGF−Dアミノ酸配列のおよそ残基100から196)。 したがってVEGF−Dの生理活性の部分は、この保存領域に存在するであろう と考えられていた。この仮説についてテストするために、VEGF−Dの生合成 について研究し、そしてヒトVEGF−Dの前記保存領域を哺乳動物細胞におい て発現させ、精 製し、そして以下に記載するバイオアッセイにおいてテストした。 プラスミドコンストラクション ヒトVEGF−Dの残基93から201の部分をコードするDNAフラグメン ト、即ちN−末端およびC−末端領域を除去したもの、をテンプレートとして全 長ヒトVEGF−D cDNAを含むプラスミドを使用して、Pfu DNAポ リメラーゼを用いて、ポリメラーゼ連鎖反応によって増幅した。増幅されたDN Aフラグメントは、その配列をヌクレオチドシークエンシングによって確認し、 そして発現ベクターpEFBOSSFLAGに挿入し、それによって生じたプラ スミドをpEFBOSVEGFD△N△Cと命名した。pEFBOSSFLAG ベクターは、インターロイキン−3(IL−3)遺伝子由来のタンパク質分泌の ためのシグナル配列およびFLAGTMオクタペプチドをコードするDNAを含ん でいる。FLAGTMオクタペプチドは、M2モノクローナル抗体(IBI/Kodak)等 の市販の抗体によって認識されることができる。VEGF−D PCRフラグメ ントを、IL−3シグナル配列がFLAGTM配列のすぐに上流となり、そしてF LAGTM配列がVEGF−D配列のすぐに上流となるように、そのベクターに挿 入した。3つの配列すべてが同じ読み枠内となり、そのため哺乳動物細胞へのp EFBOSVEGFD△N△Cのトランスフェクションの結果として起こるmR NAの翻訳により、そのN−末端にIL−3シグナル配列を有し、続いてFLA GTMオクタペプチドおよびVEGF−D配列が並ぷタンパク質が生じるであろう 。シグナル配列の切断と引き続いて起こる細胞からのタンパク質の分泌により、 N−末端に隣接してFLAGTMオクタペプチドがタグ付加されたVEGF−Dポ リペプチドが生じるであろう。このタンパク質をVEGFD△N△Cと命名した 。 さらに、ヒトVEGF−Dの全長コード配列が、FLAGTMオクタペプチドの 配列がVEGF−Dのコード配列のすぐ下流となり、そしてVEGF−Dのコー ド配列と同じ読み枠となるようにpEFBOSIFLAGに挿入された、pEF BOSVEGFDfullFLAGと称する第2のプラスミドを構築した。プラ スミドpEFBOSIFLAGはIL−3シグナル配列を有さず、したがってV EGF−D/FLAG融合タンパク質の分泌はVEGF−Dのシグナル配列によ って行われた。pEFBOSVEGFDfullFLAGはC−末端にFLAGTM オクタペプチドがタグ付加された全長のVEGF−Dを哺乳動物細胞中で発現 させるようにデザインされた。このタンパク質をVEGFDfullFLAGと 命名し、これはVEGF−D生合成の研究にとって有用である。 VEGF−Dの翻訳後プロセシングについての分析 VEGF−Dポリペプチドがプロセシングされて成熟した完全に活性のあるタ ンパク質となるか否かを調べるため、pEFBOSVEGFDfullFLAG をCOS細胞に一過性にトランスフェクトした(アルッフォ(Aruffo)およびシ ード(Seed),1987)。COS細胞中での発現、そしてその後の35S−メチオニン /システインでの生合成ラベリングおよびM2ゲルでの免疫沈降によって、およ そ43kD(fA)および25kD(fB)の種が示された(図12A)。これら のバンドは、VEGF−Dは切断されてC−末端フラグメント(FLAGTMがタ グ付加)および内部ペプチド(ほぼVEGFD△N△Cタンパク質に対応する) を生じるという考えに一致する。免疫沈降の還元(M2)によっていくらかf Aバンドが還元され、これは2つのフラグメントの間のジスルフィド結合の可能 性を示すものである。 内部VEGF−Dポリペプチドの発現および精製 プラスミドpEFBOSVEGFD△N△Cを用いて、以前に記載されたDE AE−デキストラン法(アルッフォ(Aruffo)およびシード(Seed),1987)によ ってCOS細胞に一過性にトランスフェクトした。その結果得られる条件細胞培 養培地(およそ150ml)を、7日間のインキュベーションの後収集し、M2 モノクローナル抗体を結合させた樹脂を用いたアフィニティークロマトグラフィ ーにかけた。簡単に説明すると、前記培地を、1mlのM2抗体カラムに、およ そ4時間、4℃でバッチ式に流した。カラムを次に10mM Tris−HCl 、pH8.0、150mM NaClで十分に洗浄し、その後同じバッファー中 で25μg/mlの遊離のFLAGTMペプチドで溶出した。その結果得られた物 質を以下に記載するバイオアッセイにおいて使用した。 精製されたVEGFD△N△Cを検出するためにM2アフィニティーカラムか ら溶出されたフラクションをウエスタンブロット分析にかけた。カラムフラクシ ョンのアリコットを2xSDS−PAGEサンプルバッファーと混ぜボイルして 15%SDSポリアクリルアミドゲルにローディングした。分離したフラクショ ンをニトロセルロースメンブランにトランスファーし、そして非−特異的結合部 位を、Tris/NaCl/Tween20(TST)および10%脱脂粉乳(B LOTTO)中でのインキュベーションによりブロッキングした。メンブランを次に3 μg/mlのモノクローナル抗体M2またはコントロール抗体とともに室温で2 時間インキュベートし、その後TST中で十分に洗浄した。次にメンブランを二 次ヤギ抗−マウスHRP−結合抗血清とともに室温で1時間インキュベートし、 その後TSTバッファー中で洗浄した。タンパク質種の検出は化学発光試薬(ECL ,Amersham)を用いて行った(図12B)。 非還元条件下において分子量およそ23kDの種(VEGFD△N△C)が、 M2抗体によって検出された。これは、この内部フラグメントに対する予想分子 量(12,800)にN−結合型グリコシル化を足したものと一致する; VEGFD△N△Cは2つの潜在的N−結合型グリコシル化部位を含んでいる。 およそ40kDの種も検出されたが、これは前記23kDタンパク質(VEGF D△N△C)の非−共有結合性のダイマーを表すものである可能性がある。 バイオアッセイ ポリペプチドがVEGF受容体−2に結合する能力についてのバイオアッセイ に関しては例7において詳細に記載されている。M2アフィニティーカラムから 溶出したVEGFD△N△Cタンパク質を含有するフラクションのアリコットを 培地で希釈し、そして以前に記載されたようにVEGFR2バイオアッセイにお いてテストした。精製VEGFD△N△Cタンパク質を含有することが示された (図12B)、アフィニティーカラムからのフラクション#3は、この精製フラク ションの希釈度1/100まで、バイオアッセイ細胞ラインの増殖を誘導する明 らかな能力を示した(図13)。それに対して、アフィニティーカラムのボイド容 量(フラクション #1)は活性を示さず、一方オリジナルのVEGFD△N△C条件培地は弱い活 性しか示さなかった。 血管透過性アッセイ(マイルズ(Miles)およびマイルズ(Miles),1952)は例 8において簡単に記載されている。精製VEGFD△N△Cのアリコットおよび M2アフィニティーカラムのボイド容量のサンプル(ネガティブコントロール) を培地と混合し、モルモットの皮膚に、皮内注入(注射)した。注射部位の皮膚 の領域を切除し、そして血管外遊出した色素を溶出させた。精製VEGFD△N △Cの注入に起因する620nmにおける血管外遊出した色素の吸光度は0.1 31±0.009であった。それに対してボイド容量のサンプルの注入に起因す る吸光度値は0.092±0.020であった。したがってVEGFD△N△C は血管透過性を誘導したが、その効果は僅かな(marginal)ものでしかなかった。 VEGFR2に結合する能力があること、および、全長VEGF−Dに比べて 血管透過性の誘導が低いということから、VEGF−D△N△Cは競合阻害によ って、VEGF−Dによる血管透過性の誘導を相対的に低下させるといえるかも しれない。この意味において、VEGF−D△N△Cフラグメントは、血管透過 性の誘導に関してVEGF−Dに対するアンタゴニストであると考えられる可能 性がある。 要約 2つの要因によって我々は活性の促進についてVEGF−Dの内部フラグメン トを探索することにした。まず第1に、VEGFファミリーのその他のすべての メンバーとアミノ酸ホモロジーを示すのは、VEGF−Dの中央部分であるとい うことがある。第2に、PDGF−BB等の他の増殖因子では内部生理活性ポリ ペプチドの生成を引き起こすタンパク分解性プロセシングが起こるということが ある。更にCOS細胞中の全長VEGF−Dタンパク質について見られる活性は 、VEGF−AをトランスフェクトされたCOS細胞からの条件培地に対応する ものよりも低かった。 成熟VEGF−D配列は、FAA^TFYおよびIIRR^SIQIで切断さ れ、残基92−205内に含まれるフラグメントに由来するであろうということ が予想された。COS細胞中で発現させたVEGF−DfullFLAGの免疫 沈降分 析から、VEGF−Dポリペプチドの、これらの部位における内部タンパク分解 性切断物(cleavage)と一致する種が生じていた。したがって、N−末端およびC −末端領域が除去された(VEGFD△N△C)、切形(truncated)形態のVEG F−Dが、COS細胞中で産生および発現されていた。このタンパク質をM2抗 体を用いて同定および精製した。VEGFD△N△Cタンパク質は、VEGF− Dの92−205フラグメント内のペプチドを認識する、A2抗体によっても検 出された(ここでは示されていない)。VEGFD△N△CをVEGFR2バイオ アッセイおよびMiles血管透過性アッセイによって評価したところ、VEG FR2の細胞外ドメインとのクロスリンクを検出するようにデザインされたバイ オアッセイにおいて、VEGFR2受容体に結合してそれを活性化することが示 された。Milesアッセイにおけるこのポリペプチドによる血管透過性の誘導 は、VEGF−Aの効果とは対照的に最低限のものであった。例10 VEGF−DのVEGFR−3に対する結合および活性化 組換えVEGF−Dの産生のために、ヒトVEGF−D cDNAをバキュロ ウイルスシャトルベクターにクローニングした。無修飾のVEGF−D cDN A(“全長VEGF−D”と称する)を含む、バキュロウイルスシャトルベクター の他に、VEGF−D cDNAが以下のように修飾された2種のバキュロウイ ルスシャトルベクターを構築した。 一つのコンストラクト(“全長VEGF−D−H6”と称する)においては、 C−末端にヒスチジンタグを付加した。もう一方のコンストラクトにおいては、 推定上のN−末端およびC−末端のプロペプチドを除去し、メリチンシグナルペ プチドをイン・フレームにてN−末端に融合させ、そして残りのVEGFホモロ ジードメインのC−末端にヒスチジンタグを付加した(“△N△C−MELsp −VEGF−D−H6”と称する)。 前記3つのコンストラクトのそれぞれについて、2または3の独立のトランス フェクションの、バキュロウイルスのクローンを増幅した。High Five (HF)細胞の上清を、高いタイターのウイルスストックでの感染の48時間後 に収集した。上清を、NaOHでpH7に調整し、一容量のD−MEM(0.2 % FCS)で希釈した。 ヨウコフ(Joukov)他,1996に記載されているように、サンプルをNIH3T 3細胞上のVEGFR−3(Flt4受容体)のチロシンリン酸化を刺激する能 力についてテストした。感染していない細胞の上清と、VEGFR−3のチロシ ンリン酸化を刺激しない、VEGF−Cの短い(short)スプライスバリアントで 感染させた細胞の上清とを、ネガティブコントロールとして使用した。△N△C −melSP−VEGF−D−H6と同じ様に修飾したVEGF−Cをポジティ ブコントロールとして使用した。結果を図14に示す。 125および195kDの新しいバンドの出現は、受容体のリン酸化、したが って受容体の活性化を示す。例11 VEGF−DのVEGFR−2に対する結合および活性化 例10において記載されているように組換えVEGF−Dの産生のために、修 飾および無修飾のヒトVEGF−D cDNAをバキュロウイルスシャトルベク ターにクローニングした。 前記3つのコンストラクト、全長VEGF−D、全長VEGF−D−H6、お よび△N△C−melSP−VEGF−D−H6のそれぞれについて、2または 3の独立のトランスフェクションの、バキュロウイルスのクローンを増幅した。 High Five(HF)細胞の上清を、高いタイターのウイルスストックで の感染の48時間後に収集した。上清を、NaOHでpH7に調整し、一容量の D−MEM(0.2% FCS)で希釈した。 ヒスチジンタグ付加されたタンパク質によって条件づけられた(conditioned) 上清について、ヨウコフ(Joukov)他,1996にしたがって、KDR受容体のチロ シンリン酸化を刺激する能力についてテストした。KDRは、flk1(VEG FR2)のヒトホモローグである。 感染していない細胞の上清と、KDRを刺激しない、VEGF−C 156S ミュータントで感染させた細胞の上清とを、ネガティブコントロールとして使用 した。VEGF165と△N△C−melSP−VEGF−D−H6と同じ様に修飾 したVEGF−Cとをポジティブコントロールとして使用した。結果を図15に 示す。 およそ210kDの新しいバンドの出現は、受容体のリン酸化、したがって受 容体の活性化を示す。例12 VEGF−D遺伝子発現の分析 ヒトおよびマウス胚におけるVEGF−D遺伝子発現のパターンをキャラクタ ライズするために、VEGF−D cDNAを、ポリアデニル化されたヒトRN Aのノーザンブロット分析、およびマウス胚を用いたin situハイブリダイゼー ション分析のための、ハイブリダイゼーションプローブとして使用した。 成人(adult human)における遺伝子発現 図4(配列番号4)に示すヒトVEGF−D cDNAの、EcoRV部位か ら3’−末端にわたる(ヌクレオチド911から2029)1.1kbフラグメ ントをMegaprime DNAラベリングシステム(Amersham)を用いて製造業者の指 示に従って、[α−32P]dATPで標識した。このプローブを用いて、再び製 造業者の指示に従って、ヒト多組織ノーザンブロット(Clontech)を、ハイブリダ イゼーションによってスクリーニングした。これらのブロットは、見かけ上病気 を患っていない成人の組織から得られたポリアデニル化されたRNAを含むもの であった。標識されたブロットのオートラジオグラフィーにより、VEGF−D mRNAは、心臓、肺、および骨格筋において最も大量であることが明らかに なった。VEGF−D mRNAは、脾臓、卵巣、小腸および大腸においては中 程度に豊富であり、そして腎臓、膵臓、胸腺、前立腺および精巣においては少量 であった。脳、胎盤、肝臓または末梢血白血球からのRNAにおいては、VEG F−D mRNAは検出されなかった。、VEGF−D mRNAが検出された 組織のほとんどにおいては転写産物のサイズは2.3kbであった。唯一の例外 は骨格筋であり、2.3kbと2.8kbの2種のVEGF−D転写産物が検出 された。骨格筋において2.3kbの転写産物の方が、2.8kbの転写産物よ りも大量であった。 マウス胚における遺伝子発現 マウスVEGF−D mRNAに対するアンチセンスRNAプローブを生成す る ために、図7(配列番号7)に示すマウスVEGF−D2 cDNAを、転写ベ クターpBluescriptIIKS+(Stratagene)に挿入した。その結果得 られたプラスミドを制限酵素(制限エンドヌクレアーゼ)FokIで完全に(toc ompletion)消化し、そしてT3RNAポリメラーゼを用いたin vitro転写反応の ためのテンプレートとして使用した。この転写反応は、VEGF−D2 cDN A(図7)の3’−末端から、最も3’−末端に近いFokI切断部位にわたる 領域(ヌクレオチド1135から700)に対して、配列において相補的なVE GF−D mRNAに対するアンチセンスRNAプローブを生じさせるものであ った。このアンチセンスRNAプローブを、交尾後15.5日のマウス胚から作 成したパラフィン包埋した組織切片と、高いストリンジェンシーにてハイブリダ イズさせた。ハイブリダイゼーションと洗浄は、本質的に以前に記載されたもの と同様であった(アーヘン(Achen)他,1995)。 洗浄と乾燥の後、スライドを6日間オートラジオグラフィーフィルムに露光し た。 オートラジオグラフィーフィルムの現像により、VEGF−D mRNAは、 交尾後15.5日の胚の発生中の肺に局在していることが明らかになった。肺に おけるこのVEGF−D mRNAに対するシグナルは、強く、そして高度に特 異的なものであった。センスプローブでのコントロールハイブリダイゼーション では、肺においてもその他の組織においても検出可能なバックグラウンドは見ら れなかった。 要約 VEGF−D遺伝子は成人において広く発現しているが、確実に遍在性に発現 している訳ではない。最も強い発現は、心臓、肺および骨格筋において検出され た。交尾後15.5日のマウス胚において、強い特異的なVEGF−D遺伝子発 現が肺において検出された。これらのデータは、VEGF−Dが肺の発達におい て役割を果たしている可能性があること、および肺におけるVEGF−D遺伝子 発現が、少なくともヒトでは成体においても持続していることを示唆している。 成人における他の組織での遺伝子発現は、VEGF−Dがその他の成体組織にお いて別の機能を果たしているということを示唆している。例13 VEGF−Dは内皮細胞に対して(細胞)分裂促進性である VEGFファミリーのタンパク質のいくらかのメンバー、すなわちVEGF− A(リョン(Leung)他,1989)およびVEGF−B(オロフソン(Olofsson)他, 1996)は、内皮細胞に対して(細胞)分裂促進性である。内皮細胞に対するVE GFD△N△Cの分裂促進能力をテストするために、このタンパク質を例9に記 載されているように発現させ、アフィニティークロマトグラフィーによって精製 した。VEGFD△N△Cを含有する、M2アフィニティーカラムから溶出した 、フラクション#3を、5%血清を含む細胞培養培地中で10分の1に希釈し、 そして10%血清を含む培地中で増殖させたウシ大動脈内皮細胞(BAE)に与 えた。BAEは、VEGFD△N△Cの添加の前日にウェル当たり10,000 細胞の密度で24−穴シャーレに播いておき、このポリペプチドの添加の3日後 、細胞をトリプシンによって解離させ、数えた。ポジティブコントロールとして この実験に精製VEGF−Aを用いた。結果を図16に示す。細胞培養培地にフ ラクション#3を添加することにより、インキュベーションの3日後のBAEの 数は2.4倍に増加し、この結果はVEGF−Aについて得られたものに匹敵す るものであった。明らかにVEGFD△N△Cは内皮細胞に対して分裂促進性で ある。例14 ヒト染色体上のVEGF−D遺伝子の局在 ヒト染色体上のVEGF−D遺伝子の局在化のためのハイブリダイゼーション プローブを作成するために、ヒトゲノムDNAライブラリー(Clontech)から、V EGF−DのヒトゲノムDNAクローンを単離した。ゲノムライブラリーを、標 準的方法(サムブルック(Sambrook)他,1989)を用いて、図4に示すヒトVEG F−D cDNAでのハイブリダイゼーションによってスクリーニングした。そ のようにして単離したクローンの1つは、ヒトVEGF−D cDNAからの配 列に由来する多数のオリゴヌクレオチドに対するハイブリダイゼーションにより 、VEGF−D遺伝子の部分を含んでいることが示された。およそ13kbのサ イズの、このゲノムクローンの領域をアガロースゲルから精製し、ビオチン−1 4−dATPでニックトランスレーションによって標識し、そして2人の正常ヒ ト男性からの(分裂)中期(metaphase)に対して最終濃度20ng/μlにてin situでハ イブリダイズさせた。蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)法を以 前に記載されたもの(カレン(Callen)他,1990)から以下の点において改変した 。つまり、染色体をよう化プロピジウム(対比染色として)とDAPI(染色体 同定のため)で分析の前に染色した。中期標本のイメージ(像)を、the Cyto V ision Ultra image collection and enhancement system(Applied Imaging Int. Ltd.)を用いて、冷却CCDカメラで捕らえた。FISHシグナルとDAPI結 合パターンを分析のために組み合わせた(merged)。 一人目の正常男性からの15の中期(metaphases)を蛍光シグナルについて調べ た。中期のうち10は、X染色体のバンドp22.1の、1つの染色分体上(3 細胞)または両方の染色分体上(7細胞)にシグナルを示した。これら15の中 期において、全部で9の非−特異的バックグラウンドドット(dots)が観察された 。二人目の正常男性からの15の中期に対するプローブのハイブリダイゼーショ ンからも同様の結果が得られ、その際、シグナルは7細胞においては1つの染色 分体上、そして4細胞においては両方の染色分体上に、Xp22.1において観 察された。結論を述べると、ヒトVEGF−D遺伝子はX染色体のバンドp22 .1上に位置している。例15 マウス染色体上のマウスVEGF−D遺伝子の局在 VEGF−D遺伝子のマウス染色体の位置を、以前に記載されているように( コープランド(Copeland)およびジェンキンス(Jenkins),1991)、(C57B L/6JxMus Spretus)F1雌とCB7BL/67雄とを交配することによっ て得られた子孫を用いた種間戻し交雑分析によって決定した。この種間戻し交雑 マッピングパネルは、すべての常染色体およびX染色体の間に広く分布する、2 400以上の遺伝子座についてタイプされている(コープランド(Copeland)お よびジェンキンス(Jenkins),1991)。C57BL/6JおよびM.SpretusのDN Aをいくつかの酵素で消化し、そして情報源である(informative)制限断片長多 型(RFLP)について、本質的に記載されたように(ジェンキンス(Jenkins) 他,1982)、1.3kbのマウスVEGF−D cDNAプローブを用いてサザン ブロットハイブリダイゼーションによって分析した。TaqIで消化したC57 BL/6JDNAにおいて、7.1、6.3、4.7、2.5および2.2kb のフラグメン トが検出され、そしてTaqIで消化したM.Spretus DNAにおいて、7.1 、3.7、2.7、および2.2kbの主要なフラグメントが検出された。同時 分離した、3.7および2.7のTaqIM.Spretus特異的フラグメントの存在 または不在は戻し交雑したマウスにおいて伴った(followed)。マッピングの結果 は、VEGF−D遺伝子が、Bik、DxPasIおよびPtmb4に連鎖(リ ンク)して、マウスX染色体の末端領域に位置するということを示す。89のマ ウスにおいてはすべてのマーカーについて分析したが、133のマウスはいくつ かのマーカーの対についてタイプした。それぞれの遺伝子座を、追加のデータを 用いて組換え頻度について対の組み合わせにおいて分析した。各遺伝子座の対に ついて分析したマウスの総数に対する、組換え染色体を示すマウスの総数の比、 および最も確からしい遺伝子順序は以下の通りである:セントロメア−Btk− 14/121−DxPasI−3/99−VEGF−D−5/133−Ptmb 4。Map Manager(version 2.6.5)を用いて算出した組換え頻度[遺伝的距離とし て、センチモルガン(cM)±標準誤差にて表現した]は、−Btk−11.6 +/−2.9−DxPasI−3.0+/−1.7−VEGF−D−3.8+/ −1.7−Ptmb4である。Btk、DxPasI、およびPtmb4を含む 、VEGF−D遺伝子に連鎖した遺伝子座についてのプローブおよびRFLPの 記載は、以前に報告されたものである(ハックフリガー(Hacfliger)他,1992; ホロウェイ(Holloway)他,1997)。 我々は、我々のX染色体の種間(遺伝学的)地図と、多くのクローニングされ ていない突然変異の地図位置を報告している複合性のマウス連鎖地図(The Jack son Library,Bar Harbor,MEに維持されているコンピュータ処理したデータベー スである、Mouse Genome Databaseから提供されたもの)とを比較した。内皮細 胞分裂促進因子の遺伝子座における変化に関して予期されるであろう、マウスの 表現型の突然変異を欠くものである、複合性の(遺伝学的)地図の領域にVEG F−D遺伝子を、(染色体上に)位置づけた。マウスX染色体の末端領域は、ヒ ト染色体の短腕と、ホモロジー領域を共有している(Mouse Genome Database)。 マウスにおけるこの間隔でのVEGF−D遺伝子の配置は、ヒトホモローグが染 色体上でXp22に位置するであろうということを示唆している。これは、この ヒト遺伝子が Xp22.1に局在するとした我々のFISH分析と一致する。 多数の疾患状態が、ヒトにおいて、Xp22.1およびこの領域のすぐ周囲の 位置に位置づけられた未知の遺伝子における突然変異によって引き起こされる。 これらの疾患状態には、カルマン症候群、眼球白子症(Nettleship− Falls型)、眼球白子症および感音系難聴、Partington症候群、 脊椎骨異形成症(遅発型)、網膜色素変性症15、性腺形成異常症(XY女性型)、 Nance−Horan白内障−歯症候群、網膜分離症、シャルコー-マリー-ツ ース病、F−細胞産生、低マグネシウム血症、毛包性角化症spinulosa decalvance、コフィン-ローリー症候群、角膜類皮腫、低リン酸塩血 症、無ガンマグロブリン血症、エカルディ症候群、遺伝性低リン酸血症II、精神 薄弱(非−異形)、オピッツG症候群、色素障害(網状)、dosage−sens itive性転換、副腎形成不全、網膜色素変性症−6、難聴−4(先天性感音 性)、およびウィルソン−ターナー症候群が含まれる。これらの疾病状態に関与 する遺伝子の位置は、Johns Hopkins University(USA)のDr.Victor McKusickお よびその同僚によって編集されたOMIM遺伝子地図に示されている。VEGF−Dの機能の判定のためのバイオアッセイ VEGF−Dが、内皮細胞に対する機能、血管新生および創傷治癒に関して、 VEGFと類似の活性を有するか否かを評価するための他のアッセイを行った。 受容体結合分布研究の結果によっては更なるアッセイを行ってもよいであろう。 I.内皮細胞に対する機能についてのアッセイ a)内皮細胞増殖 内皮細胞増殖アッセイを、例えばファーララ(Ferrara)およびヘンゼル(Hen zel)(1989),ゴスポダロヴィッツ(Gospodarowicz)他(1989),および/または クラッフェイ(Claffey)他,Biochim.Biophys.Acta,1995 1246 1-9の方法などの 、当業者に周知の方法によって行う。 b)細胞接着アッセイ 多形核顆粒球の内皮細胞に対する接着に関するVEGF−Dの効果についてテ ストする。 c)走化性 標準的なボイデンチャンバー(Boyden Chamber)走化性アッセイを用いて、走化 性に関するVEGF−Dの効果についてテストする。 d)プラスミノーゲン活性化因子アッセイ ペッパー(Pepper)他(1991)の方法を用いて、内皮細胞を、プラスミノーゲン 活性化因子およびプラスミノーゲン活性化因子阻害剤の産生に関するVEGF− Dの効果についてテストする。 e)内皮細胞遊走アッセイ モンテサノ(Montesano)他(1986)に記載されているようにして、内皮細胞の 遊走および管(チューブ)の形成を刺激するVEGF−Dの能力についてアッセ イする。別法として、ヨウコフ(Joukov)他(1996)によって記載された三次元コ ラーゲンゲルアッセイまたは改変ボイデンチャンバー(Boyden Chamber)における ゼラチン化メンブラン(グレイザー(Glaser)他,1980)を用いてもよい。 II.血管新生アッセイ リョン(Leung)他(1989)に記載されているようにして、ニワトリ漿尿膜にお ける血管形成応答を誘導するVEGF−Dの能力についてテストする。別法とし てラスティネジャド(Rastinejad)他(1989)のラット角膜アッセイを用いてもよ い;これはin vivo血管新生アッセイについて受け入れられている方法であり、 その結果はその他のin vivoシステムにすぐに移行可能である。 III.創傷治癒 創傷治癒を刺激するVEGF−Dの能力について、シリング(Schilling)他( 1959)によって記載され、ハント(Hunt)他(1967)によって利用された、使用可 能な臨 床的に最も関連性のあるモデルにおいてテストする。 IV.造血系 造血系に特異的な細胞集団を用いた多様なin vitroおよびin vivoのアッセイ が当業者に知られているが、以下にその概要を述べる。具体的には、蛍光活性化 セルソーターで精製した細胞を用いた多様なin vitroマウス幹細胞アッセイが特 に便利である。 a)再増殖幹細胞 これらは致死照射されたマウスの骨髄を再増殖させることができ、そしてLi n-、Rhh1,Ly−6A/E+−kit+の表現型を有する細胞である。VEG F−Dを、これらの細胞単独と、またはその他の因子とともに、共−インキュベ ーションし、その後3H−チミジン取り込みによる細胞の増殖の測定を行うこと によってテストする。 b)後期段階幹細胞 これらは比較的弱い骨髄再増殖能力を有するが、D13 CFU−Sを産生す ることができる細胞である。これらの細胞はLin-、Rhh1,Ly−6A/E+ 、c−kit+の表現型を有する。VEGF−Dを、これらの細胞とともに一定 期間インキュベートし、致死照射されたレシピエントに注入し、そしてD13脾 コロニーの数を数える。 c)前駆(progenitor)-濃縮細胞 これらはin vitroで単一の増殖因子に応答し、Lin-、Rhh1,Ly−6A /E+、c−kit+の表現型を有する細胞である。このアッセイは、VEGF− Dが直接的に造血前駆細胞に対して作用することができるか否かを示すものであ る。VEGF−Dをこれらの細胞とともに寒天培養においてインキュベートし、 そして7−14日後に存在するコロニーの数を数える。 V.アテローム性動脈硬化症 平滑筋細胞はアテローム性動脈硬化症の発達または惹起において重大な役割を 果たしており、それはそれらの表現型が収縮性から合成の状態へと変化すること を必要とする。マクロファージ、内皮細胞、Tリンパ球および血小板はすべて、 平滑筋細胞の増殖および表現型の変調に影響を与えることによって、アテローム 斑の発達において役割を果たしている。その中において異なる細胞タイプが対の (opposite)カバーグラスに播かれる、改変Roseチャンバーを使用したin vit roアッセイは、多細胞の環境における平滑筋細胞の増殖速度および表現型の変調 を測定するものであり、それを用いてVEGF−Dの平滑筋細胞に対する効果が 評価される。 VI.転移 転移を阻害するVEGF−Dの能力について、例えばカオ(Cao)他(1995)の 方法を使用して、ルイス肺癌モデルを用いてアッセイする。 VII.その他の細胞タイプにおけるVEGF−D 他の細胞タイプ、例えば肝臓細胞、心筋およびその他の細胞、内分泌細胞そし て骨芽細胞(造骨細胞)の、増殖、分化そして機能に対するVEGF−Dの効果 は、in vitro培養による3H−チミジン取り込みなどの当業者に周知の方法によ って簡単にアッセイすることができる。これらおよびその他の組織におけるVE GF−Dの発現は、ノーザンブロッティングおよびハイブリダイゼーション等の 技術、またはin situハイブリダイゼーションによって判定することができる。 VIII.VEGF−D変異体(variant)およびアナログの作成 VEGF−Dは、PDGFファミリーの増殖因子のメンバーであり、PDGF ファミリーのその他のメンバーと高度なホモロジーを示す。VEGF−Dはこの ファミリーの増殖因子に特有の8つの保存されたシステイン残基を含む。これら の保存されたシステイン残基は、システインノット構造を作る、鎖内ジスルフィ ド結合、およびPDGFファミリーの増殖因子のメンバーの特徴であるタンパク 質ダイマーを作る、鎖間ジスルフィド結合を形成する。VEGF−Dは、タンパ ク質チロシン キナーゼ増殖因子受容体と相互作用する。 受容体への結合およびその結果としての活性のために必要とされる、タンパク 質の構造および活性部位について、ほとんどまたはまったく知られていないタン パク質とは対照的に、VEGF−Dの活性のあるミュータントのデザインは、P DGFファミリーの増殖因子のメンバーの、活性部位および重要なアミノ酸につ いて多くの知見が得られているという事実によって大幅に促進される。 PDGFファミリーの増殖因子のメンバーの、構造/活性の関係を明らかにす る既発表論文には、以下のものが含まれる。PDGFについて:エストマン(Oes tman)他,J.Biol.Chem.,1991 266 10073-10077;アンダーソン(Andersson)他,J. Biol.Chem.,1992 267 11260-1266;エフナー(Oefner)他,EMBO J.,1992 11 3921-3 926;フレミング(Flemming)他,Molecular and Cell Biol.,1993 13 4066-4067 およびアンダーソン(Andersson)他,Growth Factors,1995 12 159-164;そして VEGFについて:キム(Kim)他,Growth Factors,1992 7 153-64;ペトジェン ス(Poetgens)他,J.Biol.Chem.,1994 269 32879-32885およびクラッフェイ(Cl affey)他,Biochem.Biophys.Acta,1995 1246 1-9。これらの出版物から、8つの 保存されたシステイン残基のために、PDGFファミリーの増殖因子のメンバー は、特徴的なノットのある折りたたみ構造および二量体化を示し、その結果、二 量体化した分子のそれぞれの端において3つの露出されたループ領域が形成され 、そこにおいて活性受容体結合部位が位置していると予想され得るということが 明らかである。 この情報に基づいて、バイオテクノロジー技術分野に習熟した当業者は、ノッ トのある折りたたみ配列および二量体化の原因である8つのシステイン残基を保 存することによって、およびタンパク質構造のループ1、ループ2、ループ3領 域におけるおそらく受容体配列である配列を保存するか、または保存的なアミノ 酸置換のみを行うことによっても、VEGF−D活性を高い確率で保持するVE GF−Dミュータントをデザインすることができる。 タンパク質構造において、特異的に標的とする部位における所望の(突然)変 異の形成はタンパク質化学者の技術の蓄積において標準的な技術であると考えら れる(クンケル(Kunkel)他,Methods in Enzymol.,1987 154 1367-382)。VEG Fに関するそのような部位特異的突然変異誘発の例は、ペトジェンス(Poetgens) 他,J.Biol. Chem.,1994 269 32879-32885およびクラッフェイ(Claffey)他,Biochim.Biophys. Acta,1995 1246 1-9において見ることができる。事実、部位特異的突然変異誘発 は、非常に一般的なものであるのでそのような方法を容易にするキットは市販さ れている(例えばPromega 1994-1995 Catalog.,Pages 142-145)。 VEGF−Dミュータントの内皮細胞増殖活性は、よく確立されているスクリ ーニング手法によってに簡単に確認することができる。例えば、クラッフェイ( Claffey)他,(Biochim.Biophys.Acta,1995 1246 1-9)によって記載されている内 皮細胞有系分裂アッセイに類似の手法を利用することができる。同様に、その他 の細胞タイプの増殖、細胞分化およびヒトの転移に対するVEGF−Dの効果は 、当業者に周知の方法を用いてテストすることができる。 本発明を明瞭化および理解の目的でかなり詳細に記載したが、この明細書にお いて開示した発明の概念の範囲から逸脱することなく、ここに記載した態様およ び方法に対する様々な改変および変更を行うことができるということは、当業者 にとって明らかであろう。 ここで引用した文献を以下の頁においてリストし、この記載により、それらは 参考文献として本出願にその内容が合体される。
【手続補正書】特許法第184条の8第1項 【提出日】平成10年9月30日(1998.9.30) 【補正内容】 特許請求の範囲 1. 配列番号3,配列番号5,配列番号8,または配列番号9に示すアミノ酸 配列に実質的に相当するアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸配 列からなる単離核酸分子であって、前記ポリペプチドが、血管透過性または内皮 細胞の増殖を刺激する能力を有するか、または、それらのフラグメントまたはア ナログが、血管新生、血管透過性、内皮細胞増殖、分化、遊走もしくは生存から なるグループから選択される少なくとも一つの生物活性を刺激する能力を有する か、あるいは内皮細胞に結合する能力を有するが少なくとも一つの前記生物活性 を刺激する能力を有さない、配列番号3,配列番号5,配列番号8,または配列 番号9に示すアミノ酸配列に実質的に相当するアミノ酸配列を有するポリペプチ ドをコードする核酸配列からなる単離核酸分子。 2. 前記核酸分子がアミノ酸配列、 ドする核酸配列を含む、請求項1の核酸分子。 3. 前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項1の核酸分子。 4. ゲノムDNAである、請求項1の核酸分子。 5. cDNAである、請求項1の核酸分子。 6. アミノ酸配列、 ドし、そして、配列番号1,配列番号4,配列番号6,配列番号7の核酸配列、 または、ストリンジェントな条件下で前述の配列の一つとハイブリダイズするD NA配列を有する、請求項5の核酸分子。 7. 配列番号4の核酸配列を有する、請求項6の核酸分子。 8. 血管透過性または内皮細胞の増殖を刺激する能力を有するポリペプチドを コードする、請求項1〜7のいずれかの核酸分子。 9. 配列番号3の64から172のアミノ酸残基、または、配列番号5の93 から201のアミノ酸残基を有するポリペプチドをコードする、請求項1の核酸 分子。 10.前記ポリペプチドが、更にアフィニティータグペプチド配列を有する、請 求項9の核酸分子。 11.内皮細胞に結合する能力を有するが内皮細胞の増殖を刺激する能力を有さ ないポリペプチドをコードする、請求項1〜7のいずれかの核酸分子。 12.前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項11の核酸分子。 13.前記核酸分子がヒトDNA分子である、請求項1の核酸分子。 14.請求項1〜7,9,10および13のいずれかの核酸を有するベクター。 15.請求項14のベクターでトランスフォームまたはトランスフォームされた 宿主細胞。 16.配列番号3,配列番号5,配列番号8,または配列番号9に示すアミノ酸 配列に実質的に相当するアミノ酸配列を有する単離ポリペプチドであって、前記 ポリペプチドが、血管透過性または内皮細胞の増殖を刺激する能力を有するか、 または、それらのフラグメントまたはアナログが、細胞増殖、細胞分化、細胞遊 走、細胞生 存、および血管透過性からなるグループがら選択される少なくとも一つの内皮細 胞生物活性を刺激する能力を有するか、あるいは内皮細胞に結合する能力を有す るが少なくとも一つの前記生物活性を刺激する能力を有さない、配列番号3,配 列番号5,配列番号8,または配列番号9に示すアミノ酸配列に実質的に相当す るアミノ酸配列を有する単離ポリペプチド。 17.前記ポリペプチドが、アミノ酸配列、 る、請求項16のポリペプチド。 18.前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項16のポリペプチド。 19.配列番号3または配列番号5に実質的に相当するアミノ酸配列を有する、 請求項16のポリペプチド。 20.配列番号5に実質的に相当するアミノ酸配列を有する、請求項19のポリ ペプチド。 21.内皮細胞の増殖を刺激する能力を有する、請求項16〜20のいずれかの ポリペプチド。 22.内皮細胞の分化を誘導する能力を有する、請求項16〜20のいずれかの ポリペプチド。 23.血管透過性を誘導する能力を有する、請求項16〜20のいずれかのポリ ペプチド。 24.配列番号3の64から172、または、配列番号5の93から201、の ア ミノ酸残基を有する、請求項16のポリペプチド。 25.更にアフィニティータグペプチド配列を有する、請求項24のポリペプチ ド。 26.内皮細胞に結合する能力を有するが内皮細胞の増殖を刺激する能力を有さ ない、請求項16または17のポリペプチド。 27.前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項26のポリペプチド。 28.前記ポリペプチドがヒトタンパク質である、請求項16〜20のいずれか のポリペプチド。 29.請求項16〜20,24および25のいずれかのポリペプチドと特異的に反応 性を有する抗体。 30.前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項29の抗体。 31.前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項29の抗体。 32.前記抗体が検出可能なラベルで標識されている、請求項29の抗体。 33.請求項16のポリペプチドを作る方法であって、前記方法が以下の工程: 前記ポリペプチドをコードする核酸配列が発現するように、プロモーター配列 に操作可能に結合した前記ポリペプチドをコードする核酸配列を有するベクター でトランスフォームまたはトランスフェクトされた宿主細胞を培養する工程;そ して 前記宿主細胞から、または前記宿主細胞が培養される増殖培地から前記ポリペ プチドを単離する工程、 を有する請求項16のポリペプチドを作る方法。 34.請求項16のポリペプチドを単離する方法であって、前記ポリペプチドを 発現する細胞を、細胞からの前記ポリペプチドの放出を促進するためにヘパリン に曝す工程と、そしてそのようにして放出されたポリペプチドを精製する工程と を有する、請求項16のポリペプチドを単離する方法。 35.請求項1〜7および9のいずれかの核酸分子によってコードされるポリペ プチドを発現する能力のあるベクターを作る方法であって、前記方法が、前記核 酸分子が少なくとも一つのプロモーターと作用するように結合する位置において 、前記核酸分子をベクターに挿入する工程を有する、請求項1〜7および9のい ずれかの核酸分子によってコードされるポリペプチドを発現する能力のあるベク ターを作る方法。 36.アンチセンスヌクレオチド配列を有するベクターであって、前記アンチセ ンスヌクレオチド配列が、請求項16のポリペプチドをコードする、ゲノムDN A配列、RNA配列、またはcDNA配列、あるいは、血管透過性、内皮細胞の 増殖および内皮細胞分化から選択される少なくとも一つの生理活性を促進する、 それらのフラグメントまたはアナログの、少なくとも一部に対して相補的であっ て、前記ベクターが前記少なくとも一つの生理活性を阻害するために使用可能で ある、アンチセンスヌクレオチド配列を有するベクター。 37.内皮細胞を、内皮細胞の増殖を刺激するのに有効な量の請求項16のポリ ペプチドに接触させる工程を有する、内皮細胞の増殖を刺激する方法。 38.前記内皮細胞が、血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループか ら選択される、請求項37の方法。 39.内皮細胞の増殖、内皮細胞分化および血管透過性から選択される少なくと も一つの生理活性をイン・ヴィヴォで哺乳類において刺激する方法であって、前 記方 法が、前記哺乳類に生理活性を刺激するのに有効な量の、前記少なくとも一つの 生理活性を刺激する能力を有する請求項16のポリペプチドを投与する工程を有 する、内皮細胞の増殖、内皮細胞分化および血管透過性から選択される少なくと も一つの生理活性をイン・ヴィヴォで哺乳類において刺激する方法。 40.前記ポリペプチドが、配列番号3の64から172のアミノ酸残基、また は、配列番号5の93から201のアミノ酸残基を有する、請求項39の方法。 41.リンパ管内皮細胞の増殖が刺激される、請求項39の方法。 42.哺乳類における血管新生および新血管新生から選択される少なくとも一つ の生理活性を刺激する方法であって、前記方法が、前記哺乳類に、血管新生また は新血管新生を刺激するのに有効な量の、請求項16のポリペプチドを投与する 工程を有し、前記ポリペプチドが内皮細胞の増殖を刺激する能力を有する、哺乳 類における血管新生および新血管新生から選択される少なくとも一つの生理活性 を刺激する方法。 43.前記ポリペプチドが、配列番号3の64から172のアミノ酸残基、また は、配列番号5の93から201のアミノ酸残基を有する、請求項42の方法。 44.前記ポリペプチドが、更にアフィニティータグペプチド配列を有する、請 求項43の方法。 45.更に、VEGF,VEGF−B,VEGF−C,PIGF,PDGF,F GFおよびヘパリンからなるグループから選択される少なくとも一つの物質を同 時投与する工程を有する、請求項32の方法。 46.哺乳類における血管新生および新血管新生から選択される生理活性を阻害 する方法であって、前記方法が、前記哺乳類に、血管新生または新血管新生を阻 害す るのに有効な量の、請求項16のポリペプチドに対するアンタゴニストを投与す る工程を有する、哺乳類における血管新生および新血管新生から選択される生理 活性を阻害する方法。 47.前記アンタゴニストが、前記ポリペプチドに対して特異的な抗体を含む、 請求項46の方法。 48.前記アンタゴニストが、内皮細胞に結合するが、内皮細胞の増殖、内皮細 胞分化および血管透過性から選択される少なくとも一つの生物活性を刺激する能 力を有さない、ポリペプチドを含む、請求項46の方法。 49.前記内皮細胞が、血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループか ら選択される、請求項48の方法。 50.哺乳類においてVEGF−Dの発現を阻害する方法であって、VEGF− Dを発現する標的細胞を、請求項36のベクターでトランスフォームする工程を 有する、哺乳類においてVEGF−Dの発現を阻害する方法。 51.請求項16から20および24のいずれかのポリペプチド、および薬学で 許容されるキャリアまたはアジュバントを有する、医薬組成物。 52.更に、VEGF,VEGF−B,VEGF−C,PIGF,PDGF,お よびヘパリンからなるグループから選択される少なくとも一つの物質を有する、 請求項51の医薬組成物。 53.請求項29の抗体、および薬学で許容されるキャリアまたはアジュバント を有する、医薬組成物。 54.前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項53の医薬組成物。 55.請求項16から20および24のいずれかの第一のポリペプチド、および 第二のポリペプチドからなる、タンパク質ダイマー。 56.前記タンパク質ダイマーがホモダイマーであり、前記第二のポリペプチド が、前記第一のポリペプチドと同じである、請求項55のタンパク質ダイマー。 57.前記タンパク質ダイマーがヘテロダイマーであり、前記第二のポリペプチ ドが、VEGF,VEGF−B,VEGF−C,PIGFおよびPDGFから選 択される、請求項55のタンパク質ダイマー。 58.生物試料中における請求項16のポリペプチドを検出する方法であって、 前記試料を、前記ポリペプチドに結合する能力のある試薬に接触させる工程と、 前記試薬の結合の発生を検出する工程とを有する、生物試料中における請求項1 6のポリペプチドを検出する方法。 59.前記試薬が請求項29の抗体を含む、請求項58の方法。 60.哺乳類における血管透過性を変調する方法であって、前記方法が、前記哺 乳類に血管透過性を変調するのに有効な量の、請求項16から20および24の いずれかのポリペプチド、または請求項29の抗体を投与する工程を有する、哺 乳類における血管透過性を変調する方法。 61.内皮細胞の増殖を刺激する能力を有する、請求項16のポリペプチドを、 前記哺乳類に投与する工程を有する、請求項60の方法。 62.内皮細胞に結合する能力を有するが、内皮細胞の増殖を刺激する能力を有 さない、請求項16のポリペプチドを、前記哺乳類に投与する工程を有する、請 求項60の方法。 63.VEGF受容体2の活性化方法であって、前記受容体を有する細胞を、受 容体を活性化するのに有効な用量の請求項16のポリペプチドに曝す工程を有す る、VEGF受容体2の活性化方法。 64.VEGF受容体3の活性化方法であって、前記受容体を有する細胞を、受 容体を活性化するのに有効な用量の請求項16のポリペプチドに曝す工程を有す る、VEGF受容体3の活性化方法。 65.前記方法が、イン・ヴィヴォで行われる、請求項63または64の方法。 66.前記方法が、イン・ヴィトロで行われる、請求項63または64の方法。 67.請求項16のポリペプチドに特異的に結合する試薬と、前記試薬の結合を 検出するための手段を有する、診断または予知のテストキット。 68.前記特異的に結合する試薬が、請求項29の抗体を含む、請求項67のテ ストキット。 69.ポリメラーゼに作用するように結合する、請求項1の核酸分子に対して特 異的なプライマーの対を有する、診断または予知のテストキットであって、前記 ポリメラーゼがDNAサンプルからの前記ポリヌクレオチドを選択的に増幅する ことが可能となる、診断または予知のテストキット。 70.試験対象において請求項16のポリペプチドをコードする遺伝子構造の異 常を検出する方法であって、以下の工程: 前記試験対象からDNAサンプルを提供する工程; 前記サンプルを、ポリメラーゼに作用するように結合した、前記遺伝子構造に 対して特異的な、プライマーのセットに接触させ、そして前記サンプルからの前 記遺 伝子構造をポリメラーゼ連鎖反応によって選択的に増幅させる工程;および 前記サンプルからの増幅された遺伝子構造のヌクレオチド配列を、配列番号1 または配列番号4に示すヌクレオチド配列と比較する工程、 を有する、試験対象において請求項16のポリペプチドをコードする遺伝子構造 の異常を検出する方法。 71.請求項16のポリペプチドに対するアンタゴニストであって、前記アンタ ゴニストが、血管透過性、内皮細胞の増殖および内皮細胞分化から選択される、 前記ポリペプチドによって誘導される少なくとも一つの生物活性を阻害する能力 を有し、前記アンタゴニストが前記ポリペプチドまたは前記ポリペプチドに対す る受容体に結合するが、前記ポリペプチドよりも前記少なくとも一つの生物活性 を刺激する能力が弱い(less able)、請求項16のポリペプチドに対するアンタ ゴニスト。 72.前記アンタゴニストが、前記ポリペプチドに選択的に結合する抗体を含む 、請求項71のアンタゴニスト。 73.前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項72のアンタゴニスト。 74.前記アンタゴニストが、前記ポリペプチドに対する受容体に結合するが、 前記少なくとも一つの生物活性を刺激する能力が弱い、前記ポリペプチドのフラ グメントまたはアナログを含む、請求項71のアンタゴニスト。 75.哺乳類における肺の血液循環および/またはガス交換を改善する方法であ って、前記方法が、前記哺乳類に、血液循環および/またはガス交換を改善する のに有効な量の、請求項16のポリペプチドを投与する工程を有する、哺乳類に おける肺の血液循環および/またはガス交換を改善する方法。 76.哺乳類における、血管透過性の増加による心臓および/または肺の液体貯 留を治療する方法であって、前記方法が前記哺乳類に血管透過性を減少させるの に有 効な量の、請求項16のポリペプチドに対するアンタゴニストを投与する工程を 有する、哺乳類における、血管透過性の増加による心臓および/または肺の液体 貯留を治療する方法。 77.腸の吸収不良症候群を患う患者における腸の吸収不良症候群を治療する方 法であって、前記方法が前記患者に腸の血液循環および/または血管透過性を増 加させるのに有効な量の、請求項16のポリペプチドを投与する工程を有する、 腸の吸収不良症候群を患う患者における腸の吸収不良症候群を治療する方法。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61K 45/00 A61P 43/00 111 48/00 C07K 14/475 A61P 43/00 14/49 111 14/515 C07K 14/475 16/22 14/49 C12N 1/15 14/515 1/19 16/22 1/21 C12N 1/15 C12P 21/02 C 1/19 21/08 1/21 C12N 15/00 ZNAA 5/10 5/00 A C12P 21/02 A61K 37/24 21/08 37/02 (31)優先権主張番号 PO 3554 (32)優先日 平成8年11月11日(1996.11.11) (33)優先権主張国 オーストラリア(AU) (31)優先権主張番号 60/031,097 (32)優先日 平成8年11月14日(1996.11.14) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 PO 4954 (32)優先日 平成9年2月5日(1997.2.5) (33)優先権主張国 オーストラリア(AU) (31)優先権主張番号 60/038,814 (32)優先日 平成9年2月10日(1997.2.10) (33)優先権主張国 米国(US) (31)優先権主張番号 PO 7435 (32)優先日 平成9年6月19日(1997.6.19) (33)優先権主張国 オーストラリア(AU) (31)優先権主張番号 60/051,426 (32)優先日 平成9年7月1日(1997.7.1) (33)優先権主張国 米国(US) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(GH,KE,LS,MW,S D,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG ,KZ,MD,RU,TJ,TM),AL,AM,AT ,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA, CH,CN,CU,CZ,DE,DK,EE,ES,F I,GB,GE,GH,HU,IL,IS,JP,KE ,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS, LT,LU,LV,MD,MG,MK,MN,MW,M X,NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE ,SG,SI,SK,SL,TJ,TM,TR,TT, UA,UG,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 ウィルクス,アンドリュー,エフ オーストラリア国 ヴィクトリア 3141 サウス・ヤラ マクファーラン・レーン 6 (72)発明者 スタッカー,スティーヴン,エイ オーストラリア国 ヴィクトリア 3068 ノース・フィッツロイ マッキーン・スト リート 30 (72)発明者 アリタロ,カリ フィンランド国 エフアイエヌ―02100 エスポー ナイイリキンティエ 4 エイ

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 配列番号3,配列番号5,配列番号8,または配列番号9に示すアミノ酸 配列に実質的に相当するアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする核酸配 列からなる単離核酸分子であって、前記ポリペプチドが、血管透過性または内皮 細胞の増殖を刺激する能力を有するか、または、それらのフラグメントまたはア ナログが、血管新生、血管透過性、内皮細胞増殖、分化、遊走もしくは生存から なるグループから選択される少なくとも一つの生物活性を刺激する能力を有する か、あるいは内皮細胞に結合する能力を有するが少なくとも一つの前記生物活性 を刺激する能力を有さない、配列番号3,配列番号5,配列番号8,または配列 番号9に示すアミノ酸配列に実質的に相当するアミノ酸配列を有するポリペプチ ドをコードする核酸配列からなる単離核酸分子。 2. 前記核酸分子がアミノ酸配列、 ドする核酸配列を含む、請求項1の核酸分子。 3. 前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項1の核酸分子。 4. ゲノムDNAである、請求項1の核酸分子。 5. cDNAである、請求項1の核酸分子。 6. 配列番号1,配列番号4,配列番号6,配列番号7の核酸配列、または、 ストリンジェントな条件下で前述の配列の一つとハイブリダイズするDNA配列 を有する、請求項5の核酸分子。 7. 配列番号4の核酸配列を有する、請求項6の核酸分子。 8. 血管透過性または内皮細胞の増殖を刺激する能力を有するポリペプチドを コードする、請求項1〜7のいずれかの核酸分子。 9. 配列番号3の64から172のアミノ酸残基、または、配列番号5の93 から201のアミノ酸残基を有するポリペプチドをコードする、請求項1の核酸 分子。 10.前記ポリペプチドが、更にアフィニティータグペプチド配列を有する、請 求項9の核酸分子。 11.内皮細胞に結合する能力を有するが内皮細胞の増殖を刺激する能力を有さ ないポリペプチドをコードする、請求項1〜7のいずれかの核酸分子。 12.前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項11の核酸分子。 13.前記核酸分子がヒトDNA分子である、請求項1の核酸分子。 14.請求項1〜13のいずれかの核酸を有するベクター。 15.請求項14のベクターでトランスフォームまたはトランスフォームされた宿 主細胞。 16.配列番号3,配列番号5,配列番号8,または配列番号9に示すアミノ酸 配列に実質的に相当するアミノ酸配列を有する単離ポリペプチドであって、前記 ポリペプチドが、血管透過性または内皮細胞の増殖を刺激する能力を有するか、 または、それらのフラグメントまたはアナログが、細胞増殖、細胞分化、細胞遊 走、細胞生存、および血管透過性からなるグループから選択される少なくとも一 つの内皮細胞生物活性を刺激する能力を有するか、あるいは内皮細胞に結合する 能力を有するが 少なくとも一つの前記生物活性を刺激する能力を有さない、配列番号3,配列番 号5,配列番号8,または配列番号9に示すアミノ酸配列に実質的に相当するア ミノ酸配列を有する単離ポリペプチド。 17.前記ポリペプチドが、アミノ酸配列、 る、請求項16のポリペプチド。 18.前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項16のポリペプチド。 19.配列番号3または配列番号5に実質的に相当するアミノ酸配列を有する、 請求項16のポリペプチド。 20.配列番号5に実質的に相当するアミノ酸配列を有する、請求項19のポリ ペプチド。 21.内皮細胞の増殖を刺激する能力を有する、請求項16〜20のいずれかの ポリペプチド。 22.内皮細胞の分化を誘導する能力を有する、請求項16〜20のいずれかの ポリペプチド。 23.血管透過性を誘導する能力を有する、請求項16〜20のいずれかのポリ ペプチド。 24.配列番号3の64から172、または、配列番号5の93から201、の アミノ酸残基を有する、請求項16のポリペプチド。 25.更にアフィニティータグペプチド配列を有する、請求項24のポリペプチ ド。 26.内皮細胞に結合する能力を有するが内皮細胞の増殖を刺激する能力を有さ ない、請求項16または17のポリペプチド。 27.前記内皮細胞が血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループから 選択される、請求項26のポリペプチド。 28.前記ポリペプチドがヒトタンパク質である、請求項16〜20のいずれか のポリペプチド。 29.請求項16〜28のいずれかのポリペプチドと特異的に反応性を有する抗 体。 30.前記抗体がポリクローナル抗体である、請求項29の抗体。 31.前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項29の抗体。 32.前記抗体が検出可能なラベルで標識されている、請求項29の抗体。 33.請求項16のポリペプチドを作る方法であって、前記方法が以下の工程: 前記ポリペプチドをコードする核酸配列が発現するように、プロモーター配列 に操作可能に結合した前記ポリペプチドをコードする核酸配列を有するベクター でトランスフォームまたはトランスフェクトされた宿主細胞を培養する工程;そ して 前記宿主細胞から、または前記宿主細胞が培養される増殖培地から前記ポリペ プチドを単離する工程、 を有する請求項16のポリペプチドを作る方法。 34.VEGF−Dを単離する方法であって、VEGF−Dを発現する細胞を、 細胞からのVEGF−Dの放出を促進するためにヘパリンに曝す工程と、そして その ようにして放出されたVEGF−Dを精製する工程とを有する、VEGF−Dを 単離する方法。 35.請求項1〜9のいずれかの核酸分子によってコードされるポリペプチドを 発現する能力のあるベクターを作る方法であって、前記方法が、前記核酸分子が 少なくとも一つのプロモーターと作用するように結合する位置において、前記核 酸分子をベクターに挿入する工程を有する、請求項1〜9のいずれかの核酸分子 によってコードされるポリペプチドを発現する能力のあるベクターを作る方法。 36.アンチセンスヌクレオチド配列を有するベクターであって、前記アンチセ ンスヌクレオチド配列が、VEGF−DゲノムDNA配列、またはVEGF−D RNA配列、またはVEGF−DをコードするcDNA配列、あるいは、血管 透過性、内皮細胞の増殖および内皮細胞分化から選択される少なくとも一つの生 理活性を促進する、それらのフラグメントまたはアナログの、少なくとも一部に 対して相補的であって、前記ベクターが前記少なくとも一つの生理活性を阻害す るために使用可能である、アンチセンスヌクレオチド配列を有するベクター。 37.内皮細胞を、内皮細胞の増殖を刺激するのに有効な量の請求項16のポリ ペプチドに接触させる工程を有する、内皮細胞の増殖を刺激する方法。 38.前記内皮細胞が、血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループか ら選択される、請求項37の方法。 39.内皮細胞の増殖、内皮細胞分化および血管透過性から選択される少なくと も一つの生理活性をイン・ヴィヴォで哺乳類において刺激する方法であって、前 記方法が、前記哺乳類に生理活性を刺激するのに有効な量の、前記少なくとも一 つの生理活性を刺激する能力を有する請求項16のポリペプチドを投与する工程 を有する、内皮細胞の増殖、内皮細胞分化および血管透過性から選択される少な くとも一つの生理活性をイン・ヴィヴォで哺乳類において刺激する方法。 40.前記ポリペプチドが、配列番号3の64から172のアミノ酸残基、また は、配列番号5の93から201のアミノ酸残基を有する、請求項39の方法。 41.リンパ管内皮細胞の増殖が刺激される、請求項39の方法。 42.哺乳類における血管新生および新血管新生から選択される少なくとも一つ の生理活性を刺激する方法であって、前記方法が、前記哺乳類に、血管新生また は新血管新生を刺激するのに有効な量の、請求項16のポリペプチドを投与する 工程を有し、前記ポリペプチドが内皮細胞の増殖を刺激する能力を有する、哺乳 類における血管新生および新血管新生から選択される少なくとも一つの生理活性 を刺激する方法。 43.前記ポリペプチドが、配列番号3の64から172のアミノ酸残基、また は、配列番号5の93から201のアミノ酸残基を有する、請求項42の方法。 44.前記ポリペプチドが、更にアフィニティータグペプチド配列を有する、請 求項43の方法。 45.更に、VEGF,VEGF−B,VEGF−C,P1GF,PDGF,F GFおよびヘパリンからなるグループから選択される少なくとも一つの物質を同 時投与する工程を有する、請求項32の方法。 46.哺乳類における血管新生および新血管新生から選択される生理活性を阻害 する方法であって、前記方法が、前記哺乳類に、血管新生または新血管新生を阻 害するのに有効な量の、VEGF−Dのアンタゴニストを投与する工程を有する 、哺乳類における血管新生および新血管新生から選択される生理活性を阻害する 方法。 47.前記VEGF−Dのアンタゴニストが、VEGF−Dに対して特異的な抗 体 を含む、請求項46の方法。 48.前記VEGF−Dのアンタゴニストが、内皮細胞に結合するが、内皮細胞 の増殖、内皮細胞分化および血管透過性から選択される少なくとも一つの生物活 性を刺激する能力を有さない、ポリペプチドを含む、請求項46の方法。 49.前記内皮細胞が、血管内皮細胞およびリンパ内皮細胞からなるグループか ら選択される、請求項48の方法。 50.哺乳類においてVEGF−Dの発現を阻害する方法であって、VEGF− Dを発現する標的細胞を、請求項36のベクターでトランスフォームする工程を 有する、哺乳類においてVEGF−Dの発現を阻害する方法。 51.請求項16〜24のいずれかのポリペプチド、および薬学で許容されるキ ャリアまたはアジュバントを有する、医薬組成物。 52.更に、VEGF,VEGF−B,VEGF−C,PlGF,PDGF,お よびヘパリンからなるグループから選択される少なくとも一つの物質を有する、 請求項51の医薬組成物。 53.請求項29〜32のいずれかの抗体、および薬学で許容されるキャリアま たはアジュバントを有する、医薬組成物。 54.前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項53の医薬組成物。 55.請求項16〜24のいずれかの第一のポリペプチド、および第二のポリペ プチドからなる、タンパク質ダイマー。 56.前記タンパク質ダイマーがホモダイマーであり、前記第二のポリペプチド が、 前記第一のポリペプチドと同じである、請求項55のタンパク質ダイマー。 57.前記タンパク質ダイマーがヘテロダイマーであり、前記第二のポリペプチ ドが、VEGF,VEGF−B,VEGF−C,PlGFおよびPDGFから選 択される、請求項55のタンパク質ダイマー。 58.生物試料中におけるVEGF−Dを検出する方法であって、前記試料を、 VEGF−Dに結合する能力のある試薬に接触させる工程と、前記試薬の結合の 発生を検出する工程とを有する、生物試料中におけるVEGF−Dを検出する方 法。 59.前記試薬が請求項29〜32のいずれかの抗体を含む、請求項58の方法 。 60.哺乳類における血管透過性を変調する方法であって、前記方法が、前記哺 乳類に血管透過性を変調するのに有効な量の、請求項16〜24のいずれかのポ リペプチド、または請求項29〜32のいずれかの抗体を投与する工程を有する 、哺乳類における血管透過性を変調する方法。 61.内皮細胞の増殖を刺激する能力を有する、請求項16のポリペプチドを、 前記哺乳類に投与する工程を有する、請求項60の方法。 62.内皮細胞に結合する能力を有するが、内皮細胞の増殖を刺激する能力を有 さない、請求項16のポリペプチドを、前記哺乳類に投与する工程を有する、請 求項60の方法。 63.VEGF受容体2の活性化方法であって、前記受容体を有する細胞を、受 容体を活性化するのに有効な用量のVEGF−Dに曝す工程を有する、VEGF 受容体2の活性化方法。 64.VEGF受容体3の活性化方法であって、前記受容体を有する細胞を、受 容 体を活性化するのに有効な用量のVEGF−Dに曝す工程を有する、VEGF受 容体3の活性化方法。 65.前記方法が、イン・ヴィヴォで行われる、請求項63または64の方法。 66.前記方法が、イン・ヴィトロで行われる、請求項63または64の方法。 67.VEGF−Dに特異的に結合する試薬と、前記試薬の結合を検出するため の手段を有する、診断または予知のテストキット。 68.前記特異的に結合する試薬が、請求項29〜32のいずれかの抗体を含む 、請求項67のテストキット。 69.ポリメラーゼに作用するように結合する、VEGF−D DNAに対して 特異的なプライマーの対を有する、診断または予知のテストキットであって、前 記ポリメラーゼがDNAサンプルからのVEGF−D DNAを選択的に増幅す ることが可能となる、診断または予知のテストキット。 70.試験対象においてVEGF−D遺伝子構造の異常を検出する方法であって 、以下の工程: 前記試験対象からDNAサンプルを提供する工程; 前記サンプルを、ポリメラーゼに作用するように結合した、VEGF−D D NAに対して特異的な、プライマーのセットに接触させ、そして前記サンプルか らのVEGF−D DNAをポリメラーゼ連鎖反応によって選択的に増幅させる 工程;および 前記サンプルからの増幅されたVEGF−D DNAのヌクレオチド配列を、 配列番号1または配列番号4に示すヌクレオチド配列と比較する工程、 を有する、試験対象においてVEGF−D遺伝子構造の異常を検出する方法。 71.VEGF−Dのアンタゴニストであって、血管透過性、内皮細胞の増殖お よび内皮細胞分化から選択される、VEGF−Dによって誘導される少なくとも 一つの生物活性を阻害する能力を有し、前記アンタゴニストがVEGF−Dまた はVEGF−D受容体に結合するが、VEGF−Dよりも前記少なくとも一つの 生物活性を刺激する能力が弱い(less able)、VEGF−Dのアンタゴニスト。 72.前記アンタゴニストが、VEGF−Dに選択的に結合する抗体を含む、請 求項71のVEGF−Dのアンタゴニスト。 73.前記抗体がモノクローナル抗体である、請求項72のVEGF−Dのアン タゴニスト。 74.前記アンタゴニストが、VEGF−D受容体に結合するが、前記少なくと も一つの生物活性を刺激する能力が弱い、VEGF−Dポリペプチドのフラグメ ントまたはアナログを含む、請求項71のVEGF−Dのアンタゴニスト。 75.哺乳類における肺の血液循環および/またはガス交換を改善する方法であ って、前記方法が、前記哺乳類に、血液循環および/またはガス交換を改善する のに有効な量の、VEGF−Dを投与する工程を有する、哺乳類における肺の血 液循環および/またはガス交換を改善する方法。 76.哺乳類における、血管透過性の増加による心臓および/または肺の液体貯 留を治療する方法であって、前記方法が前記哺乳類に血管透過性を減少させるの に有効な量の、VEGF−Dのアンタゴニストを投与する工程を有する、哺乳類 における、血管透過性の増加による心臓および/または肺の液体貯留を治療する 方法。 77.腸の吸収不良症候群を患う患者における腸の吸収不良症候群を治療する方 法であって、前記方法が前記患者に腸の血液循環および/または血管透過性を増 加させるのに有効な量の、VEGF−Dを投与する工程を有する、腸の吸収不良 症候群 を患う患者における腸の吸収不良症候群を治療する方法。
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