ES2308791T3 - Clonacion y caracterizacion de napsina, una proteasa aspartica. - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE AL CLONADO, A PARTIR DE UN BANCO DE HIGADO HUMANO, DE UNA PROTEASA ASPARTICA DESCONOCIDA ANTERIORMENTE, CAPAZ DE LLEVAR A CABO UNA FISURA DE PROTEINAS POR HIDROLISIS Y QUE SE LLAMA A CONTINUACION "NAPSINA". SE HAN CLONADO, SECUENCIADO Y EXPRESADO DOS CLONES DE ADN COMPLEMENTARIO QUE CODIFICAN ISOENZIMAS DE LA PROTEASA LLAMADAS "NAPSINA A" Y "NAPSINA B". TAMBIEN SE HA OBTENIDO Y SECUENCIADO PARCIALMENTE EL GEN. SE HA DESARROLLADO TAMBIEN UN PROCEDIMIENTO DE PURIFICACION RAPIDA DE LA ENZIMA GRACIAS A UNA PEPSTATINA INMOVILIZADA Y SE HA AISLADO UNA ENZIMA PROCEDENTE DEL TEJIDO RENAL HUMANO. SE HAN PRODUCIDO ANTICUERPOS POLICLONALES CONTRA LAS ENZIMAS, PERMITIENDO ESTOS ANTICUERPOS TAMBIEN AISLAR Y DETECTAR LA ENZIMA. SIMILARIDADES CON OTRAS PROTEASAS ASPARTICAS, ESPECIALMENTE LA CATEPSINA D, DEMUESTRAN LA UTILIDAD DE LA ENZIMA EN PROCEDIMIENTOS DIAGNOSTICOS, ASI COMO PROTEASA. SE PUEDE DETERMINAR LA CANTIDAD Y/O EL TIPO DE NAPSINA EXPRESADA EN UN TEJIDO PARTICULAR UTILIZANDO SONDAS DE NUCLEOTIDOS O ANTICUERPOS MARCADOS CONTRA LA NAPSINA.
Description
Clonación y caracterización de napsina, una
proteasa aspártica.
La presente invención se refiere a una proteasa
aspártica antes desconocida que esta presente en el hígado humano,
aislada por clonaje de un gen desde una librería de ADNc del hígado
humano.
Los miembros de esta familia de proteasa
aspártica son caracterizados por la presencia de residuos de ácido
aspártico catalítico en su centro activo. Existen cinco proteasas
aspártica conocidas que están presente en el cuerpo humano. Pepsina
y gastricsina son secretados en el estómago para la digestión de las
comidas. Gastricsina está también presente en el plasma seminal.
Catepsina D y E están presentes intracelularmente para llevar a
cabo el catabolismo de proteínas. Renina, está presente en el
plasma, y es la enzima clave que regula el sistema de angiotensina
y en última instancia la presión sanguínea.
En eucariotas, incluyendo el ser humano, las
proteasas aspárticas son homologas en la secuencias de genes y de
proteína, pero tienen diferentes aminoácidos y secuencias de
nucleótidos. El ADNc y los genes de las cinco proteasas aspárticas
humana han sido clonados y secuenciados. Son sintetizados como
cimógenos de simple cadena de aproximadamente 380 residuos, que son
secretados o dirigidos a la vacuola intracelular. En la activación
por un proceso autocatalizado (excepto prorenina), un segmento
pro del N terminal de aproximadamente 45 residuos esta
anclado para producir enzimas maduras (Tang y Wong, J Cell.
Biochem. 33, 53-63 (1987)). En algunos casos,
por ejemplo, con catepsina D y renina, las proteasas maduras son
cortadas posteriormente en dos cadenas. Las estructuras
tridimensionales de las proteasas aspárticas son muy similares. Cada
enzima contiene dos lóbulos interiormente homólogos (Tang et
al., Nature 271, 618-621 (1978)). El sitio
activo cortado, puede acomodar ocho residuos de sustrato, y dos
ácidos aspárticos catalíticos están localizados entre los
lóbulos.
Estas proteasas tienen papeles fisiológicos
distintos e importantes. Además de su importancia en las funciones
fisiológicas, estas enzimas también están relacionadas con estados
patológicos. Por ejemplo, pepsina humana y gastricsina son
indicadores de diagnósticos para las úlceras del estómago y el
cáncer (Samloff, de Gastroenterology, 96
586-595 (1989); Miki et al., Jpn. J. Cancer
Res. 84, 1086-1090 (1993)). Catepsina D está
localizado en el lisosoma. Su función principal es el catabolismo
de proteínas del tejido. Pruebas recientes en estudios de ratones
sin el gen de catepsina D funcional, sin embargo, indican que esta
enzima tiene un papel en el desarrollo del intestino en animales
recién nacidos. Catepsina D también se refiere a metástasis de
cáncer de mama en humanos (Rochefort, Acta Oncologica 31,
125-130 (1992)). Catepsina E está localizada en el
reticulum endoplasmático de algunas células, como eritrocitos
y células de la mucosa del estómago. Esta ha sido aplicada en el
procesamiento de antígenos en células inmunizadas.
Las proteasas aspárticas humanas tienen usos
médicos importantes. Los niveles de las proenzimas pepsinógenas y
progastricisinas humanas presentes en el flujo de sangre y la
proporción entre los dos niveles se usan en el diagnóstico
selectivo del cáncer de estómago humano (Defize, et al.,
Cancer 59, 952-958 (1987); Miki, et al.,
Jpn. J. Cancer Res. 84, 1086-1090 (1993)) y en
úlcera (Miki, et al., Adv. Exp. Med. Biol. 362,
139-143 (1995)). La secreción de procatepsina D se
eleva en el tejido de cáncer de mama. Por lo tanto, el nivel de
procatepsina D en el cáncer de mama es usado para el pronóstico
clínico (Rochefort, Acta Oncologica 31,
125-130 (1992)). El análisis de renina en el
diagnóstico de la hipertensión es un procedimiento clínico
rutinario (Brown et al., Handbook of Hypertension 1,
278-323 Robertson, editor (Elsevier Science
Publishers, Amsterdam, 1983).
Estos ejemplos establecen que las proteasas
aspárticas humanas están relacionadas con enfermedades humanas y
además previamente las proteasas aspárticas no identificadas, es
probable que tengan aplicaciones clínicas.
Por lo tanto un objeto de la presente invención
es el de proporcionar un anticuerpo inmunoreactivo específicamente
con una proteasa aspárticas como se establece en la reivindicación
1.
Se caracteriza y clona la proteasa aspárticas,
se identifican los tejidos en los que la proteasa aspárticas se
expresa y las aplicaciones en la química clínica y el
diagnóstico.
Una proteasa aspártica antes desconocida capaz
de cortar las proteínas por hidrólisis, referida aquí como
"Napsina", ha sido clonada de una librería de hígado humano.
Dos clones de ADNc han sido clonados, secuenciados y expresados.
Estas codifican isoenzimas de la proteasa, referidas como "
Napsina A " y "Napsina B". Un clon que es inusual, en lo
que respecta a que no incluye un codon de parada, pero que puede ser
usado para expresar las proteínas. El gen también se ha obtenido
parcialmente secuenciado. Un proceso para la purificación rápida de
la enzima usando pepstatina inmovilizada también ha sido
desarrollado, y la enzima aislada del tejido de riñón humano.
Anticuerpos policlonales a las enzimas han sido hechos para que sean
también útiles para el aislamiento y la detección de la enzima.
Las semejanzas a otras proteasas aspárticas,
especialmente catepsina D, establecen la utilidad de la enzima en
los ensayos de diagnósticos como una proteasa. Cualquier tipo de
napsina ó cantidad, ó ambos, expresadas en un tejido en particular
pueden ser determinados usando anticuerpos marcados o sondas de
nucleótidos a la napsina.
Las figuras 1A-1D son secuencias
de aminoácidos putativas y la del ADNc de Napsina A humana.
Elementos del sitio activo característico (DTG) y Tyr75 son
subrayados. El patrón de unión RGD integrina está también
subrayado. Las lisinas en el extremo carboxi le corresponden
a la región poli-A.
Las figuras 2A-2C son una
comparación de la secuencia de aminoácidos de la napsina A humana
con las secuencias de aminoácidos de una proteína como la proteasa
aspártica de ratón (Mori, et al., 1997) y la catepsina D
humana ("cath D"). La figura 2D es un esquema o la presentación
de un dendrograma de secuencia relacionada entre la napsina y otras
proteasas aspárticas humanas.
Las figuras 3A-3E son el ADN
genómico humano de la Napsina. El intron se indica en letra
minúscula, en el caso del exón en letra mayúscula. La
secuencia de aminoácidos putativa indica la posición de los cruces
intro/exón. La figura 3F es una presentación esquemática de
la napsina A humana. Los exones son mostrados como barras
verticales con la numeración más arriba. Las flechas dobles
encabezadas representan las áreas donde la secuencia fue
determinada. Las letras son posiciones de sitios de restricción
donde X es XhoI, B es BamHI, y E es EcoRI.
Las figuras 4A-4E son el ADNc y
la secuencia de aminoácidos putativa de la Napsina B humana.
Elementos de sitios activos característicos (DTG) y Tyr75
son subrayados. El patrón de unión de integrina RGD está también
subrayado. Las lisinas en el extremo carboxi le corresponde a
la región poli-A.
Los clones identificados por una búsqueda de
homología de las bases de datos de secuencias de ADNc humana del
Instituto para investigación de Genoma (Adams et al., Science
252, 1651-1656 (1991), reporta que la porción que
codifica para catepsina D, fue obtenida desde American Type
Culture Collection, Rockville, MD. Estas están referido como
clon ATCC número 559204, 540096, 346769, 351669, y 314203;
Genbank números W19120, N45144, R18106, R11458, y T54068,
respectivamente. El análisis de las secuencias indica que éstos no
codifican a catepsina D, y no son ADNcs de longitud completa. Las
plantillas fueron diseñadas y usadas con PCR para obtener clones
adicionales, usando una librería de ADNc de hígado humano como
plantilla. Los clones que fueron obtenidos incluyen regiones no
presente en los clones ATCC.
Debido a que estos clones proporcionan solo
aproximadamente 600 pb del ADNc, el clon ADNc más largo fue buscado
usando 5' RACE PCR (reacción de cadena de polimerasa), en el que el
ADN de dos librerías del ADNc de hígado humano se separan y clonan
en el \lambdagt10 fue usado como plantilla y patrones
basados en la secuencia cercana al extremo 5'
(AGGGCACACTGAAGAAGTGGCATCTCC) y la secuencia del vector
\lambdagt10 hacia arriba del inserto en la dirección
delantera (CTTTTGAGCAAGTTCAGCCTGGTTAAG). Dos clones,
pHL-1 (154 bp) y pHL-2 (288 bp)
fueron obtenidos, uno (pHL-2) el que se extiende
hasta la secuencia extremo 5' dentro de región del péptido líder
(figuras 1A-1D).
La secuencia de ADNc de la napsina A humana
carece de un codon de parada en todos los clones obtenidos, todavía
todas las características demuestran una proteasa aspártica
funcional, que incluye elementos de los sitios activos intactos, un
Tyr75 conservado (pepsina numerada), y un polipéptido de
aproximadamente 40 aminoácidos. Diferente de la pepsina, la
proteasa aspártica característica, la napsina A contiene en su
extensión C-terminal abundancia de residuos de
prolina, y un patrón RGD (patrón de enlace a integrina) cerca de la
superficie de la estructura terciaria de la napsina D como a juzgar
por las estructuras de cristal homologas de proteasas aspártica de
mamíferos (i.e., Pepsina y catepsina D).
Varios clones de ADNc relacionados de la napsina
fueron obtenidos por selección desde librerías de ADNc de hígado
humano y determinadas las secuencias de los nucleótidos. Estos
clones representan partes diferentes del ARN mensajero de la
napsina. Uniones juntas a la secuencia de los nucleótidos que
codifican a la napsina A tienen una secuencia de aminoácidos
deducida que se muestra en las figuras 1A-1D.
El ADNc de la Napsina A, incluyen el péptido
líder y la región sin traducir 3' y un strech de poliadenina
que fue amplificado por PCR con PLHNAP – FWD
(5'-AAGCTTATGTCTCCACCACCGCTGCTGCTACCCTTGCTGC) y
PLHNAP-REV (5'-
AAGCTTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTCAATGGAAATATTGG) y clonado en el sitio
HindIII del vector pLNCX para la expresión del promotor CMV
(Dusty Miller). El plásmido aislado fue transformado en
células de riñón 293 humanas (ATCC). Las células fueron recobradas
(8-120 mg) y lisadas con 50 mM NaOAc, 20 mM de
zwitergente, pH 3,5 (tampón NAZ) con vortex.
Los lisados fueron incubados en hielo durante 1
hora. El sobrenadante de la centrifugación a 14,000 x g fue
empleado directamente para la identificación de la expresión de la
Napsina A por la adición de una alícuota de 40 \mul de pepstatina
- A agarosa (Sigma). La muestra fue girada en un tubo cónico
de 50 ml a 4ºC por 1 semana. La matriz fue fijada y lavada dos
veces con 20 ml de tampón NAZ y tres veces con 20 mM de
Tris-HCl, 0,5 M de KCl, pH 8,2 (tampón TK). Los
lavados finales fueron llevados a cabo con 20 mM de
Tris-HCl, 50 mM NaCl, 20 mM zwitergente, pH 9,5. La
agarosa pepstatina A fijada (aproximadamente 40 \mul) fue mezclada
con 40 \mul de tampón de corrida
SDS-\beta-mercaptoetanol (NOVEX) y
calentado a 70ºC durante 10 minutos. Alícuotas fueron aplicadas a
10% Tricina SDS-PAGE (NOVEX) y transferido a
membranas de PVDF usando un sistema tampón
Tris-Tricina 10%. Las membranas fueron teñidas con
amido negro o bloqueadas con solución 5% de leche descremada para
identificación por inmunoquímica. Cortes transversales de la
membrana teñida con amido negro fueron cortadas y lavadas en
H_{2}O estéril para análisis de secuencia amino -terminal en un
secuenciador de proteína automático.
Clones Genómicos de napsina humana fueron
obtenidos por selección de una librería de ADN genómico humano,
clonado en cromosomas artificiales bacterianos
(pBELO-BAC11) (Kim et al., Nucl. Acids. Res.
20, 1083-1085 (1992)). El origen de ADN genómico
para la librería fue desde líneas de células de espermatozoides
humanos 978SK, y contenían más de 140,000 clones. Sondas de
oligonucleótidos sintéticas fueron marcadas con ^{32}P:
para selección primaria Nap-3' |
(GAGGGCGAGCGCGCGCCAGTCCCACTCGTGCGCCGCTCTTCATGTCCCCG), |
para selección secundaria Nap-5' |
(CCATCCCCTCAGTAGGTTCAGGGTCCTGCGTCCAGGGTGGACTTGACGAA). |
La selección fue llevada a cabo en Research
Genetics, Huntsville, Alabama. Dos clones independientes fueron
aislados, ambos aproximadamente de longitud de 30 kbp, y fueron
cortados con enzima de restricción y analizados por electroforesis
en gel de agarosa pulse field. Fragmentos de interés fueron
identificados por Soutern Blotting, subclonado en pBlue y
secuenciado. El ADN genómico de Napsina A humano se muestra en las
figuras 3A-3E.
El gen de Napsina A humano se codifica en 9
exones (Figura 3F). Las uniones exón/intron se definen por
ambos, en la secuencia de ADNc como el motivo de unión. La región
que codifica a Napsina A humana contiene un marco de lectura
abierto "open reading frame" que comienza desde el codon
de iniciación ATG (nucleótido 1 en las figura
1A-1D) hasta aproximadamente 1,2 kb de una
prolongación de polyA en la secuencia de ADNc. Como en la
secuencia de ADNc de la Napsina A, la secuencia del exón genómico de
la Napsina A no contiene codon de parada
"in-frame" en la región de codificación
completa antes de la prolongación del poli A. La falta de un
codon de parada en la Napsina A es confirmada. La falta de un codon
de parada no ha sido observada para el gen de otras proteínas
mamíferas. El ADNc (por tanto, el ARNm) de la Napsina A está
presente en los diferentes tejidos humanos. Esto fue de interés
para ver si el gen napsina A es capaz de expresar el producto de
proteína. Estos resultados son descritos más
adelante.
adelante.
Clones 559204 y 163167 que expresan la napsina B
humana fueron obtenidos desde ATCC y secuenciados parcialmente como
se describe arriba. Las figuras 4A-4E indican la
secuencia de ADN de longitud completa resultante que codifica para
la Napsina B y la secuencia de aminoácidos pronosticada. Los
nucleótidos del 1-1191 fueron obtenidos de clones
genómicos (descrito arriba para la Napsina A) y de
1192-1910 desde clones de ADNc de ATCC. La
secuencia de gen de la Napsina B es un 92% idéntico a la de la
Napsina A, y la secuencia de proteína putativa de cada expuesta
identifica un 91% de similitud. Similar a la napsina A, la secuencia
de proteína de la napsina B deducida posee un motivo típico de
proteasa aspártica, y la misma extensión en el extremo C, motivo
RGD, y las regiones rica en prolina, como el ADNc de la Napsina A
(Figura 4A-4E). A diferencia del gen napsina A, gen
napsina B tienen un codon parada
in-frame.
La comparación de la secuencia de la napsina A
con otras tres proenzimas de proteasas aspárticas humanas se
muestra en las figuras 2A-2C. Está claro que la
napsina está relacionada con la catepsina D humana, y es similar
para proteínas como proteasa aspártica de ratón, pero las
diferencias son fácilmente evidentes. La relación para otras
proteasas aspárticas humanas se analiza después en la figura 2D, que
es una diagrama del grado de relación y los porcentajes de residuos
idénticos presentes. Evidentemente, por ambos criterios, la napsina
como muchas otras proteasas aspárticas es diferente como ellas son
diferentes a otras.
Además la semejanza de secuencia a otras
proteasas aspárticas humanas, la conclusión de que la napsina es
una proteasa aspártica esta descrita por las siguientes
observaciones. (a) los sitios críticos de residuos aspárticos
activos en posición 32 y 215 están presente en las secuencias DTG
conversa. (b) la presencia de Tyr-75 (Y) y
algunos residuos conservados alrededor de él demuestran un
"flap" funcional que es característico de las proteasas
aspárticas. (c) la región pro que corresponde a los residuos
1p hasta 44p están presentes en la napsina, indicando que es una
proenzima de la proteasa aspártica y es capaz de la activación.
Una secuencia RGD se encuentra en la posición
315 a 317 (número de residuo de pepsina porcina por convención).
Este motivo ha sido demostrado que es importante para la unión
integrina que esta relacionada a la regulación de las funciones
celulares como el ciclo celular, hemostasis, la inflamación y la
proliferación celular. Esta secuencia podría tener una función
especial por medio de la napsina.
Un suero policlonal específico a la napsina fue
producido usando el siguiente procedimiento. Un epítope del
aminoácido 18 de la Napsina A fue sintetizado como un péptido
antigénico múltiple (MAP) sobre un nodo central
poli-lisina por Molecular Biolgy Resource
Facility (OUHSC). Este epítope (MKSGARVGLARARPRG) fue común
tanto a Napsina A como B, y suficientemente diferente de la
catepsina D, su homólogo más cercano. Esta región es muy probable
que este ubicada sobre la superficie de la Napsina A, como esta
determinada desde la estructura de cristal catepsina D coordinada
(Erickson, 1993). Alícuotas de 1 mg en 1 ml de H_{2}O fue
usado para inmunizar a cabras (Hybridoma Lab, Oklahoma Medical
Research Foundation). Suero colectado fue precipitado con
sulfato amonio múltiples veces (Antibodies Lab Manual) y
purificada por afinidad usando la Napsina acoplada al MAP juntó con
affi-gel 10 (BioRad). Este antisuero
fue usado a la dilución 1: 5000 en la detección de Napsina A sobre
membranas de PVDF transferidos de geles de SDS-PAGE
(NOVEX). El sistema ECL (Pierce) fue usado para la detección
del anticuerpo primario.
Manchas "Inmunoblots" de muestras de
Napsina A recombinante de células 293 de riñones humanos son
preparadas como se describe arriba y se detecta la Napsina A. Estos
resultados demuestran la expresión de gen de la napsina A
produciendo una banda inmunoespecífica que migra en la
electroforesis SDS-poliacrilamida con una movilidad
similar a la Napsina B. Por tanto, a pesar de la falta de un codon
de parad en la Napsina A, la proteína esta correctamente expresada
en la línea de célula humana. El hecho de que esta proteína Napsina
A fue recobrada desde la columna de afinidad pepstatina sugiere que
la presencia de un sitio activo es similar a todas las proteasas
aspárticas.
Las secciones de aproximadamente 8 gramos de
corteza de riñón humana (red de tejido humana cooperativa,
Cooperative Human Tissue Network, National Cancer Institute,
NIH) fueron homogeneizadas en una licuadora Waring en un
tampón compuesto por 20 mM Tris HCl, 50 mM NaCl, 20 mM
zwitergente, y 1 \muM cada uno de TPCK, TLCK, y EDTA, pH
7,5 (Tampón TZ). Al homogenizado se le adiciona sulfato de amonio
40% y se centrifuga a 10,000 x g con agitación ligera. El
sobrenadante resultante se adiciona en sulfato de amonio 70% y se
centrifuga a 10,000 x g. El material insoluble en el sulfato de
amonio 70% (cortado entre 40-70%) fue disuelto en 15
ml Tampón TZ y se lleva a pH 4.0 con 30 ml de tampón NAZ. Luego de
la incubación en hielo durante 1 hora, la muestra se centrifuga a
14,000 x g. El sobrenadante resultante, se le añade una alícuota de
0,1 ml de agarosa - pepstatina A (Sigma). La detección de Napsina B
en líneas de células se realiza siguiendo el procedimiento
argumentado arriba para la detección de Napsina A recombinante.
La napsina B fue detectada en muestras de
tejidos de la corteza de riñón humana y en línea de célula
Hut-78 de riñón humano: riñón humano (corte
0-40% sulfato de amonio) riñón humano (corte
40-70%); células Hut-78, en cuatro
formas aparentemente. En el corte de sulfato de amonio entre
0-40%, una proteasa de simple cadena de
50-54 kDa con una secuencia del extremo amino
heterogénea se detecta de una derivada de la secuencia de proteína
SPGDKPIFVPLSNYR (con otros extremos en Asp4 y Lys5). Estas
secuencias del extremo -N coinciden con el sitio de anclaje de la
activación pronosticada en pronapsina B comparando con los sitios de
anclaje de activación en procatepsina D homologa y en otras
proteasas aspárticas de cimógenos. En el corte de sulfato de amonio
40-70%, tres formas fueron detectadas. Una forma de
simple cadena 46-50 kDa, y dos forma de doble
cadena. La banda de 46-50 kDa produce la misma
secuencia heterogénea de la secuencia de Napsina B obtenida desde
la banda de peso molecular más grande en el gradiente de sulfato de
amonio 40%. Los dos fragmentos de peso molecular más bajos de
aproximadamente 8 y 4 kDa producen la misma secuencia amino terminal
(VRLCLSGFQALDVPPPAGPF) que se corresponde con la región
C-terminal de Napsina B. Una banda de 40 kDa
prominente de las preparaciones transferidas fueron secuenciadas, y
produce la misma secuencia heterogénea amino terminal como la banda
de 46-50 kDa, indicando dos especies de Napsina B
de doble cadena: uno de 8 kDa y 40 kDa y también especies como 4
kDa y 40 kDa.
Una gran variedad de usos clínicos y de
diagnósticos para la enzima pueden ser diseñados sobre la base de
la analogía con los usos de las proteasas aspárticas relacionadas.
Las proteínas, las moléculas de nucleótidos, y los métodos para el
aislamiento y uso de éstas tienen una gran variedad de aplicaciones,
particularmente en las aplicaciones diagnósticas. Debido a que las
proteasas aspárticas que son conocidas se correlacionan con ciertos
trastornos, como el cáncer de mama y la hipertensión arterial, y la
napsina se expresa en el riñón, la medición de los niveles y de los
tipos de napsina que se expresan en los tejidos, especialmente el
riñón, se pueden correlacionar con la presencia y la gravedad de
los trastornos. El ADN recombinante y los reactivos derivados de
ésta pueden ser usados para determinar la expresión de napsina en
personas sanas y en personas que afectadas con la enfermedad. Las
secuencias de Napsina pueden ser usadas siguiendo de forma paralela
la presencia de genes de napsina en pacientes para el vínculo a
posibles enfermedades.
La cantidad de napsina puede ser determinada
usando las técnicas de selección estándares, que se extienden desde
el aislamiento de la napsina del tejido, usando por ejemplo la
anti-napsina inmovilizada
(anti-napsina A ó anti-napsina B) o
pepstatina, para la detección y la cuantificación de anticuerpos
marcados, la determinación de la cantidad de ARNm transcrito en el
tejido, usando sensores de nucleótidos marcados.
Los anticuerpos policlonales fueron producidos
usando las técnicas estándares para la inmunización de un animal
con proteína purificada en combinación con un adyuvante como
adyuvante Freunds'. Anticuerpos monoclonales también pueden
ser preparados usando técnicas estándares, por ejemplo, ratones
inmunizados hasta que el título de anticuerpo sea suficientemente
alto, aislando el bazo y haciendo una fusión, y luego seleccionando
los hibridomas para aquellos que producen los anticuerpos de
interés. Éstos pueden ser anticuerpos reactivos con cualquier
napsina, o reactivo con Napsina A pero no B, y viceversa.
Los anticuerpos humanizados para aplicaciones
terapéuticas, y fragmentos de anticuerpos recombinantes pueden
también ser generados usando una metodología estándar. Un anticuerpo
humanizado es aquel en el cual solamente los sitios de
reconocimiento del antígeno ó de las regiones hipervariable (CDRs)
determinan la complementariedad de que son de origen no humano, y
que todas las regiones framework (FR) de dominios variables
son productos de genes humanos. En un método de humanización de un
anticuerpo monoclonal anti-idiotípico de animal,
RPAS esta combinado con el método CDR injertado descrito por
Daugherty et al., Nucl. Acids Res., 19:
2471-2476 (1991). Brevemente, la región de ADN
variable de un ScFv anti-idiotípico recombinante del
animal seleccionado se secuencia por el método Clackson, T., et
al., Nature, 352: 624-688 (1991). Usando esta
secuencia, CDRs en el animal se distinguen regiones
framework del animal (FR) sobre la base de las localizaciones
de los CDRs en las secuencias conocidas de genes variable del
animal. Kabat, H.A., et al., Sequences of Proteins of
Immunological Interest, 4th Ed. (U.S. Dept. Health and Human
Services, Bethesda, MD, 1987). En cuanto a los CDRs del animal
y el FR son identificados, los CDRs se injertan en la cadena pesada
de la región variable humana por el uso de los oligonucleótidos
sintéticos y de la recombinación de reacción en cadena de polimerasa
(PCR). Codones para los CDRs de cadena pesada del animal, también
están disponibles en regiones variables framework de cadena
pesada de humano, son construidas de cuatro oligonucleótidos (cada
uno largo de 100 bases). Se usa PCR en la secuencia de ADN del
injerto de 400 bases formadas, que codifica para la región FR de
cadena pesada humana/CDRs de animal recombinante. La expresión del
gen recombinante de inmunoglobulina del CDR injertado se logra por
su transfección en células 293 humanas (células de riñón
embrionarias primarias transformadas, comercialmente disponible
desde, American Type Culture Collection, Rockville, MD 20852)
que secretan el anticuerpo injertado completamente. Ver, por
ejemplo, Daugherty, B.L., et al., Nucl. Acids. Res., 19:
2471-2476, 1991. Por otra parte ScFv humanizado se
expresa aparentemente de bacteriófago y se produce en E.
coli con el método RPAS descrito más adelante.
El sistema Pharmacia's (Pharmacia LKB
Biotechnology, Sweden) "Recombinant Phage Antibody
System" (RPAS) puede ser usado para éste propósito. En el
RPAS, los genes de cadena pesada y ligera de anticuerpos variables
son amplificados por separado del ARNm del hibridoma y clonados en
un vector de expresión. Los dominios de cadena pesada y ligera son
coexpresados sobre la misma cadena de polipéptidos después de unido
con un enlace corto al ADN, el que codifica para un péptido
flexible. Este ensamblaje genera un fragmento Fv de cadena simple
(ScFv) el que incluye el dominio de unión antígeno completo al
anticuerpo. Usando el sistema de selección dirigido al antígeno, se
selecciona el ScFv con la característica de unión equivalente a
aquel anticuerpo monoclonal original [ver, por ej. McCafferty,
J, et al., Nature, 348: 552-554 (1990);
Clackson, T., et al., Nature, 352: 624-688
(1991). El ScFv recombinante incluye un número de epítopes
considerablemente más pequeño que el anticuerpo monoclonal intacto,
y representa un estímulo inmunogénico mucho más débil cuando se
inyecta en seres humanos. Una inyección intravenosa de ScFv en seres
humanos, por tanto se espera que sea más eficiente e
inmunológicamente tolerable en comparación con anticuerpos
monoclonales enteros actualmente usados [Norman, D.J., et al.,
Transplant Proc., 25, suppl. 1: 89-93
(1993).
Las sondas de nucleótidos pueden ser usadas para
seleccionar la expresión de la napsina o los tipos y/o las
proporciones de isoformas presentes. Estas pueden ser las secuencias
de ADNc o de otras moléculas diseñadas sobre la base de las
secuencias reportadas aquí, o las que son obtenidas usando técnicas
estándares de librerías generadas de diferentes tipos de células o
especie. Se comprende que mientras la secuencia reportada aquí sea
de origen humano, las mismas proteasas estarán presentes en las
otras especies de animales, y variarán hasta cierto punto en ambas
secuencias de aminoácidos y en la secuencia de nucleótidos. La
Napsina esta referida aquí, como una proteasa aspártica que tiene
la secuencia de aminoácidos que ocurre de forma natural en el ser
humano u otros animales, o una secuencia compuesta construida por la
sustitución de aminoácidos de una especie dentro de otra, en la
posición equivalente, u otro sitio activo, discutido arriba. Una
molécula de nucleótidos que codifica para la napsina puede estar
existiendo de forma natural, como se describe aquí, o diseñado y
hecho sintéticamente sobre la base de la secuencia de aminoácidos.
Además, debido a que al menos dos isoformas han sido identificadas,
se espera que isoformas adicionales sean encontradas en tejidos
aparte del riñón o el hígado. Estas isoformas son incluidas dentro
del término "napsina".
Las moléculas de nucleótidos pueden ser usadas
para determinar cantidad, el tipo o una combinación de esta, usando
técnicas de diagnóstico estándares. En general, las sondas incluirán
un segmento de un ADN que codifica al menos catorce nucleótidos de
napsina, que deben ser suficientes para proporcionar la
especificidad bajo las condiciones de hibridación estándares, y aun
más bajo condiciones severas. Las condiciones de reacción para la
hibridación de una sonda de oligonucleótidos o plantilla para una
secuencia de ácido nucleicos que varía de oligonucleótido a
oligonucleótido, dependiendo de los factores como la longitud del
oligonucleótido, el número de nucleótidos G y C, y la composición
del tampón utilizado en la reacción de hibridación. Las condiciones
de hibridación medianamente severas son generalmente comprendidas
por aquellos expertos como condiciones aproximadamente de 25ºC por
debajo de la temperatura de fusión de un ADN doble hebra
perfectamente pareado. La especificidad más alta se alcanza
empleando condiciones de incubación que tienen más altas
temperaturas, en otras palabras, condiciones más severas. En
general, el largo de la secuencia o el mayor contenido de C y G,
requiere la mayor temperatura y concentración de sal. Capítulo 11
del Manual del laboratorio de Sambrook et al., MOLECULAR
CLONING: A LABORATORY MANUAL, second edition, Cold Spring Harbor
Laboratory Press, New York (1990), describe las condiciones de
hibridación para sondas de oligonucleótidos y plantilla en gran
detalle, incluyendo una descripción de los factores y el nivel de
severidad necesaria para garantizar la hibridación con la
especificidad. Por debajo de 10 nucleótidos los sistemas
hibridizados no son estables y empezarán a desnaturalizarse más
arriba de 20ºC. Por arriba de 100,000 nucleótidos, uno descubre que
la hibridación (renaturalización) se hace un proceso mucho más
lento e incompleto, como se describe en el texto MOLECULAR
GENETICS, Stent, G.S. and R. Calender, pp.
213-219 (1971). Idealmente, la sonda debe ser de 20
a 10,000 nucleótidos. Secuencias de nucleótidos más pequeñas
(20-100) se prestan a la producción por técnica de
síntesis orgánica automática. Las secuencias de nucleótidos de
100-10,000 pueden ser obtenidas desde tratamientos
de endonucleasas de restricción adecuada. El marcaje de las sondas
más pequeñas con la parte quimioluminicente relativamente voluminosa
puede en algunos casos interferir el proceso de hibridación.
Ambas moléculas de nucleótidos y anticuerpos
pueden ser marcadas con las técnicas estándares, por ejemplo, con
marcadores radioactivos, marcadores fluorescentes, marcadores
quimioluminiscente, tinturas, enzimas, y otros medios para la
detección, como partículas magnéticas. Por ejemplo, marcaje
selectivo del sitio activo con fluoresceína puede ser llevado a
cabo por el método de Bock (Bock, P.E. (1988)
Biochemistry 27, 6633-6639). En resumen, un
agente bloqueador reacciona con la enzima durante 1 hora a
temperatura ambiente. Después de la diálisis, la enzima
covalentemente modificada se incuba a temperatura ambiente durante
una hora con 200 \muM de 5-(iodoacetamido) fluoresceína (Sensores
moleculares). Fluoresceína libre es eliminada por gel filtración en
una columna P-10 (Pharmacia). Con este
método, cada molécula de enzima fluoresceinada contiene una sola
tintura en el sitio activo y por lo tanto todas las moléculas
fluorescentes actúan de forma idéntica. Por otra parte, yodo gen
(Pierce) puede usarse en la enzima radiomarcada con
Na[^{125}I] (Amersham) de acuerdo con el protocolo
del artículo de fabricación. El ^{125}I libre puede ser eliminado
por gel filtración en una columna P-10.
Proteínas recombinantes, y fragmentos de estas,
son útiles como controles en los métodos de diagnósticos. El ADNc y
las secuencias de genes de Napsina A fueron determinadas. El ADN fue
expresado en un sistema recombinante (línea celular humana) y la
actividad de la enzima caracterizada. El ADNc y la secuencia del gen
de napsina B fueron determinadas. Las proteínas pueden ser usadas
como estándares, o como fue discutido debajo, terapéuticamente como
proteasas aspárticas y en estudios del comportamiento de la enzima.
La expresión de proteínas recombinantes desde un ADNc sin codon de
parada puede ofrecer ciertas ventajas.
Sondas de nucleótidos y anticuerpos son
principalmente útiles en la detección de napsina, o sus isoformas.
En algunos casos podría ser también útil para aislar la proteína
purificada. Como se describe arriba, un procedimiento que fue
creado para unir Napsina A y Napsina B a una columna de afinidad -
pepstatina. Pepstatina inmovilizada puede ser usada para purificar
napsina, natural, o recombinante, desde tejidos en los que se
expresa, para aplicaciones diagnósticas.
Las proteasas aspárticas podrían ser útiles en
aplicaciones similares a éstas en el que es usada Catepsina D.
Clínicamente, podría ser ventajoso para transfectar, incluso
temporalmente, el gen que codifica napsina para tratar los
trastornos en los que la persona es deficiente en la proteasa, o
transfectar a una antisonda, dirigida a ribozima o secuencia guía
de ribozima, o triple hélice para prevenir o reducir la expresión de
la enzima, en personas con los trastornos caracterizados por el
elevado nivel de enzima.
\vskip1.000000\baselineskip
\bullet US 9721684 W
\bullet US 60031196 B
\bullet US 60046126 B
\bulletTANG; WONG. J. Cell.
Biochem., 1987, vol. 33,53-63
\bulletTANG et al. Nature,
1978, vol. 271, 618-621
\bulletSAMLOFF.
Gastroenterology, 1989, vol.
96,586-595
\bulletMIKI et al. Jpn. J. Cancer
Res., 1993, vol. 84,1086-1090
\bulletROCHEFORT. Acta
Oncologica, 1992, vol. 31,125-130
\bulletDEFIZE et al. Cancer,
1987, vol. 59, 952-958
\bulletMIKI et al. Adv. Exp. Med.
Biol., 1995, vol. 362,139-143
\bulletBROWN et al. Handbook of
Hypertension. ElsevierScience Publishers, 1983, vol. 1,
278-323
\bulletADAMS et al. Science,
1991, vol. 252, 1651-1656
\bulletKIM et al. Nucl. Acids
Res., 1992, vol. 20, 1083-1085
\bulletDAUGHERTY et al. Nucl. Acids
Res., 1991, vol. 19,2471-2476
\bulletCLACKSON, T. et al.
Nature, 1991, vol. 352,624-688
\bulletKABAT, H.A. et al. Sequences
of Proteins of ImmunologicalInterest. U.S. Dept. Health and
HumanServices, 1987
\bulletDAUGHERTY, B.L. et al. Nucl.
Acids Res., 1991, vol. 19, 2471-2476
\bulletMCCAFFERTY, J. et al.
Nature, 1990, vol. 348,552-554
\bulletNORMAN, D.J. et al.
Transplant Proc., 1993, vol. 25(1),
89-93
\bulletSAMBROOK et al. MOLECULAR
CLONING: A LABORATORYMANUAL. Cold Spring Harbor LaboratoryPress,
1990
\bulletSTENT, G.S.; R.
CALENDER. MOLECULAR GENETICS, 1971,
213-219
\bulletBOCK, P.E. Biochemistry,
1988, vol. 27, 6633-6639
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Oklahoma Medical Research Foundtion
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TITULO DE LA INVENCIÓN: Clonaje y caracterización de Napsina
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 14
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN CORRESPONDIENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DIRECCIÓN: Patrea L. Pabst
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 2800 One Atlantic Center, 1201 W. Peachtree St.
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Atlanta
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: GA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: USA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 30309-3450
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA DE LECTURA EN COMPUTADORA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO MEDIO: disco Floppy
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- COMPUTADORA: PC compatible IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release #1.0, Version #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NUMERO DE SOLICITUD: PCT/US 97/21684
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 20-NOV-1997
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD DE PRIORIDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NUMERO DE SOLICITUD: US 60/031,196
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 20-NOV-1996
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD DE PRIORIDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NUMERO DE SOLICITUD: US 60/046,126
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 09-MAY-1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Pabst, Patrea L.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 31,284
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE ROTULO REFERENCIA/: OMRF 166
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 404-873-8794
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 404-873-8795
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO.1
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1353 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: SIMPLE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: LINEAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No.1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No:2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 451 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No:2:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.3
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1651 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO:3:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1910 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:4:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 420 amino ácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: amino ácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No.5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 419 amino ácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: amino ácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No.6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 412 amino ácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: amino ácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No.7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 445 amino ácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: amino ácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Homo sapiens
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No.8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID N. 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGGGCACACT GAAGAAGTGG CATCTCC
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 27 pares bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No. 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTTTGAGCA AGTTCAGCCT GGTTAAG
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 40 pares bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No. 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAGCTTATGT CTCCACCACC GCTGCTGCTA CCCTTGCTGC
\hfill40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 42 pares bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No. 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAGCTTTTAT TTTTTTTTTT TTTTTTTTCAA TGGAAATATT GG
\hfill42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 50 pares bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No. 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGAGGGCGAGC GCGCGCCAGT CCCACTCGTGTG CGCCGCTCTT CATGTCCCCG
\hfill50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID No.14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 50 pares bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TRENZADO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID No.14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCATCCCCTC AGTAGGTTCA GGGTCCTGCG TCCAGGGTGG ACTTGACGAA
\hfill50
Claims (9)
1. Un anticuerpo inmunoreactivo específicamente
sea con una o ambas 1) una napsina que tiene la secuencia de
aminoácidos de -64 a 375 ó de 1 a 375 de H-napsina
de la figura 2A a 2C y 2) una napsina que tiene la secuencia de
aminoácidos de la figura 4A a la 4F, o de los aminoácidos de la
figura 4A a la 4F desde la secuencia SPGDK
PIFVPLSNYR hacia adelante, en el que el anticuerpo es capaz de unirse a un epítope que consta de la secuencia de aminoácidos MKSGARVGLARARPRG.
PIFVPLSNYR hacia adelante, en el que el anticuerpo es capaz de unirse a un epítope que consta de la secuencia de aminoácidos MKSGARVGLARARPRG.
2. El anticuerpo de la reivindicación 1, en el
que el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal.
3. El anticuerpo de la reivindicación 1, en el
que el anticuerpo es un anticuerpo marcado.
4. El anticuerpo de la reivindicación 3, en el
que el anticuerpo marcado es marcado con radioactividad, con marca
fluorescente, con marca quimioluminescente, tintura o enzima.
5. Un método para detectar una napsina en una
muestra, método que consta de los pasos de:
- (a)
- poner en contacto la muestra con el anticuerpo de la reivindicación 3;
- (b)
- permitir que el anticuerpo se una a la napsina; y
- (c)
- detectar el anticuerpo marcado.
6. Un método para aislar la napsina de una
muestra, que consta de los pasos de:
- (a)
- poner en contacto la muestra con el anticuerpo de la reivindicación 1;
- (b)
- permitir que el anticuerpo se una a la napsina; y
- (c)
- separar el anticuerpo de la muestra.
7. El método de una cualquiera de las
reivindicaciones 5 ó 6, en el que la muestra es una muestra de
tejido humano.
8. El método de una cualquiera de las
reivindicaciones 5 ó 6, en el que dicha muestra es una muestra de
línea celular.
9. El método de una cualquiera de las
reivindicaciones 5 ó 6, en el que dicha muestra es una muestra de
una línea celular humana.
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