ES2275528T3 - Metodos para detectar simultaneamente ambos miembros de un par de union. - Google Patents

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Abstract

Un método para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica, cuyo método comprende: a) proporcionar un reactivo en fase sólida, comprendiendo dicho reactivo en fase sólida una partícula revestida con anticuerpos de captura que tienen actividades de unión específicas por dicho miembro A de dicho par de unión, b) poner en contacto dicha muestra biológica con dicho reactivo en fase sólida en condiciones en las que dicho miembro A, si está presente, resulta unido a dicha partícula, para formar una primera partícula reaccionda; c) poner en contacto dicha primera partícula reaccionada con primeros anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro A, en los que dichos primeros anticuerpos están marcados con una primera marca, y con segundos anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro B de dicho par de unión, en los que dichos segundos anticuerpos están marcados con una segunda marca, que es diferente de dicha primera marca, para formar una segunda partícula reaccionada, y d) medir dichas primera y segunda marcas en dicha segunda partícula reaccionada.

Description

Métodos para detectar simultáneamente ambos miembros de un par de unión.
La invención se refiere a métodos para detectar simultáneamente ambos miembros de un par de unión en una muestra biológica.
Debe examinarse rutinariamente en productos sanguíneos usados para transfusión y transferencia de componentes de la sangre la presencia de agentes infecciosos tales como el virus de la inmunodeficiencia humana (HIV), virus de hepatitis, virus linfocitotrópico T humano y citomegalovirus. Tales agentes se detectan típicamente por identificación de antígenos víricos o por detección de una respuesta inmune al virus (es decir, anticuerpos anti-víricos derivados del hospedante) usando análisis de inmunoensayo de enzimas (EIA) o radioinmunoensayos (RIA). Las técnicas de inmunoensayos se limitan en su capacidad a detectar la presencia de contaminantes víricos en fases tempranas de infección, variando el período de incertidumbre entre infección con un virus y detección por técnicas de inmunoensayo de dos a cuatro semanas para HIV y hasta aproximadamente 10 semanas para virus de la hepatitis C (HCV). Técnicas tales como reacción de cadena de transcriptasa inversa polimerasa (RT-PCR) o análisis de ADN de cadena ramificada pueden acortar el período de tiempo entre infección y detección, pero son de coste prohibitivo para usarse en base a un donante individual y no eliminan el período de incertidumbre.
El documento EP-A-0 595 211 describe un método para determinar simultáneamente un antígeno de un agente causante y un anticuerpo dirigido contra este agente causante pero no dicho antígeno. El método comprende la unión del antígeno y anticuerpo a receptores R1 y R2, respectivamente, unidos ambos a una fase sólida y la detección del antígeno y anticuerpo uniéndose a receptores R3 y R4, respectivamente, para ellos, estando marcados ambos con una misma marca. La Patente de los EE.UU. Nº 5.627.026 describe un método para detectar simultáneamente un antígeno y un anticuerpo en una muestra biológica. El método incluye poner en contacto un sustrato sólido que contiene una primera posición revestida de anticuerpo y una segunda posición revestida de antígeno con una muestra biológica y una mezcla de antígeno marcado y anticuerpo marcado y determinar si está presente una marca en la posición apropiada en el sustrato sólido.
La invención se basa en un método rápido y sensible para detectar simultáneamente ambos miembros de un par de unión, tales como un ligando y receptor o un antígeno y anticuerpo de hospedante, de una muestra biológica. Los métodos de la invención pueden, por ejemplo, aumentar la capacidad para detectar infecciones en una fase temprana, conduciendo a un tratamiento más temprano de la infección.
La invención presenta un método para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica. La muestra biológica se selecciona del grupo constituido por sangre, plasma, suero, orina, fluido cerebroespinal, esputo, lágrimas, fluido amniótico, humor vítreo, saliva y sobrenadantes de cultivo de tejidos. El método incluye proporcionar un reactivo en fase sólida, que incluye una partícula revestida con anticuerpos de captura que tienen afinidades de unión específicas por el miembro A del par de unión, y poner en contacto una muestra biológica con el reactivo en fase sólida en condiciones en las que el miembro A, si está presente, resulta unido a la partícula, para formar una primera partícula reaccionada. Los anticuerpos de captura pueden ser monoclonales. La primera partícula reaccionada se pone en contacto con primeros anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por el miembro A, en los que los primeros anticuerpos están marcados con una primera marca, y con segundos anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por el miembro B del par de unión, en los que los segundos anticuerpos están marcados con una segunda marca, que es diferente de dicha primera marca, para formar una segunda partícula reaccionada. Los primeros y segundos anticuerpos pueden ser monoclonales. Se miden la primera y segunda marcas (por ejemplo, fluoróforos) en la segunda partícula reaccionada usando citometría de
flujo.
En ciertas realizaciones, sustancialmente todos los anticuerpos de captura están orientados en la partícula de tal modo que las regiones de unión de antígeno de los anticuerpos de captura están disponibles para unirse al miembro A del par de unión.
El miembro A del par de unión puede ser, por ejemplo, un antígeno y el miembro B puede ser un anticuerpo del hospedante. El antígeno puede ser un antígeno vírico tal como antígeno de hepatitis C, un antígeno de hepatitis B o un antígeno de virus de la inmunodeficiencia humana, o un autoantígeno tal como descarboxilasa de ácido glutámico. El miembro A del par de unión puede ser también un ligando, tal como una citoquina, y el miembro B puede ser un receptor, tal como un receptor de citoquina. Además, el miembro A puede ser una enzima y el miembro B puede ser un sustrato. Por ejemplo, la enzima puede ser caspasa-3 o caspasa-1, y el sustrato puede ser polimerasa poli(ADP-ribosa) o proInterleuquina-1, respectivamente.
La invención presenta también un juego para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica. El juego incluye un reactivo en fase sólida, que incluye una partícula revestida con anticuerpos de captura que tienen afinidades de unión específicas por el miembro A del par de unión; primeros anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por el miembro A del par de unión, en los que los primeros anticuerpos están marcados con una primera marca; y segundos anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por el miembro B del par de unión, en los que los segundos anticuerpos están marcados con una segunda marca, que es diferente de dicha primera marca. Sustancialmente todos los anticuerpos de captura están orientados en la partícula de tal modo que las regiones de unión de antígeno de los anticuerpos de captura están disponibles para unirse al miembro A del par de unión. El juego puede incluir además una marca o inserto de paquete, que indica que el reactivo en fase sólida, los primeros anticuerpos marcados y los segundos anticuerpos marcados pueden usarse para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica por citometría de flujo.
Salvo definición en contrario, todos los términos técnicos y científicos usados aquí tienen el mismo significado que el que se entiende comúnmente por un experto ordinario en la técnica a la que pertenece la invención. Aunque pueden usarse para practicar la invención métodos y materiales similares o equivalentes a los descritos aquí, se describen después métodos y materiales adecuados. En caso de conflicto con publicaciones, solicitudes de patente, patentes y otras referencias mencionadas aquí, mandará la presente memoria descriptiva, incluyendo definiciones. Además, los materiales, métodos y ejemplos son sólo ilustrativos, y no pretenden ser limitativos.
Otros aspectos y ventajas de la invención se evidenciarán a partir de la siguiente descripción y las reivindicaciones.
La Figura 1 es una representación esquemática de un ensayo para detectar el miembro A y un anticuerpo anti-miembro A del hospedante (miembro B).
Las Figuras 2A-2H son dispersogramas que indican la detección simultánea de antígeno superficial de virus de la hepatitis B (HBV), anticuerpo anti-HBV del hospedante, antígeno de núcleo de HCV, y anticuerpo anti-HCV del hospedante por citometría de flujo. La Figura 2A es antígeno y anticuerpo de HBV en una muestra normal. La Figura 2B es antígeno y anticuerpo de HCV en una muestra normal. La Figura 2C es es antígeno y anticuerpo de HBV en una muestra positiva en HBV. La Figura 2D es antígeno y anticuerpo de HCV en una muestra positiva en HBV. La Figura 2E es antígeno y anticuerpo de HBV en una muestra positiva en HCV. La Figura 2F es antígeno y anticuerpo de HCV en una muestra positiva en HCV. La Figura 2G es antígeno y anticuerpo de HBV en una muestra positiva en HBV/positiva en HCV. La Figura 2H es antígeno y anticuerpo de HCV en una muestra positiva en HBV/positiva en HCV.
Formato de inmunoensayo
En general, la invención usa un método de inmunoensayo sándwich para detectar simultáneamente ambos miembros de un par de unión en una muestra biológica. Los pares de unión incluyen cualquier combinación de moléculas que forma un complejo, incluyendo pares compuestos por ácidos nucleicos, proteínas o una molécula pequeña y una proteína. Los pares de ácidos nucleicos pueden ser pares ADN:ARN o pares ADN:ADN. Por ejemplo, puede usarse un par de unión ADN/ARN tal como un ADN de cadena sencilla (ss) y un mARN como sistema de detección de producto de PCR. Puede usarse un par de unión ADN/ADN tal como un ssADN y un ADN vírico en un ensayo de competencia para cuantificar un virus por ADN multiplicado.
Los ejemplos no limitativos de pares de unión de proteína, o una molécula pequeña y proteína, incluyen una hormona, una citoquina, un péptido, un fármaco, una proteína vírica u otro antígeno y un receptor cognado o anticuerpo del hospedante. Los pares de unión proteína vírica/receptor pueden ser, por ejemplo, gp120 de HIV y CD4 soluble. Los pares de unión fármaco y receptor de fármaco pueden ser, por ejemplo, cocaína y un receptor de dopamina. Los pares de unión péptido y receptor de péptido pueden ser, por ejemplo, acetilcolina y un receptor muscarínico o dopamina y un receptor de dopamina. Los pares de unión hormona y receptor de hormona pueden ser, por ejemplo, insulina y receptor de insulina. Los pares de unión citoquina y receptor de citoquina pueden ser, por ejemplo, factor de necrosis de tumores (TNF) y un receptor de TNF Tipo I o Tipo 2 o interleuquina 2 (IL-2) y receptor de IL-2. Los pares antígeno y anticuerpo pueden ser, por ejemplo, una proteína vírica y un anticuerpo anti-proteína vírica o un autoantígeno y un anticuerpo anti-autoantígeno del hospedante. p24 de HIV/anticuerpo anti-HIV humano, gp120 de HIV/anticuerpo anti-gp120 de HIV humano, antígeno superficial de HBV/antígeno superficial anti-HBV humano, y proteína de núcleo de HCV/anticuerpo anti-núcleo de HCV humano son ejemplos de pares de unión proteína vírica y anticuerpo del hospedante. Un par de unión autoantígeno y anticuerpo anti-autoantígeno del hospedante puede ser, por ejemplo, descarboxilasa de ácido glutámico (GAD) y anticuerpo anti-GAD del hospedante.
Otros pares de unión de proteína que pueden detectarse son pares de unión de enzima y sustrato de enzima. Por ejemplo, el par enzima/sustrato puede ser caspasa-3/polimerasa poli(ADP-ribosa) o caspasa-1/proInterleuquina-1.
El miembro A, que puede ser cualquier miembro del par de unión, es capturado con un reactivo en fase sólida que es una partícula revestida con anticuerpos de captura que tienen afinidades de unión específicas por el miembro A. Por ejemplo, si el par de unión a detectar simultáneamente es gp120 de HIV/anticuerpo anti-gp120 de HIV del hospedante, la partícula puede revestirse con anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por gp120 de HIV o anti-inmunoglobulina (Ig) del hospedante.
El miembro A se captura poniendo en contacto una muestra biológica con la partícula revestida con anticuerpos de captura. Según se usa aquí, las muestras biológicas adecuadas contienen células o material celular, e incluyen, por ejemplo, sangre, plasma, suero, orina, saliva, esputo, lágrimas, fluido amniótico, humor vítreo y fluido cerebroespinal. Otras muestras pueden incluir medio de cultivo de tejidos in vitro/sobrenadantes. Las muestras biológicas pueden tratarse con un detergente no iónico tal como 0,5% de Triton-X 100 o Nonidet P40 (Sigma Chemical Company, St. Louis, MO) para exponer antígenos de núcleo de patógenos.
El reactivo en fase sólida y la muestra biológica se ponen en contacto en condiciones que facilitan la unión del miembro A, si está presente, a la partícula, para formar una primera partícula reaccionada. Tales condiciones pueden incluir el uso de un tampón que contiene 1% de suero de bovino fetal (FBS) y 0,1% de azida sódica en solución salina tamponada con fosfato (PBS) a temperatura ambiente, o el uso de cualquier fluido biológico, en condiciones de pH fisiológico. La primera partícula reaccionada se pone después en contacto con dos grupos de anticuerpos marcados (es decir, anticuerpos informadores) para formar una segunda partícula reaccionada. Los primeros anticuerpos tienen afinidades de unión específicas por el miembro y se marcan con una primera marca. Los primeros anticuerpos son capaces de unirse al miembro A mientras el miembro A está unido a anticuerpos de captura. Así, los anticuerpos de captura y los primeros anticuerpos deben trabajar como un par. Los segundos anticuerpos tienen afinidades de unión específicas por el miembro B del par de unión y se marcan con una segunda marca. Son particularmente útiles en este método anticuerpos marcados fluorescentemente.
La Figura 1 proporciona un esquema de un ensayo para detectar el miembro A y el anticuerpo anti-miembro A del hospedante. En esta realización, anticuerpos de captura biotinados tienen afinidades de unión específicas por el miembro A y están acoplados a perlas de captura de antígeno mediante avidina. Los primeros anticuerpos tienen afinidades de unión específicas por el miembro A y están marcados con ficoeritrina (primera marca). Los segundos anticuerpos están marcados con cianina-ficoeritrina (segunda marca) y tienen afinidades de unión específicas por la Ig del hospedante (miembro B). La primera partícula reaccionada incluye el miembro A, los anticuerpos anti-miembro A del hospedante, anticuerpos de captura y el reactivo en fase sólida (por ejemplo, perlas de captura de antígeno), en la que la segunda partícula reaccionada incluye la primera partícula reaccionada y los dos anticuerpos marcados.
Puede usarse citometría de flujo para medir la cantidad de marca en la segunda partícula reaccionada. Según se usa aquí, el término "medir" se refiere a mediciones cualitativas y cuantitativas. En otras palabras, el término "medir" incluye informar de la presencia o ausencia de marca en la segunda partícula reaccionada, así como determinar la cantidad de marca presente. Los citómetros de flujo son capaces de medir al menos tres intervalos de longitud de onda de emisión de fluorescencia discretos usando filtros ópticos para dividir la emisión fluorescente y separar tubos fotomultiplicadores para amplificar las señales de emisión individuales. La intensidad de emisión fluorescente asociada con las partículas es directamente proporcional a la concentración de analito presente en la muestra biológica. Así, el uso de diferentes colorantes con diferentes espectros de emisión, en los que cada colorante está acoplado a un anticuerpo diferente, permite el análisis de analitos múltiples por población de partículas. El citómetro de flujo puede distinguir también partículas de diferentes tamaños de tal modo que una partícula, de por ejemplo aproximadamente 7 \mum de diámetro, puede diferenciarse de una partícula de aproximadamente 10 \mum de diámetro. Por tanto, pueden detectarse componentes adicionales usando una combinación de colorantes fluorescentes múltiples y dos o tres poblaciones de partículas de diferentes diámetros medios.
Producción de anticuerpos
Pueden producirse mediante métodos estándares anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por el miembro A o el miembro B. Alternativamente, pueden estar disponibles comercialmente anticuerpos, por ejemplo, de BiosPacific (Emeryville, CA), Coulter (Hialeah, FL), Maine Biotechnology Service (Portland, ME) o Biodesign International (Kennebunk, ME). Según se usan aquí, los términos "anticuerpo" o "anticuerpos" incluyen moléculas intactas así como fragmentos de ellas que sean capaces de unirse a un determinante epitópico en el miembro A o el miembro B. El término "epítope" se refiere a un determinante antígeno o un antígeno al que se une al parátopo de un anticuerpo. Los determinantes epitópicos consisten usualmente en agrupamientos superficiales activos químicamente de moléculas tales como aminoácidos o cadenas secundarias de azúcares, y tienen típicamente tres características estructurales dimensionales específicas, así como características de carga específicas. Los epítopes tienen generalmente al menos cinco aminoácidos contiguos. Así, los términos "anticuerpo" y "anticuerpos" incluyen anticuerpos policlonales, anticuerpos monoclonales, anticuerpos humanizados o quiméricos, fragmentos de anticuerpos Fv de cadena sencilla, fragmentos Fab y fragmentos F(ab)_{2}. Son particularmente útiles anticuerpos monoclonales.
En general, una proteína de interés se produce recombinantemente, por síntesis química o por purificación de la proteína nativa, y se usa después para inmunizar animales. Pueden inmunizarse por inyección de la proteína de interés diversos animales hospedantes, incluyendo, por ejemplo, conejos, pollos, ratones, cobayas y ratas. Pueden usarse coadyuvantes para aumentar la respuesta inmunológica dependiendo de las especies hospedantes e incluyen coadyuvante de Freund (completo e incompleto), geles minerales tales como hidróxido de aluminio, sustancias tensioactivas tales como lisolecitina, polioles plurónicos, polianiones, péptidos, emulsiones de aceite, hemocianina de lapa ojo de cerradura (KLH) y dinitrofenol. Los anticuerpos policlonales son poblaciones heterogéneas de moléculas de anticuerpos que son específicas para un antígeno particular, que están contenidas en los sueros de los animales inmunizados. Los anticuerpos monoclonales, que son poblaciones homogéneas de anticuerpos para un epítope particular contenido dentro de un antígeno, pueden prepararse usando tecnología de hibridomas estándar. En particular, pueden obtenerse anticuerpos monoclonales por cualquier técnica que proporcione la producción de moléculas de anticuerpo por linajes celulares continuos en cultivo tal como se describe por Kohler, G. et al., Nature, 1975, 256:495, la técnica de hibridomas de células B humanas (Kosbor et al., Immunology Today, 1983, 4:72; Cole et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1983, 80:2026) y la técnica de hibridomas EBV (Cole et al., "Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy", Alan R. Liss, Inc., 1983, págs. 77-96). Tales anticuerpos pueden ser cualquier clase de inmunoglobulina incluyendo IgG, IgM, IgE, IgA, IgD y cualquier subclase de ellas. El hibridoma que produce los anticuerpos monoclonales de la invención puede cultivarse in vitro o in vivo.
Un anticuerpo quimérico es una molécula en la que diferentes porciones se derivan de diferentes especies de animales, tales como las que tienen una región variable derivada de un anticuerpo monoclonal de ratón y una región constante de inmunoglobulina humana. Pueden producirse anticuerpos quiméricos mediante técnicas estándares.
Pueden generarse por técnicas conocidas fragmentos de anticuerpos que tienen afinidad de unión específica por los miembros A o B. Por ejemplo, tales fragmentos incluyen, pero sin limitarse a ellos, fragmentos F(ab')_{2} que pueden producirse por digestión con pepsina de la molécula de anticuerpo, y fragmentos Fab que pueden generarse reduciendo los puentes disulfuro de fragmentos F(ab')_{2}. Alternativamente, pueden construirse genotecas de expresión de Fab. Véase, por ejemplo, Huse et al., 1989, Science, 246:1275. Se forman fragmentos de anticuerpo Fv de cadena sencilla enlazando los fragmentos de cadena pesada y ligera de la región de Fv mediante un puente de aminoácidos (por ejemplo, 15 a 18 aminoácidos), produciendo un polipéptido de cadena sencilla. Los fragmentos de anticuerpo Fv de cadena sencilla pueden producirse mediante técnicas estándares. Véase, por ejemplo, la Patente de los EE.UU. Nº 4.946.778.
Una vez producidos, se ensaya en los anticuerpos o fragmentos de ellos el reconocimiento del miembro A o el miembro B por métodos de inmunoensayo estándares que incluyen, por ejemplo, técnicas ELISA o RIA. Véase Short Protocols in Molecular Biology, Capítulo 11, Green Publishing Associates and John Wiley & Sons, redactado por Ausubel, F.M. et al., 1992. Los anticuerpos adecuados tienen preferiblemente iguales afinidades de unión por proteínas recombinantes y nativas.
Alternativamente, pueden valorarse anticuerpos por su capacidad para formar pares de unión en un ensayo sándwich fluorescente de la siguiente manera. Pueden revestirse perlas con anticuerpos biotinados, por ejemplo anticuerpos anti-proteína vírica, e incubarse después durante aproximadamente 30 minutos con 2 ng/ml de la proteína apropiada, por ejemplo, proteína vírica recombinante, en un volumen de 100 \mul. Después de lavar las perlas dos veces con 2 ml de tampón que contiene 1% de FBS y 0,1% de azida sódica en PBS, se incuban las perlas con aproximadamente
0,5 \mug de anticuerpo marcado con ficoeritrina. Son adecuados para uso en ensayos de la invención pares de anticuerpos que produzcan una señal fluorescente fuerte.
Reactivos en fase sólida
Las partículas adecuadas (por ejemplo, perlas) tienen un diámetro medio de aproximadamente 2 \mum a 15 \mum y pueden ser poliestireno, ferromagnéticas o paramagnéticas. Por ejemplo, las partículas pueden tener un diámetro medio de alrededor de 4 \mum a aproximadamente 11 \mum. Los diámetros de partículas medios típicos son aproximadamente 4-5 \mum, 7-8 \mum y 10-11 \mum. Están disponibles comercialmente partículas, por ejemplo, de Spherotech Inc., Libertyville, IL. Las partículas pueden revestirse con anticuerpos de captura por técnicas conocidas. Por ejemplo, perlas paramagnéticas revestidas con avidina o estreptavidina pueden revestirse con anticuerpos de captura biotinados. En general, se resuspenden perlas revestidas con avidina o estreptavidina en una solución salina, tal como PBS, mezclada con anticuerpos biotinados en condiciones de saturación (aproximadamente 40 \mug de proteína por 3,9 x 10^{7} perlas de
7 \mum), y se incuban a temperatura ambiente. Después de completarse la unión, se lavan las perlas y se bloquean con, por ejemplo, tampón que contiene 1% de FBS y 0,1% de azida sódica en PBS.
Pueden acoplarse perlas revestidas con avidina o estreptavidina a ácidos nucleicos biotinados cuando se miden pares de unión de ácidos nucleicos. Los ácidos nucleicos pueden estar marcados con biotina por incorporación de biotina-11-dUTP en unas reacciones de traducción de corte estándar.
En realizaciones particulares, sustancialmente todos los anticuerpos de captura están orientados en la partícula de tal modo que están disponibles regiones de unión de antígeno para unirse al miembro A, aumentando la sensibilidad total del ensayo. La expresión "sustancialmente todos" indica que al menos el 80% y preferiblemente al menos el 90% (por ejemplo, 95% a 99%) de los anticuerpos están orientados de esta manera. Puede estimarse cualitativamente la orientación porcentual midiendo la fluorescencia asociada con la unión de anticuerpo anti-ratón de cabra marcado con ficoeritrina, y comparando con partículas fluorescentes estandarizadas. Están disponibles regiones de unión de antígeno de anticuerpos para unirse al miembro A cuando el anticuerpo está biotinado en residuos de aminoácidos principalmente fuera de la región de unión de antígeno. Así, durante la biotinación de anticuerpos, se usa una relación molar de biotina:anticuerpo de alrededor de 5:1 a aproximadamente 10:1 y otras condiciones de reacción estándares. Por ejemplo, puede usarse éster de N-hidroxisuccinimidilo de biotina o éster de succinimidilo de biotina con un pH de aproximadamente 8,1. Alternativamente, puede usarse hidrazida de biotina a un pH de 4,5-5,0.
También se aumenta la sensibilidad del ensayo porque la captura del miembro A de una muestra biológica no está limitada a volúmenes de reacción de 200 \mul o menos, como en ensayos tradicionales. Son fáciles de recoger partículas de grandes volúmenes de muestra biológica por separación magnética o centrifugación. Además, cada partícula contiene, como media, aproximadamente 180.000 a 240.000 lugares de unión de anticuerpo, y aproximadamente 300.000 a 350.000 lugares de unión de antígeno biotinado por partícula. Así, cada partícula tiene una gran capacidad de unión y un gran intervalo eficaz de análisis para concentración de antígeno.
Marcas detectables
Cada anticuerpo marcado puede visualizarse de manera distinta marcando con un fluoróforo que emite luz de un color que contrasta con otros fluoróforos. Por ejemplo, puede usarse una combinación de los siguientes fluoróforos: ácido 7-amino-4-metilcumarin-3-acético (AMCA), Texas Red® (Molecular Probes, Inc., Eugene, OR), 5-(y 6-)-carboxi-X-rodamina, lisamina rodamina B, 5-(y 6)-carboxifluoresceína, 5-isotiocianato de fluoresceína (FITC), ácido 7-dietilaminocumarin-3-carboxílico, 5-(y 6)-isotiocianato de tetrametilrodamina, 5-(y 6)-carboxitetrametilrodamina, ácido 7-hidroxicumarin-3-carboxílico, ácido 6-[fluorescein-5(y 6)-carboxamido]hexanoico, ácido N-(4,4-difluoro-5,7-dimetil-4-bora-3a,4a-diaza-3)-indacenopropiónico, 5-isotiocianato de eosina, 5-isotiocianato de eritrosina, ficoeritrina (B-, R- o cianina-), aloficocianina, Oregon Green® y Cascade® azul acetilazida (Molecular Probes, Inc., Eugene, OR).
También pueden marcarse anticuerpos con nanocristales semiconductores. Los nanocristales solubles en agua están compuestos por diferentes tamaños de nanocristales de núcleo-envoltura de cadmio-selenio/cadmio-azufre encerrados en una envoltura de sílice o nanocristales de cadmio-selenio/zinc-azufre solubilizados en ácido mercaptoacético. Tales nanocristales solubles en agua tienen un espectro de emisión simétrico, estrecho y sintonizable y son estables fotométricamente. Véase Bruchez Jr. et al., Science, 1998, 281:2013-2016 y Chan et al., Science, 1998, 281:2016-2018.
Detección de antígenos múltiples y anticuerpo del hospedante
Puede usarse una combinación de marcas, tales como Oregon Green® (Molecular Probes, Inc., Eugene, OR), ficoeritrina y cianina-ficoeritrina, para detectar, entre otros, dos antígenos y un anticuerpo del hospedante. Por ejemplo, pueden detectarse simultáneamente HCV, antígeno superficial de HBV, anticuerpo anti-HCV del hospedante y anticuerpo anti-antígeno superficial de HBV del hospedante usando anticuerpos marcados con ficoeritrina que tienen afinidades de unión específicas por HCV, anticuerpos marcados con Oregon Green® que tienen afinidades de unión específicas por antígeno superficial de HBV y anticuerpos anti-Ig del hospedante marcados con cianina-ficoeritrina. La utilización de tres marcas diferentes y dos poblaciones de partículas que tengan tamaños diferentes (por ejemplo, diámetros medios de 7-8 \mum y 10-11 \mum) permite detectar simultáneamente hasta 6 antígenos víricos y anticuerpos del hospedante diferentes. El uso de una tercera población de partículas de un diámetro medio diferente permite detectar simultáneamente hasta 9 antígenos víricos y anticuerpos del hospedante diferentes.
Puede ser difícil detectar antígenos víricos en muestras de plasma una vez que un individuo se ha seroconvertido (es decir, ha desarrollado anticuerpos del hospedante) porque se han bloqueado por el anticuerpo del hospedante los lugares de unión para la captura o anticuerpos informadores en la partícula vírica. La presente invención supera esta dificultad debido a la sensibilidad mejorada del ensayo sobre formatos de inmunoensayo tradicionales. Así, puede detectarse antígeno vírico usando los presentes métodos en situaciones en las que no lo hacen formatos de inmunoensayos tradicionales. Como se ha descrito aquí, pueden capturarse antígenos víricos usando partículas revestidas con anticuerpos monoclonales que tienen afinidades de unión específicas por la proteína vírica, y detectarse su presencia con anticuerpos monoclonales informadores dirigidos contra la proteína vírica en individuos seropositivos. El anticuerpo del hospedante dirigido contra la proteína vírica puede detectarse simultáneamente mediante anti-Ig humana de cabra marcado. La detección de proteína vírica sin anticuerpo del hospedante indica que el hospedante se infectó recientemente y no se ha seroconvertido, mientras que la detección de proteína vírica y anticuerpo del hospedante indica la presencia de infección así como seroconversión. En ciertas muestras, puede detectarse anticuerpo del hospedante pero no hay proteína vírica cuando, por ejemplo, no están disponibles lugares de unión para el primer anticuerpo. Aunque las proteínas víricas no se miden directamente en este caso, hay aún presentes proteínas víricas en la muestra, porque la perla de captura revestida con anticuerpo dirigida contra la proteína vírica captura el complejo inmune de antígeno vírico y anticuerpo del hospedante.
La invención se describirá adicionalmente en los siguientes Ejemplos, que no limitan el alcance de la invención descrito en las reivindicaciones.
Ejemplo 1 Biotinación de proteínas
Se conjugaron anticuerpos con una concentración de 5 mg/ml; se conjugaron antígenos víricos con una concentración de 1 mg/ml. Para marcar con biotina anticuerpos anti-proteína vírica y antígenos víricos, se intercambiaron las proteínas en tampón de KH_{2}CO_{3} 100 mM (pH 8,3) usando un filtro de tamaño apropiado Centricon (Amicon).
Se preparó inmediatamente antes de usar éster de N-hidroxisuccinimidilo de biotina (Molecular Probes, Eugene, OR) en DMSO (10 mg/ml, Sigma Chemical Co., St. Louis, MO, Cat. D8779), y se añadió a la proteína a biotinar en una relación molar 5:1 o 10:1. Se realizaron las reacciones sometiendo a torbellino la solución de proteína ligeramente, y añadiendo la biotina/DMSO a la solución de proteína y mezclando a fondo. La proteína y el éster de biotina se hicieron reaccionar durante una hora a temperatura ambiente en la oscuridad. Se separó proteína conjugada de biotina libre por separación en una columna de gel Sephadex-25 de 10 ml o una columna de rotación usando 1X PBS para eluir. Se recogieron fracciones individuales de 1 ml y se midió la absorbancia a A280 nm. Las fracciones que representaban el pico inicial de A280 se recogieron y agruparon, mientras que las fracciones restantes, incluyendo las que representaban el segundo pico de A280, se desecharon.
Cuando se usaron columnas de rotación, la mezcla de reacción se distribuyó igualmente entre cuatro columnas de rotación y se hicieron girar usando una centrífuga Serofuge a alta velocidad durante 2 min. Se recogió el material que pasaba a través de la columna y se lavaron las columnas llenando la columna con 1X PBS y haciendo girar a alta velocidad en una Serrofuge durante 2 min y repitiendo cinco veces. El material recogido se redistribuyó igualmente entre cuatro columnas, y se hizo girar después usando la centrífuga Serofuge a alta velocidad durante 2 min. Se recogió el material que pasaba a través de la columna, se agrupó, se reanalizó A280 y se determinó la concentración. La proteína conjugada se guardó a 4ºC.
Ejemplo 2 Producción de perlas de captura de analita
Se prepararon perlas de captura de analita resuspendiendo completamente perlas paramagnéticas revestidas de avidina (7 \mum, Spherotech, VM-60-100) mezclando bien. Se pusieron perlas (típicamente 3,8 x 10^{6} perlas) en un tubo de centrífuga de 50 ml y se mezclaron con 30 ml de 1X PBS. Después de retener perlas en el lado del tubo con imanes, se separó toda la PBS. Las perlas se lavaron dos veces más con PBS.
Después del lavado final con PBS, se añadió a las perlas el volumen requerido de anticuerpo biotinado (típicamente 40 \mug) y 2 ml de 1X PBS. Se resuspendieron las perlas sometiendo a torbellino continuamente durante un mínimo de 3 horas, o sometiendo a torbellino durante una hora y guardando después durante la noche a 4ºC. Las perlas guardadas durante la noche se sometieron a torbellino durante 2 horas más a la mañana siguiente. Se usaron aproximadamente 30 ml de tampón que contenía 1% de FBS y 0,1% de NaN_{3} en PBS para lavar las perlas conjugadas tres veces. Se resuspendieron perlas en 19,25 ml del mismo tampón y se guardaron a 4ºC hasta usar.
Para marcar anticuerpos con el derivado de fluoresceína Oregon Green® (Molecular Probes, Eugene, OR), se intercambiaron anticuerpos en tampón de KH_{2}CO_{3} 100 mM (pH 9,0) con una concentración de 5 mg/ml. Se añadió Oregon Green® (10 mg/ml en dimetilformamida, DMF) al anticuerpo en una relación molar 25:1 y se incubó durante 1 hora a temperatura ambiente, en la oscuridad. Se separó del anticuerpo Oregon Green® libre en una columna Sephadex G-25. Se produjeron conjugados de R-ficoeritrina (PE, Intergen BioDiagnostics, Purchase, NY) y cianina-ficoeritrina (Cy5PE) usando 2-iminotiolano (Pierce Chemical Co., Rockford, IL) en una relación molar 1625:1 para modificar el fluorocromo y sulfo-SMCC (Pierce) en una relación molar 20:1 para modificar el anticuerpo. El fluorocromo y el anticuerpo modificados se incubaron juntos durante 1 hora a temperatura ambiente en la oscuridad. Se separaron fluorocromo y anticuerpo libres del anticuerpo conjugado a fluorocromo en columnas Sephacryl S-300-HR (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO). Se marcó con PE o Cy5-PE antisuero anti-Ig humana F(ab')_{2} de cabra (específico de cadena pesada y ligera) purificado por afinidad y absorbido frente a anticuerpos de ratón, equino, bovino, de rata y de conejo. Pueden hacerse alteraciones en la relación de fluorocromo a proteína para optimizar la señal fluorescente para un anticuerpo o antígeno vírico particular.
Ejemplo 3 Detección de antígenos víricos y anticuerpo del hospedante
Se obtuvieron muestras de plasma de individuos normales y de individuos positivos en HCV, HIV o HBV de New York Biologicals (Southampton, NY), Scantibodies Laboratory (Santee, CA) o Intergen BioDiagnostics (Purchase, NY). Se trataron las muestras de plasma con detergente Triton-X 100 hasta una concentración final de 0,5% para lisar membranas víricas y exponer las partículas de núcleo antes de ensayar. Se obtuvieron antígenos víricos recombinantes derivados de E. coli, incluyendo antígenos superficiales y de núcleo, de BiosPacific (Emeryville, CA) o Intergen BioDiagnostics. Se añadieron antígenos a muestras de suero normal no patológico para desarrollar una curva patrón de referencia y para su uso en análisis de punta y recuperación.
El análisis de citometría de flujo se realizó en un citómetro de flujo Coulter EPICS Profile II, un Coulter XL, o un Partec PAS, usando un dispersor de luz delantero frente a lateral lineal para poner compuertas a la población de perlas. La señal de fluorescencia se amplificó logarítmicamente. Se segregaron las emisiones de fluorescencia en colores discretos mediante filtros ópticos. Se usó un filtró de banda de 525 nm para recoger la fluorescencia verde (Oregon Green y FITC), un filtro de banda de 565 nm para recoger la fluorescencia naranja (PE) y un filtro de paso largo de 630 nm para recoger la fluorescencia roja (Cy5PE).
Se incubaron muestras con anticuerpo anti-Ig humana (específica de cadena pesada y ligera) F(ab')_{2} de cabra marcado con PE y Cy5PE. En cada caso, se detectaron anticuerpos anti-víricos del hospedante en perlas con antígeno capturado y no en perlas de muestras normales o un virus incorrecto. Se detectaron antígeno superficial de HBV y anticuerpo anti-HBV, así como antígeno de núcleo de HCV y anticuerpo anti-HCV usando un anticuerpo marcado con PE que tenía afinidad de unión específica por antígeno de núcleo de HCV, un anticuerpo marcado con Oregon Green que tenía actividad de unión específica por antígeno superficial de HBV y un anticuerpo anti-Ig humana de cabra marcado con Cy5PE. Como se indica en las Figuras 2A-2H, era posible la detección individual y simultánea de HCV, HBV y anticuerpo del hospedante.

Claims (19)

1. Un método para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica, cuyo método comprende:
a) proporcionar un reactivo en fase sólida, comprendiendo dicho reactivo en fase sólida una partícula revestida con anticuerpos de captura que tienen actividades de unión específicas por dicho miembro A de dicho par de
unión,
b) poner en contacto dicha muestra biológica con dicho reactivo en fase sólida en condiciones en las que dicho miembro A, si está presente, resulta unido a dicha partícula, para formar una primera partícula reaccionada;
c) poner en contacto dicha primera partícula reaccionada con primeros anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro A, en los que dichos primeros anticuerpos están marcados con una primera marca, y con segundos anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro B de dicho par de unión, en los que dichos segundos anticuerpos están marcados con una segunda marca, que es diferente de dicha primera marca, para formar una segunda partícula reaccionada, y
d) medir dichas primera y segunda marcas en dicha segunda partícula reaccionada.
2. El método de la reivindicación 1, en el que sustancialmente todos de dichos anticuerpos de captura están orientado en dicha partícula de tal modo que las regiones de unión de antígeno de dichos anticuerpos de captura están disponibles para unirse a dicho miembro A de dicho par de unión.
3. El método de las reivindicaciones 1 ó 2, en el que dicho miembro A es un antígeno y dicho miembro B es un anticuerpo del hospedante.
4. El método de la reivindicación 3, en el que dicho antígeno es un antígeno vírico.
5. El método de la reivindicación 4, en el que dicho antígeno vírico es un antígeno de hepatitis C, un antígeno de hepatitis B o un antígeno de virus de la inmunodeficiencia humana.
6. El método de la reivindicación 3, en el que dicho antígeno es un autoantígeno.
7. El método de la reivindicación 6, en el que dicho antígeno es descarboxilasa de ácido glutámico.
8. El método de las reivindicaciones 1 ó 2, en el que dicho miembro A es un ligando y dicho miembro B es un receptor.
9. El método de la reivindicación 8, en el que dicho ligando es una citoquina y dicho receptor es un receptor de citoquina.
10. El método de las reivindicaciones 1 ó 2, en el que dicho miembro A es una enzima y dicho miembro B es un sustrato.
11. El método de la reivindicación 10, en el que dicha enzima es caspasa-3 y dicho sustrato es polimerasa poli(ADP-ribosa) o en el que dicha enzima es caspasa-1' y dicho sustrato es prointerleuquina-1.
12. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11, en el que dichas primera y segunda marcas son fluoróforos.
13. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12, en el que dicha muestra biológica se selecciona del grupo constituido por sangre, plasma, suero, orina, fluido cerebroespinal, esputo, lágrimas, fluido amniótico, humor vítreo, saliva y sobrenadantes de cultivo de tejidos.
14. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 13, en el que dichos anticuerpos de captura son monoclonales.
15. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 14, en el que dichos primeros anticuerpos son monoclonales.
16. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15, en el que dichos segundos anticuerpos son monoclonales.
17. Un juego para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica, cuyo juego comprende:
a) un reactivo en fase sólida, comprendiendo dicho reactivo en fase sólida una partícula revestida con anticuerpos de captura que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro A de dicho par de unión, en el que sustancialmente todos de dichos anticuerpos de captura están orientados en dicha partícula de tal modo que las regiones de unión de antígeno de dichos anticuerpos de captura están disponibles para unirse a dicho miembro A de dicho par de unión,
b) primeros anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro A de dicho par de unión, en los que dichos primeros anticuerpos están marcados con una primera marca; y
c) segundos anticuerpos que tienen afinidades de unión específicas por dicho miembro B de dicho par de unión, en los que dichos segundos anticuerpos están marcados con una segunda marca que es diferente de dicha primera marca.
18. El juego de la reivindicación 17, comprendiendo además dicho juego una marca o inserto de paquete, en el que dicha marca o inserto de paquete indica que dicho reactivo en fase sólida, dichos primeros anticuerpos y dichos segundos anticuerpos pueden usarse para medir simultáneamente ambos miembros A y B de un par de unión en una muestra biológica por citometría de flujo.
19. El método de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 16, en el que dicha medida de dichas primera y segunda marcas en dicha partícula reaccionada es por citometría de flujo.
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