ES2275301T3 - Genes de apoxigenasa vegetal de acido graso y la utilizacion de estos genes. - Google Patents
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Abstract
La invención se refiere de forma general a nuevas secuencias genéticas que codifican a la encima epoxigenasa de ácido graso. En particular la invención se refiere a unas secuencias genéticas que codifican la enzima 12-epoxigenasa de ácido graso que comprende las funciones mixtas de enzimas de monooxigenasas. En particular, la presente invención proporciona las secuencias de cADN que codifican las epoxigenasas de los ácidos grasos de las plantas, en particular la 12- epoxigenasa Crepis palaestina y derivados homólogos y análogos de éstos. Las secuencias genéticas de la presente invención proporcionan los medios por las que se puede alterar o manipular el metabolismo de los ácidos grasos en organismos tales como levaduras, mohos, bacterias, insectos, aves, mamíferos y plantas, y en particular para convertir los ácidos grasos insaturados a ácidos grasos epoxigenados. La invención se extiende a organismos genéticamente modificados que acumulan aceite y transformados con estas secuencias genéticas y a los aceites obtenidos de estos organismos. Los aceites así producidos permiten obtener materias primas convenientemente ventajosas para una producción eficaz de revestimientos, resinas, colas, plásticos, tensioactivos y lubricantes, etc.
Description
Genes de epoxigenasa vegetal de ácido graso y la
utilización de estos genes.
La presente invención se relaciona generalmente
con nuevas secuencias genéticas que codifican a las enzimas
epoxigenasas de ácido graso. En particular, la presente invención se
relaciona con secuencias genéticas que codifican a las enzimas
\Delta12-epoxigenasas de ácido graso como se las
define aquí. Más particularmente, la presente invención provee ADNc
y secuencias genómicas de genes que codifican epoxigenasas vegetales
de ácido graso, preferiblemente a las
\Delta12-epoxigenasas de Crepis palaestina
o Euphorbia lagascae. Las secuencias genéticas de la
presente invención proveen los medios por medio de los cuales se
puede alterar o manipular el metabolismo del ácido graso en
organismos tales como levaduras, mohos, bacterias, insectos, aves,
mamíferos y plantas, en particular para convertir allí dentro ácidos
grasos insaturados en ácidos grasos epoxigenados. La invención se
extiende a los organismos modificados genéticamente que acumulan
aceite transformados con las secuencias genéticas objetivo y a los
aceites derivados de allí. Los aceites producidos así proveen los
medios para utilizar las materias primas con mayor rentabilidad en
la producción eficiente de recubrimientos, resinas, encolados,
plásticos, tensoactivos y lubricantes, entre otros.
A lo largo de estas especificaciones y de las
reivindicaciones que van a continuación, a menos que el contexto lo
requiera de otra manera, la palabra "comprender", o variaciones
tales como "comprende" o "que comprende", se entenderá
que implican la inclusión de un número entero establecido o grupos
de enteros pero no la exclusión de ningún otro entero o grupo de
enteros.
Los detalles bibliográficos de las publicaciones
mencionadas por el autor en esta descripción están reunidos a final
de la misma. Los números de identificación de la secuencia (SEQ. ID.
NO.), para las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos
mencionadas en la descripción, están definidos después de la
bibliografía.
Existe un interés considerable en todo el mundo
en la producción de materias primas químicas, tales como ácidos
grasos, para uso industrial a partir de fuentes vegetales renovables
en vez de fuentes petroquímicas no renovables. Este concepto es muy
atractivo para los fabricantes y consumidores sobre la base de la
conservación de los recursos y provee una oportunidad significativa
para la agricultura para desarrollar nuevos cultivos
industriales.
Existe una gran diversidad de ácidos grasos
inusuales en la naturaleza que han sido bien caracterizados (Badam
& Patil, 1981; Smith, 1970). Muchos de estos ácidos grasos
inusuales tienen potencial industrial y esto ha conducido a un gran
interés en la domesticación de tales especies para permitir la
producción agrícola de ácidos grasos particulares.
Una clase de ácidos grasos de interés particular
son los ácidos grasos epóxidos, que consisten de una cadena acílica
en la cual dos enlaces de carbono adyacentes están unidos por medio
de un puente epóxico. Debido a su gran reactividad, ellos tienen
considerable aplicación en la producción de recubrimientos, resinas,
encolados, plásticos, tensoactivos y lubricantes. Estos ácidos
grasos son actualmente producidos por medio de epoxidación química
de aceites vegetales, principalmente aceite de soja y aceite de
linaza, sin embargo, este proceso produce mezclas de formas
múltiples e isómeras e involucra costos de procesamiento
significativos.
Se están haciendo ensayos por parte de otros
grupos para desarrollar algunas plantas silvestres que contienen
ácidos grasos epóxidos (por ejemplo, Euphorbia lagascae, Vernonia
galamensis) para convertirlas en fuentes comerciales de estos
aceites. Sin embargo, los problemas relacionados con la
adaptabilidad agronómica y el bajo potencial productivo limitan
severamente la utilidad comercial de los cultivos de plantas
tradicionales y de acceso a los cultivos.
El rápido incremento en la sofisticación de la
tecnología de ADN recombinante facilita grandemente la eficiencia
de los procesos industriales de importancia comercial, por medio de
la expresión de genes aislados a partir de un primer organismo o
especie en un segundo organismo o especie para conferirle nuevos
fenotipos. Más particularmente, los procesos industriales
convencionales pueden hacerse más eficientes o más rentables, dando
como resultado un mayor rendimiento por unidad de costo por medio
de la aplicación de técnicas de ADN recombinante.
Además, la escogencia apropiada de organismos
huéspedes para la expresión de una secuencia genética de interés
provee lo necesario para la producción de compuestos que no son
normalmente producidos o sintetizados por el huésped, con alto
rendimiento y pureza.
Sin embargo, a pesar de la efectividad general
de la tecnología de ADN recombinante, el aislamiento de las
secuencias genéticas que codifican enzimas importantes en el
metabolismo de ácido graso, en particular los genes que codifican a
las enzimas \Delta12-epoxigenasas de ácido graso
responsables de la producción del ácido
12,13-epoxi-9-octadecenóico
(ácido vernólico) y del ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico,
entre otros, permanece como un obstáculo mayor para el desarrollo
de organismos genéticamente modificados por ingeniería genética que
producen a estos ácidos grasos.
Hasta la presente invención, existían únicamente
datos bioquímicos limitados que indicaban la naturaleza de las
enzimas epoxigenasas de ácido graso, en particular las
\Delta12-epoxigenasas. Sin embargo, en
Euphorbia lagascae, la formación del ácido
12,13-epoxi-9-octadecenóico
(ácido vernólico) a partir del ácido linoleico parece ser
catalizado por una enzima \Delta12-epoxigenasa que
depende del citocromo P450 (Bafor y colaboradores, 1993; Blee y
colaboradores, 1994). Adicionalmente, el desarrollo de semillas de
plantas de linaza tiene la capacidad de convertir el ácido
vernólico añadido al ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico
por medio de una \Delta15 desaturasa endógena (Engeseth y Stymne,
1996). Los ácidos grasos epóxidos pueden ser producidos también por
medio de una peroxigenasa que depende de peróxido en los tejidos de
la planta (Blee y Schuber, 1990).
En los trabajos que condujeron a la presente
invención, los inventores buscaron aislar secuencias genéticas que
codifiquen genes que sean importantes para la producción de ácidos
grasos epóxidos, tales como el ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico
y transferir estas secuencias genéticas dentro de plantas de
semillas oleaginosas altamente productivas y/o de otros organismos
que acumulan aceite.
Un aspecto de la invención provee una molécula
aislada de ácido nucleico que codifica o es complementaria a una
molécula aislada de ácido nucleico que codifica a una epoxigenasa de
ácido graso.
Un segundo aspecto de la invención provee una
molécula aislada de ácido nucleico que hibrida al menos bajo
condiciones poco rigurosas al menos hasta 20 nucleótidos contiguos
de las SEQ ID NOs: 1 ó 3 ó 5 ó 19 ó 20, o una secuencia
complementaria de la misma.
Un aspecto adicional de la invención provee una
molécula aislada de ácido nucleico que comprende una secuencia de
nucleótidos que es al menos 65% idéntica a la SEQ ID NO: 1 ó 3 ó 5
que es al menos 75% idéntica a al menos 200 nucleótidos contiguos
en las SEQ ID NOs: 19 ó 20, o una secuencia complementaria de la
misma.
Un aspecto adicional de la invención provee una
construcción genética que comprende a la molécula aislada de ácido
nucleico supra, ya sea en orientación sentido o antisentido,
en conexión operable con una secuencia del
promotor.
promotor.
Un aspecto adicional de la invención provee un
método para alterar el nivel de ácidos grasos epóxidos en una
célula, tejido, órgano u organismo, dicho método comprendiendo la
expresión de una molécula cosupresora o molécula de ribozima
sentido o antisentido que comprenden a la molécula aislada de ácido
nucleico supra en dicha célula durante un tiempo y bajo
condiciones suficientes para que se incremente o se reduzca el nivel
de ácidos grasos epóxidos allí dentro.
Un aspecto adicional de la invención provee un
método para producir un polipéptido de una epoxigenasa recombinante
enzimáticamente activa en una célula, dicho método comprendiendo la
expresión de la molécula aislada de ácido nucleico supra en
dicha célula durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para
que se produzca la epoxigenasa codificada por esta.
Un aspecto adicional de la invención provee un
método para producir un polipéptido de una epoxigenasa recombinante
enzimáticamente activa en una célula, dicho método comprendiendo las
etapas de:
- (i)
- producir una construcción genética que comprende a la molécula aislada de ácido nucleico supra colocada operablemente bajo el control de un promotor capaz de conferir expresión sobre dicha secuencia genética en dicha célula, y opcionalmente un elemento reforzador de la expresión;
- (ii)
- transformar dicha construcción genética dentro de dicha célula; y
- (iii)
- seleccionar los transformantes que expresen una epoxigenasa funcional codificados por la secuencia genética en un nivel alto.
Un aspecto aún adicional de la invención provee
un método para producir un polipéptido de una epoxigenasa
recombinante enzimáticamente activa en una planta transgénica que
comprende las etapas de:
- (i)
- producir una construcción genética que comprende a la molécula aislada de ácido nucleico supra colocada operablemente bajo el control de un promotor específico para la semilla y opcionalmente un elemento reforzador de la expresión, en donde dichas secuencias genéticas están colocadas también secuencia arriba de una secuencia de terminación de la transcripción;
- (ii)
- transformar dicha construcción genética dentro de una célula o tejido de dicha planta; y
- (iii)
- seleccionar los transformantes que expresen una epoxigenasa funcional codificados por la secuencia genética en un nivel alto en las semillas.
Un aspecto adicional de la invención provee un
polipéptido de una epoxigenasa recombinante o molécula funcional de
una enzima.
\newpage
Un aspecto adicional de la invención provee una
epoxigenasa recombinante que comprende una secuencia de aminoácidos
expuesta en una cualquiera de las SEQ ID NOs: 2 ó 4 ó 6 o un
homólogo, análogo o derivado de las mismas que es al menos
aproximadamente 50% idéntico a las mismas.
Un aspecto aún adicional de la invención provee
un método para producir un ácido graso epoxigenado en una célula,
tejido, órgano u organismo, dicho método comprendiendo incubar una
célula, tejido, órgano u organismo que expresa a una epoxigenasa
recombinante enzimáticamente activa con un sustrato de ácido graso y
preferiblemente, un sustrato insaturado de ácido graso, durante un
tiempo y bajo condiciones suficientes para que un carbono enlazado,
preferiblemente un carbono doblemente enlazado, de dicho sustrato
sea convertido en un grupo epoxi.
Un aspecto adicional de la invención provee una
molécula inmunológicamente interactiva que se enlaza al polipéptido
de la epoxigenasa recombinante descrito aquí o a un homólogo,
análogo o derivado del mismo.
La Figura 1 es una representación lineal de un
plásmido de expresión que comprende a un gen estructural de la
epoxigenasa, colocado operativamente bajo el control del promotor
truncado de la napina (FP1; casilla sombreada a mano derecha) y
colocado secuencia arriba de la secuencia terminal NOS (casilla
punteada a mano derecha). La secuencia genética de la epoxigenasa
se indica por medio de la casilla rectangular sin relleno a mano
derecha. La construcción también comprende al promotor NOS (casilla
sombreada a mano izquierda) que dirige la expresión del gen
NPTII (casilla sin relleno a mano izquierda) y colocado
secuencia arriba del terminal NOS (casilla punteada a mano
izquierda). También se indican las secuencias en el margen derecho y
el margen izquierdo del plásmido Ti de Agrobacterium
tumefaciens.
La Figura 2 es una representación esquemática
mostrando el alineamiento de las secuencias de aminoácidos del
polipéptido de la epoxigenasa de Crepis palaestina (Cpa12;
SEQ ID NO: 2), una epoxigenasa adicional derivada de una Crepis
sp. diferente de la C. palaestina que produce niveles
altos de ácido vernólico (CrepX; SEQ ID NO: 4), una secuencia
parcial de aminoácidos de un polipéptido de epoxigenasa derivado de
Vernonia galamensis (Vgal1; SEQ ID NO: 6), la secuencia de
aminoácidos de la \Delta12 acetilenasa de Crepis alpina
(Crep1; SEQ ID NO: 8), las \Delta12 desaturasas de A.
thatiana (L26296; SEQ ID NO: 9), Brassica juncea (X91139;
SEQ ID NO: 10), Glycine max (L43921; SEQ ID NO: 11),
Solanum commersonii (X92847; SEQ ID NO: 12) y Glycine
max (L43920; SEQ ID NO: 13), y la \Delta12 hidroxilasa de
Ricinos communis (U22378, SEQ ID NO: 14). Los subrayados son
tres motivos ricos en histidina que se conservan en monoxigenasas de
función mezclada que no contienen hemo.
La Figura 3 es una copia de una representación
fotográfica de una hibridación de transferencias de northern que
muestra la expresión específica de la semilla del gen de la
epoxigenasa de Crepis palaestina ejemplificada por la SEQ ID
NO: 1. El análisis de las transferencias de Northern del ARN total
de las hojas (senda 1) y de semillas en desarrollo (senda 2) de
Crepis palaestina. Se corrieron 15 \mug de ARN total sobre
un gel de Northern y se transfirieron sobre membranas Hybond
N^{+} de Amersham de acuerdo a las instrucciones del fabricante.
La transferencia se hibridó a 60ºC con una sonda elaborada a partir
de la región 3' no traducida de la SEQ ID NO: 1. La transferencia
fue lavada dos veces en 2 x SSC (búfer de Citrato de
Sodio-NaCl) a temperatura ambiente durante 10
minutos, luego en 0,1 x SSC a 60ºC durante 20 minutos.
La Figura 4 es una representación esquemática
que muestra la secuencia de nucleótidos del iniciador PCR degenerado
(dirección 5'a 3') utilizada para aislar los genes de la
epoxigenasa de Euphorbia lagascae descritos aquí.
La Figura 5 es una copia de una representación
fotográfica de una hibridación de una transferencia de ARN con
forma de punto que muestra la expresión del gen de la epoxigenasa
ejemplificado en la SEQ ID NO: 3 en plantas que producen ácido
vernólico comparado con plantas que no producen ácido vernólico. Se
aisló 1 \mug de ARN total a partir del tejido especificado y del
punto transferido sobre la membrana Hybond N^{+} de Amersham de
acuerdo con las instrucciones del fabricante. La transferencia fue
hibridada a 42ºC en formamida al 50% con la sonda relevante marcada
con ^{32}P elaborada a partir de la SEQ ID NO: 3 durante 16 horas.
Las transferencias fueron lavadas dos veces en 2 x SSC (búfer de
Citrato de Sodio-NaCl) a temperatura ambiente y
luego en 0,5 x SSC a 55ºC durante 20 minutos. Se obtuvieron
autorradiografías después de una exposición durante la noche. El
panel A muestra el ARN total a partir de la semilla en desarrollo de
Euphorbia lagascae (1), Euphorbia cyparissus (2),
Vermonia galamensis (3), y de lino (Linum
usitatissimum) (4). El panel B muestra el ARN total de
diferentes tejidos de Euphorbia lagascae, incluida la semilla
en desarrollo (1), raíz (2) y hoja (3).
La Figura 6 es una representación esquemática
que muestra el método de hibridación sustractiva utilizado para
aislar los genes de la epoxigenasa de Euphorbia lagascae
descritos aquí. El conjunto de +6ADNc consistió predominantemente
de secuencias tipo proteína para almacenamiento de semilla. Se
biotinilaron un conjunto de 15 tales secuencias y se restaron
adicionalmente del +6ADNc. LH = Hibridación Larga - 20 horas; SH =
Hibridación Corta - 3 horas.
La Figura 7 es una copia de una representación
fotográfica de una hibridación de una transferencia de ARN con
forma de punto que muestra la expresión del gen de la epoxigenasa
ejemplificado en la SEQ ID NO: 20 en plantas que producen ácido
vernólico comparado con plantas que no producen ácido vernólico. Se
aisló 1 \mug de ARN total a partir del tejido especificado y del
punto transferido sobre la membrana Hybond N^{+} de Amersham de
acuerdo con las instrucciones del fabricante. La transferencia fue
hibridada a 42ºC en formamida al 50% con la sonda relevante marcada
con ^{32}P elaborada a partir de la SEQ ID NO: 20 durante 16
horas. Las transferencias fueron lavadas dos veces en 2 x SSC
(búfer de Citrato de Sodio-NaCl) a temperatura
ambiente y luego en 0,5 x SSC a 55ºC durante 20 minutos. Se
obtuvieron autorradiografías después de una exposición durante la
noche. El panel A muestra el ARN total a partir de la semilla en
desarrollo de Euphorbia lagascae (1), Euphorbia
cyparissus (2), Vermonia galamensis (3), y de lino
(Linum usitatissimum) (4). El panel B muestra el ARN total
de diferentes tejidos de Euphorbia lagascae, incluida la
semilla en desarrollo (1), raíz (2) y hoja (3).
La Figura 8 es una representación esquemática de
un vector de plásmido binario que contiene un casete de expresión
que comprende un promotor truncado específico para semilla de napina
(Napina) y un terminal de nopalina sintasa (NT), con un sitio para
clonación BamHI entre ellos, además del gen para resistencia
a la kanamicina NPTII conectado operativamente a las
secuencias del promotor de la nopalina sintasa (NP) y del terminal
de la nopalina sintasa (NT). El casete de expresión está flanqueado
por secuencias de T-ADN en el borde izquierdo (LB) y
en el borde derecho (RB).
La Figura 9 es una representación esquemática de
un vector plásmido binario que contiene un casete de expresión que
comprende a la SEQ ID NO: 1 localizado operativamente bajo el
control de un promotor truncado específico para semilla de napina
(Napina) y secuencia arriba del terminal de la nopalina sintasa
(NT), además del gen de resistencia a la kanamicina NPTII
conectado operativamente a las secuencias del promotor de la
nopalina sintasa (NP) y del terminal de la nopalina sintasa (NT).
El casete de expresión está flanqueado por secuencias de
T-ADN en el borde izquierdo (LB) y en el borde
derecho (RB). Para producir esta construcción, se inserta la SEQ ID
NO: 1 dentro del sitio BamHI del vector binario expuesto en
la Figura 8.
La Figura 10 es una representación gráfica de
trazas en cromatografía gaseosa de ésteres metílicos de ácido graso
preparados a partir de semillas oleaginosas de plantas no
transformadas de Arabidopsis thaliana [panel (a)], o plantas
de A. thaliana (línea transgénica Cpal-17)
que han sido transformadas con la SEQ ID NO: 1 utilizando la
construcción genética expuesta en la Figura 9 [paneles (b) y (c)].
En los paneles (a) y (b), se separaron los ésteres metílicos de
ácido graso utilizando columnas empacadas para separación. En el
panel (c), los ésteres metílicos de ácido graso se separaron
utilizando una columna capilar para la separación. Se indican las
posiciones para la elusión del ácido vernólico.
La Figura 11 es una representación gráfica que
muestra la distribución de la unión de los ácidos grasos epóxidos
en semilla autogama sobre plantas T_{1} de plantas Arabidopsis
thaliana transformadas con Cpal2 como se determinó utilizando
cromatografía gaseosa. Los niveles tanto del ácido vernólico (eje x)
como del ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico
(eje y) se determinaron y se graficaron en relación el uno con el
otro. Los datos muestran una correlación positiva entre los niveles
de estos ácidos grasos en plantas transgénicas.
La Figura 12 es una representación gráfica que
muestra la incorporación de la etiqueta con ^{14}C dentro de la
fase en cloroformo obtenida a partir de la extracción de lípidos de
la cotiledóneas de linaza durante la alimentación del sustrato
marcado. Símbolos utilizados: \blacklozenge, alimentación con
ácido oleico [^{14}C]; \blacksquare, alimentación con ácido
vernólico [^{14}C].
La Figura 13 es una representación gráfica que
muestra la incorporación de la etiqueta con ^{14}C dentro de la
fosfatidilcolina de cotiledóneas de la linaza durante la
alimentación del sustrato marcado. Símbolos utilizados:
\blacklozenge, alimentación con ácido oleico [^{14}C];
\blacksquare, alimentación con ácido vernólico [^{14}C].
La Figura 14 es una representación gráfica que
muestra la incorporación de la etiqueta con ^{14}C dentro de
triacilgliceroles de cotiledóneas de la linaza durante la
alimentación del sustrato marcado. Símbolos utilizados:
\blacklozenge, alimentación con ácido oleico [^{14}C];
\blacksquare, alimentación con ácido vernólico [^{14}C].
Un aspecto de la presente invención provee una
molécula aislada de ácido nucleico que codifica o es complementaria
a una molécula aislada de ácido nucleico que codifica a una
epoxigenasa de ácido graso.
En donde la molécula aislada de ácido nucleico
de la invención codifica a una enzima que está involucrada en la
epoxidación directa del ácido araquidónico, se prefiere
particularmente que la molécula de ácido nucleico objetivo se
derive de una fuente que no sea de mamífero.
Como se lo utiliza aquí, el término "derivado
de" se lo debe utilizar para indicar que un entero particular o
grupo de enteros se ha originado a partir de las especies
especificadas, pero no ha sido necesariamente obtenido directamente
a partir de la fuente especificada.
El término "fuente diferente a la de los
mamíferos" se refiere a cualquier organismo diferente a la de un
mamífero o un tejido o célula derivada de los mismos.
En el presente contexto, el término "derivado
de una fuente diferente a la de los mamíferos" se lo debe
utilizar para indicar que un entero particular o grupo de enteros
se han derivado a partir de bacterias, levaduras, aves, anfibios,
reptiles, insectos, plantas, mohos, mohos y algas u otros no
mamíferos.
En una modalidad preferida de la presente
invención, el organismo fuente es cualquiera de tales organismos
que posean la capacidad genética para sintetizar ácidos grasos
epóxidos. Más preferiblemente, el organismo fuente es una planta
tal como, pero no limitada a Chrysanthemum spp., Crepis spp,
Euphorbia spp., y Vernonia spp., entre otros.
Aún más preferiblemente, el organismo fuente se
selecciona de la lista que comprende Crepis biennis, Crepis
aurea, Crepis conyzaefolia, Crepis intermedia, Crepis occidentalis,
Crepis palaestina, Crepis vesicaria, Crepis xacintha, Euphorbia
lagascae y Vernonia galamensis. Otras especies no están
excluidas.
En una modalidad particularmente preferida de la
presente invención, el organismo fuente es un Crepis sp. que
contiene niveles altos de ácido vernólico tales como Crepis
palaestina, entre otros o alternativamente, Vernonia
galamensis o Euphorbia lagascae.
En donde la molécula aislada de ácido nucleico
de la invención codifica a una enzima
\Delta6-epoxigenasa o
\Delta9-epoxigenasa o una enzima
\Delta12-epoxigenasa o
\Delta15-epoxigenasa, o al menos codifique a una
enzima que no está involucrada en la epoxidación directa de ácido
araquidónico, se puede derivar la molécula de ácido nucleico
objetivo a partir de cualquier fuente que produzca dicha enzima,
incluyendo, pero no limitándose a, levaduras, mohos, bacterias,
insectos, aves, mamíferos y plantas.
La molécula de ácido nucleico de la invención de
acuerdo con cualquiera de las modalidades anteriores puede ser ADN,
tal como un gen, molécula de ADNc, molécula de ARN o una molécula de
oligonucleótido sintético, ya sea monocatenaria o bicatenaria e
independientemente de cualquiera de las características de la
estructura secundaria a menos que se haya establecido
específicamente.
La referencia que se hace aquí a un "gen"
se toma en su contexto más amplio e incluye:
- (i)
- un gen genómico clásico que consiste de secuencias reguladoras transcripcionales y/o de traducción y/o de una región de codificación y/o de secuencias no traducidas (esto es, intrones, secuencias no traducidas 5' y 3'); o
- (ii)
- ARNm o ADNc correspondiente a las regiones de codificación (esto es, exones) y a las secuencias no traducidas 5' y 3' del gen.
El término "gen" es también utilizado para
describir moléculas sintéticas o de fusión que codifican todo o
parte de un producto funcional. Los genes preferidos de la
epoxigenasa de la presente invención se pueden derivar a partir de
un gen de epoxigenasa de ocurrencia natural por medio de técnicas
recombinantes estándar. Generalmente, un gen de epoxigenasa puede
ser sometido a mutagénesis para producir sustituciones, supresiones
y/o adiciones de nucleótidos, múltiples o sencillas.
Los derivados insercionales de nucleótidos
incluyen fusiones terminales 5' y 3' así como inserciones
intrasecuencia de nucleótidos múltiples o sencillos. Las variantes
de la secuencia insercional de nucleótidos son aquellas en las
cuales uno o más nucleótidos son introducidos en un sitio
predeterminado en la secuencia de nucleótidos aunque la inserción
aleatoria también es posible con una evaluación selectiva adecuada
del producto resultante.
Las variantes de supresión se caracterizan por
la remoción de uno o más nucleótidos de la secuencia.
Las variantes por sustitución de nucleótidos son
aquellas en las cuales al menos un nucleótido en la secuencia ha
sido removido y se ha insertado un nucleótido diferente en su lugar.
Tal sustitución puede ser "silenciosa" por cuanto la
sustitución no cambia al aminoácido definido por el codón.
Alternativamente, los sustituyentes están diseñados para alterar un
aminoácido por otro aminoácido que actúe en forma similar, o por un
aminoácido con carga, polaridad o hidrofobicidad similar.
En el contexto de la presente invención, el
término "epoxigenasa de ácido graso" debe entenderse que se
refiere a cualquier enzima o derivado enzimáticamente activo o
equivalente funcional de la misma que catalice la biosíntesis de un
ácido graso epoxigenado, por medio de la conversión de un enlace
carbonado de un ácido graso en un grupo epoxi y preferiblemente,
por medio de la conversión de un enlace carbonado doble de un ácido
graso insaturado en un grupo epoxi. Aunque no limita la invención,
una epoxigenasa de ácido graso puede catalizar la biosíntesis de un
ácido graso epóxico seleccionado de la lista que comprende al ácido
12,13-epoxi-9-octadecenóico
(ácido vernólico), al ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico,
al ácido
15,16-epoxi-9,12-octadecadienóico,
al ácido
9,10-epoxi-12-octadecenóico,
y al ácido 9,10-epoxi-octadecanóico,
entre otros.
El término "epoxi", "grupo epoxi" y
"residuo epoxi" será conocido por aquellos capacitados en el
arte para referirse a un anillo de tres miembros que comprende dos
átomos de carbono y un átomo de oxígeno enlazados por medio de
enlaces sencillos como sigue:
Por lo tanto, el término "epóxido" se
refiere a compuestos que comprenden al menos un grupo epoxi como se
definió aquí anteriormente.
Aquellos capacitados en el arte saben que la
nomenclatura de ácidos grasos se basa en la longitud de la cadena
carbonada y en la posición de los átomos de carbono insaturados
dentro de aquella cadena carbonada. Por lo tanto, los ácidos grasos
se diseñan utilizando la notación taquigráfica:
Carbono_{total}: dobles
enlaces_{totales}^{posición \ de \ los \ dobles \
enlaces(\Delta)},
en donde los dobles enlaces son cis
a menos que se indique otra cosa. Por ejemplo, el ácido palmítico
(ácido n-hexadecanóico) es un ácido graso saturado
de 16 átomos de carbono (esto es, 16:0), ácido oleico (ácido
octadecenóico) es un ácido graso insaturado de 18 átomos de carbono
con un doble enlace entre C-9 y C-10
(esto es, 18:1^{\Delta 9}), y el ácido linoleico (ácido
octadecadienóico) es un ácido graso insaturado de 18 átomos de
carbono con dos dobles enlaces entre C-9 y
C-10 y entre C-12 y
C-13 (esto es, 18:2^{\Delta
9,12}).
Sin embargo, en el presente contexto una enzima
epoxigenasa puede catalizar la conversión de cualquier enlace de
carbono a un grupo epoxi o alternativamente, la conversión de
cualquier doble enlace en un sustrato de ácido graso insaturado a
un grupo epoxi. En este sentido, aquellos capacitados en el arte
saben que la mayoría de los ácidos grasos monoinsaturados de
organismos superiores son ácidos grasos insaturados de 18 átomos de
carbono con al menos uno de los dobles enlaces localizados allí
entre C-9 y C-10. Adicionalmente,
las bacterias también procesan a los ácidos grasos monoinsaturados
de 16 átomos de carbono. Además, la epoxigenasa de la presente
invención puede actuar sobre más de una molécula sencilla de
sustrato de ácido graso y, en consecuencia, la presente invención
no está limitada por la naturaleza de la molécula de sustrato sobre
la cual actúa la enzima epoxigenasa objetivo.
Preferiblemente, la molécula de sustrato para la
epoxigenasa de la presente invención es un ácido graso insaturado
que contiene al menos un doble enlace.
Además, las enzimas epoxigenasas pueden actuar
sobre cualquier cantidad de átomos de carbono en cualquier molécula
de sustrato. Por ejemplo, ellas se pueden caracterizar como enzimas
\Delta6-epoxigenasa,
\Delta9-epoxigenasa,
\Delta12-epoxigenasa o
\Delta15-epoxigenasa, entre otras. Por lo tanto,
la presente invención no está limitada por la posición del átomo de
carbono en el sustrato sobre el cual puede actuar una enzima
epoxigenasa.
El término
"\Delta6-epoxigenasa" como se lo utiliza aquí
debe entenderse que se refiere a una enzima epoxigenasa que
cataliza la conversión del enlace de carbono \Delta6 de un
sustrato de ácido graso a un grupo epoxi \Delta6 y
preferiblemente, cataliza la conversión del doble enlace \Delta6
de al menos un ácido graso insaturado a un grupo epoxi
\Delta6.
El término
"\Delta9-epoxigenasa" como se lo utiliza aquí
debe entenderse que se refiere a una enzima epoxigenasa que
cataliza la conversión del enlace de carbono \Delta9 de un
sustrato de ácido graso a un grupo epoxi \Delta9 y
preferiblemente, cataliza la conversión del doble enlace \Delta9
de al menos un ácido graso insaturado a un grupo epoxi
\Delta9.
Como se lo utiliza aquí, el término
"\Delta12-epoxigenasa" debe entenderse que se
refiere a una enzima epoxigenasa que cataliza la conversión del
enlace de carbono \Delta12 de un sustrato de ácido graso a un
grupo epoxi \Delta12 y preferiblemente, cataliza la conversión
del doble enlace \Delta12 de al menos un ácido graso insaturado a
un grupo epoxi \Delta12.
Como se lo utiliza aquí, el término
"\Delta15-epoxigenasa" debe entenderse que se
refiere a una enzima epoxigenasa que cataliza la conversión del
enlace de carbono \Delta15 de un sustrato de ácido graso a un
grupo epoxi \Delta15 y preferiblemente, cataliza la conversión
del doble enlace \Delta15 de al menos un ácido graso insaturado a
un grupo epoxi \Delta15.
La presente invención claramente se extiende a
secuencias genéticas que codifican a todas las enzimas epoxigenasas
enlistadas supra, entre otras.
En una modalidad preferida de la invención, la
molécula aislada de ácido nucleico codifica a una enzima epoxigenasa
de ácido graso que convierte al menos un enlace de carbono en ácido
palmitoleico (16:1^{\Delta 9}), ácido oleico (18:1^{\Delta 9}),
ácido linoleico (18:2^{\Delta 9,12}), ácido linolénico
(18:3^{\Delta 9,12,15}), o ácido araquidónico (20:4^{\Delta
5,8,11,14}) a un enlace epoxi. Preferiblemente, el enlace de
carbono es un doble enlace de carbono.
Más preferiblemente, la molécula aislada de
ácido nucleico de la invención codifica a una enzima epoxigenasa de
ácido graso que convierte al menos uno o ambos dobles enlaces en el
ácido linoleico en un grupo epoxi. De acuerdo con esta modalidad,
una epoxigenasa que convierte tanto al doble enlace \Delta9 como
al doble enlace \Delta12 del ácido linoleico en un grupo epoxi,
puede catalizar tales conversiones independientemente una de la
otra de tal forma que dicha epoxigenasa es una enzima
\Delta9-epoxigenasa y/o una
\Delta12-epoxigenasa como se definió aquí
anteriormente.
En una modalidad alternativa preferida, la
epoxigenasa de ácido graso de la presente invención es una
\Delta12-epoxigenasa, una
\Delta15-epoxigenasa o una
\Delta9-epoxigenasa como se definió aquí
anteriormente.
Más preferiblemente, la epoxigenasa de ácido
graso de la invención es una \Delta12-epoxigenasa
como s definió aquí anteriormente.
En una modalidad particularmente preferida de la
invención, se provee una molécula aislada de ácido nucleico que
codifica a la linoleato \Delta12-epoxigenasa, la
enzima que convierte al menos al doble enlace \Delta12 del ácido
linoléico en un grupo \Delta12-epoxi, produciendo
por lo tanto al ácido
12,13-9-octadecenóico (ácido
vernólico).
Aunque no limita a la presente invención, la
fuente preferida de la \Delta12-epoxigenasa de la
invención es una planta, en particular Crepis palaestina o
una Crepis sp. adicional que es distinta de C.
palaestina pero que contiene niveles altos de ácido vernólico,
Vernonia galamensis o Euphorbia lagascae.
De acuerdo a esta modalidad, una
\Delta12-epoxigenasa puede catalizar la conversión
de ácido palmitoleico en ácido
9,10-epoxi-palmítico y/o la
conversión de ácido oleico en ácido
9,10-epoxi-esteárico y/o la
conversión de ácido linoleico en uno cualquiera o más de los ácidos
9,10-epoxi-12-octadecenóico
ó
12,13-epoxi-9-octadecenóico
ó 9,10,12,13-diepoxi-esteárico, y/o
la conversión de ácido linolénico en uno cualquiera o más de los
ácidos
9,10-epoxi-12,15-octadecadienóico
ó
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico
ó 15,16-epoxi-octadecadienóico ó
9,10,12,13-diepoxi-15-octadecenóico
ó
9,10,15,16-diepoxi-12-octadecenóico
ó
12,13,15,16-diepoxi-9-octadecenóico
ó
9,10,12,13,15,16-triepoxi-esteárico
y/o la conversión del ácido araquidónico en uno cualquiera o más de
los ácidos
5,6-epoxi-8,11,14-tetracosatrienóico
ó
8,9-epoxi-5,11,14-tetracosatrienóico
ó
11,12-epoxi-5,8,14-tetracosatrienóico
ó
14,15-epoxi-5,8,11-tetracosatrienóico
ó
5,6,8,9-diepoxi-11,14-tetracosadienóico
ó
5,6,11,12-diepoxi-8,14-tetracosadienóico
ó
5,6,14,15-diepoxi-8,11-tetracosadienóico
ó
8,9,11,12-diepoxi-5,14-tetracosadienóico
o
8,9,14,15-diepoxi-5,11-tetracosadienóico
ó
11,12,14,15-diepoxi-5,8-tetracosadienóico
ó
5,6,8,9,11,12-triepoxi-14-tetracosenóico
ó
5,6,8,9,14,15-triepoxi-11-tetracosenóico
ó
5,6,11,12,14,15-triepoxi-8-tetracosenóico
ó
8,9,11,12,14,15-triepoxi-5-tetracosenóico,
entre otros.
Aquellos capacitados en el arte pueden saber que
no todos los sustratos enlistados supra se pueden derivar de
una fuente natural, pero a pesar de esto, pueden ser producidos por
medio de síntesis química. La conversión tanto del ácido graso
insaturado sintetizado químicamente como del de ocurrencia natural
en ácidos grasos epóxidos está dentro del alcance de la presente
invención, siendo el único requisito el que la molécula de ácido
nucleico de la presente invención como la descrita aquí codifique a
una enzima o parte funcional de la misma que sea capaz de catalizar
dicha conversión.
De acuerdo a la discusión anterior, aquellos
capacitados en el arte sabrán que una epoxigenasa de ácido graso
puede ser una enzima monoxigenasa que depende del citocromo P450 o
de una enzima monoxigenasa de función mixta o alternativamente de
una enzima peroxigenasa que depende de peróxido, o una enzima
similar, entre otras. Sin embargo, la presente invención está
dirigida particularmente a aquellas enzimas epoxigenasas que son
enzimas monoxigenasas de función mixta y a moléculas de ácido
nucleico que codifican a las mismas y los usos para estas. Por lo
tanto, se prefiere particularmente que la molécula de ácido nucleico
de la invención codifique a una epoxigenasa de ácido graso que es
una enzima monoxigenasa de función mixta.
En el contexto de la presente invención, el
término "enzima monoxigenasa de función mixta" se debe tomar
como referencia a cualquier enzima que catalice la epoxigenación de
un enlace de carbono o de un doble enlace de carbono en una
molécula de ácido graso, en donde dicha enzima comprende además una
secuencia de aminoácidos que contiene tres regiones ricas en
histidina como sigue:
(i) | His-(Xaa)_{3-4}-His; | |
(ii) | His-(Xaa)_{2-3}-His-His; y | |
(iii) | His-(Xaa)_{2-3}-His-His, |
en donde His designa histidina, Xaa
designa a cualquier residuo aminoácido de ocurrencia natural como se
expone aquí en la Tabla 1, el entero
(Xaa)_{3-4} se refiere a una secuencia de
aminoácidos que comprende tres o cuatro repeticiones de Xaa, y el
entero (Xaa)_{2-3} se refiere a una
secuencia de aminoácidos que comprende dos o tres repeticiones de
Xaa.
El término "tipo enzima monoxigenasa de
función mixta" se debe tomar como referencia a cualquier enzima
que comprenda tres de las regiones ricas en histidina enlistadas
supra.
En la ejemplificación de la invención descrita
aquí, los inventores han demostrado que la secuencia de aminoácidos
de la Crepis palaestina proveída aquí comprende una enzima
\Delta12-epoxigenasa que incluye los motivos de
la secuencia de aminoácidos característica de una enzima
monoxigenasa de función mixta como se definió aquí anteriormente.
La cercana identidad de la secuencia de aminoácidos entre la enzima
\Delta12-epoxigenasa de C. palaestina (SEQ
ID NO: 2) y las secuencias de aminoácidos de los polipéptidos
derivados de una Crepis sp. no identificada y una
Vernonia galamensis como la proveída aquí (SEQ ID NOs: 4 y
6), comparada con las secuencias de aminoácidos de otras
monoxigenasas de función mixta tal como las desaturasas y las
hidroxilasas, sugiere que dichas secuencias de aminoácidos de
Crepis sp. y V. galamensis son también enzimas
epoxigenasa de ácido graso y pueden ser enzimas
\Delta12-epoxigenasa. En este sentido, la
secuencia de aminoácidos de Vernonia galamensis
ejemplificada aquí, es una secuencia parcial que comprende solamente
un motivo completo rico en histidina (esto es,
His-Arg-Asn-His-His)
y una secuencia parcial del primer motivo rico en histidina (esto
es, comprende a los dos últimos residuos de histidina del motivo
His-Glu-Cys-Gly-His-His),
ya que la secuencia de nucleótidos correspondiente que codifica a
la misma fue amplificada por medio de la reacción en cadena de la
polimerasa como una secuencia parcial de ADNc, utilizando un primer
iniciador para este primer motivo rico en histidina y un segundo
iniciador de amplificación diseñado para una región secuencia arriba
del tercer motivo rico en histidina (esto es,
His-Val-Met-His-His).
Adicionalmente, el hecho de que la secuencia de V.
galamensis fuera amplificada utilizando un iniciador específico
para el primer motivo rico en histidina indica que la secuencia de
longitud completa correspondiente comprendería también a este
motivo.
Por lo tanto, en una modalidad preferida
particular, la molécula de ácido nucleico de la invención codifica
a una enzima epoxigenasa monoxigenasa de función mixta o una enzima
similar derivada de Crepis spp., incluida la Crepis
palaestina o alternativamente, derivada de Vernonia
galamensis. De acuerdo a esta modalidad, se prefiere aún más
que la epoxigenasa objetivo comprenda al menos una secuencia de
aminoácidos que contiene tres o más regiones ricas en histidina
como sigue:
(i) | His-Glu-Cys-Gly-His-His | (SEQ ID NO: 15); | |
(ii) | His-Arg-Asn-His-His | (SEQ ID NO: 16); y | |
(iii) | His-Val-Met-His-His | (SEQ ID NO: 17), |
o un homólogo, análogo o derivado
de las mismas, en donde His designa histidina, Glu designa
glutamato, Cys designa cisteína, Gly designa glicina, Arg designa
arginina, Asn designa asparagina, Val designa valina, Met designa
metionina.
La presente invención claramente se extiende a
los genes de la epoxigenasa derivados de otras especies, incluidos
los genes de la epoxigenasa derivados de Chrysanthemum spp. y
Euphorbia lagascae, entre otros.
En una modalidad preferida, aun cuando no limita
a la presente invención, los genes de la epoxigenasa de otras
especies que son abarcadas por la presente invención codifican a las
enzimas monoxigenasas de función mixta. La presente invención se
extiende además a los polipéptidos recombinantes o aislados
codificados por tales genes y a los usos de dichos genes y
polipéptidos.
La invención descrita de acuerdo a esta
modalidad no abarca a las moléculas de ácido nucleico que codifican
a las actividades de la enzima diferentes a las actividades de la
epoxigenasa como se definió aquí, en particular las enzimas
\Delta12-desaturasa derivadas de Arabidopsis
thaliana, Brassica juncea, Brassica napus o Glycine max,
entre otras, que son conocidas por contener motivos similares ricos
en histidina.
En el presente contexto, "homólogos" de una
secuencia de aminoácidos se refiere a aquellas secuencias de
aminoácidos o secuencia de péptidos que se derivan de polipéptidos,
enzimas o proteínas de la presente invención o alternativamente,
corresponden sustancialmente a las secuencias de aminoácidos
enlistados supra, a pesar de cualquier sustitución, adición
o supresión de aminoácidos de ocurrencia natural de las mismas.
Por ejemplo, los aminoácidos pueden ser
reemplazados por otros aminoácidos que tengan propiedades similares,
por ejemplo hidrofobicidad, hidrofilicidad, momento hidrófobo,
antigenicidad, propensión a formar o a romper estructuras
\alpha-helicoidales o estructuras en lámina
\beta, y así sucesivamente. Alternativamente, o adicionalmente,
los aminoácidos de una secuencia de aminoácidos homólogos pueden ser
reemplazados por otros aminoácidos que tengan propiedades
similares, por ejemplo hidrofobicidad, hidrofilicidad, momento
hidrófobo, carga o antigenicidad, etc.
Los residuos aminoácidos de ocurrencia natural
contemplados aquí se describen en la Tabla 1.
Un homólogo de una secuencia de aminoácidos
puede ser un péptido sintético producido por medio de cualquier
método conocido por aquellos capacitados en el arte, tal como por
medio del uso de química Fmoc.
Alternativamente, un homólogo de una secuencia
de aminoácidos se puede derivar de una fuente natural, ya sea de la
misma o de otra especie como los polipéptidos, enzimas o proteínas
de la presente invención. La fuentes preferidas de homólogos de las
secuencias de aminoácidos enlistadas supra incluyen a
cualquiera de las fuentes contempladas aquí.
Los "análogos" de una secuencia de
aminoácidos abarcan a aquellas secuencias de aminoácidos que son
sustancialmente idénticas a las secuencias de aminoácidos
enlistadas supra a pesar de la presencia de cualquiera de los
análogos de los aminoácidos de ocurrencia no natural allí
dentro.
Los aminoácidos preferidos de ocurrencia no
natural contemplados aquí se enlistan más abajo en la Tabla 2.
El término "derivado" en relación con una
secuencia de aminoácidos debe ser utilizado para referirse de aquí
en adelante a mutantes, partes, fragmentos o fusiones de
polipéptidos de las secuencias de aminoácidos enlistadas
supra. Los derivados incluyen secuencias modificadas de
aminoácidos o péptidos en los cuales los ligandos están unidos a
uno o más de los residuos aminoácidos contenidos allí dentro, tales
como carbohidratos, enzimas, proteínas, polipéptidos o moléculas
reporteras tales como radionúclidos o compuestos fluorescentes. Las
formas glicosiladas, fluorescentes, aciladas o alquiladas de los
péptidos objetivo son también contempladas por la presente
invención. Adicionalmente, los derivados pueden comprender
fragmentos o partes de una secuencia de aminoácidos divulgados aquí
y están dentro del alcance de la invención, que son los
homopolímeros o heteropolímeros que comprenden dos o más copias de
las secuencias objetivo.
Los procedimientos para derivatización de
péptidos son bien conocidos en el arte.
Las sustituciones abarcan alteraciones en los
aminoácidos en los cuales un aminoácido es remplazado con un
residuo aminoácido diferente de ocurrencia natural o un residuo
aminoácido no convencional. Tales sustituciones se pueden
clasificar como "conservadoras", en cuyo caso un residuo
aminoácido es remplazado con otro aminoácido de ocurrencia natural
de carácter similar, por ejemplo Gly\leftrightarrowAla,
Val\leftrightarrowIle\leftrightarrowLeu,
Asp\leftrightarrowGlu, Lys\leftrightarrowArg,
Asn\leftrightarrowGln o
Phe\leftrightarrowTrp\leftrightarrowTyr.
Las sustituciones abarcadas por la presente
invención pueden ser también "no conservadoras", en las cuales
un residuo aminoácido que esta presente en un polipéptido represor
es sustituido con un aminoácido que tiene propiedades diferentes,
tales como un aminoácido de ocurrencia natural de un grupo diferente
(por ejemplo, un aminoácido sustituido o cargado o hidrófobo con
alanina), o alternativamente, en el cual un aminoácido de
ocurrencia natural es sustituido con un aminoácido no
convencional.
Las sustituciones de aminoácidos son típicamente
de residuos únicos, pero pueden ser de residuos múltiples, ya sea
agrupados o dispersos.
Las supresiones de aminoácidos serán usualmente
del orden aproximadamente de 1-10 residuos
aminoácidos, mientras que las inserciones pueden ser de cualquier
longitud. Las supresiones y las inserciones pueden hacerse en el
N-terminal, el C-terminal o ser
supresiones o inserciones internas. Generalmente, las inserciones
dentro de la secuencia de aminoácidos serán más pequeñas que las
fusiones amino o carboxi terminales y del orden de
1-4 residuos aminoácidos.
La presente invención claramente se extiende a
la molécula objetivo aislada de ácido nucleico cuando se le integra
dentro del genoma de una célula como una adición al complemento
celular endógeno de los genes de la epoxigenasa. Alternativamente,
en donde la célula huésped no codifica normalmente a las enzimas
requeridas para la biosíntesis de ácido graso epóxico, la presente
invención se extiende hasta la molécula objetivo aislada de ácido
nucleico cuando se integra dentro del genoma de dicha célula como
una adición al genoma celular endógeno.
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(Tabla pasa a página
siguiente)
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Un Segundo aspecto de la presente invención
provee una molécula aislada de ácido nucleico que comprende la
secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1
ó 3 ó 5 ó 19 ó 20 o una secuencia complementaria de la misma, o un
homólogo, análogo o derivado de la misma.
Para los propósitos de la nomenclatura, la
secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ ID NO: 1 se deriva de
Crepis palaestina y codifica a la secuencia de la
monoxigenasa de función mixta o una secuencia como la de la
monoxigenasa de función mixta expuesta en la SEQ ID NO: 2. Como se
ejemplifica aquí, la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID
NO: 2 tiene actividad de epoxigenasa, más particularmente actividad
de la \Delta12-epoxigenasa.
La secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ
ID NO: 3 corresponde a un ADNc derivado de una Crepis sp.
diferente a la C. palaestina que contiene niveles altos de
ácido vernólico. La secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID
NO: 4 corresponde a la secuencia de aminoácidos derivada del gen de
la epoxigenasa de Crepis sp. proveído en la SEQ ID NO:
3.
La secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ
ID NO: 5 corresponde al ADN amplificado derivado de Vernonia
galamensis utilizando iniciadores de amplificación derivados de
una secuencia de consenso de monoxigenasas de función mixta,
incluidas las secuencias de la invención del gen de la epoxigenasa
de Crepis spp. El ADN amplificado comprende una secuencia
parcial del gen de la epoxigenasa, que incluye secuencias de
nucleótidos capaces de codificar al motivo rico en histidina
His-Arg-Asn-His-His
que es característico de las enzimas monoxigenasas de función
mixta. La secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID NO: 6
corresponde a la secuencia de aminoácidos derivada del gen de la
epoxigenasa de Vernonia galamensis proveído en la SEQ ID NO:
5.
La secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ
ID NO: 7 se relaciona con la secuencia parcial de un gen de la
acetilenasa de Crepis alpina que fue utilizada como una sonda
para aislar a la molécula de ácido nucleico que comprende a la
secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ ID NO: 1. La secuencia
de aminoácidos expuesta en la SEQ ID NO: 8 corresponde a la
secuencia de aminoácidos derivada de dicha secuencia parcial del gen
de la acetilenasa de C. alpina.
Como se lo utiliza aquí, el término
"acetilenasa" debe ser utilizado para referirse a una enzima
que es capaz de catalizar la conversión de un doble enlace de
carbono en una molécula de sustrato de ácido graso en un enlace
triple de carbono o alternativamente, que es capaz de catalizar la
formación de un enlace triple de carbono en una molécula de ácido
graso.
La secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ
ID NO: 18 corresponde a un iniciador degenerado para amplificación
utilizado para amplificar las secuencias putativas del gen de la
epoxigenasa de Euphorbia lagascae. En este sentido, los
residuos nucleótidos mostrados en la SEQ ID NO: 18 son aquellos
recomendados por la Comisión de Nomenclatura Bioquímica
IUPAC-IUB, en donde A representa Adenina, C
representa Citosina, G representa Guanina, T representa Timina, Y
representa a un residuo de pirimidina, R representa a un residuo de
purina, M representa Adenina o Citosina, K representa Guanina o
Timina, S representa Guanina o Citosina, W representa Adenina o
Timina, H representa a un nucleótido diferente de Guanina, B
representa a un nucleótido diferente de Adenina, V representa a un
nucleótido diferente de Timina, D represente a un nucleótido
diferente de Citosina y N representa a cualquier residuo
nucleótido.
La secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ
ID NO: 19 se deriva de Euphorbia lagascae y codifica a la
secuencia de la monoxigenasa dependiente del citocromo P450 o a una
secuencia tipo monoxigenasa dependiente del citocromo P450.
La secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ
ID NO: 20 se deriva de Euphorbia lagascae y codifica a la
secuencia putativa de la monoxigenasa dependiente del citocromo
P450 o a una secuencia tipo monoxigenasa dependiente del citocromo
P450.
La presente invención claramente se extiende a
los equivalentes del gen genómico de las moléculas de ADNc
ejemplificadas en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 19 ó
20.
En una modalidad más particularmente preferida,
la presente invención provee una molécula aislada de ácido nucleico
que comprende la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera de
las SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 19 ó 20 o un equivalente del gen genómico
de dicha secuencia de nucleótidos o un homólogo, análogo o derivado
de la
misma.
misma.
Para el propósito presente, "homólogos" de
una secuencia de nucleótidos deberá entenderse que se refiere a una
molécula aislada de ácido nucleico que es sustancialmente la misma
que la molécula de ácido nucleico de la presente invención o su
secuencia complementaria de nucleótidos, a pesar de la ocurrencia
dentro de dicha secuencia, de una o más sustituciones de
nucleótidos, inserciones, supresiones, o reordenamientos.
"Análogos" de una secuencia de nucleótidos
expuesta aquí deberá entenderse que se refiere a una molécula
aislada de ácido nucleico que es sustancialmente la misma que una
molécula de ácido nucleico de la presente invención o su secuencia
complementaria de nucleótidos, a pesar de la ocurrencia de
cualquiera de los constituyentes no nucleótidos que no está
normalmente presente en dicha molécula aislada de ácido nucleico,
por ejemplo carbohidratos, radioquímicos incluidos los
radionucleótidos, las moléculas reporteras tales como, pero sin
limitarse a DIG, fosfatasa alcalina o peroxidasa de rábano, entre
otros.
"Derivados" de una secuencia de nucleótidos
expuesta aquí deberá entenderse que se refiere a cualquier molécula
aislada de ácido nucleico que contiene una similitud de secuencia
significativa con dicha secuencia o con una parte de la misma.
Generalmente, homólogos, análogos o derivados de
la molécula de ácido nucleico de la invención son producidos por
medios sintéticos o alternativamente, derivados de fuentes de
ocurrencia natural. Por ejemplo, la secuencia de nucleótidos de la
presente invención puede ser sometida a mutagénesis para producir
sustituciones, supresiones y/o inserciones de nucleótidos sencillos
o múltiples como se indicó supra.
En una modalidad de la invención, los homólogos,
análogos o derivados preferidos de las secuencias de nucleótidos
expuestas en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 19 ó 20 o
secuencias complementarias de las mismas, codifican polipéptidos
inmunológicamente activos o enzimáticamente activos.
Como se lo utiliza aquí, el término
"inmunológicamente activo" deberá entenderse que se refiere a
la capacidad de una molécula de polipéptido para provocar una
respuesta inmune en un mamífero, en particular una respuesta inmune
suficiente para producir una molécula de anticuerpo tal como, pero
no limitada a, una molécula de IgM o de IgG o de suero entero que
contenga a dicha molécula de anticuerpo. El término
"inmunológicamente activo" también se extiende a la capacidad
de un polipéptido para provocar una respuesta inmune suficiente para
la producción de anticuerpos monoclonales, de fragmentos sintéticos
de Fab de una molécula de anticuerpos, de una molécula de
anticuerpo de cadena sencilla o de otra molécula
inmunointeractiva.
Como se lo utiliza aquí, el término
"enzimáticamente activo" deberá entenderse que se refiere a la
capacidad de una molécula de polipéptido para catalizar una
reacción enzimática, en particular una reacción enzimática que
comprende la epoxigenación de un enlace de carbono en una molécula
de sustrato de ácido graso. Más particularmente, en tanto que no
limita a la invención, el término "enzimáticamente activo"
puede referirse también a la capacidad de una molécula de
polipéptido para catalizar la epoxigenación de
\Delta-9 o \Delta-12 en una
molécula de sustrato de ácido graso tal como ácido linoléico o
ácido vernólico.
En una modalidad alternativa, un homólogo,
análogo o derivado preferido de la secuencia de nucleótidos expuesta
en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1 ó 3 ó 5, o una secuencia
complementaria de las mismas, comprende una secuencia de
nucleótidos que es al menos 65% idéntica a al menos 20 nucleótidos
contiguos allí dentro, diferente a la secuencia de nucleótidos que
codifica a una enzima acetilenasa de Crepis sp.
Más preferiblemente, el porcentaje de identidad
con cualquiera de las SEQ ID NOs: 1 ó 3 ó 5 es aproximadamente al
menos del 85%. Aún más preferible, un homólogo, análogo o derivado
de las SEQ ID NOs: 1 ó 3 ó 5 es aproximadamente al menos del 90% y
aún más preferiblemente aproximadamente al menos del 95% de
identidad con al menos 100 ó 250 ó 500 ó 1.000 nucleótidos
contiguos allí dentro.
El porcentaje de identidad con las SEQ ID NOs:
19 ó 20, o con las secuencias complementarias de las mismas es
aproximadamente al menos del 75% al menos aproximadamente sobre 200
nucleótidos contiguos, aún más preferiblemente aproximadamente al
menos del 80%, todavía aún más preferiblemente aproximadamente al
menos del 90% y todavía aún más preferiblemente aproximadamente al
menos del 95%, incluido aproximadamente al menos 99% de identidad.
Las secuencias de nucleótidos que son al menos 65% sobre
aproximadamente al menos 400 nucleótidos contiguos en las SEQ ID
NOs: 19 ó 20 están también dentro del alcance de la invención.
La referencia que se hace aquí a un porcentaje
de identidad o porcentaje de similitud entre dos o más nucleótidos
o secuencias de aminoácidos deberá entenderse que se refiere al
número de residuos idénticos o similares en una alineación de
secuencia de nucleótidos o de aminoácidos, como se determina
utilizando cualquier algoritmo estándar conocido por aquellos
capacitados en el arte. En particular, las identidades y similitudes
de una secuencia de nucleótidos y/o de aminoácidos se pueden
calcular utilizando el programa Gap, que utiliza el algoritmo de
Needleman y Wunsch (1970) para maximizar el número de
correspondencias de los residuos y minimizar el número de vacíos en
la secuencia. El programa Gap es parte del Paquete de Software para
Secuenciación y Análisis del Computer Genetics Group Inc.,
University Research Park, Madison, Wisconsin, Estados Unidos de América (Devereux y colaboradores, 1984).
University Research Park, Madison, Wisconsin, Estados Unidos de América (Devereux y colaboradores, 1984).
En una modalidad alternativa adicional, un
homólogo, análogo o derivado preferido de la secuencia de
nucleótidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 19 ó
20 o una secuencia complementaria de las mismas, se hibrida al
menos bajo condiciones poco rigurosas al menos hasta 20 nucleótidos
contiguos derivados de dicha secuencia.
Más preferiblemente, la rigurosidad de la
hibridación es al menos de rigurosidad moderada, aún más
preferiblemente al menos rigurosidad alta.
Para los propósitos de definir el nivel de
rigurosidad, aquellos capacitados en el arte sabrán que se pueden
emplear varias condiciones diferentes de hibridación. Por ejemplo,
una rigurosidad baja puede comprender una hibridación y/o un lavado
llevados a cabo en búfer 6xSSC, SDS al 0,1% (p/v) a 28ºC. Una
rigurosidad moderada puede comprender una hibridación y/o un lavado
llevados a cabo en búfer 2xSSC, SDS al 0,1% (p/v) a una temperatura
en el rango entre 45ºC y 65ºC. Una rigurosidad alta puede comprender
una hibridación y/o un lavado llevados a cabo en búfer 0,1xSSC, SDS
al 0,1% (p/v) a una temperatura de al menos 65ºC.
Generalmente, la rigurosidad se incrementa
reduciendo la concentración de búfer SSC, y/o incrementando la
concentración de SDS en el búfer de hibridación o en el búfer de
lavado y/o incrementando la temperatura a la cual se llevan a cabo
la hibridación y/o el lavado. Las condiciones para las hibridaciones
y los lavados son bien entendidas por aquellos normalmente
capacitados en el arte. Para los propósitos de clarificación de los
parámetros que afectan la hibridación entre moléculas de ácido
nucleico, se puede hacer referencia convenientemente a las páginas
2.10.8 hasta 2.10.16 de Ausubel y colaboradores (1987), que se
incorpora aquí por referencia.
Las moléculas aisladas de ácido nucleico
divulgadas aquí pueden ser utilizadas para aislar o identificar
homólogos, análogos o derivados de las mismas a partir de otras
células, tejidos, o tipos de órganos, o a partir de las células,
tejidos, u órganos de otras especies utilizando cualquiera entre una
variedad de medios conocidos por aquellos capacitados en el
arte.
Por ejemplo, el ADN genómico, o el ARNm, o el
ADNc pueden ser puestos en contacto, al menos bajo condiciones de
hibridación de baja rigurosidad o equivalentes, con una cantidad
efectiva para hibridación de una molécula aislada de ácido nucleico
que comprende a la secuencia de nucleótidos expuesta en cualquiera
de las SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 19 ó 20 o una secuencia complementaria
de las mismas, o una parte funcional de las mismas, y detectar la
hibridación utilizando un medio de detección.
El medio de detección puede ser una molécula
reportera capaz de producir una señal identificable (por ejemplo,
un radioisótopo tal como ^{32}P o ^{35}S o una molécula
biotinilada) enlazada covalentemente a la molécula aislada de ácido
nucleico de la invención.
En un método alternativo, el medio de detección
es cualquier formato conocido de la reacción en cadena de la
polimerasa (PCR). De acuerdo a este método, las reservas degeneradas
de "moléculas de iniciador" de ácido nucleico aproximadamente
de 15-50 nucleótidos de longitud están diseñadas con
base en las secuencias de nucleótidos divulgadas en las SEQ ID NOs:
1, 3, 5, 19 ó 20 o una secuencia complementaria de las mismas. Los
homólogos, análogos o derivados (esto es, la "molécula patrón"
se hibridan con dos de dichas moléculas de iniciador, de tal manera
que un primer iniciador hibride a una región sobre una cadena de la
molécula patrón y un segundo iniciador hibride a una secuencia
complementaria de la misma, en donde el primero y el segundo
iniciadores no estén hibridados dentro de la misma región o una
región superpuesta de la molécula patrón, y en donde cada iniciador
se posiciona en una orientación 5' a 3' con relación a la posición
en la cual el otro iniciador se hibrida sobre la cadena opuesta.
Las copias específicas de la molécula de ácido nucleico de la
molécula patrón se amplifican enzimáticamente en una reacción en
cadena de la polimerasa, una técnica que es bien conocida para
alguien capacitado en el arte.
Las moléculas de iniciador pueden comprender a
cualquier residuo nucleótido de ocurrencia natural (esto es,
adenina, citidina, guanina, timina) y/o puede comprender inosina o
análogos funcionales o derivados de la misma, capaces de ser
incorporados dentro de una molécula de polinucleótido. Las moléculas
de ácido nucleico del iniciador pueden estar contenidas también en
una mezcla acuosa de otras moléculas de ácido nucleico del
iniciador o estar en forma sustancialmente pura.
La secuencia detectada puede estar en una forma
recombinante, en una partícula de virus, en una partícula de
bacteriófago, en una célula de levadura, en una célula animal, o en
una célula de una planta. Preferiblemente, la secuencia genética
relacionada se origina a partir de otra especie de planta.
Un tercer aspecto de la presente invención
provee una molécula aislada de ácido nucleico que codifica a la
secuencia de aminoácidos expuesta en cualquiera de las SEQ ID NOs: 2
ó 4 ó 6 o un homólogo, análogo o derivado de las mismas.
En una modalidad contemplada aquí, los
homólogos, análogos o derivados preferidos de las secuencias de
aminoácidos expuestas en las SEQ ID NOs: 2, 4 ó 6 son polipéptidos
inmunológicamente activos o enzimáticamente activos como se definió
supra.
En una modalidad alternativa de la invención,
los homólogos, análogos o derivados preferidos de las secuencias de
aminoácidos expuestas en cualquiera de las SEQ ID NOs: 2, 4 ó 6
comprenden una secuencia de aminoácidos que es al menos 60%
idéntica a las mismas, diferente a un polipéptido de acetilenasa de
Crepis sp. Más preferiblemente, los homólogos, análogos o
derivados de las SEQ ID NOs: 2 ó 4 ó 6 que son abarcados por la
presente invención, son aproximadamente al menos 85% idénticos, aún
más preferiblemente aproximadamente al menos 90% idénticos y
todavía aún más preferiblemente aproximadamente al menos 95%
idénticos, y todavía más preferiblemente aproximadamente al menos
99%-100% idénticos a las mismas.
Los homólogos, análogos o derivados de
cualquiera de las SEQ ID NOs: 2 ó 4 ó 6 pueden comprender además una
región rica en histidina como se definió supra. Aún más
preferiblemente, la epoxigenasa objetivo comprende al menos una
secuencia de aminoácidos que contiene tres o más regiones ricas en
histidina como sigue:
(i) | His-Glu-Cys-Gly-His-His | (SEQ ID NO: 15); | |
(ii) | His-Arg-Asn-His-His | (SEQ ID NO: 16); y | |
(iii) | His-Val-Met-His-His | (SEQ ID NO: 17), |
o un homólogo, análogo o derivado
de las
mismas.
\newpage
La invención descrita de acuerdo a esta
modalidad alternativa no abarca a las enzimas
\Delta12-desaturasas derivadas de Arabidopsis
thaliana, Brassica juncea, Brassica napus o Glycine max,
entre otras.
La molécula aislada de ácido nucleico de la
presente invención es útil para desarrollar construcciones genéticas
que comprenden una molécula sentido en donde dichas construcciones
genéticas se diseñan para la expresión en una célula que
normalmente no expresa a dicha molécula de ácido nucleico o la sobre
expresión de dicha molécula de ácido nucleico en una célula que
normalmente expresa a dicha molécula de ácido nucleico.
Por lo tanto, un aspecto adicional de la
invención provee una construcción genética que comprende una
molécula sentido que está operativamente conectada a una secuencia
del promotor.
El término "molécula sentido" como se lo
utiliza aquí deberá entenderse que se refiere a una molécula aislada
de ácido nucleico que codifica o es complementaria a una molécula
de ácido nucleico que codifica a una epoxigenasa de ácido graso en
donde dicha molécula de ácido nucleico es proveída en un formato
adecuado para su expresión para producir un polipéptido
recombinante cuando dicha molécula sentido se introduce dentro de
una célula huésped por medio de transfección o de
transformación.
Aquellos entrenados en el arte sabrán que una
construcción genética puede ser utilizada para "transfectar"
una célula, en cuyo caso se la introducirá dentro de dicha célula
sin integración dentro del genoma de la célula. Alternativamente,
una construcción genética puede ser utilizada para
"transformar" una célula, en cuyo caso se integra en forma
estable dentro del genoma de dicha célula.
Una molécula sentido que corresponde a una
secuencia del gen de la epoxigenasa de ácido graso o un homólogo,
análogo o derivado de la misma, puede ser introducido dentro de una
célula utilizando cualquier método conocido para la transfección o
la transformación de dicha célula. En donde una célula se transforma
por medio de la construcción genética de la invención, se puede
regenerar un organismo completo a partir de una célula única
transformada, utilizando cualquier método conocido por aquellos
capacitados en el arte.
Por lo tanto, los genes de la epoxigenasa
descritos aquí pueden ser utilizados para desarrollar células
sencillas u organismos completos que sinteticen ácidos grasos
epóxidos que normalmente no son producidos por organismos
silvestres o de ocurrencia natural que pertenecen al mismo género o
especie que el género o especie a partir del cual se deriva la
célula transfectada o transformada, o para incrementar los niveles
de tales ácidos grasos más arriba de los niveles normalmente
encontrados en tales organismos silvestres o de ocurrencia
natural.
En una modalidad alternativa preferida, la
molécula aislada de ácido nucleico de la invención es capaz de
reducir el nivel de ácidos grasos epóxidos en una célula, cuando se
expresan allí dentro, en la orientación antisentido o como una
molécula de ribosoma o de cosupresión, bajo el control de una
secuencia adecuada del promotor.
La cosupresión es la reducción en expresión de
un gen endógeno que se presenta cuando una o más copias de dicho
gen, o una o más copias de un gen sustancialmente similar son
introducidas dentro de la célula. La presente invención también se
extiende al uso de cosupresión para inhibir la expresión de un gen
de epoxigenasa como se describió aquí.
En el contexto de la presente invención, una
molécula antisentido es una molécula de ARN que se transcribe a
partir de la cadena complementaria de un gen nuclear que normalmente
se transcribe para producir una molécula "sentido" de ARNm o
una parte de la misma. Aunque no limita la forma de acción de las
moléculas antisentido de la presente invención a ningún mecanismo
específico, la molécula antisentido de ARN posee la capacidad de
formar un ARNm bicatenario por medio de apareamiento de bases con el
ARNm sentido, que puede prevenir la traducción del ARNm sentido y
la síntesis posterior de un polipéptido como producto génico.
Las ribozimas son moléculas sintéticas de ARN
que comprenden una región de hibridación complementaria a dos
regiones, cada una al menos de 5 bases nucleótidas continuas en el
ARNm sentido objetivo. Además, las ribozimas poseen actividad
endoribonucleasa altamente específica, que escinde
autocatalíticamente al ARNm sentido objetivo. Una descripción
completa de la función de las ribozimas es presentada por Haseloff y
Gerlach (1988) y está contenida en la Solicitud Internacional de
Patente No. WO89/05852. La presente invención se extiende a las
ribozimas cuyo ARNm sentido objetivo codifica a un polipéptido
epoxigenasa descrito aquí, hibridando por lo tanto a dicho ARNm
sentido y escindiéndolo, de tal manera que ya no pueda ser traducido
para sintetizar a un producto polipeptídico funcional.
De acuerdo a esta modalidad, la presente
invención provee una ribozima o molécula antisentido que comprende
una secuencia de bases contiguas de nucleótidos que son capaces de
formar un complejo por medio de enlaces de hidrógeno con un ARNm
sentido que codifica a una epoxigenasa descrita aquí, para reducir
la traducción de dicho ARNm. Aunque las moléculas antisentido y/o
las moléculas de ribozima preferidas hibridan aproximadamente al
menos con 10 a 20 nucleótidos de la molécula objetivo, la presente
invención se extiende a moléculas capaces de hibridar
aproximadamente al menos con 50-100 bases
nucleótidas de longitud, o una molécula capaz de hibridar a una
ARNm epoxigenasa de longitud completa o sustancialmente
completa.
Se entiende en el arte que ciertas
modificaciones, incluidas las sustituciones de nucleótidos entre
otras, pueden ser hechas con moléculas antisentido y/o de ribozima
de la presente invención, sin destruir la eficacia de dichas
moléculas en la inhibición de la expresión del gen de la
epoxigenasa. Por lo tanto, está dentro del alcance de la presente
invención el incluir a cualquiera de las variantes, homólogos,
análogos o fragmentos de la secuencia de nucleótidos de dicho gen
que los codifica, siendo el único requisito el que dicha variante
de la secuencia de nucleótidos, cuando se transcribe, produce una
molécula antisentido y/o una molécula de ribozima que es capaz de
hibridar a dicha molécula de ARNm sentido.
La presente invención se extiende a
construcciones genéticas diseñadas para facilitar la expresión de
una molécula sentido, una molécula antisentido, molécula de
ribozima, o molécula cosupresora que es capaz de alterar el nivel
de ácidos grasos epóxidos en una célula.
En una modalidad particularmente preferida, la
molécula sentido, una molécula antisentido, una molécula de
ribozima, una molécula cosupresora, o una molécula para dirigir al
gen que son capaces de alterar la composición del ácido graso
epóxido de una célula derivada de una planta o de otro organismo,
comprende una secuencia de nucleótidos expuesta en una cualquiera
de las SEQ ID NOs: 1, 3, 5, 19 ó 20 y más preferiblemente en
cualquiera de las SEQ ID NOs: 1 ó 3 ó 5 y aún más preferiblemente
en la SEQ ID NO: 1 o una cadena complementaria, homólogo, análogo o
derivado de la misma.
Aquellos capacitados en el arte también sabrán
que la expresión de una molécula sentido, antisentido, de ribozima
o cosupresora pueden requerir que la molécula de ácido nucleico de
la invención sea colocada en conexión operativa con una secuencia
del promotor. La escogencia del promotor para el presente propósito
puede variar dependiendo del nivel de expresión de la molécula
sentido requerida y/o de las especies a partir de las cuales se
deriva la célula huésped y/o la especificidad del tejido o la
especificidad en el desarrollo de la expresión de la molécula
sentido que se requiere.
La referencia aquí a un "promotor" se debe
tomar en su contexto más amplio e incluye a las secuencias
reguladoras transcripcionales de un gen genómico eucariota clásico,
que incluye a la caja TATA que se requiere para el inicio preciso
de la transcripción, con o sin una secuencia de la caja CCAAT y
elementos reguladores adicionales (esto es, secuencias de
activación secuencia arriba, reforzadores y silenciadores) que
alteran la expresión génica en respuesta a los estímulos externo
y/o de desarrollo, o en una forma específica para el tejido. En el
contexto de la presente invención, el término "promotor"
también incluye a las secuencias reguladoras transcripcionales de
un gen procariota clásico, en cuyo caso puede incluir una secuencia
de caja a -35 y/o secuencias reguladoras transcripcionales de caja
a -10.
En el presente contexto, el término
"promotor" es utilizado también para describir una molécula
sintética o de fusión, o derivada que confiera, active o refuerce
la expresión de dicha molécula sentido en una célula. Los
promotores preferidos pueden contener copias adicionales de uno o
más elementos reguladores específicos, para reforzar adicionalmente
la expresión de la molécula sentido y/o para alterar la expresión
espacial y/o la expresión temporal de dicha molécula sentido. Por
ejemplo, los elementos reguladores en respuesta al cobre pueden ser
colocados en forma adyacente a una secuencia heteróloga del promotor
que dirige la expresión de una molécula sentido para conferir una
expresión inducible por el cobre sobre ella.
La colocación de una molécula sentido,
antisentido, de ribozima o cosupresora bajo el control regulador de
una secuencia del promotor significa posicionar a dicha molécula de
tal manera que la expresión este controlada por medio de la
secuencia del promotor. Un promotor se posiciona usualmente, pero no
necesariamente, secuencia arriba o 5' de una molécula de ácido
nucleico a la cual regula. Además, los elementos reguladores que
comprenden a un promotor se posicionan usualmente dentro de 2 kb
del sitio de inicio de la transcripción de la molécula sentido,
antisentido, de ribozima o cosupresora o del gen quimérico que la
incluye. En la construcción de combinaciones del gen
promotor/estructural heterólogo, se prefiere generalmente ubicar al
promotor a una distancia del sitio de inicio de la transcripción
del gen que sea aproximadamente la misma que la distancia entre ese
promotor y el gen que el controla en su ambiente natural, esto es,
el gen a partir del cual se deriva el promotor. Como se conoce en
el estado del arte, alguna variación en esta distancia puede ser
acomodada sin perdida de la función del promotor. En forma similar,
El posicionamiento preferido de un elemento regulador de la
secuencia con respecto a un gen heterólogo para ser colocado bajo
su control, se define por medio de la ubicación del elemento en su
ambiente natural, esto es, los genes a partir de los cuales se
deriva. Nuevamente, como se conoce en el estado del arte, también
puede ocurrir alguna variación en esta distancia.
Los ejemplos de promotores adecuados para ser
utilizados en construcciones genéticas de la presente invención
incluyen a promotores derivados a partir de los genes de virus,
levaduras, mohos, bacterias, insectos, aves, mamíferos y plantas
que se capaces de funcionar en células aisladas o en organismos
completos regenerados a partir de allí. El promotor puede regular
la expresión de la molécula sentido, antisentido, de ribozima o
cosupresora en forma constitutiva, o diferencial con respecto al
tejido en el cual ocurre la expresión o, con respecto a la etapa de
desarrollo en la cual ocurre la expresión, o en respuesta a
estímulos externos tales como estrés fisiológico, patógenos, o
iones metálicos, entre otros.
Los ejemplos de promotores incluyen al promotor
CaMV 35S, al promotor NOS, al promotor de la octopina sintasa
(OCS), al promotor del gen SSU de la Arabidopsis thaliana, al
promotor específico para la semilla de napina, al promotor
P_{32}, al promotor BK5-T imm, al promotor
lac, al promotor tac, a los promotores del fago lambda
\lambda_{L} o \lambda_{R}, al promotor CMV (patente
estadounidense No. 5.168.062), al promotor T7, al promotor lacUV5,
al promotor temprano SV40 (patente estadounidense No. 5.118.627), al
promotor tardío SV40 (patente estadounidense No. 5.118.627), al
promotor del adenovirus, al promotor del baculovirus P10 o al
promotor de la polihedrina (patente estadounidense Nos. 5.243.041,
5.242.687, 5.266.317, 4.745.051 y 5.169.784), y similares. Además
de los promotores específicos identificados aquí, son útiles los
promotores celulares para los así llamados genes caseros o de
mantenimiento.
Los promotores preferidos de acuerdo a esta
modalidad son aquellos promotores que son capaces de funcionar en
levaduras, mohos o células de plantas. Más preferiblemente, los
promotores adecuados para ser utilizados de acuerdo a esta
modalidad son capaces de funcionar en células derivadas de levaduras
oleaginosas, mohos oleaginosos o en plantas de cultivos de semillas
oleaginosas, tal como el lino vendido bajo la marca comercial
Linola® (de ahora en adelante mencionado como "lino Linola®"),
girasol, cártamo, soja, linaza, ajonjolí, semilla de algodón,
cacahuete, palma de oliva o palma aceitera, entre otros.
Linola® es una marca registrada de la
Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization
(CSIRO), Australia.
En una modalidad más preferida, el promotor se
puede derivar de un clon genómico que codifica a una enzima
epoxigenasa, preferiblemente derivada del gen genómico equivalente
de los genes de la epoxigenasa derivados de Chrysanthemum spp.,
Crepis spp. incluida C. palaestina u otras Crepis sp.,
Euphorbia lagascae o Vernonia galamensis, que se
mencionan aquí.
En una modalidad más preferida, el promotor se
puede derivar de un gen de semilla altamente expresado, tal como el
gen de napina, entre otros.
La construcción genética de la invención puede
comprender además una secuencia terminadora y ser introducida
dentro de una célula huésped adecuada en donde es capaz de ser
expresada para producir un polipéptido recombinante como producto
génico o alternativamente, una molécula de ribozima o
antisentido.
El término "terminadora" se refiere a una
secuencia de ADN en el extremo de una unidad transcripcional que
señala la terminación de la transcripción. Los terminadores son
secuencias de ADN 3' no traducidas que contienen una señal de
poliadenilación, que facilita la adición de secuencias de
poliadenilato al extremo 3' de un transcripto primario. Los
terminadores activos células derivadas de virus, levaduras, mohos,
bacterias, insectos, aves, mamíferos y plantas son conocidos y
están descritos en la literatura. Ellos se pueden aislar a partir de
bacterias, hongos, virus, animales y/o plantas.
Ejemplos de terminadores particularmente
adecuados para el uso en las construcciones genéticas de la presente
invención incluyen al terminador el gen de la nopalina sintasa
(NOS) de Agrobacterium tumefaciens, al terminador del gen
35S del virus del mosaico de la Coliflor (CaMV), Aldo terminador del
gen zein de Zea mays, a las secuencias del terminador
del gen de la pequeña subunidad de Rubisco (SSU), a los terminadores
de la secuencia del gen del virus achaparrado de trébol subterráneo
(SCSV), cualquier terminador de E. coli independiente de
rho-, entre otros.
Aquellos capacitados del arte sabrán de
secuencias adicionales del promotor y de secuencias del terminador
que pueden ser adecuadas para el uso en la realización de la
invención. Tales secuencias pueden ser utilizadas fácilmente sin
ninguna experimentación excesiva.
Las construcciones genéticas de la invención
pueden incluir además un origen de secuencia de replicación que se
requiere para la replicación en un tipo de célula específico, por
ejemplo una célula bacterial, cuando se requiere que dicha
construcción genética se mantenga como un elemento genético episomal
(por ejemplo, molécula de plásmido o de cósmido) en dicha
célula.
Los orígenes preferidos de replicación incluyen,
pero no se limitan a, los orígenes de replicación f1-ori y
colE1.
La construcción genética puede comprender además
un gen o genes marcadores seleccionables que son funcionales en una
célula dentro de la cual se introduce dicha construcción
genética.
Como se lo utiliza aquí, el término "gen
marcador seleccionable" incluye a cualquier gen que confiera un
fenotipo sobre una célula en la cual se exprese para facilitar la
identificación y/o la selección de células que son transfectadas o
transformadas con una construcción genética de la invención o un
derivado de la misma.
Los genes marcadores seleccionables apropiados
contemplados aquí incluyen resistencia a la ampicilina (Amp^{r}),
un gen de resistencia a la tetraciclina (Tc^{r}), un gen de
resistencia a la kanamicina bacteriana (Kan^{r}), un gen de
resistencia a la fosfinotricina, un gen de neomicina
fosfotransferasa (nptII), un gen de resistencia a la
higromicina, un gen de la \beta-glucoronidasa
(GUS), un gen de la cloranfenicol acetiltransferasa (CAT) y un gen
de la luciferasa, entre otros.
Un aspecto adicional de la presente invención
provee una célula, tejido, órgano u organismo completo transfectado
o transformado se expresa a un polipéptido epoxigenasa recombinante
o molécula de ribozima, antisentido o cosupresora como se describe
aquí, o un homólogo, análogo o derivado de los mismos.
Preferiblemente, la molécula aislada de ácido
nucleico está contenida dentro de una construcción genética como la
descrita aquí. La construcción genética de la presente invención
puede ser introducida dentro de una célula por medio de diferentes
técnicas conocidas por aquellos capacitados en el arte. La técnica
utilizada puede variar dependiendo de las técnicas exitosas
conocidas para aquel organismo particular.
El medio para introducir ADN recombinante dentro
de células bacterianas, células de levadura, o tejidos o células de
plantas, insectos, hongos (incluidos mohos), de aves o de mamíferos,
pero no se limitan a, transformación utilizando CaCl_{2} y
variaciones del mismo, en particular el método descrito por Hanahan
(1983), incorporación directa de ADN dentro de los protoplastos
(Krens y colaboradores, 1982; Paszkowski y colaboradores, 1984),
incorporación mediada por PEG a los protoplastos (Armstrong y
colaboradores, 1990), bombardeo de micropartículas, electroporación
(Fromm y colaboradores, 1985), microinyección de ADN (Crossway y
colaboradores, 1986), bombardeo de micropartículas de explantes o
de células (Christou y colaboradores, 1988; Sanford, 1988),
infiltración al vacío del tejido con ácido nucleico, o en el caso
de las plantas, transferencia mediada por T-ADN a
partir de Agrobacterium al tejido de la planta como lo
describieron esencialmente An y colaboradores (1985),
Herrera-Estrella y colaboradores (1983a, 1983b,
1985).
Para el bombardeo de las células con
micropartículas, se impulsa una micropartícula dentro de una célula
para producir una célula transformada. Se puede utilizar cualquier
metodología y aparatos de balística adecuados para transformación
de la célula en la realización de la presente invención. Ejemplos de
aparatos y de procedimientos son divulgados por Stomp y
colaboradores (patente estadounidense No. 5.122.466) y Sanford y
Wolf (patente estadounidense No. 4.945.050). Cuando se utilizan
procedimientos balísticos de transformación, la construcción
genética puede incorporar un plásmido capaz de replicación en la
célula que va a ser transformada.
Los ejemplos de micropartículas adecuadas para
ser utilizadas en tales sistemas incluyen esferas de oro de 1 a 5
\mum. La construcción de ADN se puede depositar sobre la
micropartícula por medio de cualquier técnica adecuada, tal como
precipitación.
En una modalidad particularmente preferida, en
donde la construcción genética comprenda una molécula
"sentido", se prefiere particularmente que el polipéptido
recombinante de epoxigenasa producido a partir de allí sea
enzimáticamente activo.
Alternativamente, en donde la célula se derive
de un organismo multicelular y donde la tecnología relevante esté
disponible, se puede regenerar un organismo completo a partir de la
célula transformada, de acuerdo con procedimientos bien conocidos
del arte.
Aquellos capacitados del arte conocerán los
métodos para transformar, regenerar y propagar otro tipo de células,
tales como aquellas de los hongos.
El caso de las plantas, el tejido de la planta
capaz de propagación clonal posterior, ya sea por medio de
organogénesis o de embriogénesis, puede ser transformado con una
construcción genética de la presente invención y una planta
completa regenerada a partir de allí. El tejido particular escogido
variará dependiendo de los sistemas clonales de propagación
disponibles y más adecuados para las especias particulares que están
siendo transformadas. Los ejemplos de tejidos objetivo incluyen
discos de hojas, polen, embriones, cotiledones, hipocótilos,
megagametofitos, tejido calloso, tejido meristemático existente (por
ejemplo, meristema apical, yemas axilares, y meristemas de la
raíz), y tejidos inducidos de meristema (por ejemplo, meristema del
cotiledón y meristema del hipocótilo).
El término "organogénesis", como se lo
utiliza aquí, significa un proceso por medio del cual se desarrollan
en forma secuencial brotes y raíces a partir de centros
meristemáticos.
El término "embriogénesis", como se lo
utiliza aquí, significa un proceso por medio del cual los brotes y
las raíces se desarrollan juntos en una forma concertada (no
secuencial), ya sea a partir de células somáticas o de gametos.
Las plantas transformadas regeneradas se pueden
propagar por medio de una variedad de medios, tales como por medio
de técnicas de propagación clonal o de reproducción clásica. Por
ejemplo, un a primera generación de una planta transformada (o T1)
puede ser autogama para producir homocigotos transformados de
segunda generación (o T2), y las plantas T2 propagadas además a
través de técnicas clásicas de reproducción.
Los organismos transformados regenerados
contemplados aquí pueden tomar una variedad de formas. Por ejemplo,
ellos pueden ser quimeras de células transformadas y de células no
transformadas; los transformantes clonales (por ejemplo, todas las
células transformadas para contener el casete de expresión);
injertos de tejidos transformados y no transformados (por ejemplo,
en plantas, un conjunto de raíces transformadas implantadas a un
injerto no transformado).
Un aspecto adicional de la invención provee un
método para alterar el nivel de ácidos grasos epóxidos en una
célula, tejido, órgano u organismo, dicho método comprendiendo la
expresión de una molécula sentido, antisentido, de ribozima o
cosupresora como se describe aquí en dicha célula durante un tiempo
y bajo condiciones suficientes para incrementar o reducir allí
dentro el nivel de ácidos grasos epóxidos.
En una modalidad preferida, el método objetivo
comprende la primera etapa adicional de transformar la célula,
tejido, órgano u organismo con la molécula sentido, antisentido, de
ribozima o cosupresora.
Como se discutió supra, la molécula
aislada de ácido nucleico puede estar contenida dentro de una
construcción genética.
De acuerdo con esta modalidad, la célula,
órgano, tejido u organismo en el cual la molécula objetivo sentido,
antisentido, de ribozima o cosupresora se expresa, se puede derivar
de una bacteria, levadura, hongo (incluido un moho), insecto,
planta, ave o mamífero.
Debido a que el polipéptido de la epoxigenasa
recombinante puede ser producido en el transformante regenerado así
como ex vivo, una modalidad alternativa preferida de la presente
invención provee un método para producir un polipéptido
recombinante de epoxigenasa enzimáticamente activo en una célula,
dicho método comprendiendo las etapas de:
- (i)
- producir una construcción genética que comprenda al ADNc o a la secuencia genética de la epoxigenasa genómica de la invención colocada operativamente bajo el control de un promotor capaz de conferir expresión sobre dicha secuencia genética en dicha célula, y opcionalmente un elemento reforzador de la expresión;
- (ii)
- transformar dicha construcción genética dentro de dicha célula; y
- (iii)
- seleccionar a los transformantes que expresan a la epoxigenasa codificada por la secuencia genética a un nivel alto.
Una modalidad particularmente preferida de la
presente invención provee un método para producir un polipéptido
recombinante de epoxigenasa enzimáticamente activo en una planta
transgénica que comprende las etapas de:
- (i)
- producir una construcción genética que comprenda al ADNc o a la secuencia genética de la epoxigenasa genómica de la invención colocada operativamente bajo el control de un promotor específico para la semilla y opcionalmente un elemento reforzador de la expresión, en donde dichas secuencias genéticas están colocadas también secuencia arriba de una secuencia terminadora de transcripción;
- (ii)
- transformar dicha construcción genética dentro de una célula o tejido de dicha planta; y
- (iii)
- seleccionar a los transformantes que expresan a la epoxigenasa codificada por la secuencia genética a un nivel alto en las semillas.
En una modalidad más particularmente preferida,
la planta es una especie oleaginosa que normalmente produce niveles
significativos de ácido linoléico, por ejemplo lino Linola®, colza
oleaginosa, girasol, cártamo, soja, linaza, ajonjolí, semilla de
algodón, cacahuete, palma de oliva o palma aceitera, entre
otros.
En una modalidad aún más particularmente
preferida, la planta es una especie oleaginosa que normalmente
produce niveles significativos de ácido linoléico, por ejemplo lino
Linola®, girasol o cártamo, entre otros.
Las epoxigenasas recombinantes enzimáticamente
activas descritas aquí son particularmente útiles para la producción
de ácidos grasos epoxigenados a partir de sustratos de ácido graso
no saturado. La presente invención contempla especialmente la
producción de ácidos grasos epoxigenados específicos en células u
organismos transformados regenerados que normalmente no producen
aquel ácido graso epoxigenado específico.
Por lo tanto, un aspecto adicional de la
invención provee un método para producir un ácido graso epoxigenado
en una célula, tejido, órgano u organismo, dicho método
comprendiendo incubar una célula, tejido, órgano u organismo que
exprese a una epoxigenasa recombinante enzimáticamente activa de la
presente invención con una molécula sustrato de ácido graso,
preferiblemente una molécula sustrato de ácido graso no saturado,
durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para que al menos
un enlace de carbono de dicho sustrato sea convertido en un grupo
epoxi.
En una modalidad alternativa, el método objetivo
comprende además la primera etapa adicional de transformar o
transfectar la célula, tejido, órgano u organismo con una molécula
de ácido nucleico que codifique a dicha epoxigenasa recombinante o
a un homólogo, análogo o derivado de la misma, como se describió
aquí anteriormente. Como se discutió supra, la molécula
aislada de ácido nucleico puede estar contenida dentro de una
construcción genética.
De acuerdo a esta modalidad, la célula, órgano,
tejido u organismo en el cual la epoxigenasa objetivo se expresa,
se deriva de una bacteria, levadura, hongo (incluido un moho),
insecto, planta, ave o mamífero. Más preferiblemente, la célula,
órgano, tejido u organismo se deriva de una levadura, planta u
hongo, aún más preferiblemente a partir de una levadura oleaginosa
o planta u hongo, o a partir de una planta oleaginosa que
normalmente no expresa a la epoxigenasa recombinante de la
invención.
Entre las plantas oleaginosas económicas
principales contempladas aquí, son objetivos principales los
genotipos muy linoléicos de lino, girasol, maíz y cártamo. La soja
y la semilla de colza son objetivos alternativos pero son menos
adecuados para una síntesis máxima de ácido graso epóxido debido a
sus bajos niveles de sustrato de ácido linoléico y a la presencia
de una \Delta15-desaturasa activa que compite con
la epoxigenasa por el sustrato de ácido linoléico.
Una modalidad alternativa es la transformación
de Linola® (= lino con bajo ácido linoléico) con la epoxigenasa de
la invención. El lino Linola® normalmente contiene alrededor de 70%
de ácido linoléico con muy poco de ésta (< 2%) siendo
posteriormente convertido a ácido linolénico por medio de
\Delta15-desaturasa (Green, 1986).
Los sustratos preferidos de ácido graso
insaturado contemplados aquí incluyen, pero no se limitan a, ácido
palmitoléico, ácido oleico, ácido linoléico, ácido linolénico, y
ácido araquidónico, entre otros.
En especies de plantas que naturalmente
contienen altos niveles de ácido vernólico, la
\Delta12-epoxigenasa allí dentro puede ser muy
eficiente en la epoxidación de ácido linoléico. En consecuencia, la
presente invención contempla particularmente la expresión de
\Delta12-epoxigenasa recombinante derivada de
Euphorbia lagascae, Vernonia spp. y Crepis spp. en
niveles altos en oleaginosas transgénicas durante la síntesis de
aceite de semillas, para producir altos niveles de ácido vernólico
allí dentro.
Por lo tanto, el ácido linoléico es un sustrato
particularmente preferido de acuerdo a esta modalidad de la
invención. No están excluidos otros sustratos adicionales.
Los productos de las moléculas de sustrato
enlistadas supra serán fácilmente determinadas por aquellos
capacitados en el arte, sin una experimentación excesiva. Los
ácidos grasos epóxidos particularmente preferidos producidos de
acuerdo a la presente invención incluyen al ácido
12,13-epoxi-9-octadecenóico
(ácido vernólico) y al
ácido12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico,
entre otros.
Las condiciones para la incubación de células,
órganos, tejidos u organismos que expresan a la epoxigenasa
recombinante en presencia de la molécula sustrato, variarán,
dependiendo al menos de la incorporación del sustrato dentro de la
célula, tejido, órgano u organismo, y de la afinidad de la
epoxigenasa por la molécula de sustrato en el ambiente particular
seleccionado. Las condiciones óptimas pueden ser fácilmente
determinadas por aquellos capacitados en el arte relevante.
La presente invención claramente se extiende al
aceite aislado que contiene ácidos grasos epóxidos, y/o al ácido
graso epóxido aislado en sí mismo, producido como se describió aquí
y a cualquiera de los productos derivados de allí, por ejemplo
recubrimientos, resinas, encolados, plásticos, tensoactivos y
lubricantes, entre otros.
Los inventores han mostrado además que la
monoxigenasa de función mixta (MMO) que realizan funciones
catalíticas tales como desaturación, acetilenación, hidroxilación
y/o epoxigenación, forman una familia de genes que comparten una
considerable similitud de secuencia de nucleótidos y de aminoácidos.
Por ejemplo, las enzimas desaturasa, acetilenasa, hidroxilasa y/o
epoxigenasa que actúan sobre moléculas de sustrato que tienen una
longitud y posición similares en la cadena de cualquier
doble(s) enlace(s) (si está(n) presente(s))
están más estrechamente relacionadas entre sí que las enzimas que
actúan sobre otros sustratos, y pueden ser consideradas como una
"familia".
Sin estar ligada a ninguna teoría o modo de
acción, la similitud de secuencias entre los miembros de cualquier
familia de genes tiene su base en la identidad del sustrato
involucrado y la similitud bioquímica de los eventos de reacción
que ocurren en el enlace de carbono objetivo durante la reacción de
modificación, sugiriendo que secuencias divergentes dentro de una
familia pueden incluir determinantes catalíticos o al menos una
parte funcional de los mismos que contribuyen a las propiedades
catalíticas específicas de los miembros de la familia.
Un ejemplo de una familia son las enzimas
desaturasa, acetilenasa, hidroxilasa y/o epoxigenasa que catalizan
desaturación, acetilenación, hidroxilación y/o epoxigenación
respectivamente, de la posición \Delta12 del ácido linoléico (de
aquí en adelante denominada como la "familia
\Delta12-MMO C18"). Los actuales inventores
han comparado las secuencias de nucleótidos y de aminoácidos de
miembros de la familia \Delta12-MMO C18 para
determinar las regiones divergentes de la misma que potencialmente
comprende a los determinantes de funciones catalíticas alternativas
en la posición \Delta12 (de aquí en adelante denominadas como
"determinantes catalíticos putativos").
Además, la presencia de tales familias de los
MMO que modifican al ácido graso se contempla con respecto a otra
longitud de la cadena de ácido graso y a las posiciones de los
dobles enlaces. Por ejemplo, se contempla la
\Delta15-desaturasa C18 por pertenecer a una
familia de enzimas relacionadas capaces de desaturación,
acetilenación, hidroxilación y/o epoxidación de la posición
\Delta15 en los sustratos de ácido graso C18, la familia
\Delta15-MMO C18.
Por medio de la producción de genes sintéticos
en los cuales estos determinantes catalíticos han sido
intercambiados (denominado como "permutación del dominio"), es
posible convertir genes que codifican una función catalítica en
aquellas funciones catalíticas alternativas de codificación. Por
ejemplo, la \Delta12 epoxigenasa de la presente invención puede
ser convertida en una \Delta12 acetilenasa por medio del reemplazo
de porciones de sus secuencias C-terminal y
N-terminal con los dominios equivalentes de una
\Delta12 acetilenasa de Crepis alpina. En forma similar,
también puede realizarse la permutación inversa del dominio.
Como un refinamiento adicional, tales cambios en
la función catalítica pueden verse afectados en forma similar
haciendo cambios específicos (por ejemplo, adición, sustitución o
supresión) solamente en aquellas aminoácidos dentro de cada dominio
que son críticos para determinar la función catalítica relevante
(tal como una mutagénesis dirigida al sitio).
Por lo tanto, un aspecto adicional de la
presente invención contempla a un gen sintético de ácido graso que
comprende una secuencia de nucleótidos derivada de un gen de la
epoxigenasa como se describió aquí como en donde dicho gen
sintético de ácido graso codifica a un polipéptido con actividad de
epoxigenasa o de acetilenasa o de hidroxilasa o de desaturasa, en
donde dicho polipéptido comprende ya sea una secuencia de
aminoácidos que difiere de una enzima epoxigenasa de ocurrencia
natural o de una acetilenasa o de una hidroxilasa o de una
desaturasa, o en donde dicho polipéptido exhibe propiedades
catalíticas que son diferentes de las de una enzima epoxigenasa de
ocurrencia natural o de una acetilenasa o de una hidroxilasa o de
una desaturasa o dicho polipéptido comprende una secuencia de
aminoácidos que son aproximadamente al menos 60% idénticos a una
parte de la SEQ ID NO: 2 o de la 4 o de la 6 o un homólogo, análogo
o derivado de dicha parte.
Preferiblemente, el gen sintético de ácido graso
de la invención se deriva de un gen de \Delta12 epoxigenasa.
En una modalidad, el gen sintético de ácido
graso de la invención codifica a un polipéptido de fusión en el
cual los aminoácidos N-terminales y/o
C-terminales de cualquiera de las SEQ ID NO: 2 ó 4 ó
6 son reemplazados, en el marco, por secuencias de aminoácidos de
un miembro diferente de la misma familia.
En una modalidad particular preferida, los
aminoácidos N-terminales y/o
C-terminales de las SEQ ID NO: 2 ó 4 ó 6 son
reemplazados por las regiones correspondientes de los polipéptidos
de la acetilenasa, desaturasa o hidroxilasa expuestos en la Figura
2. Más preferiblemente, aproximadamente al menos 30 residuos
aminoácidos de las regiones N-terminales y/o
C-terminales de cualquiera de las SEQ ID NO: 2 ó 4 ó
6 son reemplazados, en el marco, por las regiones correspondientes
de los polipéptidos de la acetilenasa, desaturasa o hidroxilasa
expuestos en la Figura 2.
En una modalidad alternativa, el gen sintético
de ácido graso de la invención codifica a un polipéptido de fusión
en el cual los aminoácidos N-terminales y/o
C-terminales de una acetilenasa de ácido graso o una
hidroxilasa de ácido graso o una desaturasa de ácido graso son
reemplazados, en el marco, por la región N-terminal
y/o C-terminal de cualquiera de las SEQ ID NO: 2 ó
4 ó 6.
En una modalidad particularmente preferida, los
aminoácidos N-terminales y/o
C-terminales de una acetilenasa de ácido graso o
una hidroxilasa de ácido graso o una desaturasa de ácido graso son
reemplazados, en el marco, por la región N-terminal
y/o C-terminal de cualquiera de las SEQ ID NO: 2 ó 4
ó 6. Aún más preferiblemente, la acetilenasa de ácido graso o la
hidroxilasa de ácido graso o la desaturasa de ácido graso se
seleccionan de la lista expuesta en la Figura 2.
Todavía aún más preferiblemente, aproximadamente
al menos 30 residuos aminoácidos de las regiones
N-terminal y/o C-terminal de una
acetilenasa de ácido graso o una hidroxilasa de ácido graso o una
desaturasa de ácido graso son reemplazados, en el marco, por la
región N-terminal y/o C-terminal de
cualquiera de las SEQ ID NOs: 2 ó 4 ó 6.
Por lo tanto, la presente invención se extiende
a cualquiera de las variantes de las enzimas epoxigenasa mencionadas
aquí, en donde dichas variantes se derivan de un polipéptido de
epoxigenasa como se describió aquí y exhibe actividad demostrable
de acetilenasa o de hidroxilasa o de desaturasa, y comprende ya sea
a una secuencia de aminoácidos que difiere de una enzima
acetilenasa o hidroxilasa o desaturasa de ocurrencia natural, o
exhibe propiedades catalíticas que son diferentes de las de la
enzima acetilenasa o hidroxilasa o desaturasa de ocurrencia
natural, o comprende una secuencia de aminoácidos que es
aproximadamente al menos 60% idéntica a cualquiera de las SEQ ID
NOs: 2 ó 4 ó 6.
Como con otros aspectos de la invención, las
variantes descritas aquí pueden ser producidas como polipéptidos
recombinantes o en organismos transgénicos, una vez que los genes
sintéticos sean introducidos dentro de una célula huésped adecuada
y expresados allí dentro.
Los polipéptido recombinantes descritos aquí o
un homólogo, análogo o derivado de los mismos, pueden ser también
moléculas inmunológicamente activas.
Un aspecto adicional de la presente invención
provee una molécula inmunológicamente interactiva que es capaz de
enlazarse a un polipéptido recombinante de epoxigenasa de la
invención.
Preferiblemente, el polipéptido recombinante de
epoxigenasa al cual la molécula inmunológicamente interactiva es
capaz de enlazarse comprende una secuencia aminoácidos expuesta en
cualquiera de las SEQ ID NOs: 2, 4 ó 6, aún un homólogo, o análogo
o derivado de las mismas.
En una modalidad, la molécula inmunológicamente
interactiva es una molécula de anticuerpo. La molécula de
anticuerpo puede ser monoclonal o policlonal. Los anticuerpos
monoclonales o policlonales se pueden seleccionar a partir de los
anticuerpos de ocurrencia natural para un epítopo, o fragmento de
péptido, o péptido sintético de epoxigenasa derivado de un producto
génico recombinante creado específicamente contra una epoxigenasa
recombinante o un homólogo, análogo o derivado de la misma.
Tanto el anticuerpo monoclonal como el
policlonal se pueden obtener por medio de inmunización con un
producto génico apropiado, o epítopo, o fragmento de péptido de un
producto génico. Alternativamente, se pueden utilizar fragmentos de
anticuerpos, tales como los fragmentos Fab. La presente invención se
extiende a los anticuerpos sintéticos y recombinantes y a los
híbridos de anticuerpo. Un "anticuerpo sintético" se considera
aquí que incluye fragmentos e híbridos de anticuerpos.
Los anticuerpos contemplados aquí pueden ser
utilizados para identificar secuencias genéticas que expresan
polipéptidos relacionados de epoxigenasa abarcados por las
modalidades descritas aquí.
El único requisito para la detección exitosa de
una secuencia genética relacionada de epoxigenasa es que dicha
secuencia genética se exprese para producir al menos un epítopo
reconocido por medio de la molécula de anticuerpo. Preferiblemente,
para los propósitos de obtener expresión para facilitar la
detección, se coloca la secuencia genética relacionada
operativamente detrás de una secuencia del promotor, por ejemplo el
promotor bacterial lac. De acuerdo a esta modalidad preferida, los
anticuerpos se emplean para detectar la presencia de un plásmido o
bacteriófago que exprese la epoxigenasa relacionada. Por lo tanto,
las moléculas de anticuerpo también son útiles en la purificación
del plásmido o del bacteriófago que exprese a la epoxigenasa
relacionada.
Las moléculas de anticuerpo objetivo también se
pueden emplear para purificar a la epoxigenasa recombinante de la
invención o a un equivalente de ocurrencia natural o a un homólogo,
análogo o derivado de la misma.
La presente invención es descrita además con
referencia a los siguientes Ejemplos no limitantes.
Se seleccionaron las semillas de la especie
silvestre Euphorbia lagascae y de diferentes especies de
Crepis por medio de cromatografía líquido gas para la
presencia que ácidos grasos epóxidos.
Como se muestra en la Tabla 3, Euphorbia
lagascae contiene niveles muy altos del ácido graso epóxido,
ácido vernólico, en su aceite de la semilla. Se mostró que las
semillas de Crepis palaestina contenían 61,4% en peso de
ácido vernólico y 0,71% en peso del ácido graso acetilénico, ácido
crepénico, de los ácidos grasos totales (Tabla 3).
La enzima, linoleato
\Delta12-epoxigenasa sintetiza al ácido vernólico
a partir del ácido linoleico. Las linoleato
\Delta12-epoxigenasas derivadas a partir de
Euphorbia lagascae y de Crepis palaestina se localizan
en los microsomas. Las enzimas de estas especies al menos pueden
permanecer activas en fracciones de membrana (microsómica)
preparadas a partir de semillas en desarrollo.
Las preparaciones de membranas a partir de
Euphorbia lagascae y los ensayos de sus actividades de
epoxigenasa fueron realizados como lo describen Bafor y
colaboradores (1993) con incubaciones que contienen NADPH, a menos
que se indique otra cosa en la Tabla 4. La extracción de lípidos,
separación y metilación así como las separaciones por medio de GLC
y radio-GLC fueron realizadas esencialmente como lo
describen Kohn y colaboradores (1994) y Bafor y colaboradores
(1993).
Las preparaciones de las membranas a partir de
Crepis alpina y de Crepis palaestina fueron obtenidas
como sigue. Se cultivaron plantas de Crepis alpine y
Crepis palaestina en invernaderos y se cosecharon las
semillas en su etapa media de desarrollo (17-20
días después de la floración). Los cotiledones fueron sacados de las
cubiertas de las semillas y homogenizados con mortero y pistilo en
búfer de fosfato 0,1M, pH 7,2 que contenía sacarosa 0,33M, NADH 4
mM, CoASH 2 mM, 1 mg de albúmina de suero bovino/ml y 4.000 unidades
de catalasa/ml. El homogenizado fue centrifugado durante 10 min a
18.000 x g y el sobrenadante resultante centrifugado durante 60 min
a 150.000 x g para obtener un precipitado microsómico.
Los ensayos estándar de desaturasa, acetilenasa
y epoxigenasa con membranas microsómicas de la especie Crepis
se llevaron a cabo a 25ºC con preparaciones microsómicas
equivalentes a 0,2 mg de proteína microsómica resuspendida en búfer
fresco para homogenización y 10 nmol ya sea de
[1-^{14}C]18:1-CoA o de
[1-^{14}C]18:2-CoA
(actividad específica 85.000 d.p.m./nmol) en un volumen total de
360 \mul. Cuando se utilizó NADPH como coreductor, las membranas
fueron resuspendidas en búfer de homogenización donde NADH había
sido reemplazado NADPH.
Se llevó a cabo la caracterización bioquímica de
la linoleato \Delta12-epoxigenasa microsómica
derivada a partir de Euphorbia lagascae y de Crepis
palaestina y los datos obtenidos fueron comparados con las
características bioquímicas de las enzimas oleato
\Delta12-desaturasa y linoleato
\Delta12-acetilenasa derivadas a partir de
preparaciones microsómicas de Crepis alpina (Tabla 4).
Como se muestra en la Tabla 4, la linoleato
\Delta12-epoxigenasa de Crepis palaestina
exhibe rasgos bioquímicos similares a la linoleato
\Delta12-acetilenasa y la oleato
\Delta12-desaturasa de Crepis alpina, en la
medida en que las tres enzimas requieran O_{2}, trabajen
igualmente bien ya sea con NADH o con NADPH como los coreductores,
y son inhibidos por cianuro pero no por monóxido de carbono.
Adicionalmente, ninguna de estas enzimas es inhibida por
anticuerpos monoclonales contra la reductasa del citocromo P450.
Los datos de la Tabla 4 sugieren que la
linoleato \Delta12-epoxigenasa de Crepis
palaestina pertenece a la misma clase de enzimas que la oleato
\Delta12-desaturasa microsómica y la linoleato
\Delta12-acetilenasa de Crepis alpina.
En contraste, la linoleato
\Delta12-epoxigenasa de Euphorbia lagascae
requiere NADPH como el coreductor, no es inhibida por cianuro, pero
es inhibida por monóxido de carbono (Tabla 4). Adicionalmente, los
inventores han descubierto que la linoleato
\Delta12-epoxigenasa de Euphorbia lagascae
es inhibida por anticuerpos monoclonales surgidos contra una enzima
reductasa del citocromo P450. Estos datos sugieren que la linoleato
\Delta12-epoxigenasa de Euphorbia lagascae
pertenece a la clase de proteínas del citocromo P450 y no está por
lo tanto relacionada bioquímicamente con la linoleato
\Delta12-epoxigenasa de Crepis
palaestina.
\vskip1.000000\baselineskip
La clonación de los genes de epoxigenasa de
Crepis palestina contó con las características de las enzimas
de C. palaestina y de C. alpina descritas en los
Ejemplos anteriores.
En particular, se aisló el ARN poli (A)+ a
partir de semillas en desarrollo de Crepis palaestina usando
un kit de purificación QuickPrep Micro mRNA (Pharmacia
Biotechnology) y utilizado para sintetizar un ADNc bicatenario
iniciado con oligosacárido d(T). Se ligó el ADNc bicatenario
así obtenido a adaptadores EcoRI/NotI (Pharmacia
Biotechnology) y se construyó una genoteca de ADNc utilizando el kit
de clonación ZAP-cDNA Gigapack (Stratagene).
El ADNc monocatenario fue preparado a partir de
ARN derivado de las semillas en desarrollo de Crepis alpina,
utilizando procedimientos estándar. Se obtuvo un fragmento de la
PCR, designado como D12V (SEQ ID NO: 7), por medio de amplificación
del ADNc monocatenario utilizando iniciadores derivados de las
secuencias deducidas de aminoácidos de monoxigenasas de la planta
con función mixta.
El fragmento D12V fue marcado posteriormente en
forma aleatoria y utilizado para seleccionar la genoteca de ADNc de
Crepis palaestina supra sobre filtros de membrana Hybond
N^{+} de Amersham de acuerdo a las prescripciones del fabricante,
utilizando condiciones de hibridación estándar. Esta aproximación
resultó en la purificación de un bacteriófago recombinante,
designado como Cpa12.
Se determinó la secuencia de nucleótidos del
ADNc de Cpa12 y se la expuso en la SEQ ID NO: 1.
El ADNc de Cap12 parece ser de longitud
completa. Una representación esquemática de un vector de expresión
que comprende al ADNc de Cap12 es presentada en la Figura 1. La
construcción genética expuesta allí está diseñada para ser
introducida dentro del material de la planta para la producción de
una planta transgénica que exprese a la epoxigenasa objetivo.
Aquellos entrenados en el arte reconocerán que se pueden producir
vectores similares de expresión, sin experimentación excesiva, y
utilizarlos para la producción de plantas transgénicas que expresen
cualquiera de las secuencias genéticas de la actual invención, por
medio del reemplazo del ADNc de Cpa12 con otra secuencia génica
estructural.
Como se muestra en la Figura 2, la secuencia de
nucleótidos del ADNc de Crep1 codificó a un polipéptido que estaba
muy cercanamente relacionado con el nivel de aminoácidos, al menos
para una enzima acetilenasa de C. alpina (Bafor y
colaboradores, 1997; Solicitud Internacional de Patente No.
PCT/SE97/00247).
El inserto de 1,4 kb de pCpal2 fue secuenciado
(SEQ ID NO: 1) y se mostró que contiene un marco de lectura abierta
que codifica a un polipéptido de 374 aminoácidos de longitud. La
secuencia deducida de aminoácidos de Cpa12 mostró un 81% de
identidad y un 92% de similitud con la
\Delta12-acetilenasa de Crepis alpina, y
aproximadamente 60% de identidad y 80% de similitud con las
proteínas de la \Delta12-desaturasa microsómica
de la planta (Figura 2). Sin embargo, el péptido codificado por
Cpa12 contiene diferencias significativas en la secuencia de
aminoácidos comparada con las enzimas no epoxigenasas. En
particular, la Cpa12 tiene una supresión de seis aminoácidos
contiguos en la región 5' terminal comparado con todas las
\Delta12-desaturasas microsómicas, y una
supresión de dos aminoácidos contiguos en la región terminal 3'
comparado con la \Delta12-acetilenasa de Crep1
(Figura 2).
Aunque los genes de la desaturasa de ácido graso
enlazado a la membrana muestran homologías de secuencia limitadas,
todas ellas contienen tres regiones de motivos conservados ricos en
histidina como sigue:
(i) | His-(Xaa)_{3-4}-His; | |
(ii) | His-(Xaa)_{2-3}-His-His; y | |
(iii) | His-(Xaa)_{2-3}-His-His, |
en donde His designa a histidina,
Xaa designa a cualquier residuo aminoácido de ocurrencia natural
como se expone aquí en la Tabla 1, el entero
(Xaa)_{3-4} se refiere a una secuencia de
aminoácidos que contiene tres o cuatro repeticiones de Xaa, y el
entero (Xaa)_{2-3} se refiere a una
secuencia de aminoácidos que contiene dos o tres repeticiones de
Xaa. Se sugiere que estas regiones ricas en histidina son parte del
centro activo de la enzima (Shanklin y colaboradores,
1994).
La secuencia de aminoácidos codificada por el
ADNc de Cpa12 contiene tres motivos ricos en histidina similares,
pero no idénticos, a los motivos ricos en histidina de las enzimas
\Delta12-desaturasas. Estos datos sugieren que el
ADNc de Cpa12 codifica a una enzima que pertenece a la clase de
enzimas monoxigenasa de función mixta.
El análisis de ácidos grasos presentado en el
Ejemplo 1 supra indica que el ácido vernólico estaba presente
al menos en las semillas de Crepis palaestina. Esta enzima
puede en realidad estar presente exclusivamente en las semillas de
d C. palaestina. La expresión del gen Cpa12 fue examinada
utilizando la región no traducida 3' del clon de ADNc de Cpa12 como
una sonda de hibridación sobre transferencias de northern de ARNm
derivado de semillas en desarrollo y de hojas de C.
palaestina. Como se muestra en la Figura 3, el gen Cpa12 fue
altamente expresado en las semillas en desarrollo pero no se podía
detectar expresión en las hojas. Estos datos son consistentes con
el perfil de actividad de la enzima de la linoleato
\Delta12-epoxigenasa de C. palaestina en
estos tejidos.
La clonación de los genes de epoxigenasa de
Euphorbia lagascae cuanta con las características de las
enzimas de E. lagascae como se describió en los Ejemplos
precedentes.
En una aproximación realizada para clonar los
genes de epoxigenasa de Euphorbia lagascae, se recolectó ARN
a partir de embriones inmaduros de Euphorbia lagascae tomados
en una etapa de síntesis activa de ácido vernólico y se lo utilizó
para construir una genoteca de ADNc. La genoteca de ADNc fue
construida en el vector Lambda Zap II (Stratagene) como se
describió en el Ejemplo anterior, con la excepción de que los
insertos de ADNc fueron clonados en una forma direccional dentro de
los sitios EcoRI-XhoI del vector plásmido embebido en
el vector lambda.
Se sintetizó el iniciador PCR degenerado
expuesto en la Figura 4 (SEQ ID NO: 18) y se lo utilizó para
amplificar las secuencias de nucleótidos que codifican a las
secuencias de la enzima P450 de la genoteca de ADNc de Euphorbia
lagascae. Para las reacciones de amplificación de la PCR, se
extrajo una alícuota de 100 \mul de la genoteca de ADNc con
fenol:cloroformo [1:1(v/v)] y se precipitó el ADN por medio
de la adición de 2 volumenes de etanol y finalmente se lo
resuspendió en 100 \mul de agua. Se utilizó una alícuota (1
\mul) del ADN resuspendido como patrón en una reacción de
amplificación por PCR. Las reacciones por PCR fueron realizadas en
10 \mul de búfer TaqI polimerasa que contenía 200 \muM
de cada dNTP, 10 pmol del iniciador degenerado, 1 pmol del iniciador
del promotor T7 polimerasa y 0,4 unidades de TaqI
polimerasa.
Las condiciones de amplificación fueron 2 min a
94ºC, y cinco ciclos, cada ciclo comprendiendo 1 min a 48ºC seguido
por 2 min a 72ºC seguido por 30 seg a 93ºC, luego 28 ciclos, cada
ciclo comprendiendo 30 seg a 55ºC seguido por 90 seg a 72ºC seguido
por 30 seg a 93ºC, y finalmente un ciclo comprendiendo 30 seg a 55ºC
seguido por 10 min a 72ºC seguido por 1 min a 25ºC.
Los productos PCR fueron purificados y digeridos
utilizando EcoRI y XhoI, y luego subclonados dentro
del vector Bluescript para la caracterización de la secuencia. Se
encontró que uno de los clones PCR codifica una secuencia de P450 y
fue utilizado como una sonda para aislar un clon de ADNc de longitud
completa. Esta secuencia de nucleótidos es expuesta en la SEQ ID
NO: 19. La SEQ ID NO: 19 tenía similitud con otros miembros de la
familia 2C de los genes de P450. En particular, la SEQ ID NO: 19
muestra en promedio un 40% de identidad con las secuencias de la
epoxigenasa araquidónica humana y de rata, utilizando el programa
BLAST.
Adicionalmente, se mostró que el transcripto con
la SEQ ID NO: 19 se expresa en las semillas de Euphorbia
lagascae pero no en las raíces o en las hojas (Figura 5B). El
transcripto con la SEQ ID NO: 19 fue detectado en las semillas en
desarrollo de Vernonia galamensis pero no en aquellas de
E. cyparissis o de lino, dos especies que no producen ácidos
grasos epóxidos (Figuras 5A y 5B).
En una aproximación alternativa realizada para
clonar a los genes de epoxigenasa de Euphorbia lagascae, se
empleó una estrategia de hibridación sustractiva para aislar los
genes que se expresan específicamente en un organismo que produce
niveles altos de ácidos grasos epóxidos.
En particular, el método de hibridación
sustractiva descrito en la Figura 6 fue empleado para aislar los
genes de la epoxigenasa que se expresaron específicamente en
Euphorbia lagascae, que produce niveles altos del ácido
graso epóxido, ácido vernólico (Ejemplo 1) y no en la especie
estrechamente relacionada Euphorbia cyparissus, que no
produce ácido vernólico.
Por lo tanto, se aisló el ARNm de los embriones
en desarrollo de Euphorbia lagascae en una etapa en donde
ellos están sintetizando activamente ácido vernólico y utilizado
para generar al así llamado ADNc "probador". Adicionalmente,
se aisló el ARNm a partir de los embriones en desarrollo de E.
cyparissis (en una etapa similar de desarrollo que E.
lagascae) y utilizado para generar al así llamado ADNc
"conductor".
El procedimiento de hibridación sustractiva
conduce a una genoteca que fue enriquecida por secuencias
exclusivamente expresadas en Euphorbia lagascae. Los clones
de esta genoteca fueron secuenciados y al menos dos de las
secuencias fueron identificadas por codificar a las proteínas de
P450 con base en la similitud con otras secuencias de P450 en la
base de datos. Estos dos clones por PCR de P450 fueron utilizados
como sondas para aislar a los clones correspondientes de ADNc de
longitud completa de la genoteca de ADNc mencionada
anteriormente.
Uno de los ADNc aislados de P450, que contiene a
la secuencia de nucleótidos expuesta en la SEQ ID NO: 20, parece
ser expresada en los tejidos de Euphorbia lagascae (Figura
7B) y no se detectaron transcriptos homólogos en el tejido de la
semilla de E. cyparissus o de lino, dos especies que no
producen ácidos grasos epóxidos. La secuencia deducida de
aminoácidos de la SEQ ID NO: 20 indica que el clon de ADNc es de
longitud completa y codifica a una enzima de P450. Estos datos
sugieren que el ADNc ejemplificado por la SEQ ID NO: 20 puede
codificar a una epoxigenasa, por ejemplo la linoleato
\Delta12-epoxigenasa que convierte al ácido
linoleico en ácido vernólico.
La confirmación de que los clones de ADNc que
ejemplifican la invención codifican las actividades de la
epoxigenasa fue obtenida por medio de la transformación de
Arabidopsis thaliana, que no produce ácidos grasos epóxidos,
en particular ácido vernólico, con cada clon candidato individual y
examinando el tejido transformado por la presencia de ácidos grasos
epoxigenados que ellos no producirían de otra manera, o por los
hidroxi ácidos grasos que se pueden formar a partir del metabolismo
de un ácido graso epoxigenado por medio de la acción de hidrolasas
epóxidas endógenas (Blee y Schuber, 1990).
El ADNc de la epoxigenasa que contiene la SEQ ID
NO: 1 fue clonado dentro de la construcción del vector Binario
expuesto en la Figura 8. En resumen, la secuencia de ADNc fue
subclonada a partir del plásmido pCpal2 (Figura 1) dentro del
plásmido binario, por medio de la digestión de pCpal2 con
EcoRI y rellenando el extremo del fragmento de restricción
utilizando a la enzima T4 ADN polimerasa. El vector Binario (Figura
8) fue linealizado utilizando BamHI y también rellenando el
extremo utilizando T4 ADN polimerasa. Para las reacciones de relleno
del extremo se resuspendió 1 \mug de inserto de ADNc o del ADN
del vector Binario linealizado en 50 \mul de búfer con T4 ADN
polimerasa (Tris-acetato 33 mM pH 7,9, acetato de
potasio 66 mM, acetato de magnesio 10 mM y DDT 5 mM) suplementado
con 100 mM de cada dNTP y 0,1 mg/ml de BSA y 3 unidades de T4 ADN
polimerasa, y se incubó por un período de 6 min a 37ºC. La reacción
se suspendió por medio de calentamiento a 75ºC durante 10 min. El
ADNc con extremo romo y el ADN del vector Binario fueron ligados
utilizando T4 ADN ligasa y las condiciones estándar de ligación
recomendadas por Promega. Se seleccionaron los clones en los cuales
se inserto la secuencia SEQ ID NO: 1 por detrás del promotor de
napina, en la orientación sentido, permitiendo así la expresión del
polipéptido epoxigenasa. El plásmido Binario que cosecha la SEQ ID
NO: 1, en la orientación sentido, operativamente bajo el control
del promotor truncado de napina, se representa esquemáticamente en
la Figura 9.
El plásmido Binario expuesto en la Figura 9 fue
transformado dentro de una cepa de Agrobacterium AGLI
utilizando electroporación y utilizado para transformar a la
Arabidopsis thaliana. Las plantas de A. thaliana se
obtuvieron de acuerdo al método descrito por Valvekens y
colaboradores (1988) y Dolferus y colaboradores (1994).
Las plantas transgénicas y las plantas no
transformadas (esto es, de control) crecieron hasta la madurez. La
semilla madura de cada planta fue analizada por la composición de
ácidos grasos por medio de técnicas estándar. Se establecieron las
plantas con transformante primario (T_{o}) y se cosecharon las
semillas T1 de cada planta y se las analizó por la composición de
ácidos grasos por medio de cromatografía de gases. Doce plantas
T_{o} mostraron que contenían ácido vernólico en los lípidos de
sus semillas en concentraciones en un rango entre 0,9% y 15,8% de
ácidos grasos totales, mientras que las plantas de control no
transformadas no contenían ácido vernólico (Tabla 5). La línea de
plantas con expresión más alta fue la Cpal-17, para
la cual se presentan los perfiles de elución por GLC (por análisis
a través de una columna empacada y de una columna capilar) en la
Figura 10. El perfil de elución por GLC de la columna empacada para
el control no transformado es mostrado también en la Figura 10.
Alternativamente, o adicionalmente, las
secuencias putativas de epoxigenasa de ácido graso descritas aquí
son transformadas cada una dentro de Linum usitatissimun
(lino) y Arabidopsis thaliana bajo el control del promotor
específico para la semilla de napina. Las plantas de lino
transgénico y de Arabidopsis thaliana se examinaron por la
presencia de ácidos grasos epóxidos en oleaginosas en desarrollo. El
trabajo previo ha mostrado que si se alimentan los ácidos grasos
epóxidos a los embriones de lino en desarrollo, éstos se incorporan
dentro de los triglicéridos (Ejemplo 10).
Alternativamente, las levaduras también son
transformadas con los clones de epoxigenasa de la invención y
ensayados para la producción de ácidos grasos epóxidos.
La cromatografía de gases de los ésteres
metílicos preparados a partir de los lípidos de semilla de semilla
T1 de plantas de Arabidopsis thaliana transformadas con Cpal2
(Ejemplo 5) reveló la presencia de dos ácidos grasos adicionales
comparado con los controles no transformados. El primero de estos
compuestos tenía un tiempo de retención equivalente a aquel del
estándar de ácido vernólico. El segundo compuesto tenía un tiempo de
retención más largo y fue identificado putativamente como ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico,
un derivado esperado de ácido vernólico, resultante de la
desaturación en la posición A 15 por medio de la
\Delta15-desaturasa endógena de Arabidopsis
thaliana.
La confirmación de la identidad exacta de los
dos picos se obtuvo por medio de espectroscopía de masas de dioles
que fueron preparados a partir de la fracción de ácido graso epóxido
derivada de plantas transformadas con Cpal2. Los dioles
fueron convertidos además en éteres de trimetilsililo y analizados
por medio de GC-MS DB23 sobre una columna capilar
de sílice fundida (Hewlett-Packard 5890 II GC
acoplada a un Hewlett-Packard 5989A MS trabajando
en impacto electrónico a 70eV15). El cromatograma iónico total
mostró dos picos como sigue:
- (i)
- El primer pico de elución tenía iones prominentes de masa 73, 172, 275 y 299, indicando que el grupo epoxi estaba posicionado en C-12 de un ácido graso C18 y que ocurrió un doble enlace entre el grupo epoxi y el carboxilo terminal. Este espectro de masas fue idéntico al espectro de un éter de trimetilsililo derivado de dioles preparados a partir de ácido vernólico puro (ácido 12,13-epoxi-9-octadecenóico); y
- (ii)
- El segundo pico de elución tenía iones prominentes de masa 73, 171, 273 y 299, indicando la presencia de dos dobles enlaces y un grupo epoxi posicionado en C-12 de un ácido graso C18, consistente con el espectro de masa para el ácido 12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico.
La semilla T1 derivada de plantas transformadas
de Arabidopsis thaliana que expresan al clon de ADNc Cpa12
bajo el control del promotor de napina fue germinada y se
establecieron plantas T1 a partir de cinco líneas T_{0} (Nos. 4,
8, 13, 17 & 21 en la Tabla 5). Se cosechó la semilla T2 de cada
planta T1 y se la analizó por la composición de ácidos grasos. La
progenie de los transformantes Nos. 4, 8, 13 y 21 (Tabla 5)
segregada como se esperaba por la presencia de ácido vernólico, con
aquellas plantas conteniendo ácido vernólico en un rango hasta del
3,1% (Tabla 6).
Todas las plantas T1 que contenían ácido
vernólico (esto es, epoxi 18:1 en la Tabla 6) también contenían
ácido
12,13-epoxi-9,15-octadecadienóico
(esto es, epoxi 18:2 en la Tabla 6; ver también la Figura 11),
indicando que algo del ácido vernólico sintetizado por la
epoxigenasa Cpal2 fue posteriormente desaturada por medio de la
\Delta15-desaturasa endógena.
(Continuación)
\newpage
(Continuación)
La construcción del plásmido binario descrita
anteriormente que contiene al clon de ADNc Cpal2 (Figura 9) fue
transformada dentro de la cepa AGL1 de Agrobacterium
tumefaciens, utilizando electroporación. La A.
tumefaciens transformada fue utilizada para infectar a los
explantes de Eyre de una variedad de Linum usitatissimun como
lo describen Lawrence y colaboradores (1989), excepto que el medio
MS fue utilizado como el medio básico para la inducción de las
raíces sobre material regenerado de vástago.
Dos transformantes primarios de Linola (plantas
T0) denominados AP20 y AP21 fueron confirmados como transgénicos
por medio de PCR utilizando iniciadores dirigidos contra el gen
Cpal2 y por medio de la demostración de que estas plantas eran
resistentes a la kanamicina. Se analizaron diez semillas T1
individualmente para la composición de ácidos grasos utilizando
técnicas estándar.
Como se muestra en la Tabla 7, las semillas de
AP20 segregadas en 3 clases, constaban de tres semillas sin ácido
vernólico, dos con ácido vernólico superior al 0,7%, y cinco con
niveles intermedios de ácido vernólico
(0,13-0,47%).
En forma similar, las semillas de AP21
segregadas en 3 clases, constaban de cinco semillas sin ácido
vernólico, dos con ácido vernólico superior al 0,25%, y tres con un
nivel intermedio de ácido vernólico (0,09-0,14%)
(Tabla 8).
Por lo tanto, se obtuvo un total de doce
semillas que contenían ácido vernólico. Ocho de las doce semillas
de AP20 y AP21 que contenían ácido vernólico también contenían ácido
12,13-epoxy-9,15-octadecadienóico.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
Se establecieron cuatro plantas T1 de los
semilleros de AP20 resistentes a la kanamicina. Se mostró
posteriormente que las cuatro plantas producían ácido vernólico en
sus semillas T2 (Tabla 9). Los niveles de ácidos grasos epóxidos
18:2 no fueron analizados en estas semillas T2.
La producción de un aceite rico en ácido
vernólico se logro por medio de la transformación del gen de la
epoxigenasa descrito aquí, en particular de la SEQ ID NO: 1, dentro
de Arabidopsis thaliana, como se describió en los Ejemplos
anteriores. Como se muestra en la Tabla 5, las líneas transgénicas
de A. thaliana que expresan la SEQ ID NO: 1 producen niveles
altos de ácido vernólico en sus semillas, con relación a otros
ácidos grasos. En particular, en una línea transgénica
(Cpal-17), el ácido vernólico producido es tan alto
como el 15,2% (p/p) del contenido total de ácido graso en las
semillas.
La producción de un aceite rico en ácido
vernólico se logra también por medio de la transformación del gen
de la epoxigenasa descrito aquí, en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1,
3, 5, 19 ó 20 y preferiblemente en cualquiera de las SEQ ID NOs: 1
ó 3 ó 5, dentro de cualquier organismo que acumula aceite que
normalmente tiene niveles muy altos de ácido linoléico y actividad
mínima de otras enzimas que compiten, capaz de utilizar ácido
linoléico como sustrato. Las secuencias genéticas de la invención
se colocan operativamente bajo el control de un promotor que
produce expresión de alto nivel en oleaginosas, por ejemplo el
promotor específico para semillas de napina.
En otra aproximación alternativa para la
transformación de A. thaliana, se transformaron genotipos
linoléicos altos de lino, girasol, maíz o cártamo con la
epoxigenasa de la invención. Los altos niveles de ácido vernólico
se producen por medio de plantas transgénicas durante la síntesis de
aceite de semilla, cuando el gen de la epoxigenasa se expresa en
niveles altos.
Alternativamente, se transforma lino Linola® (=
ácido linolénico bajo) con la epoxigenasa de la invención. Los
altos niveles de ácido vernólico son producidos por medio de plantas
transgénicas de lino Linola® durante la síntesis de aceite de
semilla, cuando el gen de la epoxigenasa se expresa en niveles
altos.
Adicionalmente, los inventores han mostrado que
el ácido vernólico marcado alimentado a las semillas de lino en
desarrollo no se degrada sino que se incorpora dentro de lípidos de
almacenamiento en todas las tres posiciones de la molécula de
triglicérido (ver Ejemplo 10). Consistente con estos datos, los
niveles altos de ácido vernólico sintetizado por la epoxigenasa
introducida se depositan fácilmente en los triglicéridos de aceite
de semilla de esta especie.
Los cotiledones separados de la semilla de lino
en desarrollo (seis pares en cada incubación, incubaciones por
duplicado) en la etapa media del desarrollo de la semilla (20 días
después de la floración) fueron incubados con 10 nmol de las sales
de amonio ya sea del ácido
vernólico[1-^{14}C] (actividad específica
3000 d.p.m./nmol) o ácido oleico[1-^{14}C]
(actividad específica 5000 d.p.m./nmol) en 0,2 ml de búfer de
fosfato pH 7,2 durante 30 min a 30ºC. Se lavaron entonces los
cotiledones tres veces con 1 ml de agua destilada y se extrajo
inmediatamente ya sea en un Ultra Turrax de acuerdo con Bligh y
Dyer (1959) o se incubó adicionalmente en 0,5 ml de búfer de
fosfato 0,1 M pH 7,2 durante 90 ó 270 min antes de la extracción. Se
metiló una alícuota de los lípidos en la fase de cloroformo y se
separó sobre placas para TLC en gel de sílice en
n-hexano/dietiléter/ácido acético (85:15:1). El
resto de los lípidos en la fase de cloroformo de cada muestra fueron
aplicados sobre dos placas separadas para TLC en gel de sílice y se
desarrollaron las placas en cloroformo/metanol/ácido acético/agua
(85:15:10:3,5 en volumen) para la separación de lípidos polares y en
n-hexano/dietiléter/ácido acético (60:40:1,5) para
la separación de lípidos neutros. Las áreas de lípido con migración
correspondientes a estándares auténticos fueron removidas y se
cuantificó la radioactividad en cada lípido por medio del recuento
de centelleo líquido.
La recuperación del marcador ^{14}C en la fase
de cloroformo es descrita en la Figura 12. Algo más de la mitad de
la radioactividad añadida tanto del ácido oleico[^{14}C]
como de ácido vernólico[^{14}C] fueron recibidos por los
cotiledones y recobrados como sustancias lipofílicas después de 30
min de la marcación por impulso. Esta cantidad permaneció
virtualmente inalterada durante los 270 min adicionales de
incubación con ambos sustratos. La separación de los metilésteres
radioactivos de los lípidos mostró que la mayor parte de la
radioactividad (92%) de los experimentos alimentados con ácido
vernólico[^{14}C] residió en compuestos con la misma
migración del metil-vernolato, indicando que el
grupo epoxi permaneció intacto en los cotiledones de las semillas
de lino durante los 270 min de la
incubación.
incubación.
Aproximadamente 28% de la actividad a partir de
la alimentación con ácido vernólico[^{14}C] que estaba
presente en la fase de cloroformo residía en la fosfatidilcolina
después de 30 min, y la radioactividad disminuyó hasta únicamente
el 5% a los 300 min de la incubación (Figura 13).
Aproximadamente 22% de la actividad a partir de
la alimentación con ácido oleico[^{14}C] que estaba
presente en la fase de cloroformo residía en la fosfatidilcolina
después de 30 min, y la radioactividad disminuyó hasta
aproximadamente el 11% a los 300 min de la incubación (Figura
13).
Aproximadamente 32% de la actividad a partir de
la alimentación con ácido vernólico[^{14}C] que estaba
presente en la fase de cloroformo residía en los triacilgliceroles
después de 30 min, y la radioactividad incremento hasta el 60% a
los 300 min de la incubación (Figura 14). Los diacilgliceroles
contenían algo como el 24% de la actividad en los experimentos de
alimentación con ácido vernólico[^{14}C] y esta cantidad
permaneció bastante constante durante los períodos de
incubación.
Aproximadamente 5% de la actividad a partir de
la alimentación con ácido oleico[^{14}C] que estaba
presente en la fase de cloroformo residía en los triacilgliceroles
después de 30 min, y la radioactividad incrementó hasta el 18% a
los 300 min de la incubación (Figura 14). Los diacilgliceroles
contenían algo como el 19% de la actividad después de 30 min en los
experimentos de alimentación con ácido oleico[^{14}C] y
esta cantidad permaneció bastante constante durante los períodos de
incubación.
El experimento anterior muestra que los
cotiledones de la semilla de lino no metabolizan al grupo epoxi del
ácido vernólico en gran medida. Además muestra que los cotiledones
de la semilla de lino poseen mecanismos para remover en forma
eficiente al ácido vernólico de los lípidos de la membrana e
incorporarlos dentro de los triacilgliceroles.
Los homólogos del gen de la
\Delta12-epoxigenasa Cpal2 se obtienen a partir de
otras especies que son ricas en ácidos grasos epóxidos, por medio
de la clonación de los miembros de la familia de genes de
monoxigenasas de función mixta A12 que se expresan altamente en las
semillas en desarrollo y comparando sus secuencias de aminoácidos
con aquellas secuencias conocidas de
\Delta12-desaturasa y
\Delta12-epoxigenasa. Tales genes se clonan ya
sea por selección de genotecas de ADNc de semilla en desarrollo con
sondas genéticas con base ya sea en el gen Cpal2 (SEQ ID NO: 1) o
el fragmento D12V (SEQ ID NO: 7), o por medio de amplificación de
fragmentos por PCR utilizando iniciadores diseñados contra
secuencias conservadas de las monoxigenasas de la planta de función
mixta A12, como se describió aquí. Las secuencias putativas
\Delta12-epoxigenasa muestran una mayor identidad
de secuencia total con las secuencias de la
\Delta12-epoxigenasa divulgada aquí, que con las
secuencias conocidas de la A12-desaturasa.
En un ejemplo de esta aproximación, se obtuvo
una secuencia de longitud completa del tipo de la
\Delta12-epoxigenasa a partir de una Crepis
sp. no identificada que contenía niveles altos de ácido
vernólico en sus aceites de semilla y conocida por no ser Crepis
palaestina. Se aisló ARN poli(A)+ a partir de semillas en
desarrollo de esta Crepis sp. usando un kit de purificación
QuickPrep Micro mRNA (Pharmacia Biotechnology) y utilizado para
sintetizar un ADNc bicatenario iniciado con oligosacárido
d(T). Se ligó el ADNc bicatenario así obtenido a adaptadores
EcoRI/NotI (Pharmacia Biotechnology) y se construyó
una genoteca de ADNc utilizando el kit de clonación
ZAP-cDNA Gigapack (Stratagene). Se seleccionó la
genoteca de ADNc sobre filtros de membrana Hybond N+ (Amersham) con
el fragmento D12V marcado en forma aleatoria (SEQ ID NO: 7) derivado
de Crepis alpina como lo describe el fabricante, utilizando
condiciones estándar de hibridación. Esto resultó en la purificación
de un bacteriófago recombinante designado como CrepX.
Se determinó la secuencia de nucleótidos del
ADNc de CrepX y se la expuso en la SEQ ID NO: 3. La secuencia
deducida de aminoácidos de CrepX (SEQ ID NO: 4) contiene una
proteína de 374 aminoácidos que tiene 97% de identidad con la
secuencia de la \Delta12-epoxigenasa Cpal2, pero
únicamente 57% de identidad con la secuencia de la
\Delta12-desaturasa L26296 de Arabidopsis
thaliana. Esto demuestra claramente la presencia de un gen en
otra Crepis sp. que tiene un alto contenido de ácido vernólico, cuyo
gen es altamente homólogo con el gen de la
\Delta12-epoxigenasa Cpal2 y claramente no es un
gen de desaturasa.
En un segundo ejemplo de esta aproximación, se
obtuvo una secuencia parcial del tipo de la
\Delta12-epoxigenasa de la especie de Vernonia
galamensis que contiene ácido vernólico. Se prepararon patrones
de ADNc de la primera cadena a partir del ARN total aislado de las
semillas en desarrollo de V. galamensis utilizando
procedimientos estándar.
Se obtuvo un fragmento de PCR (550 nucleótidos
de longitud), designado como VgaII, por medio de la amplificación
del ADNc monocatenario utilizando iniciadores derivados de la
secuencia deducida de aminoácidos de las monoxigenasas de función
mixta de la planta. Se determinó la secuencia de nucleótidos del ADN
amplificado utilizando procedimientos estándar y se la expone en la
SEQ ID NO: 5.
El alineamiento de la secuencia deducida de
aminoácidos del fragmento de PCR Vgal1 (SEQ ID NO: 6) con la
secuencia completa de la \Delta12-epoxigenasa
Cpal2 y de la \Delta12-desaturasa L26296 de
Arabidopsis thaliana (Figura 12) demuestra que la secuencia
amplificada de Vgal1 codifica a una secuencia de aminoácidos que
corresponde a la región de expansión de los residuos aminoácidos
103-285 del polipéptido Cpal2. Dentro de esta
región, la secuencia de Vgal1 mostró una mayor identidad de
aminoácidos con la secuencia de la
\Delta12-epoxigenasa Cpal2 (67%) que con la
secuencia de la A12-desaturasa de A. thaliana
(60%), sugiriendo que el ADN amplificado corresponde a una
epoxigenasa en vez de a una secuencia de desaturasa.
Aquellos capacitados en el arte sabrán que la
presente invención es objeto de variaciones y de modificaciones
diferentes a aquellas específicamente descritas aquí. Se debe
entender que la invención incluye a todas estas variaciones y
modificaciones. La invención también incluye todas las etapas,
características, composiciones y compuestos mencionados o indicados
en esta descripción, individual o colectivamente, y a cualquiera o a
todas las combinaciones de dos o más de dichas etapas o
características.
1. An y colaboradores (1985)
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5536-5540.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization AND Sten Stymne
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: GENES DE EPOXIGENASA VEGETAL DE ÁCIDO GRASO Y LA UTILIZACIÓN DE ESTOS GENES
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 20
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DIRECCIÓN: DAVIES COLLISON STREET
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 1 LITTLE COLLINS STREET
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: MELBOURNE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: VICTORIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: AUSTRALIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 3000
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA QUE PUEDE LEERSE EN EL COMPUTADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- COMPUTADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Versión #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICTUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICTUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD: AU PO6223
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 15 DE ABRIL DE 1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICTUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD: AU PO6226
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 15 DE ABRIL DE 1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICTUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD: US 60/043706
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 16 DE ABRIL DE 1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICTUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE LA SOLICITUD: US 60/050403
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 20 DE JUNIO DE 1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: HUGHES, DR E JOHN L
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- REFERENCIA/NÚMERO DEL EXPEDIENTE: MRO/EJH/JMC
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE LAS TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: +61 3 9254 2777
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: +61 3 9254 2770
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TELEX: AA 31787
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1358 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 30..1151
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 374 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1312 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Crepis sp.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 26..1147
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 374 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 550 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Vernonia galamensis
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..545
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 183 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 177 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Crepis alpina
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 1..177
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 59 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 383 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Arabidopsis thaliana
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 384 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Brassica juncea
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 383 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Glycine max
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 383 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Solanum commersonii
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 387 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Glycine max
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 387 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Ricinos communis
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Glu Cys Gly His His}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Arg Asn His His}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Val Met His His}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: oligonucleótido
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGAATTCCY TBMGNNNNYT SGGNHTBGG
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1610 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- FUENTE ORIGINAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- ORGANISMO: Euphorbia lagascae
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 8..1546
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1698 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- ENTRELAZAMIENTO: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 8..1504
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
Claims (35)
1. Una molécula aislada de ácido nucleico que
codifica o es complementaria a una molécula aislada de ácido
nucleico que codifica a una epoxigenasa que es un polipéptido de
monoxigenasa de función mixta que es capaz de catalizar la
epoxigenación de un enlace de carbono en una molécula de ácido
graso, en donde dicha epoxigenasa comprende una secuencia de
aminoácidos que tiene los tres motivos ricos en histidina:
2. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a la reivindicación 1, en donde el enlace de carbono es un
doble enlace en una molécula de ácido graso insaturada.
3. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a las reivindicaciones 1 ó 2, en donde dicha epoxigenasa es
una enzima \Delta6-epoxigenasa, una enzima
\Delta9-epoxigenasa, una enzima
\Delta12-epoxigenasa o una enzima
\Delta15-epoxigenasa.
4. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3, derivada de una
planta.
5. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a la reivindicación 4, en donde la planta se selecciona de
la lista que comprende Crepis spp., Euphorbia spp., Chrysanthemum
spp. y Vernonia spp.
6. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a la reivindicación 4, en donde la planta produce niveles
altos de ácido vernólico.
7. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a la reivindicación 5, en donde la planta se selecciona de
la lista que comprende Crepis biennis, Crepis aurea, Crepis
conyzaefolia, Crepis intermedia, Crepis occidentalis, Crepis
palaestina, Crepis vesicaria, Crepis xacintha y Vernonia
galamensis.
8. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, que comprende
una secuencia de nucleótidos que es aproximadamente al menos 65%
idéntica a una cualquiera de las SEQ ID NOs: 1, 3 ó 5 o una
secuencia complementaria de las mismas.
9. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 capaz de
hibridación al menos bajo condiciones rigurosas moderadas para al
menos 20 nucleótidos contiguos contenidos dentro de cualquiera de
las SEQ ID NOs: 1, 3 ó 5 o una secuencia complementaria de las
mismas.
10. La molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9, que comprende la
secuencia de nucleótidos expuesta en las SEQ ID NOs: 1, 3 ó 5, p una
secuencia complementaria de nucleótidos de las mismas o al menos 20
nucleótidos contiguos de la misma.
11. Una construcción genética que comprende a la
molécula aislada de ácido nucleico de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 10 operativamente conectada a una secuencia
promotora, en donde dicha molécula de ácido nucleico es capaz de ser
transcrita en la orientación sentido o antisentido con relación a la
dirección de una transcripción in vivo de un gen de
ocurrencia natural de la epoxigenasa monoxigenasa de función
mixta.
12. Un método para alterar el nivel de ácidos
grasos epóxidos en una célula, tejido, órgano, organismo no humano,
o microorganismo, dicho método comprendiendo introducir una molécula
sentido, antisentido, de ribozima o cosupresora que comprende a la
molécula aislada de ácido nucleico de acuerdo a cualquiera de la
reivindicaciones 1 a 10 en una célula, tejido, órgano u organismo no
humano e incubar dicha célula durante un tiempo y bajo condiciones
suficientes para que ocurra la expresión de dicha molécula sentido,
antisentido, de ribozima o cosupresora.
13. El método de acuerdo a la reivindicación 12,
en donde la etapa de introducir la molécula sentido, antisentido, de
ribozima o cosupresora comprende la transformación en forma estable
de la célula, tejido, órgano u organismo no humano con la molécula
sentido, antisentido, de ribozima o cosupresora.
14. Un método para producir un polipéptido
recombinante de epoxigenasa monoxigenasa de función mixta
enzimáticamente activo en una célula, dicho método comprendiendo
cultivar una célula que comprende a la molécula aislada de ácido
nucleico de acuerdo a cualquiera de la reivindicaciones 1 a 10
durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para que ocurra la
expresión.
\newpage
15. El método de acuerdo a la reivindicación 14,
que comprende la primera etapa adicional de transformar la célula
con la molécula aislada de ácido nucleico.
16. Un método para producir un polipéptido
recombinante de epoxigenasa monoxigenasa de función mixta
enzimáticamente activo en una célula, dicho método comprendiendo las
etapas de:
- (i)
- producir una construcción genética que comprende a la molécula aislada de ácido nucleico de acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10 colocada operablemente bajo el control de un promotor capaz de conferir expresión sobre dicha secuencia genética en dicha célula, y opcionalmente un elemento reforzador de la expresión;
- (ii)
- transformar dicha construcción genética dentro de dicha célula; y
- (iii)
- seleccionar los transformantes que expresan una epoxigenasa funcional codificada por la secuencia genética en un nivel alto.
17. Un método para producir un polipéptido
recombinante de epoxigenasa monoxigenasa de función mixta
enzimáticamente activo en una planta transgénica, comprendiendo las
etapas de:
- (i)
- producir una construcción genética que comprende a la molécula aislada de ácido nucleico de acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 1 a 10 colocada operablemente bajo el control de un promotor específico para la semilla y opcionalmente un elemento reforzador de la expresión, en donde dichas secuencias genéticas se ubican también secuencia arriba de una secuencia terminadora de la transcripción;
- (ii)
- transformar dicha construcción genética dentro de una célula o tejido de dicha planta; y
- (iii)
- seleccionar los transformantes que expresan una epoxigenasa funcional codificada por la secuencia genética en un nivel alto en las semillas.
18. El método de acuerdo a la reivindicación 17,
en donde la planta es una especie oleaginosa que normalmente produce
niveles altos de ácido linoleico.
19. El método de acuerdo a las reivindicaciones
17 ó 18, en donde la planta se selecciona de la lista que comprende
lino Linola®, colza oleaginosa, girasol, cártamo, soja, linaza,
ajonjolí, semilla de algodón, cacahuete, palma de oliva o palma
aceitera.
20. Un polipéptido recombinante de epoxigenasa
monoxigenasa de función mixta producido de acuerdo con el método de
acuerdo a cualquiera de las reivindicaciones 14 a 19.
21. Un polipéptido recombinante de epoxigenasa
monoxigenasa de función mixta de acuerdo a la reivindicación 20, que
comprende una secuencia de aminoácidos expuesta en cualquiera de las
SEQ ID NOs: 2, 4 ó 6 o que es aproximadamente al menos 50% idéntica
a las mismas.
22. Un método para producir un ácido graso
epoxigenado en una célula, tejido, órgano, organismo no humano, o
microorganismo, dicho método comprendiendo incubar una célula,
tejido, órgano u organismo no humano que exprese al polipéptido
recombinante de acuerdo a las reivindicaciones 20 ó 21 con un
sustrato de ácido graso durante un tiempo y bajo condiciones
suficientes para que al menos un enlace de carbono de dicho sustrato
sea convertido en un grupo epoxi.
23. El método de acuerdo a la reivindicación 22,
en donde el sustrato de ácido graso es un ácido graso insaturado y
el enlace de carbono de dicho sustrato que está epoxigenado es un
enlace doble de carbono.
24. El método de acuerdo a las reivindicaciones
22 ó 23, en donde el sustrato de ácido graso se selecciona de la
lista que comprende ácido palmitoleico, ácido oleico, ácido
linoleico, ácido linolénico, ácido
9,15-octadecadienóico y ácido araquidónico.
25. El método de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 22 a 24, en donde el enlace de carbono que es
epoxigenado es un enlace de carbono \Delta6 o un enlace de carbono
\Delta9 o un enlace de carbono \Delta12 o un enlace de carbono
\Delta15.
26. El método de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 22 a 25, en donde el ácido graso epoxigenado que se
produce es ácido vernólico.
27. El método de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 22 a 26, que comprende la primera etapa adicional
de transformar o de transfectar la célula, tejido, órgano u
organismo no humano con una molécula de ácido nucleico que codifica
a la epoxigenasa recombinante monoxigenasa de función mixta.
\newpage
28. El método de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 22 a 27, en donde la célula, órgano, tejido u
organismo no humano en el cual se expresa la epoxigenasa
recombinante monoxigenasa de función mixta se deriva de una
bacteria, levadura, hongo, moho, insecto, planta, ave o mamífero no
humano.
29. El método de acuerdo a la reivindicación 28
en donde la levadura, planta, hongo o moho es una levadura, planta,
hongo o moho oleaginoso.
30. El método de acuerdo a la reivindicación 29
en donde la planta es una planta oleaginosa que no expresa
normalmente a la epoxigenasa recombinante monoxigenasa de función
mixta en un nivel alto.
31. El método de acuerdo a la reivindicación 30
en donde la planta oleaginosa se selecciona de la lista que
comprende lino Linola®, colza oleaginosa, girasol, cártamo, soja,
linaza, ajonjolí, semilla de algodón, cacahuete, palma de oliva o
palma aceitera.
32. Una planta transformada con la molécula
aislada de ácido nucleico de acuerdo a cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 10 o una célula, tejido u órgano derivado de
allí o la progenie de dicha planta que comprende también a dicha
molécula de ácido nucleico.
33. Una planta transformada que es capaz de
expresar al polipéptido recombinante de acuerdo a las
reivindicaciones 20 ó 21 o una célula, tejido u órgano derivado de
allí o la progenie de dicha planta que es capaz también de expresar
a dicho polipéptido recombinante.
34. La planta o una célula, tejido u órgano
derivado de allí o la progenie de los mismos de acuerdo a las
reivindicaciones 32 ó 33, que es o se deriva de lino Linola®, colza
oleaginosa, girasol, cártamo, soja, linaza, ajonjolí, semilla de
algodón, cacahuete, palma de oliva o palma aceitera.
35. La planta o una célula, tejido u órgano
derivado de allí o la progenie de los mismos de acuerdo a las
reivindicaciones 32 ó 33, que es o se deriva de Arabidopsis
thaliana o de Linum usitatissimum.
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