ES2239367T3 - Polipeptidos llg de la familia de las triacilglicerol lipasas, y composiciones y metodos para su uso en la hidrolisis enzimatica y terapias proteicas y genicas. - Google Patents
Polipeptidos llg de la familia de las triacilglicerol lipasas, y composiciones y metodos para su uso en la hidrolisis enzimatica y terapias proteicas y genicas.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A POLIPEPTIDOS DEL TIPO LIPOPROTEINA LIPASA, ACIDOS NUCLEICOS QUE CODIFICAN DICHOS POLIPEPTIDOS, UNAS SECUENCIAS DE ANTIDETECCION ASI COMO ANTICUERPOS DIRIGIDOS CONTRA DICHOS POLIPEPTIDOS. ESTA INVENCION SE REFIERE TAMBIEN A UNOS PROCEDIMIENTOS DE PREPARACION DE DICHOS POLIPEPTIDOS, EN UN SISTEMA DE RECOMBINACION, ASI COMO SU USO PARA EL CRIBADO DE LOS AGONISTAS Y/O ANTAGONISTAS DE ESTOS POLIPEPTIDOS. ESTA INVENCION SE REFIERE FINALMENTE A UNOS PROCEDIMIENTOS Y A UNAS COMPOSICIONES DE TRATAMIENTO DE LOS TRASTORNOS DEL METABOLISMO LIPIDICO.
Description
Polipéptidos LLG de la familia de las
triacilglicerol lipasas, y composiciones y métodos para su uso en la
hidrólisis enzimática y terapias proteicas y génicas.
La presente invención se refiere a los
polipéptidos de la familia de las triaciglicerol lipasas, a los
ácidos nucleicos que codifican a dichos polipéptidos, a las
secuencias antisentido derivadas de los ácidos nucleicos mencionados
y a los anticuerpos contra dichos polipéptidos. Esta invención
también se refiere a la preparación de los polipéptidos mencionados
utilizando la tecnología recombinante y al uso de dichos
polipéptidos para seleccionar los agonistas o los antagonistas de
dichos polipéptidos. Esta invención de igual modo se refiere a los
métodos que se establecen para el uso de tales polipéptidos y de las
secuencias de ácido nucleico que codifican a los mismos en los
compuestos farmacéuticos, que incluyen los compuestos genéticos
terapéuticos para el tratamiento de los trastornos del metabolismo
de los lípidos y de las lipoproteínas.
Los lípidos son biomoléculas orgánicas insolubles
en agua, las cuales son componentes esenciales de funciones
biológicas diversas, que incluyen el almacenamiento, el transporte y
el metabolismo de la energía y la estructura de la membrana y la
fluidez. Los lípidos son derivados de dos fuentes en el hombre y en
otros animales: algunos lípidos se ingieren como grasas y aceites
alimenticios y otros lípidos son biosintetizados por el hombre o el
animal. En los mamíferos, por lo menos el 10% del peso corporal es
lípido, la mayor cantidad del cual se encuentra en forma de
triacilgliceroles.
Los triacilgliceroles, también conocidos como
triglicéridos y triacilglicéridos, están constituidos por tres
ácidos grasos esterificados hasta el glicerol. Los triacilgliceroles
alimenticios se depositan en los tejidos adiposos como una fuente de
energía, o bien son hidrolizados en el tracto digestivo por medio de
las triacilglicerol lipasas, de las cuales la más importante es la
lipasa pancreática. Los triacilgliceroles se transportan a través de
los tejidos en forma de lipoproteínas.
Las lipoproteínas son ensambles similares a las
micelas que se encuentran en el plasma, las cuales contienen
proporciones variables de diferentes tipos de lípidos y proteínas
(que se denominan apoproteínas). Existen cinco clases principales de
lipoproteínas plasmáticas, cuya función principal es el transporte
de los lípidos. Estas clases son, en orden de incremento de la
densidad, los quilomicrones, las lipotroteínas de muy baja densidad
(VLDL), las lipoproteínas de densidad intermedia (IDL), las
lipoproteínas de baja densidad (LDL), y las lipoproteínas de alta
densidad (HDL). Si bien muchos tipos de lípidos se encuentran
asociados con cada clase de lipoproteína, cada clase transporta en
forma predominante un tipo de lípido; los triacilgliceroles que se
han descripto con anterioridad son transportados en quilomicrones,
VLDL e IDL, mientras que los fosfolípidos y los ésteres del
colesterol son transportados en las HDL y en las LDL
respectivamente.
Los fosfolípidos son ésteres de ácido
di-graso de glicerol fosfato, que también contienen
un grupo polar acoplado al fosfato. Los fosfolípidos son componentes
estructurales importantes o membranas celulares. Los fosfolípidos
son hidrolizados por las enzimas denominadas fosfolipasas. La
fosfatidilcolina, un fosfolípido que se ofrece a modo de ejemplo es
el componente principal de la mayoría de las membranas de la célula
eucariótica.
El colesterol es el precursor metabólico de las
hormonas esteroides y de los ácidos biliares al igual que un
componente esencial de las membranas celulares. En el hombre y en
otros animales, el colesterol se ingiere en la dieta y también es
sintetizado por el hígado y otros tejidos. El colesterol es
transportado a través de los tejidos en la forma de ésteres de
colesteril en las LDL y en otras lipoproteínas.
Las membranas rodean cada una de las células
vivas y sirven como una barrera entre los compartimientos
intracelulares y extracelulares. Las membranas también incluyen al
núcleo eucariótico, forman el retículo endoplásmático y sirven para
las funciones especializadas tales como en la vaina de mielina que
rodea a los axones. Una membrana típica contiene alrededor del 40%
de lípido y alrededor del 60% de proteínas pero existe una variación
considerable. Los componentes lipídicos principales son los
fosfolípidos, específicamente la fosfatidilcolina, la
fosfatidiletanolamina y el colesterol. Las propiedades
fisicoquímicas de las membranas, tales como la fluidez, se pueden
cambiar por medio de la modificación de los perfiles del ácido graso
de los fosfolípidos o bien del contenido del colesterol. La
modulación de la composición y la organización de los lípidos de la
membrana también modula las funciones celulares que dependen de la
membrana tales como la actividad del receptor, la endocitosis y el
flujo del colesterol.
Las triacilglicerol lipasas son una familia de
enzimas que desempeñan varias funciones pivotales en el metabolismo
de los lípidos en el cuerpo. Se han descripto tres miembros de la
familia de triacilglicerol lipasa: la lipasa pancreática, la lipasa
de las lipoproteínas y la lipasa hepática (Goldberg. I.J., Le,
N.-A., Ginsberg, H.N., Krauss, R.M., y Lindgren, F.T. (1988) J.
Clin. Invest. 81,561-568; Goldberg, I.J., Le. N.,
Paterniti J.R., Ginsberg, H.N., Lindgren. F.T., y Brown, W.V. (1982)
J. Clin. Invest. 70, 1184-1192; Hide, W.A., Chan.
L., y Li, W.-H. (1992) J. Lipid. Res. 33, 167-178).
La lipasa pancreática es principalmente responsable de la hidrólisis
de los lípidos alimenticios. Se han descripto las variantes de la
lipasa pancreática pero no se ha determinado su función fisiológica.
(Gilier, T., Buchwald, P., Blum-Kaelin, D., y
Hunziker, W. (1992) J. Biol. Cherm.
267,16509-16516). La lipoproteína lipasa es la
principal enzima responsable de la distribución y de la utilización
de los triglicéridos en el cuerpo. La lipoproteína lipasa hidroliza
los triglicéridos tanto en los quilomicrones como en la VLDL. La
lipasa hepática hidroliza los triglicéridos en la IDL y en la HDL y
es responsable de la remodelación de la lipoproteína. La lipasa
hepática también funciona como una fosfolipasa e hidroliza los
fosfolípidos en la HDL.
Las fosfolipasas desempeñan papeles importantes
en el catabolismo y la remodelación del componente fosfolipídico de
las lipoproteínas y los fosfolípidos de las membranas. Las
fosfolipasas también desempeñan un papel en la liberación de ácido
araquidónico y la formación subsiguiente de las prostaglandinas, los
leucotrienos y otros lípidos que están involucrados en una variedad
de procesos inflamatorios.
Los polipéptidos de la lipasa codificados por
estos genes de la lipasa son aproximadamente 450 aminoácidos de
longitud con péptidos señal líderes para facilitar la secreción. Las
proteínas de la lipasa están comprendidas por dos dominios
principales (Winkler, K., D' Arcy, A., y Hunziker, W. (1990) Nature
343, 771-774). El dominio amino terminal contiene el
sitio catalítico mientras que se cree que el dominio carboxilo es
responsable de la unión con el substrato, la asociación con el
cofactor y la interacción con los receptores celulares (Wong, H.,
Davis, R.C., Nikazy, J., Seebart, K.B., y Scholz, M.C. (1991) Proc.
Natl. Acad. Sci USA 88, 11290-11294; van Tilbeurgh,
H., Roussel, A., Lalouel, J.-M., y Cambillau, C. (1994) J. Biol.
Chem. 269, 4626-4633; Wong, H., Davis, R.C., Thuren,
T., Goers, J.W., Nikazy, J., Waite, M., y Schotz, M.C. (1994) J.
Biol. Chem. 269,10319-10323; Chappell, D.A., Inoue,
I., Fry, G.L., Pladet, M.W., Bowen. S.L., lverius, P.-H., Lalouel,
J.-M., y Strickland, D.K. (1994) J. Biol. Chem.
269,18001-18006). El nivel general de homología de
los aminoácidos entre los miembros de la familia es de
22-65%, con regiones locales de alta homología que
corresponden a las homologías estructurales las cuales están
vinculadas con la función enzimática.
La proteína lipoproteína lipasa que se produce en
forma natural es glicosilada y la glicosilación es necesaria para la
actividad enzimática de LPL (Semenkovich, C.F., Luo, C.-C.,
Nakanishi. M.K., Chen, S.H., Smith, L C., y Chao L. (1990) J. Biol.
Chem. 265, 5429-5433). Existen dos sitios para la
glicosilación unida a N en la lipasa hepática y en la lipoproteína
lipasa y uno en la lipasa pancreática. De manera adicional, cuatro
conjuntos de cisteínas forman puentes de disulfuro que son
esenciales para mantener la integridad estructural de la actividad
enzimática (Lo, J.-Y., Smith. L.C., y Chan. L. (1995) Biochem.
Biophys. Res. Commun. 206, 266-271; Brady, L.,
Brzozowski, A.M., Derewenda, Z.S., Dodson, E., Dodson G., Tolley,
S., Turkenburg, J.P., Christiansen, L., Huge-Jensen
B., Norskov, L., Thim, L., y Menge, U (1990) Nature 343,
767-770).
Los miembros de la familia de las triacilglicerol
lipasas comparten una cantidad de características estructurales
conservadas. Una de tales características es el motivo "GXSXG",
en el cual el residuo central de serina es uno de los tres residuos
que comprenden la "tríada catalítica" (Winkler, K., D'Arcy, A.,
y Hunziker. W. (1990) Nature 343, 771-774;
Faustinella, F., Smith, L.C., y Chan, L. (1992) Biochemistry 31,
7219-7223). Los residuos conservados de aspartato e
histidina constituyen el balance de la tríada catalítica. Un pequeño
abanico de 19-23 aminoácidos (la "región de la
tapa") forma una estructura helicoidal anfipática y cubre el
bolsillo catalítico de la enzima (Winkler, K., D' Alcy, A., y
Hunziker, W. (1990) Nature 343, 771-774). Esta
región discrepa entre los miembros de la familia y recientemente se
ha determinado que el abanico confiere la especificidad del
substrato a las enzimas (Dugi, K.A., Dichek H.L., y
Santamarina-Fojo, S. (1995) 1. Biol. Chem. 270,
25396-25401). Las comparaciones entre la lipasa
hepática y la lipoproteína lipasa han demostrado que las diferencias
en las actividades de la triacilglicerol lipasa y de la fosfolipasa
de las enzimas son en parte mediadas por esta región de tapa (Dugi,
K.A., Dichek H.L., y Santamarina-Fojo, S. (1995) J.
Biol. Chem. 270, 25396-25401).
Las triacilglicerol lipasas poseen grados
variables de actividad de unión a la heparina. La lipoproteína
lipasa tiene la mayor afinidad por la heparina y se ha hecho un mapa
de su actividad de unión hasta los trechos de residuos cargados en
forma positiva en el dominio amino terminal (Ma, Y., Henderson,
H.E., Liu, M.-S., Zhang, H., Forsythe, I.J.,
Clarke-Lewis, I., Hayden, M.R., y Brunzell, J.D. J.
Lipid Res. 35, 2049-2059). La localización de la
lipoproteína lipasa en la superficie del endotelio (Cheng, C.P.,
Oosta, G.M., Bensadoun, A., y Rosenberg, R.D. (1981) J. Biol. Chem.
256, 12893-12896) está principalmente mediada a
través de la unión a los proteoglicanos de la superficie (Shimada
K., Gill, P.J., Silbert, J.E., Douglas, W.H.J., y Fanburg, B.L.
(1981) J. Clin. Invest. 68, 995-1002; Saxena, U.,
Klein, M.G., y Goldberg, I.J. (1991) J. Biol. Chem. 266,
17516-17521; Eisenberg, S., Sehayek, E., Olivecrona,
T., y Vlodavsky, I. (1992) J. Clin Invest. 90,
2013-2021). Esta actividad de unión es la que
permite a la enzima acelerar la recaptación de LDL al actuar como un
puente entre LDL y la superficie celular (Mulder, M., Lombardi, P.,
Jansen, H., van Berkel T.J., Frants R.R., y Havekes, L.M. (1992)
Biochem. Biophys. Res. Comm. 185, 582-587; Rutledge,
J.C., y Goldberg, I.J., (1994) J. Lipid Res. 35.
1152-1160; Tsuchiya, S., Yamabe, M., Yamaguchi, T.,
Kobayashi, Y., Konno, T., y Tada, K. (1980) Int. J. Cancer 26,
171-176).
Se sabe que tanto la lipoproteína lipasa y la
lipasa hepática funcionan en conjunto con las proteínas del
co-activador: la apolipoproteína CII para la
lipoproteína lipasa y la colipasa para la lipasa pancreática.
\newpage
Se han informado las secuencias genéticas que
codifican la lipasa pancreática humana, la lipasa hepática y la
lipoproteína lipasa (Acceso Genbank #M93285, #J03540, y #M15856
respectivamente). Los ARN mensajeros de la lipasa hepática humana y
de la lipasa pancreática son de aproximadamente 1,7 y 1,8 kilobases
de longitud respectivamente. Dos ARNm transcripciones de 3,6 y 3,2
kilobases se producen a partir del gen de la lipoproteína lipasa
humana. Estas dos transcripciones utilizan señales de
poliadenilación alternativas y difieren en su eficiencia para la
traducción (Ranganathan, G., Ong, J.M., Yukht, A.. Saghizadeh, M.,
Simsolo, R.B., Pauer, A., y Kern, P.A. (1995) J. Biol. Chem. 270,
7149-7155).
El metabolismo de los lípidos involucra la
interacción de los lípidos, las apoproteínas, las lipoproteínas y
las enzimas.
La lipasa hepática y la lipoproteína hepática son
proteínas multifuncionales que median la unión, la recaptación, el
catabolismo y la remodelación de las lipoproteínas y los
fosfolípidos. La lipoproteína lipasa y la lipasa hepática funcionan
mientras se unen a la superficie luminal de las células endoteliales
en los tejidos periféricos y el hígado respectivamente. Ambas
enzimas participan en el transporte inverso del colesterol, el cual
constituye el movimiento del colesterol desde los tejidos
periféricos hasta el hígado ya sea para la excreción desde el cuerpo
o para el reciclado. Se sabe que los defectos genéticos tanto en la
lipasa hepática como en la lipoproteína lipasa constituyen la causa
de los trastornos familiares del metabolismo de la lipoproteína. Los
defectos del metabolismo de las lipoproteínas dan como resultado
trastornos metabólicos severos, que incluyen la hipercolesterolemia,
la hiperlipidemia y la aterosclerosis.
La aterosclerosis es una enfermedad poligénica
compleja que se define en términos histológicos por depósitos
(placas de lípidos o fibrolípidos) de lípidos y de otros derivados
de la sangre en las paredes de los vasos sanguíneos, especialmente
las grandes arterias (aorta, arterias coronarias, carótida). Estas
placas, que están más o menos calcificadas de acuerdo con el grado
de progresión del proceso aterosclerótico, se pueden acoplar con
lesiones y se asocian con la acumulación en los vasos de los
depósitos de grasa que consisten esencialmente en ésteres de
colesterol. Estas placas son acompañadas por el engrosamiento de la
pared vascular, la hipertrofia de los músculos lisos, el aspecto de
las células espumosas (células cargadas con lípidos que son
generadas por la recaptación descontrolada del colesterol por medio
de los macrófagos reclutados) y la acumulación del tejido fibroso.
La placa ateromatosa sobresale de manera acentuada de la pared,
dotándola con una tendencia a provocar estenosis responsable de las
oclusiones vasculares por el ateroma, la trombolia o la embolia, las
cuales se producen en aquellos pacientes que resultan más afectados.
Estas lesiones pueden conducir a patologías cardiovasculares severas
tales como el infarto, la muerte súbita, la insuficiencia cardiaca y
el accidente cerebrovascular.
El papel que desempeñan las triacilglicerol
lipasas en las patologías vasculares tales como la aterosclerosis ha
sido un área de estudio intenso (revisada en Olivecrona, G., y
Olivecrona, T. (1995) Curr. Opin. Lipid. 6,291-305).
Por lo general, se cree que la acción de las triacilglicerol lipasas
es antiaterogénica porque estas enzimas reducen los niveles de
triacilglicerol en suero y promueven la formación de HDL. Los
animales transgénicos que expresan la lipoproteína lipasa humana o
la lipasa hepática tienen niveles reducidos de triglicéridos en
plasma y un mayor nivel de lipoproteínas de alta densidad (HDL)
(Shimada, M., Shimano, H. Gotoda, T., Yamamoto, K., Kawamura, M.,
Inaba, T., Yazaki, t., y Yamada, N. (1993) J. Biol. Chem. 268,
17924-17929; Liu, M.-S., Jirik, F. R., LeBoeuf. R.
C., Henderson, H., Castellani, L.W.. Lusis, A. J., ma, Y., Forsythe,
I.J., Zhang, H., Kirk, E., Brunzell, J.D., y Hayden, M.R. (1994) J.
Biol. Chem. 269, 11417-11424). Se halló que los
humanos con defectos genéticos que tienen como resultado niveles
reducidos de la actividad de la lipoproteína lipasa presentan
hipertrigliceridemia pero no un aumento en el riesgo de contraer la
enfermedad cardiaca coronaria. Se informa que esto se debe a la
falta de producción de lipoproteínas aterogénicas de tamaño
intermedio que se podrían acumular dentro del espacio subendotelial
(Zilversmit. D.B. (1973) Circ. Res. 33,
633-638).
Sin embargo, se plantea la hipótesis según la
cual en el área localizada de una lesión aterosclerótica, el nivel
más alto de la actividad de la lipasa acelera el proceso aterogénico
(Zilversmit, D.B. (1995) Clin. Chem. 41, 153-158;
Zambon, A., Torres, A., Bijvoet, S., Gagne, C., Moojani. S.,
Lupien, P.J., Hayden M.R., y Brunzell. J.D. (1993) Lancet 34,
1119-1121). Esto se puede deber a un aumento en la
unión y la recaptación de las lipoproteínas por el tejido vascular
mediada por las lipasas (Eisenberg,S., Sehayek, E., Olivecrona, T.
Vlodavsky, I. (1992) J. Clin. Invest. 90,2013-2021;
Tabas, I., Li, I., Brocia R.W., Xu, S.W., Swenson T.L., Williams.
KJ. (1993) J. Biol. Chem. 268, 20419-20432;
Nordestgaard, B.G., y Nielsen, A.G. (1994) Curr. Opin. Lipid.
5,252-257; Williams, KJ., y Tabas, I. (1995) Art.
Thromb. and Vasc. Biol. 15, 551-561). De manera
adicional, un nivel local alto de la actividad de la lipasa puede
dar como resultado niveles citotóxicos de los ácidos grasos y la
lisofosfatifilcolina que se produce en los precursores de las
lesiones ateroscleróticas.
Aún cuando se comprende aquello que ha
evolucionado con respecto al papel de la actividad de la lipasa en
la homeostasis, existe la necesidad de identificar dentro de la
especialidad los genes adicionales que codifican las proteínas que
regulan el metabolismo de los lípidos.
La presente invención se refiere al
descubrimiento de un gen similar a la lipasa (LLG), sus productos
expresados en el polipéptido y las composiciones y los métodos para
su uso. El polipéptido del LLG se une a la heparina, tiene homología
con la lipoproteína lipasa humana y con la lipasa hepática y
comprende un dominio catalítico de 39 kD de la familia de la
triacilglicerol lipasa. En una realización adicional, el polipéptido
tiene la actividad de la fosfolipasa A.
Esta invención suministra un polipéptido aislado
que comprende la secuencia SEQ ID NO: 10.
Esta invención además suministra un polipéptido
aislado que comprende la secuencia SEQ ID NO: 8 y que tiene un peso
molecular aparente de alrededor de 55 kD o 68 kD sobre un gel 10%
50S-PAGE.
Esta invención también suministra un polipéptido
aislado que comprende la secuencia SEQ ID NO: 6 y que tiene un peso
molecular aparente de alrededor de 40 kD sobre un gel de 10%
50S-PAGE.
La invención suministra además un fragmento
antigénico del polipéptido de LLG.
Otro aspecto de esta invención es un ácido
nucleico aislado que codifica un polipéptido que tiene la secuencia
que se mencionó con anterioridad.
Otro aspecto de la invención es un vector que
comprende el ácido nucleico que se mencionó con anterioridad que
codifica a dicho polipéptido que está enlazado en forma operativa
con una región regulatoria como por ejemplo un promotor.
Otro aspecto de esta invención es una célula
recombinante que comprende el vector que se ha descripto con
anterioridad.
Otro aspecto de esta invención es un método de
preparación de un polipéptido que comprende el cultivo de las
células recombinantes que contienen al polipéptido mencionado que
codifica al ácido nucleico bajo condiciones que permiten la
expresión del polipéptido mencionado.
Otro aspecto de esta invención es un anticuerpo
que es capaz de unirse de manera específica a y/o neutralizar la
actividad biológica de los polipéptidos de acuerdo con la invención.
En realidad, una característica adicional de un polipéptido de la
invención es que el mismo se une de manera específica a un
anticuerpo de la invención, es decir, un anticuerpo específico para
un polipéptido de LLG.
Otro aspecto de la presente invención es una
composición que comprende un polipéptido, un ácido nucleico, un
vector, un ácido nucleico antisentido, o un anticuerpo de acuerdo
con la presente invención y un portador aceptable desde el punto de
vista farmacéutico.
Otro aspecto de esta invención es un método para
seleccionar los agonistas o los antagonistas de la actividad
enzimática exhibida por los polipéptidos de la presente invención
que comprenden el hecho de poner en contacto a los agonistas
potenciales o los antagonistas con los mencionados polipéptidos y un
substrato de los mismos y la medición de la capacidad de los
agonistas o los antagonistas potenciales para realzar o inhibir la
actividad.
Otro aspecto de la presente invención es un
método para la hidrólisis enzimática de un éster de fosfatidilcolina
que comprende el hecho de poner en contacto al éster de
fosfatidilcolina que se ha mencionado con un polipéptido de acuerdo
con la presente invención.
Otros aspectos y ventajas de la presente
invención se describen más adelante en los dibujos y en la
descripción detallada de las realizaciones preferidas de los mismos
que figura a continuación.
La Figura 1 muestra las secuencias (SEQ ID Nos:
17-31) de los cebadores utilizados en las
amplificaciones de PCR que se ofrecen a modo de ejemplo.
La Figura 2 muestra la secuencia de ácido
nucleico (SEQ ID NO: I) y la secuencia de aminoácido deducida (SEQ
ID NO: 2) del producto RT-PCR de la representación
diferencial que contiene el ADNc del gen similar a la lipasa. Las
secuencias correspondientes a los dos cebadores utilizados en la
amplificación están subrayadas. El codón de terminación y la señal
de poliadenilación están recuadrados. Los motivos GAATTC y la
secuencia flanqueante son del vector de pCRII dentro del cual fue
clonado el producto.
La Figura 3 muestra la secuencia de ácido
nucleico (SEQ ID NO: 3) y la secuencia de aminoácido deducida (SEQ
ID NO: 4) de la extensión de 5'RACE del LLG eDNA. Las secuencias
correspondientes a los dos cebadores utilizados en la amplificación
están subrayadas. Los motivos GAATTC y la secuencia flanqueante
proveniente del vector pCRII en él dentro del cual fue clonado el
producto.
La Figura 4 muestra la secuencia (SEQ ID NO: 7)
del ADNc que contiene el marco completo de lectura abierta del gen
similar a la lipasa, LLGXL. El codón de inicio (ATG) y el codón de
terminación (TGA) están recuadradas. El sitio DraI (TTTAAA) y Srfl
(GCCCGGGC) utilizados en la construcción de los vectores de
expresión están subrayados.
La Figura 5 muestra la secuencia de aminoácido
deducida (SEQ ID NO: 8) de la proteína LLGXL. La secuencia de la
señal predecida está subrayada.
La Figura 6 muestra una alineación de la
secuencia de la proteína de los miembros de la familia genética de
la triacilglicerol lipasa (SBQ ID Nos: 13-IS). Los
residuos sombreados son idénticos a la proteína LLGXL (SEQ ID NO:
8). Se introdujeron espacios en las secuencias para maximizar los
valores de alineación utilizando el programa CLUSTAL.
La Figura 7 muestra un análisis Northern de LLG
ARNm en las células THP-1. Las células fueron
estimuladas ya sea con PMA o bien con PMA LDL oxidado (PMA + oxLDL).
Los números que aparecen a la izquierda indican las posiciones de
los standards ARN (en kilobases).
La Figura 8 muestra un análisis Northern de los
ARNm de los múltiples tejidos humanos investigados con LLG,
lipoproteína lipasa (LPL) y los ADNc de la actina beta humana. La
posición estándar de un ARN 4,4 kilobase R se indica a la izquierda
de los paneles de LLG y LPL.
La Figura 9 muestra el análisis Northern de la
expresión LLG y LPL en la célula del cultivada del endotelio humano
y la célula THP-I. Las células fueron ya sea no
estimulada (no expuestas a PMA) o bien estimuladas con PMA.
La Figura 10 muestra la secuencia del péptido
inmunizante (SEQ ID NO: 16) y su relación con la secuencia de la
proteína LLGXL. El péptido se muestra en el recuadro sombreado. La
cisteína terminal fue introducida para contribuir al acople del
péptido con la proteína del portador.
La Figura 11 muestra un análisis Western de las
proteínas concentradas heparina-Sefarosa de los
medios condicionados de las células endoteliales cultivadas. Se
investigó la mancha con antisuero anti-LLG. Los
números que figuran a la izquierda indican las posiciones de los
estándares de las proteínas en kilodaltons.
La Figura 12 muestra un análisis Western de las
proteínas unidas heparina-Sefarosa en el medio
acondicionado de las células COS-7 transfectadas de
manera transitoria con un vector de expresión que contiene un ADNc
para LLGN o LLGXL o ningún ADN (Mock). Las proteínas provenientes de
las células endoteliales estimuladas por PMA (HCAEC + PMA) se
incluyeron para tener una referencia del tamaño. Los números que
figuran a la izquierda indican el peso molecular aparente de las
proteínas inmunorreactivas principales según lo que se determinó por
medio de la comparación con los estándares de proteínas.
La Figura 13 muestra la secuencia del producto
LLG PCR del conejo (RLLG.SEQ, SEQ ID NO: 11) y la alineación de la
secuencia entre el producto LLG PCR del conejo y la secuencia
correspondiente en el ADNc humano (LLG7742A). Los nucleótidos
idénticos están sombreados.
La Figura 14 muestra la actividad de la
fosfolipasa A de LPL, LLGN, y LLGXL humanas, utilizando un
substrato de fosfatidilcolina.
La Figura 15 muestra la actividad de la
triacilglicérido lipasa de LPL, LLGN, y LLGXL humanas, utilizando un
substrato de trioleína.
La Figura 16 muestra la hibridización de las
investigaciones de LLG y LPL para los ADN genómicos de diferentes
especies.
La presente invención se refiere al
descubrimiento de un gen similar a la lipasa (LLG) y sus productos
expresados en el polipéptido. Los productos polipeptídicos, miembros
de la familia de la triacilglicerol lipasa, comprenden un dominio
catalítico de aproximadamente 39,kD de la familia de la
triacilglicerol lipasa, por ejemplo, que tienen la secuencia SEQ ID
NO: 10. Una realización de la presente invención es el polipéptido
LLGN, el cual tiene 354 aminoácidos: Una segunda realización de la
presente invención es el polipéptido LLGXL, el cual tiene 500
aminoácidos y exhibe una similitud del 43% con la lipoproteína
lipasa humana y una similitud del 37% con la lipasa hepática
humana. El polipéptido LLGXL tiene la actividad de la fosfolipasa
A.
Los inventores aislaron un ADNc parcial del ARNm
de las células THP-I que han sido expuestas al éster
de forbol y a los LDL oxidados. Siguiendo una extensión de 5'RACE de
este ADNc parcial, se aisló el ADNc más pequeño con empalmes
alternativos. Un segundo ADNc, más grande, se aisló a partir de una
librería del ADNc de la placenta humana.
Los análisis Northern han demostrado que el gen
LLG está expresado en las células endoteliales. Los antisueros que
surgen para un péptido predecido a partir del marco de lectura
abierto de las proteínas detectadas del ADNc de los tamaños
predecidos para LLGN y LLGXL en un medio acondicionado proveniente
de las células endoteliales cultivadas. El tratamiento de las
células endoteliales con los ésteres de forbol dieron como resultado
un aumento en la producción de LLG tanto en el nivel del ARNm como
en el nivel de la proteína. Este es el primer miembro de la familia
de la triacilglicerol lipasa que se descubrió que es expresado por
las células endoteliales.
Los siguientes términos definidos se utilizan a
lo largo de toda la presente memoria descriptiva y deben ser útiles
para la comprensión del alcance y la práctica de la presente
invención.
Un "polipéptido" es un compuesto
polimérico que comprende residuos de aminoácidos unidos por enlace
covalente. Los aminoácidos tienen la estructura general
siguiente:
R ---
\melm{\delm{\para}{NH _{2} }}{C}{\uelm{\para}{H}}--- COOH
Los aminoácidos se clasifican en siete grupos
sobre la base de la cadena lateral R: (1) cadenas alifáticas
laterales (2) cadenas laterales que contienen un grupo hidroxílico
(OR) (3) cadenas laterales que contienen átomos de azufre (4)
cadenas laterales que contienen un grupo acídico o amida (5) cadenas
laterales que contienen un grupo básico (6) cadenas laterales que
contienen un anillo aromático y (7) prolina, un aminoácido en el
cual la cadena lateral se fusiona con el grupo amino.
Una "proteína" es un polipéptido que
desempeña un papel o una función estructural en una célula viva.
Los polipéptidos y las proteínas de la invención
pueden ser glicosilados o no glisosilados.
"Homología" significa una similitud
de la secuencia que refleje un origen de evolución común.
Se dice que los polipéptidos o las proteínas
tienen homología o similitud, si una cantidad substancial de sus
aminoácidos son ya sea (I) idénticos, o bien (2) tiene una cadena
lateral R químicamente similar. Se dice que los ácidos nucleicos
tienen homología si una cantidad sustancial de sus nucleótidos es
idéntica.
"Péptido aislado" o "Proteína
aislada" es un polipéptido o una proteína que está
substancialmente libre de aquellos compuestos que normalmente están
asociados con el mismo en su estado natural (por ejemplo, otras
proteínas o polipéptidos, ácidos nucleicos, carbohidratos, lípidos).
"Aislado" no significa excluir las mezclas sintéticas o
artificiales con otros compuestos o la presencia de impurezas que no
interfieren con la actividad biológica y que pueden estar presentes,
por ejemplo, debido a la purificación incompleta, la adición de
estabilizadores o la formación de un compuesto en una preparación
aceptable desde el punto de vista farmacéutico.
Una molécula es "antigénica" cuando
es capaz de interactuar de manera específica con un antígeno,
molécula de reconocimiento del sistema inmune tal como una
inmunoglobulina (anticuerpo) o receptor del antígeno de la célula T.
Un polipéptido antigénico contiene por lo menos alrededor de 5 y con
preferencia por lo menos alrededor de 10 aminoácidos. Una porción
antigénica de una molécula puede ser aquella porción que es
inmunodominante para el anticuerpo o el reconocimiento del receptor
de la célula T o puede ser una porción utilizada para generar un
anticuerpo para la molécula por medio de la conjugación de la
porción antigénica con una molécula portadora para la inmunización.
Una molécula que es antigénica no necesita ser inmunogénica ella
misma, es decir, capaz de elicitar una respuesta inmune sin un
portador.
"Polipéptido LLGN" y "proteína
LLGN" significan un polipéptido que incluye la secuencia SEQ
ID NO: 6, siendo dicho polipéptido glicosilado o no glicosilado.
"Polipéptido LLGXL" y "proteína
LLGXL" significan un polipéptido que incluya la secuencia SEQ
ID NO: 8, siendo dicho polipéptido glicosilado o no glicosilado.
"Polipéptido LLG" describe en forma
genérica tanto al polipéptido LLGN como al polipéptido LLGXL.
El polipéptido LLG o la proteína de la presente
invención incluyen cualquier derivado del fragmento análogo o
mutante que deriva de un polipéptido LLG y que conserva por lo menos
una propiedad biológica del polipéptido LLG. En la naturaleza
existen diferentes variantes del polipéptido LLG. Estas variantes
pueden ser variaciones alélicas caracterizadas por las diferencias
existentes en las secuencias del nucleótido del gen estructural que
codifica la proteína o bien pueden implicar un empalme diferencial o
una modificación posterior a la traducción. La persona idónea en la
especialidad puede producir variantes que tengan sustituciones de
aminoácidos únicas o variables, supresiones, agregados o reemplazos.
Estas variantes pueden incluir: entre otras: (a) variantes en las
cuales uno o más residuos de aminoácidos son sustituidos por
aminoácidos conservadores o no conservadores, (b) variantes en las
cuales uno o más aminoácidos se agregan al polipéptido LLG, (c)
variantes en las cuales uno o más aminoácidos incluyen un grupo
sustituyente y (d) variantes en las cuales el polipéptido LLG se
fusiona con otro polipéptido tal como la albúmina sérica. Otros
polipéptidos LLG de la invención incluyen las variantes en las
cuales los residuos de aminoácidos de una de las especies son
sustituidos por el residuo correspondiente en otras especies, ya sea
en las posiciones conservadas o bien en las posiciones no
conservadas. En otra realización, los residuos de aminoácidos de las
posiciones no conservadas son sustituidos con residuos conservadores
o no conservadores. Las técnicas adecuadas para obtener estas
variantes, que incluyen las técnicas genéticas (supresiones,
eliminaciones, mutaciones, etc.), químicas, y enzimáticas, son
conocidas por las personas idóneas en la especialidad.
En caso de que las variaciones alélicas, los
análogos, los fragmentos, los derivados, los mutantes y las
modificaciones, que incluyen las formas de ARNm con empalmes y las
formas alternativas de modificación posteriores a la traducción den
como resultado derivados del polipéptido LLG que conservan
cualquiera de las propiedades biológicas del polipéptido LLG, las
mismas se incluyen dentro del alcance de la presente invención.
Un "ácido nucleico" es un compuesto
que comprende las subunidades unidas mediante enlace covalente
denominadas nucleótidos. El ácido nucleico incluye el ácido
polirribonucleico (ARN) y el ácido polideoxirribonucleico (ADN),
ambos de los cuales pueden ser de hebra única o de doble hebra. El
ADN incluye el ADNc, el ADN genómico, el ADN sintético y el ADN
semi-sintético. La secuencia de nucleótidos que
codifica una proteína se denomina secuencia sentido.
Un "ácido nucleico antisentido" es
una secuencia de nucleótidos que es complementaria de la secuencia
sentido. Los ácidos nucleicos antisentido se pueden utilizar para
regular por disminución o para bloquear la expresión del
polipéptido codificado por la hebra sentido.
"Ácido nucleico aislado" significa un
ácido nucleico que está substancialmente libre de aquellos
compuestos que normalmente están asociados con el mismo en su estado
natural. "Aislado" no significa excluir las mezclas
artificiales o sintéticas con otros compuestos o la presencia de
impurezas que no interfieren con la actividad biológica y que pueden
estar presentes por ejemplo, debido a la purificación incompleta, el
agregado de estabilizantes o la composición en una preparación
farmacéuticamente aceptable.
La frase "un ácido nucleico que se hibridiza
con mucho rigor" significa que los ácidos nucleicos
hibridizados son capaces de resistir un lavado bajo condiciones muy
rigurosas. Un ejemplo de condiciones de lavado muy rigurosas para
los híbridos ADN-ADN es 0.1X SSC, 0.5% SDS a 68ºC.
Otras condiciones muy rigurosas para el lavado son conocidas para
las personas idóneas en la especialidad.
"Región regulatoria" significa una
secuencia de ácido nucleico que regula la expresión de un ácido
nucleico. Una región regulatoria puede incluir las secuencias que
naturalmente son responsables de expresar un ácido nucleico
particular (una región homóloga) o puede incluir secuencias de
origen diferente (responsables de expresar proteínas diferentes o
inclusive proteínas sintéticas). En particular, las secuencias
pueden ser secuencias de genes eucarióticos o virales o secuencias
derivadas que estimulan o reprimen la transcripción de un gen de una
manera específica o no específica y de una manera inducible o no
inducible. Las regiones regulatorias incluyen los orígenes de la
replicación, los sitios de empalme del ARN, los realzadores, las
secuencias de transcripción de terminación, las secuencias de la
señal que dirigen al polipéptido dentro de las vías de secreción de
la célula blanco y los promotores.
Una región regulatoria de una "fuente
heteróloga" es una región regulatoria que naturalmente no
está asociada con el ácido nucleico expresado. Están incluidas entre
las regiones heterólogas de regulación las regiones provenientes de
una especie distinta, las regiones regulatorias de un gen diferente,
las secuencias regulatorias híbridas y las secuencias regulatorias
que no se producen en la naturaleza, pero que son diseñadas por las
personas idóneas en la especialidad.
Un "vector" es cualquier medio para
la transferencia de un ácido nucleico de acuerdo con la invención en
una célula huésped. El término "vector" incluye tanto a los
medios virales como no virales para introducir el ácido nucleico en
una célula procariótica o eucariótica in vitro, ex vivo o
in vivo. Los vectores no virales incluyen los plásmidos, los
liposomas, los lípidos cargados eléctricamente (citofectinas), los
complejos de proteína - ADN y los biopolímeros. Los vectores virales
incluyen los retrovirus, los virus adeno-asociados,
viruela, baculovirus, vaccinia, herpes simplex,
Epstein-Barr y los vectores del adenovirus. Además
del "ácido nucleico" de acuerdo con la presente invención, un
vector también puede contener una o más regiones regulatorias y/o
marcadores que se pueden seleccionar, marcadores útiles para
seleccionar, medir y monitorear los resultados de la transferencia
de ácido nucleico (a qué tejidos se transfiere, la duración de la
expresión, etc.).
Una "célula recombinante" es una
célula que contiene un ácido nucleico que naturalmente no está
presente en la célula. La "célula recombinante" incluye
las células eucarióticas superiores tales como las células de
mamíferos, las células eucarióticas inferiores tales como las
células de los fermentos, las células procarióticas y las células
arqueobacterianas.
El "portador aceptable desde el punto de
vista farmacéutico" incluye los diluyentes y los rellenos que
son aceptables desde el punto de vista farmacéutico para el método
de administración, son estériles y pueden ser suspensiones acuosas u
oleaginosas formuladas mediante la utilización de agentes adecuados
de dispersión o humectación y de agentes de suspensión. El portador
particular aceptable desde el punto de vista farmacéutico y la
proporción del compuesto activo con el portador son determinadas por
la solubilidad y las propiedades químicas de la composición, el modo
particular de administración y la práctica farmacéutica
estándar.
Una "lipasa" es una proteína que
puede dividir enzimáticamente un substrato lipídico.
Una "fosfolipasa" es una proteína que
puede dividir enzimáticamente un substrato fosfolipídico.
Una "triacilglicerol lipasa" es una
proteína que puede dividir enzimáticamente un substrato de
triacilglicérido.
"Fosfatidilcolina" es un fosfolípido
del glicerol que tiene la estructura siguiente:
R y R' son las cadenas laterales de hidrocarburo
de los ácidos grasos. La fosfatidilcolina también es conocida como
lecitina.
"Perfil de lípidos" significa el
conjunto de las concentraciones del colesterol, los triglicéridos,
colesterol lipoproteico y otros lípidos en el cuerpo de un humano u
otro animal.
Un "perfil indeseable de lípidos" es
la condición en la cual las concentraciones de colesterol,
triglicéridos o colesterol lipoproteico están fuera de los rangos de
referencia ajustados por la edad y el sexo. Por lo general, una
concentración de colesterol total > 200 mg/dl, de triglicéridos
en plasma > 200 mg/dl, de colesterol LDL > 130 mg/dl, de
colesterol HDL < 39 mg/dl, o una proporción de colesterol total
con colesterol HDL > 4.0 se considera que es un perfil de lípidos
indeseable. Un perfil de lípidos indeseable se asocia con una
variedad de condiciones patológicas, que incluyen las
hiperlipidemias, la diabetes, la hipercolesterolemia, la
aterosclerosis y otras formas de enfermedad de la arteria
coronaria.
La presente invención provee polipéptidos que son
miembros de la familia de triacilglicerol lipasa y que comprenden un
dominio catalítico de 39 kD de la familia de triacilglicerol lipasa,
por ejemplo, que tienen la secuencia SEQ ID NO: 10. Una realización
de la presente invención es un polipéptido LLG aislado que comprende
la secuencia SEQ ID NO: 6 y que tiene un peso molecular aparente de
alrededor de 40 kD sobre un gel 10% SDS.PAGE. Otra realización de la
presente invención es un polipéptido LLO aislado que comprende la
secuencia SEQ ID NO: 8 y tiene un peso molecular de alrededor de 5S
kD o 68 kD en un gel 10% SDS-PAGE.
Los polipéptidos y las proteínas de la presente
invención pueden ser polipéptidos recombinantes, polipéptidos
naturales o polipéptidos sintéticos y pueden ser de origen humano,
de conejos o de otros animales. Los polipéptidos se caracterizan por
un peso molecular único que se puede reproducir y/o un conjunto
múltiple de pesos moleculares, la respuesta cromatográfica y los
perfiles de elución, la composición y la secuencia de aminoácidos y
la actividad biológica.
Los polipéptidos de la presente invención pueden
ser aislados de las fuentes naturales tales como los extractos de
placenta, el plasma humano o los medios acondicionados de células
cultivadas tales como los macrófagos o las células endoteliales,
utilizando los procedimientos de purificación conocidos para las
personas idóneas en la especialidad.
De manera alternativa, los polipéptidos de la
presente invención se pueden preparar utilizando la tecnología del
ADN recombinante, la cual comprende el hecho de combinar un ácido
nucleico que codifique al polipéptido del mismo en un vector
adecuado, insertar el vector resultante en una célula huésped
adecuada, recuperar el polipéptido producido por la célula huésped
resultante y purificar el polipéptido recuperado.
La presente invención suministra ácidos nucleicos
aislados que codifican los polipéptidos LLG.
La presente invención también suministra ácidos
nucleicos que se pueden utilizar para regular por disminución o
bloquear la expresión de los polipéptidos LLG in vitro, ex
vivo o in vivo.
Las técnicas de la tecnología del ADN
recombinante son conocidas por las personas idóneas en la
especialidad. Los métodos generales para la clonación y la
expresión de las moléculas recombinantes se describen en Maniatis
(Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratories, 1982), y
en Ausubel (Current Protocols in Molecular Biology: Wiley and
Sons, 1987), que se incorporan a título de referencia.
Los ácidos nucleicos de la presente invención se
pueden unir con una o más regiones regulatorias. La selección de la
o las regiones regulatorias adecuadas es una cuestión de rutina,
dentro del nivel de idoneidad común dentro de la especialidad. Las
regiones regulatorias incluyen los promotores y pueden incluir los
realzadores, los supresores, etc.
Los promotores que se pueden utilizar en la
presente invención incluyen tanto los promotores constitutivos como
los promotores regulados (inducibles). Los promotores pueden ser
procarióticos o eucarióticos dependiendo del huésped. Entre los
promotores procarióticos (que incluyen los bacteriófagos) útiles
para la práctica de esta invención están los promotores lacI, lacZ.
T7, lambda P, P, y trp. Entre los promotores eucarióticos (que
incluyen a los virales) los promotores útiles para la práctica de
esta invención son los promotores ubicuos (por ejemplo, HPRT;
vimentina, actina, tubulina), los promotores de filamentos
intermedios (por ejemplo, desmina, neurofilamentos, queratina.
GFAP), los promotores terapéuticos genéticos (por ejemplo, el tipo
MDR, CFTR, el factor VIII), los promotores tisulares específicos
(por ejemplo, el promotor de actina en las células del músculo liso,
o los promotores Flt y Flk activos en las células endoteliales), los
promotores que preferentemente se activan en las células divisoras,
los promotores que responden a un estímulo (por ejemplo, el receptor
de la hormona esteroide, el receptor del ácido retinoico), los
moduladores de la transcripción regulados por la tetraciclina, el
citomegalovirus inmediato-temprano, el LTR
retroviral, la metalotioneína, el SV-40, los
promotores Ela y MLP. Los moduladores de transcripción regulados por
la tetraciclina y los promotores de CMV se describen en WO 96/01313.
US 5.168.062 y 5.385.839, cuyos contenidos se incorporan a la
presente a título de referencia.
Preferentemente, los vectores virales utilizados
en la terapia genética son de replicación defectiva, es decir, son
incapaces de replicarse de manera autónoma en la célula blanco. En
general, el genoma de los vectores virales de replicación defectiva
que se utilizan dentro del alcance de la presente invención carecen
por lo menos de una región que es necesaria para la replicación del
virus en la célula infectada. Estas regiones pueden ser eliminadas
(ya sea en su totalidad o bien en parte), volverse no funcionales
por medio de cualquier técnica conocida para las personas idóneas en
la especialidad. Estas técnicas incluyen la eliminación total, la
substitución (por otra, las secuencias, en particular por el ácido
nucleico que se insertó), la eliminación o el agregado parcial de
una o más bases a una región esencial (para la replicación). Tales
técnicas se pueden realizar in vitro (en el ADN aislado) o
in situ, utilizando las técnicas de genética, manipulación o
por medio del tratamiento con agentes mutagénicos.
Preferentemente, el virus de replicación
defectiva retiene las secuencias de su genoma, que son necesarias
para encapsidar las partículas virales.
Los retrovirus son virus integradores que
infectan las células divisoras. El genoma del retrovirus incluye dos
LTR, una secuencia de encapsidación y tres regiones codificadoras
(gag, pol y env). Se ha descripto la construcción de los vectores
retrovirales recombinantes: ver, en particular, EP 453242, EPI78220,
Bernstein et al. Genet. Eng.7 (1985) 235; McCormick,
BioTechnology 3 (1985) 689, etc. En los vectores retrovirales
recombinantes, los genes gag, pol y env por lo general son
eliminados, en su totalidad o en parte, y son reemplazados con una
secuencia de ácido nucleico heterólogo de interés. Estos vectores se
pueden construir a partir de los diferentes tipos de retrovirus,
tales como, MoMuL V ("murine Moloney leukaemia virus" MSV
("murine Moloney sarcoma virus"), HaSV ("Harvey sarcoma
virus"); SNV ("spleen necrosis virus"); RSV ("Rous sarcoma
virus") y Friend virus.
En general, a fin de construir los retrovirus
recombinantes que contienen una secuencia que codifica LLG de
acuerdo con la invención, se construyó un plásmido que contiene los
LTR, la secuencia de encapsidación y la secuencia de codificación.
Esta construcción se utiliza para transfectar una línea celular de
empaque, cuya línea celular está en condiciones para suministrar en
trans las funciones retrovirales que son deficientes en el plásmido.
Por lo general, las líneas celulares de empaque están por
consiguiente en condiciones de expresar los genes gag pol y env. Las
líneas celulares de empaque han sido descriptas en la especialidad
con anterioridad, en particular la línea celular PA317
(US4,86I,719); la línea celular PsiCRIP (W090/02806) y la línea
celular GP+envAm-12 (W089/07150). Además, los
vectores retrovirales recombinantes pueden contener modificaciones
dentro de los LTR para suprimir la actividad de transcripción al
igual que las secuencias de encapsidación extensiva que pueden
incluir una parte del gen gag (Bender et al., 1. Virol. 61
(1987) 1639). Los vectores retrovirales recombinantes son
purificados por medio de técnicas estándar conocidas por las
personas idóneas en la especialidad.
Los virus adeno-asociados (AA V)
son los virus del ADN de un tamaño relativamente pequeño que se
pueden integrar de una manera estable y específica para el sitio, en
el genoma de las células que infectan. Los mismos están en
condiciones de infectar un amplio espectro de células sin inducir
ningún efecto sobre el crecimiento celular, la morfología o la
diferenciación y no parecen estar involucrados en patologías
humanas.
El genoma AAV ha sido clonado, secuenciado y
caracterizado. Abarca aproximadamente 4700 bases y contiene una
región de repetición terminal invertida (ITR) de aproximadamente 145
bases en cada extremo, el cual sirve como un origen de replicación
para el virus. El resto del genoma se divide en dos regiones
esenciales que llevan a cabo las funciones de encapsidación: la
parte izquierda del genoma, que contiene el gen rep involucrado en
la replicación viral y en la expresión de los genes virales; y la
parte derecha del genoma, que contiene el gen cap que codifica las
proteínas capsídicas del virus.
Se ha descripto el uso de los vectores derivados
de AAVs para transferir los genes in vitro e in vivo
(ver WO 91/18088; WO 93/09239; US 4,797,368. US 5,139,941, EP
488528). Estas publicaciones describen varios constructos derivados
de AAV en los cuales los genes rep y/o cap son eliminados y
reemplazados por un gen de interés y el uso de estos constructos
para transferir al gen de interés mencionado in vitro (en
las células cultivadas) o in vivo, (directamente dentro de un
organismo). La replicación defectiva recombinante AAVs de acuerdo
con la invención se puede preparar al cotransfectar un plásmido que
contenga la secuencia de ácido nucleico de interés rodeada por dos
regiones de repetición terminal invertidas AA V (ITR) y un plásmido
que porta los genes de encapsidación AA V (genes rep y cap), en una
línea celular que es infectada con un virus helper humano (por
ejemplo un adenovirus). Los AA V recombinantes que se producen luego
son purificados por medio de las técnicas estándar. La invención
también se refiere, por lo tanto, a un virus recombinante derivado
de AA V cuyo genoma comprende una secuencia que codifica un
polipéptido LLG rodeado por AA V ITRs. La invención también se
refiere a un plásmido que comprende una secuencia que codifica un
polipéptido LLG rodeado pro dos ITRs provenientes de un AA V. Un
plásmido de esa naturaleza se puede utilizar como tal para
transferir la secuencia de LLG, con el plásmido, cuando corresponda,
incorporado en un vector de liposoma (pseudo-virus).
En una realización preferida, el vector es un vector de
adenovirus.
Los adenovirus son virus de ADN eucariótico que
se pueden modificar para liberar de manera eficiente un ácido
nucleico de la invención hasta una variedad de tipos de células.
Existen varios serotipos de adenovirus. De estos
serotipos, se otorga preferencia, dentro del alcance de la presente
invención; a utilizar los adenovirus de tipo 2 o de tipo 5 humano
(Ad 2 o Ad 5) o a los adenovirus de origen animal (ver W094126914).
Estos adenovirus de origen animal que se pueden utilizar dentro del
alcance de la presente invención incluyen los adenovirus de canino,
bovino, murino (ejemplo: Mavl, Beard et al., Virology 75
(1990) 81), ovino, porcino, de ave y de simio (ejemplo: SAV) origen.
Preferentemente, el adenovirus de origen animal es un adenovirus
canino, con mayor preferencia un CAV2 adenovirus (por ejemplo
Manhattan o variedad A26/61 (A TCC VR-800), por
ejemplo).
Preferentemente, los vectores de adenovirus de
replicación defectiva de la invención comprenden los ITR, una
secuencia de encapsidación y el ácido nucleico de interés. De manera
aún más preferida, por lo menos la región E1 del vector del
adenovirus es no funcional. La eliminación en la región E1 se
extiende con preferencia desde los nucleótidos 455 hasta 3329 en la
secuencia de los adenovirus Ad5. De igual modo se pueden modificar
otras regiones, en particular la región E3 (W095/02697), la región
E2 (W094/28938), la región E4 (W094/28152, W094/12649 y W095/02697),
o en cualquiera de los últimos genes L1-L5. Los
vectores retrovirales defectivos se revelan en W095/02697.
En una realización preferida, el vector
adenoviral tiene una supresión en las regiones E1 y E4. En otra
realización preferida, el vector adenoviral tiene una supresión en
la región E1 en la cual están insertas la región E4 y la secuencia
que codifica a LLG (ver FR94 13355).
Los adenovirus recombinantes de replicación
defectiva de acuerdo con la presente invención pueden ser preparados
por medio de cualquier técnica conocida por las personas idóneas en
la especialidad (Levrero et al., Gene 101 (1991) 195, EP 185
573; Graham, EMBO J. 3 (1984) 2917). En particular, pueden ser
preparados por medio de la recombinación de homólogos entre un
adenovirus y un plásmido que porta, entre ellos, la secuencia de
ADN de interés. La recombinación de homólogos se efectúa después de
la cotransfección del adenovirus y del plásmido mencionados en una
línea celular adecuada. La línea celular que se emplea, con
preferencia debería (i) ser transformable por parte de los elementos
mencionados y (ii) contener las secuencias que están en condiciones
de complementar la parte del genoma del adenovirus de replicación
defectiva, con preferencia en forma integrada a fin de evitar los
riesgos de la recombinación. Son ejemplos de las líneas celulares
que se pueden utilizar la línea celular 293 de riñón embriónico
humano (Graham et al., 1. Gen. Virol. 36 (1977) 59) que
contiene la parte izquierda del genoma de un adenovirus Ad5 (12%)
integrada en su genoma y las líneas celulares que están en
condiciones de complementar las funciones E1 y E4, tal como se
describen en las solicitudes W094/269l4 y W095/02697. Los adenovirus
recombinantes se recuperan y se purifican utilizando las técnicas
biológicas moleculares estándar que son de conocimiento de conocidas
por las personas idóneas en la especialidad.
La regulación por disminución de la expresión
genética utilizando ácidos nucleicos antisentido se puede lograr en
el nivel de traducción o de transcripción. Los ácidos nucleicos
antisentido de la invención son con preferencia fragmentos de ácidos
nucleicos capaces de hibridizarse de manera específica con todos o
parte de un ácido nucleico que codifica LLG o el ARN mensajero
correspondiente. Estos ácidos nucleicos antisentido pueden ser
oligonucleótidos sintéticos, opcionalmente modificados para mejorar
su estabilidad y su selectividad. También pueden ser secuencias de
ADN cuya expresión en la célula produce ARN complementario para todo
o parte del ARNm de LLG. Los ácidos nucleicos antisentido pueden ser
preparados por medio de la expresión de toda o parte de una
secuencia seleccionada a partir de un grupo que consiste en la SEQ
ID No. 2, la SEQ ID No. 3, la SEQ ID No. 7, o la SEQ ID No. 11, en
la orientación opuesta, tal como se describe en EP 140308. Cualquier
longitud de la secuencia antisentido es adecuada para la práctica de
la invención con tal que sea capaz de regular por disminución o de
bloquear la expresión de LLG. Preferentemente, la secuencia
antisentido es por lo menos de 20 nucleótidos de longitud. La
preparación y el uso de los ácidos nucleicos antisentido, Los ARN
antisentido que codifican el ADN y el uso de antisentidos oligo y
genético se revelan en W092115680, cuyos contenidos se incorporan a
la presente a título de referencia.
La presente invención suministra anticuerpos
contra el polipéptido LLG. Estos anticuerpos pueden ser los
anticuerpos monoclonales o los anticuerpos policlonales. La presente
invención incluye los anticuerpos quiméricos, de cadena única y los
anticuerpos humanizados, al igual que los fragmentos Fab y los
productos de una librería con la expresión Fab.
Se pueden preparar anticuerpos policlonales
contra un fragmento antigénico de un polipéptido LLG, tal como se
describe en el Ejemplo 4A. De igual modo es posible generar los
anticuerpos contra la proteína o el polipéptido LLG intactos o
contra un fragmento, derivado o epitope de la proteína o el
polipéptido. Los anticuerpos se pueden obtener después de la
administración de la proteína, el polipéptido, el fragmento, el
derivado o el epitope a un animal, utilizando las técnicas y los
procedimientos que se conocen en la especialidad.
Los anticuerpos monoclonales se pueden preparar
utilizando el método de Mishell, B. B., et al., Selected
Methods In Cellular Immunology, (W.H. Freeman, ed.) San Francisco
(1980). En síntesis, un polipéptido de la presente invención se
utiliza para inmunizar las células del bazo de ratón Balb/C. Las
células del bazo inmunizadas se fusionan con las células del
mieloma. Las células fusionadas que contienen las características
celulares del bazo y el mieloma son aisladas por medio del
crecimiento en el medio HAT, un medio que extermina a las células
madre, pero que permite que los productos fusionados sobrevivan y
crezcan.
Los anticuerpos monoclonales de la presente
invención se pueden "humanizar" para evitar que el huésped arme
una respuesta inmune a los anticuerpos. Un "anticuerpo
humanizado" es un anticuerpo en el cual las regiones que
determinan la complementariedad (CDR) y/u otras porciones del marco
del dominio variable liviano o pesado derivan de una inmunoglobulina
no humana, pero las porciones restantes de la molécula derivan de
una o más inmunoglobulinas humanas. Los anticuerpos humanizados
también incluyen los anticuerpos caracterizados por una cadena
pesada humanizada asociada con una cadena liviana sin modificar
donante o aceptora o una cadena liviana quimérica o viceversa. La
humanización de los anticuerpos se puede llevar a cabo por medio de
los métodos conocidos en la especialidad (ver, por ejemplo G.E. Made
y E.A. Padlan" Capítulo 4. Humanization of Monoclonal
Antibodies", The Handbook of Experimental Pharmacology Vol. 113,
Springer-Verlag, New York, 1994). Los animales
transgénicos se pueden utilizar para expresar los anticuerpos
humanizados.
Las técnicas conocidas en la especialidad para la
producción de anticuerpos de cadena única se pueden adaptar para
producir anticuerpos de cadena única para los polipéptidos
inmunogénicos y las proteínas de la presente invención.
Los anticuerpos anti-LLG son
útiles en los ensayos para detectar o cuantificar los niveles de
LLG. En una realización, estos ensayos proveen un diagnóstico
clínico y una valoración de LLG en varios estados de enfermedad y un
método para monitorear la eficacia del tratamiento.
La presente invención provee métodos de selección
de las librerías pequeñas o las fuentes de productos naturales para
los agonistas (realzadores o co-activadores que
incluyen a los co-activadores proteináceos) o los
antagonistas (inhibidores) de la actividad de LLGXL. Un agonista o
un antagonista potencial se contacta con la proteína LLGXL y un
substrato de LLGXL y se mide la capacidad del agonista o del
antagonista potencial para realzar o inhibir la actividad de
LLGXL.
La proteína LLGXL utilizada en el método se puede
producir de manera recombinante en una variedad de células huésped
que incluyen las células de mamífero (tal como se muestra en el
Ejemplo 7), las células de insectos infectadas con baculovirus,
levadura y bacterias. La expresión LLG en las células CHO
transfectadas de manera estable se pueden optimizar por medio de la
amplificación del metotrexato de las células. La proteína LLGXL
también puede ser purificada a partir de las fuentes naturales tales
como el plasma humano, los extractos de placenta o los medios
acondicionados de células endoteliales cultivadas, las células
THP-I o los macrófagos.
La optimización de los parámetros de ensayo que
incluyen el pH, las concentraciones iónicas, la temperatura, la
concentración del substrato y las condiciones de emulsión están
determinadas en forma empírica por las personas idóneas en la
especialidad.
Los sustituyentes del ácido graso de los
substratos pueden variar en la longitud de la cadena al igual que en
el grado y la posición de la insaturación. Los substratos pueden
estar radiomarcados en cualquiera de las diversas posiciones. Los
substratos de los fosfolípidos tales como la fosfatidilcolina pueden
estar radiomarcados, por ejemplo, en la posición del ácido graso
Sn-1 o Sn-2 o en el glicerol, el
fosfato o el grupo polar cabecera (colina en el caso de la
fosfatidilcolina).
Como una alternativa para los substratos
radiomarcados, se pueden utilizar en los métodos de selección otras
clases de substratos marcados tales como los substratos
fluorescentes o los substratos que contengan tio.
Los substratos fluorescentes son particularmente
útiles para los ensayos de selección porque la catálisis enzimática
se puede medir en forma continua al medir la intensidad de la
fluorescencia sin la separación física (extracción) de los productos
provenientes de los substratos. Un ejemplo de un substrato
fluorescente de fosfatidilcolina es C_{6}NBD-PC
(1-acil-2-[6-(nitro-2,1,3-benzoxadiazol-4-il)amino]caproilfosfatidilcolina.
Los substratos que contienen tio incluyen
1,2-bis(hexanoiltio)-1.2-dideoxi-sn-glicero-3-fosforilcolina
(L.I.
Reynolds. W.N. Washburn, R.A. Deems. y E.A. Dennis. 1991. Methods in Enzymology 197: 3-23; L. Yu y E.A. Dennis. 1991. Methods in Enzymology 197: 65-75; L.A. Wittenauer. K. Shirai. R.L. Jackson, y J.D. Johnson. 1984. Biochem. Biophys. Res. Commun. 118: 894-901).
Reynolds. W.N. Washburn, R.A. Deems. y E.A. Dennis. 1991. Methods in Enzymology 197: 3-23; L. Yu y E.A. Dennis. 1991. Methods in Enzymology 197: 65-75; L.A. Wittenauer. K. Shirai. R.L. Jackson, y J.D. Johnson. 1984. Biochem. Biophys. Res. Commun. 118: 894-901).
La presente invención suministra un método para
la hidrólisis enzimática de los ésteres de fosfatidilcolina, por
ejemplo, para el procesamiento industrial o alimenticio o en los
detergentes para lavandería. Los polipéptidos de la presente
invención se pueden utilizar para hidrolizar los ésteres de
fosfatidilcolina en solución o las enzimas se pueden unir a un
soporte sólido que luego se pone en contacto con el substrato. Este
método se puede utilizar para producir lisofosfolípidos y ácidos
libres de grasa.
La presente invención suministra composiciones en
una solución biológicamente compatible (biocompatible) que comprende
los polipéptidos, los ácidos nucleicos, los vectores y los
anticuerpos de la presente invención. Una solución biológicamente
compatible es una solución en la cual el polipéptido, el ácido
nucleico, el vector, o el anticuerpo de la invención se mantiene en
una forma activa, por ejemplo, en una forma capaz de efectuar una
actividad biológica: Por ejemplo, un polipéptido de la invención
tendría una actividad de la fosfolipasa, un ácido nucleico estaría
en condiciones de replicar, traducir un mensaje o hibridizarse hasta
un ácido nucleico complementario; un vector sería capaz de
transfectar una célula blanco; un anticuerpo se uniría a un
polipéptido de la invención. Por lo general, una solución de este
tipo biológicamente compatible será una solución buffer acuosa, por
ejemplo, Tris, fosfato o solución buffer HEPES, que contengan iones
de sal. Por lo general, la concentración de iones de sal será
similar a los niveles fisiológicos. En una realización específica,
la solución biocompatible es una composición aceptable desde el
punto de vista farmacéutico. Las soluciones biológicamente
compatibles pueden incluir agentes estabilizantes y
conservantes.
Tales composiciones se pueden formular para la
administración por vía tópica, oral, parenteral, intranasal,
subcutánea e intraocular. La administración parenteral significa
incluir las técnicas de inyección endovenosa, inyección
intramuscular, inyección intraarterial o de infusión. La composición
se puede administrar por vía parenteral en formulaciones de
dosificación por unidad que contengan portadores, adyuvantes o
vehículos estándar no tóxicos conocidos fisiológicamente aceptados
según se desee.
Las preparaciones estériles preferidas pueden ser
una solución o una suspensión en un solvente o diluyente no tóxico
aceptable para la vía parenteral. Los ejemplos de los portadores
aceptables desde el punto de vista farmacéutico son la solución
salina, la solución salina amortiguada, la solución salina isotónica
(por ejemplo, el fosfato monosódico o disódico, el sodio, el
potasio, el calcio o el cloruro de magnesio o las mezclas de tales
sales), la solución de Ringer, la dextrosa, el agua, el agua
estéril, el glicerol, el etanol y las combinaciones de los mismos.
El 1,3-butanodiol y los aceites estériles fijos son
empleados de manera conveniente como solventes o medios de
suspensión. Se puede emplear cualquier aceite insípido fijo que
incluye los mono o los di-glicéridos sintéticos. Los
ácidos grasos tales como el ácido oleico también encuentran su uso
en la preparación de inyectables.
El medio de composición también puede ser un
hidrogel que se prepara a partir de cualquier polímero biocompatible
o no citotóxico (homo o hetero) tal como un polímeroácido
hidrofílico poliacrílico que puede actuar como una esponja que
absorba la droga. Dichos polímeros han sido descriptos, por ejemplo,
en la solicitud W093/08845, cuyo contenido completo se incorpora a
la presente a título de referencia. Algunos de los mismos como por
ejemplo, en particular, los que se han obtenido a partir del óxido
de etileno y/o propileno están comercialmente disponibles. Se puede
depositar un hidrogel directamente sobre la superficie del tejido
que se debe tratar, por ejemplo durante la intervención
quirúrgica.
Otra realización preferida de la presente
invención se refiere a una composición farmacéutica que comprende un
virus recombinante de replicación defectiva y poloxámero. De un modo
más específico, la invención se refiere a una composición que
comprende un virus recombinante de replicación defectiva que
comprende un ácido nucleico que codifica un polipéptido LLG y. Un
poloxámero preferido es el Poloxamer 407, que está comercialmente
disponible (BASF, Parsipanny, NJ) y es un poliol no tóxico,
biocompatible y es el que goza de mayor preferencia. Un poloxámero
impregnado con virus recombinantes se puede depositar directamente
sobre la superficie del tejido que se debe tratar, por ejemplo
durante una intervención quirúrgica. El poloxámero posee
esencialmente las mismas ventajas que el hidrogel mientras que tiene
una viscosidad inferior.
La presente invención es útil en los métodos de
tratamiento que comprenden la administración a un humano o a otros
animales de una cantidad efectiva de una composición de la presente
invención.
La cantidad efectiva puede variar en función de
la edad, el tipo y la severidad de la condición que debe ser
tratada, el peso corporal, la duración deseada para el tratamiento,
el método de administración y otros parámetros. Las cantidades
efectivas son determinadas por un médico u otro profesional médico
calificado.
Los polipéptidos de acuerdo con la presente
invención por lo general son administrados en dosis de alrededor de
0,01 mg/kg a alrededor de 100 mg/kg, con preferencia de alrededor de
0,1 mg/kg a alrededor de 50 mg/kg y con mayor preferencia de
alrededor de 1 mg/kg a alrededor de 10 mg/kg de peso corporal por
día.
Los virus recombinantes de acuerdo con la
presente invención por lo general se formulan y se administran en la
forma de dosis de entre alrededor de 10^{4} y alrededor de
10^{14} pfu. En el caso de AAVs y de los adenovirus, con
preferencia se usan las dosis de desde alrededor de 10^{6} a hasta
alrededor de 10'' pfu. El término pfu ("unidad formadora de
placa") corresponde al poder de infección de una suspensión de
viriones y se determina por la infección de un cultivo celular
adecuado y la medición de la cantidad de placas formadas. Las
técnicas para determinar el título de pfu de una solución viral
están bien documentadas en la especialidad con anterioridad.
La presente invención es útil en los métodos para
tratar la aterosclerosis cuando dicha aterosclerosis es el resultado
del exceso, la expresión anormal o inadecuada de la actividad del
polipéptido LLG.
La presente invención es útil en los métodos para
tratar a un humano u otro animal que tiene un perfil de lípidos no
deseado, donde dicho perfil de líquidos no deseado es el resultado
de la expresión anormalmente alta o inadecuada de la actividad del
polipéptido LLG.
La presente invención además es útil en los
métodos de tratamiento par ala diabetes, la hiperlipidemia, la
colestasis intrahepática u otros trastornos metabólicos en los
cuales la diabetes, la hiperlipidemia, la colestasis intrahepática u
otros trastornos metabólicos es el resultado de la expresión
anormalmente alta o inadecuada de la actividad del polipéptido
LLG.
Los métodos para reducir la expresión del
polipéptido LLG para corregir las condiciones mencionadas en las
cuales la actividad del polipéptido LLG contribuye a una enfermedad
o a un trastorno asociado con un perfil de lípidos no deseado
incluyen pero no se limitan a la administración de una composición
que comprende un ácido nucleico antisentido, la administración de
una composición que comprende una proteína de unión intracelular tal
como un anticuerpo, la administración de una composición que
comprende el polipéptido LLGN u otro fragmento de LLG y la
administración de una composición que comprende un ácido nucleico
que codifica al polipéptido LLGN u otro fragmento de LLG.
En una realización, una composición que comprende
un ácido nucleico antisentido se utiliza para regular por
disminución o bloquear la expresión de LLG. En una realización
preferida, el ácido nucleico codifica las moléculas ARN antisentido.
En esta realización, el ácido nucleico de manera operativa se une a
las señales que permiten la expresión de la secuencia del ácido
nucleico y se introduce en una célula utilizando con preferencia los
constructos del vector recombinante que expresarán el ácido nucleico
antisentido una vez que el vector se haya introducido dentro de la
célula. Los ejemplos de vectores adecuados incluyen los plásmidos,
los adenovirus, los virus adeno-asociados, los
retrovirus y los herpes virus. Con preferencia, el vector es un
adenovirus. Con mayor preferencia, el vector es un adenovirus con
replicación defectiva que comprende una eliminación en las regiones
E1 y/o E3 del virus.
En otra realización, la expresión de LLG es
regulada por disminución o bloqueada por medio de la expresión de
una secuencia de ácido nucleico que codifica a una proteína de unión
intracelular que es capaz de interactuar de manera selectiva con
LLG. WO 94/29446 y WO 94/02610, cuyos contenidos se incorporan a la
presente a título de referencia, revelan la transfixión celular con
los genes que codifican una proteína de unión intracelular. Una
proteína de unión intracelular incluye cualquier proteína capaz de
interactuar de manera selectiva con LLG en la célula en la cual se
expresa y capaz de neutralizar la función de unión de LLG. Con
preferencia, la proteína de unión intracelular es un anticuerpo o un
fragmento de un anticuerpo. Con mayor preferencia la proteína de
unión intracelular es un anticuerpo de cadena única.
WO 94/02610 revela la preparación de los
anticuerpos y la identificación del ácido nucleico que codifica un
anticuerpo particular. Alutilizar LLG o un fragmento del mismo, se
prepara un anticuerpo monoclonal específico por medio de las
técnicas conocidas por las personas idóneas en la especialidad. Un
vector que comprende el ácido nucleico que codifica una proteína de
unión intracelular o una porción de la misma y es capaz de la
expresión en una célula huésped se prepara de manera subsiguiente
para utilizar en el método de esta invención.
De manera alternativa, la actividad de LLG puede
ser bloqueada por medio de la administración de un anticuerpo
neutralizante en la circulación. Un anticuerpo neutralizante de esa
naturaleza se puede adminsitrar directamente como una proteína o
bien se puede expresar a partir de un vector (con una señal
secretoria).
En otra realización, la actividad de LLGXL se
inhibe por medio de la administración de una composición que
comprende el polipéptido LLGN u otro fragmento de LLG. Esta
composición puede ser administrada de una manera conveniente, tal
como por vía oral, tópica, endovenosa, intraperitoneal,
intramuscular, subcutánea, intranasal o intradérmica. La composición
se puede administrar directamente o puede ser encapsulada (por
ejemplo, en un sistema de lípidos, en microesferas de aminoácido o
en dendrímeros globulares). En algunos casos, el polipéptido puede
estar unido a otro polímero tal como la albúmina sérica o la
polivinil pirrolidona.
En otra realización, la actividad de LLGXL es
inhibida por medio del uso de compuestos de bajo peso molecular que
interfieren con sus propiedades enzimáticas o impiden su
reconocimiento adecuado por parte de los sitios de unión
celular.
En otra realización, la actividad de LLGXL es
inhibida por medio del uso de la terapia genética, es decir, a
través de la administración de una composición que comprende un
ácido nucleico que codifica y direcciona la expresión del
polipéptido LLGN u otro fragmento de LLG.
En una realización específica, el gen LLG de la
presente invención también tiene una afinidad por la heparina. El
polipéptido LLG que se une a la heparina extracelular en el lumen de
los vasos sanguíneos permitiría a LLG y unirse a y acelerar la
recaptación de LDL al actuar como un puente entre LDL y la
heparina extracelular. En el área localizada de una lesión
aterosclerótica, se plantea la hipótesis según la cual un mayor
nivel de actividad de la lipasa acelera el proceso aterogénico
(Zilversmit. D.B. (1995) Clin. Chem. 41.153-158;
Zambon, A., Torres, A., Bijvoet, S., Gagne, C. Moojani, S. Lupien,
P.J., Hayden M.R., y Brunzell, J.D., (1993) Lancet 341.
1119-1121). Esto se puede deber a un aumento
producido en la unión y la recaptación de las lipoproteínas por
medio del tejido vascular mediado por las lipasas (Eisenberg, S.,
Sehayek. E., Olivecrona, T. Vlodavsky, I. (l992) I. Clin. Invest.
90,2013-2021; Tabas, I., Li, I., Brocia R.W., Xu,
S.W., Swenson T.L. Williams, KJ. (1993) J. Biol. Chem.
268.20419-20432; Nordestgaard. B.G., y Nielsen, A.G.
(1994) Curr. Opin. Lipid. 5.252-257; Williams. K.J.,
y Tabas, I. (1995) Art. Thromb. and Vasc. Biol.
15,551-561). De manera adicional, un alto nivel
local de la actividad de la lipasa puede dar como resultado niveles
citotóxicos de los ácidos grasos y producir lisofosfatidilcolina en
los precursores de las lesiones ateroscleróticas. Esta actividad
particular de LLG puede contribuir al desarrollo o la progresión de
la aterosclerosis, particularmente dentro del contexto de los
niveles excesivos de lípidos en un paciente debido a factores
relacionados con la dieta o a factores genéticos. Por lo tanto, la
presente invención permite la inhibición de la acumulación de
lipoproteína por medio de la inhibición de la expresión del
polipéptido LLG o de la unión a la lipoproteína (por ejemplo,
LDL).
Los métodos para aumentar la expresión de LLG
para corregir aquellas condiciones en las cuales la actividad del
polipéptido contribuye a una enfermedad o a un trastorno asociado
con un perfil de lípidos no deseado, incluyen pero no se limitan a
la administración de un a composición que comprende el polipéptido
LLGXL y la administración de una composición que comprende un ácido
nucleico que codifica al polipéptido LLGXL.
En una realización, el nivel de actividad de
LLGXL aumenta a través de la administración de una composición que
comprende el polipéptido LLGXL. Esta composición se puede
administrar de una manera conveniente tal como por medio de la vía
oral, tópica, endovenosa, intraperitoneal, intramuscular,
subcutánea, intranasal, o intradérmica. La composición se puede
adminsitrar directamente o puede ser encapsulada (por ejemplo, en
un sistema de lípidos, en microesferas de aminoácidos o en
dendrímeros globulares). En algunos casos, el polipéptido puede
estar unido a otro polímero tal como la albúmina sérica o la
polivinil pirrolidona.
En otra realización, el nivel de LLGXL se
incrementa a través del uso de compuestos de bajo peso molecular que
pueden regular hacia arriba la expresión de LLGXL en el nivel de la
post-traducción.
En otra realización, el nivel de LLGXL se
incrementa a través del uso de la terapia genética, es decir, a
través de la administración de la composición que comprende un ácido
nucleico que codifica y direcciona la expresión del polipéptido
LLGXL.
La colestasis intrahepática se puede caracterizar
por medio del aumento de los niveles del colesterol sérico y de los
fosfolípidos. Un modelo descripto recientemente de colestasis
intrahepática inducida por la droga phalloidin en ratas demostró
aumentos significativos en los niveles séricos del colesterol y los
fosfolípidos (Ishizaki. K., Kinbara. S., Miyazawa, N., Takeuchi. Y.,
Hirabayashi, N., Kasai, H., y Araki, T. (1997) Toxicol. Letters 90,
29-34). Los productos de la presente invención se
pueden utilizar para tratar la colestasis intrahepática en pacientes
que han aumentado el colesterol sérico y/o los fosfolípidos. Además,
este modelo realizado en ratas también exhibió una reducción severa
en las velocidades de excreción biliar del colesterol. El
polipéptido LLG y los productos de ácido nucleico de esta invención
se pueden utilizar para tratar pacientes con una disfunción en el
sistema de excreción biliar.
La colestasis intrahepática también se
caracteriza por un trastorno del caudal biliar desde el hígado.
Recientemente, se hizo el mapeo de las
ubicaciones para la colestasis intrahepática familiar progresiva
(PFIC o enfermedad de Byler) y la colestasis intrahepática benigna
recurrente (BRIC) hasta 18q21-q22 (Carlton, V.E.H.,
Knisely. A.S., y Freimer, N.B. (1995) Hum. Mol. Genet. 4,
1049-1053 y Houwen; R.H., Baharloo. S., Blankenship,
K., Raeymaekers. P., Juyn, J., Sandkuijl, L.A.. y Freimer, N.B.
(1994) Nature Genet. 8, 380-386. respectivamente).
En la medida que el gen LLG hace el mapa dentro de esta región
cromosómica en 18q21, el gen LLG o los productos de esta invención
pueden ser utilizados para tratar pacientes con colestasis
intrahepática que es provocada por una mutación o una expresión
defectuosa del gen o de los genes de la enfermedad PFIC/BRIC.
En otra realización, el gen LLG o los productos
del polipéptido de esta invención se pueden utilizar para tratar
pacientes con colestasis intrahepática que no se deba a un defecto
en el o los genes de la enfermedad PFIC/BRIC en
18q21-q22. Un estudio reciente sugirió que otro
locus ubicado fuera de la región 18q21-q22 también
puede producir el fenotipo PFIC (Strautnieks, S.S., Kagalwalla, A.F.
Tanner. M.S., Gardiner, R.M., y Thompson, R.I. (1996) J. Med. Genet.
33, 833-836).
No obstante ello, la administración del
polipéptido LLG, ya sea directamente o por medio de la terapia
genética, puede aliviar esta forma de la condición.
En la terapia genética, uno o más ácidos
nucleicos que codifican a un polipéptido, al igual que las regiones
regulatorias que controlan su expresión se transfieren a las células
blanco de un humano u otro animal. Esta transferencia se lleva a
cabo ya sea ex vivo en un procedimiento en el cual el ácido
nucleico se transfiere a las células en el laboratorio y las células
modificadas luego son administradas al humano o a otro animal o
in vivo en un procedimiento en el cual el ácido nucleico se
transfiere directamente a las células dentro del humano o de otro
animal. La transferencia de los ácidos nucleicos se puede lograr
utilizando ya sea los vectores virales como los no virales que han
sido descriptos con anterioridad.
Los vectores no virales se pueden transferir a
las células utilizando cualquiera de los métodos conocidos en la
especialidad, que incluyen la co-precipitación de
calcio fosfato, la lipofección (liposomas sintéticos aniónicos y
catiónicos), la liberación de genes mediada por el receptor, la
inyección de ADN descubierto, la electroporación y la aceleración
biobalística o particulada.
Los ejemplos que figuran a continuación ilustran
la invención. Estos ejemplos son solamente ilustrativos y no limitan
el alcance de la invención.
Las células monocíticas humanas
THP-1 (Smith. P.K., Krohn. R.I., Hermanson, G.T.,
Mallia, A.K., Gartner, F.H. Provenzano. M.D., Fujimoto, E.K., Goeke.
N.M., Olson, BJ., y Klenk. D.C. (1985) Anal. Biochem.
150,76-85) fueron cultivadas en el medio
RPMI-I640 (GIBCO) con 25 nM HEPES, suero fetal
bovino al 10%, 100 unidades/ml de penicilina G sódica y 100
unidades/ml de sulfato de estreptomicina. Las células fueron
colocadas sobre placas de cultivo celular de 15 cm 1,5 x 10^{7}
células/placa, y fueron tratadas con 40 ng/ml de forbol
12-miristato 13-acetato (Sigma)
durante 48 horas para inducir la diferenciación de las células. Se
adquirieron lipoproteínas de baja densidad (LDL) a Calbiochem y las
mismas fueron dializadas en forma exhaustiva contra PBS a 4ºC.
Luego, se diluyó la LDL hasta 500 \mug/ml y se dializó contra 5
\muM CuSO_{4} en PBS a 37ºC durante 16 horas. Para detener la
oxidación, la LDL fue dializada en forma exhaustiva contra150 nM
NaC, 0.3 nM EDTA y luego se esterilizó el filtro. Se determinó la
concentración de proteínas por medio del método BCA (Schuh, J.
Fairclough, G.F., y Haschemeyer. R.H., (1978) Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 15. 3113-3117) (Pierce). Se determinó el grado
de oxidación por medio de TBARS (Chomczynski, P. (1993)
Biotechniques 15,532-537), y estuvo entre
25-30 nmol MDA equivalentes/mg proteína. Las células
diferenciadas THP-I fueron expuestas durante 24
horas ya sea a 50 \mug/ml de LDL oxidada o bien a
NaCl-EDTA buffer en medio RPMI con suero fetal
bovino deficiente de lipoproteínas al 10% (Sigma). Para recolectar
el ARN, las placas se enjuagaron con 10 ml de PBS y luego se
agregaron a cada placa 14 ml de TRIZOL (Liang, P. y Pardee, A.B.
(1992) Science 257,967-971) (GIBCO). Se revolvió la
solución con una pipeta varias veces para mezclarla, luego las
muestras similares fueron agrupadas en tubos centrífugos y se
agregaron 3 ml de cloroformo por placa y se mezclaron. Se
centrifugaron los tubos durante 15 minutos a 12000 x g. Después del
centrifugado, la capa superior fue transferida a un tubo nuevo y de
agregaron 7.5 ml de isopropanol por placa y se mezclaron. Los tubos
se centrifugaron a 12000 x g durante 20 minutos. El pellet se
enjuagó con etanol al 70% enfriado en hielo y secado a temperatura
ambiente. Los pellets fueron suspendidos en 500 \mul TE
(Tris-EDTA) y tratados con 200 unidades de ADNse I
libre de ARNse y 200 unidades de inhibidor de RNase de placenta
RNasin (Promega) durante 30 minutos a 37ºC. Se purificó en ARN por
medio de extracciones secuenciales con fenol, fenol / cloroformo /
isoamil alcohol (25:24: 1), y clorofornilsoamil alcohol (24:1)
seguido de precipitación con etanol.
Se llevaron a cabo la síntesis del ADNc y la
amplificación del PCR utilizando protocolos de la versión 1.0 del
Differential Display Kit (Kit de display diferencial) (Display
Systems Biotechnology, Inc.) Este sistema se basa sobre la técnica
que fue descripta originalmente por Liang y Pardee (Mead, D.A., Pey,
N.K., Hermstadt, C., Marcil, R.A., y Smith, L.M., (1991)
Bio/Technology 9,657-663). Los pares de cebadores
que produjeron el fragmento de ADNc que contenía la primera
información del gen similar a la lipasa fueron el cebador 7
corriente abajo y el cebador 15 corriente arriba. El ADNc para la
amplificación fue sintetizado de la manera siguiente, utilizando ARN
derivado de las células THP-I tratadas con PMA
expuestas ya sea a solución buffer o bien a LDL oxidada: 3 \mul de
25 \muM del cebador 7 corriente abajo y 7.5 \mul de
dietilpirocarbonato agua tratada con (DEPC) se agregaron a 300 ng
(3.0 \mul) ARN de cada muestra de ARN de THP-1
RNA. Esto se calentó a 70ºC durante 10 minutos y luego se enfrió
sobre hielo. A este tubo se agregaron 3 \mul de 5 x PCR solución
buffer (250 mM Tris-HCl, pH 8,3. 375 mM KCl)
(GIBCO), 3 \mul 25 mM MgCl_{2}, 3 \mul 0.1M DTT, 1.2 \mul
500 \muM dNTPs, 0.7 \mul RNasin, y 5.6 \mul de agua tratada
con DEPC. Los tubos fueron incubados durante 2 minutos a temperatura
ambiente, después de lo cual se agregaron 1.5 ml (300 unidades)
Superscript II RNase H- transcriptasa inversa (GmCO). Los tubos
fueron incubados en forma secuencial a temperatura ambiente durante
2 minutos, 60 minutos a 37ºC, y 5 minutos a 95ºC, y seguidamente se
enfrió sobre hielo. Se llevó a cabo la amplificación PCR utilizando
una mezcla maestra que contenía 117 \mul 10x solución buffer PCR
(500 mM KCl, 100 mM Tris-HCl pH 8.3, 15 mM
MgCl_{2}, y 0.01% (w/v) gelatina), 70,2 \mul 25 \muM
MgCl_{2}, 5,9 alfa ^{33}PdATP (10M Ci/ml, DuPont NEN). 4,7
\mul 500 \muM dNTP mezcla, 11 \mul AmpliTaq ADN polimerasa (5
unidades/ml, Perkin-Elmer), y 493,3 \mul de agua
tratada con DEPC. Para cada reacción, se agregaron 12 ml de la
mezcla maestra a 2 ml del primer #7 corriente abajo, 1 ml de ADNc y
5 ml del cebador #15 corriente arriba. Las mezclas de la reacción se
calentaron a 94ºC durante 1 minuto, luego fueron termocicladas 40
veces con un paso de desnaturalización de 94ºC durante 15 segundos,
un paso de recocción de 40ºC durante 1 minuto y un paso de extensión
de 72ºC durante 30 segundos. Después de los 40 ciclos, las
reacciones fueron incubadas a 72ºC durante 5 minutos y se
almacenaron a 10ºC. Las reacciones PCR se llevaron a cabo en un
termociclador Perkin-Elmer GeneAmp System 9600.
Se mezclaron cuatro microlitros de la reacción de
amplificación con un volumen igual de buffer de carga (azul
bromofenol al 0.2%, Xileno cianol al 0.2%, 10 mM de EDTA con un pH
de 8.0, y glicerol al 20%). Cuatro microlitros de esta mezcla fue
extendida sobre un gel con formato de secuencias de acrilamida no
desnaturalizada al 6% durante 3 horas a 1200 voltios (voltaje
constante). El gel se secó a 80ºC durante 1,5 horas y se expuso a la
película Kodak XAR. Se identificó y se separó del gel un producto de
amplificación hallado solamente en la reacción que contenía ADNc
proveniente de las células THP-I expuestas a LDL
oxidada. Se agregaron 100 ml de agua tratada con DEPC a un tubo
microcentrífugo que contenía el fragmento de gel separado y se
incubó durante 30 minutos a temperatura ambiente seguido por 15
minutos a 95ºC.
Para volver a amplificar el producto PCR, 26.5
microlitros del ADN eluído se utilizaron en una reacción de
amplificación que también incluyó 5 \mul 10x PCR buffer, 3 \mul
25 mM MgCl_{2}, 5 \mul 500 mM dNTPs, 5 \mul 2\muM del
cebador 7 corriente abajo, 7.5 \mul del cebador 15 corriente
arriba y 0.5 \mul Amplitaq polimerasa. Los parámetros de ciclado
de PCR y el instrumento fueron los que se describieron con
anterioridad. Después de la amplificación, 20 \mul de la
reamplificación fueron analizados sobre un gel de agarosa y se
utilizaron 4 \mul para subclonar los productos PCR en el vector
pCRII utilizando el sistema de clonación T A (Forman, M.A., Dush,
M.K., y Martin, G.R. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA
85,8998-90 (2) (Invitrogen). Después de la ligación
durante toda la noche a 14ºC, los productos de ligación se
utilizaron para transformar E. coli. Se recolectaron las
transformaciones resultantes y 3 ml de los cultivos de toda la noche
se utilizaron en minipreparaciones de plásmidos. Los tamaños de
inserción se determinaron utilizando las digestiones de EcoRI de los
plásmidos y los clones que contenían inserciones del tamaño
aproximado del producto original de PCR fueron sometidos a
secuencias utilizando reactivos fluorescentes
pigmento-terminador (Prism. Applied Biosystems) y un
secuenciador de ADN Applied Biosystems 373. La secuencia del
producto de PCR se muestra en la Figura 2. La secuencia de los
cebadores de la amplificación está subrayada.
La extensión del ADNc identificada a través de
RT-PCR se realizó utilizando el sistema 5'RACE (Loh,
E.Y., Eliot, J.F., Cwirla. S., Lanier. L.L., y Davis. M.M. (1989)
Science 243, 217219; Simms, D., Guan, N., y Sitaraman, K., (1991)
Focus 13,99) (GIBCO). Un microgramo del ARN de THP-1
(LDL oxidado tratado) utilizado en forma inicial en las reacciones
de representación diferencial se utilizó en el procedimiento
5'RACE:
1 \mul (1 \mul ) de ARN se combinó con 3
\mul (3 pmol) del cebador 2a y 11 \mul de agua tratada con DEPC
y calentado a 70ºC durante 10 minutos seguido de 1 minuto sobre
hielo. Se agregaron 2.5 \mul solución buffer de reacción 10 x
(200 mM Tris-HCl pH 8.4, 500 mM KCl), 3 \mul 25
mM MgCl_{2}, 1 \mul de mezcla 10 mM dNTP y 2.5 \mul 0.1 M DTT.
La mezcla se incubó a 42ºC durante 2 minutos, luego se agregó 1
\mul de Superscipt II transcriptasa inversa. La reacción se incubó
durante un período adicional de 30 minutos a 42ºC, 15 minutos a
70ºC, y sobre hielo durante 1 minuto. Se agregó 1 microlitro de
RNase H (2 unidades) y la mezcla se incubó a 55ºC durante 10
minutos. El ADNc se purificó utilizando las columnas GlassMax
(Sambrook, J. Fritsch, E.F., y Maniatis, T. (1989) . Molecular
Cloning: A Laboratory Manual, second edition, Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Plainview, NY) que se incluye en el kit. El ADNc
fue sometido a elución desde la columna en 50 \mul dH_{2}O,
liofilizado y resuspendido en 21 \mul dH_{2}O. El acortamiento
del ADNc se llevó a cabo en la reacción siguiente: 7.5 \mul de
H_{2}O, 2.5 \mul de solución buffer de reacción (200 mM de
Tris-HCl a un pH de 8.4, 500 mM de KCl), 1.5 \mul
de 25 mM MgCl_{2}, 2.5 \mul de 2 mM dCTP, y 10 \mul del
ADNc se incubaron a 94ºC durante 3 minutos y luego se colocaron 1
minuto sorbe hielo. Se agregó 1 \mul (10 unidades) de
deoxinucleotidil transferasa terminal y la mezcla se incubó durante
10 minutos a 37ºC. La enzima se inactivó con calor por medio de
incubación a 70ºC durante 10 minutos y la mezcla se colocó sobre
hielo. La amplificación PCR del ADNc se llevó a cabo conforme a los
pasos siguientes: 5 \mul del ADNc acortado se incluyeron en la
reacción que también contenía 5 \mul de solución buffer 10x PCR
(500 mM de KCl, 100 mM de Tris HCl a un pH de 8.3, 15 mM de
MgCl_{2}, y 0.01% (p/v) gelatina), 1 \mul de mezcla 10 mM de
dNTP, 2 \mul (10 pmol) del cebador de anclaje, 1 \mul (20
pmol) del cebador 3ª y 35 \mul de dH_{2}O. La reacción se
calentó a 95ºC durante 1 minuto, luego se agregaron 0.9 \mul (4.5
unidades) de polimerasa Amplitaq. La reacción fue ciclada 40 veces
bajo las condiciones siguientes: 94ºC durante 5 segundos, 50ºC
durante 20 segundos, y 72ºC durante 30 segundos. Se utilizó un
microlitro de esta reacción en una reamplificación anidada para
incrementar los niveles del producto específico para el aislamiento
subsiguiente. La reamplificación incluyó: 1 \mul de amplificación
primaria, 5 \mul de solución buffer 10x PCR, 1 \mul de la
mezcla de 10 mM dNTP, 2 \mul (20 pmol) del cebador de
amplificación universal, 2 \mul (20 pmol) del cebador 4a y 38
\mul de dH_{2}O. La reacción se calentó hasta 95ºC durante 1
minuto, luego 0.7 \mul (3.5 unidades) Se agregó polimerasa
Amplitaq. La reacción se cicló 40 veces bajo las condiciones
mencionadas: 94ºC durante 5 segundos, 50ºC durante 20 segundos, y
72ºC durante 30 segundos. Los productos de la amplificación fueron
analizados por medio de la electroforesis por gel de agarosa al
0.8%. Se detectó un producto predominante de aproximadamente 1.2
pares de kilobase. Se clonaron dos microlitros de los productos de
la reacción en el vector pCRII del kit de clonación TA (Invitrogen)
y se incubó a 14ºC durante toda la noche. Los productos de ligación
se utilizaron para tansformar E. coli. Los tamaños de
inserción de los transformantes resultantes se determinaron a
continuación de la digestión de EcoRI. Se estableció la secuencia de
los clones que contenían inserciones del tamaño aproximado del
producto PCR utilizando reactivos fluorescentes del
pigmento-terminador (Prism, Applied Biosystems) y un
secuenciador de ADN Applied Biosystems 373. La secuencia del
producto RACE que incluye a los sitios EcoRI del vector TA se
muestra en la Figura 3. Las secuencias de los amplímeros (cebador de
amplificación universal y el complemento para el cebador 4 a
5'RACE) están subrayadas.
Una librería del ADNc de la placenta humana
(Oligo dT y cebado mediante randomización. Cat. #5014b, Lote #52033)
se obtuvo a partir de Clontech (Palo Alto, CA). Se creó una sonda
radiomarcada al suprimir la inserción de un plásmido que contenía
el producto PCR de la reacción 5'RACE que se describió con
anterioridad. La sonda fue radiomarcada utilizando la técnica de
cebado por randomización: el fragmento de ADN
(50-100 ng) se incubó con 1 \mug de hexámeros
randomizados (Gibco) a 95ºC durante 10 minutos seguido de 1 minuto
sobre hielo. Se agregó lo que figura a continuación a temperatura
ambiente: 3 \mul de solución buffer 10x Klenow (100 mM de
Tris-HCl a un pH de 7.5, 50 mM de MgCL_{2}, 57 mM
de ditiotreitol; New England Biolabs), 3 \mul de 0.5 mM dATP,
dGTP, dTTP), 100 \muCi de \alpha ^{32}PdCTP (3000 Ci/mmol, New
England Nuclear), y 1\mul del fragmento Klenow del ADN polimerasa
I (5 unidades, Gibco). La reacción se incubó durante
2-3 horas a temperatura ambiente y luego se
interrumpió la reacción aumentando el volumen hasta 100 ml con TE pH
8.0 y agregando EDTA hasta lograr una concentración final de 1 mM.
Los nucleótidos no incorporados fueron eliminados aumentando el
volumen de la reacción hasta 100 \mul y pasando por encima de una
columna giratoria G-50 (Boehringer Mannheim). Las
investigaciones resultantes tuvieron una actividad específica
superior a 5x10^{8} cpm/\mug ADN.
La librería se investigó utilizando los métodos
establecidos (Walter, P.. Gilmore, R., y Blobel. G. (1984) Cell
38,5-8). En síntesis, los filtros fueron
hibridizados durante 24 horas a 65ºC en 4.8X SSPE (20X SSPE = 3.6 M
de NaCl, 0.2 M de NaH_{2}PO., 0.02 M de EDTA, a un pH de 7.7), 20
mM de Tris HCl a un pH de 7.6, IX solución Denhardt's (100X= 2% de
Ficoll 400, 2% de polivinilpirrolidona, 2% del BSA), 10% de dextran
sulfato, 0.1% de SDS, 100 \mug/ml de ADN de esperma de salmón y
1x10^{8} cpm/ml de sonda radiomarcada. Los filtros luego se
lavaron tres veces durante 15 minutos a temperatura ambiente en 2X
SSC (IX SSC = 150 mM de NaCl, 15 mM de citrato de sodio a un pH de
7.0), 0.1% de dodecil sulfato sódico (SDS) seguido de tres lavados
durante 15 minutos cada uno a 65ºC en 0.5X SSC, 0.1% de SDS. Los
fagos que se hibridizaron a la sonda fueron aislados y amplificados.
El ADN se purificó a partir del fago amplificado utilizando el
reactivo LambdaSorb (Promega) de acuerdo con las instrucciones del
fabricante. Las inserciones fueron eliminadas del ADN del fago por
digestión con EcoRI. Las inserciones fueron subclonadas en el sitio
de EcoRI de un vector del plásmido (Bluescript II SK. Stratagene).
La secuencia del marco de lectura abierta contenida dentro del
fragmento 2.6 kb EcoRI del ADNc fue determinada por medio de la
secuencia automática que se estableció tal como se describió con
anterioridad. La secuencia se muestra en la Figura 4. La secuencia
de aminoácidos de la proteína predecida codificada por un marco de
lectura abierta se muestra en la Figura 5 y ha sido denominada
LLGXL. Se predice que la primera metionina es codificada por los
pares de nucleótidos 252-254. La proteína predecida
es de 500 aminoácidos de longitud. Los primeros 18 aminoácidos de
una secuencia característica de un péptido de señal secretoria
(Higgins, D.G., y Sharp, P.M: (1988) Gene 73,
237-244). Se predice que el propéptido tiene un peso
molecular de 56,800 Daltons. Suponiendo una división del péptido
señal en la posición 18, la proteína madura inmodificada tiene un
peso molecular de 54.724 Daltons.
Las similitudes generales entre esta proteína y
los demás miembros conocidos de la familia de la triacilglicerol
lipasa se ilustran en la Figura 6 y en la Tabla 1. En la alineación
que se muestra en la Figura 6. LLG es el polipéptido (SEQ ID NO: 6)
codificado por el ADNc (SEQ ID NO: 5) que se ha descripto en el
Ejemplo 1, y que de aquí en adelante se denomina LLGN. Esta proteína
es idéntica a la proteína LLGXL de los residuos amino terminales
345. Nueve residuos únicos son seguidos por un codón de terminación
que produce un polipéptido de 39.3 kD y una proteína madura de 37.3
kD. Las secuencias que son comunes a LLGN y LLGXL son la secuencia
de ácido nucleico SEQ ID NO: 9 y la secuencia de aminoácidos SEQ ID
NO: 10.
Es interesante mencionar que la posición en la
cual las proteínas LLGN y LLGXL divergen es en una región conocida a
partir de la estructura de la otra lipasa hasta estar entre los
dominios amino y carboxi de las proteínas. Por lo tanto, parece que
la proteína LLGN consiste en sólo uno de los dos dominios de las
triacilglicerol lipasas. Esta secuencia contiene la característica
"GXSXG", motivo de la lipasa en las posiciones
167-171 al igual que la conservación de los residuos
de la tríada catalítica en Ser 169, Asp 193, y His 274. La
conservación de los residuos de cisteína (posiciones 64, 77, 252,
272, 297, 308, 311, 316, 463, y 483) que han estado involucradas en
la unión de disulfuro en las demás lipasas sugiere que la proteína
LLGXL tiene similitudes estructurales con las demás enzimas. Existen
5 sitios previstos para la glicosilación unida a N; en las
posiciones de los aminoácidos 80, 136, 393, 469, y 491. Las
secuencias de la proteína utilizadas en las comparaciones son las
lipoproteínas lipasa humanas (LPL; acceso a Genbank #M15856, SEQ ID
NO: 13), la lipasa hepática humana (HL; acceso a Genbank #J03540,
SEQ ID NO: 14), la lipasa pancreática humana (PL; acceso a Genbank #
M93285, SEQ ID NO: 15), la proteína 1 asociada con la lipasa
pancreática humana (PLRP-1; acceso a Genbank #
M93283), y la proteína 2 asociada a la lipasa pancreática humana
(PLRP-2; acceso a Genbank # M93284).
La similitud del porcentaje se basó en una
alineación en forma de pares utilizando el algoritmo de Clustal
(Camps, L., Reina, M., Llobera, M., Vilaro, S., y Olivecrona, T.
(1990) Am. J. Physiol. 258,C673-C681) en el programa
Megalign de la Lasergene Biocomputing Software Suite (Dnastar).
El ADN de un clon Pl (Sternberg, N., Ruether, J.
y DeRiel, K. The New Biologist 2:151-62, 1990) que
contiene el ADN del LLG genómico fue marcado con digoxigenina UTP
por medio de la traducción del sobrenombre. La sonda marcada fue
combinada con el ADN humano recortado y se hibridizó hasta los
linfocitos de sangre periférica estimulada por PHA de un donante
masculino en una solución que contenía formamida al 50%, dextran
sulfato al 10% y 2X de SSC. Se detectaron señales específicas de
hibridización al incubar las células hibridizadas en los anticuerpos
de antidigoxigenina sometida a fluoresceinado seguido por
contracoloración con DAPI. Este experimento inicial dio como
resultado una rotulación específica de un cromosoma del grupo E, que
se creyó que era el cromosoma 18 sobre la base del manchado
DAPI.
Se realizó un segundo experimento en el cual una
sonda rotulada con biotina específica para el centrómero del
cromosoma 18 fue cohibridizada con la sonda de LLG. Este experimento
dio como resultado la marcación específica del centrómero del
cromosoma 18 en rojo y el brazo largo del cromosoma 18 en verde. Las
mediciones de los 11 cromosomas 18 hibridizados específicamente
rotulados demostraron que tiene un Filtro de 0.67 (medición Franke
de 0.38), la cual corresponde a la banda 18q21. Se cree que las
enfermedades genéticas severas, que incluyen la colestasis
intrahepática, distrofia de los bastones de conos y bastones y la
osteolisis expandible familiar, implican defectos en esta región de
los cromosomas.
El análisis del ARNm del cual fue derivado el
ADNc fue realizado por el análisis Northern del ARN de
THP-I. El ARN de estas células fue preparado de la
manera que se ha descripto con anterioridad. El ARNm se purificó a
partir del ARN total por medio del uso de un sistema de perla
magnética de poliy-dT (Sistema Polyattract,
Promega). Se sometieron a electroforesis 3 microgramos de poli ARNm
con contenido de (A) sobre un gel de
agarosa-formaldehído al 1%. El gel se lavó durante
30 minutos en dH_{2}O. Los ARN fueron transferidos en vacío a una
membrana de nylon utilizando un buffer alcalino de transferencia (3M
de NaCl, 8 mM de NaOH, 2 mM de sarcosil). Después de la
transferencia, la mancha fue neutralizada por medio de incubación
durante 5 minutos en 200 mM de solución buffer de fosfato a un pH
6.8. El ARN fue entrecruzado a la membrana utilizando un aparato de
entrecruzamiento ultravioleta (Stratagene).
Se realizó una investigación eliminando la
inserción de un plásmido que contenía el producto PCR de la reacción
de 5'RACE que se ha descripto con anterioridad. La sonda fue
radiomarcada utilizando la técnica de cebado randomizado que se ha
descripto en el Ejemplo 2.
Se prehibridizaron los filtros en una solución
rápida de hibridización QuikHyb (Stratagene) durante 30 minutos a
65ºC. La sonda radiomarcada (1-2 x 10^{6} cpm/ml)
y el ADN de esperma de salmón sonicado (concentración final 100
\mug/ml) fueron desnaturalizados calentándolos a 95ºC durante 10
minutos y se sometieron a enfriado rápido sobre hielo antes de
agregar al filtro en QuikHyb. La hibridización se realizó durante 3
horas a 65ºC. La sonda sin hibridizar se eliminó por medio del
lavado de los filtros dos veces durante 15 minutos en sulfato
dodecil sódico 2X SSC, 0.1% a temperatura ambiente seguido de dos
veces durante 15 minutos en 0.1 X de SSC, 0.1% de SDS a 62ºC. A
continuación de los lavados, se dejó que los filtros se secaran
durante un tiempo corto y luego se expusieron a una película Kodak
XAR-2 con pantallas intensificadoras a -80ºC. Los
resultados se muestran en la Figura 7, la cual muestra una especie
importante de ARNm de aproximadamente 4,5 kilobases. Las especies
menores de 4,3 y 1,6 kilobases también están presentes. El tamaño
esperado del ADNc del LLGN es de 1,6 kb. Es probable que la
secuencia de LLGXL sea codificada por la especie principal del ARNm
detectada.
Se obtuvo un filtro preparado comercialmente que
contenía 3 \mug de los ARNm provenientes de tejidos humanos
(corazón, cerebro, placenta, pulmón, hígado, músculo esquelético,
riñón y páncreas) de Clontech (Catálogo #7760-1).
Este filtro se investigó y se describió con anterioridad. Después de
investigar con el fragmento de LLG radiomarcado y con la
autoradiografía, la sonda se retiró por medio de lavado en 0.1X SSC
hirviendo, 0.1% SDS durante 2 x 15 minutos en un incubador a 65ºC.
Luego las membranas fueron investigadas con un fragmento de ADN par
de 1.4 kilobases que codifica a la lipoproteína lipasa humana. El
fragmento se obtuvo por RT-PCR del ARN de
THP-1 (tratado con PMA y oxLDL) utilizando los
cebadores 5' LPL y 3'LPL que se han descripto en la figura 1 y las
condiciones RT-PCR que se han descripto con
anterioridad. Después de la auto-radiografía, las
membranas fueron eliminadas nuevamente y se volvieron a investigar
con un fragmento radiomarcado del ADNc de la actina beta humana
hasta normalizar el contenido del ARN. Los resultados de estos
análisis se muestran en la figura 8. Los niveles más altos del
mensaje de LLG fueron detectados en el ARN de la placenta, y los
niveles inferiores se detectaron en los ARN derivados de los tejidos
del pulmón, del hígado y del riñón. De acuerdo con los estudios
previos realizados por otros (Verhoeven, A.J.M., Jansen, H. (1994)
Biochem. Biophys. Acta .1211,121-124), el mensaje de
la lipoproteína lipasa fue hallado en muchos tejidos, los niveles
más altos se hallaron en el tejido del corazón y del músculo
esquelético. Los resultados de este análisis indican que la
distribución del tejido de la expresión de LLG es muy diferente a la
de LPL. El modelo de la expresión de LLG también es diferente del de
la lipasa hepática o bien la lipasa pancreática, tal como fue
informado por otros (Wang, C.S.. y Hartsuck, J.A. (1993) Biochem.
Biophys. Acta 1166,1-19; Semenkovich, C.F., Chen.
S.W., Wims, M., Luo C.C., Li, W.H., y Chan, L. (1989) J. Lipid Res.
30,423-431; Adams, M.D., Kerlavage, A.R., Fields,
C., y Venter, C. (1993) Nature Genet. 4,256-265)
.
Para determinar el modelo de expresión en los
tejidos humanos adicionales, se investigó otra membrana preparada
comercialmente con ADNc de LLGXL. Esta mancha (Human RNA Master
Blot. Clontech Cat. # 7770-1) contiene
100-500 ng de ARNm proveniente de 50 tejidos
diferentes y es normalizado para conservar la expresión genética
equivalente (Chen, L., y Morin, R. (1971) Biochim. Biophys. Acta
231,194-197). Un fragmento Dral-Srfl
de 1.6 kb del ADNc de LLGXL se rotuló con ^{32}PdCTP utilizando un
sistema de cebado de oligonucleótidos randomizado (Prime It II,
Stratagene) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Después
de una prehibridización de 30 minutos a 65ºC, la investigación se
agregó a una solución de hibridización QuikHyb a 1.3 x 10^{6}.
cpm/ml. La hibridización se realizó durante 2 horas a 65ºC. La sonda
sin hibridizar fue eliminada mediante el lavado de los filtros dos
veces durante 15 minutos con 2X SSC, sulfato dodecil sódico al 1% a
temperatura ambiente seguido de dos veces durante 15 minutos en 0.1
X de SSC, 0.1% de SDS a 62ºC. A continuación de los lavados, los
filtros se dejaron secar en forma breve y luego se expusieron a una
película Kodak XAR-2 con pantallas intensificadoras
a -80ºC, durante períodos de tiempo variantes. Las imágenes
resultantes fueron cuantificadas por medio de densitometría. Los
resultados se muestran en la tabla 2. Los niveles de expresión
relativa de los tejidos representados tanto en la mancha del tejido
múltiple Northern como en la mancha del tejido múltiple fueron
similares, con los niveles más altos registrados en la placenta y
los niveles más bajos registrados en el pulmón, el hígado y en el
riñón. El hígado, el riñón y el pulmón fetal también expresan
aproximadamente los mismos niveles que los tejidos de adultos. Es
sorprendente que los niveles de expresión tisular de la tiroide
fueron los más altos de todos los tejidos representados con la
expresión del 122% en el tejido de la placenta. Aún cuando existe
prioridad para la expresión de la lipasa por la placenta (Rothwel,
J.E., Elphick. M.C. (1982) J. Dev. Physiol.
4,153-159; Verhoeven, A.J.M., Carling D., y Jansen
H. (1994) J. Lipid Res. 35,966-975;. Burton, B.K.,
Mueller, H.W. (1980) Biochim. Biophys. Acta
618.449-460), con anterioridad no se sabía que la
tiroide expresara ninguna lipasa. Estos resultados sugieren que la
expresión de LLG puede estar involucrada en el mantenimiento de la
placenta, donde LLG puede servir para liberar los ácidos grasos
libres de los substratos tales como los fosfolípidos como una fuente
de energía. El LLG expresado en la tiroide puede suministrar
precursores para la síntesis de las moléculas bioactivas por parte
de esa glándula.
Valores dados como porcentajes de expresión con
los niveles del tejido de placenta establecidos de manera arbitraria
en 100%.
Los valores son el promedio de las mediciones
densitométricas provenientes de dos exposiciones
auto-radiográficas. N.D. = no detectable.
Las células de endotelio de vena umbilical humana
(HUVEC) y las células de endotelio de la arteria coronaria humana
(HCAEC) se obtuvieron de Clonetics. Las HUVEC fueron propagadas en
un medio de crecimiento de células endoteliales preparadas desde el
punto de vista comercial (EGM, Clonetics) suplementadas con 3 mg/ml
de extracto de cerebro bovino (Maciag, T., Cerundolo, J.. Ilsley,
S., Kelley. P.R., y Forand, R. (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 76,
5674-5678), Clonetics), mientras que las HCAEC
fueron propagadas en EGM suplementado con 3 mg/ml de extracto de
cerebro bovinoy 3% de suero bovino fetal (concentración final del
5%). Las células crecieron hasta la confluencia, luego el medio se
cambió a EGM sin extracto de cerebro bovino. Los cultivos fueron
estimulados por medio del agregado de 100 ng/ml de miristato de
forbol (Sigma). Después de 24 horas de incubación, se extrajeron los
ARN de las células por medio del método Trizol que ha sido descripto
con anterioridad. Se sometieron a electroforesis veinte microgramos
de ARN total y se transfirieron a la membrana para su análisis. Las
membranas fueron sondeadas con las sondas LLG y LPL tal como se
describió con anterioridad. Los resultados se muestran en la Figura
9. Se extendieron veinte microgramos del ARN total de las células
THP-1 estimuladas con PMA sobre la mancha para su
comparación. Se detectó el ARN que hibridiza a la sonda de LLG en
las células HUVEC sin estimular y estimuladas con PMA. Por el
contrario, los niveles detectables del ARNm de LLG sólo se
encontraron en los cultivos de HCAEC después de la estimulación con
PMA. De acuerdo con los estudios previos de otros, no se detectó
ningún ARNm de la lipoproteína lipasa detectable en ninguno de los
ARN del endotelio (Verhoeven, A.J.M., Jansen, H. (1994) Biochem.
Biophys. Acta 1211,121-124).
Se generaron antisueros para los péptidos con
secuencias correspondientes a una región de la proteína predecida
codificada por el marco de lectura abierta del ADNc de LLG. Este
péptido fue elegido en función de su alto índice de antigenicidad
predecido (Jameson B.A., y Wolf, H. (1988) Comput. Applic. in the
Biosciences 4,181-186). La secuencia del péptido de
inmunización no se halló en ninguna proteína o secuencia de ADN
traducida en la base de datos Genbank. Su posición correspondiente
en la proteína LLG se muestra en la Figura 10. La cisteína carboxi
terminal del péptido no corresponde al residuo de la proteína LLG
putativa, sino que fue introducida para facilitar el acople con la
proteína portadora. El péptido fue sintetizado en un sintetizador
peptídico Applied Biosystems Model 433A. Dos miligramos de péptido
fueron acoplados a dos miligramos de hemocianina de lapa keyhole
limpet activada por maleimido después de los protocolos
incluidos en el Kit Imject Activated Immunogen Conjugation Kit
(Pierce Chemical). Después de desalinizar, una mitad del conjugado
fue emulsionada con un volumen igual del adyuvante completo de
Freund (Pierce). Esta emulsión fue inyectada en un conejo Blanco de
Nueva Zelanda. Cuatro semanas después de la inoculación inicial, se
realizó una estimulación de refuerzo con una emulsión realizada
exactamente de la manera que se describió con anterioridad con
excepción de la utilización del adyuvante incompleto de Freund
(Pierce). Dos semanas después del refuerzo, se llevó a cabo un
sangrado de prueba y los títulos de los anticuerpos específicos
fueron determinados por medio de ELISA utilizando el péptido
inmovilizado. Se realizó un refuerzo subsiguiente un mes después del
primer refuerzo.
Las células HUVEC y HCEAC fueron cultivadas y
estimuladas con PMA de la manera como se describió en el Ejemplo 3C,
excepto que las células mencionadas fueron estimuladas con PMA
durante 48 horas. Las muestras del medio acondicionado (9 ml) fueron
incubadas con 500 \mul de un elemento acuoso al 50% de
heparina-Sefarosa CL-6B en solución
buffer de fosfato (PBS, 150 mM de cloruro de sodio, 100 mM de
fosfato de sodio a un pH de 7.2). La
heparina-Sefarosa fue elegida para purificar en
forma parcial y concentrar las proteínas LLG debido a la
conservación de los residuos de la secuencia de LLGXL que han sido
identificados como críticos para la actividad de unión de la
heparina de LPL (Ma, Y. Henderson, H.E., Liu, M.S., Zhang, H.,
Forsythe, I.J., Clarke-Lewis, I., Hayden. M.R., y
Brunzell, J.D. J. Lipid Res. 35, 2049-2059; y Fig.
6.). Después de la rotación a 4ºC durante 1 hora, las muestras
fueron centrifugadas durante 5 minutos a 150 x g. El medio fue
aspirado y la Sefarosa fue lavada con 14 ml de PBS. Después del
centrifugado y de la aspiración, los pellets de
heparina-Sefarosa fueron suspendidos en 200 \mul
de solución buffer de carga 2x SDS (4% de SDS, 20% de glicerol, 2%
de \beta-mercaptoetanol, 0.002% de bromofenol
azul y 120 mM de Tris a un pH de 6.8). Las muestras se calentaron
hasta los 95ºC durante 5 minutos y 40 \mul se cargaron en un gel
de Tris-Glicina SDS al 10%. Después de la
electroforesis a 140 V durante aproximadamente 90 minutos, las
proteínas fueron transferidas a las membranas de nitrocelulosa por
medio de un aparato de electromanchado Novex (210 V, 1 hora). Las
membranas fueron bloqueadas durante 30 minutos en una solución
buffer bloqueadora al 5% de leche en polvo sin grasas, Tween 20 al
0.1%, 150 mM de cloruro de sodio, 25 mM de Tris a un pH de 7.2).
Los antisueros antipeptídicos y el suero normal de conejo se
diluyeron a 1 : 5000 en una solución buffer bloqueadora y se
incubaron con las membranas durante toda la noche a 4ºC con una
agitación suave. Luego, las membranas se lavaron 4x 15 minutos con
TBST (Tween 20 al 0.1%, 150 mM de cloruro de sodio, 25 mM de Tris a
un pH de 7.2). Antisueros de cabra anti-conejo
conjugados con peroxidasa (Boehringer Mannheim) se diluyó a 1 :5000
en una solución buffer bloqueadora y se incubó con la membrana
durante 1 hora con agitación. Las membranas se lavaron como se
indicó con anterioridad, se sometieron a reacción con un reactivo
quimioluminiscente Renaissance (DuPont NEN) y se expusieron a la
película Kodak XAR-2. Los resultados se muestran en
la Figura 11. Dos especies de proteínas inmunorreactivas están
presentes en las muestras de las células HUVEC y HCAEC sin
estimulación. Los niveles de la proteína inmunorreactiva de las
muestras HCAEC sin estimular son mucho más bajos que los que
corresponden a la muestra de HUVEC. Bajo estimulación con PMA, tres
proteínas inmunorreactivas son secretadas por medio de los cultivos
de las células endoteliales. La exposición a PMA aumentó en gran
medida el nivel de las proteínas de LLG producidas por los cultivos
de las HCAEC. La inducción de PMA de las proteínas LLG no fue tan
significativa en los cultivos de las HUVEC.
Los ADNc que codifican las proteínas LLGN y LLGXL
se clonaron en el vector de expresión de mamíferos pCDNA3 (
Invitrogen). Este vector permite la expresión de los genes extraños
en muchas células de mamíferos por medio del uso del último promotor
principal del citomegalovirus. El producto LLGN 5'RACE fue clonado
en el sitio EcoRI de pCDNA3. El ADNc de LLGXL fue digerido con Dral
y SrfI para producir un ADNc de 1.55 kb (ver la Figura 4.). El
vector fue digerido con la enzima de restricción EcoRV y el vector y
la inserción fueron ligados utilizando la ligasa T4 del ADN y los
reactivos del Rapid Ligation Kit (Boehringer Mannheim) de acuerdo
con las instrucciones del fabricante. Se utilizaron productos de
ligado para transformar el E. Coli competente. Las colonias
resultantes fueron seleccionadas por medio del análisis de
restricción y de secuencias para establecer la presencia y la
orientación de la inserción en el vector de expresión.
Los vectores de expresión de LLG se introdujeron
en las células COS-7 por medio del uso del reactivo
catiónico-lipídico de lipofectamina (GIBCO).
Veinticuatro horas antes de la transfección, las células
COS-7 fueron extendidas en placas de cultivo tisular
de 60 mm a una densidad de 2x10^{5} células / placa. Las células
fueron propagadas en el medio de Eagle modificado por Dulbecco
(DMEM; GIBCO) con un suplemento de suero de feto de ternero al 10%,
100U/ml de penicilina, 100 \mug/ml de estreptomicina. Un
microgramo de ADN de plásmido se agregó a 300 \mul de un medio
Optimem I libre de suero (Gibco). Se diluyeron diez microlitros del
reactivo Lipofectamina en 300 \mul de medio Optimem I y se
combinó con solución de ADN y se dejó asentar a temperatura ambiente
durante 30 minutos. El medio fue eliminado de las placas y las
células fueron enjuagadas con 2 ml de medio Optimem. La solución de
ADN -Lipofectamina se agregó a las placas junto con 2.7 ml del medio
Optimem y las placas fueron incubadas durante 5 horas a 37ºC.
Después de la incubación, el medio libre de suero se eliminó y fue
reemplazado con DMEM con un suplemento de FBS al 2% y antibióticos.
Doce horas después de la transfección, algunos de los cultivos
fueron tratados ya sea con 0.25 mM de Pefabloc SC (Boehringer
Mannheim), un inhibidor de proteasa o bien 10 U/ml de heparina.
Treinta minutos antes de su recolección, las muestras tratadas con
heparina fueron tratadas con un adicional de 40 U/ml de heparina. El
medio fue eliminado de las células 60 horas después de la
transfección. Se agregó Heparina-Sefarosa
CL-4B (200 \mul de un elemento acuoso al 50% en
PBS a un pH de 7.2) a 1 ml del medio y se mezcló a 4ºC durante 1
hora. La Sefarosa se transformó en pellets por medio de centrifugado
de baja velocidad y se lavó tres veces con 1 ml de PBS frío. La
sefarosa se transformó en pellets y se suspendió en 100 \mul de
solución buffer de carga 2x. Las muestras se calentaron a 95ºC
durante 5 minutos. Se cargaron 40 \mul de cada muestra sobre un
gel SDS-PAGE al 10%. La electroforesis y el análisis
Western se realizaron utilizando el antisuero
anti-LLG tal como se describió con anterioridad. Los
resultados correspondientes se muestran en la Figura 12. Las
proteínas del medio acondicionado de HCAEC se incluyeron a título de
referencia de los tamaños. LLGN migra a aproximadamente 40 kD que
corresponde a la banda más baja de HCAEC. El medio de COS, las
células transfectadas con ADNc de LLGXL ADNc contienen tanto las
especies 68 kD como 40 kD. Cuando estas células fueron tratadas con
heparina, tanto la cantidad de las proteínas de 68 kD como de 40 kD
recuperadas del medio aumentaron de manera significativa, lo cual
indica ya sea la liberación de la proteína unida a los
proteoglicanos de la superficie celular o de la estabilización de
las proteínas por parte de la heparina. Cuando las células fueron
tratadas con el inhibidor de proteasa Pefabloc, la cantidad de
proteína de 68 kD aumentó con relación a la de la especie de 40 kD.
Esto sugiere que la proteína de menor peso molecular producida por
estas células es un producto de proteolisis de la forma más amplia
68 kD. El papel del ARNm identificado por medio de la representación
diferencial que codifica a una especia más corta de 40 kD no es
conocida. No obstante ello, ha habido un informe de una forma de
lipasa hepática en forma de ensamble alternativo que aparentemente
se expresa de una manera específica en el tejido y que crearía una
proteína
truncada.
truncada.
Una librería de ADNc lambda disponible
comercialmente derivada del tejido pulmonar de conejo (Clontech,
Cat. #TL1010b) se utilizó para aislar un fragmento del homólogo de
conejo del gen de LLG. Se agregaron cinco microlitros de la librería
de stock a 45 \mul de agua y se calentaron a 95ºC durante 10
minutos. Se agregó lo siguiente en un volumen final de 100 \mul:
200 \muM de dNTPs, 20 mM de Tris-HCl a un pH de
8.4, 50 mM de KCl. 1.5 mM de MgCl_{2}, 100 \muM cada cebador
DLIP774 y LLGgen2a, y 2.5 U de Taq polimerasa (GIBCO). La reacción
fue termociclada 35 veces con los parámetros de: 15 segundos a 94ºC,
20 segundos a 50ºC y 30 segundos a 72ºC. Diez microlitros de la
reacción se analizaron por medio de electroforesis por gel de
agarosa. Se detectó un producto de aproximadamente 300 pares de
bases. Se utilizó una porción de (4 \mul) la mezcla de reacción
para clonar el producto por medio del sistema de clonación TA. Se
formaron las secuencias de la inserción del clon resultante (SEQ ID
NO: 11). Una alineación entre la secuencia de aminoácidos de conejo
deducida (SEQ ID NO: 12) y la secuencia correspondiente del ADNc
humano también se muestra en la Figura 14. De los nucleótidos que no
forman parte de ninguno de los cebadores de amplificación, hay una
identidad del 85.8% entre las secuencias de LLG del conejo y las
humanas. La proteína predecida codificada por este ADNc de conejo
comparte una identidad del 94.6% con la de la proteína humana, con
la mayoría de las substituciones de nucleótidos en la tercera
posición o en la posición "tambaleante" de los codones. Cabe
destacar que esta región se extiende sobre la secuencia "tapa"
de las proteínas LLG predecidas y es un dominio variable de la
familia genética de la lipasa. Es evidente que existe un alto grado
de conservación de este gen entre las
especies.
especies.
Para demostrar la presencia de los genes LLG en
otras especies, los ADN genómicos provenientes de varias especies
fueron digeridos con restricción con EcoRI, separados por
electroforesis en geles de agarosa y manchados sobre las membranas
de nitrocelulosa.
Las membranas fueron hibridizadas durante toda la
noche a 65ºC con 2.5 x 10^{6} de cpm/ml de una sonda con
^{32}P-LLG o :^{32}P-LPL cebados
en forma randomizada (lipoproteína lipasa) en una solución de
hibridización de 6X de SSC, sulfato de dextrano al 10%, solución de
Dendardt 5 X, SDS al 1% y 5 \mug/ml de ADN de esperma de
salmón. Las membranas fueron lavadas con 0.1 X de SSC, SDS al 0.5%
durante diez minutos a temperatura ambiente, luego en forma
secuencial durante diez minutos a 40ºC, 50ºC y 55ºC. Los
autoradiogramas de las manchas se muestran en la Figura 16.
La Figura 16 muestra la presencia de los genes de
LLG y LPL con todas las especies examinadas excepto que no se
observó ninguna hibridización con la sonda de LLG contra el ADN de
rata. Los datos excepcionales de ratas pueden representar una
sustancia artificial provocada por la generación de fragmentos de
restricción de un tamaño anormal que contengan las secuencias LLG.
Tales fragmentos pueden estar fuera del rango de fraccionamiento del
gel de agarosa o pueden colorearse de manera ineficiente. Las
diferentes bandas detectadas por medio de dos sondas indican que LPL
y LLG son genes separados conservados en forma evolutiva.
El medio acondicionado de las células
COS-7 que expresan de manera transitoria la
lipoproteína lipasa (LPL), LLGN, o LLGXL fue sometido a ensayo para
determinar la actividad de la fosfolipasa. Se utilizó MEM con un
contenido del 10% de FBS (MEM) como el blanco y los medios
condicionados de las células COS-7 transfectadas con
un plásmido LLGXL antisentido (AS) se utilizaron como un control
negativo.
Se elaboró una emulsión de fosfatidilcolina (PC)
utilizando 10 \mul de fosfatidilcolina (10 mM), 40 \mul de
^{14}C-fosfatidilcolina, dipalmitoilo (2 \muCi),
marcado en las posiciones sn 1 y 2 y 100 \mul de
Tris-TCNB [100 mM de Tris, 1% de Triton, 5 mM de
CaCl_{2}, 200 mM de NaCl, 0.1% de BSA). La emulsión se evaporó
durante 10 minutos, luego se llevó a un volumen final de 1 ml en
Tris-TCNB.
Las reacciones se realizaron por duplicado y
contuvieron 50 \mul de emulsión PC y 950 \mul del medio. Las
muestras se incubaron en un baño de agua agitada durante
2-4 horas a 37ºC. Las reacciones se terminaron
mediante la adición de 1 ml 1N de HCl, luego se extrajeron con 4 ml
de 2-propanol : hexano (1:1). La capa superior de
hexano de 1.8 ml se hizo pasar a través de una columna de gel de
sílice y los ácidos libres de ^{14}C liberados contenidos en la
fracción de flujo fueron cuantificados en un contador de centelleos.
Los resultados de estos ensayos se muestran en la Figura 14.
Los medios acondicionados de las células COS- 7
que expresan de manera transitoria la lipoproteína lipasa (LPL),
LLGN. o LLGXL fueron sometidos a ensayo para determinar la actividad
de la triacerol lipasa. Se utilizó MEM con un contenido de 10% de
FBS como el blanco y los medios acondicionados de las células
COS-7 transfectadas con un plásmido LLGXL
antisentido (AS) se utilizaron como un control negativo.
Se preparó un substrato concentrado como una
emulsión anhidro de trioleína rotulada, [9.10- ^{3}H(N)] y
trioleína no rotulada (trioleína total final = 150 mg con 6.25 x de
10^{8} cpm), la cual fue estabilizada agregando 9 mg de lecitina
en 100% de glicerol, 0.56 ml de ^{3}H-trioleína,
(0.28 mCi) se mezclaron con 0.17 ml de trioleína sin rotular y 90
\mul de lecitina (9 mg). La mezcla se evaporó bajo una corriente
de nitrógeno. La mezcla seca de lípidos fue emulsionada en 2.5 ml de
glicerol al 100% g por sonicación (nivel 2 de pulsos de 30 segundos
seguidos de ciclos de enfriado de 2 segundos durante 5 minutos].
El substrato de ensayo se preparó por medio de la
dilución de 1 volumen del substrato concentrado con 4 volúmenes de
0.2M de solución buffer Tris-HCl (pH 8.0) con un
contenido del 3% p/v de albúmina de suero bovino libre de ácidos
grasos. El substrato diluido fue agitado en vortex en forma vigorosa
durante 5 segundos.
Las reacciones fueron realizadas por duplicado en
un volumen total de 0.2 ml con un contenido de 0.1 ml den substrato
de ensayo y 0.1 ml de los medios acondicionados indicados. Las
reacciones fueron incubadas durante 90 minutos a 37ºC. Las
reacciones terminaron por medio de la adición de 3.25 ml de
metanol-cloroformheptano 1.41: 1.25: 1 (v/v/v)
seguido por 1.05 ml de 0.1M solución buffer de potasio
carbonato-borato (pH 10.5). Después de mezclar en
forma vigorosa durante 15 segundos, las muestras fueron centrifugada
durante 5 minutos a 1000 rpm. Una alícuota de 1.0 ml de la fase
superior acuosa se contó en un contador de centelleos. Los
resultados de estos ensayos se muestran en la Figura 15.
El LLG recombinante se produjo en las células
infectadas con baculovirus. El LLG recombinante es purificado a
partir del medio que contiene suero o del medio acondicionado libre
de suero por medio de cromatografía sobre heparina - Sefarosa,
seguido de cromatografía sobre una resina de intercambio de
cationes. Un tercer paso cromatográfico tal como el tamiz molecular
se utiliza en la purificación LLG en caso de ser necesario. En el
transcurso de la purificación, los anticuerpos antipeptídicos se
utilizan para monitorear la proteína LLG y se utiliza el ensayo de
fosfolipasa para seguir la actividad de LLG.
En el ensayo fluorescente, las condiciones
finales del ensayo son aproximadamente 10 mM de
Tris-HCl (pH 7.4). 100 mM de KCl, 2 mM de
CaCl_{2}, 5 \muM de C_{6}BD-PC
(1-acil-2-[6-(nitro-2.1,3-benzoxadiazol4-il)amino}
caproilfosfatidilcolina y la proteína LLG (approximadamente
1-100 ng). La reacción está sujeta a excitación por
fluorescencia a 470 nm, y la actividad enzimática, según la medición
realizada por medio de la emisión de fluorescencia a 540 nm es
monitoreada en forma continua. Los compuestos y / o las substancias
que se deben someter a prueba para la estimulación y / o la
inhibición de la actividad de LLG se agregan como
10-200 mM de soluciones en dimetilsulfóxido. Los
compuestos que estimulan o inhiben la actividad de LLG se
identifican como los causantes de una emisión de fluorescencia
aumentada o reducida a 540 nm.
En el ensayo tio, las condiciones finales del
ensayo son de aproximadamente 25 mM de Tris-HCl (pH
8.5), 100 mM de KCl, 10 mM de CaCl_{2}, 4.24 rmM de Triton
X-100, 0.5 mM de
1.2-bis(hexanoiltio)-1,2
dideoxi-sn-glicero-3-fosforilcolirio,
5 mM de 4,4'-ditiobispiridina (de una solución de
stock de 50 mM en etanol), y 1.100 ng de LLG recombinante. La
actividad de la fosfolipasa se determina por medio de la medición
del aumento de la absorción a 342 nm. Los compuestos y/o las
substancias que se deben someter a prueba para la estimulación y/o
la inhibición de la actividad de LLG se agregan como
10-200 mM de soluciones en dimetilsulfóxido. Los
compuestos que estimulan o inhiben la actividad de LLG se
identifican como los causantes de una absorción mayor o menor a 342
nm.
Para estudiar luego la función fisiológica de
LLG, se generaron ratones transgénicos que expresan el LLG
humano.
El fragmento de restricción 1.53 kb DraI/SrfI que
codifica LLGXL (ver la Figura 4) fue clonado en un vector plasmídico
(pHMG) corriente abajo del promotor para el gen reductasa de la
coenzima A (HMG CoA)
3hidroxi-3-metilglutaril expresado
en forma oblícua. Se generaron ratones transgénicos que expresan
diferentes niveles de LLGXL humano utilizando métodos estándar (ver,
por ejemplo G.L.Tromp et al. Gene
1565:199-205, 1995). Los ratones transgénicos son
utilizados para determinar el impacto de la sobreexpresión de LLG.XL
sobre el perfil de lípidos, la patología vascular, la velocidad de
desarrollo y la gravedad de la aterosclerosis y otros parámetros
fisiológicos.
Se examinó la expresión de LLGXL en la
aterosclerosis realizando una reacción en cadena de
transcripcionplimerasa inversa (RT-PCR) utilizando
ARNm aislado de las biopsias vasculares de cuatro pacientes con
aterosclerosis. Las muestras de tejido eran de la pared aórtica (una
muestra), la arteria ilíaca (dos muestras), y la arteria carótida
(una muestra).
Se recibieron las biopsias de aterosclerosis del
Gloucestershire Royal Hospital, Inglaterra y se preparó el ARNm
polyA+ y se volvió a suspender en dietilprocarbonato (DEPC) tratado
con agua a una concentración de 0.5 \mug/\mul de ARNm. Se
realizaron reacciones de transcriptasa inversa de acuerdo con el
protocolo GibcoBRL para el Sistema de preamplificación Superscript
para la Síntesis de la Primera Línea del ADNc. En síntesis, el ADNc
fue sintetizado de la manera siguiente: 2 \mul de cada ARNm se
agregó a 1 \mul de cebador de oligo
(dT)_{12-18} y 9 \mul de agua DEPC. Los
tubos fueron incubados a 70ºC durante 10 minutos y se colocaron
sobre hielo durante 1 minuto. Se agregaron los siguientes
componentes a cada uno de los tubos: 2 \mul de 10X de solución
buffer PCR, 2 \mul de 25 mM MgCl_{2}, 1 \mul de 10 mM de
mezcla dNTP y 2 \mul de 0.1M DTT. Después de 5 minutos a 42ºC, se
agregó 1 \mul (200 unidades) de Super Script II transcriptasa
inversa. Las reacciones se mezclaron con suavidad, luego se
incubaron a 42ºC durante 50 minutos. Las reacciones terminaron por
incubación a 70ºC durante 15 minutos y luego se colocaron sobre
hielo. El ARNm restante se destruyó por medio del agregado de 1
\mul de RNasa H a cada tubo y se incubó durante 20 minutos a
37ºC.
Las amplificaciones PCR se realizaron utilizando
2 \mul de las reacciones del ADNc. A cada tubo se agregó lo
siguiente: 5 \mul de solución buffer 10X PCR, 5 \mul de 2 mM
dNTPs, 1 \mul del cebador hllg-gspl (20 pmol/ml,
ver la Figura 1), 1 \mul del cebador hllg-gsp2a
(20 pmol/ml, ver La Figura 1), 1.5 \mul de 50 mM MgCl_{2}, 0.5
\mul de Taq polimerasa (5U/ml) y 34 \mul de agua. Después de
sostener las reacciones a 95ºC durante 2 minutos, se realizaron
treinta ciclos de PCR de la manera siguiente: 15 segundos a 94ºC, 20
segundos a 52ºC, y 30 segundos 72ºC. Las reacciones terminadas se
sostuvieron durante 10 minutos a 72ºC antes del análisis por
electroforesis por gel de agarosa. Los cebadores
hllg-gsp son específicos para LLG y producen un
producto esperado de 300 bp. En un PCR paralelo para mostrar que
las reacciones de síntesis del ADNc han sido exitosas, se utilizaron
los cebadores específicos para el gen gobernante, G3PDH
(gliceraldehído 3 fosfato dehidrogenasa humana) (cada uno 1 \mul a
20 pmol/ml).
Los cebadores G3PDH (ver la Figura 1) produjeron
el producto esperado de 983 bp en las cuatro muestras de biopsia
vascular. La expresión de LLG se detectó en tres de las cuatro
muestras, sin detectarse ninguna expresión en la muestra de la
arteria carótida.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- Solicitante: Jaye, Michael C.
\hskip3,1cm Doan, Kim-Anh
T.
\hskip3,1cm Krawiec, John A.
\hskip3,1cm Lynch, Kevin J.
\hskip3,1cm Amin, Dilip V.
\hskip3,1cm South, Victoria J.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: POLIPÉPTIDOS LLG DE LA FAMILIA DE LA TRIACILGLICEROL LIPASA Y COMPOSICIONES Y MÉTODOS PARA SU USO EN LA HIDRÓLISIS ENZIMÁTICA Y LAS TERAPIAS PROTEÍCAS Y GENÉTICAS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- CANTIDAD DE SECUENCIAS: 31
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE LA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Domicilio: Rhone-Boulenc Rorer Inc.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Calle: 500 Arcola Rd. 3C43
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Ciudad: Collegeville
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Estado: PA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- Pais: USA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- Código: 19426
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR COMPUTADORA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Tipo Medio: Diskette
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Computadora: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Sistema operativo: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Releasse #1.0, Versión # 1.30
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS ACTUALES DE LA SOLICITUD
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Número de Solicitud: US
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Fecha de Registro:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Clasificación
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN SOBRE EL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Nombre: Fehlner Ph.D., Paul F.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Número de Registro: 35,135
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Referencia/Número de Caso : A2582-WO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN SOBRE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Teléfono: (610)454-3839
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Fax: (610) 454-3808
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 367 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Nombre/Clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Ubicación: 22..180
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SECUENCIA ID
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 53 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 1382 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Nombre/clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Ubicación: 312...1370
\vskip0.800000\baselineskip
- (x)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(3) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERISTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 353 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLECULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 1382 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Nombre/clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Ubicación: 1..1065
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID Nº 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 355 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 6:
\vskip0.500000\baselineskip
- 1. Nombre/clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- 2. Ubicación: 1..1065
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID Nº 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 2565 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (x)
- CARACTERÍSTICA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Nombre/clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Ubicación: 252 1754
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 7
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 501 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Longitud: 1035 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- Hebra: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA
\vskip0.500000\baselineskip
- 1. Nombre/clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- 2. Ubicación: 1..1035
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID Nº 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 345 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 225 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADNc
\vskip0.800000\baselineskip
- (x)
- CARACTERÍSTICA
\vskip0.500000\baselineskip
- 1. Nombre/clave: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- 2. Ubicación: 1..225
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID Nº 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 75 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- TIPO DE MOLÉCULA: Proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 472 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 499 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ Nº 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- Longitud: 465 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Tipo: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- Hebra:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- Topología: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: poteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xii)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Pro Gu Gly Arg Leu Glu Asp Lys Leu His
Lys Pro Lys Ala Thr}
\sac{Cys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 13 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTTTTTTTTT TGA
\hfill13
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATCAATCGC
\hfill10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTAGGACATGC ACAGTGTAAT CTG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGATTGTGCTG GCCACTTCTC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGACACTCCAG GGACTGAAG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 48 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: modificada_base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 36
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /mod_base= i
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: modificada_base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 37
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /modbase= i
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: modificada_base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 41
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /mod_base= i
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: modificada_base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACÓN: 42
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /mod_base= i
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: modificada_base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 46
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /mod_base= i
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: modificada_base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- UBICACIÓN: 47
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTRA INFORMACIÓN: /mod_base= i
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCUACUACUAC UAGGCCACGC GTCGACTAGT ACGGGNNGGG NNGGGNNG
\hfill48
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCACACACAGG CCACGCGTCG ACTAGTAC
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 24:
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACCACCATGG AGAGCAAAGC CCTG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCAGTTTCAG CCTGACTTCT TATTC
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGCTGTGGAC TCAACGATGT C
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCGGGTGGGT AGGTACATTT TG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGGGTGACT TCCAGCCAGG CTGTG
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAACTCTGAAA GGCATGCCTG CCCGG
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGAAGGTCGG AGTCAACGGA TTTGGT
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares base
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- HEBRAS: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: otro ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESCRIPCIÓN: /desc = "Oligonucleótido"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID Nº: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGTGGGCC ATGAGGTCCA CCAC
\hfill24
Claims (35)
1. Un polipéptido aislado codificado por un gen
similar a la lipasa, donde el polipéptido
(a) se une a la heparina,
(b) tiene homología con la lipoproteína lipasa
humana y la lipasa hepática y
(c) comprende un dominio catalítico de 39 kD de
la familia de la triacilglicerol lipasa.
y donde
i) el polipéptido aislado comprende una secuencia
de aminoácido de la SEQ 10 NO: 8 y un peso molecular aparente de
alrededor de 55kD sobre un gel 10% SDS-PAGE, una
secuencia de aminoácido de SEQ 10 NO: 8 y un peso molecular aparente
de alrededor de 68 kD sobre un gel 10% SDS-PAGE, o
una secuencia de aminoácido de SEa ID NO: 6 y un peso molecular
aparente de alrededor de 40kD sobre un gel 10%
SDS-PAGE; o
ii) el dominio catalítico 39 kD comprende la
secuencia de aminoácido de SEQ ID NO: 10; o
iii) el polipéptido aislado es de origen de
conejo y comprende una secuencia de aminoácido de la SEQ 10 NO:
12.
2. El polipéptido aislado de la reivindicación 1,
que comprende una secuencia de aminoácido de la SEQ ID NO: 8 y un
peso molecular aparente de alrededor de 55kD sobre un gel 10%
SDS-PAGE, una secuencia de aminoácido de SEQ ID NO:
8 y un peso molecular aparente de alrededor de 68kD sobre un gel 10%
SDS-PAGE o una secuencia de aminoácido de la SEQ ID
NO: 6 y un peso molecular aparente de alrededor de 40kD sobre un gel
de 10% SDS-PAGE.
3. El polipéptido aislado de la reivindicación 1,
donde el dominio catalítico 39 kD comprende la secuencia de
aminoácido de la secuencia de SEQ ID NO: 10.
4. El polipéptido aislado de la reivindicación 1,
que es de origen de conejo y comprende una secuencia de aminoácido
de la SEQ ID NO: 12.
5. El polipéptido aislado de cualquier
reivindicación anterior, donde el polipéptido tiene la actividad de
la fosfolipasa A.
6. Un ácido nucleico aislado que codifica el
polipéptido de cualquier reivindicación anterior.
7. El ácido nucleico aislado de la reivindicación
6, que es el ADNc.
8. El ácido nucleico aislado de la reivindicación
7, donde la secuencia de nucleótidos se selecciona a partir del
grupo que consiste en las SEQ ID NOS: 5, 7 y 9.
9. El ácido nucleico aislado de la reivindicación
8 que comprende los nucleótidos 252-1754 de la SEQ
ID NO: 7.
10. El ácido nucleico aislado de la
reivindicación 6, que codifica el polipéptido de la reivindicación
4.
11. El ácido nucleico de la reivindicación 10 que
tiene una secuencia de ácido nucleico de la SEQ ID NO: 11.
12. Un ácido nucleico aislado que se hibridiza
bajo las condiciones de 0.1X SSC, 0.5% SDS a 68ºC hasta un blanco
seleccionado a partir del grupo que consiste en los nucleótidos de
44-79 de la SEQ ID NO: 3 y de los nucleótidos de
1036-1065 de la SEQ 10 NO: 5.
13. Un vector que comprende el ácido nucleico
aislado de cualquiera de las reivindicaciones 6-12
unidas operativamente a una región regulatoria.
14. El vector de la reivindicación 13 donde la
región regulatoria proviene de una fuente heteróloga.
15. El vector de la reivindicación 13 o 14, que
es un vector virtual.
16. El vector de la reivindicación 15, que es un
vector adenoviral.
17. Una célula huésped recombinante que comprende
el vector de cualquiera de las reivindicaciones
13-16.
18. La célula huésped recombinante de la
reivindicación 17 donde la célula es una célula eucariótica.
19. La célula huésped recombinante de la
reivindicación 18 donde la célula es una célula
COS-7.
20. Un método para preparar un polipéptido que
comprende el cultivo de la célula recombinante de acuerdo con
cualquiera de las reivindicaciones 17-19 bajo las
condiciones que permiten la expresión del polipéptido.
21. Un anticuerpo capaz de unirse específicamente
al polipéptido de cualquiera de las reivindicaciones
1-5.
22. Un anticuerpo de la reivindicación 21, que es
capaz de neutralizar la actividad de la fosfolipasa del
polipéptido.
23. El anticuerpo de la reivindicación 21 o de la
reivindicación 22, que es un anticuerpo monoclonal.
24. El anticuerpo de la reivindicación 22, que es
un anticuerpo policlonal.
25. Una célula de hibridoma que produce el
anticuerpo de la reivindicación 23.
26. Una composición que comprende
a) El polipéptido de cualquiera de las
reivindicaciones 1-5; o
b) el vector de cualquiera de las
reivindicaciones 13-16; o
c) el anticuerpo de cualquiera de las
reivindicaciones 21-24;
y un portador farmacéuticamente
aceptable.
27. La composición de la reivindicación 26 que
comprende el polipéptido y un portador farmacéuticamente
aceptable.
28. La composición de la reivindicación 26, que
comprende el vector y un portador farmacéuticamente aceptable.
29. La composición de la reivindicación 26, que
comprende el anticuerpo y un portador farmacéuticamente
aceptable.
30. La composición de cualquiera de las
reivindicaciones 26-29, donde el portador
farmacéuticamente aceptable es una solución biológicamente
compatible.
31. Un método para seleccionar agonistas o
antagonistas de la actividad de un polipéptido codificado por un gen
similar a la lipasa (LLG) que comprende:
contactar a los agonistas o antagonistas
potenciales con el polipéptido y un substrato del polipéptido y
(b) medir la capacidad de los agonistas o los
antagonistas potenciales para mejorar o inhibir la actividad del
polipéptido, donde el polipéptido es el polipéptido de la
reivindicación 2.
32. Un método para la hidrólisis enzimática in
vitro de un éster de fosfatidilcolina que comprende el hecho de
contactar al mencionado éster de fosfatidilcolina con el polipéptido
de las reivindicaciones 2 ó 3.
33. Uso de un polipéptido de cualquiera de las
reivindicaciones 1-5 en la elaboración de un
medicamento para mejorar el perfil de lípidos en suero de un humano
u otro animal que tenga un perfil de lípidos no deseado.
34. Uso de un anticuerpo de cualquiera de las
reivindicaciones 21-24 en la elaboración de un
medicamento para mejorar el perfil de lípidos en suero de un humano
o de otro animal que tenga un perfil de lípidos no deseado.
35. Un ratón transgénico que expresa el
polipéptido de la reivindicación 2 ó 3.
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