ES2210235T3 - Sistemas de expresion de mamiferos para proteinas de hcv. - Google Patents

Sistemas de expresion de mamiferos para proteinas de hcv.

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ES2210235T3 ES93904818T ES93904818T ES2210235T3 ES 2210235 T3 ES2210235 T3 ES 2210235T3 ES 93904818 T ES93904818 T ES 93904818T ES 93904818 T ES93904818 T ES 93904818T ES 2210235 T3 ES2210235 T3 ES 2210235T3
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James M. Casey
Suzanne L. Bode
Billy J. Zeck
Julie Yamaguchi
Donald E. Frail
Suresh M. Desai
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Abstract

SISTEMAS DE EXPRESION DE MAMIFEROS PARA LA PRODUCCION DE PROTEINAS DE HCV. TALES SISTEMAS DE EXPRESION PROPORCIONAN GRANDES CANTIDADES DE PROTEINAS DE HCV Y PERMITEN EL DESARROLLO DE REACTIVOS DE DIAGNOSTICO Y TERAPEUTICOS QUE CONTIENEN ANTIGENOS ESTRUCTURALES GLICOSILADOS Y PERMITEN TAMBIEN EL AISLAMIENTO DEL AGENTE ETIOLOGICO DE HCV.

Description

Sistemas de expresión de mamíferos para proteínas de HCV.
Antecedentes de la invención
Esta invención se refiere en general al virus de la hepatitis C (HCV), y más en particular, se refiere a sistemas de expresión de mamíferos capaces de generar proteínas y a usos de estas proteínas.
Las descripciones de la enfermedad de la hepatitis causando ictericia y color amarillento del ojo son conocidas por el hombre desde la antigüedad. Ahora se sabe que la hepatitis viral incluye un grupo de agentes virales con una estructura de organización de proteínas virales y modo de replicación característicos, causando la hepatitis con diferente grado de gravedad de daño hepático a través de distintas rutas de transmisión. La hepatitis viral aguda se diagnostica clínicamente por síntomas bien definidos en el paciente que incluyen ictericia, blandura hepática y un elevado nivel de transaminasas hepáticas tales como la aspartato-aminotransferasa y la alanina-aminotransferasa.
Actualmente, los ensayos serológicos se emplean para distinguir más detalladamente entre la hepatitis A y la hepatitis B. Hepatitis no A no B (NANBH) es un término usado por primera vez en 1975 que describe casos de hepatitis postransfusional no causados por el virus de la hepatitis A o por el virus de la hepatitis B. Feinstone et al., New Engl. J. Med. 292: 454-457 (1975). El diagnóstico de NANBH principalmente se hizo por medio de la exclusión sobre la base de los análisis serológicos para la presencia de hepatitis A o hepatitis B. NANBH es responsable de aproximadamente el 90% de los casos de hepatitis postransfusional. Hollinger et al., en N. R. Rose et al., eds. Manual of Clinical Immunology, American Society for Microbiology, Washington, D. C., 558-572 (1986).
Los intentos para identificar el virus NANBH en virtud de la similitud genómica con uno de los virus de la hepatitis conocidos han fallado hasta ahora, sugiriendo que NANBH tiene una organización genómica y estructura características. Fowler et al., J. Med. Virol. 12:205-213 (1983), y Weiner et al., J. Med. Virol. 21:239-247 (1987). El progreso en el desarrollo de ensayos para detectar anticuerpos específicos para NANBH se ha visto entorpecido por dificultades encontradas en la identificación de antígenos asociados con el virus. Wards et al., patente de Estados Unidos N1 4,870,076; Wards et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 83:6608-6612 (1986); Ohori et al., J. Med. Virol. 12:161-178 (1983); Bradly et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 84:6277-6281 (1987); Akatsuka et al., J. Med. Virol. 20:43-56 (1986).
En mayo de 1988, una colaboración de Chiron Corporation con el Centro de Control de Enfermedades tuvo como resultado la identificación de un supuesto agente NANB del virus de la hepatitis C (HCV). M. Houghton et al. clonaron y expresaron en E. coli un agente NANB obtenido a partir del plasma infeccioso de un chimpancé. Cuo et al., Science 244:359-361 (1989); Choo et al., Science 244:362-364 (1989). Se identificaron las secuencias de ADNc a partir de HCV que codifican para antígenos que inmunológicamente reaccionan con anticuerpos presentes en la mayoría de los pacientes clínicamente diagnosticados con NANBH. Basado en la información disponible y en la estructura molecular de HCV, la estructura genética de los virus consiste en un ARN lineal de una sola hebra (hebra positiva) de peso molecular de aproximadamente 9,5 kb y posee un marco abierto de lectura traduccional continuo. J. A. Cuthbert, Amer. J. Med. Sci. 299:346-355 (1990). Es un virus envuelto pequeño que recuerda a los Flavivirus. Los investigadores han hecho intentos para identificar el agente NANB por cambios estructurales en los hepatocitos en individuos infectados. H. Gupta, Liver 8:111-115 (1988); D. W. Bradly J. Virol. Methods 10:307-319 (1985). Se han detectado cambios ultraestructurales similares en hepatocitos así como en secuencias de ARN de HCV amplificadas por PCR en pacientes NANBH así como en chimpancés experimentalmente infectados con plasma de HCV infeccioso. T. Shimizu et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 87:6441-6444 (1990).
Se encontró una considerable evidencia serológica para implicar al HCV como agente etiológico de la NANBH postransfusional. H. Alter et al., N. Eng. J. Med. 321:1494-1500 (1989); Estaben et al., The Lancet Aug. 5:294-296 (1989); C. van Der Poel et al., The Lancet Aug. 5:297-298 (1989); G. Sbolli, J. Med. Virol. 30:230-232 (1990); M. Makris et al., The Lancet 335:1117-1119 (1990). Aunque la detección de anticuerpos contra HCV elimina del sistema de suministro de sangre del 70 al 80% de la sangre infectada por NANBH, los anticuerpos aparentemente se detectan fácilmente durante el estado crónico de la infección, mientras que sólo el 60% de las muestras de la fase aguda de NANBH son positivas para el anticuerpo contra HCV. H. Alter et al., New Eng. J. Med. 321:1994-1500 (1989). El prolongado intervalo entre la exposición a HCV y la detección de anticuerpo, y la falta de información adecuada con respecto al perfil de respuesta inmune de varias proteínas estructurales y no estructurales plantea preguntas con respecto al estado infeccioso del paciente en las fases latente y negativa para el anticuerpo durante la infección NANBH.
Desde el descubrimiento del supuesto agente etiológico de HCV como se discute arriba, los investigadores han intentado expresar las proteínas del supuesto HCV en sistemas de expresión humanos y también aislar el virus. Hasta la fecha, no se ha publicado ningún trabajo en el que se haya expresado HCV de manera eficaz en sistemas de expresión de mamíferos, y no se ha propagado el virus en sistemas de cultivos tisulares.
Por tanto, hay una necesidad de desarrollar reactivos para ensayo y sistemas de ensayo para identificar la infección aguda y la viremia que puede presentarse, actualmente no detectable por medio de ensayos comercialmente disponibles. Se necesitan estas herramientas para ayudar a distinguir entre la infección aguda y persistente, en curso y/o crónica de aquellos de probable resolución, y para definir el curso del pronóstico de la infección NANBH, para
\hbox{desarrollar}
estrategias preventivas y/o terapéuticas. También los sistemas de expresión que permiten la secreción de estos antígenos glicosilados ayudarían a purificar y a producir reactivos diagnósticos y terapéuticos. Resumen de la invención
Esta invención proporciona nuevos sistemas de expresión que son capaces de generar altos niveles de proteínas expresadas de HCV. En particular, se expresan fragmentos estructurales de HCV de longitud completa como una fusión con la señal de secreción del precursor de la proteína amiloide (APP) o de la hormona del crecimiento humana (HGH). Estos sistemas de expresión únicos permiten la producción de altos niveles de proteínas de HCV, contribuyendo al procesamiento apropiado; glicosilación y plegamiento de la proteína(s) viral(es) en el sistema. En particular, la presente invención proporciona los plásmidos pHCV-162, pHCV-167, pHCV-168, pHCV-169 y pHCV-170. También se incluyen las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresadas por los vectores de expresión de mamíferos pHCV-162 y pHCV-167. Además, se proporcionan las proteínas de fusión HGH-HCV-E2 expresadas por los vectores de expresión de mamíferos pHCV-168, pHCV-169 y pHCV-170.
La presente invención también proporciona un método para detectar un antígeno o anticuerpo de HCV en una muestra de ensayo sospechosa de contener antígeno o anticuerpo de HCV, en donde la mejora consiste en poner en contacto la muestra con un antígeno glicosilado de HCV producido en un sistema de expresión de mamíferos. También se proporciona un método para determinar un antígeno o anticuerpo de HCV en una muestra de ensayo sospechosa de contener un antígeno o anticuerpo de HCV, en donde la mejora consiste en poner en contacto la muestra de ensayo con un anticuerpo producido usando un antígeno glicosilado de HCV producido en un sistema de expresión de mamíferos. El anticuerpo puede ser monoclonal o policlonal.
La presente invención además proporciona un kit de ensayo para detectar la presencia de antígeno de HCV o anticuerpo de HCV en una muestra de ensayo sospechosa de contener dicho antígeno o anticuerpo, que comprende un recipiente que contiene un antígeno glicosilado de HCV producido en un sistema de expresión de mamíferos. El kit de ensayo también incluye un anticuerpo producido usando un antígeno glicosilado de HCV producido en un sistema de expresión de mamíferos. Otro kit de ensayo proporcionado por la presente invención comprende un recipiente que contiene un anticuerpo producido usando un antígeno glicosilado de HCV producido en un sistema de expresión de mamíferos. El anticuerpo proporcionado para los kits de ensayo puede ser monoclonal o policlonal.
Breve descripción de los dibujos
La figura 1 muestra una representación esquemática de la estrategia empleada para generar y unir los clones genómicos de HCV.
La figura 2 muestra una representación esquemática de la localización y composición de aminoácidos de las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresadas por los vectores de expresión de mamíferos pHCV-162 y pHVC-167.
La figura 3 muestra una representación del vector de expresión de mamíferos pRC/CMV.
La figura 4 muestra los resultados de RIPA obtenidos para las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresado por pHCV-162 en células HEK-293 usando sueros humanos positivos para anticuerpo contra HCV.
La figura 5 muestra los resultados de RIPA obtenidos para las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresado por pHCV-162 en células HEK-293 usando anticuerpo policlonal de conejo dirigido contra péptidos sintéticos.
La figura 6 muestra los resultados de RIPA obtenidos para las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresado por pHCV-167 en células HEK-293 usando sueros humanos positivos para anticuerpo contra HCV.
La figura 7 muestra la digestión con endoglicosidasa-H de inmunoprecipitados de las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresados por pHCV-162 y pHCV-167 en células HEK-293.
La figura 8 muestra los resultados de RIPA obtenidos cuando sueros de americanos positivos para anticuerpo contra HCV se analizaron contra las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresadas por pHCV-162 en células HEK-293.
La figura 9 muestra los resultados de RIPA obtenidos cuando los sueros de donantes de sangre voluntarios japoneses se analizaron contra las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresadas por pHCV-162 en células HEK-293.
La figura 10 muestra los resultados de RIPA obtenidos cuando los sueros de donantes de sangre voluntarios japoneses se analizaron contra las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresadas por pHCV-162 en células HEK-293.
La figura 11 muestra una representación esquemática del vector de expresión de mamíferos pCDNA-I.
La figura 12 muestra una representación esquemática de la localización y composición de aminoácidos de la proteína de fusión HGH-HCV-E1 expresada por el vector de expresión de mamíferos pHVC-168.
\newpage
La figura 13 muestra una representación esquemática de la localización o composición de las proteínas de fusión HGH-HCV-E2 expresadas por los vectores de expresión de mamíferos pHCV-169 y pHCV-170.
La figura 14 muestra los resultados de RIPA obtenidos cuando los sueros positivos para el anticuerpo HCV E2 se analizaron contra la proteína de fusión HGH-HCV-E1 expresada por pHCV-168 en células HEK-293.
La figura 15 muestra los resultados de RIPA obtenidos cuando los sueros positivos para el anticuerpo HCV E2 se analizaron contra las proteínas de fusión HGH-HCV-E2 expresadas por pHCV-169 y pHCV-170 en células HEK-293.
Descripción detallada de la invención
La presente invención proporciona clones genómicos de longitud completa en diversos aspectos. Tales clones genómicos de longitud completa pueden permitir el cultivo de los virus HCV que sucesivamente es útil para varios propósitos. Los cultivos eficaces del virus HCV pueden permitir el desarrollo de inhibidores de la replicación viral, proteínas virales para aplicaciones diagnósticas, proteínas virales para terapias y especialmente antígenos virales estructurales, incluyendo, por ejemplo, fragmentos supuestos de la envuelta de HCV, supuestos de E1 de HCV y supuestos de E2 de HCV.
Las líneas celulares que pueden usarse para la replicación viral son numerosas, e incluyen (pero no de forma limitante), por ejemplo, hepatocitos primarios, hepatocitos permanentes o semipermanentes, cultivos transfectados con virus transformantes y con genes transformantes. Líneas celulares especialmente útiles podría incluir, por ejemplo, cultivos de hepatocitos permanentes expresan continuamente cualquiera de los varios genes heterólogos de ARN polimerasa para amplificar secuencias del ARN de HCV bajo el control de estas secuencias específicos de ARN polimerasa.
Las fuentes de secuencias virales de HCV que codifican para antígenos estructurales incluyen el supuesto núcleo, los fragmentos supuestos E1 y E2. La expresión puede llevarse a cabo en sistemas procariotas y eucariotas. La expresión de proteínas de HCV en sistemas de expresión de mamíferos permite que se produzcan proteínas glicosiladas tales como las proteínas E1 y E2. Estas proteínas glicosiladas tienen utilidad diagnóstica en varios aspectos, incluyendo, por ejemplo, los sistemas de ensayo para aplicaciones de selección y pronóstico. La expresión en mamíferos de proteínas virales HCV permite estudios de inhibidores incluyendo la elucidación de los sitos o secuencias virales específicos de unión y/o receptores virales en tipos celulares susceptibles, por ejemplo, células de hígado y similares.
La obtención de clones de expresión específicos como se describe en la presente invención en sistemas de expresión de mamíferos proporciona antígenos para ensayos diagnósticos que pueden determinar la etapa de la infección de HCV, tal como, por ejemplo, infecciones agudas frente a infecciones en curso o persistentes, y/o infecciones recientes frente a exposiciones anteriores. Estos clones de expresión específicos también proporcionan marcadores para la resolución de la enfermedad tales como para distinguir la determinación de la enfermedad a partir de hepatitis crónica causada por HCV. Se contempla que la seroconversión temprana a antígenos estructurales glicosilados posiblemente puede detectarse usando proteínas producidas en estos sistemas de expresión de mamíferos. También se pueden producir anticuerpos, monoclonales y policlonales, a partir de las proteínas derivadas de estos sistemas de expresión de mamíferos que entonces sucesivamente puede usarse para aplicaciones diagnósticas, pronósticas y terapéuticas. También, los reactivos producidos a partir de estos nuevos sistemas de expresión descritos en la presente invención pueden ser útiles en la caracterización y/o aislamiento de otros agentes infecciosos.
Las proteínas producidas por estos sistemas de expresión de mamíferos, así como reactivos producidos a partir de estas proteínas, puede ponerse en un recipiente apropiado y empaquetarse como kits de prueba convenientes para llevar a cabo ensayos. Otros aspectos de la presente invención incluyen un polipéptido que comprende un epítopo de HCV unido a una fase sólida y un anticuerpo contra un epítopo de HCV unido a una fase sólida. También están incluidos métodos para producir un polipéptido que contiene un epítopo de HCV que comprende incubar células hospedadoras transformadas con un vector de expresión de mamífero que contiene una secuencia que codifica para un polipéptido que contiene un epítopo de HCV bajo condiciones que permiten la expresión del polipéptido, y un polipéptido que contiene un epítopo de HCV producido por este método.
La presente invención proporciona ensayos que utilizan los polipéptidos recombinante o sintético proporcionados por la invención, así como los anticuerpos descritos en la presente invención en varios formatos, cualquier de los cuales puede emplear un compuesto generador de señal en el ensayo. También se proporcionan métodos de detección para los ensayos que no utilizan compuestos generadores de señal. Todos los ensayos descritos generalmente detectan el antígeno o el anticuerpo, o ambos, e incluyen poner en contacto una muestra de ensayo con al menos un reactivo proporcionado en la presente invención para formar al menos un complejo antígeno/anticuerpo y detectar la presencia del complejo. Estos ensayos se describen en detalle en la presente invención.
También se incluyen en la presente invención vacunas para el tratamiento de la infección con HCV que comprende un péptido inmunogénico obtenido a partir de un sistema de expresión de mamíferos que contiene un epítopo de HCV, o una preparación inactivada de HCV, o una preparación atenuada de HCV. También se incluye en la presente invención un método de producción de anticuerpos contra HCV que comprende la administración a un individuo de un polipéptido inmunogénico aislado que contiene un epítopo de HCV en cantidad suficiente para producir una respuesta inmune en el individuo inoculado.
También se proporciona en la presente invención una célula crecida en cultivo tisular infectada con HCV.
El término "componente corporal que contiene anticuerpo" (o muestra de ensayo) se refiere a un componente del cuerpo de un individuo que es la fuente de los anticuerpos de interés. Estos componentes son bien conocidos en la técnica. Estas muestras incluyen muestras biológicas que se puede probar por los métodos de la presente invención descritos aquí e incluyen fluidos corporales humanos y animales tales como sangre completa, suero, plasma, fluido cerebroespinal, orina, linfa y varias secreciones externas de los tractos respiratorio, intestinal y genitourinal, lágrimas, saliva, leche, células blancas de la sangre, mielomas y similares, fluidos biológicos tales como sobrenadantes de cultivos celulares, muestras de tejido fijadas y muestras de células fijadas.
Después de la preparación de las proteínas recombinantes, como se describe en la presente invención, las proteínas recombinantes puede usarse para desarrollar ensayos únicos como se describe en la presente invención para detectar la presencia de antígeno o anticuerpo contra HCV. Estas composiciones también pueden usarse para desarrollar anticuerpos monoclonales y/o policlonales con una proteína recombinante específica que une específicamente el epítopo inmunológico de HCV deseado por el especialista. También se contempla que al menos una proteína recombinante de la invención puede usarse para desarrollar vacunas siguiendo métodos conocidos en la técnica.
Se contempla que el reactivo empleado para el ensayo puede proporcionarse en forma de un kit con uno o más recipientes tales como viales o botellas, conteniendo cada recipiente un reactivo separado tal como un anticuerpo monoclonal, o un cocktail de anticuerpos monoclonales, o un polipéptido (recombinante o sintético) empleado en el ensayo.
Las "fases sólidas" ("soportes sólidos") son conocidas por los especialistas en la técnica e incluyen las paredes de los pocillo de una placa de reacción, tubos de ensayo, partículas de poliestireno, bolitas magnéticas, tiras de nitrocelulosa, membranas, micropartículas, tales como partículas de látex y otras. La "fase sólida" no es crítica y puede seleccionarla un especialista en la técnica. De ese modo, las partículas de látex, micropartículas, partículas magnéticas o no magnéticas, membranas, tubos de plástico, paredes de pocillos de microtitulación, astillas de vidrio o silicona, eritrocitos de sangre de carnero también son ejemplos adecuados. Métodos adecuados para la inmovilización de péptidos en fases sólida incluyen interacciones iónicas, hidrófobas, covalentes y similares. Una "fase sólida", como se usa en la presente invención, se refiere a cualquier material que es insoluble o puede hacerse insoluble por una reacción posterior. La fase sólida puede elegirse por su capacidad intrínseca para atraer e inmovilizar el reactivo capturado. Alternativamente, la fase sólida puede retener un receptor adicional que tiene capacidad para atraer e inmovilizar al reactivo capturado. El receptor adicional puede incluir una sustancia cargada que está opuestamente cargada con respecto al reactivo de captura en sí o a una sustancia cargada conjugada con el reactivo capturado. Aún como otra alternativa, la molécula receptora puede ser cualquier miembro de unión específica que se inmoviliza en (se une a) la fase sólida y que tiene la capacidad para inmovilizar el reactivo capturado a través de una reacción específica de unión. La molécula receptora permite la unión indirecta del reactivo capturado a un materia de fase sólida antes de llevar a cabo el ensayo o durante la realización del ensayo. De este modo, la fase sólida puede ser un plástico, un derivado del plástico, un metal magnético o no, la superficie de vidrio o de silicona de un tubo de ensayo, pocillo de microtitulación, láminas, partículas, micropartículas, fragmentos, y otras configuraciones conocidas por los especialistas en la técnica.
Se contempla y está dentro del ámbito de la invención que la fase sólida también puede contener cualquier material poroso con suficiente porosidad para permitir el acceso con anticuerpos de detección y una afinidad de la superficie adecuada para unir antígenos. Generalmente se prefieren estructuras microporosas, pero también pueden usarse los materiales con estructura de gel en estado hidratado. Tales soportes sólidos eficaces incluyen: carbohidratos poliméricos naturales y sus modificaciones sintéticas, derivados entrecruzados o sustituidos, tales como agar, agarosa, ácido algínico entrecruzado, gomas arábigas sustituidas y entrecruzadas, ésteres de celulosa, especialmente con ácido nítrico y ácidos carboxílicos, ésteres de celulosa mezclados, y éteres de celulosa; polímeros naturales que contienen nitrógeno, tales como proteínas y derivados, incluyendo gelatinas entrecruzadas o modificadas; polímero de hidrocarburos naturales, tales como el látex y el caucho; polímeros sintéticos que pueden prepararse con estructuras porosas adecuadas, tales como polímeros de vinilo, incluyendo polietileno, polipropileno, poliestireno, cloruro de polivinilo, acetato de polivinilo y sus derivados parcialmente hidrolizados, poliacrilamidas, polimetacrilatos, copolímeros y terpolímeros de los policondensados anteriores, tales como poliésteres, poliamidas y otros polímeros, tales como poliuretanos y poliepóxidos; materiales inorgánicos porosos tales como sulfatos o carbonatos de metales alcalinotérreos y magnesio, incluyendo sulfato de bario, sulfato cálcico, carbonato cálcico, silicatos de álcali y metales alcalinotérreos, aluminio y magnesio; y óxidos o hidratos de aluminio y silicona, tales como arcillas, alúmina, talco, caolín, zeolita, gel de sílice o vidrio (estos materiales puede usarse como filtros con los materiales poliméricos anteriores); y mezclas o copolímeros de las clases anteriores, tales como copolímeros de injerto obtenidos iniciando la polimerización de polímeros sintéticos sobre un polímero natural preexistente. Todos estos materiales pueden usarse en formas adecuadas; tales como películas, hojas, o placas y puede recubrir o unirse o laminar un apropiado vehículo inerte, tal como papel, vidrio, películas de plástico o tejidos.
La estructura porosa de nitrocelulosa tiene una absorción excelente y propiedades de adsorción para una amplia variedad de reactivos incluyendo los anticuerpos monoclonales. El nailon también posee características similares y también es adecuado. Se contempla que tales soportes sólidos porosos descritos anteriormente preferiblemente están en forma de hojas de grosor de aproximadamente 0,01 a 0,5 mm, preferiblemente aproximadamente 0,1 mm. El tamaño de poro puede variar entre límites amplios, y preferiblemente es de aproximadamente 0,025 a 15 micras, especialmente de aproximadamente 0,15 a 15 micras. Las superficies de tales soportes pueden activarse por procesos químicos que causan la unión covalente del antígeno o el anticuerpo al soporte. La unión irreversible del antígeno o el anticuerpo se obtiene, sin embargo, en general por adsorción al material poroso por fuerzas hidrófobas poco conocidas. También se describen soportes sólidos adecuados en la solicitud de patente de Estados Unidos con Nº de serie 227,272.
El "reactivo indicador" comprende un "compuesto generador de señal" (marcador) que es capaz de generar una señal detectable mensurable por medios externos conjugado (unido) a un miembro de unión específica de HCV. "Miembro de unión específica" como se usa en la presente invención significa un miembro de un par de unión específico. Esto es, dos moléculas diferentes en donde una de las moléculas a través de medios físicos o químicos específicamente se une a la segunda molécula. Además de ser un anticuerpo miembro de un par de unión específico para el HCV, el reactivo indicador también puede ser un miembro de cualquier par de unión específico, incluyendo sistemas hapteno-anti-hapteno tales como biotina o anti-biotina, avidina o biotina, un carbohidrato o una lectina, una secuencia de nucleótidos complementaria, un efector o una molécula receptora, un cofactor enzimático y un enzima, un inhibidor enzimático o un enzima, y similar. Un miembro de unión específico inmunoreactivo puede ser un anticuerpo, un antígeno o un complejo anticuerpo/antígeno que es capaz de unirse a HCV tanto en un ensayo de tipo sándwich, para la captura del reactivo como en un ensayo competitivo, o el miembro de unión específico auxiliar como en un ensayo indirecto.
Los varios "compuestos de generación de señal" (marcador) contemplados incluyen cromógenos, catalíticos tales como enzimas, compuestos luminiscentes tales como fluoresceína y rodamina, elementos radiactivos, y marcadores de visualización directa. Ejemplos de los enzimas incluyen la fosfatasa alcalina, peroxidasa de rábano picante, beta-galactosidasa y similares. La selección de un marcador no es crítica, pero será capaz de producir una señal por sí mismo o junto con una o más sustancias adicionales.
Los varios "compuestos de generación de señal" (marcador) contemplados incluyen cromógenos, catalíticos tales como enzimas, compuestos luminiscentes tales como fluoresceína y rodamina, compuestos quimioluminiscentes tales como los compuestos de acridina, fenantridinio y dioxetano, elementos radiactivos, y marcados de visualización directa. Ejemplos de los enzimas incluyen la fosfatasa alcalina, peroxidasa de rábano picante, beta-galactosidasa y similares. La selección de un marcador no es crítica, pero será capaz de producir una señal por sí mismo o junto con una o más sustancias adicionales.
Otras realizaciones que utilizan otras varias fases sólidas también se contemplan y están en el ámbito de esta invención. Por ejemplo, procedimientos de captura iónica por inmovilización de un complejo de reacción inmovilizable con un polímero cargado negativamente, descrito en la solicitud de patente de Estados Unidos en trámite junto con la presente con Nº de serie 150,278 correspondiente con la publicación de Patente Europea 0326100, y la solicitud de patente de Estados Unidos con Nº de serie 375,029 (publicación EP Nº 0406473), que disfrutan de propiedad común, puede emplearse de acuerdo con la presente invención para efectuar una reacción inmunoquímica rápida de fase en solución. Un complejo inmune inmovilizable se separa del resto de la mezcla de reacción por interacciones iónicas entre el complejo inmune/polianión cargado negativamente y la matriz porosa cargada positivamente tratada previamente, y se detecta usando varios sistemas generadores de señal previamente descritos, incluyendo aquellos descritos en mediciones de señales quimioluminiscentes como se describe en la solicitud de patente de Estados Unidos en trámite junto con la presente con Nº de serie 921,979 correspondiente con la publicación EPO Nº 0 273,115, que disfruta de propiedad común y que se incorpora en la presente invención como referencia.
También, los métodos de la presente invención pueden adaptarse al uso en sistemas que utilizan tecnología de micropartículas incluyendo sistemas automáticos y semiautomáticos en donde la fase sólida comprende una micropartícula. Tales sistemas incluyen los descritos en las solicitudes pendientes de patente de Estados Unidos 425,651 y 425,643, que corresponden con las solicitudes publicadas EPO Nº EP 0 425 633 y EP 0 424 634, respectivamente.
El uso de microscopía de barrido por sonda (SPM) para inmunoensayos también es una tecnología a la que los anticuerpos monoclonales de la presente invención se adaptan fácilmente. En la microscopía de barrido por sonda, en particular en la microscopia de fuerza atómica, en la fase de captura, por ejemplo, al menos uno de los anticuerpos monoclonales de la invención, se adhiere a una fase sólida y se utiliza un microscopio de barrido por sonda para detectar los complejos antígeno/anticuerpo que puede estar presentes en la superficie de la fase sólida. El uso de microscopía de efecto túnel de barrido elimina la necesidad de marcadores que normalmente han de utilizarse en muchos sistemas de inmunoensayo para detectar los complejos antígeno/anticuerpo. Tal sistema se describe en la solicitud de patente pendiente de Estados Unidos con Nº de serie 662,147, que disfruta de propiedad común.
El uso de SPM para monitorizar las reacciones de unión específica puede darse de muchas formas. En una realización, un miembro de una pareja de unión específica (sustancia específica analito que es el anticuerpo monoclonal de la invención) se une a una superficie adecuada para el barrido. La unión de la sustancia específica analito puede ser por adsorción a una pieza de prueba que comprende una fase sólida de una superficie de plástico o metal, siguiendo con métodos conocidos por los especialistas en la técnica. O puede utilizarse una unión covalente de una pareja de unión específica (sustancia específica analito) a una pieza de prueba cuya pieza de prueba comprende una fase sólida de plástico derivado, metal, silicona o vidrio. Los métodos de unión covalente son conocidos por los especialistas en la técnica e incluyen varias formas de unir las parejas de unión específica de forma irreversible a la pieza de muestra. Si la pieza de prueba es silicona o vidrio, la superficie puede activarse antes de unir la pareja de unión específica. Pueden usarse compuestos de silano activado como el trietoxi-aminopropil-silano (disponible en Sigma Chemical Co., St. Louis, MO), trietoxi-vinil-silano (Aldrich Chemical Co., Milwaukee, WI), y (3-mercapto-propil)-trimetoxi silano (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO) para introducir grupos reactivos tales como amino, vinilo y tiol, respectivamente. Tales superficies activadas pueden usarse para unir directamente la pareja de unión (en los casos de amino o tiol) o la superficie activada puede además reaccionar con enlazadores tales como glutaraldehído, bis-(succinimidil)-suberato, SPPD (succinimidil 3-[2-piridilditio] propionato), SMCC (succinimidil-4-[N-maleimidometil] ciclohexano-1-carboxilato), SIAB (succinimidil [4-yodoacetil] aminobenzoato) y SMPB (succinimidil 4-[1-maleimidofenil] butirato) para separar la pareja de unión de la superficie. El grupo vinilo puede oxidarse para proporcionar un medio de enlace covalente. También puede usarse como anclaje para la polimerización de varios polímeros tales como ácido poliacrílico, el cual puede proporcionar puntos múltiples de unión para parejas de unión específicas. La superficie amino puede reaccionar con dextranos oxidados de varios pesos moleculares para proporcionar enlazadores hidrófilos de diferente tamaño y capacidad. Ejemplo de dextranos oxidables incluyen Dextrano T-40 (peso molecular de 40.000 daltons), Dextrano T-110 (peso molecular de 110.000 daltons), Dextrano T-500 (peso molecular de 500.000 daltons), Dextrano T-2M (peso molecular de 2.000.000 daltons) (todos ellos disponibles en Pharmacia, LUGAR), o Ficoll (peso molecular de 70.000 daltons (disponible de Sigma Chemical Co., St. Louis, MO). También pueden usarse interacciones polielectrolíticas para inmovilizar una pareja de unión específica en una superficie de una pieza de muestra usando técnicas y métodos químicos descritos en las solicitudes de patente pendientes de Estados Unidos Nº de serie 150,278, clasificada el 29 de enero de 1988 y Nº de serie 375,029, clasificada el 7 de julio de 1989, que disfrutan de propiedad común. El método de unión preferido es por medios covalentes. Tras la unión de un miembro de unión específico, la superficie puede tratarse además con materiales tales como suero, proteínas u otros agentes de bloqueo para minimizar la unión no específica. La superficie también puede ser barrida en el sitio de fabricación o antes del uso para verificar su adecuación para los fines del ensayo. No se espera que el proceso de barrido altere la propiedades específicas de unión de la pieza de prueba.
Pueden usarse otros varios formatos de ensayo, incluyendo inmunoensayos tipo "sándwich" y ensayo de sonda competitivo. Por ejemplo, los anticuerpos monoclonales producidos a partir de las proteínas de la presente invención puede emplearse en varios sistemas de ensayo para determinar la presencia, si la hay, de proteínas de HCV en una muestra de ensayo. También pueden usarse los fragmentos de estos anticuerpos monoclonales proporcionados. Por ejemplo, en un primer formato de ensayo, un anticuerpo policlonal o monoclonal anti-HCV o fragmento de éste, o una combinación de estos anticuerpos, que están cubriendo una fase sólida, se pone en contacto con una muestra de ensayo que puede contener proteínas de HCV, para formar una mezcla. Esta mezcla se incuba durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para formar complejos antígeno/anticuerpo. Entonces, un reactivo indicador que comprende un anticuerpo monoclonal o policlonal o un fragmento de éstos, que específicamente se une al fragmento de HCV, o una combinación de estos anticuerpos, al que se ha unido un componente que genera una señal, se pone en contacto con los complejos antígeno/anticuerpo para formar una segunda mezcla. Entonces, esta segunda mezcla se incuba durante un tiempo y bajo las condiciones suficientes para formar complejos anticuerpo/antígeno/anticuerpo. La presencia de antígeno de HCV presente en la muestra de ensayo y capturado en la fase sólida, si lo hay, se determina por detección de la señal mensurable generada por el compuesto que genera la señal. La cantidad de antígeno de HCV presente en la muestra de ensayo es proporcional a la señal generada.
Alternativamente, un anticuerpo policlonal o monoclonal anti-HCV, un fragmento de éste o una combinación de estos anticuerpos que se une a un soporte sólido, la muestra de ensayo y un reactivo indicador que comprende un anticuerpo monoclonal o policlonal, o fragmentos de éste, que especialmente se unen al antígeno de HCV, o una combinación de estos anticuerpos a los que se une un compuesto que genera la señal, se ponen en contacto para formar una mezcla. Esta mezcla se incuba durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para formar complejos anticuerpo/antígeno/anticuerpo. La presencia, si la hay, de proteínas de HCV presentes en la muestra de ensayo y capturada en la fase sólida se determina por detección de la señal mensurable generada por el compuesto que genera la señal. La cantidad de proteínas de HCV presentes en la muestra de ensayo es proporcional a la señal generada.
En otro formato de ensayo alternativo, uno o una combinación de uno o más anticuerpos monoclonales de la invención puede emplearse como sonda competitiva para la detección de anticuerpos contra una proteína de HCV. Por ejemplo, las proteínas de HCV, solas o en combinación, pueden cubrir una fase sólida. Una muestra de ensayo sospechosa de contener anticuerpos contra un antígeno de HCV se incuba entonces con un reactivo indicador que comprende un compuesto que genera una señal y al menos un anticuerpo monoclonal de la invención durante un tiempo y bajo condiciones suficiente para formar complejos antígeno/anticuerpo de la muestra de ensayo y el reactivo indicador con la fase sólida o del reactivo indicador con la fase sólida. La reducción en la unión del anticuerpo monoclonal a la fase sólida puede medirse cuantitativamente. Una reducción mensurable en la señal comparada con la señal generada a partir de una muestra de ensayo de hepatitis NANB negativa confirmada indica la presencia de anticuerpo anti-HCV en la muestra de ensayo.
Aún en otro método de detección, cada uno de los anticuerpos monoclonales de la presente invención pueden emplearse en la detección de antígenos HCV en cortes de tejido fijados, así como en células fijadas, por análisis inmunohistoquímico.
Además, estos anticuerpos monoclonales pueden unirse a matrices similares a Sepharose activada con CNBr y usarse para la purificación por afinidad de proteínas específicas de HCV a partir de cultivos celulares, o de tejidos biológicos tales como sangre e hígado.
Los anticuerpos monoclonales de la invención puede también usarse para la generación de anticuerpos quiméricos para uso terapéutico u otras aplicaciones similares.
Los anticuerpos monoclonales o fragmentos de éstos puede proporcionarse individualmente para detectar antígenos de HCV. Las combinaciones de los anticuerpos monoclonales (y fragmentos de éstos) proporcionados en la presente invención también puede usarse juntos como componentes de una mezcla o "cocktail" de al menos un anticuerpo anti-HCV de la invención con anticuerpos contra otras regiones de HCV, cada uno con diferentes especificidades de unión. De ese modo, este cocktail puede incluir los anticuerpos monoclonales de la invención que están dirigidos contra las proteínas de HCV y otros anticuerpos monoclonales contra otros determinantes antigénicos del genoma de HCV.
El anticuerpo policlonal o fragmento de éste que puede usarse en los formatos del ensayo debería unirse específicamente a una región específica de HCV o a otras proteínas de HCV usadas en el ensayo. El anticuerpo policlonal preferiblemente usado es de origen mamífero; pueden usarse anticuerpos policlonales de humano, cabra, conejo o carnero anti-HCV. Más preferiblemente, el anticuerpo policlonal es un anticuerpo policlonal de conejo anti-HCV. El anticuerpo policlonal usado en los ensayos puede usarse sólo o como un cocktail de anticuerpos policlonales. Puesto que los cocktails usados en los formatos del ensayo están compuestos por anticuerpos monoclonales o anticuerpos policlonales que tienen especificidad diferente por HCV, serían útiles para diagnóstico, evaluación y pronóstico de infección por HCV, así como para estudiar la diferenciación de proteínas y la especificidad de HCV.
En otro formato de ensayo, puede detectarse la presencia de anticuerpo y/o antígeno contra HCV en un ensayo simultáneo como sigue. Una muestra de ensayo se pone simultáneamente en contacto con un reactivo de captura de un primer analito, en donde dicho reactivo de captura contiene un primer miembro de unión específico para un primer analito unido a una fase sólida, y un reactivo de captura para un segundo analito, en donde dicho reactivo de captura contiene un primer miembro de unión para un segundo analito unido a la segunda fase sólida, para formar de este modo, una mezcla. Esta mezcla se incuba durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para formar complejos reactivo de captura/primer analito y reactivo de captura/segundo analito. Entonces, estos complejos así formados se ponen en contacto con un reactivo indicador que contiene un miembro de un par de unión específico para el primer analito marcado con un compuesto que genera una señal y un reactivo indicador que contiene un miembro de un par de unión específico para el segundo analito marcado con un compuesto que genera una señal para formar una segunda mezcla. Esta segunda mezcla se incuba durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para formar complejos reactivo de captura/primer analito/reactivo indicador y complejos reactivo de captura/segundo analito/reactivo indicador. La presencia de uno o más analitos se determina detectando una señal generada en conexión con los complejos formados sobre una o ambas fases sólidas con una indicación de la presencia de uno o más analitos en la muestra de ensayo. En este formato de ensayo, puede utilizarse proteínas derivadas de los sistemas de expresión humanos, así como anticuerpos monoclonales producidos a partir de proteínas derivadas de los sistemas de expresión de mamíferos como se describe en la presente invención. Tales sistemas de ensayo se describen con gran detalle en la solicitud de patente pendiente de Estados Unidos Nº de serie 07/574,821 titulada Ensayo simultáneo para la detección de uno o más analitos, clasificada el 29 de agosto de 1990, que disfruta de propiedad común.
Aún en otros formatos de ensayo, pueden utilizarse proteínas recombinantes para detectar la presencia de anti-HCV en las muestras problema. Por ejemplo, una muestra de ensayo se incuba con una fase sólida en la cual al menos se ha unido una proteína recombinante. Éstas reaccionan durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para formar complejos antígeno/anticuerpo. Tras la incubación, se detecta el complejo antígeno/anticuerpo. Se pueden usar reactivos indicadores para facilitar la detección, dependiendo del sistema de ensayo escogido. En otro formato de ensayo, una muestra de ensayo se pone en contacto con una fase sólida a la que se ha unido una proteína recombinante producida como se describe en la presente invención y también se pone en contacto con un anticuerpo monoclonal o policlonal específico para la proteína, que preferiblemente se ha marcado con un reactivo indicador. Después de la incubación durante un tiempo y bajo condiciones suficientes para que se formen complejos anticuerpo/antígeno, la fase sólida se separa de la fase libre, y se detecta el marcaje en la fase sólida o en la libre como una indicación de la presencia de anticuerpo HCV. Se contemplan otros formatos de ensayo utilizando las proteínas de la presente invención. Estos incluyen poner en contacto una muestra de ensayo con una fase sólida a la que se ha unido al menos una proteína recombinante producida en el sistema de expresión de mamíferos, incubar la fase sólida y la muestra de ensayo durante un tiempo y bajo unas condiciones suficientes como para que se formen los complejos antígeno/anticuerpo, y entonces poner en contacto la fase sólida con un antígeno recombinante marcado. Ensayos tales como este y otros se describen en la solicitud de patente pendiente de Estados Unidos Nº de serie 07/787,710, que disfruta de propiedad común.
Mientras que la presente invención describe la preferencia del uso de fases sólidas, se contempla que las proteínas de la presente invención puedan utilizarse en sistemas de ensayo en fase no sólida. Estos sistemas de ensayo son conocidos por los especialistas en la técnica y se considera que están dentro del alcance de la presente invención.
Ahora la presente invención será describa por medio de ejemplo, que quieren ilustrar, pero no limitar, el espíritu y el alcance de la invención.
Ejemplos Ejemplo 1 Generación de clones genómicos de HCV
El ARN aislado a partir del suero o plasma de un chimpancé (designado como "CO") infectado experimentalmente con HCV, o de un paciente humano seropositivo para HCV (designado como "LG") se transcribieron a ADNc usando la transcriptasa inversa empleando cebadores hexaméricos aleatorios o cebadores antisentido específicos derivados de la secuencias prototipo de HCV-1. La secuencia ha sido publicado por Choo et al. (Choo et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:2451-2455 [1991], y está disponible a través de la base de datos GenBank, Nº de acceso M62321). Entonces, esta ADNc se amplificó usando PCR y ADN polimerasa AmpliTaq® (disponible en el kit Gene Amp® de Perkin Elmer Cetus, Norwalk, Conneticut 06859) empleando un segundo cebador sentido colocado aproximadamente 1.000 a 2.000 nucleótidos secuencia arriba del cebador específico antisentido o un par de cebadores sentido y antisentido flaqueando un fragmento de 1.000 a 2.000 nucleótido de HCV. Después de 25 a 35 ciclos de amplificación siguiendo procedimientos estándar conocidos en la técnica, una alícuota de esta mezcla de reacción se sometió a PCR anidada (o "PCR-2"), en donde se emplea un par de cebadores sentido y antisentido localizados en el interior del par de cebadores de PCR original para una amplificación adicional de segmentos del gen de HCV en cantidades suficientes para análisis y subclonación, utilizando secuencias de reconocimiento de endonucleasas presentes en la segunda pareja de cebadores de PCR. De esta forma, se generaron siete fragmentos de ADN contiguo de HCV que entonces podrían unirse usando la estrategia de generación de clonación presentada y descrita en la figura 1. La localización de los cebadores específicos usados de esta manera se presentan en la tabla 1 y se numeran según la secuencia de HCV-1 publicada por Choo et al. (Base de datos de GenBank, Nº de acceso M62321). Tras el montaje, la secuencia de ADN de cada uno de los fragmentos individuales se determinó y se tradujo en las secuencias genómicas de aminoácidos presentadas en las Secuencias ID. Nº 1 y 2, respectivamente, para CO y LG, respectivamente. La comparación del polipéptido genómico de CO con la de HCV-1 demostró diferencias en 98 aminoácidos. La comparación del polipéptido genómico de CO con la de LG, demostró diferencias en 150 aminoácidos. La comparación del polipéptido genómico de LG con la de HCV-1 demostró 134 diferencias de aminoácidos.
Ejemplo 2 Expresión de la proteína E2 de HCV como una fusión con el precursor de la proteína amiloide (APP)
La proteína E2 del HCV a partir de CO desarrollada como se describe en el ejemplo 1, se expresó como una fusión con el precursor de la proteína amiloide (APP). APP ha sido descrita por Kang et al. Nature 325:733-736 (1987). Brevemente, los aminoácidos 384 a 749 de HCV de CO aislado se usaron para sustituir la mayoría de la secuencia codificadora del APP como se muestra en la figura 2. Un fragmento HindIII-StyI de ADN que representa los 66 aminoácidos del extremo amino terminal en un fragmento BglII-XbaI que presenta los 105 aminoácidos del extremo carboxilo terminal de APP se ligaron a un fragmento de PCR derivado de HCV a partir del CO que representa los aminoácidos 384 a 749 de HCV que contienen sitios de restricción de StyI y BglII en sus extremos 5' y 3', respectivamente. Entonces, este casete génico de fusión APP-HCV-E2 se clonó en un vector de expresión de mamífero disponible comercialmente: pRC/CMV, mostrado en la figura 3, (disponible en Invitrogen, San Diego, CA) en los sitios únicos HindIII y XbaI. Tras la transformación en E. coli DH5a se aisló un clon designado como pHCV-162, que sitúa la expresión del casete génico de fusión APP-HCV-E2 bajo el control del potente promotor CMV. La secuencia de nucleótidos completa del vector de expresión de mamíferos pHCV-162 se presenta en la Secuencia ID. Nº 3. La traducción de los nucleótidos 922 hasta 2.535 tuvo como resultado la secuencia de aminoácidos completa de la proteína de fusión APP-HCV-E2 expresada por pHCV-162 como se presenta en la Secuencia ID. Nº 4.
Se usó para todas las transformaciones y análisis de expresión una línea celular primaria de riñón embriónico humano (HEK) transformada con el adenovirus humano de tipo 5, designada como HEK-293. Las células HEK-293 se mantuvieron en medio mínimo esencial (MEM) que se complementó con suero fetal bovino al 10% (FCS), penicilina y estreptomicina.
Se transfectaron aproximadamente 20 \mug de ADN purificado a partir de pHCV-162 en células HEK-293 usando el protocolo del fosfato cálcico modificado según publicaron Chen et al., Molecular and Cellular Biology 7(8):2745-2752 (1987). La solución de fosfato cálcico-ADN se incubó sobre las células HEK-293 durante aproximadamente 15 a 24 horas. La solución se eliminó, las células se lavaron dos veces con medios MEM, y entonces las células se incubaron en medios MEM por un período adicional de 24 a 48 horas. Para analizar la expresión de proteína, las células transfectadas se marcaron metabólicamente con 100 \muCi/ml de metionina S-35 y cisteína durante 12 a 18 horas. Los medios de cultivo se eliminaron y se almacenaron, y las células se lavaron en medios MEM y entonces se lisaron en solución salina tamponada con fosfato (PBS) que contenía Triton X-100® al 1% (disponible en Sigma Chemical Co., St. Louis, MO), dodecil sulfato sódico al 0,1% (SDS), y deoxicolato al 0,5%, designado como PBS-TDS. Entonces, este lisado celular se congeló a -70ºC durante 2 a 24 horas, se descongeló en hielo y luego se clarificó por centrifugación a 50.000 x fuerza g durante una hora a 4ºC. Entonces, se llevaron a cabo ensayos de radioinmunoprecipitación estándar (RIPA) en aquellos lisados de células marcadas y/o medios de cultivo. Brevemente, los lisados de células marcadas y/o los medios de cultivo se incubaron con 2 a 5 \mul de sueros específicos a 4ºC durante una hora. Luego se añadió Proteína A-Sepharose y se incubaron las muestras durante una hora más a 4ºC con agitación. Entonces, se centrifugaron las muestras y los sedimentos se lavaron varias veces con tampón PBS-TDS. Las proteínas recuperadas por inmunoprecipitación se eluyeron calentando en un tampón de muestra de electroforesis (Tris-HCl 50 mM, pH 6,8, ditiotreitol [DTT] 100 mM, SDS al 2%, azul de bromofenol al 0,1% y glicerol al 10%) durante cinco minutos a 95ºC. Entonces, las proteínas eluidas se separaron en geles de poliacrilamida SDS que posteriormente se trataron con un agente fluorográfico tal como Enlightening® (disponible en NEN [DuPont], Boston, MA), se secaron al vacío y se expusieron a una placa de rayos X a -70ºC con pantallas intensificadoras. La figura 4 muestra un análisis RIPA del lisado de células HEK transfectadas con pHCV-162 precipitado con suero humano normal (NHS), un anticuerpo monoclonal dirigido contra las secuencias de APP que se sustituyeron en esta construcción (MAB), y unos sueros humanos positivos para anticuerpo contra HCV (Nº 25). También se muestra en la figura 4 los medios de cultivo (sobrenadante) precipitados con los mismos sueros humanos positivos para anticuerpo contra HCV (Nº 25). A partir de la figura 4, se puede distinguir que mientras que en los medios de cultivo de las células HEK-293 transfectadas con pHCV-162 sólo se detectan bajos niveles de una proteína específica de HCV de aproximadamente 75K daltons, son evidentes altos niveles de expresión de proteína intracelular de la proteína de fusión APP-HCV-E2 de aproximadamente 70K daltons.
Para una caracterización más detallada de esta proteína de fusión APP-HCV-E2, se usó un anticuerpo policlonal de conejo obtenido contra péptidos sintéticos en un RIPA similar, los resultados de la cual se ilustran en la figura 5. Como puede distinguirse a partir de esta figura, el suero de conejo normal (NRS) no precipita la proteína de 70K daltons mientras que los sueros obtenidos contra los aminoácidos 509 a 551 (6512) de HCV, los aminoácidos 380 a 436 (6521) de HCV y los aminoácidos 45 a 62 (anti-N-terminal) de APP son altamente específicos para la proteína de fusión APP-HCV-E2 de 70K daltons.
Para aumentar la secreción de esta proteína de fusión APP-HCV-E2, se generó otro clon en el que se fusionó sólo los 66 aminoácidos del extremo amino-terminal del APP, que contiene las supuestas secuencias señal de secreción de las secuencias HCV-E2. Además, se delecionó una secuencia fuertemente hidrófoba en el extremo carboxilo-terminal de la secuencia HCV-E2 que se identificó como una potencial región transmembrana. El clon resultante se designó como pHCV-167 y se ilustra esquemáticamente en la figura 2. La secuencia de nucleótidos completa del vector de expresión de mamíferos pHCV-167 se muestra en la Secuencia ID. Nº 5. La traducción de los nucleótidos 922 hasta el 2.025 tuvo como resultado la secuencia completa de aminoácidos de la proteína de fusión APP-HCV-E2, expresada por pHCV-167 como se muestra en la Secuencia ID. Nº 6. El ADN purificado de pHCV-167 se transfirió a células HEK-293 y se analizó por RIPA y por geles de poliacrilamida SDS como se describe previamente en la presente invención. La figura 6 muestra los resultados en los que una muestra de suero humano normal (NHS) falla en reconocer la proteína de fusión APP-HCV-E2 presente en el lisado celular o en el sobrenadante celular de las células HEK-293 transfectadas con pHCV-167. La muestras de control positivo de HCV (Nº 25), sin embargo, precipita una proteína de fusión APP-HCV-E2 de aproximadamente 65K daltons presente en el lisado celular de las células HEK-293 transfectadas con pHCV-167. Además, se precipitaron de los medios de cultivo cantidades sustanciales de proteína APP-HCV-E2 secretada de aproximadamente 70K daltons con suero Nº 25.
Se llevó a cabo una digestión con endoglicosidasa-H (Endo-H) para determinar la extensión y la composición de la glicosilación unida a N en las proteínas de fusión APP-HCV-E2 expresadas por pHCV-167 y pHCV-162 en células HEK-293. Brevemente, se precipitaron alícuotas múltiples de lisados celulares marcados a partir de células HEK-293 transfectadas con pHCV-162 y pHCV-167 con suero humano Nº 50 que contenía anticuerpo contra HCV E2 como se ha descrito previamente. Entonces, los sedimentos de proteína A-Sepharose que contenían los complejos proteína-anticuerpo inmunoprecipitados se resuspendieron en tampón (acetato sódico 75 mM, SDS al 0,05%) que contenía o no 0,05 unidades por ml de Endo-H (Sigma). Las digestiones se llevaron a cabo a 37ºC durante 12 a 18 horas y todas las muestras se analizaron en geles de poliacrilamida SDS como se ha descrito previamente. La figura 7 muestra los resultados de la digestión con Endo-H. Los marcadores de peso molecular (PM) marcados con carbono-14 (obtenidos de Amersham, Arlington Height, IL) son comunes en todos los geles y representa 200K, 92,5K, 69K, 46;, 30K y 14,3 K daltons, respectivamente. El suero humano normal (NHS) no inmunoprecipita la proteína de fusión APP-HCV-E2 expresada por pHCV-162 o por pHCV-167, mientras que el suero humano positivo para el anticuerpo HCV E2 (Nº 50) fácilmente detecta la proteína de fusión APP-HCV-E2 de 72K daltons en pHCV-162 y la proteína de fusión APP-HCV-E2 de 65K daltons en pHCV-167. La incubación de estas proteínas inmunoprecipitadas en ausencia de Endo-H (Nº 50 -Endo-H) no afecta significativamente a la cantidad o movilidad de las proteínas expresadas por pHCV-162 o pHCV-167. La incubación en presencia de Endo-H (Nº 50 + Endo-H) sin embargo, reduce drásticamente la movilidad de las proteínas expresadas por pHCV-162 y pHCV-167, produciendo una distribución de tamaño heterogéneo. El peso molecular predicho para el esqueleto polipeptídico no glicosilado de pHCV-162 es de aproximadamente 59K daltons. El tratamiento con Endo-H de pHCV-162 reduce la movilidad a un mínimo de aproximadamente 44K daltons, lo que indica que la proteína de fusión APP-HCV-E2 producida por pHCV-162 se escinde proteolíticamente en el extremos carboxilo-terminal. Un tamaño de aproximadamente 44K daltons concuerda con la escisión de 720 aminoácidos en o cerca de HCV. Igualmente, el tratamiento con Endo-H de pHCV-167 reduce la movilidad a un mínimo de aproximadamente 41K daltons, que favorablemente se compara con el peso molecular predicho de aproximadamente 40K daltons de la proteína de fusión intacta APP-HCV-E2 expresada por pHCV-167.
Ejemplo 3 Detección de anticuerpos HCV E2
Se usaron el ensayo de radioinmunoprecipitación (RIPA) y los análisis en gel de poliacrilamida SDS descritos previamente para analizar en las numerosas muestras de suero la presencia de anticuerpo dirigido contra epítopos de HCV E2. Las células HEK-293 transfectadas con pHCV-162 se marcaron metabólicamente y se prepararon los lisados como se ha descrito previamente. Además del análisis RIPA, en todas las muestras de suero se analizó la presencia de anticuerpos dirigidos contra antígenos recombinantes específicos de HCV que representan áreas distintas del genoma HCV usando el Abbott Matrix® System (disponible en Abbott Laboratories, Abbott Park, IL 60064, patente de Estados Unidos Nº 5,075,077). En los datos de Matrix mostrados en las tabla 2 a 7, C100 levadura representa la región NS4 que contiene los aminoácidos 1.569 a 1.930 del HCV, C100 E. coli representa los aminoácidos 1676 a 1930 de HCV, NS3 representa los aminoácidos 1.192 a 1.457 de HCV, y NÚCLEO representa los aminoácidos 1 a 150 de HCV.
La figura 8 muestra un resultado representativo de RIPA obtenido usando un lisado celular de pHCV-162 para seleccionar donantes de sangre americanos y receptores de transfusiones positivos para anticuerpos contra HCV. La tabla 2 resume el perfil de anticuerpo de estas diversas muestras de sangre de americanos, con siete de las 17 muestras (41%) mostrando anticuerpos contra HCV E2. Se ha demostrado la variabilidad genómica de la región E2 entre los diferentes HCV aislados, particularmente en aislados distintos geográficamente que puede llevar a diferencias en las respuestas anticorpales. Por tanto, hemos analizado la presencia de anticuerpos específicos contra la proteína de fusión APP-HCV-E2 expresada por pHCV-162 en veintiséis donantes voluntarios de sangre japoneses y veinte pacientes hispanos en hemodiálisis que previamente mostraron contener anticuerpos HCV. Las figuras 9 y 10 muestran los análisis por RIPA de los veintiséis donantes voluntarios de sangre japonenses. El control positivo de sueros humanos (Nº 50) y los estándares de peso molecular (PM) aparecen en ambas figuras en las que se demuestra la inmunoprecipitación específica de la proteína de fusión APP-HCV-E2 de aproximadamente 72K daltons en varias de las muestras de suero testadas. La tabla 3 muestra los resultados de RIPA de APP-HCV-E2 y del Abbott Matrix® resumiendo los perfiles de anticuerpo de cada una de las veintiséis muestra de japoneses testadas. La tabla 4 muestran los datos similares para los 20 pacientes hispanos en hemodiálisis testados. La tabla 5 resume los resultados del RIPA obtenidos usando pHCV-162 para detectar anticuerpo específico contra E2 de HCV en estas muestras diversas. Dieciocho de los veintiséis (69%) donantes voluntarios de sangre japoneses, catorce de los 20 (70%) pacientes hispanos en hemodiálisis y siete de los diecisiete (41%) donantes de sangre o receptores de transfusión americanos mostraron una respuesta específica contra la proteína de fusión E2 del HCV. La amplia reactividad demostrada por la proteína de fusión APP-HCV-E2 expresada por pHCV-162 sugiere el reconocimiento de epítopos conservados en E2 del HCV.
Sangrados seriados a partir de cinco receptores de transfusión seroconvertidos para anticuerpos HCV también se analizaron usando la proteína de fusión APP-HCV-E2 expresada por pHCV-162. Este análisis se llevó a cabo para determinar el intervalo de tiempo tras la exposición a HCV al cual pueden detectarse los anticuerpos específicos contra E2. La tabla 6 muestra uno de tales pacientes (AN) que se reconvirtió a NS3 a los 154 días postransfusión (DPT). Los anticuerpos contra E2 del HCV no se detectaron por RIPA hasta los 271 DPT. La tabla 7 muestra otro de estos paciente (WA), que se reconvirtió para el núcleo en algún momento antes de los 76 DPT y que era positivo para anticuerpos contra E2 del HCV en la siguiente fecha disponible de sangrado (103 DPT). La tabla 8 resume los resultados serológicos obtenidos a partir de estos cinco receptores de transfusión indicando que (a) cierto perfil general de anticuerpos en la seroconversión (Estado AB); (b) los días postranfusión a los que un ensayo de ELISA detectaría con más probabilidad anticuerpos contra HCV (2.0 GEN); (c) las muestras en la que el anticuerpo contra E2 del HCV se detectó por RIPA (Estado E2 AB); y (d) el intervalo de tiempo cubierto por las fechas de sangrado probadas (Muestras testadas). Los resultados indican que el anticuerpo contra E2 del HCV, como se detecta en el procedimiento de RIPA descrito aquí, aparece tras la seroconversión para al menos uno de los otros marcadores de HCV (NÚCLEO, NS3, C100, etc) y es continuo de forma natural una vez que aparece. Además, la ausencia de anticuerpo para el gen estructural de NÚCLEO aparece altamente correlacionada con la ausencia de anticuerpo detectable contra E2, otro supuesto antígeno estructural. Está en curso un trabajo más detallado para correlacionar la presencia o ausencia de anticuerpos contra un gene específico de HCV con la progresión de la enfermedad y/o el intervalo de tiempo desde la exposición a los antígenos virales.
Ejemplo 4 Expresión de E1 y E2 del HCV usando señales de secreción de la hormona del crecimiento humano
Se generaron fragmentos de ADN del HCV que representaban a E1 del HCV (aminoácidos 192 a 384 del HCV) y a E2 del HCV (aminoácidos 384 a 750 y 384 a 684 del HCV) a partir del CO aislado, usando PCR como se describe en el ejemplo 2. Se usó un sitio de restricción de EcoRI para unir un oligonucleótido sintético que codificaba para la señal de secreción de la hormona de crecimiento humana (HGH) (Blak et al., Oncogene, 3, 129-136, 1988) en el extremo 5' de esta secuencia del HCV. Entonces, se clonó el fragmento resultante en el vector de expresión de mamíferos pCDNA-I disponible comercialmente, (disponible en Invitrogen, San Diego, California) ilustrado en la figura 11. Tras la transformación en E.coli MC1061/P3, los clones resultantes ponen la expresión de las secuencias clonadas bajo el control específico del potente promotor CMV. Tras los métodos resumidos anteriormente, se aisló un clon capaz de expresar HCV-E1 (aminoácidos 192 a 384 del HCV) empleando la seña de secreción de HGH en el extremo amino-terminal. El clon se designó como pHCV-168 y se ilustra esquemáticamente en la figura 12. De forma similar, se aislaron los clones capaces de expresar E2 del HCV (aminoácidos 384 a 750 ó 384 a 684 de HCV) empleando la señal de secreción de HGH, designados como pHCV-169 y pHCV-170, respectivamente e ilustrados en la figura 13. La secuencia completa de nucleótidos de los vectores de expresión pHCV-168, pHCV-169 y pHCV-170 se muestran en las Secuencias ID. Nº 7, 9 y 11, respectivamente. La traducción de los nucleótidos 2.227 hasta 2.913 tiene como resultado la secuencia completa de aminoácidos de la proteína de fusión HGH-HCV-E1 expresada por pHCV-168 como se muestra en la Secuencia ID. Nº 8. La traducción de los aminoácidos 2.227 hasta 3.429 tiene como resultado la secuencia completa de aminoácidos de la proteína de fusión HGH-HCV-E2 expresada por pHCV-169 como se muestra en la Secuencia ID. Nº 10. La traducción de los nucleótidos 2.227 a 3.228 tiene como resultado la secuencia completa de aminoácidos de la proteína de fusión HGH-HCV-E2 expresada por pHCV-170 como se muestra en la Secuencia ID. Nº 12. El ADN purificado a partir de pHCV-168, pHCV-169 y pHCV-170 se transfirió a las células HEK-293 que entonces se marcaron metabólicamente, se prepararon los lisados celulares y se llevaron a cabo análisis de RIPA como se describe previamente en la presente invención. Siete muestras de suero que previamente mostraron contener anticuerpos contra la proteína de fusión APP-HCV-E2 expresada por pHCV-162 se analizaron contra los lisados celulares marcado de pHCV-168, pHCV-169 y pHCV-170. La figura 14 muestra el análisis de RIPA de pHCV-168 y demostró que cinco sueros que contienen anticuerpos contra E2 del HCV también contienen anticuerpos contra E1 del HCV dirigidos contra una proteína de fusión HGH-HCV-E1 de aproximadamente 33K daltons (Nº 25, Nº 50, Nº 121, Nº 503 y Nº 728), mientras que otros dos sueros no contienen esos anticuerpos (Nº 476 y Nº 505). La figura 15 muestra los resultados de RIPA obtenidos cuando se analizaron los mismos sueros indicados anteriormente contra los lisados celulares marcados de pHCV-169 o pHCV-170. Los siete sueros positivos para anticuerpos contra E1 del HCV detectan dos especies de proteína de aproximadamente 70K y 75K daltons en células transformadas con pHCV-168. Estas dos especies diferentes de la proteína HGH-HCV-E2 podrían ser el resultado de la escisión proteolítica incompleta de la secuencia de E2 del HCV en el extremo carboxilo terminal (en o cerca del aminoácido 720 de HCV) o a partir de diferencias en el procesamiento de carbohidratos entre las dos especies. Los siete sueros positivos para anticuerpos contra E2 del HCV detectaban una única especie de proteína de aproximadamente 62K daltons para la proteína de fusión HGH-HCV-E2 expresada en pHCV-170. La tabla 9 resume el perfil serológico de seis de los siete sueros positivos para anticuerpos contra E2 de HCV analizados contra la proteína de fusión HGH-HCV-E1 expresada en pHCV. Está en curso un trabajo más detallado para correlacionar la presencia o ausencia de anticuerpos contra un gene específico de HCV con la progresión de la enfermedad y/o el intervalo de tiempo desde la exposición a los antígenos virales.
Los clones pHCV-167 y pHCV-162 se han depositado en la American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland, 20852, el 17 de enero de 1992 bajo los términos del tratado de Budapest, y se acordaron los siguientes números de designación de la ATCC: para el clon pHCV-167 se acordó el número de depósito de la ATCC 68893 y para el clon pHCV-162 se acordó en número de depósito de la ATCC 68894. Los clones pHCV-168, pHCV-169 y pHCV-170 se han depositado en la American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland, 20852 el 26 de enero de 1993 bajo los términos del tratado de Budapest, y se acordaron los siguientes números de designación de ATCC: para el clon pHCV-168 se acordó el número de depósito de la ATCC 69228, para el clon pHCV-169 se acordó el número de depósito de la ATCC 69229 y para el clon pHC-170 se acordó el número de depósito de la ATCC 69230. Los depósitos designados se mantendrán durante un período de treinta (30) años a partir de la fecha de depósito, o durante cinco (5) años tras la última solicitud del depósito, o por el periodo impuesto por la patente de Estados Unidos, el que sea más largo. Estos depósitos y otros materiales depositados mencionados en la presente invención se proporcionan sólo por conveniencia, y no se requiere practicar la invención a la vista de las descripciones de la presente invención. Las secuencias del ADNc del HCV en todos los materiales depositadas se incorporan en la presente invención como referencia.
Otras variaciones de las aplicaciones del uso de las proteínas y sistemas de expresión de mamíferos proporcionados en la presente invención serán claras para los especialistas en la técnica. Por consiguiente, se desea que la invención esté limitada sólo de acuerdo con las reivindicaciones adjuntas.
TABLA 1
1
TABLA 2 Sueros de americanos HCV positivos
2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 3 Donantes de sangre japoneses HCV positivos
3
TABLA 4 Pacientes hispanos en hemodiálisis
5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 5 Respuesta anticorporal contra proteínas de HCV
7
TABLA 6 Receptor humano de transfusión (AN)
8
TABLA 7 Receptor humano de transfusión (WA)
10
\vskip1.000000\baselineskip
TABLA 8 Receptores humanos de transfusiones
11
TABLA 9 Muestras positivas seleccionadas para anticuerpo anti E2 del HCV
12
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: CASEY, JAMES M.
\hskip3.2cm
BODE, SUZANNE L.
\hskip3.2cm
ZECK, BILLY J.
\hskip3.2cm
YAMAGUCHI, JULIE
\hskip3.2cm
FRAIL, DONALD E.
\hskip3.2cm
DESAI, SURESH M.
\hskip3.2cm
DEVARE, SUSHIL G.
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: SISTEMAS DE EXPRESIÓN DE MAMÍFEROS PARA PROTEÍNAS DE HCV
\vskip0.666000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 12
\vskip0.666000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO: ABBOTT LABORATORIES D377 / AP6D
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
CALLE: ONE ABBOTT PARK ROAD
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CIUDAD: ABBOTT PARK ROAD
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
ESTADO: IL
\vskip0.333000\baselineskip
(E)
PAÍS: ESTADOS UNIDOS
\vskip0.333000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 60064-3500
\vskip0.666000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: PC IBM compatible
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: PatenIn Release No. 1.0, Versión No. 1.25
\vskip0.666000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.666000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN DEL MANDATARIO/AGENTE:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE: POREMBSKI, PRISCILLA E.
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 33.207
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 5131.PC.01
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: 708-937-6365
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TELEFAX: 708-937-9556
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 1:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3011 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 1:
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 2:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3011 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 2:
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 3:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 7298 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 922..2532
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
35
36
37
38
39
40
41
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 4:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 537 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 4:
42
43
44
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 5:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 7106 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 922..2022
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 5:
45
46
47
48
49
50
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 6:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 367 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
51
52
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 7:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 4810 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 2227..2910
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
53
54
55
56
57
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 8:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 228 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: linear
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
58
59
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 9:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 5323 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 2227..3423
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
60
61
62
63
64
65
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 10:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 399 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 10:
66
67
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 11:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 5125 pares de bases
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.333000\baselineskip
(C)
CADENA: sencilla
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: circular
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.666000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 2227..3225
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 11:
68
69
70
71
72
\vskip0.666000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID Nº: 12:
\vskip0.666000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.333000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 333 aminoácidos
\vskip0.333000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.333000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.666000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.666000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID Nº: 12:
73
74

Claims (13)

1. El plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 68894.
2. El plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 68893.
3. El plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 69228.
4. El plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 69229.
5. El plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 69230.
6. La proteína de fusión APP-HCV-E2 (precursor de la proteína amiloide-virus de la hepatitis C-E2) que puede expresarse por el plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 68894.
7. La proteína de fusión APP-HCV-E2 que puede expresarse por el plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 68893.
8. La proteína de fusión HGH-HCV-E2 (hormona del crecimiento humano-virus de la hepatitis C-E2) que puede expresarse por el plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 69228.
9. La proteína de fusión HGH-HCV-E2 que puede expresarse por el plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 69229.
10. La proteína de fusión HGH-HCV-E2 que puede expresarse por el plásmido caracterizado por A.T.C.C. Nº 69230.
11. Un método para detectar un antígeno o anticuerpo de HCV en una muestra de ensayo sospechosa de contener un antígeno o anticuerpo de HCV que comprende poner en contacto la muestra de ensayo con una proteína de fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 10.
12. Un kit de ensayo para detectar un antígeno o anticuerpo de HCV en una muestra de ensayo sospechosa de contener un antígeno o anticuerpo de HCV que comprende:
un recipiente que contiene una proteína de fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 10.
13. El kit de ensayo de la reivindicación 12 que además comprende un anticuerpo que puede producirse usando una proteína de fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 10.
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Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
UA39944C2 (uk) * 1992-07-07 2001-07-16 Чірон Корпорейшн Спосіб визначення ранньої сероконверсії у ссавця-хазяїна до вірусу гепатиту с і набір для використання в способі
US5514539A (en) 1993-06-29 1996-05-07 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Nucleotide and deduced amino acid sequences of the envelope 1 gene of 51 isolates of hepatitis C virus and the use of reagents derived from these sequences in diagnostic methods and vaccines
US5610009A (en) * 1994-01-28 1997-03-11 Abbott Laboratories Mammalian expression systems for hepatitis C virus envelope genes
ES2174957T5 (es) 1994-07-29 2006-12-16 Innogenetics N.V. Proteinas purificadas de envoltura de virus de la hepatitis c para uso diagnostico y terapeutico.
ATE269064T1 (de) * 1994-10-05 2004-07-15 Apollon Inc Impfstoffe gegen den hepatitis b und c virus
US6235888B1 (en) * 1994-10-05 2001-05-22 The General Hospital Corporation Hepatitis C virus vaccine
RU2189254C2 (ru) * 1995-06-06 2002-09-20 Америкэн Хоум Продактс Корпорэйшн Вакцины против вирусов гепатита
US6127116A (en) 1995-08-29 2000-10-03 Washington University Functional DNA clone for hepatitis C virus (HCV) and uses thereof
US7235394B1 (en) 1995-08-29 2007-06-26 Washington University Functional DNA clone for hepatitis C virus (HCV) and uses thereof
US7049428B1 (en) * 1998-03-04 2006-05-23 Washington University HCV variants
US7338759B1 (en) 1997-03-04 2008-03-04 Washington University HCV variants
EP0947525A1 (en) 1998-03-27 1999-10-06 Innogenetics N.V. Epitopes in viral envelope proteins and specific antibodies directed against these epitopes: use for detection of HCV viral antigen in host tissue
US7108855B2 (en) 1998-06-24 2006-09-19 Innogenetics N.V. Purified hepatitis C virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use
DE19856261C1 (de) 1998-12-07 2000-03-30 Hoechst Marion Roussel De Gmbh Aß-Peptid Screening Assay
BR0112666A (pt) * 2000-07-21 2003-06-10 Schering Corp Peptìdeos como inibidores de ns3-serina protease de vìrus da hepatite c
US7244721B2 (en) * 2000-07-21 2007-07-17 Schering Corporation Peptides as NS3-serine protease inhibitors of hepatitis C virus
AR029851A1 (es) * 2000-07-21 2003-07-16 Dendreon Corp Nuevos peptidos como inhibidores de ns3-serina proteasa del virus de hepatitis c
DK1385870T3 (da) * 2000-07-21 2010-07-05 Schering Corp Peptider som inhibitorer af NS3-serinprotease fra hepatitis C-virus
US7101561B2 (en) 2000-12-01 2006-09-05 Innogenetics N.V. Purified hepatitis C virus envelope proteins for diagnostic and therapeutic use
US6673698B1 (en) 2002-01-19 2004-01-06 Megic Corporation Thin film semiconductor package utilizing a glass substrate with composite polymer/metal interconnect layers
TW544882B (en) * 2001-12-31 2003-08-01 Megic Corp Chip package structure and process thereof
TW584950B (en) 2001-12-31 2004-04-21 Megic Corp Chip packaging structure and process thereof
TW503496B (en) 2001-12-31 2002-09-21 Megic Corp Chip packaging structure and manufacturing process of the same
WO2009020628A1 (en) * 2007-08-06 2009-02-12 Epiphany Biosciences, Inc. Diagnosis of kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (kshv) infection
CA2766794A1 (en) 2009-06-30 2011-01-06 Abbott Laboratories Markers of xmrv infection and uses thereof
EP2471917A4 (en) 2009-08-28 2013-03-13 Tokyo Metropolitan Inst Medical Science POLYNUCLEOTIDE FROM A NEW HEPATITIS C VIRUS STRAIN AND USE THEREOF
CN109232721B (zh) * 2018-09-26 2021-06-29 广州市第八人民医院 Hcv包膜蛋白高度保守区域的肽段418-429及其用途

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
IE62868B1 (en) * 1987-11-18 1995-03-08 Chiron Corp Hepatitis C virus
GB2212511B (en) * 1987-11-18 1992-01-22 Chiron Corp Hepatitis c virus
UA50829C2 (uk) * 1989-03-17 2002-11-15 Чірон Корпорейшн Очищений поліпептид, що містить антиген вірусу гепатиту с, полінуклеотид, вектор, клітини, система експресії, моноклональне антитіло, препарат поліклональних антитіл, нуклеотидна проба, аналітичні набори, спосіб виявлення нуклеїнових кислот, способи імуноаналізу, вакцина, спосіб одержання антитіл
US5308750A (en) * 1989-12-22 1994-05-03 Abbott Laboratories Monoclonal antibodies to putative HCV E2/NS1 proteins and methods for using same
US5106726A (en) * 1990-02-16 1992-04-21 United Biomedical, Inc. Synthetic peptides specific for the detection of antibodies to HCV
SK286106B6 (sk) * 1990-11-08 2008-03-05 Novartis Vaccines & Diagnostics, Inc. Spôsob vykonávania imunodiagnostickej skúšky na detekciu protilátky proti vírusu hepatitídy C

Also Published As

Publication number Publication date
EP0627000A1 (en) 1994-12-07
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AU666176B2 (en) 1996-02-01
TW239147B (es) 1995-01-21
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US5667992A (en) 1997-09-16
JPH07503614A (ja) 1995-04-20
WO1993015193A1 (en) 1993-08-05

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