EP1194529A1 - Composition destinee a la conservation d'adenovirus recombinants infectieux - Google Patents

Composition destinee a la conservation d'adenovirus recombinants infectieux

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EP1194529A1
EP1194529A1 EP00917147A EP00917147A EP1194529A1 EP 1194529 A1 EP1194529 A1 EP 1194529A1 EP 00917147 A EP00917147 A EP 00917147A EP 00917147 A EP00917147 A EP 00917147A EP 1194529 A1 EP1194529 A1 EP 1194529A1
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EP
European Patent Office
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acid
liquid
tris
composition
buffer solution
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP00917147A
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German (de)
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Inventor
Francis Blanche
Shian-Jiun Shih
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Centelion SAS
Original Assignee
Aventis Pharma SA
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Filing date
Publication date
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Withdrawn legal-status Critical Current

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    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00—Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2710/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA dsDNA viruses
    • C12N2710/00011—Details
    • C12N2710/10011—Adenoviridae
    • C12N2710/10051—Methods of production or purification of viral material
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    • C12N2710/00011—Details
    • C12N2710/10011—Adenoviridae
    • C12N2710/10311—Mastadenovirus, e.g. human or simian adenoviruses
    • C12N2710/10351—Methods of production or purification of viral material

Definitions

  • the present invention relates to the storage of adenovirus in a stabilized and storable form and the liquid or frozen compositions intended for this storage.
  • adenovirus in stable compositions, undergoes two types of alteration simultaneously and rapidly over time: on the one hand, an aggregation (coagulation) of the particles in the form of clusters or filaments, which is an extremely serious because it is irreversible, and on the other hand a disintegration of the icosahedral structure of the capsids themselves (by a lysis of the capsids and release of the capsomers in the medium).
  • sucrose does not systematically provide stabilization at + 4 ° C, and depending on the case, stabilization at this temperature never exceeds a period of 2 weeks, or at best less than 2 months.
  • Tris buffer and glycerol In Human Gene Therapy, 7, 1693-99 (1996) is also used a storage formulation based on Tris buffer and glycerol, and comprising magnesium chloride. This formulation is stored at -80 ° C. More generally, the Tris-based formulations described in the literature to date systematically contain magnesium chloride (1 mM in general) or / and a salt at physiological concentration (generally NaCl at 150 mM).
  • the virus is stored systematically at -70 ° C / -80 ° C.
  • the infectious recombinant adenoviruses could be stored in an aqueous medium, at temperatures between +4 and + 20 ° C., in the form of a suspension. in a buffer solution capable of fixing the pH of the medium at slightly alkaline values, added with glycerol and without the addition of divalent metal cations or alkaline cations. More specifically, the pH of the medium is fixed between 8.0 and 9.6.
  • Liquid or frozen compositions containing the adenoviral particles in a buffer solution supplemented with glycerol fall within the scope of the present invention. These compositions have the considerable advantage of good stability, but also of being particularly suitable for the storage for a long time of high concentrations of viral particles.
  • the buffer solution capable of fixing the pH of the medium between 8.0 and 9.6 consists either of an acid / base system comprising Tris [tris (hydroxymethyl) aminomethane], or lysine and an acid chosen from a strong acid (hydrochloric acid for example) or a weak acid (maleic acid, malic acid, or acetic acid for example), or from an acid / base system comprising Hepes [acid 2- ( 4- (2-hydroxyethyl piperazine) -1-yl) ethanesulfonic] and a strong base (soda for example).
  • an acid / base system comprising Tris [tris (hydroxymethyl) aminomethane], or lysine and an acid chosen from a strong acid (hydrochloric acid for example) or a weak acid (maleic acid, malic acid, or acetic acid for example), or from an acid / base system comprising Hepes [acid 2- ( 4- (2-hydroxyethyl piperazine) -1-yl) ethan
  • the pH is fixed between 8.4 and 8.8 and even more particularly at 8.4 (value measured at 25 ° C).
  • the concentration of the buffer solution is determined to exert the buffer effect within a limit and a volume or the pH value is not affected.
  • the molar concentration of acid + base can vary from 10 to 500 mM, preferably from 20 to 100 mM, and more particularly it is fixed at 20 mM.
  • the Tris / HCl buffer solution at a concentration of 20 mM gives particularly satisfactory results.
  • the composition contains 10 to 50% of glycerol, and preferably between 20 and 25% (volumes to volumes).
  • compositions according to the invention can also optionally contain other adjuvants.
  • the latter can be chosen from polymers (polyethylene glycols, for example PEG 400, PEG 8000), pluronics (Pluronic F68 for example) in particular at a rate of approximately 1 to 20% by weight, polysorbates (in particular Tween-20 , for example at 0.01 to 1% by weight), or chosen from sugars such as for example sucrose, mannitol, or dextrose (in particular at a rate of approximately 5 to 10%) or also among alcohols (in particular ethanol) at a rate of 1 to 10% by volume.
  • polymers polyethylene glycols, for example PEG 400, PEG 8000
  • pluronics Pluronic F68 for example
  • polysorbates in particular Tween-20 , for example at 0.01 to 1% by weight
  • sugars such as for example sucrose, mannitol, or dextrose (in particular at a rate of approximately 5 to 10%) or also among alcohols (in
  • compositions according to the invention are particularly suitable for the storage of high concentration adenoviral preparations. Indeed, the compositions thus stabilized make it possible to maintain the viral particles in liquid aqueous suspension (in particular between +4 and + 20 ° C.) while preserving the infectious power of the virus and this even at very high viral concentrations (from values of 1E8 pv / ml up to 1E12 pv / ml or up to 1E13 pv / ml and possibly even up to 5E13 pv / ml).
  • the virus can also be frozen at -20 ° C., thus stored for several months or longer, then thawed in this formulation without damage either to its structure or to its infectious power.
  • compositions can be prepared by suspending in the buffer solution, adenoviral particles initially obtained in aqueous solution, then purified, followed by the addition of glycerol and optionally by the addition of an adjuvant such as cited above.
  • the infectious recombinant adeno virus can be obtained according to the usual methods of production in cells of transcomplementing packaging lines, for example cells of line 293 or of line PER-C6.
  • the viral particles can then be purified by centrifugation in a cesium chloride gradient as described for example in Journal of General Virology, 34, 19-35 (1977). More preferably, the viral particles are purified by liquid chromatography in anion exchange mode, gel filtration, hydrophobic mode or by metal chelation. Purification by anion exchange is particularly advantageous since it makes it possible to obtain, in a single chromatography step, a pure viral preparation, free of proteins, nucleic acids, and other impurities and metabolites originating from the producer cell, and free of compounds provided by the culture medium.
  • adenoviral particles are then formulated in the selected preservation buffer, using in particular dialysis, diafiltration, or gel filtration chromatography methods.
  • the composition thus obtained can optionally be frozen and stored at a desired storage temperature (for example -20 ° C.), but this operation is however not essential for long-term storage, the compositions being stable in the state liquid between +4 and + 20 ° C.
  • compositions according to the invention are stable, without significant degradation [physical and biological stability (infectious power)] for a period of at least 12 months at + 4 ° C or at least 5 months at + 20 ° C.
  • physically stable solution is more particularly understood to mean a solution which does not show the appearance of coagulation, of sedimentation of particles or of precipitate (by visual estimation, by measurement of optical density, by analysis by electron microscopy, or by l analysis of particle size distribution) after the considered storage period.
  • the present invention relates more particularly to the storage of infectious adenovirus in a stabilized form and the liquid or frozen compositions intended for this storage.
  • the formulation according to the invention has the advantage of being the first composition produced allowing the storage of adenoviruses in liquid form at temperatures of +4 to + 20 ° C. while having the possibility of having a high viral concentration.
  • the invention is particularly interesting in its application to recombinant adenoviruses, but it can be applied in general to all adenoviruses (wild or recombinant).
  • adenoviruses can be mentioned, which can advantageously be stored in a composition according to the invention: all of the wild human adenoviruses, belonging to the six known subgroups called A, B, C, D , E, and F, and more particularly all 49 different serotypes of human adenoviruses making up these six subgroups.
  • the invention may be applied to simian wild viruses, bovines, equines, pigs, sheep, or canines belonging to the family of Adenoviridae.
  • the invention may be applied to mutant viruses originating from wild viruses belonging to the family of Adenoviridae.
  • recombinant adenovirus vectors to which the present invention can be applied, there may be mentioned all the modified adenoviruses comprising one or more deletion in the region of the genome called El, or in the region E2, or in the region E3 or in the region E4 , as well as recombinant viruses with multiple deletions combined in the above regions, as well as completely deleted recombinant viruses (called gutless) [FASEB, 11, 615 (1997)].
  • the present invention also applies to recombinant adenoviral vectors further comprising a nucleic acid of interest.
  • the nucleic acid of interest can be inserted at different sites in the adenovirus genome. Advantageously, it is inserted at the level of the region E1, E3, or E4. However, it is clear that other sites can be used. In particular, access to the nucleotide sequence of the genome allows those skilled in the art to identify regions making it possible to insert the nucleic acid of interest.
  • the nucleic acid of interest can be any DNA sequence introduced, in particular any sequence whose transfer and / or expression in the target cell is sought. In particular, it may contain one or more therapeutic genes and / or one or more genes coding for antigenic proteins.
  • the therapeutic genes which can thus be transferred are all the genes whose transcription and possibly translation into the target cell generate products having a therapeutic effect.
  • the therapeutic products mention may more particularly be made of enzymes, blood derivatives, hormones, limphokines: interleukins, interferons, TNF, etc. (WO93 / 19191), growth factors, neuro transmitters or their precursors or enzymes. synthesis, trophic factors: BDNF, CNTF, NGF, IGF, GMF, aFGF, bFGF, NT3, NT5, etc., apolipoproteins: ApoAl, ApoIV, ApoE, etc.
  • dystrophin or a minidystrophin WO93 / 062273
  • the genes used to control restenosis GAX, NOS, etc.
  • the tumor suppressor genes p53, Rb, Rapl A, DCC, k-rev , etc
  • the genes coding for factors involved in coagulation Factors VII, VIII, IX, suicide genes: TK, etc.
  • natural or artificial immunoglobulins Fab, ScFv (WO94 / 29446)
  • anti-apoptotic genes AKT, etc.
  • the therapeutic gene can also be an antisense gene or sequence, the expression of which in the target cell makes it possible to control the expression of genes or the transcription of cellular mRNAs.
  • Such sequences can for example be transcribed, in the target cell, into RNAs complementary to cellular mRNAs and thus block their translation into protein, according to the technique described in patent application EP 140 308.
  • the present invention applies to recombinant adenoviral vectors allowing the production of retroviruses [Tumor Targetting, 3, 59 (1998)], to adenoviruses comprising one or more modifications in one or more proteins constituting the viral capsid, in particular fiber (protein IV) and hexon protein (protein II), or adenoviruses devoid of fiber [Journal of Virology, 73, 1601 (1999)], each of these modifications having been introduced with the aim of modifying the natural tropism of adenovirus [Current Opinion in Biotechnology, 8, 583 (1997)].
  • compositions according to the invention are particularly advantageous because they can be used for the preparation of a medicament intended for therapeutic or prophylactic treatment by gene therapy.
  • Infectious viruses have many applications among which we can cite their use in the field of vaccination and in the field of gene therapy. In these applications, after transfer of their genetic material (RNA or DNA) into the host cell, the viruses use the cellular machinery of the infected cell to carry out the synthesis of proteins encoded by their own genome, and thus induce the specific biological effect research.
  • infectious recombinant viruses carrying a gene of therapeutic interest are used to transfer this gene into specific cells of the organ of the patient to be treated.
  • a wide variety of therapeutic protocols have been described and are currently under clinical evaluation for transferring and expressing therapeutic genes using viral vectors.
  • non-replicative adenoviral vectors have been widely developed in recent years for the transfer of genes coding for therapeutic proteins.
  • these genes mention may be made of the p53 tumor suppressor gene, which is involved in the control of cell proliferation.
  • Various protocols for clinical trials of transfer of the p53 gene using adenoviruses in humans are currently being developed in anticancer indications.
  • adenoviral vectors as therapeutic agents can only be envisaged if methods are available which allow the preparations to be preserved and stored for sufficient long periods without significant loss of infectious power of the viruses in question. This is why the present invention is particularly interesting.
  • a viral suspension is prepared as follows: the 293 cells are cultured in a CellCube (Costar) in DMEM medium supplemented with 10% fetal calf serum. When they reach confluence, the cells are infected at a multiplicity of infection of 2 with an aliquot of the working library of the adenovirus expressing the p53 gene. Five days after infection, the supernatant of production is collected by drainage and clarified by passage through a train of filters of decreasing porosity 10/1 / 0.8-0.2 ⁇ m. This supernatant is then concentrated 20 times in volume by tangential ultrafiltration on a Millipore membrane having a cutoff threshold of 300 kDa.
  • the virus is then purified by chromatography on a balanced Source 15Q column and eluted with a sodium chloride gradient in 20 mM Tris / HCl buffer, pH 8.0.
  • the virus peak is collected, and the virus is concentrated by tangential ultrafiltration on a Millipore membrane having a cutoff threshold of 300 kDa.
  • the viral preparations thus obtained are of very high purity and contain ⁇ 50 ng of serum bovine albumin and ⁇ 10 ng of DNA of the host cell for 1E12 viral particles.
  • the virus is then formulated in the various buffers selected.
  • the buffer change is carried out by chromatography on a PD-10 column (Amersham-Pharmacia Biotech) filled with Sephadex G-25 balanced and eluted with the selected buffer according to the supplier's instructions. After dosing by chromatography, the concentration of the virus is adjusted if necessary to the target value by dilution in the selected formulation buffer.
  • the viral stability in the various formulations is then studied by placing, for each of the selected formulations, 2 ml of viral suspension in a polypropylene tube at the temperature studied (-20 ° C, + 4 ° C, or + 20 ° C). The samples are then stored at this temperature for a period determined for each of the experiments in question (see examples below).
  • the analyzes by electron microscopy are carried out by depositing the solution to be analyzed on a carbon grid which is then treated in negative staining with 1.5% uranyl acetate.
  • the apparatus used for these analyzes is a Jeol 1010 electron microscope operating at a voltage of 50 kV to 100 kV.
  • Viral particle size distribution analyzes are performed by photon correlation spectroscopy (PCS) using a Coulter N4 + device (Coultronics).
  • HPLC analyzes high performance liquid chromatography
  • This column mounted on an HPLC system equipped with a UV / visible detection system operating in the absorbance range 200- 300 nm, is used for the separation and the quantification of the viral particles.
  • the column is equilibrated at 30 ° C in a 20 mM Tris / HCl buffer, pH 7.5 at a flow rate of 1.5 ml / min.
  • the sample to be analyzed containing the viral particles is injected onto the column.
  • the column is washed with 5 volumes of the same buffer, and the fixed species are eluted with a linear gradient of 0 to 1 M of sodium chloride in the 20 mM Tris / HCl buffer, pH 7.5 over 30 column volumes. At the end of the gradient, the column is washed with 2 volumes of 0.5 N sodium hydroxide column before re-equilibration for the next analysis.
  • a standard curve at 260 nm is constructed with a preparation of adenovirus particles purified by chromatography. This standard preparation was previously titrated into particles by its absorbance at 260 nm in a 0.1% SDS solution using the conversion factor of 1 x 10 particles per unit of absorbance at 260 nm). The samples are filtered through a filter (0.22 ⁇ m) before analysis by chromatography.
  • the adenovirus titration technique is described by FL Graham et al., Molecular Biotechnology, 3, 207 (1995).
  • the technique for measuring the expression of the penton protein by immunotitration followed by quantification by flow cytometry is described in Boyle et al., "Determination of adenoviral vector activity using an immunotitration method", poster presented in "5 , h annual meeting of viral vector and vaccines, (1998) ”.
  • compositions according to the invention Storage at + 4 ° C of compositions according to the invention; physical stability of viral particles:
  • the infectious power of viral particles is measured by the capacity of the particles to express the transgene which they contain and to lead to the expression of the corresponding protein.
  • the protein here is the penton protein (protein III) which is detected by immunotitration using a labeling method with an antibody (anti-penton) followed by an analysis by flow cytometry. The result obtained is expressed in infection units per ml of solution (IU / ml).
  • the calculation of the pv / IU ratio represents a second way of expressing the evolution of the infectious titer over time. Under the experimental conditions used, this ratio has a value of approximately 20 ⁇ 10 for a viral preparation freshly obtained before storage.
  • the table below shows the infectious power of the particles formulated as glycerol or sucrose after 6 or 12 months of storage at + 4 ° C or after 1 month of storage at + 4 ° C then 3.5 months of storage at +20 ° C.
  • the low concentration formulation (0.36 x 10 12 pv / ml) sees its title decrease after a storage of one month at + 4 ° C followed by a storage of 3.5 months at + 20 ° C.
  • Formulations containing sucrose are totally unsuitable when the concentration is increased.
  • the particles appear native, full, whole, and symmetrical. Virtually no free subunit is detectable in the medium.
  • the particles are for the most part aggregated either into masses containing approximately 50 particles, or into filamentous structures. Some particles have lost part of their capsomers and have a more rounded or ovoid structure. The capsomers and the fibers released into the medium remain completely dispersed and are very easily observable. This is observed both at + 4 ° C and + 20 ° C. After 12 months at 4 ° C, the particles stored in 20% glycerol appear unchanged (solid, whole and symmetrical).
  • the infectivity of the particles is determined by the titration in pfu / ml.
  • pfu plaque forming unit
  • the term pfu corresponds to the determination of the infectious power of an adenovirus solution. This determination is made by infection of an appropriate cell culture, and measures, generally after 15 days of incubation, the number of plaques of infected cells. These dosages are based on biological methods and the values obtained are to a certain extent a function of the operating conditions used [J. Nirol., 70, 7498 (1996)].
  • the table below shows the infectious titer, measured in a pfu test, of a viral preparation stored for 2 months at -20 ° C.
  • the value of the measurement of the infectious titre, and more particularly the pv / pfu ratio, indicates that the viral particles were not altered by the freeze-thaw stage, nor by the storage for 2 months at -20 ° C. (This ratio has a value of approximately 20 to 30 for the initial viral preparation).
  • compositions according to the invention Storage at + 4 ° C of compositions according to the invention; physical stability of viral particles:

Abstract

Compositions liquides ou congelées contenant les particules adénovirales comprenant une solution tampon capable de fixer le pH du milieu à des valeurs légèrement alcalines, additionnée de glycérol et sans adjonction de cations métalliques divalents ou de cations alcalins.

Description

COMPOSITION DESTINEE A LA CONSERVATION D'ADENOVIRUS RECOMBINANTS INFECTIEUX
La présente invention concerne la conservation d'adénovirus sous une forme stabilisée et stockable et les compositions liquides ou congelées destinées à cette conservation.
La conservation d'adénovirus dans des compositions stables est un problème connu, qui a fait l'objet de nombreuses études, sans pour autant donner des résultats véritablement satisfaisants jusqu'à présent. Les virus recombinants ne sont en effet utilisables que si l'on parvient à les stocker sans dégradation et sans perte de leur pouvoir infectieux. L'état physique des particules adénovirales, en solution, subit deux types d'altérations simultanément et rapidement au cours du temps : d'une part une agrégation (coagulation) des particules sous forme d'amas ou de filaments, qui est un phénomène extrêmement grave car il est irréversible, et d'autre part une désintégration de la structure icosahédrale des capsides elles-mêmes (par une lyse des capsides et libération des capsomères dans le milieu).
Dans la demande internationale WO 98/02522 a été décrit un procédé de conservation de virus recombinants infectieux sous forme de suspension dans une solution aqueuse comprenant du saccharose. Les compositions préconisées ne contiennent pas de glycérol et contiennent selon un aspect préféré au moins un sel de cation divalent ou de cation alcalin monovalent.
Cependant il peut être montré que le saccharose n'apporte pas systématiquement une stabilisation à +4°C, et selon les cas la stabilisation à cette température ne dépasse jamais une période de 2 semaines, ou au mieux inférieure à 2 mois.
Dans J. Virology, 70(11), 7498-7509 (1996) ont été décrites des conservations d'adénovirus sous forme de solutions tampon à base de tampon Tris et de glycérol, mais contenant systématiquement du chlorure de magnésium. Ces préparations nécessitent une conservation à des températures très basses, de l'ordre de -70°C pour éviter une réduction de leur pouvoir infectieux.
Dans Human Gène Therapy, 7, 1693-99 (1996) est également utilisée une formulation de stockage à base de tampon Tris et de glycérol, et comprenant du chlorure de magnésium. Cette formulation est conservée à -80°C. Plus généralement, les formulations à base de Tris décrites dans la littérature à ce jour contiennent de façon systématique du chlorure de magnésium (1 mM en général) ou/et un sel à concentration physiologique ( généralement NaCl à 150 mM). On peut citer par exemple à titre illustratif [Cell, 68, 143-155 (1992) ; Nature Genetics, 3, 229-234 (1993) ; Human Gène Therapy, 6, 5-11 (1995) ; Human Gène Therapy, 6, 145-153 (1995) ; Human Gène Therapy, 6, 277-287 (1995) ; Human Gène Therapy, 6, 643- 666 (1995) ; Human Gène Therapy, 6, 1039-1044 (1995) ; Human Gène Therapy, 6, 1317-1322 (1995) ; Human Gène Therapy, 6, 1587-1593 (1995) ; Human Gène Therapy, 7, 2177-2184 (1996) ; J. Virology, 73, 1601-1608 (1999)]. Lorsque les auteurs le précisent, la conservation du virus est effectuée systématiquement à -70°C / -80°C.
Il a été montré depuis, que l'évolution de la structure virale (agrégation et lyse) est un phénomène très dépendant de facteurs tels que la concentration de certains contre-ions cationiques ajoutés à la solution et aussi tels que la concentration d'adénovirus. Au dessus de concentrations de 1E12 pv/ml environ, l'agrégation et la désintégration des capsides (donc la perte de pouvoir infectieux) sont observées en quelques heures à quelques jours, selon les compositions pharmaceutiques utilisées, alors que ces phénomènes deviennent plus lents à faible concentration. De ce fait il est particulièrement difficile de conserver pendant un temps prolongé des compositions fortement concentrées en particules virales.
Il a été ainsi trouvé, et c'est ce qui fait l'objet de la présente invention, que les adénovirus recombinants infectieux pouvaient être conservés en milieu aqueux, à des températures comprises entre +4 et +20°C, sous forme de suspension dans une solution tampon capable de fixer le pH du milieu à des valeurs légèrement alcalines, additionnée de glycérol et sans adjonction de cations métalliques divalents ou de cations alcalins. Plus spécifiquement le pH du milieu est fixé entre 8,0 et 9,6.
Les compositions liquides ou congelées contenant les particules adénovirales dans une solution tampon additionnée de glycérol entrent dans le cadre de la présente invention. Ces compositions présentent l'avantage considérable d'une bonne stabilité, mais aussi d'être particulièrement adaptées à la conservation pendant un temps prolongé de concentrations élevées en particules virales. Selon l'invention, la solution tampon capable de fixer le pH du milieu entre 8,0 et 9,6 est constituée soit d'un système acide/base comprenant le Tris [tris(hydroxymé- thyl)aminométhane], ou la lysine et un acide choisi parmi un acide fort (acide chlorhy- drique par exemple) ou un acide faible (acide maléique, acide malique, ou acide acétique par exemple), soit d'un système acide/base comprenant l'Hepes [acide 2-(4- (2-hydroxyéthyl pipérazin)-l-yl)éthanesulfonique] et une base forte (soude par exemple).
De préférence le pH est fixé entre 8,4 et 8,8 et encore plus particulièrement à 8,4 (valeur mesurée à 25°C).
La concentration de la solution tampon est déterminée de mamère à exercer l'effet tampon dans une limite et un volume ou la valeur du pH ne soit pas affectée. La concentration molaire en acide + base peut varier de 10 à 500 mM, de préférence de 20 à 100 mM, et plus particulièrement elle est fixée à 20 mM. Parmi les systèmes tampons selon l'invention, la solution tampon Tris/HCl à une concentration de 20 mM donne des résultats particulièrement satisfaisants.
Selon l'invention, la composition contient 10 à 50 % de glycérol, et de préférence entre 20 et 25 % (volumes à volumes).
Les compositions selon l'invention peuvent en outre contenir optionnellement d'autres adjuvants. Ces derniers peuvent être choisis parmi des polymères (polyéthylène glycols, par exemple PEG 400, PEG 8000), les pluronics (Pluronic F68 par exemple) notamment à raison d'environ 1 à 20 % en poids, les polysorbates (notamment le Tween-20, par exemple à 0,01 à 1 % en poids), ou choisi parmi des sucres comme par exemple le saccharose, le mannitol, ou le dextrose (notamment à raison d'environ 5 à 10 %) ou encore parmi les alcools (notamment l'éthanol) à raison de 1 à 10 % en volume.
Les compositions selon l'invention sont particulièrement adaptées à la conservation des préparations adénovirales de forte concentration. En effet les compositions ainsi stabilisées permettent de maintenir les particules virales en suspension aqueuse liquide (notamment entre +4 et +20°C) tout en préservant le pouvoir infectieux du virus et ceci même à des concentrations virales très élevées (depuis des valeurs de 1E8 pv/ml jusqu'à 1E12 pv/ml ou jusqu'à 1E13 pv/ml et pouvant même aller jusqu'à 5E13 pv/ml). Selon une autre alternative de l'invention le virus peut aussi être congelé à -20°C, conservé ainsi plusieurs mois ou plus longtemps, puis décongelé dans cette formulation sans dommage ni pour sa structure ni pour son pouvoir infectieux.
Selon l'invention, les compositions peuvent être préparées par mise en suspension dans la solution tampon, de particules adénovirales initialement obtenues en solution aqueuse, puis purifiées, suivie de l'addition de glycérol et éventuellement de l'addition d'un adjuvant tel que cité précédemment.
L'adéno virus recombinant infectieux peut être obtenu suivant les méthodes habituelles de production dans des cellules de lignées transcomplémentantes d'encapsidation, par exemple les cellules de la lignée 293 ou de la lignée PER-C6. Les particules virales peuvent être ensuite purifiées par centrifugation en gradient de chlorure de césium comme décrit par exemple dans Journal of General Virology, 34, 19-35 (1977). Plus préférentiellement les particules virales sont purifiées par chromatographie liquide en mode d'échange d'anion, de filtration sur gel, en mode hydrophobe ou par chélation de métal. La purification par échange d'anion est particulièrement avantageuse puisqu'elle permet d'obtenir en une seule étape de chromatographie une préparation virale pure, débarrassée des protéines, des acides nucléiques, et autres impuretés et métabolites provenant de la cellule productrice, et débarrassée des composés apportés par le milieu de culture. Des modes préférés de purification par chromatographie sont décrits dans la demande internationale WO 98/00524 ou comme ci-après dans les exemples. Les particules adénovirales sont ensuite formulées dans le tampon de conservation sélectionné en utilisant notamment des méthodes de dialyse, de diafiltration, ou de chromatographie de filtration sur gel. La composition ainsi obtenue peut être éventuellement congelée et conservée à une température de stockage souhaitée (par exemple -20°C), mais cette opération n'est cependant pas indispensable à la conservation sur une longue durée, les compositions étant stables à l'état liquide entre +4 et +20°C.
Les compositions selon l'invention sont stables, sans dégradation notable [stabilité physique et biologique (pouvoir infectieux)] pendant une durée d'au moins 12 mois à +4°C ou d'au moins 5 mois à +20°C. On entend plus particulièrement par solution stable physiquement, une solution ne présentant pas d'apparition de coagulation, de sédimentation de particules ou de précipité (par estimation visuelle, par mesure de la densité optique, par l'analyse en microscopie électronique, ou par l'analyse de distribution de taille des particules) après la période de conservation considérée. La présente invention concerne plus particuhèrement la conservation d'adénovirus infectieux sous une forme stabilisée et les compositions liquides ou congelées destinées à cette conservation.
La formulation selon l'invention présente l'intérêt d'être la première composition réalisée permettant la conservation des adénovirus sous forme liquide à des températures de +4 à +20°C tout en ayant la possibilité d'avoir une concentration virale élevée. L'invention est particulièrement intéressante dans son application aux adénovirus recombinants, mais elle peut être appliquée d'une manière générale à tous les adénovirus (sauvages ou recombinants).
A titre d'exemple peuvent être cités notamment les adénovirus ci-après qui peuvent être avantageusement conservés dans une composition selon l'invention : l'ensemble des adénovirus sauvages humains, appartenant aux six sous-groupes connus dénommés A, B, C, D, E, et F, et plus particulièrement l'ensemble des 49 sérotypes différents d'adénovirus humains composant ces six sous-groupes. De même, l'invention pourra s'appliquer aux virus sauvages simiens, bovins, équins, porcins, ovins, ou canins appartenant à la famille des Adenoviridae. De plus, l'invention pourra s'appliquer aux virus mutants provenant des virus sauvages appartenant à la famille des Adenoviridae.
Parmi les vecteurs adénovirus recombinants auxquels la présente invention peut s'appliquer, on peut citer tous les adénovirus modifiés comportant une ou plusieurs délétion dans la région du génome appelée El, ou dans la région E2, ou dans la région E3 ou dans la région E4, ainsi que les virus recombinants comportant plusieurs délétions combinées dans les régions ci-dessus, ainsi qu'aux virus recombinants complètement délétés (appelés gutless) [FASEB, 11, 615 (1997)].
De même, la présente invention s'applique aussi aux vecteurs adénoviraux recombinants comportant en outre un acide nucléique d'intérêt. L'acide nucléique d'intérêt peut être inséré en différents sites du génome de l'adénovirus. Avantageusement, il est inséré au niveau de la région El, E3, ou E4. Cependant, il est clair que d'autres sites peuvent être utilisés. En particulier, l'accès à la séquence nucléotidique du génome permet à l'homme du métier d'identifier des régions permettant d'insérer l'acide nucléique d'intérêt. L'acide nucléique d'intérêt peut être toute séquence d'ADN introduite, en particulier toute séquence dont le transfert et/ou l'expression dans la cellule cible est recherchée. En particulier, il peut comporter un ou plusieurs gènes thérapeutiques et/ou un ou plusieurs gènes codant pour des protéines antigéniques. Les gènes thérapeutiques qui peuvent ainsi être transférés sont tous les gènes dont la transcription et éventuellement la traduction dans la cellule cible génèrent des produits ayant un effet thérapeutique. Parmi les produits thérapeutiques, on peut citer plus particulièrement les enzymes, les dérivés sanguins, les hormones, les limphokines : interleukines, interférons, TNF, etc (WO93/19191), les facteurs de croissance, les neuro transmetteurs ou leurs précurseurs ou enzymes de synthèse, les facteurs trophiques : BDNF, CNTF, NGF, IGF, GMF, aFGF, bFGF, NT3, NT5, etc., les apolipoprotéines : ApoAl, ApoIV, ApoE, etc. (WO94/25073), la dystrophine ou une minidystrophine (WO93/06223), les gènes permettant de contrôler la resténose : GAX, NOS, etc., les gènes suppresseurs de tumeurs : p53, Rb, Rapl A, DCC, k-rev, etc (WO94/24297), les gènes codant pour des facteurs impliqués dans la coagulation : Facteurs VII, VIII, IX, les gènes suicides : TK, etc., les immunoglobulines naturelles ou artificielles : Fab, ScFv (WO94/29446), les gènes anti-apoptotiques : AKT, etc.
Le gène thérapeutique peut également être un gène ou une séquence antisens, dont l'expression dans la cellule cible permet de contrôler l'expression de gènes ou la transcription d'ARNm cellulaires. De telles séquences peuvent par exemple être transcrites, dans la cellule cible, en ARN complémentaires d'ARNm cellulaires et bloquer ainsi leur traduction en protéine, selon la technique décrite dans la demande de brevet EP 140 308.
De même, la présente invention s'applique aux vecteurs adénoviraux recombinants permettant la production de rétrovirus [Tumor Targetting, 3, 59 (1998)], aux adénovirus comportant une ou plusieurs modifications dans une ou plusieurs protéines constitutives de la capside virale, en particulier la fibre (protéine IV) et la protéine hexon (protéine II), ou aux adénovirus dépourvus de fibre [Journal of Virology, 73, 1601 (1999)], chacune de ces modifications ayant été introduite dans le but de modifier le tropisme naturel de l'adénovirus [Current Opinion in Biotechnology, 8, 583 (1997)].
Par ailleurs, les compositions selon l'invention sont particulièrement intéressantes du fait qu'elles peuvent être utilisées pour la préparation d'un médicament destiné à un traitement thérapeutique ou prophylactique par thérapie génique. Les virus infectieux ont de nombreuses applications parmi lesquelles on peut citer leur utilisation dans le domaine de la vaccination et dans le domaine de la thérapie génique. Dans ces applications, après transfert de leur matériel génétique (ARN ou ADN) dans la cellule hôte, les virus utilisent la machinerie cellulaire de la cellule infectée pour réaliser la synthèse de protéines codées par leur propre génome, et induire ainsi l'effet biologique spécifique recherché. Dans des applications de thérapie génique, des virus recombinants infectieux portant un gène d'intérêt thérapeutique sont utilisés pour transférer ce gène dans des cellules spécifiques de l'organe du patient à traiter. Une grande variété de protocoles thérapeutiques ont été décrits et sont actuellement en cours d'évaluation clinique pour transférer et exprimer des gènes thérapeutiques à l'aide de vecteurs viraux. Parmi ces vecteurs, les vecteurs adénoviraux non réplicatifs ont été largement développés durant ces dernières années pour le transfert de gènes codant pour des protéines thérapeutiques. Parmi ces gènes, on peut citer le gène suppresseur de tumeur p53, qui est impliqué dans le contrôle de la prolifération cellulaire. Divers protocoles d'essais cliniques de transfert du gène p53 à l'aide d'adénovirus chez l'homme sont actuellement développés dans des indications anticancéreuses. Parmi les autres applications en développement, on peut citer le cas du traitement de la mucoviscidose.
L'utilisation de vecteurs adénoviraux comme agents thérapeutiques n'est envisageable que si l'on dispose de méthodes permettant de conserver et stocker les préparations durant des périodes suffisantes longues sans perte significative du pouvoir infectieux des virus en question. C'est pourquoi la présente invention est particulièrement intéressante.
Les exemples suivants donnés à titre non limitatif, montrent comment l'invention peut être mise en pratique, ainsi que la stabilité des compositions et le pouvoir infectieux des particules ainsi formulées.
Exemple 1
Préparation d'une composition selon l'invention :
Une suspension virale est préparée de la manière suivante : les cellules 293 sont cultivées dans un CellCube (Costar) dans un milieu DMEM supplémenté avec 10 % de sérum de veau foetal. Lorsqu'elles atteignent la confluence, les cellules sont infectées à une multiplicité d'infection de 2 avec une aliquote de la banque de travail de l'adénovirus exprimant le gène p53. Cinq jours après l'infection, le surnageant de production est récolté par drainage et clarifié par passage à travers un train de filtres de porosité décroissante 10/1/0,8-0,2 μm. Ce surnageant est ensuite concentré 20 fois en volume par ultrafiltration tangentielle sur une membrane Millipore ayant un seuil de coupure de 300 kDa. Le virus est ensuite purifié par chromatographie sur une colonne de Source 15Q équilibrée et éluée avec un gradient de chlorure de sodium dans du tampon 20 mM Tris/HCl, pH 8,0. Le pic de virus est collecté, et le virus est concentré par ultrafiltration tangentielle sur une membrane Millipore ayant un seuil de coupure de 300 kDa. Les préparations virales ainsi obtenues sont de très grande pureté et contiennent < 50 ng d'albumine bovine sérique et < 10 ng d'ADN de la cellule hôte pour 1E12 particules virales. Le virus est ensuite formulé dans les divers tampons sélectionnés. Pour effectuer cette opération, le changement de tampon est effectué par chromatographie sur colonne PD-10 (Amersham-Pharmacia Biotech) remplie de Sephadex G-25 équilibrée et éluée avec le tampon sélectionné en suivant les instructions du fournisseur. Après dosage par chromatographie, la concentration du virus est ajustée si nécessaire à la valeur cible par dilution dans le tampon de formulation sélectionné. La stabilité virale dans les diverses formulations est ensuite étudiée en plaçant pour chacune des formulations sélectionnées, 2 ml de suspension virale dans un tube en polypropylène à la température étudiée (-20°C, +4°C, ou +20°C). Les échantillons sont ensuite conservés à cette température durant une période déterminée pour chacune des expériences en question (voir exemples ci- après).
Les analyses par microscopie électronique sont effectuées par dépôt de la solution à analyser sur une grille carbonée qui est ensuite traitée en coloration négative par l'acétate d'uranyle à 1,5 %. L'appareil utilisé pour ces analyse est un microscope électronique Jeol 1010 opérant à une tension de 50 kV à 100 kV.
Les analyses de distribution de taille des particules virales sont effectuées par spectroscopie de corrélation de photons (PCS) à l'aide d'un appareil Coulter N4+ (Coultronics).
Les analyses CLHP (chromatographie liquide hautes performances) permettant de quantifier les particules virales sont effectuées comme décrit ci-après :
Une colonne de chromatographie remplie avec environ 1 ml de Q Sepharose® XL (45- 165 μm; Amersham-Pharmacia Biotech) est préparée dans une colonne de type HR 5/5 (Amersham-Pharmacia Biotech). Cette colonne, montée sur un système CLHP équipé d'un système de détection UV/visible opérant dans la plage d'absorbance 200- 300 nm, est utilisée pour la séparation et la quantification des particules virales. Avant chaque analyse, la colonne est équilibrée à 30°C dans un tampon 20 mM Tris/HCl, pH 7,5 à un débit de 1,5 ml/min. L'échantillon à analyser contenant les particules virales est injecté sur la colonne. Après l'injection, la colonne est lavée avec 5 volumes du même tampon, et les espèces fixées sont éluées avec un gradient linéaire de 0 à 1 M de chlorure de sodium dans le tampon 20 mM Tris/HCl, pH 7,5 sur 30 volumes de colonne. En fin de gradient, la colonne est lavée avec 2 volumes de colonne de soude 0,5 N avant ré-équilibration en vue de l'analyse suivante.
Une courbe étalon à 260 nm est construite avec une préparation de particules d'adénovirus purifiée par chromatographie. Cette préparation étalon a été titrée au préalable en particules par son absorbance à 260 nm dans une solution de SDS à 0,1% en utilisant le facteur de conversion de 1 x 10 particules par unité d'absorbance à 260 nm). Les échantillons sont filtrés au travers d'un filtre (0,22 μm) avant l'analyse par chromatographie.
La technique de titration des adénovirus est décrite par F. L. Graham et al., Molecular Biotechnology, 3, 207 (1995). La technique de mesure de l'expression de la protéine penton par immunotitration suivie d'une quantification par cytométrie de flux est décrite dans Boyle et al., « Détermination of adenoviral vector activity using an immunotitration method », poster présenté au « 5,h annual meeting of viral vector and vaccines, (1998) ».
Exemple 2
Conservation à +4°C de compositions selon l'invention ; stabilité physique des particules virales :
Le tableau ci-après montre les résultats obtenus en fonction de la nature de la solution tampon et la stabilité physique des particules virales déterminée par l'analyse chromatographique des préparations :
*Tris/HCl : 20 mM ; pH = 8,4 - % glycérol : vol/vol - % saccharose : vol/vol
Exemple 3
Conservation à +4°C de compositions selon l'invention ; effet de la concentration en glycérol :
Le tableau ci-après montre les résultats obtenus en fonction de la concentration en glycérol dans la formulation et donne la stabilité physique des particules virales déterminée par l'analyse chromatographique des préparations :
*Tris/HCl : 20 M, pH = 8,4.
Les résultats présentés dans le tableau ci-dessus confirment clairement qu'une teneur de 10 % (vol/vol) est efficace pour la stabilisation physique des particules sur une période de 6 mois. L'efficacité est également confirmée sur une période de 1 an au moins pour les formulations incluant plus de 10 % de glycérol. Aucune des formulations antérieurement connues n'apportait une stabilisation sur une durée aussi prolongée : notamment la formulation comprenant Tris/HCl 10 mM + MgCl ImM + saccharose 1M ne s'avère pas appropriée pour stabiliser les particules adénovirales à concentration élevée (6,9 X 1012 pv/ml), la concentration virale chute rapidement à partir du 2eme mois. Exemple 4
Pouvoir infectieux des adénovirus conservés selon l'invention à +4 ou +20°C :
Le pouvoir infectieux des particules virales est mesuré par la capacité des particules à exprimer le transgène qu'elles comportent et à conduire à l'expression de la protéine correspondante. La protéine est ici la protéine penton (protéine III) qui est détectée par immunotitration en utilisant une méthode de marquage avec un anticorps (anti- penton) suivie d'une analyse en cytométrie de flux. Le résultat obtenu est exprimé en unités d'infection par ml de solution (Ul/ml). Le calcul du ratio pv/IU représente une seconde façon d'exprimer l'évolution du titre infectieux au cours du temps. Dans les conditions expérimentales utilisées, ce ratio a une valeur de 20 ± 10 environ pour une préparation virale fraîchement obtenue avant mise en conservation.
Le tableau ci-après montre le pouvoir infectieux des particules formulées en glycérol ou en saccharose après 6 ou 12 mois de conservation à +4°C ou après 1 mois de conservation à +4°C puis 3,5 mois de conservation à +20°C.
Tris/HCl : 20 mM, pH = 8,4.
Cette étude montre que l'activité virale est particulièrement bien préservée à +4°C pour toutes les concentrations en glycérol égales ou supérieures à 10 %, et plus spécialement encore pour toutes les concentrations en glycérol égales ou supérieures à 15%. De même, les préparations conservées 1 mois à +4°C puis 3,5 mois à +20°C et contenant au moins 10 % de glycérol ont conservé leur capacité d'infection. La possibilité de conserver à long terme et à température ambiante, des préparations adénovirales très concentrées est démontrée pour la première fois. La formulation de comparaison contenant du saccharose et du chlorure de magnésium ne permet pas la conservation du virus concentré (6,9 x 1012 pv/ml) ni à +4°C ni à +20°C. La formulation à faible concentration (0,36 x 1012 pv/ml) voit son titre décroître après une conservation d'un mois à +4°C suivie d'une conservation de 3,5 mois à +20°C. Les formulations contenant du saccharose sont totalement inadaptées lorsque l'on augmente la concentration.
Après trois mois de conservation, les différentes préparations ont été analysées par microscopie électronique. Ces analyses montrent que :
A une concentration de 20 % en glycérol les particules apparaissent natives, pleines, entières, et symétriques. Pratiquement aucune sous-unité libre n'est détectable dans le milieu. En revanche, dans la formulation de comparaison à concentration virale élevée, les particules sont pour la plupart agrégées soit en massifs contenant environ 50 particules, soit en structures filamenteuses. Certaines particules ont perdu une partie de leurs capsomères et ont une structure plus arrondie ou ovoïde. Les capsomères et les fibres libérés dans le milieu restent totalement dispersés et sont très facilement observables. Ceci est observé aussi bien à +4°C qu'à +20°C. Après 12 mois à 4°C, les particules conservées dans 20% de glycérol apparaissent inchangées (pleines, entières et symétriques).
Exemple 5
Pouvoir infectieux d'une préparation adénovirale formulée dans le Tris/HCl + glycérol et conservée à -20°C :
Dans cet exemple, le pouvoir infectieux des particules est déterminée par la titration en pfu/ml. Le terme pfu ("plaque forming unit") correspond à la détermination du pouvoir infectieux d'une solution d'adénovirus. Cette détermination est effectuée par infection d'une culture cellulaire appropriée, et mesure, généralement après 15 jours d'incubation, du nombre de plages de cellules infectées. Ces dosages reposent sur des méthodes biologiques et les valeurs obtenues sont dans une certaine mesure fonction des conditions opératoires utilisées [J. Nirol., 70, 7498 (1996)].
Le tableau ci-après montre le titre infectieux, mesuré dans un test pfu, d'une préparation virale conservé 2 mois à -20°C.
La valeur de la mesure du titre infectieux, et plus particulièrement le ratio pv/pfu indiquent que les particules virales n'ont pas été altérées par l'étape de congélation- décongélation, ni par la conservation durant 2 mois à -20°C. (Ce ratio a une valeur de 20 à 30 environ pour la préparation virale initiale).
Exemple 6
Conservation à +4°C de compositions selon l'invention ; stabilité physique des particules virales :
Le tableau ci-après montre les résultats obtenus en fonction de la nature de la solution tampon et la stabilité physique des particules virales déterminée par l'analyse chromatographique des préparations :
Exemple 7
Conservation à +4°C de compositions selon l'invention ; effet du pH des solutions tampon :
Le tableau ci-après montre l'effet du pH de la solution tampon sur le pouvoir infectieux des particules formulées dans le Tris 20mM, glycérol 10%>, après 3 mois de conservation :
Cette étude montre que l'activité virale est particulièrement bien préservée à +4°C dans les formulations Tris/HCl 20 mM contenant 10 % de glycérol à des pH allant de 8,0 à
9,5.
Au dessous de pH = 8,0, la stabilité n'est plus assurée à +4°C.

Claims

REVENDICATIONS
- Composition liquide ou congelée contenant les particules adénovirales caractérisée en ce qu'elle comprend une solution tampon capable de fixer le pH du milieu entre 8,0 et 9,6, additionnée de glycérol et sans adjonction de cations métalliques divalents ou de cations alcalins.
- Composition liquide ou congelée, selon la revendication 1 , caractérisée en ce que la solution tampon est une solution capable de fixer le pH du milieu entre 8,4 et 8,8.
- Composition liquide ou congelée, selon la revendication 2, caractérisée en ce que la solution tampon est une solution capable de fixer le pH du milieu à 8,4.
- Composition liquide ou congelée, selon la revendication 1, caractérisée en ce que la solution tampon est constituée d'un système acide/base comprenant le Tris ou la lysine et un acide choisi parmi un acide fort ou un acide faible, ou bien d'un système acide/base comprenant l'Hepes et une base forte.
- Composition liquide ou congelée, selon la revendication 4, caractérisée en ce que que la solution tampon est constituée d'un système acide/base choisi parmi les systèmes Tris/HCl, lysine/HCl, Tris/acide maléique, Tris/acide malique, Tris/acide acétique et Hepes/soude.
- Composition liquide ou congelée, selon l'une des revendications 1 à 5, caractérisée en ce qu'elle contient en outre un adjuvant choisi parmi des polymères, des sucres, ou un alcool.
- Composition liquide ou congelée, selon la revendication 6, caractérisée en ce que les polymères sont choisis parmi les polyéthylène glycols, les pluronics ou les polysorbates, les sucres sont choisis parmi le saccharose, le dextrose ou le mannitol et l'alcool est l'éthanol.
- Utilisation d'une composition selon l'une des revendications 1 à 7 pour la conservation d'adénovirus.
- Utilisation thérapeutique ou prophylactique d'une composition de particules adénovirales selon l'une des revendications 1 à 7, pour la préparation d'un médicament destiné à un traitement par thérapie génique.
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