DE4337597A1 - DNA-Sequenzen für Ammoniumtransporter, Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen- und Pflanzen enthaltend den Transporter - Google Patents
DNA-Sequenzen für Ammoniumtransporter, Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen- und Pflanzen enthaltend den TransporterInfo
- Publication number
- DE4337597A1 DE4337597A1 DE4337597A DE4337597A DE4337597A1 DE 4337597 A1 DE4337597 A1 DE 4337597A1 DE 4337597 A DE4337597 A DE 4337597A DE 4337597 A DE4337597 A DE 4337597A DE 4337597 A1 DE4337597 A1 DE 4337597A1
- Authority
- DE
- Germany
- Prior art keywords
- dna sequences
- ammonium
- sequences according
- transporters
- plant
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8242—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits
- C12N15/8243—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with non-agronomic quality (output) traits, e.g. for industrial processing; Value added, non-agronomic traits involving biosynthetic or metabolic pathways, i.e. metabolic engineering, e.g. nicotine, caffeine
- C12N15/8251—Amino acid content, e.g. synthetic storage proteins, altering amino acid biosynthesis
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
- Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
- Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Botany (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Nutrition Science (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
Description
Die vorliegende Erfindung betrifft DNA-Sequenzen, die die Kodierregion von
Ammoniumtransportern enthalten, deren Einführung in ein pflanzliches Genom eine
Veränderung der Aufnahme und Weiterleitung von Stickstoffverbindungen in
transgenen Pflanzen hervorruft, sowie Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen
und Pflanzen enthaltend diese DNA-Sequenzen.
Die Versorgung einer wachsenden Pflanze mit Stickstoffverbindungen ist ein
limitierender Faktor der Biomasseproduktion und damit begrenzend für den Ertrag
landwirtschaftlicher Produktion. Aus diesem Grund werden bei landwirtschaftlicher
Biomasseproduktion Stickstoffverbindungen, häufig in Form von mineralischen
Düngern, zugeführt. Eine nur teilweise Aufnahme der angebotenen
Stickstoffverbindungen durch die Pflanze macht es einerseits nötig, daß die unter
hohem Energieaufwand produzierten Stickstoffdünger im Überschuß aufgewendet
werden; andererseits führt eine nur teilweise Aufnahme dazu, daß die angebotenen
Stickstoffverbindungen in das Grundwasser ausgewaschen werden, was erhebliche
ökologische Probleme hervorrufen kann.
Es besteht daher ein großes Interesse an Pflanzen, die befähigt sind, größere
Mengen Stickstoff aufzunehmen sowie an der Bereitstellung von Möglichkeiten zur
Veränderung der Stickstoffaufnahme in Pflanzen.
Für viele Pflanzenspezies liegen Hinweise vor, daß die Aufnahme von Stickstoff im
wesentlichen in Form von Nitratsalzen erfolgt. In stark sauren Böden oder in Böden,
die infolge intensiver Bewirtschaftung stark tanninhaltig sind, ist die Nitratbildung
(Nitrifizierung) jedoch stark eingeschränkt, und die Aufnahme von Stickstoff in Form
von Ammonium wird zum wichtigen Mechanismus der Aufnahme von
Stickstoffverbindungen (Raven & Smith, 1976, New Phytol 76: 415-431). Pflanzen,
die an saure Böden gut angepaßt sind, scheinen z. T. die Aufnahme von Ammonium
gegenüber der Nitrataufnahme zu bevorzugen und sind außerdem in der Lage,
Ammoniumionen-Konzentrationen zu tolerieren, die für andere Pflanzen toxisch
sind. Zu diesen Pflanzen gehören beispielsweise Zuckerrohr, Betula verucosa oder
Lolium rigidum (Foy et al., 1978, Ann Rev Plant Physiol 29: 511-566). Die Toxizität
des Ammoniums ergibt sich als Folge einer Verschiebung der Ionenbalance: die
Aufnahme des positiv geladenen Ammoniumions führt zu einer Ansäuerung des
Cytoplasmas, sofern nicht Kationen im Gegentausch sekretiert werden. Bei einer
Aufnahme von Ammonium durch ein Transportsystem, dessen
Aufnahmemechanismus auf einem Ammoniumionen-Protonen-Antiport beruht,
ergibt sich das Problem der Ionenimbalance nicht.
Es besteht daher auch ein großes Interesse an Transportsystemen, die nach dem
Mechanismus eines Ammoniumionen-Protonen-Antiports arbeiten, bzw. an
Systemen, die durch Techniken des "protein engineering" in Ammoniumionen-
Protonen-Antiporter umgewandelt werden könnten.
Transportsysteme, mit deren Hilfe Pflanzen Ammonium aufnehmen bzw. mit deren
Hilfe sich Pflanzen vor einem durch Membrandiffusion verursachten
Ammoniumionen-Verlust schützen (Retrieval Systeme), sind nicht bekannt.
Unter Ammonium ist auch Methylamin zu verstehen, das dem Ammonium analog
ist.
Bei dem Pilz Aspergillus nidulans ist ein aktives Aufnahmesystem für Ammonium
untersucht worden (z. B. Arst et al., 1973, Mol Gen Genet 121: 239-245), ebenso bei
Penicillum chrysogenum (Hackette et al., J Biol Chem 245: 4241-4250). Bei diesen
Studien wurde Methylamin als Ammoniumanaloges eingesetzt. Für Aspergillus
nidulans konnten so fünf genetische Loci ermittelt werden, die am Transport von
Methylamin beteiligt sind (Pateman et al., 1973, J Bacteriol 114: 943-950). Bei
biochemischen Untersuchungen des Methylammoniumtransportes in Penicllium
chrysogenum bzw. in Saccharomyces cerevisisae zeigte sich, daß der Transport
temperatur- und pH-Wert-abhängig ist, wobei ein pH Optimum von 6.0 bis 6.5
besteht, und die Transporteffizienz bis zu einer Temperatur von 35°C stetig
zunimmt (Roon et al., 1975, J Bacteriol 122: 502-509). Der Methylamin- bzw.
Ammoniumtransport in Saccharomyces cerevisiae ist von der Zufuhr leicht
verwertbarer chemischer Energie, z. B. in Form von Glukose, abhängig. Das
Transportsystem besteht aus mindestens drei unabhängigen Transportern, die sich
in Transportkapazität und Affinität zum Substrat unterscheiden: neben einem
hochaffinen Transporter mit geringer Kapazität (Km Wert = 250pM,
Maximalgeschwindigkeit Vmax = 20 nmol/min pro mg Zellen (Trockengewicht))
kommen ein niedrig affines System mit hoher Kapazität (Km = 2 mM, Vmax =
50 nmol/min pro mg Zellen) und ein niedrig affines mit mittlerer Kapazität (Km =
20 mM, Vmax = 33 nmol/min pro mg Zellen) vor (Dubois & Grenson, 1979, Mol Gen
Genet 175: 67-76). Bei Anwesenheit von Glutamin oder Asparagin im umgebenden
Medium wird die Ammoniumaufnahme um 60 bis 70% reduziert, während andere
Amine kaum einen Einfluß haben (Roon et al., 1975, J Bacteriol 122: 502-509).
Über die molekulare Natur des Ammoniumtransporters bei den genannten oder
anderen Pilzen und sonstigen Organismen, wie beispielsweise den Bakterien, ist
nichts bekannt. Ebenso ist über Systeme, mit deren Hilfe sich Pilze oder Bakterien
vor einem durch Membrandiffusion verursachten Ammoniumionen-Verlust schützen
(Retrieval Systeme) auf molekularer Ebene nichts bekannt. Ferner sind Gene, die
Ammoniumtransporter kodieren, nicht bekannt.
Verschiedene Evidenzen deuten darauf hin, daß der Ammoniumtransport in
Saccharomyces cerevisiae von zumindest zwei funktionell verschiedenen
Transportsystemen bewerkstelligt wird (Dubois & Grenson, 1979, Mol Gen Genet
175: 67-76):
- 1. Kinetische Analysen der Methylamin-Aufnahme durch Saccharomyces zeigen einen abrupten Übergang zwischen apparent linearen Abschnitten, wobei beide Funktionen durch Ammonium inhibierbar sind.
- 2. Beide Funktionen können durch Mutation separat ausgeschlossen werden. Die entstandenen Mutationen mep-1 bzw. mep-2 sind genetisch unabhängig.
- 3. Die Mutanten mep-1 bzw. mep-2 können jeweils in Medien mit Ammonium als einziger Stickstoffquelle wachsen, während eine Doppelmutante mep-1/mep-2 kaum noch Wachstum unter diesen Bedingungen zeigt (Daten entnommen aus Dubois & Grenson, 1979).
Eine Aufklärung der Ammonium-Transportvorgänge bei Pflanzen, die zu ähnlich
detaillierten Informationen wie für Hefe führt, liegt nicht vor und ist wegen der
Schwierigkeit der molekularbiologischen Analyse von Mutationen auf einem
entsprechenden Weg kaum durchführbar.
Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es nun, DNA-Sequenzen von Ammonium
transportern zur Verfügung zu stellen, die in transgenen Pflanzen eine Veränderung
der Aufnahme und Weiterleitung von Stickstoffverbindungen hervorrufen.
Aufgabe der Erfindung ist weiterhin, DNA-Konstrukte, wie Plasmide bereitzustellen,
mit denen der Ammoniumtransport in transgenen Pflanzen verändert werden kann,
indem die entsprechenden Konstrukte (Plasmide) in das pflanzliche Genom
eingeführt werden und infolge ihrer Transkription zur Bildung neuer Ammonium-
Transportermoleküle in der transgenen Pflanze bzw. zur Unterdrückung der Bildung
der pflanzeneigenen Ammonium-Transportermoleküle führen.
Es wurden nun überraschend DNA-Sequenzen gefunden, die die Kodierregion
eines pflanzlichen Ammoniumtransporters enthalten, wobei die in der
Nukleotidabfolge enthaltende Information bei Integration in ein pflanzliches Genom
- a) unter Kontrolle eines Promotors in sense Orientierung, die Expression einer translatierbaren mRNA ermöglicht, was zur Synthese eines Ammonium transporters in transgenen Pflanzen führt oder
- b) unter Kontrolle eines Promotors in anti-sense Orientierung, die Expression einer nicht-translatierbaren mRNA ermöglicht, was die Synthese eines endogenen Ammoniumtransporters in transgenen Pflanzen verhindert.
In analoger Weise können Ammoniumtransporter auch zur Veränderung tierischer
und menschlicher Zellen verwendet werden
Die Identifikation der Kodierregion des Ammoniumtransporters wird über ein
Verfahren durchgeführt, bei dem die Isolation von pflanzlichen DNA-Sequenzen, die
Transporter Moleküle kodieren, mittels Komplementation von spezifischen
Mutationen in der Hefe Saccharomyces cerevisiae erfolgen soll.
Hierzu müssen zunächst geeignete Hefe-Mutanten verfügbar sein, die nicht in der
Lage sind, diejenige Substanz aufzunehmen, für die aus einer pflanzlichen Genbank
die Kodierregion eines Transporter-Moleküls isoliert werden soll. Eine Mutante, die
nicht in der Lage ist, in Medien mit Ammonium als einziger Stickstoffquelle zu
wachsen, ist beispielsweise die von Dubois & Grenson (179, Mol Gen Genet 175:
67-76) beschriebene Doppelmutante mep-1/mep-2 (Stamm 26972c).
Eine geeignete Hefemutante, wie beispielsweise die mep-1/mep-2 Doppelmutante,
wird mit für die Verwendung in Hefe geeigneten Expressions-Plasmiden, die als
Insertion cDNA Fragmente aus einer pflanzlichen cDNA Bibliothek tragen,
transformiert. Durch Selektion von Transformanden, die infolge der Expression
pflanzlicher cDNA-Sequenzen in der Lage sind, auf Ammonium als einziger
Stickstoffquelle zu wachsen, sollen pflanzliche Ammoniumtransporter identifiziert
werden.
Ob es möglich ist, unter Verwendung eines derartigen Komplementations-
Verfahrens DNA-Sequenzen, die pflanzliche Ammoniumtransporter kodieren, zu
identifizieren, hängt von verschiedenen Faktoren ab. Zum einen müssen die für die
Verwendung in Hefe geeigneten Expressions-Plasmide cDNA-Fragmente enthalten,
die pflanzliche Ammoniumtransporter kodieren, d. h. die der cDNA Synthese
zugrundeliegende mRNA muß aus Geweben stammen, die Ammoniumtransporter
exprimieren. Da über pflanzliche Ammoniumtransporter nichts bekannt ist, sind
Gewebe, die Ammoniumtransporter kodieren, jedoch ebenfalls nicht bekannt.
Eine weitere Voraussetzung für den Erfolg der Komplementationsstrategie ist, daß
ein in Pflanzen existierendes Ammoniumtransportsystem in Hefe funktional
exprimiert werden kann, da nur in diesem Fall eine Komplementation der durch die
Mutation ausgelösten Defizienz möglich ist. Da über pflanzliche Ammonium
transporter nichts bekannt ist, ist ebenfalls nicht bekannt, ob eine funktionale
Expression in Hefe möglich ist.
Ferner wurde nun überraschend gefunden, daß bei Expression einer cDNA-
Bibliothek beispielsweise aus Blattgewebe von Arabidopsis thaliana mittels für die
Verwendung in Hefe geeigneter Expressions-Plasmide, die den Promotor der
Phosphoglyceratkinase aus Hefe enthalten, die Komplementation der
Doppelmutation mep-1/mep-2 möglich ist, wenn die Expressions-Plasmide
bestimmte pflanzliche cDNA-Fragmente enthalten. Diese cDNA-Fragmente
kodieren pflanzliche Ammoniumtransporter.
Die Identifikation von pflanzlichen Ammoniumtransportern wird hier am Beispiel von
Arabidopsis thaliana beschrieben, ist aber nicht auf diese Pflanzenspezies
beschränkt.
Ein cDNA-Fragment, das einen pflanzlichen Ammoniumtransporter kodiert, kann
beispielsweise die folgende Sequenz aufweisen (Seq. ID No:1):
Die mit Hilfe der transformierten Hefestämme identifizierten erfindungsgemäßen
cDNA-Sequenzen, wie z. B. die Sequenz Seq. ID No. 1, können in Plasmide
eingebracht und dabei mit Steuerelementen für Expression in eukaryontischen
Zellen kombiniert werden (s. Ausführungsbeispiel 4). Derartige Steuerelemente sind
einerseits Transkriptions-Promotoren und andererseits Transkriptions-Terminatoren.
Mit den Plasmiden können eukaryontische Zellen transformiert werden, mit dem Ziel
der Expression einer translatierbaren mRNA, die die Synthese eines Ammonium
transporters in den Zellen ermöglicht (sense Orientierung) oder mit dem Ziel der
Expression einer nicht-translatierbaren mRNA, die die Synthese eines endogenen
Ammoniumtransporters verhindert (anti-sense Orientierung).
Diese Plasmide sind ebenfalls Gegenstand der Erfindung.
Bevorzugte Plasmide sind die bei der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen
(DSM) hinterlegten Plasmide p35S-MEP-a und p35S-a-MEP-a.
Ebenfalls Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind Hefen, die die
erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen enthalten.
Die zur Identifikation eines pflanzlichen Methylamin- bzw. Ammoniumtransporters
verwendeten Hefestämme können für Studien der Eigenschaften des Transporters
sowie seiner Substrate genutzt werden. Die in Plasmiden vorliegenden DNA-
Sequenzen eines pflanzlichen Ammoniumtransporters können entsprechend der
Ergebnisse dieser Studien einer Mutagenese oder einer Sequenzveränderung
durch Rekombination unterzogen werden, um Eigenschaften des Transporters zu
verändern. Durch Veränderung der Spezifität des Transport-Systems ist der
Transport neuer Verbindungen möglich, der interessante Anwendungsmöglichkeiten
erschließt (s. unten). Darüberhinaus kann durch geeignete Veränderung des
Transporters der Transportmechanismus verändert werden. Hierbei ist
insbesondere, aber nicht ausschließlich, an eine Veränderung zu denken, die die
Kotransporteigenschaften des Transporters verändert, beispielsweise dahingehend,
daß es durch die Veränderung zu einem Ammoniumionen-Protonen-Antiport
kommt, der eine Toxizität aufgenommener Ammoniumionen für Pflanzen infolge
Ansäuerung des Cytoplasmas verhindert. Hierbei kann der erfindungsgemäße
Hefestamm, der die cDNA Sequenz eines pflanzlichen Ammoniumtransporters in
einem Expressionsplasmid enthält, für ein Mutations-Selektions-System genutzt
werden.
Durch Expression einer RNA entsprechend der erfindungsgemäßen DNA-
Sequenzen von pflanzlichen Ammoniumtransportern in transgenen Pflanzen wird
eine Veränderung des pflanzlichen Stickstoffmetabolismus möglich, deren
wirtschaftliche Bedeutung offensichtlich ist: Stickstoff ist der hauptsächlich das
Wachstum begrenzende Nährstoff. Die Lebensfähigkeit von Keimlingen sowie die
Keimungsfähigkeit von Samen ist direkt abhängig vom Stickstoffgehalt der
Speichergewebe. Die Bildung von hochwertigen, stark proteinhaltigen
Nahrungsmitteln ist von einer ausreichenden Stickstoffzufuhr abhängig.
Die Veränderung der Stickstoffaufnahme, beispielsweise im Sinne eines
Hinzufügens eines neuen Aufnahmesystems für Stickstoffverbindungen wie
Ammonium, kann daher zu einer Ertragssteigerung von transgenen Nutzpflanzen,
insbesondere unter Stickstofflimitation führen. Auf diesem Wege können transgene
Pflanzen erzeugt werden, die hohe Erträge unter "low input" Bedingungen
erwirtschaften.
Die Möglichkeit der Unterdrückung der Ammoniumaufnahme in die transgene
Pflanze kann jedoch unter bestimmten Bedingungen ebenfalls erwünscht sein.
Beispielsweise ist an den Anbau von nicht für das Wachstum auf sauren Böden
angepaßten transgenen Pflanzen zu denken. Infolge der Unterdrückung der
Nitrifizierung können auf solchen Böden Ammoniumionen-Konzentrationen
vorliegen, die für bestimmte Pflanzen toxisch sind, weil das von den Pflanzen
aufgenommene Ammonium in der Zelle nicht mehr vollständig umgewandelt werden
kann und dann als Zellgift wirkt. Die Unterdrückung der Ammoniumaufnahme durch
Unterdrückung der Biosynthese des Ammoniumtransporters kann daher transgene
Pflanzen derart verändern, daß ein Anbau auf sauren Böden möglich wird.
Transgene Nutzpflanzen sind z. B. Tabak, Kartoffel, Zuckerrübe, Sojabohne, Erbse,
Bohne und Mais.
Die genetische Modifikation dikotyler und monokotyler Pflanzen wird nach gängigen
Verfahren durchgeführt (s. u.a. Gasser, C. S., Fraley, R. T., 1989, Science 244: 1293-
1299; Potrykus, 1991, Ann Rev Plant Mol Biol Plant Physiol 42: 205-225). Zur
Expression der kodierenden Sequenzen in Pflanzen müssen diese mit
transkriptionell regulatorischen Elementen verknüpft werden. Solche Elemente,
Promotoren genannt, sind vielfältig beschrieben (s. z. B. EP 375 091). Ferner
müssen die Kodierregionen mit einem Transkriptionsterminationssignal versehen
werden, damit sie korrekt transkribiert werden können. Derartige Elemente sind
ebenfalls beschrieben (vgl. Gielen et al., 1989, EMBO J 8: 23-29). Der
transkriptionelle Startbereich kann sowohl nativ bzw. homolog als auch fremdartig
bzw. heterolog zur Wirtspflanze sein. Terminationsbereiche sind gegeneinander
beliebig austauschbar. Die DNA-Sequenz der Transkriptionsstart- und -termina
tionsregionen kann synthetisch hergestellt oder natürlich gewonnen sein oder eine
Mischung aus synthetischen und natürlichen DNA-Bestandteilen enthalten. Zur
Vorbereitung der Einführung fremder Gene in höhere Pflanzen sind eine große
Anzahl Klonierungsvektoren verfügbar, die ein Replikationssignal für Escherichia
coli und einen Marker beinhalten, der eine Selektion der transformierten Zellen
erlaubt. Beispiele für Vektoren sind pBR 322, pUC-Serien, M13 mp-Serien, pACYC
184 usw . . Je nach Einführungsmethode gewünschter Gene in die Pflanze können
weitere DNA-Sequenzen erforderlich sein. Werden z. B. für die Transformation der
Pflanzenzelle das Ti- oder Ri-Plasmid verwendet, so muß mindestens die rechte
Begrenzung, häufig jedoch die rechte und die linke Begrenzung der Ti- und Ri-
Plasmid T-DNA, als Flankenbereich den einzuführenden Genen angefügt werden.
Die Verwendung von T-DNA für die Transformation von Pflanzenzellen ist intensiv
untersucht und ausreichend in EP 120 516; Hoekema, In: The Binary Plant Vektor
System, Offset-drukkerÿ Kanters B.V. Ablasserdam, (1985), Chapter V; Fraley, et
al., Crit. Rev. Plant Sci., 4 : 1-46 und An et al. (1985) EMBO J. 4 : 277-287
beschrieben worden. Ist die eingeführte DNA einmal im Genom integriert, so ist sie
dort in der Regel stabil und bleibt auch in den Nachkommen der ursprünglich
transformierten Zelle erhalten. Sie enthält normalerweise einen Selektionsmarker,
der den transformierten Pflanzenzellen Resistenz gegenüber einem Biozid oder
einem Antibiotikum wie Kanamycin, G 418, Bleomycin, Hygromycin oder
Phosphinotricin u. a. vermittelt. Der individuell verwendete Marker sollte daher die
Selektion transformierter Zellen gegenüber Zellen, denen die eingefügte DNA fehlt,
gestatten.
Für die Einführung von DNA in eine pflanzliche Wirtszelle stehen neben der
Transformation mit Hilfe von Agrobakterien viele andere Techniken zur Verfügung.
Diese Techniken umfassen die Fusion von Protoplasten, die Mikroinjektion von
DNA, die Elektroporation sowie ballistische Methoden und Virusinfektion. Aus den
transformierten Pflanzenzellen können dann in einem geeigneten Medium, welches
Antibiotika oder Biozide zur Selektion enthalten kann, wieder ganze Pflanzen
regeneriert werden. Die so erhaltenen Pflanzen können dann auf Anwesenheit der
eingeführten DNA getestet werden.
Ebenfalls Gegenstand der Erfindung sind Pflanzenzellen, die die erfindungsge
mäßen DNA-Sequenzen enthalten.
Bei der Injektion und Elektroporation sind an sich keine speziellen Anforderungen
an die Plasmide gestellt. Es können einfache Plasmide wie z. B. pUC-Derivate
verwendet werden. Sollen aber aus derartig transformierten Zellen ganze Pflanzen
regeneriert werden, ist die Anwesenheit eines selektierbaren Markergens
notwendig. Die transformierten Zellen wachsen innerhalb der Pflanzen in der
üblichen Weise (siehe auch McCormick et al. (1986) Plant Cell Reports 5: 81-84).
Diese Pflanzen können normal angezogen werden und mit Pflanzen, die die gleiche
transformierte Erbanlage oder andere Erbanlagen besitzen, gekreuzt werden. Die
daraus entstehenden hybriden Individuen haben die entsprechenden
phänotypischen Eigenschaften.
Die Einführung von DNA-Sequenzen eines pflanzlichen Ammoniumtransporters zur
Veränderung der Aufnahme von Stickstoffverbindungen wird in der vorliegenden
Erfindung am Beispiel von Arabidopsis thaliana und Tabak beschrieben. Die
Anwendung ist aber nicht auf diese Spezies beschränkt.
Die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen können in Plasmide eingebracht und
dabei mit Steuerelementen für eine Expression in prokaryontischen Zellen
kombiniert werden. Die Bildung einer von Bakterien translatierbaren RNA Sequenz
eines eukaryontischen Ammoniumtransporters führt trotz der erheblichen
Unterschiede in den Membranstrukturen von Pro- und Eukaryonten überraschend
dazu, daß Prokaryonten nun einen funktionalen eukaryontischen Ammonium
transporter mit dessen Substratspezifität exprimieren. Dies ermöglicht die
Produktion von Bakterienstämmen, die wie die zur Identifikation des Ammonium
transporters verwendeten Hefestämme für Studien der Eigenschaften des
Transporters sowie seiner Substrate genutzt werden können, wobei weitere
Anwendungsmöglichkeiten erschlossen werden können.
Ebenfalls Gegenstand der Erfindung sind Bakterien, die die erfindungsgemäßen
DNA-Sequenzen enthalten.
Die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen können in Plasmide eingebracht werden,
die eine Mutagenese oder eine Sequenzveränderung durch Rekombination von
DNA-Sequenzen mit Hilfe von Standardverfahren der Mikrobiologie erlauben.
Dadurch ist eine besonders einfache Veränderung der Spezifität des Ammonium
transporters möglich. Veränderte Ammoniumtransporter können beispielsweise
verwendet werden zur Transformation von landwirtschaftlich genutzten transgenen
Pflanzen, wobei ebenso an den Transport von Pestiziden wie auch von Substraten
für Stoffwechselreaktionen der Pflanze zu denken ist. Mit Hilfe von
Standardverfahren (vgl. Sambrook et al., 1989, Molecular cloning: A laboratory
manual, 2. Aufl., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA) können
Basenaustausche vorgenommen oder natürliche oder synthetische Sequenzen
hinzugefügt werden. Für die Verbindung der DNA-Fragmente untereinander können
an die Fragmente Adaptoren oder linker angesetzt werden. Ferner können
Manipulationen, die passende Restriktionsschnittstellen bereitstellen oder die
überflüssige DNA oder Restriktionsschnittstellen entfernen, eingesetzt werden. Wo
Insertionen, Deletionen oder Substitutionen wie z. B. Transitionen und
Transversionen in Frage kommen, können in vitro-Mutagenese, "primerrepair",
Restriktion oder Ligation verwendet werden. Als Analysemethode werden im
allgemeinen eine Sequenzanalyse, eine Restriktionsanalyse und weitere
biochemisch-molekularbiologische Methoden durchgeführt. Nach jeder Manipulation
kann die verwendete DNA-Sequenz gespalten und mit einer anderen DNA-Sequenz
verbunden werden. Jede Plasmid-Sequenz kann in den gleichen oder anderen
Plasmiden kloniert werden.
Die Erfindung betrifft somit auch Derivate oder Teile von Plasmiden, auf denen die
erfindungsgemäßen DNA-Seqenzen lokalisiert sind.
Ferner können die erfindungsgemäßen DNA-Sequenzen dazu genutzt werden,
nach Standardverfahren aus dem Genom von Pflanzen verschiedener Spezies, aus
dem Genom von Pilzen und aus dem Genom von Bakterien ähnliche Sequenzen zu
isolieren, die ebenfalls Ammoniumtransporter kodieren. Mit diesen Sequenzen
können Konstruktionen zur Transformation von Pflanzenzellen hergestellt werden,
die Transportvorgänge in den transgenen Pflanzen verändern.
Um verwandte DNA-Sequenzen zu bestimmen, muß man zunächst Genbanken
anlegen, die für den Gehalt von Genen einer Pflanzenart oder für die Expression
von Genen in einer Pflanzenart repräsentativ sind. Erstere sind genomische,
letztere sind cDNA-Banken. Aus diesen können mit Hilfe der erfindungsgemäßen
DNA-Sequenzen als Sonde verwandte Sequenzen isoliert werden. Hat man die
dazugehörigen Gene identifiziert und isoliert, ist eine Bestimmung der Sequenz und
eine Analyse der Eigenschaften der von dieser Sequenz kodierten Proteine möglich.
Auf diesem Weg gewonnene DNA-Sequenzen von Ammoniumtransportern sind
ebenfalls Gegenstand der Erfindung und können wie oben beschrieben eingesetzt
werden.
Die Verwendung der DNA-Sequenzen wie oben beschrieben ist ebenfalls
Gegenstand der Erfindung.
Am 26. 10. 1993 wurden bei der Deutschen Sammlung von Mikroorganismen (DSM)
in Braunschweig, Bundesrepublik Deutschland, folgende Plasmide hinterlegt
(Hinterlegungsnummern):
Plasmid p35S-MEP-a (DSM 8651)
Plasmid p35S-a-MEP-a (DSM 8652).
Plasmid p35S-MEP-a (DSM 8651)
Plasmid p35S-a-MEP-a (DSM 8652).
Fig. 1 zeigt das Plasmid p35S-MEP-a, bei dem es sich um ein Derivat des
Plasmids pBIN19 (Bevan, M., 1984, Nucl Acids Res 12: 8711-8721)
handelt.
Dabei bedeuten:
A = Fragment aus dem Genom des Blumenkohl Mosaik Virus, das den
35S Promotor (nt 6909-7437) trägt. Das Promotorfragment wurde
als EcoRI/KpnI Fragment aus dem Plasmid pDH51 (Pietrzak et al.,
NucI Acids Res 14: 5857-5868) präpariert.
B = NotI/NotI-Fragment der cDNA mit der Kodierregion des Ammonium
transporters von Arabidopsis thaliana in sense-Orientierung zum
Fragment A. Der in Fragment B eingezeichnete Pfeil gibt die
Leserichtung der cDNA an.
c = Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Plasmids
pTiACH5 (Gielen et al., EMBO J 3: 835-846), Nukleotide 11749 bis
11939, welches als PvuII/HindIII-Fragment aus dem Plasmid
pAGV40 (Herrera-Estrella et al., 1983, Nature 303: 209-213) isoliert
und nach Addition eines SphI-Linkers an die PvuII-Schnittstelle
zwischen die SphI- und die HindII/-Schnittstelle des Polylinkers von
pBIN19 kloniert wurde.
Fig. 2 zeigt das Plasmid p35S-a-MEP-a, bei dem es sich um Derivate des
Plasmids pBIN19 (Bevan, M.,1984, Nucl Acids Res 12: 8711-8721)
handelt.
Dabei bedeuten:
A = Fragment aus dem Genom des Blumenkohl Mosaik Virus, das den
35S Promotor (nt 6909-7437) trägt. Das Promotorfragment wurde
als EcoRI/KpnI Fragment aus dem Plasmid pDH51 (Pietrzak et al.,
Nucl Acids Res 14: 5857-5868) präpariert.
B = NotI/NotI-Fragment der cDNA mit der Kodierregion des Ammonium
transporters von Arabidopsis thaliana in antisense Orientierung zum
Fragment A. Der in Fragment B eingezeichnete Pfeil gibt die
Leserichtung der cDNA an.
C = Polyadenylierungssignal des Gens 3 der T-DNA des Plasmids
pTiACH5 (Gielen et al., EMBO J 3: 835-846), Nukleotide 11749 bis
11939, welches als PvuII/HindIII-Fragment aus dem Plasmid
pAGV40 (Herrera-Estrella et al., 1983, Nature 303: 209-213) isoliert
und nach Addition eines SphI-Linkers an die PvuII-Schnittstelle
zwischen die SphI- und die HindIII-Schnittstelle des Polylinkers von
pBIN19 kloniert wurde.
Die nachfolgenden Ausführungsbeispiele erläutern den Gegenstand der Erfindung
ohne ihn einzuschränken, wobei die Klonierung und Identifikation, sowie die
Funktion eines pflanzlichen Ammoniumtransporters und seine Verwendung zur
genetischen Veränderung von Pflanzen mit dem Ziel der Veränderung der
Aufnahme und Weiterleitung von Stickstoffverbindungen beschrieben wird. Analog
zu den dargestellten Beispielen können auch andere Pflanzen, insbesondere
landwirtschaftliche Nutzpflanzen wie Kartoffel, Zuckerrübe, Mais etc. verändert
werden.
In den Ausführungsbeispielen 1 bis 4 werden die folgenden Standardverfahren und
Spezialtechniken verwendet.
Zur Klonierung in E. coli wurde ein Derivat des Vektors pACYC, das den polylinker
aus pBluescript enthält, verwendet.
Für die Transformation von Hefen wurde der Vektor pFL61 verwendet (Minet &
Lacroute, 1990,CurrGenet 18: 287-291).
Für die Pflanzentransformation wurden die Genkonstruktionen in den binären
Vektor pBinAR, einem Derivat von pBIN19 (Bevan, 1984, NucI Acids Res 12: 8711-
8721), kloniert (s. Ausführungsbeispiel 4).
Für den pACYC-Vektor sowie für pBinAR-Konstrukte wurde der E. coli-Stamm
DH5α verwendet.
Als Ausgangsstamm für die Expression der cDNA-Bibliothek in Hefe wurde der
Hefestamm 26972c (Dubois & Grenson, 1979, Mol Gen Gnete 175: 67-76) mit den
Mutationen mep-1/mep-2 und ura3 verwendet.
Die Transformation der Plasmide in die Kartoffelpflanze wurde mit Hilfe des
Agrobacterium tumefaciens-Stammes LBA4404 (Bevan (1984) Nucl. Acids Res 12:
8711-8720) durchgeführt.
Der Transfer der DNA in die Agrobakterien erfolgte durch direkte Transformation
nach der Methode von Höfgen & Willmitzer (1988, Nucleic Acids Res 16: 9877). Die
Plasmid-DNA transformierter Agrobakterien wurde nach der Methode von Birnbolm
& Doly (1979, Nucl Acids Res 7: 1513-1523) isoliert und nach geeigneter
Restriktionsspaltung gelelektrophoretisch analysiert.
10 ml einer unter Selektion gewachsenen Übernachtkultur von Agrobacterium
tumefaciens wurden sedimentiert und im gleichen Volumen antibiotikumfreien
Mediums resuspendiert. In einer sterilen Petrischale wurden Blattscheiben aus
Sterilkultur (ca. 1 cm²), deren Mittelrippe entfernt wurde, in der Bakteriensuspension
gebadet. Anschließend wurden die Blattscheiben in Petrischalen, die MS-Medium
(nach Murashige und Skoog, 1962, Physiologia Plantarum 15: 473-497) mit 2%
Saccharose und 0,8% Bacto-Agar enthalten, dicht ausgelegt. Nach zweitägiger
Inkubation bei 25°C im Dunkeln wurden sie auf MS-Medium übertragen, das 500
mg/l Claforan, 50 mg/l Kanamycin, 1 mg/l Benzylaminopurin (BAP), 0,2 mg/l
Naphtylessigsäure(NAA) und 0,8% Agar enthielt. Wachsende Sprosse wurden auf
hormonfreies MS-Medium mit 250 mg/l Claforan und 50 mg/l Kanamycin überführt.
Kotyledonen einer sieben Tage alten, aus Samen angezogenen Sterilkultur von
Arabidopsis thaliana wurden auf Cl Medium mit einer Schicht von Tabak-
Suspensionskultur (als "feeder layer") zwei Tage lang vorinkubiert und dann
5 Minuten in einer Suspension mit Agrobacterium tumefaciens (Herstellung der
Suspension s. Tabak-Transformation) und anschließend für zwei Tage auf Cl-
Medium mit "feeder layer" im Schwachlicht inkubiert. Nach dieser Kokultivierung mit
Agrobakterien wurden die Explantate auf SIM I Medium ausgelegt, das wöchentlich
erneuert wurde. Nach Bildung von Kallus wurden die Explantate auf SIM II Medium
umgesetzt und weiterhin unter Selektion mit Kanamycin kultiviert. Kleine Sprosse
wurden vom Kallusmaterial abgetrennt und auf RI Medium umgesetzt. Nach der
Abreifung der Samen konnten diese analysiert werden.
Die einzelnen Medien setzen sich wie folgt zusammen:
Zur Komplementation der Ammoniumtransport-Doppelmutation des Hefestamms
26972c (Dubois & Grenson, 1979, Mol Gen Genet 175: 67-76) wurde eine cDNA
von jungen Keimlingen von Arabidopsis thaliana (Zwei-Blatt-Stadium) im Hefe-
Expressionsvektor pFL61 (Minet & Lacroute, 1990, Curr Genet 18: 287-291)
verwendet, die von Minet zur Verfügung gestellt wurde (Minet et al., 1992, Plant J 2:
417-422). Etwa 1 µg des Vektors mit der cDNA-Insertion wurden in den Hefestamm
26972c nach der Methode von Dohmen et al. (1991, Yeast 7: 691-692) transformiert.
Hefetransformanden, die auf Minimalmedium mit 1 mM NH4Cl als einziger
Stickstoffquelle wachsen konnten, wurden propagiert. Aus den Linien wurde
Plasmid-DNA nach Standardverfahren präpariert. Diese DNA wurde erneut in den
Stamm 26972c transformiert. Auf diesem Weg wurde ein Plasmid pFL61-MEP-a
erhalten, das die mep-1/mep-2 Doppelmutation komplementieren kann. Dieses
Plasmid hat eine Insertion der Größe 1,75 kbp.
Der durch Transformation von 26972c mit dem Plasmid pFL61-MEP-a erhaltene
Hefestamm 26972c::pFL61-MEP-a kann für Aufnahmestudien mit Methylamin oder
Ammonium verwendet werden (s. Ausführungsbeispiel 3). Durch gentechnische
Veränderung der Kodierregion des Ammoniumtransportergens MEP-a nach
Standardverfahren (vgl. Sambrook et al., 1989, Molecular cloning: A loboratory
manual, 2. Aufl., Cold Spring Harbor Laboratory Press, NY, USA) kann dessen
Spezifität bzw. die Charakteristik des Transportmechanismus verändert werden.
Der Stamm 26972c::pFL61-MEP-a eignet sich direkt für die Untersuchung von
Inhibitoren oder Promotoren des Ammoniumtransports mit Hilfe des
erfindungsgemäßen Ammoniumtransportsystems (vgl. Ausführungsbeispiel 3).
Die cDNA Insertion des Plasmids pFL61-MEP-a kann zur Identifikation ähnlicher
DNA-Sequenzen aus Pflanzen anderer Spezies oder aus anderen Organismen wie
Bakterien oder animalischen Systemen verwendet werden. Hierzu sind
Hybridisierungstechniken verwendbar. Ebenso kann mit Hilfe der cDNA Sequenz
nach Standardverfahren ein Konstrukt zur Expression des Genprodukts als
Fusionsprotein in Bakterien hergestellt werden. Mit Hilfe des Fusionsproteins
können Antikörper hergestellt werden, die der Identifikation ähnlicher Proteine in
anderen Organismen dienen.
Aus der entsprechend Ausführungsbeispiel 1 erhaltenen Hefe-Linie 26972c::pFL61-
MEP-a wurde das Plasmid pFL61-MEP-a isoliert und dessen cDNA-Insertion als
NotI Fragment präpariert. Das Fragment wurde in einen modifizierten pACYC
Vektor (Chang & Cohen, 1978, J Bacteriol 134. 1141-1156) kloniert, der zwischen
einer HincII (nt 3211) und einer aufgefüllten HindIII (nt 1523) Schnittstelle den
polylinker aus pBluescript als BssHII Fragment enthält. Durch die Modifikation geht
die Tetracyclinresistenz verloren. Das cDNA Fragment wurde in den so erhaltenen
Vektor pACH-H als NotI Fragment in die NotI Schnittstelle kloniert. Mit Hilfe
synthetischer Oligonukleotide wurde die Insertion nach der Methode von Sanger et
al. (1977, Proc Natl Acad Sci USA 74: 5463-5467) sequenziert. Die Sequenz ist in
Seq-ID No 1 wiedergegeben.
Die Hefe-Linien 26972c::pFL61, 26972c::pFL61-MEP-a und deren Ausgangslinie
Σ1278b (Dubois & Grenson, 1979, Mol Gen Genet 175: 67-76, MEP-1/MEP-2 ura3)
wurden in Flüssigmedium mit 1,7 g Yeast Nitogen Base ohne Ammonium und ohne
Aminosäuren (Difco), 20g Agarose, 1% Glukose (w:v), 0,5 mg/l Prolin angezogen,
bis die Kulturen die logarithmische Phase erreicht hatten. Nach Zentrifugation von
jeweils 25 ml der Kultur wurden die Zellen mit 10 mM Phosphat ph7 bzw. pH4
gewaschen und in 1,5 ml 10 mM Phosphatpuffer aufgenommen. Zehn Minuten vor
Beginn der Transportmessungen wurde auf eine Endkonzentration von 10 mM
Glukose eingestellt. 100 µl der Suspension wurden einer Lösung von 10 mM
Phosphat pH 4 bzw. 7, 100 µM unmarkierten Methylamins, und 5 µCi 14C-markierten
Methylamins(0.1 mCi/1,9 µmol) zugesetzt (jeweils Endkonzentrationen). Die
Aufnahme des markierten Methylamins wurde nach 10, 60, 120 und 180 sek
gemessen. Hierzu wurden dem Ansatz jeweils 50 µl entnommen und in einem
Volumen von 1 ml H2O + 3 mM unmarkierten Methylamins auf Glasfaserfilter
aufgezogen. Nach Waschen mit 10 ml H2O + 3 mM unmarkierten Methylamins
wurde die Menge aufgenommenen 14C-Methylamins durch Scintillation gemessen
(Tabelle Ia bzw. Ib). Die Aufnahme des markierten Methylamins wurde derjenigen
bei Koinkubation mit 0,5 mM NH4Cl (Tabelle II) bzw. 0,5 mM KCl (Tabelle III), sowie
derjenigen bei Koinkubation mit den Entkopplern Dinitrophenol (DNP) und Carbonyl-
cyanid-m-chlorphenylhydrazon (CCCP) verglichen (Tabelle IV). Die Werte jeweils
eines typischen Experiments sind in den Tabelle I bis IV aufgeführt:
Aufnahme von 14C-Methylamin in Hefestämme nach Inkubation mit 10 mM Glukose
bei unterschiedlichen pH Werten (zu jedem Zeitpunkt werden für die MEP-a
Transformande und die Nullkontrolle (Plasmid pFL61 ohne cDNA Insertion) Werte
aus zwei unabhängigen Meßreihen angegeben). Meßwerte in cpm (counts per
minute).
Aufnahme von 14C-Methylamin in Hefestämme nach Inkubation mit 10 mM Glukose
in Gegenwart von 0,5 mM NH4Cl. Meßwerte in cpm. Der pH Wert beträgt 7.
Aufnahme von 14C-Methylamin in Hefestämme nach Inkubation mit 10 mM Glukose
in Gegenwart von 0,5 mM KCl, wenn nicht anders vermerkt. Meßwerte in cpm. Der
pH Wert beträgt 7.
Aufnahme von 14C-Methylamin in Hefestämme nach Inkubation mit 10 mM Glukose
in Gegenwart von 0,1 mM Dinitrophenol (DNP) oder 10 µM Carbonylcyanid-m-
chlorophenylhydrazon (CCCP) wie vermerkt. Meßwerte in cpm. Der pH Wert beträgt
7.
Aus dem Plasmid pFL61-MEP-a, das als Insertion die cDNA für den Methylamin-
bzw. Ammoniumtransporter von Arabidopsis thaliana enthält, wurde die Insertion als
NotI Fragment isoliert und nach Auffüllen überhängender Enden in die SmaI
Schnittstelle von pBinAR kloniert. Die cDNA trägt in der Plasmidkarte (Fig. 1) die
Bezeichnung "B". Je nachdem, ob B in sense Orientierung zum 35S Promotor von
pBinAR eingeführt wurde oder nicht, trägt das entstandene Plasmid die Bezeichnung
p35S-MEP-a bzw. p35S-a-MEP-a. Das Plasmid pBinAR ist ein Derivat von pBIN19
(Bevan, 1984, Nucl Acids Res 12: 8711-8720). Zwischen dessen EcoRI und KpnI
Schnittstelle wurde ein Fragment aus dem Genom des Blumenkohl Mosaik Virus,
das den 35S Promotor (nt 6909-7437) trägt, eingefügt. Das Promotorfragment
wurde als EcoRI/KpnI Fragment aus dem Plasmid pDH51 (Pietrzak et al., Nucl
Acids Res 14: 5857-5868) präpariert. In der Plasmidkarte trägt das
Promotorfragment die Bezeichnung "A". Zwischen der SphI und der HindIII
Schnittstelle von pBinAR ist außerdem das Polyadenylierungssignal des Gens 3 der
T-DNA des Plasmids pTiACH5 (Gielen et al., EMBO J 3: 835-846) eingefügt. Hierzu
war ein PvuII/HindIII Fragment (nt 11749-11939) aus dem Plasmid pAGV 40
(Herrera-Estrella et al., 1983, Nature 303: 209-2139) an der PvuII Schnittstelle mit
einem SphI linker versehen worden. Das Polyadenylierungssignal trägt in der
Plasmidkarte die Bezeichnung "C".
Nach Transformation von Agrobakterien mit den Plasmiden p35S-MEP-a und p35S-
a-MEP-a wurden diese zur Infektion von Blattsegmenten von Tabak und
Arabidopsis thaliana eingesetzt.
Zehn unabhängig erhaltene Transformanden für beide Konstrukte, in denen die
Präsenz des intakten, nicht rearrangierten chimären Gens mit Hilfe von Southern
blot Analysen nachgewiesen worden war, wurden bezüglich der Veränderungen im
Stickstoffhaushalt untersucht.
SEQ ID NO: 1
ART DER SEQUENZ: Nukleotid mit entsprechendem Protein SEQUENZLÄNGE: 1748 Basenpaare
STRANG FORM: Einzelstrang TOPOLOGlE: linear ART DES MOLEKÜLS: cDNA
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT
ORGANISMUS: Arabidopsis thaliana HERKUNFT: cDNA Bibliothek im Plasmid pFL61
MERKMALE: von 21 bis 1523 Kodierregion
EIGENSCHAFTEN: Ammoniumtransporter
SEQ ID NO: 1
SEQUENCE TYPE: Nucleotide with corresponding protein SEQUENCE LENGH: 1748 base pairs
STRANDEDNESS: single TOPOLOGY: linear MOLEGULE TYPE: cDNA
ORIGINAL SOURCE
ORGANISM: Arabidopsis thaliana IMMEDIATE EXPERIMENTAL SOURCE: cDNA library in plasmid pFL61
FEATURES: from 21 to 1523 coding region
PROPERTIES: ammonia transporter
ART DER SEQUENZ: Nukleotid mit entsprechendem Protein SEQUENZLÄNGE: 1748 Basenpaare
STRANG FORM: Einzelstrang TOPOLOGlE: linear ART DES MOLEKÜLS: cDNA
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT
ORGANISMUS: Arabidopsis thaliana HERKUNFT: cDNA Bibliothek im Plasmid pFL61
MERKMALE: von 21 bis 1523 Kodierregion
EIGENSCHAFTEN: Ammoniumtransporter
SEQ ID NO: 1
SEQUENCE TYPE: Nucleotide with corresponding protein SEQUENCE LENGH: 1748 base pairs
STRANDEDNESS: single TOPOLOGY: linear MOLEGULE TYPE: cDNA
ORIGINAL SOURCE
ORGANISM: Arabidopsis thaliana IMMEDIATE EXPERIMENTAL SOURCE: cDNA library in plasmid pFL61
FEATURES: from 21 to 1523 coding region
PROPERTIES: ammonia transporter
Claims (20)
1. DNA-Sequenzen, die die Kodierregion eines pflanzlichen Ammonium
transporters enthalten, dadurch gekennzeichnet, daß die in der Nukleotid
abfolge enthaltende Information bei Integration in ein pflanzliches Genom,
unter Kontrolle eines Promotors in sense Orientierung, die Expression
einer translatierbaren mRNA ermöglicht, was zur Synthese eines Ammonium
transporters in transgenen Pflanzen führt.
2. DNA-Sequenzen, die die Kodierregion eines pflanzlichen Ammonium
transporters enthalten, dadurch gekennzeichnet, daß die in der Nukleotid
abfolge enthaltende Information bei Integration in ein pflanzliches Genom,
unter Kontrolle eines Promotors in anti-sense Orientierung, die Expression
einer nicht-translatierbaren mRNA ermöglicht, was die Synthese eines
endogen Ammoniumtransporters in transgenen Pflanzen verhindert.
3. DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1 und 2, dadurch gekennzeichnet,
daß die Kodierregion folgende Nukleotidabfolge (Seq-ID No 1) enthält:
4. Plasmide, enthaltend DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3.
5. Plasmid p35S-MEP-a (DSM 8651).
6. Plasmid p35S-a-MEP-a (DSM 8652).
7. Verwendung der Plasmide gemäß den Ansprüchen 4-6 oder Derivate oder
Teile davon zur Transformation pro- und eukaryontischer Zellen.
8. Transgene Pflanzen, enthaltend DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen
1-3.
9. Hefen, enthaltend DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3.
10. Bakterien, enthaltend DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3.
11. Pflanzenzellen, enthaltend DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3.
12. Verwendung von Pflanzenzellen gemäß Anspruch 11 zur Regenerierung
ganzer Pflanzen.
13. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3 zur
Herstellung von Derivaten mit veränderter Spezifität des Ammonium
transporters.
14. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3 zur Isolierung
ähnlicher Sequenzen aus dem Genom von Bakterien, Pilzen und transgenen
Pflanzen.
15. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1 und 3, in
Kombination mit einem Transkriptions-Promotor in sense Orientierung, zur
Expression einer translatierbaren mRNA, die die Synthese eines Ammonium
transporters in pro- und eukaryontischen Zellen ermöglicht.
16. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 2 und 3, in
Kombination mit einem Transkriptions-Promotor in anti-sense Orientierung, zur
Expression einer nicht translatierbaren mRNA, die die Synthese eines endo
genen Ammoniumtransporters in pro- und eukaryontischen Zellen verhindert.
17. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1-3 zur
Herstellung von transgenen Pflanzen mit verändertem Stickstoffmetabolismus.
18. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 1 und 3 zur
Herstellung von transgenen Nutzpflanzen, wie Tabak, Kartoffel, Rübe und
Mais, mit gesteigertem Ertrag.
19. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 2 und 3 zur
Herstellung von Nutzpflanzen, wie Tabak, Kartoffel, Rübe und Mais, für "low
input" Bewirtschaftung.
20. Verwendung der DNA-Sequenzen gemäß den Ansprüchen 2 und 3, zur
Herstellung von transgenen Nutzpflanzen, die auch auf sauren Böden
wachsen.
Priority Applications (11)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE4337597A DE4337597C2 (de) | 1993-10-28 | 1993-10-28 | DNA-Sequenzen für Ammoniumtransporter, Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen und Pflanzen enthaltend den Transporter |
CA002175211A CA2175211A1 (en) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Dna sequences for ammonium transporter, plasmids, bacteria, yeasts, plant cells and plants containing the transporter |
US08/635,967 US6620610B2 (en) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | DNA sequence from Arabidopsis thaliana encoding ammonium transporter, and plasmids, bacteria and yeast comprising the DNA sequence |
IL11137294A IL111372A0 (en) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Dna sequences for ammonium transporter, plasmids, bacteria, yeasts, plant cells and plants containing the transporter |
PCT/EP1994/003499 WO1995011978A1 (en) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Dna sequences for ammonium transporter, plasmids, bacteria, yeasts, plant cells and plants containing the transporter |
AU80600/94A AU694457B2 (en) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | DNA sequences for ammonium transporter, plasmids, bacteria, yeasts, plant cells and plants containing the transporter |
EP94931547A EP0730652B1 (de) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Für ammonium-transporter kodierende dna-sequenzen und dieser enthaltende, plasmide, bakterien, hefen und pflanzenzellen |
AT94931547T ATE246249T1 (de) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Für ammonium-transporter kodierende dna-sequenzen und dieser enthaltende, plasmide, bakterien, hefen und pflanzenzellen |
JP7512404A JPH09504171A (ja) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | アンモニウム輸送体、該輸送体を含有するプラスミド、細菌、酵母、植物細胞および植物 |
DE69432988T DE69432988T2 (de) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Für ammonium-transporter kodierende dna-sequenzen und dieser enthaltende, plasmide, bakterien, hefen und pflanzenzellen |
US10/449,148 US20030204867A1 (en) | 1993-10-28 | 2003-05-30 | DNA sequences for ammonium transporter, plasmids, bacteria, yeasts, plant cells and plants containing the transporter |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE4337597A DE4337597C2 (de) | 1993-10-28 | 1993-10-28 | DNA-Sequenzen für Ammoniumtransporter, Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen und Pflanzen enthaltend den Transporter |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
DE4337597A1 true DE4337597A1 (de) | 1995-05-04 |
DE4337597C2 DE4337597C2 (de) | 2002-07-18 |
Family
ID=6501748
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE4337597A Expired - Fee Related DE4337597C2 (de) | 1993-10-28 | 1993-10-28 | DNA-Sequenzen für Ammoniumtransporter, Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen und Pflanzen enthaltend den Transporter |
DE69432988T Expired - Fee Related DE69432988T2 (de) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Für ammonium-transporter kodierende dna-sequenzen und dieser enthaltende, plasmide, bakterien, hefen und pflanzenzellen |
Family Applications After (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
DE69432988T Expired - Fee Related DE69432988T2 (de) | 1993-10-28 | 1994-10-24 | Für ammonium-transporter kodierende dna-sequenzen und dieser enthaltende, plasmide, bakterien, hefen und pflanzenzellen |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US6620610B2 (de) |
EP (1) | EP0730652B1 (de) |
JP (1) | JPH09504171A (de) |
AT (1) | ATE246249T1 (de) |
AU (1) | AU694457B2 (de) |
CA (1) | CA2175211A1 (de) |
DE (2) | DE4337597C2 (de) |
IL (1) | IL111372A0 (de) |
WO (1) | WO1995011978A1 (de) |
Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5750362A (en) * | 1993-12-16 | 1998-05-12 | Basf Aktiengesellschaft | Methods for identifying substances with a potential herbicidal or growth-regulating action by means of plant transporter proteins, the use of the transporter proteins, and substances with a herbicidal and growth-regulating action |
WO2007137973A2 (en) | 2006-05-31 | 2007-12-06 | Metanomics Gmbh | Manipulation of the nitrogen metabolism using ammonium transporter or glucose 6-phosphate deshydrogenases or farnesyl phosphate synthetase (fpp) |
DE112008002435T5 (de) | 2007-09-18 | 2010-07-22 | Basf Plant Science Gmbh | Pflanzen mit erhöhtem Ertrag |
DE112008003433T5 (de) | 2007-12-21 | 2010-11-04 | Basf Plant Science Gmbh | Pflanzen mit erhöhtem Ertrag (KO NUE) |
US8809059B2 (en) | 2007-09-21 | 2014-08-19 | Basf Plant Science Gmbh | Plants with increased yield |
Families Citing this family (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2053799A (en) * | 1997-12-15 | 1999-07-05 | Max-Planck-Gesellschaft Zur Forderung Der Wissenschaften E.V. | Transgenic plants with an altered potassium metabolism |
US20080184386A1 (en) * | 1998-11-16 | 2008-07-31 | Yongwei Cao | Plant genome sequences and uses thereof |
US7335510B2 (en) * | 2004-12-16 | 2008-02-26 | Ceres, Inc. | Modulating plant nitrogen levels |
BRPI0720219A2 (pt) | 2006-12-08 | 2013-12-24 | Univ Iowa State Res Found Inc | Genes de planta envolvidos em absorção e metabolismo de nitrato |
MX2010004699A (es) * | 2007-11-22 | 2010-05-14 | Cropdesign Nv | Plantas que tienen rasgos incrementados relacionados con el rendimiento y un metodo para producirlas. |
CN102146125B (zh) * | 2010-12-24 | 2013-04-24 | 中国农业大学 | 与铵盐吸收相关的蛋白及其编码基因与应用 |
KR101395434B1 (ko) * | 2012-05-25 | 2014-05-14 | 포항공과대학교 산학협력단 | 모노리그놀 수송체 유전자들의 발현량을 변화시키는 재조합 벡터 및 리그닌 함량이 변화된 형질전환 식물 |
CN105622740A (zh) * | 2016-04-01 | 2016-06-01 | 江苏科技大学 | 桑树铵转运蛋白MmAMT2及其应用 |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4866067A (en) * | 1987-12-07 | 1989-09-12 | Ricerche De Schiena s.n.c del Dr. Michele Giuseppe Di Schiena & C. | 6-piperidino-2,4-diaminopyrimidine-3-oxide salt of 3-carboxypyridine n-oxide and topical, related compositions |
DE4035756A1 (de) * | 1990-11-08 | 1992-05-14 | Inst Genbiologische Forschung | Neue plasmide zur herstellung von im habitus und ertrag veraenderten transgenen pflanzen |
-
1993
- 1993-10-28 DE DE4337597A patent/DE4337597C2/de not_active Expired - Fee Related
-
1994
- 1994-10-24 US US08/635,967 patent/US6620610B2/en not_active Expired - Fee Related
- 1994-10-24 JP JP7512404A patent/JPH09504171A/ja active Pending
- 1994-10-24 IL IL11137294A patent/IL111372A0/xx unknown
- 1994-10-24 DE DE69432988T patent/DE69432988T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1994-10-24 EP EP94931547A patent/EP0730652B1/de not_active Expired - Lifetime
- 1994-10-24 AT AT94931547T patent/ATE246249T1/de not_active IP Right Cessation
- 1994-10-24 CA CA002175211A patent/CA2175211A1/en not_active Abandoned
- 1994-10-24 AU AU80600/94A patent/AU694457B2/en not_active Ceased
- 1994-10-24 WO PCT/EP1994/003499 patent/WO1995011978A1/en active IP Right Grant
-
2003
- 2003-05-30 US US10/449,148 patent/US20030204867A1/en not_active Abandoned
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5750362A (en) * | 1993-12-16 | 1998-05-12 | Basf Aktiengesellschaft | Methods for identifying substances with a potential herbicidal or growth-regulating action by means of plant transporter proteins, the use of the transporter proteins, and substances with a herbicidal and growth-regulating action |
WO2007137973A2 (en) | 2006-05-31 | 2007-12-06 | Metanomics Gmbh | Manipulation of the nitrogen metabolism using ammonium transporter or glucose 6-phosphate deshydrogenases or farnesyl phosphate synthetase (fpp) |
EP2497778A2 (de) | 2006-05-31 | 2012-09-12 | Metanomics GmbH | Manipulation des Stickstoffmetabolismus |
DE112008002435T5 (de) | 2007-09-18 | 2010-07-22 | Basf Plant Science Gmbh | Pflanzen mit erhöhtem Ertrag |
US8664475B2 (en) | 2007-09-18 | 2014-03-04 | Basf Plant Science Gmbh | Plants with increased yield |
US8809059B2 (en) | 2007-09-21 | 2014-08-19 | Basf Plant Science Gmbh | Plants with increased yield |
DE112008003433T5 (de) | 2007-12-21 | 2010-11-04 | Basf Plant Science Gmbh | Pflanzen mit erhöhtem Ertrag (KO NUE) |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
AU8060094A (en) | 1995-05-22 |
DE69432988T2 (de) | 2004-04-22 |
US20010003848A1 (en) | 2001-06-14 |
WO1995011978A1 (en) | 1995-05-04 |
AU694457B2 (en) | 1998-07-23 |
US20030204867A1 (en) | 2003-10-30 |
DE69432988D1 (de) | 2003-09-04 |
DE4337597C2 (de) | 2002-07-18 |
IL111372A0 (en) | 1994-12-29 |
JPH09504171A (ja) | 1997-04-28 |
EP0730652A1 (de) | 1996-09-11 |
ATE246249T1 (de) | 2003-08-15 |
EP0730652B1 (de) | 2003-07-30 |
US6620610B2 (en) | 2003-09-16 |
CA2175211A1 (en) | 1995-05-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
DE4420782C1 (de) | DNA-Sequenz, kodierend einen 2-Oxoglutarat/Malat-Translokator, Plasmide, Bakterien, Hefen und Pflanzen enthaltend diesen Transporter | |
EP0375092B1 (de) | Kartoffelknollenspezifische transkriptionale Regulation | |
DE69333079T2 (de) | Expressionskassette und plasmid für eine expression spezifisch für schliesszellen und ihre verwendung zur einführung in transgene pflanzenzellen und pflanzen | |
DE4004800C2 (de) | Im Habitus und Ertrag veränderte transgene Pflanzen | |
EP0375091A1 (de) | Wundinduzierbare und kartoffelknollenspezifische transkriptionale Regulation | |
DE4337597C2 (de) | DNA-Sequenzen für Ammoniumtransporter, Plasmide, Bakterien, Hefen, Pflanzenzellen und Pflanzen enthaltend den Transporter | |
DE69132758T2 (de) | Plasmide zur Herstellung von transgenen Pflanzen welche in Habitus und Ertrag verändert sind | |
DE4220759A1 (de) | DNA-Sequenzen für Oligosaccharid-Transporter, Plasmide, Bakterien und Pflanzen enthaltend einen Transporter sowie Verfahren zur Herstellung und Transformation von Hefestämmen zur Identifikation des Transporteers | |
DE4220758A1 (de) | DNA-Sequenz und Plasmide zur Herstellung von Pflanzen mit veränderter Saccharose-Konzentration | |
DE69326770T2 (de) | Für einen amnosäauretransporter kodierende dna-sequenzen, plasmide, bakterien,hefen, und pflanzen die einer transporter enthalten sowie ihre verwendung | |
DE4444460A1 (de) | Verfahren zur Steigerung des Ertrags sowie zur Veränderung des Blühverhaltens bei Pflanzen | |
DE19853778C1 (de) | DNA-Sequenzen kodierend einen Glutamat/Malat-Translokator, Plasmide Bakterien, Hefen und Pflanzen enthaltend diesen Transporter | |
DE19940270C2 (de) | Verfahren zur Herstellung von Pflanzen mit gesteigerter Photosyntheserate | |
DE4439748A1 (de) | Verfahren zur Veränderung des Blühverhaltens bei Pflanzen | |
DE19600357C1 (de) | DNA-Sequenz kodierend einen Phosphoenolpyruvat-Phosphat-Translokator, Plasmide, Bakterien, Hefen und Pflanzen enthaltend diesen Transporter | |
EP1276882A2 (de) | Verfahren zur genetischen modifizierung einer pflanze | |
DE19732926C2 (de) | DNA-Sequenzen, kodierend einen Glukose-6-phosphat-Phosphat-Translokator, sowie Plasmide, Bakterien, Hefen und Pflanzen, enthaltend diesen Transporter | |
DE19607697C2 (de) | Speicherwurzelgewebespezifisches Regulon der Zuckerrübe | |
EP1346054B1 (de) | Nucleinsäuren, die vacuoläre invertasen codieren, pflanzenzellen und pflanzen, die diese enthalten sowie ihre verwendung | |
EP1307561B1 (de) | Nucleinsäuren, mit deren hilfe pflanzen mit verändertem metabolit-gehalt erzeugt werden können | |
DE10050233A1 (de) | Verfahren zur genetischen Modifizierung einer Pflanze |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
8127 | New person/name/address of the applicant |
Owner name: HOECHST SCHERING AGREVO GMBH, 13509 BERLIN, DE |
|
8127 | New person/name/address of the applicant |
Owner name: AVENTIS CROPSCIENCE GMBH, 13509 BERLIN, DE |
|
8110 | Request for examination paragraph 44 | ||
8125 | Change of the main classification |
Ipc: C12N 15/82 |
|
8127 | New person/name/address of the applicant |
Owner name: AVENTIS CROPSCIENCE GMBH, 65929 FRANKFURT, DE |
|
D2 | Grant after examination | ||
8327 | Change in the person/name/address of the patent owner |
Owner name: BAYER CROPSCIENCE GMBH, 65929 FRANKFURT, DE |
|
8339 | Ceased/non-payment of the annual fee |