DE4328336A1 - Thrombininhibitor aus Speichel von Protostomiern - Google Patents

Thrombininhibitor aus Speichel von Protostomiern

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DE4328336A1
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Bernard Dr Haendler
Ulrike Dr Hechler
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    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/81Protease inhibitors
    • C07K14/8107Endopeptidase (E.C. 3.4.21-99) inhibitors
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Description

Die Erfindung betrifft Proteine, die Thrombininhibitoren aus Speichel von Protostomiern sind.
Stand der Technik
Thrombin hat eine Schlüsselfunktion bei der Thrombusbildung in Blutgefäßen. Es katalysiert die Spaltung von Fibrinogen zu Fibrin. Es führt zur Bildung von Blutgerinnseln. Weiterhin induziert es die Aggregation von Blutplättchen. Das Enzym ist in der Pathogenese verschiedener Krankheiten, wie z. B. arteriel­ ler und venöser Thrombose oder Arteriosklerose, involviert.
Deshalb ist der Einsatz eines Thrombininhibitors zur Therapie von Thrombosen erfolgversprechend. Die wichtigsten bisher bekannten Thrombininhibitoren sind Antithrombin III-Heparin und Hirudin. Antithrombin III ist ein im Plasma vorkommendes Protein mit einem Molekulargewicht von 58 kDa. Antithrombin III bindet zuerst an Heparin, das ein Polysaccharid ist. Dann bindet der Antithrombin III - Heparin - Komplex an Thrombin und inhibiert dieses Throm­ bin. Es entsteht ein sehr stabiler Komplex aus Thrombin und Antithrombin III und Antithrombin III wird von Thrombin gespalten. Neben Thrombin hemmt Antithrombin III auch andere Serinproteasen wie z. B. Faktor Xa (Pratt,C.W. und Church, F.C. (1991) "Antithrombin: Structure and Function", Seminars in Hematology 28 : 3-9).
Aus dem Blutegel Hirudo medicinalis wurde das Protein Hirudin isoliert. Es hat ein Molekulargewicht von etwa 7 kDa und bindet über ionische Wechselwirkung am Thrombin. Es ist spezifisch für Thrombin ( Johnson, P.H. et al. (1989) "Biochemistry and Genetic engineering of hirudin", Seminars in Thrombosis and Hemostasis 15 : 302-315).
Beschreibung der Erfindung
Neben den zuvor erwähnten Thrombininhibitoren, die zum Stand der Technik zählen, sind weitere Inhibitoren notwendig, die einen anderen Wirkmechanis­ mus, oder eine gesteigerte Aktivität besitzen.
Die Erfindung liefert natürliche oder synthetisch herstellbare Proteine, die Thrombininhibitoren sind und aus dem Speichel von Insekten, die Säugetierblut saugen, isolierbar sind.
Bevorzugt sind erfindungsgemäße Proteine, die aus der Raubwanze Triatoma pallidipennis isolierbar sind.
Die erfindungsgemäßen Proteine können natürlichen Ursprungs sein. Die Proteine werden gewonnen, indem der Speichel gereinigt wird. Ebenfalls ist möglich, die Proteine aus den Speicheldrüsen zu isolieren oder die das Protein synthetisierenden Zellen aus der Speicheldrüse zu nehmen und in Kultur zu halten. Die von dieser Zellkultur produzierten Überstände werden geerntet und aufgearbeitet. Der Zellüberstand wird gereinigt und die erfindungsgemäßen Proteine isoliert und angereichert. Alle Anreicherungsstufen der Isolierung und der Reinigung sind Teil der Erfindung. Bevorzugt sind die Anreicherungsstufen der Isolierung und Reinigung, bei denen die erfindungsgemäßen Proteine zu pharmazeutischen Zwecken verwendet werden können. So werden Reinigungen von 50% des Thrombininhibitors bezogen auf das Gesamtprotein erzielt, bevorzugt sind 85%, mehr bevorzugt 95% und am meisten bevorzugt 99% des Thrombininhibitors bezogen auf das Gesamtprotein.
Die Erfindung umfaßt nicht allein die Proteine, die von Triatoma pallidipennis isolierbar sind, sondern auch Proteine, die von anderen Insektenarten synthetisiert werden können. So sind neben den Proteine, die von Triatoma pallidipennis isolierbar sind, die zur Gruppe der bevorzugtesten zählen, weitere Proteine bevorzugt, die von Triatoma infestans, Triatoma dimidiata, Triatoma maculata, Rhodnius prolixus, Panstrongylus megistus und Fanstrongylus infestans stammen.
Ebenso ist es möglich, die erfindungsgemäßen Proteine synthetisch herzustellen. Dazu zählt die Proteinsynthese nach J.M. SEWART and J.D. YOUNG, San Franzisco, 1969 and J. MEIENHOFER, Hormonal Proteins and Peptides Vol. 2 p 46, Academic Press (New York), 1973 und E. SCHODER and K. LUBKE, The Peptides, Vol. 1, Academic Press (New York) 1965. Zu den synthetisch hergestellten Proteinen zählen auch die rekombinanten Proteine, die nach bekannten Verfahren hergestellt werden. Je nach Wirtsorganismus können die erfindungsgemäßen Proteine glykosyliert oder, wenn sie in Prokaryonten synthetisiert werden, unglykosyliert sein.
Die Funktion der Inhibitoren ist in verschiedenen Testsystemen zu ermitteln. In den Beispielen 2 bis 4 und 9 sind gängige Testverfahren beschrieben.
Die erfindungsgemäßen Proteine sind in dem Speichel von Insekten, die Säugetierblut saugen, festzustellen. Diese Proteine werden üblicherweise von Zellen der Speicheldrüsen synthetisiert. Daher können die Proteine aus dem Speichel isoliert werden. Die erfindungsgemäßen Proteine sind nicht auf diese Herstellungsweise und Isolierung beschränkt. Vielmehr sind alle synthetisch hergestellten, erfindungsgemäßen Thrombininhibitoren mitumfaßt, die sich im dem Speichel nachweisen und daraus isolieren lassen.
N-Terminale Sequenzen des reifen Proteins
Die Erfindung umfaßt weiterhin ein natürliches oder synthetisch herstellbares Protein, das ein Thrombininhibitor ist und aus dem Speichel von Insekten, die Säugetierblut saugen, bevorzugt aus Triatoma pallidipennis, isolierbar ist,
  • a) wobei das Protein als aktives Protein eine N-terminale Sequenz wie folgt besitzt:
oder
  • b) wobei das Protein als aktives Protein allelische Modifikationen der zuvor unter a) genannten N-terminalen Aminosäure-Sequenz aufweist, wobei eine oder zwei Aminosäuren der N-terminalen Aminosäure- Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert sind, ohne dabei die Aktivität des aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen,
oder
  • c) wobei das Protein als aktives Protein posttranslationale Modifikationen der N-terminalen Sequenzen unter a) und b) aufweist, die nicht wesentlich die Aktivität des aktiven Proteins beeinflussen.
Sequenzen der reifen Proteine
Die Erfindung umfaßt weiterhin ein Protein, das ein Thrombininhibitor ist und
  • d) das als aktives reifes Protein eine der folgenden Sequenzen besitzt:
    • i) Sequence Identifer 1 (Sequenz Protokoll Nr. 1);
    • ii) Sequence Identifer 2 (Sequenz Protokoll Nr. 2);
    • iii) Sequence Identifer 3 (Sequenz Protokoll Nr. 3) und
    • iv) Sequence Identifer 4 (Sequenz Protokoll Nr. 4);
oder
  • e) das als aktives reifes Protein allelische Modifikationen einer der zuvor unter d) genannten Aminosäure-Sequenzen aufweist, wobei wenigstens eine Aminosäure der Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert sind, ohne dabei die Aktivität des aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen
oder
  • f) das als aktives reifes Protein posttranslationale Modifikationen einer der Sequenzen unter d) und e) aufweist, die nicht wesentlich die Aktivität des aktiven Proteins beeinflussen.
Alle allelischen Modifikationen, die die Substitutionen, die Deletionen und/oder die Insertionen von bis zu 30 Aminosäuren umfassen, gehören zur Gruppe der erfindungsgemäßen Proteine. Bevorzugt sind Deletionen, Substitutionen und/oder Insertionen von bis zu 20 Aminosäuren, mehr bevorzugt von bis zu 10 Aminosäuren, am meisten bevorzugt sind die Deletionen, Substitutionen und/oder Insertionen von einer, zwei, drei, vier, fünf, sechs, sieben, acht oder neun Aminosäuren.
Sequenzen der reifen Proteine mit Signalsequenz
Eine weitere Ausführungsform der erfindungsgemäßen Proteine bestehen in einem Protein, das aus einer Signalsequenz und einem reifen erfindungsgemäßen Protein besteht,
  • g) wobei das Protein eine der folgenden Sequenzen besitzt:
    • i) Sequence Identifier 5 (Sequenz Protokoll Nr. 5);
    • i) Sequence Identifier 6 (Sequenz Protokoll Nr. 6);
    • i) Sequence Identifier 7 (Sequenz Protokoll Nr. 7) und
    • i) Sequence Identifier 8 (Sequenz Protokoll Nr. 8);
oder
  • h) wobei das Protein allelische Modifikationen einer der zuvor unter g) genannten Aminosäure-Sequenzen aufweist, wobei wenigstens eine Aminosäure der Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei die Aktivität des reifen aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen,
oder
  • i) wobei das Protein posttranslationale Modifikationen einer der Sequenzen unter g) und h) aufweist, die nicht westenlich die Aktivität des aktiven reifen Proteins beeinflussen.
Alle allelischen Modifikationen, die die Substitutionen, die Deletionen und/oder die Insertionen von bis zu 32 Aminosäuren umfassen, gehören zur Gruppe der erfindungsgemäßen Proteine. Bevorzugt sind Deletionen, Substitutionen und/oder Insertionen von bis zu 21 Aminosäuren, mehr bevorzugt von bis zu 11 Aminosäuren, am meisten bevorzugt sind die Deletionen, Substitutionen und/oder Insertionen von einer, zwei, drei, vier, fünf, sechs, sieben, acht oder neun Aminosäuren.
Am meisten bevorzugt sind erfindungsgemäße Proteine, die rekombinante Proteine sind. Dabei können die Proteine glykosyliert sein.
Die erfindungsgemäßen Protein umfassen die reifen Proteine und die entsprechende Vorläuferproteine, welche sich aus einer "Signal-Sequence" (Signal-Sequenz) und der Sequenz des reifen Proteins zusammensetzen. Dabei geht die "Signal-Sequenz" der Sequenz des reifen Proteins voraus. Das reife Protein beginnt mit der zuvor genannten N-terminalen Sequenz. Die "Signal-Sequenz" ist für die Durchdringung des endoplasmatischen Retikulums erforderlich.
cDNA oder DNA kodierend für die erfindungsgemäßen Proteine
Die Erfindung umfaßt weiterhin auch cDNA oder DNA, die einen reifen Thrombininhibitor kodiert,
  • aa) wobei die cDNA oder DNA eine der folgenden Aminosäure-Sequenzen kodiert:
    • i) Sequence Identifier 1 (Sequenz Protokoll Nr. 1);
    • ii) Sequence Identifier 2 (Sequenz Protokoll Nr. 2);
    • iii) Sequence Identifier 3 (Sequenz Protokoll Nr. 3) und
    • iv) Sequence Identifier 4 (Sequenz Protokoll Nr. 4),
oder
  • bb) wobei die cDNA oder DNA allelische Modifikationen einer der Aminosäure-Sequenzen unter aa) kodiert,
worin wenigstens eine Aminosäure der Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei der Aktivität des aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen.
Die allelischen Modifikationen sind zuvor unter dem Punkt "Sequenzen der reifen Proteine" definiert worden.
Weiterhin umfaßt die Erfindung eine cDNA oder DNA, die einen Thrombininhibitor kodiert,
  • cc) wobei die cDNA oder DNA eine der folgenden Nukleotidsequenzen besitzt:
    • i) Sequence Identifier 9 (Sequenz Protokoll Nr. 9);
    • ii) Sequence Identifier 10 (Sequenz Protokoll Nr. 10);
    • iii) Sequence Identifier 11 (Sequenz Protokoll Nr. 11) und
    • iv) Sequence Identifier 12 (Sequenz Protokoll Nr. 12),
oder
  • dd) wobei die cDNA oder DNA eine allelische Modifikation einer der Nukleotidsequenzen unter cc) aufweist, wobei wenigstens ein Nukleotid substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei die Aktivität des Proteins, das von der allelischen Modifikation der Nukleotidsequenz unter cc) kodiert wird, wesentlich zu beeinflussen.
Grundsätzlich zählen alle DNA-Konstrukte, zu den erfindungsgemäßen aufgezählten Sequenzen, wenn Nukleotide ausgetauscht werden, die aufgrund des degenerierten Kodes dieselbe Aminosäure kodieren. Der Austausch derartiger Nukleotide ist offensichtlich und die sich entsprechenden Aminosäuren sind in jedem Biochemielehrbuch offenbart. (R. KNIPPERS, 1982, 3. Auflage, Molekulare Genetik, Georg Thieme Verlag).
Alle allelischen Modifikationen, die zu einer Veränderung der Aminosäure- Sequenz führen, gehören zur Erfindung, sofern diese Modifikationen die Substitutionen, die Deletionen und/oder die Insertionen von bis zu 30 Aminosäuren umfassen. Bevorzugt sind Deletionen, Substitutionen und/oder Insertionen von bis zu 20 Aminosäuren, mehr bevorzugt von bis zu 10 Aminosäuren, am meisten bevorzugt sind die Deletionen, Substitutionen und/oder Insertionen von einer, zwei, drei, vier, fünf, sechs, sieben, acht oder neun Aminosäuren.
Weiterhin umfaßt die Erfindung auch ein genetisches Material, das neben der das reife Protein kodierenden Sequenz ebenfalls auch eine Signalsequenz enthält. Diese Signalsequenz ist in der cDNA-Bank gefunden worden, auch andere Signalsequenzen sind denkbar, die eine Expression und Ausschleusung des Proteins erlauben.
Somit umfaßt die Erfindung eine cDNA oder DNA, die einen Thrombininhibitor mit Signalsequenz kodiert,
  • ee) wobei die cDNA oder DNA eine der folgenden Nukleotidsequenzen besitzt:
    • i) Sequence Identifier 13 (Sequenz Protokoll Nr. 13);
    • ii) Sequence Identifier 14 (Sequenz Protokoll Nr. 14);
    • iii) Sequence Identifier 15 (Sequenz Protokoll Nr. 15) und
    • iv) Sequence Identifier 16 (Sequenz Protokoll Nr. 16),
oder
  • ff) wobei die cDNA oder DNA eine allelische Modifikation einer der Nukleotidsequenzen unter ee) aufweist, wobei wenigstens ein Nukleotid substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei der Aktivität des reifen Proteins, das einschießlich seiner Signalsequenz von der allelischen Modifikation der Nukleotidsequenz unter ee) kodiert wird, wesentlich zu beeinflussen.
Die allelische Modifikationen sind zuvor unter dd) definiert worden.
Wenn die Aktivität des Proteins angegeben wird, um festzustellen, ob die allelische Modifikation unter die Gruppe der erfindungsgemäßen Proteine zählt, so ist immer das reife Protein zu messen, auch wenn die Signalsequenz ebenfalls angeführt ist. Sollte die Signalsequenz angegeben sein, so ist die Funktion immer an dem Protein zu messen, daß nach Entfernen der Signalsequenz erhalten wird.
Weiterhin umfaßt die Erfindung Bindungsmoleküle (zum Beispiel Peptide oder deren Derivate), Einzelketten-Proteine (Single Chain Proteins), Antikörper oder Fragmente der Antikörper, die Domänen auf dem reifen, erfindungsgemäßen Protein spezifisch erkennen. Wenn das gereinigte erfindungsgemäße Protein vorliegt, ist es für den Fachmann leicht möglich, monoklonale Antikörper herzustellen. Dabei wird die bekannte Methode von Köhler und Milstein und deren Weiterführungen angewendet. Dabei wird im einzelnen in konventioneller Methode eine Maus mit dem gereinigten Protein mehrfach immunisiert, die Milzzellen entnommen und mit geeigneten Tumorzellen fusioniert. Die Hybride werden anschließend selektioniert.
Die Proteine der Erfindung können aus dem Speichel der Raubwanze Triatoma pallidipennis isoliert werden. Die Reinigung erfolgt durch eine Gelfiltration und eine anschließende Affinitätschromatographie an Thrombin-Sepharose (siehe Beispiel 1). Die Proteine haben die zuvor beschriebene Aminosäure- Sequenzen. Sie haben ein Molekulargewicht von ca. 18 000 ± 3000 Da (siehe Beispiel 6). Der isoelektrische Punkt liegt im Bereich von pH 4,5 bis 5,2, wenn die im Beispiel 8 beschriebene Methode angewendet wird.
Die Proteine der Erfindung hemmen die Wirkung von Thrombin bei der Blutgerinnung und bei der Aktivierung von Plättchen und im amidolytischen Test. Die Test-Systeme sind in den Beispielen 2, 3, 4 und 9 beschrieben.
Die Proteine hemmen die Gerinnung in einer Konzentration von 8 nmol/l bei einer Thrombinkonzentration von 1,27 nmol/l. Sie hemmen die Thrombin­ induzierte Plättchen-Aggregation zu 100% in einer Konzentration von 15 ng/ml. Diese Konzentration entspricht bei einer eingesetzten Thrombinkonzentration von 0,06 IU/ml = 0,812 pmol/ml (IU = Internationale Einheiten) einem molaren Verhältnis von Thrombin zum Protein der Erfindung von etwa 1 : 1. Dagegen hemmen die Proteine der Erfindung die Aktivität von Thrombin im amidolytischen Test bei einem Verhältnis von Thrombin zum Protein der Erfindung von 1 : 87 nur zu etwa 50%. Die Proteine der Erfindung verlängern in einer Konzentration von 35 nmol/l die Thrombin-Zeit (1 IU/ml) um das 5- fache.
Die Proteine der Erfindung sind spezifisch für Thrombin. Andere Serinproteasen (z. B. Faktor Xa oder Trypsin) werden auch bei einem 40-fachen Überschuß nicht nachweislich gehemmt (s. Beispiel 7).
Vektoren mit der erfindungsgemäßen DNA
Ein weiterer Teil der Erfindung ist ein Vektor, der eine erfindungsgemäße cDNA oder DNA, weiterhin einen passenden Promotor und gegebenenfalls einen passenden Enhancer enthält. Ebenfalls kann auch noch eine "Signal-Sequenz" umfaßt sein. Vektoren sind ausführlich in den europäischen Publikationen EP 0 480 651, EP 0 462 632 und EP 0 173 177 beschreiben.
Eine weitere Ausführungsform der Erfindung besteht in einer eukaryontischen oder prokaryontischen Wirtszelle, die mit einem erfindungsgemäßen Vektor transformiert ist.
Allelische Modifikationen
Die meisten Deletionen, Insertionen und Substitutionen scheinen keine durchgreifende Änderung in der Charakteristik des Proteins der Erfindung zur Folge zu haben. Da es schwer ist, den genauen Effekt einer Substitution, einer Deletion oder einer Insertion im voraus anzugeben, muß die Funktion des veränderten Proteins mit der Funktion des erfindungsgemäßen Proteins ver­ glichen werden. Die hierfür zu verwendenden Methoden sind zum Beispiel in den Beispielen 2 bis 4 und 9 angegeben. Als Standard dient das Protein, das nach Beispiel 1 gereinigt wird, und auch die Reinigungsmethode des Beispiels 1 für das Vergleichsprotein.
Der genetische Code ist degeneriert, das bedeutet, daß die meisten Amino­ säuren von mehr als einem Codon aus drei Nukleotiden kodiert werden. Da­ her führen einige allelische Modifikationen auf der Ebene der Nukleotide nicht zu einer Änderung der Aminosäure-Sequenz. Daher ereignen sich allelische Modifikationen vornehmlich auf der Ebene der DNA und können sich sekundär auf die Aminosäure-Sequenz auswirken.
Die cDNA- oder DNA-Sequenzen, die die erfindungsgemäßen Proteine kodieren, können gemäß konventioneller Techniken modifiziert werden, um Varianten der erfindungsgemäßen Proteine herzustellen, die im wesentlichen die gleiche Aktivität wie die beschriebenen und charakterisierten Proteine der Erfindung besitzen. Dabei wird die Aktivität so gemessen, wie es in den Beispielen 2 bis 4 und 9 beschrieben ist.
Aminosäuren können wie in der Tabelle 1 dargestellt substituiert werden, ohne dabei die Funktion des Proteins wesentlich zu beeinflussen. In jedem einzel­ nen Fall ist durch den Aktivitätstest zu entscheiden, welchen Einfluß die Verän­ derung auf die Funktion des Proteins hat.
Übliche Substituierung von Aminosäuren in einem Protein
Ursprüngliche Aminosäure
Beispielsweise vorgenommene Substituierung
Ala
Gly, Ser
Arg Lys
Asn Gln, His
Asp Glu
Cys Ser
Gln Asn
Glu Asp
Gly Ala, Pro
His Asn, Gln
Ile Leu, Val
Leu Ile, Val
Lys Arg, Gln, Glu
Met Leu, Tyr, Ile
Phe Met, Leu, Tyr
Ser Thr
Thr Ser
Trp Tyr
Tyr Trp, Phe
Val Ile, Leu
Die Funktionen oder die immunologische Identität werden wesentlich verän­ dert, wenn Substituenten gewählt werden, die weniger konservative als die in Tabelle 1 gezeigten Aminosäuren sind. Derartige wesentlichen Veränderun­ gen lassen sich durch Substituierungen mit Aminosäuren erzielen, die sich mehr in ihrer Struktur und in den funktionellen Gruppen unterscheiden. We­ sentliche Veränderungen wirken sich dahingehend aus, daß die dreidimensio­ nale Struktur verändert wird und/oder daß zum Beispiel die Faltblatt-Struktur oder die helikale Struktur beeinflußt wird. Auch Wechselwirkungen der La­ dungen und der hydrophoben Ketten sind bei den Veränderungen zu beachten.
Die Mutationen werden durch die Homologie (Similarity) zweier zum Vergleich anstehender Proteine definiert. Der Ausdruck Homologie umfaßt ähnliche Aminosäuren (zum Beispiel Tabelle 1) und Lücken in den Sequenzen der Aminosäuren (Homologie = similarity). Die erfindungsgemäßen Proteine haben Aminosäure-Sequenzen, die eine Homologie von wenigstens 80%, bevorzugt 90%, mehr bevorzugt 95% und am meisten bevorzugt 98% der erfindungsgemäßen Strukturen besitzt, wie sie durch die Sequenzen unter d) oder g) definiert sind und wie sie weiterhin nach der Reinigung gemäß Beispiel 1 erhalten werden.
Wie zuvor erwähnt umfaßt die Erfindung auch Modifikationen der DNA oder cDNA. Diese modifizierten Sequenzen hybridisieren unter stringenten Bedin­ gungen mit den DNA-Sequenzen, die die erfindungsgemäßen Proteine kodieren (siehe Sequenzen unter aa); cc) und ee)). Die cDNA- oder DNA-Sequenzen haben Nukleotid-Sequenzen, die eine Identität einschließlich kurzer (bis 15 Nukleotide) Deletionen und Insertionen von wenigstens 70%, bevorzugt 82%, mehr bevorzugt 90% und am meisten bevorzugt von 95% mit den erfindungsgemäßen cDNA- oder DNA-Sequenzen besitzen (siehe aa), cc) und ee)). Die Identität einschließlich der kurzen (bis 15 Nukleotide) Deletionen und Insertionen kann durch eine Hybridisierung gemessen werden, wie sie in R. KNIPPERS, Molekulare Genetik, 1982, dritte Auflage, Georg Thieme Verlag Stuttgart, New York beschrieben ist.
Posttranslationale Modifikationen
Unter den zuvor erwähnten posttranslationalen Modifikationen versteht man Veränderungen, die während oder nach der Translation auftreten. Hierzu zählen die Glykosylierung, die Ausbildung von Disulfid-Brücken, die chemische Modifikationen der Aminosäuren, so zum Beispiel die Sulfatierung, die im Zu­ sammenhang mit dem Hirudin beschrieben ist. (J.W. FENTON (1989) "Thrombin Interactions with Hirudin", Seminars in Thrombosis and Hemostasis 15 : 265-268).
Die Glykosylierung ist eine wesentliche Funktion des endoplasmatischen Retikulums und/oder des Golgi-Apparates. Die Sequenz und die Verästelung der Oligosaccharide wird in dem endoplasmatischem Retikulum gebildet und in dem Golgi-Apparat verändert. Die Oligosaccharide können N-verknüpfte Oligosaccharide (Asparagin-verknüpfte) oder O-verknüpfte Oligosaccharide (Serin-, Threonin- oder Hydroxylysin-verknüpfte) sein. Die Form der Glykosy­ lierung ist von dem produzierenden Zelltyp und von der Art abhängig, von der der entsprechende Zelltyp stammt. Das Ausmaß und die Art der Glykosylie­ rung kann durch Substanzen beeinflußt werden, wie es in der europäischen Publikation EP 0 222 313 beschrieben ist. Die Variierung der Glykosylierung kann die Funktion des Proteins verändern.
Proteine bilden häufig kovalente Bindungen innerhalb der Ketten aus. Diese Disulfid-Brücken werden zwischen zwei Cysteinen hergestellt. Dabei wird das Protein spezifisch gefaltet. Die Disulfid-Brücken stabilisieren die dreidimensio­ nale Struktur der Proteine.
Weiterhin können die Aminosäuren so verändert werden, wie es in der inter­ nationalen Publikation WO 91/10684 beschrieben ist. Ebenfalls kann das Protein sulfatiert sein. Diese Veränderung ist im Zusammenhang mit Hirudin beschreiben.
Isolierung und Herstellung der erfindungsgemäßen Proteine
Die Erfindung umfaßt weiterhin ein Verfahren zur Herstellung der erfindungs­ gemäßen Proteine mit den folgenden Schritten:
Kultivierung einer Wirtszelle, die mit einem Vektor transformiert ist, welcher eine erfindungsgemäße cDNA oder DNA enthält,
und
Isolieren und Reinigen des oder der Proteine.
Die Proteine werden bevorzugt gemäß Beispiel 1 gereinigt. Jedoch sind auch andere Isolierungs- und Reinigungs-Methoden möglich:
Methods of Enzymology, Volume 182: Guide to Protein Purification, ed. Murray P. DEUTSCHER, Academic Press, 1990;
Protein Purification Application - A Practical Approach, ed. E.L.V. HARRIS and S. ANGEL, IRL-Press 1990;
Protein Purification, Principles and Practice, Ropert SCOPES, Springer- Verlag 1982; and
Protein Purification, Principles, High Resolution Methods and Applica­ tions, ed. H.-C. JANSON and L. RYDEN, VCH publishers 1989.
Die Erfindung umfaßt ebenfalls ein Verfahren zur Reinigung erfindungsgemäßer Proteine, wobei die Proteine isoliert, über wenigstens eine Säule gereinigt und anschließend eingeengt werden. Bevorzugt sind Chromatographie-Säulen oder Adsorptionschromatographie-Säulen.
Die Erfindung umfaßt darüber hinaus ein Verfahren zur Reinigung von erfindungsgemäßen Proteinen, wobei das Verfahren aus folgenden Schritten besteht:
Auftragen des Speichels auf eine "Superose 12 HR-Säule" und Eluieren und
erneute Auftragung auf einer CH-aktivierten Sepharose-Säule, an der zuvor Thrombin gekoppelt wurde, und Eluieren.
Die Reinigung ist ausführlich im Beispiel 1 beschrieben.
Verwendung als Arzneimittel
Die Proteine gemäß der Erfindung besitzen pharmakologische Effekte und sind deshalb als pharmazeutische Wirkstoffe verwendbar. Die Erfindung umfaßt ebenfalls ein Arzneimittel, das eines der erfindungsgemäßen Proteine oder ein Gemisch davon enthält. Weiterhin gehört zur Erfindung eine pharmazeutische Zusammensetzung, die eines der erfindungsgemäßen Proteine oder ein Gemisch erfindungsgemäßer Proteine enthält, in Gegenwart von pharmazeutisch verträglichen und annehmbaren Verbindungen und Trägern. Ebenfalls umfaßt die Erfindung eine pharmazeutische Zusammensetzung, die eines der pharmazeutisch aktiven, erfindungsgemäßen Proteine oder deren Gemisch und ein pharmazeutisch verträgliches Salz oder einen pharmazeutisch verträglichen Träger enthält.
Insbesondere zeigen die erfindungsgemäßen Proteine gemäß den Sequenz- Protokollen 1 bis 4 eine Inhibierung der Thrombinaktivität.
Die Inhibierung der Thrombinaktivität kann im Gerinnungstest (siehe Beispiel 2), im Blutplättchen-Aggregationstest (siehe Beispiel 3) und im amidolytischen Test (siehe Beispiel 4) und durch Messen der Thrombin-Zeit (siehe Beispiel 9) nach­ gewiesen werden. Die Messung der Thrombin-Zeit ist das bevorzugte Test­ system.
Die erfindungsgemäßen Proteine zeigen eine Verlängerung der Thrombinzeit bei Konzentrationen von 10 bis 60 nmol/l (Thrombinkonzentration 1 IU/ml). Bei einer Konzentration von 58 nmol/l erfolgt eine 9-fache Verlängerung. Höhere Konzentrationen sind anwendbar, ohne das Testsystem zu stören. Somit sind die erfindungsgemäßen Proteine in Konzentrationen von 10 bis 200 nmol/l einsetzbar.
Die Versuchsergebnisse dieses in-vitro-Testes zeigen, daß die erfindungsge­ mäßen Proteine als Arzneimittel oder zur medizinischen Behandlung verwendet werden können. Diese Versuchsergebnisse lassen sich von dem in-vitro- Testsystem auf ein in-vivo-System übertragen, da es sich bei dem Gerin­ nungstest um eine etablierte Versuchsanordnung handelt. (M. TALBOT (1989) "Biology of Recombinant Hirudin, A New Prospect in the Treatment of Throm­ bosis" Seminars in Thrombosis and Hemostasis 15 : 293-301) Die Proteine der Erfindung können deshalb zur Behandlung und Prävention von Thrombo­ sen, instabiler Angina oder Arteriosklerose, oder zur Prävention eines Wieder­ verschlusses von Gefäßen nach PTCNPTA (Angioplastie mit einem Ballon­ katheter) oder zur Verhinderung der Blutgerinnung bei der Hämodialyse dienen. Die Proteine der Erfindung können als ein antithrombotisches und/oder anti­ arteriosklerotisches Medikament bei Säugern, insbesondere Menschen, zur Behandlung von thrombotischen und/oder arteriosklerotischen Beschwerden eingesetzt werden. Diese können beim Reißen von arteriosklerotischen Aggregationen (Plaques), bei Zerstörung von Endothelgewebe, wie zum Bei­ spiel bei Sepsis, bei Transplantaten oder bei instabiler Angina, auftreten. Sie können ebenfalls verwendet werden, um erneute Verschlüsse nach der Be­ handlung von myokardialen Infarkten und/oder bei Fibrinolyse oder Angioplastie zu vermeiden. Dabei kann das Protein der Erfindung vor, bei und/oder nach der Einführung des Katheters verabreicht werden.
Die Erfindung liefert weiterhin
  • (i) die Verwendung eines der erfindungsgemäßen Proteine oder deren Gemisch zur Herstellung eines Medikaments zur Behandlung von Thrombosen, instabiler Angina oder Arteriosklerose, oder zur Präven­ tion eines Wiederverschlusses von Gefäßen nach PTCA/PTA oder zur Verhinderung der Blutgerinnung bei der Hämodialyse;
  • (ii) ein Verfahren zur Behandlung von Thrombosen, instabiler Angina oder Arteriosklerose, oder zur Prävention eines Wiederverschlusses von Gefäßen nach PTCA/PTA oder Throm­ bolyse oder zur Verhinderung der Blutgerinnung bei der Hämodialyse, welches Verfahren eine Verabreichung einer Proteinmenge gemäß der Erfindung umfaßt, wobei die Menge die Krankheit unterdrückt, und wobei die Proteinmenge einem Patienten gegeben wird, der ein solches Medi­ kament benötigt;
  • (iii) eine pharmazeutische Zusammensetzung zur Behandlung von Thrombosen, instabiler Angina oder Arteriosklerose, oder zur Prävention eines Wiederverschlusses von Gefäßen nach PTCA/PTA oder Throm­ bolyse oder zur Verhinderung der Blutgerinnung bei der Hämodialyse, welche Behandlung eines der erfindungsgemäßen Proteine oder deren Gemisch und wenigstens einen pharmazeutisch verträglichen Träger und Zusatz umfaßt.
Für diese therapeutische Wirkung sind unterschiedliche Dosen geeignet. Sie hängen beispielsweise von dem verwendeten Protein, von dem Wirt, von der Art der Verabreichung und von der Art und der Schwere der zu behandelnden Zustände ab.
Im allgemeinen sind jedoch bei Tieren zufriedenstellende Resultate zu erwar­ ten, wenn die tägliche Dosen einen Bereich von 2 µg bis 2000 µg pro kg Kör­ pergewicht umfassen. Bei größeren Säugetieren, beispielsweise dem Menschen, liegt eine empfohlenen tägliche Dosis im Bereich von 2 bis 2000 µg pro kg Körpergewicht, wenn das nach Beispiel 1 gereinigte Protein verwendet wird. Zum Beispiel wird diese Dosis zweckmäßigerweise in Teildosen bis zu viermal täglich verabreicht. Die täglichen Dosen bei der kurzzeitigen Behand­ lung von akuten Thromben können mit 20 bis 2000 µg pro kg Körpergewicht höher als die Dosen bei der chronischen Behandlung mit 2 bis 200 µg pro kg Körpergewicht ausfallen.
Ebenfalls sind zufriedenstellende Resultate zu erwarten, wenn das Protein der Erfindung subkutan verabreicht wird. Bevorzugt ist die gezielte Injektion in den Teil des Körpers, in dem sich Thromben gebildet haben.
Die erfindungsgemäßen Proteine können auf jedem üblichen Weg verabreicht werden, insbesondere in Form von Injektionslösungen oder Suspensionen.
Die vorliegende Erfindung stellt pharmazeutische Zusammensetzungen zur Verfügung, die eines der erfindungsgemäßen Proteine oder deren Gemisch und wenigstens einen pharmazeutisch verträglichen Träger oder Zusatz umfassen. Solche Zusammensetzungen können nach bekannten Verfahren hergestellt werden. Dabei ist auf Remington′s Pharmaceutical Science, 15th ed Mack Publishing Company, East Pennsylvania (1980) hinzuweisen.
Die Versuchsergebnisse werden anhand der Figuren verdeutlicht, die im einzel­ nen folgendes zeigen:
Fig. 1 Verlängerung der Thrombin-Zeit bei Zugabe von erfindungsge­ mäßem Protein aus Triatoma pallidipennis.
Fig. 2 Inhibierung der Thrombinaktivität im amidolytischen Test (Triatoma = Trombininhibitor aus Triatoma pallidipennis).
Fig. 3 Inhibierung der Thrombinaktivität im Gerinnungstest.
Beispiele Beispiel 1 Gewinnung des Speichels von Triatoma pallidipennis und Reinigung des Proteins der Erfindung
Die Raubwanzen werden durch mechanische Stimulation ihrer Probszis zur Ab­ sonderung ihres Speichels angeregt. Der Speichel wird auf einer Glasplatte aufgefangen und mit einer silikonisierten, ausgezogenen Pasteurpipette ge­ sammelt.
Der Speichel wird gefriergetrocknet und in einer Konzentration von 2,5 mg/ml in destilliertem Wasser gelöst. 2 ml dieser Lösung werden über eine "Superose 12 HR 16/50"-Säule (Pharmacia) in 10 mmol/l Tris/HCl, pH 7,4, 0,0001% "Pluronic F68" gelfiltriert. Die im Gerinnungstest (siehe Beispiel 2) aktiven Fraktionen werden vereinigt und auf eine CH-aktivierte Sepharose (Pharmacia), an die zuvor Thrombin nach den Angaben des Herstellers gekoppelt wurde, aufgetragen. Das Protein der Erfindung bindet an diese mit Thrombin ver­ sehenen Säule. Zunächst wird die Säule mit Tyrode-Puffer (ohne Serum­ albumin) gewaschen, dann wird erst mit 10 mmol/l Na-Acetat, pH 4,5, und dann mit 10 mmol/l Glycin, pH 2,5, eluiert. In den Eluaten wird der pH-Wert auf 7 eingestellt. Das 10 mmol/l Glycin Eluat enthält das gereinigte Protein der Erfindung. Es ist aktiv im Gerinnungstest (siehe Beispiel 2), im Plättchen- Aggregationstest (siehe Beispiel 3), im amidolytischen Test (siehe Beispiel 4) und verlängert die Thrombin-Zeit (siehe Beispiel 9). Die Präparation enthält keine in der SDS-Gelelektrophorese detektierbare Verunreinigungen.
Beispiel 2 Inhibierung der Thrombinaktivität im Gerinnungstest
In eine Mikrotiterplatte, die mit Rinderserumalbumin beschichtet ist (0,1% in 0,1 mol/l NaHCO₃, pH 9,5), werden 80 µl 20 mmol/l HEPES, pH 7,4; 0,15 mmol/l NaCl; 20 µl 20 mmol/l CaCl₂; 100 µl einer verdünnten Lösung des Proteins der Erfindung (5-50 ng) und 20 µl Thrombin (0,03 IU = 0,03 Internationale Einheiten) pipettiert. Nach einer Inkubation 2 Minuten bei 37°C werden 100 µl Fibrinogen (5 mg/ml) zugegeben und 40 Minuten bei 37°C inkubiert. Anschließend wird die Absorption bei 405 nm gemessen. 45 ng (=8 nmol/l) des gereinigten Proteins der Erfindung hemmen die Fibrinogenspaltung vollständig. Unter den gleichen Testbedingungen zeigt Hirudin die gleiche Wirksamkeit (vollständige Hemmung mit 8 nmol/l), (siehe Fig. 3).
Beispiel 3 Inhibierung der Thrombinaktivität im Blutplättchen-Aggregationstest
500 µl gelfiltrierte Blutplättchen (300 000/ml) werden mit dem Protein dieser Er­ findung (5-100 ng/ml) für 1 Minute bei 37°C inkubiert. Dann wird die Aggre­ gation mit Thrombin (0,06 IU/ml) induziert und die Aggregation in einem Aggre­ gometer aufgezeichnet. Messungen mit dem gereinigten Protein der Erfin­ dung zeigen, daß bei einer Konzentration von 15 ng/ml die Aggregation zu 100% gehemmt wird.
Beispiel 4 Inhibierung der Thrombinaktivität im amidolytischen Test
In einer Mikrotiterplatte werden 80 µl 100 mmol/l Tris/HCL, pH 7,4; 150 mmol/l NaCl und 0,03 IU (1,35 nmol/l) Thrombin und 100 µl einer verdünnten Lösung des Proteins der Erfindung (32-630 ng) 10 Minuten bei 37°C inkubiert und dann mit 100 µl (50 nmol) des Substrates S2238 (Kabi Vitrum) versetzt. Nach einer Inkubation von 30 Minuten bei 37°C wird die Absorption bei 405 nm ge­ messen. 630 ng (117 nmol/l) hemmen die Aktivität des Thrombins zu ungefähr 50%. Hirudin hemmt in einer Konzentration von 6 nmol/l die Aktivität des Thrombins zu 85% (siehe Fig. 2).
Beispiel 5 Bestimmung der N-terminalen Aminosäure-Sequenz
Das gereinigte Protein der Erfindung wurde in einem automatischen Amino­ säuresequenator (Applied Biosystems, Inc.) nach den Instruktionen des Herstel­ lers sequenziert. Die Sequenz der Aminosäuren 1 bis 21 (vom N-Terminus) ist: Ala-Glu-Gly-Asp-Asp-Cys-Ser-Leu-Glu-Lys-Ala-Met-Gly-Asp-Phe-?-Pro-Gl-u- Glu-Phe-Phe. "?" bedeutet, nicht mit vollständiger Sicherheit identifizierbar. Bei dieser Aminosäure handelt es sich mit einiger Wahrscheinlichkeit um Lysin.
Beispiel 6 SDS-Gelelektrophorese und Bestimmung des Molekulargewichts
Das Protein der Erfindung wurde im reduziertem (Reduktion mit Dithiothreit) und im nicht reduziertem Zustand zusammen mit den Molekulargewichtsmarkern (Electrophoresis Calibration Kit von Pharmacia) Phosporylase b (94 kDa), Album in (67 kDa), Ovalbumin (43 kDa), Carbonic Anhydrase (30 kDa), Trypsin Inhibitor (20,1 kDa) und Lactalbumin (14,4 kDa) auf ein 12,5%-iges SDS-Poly­ acrylamidgel aufgetragen und nach der Elektrophorese nach Laemmli (1970, Nature 227, 680-685) mit Coomassie brillant blue gefärbt. Im reduzierten Zu­ stand wandert das Protein der Erfindung während der Elektrophorese nur ge­ ringfügig oberhalb des Trypsin Inhibitors. Das entspricht einem Molekular­ gewicht von etwa 21 000 Da. Im nicht reduziertem Zustand wandert das Protein der Erfindung zwischen dem Trypsin Inhibitor und Lactalbumin, was ei­ nem Molekulargewicht von etwa 18 000 Da entspricht.
Beispiel 7
Das Protein der Erfindung hemmt nicht die Serinproteasen Faktor Xa und Trypsin.
Die Aktivität von Faktor Xa und von Trypsin werden mit dem folgenden Test gemessen. Zu 80 µl 50 mmol/l Tris/HCl pH 8,0, 227 mmol/l NaCl, werden für die Faktor Xa Bestimmung 0,004 IU (0,653 pmol) Faktor Xa (American Diagnostica) und 0,5 µg (28 pmol) des Proteins der Erfindung und für die Tryp­ sin-Bestimmung 0,004 IU (0,019 pmol) Trypsin (Sigma) und 0,016 µg (0,817 pmol) des Proteins der Erfindung gegeben und für 2 Minuten bei 37°C inku­ biert. Nach Zugabe von 0,05 µmol des Substrates S2222 (Kabi Vitrum) wird für 20 Minuten bei 37°C inkubiert und anschließend die Absorption bei 405 nm gemessen. Die Absorption dieser Ansätze ist genauso hoch wie die von An­ sätzen ohne das Protein der Erfindung, d. h. das Protein hemmt weder die Aktivität von Faktor Xa noch die von Trypsin.
Beispiel 8 Isoelektrische Fokussierung
Das Protein der Erfindung wird auf ein Gel für isoelektrische Fokussierung im Bereich von pH 3 bis 9 (Pharmacia) aufgetragen und zusammen mit Standard­ proteinen (Calibration Kit pH 3 bis 10 von Pharmacia) fokussiert. Die Fokussie­ rungsstelle des Proteins der Erfindung lag zwischen der des Sojabohnen- Trypsininhibitors (I.P. = 4,55) und der von β-Lactoglobulin A (I.P. = 5,2).
Beispiel 9 Verlängerung der Thrombin-Zeit
Die Thrombin-Zeit mißt die Aktivität von exogenem Thrombin, das zum Test­ plasma zugesetzt wird. Zu 0,1 ml Plasma werden 50 µl Lösung des Proteins der Erfindung in verschiedenen Verdünnungen (6 bis 58 nmol/l) und 50 µl Diäthylbarbiturat-Acetat-Puffer mit pH 7,6 gegeben und 1 Minute bei 37°C in­ kubiert. Nach Zugabe von 0,1 ml Thrombin-Lösung (3 IU/ml) wird die Zeit bis zum Gerinnungseintritt gemessen (Biomatic 2000 Coagulometer von Sarstedt). Das Protein der Erfindung, das in einer Konzentration von 35 nmol/l vorliegt, verlängert die Gerinnungszeit im Vergleich zu einem Kontrollansatz um das 5- fache.
Beispiel 10 Bestimmung von internen Aminosäuresequenzen nach Spaltung mit Lys C
Das gereinigte Protein der Erfindung (59 µg) wird mit 10% 2-Mercaptoethanol reduziert (2 Stunden bei Raumtemperatur unter N₂) und dann mit 4-Vinylpyridin umgesetzt (2 Stunden bei Raumtemperatur unter N₂). Nach einer Dialyse gegen 25 mmol/l Tris/HCl, pH 8,5; 1 mmol/l EDTA wird die Probe mit 1 µg Lys C (Boehringer Mannheim) versetzt und 6 Stunden bei 37°C inkubiert. Dieser Spaltansatz wird auf eine Supersper RP-18, 4 µm (250 × 4 mm, MZ- Analysentechnik, Mainz)-Säule aufgetragen und mit einem Gradienten 0,1% TFA in H₂O - 0,08% TFA in 70% Acetonitril eluiert (HPLC-Anlage von Waters). Die Absorption bei 280 nm und bei 214 nm wird aufgezeichnet und das Eluat wird fraktioniert. Die Fraktionen, die den Absorptions-Peaks entsprechen, werden zur Trockne gebracht und in 30 µl H₂O aufgenommen. Einzelne Fraktionen werden in einem automatischen Aminosäuresequenator (Applied Biosystems Inc.) nach den Instruktionen des Herstellers sequenziert. Dabei ergeben sich folgende Sequenzen (Start jeweils vom N-Terminus, "?" bedeutet, nicht eindeutig identifiziert):
  • 1. Ala - Met - Gly - Asp - Phe - Lys - Pro - Glu - Glu - Phe - Phe - ? - Gly - Thr - Arg(?) - Tyr - Leu - Ala (Die Bestimmung der Aminosäure Arg ist mit Unsicherheit behaftet.)
  • 2. Gly - Phe - Thr - Gln - Ile - Val - Glu - Ile - Gly - Tyr - Asn - Lys -.
  • 3. Asn - Gly - Glu - Gln - Tyr - Ser - Phe - Lys -.
(Beispiel 10 geht über die Offenbarung der DE-P 42 41 659.0 [Anmeldetag 4. Dezember 1992] hinaus).
Beispiel 11 Molekulare Klonierung von den erfindungsgemäßen cDNAs
Wenn die Sequenz des N-terminalen Endes des erfindungsgemäßen Proteins bekannt ist, läßt sich eine korrespondierende Nukleotidsequenz ermitteln (siehe WO 90/07861).
aa) Herstellung von spezifischen Proben bei der PCR
Um die erfindungsgemäßen cDNA zu ermitteln, wird zuerst der Primer (Vorlage, Startstück) synthetisiert, der von der zuvor im Edman-Abbau ermittelte Ami­ nosäuresequenz abgeleitet wird. Die synthetisierten Oligonucleotidesequen­ zen des Primers werden genutzt um mit der PCR (Polymerase Chain Reaction = Polymerase-Kettenreaktion) ein Fragment der erfindungsgemäßen cDNA zu amplifizieren (siehe US-Patent 4,800,159).
Zwei Oligonukleotid-Primer werden hergestellt, indem die Nukleotid-Sequenz von der zuvor teilweise bestimmten Aminosäure-Sequenz des N-terminalen Be­ reichs des vollständigen erfindungsgemäßen Proteins und eines seiner Frag­ mente hergeleitet wird. Dabei werden die folgenden Aminosäure-Sequenzen verwendet:
N-terminale Sequenz des vollständigen Proteins:
und N-terminale Sequenz des Fragmentes:
Die Matritze (template) besteht aus der cDNA, die von einer poly-A⁺-RNA stammt, welche zuvor aus den Speicheldrüsen von Triatoma pallidipennis isoliert worden ist (SAMBROCK et al.: Molekular Cloining (Chapter 7, pp 18- 22, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989).
Matritzen-Startstück (Sense primer):
5′-GCI GA(A/G) GGI GA(C/T) GA(C/T) TG(CIT) TCI CTI GA(NG) AA(A/G) GCI ATG GGI GA(C/T) TT-3′.
Nicht-Matritzen-Startstück (Antisense primer):
5′-TT (G/A)TT (G/A)TA ICC (G/A)AT (T/C)TC IAC (G/A)AT (T/C)TG IGT (G/A)AA-3.
A = Desoxyadenosin; C = Desoxycytidin; G = Desoxyguanosin; T = Desoxythymidin und I = Desoxyinosin.
Die PCR setzt sich aus 40 Zyklen zusammen. Ein Zyklus sieht wie folgt aus:
  • a) 2 Minuten Denaturierung bei 94°C,
  • b) 90 Sekunden Hybridisierung bei 52°C und
  • c) 2 Minuten Verlängerung bei 72°C.
Das durch das zuvor beschriebene Verfahren gewonnen PCR- Vermehrungprodukt weist auf einem Agarose-Gel eine Bande auf. Diese wird von dem Agarose-Gel, das einen niedrigen Schmelzpunkt aufweist, isoliert und direkt in das PCR Plasmid (Stratagene) überführt und subkloniert. Das Verfahren entspricht der Beschreibung aus den Protokoll des Herstellers (pCR- ScriptTM SK(+) Cloning Kit von Stratagen). Die DNA-Sequenz des Insertionsproduktes entspricht der Sequenz des PCR-Produktes und wird so ermittelt, wie es in SANGER et al. Proc Natl Acad Sci USA (1977) 74 : 5463- 5467 beschrieben ist.
bb) Selektionsverfahren der cDNA-Bank und Isolierung des erfindungsgemäßen cDNA-Klons
Etwa 400 000 primäre Klone aus der Speicheldrüsen-cDNA-Bank von T pallidipennis (cDNA library) werden auf Nylonmembranen (Pall Biosupport East Hills, NY, USA) transferiert und gescreent, wie es der Hersteller vorschreibt. Eine markierte Probe, die mit Hilfe der zuvor beschriebenen PCR- Vermehrungsmethode gewonnen worden ist, wird dabei verwendet. Das Selektionsverfahren wird zweimal durchgeführt, gefolgt von eine Umwandlung der Phagen-DNA in Plasmid-DNA und eine Sequenzanalyse des Inserts (eingebaute DNA) dieses Plasmids. Dadurch werden vier cDNA-Sequenzen ermittelt, die in den Sequenz Identifier 13 bis 16 abgebildet sind, wobei lediglich die Triplika für die Aminosäuren -17 bis -9 bei Ti 28 und Ti 45 und das Triplika für die Aminosäure -18 bei Ti 12 fehlen.
Je beide Stränge der isolierten DNA werden sequenziert. Die von der kodierenden DNA abgeleitete Aminosäure-Sequenz stimmt vollständig mit der Aminosäure-Sequenz überein, die zuvor mittels des Edman-Abbaus von dem erfindungsgemäßen gereinigten Protein herausgefunden worden ist.
Der längste cDNA Klone (Ti12) beginnt mit den Nukleotiden TG, die einem unvollständigen Startkodon für Methionin entsprechen. Dieses wird offensichtlich, wenn ein weiterer isolierter Klon (Ti5) berücksichtigt wird, der bei einem Selektionierungsverfahren mit 600 000 Phagen derselben cDNA-Bank gefunden wurde, welche bei der Selektionierung von Ti12, Ti28 und Ti45 verwendet wurde.
Tabelle 2
Positionen, in denen die erfindungsgemäßen Proteine Unterschiede besitzen
Die vier cDNA-Sequenzen des erfindungsgemäßen Proteins werden gemäß der zuvor beschriebenen Methode selektioniert, identifiziert und sequenziert. Lediglich 9 Positionen weisen Unterschiede in der abgeleiteten Aminosäure- Sequenz auf.
Die Identität (Identity) und Ähnlichkeit (Similarity) der vier reifen erfindungsgemäßen Proteine ist etwa 95 oder 98%, je nachdem welcher Vergleichspartner gewählt wird. (Das Beispiel 11 geht über die am 12. Februar 1993 offenbarten Beispiele 1 bis 10 hinaus.)
Liegen die DNA-Sequenzen vor, so werden passende Promotoren und gegebe­ nenfalls passende Enhancer mit den jeweiligen DNA-Sequenzen verbunden, so daß ein brauchbarer Vektor vorliegt. (M. WIRTH, L. SCHUMACHER and H. HAUS ER, in H.S. CONRADT (ed) Protein Glycosylation, Cellular Biotechnical and Analytical Aspects Vol 15, 49-52, VCH publishers, Weinheim, 1991) Ebenfalls auch J. KRÄTZSCHMAR et al. (1992) Gene 116 : 281-284. Die Expression eines solchen Vektors ist in Eukaryonten (zum Beispiel Baby Hamster Kidney Cells) möglich. Weiterhin werden die DNA-Sequenzen in passende prokaryontische Vektoren zur Erpression in E. coli Stämmen eingebaut.
SEQ ID NO: 1
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 142 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein Ti 12
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallldipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 2
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 142 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein Ti 28
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 3
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 142 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein Ti 45
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 4
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 142 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein Ti 5
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 5
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 160 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz Ti12
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 6
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 160 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz Ti 28
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 7
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 160 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz Ti 45
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 8
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 160 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz Ti 5
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 9
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 429 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein kodierende cDNA Ti 12
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende cDNA
SEQ ID NO: 10
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 429 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein kodierende cDNA Ti28
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende cDNA
SEQ ID NO: 11
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 429 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein kodierende cDNA Ti45
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende cDNA
SEQ ID NO: 12
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 429 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein kodierende cDNA Ti5
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende cDNA
SEQ ID NO: 13
ART DER SEQUENZ: Nukelotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 483 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz kodierende cDNA Ti12
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende cDNA
SEQ ID NO: 14
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 483 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz kodierende cDNA Ti28
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende Sequenz
SEQ ID NO: 15
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 483 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: reifes Protein mit Signalsequenz kodierende cDNA Ti45
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende Sequenz
SEQ ID NO: 16
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 483 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: das reife Protein mit Signalsequenz kodierende cDNA Ti5
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: kodierende cDNA
SEQ ID NO: 17
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 15 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: N-terminales Proteinfragment
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein:Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 18
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 21 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: N-terminales Proteinfragment
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein: Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 19
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 21 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: N-terminales Proteinfragment
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein: Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 20
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 18 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: N-terminales Proteinfragment nach Spaltung mit Lys C
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein: Thrombininhibitor
"?" Unbestimmt; Arg(?) = Mit Unsicherheit
SEQ ID NO: 21
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 12 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: N-terminales Proteinfragment nach Spaltung mit Lys C
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein: Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 22
ART DER SEQUENZ: Aminosäure-Sequenz
SEQUENZLÄNGE: 8 Aminosäuren
ART DES MOLEKÜLS: N-terminales Proteinfragment nach Spaltung mit Lys C
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Speicheldrüse von Triatoma pallidipennis
EIGENSCHAFTEN: als reifes Protein: Thrombininhibitor
SEQ ID NO: 23
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 44 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: Matritzen-Startstück/Sense Primer
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Abgeleitet von der Aminosäure-Sequenz
EIGENSCHAFTEN: Primer
SEQ ID NO: 24
ART DER SEQUENZ: Nukleotidsequenz
SEQUENZLÄNGE: 32 Nukleotide
ART DES MOLEKÜLS: Nicht-Matritzen-Startstück (Antisense primer):
URSPRÜNGLICHE HERKUNFT: Abgeleitet von einer Aminosäure-Sequenz
EIGENSCHAFTEN: Antisense Primer

Claims (27)

1. Natürliche oder synthetisch herstellbare Proteine, die Thrombin­ inhibitoren sind und aus dem Speichel von Insekten, die Säugetierblut saugen, isolierbar sind.
2. Proteine nach Anspruch 1, die aus der Raubwanze Triatoma pallidi­ pennis isolierbar sind.
3. Ein Protein nach einem der Ansprüche 1 und 2
  • a) das als aktives Protein eine N-terminale Sequenz wie folgt besitzt: oder
  • b) das als aktives Protein allelische Modifikationen der zuvor unter a) genannten N-terminalen Aminosäure-Sequenz aufweist, wobei eine oder zwei Aminosäuren der N-terminalen Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert sind, ohne dabei die Aktivität des aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen,
oder
  • c) das als aktives Protein posttranslationale Modifikationen der N- terminalen Sequenzen unter a) und b) aufweist, die nicht wesentlich die Aktivität des aktiven Proteins beeinflussen.
4. Ein Protein, das ein Thrombininhibitor ist und
  • d) das als aktives reifes Protein eine der folgenden Sequenzen besitzt:
  • i) Sequence Identifier 1 (Sequenz Protokoll Nr. 1)
  • ii) Sequence Identifier 2 (Sequenz Protokoll Nr. 2)
  • iii) Sequence Identifier 3 (Sequenz Protokoll Nr. 3) und
  • iv) Sequence Identifer 4 (Sequenz Protokoll Nr. 4)
oder
  • e) das als aktives reifes Protein allelische Modifikationen einer der zuvor unter d) genannten Aminosäure-Sequenzen aufweist, wobei wenigstens eine Aminosäure der Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei die Aktivität des aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen,
oder
  • f) das als aktives reifes Protein posttranslationale Modifikationen einer der Sequenzen unter d) und e) aufweist, die nicht wesentlich die Aktivität des aktiven Proteins beeinflussen.
5. Ein Protein, bestehend aus einer Signalsequenz und einem reifen Protein nach einem der Ansprüche 1 und 2,
  • g) wobei das Protein eine der folgenden Sequenzen besitzt:
  • i) Sequence Identifier 5 (Sequenz Protokoll Nr. 5)
  • ii) Sequence Identifier 6 (Sequenz Protokoll Nr. 6)
  • iii) Sequence Identifier 7 (Sequenz Protokoll Nr. 7) und
  • iv) Sequence Identifer 8 (Sequenz Protokoll Nr. 8)
oder
  • h) wobei das Protein allelische Modifikationen einer der zuvor unter g) genannten Aminosäure-Sequenzen aufweist, wobei wenigstens eine Aminosäure der Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei die Aktivität des reifen aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen,
oder
  • i) wobei das Protein posttranslationale Modifikationen einer der Sequenzen unter g) und h) aufweist, die nicht wesentlich die Aktivität des aktiven reifen Proteins beeinflussen.
6. Ein Protein nach einem der vorherigen Ansprüche, wobei das Protein ein rekombinantes Protein ist.
7. Ein Protein nach einem der vorherigen Ansprüche, wobei das Protein glykosyliert ist.
8. Eine cDNA oder DNA, die einen reifen Thrombininhibitor kodiert,
  • aa) wobei die cDNA oder DNA eine der folgenden Aminosäure-Sequenzen kodiert:
  • i) Sequence Identifier 1 (Sequenz Protokoll Nr. 1)
  • ii) Sequence Identifier 2 (Sequenz Protokoll Nr. 2)
  • iii) Sequence Identifier 3 (Sequenz Protokoll Nr. 3) und
  • iv) Sequence Identifer 4 (Sequenz Protokoll Nr. 4)
oder
  • bb) wobei die cDNA oder DNA allelische Modifikationen einer der Aminosäure- Sequenzen unter aa) kodiert,
worin wenigstens eine Aminosäure der Aminosäure-Sequenz substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei die Aktivität des aktiven Proteins wesentlich zu beeinflussen.
9. Eine cDNA oder DNA, die einen Thrombininhibitor kodiert,
  • cc) wobei die cDNA oder DNA eine der folgenden Nukleotidsequenzen besitzt:
  • i) Sequence Identifier 9 (Sequenz Protokoll Nr. 9)
  • ii) Sequence Identifier 10 (Sequenz Protokoll Nr. 10)
  • iii) Sequence Identifier 11 (Sequenz Protokoll Nr. 11) und
  • iv) Sequence Identifer 12 (Sequenz Protokoll Nr. 12) oder
  • dd) wobei die cDNA oder DNA eine allelische Modifikation einer der Nukleotidsequenzen unter cc) aufweist, wobei wenigstens ein Nukleotid substituiert, deletiert oder insedrtiert ist, ohne dabei die Aktivität des Proteines, das von der allelischen Modifikation der Nukleotidsequenz unter cc) kodiert wird, wesentlich zu beeinflussen.
10. Eine cDNA oder DNA, die einen Thrombininhibitor mit Signalsequenz kodiert,
  • ee) wobei die cDNA oder DNA eine der folgenden Nukleotidsequenzen besitzt:
  • i) Sequence Identifier 13 (Sequenz Protokoll Nr. 13)
  • ii) Sequence Identifier 14 (Sequenz Protokoll Nr. 14)
  • iii) Sequence Identifier 15 (Sequenz Protokoll Nr. 15) und
  • iv) Sequence Identifer 16 (Sequenz Protokoll Nr. 16)
oder
  • ff) wobei die cDNA oder DNA eine allelische Modifikation einer der Nukleotidsequenzen unter ee) aufweist, wobei wenigstens ein Nukleotid substituiert, deletiert oder insertiert ist, ohne dabei die Aktivität des reifen Proteines, das einschließlich seiner Signalsequenz von der allelischen Modifikation der Nukleotidsequenz unter ee) kodiert wird, wesentlich zu beeinflussen.
11. Ein Vektor, der eine cDNA oder DNA nach einem der Ansprüche 8 bis 10, weiterhin einen passenden Promotor und gegebenenfalls einen passenden Enhancer enthält.
12. Eine eukaryontische oder prokaryontische Wirtszelle, die mit einem Vek­ tor nach Anspruch 11 transformiert ist.
13. Ein Verfahren zur Herstellung der Proteine nach einem der Ansprüche 1 bis 7 mit folgenden Schritten:
  • Kultivierung einer Wirtszelle, die mit einem Vektor transformiert ist, welcher eine cDNA oder DNA nach einem der Ansprüche 8 bis 10 enthält,
    und
  • Isolieren und Reinigen der Proteine.
14. Ein Verfahren zur Reinigung von Proteinen nach einem der Ansprüche 1 bis 7, wobei die Proteine isoliert, über wenigstens eine Säule gereinigt und an­ schließend eingeengt werden.
15. Ein Verfahren zur Reinigung von Proteinen nach einem der Ansprüche 1 bis 7 und 13 bis 14, wobei das Verfahren aus folgenden Schritten besteht:
  • Auftragen des Speichels auf eine "Superose-12-HR-Säule" und Eluieren und
  • erneute Auftragung auf einer CH-aktivierten Sepharose-Säule, an der zuvor Thrombin gekoppelt wurde, und Eluieren.
16. Eines der Proteine oder deren Gemisch nach einem der Ansprüche 1 bis 7 und 13 bis 15 als pharmazeutischer Wirkstoff.
17. Ein Arzneimittel, das eines der Proteine oder deren Gemisch nach einem der Ansprüche 1 bis 7 und 13 bis 15 enthält.
18. Eine pharmazeutische Zusammensetzung, die eines der Proteine oder deren Gemisch nach einem der Ansprüche 1 bis 7 und 13 bis 15 enthält, in Gegenwart von pharmazeutisch verträglichen und annehmbaren Verbindungen und Trägern.
19. Verwendung eines der Proteine oder deren Gemisch nach einem der Ansprüche 1 bis 7 und 13 bis 15 zur Herstellung eines Arzneimittels zur Behandlung von Thrombosen oder instabiler Angina oder Arteriosklerose, oder zur Prä­ vention eines Wiederverschlusses von Gefäßen nach PTCA/PTA oder zur Verhinderung der Blutgerinnung bei der Hämodialyse.
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