DE10011358A1 - Neuartige L-Form-Bakterienstämme, Verfahren zu deren Herstellung sowie deren Verwendung zur Herstellung von Genprodukten - Google Patents
Neuartige L-Form-Bakterienstämme, Verfahren zu deren Herstellung sowie deren Verwendung zur Herstellung von GenproduktenInfo
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Abstract
Verfahren zur Gewinnung von modifizierten L-Form-Bakterienstämmen bei dem man (a) einen an ein komplexes Nährmedium adaptierten L-Form-Bakterienstamm alternierend bei unterschiedlichen Temperaturen im Temperaturbereich von 20 bis 40 DEG C kultiviert und (b) bei ansteigender hydromechanischer Belastung der Zellen fermentiert, modifizierte L-Form-Bakterienstämme, die gemäß dem Verfahren erhältlich sind, und deren Verwendung zur Herstellung von Genprodukten.
Description
Die Erfindung betrifft zellwandlose bakterielle L-Form-Stämme,
Verfahren zu deren Gewinnung und deren Verwendung zur Herstellung
von Genprodukten.
Künstlich hergestellte Proteine sind Bestandteil von Arznei
mitteln, Lebensmitteln, Waschmitteln und anderen für den
täglichen Gebrauch wesentlichen Stoffen und Zusammensetzungen.
Zur Herstellung solcher Proteine steht heutzutage eine Vielzahl
von unterschiedlichen Verfahren zur Verfügung. Besonders wichtig
ist in diesem Zusammenhang die Herstellung von Proteinen in
Zellkulturen. Die so hergestellten Proteine werden als rekom
binant bezeichnet. Die Herstellung oder Expression rekombinanter
Proteine ist in vielen verschiedenen Zellkultursystemen, auch
Expressionssysteme genannt, im Stand der Technik bekannt. Je nach
Typ der verwendeten Zelle unterscheidet man zwischen prokaryoti
schen Expressionssystemen, wenn Bakterien als Produzentenzellen
verwendet werden, und eukaryotischen Expressionssystemen, wenn
eukaryotische Zellen von Hefen, Pilzen, Pflanzen oder Tieren als
Produzentenzellen verwendet werden.
Trotz der Vielzahl der bekannten und verwendeten Systeme lassen
sich zahlreiche Proteine, insbesondere Membranproteine, bisher
nicht oder nur mit einer unbefriedigenden Ausbeute und Reinheit
herstellen. Bei der Verwendung von eukaryotischen Expressions
systemen liegen die Ursachen dafür vor allem im proteolytischen
Abbau der hergestellten Proteine durch zelleigene Proteasen, in
der häufig auftretenden Toxizität der fremden Proteine für die
Erzeugerzellen sowie, im Falle von Membranproteinen, in der
starken Assoziation der hergestellten Proteine mit den Zellmem
branen der Produzentenzellen. Hinzu kommt, daß Membranproteine
nur in geringen Mengen in den Membranen vorkommen und daß das
Membranmaterial nur in begrenzten Mengen verfügbar ist (z. B. bei
Säugerzellen). Die Isolierung der Membranen erfordert zudem meist
material- und zeitaufwendige Abtrennverfahren, um störende
Strukturen wie Zellwand, Geißeln, Fimbrien und andere Membran-
und Zellorganellen zu entfernen.
Die Produktion rekombinanter Proteine in prokaryotischen
Expressionssystemen hat den Nachteil, daß sich die Proteine
häufig zu funktionell inaktiven Aggregaten im Zytosol oder
Periplasma, sogenannten "inclusion bodies", zusammenlagern.
Ferner weisen auch prokaryotische Produzentenzellen zelleigene
Proteasen auf, welche die hergestellten, fremden Proteine abbauen
können. Außerdem erschweren bei der Verwendung von E. coli als
Produzentenzellen häufig toxische Zellbestandteile, insbesondere
Bestandteile der Zellwände, die Gewinnung von für den Verbraucher
unschädlichen Proteinpräparaten.
Um die mit der Produktion von rekombinanten Proteinen in
prokaryotischen Zellen einhergehenden Nachteile zu überwinden,
wurde im Stand der Technik die Verwendung sogenannter L-Form-
Bakterienzellen vorgeschlagen. L-Form-Stämme sind Bakterien,
welche mit einer stark veränderten oder ohne Zellwand wachsen.
Nach der Beschaffenheit der Zellumhüllung und ihrer Stabilität
lassen sich L-Form-Bakterienstämme in vier Gruppen unterteilen.
Sphäroplasten-Typ L-Formen besitzen noch Reste der Zellwand, z. B.
der äußeren Membran, während Protoplasten-Typ L-Form-Zellen
lediglich von der Zytoplasmamembran umgeben sind. Zellen, welche
nur unter ständigem Selektionsdruck mit Hilfe von Inhibitoren der
Zellwandbiosynthese (beispielsweise Ampicillin) in der L-Form-
Phase verbleiben, werden instabile L-Formen genannt. Als stabile
L-Formen werden dagegen die Stämme bezeichnet, deren Zellen die
Fähigkeit zur Ausbildung einer Zellwand vollständig verloren
haben.
Die Umwandlung von gewöhnlichen Bakterienzellen, sogenannten
Elternbakterien, in L-Form-Zellen ist an sich bekannt (J. Gumpert
und U. Taubeneck, 1983, Experientia Suppl. Vol. 46, 227-241;
L. H. Mattmann, 1993, Cell Wall Deficient Forms, CRC Press, Boca
Raton).
Hierbei werden Zellen einer Bakterienart zunächst durch Behand
lung mit Substanzen, welche die Zellwandbiosynthese hemmen (z. B.
β-Lactam-Antibiotika, Vancomycin, D-Cycloserin) oder welche
die Zellwand abbauen (z. B. lytische Enzyme wie Lysozym) in
Sphäroplasten oder Protoplasten umgewandelt. Diese zellwanddefek
ten Zellen werden auf einem geeigneten Medium bis zur Bildung
typischer L-Form-Kolonien vermehrt und solange auf L-Form-Medium
übertragen, bis ein Wachstum als dichter Kolonierasen erreicht
ist.
Als Nährmedium dient eine Lösung, die eine komplexe Nährkom
ponente, vorzugsweise frisch hergestellten Fleischextrakt, zur
Grundversorgung mit C- und N-Quellen, Aminosäuren und Ionen,
einen Wachstumsstimulator, vorzugsweise Hefeextrakt mit essen
tiellen Vitaminen und Aminosäuren, einen osmotischen Stabilisator
zur Vermeidung von Zellyse, vorzugsweise Saccharose oder NaCl,
einen Membranstabilisator, vorzugsweise Serum und zweiwertige
Kationen wie Mg2+, und einen Zellwandbiosynthese-Inhibitor,
vorzugsweise β-Lactam-Antibiotika wie Penicillin, enthält
(primäres L-Form-Medium).
Ein häufig verwendetes komplexes Medium ist L-Form-Standard-
Medium (LFS). LFS-Medium enthält frischen Fleischextrakt mit
Zusätzen von Hefeextrakt (0,5-1% w/v), Pferdeserum (8-10% v/v),
Saccharose (6-10% w/v), Penicillin (200-1000 U/ml), Bacto-Agar
(1-1,5% w/v).
Die Abkürzung w/v steht für Masse pro Volumen, d. h. 10% w/v
entsprechen 10 g pro 100 ml. Falls nicht anders angegeben sind
alle Prozentangaben in der vorliegenden Beschreibung w/v-Angaben.
Die Abkürzung v/v steht für Volumen pro Volumen.
Der Fleischextrakt wird erhalten, indem man 2 kg Rindfleisch mit
4 l Wasser für 1 Stunde im Dampftopf extrahiert, man das Filtrat
dann mit 0,3 bis 1% Bacto Pepton und 0,5 bis 2% NaCl versetzt
und auf pH 7,0 eingestellt.
Anschließend selektiert man stabile L-Formen, d. h. solche L-
Formen, welche die Fähigkeit zur Reversion, d. h. zur Resynthese
der Zellwand in Abwesenheit von Penicillin verloren haben. Dazu
werden Agarblöckchen mit L-Form-Kolonien einer Kultur so lange
parallel auf LFS-Agarmedium mit und ohne Penicillinzusatz
übertragen, bis auf den penicillinfreien Platten nur noch L-Form-
Kolonien wachsen und keine Reversion mehr erfolgt. Diese stabilen
L-Form-Kolonien werden vermehrt, bis ein dichter Kolonierasen auf
den penicillinfreien LSF-Agarplatten erreicht ist.
Die Herstellung stabiler L-Formen von E. coli wird beispielsweise
von U. Taubeneck und E. Schumann in Zeitschrift für Allg.
Mikrobiologie, Band 6, 1966, Seiten 341-343, und von P. mirabilis
von U. Taubeneck in Zeitschrift für Allg. Mikrobiologie, Band 2,
1962, Seiten 132-156 beschrieben.
Die stabilen L-Formen werden anschließend an ein Wachstum in
flüssigem LFS-Medium adaptiert. Dieses enthält frisch hergestell
ten Fleischextrakt (2-5%), Bacto-Pepton (0,5-1%), NaCl (0,5-
2% w/v), Hefeextrakt (0,5-1% v/v), Pferdeserum (8-10% v/v) und
Saccharose (6-10%). Hierzu werden Agarblöcke (2 × 2 cm) mit
reichlich Kolonierasen in 10-40 ml flüssiges LFS-Medium gegeben
und bei 37°C unter Schütteln bebrütet. Eine Optimierung des
Wachstums in flüssigem LFS-Medium wird durch fortlaufende
Übertragung der Kulturen (alle 2-5 Tage) in frisches Medium, bis
die L-Form-Zellen im Verlauf von 24 Stunden zu Zelldichten von
108 Zellen/ml wachsen, erreicht. Durch fortlaufende Übertragung
und Wachstum in frischem LFS-Medium mit stufenweise reduzierten
Mengen an Serum und Saccharose werden im Verlauf von 50-80
Passagen L-Form-Stämme, z. B. von P. mirabilis und E. coli,
selektiert, die auch ohne Zusätze von Serum und Saccharose gutes
Wachstum zeigen. Diese können dann durch schrittweisen Ersatz des
Fleischextrakt-Anteils des LFS-Mediums durch andere in ihrer
Zusammensetzung definierte Nährkomponenten an ein Wachstum in
fleischextraktfreien Nährmedien adaptiert werden.
Besonders geeignete definierte komplexe Nährkomponenten zum
Ersatz des Fleischextrakts sind Brain-heart-infusion-(BHI)-broth
(BHIB), Tryptic-soy-broth (TSOYB), Todd-Hewitt-broth (THEB) und
L-broth (LB). Die detaillierte Zusammensetzung dieser Nährkom
ponenten ist in den Firmenhandbüchern Merck-Nährboden Handbuch,
E. Merck, Darmstadt, 1992 und Difco-Mannual 10th. Edition 1984,
Difco Laboratoris Detroit MI USA beschrieben.
Die bekannten L-Form-Stämme zeigen in diesen Medien aus un
erklärlichen Gründen oft unbefriedigendes Wachstum.
Gumpert et al. offenbaren stabile L-Form-Zellen, die auf die
Behandlung normaler Bakterienzellen mit Zellwandbiosynthesehem
mern wie beispielsweise Ampicillin und gleichzeitige osmotische
Stabilisierung zurück gehen. Diese Zellen bilden keine Zellwand
und kein periplasmatisches Kompartiment mehr aus und weisen
keinerlei extrazellulär detektierbare Proteasen auf (J. Gumpert,
E. Schuhmann, U. Taubeneck 1971, Zeitschrift Allg. Mikrobiologie,
11, 19-33; J. Gumpert, U. Taubeneck 1983, Experientia Suppl.
Vol. 46, 227-241).
L-Form-Bakterienstämme sind aus vielerlei Gründen prinzipiell für
die Herstellung rekombinanter Proteine geeignet. Beispielsweise
ist ihre Membran, die für die Herstellung von Membranproteinen
ein adäquates Milieu darstellt, von außen frei zugänglich
(K. Gura, J. Gumpert, C. Hoischen, 1997, IMB Anual Report 1996,
101-104; C. Hoischen, K. Gura, C. Luge, J. Gumpert 1997, Journal
Bacteriol. 197, 3430-3436). Ferner weisen Protoplasten-Typ L-
Form-Stämme außer der zytoplasmatischen Membran keinerlei
Zellorganellen auf, von denen das hergestellte Protein abgetrennt
werden muß.
Die DD 269 166 A1 beschreibt die Verwendung zellwandloser Gram
negativer Bakterien, wie Pseudomonas, Agrobacterium, Proteus und
Escherichia, sowie Gram-positiver Bakterien, wie Staphylococcus,
Streptococcus, Bacillus, Lactobacillus, Streptomyces und
Thermoactinomyces, zur Gewinnung rekombinanter Genprodukte, wie
Streptokinase, Human-Interferon-alpha-1 oder Prochymosin.
Die DD 280 333 A1 offenbart ein Verfahren zur Gewinnung milch
fällender Enzyme unter Verwendung von stabilen L-Form-Stämmen
bakteriellen oder pilzlichen Ursprungs.
Die DD 281 816 A5 betrifft die Herstellung von Serotyp C-
Streptokinase unter Verwendung von L-Form-Stämmen von z. B.
P. mirabilis und Bac. subtilis.
Bisher wurde die Gewinnung von mehr als 20 verschiedenen
Proteinen unter Verwendung von L-Form-Expressions-Systemen
beschrieben. Die Herstellung der Proteine mit L-Form-Zellen
erfolgte zum Teil unter halb-technischen Bedingungen in 2 bis
100 l Fermentern (J. Gumpert und C. Hoischen 1998, Current
Opinion in Biotechnology, 9, 506-509).
Gumpert und Taubeneck offenbaren L-Form-Stämme, die in der Lage
sind, in Kulturmedien ohne Zusatz von Serum oder osmotischen
Stabilisatoren zu wachsen (J. Gumpert und U. Taubeneck 1983,
Experientia Suppl. Vol. 46 (1983), 227-241).
Die bekannten L-Form-Zellen sind aufgrund ihrer fehlenden
Zellwand empfindlich, beispielsweise gegenüber Umgebungsein
flüssen und chemischen und physikalischen Veränderungen des
Wachstumsmediums. Sie eignen sich daher eher für die Produktion
von Proteinen in kleinen Mengen, weniger für Fermentationen in
technischem Maßstab (J. Gumpert und C. Hoischen 1998, Current
Opinion in Biotechnology, 9, 506-509).
Die Herstellung rekombinanter Genprodukte in membrangebundener
Form, wobei die funktionell aktiven Moleküle auf der Außenseite
der Zelloberfläche frei zugänglich sind (Surface-Display), ist
sowohl für die Untersuchung von Struktur-Funktionsbeziehungen,
für Interaktionsstudien als auch für diagnostische und immuno
protektive Anwendungen von großer Bedeutung. Hierbei werden
antigene Determinanten, single chain Antikörperfragmente,
heterologe Enzyme, Polyhistidyl-Tags und Peptidbibliotheken auf
der bakteriellen Oberfläche exprimiert (Ståhl, S. und Uhlén, M.,
TIBTECH 1997, 15, 185-192). Bei den bisher üblichen bakteriellen
Zelltypen, die für das Surface-Display eingesetzt werden, handelt
es sich um Gram-negative E. coli Stämme und Gram-positive Stämme,
wie z. B. Bac. subtilis und Staphylococcus Arten.
Beim Surface-Display mit Gram-negativen Stämmen wird das
präsentierte Protein in der Regel mit Proteinkomponenten der
äußeren Membran, wie OmpA, LamE und PhoE, Flagellenproteinen
(Flagellin) oder Proteinen der Fimbrien (FimA, FimH), fusioniert
und dadurch in der äußeren Membran verankert. Die Nachteile
dieses Systems liegen darin, daß (i) die präsentierten Proteine
durch innere Membran, Periplasma und Zellwand (Mureinsacculus und
äußere Membran) transportiert werden müssen, (ii) daß die Größe
der präsentierten Proteine limitiert ist und (iii) daß durch
zahlreiche immunreaktive Komponenten der Zelloberfläche eine
Reihe medizinischer Anwendungen ausgeschlossen bleiben.
In Gram-positiven Bakterien wird das präsentierte Protein meist
mit einem Oberflächenprotein der Zellwand (z. B. Protein A, M6
Protein) fusioniert und hierdurch in der Zellwand fixiert.
Nachteilig auf das Surface-Display mit Gram-positiven Bakterien
wirken sich das Vorhandensein zelleigener Antigendeterminanten
und das häufige Auftreten extrazellulärer Proteasen auf. Das
präsentierte Protein muß ebenfalls erst durch die zytoplasmati
sche Membran und die Zellwand transportiert werden.
Der Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, neue L-Form-Stämme für
die biotechnologische Gewinnung von Genprodukten bereitzustellen,
die eine erhöhte Stabilität gegenüber chemischen, physikalischen
und mechanischen Belastungen aufweisen und die sich daher
besonders für Fermentationen unter technischen Bedingungen und
insbesondere zur Herstellung membranständiger Proteine eignen.
Diese Aufgabe wurde überraschenderweise durch ein Verfahren zur
Gewinnung von modifizierten L-Form-Bakterienstämmen gelöst, bei
dem man
- a) einen an ein komplexes Nährmedium adaptierten L-Form- Bakterienstamm alternierend bei unterschiedlichen Tempera turen im Bereich von 20 bis 40°C kultiviert, und
- b) die Zellen unter zunehmenden hydromechanischen Belastung fermentiert.
Als Ausgangsstamm für Schritt (a) eignen sich grundsätzlich alle
L-Form-Stämme, insbesondere L-Form-Stämme, die mit Wachstumsraten
µ < 0,1 h-1 zu Zellkonzentrationen von 108 Zellen/ml wachsen.
Erfindungsgemäß werden vorzugsweise stabile L-Formen von
Bakterien verwendet, insbesondere stabile Protoplasten-Typ L-
Formen.
Es können sowohl in fleischextrakthaltigen Komplexmedien,
vorzugweise LFS-Medium, als auch in fleischextraktfreien
Komplexmedien, vorzugweise solchen, die auf den oben genannten
definierten komplexen Nährkomponenten basieren, besonders
bevorzugt BHIB, stabil wachsende Stämme eingesetzt werden.
Fleischextraktfreie Medien sind bevorzugt, da diese reproduzier
barer und konstengünstiger in Herstellung und bei der Gewinnung
medizinischer Produkte unbedenklicher sind.
Als Ausgangsstämme geeignete L-Formen werden beispielsweise von
J. Gumpert und U. Taubeneck 1983, Experientia Suppl. Vol. 46,
227-241, in der dort zitierten Literatur und in DD 269 166 A1
beschrieben. Bevorzugte Ausgangsstämme sind die dort genannten
L-Form-Stämme von Escherichia coli, Proteus mirabilis und
Bacillus subtilis. Weitere bevorzugte L-Form-Stämme sind solche
von Bacillus licheniformis, Nocardia asteroldes, Pseudomonas
stutzeri, Staphylococcus aureus, Streptococcus faecalis,
Streptomyces hygroscopicus und Thermoactinomyces vulgaris. Beson
ders bevorzugte Ausgangsstämme sind die L-Formen von P. mirabilis
LVI, P. mirabilis L99, E. coli LWF+, E. coli LWF- und Bac.
subtilis L170.
Die als Ausgangsstämme des erfindungsgemäßen Verfahrens bevorzug
ten L-Form-Stämme von P. mirabilis LVI, P. mirabilis L99, E. coli
LWF+, E. coli LWF- und Bac. subtilis L170 sind in der DMSZ
(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen,
Marscheroder Weg 1b, 38124 Braunschweig) hinterlegt. Die
Hinterlegungsnummern lauten: DSM 7988 (Proteus mirabilis LVI),
DSM 7990 (Proteus mirabilis L99), DSM 7989 (Escherichia coli
LWF+), DSM 8012 (Escherichza coli LWF-) und DSM 7978 (Bacillus
subtilis L170).
Es wurde gefunden, daß sich L-Form-Bakterienstämme, die gemäß den
obigen Verfahrensschritten (a) oder (b), vorzugsweise (a) und (b)
behandelt wurden, neben einem stabilen Wachstumsverhalten ins
besondere durch eine hohe mechanische Belastbarkeit und eine hohe
Temperaturtoleranz auszeichnen. Sie sind gegenüber Schwankungen
der Wachstumstemperatur, der Mediumzusammensetzung, des pH-Werts
und anderer Fermentationsparameter deutlich widerstandsfähiger
und eignen sich daher besonders zur Produktion rekombinanter
Genprodukte unter technischen Bedingungen.
Die Schritte (a) und (b) können gleichzeitig oder nacheinander
durchgeführt werden. Bevorzugt ist die Reihenfolge Schritt (a)
gefolgt von Schritt (b). Der Schritt (a), der Schritt (b) oder
vorzugsweise beide Schritte können ein- oder mehrfach wiederholt
werden.
Der Schritt (a) umfaßt ein mehrstufiges Wachstumsregime mit
alternierenden Wachstumstemperaturen. Vorzugsweise wird Schritt
(a) in der Weise durchführt, daß man die Temperatur alternierend
zwischen zwei Temperaturen T1 und T2 variiert, wobei T1 im
Verlauf des Schrittes (a) gleich bleibt und T2 variiert wird.
Hierbei liegen die Werte für T2 vorzugsweise unter dem Wert für
T1. Gemäß einer bevozugten Ausführungsform wird T2 stufenweise
abgesenkt und nach dem Erreichen der angestrebten minimalen
Temperatur auf einen Wert oberhalb von T1 erhöht.
In Schritt (a) wird zunächst die betreffende Kultur in frisches
Medium überimpft und im Schüttelinkubator bei einer konstanten
Temperatur (T1) über 24 bis 36 Stunden als submerse Schüttelkul
tur bebrütet (Stufe 1). Die Kultivierung erfolgt beispielsweise
in 100 ml Gefäßen, vorzugsweise in 35 ml 3%igem BHI-Medium mit
Zusatz von 0,5% Hefeextrakt. Die Kultivierung wird fortgesetzt
bis eine Zellkonzentration von 109 Zellen/ml erreicht ist.
Anschließend wird ein Teil der Kultur aus Stufe 1 in frisches
Medium übertragen (Inokulum etwa 10% v/v) und bei einer Temperatur
(T2), die vorzugsweise niedriger als die Temperatur T1 ist,
über einen Zeitraum von vorzugsweise 18 bis 48 Stunden, besonders
bevorzugt 24 bis 36 Stunden bebrütet (Stufe 2). Im Anschluß an
Stufe 2 wird die Kultur wieder in frisches Medium übertragen und
bei der Temperatur T1 kultiviert (Stufe 3). T1 ist vorzugsweise
die für den Ausgangsstamm optimale Wachstumstemperatur, also
beispielsweise 37°C, und wird im Verlauf des Schrittes (a) nicht
verändert, während T2 stufenweise abgesenkt wird, vorzugsweise
bis auf einen Wert von 20 bis 22°C besonders bevorzugt etwa
20°C. T2 wird vorzugsweise in 5 bis 10 Etappen, vorzugsweise
etwa 7 Etappen auf die gewünschte Zieltemperatur abgesenkt, so
daß Schritt (a) vorzugsweise insgesamt 10 bis 20 und besonders
bevorzugt etwa 14 Stufen umfaßt. In jeder Stufe werden die Zellen
vorzugsweise für 18 bis 48 Stunden, besonders bevorzugt 24 bis
36 Stunden bei der jeweiligen Temperatur kultiviert. Vorzugsweise
wird die Kultivierung jeweils solange fortgesetzt bis eine
Zellkonzentration von 109 Zellen/ml erreicht ist.
Die Temperatur T2 wird pro Etappe vorzugsweise um 2 bis 5°C
gesenkt, wobei die Temperaturänderung von Etappe zu Etappe auch
unterschiedlich ausfallen kann. Die Verwendung von mehr als zwei
unterschiedlichen Temperaturen, also beispielsweise 3 oder 4
Temperaturen ist möglich. Nach dem Erreichen der angestrebten
Minimaltemperatur kann T2 gemäß einer bevorzugten Ausführungsform
auf einen Wert oberhalb von T1, vorzugsweise 2 bis 5°C oberhalb
der optimalen Wachtumstemperatur, beispielsweise also 40°C
angehoben werden.
Gemäß einer besonders bevorzugten Ausführungsform wird die Kultur
alle 24 Stunden in frisches Medium gleicher Zusammensetzung
übertragen, wobei die Wachstumstemperatur alternierend gemäß
folgendem Schema variiert wird: Start: T1 = 37°C → T2 = 32°C →
T1 = 37°C → T2 = 30°C → T1 = 37°C → T2 = 28°C → T1 = 37°C → T2
= 26°C → T1 = 37°C → T2 = 24°C → T1 = 37°C → T2 = 22°C → T1 =
37°C → T2 = 20°C → T1 = 37°C → T2 = 40°C → T2 = 20°C Ende.
Als Ergebnis werden Stämme erhalten, die gegenüber den Ausgangs
stämmen reproduzierbarer im Wachstumsverlauf, toleranter
gegenüber Wachstumstemperaturen und konstanter in der Wachstums
rate sind.
Im Verfahrensschritt (b) werden die L-Form-Zellen alternierend
zunehmenden hydromechanischen Belastungen ausgesetzt. Dazu werden
die in Schritt (a) erhaltenen L-Form-Kulturen als Ausgangsstamm
bei variierenden Scherkräften und vorzugsweise auch bei variie
renden Belüftungsraten fermentiert. Variierende Scherkräfte
lassen sich beispielsweise durch das Variieren der Rührerdrehzahl
erzeugen, mit der das Fermentationsmedium gerührt wird.
Schritt (b) wird vorzugsweise in einem Fermenter mit einem
Nettovolumen von 2 l, einer Höhe von 35 cm und einem Durchmesser
von 18 cm durchgeführt, der mit einem Wellendiskusrührer mit
einem Durchmesser von 7 cm ausgestattet ist.
Das Fermentationsregime wird beispielsweise so gestaltet, daß
nacheinander mehrere Fermenterläufe durchgeführt werden, wobei
die Zellen eines Fermenterlaufes als Inokulum für den nächsten
Fermentationslauf eingesetzt werden.
Vorzugsweise werden 1000 bis 2000 ml BHIB Medium mit 0,7%
Hefeextrakt und 1% Saccharose mit 10% (V/V) der Kultur aus
Schritt (a) bzw. der vorherigen Fermenterkultur beimpft und bei
konstanter Rührgeschwindigkeit (Festdrehzahl VF) und Belüftungs
rate bei vorzugsweise 32°C bis 37°C fermentiert. Die Fermenta
tion wird bis zu einer Zellkonzentration von 108 bis 109 Zel
len/ml fortgesetzt (etwa 24 bis 48 Stunden). Unter diesen
Bedingungen ist der Sauerstoffverbrauch der L-Form-Zellen stark
erhöht. Ein Absinken des Sauerstoffpartialdrucks pO2 auf Werte
unter etwa 5% sollte vermieden werden. Hierzu wird bei Erreichen
eines Sauerstoffpartialdrucks von etwa 5% die Rührgeschwindig
keit kurzfristig auf einen festgelegten Wert (Umschaltdrehzahl
VU) erhöht und bei Erreichen eines Partialdrucks von 20 bis 30%
auf die Festdrehzahl VF zurückgesetzt. Die Prozentangabe
bezieht sich auf die Sättigungskonzentration von Sauerstoff in
dem betreffenden Kulturmedium. Im Verlauf des Schrittes (b)
werden die Festdrehzahl VF und die Umschaltdrehzahl W des
Rührers in den aufeinanderfolgenden Fermenterläufen verändert.
Vorzugsweise umfaßt Schritt (b) 5 bis 10, besonders bevorzugt
etwa 7 Fermenterläufe.
Gemäß einer besonders bevorzugten Ausführungsform werden die
Rührgeschwindigkeiten in Schritt (b) entsprechend dem folgenden
Schema verändert:
1. Lauf: VF = 200 U/min - VU = 500 U/min;
2. Lauf: VF = 250 U/min - VU = 500 U/min;
3. Lauf: VF = 300 U/min - VU = 600 U/min;
4. Lauf: VF = 350 U/min - VU = 600 U/min;
5. Lauf: VF = 400 U/min - VU = 700 U/min;
6. Lauf: VF = 450 U/min - VU = 700 U/min;
7. Lauf: VF = 500 U/min - VU = 800 U/min.
1. Lauf: VF = 200 U/min - VU = 500 U/min;
2. Lauf: VF = 250 U/min - VU = 500 U/min;
3. Lauf: VF = 300 U/min - VU = 600 U/min;
4. Lauf: VF = 350 U/min - VU = 600 U/min;
5. Lauf: VF = 400 U/min - VU = 700 U/min;
6. Lauf: VF = 450 U/min - VU = 700 U/min;
7. Lauf: VF = 500 U/min - VU = 800 U/min.
Die Belüftungsrate wird vorzugsweise auf 0,2 bis 1,0, besonders
bevorzugt 0,6 bis 1,0 Volumeneinheiten Luft pro Volumeneinheit
Medium pro Minute (l/l min), ganz besonders bevorzugt etwa 0,7 l/l min
eingestellt.
Die genaue Zusammensetzung der in den Verfahrensschritten (a) und
(b) einzusetzenden Nährmedien wird entsprechend den Stoff
wechseltypen und physiologischen Eigenheiten der Elternbakterien
ausgewählt. Für die jeweiligen Ausgangsstämme geeignete Medien
sind bekannt, siehe z. B. J. Gumpert 1982, Ztschr. Allg. Mikro
biol., 22, 617-627. Vorzugsweise werden in den Schritten (a) und
(b) Brain-heart-infusion-broth (BHIB), Todd-Hewitt-broth (THEB),
Tryptic-Soy-broth (TSOYB) oder L-broth (LB) als Medium verwendet.
Für die erfindungsgemäß bevorzugten Ausgangsstämme eignet sich
besonders ein Medium folgender Zusammensetzung: BHIB (Fa. Difco)
3 g, Hefeextrakt (Fa. Difco) 0,5 g, Saccharose 1 g, destilliertes
Wasser 100 ml. Ausgehend von den bekannten Medien kann die
optimale Mediumzusammensetzung für Stämme wie beispielsweise
Streptokokken und Streptomyceten durch routinemäßige Versuchs
reihen ermittelt werden.
Bei der Verwendung der bevorzugten L-Form Ausgangsstämme werden
als Verfahrensprodukte die modifizierten Stämme P. mirabilis
LVIWEI, P. mirabilis L99WEI, E. coli LWF + WEI, E. coli LWF - WEI und
B. subtilis L170WEI erhalten. Diese wurden bei der Deutschen
Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen in Braunschweig
unter den Hinterlegungsnummern DSM 13363 (P. mirabilis LVIWEI),
DSM 13364 (P. mirabilis L99WEI), DSM 13362 (E. coli LWF + WEI) und
DSM 13361 (B. subtilis L170WET) hinterlegt.
Die nach dem erfindungsgemäßen Verfahren gewonnenen L-Form-Stämme
weisen im Vergleich zu den Ausgangsstämmen neben den bereits
genannten folgende Vorteile auf: unmittelbare Einsetzbarkeit in
Fermentationen, homogenere Zellpopulationen mit geringeren
Anteilen an lysierenden Zellen, stabilerer Stoffwechsel, höhere
Zellzahlen, höhere Biomassekonzentrationen, höhere Verdopplungs
raten in der exponentiellen Wachstumsphase, günstigere pH-
Profile, bessere Verträglichkeit von Antischaummitteln, bessere
Tolerierung von höheren Rührgeschwindigkeiten. Die Zellen können
im Temperaturbereich von 20 bis 40°C unmittelbar bei der für die
Gewinnung des gewünschten Genprodukts geeigneten Temperatur
fermentiert werden.
Ein weiterer Vorteil der modifizierten L-Form-Stämme ist darin
zu sehen, daß sie in verfahrenstechnisch relevanten Nährmedien
wie BHIB, THEB, TSOYB, ggf. mit Zusatz von Hefeextrakt (0,5-1%)
ein verbessertes Wachstum zeigen.
Für P. mirabilis LVI WEI wurden im Vergleich zum Ausgangsstamm
beispielsweise folgende Werte erzielt:
Ähnliche Verbesserungen wurden für die übrigen L-Formstämme
gefunden.
Die nach dem erfindungsgemäßen Verfahren gewonnenen L-Form-Stämme
eignen sich daher insbesondere für Fermentationen in Rühr- und
Airlift-Fermentern von 2-300 l und sind aufgrund ihrer guten
Suspendierbarkeit, ihres Tolerierungsvermögens von Antischaum
mitteln und hydromechanischen Stressfaktoren verfahrenstechnisch
vorteilhaft handhabbar.
Im Vergleich zu den zytoplasmatischen Membranen der Ausgangs-L-
Form-Stämme zeigen die zytoplasmatischen Membranen der erfin
dungsgemäß gewonnenen L-Form-Stämme charakteristische Unter
schiede im Proteinmuster. Sie sind beispielhaft für E. coli LWF+
und E. coli LWF + WEI in den Ausführungsbeispielen beschrieben und
weisen auf genotypische und phänotypische Veränderungen hin.
Weitere genotypische Veränderungen in den neuen Stämmen manife
stieren sich in Unterschieden in den Bandenmustern der chromoso
malen DNA nach Verdau mit Restriktasen und Auftrennung mittels
Pulsfeld-Gelelektrophorese. Sie sind für E. coli LWF+ und E. coli
LWF + WEI ebenfalls in den Ausführungsbeispielen dokumentiert.
Die L-Form-Stämme beispielsweise von E. coli, P. mirabilis und
B. subtilis besitzen keine extrazellulären bzw. periplasmatischen
Proteaseaktivitäten, und damit ist die Gefahr von proteolytischen
Abbauprozessen an rekombinanten Proteinen wesentlich verringert.
Darüber hinaus lassen sich die erfindungsgemäß modifizierten
Stämme, z. B. durch die Zugabe von 0,1-1 µg/ml lyso-Lecithin zum
Kulturmedium, zur Bildung von extrazellulären Membranvesikeln
anregen. Diese Eigenschaft ist für die Synthese rekombinanter
Membranproteine vorteilhaft.
Ein weiterer Vorteil liegt darin, daß mit den für E. coli
(Elternform) optimierten Genkonstrukten (Promotoren, Kontroll
sequenzen, Originregionen, Signalsequenzen) eine gut kontrollier
bare Genexpression und Produktsynthese möglich ist, so daß auf
ein großes Repertoire bekannter Mittel zur genetischen Trans
formation und Überexpression heterologer Genprodukte zurückge
griffen werden kann. Diese Genkonstrukte können sowohl für
modifizierte L-Formen von E. coli als auch für andere Stämme wie
beispielsweise P. mirabilis und Bac. subtilis eingesetzt werden.
Die erfindungsgemäß gewonnenen L-Form-Stämme weisen zudem eine
einheitlichere Zellmorphologie, einen stabilen Zellstoffwechsel
und stabile, reproduzierbare Wachstumseigenschaften auf. Sie
lassen sich durch Fermentation in 1 bis 300 l Fermentern
kostengünstig in großen Mengen bereitstellen.
Alternativ können an technische Wachstumsbedingungen angepaßte
neue L-Form-Stämme durch gezielte genetische Manipulation der
Ausgangs-L-Form-Stämme hergestellt werden. Beispielsweise lassen
sich durch Mutationen in den Genen recA, hsdR/S, relA, supE und
durch Einführung von amber- und ochre-Mutanten Rekombination,
Modifikation und Restriktion so gestalten, daß eine verbesserte
Transformation und Plasmidstabilität erreicht wird. Desweiteren
können durch Insertion von Genen der Transkriptions- und
Translationskontrolle, wie lacJq und lacUV-T7, in das Chromosom
die Expression und Produktsynthese verbessert werden.
Die erfindungsgemäß gewonnenen L-Form-Stämme eignen sich zur
Herstellung beliebiger Genprodukte, insbesondere zur Herstellung
rekombinanter Proteine, vorzugsweise löslicher, extrazellulärer
Proteine und besonders zur Herstellung membrangebundener
Proteine. Die Proteine können als Biochemikalien für die
molekularbiologische und medizinische Forschung, als Diagnostika,
als Arzneimittel und als Enzyme mit Potential zur Stoffumwandlung
eingesetzt werden.
Hierzu werden die Zellen zunächst auf an sich bekannte Weise mit
einer für ein Genprodukt kodierenden Nucleotidsequenz trans
formiert, z. B. mit einem geeigneten Vektor, der das Produktgen
unter Kontrolle eines oder mehrerer Promotors enthält. Der Vektor
enthält vorzugsweise auch eine Gensequenz, die für ein Signalpep
tid kodiert, das einen aktiven Transport des Genprodukts durch
die Zytoplasmamembran in das Kulturmedium oder eine Verankerung
des Genprodukts an der Membran ermöglicht (Membrananker). Der
transformierte Stamm wird unter geeigneten Bedingungen kulti
viert, dann ggf. die Expression der rekombinanten Proteine
induziert, z. B. durch Zugabe eines Induktors, und anschließend
das rekombinante Protein isoliert. Verfahren zur Gewinnung von
Genprodukten sind ebenfalls Gegenstand der vorliegenden Erfin
dung.
Die Zellen sind in der Lage, posttranslationale Modifizierungs
prozesse durchzuführen. Die L-Form-Membran ist in ihrem Lipid
anteil so verändert, daß sie für die Insertion und Anreicherung
von fremden Membranproteinen genügend Raum bietet und daß in bzw.
an der Membran die für die Funktionalität essentiellen Faltungs-
und Prozessierungsprozesse erfolgen können.
Die Konstruktion geeigneter Vektoren ist an sich bekannt. Hierzu
wird mit üblichen gentechnischen Methoden (T. Maniatis,
E. Firtsch, und J. Sambrook 1989 Molecular Cloning: A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Lab. Cold Spring Harbor N. Y.;
F. N. Ansubel 1998, Current Protocols in Molecular Biology, Wiley
and Sons) das Strukturgen eines zu exprimierenden löslichen oder
membrangebundenen Proteins oder Fusionsproteins in ein für die
Expression geeignetes Plasmid integriert. Die Promotoren müssen
für die Produktgene, auch wenn deren Überexpression letal ist,
gut regulierbar sein und damit ein Subklonieren ermöglichen.
Bevorzugt sind Promotoren, deren Expressionsstart durch Zugabe
eines induktiv wirkenden Substrats oder Substratanalogons
(Induktor) bzw. durch einen entsprechenden Substratshift erfolgt,
z. B. lac-P/O und dessen Derivate wie lacUV, tac etc. (H. A. de
Boer, L. J. Comstock, M. Wasser, 1983, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
80, 21-25), Induktion durch IPGT-Zusatz (Isopropyl-β-D-Thiogalac
toside) bzw. Glucose/Lactose-Shift; oder tetA-P/O (A. Skerra,
1994, Gene 151, 131-135); Induktion durch Zusatz von aTC
(anhydro-Tetracyclin); Promotoren, deren Expressionsstart durch
Änderung der physiologischen Bedingungen eingeleitet wird, z. B.
λPL (E. Remaut, P. Stanssans, W. Fiers 1981, Gene 15, 81-93);
Expressionsstart durch Inaktivierung des Repressormoleküls cIts857
nach Temperaturerhöhung); cspA-P/O (J. A. Vanisa, F. Baneyx, 1996,
Appl. Environ. Microbiol. 62, 1444-1447); Expressionsstart durch
Temperaturabsenkung); Vhb "oxygen-regulated element" (C. Koshla,
J. Curtis, P. Bydalek, J. R. Swartz, J. E. Bailey, 1990, Biotech
nol. Bioeng. 48, 151-160); Expressionsstart durch Sauerstoff
absenkung, pO2 < 5% Sättigung; induzierbare Promotor-Hybride, die
aus DNA-Sequenzen verschiedener Promotoren bestehen, z. B.
PLtetO-1 aus tetA-P/O und PL-P/O aus dem Phagen λ (R. Lutz,
H. Bujard, 1997, Nucl. Acid. Res. 25, 1203-1210); konstitutive
Promotoren und Promotorhybride, die ohne Induktion eine permanen
te Genexpression erlauben (z. B. P-lacI (lac-Repressor-Gen), P-
bla (β-Lactamase-Gen), P-lacI/P-bla-hybrid, speA (Streptococcus
Exotoxin A-Gen).
Zwischen der P/O-Region und dem Startcodon der Proteinsynthese
müssen desweiteren spezifische DNA-Sequenzen als ribosomale
Bindungsstelle (rbs; auch Shine-Delgano-Sequenz, SD) eingefügt
werden, die eine Bindung der mRNA an das Ribosom als Voraus
setzung für den Proteinsynthesestart ermöglichen.
Die Expressionskassette (P/O, SD, Signalsequenz, Strukturgen)
kann von Transkriptionsterminator-Strukturen flankiert werden,
um mögliche Interferenzen mit benachbarten Expressionskassetten
zu minimieren. Weiterhin können die für eine effektive Steuerung
der P/O-Regionen notwendigen Regulatorgene (z. B. lacI oder lacIq
für lacP/O und tacP/O; tetR für tetAP/O; cIts857 für PL etc.) auf
den gleichen oder anderen autonom replizierenden Vektoren
lokalisiert oder in das Chromosom integriert sein.
Gensequenzen, die für Signalpeptide kodieren, werden N-terminal
vor das Produktgen eingeführt. Als Signalpeptide für Genprodukte,
die in das Kulturmedium sekretiert werden sollen, wie Fusions
proteine oder bestimmte Proteindomänen, z. B. den extramembranären
Regionen von Rezeptoren, eignen sich prokaryotische oder
eukaryotische Signalpeptide. Bevorzugt sind die Signalpeptide des
OmpA Proteins (ompA), der Staphylokinase (sak), der alkalischen
Phosphatase aus E. coli (phoA), der Streptokinase (speA) und der
periplasmatischen Pectinlyase aus Erwinia (pelB) (A. M. Bushueva,
A. B. Shevelev, J. Gumpert, G. G. Chestukina, C. Hoischen,
M. V. Matz, M. V. Kuryatova und V. H. Stepanov, 1998, FEMS Letters
159, 145-150; M. Kujau, C. Hoischen, D. Riesenberg und J. Gum
pert, 1998, Appl. Microbiol. Biotechnol. 49, 51-58; C. H. Klessen,
K. H. Schmidt, J. Gumpert, H. H. Grosse und H. Malke, 1989, Appl.
Environm. Microbiol. 55, 1009-1015). Zum Teil enthalten die
Produktgene jedoch bereits natürliche Signalsequenzen, die einen
Transport durch die Membran sicherstellen.
Für eine Verankerung Proteinen eignen sich besonders solche
Signalpeptide die nicht durch L-Form-eigene Signalpeptidasen
abgespalten werden können. Diese können aus herkömmlichen
Signalpeptiden beispielsweise dadurch erhalten werden, daß die
Schnittstellen für Signalpeptidasen beispielsweise durch den
Austausch von Aminosäuren so modifiziert werden, daß diese von
den Signalpeptidasen nicht erkannt werden.
Zum besseren Nachweis und zur Aufreinigung des Genprodukts können
an das Strukturgen codierende Sequenzen für entsprechende Peptide
(z. B. c-myc, His-tag, Strep-tag) oder Proteine (z. B. GST) mit
und ohne dazwischen liegenden Sequenzen für eine spezifische
Peptidase-Abspaltung angefügt werden.
Im weiteren Verlauf der Vektorkonstruktion erfolgt die Integra
tion dieser Expressionskassetten (Promotor-Signalsequenz-
Produktgen-Konstrukte) in ein geeignetes Plasmid. Dieses muß zur
Vermehrung in den L-Form-Zellen einen geeigneten Replikations
ursprung und mindestens ein Selektionsgen enthalten. Für die L-
Formen aus Gram-negativen Bakterien, insbesondere für P.
mirabilis und E. coli, eignen sich vorzugsweise das ColE1
Replicon (hohe Kopienzahl), das pBR322 Replicon (= ColE1 + rop
Gen, mittlere Kopienzahl) und die pI5A und pSC101 Replicons
(niedrige Kopienzahl). Für L-Formen von Gram-positiven Bakterien
wie Bac. subtilis eignen sich Replikationsursprungssequenzen von
Vektoren mit breitem Wirtsspektrum (z. B. pUB101 von Staphylokok
ken, pIP501, pAMβ1, pSM19035 von Streptokokken) oder für
Streptomyceten L-Formen die Replicons der Vektoren pIY101, pWOR
und pSG5. Die Wahl des Replikationsursprungs erlaubt zusätzlich
eine Variation der Expressionsstärke des Strukturgens über die
Kopienzahl und damit der Gendosis.
Die Verwendung kompatibler Replikations-Origins und unter
schiedlicher Selektions-Gene auf verschiedenen Vektoren er
möglicht den Einsatz dualer oder multipler Vektorsysteme in L-
Form-Zellen für die Koexpression verschiedener Strukturgene
(S. Sieben, R. Hertle, J. Gumpert und V. Braun 1998, Arch.
Microbiol. 170, 236-242).
Als Selektionsmarker sind Resistenzen gegenüber β-Lactam-
Antibiotika (z. B. Ampicillin) und Chloramphenicol für alle L-
Formen ungeeignet. Es müssen deshalb für die Plasmidkonstrukte
geeignete Resistenzgene ermittelt werden, wobei vorzugsweise
solche gegen Kanamycin, Erythromycin, Nourseothricin, Phleomycin
und Neomycin eingesetzt werden.
Die Transformation der L-Form-Stämme mit dem Expressionsvektor
erfolgt nach einer an sich bekannten Standardmethode (J. Gumpert,
H. Cron, R. Plapp, H. Niersbach und C. Hoischen 1996, J. Basic
Mircobiol. 36, 88-98). Danach werden L-Form-Zellen mit Plasmid-
DNA und Polyethylenglycol MG 6000 im Eisbad und bei 37°C
inkubiert. Nach Zugabe von LFS-Medium erfolgt eine 1-3-stündige
Bebrütung bei 37°C, und danach wird diese Vermehrungskultur auf
Selektivagarmedium ausplattiert.
Als Selektivantibiotikum werden entsprechend den Vektorkon
struktionen bevorzugt Kanamycin, Erythromycin, Nourseothricin und
Neomycin verwendet. Die positiven Transformanten werden auf
Agarmedium vermehrt und durch 2-5-maliges Übertragen in frisches
Medium an das Wachstum in flüssigen Nährmedien adaptiert.
Bevorzugte Wachstumsmedien sind LFS-Medium und BHIB-Medium mit
Zusätzen von 0,3-1% Hefeextrakt, 1-2% Saccharose und 2-50 µg/ml
Selektivantibiotikum. Die Agar-Kulturen oder Submers-Kulturen
werden auf das Vorhandensein der intakten Plasmid-DNA mit
Restriktionsanalyse und Agarose-Gelelektrophorese überprüft.
Eine zweite Transformationsmethode wird in der Weise ausgeführt,
daß der Transformationsansatz (Plasmid-DNA/L-Form-Zellen/PEG)
nach Aufenthalten im Eisbad und bei 37°C mit LFS-Medium 1 : 1
aufgefüllt und 2-6 Stunden bei 37°C bebrütet wird. Danach
erfolgen die Zugabe von 2-10 ml LFS-Medium mit 2-50 µg/ml des
entsprechenden Selektivantibiotikums und weitere Inkubation unter
Schüttelbedingungen bei 30-37°C über 10-48 Stunden. Mit
dieser Methode werden Mischpopulationen von Transformanten
erhalten, von denen durch Ausplattieren auf Selektivmedium
Einzelkolonie-Kulturen gezüchtet werden können.
Im Falle der Verwendung von dualen Vektorsystemen (z. B. der
gekoppelten und unter Rifampicin-Zusatz spezifischen Expression
von Strukturgenen unter Kontrolle des T7-RNA-Polymerase/T7-
Promotor-Systems auf den Plasmiden pGP1-2 und pSAT14), werden die
L-Form-Zellen zunächst mit einem Plasmid transformiert und
selektiert. In diese Transformanten erfolgt danach die Trans
formation des zweiten Plasmids unter Selektion auf das Vorhanden
sein der Selektionsmarker beider Plasmide. Im Ergebnis werden L-
Form-Transformanten-Kulturen bereitgestellt, die einen oder
mehrere Expressionsvektoren enthalten.
Für eine maximale Produktsynthese können die Wachstums- und
Fermentationsbedingungen für die einzelnen Proteine unter
schiedlich sein. Sie hängen davon ab, ob die Produktsynthese
wachstumsgekoppelt ist oder vorwiegend in der stationären
Wachstumsphase erfolgt, ob das Produkt effizienter bei Temperatu
ren von 26 bis 30°C oder von 37°C gebildet wird, und ob das
Proteinprodukt pH-empfindlich ist und, z. B. wie Prochymosin, bei
pH-Werten über pH 7,3 autokatalytisch abgebaut wird. Es wurde
gefunden, daß die erfindungsgemäß modifizierten Zellen in der
Lage sind, sich rasch und ohne Probleme an die für das jeweilige
Protein optimalen Wachstumsbedingungen anzupassen.
Die Überexpression von Fremdproteinen in den L-Form-Zellen ist
so kontrollierbar, daß im Verlaufe der Isolierung und Kultivie
rung der Transformanten und ihres Wachstums in flüssigen Medien
kein rekombinantes Protein gebildet wird. Die Proteinsynthese
wird erst bei Erreichen hoher Zellzahlen induziert.
Das Wesen der Kultivierung liegt darin, daß die Kultur möglichst
hohe Zellzahlen (109-1010 Zellen/ml) erreicht, daß diese zum
richtigen Zeitpunkt zur Expression und Überproduktion angeregt
werden, daß die Proteine in hohen Konzentrationen sekretiert bzw.
in die Membran eingebaut, bzw. auf der Membran präsentiert
werden, daß ein Abbau der Proteine vermieden wird und daß die
Kulturüberstände bzw. die L-Form-Zellen mit maximalem Gehalt an
Proteinprodukten für die anschließende Isolation bereitgestellt
werden.
Die konkreten Bedingungen und Parameter sind für die eingesetzten
Produzentenstämme (L-Formen von E. coli, P. mirabilis, B.
subtilis) und für die Proteinprodukte unterschiedlich und müssen
im Einzelfall ermittelt und optimiert werden. Im einzelnen
betrifft dies die Zusammensetzung der Nährmedien (insbesondere
C- und N-Quellen), die Konzentration der Selektivantibiotika
(0,5-50 µg/ml), optimale Wachstums- und Synthesetemperaturen (20-40°C,
vorzugsweise 26-37°C), Regelung des pH-Wertes (pH 6,0-8,5,
vorzugsweise pH 7,5), optimaler Sauerstoffeintrag durch Wahl
der Fermentationsbehälter, Schüttelfrequenzen (50-330 U/min),
Rührgeschwindigkeiten (200-600 U/min), Belüftungsraten (kon
stanter pO2), Zufütterung von C- und N-Quellen (insbesondere
Glukose), Zeitpunkt zur Induktion der Genexpression (z. B. durch
Zugabe von IPTG, anhydro-Tetrazyklin, 20-60 min Temperatur
erhöhung auf 42°C) sowie die Länge der Synthesezeit (4-50 Std.).
Das Wachstum und die Produktsynthese können in dieser Stufe durch
zusätzliche Faktoren optimiert werden, z. B. niedermolekulare
Effektoren, Vitamine, Aminosäuren-gemische, Lipidkomponenten,
Thiolreagenzien und nichtmetabolisierbare Zucker.
Eine Verbesserung der Bildung von funktionell aktiven Gen
produkten kann auch durch Zugabe von Zuckern erreicht werden,
beispielsweise von 1-5% Saccharose. Es wird angenommen, daß
solche Zucker die Faltungsprozesse verschiedener Proteine
verbessern.
Bei hoher struktureller und segregativer Stabilität der Plasmide
in den L-Form-Zellen (z. B. von pHC1, pSTS2sak, pMK7GFP) können
Wachstum und Produktsynthese auch ohne Zugabe der Selektivanti
biotika (Kanamycin, Neomycin, Nourseothricin usw.) erfolgen.
Die anschließende Isolierung und Reinigung der Genprodukte ist
davon abhängig, ob das Protein als lösliches extrazelluläres oder
als membrangebundenes Protein, z. B. peripheres bzw. integrales
Membranprotein anfällt. Da die L-Form-Zellen im Gegensatz zu
allen anderen Produzentenzellen in der Regel außer der zytoplas
matischen Membran keine weiteren Zellorganellen wie Geißeln,
Fimbrien, Sporen, Zellwände und innere Membransysteme besitzen,
entfallen die Reinigungsschritte, die zur Abtrennung dieser
Komponenten erforderlich sind. Die Membranen und Membranproteine
können relativ einfach durch Zellyse (osmotischer Schock,
Ultraschall, French Press) und anschließende Zentrifugation und
Waschen in Pufferlösungen isoliert und gereinigt werden.
Im Falle der Gewinnung von extrazellulären löslichen Proteinen
werden die L-Form-Zellen durch Zentrifugation (6000 g/10 min) vom
Nährmedium abgetrennt und aus diesem Überstand mit den bekannten
Methoden der Proteinisolierung (Fällung, Sedimentation, Ex
traktion, Filtration, elektrophoretische Auftrennung; Affini
täts-, Ionenaustausch-, Größenausschluß- und hydrophobe Chromato
graphie etc.) die Proteine separiert und gereinigt.
Zur Isolierung membrangebundener Proteine werden die L-Form-
Zellen in gleicher Weise durch Zentrifugation sedimentiert und
gewaschen. Die Gewinnung der Protein-Membrankomplexe erfolgt
durch Lyse der Zellen (osmotische Lyse, Ultraschallbehandlung,
Einfrieren und Auftauen, French-Press-Behandlung). Die Membranen
(leere Zellen) werden anschließend in magnesiumhaltigen (z. B. 0,1% MgSO4)
Pufferlösungen gewaschen.
Der Nachweis der membrangebundenen Proteine erfolgt mit bekannten
Methoden, vorzugsweise durch immunochemische Methoden auf der
Basis synthetischer Peptide, (Western-Blot, Dot-Blot, ELISA,
synthetische Sequenz-spezifische Antikörper), zytochemische
Methoden (Immunoelektronenmikroskopie mit Immunogold, Fluo
reszenzmikroskopie), radiochemische Methoden (Markierung mit S35
Methionin oder H3-Leucin) und funktionellen Tests (enzymatische
Reaktionen, Bindungskinetiken).
Die weitere Isolierung und Anreicherung richtet sich nach dem
Verwendungszweck, d. h. ob das Proteinprodukt als reines Protein
gewonnen werden soll oder als Komplex mit Membranen oder
Lipidkomponenten. Die Protein-Membran-Komplexe liegen in der
Regel als Vesikel (0,01-5 µm Durchmesser) vor und können in
Pufferlösungen (TRIS, BBS, mit Zusätzen von 0,1% MgSO4,
Phenylmethylsulfonfluorid, Dithiothreitol) als Suspension stabil
erhalten bzw. aufbewahrt werden.
Die Membranvesikel können durch Inversion mittels French-Press-
Behandlung oder Einfrieren-Auftauen in inside-out Vesikel
umgewandelt werden. Dabei werden die zytoplasmaseitigen inneren
Bereiche der Proteinmoleküle an der äußeren Oberfläche der
Membranvesikel frei zugänglich. Derart hergestellte invertierte
Protein-Membran-Komplexe machen Interaktionsstudien und Struktur
aufklärung der zytoplasmaseitigen extramembranären Domänen
möglich.
In einer weiteren Variante des Verfahrens kann die Lipidmatrix
der Membranen durch geeignete Detergentien (SDS, Plantaren, Tween
20, Triton X100) aufgelöst werden. Dabei kommt es zu einer
Freisetzung der integralen und peripheren Membranproteine, und
diese können als lösliche oder aggregierte Proteinmoleküle
isoliert und gereinigt werden.
In einem alternativen Schritt des Verfahrens können die auf diese
Weise isolierten membrangebundenen Proteine wieder in Lipid
strukturen mit definierter molekularer Zusammensetzung rekon
stituiert werden. Auf diese Weise lassen sich ihre richtige
molekulare Konfiguration und ihre Funktionalität erhalten bzw.
wiederherstellen. Viele Membranproteine sind nur dann funktionell
aktiv, wenn sie in einem geeigneten Lipidmilieu eingebettet sind.
Als Lipide eignen sich insbesondere Phospholipide mit ausgepräg
ter Tendenz zur Bildung unilamellarer Bilayer-Vesikel (z. B.
Phosphatidylethanolamin, Phosphatidylglycerol, Phosphatidyl
cholin).
Die erfindungsgemäßen L-Form-Stämme und das erfindungsgemäße
Verfahren zur Herstellung von Genprodukten eignen sich besonders
zur Herstellung von membrangebundenen Proteinen. Unter mem
brangebundenen Proteinen werden solche Proteine verstanden, die
an Biomembranen gebunden sind. Hierunter fallen sowohl die
sogenannten Membranproteine, die aufgrund ihrer chemisch
physikalischen Eigenschaften an Membranen binden, entweder
integral oder peripher, als auch Proteine, die selbst nicht an
Membranen binden und erst durch geeignete Membrananker an die
Membran gebunden werden.
Der Begriff Membranprotein umfaßt integrale oder periphere
Membranproteine, wie Rezeptoren (z. B. Acetylcholin, Bradykinin,
Endothelin, Hormone), Carrierproteine (z. B. für Aminosäuren,
Zucker, Ionen, Peptide, kompatible Solute, Elektronentransport),
Ionenkanäle, ABC-Transporter, Preproteintranslokatoren.
In besonderer Weise eignen sich das erfindungsgemäße Verfahren
und die erfindungsgemäßen L-Form-Stämme zur Expression und zur
Gewinnung von bakteriellen "outer-membrane-proteins" (Omps),
insbesondere Omps mit β-Faltblattstruktur. Diese Proteine sind
in der äußeren Membran von Gram-negativen Zellen lokalisiert.
Überraschenderweise war es erstmals möglich, Omps in großen
Mengen auch in löslicher Form zu exprimieren. Omps sind mit
herkömmlichen bakteriellen Expressionssystemen nur schlecht in
reiner Form herstellbar (Meens et al. 1997, Applied. Environment.
Microbiol. 63: 2814-2820). Die Verwendung von L-Form-Stämmen zur
Herstellung von Omps, insbesondere Omps in löslicher Form und
Omps mit β-Faltblattstruktur, wurde bisher nicht beschrieben und
ist ebenfalls Gegenstand der Erfindung.
Outer-membrane-proteins (Omps) Gram-negativer Bakterien speziell
pathogener Arten eignen sich in löslicher oder membrangebundener
Form für Interaktionstests, Struktur-Funktionsstudien, Diagnostik
und Vakzinierung.
Zu der zweiten Gruppe membrangebundener Proteine zählen bei
spielsweise lösliche Proteine und hydrophile Proteine, die erst
nach dem Verknüpfen mit beispielsweise einer hydrophobe Aminosäu
resequenzen zu einer Bindung an Lipidmembranen in der Lage sind.
Die hydrophobe Aminosäuresequenz dient hierbei als Membrananker.
Bevorzugte Membrananker sind homologe und heterologe Signalpepti
de, wie beispielsweise das eukaryotische Signalpepted des SERP-
Proteins aus Plasmodlum falciparum, die Schnittstellen besitzen,
die von den bakteriellen Leaderpeptidasen nicht erkannt werden.
Weiter bevorzugte Membrananker sind Sequenzen homologer und
heterologer transmembraner Regionen von Membranproteinen wie
hydrophobe Transmembranhelices von homologen und heterologen
prokaryotischen und eukaryotischen Membranproteinen, vorzugsweise
Helix 1 oder Helices 1 bis 3 der Lactose-Permease LacY von E.
coli, der Präprotein-Translokase SecY von E. coli oder des
Schwärmproteins CcmA von P. mirabilis.
Ebenfalls geeignet sind synthetische hydrophobe Aminosäuresequen
zen mit 8 bis 150, vorzugsweise 10 bis 120, ganz besonders
bevorzugt 10 bis 30 Aminosäuren, wie beispielsweise dem Leucin-
Zipper. Als ausreichend hydrophob werden Aminosäuresequenzen dann
angesehen, wenn sie gemäß den von G. von Heijne publizierten
Verfahren an Biomembranen binden (von Heijne G., "Assembly of
Integral Membrane Proteins" in Biological Membranes: Structure,
Biogenesis and Dynamics, Springer Verlag Berlin 1994, J. A. F. Op
den Kamp (Herausgeber), Seiten 199 bis 205; Cserzo, M., Wallin,
E., Simon, I., Von Heijne G., Eloffson, A. Protein Eng. 1997, 10:
673-676). Besonders bevorzugte Membrananker sind in den Aus
führungsbeispielen beschrieben.
Die Verankerung von Proteinen an Membranen ermöglicht die
Oberflächenpräsentation (Surface Display) der Proteine auf den
L-Form-Membranen. Durch das Fehlen von Zellwandkomponenten
(Peptidoglycan, äußere Membran, Lipopolysaccharide) und extrazellulären
Proteasen ist es mit den L-Form-Stämmen möglich, die
interessierenden Proteine direkt auf der Zytoplasmamembran zu
präsentieren. Das Fehlen antigener Komponenten ist im Hinblick
auf medizinischen Anwendungen wie Vakzinierungen und diagnosti
sche Methoden vorteilhaft. Das eröffnet gegenüber herkömmlichen
Gram-positiven und Gram-negativen bakteriellen Surface-Display-
Systemen erhebliche Vorteile. Zudem lassen sich hohe Konzen
trationen der Proteine auf der L-Form-Membran erzielen (bis etwa
100 mg/l). Es wurde überraschend gefunden, daß bei der Ver
ankerung von Proteinen in der Zytoplasmamembran mit heterologen
und homologen Ankersequenzen die Proteine zum größten Teil auf
der Außenseite der zytoplymatischen Membran angeordnet und
biologisch Aktiv sind. Die Proteine sind damit für die Wechsel
wirkung mit extrazellulären Komponenten, Funktionstests und
Interaktionsstudien einfach zugänglich. Die Verankerung erwies
sich zudem als sehr stabil, und die Proteinmoleküle wurden
beispielsweise im Verlauf der Fermentation nicht von den
Membranankern abgerissen.
Durch die Oberflächenpräsentation von Proteinen ist beispiels
weise die Gewinnung neuartiger Impfstoffe und Interaktions-
Screeningsystemen möglich. Hierzu wird das gewünschte Antigen auf
der Membran von L-Form-Zellen verankert, und die Zellen werden
dann zur Impfung eingesetzt. Dabei werden vorzugsweise lediglich
die aktiven, d. h. antigenen Komponenten beispielsweise von
Proteinen zur Verankerung verwendet. Durch die hohe Konzentration
an Protein auf der Membran ist nur eine geringe Zellzahl zur
Impfung erforderlich, und der Gebrauch patogener Zellen oder
Proteine kann ganz vermieden werden.
Zu den Proteinen, die sich für das Surface-Display besonders
eignen gehören neben verschiedenen antigenen Determinanten von
pathogenen Organismen für Vakzinierungen besonders auch single
chain Antikörper und Antikörperfragmente, heterologe Enzyme,
Polyhistidyl Tags und Peptidbibliotheken. Die so modifizieten L-
Form-Zellen eignen sich für die Verwendung in Diagnostik und
Therapie und zur Herstellung von Mitteln für die Diagnostik und
Therapie, als Biokatalysatoren, und für die Anwendung in Inter
aktionsscreenings.
Die Verwendung von L-Form-Zellen zur Oberflächenpräsentation von
Proteinen wurde bisher nicht beschrieben und ist daher ebenfalls
Gegenstand der vorliegenden Erfindung, ebenso wie Verfahren zur
Oberflächenpräsentation von Proteinen unter Verwendung von L-Form-
Zellen und die Verwendung von L-Formen mit an der Zytoplasmamem
bran verankerten Proteinen zur Herstellung von Mitteln für
Therapie und Diagnostik. Diese Verfahren umfassen die oben
beschriebenen Schritte zur Herstellung von Proteinen unter
Verwendung von L-Formen, wobei die Zellen mit dem Genkonstrukt
aus einer Ankersequenz und einer Proteinsequenz transformiert
werden. Die Zellen werden bei der Isolation des Genprodukts
vorzugsweise nicht durch Tenside oder dergleichen aufgeschlossen
sondern als ganzes isoliert.
Zur Oberflächenpräsentation von Proteinen eignen sich alle L-
Formen von Bakterien, insbesondere stabile L-Formen und ganz
besonders stabile Protoplasten-Typ-L-Formen. Bevorzugte und
besonders bevorzugte L-Formen sind die oben als Ausgangsstämme
zur Herstellung modifizierter L-Formen genannten, insbesondere
die erfindungsgemäß modifizierten L-Formen.
Die erfindungsgemäßen L-Form-Stämme und das erfindungsgemäße
Verfahren zur Herstellung von Genprodukten eignet sich weiterhin:
zur Herstellung von Proteinen zur Verwendung als Arzneimittel und Diagnostika, wie beispielsweise pharmazeutisch wirksamen Enzymen und Enzymaktivatoren (Exo- und Endopeptidasen, Staphylokinase, Streptokinase, Hämolysinaktivator ShlB), Wachstumsfaktoren, Peptidhormonen, Antikörperkonstrukten (z. B. Fab-, Fv-Fragmenten, deren single chain Varianten, Miniantikörpern, Diabodies, kompletten Antikörperproteinen), membranständigen Fusions proteinen und anderen rekombinanten Fusionsproteinen, mit mono-, bi- oder multivalenten Bindungseigenschaften für die medizinische Diagnostik oder Therapie (z. B. von Tumoren), dazu zählen u. a. Rezeptoren mit Liganden-Bindungseigenschaften;
zur Herstellung und Präsentation von Immundeterminanten wie Oberflächenantigenen von pro- und eukaryotischen Organismen (z. B. des SERP- und MSP1-Proteins des Malariaerregers Plasmodium falciparum, viralen Hüllproteinen (z. B. vom HIV-Virus und anderen Retroviren), viralen Transkriptasen zur Antikörperbildung und Immunisierung;
zur Herstellung von Enzymaktivatoren und Enzyminhibitoren wie z. B. Proteaseinhibitoren;
zur Herstellung von Enzymen und Proteinen der Signalübertragung;
und zur Herstellung von Precursorproteinen, d. h. Vorstufen von reifen, biologisch aktiven Proteinen, die aufgrund der fehlenden extrazellulären proteolytischen Aktivität der L-Form-Zellen erhalten bleiben und als inaktive Form für therapeutische und diagnostische Zwecke eingesetzt und im Organismus bzw. Diagno stiktest erst aktiviert werden.
zur Herstellung von Proteinen zur Verwendung als Arzneimittel und Diagnostika, wie beispielsweise pharmazeutisch wirksamen Enzymen und Enzymaktivatoren (Exo- und Endopeptidasen, Staphylokinase, Streptokinase, Hämolysinaktivator ShlB), Wachstumsfaktoren, Peptidhormonen, Antikörperkonstrukten (z. B. Fab-, Fv-Fragmenten, deren single chain Varianten, Miniantikörpern, Diabodies, kompletten Antikörperproteinen), membranständigen Fusions proteinen und anderen rekombinanten Fusionsproteinen, mit mono-, bi- oder multivalenten Bindungseigenschaften für die medizinische Diagnostik oder Therapie (z. B. von Tumoren), dazu zählen u. a. Rezeptoren mit Liganden-Bindungseigenschaften;
zur Herstellung und Präsentation von Immundeterminanten wie Oberflächenantigenen von pro- und eukaryotischen Organismen (z. B. des SERP- und MSP1-Proteins des Malariaerregers Plasmodium falciparum, viralen Hüllproteinen (z. B. vom HIV-Virus und anderen Retroviren), viralen Transkriptasen zur Antikörperbildung und Immunisierung;
zur Herstellung von Enzymaktivatoren und Enzyminhibitoren wie z. B. Proteaseinhibitoren;
zur Herstellung von Enzymen und Proteinen der Signalübertragung;
und zur Herstellung von Precursorproteinen, d. h. Vorstufen von reifen, biologisch aktiven Proteinen, die aufgrund der fehlenden extrazellulären proteolytischen Aktivität der L-Form-Zellen erhalten bleiben und als inaktive Form für therapeutische und diagnostische Zwecke eingesetzt und im Organismus bzw. Diagno stiktest erst aktiviert werden.
Die gewonnenen Proteine sind funktionell aktiv und enthalten
keine störenden Membrankomponenten, wie z. B. Lipopolysaccharide
der äußeren Membran Gram-negativer Bakterien, die Gewinnung und
Funktionalität der Proteinprodukte stören. Die genannten
Genprodukte werden entweder in das Kulturmedium transloziert oder
in membrangebundener Form isoliert.
Im folgenden wird die Erfindung anhand von Ausführungsbeispielen
näher erläutert. Die Beispiele wurden unter Verwendung der
hinterlegten L-Form-Stämme durchgeführt, wobei diese durch die
Verfahrensschritte (a) und (b) ausgehend von den bekannten
Stämmen erhalten wurden.
Beispiel 1 zeigt, daß die modifizierten Stämme genotypisch
verändert sind.
Beispiel 2 belegt, daß sie phänotypische und genotypische
Membranveränderungen aufweisen.
In Beispiel 3 wird gezeigt, daß erfindungsgemäß modifizierte
Stämme besser fermentierbar sind und mehr Produkt bilden als die
Ausgangsstämme.
Beispiel 4 beschreibt die kontrollierte Genexpression und
Produktsynthese mit erfindungsgemäß modifizierten Stämmen.
Beispiel 5 beschreibt die Verankerung rekombinater Proteine in
der Zytoplasmamembran unter Verwendung homologer und heterologer
Peptidsequenzen von integralen Membranproteinen als Membrananker.
Die Pulsfeldgelelektrophorese ermöglicht die Auftrennung von DNA-
Fragmenten über einen großen Längenbereich auf einem Gel. Das
erlaubt eine vergleichende Analyse der genomischen DNA von Arten
und Stämmen.
Veränderungen in der DNA, die Auswirkungen auf die Erkennungs
sequenzen von Restriktionsenzymen haben, ergeben veränderte
Bandenmuster. Damit werden nach Restriktasebehandlung Aussagen
über die genetische Diversität eines Stammes möglich (Lezhava,
A., J. Bacteriol. 1995, 177, 6491-6498; Pandza, K., Microbiol.
1997, 143, 1493-1501).
Die L-Form-Stämme E. coli LWF + WEI und E. coli LWF+ und der
zellwandhaltige Elternstamm E. coli WF+ werden unter gleichen
Bedingungen angezüchtet. Die Kultur erfolgte in Steilbrust
flaschen (100 ml) mit 30 ml LFS-Medium und Zusätzen von Pferdese
rum (6% V/V), Hefeextrakt (0,7%) und Saccharose (4%) bei 37°C
auf einem Rotationsschüttler bei 200 U/min. Von jedem Stamm
werden nach einer 3-6-stündigen Kultivierung Proben in einem
Äquivalent entsprechend einer optischen Dichte von 2, gemessen
bei 550 nm, genommen, um vergleichbare finale Biomassen zu
erhalten. Nach einer Zentrifugation der Zellsuspension bei 3000
× g, 4°C und 10 min wurde das Pellet vorsichtig in einer
osmotisch gepufferten Hefe-EDTA-Saccharose-Lösung (HES-Puffer
nach Evans, M., Dyson, P. 1993, Trends in Genetics, 9, 72-78)
resuspendiert, mit fast erstarrter Agarose (0,7%, BioRad)
vermischt und anschließend bei 4°C verfestigt. Dadurch lassen
sich unspezifische Bandenmuster als Folge von Scherwirkungen
vermeiden. Die Proben des Elternstammes E. coli WF+ wurden danach
mit Lysozym behandelt (Serva Electrophoresis, 1 mg/ml HES, 2 Std.
bei 37°C). Der nachfolgenden alkalischen Lyse der Zellen
innerhalb des Agaroseblockes (etwa 0,2 cm3), kombiniert mit einem
hinreichenden Proteinverdau (1 mg Proteinase K (Merck Eurolab)/ml
N-Lauroylsarcosinat-EDTA-Glycin-NaOH-Lösung (NDS-Lösung; Evans,
M., Dyson, P. 1993, Trends in Genetics 9, 72-78) für 16 Std. bei
37°C), schlossen sich die nötigen Waschschritte an: 1 × 15 min
mit NDS, 1 × 15 min mit Hefe-EDTA-Lösung (HE-Puffer), 1 × 1,5 Std.
mit HE-Puffer + 50 µg Pefabloc (Roche Diagnostics)/ml bei
37°C, 5 × 30 min mit HE. Nach einer solchen Behandlung lag die
DNA in einer Form vor, die ein sequenzspezifisches Schneiden mit
Restriktasen erlaubt. Es wurde eine ausreichende Menge von 60
Units der jeweiligen Restriktase einem Agarosestück (etwa 0,05 cm3)
zugesetzt und die Inkubationszeit von 16 Std. gewählt, um
eine vollständige Spaltung zu erreichen. Die Auftrennungs
bedingungen der DNA-Fragmente in einem 1,5% Gel (SeaKemGold, FMC
Bioproducts) bei 170 V, 22 Std., Pulszeiten von 2,5-38 s und 12°C
beruhen auf optimierten Erfahrungswerten. Es wurde eine Puls
feldgelelektrophoreseapparatur des Typs CHEF-DRII (BioRad)
verwendet.
Die eingesetzten Restriktionsendonukleasen (SdaI von MBI
Fermentas, alle restlichen von New England Biolabs) haben
folgende unterschiedliche spezifische Spaltsequenzen:
Die Restriktionsendonukleasen XbaI, NotI, SwaI, AvrII, AscI, SfiI
und SdaI ergaben bei beiden L-Form-Stämmen und dem Elternstamm
weitestgehend identische Grund-Fragmentmuster. Das ist ein
Nachweis dafür, daß es sich taxonomisch um denselben Organismus,
d. h. E. coli, handelt (Abb. 1, 2).
Abb. 1 zeigt Spaltmuster chromosomaler DNA des modifizierten
L-Form-Stammes E. coli LWF + WEI (2, 4, 6, 8) und des Ausgangs
stammes E. coli LWF+ (3, 5, 7, 9) nach Verdau mit jeweils 60
Units der Restriktionsendonukleasen SwaI (2, 3), SpeI (4, 5),
XBaI (6, 7) und NotI (8, 9) (alle von New England Biolabs); die
Spuren 1 und 10 zeigen Längenmarker, Spur 1: Low Range (New
England Biolabs), Spur 10: Lambda-Ladder (New England Biolabs).
Abb. 2 zeigt die Spaltmuster chromosomaler DNA des
wandhaltigen Elternstammes E. coli WF+ (2, 5, 8), des L-Form-
Ausgangsstammes E. coli LWF+ (3, 6, 9) und des weiterentwickelten
Stammes E. coli LWF + WEI (4, 7, 10) nach Verdau mit jeweils 60
Units der Restriktionsendonukleasen SpeI (2, 3, 4), NotI (5, 6,
7) und XbaI (8, 9, 10) (alle von New England Biolabs), Spur 1:
Längenmarker Low Range (New England Biolabs).
Nach Verdau mit SpeI ist ein klarer Unterschied der Banden im
Größenbereich zwischen 240 kb und 290 kb im Stamm E. coli LWF + WEI
und im Stamm E. coli LWF+ zu sehen. Dieser reproduzierbare
Unterschied ist ein eindeutiger Hinweis darauf, daß der weiter
entwickelte Stamm E. coli LWF + WEI im Vergleich zum Ausgangsstamm
E. coli LWF+ genotypisch verändert ist (Abb. 1, siehe Pfeile).
Spaltungen mit SpeI, NotI und XbaI ergaben bei den L-Form-Stämmen
ein Muster, das jeweils gleich verschieden zu dem der N-Form ist
(Abb. 2, siehe Kreuze). Nur SpeI zeigte einen anderen Unterschied
zur N-Form (Abb. 2, siehe Kreise).
Ein Vergleich der Gemeinsamkeiten und Unterschiede in den
Bandenmustern zeigt eindeutig, daß die Stämme E. coli WF+, E.
coli LWF+ und E. coli LWF + WEI taxonomisch der gleichen Spezies
angehören, daß beide L-Form-Stämme gegenüber dem N-Form Eltern
stamm genotypische Unterschiede zeigen und daß der weiter
entwickelte L-Form-Stamm E. coli LWF + WEI gegenüber dem Sammlungs
stamm E. coli LWF+ genotypisch verändert ist.
Neben der vergleichenden Analyse der chromosomalen DNA nach
Restriktasebehandlung erlaubt auch die vergleichende Analyse der
Proteinmuster zweier Stämme Rückschlüsse auf genotypische und
phänotypische Veränderungen. Unter Anwendung der zweidimensiona
len Gelelektrophorese (2D-PAGE) ist eine detaillierte Trennung
und Charakterisierung von Proteingemischen möglich. Im ersten
Schritt erfolgt dabei die Trennung nach dem isoelektrischen Punkt
(p1) in einem Fokussiergel (IEF). Im zweiten Schritt werden dann
in einem SDS-Polyacrylamidgel (SDS-PAGE) die fokussierten
Proteine nach ihrem Molekulargewicht (MW) getrennt.
Im Ausführungsbeispiel wurden die Membranproteine des Ausgangs
stammes E. coli LWF+ mit denen des erfindungsgemäß modifizierten
Stammes E. coli LWF + WEI verglichen. Die Beschränkung auf die
Membranproteine ist deshalb gewählt worden, weil die L-Form-
Membranen nur ca. 500 verschiedene Proteine enthalten, während
in den ganzen Zellen ein Vielfaches davon vorliegt. Desweiteren
sind die Membranproteine zum größten Teil essentiell und in der
Regel ständig in der Membran vorhanden. Reproduzierbare qualita
tive Unterschiede im Muster der Membranproteine sind deshalb ein
Hinweis auf strukturelle und funktionelle Unterschiede im Genom.
Die Zellen der beiden Stämme werden unter identischen Bedingungen
gezüchtet (BHI-Medium mit Zusätzen von 0,5% Hefeextrakt und 5%
v/v Pferdeserum, Bebrütung im Schüttelinkubator bei 37°C), nach
24 Std. abzentrifugiert (6000 × g, 10 min), in 0,4 M Saccharose
gewaschen und durch osmotischen Schock (0,05 M TRIS/HCl-Puffer
pH 7,0 mit Zusatz von 0,1% MgSO4 und 30 µg/ml DNAse) lysiert.
Durch Ultrazentrifugation (80000 × g, 20 min, 4°C, Beckmann
Optima XL80) und Waschen in 0,05 M TRIS/HCl-Puffer mit 0,1%
MgSO4 erfolgt die Isolierung und Reinigung der Membranen.
Die gereinigten Membranfraktionen werden zunächst mit der 5-
fachen Einwaagemenge dest. Wassers gewaschen und danach 45 min bei
5°C mit 14000 Upm zentrifugiert (Sorvallzentrifuge Typ RMC 14).
Das Pellet wird wie unten beschrieben weiterverarbeitet.
Das gewaschene Membranpellet wird in der 6-fachen Menge Solubili
sierungspuffer (9,5 M Harnstoff, 4% 3-[(3-Cholamidopropyl)-
dimethylammonio]-1-propansulfonat (CHAPS, Serva), 5% einer 40%igen
Ampholytlösung 3-10, 100 mM Dithiolthretitol (DTT)
aufgenommen und zusätzlich fester Harnstoff in einer Menge von
45% der Membraneinwaage zugegeben, um die Harnstoffkonzentration
der Gesamtlösung wieder auf 9,5 M zu bringen. Die Suspension
wird durch Schütteln bei Raumtemperatur in Lösung gebracht und
2 Std. stehengelassen mit wiederholten Schüttelvorgängen.
Anschließend wird die klare Lösung 50 min mit 75000 Upm in einer
Ultrazentrifuge zentrifugiert (Typ Beckmann® Optima TLX bei 20°C).
Der Überstand enthält die unter den gewählten Bedingungen
gelösten Membranproteine. Jeweils 15-20 µl dieser Lösung werden
auf die Fokussierungsgele aufgetragen und zweidimensional
analysiert.
Zur Analyse der Proteinkomponenten wurde das Investigator® 2-D
Electrophoresis System von Oxford Glyco-Systems verwendet.
Isoelektrische Fokussierung (1. Dimension): Keine Präfokussie
rung, Strom maximal 110 µA/Gel, Spannung konstant 1000 V (17 Std.)
und 2000 V (30 min), d. h. 18000 Vh insgesamt.
SDS-PAGE (2. Dimension): 11,5% Polyacrylamid-Gele (Duracryl
30,65% T), kein Stacking-Gel, Spannung maximal 500 V, 20 W/Gel.
Alle Gele werden mit Coomassie Brilliant Blau G-250 nach der
Methode von Neuhoff et al. (Electrophoresis 1988, 9, 255-262)
gefärbt, bei welcher die kolloidalen Eigenschaften dieses
Farbstoffes zur Anwendung kommen.
Abb. 3 zeigt Membranproteine von Escherichia coli LWF+ (Gel
A1) und E. coli LWF + WEI (Gel B1) nach Auftrennung mit 2D-PAGE in
dem pI-Bereich 4,8-6,7 und dem MW-Bereich 31-60 kDa. Die
schwarzen Pfeile markieren Spots bzw. Spotmuster, die nur im
Stamm E. coli LWF+ vorliegen, und die weißen Pfeile dokumentieren
Proteine, die für den Stamm E. coli LWF + WEI spezifisch sind. Der
Vergleich der Spotmuster in den Gelbereichen 3,5 < p1 < 7,0 und
22 kDa < MW < 80 kDa ergab in den Membranen beider L-Form-Stämme
ca. 150 detektierte Proteine. Die Mehrzahl der Spots ist
identisch. Von den zwölf divergierenden Proteinen lagen sechs nur
im Ausgangsstamm E. coli LWF+ und sechs nur im Stamm E. coli
LWF + WEI vor.
In Abb. 3 sind die Gelbereiche 4,8 < pI < 6,7 und 31 kDa
< MW < 60 kDa als Ausschnitte vergrößert, und sie zeigen
jeweils vier differierende Proteine. Auf Grund der völlig
identischen Anzuchtbedingungen und Probenbehandlungen und der
mehrfach reproduzierten Daten muß aus den Ergebnissen geschlossen
werden, daß die Zusammensetzung der Membranproteine im Stamm E.
coli LWF + WEI signifikant verändert ist und daß dies auf Ver
änderungen im Genotyp beruht.
Die Gewinnung rekombinanter Proteine, die zur Vakzinierung
eingesetzt werden können, ist eine vordringliche Aufgabe,
insbesondere für bisher dafür nicht zugängliche Krankheiten wie
z. B. Malaria. Das MSP1-Gen kodiert ein Protein, das von den
Merozoiten-Stadien des Erregers Plasmodium falciparum syn
thetisiert wird und ein Kandidat für Vakzinierungsstrategien
gegen Malaria darstellt. Zur Gewinnung des Proteins, d. h. in der
Ausführung des 42 kDa großen C-terminalen Fragmentes, wurden die
Stämme P. mirabilis LVI und P. mirabilis LVIWEI mit dem
Plasmid p6H-42-3D7 transformiert. Im Beispiel wird die Fermenta
tion beider Transformanten verglichen und dokumentiert, daß der
neue Stamm P. mirabilis LVIWEI bessere Eigenschaften im Hinblick
auf Wachstum und Produktbildung hat.
Die Stämme P. mirablis LVIWEI (p6H-42-3D7) und P. mirabilis LVI
(p6H-42-3D7) enthalten das gleiche Plasmid mit dem Gen für das
42 kDa Fragment des Malaria-Surface-Proteins 1 (MSP1) in der
Allel-Variante 3D7 (MAD20) des humanspezifischen Erregers
Plasmodium falciparum (Pan, W. et al. 1999, Nucleic Acids
Research 27, 1094-1103). Am 42 kDa-Fragment ist N-terminal das
ompA-Signalpeptid fusioniert, was für eine Sekretion in das
Medium notwendig ist. Die Gewinnung der Transformanten erfolgte
nach den gleichen Schritten wie sie in der Patentbeschreibung und
im Ausführungsbeispiel 5 beschrieben sind. Sie sind hinsichtlich
Plasmididentität (Restriktionsmuster) und der unter Kontrolle
des PLtetO-1 Promotors (Lutz, R. und Bujard, H. 1997, Nucleic Acids
Research 25, 1203-1210) induzierbaren Produktbildung getestet.
Zur Fermentation wurden zuerst Vorkulturen aus den an Wachstum
in flüssigen Medien adaptierten Transformanten hergestellt. Eine
erste Vorkultur erfolgte bei 37°C (100 ml Glaskolben mit 35 ml
BHI-Medium und Zusätzen von 50 mM Na-Phosphat pH 7,2 und 50 µg/ml
Kanamycin) über 24 Std. als Schüttelkultur bei 220 rpm.
Nachfolgend wird eine zweite Vorkultur in gleichem Maßstab bei
28°C für 24 Std. kultiviert. Diese dient als Inokulum für die
dritte Vorkultur (500 ml Glasflaschen mit 150 ml Fermentations
medium, 12 Std. bei 26°C kultiviert). Nach einer mikroskopischen
Kontrolle der Vorkulturen erfolgt die Beimpfung der Fermenter.
Der eingesetzte Fermenter (BIOSTAT B Gerät, Braun BBI Melsungen)
ist ausgerüstet mit Rührkessel-Kulturgefäß B2 (Arbeitsvolumen 2 l),
Belüftungseinrichtung, Rührwelle mit zwei Paddelrührern B5
im Medium und einem 6-Blatt-Scheibenrührer B2 im Schaumbereich,
einer pH-Sonde (Ingold 405D-K8S/200), einer pO2-Sonde (Mettler
Toledo 34 100 3057), einer Schaumsonde, einer Gasmischstation mit
2 ml Mass-flow Controller für Luft und Sauerstoff und Zuluftfil
ter 0,2 µm (Sartorius Midisart 2000), Abluftkühler mit Schaumfal
le, Sterilfilter (Gelmann Acro 50ST), Abgasanalysensystem
(Hartmann und Braun, Frankfurt) mit Uras 10p für CO2-Analyse und
Magnos 6G für O2-Analyse, Kühlwasserkreislaufkühler KK4s
(Medingen, 6°C), Dosiereinrichtung für Glukose mit Peristaltik
pumpe WM 101U/2 rpm (Watson-Marlow, Silikonschlauch ID = 1,6 mm)
und Steuerung über Schaltuhr, off-line Analytik für Glukose mit
ECA 2000 Glukose-Analysator (Medingen).
Das Medium im Fermenter ist 1,35 l BHIB (35 g/l) gelöst in Na-
Phosphatpuffer (50 mM, pH 7,2) mit Zusätzen von Glukose (0,5%),
Saccharose (1%), Hefeextrakt (0,1%), Na-Fumarat (40 mM),
Kanamycin (50 µg/ml) und Ampicillin (200 µg/ml). Es wird mit 150 ml
der 12-stündigen Vorkultur beimpft zu einer Startzellkonzen
tration entsprechend einer OD550 nm = 0,5.
Das Fermentationsregime umfaßt: Temperatur = 26°C; pH-Wert =
konstant pH 7,2 (+/-0,3), reguliert mit H2SO4 (12%) und NaOH
(12%); Belüftungsrate = 20 SLPM konstant; Rührgeschwindigkeit
= 100-500 rpm, gekoppelt an die festgelegte pO2-Konzentration
von 20%; Induktorzugabe anhydro-Tetracyclin (400 µg/l, nach
erster Verdopplung der OD und 400 µg/l nach zweiter Verdopplung
der OD, danach 12 Std. Weiterführung der Fermentation). Als
Antischaummittel wurde Ucolub nach Bedarf zugegeben. Zu den in
Abb. 4a und 4b angegebenen Meßpunktzeiten werden Proben
entnommen (10 ml) und die Zellkonzentration als optische Dichte
(OD als Extinktion bei 550 nm, Photometer Spekol 11 Zeiss) als
Maß für die Biomasse bestimmt.
Die Fermentationsproben werden nach Zentrifugation (6000 × g,
10 min) in den Überstand mit löslichem Produkt und in das
Sediment mit zellgebundenem Produkt fraktioniert. Die Produktbil
dung wird durch SDS-Gelelektrophorese und Western blot mit
produktspezifischen Antikörpern und quantitativer Auswertung der
Banden (Scan- und Auswerte-Software Phoretix 1D, NonLinear
Dynamics Ltd, UK) ermittelt.
Die Ergebnisse der Fermentationskinetik und der Produktbildung
mit Proteus mirabilis LVI(p6H-42-3D7) (a) und P. mirabilis
LVIWEI (p6H-42-3D7) (b) sind in Abb. 4 dargestellt. Die
Mengen an synthetisierten löslichem und zellgebundenem Malari
aprotein sind als relative Einheiten ("units" = Fläche ×
Farbintensität der gescannten Produktbanden im Western blot)
angegeben.
- 1. Unter weitestgehend gleichen Bedingungen (Vorkultur aus intakten L-Form-Zellen, gleichen Wachstumsmedien, Animpfdichten, Wachstumstemperaturen, pH-Regelung, Glukosezufütterung, Induktion der Genexpression und Regelung des Sauerstoffeintrages mit Schwellenwert von pO2 = 20% durch Kopplung an Erhöhung der Rührgeschwindigkeit) zeigt die Transformante P. mirabilis LVIWEI (p6H-42-3D7) des weiterentwickelten Stammes deutlich bessere Eigenschaften.
- 2. Im Vergleich zum Stamm P. mirabilis LVI (p6H-42-3D7) zeigt sie ein schnelleres Wachstum unmittelbar nach dem Start der Fermenta tion, eine ausgeprägte exponentielle Wachstumsphase bis 12 Std., sehr viel höhere Zellzahlen und Biomassewerte, verbunden mit wesentlich stärkerer CO2-Bildung und damit aktiveren Stoff wechsel, sowie bessere Verträglichkeit für Antischaummittel. Die Transformante des Ausgangsstamm P. mirabilis LVI (p6H-42-3D7) zeigt dagegen nach Zugabe von Antischaummittel eine Abnahme der Stoffwechselaktivität, verdeutlicht durch das Absinken der CO2- Bildung und des O2-Verbrauches.
- 3. Die Transformante P. mirabilis LVIWEI (p6H-42-3D7) erzielt eine wesentlich höhere Volumenausbeute an synthetisiertem Malariaprotein. Das betrifft sowohl die Menge an zellgebundenem Proteinprodukt (Abb. 4a und 4b) als auch die Menge an löslichem Produkt, die in beiden Stämmen nur gering bleibt.
Für die erfolgreiche Verwendung von Bakterienzellen zur Synthese
rekombinanter Proteinprodukte ist eine kontrollierbare Über
expression der Produktgene von entscheidender Bedeutung. Das
Beispiel 4 dokumentiert, daß eine solche induzierbare Produktsyn
these auf der Grundlage der für E. coli optimierten Genkon
struktionen und Regulationsprinzipien auch in L-Form-Zellen von
P. mirabilis LVIWEI möglich ist.
Die eingesetzten Vektoren wurden mit bekannten gentechnischen
Methoden konstruiert (Maniatis et al., 1989, Molecular Cloning:
A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Lab. Cold Spring Harbor
N. Y.; Ausubel, F. N., 1998, Current Protocols in Molecular
Biology. Wiley and Sons).
Als einfacher Nachweis für die Funktionalität der Vektoren wurde
das Gen für das Grün-fluoreszierende Protein (GFP; Crameri et
al., 1996, Nature Biotechnol. 14, 315-319), stellvertretend für
die Gene unterschiedlichster rekombinanter Proteine, in die
Expressionskassetten unter der Kontrolle verschiedener Promotoren
einkloniert. Das korrekt gefaltete, funktionale GFP besitzt ein
chromogenes Zentrum, das bei Anregung im UV-Bereich (395 nm)
grünliches Licht emitiert (509 nm). Der Nachweis und die Stärke
der grünen Fluoreszenz sind ein Maß der Effizienz der Vektoren
und der Produktbildung in L-Form-Zellen hinsichtlich der
Induktion des Transkriptionsstarts (mRNA-Bildung), der Trans
lation (Proteinsynthese nach kodierender mRNA-Sequenz) sowie der
korrekten Faltung des Proteins.
Für eine induzierbare und gut regulierbare Proteinbildung wird
das GFP-Gen unter die Kontrolle der Promotoren lac-P/O (+lacI-
Repressor-Gen; Repressor-Inaktivierung durch Zugabe von 5 mM IPTG)
bzw. tetA-P/O (+tetR-Repressor-Gen, Repressor-Inaktivierung
durch Zugabe von 200 µg/ml anhydro-Tetracyclin [aTC]) gestellt.
Für eine konstitutive Produktbildung steht das GFP-Gen unter
Kontrolle der Promotor-Region des lacI-Repressor-Gens (P-lacI)
bzw. noch zusätzlich unter Kontrolle der Promotor-Region des β-
Lactamase-Gens (P-bla) als Tandem-Hybrid (P-lacI/P-bla).
Als Beispiel für die Regulation der Expressionsstärke über den
Gendosis-Effekt, d. h. einer Beeinflussung der Synthese des
rekombinanten Proteins durch unterschiedliche Anzahl (Kopien) der
Vektor-DNA mit dem kodierenden Gen pro Zelle, werden Vektoren für
die lac-P/O-kontrollierte GFP-Expression mit den Replikations
origins ColE1, pBR322 und p15A konstruiert.
Die Übertragung der Vektoren in die L-Form-Stämme erfolgte wie
im Ausführungsbeispiel 5 beschrieben. Alle Vektoren trugen das
Kanamycin-Resistenzgen als Selektionsmarker.
L-Form-Zellen von Proteus mirabilis LVIWEI mit den entsprechen
den Vektoren werden in einer Schüttelkultur (LFS-Medium mit 0,5%
Hefeextrakt; 18 Std. bei 37°C) ohne Induktoren kultiviert. Von
diesen Kulturen und dem plasmidfreien Kontrollstamm werden je 0,1 ml
Zellsuspension auf LFS-Medium-Agar-Platten (ohne bzw. mit
Induktor-Zusatz) ausgestrichen. Nach 24 Std. Wachstum bei 37°C
erfolgt die Anregung mit UV-Licht zur Emission des grünen
Fluoreszenz-Lichtes und die Fotographie mit einer CCD-Kamera.
Die auf den Agarplatten in Abb. 5 gewachsenen und induzier
ten Zellen von P. mirabilis LVIWEI enthalten Vektoren mit
folgenden Merkmale (Tabelle 1).
Die aus Abb. 5 zusammengefaßten Ergebnisse dokumentieren, daß
- - Zellen ohne GFP-Expressionsvektoren (Nr. 0) unter allen Bedingungen keine Fluoreszenz zeigen,
- - die drei Konstrukte mit dem lac-P/O (Nr. 1-3) nur nach Induktion mit 1-10 mM IPTG das GFP synthetisieren,
- - dabei mit Plasmiden, die in hoher Kopiezahl vorliegen (Nr. 3-6, mit ColE1/pUC ori), mehr GFP gebildet wird als mit solchen, die nur in wenigen Kopien in den Zellen vorhanden sind (Nr. 1, mit p15A ori),
- - auch mit dem tetA-P/O eine spezifische Genexpression möglich ist (Nr. 6) und
- - in den Zellen, die Vektoren mit dem GFP-Gen unter Kontrolle des konstitutiven lacI-P/O enthalten (Nr. 4), unter allen geteste ten Bedingungen eine GFP-Synthese erfolgt.
Diese Ergebnisse erlauben die Schlußfolgerung, daß die für die
üblichen E. coli-Wirtsstämme konstruierten und optimierten
Expressionsvektoren auch in den L-Form-Zellen von P. mirabilis
LVIWEI effektiv arbeiten.
Von P. mirabilis LVIWEI (pMK3c2GFP) mit konstitutiver GFP-
Expression (Nr. 4 in Tab. 1 und auf Agar-Platte in Abb. 5) werden
Schüttelkulturen in LFS-Medium mit und ohne Selektivantibiotikum
(50 µg/ml Kanamycin) wie unter Beispiel 5 beschrieben angelegt,
die jeweils wiederum nach 24 Std., d. h. nach ca. 4-5 Zell
generationen, in frisches Medium übertragen und erneut, insgesamt
über 12 Passagen, kultiviert werden. Nach jeder 3. Passage
erfolgen Verdünnungsreihen (10-3 bis 10-7) der Kulturen auf LFS-
Medium-Agar-Platten mit und ohne Selektivantibiotikum, und nach
3-tägigem Wachstum werden unter UV-Licht die fluoreszierenden
bzw. nicht fluoreszierenden Einzelkolonien ausgezählt (Abb. 6).
Der Verlauf des Anteils fluoreszierender Einzelkolonien, d. h. der
plasmidhaltigen Zellen in den Kulturen mit und ohne Selektions
druck, ergibt auch über lange Kultivierungsdauer (mit über 50
Generationen ohne Selektivantibiotikum) keine signifikanten
Unterschiede. Dies wird in Abb. 6 dolumentiert. Die grüne
Fluoreszenz aller plasmidhaltigen Einzelkolonien verdeutlicht
damit die strukturelle und funktionelle Stabilität der Vektoren.
Als Beispiel für die Produktivität des L-Form-Expressionssystems
wurde die GFP-Expression mit verschiedenen Vektoren in L-Form-
Zellen von P. mirabilis LVIWEI mit der Expression in N-Form-
Zellen vom E. coli Produktionsstamm RV308 verglichen. Beide
Zelltypen werden unter gleichen Bedingungen in Komplexmedium
kultiviert und die GFP-Expression induziert. Die Bestimmung der
Zellkonzentration der Kulturen (g Biotrockenmasse/l) erfolgte
durch Absorptionsmessung bei SSOnm. Die Zellen werden durch
Zentrifugation geerntet, mittels Ultraschall-Behandlung aufge
schlossen, die GFP-Aktivität (Fluoreszenz) am Fluoreszenz-
Photometer quantifiziert und die der Aktivität zugrunde liegende
Menge des synthetisierten GFP-Totalproteins über denaturierende
SDS-PAGE, Coomassie-Färbung und Gelauswertung und einer Eichkurve
quantifiziert. Die Menge an synthetisierten funktionalem GFP wird
auf die eingesetzte Biomasse der P. mirabilis L-Form-Zellen bzw.
der E. coli N-Form-Zellen bezogen (spezifische Aktivität).
Die in Tabelle 2 aufgeführten Werte an funktionalem GFP (mg GFP
/g Biotrockenmasse) zeigen die gleiche Effizienz der Expres
sionsvektoren (Beispiele: pMK31GFP (IPTG-Induktion), pMK7GFP
(aTC-Induktion) bzw. pMK3c2GFP (konstitutiv)) für die rekom
binante Proteinbildung in den weiterentwickelten L-Form-Stämmen
wie für bereits etablierte N-Form-E.-coli-Expressionssysteme und
-Produktionsstämme.
Das Beispiel beschreibt die Herstellung von rekombinanter
Staphylokinase in membrangebundener Form. Als L-Form-Zellen
wurden die Stämme E. coli LWF + WEI und P. mirabilis LVIWEI
verwendent. Staphylokinase ist ein medizinisch bedeutsamer
Plasminogenaktivator (15 kDa), der von L-Form-Zellen als
extrazelluläres, lösliches, funktionell aktives, rekombinantes
Genprodukt synthetisiert werden kann (Sieben, S., Dissertation
Universität Jena, 1998). Beim Translokationsprozess wird das
27 Aminosäuren lange Signalpeptid proteolytisch abgetrennt.
In dem ersten Schritt wird die DNA-Sequenz (Behnke, D. und
Gerlach, D., Mol. Gen. Genetics 1987, 210, 528-534) des reifen
Proteins (Aminosäuren 28-163) mittels PCR (Boehringer, Expand
High Fidelity PCR Kit) amplifiziert. Durch Auswahl von geeigneten
Primern wird das sak-Konstrukt modifiziert, um die anschließende
Fusion mit den Membrananker-DNA-Sequenzen über eine PstI-
Schnittstelle am 5'-Ende und die Integration in das Expressions
plasmid pF003-Kan über eine HindIII-Schnittstelle am 3'-Ende zu
ermöglichen (Tab. 1). Dieses sak-Fragment ist die Grundlage für
alle Fusionsproteine. Durch die Insertion der PstI-Schnittstelle
wird gleichzeitig in alle Konstrukte eine Spacersequenz von zwei
Aminosäuren zwischen Membrananker und Sak eingebaut.
Im zweiten Schritt erfolgt die Bereitstellung von Membrananker-
Sequenzen. Als solche Ankersequenzen werden die Helix I (Amino
säuren 1-51; LacYH1) und die Helices 1-3 (Aminosäuren 1-127;
LacYH1-3) der Laktose-Permease LacY aus E. coli verwendet. Andere
Ankersequenzen sind die Helix 1 (Aminosäuren 1-74; SecYH1) und
die Helices 1-3 (Aminosäuren 1-153, SecYH1-3) der Preprotein-
Translokase SecY aus E. coli sowie die Helix 1 (Aminosäuren 1-34;
CcmAH1) des Schwärmproteins CcmA von P. mirabilis zuzüglich eines
zusätzlichen Spacers von 5 Aminosäuren Länge. Die entsprechenden
genauen Sequenzen sind in Abb. 7 zusammengestellt. Die DNA
der Membrananker wird mittels PCR aus genomischer DNA von E. coli
DHSα und P. mirabilis VI isoliert (Quiagen Genomic DNA Handbook,
1997). Hierfür werden Primer (Tab. 3) benutzt, die die Integra
tion in das Expressionsplasmid pF003-Kan über eine am V-Ende
eingefügte NdeI-Schnittstelle und die Fusion mit dem sak-Fragment
über eine am 3'-Ende eingefügte PstI-Schnittstelle ermöglichen.
Im dritten Schritt wird das sak-Fragment in den Vektor pF003
einkloniert, amplifiziert und anschliessend im Expressionsvektor
mit den verschiedenen modifizierten Membranankerfragmenten
fusioniert (Tab. 4; Abb. 8). Die Membrananker-sak-Fusions-Gene
stehen unter der Kontrolle des tac Promotors und sind damit durch
IPTG (Isopropyl-β-D-Thiogalactopyranosid) induzierbar.
Mit den in Tabelle 4 beschriebenen Expressionsplasmiden der pF-
Serie erfolgt dann im Schritt 4 die Transformation in die L-Form-
Zellen von P. mirabilis LVIWEI und E. coli LWF + WEI. Tranformiert
wird mit der PEG-Methode (Gumpert et al., aao). Die Isolierung
der Transformanten wird auf BHI-Agarplatten mit Zusätzen von
Pferdeserum (8%), Hefeextrakt (0,5%) und Kanamycin (0-50 µg/ml)
durchgeführt. Einzelne Transformantenkolonien werden danach auf
BHI-Agarplatten mit den gleichen Zusätzen an Serum und Hefeex
trakt sowie Kanamycin (50 µg/ml) übertragen und 1-3 mal passa
giert, bis dichtes Wachstum als Kolonierasen erreicht ist. Die
Flüssigkeitskultur der Transformanten wird in der Weise erhalten,
daß ein Agarblöckchen mit reichlich Koloniewachstum in 30 ml BHI-
Medium mit Zusätzen von Hefeextrakt (0,5%) und Kanamycin (50 µg/ml)
eingebracht und unter Schütteln bebrütet (37°C) wird. Nach
2-4 Passagen unter den gleichen Wachstumsbedingungen werden so
Flüssigkeitskulturen erhalten, die zu Zellkonzentrationen von
1010/ml wachsen. Im Fall der Transformanten von E. coli LWF + WEI
sind die Zusätze von Kanamycin geringer (1-5 µg/ml).
Im 5. Schritt wird die Flüssigkeitskultur der Transformante zur
Synthese des Fusionsproteins angeregt und in die Fraktionen
Kulturmedium (Überstand), L-Form-Zellen, L-Form-Membranen und
Zytoplasma aufgetrennt. Dazu werden Transformanten, z. B. P.
mirabilis LVIWEI (pFCcmAH1-Sak) in Glaskölbchen (100 ml) oder
Fermenter (21 Nettovolumen) in BHI-Medium mit Zusätzen von Hefe
extrakt (0,5%) und Kanamycin (50 µg/ml) inkubiert (37°C). Nach
2-6 Std. erfolgte durch Zugabe von IPTG (3 mM) die Induktion
der Genexpression von den Fusionsproteinen. Aus den Kulturen
wurden nach 8, 24 und 48 Std. Proben entnommen. In ihnen erfolgt
durch Zentrifugation (6000 g, 10 min) eine Abtrennung der Zellen
als Pellet und des Kulturmediums als Überstand.
Die Zellen werden einmal in Saccharoselösung (0,4 M) in dest.
Wasser gewaschen und anschließend zur Trennung von Zytoplasma und
Membranen aufgeschlossen. Der Aufschluß der Zellen von P.
mirabilis LVIWEI erfolgt durch Ultraschallbehandlung mit einem
Branson Sonifier 240. Die Zellen werden dazu in TRIS/HCl Puffer
(0,05 M, pH 7,0) mit Zusatz von MgSO4 (0,1%) resuspendiert (OD
bei 600 nm um 10, Zellkonzentration um 1010/ml, 10 ml Probenmen
ge) und 1-3 min mit Energiestufe 3 beschallt, wobei sich das
Glasgefäß in einem Eisbad befindet. Durch Kontrolle von Proben
im Phasenkontrastmikroskop (Vergrößerung 2000 ×) wird der
Zeitpunkt ermittelt, zu dem die Zellen zerstört sind und nur noch
Membranvesikel vorliegen.
Im Falle der Transformantenkulturen von E. coli LWF + WEI erfolgt
der Zellaufschluß durch osmotische Lyse. Dabei werden die mit 0,4 M
Saccharose gewaschenen Zellen in TRIS/HCl Puffer (0,05 M, pH
7,0) mit Zusätzen von 0,1% MgSO4 und 30 µg/ml DNAse (Boehringer
Mannheim) resuspendiert (Zellkonzentration 107/ml) und bei
Zimmertemperatur stehengelassen. Durch fortlaufende mikroskopi
sche Kontrolle wird wiederum der Zeitpunkt der weitgehenden
Zellyse bestimmt. Mit den so erhaltenen Suspensionen erfolgt dann
die Trennung der Membranvesikel vom Zytoplasma durch Ultrazen
trifugation bei 80000 g in einer Optima XL80 Zentrifuge (Beck
mann).
Im 6. Schritt erfolgt der biochemische und funktionelle Nachweis
des Genproduktes in den 4 Fraktionen. Dazu werden 30 µl Probe im
Western blot (Ausubel, F. M. 1999; Current Protocols in Molecular
Biology) im SDS-Gel (13-15%) aufgetrennt und die Proteine nach
Transfer auf eine PVDF-Membran (Millipore) mit Staphylokinase
spezifischen primären Antikörpern und sekundären Antikörperm, die
an alkalische Phosphatase gekoppelt sind und somit eine Farb
reaktion bewirken können, sichtbar gemacht.
Der Nachweis der funktionellen Aktivität erfolgt mit dem
Milchagar-Plattentest. In Agarplatten (15 cm Durchmesser), die
mit aq 07999 00070 552 001000280000000200012000285910788800040 0002010011358 00004 07880ua dest. Agar (30 ml, 1,5%) mit Zusätzen von Magermilch
(10%) und Plasminogen (10-1 µg/ml; Boehringer Mannheim) gefüllt
sind, werden Löcher (9 mm Durchmesser) ausgestanzt, in die 50 µl
der Proben gegeben werden. Nach 2-18 Std. Inkubation (37°C)
erfolgt die Ausmessung der Aufklarzonen. Durch biologisch aktive
Staphylokinase wird das Plasminogen aktiviert, und das enstehende
Plasmin spaltet das Casein der Milch und führt zu Aufklarzonen
um das Stanzloch. Durch Vergleich mit Staphylokinase-Standards
kann so die biologische Aktivität der Staphylokinase quantitativ
bestimmt werden.
Im 7. Schritt wird die Lokalisation des Fusionsproteins an der
Außenseite der L-Form-Membran durch Trypsinverdau und durch
Gefrierbruch-Elektronenmikroskopie mit Immunogoldmarkierung am
Replikon untersucht. Zusätzlich wird die Membranständigkeit des
Fusionsproteins durch den Nachweis der Rekonstitution in
micellenbildenden Detergention wie Octylglycosid oder Triton X100
bewiesen.
In Abb. 7 sind die Aminosäure und Nukleotidsequenzen der
Membrananker und der Fusionsproteine dokumentiert. Mit der
Sequenz der maturen Staphylokinase, die den Aminosäuren 28-163
des kompletten Proteins entspricht (nichtmarkierte Aminosäure-
und Nukleotidsequenzbereiche), wurden N-terminal über eine
eingefügte PstI Schnittstelle (Sequenzbereiche fett, kursiv,
unterstrichen) und einem dementsprechenden kurzen Aminosäurelin
ker die folgenden membranspannenden Domänen fusioniert (Sequenz
bereiche doppelt unterstrichen): a) Helix 1 (Aminosäuren 1-51;
LacYH1) der Laktosepermease, b) Helices 1-3 (Aminosäuren 1-127;
LacYH1-3) der Laktose-Permease, c) Helix 1 (Aminosäuren 1-74;
SecYH1) der Preprotein-Translokase, d) Helices 1-3
(Aminosäuren 1-153; SecYH1-3) der Preprotein-Translokase und
e) Helix 1 (Aminosäuren 1-34; CcmAH1) des Schwärmproteins mit
einer zusätzlichen Spacersequenz von fünf Aminosäuren (Sequenzbe
reiche fett, kursiv).
In Abb. 8 ist beispielhaft das Expressionsplasmid pFLacYH1-3-Sak
zur Synthese von rekombinanter membrangebundener Staphylokinase
mit L-Form-Zellen von E. coli LWF + WEI dargestellt. Ptac: tac-
Promotor; lacYH1-3: Helices 1-3 der Laktose-Permease (As 1-127);
sak: Gen für Staphylokinase (As 28-163); Spacer: 2 As;
lacYH1-3-sak: Fusionsprotein; rrnBT: Transkriptionsterminator
des rrnB Operons; kann: Kanamycinresistenz-Kassette; ori:
Replikationsorigin von pBR322; lacIq: Lac-Repressor mit
modifiziertem Promotor.
Abb. 9 dokumentiert die Synthese der membrangebundenen Fusions
poteine LacYH1-Sak und LacYH1-3-Sak und erläutert schematisch das
Prinzip des Surface-Displays mit E. coli LWF + WEI. a: Western
blot-Analyse mit Sak-spezifischer Immunofärbung; lane 1,
Molekulargewichtstandard; lane 2, Sak-Standard; lane 3, Membran
fraktion von LacYH1-Sak exprimierenden Zellen; lane 4, Membran
fraktion von LacYh1-3-Sak exprimierenden Zellen. b: Prinzip der
Verankerung der Fusionsproteine im Phospholipidbilayer der
Membran; 5, Staphylokinaseanteil; 6, Laktose-Permeaseanteil
(transmembrane Helices im Phospholipid-Bilayer).
- 1. Mit den angewandten Verfahren können die Gensequenzen der integralen Membrananker-Domänen (Helix 1 und Helices 1-3) von der Laktose-Permease LacY, von der Preprotein-Translokase SecY aus E. coli und von dem Schwärmprotein CcmA (Helix 1) aus P. mirabilis (Abb. 7) so mit dem Staphylokinasegen fusioniert werden, daß sie sich in das Plasmid pF003-Kan integrieren lassen (Abb. 8).
- 2. Die neuartigen Membrananker-Staphylokinase-Genkonstrukte LacYH1-Sak, LacYH1-3-Sak, SecYH1-Sak, SecYH1-3-Sak und CcmAH1-Sak werden durch IPTG-Induktion kontrollierbar in den Stämmen E. coli LWF + WEI und P. mirabilis LVIWEI überexprimiert, ohne daß das Zellwachstum gehemmt wird und die Zellen geschädigt oder lysiert werden.
- 3. Die Genprodukte der Membrananker-Staphylokinase-Fusions proteine werden in solchen Mengen von den L-Form-Transformanten gebildet, daß sie im SDS-Gel und Western blot als spezifisch gefärbte Banden dargestellt werden. In Abb. 9a ist stellver tretend für alle Fusionsproteine die erfolgreiche Expression der Fusionsproteine LacYH1-Sak und LacYH1-3-Sak in E. coli LWF + WEI mittels Western blot-Analyse mit Sak-spezifischen Antikörpern dargestellt. Die Banden entsprechen den jeweiligen zu erwartenden Molekulargewichten (LacYH1-Sak = 20,8 kDa, LacYH1-3-Sak = 27,9 kDa). Ungefähr 5-50 mg/l Fusionsprodukt wurden gebildet. Abb. 9b veranschaulicht das Prinzip der Membrananker und der Fusions proteine. Die Expression der Fusionsproteine SecYH1-Sak (23,7 kDa) und SecYH1-3-Sak (32,1 kDa) konnte in E. coli LWF + WEI mit den gleichen Methoden nachgewiesen werden. SecYH1-3-Sak wird allerdings nur in geringen Mengen exprimiert. P. mirabilis LVIWEI ist weniger gut für die Expression von Fusionsproteinen mit heterologen Membranankern von E. coli geeignet. Die Expression des Fusionsprodukts CcmAH1-Sak in P. mirabilis LVIWEI verlief hingegen sehr erfolgreich. Die Menge membrangebundener Staphylo kinase lag im Bereich von 100 mg/l.
- 4. Die Genprodukte sind überwiegend oder ausschließlich in den Membranfraktionen lokalisiert. Nur geringe Mengen können im Zytoplasma oder im Mediumüberstand gefunden werden. Im Falle der Fusionsproteine mit einer Helix (H1) ist die synthetisierte Menge an Staphylokinase wesentlich höher (3-10 mal) als bei den Konstruktionen mit 3 Helices (H1-3). Sie bleibt fast vollständig an die L-Form-Membran gebunden. Die mit drei Helices fusionierte Staphylokinase ist ausschließlich in membrangebundener Form nachweisbar.
- 5. Die in den Membranfraktionen lokalisierte Staphylokinase ist funktionell aktiv. Mit dem Milchagar-Test wurde aktive Staphylo kinase nachgewiesen.
- 6. Die Staphylokinasemoleküle befinden sich auf der Außenseite der L-Form-Membran. Neben der positiven funktionellen Aktivität wurde dies durch den Verlust der Staphylokinase nach proteolyt ischem Abbau mit Trypsin, durch Rekonstitutionsexperimente in Triton X100 und Octylglycosid sowie durch Immunogoldfärbung und anschließender Elektronenmikroskopie nachgewiesen. Aus den mechanischen und chemischen Behandlungen der Membranen (Scher kräfte bei Kultivierung, Waschen mit TRIS/HCl-Puffer, Präparation und Waschungen der Membran) kann geschlossen werden, daß die Staphylokinase-Moleküle sehr fest an der L-Form-Membran gebunden bleiben.
Die Ergebnisse belegen die Entwicklung neuartiger Surface-
Display-Systeme, mit denen membrangebundene und Fusionsproteine
aus Membrananker-Peptiden und löslichen Proteinen kontrolliert
synthetisiert und in relativ großen Mengen in L-Form-Membranvesi
keln hergestellt werden können. Im Vergleich zu den bisherigen
bekannten bakteriellen Surface-Display-Systemen liegen die
Vorteile dieses Systems darin, daß L-Form-Membranen relativ
einfach in reiner Form gewinnbar sind, daß darin immunreaktive
Komponenten (z. B. LPS, Muramylpeptide, Fimbrien, Geißeln)
weitestgehend fehlen, daß extrazelluläre Proteasen fehlen, daß
für das Surface-Display nur die Translokation durch die Zytoplas
mamembran notwendig ist, daß relativ große Mengen des Fusions
proteins an der Außenseite der L-Form-Membran exponiert wird und
daß das Proteinprodukt als funktionell aktive Moleküle auf der
Membran gebunden bleiben.
Damit eröffnen sich mit dem L-Form-Surface-Display-System neue
Wege zur Untersuchung von Struktur-Funktions-Beziehungen und
Zell-Zell-Interaktionen sowie zur Entwicklung neuer und alterna
tiver Vaccinierungsstrategien und diagnostischer Testsysteme.
Claims (29)
1. Verfahren zur Gewinnung von modifizierten L-Form-Bakterien
stämmen, dadurch gekennzeichnet, daß
- a) man einen an ein komplexes Nährmedium adaptierten L- Form-Bakterienstamm alternierend bei unterschiedlichen Temperaturen im Temperaturbereich von 20 bis 40°C kultiviert, und
- b) bei ansteigender hydromechanischer Belastung der Zellen fermentiert.
2. Verfahren nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß der
in Schritt (a) und (b) eingesetzte L-Form-Bakterienstamm
eine stabile Protoplasten-Typ L-Form ist.
3. Verfahren nach Anspruch 1 oder 2, dadurch gekennzeichnet,
daß der L-Form-Bakterienstamm eine L-Form von Escherichia
coli, Proteus mirabilis, Bacillus subtilis, Bacillus
licheniformis, Nocardia asteroldes, Pseudomonas stutzeri,
Staphylococcus aureus, Streptococcus faecalis, Streptomyces
hygroscopicus oder Thermoactinomyces vulgaris ist.
4. Verfahren nach Anspruch 3, dadurch gekennzeichnet, daß der
L-Form-Bakterienstamm eine L-Formen von P. mirabilis LVI,
P. mirabilis L99, E. coli LWF+, E. coli LWF- oder Bac.
subtilis L170 ist.
5. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 4, dadurch gekenn
zeichnet, daß man die Schritte (a) und (b) in dieser Reihen
folge durchführt.
6. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 5, dadurch gekenn
zeichnet, daß man den Schritt (a) in der Weise durchführt,
daß man die Temperatur alternierend zwischen zwei Temperaturen
T1 und T2 variiert, wobei T1 im Verlauf des Schrittes
(a) gleich bleibt und T2 variiert wird.
7. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 6, dadurch gekenn
zeichnet, daß man den Schritt (b) in der Weise durchführt,
daß man die Rührgeschwindigkeit variiert mit der das
Fermentationsmedium gerührt wird.
8. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 7, dadurch gekenn
zeichnet, daß in den Schritten (a) und (b) das Nährmedium
aus Brain-heart-infusion-broth (BHIB), Todd-Hewitt-broth
(THEB), Tryptic-Soy-broth (TSOYB) und L-broth (LB) ausge
wählt ist.
9. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 8, dadurch gekenn
zeichnet, daß die Belüftungsrate von 0,2 bis 1 Volumen
Luft/Minute/Volumen Medium variiert wird.
10. Verfahren zur Gewinnung von modifizierten L-Form-Bakterien
stämmen, dadurch gekennzeichnet, daß man einen an ein
komplexes Nährmedium adaptierten L-Form-Bakterienstamm durch
Mutationen in den Genen recA, hsdR/S, relA, supE und/oder
durch Einführung von amber- und ochre-Mutanten Rekombina
tion, Modifikation und Restriktion und/oder durch Insertion
von Genen der Transkriptions- und Translationskontrolle, wie
lacJq und lacUV-T7, in das Chromosom modifiziert.
11. L-Form-Bakterienstamm, erhältlich durch ein Verfahren gemäß
den Ansprüchen 1 bis 10.
12. L-Form-Bakterienstamm nach Anspruch 11, dadurch gekennzeich
net, daß er aus der aus P. mirabilis LVIWEI (Hinterlegungs
nummer DSM 13363); P. mirabilis L99WEI (Hinterlegungsnummer
DSM 13364), E. coli LWF + WEI (Hinterlegungsnummer DSM 13362)
und B. subtilis L170WEI (Hinterlegungsnummer DSM 13361)
bestehenden Gruppe ausgewählt ist.
13. Verfahren zur Herstellung von Genprodukten, dadurch gekenn
zeichnet, daß man einen L-Form-Bakterienstamm gemäß einem
der Ansprüche 11 bis 12 mit einer für ein Genprodukt kodie
renden Nukleotidsequenz transformiert, man dann den trans
formierten L-Form-Bakterienstamm kultiviert und zur Ex
pression des Genprodukts anregt und man schließlich das
Genprodukt isoliert.
14. Verfahren nach Anspruch 13, dadurch gekennzeichnet, daß man
zur Transformation ein Vektorsystem verwendet, das die für
das Genprodukt kodierende Nukleotidsequenzen verknüpft mit
Regulationssequenzen enthält.
15. Verfahren nach Anspruch 13 oder 14, dadurch gekennzeichnet,
daß das Genprodukt ein membrangebundenes Protein ist.
16. Verfahren nach Anspruch 15, dadurch gekennzeichnet, daß das
Produktgen mit einer zusätzlichen Gensequenz verknüpft ist,
die für einen Signalpeptid, eine Sequenz einer transmem
branen Region von Membranproteinen oder eine hydrophoben
Aminosäuresequenz kodiert.
17. Verfahren nach Anspruch 16, dadurch gekennzeichnet, daß die
zusätzliche Gensequenz für ein Signalpeptid, das nicht durch
prokaryotische Signalpeptidasen vom Produktprotein abgespal
ten wird, für eine Transmembranhelix von integralen Membran
proteinen, für eine homologe oder heterologe transmembrane
Region prokaryotischer Membranproteine, für das eukaryo
tische Signalpeptid des SERP-Proteins oder eine hydrophobe
Aminosäuresequenz mit 8 bis 150 Aminosäuren kodiert.
18. Verfahren nach einem der Ansprüche 13 bis 17, dadurch ge
kennzeichnet, daß das Genprodukt ein als Arzneimittel oder
Diagnostikum verwendbares Protein, eine Immundeterminante,
ein Enzyminhibitor, ein Enzymaktivator, ein Rezeptor, ein
Precursor-Protein oder ein Enzym oder ein Protein der
Signalübertragung ist.
19. Verfahren zur Herstellung von an Zelloberflächen gebundenem
Protein, dadurch gekennzeichnet, daß man einen L-Form-
Bakterienstamm mit einer Nukleotidsequenz transformiert, die
für ein Genprodukt und ein damit verbundenes Signalpeptid,
eine damit verbundene Sequenz einer transmembrane Region von
Membranproteinen oder eine damit verbundene hydrophobe
Aminosäuresequenz kodiert, man dann den transformierten L-
Form-Bakterienstamm kultiviert und zur Expression des
Genprodukts anregt und man schließlich das Genprodukt in an
die Zellen des L-Form-Stamms gebundener Form isoliert.
20. Verfahren zur Herstellung von outer-membrane-protein (Omp)
von Gram-negativen Bakterien, dadurch gekennzeichnet, daß
man einen L-Form-Bakterienstamm mit einer Nukleotidsequenz
transformiert, die für ein Omp und ein damit verbundenes
Signalpeptid, eine damit verbundene Sequenz einer transmem
brane Region von Membranproteinen oder eine damit verbundene
hydrophobe Aminosäuresequenz kodiert, man dann den transfor
mierten L-Form-Bakterienstamm kultiviert und zur Expression
des Genprodukts anregt und man schließlich das Genprodukt
isoliert.
21. Verfahren nach Anspruch 20, dadurch gekennzeichnet, daß das
Omp ein Omp mit β-Faltblattstruktur ist.
22. Verfahren nach Anspruch 20 oder 21, dadurch gekennzeichnet,
daß das Signalpeptid ein Signalpeptid zur Translokation ist.
23. Verfahren nach einem der Ansprüche 18 bis 19, dadurch
gekennzeichnet, daß das Genprodukt eine antigenen Determi
nanten von pathogenen Organismen, ein single chain Antikör
per oder Antikörperfragment, ein heterologes Enzym, ein
Polyhistidyl Tag oder eine Peptidbibliothek ist.
24. L-Form-Bakterienstamm, dadurch gekennzeichnet, daß er
rekombinante Proteine aufweist, die über ein Signalpeptid,
eine Sequenz einer transmembranen Region von Membranprotei
nen oder eine hyrophobe Aminosäuresequenz an der Zytoplasma
membran der L-Form-Zellen verankert sind.
25. L-Form-Bakterienstamm nach Anspruch 24, dadurch gekenn
zeichnet, daß das rekombinante Protein eine antigene
Determinante von pathogenen Organismen, ein single chain
Antikörper oder Antikörperfragment, ein heterologes Enzym,
ein Polyhistidyl Tag oder eine Peptidbibliothek ist.
26. L-Form-Bakterienstamm, dadurch gekennzeichnet, daß er
rekombinante Proteine aufweist, die Omps mit β-Faltblatt
struktur sind.
27. Impfstoff enthaltend einen L-Form-Bakterienstamm gemäß einem
der Ansprüche 24 bis 25.
28. Verwendung eines L-Form-Bakterienstamms nach einem der
Ansprüche 24 bis 26 zur Expression von Proteinen, als Impf
stoff, zur Herstellung eines Mittels für die Diagnostik und
Therapie, als Biokatalysator oder für Interaktionsscree
nings.
29. Verwendung eines L-Form-Bakterienstamms nach einem der An
sprüchen 10 bis 11 zur Expression von Proteinen.
Priority Applications (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE10011358A DE10011358A1 (de) | 2000-03-10 | 2000-03-12 | Neuartige L-Form-Bakterienstämme, Verfahren zu deren Herstellung sowie deren Verwendung zur Herstellung von Genprodukten |
AU52174/01A AU5217401A (en) | 2000-03-10 | 2001-03-08 | Novel l-form bacterial strains, method for producing same and the use thereof for producing gene products |
PCT/EP2001/002630 WO2001066776A2 (de) | 2000-03-10 | 2001-03-08 | Neuartige l-form-bakterienstämme, verfahren zu deren herstellung sowie deren verwendung zur herstellung von genprodukten |
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DE10011617 | 2000-03-10 | ||
DE10011358A DE10011358A1 (de) | 2000-03-10 | 2000-03-12 | Neuartige L-Form-Bakterienstämme, Verfahren zu deren Herstellung sowie deren Verwendung zur Herstellung von Genprodukten |
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DE10011358A Ceased DE10011358A1 (de) | 2000-03-10 | 2000-03-12 | Neuartige L-Form-Bakterienstämme, Verfahren zu deren Herstellung sowie deren Verwendung zur Herstellung von Genprodukten |
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DE (1) | DE10011358A1 (de) |
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DE102004013988A1 (de) * | 2004-03-19 | 2005-10-13 | Henkel Kgaa | Der Faktor RecA aus Bacillus licheniformis und recA-inaktivierte Sicherheitsstämme für die biotechnologische Produktion |
CN113688010A (zh) * | 2021-08-26 | 2021-11-23 | 浙江九州云信息科技有限公司 | 一种基于注解的k8s与harbor项目一致性控制器 |
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2000
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