CZ302878B6 - Proteinová vakcína - Google Patents
Proteinová vakcína Download PDFInfo
- Publication number
- CZ302878B6 CZ302878B6 CZ20001091A CZ20001091A CZ302878B6 CZ 302878 B6 CZ302878 B6 CZ 302878B6 CZ 20001091 A CZ20001091 A CZ 20001091A CZ 20001091 A CZ20001091 A CZ 20001091A CZ 302878 B6 CZ302878 B6 CZ 302878B6
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- protein
- tat
- nef
- glu
- amino acids
- Prior art date
Links
- 229940023143 protein vaccine Drugs 0.000 title claims abstract description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 91
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 82
- 101710149951 Protein Tat Proteins 0.000 claims abstract description 80
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 69
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 claims abstract description 34
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 31
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 claims abstract description 27
- 238000012217 deletion Methods 0.000 claims abstract description 26
- 230000037430 deletion Effects 0.000 claims abstract description 26
- 101710192141 Protein Nef Proteins 0.000 claims abstract description 24
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims abstract description 22
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 claims abstract description 15
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 claims abstract description 13
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 claims abstract description 13
- 108010070875 Human Immunodeficiency Virus tat Gene Products Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 108010084873 Human Immunodeficiency Virus nef Gene Products Proteins 0.000 claims abstract 5
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 claims description 27
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims description 25
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims description 23
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 19
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 15
- 241000235058 Komagataella pastoris Species 0.000 claims description 13
- GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N α-tocopherol Chemical compound OC1=C(C)C(C)=C2O[C@@](CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-IEOSBIPESA-N 0.000 claims description 9
- GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N d-alpha-tocopherol Natural products OC1=C(C)C(C)=C2OC(CCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C)(C)CCC2=C1C GVJHHUAWPYXKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 229940035032 monophosphoryl lipid a Drugs 0.000 claims description 7
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 7
- 102100037840 Dehydrogenase/reductase SDR family member 2, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 6
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 6
- 101710188053 Protein D Proteins 0.000 claims description 6
- 101710132893 Resolvase Proteins 0.000 claims description 6
- 239000011732 tocopherol Substances 0.000 claims description 6
- 229930003799 tocopherol Natural products 0.000 claims description 6
- 235000010384 tocopherol Nutrition 0.000 claims description 6
- 229960001295 tocopherol Drugs 0.000 claims description 6
- YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N (6E,10E,14E,18E)-2,6,10,15,19,23-hexamethyltetracosa-2,6,10,14,18,22-hexaene Chemical compound CC(C)=CCCC(C)=CCCC(C)=CCCC=C(C)CCC=C(C)CCC=C(C)C YYGNTYWPHWGJRM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N Tetramethylsqualene Natural products CC(=C)C(C)CCC(=C)C(C)CCC(C)=CCCC=C(C)CCC(C)C(=C)CCC(C)C(C)=C BHEOSNUKNHRBNM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N dodecahydrosqualene Natural products CC(C)CCCC(C)CCCC(C)CCCCC(C)CCCC(C)CCCC(C)C PRAKJMSDJKAYCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229940031439 squalene Drugs 0.000 claims description 5
- TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N squalene Natural products CC(=CCCC(=CCCC(=CCCC=C(/C)CCC=C(/C)CC=C(C)C)C)C)C TUHBEKDERLKLEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 241000606768 Haemophilus influenzae Species 0.000 claims description 4
- 239000007764 o/w emulsion Substances 0.000 claims description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 4
- 239000001397 quillaja saponaria molina bark Substances 0.000 claims description 4
- 229930182490 saponin Natural products 0.000 claims description 4
- 150000007949 saponins Chemical class 0.000 claims description 4
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 3
- 150000004676 glycans Chemical class 0.000 claims description 2
- -1 polyoxyethylene Polymers 0.000 claims description 2
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 claims description 2
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 claims description 2
- 208000037798 influenza B Diseases 0.000 claims 2
- ZORQXIQZAOLNGE-UHFFFAOYSA-N 1,1-difluorocyclohexane Chemical compound FC1(F)CCCCC1 ZORQXIQZAOLNGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 claims 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims 1
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims 1
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims 1
- 229940035049 sorbitan monooleate Drugs 0.000 claims 1
- 235000011069 sorbitan monooleate Nutrition 0.000 claims 1
- 239000001593 sorbitan monooleate Substances 0.000 claims 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 abstract description 19
- 238000007792 addition Methods 0.000 abstract description 14
- 239000000203 mixture Substances 0.000 abstract description 13
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 abstract 6
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 61
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 57
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 38
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 25
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 25
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 21
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 20
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 20
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 18
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 18
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 18
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 18
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 14
- 235000014304 histidine Nutrition 0.000 description 14
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 10
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 10
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 9
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 9
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 9
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 9
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 8
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 8
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 8
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 8
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 8
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 8
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N Glu-Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 7
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 7
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 7
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 7
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 7
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 7
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 7
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 7
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 7
- 108700004027 tat Genes Proteins 0.000 description 7
- 101150098170 tat gene Proteins 0.000 description 7
- XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N Asn-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XEGZSHSPQNDNRH-JRQIVUDYSA-N 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 6
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 6
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 6
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 6
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 6
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 6
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 6
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 6
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 6
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 6
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 6
- 108010015666 tryptophyl-leucyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- IGXNPQWXIRIGBF-KEOOTSPTSA-N (2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoyl]amino]-3-(1h-imidazol-5-yl)propanoic acid Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IGXNPQWXIRIGBF-KEOOTSPTSA-N 0.000 description 5
- KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N Ala-Asp-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N Ala-Lys-Lys Natural products NCCCCC(NC(=O)C(N)C)C(=O)NC(CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N Ala-Phe-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N HYIDEIQUCBKIPL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 5
- QAODJPUKWNNNRP-DCAQKATOSA-N Arg-Glu-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O QAODJPUKWNNNRP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 5
- HOBNTSHITVVNBN-ZPFDUUQYSA-N Asp-Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N HOBNTSHITVVNBN-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 5
- CGYDXNKRIMJMLV-GUBZILKMSA-N Glu-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CGYDXNKRIMJMLV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- QITBQGJOXQYMOA-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN QITBQGJOXQYMOA-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 5
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 5
- IHRFZLQEQVHXFA-RHYQMDGZSA-N Met-Thr-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IHRFZLQEQVHXFA-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 5
- 108010003201 RGH 0205 Proteins 0.000 description 5
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 5
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 5
- ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N Ser-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ZIFYDQAFEMIZII-GUBZILKMSA-N 0.000 description 5
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 5
- 108010003700 lysyl aspartic acid Proteins 0.000 description 5
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 5
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 description 5
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 description 5
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- OVVUNXXROOFSIM-SDDRHHMPSA-N Arg-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O OVVUNXXROOFSIM-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 4
- NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N Arg-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NKBQZKVMKJJDLX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- FKQITMVNILRUCQ-IHRRRGAJSA-N Arg-Phe-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FKQITMVNILRUCQ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 4
- RAUPFUCUDBQYHE-AVGNSLFASA-N Asn-Phe-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RAUPFUCUDBQYHE-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- YNCHFVRXEQFPBY-BQBZGAKWSA-N Asp-Gly-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YNCHFVRXEQFPBY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- JNNVNVRBYUJYGS-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JNNVNVRBYUJYGS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- MYLZFUMPZCPJCJ-NHCYSSNCSA-N Asp-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O MYLZFUMPZCPJCJ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 4
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 4
- MFMDKTLJCUBQIC-MXAVVETBSA-N Cys-Phe-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O MFMDKTLJCUBQIC-MXAVVETBSA-N 0.000 description 4
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 4
- WDTAKCUOIKHCTB-NKIYYHGXSA-N Glu-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O WDTAKCUOIKHCTB-NKIYYHGXSA-N 0.000 description 4
- PMSDOVISAARGAV-FHWLQOOXSA-N Glu-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 PMSDOVISAARGAV-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 4
- OJNZVYSGVYLQIN-BQBZGAKWSA-N Gly-Met-Asp Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O OJNZVYSGVYLQIN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- RZEDHGORCKRINR-STQMWFEESA-N Gly-Trp-Cys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)CN RZEDHGORCKRINR-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N Gly-Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 OCRQUYDOYKCOQG-IRXDYDNUSA-N 0.000 description 4
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N L-Phenylalanyl-L-lysin Natural products NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 4
- DZQMXBALGUHGJT-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DZQMXBALGUHGJT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N Leu-Glu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O NEEOBPIXKWSBRF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N Leu-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 KYIIALJHAOIAHF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 4
- HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N Leu-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HVHRPWQEQHIQJF-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- ADJWHHZETYAAAX-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N ADJWHHZETYAAAX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- ODRREERHVHMIPT-OEAJRASXSA-N Leu-Thr-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ODRREERHVHMIPT-OEAJRASXSA-N 0.000 description 4
- WLCYCADOWRMSAJ-CIUDSAMLSA-N Lys-Asn-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O WLCYCADOWRMSAJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 4
- JQEBITVYKUCBMC-SRVKXCTJSA-N Met-Arg-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O JQEBITVYKUCBMC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 4
- IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- FXBKQTOGURNXSL-HJGDQZAQSA-N Met-Thr-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O FXBKQTOGURNXSL-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 4
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 4
- AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 4
- LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WLJPJRGQRNCIQS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 4
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000024932 T cell mediated immunity Effects 0.000 description 4
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N Thr-His Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N 0.000 description 4
- OWSRIUBVJOQHNY-IHPCNDPISA-N Trp-Lys-His Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)O)N OWSRIUBVJOQHNY-IHPCNDPISA-N 0.000 description 4
- FMXFHNSFABRVFZ-BZSNNMDCSA-N Tyr-Lys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FMXFHNSFABRVFZ-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 4
- NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N Val-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)C(C)C NHXZRXLFOBFMDM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 4
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 description 4
- 108010054813 diprotin B Proteins 0.000 description 4
- 239000006167 equilibration buffer Substances 0.000 description 4
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 4
- 108010020688 glycylhistidine Proteins 0.000 description 4
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 4
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 4
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 4
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 4
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 4
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 4
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 4
- FGDZQCVHDSGLHJ-UHFFFAOYSA-M rubidium chloride Chemical compound [Cl-].[Rb+] FGDZQCVHDSGLHJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 4
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 3
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N Ala-Ala-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- SVBXIUDNTRTKHE-CIUDSAMLSA-N Ala-Arg-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SVBXIUDNTRTKHE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- XQGIRPGAVLFKBJ-CIUDSAMLSA-N Ala-Asn-Lys Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O XQGIRPGAVLFKBJ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- UQJUGHFKNKGHFQ-VZFHVOOUSA-N Ala-Cys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UQJUGHFKNKGHFQ-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 3
- ZPXCNXMJEZKRLU-LSJOCFKGSA-N Ala-His-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CN=CN1 ZPXCNXMJEZKRLU-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 3
- LXAARTARZJJCMB-CIQUZCHMSA-N Ala-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LXAARTARZJJCMB-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 3
- XRUJOVRWNMBAAA-NHCYSSNCSA-N Ala-Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)C)CC1=CC=CC=C1 XRUJOVRWNMBAAA-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- JJIBHAOBNIFUEL-SRVKXCTJSA-N Arg-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JJIBHAOBNIFUEL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- YNDLOUMBVDVALC-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N YNDLOUMBVDVALC-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- CZIXHXIJJZLYRJ-SRVKXCTJSA-N Asn-Cys-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 CZIXHXIJJZLYRJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N Asn-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O AMGQTNHANMRPOE-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 3
- DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N Asp-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DWOGMPWRQQWPPF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N Asp-Leu-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O UMHUHHJMEXNSIV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- WNGZKSVJFDZICU-XIRDDKMYSA-N Asp-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N WNGZKSVJFDZICU-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 3
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- ZARXTZFGQZBYFO-JQWIXIFHSA-N Asp-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)N)C(O)=O)=CNC2=C1 ZARXTZFGQZBYFO-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 3
- OJQJUQUBJGTCRY-WFBYXXMGSA-N Cys-Ala-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N OJQJUQUBJGTCRY-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 3
- OETOANMAHTWESF-KKUMJFAQSA-N Cys-Phe-His Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N OETOANMAHTWESF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- JIVJQYNNAYFXDG-LKXGYXEUSA-N Cys-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O JIVJQYNNAYFXDG-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 3
- WTXCNOPZMQRTNN-BWBBJGPYSA-N Cys-Thr-Ser Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O WTXCNOPZMQRTNN-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 3
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 3
- CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CGOHAEBMDSEKFB-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- OCJRHJZKGGSPRW-IUCAKERBSA-N Glu-Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O OCJRHJZKGGSPRW-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- STOOMQFEJUVAKR-KKUMJFAQSA-N His-His-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CNC=N1 STOOMQFEJUVAKR-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 3
- SVVULKPWDBIPCO-BZSNNMDCSA-N His-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SVVULKPWDBIPCO-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 3
- KEKTTYCXKGBAAL-VGDYDELISA-N Ile-His-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N KEKTTYCXKGBAAL-VGDYDELISA-N 0.000 description 3
- IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N L-Leucyl-L-Arginyl-L-Proline Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CCCN=C(N)N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O IBMVEYRWAWIOTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WQWSMEOYXJTFRU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- FEHQLKKBVJHSEC-SZMVWBNQSA-N Leu-Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 FEHQLKKBVJHSEC-SZMVWBNQSA-N 0.000 description 3
- CCQLQKZTXZBXTN-NHCYSSNCSA-N Leu-Gly-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O CCQLQKZTXZBXTN-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 3
- JFSGIJSCJFQGSZ-MXAVVETBSA-N Leu-Ile-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N JFSGIJSCJFQGSZ-MXAVVETBSA-N 0.000 description 3
- KCXUCYYZNZFGLL-SRVKXCTJSA-N Lys-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KCXUCYYZNZFGLL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 3
- WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N Lys-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 3
- VLMNBMFYRMGEMB-QWRGUYRKSA-N Lys-His-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CNC=N1 VLMNBMFYRMGEMB-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- PLOUVAYOMTYJRG-JXUBOQSCSA-N Lys-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O PLOUVAYOMTYJRG-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 3
- NSMXRFMGZYTFEX-KJEVXHAQSA-N Met-Thr-Tyr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)N)O NSMXRFMGZYTFEX-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 3
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N N-L-cysteinyl-L-phenylalanine Natural products SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XZFYRXDAULDNFX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N Ser-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O UGJRQLURDVGULT-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 3
- FHXGMDRKJHKLKW-QWRGUYRKSA-N Ser-Tyr-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FHXGMDRKJHKLKW-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- 101710172711 Structural protein Proteins 0.000 description 3
- SGAOHNPSEPVAFP-ZDLURKLDSA-N Thr-Ser-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O SGAOHNPSEPVAFP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 3
- WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N Val-Glu-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N WDIGUPHXPBMODF-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 3
- VHIZXDZMTDVFGX-DCAQKATOSA-N Val-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](C(C)C)N VHIZXDZMTDVFGX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 3
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 3
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 3
- 229960000074 biopharmaceutical Drugs 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 3
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 3
- 229930195729 fatty acid Natural products 0.000 description 3
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 3
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 3
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 3
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 108010076756 leucyl-alanyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 3
- 108700004028 nef Genes Proteins 0.000 description 3
- 101150023385 nef gene Proteins 0.000 description 3
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 3
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 3
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 2
- VJVQKGYHIZPSNS-FXQIFTODSA-N Ala-Ser-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N VJVQKGYHIZPSNS-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- XQNRANMFRPCFFW-GCJQMDKQSA-N Ala-Thr-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O XQNRANMFRPCFFW-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- YXXPVUOMPSZURS-ZLIFDBKOSA-N Ala-Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N)=CNC2=C1 YXXPVUOMPSZURS-ZLIFDBKOSA-N 0.000 description 2
- BVLPIIBTWIYOML-ZKWXMUAHSA-N Ala-Val-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O BVLPIIBTWIYOML-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- 108010025188 Alcohol oxidase Proteins 0.000 description 2
- OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N Arg-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O OTCJMMRQBVDQRK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N Arg-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OTZMRMHZCMZOJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- MJINRRBEMOLJAK-DCAQKATOSA-N Arg-Lys-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N MJINRRBEMOLJAK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- QCTOLCVIGRLMQS-HRCADAONSA-N Arg-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O QCTOLCVIGRLMQS-HRCADAONSA-N 0.000 description 2
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 2
- NYGILGUOUOXGMJ-YUMQZZPRSA-N Asn-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O NYGILGUOUOXGMJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- QDXQWFBLUVTOFL-FXQIFTODSA-N Asn-Met-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCSC)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N QDXQWFBLUVTOFL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N Asp-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O QCVXMEHGFUMKCO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- NWAHPBGBDIFUFD-KKUMJFAQSA-N Asp-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O NWAHPBGBDIFUFD-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- 102100021277 Beta-secretase 2 Human genes 0.000 description 2
- 101710150190 Beta-secretase 2 Proteins 0.000 description 2
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- YNJBLTDKTMKEET-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YNJBLTDKTMKEET-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- JIZRUFJGHPIYPS-SRVKXCTJSA-N Cys-Tyr-Cys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O JIZRUFJGHPIYPS-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 2
- KEBACWCLVOXFNC-DCAQKATOSA-N Glu-Arg-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O KEBACWCLVOXFNC-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- VAZZOGXDUQSVQF-NUMRIWBASA-N Glu-Asn-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O VAZZOGXDUQSVQF-NUMRIWBASA-N 0.000 description 2
- MXJYXYDREQWUMS-XKBZYTNZSA-N Glu-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MXJYXYDREQWUMS-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN PYTZFYUXZZHOAD-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- LJPIRKICOISLKN-WHFBIAKZSA-N Gly-Ala-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O LJPIRKICOISLKN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- CQIIXEHDSZUSAG-QWRGUYRKSA-N Gly-His-His Chemical compound C([C@H](NC(=O)CN)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 CQIIXEHDSZUSAG-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N Gly-Leu-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O ULZCYBYDTUMHNF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 2
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N Gly-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)CN)C(=O)O IEGFSKKANYKBDU-QWHCGFSZSA-N 0.000 description 2
- AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 2
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 2
- RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N Gly-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=C(O)C=C1 RIYIFUFFFBIOEU-KBPBESRZSA-N 0.000 description 2
- GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N Gly-Val-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GJHWILMUOANXTG-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 2
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N Glycyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 2
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MWAJSVTZZOUOBU-IHRRRGAJSA-N His-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MWAJSVTZZOUOBU-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- YJBMLTVVVRJNOK-SRVKXCTJSA-N His-Asp-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N YJBMLTVVVRJNOK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- WGHJXSONOOTTCZ-JYJNAYRXSA-N His-Glu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O WGHJXSONOOTTCZ-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- QAMFAYSMNZBNCA-UWVGGRQHSA-N His-Gly-Met Chemical compound CSCC[C@H](NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)Cc1cnc[nH]1)C(O)=O QAMFAYSMNZBNCA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N His-Ser-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 VIJMRAIWYWRXSR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- WRPDZHJNLYNFFT-GEVIPFJHSA-N His-Thr Chemical compound C[C@@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O WRPDZHJNLYNFFT-GEVIPFJHSA-N 0.000 description 2
- KFQDSSNYWKZFOO-LSJOCFKGSA-N His-Val-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KFQDSSNYWKZFOO-LSJOCFKGSA-N 0.000 description 2
- UQXADIGYEYBJEI-DJFWLOJKSA-N Ile-His-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N UQXADIGYEYBJEI-DJFWLOJKSA-N 0.000 description 2
- WLRJHVNFGAOYPS-HJPIBITLSA-N Ile-Ser-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N WLRJHVNFGAOYPS-HJPIBITLSA-N 0.000 description 2
- JSLIXOUMAOUGBN-JUKXBJQTSA-N Ile-Tyr-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N JSLIXOUMAOUGBN-JUKXBJQTSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N Lys-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FZIJIFCXUCZHOL-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- CLBGMWIYPYAZPR-AVGNSLFASA-N Lys-Arg-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O CLBGMWIYPYAZPR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N Lys-Gly-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O ISHNZELVUVPCHY-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 2
- ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N Lys-Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N ZJWIXBZTAAJERF-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 2
- AHFOKDZWPPGJAZ-SRVKXCTJSA-N Lys-Lys-Cys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N AHFOKDZWPPGJAZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- GVKINWYYLOLEFQ-XIRDDKMYSA-N Lys-Trp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GVKINWYYLOLEFQ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 2
- LMKSBGIUPVRHEH-FXQIFTODSA-N Met-Ala-Asn Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LMKSBGIUPVRHEH-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-valine Natural products CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N Phe-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O YKUGPVXSDOOANW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- RMKGXGPQIPLTFC-KKUMJFAQSA-N Phe-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RMKGXGPQIPLTFC-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 2
- DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N Pro-Gly-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DXTOOBDIIAJZBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- XQPHBAKJJJZOBX-SRVKXCTJSA-N Pro-Lys-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XQPHBAKJJJZOBX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N Pro-Thr-Ser Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RMJZWERKFFNNNS-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N Ser-Arg-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O QEDMOZUJTGEIBF-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- HQTKVSCNCDLXSX-BQBZGAKWSA-N Ser-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O HQTKVSCNCDLXSX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- IXCHOHLPHNGFTJ-YUMQZZPRSA-N Ser-Gly-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CO)N IXCHOHLPHNGFTJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N Ser-Gly-Tyr Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 OQPNSDWGAMFJNU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- IUXGJEIKJBYKOO-SRVKXCTJSA-N Ser-Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N IUXGJEIKJBYKOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FPCGZYMRFFIYIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N Thr-Ala-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O IGROJMCBGRFRGI-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 2
- SWIKDOUVROTZCW-GCJQMDKQSA-N Thr-Asn-Ala Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)O)N)O SWIKDOUVROTZCW-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 2
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 2
- KRDSCBLRHORMRK-JXUBOQSCSA-N Thr-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KRDSCBLRHORMRK-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 2
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- AHERARIZBPOMNU-KATARQTJSA-N Thr-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O AHERARIZBPOMNU-KATARQTJSA-N 0.000 description 2
- IKUMWSDCGQVGHC-UMPQAUOISA-N Trp-Pro-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)N)O IKUMWSDCGQVGHC-UMPQAUOISA-N 0.000 description 2
- KSCVLGXNQXKUAR-JYJNAYRXSA-N Tyr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KSCVLGXNQXKUAR-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 2
- JAGGEZACYAAMIL-CQDKDKBSSA-N Tyr-Lys-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N JAGGEZACYAAMIL-CQDKDKBSSA-N 0.000 description 2
- RUCNAYOMFXRIKJ-DCAQKATOSA-N Val-Ala-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN RUCNAYOMFXRIKJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- WPSXZFTVLIAPCN-WDSKDSINSA-N Val-Cys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O WPSXZFTVLIAPCN-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- RKIGNDAHUOOIMJ-BQFCYCMXSA-N Val-Glu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 RKIGNDAHUOOIMJ-BQFCYCMXSA-N 0.000 description 2
- CELJCNRXKZPTCX-XPUUQOCRSA-N Val-Gly-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CELJCNRXKZPTCX-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N Val-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC([O-])=O AEFJNECXZCODJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N alumane Chemical class [AlH3] AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010072041 arginyl-glycyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 2
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N cholesterol Chemical compound C1C=C2C[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H]2[C@@H]1[C@@H]1CC[C@H]([C@H](C)CCCC(C)C)[C@@]1(C)CC2 HVYWMOMLDIMFJA-DPAQBDIFSA-N 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010004073 cysteinylcysteine Proteins 0.000 description 2
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 2
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 2
- 238000006872 enzymatic polymerization reaction Methods 0.000 description 2
- 238000001641 gel filtration chromatography Methods 0.000 description 2
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 229940047650 haemophilus influenzae Drugs 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000000155 isotopic effect Effects 0.000 description 2
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 2
- 108010025153 lysyl-alanyl-alanine Proteins 0.000 description 2
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 2
- ATHGHQPFGPMSJY-UHFFFAOYSA-N spermidine Chemical compound NCCCCNCCCN ATHGHQPFGPMSJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WWJZWCUNLNYYAU-UHFFFAOYSA-N temephos Chemical compound C1=CC(OP(=S)(OC)OC)=CC=C1SC1=CC=C(OP(=S)(OC)OC)C=C1 WWJZWCUNLNYYAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 229960000984 tocofersolan Drugs 0.000 description 2
- 229950003937 tolonium Drugs 0.000 description 2
- HNONEKILPDHFOL-UHFFFAOYSA-M tolonium chloride Chemical compound [Cl-].C1=C(C)C(N)=CC2=[S+]C3=CC(N(C)C)=CC=C3N=C21 HNONEKILPDHFOL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 2
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 2
- BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N (2s)-1-[2-[[(2s)-pyrrolidine-2-carbonyl]amino]acetyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@H]1NCCC1 BRPMXFSTKXXNHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- TWJNQYPJQDRXPH-UHFFFAOYSA-N 2-cyanobenzohydrazide Chemical compound NNC(=O)C1=CC=CC=C1C#N TWJNQYPJQDRXPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940006193 2-mercaptoethanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- 101150061183 AOX1 gene Proteins 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- UWQJHXKARZWDIJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Cys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O UWQJHXKARZWDIJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N Ala-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)N JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- KQFRUSHJPKXBMB-BHDSKKPTSA-N Ala-Ala-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 KQFRUSHJPKXBMB-BHDSKKPTSA-N 0.000 description 1
- GORKKVHIBWAQHM-GCJQMDKQSA-N Ala-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GORKKVHIBWAQHM-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- KUDREHRZRIVKHS-UWJYBYFXSA-N Ala-Asp-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O KUDREHRZRIVKHS-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- VBRDBGCROKWTPV-XHNCKOQMSA-N Ala-Glu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N VBRDBGCROKWTPV-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- LJFNNUBZSZCZFN-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Cys Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O LJFNNUBZSZCZFN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N Ala-Leu-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O MNZHHDPWDWQJCQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N Ala-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SOBIAADAMRHGKH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VCSABYLVNWQYQE-SRVKXCTJSA-N Ala-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O VCSABYLVNWQYQE-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- RTZCUEHYUQZIDE-WHFBIAKZSA-N Ala-Ser-Gly Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O RTZCUEHYUQZIDE-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- QKHWNPQNOHEFST-VZFHVOOUSA-N Ala-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C)N)O QKHWNPQNOHEFST-VZFHVOOUSA-N 0.000 description 1
- VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N Arg-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N Arg-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O XPSGESXVBSQZPL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- AQPVUEJJARLJHB-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N AQPVUEJJARLJHB-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IYMAXBFPHPZYIK-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Asp Chemical group NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O IYMAXBFPHPZYIK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- YBIAYFFIVAZXPK-AVGNSLFASA-N Arg-His-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O YBIAYFFIVAZXPK-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N Arg-Tyr Natural products NC(CCNC(=N)N)C(=O)NC(Cc1ccc(O)cc1)C(=O)O UVTGNSWSRSCPLP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FBODFHMLALOPHP-GUBZILKMSA-N Asn-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FBODFHMLALOPHP-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WLVLIYYBPPONRJ-GCJQMDKQSA-N Asn-Thr-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O WLVLIYYBPPONRJ-GCJQMDKQSA-N 0.000 description 1
- ZEDBMCPXPIYJLW-XHNCKOQMSA-N Asp-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)C(=O)O ZEDBMCPXPIYJLW-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 1
- WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N Asp-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WSGVTKZFVJSJOG-RCOVLWMOSA-N 0.000 description 1
- RWHHSFSWKFBTCF-KKUMJFAQSA-N Asp-His-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N RWHHSFSWKFBTCF-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N Asp-Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C(O)=O HJCGDIGVVWETRO-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- USNJAPJZSGTTPX-XVSYOHENSA-N Asp-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O USNJAPJZSGTTPX-XVSYOHENSA-N 0.000 description 1
- ZKAOJVJQGVUIIU-GUBZILKMSA-N Asp-Pro-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZKAOJVJQGVUIIU-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FOXXZZGDIAQPQI-XKNYDFJKSA-N Asp-Pro-Ser-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FOXXZZGDIAQPQI-XKNYDFJKSA-N 0.000 description 1
- ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N Asp-Ser-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O ZBYLEBZCVKLPCY-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- JJQGZGOEDSSHTE-FOHZUACHSA-N Asp-Thr-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(O)=O JJQGZGOEDSSHTE-FOHZUACHSA-N 0.000 description 1
- XWKBWZXGNXTDKY-ZKWXMUAHSA-N Asp-Val-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O XWKBWZXGNXTDKY-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101100512078 Caenorhabditis elegans lys-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100289888 Caenorhabditis elegans lys-5 gene Proteins 0.000 description 1
- VDUPGIDTWNQAJD-CIUDSAMLSA-N Cys-Lys-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CS)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O VDUPGIDTWNQAJD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- KGIHMGPYGXBYJJ-SRVKXCTJSA-N Cys-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CS KGIHMGPYGXBYJJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LLUXQOVDMQZMPJ-KKUMJFAQSA-N Cys-Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CS)CC1=CC=C(O)C=C1 LLUXQOVDMQZMPJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 235000001815 DL-alpha-tocopherol Nutrition 0.000 description 1
- 239000011627 DL-alpha-tocopherol Substances 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 108050009160 DNA polymerase 1 Proteins 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 101710177291 Gag polyprotein Proteins 0.000 description 1
- SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- SBYVDRJAXWSXQL-AVGNSLFASA-N Glu-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SBYVDRJAXWSXQL-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- HKTRDWYCAUTRRL-YUMQZZPRSA-N Glu-His Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 HKTRDWYCAUTRRL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SNFUTDLOCQQRQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- YGLCLCMAYUYZSG-AVGNSLFASA-N Glu-Lys-His Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 YGLCLCMAYUYZSG-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- CQAHWYDHKUWYIX-YUMQZZPRSA-N Glu-Pro-Gly Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(O)=O CQAHWYDHKUWYIX-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- JPUNZXVHHRZMNL-XIRDDKMYSA-N Glu-Pro-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O JPUNZXVHHRZMNL-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- NNQDRRUXFJYCCJ-NHCYSSNCSA-N Glu-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NNQDRRUXFJYCCJ-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- ZGXGVBYEJGVJMV-HJGDQZAQSA-N Glu-Thr-Met Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O ZGXGVBYEJGVJMV-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- JDAYMLXPUJRSDJ-XIRDDKMYSA-N Glu-Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O)=CNC2=C1 JDAYMLXPUJRSDJ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- HQTDNEZTGZUWSY-XVKPBYJWSA-N Glu-Val-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O HQTDNEZTGZUWSY-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 1
- YMUFWNJHVPQNQD-ZKWXMUAHSA-N Gly-Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN YMUFWNJHVPQNQD-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N Gly-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XUORRGAFUQIMLC-STQMWFEESA-N Gly-Arg-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)CN)O XUORRGAFUQIMLC-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O HDNXXTBKOJKWNN-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N Gly-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N Gly-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCCN VEPBEGNDJYANCF-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- GLACUWHUYFBSPJ-FJXKBIBVSA-N Gly-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN GLACUWHUYFBSPJ-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- ZZWUYQXMIFTIIY-WEDXCCLWSA-N Gly-Thr-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O ZZWUYQXMIFTIIY-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- PASHZZBXZYEXFE-LSDHHAIUSA-N Gly-Trp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CNC3=CC=CC=C32)NC(=O)CN)C(=O)O PASHZZBXZYEXFE-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 1
- GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N Gly-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)CN)O GBYYQVBXFVDJPJ-WLTAIBSBSA-N 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 101150069554 HIS4 gene Proteins 0.000 description 1
- 108700010908 HIV-1 proteins Proteins 0.000 description 1
- 101001015673 Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) Glycerophosphodiester phosphodiesterase Proteins 0.000 description 1
- IPIVXQQRZXEUGW-UWJYBYFXSA-N His-Ala-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IPIVXQQRZXEUGW-UWJYBYFXSA-N 0.000 description 1
- ZIMTWPHIKZEHSE-UWVGGRQHSA-N His-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O ZIMTWPHIKZEHSE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- IDNNYVGVSZMQTK-IHRRRGAJSA-N His-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N IDNNYVGVSZMQTK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WCNXUTNLSRWWQN-DCAQKATOSA-N His-Asp-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N WCNXUTNLSRWWQN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- MAJYPBAJPNUFPV-BQBZGAKWSA-N His-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MAJYPBAJPNUFPV-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- YADRBUZBKHHDAO-XPUUQOCRSA-N His-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O YADRBUZBKHHDAO-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- FHGVHXCQMJWQPK-SRVKXCTJSA-N His-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O FHGVHXCQMJWQPK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- PYNPBMCLAKTHJL-SRVKXCTJSA-N His-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PYNPBMCLAKTHJL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CWSZWFILCNSNEX-CIUDSAMLSA-N His-Ser-Asn Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N CWSZWFILCNSNEX-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- 108010048209 Human Immunodeficiency Virus Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000598436 Human T-cell lymphotropic virus Species 0.000 description 1
- 108700020134 Human immunodeficiency virus 1 nef Proteins 0.000 description 1
- YPWHUFAAMNHMGS-QSFUFRPTSA-N Ile-Ala-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N YPWHUFAAMNHMGS-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- HGNUKGZQASSBKQ-PCBIJLKTSA-N Ile-Asp-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N HGNUKGZQASSBKQ-PCBIJLKTSA-N 0.000 description 1
- WIZPFZKOFZXDQG-HTFCKZLJSA-N Ile-Ile-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O WIZPFZKOFZXDQG-HTFCKZLJSA-N 0.000 description 1
- BBQABUDWDUKJMB-LZXPERKUSA-N Ile-Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C([O-])=O BBQABUDWDUKJMB-LZXPERKUSA-N 0.000 description 1
- CNMOKANDJMLAIF-CIQUZCHMSA-N Ile-Thr-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O CNMOKANDJMLAIF-CIQUZCHMSA-N 0.000 description 1
- QGXQHJQPAPMACW-PPCPHDFISA-N Ile-Thr-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N QGXQHJQPAPMACW-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- WCNWGAUZWWSYDG-SVSWQMSJSA-N Ile-Thr-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N WCNWGAUZWWSYDG-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N L-alanine-L-arginine Natural products CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N L-arginyl-L-glutamic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N Leu-Asp-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O ULXYQAJWJGLCNR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N Leu-Glu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OGUUKPXUTHOIAV-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- WRLPVDVHNWSSCL-MELADBBJSA-N Leu-His-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O)N WRLPVDVHNWSSCL-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- AMSSKPUHBUQBOQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N AMSSKPUHBUQBOQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- ICYRCNICGBJLGM-HJGDQZAQSA-N Leu-Thr-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O ICYRCNICGBJLGM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- 229910012258 LiPO Inorganic materials 0.000 description 1
- AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N Lys-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LPAJOCKCPRZEAG-MNXVOIDGSA-N Lys-Glu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN LPAJOCKCPRZEAG-MNXVOIDGSA-N 0.000 description 1
- IMAKMJCBYCSMHM-AVGNSLFASA-N Lys-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMAKMJCBYCSMHM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LCMWVZLBCUVDAZ-IUCAKERBSA-N Lys-Gly-Glu Chemical compound [NH3+]CCCC[C@H]([NH3+])C(=O)NCC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC([O-])=O LCMWVZLBCUVDAZ-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- GNLJXWBNLAIPEP-MELADBBJSA-N Lys-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O GNLJXWBNLAIPEP-MELADBBJSA-N 0.000 description 1
- WBSCNDJQPKSPII-KKUMJFAQSA-N Lys-Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O WBSCNDJQPKSPII-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ATNKHRAIZCMCCN-BZSNNMDCSA-N Lys-Lys-Phe Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ATNKHRAIZCMCCN-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- AEIIJFBQVGYVEV-YESZJQIVSA-N Lys-Phe-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)C(=O)O AEIIJFBQVGYVEV-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- QTZXSYBVOSXBEJ-WDSKDSINSA-N Met-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O QTZXSYBVOSXBEJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- DNDVVILEHVMWIS-LPEHRKFASA-N Met-Asp-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N DNDVVILEHVMWIS-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- OGAZPKJHHZPYFK-GARJFASQSA-N Met-Glu-Pro Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OGAZPKJHHZPYFK-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N Met-Gly-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O UZWMJZSOXGOVIN-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CGUYGMFQZCYJSG-DCAQKATOSA-N Met-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CGUYGMFQZCYJSG-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- 241001092142 Molina Species 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 102000008300 Mutant Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010021466 Mutant Proteins Proteins 0.000 description 1
- 235000021360 Myristic acid Nutrition 0.000 description 1
- TUNFSRHWOTWDNC-UHFFFAOYSA-N Myristic acid Natural products CCCCCCCCCCCCCC(O)=O TUNFSRHWOTWDNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N N-L-alanyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000729 N-terminal amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- OJUMUUXGSXUZJZ-SRVKXCTJSA-N Phe-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O OJUMUUXGSXUZJZ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N Phe-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- ZLAKUZDMKVKFAI-JYJNAYRXSA-N Phe-Pro-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O ZLAKUZDMKVKFAI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N Phe-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KLYYKKGCPOGDPE-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- LNLNHXIQPGKRJQ-SRVKXCTJSA-N Pro-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 LNLNHXIQPGKRJQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZYBUKTMPPFQSHL-JYJNAYRXSA-N Pro-Asp-Trp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O ZYBUKTMPPFQSHL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- LCUOTSLIVGSGAU-AVGNSLFASA-N Pro-His-Arg Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O LCUOTSLIVGSGAU-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- WFIVLLFYUZZWOD-RHYQMDGZSA-N Pro-Lys-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WFIVLLFYUZZWOD-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 GVUVRRPYYDHHGK-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- KHRLUIPIMIQFGT-AVGNSLFASA-N Pro-Val-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KHRLUIPIMIQFGT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 241001222774 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Minnesota Species 0.000 description 1
- 241000219287 Saponaria Species 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N Ser-Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O NLQUOHDCLSFABG-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N Ser-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CCCN=C(N)N WDXYVIIVDIDOSX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- COAHUSQNSVFYBW-FXQIFTODSA-N Ser-Asn-Met Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O COAHUSQNSVFYBW-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N Ser-Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO BYIROAKULFFTEK-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IOVBCLGAJJXOHK-SRVKXCTJSA-N Ser-His-His Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CO)N)C(=O)N[C@@H](CC=1NC=NC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 IOVBCLGAJJXOHK-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- CAOYHZOWXFFAIR-CIUDSAMLSA-N Ser-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O CAOYHZOWXFFAIR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GZSZPKSBVAOGIE-CIUDSAMLSA-N Ser-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GZSZPKSBVAOGIE-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OWCVUSJMEBGMOK-YUMQZZPRSA-N Ser-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O OWCVUSJMEBGMOK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CO)N NVNPWELENFJOHH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N Ser-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CO OZPDGESCTGGNAD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N Ser-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O PYTKULIABVRXSC-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N Ser-Thr-Gly Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N)O PURRNJBBXDDWLX-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N Ser-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C(C)C)C(O)=O HSWXBJCBYSWBPT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 239000012505 Superdex™ Substances 0.000 description 1
- ZUXQFMVPAYGPFJ-JXUBOQSCSA-N Thr-Ala-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN ZUXQFMVPAYGPFJ-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 1
- MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N Thr-Gly-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MPUMPERGHHJGRP-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N Thr-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O JLNMFGCJODTXDH-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- QHUWWSQZTFLXPQ-FJXKBIBVSA-N Thr-Met-Gly Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(O)=O QHUWWSQZTFLXPQ-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N Thr-Ser-Glu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N)O XHWCDRUPDNSDAZ-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N Thr-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WPSKTVVMQCXPRO-BWBBJGPYSA-N 0.000 description 1
- XGFYGMKZKFRGAI-RCWTZXSCSA-N Thr-Val-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N XGFYGMKZKFRGAI-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- HXMJXDNSFVNSEH-IHPCNDPISA-N Trp-Cys-Tyr Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)N HXMJXDNSFVNSEH-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- WNZRNOGHEONFMS-PXDAIIFMSA-N Trp-Ile-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O WNZRNOGHEONFMS-PXDAIIFMSA-N 0.000 description 1
- WSMVEHPVOYXPAQ-XIRDDKMYSA-N Trp-Ser-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N WSMVEHPVOYXPAQ-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- CVXURBLRELTJKO-BWAGICSOSA-N Tyr-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N)O CVXURBLRELTJKO-BWAGICSOSA-N 0.000 description 1
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N Tyr-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- UUJHRSTVQCFDPA-UFYCRDLUSA-N Tyr-Tyr-Val Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 UUJHRSTVQCFDPA-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 1
- VKYDVKAKGDNZED-STECZYCISA-N Tyr-Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N VKYDVKAKGDNZED-STECZYCISA-N 0.000 description 1
- MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N Val-Gly-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N MDYSKHBSPXUOPV-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- LKUDRJSNRWVGMS-QSFUFRPTSA-N Val-Ile-Asp Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LKUDRJSNRWVGMS-QSFUFRPTSA-N 0.000 description 1
- KNYHAWKHFQRYOX-PYJNHQTQSA-N Val-Ile-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N KNYHAWKHFQRYOX-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 1
- LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N Val-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N LYERIXUFCYVFFX-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- UGFMVXRXULGLNO-XPUUQOCRSA-N Val-Ser-Gly Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)NCC(O)=O UGFMVXRXULGLNO-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- 108010003533 Viral Envelope Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- FHICGHSMIPIAPL-HDYAAECPSA-N [2-[3-[6-[3-[(5R,6aS,6bR,12aR)-10-[6-[2-[2-[4,5-dihydroxy-3-(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]ethoxy]ethyl]-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]oxy-5-hydroxy-2,2,6a,6b,9,9,12a-heptamethyl-1,3,4,5,6,6a,7,8,8a,10,11,12,13,14b-tetradecahydropicene-4a-carbonyl]peroxypropyl]-5-[[5-[8-[3,5-dihydroxy-4-(3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl)oxyoxan-2-yl]octoxy]-3,4-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]methoxy]-3,4-dihydroxyoxan-2-yl]propoxymethyl]-5-hydroxy-3-[(6S)-6-hydroxy-2,6-dimethylocta-2,7-dienoyl]oxy-6-methyloxan-4-yl] (2E,6S)-6-hydroxy-2-(hydroxymethyl)-6-methylocta-2,7-dienoate Chemical compound C=C[C@@](C)(O)CCC=C(C)C(=O)OC1C(OC(=O)C(\CO)=C\CC[C@](C)(O)C=C)C(O)C(C)OC1COCCCC1C(O)C(O)C(OCC2C(C(O)C(OCCCCCCCCC3C(C(OC4C(C(O)C(O)CO4)O)C(O)CO3)O)C(C)O2)O)C(CCCOOC(=O)C23C(CC(C)(C)CC2)C=2[C@@]([C@]4(C)CCC5C(C)(C)C(OC6C(C(O)C(O)C(CCOCCC7C(C(O)C(O)CO7)OC7C(C(O)C(O)CO7)O)O6)O)CC[C@]5(C)C4CC=2)(C)C[C@H]3O)O1 FHICGHSMIPIAPL-HDYAAECPSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 238000005377 adsorption chromatography Methods 0.000 description 1
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 229940087168 alpha tocopherol Drugs 0.000 description 1
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 229940037003 alum Drugs 0.000 description 1
- ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K aluminium phosphate Chemical compound O1[Al]2OP1(=O)O2 ILRRQNADMUWWFW-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 229940024546 aluminum hydroxide gel Drugs 0.000 description 1
- INJRKJPEYSAMPD-UHFFFAOYSA-N aluminum;silicic acid;hydrate Chemical compound O.[Al].[Al].O[Si](O)(O)O INJRKJPEYSAMPD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SMYKVLBUSSNXMV-UHFFFAOYSA-K aluminum;trihydroxide;hydrate Chemical compound O.[OH-].[OH-].[OH-].[Al+3] SMYKVLBUSSNXMV-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 1
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 235000012000 cholesterol Nutrition 0.000 description 1
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 230000003749 cleanliness Effects 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- ZNEWHQLOPFWXOF-UHFFFAOYSA-N coenzyme M Chemical compound OS(=O)(=O)CCS ZNEWHQLOPFWXOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N dATP Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N dATP Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 SUYVUBYJARFZHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J dCTP(4-) Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-J 0.000 description 1
- HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N dGTP Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O1 HAAZLUGHYHWQIW-KVQBGUIXSA-N 0.000 description 1
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 239000013024 dilution buffer Substances 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000000459 effect on growth Effects 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000005021 gait Effects 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 108091006104 gene-regulatory proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034356 gene-regulatory proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N glyclproline Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 108010090037 glycyl-alanyl-isoleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N glycylvaline Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 description 1
- 230000028996 humoral immune response Effects 0.000 description 1
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 1
- 230000005847 immunogenicity Effects 0.000 description 1
- 230000003308 immunostimulating effect Effects 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 230000001589 lymphoproliferative effect Effects 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 1
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N phosphorous acid Chemical compound OP(O)O OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010089520 pol Gene Products Proteins 0.000 description 1
- 229920002627 poly(phosphazenes) Polymers 0.000 description 1
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000244 polyoxyethylene sorbitan monooleate Substances 0.000 description 1
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 108010014614 prolyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 1
- 238000000164 protein isolation Methods 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- RWVGQQGBQSJDQV-UHFFFAOYSA-M sodium;3-[[4-[(e)-[4-(4-ethoxyanilino)phenyl]-[4-[ethyl-[(3-sulfonatophenyl)methyl]azaniumylidene]-2-methylcyclohexa-2,5-dien-1-ylidene]methyl]-n-ethyl-3-methylanilino]methyl]benzenesulfonate Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C(=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C)C=2C(=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C)C=C1 RWVGQQGBQSJDQV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229940063673 spermidine Drugs 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000011146 sterile filtration Methods 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 1
- TUNFSRHWOTWDNC-HKGQFRNVSA-N tetradecanoic acid Chemical compound CCCCCCCCCCCCC[14C](O)=O TUNFSRHWOTWDNC-HKGQFRNVSA-N 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- 125000002264 triphosphate group Chemical class [H]OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])O* 0.000 description 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical class [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010003137 tyrosyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 238000010200 validation analysis Methods 0.000 description 1
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 1
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 description 1
- 150000003751 zinc Chemical class 0.000 description 1
- 239000002076 α-tocopherol Substances 0.000 description 1
- 235000004835 α-tocopherol Nutrition 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/62—DNA sequences coding for fusion proteins
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16311—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV regulatory proteins
- C12N2740/16322—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- AIDS & HIV (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Podstatu rešení tvorí proteinová vakcína, která obsahuje exprimovaný, purifikovaný a izolovaný protein ze skupiny: a) úplný protein HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaný Tat po vypuštení, pridání nebo náhrade jedné z aminokyselin nebo mutovaný Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, spojený s i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo ii) úplným proteinem HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštení, pridání nebo náhrade jedné z aminokyselin nebo b) úplný izolovaný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštení, pridání nebo náhrade jedné z aminokyselin, spojený s i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo ii) úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaným Tat po vypuštení, pridání nebo náhrade jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, nebo c) úplný izolovaný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštení, pridání nebo náhrade jedné z aminokyselin, spojený s úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaným Tat po vypuštení, pridání nebo náhrade jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23 a proteinem nebo lipoproteinem jako fúzním partnerem, ve smesi s farmaceuticky prijatelnými pomocnými látkami.
Description
Oblast techniky
Vynález popisuje nové konstrukce proteinu HTV a jejich použití v medicíně. Dále se popisují farmaceutické kompozice, které je obsahují a způsoby jejich výroby.
Vynález se dále týká fuzních proteinů, které zahrnují proteiny HIV-1 Tat a a/nebo Nef.
Dosavadní stav techniky
HIV-1 způsobuje syndrom získaného selhání imunity (AIDS), který je jedním z hlavních světo15 vých zdravotních problémů. Ačkoli vědci s celého světa vyvíjí velké úsilí, aby vytvořili vakcínu, jejich snaha zatím nebyla úspěšná.
Jsou popsány proteiny HIV-1, které se nevyskytují v obalu viru, a zahrnují například vnitřní strukturální proteiny, jako jsou produkty genů gag nebo pol a jiné nestrukturální proteiny, jako je
Rev, Nef, Vif a Tat (popisuje se v publikaci Greene et al., New England J. Med., 324, 5, 308 et seq (1991) a Bryan et al., (Ed. Pizzo), Pediatr. Infect. Dis. J., 11, 5, 390 et seq (1992).
Proteiny HIV Nef a Tat jsou časné proteiny, které se exprimují v časném stádiu infekce a bez přítomnosti strukturních proteinů.
Podstata vynálezu
Podstatu vynálezu tvoří proteinová vakcína, která obsahuje exprimovaný, purifikovaný a izolova30 ný protein ze skupiny:
a) úplný protein HTV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaný Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaný Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, spojený s
i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo ii) úplným proteinem HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě, jedné z aminokyselin nebo
b) úplný izolovaný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, spojený s
i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo ii) úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaným Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, nebo
c) úplný izolovaný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, spojený s úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaným Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23 a proteinem nebo lipoproteinem jako fúzním partnerem, ve směsi s farmaceuticky přijatelnými pomocnými látkami.
-1 CZ 302878 B6
Vynález poskytuje proteiny s následující strukturou:
Lipo D 1/3 | Nef | His(6) |
LipoD 1/3 | Nef-Tat | His (6) |
Prot D 1/3 | Nef | His(6) |
Prot D 1/3 | Nef-Tat Nef-Tat | His (6) His G) |
Na obrázku č. 1 je znázorněna aminokyselinová sekvence (SEQ ID NO: 7) a sekvence DNA (SEQ ID NO: 6) fúzního partnera takových konstrukcí.
V preferovaném provedení vynálezu se proteiny exprimují s histidinovým koncem, který zahrnuje 5 až 10 a přednostně 6 histidinových konců. To je výhodné při čištění. Oddělená exprese Nef (popisuje se v publikaci Macreadie I. G. Et. al., 1993, Yeast 9 (6) 565 až 573) a Tat (popisuje se v publikaci Braddock M. et al., 1989, Cell 58 (2) 269 až 79) v kvasinkách (Saccharomyces cerevisiae) už byla popsána. Pouze protein Nef je myristilován. Vynález poprvé popisuje oddělenou expresi proteinů Nef a Tat v expresním systému organizmu Pichia (konstrukce Nef-His a Tat-His) a úspěšnou konstrukci fúze Nef-Tat-His. Sekvence DNA a aminokyselinové sekvence Nef-His (SEQ ID NO: 8 a 9), Tat-His (SEQ ID NO: 10a 11) a fúzních proteinů Nef-Tat-His (SEQ ID NO: 12 a 13) jsou uvedeny na obrázku č. 2.
Deriváty podle vynálezu také zahrnují mutované proteiny. Termín „mutovaný“ znamená molekulu, kde dochází k deleci, adici nebo substituci jedné nebo více aminokyselin za použití dobře známých metod pri místně řízené mutagenezi nebo libovolné jiné běžné metodě.
Mutovaný Tat je zobrazen na obrázku č. 2 (SEQ ID NO: 22 a 23) jako je Nef-Tat mutant-His (SEQ ID NO: 24 a 25).
Vynález zahrnuje DNA kódující proteiny podle vynálezu. Takové sekvence se mohou začlenit do vhodného expresního vektoru a mohou se exprimovat ve vhodném hostiteli.
Sekvence DNA kódující proteiny podle vynálezu se mohou syntetizovat za použití standardních metod syntézy DNA, jako je enzymatická ligace, jak se popisuje v publikaci D, M. Roberts et at, Biochemistry 1985, 24, 5090 až 5098, chemická syntéza, enzymatická polymerizace in vitro nebo technologie PCR za použití například polymerázy stabilní vůči teplu nebo kombinace těchto metod.
Enzymatická polymerizace DNA může probíhat in vitro za použití DNA polymerázy, jako je DNA polymeráza 1 (Klenow fragment) ve vhodném pufru, který obsahuje nukleosidtrifosfáty dATP, dCTP, dGTP a dTTP, při teplotě 10 až 37 °C. Objem reakce je 50 μΐ nebo méně. Enzymatická ligace fragmentů DNA může probíhat za použití ligázy DNA, jako je DNA ligáza T4 ve vhodném pufru, jako je 0,05MTris (pH 7,4), 0,01M MgCt, 0,01M dithiothreitol, lmM spermidin, lmM ATP a 0,1 mg/ml hovězí sérový albumin při teplotě 4 °C až při teplotě prostředí. Objem reakce je většinou 50 μΐ nebo méně. Chemická syntéza polymeru nebo fragmentů DNA se provádí běžnými způsoby chemie fosfotriesteru, fosfitu nebo fosforamiditu za použití metody na pevné fázi, jak se popisuje v publikaci Chemical and Enzymatic Synthesis of Gene Fragments, A Laboratory Manual (ed. H. G. Gassen and A. Lang), Verlag Chemie, Weinheim (1982) nebo v jiné vědecké literatuře například M. J, Gait, H. W. D. Matthes, M. Singh, B. S. Sproat a R. C. Titmas, Nucleic Acids Reseach, 1982, 10, 6243, B. S, Sproat and W. Bannwarth, Tetrahedron Letters, 1983, 24, 5771, M. D. Matteucci and Μ. H. Caruthes, Tetrahedron Letters, 1980, 21, 719, M. D. Matteucci and Μ. H. Caruthers, Journal of the American Chemical Society, 1981, 103, 3185, S. P. Adams et al., Journal of the American Chemical Society, 1983, 105, 661, N. D. Sinha, J. Biemat, J. McMannus and H. Koester, Nucleic Acids Reseach, 1984, 12, 4539 a H. W. D. Matthes et al., EMBO Journal, 1984, 3, 801.
-2CZ 302878 B6
Vynález dále popisuje způsob přípravy proteinu podle vynálezu zahrnující:
i) Přípravu replikovatelného nebo integračního expresivního vektoru, který je schopný v hostitelské buňce exprimovat polymer DNA zahrnující nukleotidovou sekvenci, která kóduje protein nebo jeho derivát.
i i) Transformaci hostitelské buňky uvedeným vektorem.
iii) Kultivaci uvedené transformované buňky za podmínek, které umožňují exprimovat uvedený polymer DNA za vzniku uvedeného proteinu.
iv) Získání uvedeného proteinu.
Tento způsob podle vynálezu se může také uskutečnit běžnými rekombinantními postupy, jak se popisuje v publikaci Maniatis et al., Molecular Cloning-A laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 1982 až 1989.
Termín „transformace“ znamená zavedení cizorodé DNA do hostitelské buňky. Toho je možné dosáhnout například transformací, transfekcí nebo infekcí s vhodným plazmidem nebo virovým vektorem za použití například běžných metod, jak se popisuje v publikaci Genetic Engineering, Eds„ S. M. Kingsman and A. J. Kingsman, Blackwell Scientific Publications, Oxford, Engtand, 1988. Termín „transformovaný“ nebo „transformant“ se používá pro výslednou hostitelskou buňku obsahující a exprimující cizorodý gen.
Expresivní vektory jsou nové a také tvoří část vynálezu.
Replikovatelné expresní vektory se mohou připravit podle vynálezu štěpením vektoru kompatibilního s hostitelskou buňkou za vzniku lineárního segmentu DNA vykazující intaktní replikon a kombinací uvedeného lineárního segmentu s jednou nebo více molekul DNA, které spolu s uvedeným lineárním segmentem tvoří polymer DNA kódující protein podle vynálezu nebo jeho derivát za podmínek ligace.
Polymer se podle potřeby může připravit nebo předpřipravit během konstrukce vektoru.
Volbu vektoru stanoví z části hostitelská buňka, která může být prokaryontní nebo eukaryontní, ale upřednostňuje se mikroorganizmus E. coli nebo kvasinky. Vhodné vektory zahrnují plazmidy, bakteriofágy, kosmidy a rekombinantní viry.
Příprava replikovatelného expresního vektoru může probíhat běžně s enzymy vhodnými k restrikci, polymerizací a ligací DNA postupem popsaným například v publikaci Maniatis et al., Molecular Cloning-A laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 1982 až 1989.
Rekombinantní hostitelské buňky podle vynálezu se připravily transformací hostitelské buňky s replikovatelným expresivním vektorem podle vynálezu za podmínek transformace. Vhodné transformační podmínky jsou popsané v publikaci Maniatis et al., Molecular Cloning-A laboratoiy Manual, Cold Spring Harbor, 1982 až 1989 nebo v publikaci „DNA Cloning“ vol. II, D. M. Glover ed., IRL Press Ltd., 1985.
Volba transformačních podmínek je určena hostitelskou buňkou. Bakteriální hostitel, jako je E. coli se může ošetřit roztokem CaCl2 (Cohen et al., Proč. Nati. Acad. Sci., 1973, 69, 2110) nebo roztokem obsahujícím směs RbCl, MnCl2, acetát draselný a glycerol a pak kyselinou 3-[Nmorfolinoj-propansulfonovou, RbCl a glycerolem. Savčí buňky v kultuře se mohou transformovat ko-precipitací vektoru DNA s vápníkem do buněk. Vynález dále popisuje hostitelskou buňku transformovanou replikovatelným expresivním vektorem podle vynálezu.
-3CZ 302878 B6
Kultivace transformované hostitelské buňky za podmínek, které umožňují expresi polymeru DNA, se provádí podle postupu popsaném v publikaci Maniatis et al., Molecular Clon ing-A laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 1982 až 1989 a „DNA Cloning“ vol. ΪΙ, D. M. Glover ed., IRL Press Ltd., 1985. Tak se v buňce přednostně doplní nutrienty a buňky se kultivují při teplotě nižší než 50 °C.
Produkt se získává běžnými metodami v závislosti na hostitelské buňce. V případě, že hostitelskou buňkou je bakterie, taková jako je E. coli nebo kvasinka, jako je Pichia, může se lyžovat io fyzikálně, chemicky nebo enzymaticky a z výsledného lyzátu se izoluje proteinový produkt.
V případě, že hostitelská buňka je savčí, produkt se může v obecném případě izolovat z nutričního média nebo z buněčného volného extraktu. Vhodná metoda izolace proteinu zahrnuje selektivní precipitaci, adsorpční chromatografii a afinitní chromatografii obsahující afinitní chromatografii s monoklonálními protilátkami.
V případě proteinů podle vynálezu, které mají histidinový konec, je čištění možné jednoduše dosáhnout použitím afinitní kolony s kovovými ionty. V preferovaném provedení se protein dále čistí tak, že se podrobí chromatografii s výměnou kationtu a/nebo gelové filtrační chromatografii. Protein se pak sterilizuje průchodem přes membránu s velikostí pórů 0,22 pm.
Protein podle vynálezu se může pak připravit jako vakcína nebo se mohou enzymaticky odštěpit hístidinové zbytky.
Proteiny podle vynálezu se přednostně připravují v alespoň 80% čistotě, více se preferuje čistota 25 90%, jak je možné vidět na SDS PAGE. Je výhodné, aby se protein jevil na SDS PAGE jako jediný pruh.
Vynález dále popisuje farmaceutickou kompozici obsahující protein podle vynálezu ve farmaceuticky přijatelném excipientu.
Příprava vakcíny se v obecném případě popisuje v publikaci New Trends and Developments in
Vaccines, Voliér et al., (eds.), University Park Press, Baltimore, Maryland, 1978. Tvorba kapsulí s lipozómy se popisuje v publikaci Fullerton, Patent US 4 235 877.
Proteiny podle vynálezu se přednostně upravují do vakcinaěního přípravku podle vynálezu.
Vhodné adjuvans zahrnuje sůl hliníku, jako je gel hydroxidu hlinitého (alum) nebo fosforečnan hlinitý, ale mohou to být také sole vápníku, železa nebo zinku nebo může jít o nerozpustnou suspenzi acylovaného tyrozinu nebo acylovaných cukrů nebo kationtově nebo aniontově odvozené polysacharidy nebo polyfosfazeny.
Ve formulacích podle vynálezu se preferuje, že kompozice indukuje preferovanou THI odezvu.
Vhodné systémy adjuvans zahrnují například kombinací monofosforyllipidu A nebo jeho derivátu, upřednostňuje se 3- de-O-acylovaný monofosforyllipid A (3D-MPL) spolu se solí hliníku.
Zesílený systém zahrnuje kombinací monofosforyllipidu A a derivátu saponinu, zvláště pak kombinací QS21 a 3D-MPL, jak se popisuje v dokumentu WO 94/00 153, nebo méně reaktivní kompozici, kde QS21 se zhasíná cholesterolem, jak se popisuje v publikaci WO 96/33 739.
Zvláště silné formulace adjuvans zahrnují QS21, 3D-MPL a tokoferol v emulzi olej voda, jak se popisuje v dokumentu WO 95/17 210 a stává se preferovanou formulací.
V jednom provedení vynálezu se popisuje vakcína obsahující protein podle vynálezu upravený podle vynálezu adjuvans monofosforyllipidem A nebo jeho derivátem, zvláště 3D-MPL.
Upřednostňuje se, aby vakcína obsahovala saponin, s výhodou QS21.
-4CZ 302878 B6
Je výhodné, aby formulace obsahovala emulzi olej ve vodě a tokoferol. Vynález také popisuje způsob produkce vakcinační formulace, která obsahuje smíšený protein podle vynálezu spolu s farmaceuticky přijatelným excipientem, jako je 3D-MPL.
Vakcína podle vynálezu může dále obsahovat další proteiny HIV, jako je obalový glykoprotein gpl60 nebo jeho derivát gpl20.
Vynález popisuje protein HIV Nef nebo HIV Tat nebo jeho derivát exprimovaný v Pichia pastoio ris.
Příklady provedení vynálezu
Proteiny Nef a Tat jsou dva regulační proteiny kódované lidským virem imunonedostatečnosti (HIV-1), které byly produkovány v mikroorganizmu E. coli a v methylotrofhích kvasinkách Pichia pastoris.
Gen nef z izolátu Bru/Lai (popisuje se v publikaci Cell 40: 9 až 17, 1985) se vybral z těchto konstrukcí, protože tento gen je mezi těmi, které jsou nejvíce příbuzné konvenčnímu Nef.
Počáteční materiál v případě genu nef Bru/Lai byl fragment DNA 1170 bp klonovaný do savčího expresního vektoru pcDNA3 (pcDNA3/rce/).
Gen tat pochází z molekulového klonu BH10. Tento gen byl obdržen, jako cDNA klon HTLV 111, který se nazývá pCV 1 a popisuje se v publikaci Science, 229, 69 až 73, 1985.
1. Exprese sekvencí HIV-1 nef a tat v mikroorganizmu E. coli.
Sekvence kódující protein Nef stejně jako fúze sekvence nef a tat se umístily do plazmidových vektorů: pRIT14586 a pRIT14589 (obrázek č. 1).
Fúze Nef a Nef-Tat vznikla jako fúzní proteiny za použití fúzního partnera, kteiým je část proteinu D. Protein D je vazebný protein imunoglobulinu D, který je exponovaný na povrchu gram negativní bakterie Haemophilus influenzae.
PRIT14586 obsahuje sekvenci DNA pocházející z bakterie Haemophilus influenzae řízenou promotorem XPL. Uvedená sekvence DNA kóduje prvních 127 aminokyselin proteinu D (popisuje se v publikaci Infect. Immun. 60: 1336 až 1342, 1992), po kterém bezprostředně následuje oblast vícenásobného klonovacího místa plus sekvence DNA kódující jeden glycin, 6 histidinových zbytků a terminální kodon. (obrázek č. 1 A).
Tento vektor je označen tak, aby exprimoval zpracovaný lipidovaný fúzní protein s His koncem (fúzní protein LipoD). Fúzní protein se syntetizoval jako prekurzor s dlouhou signální sekvencí s 18 aminokyselinovými zbytky a po zpracování se cystein v poloze 19 v molekule prekurzoru stává aminoterminálním zbytkem, který se pak upravuje kovalentně vázanými mastnými kyselinami (obrázek č. 1B).
PR1T14589 je skoro identický spRIT14586 s výjimkou, že sekvence získaná zprotD začíná bezprostředně po kodonu cysteinu 19.
Exprese z tohoto vektoru vede ke vzniku ne lipido váného fúzního proteinu s koncem His (fúzní protein Prot D).
-5CZ 302878 B6
Připravily se čtyři konstrukce: LipoD-neAHis, LipoD-rt^A-tat-His, ProtD-z;e/-His a ProtD-zítýtaí-His.
První dvě konstrukce se připravily za použití expresního vektoru pRIT 14586, u posledních dvou 5 konstrukcí se použil pRIT14589.
1.1 Konstrukce rekombinantního kmene ECLD-N1 produkující ffizní protein LIPOD-Nef-HIS.
1.1.1 Konstrukce plazmidu pRIT1495 exprimujícího lipoD-we/^HÍs.
io
Gen nej (izolát Bru/Lai) se amplifikoval pomocí PCR z plazmidu pcDNA3/Nef sprimery 01 a 02.
Ncol
Primer 01 {SEQ ID NO: 1): 5 # ATCGTCCMG GGT. GGC AAG. TGG. T 3'
Spěl
Primer 02 {SEQ ID NO: 2): 5'CGGCTACTAGTGCAGTTCTTGAA 3'
Amplifikovaná oblast DNA nef začíná v nukleotidu 837 a končí v nukleotidu 8971 (popisuje se v publikaci Cell 40: 9 až 17, 1985).
Restrikční místo rozeznávané restrikčním enzymem Ncol (které nese ATG kodon genu nef) se zavedlo na 5' konec fragmentu PCR, zatímco místo Spěl se zavedlo na 3' konec.
Získal se fragment PCR a expresní plazmid pR!T14586, které se štěpily restrikčními enzymy Ncol a Spěl, čistily se na agarózovém gelu, ligovaly se a transformovaly se do vhodné hostitelské buňky E. coli kmene AR58. Tento kmen je skrytý lysogen λ získaný z N99, který je ga/E::Tnl 0,A-8(chlD-pgl), Δ-Η1 (cro-chlA)N+ a cI857.
Výsledný rekombinantní plazmid se získal po ověření amplifikované oblasti nef automatickým sekvenováním (popisuje se v sekci 1.1.2 dále v textu) a označil se pRIT14595.
t. 1.2 Selekce transformantů E. coli kmene AR58 s pRIT 14595
Když se transformuje hostitelský kmen AR58 mikroorganizmu E. coli, rekombinantní plazmid řídí teplem indukovatelnou produkci heterologního proteinu.
Na SDS-PAGE obarvených Coomassie modří se analyzovala produkce proteinu indukovatelná teplem pro několik transformantů rekombinantním lipoD-Nef-His. Všechny analyzované transformanty vykazují teplem indukovatelnou produkci heterologního proteinu. Četnost rekombinantního LipoD-Nef-Tat-His fúzního proteinu se odhadla na 10 % celkového proteinu.
Vybral se jeden z transformantů a přidělilo se mu označení ECLD-N 1.
Rekombinantní plazmid se opět izoloval z kmene ECLD-N 1 a sekvence kódující oblasti ne/^His se potvrdila automatickým sekvenováním. Tento plazmid se oficiálně označil jako pRIT14595.
Plně zpracovaný a acylovaný rekombinantní fúzní protein Lípo D-ne/^His produkovaný kmenem ECLD-N1 se skládá z:
• Mastných kyselin
-6CZ 302878 B6 • 109 aminokyselin proteinu D (začíná u aminokyseliny v poloze 19 a pokračuje k aminokyselině v poloze 127).
· Methioninu, který vznikl použitím klonovacího místa Ncol pRIT14586 (obrázek č. I).
• 205 aminokyselin proteinu Nef (začíná aminokyselinou v poloze 2 a pokračuje k aminokyselině v poloze 206).
io · Threoninu a šeřinu vytvořených postupem klonování (klonování v restrikčním místě Spěl pRIT14586).
• Jeden glycin a šest histidinů.
1.2 Konstrukce rekombinantního kmene NECD-N1 produkujícího fúzní protein PROT D-NefHIS.
Konstrukce expresního plazmidu pRIT 14600 kódujícího fúzní protein Prot D Nef-His byla shodná s plazmidovou konstrukcí popsanou v příkladu 1.1.1 stou výjimkou, že pRIT 14586 se používal jako receptorový plazmid pro fragment nef amplifikovaný PCR.
Kmen AR59 mikroorganizmu E. colí se transformoval pRIT 14600 a transformanti se analyzovaly, jak se popisuje v příkladu 1.1.2, Vybraný transformant se označil jako ECD-N1.
1.3 Konstrukce rekombinantního kmene ECLD-NT6 produkující fúzní protein LÍPO O NefTat-HlS.
1.3.1 Konstrukce plazmidu pRIT14596 exprimujícího D-Nef-Tat-His jo Gen tat (izolát BH10) se amplifíkoval pomocí PCR z derivátu plazmidu pCVl s primery 03 a 04. Restrikční místa Spěl se zavedla na oba konce fragmentu PCR.
Spěl
Primer 03 (SEQ ID NO: 3): 5 *ATCGTACTAGT.GAG.CCA.GTA.GAT .C 3' Spěl
Primer 04 (SEQ ID NO: 4): 5' CGGCTACTAGTTTCCTTCGGGCCT 3'
Nukleotidová sekvence amplifikovaného genu tat se ilustruje v klonu pCVl (Science 229: 69 až 73, 1985) a pokrývá oblast od nukleotidu 5414 až nukleotid 7998.
Získaný fragment PCR a plazmid pRIT 14595 (exprimující protein lipoD-Nef-His) se štěpily restrikčním enzymem Spěl, čistily se na agarózovém gelu, ligovaly se a transformovaly se do kompetentních buněk AR58. Získal se výsledný rekombinantní plazmid a po ověření amplifikované sekvence tat pomocí automatického sekvenování (popisuje se v sekci 1.3.2 dále v textu) získal označení pRIT14596.
1.3.2 Výběr transformantů kmene AR58 nesoucích pRIT14596
Transformanty se kultivovaly a indukovaly se teplem a jejich proteiny se analyzovaly na gelech obarvených Coomassie modří. Stupeň produkce rekombinantního proteinu se odhaduje na l % celkového proteinu. Vybral se jeden rekombinantní kmen a označil se ECLD-NT6.
-7CZ 302878 B6
Z kmene ECLD-NT6 se znovu izoloval rekombinantní plazmid lipoD-zie^-tóZ-His, sekvenoval se a označil se jako pRIT14596.
Plně zpracovaný a acylovaný rekombinantní fúzní protein Lípo D-Nef-Tat-His produkovaný 5 kmenem ECLD-N6 zahrnuje:
• Mastné kyseliny • 109 aminokyselin proteinu D (začíná u aminokyseliny v poloze 19 a pokračuje k aminokyseio line v poloze 127).
• Methionin, který vznikl použitím klonovacího místa Ncol pRIT14586.
• 205 aminokyselin proteinu Nef (začíná aminokyselinou v poloze 2 a pokračuje k aminokyse15 lině v poloze 206).
• Threonin a serin vytvořené postupem klonování • 85 aminokyselin proteinu Tat (začínající aminokyselinou v poloze 2 a pokračující k amino20 kyselině v poloze 86) • Threonin a serin vytvořené postupem klonování • Jeden glycin a šest histidinů.
1.4 Konstrukce rekombinantního kmene ECD-NT1, který produkuje fúzní protein PROT D— Nef-Tat-HIS
Konstrukce expresního plazmidu pRIT14601 kódující fúzní protein Prot D-Nef-Tat-His je shod30 ný s konstrukcí plazmidu popsanou v příkladu 1.3.1 s výjimkou, že pRIT14600 se použil jako receptorový plazmid pro fragment nef amplifikovaný PCR.
Kmen AR58 mikroorganizmu E. coli se transformoval pR!T14601 a transformanty se analyzovaly způsobem popsaným shora v textu. Vybraný transformant se označil ECD-NT1.
2. Exprese sekvencí nef a Zař HIV-1 v Pichiá Pastoři s
Protein Nef, Tat a fúzní protein Nef-Tat se exprimovaly methy lotrofních kvasinkách Pichiá pastoris. Expresi řídí indukovatelný promotor alkoholoxidázy (AOX1).
Za účelem exprese těchto genů HIV-1 se použila upravená verze integračního vektoru PHIL-D2 (INVITROGEN). Tento vektor se modifikoval takovým způsobem, že exprese heterologního proteinu začíná bezprostředně po přirozeném kodónu ATG genu AOX1 a vznikne rekombinantní protein s koncem tvořeným jedním glycinem a šesti histidinovými zbytky. Tento vektor PHIL45 D2-MOD se zkonstruoval klonováním oligonukleotidového linkeru mezi přilehlými oligonukleotidovými místy AsuII a EcoRI vektoru PHIL-D2 (obrázek č. 3).
Vedle konce His tento linker nese restrikční místa Ncol, Spěl a Xbal, mezi které se začlenily nef tat a fúze nef—tat.
2.1 Konstrukce integračních vektorů pR!T14597 (kódující protein Nef-His), pRlT14598 (kódující protein Tat-His) a pRIT 14599 (kódující fúzi Nef-Tat-His).
-8CZ 302878 B6
Gen nef se amplifíkoval pomocí PCR z plazmidů pcDNA3/Nef s primery 01 a 02 (v sekci 1.1.1 se popisuje konstrukce pR!T14595). Získal se fragment PCR a integrační vektor PHIL-D2MOD, které se Štěpily restrikěními enzymy Ncol a Spěl, čistily se na agarózovém gelu a ligovaly se za vzniku integračního plazmidů pRIT14597 (zobrazeno na obrázku č. 3).
Gen tat se amplifíkoval pomocí PCR z derivátu plazmidů pCVl za použití primerů 05 a 04 (konstrukce pRIT14596 se popisuje v sekci 1.3,1):
Ncol
Primer 05 (SEQ ID NO: 5): 5'ATCGTCCATGGAGCCAGTAGATC 3' io
Restrikční místo Ncol se zavedlo na 5' konec fragmentu PCR, zatímco restrikění místo Spěl se zavedlo na 3 konec primerem 04. Získal se fragment PCR a vektor PHÍL-D2-MOD, které se štěpily restrikěními enzymy Ncol a Spěl, čistily se na agarózovém gelu a ligovaly se za vzniku integračního plazmidů pRIT14598.
Aby mohla vzniknout konstrukce pRIT14599 fragment DNA o velikosti 910 bp odpovídající kódující sekvenci «ef-Zař-His se ligoval mezi tupý konec vytvořený restríkčním enzymem EcoRI a ošetřený T4 polymerázou a restrikční místo Ncol vektoru PH1L-D2-MOD. Kódující fragment nef-tat-\A\s se získal použitím restrikčního enzymu Xbal a ošetřil se T4 polymerázou a štěpením pRIT14596 restríkčním enzymem Ncol.
2.2 Transformace Pichia pastořis kmen GS115 (his4)
Za účelem získání kmenu Pichia pastoris, který exprímuje Nef-His, Tat-His a tuzí Nef-Tat-His 25 se kmen GS115 transformoval lineárními fragmenty Notl, které nesou expresní kazety plus gen
HIS4, aby došlo ke komplementaci his4 v hostitelském genomu. Transformace GS115 fragmenty linearizovanými restríkčním enzymem Notl je výhodná pro rekombinací v lokusu AOXI.
Kvantitativní dot blot analýzou se vybraly kopie integračních klonů a stanovil se typ integrace, 30 inzerce (fenotyp Mut+) a trans umístění (fenotyp Mut5).
Z každé transformace se vybral jeden transformant vykazující vysoký stupeň produkce rekombinantního proteinu:
Kmen Y1738 (fenotyp Muf) produkující rekombinantní protein Nef-His, což je myristilovaný protein obsahující 215 aminokyselin, který zahrnuje:
• Kyselinu myristovou, · Methionin, vzniklý použitím klonovacího restrikčního místa Ncol vektoru PHIL-D2-MOD, • 205 aminokyselin proteinu Nef (začínající aminokyselinou v poloze 2 a pokračující k aminokyselině 206), · Threonin a serin vzniklý klonováním (klonování do restrikčního místa Spěl vektoru PHILD2-MOD) • Jeden glycin a šest histidinů.
Kmen Y1739 (fenotyp Muf) produkující protein Tat-His, obsahující 95 aminokyselin skládající se z:
I
-9CZ 302878 B6 • Methioninu vytvořeného použitím klonovacího místa Ncol • 85 aminokyselin proteinu Tat (začínající aminokyselinou v poloze 2 a pokračující k aminokyselině v poloze 86) • Threoninu a šeřinu zavedených klonováním • Jednoho glycinu a šesti histidinů io Kmen Y1737 (fenotyp Muí) produkující rekombinantní fúzní protein Nef-Tat-His, myristylovaný protein obsahující 302 aminokyselin skládající se z:
• kyseliny myristové · Methioninu vytvořeného použitím klonovacího místa Ncol • 205 aminokyselin proteinu Tat (začínající aminokyselinou v poloze 2 a pokračující k aminokyselině v poloze 206) · Threoninu a šeřinu zavedených klonováním • 85 aminokyselin proteinu Tat (začínající aminokyselinou v poloze 2 a pokračující k aminokyselině v poloze 86) · Threoninu a šeřinu zavedeného postupem klonování • Jednoho glycinu a šesti histidinů
3. Exprese HIV-1 mutantu Tat v Pichia pastoris
Stejně jako mutantní fúzní protein Nef-Tat, se exprimoval mutantní rekombinantní protein Tat. Mutantní protein Tat nemůže být biologicky aktivní, zatímco si uchovává své ímunogenní epitopy35 Pro účely této konstrukce se vybral dvojitý mutantní gen tat konstruovaný D.CIements (Tulané University).
Tento gen tat (pocházející z molekulového klonu BH10) nese mutace v oblasti aktivního místa (Lys41-»Ala) a v motivu RGD (Arg78-»Lys a Asp80->Glu) (popisuje se v publikaci Virology
2 3 5 : 48 až 64, 1997).
Mutantní gen tat se získal jako fragment cDNA subklonovaný mezi restrikčními místy EcoRI a Hindi II v expresivním plazmidu CM V (pCMVLys41/KGE).
3.1 Konstrukce integračních vektorů pRIT14912 (kódující Tat mutant proteinu His) a pRlT14913 (kódující fúzi Nef-Tat mutant-His).
Mutantní gen tat se amplifikoval pomocí PCR z plazmidu pCMVLys41/KGE pomocí primerů 05 a 04 (konstrukce pRIT 14598 se popisuje v sekci 2.1).
Na 5' konec fragmentu PCR se zavedlo restrikční místo Ncol, zatímco restrikční místo Spěl se zavedlo na 3' konec s primerem 04. Získal se fragment PCR a vektor PHIL-D2-MOD, které se štěpily restrikčními enzymy Ncol a Spěl, čistily se na agarózovém gelu a ligovaly se za vzniku integračního plazmidu pRIT14912.
- 10CZ 302878 B6
Za účelem vzniku konstrukce pRIT14913 se mutant tat amplifíkoval pomocí PCR zplazmidu pCMVLys41/KGE s primery 03 a 04 (konstrukce pRIT14596 se popisuje v sekci 1.3.1).
Získal se fragment PCR a plazmid pRIT 14597 (exprimující protein Nef-His), které se štěpily restrikčním enzymem Spěl, čistily se na agarózovém gelu a ligovaly se za vzniku integračního plazmidu pRJT14913.
3.2 Transformace Pichia pastoris kmen GS115
Kmeny Pichia pastoris exprimující Tat mutant-His protein a fúzní protein Nef-Tat mutant-His se získaly aplikací integrační a rekombinantní strategie selekce kmenů (popsaná shora v textu v sekci 2.2).
Vybraly se dva rekombinantní kmeny produkující Tat mutant-His protein obsahující 95 aminokyselin: Y1775 (fenotyp Mut+) a Y1776 (fenotyp Mut5).
Vybral se jeden rekombinantní kmen exprimující fúzní protein Nef-Tat mutant-His obsahující 302 aminokyselin: Y1774 (fenotyp Muf).
4. Čištění fúzního proteinu Nef-Tat-His (Pichia pastoris)
Vyvinulo se schéma čištění ze 146 g rekombinantních buněk Pichia pastoris (vlhká hmotnost) nebo ze 21 homogenátu (homogenizér Dyno) OD 55. Krok čištění chromatografii se uskutečnil pri teplotě místnosti. Mezi jednotlivými kroky se frakce obsahující Nef-Tat uchovávala přes noc v chladu (4 °C). Pri uchovávání po delší dobu se vzorky mrazí na teplotu -20 °C.
146 g buněk Pichia pastoris i homogenizace
Porušení buněk zařízení Dyno (4 průchody) i
Centrifugace
Pelet prochází zařízení Dyno
Promytí (1H při teplotě 4 °C)
Centrifugace
Pelet
Φ
Rozpuštění
Redukce (4 h při teplotě místnosti ve tmě
Pufr: 21 50mM PO4 pH 7,0, konečná hodnota OD: 50 rotor JA10/9 500 ot./min./teplota místnosti pufr: 21 lOmM PO4 pH 7,5-150mM NaCI 0,5% empigen rotor JA10/9 500 ot,/min./teplota místnosti pufr: 660 ml 10 mM PO4 pH 7,5-150mM NaCl-4,0M GuHCl +0,2M 2-merkaptoethansulfonová kyselina, sodná sůl (přidání prášku)/pH se upravilo na hodnotu 7,5 (roztokem 0,5M NaOH) před inkubací
Karboxymethylace (30 min, teplota místnosti
-11 CZ 302878 B6 ve tmě)
Afinitní chromatografie s imobilizovanými ionty kovů na Ni++-NTA-agaróza (Qiagen-30 ml pryskyřice)
Ředění i
Chromatografie s výměnou Kationtů na SP sefaróze FF (Pharmacia-30 ml pryskyřice)
Zvýšení koncentrace
Gelová filtrační Chromatografie na Superdexu 200XK 16/60 (Pharmacia-120 ml pryskyřice) dialýza (pres noc, pri teplotě 4 °C)
Sterilní filtrace +0,25M jodoacetamid (přidání prášku )/hodnota pH se upravila na 7,5 (roztokem 0,5M NaOH) před inkubací ekvilibrační pufr: lOmM PO4 pH 7,5-150mM NaCl-4M GuHCl promývací pufr: 1) ekvilibrační pufr
2) lOmM PO4 pH 7,5-150mM
NaCl-óM močovina
3) lOmM PO4 pH 7,5-+50mM NaCl-6M močovina-25mM imidazol
Eluční pufr: lOmM PO4 pH 7,5-150mM NaCl-óM močovina0,5M imidazol ředění na iontovou sílu 18 mS/cm2
Ředicí pufr: lOmM PO4 pH 7,5-6M močovina ekvilibrační pufr: lOmM PO4 pH 7,5-150mM NaCl-6M močovina promývací pufr:
1) ekvilibrační pufr
2) lOmM PO4 pH 7,5-250mM
NaCl-6M močovina
Eluční pufr: lOmM borát pH 9,0-2M NaCl-6M močovina na 5mg/ml
Membrána Omega lOKDa (Fíltron) eluční pufr: lOmM PO4 pH 7,5-150mM NaCl-6M močovina ml vzorku/injekce—>5 injekcí pufr: lOmM PO4 pH 6,8-150mM NaCl-0,5M arginin*
Millex GV 0,22 pm *poměr: 0,5M arginin pro koncentraci proteinu 1600 pg/ml. 40 Čistota
Stupeň čistoty se odhaduje pomocí SDS-PAGE a je zobrazen na obrázku č. 4. Datchiovým barvením stříbrem a na obrázku č. 5 barvením Coomassie modří G250.
Po kroku se Superdex200 je čistota vyšší než 95 %.
Po dialýze a sterilizaci filtrací je čistota vyšší než 95 %.
- 12CZ 302878 B6
Získaný protein
Ze 146 g buněk Pichia pastoris (=21 homogenátu, zařízení Dyno, OD 50) se získalo 51 mg pro5 teinu Nef-Tat-his.
5. Příprava vakcíny
Vakcína připravená v souladu s vynálezem obsahuje produkt exprese rekombinantní DNA, která io kóduje antigen, jak se popisuje v příkladu 1 nebo 2, ajako adjuvans slouží formulace obsahující směs 3-de-O-acetylovaný monofosforyllipid A 3D-MPL a QS21 v emulzi olej/voda.
3D-MPL: je chemicky detoxifikovaná forma lipopolysacharidu (LPS) gram-negativní bakterie Salmonella minnesota.
Experimenty provedené v instituci Smith Kline Beecham Biologicals ukázaly, že 3D-MPL kombinované s různými vehikuly silně zvyšuje jak humorální, tak buněčnou imunitu typu THL
QS21: je saponin čištěný ze surového extraktu kůry stromu Quilaja Saponaria Molina, které mají 20 silnou aktivitu adjuvans: aktivuje jak antigen-specifickou lymfoproliferaci a CTL vůči několika antigenům.
Experimenty provedené v instituci Smith Kline Beecham Biologicals ukázaly jasně synergický účinek kombinací 3D-MPL a QS21 pri indukci jak humorální tak buněčné imunitní odezvy typu
THL
Emulze olej/voda obsahuje 2 oleje (tokoferol a skvalen) a PBS obsahující jako emulgátor Tween 80. Emulze obsahovala 5 % skvalenu, 5 % tokoferol, 0,4 % Tween 80 a průměrná velikost partikulí je 180 nm (popisuje se v dokumentu WO 95/17 210).
Experimenty provedené v instituci Smith Kline Beecham Biologicals prokázaly, že přidání této emulze k 3D-MPL/QS21 dále zvyšuje jejich imunostimulační vlastnosti.
Příprava emulze olej/voda (2x koncentrováno)
Tween 80 se rozpustil ve fyziologickém roztoku pufrovaném fosforečnanem (PBS) za vzniku 2% roztoku v PBS. Aby vzniklo 100 ml dvakrát koncentrované emulze, tak se na vortexu promíchalo 5 g DL-alfa-tokoferolu a 5 ml skvalenu. Přidalo se 90 ml roztoku PBS/Tween a vše se promíchalo. Výsledná emulze pak prošla stříkačku a nakonec se mikrofluidizovala použitím mikroflui40 dizačního přístroje Ml 10S. Výsledné olejové kapky mají velikost přibližně 180 nm.
Příprava formulace olej ve vodě.
Antigen připravený v souladu s příkladem 1 nebo 2 (5 pg) se naředil v 1 Okřát koncentrovaném 45 PBS pH 6,8 a vodě a pak se přidávalo v pětiminutových intervalech SB6, 3D-MPL (5 pg), QS21 (5 μg) a 50 μg/mt thiomerzal, který se používá jako konzervační činidlo. Objem emulze odpovídá 50 % celkovému objemu (50 μΐ pro dávku 100 μΐ).
Všechny inkubace se provedly pri teplotě místnosti za stálého míchání.
6. Imunogenicita Tat a Nef-Tat u hlodavců
Provedla se charakterizace imunitní odezvy vyvolané po imunizaci Tat a Nef-Tat. Aby se získaly informace o izotopových profilech a buňkami zprostředkované imunitě (CMI), provedly se dva imunizační experimenty. Při prvním experimentu se myši imunizovaly dvakrát v intervalu dvou
- 13CZ 302878 B6 týdnů do tlapek proteinem Tat nebo Nef-Tat v oxidované nebo redukované formě. Antigeny se připravily v emulzi olej/voda, která obsahuje skvalen, tween 80™ (polyoxyethylensorbitanmonooleát) QS21, 3D-MPL a α-tokoferol a kontrolní skupině zvířat se aplikovalo pouze samotné adjuvans. Dva týdny po poslední imunizaci se získala séra a zkoumala se testem ELISA specifíc5 kým pro Tat (pří potahování se použil redukovaný Tat) za účelem stanovení titrů protilátek a izotopů (obrázek č. 6a). Titry protilátek jsou nejvyšší u myší, kterým se aplikoval oxidovaný Tat. V obecném případě oxidovaná molekula indukuje vyšší titry protilátek ve srovnání s redukovanými formami a samotný Tat vyvolal vyšší titry protilátek ve srovnání s Nef-Tat. Pozdější pozorování se porovnalo v druhém experimentu. Nejzajímavější je, že izotopový profil protilátek speciio fických pro Tat se liší v závislosti na antigenech používaných při imunizaci. Samotný Tat vyvolává rovnovážný profil IgGl a IgG2a, zatímco Nef-Tat vyvolává silnější odezvu TH2 (zobrazeno na obrázku č. 6b). To se potvrdilo ve druhém experimentu.
Ve druhém experimentu na myších se zvířatům aplikovaly pouze redukované formy molekul is nebo samotného adjuvans. Vedle serologických analýz (popisuje se shora v textu) se hodnotily také lymfoproliferaění odezvy z buněk lymfatických uzlin. Po opětné stimulaci těchto buněk in vitro s Tat nebo Nef-Tat se měřil po čtyřech dnech kultivace začleněný 3H-thymidin. Prezentace výsledků ukazuje, že velmi silné odezvy se indukovaly v obou skupinách myší, kterým se aplikoval antigen (obrázek č. 7).
Závěrem lze říci, že studium myší ukazuje, že Tat stejně jako Nef-Tat je vysoce imunogenní kandidát vakcinačnícb antigenů. Imunitní odezvy proti oběma molekulám se charakterizuje vysokou odezvou protilátek s alespoň 50 % lgG 1. Dále se zjistila silná odezva CMI (měřená lymfoproliferací).
6. Funkční vlastnosti proteinů Tat a Nef-Tat
U molekul Tat a Nef-Tat v oxidované a redukované formě se zkoumala schopnost vázat se na lidské linie T buněk. Dále se posuzoval účinek na růst těchto buněčných linií. Destičky vhodné io po test ELISA se potáhly přes noc různými koncentracemi proteinu Tat a Nef-Tat, irelevantní gD z viru herpes simplex typ II, nebo samotným pufrem, což slouží jako kontrola. Po dvou hodinách inkubace se prohlubně promyly a mikroskopicky se hodnotilo navázání buněk na dno prohlubní.
Buňky se obarvily toluidinovou modří, lyžovaly se SDS a koncentrace toluidinové modře v supematantu se stanovila odečítacím zařízením vhodným pro mikrotitrační destičky pro test
ELISA. Výsledky ukazují, že všechny čtyři proteiny Tat a Nef-Tat v oxidované nebo redukované formě zprostředkovávají navázání buněk na destičky vhodné pro test ELISA (zobrazeno na obrázku č. 8). Irelevantní protein (data nejsou uvedeny) a samotný pufr nezpůsobily fixaci buněk. Tato skutečnost naznačuje, že rekombinantně exprimované proteiny obsahující Tat se specificky vážou na lidské linie T buněk.
Při druhém experimentu buňky HUT-78 se nechaly v přítomnosti proteinů po dobu 16 hodin. Na konec inkubace se buňky značily [3H]-thymidinem a rychlost začlenění se stanovilo jako míra buněčného růstu. Všechny čtyři proteiny, které se účastní v tomto testu inhibovaly růst buněk, jak se odhaduje ze snížení začleněné radioaktivity (obrázek č. 9). Kontrolní měření nezprostředková45 vá tento účinek. Tyto výsledky demonstrují, že rekombinantní proteiny obsahující Tat jsou schopny inhibovat růst lidské buněčné linie buněk T.
Funkční charakterizace proteinů Tat a Nef-Tat ukázala, že tyto proteiny jsou schopny vázat lidskou buněčnou linii T buněk. Dále, takové proteiny jsou schopny inhibovat růst takových buněčných linií.
- 14CZ 302878 B6
Seznam sekvencí (2) Informace o SEQ ID NO: 1:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 28 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová io (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 1:
ATCGTCCATG .GGT.GGC.A AG.TGG.T 28 (2) Informace o SEQ ID NO: 2:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 23 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 2:
CGGCTACTAG TGCAGTTCTT GAA 23 (2) Informace o SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 29 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 3:
35 ATCGTACTAG T.GAG.CCA. GTA.GAT.C 29 (2) Informace o SEQ ID NO: 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 24 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 4:
CGGCTACTAG TTTCCTTCGG GCCT 24
- 15 CZ 302878 B6 (2) Informace o SEQ ID NO: 5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 23 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 5:
ATCGTCCATG GAGCCAGTAG ATC 23 (2) Informace o SEQ ID NO: 6:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 441 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 6:
atggatccaa aaactttagc cctttcttta TTAGCAGCTG GCGTACTAGC AGGTTGTAGC 60
AGCCATTCAT CAAATATGGC GAATACCCAA ATGAAATCAG ACAAAATCAT TATTGCTCAC 120
CGTGGTGCTA GCGGTTATTT ACCAGAGCAT ACGTTAGAAT CTAAAGCACT TGCTTTTGCA 180
CAACAGGCTG ATTATTTAGA GCAAGATTTA GCAATGACTA AGGATGGTCG TTTAGTGGTT 240
ATTCACGATC ACTTTTTAGA TGGCTTGACT GATGTTGCGA AAAAATTCCC ACATCGTCAT 300
CGTAAAGATG GCCGTTACTA TGTCATCGAC TTTACCTTAA AAGAAATTCA AAGTTTAGAA 360
ATGAGAGAAA ACTTTGAAAC CATGGCCACG TGTGATCAGA GCTCAACTAG TGGCCACCAT 420
CACCATCACC ATTAATCTAG A 441 (2) Informace o SEQ ID NO: 7:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 144 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 7:
Met | Asp | Pro | Lys | Thr | Leu | Ala | Leu | Ser | Leu | Leu | Ala | Ala | Gly | Val | Leu |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||||
Ala | Gly | Cys | Ser | Ser | His | Ser | Ser | Asn | Met | Ala | Asn | Thr | Gin | Met | Lys |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ser | Asp | Lys | Zle | Zle | Zle | Ala | His | Arg | Gly | Ala | Ser | Gly | Tyr | Leu | Pro |
35 | 40 | 45 | |||||||||||||
Glu | His | Thr | Leu | Glu | Ser | Lys | Ala | Leu | Ala | Phe | Ala | Gin | Gin | Ala | Asp |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Tyr | Leu | Glu | Gin | Asp | Leu | Ala | Met | Thr | Lys | Asp | Gly Arg | Leu | Val | Val | |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Ile | His | Asp | His | Phe | Leu | Asp | Gly | Leu | Thr | Asp | Val | Ala | Lys | Lys | Phe |
85 | 90 | 95 |
- 16CZ 302878 B6
Pro His | Arg | His Arg Lys Asp Gly Arg Tyr Tyr Val Ile Asp Phe Thr | ||||||||||||
100 | 105 | 110 | ||||||||||||
Leu | Lys | Glu | Ile | Gin | Ser | Leu | Glu | Met Thr | Glu | Asn | Phe | Glu | Thr | Met |
1X5 | 120 | 125 | ||||||||||||
Ala | Thr | Cys | Asp | Gin | Ser | Ser | Thr | Ser Gly | Hia | His | His | His | His | His |
130 | 135 | 140 |
(2) Informace o SEQ ID NO: 8:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 648 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 8:
ATGGGTGGCA AGTGGTCAAA AAGTAGTGTG GTTGGATGGC CTACTGTAAG GGAAAGAATG AGACGAGCTG AGCCAGCAGC AGATGGGGTG GGAGCAGCAT CTCGAGACCT GGAAAAACAT GGAGCAATCA CAAGTAGCAA TACAGCAGCT ACCAATGCTG OTGTGCCTG GCTAGAAGCA CAAGAGGAGG AGGAGGTGGG TTTTCCAGTC ACACCTCAGC TACCTTTAAG ACCAATGACT TAGAAGGCAG CTGTAGATCT TAGCCACTTT TTAAAAGAAA AGGGGGGACT GGAAGGGCTA ATTCACTCCC AACGAAGACA AGATATCOT GATCTGTGGA TCTACCACAC ACAAGGCTAC TTCCCTGATT GGCAGAACTA CACACCAGGG CCAGGGGTCA GATATCCACT GACCTTTGGA TGGTGCTACA AGCTAGTACC AGTTGAGCCA GATAAGGTAG AAGAGGCCAA TAAAGGAGAG AACACCAGCT TGTTACACCC TGTGAGCCTG CATGGAATGG ATGACCCTGA GAGAGAAGTG TTAGAGTGGA GGTTTGAGAG CCGCCTAGCA TTTCATCACG TGGCCCGAGA GCTGCATCCG GAGTACTTCA AGAACTGCAC TAGTGGCCAC CATCACCATC ACCATTAA (2) Informace o SEQ ID NO: 9:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 216 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 9:
120
190
240
300
360
420
4S0
540
600
648
Met 1 | Gly Gly Lys | Trp Ser 5 | Lys | Ser | Ser | Val 10 | Val | Gly Trp | Pro | Thr Val 15 | ||
Arg | Glu | Arg Met Arg Arg 20 | Ala | Glu | Pro 25 | Ala | Ala | Asp Gly | Val 30 | Gly Ala | ||
Ala | Ser | Arg Asp 35 | Leu | Glu | Lys | His 40 | Gly | Ala | Ile | Thr Ser 45 | Ser | Asn Thr |
Ala | Ala 50 | Thr Asn | Ala | Ala | Cys 55 | Ala | Trp | Leu | Glu | Ala Gin 60 | Glu | Glu Glu |
Glu 65 | Val | Gly Phe | Pro | Val 70 | Thr | Pro | Gin | Val | Pro 75 | Leu Arg | Pro | Met Thr 80 |
Tyr | Lys | Ala Ala | Val 85 | Asp | Leu | Ser | His | Phe 90 | Leu | Lys Glu | Lys | Gly Gly 95 |
Leu | Glu | Gly Leu 100 | Ile | His | Ser | Gin | Arg 105 | Arg | Gin | Asp Ile | Leu 110 | Asp Leu |
Trp | Ile | Tyr His 115 | Thr | Gin | Gly | Tyr 120 | Phe | Pro | Asp | Trp Gin 125 | Asn | Tyr Thr |
- 17CZ 302878 B6
Pro Gly 130 | Pro Gly | Val | Arg | Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys | |||||||||||
135 | 140 | ||||||||||||||
Leu | Val | Pro | Val | Glu | Pro | Asp | Lys | Val | Glu | Glu | Ala | Asn | Lys | Gly | Glu |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Aan | Thr | Ser | Leu | Leu | His | Pro | Val | Ser | Leu | His | Gly | Met | Asp | Asp | Pro |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Glu | Arg | Glu | Val | Leu | Glu | Trp | Arg | Phe | Asp | Ser | Arg | Leu | Ala | Phe | His |
130 | 185 | 190 | |||||||||||||
H±3 | Val | Ala | Arg | Glu | Leu | His | Pro | Glu | Tyr | Phe | Lys | Asn | Cys | Thr | Ser |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Gly | His | His | His | His | His | His | |||||||||
210 | 215 |
(2) Informace o SEQ ID NO: 10:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 288 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 10:
ATGGAGCCAG TAGATCCTAG ACTAGAGCCC TGGAAGCATC CAGGAAGTCA GCCTAAAACT 60
GCTTGTACCA ATTGCTATTG TAAAAAGTGT TGCTTTCATT GCCAAGTTTG TTTCATAACA 120
AAAGCCTTAG GCATCTCCTA TGGCAGGAAG AAGCGGAGAC AGCGACGAAG ACCTCCTCAA 180
GGCAGTCAGA CTCATCAAGT TTCTCTATCA AAGCAACCCA CCTCCCAATC CCGAGGGGAC 240
CCGACAGGCC CGAAGGAAAC TAGTGGCCAC CATCACCATC ACGAZTAA 288 (2) Informace o SEQ ID NO: 11:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 96 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 11:
Met 1 | Glu | Pro | Val | Asp 5 | Pro | Arg | Leu Glu | Pro 10 | Trp | Lys | His | Pro | Gly 15 | Ser |
Gin | Pro | Lys | Thr 20 | Ala | Cys | Thr | Asn Cys 25 | Tyr Cys | Lys | Lys | Cys 30 | Cys | Phe | |
His | Cys | Gin 35 | Val | Cys | Phe | Ile | Thr Lys 40 | Ala | Leu | Gly | Ile 45 | Ser | Tyr | Gly |
Arg | Lys 50 | Lys | Arg | Arg | Gin | Arg 55 | Arg Arg | Pro | Pro | Gin 60 | Gly | Ser | Gin | Thr |
His 65 | Gin | val | Ser | Leu | Ser 70 | Lys | Gin Pro | Thr | Ser 75 | Gin | Ser | Arg | Gly | Asp 80’ |
Pro | Thr | Gly | Pro | Lys 85 | Glu | Thr | Ser Gly | His 90 | His | His | His | His | His 95 |
(2) Informace o SEQ ID NO: 12:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 909 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina
- 18CZ 302878 B6 (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 12:
atgggtggca agtggtcaaa aagtagtgtg gttggatggc ctactgtaag ggaaagaatg AGACGAGCTG AGCCAGCAGC AGATGGGGTG GGAGCAGCAT CTCGAGACCT GGAAAAACAT GGAGCAATCA CAAGTAGCAA TACAGCAGCT ACCAATGCT5 CTTGTGCCTG GCTAGAAGCA CAAGAGGAGG AGGAGGTGGG TTTTCCAGTC ACACCTCAGG TACCTTTAAG ACCAATGACT TACAAGGCAG CTGTAGATCT TAGCCACTTT TTAAAAGAAA AGGGGGGACT GGAAGGGCTA attcactccc aacgaagaca agatatcctt gatctgtgga tctaccacac acaaggctac TTCCCTGATT GGCAGAACTA CACACCAGGG CCAGGGGTCA GATATCCACT GACCTTTGGA TGGTGCTAGA AGCTAGTACC AGTTGAGCCA GATAAGGTAG AAGAGGCCAA TAAAGGAGAG AACACCAGCT TGTTACACCC TGTGAGCCTG CATGGAATGG ATGACCCTGA GAGAGAAGTG TTAGAGTGGA GGTTTGACAG CCGCCTAGCA TTTCATCACG TGGCCCGAGA GCTGCATCCG gagtacttca agaactgcac tagtgagcca GTAGATCCTA gactagagcc ctggaagcat CCAGGAAGTC AGCCTAAAAC TGCTTGTACC AATTGCTATT GTAAAAAGTG TTGCTTTCAT TGCCAAGTTT GTTTCATAAC AAAAGCCTTA GGCATCTCCT ATGGCAGGAA GAAGCGGAGA CAGCGACGAA GACCTCCTCA AGGCAGTCAG ACTCATCAAG TTTCTCTATC AAAGCAACCC ACCTCCCAAT CCCGAGGGGA CCCGACAGGC CCGAAGGAAA CTAGTGGCCA CCATCACCAT
CACCATTAA (2) Informace o SEQ ID NO: 13:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: io (A) DÉLKA: 303 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 13:
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
909
Met 1 | Gly | Gly | Lys | Trp 5 | Ser | Lys | Ser | Ser | Val 10 | Val | Gly | Trp | Pro | Thr 15 | Val |
Arg | Glu | Arg | Met 20 | Arg | Arg | Ala | Glu | Pro 25 | Ala | Ala | Asp | Gly | Val 30 | Gly | Ala |
Ala | Ser | Arg 35 | Asp | Leu | Glu | Lys | His 40 | Gly | Ala | Ue | Thr | Ser 45 | Ser | Asn | Thr |
Ala | Ala 50 | Thr | Asn | Ala | Ala | Cys 55 | Ala | Trp | Leu | Glu | Ala 60' | Gin | Glu | Glu | Glu |
Glu 65 | Val | Gly | Phe | Pro | Val 70 | Thr | Pro | Gin | Val | Pro 75 | Leu | Arg | Pro | Met | Thr 80 |
Tyr | Lys | Ala | Ala | Val 85 | Asp | Leu | Ser | His | Phe 90 | Leu | Lys | Glu | Lys | Gly Gly 95 | |
Leu | Glu | Gly | Leu 100 | Ile | His | Ser | Gin | Arg 105 | Arg | Gin | ASP | Ile | Leu 110 | Asp | Leu |
Trp | Ile | Tyr 115 | His | Thr | Gin | Gly | Tyr 120 | Phe | Pro | Asp | Trp | Gin 125 | Asn | Tyr | Thr |
Pro | Gly 130 | Pro | Gly | Val | Arg | Tyr 135 | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly 140 | Trp | Cys | Tyr | Lys |
Leu 145 | Val | Pro | Val | Glu | Pro 150 | Asp | Lys | Val | Glu | Glu 155 | Ala | Asn | Lys | Gly | Glu 160 |
Asn | Thr | Ser | Leu | Leu 165 | His | Pro | Val | Ser | Leu 170 | HiS | Gly | Met | Asp | Asp 175 | Pro |
Glu | Arg | Glu | Val 180 | Leu | Glu | Trp | Arg | Phe 185 | Asp | Ser | Arg | Leu | Ala 190 | Phe | His |
- 19 CZ 302878 B6
His Val Ala Arg Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Thr Ser 195 200 205
Glu Pro Val Asp Pro Arg Leu Glu Pro Trp Lys His Pro Gly Ser Gin 210 215 220
Pro Lys Thr Ala Cys Thr Asn Cys Tyr Cys Lys Lys Cys Cys Phe His
225 230 235 240
Cys Gin Val Cys Phe Ile Thr Lys Ala Leu Gly Ile Ser Tyr Gly Arg
245 250 255
Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Gin Gly Ser Gin Thr His
260 265 270
Gin Val Ser Leu Ser Lys Gin Pro Thr Ser Gin Ser Arg Gly Asp Pro
275 280 285
Thr Gly Pro Lys Glu Thr Ser Gly His His His His His His
290 295 300 (2) Informace o SEQ ID NO: 14:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1029 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 14:
ATGGAICCAA AAACTTTAGC CCTTTCTTTA TTAGCAGCTG GCGTACTAGC AGGTTGTAGC 60
AGCCATTCAT CAAATATGGC GAATACCCAA ATGAAATCAG ACAAAATCAT TATTGCTCAC 120
CGTGGTGCTA GCGGTTATTT ACCAGAGCAT ACGTTAGAAT CTAAAGCACT TGCTTTTGCA 180
CAACAGGCTG ATTATTTAGA GCAAGATTTA GCAATGACTA AGGATGGTCG TTTAGTGGTT 240
ATTCACGATC ACTTTTTAGA TGGCTTGACT GATGTTGCGA AAAAATTCCC ACATCGTCAT 300
CGTAAAGATG GCCGTTACTA TGTCATCGAC TTTACCTTAA AAGAAATTCA AAGTTTAGAA 360
ATGACAGAAA ACTTTGAAAC CATGGGTGGC AAGTGGTCAA AAAGTAGTGT GGTTGGATGG 420
CCTACTGTAA GGGAAAGAAT GAGACGAGCT GAGCCAGCAG CAGATGGGGT GGGAGCAGCA 480
TCTCGAGACC TGGAAAAACA TGGAGCAATC ACAAGTAGCA ATACAGCAGC TACCftATGCT S40
GCTTGTGCCT GGCTAGAAGC ACAAGAGGAG GACGAGGTGG GTTTTCCAGT CACACCTCAG 600
GTACCTTTAA GACCAATGAC TTACAAGGCA GCTGTAGATC TTAGCCACTT TTTAAAAGAA 660
AAGGGGGGAC TGGAAGGGCT AATTCACTCC CAACGAAGAC AAGATATCCT TGATCTGTGG 720
ATCTACCACA CACAAGGCTA CTTCCCTGAT TGGCAGAACT ACACACCAGG GCCAGGGGTC 780
AGATATCCAC TGACCTTTGG ATGGTGCTAC AAGCTAGTAC CAGTTGAGCC AGATAAGGTA 840
GAAGAGGCCA ATAAAGGAGA GAACACCAGC TTGTTACACC CTGTGAGCCT GCATGGAATG 900
GATGACCCTG AGAGAGAAGT GTTAGAGTGG AGGTTTGACA GCCGCCTAGC ATTTCATCAC 960
GTGGCCCGAG AGCTGCATCC GGAGTACTTC AAGAACTGCA CTAGTGGCCA CCATCACCAT 1020
CftCCATTAA 1029 (2) Informace o SEQ ID NO: 15:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 325 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 15:
-20CZ 302878 B6
Cys Ser Ser His | Ser Ser Asn | Met Ala Asn | Thr Gin | Met | Lys Ser Asp |
1 | 5 | 10 | 15 | ||
Lys Zle Ile Ile | Ala His Arg Gly Ala Ser | Gly Tyr | Leu | Pro Glu His | |
20 | 25 | 30 | |||
Thr Leu Glu Ser | Lys Ala Leu | Ala Phe Ala | Gin Gin | Ala | Asp Tyr Leu |
35 | 40 | 45 | |||
Glu Gin Asp Leu | Ala Met Thr | Lys Asp Gly Arg Leu | Val | Val Ile His | |
50. | 55 | 60 | |||
Asp His Phe Leu | Asp Gly Leu | Thr Asp Val | Ala Lys | Lys | Phe Pro His |
65 | 70 | 75 | 80 | ||
Arg His Arg Lys Asp Gly Arg Tyr Tyr Val | Ile Asp | Phe | Thr Leu Lys | ||
95 | 90 | 95 | |||
Glu Ile Gin Ser | Leu Glu Met | Thr Glu Asn | Phe Glu | Thr | Met Gly Gly |
100 | 105 | 110 | |||
Lys Trp Ser Lys | Ser Ser Val | Val Gly Trp | Pro Thr | val | Arg Glu Arg |
115 | 120 | 125 | |||
Met Arg Arg Ala | Glu Pro Ala | Ala Asp Gly | Val Gly | Ala | Ala Ser Arg |
130 | 135 | 140 | |||
Asp Leu Glu Lys | His Gly Ala | Ile Thr Ser | Ser Asn | Thr | Ala Ala Thr |
145 | 150 | 155 | 160 | ||
Asn Ala Ala Cys | Ala Trp Leu | Glu Ala Gin | Glu Glu | Glu | Glu Val Gly |
165 | 170 | 175 | |||
Phe Pro Val Thr | Pro Gin Val | Pro Leu Arg | Pro Met | Thr | Tyr Lys Ala |
ISO | 185 | 190 | |||
Ala Val Asp Leu | Ser His Phe | Leu Lys Glu | Lys Gly Gly | Leu Glu Gly | |
195 | 200 | 205 | |||
Leu Ile His Ser | Gin Arg Arg | Gin Asp Ile | Leu Asp | Leu | Trp Ile Tyr |
210 | 215 | 220 | |||
His Thr Gin Gly | Tyr Phe Pro | Asp Trp Gin | Asn Tyr | Thr | Pro Gly Pro |
225 | 230 | 235 | 240 | ||
Gly Val Arg Tyr | Pro Leu Thr | Phe Gly Trp Cys Tyr Lys | Leu Val Pro | ||
245 | 250 | 255 | |||
Val Glu Pro Asp Lys Val Glu | Glu Ala Asn | Lys Gly | Glu | Asn Thr Ser | |
260 | 265 | 270 | |||
Leu Leu His Pro | Val Ser Leu | His Gly Met | Asp Asp | Pro | Glu Arg Glu |
275 | 280 | 285 | |||
Val Leu Glu Trp Arg Phe Asp | Ser Arg Leu | Ala Phe | His | His Val Ala | |
290 | 295 | 300 | |||
Arg Glu Leu His | Pro Glu Tyr | Phe Lys Asn | Cys Thr | Ser | Gly His His |
305 | 310 | 315 | 320 | ||
His His His Bis |
(2) Informace o SEQ ID NO: 16:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1290 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 16:
-21 CZ 302878 B6
ATGGATCCAA AAACTTTAGC CCTTTCTTTA TTAGCAGCTG GCGTACTAGC AGGTTGTAGC AGCCATTCAT CAAATATGGC GAATACCCAA ATGAAATCAG ACAAAATCAT TATTGCTCAC CGTGGTGCTA GCGGTTATTT ACCAGAGCAT ACGTTAGAAT CTAAAGCACT TGCGTTTGCA CAACAGGCTG ATTATTTAGA GCAAGATTTA GCAATGACTA AGGATGGTCG TTTAGTGGTT ATTCACGATC ACTTTTTAGA TGGCTTGACT GATGTTGCGA AAAAATTCCC ACATCGTCAT CGTAAAGATG GCCGTTACTA TGTCATCGAC TTTACCTTAA AAGAAATTCA AAGTTTAGAA ATGACAGAAA ACTTTGAAAC CATGGGTGGC AAGTGGTCAA AAAGTAGTGT GGTTGGATGG CCTACTGTAA GGGAAAGAAT GAGACGAGCT GAGCCAGCAG CAGATGGGGT GGGAGCAGCA TCTCGASACC TGGAAAAACA TGGAGCAATC ACAAGTAGCA AxaCAGCaOC ŤAČCAATGCT GCTTGTGCCT GGCTAGAAGC ACAAGAGGAG GAGGAGGTGG GTTTTCCAGT CACACCTCAG GTACCTTTAA GACCAATGAC TTACAAGGCA GCTGTAGATC TTAGCCACTT TTTAAAAGAA AAGGGGGGAC TGGAAGGGCT AATTCACTCC CAACGAAGAC AAGATATCCT TGATCTGTGG ATCTACCACA CACAAGGCTA CTTCCCTGAT TGGCAGAACT ACACACCAGG GCCAGGGGTC AGATATCCAC TGACCTTTGG ATGGTGCTAC AAGCTAGTAC CAGTTGAGCC AGATAAGGTA GAAGAGGCCA ATAAAGGAGA GAACACCAGC TTGTTACACC CTGTGAGCCT GCATGGAATG
GATGACCCTG AGAGAGAAGT GTTAGAGTGG AGGTTTGACA GCCGCCTAGC ATTTCATCAC gtggcccgag AGCTGCATCC GGAGTACTTC AAGAACTGCA ctagtgagcc AGTAGATCCT AGACTAGAGC CCTGGAAGCA TCCAGGAAGT CAGCCTAAAA CTGCTTGTAC CAATTGCTAT TGTAAAAAGT GTTGCTTTCA TTGCCAAGTT TGTTTCATAA CAAAAGCCTT AGGCATCTCC TATGGCAGGA AGAAGCGGAG ACAGCGACGA AGACCTCCTC AAGGCAGTCA GACTCATCAA GTTTCTCTAT CAAAGCAACC CACCTCCCAA TCCCGAGGGG ACCCGACAGG CCCGAAGGAA ACTAGTGGCC ACCATCACCA TCACCATTAA
120
180
240
300
360
420
480
540
600
660
720
780
840
900
960
1020
1080
1140
1200
1260
1290 (2) Informace o SEQ ID NO: 17:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 412 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 17:
Cys Ser | Ser | His Ser Ser Asn Met Ala | Asn Thr Gin | Met | Lys | Ser | Asp |
1 | 5 | 10 | 15 | ||||
Lys 11· | Ile | 11· Ala His Arg Gly Ala 20 25 | Ser Gly Tyr | Leu | Pro 30 | Glu | HiS |
Thr Leu | Glu 35 | Ser Lys Ala Leu Ala Phe 40 | Ala Gin Gin | Ala 45 | Asp | Tyr | Leu |
Glu Gin 50 | Asp | Leu Ala Met Thr Lys Asp 55 | Gly Arg Leu 60 | Val | Val | Xle | His |
Asp His 65 | Phe | Leu Asp Gly Leu Thr Asp 70 | Val Ala Lys 75 | Lys | Phe | Pro | His 80 |
Arg His | Arg Lys Asp Gly Arg Tyr Tyr 85 | Val Ile Asp 90 | Phe | Thr | Leu 95 | Lys | |
Glu 11· | Gin | Ser Leu Glu Met Thr Glu 100 105 | Asn Phe Glu | Thr | Met 110 | Gly | Gly |
Lys Trp | Ser 115 | Lys Ser Ser Val Val Gly Trp Pro Thr 120 | val 125 | Arg | Glu | Arg | |
Met Arg 130 | Arg | Ala Glu Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly 135 140 | Ala | Ala | Ser | Arg | |
Asp Leu 145 | Glu | Lys His Gly Ala Xle Thr 150 | Ser Ser Asn 155 | Thr | Ala | Ala | Thr 160 |
Asn Ala | Ala | Cys Ala Trp Leu Glu Ala 165 | Gin Glu Glu 170 | Glu | Glu | Val 175- | Gly |
Phe Pro | Val | Thr Pro Gin Val Pro Leu 180 185 | Arg Pro Met | Thr | Tyr 190 | Lys | Ala |
Ala Val | Asp 195 | Leu Ser His Phe Leu Lys 200 | Glu Lys Gly Gly 205 | Leu | Glu | Gly |
-22 CZ 302878 B6
Leu Ile His Sec Gin Arg Acg Gin Asp Ile Leu Asp Leu Tep Ile Tyr
210 215 220
His The Gin Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gin Asn Tyr Thr Pro Gly Pro
225 230 235 240
Gly Vel Arg Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Trp Cys Tyr Lys Leu Val Pro
245 250 255
Val Glu Pro Asp Lys Val Glu Glu Ala Asn Lys Gly Glu Asn Thr Ser
260 265 270
Leu Leu His Pro Val Ser Leu His Gly Met Asp Asp Pro Glu Arg Glu
275 280 285
Val Leu Glu Trp Arg Phe Asp Ser Arg Leu Ala Phe His His Val Ala
290 295 300
Arg Glu Leu His Pro Glu Tyr Phe Lys Asn Cys Thr Ser Glu Pro Val
305 310 315 320
Asp Pro Arg Leu Glu Pro Trp Lys His Pro Gly Ser Gin Pro Lys Thr
325 330 335
Ala Cys Thr Asn Cys Tyr Cys Lys Lys Cys Cys Phe His Cys Gin Val
340 345 350
Cys Phe Ile Thr Lys Ala Leu Gly Ile Ser Tyr Gly Arg Lys Lys Arg
355 360 365
Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Gin Gly Ser Gin Thr His Gin Val Ser
370 375 380
Leu Ser Lys Gin Pro Thr Ser Gin Ser Arg Gly Asp Pro Thr Gly Pro 385 390 395 400
Lys Glu Thr Ser Gly His His His His His His
405 4io (2) Informace o SEQ ID NO: 18:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 98 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 18:
ATGGATCCAA GCAGCCATTC ATCAAATATG GCGAATACCC AAATGAAATC AGACAAAATC 60
ATTATTGCTC ACCGTGGTGC TAGCGGTTAT TTACCAGAGC ATACGTTAGA ATCTAAAGCA 120
CTTGCGTTTG CACAACAGGC TGATTATTTA GAGCAAGATT TAGCAATGAC TAAGGATGGT 180
CGTTTAGTGG TTATTCACGA TCACTTTTTA GATGGCTTGA CTGATGTTGC GAAAAAATTC 240
CCACATCGTC ATCGTAAAGA TGGCCGTTAC TATGTCATCG ACTTTACCTT AAAAGAAATT 300
CAAAGTTTAG AAATGACAGA AAACTTTGAA ACCATGGGTG GCAAGTGGTC AAAAAGTAGT 360
GTGGTTGGAT GGCCTACTGT AAGGGAAAGA ATGAGACGAG CTGAGCCAGC AGCAGATGGG 420
GTGGGAGCAG CATCTCGAGA CCTGGAAAAA CATGGAGCAA TCACAAGTAG CAATACAGCA 480
GCTACCAATG CTGCTTGTGC CTGGCTAGAA GCACAAGAGG AGGAGGAGGT GGGTTTTCCA 540
GTCACACCTC AGGTACCTTT AAGACCAATG ACTTACAAGG CAGCTGTAGA TCTTAGCCAC 600
TTTTTAAAAG AAAAGGGGGG ACTGGAAGGG CTAATTCACT CCCAACGAAG ACAAGATATC 660
CTTGATCTGT GGATCTACCA CACACAAGGC TACTTCCCTG ATTGGCAGAA CTACACACCA 720
GGGCCAGGGG TCAGATATCC ACTGACCTTT GGATGGTGCT ACAAGCTAGT ACCAGTTGAG 780
CCAGATAAGG TAGAAGAGGC CAATAAAGGA GAGAACACCA GCTTGTTACA CCCTGTGAGC 840
CTGCATGGAA TGGATGACCC TGAGAGAGAA GTGTTAGAGT GGAGGTTTGA CAGCCGCCTA 900
GCATTTCATC ACGTGGCCCG AGAGCTGCAT CCGGAGTACT TCAAGAACTG CACTAGTGGC 960
CACCATCACC ATCACCATTA A 981 (2) Informace o SEQ ID NO: 19:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 327 aminokyselin
-23CZ 302878 B6 (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 19:
Met 1 | Asp | Pro Ser Ser His Ser Ser Asn Met Ala Asn Thr Gin Met | Lys | ||
5 | 10 | 15 | |||
Sex | Asp | Lys Ile Zle 20 | Ile Ala His Arg Gly 25 | Ala Ser Gly Tyr Leu 30 | Pro |
Glu | His | Thr Leu Glu 35 | Ser Lys Ala Leu Ala 40 | Phe Ala Gin Gin Ala 45 | Asp |
Tyr | Leu 50 | Glu Gin Asp | Leu Ala Met Thr Lys 55 | Asp Gly Arg Leu Val 60 | Val |
Ile 65 | His | Asp His Phe | Leu Asp Gly Leu Thr 70 | Asp Val Ala Lys Lys 75 | Phe 80 |
Pro | His | Arg His Arg Lys Asp Gly Arg Tyr Tyr Val Xle Asp Phe 85 90 95 | Thr | ||
Leu | Lys | Glu Ile Gin 100 | Ser Leu Glu Met Thr 105 | Glu Asn Phe Glu Thr 110 | Met |
Gly Gly | Lys Trp Ser 115 | Lys Ser Ser Val Val 120 | Gly Trp Pro Thr Val 125 | Arg | |
Glu | Arg 130 | Met Arg Arg | Ala Glu Pro Ala Ala 135 | Asp Gly Val Gly Ala 140 | Ala |
Ser 145 | Arg | Asp Leu Glu | Lys His Gly Ala Ile 150 | Thr Ser Ser Asn Thr 155 | Ala 160 |
Ala | Thr | Asn Ala Ala 165 | Cys Ala Trp Lau Glu Ala Gin Glu Glu Glu 170 175 | Glu | |
Val | Gly | Phe Pro Val 180 | Thr Pro Gin Val Pro 183 | Leu Arg Pro Met Thr 190 | Tyr |
I*ys | Ala | Ala Val Asp 195 | Leu Ser His Phe Leu 200 | Lys Glu Lys Gly Gly 205 | Leu |
Glu | Gly 210 | Leu Ile His | Ser Gin Arg Arg Gin 215 | Asp Ile Leu Asp Leu 220 | Trp |
Ile 225 | Tyr | His Thr Gin | Gly Tyr Phe Pro Asp 230 | Trp Gin Asn Tyr Thr 235 | Pro 240 |
Gly | Pro | Gly Val Acg Tyr Pro Leu The Pha 243 230 | Gly Trp Cys Tyr Lys 255 | Leu | |
Val | Pro | Val Glu Pro 260 | Asp Lys Val Glu Glu 265 | Ala Asn Lys Gly Glu 270 | Asn |
Thr | Ser | Leu Leu His 275 | Pro Val Ser Leu His 280 | Gly Met Asp Asp Pro 285 | Glu |
Arg | Glu 290 | Val Leu Glu | Trp Arg Phe Asp Ser 295 | Arg Leu Ala Phe His 300 | His |
Val 305 His | Ala His | Arg Glu Leu His His His | His Pro Glu Tyr Phe 310 His | Lys Asn Cys Thr Ser 315 | Gly 320 |
325 (2) Informace o SEQ ID NO: 20: io (i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1242 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineami (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 20:
ATGGATCCAA GCAGCCATTC ATCAAATATG GCGAATACCC AAATGAAATC AGACAAAATC 60
ATTATTGCTC ACCGTGGTGC TAGCGGTTAT TTACCAGAGC ATACGTTAGA ATCTAAAGCA 120
CTTGCGTTTG CACAACAGGC TGATTATTTA GAGCAAGATT TAGCAATGAC TAAGGATGGT 180
CGTTTAGTGG TTATTCACGA TCACTTTTTA GATGGCTTGA CTGATGTTGC GAAAAAATTC 240
CCACATCGTC ATCGTAAAGA TGGCCGTTAC TATGTCATCG ACTTTAGCTT AAAAGAAATT 300
CAAAGTTTAG AAATGAGAGA AAACTTTGAA ACCATGGGTG GCAAGTGGTC AAAAAGTAGT 360
GTGGTTGGAT GGCCTACTGT AAGGGAAAGA ATGAGACGAG CTGAGCCAGC AGCAGATGGG 420
GTGGGAGCAG CATCTCGAGA CCTGGAAAAA CAIGGAGCAA TCACAAGTAG CAATACAGCA 480
GCTACCAATG CTGCTTGTGC CTGGCTAGAA GCACAAGAGG AGGAGGAGGT GGGTTTTCCA 540
GTCACACCTC AGGTACCTTT AAGACCAATG ACTTACAAGG CAGCTGTAGA TCTTAGCCAC 600
TTTTTAAAAG AAAAGGGGGG ACTGGAAGGG CTAATTCACT CCCAACGAAG ACAAGATATC 660
CTTGATCTGT GGATCTACCA CACACAAGGC TACTTCCCTG ATTGGCAGAA CTACACACCA 720
GGGCCAGGGG TCAGATATCC ACTGACCTTT GGATGGTGCT ACAAGCTAGT ACCAGTTGAG 780
CCAGATAASG TAGAAGAGGC CAATAAAGGA GAGAACACCA GCTTGTTACA CCCTGTGAGC 840
CTGCATGGAA TGGATGACCC TGAGAGAGAA GTGTTAGAGT GGAGGTTTGA CAGCCGCCTA 900
GCATTTCATC ACGTGGCCCG AGAGCTGCAT CCGGAGTACT TCAAGAACTG CACTAGTGAG 960
CCAGTAGATC CTAGACTAGA GCCCTGGAAG CATCCAGGAA* GTCAGCCTAA AACTGCTTGT 1020
ACCAATTGCT ATTGTAAAAA GTGTTGCTTT CATTGCCAAG TTTGTTTCAT AACAAAAGCC 1080
TTAGGCATCT CCTATGGCAG GAASAAGCGG AGACAGCGAC GAAGACCTCC TCAAGGCAGT 1140
CAGACTCATC AAGTTTCTCT ATCAAAGCAA CCCACCTCCC AATCCCGAGG GGACCCGACA 1200
GGCCCGAAGG AAAGTAGTGG CCACCATCAC CATCACCATT AA 1242 (2) Informace o SEQ ID NO: 21:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 414 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová io (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 21:
Met Asp Pro Ses Ser His Ser | Ser Asn Met Ala Asn | Thr Gin | Met | Lys |
1 5 | 10 | 15 | ||
Ser Asp Lys Ile Ile Ile Ala | His Arg Gly Ala Ser | Gly Tyr | Leu | Pro |
20 | 25 | 30 | ||
Glu His Thr Leu Glu Ser Lys | Ala Leu Ala Phe Ala | Gin Gin Ala | Asp | |
35 | 40 | 45 | ||
Tyr Leu Glu Gin Asp Leu Ala | Met Thr Lys Asp Gly Arg Leu | Val | Val | |
50 55 | 60 | |||
Ile His Asp His Phe Leu Asp | Gly Leu Thr Asp Val | Ala Lys | Lys | Phe |
65 70 | 75 | 80 | ||
Pro His Arg His Arg Lys Asp | Gly Arg Tyr Tyr Val | Ile Asp | Phe | Thr |
85 | 90 | 95 | ||
Leu Lys Glu Χία Gin Ser Leu | Glu Met Thr Glu Asn | Phe Glu | Thr | Met |
100 | 105 | 110 | ||
Gly Gly Lys Trp Ser Lys Ser | Ser Val Val Gly Trp | Pro Thr | Val | Arg |
115 | 120 | 125 | ||
Glu Arg Met Arg Arg Ala Glu | Pro Ala Ala Asp Gly Val Gly Ala | Ala | ||
130 135 | 140 | |||
Ser Arg Asp Leu Glu Lys His | Gly Ala Ile Thr Ser | Ser Asn | Thr | Ala |
145 150 | 155 | 160 | ||
Ala Thr Asn Ala Ala Cys Ala | Trp Leu Glu Ala Gin | Glu Glu | Glu | Glu |
165 | 170 | 175 | ||
Val Gly Phe Pro Val Thr Pro | Gin Val Pro Leu Arg | Pro Met | Thr | Tyr |
180 | 185 | 190 |
-25CZ 302878 B6
Lys | Ala | Ala | Val | Asp | Leu | Ser | His | Phe | Leu | Lys | Glu | Lys | Gly Gly | Leu | |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Glu | Gly | Leu | Ile | His | Ser | Gin | Arg | Arg | Gin | Asp | Ile | Leu | Asp | Leu | Trp |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Ile | Tyr | His | Thr | Gin | Gly Tyr | Phe | Pro | Asp Trp | Gin | Asn | Tyr | Thr | Pro | ||
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gly | Pro | Gly | Val | Arg | Tyr | Pro | Leu | Thr | Phe | Gly | Trp | Cys | Tyr | Lys | Leu |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Val | Pro | Val | Glu | Pro | Asp | Lys | Val | Glu | Giu | Ala | Asn | Lys | Gly | Glu | Asn |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Thr | Ser | Leu | Leu | His | Pro | Val | Ser | Leu | His | Gly | Met | Asp | Asp | Pro | Glu |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Arg | Glu | Val | Leu | Glu | Trp | Arg | Phe | Asp | Ser | Arg | Leu | Ala | Phe | His | His |
290 | 295 | 300· | |||||||||||||
Val | Ala | Arg | Glu | Leu | His | Pro | Glu | Tyr | Phe | Lys | Asn | Cys | Thr | Ser | Glu |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Pro | Val | Asp | Pro | Arg | Leu | Glu | Pro | Trp Lys | His | Pro | Gly | Ser | Gin | Pro | |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Lys | Thr | Ala | Cys | Thr | Asn | Cys | Tyr Cys | Lys | Lys | Cys | Cys | Phe | Bis | Cys | |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Gin | Val | Cys | Phe | Ile | Thr | Lys | Ala | Leu | Gly | Ile | Ser | Tyr | Gly | Arg | Lys |
355 | 360 | 365 | |||||||||||||
Lys | Arg | Arg | Gin | Arg Arg Arg | Pro | Pro | Gin | Gly | Ser | Gin | Thr | His | Gin | ||
370 | 375 | 380 | |||||||||||||
Val | Ser | Leu | Ser | Lys | Gin | Pro | Thr | Ser | Gin | Ser | Arg | Gly | Asp | Pro | Thr |
385 | 390 | 395 | 400 | ||||||||||||
Gly | Pro | Lys | Glu | Thr | Ser | Gly | His | His | His | His | His | His |
405 410 (2) Informace o SEQ ID NO: 22:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 288 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová io (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 22:
ATGGAGCCAG TAGATCCTAG ACTAGAGCCC TGGAAGCATC CAGGAAGTCA GCCTAAAACT 60
GCTTGTACCA ATTGCTATTG TAAAAAGTGT TGCTTTCATT GCCAAGTTTG TTTCATAACA 120
GCTGCCTTAG GCATCTCCTA TGGCAGGAAG AAGCGGAGAC AGCGACGAAG ACCTCCTCAA 180
GGCAGTCAGA CTCATCAAGT TTCTCTATCA AAGCAACCCA CCTCCCAATC CAAAGGGGAG 240
CCGACAGGCC CGAAGGAAAC TAGTGGCCAC CATCACCATC ACCATTAA 288 (2) Informace o SEQ ID NO: 23:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 96 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 23:
-26CZ 302878 B6
Met Glu Pro Val Asp Pro Arg Leu Glu Pro Trp Lys His Pro Gly Ser 15 10 15
Gin Pro Lys Thr Ala Cys Thr Asn Cys Tyr Cys Lys Lys Cys Cys Phe 20 25 30
His Cys Gin Val Cys Phe Ile Thr Ala Ala Leu Gly Ile Ser Tyr Gly
40 45
Arg Lys Lys Arg Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Gin Gly Ser Gin Thr
55 60
His Gin Val Ser Leu Ser Lys Gin Pro Thr Ser Gin Ser Lys Gly Glu
70 75 80
Pro Thr Gly Pro Lys Glu Thr Ser Gly His His His His His His
90 95 (2) Informace o SEQ ID NO: 24:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 909 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 24:
ATGGGTGGCA AGTGGTCAAA AAGTAGTGTG GTTGGATGGC CTAGTGTAAG GGAAAGAATG 60
AGACGAGCTG AGCCAGCAGC AGATGGGGTG GGAGCAGCAT CTCGAGACCT GGAAAAACAT 120
GGAGCAATCA CAAGTAGCAA TACAGCAGCT ACCAATGCTG CTTGTGCCTG GCTAGAAGCA 180
CAAGAGGAGG AGGAGGTGGG TTTTCCAGTC ACACCTCAGG TACCTTTAAG ACCAATGACT 240
TACAAGGCAG CTGTAGATCT TAGCCACTTT TTAAAAGAAA AGGGGGGACT GGAAGGGCTA 300
ATTCACTCCC AACGAAGACA AGATATCCTT GATCTGTGGA TCTACCACAC ACAAGGCTAC 360
TTCCCTGATT GGCAGAACTA CACACCAGGG CCAGGGGTCA GATATCCACT GACCTTTGGA 420
TGGTGCTACA AGCTAGTACC AGTTGAGCCA GATAAGGTAG AAGAGGCCAA TAAAGGAGAG 480
AACACCAGCT TGTTACACCC TGTGAGCCTG CATGGAATGG ATGACCCTGA GAGAGAAGTG S40
TTAGAGTGGA GGTTTGACAG CCGCCTAGCA TTTCATCACG TGGCCCGAGA GCTGCATCCG 600
GAGTACTTCA AGAACTGCAC TAGTGAGCCA GTAGATCCTA GACTAGAGCC CTGGAAGCAT 660
CCAGGAAGTC AGCCTAAAAC TGCTTGTACC AATTGCTATT GTAAAAAGTG TTGCTTTCAT 720
TGCCAAGTTT GTTTCATAAC AGCTGCCTTA GGCAICTCCT ATGGCAGGAA GAAGCGGAGA 780
CAGCGACGAA GACCTCCTCA AGGCAGTCAG ACTCATCAAG TTTCTCTATC AAAGCAACCC 840
ACCTCCCAAT CCAAAGGGGA GCCGACAGGC CCGAAGGAAA CTAGTGGCCA CCATCACCAT 900
CACCATTAA 909 (2) Informace o SEQ ID NO: 25:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 303 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 25:
-27CZ 302878 B6
Met | Gly | Gly | Lys Trp Ser | Lys Ser Ser Val Val | Gly Trp Pro Thr | Val |
1 | 5 | 10 | 15 | |||
Arg | Glu | Arg | Met Arg Arg | Ala Glu Pro Ala Ala | Asp Gly Val Gly | Ala |
20 | 25 | 30 | ||||
Ala | Ser | Arg | Asp Leu Glu | Lys His Gly Ala Ile | Thr Ser Ser Asn | Thr |
35 | 40 | 45 | ||||
Ala | Ala | Thr | Asn Ala Ala | Cys Ala Trp Leu Glu | Ala Gin Glu Glu | Glu |
50 | 55 | 60 | ||||
Glu | Val | Gly | Phe Pro Val | Thr Pro Gin Val Pro | Leu Arg Pro Met | Thr |
65 | 70 | 75 | 80 | |||
Tyr Lys | Ala | Ala Val Asp | Leu Ser His Phe Leu | Lys Glu Lys Gly Gly | ||
85 | 90 | 95 | ||||
Leu | Glu | Gly | Lau Ile His | Ser Gin Arg Arg Gin Asp Ile Leu Asp | Leu | |
100 | 105 | 110 | ||||
Trp | Ile | Tyr | His Thr Gin | Gly Tyr Phe Pro Asp Trp Gin Asn Tyr | Thr | |
115 | 120 | 125 | ||||
Pro | Gly | Pro | Gly Val Arg | Tyr Pro Leu Thr Phe | Gly Trp Cys Tyr | Lys |
130 | 135 | 140 | ||||
Leu | Val | Pro | Val Glu Pro | Asp Lys Val Glu Glu | Ala Asn Lys Gly | Glu |
145 | 150 | 155 | 160 | |||
Asn | Thr | Ser | Leu Leu His | Pro Val Ser Leu His | Gly Met Asp Asp | Pro |
165 | 170 | 175 | ||||
Glu Arg | Glu | Val Leu Glu | Trp Arg Phe Asp Ser | Arg Leu Ala Phe | His | |
180 | 185 | 190 | ||||
His | Val | Ala | Arg Glu Leu | His Pro Glu Tyr Phe | Lys Asn Cys Thr | Ser |
195 | 200 | 205 | ||||
Glu | Pro | Val | Asp Pro Arg | Leu Glu Pro Trp Lys | His Pro Gly Ser | Gin |
210 | 215 | 220 | ||||
Pro | Lys | Thr | Ala Cys Thr | Asn Cys Tyr Cys Lys | Lys Cys Cys Phe | His |
225 | 230 | 235 | 240 | |||
Cys | Gin | Val | Cys Phe Ile | Thr Ala Ala Leu Gly | Ile Ser Tyr Gly Arg | |
245 | 250 | 255 | ||||
Lys | Lys | Arg Arg Gin Arg Arg Arg Pro Pro Gin Gly Ser Gin Thr His | ||||
260 | 265 | 270 | ||||
Gin | Val | Ser | Leu Ser Lys Gin Pro Thr Ser Gin Ser Lys Gly Glu Pro | |||
275 | 280 | 285 | ||||
Thr | Gly | Pro | Lys Glu Thr | Ser Gly His Bis His | His His His | |
290 | 295 | 300 |
(2) Informace o SEQ ID NO: 26:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 57 párů bází (B) TYP: nukleová kyselina (C) DRUH ŘETĚZCE: jednoretězcová (D) TOPOLOGIE: lineární io (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 26:
TTCGAAACCA TGGCCGCGGA CTAGTGGCCA CCATCACCAT CACCATTAAC GGAATTC (2) Informace o SEQ ID NO: 27:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 17 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina
-28CZ 302878 B6 (C) DRUH ŘETĚZCE; jednořetězcová (D) TOPOLOGIE: lineární (xi) POPIS SEKVENCE: SEQ ID NO: 27:
Thr Ser Gly His His His His His His
Claims (20)
10 PATENTOVÉ NÁROKY
1. Proteinová vakcína, vyznačující se tím, že obsahuje exprimovaný, puntíkovaný a izolovaný protein ze skupiny:
a) úplný protein HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaný Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaný Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, spojený s
20 i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo ii) úplným proteinem HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo
25 b) úplný izolovaný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, spojený s i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo
30 ii) úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaným Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, nebo
c) úplný izolovaný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým koncem nebo Nef
35 po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, spojený s úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým koncem nebo mutovaným Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23 a proteinem nebo lipoproteinem jako fúzním partnerem, ve směsi s farmaceuticky přijatelnými pomocnými látkami.
2. Vakcína podle nároku 1, vyznačující se tím, že obsahuje fúzní protein Tat-Nef nebo jeho derivát.
3. Vakcína podle nároku 1, vyznačující se tím, že obsahuje fúzní protein Nef-Tat
45 nebo jeho derivát.
4. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků laž3, vyznačující se tím, že lipoprotein je lipoprotein D Haemophilus influenza B nebo jeho derivát.
50 5. Vakcína podle nároku 4, vyznačující se tím, že fúzní partner obsahuje 100 až
130 aminokyselin, pocházejících z N-konce proteinu D Haemophilus influenza B.
-29CZ 302878 B6
6. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků 1 až 5, vy z n ač uj íc í se tím , že protein Tat je fúzován s proteinem HIV Nef a fúzním partnerem.
7. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků 1 až 6, vyznačující se tím, že protein má
5 histidinový konec.
8. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků Iaž5a7, vyznačující se tím, že proteinem je fúzní protein Nef-Tat, přičemž protein je karboxy methyl ován.
io
9. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků laž8, vyznačující se tím, že navíc obsahuje adjuvans.
10. Vakcína podle nároku 9, vyznačující se tím, že adjuvans vyvolává odpověď TH1.
11. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků 9a 10, vyznačující se tím, že adjuvans obsahuje monofosforyllipid A nebo jeho derivát, například 3-de-O-acyl ováný monofosforyllipid A.
20
12. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků 9ažll, vyznačující se tím, že dále obsahuje saponinové adjuvans.
13. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků 11 nebo 12, vyznačující se tím, že navíc obsahuje emulzi oleje ve vodě a tokoferol.
14. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků 9až13, vyznačující se tím, že adjuvans obsahuje polysacharid 3D-MPL, saponin QS21 a emulzi oleje ve vodě s obsahem tokoferolu, skvalenu a polyoxyethylen(80)sorbitanmonooleátu.
30
15. Vakcína podle kteréhokoliv z nároků lažl4, vyznačující se tím, že dále obsahuje HIV gpl60 nebo jeho derivát gpl20.
16. Protein, zahrnující úplný protein HIV Tat nebo úplný Tat s C-terminálním histidinovým zakončením nebo mutovaný úplný Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin
35 nebo mutovaný Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23, spojený s úplným proteinem HIV Nef nebo s úplným Nef s C-terminálním histidinovým zakončením nebo s úplným Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin v orientaci Nef-Tat nebo Tat-Nef.
17. Způsob výroby proteinu, který zahrnuje
a) úplný protein HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým zakončením nebo mutovaný Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaný Tat se sekvencí SEQ ID NO, 23, spojený s
45 i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo ii) úplným proteinem HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým zakončením nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo
50 b) úplný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým zakončením nebo Nef po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, spojený s i) fúzním partnerem typu proteinu nebo lipoproteinu nebo
-30CZ 302878 B6 i i) úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým zakončením nebo mutovaným Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, nebo
c) úplný protein HIV Nef nebo Nef s C-terminálním histidinovým zakončením nebo Nef po
5 vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin, spojený s úplným proteinem HIV Tat nebo Tat s C-terminálním histidinovým zakončením nebo mutovaným Tat po vypuštění, přidání nebo náhradě jedné z aminokyselin nebo mutovaným Tat se sekvencí SEQ ID NO. 23 a proteinem nebo lipoproteinem jako fúzním partnerem, v Pichia pastoris, vyznačující se ío t í m, že se Pichia pastoris transformuje kódovou DNA pro tento protein, protein je exprimován a po expresi se protein izoluje.
18. Způsob podle nároku 17, vyznačující se tím, že proteinem je fúzní protein NefTat a způsob dále zahrnuje karboxymethylaci exprimovaného proteinu.
19. Způsob výroby vakcíny, vyznačující se tím, že se protein, získaný způsobem podle kteréhokoliv z nároků 17 a 18 smísí s farmaceuticky přijatelným ředidlem.
20. Způsob podle nároku 19, vyznačující se tím, že se přidá ještě HIV gp 160 nebo
20 jeho derivát gpl20.
21. Způsob podle nároků 19 a 20, vyznačující se tím, že se dále přidává adjuvans, zvláště adjuvans, vyvolávající odpověď TH1.
25 22. Protein Nef-Tat-His nebo Nef-Tat-mutanta-His nebo polynukleotid kódující tento protein, mající aminokyselinovou nebo DNA sekvencí podle SEQ ID NO, 12, 13, 16, 17, 20, 21, 24 nebo 25.
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB9720585.0A GB9720585D0 (en) | 1997-09-26 | 1997-09-26 | Vaccine |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ20001091A3 CZ20001091A3 (cs) | 2000-09-13 |
CZ302878B6 true CZ302878B6 (cs) | 2012-01-04 |
Family
ID=10819735
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ20001091A CZ302878B6 (cs) | 1997-09-26 | 1998-09-17 | Proteinová vakcína |
Country Status (28)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP1015596B2 (cs) |
JP (2) | JP2001518300A (cs) |
KR (1) | KR100554487B1 (cs) |
CN (1) | CN1188519C (cs) |
AR (2) | AR017147A1 (cs) |
AT (1) | ATE338128T1 (cs) |
AU (1) | AU746564B2 (cs) |
BR (1) | BR9812547A (cs) |
CA (1) | CA2305013C (cs) |
CO (1) | CO4810339A1 (cs) |
CZ (1) | CZ302878B6 (cs) |
DE (1) | DE69835756T3 (cs) |
DK (1) | DK1015596T4 (cs) |
ES (1) | ES2272012T5 (cs) |
GB (1) | GB9720585D0 (cs) |
HK (1) | HK1030431A1 (cs) |
HU (1) | HUP0004896A3 (cs) |
IL (1) | IL135102A0 (cs) |
NO (2) | NO328824B1 (cs) |
NZ (1) | NZ503482A (cs) |
PL (1) | PL195243B1 (cs) |
PT (1) | PT1015596E (cs) |
SA (1) | SA98190877B1 (cs) |
SI (1) | SI1015596T2 (cs) |
TR (1) | TR200000864T2 (cs) |
TW (1) | TW499436B (cs) |
WO (1) | WO1999016884A1 (cs) |
ZA (1) | ZA988789B (cs) |
Families Citing this family (48)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB9706957D0 (en) | 1997-04-05 | 1997-05-21 | Smithkline Beecham Plc | Formulation |
GB9720585D0 (en) * | 1997-09-26 | 1997-11-26 | Smithkline Beecham Biolog | Vaccine |
GB9820525D0 (en) * | 1998-09-21 | 1998-11-11 | Allergy Therapeutics Ltd | Formulation |
JP2002537354A (ja) * | 1999-02-25 | 2002-11-05 | スミスクライン ビーチャム バイオロジカルズ ソシエテ アノニム | ペプチド、及びH.influenzaeのプロテインD由来の担体を含む免疫原 |
AU4342900A (en) * | 1999-04-12 | 2000-11-14 | Modex Therapeutiques, S.A. | Transiently immortalized cells for use in gene therapy |
ATE306938T1 (de) * | 1999-06-29 | 2005-11-15 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Verwendung von cpg als adjuvans für hivimpstoff |
GB0000891D0 (en) | 2000-01-14 | 2000-03-08 | Allergy Therapeutics Ltd | Formulation |
PL211762B1 (pl) * | 2000-01-31 | 2012-06-29 | Smithkline Beecham Biolog | Zastosowanie białka fuzyjnego zawierającego białka HIV Tat i HIV Nef lub polinukleotyd kodujący takie białko, białka lub polinukleotydu HIV gp120, białka lub polinukleotydu SIV Nef, adiuwanta indukującego TH1 zawierającego monofosforylolipid A lub jego pochodną i adiuwanta saponinowego oraz kompozycja szczepionki |
WO2006033665A1 (en) | 2004-03-16 | 2006-03-30 | Inist Inc. | Tat-based vaccine compositions and methods of making and using same |
US6472176B2 (en) | 2000-12-14 | 2002-10-29 | Genvec, Inc. | Polynucleotide encoding chimeric protein and related vector, cell, and method of expression thereof |
GB0110431D0 (en) * | 2001-04-27 | 2001-06-20 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Novel compounds |
EP1279404A1 (en) * | 2001-07-26 | 2003-01-29 | Istituto Superiore di Sanità | Use of HIV-1 tat, fragments or derivatives thereof, to target or to activate antigen-presenting cells, to deliver cargo molecules for vaccination or to treat other diseases |
GB0118367D0 (en) * | 2001-07-27 | 2001-09-19 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Novel use |
NZ532383A (en) | 2001-11-21 | 2007-03-30 | Univ Pennsylvania | Pan-7 simian adenovirus nucleic acid and amino acid sequences, vectors containing same, and methods of use |
EP1944043A1 (en) | 2001-11-21 | 2008-07-16 | The Trustees of the University of Pennsylvania | Simian adenovirus nucleic acid and amino acid sequences, vectors containing same, and methods of use |
KR100466382B1 (ko) * | 2002-01-08 | 2005-01-14 | 주식회사 엘지생명과학 | 인간 면역 결핍 바이러스-1, -2 타입의 단백질이 융합된 재조합 콤보 단백질, 이의 생산방법, 이를 포함하는 벡터, 형질전환된 대장균 및 진단키트 |
GB0206359D0 (en) | 2002-03-18 | 2002-05-01 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Viral antigens |
GB0206360D0 (en) | 2002-03-18 | 2002-05-01 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Viral antigens |
DK1506223T3 (da) | 2002-05-16 | 2006-04-10 | Bavarian Nordic As | Fusionsprotein af regulatoriske/accessoriske HIV-proteiner |
GB0225788D0 (en) | 2002-11-05 | 2002-12-11 | Glaxo Group Ltd | Vaccine |
TW200613554A (en) | 2004-06-17 | 2006-05-01 | Wyeth Corp | Plasmid having three complete transcriptional units and immunogenic compositions for inducing an immune response to HIV |
GB0417494D0 (en) | 2004-08-05 | 2004-09-08 | Glaxosmithkline Biolog Sa | Vaccine |
GB0507003D0 (en) * | 2005-04-06 | 2005-05-11 | Molmed Spa | Therapeutic |
IN2014DN06624A (cs) | 2005-10-18 | 2015-07-10 | Univ Colorado | |
BRPI0819774A2 (pt) | 2007-11-28 | 2014-10-14 | Univ Pennsylvania | Subfamília c de adenovírus sadv-40, -31 e -34 de símio e seus usos |
DK2220241T3 (en) | 2007-11-28 | 2017-01-09 | Univ Pennsylvania | Adenovirus comprising a simian adenovirus E-SAdV-39-capsidhexonprotein and uses thereof |
JP5661476B2 (ja) | 2008-03-04 | 2015-01-28 | ザ・トラステイーズ・オブ・ザ・ユニバーシテイ・オブ・ペンシルベニア | サルアデノウイルスSAdV−36、−42.1、−42.2および−44ならびにそれらの用途 |
CA2723114C (en) | 2008-05-16 | 2018-02-27 | Taiga Biotechnologies, Inc. | Antibodies and processes for preparing the same |
CN102083970B (zh) | 2008-07-21 | 2014-10-22 | 泰加生物工艺学公司 | 分化无核细胞及其制备方法 |
DK2966084T3 (en) | 2008-08-28 | 2018-08-06 | Taiga Biotechnologies Inc | MODULATORS OF MYC, PROCEDURES FOR USING SAME AND PROCEDURES FOR IDENTIFYING SUBSTANCES MODULATING MYC |
EP2350269B1 (en) | 2008-10-31 | 2015-09-09 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Simian adenoviruses with sadv-46 hexon capsid proteins and uses thereof |
CA2755897C (en) | 2009-03-23 | 2020-01-28 | Nanirx, Inc. | Treatment of cancers with immunostimulatory hiv tat derivative polypeptides |
US8846031B2 (en) | 2009-05-29 | 2014-09-30 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Simian adenovirus 41 and uses thereof |
EP2643465B1 (en) | 2010-11-23 | 2016-05-11 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Subfamily e simian adenovirus a1321 and uses thereof |
US9110059B2 (en) * | 2011-03-15 | 2015-08-18 | Industry-Academic Cooperation Foundation, Yonsei University | Bio-pin |
BR112014028684A2 (pt) | 2012-05-18 | 2017-07-25 | Univ Pennsylvania | subfamília e adenovírus de símio a1302, a1320, a1331 e a1337 e usos dos mesmos |
WO2014012090A1 (en) * | 2012-07-13 | 2014-01-16 | The Broad Institute, Inc. | Molecular sleds comprising a positively-charged amino acid sequence and a molecular cargo and uses thereof |
US9789135B2 (en) | 2012-07-20 | 2017-10-17 | Taiga Biotechnologies, Inc. | Enhanced reconstitution and autoreconstitution of the hematopoietic compartment |
US9365825B2 (en) | 2013-03-11 | 2016-06-14 | Taiga Biotechnologies, Inc. | Expansion of adult stem cells in vitro |
US10272115B2 (en) | 2013-03-11 | 2019-04-30 | Taiga Biotechnologies, Inc. | Production and use of red blood cells |
US9663556B2 (en) | 2013-10-04 | 2017-05-30 | Pin Pharma, Inc. | Treatment of cancers with immunostimulatory HIV tat derivative polypeptides |
CA2947614C (en) | 2014-05-13 | 2023-10-03 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Compositions comprising aav expressing dual antibody constructs and uses thereof |
CN107708671B (zh) * | 2015-04-16 | 2020-12-04 | 纽约州立大学研究基金会 | 包含钴卟啉-磷脂缀合物和聚组氨酸标签的纳米结构 |
US11207421B2 (en) | 2015-04-16 | 2021-12-28 | The Research Foundation For The State University Of New York | Nanostructures comprising cobalt porphyrin-phospholipid conjugates and polyhistidine-tags |
KR20190092472A (ko) | 2016-12-02 | 2019-08-07 | 타이가 바이오테크놀로지스, 인코포레이티드 | 나노입자 제제 |
US10149898B2 (en) | 2017-08-03 | 2018-12-11 | Taiga Biotechnologies, Inc. | Methods and compositions for the treatment of melanoma |
MX2023012643A (es) | 2021-04-27 | 2024-01-05 | Generation Bio Co | Vectores de adn no virales que expresan anticuerpos terapéuticos y usos de estos. |
WO2023177655A1 (en) | 2022-03-14 | 2023-09-21 | Generation Bio Co. | Heterologous prime boost vaccine compositions and methods of use |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1994016737A1 (en) * | 1993-01-26 | 1994-08-04 | Weiner David B | Compositions and methods for delivery of genetic material |
US5583038A (en) * | 1991-10-21 | 1996-12-10 | Medimmune, Inc. | Bacterial expression vectors containing DNA encoding secretion signals of lipoproteins |
EP1015596A1 (en) * | 1997-09-26 | 2000-07-05 | SMITHKLINE BEECHAM BIOLOGICALS s.a. | Fusion proteins comprising hiv-1 tat and/or nef proteins |
Family Cites Families (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB9003010D0 (en) * | 1990-02-09 | 1990-04-04 | Glaxo Group Ltd | Gene expression in yeast cells |
ES2123062T3 (es) * | 1992-08-21 | 1999-01-01 | Biogen Inc | Polipeptidos de transporte derivados de la proteina tat. |
EP0814834B2 (fr) * | 1995-03-08 | 2009-03-18 | Neovacs | Immunogenes denues de toxicite derivant d'une proteine de regulation retrovirale, anticorps diriges contre ces immunogenes, procede pour leur preparation et compositions pharmaceutiques les renfermant |
-
1997
- 1997-09-26 GB GBGB9720585.0A patent/GB9720585D0/en not_active Ceased
-
1998
- 1998-09-17 EP EP98952625A patent/EP1015596B2/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-17 CN CNB988114321A patent/CN1188519C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1998-09-17 JP JP2000513953A patent/JP2001518300A/ja not_active Withdrawn
- 1998-09-17 DK DK98952625.6T patent/DK1015596T4/da active
- 1998-09-17 SI SI9830860T patent/SI1015596T2/sl unknown
- 1998-09-17 CZ CZ20001091A patent/CZ302878B6/cs not_active IP Right Cessation
- 1998-09-17 TR TR2000/00864T patent/TR200000864T2/xx unknown
- 1998-09-17 PL PL98339432A patent/PL195243B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1998-09-17 WO PCT/EP1998/006040 patent/WO1999016884A1/en active IP Right Grant
- 1998-09-17 NZ NZ503482A patent/NZ503482A/en not_active IP Right Cessation
- 1998-09-17 AU AU10255/99A patent/AU746564B2/en not_active Ceased
- 1998-09-17 DE DE69835756T patent/DE69835756T3/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-17 HU HU0004896A patent/HUP0004896A3/hu unknown
- 1998-09-17 PT PT98952625T patent/PT1015596E/pt unknown
- 1998-09-17 ES ES98952625T patent/ES2272012T5/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-09-17 KR KR1020007003180A patent/KR100554487B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1998-09-17 IL IL13510298A patent/IL135102A0/xx not_active IP Right Cessation
- 1998-09-17 AT AT98952625T patent/ATE338128T1/de active
- 1998-09-17 BR BR9812547-8A patent/BR9812547A/pt not_active IP Right Cessation
- 1998-09-17 CA CA002305013A patent/CA2305013C/en not_active Expired - Fee Related
- 1998-09-24 AR ARP980104779A patent/AR017147A1/es active IP Right Grant
- 1998-09-25 ZA ZA9808789A patent/ZA988789B/xx unknown
- 1998-09-25 CO CO98056054A patent/CO4810339A1/es unknown
- 1998-10-22 TW TW087117493A patent/TW499436B/zh not_active IP Right Cessation
- 1998-12-15 SA SA98190877A patent/SA98190877B1/ar unknown
-
2000
- 2000-03-23 NO NO20001508A patent/NO328824B1/no not_active IP Right Cessation
- 2000-12-27 HK HK00108429A patent/HK1030431A1/xx not_active IP Right Cessation
-
2007
- 2007-12-14 NO NO20076467A patent/NO20076467L/no unknown
-
2009
- 2009-06-30 JP JP2009155916A patent/JP2009213492A/ja active Pending
-
2011
- 2011-02-28 AR ARP110100606A patent/AR080331A2/es not_active Application Discontinuation
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5583038A (en) * | 1991-10-21 | 1996-12-10 | Medimmune, Inc. | Bacterial expression vectors containing DNA encoding secretion signals of lipoproteins |
WO1994016737A1 (en) * | 1993-01-26 | 1994-08-04 | Weiner David B | Compositions and methods for delivery of genetic material |
EP1015596A1 (en) * | 1997-09-26 | 2000-07-05 | SMITHKLINE BEECHAM BIOLOGICALS s.a. | Fusion proteins comprising hiv-1 tat and/or nef proteins |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
Echarri a kol. (1996) J. Mol. Biol. 262, 640-651 * |
Goldstein (1996) Nature Medicine 2, 960-964 * |
Salfeld a kol. (1990) EMBO J. 9, 965-970 * |
Also Published As
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ302878B6 (cs) | Proteinová vakcína | |
KR101501495B1 (ko) | Hiv-감염의 예방 및 치료를 위한 백신 | |
AU783005B2 (en) | Novel use | |
SG194360A1 (en) | Novel method and compositions | |
JP2010187681A (ja) | HIVに対する免疫のためのgp120と、Nef及び/又はTatを含むワクチン | |
MXPA04002631A (es) | Vacunas de adn optimizadas por codon gag-vih. | |
KR20100109555A (ko) | 백신 | |
SG184188A1 (en) | Hiv vaccine | |
US20100215681A1 (en) | Fusion proteins comprising hiv-1 tat and/or nef proteins | |
KR101953374B1 (ko) | 단백질 나노입자 기반의 복합백신 | |
US7588764B2 (en) | Compositions comprising human immunodeficiency virus Tat adsorbed to the surface of anionic nanoparticles | |
MXPA00002973A (en) | Fusion proteins comprising hiv-1 tat and/or nef proteins | |
KR101067231B1 (ko) | Hiv-gag 코돈-최적화된 dna 백신 | |
AU2010210071A1 (en) | Novel gp41 antigens |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic | ||
MM4A | Patent lapsed due to non-payment of fee |
Effective date: 20140917 |